607 4382 88 44 102 chr2 3008135 3008540 -178739547 - RMER17A LTR ERVK 0 751 341 1 607 4382 88 44 102 chr2 3008691 3009082 -178739005 - RMER17A LTR ERVK -411 340 2 1 607 927 248 69 58 chr2 3011140 3011519 -178736568 - RLTR26 LTR ERVK -225 417 5 1 608 3498 137 41 16 chr2 3016927 3017542 -178730545 - RLTR17 LTR ERVK -62 630 1 2 608 317 245 89 64 chr2 3021855 3022012 -178726075 + MTEa LTR MaLR 182 342 -37 3 608 413 296 28 80 chr2 3023653 3023866 -178724221 - MLT2D LTR ERVL -212 202 1 3 608 345 283 144 45 chr2 3025235 3025514 -178722573 + ORR1E LTR MaLR 3 319 -40 3 608 3436 30 5 0 chr2 3027139 3027533 -178720554 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 608 9766 22 0 0 chr2 3027533 3028631 -178719456 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 4 608 3491 23 5 0 chr2 3028631 3029025 -178719062 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 608 920 251 93 50 chr2 3033986 3034288 -178713799 - MTE2a LTR MaLR -7 372 58 5 608 268 310 100 137 chr2 3034507 3034607 -178713480 - MTE2a LTR MaLR -327 92 6 5 608 771 263 191 41 chr2 3034832 3035224 -178712863 + MER31A LTR ERV1 35 485 0 5 608 526 328 43 76 chr2 3040910 3041280 -178706807 - ORR1E LTR MaLR 0 359 2 6 608 2389 134 85 3 chr2 3044496 3044885 -178703202 + MTC LTR MaLR 1 421 0 6 608 2073 141 63 68 chr2 3059202 3059598 -178688489 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 8 608 1361 218 58 19 chr2 3062007 3062316 -178685771 - RLTR14 LTR ERV1 -61 321 1 9 608 364 285 55 28 chr2 3063158 3063359 -178684728 + MTEb LTR MaLR 149 364 -15 9 608 688 237 122 22 chr2 3063359 3063537 -178684550 - MTD LTR MaLR -3 416 221 9 608 1835 128 76 0 chr2 3063537 3063826 -178684261 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 57 9 608 994 197 28 19 chr2 3063861 3064073 -178684014 - MTD LTR MaLR -194 225 12 9 608 231 286 0 41 chr2 3065080 3065153 -178682934 - MLT1K LTR MaLR -34 561 492 1 608 2224 172 59 32 chr2 3068101 3068593 -178679494 - RLTR16 LTR ERVK 0 505 1 1 608 276 330 129 28 chr2 3081540 3081718 -178666369 - MER74A LTR ERVL 0 558 363 1 608 928 298 39 60 chr2 3081881 3082217 -178665870 - MER74A LTR ERVL -213 345 17 1 608 4443 140 107 68 chr2 3082705 3083573 -178664514 + RMER19B LTR ERVK 1 902 0 1 608 686 289 121 15 chr2 3084644 3084932 -178663155 - LTR40b LTR ERVL -56 463 74 1 608 640 238 49 0 chr2 3096268 3096411 -178651676 - MTE2b LTR MaLR -229 150 1 1 608 1618 166 31 124 chr2 3099030 3099449 -178648638 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 5 1 608 753 269 372 0 chr2 3100984 3101259 -178646828 + MTE2b LTR MaLR 1 377 -2 1 608 610 309 186 19 chr2 3102604 3102868 -178645219 - ORR1E LTR MaLR -21 338 31 1 608 289 257 107 19 chr2 3106655 3106758 -178641329 - ORR1E LTR MaLR -200 159 48 1 608 436 291 107 73 chr2 3120275 3120631 -178627456 - MLT1F LTR MaLR -7 541 174 1 608 423 156 12 1 chr2 3121222 3121305 -178626782 - MTD LTR MaLR -8 411 279 1 608 299 301 62 113 chr2 3121815 3122186 -178625901 + ORR1E LTR MaLR 1 352 -7 1 608 4272 124 88 4 chr2 3122698 3123378 -178624709 - RMER19A LTR ERVK 0 737 1 1 608 1334 134 121 14 chr2 3132195 3132667 -178615420 - RMER4B LTR ERVK 0 585 34 2 608 1082 217 103 94 chr2 3134295 3134733 -178613354 + RMER4A LTR ERVK 17 458 -8 2 609 2718 132 102 6 chr2 3149438 3149918 -178598169 + RLTR11A LTR ERVK 1 526 -2 2 609 237 259 17 0 chr2 3149957 3150015 -178598072 - MTEb LTR MaLR -223 156 98 2 609 504 291 11 63 chr2 3153519 3153710 -178594377 + MER76 LTR ERVL 4 184 -507 2 609 341 291 99 25 chr2 3153709 3153871 -178594216 + MER76 LTR ERVL 401 574 -117 2 609 3223 51 8 8 chr2 3157946 3158342 -178589745 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 609 6927 72 79 73 chr2 3158342 3159434 -178588653 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 2 609 1628 72 4 8 chr2 3159434 3159672 -178588415 + MTA_Mm LTR MaLR 1 237 -159 2 609 2932 161 31 15 chr2 3165198 3165717 -178582370 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 527 0 2 609 1984 135 100 24 chr2 3166096 3166476 -178581611 + RLTR9E LTR ERVK 1 409 0 2 609 1161 216 179 33 chr2 3166940 3167275 -178580812 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 2 609 657 307 51 88 chr2 3169448 3169802 -178578285 - ORR1E LTR MaLR -10 349 9 2 609 530 299 89 33 chr2 3170568 3170904 -178577183 - ORR1E LTR MaLR -4 355 1 2 609 1358 209 155 30 chr2 3171842 3172339 -178575748 + RMER4B LTR ERVK 16 574 -11 2 609 349 194 70 20 chr2 3174813 3174913 -178573174 + LTR90A LTR LTR 858 962 -14 2 609 570 251 92 145 chr2 3182249 3182649 -178565438 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 2 609 432 279 94 68 chr2 3186085 3186393 -178561694 - MLT1C LTR MaLR -36 431 116 2 609 366 237 116 75 chr2 3186616 3186900 -178561187 - MTE2a LTR MaLR -5 374 49 3 609 284 274 16 79 chr2 3186998 3187142 -178560945 + LTR40a LTR ERVL 57 193 -269 3 609 1417 172 191 8 chr2 3207584 3207935 -178540152 - RMER4A LTR ERVK -1 465 51 3 609 231 355 21 35 chr2 3210288 3210431 -178537656 + MTE2b LTR MaLR 226 366 -13 3 609 231 266 63 135 chr2 3210638 3210764 -178537323 + MLT1A LTR MaLR 242 358 -16 3 609 326 235 99 16 chr2 3214018 3214139 -178533948 - MTEb LTR MaLR -125 254 124 3 609 503 253 43 25 chr2 3218381 3218543 -178529544 - MLT1G LTR MaLR -415 176 12 3 609 4188 186 82 41 chr2 3234733 3236172 -178511915 - ORR1A4-int LTR MaLR -288 1504 1 3 609 2039 139 12 3 chr2 3236172 3236496 -178511591 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 3 3 609 1115 266 67 37 chr2 3236671 3237046 -178511041 - MTD LTR MaLR -33 386 1 3 609 287 167 15 29 chr2 3264846 3264914 -178483173 + RLTR12B LTR ERVK 1 67 -461 4 609 514 243 83 44 chr2 3265842 3266023 -178482064 + MTC LTR MaLR 230 417 -4 4 609 257 98 24 0 chr2 3268113 3268154 -178479933 + MT2A LTR ERVL 1 42 -491 4 609 767 273 181 4 chr2 3268538 3268803 -178479284 + MTD LTR MaLR 108 419 0 4 609 490 349 8 42 chr2 3269098 3269337 -178478750 + RMER15 LTR ERVL 273 503 -72 4 609 1333 233 101 9 chr2 3271731 3272069 -178476018 - ORR1D2 LTR MaLR -1 369 1 4 609 369 248 0 79 chr2 3274551 3274665 -178473422 + MT2B LTR ERVL 153 257 -344 4 610 1545 302 61 42 chr2 3292136 3292616 -178455471 + MTEa-int LTR MaLR 352 845 -735 5 610 2572 89 0 77 chr2 3292616 3293005 -178455082 - RLTR10D LTR ERVK 0 359 1 5 610 1545 302 61 42 chr2 3293005 3293149 -178454938 + MTEa-int LTR MaLR 846 988 -592 5 610 1369 269 79 7 chr2 3293336 3293752 -178454335 + MTEa-int LTR MaLR 972 1417 -163 5 610 1402 252 10 55 chr2 3299871 3300326 -178447761 + MTEa LTR MaLR 1 348 -31 5 610 347 294 0 23 chr2 3301717 3301804 -178446283 - MER57-int LTR ERV1 -294 7243 7159 5 610 279 245 9 101 chr2 3304463 3304572 -178443515 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 310 5 610 445 133 88 140 chr2 3305903 3306017 -178442070 - ORR1B2 LTR MaLR -215 152 29 5 610 3386 169 81 6 chr2 3306494 3307125 -178440962 + RLTR33 LTR ERVK 1 678 0 5 610 616 245 127 53 chr2 3307866 3308150 -178439937 + MTE2a LTR MaLR 67 371 -8 5 610 2274 137 0 0 chr2 3309783 3310112 -178437975 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 5 610 2040 200 95 16 chr2 3310276 3310368 -178437719 - RLTR20B2 LTR ERVK 0 560 467 5 610 2040 200 95 16 chr2 3310395 3310819 -178437268 - RLTR20B2 LTR ERVK -94 466 4 5 610 381 183 84 28 chr2 3310832 3310939 -178437148 - RLTR23 LTR ERV1 -4 426 314 5 610 1093 239 84 71 chr2 3311518 3311910 -178436177 + MTD LTR MaLR 8 404 -15 5 610 2121 245 135 104 chr2 3311926 3312765 -178435322 + MTD-int LTR MaLR 1 824 -434 5 610 2121 245 135 104 chr2 3312798 3313060 -178435027 + MTD-int LTR MaLR 825 1135 -123 5 610 2121 245 135 104 chr2 3313398 3313496 -178434591 + MTD-int LTR MaLR 1136 1239 -19 5 610 1341 244 46 72 chr2 3313501 3313649 -178434438 + MTD LTR MaLR 2 135 -284 5 610 1341 245 46 69 chr2 3314161 3314439 -178433648 + MTD LTR MaLR 136 405 -14 5 610 3080 59 5 32 chr2 3314460 3314861 -178433226 + RLTR10 LTR ERVK 1 390 0 5 610 441 279 0 210 chr2 3315451 3315646 -178432441 - MTE2b LTR MaLR -225 154 1 5 610 278 211 0 0 chr2 3317123 3317175 -178430912 + RLTR4_MM-int LTR ERV1 4869 4920 -2681 5 610 784 268 85 52 chr2 3324344 3324670 -178423417 - ORR1E LTR MaLR -5 354 12 5 610 313 316 47 83 chr2 3325062 3325488 -178422599 - MLT1C LTR MaLR -5 462 9 5 610 265 244 112 61 chr2 3332360 3332574 -178415513 + RMER5 LTR ERV1 141 365 -169 5 610 2126 170 106 7 chr2 3340116 3340567 -178407520 - RMER5 LTR ERV1 -22 512 17 5 610 261 306 117 0 chr2 3344307 3344418 -178403669 - MLT1G LTR MaLR -11 580 457 5 610 1532 179 90 69 chr2 3360047 3360480 -178387607 + RMER10A LTR ERVL 1 442 0 6 610 258 268 0 8 chr2 3362090 3362106 -178385981 + ORR1B1-int LTR MaLR 632 646 -863 6 610 356 235 48 19 chr2 3365119 3365223 -178382864 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 324 6 610 310 270 40 121 chr2 3368424 3368597 -178379490 - MLT1B LTR MaLR -69 321 149 6 610 982 221 48 44 chr2 3373473 3373743 -178374344 + MTD LTR MaLR 21 291 -128 6 610 2381 136 37 15 chr2 3395761 3396165 -178351922 + MTC LTR MaLR 1 413 -8 6 610 416 282 47 53 chr2 3396302 3396452 -178351635 + MLT1A0 LTR MaLR 4 152 -213 6 610 1610 149 61 67 chr2 3396672 3397016 -178351071 + ORR1C2 LTR MaLR 1 342 -42 6 610 318 164 0 0 chr2 3397579 3397634 -178350453 + ORR1C2 LTR MaLR 330 384 0 6 610 265 253 42 52 chr2 3399302 3399398 -178348689 + MTEa LTR MaLR 277 371 -8 6 610 765 338 98 8 chr2 3399400 3399871 -178348216 + MTEa-int LTR MaLR 1 513 -1067 6 610 275 180 108 43 chr2 3400158 3400251 -178347836 + MTEa-int LTR MaLR 1259 1357 -223 6 610 290 205 107 12 chr2 3400551 3400635 -178347452 + MTEa LTR MaLR 288 379 0 7 610 2981 28 11 8 chr2 3400785 3401151 -178346936 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 7 610 29230 23 1 2 chr2 3401151 3404427 -178343660 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 3210 7 610 8228 90 64 21 chr2 3404426 3405679 -178342408 - IAPEz-int LTR ERVK -5168 1313 8 7 610 2981 28 11 8 chr2 3405679 3406045 -178342042 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 7 611 226 346 15 38 chr2 3411225 3411357 -178336730 + RMER15 LTR ERVL 296 424 -151 7 611 3481 28 0 5 chr2 3414737 3415135 -178332952 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 7 611 263 224 49 24 chr2 3435472 3435564 -178312523 - MTEb LTR MaLR 0 379 285 7 611 1790 180 116 22 chr2 3436862 3437266 -178310821 + RMER10A LTR ERVL 1 442 0 7 611 1048 48 11 51 chr2 3441530 3441707 -178306380 - RMER17B LTR ERVK -551 407 238 7 611 1098 252 120 12 chr2 3442511 3442852 -178305235 - MTEa LTR MaLR -1 378 1 7 611 2043 152 42 57 chr2 3444136 3444520 -178303567 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 7 611 230 311 97 45 chr2 3445265 3445420 -178302667 - MLT1J LTR MaLR -71 441 279 7 611 226 242 131 46 chr2 3445479 3445609 -178302478 - MLT1J LTR MaLR -336 176 36 7 611 1815 205 57 3 chr2 3447430 3447816 -178300271 + MTD LTR MaLR 13 419 0 7 611 1418 220 38 0 chr2 3449048 3449362 -178298725 - MTEa LTR MaLR -17 362 37 7 611 418 135 102 59 chr2 3460642 3460760 -178287327 + ORR1B2 LTR MaLR 1 123 -244 7 611 1707 179 19 6 chr2 3460768 3461089 -178286998 + ORR1B1 LTR MaLR 62 386 -8 8 611 487 287 47 43 chr2 3461458 3461695 -178286392 - RMER17C LTR ERVK -25 385 82 8 611 332 296 17 74 chr2 3461785 3461869 -178286218 - RMER17C LTR ERVK -329 81 1 8 611 290 318 59 44 chr2 3464724 3464859 -178283228 + LTR33 LTR ERVL 16 152 -363 8 611 1096 195 85 39 chr2 3471447 3471831 -178276256 + RLTR33 LTR ERVK 175 615 -63 8 611 303 318 160 64 chr2 3472078 3472212 -178275875 - MLT1D LTR MaLR 0 505 368 8 611 303 318 160 64 chr2 3472425 3472740 -178275347 - MLT1D LTR MaLR -138 367 13 8 611 719 273 125 95 chr2 3472913 3473086 -178275001 - MTEa LTR MaLR 0 379 173 8 611 719 273 125 95 chr2 3473546 3473740 -178274347 - MTEa LTR MaLR -207 172 1 8 611 496 304 0 14 chr2 3473740 3473880 -178274207 - MTEa-int LTR MaLR 0 1580 1443 8 611 2693 172 124 23 chr2 3474313 3474868 -178273219 - RMER19C LTR ERVK 0 611 1 8 611 226 308 135 52 chr2 3481690 3481882 -178266205 + MLT1J2 LTR MaLR 1 208 -240 8 611 3010 16 0 107 chr2 3485068 3485479 -178262608 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 8 611 1148 223 78 25 chr2 3493676 3493998 -178254089 + MTD LTR MaLR 81 419 0 8 611 1370 205 49 46 chr2 3497595 3497857 -178250230 - ORR1C2 LTR MaLR -15 369 99 8 611 1370 205 49 46 chr2 3497910 3498015 -178250072 - ORR1C2 LTR MaLR -286 98 1 8 611 296 215 47 71 chr2 3500633 3500718 -178247369 - MLT1A0 LTR MaLR -27 338 256 1 611 823 302 55 36 chr2 3501714 3501747 -178246340 - MLT2C1 LTR ERVL -8 389 357 3 611 823 302 55 36 chr2 3501784 3502114 -178245973 - MLT2C1 LTR ERVL -41 356 21 3 611 508 239 114 66 chr2 3509667 3509878 -178238209 + MTEa LTR MaLR 21 241 -138 1 611 3075 29 0 0 chr2 3510844 3511227 -178236860 + MTA_Mm LTR MaLR 1 383 -13 1 611 2116 128 64 9 chr2 3512819 3513165 -178234922 + ORR1B2 LTR MaLR 3 367 0 2 611 2663 159 146 12 chr2 3514319 3515026 -178233061 - RLTR13C1 LTR ERVK 0 983 5 2 611 2598 164 13 181 chr2 3522606 3523319 -178224768 + RLTR17 LTR ERVK 1 593 -99 5 611 336 198 0 36 chr2 3525093 3525177 -178222910 + RLTR17 LTR ERVK 612 692 0 5 611 412 251 20 157 chr2 3527182 3527301 -178220786 + RLTR15 LTR ERVK 1 109 -250 6 611 412 251 20 157 chr2 3527362 3527533 -178220554 + RLTR15 LTR ERVK 110 253 -106 6 611 684 170 7 7 chr2 3530322 3530453 -178217634 - RMER19B LTR ERVK -12 890 759 6 611 1066 214 229 23 chr2 3530439 3530577 -178217510 - RMER19B LTR ERVK -375 527 382 6 611 3458 35 2 0 chr2 3530577 3530972 -178217115 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 611 1066 200 164 30 chr2 3530972 3531226 -178216861 - RMER19B LTR ERVK -521 381 1 6 611 450 225 33 75 chr2 3533540 3533660 -178214427 + MTEa LTR MaLR 1 115 -264 7 611 455 250 216 24 chr2 3534611 3534873 -178213214 + MLT1A LTR MaLR 60 371 -3 7 611 480 322 20 0 chr2 3537508 3537657 -178210430 + MLT1F1 LTR MaLR 165 316 -253 7 611 300 211 13 53 chr2 3538517 3538592 -178209495 - RLTR28 LTR ERVL -15 509 438 8 76 717 163 62 23 chr2 3538783 3538959 -178209128 - RLTR28 LTR ERVL -341 183 1 8 612 643 265 93 5 chr2 3538986 3539202 -178208885 + RMER15 LTR ERVL 295 529 -46 8 612 2312 122 90 11 chr2 3551964 3552329 -178195758 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 1 612 295 233 47 0 chr2 3553584 3553670 -178194417 + MLT2B2 LTR ERVL 8 97 -418 1 612 1410 211 63 0 chr2 3555681 3555999 -178192088 - RMER20A LTR ERVK -169 347 10 1 612 955 302 11 53 chr2 3559547 3559921 -178188166 + MLT1A0 LTR MaLR 8 365 0 1 612 247 214 100 0 chr2 3561050 3561120 -178186967 - MTE2a LTR MaLR -23 356 280 1 612 3185 39 57 0 chr2 3569071 3569460 -178178627 + RLTR10A LTR ERVK 1 411 0 1 612 260 261 29 0 chr2 3571954 3572023 -178176064 + RMER15 LTR ERVL 403 473 -102 1 612 1858 168 14 11 chr2 3572395 3572751 -178175336 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 38 1 612 476 241 208 5 chr2 3573698 3573890 -178174197 - MLT2B1 LTR ERVL 0 567 337 1 612 446 264 48 0 chr2 3574252 3574377 -178173710 - ORR1E LTR MaLR -228 131 1 1 612 276 237 129 17 chr2 3576507 3576739 -178171348 - RMER17C LTR ERVK -150 260 3 1 612 571 248 120 48 chr2 3584916 3585124 -178162963 - RMER15 LTR ERVL 0 575 353 1 612 435 265 105 139 chr2 3587071 3587501 -178160586 + RMER10A LTR ERVL 3 417 -25 1 612 244 220 17 0 chr2 3590415 3590474 -178157613 + MLT2B4 LTR ERVL 16 75 -481 1 612 508 337 82 48 chr2 3590522 3590790 -178157297 + MLT2B4 LTR ERVL 72 348 -208 1 612 560 296 184 32 chr2 3591504 3591787 -178156300 + MLT-int LTR MaLR 298 623 -1112 1 612 747 235 213 76 chr2 3593201 3593689 -178154398 - RMER4B LTR ERVK -14 571 17 2 612 2000 184 67 84 chr2 3608831 3608985 -178139102 + RLTR17 LTR ERVK 168 317 -375 2 612 2000 184 67 84 chr2 3609839 3610218 -178137869 + RLTR17 LTR ERVK 318 692 0 2 612 1781 196 39 25 chr2 3610218 3611028 -178137059 + RMER3D-int LTR ERVK 1 1386 -1456 2 612 5604 192 46 54 chr2 3611076 3612644 -178135443 + RMER3D-int LTR ERVK 1382 2842 0 2 612 1334 239 51 17 chr2 3612646 3613000 -178135087 + RLTR17 LTR ERVK 3 368 -324 2 612 419 260 81 0 chr2 3614912 3615035 -178133052 - MLT1C LTR MaLR -304 163 31 2 612 651 274 24 56 chr2 3616447 3616702 -178131385 + MTD LTR MaLR 33 269 -138 2 612 394 246 30 53 chr2 3616779 3616912 -178131175 + MTD LTR MaLR 276 405 -14 2 612 1039 263 79 0 chr2 3623461 3623739 -178124348 - MTE2b LTR MaLR -4 375 76 2 612 244 278 9 102 chr2 3624721 3624829 -178123258 - ORR1E LTR MaLR -183 176 79 2 612 495 329 88 62 chr2 3624980 3625348 -178122739 + MLT1E3 LTR MaLR 216 600 -24 2 612 363 215 26 7 chr2 3625837 3625938 -178122149 + MTD LTR MaLR 3 103 -293 2 612 388 289 87 46 chr2 3627477 3627673 -178120414 - MLT1B LTR MaLR -8 382 179 2 612 1112 279 35 24 chr2 3627842 3628213 -178119874 + MTEb LTR MaLR 3 377 -2 2 612 345 222 62 0 chr2 3629004 3629085 -178119002 + MTEb LTR MaLR 294 379 0 2 612 1314 169 117 156 chr2 3645858 3646128 -178101959 - MTC LTR MaLR -2 419 125 2 612 1314 169 117 156 chr2 3646275 3646440 -178101647 - MTC LTR MaLR -297 124 1 2 612 562 331 58 20 chr2 3646516 3646806 -178101281 - MLT1A0 LTR MaLR -42 332 18 2 612 978 228 108 110 chr2 3651656 3651719 -178096368 - RLTR20B3 LTR ERVK -9 519 459 2 612 1032 227 89 53 chr2 3651814 3652252 -178095835 - RLTR20B3 LTR ERVK -106 471 20 2 612 283 266 22 30 chr2 3652998 3653141 -178094946 - MTEb LTR MaLR 0 379 243 3 613 699 232 117 14 chr2 3670278 3670501 -178077586 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 139 3 613 277 310 100 53 chr2 3671619 3671769 -178076318 - MLT1A LTR MaLR -200 174 18 3 613 3427 33 13 0 chr2 3678542 3678933 -178069154 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 613 2204 155 48 18 chr2 3680369 3680764 -178067323 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 3 613 3161 61 5 5 chr2 3694642 3695038 -178053049 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 613 301 333 49 0 chr2 3699886 3700030 -178048057 - RMER15 LTR ERVL -3 572 422 3 613 289 318 50 100 chr2 3704737 3704957 -178043130 + MLT2B3 LTR ERVL 254 462 -92 3 613 1320 160 326 0 chr2 3707351 3707633 -178040454 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 3 613 2046 106 83 0 chr2 3712429 3712731 -178035356 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 3 613 3636 106 14 14 chr2 3715293 3715875 -178032212 - RLTR13D1 LTR ERVK 0 806 225 3 613 2867 126 37 33 chr2 3715846 3716387 -178031700 - RLTR13D1 LTR ERVK -359 543 1 3 613 1588 129 84 59 chr2 3718405 3718726 -178029361 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 3 613 474 321 16 21 chr2 3718759 3718950 -178029137 - ORR1E LTR MaLR -169 190 1 3 613 3039 63 34 3 chr2 3719448 3719831 -178028256 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 2 3 613 7315 74 7 4 chr2 3719832 3720911 -178027176 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 16 3 613 1332 242 59 18 chr2 3726508 3726845 -178021242 + MTEa LTR MaLR 13 363 -16 4 613 1019 257 64 100 chr2 3731673 3732062 -178016025 - MTEb LTR MaLR 0 379 5 4 613 543 261 104 5 chr2 3736716 3736928 -178011159 - MLT1B LTR MaLR -143 247 15 4 613 277 328 51 51 chr2 3740119 3740315 -178007772 - LTR88b LTR Gypsy? 0 837 642 4 613 1741 229 73 38 chr2 3742901 3743314 -178004773 - RLTR12A LTR ERVK -3 565 126 4 613 1741 229 73 38 chr2 3743428 3743536 -178004551 - RLTR12A LTR ERVK -443 125 26 4 613 2147 116 3 3 chr2 3746508 3746829 -178001258 - ORR1A4 LTR MaLR -8 321 1 4 613 11643 135 21 52 chr2 3746829 3748854 -177999233 - ORR1A4-int LTR MaLR 0 1963 2 4 613 2365 128 0 0 chr2 3748856 3749184 -177998903 - ORR1A4 LTR MaLR -1 328 1 4 613 2302 143 51 40 chr2 3749338 3749789 -177998298 - RLTR19 LTR ERVK -41 458 3 4 613 1439 93 0 14 chr2 3749814 3750031 -177998056 - ORR1A4-int LTR MaLR -811 1152 939 4 613 2507 28 3 0 chr2 3751428 3751754 -177996333 - MT-int LTR MaLR -61 1037 711 4 613 2483 184 42 39 chr2 3751797 3752383 -177995704 + RLTR26 LTR ERVK 17 642 0 4 613 862 163 28 23 chr2 3753855 3754031 -177994056 - RLTR1 LTR ERV1 0 624 448 4 613 319 267 69 0 chr2 3754026 3754127 -177993960 - RLTR1 LTR ERV1 -289 335 228 4 613 2231 181 36 141 chr2 3755695 3756363 -177991724 - RMER19C LTR ERVK -2 609 12 4 613 753 272 116 29 chr2 3758991 3759370 -177988717 - RMER5 LTR ERV1 0 534 123 4 613 962 268 74 71 chr2 3769867 3770245 -177977842 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 4 613 1391 331 100 36 chr2 3770686 3770808 -177977279 - MER21B LTR ERV1 -29 834 706 4 613 1391 331 100 36 chr2 3770836 3771472 -177976615 - MER21B LTR ERV1 -158 705 28 4 613 3327 56 2 0 chr2 3772099 3772494 -177975593 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 613 6636 75 1 23 chr2 3772494 3773479 -177974608 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 963 -135 4 613 830 85 28 0 chr2 3779635 3779776 -177968311 + MTA_Mm-int LTR MaLR 954 1098 0 4 613 3297 58 2 2 chr2 3779776 3780172 -177967915 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 613 2349 108 6 3 chr2 3787723 3788049 -177960038 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 4 613 367 341 54 11 chr2 3792441 3792625 -177955462 - MLT1D LTR MaLR 0 505 314 5 613 1462 248 46 52 chr2 3793711 3794188 -177953899 - RMER19C LTR ERVK 0 611 138 5 613 757 180 57 186 chr2 3797009 3797216 -177950871 - ORR1D1 LTR MaLR -55 319 152 5 613 757 180 57 186 chr2 3797244 3797316 -177950771 - ORR1D1 LTR MaLR -223 151 76 5 613 2509 69 22 0 chr2 3798286 3798604 -177949483 - ORR1A2 LTR MaLR -2 325 1 5 613 2454 164 0 2 chr2 3800630 3801045 -177947042 - MTC LTR MaLR 0 421 8 5 614 685 227 128 50 chr2 3810839 3811217 -177936870 - RMER20B LTR ERVK -37 590 122 5 614 2218 191 131 79 chr2 3824265 3824844 -177923243 - RMER19C LTR ERVK -2 609 1 5 614 6712 79 27 9 chr2 3829600 3830512 -177917575 + RLTR13B3 LTR ERVK 1 929 0 5 614 574 158 26 17 chr2 3838522 3838650 -177909437 + ORR1B1 LTR MaLR 1 132 -227 5 614 2994 30 0 76 chr2 3839231 3839626 -177908461 + RLTR10B2 LTR ERVK 1 365 0 5 614 1615 113 85 25 chr2 3840132 3840414 -177907673 + ORR1B1 LTR MaLR 96 394 0 5 614 1481 192 90 6 chr2 3845216 3845561 -177902526 - ORR1C2 LTR MaLR -8 376 3 5 614 2938 86 25 2 chr2 3845577 3845975 -177902112 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 5 614 4477 14 2 0 chr2 3850009 3850501 -177897586 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 5 614 321 0 0 0 chr2 3850501 3850539 -177897548 - MERVL-int LTR ERVL 0 5485 5448 5 614 344 179 46 35 chr2 3850539 3850626 -177897461 - ORR1A3-int LTR MaLR -1323 640 553 5 614 48456 15 6 0 chr2 3850626 3855952 -177892135 - MERVL-int LTR ERVL -125 5360 1 5 614 4477 14 2 0 chr2 3855952 3856444 -177891643 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 5 614 579 312 144 26 chr2 3856551 3856767 -177891320 + MLT1J LTR MaLR 3 227 -285 5 614 579 312 144 26 chr2 3856807 3856860 -177891227 + MLT1J LTR MaLR 228 304 -208 5 614 1294 223 68 60 chr2 3860651 3860710 -177887377 - MTD LTR MaLR 0 419 365 5 614 1917 136 8 110 chr2 3860710 3861074 -177887013 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 5 614 1294 223 68 60 chr2 3861074 3861429 -177886658 - MTD LTR MaLR -55 364 2 5 614 2137 178 32 5 chr2 3861480 3861778 -177886309 - MTC LTR MaLR -9 412 102 6 614 3448 28 5 0 chr2 3861778 3862172 -177885915 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 614 2137 178 32 5 chr2 3862172 3862274 -177885813 - MTC LTR MaLR -320 101 1 6 614 517 245 204 35 chr2 3865484 3865797 -177882290 - RLTR9A LTR ERVK -2 366 1 6 614 1355 205 133 9 chr2 3867655 3867985 -177880102 + MTD LTR MaLR 3 373 -46 6 614 496 243 117 36 chr2 3868526 3868722 -177879365 - MLT1A1 LTR MaLR -196 212 1 6 614 341 271 0 23 chr2 3869467 3869554 -177878533 - RMER15 LTR ERVL -154 421 337 6 614 2348 153 61 30 chr2 3869787 3870326 -177877761 - RLTR31_Mm LTR ERVK 0 561 6 6 614 304 186 103 11 chr2 3871619 3871706 -177876381 + ORR1E LTR MaLR 257 351 -8 6 614 4296 168 58 16 chr2 3872100 3872940 -177875147 + RMER13B LTR ERVK 2 877 -31 6 614 3579 158 26 165 chr2 3873327 3874359 -177873728 - RMER19B LTR ERVK -13 889 1 6 614 482 374 23 0 chr2 3874381 3874595 -177873492 + MLT1C LTR MaLR 167 385 -82 6 614 1000 169 37 81 chr2 3875452 3875748 -177872339 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 40 322 0 6 614 329 327 103 66 chr2 3878933 3879019 -177869068 - MER31B LTR ERV1 -215 251 163 6 614 329 327 103 66 chr2 3879230 3879385 -177868702 - MER31B LTR ERV1 -304 162 1 6 614 1971 100 3 70 chr2 3887055 3887411 -177860676 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK -5 332 1 6 614 26968 13 3 0 chr2 3887411 3890358 -177857729 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 3525 6 614 953 80 24 0 chr2 3890358 3890483 -177857604 - IAPEz-int LTR ERVK -2770 4910 4783 6 614 1894 107 4 4 chr2 3890478 3890740 -177857347 - IAPEz-int LTR ERVK -5183 2497 2236 6 614 464 78 0 30 chr2 3890726 3890792 -177857295 - IAPEz-int LTR ERVK -5059 1422 1359 6 614 3573 65 4 51 chr2 3890792 3891564 -177856523 - IAPEz-int LTR ERVK -5819 662 6 6 614 2122 97 11 70 chr2 3891564 3891920 -177856167 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK -2 335 1 6 614 517 276 52 3 chr2 3893128 3893454 -177854633 - MLT2B1 LTR ERVL -57 505 9 6 614 296 271 52 10 chr2 3895463 3895560 -177852527 - MTEa LTR MaLR -4 375 275 6 614 975 119 77 24 chr2 3896663 3896887 -177851200 - LTRIS5 LTR ERV1 0 512 217 6 614 343 134 60 0 chr2 3896923 3896990 -177851097 - LTRIS5 LTR ERV1 -376 71 1 6 614 8500 257 75 72 chr2 3896990 3901500 -177846587 - MuRRS4-int LTR ERV1 0 4690 43 6 614 232 119 0 23 chr2 3901652 3901688 -177846399 - RLTR6_Mm LTR ERV1 0 654 620 6 614 946 137 30 38 chr2 3901688 3901909 -177846178 - LTRIS5 LTR ERV1 0 512 228 6 614 350 141 47 0 chr2 3901941 3902005 -177846082 - LTRIS5 LTR ERV1 -380 67 1 6 614 678 264 71 132 chr2 3909763 3909861 -177838226 + MTEa LTR MaLR 2 97 -282 6 614 678 264 71 132 chr2 3910045 3910250 -177837837 + MTEa LTR MaLR 98 292 -87 6 614 1645 161 113 25 chr2 3912364 3912682 -177835405 - ORR1A2 LTR MaLR 0 346 1 6 614 10614 139 17 17 chr2 3912682 3914473 -177833614 - ORR1A2-int LTR MaLR 0 1792 1 6 614 1952 118 13 0 chr2 3914477 3914792 -177833295 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 6 614 1929 118 6 13 chr2 3914929 3915247 -177832840 + MTB_Mm LTR MaLR 1 316 -11 6 614 6040 140 121 18 chr2 3915258 3916398 -177831689 + MTB_Mm-int LTR MaLR 1 1258 0 6 614 3361 59 0 12 chr2 3916398 3916809 -177831278 + MTB_Mm LTR MaLR 1 406 -1 6 614 3627 35 28 2 chr2 3919199 3919624 -177828463 + RLTR10C LTR ERVK 1 436 0 6 614 3129 142 23 21 chr2 3930785 3931312 -177816775 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 1 6 615 232 315 121 88 chr2 3945236 3945476 -177802611 - MLT1K LTR MaLR -344 251 4 7 615 656 249 79 22 chr2 3951929 3952237 -177795850 + MTEa LTR MaLR 6 377 -2 7 615 252 245 216 47 chr2 3953096 3953267 -177794820 - MLT1A1 LTR MaLR -197 211 12 7 615 1929 102 273 10 chr2 3959558 3959845 -177788242 + RLTR25A LTR ERVK 605 896 -207 7 615 1929 102 273 10 chr2 3959896 3960003 -177788084 + RLTR25A LTR ERVK 897 1102 -1 7 615 301 306 0 59 chr2 3965549 3965667 -177782420 - MLT1A LTR MaLR -221 153 43 7 615 672 171 150 7 chr2 3966446 3966593 -177781494 - ORR1B1 LTR MaLR -226 168 1 7 615 549 320 96 15 chr2 3977268 3977601 -177770486 - MLT1B LTR MaLR 0 390 31 7 615 255 186 0 17 chr2 3978511 3978571 -177769516 + MLT1A1 LTR MaLR 350 408 0 7 615 681 284 138 38 chr2 3979594 3979912 -177768175 + ORR1E LTR MaLR 10 359 0 7 615 321 285 19 164 chr2 3981010 3981224 -177766863 - MTEa LTR MaLR -188 191 9 7 615 304 164 59 15 chr2 3981342 3981410 -177766677 - MLT1A0 LTR MaLR -167 198 128 7 615 676 325 54 51 chr2 3982725 3983059 -177765028 + ORR1E LTR MaLR 25 359 0 7 615 584 181 179 12 chr2 3997978 3998151 -177749936 + ORR1D2 LTR MaLR 169 370 0 7 615 418 208 49 10 chr2 4003591 4003693 -177744394 - MTD LTR MaLR -72 347 242 9 615 480 216 0 0 chr2 4003668 4003765 -177744322 - MTD LTR MaLR -322 97 1 9 615 378 333 36 45 chr2 4003873 4004093 -177743994 - MLT1F1 LTR MaLR -4 565 348 1 615 1406 218 87 24 chr2 4004228 4004562 -177743525 - MTEa LTR MaLR -3 376 22 1 615 321 264 113 0 chr2 4004584 4004690 -177743397 - MLT1F1 LTR MaLR -440 120 3 1 615 995 282 77 56 chr2 4006779 4007298 -177740789 + MT2A LTR ERVL 1 530 -3 1 615 2307 210 35 38 chr2 4008730 4009360 -177738727 - RMER13B LTR ERVK -9 899 272 2 615 1153 181 132 50 chr2 4009379 4009781 -177738306 - RMER17B LTR ERVK -519 439 5 2 615 1260 259 70 0 chr2 4011402 4011761 -177736326 - MLT1B LTR MaLR -1 389 6 2 615 690 278 161 50 chr2 4013567 4013908 -177734179 - MTE2a LTR MaLR 0 379 1 3 615 1397 214 38 95 chr2 4014254 4014621 -177733466 - MTEb LTR MaLR -31 348 3 3 615 1875 183 63 46 chr2 4015492 4015904 -177732183 - MTC LTR MaLR 0 421 3 3 615 253 274 132 0 chr2 4016110 4016216 -177731871 - ORR1E LTR MaLR -8 371 252 4 615 2014 117 9 3 chr2 4016229 4016546 -177731541 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 4 615 532 308 10 36 chr2 4016595 4016787 -177731300 - ORR1E LTR MaLR -167 192 6 4 615 1813 148 81 6 chr2 4016832 4017166 -177730921 - ORR1B2 LTR MaLR -8 359 1 4 615 4028 42 4 2 chr2 4024558 4025032 -177723055 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 1 5 615 1704 67 135 16 chr2 4025093 4025382 -177722705 - ORR1A0 LTR MaLR -31 343 1 5 615 367 266 53 119 chr2 4032093 4032319 -177715768 + MLT1C LTR MaLR 139 426 -41 7 615 1568 153 136 17 chr2 4036653 4036998 -177711089 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 1 7 615 1570 154 85 74 chr2 4039800 4039977 -177708110 + ORR1C1 LTR MaLR 11 162 -216 8 615 1570 154 85 74 chr2 4040031 4040213 -177707874 + ORR1C1 LTR MaLR 163 374 -4 8 615 242 257 248 0 chr2 4043126 4043231 -177704856 + MTEa LTR MaLR 249 379 0 8 615 263 273 26 0 chr2 4050159 4050236 -177697851 - ORR1E LTR MaLR 0 379 301 1 615 268 318 112 0 chr2 4050365 4050472 -177697615 - ORR1E LTR MaLR -238 121 3 1 615 951 289 49 28 chr2 4060886 4061174 -177686913 - ORR1E LTR MaLR -65 294 1 1 616 677 186 18 43 chr2 4064195 4064358 -177683729 - RMER17C LTR ERVK -13 397 239 1 616 2444 110 15 30 chr2 4064358 4064753 -177683334 - RMER17C-int LTR ERVK -602 2636 2248 1 616 571 271 56 126 chr2 4065526 4065796 -177682291 + MTEa LTR MaLR 121 371 -8 1 616 236 328 56 24 chr2 4086269 4086394 -177661693 - MamGypLTR1a LTR Gypsy 0 784 656 1 616 1656 139 234 40 chr2 4086435 4086786 -177661301 - MTC LTR MaLR 0 421 3 1 616 4344 159 91 14 chr2 4088629 4089467 -177658620 + RMER19B LTR ERVK 1 902 0 1 616 477 289 45 114 chr2 4090268 4090600 -177657487 - ORR1E LTR MaLR -42 317 9 1 616 493 311 109 85 chr2 4091585 4091951 -177656136 - MTE2a LTR MaLR -4 375 1 1 616 1223 172 49 97 chr2 4093175 4093511 -177654576 + ORR1C2 LTR MaLR 15 374 0 1 616 1103 251 58 138 chr2 4097807 4098219 -177649868 - MTEa LTR MaLR 0 379 1 1 616 1084 151 42 0 chr2 4102898 4103110 -177644977 - RLTR11B LTR ERVK 0 453 233 1 616 2392 85 25 3 chr2 4107291 4107611 -177640476 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 1 616 319 291 116 98 chr2 4107655 4107983 -177640104 - ORR1E LTR MaLR -18 341 8 1 616 360 215 25 25 chr2 4113485 4113566 -177634521 + ORR1E LTR MaLR 6 86 -273 2 616 1664 150 57 48 chr2 4117623 4117974 -177630113 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 41 2 616 232 370 50 35 chr2 4125739 4125938 -177622149 - LTR16B2 LTR ERVL -234 228 27 2 616 509 299 7 0 chr2 4127843 4127975 -177620112 + MTD LTR MaLR 9 141 -278 2 616 244 149 25 75 chr2 4127975 4128055 -177620032 - RLTR16 LTR ERVK 0 505 430 2 616 1315 217 259 8 chr2 4128052 4128442 -177619645 - RLTR16 LTR ERVK -12 493 6 2 616 278 303 0 0 chr2 4128448 4128524 -177619563 + MTD LTR MaLR 136 211 -208 2 616 263 188 30 30 chr2 4128533 4128599 -177619488 + MTD LTR MaLR 176 241 -180 2 616 1012 273 131 3 chr2 4129492 4129852 -177618235 - MTD LTR MaLR -3 416 11 2 616 1180 234 99 6 chr2 4131836 4132159 -177615928 + MTD LTR MaLR 67 419 0 2 616 648 305 29 103 chr2 4144828 4145237 -177602850 + MTEb LTR MaLR 1 379 0 2 616 436 281 34 72 chr2 4147137 4147435 -177600652 + MTEa LTR MaLR 78 371 -8 2 616 636 333 56 62 chr2 4154904 4155390 -177592697 - MER74A LTR ERVL -70 488 6 2 616 322 345 83 17 chr2 4159784 4160110 -177587977 + ORR1D2 LTR MaLR 13 372 -7 2 616 539 320 102 52 chr2 4161365 4161708 -177586379 + MTEa LTR MaLR 5 364 -15 2 616 1914 215 37 2 chr2 4177412 4177813 -177570274 - MTC LTR MaLR 0 421 7 3 616 354 341 74 0 chr2 4177816 4177951 -177570136 - MLT1B LTR MaLR -228 162 18 3 616 1578 127 119 10 chr2 4179848 4180159 -177567928 - IAPLTR4 LTR ERVK 0 345 1 3 616 259 360 111 63 chr2 4182212 4182562 -177565525 - MER21B LTR ERV1 -279 584 218 3 616 294 199 106 43 chr2 4186395 4186521 -177561566 - MTEb LTR MaLR -2 377 225 3 617 1568 172 92 82 chr2 4209481 4209861 -177538226 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 3 617 3336 38 8 0 chr2 4210079 4210474 -177537613 - MTB LTR MaLR -2 398 1 3 617 1873 213 50 5 chr2 4211622 4212023 -177536064 - MTD LTR MaLR 0 419 1 3 617 725 274 141 7 chr2 4216704 4216987 -177531100 + ORR1E LTR MaLR 1 321 -38 3 617 563 273 74 32 chr2 4229563 4229752 -177518335 - MTEa LTR MaLR -4 375 179 4 617 303 194 0 45 chr2 4229750 4229816 -177518271 - MTEa LTR MaLR -308 71 9 4 617 512 294 57 38 chr2 4263741 4263833 -177484254 - MLT1J2 LTR MaLR -166 282 188 4 617 512 294 57 38 chr2 4264652 4264771 -177483316 - MLT1J2 LTR MaLR -261 187 68 4 617 264 280 13 0 chr2 4271981 4272056 -177476031 + MTE2a LTR MaLR 291 366 -13 4 617 478 295 58 118 chr2 4281419 4281800 -177466287 - MTEa LTR MaLR -21 358 1 5 617 1032 251 101 15 chr2 4286066 4286402 -177461685 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 1 5 617 2810 122 150 10 chr2 4290818 4291331 -177456756 - RMER4B LTR ERVK 0 585 1 5 617 3120 75 15 12 chr2 4297623 4298029 -177450058 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 5 617 3403 35 5 0 chr2 4299118 4299512 -177448575 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 617 269 329 105 26 chr2 4299512 4299665 -177448422 - MLT1A LTR MaLR -16 358 194 5 617 228 335 30 84 chr2 4300500 4300702 -177447385 + MLT1A LTR MaLR 128 318 -56 5 617 511 284 172 14 chr2 4302187 4302408 -177445679 + ORR1E LTR MaLR 104 359 0 5 617 2075 143 134 8 chr2 4302751 4303125 -177444962 - MTC LTR MaLR 0 421 1 5 617 293 277 153 0 chr2 4307584 4307721 -177440366 - MLT1H LTR MaLR -28 521 364 5 617 505 306 91 14 chr2 4307792 4307939 -177440148 - MLT1H LTR MaLR -307 242 97 5 617 505 306 91 14 chr2 4307991 4308052 -177440035 - MLT1H LTR MaLR -453 96 19 5 617 279 276 69 0 chr2 4312107 4312194 -177435893 - MTEb LTR MaLR 0 379 287 5 617 602 274 52 86 chr2 4312543 4312907 -177435180 - ORR1E LTR MaLR -14 365 1 5 617 738 197 120 3 chr2 4318724 4318919 -177429168 - ORR1C2 LTR MaLR -17 367 148 5 617 719 186 12 18 chr2 4319020 4319184 -177428903 - ORR1C2 LTR MaLR -190 188 26 5 618 578 286 16 26 chr2 4335273 4335467 -177412620 - ORR1E LTR MaLR -167 192 1 6 618 1044 214 92 112 chr2 4338200 4338558 -177409529 + MTEb LTR MaLR 6 356 -23 6 618 625 251 29 18 chr2 4340968 4341138 -177406949 - RMER15 LTR ERVL -47 528 357 6 618 228 65 0 0 chr2 4343295 4343326 -177404761 - RMER19A LTR ERVK 0 737 707 6 618 4182 123 95 8 chr2 4344914 4345576 -177402511 - RMER19A LTR ERVK -15 722 3 6 618 1439 189 87 52 chr2 4359143 4359323 -177388764 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 192 6 618 1439 189 87 52 chr2 4359394 4359582 -177388505 - ORR1C2 LTR MaLR -193 191 3 6 618 537 290 44 22 chr2 4365846 4366026 -177382061 - MLT1B LTR MaLR -16 374 191 6 618 989 269 98 35 chr2 4375230 4375576 -177372511 - MTEa LTR MaLR 0 379 12 6 618 262 322 23 99 chr2 4386276 4386407 -177361680 + RMER12 LTR ERVK 731 851 -471 7 618 261 320 7 138 chr2 4387974 4388119 -177359968 - MT2B LTR ERVL -331 270 145 7 618 1464 194 71 71 chr2 4389903 4390257 -177357830 - ORR1E LTR MaLR -5 354 1 7 618 3164 26 50 15 chr2 4392504 4392901 -177355186 + IAPLTR2a LTR ERVK 1 411 0 7 618 485 329 78 39 chr2 4412519 4412905 -177335182 - RMER10A LTR ERVL -25 417 17 7 618 530 311 98 68 chr2 4413251 4413620 -177334467 - MER74A LTR ERVL -154 404 25 7 618 656 325 63 54 chr2 4415269 4415584 -177332503 + ORR1E LTR MaLR 37 354 -5 7 618 908 253 6 141 chr2 4419326 4419653 -177328434 - MTE2a LTR MaLR -96 283 1 7 618 446 271 198 28 chr2 4428013 4428195 -177319892 - MLT2B2 LTR ERVL -3 564 352 7 618 376 211 96 0 chr2 4428591 4428695 -177319392 - MLT2B2 LTR ERVL -388 127 14 7 618 1422 245 55 19 chr2 4429219 4429585 -177318502 - MTE2b LTR MaLR 0 379 1 7 618 1612 138 12 81 chr2 4433773 4434119 -177313968 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 322 0 8 618 802 287 59 70 chr2 4443665 4444021 -177304066 - ORR1E LTR MaLR -7 352 1 8 618 1513 230 58 26 chr2 4444759 4445107 -177302980 - ORR1E LTR MaLR 0 359 1 8 619 1166 194 123 8 chr2 4461785 4462045 -177286042 - MTD LTR MaLR -129 290 1 8 619 247 336 25 33 chr2 4465980 4466100 -177281987 - LTR78 LTR ERV1 -102 1202 1084 8 619 348 285 41 87 chr2 4466511 4466730 -177281357 - ORR1E LTR MaLR -142 217 9 8 619 785 290 167 28 chr2 4472264 4472587 -177275500 - MTEa LTR MaLR -3 376 9 8 619 1299 250 69 16 chr2 4474521 4474838 -177273249 + MTD LTR MaLR 1 334 -85 8 619 1105 201 158 44 chr2 4486088 4486405 -177261682 - RLTR20B1 LTR ERVK 0 577 225 9 619 516 211 149 8 chr2 4486397 4486452 -177261635 + RLTR20B1 LTR ERVK 411 466 -97 9 619 516 211 149 8 chr2 4486490 4486532 -177261555 + RLTR20B1 LTR ERVK 467 517 -46 9 619 516 211 149 8 chr2 4486583 4486618 -177261469 + RLTR20B1 LTR ERVK 518 562 -1 9 619 1290 243 93 45 chr2 4494415 4494811 -177253276 - MTD LTR MaLR 0 419 5 9 619 567 179 197 82 chr2 4512737 4512920 -177235167 - MTEb LTR MaLR -4 375 172 2 619 386 285 43 65 chr2 4514478 4514674 -177233413 - ORR1E LTR MaLR -8 371 161 2 619 398 250 86 86 chr2 4514714 4514889 -177233198 - ORR1E LTR MaLR -137 222 48 2 619 572 295 151 19 chr2 4537036 4537347 -177210740 - ORR1E LTR MaLR -7 352 1 4 619 733 252 207 97 chr2 4550386 4550904 -177197183 + RLTR40 LTR ERVK 38 612 -205 6 619 380 252 84 21 chr2 4563094 4563236 -177184851 + MTEa LTR MaLR 45 195 -184 8 619 4749 20 0 2 chr2 4563236 4563772 -177184315 - MERVL-int LTR ERVL -4928 557 23 8 619 646 206 158 14 chr2 4563777 4563999 -177184088 + MTEb LTR MaLR 117 370 -9 8 619 2147 118 48 3 chr2 4575849 4576180 -177171907 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 1 619 379 323 50 19 chr2 4577438 4577594 -177170493 - ORR1E LTR MaLR 0 359 199 1 619 1089 193 167 113 chr2 4577594 4577717 -177170370 + RLTR16 LTR ERVK 1 114 -391 1 619 3251 23 0 227 chr2 4577717 4578281 -177169806 + RLTR10C LTR ERVK 1 436 0 1 619 1089 193 167 113 chr2 4578313 4578667 -177169420 + RLTR16 LTR ERVK 115 504 -1 1 619 294 291 95 16 chr2 4578667 4578830 -177169257 - ORR1E LTR MaLR -187 192 1 1 619 471 301 48 63 chr2 4579067 4579273 -177168814 - MLT2B2 LTR ERVL -74 441 239 1 619 1600 219 75 54 chr2 4581689 4582153 -177165934 - RMER19C LTR ERVK 0 611 138 1 619 1157 99 73 0 chr2 4584528 4584719 -177163368 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 125 1 619 3568 26 31 0 chr2 4585096 4585549 -177162538 + MT2C_Mm LTR ERVL 7 473 -2 1 620 2337 144 9 74 chr2 4589061 4589482 -177158605 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 1 620 2458 155 56 16 chr2 4593171 4593669 -177154418 - RLTR11A2 LTR ERVK -1 526 9 1 620 1890 162 141 7 chr2 4596150 4596561 -177151526 + RMER4A LTR ERVK 1 466 0 1 620 1138 171 178 13 chr2 4596869 4597172 -177150915 - ORR1D2 LTR MaLR -17 353 1 1 620 1836 142 20 9 chr2 4597191 4597540 -177150547 - RLTR16 LTR ERVK 0 505 153 1 620 391 190 0 101 chr2 4597541 4597670 -177150417 + RLTR16 LTR ERVK 380 495 -10 1 620 249 216 27 13 chr2 4597660 4597735 -177150352 + RLTR16 LTR ERVK 430 505 0 1 620 249 194 74 115 chr2 4601760 4601835 -177146252 + MT2B LTR ERVL 1 82 -451 1 620 249 194 74 115 chr2 4601855 4601901 -177146186 + MT2B LTR ERVL 83 117 -416 1 620 1233 175 59 121 chr2 4601883 4602210 -177145877 + MT2B LTR ERVL 237 552 -49 1 620 1233 175 59 121 chr2 4602235 4602296 -177145791 + MT2B LTR ERVL 553 601 0 1 620 2481 53 3 26 chr2 4602490 4602836 -177145251 + ORR1A1 LTR MaLR 1 338 -8 1 620 9789 137 9 106 chr2 4602840 4605008 -177143079 + ORR1A1-int LTR MaLR 1 1957 -6 1 620 2956 41 3 0 chr2 4605028 4605373 -177142714 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 1 620 420 309 127 35 chr2 4605386 4605505 -177142582 - MLT2D LTR ERVL -93 321 207 1 620 1983 102 28 22 chr2 4605505 4605825 -177142262 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 1 620 420 309 127 35 chr2 4605825 4605933 -177142154 - MLT2D LTR ERVL -208 206 74 1 620 2319 73 58 0 chr2 4606316 4606658 -177141429 + MTB LTR MaLR 39 400 0 1 620 1235 235 94 12 chr2 4606968 4607308 -177140779 + ORR1D2 LTR MaLR 1 368 -2 1 620 2987 71 24 0 chr2 4607662 4608073 -177140014 + BGLII LTR ERVK 1 421 0 1 620 483 170 0 118 chr2 4608629 4608756 -177139331 - MT2B LTR ERVL -337 264 153 1 620 1517 150 24 66 chr2 4612065 4612400 -177135687 + ORR1A4 LTR MaLR 1 321 -8 1 620 295 342 149 0 chr2 4619599 4619760 -177128327 - LTR16A LTR ERVL -233 218 34 1 620 3260 35 30 0 chr2 4622092 4622491 -177125596 + RLTR10A LTR ERVK 1 411 0 2 620 945 331 96 17 chr2 4622735 4623257 -177124830 + MLT1G1 LTR MaLR 15 577 -2 2 620 437 222 15 45 chr2 4625111 4625243 -177122844 + RLTR16 LTR ERVK 24 151 -354 2 620 4043 113 129 8 chr2 4628015 4628672 -177119415 + RMER19A LTR ERVK 1 737 0 2 620 575 189 0 9 chr2 4630561 4630668 -177117419 + MTD LTR MaLR 1 106 -313 2 620 536 209 9 0 chr2 4630713 4630823 -177117264 + MTD LTR MaLR 112 222 -197 2 620 516 252 43 38 chr2 4630823 4631033 -177117054 + RLTR15 LTR ERVK 1 211 -148 2 620 3240 29 37 0 chr2 4631100 4631482 -177116605 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 620 886 177 57 10 chr2 4631573 4631767 -177116320 + MTD LTR MaLR 217 419 0 2 620 359 340 111 39 chr2 4633854 4634062 -177114025 + MLT1D LTR MaLR 261 483 -22 2 620 543 315 80 61 chr2 4636229 4636388 -177111699 + MLT1B LTR MaLR 22 187 -203 2 620 543 315 80 61 chr2 4636600 4636802 -177111285 + MLT1B LTR MaLR 188 390 0 2 620 1623 225 99 92 chr2 4645747 4646496 -177101591 - RMER17B LTR ERVK -165 793 40 2 620 1763 198 45 14 chr2 4648762 4649121 -177098966 - ORR1D1 LTR MaLR -4 370 1 2 620 886 108 35 29 chr2 4654549 4654721 -177093366 + RLTR11A LTR ERVK 231 403 -125 2 620 455 166 50 7 chr2 4655443 4655583 -177092504 - RMER17B LTR ERVK -511 447 302 2 620 2007 87 34 0 chr2 4664706 4665004 -177083083 - ORR1A2 LTR MaLR -2 325 18 2 620 270 260 17 96 chr2 4690749 4690864 -177057223 - MT2B LTR ERVL -341 260 155 2 620 2054 153 94 8 chr2 4708917 4709279 -177038808 - ORR1B1 LTR MaLR -1 393 1 3 620 533 178 105 6 chr2 4711328 4711509 -177036578 + RMER17C LTR ERVK 80 278 -132 3 620 457 269 148 37 chr2 4711657 4711900 -177036187 - MT2A LTR ERVL -72 461 192 3 620 294 309 3 11 chr2 4712324 4712431 -177035656 - MLT1C LTR MaLR -17 450 299 3 620 553 292 61 86 chr2 4714459 4714785 -177033302 - ORR1E LTR MaLR -11 348 31 3 621 295 310 115 8 chr2 4728642 4728772 -177019315 - MLT1J LTR MaLR -331 181 38 3 621 4802 112 65 16 chr2 4729925 4730696 -177017391 + RMER17D2 LTR ERVK 1 809 0 3 621 1893 125 235 0 chr2 4730806 4731142 -177016945 + MTC LTR MaLR 3 417 -4 3 621 1011 264 59 144 chr2 4733682 4734106 -177013981 + MTD LTR MaLR 18 405 -14 3 621 731 279 70 58 chr2 4735533 4735946 -177012141 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 409 -32 3 621 228 233 89 59 chr2 4735963 4736132 -177011955 - RMER17C LTR ERVK -190 220 47 3 621 2449 146 51 5 chr2 4737257 4737670 -177010417 - RLTR17 LTR ERVK -260 432 1 3 621 267 273 95 61 chr2 4739161 4739309 -177008778 - MLT1A0 LTR MaLR -212 153 1 3 621 337 265 57 57 chr2 4741590 4741714 -177006373 + MLT1A LTR MaLR 23 146 -244 3 621 375 204 255 28 chr2 4743701 4743842 -177004245 + MLT1A LTR MaLR 183 355 -19 3 621 1276 231 112 75 chr2 4748847 4749410 -176998677 - RMER13A LTR ERVK -201 659 1 3 621 392 257 81 37 chr2 4753246 4753426 -176994661 - MLT1A1 LTR MaLR -17 391 166 3 621 4670 126 88 13 chr2 4757440 4757860 -176990227 - RMER17A2 LTR ERVK -12 894 446 4 621 4670 126 88 13 chr2 4757961 4758372 -176989715 - RMER17A2 LTR ERVK -461 445 2 4 621 722 172 77 12 chr2 4759165 4759422 -176988665 - ORR1D1 LTR MaLR -13 371 1 4 621 284 289 59 49 chr2 4760477 4760579 -176987508 + MLT1A1 LTR MaLR 4 106 -302 4 621 631 226 44 25 chr2 4760809 4761020 -176987067 + ORR1E LTR MaLR 20 368 -11 4 621 359 286 12 0 chr2 4761145 4761229 -176986858 - MTEb LTR MaLR 0 379 295 4 621 292 246 58 0 chr2 4761249 4761318 -176986769 - MTEb LTR MaLR -258 101 29 4 621 3283 46 0 2 chr2 4764215 4764611 -176983476 - MTB LTR MaLR 0 400 6 4 621 234 320 24 89 chr2 4766426 4766448 -176981639 - RMER12 LTR ERVK -450 872 851 4 621 234 320 24 89 chr2 4766592 4766737 -176981350 - RMER12 LTR ERVK -472 850 716 4 621 236 304 121 78 chr2 4768124 4768406 -176979681 + ORR1E LTR MaLR 61 354 -5 4 621 265 319 51 8 chr2 4770200 4770317 -176977770 - RMER12 LTR ERVK -468 854 733 4 621 2667 152 81 18 chr2 4771920 4772716 -176975371 - RMER19B LTR ERVK -12 890 1 4 621 256 250 114 38 chr2 4772780 4772837 -176975250 - MT2B LTR ERVL -362 239 176 4 621 256 250 114 38 chr2 4773030 4773051 -176975036 - MT2B LTR ERVL -426 175 155 4 621 373 273 53 8 chr2 4773142 4773275 -176974812 + RLTR15 LTR ERVK 1 139 -220 4 621 319 280 59 91 chr2 4773438 4773725 -176974362 + RLTR15 LTR ERVK 72 349 -10 4 621 356 340 75 20 chr2 4780377 4780629 -176967458 + RMER15 LTR ERVL 296 561 -14 4 621 389 269 48 76 chr2 4781143 4781288 -176966799 - MTEb LTR MaLR 0 379 239 4 621 2129 121 126 21 chr2 4781680 4782061 -176966026 - MTC LTR MaLR 0 421 1 4 621 1546 148 35 163 chr2 4782692 4783121 -176964966 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 4 621 1415 163 235 0 chr2 4783706 4783850 -176964237 + ORR1C1 LTR MaLR 1 163 -215 4 621 1415 163 235 0 chr2 4783911 4784072 -176964015 + ORR1C1 LTR MaLR 164 377 -1 4 621 409 231 0 92 chr2 4788298 4788417 -176959670 - MT2B LTR ERVL -343 258 151 5 621 263 202 209 22 chr2 4789269 4789360 -176958727 - MLT1D LTR MaLR -111 394 287 5 621 1223 169 314 7 chr2 4792748 4793171 -176954916 + RMER15 LTR ERVL 14 566 -9 5 621 235 287 121 40 chr2 4794465 4794521 -176953566 - MT2B LTR ERVL -436 165 98 5 621 595 183 153 44 chr2 4795883 4796066 -176952021 + MTD LTR MaLR 173 375 -44 5 621 297 323 7 91 chr2 4796176 4796319 -176951768 - MLT1E2 LTR MaLR -476 151 21 5 621 2262 150 15 71 chr2 4796801 4796934 -176951153 + RMER10A LTR ERVL 1 133 -309 5 621 2262 150 15 71 chr2 4796978 4797310 -176950777 + RMER10A LTR ERVL 134 439 -3 5 621 1727 142 67 7 chr2 4807523 4807820 -176940267 - MTC LTR MaLR -2 419 105 5 621 1091 205 233 32 chr2 4808842 4808989 -176939098 - MTD LTR MaLR -1 418 213 5 621 1091 205 233 32 chr2 4809022 4809222 -176938865 - MTD LTR MaLR -207 212 1 5 621 1207 171 111 26 chr2 4821289 4821592 -176926495 - ORR1D1 LTR MaLR -4 366 8 5 621 419 155 99 40 chr2 4832395 4832496 -176915591 + MTD LTR MaLR 292 398 -21 6 621 862 314 171 32 chr2 4832603 4833100 -176914987 + MTE-int LTR MaLR 747 1312 -268 6 621 274 216 39 0 chr2 4833254 4833305 -176914782 - ORR1E LTR MaLR -303 56 4 6 621 2255 92 322 0 chr2 4833644 4834026 -176914061 - LTRIS4 LTR ERV1 -2 505 1 6 621 745 69 198 0 chr2 4834046 4834162 -176913925 - RMER19B LTR ERVK -5 897 759 6 621 1745 147 152 23 chr2 4834276 4834510 -176913577 + ORR1B1 LTR MaLR 1 282 -112 6 621 3812 135 108 112 chr2 4834510 4834878 -176913209 + RMER17A2 LTR ERVK 1 397 -509 6 621 3812 135 108 112 chr2 4834905 4835446 -176912641 + RMER17A2 LTR ERVK 398 906 0 6 621 1745 147 152 23 chr2 4835446 4835560 -176912527 + ORR1B1 LTR MaLR 283 394 0 6 621 513 159 112 46 chr2 4836163 4836315 -176911772 + RLTR15 LTR ERVK 1 162 -197 6 621 276 253 63 0 chr2 4836381 4836476 -176911611 + RLTR15 LTR ERVK 99 199 -160 6 621 400 227 62 43 chr2 4836745 4836906 -176911181 + RLTR15 LTR ERVK 178 341 -18 6 621 1989 157 61 54 chr2 4838193 4838603 -176909484 + MTC LTR MaLR 1 413 -8 6 621 2595 130 34 19 chr2 4843973 4844388 -176903699 + MTC LTR MaLR 1 421 0 6 621 355 248 90 22 chr2 4845214 4845357 -176902730 - RLTR9E LTR ERVK -2 407 244 6 621 395 252 85 99 chr2 4845846 4845879 -176902208 + MT2B LTR ERVL 125 155 -446 6 621 1299 226 132 6 chr2 4846019 4846353 -176901734 - RLTR1 LTR ERV1 0 624 249 6 622 2152 159 99 0 chr2 4850431 4850814 -176897273 - MTC LTR MaLR 0 421 1 6 622 3808 37 5 0 chr2 4854644 4855078 -176893009 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 6 622 531 297 29 107 chr2 4856374 4856683 -176891404 - MT2A LTR ERVL -4 529 245 6 622 564 282 0 0 chr2 4860288 4860444 -176887643 - RLTR6-int LTR ERV1 -2740 5038 4883 6 622 453 264 67 22 chr2 4860752 4860977 -176887110 - MuRRS4-int LTR ERV1 -3319 1744 1510 6 622 318 316 13 13 chr2 4861648 4861802 -176886285 - MuRRS4-int LTR ERV1 -6866 735 582 6 622 1923 139 137 81 chr2 4862373 4862795 -176885292 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 1 6 622 258 191 0 81 chr2 4863821 4863895 -176884192 + RNLTR23 LTR ERVK 514 581 -61 7 622 283 213 12 96 chr2 4864079 4864162 -176883925 + RNLTR23 LTR ERVK 567 642 0 7 622 3302 48 0 8 chr2 4864248 4864647 -176883440 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 7 622 2517 47 3 53 chr2 4865699 4866038 -176882049 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 322 0 7 622 36899 44 8 9 chr2 4866038 4870548 -176877539 + MMETn-int LTR ERVK 1 4508 -336 7 622 250 352 78 34 chr2 4870548 4870754 -176877333 + RLTR13A LTR ERVK 172 386 -469 7 622 1036 74 0 14 chr2 4870754 4870892 -176877195 + MMETn-int LTR ERVK 4709 4844 0 7 622 2368 47 3 116 chr2 4870892 4871255 -176876832 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 322 0 7 622 829 154 8 0 chr2 4872833 4872956 -176875131 - ETnERV2-int LTR ERVK -213 7193 7070 7 622 260 238 274 9 chr2 4873241 4873347 -176874740 - MLT1B LTR MaLR -6 384 251 7 622 402 214 23 35 chr2 4873357 4873444 -176874643 + MTEa LTR MaLR 13 98 -261 7 622 1697 164 99 58 chr2 4873446 4873808 -176874279 - ORR1C1 LTR MaLR -1 377 1 7 622 420 201 288 15 chr2 4873819 4873964 -176874123 + MTEa LTR MaLR 167 362 -17 7 622 258 300 57 78 chr2 4873975 4874116 -176873971 - MLT1B LTR MaLR -163 227 90 7 622 2424 130 93 19 chr2 4874235 4874477 -176873610 - RLTR44B LTR ERVK 0 449 200 7 622 2424 130 93 19 chr2 4874562 4874736 -176873351 - RLTR44B LTR ERVK -250 199 3 7 622 233 222 195 12 chr2 4874756 4874838 -176873249 - MLT1B LTR MaLR -289 101 5 7 622 2872 68 52 10 chr2 4875553 4875957 -176872130 + BGLII LTR ERVK 1 421 0 7 622 4943 51 3 0 chr2 4877555 4878140 -176869947 - LTRIS_Mus LTR ERV1 0 587 1 7 622 267 277 18 73 chr2 4880042 4880151 -176867936 - MLT1L LTR MaLR 0 610 508 7 622 320 284 0 89 chr2 4883251 4883280 -176864807 - MT2B LTR ERVL -444 157 139 7 622 423 206 102 5 chr2 4885048 4885166 -176862921 + MTE2a LTR MaLR 1 120 -299 7 622 1004 300 48 36 chr2 4885304 4885636 -176862451 + MTE2a LTR MaLR 42 377 -2 7 622 489 245 19 14 chr2 4887106 4887239 -176860848 - MER67D LTR ERV1 -253 408 161 7 622 322 256 83 33 chr2 4888073 4888194 -176859893 - RMER2 LTR ERV1 0 567 441 7 622 760 172 92 14 chr2 4888246 4888473 -176859614 - RMER2 LTR ERV1 -221 346 4 7 622 866 250 86 69 chr2 4888905 4889253 -176858834 + RLTR9A LTR ERVK 15 368 0 7 622 265 291 139 0 chr2 4889569 4889655 -176858432 - MER67D LTR ERV1 -414 100 3 7 622 2472 131 38 34 chr2 4895495 4895939 -176852148 - RMER4A LTR ERVK -20 446 1 7 622 232 217 16 62 chr2 4913051 4913115 -176834972 + MTEa LTR MaLR 306 366 -13 8 622 340 193 39 137 chr2 4918998 4919100 -176828987 + MT2B LTR ERVL 166 257 -344 8 622 264 358 60 65 chr2 4922584 4922799 -176825288 + MLT1J LTR MaLR 40 253 -259 8 622 364 314 197 29 chr2 4922822 4923101 -176824986 + MER70B LTR ERVL 5 330 -248 8 622 1539 173 132 12 chr2 4923348 4923558 -176824529 + ORR1D1 LTR MaLR 9 228 -146 8 622 1539 173 132 12 chr2 4923592 4923708 -176824379 + ORR1D1 LTR MaLR 229 373 -1 8 622 342 290 105 88 chr2 4935673 4935911 -176812176 - ORR1E LTR MaLR -43 316 75 8 622 2317 145 198 4 chr2 4936035 4936500 -176811587 - RMER4B LTR ERVK 0 585 31 8 622 318 217 0 145 chr2 4938226 4938350 -176809737 + MT2B LTR ERVL 152 257 -344 8 622 4830 79 43 31 chr2 4938613 4939355 -176808732 - RMER17A LTR ERVK 0 751 1 8 622 337 264 66 54 chr2 4941046 4941214 -176806873 + MTEb LTR MaLR 211 379 0 8 622 242 250 140 28 chr2 4944424 4944531 -176803556 + ORR1E LTR MaLR 230 348 -11 8 622 981 279 214 16 chr2 4949059 4949504 -176798583 + MLT1F LTR MaLR 1 533 -15 9 622 369 217 16 124 chr2 4951971 4952092 -176795995 + MT2B LTR ERVL 153 260 -341 9 622 269 342 52 32 chr2 4954397 4954551 -176793536 + MTE2a LTR MaLR 13 169 -250 9 622 620 204 108 46 chr2 4954681 4954876 -176793211 + MTE2a LTR MaLR 168 374 -5 9 622 272 277 0 63 chr2 4960023 4960052 -176788035 + ORR1B1-int LTR MaLR 607 716 -793 9 622 314 265 124 33 chr2 4960052 4960173 -176787914 + RLTR25A LTR ERVK 442 573 -530 9 622 2635 147 77 99 chr2 4972380 4972567 -176775520 + RMER15 LTR ERVL 1 190 -385 9 622 2635 147 77 99 chr2 4972755 4972953 -176775134 + RMER15 LTR ERVL 191 368 -207 9 622 5954 79 44 18 chr2 4972953 4973786 -176774301 + RLTR13A LTR ERVK 1 855 0 9 622 2635 147 77 99 chr2 4973786 4973987 -176774100 + RMER15 LTR ERVL 369 575 0 9 623 262 226 132 88 chr2 4980795 4980931 -176767156 + MT2B2 LTR ERVL 122 263 -321 1 623 1032 299 44 70 chr2 4985970 4986319 -176761768 - MER21B LTR ERV1 -39 824 465 1 623 1032 299 44 70 chr2 4986506 4986562 -176761525 - MER21B LTR ERV1 -399 464 426 1 623 3430 28 8 0 chr2 4986562 4986955 -176761132 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 623 9246 31 7 1 chr2 4986955 4988046 -176760041 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 1 623 3430 28 8 0 chr2 4988046 4988439 -176759648 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 623 1032 299 44 70 chr2 4988439 4988458 -176759629 - MER21B LTR ERV1 -438 425 410 1 623 256 295 51 0 chr2 4989921 4989999 -176758088 + MER57A-int LTR ERV1 5804 5885 -302 1 623 2772 120 6 128 chr2 4989999 4990507 -176757580 + RLTR41 LTR ERV1 1 446 0 1 623 256 143 0 0 chr2 4990513 4990555 -176757532 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 333 1 623 350 243 49 53 chr2 4992840 4992904 -176755183 + RMER17D LTR ERVK 212 267 -622 1 623 350 243 49 53 chr2 4993179 4993340 -176754747 + RMER17D LTR ERVK 268 435 -454 1 623 2096 88 5 24 chr2 4994455 4994861 -176753226 + ORR1A2 LTR MaLR 8 394 0 1 623 1757 166 91 37 chr2 4997593 4997796 -176750291 - ORR1C1 LTR MaLR -8 370 166 1 623 2501 98 0 0 chr2 4997796 4998122 -176749965 - ORR1A2 LTR MaLR -1 326 1 1 623 1757 166 91 37 chr2 4998122 4998269 -176749818 - ORR1C1 LTR MaLR -213 165 1 1 623 7098 168 71 17 chr2 4998269 4999700 -176748387 - ORR1C1-int LTR MaLR 0 1509 1 1 623 1656 141 40 11 chr2 4999702 4999974 -176748113 - ORR1C1 LTR MaLR -2 365 86 1 623 400 311 42 46 chr2 5000029 5000268 -176747819 - RLTR42-int LTR ERVK -4137 1385 1148 1 623 878 288 111 15 chr2 5000327 5000669 -176747418 - MLT2C2 LTR ERVL -89 375 1 3 623 2548 95 152 101 chr2 5001494 5001988 -176746099 - MURVY-LTR LTR ERV1 0 519 1 6 623 1549 153 7 40 chr2 5006332 5006631 -176741456 + ORR1A4 LTR MaLR 1 289 -40 1 623 2153 166 91 0 chr2 5007415 5007512 -176740575 + MTC LTR MaLR 1 103 -318 2 623 2153 166 91 0 chr2 5007672 5007960 -176740127 + MTC LTR MaLR 104 420 -1 2 623 1381 104 103 11 chr2 5008264 5008488 -176739599 - RMER4B LTR ERVK -298 287 57 2 623 1381 104 103 11 chr2 5008541 5008579 -176739508 - RMER4B LTR ERVK -529 56 3 2 623 229 277 89 62 chr2 5008986 5009132 -176738955 + RLTR41 LTR ERV1 252 401 -45 2 623 267 346 67 0 chr2 5009787 5009891 -176738196 - MLT1J1 LTR MaLR -147 297 187 3 623 518 220 292 3 chr2 5010116 5010337 -176737750 - MLT1A0 LTR MaLR -4 386 97 3 623 2116 167 26 33 chr2 5011027 5011333 -176736754 - MTD LTR MaLR 0 419 118 3 623 2116 167 26 33 chr2 5011358 5011473 -176736614 - MTD LTR MaLR -302 117 1 3 623 279 341 69 8 chr2 5011977 5012107 -176735980 + MLT1J1 LTR MaLR 39 176 -268 3 623 270 342 91 11 chr2 5012148 5012334 -176735753 + MLT1J1 LTR MaLR 244 444 0 3 623 376 297 144 31 chr2 5013260 5013632 -176734455 + MLT1H LTR MaLR 82 469 -80 4 623 1261 194 117 101 chr2 5015596 5015963 -176732124 - ORR1D1 LTR MaLR -1 373 1 5 623 329 277 1 10 chr2 5023377 5023490 -176724597 + MLT1A1 LTR MaLR 239 394 -14 6 623 3430 30 5 0 chr2 5026186 5026580 -176721507 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 7 623 499 221 31 8 chr2 5027254 5027382 -176720705 - RLTR25A LTR ERVK 0 1028 898 7 623 473 162 14 182 chr2 5027371 5027514 -176720573 - RLTR25A LTR ERVK -262 766 648 7 623 765 173 47 91 chr2 5027512 5027766 -176720321 - ORR1A3-int LTR MaLR -1003 960 718 7 623 1278 133 65 80 chr2 5027720 5027982 -176720105 - MT2B LTR ERVL -309 292 35 7 623 760 143 169 149 chr2 5027831 5028086 -176720001 - ORR1A3-int LTR MaLR -1205 758 499 7 623 2408 185 7 92 chr2 5028009 5028333 -176719754 - RLTR25A LTR ERVK -579 524 237 7 623 2408 185 7 92 chr2 5028496 5028743 -176719344 - RLTR25A LTR ERVK -867 236 2 7 623 1043 248 40 71 chr2 5029027 5029352 -176718735 - ORR1E LTR MaLR -2 357 43 8 623 2308 173 92 56 chr2 5031949 5032834 -176715253 + RLTR13D1 LTR ERVK 1 855 0 9 623 1835 181 80 0 chr2 5033159 5033534 -176714553 + MTD LTR MaLR 1 405 -14 9 623 1183 194 173 18 chr2 5034526 5034867 -176713220 + MTD LTR MaLR 22 415 -4 9 623 3197 37 42 0 chr2 5036493 5036873 -176711214 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 623 280 323 102 13 chr2 5039662 5039819 -176708268 + MLT1H2 LTR MaLR 27 197 -292 1 623 867 266 116 47 chr2 5048528 5049125 -176698962 + RMER13A LTR ERVK 21 681 -227 1 623 1529 201 13 69 chr2 5051923 5052041 -176696046 + MTD LTR MaLR 1 115 -304 1 623 1529 201 13 69 chr2 5052343 5052598 -176695489 + MTD LTR MaLR 116 353 -66 1 623 431 313 97 0 chr2 5052621 5052816 -176695271 + ERVL-E-int LTR ERVL 3766 3979 -1688 1 623 577 270 128 20 chr2 5052853 5053057 -176695030 + ERVL-E-int LTR ERVL 4049 4274 -1393 1 623 2985 153 101 5 chr2 5053210 5053774 -176694313 - RMER19B LTR ERVK -283 619 2 1 623 299 311 8 16 chr2 5053857 5053978 -176694109 + ERVL-E-int LTR ERVL 4449 4568 -1099 1 623 2395 131 50 8 chr2 5054624 5055002 -176693085 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 1 623 434 325 39 63 chr2 5055026 5055402 -176692685 - ORR1E LTR MaLR -2 368 12 1 623 800 331 86 21 chr2 5056196 5056535 -176691552 + MLT1B LTR MaLR 30 390 0 1 623 418 272 86 44 chr2 5061088 5061360 -176686727 - ORR1E LTR MaLR -52 307 8 1 623 380 322 74 37 chr2 5062681 5062871 -176685216 + ORR1E LTR MaLR 1 197 -162 1 623 1329 191 168 6 chr2 5064507 5064823 -176683264 - ORR1D1 LTR MaLR -4 370 4 1 623 1035 211 192 22 chr2 5066957 5067233 -176680854 - MTD LTR MaLR 0 419 97 1 623 2235 96 12 61 chr2 5070087 5070431 -176677656 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 1 623 740 291 47 9 chr2 5071648 5071880 -176676207 - MER54A LTR ERVL -16 885 645 1 623 552 182 30 20 chr2 5072009 5072110 -176675977 - ORR1D1 LTR MaLR -265 109 8 1 623 336 222 32 136 chr2 5072090 5072215 -176675872 - MER54A LTR ERVL -531 370 259 1 623 411 254 29 44 chr2 5072873 5073009 -176675078 - MTEb LTR MaLR 0 379 246 1 623 360 275 115 40 chr2 5073145 5073293 -176674794 - MTEb LTR MaLR -162 197 39 1 623 403 222 33 11 chr2 5076975 5077066 -176671021 - MTD LTR MaLR -326 93 1 2 623 1885 158 19 77 chr2 5080529 5080905 -176667182 + ORR1C1 LTR MaLR 1 354 -24 2 623 1907 242 122 97 chr2 5085358 5085855 -176662232 + RLTR40 LTR ERVK 40 582 -235 2 623 1907 242 122 97 chr2 5085906 5086164 -176661923 + RLTR40 LTR ERVK 583 814 -3 2 623 421 306 62 99 chr2 5090944 5091187 -176656900 - MLT1L LTR MaLR -183 427 194 2 623 281 286 137 41 chr2 5095061 5095207 -176652880 + MLT1K LTR MaLR 156 315 -280 2 623 340 315 74 63 chr2 5096093 5096283 -176651804 - ORR1E LTR MaLR -167 192 1 2 623 436 125 0 0 chr2 5096415 5096487 -176651600 + ORR1A2 LTR MaLR 6 77 -250 2 623 1079 212 32 1 chr2 5097791 5098028 -176650059 - MER57D LTR ERV1 -26 385 131 2 623 3002 58 65 0 chr2 5099272 5099654 -176648433 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 2 623 254 311 57 44 chr2 5100372 5100530 -176647557 - MER57-int LTR ERV1 -1425 6112 5953 2 623 2323 126 55 16 chr2 5100631 5101010 -176647077 + MTB_Mm LTR MaLR 1 394 -13 2 623 1238 211 260 0 chr2 5101905 5102236 -176645851 + MTD LTR MaLR 1 417 -2 2 623 535 284 60 9 chr2 5102556 5102773 -176645314 - MER34B-int LTR ERV1 -2173 3183 2956 2 623 2142 119 64 74 chr2 5105692 5106082 -176642005 + ORR1B1 LTR MaLR 1 386 -8 2 623 261 32 0 0 chr2 5106488 5106519 -176641568 + MTD LTR MaLR 1 31 -388 2 623 1944 146 21 146 chr2 5109206 5109638 -176638449 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 2 623 2424 85 12 0 chr2 5110269 5110588 -176637499 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 5 2 624 1023 232 230 9 chr2 5115395 5115738 -176632349 + MTD LTR MaLR 1 419 0 2 624 2284 106 16 0 chr2 5125460 5125780 -176622307 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 3 2 624 473 258 199 81 chr2 5126355 5126598 -176621489 + ORR1E LTR MaLR 1 278 -81 3 624 473 258 199 81 chr2 5126628 5126705 -176621382 + ORR1E LTR MaLR 279 358 -1 3 624 1246 263 30 30 chr2 5131708 5132080 -176616007 - MTEa LTR MaLR -2 377 6 3 624 1029 246 159 22 chr2 5138231 5138589 -176609498 - MTD LTR MaLR -12 407 1 3 624 1940 166 74 11 chr2 5139304 5139657 -176608430 - ORR1C1 LTR MaLR -3 375 1 3 624 337 115 0 0 chr2 5141795 5141847 -176606240 + RMER6A LTR ERVK 1 52 -409 3 624 1564 41 82 0 chr2 5141850 5142070 -176606017 + MTA_Mm LTR MaLR 1 238 -158 3 624 1397 50 0 0 chr2 5142056 5142238 -176605849 + MT2C_Mm LTR ERVL 294 475 0 3 624 3707 127 31 44 chr2 5142255 5142962 -176605125 + RMER6A LTR ERVK 59 756 0 3 624 363 387 16 41 chr2 5146094 5146339 -176601748 - LTR16A LTR ERVL -1 450 212 3 624 1719 131 63 41 chr2 5146602 5146921 -176601166 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 3 624 331 292 35 17 chr2 5153848 5153963 -176594124 + MLT1A0 LTR MaLR 249 365 0 3 624 403 326 60 39 chr2 5155175 5155408 -176592679 + ERVL-E-int LTR ERVL 1619 1856 -3811 3 624 468 299 36 102 chr2 5157201 5157536 -176590551 - ORR1E LTR MaLR -44 315 3 3 624 510 238 244 40 chr2 5158789 5159095 -176588992 + ORR1E LTR MaLR 3 370 -9 3 624 273 266 76 61 chr2 5159725 5159857 -176588230 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 232 3 624 587 302 73 64 chr2 5164168 5164497 -176583590 - MLT1A LTR MaLR 0 374 43 3 624 1529 192 79 35 chr2 5164884 5165082 -176583005 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 171 3 624 1529 192 79 35 chr2 5165246 5165393 -176582694 - ORR1C2 LTR MaLR -214 170 19 3 624 1529 192 79 35 chr2 5165585 5165606 -176582481 - ORR1C2 LTR MaLR -366 18 1 3 624 1345 188 135 50 chr2 5165750 5166091 -176581996 + ORR1D1 LTR MaLR 5 374 0 3 624 585 289 100 86 chr2 5169593 5169979 -176578108 + MLT2B1 LTR ERVL 11 427 -129 3 624 3078 26 0 0 chr2 5170456 5170802 -176577285 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 3 624 2344 93 0 58 chr2 5172184 5172527 -176575560 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 5 3 624 426 237 10 0 chr2 5174045 5174142 -176573945 + MTD LTR MaLR 1 98 -321 3 624 1214 157 154 21 chr2 5175395 5175675 -176572412 + MTD LTR MaLR 101 417 -2 3 624 3600 15 2 0 chr2 5177580 5177975 -176570112 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 624 1985 179 10 134 chr2 5178424 5178933 -176569154 + RLTR25B LTR ERVK 1 446 -582 4 624 1167 133 2 252 chr2 5178989 5179430 -176568657 + ORR1A3-int LTR MaLR 634 964 -999 4 624 525 159 26 154 chr2 5179412 5179568 -176568519 + RLTR25B LTR ERVK 631 766 -262 4 624 1384 198 42 72 chr2 5179731 5180117 -176567970 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 4 624 994 278 94 21 chr2 5181559 5181890 -176566197 - ORR1D2 LTR MaLR -15 355 1 4 624 2049 118 9 0 chr2 5182041 5182356 -176565731 - ORR1A3 LTR MaLR -8 318 1 4 624 1186 196 57 53 chr2 5182465 5183005 -176565082 - RMER10B LTR ERVL 0 398 1 4 624 5207 107 11 72 chr2 5184998 5185854 -176562233 - RLTR13B4 LTR ERVK 0 803 1 4 624 3642 177 34 53 chr2 5187156 5188189 -176559898 + RLTR13B4 LTR ERVK 1 1023 0 4 624 1601 177 34 110 chr2 5188217 5188455 -176559632 + RMER17C LTR ERVK 1 214 -196 4 624 1601 177 34 110 chr2 5188602 5188807 -176559280 + RMER17C LTR ERVK 215 410 0 4 624 2030 144 22 30 chr2 5190151 5190522 -176557565 - RLTR9A LTR ERVK 0 368 1 4 624 357 192 27 0 chr2 5190523 5190596 -176557491 - ETnERV2-int LTR ERVK -1 7405 7331 4 624 399 292 35 0 chr2 5190808 5190921 -176557166 - ETnERV2-int LTR ERVK -984 6422 6306 4 624 530 230 0 45 chr2 5191050 5191182 -176556905 - ETnERV2-int LTR ERVK -1195 6211 6086 4 624 15340 148 59 28 chr2 5191179 5192457 -176555630 - ETnERV2-int LTR ERVK -1230 4176 2874 4 624 15340 159 31 55 chr2 5192486 5193745 -176554342 - ETnERV2-int LTR ERVK -3482 3924 2674 4 624 15340 159 31 55 chr2 5194147 5195838 -176552249 - ETnERV2-int LTR ERVK -4733 2673 1054 4 624 2064 124 31 14 chr2 5196228 5196588 -176551499 - RLTR9A LTR ERVK -1 367 2 4 624 1688 168 130 15 chr2 5202992 5203331 -176544756 - ORR1C2 LTR MaLR -4 380 3 4 624 1039 154 119 5 chr2 5205486 5205688 -176542399 + RLTR9D LTR ERVK 73 297 -106 4 624 1891 121 200 6 chr2 5206179 5206529 -176541558 - MTC LTR MaLR -3 418 1 4 624 915 188 294 17 chr2 5206587 5206880 -176541207 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 4 624 2061 149 132 24 chr2 5210444 5210862 -176537225 - RMER4A LTR ERVK -3 463 1 4 624 304 238 11 97 chr2 5212906 5212999 -176535088 + MT2B LTR ERVL 173 257 -344 4 624 768 252 269 27 chr2 5227642 5227936 -176520151 + MLT2D LTR ERVL 1 365 -49 4 624 440 325 110 70 chr2 5231038 5231366 -176516721 + ORR1E LTR MaLR 8 348 -11 4 624 924 314 54 17 chr2 5233697 5234047 -176514040 + MLT1A0 LTR MaLR 3 365 0 4 624 1023 258 89 6 chr2 5238520 5238831 -176509256 + ORR1E LTR MaLR 5 364 -15 4 624 3415 40 2 0 chr2 5239097 5239492 -176508595 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 624 750 215 64 168 chr2 5241802 5242271 -176505816 + RMER13B LTR ERVK 480 899 -9 5 625 414 272 102 48 chr2 5258419 5258681 -176489406 - ORR1E LTR MaLR -3 376 1 5 625 412 196 0 0 chr2 5277508 5277592 -176470495 + MER31B LTR ERV1 1 84 -459 5 625 226 380 116 47 chr2 5278352 5278670 -176469417 - MER31B LTR ERV1 -125 341 2 5 625 298 268 145 66 chr2 5279270 5279422 -176468665 + MER31B LTR ERV1 303 466 0 5 625 1553 234 25 14 chr2 5282347 5282707 -176465380 - MTD LTR MaLR -52 367 4 5 625 326 310 127 0 chr2 5285605 5285747 -176462340 + MLT1A LTR MaLR 44 203 -171 5 625 1952 124 21 80 chr2 5286614 5286990 -176461097 + ORR1B1 LTR MaLR 41 394 0 5 625 400 214 169 31 chr2 5288088 5288306 -176459781 + MTEa LTR MaLR 4 306 -73 5 625 321 233 44 11 chr2 5288465 5288548 -176459539 + MTEa LTR MaLR 288 373 -6 5 625 274 252 68 51 chr2 5289437 5289554 -176458533 + MLT1B LTR MaLR 7 125 -265 5 625 934 319 76 24 chr2 5290254 5290674 -176457413 + MLT2B1 LTR ERVL 1 442 -78 5 625 1008 261 34 119 chr2 5291987 5292400 -176455687 - MTEa LTR MaLR -1 378 1 5 625 521 322 55 48 chr2 5297921 5298211 -176449876 + LTR16A LTR ERVL 59 350 -101 6 625 257 295 34 11 chr2 5311124 5311213 -176436874 - ORR1E LTR MaLR 0 359 269 6 625 3761 42 5 0 chr2 5314643 5315077 -176433010 + RLTR10C LTR ERVK 1 436 0 6 625 508 260 68 63 chr2 5316007 5316212 -176431875 - RMER2 LTR ERV1 -28 539 334 6 625 423 312 26 13 chr2 5319663 5319819 -176428268 + MTD LTR MaLR 18 175 -244 6 625 632 240 147 5 chr2 5320807 5321004 -176427083 + MTD LTR MaLR 194 418 -1 6 625 401 334 126 25 chr2 5321271 5321596 -176426491 + ORR1E LTR MaLR 1 358 -1 6 625 2131 116 77 13 chr2 5322682 5323074 -176425013 - RMER4A LTR ERVK -2 464 48 6 625 304 304 113 22 chr2 5325144 5325401 -176422686 + MLT1A0 LTR MaLR 44 357 -33 6 625 4543 93 51 17 chr2 5328537 5328875 -176419212 + RMER17A LTR ERVK 1 339 -412 6 625 4543 93 51 17 chr2 5329053 5329437 -176418650 + RMER17A LTR ERVK 340 747 -4 6 625 333 348 50 29 chr2 5329566 5329705 -176418382 - MLT1J2 LTR MaLR -237 211 70 6 625 527 335 50 18 chr2 5334506 5334728 -176413359 + ORR1E LTR MaLR 4 232 -127 6 625 742 232 16 146 chr2 5337840 5338223 -176409864 + RLTR15 LTR ERVK 14 346 -13 6 625 1155 235 27 89 chr2 5342259 5342355 -176405732 - MTD LTR MaLR -68 351 266 6 625 1155 235 27 89 chr2 5342507 5342582 -176405505 - MTD LTR MaLR -154 265 195 6 625 1155 235 27 89 chr2 5342781 5342976 -176405111 - MTD LTR MaLR -225 194 7 6 625 350 252 7 84 chr2 5343145 5343288 -176404799 - ORR1E LTR MaLR -216 143 12 7 625 245 293 86 57 chr2 5345156 5345261 -176402826 + MTEa LTR MaLR 21 128 -251 7 625 3441 43 2 0 chr2 5350005 5350404 -176397683 - MTB LTR MaLR 0 400 1 7 625 869 176 22 22 chr2 5354696 5354876 -176393211 + ORR1E LTR MaLR 11 190 -169 7 625 4803 131 18 137 chr2 5355097 5355975 -176392112 + RMER21A LTR ERV1 1 750 -197 7 625 4803 131 18 137 chr2 5356003 5356195 -176391892 + RMER21A LTR ERV1 751 943 -4 7 625 1041 138 0 0 chr2 5356198 5356365 -176391722 + RMER21A LTR ERV1 781 947 0 7 625 242 254 197 0 chr2 5356365 5356429 -176391658 + RMER21B LTR ERV1 765 842 0 7 625 277 204 0 0 chr2 5370067 5370116 -176377971 - ORR1B2 LTR MaLR -8 386 338 7 625 453 171 12 0 chr2 5370138 5370220 -176377867 - ORR1B2 LTR MaLR -136 231 149 7 625 1765 192 92 28 chr2 5370220 5370654 -176377433 + RMER20B LTR ERVK 1 462 -165 7 625 870 225 289 15 chr2 5371505 5371834 -176376253 + MTD LTR MaLR 1 419 0 7 626 1015 124 30 0 chr2 5378169 5378338 -176369749 - ORR1C1 LTR MaLR -204 174 1 7 626 2121 72 3 65 chr2 5386583 5386922 -176361165 - ORR1A3 LTR MaLR -8 318 1 7 626 1594 247 13 51 chr2 5391112 5391399 -176356688 + MTE2a LTR MaLR 6 284 -95 7 626 1566 211 36 25 chr2 5391399 5391763 -176356324 + ORR1D2 LTR MaLR 1 368 -2 7 626 1594 247 13 51 chr2 5391763 5391864 -176356223 + MTE2a LTR MaLR 285 379 0 7 626 513 183 32 0 chr2 5391865 5391958 -176356129 + ORR1C1 LTR MaLR 1 96 -278 7 626 3224 189 103 80 chr2 5391961 5392738 -176355349 + RMER19B LTR ERVK 2 796 -106 7 626 944 190 109 18 chr2 5392737 5392957 -176355130 + ORR1C1 LTR MaLR 139 378 0 7 626 4458 162 113 8 chr2 5393120 5393940 -176354147 + RMER13B LTR ERVK 1 906 -2 7 626 915 212 32 252 chr2 5395173 5395665 -176352422 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 7 626 615 306 12 18 chr2 5396333 5396496 -176351591 + MTE2a LTR MaLR 43 204 -175 7 626 343 302 147 0 chr2 5397247 5397363 -176350724 + MTD LTR MaLR 18 150 -269 7 626 499 294 50 150 chr2 5397463 5397723 -176350364 + MTD LTR MaLR 186 419 0 7 626 4519 12 0 0 chr2 5400378 5400871 -176347216 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 7 626 312 209 72 29 chr2 5402517 5402586 -176345501 + RLTR25B LTR ERVK 438 509 -519 7 626 265 247 25 38 chr2 5403611 5403691 -176344396 + MTEa LTR MaLR 278 356 -23 7 626 2493 65 3 58 chr2 5407276 5407618 -176340469 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 5 8 626 1160 225 137 36 chr2 5410989 5411326 -176336761 + MTE2a LTR MaLR 9 379 0 8 626 1230 331 75 11 chr2 5413948 5414415 -176333672 + RMER5 LTR ERV1 38 534 0 8 626 445 287 79 48 chr2 5417589 5417754 -176330333 - MTEa LTR MaLR 0 379 210 8 626 338 279 115 0 chr2 5417854 5417958 -176330129 + MTEb LTR MaLR 197 312 -67 8 626 757 286 210 11 chr2 5418744 5419111 -176328976 + MER21B LTR ERV1 406 845 -18 8 626 615 291 158 14 chr2 5419743 5419952 -176328135 + ORR1E LTR MaLR 3 241 -118 8 626 277 302 129 58 chr2 5420018 5420065 -176328022 + RLTR15 LTR ERVK 50 96 -263 8 626 277 302 129 58 chr2 5420108 5420338 -176327749 + RLTR15 LTR ERVK 97 347 -12 8 626 279 264 85 0 chr2 5424599 5424681 -176323406 + MTE2a LTR MaLR 269 367 -12 8 626 4168 153 134 21 chr2 5426665 5427479 -176320608 + RLTR25B LTR ERVK 123 1028 0 8 626 1284 45 0 0 chr2 5427575 5427731 -176320356 + IAPEY3_LTR LTR ERVK 1 156 -176 8 626 1903 106 0 0 chr2 5430424 5430680 -176317407 - ORR1A2 LTR MaLR -71 256 1 8 626 263 204 19 0 chr2 5433663 5433717 -176314370 + ORR1E LTR MaLR 10 64 -295 8 626 528 237 153 84 chr2 5435209 5435458 -176312629 + ORR1E LTR MaLR 88 353 -6 8 626 486 281 78 93 chr2 5436840 5437162 -176310925 - ORR1E LTR MaLR -42 317 1 8 626 235 311 126 22 chr2 5437641 5437776 -176310311 + RLTR20A2 LTR ERVK 83 231 -347 8 626 1287 226 42 66 chr2 5440224 5440603 -176307484 - MER89 LTR ERV1 -10 549 180 8 626 853 194 21 41 chr2 5445976 5446170 -176301917 + ORR1D1 LTR MaLR 1 190 -184 8 626 481 204 259 0 chr2 5446214 5446376 -176301711 + ORR1D1 LTR MaLR 166 369 -5 8 626 377 232 14 31 chr2 5450347 5450460 -176297627 - MTEa LTR MaLR -23 396 280 8 626 417 341 94 53 chr2 5451845 5452164 -176295923 - ORR1E LTR MaLR -8 351 20 8 626 253 264 71 18 chr2 5453233 5453345 -176294742 + ORR1D2 LTR MaLR 19 136 -223 9 626 258 100 0 0 chr2 5453404 5453444 -176294643 + ORR1D2 LTR MaLR 329 368 -2 9 626 264 0 0 0 chr2 5466923 5466955 -176281132 - MTA_Mm LTR MaLR -364 32 1 9 626 8963 52 6 1 chr2 5466955 5468047 -176280040 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 9 626 3247 39 18 0 chr2 5468047 5468436 -176279651 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 9 626 8975 51 6 1 chr2 5468436 5469528 -176278559 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 9 626 3358 46 2 0 chr2 5469528 5469923 -176278164 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 9 626 465 297 167 62 chr2 5470262 5470717 -176277370 + MLT2B2 LTR ERVL 13 515 0 9 626 3474 25 2 2 chr2 5471067 5471463 -176276624 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 9 626 3615 46 9 0 chr2 5475381 5475813 -176272274 + RLTR10C LTR ERVK 1 436 0 9 626 2837 50 3 0 chr2 5475813 5476155 -176271932 + MMERVK10C-int LTR ERVK 1 343 -7238 9 626 933 148 4 177 chr2 5476153 5476424 -176271663 + MMERVK10C-int LTR ERVK 729 952 -6629 9 626 692 242 154 70 chr2 5476512 5476900 -176271187 + MMERVK10C-int LTR ERVK 2075 2425 -4819 9 626 313 175 0 0 chr2 5476887 5476944 -176271143 + MMERVK10C-int LTR ERVK 1089 1145 -4261 9 626 362 111 0 0 chr2 5476949 5477012 -176271075 + MMERVK10C-int LTR ERVK 1885 1947 -5634 9 626 46341 9 0 0 chr2 5477018 5482041 -176266046 + MMERVK10C-int LTR ERVK 2552 7576 -5 9 626 3615 46 9 0 chr2 5482046 5482478 -176265609 + RLTR10C LTR ERVK 1 436 0 9 626 2408 165 39 12 chr2 5484200 5484610 -176263477 + MTC LTR MaLR 1 421 0 9 626 381 339 140 66 chr2 5496157 5496627 -176251460 + MLT1D LTR MaLR 1 505 0 9 626 3594 105 81 45 chr2 5501791 5502371 -176245716 + MT2B LTR ERVL 1 601 0 3 626 595 319 6 12 chr2 5502827 5502998 -176245089 - MTEa LTR MaLR -209 170 1 7 627 237 200 67 0 chr2 5505440 5505485 -176242602 - MER87 LTR ERV1 -493 48 1 1 627 317 209 29 157 chr2 5507767 5507869 -176240218 - MT2B LTR ERVL -361 240 152 1 627 260 347 50 10 chr2 5523654 5523753 -176224334 + MLT1J LTR MaLR 57 159 -353 4 627 261 302 105 0 chr2 5524189 5524275 -176223812 + MLT1J LTR MaLR 342 436 -76 4 627 1333 248 58 6 chr2 5529608 5529933 -176218154 - MTEa LTR MaLR 0 379 38 5 627 420 286 129 67 chr2 5531826 5532066 -176216021 - MLT2B4 LTR ERVL 0 556 302 5 627 241 221 0 154 chr2 5538381 5538472 -176209615 + MT2B LTR ERVL 158 234 -367 6 627 688 254 138 76 chr2 5543857 5544203 -176203884 - ORR1E LTR MaLR -6 388 1 8 627 538 302 56 16 chr2 5546631 5546834 -176201253 - ORR1E LTR MaLR -191 193 1 8 627 848 278 61 81 chr2 5547436 5547796 -176200291 - MTE2a LTR MaLR -7 372 20 8 627 359 297 234 43 chr2 5548028 5548337 -176199750 + ORR1D1 LTR MaLR 7 374 0 8 627 237 397 24 16 chr2 5548626 5548749 -176199338 + LTR82A LTR ERVL 128 251 -621 8 627 246 318 44 26 chr2 5549777 5549890 -176198197 - MTEb LTR MaLR -164 215 101 8 627 414 258 16 55 chr2 5549971 5550098 -176197989 + LTR79 LTR ERVL 406 527 0 9 627 238 196 89 0 chr2 5558157 5558213 -176189874 + MER68 LTR ERVL 1 61 -502 1 627 833 291 74 12 chr2 5558295 5558552 -176189535 + MER68 LTR ERVL 67 339 -224 1 627 620 208 108 87 chr2 5559183 5559378 -176188709 - MTEb LTR MaLR -180 199 1 1 627 1352 119 143 121 chr2 5559408 5559723 -176188364 + ORR1A4 LTR MaLR 8 329 0 1 627 572 301 75 73 chr2 5560508 5560866 -176187221 - ORR1E LTR MaLR 0 359 1 1 627 1196 231 57 121 chr2 5563357 5563434 -176184653 + MTEa LTR MaLR 2 54 -325 1 627 1196 231 57 121 chr2 5563694 5564020 -176184067 + MTEa LTR MaLR 55 379 0 1 627 1901 131 199 6 chr2 5576331 5576677 -176171410 - MTC LTR MaLR -8 413 1 1 627 493 236 133 96 chr2 5591298 5591581 -176156506 + RMER2 LTR ERV1 3 427 -140 1 627 531 316 126 21 chr2 5591819 5592058 -176156029 + MER21B LTR ERV1 360 623 -240 1 627 1547 183 103 9 chr2 5595536 5595856 -176152231 - ORR1B2 LTR MaLR -8 359 10 1 627 310 282 11 34 chr2 5602770 5602858 -176145229 + MER21B LTR ERV1 1 86 -777 2 627 550 350 85 55 chr2 5602902 5603467 -176144620 + MER21B LTR ERV1 78 659 -204 2 627 3041 21 0 0 chr2 5605071 5605408 -176142679 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 337 0 2 627 56788 20 15 8 chr2 5605408 5611837 -176136250 + IAPEz-int LTR ERVK 8 6481 0 2 627 3041 21 0 0 chr2 5611837 5612174 -176135913 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 337 0 2 627 698 277 199 22 chr2 5619664 5619941 -176128146 + MTEb LTR MaLR 18 343 -36 2 627 1026 243 43 86 chr2 5626727 5627123 -176120964 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 2 627 396 227 0 110 chr2 5633087 5633196 -176114891 + MT2B LTR ERVL 162 258 -343 2 628 1964 216 15 36 chr2 5643907 5644380 -176103707 + RLTR33 LTR ERVK 174 678 0 2 628 1238 269 65 3 chr2 5644851 5645205 -176102882 + MTEb LTR MaLR 4 379 0 2 628 2258 71 58 6 chr2 5649159 5649470 -176098617 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 2 628 527 301 179 34 chr2 5650175 5650586 -176097501 + MLT2B1 LTR ERVL 17 514 -6 3 628 249 306 54 36 chr2 5652313 5652345 -176095742 - RMER19C LTR ERVK 0 611 546 3 628 249 306 54 36 chr2 5652404 5652425 -176095662 - RMER19C LTR ERVK 0 545 498 3 628 238 217 13 92 chr2 5652527 5652603 -176095484 + RLTR25B LTR ERVK 430 499 -529 3 628 238 140 0 0 chr2 5655067 5655110 -176092977 + ORR1A4 LTR MaLR 1 43 -286 3 628 271 75 0 0 chr2 5655110 5655150 -176092937 + ORR1A2 LTR MaLR 1 40 -287 3 628 247 100 0 0 chr2 5655153 5655193 -176092894 + ORR1A4 LTR MaLR 1 40 -289 3 628 271 75 0 0 chr2 5655196 5655236 -176092851 + ORR1A2 LTR MaLR 1 40 -287 3 628 238 140 0 0 chr2 5655239 5655289 -176092798 + ORR1A4 LTR MaLR 1 50 -279 3 628 909 157 241 13 chr2 5655325 5655567 -176092520 + ORR1A1 LTR MaLR 1 293 -101 3 628 315 232 87 39 chr2 5655566 5655669 -176092418 + RMER10A LTR ERVL 310 417 -25 3 628 1922 142 239 30 chr2 5656007 5656376 -176091711 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 1 3 628 228 232 18 18 chr2 5656599 5656656 -176091431 - RMER10B LTR ERVL -313 85 29 3 628 1838 168 67 3 chr2 5658102 5658443 -176089644 + ORR1B1 LTR MaLR 32 394 0 3 628 321 299 67 143 chr2 5663414 5663489 -176084598 + ORR1E LTR MaLR 32 111 -248 3 628 321 299 67 143 chr2 5663636 5663903 -176084184 + ORR1E LTR MaLR 112 348 -11 3 628 1196 156 354 4 chr2 5664180 5664457 -176083630 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 3 628 1404 134 110 161 chr2 5668712 5669104 -176078983 + ORR1B1 LTR MaLR 17 388 -6 3 628 950 89 0 0 chr2 5672276 5672409 -176075678 - ORR1A2 LTR MaLR 0 326 194 3 628 2182 82 112 17 chr2 5672409 5672757 -176075330 + RMER2 LTR ERV1 1 381 -186 3 628 1209 113 5 16 chr2 5672756 5672944 -176075143 - ORR1A2 LTR MaLR -141 186 1 3 628 246 185 98 98 chr2 5675172 5675274 -176072813 + MTEb LTR MaLR 278 379 0 3 628 3579 144 96 9 chr2 5681315 5681952 -176066135 - RLTR17 LTR ERVK 0 692 1 3 628 334 241 24 0 chr2 5684481 5684564 -176063523 + MTD LTR MaLR 29 113 -306 3 628 378 239 10 42 chr2 5685081 5685177 -176062910 - MTD LTR MaLR -304 115 23 3 628 3415 48 38 7 chr2 5695493 5695916 -176052171 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 3 628 42210 43 9 10 chr2 5695916 5700951 -176047136 - MMERVK10C-int LTR ERVK 0 7581 2552 3 628 388 95 0 0 chr2 5700957 5701020 -176047067 - MMERVK10C-int LTR ERVK -5634 1947 1885 3 628 369 188 125 0 chr2 5701012 5701092 -176046995 - MMERVK10C-int LTR ERVK -5110 1027 938 3 628 336 276 103 15 chr2 5701092 5701228 -176046859 - MMERVK10C-int LTR ERVK -5466 671 524 3 628 962 169 208 8 chr2 5701224 5701474 -176046613 - MMERVK10C-int LTR ERVK -4795 611 312 3 628 982 161 4 112 chr2 5701563 5701814 -176046273 - MMERVK10C-int LTR ERVK -6629 952 729 4 628 1357 118 137 137 chr2 5701812 5702155 -176045932 - MMERVK10C-int LTR ERVK -7238 343 1 4 628 3577 42 28 5 chr2 5702155 5702581 -176045506 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 4 628 514 261 28 50 chr2 5702655 5702873 -176045214 + RLTR12B LTR ERVK 42 254 -274 4 628 2362 102 6 6 chr2 5702876 5703203 -176044884 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 4 628 1311 253 41 28 chr2 5705572 5705952 -176042135 + MTEa LTR MaLR 3 418 -1 4 628 716 247 137 13 chr2 5706482 5706708 -176041379 + MTEa-int LTR MaLR 4 257 -1323 4 628 335 98 8 0 chr2 5706708 5706760 -176041327 - ORR1A4 LTR MaLR 0 374 277 4 628 1462 156 42 68 chr2 5707797 5708134 -176039953 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 2 4 628 887 268 59 0 chr2 5708146 5708385 -176039702 + MTEa-int LTR MaLR 266 518 -1062 4 628 1344 180 101 8 chr2 5708423 5708915 -176039172 - RMER19A LTR ERVK -44 693 1 4 628 2184 293 84 15 chr2 5708920 5709723 -176038364 + MTEa-int LTR MaLR 660 1578 -2 4 628 560 241 105 35 chr2 5709725 5709897 -176038190 + MTEa LTR MaLR 1 184 -195 4 628 364 115 33 0 chr2 5710358 5710419 -176037668 + ORR1C2 LTR MaLR 322 384 0 4 628 410 313 27 72 chr2 5711043 5711305 -176036782 - RLTR26 LTR ERVK -225 417 168 4 628 3581 20 0 0 chr2 5712079 5712475 -176035612 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 628 1691 188 25 14 chr2 5713146 5713503 -176034584 - ORR1C2 LTR MaLR -19 365 5 4 628 1938 113 25 131 chr2 5713673 5714069 -176034018 + ORR1B2 LTR MaLR 6 359 -8 4 628 2511 80 3 0 chr2 5715372 5715698 -176032389 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 4 628 270 239 42 76 chr2 5720734 5720852 -176027235 + MTEa LTR MaLR 5 118 -261 4 628 1827 159 135 0 chr2 5731176 5731509 -176016578 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 4 628 1340 225 80 37 chr2 5732789 5733190 -176014897 + MTD LTR MaLR 2 419 0 4 628 436 156 82 9 chr2 5735302 5735412 -176012675 - ORR1D1 LTR MaLR -222 152 35 4 628 958 217 158 0 chr2 5737418 5737690 -176010397 + ORR1D2 LTR MaLR 5 319 -51 4 628 3253 26 42 0 chr2 5749885 5750265 -175997822 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 628 522 315 107 43 chr2 5751472 5751771 -175996316 + MLT1A0 LTR MaLR 6 323 -42 5 628 232 381 80 46 chr2 5755400 5755486 -175992601 + MLT1H LTR MaLR 59 146 -403 5 628 232 381 80 46 chr2 5755673 5755823 -175992264 + MLT1H LTR MaLR 147 303 -246 5 628 610 318 81 34 chr2 5755965 5756372 -175991715 - LTR40b LTR ERVL -13 449 24 5 628 1631 251 23 75 chr2 5759561 5760122 -175987965 + RLTR18 LTR ERVK 27 558 -58 5 629 855 262 73 25 chr2 5770249 5770535 -175977552 - RMER15-int LTR ERVL -510 4489 4190 5 629 1654 166 141 3 chr2 5779451 5779814 -175968273 - MTC LTR MaLR -8 413 1 5 629 633 103 10 0 chr2 5794211 5794308 -175953779 + ORR1B1 LTR MaLR 289 386 -8 5 629 414 180 16 119 chr2 5802884 5803010 -175945077 - MT2B LTR ERVL -337 264 152 6 629 655 295 113 45 chr2 5809805 5810160 -175937927 + MTEb LTR MaLR 1 379 0 6 629 4475 191 36 23 chr2 5828165 5829180 -175918907 + RMER12 LTR ERVK 1 1029 -293 6 629 354 287 172 5 chr2 5829449 5829652 -175918435 - MLT1A0 LTR MaLR -70 295 59 6 629 3389 28 2 8 chr2 5830002 5830396 -175917691 + MTA_Mm LTR MaLR 1 392 -4 6 629 3591 10 5 0 chr2 5836248 5836642 -175911445 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 629 1360 197 91 43 chr2 5841984 5842334 -175905753 + ORR1D1 LTR MaLR 5 371 -3 7 629 4178 12 0 105 chr2 5845645 5846196 -175901891 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 7 629 295 85 21 0 chr2 5848768 5848815 -175899272 - ORR1D1 LTR MaLR -150 224 177 7 629 1612 146 111 15 chr2 5849353 5849694 -175898393 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 7 629 458 200 104 0 chr2 5852707 5852728 -175895359 + ORR1D2 LTR MaLR 1 21 -349 7 629 458 200 104 0 chr2 5852753 5852856 -175895231 + ORR1D2 LTR MaLR 22 137 -233 7 629 225 254 143 52 chr2 5857322 5857476 -175890611 + MTEb LTR MaLR 199 366 -13 7 629 1267 194 156 21 chr2 5858678 5858896 -175889191 + RMER4B LTR ERVK 23 252 -333 7 629 1267 201 130 56 chr2 5858934 5859178 -175888909 + RMER4B LTR ERVK 249 466 0 7 629 230 333 43 14 chr2 5860892 5861015 -175887072 + MLT1J-int LTR MaLR 633 758 -629 7 629 230 333 43 14 chr2 5861105 5861121 -175886966 + MLT1J-int LTR MaLR 759 776 -611 7 629 370 322 51 26 chr2 5861303 5861459 -175886628 + MLT1J LTR MaLR 30 189 -323 7 629 2172 139 71 0 chr2 5865054 5865407 -175882680 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 7 629 723 182 97 27 chr2 5865725 5865911 -175882176 - ORR1D1 LTR MaLR -30 344 146 7 629 1890 157 122 75 chr2 5867755 5868181 -175879906 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 1 8 629 1586 188 55 86 chr2 5868444 5868568 -175879519 + RMER16 LTR ERVK 1 173 -360 8 629 1586 190 124 24 chr2 5868754 5869079 -175879008 + RMER16 LTR ERVK 174 532 -1 8 629 364 238 9 65 chr2 5892062 5892170 -175855917 - MT2B LTR ERVL -348 253 152 8 629 407 259 34 26 chr2 5897874 5898073 -175850014 - RMER4B LTR ERVK -9 576 343 8 629 227 81 0 26 chr2 5898074 5898112 -175849975 + ORR1A2 LTR MaLR 1 37 -290 8 630 581 165 78 9 chr2 5900068 5900184 -175847903 - RLTR20B1 LTR ERVK -439 124 1 8 630 1686 168 164 34 chr2 5901406 5901789 -175846298 - RMER4A LTR ERVK -32 434 2 8 630 275 275 10 62 chr2 5903202 5903299 -175844788 - MLT1K LTR MaLR -493 102 11 9 630 344 254 126 33 chr2 5905272 5905455 -175842632 - MTD LTR MaLR 0 419 220 9 630 361 185 163 0 chr2 5905480 5905572 -175842515 - MTD LTR MaLR -296 123 17 9 630 531 129 136 0 chr2 5908458 5908590 -175839497 - RMER17B LTR ERVK -497 461 312 9 630 3119 44 21 0 chr2 5917380 5917768 -175830319 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 9 630 480 252 62 19 chr2 5919333 5919495 -175828592 - RLTR42-int LTR ERVK -4122 1400 1232 9 630 261 302 14 137 chr2 5919963 5920054 -175828033 + MT2A LTR ERVL 1 75 -458 9 630 261 302 14 137 chr2 5920201 5920255 -175827832 + MT2A LTR ERVL 76 128 -405 9 630 247 282 119 94 chr2 5928189 5928430 -175819657 - MTEb LTR MaLR -29 350 80 9 630 2514 80 52 8 chr2 5935332 5935699 -175812388 + MTA_Mm LTR MaLR 14 396 0 9 630 1186 248 86 91 chr2 5938852 5939046 -175809041 + MTD LTR MaLR 13 209 -210 1 630 1186 248 86 91 chr2 5939192 5939392 -175808695 + MTD LTR MaLR 210 405 -14 1 630 1796 122 118 0 chr2 5941005 5941292 -175806795 + ORR1A4 LTR MaLR 1 321 -8 1 630 10714 133 25 67 chr2 5941296 5943342 -175804745 + ORR1A4-int LTR MaLR 1 1961 -2 1 630 966 149 99 16 chr2 5943346 5943606 -175804481 + ORR1A4 LTR MaLR 3 338 -8 1 630 438 209 31 94 chr2 5959133 5959260 -175788827 - MT2B LTR ERVL -337 264 146 1 630 548 236 245 5 chr2 5960480 5960684 -175787403 - MTD LTR MaLR 0 419 167 1 630 241 279 16 0 chr2 5964365 5964426 -175783661 - ORR1E LTR MaLR -13 366 305 1 630 438 300 138 22 chr2 5964619 5964844 -175783243 - ORR1E LTR MaLR -54 305 55 1 630 338 243 55 68 chr2 5970917 5971063 -175777024 - LTR80B LTR ERVL -275 309 166 1 630 2003 154 75 7 chr2 5972949 5973374 -175774713 - MTC-int LTR MaLR -782 476 23 1 630 1897 123 126 0 chr2 5973398 5973731 -175774356 - MTC LTR MaLR -44 377 3 1 630 814 264 109 25 chr2 5975872 5976148 -175771939 - MLT1C LTR MaLR -166 301 3 1 630 1087 204 190 14 chr2 5981351 5981704 -175766383 - RLTR9F LTR ERVK 0 415 1 1 630 621 173 22 22 chr2 5987231 5987367 -175760720 - RMER4B LTR ERVK 0 585 450 1 630 2097 101 3 92 chr2 5987858 5988238 -175759849 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 41 1 630 2230 123 58 18 chr2 5989290 5989687 -175758400 - MTC LTR MaLR -8 413 1 1 630 1929 192 65 21 chr2 5990523 5990997 -175757090 - RLTR20B2 LTR ERVK -65 495 1 1 630 255 230 67 39 chr2 5991200 5991304 -175756783 + MLT1A1 LTR MaLR 19 125 -283 1 630 2276 85 3 3 chr2 5995616 5995935 -175752152 + ORR1A2 LTR MaLR 9 327 0 1 630 245 333 111 16 chr2 6006224 6006413 -175741674 + MT2B LTR ERVL 34 240 -361 1 630 408 280 46 117 chr2 6010729 6010863 -175737224 + RMER17C LTR ERVK 16 94 -316 3 630 408 303 158 75 chr2 6010932 6011188 -175736899 + RMER17C LTR ERVK 95 377 -33 3 630 1200 274 152 47 chr2 6027089 6027617 -175720470 + RMER4B LTR ERVK 1 583 -2 5 631 261 68 68 0 chr2 6033514 6033558 -175714529 - RLTR26 LTR ERVK -595 47 1 7 631 1644 141 79 92 chr2 6038350 6038718 -175709369 + RLTR10B2 LTR ERVK 1 363 -2 8 631 1503 113 73 13 chr2 6043503 6043772 -175704315 - ORR1A4 LTR MaLR -8 386 4 9 631 428 316 124 29 chr2 6046968 6047274 -175700813 + ORR1E LTR MaLR 20 354 -5 1 631 3638 8 2 0 chr2 6053508 6053901 -175694186 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 3 1 631 261 283 24 103 chr2 6055449 6055575 -175692512 + MT2B LTR ERVL 154 269 -332 1 631 1143 116 119 50 chr2 6056846 6057064 -175691023 - RLTR28 LTR ERVL -291 233 1 1 631 322 302 0 85 chr2 6058761 6058855 -175689232 - MT2B LTR ERVL -361 240 155 1 631 1138 218 104 60 chr2 6063904 6064240 -175683847 + MTEb LTR MaLR 27 377 -2 1 631 251 165 143 60 chr2 6069646 6069730 -175678357 + MER34 LTR ERV1 376 466 -76 1 631 390 288 89 82 chr2 6070068 6070437 -175677650 - MLT1A LTR MaLR -2 406 4 1 631 986 226 136 10 chr2 6072354 6072649 -175675438 + MLT1B LTR MaLR 14 345 -45 1 631 1253 137 29 0 chr2 6074723 6074927 -175673160 + ORR1B1 LTR MaLR 177 386 -8 1 631 982 260 96 2 chr2 6078863 6079144 -175668943 - MLT1B LTR MaLR -13 361 70 1 631 2297 116 22 0 chr2 6082542 6082862 -175665225 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 1 631 1304 285 79 42 chr2 6084570 6085050 -175663037 + MLT1D LTR MaLR 7 504 -1 2 631 233 346 68 45 chr2 6086554 6086687 -175661400 - RMER12 LTR ERVK -445 877 742 2 631 229 140 74 74 chr2 6091485 6091539 -175656548 - MTEa LTR MaLR -325 54 1 2 631 727 280 250 28 chr2 6091539 6091899 -175656188 - MTEa-int LTR MaLR 0 1580 1141 2 631 305 247 111 123 chr2 6091896 6092002 -175656085 - MTEb LTR MaLR -75 304 192 2 631 4034 52 28 18 chr2 6092002 6092509 -175655578 + RLTR1B LTR ERV1 1 512 0 2 631 305 247 111 123 chr2 6092509 6092573 -175655514 - MTEb LTR MaLR -188 191 136 2 631 429 297 87 68 chr2 6092890 6093096 -175654991 - LTR16E2 LTR ERVL 0 568 359 2 631 385 269 81 93 chr2 6094385 6094631 -175653456 - RLTR42-int LTR ERVK -4127 1395 1153 2 631 2246 125 57 14 chr2 6095127 6095493 -175652594 - ORR1B1 LTR MaLR -5 389 8 2 631 1036 232 48 64 chr2 6095553 6095581 -175652506 - MT2A LTR ERVL -17 584 549 2 631 1680 161 139 175 chr2 6095664 6096146 -175651941 - MT2A LTR ERVL -53 548 1 2 631 883 247 171 13 chr2 6100883 6101187 -175646900 + ORR1E LTR MaLR 2 353 -6 2 631 343 239 53 84 chr2 6102914 6103104 -175644983 + MLT1F2 LTR MaLR 98 307 -288 2 631 402 323 64 100 chr2 6103917 6104278 -175643809 + RLTR11A2 LTR ERVK 163 510 -17 2 631 1816 248 30 51 chr2 6105642 6106175 -175641912 + RMER19C LTR ERVK 15 611 0 2 631 903 255 118 18 chr2 6113201 6113533 -175634554 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 1 2 631 4338 16 14 0 chr2 6118415 6118901 -175629186 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 2 631 305 0 0 0 chr2 6118901 6118939 -175629148 - MERVL-int LTR ERVL 0 5485 5448 2 631 366 157 58 46 chr2 6118939 6119026 -175629061 - ORR1A3-int LTR MaLR -1323 640 553 2 631 14824 25 1 0 chr2 6119026 6120765 -175627322 - MERVL-int LTR ERVL -125 5360 3621 2 631 230 140 23 23 chr2 6120765 6120809 -175627278 - ORR1A1-int LTR MaLR -1748 44 1 2 631 4381 16 12 0 chr2 6120809 6121296 -175626791 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 2 631 627 267 24 24 chr2 6134869 6135076 -175613011 + RMER15 LTR ERVL 298 504 -71 3 631 372 362 105 60 chr2 6136813 6137080 -175611007 - MLT1I LTR MaLR -62 349 71 3 631 1089 229 213 77 chr2 6144845 6145300 -175602787 - MLT2B1 LTR ERVL -3 517 1 3 631 447 290 214 40 chr2 6145951 6146199 -175601888 + MTEb LTR MaLR 79 378 -1 3 631 1399 172 75 5 chr2 6146307 6146611 -175601476 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 41 3 631 735 161 0 54 chr2 6146599 6146781 -175601306 - ORR1D1 LTR MaLR -248 146 1 3 631 1378 170 223 16 chr2 6149967 6150277 -175597810 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 3 631 1561 195 163 6 chr2 6152545 6152657 -175595430 + MTD LTR MaLR 1 134 -285 3 631 1561 195 163 6 chr2 6152687 6152935 -175595152 + MTD LTR MaLR 135 418 -1 3 631 309 370 35 41 chr2 6153262 6153431 -175594656 + MLT1C LTR MaLR 1 168 -299 3 631 822 202 112 14 chr2 6156964 6157309 -175590778 + RMER17C LTR ERVK 1 278 -132 3 631 822 219 37 37 chr2 6157369 6157495 -175590592 + RMER17C LTR ERVK 279 405 -5 3 631 718 249 146 54 chr2 6157483 6157852 -175590235 - RMER17C LTR ERVK -7 403 1 3 631 1229 118 53 0 chr2 6157967 6158154 -175589933 - ORR1C2 LTR MaLR -13 371 175 3 631 1011 190 17 11 chr2 6158220 6158396 -175589691 - ORR1C2 LTR MaLR -198 180 4 3 631 241 284 17 68 chr2 6158457 6158574 -175589513 + RLTR25B LTR ERVK 386 496 -532 3 631 2154 148 76 14 chr2 6158708 6159077 -175589010 + ORR1B1 LTR MaLR 1 392 -2 3 631 914 145 19 71 chr2 6159990 6160257 -175587830 + RMER17C LTR ERVK 1 253 -157 3 78 299 281 76 62 chr2 6160356 6160500 -175587587 + RLTR14 LTR ERV1 217 362 -20 3 632 429 276 56 74 chr2 6160708 6160939 -175587148 + RLTR14-int LTR ERV1 182 408 -4909 3 632 1956 117 80 115 chr2 6160939 6161364 -175586723 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 3 632 279 266 51 41 chr2 6161428 6161526 -175586561 + RLTR14 LTR ERV1 284 382 0 3 632 341 200 0 144 chr2 6163985 6164013 -175584074 + MT2B LTR ERVL 146 157 -444 3 632 3394 38 5 10 chr2 6164705 6165103 -175582984 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 632 1675 151 248 62 chr2 6165206 6165587 -175582500 + RLTR20C LTR ERVK 1 457 -94 4 632 653 200 89 13 chr2 6165613 6165704 -175582383 + RLTR20C LTR ERVK 458 550 -1 4 632 497 230 72 29 chr2 6166669 6166834 -175581253 - MTEa LTR MaLR 0 379 214 4 632 2634 178 117 35 chr2 6167220 6167785 -175580302 + RMER19C LTR ERVK 1 611 0 4 632 3280 36 18 3 chr2 6169075 6169465 -175578622 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 632 365 250 28 9 chr2 6172064 6172173 -175575914 + MLT1B LTR MaLR 11 121 -269 4 632 444 290 81 16 chr2 6173052 6173163 -175574924 + RMER15 LTR ERVL 372 494 -81 4 632 444 290 81 16 chr2 6173190 6173264 -175574823 + RMER15 LTR ERVL 495 568 -7 4 632 1252 223 36 7 chr2 6173398 6173678 -175574409 - MTD LTR MaLR -126 293 6 4 632 4743 128 63 84 chr2 6175287 6176210 -175571877 - RMER17A2 LTR ERVK 0 906 4 4 632 2315 168 37 10 chr2 6180292 6180701 -175567386 - MTC LTR MaLR -1 420 1 4 632 232 305 100 15 chr2 6181340 6181470 -175566617 - ORR1E LTR MaLR -5 354 214 4 632 1309 222 49 46 chr2 6185515 6185860 -175562227 + MTEa LTR MaLR 17 362 -17 4 632 739 256 113 22 chr2 6186712 6187032 -175561055 + ORR1E LTR MaLR 1 378 -1 4 632 515 320 26 72 chr2 6189272 6189627 -175558460 + MLT1A1 LTR MaLR 40 361 -47 4 632 2179 202 84 11 chr2 6190044 6190569 -175557518 + RLTR20B1 LTR ERVK 1 563 0 4 632 250 198 179 54 chr2 6197967 6197995 -175550092 - MTE2b LTR MaLR -1 378 351 4 632 250 198 179 54 chr2 6198116 6198199 -175549888 - MTE2b LTR MaLR -29 350 254 4 632 732 247 77 31 chr2 6198955 6199214 -175548873 - RLTR20D LTR ERVK -288 280 10 4 632 604 304 169 64 chr2 6203489 6203992 -175544095 - RLTR18 LTR ERVK -54 562 7 4 632 2137 156 82 61 chr2 6205010 6205521 -175542566 + RLTR11A LTR ERVK 7 528 0 4 632 924 310 118 10 chr2 6206899 6207331 -175540756 + MLT1F LTR MaLR 4 488 -60 4 632 924 310 118 10 chr2 6207543 6207601 -175540486 + MLT1F LTR MaLR 489 546 -2 4 632 1834 160 21 37 chr2 6208199 6208477 -175539610 - ORR1D1 LTR MaLR -2 372 91 4 632 2332 178 36 31 chr2 6208477 6209000 -175539087 - RLTR11A2 LTR ERVK -1 526 1 4 632 1834 160 21 37 chr2 6209000 6209098 -175538989 - ORR1D1 LTR MaLR -284 90 2 4 632 324 349 75 6 chr2 6215931 6216133 -175531954 - MLT1J2 LTR MaLR -229 215 1 5 632 1327 213 70 7 chr2 6223537 6223839 -175524248 + MTC LTR MaLR 93 413 -8 5 632 2097 164 74 32 chr2 6224475 6224878 -175523209 + MTC LTR MaLR 2 421 0 5 632 234 281 144 10 chr2 6226766 6226870 -175521217 - MLT1J LTR MaLR -2 510 393 5 632 877 141 110 0 chr2 6227242 6227404 -175520683 + RLTR24 LTR ERV1 1 180 -349 5 632 1994 117 39 25 chr2 6227404 6227765 -175520322 - BGLII_B LTR ERVK 0 441 76 5 632 639 328 83 45 chr2 6230163 6230235 -175517852 - MLT1I LTR MaLR 0 411 335 5 632 639 328 83 45 chr2 6230420 6230743 -175517344 - MLT1I LTR MaLR -77 334 1 5 632 2092 140 72 17 chr2 6236000 6236348 -175511739 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 5 632 723 277 95 42 chr2 6236969 6237008 -175511079 - RLTR12B LTR ERVK -42 486 447 5 632 723 277 95 42 chr2 6237033 6237403 -175510684 - RLTR12B LTR ERVK -82 446 55 5 632 242 262 12 36 chr2 6237847 6237930 -175510157 + LTR33B LTR ERVL 419 499 -4 5 632 1434 125 346 0 chr2 6267231 6267511 -175480576 - ORR1C1 LTR MaLR -1 377 1 5 632 1401 156 72 13 chr2 6271191 6271496 -175476591 - ORR1B2 LTR MaLR -15 352 30 6 632 331 293 103 28 chr2 6277415 6277629 -175470458 - RLTR12B LTR ERVK -297 231 2 6 632 609 204 94 18 chr2 6278532 6278702 -175469385 + MTD LTR MaLR 237 419 0 6 632 1208 167 92 33 chr2 6278754 6279027 -175469060 - RMER5 LTR ERV1 0 534 246 6 632 1305 146 158 27 chr2 6280075 6280405 -175467682 + ORR1C1 LTR MaLR 1 373 -5 6 633 1148 176 69 60 chr2 6299332 6299696 -175448391 + RLTR20C LTR ERVK 1 488 -90 6 633 696 197 71 13 chr2 6299728 6299819 -175448268 + RLTR20C LTR ERVK 489 577 -1 6 633 491 258 138 42 chr2 6304257 6304615 -175443472 - MER31B LTR ERV1 -3 463 30 6 633 421 219 159 12 chr2 6304713 6304867 -175443220 - MLT1D LTR MaLR -9 618 324 6 633 2588 42 0 15 chr2 6305064 6305405 -175442682 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 11 6 633 1142 219 155 6 chr2 6310220 6310556 -175437531 - MTD LTR MaLR -16 403 18 6 633 251 217 17 0 chr2 6310588 6310648 -175437439 + MTD LTR MaLR 359 419 0 6 633 473 244 32 65 chr2 6310944 6311205 -175436882 - RLTR15 LTR ERVK -95 264 48 6 633 374 189 5 120 chr2 6311240 6311456 -175436631 + RMER17C LTR ERVK 84 274 -136 6 633 459 307 105 62 chr2 6311504 6311810 -175436277 - ORR1E LTR MaLR 0 359 41 6 633 828 273 76 24 chr2 6313655 6313985 -175434102 + MTD LTR MaLR 1 347 -72 6 633 2486 135 144 25 chr2 6318470 6318941 -175429146 - RLTR11A2 LTR ERVK 0 527 1 6 633 329 269 59 102 chr2 6324952 6325188 -175422899 - RMER13A LTR ERVK -558 302 77 7 633 231 186 16 33 chr2 6327685 6327746 -175420341 - MTEb LTR MaLR -174 205 146 7 633 433 291 160 67 chr2 6343127 6343503 -175404584 - ERVL-int LTR ERVL -418 5339 4929 7 633 1363 173 201 19 chr2 6358393 6358717 -175389370 + ORR1C2 LTR MaLR 1 383 -1 7 633 599 241 149 35 chr2 6370834 6371142 -175376945 - ORR1E LTR MaLR -9 361 1 7 633 234 333 77 35 chr2 6373363 6373506 -175374581 - ORR1E LTR MaLR -162 197 49 7 633 289 254 12 6 chr2 6373528 6373627 -175374460 - ORR1E LTR MaLR -274 100 1 7 633 1107 227 217 9 chr2 6373671 6374017 -175374070 + MTD LTR MaLR 2 419 0 7 633 240 270 40 13 chr2 6375359 6375434 -175372653 - MLT1H1 LTR MaLR -478 77 1 7 633 1380 94 38 5 chr2 6377005 6377218 -175370869 - BGLII LTR ERVK 0 421 202 7 633 1972 171 28 8 chr2 6377200 6377553 -175370534 - RLTR17 LTR ERVK -265 427 68 7 633 376 306 141 67 chr2 6381166 6381450 -175366637 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 61 7 633 1806 173 73 25 chr2 6381682 6382038 -175366049 - ORR1C1 LTR MaLR -1 377 5 7 633 869 301 93 48 chr2 6382047 6382550 -175365537 + MT2A LTR ERVL 1 526 -7 7 633 400 250 22 11 chr2 6382795 6382884 -175365203 + MLT1E2 LTR MaLR 34 123 -504 7 633 226 356 19 19 chr2 6382931 6383034 -175365053 + MLT1A LTR MaLR 19 121 -253 7 633 588 242 173 24 chr2 6383145 6383399 -175364688 + ORR1E LTR MaLR 68 359 0 7 633 462 251 84 24 chr2 6383399 6383551 -175364536 + MLT1B LTR MaLR 79 240 -150 7 633 971 293 127 26 chr2 6383586 6384003 -175364084 - MLT2B1 LTR ERVL -60 460 2 7 633 1626 167 64 92 chr2 6384128 6384503 -175363584 - ORR1B1 LTR MaLR 0 419 32 7 633 979 277 84 13 chr2 6384761 6385072 -175363015 + MLT1A0 LTR MaLR 14 346 -19 7 633 388 301 68 58 chr2 6385101 6385306 -175362781 - MLT1J LTR MaLR -196 316 110 7 633 241 310 207 0 chr2 6386190 6386306 -175361781 - ORR1E LTR MaLR -26 353 214 7 633 345 283 10 42 chr2 6386381 6386477 -175361610 - ORR1E LTR MaLR -264 95 3 7 633 2536 107 133 2 chr2 6386780 6387200 -175360887 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 7 633 372 304 58 39 chr2 6391428 6391582 -175356505 - MLT1J LTR MaLR -352 160 4 7 633 556 294 68 72 chr2 6392869 6393035 -175355052 + MLT1B LTR MaLR 15 182 -208 7 633 556 294 68 72 chr2 6393055 6393181 -175354906 + MLT1B LTR MaLR 183 305 -85 7 633 270 314 10 10 chr2 6394225 6394328 -175353759 - LTR41B LTR ERVL -2 756 654 7 633 499 329 177 35 chr2 6394653 6395088 -175352999 - LTR41B LTR ERVL -186 572 76 7 633 2695 76 187 46 chr2 6396559 6397014 -175351073 - MURVY-LTR LTR ERV1 0 519 1 8 633 329 295 26 103 chr2 6397502 6397619 -175350468 - MT2B LTR ERVL -337 264 157 8 633 3277 46 8 2 chr2 6401556 6401950 -175346137 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 8 633 351 269 14 88 chr2 6405682 6405829 -175342258 + RLTR21 LTR ERVK 1171 1306 -266 8 633 2317 53 60 0 chr2 6408088 6408389 -175339698 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 8 633 2058 186 70 144 chr2 6412638 6413296 -175334791 + RMER19C LTR ERVK 3 611 0 8 633 438 312 144 35 chr2 6413347 6413666 -175334421 - ORR1E LTR MaLR -5 354 1 8 633 636 281 178 22 chr2 6417781 6417798 -175330289 + MTEa LTR MaLR 60 75 -304 8 633 636 281 178 22 chr2 6418076 6418327 -175329760 + MTEa LTR MaLR 76 370 -9 8 633 703 291 83 94 chr2 6418440 6418728 -175329359 + MLT1B LTR MaLR 3 287 -103 8 633 227 255 184 0 chr2 6421733 6421831 -175326256 - MLT1A LTR MaLR -2 372 257 8 633 545 246 16 0 chr2 6422226 6422352 -175325735 + MTE2b LTR MaLR 3 130 -249 8 634 575 321 49 56 chr2 6423153 6423276 -175324811 + MLT1A0 LTR MaLR 18 145 -220 8 634 2910 22 0 167 chr2 6423276 6423714 -175324373 - RLTR10B2 LTR ERVK 0 365 1 8 634 575 321 49 56 chr2 6423714 6423869 -175324218 + MLT1A0 LTR MaLR 146 294 -71 8 634 370 273 31 62 chr2 6423869 6423998 -175324089 + ORR1E LTR MaLR 4 128 -231 8 634 231 258 0 46 chr2 6423997 6424062 -175324025 + ORR1E LTR MaLR 76 137 -222 8 634 345 305 102 100 chr2 6424569 6424930 -175323157 - MLT1A0 LTR MaLR -3 362 1 8 634 704 276 11 39 chr2 6425164 6425345 -175322742 + MTEa LTR MaLR 2 177 -202 8 634 419 301 123 63 chr2 6428130 6428431 -175319656 + MTEb LTR MaLR 1 319 -60 8 634 597 330 128 33 chr2 6429617 6429921 -175318166 - ORR1E LTR MaLR -23 336 4 8 634 497 277 33 60 chr2 6429923 6429948 -175318139 + MLT1A0 LTR MaLR 25 47 -318 8 634 3313 55 8 0 chr2 6429948 6430345 -175317742 + MTB LTR MaLR 1 400 0 8 634 8448 61 22 2 chr2 6430345 6431421 -175316666 + MTB-int LTR MaLR 1 1098 0 8 634 3246 53 18 0 chr2 6431421 6431814 -175316273 + MTB LTR MaLR 1 400 0 8 634 497 277 33 60 chr2 6431814 6431936 -175316151 + MLT1A0 LTR MaLR 48 168 -197 8 634 2400 77 51 0 chr2 6432052 6432363 -175315724 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 8 634 1729 271 94 90 chr2 6432742 6433815 -175314272 + RLTR22_Mur LTR ERVK 5 1318 -530 8 634 1275 270 83 141 chr2 6433864 6434381 -175313706 + RLTR22_Mur LTR ERVK 837 1638 -210 8 634 481 261 95 6 chr2 6435375 6435533 -175312554 - RMER20B LTR ERVK -222 405 234 8 634 251 291 214 39 chr2 6436647 6436829 -175311258 + MLT1C LTR MaLR 23 236 -231 8 634 2981 81 39 0 chr2 6438908 6439289 -175308798 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 8 634 282 197 99 106 chr2 6443887 6443954 -175304133 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 350 8 634 282 197 99 106 chr2 6444026 6444100 -175303987 - MLT1A1 LTR MaLR -59 349 268 8 634 1295 216 34 23 chr2 6445831 6446230 -175301857 - MT2A LTR ERVL 0 533 16 9 634 1614 125 160 30 chr2 6446814 6447177 -175300910 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 9 634 464 302 80 57 chr2 6447229 6447580 -175300507 + ORR1E LTR MaLR 1 359 0 9 634 248 315 36 0 chr2 6450004 6450115 -175297972 + ORR1E LTR MaLR 86 200 -159 9 634 369 281 115 5 chr2 6452509 6452709 -175295378 - RLTR12A LTR ERVK -109 459 238 9 634 257 160 58 222 chr2 6498274 6498499 -175249588 + RMER17C LTR ERVK 86 273 -137 9 634 436 303 36 36 chr2 6503761 6503953 -175244134 + ORR1E LTR MaLR 1 192 -167 7 634 897 265 115 22 chr2 6505216 6505529 -175242558 + MTEa LTR MaLR 1 342 -37 1 634 1947 221 74 25 chr2 6511449 6511977 -175236110 + RLTR12A LTR ERVK 3 556 -12 2 634 842 225 189 78 chr2 6541714 6542047 -175206040 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 3 634 1050 215 111 17 chr2 6542047 6542345 -175205742 + ORR1D2-int LTR MaLR 1 326 -1044 3 634 2200 256 113 89 chr2 6542493 6543471 -175204616 + ORR1D2-int LTR MaLR 325 1326 -44 3 634 2606 83 6 162 chr2 6548906 6549020 -175199067 + MTB LTR MaLR 1 79 -321 4 634 2606 83 6 162 chr2 6549163 6549522 -175198565 + MTB LTR MaLR 80 400 0 4 635 1420 249 60 0 chr2 6566135 6566484 -175181603 + MTEa LTR MaLR 10 379 0 6 635 279 252 75 28 chr2 6597249 6597355 -175150732 + RLTR42-int LTR ERVK 4292 4402 -1120 1 635 3366 33 5 0 chr2 6605192 6605586 -175142501 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 635 283 269 36 18 chr2 6631863 6631973 -175116114 + RMER15 LTR ERVL 308 419 -156 1 635 2467 66 20 11 chr2 6670369 6670722 -175077365 - BGLII LTR ERVK 0 421 66 1 635 1456 225 78 12 chr2 6671487 6671833 -175076254 + ORR1D1 LTR MaLR 6 374 0 1 635 1179 249 26 69 chr2 6672355 6672704 -175075383 - MTD LTR MaLR -73 346 13 1 636 2388 136 40 52 chr2 6694104 6694585 -175053502 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 2 636 4253 58 61 22 chr2 6694587 6695229 -175052858 + IAPEz-int LTR ERVK 3 662 -5819 2 636 424 38 0 0 chr2 6695229 6695282 -175052805 + IAPEz-int LTR ERVK 1359 1411 -5070 2 636 1751 111 4 4 chr2 6695281 6695543 -175052544 + IAPEz-int LTR ERVK 2236 2497 -5183 2 636 886 73 24 0 chr2 6695540 6695663 -175052424 + IAPEz-int LTR ERVK 4785 4910 -2770 2 636 20025 15 1 2 chr2 6695665 6698026 -175050061 + IAPEz-int LTR ERVK 4123 6481 0 2 636 2384 136 40 52 chr2 6698026 6698507 -175049580 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 2 636 292 325 88 77 chr2 6701961 6702301 -175045786 + RMER10A LTR ERVL 18 361 -81 2 636 717 278 133 100 chr2 6702967 6703327 -175044760 + MTD LTR MaLR 8 379 0 2 636 330 289 121 101 chr2 6711887 6712284 -175035803 - RMER10A LTR ERVL -25 417 13 2 636 391 338 140 43 chr2 6715922 6716200 -175031887 + MLT1G LTR MaLR 279 583 -8 2 636 2232 183 81 13 chr2 6732055 6732598 -175015489 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 1746 2325 -1 2 636 2921 117 48 33 chr2 6732599 6733119 -175014968 + RLTR11A LTR ERVK 1 528 0 2 636 1721 216 51 25 chr2 6735488 6735658 -175012429 + MTD LTR MaLR 6 189 -230 2 636 1721 216 51 25 chr2 6735859 6736083 -175012004 + MTD LTR MaLR 190 410 -9 2 636 6111 79 50 73 chr2 6740385 6741395 -175006692 + RLTR13D4 LTR ERVK 1 986 -47 2 636 895 249 116 66 chr2 6756459 6756881 -174991206 + RLTR28B LTR ERVL 1 443 -38 2 636 315 194 16 0 chr2 6758159 6758221 -174989866 + RMER13B LTR ERVK 846 908 0 2 636 648 295 96 82 chr2 6759682 6760025 -174988062 + MLT1A LTR MaLR 8 355 -19 3 636 306 272 9 88 chr2 6769823 6769936 -174978151 + MT2B LTR ERVL 155 258 -343 3 637 253 330 184 48 chr2 6836590 6836797 -174911290 + LTR86B1 LTR ERVL 134 368 -125 3 637 3290 62 28 0 chr2 6838866 6839255 -174908832 - MTB LTR MaLR 0 400 1 3 637 422 293 125 14 chr2 6840994 6841252 -174906835 + LTR16B2 LTR ERVL 87 369 -94 3 637 336 206 37 73 chr2 6841355 6841491 -174906596 + RMER17A LTR ERVK 335 465 -286 3 637 680 276 73 10 chr2 6842893 6843098 -174904989 - MTE2b LTR MaLR -13 366 149 3 637 262 314 11 11 chr2 6843291 6843378 -174904709 + LTR16B LTR ERVL 302 388 -75 3 637 1055 270 49 19 chr2 6848074 6848448 -174899639 + MTD LTR MaLR 1 374 -5 4 637 2297 158 80 10 chr2 6862290 6862680 -174885407 + MTC LTR MaLR 5 421 0 4 637 2370 169 11 3 chr2 6862859 6863233 -174884854 + ORR1C1 LTR MaLR 2 378 0 4 637 735 319 74 44 chr2 6866090 6866388 -174881699 + MLT1F2 LTR MaLR 5 311 -249 4 637 270 293 0 0 chr2 6866508 6866583 -174881504 + MLT1F2 LTR MaLR 495 569 0 4 637 515 276 22 7 chr2 6877971 6878106 -174869981 - MTE2a LTR MaLR -184 195 59 4 637 323 229 52 10 chr2 6885463 6885560 -174862527 + ORR1E LTR MaLR 259 359 0 4 637 996 272 81 115 chr2 6886718 6886900 -174861187 - MTE2b LTR MaLR 0 379 183 4 637 996 272 81 115 chr2 6886960 6887159 -174860928 - MTE2b LTR MaLR -197 182 11 4 637 312 364 24 6 chr2 6890117 6890283 -174857804 + LTR86B1 LTR ERVL 16 184 -309 4 637 503 228 214 9 chr2 6895725 6895940 -174852147 + MTEa LTR MaLR 21 287 -92 4 637 336 380 52 32 chr2 6918801 6919111 -174828976 + MLT1E2 LTR MaLR 5 320 -307 5 637 1910 162 0 55 chr2 6920191 6920537 -174827550 + ORR1A4 LTR MaLR 1 327 -2 5 637 8387 154 66 32 chr2 6920537 6922135 -174825952 + ORR1A4-int LTR MaLR 3 1653 -310 5 637 310 119 0 132 chr2 6922132 6922200 -174825887 + ORR1A4-int LTR MaLR 1182 1240 -269 5 637 534 57 0 0 chr2 6922191 6922261 -174825826 + ORR1A4 LTR MaLR 260 329 0 5 637 2417 93 3 3 chr2 6926165 6926489 -174821598 + ORR1A2 LTR MaLR 2 325 -2 5 637 280 298 52 68 chr2 6931916 6932107 -174815980 - ORR1E LTR MaLR -121 238 51 5 637 1821 151 112 9 chr2 6941413 6941761 -174806326 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 5 637 3210 188 47 46 chr2 6944936 6945611 -174802476 + RLTR17 LTR ERVK 1 676 -16 5 638 1074 262 59 34 chr2 6947418 6947738 -174800349 - ORR1D2 LTR MaLR -42 328 1 5 638 254 318 57 44 chr2 6949553 6949709 -174798378 + MLT1A LTR MaLR 10 167 -207 5 638 995 296 74 3 chr2 6950012 6950351 -174797736 + MLT1A0 LTR MaLR 1 363 -2 5 638 2624 160 26 65 chr2 6950745 6951328 -174796759 + RLTR20B2 LTR ERVK 1 560 0 5 638 798 244 101 12 chr2 6953810 6954094 -174793993 + MLT1F LTR MaLR 269 595 0 5 638 943 256 112 54 chr2 6954776 6955153 -174792934 + MER57C2 LTR ERV1 1 411 0 5 638 259 207 106 16 chr2 6955322 6955445 -174792642 - RMER12 LTR ERVK -476 846 713 5 638 905 260 211 7 chr2 6971362 6971656 -174776431 + ORR1E LTR MaLR 1 354 -5 6 638 512 231 79 23 chr2 6973280 6973457 -174774630 + MTEa LTR MaLR 189 375 -4 6 638 866 189 116 0 chr2 6979031 6979221 -174768866 - ORR1C2 LTR MaLR 0 378 167 6 638 977 160 34 0 chr2 6979337 6979512 -174768575 - ORR1C2 LTR MaLR -199 185 5 6 638 226 359 21 21 chr2 6980355 6980449 -174767638 + ORR1E LTR MaLR 1 94 -265 6 638 257 269 83 46 chr2 6991862 6991971 -174756116 + ORR1E LTR MaLR 240 352 -7 6 638 710 316 73 68 chr2 6993465 6994083 -174754004 + MER67A LTR ERV1 52 661 0 6 638 652 189 176 8 chr2 6998586 6998757 -174749330 - ORR1B2 LTR MaLR 0 378 184 6 638 486 226 9 0 chr2 6998726 6998832 -174749255 + ORR1D2 LTR MaLR 264 370 0 6 638 332 164 33 133 chr2 7009289 7009409 -174738678 - MT2B LTR ERVL -351 250 143 2 638 587 280 6 22 chr2 7011791 7011970 -174736117 + ORR1E LTR MaLR 1 176 -183 3 638 821 174 63 40 chr2 7015498 7015844 -174732243 - RMER10B LTR ERVL 0 398 6 4 638 1127 290 44 17 chr2 7016591 7016952 -174731135 + MTE2b LTR MaLR 1 371 -8 4 638 387 319 84 106 chr2 7017294 7017534 -174730553 + MLT2B1 LTR ERVL 81 417 -150 4 638 3912 152 55 8 chr2 7017534 7018195 -174729892 + RLTR17 LTR ERVK 1 692 0 4 638 387 322 6 95 chr2 7018195 7018301 -174729786 + MLT2B1 LTR ERVL 418 511 -56 4 638 2341 105 6 0 chr2 7018939 7019264 -174728823 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 4 638 805 250 74 17 chr2 7021755 7022099 -174725988 + ORR1E LTR MaLR 1 378 -1 5 638 502 295 68 22 chr2 7023947 7024220 -174723867 - ORR1E LTR MaLR -90 280 1 5 638 1683 125 30 0 chr2 7027154 7027418 -174720669 - MTC LTR MaLR -8 413 142 6 638 1219 231 0 0 chr2 7027414 7027669 -174720418 - MTC LTR MaLR -166 255 1 6 638 848 258 101 52 chr2 7031659 7032018 -174716069 + MTD LTR MaLR 6 405 -14 6 638 392 311 126 51 chr2 7032747 7033103 -174714984 + RLTR12B LTR ERVK 104 486 -42 7 638 431 342 24 93 chr2 7033267 7033599 -174714488 + LTR16E2 LTR ERVL 257 565 -3 7 638 233 336 115 0 chr2 7066752 7066865 -174681222 - MLT1I LTR MaLR -51 360 235 1 638 2104 142 36 41 chr2 7072246 7072634 -174675453 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 1 1 638 355 352 47 130 chr2 7077340 7077748 -174670339 + MTEb LTR MaLR 6 379 0 1 639 553 312 146 29 chr2 7078307 7078587 -174669500 + ORR1E LTR MaLR 45 357 -2 1 639 499 325 81 22 chr2 7078784 7079055 -174669032 + RMER15 LTR ERVL 275 561 -14 1 639 943 257 109 79 chr2 7081242 7081610 -174666477 - MTEa LTR MaLR 0 379 1 1 639 333 309 39 103 chr2 7098811 7099163 -174648924 + MLT1B LTR MaLR 49 358 -50 1 639 1452 178 136 18 chr2 7101805 7102143 -174645944 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 1 639 722 299 76 15 chr2 7109135 7109472 -174638615 + ORR1E LTR MaLR 2 375 -4 1 639 913 258 62 95 chr2 7112414 7112804 -174635283 - MTE2a LTR MaLR 0 379 3 1 639 660 198 33 100 chr2 7113212 7113392 -174634695 + ORR1C2 LTR MaLR 5 172 -212 1 639 938 153 110 11 chr2 7113565 7113756 -174634331 + ORR1C2 LTR MaLR 175 384 0 1 639 590 329 49 12 chr2 7133170 7133416 -174614671 - MLT1D LTR MaLR -228 277 23 2 639 1287 242 46 30 chr2 7135361 7135727 -174612360 - ORR1D1 LTR MaLR -2 372 1 2 639 820 260 136 22 chr2 7138393 7138762 -174609325 - MTD LTR MaLR -4 415 5 2 639 2153 166 90 8 chr2 7146501 7146890 -174601197 - MTC LTR MaLR 0 421 1 2 639 2177 101 42 0 chr2 7147827 7148135 -174599952 - ORR1A2 LTR MaLR -2 325 5 2 639 263 265 23 206 chr2 7152514 7152644 -174595443 + MT2B LTR ERVL 167 282 -319 2 639 263 265 23 206 chr2 7152684 7152758 -174595329 + MT2B LTR ERVL 283 341 -260 2 639 240 289 61 10 chr2 7153256 7153354 -174594733 + MLT1I LTR MaLR 309 411 0 2 639 1487 252 24 22 chr2 7155608 7156025 -174592062 - MTD LTR MaLR -1 418 1 2 639 779 234 212 12 chr2 7159046 7159202 -174588885 + ORR1C2 LTR MaLR 1 181 -203 2 639 779 234 212 12 chr2 7159295 7159454 -174588633 + ORR1C2 LTR MaLR 182 379 -5 2 639 551 320 89 27 chr2 7159752 7159977 -174588110 - ORR1E LTR MaLR -60 299 61 2 639 3293 35 5 2 chr2 7168851 7169246 -174578841 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 639 512 333 66 69 chr2 7189729 7190064 -174558023 + ORR1E LTR MaLR 10 343 -27 2 639 1010 295 98 51 chr2 7190081 7190383 -174557704 + ORR1E-int LTR MaLR 909 1376 -204 2 639 3428 25 2 2 chr2 7190383 7190779 -174557308 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 639 1010 287 108 52 chr2 7190779 7190936 -174557151 + ORR1E-int LTR MaLR 1377 1528 -52 2 639 362 307 50 14 chr2 7190936 7191075 -174557012 + ORR1E LTR MaLR 2 145 -214 2 640 2203 143 52 21 chr2 7219110 7219496 -174528591 - RMER10B LTR ERVL 0 398 1 3 640 250 218 132 19 chr2 7220010 7220169 -174527918 - RMER17C LTR ERVK -190 220 44 3 640 410 370 70 84 chr2 7227090 7227370 -174520717 + LTR16A LTR ERVL 8 290 -161 3 640 410 370 70 84 chr2 7227443 7227602 -174520485 + LTR16A LTR ERVL 291 441 -10 3 640 914 266 133 12 chr2 7234858 7235196 -174512891 + MTEa LTR MaLR 1 379 0 3 640 519 226 35 70 chr2 7237075 7237268 -174510819 + MTE2b LTR MaLR 184 372 -7 3 640 466 281 8 30 chr2 7239380 7239512 -174508575 + MLT1B LTR MaLR 253 381 -9 3 640 940 275 174 18 chr2 7242729 7243069 -174505018 - MTD LTR MaLR -17 402 10 3 640 777 343 67 27 chr2 7247297 7247671 -174500416 + MER89 LTR ERV1 138 526 -33 3 640 1296 217 110 51 chr2 7247673 7248027 -174500060 + MTE2b LTR MaLR 3 377 -2 3 640 349 318 84 0 chr2 7252553 7252660 -174495427 + LTR53 LTR ERVL 102 217 -302 3 640 2318 174 13 8 chr2 7252973 7253349 -174494738 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 3 640 315 371 63 0 chr2 7253491 7253696 -174494391 + LTR53 LTR ERVL 266 483 -36 3 640 1776 194 144 8 chr2 7255920 7256289 -174491798 + MTD LTR MaLR 1 419 0 4 640 506 288 54 48 chr2 7259101 7259269 -174488818 + LTR48 LTR ERV1 1 169 -618 4 640 1335 228 174 116 chr2 7263145 7263646 -174484441 + MT2A LTR ERVL 3 532 -1 4 640 3975 135 53 0 chr2 7265581 7266150 -174481937 + MT2B LTR ERVL 3 601 0 4 640 634 309 44 11 chr2 7266170 7266350 -174481737 - ORR1E LTR MaLR -70 289 104 4 640 939 314 40 14 chr2 7271083 7271432 -174476655 - ORR1E LTR MaLR 0 359 2 4 640 417 328 23 93 chr2 7280413 7280628 -174467459 - MLT1A0 LTR MaLR -154 211 12 4 640 341 320 118 60 chr2 7286293 7286630 -174461457 + ORR1E LTR MaLR 3 370 0 4 640 1026 276 86 6 chr2 7287104 7287443 -174460644 - ORR1D2 LTR MaLR -3 367 2 4 640 2526 89 45 20 chr2 7287963 7288362 -174459725 + RLTR9E LTR ERVK 1 409 0 4 640 333 171 16 10 chr2 7288415 7288494 -174459593 - MTE2a LTR MaLR 0 421 307 4 640 374 298 10 21 chr2 7288576 7288672 -174459415 - MTE2a LTR MaLR -277 102 8 4 640 783 242 93 116 chr2 7290239 7290627 -174457460 - MTE2a LTR MaLR 0 379 1 4 640 341 290 53 41 chr2 7291986 7292155 -174455932 + MTEa LTR MaLR 201 371 -8 4 640 306 367 93 51 chr2 7293766 7294099 -174453988 + ORR1D2 LTR MaLR 11 357 -13 4 640 376 330 54 0 chr2 7302088 7302200 -174445887 - MER74B LTR ERVL -459 163 46 4 640 779 310 146 30 chr2 7309089 7309458 -174438629 - MLT1C LTR MaLR -20 447 36 4 640 889 323 110 14 chr2 7309865 7310211 -174437876 - MTEa LTR MaLR 0 379 1 4 640 2152 81 59 23 chr2 7325699 7326053 -174422034 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 5 640 8941 62 46 43 chr2 7326053 7327355 -174420732 + IAPEz-int LTR ERVK 8 1313 -5168 5 640 28839 20 1 1 chr2 7327354 7330621 -174417466 + IAPEz-int LTR ERVK 3210 6478 -3 5 640 2152 81 59 23 chr2 7330625 7330979 -174417108 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 5 640 1290 231 121 16 chr2 7331470 7331849 -174416238 - MTD LTR MaLR 0 419 1 5 640 3345 30 8 0 chr2 7334343 7334736 -174413351 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 641 422 316 22 71 chr2 7344139 7344364 -174403723 - ERVL-E-int LTR ERVL -2671 2996 2783 5 641 258 308 21 21 chr2 7345190 7345283 -174402804 - MLT1J1 LTR MaLR 0 444 352 5 641 1356 217 18 47 chr2 7345451 7345790 -174402297 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 5 641 1191 299 38 19 chr2 7347553 7347924 -174400163 + MTE2b LTR MaLR 2 379 0 5 641 725 213 7 26 chr2 7358095 7358249 -174389838 + RMER10B LTR ERVL 196 346 -52 5 641 664 272 192 89 chr2 7358514 7358695 -174389392 + MTD LTR MaLR 1 197 -222 5 641 664 272 192 89 chr2 7358895 7359093 -174388994 + MTD LTR MaLR 198 419 0 5 641 274 252 141 0 chr2 7359726 7359825 -174388262 + RMER15 LTR ERVL 395 507 -68 5 641 278 173 18 55 chr2 7368594 7368649 -174379438 + ORR1C2 LTR MaLR 330 382 -2 5 641 671 334 90 40 chr2 7380313 7380634 -174367453 + ORR1E LTR MaLR 1 337 -22 5 641 774 266 37 33 chr2 7388892 7389137 -174358950 - RMER5 LTR ERV1 -4 530 285 5 641 906 281 8 38 chr2 7389279 7389545 -174358542 - RMER5 LTR ERV1 -264 270 13 5 641 925 236 216 12 chr2 7390168 7390608 -174357479 - RMER5 LTR ERV1 -2 532 3 5 641 1092 272 73 3 chr2 7392313 7392667 -174355420 - MTE2a LTR MaLR 0 379 1 5 641 1125 221 258 3 chr2 7393960 7394255 -174353832 + ORR1D1 LTR MaLR 1 370 -4 5 641 259 216 67 13 chr2 7400118 7400193 -174347894 - MLT1E1 LTR MaLR -507 147 69 5 641 266 354 122 8 chr2 7407998 7408129 -174339958 - LTR16B1 LTR ERVL -50 430 285 6 641 340 397 16 21 chr2 7412544 7412732 -174335355 + ORR1E LTR MaLR 10 196 -163 6 641 290 370 102 55 chr2 7415544 7415887 -174332200 - LTR40a LTR ERVL -159 360 2 6 641 740 266 112 39 chr2 7419286 7419571 -174328516 + MLT2C2 LTR ERVL 3 308 -156 6 641 280 328 15 76 chr2 7420876 7421008 -174327079 + MTEa LTR MaLR 3 126 -253 6 641 329 186 0 0 chr2 7421173 7421232 -174326855 - RMER12B LTR ERVK -1345 59 1 6 641 1367 125 0 0 chr2 7428147 7428347 -174319740 - RLTR27 LTR ERVK 0 309 110 6 641 1969 90 7 0 chr2 7428317 7428595 -174319492 - RLTR10A LTR ERVK -131 280 1 6 641 4570 90 25 14 chr2 7428600 7429289 -174318798 - RLTR10-int LTR ERVK -4 1983 1288 6 641 281 49 0 0 chr2 7429286 7429327 -174318760 - IAP-d-int LTR ERVK -827 5715 5675 6 641 3535 63 88 12 chr2 7429336 7429838 -174318249 - IAP-d-int LTR ERVK -1015 5527 4988 6 641 740 199 6 6 chr2 7429823 7429980 -174318107 - IAP-d-int LTR ERVK -6039 503 347 6 641 463 110 0 0 chr2 7429974 7430047 -174318040 - IAP-d-int LTR ERVK -6365 177 105 6 641 261 61 0 0 chr2 7430110 7430143 -174317944 - IAP-d-int LTR ERVK -6385 157 125 6 641 263 31 0 0 chr2 7430179 7430211 -174317876 - IAP-d-int LTR ERVK -6387 155 124 6 641 385 78 0 0 chr2 7430236 7430287 -174317800 - IAP-d-int LTR ERVK -6387 155 105 6 641 369 254 30 66 chr2 7430385 7430709 -174317378 - RLTR10-int LTR ERVK -6709 872 553 6 641 284 139 0 0 chr2 7430930 7430973 -174317114 - RLTR10-int LTR ERVK -7314 267 225 6 641 1347 135 0 5 chr2 7431013 7431214 -174316873 - RLTR27 LTR ERVK 0 309 110 6 641 2010 90 4 0 chr2 7431184 7431463 -174316624 - RLTR10A LTR ERVK -131 280 1 6 641 1081 219 5 5 chr2 7433779 7433990 -174314097 - MTD LTR MaLR -9 410 200 6 641 244 0 54 54 chr2 7434191 7434228 -174313859 - MTD LTR MaLR -374 47 11 6 641 3567 15 0 0 chr2 7434820 7435216 -174312871 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 641 299 302 101 48 chr2 7435371 7435559 -174312528 - MLT1A0 LTR MaLR -167 198 1 6 641 3081 42 42 0 chr2 7436863 7437243 -174310844 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 641 7329 69 20 78 chr2 7437243 7438407 -174309680 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 3 6 641 627 67 0 11 chr2 7438413 7438503 -174309584 - MT2C_Mm LTR ERVL -2 473 385 6 641 1077 35 124 0 chr2 7438508 7438653 -174309434 - MT2C_Mm LTR ERVL -312 163 1 6 641 3012 35 65 0 chr2 7442387 7442759 -174305328 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 641 474 279 0 151 chr2 7449756 7449942 -174298145 + ORR1E LTR MaLR 1 158 -201 6 641 1685 64 211 0 chr2 7458127 7458378 -174289709 + LTRIS2 LTR ERV1 1 304 -260 6 641 2034 72 7 7 chr2 7459422 7459702 -174288385 + LTRIS2 LTR ERV1 285 564 0 6 641 1809 211 19 19 chr2 7464170 7464542 -174283545 - ORR1C1 LTR MaLR -6 372 1 6 641 232 260 193 12 chr2 7465149 7465320 -174282767 - RLTR21 LTR ERVK -319 1253 1052 7 641 307 262 205 29 chr2 7468104 7468342 -174279745 + MLT2B4 LTR ERVL 1 280 -276 7 642 1437 191 25 18 chr2 7474182 7474459 -174273628 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 89 7 642 1304 228 95 76 chr2 7474560 7474982 -174273105 - RLTR11A LTR ERVK -95 433 4 7 642 417 191 203 21 chr2 7474982 7475096 -174272991 - ORR1B2 LTR MaLR -254 120 1 7 642 392 325 72 24 chr2 7475340 7475548 -174272539 + LTR40b LTR ERVL 2 219 -243 7 642 501 316 4 92 chr2 7492100 7492327 -174255760 - MTC LTR MaLR -214 207 1 7 642 1517 214 49 33 chr2 7523472 7523840 -174224247 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 1 642 2278 124 210 27 chr2 7531588 7532069 -174216018 + RLTR6_Mm LTR ERV1 37 605 -49 2 642 1956 13 0 0 chr2 7532069 7532301 -174215786 + RLTR6-int LTR ERV1 1 232 -7546 2 642 259 250 86 111 chr2 7544192 7544309 -174203778 - MLT1B LTR MaLR -19 392 279 3 642 253 335 68 46 chr2 7544336 7544555 -174203532 + MLT1D LTR MaLR 13 236 -269 3 642 483 335 19 78 chr2 7545494 7545750 -174202337 + MLT1D LTR MaLR 264 504 -1 3 642 411 367 42 30 chr2 7547882 7548146 -174199941 - MLT1B LTR MaLR -121 269 3 3 642 2292 79 20 3 chr2 7551734 7552038 -174196049 - RLTR27 LTR ERVK 0 309 1 5 642 1302 165 24 24 chr2 7552038 7552293 -174195794 - MMERVK10C-int LTR ERVK 0 7581 7327 5 642 353 309 28 17 chr2 7552423 7552604 -174195483 - MMERVK10C-int LTR ERVK -501 7080 6898 5 642 2179 284 47 47 chr2 7553091 7554404 -174193683 - MMERVK10C-int LTR ERVK -2104 5477 4165 5 642 2102 108 13 19 chr2 7554431 7554742 -174193345 - RLTR27 LTR ERVK 0 309 1 5 642 643 321 81 31 chr2 7557252 7557512 -174190575 + MLT1J1 LTR MaLR 38 310 -134 5 642 449 331 13 63 chr2 7558907 7559057 -174189030 + MTD LTR MaLR 5 146 -233 5 642 730 233 6 28 chr2 7559057 7559234 -174188853 + MT2A LTR ERVL 1 173 -360 6 642 743 228 43 22 chr2 7559299 7559483 -174188604 + MTD LTR MaLR 223 410 -9 5 642 1555 272 14 6 chr2 7560844 7561202 -174186885 - MTE2a LTR MaLR 0 379 19 6 642 633 250 138 124 chr2 7572614 7572959 -174175128 + MT2A LTR ERVL 5 487 -114 8 642 257 203 0 41 chr2 7573083 7573167 -174174920 + MLT2B1 LTR ERVL 478 565 -2 9 642 1321 282 21 3 chr2 7573187 7573525 -174174562 + ORR1C2-int LTR MaLR 32 375 -995 9 642 3028 229 89 36 chr2 7573527 7574349 -174173738 + ORR1C2-int LTR MaLR 506 1370 0 9 642 1351 197 126 23 chr2 7574349 7574697 -174173390 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 9 642 2096 214 34 126 chr2 7574986 7575606 -174172481 + RMER19C LTR ERVK 1 563 -48 9 642 3259 18 39 0 chr2 7578025 7578406 -174169681 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 9 642 9096 31 5 2 chr2 7578406 7579499 -174168588 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1096 -2 9 642 3259 18 39 0 chr2 7579501 7579882 -174168205 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 9 642 601 294 66 10 chr2 7580454 7580650 -174167437 - MTEb LTR MaLR -2 377 171 9 642 453 317 95 24 chr2 7587228 7587396 -174160691 - MTEb LTR MaLR -197 182 3 9 642 1373 187 93 90 chr2 7588882 7589259 -174158828 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 1 642 577 289 135 34 chr2 7589363 7589685 -174158402 - MLT2C1 LTR ERVL -59 355 13 1 642 235 271 17 17 chr2 7591665 7591725 -174156362 - MLT1C LTR MaLR -64 403 344 1 643 569 278 54 37 chr2 7603959 7604254 -174143833 + RLTR15 LTR ERVK 45 344 -15 1 643 234 336 68 68 chr2 7608400 7608665 -174139422 + RLTR14 LTR ERV1 112 376 -6 1 643 1671 171 15 112 chr2 7608674 7609128 -174138959 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 1 643 1942 250 38 16 chr2 7609597 7610097 -174137990 - RLTR18B LTR ERVK -1 511 1 1 643 4118 154 47 25 chr2 7613208 7613996 -174134091 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1 805 -1043 1 643 1084 173 103 4 chr2 7614281 7614513 -174133574 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1590 1844 -4 1 643 1408 258 19 8 chr2 7625399 7625762 -174122325 + ORR1D2 LTR MaLR 1 367 -3 1 643 636 245 13 33 chr2 7625872 7626024 -174122063 + ORR1D2 LTR MaLR 1 149 -221 1 643 714 282 36 36 chr2 7627734 7627958 -174120129 + ORR1D2 LTR MaLR 144 367 -3 1 643 441 298 91 111 chr2 7633696 7634211 -174113876 + RMER20B LTR ERVK 1 516 0 1 643 1587 250 51 8 chr2 7637601 7637996 -174110091 - MTC LTR MaLR -8 413 2 1 643 2297 156 159 74 chr2 7643983 7644109 -174103978 + RMER6C LTR ERVK 1 121 -569 1 643 2297 156 159 74 chr2 7644129 7644625 -174103462 + RMER6C LTR ERVK 122 675 -15 1 643 304 335 84 17 chr2 7644820 7644999 -174103088 + MLT2B1 LTR ERVL 218 408 -112 1 643 814 290 91 11 chr2 7645243 7645508 -174102579 - MLT2C2 LTR ERVL -176 288 3 1 643 243 320 145 13 chr2 7645735 7645887 -174102200 - RMER15 LTR ERVL -16 559 388 1 643 1659 205 69 15 chr2 7648788 7649179 -174098908 - MTD LTR MaLR 0 419 8 1 643 1872 182 86 17 chr2 7654319 7654726 -174093361 - RMER10A LTR ERVL -4 438 4 2 643 558 338 80 36 chr2 7656543 7656880 -174091207 + MLT1A0 LTR MaLR 9 360 -5 2 643 259 397 19 38 chr2 7665169 7665326 -174082761 - LTR33B LTR ERVL -310 193 40 2 643 1673 201 79 11 chr2 7665779 7666132 -174081955 + RLTR14 LTR ERV1 3 379 -3 2 643 614 310 29 60 chr2 7685193 7685482 -174062605 + RLTR15 LTR ERVK 45 327 -32 2 643 5533 133 65 7 chr2 7685482 7686387 -174061700 - RMER17B LTR ERVK 0 958 1 2 643 614 310 29 60 chr2 7686387 7686413 -174061674 + RLTR15 LTR ERVK 328 350 -9 2 643 788 287 107 55 chr2 7698812 7699122 -174048965 - MER67D LTR ERV1 -152 362 37 2 643 322 217 17 78 chr2 7699647 7699762 -174048325 + RLTR40 LTR ERVK 566 673 -144 2 643 3118 47 23 3 chr2 7702848 7703236 -174044851 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 643 228 291 89 59 chr2 7703935 7704070 -174044017 + MER31B LTR ERV1 298 436 -30 2 643 370 309 193 48 chr2 7714119 7714437 -174033650 + MTEa LTR MaLR 1 364 -15 2 643 751 311 55 55 chr2 7727730 7728097 -174019990 - MTE2a LTR MaLR -1 378 12 2 644 1827 129 32 84 chr2 7744641 7744987 -174003100 + ORR1A4 LTR MaLR 1 328 -1 3 644 593 321 38 40 chr2 7745288 7745577 -174002510 + MLT2B4 LTR ERVL 1 291 -123 3 644 370 283 132 30 chr2 7748608 7748805 -173999282 - RMER12 LTR ERVK -350 972 756 3 644 668 341 55 16 chr2 7750404 7750771 -173997316 + MER90a LTR ERV1 86 466 -148 3 644 799 317 85 41 chr2 7752578 7752943 -173995144 + LTR52 LTR ERVL 15 395 -26 3 644 982 260 25 87 chr2 7752965 7753332 -173994755 + LTR52-int LTR ERVL 10 353 -3203 3 644 317 267 69 40 chr2 7756274 7756449 -173991638 + MTE2b LTR MaLR 193 355 -15 3 644 270 264 116 61 chr2 7760876 7761074 -173987013 + MTEa LTR MaLR 169 377 -2 3 644 723 296 20 10 chr2 7776804 7777002 -173971085 - MTEa LTR MaLR -158 221 22 3 644 771 344 48 8 chr2 7778381 7778630 -173969457 + MTEa LTR MaLR 117 375 -4 3 644 251 331 29 36 chr2 7780652 7780790 -173967297 + MLT1A1 LTR MaLR 16 152 -213 3 644 303 343 63 21 chr2 7780871 7781014 -173967073 + MLT1A1 LTR MaLR 259 407 -1 3 644 393 292 84 80 chr2 7784693 7784931 -173963156 + RMER2 LTR ERV1 329 567 0 3 644 1551 222 37 110 chr2 7801246 7801727 -173946360 + RLTR41 LTR ERV1 1 446 0 3 644 3007 84 0 0 chr2 7806835 7807229 -173940858 - MTA_Mm LTR MaLR -2 394 1 3 644 1438 223 150 82 chr2 7823081 7823580 -173924507 - MT2A LTR ERVL 0 533 1 4 644 854 246 57 86 chr2 7824175 7824455 -173923632 - RLTR25B LTR ERVK 0 1028 757 4 644 4186 180 36 26 chr2 7824664 7825513 -173922574 - RLTR25B LTR ERVK -170 858 1 4 644 239 368 70 73 chr2 7831384 7831686 -173916401 - ORR1D2 LTR MaLR -25 345 45 4 644 1121 292 28 56 chr2 7845721 7846080 -173902007 + MTEb LTR MaLR 13 361 -18 4 644 3148 44 18 0 chr2 7850394 7850783 -173897304 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 644 257 250 25 50 chr2 7854278 7854358 -173893729 + RMER16 LTR ERVK 1 78 -455 4 644 752 218 122 5 chr2 7854512 7854733 -173893354 + RMER16 LTR ERVK 287 533 0 4 644 1412 234 82 44 chr2 7856955 7857429 -173890658 + RMER5 LTR ERV1 33 524 -10 4 644 1791 199 43 36 chr2 7858142 7858559 -173889528 - MTC LTR MaLR -1 420 1 4 644 672 238 87 11 chr2 7860222 7860486 -173887601 - MTC LTR MaLR -28 393 1 4 644 298 371 30 0 chr2 7861106 7861238 -173886849 - MLT1H-int LTR MaLR -1248 161 26 4 645 3372 25 5 2 chr2 7867295 7867690 -173880397 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 645 534 325 90 45 chr2 7868976 7869266 -173878821 - MLT1D LTR MaLR -181 324 22 4 645 547 325 92 12 chr2 7871871 7872195 -173875892 + MTEa LTR MaLR 2 353 -26 4 645 547 325 92 12 chr2 7872278 7872299 -173875788 + MTEa LTR MaLR 354 374 -5 4 645 3962 151 16 35 chr2 7882991 7883744 -173864343 - RMER17A LTR ERVK 0 751 13 5 645 2230 84 19 0 chr2 7884093 7884413 -173863674 - IAPEY2_LTR LTR ERVK 0 357 32 5 645 4266 182 82 26 chr2 7884876 7885718 -173862369 - RMER19B LTR ERVK -13 889 1 5 645 1027 236 94 34 chr2 7887251 7887602 -173860485 + MLT1B LTR MaLR 1 372 -18 5 645 690 355 64 14 chr2 7893933 7894319 -173853768 - MER77 LTR ERVL -13 594 157 5 645 358 305 35 139 chr2 7894383 7894585 -173853502 - MER77 LTR ERVL -413 194 14 5 645 1262 182 11 169 chr2 7895679 7896129 -173851958 - RMER17C LTR ERVK -29 381 3 5 645 460 289 99 70 chr2 7896216 7896570 -173851517 + RMER20B LTR ERVK 1 371 -145 5 645 479 294 40 99 chr2 7896836 7897059 -173851028 + RMER20B LTR ERVK 390 599 -28 5 645 794 153 8 0 chr2 7897874 7898005 -173850082 + RMER19B LTR ERVK 1 132 -770 5 645 3173 159 35 85 chr2 7898014 7898661 -173849426 + RMER19B LTR ERVK 288 902 0 5 645 1013 249 136 87 chr2 7900297 7900737 -173847350 + RLTR20A2 LTR ERVK 1 444 -134 5 645 1013 244 135 94 chr2 7900813 7900859 -173847228 + RLTR20A2 LTR ERVK 445 490 -88 5 645 1013 244 135 94 chr2 7900938 7901005 -173847082 + RLTR20A2 LTR ERVK 491 575 -3 5 645 3820 177 26 8 chr2 7905306 7905356 -173842731 + RMER6A LTR ERVK 3 56 -700 5 645 3820 177 26 8 chr2 7905380 7906068 -173842019 + RMER6A LTR ERVK 57 753 -3 5 645 240 279 23 0 chr2 7911637 7911714 -173836373 + MTE2a LTR MaLR 291 370 -9 5 645 272 237 0 0 chr2 7924545 7924604 -173823483 + MLT2B2 LTR ERVL 1 59 -456 5 645 393 330 82 23 chr2 7925137 7925357 -173822730 + RMER5 LTR ERV1 256 488 -46 5 645 944 277 74 3 chr2 7936404 7936687 -173811400 + MTEa LTR MaLR 69 371 -8 5 645 231 294 54 27 chr2 7937068 7937180 -173810907 + MTEb LTR MaLR 249 363 -16 5 645 1544 158 12 68 chr2 7941983 7942323 -173805764 - RLTRETN_Mm LTR ERVK -1 321 1 5 645 3469 42 28 5 chr2 7942412 7942838 -173805249 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 6 645 880 179 16 27 chr2 7945743 7945927 -173802160 + ORR1A1 LTR MaLR 1 182 -164 6 645 1090 116 60 42 chr2 7946264 7946306 -173801781 + ORR1A2 LTR MaLR 106 144 -185 6 645 1195 82 41 0 chr2 7946911 7947084 -173801003 + ORR1A2 LTR MaLR 145 325 -4 6 645 971 140 0 13 chr2 7949788 7949947 -173798140 + ORR1B1 LTR MaLR 238 394 0 6 645 229 183 46 77 chr2 7957027 7957092 -173790995 + RMER20A LTR ERVK 186 248 -268 6 645 1495 214 45 167 chr2 7966127 7966883 -173781204 + RMER6D LTR ERVK 3 689 -31 6 645 488 341 90 59 chr2 7968931 7969252 -173778835 + ORR1E LTR MaLR 9 339 -20 6 645 4218 132 31 58 chr2 7975923 7976700 -173771387 - RMER6A LTR ERVK 0 756 1 6 645 3025 226 83 54 chr2 7976919 7977500 -173770587 - RMER19B LTR ERVK 0 902 297 6 645 3025 226 83 54 chr2 7977534 7977828 -173770259 - RMER19B LTR ERVK -606 296 1 6 645 235 389 23 0 chr2 7991437 7991568 -173756519 - MLT1A LTR MaLR -230 144 11 6 645 2858 77 10 10 chr2 7994865 7995261 -173752826 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 646 1609 201 50 39 chr2 7996664 7996824 -173751263 + ORR1C2 LTR MaLR 14 171 -213 6 646 1609 201 50 39 chr2 7996907 7997103 -173750984 + ORR1C2 LTR MaLR 172 374 -10 6 646 1905 206 18 85 chr2 7997964 7998273 -173749814 - MTC LTR MaLR -2 419 110 6 646 1905 209 19 82 chr2 7998401 7998536 -173749551 - MTC LTR MaLR -312 109 5 6 646 425 329 149 28 chr2 8005301 8005589 -173742498 + MLT2B5 LTR ERVL 1 323 -394 8 646 317 345 34 34 chr2 8005623 8005770 -173742317 + MLT2B5 LTR ERVL 329 475 -79 8 646 2884 76 5 32 chr2 8019489 8019896 -173728191 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 646 355 302 62 102 chr2 8024375 8024600 -173723487 - MLT1B LTR MaLR -171 219 4 4 646 277 327 53 53 chr2 8036992 8037105 -173710982 - ORR1E LTR MaLR -246 113 1 6 646 727 330 13 73 chr2 8037539 8037853 -173710234 + MLT1I LTR MaLR 117 411 0 6 646 2573 94 31 48 chr2 8042034 8042448 -173705639 - RLTR9E LTR ERVK 0 409 3 7 646 244 281 49 0 chr2 8044965 8045047 -173703040 + MTEb LTR MaLR 294 379 0 8 646 802 315 53 29 chr2 8046056 8046396 -173701691 - MLT1C LTR MaLR -20 447 100 8 646 232 301 35 35 chr2 8046489 8046575 -173701512 - MLT1C LTR MaLR -381 86 1 8 646 1449 214 92 0 chr2 8047052 8047398 -173700689 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 8 646 1349 257 25 3 chr2 8056588 8056943 -173691144 - ORR1B2 LTR MaLR -4 363 1 9 646 1709 206 119 21 chr2 8059710 8060180 -173687907 - RMER13B LTR ERVK 0 908 393 1 646 3643 208 62 87 chr2 8060177 8060742 -173687345 - RMER17B LTR ERVK -15 943 401 1 646 3643 208 62 87 chr2 8060920 8061321 -173686766 - RMER17B LTR ERVK -558 400 1 1 646 2326 175 5 5 chr2 8061322 8061719 -173686368 - RMER13B LTR ERVK -511 397 1 1 646 503 242 77 19 chr2 8063397 8063553 -173684534 - RMER15 LTR ERVL 0 575 411 1 646 332 301 34 68 chr2 8063624 8063770 -173684317 - RMER15 LTR ERVL -377 198 58 1 646 830 341 12 72 chr2 8063868 8064200 -173683887 + ORR1E LTR MaLR 8 319 -40 1 646 1144 203 170 12 chr2 8067824 8068153 -173679934 + ORR1C2 LTR MaLR 4 384 0 1 646 308 252 170 10 chr2 8069490 8069590 -173678497 + MTEa LTR MaLR 6 121 -258 1 646 537 312 29 6 chr2 8069608 8069782 -173678305 + MTEa LTR MaLR 202 379 0 1 646 535 382 56 28 chr2 8070113 8070471 -173677616 + MTE-int LTR MaLR 574 941 -639 1 646 231 267 22 55 chr2 8073172 8073263 -173674824 - RMER20A LTR ERVK -243 273 186 1 646 267 268 8 40 chr2 8074909 8075059 -173673028 + MTEb LTR MaLR 228 375 -4 1 646 901 335 41 65 chr2 8075075 8075617 -173672470 - MT2A LTR ERVL -4 529 1 1 646 294 383 25 36 chr2 8078681 8078960 -173669127 + ERVL-E-int LTR ERVL 3414 3689 -1978 1 646 2998 161 158 90 chr2 8084195 8084628 -173663459 + RMER17A2 LTR ERVK 3 466 -440 1 646 2998 161 158 90 chr2 8084687 8085099 -173662988 + RMER17A2 LTR ERVK 467 906 0 1 646 620 286 72 19 chr2 8092153 8092360 -173655727 + MTEa LTR MaLR 1 218 -161 1 646 303 240 0 13 chr2 8092760 8092836 -173655251 + MTEa LTR MaLR 300 374 -5 1 646 3182 49 0 0 chr2 8094305 8094695 -173653392 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 7 1 646 2080 183 102 9 chr2 8096775 8097205 -173650882 - RLTR20B3 LTR ERVK -107 470 1 1 646 1176 219 32 173 chr2 8098365 8098839 -173649248 - RMER19C LTR ERVK -338 399 1 1 646 548 29 0 0 chr2 8100298 8100367 -173647720 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 69 -253 1 646 1965 77 0 0 chr2 8100368 8100629 -173647458 + ETnERV2-int LTR ERVK 1400 1660 -1654 1 646 14879 204 31 29 chr2 8100862 8104923 -173643164 + ETnERV2-int LTR ERVK 1791 6642 -764 1 646 5530 110 12 18 chr2 8112297 8113212 -173634875 + MMETn-int LTR ERVK 3935 4844 0 1 646 1089 76 0 90 chr2 8113212 8113400 -173634687 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 171 -151 1 646 3781 32 5 0 chr2 8113400 8113834 -173634253 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 1 646 7707 37 0 0 chr2 8113834 8114770 -173633317 - MMERVK10C-int LTR ERVK 0 7581 6646 1 646 40035 40 0 1 chr2 8114756 8119704 -173628383 - MMERVK10C-int LTR ERVK -1771 5810 870 1 646 2465 92 55 3 chr2 8119702 8120081 -173628006 - MMERVK10C-int LTR ERVK -7182 399 1 1 646 3794 30 5 0 chr2 8120081 8120515 -173627572 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 1 646 500 242 52 26 chr2 8120515 8120668 -173627419 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 166 322 0 1 646 316 325 72 14 chr2 8122333 8122542 -173625545 + RMER15-int LTR ERVL 4579 4799 -200 1 646 397 366 143 16 chr2 8122595 8122917 -173625170 + MTD LTR MaLR 28 390 -31 1 646 711 299 21 50 chr2 8123077 8123174 -173624913 - ORR1E LTR MaLR -125 234 146 1 646 711 299 21 50 chr2 8123234 8123375 -173624712 - ORR1E LTR MaLR -214 145 3 1 646 1861 193 40 48 chr2 8124365 8124763 -173623324 + RMER17B LTR ERVK 1 395 -563 1 80 3290 191 16 58 chr2 8126040 8126730 -173621357 + RMER17B LTR ERVK 298 958 0 1 647 229 258 0 88 chr2 8128009 8128077 -173620010 + ORR1E LTR MaLR 5 66 -313 1 647 259 336 54 104 chr2 8128144 8128264 -173619823 + ORR1E LTR MaLR 77 197 -162 1 647 259 336 54 104 chr2 8128298 8128456 -173619631 + ORR1E LTR MaLR 198 341 -18 1 647 487 258 58 76 chr2 8138054 8138331 -173609756 + RLTR10A LTR ERVK 140 411 0 1 647 355 202 61 52 chr2 8138350 8138465 -173609622 + RLTR10-int LTR ERVK 318 433 -1554 1 647 2543 314 59 43 chr2 8138683 8138988 -173609099 + IAP-d-int LTR ERVK 2689 2994 -3548 1 647 1981 20 163 4 chr2 8138988 8139240 -173608847 + RLTR10B LTR ERVK 1 292 0 1 647 2543 313 55 41 chr2 8139240 8141321 -173606766 + IAP-d-int LTR ERVK 992 5080 -1462 1 647 867 171 17 9 chr2 8141448 8141613 -173606474 + RLTR45-int LTR ERVK 6911 7040 -204 1 647 556 261 141 12 chr2 8141653 8141894 -173606193 + RLTR10A LTR ERVK 140 411 0 1 647 638 280 35 18 chr2 8141994 8142165 -173605922 - MTEa LTR MaLR -204 175 2 1 647 2102 120 3 52 chr2 8149142 8149485 -173598602 + ORR1A3 LTR MaLR 1 326 0 2 647 441 282 6 57 chr2 8149843 8150001 -173598086 + MLT1C LTR MaLR 4 153 -314 2 647 783 325 78 13 chr2 8151416 8151767 -173596320 - MTEa LTR MaLR 0 379 15 2 647 294 315 62 8 chr2 8152389 8152517 -173595570 + MLT2B4 LTR ERVL 74 208 -348 2 647 232 188 61 30 chr2 8153908 8153974 -173594113 + MLT2B2 LTR ERVL 490 557 -5 2 647 690 313 90 0 chr2 8156409 8156754 -173591333 - MTEa LTR MaLR -3 376 1 2 647 1007 281 122 9 chr2 8157017 8157344 -173590743 + ORR1D2 LTR MaLR 1 364 -6 2 647 1459 264 84 23 chr2 8157344 8157829 -173590258 + ORR1D2-int LTR MaLR 12 526 -844 2 647 1420 249 54 59 chr2 8158767 8159173 -173588914 - MTC LTR MaLR -8 413 10 2 647 5237 148 141 6 chr2 8160769 8161751 -173586336 - RLTR13D3 LTR ERVK 0 1114 1 2 647 407 329 37 25 chr2 8168341 8168503 -173579584 + MLT1B LTR MaLR 220 383 -7 2 647 506 324 124 94 chr2 8168589 8168960 -173579127 + MTD LTR MaLR 1 382 -14 2 647 2178 116 22 3 chr2 8172185 8172506 -173575581 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 2 647 414 269 135 71 chr2 8173859 8174111 -173573976 + ORR1E LTR MaLR 44 311 -48 2 647 1024 211 56 96 chr2 8176453 8176760 -173571327 - RMER19C LTR ERVK -406 496 1 2 647 868 294 54 55 chr2 8200079 8200434 -173547653 - MTE2a LTR MaLR -2 417 53 2 647 337 330 70 68 chr2 8200830 8201155 -173546932 - MTEa LTR MaLR -4 375 50 2 647 3213 62 10 12 chr2 8205425 8205833 -173542254 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 2 647 243 363 79 29 chr2 8206823 8206962 -173541125 - RMER15 LTR ERVL -132 443 298 2 647 744 319 72 61 chr2 8208241 8208685 -173539402 - RMER15-int LTR ERVL -62 4937 4489 2 647 1872 347 82 15 chr2 8209269 8210284 -173537803 - RMER15-int LTR ERVL -3532 1467 384 2 647 517 352 24 80 chr2 8210631 8210881 -173537206 - RMER15 LTR ERVL -2 573 338 2 647 635 220 121 6 chr2 8212968 8213116 -173534971 - MTD LTR MaLR 0 419 252 2 647 1447 234 25 68 chr2 8213148 8213543 -173534544 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 2 647 471 324 70 42 chr2 8213763 8213976 -173534111 - MTD LTR MaLR -152 267 49 2 647 290 276 0 0 chr2 8216062 8216120 -173531967 - MTD LTR MaLR -316 63 6 2 647 1029 286 28 45 chr2 8216840 8217201 -173530886 + MTE2b LTR MaLR 15 369 -50 2 647 2430 135 14 50 chr2 8223023 8223460 -173524627 - RLTR11B LTR ERVK 0 453 33 3 647 466 340 74 32 chr2 8227998 8228308 -173519779 - MLT2B3 LTR ERVL -229 325 3 3 647 274 284 70 63 chr2 8235137 8235295 -173512792 - MTEb LTR MaLR -17 362 204 3 647 469 323 25 0 chr2 8240766 8240927 -173507160 + MTEa LTR MaLR 214 378 -1 3 647 1812 174 31 64 chr2 8243747 8244139 -173503948 + RMER20B LTR ERVK 1 379 -248 3 647 477 248 140 52 chr2 8244156 8244292 -173503795 + RMER20B LTR ERVK 480 627 0 3 647 2243 226 47 15 chr2 8246112 8246704 -173501383 - RMER19C LTR ERVK 0 611 1 3 647 2395 98 3 0 chr2 8249889 8250215 -173497872 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 3 647 479 191 0 99 chr2 8251136 8251298 -173496789 + MT2B LTR ERVL 154 287 -314 3 647 1272 236 14 81 chr2 8251295 8251664 -173496423 + RMER6C LTR ERVK 347 690 0 3 647 248 279 35 11 chr2 8253635 8253722 -173494365 - MER34 LTR ERV1 -74 468 380 3 648 421 306 101 24 chr2 8263912 8264160 -173483927 + MTE-int LTR MaLR 1160 1426 -154 3 648 259 208 0 0 chr2 8264443 8264496 -173483591 + MTEa LTR MaLR 204 256 -123 3 648 283 350 0 74 chr2 8265474 8265622 -173482465 + MTEa LTR MaLR 134 270 -109 3 648 1047 322 25 47 chr2 8267727 8268225 -173479862 + MLT-int LTR MaLR 289 786 -585 3 648 493 360 44 10 chr2 8268628 8268833 -173479254 + MLT-int LTR MaLR 1310 1521 -214 3 648 543 338 77 36 chr2 8269127 8269489 -173478598 + MLT1F-int LTR MaLR 150 526 -963 3 648 243 391 23 8 chr2 8269764 8269893 -173478194 - ORR1E LTR MaLR -227 132 2 3 648 476 236 136 89 chr2 8277315 8277529 -173470558 - RMER15 LTR ERVL -14 561 338 3 648 236 314 64 37 chr2 8278302 8278411 -173469676 - MER65D LTR ERV1 -135 338 227 3 648 3334 64 28 2 chr2 8283810 8284235 -173463852 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 3 648 236 235 0 0 chr2 8285754 8285805 -173462282 - MLT1B LTR MaLR -2 388 338 4 648 317 279 19 19 chr2 8286436 8286542 -173461545 - MLT1C LTR MaLR -45 422 317 4 648 3490 77 10 19 chr2 8287424 8287903 -173460184 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 1 4 648 235 304 12 71 chr2 8288709 8288794 -173459293 - MTEa LTR MaLR -297 82 3 4 648 1453 202 120 0 chr2 8295094 8295411 -173452676 - RMER19B LTR ERVK 0 902 548 4 648 2167 169 47 3 chr2 8295428 8295814 -173452273 - RMER19B LTR ERVK -499 403 1 4 648 1846 149 138 7 chr2 8297428 8297847 -173450240 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 474 -1 4 648 3425 96 19 37 chr2 8297850 8298621 -173449466 + IAPEz-int LTR ERVK 3 662 -5819 4 648 2610 85 0 3 chr2 8298621 8298964 -173449123 + IAPEz-int LTR ERVK 1359 1700 -4781 4 648 6167 77 12 2 chr2 8298959 8299780 -173448307 + IAPEz-int LTR ERVK 5653 6481 0 4 648 1743 156 117 47 chr2 8299780 8300224 -173447863 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 4 648 1087 244 85 23 chr2 8305016 8305368 -173442719 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 4 648 1977 163 33 8 chr2 8307123 8307482 -173440605 + RLTR9A LTR ERVK 1 368 0 4 648 624 302 64 14 chr2 8309877 8310095 -173437992 - MLT1A0 LTR MaLR -134 231 3 4 648 729 311 58 72 chr2 8310859 8311220 -173436867 - ORR1E LTR MaLR 0 359 4 4 648 333 308 60 40 chr2 8313539 8313688 -173434399 - MLT1C LTR MaLR 0 467 316 4 648 2038 117 35 3 chr2 8318904 8319221 -173428866 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 4 648 789 280 56 50 chr2 8323822 8324179 -173423908 - RLTR10D LTR ERVK 0 359 1 4 648 1469 215 41 17 chr2 8324179 8324524 -173423563 - IAP-d-int LTR ERVK 0 6542 6190 4 648 3693 264 20 56 chr2 8324519 8325809 -173422278 - IAP-d-int LTR ERVK -459 6083 4840 4 648 4495 291 17 18 chr2 8326905 8328534 -173419553 - IAP-d-int LTR ERVK -1746 4796 3170 4 648 463 202 30 0 chr2 8328580 8328679 -173419408 - IAP-d-int LTR ERVK -6401 141 40 4 648 715 240 71 57 chr2 8328744 8329089 -173418998 - RLTR10D LTR ERVK -2 409 1 4 648 565 246 183 50 chr2 8331374 8331614 -173416473 + RLTR10A LTR ERVK 140 411 0 4 648 2005 104 26 7 chr2 8339061 8339371 -173408716 + IAPLTR2b LTR ERVK 1 316 -11 4 648 1623 203 33 3 chr2 8344289 8344625 -173403462 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 4 648 9230 143 24 41 chr2 8346211 8347857 -173400230 - RMER6-int LTR ERVK -3557 1703 7 4 648 3150 186 92 8 chr2 8347894 8348550 -173399537 - RMER6D LTR ERVK -9 711 1 4 648 235 260 0 27 chr2 8353545 8353620 -173394467 - MTEa LTR MaLR 0 379 307 5 648 516 301 32 110 chr2 8353647 8353893 -173394194 - MTEa LTR MaLR -63 316 90 5 648 1104 242 169 109 chr2 8354276 8354362 -173393725 + MT2A LTR ERVL 1 86 -447 5 648 1104 242 169 109 chr2 8354507 8354916 -173393171 + MT2A LTR ERVL 87 526 -7 5 648 229 208 0 0 chr2 8356396 8356444 -173391643 + MLT1A1 LTR MaLR 343 390 -18 5 648 975 212 26 87 chr2 8356808 8357072 -173391015 - RLTR40 LTR ERVK 0 817 570 5 648 2048 193 190 19 chr2 8357161 8357734 -173390353 - RLTR40 LTR ERVK -146 671 1 5 648 2197 99 9 24 chr2 8361121 8361230 -173386857 + IAPEY2_LTR LTR ERVK 32 140 -217 5 648 3563 35 28 2 chr2 8361230 8361655 -173386432 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 5 648 2197 99 9 24 chr2 8361655 8361876 -173386211 + IAPEY2_LTR LTR ERVK 141 357 0 5 648 617 193 0 0 chr2 8367995 8368104 -173379983 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 286 5 648 394 188 0 23 chr2 8368100 8368217 -173379870 - ORR1B1 LTR MaLR -288 106 8 5 648 6362 201 36 78 chr2 8368209 8368780 -173379307 - ORR1B1-int LTR MaLR -303 1660 990 5 648 6362 198 36 78 chr2 8368817 8368848 -173379239 - ORR1B1-int LTR MaLR -870 1093 1080 5 648 6362 198 36 78 chr2 8368881 8368944 -173379143 - ORR1B1-int LTR MaLR -884 1079 1026 5 648 6362 198 36 78 chr2 8369841 8370766 -173377321 - ORR1B1-int LTR MaLR -938 1025 157 5 648 756 262 128 33 chr2 8374946 8375282 -173372805 - RLTR9A LTR ERVK 0 368 1 5 648 873 235 66 69 chr2 8377780 8378068 -173370019 - RMER6D LTR ERVK -1 719 433 5 648 456 195 26 26 chr2 8378051 8378151 -173369936 - RMER6D LTR ERVK -444 276 177 5 648 2457 139 28 10 chr2 8378151 8378551 -173369536 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 5 648 456 195 26 26 chr2 8378551 8378566 -173369521 - RMER6D LTR ERVK -544 176 161 5 648 2247 128 41 34 chr2 8378566 8378964 -173369123 - MTB_Mm-int LTR MaLR 0 1098 683 5 648 947 144 70 0 chr2 8378960 8379133 -173368954 - MT-int LTR MaLR -898 200 1 5 648 512 214 181 27 chr2 8379133 8379147 -173368940 - RMER6D LTR ERVK -527 193 180 5 648 2770 62 84 13 chr2 8379147 8379526 -173368561 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 2 5 648 512 214 181 27 chr2 8379526 8379660 -173368427 - RMER6D LTR ERVK -541 179 22 5 649 688 250 65 53 chr2 8394749 8394994 -173353093 + RLTR14 LTR ERV1 2 249 -133 5 649 1178 168 158 59 chr2 8402333 8402528 -173345559 + RMER17C LTR ERVK 1 179 -231 5 649 1178 168 158 59 chr2 8402596 8402773 -173345314 + RMER17C LTR ERVK 180 409 -1 5 649 1884 115 75 3 chr2 8404634 8404939 -173343148 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 5 649 1989 152 15 1 chr2 8405202 8405563 -173342524 - ORR1A4 LTR MaLR 0 394 1 5 649 5014 139 19 99 chr2 8405563 8406546 -173341541 - ORR1A4-int LTR MaLR 0 1963 1059 5 649 1287 215 16 25 chr2 8410041 8410404 -173337683 - ORR1A4-int LTR MaLR -886 1077 718 5 649 1156 206 71 68 chr2 8410363 8410644 -173337443 - MT2B LTR ERVL -314 287 6 5 649 4241 157 7 45 chr2 8410479 8411240 -173336847 - ORR1A4-int LTR MaLR -1213 750 19 5 649 1496 168 118 17 chr2 8411240 8411597 -173336490 - ORR1A4 LTR MaLR -1 393 1 5 649 336 274 175 15 chr2 8418525 8418662 -173329425 - MT2A LTR ERVL -5 528 370 5 649 826 282 52 45 chr2 8418990 8419257 -173328830 + MTE2a LTR MaLR 110 378 -1 5 649 226 298 23 45 chr2 8422333 8422421 -173325666 - RMER15 LTR ERVL -452 123 38 6 649 1926 258 67 93 chr2 8426037 8426947 -173321140 - RMER17B LTR ERVK -57 901 16 6 649 992 265 33 94 chr2 8431312 8431707 -173316380 - MLT2D LTR ERVL -43 371 1 6 649 356 361 60 6 chr2 8442207 8442374 -173305713 - LTR86B2 LTR ERVL -23 464 289 6 649 1018 202 4 152 chr2 8445621 8445761 -173302326 + MT2A LTR ERVL 1 127 -406 6 649 1018 230 33 86 chr2 8445901 8446093 -173301994 + MT2A LTR ERVL 128 466 -118 6 649 3102 11 0 42 chr2 8450080 8450463 -173297624 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 6 649 55368 22 17 3 chr2 8450463 8456848 -173291239 + IAPEz-int LTR ERVK 8 6481 0 6 649 3089 14 0 42 chr2 8456848 8457231 -173290856 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 6 649 1556 204 56 41 chr2 8461759 8462153 -173285934 + MTB LTR MaLR 1 400 0 6 649 303 345 54 78 chr2 8462253 8462511 -173285576 - MTEa LTR MaLR -120 259 8 6 649 4324 179 76 18 chr2 8467626 8468271 -173279816 - RMER19B LTR ERVK 0 902 237 6 649 4324 179 76 18 chr2 8468308 8468514 -173279573 - RMER19B LTR ERVK -666 236 1 6 649 802 323 82 27 chr2 8475717 8476045 -173272042 + MTD LTR MaLR 42 387 -32 6 649 708 341 30 30 chr2 8485165 8485528 -173262559 + MLT1A0 LTR MaLR 3 365 0 6 649 373 385 46 35 chr2 8485815 8486181 -173261906 - MER89 LTR ERV1 -5 554 185 6 649 505 399 16 60 chr2 8487679 8487996 -173260091 + MTEb LTR MaLR 11 313 -66 6 649 1013 325 102 17 chr2 8495819 8496190 -173251897 + MTE2b LTR MaLR 14 384 -35 7 649 1421 240 63 33 chr2 8496193 8496301 -173251786 + ORR1C1 LTR MaLR 1 124 -254 7 649 3007 59 5 13 chr2 8496301 8496698 -173251389 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 3 7 649 1421 240 63 33 chr2 8496698 8496955 -173251132 + ORR1C1 LTR MaLR 125 377 -1 7 649 1462 252 20 201 chr2 8508719 8509465 -173238622 - RMER19C LTR ERVK 0 611 1 8 649 863 196 45 0 chr2 8509961 8510140 -173237947 + RLTR11B LTR ERVK 265 451 -2 1 649 4499 100 24 32 chr2 8511751 8512493 -173235594 + RMER17A LTR ERVK 1 736 -15 1 81 309 373 60 64 chr2 8519611 8519846 -173228241 - MLT1A0 LTR MaLR -82 283 50 1 650 370 254 40 32 chr2 8520274 8520400 -173227687 + RMER15 LTR ERVL 3 129 -446 1 650 831 279 128 8 chr2 8520469 8520718 -173227369 + RMER15 LTR ERVL 297 575 0 1 650 315 209 254 12 chr2 8533056 8533221 -173214866 - MT2A LTR ERVL -26 507 303 2 650 1158 218 179 21 chr2 8536970 8537271 -173210816 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 8 3 650 365 264 37 19 chr2 8538177 8538285 -173209802 + RLTR23 LTR ERV1 321 430 0 3 650 322 141 230 23 chr2 8541081 8541168 -173206919 - ORR1C2 LTR MaLR -2 382 278 3 650 686 155 127 0 chr2 8541206 8541348 -173206739 - RMER4B LTR ERVK -408 177 18 3 650 423 238 0 110 chr2 8541352 8541470 -173206617 - ORR1C2 LTR MaLR -279 105 1 3 650 300 336 13 81 chr2 8544655 8544804 -173203283 + MLT1C LTR MaLR 1 139 -328 4 650 275 319 86 79 chr2 8544978 8545002 -173203085 + MLT1C LTR MaLR 179 204 -263 4 650 275 319 86 79 chr2 8545033 8545287 -173202800 + MLT1C LTR MaLR 205 458 -9 4 650 273 327 100 62 chr2 8546285 8546445 -173201642 + MLT1N2 LTR MaLR 131 296 -266 4 650 5702 127 40 5 chr2 8546652 8547578 -173200509 - RMER17B LTR ERVK 0 958 1 4 650 4126 205 39 79 chr2 8548245 8549288 -173198799 + RLTR25B LTR ERVK 27 1028 0 4 650 1861 174 10 88 chr2 8557447 8557831 -173190256 + RMER19B LTR ERVK 25 378 -524 5 650 309 189 0 0 chr2 8557831 8557884 -173190203 - RLTR31_Mur LTR ERVK 0 553 501 6 650 744 276 52 0 chr2 8558691 8558883 -173189204 - MTEa LTR MaLR -4 375 174 6 650 814 250 137 29 chr2 8560161 8560503 -173187584 - MTE2b LTR MaLR 0 379 1 6 650 3288 38 5 0 chr2 8563281 8563675 -173184412 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 7 650 333 363 72 61 chr2 8564897 8565243 -173182844 - MLT1A0 LTR MaLR -15 350 1 7 650 270 215 38 134 chr2 8569832 8569980 -173178107 + RLTR8 LTR ERVK 228 364 0 8 650 3862 138 28 40 chr2 8570949 8571709 -173176378 - RMER17A LTR ERVK 0 751 1 8 650 1852 143 140 3 chr2 8574489 8574854 -173173233 + RLTR9F LTR ERVK 1 415 0 8 650 421 237 151 29 chr2 8581617 8581756 -173166331 + ORR1C2 LTR MaLR 171 326 -58 1 650 296 143 18 18 chr2 8581885 8581942 -173166145 + ORR1C2 LTR MaLR 325 381 -3 1 650 376 274 162 47 chr2 8608485 8608792 -173139295 - ORR1E LTR MaLR 0 379 6 1 650 459 347 33 22 chr2 8615156 8615336 -173132751 + ORR1E LTR MaLR 19 200 -159 1 650 444 282 132 91 chr2 8635251 8635591 -173112496 + ORR1D2 LTR MaLR 14 367 -3 1 650 3269 71 28 5 chr2 8643050 8643476 -173104611 + RLTR10C LTR ERVK 1 436 0 1 650 3076 73 2 5 chr2 8644465 8644866 -173103221 - MTB LTR MaLR 0 400 1 1 651 1078 254 91 38 chr2 8664509 8664849 -173083238 + MTE2b LTR MaLR 21 378 -1 2 651 289 359 99 20 chr2 8669182 8669384 -173078703 - LTR16A LTR ERVL -4 447 230 2 651 818 288 48 67 chr2 8681083 8681441 -173066646 - ORR1E LTR MaLR 0 359 9 2 651 416 324 106 75 chr2 8686895 8687412 -173060675 + MT2A LTR ERVL 1 533 0 2 651 431 314 19 44 chr2 8689287 8689447 -173058640 + ORR1E LTR MaLR 20 175 -184 2 651 1383 227 60 52 chr2 8693952 8694333 -173053754 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 2 651 619 249 3 119 chr2 8695341 8695651 -173052436 + BGLII_B LTR ERVK 1 274 -167 2 651 342 299 192 10 chr2 8706367 8706570 -173041517 + MTC LTR MaLR 86 325 -96 2 651 3353 23 5 8 chr2 8726649 8727046 -173021041 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 651 2766 155 86 22 chr2 8727318 8727852 -173020235 + RLTR12A LTR ERVK 1 568 0 2 651 1000 214 49 11 chr2 8729636 8729901 -173018186 + RLTR20B2 LTR ERVK 108 382 -178 3 651 1676 191 48 14 chr2 8733511 8733866 -173014221 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 3 651 229 239 18 27 chr2 8738056 8738083 -173010004 + ORR1B1-int LTR MaLR 623 733 -776 3 651 2149 168 18 5 chr2 8744355 8744744 -173003343 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 3 651 1529 219 56 46 chr2 8746090 8746483 -173001604 + ORR1B1-int LTR MaLR 941 1337 -172 3 651 234 214 14 106 chr2 8757917 8758058 -172990029 + RMER17D LTR ERVK 374 501 -388 3 651 378 255 0 31 chr2 8759371 8759468 -172988619 - RMER12 LTR ERVK -471 851 758 3 651 249 346 141 19 chr2 8772900 8773056 -172975031 + ORR1E LTR MaLR 4 178 -181 3 652 588 331 46 43 chr2 8785051 8785332 -172962755 - MTE2b LTR MaLR -76 303 22 3 652 256 238 46 35 chr2 8785935 8786022 -172962065 - MLT1A1 LTR MaLR -3 405 318 3 652 231 344 80 50 chr2 8791411 8791610 -172956477 - MLT1F2 LTR MaLR -328 232 28 4 652 2771 163 14 60 chr2 8796350 8796865 -172951222 + RMER19A LTR ERVK 1 491 -246 4 652 282 143 0 51 chr2 8796845 8796904 -172951183 + RMER19A LTR ERVK 681 736 -1 4 652 232 320 0 26 chr2 8815027 8815104 -172932983 + MTEb LTR MaLR 5 79 -300 4 652 3259 33 8 2 chr2 8823416 8823810 -172924277 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 652 7585 68 31 22 chr2 8823810 8824205 -172923882 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 391 -707 4 652 7585 68 31 22 chr2 8824396 8825088 -172922999 + MTA_Mm-int LTR MaLR 392 1098 0 4 652 3266 43 5 0 chr2 8825088 8825482 -172922605 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 652 707 308 101 76 chr2 8825660 8826068 -172922019 - MTD LTR MaLR 0 419 2 4 652 3241 110 4 11 chr2 8826582 8827058 -172921029 + MT2C_Mm LTR ERVL 3 475 0 4 652 1698 167 81 47 chr2 8829255 8829663 -172918424 - RMER6C LTR ERVK -266 424 3 4 652 16161 142 72 47 chr2 8829665 8830240 -172917847 - RMER6-int LTR ERVK 0 3177 2577 4 652 16161 142 72 47 chr2 8830301 8832764 -172915323 - RMER6-int LTR ERVK 0 2576 1 4 652 471 162 12 0 chr2 8832764 8832844 -172915243 - RMER6C LTR ERVK 0 690 610 4 652 2020 195 105 48 chr2 8838462 8838919 -172909168 - RMER19C LTR ERVK 0 611 129 4 652 891 155 97 0 chr2 8908770 8908925 -172839162 - RMER6D LTR ERVK -468 252 83 5 652 1333 242 104 16 chr2 8909214 8909580 -172838507 + RMER15 LTR ERVL 1 398 -177 5 652 499 202 50 20 chr2 8910665 8910766 -172837321 + RLTR19 LTR ERVK 353 456 -43 5 652 323 192 82 0 chr2 8911084 8911157 -172836930 + RMER15 LTR ERVL 379 457 -118 5 653 2637 54 40 11 chr2 8920952 8921306 -172826781 - RLTR10B2 LTR ERVK -1 364 1 5 653 448 332 8 64 chr2 8925717 8925952 -172822135 - RMER15 LTR ERVL -2 573 352 5 653 703 334 32 19 chr2 8928740 8929112 -172818975 - MTEb LTR MaLR 0 379 3 5 653 706 305 102 11 chr2 8932203 8932478 -172815609 + RMER15 LTR ERVL 276 575 0 6 653 1107 259 23 128 chr2 8933171 8933570 -172814517 - MTE2a LTR MaLR -17 362 6 6 653 2870 112 39 11 chr2 8946054 8946516 -172801571 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 6 653 5960 38 11 25 chr2 8946518 8947273 -172800814 - IAPEz-int LTR ERVK -2 6479 5736 6 653 2218 68 0 0 chr2 8947272 8947550 -172800537 - IAPEz-int LTR ERVK -4845 1636 1359 6 653 3559 56 0 17 chr2 8947550 8948086 -172800001 - IAPEz-int LTR ERVK -5819 662 211 6 653 1123 112 45 57 chr2 8948086 8948428 -172799659 - IAPEz-int LTR ERVK -6052 429 168 6 653 229 273 0 0 chr2 8948428 8948472 -172799615 - RLTR27 LTR ERVK -34 275 232 6 653 286 81 0 0 chr2 8948472 8948509 -172799578 - IAPEz-int LTR ERVK -7400 181 145 6 653 227 267 0 0 chr2 8948509 8948554 -172799533 - RLTR27 LTR ERVK -34 275 231 6 653 567 87 0 228 chr2 8948554 8948703 -172799384 - IAPEz-int LTR ERVK -6358 123 9 6 653 2329 97 101 11 chr2 8948704 8949081 -172799006 - IAPLTR2a LTR ERVK 0 411 1 6 653 3355 31 5 0 chr2 8950690 8951082 -172797005 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 3 6 653 742 316 106 25 chr2 8965736 8965786 -172782301 + MTEb LTR MaLR 18 68 -311 6 653 1723 163 8 71 chr2 8965786 8966137 -172781950 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 6 653 742 319 104 24 chr2 8966137 8966410 -172781677 + MTEb LTR MaLR 69 378 -1 6 653 1496 355 86 77 chr2 8966429 8967870 -172780217 - MTE-int LTR MaLR -96 1484 91 6 653 1443 251 28 14 chr2 8983728 8984080 -172764007 - MTD LTR MaLR -62 357 1 6 653 348 370 111 65 chr2 8987743 8988084 -172760003 - ORR1E LTR MaLR 0 359 3 6 653 1906 143 12 19 chr2 8991108 8991429 -172756658 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 6 653 282 296 83 107 chr2 9000863 9001105 -172746982 - ORR1E LTR MaLR -7 352 117 1 653 3078 47 5 0 chr2 9001109 9001496 -172746591 - MTA_Mm LTR MaLR -7 389 1 2 653 9118 36 0 2 chr2 9001496 9002596 -172745491 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 2 653 2879 53 40 0 chr2 9002597 9002971 -172745116 - MTA_Mm LTR MaLR -7 389 1 2 653 1963 145 82 143 chr2 9015483 9015958 -172732129 + RLTR41 LTR ERV1 1 446 0 2 653 513 340 53 90 chr2 9023471 9023827 -172724260 - MTEb LTR MaLR -17 362 20 3 653 592 354 46 50 chr2 9024961 9025378 -172722709 - MTD LTR MaLR -2 417 3 3 653 4033 144 59 22 chr2 9029972 9030698 -172717389 + RMER6A LTR ERVK 4 756 0 3 653 1138 214 201 103 chr2 9041701 9041769 -172706318 + MT2A LTR ERVL 14 80 -453 5 653 1138 214 201 103 chr2 9041833 9041940 -172706147 + MT2A LTR ERVL 81 148 -385 5 653 1138 214 201 103 chr2 9042711 9042992 -172705095 + MT2A LTR ERVL 149 516 -17 5 653 308 362 71 33 chr2 9043053 9043236 -172704851 - ORR1E LTR MaLR -169 190 1 5 654 447 251 256 11 chr2 9060473 9060757 -172687330 + MTE2b LTR MaLR 13 366 -13 6 654 235 313 24 24 chr2 9063489 9063574 -172684513 - MTE2a LTR MaLR -31 388 304 7 654 401 198 81 30 chr2 9065292 9065391 -172682696 - MTE2a LTR MaLR -109 270 167 7 654 442 299 173 43 chr2 9065814 9065999 -172682088 - MTE2a LTR MaLR -163 216 8 7 654 5944 71 9 24 chr2 9067746 9068042 -172680045 - RLTR13C2 LTR ERVK 0 983 523 8 654 5944 48 1 20 chr2 9068151 9068675 -172679412 - RLTR13C2 LTR ERVK -286 522 1 8 654 1552 148 0 4 chr2 9068684 9068935 -172679152 - ETnERV3-int LTR ERVK -30 5778 5529 8 654 5309 109 18 24 chr2 9068949 9069794 -172678293 - RLTR45-int LTR ERVK -1173 6071 5232 8 654 362 307 0 10 chr2 9072658 9072760 -172675327 + MLT1A1 LTR MaLR 294 394 -14 9 654 277 360 72 98 chr2 9084155 9084460 -172663627 + ORR1E LTR MaLR 7 303 -56 1 654 554 326 83 49 chr2 9087732 9088203 -172659884 + MLT2B1 LTR ERVL 5 567 0 1 654 2282 191 88 38 chr2 9113979 9114535 -172633552 + RLTR31A_Mm LTR ERVK 1 584 0 1 654 373 310 25 33 chr2 9117276 9117396 -172630691 - MER90a LTR ERV1 -22 592 474 1 654 875 275 46 119 chr2 9119599 9119987 -172628100 - MTE2a LTR MaLR -14 365 6 1 654 756 313 124 13 chr2 9120547 9120583 -172627504 + ORR1E LTR MaLR 1 37 -322 1 654 756 313 124 13 chr2 9120652 9120929 -172627158 + ORR1E LTR MaLR 38 348 -11 1 654 4096 169 29 0 chr2 9121786 9122500 -172625587 - RMER19A LTR ERVK 0 737 3 1 654 292 351 68 80 chr2 9129944 9130195 -172617892 - MLT1K LTR MaLR -17 578 331 1 654 804 309 149 3 chr2 9152656 9152971 -172595116 + MLT1A1 LTR MaLR 1 361 -47 1 654 1010 199 131 46 chr2 9156625 9156931 -172591156 - IAPEY3_LTR LTR ERVK 0 332 1 2 654 1214 204 55 15 chr2 9156931 9157274 -172590813 - IAP-d-int LTR ERVK 0 6481 6125 2 654 1589 124 57 26 chr2 9157292 9157618 -172590469 - IAPEY3-int LTR ERVK -343 7337 6965 2 654 1314 129 107 0 chr2 9157618 9157843 -172590244 - IAP-d-int LTR ERVK -1287 5255 5007 2 654 343 158 0 0 chr2 9157843 9157900 -172590187 - IAP-d-int LTR ERVK -6039 503 447 2 654 683 210 99 0 chr2 9158135 9158297 -172589790 - IAP-d-int LTR ERVK -4917 489 312 2 654 721 146 15 0 chr2 9158273 9158410 -172589677 - MMERVK10C-int LTR ERVK -6735 846 708 2 654 1825 103 130 134 chr2 9158513 9158937 -172589150 - MMERVK10C-int LTR ERVK -7159 422 1 2 654 1060 205 127 46 chr2 9158937 9159244 -172588843 - IAPEY3_LTR LTR ERVK 0 332 1 2 654 1639 274 64 17 chr2 9170231 9170699 -172577388 - RLTR16 LTR ERVK -15 490 1 2 654 283 415 53 57 chr2 9172224 9172469 -172575618 - MLT1E2 LTR MaLR -28 652 351 2 655 940 300 100 22 chr2 9175345 9175716 -172572371 - MTD LTR MaLR 0 419 20 2 655 490 198 0 124 chr2 9180264 9180385 -172567702 + MT2B LTR ERVL 152 257 -344 2 655 937 69 15 0 chr2 9180866 9180997 -172567090 - ORR1A3-int LTR MaLR -842 1121 989 2 655 226 295 139 28 chr2 9181506 9181614 -172566473 - MLT1J-int LTR MaLR -434 953 834 2 655 297 403 25 50 chr2 9190507 9190708 -172557379 - MamGypLTR2b LTR Gypsy -725 197 2 2 655 227 219 108 14 chr2 9190930 9191004 -172557083 - RLTR19A LTR ERVK -39 457 377 2 655 858 255 124 93 chr2 9191036 9191400 -172556687 + MTEb LTR MaLR 5 379 0 2 655 226 237 51 0 chr2 9200623 9200682 -172547405 - MLT1A1 LTR MaLR -26 382 321 2 655 274 281 0 0 chr2 9202200 9202257 -172545830 + MLT1E2 LTR MaLR 1 57 -570 2 655 255 304 30 80 chr2 9202609 9202709 -172545378 - MT2B LTR ERVL -380 221 127 2 655 236 211 0 19 chr2 9202682 9202735 -172545352 + MLT1G1 LTR MaLR 528 579 0 2 655 301 298 74 84 chr2 9222844 9223188 -172524899 + MTEa LTR MaLR 34 379 0 3 655 560 276 98 125 chr2 9223704 9223864 -172524223 + ORR1E LTR MaLR 1 152 -207 3 655 560 276 98 125 chr2 9224014 9224221 -172523866 + ORR1E LTR MaLR 153 358 -1 3 655 238 362 9 37 chr2 9238747 9238856 -172509231 - LTR16A LTR ERVL -56 395 290 3 655 611 366 73 15 chr2 9260193 9260534 -172487553 + MLT1A0 LTR MaLR 1 361 -4 3 655 1286 174 85 28 chr2 9261240 9261370 -172486717 - RMER17C LTR ERVK -73 337 194 4 655 1286 174 85 28 chr2 9261400 9261588 -172486499 - RMER17C LTR ERVK -217 193 1 4 655 345 198 101 30 chr2 9292792 9292891 -172455196 + MTE2b LTR MaLR 226 331 -48 4 655 983 193 139 39 chr2 9302847 9303127 -172444960 + ORR1B2 LTR MaLR 28 335 -32 4 656 288 149 0 99 chr2 9308017 9308085 -172440002 + ORR1B1 LTR MaLR 266 394 0 4 656 981 258 132 13 chr2 9310933 9311251 -172436836 + ORR1E LTR MaLR 4 359 0 4 656 246 274 0 87 chr2 9311816 9311908 -172436179 + MLT1A0 LTR MaLR 11 94 -314 4 656 330 328 86 0 chr2 9312039 9312167 -172435920 + MLT1A0 LTR MaLR 175 313 -52 4 656 1263 242 10 23 chr2 9315215 9315519 -172432568 + MTEb LTR MaLR 76 375 -4 4 656 571 304 43 43 chr2 9322306 9322364 -172425723 - MLT1B LTR MaLR -156 234 178 4 656 571 304 43 43 chr2 9322495 9322670 -172425417 - MLT1B LTR MaLR -213 177 1 4 656 1493 265 32 30 chr2 9334854 9335227 -172412860 - MTEa LTR MaLR -5 374 1 5 656 314 316 132 69 chr2 9336203 9336492 -172411595 - LTR82A LTR ERVL -495 377 71 5 656 639 171 35 6 chr2 9337471 9337619 -172410468 + ORR1B1 LTR MaLR 1 164 -214 5 656 1580 176 21 21 chr2 9339410 9339689 -172408398 + ORR1B1 LTR MaLR 116 394 0 5 656 288 271 0 144 chr2 9341903 9342028 -172406059 + MT2B LTR ERVL 151 257 -344 5 656 297 294 78 56 chr2 9347252 9347502 -172400585 + MTEa LTR MaLR 82 367 -12 5 656 317 298 364 63 chr2 9361330 9361563 -172386524 + MTE2a LTR MaLR 77 379 0 5 656 1197 265 80 21 chr2 9365943 9366282 -172381805 + ORR1E LTR MaLR 1 359 0 5 656 1401 203 51 30 chr2 9366732 9367103 -172380984 - MTE2a LTR MaLR 0 379 1 5 656 2486 84 12 0 chr2 9375983 9376306 -172371781 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 5 656 562 82 0 0 chr2 9376306 9376379 -172371708 - ORR1A2-int LTR MaLR 0 1963 1891 5 656 1627 201 103 14 chr2 9384531 9384889 -172363198 - MTD LTR MaLR -28 391 2 6 656 241 152 22 0 chr2 9390916 9390962 -172357125 + MLT1A1 LTR MaLR 350 396 -12 6 656 1029 141 91 5 chr2 9398613 9398812 -172349275 + MTC LTR MaLR 1 216 -205 6 656 1736 227 64 56 chr2 9400691 9401191 -172346896 + RMER19C LTR ERVK 108 611 0 6 656 813 241 30 21 chr2 9421269 9421502 -172326585 + MTEb LTR MaLR 136 370 -9 6 657 1612 219 44 12 chr2 9455613 9456019 -172292068 - MTD LTR MaLR 0 419 1 7 657 227 254 0 17 chr2 9457490 9457550 -172290537 + ORR1D2 LTR MaLR 33 91 -279 7 657 431 245 239 0 chr2 9471083 9471238 -172276849 + MTEb LTR MaLR 15 206 -173 7 657 381 250 83 0 chr2 9471333 9471453 -172276634 + MTEb LTR MaLR 210 339 -40 7 657 361 179 0 0 chr2 9471620 9471687 -172276400 + MTEb LTR MaLR 311 377 -2 7 657 492 265 41 29 chr2 9476171 9476342 -172271745 - MLT1B LTR MaLR -217 173 1 7 657 662 316 91 73 chr2 9477763 9478214 -172269873 + MLT1C LTR MaLR 1 459 -8 7 657 309 326 167 0 chr2 9505536 9505680 -172242407 + LTR16A LTR ERVL 257 424 -27 8 657 1096 241 94 3 chr2 9513189 9513476 -172234611 - MTE2a LTR MaLR -45 334 22 2 657 1082 234 100 7 chr2 9522196 9522476 -172225611 + MTD LTR MaLR 114 419 0 5 657 1122 244 44 35 chr2 9523583 9523902 -172224185 - RMER15 LTR ERVL 0 575 254 5 657 1870 147 46 0 chr2 9530849 9531176 -172216911 - ORR1B2 LTR MaLR -23 344 3 6 657 305 350 219 9 chr2 9545292 9545624 -172202463 - MLT1J LTR MaLR -53 459 59 1 657 764 247 144 57 chr2 9546811 9547164 -172200923 + MTD LTR MaLR 6 405 -14 1 657 1385 159 158 41 chr2 9565917 9566106 -172181981 - RMER17C LTR ERVK 0 410 216 1 657 1385 159 158 41 chr2 9566167 9566293 -172181794 - RMER17C LTR ERVK -195 215 51 1 657 1385 159 158 41 chr2 9566330 9566380 -172181707 - RMER17C LTR ERVK -360 50 1 1 658 775 244 32 80 chr2 9577080 9577329 -172170758 - MTEb LTR MaLR -118 261 25 1 658 232 168 112 56 chr2 9582556 9582663 -172165424 - RLTR25B LTR ERVK -519 509 397 1 658 421 288 131 57 chr2 9583777 9584060 -172164027 + MLT1J LTR MaLR 5 308 -204 1 658 233 270 0 16 chr2 9584241 9584305 -172163782 + MLT1J LTR MaLR 261 323 -182 1 658 425 333 52 44 chr2 9584351 9584697 -172163390 - MTEb LTR MaLR -10 369 2 1 658 343 336 34 20 chr2 9592476 9592622 -172155465 - ORR1E LTR MaLR -206 153 6 2 658 321 278 31 23 chr2 9594470 9594599 -172153488 + MLT1B LTR MaLR 258 387 -3 2 658 267 214 39 138 chr2 9609506 9609636 -172138451 + MLT1A1 LTR MaLR 292 408 0 2 658 3372 43 2 0 chr2 9618116 9618511 -172129576 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 658 398 231 54 152 chr2 9626355 9626539 -172121548 + MTEa LTR MaLR 208 376 -3 2 658 2998 131 96 47 chr2 9635356 9635910 -172112177 + RMER4B LTR ERVK 1 581 -4 2 658 426 332 5 32 chr2 9638347 9638537 -172109550 - MTE2b LTR MaLR -20 359 175 3 658 240 280 149 15 chr2 9638541 9638602 -172109485 - MT2A LTR ERVL -381 152 1 3 658 434 178 0 0 chr2 9638602 9638675 -172109412 - MTE2b LTR MaLR -306 73 1 3 658 711 221 156 151 chr2 9651334 9651686 -172096401 - ORR1D2 LTR MaLR -7 363 10 3 658 3512 20 2 8 chr2 9659451 9659849 -172088238 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 658 1061 224 106 41 chr2 9666751 9667091 -172080996 + ORR1D1 LTR MaLR 1 362 -12 3 658 376 295 68 17 chr2 9670238 9670414 -172077673 + ORR1E LTR MaLR 8 192 -167 3 658 269 318 102 9 chr2 9670516 9670624 -172077463 + ORR1E LTR MaLR 260 377 -2 3 658 924 271 83 39 chr2 9674156 9674517 -172073570 + MTE2a LTR MaLR 3 379 0 3 658 462 274 13 97 chr2 9680144 9680370 -172067717 - MLT1A LTR MaLR -157 217 11 3 658 906 279 131 21 chr2 9681064 9681401 -172066686 - MTEb LTR MaLR -3 376 3 3 658 438 273 65 24 chr2 9681444 9681613 -172066474 + MLT2B4 LTR ERVL 8 183 -373 3 658 241 285 181 31 chr2 9681614 9681741 -172066346 + MTE2b LTR MaLR 1 146 -233 3 658 322 259 16 72 chr2 9681939 9682064 -172066023 + MLT2B4 LTR ERVL 425 542 -18 3 658 1132 223 174 12 chr2 9684732 9684879 -172063208 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 218 4 658 1132 223 174 12 chr2 9684951 9685124 -172062963 - ORR1D1 LTR MaLR -157 217 2 4 658 568 326 98 7 chr2 9686031 9686306 -172061781 - RMER15 LTR ERVL -2 573 274 4 658 244 348 22 22 chr2 9687376 9687467 -172060620 - LTR81A LTR ERV1? -702 648 558 4 658 348 281 0 0 chr2 9693731 9693820 -172054267 - MLT1N2 LTR MaLR -75 487 399 4 658 231 299 0 29 chr2 9694416 9694485 -172053602 - ORR1E LTR MaLR -22 337 271 4 659 676 326 68 35 chr2 9704362 9704702 -172043385 - ORR1E LTR MaLR -8 351 1 4 659 395 314 131 34 chr2 9706207 9706382 -172041705 + ORR1E LTR MaLR 2 193 -166 4 659 363 253 11 0 chr2 9706816 9706907 -172041180 + ORR1E LTR MaLR 288 379 0 4 659 539 303 32 51 chr2 9825631 9825890 -171922197 - MTE2a LTR MaLR -5 365 90 7 659 288 249 50 17 chr2 9826188 9826288 -171921799 - MTE2a LTR MaLR -311 108 1 7 659 360 228 19 122 chr2 9826901 9827065 -171921022 - MT2B LTR ERVL -356 245 98 7 660 840 264 154 23 chr2 9843676 9843982 -171904105 + ORR1D2 LTR MaLR 25 370 0 8 660 889 329 15 18 chr2 9843982 9844325 -171903762 + ORR1D2-int LTR MaLR 1 342 -1028 8 660 552 264 124 37 chr2 9844733 9845032 -171903055 + ORR1D2-int LTR MaLR 335 659 -711 8 660 395 249 148 17 chr2 9845083 9845259 -171902828 + ORR1D2-int LTR MaLR 859 1057 -523 8 660 453 207 197 26 chr2 9846039 9846231 -171901856 + MTE2b LTR MaLR 86 323 -56 8 660 258 259 128 8 chr2 9860674 9860791 -171887296 + RMER10A LTR ERVL 310 440 -2 8 660 259 250 26 96 chr2 9880877 9880992 -171867095 + MLT1H2 LTR MaLR 80 186 -303 8 660 231 336 53 38 chr2 9881069 9881202 -171866885 + MLT1H2 LTR MaLR 383 517 -32 8 660 1372 222 47 30 chr2 9882323 9882685 -171865402 - MTE2a LTR MaLR -11 368 1 8 660 401 202 50 0 chr2 9884945 9885044 -171863043 + ORR1E LTR MaLR 1 104 -255 8 660 388 266 195 29 chr2 9885350 9885524 -171862563 + MTE-int LTR MaLR 168 370 -1210 8 660 1697 128 50 9 chr2 9887122 9887464 -171860623 + ORR1A2 LTR MaLR 1 386 -8 8 660 918 248 68 31 chr2 9888868 9889206 -171858881 + ORR1D2 LTR MaLR 1 347 -23 8 660 2341 128 214 11 chr2 9898589 9899138 -171848949 + RMER6A LTR ERVK 1 756 0 9 660 283 304 191 78 chr2 9918156 9918483 -171829604 + MLT1L LTR MaLR 173 542 -68 9 660 283 304 191 78 chr2 9918517 9918571 -171829516 + MLT1L LTR MaLR 543 596 -14 9 660 258 340 10 0 chr2 9936011 9936111 -171811976 - LTR40b LTR ERVL -32 430 330 9 660 747 291 107 14 chr2 9949401 9949746 -171798341 - MTE2b LTR MaLR -2 377 1 1 660 2480 81 16 0 chr2 9961060 9961382 -171786705 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 1 661 1483 194 156 91 chr2 9971571 9972022 -171776065 + MT2A LTR ERVL 1 462 -71 1 661 372 283 170 11 chr2 9972673 9972855 -171775232 - LTR16A LTR ERVL -12 439 229 1 661 1687 156 108 29 chr2 9973845 9974188 -171773899 + ORR1D1 LTR MaLR 5 374 0 1 661 229 116 93 0 chr2 9975193 9975236 -171772851 - MLT1B LTR MaLR -295 95 49 1 661 306 346 58 36 chr2 9976288 9976513 -171771574 - HERV16-int LTR ERVL -1933 3063 2834 1 661 1883 111 100 13 chr2 9981994 9982295 -171765792 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 1 661 6025 138 99 223 chr2 9982295 9984339 -171763748 + ORR1A2-int LTR MaLR 1 1790 -2 1 661 584 98 128 0 chr2 9984339 9984441 -171763646 + ORR1A2 LTR MaLR 36 150 -177 1 661 329 220 231 6 chr2 9989709 9989720 -171758367 + RMER17C LTR ERVK 204 214 -196 1 661 329 220 231 6 chr2 9989783 9989940 -171758147 + RMER17C LTR ERVK 215 409 -1 1 661 506 289 170 13 chr2 9989940 9990150 -171757937 - MTD LTR MaLR -122 297 51 1 661 385 296 0 0 chr2 9993410 9993508 -171754579 - RMER15 LTR ERVL -106 469 372 1 661 542 204 183 17 chr2 9995225 9995400 -171752687 + RMER21B LTR ERV1 366 569 -273 1 661 1399 145 174 27 chr2 9996275 9996608 -171751479 + RLTR9D LTR ERVK 21 402 -1 1 661 2202 116 22 0 chr2 10005677 10005996 -171742091 + ORR1A3 LTR MaLR 1 326 0 1 661 1627 131 28 0 chr2 10006527 10006817 -171741270 - RMER17B LTR ERVK -13 945 648 1 661 1290 121 24 0 chr2 10006798 10007005 -171741082 - RMER17B LTR ERVK -746 212 1 1 661 1441 132 7 50 chr2 10020535 10020815 -171727272 + ORR1C1 LTR MaLR 1 268 -110 4 661 529 368 113 20 chr2 10022550 10022958 -171725129 + LTR31 LTR ERV1 144 589 -30 5 661 304 279 46 26 chr2 10023376 10023527 -171724560 + MLT1A LTR MaLR 16 169 -205 5 661 2822 34 2 178 chr2 10033721 10034192 -171713895 + RLTR10 LTR ERVK 1 388 -2 7 661 809 267 51 142 chr2 10037505 10037920 -171710167 + MTE2a LTR MaLR 3 379 0 8 661 977 264 114 37 chr2 10039286 10039636 -171708451 - MTE2a LTR MaLR 0 379 3 9 661 241 302 83 16 chr2 10040482 10040603 -171707484 + MLT1C LTR MaLR 12 140 -365 9 661 313 275 17 13 chr2 10040794 10040900 -171707187 + MLT1C LTR MaLR 348 448 -19 9 661 2467 98 3 0 chr2 10041822 10042148 -171705939 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 9 661 387 286 198 22 chr2 10054222 10054540 -171693547 + MLT1A LTR MaLR 1 374 0 1 661 4192 87 19 14 chr2 10058418 10058999 -171689088 - MT2B2 LTR ERVL 0 584 1 1 661 1402 252 55 11 chr2 10060720 10061081 -171687006 + MTEa LTR MaLR 3 379 0 1 661 932 265 33 129 chr2 10064889 10065204 -171682883 + MTE2a LTR MaLR 6 289 -90 1 661 2034 138 123 3 chr2 10065204 10065554 -171682533 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 3 1 661 932 265 33 129 chr2 10065554 10065633 -171682454 + MTE2a LTR MaLR 290 362 -17 1 661 465 238 64 24 chr2 10066585 10066710 -171681377 + MLT1D LTR MaLR 31 160 -345 1 661 837 247 22 18 chr2 10068250 10068473 -171679614 - ORR1D2 LTR MaLR -83 287 64 1 661 555 197 111 106 chr2 10069363 10069562 -171678525 - MTE2b LTR MaLR -12 367 168 1 661 597 282 24 24 chr2 10069906 10070073 -171678014 - MTE2b LTR MaLR -196 183 17 1 661 2595 140 56 10 chr2 10085487 10085991 -171662096 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 527 0 1 661 599 331 26 49 chr2 10088250 10088638 -171659449 - MER74B LTR ERVL -111 511 64 1 662 2118 94 7 0 chr2 10093747 10094055 -171654032 - ORR1A2 LTR MaLR -14 313 4 2 662 308 155 36 39 chr2 10098698 10098798 -171649289 + RMER21A LTR ERV1 466 538 -409 2 662 4495 14 2 0 chr2 10098802 10099294 -171648793 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 2 662 321 0 0 0 chr2 10099294 10099332 -171648755 - MERVL-int LTR ERVL 0 5485 5448 2 662 362 167 46 35 chr2 10099332 10099419 -171648668 - ORR1A3-int LTR MaLR -1323 640 553 2 662 7360 31 1 0 chr2 10099419 10100257 -171647830 - MERVL-int LTR ERVL -125 5360 4522 2 662 38994 13 8 0 chr2 10100257 10104529 -171643558 - MERVL-int LTR ERVL -1180 4305 1 2 662 4495 14 2 0 chr2 10104529 10105021 -171643066 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 2 662 533 315 110 37 chr2 10108919 10109301 -171638786 + LTR65 LTR ERV1 168 577 -92 2 662 306 283 28 9 chr2 10109541 10109648 -171638439 + LTR65 LTR ERV1 542 650 -19 2 662 495 263 84 142 chr2 10111207 10111553 -171636534 - ORR1E LTR MaLR -32 327 2 2 662 3423 136 45 4 chr2 10116152 10116704 -171631383 - RMER15 LTR ERVL 0 575 1 2 662 666 280 95 0 chr2 10118041 10118230 -171629857 + MTEb LTR MaLR 3 209 -170 2 662 1790 178 11 75 chr2 10118246 10118622 -171629465 - ORR1D1 LTR MaLR -6 368 17 2 662 561 261 36 0 chr2 10118634 10118772 -171629315 + MTEb LTR MaLR 232 374 -5 2 662 1670 151 8 136 chr2 10118905 10119281 -171628806 + ORR1A4 LTR MaLR 1 328 -1 2 662 1004 279 58 0 chr2 10121839 10122150 -171625937 - MTEa LTR MaLR -52 327 1 2 662 960 260 134 6 chr2 10123581 10123910 -171624177 + MTEa LTR MaLR 1 371 -8 2 662 1131 253 105 0 chr2 10126953 10127249 -171620838 + MTE2b LTR MaLR 2 328 -51 2 662 382 257 106 51 chr2 10129402 10129558 -171618529 + MTE2a LTR MaLR 59 205 -174 2 662 2856 153 19 30 chr2 10132076 10132609 -171615478 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 527 0 2 662 1050 266 78 45 chr2 10139077 10139435 -171608652 + MTE2a LTR MaLR 2 371 -8 2 662 496 294 84 57 chr2 10142054 10142353 -171605734 - ORR1E LTR MaLR -2 357 51 2 662 454 256 58 0 chr2 10142679 10142800 -171605287 + MTEa LTR MaLR 1 128 -251 2 662 411 257 59 158 chr2 10142930 10143184 -171604903 + MTEa LTR MaLR 151 379 0 2 662 467 336 24 78 chr2 10146072 10146407 -171601680 - ORR1E LTR MaLR -42 317 1 2 662 1182 212 114 32 chr2 10151303 10151619 -171596468 - MTE2b LTR MaLR -6 373 32 3 662 2177 137 20 87 chr2 10155407 10155800 -171592287 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 3 662 1201 253 113 53 chr2 10168121 10168476 -171579611 - MTE2a LTR MaLR -3 376 1 3 662 534 278 63 138 chr2 10168605 10168968 -171579119 + ORR1E LTR MaLR 7 342 -17 3 662 333 312 100 103 chr2 10169942 10170118 -171577969 - ORR1E LTR MaLR -10 349 189 3 662 1936 138 110 22 chr2 10170118 10170482 -171577605 - RMER10B LTR ERVL 0 398 3 3 662 333 312 100 103 chr2 10170482 10170655 -171577432 - ORR1E LTR MaLR -171 188 1 3 662 357 301 107 59 chr2 10177306 10177493 -171570594 + MLT1A1 LTR MaLR 199 394 -14 3 662 1007 228 58 64 chr2 10178717 10179063 -171569024 + ORR1D2 LTR MaLR 1 344 -26 3 662 1570 214 47 89 chr2 10179476 10179902 -171568185 - MTD LTR MaLR -1 418 11 3 662 1215 249 65 79 chr2 10186910 10187294 -171560793 - MTE2a LTR MaLR 0 374 1 3 662 3354 26 37 0 chr2 10191177 10191559 -171556528 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 662 618 319 45 16 chr2 10193661 10193903 -171554184 - MLT1C LTR MaLR -177 290 42 3 662 1488 224 10 119 chr2 10193903 10194313 -171553774 + MTE2a LTR MaLR 1 365 -14 3 662 2719 110 7 65 chr2 10194430 10194858 -171553229 + RLTR9D LTR ERVK 1 403 0 3 662 1607 193 69 66 chr2 10195645 10196022 -171552065 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 3 662 244 382 33 13 chr2 10202884 10203035 -171545052 + MLT2D LTR ERVL 191 344 -70 4 662 234 268 95 73 chr2 10203067 10203204 -171544883 + LTR33B LTR ERVL 357 496 -7 4 662 2681 82 212 5 chr2 10204791 10205221 -171542866 + MURVY-LTR LTR ERV1 1 519 0 4 662 575 279 84 111 chr2 10219551 10219885 -171528202 + ORR1E LTR MaLR 18 342 -17 4 662 694 270 127 4 chr2 10222589 10222864 -171525223 - MTE2b LTR MaLR -52 327 19 4 663 233 227 0 0 chr2 10228958 10229002 -171519085 - MLT1J LTR MaLR -201 311 268 4 663 376 350 0 25 chr2 10229088 10229208 -171518879 - MLT1J LTR MaLR -290 222 106 4 663 390 238 115 65 chr2 10229982 10230121 -171517966 - MLT2B1 LTR ERVL -91 476 322 4 663 1322 237 10 79 chr2 10233421 10233815 -171514272 + ORR1D2 LTR MaLR 4 370 0 4 663 832 213 207 8 chr2 10240852 10240990 -171507097 + ORR1D1 LTR MaLR 25 164 -210 4 663 832 213 207 8 chr2 10241133 10241240 -171506847 + ORR1D1 LTR MaLR 165 318 -56 4 663 353 265 29 10 chr2 10243765 10243868 -171504219 + ORR1D2 LTR MaLR 258 362 -8 4 663 2871 116 78 8 chr2 10244123 10244636 -171503451 - RMER15 LTR ERVL 0 575 27 4 663 245 244 333 11 chr2 10246305 10246392 -171501695 - MTEa LTR MaLR -127 252 138 4 663 325 258 0 110 chr2 10247584 10247693 -171500394 - MT2B LTR ERVL -343 258 162 5 663 290 282 159 6 chr2 10248771 10248928 -171499159 - MTD LTR MaLR -16 403 223 5 663 285 346 49 31 chr2 10249449 10249673 -171498414 - MLT1J2 LTR MaLR -215 233 6 5 663 636 295 78 29 chr2 10251770 10252082 -171496005 - ORR1E LTR MaLR -9 370 10 5 663 1056 255 63 30 chr2 10268792 10269156 -171478931 - MTEb LTR MaLR -3 376 1 5 663 1151 254 50 73 chr2 10273673 10273835 -171474252 + MTD LTR MaLR 45 202 -217 5 663 1151 254 50 73 chr2 10274048 10274266 -171473821 + MTD LTR MaLR 203 416 -3 5 663 859 279 40 103 chr2 10283528 10283927 -171464160 + MTE2a LTR MaLR 6 379 0 5 663 2548 153 2 42 chr2 10286617 10287089 -171460998 - RLTR11B LTR ERVK 0 453 1 6 663 279 372 43 39 chr2 10300859 10301066 -171447021 - ORR1E LTR MaLR -120 239 32 6 663 822 253 48 89 chr2 10305544 10305956 -171442131 - MTE2a LTR MaLR 0 419 18 6 663 2454 86 6 0 chr2 10312939 10313264 -171434823 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 6 663 833 300 61 13 chr2 10321347 10321658 -171426429 - MTEa LTR MaLR -53 326 1 6 663 489 237 82 29 chr2 10330080 10330277 -171417810 - MTE2a LTR MaLR -5 374 151 6 663 400 266 34 114 chr2 10330279 10330507 -171417580 - MTE2a LTR MaLR -156 223 8 6 663 226 223 80 176 chr2 10332855 10332980 -171415107 - MT2B2 LTR ERVL -319 265 153 6 663 882 241 216 11 chr2 10339155 10339503 -171408584 + MTD LTR MaLR 1 419 0 7 663 644 280 37 14 chr2 10342843 10343057 -171405030 - ORR1E LTR MaLR -86 273 55 7 663 245 238 162 0 chr2 10345456 10345467 -171402620 - MT2A LTR ERVL -438 95 3 7 663 375 159 29 0 chr2 10345467 10345536 -171402551 - ORR1E LTR MaLR -306 73 3 7 663 228 160 40 0 chr2 10346752 10346802 -171401285 + ORR1D1 LTR MaLR 3 54 -316 7 663 551 241 196 93 chr2 10346804 10347212 -171400875 - RMER4A LTR ERVK 0 466 17 7 663 568 168 130 23 chr2 10347223 10347400 -171400687 + ORR1D1 LTR MaLR 55 250 -124 7 663 806 280 99 36 chr2 10350457 10350850 -171397237 - MLT2B4 LTR ERVL -125 431 14 7 664 297 287 65 72 chr2 10365169 10365308 -171382779 - MLT1B LTR MaLR -34 356 219 7 664 410 254 51 26 chr2 10366026 10366143 -171381944 - MTEb LTR MaLR -10 369 250 7 664 242 268 0 104 chr2 10369991 10370087 -171378000 - MLT1D LTR MaLR -4 501 416 7 664 234 276 62 128 chr2 10370213 10370408 -171377679 - MLT1D LTR MaLR -129 261 80 7 664 3380 70 8 16 chr2 10374784 10375278 -171372809 - RLTR1C LTR ERV1 -13 490 1 7 664 229 400 32 13 chr2 10393824 10393981 -171354106 - RMER12 LTR ERVK -425 897 738 8 664 252 357 51 0 chr2 10430294 10430392 -171317695 + RMER12 LTR ERVK 749 851 -471 9 664 435 260 197 15 chr2 10449421 10449690 -171298397 - MTE2a LTR MaLR -5 374 57 1 664 767 212 214 19 chr2 10453029 10453346 -171294741 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 6 1 665 263 315 56 0 chr2 10485800 10485889 -171262198 - RMER15 LTR ERVL -111 464 371 1 665 589 267 287 27 chr2 10498655 10498955 -171249132 - MTE2b LTR MaLR 0 379 2 1 665 638 275 93 5 chr2 10502962 10503156 -171244931 - MTD LTR MaLR -17 402 192 8 665 504 211 83 43 chr2 10517034 10517233 -171230854 - MTD LTR MaLR -7 412 209 2 665 2726 156 66 25 chr2 10521900 10522412 -171225675 - RMER16 LTR ERVK 0 533 1 2 665 2398 95 3 63 chr2 10524898 10525246 -171222841 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 3 665 2766 116 39 28 chr2 10527802 10528238 -171219849 - BGLII_B LTR ERVK 0 441 1 3 665 568 156 117 0 chr2 10528245 10528373 -171219714 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -28 2298 2156 3 665 1933 164 61 0 chr2 10529268 10529610 -171218477 + RLTR30 LTR ERV1 12 374 -5 3 665 294 325 123 0 chr2 10529702 10529816 -171218271 + MTEa LTR MaLR 1 128 -251 4 665 956 278 52 7 chr2 10529994 10530266 -171217821 + MT2A LTR ERVL 242 525 -8 4 665 321 282 0 0 chr2 10533866 10533937 -171214150 + MTEa LTR MaLR 201 271 -108 4 665 760 290 111 99 chr2 10536285 10536618 -171211469 + MTEa LTR MaLR 39 375 -4 5 665 335 342 42 25 chr2 10538482 10538602 -171209485 - MLT1A0 LTR MaLR -103 262 141 6 665 602 322 66 20 chr2 10539320 10539564 -171208523 - MLT1A0 LTR MaLR -106 259 5 6 665 977 263 44 117 chr2 10541086 10541495 -171206592 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 6 665 1435 276 32 37 chr2 10543972 10544379 -171203708 + MTD LTR MaLR 1 405 -14 7 665 2192 209 77 10 chr2 10546883 10546921 -171201166 - MT2A LTR ERVL -6 527 490 7 665 2192 209 77 10 chr2 10546978 10547433 -171200654 - MT2A LTR ERVL -44 489 1 7 665 418 301 120 67 chr2 10549951 10550218 -171197869 - ORR1E LTR MaLR -2 357 77 8 665 547 255 14 21 chr2 10564716 10564860 -171183227 - MTD LTR MaLR -268 151 9 9 665 2315 72 7 0 chr2 10571005 10571310 -171176777 + ORR1A2 LTR MaLR 2 308 -19 1 665 710 291 60 60 chr2 10571607 10571922 -171176165 - MLT1B LTR MaLR -75 315 1 1 665 2516 66 119 11 chr2 10573364 10573716 -171174371 - RLTR10 LTR ERVK 0 390 1 1 665 486 332 83 9 chr2 10574763 10574979 -171173108 + MLT1A LTR MaLR 137 368 -6 1 665 238 310 0 0 chr2 10576005 10576076 -171172011 + MTEa LTR MaLR 295 365 -14 1 665 459 252 62 16 chr2 10579695 10579824 -171168263 - MTEb LTR MaLR -11 368 234 1 665 769 301 15 0 chr2 10581783 10581979 -171166108 - MLT1D LTR MaLR -5 500 302 1 665 763 277 120 49 chr2 10587521 10587823 -171160264 - MLT1B LTR MaLR -1 389 65 1 665 1218 244 105 22 chr2 10587823 10588138 -171159949 + ORR1D2 LTR MaLR 1 341 -29 1 665 3160 26 29 0 chr2 10588438 10588538 -171159549 + MTA_Mm LTR MaLR 1 100 -296 1 665 3160 26 29 0 chr2 10588977 10589261 -171158826 + MTA_Mm LTR MaLR 101 394 -2 1 665 2402 135 30 20 chr2 10589466 10589859 -171158228 - RLTR9D LTR ERVK -6 397 1 1 665 3181 67 23 5 chr2 10590424 10590817 -171157270 + MTB LTR MaLR 1 400 0 1 665 1383 275 71 21 chr2 10591087 10591566 -171156521 + RMER5 LTR ERV1 32 534 0 1 665 1577 246 40 13 chr2 10594516 10594895 -171153192 + MTD LTR MaLR 1 389 -30 1 665 889 265 58 140 chr2 10607370 10607783 -171140304 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 1 665 255 298 8 123 chr2 10609489 10609506 -171138581 + MT2B LTR ERVL 150 151 -450 1 665 1221 183 84 90 chr2 10612472 10612827 -171135260 + ORR1C1 LTR MaLR 26 378 0 1 665 321 187 53 0 chr2 10613140 10613215 -171134872 - MTEa LTR MaLR -8 371 293 1 666 1130 270 48 16 chr2 10619397 10619706 -171128381 - MTEa LTR MaLR -59 320 2 1 666 437 334 84 74 chr2 10619928 10620332 -171127755 - MLT1C LTR MaLR 0 467 60 1 666 234 271 0 28 chr2 10623615 10623687 -171124400 + ORR1E LTR MaLR 1 70 -289 1 666 330 266 10 21 chr2 10627852 10627948 -171120139 + MTEa LTR MaLR 285 379 0 1 666 332 318 204 19 chr2 10628096 10628365 -171119722 + MLT1C LTR MaLR 67 385 -82 1 666 268 362 37 16 chr2 10630517 10630705 -171117382 + MLT1C LTR MaLR 224 415 -52 1 666 592 330 50 78 chr2 10632824 10633206 -171114881 - MLT1A0 LTR MaLR -3 371 1 1 666 1050 278 41 18 chr2 10634066 10634406 -171113681 + ORR1E LTR MaLR 9 356 -3 1 666 1894 149 12 21 chr2 10635640 10635968 -171112119 + ORR1A2 LTR MaLR 3 327 0 1 666 1216 281 40 3 chr2 10636630 10636955 -171111132 + MTE2b LTR MaLR 3 339 -40 1 666 225 242 0 16 chr2 10638266 10638329 -171109758 - MTD LTR MaLR -23 356 295 2 666 942 252 20 16 chr2 10642868 10643076 -171105011 - MTD LTR MaLR -210 209 1 2 666 448 288 93 44 chr2 10649678 10650018 -171098069 + MLT2B4 LTR ERVL 1 374 -40 2 666 1251 220 94 12 chr2 10653871 10654212 -171093875 + ORR1D1 LTR MaLR 2 370 -4 2 666 1249 207 72 81 chr2 10660269 10660715 -171087372 + RMER10A LTR ERVL 1 442 0 2 666 1504 177 39 0 chr2 10662046 10662328 -171085759 + MT2A LTR ERVL 1 293 -240 2 666 1330 163 4 4 chr2 10662330 10662576 -171085511 - RLTR11B LTR ERVK -1 452 207 2 666 920 185 139 0 chr2 10662613 10662829 -171085258 + MT2A LTR ERVL 288 533 0 2 666 798 272 54 85 chr2 10663373 10663733 -171084354 + ORR1E LTR MaLR 3 372 -7 2 666 327 299 43 21 chr2 10670711 10670802 -171077285 + MTEb LTR MaLR 2 94 -265 2 666 328 322 370 24 chr2 10670841 10671053 -171077034 + MTEb LTR MaLR 95 379 0 2 666 747 322 101 11 chr2 10671053 10671403 -171076684 + MER74A LTR ERVL 144 525 -33 2 666 1077 266 42 25 chr2 10684760 10685119 -171062968 - MTE2b LTR MaLR -9 370 6 2 666 2094 192 19 17 chr2 10687150 10687569 -171060518 - MTC LTR MaLR -1 420 1 3 666 1112 265 111 3 chr2 10692287 10692620 -171055467 - MTEa LTR MaLR -2 377 9 3 666 1017 252 152 51 chr2 10698822 10699270 -171048817 + RMER5 LTR ERV1 33 525 -9 3 666 609 200 26 105 chr2 10701143 10701333 -171046754 + MLT1B LTR MaLR 188 362 -28 3 666 570 316 87 26 chr2 10702166 10702478 -171045609 - MLT1A0 LTR MaLR -32 333 3 3 666 1595 226 46 5 chr2 10704399 10704790 -171043297 + MTD LTR MaLR 5 411 -8 3 666 707 156 16 50 chr2 10705951 10706133 -171041954 - RMER17C LTR ERVK -234 176 1 3 666 248 158 112 17 chr2 10713967 10714083 -171034004 + RMER17C LTR ERVK 181 307 -103 3 666 1782 246 137 24 chr2 10717219 10717810 -171030277 + RMER13A LTR ERVK 1 658 -202 3 666 229 211 0 0 chr2 10718085 10718137 -171029950 - RMER13A LTR ERVK -808 52 1 3 666 1115 267 27 107 chr2 10718759 10719170 -171028917 + MTEa LTR MaLR 2 379 0 3 666 766 274 55 70 chr2 10721717 10722064 -171026023 + MTE2a LTR MaLR 39 374 0 3 666 1820 189 26 47 chr2 10722896 10723278 -171024809 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 3 666 239 316 140 0 chr2 10727089 10727203 -171020884 + ORR1E LTR MaLR 4 133 -226 3 666 363 301 54 19 chr2 10727423 10727590 -171020497 + MLT1B LTR MaLR 66 251 -216 3 666 459 359 11 16 chr2 10730484 10730668 -171017419 + MTD LTR MaLR 5 187 -232 3 666 416 256 0 239 chr2 10730745 10730904 -171017183 - MTE-int LTR MaLR -578 1002 843 3 666 664 290 92 31 chr2 10731839 10732188 -171015899 - MER34A LTR ERV1 -3 568 199 3 666 602 259 47 24 chr2 10738168 10738338 -171009749 - MTEa LTR MaLR -203 176 3 4 666 2147 86 15 31 chr2 10738920 10739244 -171008843 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 4 83 246 331 133 28 chr2 10747885 10748028 -171000059 + MLT2B4 LTR ERVL 1 158 -398 4 667 370 276 123 38 chr2 10748069 10748304 -170999783 + MLT2B4 LTR ERVL 285 556 -4 4 667 357 300 49 14 chr2 10750525 10750667 -170997420 - MTD LTR MaLR -272 147 1 4 667 549 345 41 78 chr2 10751100 10751640 -170996447 + MT2A LTR ERVL 1 520 -13 4 667 3645 23 5 0 chr2 10754370 10754764 -170993323 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 667 676 346 57 12 chr2 10758957 10759290 -170988797 + LTR73 LTR ERV1 4 351 -221 4 667 358 364 18 24 chr2 10765997 10766166 -170981921 + MLT1C LTR MaLR 4 171 -219 4 667 454 300 0 68 chr2 10766161 10766322 -170981765 + MLT1C LTR MaLR 302 451 -16 4 667 1673 214 41 16 chr2 10768340 10768705 -170979382 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 4 667 1186 271 15 83 chr2 10768717 10769055 -170979032 + ORR1E LTR MaLR 45 359 0 4 667 1332 255 32 108 chr2 10769061 10769469 -170978618 + MTE2a LTR MaLR 3 379 0 4 667 302 224 58 11 chr2 10775887 10776002 -170972085 - MLT1A0 LTR MaLR -216 158 39 4 667 1158 190 94 116 chr2 10777014 10777385 -170970702 + MT2A LTR ERVL 1 363 -170 4 667 339 341 52 46 chr2 10777665 10777988 -170970099 + MTEb LTR MaLR 55 379 0 4 667 1258 238 72 56 chr2 10778428 10778788 -170969299 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 5 4 667 332 261 65 0 chr2 10782066 10782158 -170965929 + MER74A LTR ERVL 49 146 -412 4 667 659 304 82 71 chr2 10787146 10787514 -170960573 + MTEa LTR MaLR 3 374 -5 4 667 625 232 0 124 chr2 10796946 10797148 -170950939 - MTE2b LTR MaLR -16 363 187 5 667 579 184 59 5 chr2 10797166 10797284 -170950803 - ORR1B1 LTR MaLR -98 296 179 5 667 1529 232 86 11 chr2 10797284 10797738 -170950349 + RMER19C LTR ERVK 1 564 -47 5 667 253 116 0 0 chr2 10799310 10799353 -170948734 + RMER19C LTR ERVK 569 611 0 5 667 944 164 68 0 chr2 10799353 10799530 -170948557 - ORR1B1 LTR MaLR -205 189 1 5 667 759 222 7 0 chr2 10799530 10799683 -170948404 - ORR1E LTR MaLR -198 161 8 5 667 1349 249 72 6 chr2 10799888 10800079 -170948008 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 183 5 667 1349 249 72 6 chr2 10800134 10800302 -170947785 - ORR1C2 LTR MaLR -202 182 2 5 667 577 241 13 70 chr2 10807141 10807297 -170940790 - ORR1E LTR MaLR -192 167 21 5 667 1247 139 0 0 chr2 10807776 10807963 -170940124 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 221 5 667 3380 26 0 81 chr2 10808670 10809092 -170938995 - RLTR10 LTR ERVK -2 388 1 5 667 14239 23 2 1 chr2 10809092 10811118 -170936969 - RLTR10-int LTR ERVK -1 1986 1 5 667 3394 28 0 80 chr2 10811118 10811542 -170936545 - RLTR10 LTR ERVK 0 390 1 5 667 3270 51 23 3 chr2 10812428 10812819 -170935268 + MTB LTR MaLR 2 400 0 5 667 883 207 37 51 chr2 10820900 10821114 -170926973 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 164 5 667 726 207 64 96 chr2 10821214 10821401 -170926686 - ORR1D1 LTR MaLR -193 181 1 5 667 886 238 56 101 chr2 10824560 10824915 -170923172 + ORR1E LTR MaLR 1 339 -20 5 667 2405 133 10 0 chr2 10826034 10826426 -170921661 + RMER12 LTR ERVK 372 767 -555 5 667 2086 183 62 5 chr2 10834159 10834532 -170913555 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 5 667 561 241 161 10 chr2 10836478 10836557 -170911530 - RLTR20D LTR ERVK -3 565 479 5 667 965 175 138 20 chr2 10836597 10836868 -170911219 - RLTR20D LTR ERVK -90 478 107 5 667 909 309 97 46 chr2 10842636 10843246 -170904841 + MER76 LTR ERVL 51 691 0 6 667 910 273 83 18 chr2 10850046 10850322 -170897765 - MTE2a LTR MaLR -85 294 1 6 667 2362 165 33 19 chr2 10864127 10864553 -170883534 + RLTR20B2 LTR ERVK 1 432 -128 6 667 257 261 45 30 chr2 10864606 10864673 -170883414 + RLTR20B2 LTR ERVK 492 559 -4 6 667 1043 302 24 19 chr2 10875340 10875714 -170872373 - MTEa LTR MaLR -2 377 2 6 667 343 286 27 89 chr2 10875764 10875851 -170872236 - MLT1C LTR MaLR -308 159 77 6 667 343 286 27 89 chr2 10875998 10876056 -170872031 - MLT1C LTR MaLR -391 76 23 6 667 271 206 68 37 chr2 10877639 10877800 -170870287 - RMER17D LTR ERVK -479 410 245 6 668 402 392 16 37 chr2 10881618 10881806 -170866281 - MLT1G LTR MaLR -201 390 207 6 668 238 357 86 21 chr2 10882227 10882413 -170865674 - MLT1G LTR MaLR -332 223 26 6 668 717 287 91 17 chr2 10889239 10889590 -170858497 + MTEa LTR MaLR 1 377 -2 6 668 548 311 64 15 chr2 10892528 10892730 -170855357 - ORR1E LTR MaLR -143 216 5 6 668 618 267 106 41 chr2 10898418 10898797 -170849290 - MLT2B4 LTR ERVL -35 532 47 6 668 797 245 80 90 chr2 10902279 10902686 -170845401 + MT2A LTR ERVL 1 541 -60 7 668 417 292 23 8 chr2 10904444 10904575 -170843512 + ORR1D2 LTR MaLR 238 370 0 7 668 435 168 18 90 chr2 10906897 10907008 -170841079 + MT2B LTR ERVL 155 257 -344 7 668 2169 124 3 9 chr2 10910395 10910744 -170837343 - RLTR15 LTR ERVK 0 359 13 7 668 367 333 25 62 chr2 10912285 10912525 -170835562 - MLT1H LTR MaLR -297 252 22 7 668 1312 267 21 21 chr2 10914040 10914419 -170833668 + MTEa LTR MaLR 1 379 0 7 668 560 308 68 35 chr2 10915243 10915553 -170832534 + MER90a LTR ERV1 289 608 -6 7 668 640 283 173 67 chr2 10918200 10918541 -170829546 - MTEa LTR MaLR 0 379 3 7 668 237 273 36 4 chr2 10921545 10921659 -170826428 + MLT1A LTR MaLR 40 158 -216 7 668 1017 273 53 25 chr2 10921726 10921741 -170826346 - MTE2b LTR MaLR -3 376 361 7 668 1017 273 53 25 chr2 10921859 10922200 -170825887 - MTE2b LTR MaLR -19 360 11 7 668 607 333 42 17 chr2 10924644 10924931 -170823156 - MLT1A0 LTR MaLR -63 302 9 7 668 312 300 15 44 chr2 10929116 10929252 -170818835 + LTR65 LTR ERV1 4 135 -534 7 668 516 280 157 26 chr2 10929556 10929824 -170818263 + LTR65 LTR ERV1 208 510 -159 7 668 801 225 31 109 chr2 10930226 10930575 -170817512 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 322 0 7 668 1817 95 85 31 chr2 10935383 10935676 -170812411 - RLTR27 LTR ERVK 0 309 1 7 668 1069 245 110 3 chr2 10936851 10937187 -170810900 - MTEb LTR MaLR -5 374 3 7 668 649 317 57 82 chr2 10938008 10938376 -170809711 - ORR1E LTR MaLR 0 359 1 7 668 852 212 67 34 chr2 10940678 10940947 -170807140 - RLTR13D6 LTR ERVK -12 890 613 7 668 2696 127 37 39 chr2 10942973 10943456 -170804631 + RLTR45 LTR ERVK 1 482 0 7 668 1643 242 53 7 chr2 10947726 10948138 -170799949 - BGLII_B LTR ERVK -10 431 1 7 668 3558 205 74 9 chr2 10948203 10949099 -170798988 - MYSERV-int LTR ERVK -60 6490 5537 7 668 3080 79 7 2 chr2 10949663 10950082 -170798005 + BGLII LTR ERVK 1 421 0 7 668 692 171 92 107 chr2 10951138 10951400 -170796687 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -998 1328 1071 7 668 291 191 64 106 chr2 10951422 10951516 -170796571 - RMER4A LTR ERVK -47 419 330 7 668 1174 220 129 49 chr2 10957802 10958189 -170789898 + MTD LTR MaLR 2 419 0 7 668 2715 151 40 22 chr2 10958354 10958850 -170789237 + RLTR16 LTR ERVK 1 505 0 7 668 345 276 53 26 chr2 10958887 10959021 -170789066 - MLT1I LTR MaLR -277 235 82 7 668 331 269 147 45 chr2 10959268 10959424 -170788663 + MLT1A LTR MaLR 203 374 0 7 668 329 331 228 12 chr2 10961391 10961645 -170786442 + MER70B LTR ERVL 114 422 -156 7 668 264 287 0 218 chr2 10962634 10962663 -170785424 - MT2B LTR ERVL -323 275 150 8 668 593 292 21 11 chr2 10963973 10964160 -170783927 - RMER15 LTR ERVL -111 464 276 8 668 677 245 227 33 chr2 10964944 10965248 -170782839 - MLT1A LTR MaLR -11 363 1 8 668 1122 192 35 9 chr2 10965904 10966130 -170781957 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 153 8 668 959 176 24 0 chr2 10966292 10966447 -170781640 - ORR1C2 LTR MaLR -220 164 6 8 668 227 184 0 0 chr2 10967174 10967212 -170780875 + MER34A LTR ERV1 1 38 -533 8 668 507 263 74 91 chr2 10967246 10967476 -170780611 + MER34A LTR ERV1 13 238 -333 8 668 695 152 56 0 chr2 10967483 10967608 -170780479 + ORR1C2 LTR MaLR 253 384 0 8 668 645 349 23 103 chr2 10970869 10971259 -170776828 + ORR1E LTR MaLR 1 359 0 8 668 228 284 55 9 chr2 10974669 10974779 -170773308 - ORR1E LTR MaLR -172 187 73 8 668 380 245 182 7 chr2 10980648 10980796 -170767291 - LTR48 LTR ERV1 -106 681 508 8 668 446 335 57 69 chr2 10989427 10989776 -170758311 + ORR1E LTR MaLR 10 354 -5 8 668 367 194 353 29 chr2 10990594 10990750 -170757337 - MTE2a LTR MaLR 0 379 177 8 668 3554 80 2 19 chr2 10990783 10991266 -170756821 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 1 8 668 3657 86 22 0 chr2 10991266 10991768 -170756319 - MT2B2 LTR ERVL -71 513 1 8 668 1879 189 96 20 chr2 11001062 11001553 -170746534 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 1 3 668 1008 273 34 68 chr2 11005988 11006369 -170741718 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 3 9 669 2251 79 6 0 chr2 11011105 11011422 -170736665 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 2 669 2908 72 20 15 chr2 11014330 11014533 -170733554 - MTB LTR MaLR 0 400 197 2 669 2908 72 20 15 chr2 11014700 11014873 -170733214 - MTB LTR MaLR -204 196 23 2 669 2908 72 20 15 chr2 11014916 11014936 -170733151 - MTB LTR MaLR -378 22 2 2 669 905 277 35 99 chr2 11015965 11016370 -170731717 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 2 669 3057 83 64 13 chr2 11026447 11026899 -170721188 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 4 669 3305 85 32 36 chr2 11026900 11027809 -170720278 + IAPEz-int LTR ERVK 9 662 -5819 4 669 2807 58 0 3 chr2 11027809 11028155 -170719932 + IAPEz-int LTR ERVK 1359 1703 -4778 4 669 6823 44 2 24 chr2 11028147 11028992 -170719095 + IAPEz-int LTR ERVK 5653 6479 -2 4 669 2929 93 26 76 chr2 11028994 11029494 -170718593 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 4 669 2021 180 32 5 chr2 11034579 11034981 -170713106 + MTC LTR MaLR 1 413 -8 6 669 454 274 8 0 chr2 11036404 11036521 -170711566 + MLT1A0 LTR MaLR 248 365 0 6 669 250 269 0 93 chr2 11036751 11036837 -170711250 - RMER21B LTR ERV1 -109 733 656 6 669 696 277 100 14 chr2 11036858 11037147 -170710940 - RMER21B LTR ERV1 -275 567 254 6 669 383 332 66 58 chr2 11040324 11040688 -170707399 + MLT1F-int LTR MaLR 1115 1481 -8 7 669 370 238 140 14 chr2 11041088 11041246 -170706841 - MTD LTR MaLR -39 380 226 7 669 247 227 69 40 chr2 11041248 11041349 -170706738 - MTD LTR MaLR -315 106 3 7 669 368 344 22 5 chr2 11055957 11056141 -170691946 + MER90 LTR ERV1 3 189 -386 9 669 331 326 42 0 chr2 11056343 11056438 -170691649 + MER90 LTR ERV1 516 614 0 9 669 426 320 88 56 chr2 11057377 11057718 -170690369 + ORR1E LTR MaLR 3 354 -5 9 669 560 278 72 20 chr2 11057722 11057917 -170690170 - MER67A LTR ERV1 -258 285 81 9 669 359 307 41 47 chr2 11062748 11062919 -170685168 + MER110A LTR ERV1 58 227 -241 1 669 568 322 78 26 chr2 11063686 11063957 -170684130 - MER110A LTR ERV1 -126 342 58 1 669 408 290 38 31 chr2 11064562 11064722 -170683365 - LTR82A LTR ERVL -21 851 691 1 669 361 359 28 5 chr2 11064952 11065165 -170682922 - LTR82A LTR ERVL -499 373 156 1 669 565 226 12 175 chr2 11066857 11067109 -170680978 - MTEa LTR MaLR -7 372 162 1 669 536 245 41 14 chr2 11067363 11067508 -170680579 - MTEa LTR MaLR -229 150 2 1 669 606 313 97 3 chr2 11075790 11076101 -170671986 + MLT1B LTR MaLR 35 374 -16 1 669 375 318 66 44 chr2 11076797 11077024 -170671063 - ORR1E LTR MaLR -127 232 1 1 669 1851 134 25 72 chr2 11077342 11077705 -170670382 + ORR1B1 LTR MaLR 41 386 -8 1 669 2424 144 25 5 chr2 11078793 11079197 -170668890 + MTC LTR MaLR 10 421 0 1 669 1126 192 165 22 chr2 11098090 11098405 -170649682 - MTEa LTR MaLR 0 379 20 1 669 516 295 162 8 chr2 11103840 11104012 -170644075 + MTE2b LTR MaLR 1 188 -191 1 669 516 295 162 8 chr2 11104053 11104133 -170643954 + MTE2b LTR MaLR 189 291 -88 1 669 1238 237 89 11 chr2 11104564 11104914 -170643173 - MTEa LTR MaLR -2 377 1 1 669 422 287 58 14 chr2 11118853 11118991 -170629096 + MTE2b LTR MaLR 73 216 -163 2 669 892 192 6 6 chr2 11119174 11119347 -170628740 + MTE2b LTR MaLR 204 376 -3 2 669 1014 269 64 91 chr2 11126503 11126908 -170621179 + MTD LTR MaLR 8 401 -18 2 669 1300 281 5 29 chr2 11128988 11129372 -170618715 - MTE2b LTR MaLR -4 375 1 2 669 956 259 48 42 chr2 11132698 11133008 -170615079 + MTE2a LTR MaLR 68 379 0 2 669 381 271 70 37 chr2 11137121 11137305 -170610782 - MTEb LTR MaLR 0 379 156 2 669 1139 237 127 11 chr2 11137687 11138041 -170610046 + MTD LTR MaLR 10 404 -15 2 669 275 315 77 87 chr2 11138055 11138354 -170609733 + ORR1E LTR MaLR 63 358 -1 2 670 455 277 77 50 chr2 11141355 11141628 -170606459 + MLT1H LTR MaLR 3 322 -227 2 670 385 324 59 63 chr2 11142245 11142417 -170605670 - ORR1E LTR MaLR -126 233 63 2 670 2067 142 19 3 chr2 11142417 11142741 -170605346 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 2 670 385 324 59 63 chr2 11142741 11142789 -170605298 - ORR1E LTR MaLR -297 62 14 2 670 612 294 53 79 chr2 11150655 11151085 -170597002 + MTD LTR MaLR 1 405 -14 2 670 339 279 0 14 chr2 11158933 11159032 -170589055 - MTEa LTR MaLR -42 337 242 3 670 330 224 887 10 chr2 11159048 11159154 -170588933 - RLTR40 LTR ERVK -17 800 601 3 670 330 139 0 27 chr2 11159203 11159235 -170588852 - RLTR40 LTR ERVK -217 600 570 3 670 1819 210 143 28 chr2 11159259 11159861 -170588226 - RLTR40 LTR ERVK -146 671 1 3 670 739 275 20 59 chr2 11159862 11159895 -170588192 - MTEa LTR MaLR -134 245 211 3 670 739 275 20 59 chr2 11159953 11160174 -170587913 - MTEa LTR MaLR -169 210 1 3 670 2670 251 84 23 chr2 11160183 11160981 -170587106 - MTEa-int LTR MaLR -13 1567 721 3 670 3422 25 8 0 chr2 11163811 11164204 -170583883 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 670 8987 50 1 2 chr2 11164204 11165303 -170582784 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 3 670 3417 35 5 0 chr2 11165303 11165697 -170582390 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 670 261 265 23 35 chr2 11178258 11178344 -170569743 - MLT1B LTR MaLR -264 126 42 3 670 2225 101 3 68 chr2 11180933 11181285 -170566802 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 3 670 3805 7 126 0 chr2 11183055 11183493 -170564594 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 3 670 2326 82 3 0 chr2 11183700 11184018 -170564069 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 3 670 1274 245 59 21 chr2 11184917 11185343 -170562744 - RMER5 LTR ERV1 -34 500 59 3 670 2939 64 28 5 chr2 11185600 11185991 -170562096 - MTB LTR MaLR 0 400 1 3 670 411 313 50 73 chr2 11197128 11197431 -170550656 - RLTR12B LTR ERVK -232 296 1 3 670 2294 79 3 0 chr2 11206987 11207305 -170540782 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 3 670 343 262 91 3 chr2 11213934 11214097 -170533990 - MLT1A LTR MaLR -35 355 156 3 670 416 270 60 20 chr2 11214550 11214701 -170533386 - MLT1A LTR MaLR -217 157 1 3 670 293 326 124 104 chr2 11218229 11218575 -170529512 + ORR1E LTR MaLR 6 358 -1 4 670 650 241 209 20 chr2 11220299 11220649 -170527438 - MTC LTR MaLR -14 407 5 4 670 830 268 148 53 chr2 11223598 11223937 -170524150 + MTE2b LTR MaLR 2 372 -7 4 670 638 280 125 57 chr2 11226674 11227026 -170521061 - MER31B LTR ERV1 -90 376 1 4 670 899 214 81 52 chr2 11227663 11227898 -170520189 + MTEb LTR MaLR 4 248 -131 4 670 1353 228 154 11 chr2 11227898 11228261 -170519826 + MTD LTR MaLR 5 419 0 4 670 899 214 81 52 chr2 11228261 11228296 -170519791 + MTEb LTR MaLR 249 282 -97 4 670 600 86 21 0 chr2 11228309 11228402 -170519685 + ORR1D1 LTR MaLR 1 95 -279 4 670 1434 255 96 29 chr2 11228448 11228542 -170519545 - RLTR11A2 LTR ERVK -14 513 418 4 670 1434 255 96 29 chr2 11228723 11229109 -170518978 - RLTR11A2 LTR ERVK -110 417 1 4 670 1068 176 64 104 chr2 11229110 11229408 -170518679 + ORR1C2 LTR MaLR 99 384 0 4 670 249 203 31 0 chr2 11230178 11230242 -170517845 + MTEb LTR MaLR 314 379 0 4 670 451 298 155 0 chr2 11230245 11230406 -170517681 + MTEb-int LTR MaLR 4 189 -1391 4 670 235 268 56 0 chr2 11230449 11230520 -170517567 - MTEa LTR MaLR -292 87 13 4 670 676 145 0 14 chr2 11233391 11233531 -170514556 + ORR1C1 LTR MaLR 1 129 -265 4 670 1734 184 9 9 chr2 11234154 11234473 -170513614 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 4 670 388 282 34 17 chr2 11234596 11234715 -170513372 - MTD LTR MaLR -298 121 1 4 670 1983 167 55 33 chr2 11235947 11236344 -170511743 + MTB_Mm LTR MaLR 2 407 0 4 670 257 272 42 42 chr2 11240157 11240253 -170507834 + MTD LTR MaLR 1 96 -323 4 670 3330 91 180 0 chr2 11240977 11241472 -170506615 + MT2B2 LTR ERVL 1 584 0 4 670 3344 28 8 8 chr2 11243384 11243779 -170504308 + MTA_Mm LTR MaLR 1 395 -1 4 670 9265 122 94 8 chr2 11245294 11247019 -170501068 - ORR1A2-int LTR MaLR -88 1875 1 4 670 1812 95 15 6 chr2 11247023 11247319 -170500768 - ORR1A2 LTR MaLR -8 338 45 4 670 1613 113 20 4 chr2 11247596 11247845 -170500242 + ORR1A2 LTR MaLR 1 253 -74 4 670 448 288 7 67 chr2 11247852 11248001 -170500086 + MTD LTR MaLR 145 284 -135 4 670 400 219 113 8 chr2 11248037 11248161 -170499926 + MTD LTR MaLR 268 404 -15 4 670 231 250 18 0 chr2 11249060 11249116 -170498971 + ORR1E LTR MaLR 67 123 -256 4 670 317 302 189 0 chr2 11250252 11250411 -170497676 + ORR1E LTR MaLR 141 329 -30 4 670 1622 226 47 43 chr2 11252060 11252573 -170495514 + RLTR20B1 LTR ERVK 49 563 0 4 670 1046 248 111 6 chr2 11252717 11253041 -170495046 - MTE2b LTR MaLR -21 358 1 4 670 881 127 44 6 chr2 11255738 11255897 -170492190 + ORR1B2 LTR MaLR 151 315 -52 4 670 2569 187 70 28 chr2 11262366 11263157 -170484930 + RLTR13D3 LTR ERVK 1 1114 0 5 670 233 295 65 19 chr2 11265990 11266097 -170481990 + ORR1E LTR MaLR 1 112 -247 5 670 1038 213 184 11 chr2 11267483 11267830 -170480257 + MTD LTR MaLR 12 418 -1 5 670 694 132 16 8 chr2 11267974 11268096 -170479991 + MTC LTR MaLR 4 126 -295 5 670 271 208 0 0 chr2 11270078 11270131 -170477956 - MTE2b LTR MaLR -12 367 315 5 83 51044 33 6 0 chr2 11270234 11276083 -170472004 + RLTR6-int LTR ERV1 1899 7778 0 5 671 244 182 227 0 chr2 11276083 11276149 -170471938 + RLTR6_Mm LTR ERV1 1 81 -573 5 671 1855 122 257 34 chr2 11276189 11276637 -170471450 + RLTR6_Mm LTR ERV1 37 584 -70 5 671 946 273 59 45 chr2 11276622 11276910 -170471177 - MTE2b LTR MaLR -84 295 4 5 671 373 306 185 22 chr2 11277774 11278001 -170470086 - MT2A LTR ERVL -2 531 268 5 671 341 235 114 144 chr2 11278159 11278423 -170469664 - MT2A LTR ERVL -260 273 18 5 671 3407 44 0 17 chr2 11278942 11279356 -170468731 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 5 671 624 280 79 155 chr2 11286359 11286714 -170461373 - MTE2a LTR MaLR -44 335 8 5 671 1330 232 57 27 chr2 11287498 11287802 -170460285 - MTEa LTR MaLR 0 379 67 5 671 1330 232 57 27 chr2 11287831 11287894 -170460193 - MTEa LTR MaLR -313 66 2 5 671 1737 206 29 38 chr2 11288363 11288685 -170459402 + MTC LTR MaLR 1 317 -104 5 671 1737 206 29 38 chr2 11288872 11288961 -170459126 + MTC LTR MaLR 324 413 -8 5 671 1083 241 81 19 chr2 11288971 11289280 -170458807 - MTD LTR MaLR -86 333 6 5 671 663 301 92 33 chr2 11290821 11291213 -170456874 + MTD LTR MaLR 5 419 0 5 671 872 274 132 33 chr2 11295675 11296007 -170452080 + MTE2b LTR MaLR 7 371 -8 5 671 656 273 12 0 chr2 11298650 11298811 -170449276 + MTEb LTR MaLR 1 163 -216 5 671 680 239 39 11 chr2 11298880 11299062 -170449025 + MTEb LTR MaLR 182 368 -11 5 671 573 337 67 51 chr2 11300653 11301178 -170446909 + MT2A LTR ERVL 1 533 0 5 671 2172 216 102 71 chr2 11302713 11303460 -170444627 + RMER17B LTR ERVK 1 770 -188 5 671 1812 180 132 29 chr2 11306081 11306552 -170441535 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 11 5 671 2088 127 81 47 chr2 11307006 11307387 -170440700 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 6 671 442 255 94 50 chr2 11310893 11310919 -170437168 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 345 6 671 3339 52 0 7 chr2 11310919 11311322 -170436765 + MTB LTR MaLR 1 400 0 6 671 442 255 94 50 chr2 11311322 11311497 -170436590 - MLT1A0 LTR MaLR -21 344 155 6 671 3548 15 5 0 chr2 11316029 11316423 -170431664 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 671 3662 178 108 12 chr2 11316514 11317360 -170430727 - RLTR25B LTR ERVK -101 927 1 6 671 3792 43 33 0 chr2 11327042 11327502 -170420585 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 475 0 6 671 7314 84 28 3 chr2 11328339 11329337 -170418750 - RLTR13D5 LTR ERVK 0 1023 1 6 671 2376 129 103 181 chr2 11335894 11336319 -170411768 + MTB-int LTR MaLR 519 930 -328 6 671 2376 129 103 181 chr2 11336372 11336747 -170411340 + MTB-int LTR MaLR 931 1257 -1 6 671 2915 46 18 2 chr2 11336747 11337141 -170410946 + MTB LTR MaLR 1 400 0 6 671 3420 36 5 0 chr2 11341383 11341776 -170406311 - MTA_Mm LTR MaLR -1 395 1 6 671 529 232 137 44 chr2 11344618 11344882 -170403205 - ORR1D1 LTR MaLR 0 367 100 6 671 301 224 0 56 chr2 11345843 11345914 -170402173 + MTEb LTR MaLR 2 68 -311 6 671 876 213 74 26 chr2 11346400 11346631 -170401456 + MTEb LTR MaLR 33 274 -105 6 671 338 283 50 8 chr2 11352914 11353035 -170395052 - MLT1B LTR MaLR -199 191 66 7 671 308 338 102 53 chr2 11353037 11353359 -170394728 + ORR1E LTR MaLR 7 344 -15 7 671 1934 164 50 8 chr2 11354102 11354253 -170393834 + ORR1C1 LTR MaLR 1 163 -215 7 671 1934 164 50 8 chr2 11354309 11354520 -170393567 + ORR1C1 LTR MaLR 164 378 0 7 671 1789 147 30 7 chr2 11357829 11358131 -170389956 + RLTR27 LTR ERVK 1 309 0 7 671 231 286 43 21 chr2 11360613 11360706 -170387381 - RLTR15 LTR ERVK -152 207 113 7 671 362 349 37 11 chr2 11362506 11362697 -170385390 + LTR16A1 LTR ERVL 259 454 -2 7 671 2233 148 40 10 chr2 11370888 11371285 -170376802 - MTC LTR MaLR -8 413 5 7 671 354 303 48 53 chr2 11379706 11379894 -170368193 + LTR31 LTR ERV1 157 343 -276 7 671 1998 147 52 62 chr2 11381349 11381478 -170366609 - RLTR14 LTR ERV1 0 382 259 7 671 1998 147 52 62 chr2 11381625 11381880 -170366207 - RLTR14 LTR ERV1 -124 258 2 7 671 1124 274 38 23 chr2 11382079 11382426 -170365661 + MTE2a LTR MaLR 15 366 -13 7 671 918 267 75 75 chr2 11390629 11390921 -170357166 + MTE2b LTR MaLR 1 292 -87 8 671 1183 233 110 55 chr2 11390927 11391291 -170356796 - MTD LTR MaLR -14 405 22 8 671 357 198 69 11 chr2 11391486 11391573 -170356514 + RMER10A LTR ERVL 46 137 -305 8 672 244 246 129 84 chr2 11415728 11415746 -170332341 + MT2B2 LTR ERVL 133 207 -377 8 672 244 246 129 84 chr2 11415865 11415883 -170332204 + MT2B2 LTR ERVL 208 294 -290 8 672 1305 237 99 6 chr2 11418176 11418520 -170329567 + MTEb LTR MaLR 1 376 -3 8 672 2498 77 3 15 chr2 11428015 11428346 -170319741 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 8 672 2903 155 7 0 chr2 11428346 11428804 -170319283 + ORR1A2-int LTR MaLR 1 461 -1502 8 672 2937 138 30 119 chr2 11431089 11431126 -170316961 + RMER15 LTR ERVL 1 37 -538 9 672 2937 138 30 119 chr2 11431321 11431914 -170316173 + RMER15 LTR ERVL 38 575 0 9 672 2309 146 19 21 chr2 11433842 11434219 -170313868 + ORR1C1 LTR MaLR 3 378 0 9 672 284 173 141 39 chr2 11436081 11436159 -170311928 - MTEa LTR MaLR 0 379 294 9 672 262 238 29 21 chr2 11436808 11436908 -170311179 - MTE2b LTR MaLR -9 370 272 9 672 989 266 115 53 chr2 11438279 11438636 -170309451 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 9 672 319 322 79 32 chr2 11439155 11439344 -170308743 - MLT1J LTR MaLR -238 274 77 9 672 939 224 226 7 chr2 11444495 11444801 -170303286 + MTEb LTR MaLR 1 373 -6 9 672 942 195 160 134 chr2 11448496 11448629 -170299458 + ORR1C2 LTR MaLR 31 171 -213 9 672 942 195 160 134 chr2 11448664 11448793 -170299294 + ORR1C2 LTR MaLR 172 329 -55 9 672 942 195 160 134 chr2 11449446 11449478 -170298609 + ORR1C2 LTR MaLR 330 338 -46 9 672 942 195 160 134 chr2 11449624 11449671 -170298416 + ORR1C2 LTR MaLR 339 382 -2 9 672 2551 161 154 2 chr2 11450998 11451491 -170296596 + RMER15 LTR ERVL 8 575 0 9 672 2633 39 72 0 chr2 11459866 11460199 -170287888 + RLTR10B2 LTR ERVK 1 357 -8 1 672 1539 181 75 56 chr2 11462461 11462835 -170285252 - ORR1C2 LTR MaLR -3 381 1 1 672 248 263 0 21 chr2 11465514 11465611 -170282476 - ORR1B1-int LTR MaLR -784 725 631 1 672 2813 104 7 22 chr2 11477170 11477583 -170270504 + RLTR9F LTR ERVK 5 411 -4 1 672 2473 119 5 26 chr2 11482583 11482963 -170265124 - RLTR14 LTR ERV1 -10 372 1 1 672 277 355 70 14 chr2 11484071 11484214 -170263873 + MER21B LTR ERV1 659 809 -54 1 672 305 231 282 0 chr2 11486415 11486532 -170261555 - MLT1E3 LTR MaLR -468 156 7 1 672 428 206 0 85 chr2 11494084 11494190 -170253897 + MT2B LTR ERVL 161 257 -344 1 672 2917 163 163 66 chr2 11500922 11501565 -170246522 - RMER19B LTR ERVK -35 867 129 6 672 2631 84 198 80 chr2 11501565 11502029 -170246058 - MURVY-LTR LTR ERV1 0 519 1 7 672 2917 163 163 66 chr2 11502029 11502175 -170245912 - RMER19B LTR ERVK -774 128 1 6 672 3402 153 102 36 chr2 11502816 11503555 -170244532 + RMER19B LTR ERVK 1 787 -115 1 672 1007 251 76 89 chr2 11509442 11509823 -170238264 + MTE2a LTR MaLR 1 376 -3 2 672 3055 61 18 2 chr2 11513332 11513726 -170234361 + MTB LTR MaLR 1 400 0 2 672 422 105 118 0 chr2 11523152 11523228 -170224859 - MT2A LTR ERVL -448 85 1 5 672 3435 108 120 7 chr2 11525533 11526073 -170222014 - MT2B LTR ERVL 0 601 1 5 672 225 256 74 0 chr2 11532099 11532220 -170215867 - ORR1B1-int LTR MaLR -755 754 625 7 672 1176 131 9 28 chr2 11533879 11534092 -170213995 + RLTR9D LTR ERVK 194 402 -1 8 672 506 207 56 62 chr2 11534098 11534258 -170213829 + ETnERV2-int LTR ERVK 3 161 -3153 8 673 235 267 33 0 chr2 11534380 11534440 -170213647 - MTD LTR MaLR -285 134 73 8 673 5453 98 84 64 chr2 11534549 11535561 -170212526 + ETnERV2-int LTR ERVK 1083 2116 -5290 8 673 5920 117 34 6 chr2 11535567 11536507 -170211580 + ETnERV2-int LTR ERVK 2496 3461 -3945 8 673 3942 120 26 5 chr2 11536670 11537282 -170210805 + ETnERV2-int LTR ERVK 3447 4071 -3335 8 673 548 244 149 34 chr2 11540514 11540722 -170207365 + MTE-int LTR MaLR 1120 1351 -229 9 673 247 280 13 0 chr2 11543662 11543737 -170204350 - RMER15 LTR ERVL -108 467 392 9 673 738 234 247 87 chr2 11550569 11551019 -170197068 + RMER2 LTR ERV1 4 525 -42 1 673 1907 132 22 3 chr2 11554282 11554594 -170193493 + ORR1A3 LTR MaLR 1 318 -8 1 673 305 223 25 127 chr2 11562442 11562560 -170185527 + MT2B LTR ERVL 152 257 -344 1 673 902 168 63 44 chr2 11562528 11562734 -170185353 - MTC LTR MaLR -211 210 1 1 673 545 168 0 38 chr2 11578047 11578152 -170169935 + ORR1D1 LTR MaLR 1 101 -273 1 673 396 200 138 16 chr2 11578279 11578422 -170169665 + ORR1D1 LTR MaLR 216 377 -2 1 673 669 208 74 41 chr2 11580702 11581143 -170166944 - RMER17C LTR ERVK -29 381 1 2 673 991 188 81 14 chr2 11581353 11581574 -170166513 - ORR1B2 LTR MaLR -131 236 1 2 673 3189 70 2 2 chr2 11581575 11581975 -170166112 - MTB LTR MaLR 0 400 1 2 673 1404 229 106 36 chr2 11582407 11582823 -170165264 - RLTR20B3 LTR ERVK -26 551 107 2 673 1105 254 94 43 chr2 11583019 11583331 -170164756 + MTE2b LTR MaLR 1 312 -67 2 673 1105 254 94 43 chr2 11583496 11583533 -170164554 + MTE2b LTR MaLR 313 367 -12 2 673 577 156 31 15 chr2 11586175 11586305 -170161782 - ORR1E LTR MaLR -227 132 1 2 673 478 165 44 0 chr2 11594652 11594743 -170153344 - ORR1D1 LTR MaLR -277 97 3 2 673 400 287 62 62 chr2 11594807 11595015 -170153072 - MLT2B3 LTR ERVL -344 210 3 2 673 491 286 97 82 chr2 11597760 11598202 -170149885 - RMER13A LTR ERVK -25 602 86 2 673 495 299 128 12 chr2 11601233 11601490 -170146597 - RMER15 LTR ERVL -14 561 275 2 673 2054 161 38 5 chr2 11602755 11603124 -170144963 - MTC LTR MaLR -2 419 39 2 673 2435 97 16 14 chr2 11604216 11604583 -170143504 - RLTR9A LTR ERVK 0 368 1 2 673 740 230 17 6 chr2 11604922 11605097 -170142990 - MTEb LTR MaLR 0 379 203 2 673 509 265 149 0 chr2 11605229 11605410 -170142677 - MTEb LTR MaLR -166 213 6 2 673 1103 253 58 99 chr2 11608150 11608545 -170139542 - MTE2a LTR MaLR 0 379 1 2 673 639 266 121 80 chr2 11613960 11614299 -170133788 + ORR1E LTR MaLR 1 353 -6 2 673 1017 214 137 30 chr2 11614494 11614860 -170133227 + MTD LTR MaLR 1 405 -14 2 673 340 255 49 0 chr2 11614896 11614998 -170133089 + MLT1J LTR MaLR 110 216 -296 2 673 1918 152 70 39 chr2 11615917 11616348 -170131739 - RLTR20C LTR ERVK -90 444 1 2 673 463 292 214 10 chr2 11618093 11618382 -170129705 - MTEb LTR MaLR -31 348 1 2 673 3262 43 5 10 chr2 11618553 11618951 -170129136 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 673 389 220 145 30 chr2 11621004 11621135 -170126952 - MTD LTR MaLR -73 346 201 2 673 563 272 138 6 chr2 11621462 11621634 -170126453 - MTD LTR MaLR -223 196 1 2 673 1395 167 53 231 chr2 11621694 11622161 -170125926 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 2 673 1740 248 52 34 chr2 11635186 11635416 -170112671 + RLTR17 LTR ERVK 105 326 -366 3 673 2939 46 3 0 chr2 11635416 11635761 -170112326 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 3 673 1740 248 52 34 chr2 11635761 11636035 -170112052 + RLTR17 LTR ERVK 327 618 -74 3 673 302 284 0 22 chr2 11636866 11636956 -170111131 - MLT1A1 LTR MaLR -12 396 309 3 673 295 233 0 40 chr2 11636993 11637069 -170111018 + ORR1A3-int LTR MaLR 567 639 -1324 3 673 1420 174 188 11 chr2 11637133 11637274 -170110813 + MT2A LTR ERVL 1 166 -367 3 673 1420 174 188 11 chr2 11637302 11637521 -170110566 + MT2A LTR ERVL 167 425 -108 3 673 311 318 77 43 chr2 11642306 11642513 -170105574 - LTR40b LTR ERVL -234 228 15 3 673 946 241 44 115 chr2 11642731 11642962 -170105125 - MTE2a LTR MaLR 0 379 172 3 673 946 241 44 115 chr2 11643159 11643335 -170104752 - MTE2a LTR MaLR -208 171 1 3 673 608 257 57 18 chr2 11648361 11648570 -170099517 - MTD LTR MaLR -14 405 195 3 673 4554 216 153 28 chr2 11656891 11658108 -170089979 + ORR1D1-int LTR MaLR 1 1369 -1 3 673 796 162 0 25 chr2 11658111 11658207 -170089880 + ORR1D1 LTR MaLR 3 98 -276 3 673 3276 66 10 0 chr2 11658207 11658603 -170089484 - MTB LTR MaLR 0 400 1 3 673 796 158 28 151 chr2 11658603 11658685 -170089402 + ORR1D1 LTR MaLR 87 158 -209 3 673 2428 113 13 5 chr2 11659572 11659955 -170088132 + ORR1B1 LTR MaLR 1 386 -8 3 673 2303 82 35 3 chr2 11661527 11661844 -170086243 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 3 673 846 240 102 49 chr2 11662150 11662435 -170085652 + ORR1E LTR MaLR 54 353 -6 3 674 299 321 107 98 chr2 11667052 11667439 -170080648 + MTEb LTR MaLR 1 365 -14 4 674 2624 37 6 12 chr2 11674654 11674984 -170073103 + MTA_Mm LTR MaLR 1 328 -68 4 674 8797 51 5 14 chr2 11674988 11676096 -170071991 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 4 674 3270 31 39 0 chr2 11676096 11676477 -170071610 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 674 473 254 25 8 chr2 11683172 11683291 -170064796 + MLT1B LTR MaLR 248 368 -22 4 674 1859 130 160 3 chr2 11704088 11704419 -170043668 + ORR1C2 LTR MaLR 1 383 -1 4 674 887 235 117 99 chr2 11713238 11713618 -170034469 + MTE2a LTR MaLR 28 405 -14 4 674 574 183 25 34 chr2 11715289 11715408 -170032679 + MTE2b LTR MaLR 1 118 -261 4 674 541 220 140 49 chr2 11715822 11715989 -170032098 + MTE2b LTR MaLR 127 291 -88 4 674 887 267 145 35 chr2 11716934 11717307 -170030780 - MTD LTR MaLR -5 414 1 4 674 810 239 18 81 chr2 11722490 11722713 -170025374 + MTEa LTR MaLR 2 210 -169 5 674 235 281 82 35 chr2 11724354 11724439 -170023648 - MLT1A0 LTR MaLR 0 467 379 5 674 302 215 62 12 chr2 11724510 11724590 -170023497 - MLT1A0 LTR MaLR -229 136 53 5 674 3283 48 5 2 chr2 11725736 11726135 -170021952 - MTB LTR MaLR 0 400 1 5 674 2163 27 114 0 chr2 11737698 11737960 -170010127 - RLTR10B LTR ERVK 0 292 1 5 674 2146 51 0 90 chr2 11740422 11740743 -170007344 + RLTR10B LTR ERVK 1 292 0 5 674 1160 269 84 68 chr2 11744496 11744930 -170003157 + RLTR11A LTR ERVK 10 451 -77 5 674 1160 269 84 68 chr2 11744964 11745040 -170003047 + RLTR11A LTR ERVK 452 527 -1 5 674 1731 234 40 9 chr2 11764961 11765466 -169982621 + RMER20B LTR ERVK 3 516 0 5 674 700 181 291 63 chr2 11773990 11774261 -169973826 - RMER21B LTR ERV1 -498 344 12 5 674 3257 179 38 21 chr2 11774265 11774871 -169973216 - RMER21A LTR ERV1 0 947 332 5 674 1856 222 27 22 chr2 11779924 11780329 -169967758 + MTD LTR MaLR 1 407 -12 5 674 2573 81 10 29 chr2 11786740 11787123 -169960964 + IAPEY_LTR LTR ERVK 5 385 0 5 674 1692 253 96 42 chr2 11791988 11792508 -169955579 - RMER15 LTR ERVL 0 575 28 5 674 4227 98 33 94 chr2 11794504 11795318 -169952769 - RMER17A LTR ERVK 0 751 1 5 84 3808 180 89 38 chr2 11795857 11796769 -169951318 + RLTR13D2 LTR ERVK 43 1007 -16 5 675 1698 133 53 62 chr2 11799396 11799716 -169948371 + ORR1A2 LTR MaLR 1 317 -10 5 675 947 350 35 11 chr2 11813917 11814264 -169933823 - ORR1E LTR MaLR -2 357 3 5 675 1998 161 24 137 chr2 11817137 11817634 -169930453 + BGLII_B LTR ERVK 1 441 0 5 675 369 307 78 24 chr2 11825203 11825370 -169922717 - MTD LTR MaLR -243 176 1 6 675 2028 175 49 15 chr2 11828692 11829099 -169918988 + MTC LTR MaLR 1 421 0 6 675 595 177 5 186 chr2 11829101 11829295 -169918792 + MTC-int LTR MaLR 5 163 -1095 6 675 339 195 11 65 chr2 11829722 11829815 -169918272 + MTC-int LTR MaLR 150 237 -1021 6 675 345 161 16 0 chr2 11829813 11829875 -169918212 + MTC LTR MaLR 359 421 0 6 675 796 307 24 20 chr2 11832105 11832401 -169915686 - BGLII_B LTR ERVK 0 441 145 6 675 317 310 17 17 chr2 11835349 11835464 -169912623 - MLT1A0 LTR MaLR -149 216 102 6 675 1639 250 42 73 chr2 11836334 11836852 -169911235 - RMER19C LTR ERVK 0 611 110 6 675 1131 343 113 49 chr2 11838867 11839885 -169908202 - MTE-int LTR MaLR -467 1113 31 6 675 1417 208 31 40 chr2 11842531 11842882 -169905205 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 47 6 675 904 266 21 25 chr2 11844945 11845186 -169902901 + MTD LTR MaLR 18 257 -162 6 675 2238 186 43 0 chr2 11845186 11845585 -169902502 + MTC LTR MaLR 1 416 -5 6 675 930 293 51 32 chr2 11846103 11846417 -169901670 - ORR1E LTR MaLR 0 359 40 6 675 503 280 13 13 chr2 11846676 11846828 -169901259 - MTC LTR MaLR -268 153 2 6 675 1501 174 92 0 chr2 11854268 11854561 -169893526 - IAPEY3_LTR LTR ERVK -12 320 1 6 675 1270 194 58 20 chr2 11854561 11854909 -169893178 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 6121 6 675 4060 88 29 0 chr2 11854921 11855500 -169892587 - IAPEY3-int LTR ERVK -342 7338 6743 6 675 3157 101 0 7 chr2 11855490 11855947 -169892140 - IAPEY3-int LTR ERVK -1367 6214 5761 6 675 3301 73 0 16 chr2 11855938 11856385 -169891702 - IAPEY3-int LTR ERVK -1939 5642 5203 6 675 767 85 17 8 chr2 11856664 11856783 -169891304 - IAPEY3-int LTR ERVK -2932 4649 4530 6 675 387 198 18 36 chr2 11856809 11856919 -169891168 - MMETn-int LTR ERVK -2380 2464 2357 6 675 1905 132 109 10 chr2 11856924 11857517 -169890570 - IAPEY3-int LTR ERVK -3135 4271 3568 6 675 584 219 0 0 chr2 11857544 11857663 -169890424 - IAPEY3-int LTR ERVK -4653 2753 2635 6 675 291 267 0 55 chr2 11857675 11857766 -169890321 - IAPEY3-int LTR ERVK -4867 2539 2454 6 675 309 250 93 17 chr2 11857779 11857897 -169890190 - RMER16-int LTR ERVK -4196 1210 1084 6 675 1379 190 111 52 chr2 11857878 11858383 -169889704 - RMER16-int LTR ERVK -4783 623 251 6 675 310 143 55 118 chr2 11858505 11858632 -169889455 - MMERVK10C-int LTR ERVK -6629 952 834 6 675 2625 76 10 10 chr2 11858605 11858991 -169889096 - IAPLTR4_I LTR ERVK -704 766 381 6 675 2733 44 55 0 chr2 11865257 11865620 -169882467 - IAPLTR4_I LTR ERVK -1077 393 11 6 675 1486 167 92 0 chr2 11865620 11865913 -169882174 - IAPEY3_LTR LTR ERVK -12 320 1 6 675 282 260 88 115 chr2 11886555 11886885 -169861202 - RLTR15 LTR ERVK -38 321 1 6 675 1601 252 43 20 chr2 11887964 11888361 -169859726 - MTD LTR MaLR -13 406 1 6 675 3003 141 44 67 chr2 11891850 11892503 -169855584 + RMER21A LTR ERV1 302 939 -8 6 675 615 209 204 45 chr2 11892519 11892784 -169855303 + RMER21B LTR ERV1 13 319 -523 6 675 1919 173 152 3 chr2 11894274 11894656 -169853431 + BGLII_B LTR ERVK 1 439 -2 6 675 1069 205 0 0 chr2 11910495 11910695 -169837392 + RMER3D-int LTR ERVK 1184 1383 -1459 7 675 2072 216 83 63 chr2 11910698 11911461 -169836626 + RMER3D-int LTR ERVK 1382 1992 -850 7 675 1146 192 132 36 chr2 11917891 11918194 -169829893 - IAPEY3_LTR LTR ERVK 0 332 1 7 675 1469 183 55 17 chr2 11918194 11918538 -169829549 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 6125 7 675 1721 121 56 31 chr2 11918555 11918882 -169829205 - IAPEY3-int LTR ERVK -342 7338 6965 7 675 1453 120 107 0 chr2 11918882 11919107 -169828980 - IAPEz-int LTR ERVK -1287 5255 5007 7 675 363 158 0 0 chr2 11919107 11919164 -169828923 - IAPEz-int LTR ERVK -6039 503 447 7 675 275 270 49 20 chr2 11919181 11919283 -169828804 - RMER16-int LTR ERVK -6015 1566 1462 7 675 263 231 58 0 chr2 11919346 11919398 -169828689 - RMER16-int LTR ERVK -983 1004 950 7 675 301 241 50 12 chr2 11919393 11919473 -169828614 - RMER16-int LTR ERVK -4591 815 733 7 675 666 219 111 0 chr2 11919512 11919765 -169828322 - RMER16-int LTR ERVK -4747 659 313 7 675 886 138 7 0 chr2 11919741 11919893 -169828194 - MMERVK10C-int LTR ERVK -6721 860 708 7 675 2990 113 2 7 chr2 11919992 11920420 -169827667 - MMERVK10C-int LTR ERVK -7155 426 1 7 675 1118 202 132 36 chr2 11920420 11920723 -169827364 - IAPEY3_LTR LTR ERVK 0 332 1 7 675 1797 175 107 9 chr2 11923093 11923439 -169824648 + RLTR14 LTR ERV1 3 382 0 7 675 3080 50 42 0 chr2 11925056 11925436 -169822651 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 7 676 395 219 51 138 chr2 11928204 11928400 -169819687 - RMER13B LTR ERVK -9 899 721 7 676 234 211 411 0 chr2 11928449 11928539 -169819548 - RLTR26 LTR ERVK -515 127 1 7 676 1111 243 228 16 chr2 11929505 11929944 -169818143 + MT2A LTR ERVL 1 532 -1 7 676 3718 174 45 6 chr2 11933821 11934487 -169813600 - RLTR17 LTR ERVK 0 692 1 7 676 2617 199 6 134 chr2 11935064 11935765 -169812322 - RMER19C LTR ERVK 0 611 1 7 676 264 335 96 66 chr2 11938873 11938938 -169809149 + MLT1J LTR MaLR 245 319 -193 7 676 264 335 96 66 chr2 11939162 11939262 -169808825 + MLT1J LTR MaLR 320 414 -98 7 676 3600 33 5 0 chr2 11948772 11949166 -169798921 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 7 676 933 149 41 6 chr2 11951181 11951350 -169796737 + RLTR25A LTR ERVK 1 175 -928 7 676 355 254 147 92 chr2 11954079 11954330 -169793757 - MTEa LTR MaLR -4 375 111 7 676 416 289 78 0 chr2 11963002 11963130 -169784957 + MLT2B2 LTR ERVL 375 512 -50 7 676 985 304 27 43 chr2 11963157 11963643 -169784444 + MT2B LTR ERVL 1 544 -57 7 676 2735 124 51 38 chr2 11964827 11965296 -169782791 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 7 676 9414 16 1 0 chr2 11965296 11966331 -169781756 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 5446 7 676 1798 5 0 0 chr2 11966330 11966523 -169781564 - IAPEz-int LTR ERVK -2764 3717 3525 7 676 937 88 24 0 chr2 11966523 11966648 -169781439 - IAPEz-int LTR ERVK -2770 4910 4783 7 676 1857 115 4 4 chr2 11966643 11966905 -169781182 - IAPEz-int LTR ERVK -5183 2497 2236 7 676 446 66 0 32 chr2 11966894 11966957 -169781130 - IAPEz-int LTR ERVK -5062 1419 1359 7 676 4424 44 95 22 chr2 11966957 11967559 -169780528 - IAPEz-int LTR ERVK -5819 662 17 7 676 2789 111 51 45 chr2 11967582 11968054 -169780033 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 7 676 2404 155 127 19 chr2 11968757 11969231 -169778856 + RLTR11A2 LTR ERVK 3 527 0 8 676 1971 201 27 10 chr2 11969979 11970387 -169777700 - RLTR11A2 LTR ERVK 0 527 113 8 676 638 148 18 9 chr2 11970412 11970521 -169777566 - RLTR11A2 LTR ERVK -300 227 118 8 676 738 277 128 16 chr2 11991560 11991879 -169756208 + MLT1D LTR MaLR 138 492 -13 8 676 3282 76 2 12 chr2 11999237 11999662 -169748425 + BGLII LTR ERVK 1 421 0 8 676 1787 195 150 11 chr2 12000283 12000830 -169747257 - RMER19B LTR ERVK -279 623 1 2 676 2151 106 6 83 chr2 12002511 12002862 -169745225 - ORR1A2 LTR MaLR -3 324 1 8 676 1831 202 40 63 chr2 12016580 12017008 -169731079 - MTD LTR MaLR -1 418 1 2 676 493 315 254 35 chr2 12017234 12017626 -169730461 + MER31A LTR ERV1 2 479 -6 2 676 2832 44 6 6 chr2 12020440 12020786 -169727301 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 3 676 706 305 67 83 chr2 12026400 12026761 -169721326 - ORR1E LTR MaLR -2 357 3 3 676 1907 180 96 5 chr2 12027066 12027452 -169720635 - MTC LTR MaLR 0 421 1 3 676 1088 241 25 5 chr2 12043521 12043784 -169704303 - MTD LTR MaLR 0 421 129 6 676 249 329 62 56 chr2 12049126 12049271 -169698816 + MLT1C LTR MaLR 42 188 -279 8 676 249 329 62 56 chr2 12049588 12049603 -169698484 + MLT1C LTR MaLR 189 203 -264 8 676 499 317 47 85 chr2 12054797 12055138 -169692949 + ORR1E LTR MaLR 28 355 -4 9 676 3553 126 132 26 chr2 12057585 12057598 -169690489 - RMER6A LTR ERVK 0 756 742 1 84 3553 126 132 26 chr2 12058420 12059090 -169688997 - RMER6A LTR ERVK -15 741 2 1 677 287 298 197 120 chr2 12059188 12059497 -169688590 + MTEa LTR MaLR 1 333 -46 1 677 250 258 9 118 chr2 12061032 12061142 -169686945 - MT2B2 LTR ERVL -321 263 166 1 677 1071 268 62 83 chr2 12079022 12079396 -169668691 + MTE2a LTR MaLR 1 366 -13 1 677 1798 119 18 96 chr2 12090007 12090341 -169657746 + ORR1B2 LTR MaLR 52 359 -8 1 677 1123 238 140 52 chr2 12094837 12095222 -169652865 - MTD LTR MaLR 0 419 1 1 677 237 296 23 0 chr2 12124790 12124878 -169623209 - LTR16B2 LTR ERVL -27 435 346 2 677 1984 115 118 89 chr2 12127663 12128045 -169620042 + RLTR9C LTR ERVK 1 393 0 2 677 304 404 28 18 chr2 12128260 12128477 -169619610 + LTR16C LTR ERVL 271 489 0 2 677 2874 83 26 3 chr2 12129283 12129671 -169618416 + MTB_Mm LTR MaLR 1 397 -10 2 677 304 269 64 46 chr2 12135557 12135666 -169612421 + MLT1B LTR MaLR 227 337 -53 2 677 2252 152 101 7 chr2 12165249 12165673 -169582414 + RMER4A LTR ERVK 1 464 -2 2 677 3156 53 5 12 chr2 12167302 12167701 -169580386 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 677 520 230 111 0 chr2 12170640 12170775 -169577312 + ORR1B2 LTR MaLR 218 367 0 2 677 228 370 21 56 chr2 12180221 12180364 -169567723 - MT2B LTR ERVL -327 274 137 2 677 430 81 16 0 chr2 12181682 12181744 -169566343 - RMER19A LTR ERVK -674 63 1 2 677 1847 159 45 24 chr2 12183064 12183399 -169564688 + ORR1D1 LTR MaLR 5 346 -28 3 678 349 183 42 14 chr2 12196395 12196467 -169551620 + ORR1E LTR MaLR 1 74 -285 3 678 333 316 127 61 chr2 12199750 12199979 -169548108 + LTR33B LTR ERVL 90 333 -170 3 678 626 304 93 30 chr2 12202474 12202806 -169545281 - ORR1E LTR MaLR -1 358 6 3 678 267 285 52 93 chr2 12205538 12205882 -169542205 + RMER17A LTR ERVK 258 587 -164 3 678 2974 90 2 2 chr2 12206417 12206817 -169541270 - MTB LTR MaLR 0 400 1 3 678 753 311 94 32 chr2 12211820 12212246 -169535841 + MLT1D LTR MaLR 68 502 -3 3 678 391 239 25 58 chr2 12231238 12231358 -169516729 - MTEb LTR MaLR -6 373 258 3 678 759 286 26 29 chr2 12232220 12232562 -169515525 - RLTR15 LTR ERVK -13 346 6 3 678 747 158 39 229 chr2 12240582 12240825 -169507262 - RLTR25B LTR ERVK 0 1028 816 4 678 747 158 39 229 chr2 12240878 12240970 -169507117 - RLTR25B LTR ERVK -213 815 757 4 678 529 282 45 91 chr2 12242368 12242633 -169505454 - ORR1E LTR MaLR -4 355 103 4 678 2197 172 67 35 chr2 12242635 12243098 -169504989 - RLTR17 LTR ERVK 0 692 215 4 678 1577 128 4 8 chr2 12243120 12243371 -169504716 + ORR1A2 LTR MaLR 27 276 -51 4 678 315 109 0 0 chr2 12243765 12243811 -169504276 + ORR1A2 LTR MaLR 281 326 0 4 678 457 269 10 0 chr2 12243811 12243913 -169504174 - ORR1E LTR MaLR -256 103 1 4 678 3474 76 0 4 chr2 12244790 12245279 -169502808 - RLTR1C LTR ERV1 -16 487 1 4 678 1844 100 6 80 chr2 12252393 12252730 -169495357 + ORR1A4 LTR MaLR 18 329 0 4 678 778 177 13 76 chr2 12253218 12253461 -169494626 + RMER17C LTR ERVK 12 410 -548 4 678 778 243 78 2129 chr2 12253519 12253620 -169494467 + RMER17C LTR ERVK 193 199 -211 4 678 971 138 0 12 chr2 12255272 12255440 -169492647 + RLTR1B LTR ERV1 347 512 0 4 678 468 69 0 0 chr2 12255440 12255498 -169492589 + RLTR1B-int LTR ERV1 1 58 -3241 4 678 9984 43 39 6 chr2 12255496 12256719 -169491368 + RLTR1B-int LTR ERV1 846 2109 -1190 4 678 4959 32 50 78 chr2 12256716 12257400 -169490687 + RLTR1B-int LTR ERV1 2635 3299 0 4 678 2193 48 34 0 chr2 12257400 12257695 -169490392 + RLTR1B LTR ERV1 1 305 -207 4 678 1085 128 11 0 chr2 12257694 12257873 -169490214 + RLTR1B LTR ERV1 256 436 -76 4 678 1300 226 99 6 chr2 12260727 12261061 -169487026 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 6 4 678 235 366 29 29 chr2 12263977 12264115 -169483972 + MLT1G3 LTR MaLR 237 374 -221 4 678 2397 149 54 25 chr2 12265582 12265989 -169482098 - MTC LTR MaLR 0 421 3 4 678 231 321 143 40 chr2 12268339 12268514 -169479573 + MLT1G1 LTR MaLR 290 482 -97 4 678 361 312 108 42 chr2 12277830 12278071 -169470016 - LTR69 LTR ERVL -128 460 204 4 678 2495 159 118 6 chr2 12279607 12280099 -169467988 + ORR1A2-int LTR MaLR 260 806 -1157 4 678 936 167 0 71 chr2 12279995 12280163 -169467924 + MT2B LTR ERVL 132 287 -314 4 678 5710 126 31 8 chr2 12280150 12280274 -169467813 + ORR1A2-int LTR MaLR 746 873 -1090 4 678 5710 126 31 8 chr2 12280316 12281153 -169466934 + ORR1A2-int LTR MaLR 874 1728 -235 4 678 1881 115 42 8 chr2 12281153 12281478 -169466609 + ORR1A2 LTR MaLR 1 352 -42 4 678 442 55 0 0 chr2 12281651 12281706 -169466381 + ORR1A3 LTR MaLR 272 326 0 4 678 798 286 30 43 chr2 12289025 12289311 -169458776 + RLTR11A2 LTR ERVK 7 286 -167 4 678 374 284 41 103 chr2 12289338 12289609 -169458478 + RLTR12B LTR ERVK 241 494 -34 4 678 270 217 138 21 chr2 12298304 12298398 -169449689 + RLTR19-int LTR ERVK 3849 3953 -2184 4 678 2858 155 25 40 chr2 12299385 12299908 -169448179 + RMER20A LTR ERVK 2 516 0 4 678 1131 254 72 103 chr2 12300587 12301074 -169447013 + RMER15 LTR ERVL 3 474 -101 4 678 861 313 76 6 chr2 12306047 12306375 -169441712 + MER74C LTR ERVL 30 380 -80 5 678 939 238 144 38 chr2 12306746 12307065 -169441022 + ORR1E LTR MaLR 4 356 -3 5 678 443 248 23 8 chr2 12312102 12312232 -169435855 - ORR1C2 LTR MaLR -250 134 3 5 678 363 247 0 61 chr2 12312235 12312334 -169435753 - MTD LTR MaLR -326 93 1 5 679 249 288 62 142 chr2 12335144 12335192 -169412895 + MT2B LTR ERVL 127 178 -423 5 679 249 288 62 142 chr2 12335266 12335378 -169412709 + MT2B LTR ERVL 179 274 -327 5 679 577 285 60 30 chr2 12335886 12336154 -169411933 + RLTR11B LTR ERVK 1 276 -177 5 679 256 265 0 144 chr2 12338724 12338821 -169409266 + MT2B LTR ERVL 153 235 -366 5 679 1026 233 114 20 chr2 12343883 12344225 -169403862 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 5 679 850 124 0 8 chr2 12344508 12344638 -169403449 - RLTR9E LTR ERVK 0 409 281 5 679 3630 70 8 4 chr2 12344638 12345124 -169402963 + RLTR1C LTR ERV1 1 488 -15 5 679 1879 64 65 34 chr2 12345118 12345411 -169402676 - RLTR9E LTR ERVK -107 302 1 5 679 242 352 8 39 chr2 12348134 12348264 -169399823 + MLT1B LTR MaLR 265 390 0 5 679 2345 121 139 25 chr2 12348561 12348994 -169399093 - RLTR45 LTR ERVK 0 482 1 5 679 691 299 68 23 chr2 12350905 12351192 -169396895 + MLT1A0 LTR MaLR 53 390 -21 5 679 1944 196 117 39 chr2 12357062 12357556 -169390531 - RMER16 LTR ERVK 0 533 1 6 679 886 204 94 77 chr2 12357956 12358318 -169389769 - RLTR9A LTR ERVK 0 368 1 6 679 267 246 129 45 chr2 12363474 12363606 -169384481 - MLT1K LTR MaLR -17 578 436 6 679 488 32 0 0 chr2 12367360 12367423 -169380664 - ORR1A0 LTR MaLR -283 63 1 6 679 8240 39 9 2 chr2 12367423 12368467 -169379620 - ORR1A0-int LTR MaLR 0 1792 742 6 679 2695 25 6 33 chr2 12371006 12371342 -169376745 + IAPLTR2b LTR ERVK 1 327 0 6 679 1247 194 175 39 chr2 12371694 12372054 -169376033 - MTD LTR MaLR 0 419 11 6 679 1124 210 102 57 chr2 12372238 12372579 -169375508 - MTD LTR MaLR -15 404 12 6 679 229 292 105 48 chr2 12373624 12373872 -169374215 + RMER17C LTR ERVK 48 309 -101 6 679 756 270 77 54 chr2 12378636 12378949 -169369138 + RLTR15 LTR ERVK 1 320 -39 6 679 351 343 135 17 chr2 12379113 12379350 -169368737 + MLT1E2 LTR MaLR 345 609 -18 6 679 324 159 48 0 chr2 12382832 12382895 -169365192 - ORR1C1 LTR MaLR 0 384 319 6 679 1016 207 60 143 chr2 12383009 12383310 -169364777 - ORR1C1 LTR MaLR -57 321 53 6 679 2910 75 14 30 chr2 12383310 12383738 -169364349 + BGLII LTR ERVK 1 421 0 6 679 1016 207 60 143 chr2 12383738 12383786 -169364301 - ORR1C1 LTR MaLR -326 52 1 6 679 772 247 64 75 chr2 12387528 12387565 -169360522 + RMER4B LTR ERVK 1 33 -433 6 679 904 215 83 45 chr2 12387983 12388244 -169359843 + RMER4B LTR ERVK 34 293 -292 6 679 3164 126 23 63 chr2 12388262 12388438 -169359649 - LTRIS2 LTR ERV1 -18 546 383 6 679 3164 126 23 63 chr2 12388627 12389019 -169359068 - LTRIS2 LTR ERV1 -182 382 1 6 679 500 236 194 72 chr2 12389036 12389335 -169358752 + RMER4B LTR ERVK 324 611 0 6 679 2205 212 38 103 chr2 12389749 12390402 -169357685 + RMER19C LTR ERVK 1 611 0 6 679 415 297 201 21 chr2 12391999 12392278 -169355809 + MLT1A0 LTR MaLR 1 329 -36 6 679 3155 139 38 24 chr2 12399857 12400409 -169347678 - RLTR12A LTR ERVK -8 560 1 6 679 914 170 5 21 chr2 12403876 12404062 -169344025 - MTC LTR MaLR 0 421 239 6 679 3224 51 2 8 chr2 12411967 12412365 -169335722 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 7 679 2318 221 35 55 chr2 12417061 12417640 -169330447 - RMER2 LTR ERV1 0 567 1 7 679 825 201 43 0 chr2 12418725 12418889 -169329198 - MTD LTR MaLR 0 419 249 7 679 1189 173 81 5 chr2 12425288 12425509 -169322578 - MTD LTR MaLR -177 242 5 7 679 313 271 0 23 chr2 12434916 12435003 -169313084 - MLT1A1 LTR MaLR -13 395 311 7 679 953 277 45 34 chr2 12438080 12438435 -169309652 + ORR1E LTR MaLR 1 359 0 7 680 239 262 49 0 chr2 12457551 12457612 -169290475 + MLT1N2 LTR MaLR 413 476 -86 7 680 680 293 66 66 chr2 12457837 12458170 -169289917 + ORR1E LTR MaLR 6 338 -21 7 680 1810 199 132 47 chr2 12460652 12461071 -169287016 - RMER15 LTR ERVL -62 513 48 7 680 1810 199 132 47 chr2 12461542 12461586 -169286501 - RMER15 LTR ERVL -528 47 11 7 680 1584 219 39 27 chr2 12464962 12465299 -169282788 + ORR1D1 LTR MaLR 33 373 -1 7 680 301 290 69 53 chr2 12465834 12465965 -169282122 - LTR40a LTR ERVL -386 133 1 7 680 3039 65 12 12 chr2 12479531 12479952 -169268135 + BGLII LTR ERVK 1 421 0 8 680 2214 104 35 0 chr2 12482996 12483312 -169264775 + ORR1A4 LTR MaLR 3 329 0 8 680 244 292 20 20 chr2 12484549 12484647 -169263440 - RMER15 LTR ERVL -82 493 396 8 680 795 307 142 42 chr2 12485268 12485747 -169262340 + RMER15 LTR ERVL 49 575 0 8 680 507 301 119 10 chr2 12506332 12506533 -169241554 - MLT1D LTR MaLR -260 245 23 6 680 417 254 82 109 chr2 12506770 12507018 -169241069 + MTEa LTR MaLR 105 379 0 7 681 1864 243 38 32 chr2 12583285 12583756 -169164331 + RMER19C LTR ERVK 138 611 0 6 681 3456 20 5 0 chr2 12588388 12588782 -169159305 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 681 9075 38 3 1 chr2 12588782 12589876 -169158211 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1096 -2 6 681 3384 23 13 0 chr2 12589878 12590269 -169157818 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 681 273 412 74 23 chr2 12598528 12598744 -169149343 + MLT2B3 LTR ERVL 139 365 -189 8 681 757 317 51 96 chr2 12603165 12603560 -169144527 + MTEa LTR MaLR 1 377 -2 8 681 2092 83 0 3 chr2 12605419 12605708 -169142379 + MTA_Mm LTR MaLR 1 288 -108 9 681 621 247 311 21 chr2 12611575 12611854 -169136233 - ORR1D2 LTR MaLR -9 361 3 9 681 3764 71 17 14 chr2 12614565 12615082 -169133005 + MURVY-LTR LTR ERV1 1 519 0 1 681 232 239 56 56 chr2 12618321 12618392 -169129695 + MLT1A1 LTR MaLR 336 406 -2 1 681 2494 185 116 39 chr2 12619644 12620211 -169127876 + RMER19C LTR ERVK 1 611 0 1 681 935 284 67 51 chr2 12626036 12626411 -169121676 + MLT1D LTR MaLR 117 497 -8 1 681 445 326 16 37 chr2 12627844 12628035 -169120052 - MER67D LTR ERV1 -88 426 240 1 681 501 255 68 60 chr2 12628099 12628347 -169119740 - MER67D LTR ERV1 -455 256 2 1 681 417 315 109 29 chr2 12629098 12629337 -169118750 - LTR88b LTR Gypsy? -511 326 69 1 681 416 364 74 12 chr2 12629127 12629369 -169118718 - LTR88c LTR Genie? -558 304 48 1 681 237 208 39 65 chr2 12633566 12633643 -169114444 + RMER15 LTR ERVL 1 75 -500 1 681 341 269 245 32 chr2 12633796 12633984 -169114103 + RMER15 LTR ERVL 336 563 -12 1 681 1450 236 38 30 chr2 12635612 12635984 -169112103 - MTE2b LTR MaLR 0 379 5 1 681 1277 227 213 35 chr2 12640160 12640649 -169107438 + RMER4B LTR ERVK 1 576 -9 1 681 258 341 143 33 chr2 12643072 12643345 -169104742 + LTR50 LTR ERVL 466 768 -27 1 681 922 303 91 36 chr2 12652650 12653034 -169095053 - MTD LTR MaLR -14 405 1 1 681 1194 227 111 32 chr2 12661049 12661390 -169086697 + ORR1C2 LTR MaLR 1 368 -16 1 681 2709 230 13 25 chr2 12679139 12679742 -169068345 + RLTR17 LTR ERVK 1 596 -96 2 681 1577 308 112 8 chr2 12682668 12683424 -169064663 - ERVL-int LTR ERVL -374 5383 4549 2 681 341 328 81 48 chr2 12684669 12684855 -169063232 - MLT2B2 LTR ERVL -320 195 4 2 681 585 351 82 50 chr2 12689746 12690223 -169057864 + MLT1D LTR MaLR 1 492 -13 2 681 425 321 48 38 chr2 12690225 12690514 -169057573 - MTEa LTR MaLR -12 367 49 2 681 767 287 135 33 chr2 12690536 12691204 -169056883 - MTEa-int LTR MaLR -56 1524 667 2 681 328 294 53 45 chr2 12691230 12691362 -169056725 + MLT1D-int LTR MaLR 613 745 -626 2 681 364 357 60 5 chr2 12691396 12691596 -169056491 + MLT1D-int LTR MaLR 837 1047 -442 2 681 1353 215 32 0 chr2 12693757 12694003 -169054084 + ORR1B2 LTR MaLR 1 254 -113 2 681 1151 258 106 23 chr2 12694637 12694939 -169053148 + ORR1E LTR MaLR 3 329 -30 2 681 1745 208 89 5 chr2 12700551 12700933 -169047154 - MTC LTR MaLR -7 414 1 2 681 492 239 109 68 chr2 12702261 12702481 -169045606 + RLTR14 LTR ERV1 56 284 -98 2 681 1206 241 157 68 chr2 12702566 12702707 -169045380 + RMER4B LTR ERVK 21 170 -415 2 681 3359 33 2 5 chr2 12702707 12703103 -169044984 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 2 2 681 7732 70 8 70 chr2 12703104 12704275 -169043812 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 2 681 3097 58 8 8 chr2 12704275 12704671 -169043416 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 681 1206 241 157 68 chr2 12704671 12704867 -169043220 + RMER4B LTR ERVK 171 380 -205 2 681 3014 50 42 3 chr2 12704867 12705248 -169042839 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 681 1206 241 157 68 chr2 12705248 12705417 -169042670 + RMER4B LTR ERVK 381 575 -10 2 681 1438 149 152 14 chr2 12705534 12705948 -169042139 + RLTR31B_Mm LTR ERVK 1 471 -86 2 681 336 241 58 0 chr2 12713369 12713456 -169034631 - MLT2B4 LTR ERVL -59 497 406 2 681 979 263 60 26 chr2 12713436 12713705 -169034382 + MTE2b LTR MaLR 100 377 -2 2 681 278 338 43 25 chr2 12713709 12713870 -169034217 - MLT2B4 LTR ERVL -307 249 86 2 682 261 387 70 18 chr2 12714385 12714550 -169033537 + MLT1B LTR MaLR 4 178 -212 2 682 261 324 0 1759 chr2 12714603 12714668 -169033419 + MLT1B LTR MaLR 179 294 -96 2 682 1893 170 80 45 chr2 12722113 12722513 -169025574 + MTD LTR MaLR 1 414 -5 2 682 1518 219 38 33 chr2 12724918 12725286 -169022801 - ORR1D1 LTR MaLR -4 370 1 2 682 1340 231 146 62 chr2 12731153 12731641 -169016446 + RMER4B LTR ERVK 46 574 -11 2 682 2387 216 146 71 chr2 12734332 12735160 -169012927 + RMER19B LTR ERVK 1 890 -12 2 682 575 246 122 57 chr2 12741684 12741714 -169006373 - ORR1A2 LTR MaLR -48 326 299 3 682 1520 115 23 7 chr2 12741777 12742021 -169006066 - ORR1A2 LTR MaLR -76 298 4 3 682 985 232 65 108 chr2 12742138 12742542 -169005545 - MT2A LTR ERVL -70 531 13 3 682 390 191 34 78 chr2 12747081 12747226 -169000861 + ORR1A3 LTR MaLR 5 128 -198 3 682 1272 103 144 80 chr2 12747156 12747420 -169000667 - MT2B LTR ERVL -320 281 1 3 682 3018 184 20 55 chr2 12770023 12770656 -168977431 + RMER19C LTR ERVK 1 611 0 3 682 1245 227 90 36 chr2 12771512 12771869 -168976218 + MTE2a LTR MaLR 1 376 -3 3 682 433 294 131 24 chr2 12773158 12773364 -168974723 + MTEa LTR MaLR 1 228 -151 3 682 384 286 198 19 chr2 12773361 12773618 -168974469 + MT2A LTR ERVL 231 533 0 3 682 312 314 26 75 chr2 12784939 12785116 -168962971 + MLT1C LTR MaLR 223 467 0 3 682 799 278 88 117 chr2 12786776 12787206 -168960881 + MTD LTR MaLR 2 405 -14 3 682 396 363 25 15 chr2 12789098 12789294 -168958793 - MLT1L LTR MaLR -288 322 125 3 682 3044 50 42 0 chr2 12792304 12792684 -168955403 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 682 8637 52 10 0 chr2 12792684 12793771 -168954316 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 3 682 3103 42 42 0 chr2 12793771 12794151 -168953936 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 682 807 259 72 33 chr2 12794395 12794730 -168953357 - RLTR15 LTR ERVK -11 348 1 4 682 1643 177 39 115 chr2 12796927 12797190 -168950897 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 158 4 682 1643 177 39 115 chr2 12797368 12797513 -168950574 - ORR1C1 LTR MaLR -221 157 1 4 682 6921 62 19 3 chr2 12801665 12802544 -168945543 + RLTR13B1 LTR ERVK 1 893 0 4 682 257 218 146 0 chr2 12827843 12827898 -168920189 + ORR1E LTR MaLR 3 65 -294 4 682 495 330 48 24 chr2 12827912 12828120 -168919967 - MLT1A0 LTR MaLR -149 216 4 4 682 1843 212 78 3 chr2 12832193 12832580 -168915507 + MTD LTR MaLR 4 419 0 4 682 251 342 117 0 chr2 12840440 12840560 -168907527 - MLT1J LTR MaLR -368 144 11 4 682 1783 208 0 18 chr2 12841302 12841645 -168906442 - MTB_Mm LTR MaLR -70 337 1 4 683 226 236 0 18 chr2 12848739 12848795 -168899292 - MTEa LTR MaLR -8 371 317 4 683 2114 189 37 60 chr2 12848797 12849318 -168898769 - RLTR31A_Mm LTR ERVK -2 559 1 4 683 1097 256 16 33 chr2 12849340 12849582 -168898505 - MTEa LTR MaLR -71 308 71 4 683 696 319 113 45 chr2 12849636 12849971 -168898116 - MTE2b LTR MaLR -3 376 19 4 683 1109 268 58 17 chr2 12851965 12852326 -168895761 - MLT1B LTR MaLR -3 387 12 4 683 1506 240 40 92 chr2 12852842 12853017 -168895070 + MTEa LTR MaLR 1 172 -207 4 683 1506 240 40 92 chr2 12853382 12853606 -168894481 + MTEa LTR MaLR 173 379 0 4 683 1959 155 65 63 chr2 12857751 12858276 -168889811 - RMER4B LTR ERVK -9 576 17 4 683 280 291 0 25 chr2 12869802 12869883 -168878204 - MLT1A1 LTR MaLR -12 396 318 5 683 872 226 140 48 chr2 12877256 12877591 -168870496 - RLTR9A LTR ERVK 0 368 3 5 683 3725 25 0 0 chr2 12888132 12888528 -168859559 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 683 498 321 110 55 chr2 12891046 12891387 -168856700 - MLT1A LTR MaLR -26 364 1 5 683 283 267 39 47 chr2 12891650 12891847 -168856240 - MLT1F LTR MaLR -311 238 8 5 683 437 282 155 0 chr2 12894039 12894220 -168853867 - MTE2b LTR MaLR 0 379 171 5 683 290 254 94 58 chr2 12895553 12895591 -168852496 - MLT2B4 LTR ERVL -411 145 3 5 683 330 242 50 90 chr2 12895591 12895691 -168852396 - MTE2b LTR MaLR -281 98 3 5 683 419 306 223 0 chr2 12896153 12896463 -168851624 - MTE2a LTR MaLR 0 379 1 5 683 1171 236 32 133 chr2 12898670 12899076 -168849011 - MTE2a LTR MaLR -14 365 1 5 683 330 297 130 23 chr2 12902789 12902920 -168845167 - MLT1C LTR MaLR -5 462 318 5 683 375 326 90 49 chr2 12902943 12903188 -168844899 - MLT1C LTR MaLR -186 281 27 5 683 232 231 42 56 chr2 12912981 12913076 -168835011 - ORR1D1 LTR MaLR -314 94 1 5 683 853 265 80 103 chr2 12937489 12937876 -168810211 + MTEa LTR MaLR 1 378 -1 5 683 402 276 43 45 chr2 12940516 12940707 -168807380 - MLT1A1 LTR MaLR -4 404 161 5 683 741 264 129 113 chr2 12941159 12941530 -168806557 + MTE2a LTR MaLR 3 379 0 5 683 303 312 106 39 chr2 12945726 12945878 -168802209 - MLT1B LTR MaLR -1 389 226 6 683 270 250 47 23 chr2 12945878 12945964 -168802123 + ORR1D1 LTR MaLR 3 90 -284 6 683 1343 241 83 23 chr2 12946116 12946465 -168801622 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 6 683 938 291 19 98 chr2 12948251 12948617 -168799470 + MLT1B LTR MaLR 35 371 -19 6 683 2108 140 12 0 chr2 12951015 12951277 -168796810 + ORR1A2 LTR MaLR 1 266 -61 6 683 2108 140 12 0 chr2 12952062 12952121 -168795966 + ORR1A2 LTR MaLR 267 325 -2 6 683 332 304 0 0 chr2 12952592 12952671 -168795416 + MLT1C LTR MaLR 115 193 -274 6 683 287 320 10 39 chr2 12963504 12963608 -168784479 + MTEb LTR MaLR 279 379 0 6 683 2015 214 71 23 chr2 12964172 12964568 -168783519 - MTD LTR MaLR 0 419 5 6 683 2092 157 14 20 chr2 12964698 12965056 -168783031 + MTB_Mm LTR MaLR 50 405 -2 6 683 3176 38 52 0 chr2 12967119 12967488 -168780599 - RLTR10 LTR ERVK -2 388 1 6 683 2874 10 25 6 chr2 12971223 12971539 -168776548 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 322 0 6 683 481 329 108 60 chr2 12973487 12973839 -168774248 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 2 6 683 1644 166 220 0 chr2 12975359 12975673 -168772414 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 2 6 684 3823 26 28 9 chr2 12976479 12976907 -168771180 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 6 684 255 274 88 59 chr2 12978584 12978720 -168769367 - MLT1C LTR MaLR -107 503 364 6 684 358 286 36 100 chr2 12980331 12980517 -168767570 - MLT1C LTR MaLR -52 415 166 6 684 340 281 170 43 chr2 12980670 12980799 -168767288 - MLT1C LTR MaLR -294 173 23 6 684 3549 194 55 35 chr2 12990890 12991691 -168756396 + RLTR40 LTR ERVK 1 817 0 6 684 512 238 84 8 chr2 12992899 12993030 -168755057 + MTD LTR MaLR 279 419 0 6 684 557 228 144 40 chr2 12993413 12993614 -168754473 - MLT1C LTR MaLR -193 274 53 6 684 319 316 40 104 chr2 13001214 13001387 -168746700 + ORR1E LTR MaLR 1 162 -197 3 684 1414 161 95 8 chr2 13007040 13007362 -168740725 - MTC LTR MaLR -7 412 1 7 684 895 279 48 89 chr2 13008143 13008536 -168739551 + MTEa LTR MaLR 2 378 -1 8 684 402 314 37 31 chr2 13008791 13008982 -168739105 - ORR1E LTR MaLR -167 192 1 9 684 428 330 61 61 chr2 13016550 13016876 -168731211 - ORR1E LTR MaLR -5 354 29 1 684 1003 252 30 11 chr2 13032062 13032327 -168715760 + MTD LTR MaLR 1 270 -149 3 684 827 169 62 64 chr2 13040530 13040998 -168707089 + RMER17C LTR ERVK 1 405 -5 5 684 247 360 128 19 chr2 13047873 13048029 -168700058 + LTR40a LTR ERVL 30 202 -317 6 684 324 310 44 9 chr2 13048690 13048804 -168699283 + LTR40a LTR ERVL 402 519 0 6 684 668 304 124 10 chr2 13048996 13049302 -168698785 + MTEb LTR MaLR 1 341 -38 6 684 245 313 40 80 chr2 13059810 13059935 -168688152 - MLT1A0 LTR MaLR -227 138 19 7 684 357 308 101 103 chr2 13076619 13077017 -168671070 + MLT1C LTR MaLR 1 397 -70 9 684 274 268 0 14 chr2 13083871 13083943 -168664144 - MLT1F LTR MaLR -475 73 3 9 684 235 196 17 67 chr2 13088392 13088452 -168659635 + RLTR25B LTR ERVK 428 484 -544 1 684 2337 170 84 8 chr2 13095514 13095989 -168652098 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 511 -16 1 684 225 203 16 63 chr2 13100803 13100866 -168647221 - RMER12B LTR ERVK -1182 222 163 1 684 294 298 44 44 chr2 13100878 13101015 -168647072 - ORR1E LTR MaLR -219 140 4 1 684 556 177 0 0 chr2 13104154 13104250 -168643837 + MTC LTR MaLR 1 96 -325 1 684 2497 94 25 0 chr2 13105272 13105591 -168642496 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 1 684 2033 189 15 0 chr2 13106704 13107037 -168641050 + MTC LTR MaLR 84 421 0 1 685 342 293 100 62 chr2 13110011 13110171 -168637916 + ORR1E LTR MaLR 1 166 -193 1 685 249 238 69 35 chr2 13110325 13110412 -168637675 + ORR1E LTR MaLR 287 376 -3 1 685 2224 180 24 5 chr2 13111985 13112398 -168635689 + MTC LTR MaLR 1 421 0 1 685 445 297 102 89 chr2 13113673 13113725 -168634362 - MLT1B LTR MaLR -2 388 346 1 685 377 306 81 58 chr2 13113725 13114072 -168634015 - ORR1E LTR MaLR 0 359 5 1 685 445 297 102 89 chr2 13114072 13114400 -168633687 - MLT1B LTR MaLR -45 345 3 1 685 226 318 11 76 chr2 13115651 13115670 -168632417 + MT2B2 LTR ERVL 156 241 -343 1 685 887 261 76 41 chr2 13118830 13119154 -168628933 + MLT1A1 LTR MaLR 17 355 -53 1 685 3304 46 5 0 chr2 13119154 13119548 -168628539 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 685 887 261 76 41 chr2 13119548 13119590 -168628497 + MLT1A1 LTR MaLR 356 396 -12 1 685 581 298 63 100 chr2 13125642 13125992 -168622095 + MLT1B LTR MaLR 20 356 -34 1 685 520 300 95 67 chr2 13130913 13131280 -168616807 - ORR1D2 LTR MaLR -8 362 1 1 685 435 311 179 16 chr2 13131630 13131937 -168616150 - ORR1E LTR MaLR 0 359 3 1 685 956 169 98 0 chr2 13132858 13133041 -168615046 - MERVL_2A-int LTR ERVL -5560 201 1 1 685 631 260 39 15 chr2 13133041 13133244 -168614843 - MT2B LTR ERVL 0 601 394 1 685 345 284 160 58 chr2 13134889 13135210 -168612877 - MTEa LTR MaLR -2 377 1 1 685 404 310 124 69 chr2 13141899 13142117 -168605970 + MTD LTR MaLR 185 414 -5 2 685 549 304 88 88 chr2 13151229 13151525 -168596562 + ORR1E LTR MaLR 2 297 -62 2 685 262 354 45 78 chr2 13166255 13166497 -168581590 - RLTR25A LTR ERVK -869 234 1 2 685 597 305 39 66 chr2 13167680 13167985 -168580102 + MLT1A0 LTR MaLR 3 299 -66 2 685 3036 23 2 145 chr2 13171305 13171760 -168576327 - RLTR10 LTR ERVK 0 390 1 2 685 16454 20 46 1 chr2 13171762 13173658 -168574429 - RLTR10-int LTR ERVK -3 1984 3 2 685 3036 23 2 145 chr2 13173660 13174115 -168573972 - RLTR10 LTR ERVK 0 390 1 2 685 603 316 46 78 chr2 13175284 13175631 -168572456 + MLT2B2 LTR ERVL 177 512 -3 2 685 1138 246 89 23 chr2 13175880 13176271 -168571816 + MTD LTR MaLR 3 419 0 2 685 325 315 46 0 chr2 13178785 13178893 -168569194 + MTE2b LTR MaLR 1 113 -246 2 685 499 206 167 71 chr2 13180090 13180132 -168567955 + MTE2b LTR MaLR 144 180 -199 2 685 2126 106 18 27 chr2 13180132 13180462 -168567625 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 2 685 499 206 167 71 chr2 13180462 13180617 -168567470 + MTE2b LTR MaLR 181 360 -19 2 685 1053 177 43 162 chr2 13181257 13181536 -168566551 + ORR1C2 LTR MaLR 17 321 -63 2 685 1053 164 42 160 chr2 13181716 13181792 -168566295 + ORR1C2 LTR MaLR 322 384 0 2 685 2097 73 31 100 chr2 13182410 13182705 -168565382 + ORR1A2 LTR MaLR 1 285 -42 2 685 2097 73 31 100 chr2 13182903 13182958 -168565129 + ORR1A2 LTR MaLR 286 327 0 2 685 701 287 93 38 chr2 13185824 13186168 -168561919 + MLT1B LTR MaLR 24 386 -4 2 685 331 319 16 32 chr2 13194460 13194583 -168553504 - MLT1B LTR MaLR -74 316 196 2 685 1706 167 7 81 chr2 13195166 13195649 -168552438 - RMER17C LTR ERVK -519 439 16 2 685 486 317 73 47 chr2 13195719 13195994 -168552093 - MER21B LTR ERV1 -11 852 571 2 685 257 266 0 0 chr2 13197670 13197734 -168550353 + ORR1E LTR MaLR 46 109 -250 2 685 422 283 116 88 chr2 13211138 13211456 -168536631 - MLT1A LTR MaLR 0 374 39 2 685 933 298 16 4 chr2 13214738 13214994 -168533093 + MTE2b LTR MaLR 4 262 -117 2 685 2519 184 62 47 chr2 13216932 13217524 -168530563 - RLTR25B LTR ERVK -427 601 1 2 685 1773 112 42 90 chr2 13229171 13229504 -168518583 + ORR1A4 LTR MaLR 1 317 -12 3 686 917 279 117 31 chr2 13258664 13259022 -168489065 + RMER5 LTR ERV1 26 414 -120 3 686 2803 124 18 22 chr2 13270689 13271142 -168476945 + RLTR11B LTR ERVK 1 451 -2 3 686 907 239 151 22 chr2 13274415 13274751 -168473336 - MTD LTR MaLR 0 419 13 3 686 1183 191 242 56 chr2 13275019 13275382 -168472705 + RLTR20C LTR ERVK 1 443 -91 3 686 1183 191 242 56 chr2 13275410 13275496 -168472591 + RLTR20C LTR ERVK 444 534 0 3 686 284 217 82 61 chr2 13287135 13287233 -168460854 + RMER10A LTR ERVL 321 420 -22 3 686 890 269 89 80 chr2 13287570 13287962 -168460125 - MTE2a LTR MaLR 0 419 20 3 686 1347 174 5 33 chr2 13291465 13291731 -168456356 + MT2A LTR ERVL 1 419 -182 3 686 1238 218 49 37 chr2 13295089 13295484 -168452603 + RMER16 LTR ERVK 1 394 -139 3 686 821 153 36 7 chr2 13296889 13297027 -168451060 + RMER16 LTR ERVK 392 533 0 3 686 426 329 59 108 chr2 13298294 13298665 -168449422 - ORR1E LTR MaLR -6 353 1 3 686 859 211 100 33 chr2 13304837 13305244 -168442843 - RLTR20A1 LTR ERVK -17 561 2 4 686 336 342 107 34 chr2 13314381 13314672 -168433415 + MLT1C LTR MaLR 156 467 0 4 686 268 225 14 0 chr2 13316066 13316137 -168431950 + MLT1C LTR MaLR 172 243 -224 4 686 1823 232 48 2 chr2 13327421 13327814 -168420273 + MTD LTR MaLR 1 411 -8 4 686 891 167 37 53 chr2 13339086 13339194 -168408893 + MTC LTR MaLR 2 104 -317 4 686 891 167 37 53 chr2 13339253 13339320 -168408767 + MTC LTR MaLR 105 174 -247 4 686 334 106 0 108 chr2 13339320 13339394 -168408693 + RLTR20B3 LTR ERVK 1 66 -511 4 686 2753 88 80 0 chr2 13339424 13339801 -168408286 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 4 686 1034 265 26 150 chr2 13351517 13351943 -168396144 + MTE2b LTR MaLR 1 373 -6 4 686 1273 231 52 45 chr2 13364636 13365017 -168383070 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 4 687 1488 237 24 60 chr2 13383848 13384265 -168363822 - MTD LTR MaLR -2 417 16 5 687 339 291 60 71 chr2 13391037 13391103 -168356984 + MT2B LTR ERVL 102 158 -443 5 687 3162 112 65 35 chr2 13393513 13394050 -168354037 - RMER2 LTR ERV1 -14 553 1 5 687 3151 65 8 0 chr2 13395208 13395605 -168352482 + MTB LTR MaLR 1 400 0 5 687 1012 245 147 15 chr2 13417434 13417761 -168330326 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 5 687 272 260 71 30 chr2 13440440 13440539 -168307548 + RMER15 LTR ERVL 400 502 -73 6 687 724 308 60 60 chr2 13449235 13449615 -168298472 + MER76 LTR ERVL 26 405 -286 6 687 227 320 64 64 chr2 13458876 13459063 -168289024 - RLTR21 LTR ERVK -326 1246 1060 6 687 234 295 26 87 chr2 13458983 13459098 -168288989 + RLTR13C1 LTR ERVK 162 269 -714 6 687 1038 276 94 24 chr2 13471451 13471839 -168276248 + MTD LTR MaLR 3 405 -14 6 688 528 307 83 51 chr2 13512000 13512254 -168235833 + MLT1A0 LTR MaLR 10 271 -94 2 688 346 304 140 18 chr2 13512454 13512625 -168235462 + MLT1A1 LTR MaLR 22 213 -195 2 688 518 319 131 41 chr2 13512747 13512992 -168235095 - MLT1A1 LTR MaLR -134 274 8 2 688 596 318 142 22 chr2 13519285 13519694 -168228393 + RMER5 LTR ERV1 34 491 -43 3 688 269 281 104 67 chr2 13523003 13523167 -168224920 - RMER15 LTR ERVL 0 575 406 4 688 1890 276 81 20 chr2 13523468 13524109 -168223978 - RMER15-int LTR ERVL -115 4884 4205 4 688 382 278 215 31 chr2 13528240 13528496 -168219591 - ORR1E LTR MaLR -36 323 21 4 688 2984 68 5 8 chr2 13544325 13544722 -168203365 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 688 809 333 65 92 chr2 13547767 13548031 -168200056 - MLT1D LTR MaLR 0 505 237 6 688 809 333 65 92 chr2 13548206 13548242 -168199845 - MLT1D LTR MaLR -269 236 213 6 688 809 333 65 92 chr2 13548269 13548486 -168199601 - MLT1D LTR MaLR -293 212 1 6 688 373 217 0 0 chr2 13548892 13548961 -168199126 + MTC LTR MaLR 1 69 -352 6 688 358 128 88 0 chr2 13549164 13549241 -168198846 + MTC LTR MaLR 204 312 -82 6 688 1740 160 61 10 chr2 13549552 13549862 -168198225 + MTC LTR MaLR 96 421 0 7 688 243 259 151 12 chr2 13550272 13550358 -168197729 + MTEb LTR MaLR 258 355 -24 7 688 1104 323 72 36 chr2 13551854 13552323 -168195764 - MER77 LTR ERVL -60 547 62 8 688 312 342 117 22 chr2 13553982 13554212 -168193875 - LTR16B1 LTR ERVL -2 478 227 8 688 1395 250 81 3 chr2 13558043 13558388 -168189699 - MTEa LTR MaLR -7 372 1 9 688 899 295 33 42 chr2 13567207 13567543 -168180544 - MTE2a LTR MaLR -2 377 45 1 688 413 262 81 81 chr2 13600464 13600638 -168147449 + MLT1A LTR MaLR 11 184 -190 1 688 272 245 234 0 chr2 13600612 13600706 -168147381 + MLT1A LTR MaLR 332 447 -20 1 688 403 133 13 26 chr2 13603093 13603170 -168144917 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1772 76 1 1 688 4024 54 0 2 chr2 13603777 13604295 -168143792 + RLTR22_Mus LTR ERVK 1 517 -1291 1 688 323 333 174 26 chr2 13606048 13606359 -168141728 - ORR1E LTR MaLR -2 357 1 1 688 310 243 14 0 chr2 13606359 13606415 -168141672 - MTE-int LTR MaLR -53 1527 1471 1 688 1037 262 38 17 chr2 13606431 13606790 -168141297 - MTD LTR MaLR -15 404 2 1 688 3108 302 120 33 chr2 13607706 13609033 -168139054 - MTE-int LTR MaLR -138 1442 1 1 688 572 275 143 35 chr2 13609058 13609357 -168138730 - ORR1E LTR MaLR -34 345 1 1 688 1217 281 25 85 chr2 13609925 13610325 -168137762 + MTE2b LTR MaLR 4 379 0 1 688 451 291 30 62 chr2 13626198 13626500 -168121587 - ORR1E LTR MaLR -12 347 1 1 688 1658 164 23 46 chr2 13627119 13627426 -168120661 + ORR1B2 LTR MaLR 68 367 0 1 688 1463 235 35 32 chr2 13629436 13629775 -168118312 - MTD LTR MaLR -12 407 68 2 688 273 344 108 25 chr2 13629801 13629959 -168118128 - LTR33 LTR ERVL -340 175 5 2 689 447 306 179 15 chr2 13634633 13634924 -168113163 - MLT1F LTR MaLR -93 455 89 2 689 499 103 51 0 chr2 13637274 13637352 -168110735 + MTC LTR MaLR 1 82 -339 2 689 2230 150 3 28 chr2 13639171 13639217 -168108870 + MTC LTR MaLR 68 107 -314 2 689 2230 150 3 28 chr2 13639442 13639758 -168108329 + MTC LTR MaLR 108 421 0 2 689 242 338 83 23 chr2 13640279 13640412 -168107675 + ORR1E LTR MaLR 9 149 -210 2 689 523 314 129 89 chr2 13643624 13644164 -168103923 - LTR80A LTR ERVL -13 570 2 2 689 707 320 133 42 chr2 13650159 13650609 -168097478 + MT2A LTR ERVL 28 518 -15 2 689 252 258 108 0 chr2 13651235 13651328 -168096759 - LTR37A LTR ERV1 -5 421 319 2 689 232 270 162 0 chr2 13651414 13651525 -168096562 - LTR37A LTR ERV1 -259 167 39 2 689 245 360 52 52 chr2 13657559 13657732 -168090355 + MER31A LTR ERV1 1 173 -312 2 689 1003 298 80 27 chr2 13657749 13658125 -168089962 + MTD LTR MaLR 10 405 -14 2 689 314 326 85 81 chr2 13658130 13658326 -168089761 + MER31A LTR ERV1 190 398 -87 2 689 314 326 85 81 chr2 13658596 13658657 -168089430 + MER31A LTR ERV1 399 448 -37 2 689 354 288 123 28 chr2 13658700 13658911 -168089176 + LTR37A LTR ERV1 87 317 -109 2 689 563 309 84 36 chr2 13659964 13660323 -168087764 + MTE2b LTR MaLR 3 378 -1 2 689 1802 182 105 8 chr2 13664896 13665278 -168082809 + MTC LTR MaLR 3 421 0 2 689 3699 103 73 0 chr2 13668486 13669030 -168079057 + MT2B2 LTR ERVL 1 584 0 2 689 314 248 186 0 chr2 13670047 13670160 -168077927 + LTR16A LTR ERVL 310 443 -8 2 689 1071 262 98 30 chr2 13674377 13674842 -168073245 - MT2B LTR ERVL -40 561 1 2 689 337 343 29 0 chr2 13674926 13675063 -168073024 + LTR53 LTR ERVL 3 143 -376 2 689 729 339 67 34 chr2 13675047 13675465 -168072622 + LTR53 LTR ERVL 80 511 -8 2 689 243 360 64 69 chr2 13675478 13675626 -168072461 - LTR16C LTR ERVL -115 374 224 2 689 243 360 64 69 chr2 13675655 13675694 -168072393 - LTR16C LTR ERVL -266 223 188 2 689 1536 224 70 0 chr2 13676641 13677019 -168071068 - MTD LTR MaLR -14 405 10 2 689 594 305 71 63 chr2 13678470 13678820 -168069267 - ORR1E LTR MaLR -6 353 1 2 689 1011 264 75 33 chr2 13679992 13680297 -168067790 - MTEa LTR MaLR -61 318 1 2 689 259 248 56 19 chr2 13686221 13686328 -168061759 + MTEb LTR MaLR 269 379 0 2 689 315 330 168 0 chr2 13686328 13686524 -168061563 + MLT1A0 LTR MaLR 134 362 -3 2 689 384 237 99 71 chr2 13686566 13686707 -168061380 + MLT1A LTR MaLR 19 163 -211 2 689 347 252 75 0 chr2 13686768 13686875 -168061212 + MLT1A LTR MaLR 319 433 -34 2 689 737 298 110 6 chr2 13687605 13687932 -168060155 + MLT1B LTR MaLR 27 387 -3 3 689 644 279 64 81 chr2 13688530 13688874 -168059213 - ORR1E LTR MaLR 0 359 22 3 689 1967 184 75 18 chr2 13690743 13691141 -168056946 + MTC LTR MaLR 1 421 0 3 689 234 284 27 13 chr2 13702101 13702176 -168045911 + MTEa LTR MaLR 278 353 -26 3 689 2147 143 8 6 chr2 13705333 13705691 -168042396 - ORR1B2 LTR MaLR -8 359 1 3 689 2299 163 34 16 chr2 13711413 13711855 -168036232 - RMER6B LTR ERVK -11 450 1 3 689 271 314 24 71 chr2 13712118 13712245 -168035842 + LTR81C LTR ERV1? 862 982 -171 3 689 844 246 94 3 chr2 13716102 13716388 -168031699 + MER57D LTR ERV1 96 407 -4 3 689 674 232 130 51 chr2 13718965 13719383 -168028704 - MT2A LTR ERVL -120 481 1 3 689 404 266 75 68 chr2 13728372 13728505 -168019582 - MLT1H1 LTR MaLR -10 545 412 3 689 408 321 135 48 chr2 13728540 13728769 -168019318 - MLT1H1 LTR MaLR -231 324 76 3 689 381 315 78 87 chr2 13730471 13730710 -168017377 - LTR16E2 LTR ERVL 0 568 314 3 689 792 308 37 33 chr2 13740386 13740823 -168007264 - RMER15 LTR ERVL -14 561 3 3 689 1350 267 52 22 chr2 13743358 13743389 -168004698 - MTEb LTR MaLR 0 379 346 3 689 1350 267 52 22 chr2 13743488 13743824 -168004263 - MTEb LTR MaLR -34 345 1 3 689 248 274 55 61 chr2 13744040 13744203 -168003884 + LTR73 LTR ERV1 313 474 -98 4 689 3833 194 52 44 chr2 13758532 13759391 -167988696 + RMER13B LTR ERVK 1 866 -42 4 689 497 256 133 78 chr2 13759376 13759647 -167988440 - MER34A1 LTR ERV1 -140 447 153 4 689 413 364 79 41 chr2 13759658 13759976 -167988111 + ORR1E LTR MaLR 19 348 -11 4 689 280 202 153 41 chr2 13759998 13760096 -167987991 - MER34A1 LTR ERV1 -478 109 1 4 689 2107 112 22 0 chr2 13760104 13760416 -167987671 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 4 689 670 293 63 98 chr2 13761084 13761451 -167986636 + ORR1E LTR MaLR 6 359 0 4 86 501 270 19 44 chr2 13762512 13762671 -167985416 - MLT2B1 LTR ERVL 0 567 413 4 690 731 265 39 102 chr2 13762680 13763070 -167985017 - MTEb LTR MaLR -13 366 5 4 690 251 288 179 67 chr2 13763253 13763387 -167984700 - MLT2B1 LTR ERVL -325 195 47 4 690 584 235 9 0 chr2 13763383 13763498 -167984589 + MTD LTR MaLR 9 124 -295 4 690 327 289 0 28 chr2 13765477 13765584 -167982503 + MLT1A1 LTR MaLR 305 408 0 4 690 3377 40 0 0 chr2 13769823 13770219 -167977868 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 690 9158 39 1 0 chr2 13770219 13771316 -167976771 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 4 690 3416 38 0 0 chr2 13771316 13771712 -167976375 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 690 2233 110 3 0 chr2 13778152 13778460 -167969627 + RLTR27 LTR ERVK 1 309 0 4 690 1565 263 68 8 chr2 13778694 13779074 -167969013 + MTD LTR MaLR 14 416 -3 4 690 302 314 77 99 chr2 13782633 13782866 -167965221 + ORR1E LTR MaLR 91 318 -41 4 690 2961 60 8 35 chr2 13785094 13785493 -167962594 - RLTR10 LTR ERVK -2 388 1 4 690 8460 16 0 2 chr2 13785493 13786490 -167961597 - RLTR10-int LTR ERVK -1 1986 992 4 690 7521 35 9 6 chr2 13786570 13787515 -167960572 - RLTR10-int LTR ERVK -999 988 41 4 690 2949 62 8 35 chr2 13787527 13787926 -167960161 - RLTR10 LTR ERVK -2 388 1 4 690 709 287 67 43 chr2 13793639 13793938 -167954149 + MTEa LTR MaLR 68 373 -6 4 690 683 355 69 41 chr2 13794247 13794737 -167953350 + MLT1H-int LTR MaLR 59 562 -847 4 690 562 315 70 52 chr2 13795373 13795644 -167952443 + MLT1H-int LTR MaLR 725 1000 -409 4 690 402 340 90 67 chr2 13795671 13796027 -167952060 - ORR1D2 LTR MaLR -2 368 5 4 690 646 338 65 65 chr2 13801331 13801670 -167946417 - ORR1E LTR MaLR -2 357 19 4 690 451 353 109 13 chr2 13801772 13802148 -167945939 - MT2A LTR ERVL -10 523 112 4 690 354 287 50 65 chr2 13802176 13802403 -167945684 + MTEa LTR MaLR 8 307 -72 4 690 413 269 88 80 chr2 13802453 13802703 -167945384 - MTE2b LTR MaLR -11 368 90 4 690 766 315 28 85 chr2 13804327 13804406 -167943681 + ORR1E LTR MaLR 6 83 -276 4 690 2189 119 0 58 chr2 13804406 13804753 -167943334 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 4 690 766 315 28 85 chr2 13804753 13805037 -167943050 + ORR1E LTR MaLR 84 348 -11 4 690 1178 309 149 31 chr2 13805051 13805590 -167942497 + ORR1E-int LTR MaLR 7 621 -959 4 690 598 347 167 15 chr2 13809212 13809554 -167938533 + ORR1E-int LTR MaLR 650 1043 -537 4 690 350 252 71 0 chr2 13809583 13809682 -167938405 + MLT2B3 LTR ERVL 1 106 -448 4 690 505 295 62 17 chr2 13809845 13810021 -167938066 + MTEa LTR MaLR 196 379 0 4 690 427 319 175 18 chr2 13812473 13812690 -167935397 + MTEb LTR MaLR 2 252 -107 4 690 2061 153 79 3 chr2 13812938 13813304 -167934783 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 4 690 2579 136 9 36 chr2 13813698 13814164 -167933923 + RLTR11B LTR ERVK 1 453 0 4 690 1021 295 48 10 chr2 13814956 13815247 -167932840 + MTEa LTR MaLR 1 302 -77 4 690 295 206 16 0 chr2 13815504 13815567 -167932520 + MTEa LTR MaLR 316 379 0 4 690 1246 245 21 7 chr2 13815580 13815860 -167932227 + MTE-int LTR MaLR 36 319 -1261 4 690 496 271 49 21 chr2 13815833 13815976 -167932111 + MTEb LTR MaLR 233 379 0 4 690 443 287 9 0 chr2 13816093 13816201 -167931886 - MTEb LTR MaLR -8 371 263 4 690 2456 150 19 41 chr2 13819221 13819697 -167928390 - RMER17D2 LTR ERVK 0 809 351 4 690 2456 150 19 41 chr2 13819777 13819841 -167928246 - RMER17D2 LTR ERVK -459 350 282 4 690 2149 103 48 12 chr2 13820138 13820473 -167927614 - RMER17D2 LTR ERVK -462 347 1 5 690 479 325 153 14 chr2 13821823 13822032 -167926055 + MLT1A1 LTR MaLR 169 406 -2 5 690 3469 211 66 62 chr2 13832612 13833409 -167914678 - RLTR13C1 LTR ERVK 0 983 183 5 690 4400 68 3 12 chr2 13833409 13833978 -167914109 - LTRIS2 LTR ERV1 0 564 1 5 690 3469 211 66 62 chr2 13833978 13834159 -167913928 - RLTR13C1 LTR ERVK -801 182 1 5 690 3736 55 11 88 chr2 13834746 13835301 -167912786 + RLTR1B LTR ERV1 1 512 0 5 690 610 330 78 5 chr2 13836453 13836672 -167911415 + MLT2B4 LTR ERVL 3 237 -319 5 690 713 242 7 7 chr2 13846246 13846400 -167901687 + RLTR15 LTR ERVK 10 163 -196 5 690 1338 128 66 9 chr2 13846516 13846744 -167901343 - RLTR15 LTR ERVK -6 353 113 5 690 330 341 75 52 chr2 13846923 13847136 -167900951 - ORR1E LTR MaLR -105 254 37 5 690 498 298 87 25 chr2 13849028 13849224 -167898863 + MLT1A1 LTR MaLR 4 211 -197 5 690 409 359 48 74 chr2 13851192 13851529 -167896558 - ORR1E LTR MaLR -11 348 21 5 690 664 228 132 204 chr2 13858633 13859207 -167888880 - MT2A LTR ERVL 0 533 1 5 690 975 241 139 52 chr2 13859788 13860134 -167887953 - MLT2D LTR ERVL 0 414 39 5 690 1297 254 81 24 chr2 13876012 13876479 -167871608 + RMER5 LTR ERV1 33 526 -8 5 690 1451 218 78 30 chr2 13877097 13877495 -167870592 + MTD LTR MaLR 1 417 -2 5 690 1393 313 45 10 chr2 13881737 13882224 -167865863 - RMER20A LTR ERVK 0 516 13 5 690 2192 134 97 3 chr2 13882254 13882614 -167865473 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 5 690 4815 181 195 103 chr2 13882614 13884412 -167863675 - ORR1B1-int LTR MaLR 0 1963 1 5 690 353 314 111 75 chr2 13886349 13886628 -167861459 - MLT1H LTR MaLR -197 352 64 5 690 684 229 6 89 chr2 13886880 13887047 -167861040 + RLTR11A2 LTR ERVK 6 158 -369 5 690 1741 216 31 18 chr2 13887253 13887635 -167860452 + RLTR11A2 LTR ERVK 141 527 0 5 691 603 228 51 82 chr2 13896801 13896851 -167851236 + RMER12B LTR ERVK 1211 1263 -141 5 691 603 228 51 82 chr2 13896917 13897062 -167851025 + RMER12B LTR ERVK 1264 1399 -5 5 691 974 218 25 7 chr2 13898228 13898439 -167849648 + ORR1D1 LTR MaLR 151 368 -6 5 691 288 327 28 47 chr2 13898464 13898570 -167849517 - MTE-int LTR MaLR -739 841 738 5 691 3555 179 47 70 chr2 13898972 13899778 -167848309 - RLTR13C2 LTR ERVK -20 788 1 6 691 4580 178 3 9 chr2 13899787 13900679 -167847408 - ETnERV3-int LTR ERVK -24 5784 4898 6 691 2294 174 97 14 chr2 13900679 13901185 -167846902 + RLTR13C1 LTR ERVK 392 983 0 6 691 4173 64 24 31 chr2 13901250 13901829 -167846258 + LTRIS_Mus LTR ERV1 1 575 -12 6 691 226 240 24 118 chr2 13901876 13901961 -167846126 + MLT1J1 LTR MaLR 241 317 -127 6 691 1736 203 38 68 chr2 13902149 13902593 -167845494 + RLTR1B LTR ERV1 54 512 0 6 691 805 338 58 68 chr2 13907904 13908269 -167839818 - MLT1A0 LTR MaLR -4 361 1 6 691 1791 216 89 164 chr2 13908596 13909250 -167838837 + RMER19C LTR ERVK 7 611 0 6 691 2819 188 58 0 chr2 13909250 13909820 -167838267 + MurERV4_19-int LTR ERVK 1 603 -5177 6 691 13000 125 51 15 chr2 13915859 13918050 -167830037 + MurERV4_19-int LTR ERVK 590 2859 -2921 6 691 3888 113 8 6 chr2 13920321 13920945 -167827142 + MurERV4_19-int LTR ERVK 2854 3478 -2302 6 691 2188 119 0 3 chr2 13920945 13921265 -167826822 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 6 691 10160 114 27 38 chr2 13921265 13922850 -167825237 + MurERV4_19-int LTR ERVK 3470 5042 -738 6 691 10160 114 27 38 chr2 13923367 13923554 -167824533 + MurERV4_19-int LTR ERVK 5043 5223 -557 6 691 384 202 24 0 chr2 13923573 13923657 -167824430 + MurERV4_19-int LTR ERVK 5187 5272 -508 6 691 3106 9 6 0 chr2 13923657 13924001 -167824086 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 6 691 1910 261 24 65 chr2 13924007 13924588 -167823499 + RMER19C LTR ERVK 47 603 -8 6 691 340 312 87 6 chr2 13927465 13927626 -167820461 + RLTR42-int LTR ERVK 1227 1400 -4122 6 691 267 306 82 103 chr2 13928046 13928327 -167819760 + RMER15 LTR ERVL 284 558 -17 6 691 323 295 44 21 chr2 13928528 13928653 -167819434 + MTEb LTR MaLR 233 365 -14 6 691 2364 54 22 16 chr2 13931833 13932153 -167815934 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 6 691 364 278 54 130 chr2 13932601 13932862 -167815225 + ORR1E LTR MaLR 61 301 -58 6 691 329 369 54 0 chr2 13932950 13933080 -167815007 + MLT1E2 LTR MaLR 244 380 -247 6 691 1676 112 13 0 chr2 13935485 13935717 -167812370 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 93 6 691 660 174 45 21 chr2 13937365 13937542 -167810545 - ORR1A2 LTR MaLR -146 183 1 6 691 324 320 150 65 chr2 13938443 13938896 -167809191 + MLT1H1 LTR MaLR 1 556 -23 6 691 285 266 23 102 chr2 13961679 13961767 -167786320 - MT2B LTR ERVL -361 240 160 6 691 531 216 7 118 chr2 13962911 13963063 -167785024 + ORR1D1 LTR MaLR 1 135 -239 6 691 241 210 0 24 chr2 13963030 13963113 -167784974 + ORR1D1 LTR MaLR 61 141 -253 6 691 264 210 0 10 chr2 13963150 13963253 -167784834 + ORR1B1 LTR MaLR 47 141 -253 7 691 230 200 0 0 chr2 13963233 13963293 -167784794 + ORR1B1 LTR MaLR 82 141 -253 7 691 1221 174 79 42 chr2 13963310 13963623 -167784464 + ORR1C2 LTR MaLR 40 380 -4 7 691 532 281 119 99 chr2 13964094 13964437 -167783650 + ORR1E LTR MaLR 1 350 -24 7 691 932 242 97 53 chr2 13967896 13968197 -167779890 - MTD LTR MaLR -81 298 1 7 691 1964 176 6 38 chr2 13973243 13973586 -167774501 + MTC LTR MaLR 1 332 -89 7 691 322 172 0 0 chr2 13974043 13974101 -167773986 + MTC LTR MaLR 218 275 -146 7 691 1543 114 19 50 chr2 13985495 13985753 -167762334 + RMER6A LTR ERVK 1 250 -506 7 691 2100 124 70 19 chr2 13986162 13986475 -167761612 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 7 691 1187 227 183 29 chr2 13989110 13989563 -167758524 - RLTR11A2 LTR ERVK -3 524 2 7 691 270 316 95 45 chr2 13990690 13990869 -167757218 + ORR1E LTR MaLR 24 211 -148 7 691 2054 117 12 51 chr2 13991009 13991341 -167756746 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 7 691 304 320 61 92 chr2 13991519 13991870 -167756217 - MTEb LTR MaLR -13 366 1 7 691 722 322 87 40 chr2 13992113 13992540 -167755547 + MLT1G1 LTR MaLR 133 579 0 7 691 228 264 34 102 chr2 13998977 13999064 -167749023 + MT2B2 LTR ERVL 178 256 -328 7 691 300 268 34 23 chr2 14001325 14001413 -167746674 - MT2B LTR ERVL -362 239 151 8 691 3192 106 19 8 chr2 14009715 14010183 -167737904 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 473 -2 1 691 370 248 28 56 chr2 14010731 14010838 -167737249 - MT2B LTR ERVL -323 278 175 1 691 2129 104 40 22 chr2 14019225 14019548 -167728539 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 2 691 2072 139 82 6 chr2 14019665 14020006 -167728081 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 2 691 3081 32 3 0 chr2 14020818 14021191 -167726896 + MTA_Mm LTR MaLR 1 374 -22 2 691 1012 208 92 18 chr2 14021182 14021437 -167726650 + MTD LTR MaLR 153 419 -2 2 691 551 16 0 0 chr2 14021778 14021842 -167726245 - MTA_Mm LTR MaLR -332 64 1 3 691 639 273 130 70 chr2 14024233 14024563 -167723524 + ORR1E LTR MaLR 7 374 -5 3 692 384 274 63 117 chr2 14025548 14025771 -167722316 + MTE2a LTR MaLR 1 211 -168 3 692 838 237 75 12 chr2 14029599 14029846 -167718241 - MTD LTR MaLR 0 400 116 5 692 324 204 0 0 chr2 14029846 14029900 -167718187 - ORR1C1 LTR MaLR 0 367 314 5 692 1072 205 189 25 chr2 14030097 14030372 -167717715 - ORR1C1 LTR MaLR -58 320 1 5 692 860 137 8 0 chr2 14030372 14030501 -167717586 - MTD LTR MaLR -289 130 1 5 692 1990 342 115 30 chr2 14034742 14035754 -167712333 - MTE-int LTR MaLR -419 1161 64 6 692 905 262 103 20 chr2 14051336 14051628 -167696459 - MLT1A0 LTR MaLR -45 320 5 7 692 408 223 20 113 chr2 14054029 14054095 -167693992 - MT2B LTR ERVL -432 152 105 7 692 2102 262 60 95 chr2 14061095 14062092 -167685995 - RMER17B LTR ERVK -9 899 1 8 692 238 250 88 20 chr2 14079042 14079144 -167668943 - MER31B LTR ERV1 -346 120 12 1 692 513 301 192 13 chr2 14079693 14080045 -167668042 + LTR40b LTR ERVL 98 519 0 1 692 1235 281 41 24 chr2 14088930 14089220 -167658867 - MTE2b LTR MaLR 0 379 77 1 692 2040 156 13 45 chr2 14089220 14089597 -167658490 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 3 1 692 1235 301 75 56 chr2 14089597 14089715 -167658372 - MTE2b LTR MaLR -310 109 3 1 692 1101 217 66 55 chr2 14090386 14090659 -167657428 + MTD LTR MaLR 94 369 -50 1 692 288 216 115 90 chr2 14097074 14097196 -167650891 + MT2B2 LTR ERVL 181 305 -279 1 692 470 320 53 121 chr2 14107514 14107912 -167640175 - MLT1B LTR MaLR -19 371 1 1 692 560 332 35 74 chr2 14107914 14108145 -167639942 - MLT1B-int LTR MaLR -2 1369 1148 1 692 455 359 41 45 chr2 14108393 14108635 -167639452 - MLT1B-int LTR MaLR -228 1143 903 1 692 303 327 119 26 chr2 14108671 14108822 -167639265 - MLT1C-int LTR MaLR -466 1023 859 1 692 260 331 30 72 chr2 14108847 14109013 -167639074 - MLT1C-int LTR MaLR -743 628 470 1 692 450 313 106 70 chr2 14109043 14109372 -167638715 + ORR1E LTR MaLR 2 368 -2 1 692 540 303 180 3 chr2 14109394 14109705 -167638382 - MLT1C-int LTR MaLR -996 375 10 1 692 803 342 90 21 chr2 14109713 14110137 -167637950 - MLT1C LTR MaLR -10 457 5 1 692 427 353 46 35 chr2 14127608 14127805 -167620282 - LTR88c LTR Genie? -571 291 93 1 692 2616 177 85 68 chr2 14133193 14133756 -167614331 - RMER15 LTR ERVL 0 575 3 2 692 401 234 71 47 chr2 14136689 14136859 -167611228 - RLTR21 LTR ERVK -277 1295 1122 2 692 1506 227 64 106 chr2 14136968 14137788 -167610299 - RMER12 LTR ERVK -1067 781 1 2 692 691 195 175 51 chr2 14143649 14143893 -167604194 - RMER4B LTR ERVK -19 566 343 2 692 969 186 79 23 chr2 14144020 14144235 -167603852 - RMER4B LTR ERVK -327 258 32 2 692 1723 191 89 20 chr2 14145414 14145762 -167602325 + ORR1D1 LTR MaLR 3 374 0 2 86 321 272 122 21 chr2 14155696 14155857 -167592230 - LTR16C LTR ERVL -2 536 362 2 693 356 286 29 29 chr2 14157395 14157532 -167590555 - MER67C LTR ERV1 -58 653 517 2 693 1283 212 140 20 chr2 14157933 14158273 -167589814 + MTD LTR MaLR 14 397 -22 2 693 1711 224 120 61 chr2 14166866 14167529 -167580558 - RMER13B LTR ERVK -43 915 299 2 693 358 178 29 118 chr2 14167512 14167614 -167580473 - RMER13B LTR ERVK -815 93 1 2 693 964 266 79 74 chr2 14171323 14171510 -167576577 - ORR1E LTR MaLR 0 359 178 2 693 964 266 79 74 chr2 14171585 14171750 -167576337 - ORR1E LTR MaLR -182 177 5 2 693 2437 84 6 0 chr2 14186192 14186515 -167561572 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 3 3 693 472 162 19 84 chr2 14188352 14188507 -167559580 + RMER17B LTR ERVK 315 459 -499 3 693 1169 235 29 35 chr2 14192342 14192655 -167555432 - BGLII_B LTR ERVK -130 311 1 3 693 844 326 64 39 chr2 14198591 14198858 -167549229 - MER21B LTR ERV1 -49 814 450 3 693 251 316 55 55 chr2 14198858 14198944 -167549143 - RMER17A LTR ERVK -248 503 410 3 693 844 326 64 39 chr2 14199286 14199334 -167548753 - MER21B LTR ERV1 -418 445 396 3 693 251 316 55 55 chr2 14199334 14199356 -167548731 - RMER17A LTR ERVK -346 405 340 3 693 312 350 25 17 chr2 14199376 14199495 -167548592 - MER21B LTR ERV1 -422 441 322 3 693 597 301 36 49 chr2 14200937 14201332 -167546755 - RMER15 LTR ERVL -67 508 3 3 693 772 295 51 168 chr2 14214550 14214920 -167533167 - MTEa LTR MaLR -50 329 3 3 693 873 229 6 0 chr2 14224147 14224307 -167523780 - ORR1D2 LTR MaLR -204 166 6 3 693 813 286 99 43 chr2 14225995 14226438 -167521649 - MLT1D LTR MaLR -7 647 27 3 693 457 297 60 11 chr2 14230647 14230831 -167517256 - ORR1E LTR MaLR -166 193 1 3 693 232 286 67 56 chr2 14238772 14238861 -167509226 - ORR1E LTR MaLR 0 359 270 3 693 2876 154 80 7 chr2 14238995 14239536 -167508551 - RMER6C LTR ERVK 0 690 111 3 693 3463 158 106 20 chr2 14244472 14245107 -167502980 - RLTR17 LTR ERVK 0 692 4 3 693 3905 196 60 39 chr2 14245107 14246212 -167501875 - RMER3D-int LTR ERVK 0 2842 1715 3 693 2284 130 5 55 chr2 14246256 14246639 -167501448 - RLTR17 LTR ERVK -328 364 1 4 693 286 254 127 104 chr2 14258579 14258847 -167489240 + MLT1A0 LTR MaLR 56 329 -36 4 693 4185 125 93 23 chr2 14259824 14260050 -167488037 + RMER19A LTR ERVK 1 240 -497 4 693 4185 125 93 23 chr2 14260070 14260532 -167487555 + RMER19A LTR ERVK 241 737 0 4 693 1706 165 9 151 chr2 14260962 14261405 -167486682 + ORR1C2 LTR MaLR 5 384 0 4 693 592 291 114 26 chr2 14264045 14264317 -167483770 + MLT2B1 LTR ERVL 153 448 -72 4 693 2882 12 0 0 chr2 14266996 14267318 -167480769 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 4 693 39066 28 1 17 chr2 14267318 14271707 -167476380 - MMETn-int LTR ERVK 0 4844 489 4 693 39066 28 1 17 chr2 14271750 14272239 -167475848 - MMETn-int LTR ERVK 0 488 2 4 693 2852 16 0 0 chr2 14272239 14272559 -167475528 - RLTRETN_Mm LTR ERVK -2 320 1 4 693 1623 220 148 12 chr2 14278661 14279079 -167469008 + RLTR20D LTR ERVK 2 476 -92 4 693 775 201 21 72 chr2 14279086 14279279 -167468808 + ORR1C2 LTR MaLR 202 384 0 4 693 447 351 114 55 chr2 14280068 14280541 -167467546 - MER34A LTR ERV1 -45 526 26 4 694 1388 269 21 35 chr2 14287485 14287863 -167460224 - MTE2b LTR MaLR -2 357 1 4 694 1365 289 32 13 chr2 14289566 14289825 -167458262 + MTE2b LTR MaLR 1 267 -112 4 694 2433 101 3 60 chr2 14289825 14290172 -167457915 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 4 694 1365 289 32 13 chr2 14290172 14290284 -167457803 + MTE2b LTR MaLR 268 378 -1 4 694 266 269 220 57 chr2 14291322 14291499 -167456588 + MLT1E LTR MaLR 433 638 -15 4 694 229 167 0 0 chr2 14292049 14292091 -167455996 - MTD LTR MaLR -182 237 196 4 694 260 221 58 14 chr2 14299421 14299490 -167448597 + MTE2a LTR MaLR 285 356 -23 4 694 2038 136 13 3 chr2 14301136 14301454 -167446633 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 6 4 694 3210 74 98 18 chr2 14304675 14305115 -167442972 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 4 694 12140 54 35 81 chr2 14305116 14306889 -167441198 + IAPEz-int LTR ERVK 9 1700 -4781 4 694 6518 63 12 6 chr2 14306882 14307706 -167440381 + IAPEz-int LTR ERVK 5651 6479 -2 4 694 3104 73 73 80 chr2 14307708 14308186 -167439901 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 4 694 978 138 50 6 chr2 14313645 14313806 -167434281 + RLTR24 LTR ERV1 1 168 -361 4 694 3754 154 56 14 chr2 14314037 14314695 -167433392 - RLTR17 LTR ERVK -1 691 6 4 694 947 287 87 37 chr2 14316110 14316465 -167431622 - MER34A LTR ERV1 -196 375 3 4 694 1087 139 23 0 chr2 14319198 14319370 -167428717 - RLTR13B1 LTR ERVK 0 893 718 4 694 1348 304 19 5 chr2 14321069 14321443 -167426644 - MTE2a LTR MaLR 0 379 1 5 694 2276 222 64 14 chr2 14322424 14322844 -167425243 + RLTR20A LTR ERVK 1 444 -97 5 694 2276 222 64 14 chr2 14322896 14322990 -167425097 + RLTR20A LTR ERVK 445 540 -1 5 694 2107 193 45 75 chr2 14332786 14333296 -167414791 - RLTR24 LTR ERV1 0 529 35 5 694 265 204 0 0 chr2 14339688 14339732 -167408355 - RLTR24 LTR ERV1 -485 44 1 5 694 344 313 71 42 chr2 14340009 14340249 -167407838 - RLTR18B LTR ERVK -241 271 25 5 694 301 255 135 55 chr2 14340406 14340556 -167407531 - MTE2b LTR MaLR 0 379 204 5 694 361 316 127 8 chr2 14340582 14340716 -167407371 - MTE2b LTR MaLR -229 150 1 5 694 540 269 67 67 chr2 14341219 14341398 -167406689 - MLT1A0 LTR MaLR -2 363 185 5 694 320 350 62 52 chr2 14342185 14342490 -167405597 + LTR33 LTR ERVL 75 389 -126 5 694 803 273 147 87 chr2 14345852 14345870 -167402217 - MT2B LTR ERVL -6 527 511 5 694 1038 262 48 42 chr2 14346064 14346094 -167401993 - MT2B LTR ERVL -16 585 550 5 694 1038 266 81 57 chr2 14346145 14346592 -167401495 - MT2B LTR ERVL -52 549 1 5 694 11905 170 55 70 chr2 14346594 14349049 -167399038 - MERVL_2A-int LTR ERVL -2 5759 3342 5 694 272 227 12 107 chr2 14364871 14364955 -167383132 + RMER15 LTR ERVL 422 497 -78 5 694 2237 245 5 89 chr2 14366206 14366872 -167381215 - RMER19C LTR ERVK 0 611 2 5 694 1391 227 99 3 chr2 14370781 14371113 -167376974 - ORR1D1 LTR MaLR -6 368 5 5 694 1091 289 62 31 chr2 14372205 14372594 -167375493 + MTD LTR MaLR 5 405 -14 5 694 1168 228 79 11 chr2 14375944 14376210 -167371877 + MTD LTR MaLR 3 286 -133 5 694 248 355 19 0 chr2 14378929 14379036 -167369051 + ORR1E LTR MaLR 1 109 -250 5 694 3907 103 43 7 chr2 14382087 14382651 -167365436 - MT2B2 LTR ERVL 0 584 1 5 694 510 245 51 13 chr2 14383623 14383757 -167364330 - MT2A LTR ERVL -471 130 3 5 694 351 318 25 35 chr2 14385520 14385810 -167362277 + MLT1D LTR MaLR 196 620 -7 5 694 302 315 56 0 chr2 14387195 14387303 -167360784 + MLT1A LTR MaLR 46 159 -215 5 694 2080 238 71 103 chr2 14396252 14397235 -167350852 - RMER17B LTR ERVK -9 899 1 6 694 2683 130 26 30 chr2 14398856 14399316 -167348771 - RMER6B LTR ERVK 0 461 4 6 694 1705 211 82 40 chr2 14402929 14403329 -167344758 - MTD LTR MaLR -2 417 1 6 694 2027 124 15 58 chr2 14404938 14405280 -167342807 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 6 694 384 212 0 0 chr2 14405292 14405358 -167342729 - MTEa LTR MaLR -185 194 129 6 695 400 337 56 76 chr2 14422676 14423008 -167325079 - ORR1E LTR MaLR 0 370 54 6 695 392 306 28 39 chr2 14426205 14426385 -167321702 - ORR1E LTR MaLR -174 185 8 6 695 2360 191 5 2 chr2 14427509 14427929 -167320158 - MTC LTR MaLR 0 421 1 6 695 731 306 33 9 chr2 14428331 14428542 -167319545 + MTEa LTR MaLR 1 216 -163 6 695 449 276 26 46 chr2 14437971 14438123 -167309964 - MLT1D LTR MaLR 0 505 357 6 695 390 264 139 20 chr2 14438135 14438286 -167309801 - MLT1B LTR MaLR 0 390 222 6 695 2159 166 14 43 chr2 14439779 14440194 -167307893 - RLTR9D LTR ERVK 0 403 1 6 695 2100 172 67 8 chr2 14448517 14449100 -167298987 - RMER6A LTR ERVK -7 749 1 6 695 2789 154 14 58 chr2 14451334 14451918 -167296169 + RLTR31_Mm LTR ERVK 4 561 0 6 695 603 340 65 44 chr2 14452567 14452905 -167295182 - ORR1E LTR MaLR -6 353 9 6 695 2026 112 81 12 chr2 14453616 14453960 -167294127 + RLTR9A LTR ERVK 1 368 0 6 695 436 185 53 98 chr2 14458542 14458674 -167289413 - MT2B LTR ERVL -337 264 139 7 695 451 244 149 43 chr2 14466647 14466788 -167281299 + MTE2b LTR MaLR 3 158 -221 7 695 492 173 20 16 chr2 14466800 14466912 -167281175 + MTE2b LTR MaLR 267 379 0 7 695 1568 91 50 0 chr2 14467776 14468017 -167280070 + BGLII LTR ERVK 1 253 -168 7 695 2053 106 3 29 chr2 14468017 14468321 -167279766 + RMER17A LTR ERVK 1 301 -450 7 695 2053 201 54 29 chr2 14468430 14468762 -167279325 + RMER17A LTR ERVK 302 740 -11 7 695 1219 72 54 0 chr2 14468794 14468960 -167279127 + BGLII LTR ERVK 247 421 0 7 695 484 307 53 48 chr2 14469956 14470162 -167277925 + MTEb LTR MaLR 144 372 -7 7 695 270 324 113 37 chr2 14470535 14470835 -167277252 + MLT1A1 LTR MaLR 4 374 0 7 695 3756 52 28 2 chr2 14487421 14487884 -167260203 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 475 0 7 695 571 284 45 109 chr2 14494186 14494227 -167253860 + MLT1A0 LTR MaLR 118 158 -207 7 695 571 284 45 109 chr2 14494332 14494555 -167253532 + MLT1A0 LTR MaLR 159 365 0 7 695 1346 194 0 14 chr2 14495316 14495609 -167252478 - MERVK26-int LTR ERVK -1841 5078 4790 7 695 846 193 17 6 chr2 14495609 14495781 -167252306 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 355 7 695 4533 201 34 5 chr2 14496486 14497419 -167250668 - MERVK26-int LTR ERVK -2526 4393 3434 7 695 2330 173 9 11 chr2 14497680 14498119 -167249968 - MERVK26-int LTR ERVK -3473 3446 3009 7 695 273 378 91 23 chr2 14498319 14498584 -167249503 + LTR40b LTR ERVL 180 462 0 7 695 735 319 68 12 chr2 14502558 14502809 -167245278 + MTD LTR MaLR 67 331 -88 9 695 274 181 34 45 chr2 14502981 14503072 -167245015 + MTD LTR MaLR 289 403 -18 9 695 927 261 107 73 chr2 14506909 14507264 -167240823 - ORR1D2 LTR MaLR -2 368 2 1 695 302 250 0 0 chr2 14508324 14508388 -167239699 + ORR1D1 LTR MaLR 1 64 -310 1 695 249 292 99 84 chr2 14508836 14508865 -167239222 + MT2B LTR ERVL 125 155 -446 1 695 237 243 97 37 chr2 14539156 14539310 -167208777 + MLT1A LTR MaLR 210 366 -8 6 695 385 267 118 155 chr2 14541688 14542043 -167206044 - ORR1E LTR MaLR -9 350 9 6 696 226 308 203 28 chr2 14554154 14554331 -167193756 - MLT1K LTR MaLR -52 543 336 8 696 379 340 81 24 chr2 14554927 14555138 -167192949 - ORR1E LTR MaLR -122 237 15 8 696 512 331 78 42 chr2 14555881 14556215 -167191872 - ORR1E LTR MaLR 0 359 14 8 696 249 316 52 10 chr2 14560910 14561006 -167187081 - ORR1E LTR MaLR -5 354 255 9 696 3327 41 5 0 chr2 14566345 14566739 -167181348 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 696 379 273 102 58 chr2 14574452 14574658 -167173429 - MLT1L LTR MaLR 0 610 381 1 696 1517 233 85 2 chr2 14579946 14580407 -167167680 - ORR1B1-int LTR MaLR -684 825 327 1 696 3865 145 49 43 chr2 14581048 14581442 -167166645 - RMER17D2 LTR ERVK -2 807 404 1 696 3865 145 49 43 chr2 14581509 14581912 -167166175 - RMER17D2 LTR ERVK -406 403 5 1 696 302 188 28 28 chr2 14589737 14589808 -167158279 + RLTR25B LTR ERVK 428 498 -530 1 696 298 383 74 5 chr2 14601036 14601225 -167146862 - ORR1E LTR MaLR -106 253 52 1 696 576 336 83 60 chr2 14602944 14603295 -167144792 + ORR1E LTR MaLR 1 359 0 1 696 237 278 43 32 chr2 14610458 14610551 -167137536 - MTE2a LTR MaLR -14 365 272 1 696 1162 163 0 0 chr2 14612834 14613024 -167135063 + ORR1A4 LTR MaLR 43 232 -97 2 696 1176 196 194 25 chr2 14620141 14620465 -167127622 - RLTR31_Mm LTR ERVK 0 561 183 2 696 729 113 43 0 chr2 14620479 14620594 -167127493 - BGLII_A LTR ERVK -325 120 1 2 696 521 311 73 126 chr2 14620818 14620927 -167127160 + MLT1C LTR MaLR 1 124 -343 2 696 521 311 73 126 chr2 14621072 14621399 -167126688 + MLT1C LTR MaLR 125 414 -53 2 696 1766 145 37 46 chr2 14626554 14626879 -167121208 + ORR1A4 LTR MaLR 8 329 0 2 696 2136 169 47 6 chr2 14630096 14630295 -167117792 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 177 2 696 2136 169 47 6 chr2 14630324 14630487 -167117600 - ORR1C1 LTR MaLR -202 176 3 2 696 577 313 87 66 chr2 14630869 14631204 -167116883 + MLT1D LTR MaLR 22 363 -142 2 696 381 188 12 59 chr2 14631966 14632051 -167116036 - RLTR11A LTR ERVK -6 522 442 2 696 1092 246 31 34 chr2 14632072 14632412 -167115675 + RLTR11A LTR ERVK 219 528 0 2 696 282 318 17 52 chr2 14632412 14632525 -167115562 - ORR1E LTR MaLR -187 172 64 2 696 273 321 80 29 chr2 14633576 14633714 -167114373 + LTR55 LTR ERV 401 545 -3 2 696 558 335 118 21 chr2 14633998 14634327 -167113760 - MLT1A0 LTR MaLR -4 361 1 2 696 649 269 45 17 chr2 14637676 14637854 -167110233 + MTD LTR MaLR 1 183 -236 2 696 366 303 20 20 chr2 14638640 14638741 -167109346 + MTD LTR MaLR 176 276 -143 2 696 495 343 19 33 chr2 14642016 14642230 -167105857 + MTEa LTR MaLR 1 211 -168 2 696 287 302 130 59 chr2 14642279 14642449 -167105638 + MTEa LTR MaLR 164 362 -17 2 696 2173 182 91 3 chr2 14645071 14645456 -167102631 + MTC LTR MaLR 1 419 -2 2 696 1227 188 182 30 chr2 14648244 14648595 -167099492 - RLTR44B LTR ERVK 0 452 19 2 696 1232 111 122 0 chr2 14655107 14655296 -167092791 - RLTR44A LTR ERVK -193 212 1 2 696 380 289 39 32 chr2 14657826 14657980 -167090107 - MLT1J LTR MaLR -229 283 129 2 696 227 203 0 106 chr2 14674081 14674147 -167073940 - MLT1M LTR MaLR -395 277 219 3 696 558 298 34 45 chr2 14674347 14674523 -167073564 - MTE2b LTR MaLR -4 375 202 3 696 4479 162 83 20 chr2 14674526 14675476 -167072611 - RLTR25A LTR ERVK -4 1099 1 3 696 891 265 28 0 chr2 14675476 14675685 -167072402 - MTE2b LTR MaLR -164 215 1 3 696 1474 250 29 19 chr2 14677700 14678075 -167070012 + MTE2b LTR MaLR 1 379 0 3 696 229 310 14 27 chr2 14678388 14678461 -167069626 - LTR16E1 LTR ERVL -18 520 449 3 697 2293 75 122 11 chr2 14688566 14688917 -167059170 - RLTR10 LTR ERVK 0 390 1 3 697 541 319 93 12 chr2 14692250 14692571 -167055516 - ORR1E LTR MaLR -4 375 1 3 697 243 223 14 85 chr2 14702746 14702957 -167045130 - RMER17C LTR ERVK -135 275 80 3 697 441 307 169 29 chr2 14709156 14709439 -167038648 - ORR1E LTR MaLR -7 352 15 3 697 3132 45 37 0 chr2 14713432 14713814 -167034273 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 697 3370 169 90 6 chr2 14719527 14720219 -167027868 - RMER6A LTR ERVK -4 752 3 3 697 4286 157 65 76 chr2 14720727 14721639 -167026448 - RMER19B LTR ERVK 0 902 1 3 697 566 79 0 160 chr2 14723442 14723548 -167024539 + ORR1A1 LTR MaLR 250 338 -8 3 697 2470 124 26 172 chr2 14731116 14731375 -167016712 - RLTR21 LTR ERVK 0 1572 1320 3 697 2470 124 26 172 chr2 14731413 14731662 -167016425 - RLTR21 LTR ERVK -253 1319 1126 3 697 6171 134 79 48 chr2 14731739 14732916 -167015171 - RLTR21 LTR ERVK -363 1209 2 3 697 336 281 75 38 chr2 14734795 14734954 -167013133 - LTR37B LTR ERV1 -90 378 214 4 697 2728 176 94 6 chr2 14736580 14737101 -167010986 - RMER15 LTR ERVL 0 575 9 4 697 547 139 0 56 chr2 14737573 14737680 -167010407 - RLTR28B LTR ERVL -231 293 193 4 697 1712 227 46 27 chr2 14740356 14740768 -167007319 + RLTR9B2 LTR ERVK 1 420 0 4 697 1449 118 5 5 chr2 14742744 14742957 -167005130 - RLTR28B LTR ERVL -266 215 3 4 697 377 154 154 0 chr2 14743177 14743242 -167004845 - RLTR33 LTR ERVK 0 678 604 4 697 571 206 98 49 chr2 14743243 14743406 -167004681 - RLTR33 LTR ERVK -343 335 165 4 697 1615 232 108 15 chr2 14754730 14754822 -166993265 - RLTR16 LTR ERVK 0 505 412 4 697 1615 232 108 15 chr2 14754858 14755220 -166992867 - RLTR16 LTR ERVK -94 411 11 4 697 2546 107 124 3 chr2 14759349 14759735 -166988352 - RLTR9B LTR ERVK -4 433 1 4 697 4199 154 20 4 chr2 14761900 14762644 -166985443 + RMER6A LTR ERVK 1 756 0 4 697 596 328 37 68 chr2 14767367 14767661 -166980426 + MTD LTR MaLR 6 290 -131 4 697 3906 176 102 38 chr2 14769860 14770703 -166977384 + RMER19B LTR ERVK 2 898 -4 4 697 1353 246 13 59 chr2 14773056 14773428 -166974659 + ORR1E LTR MaLR 3 357 -2 4 697 249 344 68 25 chr2 14778546 14778707 -166969380 + RMER12 LTR ERVK 720 887 -435 4 697 241 390 76 11 chr2 14779734 14779918 -166968169 - LTR41 LTR ERVL -440 328 133 4 697 858 295 44 50 chr2 14782635 14782953 -166965134 + MTE2a LTR MaLR 10 325 -54 5 697 242 231 0 0 chr2 14783138 14783190 -166964897 + MTE2a LTR MaLR 328 379 0 5 697 679 281 69 77 chr2 14783272 14783650 -166964437 + MTE2b LTR MaLR 5 379 0 5 697 2741 91 33 12 chr2 14784602 14785001 -166963086 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 5 697 579 311 51 66 chr2 14787787 14788121 -166959966 - MTEa LTR MaLR -4 375 47 5 697 413 319 82 29 chr2 14789294 14789465 -166958622 + MTD LTR MaLR 1 180 -239 5 697 668 300 91 40 chr2 14789515 14789768 -166958319 + MTD LTR MaLR 147 412 -7 5 697 1243 233 82 26 chr2 14799591 14799943 -166948144 - MTE2a LTR MaLR -7 372 1 5 697 685 222 377 26 chr2 14800626 14800936 -166947151 + MTD LTR MaLR 1 419 0 5 697 977 313 87 51 chr2 14802407 14802855 -166945232 - MT2A LTR ERVL -13 520 57 5 697 378 245 92 162 chr2 14802753 14802938 -166945149 - MTE2b LTR MaLR -204 175 4 5 697 298 340 20 10 chr2 14803036 14803134 -166944953 - MLT1H2 LTR MaLR -341 148 50 5 697 1377 218 122 42 chr2 14803455 14803833 -166944254 - MTD LTR MaLR -11 408 1 5 698 264 263 18 128 chr2 14812615 14812638 -166935449 + MT2B2 LTR ERVL 405 421 -163 5 698 435 247 0 0 chr2 14813032 14813117 -166934970 + MT2A LTR ERVL 353 437 -96 5 698 305 248 65 65 chr2 14813111 14813219 -166934868 + MTD LTR MaLR 309 416 -3 5 698 305 262 35 61 chr2 14818025 14818139 -166929948 - LTR33B LTR ERVL 0 503 393 5 698 277 339 132 21 chr2 14820850 14821040 -166927047 - MLT1J1 LTR MaLR -233 211 1 5 698 1796 154 88 3 chr2 14821708 14822027 -166926060 - ORR1B2 LTR MaLR -21 346 1 5 698 328 211 64 43 chr2 14822575 14822669 -166925418 - MER34A LTR ERV1 0 571 476 5 698 639 319 70 35 chr2 14823027 14823339 -166924748 - MER34A LTR ERV1 -231 340 18 5 698 456 287 186 90 chr2 14823917 14824250 -166923837 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 1 5 698 472 301 171 41 chr2 14825992 14826307 -166921780 + MLT1A LTR MaLR 15 370 -4 5 698 332 254 197 37 chr2 14826430 14826618 -166921469 - MLT1B LTR MaLR -71 319 102 5 698 389 345 55 75 chr2 14826652 14826987 -166921100 - ORR1E LTR MaLR -32 347 1 5 698 824 253 60 75 chr2 14837598 14837983 -166910104 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 6 698 234 357 75 41 chr2 14857828 14857974 -166890113 - ORR1E LTR MaLR -150 209 59 6 698 417 341 37 78 chr2 14859411 14859656 -166888431 - MER21B LTR ERV1 -115 748 514 6 698 674 338 69 29 chr2 14859951 14860228 -166887859 - MER21B LTR ERV1 -575 288 1 6 698 1816 143 3 71 chr2 14860604 14860957 -166887130 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 6 698 729 348 77 27 chr2 14862595 14862770 -166885317 - MT2A LTR ERVL -111 422 245 6 698 729 348 77 27 chr2 14862805 14863031 -166885056 - MT2A LTR ERVL -289 244 1 6 698 2072 144 3 15 chr2 14865219 14865551 -166882536 - ORR1A4 LTR MaLR -1 328 1 6 698 366 222 123 67 chr2 14911734 14911896 -166836191 - RLTR13D3 LTR ERVK 0 1114 981 6 698 761 308 63 18 chr2 14912899 14913454 -166834633 - ETnERV3-int LTR ERVK -246 5562 4983 6 698 2192 330 45 37 chr2 14914657 14914964 -166833123 - MMTV-int LTR ERVK -1971 5282 4968 6 698 2192 323 49 40 chr2 14915151 14917075 -166831012 - MMTV-int LTR ERVK -2286 4967 3084 6 698 493 269 109 23 chr2 14921457 14921632 -166826455 + MTE2b LTR MaLR 30 219 -160 6 698 243 167 42 0 chr2 14932788 14932836 -166815251 - ORR1D2 LTR MaLR -318 52 3 7 698 781 271 75 48 chr2 14933373 14933625 -166814462 + MTEa LTR MaLR 1 259 -120 7 698 350 191 71 9 chr2 14933691 14933814 -166814273 + MTEa LTR MaLR 235 375 -4 7 698 1601 151 72 61 chr2 14935545 14935904 -166812183 + ORR1B2 LTR MaLR 5 367 0 7 699 314 275 58 144 chr2 14949763 14949971 -166798116 + RMER20B LTR ERVK 234 423 -204 7 699 2390 137 111 24 chr2 14950583 14950996 -166797091 + RLTR44B LTR ERVK 1 449 0 7 699 502 291 71 122 chr2 14960963 14961217 -166786870 - MTE2a LTR MaLR -128 251 11 7 699 392 257 34 34 chr2 14967785 14967934 -166780153 + RMER15 LTR ERVL 319 467 -108 7 699 340 287 132 13 chr2 15004750 15004902 -166743185 - MTEa LTR MaLR -5 374 205 4 699 1016 272 176 16 chr2 15009596 15010029 -166738058 + RMER5 LTR ERV1 33 534 0 1 699 275 246 212 34 chr2 15012379 15012497 -166735590 + MLT1C LTR MaLR 4 142 -325 1 699 1817 176 74 9 chr2 15014249 15014588 -166733499 - MTC LTR MaLR -11 410 50 2 699 1069 229 201 28 chr2 15019942 15020261 -166727826 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 3 699 1218 305 48 3 chr2 15021692 15022044 -166726043 - MTE2b LTR MaLR -2 377 10 3 699 389 226 48 0 chr2 15022961 15023042 -166725045 + ORR1D1 LTR MaLR 8 92 -282 4 699 733 171 157 9 chr2 15023042 15023209 -166724878 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 206 4 699 427 361 41 36 chr2 15024809 15025030 -166723057 + MLT1F2 LTR MaLR 61 282 -278 4 699 296 287 22 96 chr2 15025061 15025196 -166722891 + MT2B LTR ERVL 167 291 -310 5 699 592 260 279 12 chr2 15042421 15042671 -166705416 - ORR1D2 LTR MaLR -32 342 26 6 699 2375 106 3 0 chr2 15046849 15047171 -166700916 + ORR1A2 LTR MaLR 5 327 0 7 699 1764 165 60 8 chr2 15047650 15048017 -166700070 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 1 7 699 332 257 65 4 chr2 15050932 15051038 -166697049 + MTEa LTR MaLR 2 121 -253 8 699 340 349 53 80 chr2 15055558 15055860 -166692227 - MER34 LTR ERV1 -248 294 1 8 699 713 257 8 58 chr2 15058049 15058283 -166689804 + MTEa LTR MaLR 131 379 0 8 699 1350 134 294 11 chr2 15058501 15058787 -166689300 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 9 699 2875 165 70 0 chr2 15059015 15059542 -166688545 - RLTR12A LTR ERVK -4 564 1 9 699 2144 148 45 11 chr2 15061400 15061755 -166686332 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 9 699 764 283 87 38 chr2 15066735 15067022 -166681065 - MLT1B LTR MaLR -4 386 86 1 699 497 344 46 59 chr2 15067841 15068147 -166679940 - ORR1E LTR MaLR -3 356 55 1 699 613 349 28 16 chr2 15068232 15068485 -166679602 - MER90 LTR ERV1 -319 256 1 1 699 1762 249 56 21 chr2 15069498 15069981 -166678106 + RLTR16 LTR ERVK 6 505 0 1 699 3031 154 63 18 chr2 15071028 15071571 -166676516 - RMER2 LTR ERV1 0 567 1 1 699 1212 125 0 0 chr2 15071578 15071754 -166676333 - RMER2 LTR ERV1 -391 176 1 1 699 839 253 6 22 chr2 15072294 15072467 -166675620 + RLTR25B LTR ERVK 2 171 -857 1 699 294 280 98 33 chr2 15072467 15072589 -166675498 - RLTR25B LTR ERVK 0 1103 974 1 699 536 210 15 195 chr2 15072561 15072756 -166675331 - RLTR25B LTR ERVK -248 780 621 1 699 251 269 48 71 chr2 15073137 15073221 -166674866 - ORR1D1 LTR MaLR -83 287 206 1 700 1563 134 208 62 chr2 15073525 15073915 -166674172 + LTRIS5 LTR ERV1 1 447 0 1 700 554 250 92 36 chr2 15073915 15074085 -166674002 - ORR1D1 LTR MaLR -190 184 4 1 700 500 274 41 27 chr2 15075253 15075474 -166672613 - MER4B-int LTR ERV1 -2757 4001 3778 1 700 339 307 145 35 chr2 15075795 15075967 -166672120 - LTR73 LTR ERV1 -335 237 47 1 700 531 219 39 15 chr2 15075995 15076125 -166671962 - RLTR17 LTR ERVK -48 644 512 1 700 1096 235 103 40 chr2 15076140 15076260 -166671827 + RMER3D-int LTR ERVK 18 133 -2709 1 700 1096 216 51 42 chr2 15076291 15076634 -166671453 + RMER3D-int LTR ERVK 134 473 -2369 1 700 3831 101 9 6 chr2 15076634 15077180 -166670907 + RMER17B LTR ERVK 1 548 -410 1 700 668 132 33 13 chr2 15077189 15077342 -166670745 + RMER3D-int LTR ERVK 1101 1256 -1070 1 700 3328 187 59 42 chr2 15077322 15078243 -166669844 + RMER3D-int LTR ERVK 1907 2842 0 1 700 3648 176 43 12 chr2 15078243 15078914 -166669173 + RLTR17 LTR ERVK 1 692 0 1 700 1289 264 42 77 chr2 15079615 15079837 -166668250 - MTD LTR MaLR 0 419 211 1 700 1289 264 42 77 chr2 15080080 15080287 -166667800 - MTD LTR MaLR -209 210 5 1 700 317 276 154 42 chr2 15080703 15080944 -166667143 - MER21B LTR ERV1 -48 815 491 1 700 517 317 7 7 chr2 15081773 15081919 -166666168 - MLT1B LTR MaLR -57 333 188 1 700 2047 193 41 26 chr2 15081947 15082362 -166665725 + MTC LTR MaLR 1 421 0 1 700 1023 39 0 23 chr2 15082536 15082667 -166665420 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 269 1 700 1302 242 141 23 chr2 15083423 15083850 -166664237 + MTC-int LTR MaLR 520 996 -262 1 700 1356 227 92 84 chr2 15084235 15084797 -166663290 + RMER2 LTR ERV1 1 567 0 1 700 2125 198 155 48 chr2 15092182 15092807 -166655280 - RLTR17 LTR ERVK 0 692 1 1 700 264 349 164 50 chr2 15094779 15095162 -166652925 - MLT1J2 LTR MaLR 0 448 22 1 700 1488 195 194 0 chr2 15098523 15098869 -166649218 + MTC LTR MaLR 1 413 -8 1 700 464 138 236 3 chr2 15102804 15102919 -166645168 + MTD LTR MaLR 237 417 -2 1 700 323 202 76 0 chr2 15106492 15106571 -166641516 - MTEb LTR MaLR -1 378 294 1 700 1494 241 34 36 chr2 15106582 15107000 -166641087 + MTD LTR MaLR 1 417 -2 1 700 911 205 28 28 chr2 15107007 15107218 -166640869 + MTD-int LTR MaLR 6 216 -1042 1 700 728 267 17 39 chr2 15107216 15107436 -166640651 - MTC-int LTR MaLR -722 536 317 2 700 1493 212 90 52 chr2 15107597 15108001 -166640086 + MTD LTR MaLR 1 405 -14 2 700 1826 181 31 20 chr2 15108159 15108393 -166639694 - ORR1B1 LTR MaLR -1 393 153 2 700 1826 181 31 20 chr2 15108448 15108562 -166639525 - ORR1B1 LTR MaLR -242 152 42 2 700 7262 146 37 33 chr2 15112816 15114066 -166634021 - MERVL_2A-int LTR ERVL -3705 2056 802 2 700 421 115 101 13 chr2 15114080 15114159 -166633928 - MERVL_2A-int LTR ERVL -4329 1432 1347 2 700 2407 163 27 5 chr2 15114184 15114591 -166633496 - MERVL_2A-int LTR ERVL -5017 744 329 2 700 1819 107 4 0 chr2 15114591 15114844 -166633243 - ORR1A2 LTR MaLR -6 321 68 2 700 340 311 152 102 chr2 15114872 15115155 -166632932 + ORR1E LTR MaLR 63 359 0 2 700 1969 99 30 49 chr2 15115175 15115503 -166632584 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 322 0 2 700 19237 159 32 24 chr2 15115503 15122346 -166625741 + ETnERV2-int LTR ERVK 1 7299 -107 2 700 2014 99 31 22 chr2 15122346 15122665 -166625422 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 322 0 2 700 269 328 65 8 chr2 15122948 15123071 -166625016 - MLT2B2 LTR ERVL -75 487 358 2 700 1450 251 99 3 chr2 15123884 15124256 -166623831 - MTD LTR MaLR -2 417 10 2 700 283 276 29 58 chr2 15124351 15124369 -166623718 - MT2B2 LTR ERVL -337 247 147 2 700 1831 160 89 16 chr2 15125493 15125875 -166622212 + RMER17C LTR ERVK 1 410 0 2 700 733 179 117 0 chr2 15132032 15132177 -166615910 - RLTR18B LTR ERVK -9 503 342 2 700 330 0 0 0 chr2 15132180 15132218 -166615869 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 456 2 700 12625 101 28 4 chr2 15132219 15133971 -166614116 - MERVL-int LTR ERVL -2460 3025 1232 2 700 972 254 128 45 chr2 15135980 15136293 -166611794 + ORR1D2 LTR MaLR 3 341 -29 2 700 302 200 0 0 chr2 15138055 15138110 -166609977 + ORR1D2 LTR MaLR 310 364 -6 2 700 5322 117 116 13 chr2 15149798 15150620 -166597467 - RMER17A2 LTR ERVK 0 906 1 2 700 632 348 42 58 chr2 15161536 15161896 -166586191 + ORR1E LTR MaLR 1 354 -5 2 700 365 355 124 23 chr2 15178932 15179197 -166568890 - ORR1E LTR MaLR -1 358 67 2 700 1290 216 40 42 chr2 15179209 15179501 -166568586 - ORR1D1 LTR MaLR 0 384 96 2 700 362 224 58 12 chr2 15179695 15179781 -166568306 - ORR1D1 LTR MaLR -284 90 1 2 700 238 239 30 0 chr2 15179781 15179840 -166568247 - ORR1E LTR MaLR -298 61 1 2 700 848 233 141 103 chr2 15186720 15187060 -166561027 - ORR1E LTR MaLR -2 357 5 2 700 232 292 13 89 chr2 15188166 15188245 -166559842 - MT2B LTR ERVL -360 241 169 2 700 2314 72 119 11 chr2 15193991 15194343 -166553744 - RLTR10 LTR ERVK 0 390 1 2 700 863 19 0 19 chr2 15194867 15194973 -166553114 - MT2C_Mm LTR ERVL -371 104 1 2 700 749 354 27 76 chr2 15196586 15196748 -166551339 + RMER15-int LTR ERVL 4185 4345 -654 3 700 3442 21 117 5 chr2 15196748 15197175 -166550912 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 3 700 749 354 27 76 chr2 15197175 15197498 -166550589 + RMER15-int LTR ERVL 4346 4646 -353 3 700 2075 251 45 131 chr2 15197882 15198858 -166549229 - RMER17B LTR ERVK -62 896 5 3 700 1727 166 63 141 chr2 15201419 15201628 -166546459 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 191 3 700 1727 166 63 141 chr2 15202130 15202347 -166545740 - ORR1B1 LTR MaLR -204 190 1 3 700 237 343 47 38 chr2 15202505 15202611 -166545476 + LTR85a LTR Gypsy? 514 620 -82 3 700 3111 66 18 0 chr2 15202699 15203091 -166544996 - MTB LTR MaLR -1 399 1 3 701 3224 102 106 21 chr2 15205894 15206401 -166541686 - LTRIS2 LTR ERV1 0 564 13 3 701 3224 102 106 21 chr2 15206460 15206472 -166541615 - LTRIS2 LTR ERV1 -552 12 1 3 701 864 277 14 9 chr2 15206548 15206763 -166541324 + MT2A LTR ERVL 77 292 -241 3 701 2918 99 5 16 chr2 15206763 15207221 -166540866 + RMER16 LTR ERVK 1 533 0 3 701 334 253 27 0 chr2 15207224 15207299 -166540788 + MT2A LTR ERVL 297 373 -160 3 701 235 246 35 0 chr2 15207369 15207426 -166540661 + MT2A LTR ERVL 376 434 -99 3 701 229 348 42 25 chr2 15207473 15207591 -166540496 - MTE-int LTR MaLR -390 1190 1071 3 701 3985 110 19 0 chr2 15210317 15210890 -166537197 - MT2B2 LTR ERVL 0 584 1 3 701 1608 201 87 42 chr2 15213318 15213745 -166534342 + RLTR41 LTR ERV1 1 446 0 3 701 2515 50 0 74 chr2 15215741 15216106 -166531981 + ORR1A1 LTR MaLR 1 338 -8 3 701 277 132 0 86 chr2 15218790 15218848 -166529239 + RLTR15 LTR ERVK 1 53 -306 3 701 1656 157 36 13 chr2 15221432 15221736 -166526351 + RLTR15 LTR ERVK 45 355 -4 3 701 388 279 63 31 chr2 15238311 15238470 -166509617 - RMER15 LTR ERVL -60 515 352 3 701 242 274 29 87 chr2 15260601 15260705 -166487382 - MTEa LTR MaLR -17 362 265 3 701 2515 115 57 52 chr2 15263587 15264029 -166484058 - BGLII_A LTR ERVK -1 444 1 3 701 329 325 50 70 chr2 15265880 15266203 -166481884 + MLT1A0 LTR MaLR 63 374 0 3 701 266 267 264 10 chr2 15268423 15268616 -166479471 + RMER12 LTR ERVK 746 987 -335 3 701 1392 244 60 12 chr2 15272506 15272842 -166475245 - MTD LTR MaLR 0 419 68 3 701 241 233 39 64 chr2 15273401 15273479 -166474608 - MTD LTR MaLR -332 87 12 3 701 348 214 164 10 chr2 15273615 15273719 -166474368 - RMER4B LTR ERVK 0 585 466 3 701 2638 191 31 8 chr2 15277144 15277644 -166470443 - RMER19B LTR ERVK 0 902 183 4 701 290 243 44 97 chr2 15280032 15280146 -166467941 + MT2A LTR ERVL 1 108 -425 4 701 1454 266 45 8 chr2 15280068 15280424 -166467663 + MTD LTR MaLR 51 419 0 4 701 504 341 22 22 chr2 15280775 15281045 -166467042 + MLT1D LTR MaLR 194 463 -42 4 701 6563 110 37 7 chr2 15284208 15285201 -166462886 - RLTR13D2 LTR ERVK 0 1023 1 4 701 4288 134 33 39 chr2 15286303 15286757 -166461330 + RMER17D2 LTR ERVK 1 454 -355 4 701 4288 134 33 39 chr2 15286867 15287226 -166460861 + RMER17D2 LTR ERVK 455 809 0 4 701 949 164 6 19 chr2 15292183 15292345 -166455742 - RMER19C LTR ERVK 0 611 452 4 701 2572 98 21 74 chr2 15306576 15306814 -166441273 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 195 4 701 2572 98 21 74 chr2 15306962 15307153 -166440934 - MTB_Mm LTR MaLR -213 194 1 4 701 745 257 133 44 chr2 15310599 15310937 -166437150 + RLTR9A LTR ERVK 1 368 0 4 701 940 320 125 14 chr2 15311674 15312114 -166435973 + MER73 LTR ERVL 27 515 -129 4 701 3986 137 77 7 chr2 15312307 15313025 -166435062 + RMER17A2 LTR ERVK 1 903 -3 4 701 659 281 164 48 chr2 15317903 15318213 -166429874 + ORR1E LTR MaLR 1 346 -13 4 701 961 222 131 38 chr2 15329709 15330023 -166418064 + RLTR15 LTR ERVK 1 343 -16 4 702 505 243 0 9 chr2 15338702 15338810 -166409277 + MTC LTR MaLR 5 111 -285 4 702 1818 164 54 0 chr2 15339771 15340069 -166408018 + MTC LTR MaLR 105 418 -3 4 702 378 265 10 0 chr2 15340084 15340183 -166407904 - ORR1C2 LTR MaLR -281 103 5 4 702 5172 234 54 53 chr2 15340187 15341555 -166406532 - ORR1C2-int LTR MaLR 0 1370 1 4 702 1202 227 39 139 chr2 15341576 15341726 -166406361 - ORR1C2 LTR MaLR -34 350 199 4 702 1202 227 39 139 chr2 15341753 15341991 -166406096 - ORR1C2 LTR MaLR -186 198 1 4 702 258 321 34 68 chr2 15346468 15346585 -166401502 - ORR1E LTR MaLR -167 192 80 4 702 1698 242 60 18 chr2 15346885 15346978 -166401109 - MTD LTR MaLR -3 416 322 4 702 1064 252 135 15 chr2 15346978 15347312 -166400775 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 4 702 1698 242 60 18 chr2 15347312 15347532 -166400555 - MTD LTR MaLR -98 321 86 4 702 2881 85 27 2 chr2 15347532 15347943 -166400144 + BGLII LTR ERVK 1 421 0 4 702 1698 242 60 18 chr2 15347943 15348027 -166400060 - MTD LTR MaLR -334 85 1 4 702 965 309 41 55 chr2 15349200 15349563 -166398524 + MTE2a LTR MaLR 19 376 -3 4 702 557 318 45 60 chr2 15351215 15351416 -166396671 + MLT1A LTR MaLR 27 224 -150 4 702 2951 27 0 0 chr2 15351974 15352311 -166395776 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 0 337 1 4 702 8208 24 2 6 chr2 15352311 15353311 -166394776 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 5486 4 702 23386 34 41 14 chr2 15353297 15356310 -166391777 - IAPEz-int LTR ERVK -3375 3106 9 4 702 2951 27 0 0 chr2 15356310 15356647 -166391440 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 0 337 1 4 702 3451 28 2 0 chr2 15366404 15366799 -166381288 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 702 472 301 169 44 chr2 15369814 15370227 -166377860 - RLTR12B LTR ERVK -14 514 50 5 702 3412 68 19 82 chr2 15374358 15374872 -166373215 - RLTR45 LTR ERVK 0 482 1 5 702 7626 142 33 26 chr2 15375543 15376001 -166372086 + RMER16-int LTR ERVK 2413 2872 -2534 5 702 7626 142 33 26 chr2 15376038 15376400 -166371687 + RMER16-int LTR ERVK 2873 3223 -2183 5 702 2142 112 42 122 chr2 15376400 15376858 -166371229 + BGLII LTR ERVK 1 421 0 5 702 7626 167 40 28 chr2 15376858 15377644 -166370443 + RMER16-int LTR ERVK 3224 3865 -1541 5 702 626 242 190 64 chr2 15378202 15378529 -166369558 + RLTR9A LTR ERVK 1 368 0 5 702 748 250 12 8 chr2 15382303 15382476 -166365611 + RMER2 LTR ERV1 1 250 -317 5 702 686 303 78 50 chr2 15382678 15382980 -166365107 + RMER2 LTR ERV1 251 558 -9 5 702 641 388 60 8 chr2 15391582 15391948 -166356139 - MLT1H1 LTR MaLR 0 555 171 5 702 1967 164 72 0 chr2 15406659 15406994 -166341093 + ORR1B2 LTR MaLR 1 359 -8 5 702 5957 128 39 5 chr2 15408436 15409363 -166338724 - RMER17B LTR ERVK 0 958 1 5 702 267 344 105 57 chr2 15410831 15411059 -166337028 - LTR40a LTR ERVL -210 309 71 5 702 318 293 37 0 chr2 15412152 15412234 -166335853 + MTD LTR MaLR 20 104 -315 5 702 2567 46 61 6 chr2 15413267 15413595 -166334492 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 5 702 292 293 95 48 chr2 15423727 15423874 -166324213 - MER110A LTR ERV1 -77 391 238 5 702 374 307 158 14 chr2 15430595 15430810 -166317277 - MER89 LTR ERV1 -2 557 312 6 702 3793 47 12 62 chr2 15431383 15431902 -166316185 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 6 702 350 318 51 40 chr2 15432058 15432235 -166315852 + HERV16-int LTR ERVL 687 865 -4131 6 702 3017 52 23 5 chr2 15433682 15434071 -166314016 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 702 8608 58 8 1 chr2 15434071 15435161 -166312926 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 6 702 3213 38 0 15 chr2 15435161 15435336 -166312751 + MTA_Mm LTR MaLR 1 170 -226 6 702 1956 150 10 3 chr2 15435336 15435643 -166312444 + RLTR27 LTR ERVK 1 309 0 6 702 3213 38 0 15 chr2 15435643 15435869 -166312218 + MTA_Mm LTR MaLR 171 396 0 6 702 492 361 121 49 chr2 15436825 15437131 -166310956 + MLT1A1 LTR MaLR 14 341 -67 6 702 672 312 34 14 chr2 15437177 15437385 -166310702 - MER68 LTR ERVL -53 510 299 6 702 679 327 31 9 chr2 15437410 15437635 -166310452 - MER68 LTR ERVL -329 234 5 6 702 3743 200 129 9 chr2 15440729 15442027 -166306060 - MERVL_2A-int LTR ERVL -80 5681 4242 6 702 3743 203 60 7 chr2 15442066 15442168 -166305919 - MERVL_2A-int LTR ERVL -1520 4241 4121 6 702 1099 226 0 14 chr2 15442193 15442408 -166305679 - MERVL_2A-int LTR ERVL -1787 3974 3763 6 702 3398 120 74 0 chr2 15442415 15442967 -166305120 + RMER17B LTR ERVK 1 593 -365 6 702 3831 61 0 14 chr2 15444225 15444707 -166303380 + RLTR44-int LTR ERVK 2338 2812 0 6 702 2178 126 156 5 chr2 15444707 15445097 -166302990 + RLTR44B LTR ERVK 1 449 0 6 702 447 360 45 51 chr2 15445105 15445439 -166302648 - ORR1E LTR MaLR -15 344 13 6 702 2118 133 63 9 chr2 15446136 15446484 -166301603 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 6 702 377 306 73 20 chr2 15457109 15457259 -166290828 - MLT1A LTR MaLR 0 374 217 6 702 242 298 152 32 chr2 15460645 15460770 -166287317 - LTR81A LTR ERV1? -1195 155 16 6 702 1308 244 75 14 chr2 15464640 15464840 -166283247 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 171 6 702 1308 244 75 14 chr2 15464901 15465062 -166283025 - ORR1C2 LTR MaLR -214 170 2 6 702 4395 263 106 29 chr2 15465062 15466330 -166281757 - ORR1C2-int LTR MaLR 0 1370 2 6 87 1059 249 99 61 chr2 15466372 15466714 -166281373 - ORR1C2 LTR MaLR -19 355 1 6 703 2877 6 0 0 chr2 15467321 15467643 -166280444 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 6 703 1151 144 44 111 chr2 15529748 15530091 -166217996 + RMER17C LTR ERVK 91 410 0 3 703 1109 15 0 0 chr2 15532046 15532177 -166215910 - MTA_Mm LTR MaLR -265 131 1 3 703 513 14 0 65 chr2 15532178 15532255 -166215832 - MTA_Mm-int LTR MaLR -1 1097 1026 3 703 456 320 136 65 chr2 15543564 15543888 -166204199 - RMER15 LTR ERVL -1 574 228 5 703 506 241 168 42 chr2 15546836 15547027 -166201060 + MTEb LTR MaLR 3 217 -162 5 703 6079 113 49 55 chr2 15551211 15552250 -166195837 - RLTR13D4 LTR ERVK 0 1033 1 6 703 3596 103 56 4 chr2 15552587 15553121 -166194966 - LTRIS2 LTR ERV1 0 564 3 6 703 683 303 0 6 chr2 15558513 15558689 -166189398 + MTEb LTR MaLR 1 175 -204 6 703 546 337 73 0 chr2 15558736 15558914 -166189173 + MTE-int LTR MaLR 949 1139 -441 6 703 369 271 66 25 chr2 15558902 15559023 -166189064 + MTEb LTR MaLR 254 379 0 6 703 393 209 27 45 chr2 15561763 15561873 -166186214 - ORR1D2 LTR MaLR 0 379 272 7 703 839 330 14 38 chr2 15563816 15564103 -166183984 - ORR1D2 LTR MaLR -90 280 1 7 703 934 284 73 17 chr2 15570081 15570436 -166177651 - MTE2a LTR MaLR 0 379 5 8 703 1798 219 11 27 chr2 15587440 15587810 -166160277 + ORR1D1 LTR MaLR 9 372 -2 9 703 235 219 109 72 chr2 15592642 15592780 -166155307 - MER34A LTR ERV1 -68 503 361 1 704 313 299 0 118 chr2 15597902 15598046 -166150041 - LTR86A2 LTR ERVL -324 184 58 1 704 802 138 51 11 chr2 15598553 15598702 -166149385 - ORR1A4 LTR MaLR -8 321 170 1 704 251 270 16 0 chr2 15601423 15601486 -166146601 - MLT1E2 LTR MaLR -6 618 555 1 704 434 399 68 27 chr2 15601620 15601914 -166146173 - MLT1E2 LTR MaLR -70 557 252 1 704 371 367 69 28 chr2 15605184 15605393 -166142694 - LTR40a LTR ERVL 0 519 245 1 704 456 35 0 0 chr2 15605393 15605450 -166142637 + MTB_Mm LTR MaLR 1 57 -350 1 704 2084 78 74 7 chr2 15605449 15605758 -166142329 + MT-int LTR MaLR 704 1033 -65 1 704 1626 182 35 95 chr2 15606383 15606560 -166141527 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 220 1 704 5038 102 140 8 chr2 15606560 15607360 -166140727 - RMER17A2 LTR ERVK 0 906 1 1 704 1626 182 35 95 chr2 15607360 15607552 -166140535 - ORR1B1 LTR MaLR -175 219 47 1 704 1563 185 11 75 chr2 15621510 15621971 -166126116 - RMER17C LTR ERVK -517 441 16 1 704 723 215 20 7 chr2 15622329 15622479 -166125608 - ORR1D1 LTR MaLR -10 364 213 1 704 1785 224 106 66 chr2 15622482 15622752 -166125335 - ORR1D1-int LTR MaLR -622 748 462 1 704 1785 224 106 66 chr2 15622893 15623171 -166124916 - ORR1D1-int LTR MaLR -909 461 178 1 704 3366 28 13 0 chr2 15634636 15635027 -166113060 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 704 2088 93 0 20 chr2 15651011 15651306 -166096781 + MTB_Mm LTR MaLR 4 292 -115 1 704 380 164 41 0 chr2 15654318 15654391 -166093696 - RLTR13C2 LTR ERVK -15 793 718 1 704 872 185 5 121 chr2 15654842 15655057 -166093030 + RMER19C LTR ERVK 1 190 -421 2 704 1205 270 108 47 chr2 15655940 15656546 -166091541 + RMER19B LTR ERVK 131 902 0 2 704 903 296 65 24 chr2 15656611 15656950 -166091137 - MTEb LTR MaLR -11 368 16 2 704 1043 243 99 55 chr2 15657742 15658125 -166089962 + MTD LTR MaLR 18 417 -2 2 704 1686 180 39 24 chr2 15658147 15658482 -166089605 + ORR1B2 LTR MaLR 5 344 -23 2 704 1077 249 45 69 chr2 15658564 15658939 -166089148 - ORR1D2 LTR MaLR -4 366 1 2 704 1960 228 43 73 chr2 15662528 15663158 -166084929 - RMER19C LTR ERVK 0 611 1 2 704 424 247 62 38 chr2 15678750 15678910 -166069177 - RLTR43A LTR ERVK 0 364 201 2 704 1678 218 95 5 chr2 15679096 15679475 -166068612 - ETnERV2-int LTR ERVK -348 7058 6646 2 704 393 296 19 19 chr2 15679717 15679731 -166068356 - RodERV21-int LTR ERV1 -434 4557 4477 2 704 461 298 0 0 chr2 15679731 15679862 -166068225 - ETnERV2-int LTR ERVK -300 6619 6489 2 704 912 185 5 21 chr2 15680749 15680909 -166067178 - RMER16-int LTR ERVK -1427 3979 3820 2 704 912 103 1472 8 chr2 15680940 15681006 -166067081 - RMER16-int LTR ERVK -1587 3819 3796 2 704 3149 201 15 0 chr2 15681016 15681674 -166066413 - ETnERV2-int LTR ERVK -1612 5794 5127 2 704 239 184 0 0 chr2 15681675 15681713 -166066374 + RLTR13D3 LTR ERVK 1 38 -1076 2 704 743 216 70 6 chr2 15681740 15681912 -166066175 - ETnERV2-int LTR ERVK -2872 4534 4352 2 704 1434 239 27 26 chr2 15683041 15683588 -166064499 - ETnERV2-int LTR ERVK -3041 4365 4077 2 704 2564 181 8 22 chr2 15683607 15684195 -166063892 - ETnERV2-int LTR ERVK -2567 2839 2302 2 704 4633 191 14 42 chr2 15684196 15685251 -166062836 - ETnERV2-int LTR ERVK -4660 2746 1721 2 704 2055 160 136 41 chr2 15685253 15685769 -166062318 - ETnERV2-int LTR ERVK -4587 819 255 2 704 250 253 0 37 chr2 15686111 15686193 -166061894 - ETnERV2-int LTR ERVK -7949 268 190 2 704 431 248 53 58 chr2 15686478 15686649 -166061438 - RLTR43A LTR ERVK 0 364 195 2 704 507 269 60 7 chr2 15694080 15694230 -166053857 + MLT1A LTR MaLR 5 162 -212 2 704 622 115 106 21 chr2 15694824 15694966 -166053121 + RMER17B LTR ERVK 308 461 -497 2 704 2425 184 26 69 chr2 15695197 15695779 -166052308 - RLTR25A LTR ERVK 0 1103 547 2 704 2244 190 27 18 chr2 15697172 15697622 -166050465 - RLTR25A LTR ERVK -649 454 1 2 704 2136 179 55 89 chr2 15698206 15698238 -166049849 - RLTR41 LTR ERV1 -3 443 414 2 704 2136 179 55 89 chr2 15698263 15698689 -166049398 - RLTR41 LTR ERV1 -33 413 1 2 704 921 280 25 6 chr2 15698787 15699136 -166048951 - RLTR6-int LTR ERV1 -72 7706 7401 2 704 1517 306 66 54 chr2 15699430 15700427 -166047660 - MuRRS4-int LTR ERV1 -1049 4014 3336 2 704 1517 297 71 66 chr2 15700476 15700891 -166047196 - MuRRS4-int LTR ERV1 -1728 3335 2929 2 704 1126 325 48 28 chr2 15700912 15701660 -166046427 - MuRRS4-int LTR ERV1 -2206 2857 2095 2 704 2211 254 31 113 chr2 15701838 15702740 -166045347 + RMER17B LTR ERVK 84 916 -42 2 704 478 252 18 59 chr2 15705722 15705891 -166042196 - RNLTR23 LTR ERVK 0 642 481 2 704 2141 173 8 50 chr2 15714560 15715012 -166033075 + BGLII_B LTR ERVK 2 400 -41 2 704 2267 75 26 90 chr2 15717316 15717785 -166030302 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 12 2 704 1734 184 98 25 chr2 15719710 15720077 -166028010 - RLTR12A LTR ERVK -4 564 171 2 704 685 345 130 30 chr2 15726720 15727213 -166020874 + MER73 LTR ERVL 22 563 -81 2 704 576 260 103 11 chr2 15727210 15727385 -166020702 + MER54A LTR ERVL 654 844 -57 2 705 229 245 90 20 chr2 15737370 15737470 -166010617 + MTC-int LTR MaLR 1152 1258 0 2 705 373 317 134 16 chr2 15737450 15737636 -166010451 + MTC LTR MaLR 1 208 -213 2 705 3011 61 5 32 chr2 15740180 15740587 -166007500 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 705 532 119 0 171 chr2 15740587 15740739 -166007348 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 973 3 705 6906 92 6 3 chr2 15741989 15742988 -166005099 - MTA_Mm-int LTR MaLR -96 1002 1 3 705 2811 106 2 2 chr2 15742988 15743384 -166004703 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 705 813 307 54 67 chr2 15744743 15745107 -166002980 - MTE2b LTR MaLR -28 391 52 3 705 1671 262 27 20 chr2 15745107 15745515 -166002572 + MTD LTR MaLR 1 411 -8 3 705 844 310 97 70 chr2 15745577 15746563 -166001524 - MTE-int LTR MaLR -40 1540 157 3 705 3111 58 5 2 chr2 15746563 15746958 -166001129 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 705 844 367 3 46 chr2 15746958 15747113 -166000974 - MTE-int LTR MaLR -1424 156 2 3 705 253 326 95 35 chr2 15760516 15760716 -165987371 - LTR80A LTR ERVL -268 316 105 3 705 1663 188 99 6 chr2 15765598 15765951 -165982136 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 1 3 705 1717 234 71 19 chr2 15768067 15768490 -165979597 - RMER19C LTR ERVK 0 611 167 3 705 1370 267 40 26 chr2 15787302 15787679 -165960408 - MTD LTR MaLR -8 411 30 3 705 368 350 19 7 chr2 15792504 15792644 -165955443 - MLT1A1 LTR MaLR -209 156 16 3 705 1024 95 33 0 chr2 15794369 15794541 -165953546 - ORR1A3 LTR MaLR -8 319 141 3 705 839 306 63 66 chr2 15795012 15795483 -165952604 - RLTR26 LTR ERVK -22 605 101 3 705 229 298 115 21 chr2 15795549 15795645 -165952442 + MTD LTR MaLR 230 334 -85 3 705 2587 188 50 30 chr2 15801107 15801710 -165946377 - RLTR21 LTR ERVK -268 1304 690 3 705 606 133 0 34 chr2 15801802 15801919 -165946168 - RLTR21 LTR ERVK -855 717 605 3 705 315 323 69 72 chr2 15805925 15806215 -165941872 - ORR1D1 LTR MaLR -7 367 79 3 705 282 315 11 22 chr2 15806278 15806369 -165941718 - ORR1D1 LTR MaLR -289 90 1 3 705 471 313 94 11 chr2 15815121 15815302 -165932785 + MTD LTR MaLR 224 419 0 4 705 225 180 0 0 chr2 15816487 15816537 -165931550 - MT2A LTR ERVL -2 531 482 4 705 343 346 62 75 chr2 15816658 15816980 -165931107 - MT2A LTR ERVL -215 318 1 4 705 336 214 0 117 chr2 15820080 15820191 -165927896 - MT2B LTR ERVL -348 253 156 4 705 282 361 44 11 chr2 15820720 15820902 -165927185 + LTR40a LTR ERVL 15 202 -317 4 705 316 323 118 46 chr2 15832250 15832445 -165915642 + MER90 LTR ERV1 205 413 -162 4 705 2036 206 34 24 chr2 15834594 15835011 -165913076 + MTC LTR MaLR 1 421 0 4 705 1960 175 137 89 chr2 15835837 15836340 -165911747 + RLTR24 LTR ERV1 3 529 0 4 705 2190 15 115 0 chr2 15843895 15844156 -165903931 + RLTR10B LTR ERVK 1 291 -1 4 705 2007 150 95 0 chr2 15847010 15847357 -165900730 - RLTR9A2 LTR ERVK 0 383 4 4 705 340 132 81 81 chr2 15847361 15847435 -165900652 - RMER16-int LTR ERVK -2 7404 7331 4 705 269 296 43 17 chr2 15847648 15847765 -165900322 - RMER16-int LTR ERVK -981 6425 6306 4 705 11248 170 68 43 chr2 15848007 15850808 -165897279 - RMER16-int LTR ERVK -1230 4176 1570 4 705 4497 130 21 60 chr2 15850803 15851672 -165896415 - RMER16-int LTR ERVK -5319 2087 1253 4 705 1193 218 21 25 chr2 15851803 15852085 -165896002 + RMER6C LTR ERVK 407 687 -3 4 705 1217 176 12 47 chr2 15857691 15857948 -165890139 - RLTR25B LTR ERVK -545 483 236 4 706 2178 214 0 7 chr2 15861943 15862367 -165885720 - MTC LTR MaLR 0 421 1 4 706 1856 156 9 33 chr2 15864044 15864381 -165883706 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 4 706 872 276 8 39 chr2 15867093 15867327 -165880760 - MTE2a LTR MaLR 0 379 153 4 706 545 250 116 23 chr2 15867843 15868015 -165880072 + MTEb LTR MaLR 192 379 0 4 706 3328 181 122 73 chr2 15869470 15870330 -165877757 - RMER19B LTR ERVK 0 902 1 4 706 2044 142 28 0 chr2 15870437 15870755 -165877332 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 4 706 4081 191 110 12 chr2 15870755 15871704 -165876383 + ORR1A2-int LTR MaLR 1 1042 -921 4 706 1347 211 108 6 chr2 15876129 15876472 -165871615 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 4 706 1138 260 22 129 chr2 15876864 15877354 -165870733 - RLTR12B LTR ERVK -44 484 47 4 706 1964 134 91 40 chr2 15882154 15882527 -165865560 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 3 4 706 388 152 0 140 chr2 15891235 15891342 -165856745 - MT2B LTR ERVL -337 264 173 5 706 864 131 19 50 chr2 15892770 15892956 -165855131 - RLTR9A LTR ERVK -115 268 77 5 706 310 308 165 23 chr2 15900180 15900356 -165847731 - MTE2a LTR MaLR -137 242 42 5 706 225 333 18 45 chr2 15900279 15900389 -165847698 - MT2A LTR ERVL -414 119 13 5 706 503 306 63 21 chr2 15901718 15901908 -165846179 - MLT1A0 LTR MaLR -155 210 13 5 706 484 404 51 35 chr2 15911755 15912207 -165835880 - MER70A LTR ERVL -13 459 1 5 706 2214 176 8 0 chr2 15914959 15915350 -165832737 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 5 706 467 92 3 0 chr2 15915365 15915441 -165832646 + ORR1B1 LTR MaLR 250 394 0 5 706 2443 214 73 26 chr2 15915442 15915975 -165832112 + ORR1B1-int LTR MaLR 2 559 -1404 5 706 470 228 36 60 chr2 15918567 15918735 -165829352 - RLTR43A LTR ERVK 0 364 201 5 706 315 230 12 0 chr2 15920332 15920429 -165827658 + MERVL_2A-int LTR ERVL 5613 5695 -66 5 706 702 261 119 60 chr2 15920806 15921075 -165827012 + MT2B LTR ERVL 3 287 -314 5 706 3287 219 56 64 chr2 15920951 15921890 -165826197 + ORR1B1-int LTR MaLR 625 1509 0 5 706 650 156 62 5 chr2 15921890 15922024 -165826063 + ORR1B1 LTR MaLR 1 154 -220 5 706 469 259 122 35 chr2 15922065 15922102 -165825985 + ORR1B1 LTR MaLR 155 187 -187 5 706 829 286 55 28 chr2 15936551 15936842 -165811245 - MTE2a LTR MaLR 0 379 81 5 706 240 244 0 0 chr2 15936863 15936908 -165811179 - MTE2a LTR MaLR -278 101 57 5 706 2821 98 5 47 chr2 15938604 15939031 -165809056 - RLTR9E LTR ERVK 0 409 1 5 706 477 28 0 100 chr2 15939031 15939111 -165808976 - ETnERV2-int LTR ERVK 0 7406 7335 5 706 19217 97 21 29 chr2 15939318 15940033 -165808054 - ETnERV2-int LTR ERVK -969 6437 5778 5 706 19217 97 21 29 chr2 15940066 15942121 -165805966 - ETnERV2-int LTR ERVK -1629 5777 3690 5 706 6585 15 1 0 chr2 15942121 15942862 -165805225 - RLTR4_Mm LTR ERV1 0 742 1 5 706 63600 15 6 0 chr2 15942862 15950422 -165797665 - RLTR4_MM-int LTR ERV1 0 7601 1 5 706 6636 15 1 0 chr2 15950422 15951163 -165796924 - RLTR4_Mm LTR ERV1 0 742 1 5 706 1380 118 28 12 chr2 15951163 15951412 -165796675 - ETnERV2-int LTR ERVK -3713 3693 3441 5 706 5171 130 48 13 chr2 15951636 15952627 -165795460 - ETnERV2-int LTR ERVK -3958 3448 1997 5 706 4498 149 67 26 chr2 15952652 15953627 -165794460 - ETnERV2-int LTR ERVK -5321 2085 1071 5 706 258 244 35 47 chr2 15953642 15953728 -165794359 - ETnERV2-int LTR ERVK -2928 386 302 5 706 1018 210 43 53 chr2 15954083 15954365 -165793722 - ETnERV2-int LTR ERVK -3032 282 4 5 706 2668 103 24 34 chr2 15954368 15954781 -165793306 - RLTR9E LTR ERVK 0 409 1 5 706 3974 125 24 54 chr2 15957231 15958022 -165790065 + RMER17A LTR ERVK 1 751 0 5 706 2621 179 96 0 chr2 15962819 15963350 -165784737 - RMER4B LTR ERVK 0 585 4 5 706 743 251 166 72 chr2 15966728 15967259 -165780828 - RMER4B LTR ERVK -4 581 1 5 706 611 241 270 27 chr2 15967348 15967650 -165780437 + MTEb LTR MaLR 5 379 0 5 706 1763 196 73 5 chr2 15967703 15968072 -165780015 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 5 706 1310 249 8 103 chr2 15969612 15970361 -165777726 - RMER19C LTR ERVK -11 891 1 5 706 318 364 17 57 chr2 15971269 15971444 -165776643 + MLT1B LTR MaLR 4 171 -203 6 706 547 306 52 34 chr2 15971456 15971713 -165776374 + MLT1B LTR MaLR 207 467 0 6 707 404 292 84 56 chr2 16009238 16009488 -165738599 - MLT1B LTR MaLR -36 354 98 1 707 335 202 247 0 chr2 16019465 16019554 -165728533 - MLT1A0 LTR MaLR -224 150 40 2 707 3144 183 37 43 chr2 16032414 16033060 -165715027 + RLTR26 LTR ERVK 1 642 0 3 707 480 163 45 58 chr2 16033799 16033955 -165714132 + RMER17A-int LTR ERVK 838 991 -737 3 707 1655 184 5 84 chr2 16034159 16034563 -165713524 + RMER17A-int LTR ERVK 1090 1461 -267 3 707 1997 254 71 59 chr2 16034563 16035450 -165712637 + RMER17B LTR ERVK 51 896 -12 3 707 416 168 117 36 chr2 16035472 16035583 -165712504 - RMER17B LTR ERVK -838 120 1 3 707 591 299 141 60 chr2 16039204 16039503 -165708584 + MTC LTR MaLR 98 420 -1 4 707 622 323 88 66 chr2 16039522 16039887 -165708200 + MLT1C LTR MaLR 44 416 -51 4 707 266 365 52 73 chr2 16048701 16048893 -165699194 - LTR16A LTR ERVL 0 451 264 5 707 1952 134 13 6 chr2 16050167 16050482 -165697605 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 3 6 707 565 161 32 0 chr2 16052277 16052370 -165695717 + MTC LTR MaLR 3 98 -323 6 707 1153 228 72 59 chr2 16052766 16053073 -165695014 + MTC LTR MaLR 107 417 -4 6 707 243 318 90 11 chr2 16054114 16054203 -165693884 - MER34 LTR ERV1 0 571 476 6 707 1381 271 119 127 chr2 16054334 16055267 -165692820 - RMER13B LTR ERVK -32 926 1 6 707 1445 179 124 12 chr2 16055341 16055664 -165692423 + RLTR11A LTR ERVK 1 359 -169 7 707 904 155 36 26 chr2 16056635 16056827 -165691260 + RLTR11A LTR ERVK 335 528 0 7 707 381 311 160 36 chr2 16056827 16057022 -165691065 - MER34 LTR ERV1 -289 253 28 6 707 2177 193 70 26 chr2 16060892 16061391 -165686696 - RLTR12B LTR ERVK -7 521 1 7 707 1652 236 112 19 chr2 16075406 16075889 -165672198 + RLTR11A LTR ERVK 1 528 0 1 707 1075 203 259 52 chr2 16082098 16082547 -165665540 + RLTR20C LTR ERVK 1 542 -9 1 707 519 271 129 56 chr2 16093760 16094104 -165653983 + MTD LTR MaLR 18 405 -14 1 707 257 386 20 0 chr2 16095129 16095230 -165652857 + LTR33 LTR ERVL 75 177 -338 1 707 800 116 40 21 chr2 16105501 16105689 -165642398 - MTA_Mm LTR MaLR 0 407 213 1 707 1259 244 184 6 chr2 16105689 16106043 -165642044 + MTD LTR MaLR 3 419 0 1 707 736 296 36 81 chr2 16109855 16110189 -165637898 + ORR1E LTR MaLR 26 344 -15 1 708 1029 261 112 101 chr2 16122516 16123080 -165625007 - RMER20B LTR ERVK -25 602 1 1 708 282 203 51 0 chr2 16123321 16123380 -165624707 - MER34A1 LTR ERV1 -7 580 519 1 708 2587 201 16 12 chr2 16124562 16125076 -165623011 - RLTR11A LTR ERVK -7 521 6 1 708 2178 145 139 14 chr2 16134827 16135026 -165613061 - BGLII LTR ERVK 0 421 154 1 708 2178 100 150 3 chr2 16135167 16135368 -165612719 - BGLII LTR ERVK -198 223 9 1 708 1514 210 126 0 chr2 16137613 16137946 -165610141 - MTC LTR MaLR -46 375 1 1 708 470 268 96 25 chr2 16140737 16140894 -165607193 - MLT2C2 LTR ERVL -85 379 212 1 708 439 285 30 15 chr2 16141026 16141158 -165606929 - MLT2C2 LTR ERVL -322 142 9 1 708 2920 65 44 0 chr2 16147901 16148284 -165599803 + MTB LTR MaLR 1 400 0 2 708 402 321 115 42 chr2 16148856 16149116 -165598971 - MLT1A LTR MaLR -95 279 1 2 708 2098 125 41 25 chr2 16153335 16153697 -165594390 - RMER17D2 LTR ERVK 0 809 442 2 708 2399 157 5 18 chr2 16157119 16157559 -165590528 - RMER17D2 LTR ERVK -375 434 1 2 708 1702 156 21 61 chr2 16160182 16160509 -165587578 - ORR1A4 LTR MaLR -14 315 2 2 708 1820 214 45 5 chr2 16162945 16163345 -165584742 - MTC LTR MaLR -4 417 2 2 708 2563 59 95 13 chr2 16163963 16164341 -165583746 - RLTR10A LTR ERVK 0 411 3 2 708 1108 179 104 9 chr2 16177207 16177438 -165570649 - RMER5 LTR ERV1 -17 517 265 2 708 1110 316 37 3 chr2 16178687 16179042 -165569045 + MTE2b LTR MaLR 5 371 -8 2 708 3792 59 12 14 chr2 16191363 16191860 -165556227 + LTRIS2 LTR ERV1 69 564 0 2 708 3451 20 5 0 chr2 16194576 16194970 -165553117 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 708 2918 52 0 32 chr2 16195112 16195489 -165552598 - RLTR10B2 LTR ERVK 0 365 1 2 708 369 356 76 65 chr2 16209282 16209636 -165538451 - MLT1A LTR MaLR -13 361 4 2 708 1502 161 32 95 chr2 16217676 16218109 -165529978 - RMER17C LTR ERVK 0 410 5 2 708 760 120 0 39 chr2 16219139 16219269 -165528818 + RMER6C LTR ERVK 506 630 -60 2 708 244 287 9 73 chr2 16219941 16219991 -165528096 - MTC LTR MaLR 0 379 331 2 708 2849 157 134 32 chr2 16219991 16220314 -165527773 + RMER6C LTR ERVK 1 349 -341 2 708 2849 157 134 32 chr2 16220400 16220701 -165527386 + RMER6C LTR ERVK 350 689 -1 2 708 244 287 9 73 chr2 16220701 16220759 -165527328 - MTC LTR MaLR -49 330 278 2 708 467 288 123 40 chr2 16221138 16221407 -165526680 - MLT1A0 LTR MaLR -30 335 14 2 708 697 329 71 24 chr2 16221420 16221759 -165526328 - ORR1E LTR MaLR -4 355 1 2 708 1026 179 0 0 chr2 16225724 16225892 -165522195 - MTC LTR MaLR -253 168 1 2 708 1438 227 102 116 chr2 16230829 16231312 -165516775 + MT2A LTR ERVL 14 492 -41 3 708 1438 227 102 116 chr2 16231391 16231434 -165516653 + MT2A LTR ERVL 493 533 0 3 708 1406 337 65 45 chr2 16236086 16237100 -165510987 + ORR1D-int LTR MaLR 457 1370 0 3 708 436 312 114 47 chr2 16237434 16237733 -165510354 + MTEb LTR MaLR 61 379 0 3 708 242 279 140 52 chr2 16237841 16237977 -165510110 + RMER15 LTR ERVL 1 148 -427 3 708 4393 16 2 0 chr2 16241888 16242380 -165505707 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 3 708 302 0 0 0 chr2 16242380 16242418 -165505669 - MERVL-int LTR ERVL 0 5485 5448 3 708 390 167 46 35 chr2 16242418 16242505 -165505582 - ORR1A3-int LTR MaLR -1323 640 553 3 708 38732 16 14 0 chr2 16242505 16247792 -165500295 - MERVL-int LTR ERVL -125 5360 1 3 708 4377 18 2 0 chr2 16247792 16248284 -165499803 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 3 88 3192 262 47 40 chr2 16251753 16252939 -165495148 - MYSERV-int LTR ERVK -1579 4971 3777 3 709 714 287 52 55 chr2 16253868 16254211 -165493876 - RLTR15 LTR ERVK -17 342 1 3 709 420 299 90 0 chr2 16256322 16256489 -165491598 - MLT1D LTR MaLR -259 246 65 3 709 1417 238 28 89 chr2 16261439 16261832 -165486255 - ORR1D1 LTR MaLR -5 369 1 3 709 2193 146 12 45 chr2 16266100 16266501 -165481586 - RLTR9F LTR ERVK -4 411 24 3 709 2395 101 95 5 chr2 16275817 16276029 -165472058 - BGLII LTR ERVK -6 415 205 3 709 2395 101 95 5 chr2 16276105 16276272 -165471815 - BGLII LTR ERVK -217 204 4 3 709 826 272 59 69 chr2 16288025 16288400 -165459687 - MTEa LTR MaLR -1 378 8 3 709 306 372 79 94 chr2 16289956 16290297 -165457790 + ORR1E LTR MaLR 1 336 -23 3 709 275 346 131 62 chr2 16291923 16292182 -165455905 - ORR1D2 LTR MaLR -14 356 80 3 709 1381 201 128 12 chr2 16292741 16293069 -165455018 - ORR1D1 LTR MaLR -8 366 1 3 709 300 287 88 18 chr2 16317208 16317518 -165430569 - MTE2b LTR MaLR -11 410 6 3 709 286 300 26 19 chr2 16324910 16325020 -165423067 + ORR1D2 LTR MaLR 268 368 -2 4 709 1797 258 91 30 chr2 16329119 16329627 -165418460 - RLTR17 LTR ERVK -82 610 106 4 709 1109 274 96 18 chr2 16337138 16337524 -165410563 + MTD LTR MaLR 1 416 -3 4 709 2483 188 35 44 chr2 16339628 16340146 -165407941 - RLTR20B3 LTR ERVK -32 545 33 4 709 232 321 36 21 chr2 16342478 16342618 -165405469 + RMER17D LTR ERVK 227 368 -521 4 709 2057 223 35 27 chr2 16346176 16346258 -165401829 - RLTR16 LTR ERVK -12 493 413 4 709 2057 223 35 27 chr2 16346305 16346711 -165401376 - RLTR16 LTR ERVK -93 412 1 4 709 246 224 0 108 chr2 16348865 16348930 -165399157 - MTE2a LTR MaLR -33 346 289 4 709 355 338 74 97 chr2 16363097 16363178 -165384909 + ORR1E LTR MaLR 6 89 -270 4 709 1870 127 14 120 chr2 16363178 16363546 -165384541 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 4 709 355 338 74 97 chr2 16363546 16363815 -165384272 + ORR1E LTR MaLR 90 348 -11 4 710 425 300 41 35 chr2 16389431 16389576 -165358511 + MLT1D LTR MaLR 355 500 -5 4 710 715 314 50 38 chr2 16392339 16392680 -165355407 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 21 4 710 1025 173 9 37 chr2 16401645 16401861 -165346226 + RLTR20C LTR ERVK 91 300 -234 5 710 503 329 114 16 chr2 16414076 16414391 -165333696 + MLT1A0 LTR MaLR 4 349 -16 5 710 344 299 17 125 chr2 16415107 16415448 -165332639 - MLT1B LTR MaLR -24 341 65 5 710 275 248 21 23 chr2 16426853 16426940 -165321147 - MTE2a LTR MaLR -35 344 246 5 710 386 348 69 6 chr2 16428984 16429143 -165318944 - MTEb LTR MaLR -2 377 209 5 710 270 401 45 28 chr2 16429336 16429513 -165318574 - MTEb LTR MaLR -199 180 1 5 710 245 319 115 46 chr2 16433351 16433525 -165314562 - ORR1C1 LTR MaLR -162 216 31 5 710 457 248 7 58 chr2 16438194 16438263 -165309824 - MTD LTR MaLR -3 416 349 5 710 457 248 7 58 chr2 16438303 16438370 -165309717 - MTD LTR MaLR -71 348 287 5 710 4778 130 23 103 chr2 16439244 16440228 -165307859 - RMER17A2 LTR ERVK 0 906 1 5 710 227 197 120 53 chr2 16445622 16445697 -165302390 - RMER10A LTR ERVL -45 397 318 5 710 440 308 19 19 chr2 16446931 16447093 -165300994 - MT2A LTR ERVL -66 467 306 5 710 227 341 44 0 chr2 16447210 16447301 -165300786 - MTEa LTR MaLR -219 160 66 5 710 293 369 117 66 chr2 16447914 16448049 -165300038 + MLT1A LTR MaLR 24 177 -197 5 710 293 369 117 66 chr2 16448096 16448294 -165299793 + MLT1A LTR MaLR 178 374 0 5 710 319 259 48 56 chr2 16450875 16451044 -165297043 - MTEa LTR MaLR 0 379 207 5 710 273 280 10 51 chr2 16451142 16451240 -165296847 - MTEa LTR MaLR -227 143 50 5 710 853 259 109 29 chr2 16451302 16451651 -165296436 + MTE2b LTR MaLR 1 377 -2 5 710 286 309 47 16 chr2 16451890 16452018 -165296069 + MLT1A1 LTR MaLR 274 405 -3 5 710 370 301 88 84 chr2 16460502 16460872 -165287215 + MLT1A LTR MaLR 4 408 0 5 710 727 152 23 10 chr2 16462958 16463162 -165284925 + RLTR26 LTR ERVK 72 238 -720 6 710 586 338 128 34 chr2 16464273 16464601 -165283486 - ORR1E LTR MaLR 0 359 1 6 710 3455 23 2 0 chr2 16464652 16465047 -165283040 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 710 277 314 98 0 chr2 16465805 16465907 -165282180 - MLT1B LTR MaLR -257 133 22 6 710 2050 106 20 62 chr2 16474884 16475208 -165272879 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 18 6 710 2050 106 20 62 chr2 16475228 16475244 -165272843 - ORR1A2 LTR MaLR -310 17 2 6 710 444 325 102 64 chr2 16476277 16476560 -165271527 - RMER15 LTR ERVL -62 513 220 6 710 1274 196 186 6 chr2 16478775 16479130 -165268957 + MTC LTR MaLR 3 421 0 6 710 5304 133 45 29 chr2 16492860 16493803 -165254284 - RMER17B LTR ERVK 0 958 1 6 710 701 343 57 27 chr2 16494889 16495291 -165252796 + RMER5 LTR ERV1 106 519 -15 6 710 454 337 72 63 chr2 16498256 16498604 -165249483 - ORR1E LTR MaLR -5 354 4 6 710 2414 132 42 42 chr2 16502708 16503183 -165244904 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 5 710 24952 17 5 0 chr2 16503183 16506126 -165241961 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 3525 5 710 886 73 24 0 chr2 16506126 16506249 -165241838 - IAPEz-int LTR ERVK -2770 4910 4785 6 710 1728 119 4 4 chr2 16506246 16506508 -165241579 - IAPEz-int LTR ERVK -5183 2497 2236 6 710 424 38 0 0 chr2 16506507 16506560 -165241527 - IAPEz-int LTR ERVK -5070 1411 1359 6 710 4642 56 5 30 chr2 16506560 16507204 -165240883 - IAPEz-int LTR ERVK -5819 662 35 6 710 2422 130 42 42 chr2 16507214 16507689 -165240398 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 7 710 3475 142 23 86 chr2 16507986 16508670 -165239417 - RLTR26 LTR ERVK 0 642 2 8 710 1641 183 41 99 chr2 16511133 16511527 -165236560 - ORR1C1 LTR MaLR -7 371 1 1 710 311 202 58 23 chr2 16512048 16512134 -165235953 - MTC LTR MaLR 0 421 333 1 710 4111 163 92 58 chr2 16512136 16513063 -165235024 + RMER17B LTR ERVK 1 958 0 1 710 4136 170 77 67 chr2 16513236 16514111 -165233976 + RMER19B LTR ERVK 6 888 -14 1 710 306 289 24 0 chr2 16514117 16514200 -165233887 - MTD LTR MaLR -302 117 33 1 710 1426 233 33 27 chr2 16514300 16514635 -165233452 + ORR1D1 LTR MaLR 1 337 -37 1 711 1423 235 10 16 chr2 16517134 16517437 -165230650 + MTD LTR MaLR 1 301 -118 2 711 242 313 0 0 chr2 16517468 16517535 -165230552 - MTD LTR MaLR -292 67 1 1 711 1825 209 21 13 chr2 16519650 16520029 -165228058 - RLTR14 LTR ERV1 0 382 1 2 711 325 276 50 180 chr2 16523211 16523533 -165224554 + RMER10A LTR ERVL 122 401 -41 3 711 280 232 19 112 chr2 16527246 16527353 -165220734 - RMER20B LTR ERVK -38 589 493 3 711 519 343 102 68 chr2 16532971 16533293 -165214794 + MLT1A LTR MaLR 22 354 -11 4 711 328 218 37 187 chr2 16533651 16533758 -165214329 - RMER19C LTR ERVK -279 332 242 4 711 841 175 299 5 chr2 16533810 16534017 -165214070 - RMER19C LTR ERVK -343 268 1 4 711 327 223 30 50 chr2 16539533 16539632 -165208455 - MT2B LTR ERVL -337 264 168 6 711 599 120 92 9 chr2 16549157 16549266 -165198821 - RMER19B LTR ERVK 0 902 785 6 711 472 139 0 0 chr2 16550557 16550629 -165197458 - RMER19B LTR ERVK -132 770 699 6 711 1684 182 55 42 chr2 16563378 16563401 -165184686 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 363 8 711 1684 182 55 42 chr2 16563421 16563776 -165184311 - ORR1C2 LTR MaLR -22 362 1 8 711 568 206 144 8 chr2 16563776 16563908 -165184179 - ORR1C2-int LTR MaLR 0 1370 1221 8 711 1999 259 30 23 chr2 16564005 16564531 -165183556 - ORR1C2-int LTR MaLR -979 530 1 8 711 1614 200 112 6 chr2 16564531 16564878 -165183209 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 8 711 1756 196 208 98 chr2 16566539 16567088 -165180999 - RMER19C LTR ERVK -1 610 2 9 711 510 335 92 19 chr2 16592358 16592674 -165155413 - MT2A LTR ERVL -13 520 182 1 711 379 310 8 17 chr2 16592701 16592819 -165155268 - MTEa LTR MaLR -257 122 6 1 711 698 308 48 100 chr2 16600451 16600822 -165147265 + MTE2a LTR MaLR 2 353 -26 1 711 408 329 129 18 chr2 16606256 16606473 -165141614 - MTEa LTR MaLR -13 366 126 1 711 419 306 205 46 chr2 16623798 16624127 -165123960 - MER77 LTR ERVL -40 567 187 1 711 1561 157 220 6 chr2 16628759 16629104 -165118983 - MTC LTR MaLR 0 421 3 1 711 1696 189 95 72 chr2 16631201 16631634 -165116453 - RMER16 LTR ERVK 0 533 91 1 711 946 173 2 21 chr2 16632363 16632607 -165115480 + RLTR17 LTR ERVK 10 196 -496 1 711 3126 44 15 3 chr2 16635561 16635952 -165112135 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 712 316 272 16 58 chr2 16654003 16654124 -165093963 - MLT1A1 LTR MaLR -4 404 289 2 712 476 341 82 22 chr2 16656006 16656276 -165091811 - MLT1D LTR MaLR 0 505 220 2 712 2136 128 0 15 chr2 16657172 16657497 -165090590 - ORR1A1 LTR MaLR -8 338 19 2 712 733 257 187 99 chr2 16664539 16664882 -165083205 + MTC LTR MaLR 6 377 -2 2 712 1040 296 67 36 chr2 16683501 16683900 -165064187 - MTD LTR MaLR -14 405 6 2 712 254 333 0 25 chr2 16683913 16683993 -165064094 - RMER15 LTR ERVL -161 414 337 2 712 337 215 17 163 chr2 16684068 16684246 -165063841 - RMER15 LTR ERVL -423 152 1 2 712 326 137 406 10 chr2 16691805 16691901 -165056186 - RLTR11A LTR ERVK -394 134 1 2 712 2542 189 19 34 chr2 16692853 16693385 -165054702 + RLTR28 LTR ERVL 1 524 0 2 712 387 268 86 138 chr2 16696492 16696920 -165051167 + RMER10A LTR ERVL 12 417 -25 2 712 621 289 65 52 chr2 16697216 16697646 -165050441 - MER21B LTR ERV1 -227 636 164 2 712 231 360 112 0 chr2 16697800 16697925 -165050162 - MER74C LTR ERVL -319 141 3 2 712 867 284 48 0 chr2 16698628 16698878 -165049209 - MT2A LTR ERVL 0 533 272 2 712 730 315 86 13 chr2 16716405 16716714 -165031373 - MLT1A1 LTR MaLR -40 368 69 3 712 1235 266 57 19 chr2 16718608 16718922 -165029165 + ORR1E LTR MaLR 34 359 0 3 712 356 326 112 83 chr2 16719887 16720187 -165027900 - LTR33 LTR ERVL -180 335 27 3 712 2226 201 121 82 chr2 16732992 16733738 -165014349 - RLTR13D6 LTR ERVK -127 775 1 3 712 281 258 0 0 chr2 16737673 16737735 -165010352 + LTR16A1 LTR ERVL 40 101 -355 3 712 232 305 63 71 chr2 16740158 16740285 -165007802 - MLT1J LTR MaLR -264 248 123 3 712 254 331 151 10 chr2 16740740 16740932 -165007155 - RMER15-int LTR ERVL -2776 2223 2005 3 712 299 219 0 0 chr2 16741212 16741276 -165006811 - RMER15-int LTR ERVL -3309 1690 1627 3 712 1452 334 36 30 chr2 16742129 16742821 -165005266 - RMER15-int LTR ERVL -3361 1638 943 3 712 426 373 19 23 chr2 16742869 16743083 -165005004 - RMER15-int LTR ERVL -4705 294 82 3 712 242 297 81 0 chr2 16743246 16743320 -165004767 - RMER15 LTR ERVL -124 451 372 3 712 941 303 98 50 chr2 16745617 16746017 -165002070 - MTD LTR MaLR 0 419 1 3 712 304 304 110 7 chr2 16747341 16747487 -165000600 + MLT1A1 LTR MaLR 243 403 -5 3 712 330 339 237 12 chr2 16750464 16750637 -164997450 + RMER15 LTR ERVL 336 547 -28 3 712 376 138 4 20 chr2 16752541 16752605 -164995482 - ORR1C1 LTR MaLR -2 376 266 3 712 3766 214 64 33 chr2 16752605 16753507 -164994580 - RMER19B LTR ERVK 0 902 1 3 712 1278 188 28 151 chr2 16753507 16753861 -164994226 - ORR1B2 LTR MaLR -57 310 1 3 712 3390 33 5 0 chr2 16754481 16754875 -164993212 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 712 355 261 130 0 chr2 16756969 16757061 -164991026 + MTE2b LTR MaLR 265 368 -11 3 712 658 329 79 30 chr2 16757087 16757353 -164990734 + MTE2b-int LTR MaLR 17 295 -1285 3 712 1195 330 27 100 chr2 16757381 16758013 -164990074 + MTE2b-int LTR MaLR 473 1058 -522 3 712 828 325 113 90 chr2 16758298 16759001 -164989086 - MLT1F-int LTR MaLR -672 817 58 3 712 665 255 135 33 chr2 16759001 16759334 -164988753 - RLTR9A LTR ERVK -1 367 1 3 712 518 324 123 100 chr2 16759334 16759372 -164988715 - MLT1F-int LTR MaLR -1352 57 13 3 712 1627 176 66 50 chr2 16760362 16760740 -164987347 + RLTR41 LTR ERV1 47 430 -16 3 712 1732 222 42 25 chr2 16761765 16761934 -164986153 - BGLII_B LTR ERVK 0 441 269 3 712 1732 222 42 25 chr2 16761999 16762263 -164985824 - BGLII_B LTR ERVK -173 268 1 3 712 257 327 79 0 chr2 16765647 16765748 -164982339 + ORR1E LTR MaLR 1 109 -250 3 712 855 281 59 23 chr2 16768077 16768347 -164979740 + ORR1E LTR MaLR 1 302 -77 3 712 315 145 143 13 chr2 16768688 16768765 -164979322 + MLT1A1 LTR MaLR 1 87 -321 3 1 6263 89 24 38 chr2 16776714 16777656 -164970431 - RLTR13B3 LTR ERVK 0 929 1 3 713 1454 292 65 24 chr2 16779047 16779711 -164968376 - MYSERV-int LTR ERVK -2085 4465 3775 3 713 978 281 26 26 chr2 16782235 16782575 -164965512 - RLTR15 LTR ERVK -16 343 4 3 713 1007 311 30 27 chr2 16782582 16782988 -164965099 + MYSERV-int LTR ERVK 4741 5147 -1403 3 713 451 313 52 0 chr2 16783010 16783144 -164964943 + RMER4A LTR ERVK 298 438 -28 3 713 556 209 103 16 chr2 16783144 16783329 -164964758 + MYSERV6-int LTR ERVK 7762 7962 -997 3 713 4011 174 34 55 chr2 16784635 16785610 -164962477 + MYSERV6-int LTR ERVK 8002 8955 -4 3 713 670 258 41 57 chr2 16785624 16785941 -164962146 + RLTR15 LTR ERVK 11 322 -37 3 713 2956 32 3 0 chr2 16788833 16789178 -164958909 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 4 713 800 176 227 20 chr2 16797890 16798093 -164949994 + RMER6A LTR ERVK 512 756 0 4 713 2192 181 226 6 chr2 16801259 16801759 -164946328 - RMER19C LTR ERVK -1 610 1 4 713 1836 208 15 49 chr2 16804300 16804689 -164943398 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 3 4 713 4027 102 7 4 chr2 16811949 16812511 -164935576 - LTRIS2 LTR ERV1 0 564 1 4 713 862 228 26 4 chr2 16812512 16812741 -164935346 - MuRRS4-int LTR ERV1 -42 5021 4788 4 713 2775 236 24 16 chr2 16812732 16813435 -164934652 - MuRRS4-int LTR ERV1 -792 4271 3563 4 713 5933 77 14 8 chr2 16813765 16814631 -164933456 - MuRRS4-int LTR ERV1 -2032 3031 2220 4 713 228 200 47 62 chr2 16820886 16820950 -164927137 - RMER20A LTR ERVK -268 248 186 4 713 2010 195 32 18 chr2 16828524 16828925 -164919162 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 4 713 1773 180 32 74 chr2 16829972 16830379 -164917708 + ORR1B1 LTR MaLR 5 394 0 4 713 283 307 11 0 chr2 16831863 16831951 -164916136 + MLT1E2 LTR MaLR 539 627 0 4 713 321 320 41 0 chr2 16832053 16832150 -164915937 + RLTR13D5 LTR ERVK 923 1023 0 4 713 1691 163 14 51 chr2 16833334 16833689 -164914398 + RLTR45-int LTR ERVK 1756 2097 -5147 4 713 5261 119 17 14 chr2 16833914 16834774 -164913313 + ETnERV2-int LTR ERVK 1319 2181 -5225 4 713 1574 68 22 9 chr2 16834785 16835008 -164913079 + RMER16-int LTR ERVK 4065 4290 -1116 4 713 1085 228 11 52 chr2 16834979 16835266 -164912821 + RMER16-int LTR ERVK 5350 5624 -184 4 713 4026 182 70 16 chr2 16835267 16836053 -164912034 - RMER19B LTR ERVK -74 828 1 4 713 591 330 97 57 chr2 16838312 16838643 -164909444 - ORR1E LTR MaLR -8 351 8 4 713 3556 40 28 0 chr2 16839064 16839488 -164908599 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 4 713 347 253 31 31 chr2 16841461 16841559 -164906528 + MLT1A1 LTR MaLR 290 387 -21 4 713 359 283 64 78 chr2 16855167 16855454 -164892633 - ORR1E LTR MaLR -14 365 79 5 713 359 308 81 99 chr2 16855830 16855895 -164892192 - ORR1E LTR MaLR -262 97 36 5 713 240 300 25 130 chr2 16859490 16859651 -164888436 + RMER20B LTR ERVK 242 385 -242 5 713 589 244 47 8 chr2 16881331 16881459 -164866628 + ETnERV2-int LTR ERVK 7070 7202 -204 5 713 468 383 73 34 chr2 16890819 16891146 -164856941 - LTR40a LTR ERVL -118 401 62 5 713 348 203 0 5 chr2 16894419 16894492 -164853595 - MTE2a LTR MaLR -306 73 3 5 713 226 184 19 58 chr2 16897980 16898032 -164850055 - RLTR13A3 LTR ERVK -545 433 384 5 713 322 372 47 33 chr2 16902080 16902294 -164845793 - ORR1D2 LTR MaLR -4 366 150 5 713 434 338 78 13 chr2 16903755 16903908 -164844179 + MLT1A LTR MaLR 30 192 -182 5 713 2822 170 24 11 chr2 16904955 16905501 -164842586 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1 553 -1295 5 714 680 205 85 55 chr2 16911048 16911249 -164836838 + RLTR22_Mur LTR ERVK 543 749 -1099 5 714 275 268 0 78 chr2 16911470 16911547 -164836540 + RMER12 LTR ERVK 1252 1322 0 5 714 583 293 28 107 chr2 16912624 16912818 -164835269 - RLTR15 LTR ERVK -57 302 114 5 714 1799 131 98 87 chr2 16912818 16913288 -164834799 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 5 714 583 287 60 53 chr2 16913288 16913530 -164834557 - RLTR15 LTR ERVK -297 231 5 5 714 3155 57 3 0 chr2 16915889 16916273 -164831814 - IAPEY_LTR LTR ERVK 0 385 1 5 714 227 365 26 65 chr2 16917929 16918084 -164830003 + ORR1E LTR MaLR 1 149 -210 5 714 1479 210 182 35 chr2 16918439 16918839 -164829248 - RLTR31B_Mm LTR ERVK 0 557 89 5 714 1479 210 182 35 chr2 16918880 16918963 -164829124 - RLTR31B_Mm LTR ERVK -469 88 4 5 714 228 368 97 62 chr2 16935682 16935908 -164812179 - LTR88a LTR Gypsy -48 768 535 6 714 339 373 45 6 chr2 16937471 16937649 -164810438 - MLT1L LTR MaLR -165 445 261 6 714 1834 208 166 21 chr2 16940314 16940569 -164807518 - RMER4B LTR ERVK 0 585 291 6 714 1834 208 166 21 chr2 16940616 16940831 -164807256 - RMER4B LTR ERVK -295 290 49 6 714 361 342 96 122 chr2 16942074 16942377 -164805710 + MLT1D LTR MaLR 139 433 -72 6 714 226 306 0 0 chr2 16942489 16942561 -164805526 + MLT1D LTR MaLR 555 626 -1 6 714 397 316 163 34 chr2 16944747 16944980 -164803107 - MLT1A1 LTR MaLR -2 406 144 6 714 1969 159 68 27 chr2 16947640 16948009 -164800078 + ORR1B1 LTR MaLR 3 386 -8 6 714 2886 85 17 7 chr2 16952839 16953255 -164794832 - BGLII LTR ERVK 0 421 2 6 714 2110 158 178 5 chr2 16956020 16956403 -164791684 - RLTR44B LTR ERVK 0 449 1 6 714 1727 239 60 73 chr2 16959428 16960046 -164788041 + RMER19C LTR ERVK 1 610 -1 6 714 2373 142 77 37 chr2 16960696 16961019 -164787068 + RMER17B LTR ERVK 1 431 -527 6 714 2373 184 106 9 chr2 16961197 16961676 -164786411 + RMER17B LTR ERVK 432 947 -11 6 714 303 282 13 0 chr2 16964153 16964231 -164783856 + ORR1E LTR MaLR 1 79 -280 6 714 2739 49 0 62 chr2 16980931 16981299 -164766788 - IAPLTR4 LTR ERVK 0 345 1 6 714 6333 191 3 11 chr2 16981299 16982446 -164765641 - IAPLTR3-int LTR ERVK -351 7329 5750 6 714 504 267 6 42 chr2 16982770 16982938 -164765149 - IAPLTR3-int LTR ERVK -914 5628 5467 6 714 2220 206 14 16 chr2 16983144 16983794 -164764293 - MMERVK10C-int LTR ERVK -1076 5745 5068 6 714 803 96 35 49 chr2 16983905 16984048 -164764039 - MMERVK10C-int LTR ERVK -2911 4670 4530 6 714 489 195 23 2 chr2 16984065 16984183 -164763904 - MMETn-int LTR ERVK -2380 2464 2357 6 714 6237 90 58 11 chr2 16984185 16985401 -164762686 - RLTR45-int LTR ERVK -2648 4596 3555 6 714 263 289 0 57 chr2 16985401 16985489 -164762598 - RLTR45-int LTR ERVK -4870 2536 2454 6 714 448 224 93 0 chr2 16985508 16985615 -164762472 - RMER16-int LTR ERVK -5083 1054 938 6 714 1174 202 194 41 chr2 16985618 16986032 -164762055 - RMER16-int LTR ERVK -5469 668 221 6 714 1174 182 152 33 chr2 16986110 16986163 -164761924 - RMER16-int LTR ERVK -5080 326 255 6 714 354 143 0 125 chr2 16986283 16986403 -164761684 - IAPLTR3-int LTR ERVK -6629 952 848 6 714 2208 264 73 71 chr2 16986415 16987348 -164760739 - IAPLTR3-int LTR ERVK -5886 935 1 6 714 2595 61 0 104 chr2 16987348 16987733 -164760354 - IAPLTR4 LTR ERVK 0 345 1 6 714 2970 172 19 8 chr2 16998137 16998671 -164749416 - RLTR17 LTR ERVK -55 637 98 6 714 5231 189 55 34 chr2 16998700 16999979 -164748108 - RMER3D-int LTR ERVK -5 2837 1532 6 714 1509 195 82 34 chr2 17000066 17000665 -164747422 - RMER3D-int LTR ERVK -1389 1453 680 1 714 841 225 80 24 chr2 17002898 17003148 -164744939 - RMER3D-int LTR ERVK -2481 361 98 1 714 1551 183 59 109 chr2 17015443 17015847 -164732240 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 1 714 7869 80 32 32 chr2 17016300 17017757 -164730330 - MuRRS4-int LTR ERV1 -1619 3444 1802 1 714 306 61 333 0 chr2 17017877 17017906 -164730181 - MuRRS4-int LTR ERV1 -3262 1801 1760 1 714 584 261 233 24 chr2 17018036 17018328 -164729759 - MuRRS4-int LTR ERV1 -5749 1807 1455 1 714 618 102 0 9 chr2 17018354 17018463 -164729624 - MuRRS4-int LTR ERV1 -2170 1129 1022 1 714 591 105 9 19 chr2 17018468 17018575 -164729512 - MuRRS4-int LTR ERV1 -2245 1054 949 1 714 1758 132 44 13 chr2 17018630 17018945 -164729142 - MMVL30-int LTR ERV1 -2214 1484 1160 2 714 594 207 68 49 chr2 17019732 17019992 -164728095 - MMVL30-int LTR ERV1 -6933 623 280 2 714 783 227 58 38 chr2 17020038 17020461 -164727626 - MMVL30-int LTR ERV1 -6933 623 198 2 714 657 84 84 0 chr2 17020477 17020584 -164727503 - MMVL30-int LTR ERV1 -3183 116 1 2 714 1642 188 25 94 chr2 17020584 17020990 -164727097 - RLTR1B LTR ERV1 0 512 135 2 714 715 250 84 11 chr2 17021078 17021256 -164726831 + ORR1C2 LTR MaLR 194 384 0 2 714 686 273 111 37 chr2 17021256 17021458 -164726629 + MTE2b LTR MaLR 108 325 -54 2 714 703 318 128 46 chr2 17025563 17026024 -164722063 - MER21B LTR ERV1 -105 758 260 3 714 416 291 83 66 chr2 17026186 17026414 -164721673 - MER21B LTR ERV1 -631 232 1 3 714 1876 258 34 36 chr2 17028433 17028939 -164719148 - RMER19C LTR ERVK 0 611 107 3 715 4492 139 53 92 chr2 17044660 17045603 -164702484 + RMER17A2 LTR ERVK 1 906 0 5 715 4114 142 75 6 chr2 17074403 17075128 -164672959 + RMER17B LTR ERVK 184 958 0 8 715 3613 35 28 0 chr2 17075336 17075760 -164672327 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 8 715 2125 132 0 3 chr2 17075793 17076105 -164671982 - RLTR10E LTR ERVK 0 311 1 8 715 399 241 9 61 chr2 17076199 17076314 -164671773 + MTEa LTR MaLR 268 376 -3 9 715 355 303 108 79 chr2 17076360 17076600 -164671487 - LTR84b LTR ERVL 0 761 515 9 715 269 322 99 42 chr2 17076635 17076826 -164671261 - LTR84b LTR ERVL -378 383 182 9 715 242 354 78 17 chr2 17076849 17076964 -164671123 - LTR84b LTR ERVL -639 122 1 9 715 4373 171 68 42 chr2 17077076 17078002 -164670085 - RMER17B LTR ERVK -4 954 5 9 715 668 255 25 23 chr2 17079791 17080036 -164668051 - ORR1D2 LTR MaLR -8 362 30 9 715 6980 60 28 6 chr2 17081267 17082176 -164665911 + RLTR13B3 LTR ERVK 1 929 0 9 715 1334 274 31 75 chr2 17086075 17086462 -164661625 - MTE2a LTR MaLR 0 379 10 9 715 256 331 65 35 chr2 17091624 17091793 -164656294 + MER34A1 LTR ERV1 9 182 -405 1 715 420 297 73 62 chr2 17095832 17096284 -164651803 + RMER20A LTR ERVK 14 466 -394 1 715 237 415 12 0 chr2 17096459 17096541 -164651546 + RMER20A LTR ERVK 514 596 -31 1 715 2674 179 4 178 chr2 17102179 17102919 -164645168 + RMER19C LTR ERVK 1 611 0 1 715 1995 149 13 85 chr2 17103648 17104038 -164644049 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 1 715 1200 225 149 99 chr2 17104547 17105050 -164643037 + RLTR11A LTR ERVK 1 528 0 1 715 574 314 104 63 chr2 17107618 17107965 -164640122 + MLT1A0 LTR MaLR 4 364 -1 1 715 1908 174 24 54 chr2 17112180 17112550 -164635537 + ORR1C1 LTR MaLR 1 359 -19 1 715 410 288 193 55 chr2 17116830 17117132 -164630955 + RMER20B LTR ERVK 189 500 -127 1 715 231 376 40 0 chr2 17117248 17117349 -164630738 + RMER20B LTR ERVK 485 589 -38 1 715 343 281 0 12 chr2 17121477 17121560 -164626527 + RMER15 LTR ERVL 372 453 -122 1 715 2058 144 94 22 chr2 17122834 17123197 -164624890 + ORR1B1 LTR MaLR 1 389 -5 1 715 490 331 99 21 chr2 17126561 17126845 -164621242 - ORR1E LTR MaLR -51 308 3 1 715 1912 164 25 0 chr2 17127248 17127566 -164620521 + ORR1A2 LTR MaLR 2 327 0 1 715 2010 221 37 128 chr2 17128691 17129292 -164618795 - RMER19C LTR ERVK 0 611 66 1 715 1827 172 60 14 chr2 17134609 17134975 -164613112 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 2 1 715 1646 118 201 26 chr2 17138931 17139279 -164608808 + RLTR9E LTR ERVK 1 409 0 1 715 1762 135 120 92 chr2 17146501 17146883 -164601204 + RLTR9C LTR ERVK 1 393 0 1 715 432 252 79 94 chr2 17148930 17149231 -164598856 + RLTR12B LTR ERVK 92 353 -215 1 715 279 283 92 79 chr2 17152134 17152423 -164595664 + RLTR12B LTR ERVK 235 514 -54 1 715 272 264 53 35 chr2 17152438 17152552 -164595535 - RLTR15 LTR ERVK -197 162 47 1 715 771 181 9 11 chr2 17156134 17156301 -164591786 - RMER19B LTR ERVK -572 165 1 1 715 1528 233 101 13 chr2 17157320 17157383 -164590704 - MTC LTR MaLR 0 421 352 1 715 1528 233 101 13 chr2 17157410 17157733 -164590354 - MTC LTR MaLR -70 351 1 1 716 324 319 87 25 chr2 17174753 17174951 -164573136 - MLT1E1A LTR MaLR -2 678 341 2 716 228 320 0 39 chr2 17175528 17175606 -164572481 - LTR81B LTR ERV1? -915 478 404 2 716 1471 192 25 136 chr2 17175916 17176102 -164571985 + ORR1A2 LTR MaLR 41 183 -211 2 716 1498 101 5 1 chr2 17176562 17176773 -164571314 + ORR1A2 LTR MaLR 118 394 0 2 716 293 265 227 20 chr2 17183941 17184091 -164563996 - MLT2B4 LTR ERVL -51 505 325 2 716 275 288 127 36 chr2 17185244 17185410 -164562677 - MLT2B4 LTR ERVL -367 189 9 2 716 290 383 166 15 chr2 17186083 17186414 -164561673 + MLT1G3 LTR MaLR 215 595 0 2 716 230 318 94 65 chr2 17188812 17188950 -164559137 + MTEb LTR MaLR 5 146 -233 2 716 309 272 128 70 chr2 17188971 17189269 -164558818 + ORR1E LTR MaLR 50 360 -7 2 716 906 270 74 89 chr2 17189870 17190329 -164557758 - RLTR12B LTR ERVK -30 498 47 2 716 565 276 83 48 chr2 17190434 17190746 -164557341 - RLTR15 LTR ERVK -36 323 1 2 716 4972 172 49 35 chr2 17190746 17191876 -164556211 - MYSERV6-int LTR ERVK -1 8958 7813 2 716 530 290 32 21 chr2 17191978 17192165 -164555922 - RMER4A LTR ERVK -27 439 251 2 716 906 275 48 56 chr2 17192165 17192756 -164555331 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -1547 779 285 2 716 402 300 7 32 chr2 17199294 17199449 -164548638 - MYSERV-int LTR ERVK -1982 4568 4418 2 716 535 226 124 81 chr2 17200336 17200659 -164547428 - RLTR15 LTR ERVK -22 337 1 2 716 1502 224 108 22 chr2 17201162 17201531 -164546556 + MTD LTR MaLR 5 405 -14 2 716 313 388 29 39 chr2 17203287 17203512 -164544575 - LTR33 LTR ERVL -288 232 12 2 716 3136 204 57 53 chr2 17208560 17209367 -164538720 - RLTR40 LTR ERVK -5 812 3 2 716 297 323 166 39 chr2 17210527 17210865 -164537222 + MER57C2 LTR ERV1 48 428 -6 2 716 2093 163 40 5 chr2 17216010 17216381 -164531706 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 2 716 5740 189 117 52 chr2 17216381 17217145 -164530942 + ORR1C2-int LTR MaLR 1 912 -597 2 716 5740 189 117 52 chr2 17217292 17217942 -164530145 + ORR1C2-int LTR MaLR 913 1508 -1 2 716 2067 156 60 0 chr2 17217948 17218300 -164529787 + ORR1C2 LTR MaLR 7 379 -5 2 716 434 353 50 55 chr2 17219222 17219423 -164528664 - MLT1J LTR MaLR -74 438 239 2 716 4729 113 35 6 chr2 17220756 17221461 -164526626 - RMER19A LTR ERVK -11 726 1 2 716 310 343 116 0 chr2 17221711 17221883 -164526204 - LTR79 LTR ERVL -278 249 58 2 716 273 271 167 0 chr2 17222864 17222960 -164525127 - MTE2b LTR MaLR -267 112 1 2 716 3185 172 5 12 chr2 17225051 17225611 -164522476 + RLTR20B2 LTR ERVK 5 560 0 2 716 4392 185 59 115 chr2 17226551 17227521 -164520566 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 1 1340 -1502 2 716 2828 93 106 38 chr2 17227521 17227966 -164520121 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 475 0 2 716 4392 171 78 95 chr2 17227966 17228150 -164519937 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 915 1067 -1259 2 716 4392 184 60 117 chr2 17228295 17228456 -164519631 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 1068 1229 -1097 2 716 5514 152 34 14 chr2 17229405 17229671 -164518416 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 1205 1473 -853 2 716 902 209 163 33 chr2 17229671 17230033 -164518054 - RLTR9E LTR ERVK 0 409 1 3 716 5514 152 34 14 chr2 17230033 17230866 -164517221 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 1474 2326 0 2 716 2946 170 32 39 chr2 17230866 17231430 -164516657 + RLTR20B2 LTR ERVK 1 560 0 2 716 1538 198 26 79 chr2 17232593 17232971 -164515116 + ORR1B2 LTR MaLR 1 358 -9 3 716 3885 172 72 30 chr2 17235528 17236283 -164511804 + RMER13A LTR ERVK 1 786 -74 3 716 227 156 89 0 chr2 17248836 17248881 -164499206 - MLT2C2 LTR ERVL 0 559 511 3 716 422 306 5 121 chr2 17254564 17254787 -164493300 - MTEa LTR MaLR -182 197 1 3 716 876 261 66 17 chr2 17254787 17255047 -164493040 + MTD LTR MaLR 134 406 -13 3 716 527 327 67 0 chr2 17256118 17256326 -164491761 + MLT1B LTR MaLR 103 324 -66 3 716 1429 239 60 50 chr2 17256946 17257285 -164490802 - RMER13B LTR ERVK -9 899 508 3 716 1429 203 98 55 chr2 17257358 17257999 -164490088 - RMER13B LTR ERVK -385 573 1 3 716 3225 52 3 0 chr2 17260177 17260561 -164487526 + IAPEY_LTR LTR ERVK 1 385 0 3 716 1258 240 112 6 chr2 17271772 17272103 -164475984 + ORR1D2 LTR MaLR 1 366 -4 3 716 887 255 70 92 chr2 17279523 17279894 -164468193 - RMER20B LTR ERVK -175 452 90 3 716 578 306 48 112 chr2 17286817 17287111 -164460976 + ORR1E LTR MaLR 67 341 -18 3 716 2028 152 67 11 chr2 17294364 17294737 -164453350 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 3 716 1442 260 59 11 chr2 17294760 17295118 -164452969 + MTE2b LTR MaLR 1 375 -4 3 717 3130 14 0 0 chr2 17301909 17302255 -164445832 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 3 717 561 263 77 53 chr2 17307339 17307687 -164440400 + MTEa LTR MaLR 1 379 0 3 717 1674 103 195 0 chr2 17308853 17309125 -164438962 - ORR1A2 LTR MaLR -2 325 1 3 717 2820 38 6 0 chr2 17309841 17310181 -164437906 + ORR1A1 LTR MaLR 1 342 -4 3 717 310 256 165 11 chr2 17315616 17315707 -164432380 - MLT1H2 LTR MaLR -298 191 87 3 717 493 349 171 10 chr2 17323659 17323969 -164424118 + MLT1A LTR MaLR 3 362 -12 4 717 2263 170 114 44 chr2 17330187 17330227 -164417860 + RMER4B LTR ERVK 1 39 -546 4 717 2263 170 114 44 chr2 17330391 17330876 -164417211 + RMER4B LTR ERVK 40 565 -20 4 717 852 301 67 48 chr2 17334383 17334697 -164413390 + MTE2a LTR MaLR 60 379 0 4 717 1064 234 76 44 chr2 17347870 17348237 -164399850 - MTE2a LTR MaLR 0 379 1 4 717 1080 254 94 17 chr2 17352663 17353015 -164395072 - MTD LTR MaLR -20 399 21 4 717 345 371 18 17 chr2 17360338 17360507 -164387580 + LTR33C LTR ERVL 11 226 -277 4 717 426 352 42 58 chr2 17364152 17364463 -164383624 + ORR1E LTR MaLR 18 323 -47 4 717 2265 180 22 7 chr2 17369635 17370050 -164378037 - MTC LTR MaLR 0 421 1 4 717 382 223 27 145 chr2 17385565 17385749 -164362338 + LTR48 LTR ERV1 386 624 -163 4 717 391 249 207 37 chr2 17386682 17386953 -164361134 + LTR37A LTR ERV1 83 399 -27 4 717 446 259 47 98 chr2 17401537 17401730 -164346357 - MTD-int LTR MaLR -555 1237 1055 5 717 284 297 43 51 chr2 17401726 17401843 -164346244 - MTD-int LTR MaLR -1142 116 1 5 717 790 245 41 10 chr2 17401855 17402049 -164346038 - MTD LTR MaLR -13 406 207 5 717 252 347 74 25 chr2 17416485 17416606 -164331481 + LTR33A LTR ERVL 159 285 -235 5 717 316 297 196 49 chr2 17429151 17429335 -164318752 + MLT1J2 LTR MaLR 192 402 -46 5 717 565 317 56 59 chr2 17429441 17429780 -164318307 - ORR1E LTR MaLR -21 338 1 5 718 530 292 62 49 chr2 17440250 17440538 -164307549 + MLT1B LTR MaLR 70 361 -29 5 718 1898 165 59 89 chr2 17440627 17440719 -164307368 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 303 5 718 1898 165 59 89 chr2 17441113 17441426 -164306661 - ORR1B1 LTR MaLR -92 302 1 5 718 349 246 114 15 chr2 17441577 17441709 -164306378 + MTEa LTR MaLR 235 379 0 5 718 3151 77 10 5 chr2 17454450 17454844 -164293243 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 718 467 318 103 65 chr2 17462792 17463132 -164284955 + ORR1E LTR MaLR 1 353 -6 5 718 1179 225 132 47 chr2 17472902 17472959 -164275128 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 299 6 718 1179 225 132 47 chr2 17473009 17473292 -164274795 - ORR1D2 LTR MaLR -72 298 3 6 718 348 290 57 82 chr2 17474333 17474597 -164273490 + RLTR20D LTR ERVK 1 283 -285 6 718 361 380 28 16 chr2 17476307 17476489 -164271598 + MLT1N2 LTR MaLR 1 184 -378 6 718 512 181 116 61 chr2 17478250 17478397 -164269690 - MTD LTR MaLR -30 389 235 6 718 335 302 118 121 chr2 17479341 17479654 -164268433 - MLT1H LTR MaLR -225 324 13 6 718 1568 142 129 22 chr2 17484816 17485134 -164262953 - ORR1B1 LTR MaLR -2 392 41 6 718 420 320 47 31 chr2 17485407 17485606 -164262481 + MTD LTR MaLR 3 175 -204 6 718 2499 111 3 0 chr2 17488094 17488419 -164259668 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 6 718 263 148 11 0 chr2 17494472 17494531 -164253556 + ORR1D1 LTR MaLR 324 384 0 6 718 583 308 82 63 chr2 17516955 17517274 -164230813 - MTEa LTR MaLR -54 325 1 2 718 412 342 94 45 chr2 17517274 17517512 -164230575 + MER68 LTR ERVL 314 563 0 2 718 2060 125 10 11 chr2 17526478 17526837 -164221250 + RMER16 LTR ERVK 1 479 -54 3 718 441 104 15 0 chr2 17527486 17527553 -164220534 + RMER16 LTR ERVK 466 533 0 3 718 275 284 79 117 chr2 17528486 17528802 -164219285 + ORR1E LTR MaLR 64 367 -12 4 718 430 148 44 35 chr2 17528906 17529017 -164219070 - ORR1C2 LTR MaLR -263 111 1 4 718 229 250 0 19 chr2 17531812 17531865 -164216222 - ORR1D1 LTR MaLR -322 52 1 5 718 3227 19 5 8 chr2 17534168 17534536 -164213551 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 5 718 8561 66 56 65 chr2 17534538 17535911 -164212176 + IAPEz-int LTR ERVK 3 1313 -5168 5 718 29637 18 1 2 chr2 17535910 17539186 -164208901 + IAPEz-int LTR ERVK 3210 6481 0 5 718 3227 19 5 8 chr2 17539186 17539554 -164208533 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 5 718 1931 147 219 18 chr2 17543343 17543424 -164204663 - RMER4A LTR ERVK 0 466 347 6 718 1931 147 219 18 chr2 17543557 17543863 -164204224 - RMER4A LTR ERVK -120 346 2 6 718 3655 33 2 0 chr2 17544061 17544456 -164203631 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 718 4432 178 75 11 chr2 17546231 17547112 -164200975 + RMER19B LTR ERVK 2 890 -12 6 718 512 283 299 68 chr2 17547850 17548201 -164199886 + MLT1B LTR MaLR 36 467 -38 7 718 2971 47 14 9 chr2 17549111 17549455 -164198632 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 7 718 2118 186 55 2 chr2 17551824 17552222 -164195865 + MTC LTR MaLR 3 421 0 7 718 327 300 37 37 chr2 17552672 17552807 -164195280 + ORR1E LTR MaLR 52 186 -173 7 718 3635 23 5 0 chr2 17554357 17554751 -164193336 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 7 718 9775 32 4 1 chr2 17554751 17555846 -164192241 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 7 718 3635 23 5 0 chr2 17555846 17556240 -164191847 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 7 718 294 271 100 17 chr2 17562105 17562225 -164185862 - MLT1C LTR MaLR -83 384 255 8 719 791 152 95 18 chr2 17567836 17568004 -164180083 + RLTR11A LTR ERVK 10 190 -338 9 719 226 159 23 0 chr2 17567996 17568040 -164180047 + RLTR11A LTR ERVK 484 528 0 9 719 2726 130 34 5 chr2 17569189 17569598 -164178489 - MTC LTR MaLR 0 421 1 9 719 2879 34 7 146 chr2 17573282 17573733 -164174354 - RLTR10 LTR ERVK -2 388 1 1 719 8814 23 2 1 chr2 17573736 17574727 -164173360 - RLTR10-int LTR ERVK -6 1981 990 1 719 7602 38 9 1 chr2 17574821 17575727 -164172360 - RLTR10-int LTR ERVK -1034 953 41 1 719 2629 47 134 0 chr2 17575739 17576081 -164172006 - RLTR10 LTR ERVK -2 388 1 1 719 371 288 40 69 chr2 17584600 17584775 -164163312 + ORR1E LTR MaLR 8 177 -182 1 719 3849 161 53 14 chr2 17592536 17593296 -164154791 + RMER13B LTR ERVK 63 851 -57 1 719 752 239 151 8 chr2 17593356 17593601 -164154486 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 91 1 719 498 147 37 189 chr2 17595466 17595710 -164152377 - RMER17C LTR ERVK -135 275 69 1 719 2573 143 34 2 chr2 17600571 17600979 -164147108 + MTC LTR MaLR 1 421 0 1 719 463 294 94 78 chr2 17607875 17608248 -164139839 - RMER10A LTR ERVL -52 390 12 1 719 1405 228 55 19 chr2 17621288 17621654 -164126433 + MTEa LTR MaLR 1 379 0 1 719 786 194 19 0 chr2 17631218 17631373 -164116714 - ORR1B1 LTR MaLR -2 392 235 1 719 434 133 0 12 chr2 17631388 17631472 -164116615 - ORR1B1 LTR MaLR -284 83 1 1 719 1672 146 22 47 chr2 17632639 17633094 -164114993 - RMER17C LTR ERVK -519 439 16 1 719 1028 270 56 58 chr2 17633219 17633597 -164114490 - MTE2a LTR MaLR 0 379 3 1 719 307 265 72 0 chr2 17633860 17633943 -164114144 + MLT1B LTR MaLR 23 111 -279 1 719 366 274 42 12 chr2 17634113 17634279 -164113808 + MLT1B LTR MaLR 96 266 -124 1 719 256 282 80 18 chr2 17635553 17635665 -164112422 + ORR1E LTR MaLR 2 120 -239 2 719 1303 246 32 38 chr2 17637999 17638371 -164109716 + MTE2b LTR MaLR 1 370 -9 2 719 311 333 60 60 chr2 17639938 17640120 -164107967 + MER21B LTR ERV1 509 690 -173 2 719 337 277 28 40 chr2 17644971 17645118 -164102969 + MTEa LTR MaLR 208 377 -2 2 719 237 274 97 10 chr2 17655755 17655858 -164092229 + ORR1E LTR MaLR 25 136 -223 2 719 886 255 108 57 chr2 17656095 17656411 -164091676 + MLT1D LTR MaLR 136 467 -38 2 719 1428 201 212 50 chr2 17657652 17658033 -164090054 + RLTR20B2 LTR ERVK 1 464 -96 2 719 1428 201 212 50 chr2 17658122 17658222 -164089865 + RLTR20B2 LTR ERVK 465 560 0 2 719 1812 198 57 0 chr2 17659227 17659581 -164088506 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 2 719 682 226 87 57 chr2 17659651 17659751 -164088336 + RLTR15 LTR ERVK 1 113 -246 2 719 682 226 87 57 chr2 17659778 17660010 -164088077 + RLTR15 LTR ERVK 114 343 -16 2 719 409 350 66 5 chr2 17664999 17665197 -164082890 - MLT1A0 LTR MaLR -4 361 152 2 719 2830 16 0 181 chr2 17668964 17669412 -164078675 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 2 719 29558 17 1 1 chr2 17669412 17672685 -164075402 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 3210 2 719 7424 62 134 89 chr2 17672684 17673933 -164074154 - IAPEz-int LTR ERVK -5168 1313 8 2 719 2801 22 0 181 chr2 17673933 17674381 -164073706 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 2 719 1759 78 77 61 chr2 17676456 17676537 -164071550 + ORR1A3 LTR MaLR 1 76 -250 2 719 2808 134 175 59 chr2 17676537 17677210 -164070877 + RMER17A LTR ERVK 1 751 0 2 719 1759 78 77 61 chr2 17677210 17677441 -164070646 + ORR1A3 LTR MaLR 77 318 -8 2 719 596 236 16 21 chr2 17689766 17689952 -164058135 + MTC-int LTR MaLR 1068 1252 -6 2 719 550 181 172 8 chr2 17690179 17690313 -164057774 + MTD LTR MaLR 210 365 -54 2 719 377 312 33 56 chr2 17692517 17692697 -164055390 + ORR1D1 LTR MaLR 6 181 -193 2 719 274 271 9 36 chr2 17692880 17692991 -164055096 + ORR1D1 LTR MaLR 272 379 0 2 719 1495 257 36 30 chr2 17693010 17693512 -164054575 + RLTR16 LTR ERVK 1 505 0 2 719 245 264 21 32 chr2 17694101 17694195 -164053892 - MTEa LTR MaLR 0 379 287 2 720 261 323 97 44 chr2 17695063 17695290 -164052797 + MLT-int LTR MaLR 1360 1598 -137 3 720 3370 33 5 2 chr2 17698256 17698651 -164049436 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 720 237 301 42 21 chr2 17699842 17699937 -164048150 + MLT1C LTR MaLR 327 423 -44 3 720 1228 212 52 10 chr2 17700903 17701194 -164046893 + RLTR11A2 LTR ERVK 225 527 0 3 720 1350 186 67 32 chr2 17702316 17702628 -164045459 - RLTR15 LTR ERVK 0 359 37 3 720 348 361 49 0 chr2 17704984 17705106 -164042981 + LTR33 LTR ERVL 76 203 -312 3 720 386 302 50 8 chr2 17713894 17714014 -164034073 + RMER17C LTR ERVK 254 378 -32 3 720 2517 169 83 32 chr2 17722124 17722631 -164025456 - RMER16 LTR ERVK 0 533 1 3 720 3737 148 26 15 chr2 17724978 17725594 -164022493 + MurERV4-int LTR ERVK 600 1222 -4038 3 720 1170 248 132 9 chr2 17725600 17725942 -164022145 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 3 720 3988 230 77 88 chr2 17725942 17726771 -164021316 - ORR1C2-int LTR MaLR 0 1370 585 3 720 4817 153 86 7 chr2 17726771 17727607 -164020480 - RMER19B LTR ERVK 0 902 1 3 720 3988 230 77 88 chr2 17727607 17728162 -164019925 - ORR1C2-int LTR MaLR -786 584 1 3 720 815 182 95 17 chr2 17728163 17728342 -164019745 - ORR1C2 LTR MaLR -8 376 184 3 720 2222 145 52 0 chr2 17728637 17729045 -164019042 - RMER10A LTR ERVL -7 435 7 3 720 954 137 0 0 chr2 17729516 17729669 -164018418 - ORR1C2 LTR MaLR -211 163 11 3 720 1182 297 119 13 chr2 17729927 17730374 -164017713 + MTE-int LTR MaLR 969 1462 -118 3 720 312 245 138 0 chr2 17732159 17732253 -164015834 + MTEa LTR MaLR 272 378 -1 3 720 1223 264 80 58 chr2 17744133 17744634 -164003453 + RMER5 LTR ERV1 1 517 -17 4 720 1223 264 80 58 chr2 17744656 17744669 -164003418 + RMER5 LTR ERV1 518 526 -8 4 720 405 313 137 47 chr2 17744864 17745025 -164003062 + ORR1E LTR MaLR 67 252 -107 4 720 405 313 137 47 chr2 17745050 17745143 -164002944 + ORR1E LTR MaLR 253 344 -15 4 720 318 223 18 64 chr2 17746514 17746528 -164001559 + MT2B LTR ERVL 153 161 -440 4 720 252 298 49 8 chr2 17747279 17747401 -164000686 + MamGypLTR2b LTR Gypsy 793 919 -3 4 720 1472 158 250 12 chr2 17751258 17751598 -163996489 - MTC LTR MaLR 0 421 1 4 720 2171 156 61 11 chr2 17751749 17752124 -163995963 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 4 720 847 256 157 26 chr2 17752292 17752605 -163995482 + MTE2b LTR MaLR 11 364 -15 4 720 693 263 145 28 chr2 17755146 17755167 -163992920 + MLT1A0 LTR MaLR 3 22 -343 4 720 693 263 145 28 chr2 17755224 17755527 -163992560 + MLT1A0 LTR MaLR 23 365 0 4 720 403 250 194 17 chr2 17755744 17755919 -163992168 - LTR81A LTR ERV1? -1084 266 61 4 720 2258 82 27 59 chr2 17756918 17757256 -163990831 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 4 720 325 307 42 35 chr2 17758492 17758758 -163989329 + MTEa LTR MaLR 56 365 -14 4 720 880 241 161 7 chr2 17768231 17768536 -163979551 - ORR1D2 LTR MaLR -18 352 1 4 720 1681 202 36 96 chr2 17769144 17769370 -163978717 - MTC LTR MaLR 0 421 211 4 720 1681 202 36 96 chr2 17769733 17769839 -163978248 - MTC LTR MaLR -211 210 105 4 720 1681 202 36 96 chr2 17769986 17770005 -163978082 - MTC LTR MaLR -317 104 87 4 720 1681 202 36 96 chr2 17770184 17770278 -163977809 - MTC LTR MaLR -335 86 1 4 720 3356 41 5 0 chr2 17770295 17770689 -163977398 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 720 266 281 34 0 chr2 17779513 17779602 -163968485 + MER57C2 LTR ERV1 283 374 -60 5 720 238 273 103 13 chr2 17787150 17787228 -163960859 + MTEb LTR MaLR 47 131 -239 5 720 244 338 0 0 chr2 17787318 17787398 -163960689 + MTEb LTR MaLR 278 357 -22 5 720 1794 138 29 116 chr2 17788051 17788445 -163959642 + RMER17C LTR ERVK 1 358 -52 5 720 1794 138 29 116 chr2 17788593 17788647 -163959440 + RMER17C LTR ERVK 359 410 0 5 720 247 246 101 0 chr2 17788733 17788802 -163959285 - MTE2b LTR MaLR -10 369 294 5 720 1518 184 35 82 chr2 17791275 17791641 -163956446 + RLTR24 LTR ERV1 1 349 -180 5 720 1152 118 21 0 chr2 17791886 17792073 -163956014 + RLTR24 LTR ERV1 339 529 0 5 720 2348 154 24 0 chr2 17796142 17796525 -163951562 + ORR1B1 LTR MaLR 1 392 -2 5 720 411 212 41 74 chr2 17797278 17797400 -163950687 + RMER17C-int LTR ERVK 115 232 -3006 5 720 379 160 13 26 chr2 17797391 17797468 -163950619 + RMER17C-int LTR ERVK 520 595 -2643 5 720 3482 182 103 32 chr2 17797601 17798470 -163949617 + RMER19B LTR ERVK 1 890 -12 5 720 2772 128 21 32 chr2 17798670 17799139 -163948948 + RMER17C-int LTR ERVK 1100 1563 -1675 5 720 882 218 186 10 chr2 17799854 17800150 -163947937 + MER31B LTR ERV1 1 348 -118 5 720 599 242 102 33 chr2 17800597 17800755 -163947332 + ORR1C2 LTR MaLR 114 338 -46 5 720 599 236 101 28 chr2 17800958 17801001 -163947086 + ORR1C2 LTR MaLR 339 381 -3 5 720 913 239 178 13 chr2 17807551 17807865 -163940222 + MTD LTR MaLR 1 366 -53 5 720 4015 51 18 16 chr2 17814005 17814072 -163934015 + LTRIS2 LTR ERV1 5 71 -493 6 720 2704 28 3 63 chr2 17814072 17814420 -163933667 - IAPLTR2b LTR ERVK 0 327 1 6 720 4015 51 18 16 chr2 17814420 17814911 -163933176 + LTRIS2 LTR ERV1 72 564 0 6 720 389 335 77 27 chr2 17817734 17817955 -163930132 - MLT1J2 LTR MaLR -23 425 194 6 720 3338 38 5 2 chr2 17819082 17819477 -163928610 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 720 513 281 122 6 chr2 17819950 17820122 -163927965 - MLT1D LTR MaLR -8 497 306 6 720 1629 236 26 42 chr2 17820402 17821096 -163926991 + RMER17B LTR ERVK 1 632 -274 6 720 2043 264 39 97 chr2 17821118 17822156 -163925931 - RMER17B LTR ERVK -7 951 1 6 720 893 252 155 70 chr2 17823132 17823474 -163924613 + MTEa LTR MaLR 8 378 -1 6 721 1819 100 74 0 chr2 17826497 17826796 -163921291 + ORR1A4 LTR MaLR 1 321 -8 6 721 233 274 37 47 chr2 17832414 17832521 -163915566 + MLT1C LTR MaLR 362 467 0 6 721 504 332 30 60 chr2 17834150 17834416 -163913671 + LTR88b LTR Gypsy? 35 292 -545 6 721 3499 23 5 0 chr2 17834737 17835131 -163912956 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 721 829 271 57 33 chr2 17839323 17839613 -163908474 + MLT1F1 LTR MaLR 306 624 0 6 721 2439 189 72 14 chr2 17840467 17841021 -163907066 - RMER19B LTR ERVK -8 894 1 6 721 413 285 212 16 chr2 17841244 17841433 -163906654 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 183 6 721 2112 163 57 12 chr2 17841673 17842095 -163905992 - BGLII_B LTR ERVK 0 441 1 6 721 7317 182 64 61 chr2 17842095 17843892 -163904195 - MYSERV16_I-int LTR ERVK 0 2326 524 6 721 1835 197 43 52 chr2 17843982 17844499 -163903588 - RMER13B LTR ERVK -38 822 292 6 721 1854 142 31 51 chr2 17845492 17845842 -163902245 - RMER13B LTR ERVK -565 343 1 6 721 427 305 30 0 chr2 17846010 17846141 -163901946 - ORR1E LTR MaLR -223 136 2 6 721 1032 260 89 3 chr2 17846288 17846601 -163901486 - ORR1D2 LTR MaLR -30 340 1 6 721 857 270 78 43 chr2 17846777 17847261 -163900826 - RLTR16 LTR ERVK 0 505 5 6 721 643 279 12 5 chr2 17847762 17847930 -163900157 + MLT1A1 LTR MaLR 196 408 0 6 721 1794 107 55 3 chr2 17853150 17853440 -163894647 - ORR1A3 LTR MaLR -19 307 3 7 721 1333 175 254 22 chr2 17857470 17857832 -163890255 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 1 7 721 235 234 0 0 chr2 17858028 17858075 -163890012 - MER34A LTR ERV1 -524 47 1 7 721 868 281 47 44 chr2 17859782 17860124 -163887963 + ORR1D2 LTR MaLR 1 343 -27 7 721 705 157 175 88 chr2 17863418 17863795 -163884292 + RMER17C LTR ERVK 1 410 0 7 721 645 294 79 24 chr2 17863817 17864071 -163884016 - MLT1A0 LTR MaLR -82 283 16 7 721 402 286 0 0 chr2 17864898 17864996 -163883091 + MLT1A LTR MaLR 1 98 -276 7 721 1239 249 92 62 chr2 17871698 17871956 -163876131 + MTD LTR MaLR 3 278 -141 7 721 1239 249 92 62 chr2 17872203 17872215 -163875872 + MTD LTR MaLR 279 298 -121 7 721 1239 249 92 62 chr2 17872302 17872431 -163875656 + MTD LTR MaLR 299 414 -5 7 721 2024 146 8 11 chr2 17873133 17873492 -163874595 - RLTR15 LTR ERVK 0 359 2 7 721 333 338 67 55 chr2 17873736 17873974 -163874113 - ORR1E LTR MaLR -110 249 9 7 721 262 314 49 41 chr2 17873980 17874103 -163873984 + LTR48 LTR ERV1 119 242 -545 7 721 730 216 52 10 chr2 17874209 17874401 -163873686 + LTR48 LTR ERV1 545 744 -43 7 721 1283 168 65 53 chr2 17875158 17875557 -163872530 + RMER16 LTR ERVK 1 533 0 7 721 382 273 50 39 chr2 17876297 17876401 -163871686 - MLT1A0 LTR MaLR -176 189 80 7 721 3370 61 189 17 chr2 17876401 17876882 -163871205 + LTRIS2 LTR ERV1 1 564 0 7 721 382 273 50 39 chr2 17876882 17876956 -163871131 - MLT1A0 LTR MaLR -286 79 10 7 721 1868 175 182 37 chr2 17877303 17877987 -163870100 - RMER19B LTR ERVK -139 763 1 7 721 2993 71 145 0 chr2 17878265 17878686 -163869401 + RLTR45 LTR ERVK 1 482 0 7 721 2024 141 10 36 chr2 17883109 17883563 -163864524 - RMER19A LTR ERVK -2 900 427 7 721 413 123 0 24 chr2 17883563 17883646 -163864441 - RMER19A LTR ERVK -217 520 440 7 721 707 189 0 44 chr2 17883643 17883803 -163864284 - RMER19A LTR ERVK -158 579 427 7 721 3176 167 35 9 chr2 17883787 17884350 -163863737 - RMER19A LTR ERVK -158 579 2 7 721 3803 162 96 64 chr2 17888272 17889134 -163858953 - RMER19B LTR ERVK -12 890 1 7 721 421 205 0 13 chr2 17889339 17889418 -163858669 + RMER10A LTR ERVL 3 80 -362 7 721 1646 166 29 90 chr2 17889400 17889484 -163858603 + RMER10A LTR ERVL 27 96 -346 7 721 2824 39 30 0 chr2 17889484 17889820 -163858267 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 7 721 1646 166 29 90 chr2 17889820 17890178 -163857909 + RMER10A LTR ERVL 97 442 0 7 721 996 206 29 36 chr2 17890357 17890909 -163857178 + RMER17C LTR ERVK 20 439 -519 7 721 1428 202 215 42 chr2 17891086 17891462 -163856625 - RMER17C-int LTR ERVK -2642 596 156 8 721 1428 193 20 52 chr2 17891655 17891813 -163856274 - RMER17C-int LTR ERVK -3083 155 2 8 721 809 299 113 62 chr2 17898592 17899009 -163849078 - MER77 LTR ERVL -78 529 92 8 721 2759 132 62 29 chr2 17899031 17899578 -163848509 - RLTR13C1 LTR ERVK -42 941 377 8 721 2211 132 39 0 chr2 17899816 17899849 -163848238 - RLTR13D3 LTR ERVK -665 449 415 8 721 2211 132 39 0 chr2 17899994 17900330 -163847757 - RLTR13D3 LTR ERVK -700 414 67 8 721 402 136 0 0 chr2 17900517 17900583 -163847504 - RLTR13D3 LTR ERVK -1048 66 1 8 721 750 139 52 26 chr2 17900876 17901031 -163847056 - RMER4A LTR ERVK 0 466 308 8 721 1713 205 120 26 chr2 17901033 17901272 -163846815 - RMER4A LTR ERVK 0 466 200 8 721 1713 205 120 26 chr2 17901304 17901490 -163846597 - RMER4A LTR ERVK -267 199 2 8 721 643 287 137 23 chr2 17904273 17904580 -163843507 - RLTR9A LTR ERVK 0 368 27 8 721 4174 45 12 6 chr2 17906746 17907255 -163840832 - RLTR1B LTR ERV1 0 512 1 8 721 260 206 97 9 chr2 17909678 17909786 -163838301 - MTD LTR MaLR -13 406 248 8 721 1692 173 135 15 chr2 17911530 17911923 -163836164 - RMER10A LTR ERVL -2 440 1 8 721 815 214 139 141 chr2 17912091 17912162 -163835925 + RLTR19-int LTR ERVK 3396 3472 -2665 8 721 815 214 139 141 chr2 17912310 17912496 -163835591 + RLTR19-int LTR ERVK 3473 3635 -2502 8 721 2220 139 56 3 chr2 17912496 17912870 -163835217 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 8 721 815 237 115 106 chr2 17912870 17913602 -163834485 + RLTR19-int LTR ERVK 3636 4312 -1825 8 721 436 282 51 124 chr2 17913653 17914025 -163834062 + RMER10A LTR ERVL 84 428 -14 8 721 2754 122 54 20 chr2 17914820 17915320 -163832767 - RLTR11A2 LTR ERVK 0 527 11 8 721 862 118 32 19 chr2 17920155 17920311 -163827776 - MT2C_Mm LTR ERVL -76 399 242 9 721 234 210 0 180 chr2 17922188 17922316 -163825771 - ORR1E LTR MaLR -203 156 52 9 721 242 213 0 0 chr2 17922700 17922747 -163825340 - MLT1C LTR MaLR -383 84 38 9 721 256 325 65 59 chr2 17923108 17923278 -163824809 - ORR1E LTR MaLR -124 235 65 9 721 2004 165 49 41 chr2 17923659 17923715 -163824372 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 353 9 721 2004 165 49 41 chr2 17923885 17924219 -163823868 - ORR1B1 LTR MaLR -42 352 1 9 721 2733 58 0 0 chr2 17925029 17925356 -163822731 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 9 721 1207 193 130 0 chr2 17929613 17929882 -163818205 + MTC LTR MaLR 3 306 -115 9 721 1944 24 8 0 chr2 17929891 17930138 -163817949 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 148 9 721 480 269 25 43 chr2 17930332 17930423 -163817664 - RLTR20D LTR ERVK -4 574 487 9 721 480 269 25 43 chr2 17930457 17930528 -163817559 - RLTR20D LTR ERVK -92 486 416 9 721 683 269 30 45 chr2 17930514 17930783 -163817304 - RLTR20D LTR ERVK -298 270 6 9 721 265 206 120 27 chr2 17930810 17930885 -163817202 - MT2B2 LTR ERVL -344 240 159 9 721 583 225 50 189 chr2 17931274 17931691 -163816396 + RLTR15 LTR ERVK 1 359 0 9 721 620 81 11 23 chr2 17931749 17931837 -163816250 - MMERVK10C-int LTR ERVK -7492 89 3 9 721 2621 127 0 12 chr2 17931846 17932268 -163815819 - RLTR10C LTR ERVK -19 417 1 9 721 243 240 133 0 chr2 17934326 17934401 -163813686 + MLT2E LTR ERVL 4 88 -540 9 721 229 332 157 26 chr2 17934645 17934874 -163813213 + LTR33C LTR ERVL 221 479 -150 9 721 813 227 267 0 chr2 17935427 17935724 -163812363 - MTD LTR MaLR -14 405 12 9 721 236 283 94 0 chr2 17935922 17936028 -163812059 + MLT1H-int LTR MaLR 273 388 -1021 9 721 380 330 33 57 chr2 17937230 17937466 -163810621 + MLT1H-int LTR MaLR 451 681 -728 9 721 3733 44 0 14 chr2 17939942 17940445 -163807642 + LTRIS2 LTR ERV1 69 564 0 9 721 2051 169 122 26 chr2 17942094 17942519 -163805568 + RMER4A LTR ERVK 1 466 0 9 722 433 314 117 56 chr2 18004084 18004280 -163743807 - MLT1K LTR MaLR -169 426 219 1 722 2237 154 65 50 chr2 18006209 18006668 -163741419 - RMER4A LTR ERVK 0 466 1 2 722 339 214 0 28 chr2 18008648 18008720 -163739367 - RMER16 LTR ERVK -459 74 5 3 722 2100 212 74 12 chr2 18009061 18009563 -163738524 - RMER16 LTR ERVK 0 533 1 3 722 692 200 89 7 chr2 18010581 18010727 -163737360 - MTC LTR MaLR -156 265 108 4 722 1612 150 201 28 chr2 18010934 18011331 -163736756 + RMER4A LTR ERVK 1 466 0 4 722 1688 133 119 0 chr2 18012889 18013174 -163734913 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 5 722 364 341 62 28 chr2 18015618 18015796 -163732291 - MER74A LTR ERVL -2 556 373 6 722 234 320 23 83 chr2 18025629 18025647 -163722440 - MT2B2 LTR ERVL -306 275 154 1 722 928 118 0 7 chr2 18037663 18037799 -163710288 + RMER6C LTR ERVK 554 688 -2 1 722 1165 127 126 46 chr2 18039003 18039136 -163708951 - MTC LTR MaLR -162 259 106 1 722 1165 127 126 46 chr2 18039325 18039430 -163708657 - MTC LTR MaLR -316 105 2 1 722 254 325 68 18 chr2 18039679 18039842 -163708245 - MLT-int LTR MaLR -252 1483 1313 1 722 796 273 82 22 chr2 18039871 18040257 -163707830 - RLTR11A2 LTR ERVK -28 413 7 1 722 3683 16 121 0 chr2 18049819 18050259 -163697828 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 1 722 237 333 54 20 chr2 18051734 18051881 -163696206 - RLTR15 LTR ERVK -73 286 135 1 722 290 268 77 99 chr2 18052600 18052873 -163695214 + RLTR15 LTR ERVK 35 301 -58 1 722 808 102 55 0 chr2 18052919 18053047 -163695040 - ORR1A4 LTR MaLR -1 328 194 1 722 1247 170 58 21 chr2 18054157 18054397 -163693690 + RLTR15 LTR ERVK 106 354 -5 1 722 1953 131 3 85 chr2 18056927 18057293 -163690794 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK -1 336 1 2 722 4689 142 70 24 chr2 18058084 18058911 -163689176 - RMER19B LTR ERVK -23 879 15 2 722 293 211 0 0 chr2 18059961 18060013 -163688074 + MTE2a LTR MaLR 1 52 -327 2 722 432 301 47 83 chr2 18060055 18060247 -163687840 + MTE2a LTR MaLR 73 257 -122 2 722 1112 171 42 21 chr2 18061263 18061502 -163686585 - RMER19A LTR ERVK 0 737 494 2 722 4230 166 58 75 chr2 18061523 18062424 -163685663 + RMER19B LTR ERVK 1 885 -17 2 722 876 287 39 75 chr2 18062876 18063181 -163684906 - RMER19B LTR ERVK -602 300 7 2 722 864 262 8 42 chr2 18067239 18067478 -163680609 + RMER10B LTR ERVL 168 398 0 2 722 377 341 145 54 chr2 18069384 18069590 -163678497 - MLT1E2 LTR MaLR -5 622 398 2 722 377 341 145 54 chr2 18069801 18069870 -163678217 - MLT1E2 LTR MaLR -230 397 322 2 722 1285 123 66 9 chr2 18071114 18071327 -163676760 - MTC LTR MaLR 0 421 197 2 722 438 188 35 0 chr2 18071326 18071411 -163676676 - MTC LTR MaLR -319 88 1 2 722 1175 286 88 74 chr2 18077749 18078085 -163670002 - RMER19A LTR ERVK -28 709 391 2 722 1175 286 88 74 chr2 18078238 18078269 -163669818 - RMER19A LTR ERVK -347 390 358 2 722 1175 268 65 172 chr2 18078400 18078640 -163669447 - RMER19A LTR ERVK -380 357 4 2 723 649 290 108 41 chr2 18091219 18091560 -163656527 - MTD LTR MaLR -45 374 27 3 723 1521 232 58 13 chr2 18095254 18095650 -163652437 - MTD LTR MaLR -16 403 5 3 723 734 201 22 61 chr2 18096874 18097054 -163651033 - ORR1C2 LTR MaLR -2 382 210 3 723 333 177 16 0 chr2 18097009 18097071 -163651016 - MT2A LTR ERVL -470 63 1 3 723 1321 139 93 36 chr2 18098000 18098247 -163649840 - MTC LTR MaLR 0 421 161 3 723 3469 169 131 95 chr2 18098257 18098475 -163649612 + RMER19B LTR ERVK 1 168 -734 3 723 3469 169 131 95 chr2 18098501 18099125 -163648962 + RMER19B LTR ERVK 169 873 -29 3 723 374 179 38 25 chr2 18099125 18099205 -163648882 - MTC LTR MaLR -336 85 5 3 723 2773 147 42 30 chr2 18099678 18100005 -163648082 - RLTR19-int LTR ERVK -4128 2009 1689 3 723 2773 147 42 30 chr2 18100052 18100298 -163647789 - RLTR19-int LTR ERVK -4449 1688 1431 3 723 1476 135 76 76 chr2 18101549 18101878 -163646209 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 3 723 2860 34 65 0 chr2 18111681 18112006 -163636081 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 3 723 14485 67 5 13 chr2 18112006 18113812 -163634275 + ORR1A1-int LTR MaLR 1 1792 0 3 723 2442 38 70 0 chr2 18113812 18114128 -163633959 + ORR1A1 LTR MaLR 1 338 -8 3 723 589 210 154 0 chr2 18129627 18129770 -163618317 - MTD LTR MaLR -254 165 1 3 723 322 281 22 22 chr2 18136316 18136407 -163611680 + ORR1D2 LTR MaLR 5 95 -275 3 723 606 155 58 69 chr2 18136708 18136881 -163611206 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 200 3 723 233 208 37 19 chr2 18136905 18136959 -163611128 - ORR1D2 LTR MaLR -315 55 1 3 723 277 299 107 20 chr2 18137818 18137968 -163610119 + RMER15 LTR ERVL 380 542 -33 3 723 1626 101 195 3 chr2 18145867 18146195 -163601892 + RLTR47_MM LTR ERV1 1 391 -141 4 723 418 295 43 14 chr2 18157504 18157645 -163590442 + HERVL40-int LTR ERVL 3847 3991 -1539 4 723 544 248 87 0 chr2 18157878 18158039 -163590048 + HERVL40-int LTR ERVL 4137 4311 -1219 4 723 281 272 7 7 chr2 18160362 18160387 -163587700 + ORR1B1-int LTR MaLR 625 649 -860 4 723 290 210 83 83 chr2 18160425 18160534 -163587553 + RLTR25B LTR ERVK 441 549 -479 4 723 4624 156 39 28 chr2 18161373 18162203 -163585884 + MurERV4-int LTR ERVK 3879 4717 -543 4 723 9320 135 29 23 chr2 18162986 18165016 -163583071 - MERVL-int LTR ERVL -3298 2416 261 4 723 387 171 0 14 chr2 18165059 18165130 -163582957 + MERVL_2A-int LTR ERVL 438 507 -5254 4 723 3477 18 2 0 chr2 18173448 18173843 -163574244 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 723 319 180 0 0 chr2 18185987 18186037 -163562050 + MERVL_2A-int LTR ERVL 4206 4255 -1506 4 723 6970 181 80 16 chr2 18186524 18188090 -163559997 + MERVL_2A-int LTR ERVL 3687 5474 -287 4 723 294 206 0 40 chr2 18188161 18188237 -163559850 + ORR1A3-int LTR MaLR 567 639 -1324 4 723 1709 172 43 15 chr2 18188293 18188721 -163559366 + MT2A LTR ERVL 1 489 -44 4 723 2086 93 63 0 chr2 18197966 18198266 -163549821 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 4 723 9569 145 93 5 chr2 18198270 18200074 -163548013 + ORR1A2-int LTR MaLR 1 1962 -1 4 723 2041 77 83 13 chr2 18200085 18200386 -163547701 + ORR1A2 LTR MaLR 6 327 0 4 723 2811 167 67 9 chr2 18202737 18203263 -163544824 - RMER19B LTR ERVK -346 556 1 5 723 502 309 50 68 chr2 18203263 18203473 -163544614 + RMER19C LTR ERVK 238 443 -168 5 724 1593 130 7 70 chr2 18221123 18221421 -163526666 + ORR1A4 LTR MaLR 5 283 -46 5 724 249 204 0 0 chr2 18221596 18221640 -163526447 + ORR1A4 LTR MaLR 274 317 -12 5 724 228 289 35 142 chr2 18240966 18240987 -163507100 - MT2B2 LTR ERVL -303 281 213 5 724 228 289 35 142 chr2 18241092 18241107 -163506980 - MT2B2 LTR ERVL -303 212 156 5 724 3288 77 135 18 chr2 18241886 18242391 -163505696 - LTRIS2 LTR ERV1 0 564 1 5 724 4133 46 14 2 chr2 18242647 18243153 -163504934 + RLTR1B LTR ERV1 1 512 0 5 724 1701 184 30 14 chr2 18243289 18243633 -163504454 - ORR1B1 LTR MaLR -29 341 1 5 724 3494 28 9 126 chr2 18244642 18245180 -163502907 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 5 724 1030 226 131 77 chr2 18246347 18246697 -163501390 + ORR1C2 LTR MaLR 16 384 0 5 724 1152 239 92 3 chr2 18248812 18249118 -163498969 + MERVL_2A-int LTR ERVL 2334 2666 -3095 5 724 304 125 21 0 chr2 18249319 18249367 -163498720 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 326 5 724 3810 204 122 19 chr2 18249366 18250261 -163497826 + ORR1D1-int LTR MaLR 384 1370 0 5 724 1905 180 68 14 chr2 18250261 18250547 -163497540 + ORR1D1 LTR MaLR 1 285 -89 5 724 3832 26 19 11 chr2 18250547 18251018 -163497069 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 5 724 1905 180 68 14 chr2 18251018 18251086 -163497001 + ORR1D1 LTR MaLR 286 374 0 5 724 4280 172 109 9 chr2 18251121 18251930 -163496157 + RMER19B LTR ERVK 1 890 -12 5 724 2568 193 105 27 chr2 18253172 18253756 -163494331 + RMER19B LTR ERVK 50 902 0 5 724 1701 174 113 17 chr2 18262107 18262453 -163485634 + MTD LTR MaLR 41 419 0 6 724 285 276 65 154 chr2 18265756 18265813 -163482274 - MT2B LTR ERVL -440 144 105 6 724 250 216 0 0 chr2 18270718 18270769 -163477318 - MER4B-int LTR ERV1 -5562 1196 1146 6 724 2406 96 28 6 chr2 18272254 18272609 -163475478 + MTB_Mm LTR MaLR 1 363 -44 6 724 262 115 231 0 chr2 18272913 18272958 -163475129 + MTB_Mm LTR MaLR 343 399 -1 6 724 1718 211 53 14 chr2 18276131 18276544 -163471543 + BGLII_B LTR ERVK 1 429 -12 6 724 2161 96 14 58 chr2 18277230 18277574 -163470513 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 6 724 2751 306 54 41 chr2 18278617 18280361 -163467726 + MYSERV6-int LTR ERVK 201 1950 -4600 6 724 4758 219 48 26 chr2 18280364 18280701 -163467386 + MYSERV6-int LTR ERVK 3217 3547 -5412 6 724 4758 245 74 62 chr2 18280849 18283065 -163465022 + MYSERV6-int LTR ERVK 3326 4648 -1902 6 724 2416 168 47 0 chr2 18286147 18286552 -163461535 - MERVL_2A-int LTR ERVL -613 5148 4725 6 724 3625 175 119 70 chr2 18286552 18287412 -163460675 - RMER19B LTR ERVK 0 902 1 6 724 9585 162 29 4 chr2 18287413 18288996 -163459091 - MERVL_2A-int LTR ERVL -1032 4729 3107 6 724 2599 151 9 37 chr2 18288993 18289454 -163458633 - MERVL_2A-int LTR ERVL -5055 706 259 6 724 1792 118 107 45 chr2 18289616 18289926 -163458161 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 6 724 886 169 13 7 chr2 18289929 18290084 -163458003 - MERVL_2A-int LTR ERVL -5605 156 1 6 724 240 122 0 0 chr2 18290084 18290125 -163457962 - MT2A LTR ERVL 0 533 493 6 724 1020 288 64 55 chr2 18290204 18290659 -163457428 - MT2A LTR ERVL -74 459 1 6 724 453 286 113 21 chr2 18305199 18305385 -163442702 - LTR90A LTR LTR -631 345 143 6 724 1051 215 157 21 chr2 18309126 18309407 -163438680 - MTD LTR MaLR -36 383 65 7 724 570 291 14 7 chr2 18309866 18310008 -163438079 + MLT1A0 LTR MaLR 3 145 -220 7 724 1656 211 91 33 chr2 18311223 18311619 -163436468 - MTD LTR MaLR 0 419 1 7 724 291 260 156 0 chr2 18315486 18315563 -163432524 - MamGypLTR3 LTR Gypsy -95 744 656 7 724 1295 194 29 53 chr2 18315966 18316326 -163431761 + MT2B LTR ERVL 1 529 -55 7 724 1057 215 169 83 chr2 18316425 18316487 -163431600 + MT2B LTR ERVL 530 584 0 7 724 775 200 0 36 chr2 18318500 18318666 -163429421 - ORR1D1 LTR MaLR -214 160 1 7 724 1069 279 94 34 chr2 18319331 18319683 -163428404 - MTE2b LTR MaLR -6 373 1 7 724 3063 34 0 0 chr2 18321367 18321721 -163426366 + IAPEY2_LTR LTR ERVK 1 354 -3 7 724 2790 189 98 26 chr2 18333807 18334218 -163413869 - RMER19C LTR ERVK 0 611 165 7 724 2790 189 98 26 chr2 18334397 18334555 -163413532 - RMER19C LTR ERVK -447 164 1 7 724 1180 265 38 47 chr2 18334900 18335241 -163412846 - MTE2b LTR MaLR -40 339 2 7 724 2501 95 3 58 chr2 18336410 18336756 -163411331 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 7 724 4425 147 56 88 chr2 18343629 18344554 -163403533 - RMER19B LTR ERVK -6 896 1 7 724 4239 158 101 71 chr2 18344781 18345657 -163402430 + RMER19B LTR ERVK 1 902 0 7 725 2733 147 40 16 chr2 18352851 18353301 -163394786 - RMER6B LTR ERVK 0 461 1 8 725 528 78 222 0 chr2 18353303 18353393 -163394694 - RMER6B LTR ERVK -351 110 1 8 725 2062 161 19 24 chr2 18353785 18354154 -163393933 - ORR1C1 LTR MaLR -11 367 1 8 725 315 310 99 40 chr2 18355379 18355685 -163392402 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 13 8 725 523 305 79 36 chr2 18360447 18360699 -163387388 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 146 8 725 321 296 57 57 chr2 18360871 18361011 -163387076 - MLT1A1 LTR MaLR -234 174 35 8 725 1727 271 49 39 chr2 18365863 18366374 -163381713 + RMER20A LTR ERVK 1 516 0 8 725 6627 95 32 33 chr2 18370237 18371196 -163376891 - RMER17B LTR ERVK 0 958 1 8 725 339 275 133 85 chr2 18371261 18371472 -163376615 + ORR1E LTR MaLR 104 324 -35 8 725 2820 129 56 18 chr2 18372230 18372679 -163375408 + RMER4A LTR ERVK 1 466 0 8 725 6005 87 9 8 chr2 18374066 18374898 -163373189 + RMER16-int LTR ERVK 2636 3831 -1977 8 725 2794 90 48 18 chr2 18375127 18375524 -163372563 + RLTR9E LTR ERVK 1 409 0 8 725 466 232 197 81 chr2 18375544 18375853 -163372234 + ETnERV2-int LTR ERVK 20 364 -2950 8 725 5308 132 65 30 chr2 18375886 18376868 -163371219 + ETnERV2-int LTR ERVK 1071 2086 -5320 8 725 5395 143 53 16 chr2 18376892 18377883 -163370204 + ETnERV2-int LTR ERVK 1995 3446 -3960 8 725 16791 97 24 3 chr2 18378141 18380414 -163367673 + ETnERV2-int LTR ERVK 3441 5762 -1644 8 725 3257 209 167 45 chr2 18380408 18380609 -163367478 + RMER16-int LTR ERVK 3093 3294 -2112 8 725 3257 209 167 45 chr2 18380633 18380710 -163367377 + RMER16-int LTR ERVK 3295 3390 -2016 8 725 2971 64 143 139 chr2 18380710 18381220 -163366867 + RLTR1B LTR ERV1 1 512 0 8 725 3257 193 58 43 chr2 18381220 18382294 -163365793 + RMER16-int LTR ERVK 2696 4172 -1234 8 725 537 68 14 0 chr2 18382508 18382581 -163365506 + RMER16-int LTR ERVK 7333 7406 0 8 725 2794 94 42 32 chr2 18382581 18382986 -163365101 + RLTR9E LTR ERVK 1 409 0 8 725 1618 99 11 34 chr2 18383630 18383892 -163364195 + RMER16-int LTR ERVK 3428 3683 -1723 8 725 484 34 0 0 chr2 18385304 18385363 -163362724 + ORR1A4 LTR MaLR 271 329 0 8 725 371 337 63 124 chr2 18385556 18385983 -163362104 - MLT1J LTR MaLR -8 504 104 8 725 965 218 240 43 chr2 18386361 18386575 -163361512 + MTD LTR MaLR 6 241 -178 8 725 3400 128 121 0 chr2 18386575 18387097 -163360990 + RMER4B LTR ERVK 1 585 0 8 725 965 218 240 43 chr2 18387097 18387228 -163360859 + MTD LTR MaLR 242 419 0 8 725 2722 170 66 8 chr2 18391309 18391808 -163356279 + RLTR12B LTR ERVK 1 528 0 8 725 904 290 94 12 chr2 18392548 18392812 -163355275 - MTEa LTR MaLR -7 372 86 8 725 1979 194 124 154 chr2 18392812 18393441 -163354646 - RMER19C LTR ERVK -1 610 1 8 725 904 290 94 12 chr2 18393441 18393518 -163354569 - MTEa LTR MaLR -294 85 4 8 725 3438 280 97 22 chr2 18393522 18394806 -163353281 - MTEa-int LTR MaLR -2 1578 199 8 725 3921 172 70 48 chr2 18394821 18395692 -163352395 - RMER19B LTR ERVK -12 890 1 8 725 450 274 128 82 chr2 18395693 18395888 -163352199 - MTEa-int LTR MaLR -1376 204 1 8 725 4888 51 0 2 chr2 18395957 18396545 -163351542 - LTRIS_Mus LTR ERV1 0 587 1 8 725 337 169 0 30 chr2 18396586 18396653 -163351434 + RMER2 LTR ERV1 5 69 -498 8 725 429 234 107 181 chr2 18397457 18397811 -163350276 + RMER2 LTR ERV1 213 540 -27 8 725 735 249 47 19 chr2 18397868 18398081 -163350006 - MTEa LTR MaLR -160 219 1 8 725 1052 200 48 5 chr2 18413215 18413524 -163334563 - RMER19B LTR ERVK -431 306 1 8 725 1251 137 9 14 chr2 18415685 18415907 -163332180 + RLTR13B4 LTR ERVK 1 221 -672 8 725 2635 146 2 18 chr2 18415933 18416372 -163331715 + MMERVK10C-int LTR ERVK 441 872 -6709 8 725 3719 96 11 56 chr2 18416376 18416997 -163331090 + RLTR13B4 LTR ERVK 211 803 0 8 725 1620 148 64 3 chr2 18418917 18419215 -163328872 + RLTR17 LTR ERVK 1 316 -376 8 725 2186 151 254 8 chr2 18419217 18419688 -163328399 - RLTR17 LTR ERVK 0 692 106 8 725 290 157 0 19 chr2 18419684 18419736 -163328351 + RLTR17 LTR ERVK 544 594 -98 8 725 282 213 0 16 chr2 18419733 18419795 -163328292 + RLTR31_Mm LTR ERVK 501 561 0 8 725 4363 156 46 74 chr2 18422130 18423051 -163325036 + RMER19B LTR ERVK 1 895 -7 8 725 639 291 46 22 chr2 18423460 18423707 -163324380 + MTD LTR MaLR 1 252 -167 9 725 1157 244 52 25 chr2 18423703 18424065 -163324022 - MTD LTR MaLR -12 407 3 9 725 2213 23 114 0 chr2 18426652 18426914 -163321173 + RLTR10B LTR ERVK 1 292 0 9 725 345 187 53 0 chr2 18432435 18432510 -163315577 - MT2A LTR ERVL -454 79 1 9 725 751 246 90 14 chr2 18435683 18435971 -163312116 + RMER5 LTR ERV1 187 496 -38 9 725 2742 88 52 12 chr2 18437948 18438350 -163309737 + BGLII LTR ERVK 4 421 0 9 725 1205 232 70 26 chr2 18442003 18442344 -163305743 + MTE2b LTR MaLR 22 377 -2 9 725 329 162 40 13 chr2 18442586 18442661 -163305426 - MTD LTR MaLR 0 419 343 9 725 608 201 22 22 chr2 18442659 18442796 -163305291 - MTD LTR MaLR -282 137 1 9 725 527 143 30 20 chr2 18443870 18443970 -163304117 - MTE2b LTR MaLR -3 376 276 9 725 977 265 143 14 chr2 18444007 18444157 -163303930 - MTD LTR MaLR 0 419 263 9 725 977 265 143 14 chr2 18444306 18444526 -163303561 - MTD LTR MaLR -157 262 2 9 725 329 216 40 0 chr2 18444685 18444759 -163303328 - MTE2a LTR MaLR 0 379 303 9 725 440 326 101 6 chr2 18444767 18444946 -163303141 - MTE2a LTR MaLR -183 196 1 9 725 661 246 269 43 chr2 18447642 18448146 -163299941 - MTC-int LTR MaLR -595 985 3 9 725 585 298 102 25 chr2 18455106 18455429 -163292658 - MT2A LTR ERVL -185 348 1 9 725 475 245 29 0 chr2 18455565 18455667 -163292420 + ORR1D2 LTR MaLR 55 159 -211 9 725 1056 204 20 102 chr2 18455606 18455900 -163292187 - ORR1D1 LTR MaLR -51 327 31 9 725 1056 188 8 104 chr2 18456092 18456135 -163291952 - ORR1D1 LTR MaLR -344 30 1 9 725 257 140 100 0 chr2 18457305 18457355 -163290732 - ORR1B1 LTR MaLR 0 378 324 9 725 768 141 44 0 chr2 18457572 18457707 -163290380 - ORR1B1 LTR MaLR -41 353 213 9 725 3027 38 0 0 chr2 18457770 18458116 -163289971 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 9 725 964 187 103 5 chr2 18458282 18458486 -163289601 - ORR1B1 LTR MaLR -170 224 1 9 725 291 153 0 48 chr2 18460340 18460402 -163287685 + RLTR25A LTR ERVK 514 572 -531 9 725 3575 161 21 222 chr2 18460658 18461787 -163286300 + RMER19B LTR ERVK 1 902 0 9 725 521 288 72 26 chr2 18462390 18462654 -163285433 + MER74A LTR ERVL 245 520 -38 9 725 1809 195 99 138 chr2 18466432 18467068 -163281019 + RMER19C LTR ERVK 1 611 0 9 725 428 298 16 58 chr2 18467840 18468029 -163280058 - MER34A LTR ERV1 -390 181 1 9 726 3984 154 105 12 chr2 18483649 18484462 -163263625 - RMER19B LTR ERVK -12 890 3 9 726 228 318 9 9 chr2 18491654 18491765 -163256322 - MLT1H1 LTR MaLR -216 363 253 1 726 409 312 61 25 chr2 18491826 18492078 -163256009 - MLT1H1 LTR MaLR -366 229 1 1 726 1326 201 129 17 chr2 18496498 18496848 -163251239 - MTD LTR MaLR -30 389 1 1 726 1874 137 146 20 chr2 18498921 18499271 -163248816 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 1 726 243 159 70 28 chr2 18499593 18499664 -163248423 - MTEb LTR MaLR -12 367 294 1 726 234 305 47 9 chr2 18504200 18504306 -163243781 + MLT1H2 LTR MaLR 380 489 0 1 726 495 344 44 83 chr2 18504326 18504735 -163243352 + MLT1H2-int LTR MaLR 44 436 -973 1 726 779 222 171 98 chr2 18505375 18505759 -163242328 - MT2A LTR ERVL -3 598 63 1 726 294 191 43 14 chr2 18505922 18505991 -163242096 - MT2A LTR ERVL -399 76 6 1 726 2109 159 58 29 chr2 18515300 18515682 -163232405 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 2 3 726 693 148 25 0 chr2 18515682 18515804 -163232283 - ORR1B1-int LTR MaLR -1 1508 1384 3 726 826 174 13 0 chr2 18515800 18515955 -163232132 - ORR1B1-int LTR MaLR -324 1185 1029 3 726 1680 113 78 0 chr2 18515956 18516238 -163231849 - ORR1B1 LTR MaLR -88 306 3 3 726 1830 161 62 26 chr2 18523446 18523835 -163224252 + RMER4A LTR ERVK 2 404 -62 5 726 244 253 61 37 chr2 18538238 18538320 -163209767 - MTE2a LTR MaLR -14 365 282 7 726 1899 153 110 89 chr2 18540436 18540873 -163207214 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 1 8 726 1855 149 102 40 chr2 18541010 18541381 -163206706 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 8 726 254 323 15 20 chr2 18542207 18542306 -163205781 - MTE2a LTR MaLR -21 358 256 8 726 246 326 176 13 chr2 18543222 18543455 -163204632 - MLT1L LTR MaLR -28 582 312 8 726 538 233 91 104 chr2 18544460 18544824 -163203263 + RLTR15 LTR ERVK 1 359 0 8 726 243 258 35 95 chr2 18545615 18545784 -163202303 - RMER4B LTR ERVK -20 565 368 8 726 763 156 45 7 chr2 18545908 18546063 -163202024 - RMER4B LTR ERVK -408 177 17 8 726 468 269 94 26 chr2 18552246 18552437 -163195650 + ORR1E LTR MaLR 51 254 -105 1 726 1812 122 3 0 chr2 18552499 18552786 -163195301 - MTC LTR MaLR -131 290 3 1 726 559 288 67 72 chr2 18552856 18553215 -163194872 - ORR1E LTR MaLR 0 359 3 1 726 966 149 6 0 chr2 18557690 18557858 -163190229 + RMER19A LTR ERVK 3 171 -566 1 726 4232 162 94 9 chr2 18557870 18558687 -163189400 - RMER19B LTR ERVK -13 889 3 1 726 1402 158 84 19 chr2 18558687 18559173 -163188914 + RMER19A LTR ERVK 160 737 0 1 726 1250 171 21 177 chr2 18559188 18559357 -163188730 - MTC LTR MaLR -144 277 121 1 726 1250 171 21 177 chr2 18559504 18559661 -163188426 - MTC LTR MaLR -301 120 2 1 726 1374 182 24 31 chr2 18564276 18564565 -163183522 - ORR1B1 LTR MaLR -13 381 95 1 726 764 199 82 6 chr2 18564508 18564652 -163183435 - RMER4A LTR ERVK -269 197 54 1 726 764 199 82 6 chr2 18564696 18564733 -163183354 - RMER4A LTR ERVK -413 53 3 1 726 2304 124 62 5 chr2 18565071 18565444 -163182643 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 1 726 920 244 13 25 chr2 18565444 18565680 -163182407 + MTE2b LTR MaLR 147 379 0 1 726 2479 127 19 11 chr2 18567328 18567703 -163180384 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 1 726 3698 187 81 24 chr2 18575161 18576036 -163172051 - RMER19B LTR ERVK -12 890 4 1 726 602 243 29 0 chr2 18576538 18576674 -163171413 - MTEb LTR MaLR 0 379 240 1 726 1686 265 103 55 chr2 18576683 18577370 -163170717 - MTE-int LTR MaLR -286 1294 575 1 726 4018 150 108 30 chr2 18577787 18577853 -163170234 + RMER19B LTR ERVK 1 71 -831 1 726 3216 75 14 0 chr2 18577853 18578268 -163169819 + BGLII LTR ERVK 1 421 0 1 726 4018 150 108 30 chr2 18578268 18578350 -163169737 + RMER19B LTR ERVK 72 160 -742 1 726 4018 150 108 30 chr2 18578537 18579224 -163168863 + RMER19B LTR ERVK 161 902 0 1 726 1536 155 164 0 chr2 18580179 18580502 -163167585 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 3 1 726 2217 107 3 71 chr2 18584765 18585118 -163162969 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 2 726 664 252 114 38 chr2 18585230 18585547 -163162540 + RLTR15 LTR ERVK 1 341 -18 2 727 287 247 47 0 chr2 18621570 18621655 -163126432 - RMER15 LTR ERVL -56 519 431 2 727 2305 154 41 24 chr2 18627190 18627602 -163120485 - MTC LTR MaLR -2 419 1 2 727 2042 172 138 66 chr2 18630879 18631409 -163116678 - RMER4B LTR ERVK 0 585 18 2 727 4500 140 51 4 chr2 18634377 18635081 -163113006 + RMER19A LTR ERVK 1 737 0 2 727 849 142 14 0 chr2 18635414 18635562 -163112525 + ORR1D1 LTR MaLR 1 150 -224 2 727 1840 113 14 3 chr2 18635565 18635842 -163112245 + ORR1A2 LTR MaLR 1 280 -47 2 727 400 73 0 0 chr2 18636013 18636068 -163112019 + ORR1A2 LTR MaLR 272 326 0 2 727 408 162 568 68 chr2 18636076 18636224 -163111863 + ORR1D1 LTR MaLR 153 374 0 2 727 3311 41 15 0 chr2 18642285 18642675 -163105412 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 727 2932 144 112 4 chr2 18642776 18643304 -163104783 - RMER4B LTR ERVK 0 585 1 2 727 229 246 18 0 chr2 18646578 18646635 -163101452 + MLT1G1 LTR MaLR 522 579 0 2 727 1652 159 131 3 chr2 18648313 18648641 -163099446 + MTC LTR MaLR 1 370 -51 2 727 1021 268 55 46 chr2 18651365 18651690 -163096397 - MTE2a LTR MaLR 0 379 52 2 727 605 280 21 0 chr2 18679249 18679392 -163068695 + MTD LTR MaLR 56 201 -218 3 727 376 316 29 29 chr2 18693181 18693318 -163054769 + MLT1G3 LTR MaLR 48 184 -411 3 727 252 297 36 0 chr2 18693548 18693632 -163054455 + MLT1G3 LTR MaLR 453 575 -49 3 727 288 247 27 0 chr2 18698764 18698837 -163049250 - MLT1A0 LTR MaLR -13 352 278 3 727 1696 170 80 0 chr2 18703798 18704122 -163043965 + ORR1C1 LTR MaLR 29 378 0 3 727 1436 242 50 12 chr2 18727713 18728056 -163020031 - MTD LTR MaLR -14 405 50 4 727 1628 223 58 41 chr2 18731632 18732044 -163016043 - MTC LTR MaLR 0 421 3 4 727 3228 140 65 4 chr2 18736368 18736919 -163011168 + RMER4B LTR ERVK 1 585 0 4 727 439 269 178 138 chr2 18737662 18738011 -163010076 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 3 4 728 1761 161 166 49 chr2 18745853 18746229 -163001858 - RMER4A LTR ERVK -5 461 36 4 728 1761 161 166 49 chr2 18746308 18746341 -163001746 - RMER4A LTR ERVK -431 35 4 4 728 759 315 16 71 chr2 18750092 18750529 -162997558 + RodERV21-int LTR ERV1 2696 3108 -1883 4 728 539 319 51 55 chr2 18750589 18750864 -162997223 + RodERV21-int LTR ERV1 3355 3628 -1363 4 728 474 206 0 10 chr2 18750862 18750965 -162997122 + RodERV21-int LTR ERV1 4688 4789 -202 4 728 369 292 60 30 chr2 18750988 18751122 -162996965 + RMER4B LTR ERVK 347 484 -101 4 728 2238 177 153 6 chr2 18751465 18751942 -162996145 + RMER4B LTR ERVK 39 585 0 4 728 2396 90 97 13 chr2 18753566 18753939 -162994148 + MTB_Mm LTR MaLR 3 406 -1 4 728 3174 24 31 5 chr2 18756513 18756897 -162991190 + RLTR10C LTR ERVK 1 394 -42 4 728 1086 231 164 30 chr2 18759298 18759628 -162988459 + MTE2b LTR MaLR 4 377 -2 4 728 261 362 26 0 chr2 18762691 18762807 -162985280 - ORR1E LTR MaLR -237 122 4 4 728 1045 171 39 146 chr2 18784348 18784656 -162963431 + RMER19B LTR ERVK 1 275 -627 5 728 2504 162 192 80 chr2 18784654 18785326 -162962761 - RMER19B LTR ERVK -155 747 1 5 728 1041 246 12 91 chr2 18789199 18789530 -162958557 + MTE2a LTR MaLR 2 306 -73 5 728 848 262 37 96 chr2 18797251 18797383 -162950704 - MTE2a LTR MaLR -41 338 203 5 728 848 262 37 96 chr2 18797444 18797657 -162950430 - MTE2a LTR MaLR -185 194 6 5 728 866 249 78 97 chr2 18807667 18808040 -162940047 + MTE2a LTR MaLR 1 366 -13 5 728 304 320 51 2 chr2 18809241 18809407 -162938680 + MLT1A LTR MaLR 219 390 0 5 728 259 285 212 14 chr2 18817888 18818034 -162930053 + RMER15 LTR ERVL 336 510 -65 5 728 1675 161 36 85 chr2 18821733 18822121 -162925966 + ORR1B1 LTR MaLR 26 394 0 5 728 1435 185 140 12 chr2 18826956 18827285 -162920802 + ORR1D1 LTR MaLR 2 372 -2 5 728 1637 206 76 8 chr2 18841393 18841775 -162906312 + MTD LTR MaLR 12 419 0 5 728 2003 120 290 34 chr2 18842100 18842517 -162905570 - RMER4B LTR ERVK 0 585 52 5 728 2003 120 290 34 chr2 18842694 18842742 -162905345 - RMER4B LTR ERVK -534 51 2 5 728 366 296 50 147 chr2 18845841 18846237 -162901850 + MLT1A LTR MaLR 2 359 -15 6 728 249 200 0 98 chr2 18871592 18871653 -162876434 + MT2B LTR ERVL 194 248 -353 6 729 323 243 65 9 chr2 18884343 18884451 -162863636 - ORR1E LTR MaLR -215 144 31 6 729 248 173 19 37 chr2 18887662 18887716 -162860371 + RLTR25B LTR ERVK 3 55 -973 6 729 4978 156 87 14 chr2 18887737 18888763 -162859324 + RLTR25A LTR ERVK 3 1103 0 6 729 438 207 55 47 chr2 18888841 18888968 -162859119 + ORR1B1 LTR MaLR 41 168 -226 6 729 3901 132 84 27 chr2 18894122 18894799 -162853288 + RMER6D LTR ERVK 1 716 -4 6 729 963 229 160 16 chr2 18900191 18900468 -162847619 + MTEa LTR MaLR 1 323 -56 6 729 2866 135 84 10 chr2 18900468 18900956 -162847131 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 524 -3 6 729 963 229 160 16 chr2 18900956 18900997 -162847090 + MTEa LTR MaLR 324 365 -14 6 729 345 300 139 48 chr2 18904224 18904476 -162843611 + ORR1E LTR MaLR 25 299 -60 6 729 1658 198 97 5 chr2 18904941 18905312 -162842775 + MTD LTR MaLR 15 419 0 6 729 2444 172 78 22 chr2 18907065 18907563 -162840524 - RLTR11A LTR ERVK -2 526 1 6 729 1057 274 105 3 chr2 18907901 18908245 -162839842 + MTE2b LTR MaLR 1 379 0 7 729 2778 147 94 24 chr2 18908953 18909495 -162838592 + RMER4B LTR ERVK 1 580 -5 7 729 1178 251 112 19 chr2 18910670 18910991 -162837096 + MTEa LTR MaLR 29 379 0 7 729 403 177 25 0 chr2 18911003 18911082 -162837005 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 294 7 729 479 160 83 1 chr2 18912710 18912823 -162835264 - ORR1D1 LTR MaLR -73 311 186 7 729 2909 162 27 6 chr2 18912816 18913330 -162834757 - RMER15 LTR ERVL -28 547 23 7 729 945 184 47 0 chr2 18913326 18913516 -162834571 - ORR1D1 LTR MaLR -175 199 1 7 729 996 238 67 128 chr2 18914183 18914690 -162833397 + RLTR12B LTR ERVK 47 522 -6 7 729 368 182 0 124 chr2 18923076 18923096 -162824991 + MT2B LTR ERVL 151 247 -352 7 729 384 248 36 36 chr2 18924852 18924990 -162823097 + MLT1A0 LTR MaLR 226 363 -2 7 729 2909 52 0 3 chr2 18932082 18932429 -162815658 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 7 729 546 303 40 61 chr2 18933058 18933336 -162814751 - MLT1D LTR MaLR -46 459 188 7 729 3511 194 81 57 chr2 18936539 18937403 -162810684 - RMER19B LTR ERVK -12 890 6 7 729 317 276 72 7 chr2 18938296 18938449 -162809638 + MER34A1 LTR ERV1 296 458 -129 7 729 397 296 8 0 chr2 18940883 18941008 -162807079 - MLT1H LTR MaLR 0 549 424 7 729 1833 139 148 17 chr2 18941103 18941240 -162806847 - RMER10B LTR ERVL 0 398 262 7 729 1833 139 148 17 chr2 18941367 18941392 -162806695 - RMER10B LTR ERVL -137 261 198 7 729 1833 139 148 17 chr2 18941552 18941740 -162806347 - RMER10B LTR ERVL -201 197 1 7 729 819 203 204 86 chr2 18941840 18942006 -162806081 - RMER17C-int LTR ERVK -141 3097 2875 7 729 819 203 204 86 chr2 18942091 18942345 -162805742 - RMER17C-int LTR ERVK -364 2874 2628 7 729 528 122 11 0 chr2 18942640 18942730 -162805357 - RMER10B LTR ERVL -233 165 75 7 729 370 326 101 54 chr2 18942742 18943018 -162805069 - MLT1H LTR MaLR -256 293 5 7 729 1101 261 152 3 chr2 18944580 18944895 -162803192 - MTD LTR MaLR -15 404 43 7 729 593 141 40 0 chr2 18951869 18951968 -162796119 + ORR1C2 LTR MaLR 1 103 -281 7 729 470 261 33 8 chr2 18951966 18952086 -162796001 + MLT1A1 LTR MaLR 8 130 -278 7 729 351 311 23 113 chr2 18952279 18952500 -162795587 + ORR1C2 LTR MaLR 124 324 -35 7 729 1132 291 37 27 chr2 18953265 18953640 -162794447 + MTE2b LTR MaLR 1 379 0 7 729 2020 139 60 131 chr2 18954369 18954433 -162793654 + RMER4A LTR ERVK 6 67 -399 7 729 2020 139 60 131 chr2 18954853 18955284 -162792803 + RMER4A LTR ERVK 68 466 0 7 729 463 256 31 16 chr2 18957460 18957608 -162790479 - MLT1A1 LTR MaLR -5 403 210 7 729 245 222 41 14 chr2 18957583 18957656 -162790431 - RLTR15 LTR ERVK -284 75 1 7 729 3078 89 15 3 chr2 18968431 18968823 -162779264 - MTB LTR MaLR -1 399 3 8 729 654 270 55 67 chr2 18971412 18971813 -162776274 + RMER2 LTR ERV1 1 540 -27 8 729 1746 209 10 41 chr2 18976601 18976979 -162771108 - ORR1B2 LTR MaLR 0 370 1 8 729 1292 217 62 62 chr2 18980866 18981220 -162766867 - ORR1E LTR MaLR -5 354 1 8 729 327 349 61 83 chr2 18983045 18983407 -162764680 + ORR1E LTR MaLR 6 359 0 8 729 470 194 73 20 chr2 18991316 18991453 -162756634 - MTC LTR MaLR -267 140 1 8 729 1945 191 37 16 chr2 19002129 19002507 -162745580 + MTD LTR MaLR 32 417 -2 7 729 305 232 29 57 chr2 19005043 19005148 -162742939 + MLT1A0 LTR MaLR 1 102 -263 1 730 302 214 0 0 chr2 19015418 19015474 -162732613 + MTEb LTR MaLR 1 56 -323 3 730 551 232 112 31 chr2 19015532 19015692 -162732395 + MTEb LTR MaLR 181 353 -26 3 730 755 212 22 56 chr2 19031587 19031767 -162716320 + RLTR31_Mm LTR ERVK 388 561 0 6 730 1564 228 72 54 chr2 19031767 19032270 -162715817 + RMER3D-int LTR ERVK 1 849 -1993 6 730 604 162 42 8 chr2 19032356 19032474 -162715613 + RMER3D-int LTR ERVK 489 610 -2232 6 730 2699 166 27 21 chr2 19032499 19033017 -162715070 + RMER3D-int LTR ERVK 1023 1543 -1299 6 730 5704 172 68 35 chr2 19034856 19036125 -162711962 + RMER3D-int LTR ERVK 1532 2841 -1 6 730 3050 159 36 22 chr2 19036126 19036679 -162711408 + RLTR31_Mm LTR ERVK 1 561 0 6 730 1935 214 53 2 chr2 19042849 19043248 -162704839 - MTD LTR MaLR 0 419 1 7 730 3442 177 79 83 chr2 19043470 19044216 -162703871 + RMER19B LTR ERVK 1 743 -159 7 730 1424 132 99 4 chr2 19044422 19044674 -162703413 - RLTR9A2 LTR ERVK 0 383 108 7 730 1600 191 28 22 chr2 19044676 19044997 -162703090 - ETnERV2-int LTR ERVK -4523 2883 2561 7 730 6837 127 59 41 chr2 19044983 19046203 -162701884 - ETnERV2-int LTR ERVK -5112 2294 1053 7 730 1920 135 74 22 chr2 19052626 19052986 -162695101 - RLTR9A2 LTR ERVK -21 362 1 8 730 1035 239 81 69 chr2 19056552 19056894 -162691193 + ORR1E LTR MaLR 2 379 0 8 730 531 225 57 10 chr2 19057679 19057824 -162690263 + MTD LTR MaLR 214 419 0 8 730 2070 135 0 58 chr2 19060613 19060960 -162687127 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 9 730 309 248 110 65 chr2 19064192 19064347 -162683740 + LTR85b LTR Gypsy? 368 529 -255 1 730 335 244 32 43 chr2 19064432 19064526 -162683561 + LTR85b LTR Gypsy? 684 776 -8 1 730 1238 260 30 16 chr2 19064882 19065253 -162682834 + MTE2b LTR MaLR 1 376 -3 1 730 3713 159 180 58 chr2 19069561 19070365 -162677722 - RMER19B LTR ERVK 0 902 1 1 730 4151 104 3 40 chr2 19076786 19077410 -162670677 - MT2B LTR ERVL 0 601 1 1 730 230 236 18 0 chr2 19078565 19078620 -162669467 + MER49 LTR ERV1 303 358 -565 1 730 349 358 105 44 chr2 19083735 19084077 -162664010 + ORR1D2 LTR MaLR 8 370 0 1 730 225 359 28 28 chr2 19085382 19085491 -162662596 - MER21B LTR ERV1 -279 584 476 1 730 1301 213 138 15 chr2 19086550 19086883 -162661204 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 1 730 434 293 90 110 chr2 19088897 19089016 -162659071 + MLT1A1 LTR MaLR 21 132 -242 1 730 3427 20 5 5 chr2 19089016 19089412 -162658675 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 730 462 266 55 79 chr2 19089412 19089652 -162658435 + MLT1A1 LTR MaLR 133 403 -5 1 730 881 334 73 71 chr2 19090405 19090869 -162657218 + MLT1C LTR MaLR 3 467 0 1 730 494 325 98 39 chr2 19092154 19092495 -162655592 - ORR1E LTR MaLR -44 330 1 1 730 1922 238 48 19 chr2 19094551 19095030 -162653057 - RLTR16 LTR ERVK -12 493 1 1 730 680 257 19 26 chr2 19095742 19095898 -162652189 - ORR1D2 LTR MaLR -211 159 5 1 730 1834 154 19 52 chr2 19097640 19098064 -162650023 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 1 730 1942 132 34 137 chr2 19102056 19102495 -162645592 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 1 730 2648 155 4 54 chr2 19106466 19106951 -162641136 - RMER6B LTR ERVK 0 461 1 1 730 390 200 157 45 chr2 19116343 19116453 -162631634 + RMER17C LTR ERVK 76 184 -226 1 730 390 200 157 45 chr2 19116492 19116559 -162631528 + RMER17C LTR ERVK 185 273 -137 1 731 498 276 107 71 chr2 19159128 19159409 -162588678 + MLT1D LTR MaLR 6 296 -209 2 731 400 333 36 47 chr2 19159506 19159698 -162588389 + MLT1D LTR MaLR 316 505 0 2 731 1417 245 132 4 chr2 19167066 19167521 -162580566 - RMER5 LTR ERV1 -9 525 13 2 731 1107 267 12 25 chr2 19168245 19168571 -162579516 - MTE2a LTR MaLR -14 365 44 2 731 282 300 92 8 chr2 19168965 19169096 -162578991 - MLT1C LTR MaLR -286 181 40 2 731 3058 80 34 5 chr2 19171037 19171314 -162576773 - RLTR44E LTR ERVK 0 452 167 2 731 3058 80 34 5 chr2 19171362 19171523 -162576564 - RLTR44E LTR ERVK -286 166 3 2 731 1700 271 70 32 chr2 19173935 19174586 -162573501 - ERVL-B4-int LTR ERVL -563 5151 4453 2 731 1262 241 61 20 chr2 19175094 19175437 -162572650 + ORR1E LTR MaLR 1 357 -2 2 731 288 320 37 104 chr2 19177297 19177625 -162570462 - RMER10A LTR ERVL -15 427 122 2 731 296 229 78 52 chr2 19177707 19177822 -162570265 - RMER10A LTR ERVL -313 129 12 2 731 1351 183 112 64 chr2 19178322 19178387 -162569700 + RMER17C LTR ERVK 1 83 -327 2 731 1351 183 112 64 chr2 19178562 19178698 -162569389 + RMER17C LTR ERVK 84 224 -186 2 731 1351 183 112 64 chr2 19178757 19178945 -162569142 + RMER17C LTR ERVK 225 410 0 2 731 746 251 17 120 chr2 19206982 19207281 -162540806 - MTE2a LTR MaLR -110 269 2 2 731 2861 25 0 153 chr2 19208253 19208684 -162539403 - RLTR10B2 LTR ERVK 0 365 1 3 731 267 299 0 108 chr2 19209705 19209825 -162538262 - MLT1D LTR MaLR -174 331 225 3 731 3106 30 62 0 chr2 19211869 19212242 -162535845 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 731 9014 45 6 2 chr2 19212242 19213335 -162534752 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 3 731 3089 30 65 0 chr2 19213335 19213707 -162534380 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 731 280 244 48 14 chr2 19213927 19214024 -162534063 - ORR1D2 LTR MaLR -3 376 278 3 731 1097 242 131 23 chr2 19220409 19220752 -162527335 + MTD LTR MaLR 1 380 -39 3 731 751 232 150 77 chr2 19227712 19228025 -162520062 - MTEa LTR MaLR 0 379 44 3 731 1594 161 12 22 chr2 19228039 19228363 -162519724 - MTC LTR MaLR -98 323 3 3 731 556 279 105 84 chr2 19228447 19228636 -162519451 - MLT1A LTR MaLR -22 352 166 3 731 556 279 105 84 chr2 19228776 19228930 -162519157 - MLT1A LTR MaLR -209 165 2 3 731 597 227 119 50 chr2 19229122 19229442 -162518645 - RLTR15 LTR ERVK -17 342 1 3 731 2679 170 12 0 chr2 19230495 19231002 -162517085 + RLTR28 LTR ERVL 2 514 -10 3 731 2036 163 27 21 chr2 19232205 19232581 -162515506 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 3 731 2384 115 44 30 chr2 19237001 19237476 -162510611 + RMER17A2 LTR ERVK 328 809 0 3 731 597 89 178 0 chr2 19237478 19237579 -162510508 + RMER17A-int LTR ERVK 3 121 -1607 3 731 6057 136 47 43 chr2 19237848 19238953 -162509134 + RMER17A-int LTR ERVK 617 1725 -3 3 731 3956 137 26 121 chr2 19238958 19239943 -162508144 + RMER17A2 LTR ERVK 3 894 -12 3 731 234 167 0 0 chr2 19241162 19241204 -162506883 - MER95 LTR ERV -229 202 161 3 731 380 222 0 22 chr2 19241221 19241313 -162506774 + MER31A LTR ERV1 13 102 -383 3 731 234 306 9 148 chr2 19241352 19241429 -162506658 - MTEb LTR MaLR -74 305 241 3 731 4303 46 4 0 chr2 19241429 19241930 -162506157 + RLTR1C LTR ERV1 1 503 0 3 731 234 306 9 148 chr2 19241930 19241967 -162506120 - MTEb LTR MaLR -139 240 207 3 731 264 320 107 24 chr2 19242085 19242290 -162505797 + MER31A LTR ERV1 92 313 -172 3 731 329 278 8 31 chr2 19242405 19242535 -162505552 - MER95 LTR ERV -299 132 6 3 731 1211 265 89 35 chr2 19244886 19245371 -162502716 - RMER5 LTR ERV1 -6 528 18 3 731 258 270 9 65 chr2 19246144 19246251 -162501836 - MER34 LTR ERV1 -67 475 375 3 731 1059 269 65 25 chr2 19246943 19247298 -162500789 - MTE2a LTR MaLR -6 373 5 3 731 720 289 40 43 chr2 19247544 19247866 -162500221 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 110 3 731 574 144 0 190 chr2 19247894 19248057 -162500030 - RLTR23 LTR ERV1 -291 139 8 3 731 3013 50 47 3 chr2 19248818 19249199 -162498888 - MTB LTR MaLR 0 400 3 3 731 1505 201 23 96 chr2 19252630 19253027 -162495060 + ORR1D1 LTR MaLR 1 368 -6 3 731 1755 145 70 91 chr2 19253960 19254346 -162493741 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 3 731 478 200 124 15 chr2 19255093 19255230 -162492857 + MTE2b LTR MaLR 1 152 -227 3 731 3085 48 47 8 chr2 19256535 19256916 -162491171 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 731 1194 242 103 12 chr2 19257635 19257974 -162490113 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 3 731 1860 147 15 67 chr2 19258025 19258404 -162489683 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 32 3 731 2871 164 19 6 chr2 19262861 19263375 -162484712 + RLTR11A LTR ERVK 5 525 -3 4 731 1290 231 102 38 chr2 19264863 19265335 -162482752 - RMER5 LTR ERV1 0 534 33 4 732 301 229 0 0 chr2 19269016 19269077 -162479010 - RMER15 LTR ERVL -112 463 403 4 732 253 241 37 25 chr2 19272249 19272330 -162475757 + MLT1A1 LTR MaLR 307 388 -20 4 732 1602 20 5 0 chr2 19275624 19275825 -162472262 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 145 4 732 2154 127 15 6 chr2 19275825 19276159 -162471928 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 0 337 1 4 732 6370 46 4 7 chr2 19276161 19276934 -162471153 - IAPEz-int LTR ERVK -2 6479 5709 4 732 3170 20 0 0 chr2 19276925 19277282 -162470805 - IAPEz-int LTR ERVK -2124 4357 4001 4 732 396 89 0 0 chr2 19277280 19277336 -162470751 - IAPEz-int LTR ERVK -3707 2774 2719 4 732 13613 102 40 28 chr2 19277335 19279361 -162468726 - IAPEz-int LTR ERVK -4136 2345 297 4 732 2848 42 11 111 chr2 19279361 19279794 -162468293 - RLTR10 LTR ERVK 0 390 1 4 732 8752 18 16 0 chr2 19279796 19280422 -162467665 - RLTR10-int LTR ERVK -3 1984 1359 4 732 8752 18 16 0 chr2 19280454 19280806 -162467281 - RLTR10-int LTR ERVK -629 1358 991 4 732 344 248 62 39 chr2 19280888 19281018 -162467069 - RLTR10-int LTR ERVK -5987 1594 1462 4 732 7773 41 29 2 chr2 19281082 19282015 -162466072 - RLTR10-int LTR ERVK -989 998 41 4 732 3003 31 7 110 chr2 19282025 19282460 -162465627 - RLTR10 LTR ERVK 0 390 1 4 732 2334 41 3 33 chr2 19282460 19282764 -162465323 - IAPEz-int LTR ERVK -6179 302 8 4 732 2166 127 15 6 chr2 19282764 19283098 -162464989 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 0 337 1 4 732 1126 54 0 0 chr2 19283100 19283248 -162464839 - ORR1A1 LTR MaLR -198 148 1 4 732 422 227 99 9 chr2 19285645 19285756 -162462331 + MTD LTR MaLR 299 419 0 4 732 491 247 36 54 chr2 19288190 19288667 -162459420 + RMER17C LTR ERVK 84 483 -326 4 732 273 322 140 18 chr2 19290782 19291003 -162457084 - MLT1J LTR MaLR -33 479 232 4 732 1728 210 41 41 chr2 19297040 19297457 -162450630 + MTD LTR MaLR 3 419 0 4 732 477 182 13 143 chr2 19297494 19297534 -162450553 + MT2B LTR ERVL 131 150 -451 4 732 1292 308 81 16 chr2 19306228 19306723 -162441364 - MER21B LTR ERV1 -60 803 277 4 732 491 333 70 16 chr2 19306799 19306985 -162441102 - MER21B LTR ERV1 -667 196 1 4 732 1181 233 134 38 chr2 19308944 19309310 -162438777 + MTD LTR MaLR 5 405 -14 4 732 718 296 178 14 chr2 19309339 19309709 -162438378 + MLT1C LTR MaLR 34 464 -3 4 732 332 352 27 22 chr2 19317360 19317543 -162430544 + RMER15 LTR ERVL 322 505 -70 5 732 1501 169 8 0 chr2 19317794 19318049 -162430038 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 122 5 732 366 335 55 61 chr2 19319437 19319799 -162428288 - MTEb LTR MaLR -15 364 1 5 732 307 299 84 45 chr2 19320707 19320861 -162427226 + MERVL_2A-int LTR ERVL 2249 2408 -3353 5 732 314 304 63 99 chr2 19322606 19322858 -162425229 - ORR1E LTR MaLR -19 340 98 5 732 3515 20 2 10 chr2 19326258 19326657 -162421430 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 732 2727 131 12 5 chr2 19329070 19329477 -162418610 + MTC LTR MaLR 12 421 0 5 732 632 290 93 22 chr2 19330665 19331055 -162417032 + MLT1H1 LTR MaLR 13 410 -145 5 732 243 206 156 18 chr2 19333002 19333111 -162414976 + MLT1H1 LTR MaLR 416 539 -16 5 732 2485 136 229 111 chr2 19333191 19333555 -162414532 - RMER6D LTR ERVK -4 716 221 5 732 2485 136 229 111 chr2 19333751 19334025 -162414062 - RMER6D LTR ERVK -500 220 3 5 732 1534 193 170 19 chr2 19334502 19334824 -162413263 + MTD LTR MaLR 1 381 -38 5 732 1408 207 88 23 chr2 19334824 19335175 -162412912 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 5 732 1534 193 170 19 chr2 19335175 19335216 -162412871 + MTD LTR MaLR 382 419 0 5 732 241 305 9 87 chr2 19341782 19341897 -162406190 - MLT1J2 LTR MaLR -120 328 223 5 732 240 299 141 33 chr2 19342014 19342135 -162405952 - MLT1J2 LTR MaLR -343 169 36 5 732 504 322 28 39 chr2 19342908 19343089 -162404998 - MTEa LTR MaLR -200 179 1 5 732 847 179 57 16 chr2 19343371 19343564 -162404523 + RMER10B LTR ERVL 74 274 -124 5 732 505 303 78 17 chr2 19346716 19346930 -162401157 + MLT1D LTR MaLR 270 466 -39 5 732 433 282 8 17 chr2 19346992 19347111 -162400976 + MLT1A0 LTR MaLR 248 365 0 5 732 387 276 37 62 chr2 19355968 19356130 -162391957 - MLT1J LTR MaLR -351 161 4 5 732 297 321 141 110 chr2 19356336 19356690 -162391397 - MLT1I LTR MaLR -1 410 46 5 732 442 252 62 16 chr2 19383471 19383600 -162364487 - ORR1D2-int LTR MaLR -1214 156 22 6 732 770 243 221 35 chr2 19383627 19383939 -162364148 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 6 732 321 301 106 55 chr2 19383944 19384162 -162363925 - MLT1C LTR MaLR -37 430 202 6 732 231 213 0 0 chr2 19384993 19385040 -162363047 - MLT1C LTR MaLR -260 130 84 6 732 238 326 22 11 chr2 19386220 19386310 -162361777 - ORR1E LTR MaLR -14 365 275 6 732 271 360 44 51 chr2 19386417 19386575 -162361512 - ORR1E LTR MaLR -202 157 1 6 732 596 310 70 0 chr2 19387552 19387752 -162360335 + MTE2b LTR MaLR 1 214 -165 6 732 3080 78 2 2 chr2 19388629 19389025 -162359062 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 732 7433 79 27 68 chr2 19389025 19390170 -162357917 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 6 732 1635 204 119 80 chr2 19397469 19397981 -162350106 - MT2A LTR ERVL 0 533 2 6 733 320 333 71 67 chr2 19403795 19404020 -162344067 + MTEb LTR MaLR 110 335 -44 6 733 1006 311 31 64 chr2 19406563 19406730 -162341357 + MTE2b LTR MaLR 1 150 -229 6 733 2842 44 6 0 chr2 19406730 19407074 -162341013 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 6 733 1006 311 31 64 chr2 19407074 19407298 -162340789 + MTE2b LTR MaLR 151 379 0 6 733 2987 56 15 10 chr2 19409018 19409412 -162338675 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 733 1046 250 17 17 chr2 19414867 19415103 -162332984 - MTE2a LTR MaLR -16 363 128 6 733 2561 142 151 6 chr2 19418479 19418988 -162329099 - RMER4B LTR ERVK -2 583 1 6 733 816 259 81 74 chr2 19426244 19426653 -162321434 - MT2B2 LTR ERVL -49 535 1 6 733 2044 145 93 0 chr2 19428112 19428456 -162319631 + RLTR30 LTR ERV1 1 376 -3 6 733 414 290 0 0 chr2 19429172 19429272 -162318815 + ORR1E LTR MaLR 2 101 -258 6 733 914 248 252 96 chr2 19445789 19446320 -162301767 + RLTR18 LTR ERVK 1 614 -2 7 733 304 252 138 9 chr2 19450314 19450430 -162297657 + LTR33B LTR ERVL 359 489 -14 7 733 225 262 44 77 chr2 19452936 19453027 -162295060 - LTR83 LTR ERVL -83 697 610 7 733 804 150 0 52 chr2 19454087 19454221 -162293866 + RMER20B LTR ERVK 1 127 -500 7 733 457 284 18 119 chr2 19454253 19454421 -162293666 + RLTR20B1 LTR ERVK 409 559 -4 7 733 867 92 7 90 chr2 19457915 19457968 -162290119 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 285 7 733 867 92 7 90 chr2 19458159 19458249 -162289838 - ORR1A3 LTR MaLR -42 284 195 7 733 492 141 0 0 chr2 19458241 19458319 -162289768 - ORR1A3 LTR MaLR -249 78 1 7 733 1842 132 84 0 chr2 19466085 19466381 -162281706 - ORR1A4 LTR MaLR -8 321 1 7 733 435 288 63 126 chr2 19467078 19467184 -162280903 + LTR40c LTR ERVL 82 202 -263 7 733 435 288 63 126 chr2 19467398 19467545 -162280542 + LTR40c LTR ERVL 203 319 -146 7 733 557 254 85 95 chr2 19474823 19475128 -162272959 + MLT1A0 LTR MaLR 48 349 -16 7 733 644 318 139 7 chr2 19479811 19480099 -162267988 + LTR82A LTR ERVL 245 570 -302 7 733 257 152 22 0 chr2 19480455 19480501 -162267586 + RMER15 LTR ERVL 3 49 -526 7 733 2386 141 61 34 chr2 19483108 19483518 -162264569 + MTC LTR MaLR 1 421 0 7 733 443 209 0 11 chr2 19484297 19484384 -162263703 + RMER5 LTR ERV1 112 197 -337 7 733 1705 207 6 9 chr2 19484430 19484771 -162263316 + RMER5 LTR ERV1 195 534 0 7 733 719 296 50 23 chr2 19485637 19485896 -162262191 + MER68 LTR ERVL 17 282 -281 7 733 475 330 130 24 chr2 19485915 19486123 -162261964 + MER68 LTR ERVL 318 547 -16 7 733 236 255 70 20 chr2 19487769 19487869 -162260218 - LTR33 LTR ERVL -15 500 396 7 733 300 301 87 31 chr2 19487938 19488099 -162259988 - LTR33 LTR ERVL -341 174 5 7 733 348 330 111 57 chr2 19488396 19488676 -162259411 - MLT1J LTR MaLR -175 337 43 7 733 261 297 6 36 chr2 19489395 19489495 -162258592 - MTEb LTR MaLR -3 376 263 8 733 244 301 20 124 chr2 19489696 19489792 -162258295 - MTEb LTR MaLR -102 257 177 8 733 272 244 12 71 chr2 19491502 19491586 -162256501 + RLTR25B LTR ERVK 423 501 -527 8 733 1277 248 98 55 chr2 19492212 19492609 -162255478 - MTD LTR MaLR 0 419 6 8 733 2555 146 95 85 chr2 19493583 19494161 -162253926 - RLTR31A_Mm LTR ERVK 0 584 1 8 733 242 330 22 0 chr2 19494811 19494902 -162253185 - MER87 LTR ERV1 -23 518 426 8 733 1819 201 29 21 chr2 19495974 19496355 -162251732 + RLTR16 LTR ERVK 120 503 -2 8 733 261 229 134 27 chr2 19496669 19496781 -162251306 + RMER10A LTR ERVL 319 442 0 8 733 937 141 25 132 chr2 19496946 19497150 -162250937 + ORR1A2 LTR MaLR 1 182 -145 8 733 570 208 86 53 chr2 19502859 19503011 -162245076 + ORR1B2 LTR MaLR 120 276 -91 5 733 1958 200 56 69 chr2 19510548 19511116 -162236971 - RLTR31_Mm LTR ERVK 0 561 1 7 733 772 238 75 16 chr2 19511765 19511953 -162236134 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 167 9 733 873 296 160 16 chr2 19512170 19512633 -162235454 - MER21B LTR ERV1 -11 852 301 1 733 263 169 16 63 chr2 19512790 19512830 -162235257 - ORR1E LTR MaLR -3 376 338 1 733 263 169 16 63 chr2 19513308 19513330 -162234757 - ORR1E LTR MaLR -42 337 317 1 733 417 250 201 72 chr2 19513553 19513846 -162234241 - ORR1E LTR MaLR -28 331 1 1 733 351 289 87 39 chr2 19513879 19514036 -162234051 - MLT1A0 LTR MaLR -226 182 10 9 733 1356 273 98 38 chr2 19515642 19516141 -162231946 + RMER5 LTR ERV1 1 529 -5 2 733 953 274 121 30 chr2 19518076 19518415 -162229672 + MTEa LTR MaLR 2 371 -8 2 733 2168 121 11 72 chr2 19519262 19519609 -162228478 + ORR1A4 LTR MaLR 1 326 -3 2 733 2144 130 14 61 chr2 19520290 19520635 -162227452 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 3 733 591 291 146 14 chr2 19521298 19521511 -162226576 - MER21B LTR ERV1 -126 737 497 3 733 768 298 53 67 chr2 19521518 19521878 -162226209 - ORR1E LTR MaLR -4 355 1 3 733 360 290 74 78 chr2 19521878 19522065 -162226022 - MER21B LTR ERV1 -382 481 296 3 733 810 307 109 59 chr2 19522350 19522755 -162225332 - MT2A LTR ERVL -108 425 1 3 733 5091 48 12 39 chr2 19523770 19523965 -162224122 + RLTR13C2 LTR ERVK 1 195 -613 3 733 5091 75 25 47 chr2 19524109 19524665 -162223422 + RLTR13C2 LTR ERVK 196 765 -164 3 733 3431 51 5 0 chr2 19525001 19525395 -162222692 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 733 1042 275 130 109 chr2 19526048 19526209 -162221878 + RLTR13C2 LTR ERVK 766 928 -1 3 733 792 128 29 29 chr2 19526229 19526366 -162221721 - RMER20B LTR ERVK -490 137 1 4 733 362 286 60 99 chr2 19527149 19527331 -162220756 + MTEa LTR MaLR 6 180 -199 4 733 539 264 41 0 chr2 19529419 19529540 -162218547 - ORR1D1 LTR MaLR -248 126 1 4 734 698 229 58 40 chr2 19531163 19531386 -162216701 + RLTR15 LTR ERVK 2 228 -131 5 734 392 252 24 8 chr2 19531397 19531521 -162216566 + RLTR15 LTR ERVK 159 284 -75 5 734 1296 190 149 41 chr2 19531714 19532077 -162216010 - MTD LTR MaLR 0 419 18 5 734 503 277 100 32 chr2 19534345 19534565 -162213522 + RMER15 LTR ERVL 337 571 -4 5 734 2074 147 38 66 chr2 19543798 19544192 -162203895 - RLTR9A2 LTR ERVK 0 383 1 7 734 3153 131 10 4 chr2 19547086 19547570 -162200517 + RLTR1C LTR ERV1 1 487 -16 7 734 239 215 12 60 chr2 19552059 19552143 -162195944 + RLTR25A LTR ERVK 521 600 -503 8 734 271 336 66 16 chr2 19552457 19552578 -162195509 - MTEb LTR MaLR 0 379 253 8 734 1146 259 111 37 chr2 19552989 19553342 -162194745 - MTE2b LTR MaLR 0 379 1 8 734 1794 190 28 3 chr2 19553491 19553808 -162194279 + MTD LTR MaLR 1 325 -94 8 734 1132 218 93 53 chr2 19553810 19554110 -162193977 + MTD LTR MaLR 100 411 -8 8 734 267 314 131 8 chr2 19555856 19555978 -162192109 - MLT1J LTR MaLR 0 512 376 9 734 2148 149 62 36 chr2 19556000 19556384 -162191703 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 9 734 695 294 17 86 chr2 19556651 19556941 -162191146 + RMER15 LTR ERVL 257 526 -49 9 734 873 147 207 30 chr2 19556957 19556990 -162191097 + RMER4B LTR ERVK 1 38 -547 9 734 873 147 207 30 chr2 19557012 19557181 -162190906 + RMER4B LTR ERVK 39 239 -346 9 734 4158 153 68 70 chr2 19557200 19558090 -162189997 - RMER19B LTR ERVK -12 890 2 1 734 803 179 156 44 chr2 19558094 19558299 -162189788 + RMER4B LTR ERVK 239 466 0 9 734 385 312 73 46 chr2 19558607 19558825 -162189262 + MLT1F LTR MaLR 26 249 -299 1 734 389 293 145 24 chr2 19559280 19559528 -162188559 + MLT1F LTR MaLR 269 546 -2 1 734 2131 115 193 0 chr2 19562694 19563119 -162184968 + RLTR47_MM LTR ERV1 26 532 0 1 734 1505 147 50 101 chr2 19563131 19563488 -162184599 - RMER17C-int LTR ERVK -808 2430 2092 1 734 867 145 33 29 chr2 19563548 19563783 -162184304 + RMER10B LTR ERVL 1 398 0 1 734 1410 78 0 0 chr2 19564071 19564263 -162183824 - MTB LTR MaLR 0 400 209 1 734 1017 97 0 0 chr2 19564246 19564391 -162183696 + MTB LTR MaLR 256 400 0 1 734 7427 102 4 60 chr2 19564391 19565554 -162182533 + MTB-int LTR MaLR 1 1098 0 1 734 2814 72 3 0 chr2 19565554 19565945 -162182142 + MTB LTR MaLR 1 392 -8 1 734 369 303 0 11 chr2 19566068 19566158 -162181929 + ORR1E LTR MaLR 1 89 -270 1 734 2801 143 39 2 chr2 19566183 19566562 -162181525 - RLTR28B LTR ERVL -3 478 84 1 734 2801 143 39 2 chr2 19566589 19566670 -162181417 - RLTR28B LTR ERVL -398 83 2 1 734 303 191 124 0 chr2 19566671 19566760 -162181327 - MER21B LTR ERV1 -301 562 463 1 734 368 286 219 49 chr2 19569045 19569369 -162178718 + MTEa LTR MaLR 1 379 0 1 734 1571 212 86 90 chr2 19571182 19571695 -162176392 + RLTR11A LTR ERVK 1 511 -17 1 734 472 222 46 9 chr2 19572077 19572186 -162175901 + MTEb LTR MaLR 1 113 -266 1 734 619 255 37 70 chr2 19572876 19573091 -162174996 + MTEb LTR MaLR 112 319 -60 1 734 4447 118 63 11 chr2 19574796 19575515 -162172572 + RMER6A LTR ERVK 1 756 0 1 734 2983 56 67 0 chr2 19575916 19576291 -162171796 + MTB LTR MaLR 1 400 0 1 734 321 257 156 40 chr2 19582696 19582942 -162165145 + MLT1A1 LTR MaLR 75 396 -12 1 734 3899 140 103 71 chr2 19589445 19590307 -162157780 + RMER19B LTR ERVK 1 890 -12 1 734 1450 169 85 50 chr2 19590754 19591096 -162156991 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 41 1 734 981 198 4 70 chr2 19594056 19594300 -162153787 + RMER10A LTR ERVL 4 231 -211 1 734 989 172 25 45 chr2 19594315 19594558 -162153529 + RMER10A LTR ERVL 205 442 0 1 734 293 254 68 26 chr2 19598306 19598423 -162149664 - MTEa LTR MaLR -8 371 250 1 734 286 248 37 65 chr2 19598485 19598593 -162149494 - MTEa LTR MaLR -244 115 11 1 734 2040 147 189 95 chr2 19601477 19601715 -162146372 - RMER4B LTR ERVK 0 585 271 1 734 2040 147 189 95 chr2 19601746 19601992 -162146095 - RMER4B LTR ERVK -315 270 49 1 734 2040 147 189 95 chr2 19602138 19602187 -162145900 - RMER4B LTR ERVK -537 48 2 1 734 905 164 184 7 chr2 19610158 19610440 -162137647 + MTD-int LTR MaLR 927 1258 0 1 734 574 234 67 39 chr2 19610440 19610618 -162137469 + MTD LTR MaLR 1 183 -236 1 734 1000 234 176 31 chr2 19614813 19615085 -162133002 - MTD LTR MaLR -14 405 81 1 734 1000 234 176 31 chr2 19615265 19615345 -162132742 - MTD LTR MaLR -339 80 2 1 734 2553 233 61 83 chr2 19615957 19616893 -162131194 - RMER17B LTR ERVK -43 915 1 1 734 767 269 88 83 chr2 19619588 19620055 -162128032 - RLTR12B LTR ERVK -14 514 46 2 734 645 224 58 6 chr2 19620082 19620253 -162127834 - MYSERV-int LTR ERVK -2 6548 6369 2 734 827 251 9 28 chr2 19626380 19626593 -162121494 + MTE2a LTR MaLR 171 379 0 2 734 257 200 45 15 chr2 19626885 19626951 -162121136 + MLT1A0 LTR MaLR 74 141 -224 2 734 3581 18 0 0 chr2 19627132 19627528 -162120559 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 734 376 321 64 90 chr2 19627714 19627865 -162120222 + MTEa LTR MaLR 1 142 -237 2 734 376 321 64 90 chr2 19627911 19628084 -162120003 + MTEa LTR MaLR 143 319 -60 2 734 2135 209 258 7 chr2 19628084 19628673 -162119414 + RMER19A LTR ERVK 1 737 0 2 734 376 321 64 90 chr2 19628673 19628724 -162119363 + MTEa LTR MaLR 320 366 -13 2 734 1349 188 73 35 chr2 19628855 19629170 -162118917 - MTD LTR MaLR -9 410 84 2 734 340 225 49 10 chr2 19635400 19635502 -162112585 - MTD LTR MaLR -318 103 8 2 734 1702 220 19 19 chr2 19635658 19636033 -162112054 - MTEb LTR MaLR -4 375 1 2 734 448 316 118 44 chr2 19641219 19641534 -162106553 - MLT1F LTR MaLR -13 535 198 2 734 427 238 130 8 chr2 19643212 19643343 -162104744 - MER34A1 LTR ERV1 -440 147 1 2 734 585 297 77 9 chr2 19643541 19643868 -162104219 + ORR1E LTR MaLR 3 379 0 2 734 2158 118 17 8 chr2 19644122 19644480 -162103607 - ORR1B1 LTR MaLR -16 378 18 2 734 719 192 26 0 chr2 19646375 19646531 -162101556 - MTD LTR MaLR 0 419 260 2 734 466 311 60 20 chr2 19646823 19647023 -162101064 - MTD LTR MaLR -209 212 5 2 734 228 325 59 53 chr2 19648280 19648449 -162099638 - MER34A LTR ERV1 -397 174 5 2 734 1839 158 21 3 chr2 19649302 19649638 -162098449 + RMER4A LTR ERVK 4 345 -121 2 734 238 185 70 84 chr2 19649675 19649746 -162098341 + RMER4A LTR ERVK 387 456 -10 2 734 1154 183 45 4 chr2 19650958 19651205 -162096882 + MTC LTR MaLR 1 257 -164 2 734 634 187 49 74 chr2 19651254 19651368 -162096719 + MTC LTR MaLR 256 361 -60 2 734 2138 206 61 45 chr2 19651368 19651943 -162096144 - RLTR31A_Mm LTR ERVK 0 584 1 2 734 634 187 49 74 chr2 19651943 19651990 -162096097 + MTC LTR MaLR 362 413 -8 2 734 1420 184 176 40 chr2 19652526 19652849 -162095238 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 2 734 595 166 101 15 chr2 19653501 19653671 -162094416 + ORR1B2 LTR MaLR 18 205 -124 2 734 305 298 197 0 chr2 19659826 19660014 -162088073 + RMER15 LTR ERVL 347 571 -4 2 735 280 367 94 12 chr2 19667252 19667423 -162080664 + RMER15 LTR ERVL 377 561 -14 2 735 1471 203 9 69 chr2 19668773 19669107 -162078980 + MTD LTR MaLR 1 314 -105 2 735 630 216 7 61 chr2 19669109 19669257 -162078830 + MTD LTR MaLR 272 411 -8 2 735 3658 30 0 0 chr2 19670642 19671038 -162077049 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 735 675 288 20 108 chr2 19671057 19671461 -162076626 - MTEa LTR MaLR -8 371 3 2 735 838 222 65 10 chr2 19672742 19672942 -162075145 + MTEa LTR MaLR 141 351 -28 2 735 2474 175 26 0 chr2 19673409 19673826 -162074261 - MT2A LTR ERVL -78 455 28 2 735 236 180 0 39 chr2 19678438 19678490 -162069597 + MT2B2 LTR ERVL 245 294 -290 2 735 412 231 38 90 chr2 19683329 19683462 -162064625 - MTEb LTR MaLR -1 378 253 2 735 229 297 27 13 chr2 19684065 19684140 -162063947 - MTEb LTR MaLR -164 195 120 2 735 230 291 47 28 chr2 19690178 19690284 -162057803 - MER72B LTR ERV1 -381 387 280 3 735 797 235 38 43 chr2 19692553 19692720 -162055367 - MTEa LTR MaLR 0 379 216 3 735 1919 195 72 0 chr2 19692720 19693069 -162055018 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 3 735 797 254 54 91 chr2 19693069 19693216 -162054871 - MTEa LTR MaLR -164 215 4 3 735 1449 217 95 32 chr2 19693454 19693802 -162054285 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 3 735 1716 167 84 71 chr2 19694555 19694923 -162053164 - ORR1D1 LTR MaLR -1 373 1 3 735 3176 79 34 0 chr2 19697756 19698163 -162049924 + BGLII LTR ERVK 1 421 0 3 735 289 363 39 19 chr2 19700524 19700628 -162047459 - LTR16D1 LTR ERVL -236 439 334 3 735 261 263 182 0 chr2 19700692 19700791 -162047296 - MLT2F LTR ERVL -68 595 479 3 735 3187 158 105 66 chr2 19702504 19703092 -162044995 + RMER19C LTR ERVK 1 611 0 3 735 287 354 82 76 chr2 19704072 19704375 -162043712 - ORR1E LTR MaLR -46 313 9 3 735 244 383 82 95 chr2 19704525 19704561 -162043526 + MER21B LTR ERV1 133 270 -593 3 735 321 367 17 100 chr2 19704561 19704791 -162043296 + MER77 LTR ERVL 174 384 -223 3 735 244 383 82 95 chr2 19704791 19704831 -162043256 + MER21B LTR ERV1 271 434 -429 3 735 745 336 144 39 chr2 19705758 19706294 -162041793 - MER76 LTR ERVL -35 656 65 3 735 663 295 104 47 chr2 19708903 19709360 -162038727 - RMER15 LTR ERVL -5 570 1 3 735 342 235 50 36 chr2 19710304 19710443 -162037644 + MTEb LTR MaLR 225 408 0 3 735 502 286 26 37 chr2 19711788 19711977 -162036110 + RMER15-int LTR ERVL 4163 4349 -650 3 735 3658 28 2 0 chr2 19716612 19717007 -162031080 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 735 4724 28 0 0 chr2 19719310 19719811 -162028276 + RLTR1C LTR ERV1 1 501 -2 3 735 357 342 124 7 chr2 19726561 19726714 -162021373 - LTR16A LTR ERVL -29 422 252 3 735 4744 171 31 68 chr2 19726714 19727637 -162020450 + RMER19B LTR ERVK 1 889 -13 3 735 283 234 12 72 chr2 19737461 19737544 -162010543 + MTEb LTR MaLR 1 78 -301 3 735 320 359 94 97 chr2 19738676 19738975 -162009112 - ORR1E LTR MaLR -61 298 1 3 735 1198 275 32 47 chr2 19744710 19745123 -162002964 - MTE2a LTR MaLR 0 419 8 3 735 339 164 0 0 chr2 19746881 19746936 -162001151 + MTD LTR MaLR 21 75 -346 3 735 1652 206 74 35 chr2 19752410 19752787 -161995300 + MTD LTR MaLR 28 419 0 3 735 802 287 30 93 chr2 19754107 19754514 -161993573 - RLTR26 LTR ERVK -226 416 1 4 735 3809 200 80 8 chr2 19755115 19755519 -161992568 + RMER19B LTR ERVK 110 534 -368 4 735 3914 55 39 2 chr2 19755519 19756013 -161992074 - RLTR1B LTR ERV1 0 512 1 4 735 3809 200 80 8 chr2 19756013 19756348 -161991739 + RMER19B LTR ERVK 535 901 -1 4 735 1562 266 48 2 chr2 19757635 19758034 -161990053 - MTD LTR MaLR -2 417 1 4 735 347 335 84 33 chr2 19767182 19767395 -161980692 - ORR1E LTR MaLR -40 319 96 4 735 328 284 101 69 chr2 19767417 19767576 -161980511 - MTEb LTR MaLR -215 164 1 4 735 403 314 42 76 chr2 19770030 19770448 -161977639 - MLT1C LTR MaLR -2 465 3 4 735 516 242 0 0 chr2 19773588 19773683 -161974404 + MTE2b LTR MaLR 1 95 -284 4 735 322 298 0 37 chr2 19773683 19773696 -161974391 + MT2A LTR ERVL 1 104 -429 4 735 2384 214 13 40 chr2 19773702 19774223 -161973864 - RLTR20A1 LTR ERVK 0 551 45 4 735 670 261 17 28 chr2 19774505 19774686 -161973401 + MTE2b LTR MaLR 201 379 0 4 735 2052 192 49 12 chr2 19787841 19788247 -161959840 - MTC LTR MaLR 0 421 1 4 735 989 235 165 0 chr2 19791054 19791309 -161956778 - ORR1D1 LTR MaLR -77 297 1 4 736 1737 243 56 43 chr2 19804566 19805030 -161943057 + RMER19C LTR ERVK 142 611 0 4 736 1540 165 128 21 chr2 19805498 19805837 -161942250 + RMER19A LTR ERVK 1 438 -299 4 736 1649 240 69 137 chr2 19810177 19810833 -161937254 - RMER19C LTR ERVK 0 611 1 4 736 1441 269 56 28 chr2 19811655 19812015 -161936072 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 4 736 1246 253 104 31 chr2 19819121 19819504 -161928583 - MTD LTR MaLR -2 417 7 5 736 719 284 109 66 chr2 19821135 19821482 -161926605 - MLT1A0 LTR MaLR -3 362 1 5 736 2176 146 9 0 chr2 19833685 19834007 -161914080 - ORR1A3 LTR MaLR -1 325 1 5 736 11796 135 53 19 chr2 19834007 19835905 -161912182 - ORR1A3-int LTR MaLR 0 1963 1 5 736 1893 142 38 6 chr2 19835909 19836235 -161911852 - ORR1A3 LTR MaLR -8 319 11 5 736 2537 99 11 35 chr2 19836445 19836811 -161911276 - IAPEY2_LTR LTR ERVK 0 357 1 5 736 411 323 97 15 chr2 19852859 19853054 -161895033 + MLT1D LTR MaLR 7 217 -288 5 736 434 317 85 51 chr2 19853074 19853327 -161894760 + MLT1D LTR MaLR 1 496 -9 5 736 262 155 92 66 chr2 19853642 19853718 -161894369 + MLT1D LTR MaLR 289 366 -13 5 736 3716 25 2 0 chr2 19854285 19854680 -161893407 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 736 651 120 16 86 chr2 19854806 19854934 -161893153 + RMER4A LTR ERVK 345 463 -3 5 736 1784 174 82 25 chr2 19863960 19864325 -161883762 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 1 5 736 2010 186 31 0 chr2 19869759 19870114 -161877973 - ORR1D1 LTR MaLR -3 371 6 5 736 1335 256 100 22 chr2 19871385 19871744 -161876343 - MTD LTR MaLR -14 405 19 5 736 638 217 14 21 chr2 19872381 19872522 -161875565 + MTD LTR MaLR 266 405 -14 5 736 3708 20 2 0 chr2 19874271 19874666 -161873421 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 736 2483 121 8 55 chr2 19883698 19884083 -161864004 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 5 736 312 303 9 44 chr2 19895013 19895127 -161852960 - MLT2B4 LTR ERVL -226 188 79 6 736 359 216 29 21 chr2 19895288 19895402 -161852685 - MLT2B4 LTR ERVL -358 106 1 6 736 607 278 128 46 chr2 19896738 19897093 -161850994 - MTD LTR MaLR -5 374 18 6 736 5592 86 23 41 chr2 19899549 19900454 -161847633 - RMER17D LTR ERVK 0 889 1 6 736 1545 43 0 0 chr2 19904923 19905109 -161842978 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 290 6 736 2053 55 4 6 chr2 19905044 19905340 -161842747 - MTA_Mm LTR MaLR -106 301 16 6 736 260 275 86 12 chr2 19910957 19911038 -161837049 + MTA_Mm LTR MaLR 18 104 -292 6 736 4724 187 122 1 chr2 19919455 19920441 -161827646 - MERVL_2A-int LTR ERVL -1091 4670 3567 6 736 662 194 69 31 chr2 19920588 19920724 -161827363 - MERVL_2A-int LTR ERVL -2195 3566 3424 6 736 780 169 93 0 chr2 19920720 19920903 -161827184 - MERVL_2A-int LTR ERVL -5026 735 536 6 736 1787 188 3 9 chr2 19921130 19921479 -161826608 - MERVL_2A-int LTR ERVL -5232 529 183 6 736 253 143 48 0 chr2 19922399 19922441 -161825646 - MT2A LTR ERVL -331 202 159 6 736 259 203 29 72 chr2 19922660 19922729 -161825358 - MT2A LTR ERVL -283 318 253 6 736 446 243 57 119 chr2 19922710 19922869 -161825218 - MT2A LTR ERVL -384 149 1 6 737 255 309 15 0 chr2 19934989 19935057 -161813030 - ORR1A4 LTR MaLR -223 106 38 6 737 1354 237 129 16 chr2 19935448 19935812 -161812275 - MTD LTR MaLR -14 405 1 6 737 299 339 60 18 chr2 19937363 19937531 -161810556 - MER89 LTR ERV1 -253 306 132 6 737 1234 209 54 26 chr2 19948578 19948927 -161799160 - RLTR10D LTR ERVK 0 359 1 6 737 369 206 130 9 chr2 19952886 19952994 -161795093 - MLT1B LTR MaLR -257 133 13 6 737 267 400 76 72 chr2 19955666 19955957 -161792130 + LTR16A LTR ERVL 19 310 -141 6 737 4419 12 2 0 chr2 19960194 19960686 -161787401 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 7 737 302 0 0 0 chr2 19960686 19960724 -161787363 - MERVL-int LTR ERVL 0 5485 5448 7 737 390 167 46 35 chr2 19960724 19960811 -161787276 - ORR1A3-int LTR MaLR -1323 640 553 7 737 45277 15 6 0 chr2 19960811 19966137 -161781950 - MERVL-int LTR ERVL -125 5360 1 7 737 4419 12 2 0 chr2 19966137 19966629 -161781458 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 7 737 653 102 119 5 chr2 19987284 19987423 -161760664 + ORR1A4 LTR MaLR 194 386 -8 7 737 706 348 5 0 chr2 19988974 19989175 -161758912 + MTE-int LTR MaLR 825 1026 -554 7 737 242 350 8 57 chr2 19989577 19989701 -161758386 - RMER12 LTR ERVK -471 851 734 7 737 245 288 121 55 chr2 19992712 19992877 -161755210 - MTEa LTR MaLR 0 379 204 7 737 482 376 86 16 chr2 19995367 19995797 -161752290 + MLT1J LTR MaLR 1 460 -52 7 737 268 261 142 47 chr2 19997620 19997873 -161750214 - ORR1C2 LTR MaLR -12 372 96 7 737 398 331 74 44 chr2 20001614 20001922 -161746165 - MLT1E3 LTR MaLR -112 512 216 3 737 253 372 34 14 chr2 20007572 20007719 -161740368 - MER21B LTR ERV1 -285 578 429 1 737 373 326 72 21 chr2 20010600 20010794 -161737293 - MER21B LTR ERV1 -638 225 22 1 737 423 303 73 85 chr2 20011903 20012281 -161735806 + MLT1A0 LTR MaLR 1 360 -48 1 737 356 304 83 131 chr2 20012490 20012509 -161735578 + MLT1A0 LTR MaLR 361 379 -29 1 737 236 238 0 31 chr2 20012494 20012559 -161735528 + MLT1A0 LTR MaLR 297 359 -6 1 737 1597 163 209 0 chr2 20015029 20015355 -161732732 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 2 737 1557 203 35 22 chr2 20015360 20015673 -161732414 + MTD LTR MaLR 1 317 -102 2 737 1447 224 108 13 chr2 20016433 20016813 -161731274 - MTD LTR MaLR -1 418 3 2 737 967 302 71 14 chr2 20016822 20017188 -161730899 + MLT1B LTR MaLR 1 387 -3 2 737 2037 139 74 29 chr2 20017454 20017831 -161730256 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 2 737 543 129 24 0 chr2 20018947 20019032 -161729055 - ORR1B1 LTR MaLR -305 89 3 3 737 352 318 41 100 chr2 20019811 20020080 -161728007 - ORR1E LTR MaLR -10 349 97 3 737 424 342 30 66 chr2 20020967 20021164 -161726923 - ORR1E LTR MaLR -169 190 1 3 737 2012 232 22 5 chr2 20023330 20023741 -161724346 + MTD LTR MaLR 1 418 -1 4 737 372 289 86 61 chr2 20023855 20024106 -161723981 + ORR1E LTR MaLR 67 362 -17 4 737 318 345 69 43 chr2 20027884 20028117 -161719970 + MLT1A1 LTR MaLR 170 408 0 4 737 2120 189 102 22 chr2 20030943 20031036 -161717051 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 104 -423 5 737 2120 189 102 22 chr2 20031350 20031744 -161716343 + RLTR11A2 LTR ERVK 105 526 -1 5 737 3096 53 8 8 chr2 20037886 20038282 -161709805 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 737 470 311 29 29 chr2 20048283 20048455 -161699632 + MER57C2 LTR ERV1 244 415 -19 6 738 1100 190 57 156 chr2 20055500 20055955 -161692132 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 7 738 3021 68 25 75 chr2 20056269 20056711 -161691376 - BGLII LTR ERVK 0 421 2 7 738 751 269 184 37 chr2 20057214 20057535 -161690552 + ORR1D2 LTR MaLR 1 368 -2 7 738 886 256 60 56 chr2 20057791 20058026 -161690061 + RLTR11A2 LTR ERVK 3 229 -298 8 738 886 256 60 56 chr2 20058213 20058246 -161689841 + RLTR11A2 LTR ERVK 230 271 -256 8 738 1780 148 122 111 chr2 20058757 20059182 -161688905 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 1 8 738 3273 86 31 16 chr2 20064253 20064737 -161683350 - MT2B2 LTR ERVL -93 491 1 9 738 3935 162 17 218 chr2 20077869 20078968 -161669119 + RMER19B LTR ERVK 3 884 -18 1 738 3935 162 17 218 chr2 20079154 20079181 -161668906 + RMER19B LTR ERVK 885 902 0 1 738 1835 142 18 62 chr2 20079642 20079979 -161668108 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 1 738 2555 175 187 23 chr2 20079982 20080507 -161667580 + RMER19C LTR ERVK 1 611 0 1 738 378 247 134 40 chr2 20082773 20082975 -161665112 - MLT1I LTR MaLR -190 221 1 1 738 609 256 163 81 chr2 20082997 20083178 -161664909 - MTD LTR MaLR 0 379 155 1 738 609 259 165 26 chr2 20083204 20083375 -161664712 - MTD LTR MaLR -229 190 4 1 738 815 343 42 92 chr2 20084300 20084444 -161663643 - MT2A LTR ERVL -71 462 326 1 738 815 343 42 92 chr2 20084672 20085003 -161663084 - MT2A LTR ERVL -208 325 11 1 738 266 238 70 87 chr2 20085006 20085121 -161662966 + ORR1E LTR MaLR 98 210 -149 1 738 253 209 243 19 chr2 20085506 20085613 -161662474 + ORR1E LTR MaLR 249 379 0 1 738 1049 286 9 67 chr2 20087689 20088004 -161660083 - ORR1E LTR MaLR 0 359 63 1 738 1043 271 103 29 chr2 20090952 20091301 -161656786 - MTE2b LTR MaLR -2 377 3 1 738 1246 254 45 14 chr2 20091326 20091685 -161656402 - RMER5 LTR ERV1 -131 403 34 1 738 749 352 50 100 chr2 20093258 20093778 -161654309 - MTEa-int LTR MaLR -610 970 494 1 738 1542 224 75 6 chr2 20093798 20094131 -161653956 - ORR1D2 LTR MaLR -12 358 3 1 738 1356 259 99 15 chr2 20094143 20094535 -161653552 - MTEa-int LTR MaLR -1127 453 29 1 738 307 208 183 29 chr2 20094589 20094693 -161653394 - MTEa LTR MaLR -10 369 250 1 738 1842 134 49 62 chr2 20095014 20095339 -161652748 + ORR1A4 LTR MaLR 1 321 -8 1 738 3029 93 12 8 chr2 20098083 20098484 -161649603 - RLTR9D LTR ERVK 0 403 1 1 738 250 125 41 20 chr2 20098485 20098534 -161649553 - ETnERV2-int LTR ERVK -2 7404 7355 1 738 9529 153 61 42 chr2 20098534 20101065 -161647022 - ETnERV2-int LTR ERVK -1812 5432 3432 1 738 3360 133 27 8 chr2 20101033 20101555 -161646532 - ETnERV2-int LTR ERVK -4379 3027 2496 1 738 3009 91 12 8 chr2 20102195 20102596 -161645491 - RLTR9D LTR ERVK 0 403 1 1 738 2667 26 2 265 chr2 20105938 20106467 -161641620 + RLTR10 LTR ERVK 1 390 0 1 738 17315 25 10 3 chr2 20106468 20108454 -161639633 + RLTR10-int LTR ERVK 9 1984 -3 1 738 2253 28 2 288 chr2 20108456 20109002 -161639085 + RLTR10 LTR ERVK 1 390 0 1 738 2900 34 61 0 chr2 20110811 20111137 -161636950 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 1 738 3205 60 14 0 chr2 20114753 20115168 -161632919 - BGLII LTR ERVK 0 421 1 1 738 2253 136 42 6 chr2 20115891 20116246 -161631841 + MTC LTR MaLR 34 401 -20 1 738 710 355 112 22 chr2 20119010 20119422 -161628665 + MER21B LTR ERV1 8 456 -407 1 738 284 226 82 12 chr2 20120030 20120115 -161627972 + MER21B LTR ERV1 628 718 -145 1 738 308 192 38 25 chr2 20120574 20120654 -161627433 - MTD LTR MaLR -12 367 287 1 738 273 232 0 68 chr2 20120866 20120940 -161627147 - MLT1A LTR MaLR -282 92 24 1 738 618 262 30 18 chr2 20120943 20121110 -161626977 - MTD LTR MaLR -245 174 6 1 738 449 328 117 20 chr2 20128222 20128418 -161619669 - LTR33 LTR ERVL -300 215 1 1 738 286 279 63 119 chr2 20129007 20129265 -161618822 + ORR1E LTR MaLR 48 295 -64 1 738 2662 9 43 0 chr2 20129443 20129767 -161618320 - ORR1A0 LTR MaLR -8 338 1 1 738 3816 142 35 55 chr2 20131070 20131776 -161616311 + RLTR17 LTR ERVK 1 692 0 1 738 679 313 98 40 chr2 20132734 20133110 -161614977 + MLT1C LTR MaLR 66 463 -4 1 738 2114 101 0 71 chr2 20133779 20134131 -161613956 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 1 738 1021 251 12 8 chr2 20149256 20149497 -161598590 + ORR1E LTR MaLR 3 244 -115 1 738 881 264 21 45 chr2 20155977 20156219 -161591868 - ORR1D2 LTR MaLR -134 236 1 2 738 380 242 0 92 chr2 20158652 20158761 -161589326 - ORR1D2 LTR MaLR -211 159 61 2 738 390 295 32 65 chr2 20159708 20159893 -161588194 + RMER15 LTR ERVL 90 268 -307 2 738 3569 190 69 73 chr2 20159896 20160679 -161587408 + RMER19B LTR ERVK 1 780 -122 2 738 1015 213 24 55 chr2 20160672 20160925 -161587162 + RMER15 LTR ERVL 328 572 -3 2 738 1676 152 149 17 chr2 20161213 20161561 -161586526 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 2 738 371 198 60 116 chr2 20161654 20161804 -161586283 - MER34 LTR ERV1 0 622 376 2 738 1300 180 74 12 chr2 20164003 20164261 -161583826 - ORR1D1 LTR MaLR -98 276 3 2 738 1002 270 63 63 chr2 20172712 20173091 -161574996 + MTEb LTR MaLR 1 379 0 2 738 1633 232 83 10 chr2 20174606 20174993 -161573094 - MTD LTR MaLR -2 417 3 2 738 1054 195 47 18 chr2 20175273 20175574 -161572513 - RMER20B LTR ERVK -41 586 224 2 738 2809 96 81 50 chr2 20175576 20176035 -161572052 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK -2 473 1 2 738 26000 14 3 0 chr2 20176035 20178882 -161569205 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 3625 2 738 1479 54 16 5 chr2 20178873 20179058 -161569029 - IAPEz-int LTR ERVK -2711 4969 4783 2 738 1861 115 4 4 chr2 20179053 20179315 -161568772 - IAPEz-int LTR ERVK -5183 2497 2236 2 738 446 66 0 32 chr2 20179304 20179367 -161568720 - IAPEz-int LTR ERVK -5062 1419 1359 2 738 3536 62 20 12 chr2 20179367 20180091 -161567996 - IAPEz-int LTR ERVK -5819 662 7 2 738 2823 94 81 50 chr2 20180092 20180551 -161567536 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK -2 473 1 2 738 1114 180 71 0 chr2 20180551 20180762 -161567325 - RMER20B LTR ERVK -398 229 4 2 739 386 328 46 15 chr2 20188162 20188357 -161559730 - MLT1H-int LTR MaLR -1119 290 90 2 739 276 209 14 56 chr2 20189778 20189849 -161558238 - MT2B LTR ERVL -337 264 197 2 739 516 325 161 28 chr2 20190962 20191352 -161556735 - MER34 LTR ERV1 -81 461 20 2 739 1418 217 73 58 chr2 20193648 20194023 -161554064 + ORR1C2 LTR MaLR 6 368 -16 2 739 1799 214 50 11 chr2 20195327 20195687 -161552400 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 2 739 1375 256 43 24 chr2 20204423 20204795 -161543292 - MTE2a LTR MaLR 0 379 1 2 739 668 216 191 20 chr2 20204853 20205138 -161542949 - MTD LTR MaLR 0 419 6 2 739 763 264 55 32 chr2 20205902 20206254 -161541833 - MTD LTR MaLR -15 404 1 2 739 305 299 137 99 chr2 20209766 20210108 -161537979 + ORR1E LTR MaLR 1 355 -4 2 739 391 281 200 105 chr2 20212211 20212515 -161535572 - ORR1E LTR MaLR -9 370 7 2 739 227 299 0 79 chr2 20219659 20219786 -161528301 - MLT1J1 LTR MaLR -3 445 329 2 739 259 355 61 68 chr2 20219833 20219996 -161528091 - MLT1J1 LTR MaLR -247 197 36 2 739 235 316 40 50 chr2 20221313 20221413 -161526674 - RLTR17 LTR ERVK -257 435 337 2 739 444 268 101 37 chr2 20221421 20221638 -161526449 - RLTR16 LTR ERVK -243 262 32 2 739 919 257 166 15 chr2 20233715 20233980 -161514107 - MTEb LTR MaLR 0 379 75 3 739 408 269 9 19 chr2 20238543 20238649 -161509438 + MTC LTR MaLR 1 105 -316 3 739 631 272 164 31 chr2 20241253 20241545 -161506542 + ORR1E LTR MaLR 29 359 0 3 739 3504 166 88 16 chr2 20243181 20243886 -161504201 + RMER6A LTR ERVK 1 756 0 3 739 625 182 80 19 chr2 20247074 20247236 -161500851 - RMER6A LTR ERVK -333 423 252 3 739 2100 187 60 5 chr2 20263278 20263676 -161484411 - MTC LTR MaLR 0 421 2 3 739 369 129 0 0 chr2 20264902 20264959 -161483128 - RMER17C LTR ERVK -356 54 4 3 739 302 317 90 16 chr2 20272259 20272381 -161475706 - MTEb LTR MaLR -11 368 238 3 739 233 268 144 0 chr2 20272418 20272515 -161475572 - MTEb LTR MaLR -243 116 6 3 739 834 262 153 21 chr2 20272916 20273250 -161474837 - MTEb LTR MaLR -1 378 1 3 739 767 217 36 26 chr2 20274918 20275090 -161472997 + MTEb LTR MaLR 6 183 -196 3 739 767 217 36 26 chr2 20275341 20275362 -161472725 + MTEb LTR MaLR 184 200 -179 3 739 761 266 94 0 chr2 20275386 20275589 -161472498 + MTEb LTR MaLR 158 379 0 3 739 1581 163 42 82 chr2 20276152 20276579 -161471508 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 3 739 656 255 157 61 chr2 20277592 20277872 -161470215 - MTEa LTR MaLR -68 311 5 3 739 424 240 214 21 chr2 20277878 20278065 -161470022 - MTEa-int LTR MaLR -2 1578 1356 3 739 2480 288 71 7 chr2 20278608 20279355 -161468732 - MTEa-int LTR MaLR -238 1342 548 3 739 2344 158 78 6 chr2 20279518 20279995 -161468092 - RLTR28 LTR ERVL -13 511 1 3 739 2779 156 62 15 chr2 20280612 20281147 -161466940 + RMER15 LTR ERVL 12 571 -4 3 739 321 208 112 20 chr2 20281476 20281574 -161466513 + RLTR23 LTR ERV1 324 430 0 3 739 4366 138 29 19 chr2 20287010 20287758 -161460329 - RMER6A LTR ERVK 0 756 1 4 739 1540 135 4 4 chr2 20288746 20288992 -161459095 - MTC LTR MaLR 0 421 176 4 739 1109 121 11 0 chr2 20288996 20289186 -161458901 - MTC-int LTR MaLR 0 1258 1067 4 739 3900 196 22 14 chr2 20289705 20290555 -161457532 - MTC-int LTR MaLR -195 1063 207 4 739 1367 184 81 7 chr2 20290559 20290717 -161457370 - MTC LTR MaLR -103 318 151 4 739 1367 184 81 7 chr2 20290928 20291065 -161457022 - MTC LTR MaLR -271 150 1 4 739 272 328 92 72 chr2 20297343 20297747 -161450340 - RMER10A LTR ERVL -19 423 12 4 739 750 245 81 91 chr2 20297982 20298278 -161449809 - MTEa LTR MaLR -8 371 79 4 739 231 307 0 81 chr2 20300362 20300486 -161447601 + MLT1A1 LTR MaLR 1 114 -294 4 739 1928 153 19 90 chr2 20301882 20302305 -161445782 - RLTR9C LTR ERVK 0 393 1 4 739 2937 64 201 9 chr2 20302746 20303174 -161444913 - RLTR1B LTR ERV1 -2 510 1 4 739 68566 16 0 1 chr2 20303174 20310731 -161437356 - MMERGLN-int LTR ERV1 0 7556 1 4 739 2979 61 200 9 chr2 20310731 20311161 -161436926 - RLTR1B LTR ERV1 0 512 1 4 739 1124 184 47 80 chr2 20313487 20313788 -161434299 + RMER10A LTR ERVL 8 298 -144 4 739 859 143 137 38 chr2 20313809 20314020 -161434067 + RMER10A LTR ERVL 211 442 0 4 739 1907 182 6 156 chr2 20314402 20314897 -161433190 + MTC LTR MaLR 1 421 0 4 740 960 217 220 53 chr2 20321146 20321633 -161426454 - RMER20B LTR ERVK -38 589 29 4 740 592 310 0 42 chr2 20322243 20322455 -161425632 + ORR1C1 LTR MaLR 1 203 -167 4 740 950 231 13 54 chr2 20322444 20322742 -161425345 + ORR1C1-int LTR MaLR 366 651 -719 4 740 1081 223 85 7 chr2 20324625 20324919 -161423168 + ORR1C1 LTR MaLR 62 378 0 4 740 269 322 87 55 chr2 20342755 20343008 -161405079 + LTR78 LTR ERV1 2 262 -1042 4 740 321 337 154 17 chr2 20343465 20343815 -161404272 + LTR78 LTR ERV1 846 1243 -61 4 740 3167 49 21 0 chr2 20344704 20345092 -161402995 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 740 7818 68 9 72 chr2 20345092 20346263 -161401824 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 4 740 3013 45 59 0 chr2 20346263 20346637 -161401450 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 740 8178 67 3 69 chr2 20346637 20347812 -161400275 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 4 740 3311 38 8 2 chr2 20347812 20348206 -161399881 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 740 4554 12 0 0 chr2 20348452 20348945 -161399142 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 4 740 321 0 0 0 chr2 20348945 20348983 -161399104 - MERVL-int LTR ERVL 0 5485 5448 4 740 344 179 46 35 chr2 20348983 20349070 -161399017 - ORR1A3-int LTR MaLR -1323 640 553 4 740 48396 15 6 0 chr2 20349070 20354396 -161393691 - MERVL-int LTR ERVL -125 5360 1 4 740 4554 12 0 0 chr2 20354396 20354889 -161393198 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 4 740 324 176 12 86 chr2 20359174 20359255 -161388832 + MT2B LTR ERVL 166 240 -361 4 740 519 336 92 4 chr2 20363965 20364216 -161383871 + MLT1A0 LTR MaLR 42 314 -51 4 740 226 135 0 88 chr2 20365004 20365061 -161383026 - MER57C2 LTR ERV1 -5 429 378 5 740 333 198 0 87 chr2 20368435 20368541 -161379546 - MLT1A0 LTR MaLR -50 358 252 5 740 2439 170 56 20 chr2 20369327 20369830 -161378257 - RLTR12B LTR ERVK -7 521 1 5 740 2512 152 15 45 chr2 20370112 20370296 -161377791 - RLTR20B1 LTR ERVK -108 455 290 5 740 2512 152 15 45 chr2 20370766 20371050 -161377037 - RLTR20B1 LTR ERVK -274 289 1 5 740 2093 115 203 30 chr2 20371189 20371583 -161376504 + RMER4A LTR ERVK 1 462 -4 5 740 800 330 69 63 chr2 20378122 20378643 -161369444 + MER74A LTR ERVL 32 555 -3 5 740 907 306 66 51 chr2 20381411 20382176 -161365911 - ORR1E LTR MaLR -19 550 1 5 740 240 240 62 104 chr2 20384345 20384489 -161363598 - MLT1A0 LTR MaLR -227 138 1 5 740 317 281 102 70 chr2 20389180 20389436 -161358651 - MLT1A LTR MaLR -25 349 86 5 740 1100 261 46 89 chr2 20394974 20395275 -161352812 - MTD LTR MaLR 0 419 115 5 740 1100 261 46 89 chr2 20395321 20395457 -161352630 - MTD LTR MaLR -305 114 1 5 740 1536 138 0 0 chr2 20396095 20396341 -161351746 - RLTR14 LTR ERV1 -131 251 6 5 740 318 328 78 28 chr2 20397507 20397686 -161350401 + MLT1C LTR MaLR 34 221 -169 5 740 430 202 32 11 chr2 20397919 20398014 -161350073 + MLT1C LTR MaLR 371 467 0 5 740 619 285 172 36 chr2 20400241 20400659 -161347428 - MER34A LTR ERV1 -79 492 18 5 740 1107 238 119 24 chr2 20401429 20401757 -161346330 + MTE2b LTR MaLR 1 359 -20 5 740 263 241 0 0 chr2 20404128 20404186 -161343901 + MTE2b LTR MaLR 312 369 -1 5 740 226 315 85 85 chr2 20412163 20412399 -161335688 - ORR1E LTR MaLR -105 254 19 5 740 1550 151 79 44 chr2 20415275 20415615 -161332472 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 16 6 740 404 235 64 68 chr2 20418934 20419153 -161328934 - RLTR15 LTR ERVK -95 264 47 6 740 324 68 0 0 chr2 20419385 20419429 -161328658 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 44 -278 6 740 18348 30 0 3 chr2 20419429 20421862 -161326225 - MMETn-int LTR ERVK -2561 2283 1 6 740 2122 73 28 16 chr2 20421862 20422180 -161325907 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 6 740 417 200 97 79 chr2 20423512 20423535 -161324552 + MTD LTR MaLR 1 17 -402 6 740 1779 192 70 32 chr2 20423535 20423938 -161324149 - MTD LTR MaLR -1 418 1 6 740 417 200 97 79 chr2 20423938 20424016 -161324071 + MTD LTR MaLR 18 104 -315 6 740 2534 143 78 62 chr2 20424016 20424567 -161323520 + RLTR20B2 LTR ERVK 1 560 0 6 740 380 306 184 26 chr2 20424567 20424663 -161323424 + MTD LTR MaLR 102 207 -212 6 740 380 306 184 26 chr2 20424800 20424974 -161323113 + MTD LTR MaLR 208 415 -4 6 740 554 281 132 13 chr2 20426415 20426649 -161321438 - RMER15 LTR ERVL -14 561 300 6 740 254 217 128 35 chr2 20427003 20427089 -161320998 + MLT1A1 LTR MaLR 1 94 -314 6 740 305 223 39 49 chr2 20427276 20427398 -161320689 + MLT1A1 LTR MaLR 270 408 0 6 740 252 253 75 12 chr2 20429673 20429704 -161318383 - MTE-int LTR MaLR -763 817 782 6 740 2399 141 53 14 chr2 20429704 20430136 -161317951 - RMER15 LTR ERVL 0 575 127 6 740 1372 161 33 74 chr2 20431302 20431638 -161316449 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 6 740 2848 85 28 5 chr2 20434395 20434784 -161313303 + MTB LTR MaLR 1 398 -2 6 741 478 179 0 0 chr2 20452377 20452461 -161295626 + RLTR28 LTR ERVL 1 84 -440 6 741 3114 130 28 42 chr2 20452669 20452934 -161295153 + RLTR28 LTR ERVL 1 263 -261 6 741 3114 130 28 42 chr2 20453082 20453345 -161294742 + RLTR28 LTR ERVL 264 522 -2 6 741 1370 268 92 22 chr2 20459126 20459584 -161288503 + RLTR16 LTR ERVK 2 491 -14 6 741 497 153 214 9 chr2 20460250 20460362 -161287725 + RLTR9E LTR ERVK 159 293 -116 7 741 2168 126 43 91 chr2 20461898 20462079 -161286008 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 196 7 741 2168 126 43 91 chr2 20462226 20462438 -161285649 - ORR1C1 LTR MaLR -183 195 4 7 741 749 240 91 0 chr2 20465642 20465850 -161282237 - MLT2C2 LTR ERVL -234 230 4 7 741 527 316 92 30 chr2 20466961 20467297 -161280790 - ORR1E LTR MaLR -2 357 1 7 741 272 298 53 0 chr2 20495934 20496028 -161252059 - MLT2B3 LTR ERVL -454 100 2 7 741 1414 179 206 84 chr2 20496835 20496977 -161251110 + MT2A LTR ERVL 1 117 -416 7 741 2755 144 107 30 chr2 20496977 20497520 -161250567 + RMER4B LTR ERVK 1 585 0 7 741 1414 179 206 84 chr2 20497520 20497852 -161250235 + MT2A LTR ERVL 118 533 0 7 741 1185 271 62 38 chr2 20498133 20498501 -161249586 - MTEa LTR MaLR 0 379 3 7 741 415 297 101 124 chr2 20502655 20503043 -161245044 - MTEa LTR MaLR 0 379 1 9 741 786 281 100 26 chr2 20503985 20504335 -161243752 - MTEa LTR MaLR -3 376 1 1 741 2062 195 3 5 chr2 20510186 20510567 -161237520 - RLTR14 LTR ERV1 0 382 3 2 741 535 299 55 86 chr2 20513646 20513747 -161234340 - ORR1E LTR MaLR -3 356 251 3 741 3614 31 28 14 chr2 20513747 20514177 -161233910 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 3 741 535 299 55 86 chr2 20514177 20514437 -161233650 - ORR1E LTR MaLR -109 250 6 3 741 972 179 41 5 chr2 20516376 20516573 -161231514 - RMER10B LTR ERVL -1 397 194 3 741 1122 199 4 40 chr2 20516591 20516864 -161231223 - RMER10B LTR ERVL -134 264 2 3 741 2862 16 0 0 chr2 20517521 20517843 -161230244 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 3 741 325 276 110 86 chr2 20518361 20518743 -161229344 - LTR48 LTR ERV1 -41 746 147 3 741 278 219 122 0 chr2 20518804 20518886 -161229201 - LTR48 LTR ERV1 -661 126 35 3 741 1371 174 30 3 chr2 20523054 20523506 -161224581 - RLTR12A LTR ERVK -55 513 1 5 741 2383 98 159 0 chr2 20526948 20527357 -161220730 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 2 5 741 287 204 28 75 chr2 20529914 20529931 -161218156 - MT2B LTR ERVL -348 253 153 6 741 600 257 109 74 chr2 20533578 20533889 -161214198 + ORR1D2 LTR MaLR 49 370 0 7 741 2264 139 87 15 chr2 20538870 20539263 -161208824 + MTC LTR MaLR 1 421 0 8 741 396 284 18 0 chr2 20542794 20542903 -161205184 - MTD LTR MaLR -232 187 77 9 741 557 90 56 0 chr2 20543044 20543133 -161204954 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 291 9 741 225 143 24 0 chr2 20543212 20543254 -161204833 + MT2A LTR ERVL 1 43 -490 9 741 285 189 145 26 chr2 20543219 20543295 -161204792 + MTC LTR MaLR 8 92 -329 9 741 299 295 110 77 chr2 20553445 20553717 -161194370 - ORR1E LTR MaLR 0 359 79 1 741 716 79 84 14 chr2 20556369 20556511 -161191576 - RMER17B LTR ERVK -495 463 312 1 741 464 304 13 7 chr2 20560031 20560180 -161187907 - MLT1A0 LTR MaLR -211 154 5 1 741 1711 215 55 5 chr2 20560525 20560909 -161187178 - MTD LTR MaLR -13 406 4 1 741 590 248 151 15 chr2 20563453 20563658 -161184429 - RMER15 LTR ERVL -40 535 303 1 741 2007 118 25 13 chr2 20572530 20572848 -161175239 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 1 741 2368 150 92 15 chr2 20573205 20573686 -161174401 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 518 -9 1 741 351 125 0 0 chr2 20573715 20573771 -161174316 - RLTR11A2 LTR ERVK -471 56 1 1 742 228 130 43 0 chr2 20583028 20583074 -161165013 + MTC LTR MaLR 289 336 -85 1 742 2451 172 9 17 chr2 20584306 20584726 -161163361 + MTC LTR MaLR 1 417 -4 1 742 2095 130 31 3 chr2 20589595 20589912 -161158175 + ORR1A3 LTR MaLR 1 326 0 1 742 4449 66 3 14 chr2 20589976 20590546 -161157541 + LTRIS2 LTR ERV1 1 564 0 1 742 380 247 155 23 chr2 20590824 20590998 -161157089 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 250 1 742 225 85 208 21 chr2 20591039 20591087 -161157000 - RLTR41 LTR ERV1 -299 147 91 1 742 868 244 92 57 chr2 20591604 20591921 -161156166 - ORR1E LTR MaLR -5 354 27 1 742 293 149 78 39 chr2 20594286 20594363 -161153724 + RLTR25B LTR ERVK 430 509 -519 1 742 343 266 161 49 chr2 20596678 20596840 -161151247 + MTE2a LTR MaLR 199 378 -1 1 742 447 233 116 8 chr2 20599665 20599786 -161148301 + MLT1B LTR MaLR 42 175 -215 2 742 332 337 186 25 chr2 20604916 20605190 -161142897 - MLT1I LTR MaLR -19 392 75 2 742 790 199 90 93 chr2 20611845 20612189 -161135898 - RLTR15 LTR ERVK -16 343 1 2 742 927 261 48 106 chr2 20613583 20614038 -161134049 - RMER10A LTR ERVL 0 442 14 2 742 660 310 123 15 chr2 20625094 20625418 -161122669 + MTEa LTR MaLR 5 363 -16 2 742 1153 257 28 54 chr2 20629817 20630171 -161117916 - ORR1E LTR MaLR -11 348 4 2 742 645 290 50 44 chr2 20637670 20637991 -161110096 - BGLII_B LTR ERVK -27 414 92 2 742 587 272 106 68 chr2 20664655 20664947 -161083140 - MLT1D LTR MaLR -152 353 51 3 742 1010 250 102 33 chr2 20667484 20667819 -161080268 - ORR1E LTR MaLR -1 358 1 3 742 1068 151 143 25 chr2 20668715 20668953 -161079134 - MTD LTR MaLR 0 419 154 3 742 1900 100 100 6 chr2 20691712 20692043 -161056044 - ORR1B2 LTR MaLR -5 362 1 3 742 1247 198 167 6 chr2 20695257 20695592 -161052495 - MTD LTR MaLR 0 419 31 3 742 1732 194 46 28 chr2 20707681 20708073 -161040014 - MTD LTR MaLR 0 419 21 3 743 230 273 15 15 chr2 20711320 20711387 -161036700 - MER31B LTR ERV1 -393 73 7 3 743 1633 136 4 14 chr2 20711993 20712269 -161035818 - RLTR16 LTR ERVK 0 505 233 3 743 839 171 44 63 chr2 20718347 20718553 -161029534 - RLTR16 LTR ERVK -303 202 1 3 743 2786 98 8 5 chr2 20718695 20719094 -161028993 - MTB LTR MaLR 0 400 1 3 743 3198 44 8 0 chr2 20737261 20737646 -161010441 - RLTR10 LTR ERVK -2 388 1 3 743 337 239 158 79 chr2 20738295 20738472 -161009615 + MLT1A0 LTR MaLR 45 235 -130 4 743 469 304 119 42 chr2 20739087 20739398 -161008689 - MLT1F2 LTR MaLR -2 652 261 4 743 5123 131 39 100 chr2 20739604 20740565 -161007522 + RMER19B LTR ERVK 1 902 0 4 743 1671 196 78 14 chr2 20741252 20741636 -161006451 - MTD LTR MaLR -14 405 10 4 743 1874 154 41 14 chr2 20742009 20742371 -161005716 - RMER6A LTR ERVK 0 756 385 4 743 1137 184 56 28 chr2 20742425 20742476 -161005611 - RMER6A LTR ERVK -278 412 355 4 743 2039 144 25 19 chr2 20743086 20743453 -161004634 - RMER6A LTR ERVK -387 369 1 4 743 1052 275 184 3 chr2 20744676 20745019 -161003068 + MTD LTR MaLR 1 405 -14 4 743 3007 133 7 4 chr2 20745389 20745849 -161002238 - RMER6B LTR ERVK 0 461 1 4 743 3433 33 3 0 chr2 20749208 20749600 -160998487 + MTA_Mm LTR MaLR 1 393 -3 4 743 3156 59 5 15 chr2 20753861 20754272 -160993815 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 4 743 1801 145 227 10 chr2 20761669 20762052 -160986035 - RMER4A LTR ERVK 0 466 1 4 743 3198 56 2 8 chr2 20766322 20766720 -160981367 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 743 6577 62 56 178 chr2 20766720 20767971 -160980116 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 4 743 3164 61 2 8 chr2 20767971 20768369 -160979718 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 743 600 261 193 36 chr2 20773957 20774231 -160973856 + MTD LTR MaLR 95 411 -8 4 743 1716 242 30 106 chr2 20789848 20790385 -160957702 + RLTR18B LTR ERVK 16 511 -1 4 743 2352 102 38 0 chr2 20800522 20800836 -160947251 + ORR1A3 LTR MaLR 1 326 0 4 743 482 223 65 24 chr2 20800883 20801007 -160947080 - RMER15 LTR ERVL -102 473 345 4 743 1366 185 103 45 chr2 20815962 20816274 -160931813 - MTD LTR MaLR -42 377 48 5 743 2205 137 9 6 chr2 20818817 20819140 -160928947 + ORR1A3 LTR MaLR 1 324 -2 5 743 2425 136 121 0 chr2 20825457 20825905 -160922182 + RLTR28 LTR ERVL 17 518 -6 5 744 553 186 9 26 chr2 20847380 20847496 -160900591 + ORR1D2 LTR MaLR 257 370 0 5 744 491 144 0 35 chr2 20850809 20850895 -160897192 + RMER15 LTR ERVL 1 83 -492 5 744 768 106 173 8 chr2 20850898 20851031 -160897056 + ORR1A2 LTR MaLR 122 276 -51 5 744 2174 149 62 108 chr2 20851037 20851565 -160896522 + RMER15 LTR ERVL 70 573 -2 5 744 881 100 15 15 chr2 20854222 20854354 -160893733 + ORR1A2 LTR MaLR 195 326 -1 5 744 1093 200 122 46 chr2 20854729 20855033 -160893054 - MTD LTR MaLR -86 333 7 5 744 1025 288 121 34 chr2 20858071 20858567 -160889520 + MER68 LTR ERVL 8 546 -17 5 744 983 257 31 56 chr2 20858582 20858903 -160889184 + MLT1F2 LTR MaLR 13 325 -235 5 744 486 282 87 93 chr2 20866607 20866939 -160881148 + ORR1D2 LTR MaLR 1 330 -40 6 744 248 149 21 21 chr2 20867097 20867145 -160880942 + ORR1D2 LTR MaLR 314 361 -9 6 744 370 231 39 87 chr2 20873225 20873329 -160874758 + MT2B LTR ERVL 159 257 -344 6 744 1306 214 138 26 chr2 20881548 20881889 -160866198 + MTEb LTR MaLR 1 379 0 6 744 3299 149 36 4 chr2 20897882 20898439 -160849648 - RMER15 LTR ERVL 0 575 1 6 744 250 299 9 45 chr2 20901331 20901404 -160846683 - MTEb LTR MaLR -14 365 297 6 744 2904 130 19 25 chr2 20901404 20901917 -160846170 + RLTR28 LTR ERVL 1 510 -14 6 744 404 333 117 0 chr2 20907736 20907916 -160840171 + MLT1H LTR MaLR 9 209 -340 7 744 652 293 128 65 chr2 20908020 20908341 -160839746 + MLT1H LTR MaLR 207 547 -2 7 744 1038 188 209 25 chr2 20913098 20913414 -160834673 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 7 744 2088 239 103 87 chr2 20913414 20913531 -160834556 - ORR1D1-int LTR MaLR 0 1370 1259 7 744 2088 239 103 87 chr2 20913678 20913829 -160834258 - ORR1D1-int LTR MaLR -112 1258 1101 7 744 2088 239 103 87 chr2 20913974 20914414 -160833673 - ORR1D1-int LTR MaLR -270 1100 650 7 744 340 250 177 7 chr2 20914687 20914828 -160833259 - ORR1D1-int LTR MaLR -747 623 459 7 744 323 120 0 0 chr2 20915468 20915518 -160832569 + MTD LTR MaLR 370 419 0 7 744 321 259 0 12 chr2 20915879 20915965 -160832122 + ORR1E LTR MaLR 1 85 -274 7 744 227 313 83 12 chr2 20926164 20926248 -160821839 + MamGypLTR1c LTR Gypsy 609 698 -105 7 744 238 125 0 0 chr2 20926352 20926392 -160821695 + MT2A LTR ERVL 494 533 0 7 744 706 257 51 38 chr2 20926735 20926970 -160821117 - MTEa LTR MaLR -139 240 3 7 744 1722 295 117 68 chr2 20927088 20927149 -160820938 - MTE-int LTR MaLR -66 1514 1455 7 744 3859 98 135 66 chr2 20927149 20927904 -160820183 - RMER17D2 LTR ERVK -2 807 1 7 744 1722 295 117 68 chr2 20927904 20928316 -160819771 - MTE-int LTR MaLR -126 1454 1053 7 744 1722 295 117 68 chr2 20928502 20929053 -160819034 - MTE-int LTR MaLR -528 1052 439 7 744 1426 277 49 0 chr2 20929352 20929800 -160818287 - MTE-int LTR MaLR -1110 470 1 7 744 846 257 121 4 chr2 20930494 20930767 -160817320 - MTEb LTR MaLR -74 305 1 7 744 225 250 23 81 chr2 20935438 20935525 -160812562 + MLT1A1 LTR MaLR 311 392 -16 7 744 531 309 136 0 chr2 20935550 20935786 -160812301 + MLT1A0 LTR MaLR 93 360 -5 7 744 278 281 22 0 chr2 20935791 20935880 -160812207 - MLT1B LTR MaLR -280 110 20 7 744 1750 204 47 8 chr2 20939462 20939863 -160808224 - MTD LTR MaLR -2 417 1 7 744 1619 167 122 0 chr2 20947506 20947842 -160800245 - ORR1C2 LTR MaLR -7 377 1 8 744 847 277 14 18 chr2 20948964 20949181 -160798906 - MTD LTR MaLR 0 419 204 8 744 3632 130 28 9 chr2 20954077 20954651 -160793436 - RMER4B LTR ERVK 0 585 1 8 744 583 294 152 20 chr2 20959337 20959587 -160788500 - MTEa LTR MaLR -96 283 1 8 744 388 62 0 0 chr2 20959799 20959847 -160788240 - MERVL_2A-int LTR ERVL -2291 3470 3423 8 744 1712 201 115 0 chr2 20959899 20960283 -160787804 - MERVL_2A-int LTR ERVL -2428 3333 2906 8 744 1750 180 43 3 chr2 20960318 20960663 -160787424 + MTC LTR MaLR 1 359 -62 8 744 304 232 280 7 chr2 20961046 20961189 -160786898 + MLT1G3 LTR MaLR 189 370 -209 8 744 482 146 1 21 chr2 20961558 20961657 -160786430 - MTC LTR MaLR 0 421 321 8 744 2153 116 24 3 chr2 20962015 20962352 -160785735 + ORR1B2 LTR MaLR 16 359 -8 8 744 1906 149 37 0 chr2 20962356 20962679 -160785408 - MTC LTR MaLR -86 335 1 8 744 745 221 343 11 chr2 20964118 20964401 -160783686 + MTE2a LTR MaLR 3 379 0 8 744 371 185 0 120 chr2 20969148 20969240 -160778847 - MT2B LTR ERVL -354 247 167 8 745 365 266 69 101 chr2 20977434 20977813 -160770274 + MTEa LTR MaLR 1 419 0 8 745 2092 131 17 3 chr2 20979192 20979544 -160768543 - ORR1B1 LTR MaLR -37 357 1 8 745 237 224 49 63 chr2 20981259 20981402 -160766685 + RMER17A LTR ERVK 329 469 -282 8 745 300 271 284 81 chr2 20984586 20984930 -160763157 - RLTR11B LTR ERVK -27 414 1 8 745 379 176 8 177 chr2 20990472 20990596 -160757491 - MT2B LTR ERVL -344 257 155 8 745 643 261 135 35 chr2 20993930 20994160 -160753927 + MLT1A0 LTR MaLR 113 365 0 8 745 289 300 132 48 chr2 20995595 20995784 -160752303 + ORR1E LTR MaLR 28 239 -120 8 745 2966 20 48 3 chr2 20996568 20996919 -160751168 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 8 745 26981 24 33 1 chr2 20996919 21000000 -160748087 + IAPEz-int LTR ERVK 8 3188 -3293 8 745 29841 18 1 1 chr2 21000000 21003295 -160744792 + IAPEz-int LTR ERVK 3189 6481 0 1 745 2966 20 48 3 chr2 21003295 21003646 -160744441 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 1 745 843 255 29 33 chr2 21004145 21004421 -160743666 + MLT1E1A LTR MaLR 406 680 0 4 745 256 282 136 8 chr2 21008438 21008570 -160739517 - RMER15 LTR ERVL -5 570 422 1 745 232 211 223 10 chr2 21009266 21009386 -160738701 + MLT1A1 LTR MaLR 196 384 -24 1 745 1911 157 114 3 chr2 21020952 21021330 -160726757 + MTC LTR MaLR 2 421 0 3 745 4035 158 92 92 chr2 21025647 21026549 -160721538 - RMER19B LTR ERVK 0 902 1 3 745 1723 162 75 20 chr2 21027345 21027691 -160720396 + ORR1B2 LTR MaLR 3 367 0 4 745 246 257 92 58 chr2 21029086 21029206 -160718881 - MLT1L LTR MaLR -135 475 352 4 745 1069 221 121 16 chr2 21031911 21032274 -160715813 + MTD LTR MaLR 5 405 -14 5 745 294 287 11 11 chr2 21037366 21037454 -160710633 + MTE2b LTR MaLR 1 88 -291 6 745 399 260 134 63 chr2 21037554 21037856 -160710231 - ORR1E LTR MaLR -17 362 15 6 745 1099 242 147 45 chr2 21040215 21040595 -160707492 + MTD LTR MaLR 1 419 0 6 745 238 345 76 15 chr2 21040872 21041070 -160707017 + MLT1E1A LTR MaLR 421 673 -7 7 745 1328 196 146 47 chr2 21041970 21042333 -160705754 + MTD LTR MaLR 13 411 -8 7 745 2689 162 131 2 chr2 21044984 21045502 -160702585 - RMER4B LTR ERVK 0 585 1 7 745 568 214 93 0 chr2 21048124 21048209 -160699878 - RLTR20C LTR ERVK 0 578 481 8 745 568 214 93 0 chr2 21048255 21048309 -160699778 - RLTR20C LTR ERVK -98 480 427 8 745 1032 198 104 64 chr2 21048312 21048609 -160699478 - RLTR20C LTR ERVK -224 310 2 8 745 460 172 23 11 chr2 21054700 21054788 -160693299 + RodERV21-int LTR ERV1 1665 1753 -3238 9 745 3885 257 24 33 chr2 21055182 21056173 -160691914 + RodERV21-int LTR ERV1 1737 2718 -2273 9 745 679 336 20 36 chr2 21056295 21056792 -160691295 + RodERV21-int LTR ERV1 3586 4074 -3017 9 745 350 254 32 16 chr2 21057752 21057876 -160690211 + RodERV21-int LTR ERV1 4979 5104 -1987 9 745 409 315 24 15 chr2 21058314 21058677 -160689410 + RodERV21-int LTR ERV1 5675 5772 -1319 9 745 3490 317 35 31 chr2 21059481 21060916 -160687171 + RodERV21-int LTR ERV1 3355 4796 -195 9 745 2141 32 0 0 chr2 21061827 21062079 -160686008 - RLTR10-int LTR ERVK -1695 292 41 1 745 2753 33 2 206 chr2 21062091 21062581 -160685506 - RLTR10 LTR ERVK 0 390 1 1 745 288 283 39 29 chr2 21071298 21071400 -160676687 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 103 -424 1 745 468 304 40 69 chr2 21071392 21071668 -160676419 + BGLII_B LTR ERVK 147 414 -27 1 745 1263 239 113 10 chr2 21073411 21073808 -160674279 - RMER5 LTR ERV1 -53 481 44 1 745 821 228 16 0 chr2 21073809 21073993 -160674094 - MTD LTR MaLR -232 187 1 1 745 715 246 133 49 chr2 21076139 21076485 -160671602 + MTEa LTR MaLR 5 379 0 1 745 1867 196 41 99 chr2 21076537 21077070 -160671017 - RLTR18B LTR ERVK -4 508 7 1 745 240 304 76 48 chr2 21078211 21078356 -160669731 + ORR1E LTR MaLR 1 149 -210 1 745 486 257 174 110 chr2 21078741 21079069 -160669018 - ORR1E LTR MaLR -10 349 1 1 745 851 254 118 14 chr2 21079069 21079221 -160668866 - MTE-int LTR MaLR -53 1527 1343 1 745 851 254 118 14 chr2 21079267 21079375 -160668712 - MTE-int LTR MaLR -238 1342 1239 1 745 1709 287 103 138 chr2 21079552 21080061 -160668026 - MTE-int LTR MaLR -300 1280 731 1 745 1709 287 103 138 chr2 21080081 21080445 -160667642 - MTE-int LTR MaLR -850 730 380 1 745 1709 287 103 138 chr2 21080484 21080927 -160667160 - MTE-int LTR MaLR -1201 379 9 1 745 396 281 53 103 chr2 21080972 21081234 -160666853 - ORR1E LTR MaLR -70 289 41 1 745 1832 152 49 6 chr2 21083803 21084147 -160663940 - RLTR15 LTR ERVK 0 359 1 1 745 1947 158 86 35 chr2 21087223 21087656 -160660431 + RMER4A LTR ERVK 1 455 -11 1 745 3571 40 28 5 chr2 21090292 21090718 -160657369 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 1 745 244 345 19 70 chr2 21090773 21090862 -160657225 + MLT1J-int LTR MaLR 207 289 -1098 1 745 2163 183 90 14 chr2 21090862 21091295 -160656792 - RMER4A LTR ERVK 0 466 1 1 745 244 345 19 70 chr2 21091295 21091361 -160656726 + MLT1J-int LTR MaLR 290 354 -1033 1 745 1350 203 75 3 chr2 21093165 21093472 -160654615 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 46 1 745 1493 218 31 37 chr2 21093539 21093615 -160654472 - RLTR16 LTR ERVK -12 493 410 1 745 1493 218 31 37 chr2 21093657 21093961 -160654126 - RLTR16 LTR ERVK -96 409 116 1 745 256 125 0 0 chr2 21094283 21094323 -160653764 + RLTR16 LTR ERVK 1 40 -465 1 745 1844 164 168 5 chr2 21094321 21094707 -160653380 + RMER4B LTR ERVK 107 555 -30 1 745 2957 92 13 0 chr2 21096153 21096545 -160651542 - MTB LTR MaLR 0 400 4 1 745 1660 239 121 79 chr2 21096999 21097893 -160650194 - RMER17B LTR ERVK -43 915 2 1 745 410 209 38 9 chr2 21098056 21098162 -160649925 - RMER10A LTR ERVL -331 111 3 1 745 2353 135 19 16 chr2 21098318 21098694 -160649393 + ORR1C1 LTR MaLR 1 377 -1 1 745 947 163 114 26 chr2 21100076 21100340 -160647747 + RMER10A LTR ERVL 151 437 -5 1 746 1999 196 32 15 chr2 21113684 21114094 -160633993 + MTD LTR MaLR 3 419 0 2 746 2371 169 5 11 chr2 21117038 21117420 -160630667 - RLTR14 LTR ERV1 0 382 3 2 746 363 304 29 15 chr2 21117508 21117645 -160630442 + MLT1B LTR MaLR 7 145 -245 2 746 1544 155 65 8 chr2 21130201 21130783 -160617304 - RMER17B LTR ERVK 0 958 1 2 746 308 367 11 34 chr2 21139107 21139282 -160608805 - MLT1H LTR MaLR -312 237 67 2 746 266 221 13 117 chr2 21143407 21143484 -160604603 + MTEa LTR MaLR 11 79 -300 2 746 348 289 24 32 chr2 21143584 21143709 -160604378 + MTEa LTR MaLR 256 379 0 2 746 1034 139 239 0 chr2 21144668 21144869 -160603218 - MTC LTR MaLR -54 367 119 2 746 304 275 0 21 chr2 21145055 21145148 -160602939 - MTEb LTR MaLR -14 365 275 2 746 3321 52 7 17 chr2 21145603 21146018 -160602069 - RLTR10A LTR ERVK 0 411 1 2 746 2453 113 3 15 chr2 21146983 21147314 -160600773 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 2 746 2095 124 17 14 chr2 21148109 21148453 -160599634 + RLTR15 LTR ERVK 15 359 0 2 746 2155 117 14 74 chr2 21149922 21150272 -160597815 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 2 746 3547 83 8 48 chr2 21151140 21151635 -160596452 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 475 0 2 746 2176 201 28 186 chr2 21162946 21163672 -160584415 - RMER19C LTR ERVK 0 611 1 2 746 3626 33 2 0 chr2 21164286 21164681 -160583406 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 746 961 152 6 0 chr2 21167633 21167797 -160580290 + RLTR9A LTR ERVK 204 368 0 3 746 1800 184 230 44 chr2 21175927 21176432 -160571655 - RMER19C LTR ERVK -12 599 1 3 746 301 256 61 15 chr2 21179364 21179495 -160568592 - MTEa LTR MaLR 0 379 243 3 746 631 222 15 7 chr2 21198092 21198228 -160549859 + MTD LTR MaLR 199 335 -84 3 746 528 181 235 43 chr2 21199731 21199893 -160548194 - ORR1D1 LTR MaLR -5 379 187 3 746 3199 67 0 37 chr2 21208780 21209217 -160538870 + BGLII LTR ERVK 1 421 0 3 746 913 267 202 6 chr2 21215791 21216108 -160531979 + MTE2b LTR MaLR 1 379 0 3 746 896 256 41 71 chr2 21220249 21220642 -160527445 + MTE2b LTR MaLR 4 363 -16 3 747 803 301 149 17 chr2 21235621 21235976 -160512111 - MLT2B1 LTR ERVL -9 511 110 3 747 1466 174 162 18 chr2 21237394 21237721 -160510366 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 3 747 2039 226 22 15 chr2 21239832 21240240 -160507847 - MTD LTR MaLR -8 411 1 4 747 1705 197 31 0 chr2 21240240 21240552 -160507535 - MTD LTR MaLR -95 324 3 4 747 473 313 109 104 chr2 21243257 21243642 -160504445 + MLT1B LTR MaLR 2 388 -2 4 747 654 290 96 21 chr2 21243883 21244159 -160503928 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 73 4 747 2052 76 3 35 chr2 21244173 21244459 -160503628 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 43 4 747 788 235 26 16 chr2 21244503 21244693 -160503394 - RLTR18B LTR ERVK -131 381 190 4 747 381 228 51 29 chr2 21244762 21244937 -160503150 - ORR1E LTR MaLR -223 161 1 4 747 268 266 89 0 chr2 21245730 21245809 -160502278 - LTR16C LTR ERVL -326 163 78 4 747 667 263 87 95 chr2 21245916 21246029 -160502058 - ORR1E LTR MaLR 0 359 241 4 747 3276 83 43 24 chr2 21246029 21246495 -160501592 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 4 747 667 263 87 95 chr2 21246495 21246738 -160501349 - ORR1E LTR MaLR -119 240 6 4 747 2637 107 94 77 chr2 21252016 21252483 -160495604 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 4 747 258 311 77 11 chr2 21261830 21261921 -160486166 + MamGypLTR1c LTR Gypsy 312 408 -395 4 747 310 299 158 61 chr2 21267898 21268094 -160479993 - MLT1A LTR MaLR -76 298 84 4 747 403 284 48 27 chr2 21270473 21270623 -160477464 + MTEb LTR MaLR 205 366 -13 4 747 2549 98 3 15 chr2 21271831 21272162 -160475925 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 4 747 1957 217 52 171 chr2 21277522 21278212 -160469875 + RMER19C LTR ERVK 1 608 -3 4 747 2152 191 19 12 chr2 21286580 21286998 -160461089 + MTC LTR MaLR 1 421 0 4 747 257 310 131 121 chr2 21287326 21287343 -160460744 + MLT1A1 LTR MaLR 6 25 -383 4 747 3375 35 2 0 chr2 21287343 21287738 -160460349 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 747 257 310 131 121 chr2 21287738 21287953 -160460134 + MLT1A1 LTR MaLR 26 210 -198 4 747 257 310 131 121 chr2 21288018 21288180 -160459907 + MLT1A1 LTR MaLR 211 405 -3 4 747 279 311 34 80 chr2 21298651 21298826 -160449261 - RLTR40 LTR ERVK -569 248 82 5 747 532 277 100 19 chr2 21302716 21302926 -160445161 - LTR40c LTR ERVL -195 270 44 5 747 1075 251 137 26 chr2 21311978 21312329 -160435758 + MLT1B LTR MaLR 1 390 0 5 747 3284 99 115 14 chr2 21312713 21313225 -160434862 - LTRIS2 LTR ERV1 0 564 1 5 747 781 309 126 43 chr2 21313564 21314024 -160434063 - MLT1F-int LTR MaLR -129 1360 863 5 747 287 312 26 0 chr2 21314716 21314793 -160433294 - MLT1F-int LTR MaLR -648 841 763 5 747 258 291 34 23 chr2 21314923 21315011 -160433076 - MLT1F-int LTR MaLR -955 454 366 5 747 1665 227 54 31 chr2 21317764 21318155 -160429932 + MTD LTR MaLR 7 406 -13 5 747 1468 239 72 35 chr2 21319748 21320136 -160427951 - MTD LTR MaLR 0 419 21 5 747 1468 239 72 35 chr2 21320186 21320201 -160427886 - MTD LTR MaLR -399 20 3 5 747 1594 222 56 107 chr2 21330442 21330779 -160417308 + RMER19B LTR ERVK 357 667 -235 5 747 1594 222 56 107 chr2 21331168 21331399 -160416688 + RMER19B LTR ERVK 668 896 -6 5 747 1454 224 21 136 chr2 21335352 21335822 -160412265 + MTD LTR MaLR 1 416 -3 5 747 1699 146 152 15 chr2 21344930 21345271 -160402816 + ORR1B1 LTR MaLR 7 394 0 5 747 991 291 150 16 chr2 21350871 21351364 -160396723 - MLT1E1A LTR MaLR -49 631 73 5 747 699 158 90 8 chr2 21354677 21354811 -160393276 - RMER17C LTR ERVK -29 381 237 5 747 328 371 99 79 chr2 21356280 21356584 -160391503 + MLT1H1 LTR MaLR 60 369 -186 5 748 1225 269 6 4 chr2 21369037 21369375 -160378712 + MTD LTR MaLR 1 419 0 6 748 1347 117 206 8 chr2 21377890 21378157 -160369930 - RLTR9A2 LTR ERVK -63 320 1 6 748 2041 105 127 25 chr2 21382208 21382569 -160365518 - RLTR9E LTR ERVK -6 403 6 6 748 260 374 29 51 chr2 21386154 21386292 -160361795 - LTR16A1 LTR ERVL -247 209 75 6 748 278 140 0 39 chr2 21387091 21387143 -160360944 - MT2A LTR ERVL 0 584 535 6 748 1314 208 55 55 chr2 21387206 21387628 -160360459 - MT2A LTR ERVL -47 554 1 6 748 2990 190 90 5 chr2 21388777 21389402 -160358685 - RLTR33 LTR ERVK 0 678 1 6 748 2944 59 20 10 chr2 21390944 21391339 -160356748 - MTB LTR MaLR 0 400 2 6 748 351 310 71 85 chr2 21396172 21396454 -160351633 - MLT1D LTR MaLR -227 278 1 6 748 250 275 0 99 chr2 21400287 21400388 -160347699 - RMER15 LTR ERVL -156 419 329 6 748 2280 64 135 11 chr2 21401755 21402102 -160345985 - RLTR10 LTR ERVK 0 390 1 6 748 3267 28 23 0 chr2 21406165 21406552 -160341535 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 748 316 274 211 0 chr2 21418365 21418460 -160329627 + ORR1E LTR MaLR 3 117 -242 6 748 2088 86 27 30 chr2 21418461 21418798 -160329289 - RLTR9A LTR ERVK 0 368 33 6 748 292 328 70 79 chr2 21419905 21420126 -160327961 + RLTR25B LTR ERVK 2 234 -869 6 748 591 336 59 51 chr2 21421749 21422103 -160325984 + ORR1E LTR MaLR 1 357 -2 6 748 622 279 56 82 chr2 21431754 21432059 -160316028 + ORR1E LTR MaLR 28 324 -35 6 748 705 344 104 34 chr2 21438220 21438660 -160309427 - MLT1D LTR MaLR -29 476 6 7 748 2271 228 42 40 chr2 21444109 21444726 -160303361 - RLTR1 LTR ERV1 -4 620 3 7 748 324 299 69 49 chr2 21447780 21447924 -160300163 - LTR55 LTR ERV -274 274 128 7 748 316 333 0 55 chr2 21454043 21454170 -160293917 + RMER10B LTR ERVL 272 391 -7 7 748 4335 121 54 27 chr2 21455406 21456185 -160291902 + RLTR13D1 LTR ERVK 1 800 -6 7 748 377 292 38 34 chr2 21459614 21459823 -160288264 + RMER15 LTR ERVL 359 568 -7 7 748 1499 164 30 19 chr2 21466638 21466905 -160281182 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 98 7 748 1405 168 15 7 chr2 21466906 21467289 -160280798 + RLTR12B LTR ERVK 1 502 -26 7 748 271 294 95 34 chr2 21471918 21472066 -160276021 - LTRIS_Mus LTR ERV1 -49 538 382 7 748 413 213 0 0 chr2 21472708 21472796 -160275291 - ORR1B2 LTR MaLR -283 84 3 7 748 4900 186 105 131 chr2 21472798 21474347 -160273740 - ORR1B2-int LTR MaLR 0 1509 2 7 748 1836 156 96 6 chr2 21474347 21474681 -160273406 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 3 7 748 510 301 93 27 chr2 21475425 21475661 -160272426 - MLT1E1A LTR MaLR -43 637 331 7 748 236 309 59 47 chr2 21475790 21475875 -160272212 - MLT1E1A LTR MaLR -575 105 20 7 748 314 318 98 51 chr2 21476534 21476789 -160271298 + MLT1E1 LTR MaLR 310 576 -78 7 748 2113 208 32 5 chr2 21493937 21494347 -160253740 + MTC LTR MaLR 1 421 0 7 749 1915 138 18 59 chr2 21497200 21497540 -160250547 + ORR1A3 LTR MaLR 1 326 0 7 749 486 330 74 26 chr2 21515476 21515706 -160232381 - ORR1E LTR MaLR -118 241 1 7 749 2808 27 0 0 chr2 21533838 21534176 -160213911 - ORR1A0 LTR MaLR -8 338 1 2 749 2862 32 21 0 chr2 21539869 21540208 -160207879 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 2 749 285 288 120 27 chr2 21542806 21542956 -160205131 - RMER15 LTR ERVL -2 573 410 2 749 707 178 31 25 chr2 21545668 21545831 -160202256 - ORR1D2 LTR MaLR -10 360 150 3 749 293 243 88 66 chr2 21546596 21546617 -160201470 - ORR1D2 LTR MaLR -178 149 130 3 749 861 242 41 14 chr2 21553299 21553517 -160194570 - ORR1D2 LTR MaLR -145 225 2 3 749 1402 288 48 18 chr2 21553579 21553972 -160194115 - MTD LTR MaLR -14 405 1 3 749 362 272 61 0 chr2 21553972 21554065 -160194022 - RMER15 LTR ERVL -203 372 273 2 749 702 305 71 13 chr2 21586528 21586754 -160161333 - MTD LTR MaLR -169 250 12 6 749 838 327 69 23 chr2 21589442 21589874 -160158213 - MER54A LTR ERVL -449 452 1 6 749 2017 156 18 18 chr2 21591600 21591939 -160156148 - RMER20A LTR ERVK -177 339 1 6 749 2549 133 26 3 chr2 21592075 21592460 -160155627 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 6 749 872 209 41 0 chr2 21592654 21592826 -160155261 + RMER20A LTR ERVK 338 516 0 6 749 699 296 114 18 chr2 21593050 21593322 -160154765 + MLT1A0 LTR MaLR 68 365 0 6 749 629 295 48 138 chr2 21596713 21596765 -160151322 - RMER5 LTR ERV1 0 534 485 7 749 629 295 48 138 chr2 21597224 21597752 -160150335 - RMER5 LTR ERV1 -50 484 6 7 749 245 175 52 17 chr2 21598766 21598824 -160149263 + MTEb LTR MaLR 296 355 -24 7 749 2444 335 36 42 chr2 21611436 21614088 -160133999 - MMERGLN-int LTR ERV1 -3664 3892 1254 1 749 314 345 18 0 chr2 21614763 21614931 -160133156 - MMERGLN-int LTR ERV1 -6741 815 645 1 749 2941 65 26 3 chr2 21616587 21616974 -160131113 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 749 291 297 0 99 chr2 21617489 21617590 -160130497 - MTEa LTR MaLR -286 93 3 1 749 2667 124 28 73 chr2 21617685 21618190 -160129897 - RLTR45 LTR ERVK 0 482 1 1 749 308 311 38 0 chr2 21620345 21620451 -160127636 - MLT1I LTR MaLR -26 385 276 1 749 264 307 27 0 chr2 21620482 21620557 -160127530 - MLT1I LTR MaLR -199 212 136 1 93 609 330 121 37 chr2 21626360 21626938 -160121149 - MER76 LTR ERVL -2 689 1 1 750 2902 63 53 0 chr2 21627752 21628131 -160119956 - MTB LTR MaLR -1 399 1 1 750 358 312 77 71 chr2 21630281 21630450 -160117637 - LTR41B LTR ERVL -195 563 394 1 750 582 335 56 44 chr2 21639142 21639463 -160108624 + ORR1E LTR MaLR 9 333 -26 1 750 488 95 0 0 chr2 21640101 21640175 -160107912 - MT-int LTR MaLR -71 1027 954 1 750 488 95 0 0 chr2 21640941 21641015 -160107072 + MT-int LTR MaLR 954 1027 -71 1 750 582 335 56 44 chr2 21641653 21641974 -160106113 - ORR1E LTR MaLR -26 333 9 1 750 291 263 58 39 chr2 21650916 21651019 -160097068 - MTEa LTR MaLR -2 377 273 1 750 410 332 92 35 chr2 21651263 21651491 -160096596 - MTE-int LTR MaLR -41 1539 1299 1 750 372 323 133 60 chr2 21651627 21651927 -160096160 + MLT1E3 LTR MaLR 273 594 -30 1 750 2142 174 20 18 chr2 21661206 21661599 -160086488 - RMER4A LTR ERVK -9 457 64 1 750 1440 236 85 18 chr2 21668545 21668934 -160079153 + MTD LTR MaLR 5 419 0 1 750 1275 269 61 31 chr2 21670905 21671296 -160076791 - MTD LTR MaLR -16 403 1 1 750 2720 157 8 45 chr2 21675437 21675944 -160072143 + RMER19B LTR ERVK 1 488 -414 1 750 1614 143 184 19 chr2 21685995 21686359 -160061728 + RLTR13D1 LTR ERVK 276 699 -107 1 750 2383 197 17 143 chr2 21687147 21687846 -160060241 - RMER19C LTR ERVK 0 611 1 1 750 4344 122 89 65 chr2 21687846 21688786 -160059301 - MurERV4_19-int LTR ERVK 0 5780 4818 1 750 3343 125 18 68 chr2 21688793 21688852 -160059235 - MurERV4_19-int LTR ERVK -2297 3483 3428 1 750 3343 125 18 68 chr2 21689039 21689642 -160058445 - MurERV4_19-int LTR ERVK -2353 3427 2854 1 750 228 184 76 67 chr2 21691839 21691944 -160056143 + RLTR25B LTR ERVK 397 502 -526 1 750 306 309 32 32 chr2 21692374 21692531 -160055556 + MER57C2 LTR ERV1 270 426 -8 1 750 243 254 0 0 chr2 21694282 21694341 -160053746 - RLTR12B LTR ERVK -458 70 12 1 750 1986 146 82 11 chr2 21702650 21703016 -160045071 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 3 2 750 2060 136 23 41 chr2 21705320 21705710 -160042377 - RLTR9A2 LTR ERVK 0 383 1 2 750 253 259 62 20 chr2 21728209 21728355 -160019732 - MER57D LTR ERV1 -6 405 254 2 750 676 289 94 66 chr2 21745228 21745587 -160002500 - MTE2a LTR MaLR -17 404 43 2 750 237 353 81 32 chr2 21746863 21746986 -160001101 + LTR81B LTR ERV1? 982 1110 -283 2 750 3248 52 3 0 chr2 21754305 21754689 -159993398 - IAPEY_LTR LTR ERVK 0 385 1 2 750 20787 47 3 6 chr2 21754689 21757408 -159990679 - IAPEy-int LTR ERVK 0 7513 4804 2 93 4913 181 47 3 chr2 21757408 21758414 -159989673 - IAPEY3-int LTR ERVK -6630 1050 1 2 751 3023 52 46 0 chr2 21758414 21758782 -159989305 - IAPEY_LTR LTR ERVK 0 385 1 2 751 5498 97 19 20 chr2 21759447 21760256 -159987831 - RLTR13C2 LTR ERVK 0 808 1 2 751 371 329 98 114 chr2 21765225 21765612 -159982475 + MLT1J-int LTR MaLR 102 453 -934 2 751 998 269 110 13 chr2 21775164 21775473 -159972614 + ORR1E LTR MaLR 6 344 -15 2 751 695 324 66 42 chr2 21780251 21780821 -159967266 + ERVL-E-int LTR ERVL 176 730 -4937 2 751 262 346 37 0 chr2 21781085 21781192 -159966895 - MLT2B2 LTR ERVL -385 130 20 2 751 305 277 48 87 chr2 21781098 21781201 -159966886 - MTEa LTR MaLR -270 109 11 2 751 3430 39 15 0 chr2 21788450 21788840 -159959247 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 751 920 292 40 83 chr2 21790453 21790849 -159957238 - MTEa LTR MaLR 0 379 1 3 751 1760 235 47 128 chr2 21797507 21797831 -159950256 + RMER17B LTR ERVK 1 311 -647 3 751 6714 125 29 26 chr2 21797831 21798847 -159949240 - RLTR13D5 LTR ERVK 0 1023 5 3 751 1760 239 37 84 chr2 21798847 21799604 -159948483 + RMER17B LTR ERVK 312 899 -9 3 751 1097 154 22 68 chr2 21799782 21799835 -159948252 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 355 3 751 1097 176 29 81 chr2 21800484 21800687 -159947400 - ORR1B1 LTR MaLR -40 354 131 3 751 2412 190 42 15 chr2 21800709 21801189 -159946898 - RLTR16 LTR ERVK -12 493 1 3 751 272 122 78 39 chr2 21801189 21801234 -159946853 - ORR1B1 LTR MaLR -190 139 93 3 751 675 156 2 62 chr2 21801421 21801558 -159946529 - ORR1B1 LTR MaLR -213 157 36 3 751 1059 293 90 11 chr2 21805210 21805645 -159942442 + RMER5 LTR ERV1 30 498 -36 3 751 2721 164 21 24 chr2 21807252 21807719 -159940368 - RMER4A LTR ERVK 0 466 1 3 751 508 214 0 10 chr2 21814445 21814549 -159933538 + RMER15 LTR ERVL 17 119 -456 3 751 7533 87 30 14 chr2 21815306 21816274 -159931813 + RLTR13C1 LTR ERVK 1 983 0 3 751 384 281 23 109 chr2 21818519 21818647 -159929440 - MT2A LTR ERVL -128 405 289 3 751 243 266 50 12 chr2 21818922 21819002 -159929085 + MT2A LTR ERVL 26 108 -425 3 751 941 246 129 33 chr2 21819028 21819087 -159929000 + MT2A LTR ERVL 170 231 -302 3 751 941 246 129 33 chr2 21819137 21819409 -159928678 + MT2A LTR ERVL 232 532 -1 3 751 638 289 85 0 chr2 21819409 21819607 -159928480 + LTR53 LTR ERVL 121 335 -184 3 751 526 309 185 25 chr2 21821040 21821267 -159926820 + MLT2B1 LTR ERVL 1 283 -237 3 751 4578 127 81 16 chr2 21821267 21821957 -159926130 - RMER19A LTR ERVK -2 735 1 3 751 526 309 171 24 chr2 21821957 21822066 -159926021 + MLT2B1 LTR ERVL 283 385 -169 3 751 542 328 81 36 chr2 21822144 21822451 -159925636 - ORR1E LTR MaLR -38 321 1 3 751 3154 145 31 12 chr2 21822635 21823152 -159924935 - RLTR11A2 LTR ERVK 0 527 1 3 751 1630 183 31 9 chr2 21823658 21823984 -159924103 - ORR1A1 LTR MaLR -8 338 6 3 751 1966 98 96 81 chr2 21829146 21829468 -159918619 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 3 751 515 330 100 4 chr2 21832316 21832596 -159915491 - MLT1A0 LTR MaLR -34 331 25 3 751 3213 204 81 49 chr2 21833383 21834259 -159913828 + RMER13B LTR ERVK 1 904 -4 3 751 3603 147 131 70 chr2 21834546 21835241 -159912846 - RMER19A LTR ERVK 0 737 1 3 751 2064 161 59 3 chr2 21835242 21835633 -159912454 + MTC LTR MaLR 1 413 -8 3 751 290 204 70 42 chr2 21836465 21836570 -159911517 + MLT1A1 LTR MaLR 290 396 -12 3 751 870 184 69 86 chr2 21837104 21837559 -159910528 + LTRIS3 LTR ERV1 1 512 0 3 751 303 381 68 32 chr2 21840659 21841071 -159907016 + MLT1F2 LTR MaLR 66 558 -2 3 751 566 279 44 44 chr2 21843540 21843788 -159904299 - MLT1D LTR MaLR -257 248 1 3 751 2110 88 143 18 chr2 21844506 21844898 -159903189 - RMER17A2 LTR ERVK -465 441 1 3 751 513 219 18 64 chr2 21859726 21859796 -159888291 + RMER13B LTR ERVK 742 811 -97 3 751 3166 54 10 22 chr2 21859796 21860197 -159887890 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 751 513 219 18 64 chr2 21860197 21860297 -159887790 + RMER13B LTR ERVK 812 904 -4 3 751 934 266 169 9 chr2 21861071 21861390 -159886697 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 3 751 330 219 39 63 chr2 21864998 21865125 -159882962 + RNLTR23 LTR ERVK 479 602 -40 4 751 346 291 107 53 chr2 21865425 21865650 -159882437 + MTEb LTR MaLR 143 379 0 4 751 2967 42 42 13 chr2 21867443 21867828 -159880259 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 751 1797 150 73 42 chr2 21876014 21876370 -159871717 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 4 751 290 270 92 34 chr2 21876439 21876558 -159871529 - MLT1A1 LTR MaLR -12 396 271 4 751 604 237 68 62 chr2 21876564 21876888 -159871199 + RLTR15 LTR ERVK 3 328 -31 4 751 454 321 138 47 chr2 21882355 21882675 -159865412 + MLT1A LTR MaLR 21 369 -5 4 752 3185 27 0 5 chr2 21889065 21889432 -159858655 + RLTR10B2 LTR ERVK 1 365 0 4 752 306 167 73 29 chr2 21893489 21893557 -159854530 + MTE2a LTR MaLR 1 71 -348 4 752 619 230 40 20 chr2 21893647 21893798 -159854289 + MTE2a LTR MaLR 226 379 0 4 752 1071 253 78 20 chr2 21896853 21897200 -159850887 + ORR1D2 LTR MaLR 1 367 -3 4 752 611 257 89 28 chr2 21897820 21898068 -159850019 + RMER5 LTR ERV1 200 462 -72 4 752 1622 196 70 0 chr2 21898614 21898955 -159849132 + ORR1D1 LTR MaLR 1 365 -9 4 752 1810 199 12 87 chr2 21900025 21900437 -159847650 + RLTR14 LTR ERV1 2 382 0 4 752 1684 129 74 3 chr2 21900576 21900888 -159847199 - RLTR15 LTR ERVK -25 334 1 4 752 4657 192 41 15 chr2 21902887 21903769 -159844318 - RMER13B LTR ERVK 0 908 4 4 752 2903 98 5 0 chr2 21905894 21906290 -159841797 - MTB LTR MaLR -2 398 1 4 752 3752 86 49 15 chr2 21906825 21907419 -159840668 - RLTR13D5 LTR ERVK -5 1018 405 4 752 554 276 47 16 chr2 21907421 21907550 -159840537 + ETnERV2-int LTR ERVK 7070 7202 -204 4 752 2841 93 2 2 chr2 21907940 21908349 -159839738 - RLTR13D5 LTR ERVK -614 409 1 4 752 1850 131 29 143 chr2 21911972 21912427 -159835660 + RLTR9F LTR ERVK 1 403 -12 4 752 265 338 105 36 chr2 21915806 21916082 -159832005 + RLTR17 LTR ERVK 148 442 -250 4 752 4717 158 54 27 chr2 21916249 21917133 -159830954 + RMER13B LTR ERVK 1 908 0 4 752 462 299 76 0 chr2 21933918 21934062 -159814025 - MER67A LTR ERV1 -236 307 153 4 752 542 176 57 107 chr2 21935274 21935414 -159812673 + RMER19B LTR ERVK 5 137 -765 4 752 1042 220 46 0 chr2 21935391 21935609 -159812478 + RMER19B LTR ERVK 55 282 -620 4 752 558 165 0 0 chr2 21935584 21935681 -159812406 + RMER19B LTR ERVK 799 895 -7 4 752 1983 143 3 7 chr2 21935861 21936170 -159811917 + RLTR10E LTR ERVK 1 308 -3 4 752 4166 130 91 29 chr2 21938498 21939260 -159808827 - RMER17D2 LTR ERVK 0 809 1 5 752 1044 255 106 18 chr2 21939901 21940288 -159807799 - RLTR11A2 LTR ERVK -8 519 99 5 752 2390 171 72 22 chr2 21941422 21941925 -159806162 + RLTR11A LTR ERVK 1 528 0 5 752 1894 284 71 88 chr2 21942518 21943393 -159804694 - RMER13A LTR ERVK 0 860 1 5 752 333 161 18 0 chr2 21944305 21944361 -159803726 + RMER13A LTR ERVK 599 655 -205 5 752 280 329 105 20 chr2 21944348 21944500 -159803587 + RMER13A LTR ERVK 538 702 -158 5 752 2336 116 136 43 chr2 21944512 21944953 -159803134 + RLTR45 LTR ERVK 1 482 0 5 752 538 312 130 28 chr2 21944954 21945177 -159802910 + RMER13A LTR ERVK 667 894 -64 5 752 397 197 0 0 chr2 21947158 21947229 -159800858 - ORR1D1 LTR MaLR 0 384 314 5 752 1458 208 49 32 chr2 21947395 21947703 -159800384 - ORR1D1 LTR MaLR -57 317 5 5 752 368 323 88 119 chr2 21953584 21953946 -159794141 + ORR1E LTR MaLR 6 356 -3 5 752 3515 316 60 76 chr2 21953968 21955539 -159792548 + ORR1E-int LTR MaLR 1 1546 -34 5 752 756 293 51 95 chr2 21955525 21955895 -159792192 + ORR1E LTR MaLR 6 359 0 5 752 1661 192 8 62 chr2 21962234 21962324 -159785763 - ORR1B1 LTR MaLR -3 391 308 5 752 2915 38 6 0 chr2 21962324 21962668 -159785419 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 5 752 1661 192 8 62 chr2 21962668 21962948 -159785139 - ORR1B1 LTR MaLR -87 307 41 5 752 1521 237 89 143 chr2 21965393 21965979 -159782108 - RLTR1D LTR ERV1 0 605 52 5 752 906 197 156 73 chr2 21966055 21966395 -159781692 - RLTR9A LTR ERVK 0 368 1 5 752 264 222 43 22 chr2 21966650 21966742 -159781345 - ETnERV2-int LTR ERVK -981 6425 6332 5 752 480 230 0 60 chr2 21966892 21967026 -159781061 - ETnERV2-int LTR ERVK -1195 6211 6086 5 752 7278 124 27 42 chr2 21967023 21968356 -159779731 - RMER16-int LTR ERVK -1230 4176 2864 5 752 579 96 87 87 chr2 21968357 21968483 -159779604 + RLTR45-int LTR ERVK 4408 4533 -2711 5 752 547 118 86 0 chr2 21968526 21968619 -159779468 - RMER16-int LTR ERVK -2544 2862 2762 5 752 1020 96 0 0 chr2 21968619 21968754 -159779333 - RLTR13C1 LTR ERVK -848 135 1 5 752 3309 40 2 5 chr2 21977766 21978163 -159769924 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 752 1696 146 64 98 chr2 21980887 21981244 -159766843 + ORR1B1 LTR MaLR 42 386 -8 5 752 2815 42 0 3 chr2 21991754 21992092 -159755995 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 0 337 1 5 752 25441 11 1 2 chr2 21992092 21995052 -159753035 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 3525 5 752 886 73 24 0 chr2 21995052 21995175 -159752912 - IAPEz-int LTR ERVK -2770 4910 4785 5 752 1751 111 4 4 chr2 21995172 21995434 -159752653 - IAPEz-int LTR ERVK -5183 2497 2236 5 752 424 38 0 0 chr2 21995433 21995486 -159752601 - IAPEz-int LTR ERVK -5070 1411 1359 5 752 4245 32 45 2 chr2 21995518 21996078 -159752009 - IAPEz-int LTR ERVK -5890 591 8 5 752 2867 36 0 3 chr2 21996078 21996416 -159751671 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 0 337 1 5 752 686 266 64 20 chr2 22015108 22015311 -159732776 + MTE2b LTR MaLR 168 379 0 9 752 266 331 47 79 chr2 22015432 22015622 -159732465 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 247 1 752 1252 267 47 68 chr2 22019433 22019613 -159728474 + MTEa LTR MaLR 1 180 -199 1 752 1252 267 47 68 chr2 22019854 22020055 -159728032 + MTEa LTR MaLR 181 374 -5 1 753 2084 154 81 6 chr2 22024710 22025069 -159723018 + ORR1B1 LTR MaLR 1 386 -8 2 753 767 256 116 22 chr2 22030646 22031016 -159717071 - MTD LTR MaLR -14 405 1 3 753 375 278 45 27 chr2 22031893 22032004 -159716083 + MTD LTR MaLR 8 120 -299 3 753 3548 8 2 2 chr2 22032072 22032468 -159715619 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 753 9542 24 0 0 chr2 22032468 22033566 -159714521 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 3 753 3547 15 2 0 chr2 22033566 22033961 -159714126 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 753 1048 316 34 3 chr2 22038966 22039258 -159708829 + MTD LTR MaLR 107 407 -12 3 753 956 212 68 0 chr2 22041609 22041940 -159706147 + MTD LTR MaLR 1 419 0 4 753 307 233 136 97 chr2 22044920 22045096 -159702991 + MTEa LTR MaLR 189 371 -8 4 753 1253 158 146 0 chr2 22045916 22046169 -159701918 + ORR1B2 LTR MaLR 1 290 -77 4 753 2135 99 46 3 chr2 22046169 22046494 -159701593 - BGLII_Mus LTR ERVK 0 422 84 4 753 1314 207 51 62 chr2 22052847 22053191 -159694896 - RLTR10D LTR ERVK -15 344 1 6 753 1894 255 9 21 chr2 22069094 22069522 -159678565 - MT2A LTR ERVL -91 442 20 7 753 2379 319 83 20 chr2 22069679 22070078 -159678009 + ERVL-B4-int LTR ERVL 3481 3918 -1796 7 753 2379 319 83 20 chr2 22070198 22070888 -159677199 + ERVL-B4-int LTR ERVL 3919 4638 -1076 7 753 2770 153 14 0 chr2 22088112 22088557 -159659530 - RLTR28B LTR ERVL -30 451 1 9 753 265 274 73 28 chr2 22088626 22088735 -159659352 - RLTR19-int LTR ERVK -1789 4348 4235 9 753 3810 221 36 46 chr2 22091741 22092647 -159655440 + RMER13B LTR ERVK 3 899 -9 1 753 1668 129 166 13 chr2 22093033 22093340 -159654747 + ORR1B1 LTR MaLR 41 394 0 1 753 897 267 126 22 chr2 22095096 22095414 -159652673 + MLT1B LTR MaLR 28 378 -12 1 753 3217 73 0 15 chr2 22095807 22096209 -159651878 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 753 250 230 13 63 chr2 22096232 22096311 -159651776 + MT2B2 LTR ERVL 160 234 -350 1 753 412 270 85 30 chr2 22096889 22097053 -159651034 - LTR88b LTR Gypsy? -641 196 24 1 753 623 210 85 8 chr2 22099359 22099549 -159648538 - RMER12 LTR ERVK -29 1293 1038 1 753 1646 227 90 31 chr2 22099746 22100435 -159647652 - RMER12 LTR ERVK -1110 698 1 1 753 893 276 151 8 chr2 22101961 22102312 -159645775 + MTC LTR MaLR 1 401 -20 1 753 3480 40 2 8 chr2 22107649 22108047 -159640040 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 753 8550 81 6 6 chr2 22108047 22109145 -159638942 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 1 753 3119 65 26 10 chr2 22109145 22109535 -159638552 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 753 7699 83 23 60 chr2 22109535 22110675 -159637412 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 1 753 3321 66 0 0 chr2 22110675 22111067 -159637020 + MTA_Mm LTR MaLR 1 392 -4 1 753 225 274 0 16 chr2 22113038 22113101 -159634986 - ORR1E LTR MaLR -212 147 86 1 753 1951 113 12 54 chr2 22113180 22113516 -159634571 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 322 0 1 753 22223 60 3 38 chr2 22113517 22116773 -159631314 + MMETn-int LTR ERVK 2 3141 -1703 1 753 8170 111 14 28 chr2 22116806 22118184 -159629903 + MMETn-int LTR ERVK 3486 4844 0 1 753 1930 116 12 54 chr2 22118184 22118520 -159629567 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 322 0 1 753 1154 283 43 19 chr2 22119105 22119473 -159628614 + MTEa LTR MaLR 3 379 0 1 753 863 312 109 47 chr2 22145909 22145981 -159602106 + MLT2B1 LTR ERVL 5 74 -446 1 753 863 312 109 47 chr2 22146036 22146349 -159601738 + MLT2B1 LTR ERVL 75 414 -106 1 753 229 176 19 38 chr2 22146538 22146591 -159601496 + MLT2B1 LTR ERVL 501 552 -2 1 754 2544 80 3 0 chr2 22152563 22152889 -159595198 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 1 754 2588 147 29 7 chr2 22155135 22155547 -159592540 + MTC LTR MaLR 1 421 0 1 754 519 328 71 21 chr2 22160856 22161096 -159586991 + ORR1E LTR MaLR 97 348 -11 1 754 3736 148 17 49 chr2 22161671 22162430 -159585657 - RMER17A LTR ERVK -16 735 1 1 754 2017 139 19 65 chr2 22168956 22169325 -159578762 - ORR1B1 LTR MaLR -2 392 41 1 754 953 279 87 0 chr2 22170772 22171119 -159576968 + MTEa LTR MaLR 3 379 0 1 754 307 247 44 22 chr2 22174465 22174556 -159573531 + MTEa LTR MaLR 8 100 -259 1 754 460 289 67 7 chr2 22174870 22175020 -159573067 + MTEa LTR MaLR 220 378 -1 1 754 1760 143 39 0 chr2 22176143 22176429 -159571658 + ORR1B2 LTR MaLR 1 297 -70 1 754 1157 259 86 49 chr2 22179630 22179858 -159568229 - MTEa LTR MaLR -8 371 133 1 754 3256 51 2 0 chr2 22179858 22180253 -159567834 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 754 7253 75 25 65 chr2 22180253 22181398 -159566689 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 1 754 3263 43 5 0 chr2 22181398 22181792 -159566295 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 754 1157 259 86 49 chr2 22181792 22181910 -159566177 - MTEa LTR MaLR -247 132 12 1 754 247 323 197 17 chr2 22189141 22189497 -159558590 + MLT1L LTR MaLR 143 562 -48 2 754 3270 43 5 0 chr2 22196243 22196637 -159551450 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 754 780 294 72 103 chr2 22196707 22196810 -159551277 - MTEb LTR MaLR -4 375 261 2 754 2722 30 0 60 chr2 22196810 22197158 -159550929 - IAPLTR2b LTR ERVK 0 327 1 2 754 780 294 72 103 chr2 22197158 22197388 -159550699 - MTEb LTR MaLR -119 260 42 2 754 780 294 72 103 chr2 22197616 22197668 -159550419 - MTEb LTR MaLR -338 41 1 2 754 504 260 102 29 chr2 22207148 22207444 -159540643 - RLTR9A LTR ERVK 0 533 138 2 754 776 236 37 71 chr2 22207444 22207668 -159540419 - RMER16 LTR ERVK -218 315 1 2 754 3407 33 2 0 chr2 22256610 22257005 -159491082 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 754 1897 232 17 160 chr2 22269309 22270022 -159478065 - RMER19C LTR ERVK 0 611 1 2 754 1868 149 33 55 chr2 22270171 22270590 -159477497 + RMER17C LTR ERVK 1 410 0 2 754 732 194 51 19 chr2 22274091 22274249 -159473838 + RLTR20B3 LTR ERVK 2 164 -413 2 754 1214 229 94 19 chr2 22277800 22278120 -159469967 + RLTR20B3 LTR ERVK 221 564 -13 2 754 2011 130 18 58 chr2 22280560 22280903 -159467184 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 3 755 2865 140 73 21 chr2 22284171 22284702 -159463385 - RLTR12A LTR ERVK -9 559 1 3 755 3700 42 5 0 chr2 22303702 22304136 -159443951 + RLTR10C LTR ERVK 1 436 0 3 755 229 195 115 13 chr2 22331091 22331169 -159416918 - ORR1E LTR MaLR 0 379 294 3 755 258 323 75 32 chr2 22331297 22331481 -159416606 - ORR1E LTR MaLR -183 187 4 3 755 2716 163 119 24 chr2 22334045 22334585 -159413502 - RLTR17 LTR ERVK -3 689 99 3 755 887 303 54 40 chr2 22341985 22342336 -159405751 - MLT1B LTR MaLR -5 385 30 3 755 3953 154 23 23 chr2 22345665 22346357 -159401730 - RLTR17 LTR ERVK 0 692 1 3 755 342 110 54 14 chr2 22346357 22346431 -159401656 - RMER3D-int LTR ERVK 0 2842 2766 3 755 1037 202 21 25 chr2 22346415 22346694 -159401393 - RMER3D-int LTR ERVK -1550 1292 1015 3 755 1126 241 91 48 chr2 22346732 22347251 -159400836 - RMER3D-int LTR ERVK -2232 610 70 3 755 586 278 17 47 chr2 22397295 22397507 -159350580 - RLTR20D LTR ERVK -332 245 1 3 755 404 304 96 16 chr2 22399253 22399440 -159348647 - MLT1B LTR MaLR 0 390 189 3 756 2778 233 115 44 chr2 22418199 22419002 -159329085 - RMER13A LTR ERVK 0 860 1 3 756 1127 254 135 51 chr2 22419718 22420088 -159327999 - MTD LTR MaLR -1 418 18 3 756 225 132 26 0 chr2 22420069 22420107 -159327980 - MT2A LTR ERVL -494 39 1 3 756 423 309 8 82 chr2 22420793 22420927 -159327160 - MTC LTR MaLR -224 197 74 3 756 787 65 9 0 chr2 22424690 22424797 -159323290 + ORR1A0 LTR MaLR 68 175 -171 4 756 3099 11 0 3 chr2 22425330 22425677 -159322410 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 4 756 13356 45 46 8 chr2 22425677 22427403 -159320684 + ORR1A0-int LTR MaLR 1 1792 0 4 756 3006 26 0 3 chr2 22427403 22427750 -159320337 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 4 756 1620 251 39 41 chr2 22454220 22454758 -159293329 + RLTR20A LTR ERVK 13 551 0 4 756 1924 133 107 3 chr2 22456006 22456316 -159291771 - ORR1B1 LTR MaLR -48 346 5 4 756 2348 131 3 24 chr2 22457864 22458239 -159289848 - RLTR20A LTR ERVK 0 541 175 4 756 3011 91 2 39 chr2 22459599 22460011 -159288076 - MTB LTR MaLR -3 397 1 4 756 5488 148 104 6 chr2 22469817 22470927 -159277160 - ORR1A2-int LTR MaLR -745 1218 1 4 756 2648 101 0 0 chr2 22470927 22471254 -159276833 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 4 756 3286 61 8 2 chr2 22491166 22491560 -159256527 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 756 705 293 121 23 chr2 22491644 22491951 -159256136 - MTEa LTR MaLR -41 338 2 4 756 2590 158 37 2 chr2 22494500 22494907 -159253180 - MTC LTR MaLR 0 421 1 4 756 347 127 18 0 chr2 22495740 22495795 -159252292 - MTB_Mm LTR MaLR -208 199 144 4 756 1107 180 57 20 chr2 22511508 22511752 -159236335 - RLTR12B LTR ERVK 0 528 276 1 756 702 151 158 0 chr2 22511900 22512046 -159236041 - RLTR12B LTR ERVK -359 169 1 1 756 2412 233 38 80 chr2 22515072 22515833 -159232254 - RMER17B LTR ERVK -210 748 20 2 756 838 246 110 66 chr2 22531571 22531906 -159216181 - ORR1E LTR MaLR -6 353 4 4 756 869 267 159 0 chr2 22531906 22532160 -159215927 - MTE-int LTR MaLR -50 1530 1234 5 756 2026 131 87 89 chr2 22532450 22532843 -159215244 - RLTR9C LTR ERVK -1 392 1 5 756 247 264 0 0 chr2 22532867 22532920 -159215167 + MTD LTR MaLR 122 174 -245 5 756 1060 223 13 22 chr2 22532908 22533137 -159214950 - MTD LTR MaLR -192 227 1 5 756 505 194 69 69 chr2 22542524 22542668 -159205419 - MLT1A0 LTR MaLR -3 362 219 6 756 297 232 72 104 chr2 22542894 22543019 -159205068 - MT2B LTR ERVL -344 257 137 6 757 1285 253 113 29 chr2 22549997 22550343 -159197744 + MTEb LTR MaLR 1 375 -4 7 757 705 250 46 17 chr2 22552901 22553076 -159195011 + RLTR28B LTR ERVL 1 180 -301 8 757 304 325 121 44 chr2 22553087 22553296 -159194791 - RMER17C LTR ERVK -46 364 133 8 757 304 325 121 44 chr2 22553351 22553479 -159194608 - RMER17C LTR ERVK -278 132 1 8 757 384 284 66 62 chr2 22563374 22563648 -159184439 - RMER17C LTR ERVK -52 358 84 9 757 1563 165 39 18 chr2 22563799 22564083 -159184004 - RMER17C-int LTR ERVK 0 3238 2949 9 757 1130 205 53 87 chr2 22564099 22564398 -159183689 - RMER17C-int LTR ERVK -202 3036 2748 9 757 1018 255 168 13 chr2 22568036 22568346 -159179741 + MTE2b LTR MaLR 18 375 -4 1 757 1116 184 40 0 chr2 22568798 22568999 -159179088 + MTC LTR MaLR 3 211 -210 1 757 1049 174 56 42 chr2 22569594 22569769 -159178318 + MTC LTR MaLR 203 382 -39 1 757 2331 224 55 62 chr2 22569769 22570384 -159177703 - RMER19C LTR ERVK 0 611 1 1 757 1049 174 56 42 chr2 22570384 22570424 -159177663 + MTC LTR MaLR 383 421 0 1 757 246 245 78 86 chr2 22571229 22571345 -159176742 - RMER20B LTR ERVK -47 580 466 1 757 1910 145 40 101 chr2 22571683 22572031 -159176056 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 67 1 757 3805 33 36 0 chr2 22572031 22572452 -159175635 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 1 757 1910 145 40 101 chr2 22572452 22572480 -159175607 - ORR1B1 LTR MaLR -328 66 41 1 757 2142 186 18 13 chr2 22574822 22575208 -159172879 - MTC LTR MaLR -33 388 1 1 757 1797 243 114 52 chr2 22577621 22578255 -159169832 + MTD-int LTR MaLR 586 1258 0 1 757 1050 225 137 10 chr2 22578256 22578622 -159169465 + MTD LTR MaLR 1 404 -3 1 757 290 219 44 44 chr2 22578812 22578905 -159169182 - ORR1E LTR MaLR -282 96 4 1 757 234 237 66 132 chr2 22578978 22579114 -159168973 + MER57D LTR ERV1 225 351 -60 1 757 1859 126 67 14 chr2 22579941 22580238 -159167849 + ORR1B2 LTR MaLR 1 313 -54 1 757 392 125 0 0 chr2 22582498 22582554 -159165533 + ORR1B2 LTR MaLR 274 329 0 1 757 1804 221 142 77 chr2 22583583 22584118 -159163969 - RMER19C LTR ERVK -39 572 3 1 757 568 295 93 66 chr2 22584227 22584485 -159163602 - RMER20B LTR ERVK -118 398 132 1 757 1747 125 30 66 chr2 22590215 22590549 -159157538 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 1 757 587 294 59 93 chr2 22591719 22592057 -159156030 - ORR1E LTR MaLR -19 351 18 1 757 3939 60 52 2 chr2 22593169 22593688 -159154399 - LTRIS2 LTR ERV1 0 564 20 1 757 3017 57 143 141 chr2 22594242 22594753 -159153334 + RLTR1B LTR ERV1 1 512 0 1 757 2846 37 65 0 chr2 22597779 22598104 -159149983 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 1 757 485 295 70 118 chr2 22608874 22609231 -159138856 - ORR1D2 LTR MaLR -30 340 1 1 757 752 311 70 30 chr2 22609881 22610179 -159137908 + RLTR18 LTR ERVK 1 310 -306 1 757 2420 140 20 33 chr2 22611873 22612498 -159135589 - RMER17A LTR ERVK -2 887 256 1 757 3220 59 10 0 chr2 22613122 22613514 -159134573 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 757 1945 237 96 70 chr2 22622054 22622402 -159125685 + RMER17B LTR ERVK 47 431 -527 1 757 1945 237 96 70 chr2 22622449 22622948 -159125139 + RMER17B LTR ERVK 432 916 -42 1 757 1240 210 164 13 chr2 22623156 22623528 -159124559 + RMER15 LTR ERVL 30 457 -118 2 757 1041 164 125 30 chr2 22634137 22634369 -159113718 - MTC LTR MaLR -167 254 1 2 757 363 325 39 13 chr2 22640430 22640586 -159107501 + ORR1E LTR MaLR 9 168 -191 2 757 2346 148 28 43 chr2 22641476 22641943 -159106144 - RMER4A LTR ERVK 0 466 7 2 757 314 263 40 58 chr2 22650563 22650702 -159097385 - MLT1G LTR MaLR -46 549 416 2 757 6875 92 32 21 chr2 22650859 22651831 -159096256 - RLTR13C1 LTR ERVK 0 983 1 2 757 275 261 53 32 chr2 22653121 22653216 -159094871 - MTEa LTR MaLR -13 366 270 2 757 1882 168 53 79 chr2 22653746 22654140 -159093947 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 2 757 1603 187 102 19 chr2 22654699 22655070 -159093017 + MTD LTR MaLR 6 407 -12 2 757 265 394 38 63 chr2 22655905 22656222 -159091865 + ORR1E LTR MaLR 51 359 0 2 757 334 211 22 22 chr2 22667724 22667816 -159080271 - MLT1A1 LTR MaLR -4 404 313 2 757 1021 236 90 85 chr2 22668995 22669231 -159078856 - ORR1D1 LTR MaLR -7 367 150 2 757 1021 236 90 85 chr2 22669267 22669395 -159078692 - ORR1D1 LTR MaLR -225 149 1 2 757 444 301 56 108 chr2 22671721 22672008 -159076079 - ORR1E LTR MaLR -13 346 75 2 758 361 309 48 24 chr2 22679259 22679425 -159068662 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 239 2 758 240 253 133 0 chr2 22679442 22679517 -159068570 - MLT1A1 LTR MaLR -323 85 1 2 758 1161 269 58 28 chr2 22681745 22682070 -159066017 - ORR1E LTR MaLR 0 359 25 2 758 634 245 22 119 chr2 22683659 22683905 -159064182 - MTEa LTR MaLR 0 379 130 3 758 1351 234 64 66 chr2 22687779 22688186 -159059901 - MTD LTR MaLR 0 419 14 3 758 3526 15 2 0 chr2 22691756 22692151 -159055936 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 758 5680 23 28 1 chr2 22692151 22692854 -159055233 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 377 3 758 3309 8 5 0 chr2 22694822 22695212 -159052875 - MTA_Mm-int LTR MaLR -706 392 1 3 758 3549 13 2 0 chr2 22695212 22695607 -159052480 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 758 407 296 80 35 chr2 22696924 22697148 -159050939 - MTEa LTR MaLR -7 372 110 3 758 2382 214 51 65 chr2 22698554 22699143 -159048944 - RLTR40 LTR ERVK -3 814 234 3 758 240 213 0 21 chr2 22699181 22699229 -159048858 - MTEa LTR MaLR -159 220 174 3 758 1849 192 17 25 chr2 22700433 22700786 -159047301 - MTD LTR MaLR -56 363 14 3 758 228 190 50 33 chr2 22708749 22708809 -159039278 - MLT1A1 LTR MaLR -21 387 327 3 758 583 296 44 44 chr2 22717010 22717236 -159030851 - MLT1C LTR MaLR -148 319 94 3 758 2429 119 109 5 chr2 22723302 22723716 -159024371 + RMER2 LTR ERV1 111 567 0 3 758 5937 110 72 12 chr2 22725251 22726152 -159021935 - RMER17B LTR ERVK -3 955 1 3 758 250 273 45 15 chr2 22732537 22732604 -159015483 + MT2B2 LTR ERVL 219 287 -297 3 758 2560 84 73 3 chr2 22734861 22735205 -159012882 - RLTR9A LTR ERVK 0 368 1 3 758 655 242 8 174 chr2 22748777 22749173 -158998914 + RMER17C LTR ERVK 3 332 -78 4 758 2208 165 236 0 chr2 22766588 22767012 -158981075 - RLTR28 LTR ERVL 0 524 1 4 758 297 236 0 152 chr2 22797785 22797890 -158950197 - MT2B LTR ERVL -361 240 152 5 758 2016 80 56 146 chr2 22798659 22798842 -158949245 + MTB LTR MaLR 1 199 -201 5 758 2016 80 56 146 chr2 22798990 22799217 -158948870 + MTB LTR MaLR 200 374 -26 5 758 786 241 89 48 chr2 22800725 22800973 -158947114 + MTD LTR MaLR 19 276 -143 5 758 229 263 0 17 chr2 22800989 22801047 -158947040 + MTD LTR MaLR 306 362 -17 5 759 252 216 65 39 chr2 22811028 22811105 -158936982 - MT2B LTR ERVL -361 240 162 5 759 2222 99 9 58 chr2 22813118 22813462 -158934625 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 5 759 1310 171 109 8 chr2 22814104 22814352 -158933735 + ORR1C1 LTR MaLR 13 285 -93 5 759 395 157 43 0 chr2 22814470 22814540 -158933547 + ORR1C1 LTR MaLR 308 380 -4 5 759 418 243 26 35 chr2 22822102 22822217 -158925870 + MER57E1 LTR ERV1 3 116 -256 5 759 314 208 8 16 chr2 22822874 22822891 -158925196 + ORR1B1-int LTR MaLR 632 647 -862 5 759 2948 29 9 0 chr2 22824633 22824976 -158923111 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 5 759 240 367 81 19 chr2 22828212 22828373 -158919714 + LTR40b LTR ERVL 144 314 -148 5 759 279 233 117 43 chr2 22828601 22828695 -158919392 + LTR40b LTR ERVL 350 450 -12 5 759 287 320 98 94 chr2 22830487 22830732 -158917355 + HERVL40-int LTR ERVL 1368 1613 -3917 5 759 458 343 101 101 chr2 22833360 22833827 -158914260 + LTR40a LTR ERVL 15 481 -38 5 759 311 141 61 200 chr2 22840443 22840558 -158907529 - RMER5 LTR ERV1 -8 526 428 6 759 252 277 135 65 chr2 22840718 22840888 -158907199 - RMER5 LTR ERV1 -320 214 33 6 759 814 116 116 0 chr2 22842044 22842182 -158905905 + MTC LTR MaLR 1 154 -267 6 759 923 147 31 31 chr2 22842199 22842361 -158905726 + MTC LTR MaLR 252 413 -8 6 759 509 318 196 44 chr2 22854129 22854491 -158893596 - LTR33C LTR ERVL -210 419 3 6 759 554 240 119 64 chr2 22854608 22854826 -158893261 - MTEa LTR MaLR -2 377 148 6 759 243 277 11 98 chr2 22857400 22857413 -158890674 + MT2B LTR ERVL 152 156 -445 6 759 1387 135 0 10 chr2 22857921 22858130 -158889957 + RMER19B LTR ERVK 1 207 -695 6 759 1688 114 36 43 chr2 22858130 22858431 -158889656 - BGLII_Mus LTR ERVK -122 300 2 6 759 3620 141 58 18 chr2 22858436 22859052 -158889035 + RMER19B LTR ERVK 262 902 0 6 759 368 208 50 30 chr2 22860681 22860780 -158887307 - MTEa LTR MaLR -313 106 6 6 759 5158 158 111 16 chr2 22860854 22861861 -158886226 + RLTR25A LTR ERVK 1 1103 0 6 759 640 261 7 18 chr2 22863899 22864087 -158884000 - ORR1D1 LTR MaLR -125 249 52 6 759 843 138 15 0 chr2 22865118 22865248 -158882839 + RMER17B LTR ERVK 1 132 -826 6 759 3699 23 93 124 chr2 22865248 22865851 -158882236 - RLTR6_Mm LTR ERV1 -70 584 1 6 759 8854 101 91 42 chr2 22865851 22868695 -158879392 - MMVL30-int LTR ERV1 0 3698 716 6 759 426 287 0 59 chr2 22868988 22869140 -158878947 - MMVL30-int LTR ERV1 -7023 533 391 6 759 6572 24 46 17 chr2 22869134 22869940 -158878147 - RLTR6-int LTR ERV1 -6949 829 1 6 759 3840 26 90 120 chr2 22869941 22870564 -158877523 - RLTR6_Mm LTR ERV1 -50 604 1 6 759 3247 109 164 25 chr2 22870564 22871257 -158876830 + RMER17B LTR ERVK 129 906 0 6 759 412 315 65 102 chr2 22871731 22872106 -158875981 + RMER20B LTR ERVK 168 560 -67 6 759 4266 166 142 18 chr2 22876915 22877717 -158870370 + RMER19B LTR ERVK 1 902 0 6 759 1642 223 34 75 chr2 22886259 22886440 -158861647 + ORR1D1 LTR MaLR 1 175 -199 7 759 1642 223 34 75 chr2 22886506 22886712 -158861375 + ORR1D1 LTR MaLR 176 372 -2 7 759 250 307 135 108 chr2 22886768 22886823 -158861264 - MLT1A LTR MaLR 0 374 326 7 759 250 307 135 108 chr2 22886862 22886884 -158861203 - MLT1A LTR MaLR -49 325 307 7 759 250 307 135 108 chr2 22887073 22887102 -158860985 - MLT1A LTR MaLR -68 306 279 7 759 250 307 135 108 chr2 22887249 22887428 -158860659 - MLT1A LTR MaLR -96 278 81 7 759 754 300 114 11 chr2 22899029 22899309 -158848778 + RMER19C LTR ERVK 94 402 -209 7 759 920 191 0 35 chr2 22899587 22899788 -158848299 + RMER19B LTR ERVK 709 902 0 7 759 807 346 34 31 chr2 22900750 22901099 -158846988 - MTEa LTR MaLR -12 367 18 7 759 481 176 185 0 chr2 22901377 22901496 -158846591 + RMER20A LTR ERVK 259 399 -117 7 759 1894 162 63 16 chr2 22901586 22901896 -158846191 + RLTR14 LTR ERV1 3 332 -50 7 759 2243 94 27 59 chr2 22901896 22902234 -158845853 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 7 759 1894 162 63 16 chr2 22902234 22902286 -158845801 + RLTR14 LTR ERV1 333 382 0 7 759 336 320 42 77 chr2 22903244 22903555 -158844532 + RMER5 LTR ERV1 122 421 -113 7 759 1662 128 90 10 chr2 22903560 22903859 -158844228 + ORR1B1 LTR MaLR 3 325 -69 7 759 2734 165 35 105 chr2 22904162 22904819 -158843268 + RMER19C LTR ERVK 1 611 0 7 759 3135 25 0 14 chr2 22905310 22905672 -158842415 + IAPEY2_LTR LTR ERVK 1 357 0 7 759 1118 181 15 95 chr2 22907726 22908140 -158839947 + ORR1C2 LTR MaLR 1 352 -15 7 759 596 286 116 55 chr2 22908451 22908762 -158839325 - MLT1B LTR MaLR -44 346 17 7 759 257 232 43 0 chr2 22908759 22908828 -158839259 - MTEb LTR MaLR -21 358 287 7 759 263 210 97 0 chr2 22909369 22909431 -158838656 + RLTR24 LTR ERV1 8 75 -454 7 759 603 127 398 17 chr2 22913288 22913484 -158834603 - RMER6B LTR ERVK 0 461 186 8 759 468 143 345 16 chr2 22913621 22913729 -158834358 - RMER6B LTR ERVK -276 185 47 8 759 3195 47 22 7 chr2 22914331 22914736 -158833351 + RLTR10A LTR ERVK 1 411 0 8 759 2007 108 3 9 chr2 22914860 22915178 -158832909 + IAPLTR2b LTR ERVK 1 316 -11 8 759 2211 27 0 154 chr2 22915632 22915977 -158832110 + RLTR10B LTR ERVK 1 292 0 8 759 1500 50 0 0 chr2 22915977 22916157 -158831930 + MMERVK10C-int LTR ERVK 1 180 -7401 8 759 233 191 0 0 chr2 22916157 22916199 -158831888 + RLTR27 LTR ERVK 231 272 -37 8 759 436 21 0 0 chr2 22916199 22916247 -158831840 + MMERVK10C-int LTR ERVK 222 269 -7312 8 759 2523 28 118 0 chr2 22916423 22916754 -158831333 + MMERVK10C-int LTR ERVK 553 909 -1078 8 759 402 294 45 41 chr2 22916755 22916975 -158831112 + MMERVK10C-int LTR ERVK 1346 1566 -6015 8 759 2705 118 7 7 chr2 22916985 22917400 -158830687 + MMERVK10C-int LTR ERVK 5002 5810 -1771 8 759 7519 47 16 29 chr2 22917391 22917429 -158830658 + MMERVK10C-int LTR ERVK 6651 6688 -893 8 759 7519 47 16 29 chr2 22917463 22918367 -158829720 + MMERVK10C-int LTR ERVK 6689 7580 -1 8 759 256 56 0 0 chr2 22918367 22918403 -158829684 + RLTR10B LTR ERVK 1 36 -256 8 759 2068 39 0 50 chr2 22918403 22918702 -158829385 + RLTR10B LTR ERVK 9 292 0 8 759 651 262 4 156 chr2 22918844 22918981 -158829106 - MTEb LTR MaLR -4 375 252 8 759 651 262 4 156 chr2 22919093 22919199 -158828888 - MTEb LTR MaLR -128 251 169 8 759 1926 233 31 90 chr2 22919216 22919522 -158828565 - RMER19C LTR ERVK -14 597 330 8 759 1926 233 31 90 chr2 22919549 22919845 -158828242 - RMER19C LTR ERVK -282 329 30 8 759 236 163 0 0 chr2 22922727 22922770 -158825317 - MTC LTR MaLR 0 421 379 8 759 855 192 98 4 chr2 22929038 22929256 -158818831 - ORR1B1 LTR MaLR -126 233 1 8 759 4083 132 48 8 chr2 22936830 22937495 -158810592 + RLTR17 LTR ERVK 1 692 0 8 760 255 284 0 105 chr2 22938485 22938599 -158809488 - MT2B2 LTR ERVL -329 255 154 8 760 2325 97 19 0 chr2 22941427 22941748 -158806339 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 8 760 5292 156 65 5 chr2 22941748 22942860 -158805227 + ORR1A2-int LTR MaLR 1 1178 -785 8 760 730 252 28 118 chr2 22947379 22947734 -158800353 - RLTR15 LTR ERVK -17 342 20 9 760 1394 186 170 22 chr2 22948624 22948982 -158799105 + MTD LTR MaLR 1 411 -8 9 760 537 277 213 24 chr2 22952586 22952862 -158795225 + MTEb LTR MaLR 3 330 -49 9 760 361 191 15 0 chr2 22953128 22953196 -158794891 + MTEb LTR MaLR 311 379 0 9 760 319 229 131 19 chr2 22957237 22957344 -158790743 - MT2B LTR ERVL -344 257 139 9 760 360 283 88 20 chr2 22970407 22970555 -158777532 - MER34A LTR ERV1 -411 160 3 9 760 2333 136 46 10 chr2 22970734 22971128 -158776959 + MTC LTR MaLR 4 411 -10 9 760 706 239 98 160 chr2 22971536 22971606 -158776481 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 254 9 760 706 239 98 160 chr2 22971736 22971787 -158776300 - ORR1D1 LTR MaLR 0 253 162 9 760 706 239 98 160 chr2 22971897 22972033 -158776054 - ORR1D1 LTR MaLR -213 161 11 9 760 925 271 60 128 chr2 22977433 22977548 -158770539 - RMER5 LTR ERV1 0 534 414 9 760 925 271 60 128 chr2 22977747 22978084 -158770003 - RMER5 LTR ERV1 -121 413 113 9 760 1733 162 54 30 chr2 22980127 22980496 -158767591 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 9 760 455 261 134 25 chr2 22981991 22982148 -158765939 - RMER5 LTR ERV1 -249 285 112 9 760 301 241 0 98 chr2 22983544 22983636 -158764451 + MLT1C LTR MaLR 94 176 -291 1 760 1955 137 56 45 chr2 22984560 22984936 -158763151 + ORR1C2 LTR MaLR 1 380 -4 1 760 350 304 130 63 chr2 22985611 22985850 -158762237 + MLT1C LTR MaLR 211 465 -2 1 760 234 291 19 46 chr2 22993594 22993702 -158754385 + ORR1D1-int LTR MaLR 1402 1506 -3 1 760 1435 174 94 23 chr2 22994037 22994379 -158753708 + ORR1D1 LTR MaLR 1 366 -8 1 760 1407 149 176 23 chr2 22997702 22998004 -158750083 + ORR1C2 LTR MaLR 37 384 0 1 760 1880 148 127 8 chr2 23002063 23002432 -158745655 + MTC LTR MaLR 1 413 -8 4 760 760 291 48 60 chr2 23006052 23006366 -158741721 + MLT2D LTR ERVL 84 393 -21 1 760 230 305 33 191 chr2 23013981 23014196 -158733891 - MLT1A1 LTR MaLR -206 202 22 3 760 259 238 61 24 chr2 23014742 23014824 -158733263 + MER21B LTR ERV1 448 532 -331 3 760 565 176 37 0 chr2 23021321 23021429 -158726658 - MTD LTR MaLR 0 419 308 5 760 621 305 107 0 chr2 23021454 23021631 -158726456 - MTD LTR MaLR -220 199 4 5 760 819 276 76 62 chr2 23032882 23033172 -158714915 - ORR1E LTR MaLR -60 299 6 8 760 1010 231 216 13 chr2 23033302 23033617 -158714470 - MTEa LTR MaLR 0 379 1 8 760 494 278 431 52 chr2 23033661 23033905 -158714182 - MTC LTR MaLR -14 407 71 8 760 238 164 14 95 chr2 23034934 23035008 -158713079 - MTC LTR MaLR -336 85 18 8 760 1067 269 121 8 chr2 23055841 23056212 -158691875 + MTD LTR MaLR 7 419 0 1 760 308 252 234 0 chr2 23057305 23057412 -158690675 + MTD LTR MaLR 274 405 -14 1 760 3774 108 114 45 chr2 23058432 23059189 -158688898 - RMER17D2 LTR ERVK 0 809 1 1 760 1923 150 166 3 chr2 23066036 23066398 -158681689 + MTC LTR MaLR 1 421 0 1 760 358 247 152 33 chr2 23067264 23067415 -158680672 + ORR1E LTR MaLR 25 193 -166 1 760 611 311 85 4 chr2 23067422 23067658 -158680429 + MTE-int LTR MaLR 41 295 -1285 1 761 1797 176 13 3 chr2 23069576 23069878 -158678209 - MTC LTR MaLR 0 421 117 1 761 494 178 2 0 chr2 23074380 23074477 -158673610 - MTC LTR MaLR -305 102 5 1 761 1598 262 56 31 chr2 23076506 23076987 -158671100 - RMER5 LTR ERV1 -9 525 33 1 761 1764 128 131 40 chr2 23077953 23078124 -158669963 - RMER17C LTR ERVK -3 407 240 1 761 1764 128 131 40 chr2 23078187 23078388 -158669699 - RMER17C LTR ERVK -171 239 2 1 761 2829 93 123 69 chr2 23078390 23078717 -158669370 - RMER17C-int LTR ERVK -4 3234 2900 1 761 2829 93 123 69 chr2 23078802 23079042 -158669045 - RMER17C-int LTR ERVK -339 2899 2638 1 761 7540 194 91 116 chr2 23079038 23079275 -158668812 - RMER17C-int LTR ERVK -417 2821 2588 1 761 7540 194 91 116 chr2 23079321 23081930 -158666157 - RMER17C-int LTR ERVK -417 2587 1 1 761 1658 165 41 58 chr2 23081931 23082348 -158665739 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 1 761 328 297 71 9 chr2 23083184 23083296 -158664791 - MTEb LTR MaLR 0 379 261 1 761 785 307 70 54 chr2 23083334 23083665 -158664422 - MTE-int LTR MaLR -501 1079 744 1 761 994 222 54 58 chr2 23083978 23084405 -158663682 - RMER2 LTR ERV1 -42 525 1 1 761 2185 133 17 22 chr2 23087374 23087735 -158660352 - ORR1B2 LTR MaLR -8 359 1 1 761 1230 233 36 11 chr2 23088393 23088671 -158659416 + ORR1D2 LTR MaLR 1 285 -85 1 761 544 280 33 27 chr2 23088989 23089172 -158658915 + ORR1D2 LTR MaLR 190 378 0 1 761 990 234 75 59 chr2 23093833 23094205 -158653882 - RLTR31_Mur LTR ERVK -114 439 62 1 761 322 210 59 92 chr2 23094213 23094365 -158653722 - RLTR31_Mur LTR ERVK -396 157 11 2 761 339 169 149 76 chr2 23095794 23095937 -158652150 - ORR1B2 LTR MaLR -185 141 1 2 761 1835 132 62 89 chr2 23102593 23102951 -158645136 + ORR1B1 LTR MaLR 47 394 0 2 761 3506 38 2 5 chr2 23111594 23111990 -158636097 + MTA_Mm LTR MaLR 2 396 0 2 761 1792 210 75 0 chr2 23113337 23113699 -158634388 + MTD LTR MaLR 6 394 -25 2 761 1891 217 27 22 chr2 23121310 23121715 -158626372 - MTD LTR MaLR -12 407 1 2 761 3355 173 38 21 chr2 23124840 23125449 -158622638 + RMER21A LTR ERV1 321 939 -8 2 761 734 177 298 50 chr2 23125467 23125729 -158622358 + RMER21B LTR ERV1 18 344 -498 2 761 1654 241 28 21 chr2 23134053 23134412 -158613675 - RMER20B LTR ERVK 0 516 152 2 761 1654 232 17 14 chr2 23134777 23134926 -158613161 - RMER20B LTR ERVK -476 151 2 2 761 1772 136 78 62 chr2 23144904 23145226 -158602861 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 2 761 3004 34 0 0 chr2 23146216 23146542 -158601545 + IAPLTR3 LTR ERVK 1 326 0 2 761 11223 41 76 0 chr2 23146543 23147910 -158600177 + IAPLTR3-int LTR ERVK 2 1472 -5349 2 761 3992 81 6 7 chr2 23147908 23148476 -158599611 + IAPLTR3-int LTR ERVK 5173 5746 -1075 2 761 9330 28 0 7 chr2 23148692 23149754 -158598333 + IAPLTR3-int LTR ERVK 5747 6801 -20 2 761 3000 31 0 0 chr2 23149754 23150080 -158598007 + IAPLTR3 LTR ERVK 1 326 0 2 761 4146 200 75 34 chr2 23163596 23164563 -158583524 - RLTR13D2 LTR ERVK -16 1007 1 2 761 4254 102 30 61 chr2 23167077 23167868 -158580219 + RMER17A LTR ERVK 1 751 0 2 761 1734 246 95 42 chr2 23169861 23170387 -158577700 + RMER15 LTR ERVL 22 575 0 2 761 294 224 45 10 chr2 23176069 23176171 -158571916 + RMER6-int LTR ERVK 804 932 -2245 2 761 862 275 125 52 chr2 23185767 23186112 -158561975 - MTE2b LTR MaLR -9 370 1 2 761 2953 218 80 89 chr2 23187025 23187801 -158560286 - RMER13A LTR ERVK -91 769 1 2 761 1184 319 125 60 chr2 23188127 23188663 -158559424 - MTE2a-int LTR MaLR 0 1580 1008 2 761 1325 177 133 75 chr2 23188663 23189024 -158559063 - ORR1C2 LTR MaLR -2 382 1 2 761 1184 278 172 34 chr2 23189024 23189408 -158558679 - MTE2a-int LTR MaLR -573 1007 528 2 761 988 331 39 39 chr2 23189429 23189793 -158558294 - MTE2a-int LTR MaLR -1214 366 3 2 761 715 306 72 52 chr2 23189795 23190157 -158557930 - MTE2a LTR MaLR -7 372 4 2 761 1664 146 155 3 chr2 23192300 23192672 -158555415 - MYSERV6-int LTR ERVK -7622 1337 909 2 762 1622 252 52 66 chr2 23210007 23210509 -158537578 - RLTR20B3 LTR ERVK -59 518 24 3 762 1942 204 113 8 chr2 23221127 23221631 -158526456 - RLTR31B_Mm LTR ERVK 0 557 1 3 762 5908 83 1 11 chr2 23222133 23222489 -158525598 + RLTR22_Mus LTR ERVK 1 354 -1454 3 762 3391 127 9 170 chr2 23222489 23223384 -158524703 + RMER17A LTR ERVK 1 751 0 3 762 5908 83 1 11 chr2 23223384 23223851 -158524236 + RLTR22_Mus LTR ERVK 355 816 -992 3 762 1619 103 51 8 chr2 23224085 23224340 -158523747 + RLTR22_Mus LTR ERVK 1543 1808 0 3 762 3615 130 117 145 chr2 23229211 23230140 -158517947 + RMER17A2 LTR ERVK 1 903 -3 3 762 477 291 91 53 chr2 23234964 23235207 -158512880 - ORR1D-int LTR MaLR -737 633 382 3 762 1416 227 48 61 chr2 23243246 23243621 -158504466 + ORR1C1 LTR MaLR 1 370 -8 3 762 288 187 12 74 chr2 23253985 23254066 -158494021 - RLTR25B LTR ERVK -530 498 423 3 762 415 261 112 9 chr2 23259710 23259826 -158488261 - MLT2B3 LTR ERVL 0 560 433 3 762 421 308 127 65 chr2 23260232 23260461 -158487626 - MLT2B3 LTR ERVL -264 290 48 3 762 234 295 40 40 chr2 23260384 23260483 -158487604 - MTEb LTR MaLR -266 113 15 3 762 816 292 34 19 chr2 23261845 23262110 -158485977 - RMER15 LTR ERVL -12 563 295 3 762 430 264 30 48 chr2 23264493 23264660 -158483427 + RNLTR23 LTR ERVK 479 642 0 3 762 521 258 162 29 chr2 23265899 23266139 -158481948 - RLTR10A LTR ERVK 0 411 140 3 762 480 373 79 9 chr2 23282773 23283000 -158465087 + MTE-int LTR MaLR 1091 1333 -247 3 762 654 239 94 30 chr2 23283105 23283308 -158464779 + MTE-int LTR MaLR 1331 1546 -34 3 762 563 333 81 32 chr2 23283295 23283605 -158464482 + ORR1E LTR MaLR 33 357 -2 3 762 801 232 141 26 chr2 23284141 23284375 -158463712 - ORR1E LTR MaLR -4 355 95 3 762 5257 118 82 9 chr2 23286906 23287748 -158460339 - RMER17A2 LTR ERVK -3 903 1 3 762 825 191 28 0 chr2 23287999 23288140 -158459947 - RLTR42 LTR ERVK -92 147 3 3 762 688 187 0 54 chr2 23288142 23288289 -158459798 - RLTR42-int LTR ERVK 0 5522 5384 3 762 6959 177 51 48 chr2 23288588 23290219 -158457868 - RLTR42-int LTR ERVK -125 5397 3762 3 762 424 168 10 21 chr2 23290252 23290349 -158457738 - RLTR42-int LTR ERVK -2016 3506 3411 3 762 1958 171 77 91 chr2 23290796 23291055 -158457032 - RLTR42-int LTR ERVK -2540 2982 2711 3 762 1958 171 77 91 chr2 23291264 23291503 -158456584 - RLTR42-int LTR ERVK -2812 2710 2483 3 762 358 169 26 0 chr2 23292112 23292189 -158455898 - RLTR42-int LTR ERVK -4722 800 722 3 762 513 200 0 83 chr2 23292212 23292332 -158455755 - RLTR42-int LTR ERVK -4948 574 465 3 762 1293 233 17 71 chr2 23292374 23292725 -158455362 - RLTR42-int LTR ERVK -5190 332 1 3 762 701 186 16 0 chr2 23292725 23292849 -158455238 - RLTR42 LTR ERVK 0 239 114 3 762 653 268 171 18 chr2 23303200 23303580 -158444507 + MTD-int LTR MaLR 821 1258 0 4 762 1142 268 126 5 chr2 23303580 23303952 -158444135 + MTD LTR MaLR 1 417 -2 4 762 2178 142 62 24 chr2 23308829 23309198 -158438889 + RLTR9A2 LTR ERVK 1 383 0 4 762 2349 141 23 57 chr2 23312794 23313231 -158434856 - BGLII_Mus LTR ERVK 0 422 1 4 762 3360 189 124 22 chr2 23319131 23319984 -158428103 - RMER17B LTR ERVK -3 955 49 4 762 1333 197 210 16 chr2 23322490 23322856 -158425231 - RLTR33 LTR ERVK -67 611 175 4 762 532 259 22 7 chr2 23322995 23323131 -158424956 + RLTR42-int LTR ERVK 1189 1326 -4196 4 762 705 249 179 41 chr2 23323436 23323665 -158424422 - RMER17C LTR ERVK -48 362 85 4 762 705 249 179 41 chr2 23323769 23323856 -158424231 - RMER17C LTR ERVK -326 84 2 4 762 653 172 283 5 chr2 23326656 23326843 -158421244 + MTC-int LTR MaLR 974 1212 -46 4 763 1851 243 11 27 chr2 23335266 23335642 -158412445 + RLTR21 LTR ERVK 5 374 -1198 4 763 1217 243 20 41 chr2 23336024 23336367 -158411720 + RLTR21 LTR ERVK 361 696 -876 4 763 379 204 51 0 chr2 23336532 23336630 -158411457 + RLTR21 LTR ERVK 694 796 -776 4 763 865 208 24 61 chr2 23336717 23336963 -158411124 + RLTR21 LTR ERVK 818 1054 -518 4 763 2816 12 3 6 chr2 23344338 23344677 -158403410 - ORR1A0 LTR MaLR -8 338 1 4 763 5293 41 51 1 chr2 23344677 23345363 -158402724 - ORR1A0-int LTR MaLR 0 1792 1073 4 763 1456 200 102 20 chr2 23346440 23346782 -158401305 + ORR1C1 LTR MaLR 1 370 -8 4 763 306 178 0 0 chr2 23350043 23350088 -158397999 + RLTR18B LTR ERVK 1 45 -467 4 763 1490 231 15 45 chr2 23350765 23351096 -158396991 + RLTR18B LTR ERVK 38 358 -154 4 763 225 67 0 0 chr2 23355393 23355423 -158392664 - RMER13A LTR ERVK -655 205 176 4 763 579 231 107 73 chr2 23357136 23357490 -158390597 + RMER17C-int LTR ERVK 2627 2848 -390 4 763 1645 201 9 98 chr2 23357780 23358217 -158389870 + RMER10B LTR ERVL 1 398 0 4 763 306 256 54 22 chr2 23358626 23358716 -158389371 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 338 4 763 2628 146 40 24 chr2 23358716 23359215 -158388872 + LTRIS4 LTR ERV1 1 507 0 4 763 1981 198 18 54 chr2 23359268 23359641 -158388446 + RLTR22_Mur LTR ERVK 330 685 -1163 4 763 1981 198 18 54 chr2 23359719 23359789 -158388298 + RLTR22_Mur LTR ERVK 686 757 -1091 4 763 321 111 30 60 chr2 23359886 23359953 -158388134 + RLTR22_Mus LTR ERVK 1545 1609 -199 4 763 961 151 116 27 chr2 23368734 23368958 -158379129 + RMER17A2 LTR ERVK 659 902 -4 4 763 3203 43 5 10 chr2 23369502 23369900 -158378187 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 763 920 293 58 42 chr2 23406782 23407092 -158340995 + ORR1E LTR MaLR 45 359 0 5 763 3216 38 13 3 chr2 23408559 23408951 -158339136 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 763 9009 38 3 2 chr2 23408951 23410047 -158338040 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1097 -1 5 763 2994 24 73 0 chr2 23410048 23410417 -158337670 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 763 932 195 53 11 chr2 23412234 23412421 -158335666 - RMER5 LTR ERV1 -339 195 1 5 763 324 125 0 0 chr2 23413863 23413911 -158334176 - ORR1A3-int LTR MaLR -1031 932 885 5 763 394 202 25 0 chr2 23416265 23416344 -158331743 + MT2A LTR ERVL 3 83 -450 5 763 911 232 51 30 chr2 23416391 23416626 -158331461 + MTC LTR MaLR 180 419 -2 5 763 911 251 155 6 chr2 23421158 23421475 -158326612 - ORR1D1 LTR MaLR -5 369 6 5 763 682 326 42 0 chr2 23428575 23428790 -158319297 - MTEb LTR MaLR -3 376 153 5 763 4074 95 89 47 chr2 23429216 23429937 -158318150 - RMER17A LTR ERVK 0 751 1 5 763 609 272 146 52 chr2 23430584 23431029 -158317058 + RLTR12B LTR ERVK 14 500 -28 5 763 2714 117 97 160 chr2 23436338 23437100 -158310987 + RMER17A2 LTR ERVK 1 714 -192 5 763 1307 220 117 15 chr2 23437509 23437850 -158310237 + RLTR30 LTR ERV1 4 379 0 5 763 2390 183 43 100 chr2 23438438 23439040 -158309047 - RLTR12A LTR ERVK 0 568 1 5 763 273 49 0 0 chr2 23439445 23439486 -158308601 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 41 -281 5 763 1049 211 16 56 chr2 23441394 23441700 -158306387 - RMER17C LTR ERVK -30 380 87 5 763 809 157 201 49 chr2 23443362 23443598 -158304489 - ORR1B1 LTR MaLR -159 235 2 5 763 3800 51 20 4 chr2 23445511 23445999 -158302088 + LTRIS2 LTR ERV1 69 564 0 6 763 225 0 0 0 chr2 23445992 23446019 -158302068 + RLTR6_Mm LTR ERV1 613 639 -15 6 763 697 65 0 0 chr2 23446226 23446319 -158301768 + RLTR1B-int LTR ERV1 201 293 -3006 6 763 870 119 68 19 chr2 23446665 23446827 -158301260 + RMER16-int LTR ERVK 141 310 -5096 6 763 3774 112 65 3 chr2 23446854 23447454 -158300633 + RMER16-int LTR ERVK 703 1339 -4067 6 763 283 205 22 78 chr2 23449575 23449665 -158298422 + RMER16-int LTR ERVK 1994 2078 -5328 6 763 2777 179 77 28 chr2 23449656 23450947 -158297140 + RLTR1B-int LTR ERV1 760 1847 -3216 6 763 3291 95 84 19 chr2 23450927 23451464 -158296623 + RLTR1B-int LTR ERV1 1619 2190 -1109 6 763 606 224 21 97 chr2 23452033 23452270 -158295817 + RMER16 LTR ERVK 263 481 -52 6 763 334 181 71 24 chr2 23452750 23452835 -158295252 + RMER17C-int LTR ERVK 379 467 -2771 6 763 814 169 180 62 chr2 23453192 23453624 -158294463 + RMER17C-int LTR ERVK 1508 1990 -1248 6 763 747 162 50 6 chr2 23453631 23453792 -158294295 + RMER17C-int LTR ERVK 2169 2336 -902 6 763 1581 131 239 42 chr2 23453804 23454394 -158293693 + RMER17C-int LTR ERVK 2533 3238 0 6 763 1172 179 49 36 chr2 23454398 23454736 -158293351 + RMER17C LTR ERVK 156 410 0 6 764 256 351 17 68 chr2 23461995 23462172 -158285915 - RMER4A LTR ERVK -274 192 25 6 764 437 351 43 43 chr2 23463332 23463543 -158284544 + MamGypLTR1c LTR Gypsy 589 799 -4 6 764 1877 203 22 20 chr2 23464667 23465024 -158283063 - ORR1B2 LTR MaLR -8 359 2 6 764 277 336 71 8 chr2 23468164 23468290 -158279797 + LTR31 LTR ERV1 462 595 -24 6 764 235 169 136 0 chr2 23469524 23469554 -158278533 + RMER5 LTR ERV1 24 61 -473 6 764 878 247 62 12 chr2 23469554 23469796 -158278291 + ORR1B1 LTR MaLR 1 254 -140 6 764 431 239 26 9 chr2 23469817 23469931 -158278156 + RMER5 LTR ERV1 289 404 -130 6 764 567 214 54 31 chr2 23470499 23470629 -158277458 + RMER5 LTR ERV1 399 531 -3 6 764 1775 226 47 16 chr2 23472870 23473256 -158274831 - MTD LTR MaLR -7 412 15 6 764 1711 63 0 0 chr2 23478191 23478414 -158269673 - RLTR10 LTR ERVK -167 223 1 6 764 1172 217 136 69 chr2 23487978 23488369 -158259718 - MTC-int LTR MaLR -142 1116 700 6 764 808 228 38 55 chr2 23488354 23488661 -158259426 - MTC-int LTR MaLR -865 393 2 6 764 1584 234 100 36 chr2 23488667 23489058 -158259029 - MTC LTR MaLR -5 416 1 6 764 1210 208 8 16 chr2 23491456 23491705 -158256382 - MERVL_2A-int LTR ERVL -643 5118 4872 6 764 1859 161 99 0 chr2 23491706 23492048 -158256039 - RLTR14 LTR ERV1 0 382 7 6 764 910 286 39 0 chr2 23492068 23492302 -158255785 - MERVL_2A-int LTR ERVL -887 4874 4632 6 764 279 160 0 23 chr2 23492526 23492613 -158255474 - MT2A LTR ERVL 0 555 466 6 764 458 294 10 0 chr2 23492652 23492776 -158255311 - MT2A LTR ERVL -63 538 348 6 764 933 215 184 4 chr2 23492786 23493052 -158255035 - RLTR22_Mur LTR ERVK 0 1848 1535 6 764 4669 143 12 25 chr2 23493237 23494060 -158254027 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1036 812 1 6 764 1029 234 13 46 chr2 23494060 23494298 -158253789 - MT2A LTR ERVL -292 241 12 6 764 1855 145 96 113 chr2 23505053 23505511 -158242576 + RLTR11B LTR ERVK 4 453 0 5 764 1043 296 108 21 chr2 23506630 23507010 -158241077 + MTD LTR MaLR 6 418 -1 7 764 1838 186 228 16 chr2 23516844 23517292 -158230795 + MT2B LTR ERVL 1 543 -58 1 764 746 257 0 44 chr2 23518592 23518775 -158229312 - RLTR31_Mur LTR ERVK 0 553 379 2 764 827 281 52 49 chr2 23518884 23519213 -158228874 - RLTR17 LTR ERVK -238 454 125 2 764 1470 283 22 7 chr2 23520356 23520769 -158227318 - MTD LTR MaLR 0 419 1 2 764 1510 272 40 28 chr2 23521736 23522136 -158225951 + MTD LTR MaLR 3 407 -12 2 764 1914 265 115 44 chr2 23522160 23522871 -158225216 + MTD-int LTR MaLR 20 781 -477 2 764 247 245 0 0 chr2 23522901 23522950 -158225137 + MTD LTR MaLR 327 375 -44 3 764 2996 178 25 52 chr2 23523706 23524305 -158223782 + RMER20B LTR ERVK 8 590 -37 3 764 4260 135 36 36 chr2 23524775 23525459 -158222628 - RMER17C-int LTR ERVK -649 2589 2002 3 764 4260 148 39 36 chr2 23525824 23526150 -158221937 - RMER17C-int LTR ERVK -1237 2001 1677 3 764 2229 98 9 9 chr2 23526150 23526469 -158221618 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 3 764 2974 157 41 2 chr2 23526473 23526990 -158221097 + ORR1A2-int LTR MaLR 1 537 -1426 3 764 409 136 61 12 chr2 23526996 23527078 -158221009 + ORR1A2-int LTR MaLR 938 1023 -940 3 764 3149 137 46 2 chr2 23527090 23527608 -158220479 - RMER2 LTR ERV1 -26 541 1 3 764 319 182 0 0 chr2 23527608 23527653 -158220434 + ORR1A2-int LTR MaLR 540 584 -1208 4 764 483 206 9 113 chr2 23527628 23527743 -158220344 + MT2B LTR ERVL 157 259 -342 4 764 277 148 180 0 chr2 23527763 23527824 -158220263 + MT2B LTR ERVL 193 264 -337 4 764 6952 132 30 10 chr2 23527778 23528938 -158219149 + ORR1A2-int LTR MaLR 781 1963 0 4 764 1996 115 42 71 chr2 23528938 23529275 -158218812 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 4 764 2253 170 74 85 chr2 23529275 23529569 -158218518 - RMER17C-int LTR ERVK -1558 1680 1387 3 764 2253 170 74 85 chr2 23529600 23529673 -158218414 - RMER17C-int LTR ERVK -1852 1386 1341 3 764 2253 170 74 85 chr2 23529850 23530091 -158217996 - RMER17C-int LTR ERVK -1898 1340 1079 3 764 2261 228 112 71 chr2 23530726 23531487 -158216600 - RMER17C-int LTR ERVK -2440 798 7 3 764 1642 171 8 45 chr2 23531493 23531892 -158216195 - RMER17C LTR ERVK -3 407 24 3 764 322 232 63 39 chr2 23535212 23535323 -158212764 - MTD LTR MaLR -28 391 273 4 764 2543 99 98 13 chr2 23537515 23537721 -158210366 + BGLII LTR ERVK 1 206 -215 5 764 2543 99 98 13 chr2 23537890 23538071 -158210016 + BGLII LTR ERVK 207 421 0 5 764 570 93 0 0 chr2 23538476 23538564 -158209523 + RMER3D-int LTR ERVK 489 564 -2278 5 764 754 185 12 171 chr2 23538579 23538990 -158209097 + RMER3D-int LTR ERVK 354 1078 -6328 5 764 2799 164 81 77 chr2 23539085 23539675 -158208412 + RMER3D-int LTR ERVK 470 1591 -1251 5 764 3676 44 2 80 chr2 23539675 23540105 -158207982 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 424 -51 5 764 3676 44 2 80 chr2 23540252 23540336 -158207751 + MT2C_Mm LTR ERVL 425 475 0 5 764 2799 163 84 79 chr2 23540336 23540445 -158207642 + RMER3D-int LTR ERVK 1592 1697 -1145 5 764 3391 200 103 7 chr2 23540434 23541374 -158206713 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 1297 2326 0 6 764 1613 48 121 23 chr2 23541374 23541630 -158206457 + BGLII LTR ERVK 1 281 -140 6 764 914 129 0 14 chr2 23541899 23542041 -158206046 + BGLII LTR ERVK 282 421 0 6 764 1199 222 276 90 chr2 23543047 23543453 -158204634 + MT2A LTR ERVL 1 459 -74 6 764 1199 222 276 90 chr2 23543519 23543557 -158204530 + MT2A LTR ERVL 460 527 -6 6 764 3778 209 108 20 chr2 23543560 23544479 -158203608 + MERVL_2A-int LTR ERVL 1 1000 -4761 6 764 529 220 36 48 chr2 23544479 23544646 -158203441 - RLTR43A LTR ERVK 0 364 200 6 764 2025 224 5 33 chr2 23544835 23545260 -158202827 - ETnERV2-int LTR ERVK -348 7058 6646 6 764 281 347 28 0 chr2 23545266 23545410 -158202677 - MERVK26-int LTR ERVK -407 7810 7663 6 764 303 351 9 0 chr2 23545522 23545636 -158202451 - MERVK26-int LTR ERVK -316 6603 6489 6 764 3240 207 93 7 chr2 23546560 23547423 -158200664 - ETnERV2-int LTR ERVK -1612 5794 5125 7 764 1996 270 30 11 chr2 23547483 23548191 -158199896 - ETnERV2-int LTR ERVK -2873 4533 4077 7 764 1017 201 10 0 chr2 23548213 23548407 -158199680 - ETnERV2-int LTR ERVK -2567 2839 2644 7 764 4506 162 23 71 chr2 23548419 23549173 -158198914 - ETnERV2-int LTR ERVK -4806 2600 1890 7 764 3522 13 2 0 chr2 23549173 23549568 -158198519 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 7 764 9320 23 0 17 chr2 23549568 23550685 -158197402 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 7 764 3532 13 2 0 chr2 23550685 23551080 -158197007 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 7 764 4506 162 23 71 chr2 23551080 23551248 -158196839 - ETnERV2-int LTR ERVK -5517 1889 1723 7 764 945 223 118 16 chr2 23551248 23551503 -158196584 - ETnERV2-int LTR ERVK -5469 668 388 7 764 4661 187 50 9 chr2 23551537 23552445 -158195642 + MERVL_2A-int LTR ERVL 993 1937 -3824 6 764 3694 235 40 6 chr2 23552445 23553268 -158194819 + MERVL_2A-int LTR ERVL 2857 3707 -2054 6 764 3563 216 64 21 chr2 23556333 23557109 -158190978 + RMER13B LTR ERVK 1 810 -98 7 764 467 267 17 64 chr2 23557400 23557572 -158190515 + RNLTR23 LTR ERVK 479 642 0 7 764 550 229 9 9 chr2 23557573 23557683 -158190404 + RMER13B LTR ERVK 799 908 0 7 764 3262 25 30 0 chr2 23558372 23558771 -158189316 - IAPLTR2a LTR ERVK 0 411 1 7 764 2403 115 23 3 chr2 23568007 23568392 -158179695 + RLTR22_Mur LTR ERVK 440 832 -1016 8 764 383 311 43 71 chr2 23568608 23568819 -158179268 + RMER12 LTR ERVK 1101 1305 -17 8 764 328 312 62 15 chr2 23569998 23570128 -158177959 - MLT1A LTR MaLR -210 164 29 8 764 867 284 92 92 chr2 23584438 23584818 -158163269 - MTD LTR MaLR -39 380 1 1 764 2093 278 134 26 chr2 23584820 23585673 -158162414 - MTD-int LTR MaLR -2 1256 312 1 764 237 191 43 0 chr2 23585708 23585755 -158162332 - MTD-int LTR MaLR -1743 49 1 1 764 1236 272 39 52 chr2 23585755 23586066 -158162021 - MTD LTR MaLR 0 419 110 1 764 1236 272 39 52 chr2 23586212 23586284 -158161803 - MTD LTR MaLR -310 109 41 1 765 1325 229 65 43 chr2 23596871 23597223 -158150864 - ORR1D1 LTR MaLR -4 370 11 1 765 4768 131 61 40 chr2 23600389 23601258 -158146829 + RMER17D LTR ERVK 1 887 -2 1 765 370 335 70 80 chr2 23602559 23602845 -158145242 - ORR1E LTR MaLR 0 359 77 1 765 1574 195 42 132 chr2 23603605 23603937 -158144150 + ORR1B1 LTR MaLR 3 344 -50 1 765 1574 195 42 132 chr2 23604076 23604174 -158143913 + ORR1B1 LTR MaLR 345 394 0 1 765 544 330 33 6 chr2 23604887 23605070 -158143017 - ORR1E LTR MaLR -162 197 10 1 765 4225 25 0 0 chr2 23608959 23609441 -158138646 + LTRIS_Mm LTR ERV1 1 482 0 1 765 356 241 51 85 chr2 23609476 23609594 -158138493 - MT2B LTR ERVL -335 266 153 1 765 2236 169 28 3 chr2 23609925 23610316 -158137771 - RLTR13D5 LTR ERVK -622 401 1 1 765 1711 207 12 32 chr2 23613125 23613465 -158134622 - ORR1B1 LTR MaLR -9 385 53 1 765 582 337 18 20 chr2 23613465 23613873 -158134214 - MuRRS4-int LTR ERV1 -5958 1598 1159 1 765 670 154 195 0 chr2 23615300 23615449 -158132638 - RLTR47_MM LTR ERV1 0 532 355 1 765 2518 173 50 111 chr2 23615716 23616320 -158131767 + RLTR18 LTR ERVK 38 604 -12 1 765 2501 83 3 0 chr2 23620410 23620747 -158127340 + ORR1A1 LTR MaLR 1 338 -8 1 765 2161 179 43 9 chr2 23624237 23624683 -158123404 + RMER6B LTR ERVK 1 461 0 1 765 3481 126 94 2 chr2 23624818 23625368 -158122719 + MT2B LTR ERVL 1 601 0 1 765 3056 81 7 5 chr2 23630588 23631008 -158117079 + BGLII LTR ERVK 1 421 0 1 765 536 198 113 0 chr2 23639840 23640017 -158108070 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 2130 2326 0 2 765 2652 82 26 5 chr2 23640017 23640408 -158107679 + BGLII LTR ERVK 1 399 -22 2 765 2395 43 10 7 chr2 23640914 23641220 -158106867 + RLTR10 LTR ERVK 1 307 -83 2 765 286 125 0 0 chr2 23641254 23641310 -158106777 + RLTR10 LTR ERVK 259 314 -76 2 765 949 39 15 15 chr2 23641331 23641461 -158106626 + RLTR10 LTR ERVK 259 388 -2 2 765 15521 27 1 32 chr2 23641473 23643480 -158104607 + RLTR10-int LTR ERVK 41 1984 -3 2 765 2395 43 10 7 chr2 23643482 23643788 -158104299 + RLTR10 LTR ERVK 1 307 -83 2 765 286 125 0 0 chr2 23643822 23643878 -158104209 + RLTR10 LTR ERVK 259 314 -76 2 765 967 39 15 15 chr2 23643899 23644031 -158104056 + RLTR10 LTR ERVK 259 390 0 2 765 2571 138 37 37 chr2 23659778 23660260 -158087827 - RLTR45 LTR ERVK 0 482 1 2 765 243 114 0 0 chr2 23660727 23660762 -158087325 - MLT2D LTR ERVL -2 558 524 2 765 283 357 99 93 chr2 23660908 23661220 -158086867 - MT2A LTR ERVL -108 425 112 2 765 663 297 46 5 chr2 23662785 23662981 -158085106 + MTE2b LTR MaLR 129 332 -47 2 765 247 250 0 0 chr2 23663032 23663084 -158085003 + MTE-int LTR MaLR 63 114 -1466 2 765 696 278 141 42 chr2 23663088 23663422 -158084665 - MTE2a LTR MaLR -4 375 9 2 765 253 242 30 15 chr2 23663443 23663510 -158084577 + RLTR16 LTR ERVK 31 98 -407 2 765 2243 111 72 9 chr2 23663513 23663859 -158084228 + RLTR9A LTR ERVK 1 368 0 2 765 259 258 59 90 chr2 23663877 23664133 -158083954 + ETnERV2-int LTR ERVK 17 264 -3050 2 765 1226 146 99 134 chr2 23664297 23664670 -158083417 + RLTR45-int LTR ERVK 2092 2451 -4793 2 765 2705 108 60 20 chr2 23665061 23665560 -158082527 + ETnERV2-int LTR ERVK 1425 1943 -5463 2 765 736 167 0 8 chr2 23665638 23665771 -158082316 + RMER16-int LTR ERVK 1406 1537 -3869 2 765 1792 251 19 51 chr2 23665792 23666589 -158081498 + RMER16-int LTR ERVK 1078 2487 -4919 2 765 9918 158 65 20 chr2 23667052 23668447 -158079640 + RMER16-int LTR ERVK 1566 3931 -3475 2 765 9918 151 65 19 chr2 23668507 23669141 -158078946 + RMER16-int LTR ERVK 2857 3502 -1904 2 765 439 256 128 30 chr2 23671339 23671472 -158076615 + MTEa LTR MaLR 65 210 -169 2 765 740 184 98 7 chr2 23681968 23682071 -158066016 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 273 2 765 740 184 98 7 chr2 23682149 23682198 -158065889 - ORR1C1 LTR MaLR -106 272 214 2 765 1555 197 86 36 chr2 23682706 23683043 -158065044 - ORR1B2 LTR MaLR -13 354 1 2 765 321 306 137 14 chr2 23683256 23683402 -158064685 - MTD LTR MaLR -45 374 211 2 765 995 331 24 38 chr2 23695304 23695674 -158052413 - MTEb LTR MaLR -14 365 1 2 765 775 237 23 23 chr2 23714466 23714643 -158033444 - RLTR20A1 LTR ERVK 0 551 375 2 765 1876 243 55 3 chr2 23715070 23715516 -158032571 - MT2A LTR ERVL -54 530 1 2 765 932 183 51 92 chr2 23716379 23716674 -158031413 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 40 2 765 435 115 24 71 chr2 23716737 23716821 -158031266 - ETnERV2-int LTR ERVK 0 7406 7327 2 765 513 247 150 73 chr2 23716825 23717187 -158030900 - RLTR13D6 LTR ERVK -371 531 90 2 765 5985 136 30 3 chr2 23717187 23718071 -158030016 - ETnERV2-int LTR ERVK -272 7134 6227 2 765 4685 118 28 29 chr2 23718187 23718973 -158029114 - MMETn-int LTR ERVK -1703 3141 2357 2 765 2879 174 62 52 chr2 23718946 23720532 -158027555 - ETnERV2-int LTR ERVK -4263 3143 1730 2 765 5911 129 41 76 chr2 23720574 23721743 -158026344 - ETnERV2-int LTR ERVK -3714 1130 3 2 765 902 203 41 81 chr2 23721747 23722042 -158026045 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 40 2 766 781 181 59 164 chr2 23725338 23725576 -158022511 - MT2A LTR ERVL -309 224 12 2 766 644 277 56 17 chr2 23727122 23727302 -158020785 - RLTR18B LTR ERVK -321 191 5 2 766 5251 154 19 21 chr2 23727755 23728665 -158019422 - RMER13B LTR ERVK 0 908 1 2 766 431 289 18 0 chr2 23728736 23728850 -158019237 + RLTR18B LTR ERVK 397 512 0 2 766 270 361 50 50 chr2 23741691 23741809 -158006278 + ORR1D2 LTR MaLR 5 129 -241 3 766 1706 197 192 35 chr2 23741809 23742294 -158005793 - RLTR31_Mm LTR ERVK 0 561 1 3 766 270 361 50 50 chr2 23742294 23742315 -158005772 + ORR1D2 LTR MaLR 130 144 -226 3 766 1247 219 65 24 chr2 23743663 23744048 -158004039 - RLTR26 LTR ERVK -202 440 1 3 766 1476 178 71 46 chr2 23746020 23746166 -158001921 + ORR1C1 LTR MaLR 2 151 -227 3 766 1476 178 71 46 chr2 23746260 23746437 -158001650 + ORR1C1 LTR MaLR 152 333 -45 3 766 225 178 15 61 chr2 23746487 23746553 -158001534 - MER88 LTR ERVL -307 157 95 3 766 287 327 14 13 chr2 23749719 23749940 -157998147 - ETnERV3-int LTR ERVK -520 5288 5130 3 766 1481 152 64 43 chr2 23750803 23751085 -157997002 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 39 3 766 244 77 0 25 chr2 23751450 23751490 -157996597 - ORR1A3 LTR MaLR -290 39 1 3 766 11318 136 29 14 chr2 23751490 23752398 -157995689 - ORR1A3-int LTR MaLR 0 1963 1039 3 766 11318 136 29 14 chr2 23752578 23753603 -157994484 - ORR1A3-int LTR MaLR -925 1038 1 3 766 2118 111 9 16 chr2 23753607 23753927 -157994160 - ORR1A3 LTR MaLR -8 318 1 3 766 369 242 32 0 chr2 23754748 23754843 -157993244 - RLTR23 LTR ERV1 -5 425 328 3 766 688 273 145 28 chr2 23754916 23755240 -157992847 + RLTR22_Mur LTR ERVK 438 799 -1049 3 766 244 192 242 11 chr2 23755315 23755407 -157992680 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1543 1701 -147 3 766 1471 194 160 43 chr2 23757236 23757635 -157990452 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 1 3 766 1700 142 19 0 chr2 23761504 23761765 -157986322 - ORR1A2 LTR MaLR -22 305 40 3 766 2303 125 42 20 chr2 23762363 23762763 -157985324 - RLTR9E LTR ERVK 0 409 1 3 766 536 40 0 50 chr2 23762763 23762843 -157985244 - MMETn-int LTR ERVK 0 7406 7331 3 766 2241 183 108 6 chr2 23762843 23763332 -157984755 - RLTR13D6 LTR ERVK -363 539 1 3 766 1097 109 11 11 chr2 23763343 23763519 -157984568 - ETnERV3-int LTR ERVK -28 5780 5605 3 766 457 136 0 12 chr2 23763548 23763630 -157984457 - ETnERV3-int LTR ERVK -199 5609 5529 3 766 969 126 31 47 chr2 23763766 23763958 -157984129 - MMETn-int LTR ERVK -955 6451 6263 3 766 1487 207 34 58 chr2 23764396 23765124 -157982963 - MMETn-int LTR ERVK -1545 3861 2696 3 766 2027 113 15 9 chr2 23765127 23765466 -157982621 - ETnERV2-int LTR ERVK -3509 3897 3557 3 766 629 117 53 18 chr2 23765630 23765743 -157982344 - ETnERV2-int LTR ERVK -3835 3571 3455 3 766 1294 207 23 26 chr2 23765735 23766038 -157982049 - ETnERV2-int LTR ERVK -4724 2682 2381 3 766 3620 163 88 12 chr2 23772214 23773101 -157974986 - ETnERV2-int LTR ERVK -5074 2332 636 3 766 564 164 9 18 chr2 23773089 23773201 -157974886 - ETnERV2-int LTR ERVK -4619 787 677 3 766 849 125 105 23 chr2 23773185 23773357 -157974730 - ETnERV2-int LTR ERVK -5080 326 141 3 766 298 186 0 17 chr2 23773811 23773871 -157974216 - RLTR45-int LTR ERVK -5095 2149 2091 3 766 2913 91 77 35 chr2 23774274 23774730 -157973357 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 3 766 31983 22 4 2 chr2 23774732 23775265 -157972822 - IAPEz-int LTR ERVK -2 6479 5944 3 766 36501 25 13 21 chr2 23775365 23781446 -157966641 - IAPEz-int LTR ERVK -538 5943 9 3 766 2860 93 75 52 chr2 23781447 23781911 -157966176 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 3 766 328 212 26 88 chr2 23781972 23782086 -157966001 - MMETn-int LTR ERVK -4630 214 108 3 766 334 234 18 27 chr2 23782117 23782227 -157965860 - MMETn-int LTR ERVK -4734 110 2 3 766 2137 129 58 20 chr2 23782229 23782623 -157965464 - RLTR9E LTR ERVK 0 409 1 3 766 433 264 30 54 chr2 23784847 23785015 -157963072 + RNLTR23 LTR ERVK 479 642 0 3 766 2435 72 29 32 chr2 23814077 23814424 -157933663 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 3 766 2358 67 37 97 chr2 23816208 23816590 -157931497 - RLTR10D LTR ERVK 0 359 1 3 766 2214 197 55 43 chr2 23816915 23817492 -157930595 + RLTR31A_Mm LTR ERVK 1 584 0 3 766 2073 141 63 35 chr2 23819256 23819654 -157928433 - RLTR9E LTR ERVK 0 409 1 3 766 2690 208 35 30 chr2 23821693 23822297 -157925790 - RLTR17 LTR ERVK -73 619 13 3 766 5763 103 54 21 chr2 23827103 23828023 -157920064 + RMER17B LTR ERVK 1 951 -7 3 766 870 291 95 75 chr2 23834012 23834361 -157913726 - MTEa LTR MaLR -6 373 18 4 766 873 135 54 0 chr2 23836533 23836681 -157911406 - RLTR40 LTR ERVK -541 276 121 4 766 476 152 0 0 chr2 23836683 23836759 -157911328 + RMER19C LTR ERVK 1 76 -535 4 766 785 225 49 75 chr2 23836759 23837115 -157910972 + RMER2 LTR ERV1 1 398 -169 4 766 1797 241 69 12 chr2 23837212 23837707 -157910380 + MERVL_2A-int LTR ERVL 94 616 -5145 4 766 392 228 76 0 chr2 23837813 23837905 -157910182 + MERVL_2A-int LTR ERVL 618 716 -5045 4 766 235 304 106 53 chr2 23837907 23838077 -157910010 + RMER17C LTR ERVK 198 376 -34 4 766 1937 208 60 2 chr2 23838080 23838499 -157909588 + MERVL_2A-int LTR ERVL 977 1419 -4342 4 766 4997 231 102 83 chr2 23838936 23840906 -157907181 + MERVL_2A-int LTR ERVL 1416 3422 -2339 4 766 624 118 11 0 chr2 23840906 23840999 -157907088 - MTC LTR MaLR -327 94 1 4 766 1090 199 52 30 chr2 23841003 23841152 -157906935 + MERVL_2A-int LTR ERVL 3702 3857 -1904 4 766 2336 91 111 85 chr2 23841152 23841622 -157906465 - RLTR45 LTR ERVK 0 482 1 4 766 1358 207 140 10 chr2 23841622 23841982 -157906105 + MERVL_2A-int LTR ERVL 3858 4261 -1500 4 766 688 274 132 124 chr2 23843918 23844289 -157903798 + MTD LTR MaLR 2 375 -4 4 766 1230 182 0 0 chr2 23844637 23844846 -157903241 + MT2A LTR ERVL 1 209 -324 4 766 852 257 6 0 chr2 23844871 23845042 -157903045 + MT2A LTR ERVL 277 448 -85 4 766 1321 91 10 29 chr2 23845250 23845455 -157902632 + MMETn-int LTR ERVK 4308 4508 -336 4 766 236 295 118 69 chr2 23845456 23845660 -157902427 + RLTR13A2 LTR ERVK 277 490 -468 4 766 727 170 7 22 chr2 23845660 23845798 -157902289 + MMETn-int LTR ERVK 4709 4844 0 4 766 2142 88 6 50 chr2 23845798 23846135 -157901952 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 322 0 4 766 1992 191 28 0 chr2 23847222 23847584 -157900503 - RMER15 LTR ERVL -31 544 173 4 766 520 267 122 84 chr2 23848834 23849071 -157899016 - RMER15 LTR ERVL -329 246 1 4 766 846 278 38 38 chr2 23849814 23850027 -157898060 + ORR1D-int LTR MaLR 697 909 -461 4 766 2137 158 39 23 chr2 23850257 23850645 -157897442 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 4 766 611 209 52 7 chr2 23850682 23850817 -157897270 - MTD LTR MaLR 0 419 279 4 766 365 281 101 29 chr2 23850889 23851028 -157897059 - MTD LTR MaLR -265 154 6 4 766 337 161 16 0 chr2 23851448 23851510 -157896577 + MTD LTR MaLR 1 63 -356 4 766 1901 176 67 5 chr2 23851797 23852168 -157895919 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 4 766 372 172 31 0 chr2 23852622 23852686 -157895401 - ORR1B1 LTR MaLR -328 66 1 4 766 1395 206 54 67 chr2 23853232 23853680 -157894407 + RMER10A LTR ERVL 1 442 0 4 767 1030 208 80 24 chr2 23856308 23856559 -157891528 + RMER10B LTR ERVL 1 265 -133 4 767 807 269 5 34 chr2 23856572 23856780 -157891307 + RMER10B LTR ERVL 196 397 -1 4 767 753 217 6 18 chr2 23857034 23857198 -157890889 - RMER13B LTR ERVK 0 908 747 4 767 3048 159 32 6 chr2 23857194 23857724 -157890363 - RMER13B LTR ERVK -364 544 1 4 767 1318 216 64 50 chr2 23857741 23858145 -157889942 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 4 767 2984 52 31 0 chr2 23861884 23862268 -157885819 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 767 8547 48 16 3 chr2 23862268 23863352 -157884735 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 4 767 3257 41 5 0 chr2 23863352 23863746 -157884341 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 767 841 272 51 78 chr2 23864822 23865157 -157882930 - RLTR18 LTR ERVK 0 616 291 4 767 1181 207 79 29 chr2 23865180 23865459 -157882628 + ORR1C1 LTR MaLR 1 293 -85 4 767 540 252 114 37 chr2 23865451 23865746 -157882341 + ORR1C1-int LTR MaLR 422 807 -563 4 767 1366 195 40 45 chr2 23865748 23866463 -157881624 + RMER3D-int LTR ERVK 220 1340 -1502 4 767 1119 186 18 47 chr2 23866479 23866755 -157881332 + RMER3D-int LTR ERVK 2573 2840 -2 4 767 2065 169 16 186 chr2 23866757 23867433 -157880654 + RLTR31_Mm LTR ERVK 1 561 0 4 767 2584 183 104 7 chr2 23867433 23867979 -157880108 + ORR1C1-int LTR MaLR 910 1508 -1 4 767 268 211 0 0 chr2 23867980 23868032 -157880055 + ORR1C1 LTR MaLR 1 52 -332 4 767 233 267 49 16 chr2 23868022 23868083 -157880004 + ORR1C1 LTR MaLR 306 368 -10 4 767 2050 199 72 58 chr2 23868197 23868923 -157879164 + RLTR31_Mm LTR ERVK 1 561 0 4 767 1121 222 167 120 chr2 23869971 23870396 -157877691 + MT2A LTR ERVL 2 446 -87 4 767 2195 155 87 5 chr2 23870389 23870790 -157877297 + RLTR17 LTR ERVK 180 613 -79 4 767 788 186 43 51 chr2 23870791 23871044 -157877043 + RMER3D-int LTR ERVK 279 477 -2365 4 767 556 179 42 8 chr2 23871133 23871251 -157876836 + RMER3D-int LTR ERVK 489 610 -2232 4 767 7814 184 35 49 chr2 23871253 23873122 -157874965 + RMER3D-int LTR ERVK 470 2837 -5 4 767 2098 167 5 24 chr2 23873127 23873392 -157874695 + RLTR17 LTR ERVK 1 261 -431 4 767 4446 12 0 0 chr2 23873392 23873885 -157874202 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 4 767 2098 167 5 24 chr2 23873885 23873994 -157874093 + RLTR17 LTR ERVK 262 368 -324 4 767 245 183 134 0 chr2 23874108 23874190 -157873897 + MT2A LTR ERVL 436 528 -5 4 767 3655 130 28 78 chr2 23881050 23881841 -157866246 - RMER17A LTR ERVK 0 751 1 4 767 305 291 106 26 chr2 23884894 23885008 -157863079 + MLT2B4 LTR ERVL 20 142 -414 4 767 286 267 208 33 chr2 23885351 23885471 -157862616 + MLT2B4 LTR ERVL 376 516 -40 4 767 661 296 114 29 chr2 23885889 23886195 -157861892 + MER34A1 LTR ERV1 235 566 -21 4 767 4037 142 55 15 chr2 23887695 23888422 -157859665 - RMER6A LTR ERVK 0 756 1 4 767 4292 21 0 0 chr2 23889298 23889780 -157858307 + LTRIS_Mm LTR ERV1 1 482 0 4 767 31596 50 16 18 chr2 23889780 23894248 -157853839 + MuRRS-int LTR ERV1 1 4690 0 4 767 4252 21 0 0 chr2 23894248 23894727 -157853360 + LTRIS_Mm LTR ERV1 1 479 -3 4 767 2780 157 30 2 chr2 23901414 23901881 -157846206 + RLTR28B LTR ERVL 2 481 0 5 767 306 220 59 35 chr2 23902828 23902913 -157845174 + RLTR23 LTR ERV1 311 397 -33 5 767 8252 106 41 28 chr2 23920190 23921177 -157826910 - MERVL-int LTR ERVL -4111 1374 390 5 767 2634 41 16 68 chr2 23921177 23921542 -157826545 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 5 767 8252 106 41 28 chr2 23921542 23921910 -157826177 - MERVL-int LTR ERVL -5096 389 1 5 767 3557 79 11 2 chr2 23921910 23922381 -157825706 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 1 5 767 3077 20 0 0 chr2 23928962 23929304 -157818783 + ORR1A0 LTR MaLR 1 342 -4 5 767 2626 41 0 0 chr2 23929308 23929646 -157818441 + ORR1A0-int LTR MaLR 1 338 -1454 5 767 1517 11 33 0 chr2 23929702 23929885 -157818202 - ORR1A0 LTR MaLR -157 189 1 5 767 4188 164 54 16 chr2 23933650 23934503 -157813584 + RMER17A2 LTR ERVK 22 906 0 5 767 1683 152 57 6 chr2 23944094 23944411 -157803676 + RLTR15 LTR ERVK 1 333 -26 5 767 779 261 125 28 chr2 23953291 23953539 -157794548 + MLT1B LTR MaLR 119 390 0 5 767 998 355 83 12 chr2 23953842 23954253 -157793834 + MLT1E3 LTR MaLR 1 440 -184 5 767 309 156 347 20 chr2 23954632 23954730 -157793357 + RMER15 LTR ERVL 351 480 -95 5 767 225 237 58 97 chr2 23956892 23956908 -157791179 + MT2B2 LTR ERVL 167 265 -319 5 767 537 290 116 92 chr2 23958254 23958634 -157789453 - MLT1B LTR MaLR -1 389 1 5 767 359 217 53 21 chr2 23959572 23959666 -157788421 - MLT1I LTR MaLR -192 219 123 5 767 3741 117 3 49 chr2 23982164 23982758 -157765329 + RMER2 LTR ERV1 1 567 0 6 768 1598 138 11 107 chr2 23987024 23987380 -157760707 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 6 768 583 284 84 19 chr2 23991181 23991396 -157756691 + MTEa-int LTR MaLR 1350 1578 -2 6 768 645 296 109 31 chr2 23991401 23991750 -157756337 + MTEa LTR MaLR 4 379 0 6 768 671 196 72 99 chr2 24002892 24003113 -157744974 + RLTR31_Mm LTR ERVK 347 561 0 4 768 228 377 48 18 chr2 24013689 24013854 -157734233 - MLT1J LTR MaLR -2 510 341 1 768 1913 177 28 58 chr2 24016170 24016566 -157731521 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 1 768 287 361 99 30 chr2 24017007 24017270 -157730817 + LTR16E1 LTR ERVL 244 524 -14 1 768 2881 18 0 38 chr2 24020532 24020872 -157727215 - IAPLTR2b LTR ERVK 0 327 1 2 768 6390 58 22 11 chr2 24020874 24021692 -157726395 - IAPEz-int LTR ERVK -2 6479 5653 2 768 10794 93 48 49 chr2 24021687 24023609 -157724478 - IAPEz-int LTR ERVK -4781 1700 9 2 768 2800 37 0 38 chr2 24023610 24023950 -157724137 - IAPLTR2b LTR ERVK 0 327 1 2 768 1252 210 57 7 chr2 24027766 24028049 -157720038 - MTD LTR MaLR -122 297 1 3 768 5825 64 0 7 chr2 24029462 24030284 -157717803 + RLTR22_Mus LTR ERVK 1 816 -992 3 768 927 202 14 112 chr2 24030535 24030830 -157717257 + RLTR22_Mus LTR ERVK 1543 1808 0 3 768 2065 168 39 32 chr2 24032990 24033428 -157714659 - BGLII_B LTR ERVK 0 441 1 4 768 577 331 63 28 chr2 24044825 24045077 -157703010 + MTE2a LTR MaLR 63 323 -56 5 768 3464 76 2 4 chr2 24045192 24045680 -157702407 - RLTR1C LTR ERV1 -16 487 1 5 768 2314 105 12 24 chr2 24048804 24049145 -157698942 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 337 0 5 768 37315 22 25 9 chr2 24049145 24053425 -157694662 + IAPEz-int LTR ERVK 8 4357 -2124 5 768 5958 64 13 18 chr2 24053416 24054191 -157693896 + IAPEz-int LTR ERVK 5709 6479 -2 5 768 2169 120 15 24 chr2 24054193 24054533 -157693554 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 337 0 5 768 3155 161 36 14 chr2 24056219 24056779 -157691308 - RMER15 LTR ERVL -3 572 1 6 768 1856 67 14 101 chr2 24058763 24058997 -157689090 + ORR1A2 LTR MaLR 49 286 -41 6 768 1856 67 14 101 chr2 24059144 24059206 -157688881 + ORR1A2 LTR MaLR 287 319 -8 6 768 2100 145 67 6 chr2 24068561 24068907 -157679180 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 8 768 293 330 126 8 chr2 24069731 24069850 -157678237 - LTR16E1 LTR ERVL -154 384 252 9 768 963 265 179 8 chr2 24070025 24070416 -157677671 + RLTR28B LTR ERVL 17 474 -7 9 768 1419 174 199 0 chr2 24078860 24079141 -157668946 + ORR1B1 LTR MaLR 58 394 0 9 768 1601 248 32 53 chr2 24080244 24080665 -157667422 + MTD LTR MaLR 6 405 -14 1 768 841 274 68 31 chr2 24081617 24081862 -157666225 + MTD LTR MaLR 21 308 -111 1 768 1288 237 110 24 chr2 24081869 24082206 -157665881 + ORR1D1 LTR MaLR 9 374 0 1 768 361 253 55 0 chr2 24082209 24082300 -157665787 + MTD LTR MaLR 307 402 -17 1 768 2022 145 10 0 chr2 24084422 24084726 -157663361 + RLTR27 LTR ERVK 3 309 0 1 768 469 238 58 35 chr2 24090004 24090178 -157657909 - RNLTR23 LTR ERVK 0 642 465 1 768 365 218 19 65 chr2 24101678 24101786 -157646301 + LTR65 LTR ERV1 6 108 -561 1 768 2380 118 8 8 chr2 24107267 24107635 -157640452 - RLTR9A LTR ERVK 0 368 1 1 768 3818 28 5 0 chr2 24109345 24109779 -157638308 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 1 768 347 361 180 10 chr2 24115163 24115457 -157632630 - LTR16E1 LTR ERVL -13 555 212 1 768 1490 177 70 4 chr2 24115867 24116139 -157631948 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 95 1 768 2777 95 15 0 chr2 24116161 24116562 -157631525 + BGLII LTR ERVK 11 417 -4 1 768 445 149 46 0 chr2 24116561 24116648 -157631439 - ORR1C2 LTR MaLR -293 91 1 1 769 245 354 77 52 chr2 24118946 24119101 -157628986 + MLT1J LTR MaLR 352 510 -2 1 769 559 157 0 0 chr2 24127562 24127651 -157620436 + ORR1B2 LTR MaLR 248 336 -31 1 769 970 155 133 10 chr2 24127641 24127837 -157620250 - ORR1B2 LTR MaLR -147 220 1 1 769 2488 95 79 0 chr2 24128205 24128572 -157619515 - MTB_Mm LTR MaLR -1 406 11 1 769 564 299 92 70 chr2 24129448 24129721 -157618366 - MLT1F1 LTR MaLR -216 363 45 1 769 507 343 32 29 chr2 24138212 24138491 -157609596 + MLT1C LTR MaLR 171 450 -17 1 769 442 308 199 38 chr2 24138547 24138938 -157609149 + MLT1F2 LTR MaLR 99 553 -7 1 769 368 336 176 16 chr2 24149352 24149727 -157598360 + MLT1D LTR MaLR 3 620 -7 1 769 900 206 106 128 chr2 24150614 24150982 -157597105 - MER57E1 LTR ERV1 -12 360 1 1 769 392 318 102 82 chr2 24161578 24162054 -157586033 - MLT1H LTR MaLR -4 545 5 1 769 733 344 163 20 chr2 24164409 24164863 -157583224 - MLT1G3 LTR MaLR -2 593 75 1 769 467 233 60 48 chr2 24170450 24170617 -157577470 + RLTR23 LTR ERV1 262 430 0 2 769 786 87 39 0 chr2 24171112 24171239 -157576848 + ORR1C2 LTR MaLR 1 132 -252 2 769 771 125 48 196 chr2 24171850 24172059 -157576028 + MT2A LTR ERVL 17 194 -339 2 769 687 181 161 0 chr2 24172060 24172209 -157575878 + MT2A LTR ERVL 353 525 -8 2 769 342 289 43 9 chr2 24173016 24173131 -157574956 + MLT1D LTR MaLR 313 431 -74 2 769 1921 85 88 0 chr2 24174313 24174607 -157573480 - ORR1A2 LTR MaLR -6 321 2 2 769 415 204 42 54 chr2 24177855 24178021 -157570066 + RLTR43A LTR ERVK 201 364 0 2 769 2543 115 5 59 chr2 24178168 24178573 -157569514 + RLTR9A2 LTR ERVK 1 383 0 2 769 3269 188 26 63 chr2 24178883 24179580 -157568507 + ETnERV2-int LTR ERVK 2080 2750 -4656 2 769 3008 178 6 24 chr2 24179575 24180169 -157567918 + ETnERV2-int LTR ERVK 2303 2839 -2567 2 769 451 239 0 0 chr2 24180194 24180307 -157567780 + RMER16-int LTR ERVK 1655 1767 -3639 2 769 2304 249 21 9 chr2 24181178 24181777 -157566310 + ETnERV2-int LTR ERVK 4077 4534 -2872 2 769 3430 187 24 6 chr2 24181837 24182494 -157565593 + ETnERV2-int LTR ERVK 5125 5793 -1613 2 769 272 75 25 0 chr2 24182505 24182545 -157565542 + RMER16-int LTR ERVK 3660 3700 -1706 2 769 993 156 62 0 chr2 24182537 24182716 -157565371 + RMER16-int LTR ERVK 3796 3976 -1430 2 769 288 313 52 22 chr2 24183886 24184020 -157564067 + RNERVK23-int LTR ERVK 7663 7800 -417 2 769 1955 214 45 17 chr2 24184034 24184438 -157563649 + ETnERV2-int LTR ERVK 6644 7058 -348 2 769 315 260 15 73 chr2 24184643 24184780 -157563307 + RLTR43B LTR ERVK 247 375 0 2 769 301 287 203 33 chr2 24185353 24185660 -157562427 - MLT1D LTR MaLR -129 376 28 2 769 1532 187 18 171 chr2 24185685 24186124 -157561963 + ORR1D1 LTR MaLR 3 374 0 2 769 3014 20 2 172 chr2 24186477 24186947 -157561140 - RLTR10 LTR ERVK 0 390 1 2 769 1984 87 135 3 chr2 24189149 24189438 -157558649 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 2 769 965 221 141 18 chr2 24194160 24194436 -157553651 + ORR1D2 LTR MaLR 58 367 -3 2 769 734 350 72 17 chr2 24204166 24204585 -157543502 - MLT1H2 LTR MaLR -23 466 25 2 769 970 257 101 89 chr2 24207896 24208400 -157539687 - LTR55 LTR ERV -23 525 16 2 769 313 99 51 174 chr2 24208618 24208716 -157539371 + RLTR19-int LTR ERVK 3488 3573 -2564 2 769 1006 208 80 95 chr2 24209053 24209641 -157538446 + RLTR19-int LTR ERVK 3578 3974 -2163 2 769 301 269 97 40 chr2 24209691 24209815 -157538272 + RLTR19-int LTR ERVK 3045 3175 -63 2 769 587 230 36 0 chr2 24209885 24210024 -157538063 + RMER10A LTR ERVL 15 158 -284 2 769 922 197 15 73 chr2 24210511 24210785 -157537302 + RMER10A LTR ERVL 183 440 -2 2 769 293 273 34 148 chr2 24211939 24212115 -157535972 + RLTR18 LTR ERVK 33 188 -428 2 769 2217 98 3 0 chr2 24212190 24212508 -157535579 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 2 769 279 300 94 64 chr2 24212571 24212774 -157535313 + RLTR18 LTR ERVK 193 401 -111 2 769 1797 187 5 68 chr2 24213883 24214308 -157533779 + RMER10B LTR ERVL 1 398 0 2 769 1413 74 169 62 chr2 24214887 24215177 -157532910 + RLTR47_MM LTR ERV1 1 321 -211 2 769 577 188 215 12 chr2 24215397 24215569 -157532518 + RLTR47_MM LTR ERV1 324 530 -2 2 769 386 312 42 53 chr2 24215863 24216193 -157531894 + MMERGLN-int LTR ERV1 308 762 -6794 2 769 1360 315 93 77 chr2 24216576 24217797 -157530290 + MMERGLN-int LTR ERV1 1187 2427 -5129 2 769 365 335 113 8 chr2 24217918 24218297 -157529790 + MuRRS4-int LTR ERV1 4162 4580 -3198 2 769 2213 259 45 27 chr2 24218610 24219428 -157528659 + MuRRS4-int LTR ERV1 3533 4025 -1038 2 769 1740 113 82 0 chr2 24224163 24224419 -157523668 - RMER17B LTR ERVK -681 277 1 2 769 382 300 223 52 chr2 24224594 24224921 -157523166 - MLT1A1 LTR MaLR -25 383 1 2 769 280 342 96 51 chr2 24226882 24227079 -157521008 - MLT2C1 LTR ERVL -2 395 190 2 769 241 187 89 51 chr2 24235521 24235600 -157512487 - MER34A LTR ERV1 -8 563 482 2 769 342 230 34 22 chr2 24246698 24246787 -157501300 - MTEb LTR MaLR -12 367 278 3 770 264 327 150 57 chr2 24249110 24249477 -157498610 - MLT1M LTR MaLR -270 402 2 3 770 2214 161 79 5 chr2 24255192 24255584 -157492503 - MTC LTR MaLR 0 421 1 3 770 4869 119 29 15 chr2 24280458 24281182 -157466905 + RMER19A LTR ERVK 1 734 -3 3 770 246 274 102 70 chr2 24287695 24287852 -157460235 + LTR81B LTR ERV1? 1116 1277 -116 3 770 818 270 92 63 chr2 24313338 24313717 -157434370 + MLT1B LTR MaLR 1 390 0 3 770 445 205 126 17 chr2 24314638 24314757 -157433330 - MTEb LTR MaLR -53 326 195 3 770 1240 221 78 89 chr2 24317198 24317581 -157430506 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 3 770 627 262 142 53 chr2 24340315 24340561 -157407526 - MTE2a LTR MaLR -2 377 110 4 770 508 229 9 9 chr2 24340733 24340839 -157407248 - MTE2a LTR MaLR -271 108 3 4 770 1202 241 84 24 chr2 24340841 24341138 -157406949 - MTEa LTR MaLR -62 317 3 4 770 595 305 123 65 chr2 24347410 24347890 -157400197 + MLT1F LTR MaLR 2 509 -39 4 770 318 250 15 0 chr2 24348976 24349044 -157399043 + LTR16D2 LTR ERVL 501 569 -3 4 770 719 256 109 106 chr2 24352613 24352989 -157395098 - MLT1B LTR MaLR -8 382 6 4 770 1890 197 16 57 chr2 24353946 24354382 -157393705 + MTD LTR MaLR 2 419 0 4 770 538 321 58 114 chr2 24354405 24354764 -157393323 + MLT1A LTR MaLR 4 342 -32 4 770 250 262 162 73 chr2 24356334 24356470 -157391617 - MLT1A1 LTR MaLR -260 148 1 4 770 3875 104 5 16 chr2 24366368 24366936 -157381151 + LTRIS2 LTR ERV1 3 564 0 4 770 526 268 17 39 chr2 24371630 24371823 -157376264 - MTEb LTR MaLR -2 377 165 4 770 891 268 24 5 chr2 24372034 24372240 -157375847 - MTEb LTR MaLR -164 215 6 4 770 1965 124 108 3 chr2 24375209 24375541 -157372546 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 4 770 700 188 98 59 chr2 24378817 24379020 -157369067 - RMER10A LTR ERVL 0 442 232 4 770 742 154 8 0 chr2 24379053 24379170 -157368917 - RMER10A LTR ERVL -324 118 1 4 771 312 338 25 31 chr2 24386316 24386475 -157361612 - MLT1J LTR MaLR 0 512 355 4 771 3086 67 23 13 chr2 24390015 24390411 -157357676 - MTB LTR MaLR 0 400 1 4 771 895 315 82 70 chr2 24407749 24408223 -157339864 - MLT1F LTR MaLR -61 487 8 5 771 1336 235 67 62 chr2 24415126 24415514 -157332573 - MTD LTR MaLR 0 419 19 5 771 1336 235 67 62 chr2 24415542 24415570 -157332517 - MTD LTR MaLR -401 18 1 5 771 322 200 121 1 chr2 24422402 24422495 -157325592 - MLT1A0 LTR MaLR -26 441 271 5 771 1122 206 66 8 chr2 24422517 24422776 -157325311 - MTD LTR MaLR -140 279 6 5 771 265 281 159 98 chr2 24431690 24431966 -157316121 + RMER10A LTR ERVL 122 414 -28 5 771 901 255 66 99 chr2 24433121 24433461 -157314626 + RLTR42-int LTR ERVK 1133 1471 -4051 5 771 901 255 66 99 chr2 24433608 24433690 -157314397 + RLTR42-int LTR ERVK 1472 1541 -3981 5 771 864 68 0 0 chr2 24433738 24433855 -157314232 + RMER16 LTR ERVK 417 533 0 5 771 852 160 31 43 chr2 24433855 24434018 -157314069 + RMER16-int LTR ERVK 1 161 -5245 5 771 8924 87 37 13 chr2 24434231 24435489 -157312598 + RMER16-int LTR ERVK 137 1425 -3981 5 771 531 174 20 65 chr2 24435541 24435671 -157312416 + RMER16-int LTR ERVK 1355 1453 -3953 5 771 788 85 0 0 chr2 24435668 24435774 -157312313 + RMER16-int LTR ERVK 404 509 -4897 5 771 25253 96 37 34 chr2 24435776 24437963 -157310124 + RMER16-int LTR ERVK 1460 3658 -1748 5 771 25253 96 37 34 chr2 24438100 24439306 -157308781 + RMER16-int LTR ERVK 3659 4873 -533 5 771 4434 68 5 31 chr2 24439306 24439909 -157308178 - LTRIS_Mus LTR ERV1 0 587 1 5 771 25253 96 37 34 chr2 24439909 24440346 -157307741 + RMER16-int LTR ERVK 4874 5303 -103 5 771 532 117 0 0 chr2 24440427 24440504 -157307583 + RMER16-int LTR ERVK 5330 5406 0 5 771 631 209 101 7 chr2 24440504 24440653 -157307434 + RMER16 LTR ERVK 1 163 -370 5 771 1031 110 104 0 chr2 24441013 24441176 -157306911 + RMER16-int LTR ERVK 141 320 -5086 5 771 435 150 11 81 chr2 24441170 24441257 -157306830 + RMER16-int LTR ERVK 1368 1448 -3958 5 771 3865 223 63 8 chr2 24441253 24442156 -157305931 + MuRRS4-int LTR ERV1 755 1707 -3356 5 771 358 358 0 0 chr2 24442155 24442306 -157305781 + MuRRS4-int LTR ERV1 4240 4390 -300 5 771 1061 215 26 0 chr2 24442297 24442525 -157305562 + MuRRS4-int LTR ERV1 4788 5021 -42 5 771 2323 97 82 40 chr2 24442526 24442955 -157305132 + LTRIS5 LTR ERV1 1 447 0 5 771 622 226 80 50 chr2 24442955 24443193 -157304894 + RMER13B LTR ERVK 660 904 -4 5 771 2342 137 102 5 chr2 24444658 24445039 -157303048 + MTC LTR MaLR 1 418 -3 5 771 3521 28 2 0 chr2 24445252 24445647 -157302440 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 771 8949 49 4 3 chr2 24445647 24446744 -157301343 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 5 771 3518 28 2 0 chr2 24446744 24447139 -157300948 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 771 548 294 23 56 chr2 24447277 24447580 -157300507 + RodERV21-int LTR ERV1 8 300 -4691 5 771 570 301 0 20 chr2 24447847 24448047 -157300040 + RodERV21-int LTR ERV1 685 880 -4111 5 771 4673 239 30 48 chr2 24450033 24451319 -157296768 + RodERV21-int LTR ERV1 876 2137 -2854 5 771 1776 241 61 45 chr2 24452428 24452989 -157295098 + RodERV21-int LTR ERV1 2125 2694 -2297 5 771 297 359 4 29 chr2 24453636 24453880 -157294207 + RodERV21-int LTR ERV1 3837 4074 -3017 5 771 3153 341 19 17 chr2 24454010 24455396 -157292691 + RodERV21-int LTR ERV1 3409 4796 -195 5 771 264 298 96 32 chr2 24455430 24455555 -157292532 + RMER4B LTR ERVK 346 478 -107 5 771 233 186 189 54 chr2 24455923 24455997 -157292090 + RMER21B LTR ERV1 480 563 -279 5 771 2153 162 147 17 chr2 24456230 24456694 -157291393 + RLTR28 LTR ERVL 1 524 0 5 771 469 266 45 115 chr2 24457147 24457347 -157290740 + MER67B LTR ERV1 45 230 -431 5 771 259 358 22 7 chr2 24457353 24457488 -157290599 - RMER15 LTR ERVL -17 558 422 5 771 265 259 157 48 chr2 24457687 24457853 -157290234 + MER67B LTR ERV1 271 454 -207 5 771 248 368 71 20 chr2 24458525 24458722 -157289365 + MER67B LTR ERV1 455 661 0 5 771 480 198 60 0 chr2 24466668 24466784 -157281303 + ORR1B2 LTR MaLR 29 151 -216 5 771 3777 168 107 22 chr2 24466782 24467596 -157280491 + ORR1B2-int LTR MaLR 627 1509 0 5 771 2052 165 25 8 chr2 24467596 24467957 -157280130 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 5 771 1939 111 40 19 chr2 24469103 24469425 -157278662 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 5 771 10829 114 33 122 chr2 24469425 24471579 -157276508 - ORR1A4-int LTR MaLR 0 1963 1 5 771 2083 120 25 12 chr2 24471579 24471900 -157276187 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 5 5 771 341 294 25 49 chr2 24474910 24475041 -157273046 + MLT1A LTR MaLR 248 448 -19 5 771 297 261 271 14 chr2 24475156 24475300 -157272787 + MTEb LTR MaLR 156 336 -43 5 771 876 276 146 15 chr2 24486019 24486354 -157261733 + MTEb LTR MaLR 1 379 0 5 771 3417 48 2 0 chr2 24492377 24492776 -157255311 + MTB LTR MaLR 1 400 0 6 771 1293 195 83 120 chr2 24497646 24498030 -157250057 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 6 771 288 289 67 32 chr2 24501121 24501250 -157246837 + LTR16E1 LTR ERVL 419 558 -10 3 771 1045 293 50 17 chr2 24504896 24505198 -157242889 + RMER15 LTR ERVL 220 531 -44 8 772 2668 132 132 16 chr2 24515914 24516415 -157231672 + RLTR31_Mm LTR ERVK 3 561 0 2 772 1800 133 163 6 chr2 24544135 24544460 -157203627 + ORR1C1 LTR MaLR 1 376 -2 6 772 1147 183 247 102 chr2 24545195 24545657 -157202430 + MT2A LTR ERVL 1 529 -4 6 772 10444 63 18 34 chr2 24551034 24552490 -157195597 + RLTR22_Mus LTR ERVK 1 1433 -375 7 772 280 359 50 17 chr2 24555860 24555979 -157192108 + MLT1F2 LTR MaLR 406 528 -32 8 772 405 360 119 98 chr2 24556025 24556920 -157191167 + MLT1F2-int LTR MaLR 18 931 -558 8 772 295 305 49 0 chr2 24557140 24557222 -157190865 + MLT1F2-int LTR MaLR 959 1044 -445 8 772 452 181 8 118 chr2 24558497 24558515 -157189572 + MT2B LTR ERVL 150 154 -447 8 772 657 375 21 29 chr2 24568800 24569319 -157178768 + MuRRS4-int LTR ERV1 2536 3050 -2013 8 772 1249 303 67 9 chr2 24569726 24570172 -157177915 + MuRRS4-int LTR ERV1 3558 4029 -1034 8 772 346 341 15 8 chr2 24570359 24570492 -157177595 + RLTR4_MM-int LTR ERV1 5493 5626 -1975 8 772 1560 181 135 32 chr2 24575935 24576106 -157171981 + ORR1C2 LTR MaLR 1 175 -209 9 772 1560 181 135 32 chr2 24576134 24576310 -157171777 + ORR1C2 LTR MaLR 176 384 0 9 772 1360 278 99 5 chr2 24577733 24578159 -157169928 + RMER20A LTR ERVK 44 509 -7 1 772 335 169 49 49 chr2 24579182 24579263 -157168824 + MT2A LTR ERVL 26 106 -427 1 772 1072 213 70 124 chr2 24579321 24579720 -157168367 + MT2B LTR ERVL 51 601 0 1 772 646 122 20 0 chr2 24579721 24579819 -157168268 + ORR1C2 LTR MaLR 285 384 0 1 772 1495 262 76 25 chr2 24581346 24581809 -157166278 + MT2A LTR ERVL 16 537 -17 1 772 2017 166 16 49 chr2 24582784 24583171 -157164916 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 1 772 5878 191 74 13 chr2 24583171 24584410 -157163677 + ORR1D1-int LTR MaLR 1 1315 -55 1 772 286 114 0 0 chr2 24584499 24584543 -157163544 + ORR1D1-int LTR MaLR 1323 1366 -4 1 772 1151 168 31 60 chr2 24584548 24584824 -157163263 + ORR1D1 LTR MaLR 1 357 -2 1 772 993 226 78 43 chr2 24585294 24585587 -157162500 - MTC LTR MaLR -67 354 5 1 772 254 297 0 13 chr2 24586509 24586584 -157161503 + MLT1H LTR MaLR 198 271 -278 1 772 1117 281 54 31 chr2 24588737 24589086 -157159001 + ORR1E LTR MaLR 3 359 0 1 772 232 287 46 0 chr2 24591133 24591220 -157156867 + ORR1D1 LTR MaLR 284 374 0 1 772 504 224 45 71 chr2 24593936 24594090 -157153997 - RLTR42-int LTR ERVK -4124 1398 1249 1 772 748 258 123 121 chr2 24596173 24596584 -157151503 + MT2B LTR ERVL 9 566 -35 1 772 336 291 127 0 chr2 24602529 24602639 -157145448 - RMER15 LTR ERVL 0 575 452 1 772 377 309 56 21 chr2 24619603 24619745 -157128342 + MLT1A1 LTR MaLR 1 147 -261 1 772 2504 175 126 2 chr2 24621270 24621780 -157126307 + RMER15 LTR ERVL 3 575 0 1 772 2808 148 43 12 chr2 24621806 24622292 -157125795 + RLTR20B2 LTR ERVK 1 501 -59 1 772 343 262 134 39 chr2 24623466 24623720 -157124367 - RMER12 LTR ERVK -332 990 713 1 772 2032 50 125 0 chr2 24624256 24624535 -157123552 + ORR1A2 LTR MaLR 6 319 -8 1 772 683 329 59 39 chr2 24626703 24627041 -157121046 - MTEa LTR MaLR 0 379 35 1 772 528 180 0 11 chr2 24627157 24627247 -157120840 - RLTR18 LTR ERVK -527 89 1 1 772 1087 254 34 47 chr2 24628006 24628304 -157119783 - MTEa LTR MaLR -3 376 83 1 772 335 299 116 16 chr2 24628515 24628587 -157119500 - MTEb LTR MaLR -290 89 5 1 772 236 146 24 0 chr2 24628591 24628632 -157119455 - MTEb-int LTR MaLR 0 1580 1539 1 772 775 285 69 17 chr2 24628716 24628948 -157119139 - MTEb-int LTR MaLR -25 1555 1312 1 772 2976 296 94 26 chr2 24629169 24630198 -157117889 - MTEb-int LTR MaLR -259 1321 223 1 772 760 233 44 6 chr2 24632469 24632650 -157115437 + MTEb LTR MaLR 6 193 -186 1 772 626 304 35 37 chr2 24632891 24633230 -157114857 - RLTR26 LTR ERVK -223 404 2 2 772 275 287 331 0 chr2 24633249 24633385 -157114702 + MTEb LTR MaLR 179 359 0 1 772 630 122 139 155 chr2 24634195 24634389 -157113698 + ORR1D1 LTR MaLR 4 194 -180 2 772 2461 119 3 3 chr2 24635551 24635897 -157112190 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 2 772 1307 173 174 31 chr2 24639242 24639564 -157108523 - ORR1D1 LTR MaLR -1 373 6 2 772 288 146 0 0 chr2 24639566 24639614 -157108473 - ORR1D1-int LTR MaLR 0 1370 1323 2 772 5534 188 100 15 chr2 24639745 24640957 -157107130 - ORR1D1-int LTR MaLR -55 1315 1 2 772 2038 135 32 40 chr2 24640957 24641334 -157106753 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 2 773 277 292 123 62 chr2 24642652 24642798 -157105289 - MT2B2 LTR ERVL -327 257 103 2 773 1657 200 48 34 chr2 24644871 24645223 -157102864 + ORR1B2 LTR MaLR 1 357 -10 2 773 266 281 0 111 chr2 24666985 24667013 -157081074 + MT2B LTR ERVL 142 157 -444 2 773 272 228 177 0 chr2 24668050 24668129 -157079958 + RMER15-int LTR ERVL 2295 2387 -2612 2 773 338 180 16 0 chr2 24668238 24668299 -157079788 + RMER15-int LTR ERVL 4255 4316 -683 2 773 546 203 100 14 chr2 24668302 24668442 -157079645 + MTD LTR MaLR 1 152 -267 2 773 3458 28 5 0 chr2 24669968 24670362 -157077725 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 773 1267 187 199 5 chr2 24670800 24671144 -157076943 + MTD LTR MaLR 1 406 -13 2 773 231 219 84 99 chr2 24675791 24675862 -157072225 + MT2B LTR ERVL 167 236 -365 2 773 443 293 87 20 chr2 24682541 24682691 -157065396 + MTE2b LTR MaLR 176 335 -44 3 773 480 227 64 157 chr2 24686781 24687016 -157061071 - MTE2b LTR MaLR -162 217 5 3 773 560 263 59 59 chr2 24699326 24699512 -157048575 + RLTR18B LTR ERVK 5 190 -322 3 773 539 201 258 121 chr2 24699695 24699967 -157048120 + RLTR18B LTR ERVK 228 600 -16 3 773 379 242 242 68 chr2 24704998 24705291 -157042796 + MER57F LTR ERV1 21 364 -72 3 773 260 337 22 61 chr2 24706148 24706328 -157041759 + RMER4B LTR ERVK 20 192 -393 3 773 2150 147 46 16 chr2 24716449 24716822 -157031265 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 3 773 1142 228 114 23 chr2 24721036 24721378 -157026709 + ORR1D1 LTR MaLR 2 374 0 3 773 458 166 9 36 chr2 24722396 24722507 -157025580 - ORR1D1 LTR MaLR -200 184 81 3 773 919 185 321 126 chr2 24724068 24724514 -157023573 - MT2A LTR ERVL 0 533 1 3 773 340 85 0 0 chr2 24724525 24724572 -157023515 - MERVL_2A-int LTR ERVL -9 5752 5706 3 773 291 179 0 43 chr2 24724572 24724642 -157023445 - ORR1D1-int LTR MaLR -1324 639 573 3 773 6672 166 50 21 chr2 24724642 24726788 -157021299 - MERVL_2A-int LTR ERVL -132 5629 3385 3 773 7722 125 27 12 chr2 24726790 24727988 -157020099 - MERVL_2A-int LTR ERVL -3351 2410 1196 3 773 1282 148 24 0 chr2 24728020 24728229 -157019858 - MERVL_2A-int LTR ERVL -2740 3021 2808 3 773 404 153 148 34 chr2 24728205 24728293 -157019794 - MERVL_2A-int LTR ERVL -1348 4413 4316 3 773 1093 225 25 29 chr2 24737159 24737438 -157010649 + RLTR18 LTR ERVK 5 282 -334 4 773 481 294 90 114 chr2 24741628 24741739 -157006348 + MTE2a LTR MaLR 1 86 -293 4 773 481 294 90 114 chr2 24741922 24742197 -157005890 + MTE2a LTR MaLR 87 378 -1 4 773 277 208 56 0 chr2 24744633 24744705 -157003382 + MTE2b LTR MaLR 52 127 -252 4 773 248 216 0 0 chr2 24744693 24744744 -157003343 + MTE2a LTR MaLR 11 61 -318 4 773 2571 171 109 26 chr2 24744987 24745556 -157002531 + RMER20B LTR ERVK 1 616 -11 4 773 350 267 78 10 chr2 24745722 24745824 -157002263 + MTE2a LTR MaLR 70 178 -201 4 773 1458 155 235 3 chr2 24746343 24746641 -157001446 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 4 773 1973 173 91 0 chr2 24749053 24749405 -156998682 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 4 773 409 270 27 68 chr2 24752023 24752170 -156995917 + RMER15-int LTR ERVL 599 739 -4260 4 773 1559 135 56 18 chr2 24752837 24753123 -156994964 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 88 4 773 816 267 13 36 chr2 24753125 24753350 -156994737 + RMER15-int LTR ERVL 4572 4791 -208 4 773 257 218 55 0 chr2 24753456 24753511 -156994576 + RMER15-int LTR ERVL 4889 4946 -53 4 773 310 225 100 14 chr2 24753527 24753667 -156994420 + RMER15 LTR ERVL 1 152 -423 4 773 259 288 35 74 chr2 24753691 24753840 -156994247 + RMER15 LTR ERVL 274 465 -110 4 773 588 259 47 20 chr2 24755273 24755423 -156992664 + RMER15-int LTR ERVL 568 721 -4278 4 773 521 307 63 24 chr2 24755440 24755477 -156992610 + RMER15-int LTR ERVL 1183 1227 -3772 4 773 521 307 63 24 chr2 24755597 24755766 -156992321 + RMER15-int LTR ERVL 1228 1396 -3603 4 773 252 300 12 24 chr2 24756958 24757040 -156991047 + RMER15-int LTR ERVL 2154 2234 -2765 4 773 547 336 28 19 chr2 24757063 24757278 -156990809 + RMER15-int LTR ERVL 2339 2555 -2444 4 773 524 190 85 11 chr2 24765813 24765948 -156982139 + MTC LTR MaLR 238 421 0 4 773 265 321 12 12 chr2 24767199 24767284 -156980803 + RMER15 LTR ERVL 426 510 -65 4 773 253 140 86 17 chr2 24767327 24767385 -156980702 + RLTR18 LTR ERVK 19 80 -536 5 773 1876 169 167 9 chr2 24767643 24768091 -156979996 + RLTR18 LTR ERVK 98 616 0 5 774 1157 210 97 26 chr2 24784367 24784719 -156963368 - RMER17C LTR ERVK -32 378 2 5 774 291 277 26 129 chr2 24785162 24785278 -156962809 + MLT1G3 LTR MaLR 491 594 -1 5 774 1614 153 220 25 chr2 24792943 24793240 -156954847 + RMER10A LTR ERVL 3 366 -76 5 774 1614 153 220 25 chr2 24793411 24793481 -156954606 + RMER10A LTR ERVL 367 442 0 5 774 1357 243 160 8 chr2 24795175 24795569 -156952518 + MT2A LTR ERVL 1 454 -79 5 774 426 184 7 178 chr2 24795679 24795831 -156952256 - MT2B LTR ERVL -309 292 167 5 774 247 249 90 30 chr2 24795833 24795871 -156952216 - ORR1B1-int LTR MaLR -860 649 602 5 774 1743 130 61 7 chr2 24797351 24797630 -156950457 + RLTR14 LTR ERV1 13 306 -76 5 774 2131 99 18 86 chr2 24800501 24800941 -156947146 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 6 774 255 259 34 92 chr2 24809078 24809197 -156938890 - MT2B2 LTR ERVL -326 258 147 6 774 1364 251 145 3 chr2 24811128 24811452 -156936635 - MTD LTR MaLR 0 419 50 6 774 405 190 246 0 chr2 24811923 24812037 -156936050 - ORR1D2-int LTR MaLR -1413 167 1 6 774 930 279 181 3 chr2 24812039 24812348 -156935739 - ORR1D2 LTR MaLR -2 368 5 6 774 1459 164 199 4 chr2 24815364 24815715 -156932372 - MTD LTR MaLR -13 406 3 6 774 314 200 57 0 chr2 24817102 24817172 -156930915 - MLT1C LTR MaLR 0 467 394 6 774 1539 173 167 3 chr2 24838304 24838628 -156909459 + ORR1C2 LTR MaLR 5 381 -3 7 774 2021 178 20 99 chr2 24840119 24840563 -156907524 - MTD LTR MaLR -9 410 2 7 774 595 173 135 0 chr2 24841334 24841467 -156906620 + RLTR40 LTR ERVK 20 170 -647 7 774 851 152 12 46 chr2 24842034 24842207 -156905880 + RLTR40 LTR ERVK 158 324 -493 7 774 556 259 485 20 chr2 24843404 24843599 -156904488 - MTEb LTR MaLR -5 374 89 7 774 415 253 21 21 chr2 24843730 24843827 -156904260 - MTEb LTR MaLR -282 97 1 7 774 369 314 32 0 chr2 24846868 24846992 -156901095 - RMER15 LTR ERVL -22 553 426 7 774 257 196 0 0 chr2 24847022 24847068 -156901019 - MTEa LTR MaLR -5 374 329 7 774 2366 116 178 10 chr2 24847229 24847639 -156900448 - RLTR33 LTR ERVK -199 479 1 7 774 4102 84 5 24 chr2 24848495 24849090 -156898997 - RLTR19-int LTR ERVK -4125 2012 1429 7 774 628 115 58 0 chr2 24858795 24858899 -156889188 - ORR1C1 LTR MaLR -268 110 1 7 774 1299 191 88 7 chr2 24859363 24859637 -156888450 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 79 7 774 312 235 0 21 chr2 24860455 24860526 -156887561 - ORR1D1 LTR MaLR -261 98 30 7 774 1449 126 61 0 chr2 24860526 24860773 -156887314 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 1865 2126 -200 7 774 691 146 73 100 chr2 24861070 24861134 -156886953 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 2113 2176 -150 7 774 691 146 73 100 chr2 24861182 24861337 -156886750 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 2177 2326 0 7 774 1318 281 43 85 chr2 24861358 24861675 -156886412 + RLTR20B2 LTR ERVK 51 336 -224 7 774 1318 281 43 85 chr2 24861778 24861898 -156886189 + RLTR20B2 LTR ERVK 337 465 -95 7 774 1318 281 43 85 chr2 24861936 24862014 -156886073 + RLTR20B2 LTR ERVK 466 545 -15 7 774 279 231 62 93 chr2 24862101 24862230 -156885857 - MT2B LTR ERVL -337 264 140 7 774 3047 63 33 12 chr2 24864885 24865284 -156882803 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 7 774 835 188 178 0 chr2 24873661 24873863 -156874224 - MTD LTR MaLR -3 416 179 8 774 1005 208 147 14 chr2 24874467 24874809 -156873278 + MTD LTR MaLR 5 411 -8 8 774 1321 255 164 29 chr2 24875268 24875745 -156872342 - RMER15 LTR ERVL 0 575 35 8 774 792 280 185 32 chr2 24876958 24877272 -156870815 - MTE2a LTR MaLR 0 379 18 8 774 2935 148 36 26 chr2 24887121 24887615 -156860472 - RLTR19 LTR ERVK 0 499 1 8 774 550 249 61 61 chr2 24890406 24890603 -156857484 - RMER15 LTR ERVL -3 572 376 8 774 233 135 0 0 chr2 24890674 24890711 -156857376 - RMER15 LTR ERVL -163 412 376 8 774 1117 209 191 27 chr2 24890782 24891117 -156856970 - RMER15 LTR ERVL -164 411 22 8 774 607 254 221 57 chr2 24891575 24891906 -156856181 - MER70B LTR ERVL -190 388 3 8 775 363 278 123 6 chr2 24904102 24904265 -156843822 - MER74B LTR ERVL -224 398 217 8 775 279 44 222 0 chr2 24919687 24919732 -156828355 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 340 8 775 1501 136 36 91 chr2 24919862 24920140 -156827947 - ORR1B1 LTR MaLR -41 353 100 8 775 1501 136 36 91 chr2 24920329 24920381 -156827706 - ORR1B1 LTR MaLR -295 99 43 8 775 2180 118 114 13 chr2 24920370 24921025 -156827062 - ORR1B1-int LTR MaLR -191 1772 1001 8 775 738 108 9 0 chr2 24921023 24921134 -156826953 + ORR1B1 LTR MaLR 281 392 -2 9 775 573 194 44 52 chr2 24921163 24921299 -156826788 - ORR1B1 LTR MaLR -219 175 41 9 775 2505 127 30 12 chr2 24921700 24922107 -156825980 + MTC LTR MaLR 5 418 -3 9 775 486 149 0 17 chr2 24922265 24922367 -156825720 - MTC LTR MaLR -322 97 5 9 775 292 353 52 0 chr2 24924131 24924267 -156823820 - MLT1B LTR MaLR -52 338 196 9 775 533 268 158 40 chr2 24924736 24924938 -156823149 - MER21B LTR ERV1 -307 556 331 9 775 611 291 54 12 chr2 24925122 24925362 -156822725 - MER21-int LTR ERV1 -61 4130 3881 9 775 2343 133 73 10 chr2 24926182 24926578 -156821509 - MTC LTR MaLR 0 421 1 9 775 285 318 118 29 chr2 24927143 24927347 -156820740 - MER21-int LTR ERV1 -2870 3888 3667 9 775 368 317 48 7 chr2 24927952 24928098 -156819989 - MER21-int LTR ERV1 -3750 441 290 9 775 404 210 168 0 chr2 24928612 24928735 -156819352 + MTEb LTR MaLR 170 341 -38 9 775 1679 173 48 106 chr2 24929688 24930121 -156817966 + MTD LTR MaLR 4 411 -8 9 775 649 272 31 108 chr2 24930187 24930625 -156817462 + MTD-int LTR MaLR 6 391 -707 9 775 3167 152 94 24 chr2 24930753 24931380 -156816707 - RMER19B LTR ERVK 0 902 232 9 775 1387 137 35 0 chr2 24932074 24932300 -156815787 - RMER19B LTR ERVK -668 234 1 9 775 555 171 153 0 chr2 24932343 24932454 -156815633 + MTD-int LTR MaLR 380 507 -751 9 775 3012 79 125 2 chr2 24933183 24933655 -156814432 + RLTR33 LTR ERVK 1 530 -148 9 775 669 173 151 0 chr2 24933991 24934130 -156813957 + RLTR33 LTR ERVK 519 678 0 9 775 502 138 29 211 chr2 24934172 24934347 -156813740 + MTD-int LTR MaLR 1149 1291 -672 9 775 2483 163 5 12 chr2 24934490 24934912 -156813175 + MTD LTR MaLR 1 419 0 9 775 229 286 249 21 chr2 24951482 24951622 -156796465 - MLT2B4 LTR ERVL -384 172 1 9 775 1779 204 19 19 chr2 24952181 24952555 -156795532 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 9 775 315 232 32 95 chr2 24958248 24958343 -156789744 - MT2B LTR ERVL -361 240 152 9 775 3360 55 0 9 chr2 24972332 24972757 -156775330 - BGLII LTR ERVK 0 421 1 9 775 3258 200 102 8 chr2 24972758 24973694 -156774393 - MYSERV16_I-int LTR ERVK 0 2326 1304 9 775 2565 180 84 63 chr2 24973690 24974359 -156773728 - RMER3D-int LTR ERVK -1145 1697 1015 9 775 3052 61 29 19 chr2 24974763 24975180 -156772907 - BGLII LTR ERVK 0 421 1 9 775 862 248 217 25 chr2 24985379 24985821 -156762266 - RMER21B LTR ERV1 -275 567 41 1 775 1471 200 182 92 chr2 24988627 24988668 -156759419 - MT2A LTR ERVL 0 533 493 1 775 1471 200 182 92 chr2 24988708 24989155 -156758932 - MT2A LTR ERVL -41 492 1 1 775 3178 66 13 0 chr2 24990177 24990572 -156757515 - MTB LTR MaLR 0 400 1 1 775 2427 150 30 2 chr2 24994087 24994167 -156753920 + MTC LTR MaLR 1 81 -340 1 775 2427 150 30 2 chr2 24994353 24994674 -156753413 + MTC LTR MaLR 82 412 -9 1 775 1976 147 127 0 chr2 24995622 24995968 -156752119 + ORR1B1 LTR MaLR 3 392 -2 1 775 3224 44 29 0 chr2 24998388 24998773 -156749314 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 775 1343 269 50 3 chr2 25002771 25003133 -156744954 - MTEa LTR MaLR 0 379 1 1 775 2020 137 133 5 chr2 25004512 25004880 -156743207 + MTC LTR MaLR 7 421 0 4 775 3620 56 28 4 chr2 25006390 25006854 -156741233 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 475 0 5 775 433 186 29 53 chr2 25009634 25009804 -156738283 + RMER17C LTR ERVK 110 275 -135 1 776 3060 48 2 119 chr2 25045621 25045840 -156702247 + MTB LTR MaLR 1 173 -227 8 776 3060 48 2 119 chr2 25045990 25046223 -156701864 + MTB LTR MaLR 174 400 0 8 776 578 244 34 0 chr2 25047269 25047388 -156700699 + ORR1D1 LTR MaLR 3 125 -249 8 776 4674 102 30 27 chr2 25056946 25057509 -156690578 + ORR1A2-int LTR MaLR 1192 1760 -203 9 776 4674 102 30 27 chr2 25057656 25057862 -156690225 + ORR1A2-int LTR MaLR 1761 1963 0 9 776 2120 103 58 13 chr2 25057862 25058175 -156689912 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 9 776 372 188 0 96 chr2 25062802 25062896 -156685191 + MT2B LTR ERVL 173 257 -344 1 776 280 278 129 89 chr2 25108911 25109136 -156638951 - MT2B LTR ERVL -337 264 31 1 776 318 263 123 0 chr2 25132178 25132292 -156615795 - MTEa LTR MaLR 0 379 252 1 776 291 300 16 127 chr2 25132356 25132369 -156615718 - MTEa LTR MaLR -247 112 100 1 776 291 300 16 127 chr2 25132486 25132557 -156615530 - MTEa LTR MaLR -260 99 32 1 776 291 300 16 127 chr2 25132750 25132790 -156615297 - MTEa LTR MaLR -328 31 1 1 776 1951 207 143 7 chr2 25134932 25135003 -156613084 - RLTR11A2 LTR ERVK 0 527 456 2 776 1951 207 143 7 chr2 25135047 25135410 -156612677 - RLTR11A2 LTR ERVK -72 455 30 2 776 1951 207 143 7 chr2 25135447 25135473 -156612614 - RLTR11A2 LTR ERVK -498 29 4 2 776 292 315 186 5 chr2 25139056 25139260 -156608827 - MLT1B-int LTR MaLR -1032 339 99 2 776 481 294 144 32 chr2 25139584 25139862 -156608225 - MLT1B LTR MaLR -29 361 53 2 776 1191 171 9 9 chr2 25156769 25156993 -156591094 + MTC LTR MaLR 63 286 -135 2 776 758 169 0 0 chr2 25157217 25157341 -156590746 + MTC LTR MaLR 236 359 -62 2 777 1439 207 36 133 chr2 25170990 25171435 -156576652 + RMER20B LTR ERVK 226 627 0 2 777 7163 40 5 8 chr2 25178650 25179546 -156568541 - RLTR13B1 LTR ERVK 0 893 1 2 777 637 309 76 59 chr2 25179804 25180210 -156567877 + MTC LTR MaLR 1 413 -8 2 777 850 147 0 0 chr2 25182923 25183052 -156565035 - RLTR14 LTR ERV1 0 382 254 2 777 2173 121 161 68 chr2 25191681 25192185 -156555902 - RMER15 LTR ERVL -2 573 23 2 777 3027 47 26 0 chr2 25212765 25213147 -156534940 + MTA_Mm LTR MaLR 5 396 0 3 777 248 240 0 127 chr2 25222904 25223014 -156525073 + MT2B LTR ERVL 155 250 -351 3 777 3194 45 7 25 chr2 25224229 25224636 -156523451 + MTB LTR MaLR 1 400 0 3 777 233 307 37 65 chr2 25235944 25236052 -156512035 + MT2B LTR ERVL 151 255 -346 3 777 567 267 71 11 chr2 25237928 25238110 -156509977 - RMER20B LTR ERVK -216 411 219 3 777 626 309 137 24 chr2 25239363 25239655 -156508432 + MLT2D LTR ERVL 1 325 -89 3 777 527 168 0 10 chr2 25239918 25240020 -156508067 - MTC LTR MaLR -320 101 1 3 777 446 211 0 21 chr2 25242611 25242708 -156505379 - MTC LTR MaLR -1 420 326 3 777 382 305 102 18 chr2 25242999 25243166 -156504921 - MER21-int LTR ERV1 -2194 1997 1817 4 777 2574 77 12 0 chr2 25244742 25245065 -156503022 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 4 777 514 180 163 14 chr2 25247605 25247746 -156500341 + MTC LTR MaLR 1 162 -259 4 777 357 179 126 59 chr2 25257661 25257780 -156490307 - MT2B LTR ERVL -323 278 152 4 777 2608 137 5 3 chr2 25266883 25267264 -156480823 - RLTR14 LTR ERV1 0 382 1 4 777 5596 143 108 69 chr2 25267264 25267604 -156480483 - RLTR14-int LTR ERV1 0 5317 4965 4 777 5596 143 108 69 chr2 25267773 25267829 -156480258 - RLTR14-int LTR ERV1 -353 4964 4942 4 777 5596 143 108 69 chr2 25267970 25268804 -156479283 - RLTR14-int LTR ERV1 -376 4941 4038 4 777 465 171 23 0 chr2 25268944 25269032 -156479055 - RLTR14-int LTR ERV1 -2046 3271 3182 4 777 6959 179 103 68 chr2 25269438 25271122 -156476965 - RLTR14-int LTR ERV1 -2137 3180 1438 4 777 1948 184 102 20 chr2 25271306 25271756 -156476331 - RLTR14-int LTR ERV1 -3871 1446 960 4 777 406 200 52 0 chr2 25271941 25272056 -156476031 - RLTR14-int LTR ERV1 -4377 940 820 4 777 229 254 59 15 chr2 25272132 25272200 -156475887 + MamGypLTR2c LTR Gypsy 192 262 -806 4 777 654 144 58 111 chr2 25272200 25272372 -156475715 - RLTR14-int LTR ERV1 -4668 649 487 4 777 330 194 30 0 chr2 25272411 25272478 -156475609 - RLTR14 LTR ERV1 -313 69 1 4 777 382 279 108 92 chr2 25273240 25273294 -156474793 - RLTR42-int LTR ERVK -4122 1400 1348 4 777 382 279 108 92 chr2 25273362 25273556 -156474531 - RLTR42-int LTR ERVK -4175 1347 1150 4 777 516 315 231 9 chr2 25282909 25283233 -156464854 + MER54A LTR ERVL 1 396 -505 4 777 3638 172 154 50 chr2 25295123 25295902 -156452185 - RMER13A LTR ERVK 0 860 1 4 778 317 282 33 142 chr2 25305417 25305628 -156442459 + MT2B LTR ERVL 66 253 -348 4 778 1163 186 154 15 chr2 25306812 25307085 -156441002 - MTD LTR MaLR 0 419 109 5 778 628 167 9 9 chr2 25307893 25308008 -156440079 - MTD LTR MaLR -300 119 5 5 778 404 266 69 42 chr2 25309156 25309303 -156438784 - MLT1A0 LTR MaLR -209 165 1 5 778 252 302 108 45 chr2 25317637 25317748 -156430339 + MLT1F2 LTR MaLR 32 149 -411 5 778 487 265 100 50 chr2 25326623 25326858 -156421229 + ORR1E LTR MaLR 3 236 -138 5 778 241 275 178 20 chr2 25335565 25335717 -156412370 + RMER15 LTR ERVL 360 535 -40 5 778 2421 141 14 0 chr2 25336182 25336544 -156411543 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 5 778 825 266 36 9 chr2 25344631 25344855 -156403232 - MTEa LTR MaLR 0 379 150 5 778 2073 113 48 112 chr2 25364015 25364453 -156383634 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 5 778 266 332 100 55 chr2 25364509 25364780 -156383307 - MLT1C LTR MaLR -154 313 31 5 778 640 313 169 3 chr2 25364948 25365256 -156382831 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 7 5 778 262 287 51 25 chr2 25365707 25365825 -156382262 - MLT-int LTR MaLR -1564 171 51 5 778 3124 23 0 0 chr2 25366258 25366604 -156381483 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 5 778 714 184 129 0 chr2 25369721 25369778 -156378309 + MTC LTR MaLR 230 287 -134 5 778 3334 63 2 0 chr2 25369778 25370177 -156377910 + MTB LTR MaLR 1 400 0 5 778 714 184 129 0 chr2 25370177 25370282 -156377805 + MTC LTR MaLR 288 412 -9 5 778 385 224 131 10 chr2 25380769 25380817 -156367270 + ORR1D1 LTR MaLR 183 230 -144 6 778 385 224 131 10 chr2 25380886 25380936 -156367151 + ORR1D1 LTR MaLR 231 293 -81 6 778 299 274 58 10 chr2 25383139 25383242 -156364845 + RMER5 LTR ERV1 425 532 -2 6 778 1964 132 146 63 chr2 25386269 25386633 -156361454 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 6 778 4368 122 26 37 chr2 25396487 25397246 -156350841 - RMER17A LTR ERVK 0 751 1 6 778 536 264 78 0 chr2 25407655 25407822 -156340265 + RMER15 LTR ERVL 380 559 -16 6 778 1117 184 111 35 chr2 25408510 25408803 -156339284 + ORR1B1 LTR MaLR 1 270 -124 6 778 320 125 18 0 chr2 25418474 25418530 -156329557 + RLTR13B1 LTR ERVK 1 57 -836 7 779 1437 144 262 20 chr2 25445982 25446443 -156301644 + RMER15 LTR ERVL 3 575 0 7 779 1558 24 0 0 chr2 25449676 25449889 -156298198 + MTA_Mm-int LTR MaLR 886 1098 0 7 779 3358 46 5 0 chr2 25449889 25450283 -156297804 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 7 779 551 261 32 19 chr2 25456213 25456369 -156291718 + MER54B LTR ERVL 516 673 -120 7 779 260 221 56 44 chr2 25458978 25459068 -156289019 + ORR1D1 LTR MaLR 8 98 -276 7 779 257 292 128 23 chr2 25459082 25459215 -156288872 + ORR1D1 LTR MaLR 170 316 -58 7 779 290 208 240 0 chr2 25464443 25464539 -156283548 + MER74B LTR ERVL 273 391 -231 7 779 691 262 77 45 chr2 25473827 25474128 -156273959 - MLT1B LTR MaLR -59 331 7 7 779 293 276 234 29 chr2 25474475 25474718 -156273369 + MLT1J LTR MaLR 75 367 -145 7 779 338 336 132 21 chr2 25474741 25475021 -156273066 + MLT1A LTR MaLR 1 311 -63 7 779 3311 143 4 4 chr2 25486825 25487324 -156260763 + RLTR19 LTR ERVK 1 499 0 7 779 283 167 16 16 chr2 25490641 25490702 -156257385 + RLTR41 LTR ERV1 355 415 -31 8 779 633 325 109 66 chr2 25491931 25492850 -156255237 + MuLV-int LTR ERV1 1476 2415 -5191 8 779 1883 318 74 47 chr2 25492903 25494146 -156253941 + MuRRS4-int LTR ERV1 2929 5204 -2248 8 779 609 322 22 18 chr2 25494979 25495251 -156252836 + MuRRS4-int LTR ERV1 4663 4935 -128 8 779 1842 161 151 47 chr2 25495340 25495744 -156252343 + RLTR41 LTR ERV1 1 446 0 8 779 276 241 73 65 chr2 25495751 25495875 -156252212 + RLTR13C2 LTR ERVK 640 747 -61 8 779 299 187 170 32 chr2 25496709 25496803 -156251284 + MTE2b LTR MaLR 236 342 -37 8 779 3235 70 5 0 chr2 25497161 25497559 -156250528 + MTB LTR MaLR 1 400 0 8 779 1645 255 77 24 chr2 25500016 25500511 -156247576 + RLTR20B3 LTR ERVK 1 521 -56 1 779 568 247 122 146 chr2 25519970 25520354 -156227733 - MTEb LTR MaLR -4 375 1 1 779 1232 186 68 23 chr2 25520779 25521043 -156227044 - RLTR28 LTR ERVL 0 524 249 2 779 759 159 24 8 chr2 25521058 25521185 -156226902 - RLTR28 LTR ERVL -352 129 1 2 779 387 299 27 34 chr2 25521386 25521535 -156226552 + RMER5 LTR ERV1 114 261 -273 2 779 892 191 11 38 chr2 25521771 25521956 -156226131 + RMER10B LTR ERVL 195 374 -24 2 779 2401 116 159 15 chr2 25521956 25522421 -156225666 - RLTR47_MM LTR ERV1 0 532 1 2 779 526 341 15 22 chr2 25522513 25522786 -156225301 - MuRRS4-int LTR ERV1 -130 4933 4663 2 779 264 323 38 38 chr2 25523074 25523206 -156224881 - MMERGLN-int LTR ERV1 -1786 5770 5639 3 779 358 314 7 7 chr2 25523367 25523508 -156224579 - MMERGLN-int LTR ERV1 -2050 5506 5366 3 779 1747 294 48 58 chr2 25523869 25524958 -156223129 - MuRRS4-int LTR ERV1 -3155 4451 2929 2 779 1392 328 55 47 chr2 25525089 25526710 -156221377 - MuRRS4-int LTR ERV1 -4676 3102 1225 2 779 1998 92 4 29 chr2 25526713 25526992 -156221095 + ORR1A2 LTR MaLR 53 324 -3 3 779 240 214 49 156 chr2 25527245 25527367 -156220720 - MT2B LTR ERVL -354 247 139 3 779 1247 161 96 27 chr2 25544233 25544676 -156203411 - RMER17B LTR ERVK -388 570 1 5 779 4221 194 9 22 chr2 25544683 25544847 -156203240 - ETnERV2-int LTR ERVK -2550 4856 4707 6 779 4221 246 30 32 chr2 25545083 25546196 -156201891 - ETnERV2-int LTR ERVK -2700 4706 2818 6 779 3776 295 56 27 chr2 25546336 25548510 -156199577 - ETnERV2-int LTR ERVK -3350 2817 707 6 779 229 318 75 43 chr2 25549900 25550061 -156198026 - MLT1C LTR MaLR -15 452 287 6 780 2773 159 9 65 chr2 25564612 25565165 -156182922 - RLTR28 LTR ERVL -2 522 1 8 780 616 319 59 53 chr2 25565533 25565874 -156182213 - MLT1A0 LTR MaLR -16 349 7 8 780 918 161 16 92 chr2 25566679 25566864 -156181223 + RMER15 LTR ERVL 6 176 -399 8 780 448 182 11 0 chr2 25567635 25567723 -156180364 + RMER15 LTR ERVL 172 260 -315 8 780 913 143 355 12 chr2 25568202 25568450 -156179637 + RMER15 LTR ERVL 243 575 0 8 780 3552 25 0 0 chr2 25571455 25571851 -156176236 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 9 780 450 182 60 10 chr2 25573981 25574081 -156174006 + MT2A LTR ERVL 40 144 -389 9 780 1990 187 131 77 chr2 25574460 25575016 -156173071 - RLTR6_Mm LTR ERV1 -68 586 1 9 780 62159 33 19 0 chr2 25575016 25582540 -156165547 - RLTR6-int LTR ERV1 0 7778 1 9 780 2028 178 131 78 chr2 25582541 25583114 -156164973 - RLTR6_Mm LTR ERV1 -51 603 1 9 780 329 115 0 0 chr2 25587670 25587722 -156160365 + BGLII_Mus LTR ERVK 371 422 0 1 780 245 288 102 148 chr2 25589182 25589487 -156158600 - ORR1E LTR MaLR 0 359 69 1 780 313 178 0 121 chr2 25595942 25595956 -156152131 - MT2B2 LTR ERVL -320 264 227 1 780 358 107 0 51 chr2 25595956 25596015 -156152072 - RLTR25A LTR ERVK -531 572 517 1 780 541 197 98 52 chr2 25596025 25596218 -156151869 + RMER17C-int LTR ERVK 2646 2847 -391 1 780 1714 176 88 59 chr2 25597497 25597841 -156150246 + RMER10B LTR ERVL 1 333 -65 1 780 1714 176 88 59 chr2 25597895 25597937 -156150150 + RMER10B LTR ERVL 334 397 -1 1 780 906 190 149 5 chr2 25598128 25598329 -156149758 - RMER15 LTR ERVL 0 575 346 1 780 674 226 162 10 chr2 25598329 25598526 -156149561 + RLTR20A2 LTR ERVK 1 227 -351 1 780 3802 32 5 0 chr2 25598528 25598962 -156149125 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 1 780 7774 42 3 28 chr2 25598962 25599917 -156148170 - MMERVK10C-int LTR ERVK 0 7581 6651 1 780 21988 56 6 2 chr2 25599908 25602612 -156145475 - MMERVK10C-int LTR ERVK -1771 5810 3095 1 780 2607 63 0 0 chr2 25602894 25603211 -156144876 - MMERVK10C-int LTR ERVK -7264 317 1 1 780 3504 34 0 128 chr2 25603211 25603711 -156144376 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 1 780 349 290 21 11 chr2 25603726 25603820 -156144267 + RLTR20A2 LTR ERVK 189 283 -285 1 780 515 252 22 45 chr2 25603794 25603948 -156144139 + RLTR20A2 LTR ERVK 383 541 -27 1 780 247 205 78 146 chr2 25603935 25604038 -156144049 - RMER15 LTR ERVL -237 338 243 1 780 452 182 11 0 chr2 25604544 25604632 -156143455 - RMER15 LTR ERVL -315 260 172 1 780 942 155 16 92 chr2 25605407 25605592 -156142495 - RMER15 LTR ERVL -399 176 6 1 780 566 303 78 37 chr2 25606494 25606737 -156141350 + MLT1A LTR MaLR 106 358 -16 1 780 2022 176 6 8 chr2 25607105 25607460 -156140627 + RLTR28 LTR ERVL 1 354 -170 1 780 284 328 97 122 chr2 25608350 25608638 -156139449 + ORR1E LTR MaLR 66 346 -13 1 780 2754 111 5 2 chr2 25610086 25610485 -156137602 - MTB LTR MaLR 0 400 1 1 780 5862 100 108 85 chr2 25610485 25611558 -156136529 - MTB-int LTR MaLR 0 1098 1 1 780 3017 93 5 0 chr2 25611558 25611956 -156136131 - MTB LTR MaLR 0 400 1 1 780 1983 174 11 52 chr2 25612030 25612412 -156135675 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 2 1 780 1026 162 120 29 chr2 25622514 25622788 -156125299 - RMER17C LTR ERVK 0 410 112 1 780 5047 150 40 32 chr2 25625268 25626169 -156121918 - RMER13B LTR ERVK 0 908 1 1 780 685 285 93 62 chr2 25627401 25627659 -156120428 + MTD LTR MaLR 5 270 -149 1 780 269 136 0 0 chr2 25627662 25627706 -156120381 - ERVL-B4-int LTR ERVL -1217 4497 4454 1 780 2117 149 5 64 chr2 25630430 25630866 -156117221 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 1 780 2208 73 117 16 chr2 25636630 25636988 -156111099 + RLTR9B LTR ERVK 19 420 0 1 780 2066 151 26 3 chr2 25640463 25640814 -156107273 - RLTR15 LTR ERVK 0 359 1 1 780 1891 187 73 0 chr2 25642688 25643046 -156105041 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 1 780 975 202 12 6 chr2 25643721 25643885 -156104202 + RLTR21 LTR ERVK 1 165 -1407 1 780 4074 130 82 0 chr2 25643887 25644512 -156103575 + RMER19A LTR ERVK 1 676 -61 1 780 2024 209 37 69 chr2 25644586 25645095 -156102992 - RLTR16 LTR ERVK -12 493 1 1 780 623 115 0 0 chr2 25645095 25645172 -156102915 + RMER19A LTR ERVK 661 737 0 1 780 4175 164 63 173 chr2 25645172 25645564 -156102523 + RLTR21 LTR ERVK 168 430 -1142 1 780 4175 172 63 171 chr2 25645743 25646689 -156101398 + RLTR21 LTR ERVK 431 1392 -12 1 780 279 292 154 70 chr2 25654512 25654784 -156093303 + MLT1A LTR MaLR 45 339 -35 1 780 4443 20 0 0 chr2 25655108 25655601 -156092486 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 1 780 21549 10 0 0 chr2 25655601 25658070 -156090017 + MERVL-int LTR ERVL 1 2468 -3017 1 780 19353 24 0 0 chr2 25658053 25660312 -156087775 + MERVL-int LTR ERVL 3112 5371 -114 1 780 360 125 26 53 chr2 25660312 25660388 -156087699 + ORR1A3-int LTR MaLR 567 640 -1323 1 780 254 221 16 168 chr2 25660397 25660426 -156087661 + ORR1A3-int LTR MaLR 591 696 -1267 1 780 694 22 0 73 chr2 25660426 25660522 -156087565 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 89 -386 1 780 2327 11 0 0 chr2 25660500 25660765 -156087322 + MT2_Mm LTR ERVL 229 493 0 1 780 268 311 90 8 chr2 25668613 25668746 -156079341 - RMER12 LTR ERVK -466 856 713 1 780 2136 100 19 3 chr2 25672056 25672376 -156075711 + ORR1A2 LTR MaLR 1 325 -2 2 780 3272 119 24 30 chr2 25673985 25674487 -156073600 + RLTR19 LTR ERVK 1 499 0 2 780 1595 151 97 26 chr2 25675969 25676338 -156071749 + RMER16 LTR ERVK 1 533 0 2 780 1872 181 8 22 chr2 25676338 25676700 -156071387 + RMER16-int LTR ERVK 1 357 -5049 2 780 2398 143 58 24 chr2 25682167 25682583 -156065504 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 1 2 780 539 299 244 0 chr2 25682586 25682857 -156065230 - MTE2b LTR MaLR -42 337 1 2 780 2379 143 23 3 chr2 25683094 25683479 -156064608 - MERVL_2A-int LTR ERVL -2762 2999 2607 2 780 487 288 41 125 chr2 25683594 25683948 -156064139 + RMER20B LTR ERVK 113 487 -140 2 780 9325 133 20 14 chr2 25684305 25685826 -156062261 - MERVL_2A-int LTR ERVL -3151 2610 1082 2 780 595 276 24 56 chr2 25685997 25686246 -156061841 + RLTR14 LTR ERV1 142 382 0 2 780 2158 154 67 0 chr2 25686250 25686608 -156061479 + RLTR14 LTR ERV1 1 382 0 2 780 1820 150 4 71 chr2 25686657 25687120 -156060967 - RMER17C LTR ERVK -519 439 16 2 780 2008 151 195 18 chr2 25687123 25687724 -156060363 - RMER17C-int LTR ERVK 0 3238 2532 2 780 831 137 36 57 chr2 25687712 25687906 -156060181 - RMER17C-int LTR ERVK -879 2359 2170 2 780 901 194 158 35 chr2 25687911 25688339 -156059748 - RMER17C-int LTR ERVK -1250 1988 1508 2 780 1323 184 102 23 chr2 25688706 25689011 -156059076 - RMER17C-int LTR ERVK -2908 330 2 2 780 1941 147 19 69 chr2 25689013 25689445 -156058642 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 2 97 3879 168 155 15 chr2 25689445 25690355 -156057732 - MERVL_2A-int LTR ERVL -4723 1038 1 2 781 518 275 108 54 chr2 25690355 25690669 -156057418 - MT2B LTR ERVL 0 601 75 2 781 351 291 0 113 chr2 25690790 25690808 -156057279 - MT2A LTR ERVL -392 141 124 2 781 351 291 0 113 chr2 25690839 25690888 -156057199 - MT2A LTR ERVL -410 123 77 2 781 351 291 0 113 chr2 25691030 25691120 -156056967 - MT2A LTR ERVL -457 76 2 2 781 1555 179 214 22 chr2 25692230 25692692 -156055395 - RMER19B LTR ERVK 0 902 307 2 781 285 314 84 51 chr2 25692813 25692991 -156055096 - MLT1D LTR MaLR -297 208 25 2 781 1756 96 162 87 chr2 25693123 25693520 -156054567 - LTRIS5 LTR ERV1 0 512 1 2 781 441 123 0 46 chr2 25703926 25704022 -156044065 + ORR1A2 LTR MaLR 124 227 -119 2 781 2314 89 35 3 chr2 25704460 25704777 -156043310 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 2 781 2211 118 28 14 chr2 25705076 25705437 -156042650 + ORR1C1 LTR MaLR 3 368 -10 2 781 1431 129 4 9 chr2 25708599 25708825 -156039262 + MTC LTR MaLR 197 421 0 2 781 1561 212 98 19 chr2 25709101 25709480 -156038607 - MTD LTR MaLR -9 410 2 2 781 342 256 235 37 chr2 25711941 25712103 -156035984 + MTE2b-int LTR MaLR 649 842 -738 2 781 1857 269 157 42 chr2 25712182 25712856 -156035231 + MTE2b-int LTR MaLR 827 1578 -2 2 781 1452 198 39 48 chr2 25712859 25713214 -156034873 + MTE2b LTR MaLR 2 353 -26 2 781 3006 33 0 88 chr2 25713256 25713656 -156034431 - RLTR10B2 LTR ERVK 0 365 1 2 781 572 284 37 0 chr2 25713976 25714209 -156033878 - RMER10B LTR ERVL 0 398 132 2 781 255 264 0 19 chr2 25714241 25714295 -156033792 - RMER17C-int LTR ERVK -2074 1164 1112 2 781 1253 189 131 49 chr2 25715244 25715611 -156032476 - RMER10B LTR ERVL -1 397 1 2 781 2135 86 19 6 chr2 25716589 25716906 -156031181 + ORR1A4 LTR MaLR 1 321 -8 2 781 1621 138 106 28 chr2 25738033 25738353 -156009734 - ORR1D1 LTR MaLR -2 372 28 2 781 326 292 0 86 chr2 25751081 25751197 -155996890 - MT2B LTR ERVL -343 258 153 2 781 615 302 146 18 chr2 25777370 25777650 -155970437 + MLT1B LTR MaLR 1 316 -74 3 781 2404 70 55 6 chr2 25779531 25779861 -155968226 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 3 781 553 207 144 121 chr2 25782146 25782410 -155965677 + MTD LTR MaLR 136 405 -14 3 781 290 311 54 54 chr2 25792300 25792412 -155955675 - MT2B LTR ERVL -337 264 153 3 781 314 246 41 123 chr2 25806257 25806323 -155941764 + MT2B LTR ERVL 103 160 -424 3 781 1764 207 71 10 chr2 25820294 25820689 -155927398 - MTD LTR MaLR 0 419 1 3 782 854 100 0 8 chr2 25823398 25823519 -155924568 + MTC LTR MaLR 1 120 -301 3 782 1146 122 120 192 chr2 25823718 25824052 -155924035 + MTC LTR MaLR 112 421 0 3 782 2649 145 108 10 chr2 25841449 25841938 -155906149 + RMER4B LTR ERVK 49 585 0 4 782 912 275 28 14 chr2 25842232 25842484 -155905603 - MTEa LTR MaLR -117 302 7 4 782 430 260 145 17 chr2 25843174 25843346 -155904741 + RMER15 LTR ERVL 377 570 -5 4 782 1890 196 84 8 chr2 25845688 25846079 -155902008 + MTC LTR MaLR 1 421 0 4 782 448 173 87 43 chr2 25853826 25853838 -155894249 + MT2B LTR ERVL 145 161 -440 4 782 2722 127 186 8 chr2 25856144 25856638 -155891449 + RMER4B LTR ERVK 4 585 0 4 782 2599 44 9 0 chr2 25858170 25858491 -155889596 + MTB LTR MaLR 1 324 -76 4 782 226 355 32 24 chr2 25868175 25868299 -155879788 + MLT1E3 LTR MaLR 303 427 -197 4 782 1015 246 46 95 chr2 25873782 25874151 -155873936 + MTEa LTR MaLR 20 370 -9 4 782 2378 89 6 0 chr2 25897969 25898294 -155849793 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 5 782 2190 81 0 50 chr2 25901194 25901533 -155846554 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 6 5 782 2259 153 55 12 chr2 25901670 25902074 -155846013 - MTC LTR MaLR 0 421 1 5 782 266 328 0 0 chr2 25906761 25906828 -155841259 + RMER15 LTR ERVL 371 437 -138 5 782 244 197 73 29 chr2 25909106 25909174 -155838913 - MT2B LTR ERVL -361 240 170 5 782 371 218 15 95 chr2 25919332 25919469 -155828618 + MT2B LTR ERVL 139 264 -337 5 782 256 301 78 17 chr2 25930031 25930146 -155817941 - MTEb LTR MaLR 0 379 258 5 782 789 241 164 42 chr2 25931153 25931483 -155816604 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 5 782 2483 55 65 0 chr2 25941258 25941583 -155806504 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 6 783 330 300 8 104 chr2 25955790 25955822 -155792265 + MT2B LTR ERVL 137 155 -446 6 783 1231 176 162 23 chr2 25960736 25961039 -155787048 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 42 6 783 1124 218 59 4 chr2 25961932 25962185 -155785902 - ORR1D1 LTR MaLR -3 371 105 6 783 3479 152 122 9 chr2 25962287 25962952 -155785135 - RMER19B LTR ERVK -17 885 146 6 783 794 141 74 0 chr2 25963118 25963267 -155784820 - RMER19B LTR ERVK -742 160 1 6 783 695 129 0 0 chr2 25963267 25963381 -155784706 - ORR1D1 LTR MaLR -260 114 1 6 783 384 268 22 82 chr2 25967279 25967297 -155780790 + MT2B LTR ERVL 153 162 -439 6 783 589 294 7 7 chr2 25980214 25980368 -155767719 + RMER10A LTR ERVL 1 154 -288 6 783 1551 128 0 26 chr2 25982024 25982296 -155765791 - RMER6A LTR ERVK -457 299 35 6 783 231 148 71 36 chr2 25982467 25982515 -155765572 - RMER6A LTR ERVK -410 51 1 6 783 592 73 0 0 chr2 25982757 25982839 -155765248 - RMER6A LTR ERVK -74 682 601 6 783 1564 143 39 185 chr2 25984924 25985361 -155762726 + ORR1C1 LTR MaLR 1 373 -5 6 783 382 153 0 141 chr2 25998099 25998198 -155749889 + MT2B LTR ERVL 167 251 -350 7 783 314 297 110 39 chr2 25999127 25999309 -155748778 + MLT1F LTR MaLR 111 305 -243 7 783 556 271 94 62 chr2 25999449 25999700 -155748387 + MLT1B LTR MaLR 6 247 -220 7 783 239 275 0 28 chr2 26007211 26007282 -155740805 + MTC LTR MaLR 3 71 -348 1 783 475 299 82 0 chr2 26007919 26008066 -155740021 + MTC LTR MaLR 46 204 -217 1 783 341 262 27 45 chr2 26018202 26018314 -155729773 - MT2B LTR ERVL -338 263 154 5 783 1095 280 46 65 chr2 26021053 26021264 -155726823 - ORR1D2 LTR MaLR -7 363 154 5 783 1095 280 46 65 chr2 26021657 26021815 -155726272 - ORR1D2 LTR MaLR -217 153 1 5 783 686 245 82 15 chr2 26022010 26022205 -155725882 - ORR1D2 LTR MaLR -162 208 1 6 783 1508 206 25 91 chr2 26028852 26029085 -155719002 - MTD LTR MaLR -8 411 210 6 783 1508 206 25 91 chr2 26029227 26029432 -155718655 - MTD LTR MaLR -210 209 2 6 783 481 245 19 0 chr2 26029521 26029627 -155718460 - ORR1E LTR MaLR -250 109 2 6 783 823 210 68 29 chr2 26035894 26036100 -155711987 - MTD LTR MaLR -198 221 8 8 783 276 269 250 55 chr2 26072492 26072728 -155675359 + MLT1F2 LTR MaLR 201 482 -78 1 784 324 121 293 0 chr2 26093752 26093868 -155654219 - RMER6B LTR ERVK -190 271 122 1 784 944 62 0 52 chr2 26094050 26094203 -155653884 - RMER6B LTR ERVK -316 145 1 1 784 2171 47 26 20 chr2 26097648 26097953 -155650134 - IAPLTR2b LTR ERVK -20 307 1 1 784 257 184 101 38 chr2 26110969 26111048 -155637039 - RLTR25B LTR ERVK -519 509 426 1 784 648 308 13 39 chr2 26121339 26121572 -155626515 + MERVK26-int LTR ERVK 6691 6917 -2 2 784 1898 169 135 2 chr2 26121575 26121991 -155626096 + RMER20A LTR ERVK 1 471 -45 2 784 287 320 177 17 chr2 26125123 26125260 -155622827 + MLT1A1 LTR MaLR 1 168 -240 2 784 287 320 177 17 chr2 26125467 26125504 -155622583 + MLT1A1 LTR MaLR 169 203 -205 2 784 436 268 232 22 chr2 26125624 26125929 -155622158 + MTE2b LTR MaLR 10 401 -18 2 784 236 283 20 89 chr2 26133217 26133318 -155614769 + MT2B LTR ERVL 161 254 -347 2 784 431 178 144 0 chr2 26145568 26145658 -155602429 - MTE2b LTR MaLR -198 181 79 2 784 721 354 86 3 chr2 26145829 26146166 -155601921 + MTE-int LTR MaLR 150 514 -1066 2 784 1204 325 118 77 chr2 26146183 26146717 -155601370 + MTE-int LTR MaLR 685 1214 -366 2 784 1204 325 118 77 chr2 26147093 26147369 -155600718 + MTE-int LTR MaLR 1215 1538 -42 2 784 269 298 67 138 chr2 26147530 26147725 -155600362 + MTEb LTR MaLR 199 379 0 2 784 2848 146 129 23 chr2 26151552 26152072 -155596015 + RMER15 LTR ERVL 1 575 0 2 784 1073 140 14 181 chr2 26157335 26157623 -155590464 + MTC LTR MaLR 182 421 0 2 784 2136 140 205 17 chr2 26157778 26158257 -155589830 - RMER15 LTR ERVL -6 569 1 2 784 1785 156 143 3 chr2 26160322 26160644 -155587443 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 2 784 3022 126 16 54 chr2 26163074 26163629 -155584458 + RLTR20C LTR ERVK 1 534 0 2 784 278 158 112 56 chr2 26163713 26163820 -155584267 - RLTR25B LTR ERVK -519 509 397 2 784 1109 211 171 48 chr2 26164002 26164083 -155584004 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 287 2 784 1109 211 171 48 chr2 26164110 26164361 -155583726 - ORR1D1 LTR MaLR -88 286 1 2 784 690 261 41 40 chr2 26165640 26165939 -155582148 - MLT1A1 LTR MaLR -3 405 72 2 784 278 284 37 0 chr2 26166850 26166931 -155581156 + MLT1C LTR MaLR 351 434 -33 2 784 1491 196 32 8 chr2 26183322 26183641 -155564446 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 41 2 784 2343 105 16 19 chr2 26188740 26189108 -155558979 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 2 784 26028 20 9 0 chr2 26189112 26192354 -155555733 - IAPEz-int LTR ERVK -3 6478 3210 2 784 6596 85 98 71 chr2 26192353 26193625 -155554462 - IAPEz-int LTR ERVK -5168 1313 8 2 784 2343 105 16 19 chr2 26193625 26193993 -155554094 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 2 785 2394 95 3 50 chr2 26306097 26306388 -155441699 + ORR1A2 LTR MaLR 1 289 -38 4 785 2394 95 3 50 chr2 26306576 26306627 -155441460 + ORR1A2 LTR MaLR 290 327 0 4 785 2249 128 119 34 chr2 26308642 26309030 -155439057 - MTC LTR MaLR 0 421 1 4 785 3379 38 8 2 chr2 26311519 26311913 -155436174 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 785 1504 254 87 23 chr2 26312166 26312637 -155435450 + RLTR20B3 LTR ERVK 21 521 -56 4 786 306 296 183 14 chr2 26365889 26366038 -155382049 + MLT1C LTR MaLR 17 185 -442 4 786 284 270 1 24 chr2 26366346 26366433 -155381654 + MLT1C LTR MaLR 297 372 -18 4 786 239 212 2 18 chr2 26375009 26375072 -155373015 + MLT1B LTR MaLR 311 363 -27 4 786 1121 166 49 52 chr2 26376252 26376517 -155371570 + RMER15 LTR ERVL 1 264 -311 4 786 368 211 31 31 chr2 26376517 26376615 -155371472 - RLTR24 LTR ERV1 0 529 432 4 786 2617 164 54 64 chr2 26376790 26377324 -155370763 - RLTR24 LTR ERV1 0 529 1 4 786 732 278 16 91 chr2 26377487 26377740 -155370347 - RLTR19-int LTR ERVK -1778 4359 4126 4 786 335 278 0 0 chr2 26377974 26378046 -155370041 - RLTR19-int LTR ERVK -2029 4108 4037 4 786 750 260 120 86 chr2 26378017 26378731 -155369356 - RLTR19-int LTR ERVK -2168 3969 2588 4 786 826 217 168 9 chr2 26383600 26383832 -155364255 + RMER21B LTR ERV1 299 567 -275 5 786 1181 226 97 39 chr2 26384957 26385265 -155362822 - MTD LTR MaLR -8 411 86 5 786 237 234 15 15 chr2 26385414 26385479 -155362608 - MTD LTR MaLR -352 67 3 5 786 261 382 41 16 chr2 26386021 26386215 -155361872 + MLT1D LTR MaLR 44 242 -263 5 786 355 272 29 10 chr2 26401343 26401447 -155346640 - MLT1C LTR MaLR -2 465 360 5 786 256 128 21 0 chr2 26401528 26401575 -155346512 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 481 5 786 331 320 76 0 chr2 26401619 26401831 -155346256 - MLT1C LTR MaLR -114 276 17 5 786 355 158 0 0 chr2 26420525 26420582 -155327505 + RMER12B LTR ERVK 1 57 -1347 5 786 297 106 0 41 chr2 26423628 26423677 -155324410 - MT2B LTR ERVL -344 257 211 5 786 2144 155 28 70 chr2 26424783 26425128 -155322959 - MTC LTR MaLR 0 421 84 5 786 2144 155 28 70 chr2 26425271 26425356 -155322731 - MTC LTR MaLR -338 83 9 5 786 272 273 110 48 chr2 26457713 26457859 -155290228 + MT2B2 LTR ERVL 194 348 -236 6 786 828 302 102 26 chr2 26464011 26464314 -155283773 - MTE2b LTR MaLR -49 330 5 6 786 319 289 0 123 chr2 26469067 26469197 -155278890 - MT2B LTR ERVL -344 257 144 6 786 882 268 141 48 chr2 26471433 26471877 -155276210 - RMER5 LTR ERV1 0 534 50 6 786 1886 167 54 47 chr2 26471992 26472194 -155275893 + MTD LTR MaLR 1 200 -219 6 786 1886 167 54 47 chr2 26472220 26472425 -155275662 + MTD LTR MaLR 201 411 -8 6 786 286 269 141 27 chr2 26474335 26474484 -155273603 + RMER15 LTR ERVL 344 509 -66 6 787 414 271 60 66 chr2 26476687 26476775 -155271312 + MT2B LTR ERVL 75 161 -440 6 787 267 304 12 25 chr2 26477011 26477092 -155270995 + MER57A-int LTR ERV1 5814 5893 -294 6 787 3347 137 150 19 chr2 26485811 26486497 -155261590 + RMER21B LTR ERV1 1 842 0 6 787 1082 205 71 169 chr2 26494013 26494464 -155253623 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 6 787 1422 233 68 14 chr2 26496842 26497195 -155250892 - MTE2b LTR MaLR 0 379 8 6 787 571 236 26 20 chr2 26497202 26497353 -155250734 - MTEb LTR MaLR -33 346 195 6 787 2825 96 127 44 chr2 26514752 26515231 -155232856 - MURVY-LTR LTR ERV1 0 519 1 2 787 863 24 137 0 chr2 26517591 26517715 -155230372 - MTA_Mm LTR MaLR -44 352 212 2 787 269 53 0 0 chr2 26518241 26518279 -155229808 + MTB_Mm LTR MaLR 1 38 -369 2 787 246 250 10 98 chr2 26518728 26518830 -155229257 - MTA_Mm LTR MaLR -131 265 173 3 787 962 322 75 47 chr2 26519849 26520451 -155227636 + RMER15-int LTR ERVL 4238 4856 -143 3 787 5681 80 7 66 chr2 26521705 26522558 -155225529 - RLTR13B4 LTR ERVK 0 803 1 3 787 732 332 22 27 chr2 26525435 26525806 -155222281 + MTE2b LTR MaLR 11 379 0 3 787 238 286 14 0 chr2 26528796 26528866 -155219221 + ORR1D2 LTR MaLR 8 78 -292 3 787 351 268 59 98 chr2 26530068 26530221 -155217866 + ORR1D2 LTR MaLR 141 287 -83 3 787 307 217 54 0 chr2 26530215 26530307 -155217780 + MTC-int LTR MaLR 11 107 -1151 3 787 535 257 19 147 chr2 26530354 26530612 -155217475 + MTC-int LTR MaLR 640 856 -402 3 787 580 152 152 0 chr2 26531674 26531799 -155216288 + RMER19B LTR ERVK 1 144 -758 4 787 254 336 28 7 chr2 26533475 26533619 -155214468 + MTE-int LTR MaLR 1 147 -1433 4 787 4119 113 166 84 chr2 26536070 26536907 -155211180 + RMER17A2 LTR ERVK 1 906 0 4 787 777 103 17 0 chr2 26538741 26538858 -155209229 + RLTR1B LTR ERV1 394 512 0 5 787 6664 102 47 16 chr2 26541470 26542423 -155205664 + RLTR13C1 LTR ERVK 1 983 0 5 787 8607 28 0 2 chr2 26553600 26554580 -155193507 - RLTR13A3 LTR ERVK 0 978 1 6 787 34680 57 17 12 chr2 26554585 26556379 -155191708 - ETnERV3-int LTR ERVK 0 5808 4010 6 787 34680 56 22 16 chr2 26556415 26558512 -155189575 - ETnERV3-int LTR ERVK -1799 4009 1878 6 787 34680 56 20 14 chr2 26558697 26560395 -155187692 - ETnERV3-int LTR ERVK -3931 1877 3 6 787 8510 32 0 3 chr2 26560397 26561378 -155186709 - RLTR13A3 LTR ERVK 0 978 1 6 787 3721 179 19 5 chr2 26562322 26562960 -155185127 + MurERV4_19-int LTR ERVK 1430 2076 -3704 6 787 3293 56 2 0 chr2 26577410 26577805 -155170282 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 7 787 464 303 47 61 chr2 26579906 26580120 -155167967 - RMER15-int LTR ERVL -122 4877 4667 7 787 3603 231 77 48 chr2 26580854 26581739 -155166348 - MYSERV-int LTR ERVK -45 6505 5593 7 787 3603 231 77 48 chr2 26582581 26582847 -155165240 - MYSERV-int LTR ERVK -958 5592 5320 7 787 443 305 141 0 chr2 26582928 26583141 -155164946 - MurERV4-int LTR ERVK -3553 1707 1465 8 787 253 316 0 31 chr2 26583155 26583253 -155164834 - MurERV4-int LTR ERVK -4375 1405 1311 8 787 1130 206 110 4 chr2 26583557 26583820 -155164267 - MurERV4-int LTR ERVK -4969 291 1 8 787 785 237 182 106 chr2 26583841 26584285 -155163802 - RMER4B LTR ERVK -36 549 72 8 787 2018 89 56 0 chr2 26597129 26597431 -155150656 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 9 787 4345 140 34 5 chr2 26597820 26598578 -155149509 - RMER17B LTR ERVK 0 958 1 9 787 1504 58 10 0 chr2 26599677 26599882 -155148205 - RMER17B LTR ERVK -751 207 1 9 787 1546 235 43 61 chr2 26600671 26601139 -155146948 + RLTR20B3 LTR ERVK 21 471 -106 1 787 1546 244 55 64 chr2 26601172 26601248 -155146839 + RLTR20B3 LTR ERVK 448 527 -1 1 787 1533 105 94 19 chr2 26605241 26605550 -155142537 + BGLII_Mus LTR ERVK 1 305 -387 1 787 1514 206 121 11 chr2 26605972 26606344 -155141743 - MTD LTR MaLR -2 417 5 1 98 4858 153 36 18 chr2 26607405 26608297 -155139790 - RMER13B LTR ERVK 0 908 1 1 788 257 303 40 47 chr2 26609686 26609835 -155138252 + MER74C LTR ERVL 20 167 -293 1 788 3411 35 2 2 chr2 26610337 26610733 -155137354 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 788 321 323 61 30 chr2 26619507 26619705 -155128382 + RMER15 LTR ERVL 346 549 -26 1 788 1500 179 42 9 chr2 26628801 26629134 -155118953 - ORR1B1 LTR MaLR -41 353 10 1 788 1751 186 34 11 chr2 26631293 26631646 -155116441 - ORR1C1 LTR MaLR -17 361 1 1 788 2839 217 111 100 chr2 26632420 26633271 -155114816 - RMER13A LTR ERVK 0 860 1 1 788 792 279 76 41 chr2 26633272 26633616 -155114471 - RMER17A-int LTR ERVK -1 1727 1372 1 788 3450 160 30 101 chr2 26633916 26634764 -155113323 + RMER12 LTR ERVK 8 794 -528 1 788 877 221 93 31 chr2 26634733 26635023 -155113064 + RMER12 LTR ERVK 958 1265 -57 1 788 411 319 57 38 chr2 26635506 26635718 -155112369 + RMER15 LTR ERVL 324 539 -36 1 788 1921 219 42 59 chr2 26636053 26636496 -155111591 + RLTR11A LTR ERVK 10 445 -83 1 788 3253 48 5 2 chr2 26636496 26636891 -155111196 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 788 1921 219 42 59 chr2 26636891 26636975 -155111112 + RLTR11A LTR ERVK 446 528 0 1 788 1470 209 140 64 chr2 26643535 26644050 -155104037 - RMER4B LTR ERVK -15 570 17 1 788 1684 187 245 14 chr2 26644924 26645352 -155102735 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 527 0 1 788 2660 153 87 8 chr2 26655976 26656403 -155091684 + RLTR20B2 LTR ERVK 1 465 -95 1 788 2660 153 87 8 chr2 26656434 26656525 -155091562 + RLTR20B2 LTR ERVK 466 560 0 1 788 617 61 0 0 chr2 26657110 26657192 -155090895 + BGLII LTR ERVK 1 82 -339 1 788 1137 197 184 0 chr2 26657416 26657710 -155090377 + RLTR1 LTR ERV1 277 624 0 1 788 2101 102 24 0 chr2 26657710 26658045 -155090042 + BGLII LTR ERVK 79 421 0 1 788 566 257 186 0 chr2 26658278 26658461 -155089626 - MTD LTR MaLR -12 407 191 1 788 796 275 32 29 chr2 26658974 26659315 -155088772 - RLTR15 LTR ERVK -15 344 3 1 788 4568 173 53 41 chr2 26659317 26659778 -155088309 - MYSERV6-int LTR ERVK 0 8959 8494 1 788 4568 173 53 41 chr2 26659963 26660523 -155087564 - MYSERV6-int LTR ERVK -466 8493 7926 1 788 545 259 2 55 chr2 26660616 26660860 -155087227 - RMER4A LTR ERVK -28 557 216 1 788 745 143 71 0 chr2 26661237 26661377 -155086710 - RMER19B LTR ERVK 0 902 753 1 788 2033 169 66 194 chr2 26662551 26663366 -155084721 - RMER19B LTR ERVK -191 711 1 1 788 3807 32 5 0 chr2 26663996 26664430 -155083657 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 1 788 305 295 21 0 chr2 26668802 26668897 -155079190 + ORR1E LTR MaLR 1 97 -262 1 788 281 300 82 16 chr2 26669025 26669147 -155078940 + ORR1E LTR MaLR 238 367 -12 1 788 853 319 70 16 chr2 26669158 26669543 -155078544 + ORR1E-int LTR MaLR 3 408 -1172 1 788 1190 103 6 0 chr2 26671369 26671544 -155076543 - ORR1A2 LTR MaLR -22 305 130 1 788 1610 233 47 37 chr2 26672049 26672612 -155075475 - RMER20A LTR ERVK -70 557 3 1 788 2166 113 62 145 chr2 26672756 26673274 -155074813 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 1 788 338 279 90 126 chr2 26682878 26683235 -155064852 - RMER17C LTR ERVK -66 344 1 1 788 2414 196 97 33 chr2 26683235 26683559 -155064528 - RMER17C-int LTR ERVK 0 3238 2900 1 788 2414 196 97 33 chr2 26683608 26683858 -155064229 - RMER17C-int LTR ERVK -339 2899 2629 1 788 3431 20 5 10 chr2 26684061 26684457 -155063630 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 3 1 788 1742 191 76 109 chr2 26686890 26687742 -155060345 - RMER17C-int LTR ERVK -2460 3677 2226 1 788 272 287 78 10 chr2 26687739 26687841 -155060246 - RMER17C-int LTR ERVK -3810 2327 2219 1 788 286 196 29 76 chr2 26687869 26687974 -155060113 - RMER17C-int LTR ERVK -1791 1447 1348 1 788 343 286 11 0 chr2 26688058 26688149 -155059938 - RMER17C-int LTR ERVK -5059 1078 987 1 788 448 266 0 38 chr2 26688142 26688275 -155059812 - RMER17C-int LTR ERVK -1978 1260 1133 1 788 850 234 52 82 chr2 26689489 26689995 -155058092 - RodERV21-int LTR ERV1 -4312 679 114 2 788 295 299 140 40 chr2 26690029 26690350 -155057737 - RMER17C LTR ERVK -57 353 1 2 788 2447 113 38 0 chr2 26690815 26691161 -155056926 + RLTR10D LTR ERVK 1 359 0 2 788 50849 55 31 22 chr2 26691161 26692340 -155055747 + IAP-d-int LTR ERVK 1 1202 -5340 2 788 50849 55 31 22 chr2 26692405 26697641 -155050446 + IAP-d-int LTR ERVK 1203 6542 0 2 788 2507 97 26 3 chr2 26697641 26697992 -155050095 + RLTR10D LTR ERVK 1 359 0 2 788 442 191 34 109 chr2 26705695 26705842 -155042245 - MT2B LTR ERVL -337 264 129 2 788 1810 164 55 50 chr2 26710837 26711216 -155036871 + ORR1C2 LTR MaLR 1 381 -3 2 788 2099 219 35 56 chr2 26711219 26711342 -155036745 + ORR1C2-int LTR MaLR 1 108 -1401 2 788 2099 219 35 56 chr2 26711489 26711916 -155036171 + ORR1C2-int LTR MaLR 109 539 -970 2 788 2047 59 12 111 chr2 26713396 26713674 -155034413 + ORR1A2 LTR MaLR 5 286 -41 2 788 2047 59 12 111 chr2 26713821 26713886 -155034201 + ORR1A2 LTR MaLR 287 314 -13 2 788 269 237 103 93 chr2 26715168 26715275 -155032812 + MTEa LTR MaLR 1 108 -271 2 788 2421 179 47 34 chr2 26716284 26716840 -155031247 - RLTR20B1 LTR ERVK 0 563 1 2 788 281 270 41 52 chr2 26717546 26717718 -155030369 + MurERV4_19-int LTR ERVK 2825 2994 -2786 2 788 494 278 92 64 chr2 26720945 26721195 -155026892 + RMER5 LTR ERV1 1 257 -277 2 788 743 172 0 0 chr2 26721369 26721485 -155026602 + RLTR14-int LTR ERV1 2504 2619 -2698 2 788 4242 156 46 34 chr2 26721580 26722225 -155025862 + RLTR14-int LTR ERV1 2616 3260 -2057 2 788 3983 156 46 34 chr2 26722410 26722553 -155025534 + RLTR14-int LTR ERV1 3261 3413 -1904 2 788 1558 153 23 4 chr2 26722553 26722659 -155025428 + RLTR14 LTR ERV1 122 233 -149 2 788 1558 153 23 4 chr2 26722698 26722847 -155025240 + RLTR14 LTR ERV1 234 381 -1 2 788 1149 256 99 3 chr2 26724454 26724767 -155023320 + MTD LTR MaLR 11 353 -66 2 788 811 263 61 23 chr2 26724746 26725007 -155023080 - RMER15 LTR ERVL -26 549 279 2 788 834 252 95 0 chr2 26725188 26725398 -155022689 + MTD LTR MaLR 1 230 -189 2 788 550 304 11 23 chr2 26725549 26725724 -155022363 - RMER15 LTR ERVL -127 448 276 2 788 779 189 50 0 chr2 26726203 26726362 -155021725 + RLTR26 LTR ERVK 1 167 -475 2 788 1940 236 63 104 chr2 26726330 26727153 -155020934 + RMER17B LTR ERVK 148 857 -3 2 788 1545 164 38 76 chr2 26730994 26731336 -155016751 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 2 788 302 209 128 0 chr2 26732576 26732662 -155015425 + MTE2b LTR MaLR 2 98 -281 2 788 735 260 127 40 chr2 26733090 26733342 -155014745 + MTE2b LTR MaLR 106 379 0 2 788 3815 135 15 68 chr2 26733508 26734160 -155013927 + RMER19A LTR ERVK 1 618 -119 2 788 2433 146 10 24 chr2 26734161 26734576 -155013511 + RLTR9E LTR ERVK 1 409 0 2 788 1061 234 89 19 chr2 26734577 26734938 -155013149 + ETnERV2-int LTR ERVK 2 387 -2927 2 788 2595 174 41 24 chr2 26734948 26735684 -155012403 + ETnERV2-int LTR ERVK 1369 1871 -5535 2 788 3763 49 12 35 chr2 26735693 26736201 -155011886 + LTRIS2 LTR ERV1 69 564 0 2 788 1935 290 66 70 chr2 26736201 26736318 -155011769 + ETnERV2-int LTR ERVK 1229 1344 -4062 2 788 4500 59 11 12 chr2 26736318 26736883 -155011204 - LTRIS2 LTR ERV1 0 564 1 2 788 5412 149 40 27 chr2 26736883 26738004 -155010083 + ETnERV2-int LTR ERVK 1345 3448 -3958 2 98 19679 93 10 9 chr2 26738238 26739057 -155009030 + ETnERV2-int LTR ERVK 3438 4271 -3135 2 789 19679 110 11 15 chr2 26739241 26741475 -155006612 + ETnERV2-int LTR ERVK 4272 6437 -969 2 789 441 120 0 0 chr2 26741678 26741753 -155006334 + ETnERV2-int LTR ERVK 7332 7406 0 2 789 2412 113 39 47 chr2 26741753 26742160 -155005927 + RLTR9E LTR ERVK 1 404 -5 2 789 786 124 46 105 chr2 26742150 26742274 -155005813 + RMER19A LTR ERVK 592 719 -18 2 789 786 124 46 105 chr2 26742419 26742447 -155005640 + RMER19A LTR ERVK 720 735 -2 2 789 1520 176 133 24 chr2 26744230 26744567 -155003520 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 2 789 921 179 164 0 chr2 26745730 26745931 -155002156 - MTD LTR MaLR -185 234 1 2 789 303 268 88 51 chr2 26746023 26746189 -155001898 + RLTR11A LTR ERVK 97 249 -314 2 789 1385 116 67 4 chr2 26746189 26746414 -155001673 - RLTR13D5 LTR ERVK 0 1023 785 2 789 1406 219 165 14 chr2 26746814 26747171 -155000916 - MTD LTR MaLR -8 411 1 2 789 335 143 89 0 chr2 26749748 26749804 -154998283 + ORR1A4 LTR MaLR 1 61 -268 3 789 6954 86 46 2 chr2 26749804 26750783 -154997304 + RLTR13D5 LTR ERVK 1 1022 -1 3 789 1719 128 26 0 chr2 26750783 26751043 -154997044 + ORR1A4 LTR MaLR 55 321 -8 3 789 8827 128 140 91 chr2 26751047 26751487 -154996600 + ORR1A4-int LTR MaLR 1 444 -1519 3 789 8827 128 140 91 chr2 26751672 26752351 -154995736 + ORR1A4-int LTR MaLR 445 1192 -771 3 789 8827 128 140 91 chr2 26752507 26753256 -154994831 + ORR1A4-int LTR MaLR 1193 1962 -1 3 789 1990 132 35 3 chr2 26753256 26753575 -154994512 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 3 789 969 244 104 30 chr2 26756125 26756484 -154991603 + RMER15 LTR ERVL 35 516 -59 3 789 378 185 133 61 chr2 26756493 26756591 -154991496 + RMER5 LTR ERV1 162 266 -268 3 789 693 232 106 28 chr2 26756727 26756944 -154991143 + RMER5 LTR ERV1 253 486 -48 3 789 931 121 121 0 chr2 26769218 26769383 -154978704 - ORR1A3-int LTR MaLR -1583 380 196 3 789 332 299 22 29 chr2 26778004 26778142 -154969945 + MLT1A1 LTR MaLR 270 406 -2 3 789 276 181 221 35 chr2 26778599 26778685 -154969402 + MT2B LTR ERVL 169 270 -331 3 789 235 244 8 22 chr2 26792639 26792773 -154955314 - ORR1B1-int LTR MaLR -755 754 623 3 789 2094 99 22 0 chr2 26803540 26803853 -154944234 - ORR1A4 LTR MaLR -9 320 1 3 789 368 306 37 0 chr2 26813489 26813597 -154934490 + MER54B LTR ERVL 146 257 -536 3 789 234 264 126 0 chr2 26813613 26813700 -154934387 + MER54B LTR ERVL 508 605 -188 3 789 381 176 165 0 chr2 26820546 26820631 -154927456 + RLTR23 LTR ERV1 2 100 -330 3 789 1471 189 55 34 chr2 26820680 26820916 -154927171 + RMER17C LTR ERVK 16 406 -552 3 789 1471 181 68 29 chr2 26820959 26821155 -154926932 + RMER17C LTR ERVK 196 409 -1 3 789 1218 134 59 0 chr2 26821177 26821379 -154926708 + RLTR23 LTR ERV1 217 430 0 3 789 1935 164 125 9 chr2 26821379 26821428 -154926659 - RLTR28 LTR ERVL -50 474 418 3 789 1935 164 125 9 chr2 26821480 26821599 -154926488 - RLTR28 LTR ERVL -107 417 257 3 789 1935 164 125 9 chr2 26821768 26822022 -154926065 - RLTR28 LTR ERVL -268 256 3 3 789 3922 11 37 0 chr2 26822277 26822742 -154925345 - LTRIS_Mm LTR ERV1 0 482 1 4 789 403 211 55 30 chr2 26825740 26825859 -154922228 - MT2A LTR ERVL -100 501 334 4 789 704 204 98 12 chr2 26825904 26826068 -154922019 - MT2A LTR ERVL -355 178 1 4 789 728 294 4 81 chr2 26826069 26826120 -154921967 - MT2A LTR ERVL -103 430 386 4 789 1820 146 72 54 chr2 26826120 26826511 -154921576 + RMER10B LTR ERVL 1 398 0 4 789 728 294 4 81 chr2 26826511 26826718 -154921369 - MT2A LTR ERVL -148 385 192 4 789 333 344 38 23 chr2 26826712 26826843 -154921244 - MTEa LTR MaLR -239 140 8 4 789 3570 95 21 68 chr2 26827027 26827089 -154920998 + RMER17A LTR ERVK 1 61 -690 4 789 2541 63 75 50 chr2 26827089 26827490 -154920597 - RLTR9F LTR ERVK -4 411 1 4 789 3570 95 21 68 chr2 26827490 26828128 -154919959 + RMER17A LTR ERVK 62 668 -83 4 789 2387 98 0 8 chr2 26828143 26828494 -154919593 - RLTR8 LTR ERVK -17 348 1 4 789 1893 193 45 24 chr2 26834706 26835082 -154913005 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 4 789 412 286 76 0 chr2 26840301 26840420 -154907667 - MLT1A0 LTR MaLR -1 364 237 4 789 662 270 0 41 chr2 26841145 26841315 -154906772 - MTE2b LTR MaLR -12 367 205 4 789 236 226 57 0 chr2 26841482 26841535 -154906552 - MTE2b LTR MaLR -266 113 58 4 789 382 276 10 30 chr2 26841532 26841633 -154906454 - MTE2b LTR MaLR -278 101 3 4 789 2069 123 12 15 chr2 26853817 26854155 -154893932 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 337 0 4 789 25260 41 11 11 chr2 26854155 26857332 -154890755 + IAPEz-int LTR ERVK 8 3185 -3296 4 789 18322 24 2 3 chr2 26857318 26859495 -154888592 + IAPEz-int LTR ERVK 4305 6478 -3 4 789 2069 123 12 15 chr2 26859499 26859837 -154888250 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 337 0 4 789 3275 61 2 0 chr2 26862693 26863088 -154884999 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 790 960 228 53 41 chr2 26886882 26887221 -154860866 + RLTR15 LTR ERVK 1 343 -16 5 790 1651 178 138 6 chr2 26887611 26887951 -154860136 + MTC LTR MaLR 35 419 -2 5 790 1163 226 186 28 chr2 26901245 26901605 -154846482 + MTD LTR MaLR 1 417 -2 5 790 3489 28 5 0 chr2 26905664 26906058 -154842029 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 790 9431 32 5 2 chr2 26906058 26907153 -154840934 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 5 790 3566 20 2 5 chr2 26907153 26907550 -154840537 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 790 1628 195 52 86 chr2 26908085 26908284 -154839803 + MTD LTR MaLR 1 179 -240 5 790 1628 195 52 86 chr2 26908560 26908780 -154839307 + MTD LTR MaLR 180 406 -13 5 790 465 61 8 23 chr2 26909477 26909555 -154838532 + MTB LTR MaLR 256 400 0 5 790 501 219 343 59 chr2 26912626 26912905 -154835182 - ORR1D2 LTR MaLR -4 366 8 5 790 926 221 321 35 chr2 26949794 26950084 -154798003 - MTE2b LTR MaLR -4 375 3 5 790 2310 95 83 3 chr2 26980693 26981031 -154767056 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 3 6 790 1621 143 148 27 chr2 26986522 26986853 -154761234 + MTC LTR MaLR 2 372 -49 6 790 1171 273 42 57 chr2 26987791 26988198 -154759889 + RLTR17 LTR ERVK 105 505 -187 6 790 227 208 21 0 chr2 26988239 26988287 -154759800 + RLTR31_Mur LTR ERVK 501 549 -4 6 790 2204 163 113 19 chr2 26993291 26993717 -154754370 + RMER4A LTR ERVK 1 466 0 6 790 605 112 35 232 chr2 26993719 26993917 -154754170 + RMER4A LTR ERVK 308 466 0 6 791 813 299 117 16 chr2 27001003 27001319 -154746768 + MTEa LTR MaLR 7 354 -25 2 791 3858 32 5 0 chr2 27001614 27002048 -154746039 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 3 791 2359 83 18 56 chr2 27006048 27006390 -154741697 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 7 791 1144 117 127 7 chr2 27011442 27011664 -154736423 - ORR1B2 LTR MaLR -127 267 1 1 791 1084 218 124 26 chr2 27012601 27012801 -154735286 + ORR1D2 LTR MaLR 11 236 -134 2 791 1741 226 35 11 chr2 27012801 27013172 -154734915 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 5 2 791 1084 202 134 17 chr2 27013172 27013299 -154734788 + ORR1D2 LTR MaLR 237 367 -3 2 791 1361 210 18 99 chr2 27013430 27013546 -154734541 + MTE2a LTR MaLR 20 114 -265 2 791 1755 184 90 9 chr2 27013546 27013745 -154734342 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 167 2 791 1755 184 90 9 chr2 27013846 27013992 -154734095 - ORR1D1 LTR MaLR -208 166 1 2 791 1361 210 18 99 chr2 27013992 27014267 -154733820 + MTE2a LTR MaLR 115 378 -1 2 791 337 328 79 10 chr2 27016463 27016666 -154731421 - MLT1D LTR MaLR -184 321 105 2 791 229 281 103 103 chr2 27019981 27020136 -154727951 + RLTR16 LTR ERVK 21 175 -330 3 791 495 328 138 9 chr2 27024505 27024852 -154723235 - MER74B LTR ERVL -50 572 181 4 791 806 260 144 104 chr2 27027031 27027434 -154720653 - MTD LTR MaLR 0 419 1 4 791 2470 109 53 28 chr2 27042374 27042771 -154705316 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 6 791 290 217 17 0 chr2 27053660 27053720 -154694367 + MTEb LTR MaLR 314 374 -5 8 791 398 233 0 97 chr2 27055429 27055442 -154692645 + MT2B LTR ERVL 155 156 -445 8 791 237 300 0 12 chr2 27069829 27069910 -154678177 + MTE2b LTR MaLR 283 362 -17 1 791 391 349 76 12 chr2 27074893 27075064 -154673023 + MLT1B LTR MaLR 1 182 -208 1 791 242 352 37 9 chr2 27075464 27075573 -154672514 + MLT1B LTR MaLR 348 459 -8 1 791 1449 225 76 22 chr2 27079647 27080015 -154668072 + MTD LTR MaLR 24 411 -8 1 791 617 270 216 7 chr2 27080652 27080939 -154667148 + ORR1E LTR MaLR 1 379 0 1 791 338 366 81 22 chr2 27082850 27083121 -154664966 + MLT1A LTR MaLR 1 287 -87 1 791 318 116 9 0 chr2 27084118 27084177 -154663910 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 62 -391 1 791 884 248 209 43 chr2 27088673 27088998 -154659089 + MTE2b LTR MaLR 1 379 0 1 791 456 315 78 34 chr2 27095734 27095938 -154652149 + MTD LTR MaLR 1 213 -206 1 791 267 215 88 88 chr2 27096026 27096040 -154652047 + MTD LTR MaLR 201 210 -169 1 791 267 215 88 88 chr2 27096087 27096174 -154651913 + MTD LTR MaLR 211 302 -77 1 791 281 186 27 14 chr2 27096336 27096410 -154651677 + MTD LTR MaLR 295 398 -21 1 791 3630 95 43 31 chr2 27104222 27104798 -154643289 - MT2B LTR ERVL -18 583 1 1 791 227 258 67 76 chr2 27106002 27106107 -154641980 - RMER10A LTR ERVL -334 108 5 1 791 789 155 123 0 chr2 27106705 27106860 -154641227 + MTC LTR MaLR 246 419 -2 1 791 2156 113 32 9 chr2 27107766 27108111 -154639976 + MT2C_Mm LTR ERVL 123 475 0 1 791 310 319 164 5 chr2 27109316 27109505 -154638582 - RMER15 LTR ERVL -10 565 347 1 791 2293 160 140 8 chr2 27109802 27110274 -154637813 + RMER12B LTR ERVK 1 534 -870 1 791 3572 194 78 165 chr2 27110297 27111562 -154636525 + RLTR21 LTR ERVK 1 1252 -152 1 791 770 282 69 112 chr2 27111601 27111769 -154636318 + RLTR21 LTR ERVK 1253 1404 0 1 791 1502 174 143 20 chr2 27111769 27112126 -154635961 - MTD LTR MaLR -18 401 1 1 791 2026 162 14 134 chr2 27112782 27113288 -154634799 + BGLII_A LTR ERVK 1 445 0 1 791 717 225 81 65 chr2 27113665 27114124 -154633963 + RMER3D-int LTR ERVK 459 1079 -1763 1 791 6780 186 78 52 chr2 27114126 27115927 -154632160 + RMER3D-int LTR ERVK 470 2842 0 1 791 2901 81 68 5 chr2 27115927 27116324 -154631763 + BGLII_Mus LTR ERVK 1 422 0 1 791 876 252 130 27 chr2 27120570 27120871 -154627216 + MTD LTR MaLR 73 404 -15 1 791 369 264 167 0 chr2 27128441 27128585 -154619502 + MTEb LTR MaLR 211 378 -1 1 791 1758 144 151 15 chr2 27130017 27130355 -154617732 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 1 791 1119 281 33 41 chr2 27130845 27131209 -154616878 + MTE2a LTR MaLR 19 379 0 1 792 1607 189 227 57 chr2 27133241 27133712 -154614375 + RLTR31_Mur LTR ERVK 1 551 -2 1 792 1066 259 139 9 chr2 27145225 27145548 -154602539 + MTD LTR MaLR 52 416 -3 2 792 1639 187 142 12 chr2 27149576 27149907 -154598180 + ORR1C1 LTR MaLR 5 378 0 2 792 2251 105 12 47 chr2 27153544 27153885 -154594202 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 2 792 758 269 189 9 chr2 27154296 27154314 -154593773 + MTD LTR MaLR 12 30 -389 2 792 758 269 189 9 chr2 27154510 27154825 -154593262 + MTD LTR MaLR 31 404 -15 2 792 757 301 12 53 chr2 27158190 27158236 -154589851 + MTE2b LTR MaLR 6 42 -337 2 792 1475 170 92 87 chr2 27158236 27158604 -154589483 + ORR1D1 LTR MaLR 5 374 0 2 792 757 301 12 53 chr2 27158604 27158803 -154589284 + MTE2b LTR MaLR 43 241 -138 2 792 638 200 220 17 chr2 27158979 27159026 -154589061 - ORR1D2 LTR MaLR -162 208 135 2 792 638 200 220 17 chr2 27159117 27159241 -154588846 - ORR1D2 LTR MaLR -236 134 2 2 792 606 238 13 33 chr2 27163928 27164080 -154584007 - MTE2a-int LTR MaLR -1429 151 3 2 792 1149 245 48 94 chr2 27164081 27164503 -154583584 - MTE2a LTR MaLR 0 421 23 2 792 273 305 0 95 chr2 27168901 27169017 -154579070 + MT2B2 LTR ERVL 155 259 -325 2 792 358 363 47 39 chr2 27177728 27177986 -154570101 + MTEb LTR MaLR 120 379 0 2 792 2677 145 92 10 chr2 27178141 27178629 -154569458 + RLTR11A LTR ERVK 1 528 0 2 792 732 308 60 30 chr2 27183021 27183322 -154564765 - MTD LTR MaLR -109 310 1 2 792 3233 48 8 8 chr2 27188413 27188809 -154559278 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 792 1947 133 84 3 chr2 27196601 27196933 -154551154 + RLTR15 LTR ERVK 1 359 0 2 792 1311 224 71 69 chr2 27198316 27198694 -154549393 - MTE2b LTR MaLR 0 379 1 2 792 337 212 11 81 chr2 27199001 27199088 -154548999 + MLT1J1 LTR MaLR 234 314 -130 2 792 461 215 11 11 chr2 27202706 27202800 -154545287 + RLTR11A LTR ERVK 1 94 -434 2 792 1167 259 83 20 chr2 27203048 27203399 -154544688 - MTE2b LTR MaLR -5 374 2 2 792 4654 166 74 26 chr2 27206609 27207469 -154540618 + RMER19B LTR ERVK 1 902 0 2 792 280 330 29 48 chr2 27215946 27216051 -154532036 + MT2B LTR ERVL 153 255 -346 2 792 365 316 102 11 chr2 27219145 27219321 -154528766 + RMER15 LTR ERVL 347 538 -37 3 792 286 284 69 76 chr2 27220120 27220265 -154527822 + MLT1J LTR MaLR 227 370 -142 3 792 287 230 14 0 chr2 27229148 27229222 -154518865 + MTC LTR MaLR 2 76 -345 3 792 377 281 130 75 chr2 27236320 27236574 -154511513 - RMER10A LTR ERVL -165 277 10 3 792 725 258 46 37 chr2 27240600 27240817 -154507270 - MTE-int LTR MaLR -592 988 770 3 792 249 299 70 83 chr2 27241469 27241626 -154506461 + RLTR25B LTR ERVK 442 596 -432 3 792 566 354 72 59 chr2 27246888 27246965 -154501122 + MTE2a LTR MaLR 10 74 -345 3 792 621 284 108 70 chr2 27247160 27247487 -154500600 + MTE2a LTR MaLR 64 419 0 3 792 495 232 14 72 chr2 27251257 27251396 -154496691 + MTEa LTR MaLR 24 154 -225 3 792 270 313 167 6 chr2 27251396 27251437 -154496650 + MLT2B3 LTR ERVL 24 232 -322 3 792 250 26 179 0 chr2 27253849 27253888 -154494199 + MTEa LTR MaLR 273 318 -8 3 792 379 301 133 52 chr2 27254339 27254567 -154493520 - MLT1A LTR MaLR -82 292 51 3 792 4353 98 141 12 chr2 27254567 27255220 -154492867 - RMER19A LTR ERVK 0 737 1 3 792 379 301 133 52 chr2 27255220 27255261 -154492826 - MLT1A LTR MaLR -324 50 1 3 792 236 224 105 12 chr2 27255588 27255674 -154492413 + MLT1B LTR MaLR 280 373 -17 3 792 2178 72 123 3 chr2 27256178 27256470 -154491617 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 3 792 9732 120 82 117 chr2 27256470 27257528 -154490559 + ORR1A2-int LTR MaLR 1 1043 -920 3 792 9732 120 82 117 chr2 27257581 27258555 -154489532 + ORR1A2-int LTR MaLR 1044 1963 0 3 792 2251 77 19 9 chr2 27258555 27258871 -154489216 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 3 792 637 162 8 0 chr2 27259415 27259532 -154488555 + MTD LTR MaLR 26 143 -276 3 793 1192 193 149 29 chr2 27274505 27274820 -154473267 - MTD LTR MaLR 0 419 67 3 793 233 299 89 40 chr2 27274828 27274929 -154473158 + LTR78 LTR ERV1 852 957 -347 3 793 402 193 29 138 chr2 27276247 27276385 -154471702 + MT2B LTR ERVL 142 264 -337 3 793 543 262 29 83 chr2 27288349 27288553 -154459534 + MTD LTR MaLR 15 207 -212 4 793 247 109 65 0 chr2 27289504 27289550 -154458537 + MTD LTR MaLR 363 411 -8 4 793 1012 248 122 133 chr2 27290836 27291459 -154456628 + RLTR18 LTR ERVK 1 616 0 4 793 312 349 55 75 chr2 27293487 27293642 -154454445 + MLT1C LTR MaLR 204 359 -108 4 793 312 349 55 75 chr2 27293835 27293933 -154454154 + MLT1C LTR MaLR 360 452 -15 4 793 243 243 0 79 chr2 27324686 27324762 -154423325 - MLT1G1 LTR MaLR -340 239 170 4 793 3283 48 5 8 chr2 27336688 27337085 -154411002 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 793 430 236 31 1 chr2 27337675 27337783 -154410304 + MLT1B LTR MaLR 2 111 -356 5 793 351 241 32 158 chr2 27341425 27341466 -154406621 + MT2B LTR ERVL 141 161 -440 5 793 593 264 48 123 chr2 27341918 27342053 -154406034 - MTE2b LTR MaLR -97 282 164 5 793 593 264 48 123 chr2 27342199 27342331 -154405756 - MTE2b LTR MaLR -216 163 35 5 793 3514 25 5 0 chr2 27344244 27344638 -154403449 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 793 234 247 0 94 chr2 27346730 27346815 -154401272 - RLTR25B LTR ERVK -511 517 441 5 793 1956 154 17 66 chr2 27348206 27348568 -154399519 - ORR1B2 LTR MaLR -8 359 16 5 793 5372 162 98 12 chr2 27348588 27349669 -154398418 - ORR1B2-int LTR MaLR 0 1509 336 5 793 1081 172 11 5 chr2 27349865 27350052 -154398035 - ORR1B2 LTR MaLR -179 188 1 5 793 984 149 97 0 chr2 27350569 27350744 -154397343 + RMER15 LTR ERVL 39 230 -345 5 793 3828 115 5 27 chr2 27350738 27351326 -154396761 + RLTR5_Mm LTR ERV1 54 628 0 5 793 15054 103 8 12 chr2 27351326 27353595 -154394492 + MURVY-int LTR ERV1 1 2261 -5191 5 793 5700 280 6 41 chr2 27353604 27354208 -154393879 + MURVY-int LTR ERV1 2684 3273 -4283 5 793 24101 82 3 14 chr2 27354355 27357788 -154390299 + MURVY-int LTR ERV1 3140 6503 -949 5 793 2980 70 6 82 chr2 27357784 27358285 -154389802 + MURVY-int LTR ERV1 6990 7452 0 5 793 4293 106 5 53 chr2 27358285 27358945 -154389142 + RLTR5_Mm LTR ERV1 1 628 0 5 793 2638 163 73 6 chr2 27359098 27359592 -154388495 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 527 0 5 793 326 227 0 107 chr2 27360728 27360812 -154387275 + MT2B LTR ERVL 166 240 -361 5 793 729 171 65 7 chr2 27364337 27364490 -154383597 - RLTR18 LTR ERVK -47 569 408 5 793 707 291 115 77 chr2 27365422 27365787 -154382300 - MTEa LTR MaLR 0 379 1 5 793 468 136 37 0 chr2 27367233 27367314 -154380773 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 284 5 793 4347 108 18 127 chr2 27367427 27368352 -154379735 + RLTR13C1 LTR ERVK 1 976 -7 5 793 1390 188 118 43 chr2 27368410 27368698 -154379389 - ORR1B2 LTR MaLR -55 312 1 5 793 333 140 0 0 chr2 27376690 27376740 -154371347 - MTD LTR MaLR -9 410 361 6 793 911 213 11 11 chr2 27376740 27376916 -154371171 - MTC LTR MaLR 0 421 246 6 793 1027 198 12 70 chr2 27377050 27377164 -154370923 - MTC LTR MaLR -179 242 140 6 793 1027 198 12 70 chr2 27377301 27377430 -154370657 - MTC LTR MaLR -282 139 13 6 793 1268 161 150 105 chr2 27377763 27377967 -154370120 - ORR1B2 LTR MaLR -8 359 133 6 793 1268 161 150 105 chr2 27378111 27378240 -154369847 - ORR1B2 LTR MaLR -235 132 11 6 793 750 276 138 5 chr2 27378623 27378873 -154369214 - MTD LTR MaLR -78 343 50 6 793 291 241 32 76 chr2 27382038 27382167 -154365920 - ORR1B1-int LTR MaLR -755 754 628 6 793 291 241 32 76 chr2 27382356 27382383 -154365704 - ORR1B1-int LTR MaLR -882 627 605 6 794 609 165 19 0 chr2 27394621 27394724 -154353363 - ORR1B1 LTR MaLR -23 371 267 6 794 542 229 17 8 chr2 27398254 27398373 -154349714 + MTE2b LTR MaLR 260 379 0 6 794 309 277 35 9 chr2 27398395 27398508 -154349579 + RMER15-int LTR ERVL 658 773 -4226 6 794 413 329 65 0 chr2 27398532 27398748 -154349339 + RMER15-int LTR ERVL 1288 1517 -3482 6 794 379 288 0 9 chr2 27399068 27399173 -154348914 + RMER15-int LTR ERVL 1514 1617 -3382 6 794 921 197 9 134 chr2 27399246 27399318 -154348769 - ORR1C1 LTR MaLR -4 390 338 6 794 921 155 52 36 chr2 27399464 27399489 -154348598 - ORR1C1 LTR MaLR -40 338 313 6 794 921 155 52 36 chr2 27399676 27399831 -154348256 - ORR1C1 LTR MaLR -66 312 155 6 794 2757 202 108 107 chr2 27399831 27400716 -154347371 + RMER19B LTR ERVK 1 886 -16 6 794 678 172 121 53 chr2 27400750 27400823 -154347264 - ORR1C1 LTR MaLR -199 168 102 6 794 7381 42 15 10 chr2 27400823 27401712 -154346375 + RLTR13B1 LTR ERVK 1 893 0 6 794 678 148 140 53 chr2 27401712 27401805 -154346282 - ORR1C1 LTR MaLR -265 113 1 6 794 5130 222 92 14 chr2 27401809 27403077 -154345010 - ORR1C1-int LTR MaLR -4 1366 1 6 794 314 128 0 0 chr2 27403079 27403126 -154344961 - ORR1C1 LTR MaLR -2 382 336 6 794 1544 184 55 0 chr2 27403474 27403739 -154344348 - ORR1C1 LTR MaLR -43 335 56 6 794 769 231 93 54 chr2 27404181 27404460 -154343627 + RMER10A LTR ERVL 30 319 -123 6 794 2776 124 131 12 chr2 27404460 27404956 -154343131 - RMER6A LTR ERVK 0 756 202 6 794 1143 117 99 6 chr2 27406112 27406293 -154341794 - RMER6A LTR ERVK -546 210 13 6 794 386 298 123 9 chr2 27407195 27407415 -154340672 - ERVL-int LTR ERVL -3943 1814 1570 6 794 849 290 63 12 chr2 27408870 27409184 -154338903 + MTE2b LTR MaLR 1 367 -12 6 794 301 294 124 78 chr2 27411155 27411525 -154336562 - MLT1C LTR MaLR -11 494 70 6 794 2047 244 97 18 chr2 27412567 27413123 -154334964 + MTEa-int LTR MaLR 727 1326 -254 7 794 402 228 363 0 chr2 27413884 27414055 -154334032 + MTEa-int LTR MaLR 1346 1578 -2 7 794 1089 221 122 81 chr2 27414057 27414401 -154333686 + MTEa LTR MaLR 1 358 -21 7 794 1321 239 105 6 chr2 27419025 27419358 -154328729 - MTE2a LTR MaLR -12 367 2 7 794 720 269 85 67 chr2 27426562 27426845 -154321242 - ORR1E LTR MaLR -21 338 51 7 794 1667 214 109 74 chr2 27430158 27430699 -154317388 - RMER4B LTR ERVK -9 576 17 7 794 2419 81 12 9 chr2 27432972 27433298 -154314789 + ORR1A4 LTR MaLR 1 327 -2 7 794 3025 150 111 228 chr2 27433617 27434639 -154313448 - RMER19B LTR ERVK 0 902 1 7 794 1479 169 184 132 chr2 27440948 27441371 -154306716 + MT2A LTR ERVL 1 445 -88 7 794 1012 237 180 18 chr2 27449472 27449818 -154298269 + MTD LTR MaLR 18 405 -14 7 794 2584 157 32 2 chr2 27453869 27454278 -154293809 + MTC LTR MaLR 1 421 0 7 794 921 248 113 99 chr2 27459346 27459699 -154288388 + MTE2a LTR MaLR 19 376 -3 7 794 472 292 105 6 chr2 27463510 27463672 -154284415 + MTEb LTR MaLR 2 179 -200 7 794 782 238 28 0 chr2 27466241 27466422 -154281665 + ORR1E LTR MaLR 24 209 -150 7 794 492 196 10 10 chr2 27466978 27467076 -154281011 + ORR1E LTR MaLR 282 379 0 7 794 618 219 59 83 chr2 27471304 27471508 -154276579 - MTD LTR MaLR 0 421 223 8 794 264 136 0 0 chr2 27471536 27471580 -154276507 - MTD LTR MaLR -155 266 223 8 794 252 81 0 0 chr2 27471579 27471616 -154276471 - MTD LTR MaLR -162 259 223 8 794 256 136 0 0 chr2 27471608 27471652 -154276435 - MTD LTR MaLR -155 266 223 8 794 239 159 0 0 chr2 27471644 27471688 -154276399 - MTD LTR MaLR -155 266 223 8 794 256 136 0 0 chr2 27471680 27471724 -154276363 - MTD LTR MaLR -155 266 223 8 794 264 136 0 0 chr2 27471752 27471796 -154276291 - MTD LTR MaLR -155 266 223 8 794 250 81 0 0 chr2 27471795 27471832 -154276255 - MTD LTR MaLR -160 259 223 8 794 256 136 0 0 chr2 27471824 27471868 -154276219 - MTD LTR MaLR -155 266 223 8 794 256 136 0 0 chr2 27471860 27471904 -154276183 - MTD LTR MaLR -155 266 223 8 794 1259 150 47 90 chr2 27471896 27472174 -154275913 - MTD LTR MaLR -153 266 1 8 794 751 221 125 6 chr2 27473363 27473673 -154274414 - MTEb LTR MaLR 0 379 33 8 794 1537 239 76 14 chr2 27478499 27478856 -154269231 - MTE2b LTR MaLR 0 379 1 8 794 2178 134 55 8 chr2 27485887 27486248 -154261839 - ORR1B1 LTR MaLR -16 378 1 8 794 373 296 87 39 chr2 27486608 27486659 -154261428 - MLT1E2 LTR MaLR -17 607 558 8 794 373 296 87 39 chr2 27486803 27487062 -154261025 - MLT1E2 LTR MaLR -68 559 287 8 794 291 360 39 70 chr2 27488171 27488428 -154259659 + MLT1E1 LTR MaLR 382 630 -24 8 794 1831 164 30 89 chr2 27497791 27498227 -154249860 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 8 794 419 301 109 30 chr2 27499090 27499471 -154248616 - MLT2B1 LTR ERVL -4 550 44 8 794 826 168 120 11 chr2 27503666 27503841 -154244246 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 191 6 794 849 170 19 7 chr2 27504011 27504165 -154243922 - ORR1C2 LTR MaLR -228 156 1 6 794 364 318 44 55 chr2 27504281 27504410 -154243677 - MLT1C LTR MaLR -153 314 187 9 794 364 318 44 55 chr2 27504603 27504656 -154243431 - MLT1C LTR MaLR -281 186 134 9 794 230 335 197 10 chr2 27505270 27505478 -154242609 - ORR1D2 LTR MaLR -35 335 89 1 794 318 227 97 26 chr2 27507539 27507652 -154240435 + MLT2B1 LTR ERVL 93 213 -307 1 794 243 267 40 13 chr2 27508095 27508171 -154239916 - MLT1F LTR MaLR -44 504 427 1 794 422 284 103 18 chr2 27508192 27508357 -154239730 - MLT1F LTR MaLR -190 358 180 1 794 381 344 110 25 chr2 27511209 27511528 -154236559 + MLT1H1 LTR MaLR 199 544 -11 2 794 2300 94 15 12 chr2 27514222 27514546 -154233541 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 2 2 794 292 254 37 103 chr2 27514719 27514855 -154233232 - MT2B LTR ERVL -322 279 153 3 794 1949 142 29 0 chr2 27515899 27516208 -154231879 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 2 3 794 11664 124 60 14 chr2 27516209 27518087 -154230000 - ORR1A2-int LTR MaLR 0 1963 1 3 794 2073 121 65 3 chr2 27518087 27518395 -154229692 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 3 794 1531 181 48 129 chr2 27524773 27524949 -154223138 + ORR1C2 LTR MaLR 1 165 -219 5 99 1531 181 48 129 chr2 27525096 27525155 -154222932 + ORR1C2 LTR MaLR 166 190 -194 5 795 1531 181 48 129 chr2 27525289 27525470 -154222617 + ORR1C2 LTR MaLR 191 384 0 5 795 1672 174 43 117 chr2 27560577 27561020 -154187067 + RMER17C LTR ERVK 1 410 0 8 795 264 360 106 4 chr2 27607475 27607712 -154140375 - MLT1D LTR MaLR -175 330 70 1 795 225 288 11 130 chr2 27618670 27618762 -154129325 - BGLII_A LTR ERVK -283 162 82 1 795 799 238 49 41 chr2 27628417 27628662 -154119425 + MER77 LTR ERVL 1 247 -360 1 795 1161 220 166 26 chr2 27637491 27637804 -154110283 - ORR1E LTR MaLR -2 357 1 1 795 837 244 25 15 chr2 27638009 27638213 -154109874 - MTEb LTR MaLR -16 363 158 1 795 4743 125 58 75 chr2 27638222 27638954 -154109133 + RMER19B LTR ERVK 1 725 -177 1 795 3414 36 10 0 chr2 27638954 27639346 -154108741 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 795 4743 125 58 75 chr2 27639346 27639524 -154108563 + RMER19B LTR ERVK 726 896 -6 1 795 479 271 60 8 chr2 27639523 27639657 -154108430 - MTEb LTR MaLR -238 141 1 1 795 3653 10 2 0 chr2 27643038 27643433 -154104654 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 795 945 223 65 1 chr2 27643653 27643883 -154104204 + MTE2b LTR MaLR 1 246 -133 1 795 533 256 16 0 chr2 27644751 27644876 -154103211 + MTE2b LTR MaLR 224 350 -29 1 795 1100 202 71 43 chr2 27644912 27645166 -154102921 + MTD LTR MaLR 21 281 -138 1 795 4377 23 0 0 chr2 27645701 27646183 -154101904 - LTRIS_Mm LTR ERV1 0 482 1 1 795 4013 83 2 65 chr2 27646355 27646921 -154101166 - MT2B LTR ERVL -2 599 64 1 795 4013 83 2 65 chr2 27647070 27647131 -154100956 - MT2B LTR ERVL -538 63 12 1 795 1232 254 98 6 chr2 27651623 27651960 -154096127 + ORR1D2 LTR MaLR 3 370 0 1 795 682 282 65 24 chr2 27652447 27652764 -154095323 - MTD LTR MaLR 0 419 34 1 795 290 268 17 136 chr2 27654112 27654276 -154093811 + ORR1E LTR MaLR 168 311 -48 1 795 290 268 17 136 chr2 27654341 27654353 -154093734 + ORR1E LTR MaLR 312 323 -36 1 796 354 272 107 46 chr2 27656757 27657066 -154091021 + RMER10A LTR ERVL 12 380 -62 1 796 973 291 30 77 chr2 27663706 27664113 -154083974 + MTE2a LTR MaLR 21 419 0 1 796 1126 254 107 14 chr2 27667293 27667640 -154080447 + MTE2b LTR MaLR 1 379 0 1 796 1309 215 134 6 chr2 27670909 27671237 -154076850 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 2 796 2187 73 12 60 chr2 27672617 27672950 -154075137 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 10 2 796 4852 134 55 33 chr2 27675697 27676555 -154071532 - RMER19B LTR ERVK -25 877 1 2 796 904 249 137 22 chr2 27676582 27676853 -154071234 + MTE2b LTR MaLR 64 365 -14 2 796 976 132 75 0 chr2 27676869 27677028 -154071059 + RMER19B LTR ERVK 173 343 -559 2 796 1429 234 65 9 chr2 27677038 27677375 -154070712 + MTE2b-int LTR MaLR 1 356 -1224 2 796 520 310 62 133 chr2 27678884 27679094 -154068993 + MTE2a LTR MaLR 2 210 -209 2 796 625 252 68 82 chr2 27679283 27679507 -154068580 + MTE2a LTR MaLR 162 405 -14 2 796 1928 211 79 13 chr2 27679541 27680011 -154068076 - RMER20A LTR ERVK -3 513 13 2 796 271 267 378 92 chr2 27681642 27681908 -154066179 + MLT1A0 LTR MaLR 16 358 -16 2 796 1109 167 163 4 chr2 27685998 27686250 -154061837 + MTD LTR MaLR 5 296 -123 2 796 920 253 97 35 chr2 27686437 27686787 -154061300 - MTE2a LTR MaLR -61 358 1 2 796 382 56 0 0 chr2 27687028 27687082 -154061005 + ORR1A4 LTR MaLR 1 54 -275 2 796 1155 237 67 59 chr2 27688449 27688807 -154059280 - ORR1D2 LTR MaLR -6 364 4 2 796 921 291 75 22 chr2 27695352 27695710 -154052377 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 32 2 796 1123 240 74 22 chr2 27699872 27700009 -154048078 + MTEa LTR MaLR 1 146 -233 2 796 1817 120 90 7 chr2 27700009 27700310 -154047777 - ORR1A2 LTR MaLR -1 326 1 2 796 1123 240 74 22 chr2 27700310 27700496 -154047591 + MTEa LTR MaLR 147 341 -38 2 796 1304 184 158 0 chr2 27700513 27700817 -154047270 + MTD LTR MaLR 64 415 -4 2 796 1757 132 18 35 chr2 27700880 27701228 -154046859 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 2 796 2067 102 3 110 chr2 27701528 27701892 -154046195 + ORR1A2 LTR MaLR 1 325 -2 2 796 234 267 80 0 chr2 27701982 27702057 -154046030 + RMER15 LTR ERVL 403 483 -92 2 796 417 257 9 9 chr2 27705875 27705981 -154042106 + MTD LTR MaLR 46 151 -268 2 796 498 311 128 0 chr2 27712258 27712515 -154035572 + MTE2b LTR MaLR 1 290 -89 2 796 297 321 140 30 chr2 27713212 27713376 -154034711 + MER74B LTR ERVL 58 239 -383 2 796 389 245 89 64 chr2 27719318 27719475 -154028612 + MLT-int LTR MaLR 1360 1520 -215 2 796 741 273 54 8 chr2 27720139 27720379 -154027708 - MLT-int LTR MaLR -139 1596 1346 2 796 660 340 51 81 chr2 27720798 27721326 -154026761 - MLT-int LTR MaLR -888 847 336 2 796 378 299 195 13 chr2 27721617 27721926 -154026161 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 1 2 796 456 308 68 32 chr2 27725177 27725398 -154022689 - RMER15 LTR ERVL 0 575 347 3 796 282 398 16 0 chr2 27732946 27733069 -154015018 - MLT1C LTR MaLR -7 460 336 3 796 241 219 110 40 chr2 27733386 27733486 -154014601 - MLT1C LTR MaLR -291 176 70 3 796 2070 169 88 3 chr2 27733965 27734350 -154013737 + MTD LTR MaLR 2 419 0 3 796 2491 145 13 18 chr2 27734501 27734895 -154013192 - ORR1B1 LTR MaLR -2 392 1 3 796 471 304 121 37 chr2 27735139 27735354 -154012733 - MLT1C LTR MaLR -12 455 223 3 796 231 242 16 16 chr2 27735371 27735434 -154012653 - MLT1C LTR MaLR -310 195 133 3 796 228 324 80 43 chr2 27737036 27737223 -154010864 + MLT1D LTR MaLR 32 225 -280 3 796 1115 217 69 25 chr2 27738384 27738658 -154009429 - MTD LTR MaLR 0 419 134 3 796 1068 264 44 73 chr2 27776457 27776862 -153971225 - MTE2a LTR MaLR 0 419 1 3 797 1737 194 91 29 chr2 27793163 27793546 -153954541 + MTD LTR MaLR 13 419 0 3 797 940 272 20 128 chr2 27800354 27800556 -153947531 + MTD LTR MaLR 8 209 -210 3 797 940 273 20 123 chr2 27800696 27800952 -153947135 + MTD LTR MaLR 210 405 -14 3 797 1414 211 73 37 chr2 27833050 27833404 -153914683 - MTEa LTR MaLR -2 377 11 4 797 419 306 24 0 chr2 27838283 27838407 -153909680 - MLT1A0 LTR MaLR -83 282 156 4 797 269 256 56 14 chr2 27862608 27862706 -153885381 - ORR1E LTR MaLR -14 365 269 4 797 542 220 159 7 chr2 27867764 27867915 -153880172 - MTEa LTR MaLR 0 379 206 4 797 2853 161 48 76 chr2 27879113 27879238 -153868849 - RMER15 LTR ERVL -1 574 446 4 797 2853 161 48 76 chr2 27879382 27879846 -153868241 - RMER15 LTR ERVL -130 445 2 4 797 485 267 157 46 chr2 27883107 27883323 -153864764 - RMER15 LTR ERVL 0 575 336 4 797 251 286 37 37 chr2 27883419 27883528 -153864559 - RMER15 LTR ERVL -466 109 1 4 797 897 248 87 12 chr2 27883663 27883916 -153864171 - RMER15-int LTR ERVL -390 4609 4338 4 797 871 173 17 16 chr2 27891106 27891312 -153856775 - ORR1B1 LTR MaLR -1 393 172 4 797 4384 148 103 55 chr2 27897520 27897748 -153850339 + RMER19B LTR ERVK 1 217 -685 4 797 2126 132 25 0 chr2 27897748 27898066 -153850021 + ORR1A3 LTR MaLR 1 326 0 4 797 11568 109 75 23 chr2 27898066 27899933 -153848154 + ORR1A3-int LTR MaLR 1 1963 0 4 797 2302 118 16 0 chr2 27899933 27900254 -153847833 + ORR1A3 LTR MaLR 1 326 0 4 797 4384 148 103 55 chr2 27900254 27900883 -153847204 + RMER19B LTR ERVK 218 900 -2 4 797 364 288 164 45 chr2 27901290 27901534 -153846553 - MLT1F2 LTR MaLR -29 531 259 4 797 231 268 14 27 chr2 27902529 27902602 -153845485 - MTEb LTR MaLR -29 350 279 4 797 430 163 50 20 chr2 27904583 27904683 -153843404 + ORR1D1 LTR MaLR 7 109 -265 4 797 3876 158 145 54 chr2 27905419 27906235 -153841852 + RMER19B LTR ERVK 1 890 -12 4 797 1082 239 75 63 chr2 27906589 27906714 -153841373 - MTEb LTR MaLR -22 357 227 4 797 1082 239 75 63 chr2 27906752 27906975 -153841112 - MTEb LTR MaLR -153 226 5 4 797 383 302 115 45 chr2 27910227 27910522 -153837565 + MTEa LTR MaLR 55 379 0 4 797 3412 11 39 0 chr2 27911186 27911567 -153836520 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 797 9652 15 5 2 chr2 27911567 27912662 -153835425 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 5 797 3590 10 5 0 chr2 27912662 27913056 -153835031 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 797 253 296 121 43 chr2 27913953 27914094 -153833993 + MLT1E1A LTR MaLR 295 446 -234 5 797 1317 214 104 19 chr2 27915353 27915718 -153832369 + MTC LTR MaLR 18 407 -14 5 797 2603 236 63 78 chr2 27917217 27917635 -153830452 + MTC-int LTR MaLR 319 753 -505 5 797 3033 153 168 3 chr2 27917635 27918217 -153829870 - RLTR33 LTR ERVK 0 678 1 5 99 2603 236 63 78 chr2 27918217 27918671 -153829416 + MTC-int LTR MaLR 754 1178 -80 5 798 237 304 132 54 chr2 27921095 27921262 -153826825 + MTEa LTR MaLR 197 376 -3 5 798 390 337 83 56 chr2 27922781 27923083 -153825004 + MLT1J-int LTR MaLR 133 442 -945 5 798 1923 157 26 24 chr2 27923281 27923620 -153824467 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 47 5 798 3530 40 28 12 chr2 27929004 27929433 -153818654 + RLTR10C LTR ERVK 1 436 0 5 798 1678 197 158 3 chr2 27936920 27937281 -153810806 + MTD LTR MaLR 1 417 -2 5 798 1141 196 166 28 chr2 27942025 27942350 -153805737 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 5 5 798 2587 211 145 8 chr2 27943443 27944077 -153804010 + RMER13A LTR ERVK 1 721 -139 5 798 2483 151 24 0 chr2 27948095 27948506 -153799581 + MTC LTR MaLR 1 421 0 5 798 4444 138 65 71 chr2 27948822 27949723 -153798364 - RMER19B LTR ERVK -6 896 1 5 798 719 179 9 17 chr2 27950968 27951128 -153796959 + MTD LTR MaLR 247 417 -2 5 798 493 280 45 0 chr2 27953010 27953167 -153794920 + ORR1E LTR MaLR 1 164 -195 5 798 523 188 125 38 chr2 27953616 27953780 -153794307 - MTD LTR MaLR -12 407 243 5 798 409 244 40 40 chr2 27953781 27953905 -153794182 - MTD LTR MaLR -295 124 1 5 798 1218 179 224 129 chr2 27958394 27958433 -153789654 - MT2A LTR ERVL 0 533 485 5 798 1218 179 224 129 chr2 27958605 27958975 -153789112 - MT2A LTR ERVL -49 484 83 5 798 1218 179 224 129 chr2 27959043 27959119 -153788968 - MT2A LTR ERVL -451 82 2 5 798 503 262 233 20 chr2 27961603 27961856 -153786231 - ORR1E LTR MaLR -15 344 38 5 798 1118 214 84 58 chr2 27963050 27963358 -153784729 - MTE2b LTR MaLR -39 340 25 5 798 1605 166 41 14 chr2 27964774 27965068 -153783019 - MTC LTR MaLR -117 304 3 5 798 1737 181 59 39 chr2 27965249 27965656 -153782431 + MTD LTR MaLR 5 419 0 5 798 1812 202 65 3 chr2 27972454 27972519 -153775568 + MTD LTR MaLR 1 69 -350 5 798 1812 202 65 3 chr2 27972540 27972861 -153775226 + MTD LTR MaLR 70 410 -9 5 798 758 284 46 14 chr2 27975404 27975622 -153772465 + MTE-int LTR MaLR 185 409 -1171 5 798 682 279 170 8 chr2 27975802 27976055 -153772032 + MTE-int LTR MaLR 823 1116 -464 5 798 766 135 21 7 chr2 27976870 27977012 -153771075 + RMER4B LTR ERVK 17 160 -425 5 798 571 230 183 56 chr2 27977087 27977314 -153770773 + RMER4B LTR ERVK 343 576 -9 5 798 831 190 83 71 chr2 27978128 27978563 -153769524 - LTRIS3 LTR ERV1 -1 511 1 6 798 470 220 28 0 chr2 27980454 27980563 -153767524 - MTEa LTR MaLR 0 379 268 6 798 2501 160 56 14 chr2 27980571 27981072 -153767015 + RLTR11A2 LTR ERVK 6 527 0 6 798 302 111 0 0 chr2 27981102 27981147 -153766940 - MTEa LTR MaLR -215 164 120 6 798 364 270 115 18 chr2 27981164 27981277 -153766810 - MTEa LTR MaLR -224 155 32 6 798 2199 211 26 98 chr2 27982612 27983268 -153764819 + RMER19C LTR ERVK 3 611 0 6 798 1030 160 87 12 chr2 27988484 27988725 -153759362 - ORR1B2-int LTR MaLR -1250 259 1 6 798 614 158 143 7 chr2 27988752 27988899 -153759188 - ORR1B2 LTR MaLR -200 167 1 6 798 2476 125 47 2 chr2 27991379 27991781 -153756306 + MTC LTR MaLR 2 421 0 6 798 887 141 43 6 chr2 27992909 27993073 -153755014 - RLTR17 LTR ERVK -324 368 199 6 798 262 232 17 0 chr2 27995021 27995087 -153753000 + MLT1C LTR MaLR 37 103 -287 6 798 244 178 112 56 chr2 27995127 27995234 -153752853 - RLTR25B LTR ERVK -519 509 397 6 798 311 333 72 13 chr2 27995438 27995590 -153752497 + MLT1C LTR MaLR 97 257 -210 6 798 2933 61 8 8 chr2 27995817 27996213 -153751874 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 798 315 290 49 20 chr2 28000101 28000203 -153747884 - RLTR42-int LTR ERVK -4122 1400 1296 1 798 555 151 0 0 chr2 28001316 28001409 -153746678 + RMER19C LTR ERVK 1 93 -518 3 798 255 268 29 58 chr2 28001533 28001636 -153746451 - RLTR17 LTR ERVK -255 437 338 4 798 490 288 65 26 chr2 28001643 28001875 -153746212 - RLTR16 LTR ERVK -241 264 24 5 798 2217 135 141 21 chr2 28001886 28002311 -153745776 + RMER19C LTR ERVK 136 611 0 6 798 548 189 88 38 chr2 28011148 28011307 -153736780 - RMER13B LTR ERVK 0 908 742 1 798 1649 251 94 119 chr2 28011283 28012188 -153735899 - RMER17B LTR ERVK -147 811 1 2 798 2195 99 15 36 chr2 28018989 28019323 -153728764 + ORR1A4 LTR MaLR 1 327 -2 3 798 2341 184 12 7 chr2 28023764 28024179 -153723908 - MTD LTR MaLR -2 417 1 4 798 396 327 40 76 chr2 28027453 28027754 -153720333 + MLT1G3 LTR MaLR 58 347 -248 4 798 587 320 74 48 chr2 28029427 28029736 -153718351 - MTEb LTR MaLR -62 317 1 5 798 1869 146 145 26 chr2 28032575 28032927 -153715160 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 6 798 2120 177 87 127 chr2 28035470 28036021 -153712066 - RLTR24 LTR ERV1 0 529 1 6 798 1010 218 151 17 chr2 28041554 28041853 -153706234 - MTD LTR MaLR -1 418 80 7 798 2117 111 13 0 chr2 28042044 28042360 -153705727 - ORR1A4 LTR MaLR -9 320 1 7 799 561 224 21 14 chr2 28079296 28079441 -153668646 - MTD LTR MaLR -2 417 272 1 799 670 306 81 31 chr2 28079497 28079757 -153668330 - MTD LTR MaLR -146 273 1 1 799 2608 83 0 3 chr2 28091326 28091653 -153656434 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 1 799 1051 192 67 26 chr2 28093121 28093441 -153654646 - LTRIS5 LTR ERV1 0 447 1 1 799 340 316 94 65 chr2 28101697 28102079 -153646008 - MLT1J LTR MaLR -90 422 30 1 799 626 283 55 5 chr2 28104054 28104253 -153643834 + MLT1A1 LTR MaLR 172 380 -28 1 799 1448 127 36 16 chr2 28104500 28104748 -153643339 - RMER19B LTR ERVK 0 902 650 1 799 2379 153 43 6 chr2 28110200 28110666 -153637421 + RLTR28 LTR ERVL 18 500 -24 1 799 878 207 95 22 chr2 28115651 28115873 -153632214 + MTD LTR MaLR 182 419 0 1 799 5360 137 62 16 chr2 28117891 28118803 -153629284 - RMER17B LTR ERVK -3 955 2 1 799 1942 142 19 47 chr2 28123457 28123818 -153624269 + ORR1B1 LTR MaLR 41 391 -3 1 799 1553 196 46 51 chr2 28124953 28125148 -153622939 - ORR1C2 LTR MaLR -11 373 175 1 799 1553 196 46 51 chr2 28125303 28125478 -153622609 - ORR1C2 LTR MaLR -210 174 5 1 799 4016 195 71 58 chr2 28129886 28130778 -153617309 + RMER13B LTR ERVK 5 907 -1 1 799 1530 259 39 85 chr2 28131852 28132516 -153615571 - RLTR18 LTR ERVK -53 563 1 1 799 1098 208 116 31 chr2 28135260 28135561 -153612526 + MTD LTR MaLR 64 371 -8 1 799 481 229 146 168 chr2 28135623 28135843 -153612244 + MTE2b LTR MaLR 2 216 -163 1 799 3763 210 29 63 chr2 28135879 28136793 -153611294 - RMER13B LTR ERVK 0 908 26 1 799 4407 22 0 12 chr2 28136793 28137292 -153610795 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 1 799 3763 210 29 63 chr2 28137292 28137313 -153610774 - RMER13B LTR ERVK -883 25 5 1 799 642 242 57 0 chr2 28137468 28137625 -153610462 + MTE2b LTR MaLR 213 378 -1 1 799 2887 87 55 0 chr2 28140689 28141068 -153607019 + MTB LTR MaLR 1 400 0 1 799 1195 223 136 9 chr2 28144111 28144441 -153603646 + MTEb LTR MaLR 1 372 -7 1 799 299 299 58 0 chr2 28146246 28146333 -153601754 - ORR1E LTR MaLR 0 359 268 1 799 1887 155 21 82 chr2 28146715 28147152 -153600935 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 1 799 236 316 49 66 chr2 28147716 28147838 -153600249 - ORR1E LTR MaLR -236 138 19 1 799 3521 132 14 12 chr2 28148331 28148906 -153599181 + RLTR1D LTR ERV1 30 605 0 1 799 452 262 26 32 chr2 28152937 28153091 -153594996 - RLTR14 LTR ERV1 0 382 230 1 799 388 314 12 60 chr2 28153807 28153973 -153594114 + RMER15 LTR ERVL 414 571 -4 1 799 1932 138 179 56 chr2 28153998 28154411 -153593676 - RMER4A LTR ERVK -2 464 1 1 799 2144 121 63 42 chr2 28155172 28155354 -153592733 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 227 1 799 2144 121 63 42 chr2 28155502 28155700 -153592387 - ORR1B1 LTR MaLR -168 226 6 1 799 275 329 151 29 chr2 28156244 28156416 -153591671 + MLT1B LTR MaLR 1 193 -197 2 799 359 292 58 58 chr2 28157971 28158127 -153589960 - MLT1D LTR MaLR -348 157 2 2 799 1093 224 178 16 chr2 28158251 28158560 -153589527 - MTE2b LTR MaLR -2 377 19 2 799 1359 202 39 31 chr2 28163356 28163712 -153584375 - ORR1C2 LTR MaLR 0 394 29 2 799 1526 196 208 17 chr2 28165031 28165401 -153582686 + RLTR20A1 LTR ERVK 1 455 -96 2 799 1526 196 208 17 chr2 28165445 28165535 -153582552 + RLTR20A1 LTR ERVK 456 548 -3 2 799 226 288 94 67 chr2 28166261 28166410 -153581677 - MER31A LTR ERV1 -248 237 85 2 799 864 291 17 64 chr2 28167470 28167496 -153580591 - MT2A LTR ERVL -36 565 542 2 799 1141 233 58 106 chr2 28167529 28167956 -153580131 - MT2A LTR ERVL -60 541 1 2 799 1634 221 82 47 chr2 28168961 28169446 -153578641 - RLTR11A LTR ERVK -10 518 17 2 799 370 304 53 55 chr2 28170035 28170469 -153577618 - MMTV-int LTR ERVK -550 5258 5028 2 799 239 311 75 93 chr2 28171160 28171440 -153576647 - MTC-int LTR MaLR -74 1184 910 2 799 1646 195 36 53 chr2 28171440 28171642 -153576445 - RLTR19-int LTR ERVK -4909 1228 1022 2 799 1646 195 36 53 chr2 28171824 28172037 -153576050 - RLTR19-int LTR ERVK -5116 1021 820 2 799 545 127 58 10 chr2 28172128 28172231 -153575856 - RLTR19-int LTR ERVK -5620 517 410 2 799 626 283 16 16 chr2 28172526 28172774 -153575313 - MMTV-int LTR ERVK -3932 3321 3074 2 799 456 268 20 75 chr2 28172897 28173151 -153574936 - MMTV-int LTR ERVK -3747 2795 2556 2 799 235 286 124 88 chr2 28173972 28174198 -153573889 - ORR1E LTR MaLR -105 254 21 2 799 1122 230 158 31 chr2 28174996 28175319 -153572768 - MTE2a LTR MaLR -1 378 15 2 799 3184 12 0 0 chr2 28176037 28176383 -153571704 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 2 799 1889 209 80 32 chr2 28176384 28176784 -153571303 - MTD LTR MaLR 0 419 1 2 799 285 260 91 154 chr2 28178768 28179124 -153568963 + RLTR15 LTR ERVK 11 285 -243 2 800 551 273 52 0 chr2 28187881 28188053 -153560034 - RMER15 LTR ERVL -15 560 380 2 800 559 302 229 9 chr2 28195669 28196045 -153552042 - MER67B LTR ERV1 0 661 210 2 800 3460 23 5 5 chr2 28196045 28196438 -153551649 + MTA_Mm LTR MaLR 1 393 -3 2 800 559 302 229 9 chr2 28196438 28196585 -153551502 - MER67B LTR ERV1 -452 209 24 2 800 769 198 11 46 chr2 28197157 28197303 -153550784 - MTD LTR MaLR 0 419 273 2 800 769 198 11 46 chr2 28197331 28197359 -153550728 - MTD LTR MaLR -147 272 251 2 800 523 294 78 24 chr2 28199092 28199259 -153548828 - MTD LTR MaLR -194 176 1 2 800 327 302 197 39 chr2 28199345 28199548 -153548539 - RMER15 LTR ERVL -5 570 336 2 800 1882 204 100 43 chr2 28200765 28201191 -153546896 + RLTR20A LTR ERVK 1 460 -81 2 800 1882 204 100 43 chr2 28201248 28201333 -153546754 + RLTR20A LTR ERVK 461 540 -1 2 800 495 260 68 8 chr2 28201815 28201947 -153546140 + MTD LTR MaLR 1 140 -239 2 800 728 323 13 22 chr2 28202178 28202403 -153545684 + MT2A LTR ERVL 247 469 -64 2 800 506 225 56 28 chr2 28202485 28202627 -153545460 + MTD LTR MaLR 140 285 -134 2 800 542 206 95 7 chr2 28202665 28202802 -153545285 + MTD LTR MaLR 269 417 -2 2 800 297 259 11 34 chr2 28204424 28204512 -153543575 - MTEb LTR MaLR -15 364 279 2 800 267 146 32 127 chr2 28204688 28204751 -153543336 - ORR1D2 LTR MaLR -308 62 6 2 800 1006 283 103 16 chr2 28208404 28208716 -153539371 - ORR1E LTR MaLR -6 353 15 2 800 1573 259 14 6 chr2 28210289 28210654 -153537433 + MTEb LTR MaLR 4 371 -8 2 800 2334 124 57 31 chr2 28216528 28216912 -153531175 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 3 800 3794 144 181 72 chr2 28231539 28232353 -153515734 + RMER19B LTR ERVK 1 902 0 3 800 5045 108 30 8 chr2 28239286 28240026 -153508061 + RMER6A LTR ERVK 1 756 0 3 800 334 333 94 20 chr2 28244558 28244760 -153503327 + RMER15 LTR ERVL 352 568 -7 3 800 2382 88 34 9 chr2 28254613 28254934 -153493153 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 3 800 2130 138 61 0 chr2 28254939 28255300 -153492787 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 4 3 800 243 209 94 17 chr2 28255975 28256092 -153491995 + RMER17D LTR ERVK 383 508 -381 3 800 1235 268 44 67 chr2 28256429 28256817 -153491270 - MTE2a LTR MaLR 0 379 1 3 800 1120 253 41 76 chr2 28261056 28261449 -153486638 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 3 800 443 296 64 0 chr2 28262298 28262470 -153485617 - MLT1A1 LTR MaLR -8 400 218 3 800 240 279 121 48 chr2 28263020 28263186 -153484901 - RLTR40 LTR ERVK -142 675 498 3 800 1222 241 86 125 chr2 28265890 28265970 -153482117 + MTD LTR MaLR 3 66 -353 3 800 1222 241 86 125 chr2 28266119 28266470 -153481617 + MTD LTR MaLR 67 417 -2 3 800 2332 100 32 140 chr2 28266517 28266578 -153481509 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 339 3 800 2332 100 32 140 chr2 28266748 28267127 -153480960 - ORR1B1 LTR MaLR -56 338 2 3 800 279 283 163 8 chr2 28272726 28272965 -153475122 + RMER12 LTR ERVK 771 1046 -276 3 800 333 231 95 22 chr2 28275375 28275512 -153472575 - RMER17A LTR ERVK -252 499 353 3 800 1327 241 72 47 chr2 28276779 28277140 -153470947 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 3 800 1459 148 140 19 chr2 28282951 28283315 -153464772 + RMER17C LTR ERVK 3 410 0 4 800 4480 39 40 14 chr2 28285503 28286053 -153462034 - LTRIS2 LTR ERV1 0 564 1 4 800 609 280 116 66 chr2 28286174 28286261 -153461826 - RMER10A LTR ERVL -28 414 323 4 800 609 280 116 66 chr2 28286285 28286575 -153461512 - RMER10A LTR ERVL -120 322 19 4 800 3874 72 76 22 chr2 28287639 28288177 -153459910 + RMER2 LTR ERV1 1 567 0 4 800 2187 95 3 59 chr2 28292414 28292751 -153455336 - ORR1A3 LTR MaLR -8 318 1 4 800 1038 221 106 145 chr2 28293859 28294323 -153453764 + RMER4B LTR ERVK 1 594 -17 4 800 3096 62 36 0 chr2 28297149 28297535 -153450552 - MTB LTR MaLR 0 400 1 4 800 2063 114 109 25 chr2 28297644 28298011 -153450076 + RMER10B LTR ERVL 1 398 0 4 800 4145 162 116 67 chr2 28298259 28298784 -153449303 - RMER13B LTR ERVK 0 908 345 4 800 4145 162 116 67 chr2 28298971 28299311 -153448776 - RMER13B LTR ERVK -564 344 1 4 800 1790 150 65 6 chr2 28300762 28301083 -153447004 + ORR1D1 LTR MaLR 31 370 -4 4 800 359 252 41 98 chr2 28301312 28301331 -153446756 + MT2B LTR ERVL 142 153 -448 4 800 1950 100 30 4 chr2 28311158 28311436 -153436651 + ORR1A4 LTR MaLR 1 281 -45 4 801 413 107 0 0 chr2 28311627 28311683 -153436404 + ORR1A4 LTR MaLR 274 329 0 4 801 494 217 233 20 chr2 28311861 28312007 -153436080 - MTE2b LTR MaLR -10 369 193 4 801 266 262 24 12 chr2 28312072 28312157 -153435930 + MLT1A1 LTR MaLR 300 385 -23 4 801 2314 90 22 0 chr2 28312793 28313105 -153434982 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 4 801 1907 94 0 4 chr2 28313105 28313372 -153434715 - ORR1A2-int LTR MaLR 0 1963 1698 4 801 360 175 16 0 chr2 28313367 28313430 -153434657 - MTE2b LTR MaLR -263 64 1 4 801 2343 135 35 28 chr2 28316397 28316793 -153431294 + MTB_Mm LTR MaLR 1 399 -8 5 801 240 330 32 97 chr2 28322465 28322508 -153425579 + MT2B LTR ERVL 127 241 -359 5 801 5844 151 87 15 chr2 28325781 28326205 -153421882 + MERVL_2A-int LTR ERVL 789 1237 -4524 5 801 2616 195 77 24 chr2 28326205 28326787 -153421300 + RLTR18 LTR ERVK 1 613 -3 5 801 5844 159 88 16 chr2 28326787 28327577 -153420510 + MERVL_2A-int LTR ERVL 1175 2032 -3729 5 801 5199 267 95 40 chr2 28327722 28328506 -153419581 + MERVL_2A-int LTR ERVL 2022 2830 -2884 5 801 11125 129 30 15 chr2 28328902 28329973 -153418114 + MurERV4-int LTR ERVK 3203 4299 -961 5 801 2626 167 39 19 chr2 28329973 28330491 -153417596 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 1 5 801 11125 129 30 15 chr2 28330491 28331348 -153416739 + MurERV4-int LTR ERVK 4300 5159 -101 5 801 259 232 69 48 chr2 28334705 28334810 -153413277 + RLTR15 LTR ERVK 45 189 -345 5 801 728 226 49 41 chr2 28334815 28335059 -153413028 - RMER13B LTR ERVK -4 904 659 5 801 935 190 5 29 chr2 28335029 28335235 -153412852 - RMER13B LTR ERVK -436 472 272 5 801 1326 204 56 120 chr2 28335245 28335713 -153412374 - RMER17B LTR ERVK -520 438 1 5 801 276 242 83 10 chr2 28335755 28335851 -153412236 + RLTR15 LTR ERVK 189 291 -68 5 801 2794 187 137 14 chr2 28336451 28337085 -153411002 - RMER19A LTR ERVK 0 737 26 5 801 238 114 0 0 chr2 28337187 28337222 -153410865 - RMER19A LTR ERVK -702 35 1 5 801 1370 314 49 33 chr2 28337649 28338628 -153409459 + MYSERV6-int LTR ERVK 269 1452 -1725 5 801 1505 190 53 59 chr2 28338692 28339033 -153409054 + RodERV21-int LTR ERV1 3517 3855 -1136 5 801 2152 103 3 0 chr2 28339033 28339344 -153408743 - ORR1A2 LTR MaLR -15 312 1 5 801 1312 170 81 19 chr2 28339346 28339604 -153408483 - ORR1B1 LTR MaLR -80 314 41 5 801 2442 106 349 21 chr2 28339733 28340299 -153407788 + RMER6A LTR ERVK 1 752 -4 5 801 2214 319 28 52 chr2 28340582 28341629 -153406458 - MMERGLN-int LTR ERV1 -3942 3614 2594 5 801 1944 78 84 39 chr2 28342072 28342405 -153405682 - RLTR10B2 LTR ERVK 0 365 18 5 801 320 24 0 0 chr2 28342427 28342469 -153405618 - RLTR10B2 LTR ERVK -250 42 1 5 801 7302 53 0 29 chr2 28342469 28343428 -153404659 - MMERVK10C-int LTR ERVK 0 7581 6651 5 801 40498 41 1 1 chr2 28343419 28348360 -153399727 - MMERVK10C-int LTR ERVK -1771 5810 870 5 801 2723 100 23 10 chr2 28348358 28348752 -153399335 - MMERVK10C-int LTR ERVK -7182 399 1 5 801 1933 81 84 39 chr2 28348752 28349085 -153399002 - RLTR10B2 LTR ERVK 0 365 18 5 801 1707 324 92 57 chr2 28349121 28349506 -153398581 - MMERGLN-int LTR ERV1 -5364 2414 2035 5 801 1707 324 92 57 chr2 28349653 28351067 -153397020 - MMERGLN-int LTR ERV1 -5744 2034 552 5 801 286 225 218 74 chr2 28351511 28351713 -153396374 - RLTR47_MM LTR ERV1 -64 468 238 5 801 1264 169 84 19 chr2 28355404 28355684 -153392403 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 63 5 801 579 177 123 35 chr2 28355684 28355854 -153392233 - MTD LTR MaLR 0 419 235 5 801 834 159 41 0 chr2 28355855 28356000 -153392087 - RMER19B LTR ERVK 0 902 752 5 801 1677 165 138 3 chr2 28356236 28356570 -153391517 + RLTR30 LTR ERV1 1 379 0 5 801 343 164 21 0 chr2 28362284 28362356 -153385731 - MTC LTR MaLR -332 75 1 5 801 2084 128 92 0 chr2 28362986 28363345 -153384742 + ORR1B1 LTR MaLR 1 392 -2 5 801 879 134 102 256 chr2 28363345 28363518 -153384569 + ORR1B1-int LTR MaLR 3 205 -1304 5 801 879 134 102 256 chr2 28363675 28363833 -153384254 + ORR1B1-int LTR MaLR 206 283 -1226 5 801 474 301 40 47 chr2 28363870 28364309 -153383778 - RLTR15 LTR ERVK -47 312 5 5 801 1359 166 4 8 chr2 28364311 28364560 -153383527 + ORR1A3-int LTR MaLR 292 539 -1424 5 801 1103 182 11 70 chr2 28364557 28364713 -153383374 + MT2B LTR ERVL 23 166 -435 6 801 320 221 0 104 chr2 28364828 28364924 -153383163 + MT2B LTR ERVL 155 240 -361 6 801 1757 209 96 40 chr2 28364941 28365419 -153382668 - RMER20A LTR ERVK -10 506 2 6 801 597 249 126 97 chr2 28365622 28365955 -153382132 + RMER20B LTR ERVK 223 550 -77 6 801 286 293 71 31 chr2 28365930 28366057 -153382030 + RMER20B LTR ERVK 471 602 -25 6 801 2746 143 97 4 chr2 28366061 28366575 -153381512 + ORR1A3-int LTR MaLR 857 1418 -545 5 801 459 294 97 60 chr2 28370785 28371085 -153377002 - MLT1F2 LTR MaLR -185 375 65 6 801 414 329 27 118 chr2 28372310 28372572 -153375515 - MLT1B LTR MaLR 0 390 153 6 801 1641 173 113 47 chr2 28396913 28397295 -153350792 - MTC LTR MaLR -12 409 3 6 801 245 297 209 8 chr2 28421541 28421670 -153326417 + MLT2C2 LTR ERVL 403 557 -2 6 801 238 302 45 34 chr2 28423266 28423355 -153324732 - RMER6D LTR ERVK -511 209 120 6 801 395 133 38 54 chr2 28430498 28430610 -153317477 + ORR1C1 LTR MaLR 58 170 -214 6 801 697 168 31 37 chr2 28431388 28431549 -153316538 + ORR1C2 LTR MaLR 11 170 -214 6 801 272 193 66 25 chr2 28437703 28437734 -153310353 + ORR1B1-int LTR MaLR 613 648 -861 7 802 1378 192 24 104 chr2 28444057 28444481 -153303606 + RMER10B LTR ERVL 9 398 0 7 802 768 305 95 73 chr2 28452115 28452621 -153295466 - MT2A LTR ERVL -16 517 1 7 802 922 229 145 30 chr2 28466287 28466625 -153281462 + MTEa LTR MaLR 3 379 0 7 802 313 336 27 27 chr2 28471193 28471303 -153276784 + MLT1C LTR MaLR 286 395 -72 7 802 2281 116 26 31 chr2 28481093 28481484 -153266603 - RMER10B LTR ERVL -9 389 1 8 802 271 236 0 0 chr2 28481758 28481813 -153266274 - MTEb LTR MaLR -5 374 320 8 802 901 236 208 51 chr2 28481837 28482207 -153265880 - MTE-int LTR MaLR -576 1004 577 8 802 1944 269 70 7 chr2 28482575 28483129 -153264958 - MTE-int LTR MaLR -988 592 4 8 802 276 219 112 95 chr2 28484611 28484727 -153263360 - MT2B LTR ERVL -337 264 147 8 802 1015 262 105 3 chr2 28484983 28485327 -153262760 + MTEa LTR MaLR 1 379 0 8 802 710 298 41 21 chr2 28488169 28488474 -153259613 + MLT2D LTR ERVL 36 343 -71 8 802 1382 207 161 6 chr2 28490868 28491203 -153256884 + MTD LTR MaLR 12 398 -21 8 802 268 361 54 7 chr2 28492239 28492387 -153255700 - RMER15 LTR ERVL -75 500 346 8 802 284 247 104 110 chr2 28494010 28494192 -153253895 + RMER17C LTR ERVK 1 181 -229 8 802 906 213 272 18 chr2 28494420 28494754 -153253333 + MTD LTR MaLR 1 419 0 8 802 875 156 166 187 chr2 28501902 28502233 -153245854 - ORR1D1 LTR MaLR -2 372 49 7 802 3354 41 5 2 chr2 28502345 28502739 -153245348 + MTA_Mm LTR MaLR 1 395 -1 8 802 1421 246 90 12 chr2 28508667 28509013 -153239074 - MTEb LTR MaLR -6 373 1 2 802 1944 141 51 6 chr2 28509407 28509722 -153238365 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 2 802 2365 93 6 15 chr2 28514540 28514866 -153233221 - ORR1A2 LTR MaLR -4 323 1 4 802 7659 102 20 80 chr2 28514866 28515132 -153232955 - ORR1A2-int LTR MaLR 0 1963 1696 4 802 7659 102 20 80 chr2 28515222 28516281 -153231806 - ORR1A2-int LTR MaLR -268 1695 718 4 802 611 203 22 72 chr2 28516240 28516378 -153231709 - MT2B LTR ERVL -314 287 157 4 802 415 150 37 12 chr2 28516336 28516417 -153231670 - ORR1A2-int LTR MaLR -1188 604 522 4 802 870 126 86 7 chr2 28516411 28516563 -153231524 - ORR1A2-int LTR MaLR -1799 164 1 4 802 444 71 0 0 chr2 28516563 28516619 -153231468 - ORR1A2 LTR MaLR 0 326 271 4 802 422 151 0 131 chr2 28520241 28520340 -153227747 + MT2B LTR ERVL 179 264 -337 5 802 284 258 20 157 chr2 28535015 28535162 -153212925 - MT2B LTR ERVL -336 265 139 8 802 291 229 77 164 chr2 28537704 28537887 -153210200 - MTEb LTR MaLR -2 377 211 9 802 782 277 62 62 chr2 28538464 28538756 -153209331 - MTEa LTR MaLR -87 292 1 9 802 410 348 38 10 chr2 28539595 28539804 -153208283 - MLT1L LTR MaLR -1 609 395 9 802 458 199 39 55 chr2 28552803 28552841 -153195246 + RMER17B LTR ERVK 333 367 -539 1 802 786 75 13 20 chr2 28552986 28553128 -153194959 + RMER17B LTR ERVK 319 460 -498 1 802 427 282 126 29 chr2 28559612 28559787 -153188300 + MTE2a LTR MaLR 112 303 -76 1 802 1895 173 55 74 chr2 28560345 28561042 -153187045 - RMER19B LTR ERVK -112 790 1 1 802 364 55 18 35 chr2 28565657 28565714 -153182373 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 312 1 802 1274 155 138 21 chr2 28565863 28566153 -153181934 - ORR1B2 LTR MaLR -42 325 2 1 803 633 274 127 0 chr2 28573773 28573952 -153174135 - MTEb LTR MaLR -99 280 76 1 803 1903 171 119 3 chr2 28578711 28579064 -153169023 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 1 803 773 204 239 101 chr2 28587312 28587688 -153160399 + MT2B LTR ERVL 106 570 -31 1 803 269 79 16 0 chr2 28587996 28588059 -153160028 - MT2A LTR ERVL -5 528 465 1 803 625 293 60 140 chr2 28588095 28588630 -153159457 - MT2A LTR ERVL -41 492 1 1 803 234 299 13 13 chr2 28599718 28599796 -153148291 - MLT1D LTR MaLR -189 316 239 1 803 1340 197 141 6 chr2 28600471 28600798 -153147289 + MTD LTR MaLR 1 371 -48 1 803 946 295 40 34 chr2 28602608 28602828 -153145259 + MTE2a LTR MaLR 29 240 -139 2 803 2585 135 45 0 chr2 28602828 28603227 -153144860 - MTC LTR MaLR 0 421 5 2 803 946 295 40 34 chr2 28603227 28603304 -153144783 + MTE2a LTR MaLR 241 327 -52 2 803 498 210 36 31 chr2 28613526 28613637 -153134450 + MTE2a LTR MaLR 200 314 -65 2 803 273 305 101 37 chr2 28614499 28614608 -153133479 + MLT1A0 LTR MaLR 1 116 -249 2 803 327 104 0 20 chr2 28615944 28615993 -153132094 - RMER10A LTR ERVL 0 398 351 2 803 483 199 85 89 chr2 28615994 28616230 -153131857 + RLTR42-int LTR ERVK 1639 1864 -3658 2 803 1581 149 31 14 chr2 28616332 28616625 -153131462 - RMER10A LTR ERVL -144 298 1 2 803 1140 283 104 89 chr2 28617253 28617890 -153130197 + RMER13A LTR ERVK 1 646 -214 2 803 437 281 43 18 chr2 28619811 28619974 -153128113 - ORR1E LTR MaLR -192 167 1 2 803 1236 246 133 3 chr2 28620486 28620840 -153127247 - MTD LTR MaLR -16 403 4 2 803 1210 226 282 35 chr2 28624109 28624591 -153123496 - MT2B LTR ERVL 0 601 1 2 803 334 264 57 11 chr2 28630821 28630909 -153117178 - MER74C LTR ERVL -35 425 334 2 803 986 267 45 68 chr2 28632376 28632685 -153115402 + MTEa LTR MaLR 66 367 -12 2 803 468 306 59 55 chr2 28634237 28634510 -153113577 - MLT1B LTR MaLR -113 277 4 2 803 2089 122 96 12 chr2 28638473 28638806 -153109281 - ORR1B2 LTR MaLR -2 365 5 2 803 262 256 51 0 chr2 28640049 28640127 -153107960 - MTEa LTR MaLR -112 267 186 2 803 798 114 18 0 chr2 28645409 28645523 -153102564 + MT2B LTR ERVL 1 116 -485 2 803 3081 91 9 43 chr2 28645722 28646175 -153101912 + MT2B LTR ERVL 122 558 -43 2 803 351 132 0 93 chr2 28646325 28646400 -153101687 + MT2B LTR ERVL 517 584 0 2 803 3237 53 2 10 chr2 28647556 28647955 -153100132 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 803 448 264 101 30 chr2 28648542 28648733 -153099354 - RLTR16 LTR ERVK -340 220 31 2 803 836 252 55 51 chr2 28649440 28649711 -153098376 - MTD LTR MaLR -61 358 76 2 803 1157 260 35 74 chr2 28656351 28656555 -153091532 + MTE2a LTR MaLR 6 187 -192 3 803 1157 260 35 74 chr2 28656600 28656761 -153091326 + MTE2a LTR MaLR 188 356 -23 3 803 1981 98 80 10 chr2 28661401 28661701 -153086386 - ORR1A2 LTR MaLR -6 321 1 3 803 358 215 0 71 chr2 28661856 28661941 -153086146 + MTEa LTR MaLR 75 153 -206 3 803 577 264 25 12 chr2 28663362 28663560 -153084527 + MTEa LTR MaLR 138 357 -22 3 803 919 274 55 98 chr2 28663663 28664122 -153083965 + RLTR18 LTR ERVK 16 421 -195 3 803 306 284 0 13 chr2 28664125 28664200 -153083887 + RLTR18 LTR ERVK 392 465 -47 3 803 399 291 201 5 chr2 28664895 28665119 -153082968 - MER74B LTR ERVL -216 406 139 3 803 478 159 0 83 chr2 28665921 28666017 -153082070 + MT2A LTR ERVL 1 88 -445 3 803 7413 140 38 3 chr2 28666322 28667463 -153080624 - MERVL_2A-int LTR ERVL -1414 4347 3168 3 803 666 259 174 73 chr2 28667475 28667562 -153080525 - MT2A LTR ERVL -7 594 505 3 803 786 191 181 9 chr2 28667742 28667937 -153080150 - MT2A LTR ERVL -97 504 120 3 803 2146 144 88 6 chr2 28669039 28669403 -153078684 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 3 803 1149 276 93 34 chr2 28669457 28669866 -153078221 - MT2A LTR ERVL -100 433 1 3 803 3917 43 19 4 chr2 28671265 28671733 -153076354 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 1 3 803 2014 103 151 0 chr2 28671737 28672056 -153076031 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 3 803 627 227 0 25 chr2 28672657 28672803 -153075284 - MTE2b LTR MaLR -143 236 101 3 803 898 247 84 13 chr2 28676240 28676466 -153071621 + MT2A LTR ERVL 199 440 -93 3 804 1642 197 126 5 chr2 28705925 28706297 -153041790 + MTD LTR MaLR 3 419 0 3 804 300 272 50 107 chr2 28718545 28718685 -153029402 + MT2B LTR ERVL 147 278 -323 4 804 1757 132 100 15 chr2 28725960 28726290 -153021797 - ORR1B2 LTR MaLR -7 360 3 4 804 270 229 45 57 chr2 28743420 28743508 -153004579 - MT2B LTR ERVL -344 257 171 4 804 1352 218 70 13 chr2 28756058 28756370 -152991717 - MTD LTR MaLR -89 330 1 4 804 415 294 58 85 chr2 28781422 28781645 -152966442 - MT2B LTR ERVL -334 267 51 4 804 2341 141 41 0 chr2 28781953 28782315 -152965772 + ORR1C1 LTR MaLR 2 378 0 5 804 396 280 83 45 chr2 28787530 28787687 -152960400 + MLT1C LTR MaLR 289 451 -16 5 804 1161 231 59 70 chr2 28787833 28788191 -152959896 + MTE2a LTR MaLR 20 373 -6 5 804 523 245 139 61 chr2 28793250 28793580 -152954507 + RLTR15 LTR ERVK 1 356 -3 5 804 327 293 145 12 chr2 28802491 28802657 -152945430 + MLT1A LTR MaLR 1 188 -186 5 804 225 304 63 32 chr2 28802721 28802816 -152945271 + MLT1A LTR MaLR 293 390 0 5 804 1034 242 87 25 chr2 28811658 28811980 -152936107 + MTEb LTR MaLR 31 372 -7 5 804 819 188 64 17 chr2 28812136 28812309 -152935778 + MTC LTR MaLR 2 182 -225 5 804 1248 221 55 83 chr2 28812340 28812798 -152935289 - RLTR12B LTR ERVK -42 486 42 5 804 1464 115 8 13 chr2 28812822 28813060 -152935027 + MTC LTR MaLR 185 421 0 5 804 692 298 117 0 chr2 28813372 28813637 -152934450 + MLT1B LTR MaLR 7 302 -88 5 804 2463 92 3 3 chr2 28817314 28817641 -152930446 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 5 804 510 316 77 66 chr2 28818484 28818758 -152929329 + MER31B LTR ERV1 4 280 -186 5 804 286 240 0 194 chr2 28827369 28827493 -152920594 - MT2B2 LTR ERVL -320 264 165 6 805 627 250 132 68 chr2 28837782 28838048 -152910039 + RMER5 LTR ERV1 15 297 -237 6 805 927 251 80 75 chr2 28840214 28840450 -152907637 + MTE2a LTR MaLR 1 231 -148 6 805 927 251 80 75 chr2 28840587 28840711 -152907376 + MTE2a LTR MaLR 232 363 -16 6 805 2660 107 19 37 chr2 28842227 28842656 -152905431 - MTC LTR MaLR 0 421 1 6 805 506 316 110 26 chr2 28845834 28846143 -152901944 - MLT1A LTR MaLR -26 348 14 6 805 575 240 159 34 chr2 28847069 28847352 -152900735 + MTEa LTR MaLR 6 353 -26 6 805 614 204 144 6 chr2 28847792 28847965 -152900122 - MTD LTR MaLR 0 419 223 6 805 898 245 9 39 chr2 28848114 28848330 -152899757 - MTD LTR MaLR -208 211 3 6 805 369 217 35 62 chr2 28850079 28850092 -152897995 + MT2B LTR ERVL 155 164 -437 6 805 250 232 17 154 chr2 28858070 28858187 -152889900 - MT2B LTR ERVL -338 263 163 6 805 571 205 66 7 chr2 28860172 28860324 -152887763 - LTR55 LTR ERV -371 177 17 6 805 329 244 48 12 chr2 28862502 28862585 -152885502 - MER77 LTR ERVL -213 394 309 6 805 348 334 107 4 chr2 28863304 28863559 -152884528 - MER77 LTR ERVL -315 292 12 6 805 377 371 65 22 chr2 28864228 28864539 -152883548 - MLT1C LTR MaLR -84 306 7 6 805 2277 108 44 36 chr2 28881982 28882346 -152865741 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 7 805 1131 232 58 78 chr2 28882608 28882968 -152865119 + MTE2a LTR MaLR 27 379 0 7 805 2057 180 43 23 chr2 28887489 28887787 -152860300 + RLTR28B LTR ERVL 4 315 -166 7 805 2057 180 43 23 chr2 28887962 28888101 -152859986 + RLTR28B LTR ERVL 316 450 -31 7 805 673 230 173 108 chr2 28912490 28912768 -152835319 - ORR1D2 LTR MaLR -70 300 5 7 805 2065 195 67 92 chr2 28923657 28923926 -152824161 - RLTR19C LTR ERVK 0 506 274 8 805 2065 195 67 92 chr2 28924078 28924327 -152823760 - RLTR19C LTR ERVK -233 273 1 8 805 1602 186 227 53 chr2 28931024 28931478 -152816609 - RMER16 LTR ERVK 0 533 1 8 805 952 229 71 59 chr2 28932697 28932899 -152815188 - RLTR15 LTR ERVK -16 343 135 8 805 3554 28 0 0 chr2 28932899 28933295 -152814792 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 8 805 952 229 71 59 chr2 28933295 28933431 -152814656 - RLTR15 LTR ERVK -225 134 1 8 805 3416 142 72 11 chr2 28935231 28935845 -152812242 - RMER6C LTR ERVK -39 651 1 8 805 535 180 221 7 chr2 28937316 28937527 -152810560 - MTD LTR MaLR -103 316 1 8 805 240 222 50 109 chr2 28942229 28942330 -152805757 - LTR33B LTR ERVL -380 123 29 8 805 2255 88 3 19 chr2 28943889 28944203 -152803884 + RLTR27 LTR ERVK 1 309 0 8 805 394 49 5 8 chr2 28944228 28944281 -152803806 + MMERVK10C-int LTR ERVK 163 267 -7314 8 805 665 233 84 35 chr2 28944313 28944540 -152803547 + MMERVK10C-int LTR ERVK 655 892 -1095 8 805 292 276 122 19 chr2 28944605 28944712 -152803375 + MMERVK10C-int LTR ERVK 798 915 -6765 8 805 7788 301 39 45 chr2 28944892 28949230 -152798857 + MMERVK10C-int LTR ERVK 1166 5476 -2105 8 805 1517 224 43 44 chr2 28949723 28950288 -152797799 + MMERVK10C-int LTR ERVK 6898 7581 0 8 805 2294 91 3 3 chr2 28950288 28950597 -152797490 + RLTR27 LTR ERVK 1 309 0 8 805 277 260 30 10 chr2 28950705 28950806 -152797281 - MTD LTR MaLR -45 374 272 8 805 1671 157 79 25 chr2 28951191 28951545 -152796542 + RLTR30 LTR ERV1 1 373 -6 8 805 1341 183 144 22 chr2 28953131 28953500 -152794587 + MT2A LTR ERVL 76 489 -44 8 805 235 149 0 0 chr2 28954159 28954226 -152793861 + MT2A LTR ERVL 467 533 0 8 805 1405 122 151 32 chr2 28956233 28956545 -152791542 - RLTR25A LTR ERVK -31 1072 724 8 805 1366 134 70 8 chr2 28956818 28957074 -152791013 - RLTR25A LTR ERVK -428 600 329 8 805 3434 71 136 22 chr2 28958317 28958823 -152789264 - LTRIS2 LTR ERV1 0 564 1 8 805 815 138 29 0 chr2 28959034 28959172 -152788915 - RMER19C LTR ERVK -49 562 421 9 805 284 68 136 0 chr2 28961217 28961261 -152786826 + MTB_Mm LTR MaLR 284 333 -74 9 805 564 229 53 14 chr2 28961504 28961639 -152786448 - MTD LTR MaLR -249 170 6 9 805 544 259 36 0 chr2 28962089 28962228 -152785859 - RMER15 LTR ERVL -16 559 416 9 805 1560 107 12 12 chr2 28963129 28963379 -152784708 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 158 9 805 509 158 10 21 chr2 28963379 28963476 -152784611 - RLTR23 LTR ERV1 -3 427 332 9 805 1389 136 277 64 chr2 28963500 28963991 -152784096 - RLTR19-int LTR ERVK -3620 2517 1922 9 805 618 336 48 32 chr2 28964047 28964499 -152783588 - MuLV-int LTR ERV1 -191 7587 7117 9 805 257 250 39 65 chr2 28965285 28965362 -152782725 - RLTR14-int LTR ERV1 -730 4587 4513 9 805 1980 137 38 0 chr2 28966244 28966559 -152781528 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 9 100 4684 98 23 190 chr2 28966559 28967154 -152780933 - ORR1A2-int LTR MaLR 0 1792 1188 9 806 4684 98 23 190 chr2 28967329 28967854 -152780233 - ORR1A2-int LTR MaLR -605 1187 859 9 806 364 73 0 35 chr2 28967952 28968009 -152780078 - ORR1A3-int LTR MaLR -880 1083 1029 9 806 1595 122 10 0 chr2 28968236 28968530 -152779557 - ORR1A3-int LTR MaLR -921 1042 746 9 806 1600 96 21 49 chr2 28968513 28968797 -152779290 + MT2C_Mm LTR ERVL 200 475 0 9 806 39528 59 40 9 chr2 28968932 28970576 -152777511 + MERVL-int LTR ERVL 197 1835 -3650 9 806 39528 59 40 9 chr2 28970722 28974082 -152774005 + MERVL-int LTR ERVL 1836 5356 -129 9 806 304 153 26 53 chr2 28974202 28974278 -152773809 + ORR1A3-int LTR MaLR 567 640 -1323 9 806 303 53 0 0 chr2 28974278 28974316 -152773771 + MERVL-int LTR ERVL 5448 5485 0 9 806 1592 219 66 143 chr2 28974316 28974682 -152773405 + MT2B LTR ERVL 1 342 -259 9 806 1836 64 88 14 chr2 28974870 28975154 -152772933 + MT2C_Mm LTR ERVL 171 475 0 9 806 842 86 0 38 chr2 28975154 28975287 -152772800 - MTB LTR MaLR -93 307 180 9 806 967 198 120 21 chr2 28975488 28975730 -152772357 + RLTR24 LTR ERV1 264 529 0 9 806 372 281 51 51 chr2 28976058 28976234 -152771853 + RLTR14 LTR ERV1 207 382 0 9 806 2606 125 129 55 chr2 28976900 28976949 -152771138 + RLTR24 LTR ERV1 1 37 -492 9 806 2606 125 129 55 chr2 28977294 28977733 -152770354 + RLTR24 LTR ERV1 38 525 -4 9 806 963 150 57 5 chr2 28982050 28982223 -152765864 - ORR1A3-int LTR MaLR -493 1470 1288 9 806 2546 72 53 3 chr2 28983398 28983774 -152764313 + MTB LTR MaLR 1 395 -5 9 806 1175 223 191 33 chr2 28989800 28990162 -152757925 - MTD LTR MaLR 0 419 1 9 806 4889 89 24 47 chr2 28997577 28998404 -152749683 - RLTR13C2 LTR ERVK 0 808 1 1 806 1376 153 121 8 chr2 29008387 29008651 -152739436 - RLTR19B LTR ERVK 0 715 422 1 806 264 257 40 26 chr2 29012177 29012253 -152735834 - MT2B2 LTR ERVL -306 278 202 2 806 372 261 64 116 chr2 29018946 29019119 -152728968 - RNLTR23 LTR ERVK 0 642 479 3 806 3464 30 2 0 chr2 29020489 29020884 -152727203 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 806 233 290 19 127 chr2 29026935 29026957 -152721130 + MT2B LTR ERVL 147 198 -403 5 806 233 290 19 127 chr2 29027059 29027093 -152720994 + MT2B LTR ERVL 199 287 -314 5 806 1458 234 77 17 chr2 29029768 29030121 -152717966 - MTE2a LTR MaLR -5 374 1 6 806 300 215 185 9 chr2 29038140 29038248 -152709839 - RLTR13C2 LTR ERVK -44 764 638 7 806 526 314 24 85 chr2 29043829 29044160 -152703927 + RLTR25B LTR ERVK 2 312 -716 9 806 2850 92 206 14 chr2 29044186 29044705 -152703382 - RLTR6_Mm LTR ERV1 -35 619 1 9 806 306 245 90 107 chr2 29064751 29064826 -152683261 + MT2B2 LTR ERVL 89 160 -424 1 806 330 239 58 48 chr2 29067238 29067369 -152680718 + MTD LTR MaLR 151 281 -119 1 806 443 258 16 31 chr2 29067398 29067538 -152680549 + MTD LTR MaLR 285 407 0 1 806 1247 223 138 26 chr2 29067539 29067880 -152680207 + MTE2b LTR MaLR 1 379 0 1 806 2509 84 22 0 chr2 29068811 29069131 -152678956 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 1 806 3158 59 26 0 chr2 29069786 29070176 -152677911 - MTB LTR MaLR 0 400 1 1 806 829 231 188 16 chr2 29075789 29076044 -152672043 + MTE2b LTR MaLR 60 358 -21 1 806 481 269 220 29 chr2 29080833 29080986 -152667101 + MTE2b LTR MaLR 63 246 -133 1 806 481 269 220 29 chr2 29081207 29081294 -152666793 + MTE2b LTR MaLR 247 348 -31 1 806 319 271 178 76 chr2 29085006 29085183 -152662904 + MLT1B LTR MaLR 8 200 -190 1 806 319 271 178 76 chr2 29085248 29085334 -152662753 + MLT1B LTR MaLR 201 298 -92 1 806 889 292 136 21 chr2 29094067 29094406 -152653681 + MTEa LTR MaLR 1 378 -1 1 807 247 222 127 0 chr2 29119817 29119880 -152628207 + ORR1E LTR MaLR 15 85 -274 2 807 300 282 62 75 chr2 29119931 29120092 -152627995 + RMER15 LTR ERVL 25 183 -392 2 807 314 283 97 9 chr2 29120183 29120297 -152627790 + RMER15 LTR ERVL 451 574 -1 2 807 544 308 38 53 chr2 29124285 29124494 -152623593 + MTEa LTR MaLR 1 206 -173 2 807 674 280 118 129 chr2 29129474 29129831 -152618256 - MTEa LTR MaLR -26 353 1 2 807 704 203 122 0 chr2 29130527 29130675 -152617412 - MTEa LTR MaLR 0 379 214 2 807 677 312 110 31 chr2 29134825 29135152 -152612935 + ORR1E LTR MaLR 1 353 -6 2 807 1177 248 25 92 chr2 29135163 29135523 -152612564 + MTE2a LTR MaLR 1 336 -43 2 807 1268 274 5 87 chr2 29135837 29136228 -152611859 - MTEb LTR MaLR -7 372 14 2 807 1182 247 140 12 chr2 29136341 29136677 -152611410 + MTEa LTR MaLR 1 379 0 2 807 1203 237 57 67 chr2 29137998 29138369 -152609718 - MTD LTR MaLR 0 419 53 2 807 1457 241 140 13 chr2 29138489 29138938 -152609149 - MT2A LTR ERVL -27 506 1 2 807 3229 42 39 0 chr2 29144743 29145124 -152602963 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 807 440 314 228 25 chr2 29161632 29162067 -152586020 + MLT2B5 LTR ERVL 45 567 -34 2 807 2599 141 106 184 chr2 29162820 29163279 -152584808 + RMER6C LTR ERVK 3 452 -238 2 807 2599 141 106 184 chr2 29163469 29163755 -152584332 + RMER6C LTR ERVK 453 690 0 2 807 1705 168 52 96 chr2 29163950 29164313 -152583774 - ORR1B1 LTR MaLR -7 387 41 3 807 918 277 128 58 chr2 29168011 29168371 -152579716 + MLT1A1 LTR MaLR 24 408 0 3 807 615 314 106 7 chr2 29173123 29173415 -152574672 + MLT1D LTR MaLR 1 321 -184 3 807 1074 233 27 40 chr2 29173676 29173956 -152574131 + MLT1D LTR MaLR 307 620 -7 3 807 364 309 88 0 chr2 29175502 29175638 -152572449 + MLT1A1 LTR MaLR 261 408 0 3 807 410 74 0 0 chr2 29179256 29179310 -152568777 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 317 3 807 1199 243 33 3 chr2 29179601 29179902 -152568185 - ORR1D2 LTR MaLR -60 310 1 3 807 245 273 0 0 chr2 29182712 29182767 -152565320 + MLT1L LTR MaLR 197 251 -359 3 807 1155 239 114 3 chr2 29182953 29183285 -152564802 + ORR1D2 LTR MaLR 1 369 -1 3 807 1496 236 91 10 chr2 29183541 29183927 -152564160 - MTD LTR MaLR -2 417 1 3 807 237 317 16 62 chr2 29184343 29184471 -152563616 - RMER12 LTR ERVK -466 856 735 3 807 477 321 70 86 chr2 29185997 29186166 -152561921 + ORR1E LTR MaLR 51 221 -138 3 807 1529 154 157 19 chr2 29186166 29186491 -152561596 + ORR1D1 LTR MaLR 5 374 0 3 807 477 321 70 86 chr2 29186491 29186635 -152561452 + ORR1E LTR MaLR 222 359 0 3 807 368 148 146 12 chr2 29186868 29186950 -152561137 + MT2B LTR ERVL 1 93 -440 3 807 321 172 0 0 chr2 29187037 29187095 -152560992 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 329 3 807 2066 42 0 121 chr2 29187096 29187419 -152560668 - RLTR10B LTR ERVK 0 292 9 3 807 288 25 50 0 chr2 29187441 29187481 -152560606 - RLTR10B2 LTR ERVK -250 42 1 3 807 7503 49 0 60 chr2 29187481 29188472 -152559615 - MMERVK10C-int LTR ERVK 0 7581 6651 3 807 2742 102 19 5 chr2 29188463 29188873 -152559214 - MMERVK10C-int LTR ERVK -1771 5810 5002 3 807 445 294 41 41 chr2 29188883 29189103 -152558984 - MMERVK10C-int LTR ERVK -6015 1566 1347 3 807 3418 147 114 44 chr2 29189098 29189924 -152558163 - MMERVK10C-int LTR ERVK -1074 913 1 3 807 2073 78 84 39 chr2 29189924 29190257 -152557830 - RLTR10B2 LTR ERVK 0 365 18 3 807 288 25 50 0 chr2 29190293 29190333 -152557754 - RLTR10B2 LTR ERVK -250 42 1 3 807 1809 143 81 3 chr2 29190333 29190642 -152557445 - ORR1B1 LTR MaLR -61 333 1 3 807 1076 253 58 31 chr2 29190768 29191062 -152557025 + MT2B LTR ERVL 253 554 -47 3 807 260 207 68 68 chr2 29195286 29195374 -152552713 - RLTR25B LTR ERVK -519 509 422 3 807 811 214 186 50 chr2 29195831 29196191 -152551896 + RLTR9E LTR ERVK 1 409 0 3 807 248 255 47 134 chr2 29196263 29196390 -152551697 - MT2B LTR ERVL -353 248 133 3 807 329 230 66 7 chr2 29196479 29196615 -152551472 + ORR1B1-int LTR MaLR 611 754 -755 3 807 3671 23 120 2 chr2 29200371 29200812 -152547275 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 4 807 241 234 61 30 chr2 29203141 29203207 -152544880 - MTEa LTR MaLR -52 327 260 4 807 290 317 0 96 chr2 29209874 29209989 -152538098 + MT2B LTR ERVL 154 257 -344 4 807 435 154 91 33 chr2 29211370 29211491 -152536596 - MTD LTR MaLR -16 403 276 4 807 456 267 94 95 chr2 29211490 29211692 -152536395 - MTD LTR MaLR -75 325 127 4 807 2445 198 71 62 chr2 29211692 29212258 -152535829 - RLTR18 LTR ERVK -3 613 42 4 807 2589 63 149 3 chr2 29212258 29212607 -152535480 + MTB LTR MaLR 1 400 0 4 807 2445 198 71 62 chr2 29212607 29212648 -152535439 - RLTR18 LTR ERVK -575 41 1 4 807 280 321 64 71 chr2 29212649 29212790 -152535297 - MTD LTR MaLR -281 140 1 4 807 672 251 72 58 chr2 29215439 29215646 -152532441 + MTD LTR MaLR 1 210 -209 4 807 1086 175 178 48 chr2 29218577 29218908 -152529179 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 4 807 336 218 165 58 chr2 29219645 29219831 -152528256 + ORR1D2 LTR MaLR 148 323 -51 4 807 1292 230 105 6 chr2 29220184 29220517 -152527570 - ORR1D2 LTR MaLR -4 366 1 4 807 2595 131 8 15 chr2 29221868 29222265 -152525822 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 4 807 756 147 23 0 chr2 29226954 29227083 -152521004 + RLTR12A LTR ERVK 437 568 0 4 808 335 281 11 11 chr2 29252724 29252814 -152495273 + MLT1A1 LTR MaLR 21 110 -298 4 808 2276 170 79 5 chr2 29261369 29261789 -152486298 + RMER4A LTR ERVK 6 456 -10 4 808 550 206 68 41 chr2 29265027 29265174 -152482913 + RMER15 LTR ERVL 349 499 -76 5 808 500 318 135 36 chr2 29271951 29272225 -152475862 - MLT1F1 LTR MaLR -240 329 29 5 808 331 335 181 22 chr2 29282658 29282972 -152465115 - LTR16A LTR ERVL -49 402 39 5 808 292 257 206 7 chr2 29283697 29283838 -152464249 - MERVL_2A-int LTR ERVL -1413 4348 4180 5 808 740 234 154 43 chr2 29308412 29308665 -152439422 - MTEa LTR MaLR -38 341 55 5 808 1781 154 102 21 chr2 29313871 29314200 -152433887 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 23 5 808 1562 154 78 141 chr2 29314200 29314584 -152433503 + ORR1C1 LTR MaLR 1 360 -18 5 808 926 190 146 10 chr2 29316180 29316474 -152431613 - MTD LTR MaLR -34 385 21 5 808 250 233 16 32 chr2 29316500 29316520 -152431567 - MTD LTR MaLR -359 20 2 5 808 1932 117 29 29 chr2 29317498 29317814 -152430273 + ORR1A4 LTR MaLR 1 316 -13 5 808 1572 222 128 16 chr2 29319160 29319536 -152428551 - MTD LTR MaLR 0 419 2 5 809 257 288 41 0 chr2 29365856 29365929 -152382158 - MTEb LTR MaLR -303 76 1 6 809 472 289 144 14 chr2 29366051 29366358 -152381729 + ORR1E LTR MaLR 4 379 0 6 809 762 312 74 0 chr2 29386406 29386675 -152361412 - RMER5 LTR ERV1 -56 478 190 6 809 308 279 19 19 chr2 29386724 29386830 -152361257 - RMER5 LTR ERV1 -317 217 112 6 809 1377 318 112 36 chr2 29387176 29387932 -152360155 - MTE-int LTR MaLR -766 814 1 6 809 417 306 88 25 chr2 29390487 29390772 -152357315 - MLT1D LTR MaLR -78 427 125 6 809 398 313 97 40 chr2 29391310 29391536 -152356551 - LTR41 LTR ERVL -519 249 11 6 809 300 233 55 89 chr2 29391603 29391621 -152356466 - MLT1D-int LTR MaLR -931 478 462 6 809 300 233 55 89 chr2 29391675 29391802 -152356285 - MLT1D-int LTR MaLR -948 461 338 6 809 3240 201 84 72 chr2 29392246 29393139 -152354948 - RMER13B LTR ERVK -4 904 1 6 809 422 277 7 91 chr2 29395069 29395212 -152352875 + MLT1J LTR MaLR 199 329 -183 6 809 252 346 48 0 chr2 29400206 29400310 -152347777 - MLT1G LTR MaLR -465 126 18 6 809 336 283 195 13 chr2 29400409 29400635 -152347452 - MLT1J1 LTR MaLR -132 312 46 6 809 1835 141 50 141 chr2 29400996 29401153 -152346934 + ORR1B2 LTR MaLR 1 165 -202 6 809 1835 141 50 141 chr2 29401224 29401386 -152346701 + ORR1B2 LTR MaLR 166 321 -46 6 809 1835 141 50 141 chr2 29401533 29401615 -152346472 + ORR1B2 LTR MaLR 322 366 -1 6 809 510 274 52 0 chr2 29408643 29408796 -152339291 - MTE2b LTR MaLR -218 161 1 7 809 335 316 99 25 chr2 29413907 29414069 -152334018 - MER21B LTR ERV1 -665 198 25 7 809 540 248 42 14 chr2 29422194 29422337 -152325750 - RMER15 LTR ERVL -154 421 275 7 809 477 239 120 0 chr2 29422336 29422478 -152325609 - RMER15 LTR ERVL -416 159 1 7 809 236 358 12 0 chr2 29424130 29424211 -152323876 - MLT1J2 LTR MaLR -8 440 359 7 809 545 273 43 21 chr2 29424599 29424786 -152323301 - RMER15 LTR ERVL -5 570 380 7 809 226 277 174 35 chr2 29425118 29425204 -152322883 - MLT1J2 LTR MaLR -282 166 69 7 809 404 311 111 48 chr2 29425283 29425617 -152322470 - ORR1E LTR MaLR -4 355 1 7 809 342 324 55 61 chr2 29426032 29426213 -152321874 + MLT1H LTR MaLR 223 402 -147 7 809 251 316 29 121 chr2 29430424 29430597 -152317490 + MLT1B LTR MaLR 178 334 -56 7 809 232 242 14 43 chr2 29430730 29430799 -152317288 + MLT1B LTR MaLR 401 467 0 7 809 2992 46 0 0 chr2 29431791 29432137 -152315950 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 7 809 3104 125 31 22 chr2 29432846 29433385 -152314702 + RLTR26 LTR ERVK 1 544 -98 7 809 735 219 13 7 chr2 29433373 29433525 -152314562 + RLTR26 LTR ERVK 490 642 0 7 809 261 361 69 0 chr2 29435358 29435488 -152312599 - MLT1C LTR MaLR 0 467 329 7 809 989 183 175 48 chr2 29439819 29439899 -152308188 + MT2A LTR ERVL 19 88 -445 7 809 989 221 140 47 chr2 29440070 29440387 -152307700 + MT2A LTR ERVL 89 582 -19 7 809 242 304 9 81 chr2 29445342 29445361 -152302726 - MT2B2 LTR ERVL -312 272 201 8 809 355 206 48 18 chr2 29445695 29445792 -152302295 - MTEa LTR MaLR -3 376 263 8 809 2895 154 140 105 chr2 29451782 29452284 -152295803 - RMER19B LTR ERVK -112 790 202 8 809 2895 154 140 105 chr2 29452412 29452577 -152295510 - RMER19B LTR ERVK -701 201 69 8 809 3384 36 33 5 chr2 29452577 29453001 -152295086 + RLTR10C LTR ERVK 1 436 0 8 809 2895 154 140 105 chr2 29453001 29453095 -152294992 - RMER19B LTR ERVK -834 68 1 8 809 1965 137 46 6 chr2 29453538 29453883 -152294204 + RLTR15 LTR ERVK 1 359 0 8 809 305 269 32 40 chr2 29460706 29460830 -152287257 - MER54A LTR ERVL -706 195 73 8 809 2291 187 232 2 chr2 29469351 29469950 -152278137 + RMER19A LTR ERVK 1 737 0 8 809 1227 205 150 28 chr2 29470558 29470750 -152277337 + MTD LTR MaLR 1 202 -217 8 809 1227 205 150 28 chr2 29470928 29471096 -152276991 + MTD LTR MaLR 203 405 -14 8 809 1868 108 145 12 chr2 29472258 29472596 -152275491 + RMER19B LTR ERVK 520 902 0 8 809 417 204 34 77 chr2 29473244 29473361 -152274726 - MT2B LTR ERVL -344 257 146 8 810 302 265 56 56 chr2 29491304 29491412 -152256675 - MLT1A0 LTR MaLR -1 364 257 9 810 1009 203 45 106 chr2 29493589 29493881 -152254206 + ORR1D1 LTR MaLR 101 374 0 9 810 433 262 93 34 chr2 29506173 29506586 -152241501 - RLTR15 LTR ERVK -18 341 1 1 810 227 319 25 41 chr2 29509488 29509609 -152238478 - RMER19A LTR ERVK -459 278 160 1 810 2710 132 12 14 chr2 29513728 29514150 -152233937 + MTC LTR MaLR 1 421 0 2 810 240 291 63 0 chr2 29515258 29515337 -152232750 - MER34 LTR ERV1 -4 538 455 2 810 251 245 83 64 chr2 29522226 29522335 -152225752 + ORR1C2 LTR MaLR 142 252 -132 3 810 416 125 69 3 chr2 29527971 29528057 -152220030 - ORR1D1 LTR MaLR -2 376 287 4 810 510 353 130 0 chr2 29548723 29548992 -152199095 - MLT1J LTR MaLR -64 448 145 8 810 1485 204 166 3 chr2 29579879 29580204 -152167883 - MTE2b LTR MaLR 0 379 2 1 810 4070 157 43 18 chr2 29584561 29585236 -152162851 - RLTR17 LTR ERVK 0 692 1 1 810 342 209 10 104 chr2 29590471 29590567 -152157520 - MT2B LTR ERVL -360 241 155 1 810 355 256 12 0 chr2 29608221 29608307 -152139780 - ORR1D1 LTR MaLR -8 366 280 1 810 1453 102 61 12 chr2 29608894 29609167 -152138920 - BGLII LTR ERVK 0 422 140 1 810 1182 162 65 34 chr2 29609364 29609384 -152138703 - BGLII LTR ERVK -283 139 120 1 810 665 293 65 61 chr2 29610941 29611384 -152136703 - RLTR11A2 LTR ERVK -70 457 13 1 810 578 290 34 52 chr2 29611978 29612269 -152135818 - RLTR15 LTR ERVK -16 343 58 2 810 5177 92 20 145 chr2 29612290 29613325 -152134762 + RMER17A2 LTR ERVK 1 906 0 2 810 1850 88 142 19 chr2 29614760 29615084 -152133003 + MTB_Mm LTR MaLR 1 364 -43 2 810 424 70 0 0 chr2 29615688 29615745 -152132342 + MTB_Mm LTR MaLR 351 407 0 2 810 2081 121 52 0 chr2 29615922 29616269 -152131818 + MTB_Mm-int LTR MaLR 10 374 -724 2 810 368 102 71 75 chr2 29616698 29616808 -152131279 + MTB_Mm-int LTR MaLR 380 449 -809 2 810 411 283 41 95 chr2 29618322 29618577 -152129510 + RMER20B LTR ERVK 193 420 -222 2 810 308 292 59 42 chr2 29618721 29618839 -152129248 + RMER20B LTR ERVK 482 601 -26 2 811 688 254 221 4 chr2 29624248 29624501 -152123586 + MTEb LTR MaLR 10 317 -62 2 811 325 250 55 46 chr2 29628202 29628311 -152119776 - MT2B LTR ERVL -336 265 156 2 811 1461 198 217 18 chr2 29630995 29631432 -152116655 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 524 -3 2 811 256 286 78 39 chr2 29654356 29654458 -152093629 + MTE2a LTR MaLR 236 341 -38 3 811 370 277 28 164 chr2 29654483 29654580 -152093507 - MTE2a LTR MaLR -121 258 183 3 811 370 277 28 164 chr2 29654719 29654798 -152093289 - MTE2a LTR MaLR -197 182 106 3 811 263 245 132 70 chr2 29654933 29655047 -152093040 - MTE2a LTR MaLR -258 121 1 3 811 358 289 48 90 chr2 29656783 29656950 -152091137 - MT2B2 LTR ERVL -320 264 105 3 811 3166 52 18 5 chr2 29669254 29669644 -152078443 - MTA_Mm LTR MaLR -1 395 1 3 811 257 319 0 0 chr2 29720153 29720222 -152027865 - MLT1A0 LTR MaLR -1 364 296 5 811 243 218 32 84 chr2 29721308 29721403 -152026684 - MT2B2 LTR ERVL -295 289 200 5 811 291 283 75 11 chr2 29721701 29721794 -152026293 - MLT1A0 LTR MaLR -70 338 240 5 811 293 261 32 130 chr2 29722861 29722953 -152025134 - MLT1A0 LTR MaLR -288 77 1 5 811 4192 38 42 8 chr2 29735138 29735640 -152012447 - MURVY-LTR LTR ERV1 0 519 1 5 811 3927 112 139 20 chr2 29738792 29739448 -152008639 - RMER19A LTR ERVK 0 737 4 5 812 465 199 54 41 chr2 29771714 29771861 -151976226 + RLTR15 LTR ERVK 33 181 -178 6 812 244 307 111 31 chr2 29771864 29772089 -151975998 + RLTR15 LTR ERVK 117 359 0 6 812 272 268 13 132 chr2 29783207 29783366 -151964721 + MT2B LTR ERVL 125 264 -337 7 812 250 116 70 0 chr2 29784417 29784460 -151963627 + MT2B LTR ERVL 260 305 -279 7 812 729 261 67 0 chr2 29789480 29789675 -151958412 - ORR1D1 LTR MaLR -166 208 1 7 812 274 230 16 117 chr2 29790231 29790359 -151957728 - RLTR25B LTR ERVK -472 556 442 7 812 272 300 59 10 chr2 29793330 29793431 -151954656 + MLT1A1 LTR MaLR 1 106 -302 7 812 289 366 43 49 chr2 29795284 29795468 -151952619 - MTEb LTR MaLR -189 190 8 7 812 1207 149 113 16 chr2 29798627 29798997 -151949090 + RMER4B LTR ERVK 139 585 0 7 812 3052 55 39 3 chr2 29801653 29802035 -151946052 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 7 812 2250 186 45 2 chr2 29805194 29805593 -151942494 - MTC LTR MaLR -4 417 2 7 812 258 348 33 11 chr2 29806595 29806685 -151941402 - ORR1E LTR MaLR -217 142 51 7 812 607 311 83 38 chr2 29808389 29808533 -151939554 - RLTR18B LTR ERVK -4 612 435 7 812 607 311 83 38 chr2 29808599 29808844 -151939243 - RLTR18B LTR ERVK -4 434 130 7 812 557 273 39 33 chr2 29809278 29809460 -151938627 - RLTR18B LTR ERVK -329 183 1 7 812 2805 162 147 21 chr2 29842710 29843321 -151904766 - RMER6C LTR ERVK -2 688 1 8 812 226 313 26 124 chr2 29847837 29847950 -151900137 + MT-int LTR MaLR 792 893 -205 8 812 1217 152 266 0 chr2 29862347 29862636 -151885451 - ORR1D1 LTR MaLR -8 366 1 9 812 1391 227 48 79 chr2 29863787 29863976 -151884111 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 210 9 812 1391 227 48 79 chr2 29864110 29864298 -151883789 - ORR1D1 LTR MaLR -165 209 9 9 812 301 222 79 8 chr2 29878906 29879033 -151869054 + ORR1B1-int LTR MaLR 619 754 -755 9 813 1272 228 119 51 chr2 29894263 29894633 -151853454 - MTD LTR MaLR 0 419 25 9 813 289 182 56 144 chr2 29902573 29902663 -151845424 - RLTR25A LTR ERVK -521 582 501 1 813 304 176 79 26 chr2 29916530 29916606 -151831481 - RLTR25B LTR ERVK -519 509 430 1 813 261 223 42 16 chr2 29939505 29939583 -151808504 - MTD LTR MaLR -19 400 296 1 813 751 256 33 62 chr2 29939801 29940076 -151808011 - MTD LTR MaLR -121 298 6 1 813 2412 183 83 2 chr2 29981468 29981951 -151766136 + RMER15 LTR ERVL 54 575 0 1 813 1232 252 42 70 chr2 29982008 29982344 -151765743 - MTC LTR MaLR 0 421 91 1 813 1232 252 42 70 chr2 29982535 29982629 -151765458 - MTC LTR MaLR -331 90 3 1 813 2425 132 135 71 chr2 29983783 29984091 -151763996 - RMER4B LTR ERVK 0 585 228 1 813 2425 132 135 71 chr2 29984236 29984430 -151763657 - RMER4B LTR ERVK -358 227 49 1 813 2425 132 135 71 chr2 29984611 29984639 -151763448 - RMER4B LTR ERVK -537 48 20 1 813 3531 54 29 2 chr2 29986418 29986901 -151761186 - LTRIS2 LTR ERV1 0 564 69 1 813 578 146 28 9 chr2 29987514 29987624 -151760463 + ORR1B1 LTR MaLR 1 105 -289 1 813 228 246 24 134 chr2 30001995 30002036 -151746051 - MT2B LTR ERVL -446 155 129 1 813 537 172 30 20 chr2 30009820 30009921 -151738166 - MYSERV-int LTR ERVK -6819 2140 2039 3 813 962 227 40 9 chr2 30009998 30010352 -151737735 - MYSERV-int LTR ERVK -5899 3060 2833 3 813 4284 241 32 55 chr2 30010591 30011457 -151736630 - MYSERV-int LTR ERVK -3996 2554 1705 3 813 4284 241 32 55 chr2 30011646 30011910 -151736177 - MYSERV-int LTR ERVK -4846 1704 1444 3 813 4284 241 32 55 chr2 30012056 30012204 -151735883 - MYSERV-int LTR ERVK -5107 1443 1305 3 813 555 235 7 29 chr2 30013114 30013254 -151734833 - MYSERV-int LTR ERVK -7787 1172 1036 3 813 664 272 100 67 chr2 30013285 30013421 -151734666 - MYSERV-int LTR ERVK -7888 1071 929 3 813 664 272 100 67 chr2 30013608 30013861 -151734226 - MYSERV-int LTR ERVK -8031 928 669 3 814 3819 88 38 4 chr2 30017748 30018296 -151729791 - RMER2 LTR ERV1 0 567 1 4 814 1374 279 38 2 chr2 30018676 30019075 -151729012 - MuRRS4-int LTR ERV1 -1049 4014 3602 5 814 402 311 98 28 chr2 30019767 30020022 -151728065 - MuLV-int LTR ERV1 -3307 4299 4027 5 814 1430 154 30 69 chr2 30020295 30020630 -151727457 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 322 0 5 814 373 324 121 5 chr2 30021416 30021639 -151726448 - MuRRS4-int LTR ERV1 -3623 1440 1192 5 814 2876 132 64 52 chr2 30022959 30022999 -151725088 - RMER2 LTR ERV1 0 567 525 5 814 2876 132 64 52 chr2 30023174 30023692 -151724395 - RMER2 LTR ERV1 -43 524 2 5 814 516 326 74 41 chr2 30023984 30024253 -151723834 - RLTR11B LTR ERVK -168 285 8 6 814 1074 228 52 99 chr2 30024272 30024340 -151723747 - RMER4B LTR ERVK -168 417 357 6 814 1074 228 52 99 chr2 30024486 30024821 -151723266 - RMER4B LTR ERVK -229 356 33 6 814 299 174 73 104 chr2 30027957 30028053 -151720034 - MT2B LTR ERVL -332 269 177 7 814 342 190 48 39 chr2 30036025 30036129 -151711958 - RLTR31_Mm LTR ERVK -6 555 451 9 814 1289 197 14 62 chr2 30036502 30036854 -151711233 - RLTR31_Mur LTR ERVK -218 335 1 9 814 1945 168 12 3 chr2 30037915 30038256 -151709831 + RLTR33 LTR ERVK 335 678 0 1 814 267 73 0 0 chr2 30038604 30038645 -151709442 + RLTR15 LTR ERVK 25 65 -463 1 814 359 307 47 35 chr2 30038728 30039053 -151709034 + RLTR15 LTR ERVK 43 291 -68 1 814 2991 43 210 2 chr2 30040070 30040494 -151707593 + RLTR1B LTR ERV1 1 512 0 1 814 888 10 0 0 chr2 30040494 30040597 -151707490 + MMERGLN-int LTR ERV1 1 103 -7453 1 814 277 81 0 0 chr2 30046064 30046101 -151701986 + MURVY-LTR LTR ERV1 1 37 -482 1 814 456 215 9 0 chr2 30046101 30046208 -151701879 + MMERGLN-int LTR ERV1 5378 5485 -2071 1 814 286 77 5 19 chr2 30046425 30046482 -151701605 + RLTR6-int LTR ERV1 7737 7778 0 1 814 2395 88 233 23 chr2 30046482 30046911 -151701176 + MURVY-LTR LTR ERV1 1 519 0 1 814 407 304 16 8 chr2 30048167 30048293 -151699794 + MER21B LTR ERV1 441 567 -296 1 814 518 215 11 149 chr2 30053987 30054044 -151694043 + RMER4A LTR ERVK 316 363 -103 1 814 518 215 11 149 chr2 30054191 30054308 -151693779 + RMER4A LTR ERVK 364 466 0 1 814 511 204 0 0 chr2 30057403 30057501 -151690586 + MTC LTR MaLR 5 102 -319 1 814 1773 119 68 10 chr2 30057889 30058185 -151689902 + MTC LTR MaLR 109 421 0 1 814 398 75 222 12 chr2 30064820 30064871 -151683216 - RMER12B LTR ERVK -83 1321 1255 1 814 398 75 222 12 chr2 30064921 30064950 -151683137 - RMER12B LTR ERVK -150 1254 1224 1 814 3395 203 98 116 chr2 30064924 30065036 -151683051 - RLTR21 LTR ERVK -487 1085 972 1 814 3395 203 98 116 chr2 30065226 30065535 -151682552 - RLTR21 LTR ERVK -601 971 715 1 814 3395 203 98 116 chr2 30065682 30066357 -151681730 - RLTR21 LTR ERVK -858 714 7 1 814 717 110 42 0 chr2 30066915 30067033 -151681054 - RMER2 LTR ERV1 0 567 445 1 814 3566 92 64 22 chr2 30067561 30068105 -151679982 - RMER2 LTR ERV1 0 567 1 1 814 1360 218 23 17 chr2 30068108 30068454 -151679633 + RLTR15 LTR ERVK 2 349 -10 1 814 3254 82 94 15 chr2 30068562 30069087 -151679000 + RLTR19B LTR ERVK 5 571 -144 1 814 956 173 0 0 chr2 30069698 30069854 -151678233 + RLTR19B LTR ERVK 560 715 0 1 814 605 314 212 3 chr2 30071041 30071380 -151676707 - MTE-int LTR MaLR -1169 411 2 2 814 542 289 52 37 chr2 30072614 30072903 -151675184 - RLTR12B LTR ERVK -266 302 5 2 814 3632 178 7 16 chr2 30073130 30073837 -151674250 - MYSERV6-int LTR ERVK -46 8913 8213 2 814 2860 18 3 0 chr2 30074010 30074345 -151673742 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 2 337 0 2 814 54017 23 13 6 chr2 30074345 30080774 -151667313 + IAPEz-int LTR ERVK 8 6481 0 2 814 2868 18 3 0 chr2 30080774 30081110 -151666977 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 337 0 2 814 1651 178 47 23 chr2 30081116 30081565 -151666522 - MYSERV6-int LTR ERVK -760 5790 5407 2 814 274 238 24 59 chr2 30081621 30081706 -151666381 - RMER4B LTR ERVK -41 544 463 2 814 1552 261 70 45 chr2 30081716 30081933 -151666154 - MYSERV6-int LTR ERVK -1342 5208 4965 2 814 1997 115 18 56 chr2 30081933 30082275 -151665812 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 2 814 1552 261 70 45 chr2 30082275 30082571 -151665516 - MYSERV6-int LTR ERVK -1586 4964 4682 2 814 261 267 142 43 chr2 30082949 30083090 -151664997 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -1924 402 248 2 814 727 226 67 52 chr2 30083349 30083618 -151664469 + RLTR5_Mm LTR ERV1 276 605 -23 2 814 34116 216 17 21 chr2 30083619 30087360 -151660727 + MURVY-int LTR ERV1 7 3758 -3694 2 814 34116 216 17 21 chr2 30087557 30091288 -151656799 + MURVY-int LTR ERV1 3759 7452 0 2 814 1420 123 69 40 chr2 30091650 30091954 -151656133 - MYSERV6-int LTR ERVK -2206 6753 6441 2 814 236 268 8 8 chr2 30102377 30102496 -151645591 - ORR1B1-int LTR MaLR -755 754 635 2 814 255 274 80 123 chr2 30123582 30123594 -151624493 - MT2B2 LTR ERVL -249 335 237 2 814 411 260 66 164 chr2 30127709 30127806 -151620281 - ORR1E LTR MaLR -3 356 253 2 814 4234 135 50 36 chr2 30127806 30128157 -151619930 + RMER6A LTR ERVK 1 352 -404 2 814 4234 135 50 36 chr2 30128304 30128696 -151619391 + RMER6A LTR ERVK 353 754 -2 2 814 411 260 66 164 chr2 30128696 30128902 -151619185 - ORR1E LTR MaLR -107 252 83 2 814 225 276 0 17 chr2 30130347 30130406 -151617681 + MT2C_Mm LTR ERVL 146 203 -272 2 814 853 118 333 0 chr2 30137081 30137267 -151610820 + RMER4B LTR ERVK 338 585 0 3 814 490 181 8 127 chr2 30139418 30139595 -151608492 - MT2B LTR ERVL -320 264 102 3 814 462 243 158 42 chr2 30145974 30146124 -151601963 - RMER15 LTR ERVL 0 575 406 3 814 462 243 158 42 chr2 30146262 30146326 -151601761 - RMER15 LTR ERVL -170 405 336 3 815 890 320 45 20 chr2 30158569 30158968 -151589119 - BGLII_B LTR ERVK -28 413 5 4 815 226 362 92 67 chr2 30160865 30161179 -151586908 - RLTR12B LTR ERVK -190 338 17 4 815 3073 139 107 22 chr2 30168951 30169552 -151578535 + RLTR33 LTR ERVK 17 668 -10 4 815 382 232 85 31 chr2 30169643 30169680 -151578407 + MT2B LTR ERVL 122 165 -436 4 815 1119 227 111 15 chr2 30173470 30173805 -151574282 - MTD LTR MaLR -10 390 1 4 815 266 283 18 92 chr2 30174720 30174829 -151573258 - MT2B LTR ERVL -345 256 156 4 815 1318 214 229 0 chr2 30181152 30181493 -151566594 - MTD LTR MaLR 0 419 1 4 815 2413 161 81 68 chr2 30190142 30190625 -151557462 - RMER4B LTR ERVK -45 540 39 5 815 2413 161 81 68 chr2 30190773 30190822 -151557265 - RMER4B LTR ERVK -547 38 1 5 815 372 186 69 15 chr2 30196373 30196504 -151551583 + RMER17C LTR ERVK 138 275 -135 5 815 233 29 29 0 chr2 30216824 30216858 -151531229 + MT2C_Mm LTR ERVL 2 36 -548 5 815 410 70 0 0 chr2 30216849 30216906 -151531181 + MT2C_Mm LTR ERVL 419 475 0 5 815 1194 276 84 0 chr2 30222587 30222884 -151525203 - MTE2a LTR MaLR -5 374 53 5 815 816 280 57 88 chr2 30223416 30223804 -151524283 - MTE2b LTR MaLR 0 379 4 5 815 784 198 93 6 chr2 30241329 30241512 -151506575 - MTC LTR MaLR -8 413 215 6 815 1984 142 40 68 chr2 30243078 30243369 -151504718 - MTC LTR MaLR -10 411 114 6 815 1984 142 40 68 chr2 30243515 30243593 -151504494 - MTC LTR MaLR -308 113 52 6 815 327 169 17 0 chr2 30277253 30277312 -151470775 + RMER13B LTR ERVK 336 395 -513 6 816 1235 231 50 24 chr2 30279458 30279799 -151468288 + RLTR31_Mur LTR ERVK 1 350 -203 6 816 859 194 100 50 chr2 30280382 30280643 -151467444 - RMER3D-int LTR ERVK -1547 1295 1022 6 816 254 175 0 0 chr2 30280861 30280918 -151467169 - RMER3D-int LTR ERVK -1992 850 794 6 816 518 207 0 41 chr2 30281404 30281525 -151466562 + RLTR31_Mur LTR ERVK 438 553 0 6 816 376 249 291 40 chr2 30286483 30286730 -151461357 - MTEb LTR MaLR 0 379 71 7 816 1751 163 148 6 chr2 30286781 30287139 -151460948 - MTD LTR MaLR -8 411 3 7 816 1020 244 57 51 chr2 30288318 30288654 -151459433 - MTC-int LTR MaLR -154 1104 767 7 816 789 242 87 58 chr2 30288631 30289162 -151458925 - MTC-int LTR MaLR -607 651 7 7 816 1238 145 327 7 chr2 30304894 30305172 -151442915 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 7 816 346 339 23 8 chr2 30312910 30313041 -151435046 + MLT1K LTR MaLR 123 255 -340 7 816 351 259 31 87 chr2 30317150 30317277 -151430810 - MT2B LTR ERVL -344 257 138 7 816 389 226 25 102 chr2 30317353 30317471 -151430616 - MT2B LTR ERVL -337 264 156 7 816 225 351 51 44 chr2 30319594 30319752 -151428335 + MLT1I LTR MaLR 72 230 -181 7 816 280 237 14 35 chr2 30338687 30338772 -151409315 - MLT1J LTR MaLR -345 167 38 8 816 229 284 37 12 chr2 30343649 30343731 -151404356 - MLT1J LTR MaLR -337 175 92 8 816 1712 184 166 8 chr2 30354776 30355138 -151392949 + MTD LTR MaLR 1 419 0 8 816 646 239 14 179 chr2 30355152 30355187 -151392900 + MTE2a LTR MaLR 63 88 -291 8 816 646 239 14 179 chr2 30355320 30355564 -151392523 + MTE2a LTR MaLR 89 296 -83 8 816 2096 105 3 12 chr2 30361518 30361837 -151386250 - ORR1A1 LTR MaLR -30 316 1 8 816 1758 168 23 3 chr2 30364183 30364536 -151383551 + MTC LTR MaLR 1 419 0 8 816 285 180 0 0 chr2 30372856 30372906 -151375181 - MT2B LTR ERVL 0 584 535 9 816 880 205 121 102 chr2 30373226 30373627 -151374460 - MT2B LTR ERVL -59 542 1 9 816 587 257 119 0 chr2 30374652 30374854 -151373233 - ORR1D2 LTR MaLR -40 330 105 9 816 270 328 8 47 chr2 30376216 30376344 -151371743 - MT2B2 LTR ERVL -324 260 138 9 816 504 280 207 12 chr2 30376411 30376653 -151371434 - MTE2b LTR MaLR -90 289 1 9 816 1409 249 61 6 chr2 30378186 30378545 -151369542 - MTEa LTR MaLR 0 379 1 9 816 1758 196 52 18 chr2 30379215 30379599 -151368488 - MTD LTR MaLR -21 398 2 9 816 596 239 323 4 chr2 30384777 30385046 -151363041 - ORR1D2 LTR MaLR -3 367 13 9 816 438 222 0 100 chr2 30388186 30388306 -151359781 + MT2B LTR ERVL 157 264 -337 9 816 637 258 206 13 chr2 30388854 30389164 -151358923 - ORR1D1 LTR MaLR -3 371 2 9 816 1501 204 41 95 chr2 30391166 30391609 -151356478 + MTD LTR MaLR 1 419 0 9 816 312 252 24 105 chr2 30392036 30392160 -151355927 + MT2B LTR ERVL 144 257 -344 9 816 248 185 11 147 chr2 30392099 30392194 -151355893 + RLTR25B LTR ERVK 444 525 -503 9 816 585 83 47 156 chr2 30393195 30393323 -151354764 + ORR1A4 LTR MaLR 8 121 -208 9 816 630 87 0 55 chr2 30393319 30393379 -151354708 + ORR1A4 LTR MaLR 227 285 -44 9 816 630 87 0 55 chr2 30393527 30393575 -151354512 + ORR1A4 LTR MaLR 286 329 0 9 816 464 259 81 12 chr2 30394881 30395041 -151353046 - MTEa LTR MaLR -25 354 184 9 816 364 228 200 16 chr2 30401468 30401593 -151346494 - MLT1D LTR MaLR -14 491 344 9 816 897 270 140 22 chr2 30405595 30405909 -151342178 + MTE2b LTR MaLR 1 351 -28 1 817 369 261 77 42 chr2 30409422 30409590 -151338497 + MLT1J1 LTR MaLR 1 174 -270 1 817 236 367 88 58 chr2 30410499 30410794 -151337293 + MTEa LTR MaLR 49 352 -27 1 817 322 211 50 91 chr2 30413970 30414069 -151334018 - MT2B LTR ERVL -338 263 169 1 817 242 289 15 76 chr2 30417581 30417712 -151330375 - MLT1A1 LTR MaLR -6 402 280 1 817 994 205 76 146 chr2 30420617 30421063 -151327024 + MTD LTR MaLR 5 419 0 1 817 818 267 60 98 chr2 30427141 30427507 -151320580 - ORR1E LTR MaLR -5 354 3 1 817 4299 137 75 80 chr2 30431077 30431983 -151316104 + RMER19B LTR ERVK 1 902 0 1 817 390 230 76 2 chr2 30432697 30432812 -151315275 - RMER17C-int LTR ERVK -2012 1226 1132 1 817 2140 138 20 25 chr2 30433427 30433827 -151314260 - RMER10B LTR ERVL 0 398 1 1 817 597 287 182 25 chr2 30434647 30434922 -151313165 + ORR1E LTR MaLR 1 318 -41 1 817 247 247 47 58 chr2 30440018 30440104 -151307983 + MLT1A1 LTR MaLR 306 390 -18 1 817 866 154 20 0 chr2 30440759 30440908 -151307179 + ORR1A3 LTR MaLR 119 270 -56 1 817 287 408 38 11 chr2 30444207 30444393 -151303694 - MLT2C1 LTR ERVL -205 192 2 1 817 234 291 11 11 chr2 30444880 30444967 -151303120 + MLT1K LTR MaLR 4 90 -505 1 817 456 336 54 46 chr2 30446505 30446764 -151301323 + MLT1J2 LTR MaLR 21 281 -167 1 817 318 158 0 0 chr2 30446835 30446892 -151301195 - MTE2a LTR MaLR 0 379 323 1 817 285 194 65 0 chr2 30447290 30447352 -151300735 - MTE2a LTR MaLR -43 336 271 1 817 331 287 43 17 chr2 30447383 30447500 -151300587 - MTE2a LTR MaLR -184 195 76 1 817 803 227 310 14 chr2 30453724 30454014 -151294073 - MTE2a LTR MaLR -1 378 3 1 817 819 279 290 2 chr2 30457186 30457610 -151290477 - MLT1F LTR MaLR 0 548 3 1 817 242 169 67 133 chr2 30458081 30458156 -151289931 + MT2B LTR ERVL 182 251 -350 1 817 490 274 77 19 chr2 30467386 30467542 -151280545 + MT2B LTR ERVL 1 165 -368 1 817 671 237 12 29 chr2 30467564 30467761 -151280326 + MT2B LTR ERVL 242 561 -40 1 817 823 286 81 81 chr2 30474885 30475304 -151272783 - MTD LTR MaLR 0 419 1 1 817 443 320 64 54 chr2 30475526 30475834 -151272253 + MLT1C LTR MaLR 22 332 -135 1 817 339 344 73 79 chr2 30475834 30476188 -151271899 - ORR1E LTR MaLR 0 359 8 1 817 246 263 102 34 chr2 30476762 30476880 -151271207 + MTD LTR MaLR 280 405 -14 1 817 3560 25 2 0 chr2 30478116 30478511 -151269576 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 817 671 282 52 40 chr2 30480530 30480781 -151267306 + MTD LTR MaLR 12 265 -154 1 817 1057 238 176 45 chr2 30481133 30481468 -151266619 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 1 817 497 242 65 0 chr2 30481528 30481652 -151266435 - MTD LTR MaLR 0 419 288 1 817 453 246 87 8 chr2 30481659 30481786 -151266301 - ORR1D2-int LTR MaLR -1121 137 1 1 817 956 262 132 27 chr2 30481786 30482119 -151265968 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 3 1 817 843 214 132 161 chr2 30482127 30482312 -151265775 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 149 1 817 843 214 132 161 chr2 30482352 30482437 -151265650 - ORR1D1 LTR MaLR -226 148 100 1 817 843 214 132 161 chr2 30482581 30482694 -151265393 - ORR1D1 LTR MaLR -275 99 3 1 817 619 267 49 16 chr2 30485096 30485279 -151262808 - MLT1B LTR MaLR -7 383 195 1 817 1641 136 56 140 chr2 30488222 30488386 -151259701 - MTC LTR MaLR -62 359 203 1 817 1641 136 56 140 chr2 30488588 30488809 -151259278 - MTC LTR MaLR -219 202 2 1 817 348 291 63 9 chr2 30494209 30494320 -151253767 + RMER15-int LTR ERVL 1130 1246 -3753 1 817 2164 277 39 35 chr2 30494516 30495257 -151252830 + RMER15-int LTR ERVL 4228 4971 -28 1 817 461 229 220 116 chr2 30495748 30495980 -151252107 - MTD LTR MaLR -12 407 152 1 817 455 288 38 8 chr2 30496084 30496108 -151251979 - MTD LTR MaLR -282 137 115 1 817 455 288 38 8 chr2 30496175 30496283 -151251804 - MTD LTR MaLR -305 114 2 1 817 227 291 52 78 chr2 30497078 30497231 -151250856 - MLT1K LTR MaLR -56 539 391 1 817 2731 182 54 0 chr2 30497412 30497945 -151250142 + RMER15 LTR ERVL 14 575 0 1 817 4237 112 87 24 chr2 30508903 30509614 -151238473 - RMER6A LTR ERVK 0 756 1 1 817 408 281 109 33 chr2 30510743 30510927 -151237160 + MLT1B LTR MaLR 43 240 -150 2 817 565 320 138 44 chr2 30511288 30511512 -151236575 - MLT1D LTR MaLR -38 467 219 2 817 565 320 138 44 chr2 30511669 30511691 -151236396 - MLT1D LTR MaLR -287 218 200 2 817 565 320 138 44 chr2 30511898 30512062 -151236025 - MLT1D LTR MaLR -306 199 18 2 817 432 297 79 26 chr2 30517391 30517581 -151230506 - MLT1A0 LTR MaLR -7 358 159 3 817 585 153 9 9 chr2 30518346 30518458 -151229629 - RLTR16 LTR ERVK 0 505 394 3 817 1185 206 176 20 chr2 30520389 30520736 -151227351 + MTD LTR MaLR 18 418 -1 4 817 1795 153 84 6 chr2 30524487 30524809 -151223278 - MTC LTR MaLR -2 419 73 5 817 474 141 13 0 chr2 30524985 30525063 -151223024 - MTC LTR MaLR -340 81 3 5 817 436 299 112 63 chr2 30529267 30529564 -151218523 - MLT1J LTR MaLR -132 380 37 6 817 1281 266 62 15 chr2 30535084 30535423 -151212664 - ORR1E LTR MaLR -4 355 1 8 817 330 361 75 23 chr2 30535900 30536071 -151212016 + MLT1J-int LTR MaLR 1 180 -1207 8 818 2137 101 12 51 chr2 30544514 30544849 -151203238 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 322 0 1 818 1354 197 33 30 chr2 30546826 30547129 -151200958 + MTC LTR MaLR 92 395 -26 1 818 229 312 112 50 chr2 30547213 30547392 -151200695 - MLT2B4 LTR ERVL -136 420 231 1 818 475 308 35 70 chr2 30555342 30555541 -151192546 + MLT1J LTR MaLR 25 216 -296 1 818 1796 181 82 35 chr2 30556409 30556809 -151191278 + MTD LTR MaLR 1 419 0 1 818 262 286 120 40 chr2 30562255 30562331 -151185756 + RMER17C LTR ERVK 173 249 -161 1 818 262 286 120 40 chr2 30562474 30562572 -151185515 + RMER17C LTR ERVK 250 360 -50 1 818 1143 178 55 3 chr2 30583501 30583734 -151164353 + MT2A LTR ERVL 8 411 -173 1 818 293 109 164 45 chr2 30583725 30583792 -151164295 + MT2A LTR ERVL 294 368 -165 1 818 580 226 59 6 chr2 30583769 30583921 -151164166 + MTD LTR MaLR 217 388 -31 1 818 1646 201 45 111 chr2 30584094 30584385 -151163702 - MTC LTR MaLR -8 413 112 1 818 1646 201 45 111 chr2 30584532 30584682 -151163405 - MTC LTR MaLR -310 111 1 1 818 1832 133 24 42 chr2 30586813 30587150 -151160937 + RLTR11B LTR ERVK 123 453 0 2 818 238 288 86 12 chr2 30590298 30590379 -151157708 - ORR1E LTR MaLR -6 373 287 2 818 249 234 127 27 chr2 30590933 30591043 -151157044 + RLTR20B2 LTR ERVK 93 213 -347 2 818 827 249 142 109 chr2 30591300 30591515 -151156572 + MTEa LTR MaLR 25 263 -116 2 818 827 249 142 109 chr2 30591691 30591813 -151156274 + MTEa LTR MaLR 264 373 -6 2 818 429 303 7 14 chr2 30591899 30592043 -151156044 - ORR1E LTR MaLR -216 143 1 2 818 1125 256 98 0 chr2 30592119 30592436 -151155651 - MTEa LTR MaLR -6 373 26 2 818 423 317 42 45 chr2 30594211 30594612 -151153475 - RLTR4_MM-int LTR ERV1 -3193 4413 4018 2 818 945 266 21 69 chr2 30595319 30595610 -151152477 - RodERV21-int LTR ERV1 -2321 2670 2394 2 818 1307 248 123 70 chr2 30595625 30595978 -151152109 + RMER4B LTR ERVK 14 405 -180 2 818 1307 248 123 70 chr2 30596210 30596397 -151151690 + RMER4B LTR ERVK 406 585 0 2 818 6319 254 63 53 chr2 30596405 30598299 -151149788 - RodERV21-int LTR ERV1 -2609 2382 470 2 818 1070 228 57 37 chr2 30598287 30598530 -151149557 - RodERV21-int LTR ERV1 -4685 306 61 2 818 1070 228 57 37 chr2 30598600 30598655 -151149432 - RodERV21-int LTR ERV1 -4931 60 2 2 818 1126 245 23 91 chr2 30605681 30606105 -151141982 - MTE2a LTR MaLR 0 419 8 2 818 2024 97 57 69 chr2 30606236 30606301 -151141786 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 287 2 818 2024 97 57 69 chr2 30606486 30606753 -151141334 - ORR1A4 LTR MaLR -43 286 1 2 818 241 62 0 0 chr2 30611217 30611249 -151136838 - MT2B LTR ERVL -360 241 210 2 818 1273 198 137 38 chr2 30617941 30618425 -151129662 + RMER4B LTR ERVK 16 579 -6 3 818 791 235 58 9 chr2 30618552 30618822 -151129265 - ORR1D2 LTR MaLR -14 405 3 3 818 540 300 62 59 chr2 30618877 30619182 -151128905 - MTEb LTR MaLR -22 357 52 3 818 266 315 65 124 chr2 30619623 30619808 -151128279 - MTE-int LTR MaLR -830 750 577 3 818 437 239 0 104 chr2 30620417 30620571 -151127516 - MTE-int LTR MaLR -1076 504 367 3 818 357 312 8 45 chr2 30621163 30621297 -151126790 - MTE-int LTR MaLR -1248 332 204 3 818 857 226 64 5 chr2 30624253 30624471 -151123616 + RLTR11A2 LTR ERVK 297 527 0 3 818 583 305 105 21 chr2 30630478 30630811 -151117276 - MTEa LTR MaLR -18 361 1 3 818 232 214 54 0 chr2 30631041 30631097 -151116990 + MLT1A0 LTR MaLR 24 82 -385 3 818 388 361 82 10 chr2 30631804 30632011 -151116076 + MLT1A0 LTR MaLR 136 357 -8 3 818 1139 165 191 0 chr2 30633399 30633666 -151114421 + MTD LTR MaLR 102 419 0 3 818 387 331 92 0 chr2 30638945 30639087 -151109000 + MLT1J LTR MaLR 37 191 -321 3 818 311 245 0 162 chr2 30648320 30648345 -151099742 + MT2B2 LTR ERVL 165 258 -326 3 818 419 242 7 99 chr2 30649164 30649306 -151098781 - MT2B LTR ERVL -337 264 136 3 818 247 309 16 106 chr2 30657795 30657918 -151090169 + MT2B LTR ERVL 152 263 -338 4 818 2097 155 19 7 chr2 30660167 30660787 -151087300 - RLTR33 LTR ERVK 0 678 11 4 818 1086 203 171 33 chr2 30665398 30665889 -151082198 + RLTR12A LTR ERVK 4 562 -6 4 818 585 314 75 54 chr2 30668213 30668638 -151079449 + RLTR4_MM-int LTR ERV1 1784 2217 -2473 4 818 1883 335 60 45 chr2 30668951 30670468 -151077619 + RLTR4_MM-int LTR ERV1 2545 4282 -3319 4 102 583 272 184 28 chr2 30670529 30670947 -151077140 + RLTR4_MM-int LTR ERV1 4972 5306 -2300 4 819 306 305 38 9 chr2 30671041 30671147 -151076940 + RLTR19-int LTR ERVK 4364 4472 -1665 4 819 3615 48 29 12 chr2 30672347 30672837 -151075250 - RLTR1C LTR ERV1 0 503 6 4 819 2998 81 27 22 chr2 30677043 30677448 -151070639 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 4 819 409 317 46 42 chr2 30685207 30685424 -151062663 - MLT1C LTR MaLR -249 218 1 4 819 1608 166 116 9 chr2 30696478 30696807 -151051280 + ORR1C2 LTR MaLR 1 364 -20 4 819 233 291 28 28 chr2 30698908 30698987 -151049100 + RMER12 LTR ERVK 766 844 -478 4 819 392 255 175 29 chr2 30721762 30721968 -151026119 + RMER12 LTR ERVK 771 1006 -316 5 819 401 337 24 6 chr2 30722202 30722369 -151025718 - RMER15 LTR ERVL -92 483 314 5 819 4381 113 100 22 chr2 30725562 30726340 -151021747 - RMER17B LTR ERVK -119 839 1 5 819 1100 192 89 188 chr2 30737148 30737425 -151010662 - MTE2a LTR MaLR -3 376 112 5 819 1100 192 89 188 chr2 30737571 30737709 -151010378 - MTE2a LTR MaLR -268 111 2 5 819 1341 222 50 47 chr2 30743241 30743643 -151004444 - MTD LTR MaLR -14 405 3 5 819 240 322 12 113 chr2 30743909 30744026 -151004061 - MT2B2 LTR ERVL -425 159 60 6 819 2070 99 92 14 chr2 30744947 30745305 -151002782 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 1 6 819 230 257 115 81 chr2 30745778 30745926 -151002161 - MT2B LTR ERVL -361 240 88 6 819 1277 214 202 18 chr2 30761585 30761978 -150986109 + RMER5 LTR ERV1 17 481 -53 6 819 226 185 33 100 chr2 30763984 30764074 -150984013 + MT2A LTR ERVL 230 313 -220 6 819 370 202 30 69 chr2 30764187 30764288 -150983799 - MT2B LTR ERVL -337 264 168 6 819 305 223 157 30 chr2 30778535 30778669 -150969418 - MLT2B2 LTR ERVL -405 151 1 7 819 266 208 178 9 chr2 30781104 30781211 -150966876 - MT2A LTR ERVL 0 533 409 7 819 421 201 84 92 chr2 30785757 30785899 -150962188 + MT2B LTR ERVL 124 264 -337 7 819 734 164 132 17 chr2 30787550 30787724 -150960363 - ORR1B1 LTR MaLR -200 194 1 7 819 403 256 26 0 chr2 30791293 30791410 -150956677 - MTD LTR MaLR -295 124 5 7 819 2558 159 41 106 chr2 30792172 30792620 -150955467 - RLTR12A LTR ERVK -3 565 154 7 819 2558 159 41 106 chr2 30793197 30793352 -150954735 - RLTR12A LTR ERVK -415 153 1 7 819 1212 185 66 9 chr2 30793352 30793648 -150954439 - MT2A LTR ERVL -94 490 1 7 819 1175 270 54 25 chr2 30793974 30794366 -150953721 + RLTR12B LTR ERVK 22 424 -104 7 819 2485 84 42 10 chr2 30794372 30794758 -150953329 + RLTR9B LTR ERVK 1 398 -39 7 819 1824 147 30 38 chr2 30795224 30795662 -150952425 + RLTR33 LTR ERVK 1 522 -156 7 819 1824 148 13 94 chr2 30795834 30796008 -150952079 + RLTR33 LTR ERVK 523 678 0 7 819 347 313 113 50 chr2 30796652 30796904 -150951183 + RLTR12B LTR ERVK 243 497 -31 7 819 228 343 9 73 chr2 30799794 30799820 -150948267 - MT2B2 LTR ERVL -310 274 172 7 819 1383 174 112 112 chr2 30801435 30801855 -150946232 + RMER16 LTR ERVK 113 532 -1 7 820 720 106 0 0 chr2 30802121 30802225 -150945862 + RLTR12A LTR ERVK 146 249 -319 8 820 1483 147 79 4 chr2 30803392 30803628 -150944459 + RLTR12A LTR ERVK 1 256 -312 8 820 1483 147 79 4 chr2 30803696 30803726 -150944361 + RLTR12A LTR ERVK 257 286 -282 8 820 2253 134 25 13 chr2 30803720 30804114 -150943973 - RLTR9D LTR ERVK -4 399 1 8 820 319 155 40 40 chr2 30804115 30804189 -150943898 - ETnERV2-int LTR ERVK -2 7404 7331 8 820 1652 175 3 0 chr2 30804345 30804631 -150943456 + RLTR12A LTR ERVK 278 564 -4 8 820 267 202 8 195 chr2 30804935 30805058 -150943029 + MT2B LTR ERVL 156 255 -346 8 820 307 306 69 11 chr2 30805309 30805433 -150942654 + MLT1A1 LTR MaLR 162 329 -79 8 820 322 158 18 0 chr2 30810882 30810939 -150937148 - MTE2b LTR MaLR 0 379 322 8 820 605 256 77 55 chr2 30819433 30819759 -150928328 - RLTR15 LTR ERVK -26 333 1 8 820 1867 164 163 32 chr2 30824600 30825067 -150923020 + RLTR12B LTR ERVK 1 528 0 8 820 379 213 289 6 chr2 30825965 30826121 -150921966 - MTD LTR MaLR -1 418 219 8 820 355 119 134 0 chr2 30826203 30826270 -150921817 - RLTR20D LTR ERVK -492 76 1 8 820 818 124 73 89 chr2 30826270 30826518 -150921569 - MYSERV16_I-int LTR ERVK 0 2326 2083 8 820 1502 182 18 40 chr2 30826547 30826873 -150921214 + RLTR20D LTR ERVK 250 568 0 8 820 416 190 37 104 chr2 30835140 30835275 -150912812 + MT2B LTR ERVL 139 264 -337 8 820 412 217 17 102 chr2 30835630 30835748 -150912339 + MTD LTR MaLR 1 108 -311 8 820 408 233 10 10 chr2 30842931 30843035 -150905052 - RLTR4_MM-int LTR ERV1 -974 6804 6701 9 820 7475 276 26 48 chr2 30843161 30845085 -150903002 - RLTR4_MM-int LTR ERV1 -1250 6306 4553 9 820 7475 322 60 59 chr2 30845277 30847090 -150900997 - RLTR4_MM-int LTR ERV1 -3049 4552 2725 9 820 7475 322 60 59 chr2 30847279 30847418 -150900669 - RLTR4_MM-int LTR ERV1 -4877 2724 2584 9 820 7475 322 60 59 chr2 30847466 30849535 -150898552 - RLTR4_MM-int LTR ERV1 -5018 2583 464 9 820 384 301 57 17 chr2 30850145 30850321 -150897766 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 264 9 820 348 319 116 23 chr2 30861424 30861597 -150886490 - MLT1B LTR MaLR -120 270 82 9 820 419 236 196 25 chr2 30889603 30889800 -150858287 + MTE2a LTR MaLR 150 379 0 9 820 669 230 48 6 chr2 30911277 30911443 -150836644 + MTE2b LTR MaLR 1 173 -206 1 820 399 335 86 0 chr2 30911866 30912063 -150836024 + MTE2b LTR MaLR 165 378 -1 1 820 1812 114 212 9 chr2 30915864 30916184 -150831903 + ORR1B1 LTR MaLR 10 394 0 1 820 1794 165 136 27 chr2 30924976 30925343 -150822744 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 1 820 225 298 10 69 chr2 30927768 30927869 -150820218 + MT2B LTR ERVL 170 264 -337 1 820 296 284 31 31 chr2 30928918 30929016 -150819071 + MTEa LTR MaLR 8 105 -274 1 820 297 323 86 25 chr2 30929140 30929314 -150818773 + MTEa LTR MaLR 159 372 -7 1 820 1082 224 134 45 chr2 30932411 30932701 -150815386 + MTD LTR MaLR 104 419 0 1 821 921 239 126 11 chr2 30955769 30956031 -150792056 + MTEb LTR MaLR 82 373 -6 1 821 1367 262 85 19 chr2 30963878 30964255 -150783832 - MTD LTR MaLR 0 419 18 1 821 1494 208 102 46 chr2 30966822 30967195 -150780892 + MTD LTR MaLR 6 399 -20 1 821 976 175 29 0 chr2 30969479 30969650 -150778437 - MTC LTR MaLR 0 421 246 1 821 761 177 7 28 chr2 30969650 30969795 -150778292 - MTC LTR MaLR -279 142 1 1 821 290 302 38 38 chr2 30969904 30969934 -150778153 - MT2B LTR ERVL -333 266 138 1 821 482 299 67 67 chr2 30970623 30970877 -150777210 + MLT1A0 LTR MaLR 112 365 0 1 821 341 238 35 122 chr2 30972669 30972784 -150775303 + MT2B LTR ERVL 136 240 -361 1 821 2120 134 0 0 chr2 30973167 30973474 -150774613 + ORR1A3 LTR MaLR 12 318 -8 1 821 1109 275 17 13 chr2 30978272 30978574 -150769513 + ORR1E LTR MaLR 2 304 -55 1 821 253 268 28 0 chr2 30978847 30978918 -150769169 + ORR1E LTR MaLR 282 354 -5 1 821 225 262 78 54 chr2 30979579 30979708 -150768379 + LTR48B LTR ERV1 62 193 -451 1 821 951 248 16 36 chr2 30982443 30982694 -150765393 + MT2A LTR ERVL 5 250 -283 1 821 687 249 151 57 chr2 30982721 30983092 -150764995 - RMER10A LTR ERVL -25 417 12 1 821 1260 182 156 51 chr2 30983191 30983562 -150764525 + RMER17C LTR ERVK 1 410 0 1 821 304 286 56 96 chr2 31010599 31010777 -150737310 - MT2B2 LTR ERVL -320 264 94 3 821 271 279 25 141 chr2 31013450 31013571 -150734516 - MT2B LTR ERVL -343 258 152 5 821 1528 220 98 3 chr2 31014488 31014826 -150733261 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 6 821 321 224 80 53 chr2 31022079 31022192 -150725895 - MT2B LTR ERVL -323 278 163 8 821 2436 147 47 12 chr2 31031044 31031451 -150716636 - MTC LTR MaLR 0 421 1 1 821 871 246 30 98 chr2 31037233 31037599 -150710488 - RLTR15 LTR ERVK -17 342 2 1 821 1008 149 113 0 chr2 31038548 31038742 -150709345 - ORR1D1 LTR MaLR -3 371 156 1 821 1608 176 130 21 chr2 31045528 31045727 -150702360 - ORR1D1 LTR MaLR -8 366 131 1 821 2358 87 21 9 chr2 31045727 31046052 -150702035 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 1 821 1608 176 130 21 chr2 31046052 31046182 -150701905 - ORR1D1 LTR MaLR -244 130 1 1 821 862 157 179 6 chr2 31051151 31051330 -150696757 - ORR1C2 LTR MaLR -1 383 174 1 821 233 57 29 0 chr2 31051485 31051520 -150696567 - ORR1C2 LTR MaLR -348 36 1 1 821 561 199 153 12 chr2 31054380 31054543 -150693544 - MTE2a LTR MaLR 0 379 194 1 821 403 292 142 6 chr2 31054874 31055043 -150693044 - MTE2a LTR MaLR -182 237 46 1 821 336 321 36 0 chr2 31055057 31055169 -150692918 + MT2A LTR ERVL 4 119 -414 1 821 632 206 145 0 chr2 31055069 31055200 -150692887 + MTE2b LTR MaLR 20 169 -210 1 822 1856 103 24 133 chr2 31084043 31084393 -150663694 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 19 2 822 1856 103 24 133 chr2 31084583 31084601 -150663486 - ORR1A4 LTR MaLR -311 18 1 2 822 2320 243 99 85 chr2 31086596 31087499 -150660588 + RMER17B LTR ERVK 1 915 -43 2 822 1223 182 163 21 chr2 31087660 31087986 -150660101 + ORR1C2 LTR MaLR 3 374 -10 2 822 2251 131 74 12 chr2 31091548 31091966 -150656121 - RMER4A LTR ERVK -5 461 18 2 822 347 304 118 81 chr2 31093175 31093295 -150654792 + MT2A LTR ERVL 88 222 -311 2 822 347 304 118 81 chr2 31093484 31093572 -150654515 + MT2A LTR ERVL 223 304 -229 2 822 242 191 0 0 chr2 31093598 31093645 -150654442 + MT2A LTR ERVL 487 533 0 2 822 589 314 72 18 chr2 31094972 31095245 -150652842 - MTEa LTR MaLR -87 292 16 2 822 2452 94 3 0 chr2 31105529 31105857 -150642230 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 2 822 1560 167 166 6 chr2 31120437 31120792 -150627295 - MTD LTR MaLR 0 419 8 3 822 1977 119 22 52 chr2 31122462 31122506 -150625581 - ORR1B2 LTR MaLR -15 352 313 3 822 1977 119 22 52 chr2 31122652 31122970 -150625117 - ORR1B2 LTR MaLR -55 312 1 3 822 1348 180 246 12 chr2 31124203 31124540 -150623547 + MTD LTR MaLR 4 419 0 3 822 1256 185 145 123 chr2 31136838 31137092 -150610995 - MTD LTR MaLR 0 419 113 3 822 1256 185 145 123 chr2 31137237 31137376 -150610711 - MTD LTR MaLR -307 112 17 3 822 1256 185 145 123 chr2 31137415 31137426 -150610661 - MTD LTR MaLR -403 16 6 3 822 2155 171 80 5 chr2 31145218 31145606 -150602481 - MTC LTR MaLR 0 421 5 3 822 716 259 42 33 chr2 31146534 31146746 -150601341 - RMER5 LTR ERV1 0 534 321 3 822 403 335 68 46 chr2 31152912 31153231 -150594856 - ORR1E LTR MaLR -29 350 1 3 822 394 200 28 3 chr2 31153529 31153619 -150594468 + MLT1J LTR MaLR 63 177 -335 3 822 908 200 51 25 chr2 31154399 31154715 -150593372 - ORR1C1 LTR MaLR -8 370 1 3 822 1037 278 98 9 chr2 31156849 31157045 -150591042 - MTEb LTR MaLR -2 377 153 3 822 2118 175 67 22 chr2 31157045 31157448 -150590639 - MTC LTR MaLR 0 421 1 3 822 1037 278 98 9 chr2 31157448 31157589 -150590498 - MTEb LTR MaLR -227 152 11 3 822 600 328 71 65 chr2 31178851 31179174 -150568913 + MTEa LTR MaLR 1 325 -54 4 822 3652 15 0 0 chr2 31181851 31182247 -150565840 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 822 353 230 22 44 chr2 31184875 31184966 -150563121 - MT2B LTR ERVL -344 257 169 4 822 2746 34 9 6 chr2 31185582 31185908 -150562179 - IAPLTR2b LTR ERVK 0 327 1 4 822 409 318 44 76 chr2 31186200 31186559 -150561528 + MLT1A1 LTR MaLR 19 404 -4 4 823 235 321 33 92 chr2 31207229 31207349 -150540738 + MT2B2 LTR ERVL 150 262 -322 5 823 1712 198 77 3 chr2 31216669 31217008 -150531079 - ORR1D1 LTR MaLR -8 366 3 5 823 243 289 75 63 chr2 31237637 31237800 -150510287 - RMER21A LTR ERV1 -179 768 489 5 823 1233 248 34 14 chr2 31239892 31240186 -150507901 - MTEa LTR MaLR -79 300 1 5 823 597 309 19 23 chr2 31249297 31249512 -150498575 - RMER15 LTR ERVL -4 571 358 5 823 2080 147 68 44 chr2 31263369 31263754 -150484333 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 5 823 585 267 6 0 chr2 31272570 31272735 -150475352 - ORR1D2 LTR MaLR -38 332 167 6 823 245 301 57 57 chr2 31274772 31274913 -150473174 + MTC LTR MaLR 7 147 -274 6 823 779 315 87 0 chr2 31274955 31275241 -150472846 + MTE2a LTR MaLR 69 379 0 6 823 237 317 12 24 chr2 31276870 31276954 -150471133 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK -23 314 232 6 823 1759 239 87 19 chr2 31282743 31283225 -150464862 - RLTR20B1 LTR ERVK 0 563 49 6 823 915 317 107 20 chr2 31301883 31302128 -150445959 - MLT1C LTR MaLR 0 467 191 6 823 1788 167 86 25 chr2 31302128 31302490 -150445597 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 6 823 915 317 107 20 chr2 31302490 31302646 -150445441 - MLT1C LTR MaLR -277 190 32 6 823 638 308 69 14 chr2 31311513 31311730 -150436357 - RMER15 LTR ERVL 0 575 347 6 824 3585 13 5 0 chr2 31333684 31334078 -150414009 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 7 824 1205 313 52 105 chr2 31389405 31389534 -150358553 + RLTR18 LTR ERVK 1 98 -518 8 824 1205 313 52 105 chr2 31389631 31390151 -150357936 + RLTR18 LTR ERVK 99 616 0 8 824 1264 214 77 123 chr2 31390523 31390928 -150357159 + MTD LTR MaLR 19 404 -15 8 824 799 254 63 130 chr2 31396420 31396782 -150351305 - MTE2a LTR MaLR -39 340 3 8 824 239 282 19 109 chr2 31396933 31396993 -150351094 - MT2B LTR ERVL -427 157 112 8 824 1176 181 32 99 chr2 31404481 31404763 -150343324 + RLTR28 LTR ERVL 251 513 -11 8 824 735 184 15 54 chr2 31404758 31404924 -150343163 - MTD LTR MaLR -210 209 68 8 824 345 238 0 12 chr2 31405105 31405186 -150342901 - MTD LTR MaLR -339 80 1 8 824 386 290 67 46 chr2 31406092 31406361 -150341726 + MLT1J2 LTR MaLR 16 317 -232 8 824 384 248 12 21 chr2 31407030 31407125 -150340962 - MTE2b LTR MaLR -278 101 8 8 824 372 94 0 19 chr2 31411532 31411586 -150336501 + ORR1A4 LTR MaLR 275 327 -2 8 824 2932 119 270 15 chr2 31411862 31412241 -150335846 - RMER21B LTR ERV1 0 842 404 8 824 2932 119 270 15 chr2 31412465 31412746 -150335341 - RMER21B LTR ERV1 -474 368 2 8 824 319 327 8 50 chr2 31412781 31412900 -150335187 - MLT1G3 LTR MaLR -91 504 391 8 824 267 339 98 16 chr2 31412959 31413082 -150335005 - MLT1G3 LTR MaLR -413 178 46 8 824 927 278 126 66 chr2 31413625 31414111 -150333976 - RMER5 LTR ERV1 -19 515 1 8 824 231 309 70 30 chr2 31415265 31415365 -150332722 + LTR16D LTR ERVL 309 412 -239 8 824 779 270 51 30 chr2 31415995 31416189 -150331898 + MTD LTR MaLR 3 201 -218 8 824 227 179 0 0 chr2 31416360 31416399 -150331688 + MTD LTR MaLR 234 272 -147 8 824 300 281 93 10 chr2 31416586 31416683 -150331404 + MTD LTR MaLR 275 379 0 8 824 4388 139 104 66 chr2 31417353 31418211 -150329876 - RMER19B LTR ERVK -12 890 1 9 824 385 262 20 139 chr2 31418321 31418354 -150329733 - MT2B LTR ERVL -329 249 140 9 824 239 187 48 133 chr2 31420759 31420864 -150327223 + RLTR22_Mur LTR ERVK 781 876 -972 9 824 1036 143 25 6 chr2 31423431 31423593 -150324494 + ORR1A3 LTR MaLR 159 323 -3 9 824 4709 167 42 63 chr2 31423909 31424825 -150323262 - RMER19B LTR ERVK -6 896 1 9 824 1783 184 57 22 chr2 31425404 31425770 -150322317 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 6 9 824 288 228 47 8 chr2 31430147 31430275 -150317812 - ORR1B1-int LTR MaLR -755 754 622 9 824 237 240 75 62 chr2 31431199 31431279 -150316808 - MT2B LTR ERVL -360 241 161 9 824 2474 192 189 44 chr2 31434859 31435257 -150312830 - ORR1B1-int LTR MaLR -490 1019 625 9 824 2474 186 244 40 chr2 31435404 31435928 -150312159 - ORR1B1-int LTR MaLR -1273 690 6 9 824 1832 150 86 78 chr2 31435936 31436319 -150311768 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 1 9 824 1708 172 62 94 chr2 31436953 31437167 -150310920 - ORR1C2 LTR MaLR -10 374 137 9 824 1708 172 62 94 chr2 31437296 31437465 -150310622 - ORR1C2 LTR MaLR -248 136 3 9 825 636 206 89 18 chr2 31475935 31476103 -150271984 + MTEb LTR MaLR 193 372 -7 1 825 320 175 0 192 chr2 31476851 31476888 -150271199 + ORR1B2 LTR MaLR 286 321 -46 1 825 320 175 0 192 chr2 31477116 31477168 -150270919 + ORR1B2 LTR MaLR 322 364 -3 1 825 1003 181 189 29 chr2 31477741 31477985 -150270102 - ORR1C2 LTR MaLR -89 295 13 1 825 431 141 21 105 chr2 31479277 31479372 -150268715 - RMER19A LTR ERVK -45 692 606 1 825 1617 191 98 0 chr2 31479355 31479711 -150268376 - RMER19A LTR ERVK -288 449 59 1 825 1544 276 78 15 chr2 31480534 31481008 -150267079 - RMER20A LTR ERVK 0 516 13 1 825 246 297 58 123 chr2 31486090 31486351 -150261736 - ORR1E LTR MaLR -4 355 112 1 825 303 269 0 61 chr2 31486302 31486401 -150261686 + MT2B LTR ERVL 148 240 -361 1 825 232 324 43 99 chr2 31488379 31488612 -150259475 + RLTR21 LTR ERVK 1175 1394 -178 1 825 1136 244 97 17 chr2 31511694 31512044 -150236043 - MTE2b LTR MaLR -1 378 1 2 825 1362 201 82 33 chr2 31512625 31512928 -150235159 - ORR1D1 LTR MaLR -55 319 2 2 825 488 275 65 78 chr2 31514118 31514362 -150233725 - MLT1G LTR MaLR -255 314 64 2 825 4970 99 60 1 chr2 31514527 31515223 -150232864 + RMER19A LTR ERVK 1 737 0 3 825 1913 151 58 12 chr2 31516341 31516684 -150231403 - RLTR15 LTR ERVK 0 359 1 3 825 431 187 42 52 chr2 31517080 31517176 -150230911 + MTB_Mm LTR MaLR 309 403 -4 3 825 3910 147 31 9 chr2 31517178 31517832 -150230255 + MTB_Mm-int LTR MaLR 2 669 -589 3 825 706 217 114 50 chr2 31518424 31518701 -150229386 + RMER20B LTR ERVK 88 370 -146 4 825 301 310 8 79 chr2 31521076 31521202 -150226885 - MT2B LTR ERVL -325 276 160 4 825 1735 65 51 47 chr2 31523766 31523925 -150224162 + RMER6A LTR ERVK 57 214 -542 5 825 1735 65 51 47 chr2 31524114 31524211 -150223876 + RMER6A LTR ERVK 215 314 -442 5 825 2118 146 53 65 chr2 31524541 31524585 -150223502 + RMER6A LTR ERVK 329 355 -401 5 825 2118 146 53 65 chr2 31524728 31525114 -150222973 + RMER6A LTR ERVK 356 754 -2 5 825 884 219 5 32 chr2 31528238 31528427 -150219660 + MTD LTR MaLR 19 202 -217 6 825 668 198 158 6 chr2 31528618 31528801 -150219286 + MTD LTR MaLR 209 419 0 6 825 599 229 151 96 chr2 31538699 31538950 -150209137 - MTE2b LTR MaLR -114 265 1 9 825 296 247 71 0 chr2 31556637 31556722 -150191365 - MER92B LTR ERV1 -34 602 512 1 825 1083 163 115 9 chr2 31557821 31558038 -150190049 - MTC LTR MaLR 0 421 182 1 825 1540 76 58 9 chr2 31558041 31558267 -150189820 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 239 1 825 1330 247 119 33 chr2 31558959 31559445 -150188642 - RMER5 LTR ERV1 -2 532 5 1 825 339 274 190 77 chr2 31568344 31568576 -150179511 - MLT1F LTR MaLR -86 483 128 1 825 339 266 213 88 chr2 31568746 31568846 -150179241 - MLT1F LTR MaLR -421 127 4 1 825 476 243 67 92 chr2 31572384 31572460 -150175627 - MT2B LTR ERVL -260 341 190 2 825 476 243 67 92 chr2 31572562 31572579 -150175508 - MT2B LTR ERVL -260 189 152 2 825 288 318 39 31 chr2 31582515 31582645 -150165442 + LTR41B LTR ERVL 1 131 -627 2 825 288 309 50 60 chr2 31583140 31583340 -150164747 - MER74B LTR ERVL -220 402 205 2 825 1273 156 138 16 chr2 31584090 31584415 -150163672 - MTC LTR MaLR 0 407 1 2 826 342 232 8 152 chr2 31591093 31591225 -150156862 - MT2B LTR ERVL -337 264 152 2 826 1288 136 60 68 chr2 31595504 31595594 -150152493 - RLTR20B1 LTR ERVK -3 560 472 2 826 1288 136 60 68 chr2 31595643 31595660 -150152427 - RLTR20B1 LTR ERVK -92 471 449 2 826 1288 136 60 68 chr2 31596424 31596558 -150151529 - RLTR20B1 LTR ERVK -115 448 313 2 826 260 200 100 0 chr2 31596554 31596614 -150151473 - RLTR20B1 LTR ERVK -494 66 1 2 826 1505 182 21 28 chr2 31600018 31600300 -150147787 - RLTR12B LTR ERVK -7 521 242 2 826 1562 162 26 4 chr2 31600290 31600597 -150147490 - RLTR12B LTR ERVK -253 315 4 2 826 248 241 94 24 chr2 31603630 31603715 -150144372 - MT2B LTR ERVL -361 240 150 3 826 305 281 131 42 chr2 31603913 31604110 -150143977 - MLT2B1 LTR ERVL -60 507 237 3 826 229 295 209 76 chr2 31604299 31604445 -150143642 - MLT2B1 LTR ERVL -320 236 56 3 826 235 227 27 120 chr2 31607699 31607713 -150140374 + MT2B LTR ERVL 152 158 -443 3 826 4975 115 57 32 chr2 31607775 31608225 -150139862 - RMER17D LTR ERVK 0 889 444 3 826 4975 115 57 32 chr2 31608252 31608667 -150139420 - RMER17D LTR ERVK -446 443 3 3 826 337 301 26 105 chr2 31610440 31610481 -150137606 - MT2B2 LTR ERVL -431 153 125 3 826 2115 130 12 18 chr2 31611309 31611638 -150136449 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 3 826 1161 111 15 16 chr2 31627835 31628081 -150120006 + MTB_Mm LTR MaLR 1 318 -8 3 826 11567 125 52 15 chr2 31628085 31629977 -150118110 + MTB_Mm-int LTR MaLR 1 1963 0 3 826 2053 104 3 42 chr2 31629977 31630309 -150117778 + MTB_Mm LTR MaLR 1 319 -8 3 826 5908 114 67 97 chr2 31630315 31631447 -150116640 + MTB_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 3 826 3397 54 5 0 chr2 31631447 31631852 -150116235 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 3 826 1239 177 294 17 chr2 31633442 31633735 -150114352 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 3 826 262 178 0 0 chr2 31635029 31635074 -150113013 - ORR1C2 LTR MaLR -339 45 1 3 826 580 267 149 65 chr2 31636334 31636655 -150111432 - MTEa LTR MaLR -4 375 28 3 826 531 303 83 64 chr2 31645287 31645601 -150102486 - ORR1E LTR MaLR -24 335 16 3 826 1901 208 65 12 chr2 31653994 31654394 -150093693 - MTC LTR MaLR 0 421 1 3 826 239 299 79 113 chr2 31710991 31711134 -150036953 - MTEb LTR MaLR 0 379 240 4 826 2083 173 127 0 chr2 31716307 31716677 -150031410 + MTD LTR MaLR 3 419 0 4 826 386 338 88 35 chr2 31718479 31718706 -150029381 - RMER15 LTR ERVL 0 575 337 4 827 383 250 108 23 chr2 31722470 31722630 -150025457 - MTE2a LTR MaLR -20 399 238 4 827 451 312 101 68 chr2 31723101 31723295 -150024792 - MTE2a LTR MaLR -134 245 35 4 827 451 312 101 68 chr2 31723505 31723547 -150024540 - MTE2a LTR MaLR -345 34 1 4 827 2100 137 133 81 chr2 31725840 31726261 -150021826 - RLTR41 LTR ERV1 -3 443 1 5 827 555 239 295 53 chr2 31756478 31756759 -149991328 - MTEa LTR MaLR -27 352 4 5 827 1612 214 5 84 chr2 31758242 31758386 -149989701 + MTD LTR MaLR 1 129 -290 5 827 1612 214 5 84 chr2 31758533 31758781 -149989306 + MTD LTR MaLR 130 362 -57 5 827 916 213 5 5 chr2 31760620 31760804 -149987283 - MTEb LTR MaLR -4 375 192 5 827 1522 167 15 76 chr2 31764365 31764640 -149983447 + ORR1A3 LTR MaLR 1 269 -57 5 827 1522 167 15 76 chr2 31764888 31764955 -149983132 + ORR1A3 LTR MaLR 270 322 -4 5 827 429 282 26 0 chr2 31784589 31784706 -149963381 - ORR1E LTR MaLR -1 378 259 6 827 674 260 147 22 chr2 31785290 31785522 -149962565 - ORR1E LTR MaLR -98 261 1 6 827 415 167 11 22 chr2 31789963 31790055 -149958032 + RMER17C LTR ERVK 320 410 0 6 827 1636 162 80 55 chr2 31790193 31790558 -149957529 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 6 827 1622 166 47 0 chr2 31795211 31795512 -149952575 - MTC LTR MaLR 0 421 107 6 827 306 235 80 28 chr2 31795706 31795956 -149952131 - RMER17A2 LTR ERVK -425 481 219 6 827 616 107 165 0 chr2 31795883 31795986 -149952101 - MTC LTR MaLR -301 120 1 6 827 966 195 97 38 chr2 31798292 31798733 -149949354 - RLTR20C LTR ERVK 0 578 1 6 827 361 257 95 85 chr2 31799530 31799632 -149948455 - MT2B2 LTR ERVL -425 159 56 6 827 343 216 71 87 chr2 31800148 31800275 -149947812 + MT2B LTR ERVL 152 276 -325 6 827 2544 189 125 19 chr2 31804188 31804707 -149943380 + RMER15 LTR ERVL 2 575 0 6 827 526 248 72 0 chr2 31813216 31813369 -149934718 - MTEa LTR MaLR 0 379 216 7 827 398 276 31 23 chr2 31813380 31813510 -149934577 - MTEa LTR MaLR -209 170 40 7 827 2048 122 51 37 chr2 31819345 31819719 -149928368 - RLTR20A LTR ERVK 0 541 163 7 827 237 205 73 14 chr2 31833069 31833140 -149914947 - RLTR33 LTR ERVK -425 253 191 7 827 264 250 112 11 chr2 31833501 31833590 -149914497 - RMER10A LTR ERVL -27 415 318 7 827 1436 166 96 31 chr2 31838909 31839202 -149908885 - ORR1D1 LTR MaLR -60 314 3 7 828 450 202 17 96 chr2 31852207 31852322 -149895765 - MT2B LTR ERVL -344 257 152 7 828 847 251 75 141 chr2 31854900 31854945 -149893142 - MTD LTR MaLR -1 418 374 7 828 847 251 75 141 chr2 31855267 31855657 -149892430 - MTD LTR MaLR -46 373 8 7 828 3030 48 214 9 chr2 31863145 31863570 -149884517 - RLTR1B LTR ERV1 0 512 1 8 828 1657 219 57 16 chr2 31868085 31868470 -149879617 - MTD LTR MaLR -7 412 12 8 828 1995 12 4 4 chr2 31902229 31902484 -149845603 - MT-int LTR MaLR -101 997 743 8 828 1160 256 171 69 chr2 31914370 31914908 -149833179 + RMER20B LTR ERVK 11 603 -24 8 828 381 125 51 89 chr2 31914973 31914986 -149833101 - MT2B LTR ERVL -368 233 158 9 828 269 333 45 37 chr2 31916303 31916437 -149831650 + RMER15 LTR ERVL 425 559 -16 9 828 1581 124 180 50 chr2 31917633 31917956 -149830131 - RLTR8 LTR ERVK 0 365 1 9 828 617 318 6 0 chr2 31917964 31918134 -149829953 + MTE2b LTR MaLR 4 174 -205 9 828 2000 161 262 7 chr2 31945326 31945784 -149802303 + RMER15 LTR ERVL 1 575 0 9 828 481 262 80 34 chr2 31947976 31948163 -149799924 + RLTR42-int LTR ERVK 1153 1352 -4170 9 828 481 262 80 34 chr2 31948284 31948333 -149799754 + RLTR42-int LTR ERVK 1353 1400 -4122 9 828 1193 221 148 0 chr2 31949040 31949357 -149798730 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 7 9 828 2279 88 22 0 chr2 31954263 31954583 -149793504 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 9 828 1816 170 67 8 chr2 31956188 31956544 -149791543 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 2 9 828 258 373 18 9 chr2 31970845 31970956 -149777131 + MLT1D LTR MaLR 17 128 -237 1 828 367 299 82 0 chr2 31971303 31971450 -149776637 + MLT1D LTR MaLR 345 503 -2 1 828 3173 40 25 0 chr2 31972625 31973026 -149775061 + IAPLTR2a LTR ERVK 1 411 0 1 828 502 108 17 136 chr2 31973027 31973145 -149774942 + IAPEz-int LTR ERVK 9 112 -6369 1 828 227 321 0 0 chr2 31973145 31973201 -149774886 + RLTR27 LTR ERVK 220 275 -34 1 828 3446 72 4 18 chr2 31973201 31973941 -149774146 + IAPEz-int LTR ERVK 67 662 -5819 1 828 2696 56 0 3 chr2 31973941 31974284 -149773803 + IAPEz-int LTR ERVK 1359 1700 -4781 1 828 6381 50 12 7 chr2 31974277 31975102 -149772985 + IAPEz-int LTR ERVK 5651 6479 -2 1 828 3125 28 46 0 chr2 31975104 31975497 -149772590 + IAPLTR2a LTR ERVK 1 411 0 1 828 2926 136 30 38 chr2 31977627 31978160 -149769927 - RLTR24 LTR ERV1 0 529 1 1 828 856 239 39 59 chr2 31978372 31978626 -149769461 - RLTR19-int LTR ERVK -1761 4376 4128 1 829 292 301 0 103 chr2 31982721 31982847 -149765240 + MT2B LTR ERVL 152 264 -337 1 829 319 261 87 35 chr2 31987387 31987502 -149760585 + MLT1C LTR MaLR 9 129 -338 1 829 239 225 55 133 chr2 31991214 31991280 -149756807 + MT2B2 LTR ERVL 199 313 -271 1 829 442 294 7 14 chr2 31996128 31996273 -149751814 - LTR31 LTR ERV1 -36 583 440 1 829 1514 133 26 72 chr2 32003485 32003792 -149744295 - RMER4A LTR ERVK 0 466 174 1 829 585 252 286 0 chr2 32022104 32022310 -149725777 - MTEa LTR MaLR -76 303 39 7 829 240 224 207 41 chr2 32028785 32028906 -149719181 - ORR1D2 LTR MaLR -153 206 66 1 829 281 263 12 50 chr2 32029033 32029113 -149718974 - ORR1D2 LTR MaLR -293 77 1 1 829 1236 147 421 124 chr2 32031849 32032006 -149716081 - RMER4B LTR ERVK 0 585 430 1 829 1236 147 421 124 chr2 32032145 32032438 -149715649 - RMER4B LTR ERVK -156 429 1 1 829 258 326 138 34 chr2 32033253 32033637 -149714450 - MLT1D LTR MaLR 0 505 82 1 829 478 251 237 16 chr2 32034348 32034542 -149713545 - RMER4B LTR ERVK -69 516 280 1 829 475 209 75 0 chr2 32034586 32034720 -149713367 - RMER4B LTR ERVK -425 160 17 1 829 1330 225 106 22 chr2 32044690 32045058 -149703029 - MTD LTR MaLR 0 419 21 1 829 845 256 116 38 chr2 32045524 32045873 -149702214 - MTE2a LTR MaLR 0 379 35 1 829 293 159 14 68 chr2 32055553 32055627 -149692460 - MT2B LTR ERVL -337 264 195 1 829 302 298 20 121 chr2 32066460 32066609 -149681478 - MT2B LTR ERVL -316 285 152 1 829 1188 211 201 121 chr2 32093165 32093721 -149654366 - MT2B LTR ERVL 0 601 1 2 829 285 323 64 81 chr2 32103801 32103973 -149644114 - MTD LTR MaLR -238 181 13 2 829 768 255 254 15 chr2 32104540 32104878 -149643209 - MTD LTR MaLR 0 419 1 2 829 631 108 20 0 chr2 32105056 32105171 -149642916 - RMER16 LTR ERVK -372 161 1 2 830 432 254 72 24 chr2 32117166 32117291 -149630796 - MTEb LTR MaLR -178 201 71 2 830 1713 153 19 22 chr2 32117300 32117339 -149630748 - ORR1A3 LTR MaLR -8 318 285 2 830 1713 153 19 22 chr2 32117508 32117782 -149630305 - ORR1A3 LTR MaLR -42 284 6 2 830 270 310 90 0 chr2 32117752 32117852 -149630235 - MTEb LTR MaLR -270 109 1 2 830 3026 45 39 16 chr2 32121622 32122009 -149626078 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 830 701 195 26 9 chr2 32122752 32122924 -149625163 + ORR1D1 LTR MaLR 1 165 -202 2 830 2279 203 71 15 chr2 32124382 32124861 -149623226 + RLTR19C LTR ERVK 1 506 0 2 830 275 259 106 71 chr2 32124861 32125002 -149623085 + RLTR19-int LTR ERVK 1 146 -5991 2 830 277 355 48 32 chr2 32125826 32126015 -149622072 + MuLV-int LTR ERV1 1127 1318 -6283 2 830 406 200 0 147 chr2 32126605 32126734 -149621353 - MT2B LTR ERVL -337 264 155 2 830 326 284 23 0 chr2 32127192 32127280 -149620807 + MuLV-int LTR ERV1 2461 2550 -2441 2 830 2187 344 62 57 chr2 32127918 32129677 -149618410 + MuLV-int LTR ERV1 2653 4423 -3183 2 830 3239 49 8 161 chr2 32129677 32130192 -149617895 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 2 830 2187 344 62 57 chr2 32130192 32130234 -149617853 + MuLV-int LTR ERV1 4424 4463 -3143 2 830 285 279 0 204 chr2 32130584 32130643 -149617444 + MuLV-int LTR ERV1 4727 4783 -2669 2 830 285 279 0 204 chr2 32130838 32130862 -149617225 + MuLV-int LTR ERV1 4784 4787 -2665 2 830 285 279 0 204 chr2 32131035 32131180 -149616907 + MuLV-int LTR ERV1 4788 4909 -2543 2 830 440 103 0 0 chr2 32131190 32131258 -149616829 - RMER16 LTR ERVK 0 533 466 2 830 346 264 13 10 chr2 32133502 32133601 -149614486 + MuLV-int LTR ERV1 7091 7240 -366 2 830 540 290 57 19 chr2 32133601 32133829 -149614258 + RLTR19C LTR ERVK 334 715 0 2 830 361 297 67 8 chr2 32137388 32137507 -149610580 + MLT1J LTR MaLR 102 227 -285 3 830 2361 160 85 44 chr2 32142230 32142734 -149605353 + RLTR24 LTR ERV1 5 529 0 3 830 405 211 124 66 chr2 32182125 32182144 -149565943 + MT2B LTR ERVL 175 318 -283 3 830 232 319 19 76 chr2 32194479 32194584 -149553503 - MT2B LTR ERVL -360 241 143 4 830 1548 234 63 25 chr2 32212933 32213297 -149534790 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 4 830 343 282 144 22 chr2 32238268 32238449 -149509638 + MLT1D LTR MaLR 300 502 -3 5 831 3604 33 28 21 chr2 32249387 32249820 -149498267 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 5 831 2325 149 82 3 chr2 32253622 32254012 -149494075 - MTC LTR MaLR 0 421 1 5 831 294 289 9 93 chr2 32254540 32254647 -149493440 + MT2B LTR ERVL 154 251 -350 5 831 238 311 76 19 chr2 32259221 32259326 -149488761 + RMER20B LTR ERVK 124 234 -393 5 831 1714 122 7 74 chr2 32259550 32259860 -149488227 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 39 5 831 2645 99 55 45 chr2 32260945 32261348 -149486739 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 5 831 230 319 143 25 chr2 32262721 32262840 -149485247 + MLT1D LTR MaLR 40 172 -333 5 831 330 318 208 0 chr2 32263054 32263246 -149484841 + MLT1D LTR MaLR 272 503 -2 5 831 236 274 126 17 chr2 32266201 32266320 -149481767 - MLT1C LTR MaLR -335 132 1 5 831 269 312 57 86 chr2 32280403 32280508 -149467579 + MTEa LTR MaLR 22 123 -256 5 831 236 197 129 41 chr2 32280553 32280640 -149467447 + MTEa LTR MaLR 236 335 -44 5 831 843 189 120 58 chr2 32288507 32288732 -149459355 - MTD LTR MaLR -180 239 1 6 831 797 229 163 22 chr2 32298769 32299071 -149449016 + MTD LTR MaLR 29 419 0 6 831 971 210 273 64 chr2 32299501 32299736 -149448351 + RMER4B LTR ERVK 1 264 -321 6 831 971 210 273 64 chr2 32299775 32300023 -149448064 + RMER4B LTR ERVK 265 585 0 6 831 299 319 27 91 chr2 32313655 32313745 -149434342 + RLTR19-int LTR ERVK 1105 1183 -4339 6 831 299 319 27 91 chr2 32313892 32313987 -149434100 + RLTR19-int LTR ERVK 1184 1278 -4244 6 831 1427 244 56 51 chr2 32313987 32314397 -149433690 + MTC-int LTR MaLR 793 1204 -54 6 831 372 156 89 188 chr2 32314744 32314880 -149433207 + RLTR19-int LTR ERVK 1870 2002 -3520 6 831 372 156 89 188 chr2 32315027 32315103 -149432984 + RLTR19-int LTR ERVK 2003 2061 -3461 6 831 483 294 38 5 chr2 32315398 32315583 -149432504 + RLTR19-int LTR ERVK 2337 2527 -3610 6 831 2223 138 51 41 chr2 32315589 32315982 -149432105 - MTB_Mm LTR MaLR -8 399 3 6 831 259 173 0 37 chr2 32315986 32316040 -149432047 + MYSERV6-int LTR ERVK 7269 7320 -1639 6 831 2046 142 12 103 chr2 32316290 32316706 -149431381 - ORR1B1 LTR MaLR -16 378 1 6 831 325 250 150 20 chr2 32316716 32316863 -149431224 + RLTR19-int LTR ERVK 2654 2819 -3318 6 831 250 185 11 69 chr2 32317021 32317108 -149430979 + RLTR19-int LTR ERVK 2098 2179 -1059 6 831 2059 202 26 96 chr2 32317192 32317822 -149430265 + RLTR19-int LTR ERVK 3413 3966 -2171 6 831 1122 243 42 93 chr2 32318215 32318569 -149429518 + RLTR19-int LTR ERVK 4034 4369 -1768 6 831 3403 149 148 62 chr2 32320529 32321275 -149426812 + RMER19B LTR ERVK 89 898 -4 6 831 262 329 0 0 chr2 32323802 32323872 -149424215 - MER76 LTR ERVL -442 249 180 7 831 361 303 24 39 chr2 32323954 32324081 -149424006 - MER76 LTR ERVL -566 125 1 7 831 232 291 0 0 chr2 32324277 32324332 -149423755 - MLT1H1 LTR MaLR -11 544 490 7 831 2688 118 38 46 chr2 32328879 32329358 -149418729 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 7 831 5482 40 1 14 chr2 32329358 32330021 -149418066 + IAPEz-int LTR ERVK 8 662 -5819 7 831 439 98 0 32 chr2 32330021 32330084 -149418003 + IAPEz-int LTR ERVK 1359 1419 -5062 7 831 1860 111 4 4 chr2 32330073 32330335 -149417752 + IAPEz-int LTR ERVK 2236 2497 -5183 7 831 934 88 24 0 chr2 32330330 32330455 -149417632 + IAPEz-int LTR ERVK 4783 4910 -2770 7 831 474 66 0 0 chr2 32330455 32330516 -149417571 + IAPEz-int LTR ERVK 3525 3585 -2896 7 831 20937 26 6 0 chr2 32330508 32332859 -149415228 + IAPEz-int LTR ERVK 4117 6481 0 7 831 2721 116 38 46 chr2 32332859 32333338 -149414749 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 7 831 289 284 220 17 chr2 32334479 32334597 -149413490 + LTR31 LTR ERV1 144 285 -334 7 831 1100 99 0 0 chr2 32334598 32334750 -149413337 - MTB LTR MaLR 0 400 249 7 831 3621 182 123 2 chr2 32334740 32335555 -149412532 - ORR1A2-int LTR MaLR -1050 913 1 7 831 2345 82 18 27 chr2 32335555 32335883 -149412204 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 3 7 831 690 270 189 50 chr2 32338355 32338678 -149409409 - MTEa LTR MaLR -6 373 6 7 831 3831 46 30 2 chr2 32345384 32345846 -149402241 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 1 7 831 2281 115 20 6 chr2 32346341 32346682 -149401405 + ORR1B1 LTR MaLR 41 386 -8 7 831 261 227 0 0 chr2 32347217 32347261 -149400826 - ORR1E LTR MaLR 0 359 316 7 831 276 264 81 110 chr2 32348577 32348713 -149399374 + RLTR25A LTR ERVK 538 669 -434 7 831 261 229 0 244 chr2 32352605 32352625 -149395462 + MT2B2 LTR ERVL 255 257 -327 8 831 2961 9 0 0 chr2 32353636 32353958 -149394129 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 322 0 8 831 3196 176 115 31 chr2 32354030 32354710 -149393377 - RMER19A LTR ERVK 0 737 1 8 831 316 291 39 88 chr2 32356446 32356458 -149391629 - MT2B2 LTR ERVL -241 343 249 8 831 225 303 36 150 chr2 32356498 32356665 -149391422 - RLTR25B LTR ERVK -490 538 391 8 831 256 265 0 56 chr2 32360947 32361091 -149386996 + ORR1B1-int LTR MaLR 619 754 -755 8 831 232 315 0 0 chr2 32361535 32361589 -149386498 + MLT1H2 LTR MaLR 97 150 -339 8 831 680 313 89 30 chr2 32366744 32366885 -149381202 + MTEb LTR MaLR 24 166 -213 8 831 680 313 89 30 chr2 32368198 32368392 -149379695 + MTEb LTR MaLR 167 379 0 8 831 518 171 29 121 chr2 32369229 32369248 -149378839 + MT2B LTR ERVL 152 157 -444 8 831 1488 98 101 76 chr2 32371873 32372149 -149375938 + ORR1A3 LTR MaLR 1 283 -43 8 832 2283 130 12 3 chr2 32376852 32377192 -149370895 + ORR1A1 LTR MaLR 1 343 -3 9 832 1638 168 124 61 chr2 32385754 32385796 -149362291 - MTD LTR MaLR 0 419 376 9 832 1638 168 124 61 chr2 32385971 32386322 -149361765 - MTD LTR MaLR -44 375 1 9 832 1391 69 0 0 chr2 32388208 32388382 -149359705 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 302 9 832 4445 157 98 5 chr2 32399546 32400366 -149347721 + RMER19B LTR ERVK 1 896 -6 9 832 2256 113 25 12 chr2 32400714 32401036 -149347051 + ORR1A3 LTR MaLR 1 326 0 9 832 346 254 47 71 chr2 32417480 32417607 -149330480 + MT2B LTR ERVL 155 278 -323 9 832 3265 63 10 0 chr2 32417880 32418276 -149329811 - MTB LTR MaLR 0 400 1 1 832 2406 113 3 3 chr2 32418513 32418840 -149329247 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 1 832 1118 234 63 30 chr2 32441155 32441520 -149306567 + MTD LTR MaLR 29 405 -14 1 832 1248 192 82 8 chr2 32454580 32454922 -149293165 - RMER5 LTR ERV1 -19 515 93 1 832 377 283 0 98 chr2 32457517 32457538 -149290549 + MT2B LTR ERVL 145 152 -449 1 832 436 188 116 33 chr2 32459287 32459408 -149288679 + RLTR18B LTR ERVK 375 505 -7 1 832 1071 166 39 59 chr2 32460100 32460345 -149287742 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 141 1 832 573 194 59 7 chr2 32466533 32466668 -149281419 - LTR41 LTR ERVL -613 155 14 1 832 236 302 35 118 chr2 32492606 32492666 -149255421 + MT2B2 LTR ERVL 109 260 -321 1 832 281 312 0 0 chr2 32498602 32498695 -149249392 - LTR33 LTR ERVL -8 507 415 1 833 961 197 202 56 chr2 32527983 32528305 -149219782 - ORR1D2 LTR MaLR -1 369 1 8 833 276 225 23 81 chr2 32547017 32547104 -149200983 + MTC LTR MaLR 11 92 -329 1 833 1258 157 13 5 chr2 32547275 32547499 -149200588 + MTC LTR MaLR 196 421 0 1 833 1861 260 93 76 chr2 32555721 32556663 -149191424 + RMER17B LTR ERVK 2 881 -27 1 833 226 306 27 27 chr2 32561906 32561980 -149186107 + MLT1C LTR MaLR 60 133 -334 1 833 238 222 82 14 chr2 32564283 32564356 -149183731 + ORR1E LTR MaLR 26 103 -256 1 833 225 338 0 24 chr2 32567563 32567645 -149180442 + LTR33C LTR ERVL 360 439 -190 1 833 403 223 0 82 chr2 32569366 32569379 -149178708 + MT2B LTR ERVL 153 155 -446 1 833 4197 151 83 74 chr2 32571623 32571648 -149176439 - RMER19B LTR ERVK 0 902 885 1 833 4197 151 83 74 chr2 32571832 32572700 -149175387 - RMER19B LTR ERVK -18 884 1 1 833 1647 163 34 130 chr2 32572786 32572947 -149175140 + ORR1C2 LTR MaLR 16 137 -247 1 833 1647 163 34 130 chr2 32573095 32573341 -149174746 + ORR1C2 LTR MaLR 138 384 0 1 833 332 147 160 0 chr2 32575002 32575077 -149173010 + ORR1D2 LTR MaLR 280 366 -4 2 833 1693 149 32 19 chr2 32581187 32581501 -149166586 - MTC LTR MaLR 0 421 104 2 833 464 242 23 61 chr2 32581843 32581926 -149166161 - MTC LTR MaLR -327 94 17 2 833 257 291 63 72 chr2 32583702 32583813 -149164274 - MT2B LTR ERVL -344 257 148 2 833 3943 188 54 81 chr2 32619267 32620251 -149127836 + RMER17B LTR ERVK 2 958 0 3 834 254 241 100 12 chr2 32642357 32642437 -149105650 + RMER15 LTR ERVL 419 505 -70 3 834 241 276 35 95 chr2 32643190 32643306 -149104781 - MT2B2 LTR ERVL -321 263 155 3 834 1860 123 116 3 chr2 32655144 32655455 -149092632 + ORR1B1 LTR MaLR 47 392 -2 3 834 1744 147 219 6 chr2 32655580 32655923 -149092164 + MTC LTR MaLR 5 420 -1 3 834 349 248 98 16 chr2 32661936 32662059 -149086028 + MLT1F1 LTR MaLR 180 312 -257 3 834 1733 201 76 37 chr2 32674391 32674774 -149073313 - MTD LTR MaLR -8 411 14 4 834 279 252 30 159 chr2 32690647 32690779 -149057308 - MT2B LTR ERVL -346 255 141 4 834 2070 138 139 10 chr2 32692076 32692486 -149055601 - RMER4A LTR ERVK 0 466 4 4 834 1707 151 242 3 chr2 32699572 32699911 -149048176 + MTC LTR MaLR 1 420 -1 5 834 1315 252 100 18 chr2 32705656 32706016 -149042071 + MTE2a LTR MaLR 27 379 0 5 834 247 291 0 131 chr2 32707387 32707486 -149040601 - MT2B2 LTR ERVL -343 241 156 5 834 239 242 38 104 chr2 32708832 32708938 -149039149 - RLTR25B LTR ERVK -530 498 400 5 834 505 183 28 37 chr2 32709685 32709793 -149038294 + RMER19B LTR ERVK 1 107 -795 5 834 435 227 82 10 chr2 32710373 32710439 -149037648 + RMER15 LTR ERVL 468 532 -43 5 834 435 227 82 10 chr2 32710476 32710507 -149037580 + RMER15 LTR ERVL 533 570 -5 5 834 238 299 53 113 chr2 32714562 32714591 -149033496 - MT2B LTR ERVL -447 154 135 5 834 295 289 70 51 chr2 32715050 32715207 -149032880 + RMER15 LTR ERVL 409 568 -7 5 834 704 215 233 35 chr2 32716202 32716564 -149031523 - RLTR11B LTR ERVK -52 389 4 5 834 1421 155 161 13 chr2 32726518 32726856 -149021231 + RMER10A LTR ERVL 9 442 0 6 835 1011 249 88 11 chr2 32768576 32768860 -148979227 - MTEa LTR MaLR -66 313 8 7 835 260 264 30 60 chr2 32771365 32771485 -148976602 - MLT1C LTR MaLR -41 426 240 7 835 3229 53 8 5 chr2 32808435 32808830 -148939257 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 8 835 308 308 19 0 chr2 32825613 32825717 -148922370 + MLT2B4 LTR ERVL 356 461 -95 8 835 1257 184 156 40 chr2 32833321 32833649 -148914438 + ORR1D1 LTR MaLR 9 374 0 8 835 2383 73 22 3 chr2 32841011 32841328 -148906759 + ORR1A4 LTR MaLR 5 327 -2 8 835 2951 174 52 0 chr2 32843147 32843779 -148904308 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 1587 2251 -75 8 835 2463 174 45 12 chr2 32843834 32844323 -148903764 + RLTR16 LTR ERVK 1 505 0 8 835 1231 199 17 23 chr2 32844622 32844921 -148903166 + RMER17C LTR ERVK 1 297 -113 8 835 4688 100 47 55 chr2 32853707 32854079 -148894008 + RLTR22_Mur LTR ERVK 17 362 -1486 9 835 4688 100 47 55 chr2 32854224 32854646 -148893441 + RLTR22_Mur LTR ERVK 363 804 -1044 9 835 1681 131 0 4 chr2 32854844 32855097 -148892990 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1591 1842 -6 9 835 1274 207 168 131 chr2 32855116 32855174 -148892913 + MT2A LTR ERVL 3 46 -487 9 835 1274 207 168 131 chr2 32855348 32855748 -148892339 + MT2A LTR ERVL 47 465 -68 9 835 1274 207 168 131 chr2 32855796 32855848 -148892239 + MT2A LTR ERVL 466 533 0 9 835 532 249 23 27 chr2 32860882 32861017 -148887070 + ORR1E LTR MaLR 1 136 -234 9 835 319 235 0 68 chr2 32861017 32861090 -148886997 + ORR1E LTR MaLR 271 338 -41 9 835 252 175 16 66 chr2 32861216 32861277 -148886810 + ORR1D1 LTR MaLR 1 58 -320 9 835 1188 235 115 10 chr2 32861291 32861487 -148886600 + ORR1D1 LTR MaLR 28 228 -146 9 835 1188 235 115 10 chr2 32861510 32861627 -148886460 + ORR1D1 LTR MaLR 229 374 0 9 835 247 264 0 152 chr2 32863400 32863525 -148884562 - MT2B LTR ERVL -351 250 145 9 835 670 314 114 43 chr2 32869805 32869986 -148878101 + MTE2a LTR MaLR 3 179 -200 9 835 670 314 114 43 chr2 32870015 32870185 -148877902 + MTE2a LTR MaLR 180 378 -1 9 835 1628 201 107 3 chr2 32871606 32871960 -148876127 + MTD LTR MaLR 14 404 -15 9 835 269 296 39 70 chr2 32874408 32874564 -148873523 + ORR1D2 LTR MaLR 89 239 -131 9 835 236 344 81 25 chr2 32877213 32877410 -148870677 + LTR88a LTR Gypsy 190 397 -419 9 835 411 239 110 24 chr2 32885756 32885925 -148862162 - MTD LTR MaLR -8 413 249 9 835 239 224 0 33 chr2 32886262 32886322 -148861765 + MLT1A1 LTR MaLR 349 406 -2 9 835 2155 106 21 18 chr2 32893887 32894215 -148853872 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 1 835 2145 124 71 9 chr2 32895279 32895631 -148852456 + MTC LTR MaLR 1 372 -49 1 835 1803 202 58 35 chr2 32895780 32895827 -148852260 + MTC LTR MaLR 370 409 -10 1 836 359 336 101 64 chr2 32902434 32902730 -148845357 + ORR1E LTR MaLR 1 307 -52 1 836 242 222 51 77 chr2 32904122 32904200 -148843887 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1365 1440 -408 1 836 866 281 130 75 chr2 32907778 32908256 -148839831 + MLT1L LTR MaLR 101 604 -6 1 836 1254 261 175 30 chr2 32910238 32910700 -148837387 + MT2A LTR ERVL 3 531 -2 1 836 441 271 43 79 chr2 32913606 32913658 -148834429 - MT2B LTR ERVL -450 151 106 1 836 588 264 156 22 chr2 32916343 32916635 -148831452 + ORR1D2 LTR MaLR 18 369 -1 1 836 250 293 229 17 chr2 32921419 32921537 -148826550 + MER77 LTR ERVL 127 269 -338 1 836 245 265 211 33 chr2 32921606 32921758 -148826329 + MER77 LTR ERVL 406 584 -23 1 836 225 329 41 41 chr2 32936653 32936726 -148811361 + MLT1M LTR MaLR 58 130 -542 1 836 384 304 114 31 chr2 32943881 32944057 -148804030 + MLT1J2 LTR MaLR 4 182 -229 1 836 393 331 69 19 chr2 32944202 32944362 -148803725 + MLT1J2-int LTR MaLR 18 185 -1202 1 836 926 217 69 65 chr2 32944362 32944623 -148803464 + MTD LTR MaLR 158 419 0 1 836 1241 258 74 15 chr2 32949285 32949623 -148798464 + MTD LTR MaLR 1 358 -61 1 836 7067 37 29 1 chr2 32949681 32950513 -148797574 + RLTR13A LTR ERVK 1 855 0 1 836 700 315 87 78 chr2 32952612 32952828 -148795259 - MER34A LTR ERV1 0 571 370 1 836 700 315 87 78 chr2 32952975 32953299 -148794788 - MER34A LTR ERV1 -202 369 27 1 836 450 355 89 48 chr2 32957541 32957878 -148790209 + MLT1K LTR MaLR 218 568 -27 1 836 439 195 23 113 chr2 32961123 32961256 -148786831 + MLT1A LTR MaLR 51 171 -203 1 836 2635 125 6 1 chr2 32961359 32961747 -148786340 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 8 1 836 6925 186 58 12 chr2 32961749 32963191 -148784896 - ORR1B1-int LTR MaLR -1 1508 1 1 836 2141 159 61 54 chr2 32963191 32963250 -148784837 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 350 1 836 2141 159 61 54 chr2 32963420 32963750 -148784337 - ORR1B1 LTR MaLR -45 349 2 1 836 317 282 0 13 chr2 32964604 32964683 -148783404 + RMER5 LTR ERV1 431 508 -26 1 836 3285 62 2 12 chr2 32964897 32965308 -148782779 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 1 836 1502 180 108 3 chr2 32967048 32967344 -148780743 - MTC LTR MaLR -3 418 92 1 836 3093 218 143 102 chr2 32970066 32970095 -148777992 - MTD-int LTR MaLR -59 1199 1168 1 836 3093 218 143 102 chr2 32970246 32971367 -148776720 - MTD-int LTR MaLR -91 1167 1 1 836 1497 213 158 10 chr2 32971369 32971732 -148776355 - MTD LTR MaLR -13 406 1 1 836 4143 100 10 12 chr2 32973219 32973407 -148774680 + MT2B2 LTR ERVL 1 189 -395 1 836 3140 81 0 2 chr2 32973407 32973804 -148774283 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 836 4143 100 10 12 chr2 32973804 32974200 -148773887 + MT2B2 LTR ERVL 190 584 0 1 836 597 304 99 66 chr2 32978394 32978697 -148769390 + MLT1A0 LTR MaLR 8 320 -45 1 836 1539 198 125 11 chr2 32980301 32980654 -148767433 + MTD LTR MaLR 27 419 0 1 836 514 210 209 6 chr2 32987764 32987941 -148760146 - MTD LTR MaLR -2 417 205 1 836 704 279 14 34 chr2 32988120 32988328 -148759759 - MTD LTR MaLR -195 224 21 1 836 1505 191 50 6 chr2 33000551 33000858 -148747229 + ORR1B1 LTR MaLR 76 393 -1 1 836 344 305 169 49 chr2 33019803 33020138 -148727949 + MLT1G3 LTR MaLR 145 519 -30 1 836 2594 111 33 5 chr2 33025428 33025827 -148722260 + MTC LTR MaLR 12 421 0 1 836 290 290 113 67 chr2 33029395 33029652 -148718435 + MLT1J2 LTR MaLR 1 319 -129 1 837 237 213 52 90 chr2 33035919 33036053 -148712034 + MLT1K LTR MaLR 22 150 -445 2 837 257 219 16 39 chr2 33037698 33037826 -148710261 - RMER17D2 LTR ERVK -432 377 253 3 837 2422 85 25 3 chr2 33053289 33053609 -148694478 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 5 837 918 253 40 8 chr2 33056945 33057192 -148690895 + MTE2a LTR MaLR 1 255 -124 6 837 889 239 49 30 chr2 33057587 33057854 -148690233 + MTEa LTR MaLR 7 278 -101 6 837 893 181 52 26 chr2 33057860 33058053 -148690034 - MTC LTR MaLR -1 420 223 6 837 779 227 70 192 chr2 33058072 33058416 -148689671 - MT2A LTR ERVL -229 304 3 6 837 311 274 60 0 chr2 33058419 33058503 -148689584 + MTEa LTR MaLR 288 376 -3 6 837 807 226 15 0 chr2 33064022 33064204 -148683883 - MTD LTR MaLR -54 367 171 7 837 610 329 162 63 chr2 33069384 33069910 -148678177 - MLT1G3 LTR MaLR -3 592 15 8 837 421 304 92 40 chr2 33108967 33109274 -148638813 - MLT1F2 LTR MaLR -49 520 117 1 837 375 232 32 89 chr2 33114046 33114169 -148633918 + MT2B LTR ERVL 163 278 -323 1 837 318 190 0 33 chr2 33114510 33114570 -148633517 + RLTR25A LTR ERVK 515 572 -531 1 837 2155 172 153 14 chr2 33117884 33117974 -148630113 - RLTR16 LTR ERVK 0 505 416 1 837 2155 172 153 14 chr2 33118035 33118387 -148629700 - RLTR16 LTR ERVK -90 415 1 1 837 253 225 70 0 chr2 33122032 33122103 -148625984 + LTR37A LTR ERV1 351 426 0 1 837 3822 141 30 30 chr2 33142600 33143290 -148604797 + RMER6C LTR ERVK 1 690 0 1 837 609 229 192 49 chr2 33147675 33147941 -148600146 + MTEb LTR MaLR 1 304 -75 1 837 233 327 50 50 chr2 33148220 33148339 -148599748 - RMER4B LTR ERVK -9 576 458 1 837 2123 92 17 7 chr2 33151873 33152190 -148595897 - ORR1A2 LTR MaLR 0 346 43 1 837 1930 167 14 63 chr2 33152266 33152312 -148595775 - ORR1A2 LTR MaLR -300 46 1 1 837 11321 120 61 19 chr2 33152314 33154196 -148593891 - ORR1A2-int LTR MaLR -2 1961 1 1 837 2236 104 9 0 chr2 33154200 33154516 -148593571 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 1 837 272 376 75 0 chr2 33155062 33155155 -148592932 + RMER4B LTR ERVK 458 557 -28 1 837 248 304 102 61 chr2 33159373 33159520 -148588567 - RMER17A2 LTR ERVK -32 874 722 1 838 1939 181 23 53 chr2 33162258 33162427 -148585660 + ORR1C2 LTR MaLR 1 175 -209 1 838 1939 181 23 53 chr2 33162485 33162711 -148585376 + ORR1C2 LTR MaLR 176 384 0 1 838 904 254 198 17 chr2 33165715 33166063 -148582024 + MTD LTR MaLR 9 419 0 2 838 283 232 78 44 chr2 33168868 33168958 -148579129 - MTC LTR MaLR -327 94 2 2 838 862 279 134 18 chr2 33169013 33169297 -148578790 + MTD LTR MaLR 103 419 0 2 838 3140 61 22 2 chr2 33170094 33170507 -148577580 + BGLII LTR ERVK 1 421 0 2 838 922 252 139 24 chr2 33174182 33174519 -148573568 + MTEa LTR MaLR 4 379 0 2 838 242 361 25 25 chr2 33176376 33176498 -148571589 - MLT1H LTR MaLR -298 251 130 2 838 2463 89 3 30 chr2 33186765 33187101 -148560986 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 2 838 2021 186 139 9 chr2 33187824 33188370 -148559717 + RLTR17 LTR ERVK 1 617 -75 2 838 1253 208 137 31 chr2 33188823 33189161 -148558926 - ORR1D1 LTR MaLR -4 417 1 2 838 2145 184 119 11 chr2 33189161 33189639 -148558448 - ORR1D1-int LTR MaLR 0 1370 841 2 838 1145 212 111 20 chr2 33189633 33189931 -148558156 - ORR1D1-int LTR MaLR -1007 363 39 2 838 1254 164 44 126 chr2 33189910 33190060 -148558027 + RLTR14 LTR ERV1 114 259 -123 2 838 1254 164 44 126 chr2 33190208 33190350 -148557737 + RLTR14 LTR ERV1 260 382 0 2 838 1194 160 309 34 chr2 33190381 33190672 -148557415 - ORR1D1 LTR MaLR -3 371 1 2 838 2906 55 0 3 chr2 33192219 33192566 -148555521 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 2 838 756 135 41 16 chr2 33200698 33200919 -148547168 + ORR1B2 LTR MaLR 1 366 -1 2 838 243 262 49 0 chr2 33213752 33213813 -148534274 + MLT1J LTR MaLR 266 329 -183 2 838 2071 172 23 41 chr2 33214145 33214538 -148533549 + ORR1B1 LTR MaLR 1 386 -8 2 838 232 200 0 100 chr2 33214771 33214821 -148533266 + MTEa LTR MaLR 20 64 -315 2 838 609 256 167 19 chr2 33214840 33215055 -148533032 + MTEa LTR MaLR 122 368 -11 2 838 239 257 63 0 chr2 33227423 33227495 -148520592 - MTE2b LTR MaLR -297 82 7 3 838 1159 243 68 6 chr2 33229596 33229948 -148518139 + MTEb LTR MaLR 4 377 -2 3 838 399 321 35 61 chr2 33231105 33231334 -148516753 + RLTR14 LTR ERV1 153 375 -7 3 838 228 327 0 82 chr2 33231742 33231852 -148516235 - LTR33B LTR ERVL -337 166 66 3 838 5793 92 66 9 chr2 33232363 33233217 -148514870 - RMER17A2 LTR ERVK -4 902 1 3 838 384 221 277 17 chr2 33233235 33233411 -148514676 + ORR1B2 LTR MaLR 1 260 -134 3 838 282 312 84 35 chr2 33233471 33233614 -148514473 + RLTR14 LTR ERV1 225 374 -8 3 838 302 242 165 0 chr2 33234407 33234498 -148513589 - LTR50 LTR ERVL -345 450 345 3 838 395 317 30 24 chr2 33235095 33235263 -148512824 - RMER15 LTR ERVL -60 515 347 3 838 404 225 8 126 chr2 33235966 33236093 -148511994 + MT2B LTR ERVL 153 264 -337 3 838 1879 136 60 13 chr2 33237167 33237481 -148510606 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 3 838 8390 141 112 118 chr2 33237485 33239387 -148508700 + ORR1A4-int LTR MaLR 1 1886 -77 3 838 8390 141 112 118 chr2 33239424 33239483 -148508604 + ORR1A4-int LTR MaLR 1887 1953 -10 3 838 3311 46 2 2 chr2 33239483 33239877 -148508210 + MTA_Mm LTR MaLR 1 394 -2 3 838 2029 113 34 28 chr2 33239893 33240220 -148507867 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 3 838 3443 33 2 0 chr2 33240513 33240908 -148507179 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 838 234 291 0 0 chr2 33241616 33241671 -148506416 - RMER15 LTR ERVL -117 458 404 3 838 408 295 196 57 chr2 33244021 33244179 -148503908 + MLT1H LTR MaLR 310 549 0 3 838 448 282 141 32 chr2 33244180 33244429 -148503658 - ERVL-E-int LTR ERVL -1758 3909 3634 3 838 1132 161 89 47 chr2 33244508 33244743 -148503344 - RLTR22_Mur LTR ERVK -12 1836 1592 3 838 599 167 18 148 chr2 33244846 33245015 -148503072 - RLTR22_Mur LTR ERVK -980 868 722 3 838 419 156 0 0 chr2 33245166 33245228 -148502859 - RLTR22_Mus LTR ERVK -1070 738 677 3 838 1807 117 44 0 chr2 33245228 33245501 -148502586 + ORR1A3 LTR MaLR 1 285 -41 3 838 880 162 25 70 chr2 33245502 33245701 -148502386 + RMER10B LTR ERVL 183 372 -26 3 838 405 75 0 0 chr2 33245685 33245738 -148502349 + ORR1A3 LTR MaLR 274 326 0 3 838 3817 141 13 36 chr2 33245738 33246428 -148501659 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1174 674 1 3 838 370 358 80 24 chr2 33246438 33246485 -148501602 - ERVL-E-int LTR ERVL -2217 3450 3440 3 838 1825 237 61 85 chr2 33246485 33247111 -148500976 + RMER19C LTR ERVK 1 611 0 3 838 370 354 79 20 chr2 33247111 33247300 -148500787 - ERVL-E-int LTR ERVL -2228 3439 3237 3 838 431 367 11 0 chr2 33248236 33248413 -148499674 - ERVL-E-int LTR ERVL -2578 3089 2911 3 838 2300 105 12 12 chr2 33248436 33248763 -148499324 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 3 838 413 311 60 7 chr2 33249442 33249591 -148498496 + RMER15 LTR ERVL 406 562 -13 3 838 1044 284 88 49 chr2 33249640 33250106 -148497981 + LTR75 LTR ERVL 1 484 -78 3 838 2200 113 107 33 chr2 33250542 33250813 -148497274 - MTC LTR MaLR -8 413 106 3 838 2200 113 107 33 chr2 33250956 33251050 -148497037 - MTC LTR MaLR -316 105 21 3 838 342 320 16 124 chr2 33251188 33251381 -148496706 + MER21B LTR ERV1 1 172 -691 3 838 306 339 54 18 chr2 33251736 33251847 -148496240 + MER21B LTR ERV1 521 635 -228 3 838 311 250 8 92 chr2 33255189 33255308 -148492779 - LTR33A LTR ERVL -11 509 401 3 838 351 204 0 111 chr2 33255965 33256064 -148492023 + MT2B LTR ERVL 162 249 -352 4 838 234 314 0 23 chr2 33256135 33256223 -148491864 - RLTR24 LTR ERV1 -439 90 5 4 838 266 171 211 0 chr2 33256260 33256336 -148491751 + MTEa LTR MaLR 1 92 -287 4 838 3441 25 10 0 chr2 33271367 33271759 -148476328 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 838 3563 20 2 0 chr2 33276552 33276947 -148471140 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 839 353 304 162 47 chr2 33305311 33305608 -148442479 - LTR33 LTR ERVL -88 427 97 5 839 370 206 146 30 chr2 33307812 33307951 -148440136 + MTD LTR MaLR 205 380 -39 5 839 748 270 159 26 chr2 33315388 33315744 -148432343 + MTD LTR MaLR 1 406 -15 5 839 773 195 19 13 chr2 33317733 33317889 -148430198 + RMER15 LTR ERVL 406 562 -13 5 839 1037 100 123 0 chr2 33325970 33326140 -148421947 - IAPEY3_LTR LTR ERVK -5 327 137 5 839 2399 56 6 53 chr2 33327356 33327694 -148420393 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 322 0 5 839 253 356 50 8 chr2 33327902 33328021 -148420066 - MLT1H LTR MaLR -381 168 45 5 839 502 326 5 113 chr2 33328691 33328912 -148419175 - MLT1H-int LTR MaLR -175 1234 1038 5 839 948 259 84 92 chr2 33328916 33329295 -148418792 - MTE2a LTR MaLR -3 376 1 5 839 253 367 161 21 chr2 33330679 33330871 -148417216 - MLT1N2 LTR MaLR -11 551 333 5 839 408 382 10 40 chr2 33331354 33331553 -148416534 + LTR33 LTR ERVL 319 511 -4 5 839 1453 248 49 98 chr2 33334178 33334711 -148413376 + RLTR11A2 LTR ERVK 21 527 0 6 839 722 295 116 22 chr2 33336689 33336709 -148411378 - ORR1D2 LTR MaLR -64 306 285 6 839 1939 162 64 17 chr2 33336709 33337066 -148411021 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 6 839 722 295 116 22 chr2 33337066 33337322 -148410765 - ORR1D2 LTR MaLR -86 284 4 6 839 1412 218 89 29 chr2 33339069 33339335 -148408752 + RLTR20B1 LTR ERVK 194 470 -93 6 839 1412 218 89 29 chr2 33339378 33339460 -148408627 + RLTR20B1 LTR ERVK 471 562 -1 6 839 1160 312 40 43 chr2 33339568 33339940 -148408147 - MTE2a LTR MaLR 0 379 9 6 839 279 211 0 19 chr2 33341042 33341095 -148406992 + RMER15 LTR ERVL 505 556 -19 6 839 1050 234 41 67 chr2 33341098 33341368 -148406719 - MTEa LTR MaLR -116 263 1 6 839 236 309 118 0 chr2 33346239 33346349 -148401738 - LTR16E1 LTR ERVL -17 521 399 6 839 757 284 42 38 chr2 33350145 33350584 -148397503 - MTD LTR MaLR -18 401 1 6 839 255 274 47 94 chr2 33350592 33350741 -148397346 + ORR1D2 LTR MaLR 242 421 0 6 839 1219 239 90 28 chr2 33351885 33352242 -148395845 - MTE2b LTR MaLR 0 379 1 6 839 4378 141 35 140 chr2 33352300 33353313 -148394774 + RMER17A2 LTR ERVK 1 906 0 6 839 830 234 202 25 chr2 33353781 33354141 -148393946 - MTD LTR MaLR 0 421 1 6 839 1226 130 11 0 chr2 33354515 33354700 -148393387 + RMER6A LTR ERVK 553 739 -17 6 839 418 170 102 41 chr2 33357809 33357907 -148390180 + MT2A LTR ERVL 3 106 -427 6 839 1339 182 227 19 chr2 33363722 33364035 -148384052 - ORR1B2 LTR MaLR 0 378 1 6 839 664 112 0 10 chr2 33364035 33364134 -148383953 - ORR1B2-int LTR MaLR 0 1509 1412 6 839 2916 242 73 68 chr2 33364345 33365523 -148382564 - ORR1B2-int LTR MaLR -192 1600 595 6 839 3059 203 16 18 chr2 33365655 33366271 -148381816 - ORR1B2-int LTR MaLR -724 646 14 6 839 1541 201 35 11 chr2 33366255 33366605 -148381482 - ORR1B2 LTR MaLR -28 366 1 6 839 653 200 0 0 chr2 33366609 33366724 -148381363 - ORR1B1 LTR MaLR -277 117 3 6 839 288 346 143 33 chr2 33367123 33367368 -148380719 - MLT1J LTR MaLR -18 494 223 7 839 1390 239 75 43 chr2 33367434 33367783 -148380304 + MTEa LTR MaLR 1 360 -19 7 839 247 105 26 0 chr2 33367985 33368023 -148380064 + MTEa LTR MaLR 324 362 -17 7 839 318 308 176 73 chr2 33368384 33368657 -148379430 + MLT1F2 LTR MaLR 98 398 -162 7 839 275 412 35 45 chr2 33373391 33373701 -148374386 - LTR16A LTR ERVL -118 333 27 7 839 1391 257 65 18 chr2 33374684 33375068 -148373019 + MTD LTR MaLR 2 403 -16 7 839 954 261 110 58 chr2 33375391 33375737 -148372350 + MTEb LTR MaLR 16 379 0 7 839 1232 278 45 134 chr2 33375737 33376085 -148372002 + MTEb-int LTR MaLR 1 287 -1293 7 839 1232 278 45 134 chr2 33376145 33376311 -148371776 + MTEb-int LTR MaLR 288 469 -1111 7 839 815 262 69 90 chr2 33376550 33376733 -148371354 + MTEb-int LTR MaLR 440 622 -958 7 839 3410 40 2 0 chr2 33376733 33377128 -148370959 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 7 839 9142 47 0 2 chr2 33377128 33378228 -148369859 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 7 839 3360 46 2 2 chr2 33378228 33378624 -148369463 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 7 839 815 262 69 90 chr2 33378624 33378815 -148369272 + MTEb-int LTR MaLR 623 806 -774 7 839 553 316 87 49 chr2 33379159 33379218 -148368869 - MTEa LTR MaLR -20 359 305 7 839 2928 44 6 0 chr2 33379218 33379562 -148368525 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 7 839 553 316 87 49 chr2 33379562 33379848 -148368239 - MTEa LTR MaLR -75 304 1 7 839 291 252 96 35 chr2 33382034 33382149 -148365938 + MER88 LTR ERVL 28 149 -315 7 839 438 300 104 16 chr2 33383346 33383529 -148364558 + MLT2E LTR ERVL 223 421 -208 7 839 947 315 96 47 chr2 33383755 33384061 -148364026 + ERVL-E-int LTR ERVL 419 723 -4944 7 839 947 315 96 47 chr2 33384552 33384798 -148363289 + ERVL-E-int LTR ERVL 724 998 -4669 7 839 617 217 204 11 chr2 33384798 33384989 -148363098 - MTD LTR MaLR 0 419 192 7 839 353 231 165 47 chr2 33385012 33385139 -148362948 - MTD LTR MaLR -277 142 1 7 839 267 317 39 97 chr2 33385207 33385413 -148362674 + ERVL-E-int LTR ERVL 1097 1290 -4377 7 839 249 308 54 11 chr2 33386015 33386107 -148361980 - RMER15 LTR ERVL -58 517 422 7 839 265 281 83 0 chr2 33386461 33386557 -148361530 + ERVL-E-int LTR ERVL 1406 1509 -4158 7 839 281 216 0 0 chr2 33386691 33386742 -148361345 + ERVL-E-int LTR ERVL 4391 4441 -1226 7 839 623 291 85 59 chr2 33386865 33387205 -148360882 + ERVL-E-int LTR ERVL 4649 4997 -670 7 839 348 89 0 0 chr2 33388154 33388199 -148359888 - ORR1A4 LTR MaLR -3 323 279 7 839 901 86 7 14 chr2 33388194 33388336 -148359751 - ORR1A4 LTR MaLR -185 141 1 7 839 792 275 108 52 chr2 33397196 33397484 -148350603 - MTE2a LTR MaLR -75 304 1 7 839 1002 289 40 50 chr2 33403176 33403599 -148344488 + MTD LTR MaLR 1 419 0 7 839 1289 235 57 75 chr2 33404403 33404723 -148343364 + MTD LTR MaLR 4 318 -101 7 839 1289 235 57 75 chr2 33404922 33405025 -148343062 + MTD LTR MaLR 319 419 0 7 839 331 241 10 94 chr2 33409293 33409305 -148338782 + MT2B LTR ERVL 232 242 -359 8 840 389 291 97 50 chr2 33453041 33453381 -148294706 - RMER17A LTR ERVK -114 637 282 8 840 740 180 217 35 chr2 33508738 33508968 -148239119 - MTEb LTR MaLR -7 372 101 2 840 2070 176 52 12 chr2 33525759 33526163 -148221924 + MTC LTR MaLR 1 420 -1 8 840 285 157 0 19 chr2 33526207 33526259 -148221828 - MTEa LTR MaLR -3 376 326 8 840 414 252 58 32 chr2 33526874 33527030 -148221057 + RMER15 LTR ERVL 347 506 -69 8 840 259 315 87 0 chr2 33528743 33528835 -148219252 + MTEa LTR MaLR 17 116 -263 9 840 414 323 43 97 chr2 33528833 33529090 -148218997 + MT2A LTR ERVL 125 367 -166 9 840 1428 124 83 0 chr2 33529354 33529596 -148218491 - ORR1C1 LTR MaLR -112 266 5 9 840 830 253 88 78 chr2 33529800 33529870 -148218217 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 310 9 840 830 253 88 78 chr2 33530003 33530215 -148217872 - ORR1D2 LTR MaLR -61 309 85 9 840 2799 103 32 2 chr2 33530657 33531066 -148217021 - MTC LTR MaLR 0 421 1 9 840 374 282 10 0 chr2 33531797 33531900 -148216187 + ERVL-B4-int LTR ERVL 1 104 -5610 1 840 1003 291 28 0 chr2 33532151 33532470 -148215617 + ERVL-int LTR ERVL 4873 5200 -557 1 840 392 195 73 0 chr2 33535846 33535928 -148212159 - MTE2b LTR MaLR -7 372 285 1 840 251 220 60 0 chr2 33536028 33536078 -148212009 - MTE2b LTR MaLR -326 53 1 1 840 1040 190 96 94 chr2 33542022 33542443 -148205644 - MT2A LTR ERVL -48 553 1 1 840 625 253 41 6 chr2 33542462 33542633 -148205454 - MTD LTR MaLR 0 419 243 1 840 509 216 19 10 chr2 33542624 33542727 -148205360 - MTD LTR MaLR -296 123 20 1 840 268 284 25 92 chr2 33549924 33550044 -148198043 - MT2B LTR ERVL -341 260 149 1 840 870 270 95 50 chr2 33551038 33551395 -148196692 + MT2B LTR ERVL 167 599 -2 1 840 2027 132 238 116 chr2 33552629 33553244 -148194843 - RMER6C LTR ERVK 0 690 1 1 841 232 292 7 178 chr2 33555464 33555610 -148192477 + MT2B2 LTR ERVL 144 264 -320 1 841 1292 149 118 57 chr2 33604935 33605249 -148142838 + ORR1D1 LTR MaLR 42 374 0 2 841 1421 196 21 179 chr2 33618926 33619412 -148128675 + MTD LTR MaLR 5 413 -8 2 841 2934 241 64 140 chr2 33619420 33620601 -148127486 + MTD-int LTR MaLR 5 1099 -159 2 841 2934 241 64 140 chr2 33620776 33620945 -148127142 + MTD-int LTR MaLR 1100 1258 0 2 841 1487 243 62 15 chr2 33620997 33621386 -148126701 + MTD LTR MaLR 13 419 0 2 841 362 324 78 43 chr2 33639333 33639565 -148108522 + ORR1E LTR MaLR 115 354 -5 2 841 416 289 39 44 chr2 33639938 33640119 -148107968 + MLT1I LTR MaLR 232 411 0 2 841 1131 246 79 7 chr2 33660178 33660481 -148087606 + MTEa LTR MaLR 2 326 -53 2 841 249 298 0 122 chr2 33662616 33662632 -148085455 + MT2B2 LTR ERVL 153 155 -429 2 841 1362 208 30 103 chr2 33674551 33674958 -148073129 + MTE2a LTR MaLR 3 379 0 3 841 943 210 190 10 chr2 33678612 33678946 -148069141 + MTD LTR MaLR 1 417 -2 3 842 1127 222 75 90 chr2 33687504 33687889 -148060198 - MTE2a LTR MaLR -19 360 2 3 842 2194 140 75 130 chr2 33688189 33688682 -148059405 + RMER4A LTR ERVK 1 466 0 3 842 1241 209 248 0 chr2 33691214 33691520 -148056567 + ORR1C2 LTR MaLR 2 383 -1 3 842 1212 214 100 22 chr2 33693648 33693959 -148054128 + ORR1D2 LTR MaLR 36 370 0 3 842 276 242 88 29 chr2 33699662 33699764 -148048323 + MLT1A0 LTR MaLR 253 360 -5 3 842 2706 129 22 12 chr2 33704840 33705257 -148042830 + MTC LTR MaLR 1 421 0 3 842 1768 166 135 176 chr2 33709748 33710304 -148037783 - MT2A LTR ERVL 0 533 1 3 842 968 292 11 15 chr2 33712391 33712671 -148035416 - ORR1D2 LTR MaLR -94 280 1 3 842 1092 246 140 58 chr2 33713397 33713776 -148034311 + MTD LTR MaLR 1 419 0 3 842 1851 238 47 0 chr2 33718001 33718388 -148029699 + MTD LTR MaLR 1 405 -14 3 842 1470 183 72 33 chr2 33720250 33720591 -148027496 + RLTR20A2 LTR ERVK 2 445 -106 3 842 436 143 312 16 chr2 33720649 33720717 -148027370 + RLTR20A2 LTR ERVK 446 549 -2 3 842 1933 191 63 18 chr2 33723759 33724158 -148023929 - MTD LTR MaLR -2 417 1 4 842 374 342 43 31 chr2 33724291 33724454 -148023633 + MER74B LTR ERVL 89 253 -369 4 842 1595 185 37 7 chr2 33724445 33724744 -148023343 - MTD LTR MaLR -9 410 103 4 842 611 218 7 15 chr2 33725213 33725348 -148022739 - MTD LTR MaLR -285 134 1 4 842 2402 119 104 26 chr2 33727590 33728057 -148020030 - RMER4B LTR ERVK -4 462 17 4 842 3091 64 23 3 chr2 33744446 33744838 -148003249 + MTB LTR MaLR 1 400 0 4 842 1303 181 48 93 chr2 33745510 33745820 -148002267 + RMER4B LTR ERVK 17 312 -273 4 842 4351 156 87 25 chr2 33746034 33746865 -148001222 - RMER19B LTR ERVK -17 885 1 4 842 361 175 180 14 chr2 33746865 33747004 -148001083 + RMER4B LTR ERVK 389 585 0 4 842 548 278 131 35 chr2 33750330 33750643 -147997444 + RLTR15 LTR ERVK 1 343 -16 4 842 6277 235 124 108 chr2 33751710 33752121 -147995966 + MYSERV-int LTR ERVK 3814 4227 -2323 4 842 6277 235 124 108 chr2 33752186 33754447 -147993640 + MYSERV-int LTR ERVK 4228 6529 -21 4 842 817 283 64 34 chr2 33754469 33754831 -147993256 + RLTR15 LTR ERVK 1 528 0 4 842 238 250 39 0 chr2 33755210 33755262 -147992825 - MLT1J1 LTR MaLR -321 123 70 4 842 1107 275 42 70 chr2 33756980 33757379 -147990708 - MTE2a LTR MaLR -16 403 19 4 842 304 147 171 13 chr2 33757357 33757433 -147990654 + RMER4B LTR ERVK 490 577 -8 4 842 233 304 76 29 chr2 33757632 33757737 -147990350 - MLT1A0 LTR MaLR -5 360 251 4 842 2550 135 14 39 chr2 33757881 33758296 -147989791 + MTB_Mm LTR MaLR 3 407 0 4 842 259 264 99 0 chr2 33758460 33758551 -147989536 + MLT1I LTR MaLR 312 411 0 4 842 319 318 74 17 chr2 33759081 33759346 -147988741 - MLT1G1 LTR MaLR -10 569 270 4 842 1532 248 50 29 chr2 33759432 33759855 -147988232 - MTD LTR MaLR -28 391 1 4 842 2243 175 199 54 chr2 33759933 33760690 -147987397 - RMER6C LTR ERVK 0 720 1 4 842 698 297 133 23 chr2 33762383 33762683 -147985404 + MLT1B LTR MaLR 58 390 0 4 842 260 167 176 29 chr2 33763040 33763108 -147984979 - ORR1E LTR MaLR -6 353 276 4 842 2516 124 51 15 chr2 33764660 33765053 -147983034 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 4 842 2354 86 13 0 chr2 33766496 33766811 -147981276 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 4 842 230 246 284 17 chr2 33766834 33766950 -147981137 + MLT1J1 LTR MaLR 18 164 -280 4 842 1734 132 19 116 chr2 33769060 33769421 -147978666 - ORR1A4 LTR MaLR -3 326 1 4 842 1345 254 44 86 chr2 33770137 33770349 -147977738 - RMER4A LTR ERVK -9 457 274 4 842 1345 254 44 86 chr2 33770394 33770637 -147977450 - RMER4A LTR ERVK -193 273 22 4 842 566 330 56 79 chr2 33772303 33772606 -147975481 - MLT1I LTR MaLR -2 409 114 4 842 1558 137 165 63 chr2 33777463 33777797 -147970290 + ORR1C1 LTR MaLR 11 378 0 5 842 698 207 33 89 chr2 33778484 33778754 -147969333 + RMER17C LTR ERVK 1 255 -155 5 842 1288 205 69 93 chr2 33778766 33779186 -147968901 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 5 842 3710 170 17 2 chr2 33783038 33783640 -147964447 + RMER19C LTR ERVK 1 611 0 5 842 2462 181 90 0 chr2 33784183 33784670 -147963417 - MT2A LTR ERVL -2 531 1 5 842 2051 117 10 3 chr2 33785425 33785733 -147962354 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 219 5 842 1118 105 5 99 chr2 33785984 33786196 -147961891 - RLTR11A LTR ERVK -2 526 335 5 842 2015 158 31 22 chr2 33786205 33786757 -147961330 - RLTR20D LTR ERVK -33 535 22 5 842 386 255 68 61 chr2 33787546 33787709 -147960378 - MLT1A LTR MaLR -25 349 186 5 842 417 238 197 0 chr2 33788354 33788476 -147959611 - MLT1A LTR MaLR -217 157 12 5 842 435 197 28 22 chr2 33789348 33789485 -147958602 + ORR1D2 LTR MaLR 1 139 -235 5 842 1135 205 145 18 chr2 33789995 33790296 -147957791 + ORR1D2 LTR MaLR 51 370 0 5 842 1200 238 37 27 chr2 33792107 33792401 -147955686 + MTD LTR MaLR 1 297 -122 5 842 247 255 18 12 chr2 33798138 33798305 -147949782 - RMER17A LTR ERVK -286 465 298 5 842 2138 108 33 60 chr2 33799725 33800060 -147948027 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 5 842 1016 237 84 92 chr2 33800431 33800812 -147947275 + MTE2a LTR MaLR 1 378 -1 5 842 949 256 46 194 chr2 33802633 33803065 -147945022 + MTEb LTR MaLR 12 379 0 5 842 348 139 54 27 chr2 33806128 33806202 -147941885 - ORR1C2 LTR MaLR -43 341 266 5 843 467 338 60 17 chr2 33820670 33820902 -147927185 - MLT1C LTR MaLR -124 343 102 6 843 808 251 29 0 chr2 33820908 33821083 -147927004 - MTEa LTR MaLR -193 186 7 6 843 778 233 86 14 chr2 33825228 33825437 -147922650 + ORR1C2 LTR MaLR 161 384 0 6 843 801 330 56 27 chr2 33825948 33826322 -147921765 - MLT1B LTR MaLR -5 385 1 6 843 1829 139 89 0 chr2 33840081 33840397 -147907690 + ORR1B1 LTR MaLR 47 390 -4 6 843 1477 144 4 8 chr2 33843508 33843753 -147904334 - MTC LTR MaLR -7 414 171 6 843 1079 172 31 11 chr2 33843751 33844000 -147904087 + MTC-int LTR MaLR 98 442 -816 6 843 608 117 194 0 chr2 33843996 33844099 -147903988 - MTC LTR MaLR -256 165 43 6 843 311 262 108 20 chr2 33844652 33844800 -147903287 - MLT1B LTR MaLR -40 350 190 6 843 285 310 0 39 chr2 33844855 33844959 -147903128 - MLT1B LTR MaLR -217 157 58 6 843 269 252 67 10 chr2 33846164 33846268 -147901819 - RMER12 LTR ERVK -477 845 736 6 843 447 302 133 25 chr2 33846630 33846666 -147901421 - MLT2B4 LTR ERVL 0 520 485 6 843 491 262 142 21 chr2 33846714 33846918 -147901169 - MLT2B4 LTR ERVL -32 524 254 6 843 1108 269 27 52 chr2 33848303 33848668 -147899419 - ORR1E LTR MaLR -2 357 2 6 843 1470 239 94 11 chr2 33849413 33849794 -147898293 - MTD LTR MaLR -2 417 5 6 843 3816 123 30 114 chr2 33850820 33851584 -147896503 + RMER6A LTR ERVK 57 756 0 6 843 1618 207 12 9 chr2 33859065 33859387 -147888700 + MT2A LTR ERVL 137 459 -74 6 843 260 237 61 22 chr2 33859462 33859575 -147888512 - MLT1G1 LTR MaLR -13 566 478 6 843 1191 177 190 7 chr2 33859821 33859979 -147888108 - ORR1D1 LTR MaLR -2 365 167 6 843 1191 154 165 4 chr2 33860061 33860198 -147887889 - ORR1D1 LTR MaLR -198 176 2 6 843 4321 150 79 99 chr2 33860489 33860615 -147887472 - RMER19B LTR ERVK -12 890 763 6 843 4321 150 79 99 chr2 33860762 33861543 -147886544 - RMER19B LTR ERVK -140 762 1 6 843 1514 178 41 84 chr2 33865680 33866023 -147882064 + ORR1E LTR MaLR 2 329 -30 7 843 1593 189 98 48 chr2 33866465 33866864 -147881223 - MTD LTR MaLR 0 419 1 7 843 800 73 18 9 chr2 33867192 33867303 -147880784 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 275 7 843 1115 226 158 0 chr2 33867387 33867593 -147880494 - ORR1D2 LTR MaLR -8 362 121 7 843 1115 226 158 0 chr2 33867637 33867740 -147880347 - ORR1D2 LTR MaLR -250 120 6 7 843 2547 152 29 0 chr2 33868846 33869255 -147878832 + MTC LTR MaLR 1 421 0 7 843 329 342 43 67 chr2 33870271 33870525 -147877562 + LTR33A_ LTR ERVL 113 360 -171 7 843 608 139 52 9 chr2 33877573 33877689 -147870398 + ORR1E LTR MaLR 1 121 -238 7 843 464 240 164 38 chr2 33877808 33878006 -147870081 + ORR1E LTR MaLR 149 419 -2 7 843 500 242 56 50 chr2 33881382 33881543 -147866544 + ORR1E LTR MaLR 7 168 -191 7 843 1972 144 40 136 chr2 33883595 33884022 -147864065 - MTC LTR MaLR -35 386 1 7 843 300 271 92 20 chr2 33895431 33895529 -147852558 - MLT1J1 LTR MaLR -274 170 66 7 843 282 279 38 0 chr2 33899028 33899107 -147848980 - MER74A LTR ERVL -3 555 474 7 843 239 304 93 36 chr2 33901292 33901432 -147846655 - ORR1E LTR MaLR -210 149 2 7 843 408 253 7 108 chr2 33901432 33901587 -147846500 + MT2B LTR ERVL 128 264 -320 7 843 883 257 211 16 chr2 33903159 33903470 -147844617 + MTEa LTR MaLR 6 364 -15 7 843 672 203 18 78 chr2 33907708 33907874 -147840213 - MTEa LTR MaLR -210 169 14 7 843 1192 233 48 102 chr2 33911270 33911662 -147836425 + MTE2a LTR MaLR 2 372 -7 8 843 878 280 132 19 chr2 33913508 33913825 -147834262 - ORR1E LTR MaLR 0 359 7 8 843 264 286 169 40 chr2 33915169 33915293 -147832794 - MLT1F LTR MaLR 0 548 409 8 843 458 304 174 60 chr2 33915312 33915610 -147832477 - MLT1F LTR MaLR -226 334 3 8 843 1388 180 210 6 chr2 33918199 33918518 -147829569 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 8 843 1053 247 63 28 chr2 33925780 33926067 -147822020 + MTD LTR MaLR 10 306 -113 8 843 550 221 23 16 chr2 33926094 33926223 -147821864 + MTD LTR MaLR 276 405 -14 8 843 558 320 58 87 chr2 33928516 33928827 -147819260 + ORR1D2 LTR MaLR 7 308 -62 8 843 2096 206 27 0 chr2 33929124 33929527 -147818560 - MTD LTR MaLR -2 417 4 8 843 475 222 151 14 chr2 33929526 33929672 -147818415 - MTD-int LTR MaLR -1 1257 1092 8 843 253 340 45 36 chr2 33932663 33932773 -147815314 + MLT1H1 LTR MaLR 20 130 -425 8 843 1522 240 16 7 chr2 33936648 33936958 -147811129 + MTD LTR MaLR 92 404 -15 8 843 229 267 72 102 chr2 33937050 33937217 -147810870 + RLTR14 LTR ERV1 120 281 -101 8 843 702 187 16 0 chr2 33937741 33937864 -147810223 - ORR1E LTR MaLR -234 125 1 8 843 1764 119 51 124 chr2 33938113 33938468 -147809619 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 8 843 1008 209 173 42 chr2 33939637 33939972 -147808115 - MTEb LTR MaLR 0 379 1 8 843 796 208 211 5 chr2 33940164 33940372 -147807715 + MTD LTR MaLR 82 332 -87 8 843 276 270 16 0 chr2 33940551 33940614 -147807473 + MTD LTR MaLR 296 359 0 8 843 490 280 61 61 chr2 33941053 33941367 -147806720 + MLT1B LTR MaLR 65 490 -15 8 843 1018 227 227 13 chr2 33941724 33942015 -147806072 + MTEb LTR MaLR 1 353 -26 8 843 1780 180 56 79 chr2 33947056 33947449 -147800638 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 8 844 4307 25 12 8 chr2 33950265 33950756 -147797331 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 9 844 4943 36 3 0 chr2 33950758 33951398 -147796689 + MT-int LTR MaLR 1 642 -456 9 844 3526 35 0 0 chr2 33951400 33951796 -147796291 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 9 844 1306 271 32 6 chr2 33952823 33953133 -147794954 + MTEa LTR MaLR 75 379 0 9 844 1499 199 149 3 chr2 33964603 33964946 -147783141 - MTD LTR MaLR -26 393 1 9 844 335 359 8 15 chr2 33970684 33970817 -147777270 + MLT1H LTR MaLR 119 250 -299 9 844 417 240 115 39 chr2 33970889 33971045 -147777042 + MLT1H LTR MaLR 382 549 0 9 844 313 264 43 45 chr2 33975405 33975552 -147772535 - MLT1C LTR MaLR -7 460 208 9 844 252 228 0 0 chr2 33980720 33980777 -147767310 + RMER15 LTR ERVL 403 459 -116 9 844 315 237 97 97 chr2 33983624 33983769 -147764318 + MLT1H LTR MaLR 405 549 0 9 844 255 260 9 91 chr2 33994765 33994875 -147753212 - MLT1J1 LTR MaLR -285 159 59 9 844 844 221 105 14 chr2 33995731 33996021 -147752066 + MTEa LTR MaLR 4 376 -3 9 844 346 282 108 9 chr2 33996528 33996639 -147751448 + RMER10B LTR ERVL 271 392 -6 9 844 242 255 84 47 chr2 33997292 33997399 -147750688 + ORR1E LTR MaLR 81 191 -168 9 844 282 265 65 52 chr2 33999528 33999683 -147748404 + RMER15 LTR ERVL 5 161 -414 9 844 485 298 175 18 chr2 33999704 33999933 -147748154 + RMER15 LTR ERVL 311 575 0 9 844 1242 276 41 6 chr2 34007307 34007624 -147740463 - MTEa LTR MaLR -51 328 1 7 844 235 333 27 100 chr2 34012391 34012541 -147735546 - ORR1E LTR MaLR -220 139 1 1 844 4308 156 44 52 chr2 34017286 34018130 -147729957 - RMER13A LTR ERVK -23 837 1 2 844 1220 242 67 93 chr2 34018555 34019063 -147729024 + MT2B LTR ERVL 1 579 -22 2 844 2370 136 46 5 chr2 34019063 34019454 -147728633 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 2 844 1220 224 52 93 chr2 34019454 34019476 -147728611 + MT2B LTR ERVL 580 601 0 2 844 1351 238 113 27 chr2 34019778 34020122 -147727965 + MTD LTR MaLR 2 380 -39 3 844 2129 110 52 0 chr2 34020122 34020432 -147727655 + ORR1A3 LTR MaLR 1 326 0 3 844 1351 238 113 27 chr2 34020432 34020459 -147727628 + MTD LTR MaLR 381 405 -14 3 844 265 242 112 31 chr2 34048903 34049001 -147699086 + LTR33 LTR ERVL 109 214 -301 7 844 520 235 8 8 chr2 34049108 34049228 -147698859 + LTR33 LTR ERVL 390 509 -6 7 844 367 271 23 0 chr2 34057900 34058029 -147690058 + MTEa LTR MaLR 228 359 -20 8 844 507 159 22 11 chr2 34058781 34058870 -147689217 + ORR1D1 LTR MaLR 1 90 -284 9 844 283 273 19 83 chr2 34061451 34061559 -147686528 + MT2B LTR ERVL 157 257 -344 9 844 3119 125 39 2 chr2 34064871 34065361 -147682726 - RLTR28 LTR ERVL -16 508 1 1 844 254 271 121 76 chr2 34074850 34074882 -147673205 + MT2B2 LTR ERVL 119 156 -428 1 845 403 250 22 108 chr2 34107319 34107458 -147640629 + MT2B LTR ERVL 132 258 -343 1 845 1784 139 51 67 chr2 34117709 34118040 -147630047 + ORR1A3 LTR MaLR 1 326 0 1 845 295 325 24 89 chr2 34128890 34128927 -147619160 + MT2B LTR ERVL 119 230 -371 1 845 295 325 24 89 chr2 34129046 34129059 -147619028 + MT2B LTR ERVL 231 276 -325 1 845 288 268 8 132 chr2 34155739 34155868 -147592219 + MT2B LTR ERVL 166 278 -323 2 845 640 248 8 0 chr2 34160682 34160811 -147587276 - MTD LTR MaLR -239 180 51 2 845 571 307 208 3 chr2 34177225 34177513 -147570574 + MLT1A1 LTR MaLR 1 347 -61 2 845 317 216 41 93 chr2 34190172 34190187 -147557900 + MT2B LTR ERVL 149 158 -443 3 845 395 350 81 58 chr2 34190648 34190957 -147557130 + ORR1E LTR MaLR 1 316 -43 3 845 235 223 27 161 chr2 34193127 34193239 -147554848 - MT2B LTR ERVL -337 264 168 3 845 1404 186 53 53 chr2 34196567 34196890 -147551197 - ORR1D-int LTR MaLR -59 1311 989 3 845 1742 176 141 6 chr2 34208507 34208868 -147539219 - MTD LTR MaLR 0 419 10 3 846 966 264 20 70 chr2 34232002 34232300 -147515787 + MTD LTR MaLR 46 328 -91 3 846 763 264 97 4 chr2 34233294 34233522 -147514565 + MTD LTR MaLR 22 270 -149 3 846 283 304 112 47 chr2 34233812 34234026 -147514061 - MLT1J LTR MaLR -8 504 277 3 846 371 362 64 8 chr2 34235161 34235395 -147512692 + MER21B LTR ERV1 40 286 -577 4 846 2014 108 3 7 chr2 34235451 34235748 -147512339 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 32 4 846 1220 225 29 39 chr2 34235974 34236284 -147511803 - ORR1E LTR MaLR -46 313 7 4 846 277 313 45 39 chr2 34236419 34236575 -147511512 + MER77 LTR ERVL 449 605 -2 4 846 383 304 103 38 chr2 34236908 34237171 -147510916 + MLT1J LTR MaLR 225 504 -8 4 846 582 292 46 144 chr2 34241921 34242142 -147505945 + MTE2a LTR MaLR 5 201 -178 4 846 582 292 46 144 chr2 34242322 34242516 -147505571 + MTE2a LTR MaLR 202 379 0 4 846 2991 170 80 138 chr2 34248046 34248969 -147499118 + RMER19B LTR ERVK 2 871 -31 4 846 251 266 99 34 chr2 34256953 34257126 -147490961 + MTE2a LTR MaLR 170 361 -18 4 846 3462 28 2 0 chr2 34257527 34257922 -147490165 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 846 3907 122 112 27 chr2 34261177 34261874 -147486213 + RMER6A LTR ERVK 1 756 0 4 846 934 263 47 112 chr2 34270474 34270571 -147477516 - MER57F LTR ERV1 -56 380 292 4 846 934 263 47 112 chr2 34270718 34271022 -147477065 - MER57F LTR ERV1 -145 291 5 4 846 237 207 62 136 chr2 34273171 34273243 -147474844 - MT2B LTR ERVL -264 337 262 5 846 229 333 20 70 chr2 34278085 34278185 -147469902 - MLT1E1A LTR MaLR -585 95 1 5 846 327 317 86 46 chr2 34279900 34280052 -147468035 - MLT1H LTR MaLR -336 213 56 5 846 1433 179 99 105 chr2 34297736 34298099 -147449988 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 14 5 846 270 171 0 248 chr2 34323377 34323478 -147424609 - MT2B LTR ERVL -355 246 171 6 846 354 373 84 28 chr2 34331284 34331499 -147416588 - LTR16A LTR ERVL -219 232 6 6 846 436 340 68 28 chr2 34331868 34332205 -147415882 - ERVL-B4-int LTR ERVL -660 5007 4648 6 846 407 366 12 12 chr2 34332687 34332850 -147415237 - MER68 LTR ERVL -8 555 393 6 847 3467 31 10 0 chr2 34347738 34348130 -147399957 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 847 280 118 19 19 chr2 34348697 34348749 -147399338 - MT2A LTR ERVL -71 462 411 6 847 713 210 43 6 chr2 34348783 34348945 -147399142 - MT2A LTR ERVL -290 243 76 6 847 290 246 0 40 chr2 34349026 34349102 -147398985 - MT2A LTR ERVL -445 88 16 6 847 7922 28 26 3 chr2 34349585 34350493 -147397594 - RLTR13B3 LTR ERVK 0 929 1 6 847 2011 49 74 0 chr2 34361327 34361611 -147386476 + ORR1A1 LTR MaLR 1 305 -41 6 847 425 36 0 0 chr2 34361850 34361905 -147386182 + ORR1A1 LTR MaLR 292 346 0 6 847 435 175 0 104 chr2 34367382 34367497 -147380590 - MT2B LTR ERVL -345 256 154 6 847 1224 108 5 25 chr2 34367523 34367722 -147380365 + MTB_Mm LTR MaLR 1 195 -212 7 847 750 223 92 63 chr2 34367989 34368141 -147379946 + MTB_Mm LTR MaLR 202 366 -55 7 847 750 223 92 63 chr2 34368283 34368336 -147379751 + MTB_Mm LTR MaLR 367 413 -8 7 847 568 135 6 10 chr2 34378216 34378347 -147369740 + ORR1A4 LTR MaLR 1 133 -194 7 847 1154 217 34 4 chr2 34384044 34384312 -147363775 - RMER19A LTR ERVK 0 737 462 7 847 3700 156 93 28 chr2 34384327 34385130 -147362957 + RMER19B LTR ERVK 19 902 0 7 847 391 248 9 62 chr2 34389638 34389750 -147358337 - RLTR25B LTR ERVK -526 502 397 7 847 1621 99 154 10 chr2 34397393 34397698 -147350389 - RLTR15 LTR ERVK -10 349 1 7 847 1387 271 24 0 chr2 34415423 34415762 -147332325 - ORR1E LTR MaLR -9 350 4 7 847 1670 161 243 14 chr2 34422434 34422805 -147325282 - RMER6B LTR ERVK -4 457 2 7 847 2410 91 119 19 chr2 34427630 34428000 -147320087 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 7 847 1930 110 79 10 chr2 34438455 34438759 -147309328 + ORR1B2 LTR MaLR 43 367 0 7 847 4224 161 99 65 chr2 34439900 34440761 -147307326 - RMER19B LTR ERVK -12 890 1 7 847 1973 199 42 27 chr2 34446471 34446880 -147301207 + MTD LTR MaLR 1 415 -4 8 847 1329 130 84 6 chr2 34461885 34462170 -147285917 + ORR1C1 LTR MaLR 2 384 0 8 847 402 311 22 58 chr2 34463261 34463452 -147284635 - MLT1F2 LTR MaLR -7 647 392 8 847 490 293 68 14 chr2 34463849 34464055 -147284032 - MLT1F2 LTR MaLR -299 250 3 8 848 619 206 328 4 chr2 34482370 34482645 -147265442 - MTD LTR MaLR -15 404 41 8 848 535 261 56 36 chr2 34501804 34501999 -147246088 - MTE2b LTR MaLR -80 299 101 5 848 2615 137 35 5 chr2 34507440 34507844 -147240243 - MTC LTR MaLR 0 421 6 1 848 1238 242 85 6 chr2 34508781 34508939 -147239148 - ORR1D2 LTR MaLR -20 350 175 1 848 1238 242 85 6 chr2 34509085 34509242 -147238845 - ORR1D2 LTR MaLR -196 174 11 1 848 541 265 58 37 chr2 34509247 34509435 -147238652 - ORR1E LTR MaLR -167 192 1 2 848 277 275 0 133 chr2 34510406 34510511 -147237576 - MT2B LTR ERVL -361 240 150 2 848 1658 196 108 35 chr2 34512183 34512554 -147235533 - MTC LTR MaLR -23 398 1 3 848 289 345 21 28 chr2 34512611 34512754 -147235333 + ERVL-B4-int LTR ERVL 954 1095 -4572 3 848 2387 79 13 6 chr2 34513131 34513448 -147234639 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 3 848 352 306 131 53 chr2 34513549 34513946 -147234141 + ERVL-B4-int LTR ERVL 1597 2024 -3690 3 848 306 361 46 0 chr2 34514505 34514613 -147233474 - MLT1G1 LTR MaLR -394 185 73 3 848 309 272 133 19 chr2 34514715 34514820 -147233267 - MLT1A1 LTR MaLR -1 407 291 3 848 4360 123 90 1 chr2 34516027 34516702 -147231385 + RMER19A LTR ERVK 3 737 0 4 848 1087 206 189 35 chr2 34516838 34517155 -147230932 + ORR1D2 LTR MaLR 1 366 -4 4 848 893 307 161 14 chr2 34518153 34518599 -147229488 + RMER5 LTR ERV1 23 534 0 4 848 346 276 23 0 chr2 34521941 34522028 -147226059 + MTD LTR MaLR 22 110 -309 6 848 324 253 89 0 chr2 34522095 34522174 -147225913 + MTD LTR MaLR 272 357 -62 6 848 602 325 89 65 chr2 34525968 34526337 -147221750 + MTE2a LTR MaLR 1 378 -1 7 848 3439 30 2 10 chr2 34534783 34535182 -147212905 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 8 848 9428 28 4 1 chr2 34535182 34536277 -147211810 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 8 848 3414 35 2 10 chr2 34536277 34536676 -147211411 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 8 848 976 219 117 118 chr2 34543303 34543691 -147204396 + MT2A LTR ERVL 1 542 -59 1 848 444 274 113 88 chr2 34543795 34543835 -147204252 + MT2A LTR ERVL 526 567 -17 1 848 317 221 129 59 chr2 34548124 34548225 -147199862 - MT2B LTR ERVL -338 263 156 1 848 321 236 27 34 chr2 34558571 34558720 -147189367 + ORR1B1-int LTR MaLR 612 759 -750 1 848 2382 148 122 42 chr2 34568981 34569390 -147178697 + RMER15 LTR ERVL 29 466 -109 1 848 2382 148 122 42 chr2 34569576 34569668 -147178419 + RMER15 LTR ERVL 467 570 -5 1 848 275 263 31 109 chr2 34574055 34574183 -147173904 - MT2B LTR ERVL -344 257 140 2 848 589 256 105 5 chr2 34575258 34575458 -147172629 + MLT1A0 LTR MaLR 120 339 -26 2 848 354 189 0 104 chr2 34579557 34579663 -147168424 - MT2B LTR ERVL -337 264 170 2 849 3577 15 2 0 chr2 34614881 34615276 -147132811 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 849 9121 41 4 1 chr2 34615276 34616371 -147131716 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 3 849 3577 15 2 0 chr2 34616371 34616766 -147131321 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 849 1883 95 28 67 chr2 34619369 34619696 -147128391 + ORR1A3 LTR MaLR 3 316 -10 3 849 1171 138 29 45 chr2 34620498 34620740 -147127347 + RLTR14 LTR ERV1 2 239 -143 3 849 656 205 16 0 chr2 34620906 34621033 -147127054 - RLTR14 LTR ERV1 -29 353 225 4 849 243 135 0 0 chr2 34621222 34621259 -147126828 + RLTR14 LTR ERV1 344 380 -2 3 849 246 221 23 105 chr2 34625619 34625705 -147122382 - MT2B LTR ERVL -361 240 162 4 849 476 144 20 80 chr2 34641670 34641821 -147106266 + RMER17B LTR ERVK 319 460 -498 4 849 1930 113 78 62 chr2 34645667 34645989 -147102098 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 4 849 1699 133 18 45 chr2 34649677 34650007 -147098080 + ORR1A4 LTR MaLR 1 321 -8 5 849 1912 93 51 117 chr2 34650123 34650475 -147097612 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 5 849 881 284 86 32 chr2 34673069 34673382 -147074705 + MTE-int LTR MaLR 662 991 -589 5 849 1608 178 109 9 chr2 34675346 34675686 -147072401 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 5 849 252 300 0 24 chr2 34675703 34675785 -147072302 + RLTR42-int LTR ERVK 1256 1335 -4187 5 849 628 171 8 24 chr2 34684839 34684965 -147063122 - RMER16 LTR ERVK -409 124 1 5 849 2035 95 42 51 chr2 34685389 34685701 -147062386 - RLTR27 LTR ERVK 0 309 1 5 849 1498 219 37 26 chr2 34685701 34686195 -147061892 - MMERVK10C-int LTR ERVK 0 7581 6995 5 849 283 244 12 35 chr2 34686717 34686802 -147061285 - MMERVK10C-int LTR ERVK -1213 5608 5526 5 849 2215 299 30 34 chr2 34687028 34688156 -147059931 - MMERVK10C-int LTR ERVK -2365 5216 4093 5 849 597 334 19 35 chr2 34688220 34688592 -147059495 - IAP-d-int LTR ERVK -5504 1038 673 5 849 257 229 0 0 chr2 34688746 34688807 -147059280 - RLTR10-int LTR ERVK -6765 915 855 5 849 699 235 60 16 chr2 34688966 34689148 -147058939 - RLTR10-int LTR ERVK -1143 844 655 5 849 1498 107 225 4 chr2 34689242 34689495 -147058592 - RLTR27 LTR ERVK 0 309 1 5 849 278 247 9 114 chr2 34690957 34690977 -147057110 + MT2B LTR ERVL 147 155 -446 6 849 2647 148 73 53 chr2 34691140 34691663 -147056424 + RMER16 LTR ERVK 1 533 0 6 849 2026 137 29 56 chr2 34702075 34702122 -147045965 - ORR1C1 LTR MaLR -10 368 337 6 849 2026 137 29 56 chr2 34702269 34702599 -147045488 - ORR1C1 LTR MaLR -42 336 1 6 849 2209 164 151 4 chr2 34703161 34703631 -147044456 - RMER15 LTR ERVL 0 575 37 6 849 1984 129 143 3 chr2 34705787 34706129 -147041958 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 5 6 850 438 201 314 13 chr2 34734500 34734656 -147013431 + ORR1E LTR MaLR 20 222 -137 7 850 357 253 42 10 chr2 34735025 34735121 -147012966 + ORR1E LTR MaLR 281 379 0 7 850 792 243 6 11 chr2 34735121 34735296 -147012791 + ORR1E-int LTR MaLR 1 174 -1406 7 850 605 205 80 43 chr2 34735294 34735432 -147012655 + MTC LTR MaLR 277 419 -2 7 850 1940 289 82 16 chr2 34735443 34736380 -147011707 + ORR1E-int LTR MaLR 496 1526 -54 7 850 652 335 82 4 chr2 34736380 34736647 -147011440 + ORR1E LTR MaLR 1 288 -71 7 850 2349 180 247 17 chr2 34740192 34740791 -147007296 - RMER19A LTR ERVK 0 737 1 7 850 2583 124 20 98 chr2 34742552 34742795 -147005292 - MTC LTR MaLR 0 421 197 7 850 2583 124 20 98 chr2 34742935 34743148 -147004939 - MTC LTR MaLR -225 196 1 7 850 237 331 45 96 chr2 34743908 34744065 -147004022 - MER21B LTR ERV1 -668 195 47 7 850 266 256 12 37 chr2 34765139 34765220 -146982867 - MT2B2 LTR ERVL -326 258 180 7 850 1903 120 31 60 chr2 34771916 34772235 -146975852 - ORR1A4 LTR MaLR -19 310 1 7 850 7697 137 149 66 chr2 34772235 34773889 -146974198 - ORR1A4-int LTR MaLR 0 1792 1 7 850 2036 106 78 10 chr2 34773889 34774195 -146973892 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 3 7 850 267 306 70 70 chr2 34775121 34775279 -146972808 + RMER15 LTR ERVL 1 158 -417 7 850 344 278 72 13 chr2 34775801 34775954 -146972133 + RMER15 LTR ERVL 258 419 -156 7 850 390 250 87 24 chr2 34778120 34778247 -146969840 - MT2B LTR ERVL -344 257 123 7 850 911 259 163 15 chr2 34779201 34779526 -146968561 + MLT2C1 LTR ERVL 19 391 -6 7 850 4506 8 0 12 chr2 34784835 34785334 -146962753 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 8 850 46245 14 6 0 chr2 34785334 34790660 -146957427 + MERVL-int LTR ERVL 1 5360 -125 8 850 366 191 46 35 chr2 34790660 34790747 -146957340 + ORR1A3-int LTR MaLR 553 640 -1323 8 850 305 0 0 0 chr2 34790747 34790785 -146957302 + MERVL-int LTR ERVL 5448 5485 0 8 850 4490 10 0 12 chr2 34790785 34791284 -146956803 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 8 850 446 300 140 49 chr2 34792847 34793155 -146954932 - MLT2C1 LTR ERVL -55 342 7 8 850 501 237 76 0 chr2 34794660 34794778 -146953309 - MLT1D LTR MaLR -8 497 371 8 850 230 338 7 119 chr2 34794836 34794987 -146953100 - MLT1D LTR MaLR -274 231 98 8 850 3525 124 67 4 chr2 34804913 34805463 -146942624 - RMER4B LTR ERVK 0 585 1 8 850 3237 136 44 16 chr2 34806126 34806158 -146941929 + RMER4B LTR ERVK 1 40 -545 8 850 3237 136 44 16 chr2 34806197 34806710 -146941377 + RMER4B LTR ERVK 41 561 -24 8 850 300 293 188 0 chr2 34807764 34807897 -146940190 - MLT1D LTR MaLR -2 503 346 8 850 277 324 56 0 chr2 34807939 34808047 -146940040 - MLT1D LTR MaLR -282 223 110 8 850 1115 244 24 119 chr2 34815096 34815515 -146932572 - MTE2a LTR MaLR 0 379 1 8 850 451 251 102 46 chr2 34821835 34822031 -146926056 + RLTR15 LTR ERVK 1 207 -152 8 850 1443 221 174 92 chr2 34822988 34823236 -146924851 - MT2A LTR ERVL -16 517 192 8 850 1443 221 174 92 chr2 34823341 34823569 -146924518 - MT2A LTR ERVL -342 191 2 8 850 349 395 86 7 chr2 34828282 34828560 -146919527 + LTR78 LTR ERV1 906 1205 -99 8 850 1415 159 92 15 chr2 34829145 34829407 -146918680 + MTD LTR MaLR 5 286 -133 8 850 1138 291 58 33 chr2 34830575 34830970 -146917117 - MTD LTR MaLR -14 405 1 8 850 334 50 0 0 chr2 34831627 34831667 -146916420 + ORR1B2 LTR MaLR 1 40 -334 8 850 1082 153 61 10 chr2 34831709 34831907 -146916180 + ORR1B2 LTR MaLR 160 367 0 8 850 1215 288 32 11 chr2 34832002 34832350 -146915737 + ORR1E LTR MaLR 3 357 -2 8 850 804 230 292 7 chr2 34833339 34833629 -146914458 - MTEb LTR MaLR 0 379 7 8 850 835 202 63 63 chr2 34834259 34834784 -146913303 + RMER17C LTR ERVK 1 408 -2 8 850 393 259 128 17 chr2 34835137 34835394 -146912693 + MER90 LTR ERV1 1 304 -310 8 850 783 205 233 35 chr2 34842226 34842514 -146905573 - ORR1D1 LTR MaLR -19 355 11 9 850 3461 146 96 5 chr2 34843330 34843957 -146904130 + RLTR33 LTR ERVK 1 665 -13 9 850 546 282 34 40 chr2 34844067 34844363 -146903724 + RLTR15 LTR ERVK 1 294 -65 9 850 983 235 61 109 chr2 34854506 34854902 -146893185 + MTE2a LTR MaLR 1 377 -2 9 850 306 282 73 53 chr2 34857057 34857207 -146890880 + MLT1A1 LTR MaLR 35 187 -221 9 106 737 301 84 35 chr2 34864987 34865334 -146882753 + MTE2a LTR MaLR 16 379 0 9 851 397 283 119 6 chr2 34869855 34870015 -146878072 + MLT1A1 LTR MaLR 228 405 -3 9 851 2974 182 25 2 chr2 34871556 34872117 -146875970 + RMER15 LTR ERVL 2 575 0 9 851 343 280 54 0 chr2 34880501 34880594 -146867493 + MTE2b LTR MaLR 1 98 -281 9 851 803 258 130 57 chr2 34880594 34880894 -146867193 + MTE2b LTR MaLR 58 379 0 9 851 2577 77 3 0 chr2 34886930 34887256 -146860831 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 9 851 323 47 0 0 chr2 34888650 34888693 -146859394 - MURVY-LTR LTR ERV1 -88 431 389 9 851 292 28 0 0 chr2 34888818 34888854 -146859233 - MURVY-LTR LTR ERV1 -483 36 1 9 851 446 293 84 32 chr2 34895787 34895942 -146852145 + MTD LTR MaLR 88 250 -169 9 851 380 229 134 78 chr2 34896097 34896239 -146851848 + MTD LTR MaLR 239 388 -31 9 851 1947 159 87 5 chr2 34896863 34897243 -146850844 + MTC LTR MaLR 2 412 -9 1 851 2392 100 76 30 chr2 34897903 34898296 -146849791 - IAPLTR2a LTR ERVK 0 411 1 1 851 1230 218 15 26 chr2 34902129 34902398 -146845689 - MTD LTR MaLR -29 390 125 1 851 254 291 72 86 chr2 34915413 34915552 -146832535 + MTEa LTR MaLR 238 374 -5 1 851 480 198 165 0 chr2 34919491 34919612 -146828475 + MTD LTR MaLR 43 183 -236 1 851 699 182 243 0 chr2 34919639 34919820 -146828267 - MTD LTR MaLR -1 418 194 1 851 2852 141 67 16 chr2 34919821 34920326 -146827761 - RMER13A LTR ERVK -329 531 1 1 851 279 256 214 0 chr2 34923281 34923398 -146824689 + MLT1F1 LTR MaLR 116 257 -312 1 851 1194 128 11 24 chr2 34923806 34924080 -146824007 + ORR1A2 LTR MaLR 1 318 -8 1 851 248 281 135 19 chr2 34925931 34926087 -146822000 + LTR16A1 LTR ERVL 218 391 -65 1 851 2083 152 35 19 chr2 34928706 34929074 -146819013 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 1 851 2370 73 131 0 chr2 34929453 34929849 -146818238 - RLTR47_MM LTR ERV1 -84 448 1 1 851 1233 309 91 58 chr2 34930887 34931063 -146817024 - MuRRS4-int LTR ERV1 -5544 2062 1747 1 851 1233 309 91 58 chr2 34931144 34931749 -146816338 - MuRRS4-int LTR ERV1 -5719 1887 1162 1 851 312 319 32 43 chr2 34932198 34932450 -146815637 - MuRRS4-int LTR ERV1 -6803 803 565 1 851 276 127 42 113 chr2 34932925 34932996 -146815091 - RLTR47_MM LTR ERV1 -8 524 459 1 851 429 338 166 4 chr2 34933574 34933815 -146814272 + RMER15 LTR ERVL 296 575 0 1 851 271 194 45 0 chr2 34934394 34934461 -146813626 + RLTR12B LTR ERVK 1 70 -458 1 851 337 264 21 32 chr2 34944391 34944485 -146803602 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 316 1 851 1868 114 123 7 chr2 34953644 34953953 -146794134 + ORR1B1 LTR MaLR 41 385 -9 1 851 2792 123 74 31 chr2 34956869 34957313 -146790774 - RMER4A LTR ERVK -3 463 1 1 851 2213 129 3 63 chr2 34957379 34957727 -146790360 - ORR1A4 LTR MaLR -2 327 1 1 851 963 197 36 14 chr2 34960017 34960238 -146787849 + ORR1D1 LTR MaLR 149 374 0 1 851 493 216 10 10 chr2 34965762 34965865 -146782222 - MTD LTR MaLR 0 419 317 1 851 356 266 385 24 chr2 34966214 34966435 -146781652 - MER57C2 LTR ERV1 -125 309 9 1 851 745 196 212 26 chr2 34969271 34969309 -146778778 - ORR1C1 LTR MaLR -99 279 232 1 851 745 196 212 26 chr2 34969702 34969890 -146778197 - ORR1C1 LTR MaLR -147 231 9 1 851 1733 189 106 3 chr2 34984670 34985009 -146763078 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 1 851 390 234 37 88 chr2 34994543 34994679 -146753408 - RMER10B LTR ERVL 0 398 270 1 852 2278 151 247 15 chr2 34996996 34997461 -146750626 - RMER15 LTR ERVL 0 575 3 1 852 1305 139 48 0 chr2 34997864 34997943 -146750144 + RLTR28B LTR ERVL 1 80 -444 1 852 1305 139 48 0 chr2 34997980 34998107 -146749980 + RLTR28B LTR ERVL 81 215 -309 1 852 1632 145 33 4 chr2 34998289 34998559 -146749528 + RLTR28B LTR ERVL 202 479 -2 1 852 320 184 68 120 chr2 35003096 35003213 -146744874 - MT2B LTR ERVL -337 264 154 9 852 1034 212 212 0 chr2 35005799 35006101 -146741986 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 5 1 852 1968 171 200 2 chr2 35009416 35009892 -146738195 - RMER15 LTR ERVL -2 573 4 1 852 923 274 136 55 chr2 35014176 35014663 -146733424 - RMER5 LTR ERV1 -8 526 1 1 852 873 57 55 5 chr2 35022048 35022188 -146725899 - MTB LTR MaLR 0 400 233 3 852 1478 221 44 39 chr2 35029644 35030053 -146718034 - MTD LTR MaLR -8 411 1 5 852 1157 191 154 22 chr2 35032721 35033187 -146714900 + RMER4B LTR ERVK 7 561 -24 5 852 253 98 24 0 chr2 35058073 35058114 -146689973 + ORR1C2 LTR MaLR 1 42 -342 9 852 6263 157 158 13 chr2 35058120 35059438 -146688649 + ORR1C2-int LTR MaLR 1 1509 0 9 852 1746 181 64 38 chr2 35059439 35059812 -146688275 + ORR1C2 LTR MaLR 2 384 0 9 852 640 142 98 0 chr2 35062373 35062491 -146685596 + ORR1B1 LTR MaLR 173 290 -104 1 852 366 192 75 66 chr2 35064590 35064696 -146683391 - MLT1J LTR MaLR -310 202 96 1 852 271 330 122 49 chr2 35066101 35066305 -146681782 - MLT1I LTR MaLR -46 365 147 1 852 477 281 102 5 chr2 35067390 35067576 -146680511 - MTD LTR MaLR 0 419 182 1 852 309 284 72 99 chr2 35067666 35067690 -146680397 - MTD LTR MaLR -179 217 194 1 852 732 230 98 11 chr2 35067947 35068143 -146679944 - MTD LTR MaLR -208 211 1 1 852 382 300 62 29 chr2 35069765 35069996 -146678091 - MTEa LTR MaLR 0 379 60 1 852 449 218 125 18 chr2 35071456 35071568 -146676519 + MTE2a LTR MaLR 15 138 -241 1 852 3103 59 18 3 chr2 35071705 35072095 -146675992 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 852 892 279 123 19 chr2 35073070 35073435 -146674652 + MTD LTR MaLR 3 405 -14 1 852 305 286 32 21 chr2 35073447 35073540 -146674547 - MLT1B LTR MaLR -296 94 1 1 852 1879 193 111 3 chr2 35073847 35074227 -146673860 + MTC LTR MaLR 1 421 0 1 852 1530 127 18 0 chr2 35074352 35074580 -146673507 - ORR1B1 LTR MaLR -161 233 2 1 852 1464 90 112 0 chr2 35074585 35074808 -146673279 - ORR1B1-int LTR MaLR -2 1507 1260 1 852 674 171 24 10 chr2 35074806 35074946 -146673141 - ORR1B1 LTR MaLR -222 172 1 1 852 408 275 37 123 chr2 35076357 35076519 -146671568 - MTEb LTR MaLR -87 292 145 1 852 1163 184 48 0 chr2 35076956 35077163 -146670924 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 162 1 852 1748 186 219 59 chr2 35077185 35077693 -146670394 + RMER19B LTR ERVK 310 898 -4 1 852 735 211 0 0 chr2 35077682 35077829 -146670258 - ORR1C1 LTR MaLR -230 148 2 1 852 1571 174 135 6 chr2 35077848 35078188 -146669899 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 1 852 435 240 16 134 chr2 35079351 35079569 -146668518 + RLTR18B LTR ERVK 3 183 -329 1 852 798 258 66 67 chr2 35079708 35080051 -146668036 + RLTR18 LTR ERVK 107 591 -25 1 852 1393 219 85 6 chr2 35080783 35081113 -146666974 + ORR1D2 LTR MaLR 13 368 -2 1 852 330 275 159 30 chr2 35081439 35081687 -146666400 + MLT1F LTR MaLR 281 565 -4 1 852 420 217 92 28 chr2 35081790 35081899 -146666188 - MLT1J LTR MaLR -10 502 387 1 852 503 188 39 154 chr2 35082326 35082342 -146665745 + MT2B LTR ERVL 151 178 -423 1 852 503 188 39 154 chr2 35082438 35082508 -146665579 + MT2B LTR ERVL 179 311 -290 1 852 225 323 110 10 chr2 35086162 35086262 -146661825 - MLT1D LTR MaLR -367 138 29 1 852 3097 32 42 10 chr2 35086321 35086704 -146661383 + MTA_Mm LTR MaLR 1 395 -1 1 852 2275 129 26 19 chr2 35089578 35089957 -146658130 + RLTR14 LTR ERV1 1 382 0 1 852 1678 158 131 40 chr2 35091642 35092038 -146656049 + RMER10A LTR ERVL 1 432 -10 1 852 269 174 0 0 chr2 35092596 35092642 -146655445 + RLTR42-int LTR ERVK 1932 1977 -3545 1 852 399 157 53 8 chr2 35092869 35092953 -146655134 + MYSERV6-int LTR ERVK 7247 7320 -1639 1 852 574 275 108 33 chr2 35092957 35093198 -146654889 + RLTR19-int LTR ERVK 2628 2886 -3251 1 852 415 222 51 117 chr2 35093236 35093409 -146654678 + RLTR19-int LTR ERVK 2866 3007 -3130 1 852 260 217 252 9 chr2 35094061 35094168 -146653919 + RLTR19-int LTR ERVK 2751 2883 -355 1 852 1193 188 14 0 chr2 35094495 35094708 -146653379 + RMER10A LTR ERVL 1 216 -226 1 852 895 242 235 20 chr2 35094862 35095266 -146652821 + RMER20B LTR ERVK 115 605 -22 1 852 230 258 158 79 chr2 35095175 35095390 -146652697 + RMER10A LTR ERVL 122 353 -89 1 852 453 295 156 74 chr2 35095991 35096317 -146651770 + ORR1E LTR MaLR 2 354 -5 1 852 1159 245 129 15 chr2 35098022 35098354 -146649733 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 2 852 2623 133 157 27 chr2 35098438 35098955 -146649132 - RMER4B LTR ERVK -1 584 1 2 852 383 257 33 99 chr2 35103789 35103910 -146644177 + MT2B LTR ERVL 152 264 -337 2 852 475 177 94 0 chr2 35106147 35106243 -146641844 - ORR1D1 LTR MaLR -2 372 268 2 852 973 202 135 33 chr2 35106558 35106585 -146641502 - ORR1D1 LTR MaLR -104 270 244 2 852 973 202 135 33 chr2 35106608 35106659 -146641428 - ORR1D1 LTR MaLR -131 243 179 2 852 973 202 135 33 chr2 35106693 35106858 -146641229 - ORR1D1 LTR MaLR -196 178 3 2 852 1850 146 136 34 chr2 35109628 35110010 -146638077 + MTC LTR MaLR 1 421 0 2 852 282 283 28 92 chr2 35115657 35115766 -146632321 - MT2B LTR ERVL -344 257 156 2 852 344 285 13 83 chr2 35125044 35125201 -146622886 - RMER12 LTR ERVK -466 856 711 2 853 2735 149 58 100 chr2 35131004 35131556 -146616531 - RLTR24 LTR ERV1 0 529 1 2 853 226 267 105 52 chr2 35132339 35132568 -146615519 + RLTR21 LTR ERVK 1075 1315 -257 2 853 881 198 242 4 chr2 35147230 35147503 -146600584 - MTD LTR MaLR -81 338 1 2 853 1128 256 145 8 chr2 35163628 35163986 -146584101 - MTC LTR MaLR -14 407 1 3 853 1435 219 205 17 chr2 35166036 35166509 -146581578 + RMER15 LTR ERVL 14 575 0 3 853 276 187 120 0 chr2 35172265 35172340 -146575747 + ORR1D2 LTR MaLR 287 370 0 3 853 1439 125 257 6 chr2 35187467 35187782 -146560305 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 3 853 2833 171 28 6 chr2 35188100 35188601 -146559486 - RLTR18B LTR ERVK 0 512 1 3 853 329 240 0 133 chr2 35189223 35189343 -146558744 - MT2B LTR ERVL -343 258 155 3 853 1733 198 43 19 chr2 35197146 35197568 -146550519 + RMER10A LTR ERVL 1 432 -10 3 853 843 290 49 72 chr2 35198552 35198626 -146549461 - MLT1B LTR MaLR -9 381 304 3 853 843 290 49 72 chr2 35198843 35199158 -146548929 - MLT1B LTR MaLR -87 303 1 3 853 849 308 142 48 chr2 35199292 35199762 -146548325 + MTE-int LTR MaLR 7 530 -1050 3 853 849 308 142 48 chr2 35199903 35199989 -146548098 + MTE-int LTR MaLR 531 615 -965 3 853 494 350 106 54 chr2 35202270 35203034 -146545053 + ERVL-int LTR ERVL 3190 3993 -1764 3 853 573 221 35 14 chr2 35207813 35207955 -146540132 + MLT2B2 LTR ERVL 3 147 -368 4 853 3454 33 2 0 chr2 35212032 35212427 -146535660 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 853 528 196 0 26 chr2 35213097 35213212 -146534875 - RLTR16 LTR ERVK 0 505 394 4 853 314 280 25 108 chr2 35213269 35213329 -146534758 + RMER3D-int LTR ERVK 1 62 -2780 4 853 314 280 25 108 chr2 35213354 35213497 -146534590 + RMER3D-int LTR ERVK 63 187 -2655 4 853 1439 228 23 41 chr2 35213812 35214206 -146533881 + RLTR16 LTR ERVK 119 505 0 4 853 261 349 81 25 chr2 35215666 35215863 -146532224 + ERVL-E-int LTR ERVL 4897 5104 -563 4 853 2422 214 20 81 chr2 35218107 35218758 -146529329 + RMER19C LTR ERVK 1 611 0 4 853 2026 169 44 3 chr2 35226095 35226458 -146521629 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 4 853 2126 132 157 9 chr2 35226458 35226903 -146521184 - ORR1C1-int LTR MaLR 0 1509 999 4 853 1744 197 31 64 chr2 35227089 35227512 -146520575 + MTD LTR MaLR 2 410 -9 4 853 276 224 43 29 chr2 35230322 35230391 -146517696 - RMER15-int LTR ERVL -4733 266 197 4 853 234 330 9 64 chr2 35230435 35230545 -146517542 - RMER15 LTR ERVL -45 530 427 4 853 1955 223 23 143 chr2 35242653 35243338 -146504749 + RMER19C LTR ERVK 1 603 -8 4 853 307 252 0 119 chr2 35247246 35247372 -146500715 - MT2B LTR ERVL -338 263 153 4 853 747 178 108 27 chr2 35248170 35248355 -146499732 - RMER21B LTR ERV1 -275 567 368 4 853 2093 85 9 25 chr2 35248355 35248679 -146499408 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 4 853 1475 146 156 18 chr2 35248694 35249021 -146499066 - RMER21B LTR ERV1 -470 372 1 4 853 474 97 14 0 chr2 35249189 35249261 -146498826 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 312 4 853 675 266 91 0 chr2 35253732 35253931 -146494156 - MTEa LTR MaLR -109 270 54 5 853 1431 145 39 87 chr2 35254860 35255193 -146492894 + ORR1A4 LTR MaLR 5 321 -8 5 854 2099 163 34 2 chr2 35259863 35260270 -146487817 - MTC LTR MaLR 0 421 2 5 854 988 119 90 6 chr2 35262439 35262616 -146485471 + RMER10B LTR ERVL 1 192 -206 5 854 1614 159 59 22 chr2 35262623 35263055 -146485032 - RMER17C LTR ERVK -519 439 1 5 854 855 221 49 4 chr2 35263065 35263310 -146484777 + RMER10B LTR ERVL 143 398 0 5 854 3652 169 127 79 chr2 35264716 35265577 -146482510 + RMER19B LTR ERVK 1 902 0 5 854 509 325 29 21 chr2 35275520 35275759 -146472328 + MLT1A LTR MaLR 40 280 -94 5 854 2514 105 20 51 chr2 35278678 35279068 -146469019 + MT2B LTR ERVL 1 378 -223 5 854 4263 91 2 3 chr2 35279059 35279635 -146468452 + ORR1A1-int LTR MaLR 1389 1963 0 5 854 623 193 42 95 chr2 35279635 35279824 -146468263 + ORR1A1 LTR MaLR 1 179 -167 5 854 437 145 32 99 chr2 35280260 35280382 -146467705 + ORR1A1 LTR MaLR 149 282 -139 5 854 311 232 56 35 chr2 35282690 35282732 -146465355 + ORR1B1-int LTR MaLR 609 653 -856 5 854 435 162 75 0 chr2 35291171 35291245 -146456842 + MTD LTR MaLR 5 84 -335 5 854 1014 187 247 0 chr2 35291445 35291712 -146456375 + MTD LTR MaLR 69 401 -18 5 854 2200 144 99 5 chr2 35293639 35294023 -146454064 + MTC LTR MaLR 2 421 0 5 854 711 291 11 17 chr2 35294716 35294894 -146453193 - MTEb LTR MaLR -201 178 2 5 854 230 227 103 29 chr2 35308300 35308368 -146439719 + MTE2a LTR MaLR 272 344 -35 6 854 2811 161 57 14 chr2 35314852 35315343 -146432744 + RMER15 LTR ERVL 62 573 -2 6 854 268 268 0 85 chr2 35319053 35319159 -146428928 + RMER21B LTR ERV1 84 180 -662 6 854 295 228 55 73 chr2 35319256 35319365 -146428722 + RMER21B LTR ERV1 396 502 -340 6 854 2390 137 62 9 chr2 35319787 35320190 -146427897 + MTC LTR MaLR 2 407 -14 6 854 922 107 0 41 chr2 35321098 35321244 -146426843 - ORR1C2 LTR MaLR -11 373 234 6 854 742 192 29 68 chr2 35321323 35321497 -146426590 + ORR1C2 LTR MaLR 5 173 -211 6 854 742 192 29 68 chr2 35321573 35321605 -146426482 + ORR1C2 LTR MaLR 174 203 -181 6 854 282 129 0 75 chr2 35325013 35325080 -146423007 - MT2A LTR ERVL 0 533 472 6 854 2346 171 26 14 chr2 35325218 35325633 -146422454 - MT2A LTR ERVL -76 457 38 6 854 391 306 0 36 chr2 35325533 35325645 -146422442 - MTE2b LTR MaLR -242 137 30 6 854 1615 173 47 11 chr2 35326319 35326631 -146421456 - MTD LTR MaLR -9 410 104 6 854 532 210 0 156 chr2 35329934 35330075 -146418012 - MTD LTR MaLR -299 120 2 6 854 2089 178 22 11 chr2 35330521 35330891 -146417196 + ORR1C1 LTR MaLR 5 378 0 6 854 2475 180 28 7 chr2 35330891 35331356 -146416731 + ORR1C1-int LTR MaLR 1 475 -1034 6 854 1671 140 26 0 chr2 35331362 35331627 -146416460 + ORR1C1-int LTR MaLR 806 1077 -432 6 854 934 183 30 0 chr2 35331626 35331790 -146416297 + ORR1C1 LTR MaLR 210 378 0 6 854 1908 150 65 78 chr2 35331913 35332310 -146415777 + ORR1B1 LTR MaLR 1 392 -2 6 854 832 230 107 50 chr2 35333530 35333938 -146414149 + RLTR20A1 LTR ERVK 73 551 0 6 854 495 296 142 63 chr2 35336010 35336504 -146411583 + RMER5 LTR ERV1 2 534 0 6 854 235 269 45 0 chr2 35336506 35336573 -146411514 - LTR73 LTR ERV1 -300 272 203 6 854 579 314 119 48 chr2 35337078 35337573 -146410514 - LTR73 LTR ERV1 -20 552 23 6 854 1329 224 135 14 chr2 35341351 35341436 -146406651 + MTD LTR MaLR 1 102 -317 6 854 1329 224 135 14 chr2 35341578 35341863 -146406224 + MTD LTR MaLR 103 416 -3 6 854 6105 86 9 9 chr2 35344638 35345352 -146402735 + RLTR22_Mus LTR ERVK 1 721 -1087 7 854 6105 86 9 9 chr2 35345518 35345649 -146402438 + RLTR22_Mus LTR ERVK 722 849 -959 7 854 1508 123 35 31 chr2 35345887 35346146 -146401941 + RLTR22_Mus LTR ERVK 1543 1802 -6 7 854 1052 258 95 0 chr2 35347146 35347398 -146400689 + MTEb LTR MaLR 3 278 -101 7 854 324 303 92 92 chr2 35348324 35348564 -146399523 + MLT1D LTR MaLR 136 375 -130 7 854 267 278 172 32 chr2 35349782 35349875 -146398212 + ORR1E LTR MaLR 1 106 -253 7 854 1639 186 128 13 chr2 35350631 35351007 -146397080 + MTD LTR MaLR 1 419 0 7 854 229 315 71 36 chr2 35351123 35351235 -146396852 - MLT1E3 LTR MaLR -7 617 502 7 854 3224 149 72 15 chr2 35353336 35353879 -146394208 - RMER15 LTR ERVL 0 575 2 7 854 1937 121 121 0 chr2 35356380 35356695 -146391392 + ORR1B2 LTR MaLR 1 353 -14 7 854 2781 24 15 3 chr2 35356807 35357141 -146390946 - ORR1A0 LTR MaLR -8 338 1 7 854 497 298 192 19 chr2 35358288 35358548 -146389539 + RMER5 LTR ERV1 48 352 -182 7 854 256 310 277 15 chr2 35358661 35358867 -146389220 + MLT1J1 LTR MaLR 31 290 -154 7 854 2301 137 9 6 chr2 35360549 35360894 -146387193 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 7 854 381 330 31 56 chr2 35362060 35362256 -146385831 + LTR40a LTR ERVL 40 230 -289 7 854 421 152 151 66 chr2 35365365 35365471 -146382616 + RLTR28B LTR ERVL 1 115 -366 7 854 1719 165 143 21 chr2 35365475 35365853 -146382234 + RLTR23 LTR ERV1 1 424 -6 7 854 298 238 184 59 chr2 35365837 35365989 -146382098 + RLTR28B LTR ERVL 181 351 -130 7 854 322 71 0 0 chr2 35371066 35371108 -146376979 + RLTR10B LTR ERVK 1 42 -250 7 854 261 57 0 0 chr2 35371130 35371165 -146376922 + RLTR10B LTR ERVK 9 43 -249 7 854 2087 39 0 121 chr2 35371172 35371495 -146376592 + RLTR10B LTR ERVK 9 292 0 7 854 1888 181 96 16 chr2 35372544 35372921 -146375166 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 7 854 446 160 60 127 chr2 35374108 35374258 -146373829 + MT2B LTR ERVL 139 278 -323 7 854 3208 95 8 40 chr2 35374326 35374819 -146373268 + LTRIS_Mus LTR ERV1 129 604 -50 7 854 3147 3 49 0 chr2 35375044 35375394 -146372693 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 7 854 54366 20 17 1 chr2 35375394 35381767 -146366320 + IAPEz-int LTR ERVK 8 6481 0 7 854 3147 3 49 0 chr2 35381767 35382117 -146365970 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 7 854 238 282 100 46 chr2 35382118 35382248 -146365839 - RLTR14 LTR ERV1 0 382 246 7 854 328 335 81 10 chr2 35382814 35383110 -146364977 + RMER17C LTR ERVK 69 385 -25 7 854 1282 241 42 30 chr2 35383606 35383939 -146364148 + MTE2a LTR MaLR 1 337 -42 7 854 688 137 100 46 chr2 35386859 35386989 -146361098 + MTC LTR MaLR 14 150 -271 8 854 1465 185 45 13 chr2 35388331 35388721 -146359366 + MTC LTR MaLR 7 413 -8 8 855 350 278 68 117 chr2 35389875 35390038 -146358049 + MER34 LTR ERV1 375 529 -13 8 855 1347 224 95 20 chr2 35390368 35390715 -146357372 + MTD LTR MaLR 8 380 -39 8 855 2064 160 37 37 chr2 35390763 35391139 -146356948 + ORR1C1 LTR MaLR 1 376 -2 8 855 947 204 122 174 chr2 35391221 35391613 -146356474 - ORR1D1 LTR MaLR -2 372 1 8 855 2966 88 2 20 chr2 35392170 35392574 -146355513 + MTB LTR MaLR 1 397 -3 8 855 7029 143 186 4 chr2 35392575 35393178 -146354909 + MTB-int LTR MaLR 2 649 -860 8 855 7029 143 186 4 chr2 35393322 35393993 -146354094 + MTB-int LTR MaLR 650 1507 -2 8 855 2100 196 18 5 chr2 35393994 35394383 -146353704 + MTB LTR MaLR 1 394 0 8 855 294 289 113 83 chr2 35396422 35396626 -146351461 + MT2A LTR ERVL 104 313 -220 8 855 348 291 120 5 chr2 35396700 35396883 -146351204 + MT2A LTR ERVL 350 598 -3 8 855 444 307 55 84 chr2 35404991 35405229 -146342858 - RLTR26 LTR ERVK -225 417 187 8 855 684 238 77 77 chr2 35408125 35408182 -146339905 + ORR1C2 LTR MaLR 115 165 -209 8 855 939 178 70 20 chr2 35408229 35408431 -146339656 + ORR1C2 LTR MaLR 166 384 0 8 855 341 322 98 12 chr2 35416286 35416459 -146331628 - MLT1B LTR MaLR -21 369 182 8 855 572 246 142 84 chr2 35420690 35420965 -146327122 + MTE2a LTR MaLR 2 292 -87 8 855 2359 132 52 50 chr2 35425730 35426113 -146321974 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 8 855 390 154 38 13 chr2 35428516 35428595 -146319492 - MTC LTR MaLR -340 81 1 8 855 345 291 137 55 chr2 35486007 35486207 -146261880 - ORR1E LTR MaLR -151 219 18 9 855 319 339 109 0 chr2 35487918 35488092 -146259995 - LTR40a LTR ERVL 0 519 327 9 855 481 267 128 5 chr2 35489698 35489894 -146258193 - MLT1D LTR MaLR -11 494 275 9 855 291 327 88 0 chr2 35490126 35490239 -146257848 - MLT1D LTR MaLR -376 129 7 9 855 2192 168 40 8 chr2 35515720 35516117 -146231970 - MTC LTR MaLR -8 413 4 2 856 696 232 77 41 chr2 35532060 35532323 -146215764 - MTD LTR MaLR -103 316 1 4 856 661 103 7 0 chr2 35537137 35537247 -146210840 + MT2C_Mm LTR ERVL 380 584 0 4 856 1939 95 17 90 chr2 35560113 35560459 -146187628 - ORR1A4 LTR MaLR -8 321 1 6 856 715 318 123 15 chr2 35579829 35580155 -146167932 - MLT1A0 LTR MaLR -4 361 1 7 856 607 268 16 32 chr2 35590207 35590396 -146157691 - LTR37A LTR ERV1 -29 397 212 9 856 1440 174 66 7 chr2 35598528 35598817 -146149270 + MTD LTR MaLR 14 319 -100 1 856 624 283 161 51 chr2 35601041 35601376 -146146711 + MLT1A LTR MaLR 3 374 0 1 856 302 330 96 54 chr2 35615018 35615312 -146132775 - MLT1B LTR MaLR -4 386 47 1 856 2521 142 47 104 chr2 35616840 35617313 -146130774 + RLTR41 LTR ERV1 1 446 0 1 856 3629 151 179 88 chr2 35617316 35618143 -146129944 - RMER19B LTR ERVK 0 902 1 1 856 1225 231 129 18 chr2 35618798 35619138 -146128949 + MTE2b LTR MaLR 2 379 0 1 856 1346 190 234 40 chr2 35619341 35619692 -146128395 - MTD LTR MaLR 0 419 1 1 856 1423 192 121 52 chr2 35625389 35625551 -146122536 + MTC LTR MaLR 23 204 -217 1 856 1423 192 121 52 chr2 35625706 35625906 -146122181 + MTC LTR MaLR 205 410 -11 1 856 304 277 83 103 chr2 35627914 35628059 -146120028 - MT2B2 LTR ERVL -327 257 116 1 856 2090 91 45 42 chr2 35628080 35628389 -146119698 + RMER13A LTR ERVK 1 310 -550 1 856 533 191 0 41 chr2 35628398 35628496 -146119591 + RMER13A LTR ERVK 767 860 0 1 856 320 312 88 73 chr2 35647562 35647766 -146100321 + MLT1J LTR MaLR 218 424 -88 2 856 1004 237 190 38 chr2 35649280 35649627 -146098460 - MTD LTR MaLR -15 404 5 2 856 242 368 100 63 chr2 35649644 35649938 -146098149 + MLT1A1 LTR MaLR 37 346 -62 2 856 242 368 100 63 chr2 35650129 35650185 -146097902 + MLT1A1 LTR MaLR 347 400 -8 2 857 1624 203 42 11 chr2 35651945 35652299 -146095788 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 3 2 857 1248 114 5 25 chr2 35653136 35653334 -146094753 + ORR1B2 LTR MaLR 1 194 -173 2 857 285 280 9 114 chr2 35662926 35663031 -146085056 - MT2B2 LTR ERVL -338 246 153 2 857 346 244 96 154 chr2 35666756 35666964 -146081123 + MLT1B LTR MaLR 2 197 -193 2 857 545 182 20 10 chr2 35671469 35671569 -146076518 + ORR1C2 LTR MaLR 275 375 -9 2 857 1265 220 165 14 chr2 35675787 35676133 -146071954 - MTD LTR MaLR -1 418 21 2 857 228 371 69 55 chr2 35679056 35679347 -146068740 + ORR1E LTR MaLR 4 298 -61 2 857 1840 117 11 124 chr2 35684126 35684497 -146063590 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 2 857 516 276 28 133 chr2 35684913 35685168 -146062919 - MLT1B LTR MaLR -159 231 4 2 857 1699 221 35 81 chr2 35692250 35692739 -146055348 + RLTR1B LTR ERV1 1 512 0 3 857 374 246 72 56 chr2 35701948 35702064 -146046023 - MLT1A0 LTR MaLR -193 172 55 3 857 927 310 16 93 chr2 35702064 35702452 -146045635 - MTE2b LTR MaLR -2 377 20 3 857 416 307 114 84 chr2 35717919 35718249 -146029838 - ORR1E LTR MaLR -4 374 12 3 857 1031 294 95 31 chr2 35720081 35720407 -146027680 - MTE2b LTR MaLR -1 378 32 3 857 238 284 116 69 chr2 35724305 35724404 -146023683 - MLT1A0 LTR MaLR -54 311 130 3 857 238 284 116 69 chr2 35724499 35724521 -146023566 - MLT1A0 LTR MaLR -54 129 86 3 857 994 276 53 78 chr2 35728977 35729410 -146018677 + BGLII_B LTR ERVK 2 423 -18 3 857 1014 270 35 88 chr2 35730007 35730384 -146017703 - MTE2a LTR MaLR -17 362 6 3 857 322 325 55 39 chr2 35733816 35733944 -146014143 + MLT1A1 LTR MaLR 1 130 -278 3 857 1129 262 133 16 chr2 35735173 35735495 -146012592 - MTE2b LTR MaLR -19 360 1 3 857 306 369 86 38 chr2 35739223 35739513 -146008574 + LTR89 LTR ERVL? 574 877 -2 3 857 269 222 157 29 chr2 35745165 35745267 -146002820 - MT2B LTR ERVL -349 252 138 3 857 609 284 123 55 chr2 35749291 35749649 -145998438 + MLT1F2 LTR MaLR 12 408 -161 3 857 227 306 0 0 chr2 35750105 35750167 -145997920 + MLT1F2 LTR MaLR 453 514 -46 3 857 497 312 116 66 chr2 35759721 35760023 -145988064 + MLT1A0 LTR MaLR 2 318 -47 4 857 961 236 32 23 chr2 35764828 35765111 -145982976 - ORR1D2 LTR MaLR 0 374 9 4 857 225 333 0 35 chr2 35767358 35767445 -145980642 - MLT1A0 LTR MaLR -261 104 21 4 857 235 214 69 28 chr2 35775595 35775667 -145972420 + ORR1E LTR MaLR 33 107 -252 4 857 1954 182 58 11 chr2 35776080 35776462 -145971625 - MTC LTR MaLR -21 400 1 4 857 648 289 54 41 chr2 35777708 35778184 -145969903 + RLTR15 LTR ERVK 1 347 -12 4 107 1658 180 176 3 chr2 35782524 35782881 -145965206 - MTD LTR MaLR 0 419 1 4 858 794 268 78 83 chr2 35785290 35785689 -145962398 - MTE2a LTR MaLR -19 400 1 4 858 410 183 24 0 chr2 35788924 35789006 -145959081 + ORR1D2 LTR MaLR 1 84 -286 4 858 488 228 69 69 chr2 35789013 35789135 -145958952 + ORR1D2 LTR MaLR 211 335 -35 4 858 488 228 69 69 chr2 35789159 35789196 -145958891 + ORR1D2 LTR MaLR 336 370 0 4 858 1800 105 92 67 chr2 35792746 35793066 -145955021 - ORR1A2 LTR MaLR -3 376 1 4 858 441 294 13 40 chr2 35798460 35798609 -145949478 - LTR87 LTR ERVL? -14 610 466 5 858 238 327 125 0 chr2 35798628 35798732 -145949355 - LTR87 LTR ERVL? -209 415 299 5 858 733 173 15 22 chr2 35803454 35803590 -145944497 + RLTR18B LTR ERVK 173 307 -205 5 858 1063 175 16 0 chr2 35803638 35803821 -145944266 + RLTR18B LTR ERVK 319 504 -8 5 858 2812 133 64 24 chr2 35804341 35804840 -145943247 + RLTR12B LTR ERVK 1 519 -9 5 858 1591 280 86 20 chr2 35805280 35805837 -145942250 + MER73 LTR ERVL 34 627 -17 5 858 289 366 67 25 chr2 35806076 35806314 -145941773 - ORR1E LTR MaLR -111 248 1 5 858 3612 13 2 0 chr2 35806494 35806889 -145941198 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 858 238 252 103 75 chr2 35812445 35812552 -145935535 - RLTR20D LTR ERVK -391 177 68 5 858 1151 233 50 19 chr2 35814770 35815092 -145932995 + BGLII_B LTR ERVK 96 441 0 5 858 6177 57 29 29 chr2 35817754 35818555 -145929532 + RLTR13B4 LTR ERVK 1 801 -2 5 858 369 241 17 85 chr2 35823544 35823561 -145924526 + MT2B LTR ERVL 149 157 -444 5 858 535 200 0 102 chr2 35830211 35830339 -145917748 - MT2B LTR ERVL -343 258 144 5 858 605 309 35 90 chr2 35840283 35840649 -145907438 + MT2A LTR ERVL 1 346 -187 5 858 296 270 29 9 chr2 35843479 35843560 -145904527 - RMER21B LTR ERV1 -46 901 772 6 858 3570 156 104 10 chr2 35843560 35844272 -145903815 - RMER21A LTR ERV1 0 947 169 6 858 379 236 18 62 chr2 35845101 35845214 -145902873 - MTE2b LTR MaLR -21 358 251 6 858 297 242 87 11 chr2 35846365 35846457 -145901630 - MLT1I LTR MaLR -1 410 312 6 858 4093 155 75 57 chr2 35847362 35848204 -145899883 - RMER13A LTR ERVK -1 859 3 6 858 388 267 103 7 chr2 35848320 35848456 -145899631 + MLT1H2 LTR MaLR 93 241 -248 6 858 238 189 0 0 chr2 35848929 35848966 -145899121 - RLTR24 LTR ERV1 -108 421 385 6 858 266 167 68 96 chr2 35848985 35849058 -145899029 - RLTR4_Mm LTR ERV1 -162 580 510 6 858 2270 129 63 8 chr2 35851546 35851725 -145896362 + MTC LTR MaLR 1 199 -222 6 858 2270 129 63 8 chr2 35851778 35851997 -145896090 + MTC LTR MaLR 200 420 -1 6 858 515 261 173 26 chr2 35852396 35852639 -145895448 - ORR1E LTR MaLR -101 269 2 6 858 481 261 65 47 chr2 35852789 35852956 -145895131 + ORR1E LTR MaLR 3 172 -187 6 858 640 109 109 0 chr2 35852956 35853075 -145895012 - RLTR28B LTR ERVL 0 524 393 6 858 893 152 0 0 chr2 35853063 35853214 -145894873 - RLTR28B LTR ERVL -330 151 1 6 858 227 299 161 22 chr2 35854057 35854194 -145893893 + RMER15 LTR ERVL 420 575 0 6 858 873 105 77 0 chr2 35854795 35854938 -145893149 - RMER15 LTR ERVL -421 154 1 6 858 873 223 64 27 chr2 35855944 35856235 -145891852 - ORR1E LTR MaLR -16 343 24 6 858 1375 162 264 11 chr2 35856273 35856629 -145891458 + RMER15 LTR ERVL 127 572 -3 6 858 2616 155 47 4 chr2 35856725 35857032 -145891055 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 211 6 858 2616 155 47 4 chr2 35857065 35857263 -145890824 - RLTR11A LTR ERVK -318 210 2 6 858 3873 183 30 45 chr2 35859327 35860209 -145887878 + RMER13B LTR ERVK 6 873 -35 6 858 707 131 429 4 chr2 35862035 35862280 -145885807 + ORR1B1 LTR MaLR 1 349 -45 6 858 279 306 78 142 chr2 35864506 35864788 -145883299 - ORR1E LTR MaLR 0 359 96 6 858 2625 18 95 6 chr2 35870072 35870409 -145877678 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 6 858 4564 49 66 14 chr2 35870409 35871032 -145877055 + IAPEz-int LTR ERVK 8 662 -5819 6 858 440 66 0 32 chr2 35871032 35871095 -145876992 + IAPEz-int LTR ERVK 1359 1419 -5062 6 858 1701 123 4 15 chr2 35871084 35871349 -145876738 + IAPEz-int LTR ERVK 2236 2497 -5183 6 858 891 88 24 0 chr2 35871344 35871469 -145876618 + IAPEz-int LTR ERVK 4783 4910 -2770 6 858 25464 17 1 0 chr2 35871469 35874422 -145873665 + IAPEz-int LTR ERVK 3525 6481 0 6 858 2603 21 95 6 chr2 35874422 35874759 -145873328 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 6 858 689 274 176 68 chr2 35879525 35879865 -145868222 + MTE2a LTR MaLR 3 379 0 6 858 1990 132 105 6 chr2 35881402 35881753 -145866334 + ORR1B1 LTR MaLR 1 386 -8 6 858 2367 69 3 0 chr2 35886448 35886766 -145861321 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 6 858 1270 235 120 18 chr2 35886795 35887129 -145860958 + ORR1D2 LTR MaLR 1 368 -2 6 858 1666 233 36 18 chr2 35887131 35887520 -145860567 + ORR1D2-int LTR MaLR 1 396 -974 6 858 643 225 33 13 chr2 35887524 35887677 -145860410 + ORR1D2 LTR MaLR 212 367 -3 6 858 393 169 112 56 chr2 35895943 35895955 -145852132 - MT2B LTR ERVL -315 246 155 6 858 534 311 90 93 chr2 35898839 35899215 -145848872 + MLT1K LTR MaLR 165 539 -56 7 858 225 277 25 0 chr2 35906512 35906631 -145841456 - ORR1B1-int LTR MaLR -755 754 633 7 858 361 288 86 102 chr2 35908778 35909213 -145838874 - MLT1C LTR MaLR -4 463 1 7 858 968 301 156 11 chr2 35909735 35910088 -145837999 - MLT2B1 LTR ERVL 0 554 96 7 858 968 298 161 11 chr2 35910120 35910179 -145837908 - MLT2B1 LTR ERVL -425 95 38 7 859 278 237 17 0 chr2 35915506 35915565 -145832522 - ERVL-E-int LTR ERVL -499 5258 5199 7 859 279 310 11 22 chr2 35915763 35915852 -145832235 - ERVL-E-int LTR ERVL -816 4851 4764 7 859 1449 223 69 34 chr2 35919231 35919580 -145828507 + MTE2a LTR MaLR 8 368 -11 7 859 253 248 74 74 chr2 35921941 35922063 -145826024 + MLT1A1 LTR MaLR 271 392 -16 7 859 288 275 65 21 chr2 35968217 35968310 -145779777 + MLT1K LTR MaLR 493 589 -6 8 859 229 295 120 43 chr2 35969227 35969344 -145778743 - MLT1A1 LTR MaLR -23 385 260 8 859 259 235 14 42 chr2 35969609 35969680 -145778407 - MLT1A1 LTR MaLR -324 84 16 8 859 2754 57 79 0 chr2 35990285 35990652 -145757435 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 8 859 1464 133 74 80 chr2 36008002 36008186 -145739901 + MTC LTR MaLR 6 209 -212 1 859 1464 133 74 80 chr2 36008731 36008870 -145739217 + MTC LTR MaLR 210 329 -92 1 859 1750 147 191 0 chr2 36009490 36009804 -145738283 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 1 859 1521 207 89 14 chr2 36016867 36017215 -145730872 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 3 859 599 143 19 9 chr2 36020947 36021053 -145727034 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 278 4 859 1271 149 106 4 chr2 36030879 36031115 -145716972 + MTC LTR MaLR 79 338 -83 6 859 272 271 0 0 chr2 36031143 36031213 -145716874 - MLT1I LTR MaLR 0 411 342 7 859 2756 20 0 0 chr2 36037028 36037369 -145710718 - ORR1A0 LTR MaLR -5 341 1 8 860 344 291 221 11 chr2 36046235 36046506 -145701581 - MER21B LTR ERV1 -92 771 444 1 860 349 196 69 40 chr2 36055153 36055254 -145692833 - MT2B LTR ERVL -344 257 154 1 860 773 248 108 58 chr2 36064677 36064972 -145683115 - MTEa LTR MaLR -68 311 2 1 860 2120 75 58 61 chr2 36076918 36077246 -145670841 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 1 860 2097 135 70 3 chr2 36077251 36077623 -145670464 + MTC LTR MaLR 1 397 -24 1 860 284 379 43 43 chr2 36079385 36079570 -145668517 + MLT1K LTR MaLR 168 352 -243 1 860 229 359 48 10 chr2 36080239 36080343 -145667744 + MLT1J2 LTR MaLR 3 110 -338 1 860 267 316 111 43 chr2 36094042 36094204 -145653883 - MamGypLTR3 LTR Gypsy -118 721 549 1 860 686 276 106 75 chr2 36101016 36101364 -145646723 - ORR1E LTR MaLR 0 359 1 2 860 928 279 81 6 chr2 36101815 36102136 -145645951 + MLT1B LTR MaLR 4 348 -42 2 860 384 296 68 62 chr2 36102789 36102951 -145645136 - MLT1C LTR MaLR -105 362 200 2 860 232 284 49 12 chr2 36103851 36103928 -145644159 - MLT1C LTR MaLR -384 83 4 2 860 256 200 78 130 chr2 36109814 36109929 -145638158 - MT2B LTR ERVL -337 264 156 2 860 537 340 55 31 chr2 36112165 36112420 -145635667 + MLT2C1 LTR ERVL 70 330 -67 2 860 731 263 53 141 chr2 36117165 36117484 -145630603 - MTE2a LTR MaLR -88 291 1 2 860 1524 155 211 22 chr2 36119540 36119721 -145628366 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 177 2 860 1524 155 211 22 chr2 36119782 36119923 -145628164 - ORR1C2 LTR MaLR -208 176 1 2 860 956 143 83 28 chr2 36122281 36122460 -145625627 + ORR1C2 LTR MaLR 40 228 -156 2 860 5476 214 69 21 chr2 36122460 36122701 -145625386 + ORR1C2-int LTR MaLR 1 242 -1128 2 860 5476 214 69 21 chr2 36122734 36123746 -145624341 + ORR1C2-int LTR MaLR 243 1313 -57 2 860 1899 183 89 39 chr2 36123746 36124128 -145623959 - MTB_Mm LTR MaLR -6 401 1 2 860 235 193 0 50 chr2 36124128 36124188 -145623899 + ORR1C2-int LTR MaLR 1451 1507 -2 2 860 1672 185 26 17 chr2 36124203 36124505 -145623582 + ORR1C2 LTR MaLR 69 373 -11 2 860 416 259 126 6 chr2 36124846 36125013 -145623074 + RMER15-int LTR ERVL 4147 4333 -666 2 860 240 296 144 27 chr2 36126928 36127039 -145621048 - MLT1B LTR MaLR -3 387 264 2 860 1317 212 86 31 chr2 36128531 36128882 -145619205 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 2 860 294 274 123 0 chr2 36129632 36129705 -145618382 - ORR1E LTR MaLR -190 169 88 2 860 878 218 24 47 chr2 36129709 36129892 -145618195 - ORR1C1 LTR MaLR -8 370 185 2 860 878 218 24 47 chr2 36130071 36130099 -145617988 - ORR1C1 LTR MaLR -194 184 164 2 860 246 293 40 73 chr2 36130078 36130125 -145617962 + RLTR40 LTR ERVK 618 718 -99 2 860 416 183 12 35 chr2 36130125 36130210 -145617877 - ORR1C1 LTR MaLR -190 188 106 2 860 246 293 40 73 chr2 36130210 36130229 -145617858 + RLTR40 LTR ERVK 719 763 -54 2 860 541 160 0 29 chr2 36130530 36130633 -145617454 - ORR1C1 LTR MaLR -284 100 1 2 860 251 269 0 0 chr2 36130668 36130720 -145617367 - ORR1E LTR MaLR -303 56 5 2 860 543 305 208 38 chr2 36131327 36131653 -145616434 + MLT1A LTR MaLR 1 408 0 2 860 1820 173 56 66 chr2 36134955 36135332 -145612755 - ORR1B1 LTR MaLR -21 373 1 2 860 2198 138 12 3 chr2 36146923 36147264 -145600823 + RLTR17 LTR ERVK 1 344 -348 3 860 245 98 24 0 chr2 36147273 36147314 -145600773 + RLTR17 LTR ERVK 290 331 -361 3 861 2172 139 12 56 chr2 36178012 36178440 -145569647 + RLTR9E LTR ERVK 1 409 0 3 861 410 224 0 0 chr2 36181741 36181826 -145566261 - ORR1B1 LTR MaLR -246 148 64 3 861 1984 177 33 8 chr2 36181902 36182267 -145565820 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 3 861 1308 205 153 12 chr2 36182804 36182964 -145565123 - ORR1C2 LTR MaLR -12 372 179 3 861 1308 205 153 12 chr2 36183021 36183186 -145564901 - ORR1C2 LTR MaLR -206 178 2 3 861 2137 108 12 58 chr2 36183787 36184130 -145563957 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 3 861 1581 175 28 49 chr2 36184505 36184895 -145563192 - RMER3D-int LTR ERVK -536 2306 1925 3 861 686 154 42 55 chr2 36184896 36185061 -145563026 - RMER3D-int LTR ERVK -1148 1694 1532 3 861 1935 150 107 21 chr2 36185093 36185572 -145562515 - RMER3D-int LTR ERVK -1309 1533 1014 3 861 560 102 32 59 chr2 36185646 36185764 -145562323 - RMER3D-int LTR ERVK -2259 583 489 3 861 608 235 0 43 chr2 36185897 36186106 -145561981 - RMER3D-int LTR ERVK -1991 851 652 3 861 536 132 44 0 chr2 36186118 36186209 -145561878 - RMER3D-int LTR ERVK -2259 583 489 3 861 3057 61 22 10 chr2 36186614 36187030 -145561057 - BGLII LTR ERVK 0 421 1 3 861 2736 115 21 89 chr2 36187661 36188178 -145559909 - RLTR45 LTR ERVK 0 482 1 3 861 226 183 48 32 chr2 36194231 36194293 -145553794 + RMER20A LTR ERVK 186 248 -268 3 861 4142 33 12 0 chr2 36201627 36202114 -145545973 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 3 861 364 21 0 0 chr2 36202114 36202161 -145545926 - MERVL-int LTR ERVL 0 5485 5439 3 861 343 95 15 60 chr2 36202161 36202228 -145545859 - ORR1A3-int LTR MaLR -1333 630 567 3 861 18165 27 0 0 chr2 36202228 36204405 -145543682 - MERVL-int LTR ERVL -114 5371 3195 3 861 3838 41 8 0 chr2 36204405 36204889 -145543198 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 488 -610 3 861 2784 118 55 2 chr2 36204889 36205340 -145542747 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 3 861 52649 23 11 8 chr2 36205342 36211762 -145536325 - IAPEz-int LTR ERVK -2 6479 36 3 861 4837 48 10 0 chr2 36211762 36211774 -145536313 + MTA_Mm-int LTR MaLR 470 481 -617 3 861 2802 113 55 2 chr2 36211774 36212225 -145535862 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 3 861 4837 48 10 0 chr2 36212225 36212833 -145535254 + MTA_Mm-int LTR MaLR 482 1095 -3 3 861 3332 30 5 10 chr2 36212835 36213233 -145534854 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 861 1422 150 148 10 chr2 36213826 36214129 -145533958 - IAPLTR4 LTR ERVK 0 345 1 3 861 5848 239 40 31 chr2 36214129 36216643 -145531444 - IAPLTR3-int LTR ERVK -351 7329 3472 3 861 794 76 17 8 chr2 36216782 36216901 -145531186 - MMERVK10C-int LTR ERVK -2932 4649 4530 3 861 418 187 9 36 chr2 36216927 36217038 -145531049 - IAPLTR3-int LTR ERVK -2380 2464 2357 3 861 6570 106 43 4 chr2 36217079 36218424 -145529663 - ETnERV3-int LTR ERVK -3200 4206 2735 3 861 310 256 0 55 chr2 36218436 36218527 -145529560 - ETnERV3-int LTR ERVK -4867 2539 2454 3 861 418 188 102 8 chr2 36218538 36218656 -145529431 - ETnERV3-int LTR ERVK -5557 1849 1721 3 861 1114 194 102 96 chr2 36218701 36219154 -145528933 - RMER16-int LTR ERVK -4783 623 251 3 861 281 152 55 118 chr2 36219267 36219366 -145528721 - MMERVK10C-int LTR ERVK -6629 952 862 3 861 11603 33 6 0 chr2 36219366 36220806 -145527281 - IAPLTR4_I LTR ERVK 0 1470 22 3 861 1348 136 59 12 chr2 36220806 36221111 -145526976 - IAPLTR4 LTR ERVK 0 332 1 3 861 603 226 115 84 chr2 36223105 36223462 -145524625 - RLTR9A LTR ERVK 0 368 1 3 861 1533 147 60 25 chr2 36227950 36228264 -145519823 - ORR1A4 LTR MaLR -4 325 1 3 861 316 312 79 16 chr2 36228417 36228544 -145519543 - MLT1B LTR MaLR -4 386 252 3 861 411 248 66 84 chr2 36236908 36237075 -145511012 - RNLTR23 LTR ERVK 0 642 479 3 861 226 273 0 0 chr2 36238862 36238917 -145509170 - ORR1D1 LTR MaLR -319 55 1 3 861 3186 265 56 17 chr2 36238917 36239760 -145508327 - ORR1D1-int LTR MaLR 0 1370 523 3 861 2726 75 3 0 chr2 36246610 36246955 -145501132 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 4 861 3857 108 45 67 chr2 36248649 36249400 -145498687 + RMER17A LTR ERVK 1 735 -16 4 861 5559 113 36 22 chr2 36253169 36254061 -145494026 + RMER17A2 LTR ERVK 3 906 0 4 861 2167 48 4 0 chr2 36257440 36257708 -145490379 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 128 4 861 4961 112 18 30 chr2 36269273 36270063 -145478024 - RLTR13D1 LTR ERVK -26 780 1 4 861 373 279 57 57 chr2 36270316 36270491 -145477596 + RLTR23 LTR ERV1 254 428 -2 4 861 4296 154 76 35 chr2 36270591 36271457 -145476630 - RLTR13D6 LTR ERVK 0 902 1 4 861 1317 221 21 24 chr2 36273350 36273680 -145474407 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 4 861 294 302 106 16 chr2 36273833 36273954 -145474133 - MLT1B LTR MaLR -19 371 248 4 861 3447 286 58 29 chr2 36281257 36282344 -145465743 - ORR1D-int LTR MaLR 0 1370 253 4 862 1658 209 36 6 chr2 36311102 36311463 -145436624 + ORR1D1 LTR MaLR 3 374 0 4 862 949 269 95 14 chr2 36311984 36312295 -145435792 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 4 862 1459 146 66 56 chr2 36313879 36314183 -145433904 - RMER4B LTR ERVK -228 357 51 4 862 2985 163 101 37 chr2 36314888 36315881 -145432206 - RLTR13D1 LTR ERVK 0 1023 1 4 862 472 299 47 8 chr2 36326470 36326598 -145421489 - ETnERV2-int LTR ERVK -204 7202 7070 4 862 254 264 0 52 chr2 36329008 36329104 -145418983 - RMER16-int LTR ERVK -5315 91 1 4 862 758 227 276 59 chr2 36329104 36329473 -145418614 - RMER16 LTR ERVK 0 533 1 4 862 2562 166 46 2 chr2 36331255 36331709 -145416378 + ORR1A3-int LTR MaLR 1490 1963 0 4 862 1759 151 36 63 chr2 36331709 36332041 -145416046 + ORR1A3 LTR MaLR 1 323 -3 4 862 383 296 68 58 chr2 36341007 36341200 -145406887 + MLT1B LTR MaLR 184 386 -4 4 862 547 159 120 9 chr2 36343965 36344073 -145404014 + RMER16 LTR ERVK 1 120 -413 4 862 1742 136 96 3 chr2 36345785 36346138 -145401949 + RMER16-int LTR ERVK 3401 3786 -1620 4 862 3462 30 0 0 chr2 36348045 36348441 -145399646 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 862 2463 191 65 34 chr2 36357720 36358274 -145389813 - RMER4B LTR ERVK 0 585 15 4 862 2383 97 156 0 chr2 36366705 36367116 -145380971 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 4 862 5765 41 5 12 chr2 36367118 36367867 -145380220 - IAPEz-int LTR ERVK -2 6479 5736 4 862 2141 58 0 0 chr2 36367866 36368144 -145379943 - IAPEz-int LTR ERVK -4845 1636 1359 4 862 3619 67 2 18 chr2 36368144 36368647 -145379440 - IAPEz-int LTR ERVK -5819 662 168 4 862 239 321 0 0 chr2 36368647 36368700 -145379387 - RLTR27 LTR ERVK -34 275 223 4 862 985 62 75 69 chr2 36368700 36368873 -145379214 - IAPEz-int LTR ERVK -6286 195 22 4 862 261 128 0 0 chr2 36368890 36368937 -145379150 - IAPEz-int LTR ERVK -1930 57 11 4 862 337 130 0 0 chr2 36368921 36368975 -145379112 - IAPEz-int LTR ERVK -1931 56 3 4 862 2367 100 156 0 chr2 36368977 36369388 -145378699 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 4 862 365 294 69 95 chr2 36379419 36379723 -145368364 - MLT1B LTR MaLR -18 372 77 4 862 1460 223 16 47 chr2 36385991 36386377 -145361710 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 4 862 4028 201 60 10 chr2 36386545 36387477 -145360610 + RMER19B LTR ERVK 3 896 -6 4 862 427 198 12 0 chr2 36387856 36387942 -145360145 - ORR1C2 LTR MaLR -12 372 286 4 862 476 289 57 19 chr2 36387938 36388097 -145359990 - ORR1C2 LTR MaLR -206 178 14 4 862 797 208 13 0 chr2 36388363 36388512 -145359575 - ORR1C2-int LTR MaLR -437 1072 922 4 862 1312 214 246 22 chr2 36389555 36389986 -145358101 - RLTR11A LTR ERVK -1 527 1 5 862 1684 147 31 7 chr2 36395692 36395980 -145352107 + RMER17A2 LTR ERVK 1 295 -611 5 862 2725 162 110 21 chr2 36408632 36408673 -145339414 + RMER17A2 LTR ERVK 274 335 -571 5 862 2725 162 110 21 chr2 36408816 36409355 -145338732 + RMER17A2 LTR ERVK 336 906 0 5 862 460 284 31 83 chr2 36409626 36409818 -145338269 + RLTR23 LTR ERV1 244 425 -5 5 862 7133 198 49 82 chr2 36409892 36411699 -145336388 - ORR1A4-int LTR MaLR -198 1765 19 5 862 1376 211 25 22 chr2 36411711 36411735 -145336352 - ORR1A4 LTR MaLR -9 320 297 5 862 1695 147 36 69 chr2 36411735 36412070 -145336017 - ORR1A2 LTR MaLR -3 324 1 5 862 1376 211 25 22 chr2 36412070 36412364 -145335723 - ORR1A4 LTR MaLR -33 296 2 5 862 1854 138 43 0 chr2 36412703 36413007 -145335080 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 11 5 862 783 157 12 33 chr2 36420549 36420767 -145327320 + RMER2 LTR ERV1 1 303 -264 5 862 879 230 36 27 chr2 36421130 36421353 -145326734 - ORR1A4 LTR MaLR -100 229 5 5 862 317 298 70 108 chr2 36421505 36421746 -145326341 - MLT1A0 LTR MaLR -3 362 131 5 862 2839 288 76 13 chr2 36432609 36433439 -145314648 - ORR1D-int LTR MaLR 0 1370 489 5 862 2687 46 3 0 chr2 36433830 36434155 -145313932 + IAPLTR3 LTR ERVK 1 326 0 5 862 4413 131 64 108 chr2 36435245 36436192 -145311895 + RMER17A2 LTR ERVK 1 906 0 5 863 1343 170 131 62 chr2 36442702 36443054 -145305033 - RMER4B LTR ERVK -201 384 9 5 863 1087 370 35 29 chr2 36445222 36446528 -145301559 - RLTR6-int LTR ERV1 -4344 3434 2121 5 863 652 338 61 46 chr2 36446646 36447314 -145300773 - RLTR6-int LTR ERV1 -3345 1718 1041 5 863 1245 240 65 48 chr2 36452982 36453336 -145294751 - RMER2 LTR ERV1 -11 556 197 5 863 400 257 49 10 chr2 36453341 36453443 -145294644 + ETnERV2-int LTR ERVK 7097 7202 -204 5 863 228 284 31 101 chr2 36453704 36453833 -145294254 + RNLTR23 LTR ERVK 523 642 0 5 863 364 215 41 119 chr2 36453833 36454012 -145294075 - RMER2 LTR ERV1 -331 236 94 5 863 1539 214 94 31 chr2 36455563 36455978 -145292109 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 88 5 863 966 241 30 21 chr2 36497644 36497881 -145250206 + RMER19B LTR ERVK 489 727 -175 5 863 474 294 36 62 chr2 36499694 36499886 -145248201 + RLTR23 LTR ERV1 244 430 0 5 863 7782 196 19 56 chr2 36500000 36501796 -145246291 - ORR1A1-int LTR MaLR -232 1731 1 1 863 1662 214 31 0 chr2 36501825 36502152 -145245935 - ORR1A1 LTR MaLR -3 343 7 1 863 1253 227 19 58 chr2 36502154 36502463 -145245624 - ORR1A4 LTR MaLR -28 301 5 2 863 2080 120 13 6 chr2 36502791 36503109 -145244978 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 8 4 863 1500 152 28 68 chr2 36504927 36505252 -145242835 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 11 322 0 9 863 813 217 25 138 chr2 36511408 36511771 -145236316 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 1 863 456 68 26 64 chr2 36511773 36511851 -145236236 - ETnERV2-int LTR ERVK -3 7403 7329 1 863 663 240 209 15 chr2 36511851 36512202 -145235885 - RLTR13D6 LTR ERVK -365 537 127 1 863 6307 126 23 8 chr2 36512203 36513244 -145234843 - ETnERV2-int LTR ERVK -238 7168 6227 1 863 4195 174 41 29 chr2 36513248 36514941 -145233146 - ETnERV2-int LTR ERVK -3321 4085 2356 1 863 1413 119 7 61 chr2 36515076 36515354 -145232733 - ETnERV2-int LTR ERVK -2741 2103 1841 1 863 1617 204 47 40 chr2 36520185 36520608 -145227479 - ETnERV2-int LTR ERVK -4485 2921 2496 1 863 463 180 129 16 chr2 36520641 36520765 -145227322 - ETnERV2-int LTR ERVK -5329 2077 1940 1 863 2381 148 117 47 chr2 36520744 36521388 -145226699 - ETnERV2-int LTR ERVK -5601 1805 1117 1 863 264 263 101 42 chr2 36521393 36521512 -145226575 - RLTR9E LTR ERVK -283 126 1 1 863 1534 165 105 34 chr2 36523809 36524191 -145223896 + RLTR9E LTR ERVK 1 409 0 2 863 3507 130 3 68 chr2 36524524 36525125 -145222962 + RMER2 LTR ERV1 1 562 -5 2 863 1538 243 16 86 chr2 36525135 36525567 -145222520 - RLTR25B LTR ERVK -604 424 23 2 863 6761 99 31 5 chr2 36526085 36527039 -145221048 - RLTR13C1 LTR ERVK -4 979 1 2 863 1434 193 28 25 chr2 36540212 36540536 -145207551 - ORR1A4 LTR MaLR -2 327 3 3 863 287 310 105 9 chr2 36540701 36540815 -145207272 - MLT1B LTR MaLR -14 376 252 3 863 1315 122 36 76 chr2 36549710 36549986 -145198101 - RLTR10B2 LTR ERVK -96 269 5 4 863 332 24 0 0 chr2 36549993 36550035 -145198052 - RLTR10B LTR ERVK -250 42 1 4 863 1155 156 39 82 chr2 36550035 36550276 -145197811 + RMER17D2 LTR ERVK 150 373 -436 4 863 2280 148 38 25 chr2 36550458 36551068 -145197019 + RMER17D2 LTR ERVK 266 889 0 4 863 1544 247 89 59 chr2 36552312 36552806 -145195281 - RLTR11A LTR ERVK -17 511 3 5 863 409 258 47 68 chr2 36557496 36557687 -145190400 + RLTR23 LTR ERV1 244 430 0 5 863 440 328 33 41 chr2 36558759 36559150 -145188937 + RLTR4_MM-int LTR ERV1 1059 1446 -3617 5 863 728 335 47 30 chr2 36560092 36560843 -145187244 + RLTR4_MM-int LTR ERV1 2534 3222 -1468 5 863 646 264 35 151 chr2 36560905 36561258 -145186829 + MuRRS4-int LTR ERV1 3677 4002 -1061 5 863 434 330 50 28 chr2 36561843 36562024 -145186063 - RLTR25B LTR ERVK 0 1103 919 5 863 446 262 9 27 chr2 36562009 36562119 -145185968 - RLTR25B LTR ERVK -300 728 621 5 863 753 157 6 130 chr2 36562726 36562895 -145185192 - ORR1A3 LTR MaLR -178 148 1 6 863 8070 179 46 99 chr2 36562895 36564968 -145183119 - ORR1A3-int LTR MaLR 0 1963 1 6 863 1670 161 28 62 chr2 36565012 36565336 -145182751 - ORR1A3 LTR MaLR -13 313 1 6 863 4077 152 14 19 chr2 36565336 36566027 -145182060 - ORR1A3-int LTR MaLR 0 1963 1276 6 863 582 295 112 41 chr2 36566010 36566349 -145181738 + RLTR9A LTR ERVK 6 368 0 6 863 3425 196 35 27 chr2 36566999 36568096 -145179991 + RMER16-int LTR ERVK 240 2038 -5368 6 864 733 218 96 0 chr2 36569325 36569522 -145178565 + RMER16-int LTR ERVK 1449 1664 -3742 6 864 1829 222 49 10 chr2 36569532 36570095 -145177992 + RMER16-int LTR ERVK 4268 4727 -2679 6 864 869 283 15 15 chr2 36570141 36570478 -145177609 + RLTR6-int LTR ERV1 7328 7664 -114 6 864 255 185 112 90 chr2 36570609 36570698 -145177389 + RMER16-int LTR ERVK 5249 5339 -67 6 864 461 281 102 56 chr2 36570843 36571178 -145176909 + RLTR9E LTR ERVK 1 381 -28 6 864 2794 211 72 25 chr2 36571106 36572071 -145176016 - ORR1A1-int LTR MaLR -666 1297 308 7 864 1531 198 44 6 chr2 36572072 36572393 -145175694 - ORR1A1 LTR MaLR -13 333 1 7 864 1650 151 10 73 chr2 36572393 36572706 -145175381 - ORR1A4 LTR MaLR -32 297 5 7 864 1942 214 21 75 chr2 36576393 36576858 -145171229 - RLTR25B LTR ERVK -582 446 7 7 864 4405 121 122 48 chr2 36579014 36579840 -145168247 + RMER17D LTR ERVK 1 887 -2 7 864 282 290 70 76 chr2 36581633 36581790 -145166297 + RLTR23 LTR ERV1 244 399 -31 7 864 3446 30 0 0 chr2 36583642 36584036 -145164051 - MTA_Mm LTR MaLR -2 394 1 8 864 9370 26 5 3 chr2 36584036 36585132 -145162955 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 8 864 3574 15 0 0 chr2 36585132 36585528 -145162559 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 8 864 1708 248 21 71 chr2 36585654 36586188 -145161899 - RLTR11A LTR ERVK -17 511 5 8 864 1603 170 68 7 chr2 36586249 36586557 -145161530 - ORR1A4 LTR MaLR -2 327 1 8 864 414 356 39 82 chr2 36586721 36587051 -145161036 - MLT1A LTR MaLR -17 357 42 8 864 1388 236 30 11 chr2 36592867 36593232 -145154855 + ORR1D1 LTR MaLR 1 372 -2 9 864 6495 221 9 6 chr2 36596004 36597656 -145150431 + IAPEz-int LTR ERVK 3968 5773 -1808 9 864 259 85 0 21 chr2 36597715 36597763 -145150324 + IAPEz-int LTR ERVK 5764 5810 -1771 9 864 3957 119 8 7 chr2 36597749 36598757 -145149330 + IAPEz-int LTR ERVK 6646 7680 0 9 864 1283 157 62 40 chr2 36598766 36599039 -145149048 + RLTR46 LTR ERVK 42 320 0 9 864 2867 49 248 2 chr2 36600695 36600785 -145147302 + RLTR1B LTR ERV1 1 90 -422 1 864 2867 49 248 2 chr2 36600811 36601131 -145146956 + RLTR1B LTR ERV1 91 511 -1 1 864 5497 95 14 10 chr2 36601624 36602422 -145145665 - RLTR13D1 LTR ERVK -5 801 1 1 864 2150 148 52 12 chr2 36622316 36622394 -145125693 - RMER17D2 LTR ERVK -388 421 342 1 864 2150 148 52 12 chr2 36622463 36622789 -145125298 - RMER17D2 LTR ERVK -468 341 1 1 864 2288 162 103 48 chr2 36623667 36624172 -145123915 - RMER4B LTR ERVK 0 585 53 1 864 2574 127 12 42 chr2 36626005 36626433 -145121654 + RLTR9F LTR ERVK 1 415 0 1 864 550 220 97 35 chr2 36626674 36626900 -145121187 + ETnERV2-int LTR ERVK 84 323 -2991 1 864 16893 150 38 27 chr2 36626920 36631172 -145116915 + ETnERV2-int LTR ERVK 1055 6422 -984 1 864 351 131 29 14 chr2 36631388 36631458 -145116629 + ETnERV2-int LTR ERVK 7332 7402 -4 1 864 726 83 4 1 chr2 36631461 36631571 -145116516 + RLTR9F LTR ERVK 1 113 -270 1 864 2058 106 18 41 chr2 36631820 36632163 -145115924 + RLTR9F LTR ERVK 81 415 0 1 864 1709 139 15 57 chr2 36632410 36632746 -145115341 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 322 0 1 864 2709 100 25 98 chr2 36632747 36633035 -145115052 + MMETn-int LTR ERVK 2 268 -4576 1 864 2709 100 25 98 chr2 36633063 36633305 -145114782 + MMETn-int LTR ERVK 269 493 -4351 1 864 5250 99 8 11 chr2 36637004 36637830 -145110257 + MMETn-int LTR ERVK 483 1306 -3538 1 864 2891 98 13 29 chr2 36637844 36638587 -145109500 + MMETn-int LTR ERVK 1730 3019 -4387 1 864 531 101 0 12 chr2 36638587 36638667 -145109420 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 244 322 0 1 864 1986 212 7 21 chr2 36651629 36652054 -145096033 + MTD LTR MaLR 1 419 0 1 864 318 285 76 8 chr2 36652719 36652894 -145095193 - MLT1B LTR MaLR -8 382 175 1 864 592 300 54 14 chr2 36656705 36656999 -145091088 - RLTR6-int LTR ERV1 -130 7648 7343 1 864 679 280 57 90 chr2 36658449 36658965 -145089122 - MMVL30-int LTR ERV1 -1516 2182 1780 1 864 362 341 92 8 chr2 36666520 36666650 -145081437 - LTR78 LTR ERV1 -960 344 204 1 864 2234 124 56 49 chr2 36673702 36674092 -145073995 - RLTR9C LTR ERVK 0 393 1 1 864 1413 206 30 71 chr2 36675043 36675409 -145072678 - RLTR9C LTR ERVK -42 351 1 1 864 473 95 0 0 chr2 36675409 36675483 -145072604 - ETnERV2-int LTR ERVK -1 7405 7332 1 864 3973 177 26 36 chr2 36675700 36677741 -145070346 - ETnERV2-int LTR ERVK -3321 4085 2356 1 864 890 158 0 24 chr2 36678292 36678461 -145069626 - RLTR13D1 LTR ERVK -156 650 486 1 864 3893 210 49 79 chr2 36678462 36680076 -145068011 - ETnERV2-int LTR ERVK -3471 1935 108 1 864 1459 172 114 96 chr2 36680219 36680605 -145067482 - RLTR9C LTR ERVK 0 393 1 1 864 1769 160 3 79 chr2 36682577 36682930 -145065157 + ORR1A3 LTR MaLR 1 326 0 1 864 849 219 91 91 chr2 36685196 36685427 -145062660 + ORR1C1 LTR MaLR 1 231 -147 1 864 396 150 3 88 chr2 36685451 36685551 -145062536 - RLTR45-int LTR ERVK -4195 3049 2969 1 864 7933 119 33 4 chr2 36685604 36686902 -145061185 - RMER16-int LTR ERVK -3982 1424 89 1 864 274 322 32 70 chr2 36687252 36687409 -145060678 - RLTR8 LTR ERVK 0 365 215 1 864 522 221 126 31 chr2 36696557 36696716 -145051371 - RMER21A LTR ERV1 -336 611 438 1 864 1469 248 122 34 chr2 36697300 36697989 -145050098 + RodERV21-int LTR ERV1 1969 2718 -2273 1 864 410 191 107 38 chr2 36698900 36699031 -145049056 - RMER21A LTR ERV1 -435 407 268 1 865 470 313 89 76 chr2 36720358 36720821 -145027266 + RMER20A LTR ERVK 1 469 -47 2 865 5639 80 26 22 chr2 36733560 36734364 -145013723 + RLTR13C2 LTR ERVK 2 808 0 2 865 250 339 57 8 chr2 36749029 36749151 -144998936 + MER67D LTR ERV1 11 138 -376 2 865 3702 151 31 33 chr2 36757138 36757781 -144990306 - RLTR26 LTR ERVK 0 642 1 2 865 1783 209 160 19 chr2 36779918 36780355 -144967732 - RLTR31A_Mm LTR ERVK 0 584 94 2 865 1783 209 160 19 chr2 36780402 36780476 -144967611 - RLTR31A_Mm LTR ERVK -491 93 2 2 865 280 150 30 91 chr2 36829121 36829187 -144918900 + RMER17B LTR ERVK 98 159 -799 3 866 553 331 62 23 chr2 36844394 36844651 -144903436 + MLT-int LTR MaLR 302 568 -1167 3 866 325 345 95 101 chr2 36844696 36844985 -144903102 + MLT-int LTR MaLR 1221 1506 -229 3 866 325 345 95 101 chr2 36845268 36845335 -144902752 + MLT-int LTR MaLR 1507 1574 -161 3 866 435 215 118 13 chr2 36845828 36845971 -144902116 + MLT-int LTR MaLR 1594 1721 -14 3 866 410 293 24 16 chr2 36846130 36846255 -144901832 + MLT1A0 LTR MaLR 231 356 -9 3 866 306 351 34 57 chr2 36854023 36854198 -144893889 - MLT1N2 LTR MaLR -344 218 48 3 866 585 152 0 67 chr2 36865902 36865988 -144882099 - RLTR15 LTR ERVK -2 357 279 3 866 3509 20 2 0 chr2 36865988 36866383 -144881704 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 866 585 152 0 67 chr2 36866383 36866416 -144881671 - RLTR15 LTR ERVK -81 278 246 3 866 2605 161 7 22 chr2 36866416 36866860 -144881227 + RLTR20B3 LTR ERVK 1 437 -140 3 866 1301 174 33 4 chr2 36866881 36867124 -144880963 - RLTR15 LTR ERVK -108 251 2 3 866 1671 179 29 78 chr2 36873436 36873781 -144874306 + ORR1B1 LTR MaLR 65 392 -2 4 866 1726 247 29 78 chr2 36893058 36893568 -144854519 + RLTR19 LTR ERVK 15 499 0 4 866 1778 208 133 55 chr2 36893579 36894219 -144853868 - RMER6C LTR ERVK 0 690 1 4 866 1493 261 83 25 chr2 36894363 36894834 -144853253 - RLTR19C LTR ERVK -2 504 7 4 866 310 368 13 13 chr2 36895047 36895155 -144852932 - RNERVK23-int LTR ERVK -559 7658 7422 4 866 430 310 0 0 chr2 36895155 36895284 -144852803 - RLTR4_MM-int LTR ERV1 -326 7275 7147 4 866 3712 59 2 56 chr2 36896899 36897401 -144850686 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 1 4 866 302 0 0 0 chr2 36897401 36897439 -144850648 - MERVL-int LTR ERVL 0 5485 5448 4 866 298 143 55 41 chr2 36897439 36897512 -144850575 - ORR1A3-int LTR MaLR -1323 640 567 4 866 6798 102 6 4 chr2 36897512 36898603 -144849484 - MERVL-int LTR ERVL -132 5629 4390 4 866 385 231 0 0 chr2 36898654 36898732 -144849355 + RMER19B LTR ERVK 825 902 0 4 866 303 351 11 65 chr2 36898772 36898958 -144849129 - RLTR19-int LTR ERVK -1586 4551 4376 4 866 819 300 91 8 chr2 36899168 36899551 -144848536 - MURVY-int LTR ERV1 -2305 5147 4733 4 866 6174 86 39 3 chr2 36899570 36900432 -144847655 - RLTR13B1 LTR ERVK 0 893 1 4 866 686 364 48 36 chr2 36901388 36902277 -144845810 - MURVY-int LTR ERV1 -3156 4450 3551 4 866 355 337 44 52 chr2 36902597 36902943 -144845144 - MURVY-int LTR ERV1 -4352 3254 2917 4 866 330 338 42 47 chr2 36904164 36904400 -144843687 - MURVY-int LTR ERV1 -5805 1751 1517 4 866 1758 237 65 13 chr2 36905744 36906219 -144841868 - RLTR19C LTR ERVK 0 506 7 4 866 618 136 59 0 chr2 36908437 36908555 -144839532 - ORR1A2 LTR MaLR -199 128 4 4 866 2213 221 25 51 chr2 36908555 36909060 -144839027 + ORR1B1-int LTR MaLR 131 622 -887 4 866 3798 179 20 22 chr2 36909251 36910034 -144838053 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 1 782 -1544 4 866 521 174 0 10 chr2 36910398 36910497 -144837590 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 867 964 -1362 4 866 1351 216 22 11 chr2 36925437 36925704 -144822383 - ORR1B2 LTR MaLR -97 270 1 4 866 2085 149 22 24 chr2 36925702 36926073 -144822014 - ORR1B2-int LTR MaLR -3 1506 1137 4 866 3489 23 2 0 chr2 36944565 36944960 -144803127 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 866 903 303 60 68 chr2 36948863 36949214 -144798873 - MLT1A0 LTR MaLR -17 348 1 4 866 3490 20 2 0 chr2 36953646 36954041 -144794046 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 866 8919 38 6 4 chr2 36954041 36955136 -144792951 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 4 866 3490 20 2 0 chr2 36955136 36955531 -144792556 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 867 226 316 59 59 chr2 36964583 36964684 -144783403 + RLTR45 LTR ERVK 4 104 -378 4 867 2073 131 10 0 chr2 36977539 36977852 -144770235 - RMER6B LTR ERVK -145 316 1 5 867 861 169 13 0 chr2 36978934 36979088 -144768999 - RMER17B LTR ERVK 0 958 803 5 867 259 318 34 116 chr2 36980564 36980710 -144767377 - MLT1H-int LTR MaLR -488 921 788 5 867 919 257 148 24 chr2 36981303 36981594 -144766493 + MLT1B LTR MaLR 21 347 -43 5 867 243 236 0 77 chr2 36990444 36990522 -144757565 - RLTR31B_Mm LTR ERVK 0 557 486 5 867 3655 145 37 28 chr2 36992861 36993544 -144754543 + RMER12 LTR ERVK 48 736 -586 5 867 2881 189 55 24 chr2 36998428 36999025 -144749062 - RLTR18 LTR ERVK 0 616 1 5 867 286 86 152 17 chr2 37003270 37003329 -144744758 - RLTR24 LTR ERV1 0 529 463 6 867 1999 170 226 12 chr2 37003501 37004000 -144744087 - RMER19C LTR ERVK -5 606 1 8 867 249 241 84 70 chr2 37022828 37022971 -144725116 - MTE2a LTR MaLR -57 322 178 1 867 1067 127 105 177 chr2 37024085 37024362 -144723725 - RLTR23 LTR ERV1 -173 257 1 1 867 608 295 12 12 chr2 37024509 37024756 -144723331 - RLTR6-int LTR ERV1 -192 7586 7340 1 867 5037 119 28 18 chr2 37033205 37034003 -144714084 + RLTR13D1 LTR ERVK 1 806 0 2 867 310 328 13 23 chr2 37034768 37035023 -144713064 - RLTR6-int LTR ERV1 -3429 4349 3947 1 867 4518 176 48 21 chr2 37035169 37036053 -144712034 - RMER13B LTR ERVK 0 908 2 2 867 605 297 36 5 chr2 37036238 37036458 -144711629 - RLTR6-int LTR ERV1 -3710 3846 3620 1 867 3305 172 35 28 chr2 37054825 37055461 -144692626 + RLTR26 LTR ERVK 1 640 -2 3 867 319 283 8 94 chr2 37059912 37060029 -144688058 - RMER4A LTR ERVK -9 457 351 4 867 943 224 59 0 chr2 37060365 37060584 -144687503 - RMER4A LTR ERVK -220 246 15 4 867 4312 105 22 122 chr2 37064871 37065706 -144682381 + RMER17A LTR ERVK 1 751 0 4 867 2102 178 146 14 chr2 37070770 37071265 -144676822 - RLTR20B2 LTR ERVK 0 560 1 5 867 417 319 91 87 chr2 37075979 37076139 -144671948 + LTR16B LTR ERVL 85 249 -214 6 867 2390 154 8 91 chr2 37076139 37076578 -144671509 - RMER4A LTR ERVK 0 466 48 6 867 2390 154 8 91 chr2 37076627 37076642 -144671445 - RMER4A LTR ERVK -419 47 47 6 867 2390 154 8 91 chr2 37076812 37076863 -144671224 - RMER4A LTR ERVK -419 47 2 6 867 417 319 91 87 chr2 37076863 37076966 -144671121 + LTR16B LTR ERVL 250 349 -114 6 867 904 302 40 11 chr2 37076998 37077276 -144670811 + MLT2B1 LTR ERVL 1 286 -234 7 867 1790 266 97 115 chr2 37077348 37077577 -144670510 - RMER12 LTR ERVK -95 1227 1013 7 867 1790 266 97 115 chr2 37077726 37078746 -144669341 - RMER12 LTR ERVK -310 1012 1 7 867 435 346 84 7 chr2 37078748 37078902 -144669185 + MLT2B1 LTR ERVL 330 495 -72 7 867 1502 164 32 0 chr2 37092290 37092540 -144655547 + ORR1A2 LTR MaLR 2 259 -68 7 868 2896 90 5 7 chr2 37112337 37112741 -144635346 - RLTR9D LTR ERVK 0 403 1 9 868 366 111 54 27 chr2 37112741 37112815 -144635272 - ETnERV2-int LTR ERVK 0 7406 7331 9 868 6396 196 16 60 chr2 37113027 37114165 -144633922 - ETnERV2-int LTR ERVK -1998 3408 2380 9 868 8503 167 62 25 chr2 37114189 37116972 -144631115 - ETnERV2-int LTR ERVK -3316 4090 787 9 868 839 251 43 78 chr2 37116987 37117385 -144630702 - ETnERV2-int LTR ERVK -2928 386 3 9 868 2977 80 5 7 chr2 37117387 37117791 -144630296 - RLTR9D LTR ERVK 0 403 1 9 868 1172 201 191 21 chr2 37127673 37127841 -144620246 + ORR1C2 LTR MaLR 5 171 -213 1 868 1172 201 191 21 chr2 37128012 37128168 -144619919 + ORR1C2 LTR MaLR 172 384 0 1 868 2209 142 16 8 chr2 37159500 37160114 -144587973 - RLTR17 LTR ERVK -34 658 1 1 868 1983 97 9 59 chr2 37160785 37161124 -144586963 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 1 868 512 275 74 41 chr2 37180502 37180771 -144567316 - RLTR12B LTR ERVK -250 278 1 1 868 6470 60 28 19 chr2 37186092 37186939 -144561148 - RLTR13A LTR ERVK 0 855 1 1 868 1900 166 83 3 chr2 37192949 37193323 -144554764 + MTD LTR MaLR 16 419 0 1 868 3171 3 43 0 chr2 37195261 37195613 -144552474 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 1 868 56889 21 16 2 chr2 37195613 37201999 -144546088 + IAPEz-int LTR ERVK 8 6481 0 1 868 3171 3 43 0 chr2 37201999 37202351 -144545736 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 1 868 3242 41 18 8 chr2 37209858 37210254 -144537833 + MTB LTR MaLR 1 400 0 2 868 3009 54 203 9 chr2 37215821 37216250 -144531837 + RLTR1B LTR ERV1 1 512 0 2 868 2343 143 35 15 chr2 37216813 37217216 -144530871 - MTC LTR MaLR -10 411 1 2 868 1145 245 138 11 chr2 37217368 37217838 -144530249 - RMER5 LTR ERV1 0 534 5 2 868 2134 143 51 32 chr2 37220392 37220767 -144527320 + RLTR14 LTR ERV1 1 382 0 2 868 1140 194 234 6 chr2 37221542 37221854 -144526233 + MTD LTR MaLR 25 407 -12 2 868 275 343 21 28 chr2 37222106 37222247 -144525840 + LTR41B LTR ERVL 14 153 -605 2 868 712 299 78 100 chr2 37222390 37222699 -144525388 + MLT1F2 LTR MaLR 245 546 -14 2 869 9069 38 2 1 chr2 37245933 37247030 -144501057 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 2 869 3398 25 5 0 chr2 37247030 37247424 -144500663 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 869 1579 314 58 136 chr2 37249452 37250241 -144497846 + MTE2b-int LTR MaLR 649 1391 -189 2 869 1579 314 58 136 chr2 37250426 37250486 -144497601 + MTE2b-int LTR MaLR 1392 1417 -163 2 869 1579 314 58 136 chr2 37250972 37251130 -144496957 + MTE2b-int LTR MaLR 1418 1578 -2 2 869 853 264 195 9 chr2 37251134 37251452 -144496635 + MTE2b LTR MaLR 3 379 0 2 869 1068 162 61 34 chr2 37253140 37253402 -144494685 + RMER10A LTR ERVL 174 442 0 2 869 1300 177 293 0 chr2 37259618 37259946 -144488141 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 424 -103 3 869 582 174 9 9 chr2 37260123 37260229 -144487858 + RLTR11A2 LTR ERVK 421 526 -1 3 869 2799 35 15 0 chr2 37266876 37267217 -144480870 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 3 869 1841 145 125 8 chr2 37283274 37283635 -144464452 - RLTR9D LTR ERVK 0 403 1 3 869 256 277 31 63 chr2 37287190 37287317 -144460770 + RMER17C LTR ERVK 183 305 -105 3 869 252 62 0 127 chr2 37287354 37287409 -144460678 - RLTR12A LTR ERVK -106 462 415 3 869 2514 151 9 33 chr2 37303426 37303511 -144444576 + MTC LTR MaLR 13 87 -334 4 869 2514 151 9 33 chr2 37303709 37304042 -144444045 + MTC LTR MaLR 88 421 0 4 869 263 213 0 0 chr2 37320289 37320336 -144427751 - RLTR11A2 LTR ERVK 0 527 481 4 869 1124 205 74 16 chr2 37320324 37320582 -144427505 - RLTR11A2 LTR ERVK -254 273 1 4 869 2320 92 0 0 chr2 37333247 37333574 -144414513 - IAPEY3_LTR LTR ERVK -5 327 1 4 869 1787 172 33 3 chr2 37339866 37340170 -144407917 - MTC LTR MaLR -108 313 1 4 869 254 263 112 130 chr2 37349360 37349503 -144398584 - LTR37B LTR ERV1 -52 416 280 5 869 254 263 112 130 chr2 37349644 37349723 -144398364 - LTR37B LTR ERV1 -189 279 198 5 869 3195 34 29 0 chr2 37351989 37352374 -144395713 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 870 297 198 133 75 chr2 37361176 37361296 -144386791 - RLTR13D3 LTR ERVK 0 1114 988 5 870 225 328 0 0 chr2 37366471 37366535 -144381552 + RMER15 LTR ERVL 404 467 -108 5 870 414 281 129 5 chr2 37368908 37369094 -144378993 - RMER20B LTR ERVK -235 392 184 5 870 1837 106 93 23 chr2 37404836 37405136 -144342951 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 7 6 870 527 178 8 119 chr2 37409362 37409496 -144338591 + RMER4B LTR ERVK 1 119 -466 6 870 592 122 148 9 chr2 37409518 37409626 -144338461 + RMER4B LTR ERVK 458 580 -5 6 870 6821 158 45 29 chr2 37409642 37410903 -144337184 + MurERV4-int LTR ERVK 38 1318 -3942 6 870 1081 91 121 6 chr2 37410903 37411069 -144337018 + RMER4B LTR ERVK 399 583 -2 6 870 232 167 24 0 chr2 37419441 37419483 -144328604 + MT2B2 LTR ERVL 250 292 -292 6 870 352 258 23 53 chr2 37460289 37460420 -144287667 + MLT1A1 LTR MaLR 277 403 -5 6 870 3066 57 23 3 chr2 37474866 37475254 -144272833 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 7 870 2505 193 117 12 chr2 37478736 37479250 -144268837 + RMER15 LTR ERVL 8 575 0 7 871 275 218 171 90 chr2 37492090 37492201 -144255886 - MT2B LTR ERVL -322 279 160 7 871 320 111 0 0 chr2 37495547 37495592 -144252495 + ORR1B2 LTR MaLR 323 367 0 7 871 3164 21 3 0 chr2 37500000 37500380 -144247707 - MTA_Mm LTR MaLR -15 381 1 1 871 835 151 25 11 chr2 37504955 37505180 -144242907 + RMER17B LTR ERVK 1 408 -550 1 871 1806 178 75 36 chr2 37505192 37505630 -144242457 + RLTR28 LTR ERVL 70 524 0 1 871 291 73 0 0 chr2 37514421 37514462 -144233625 - RLTR31_Mm LTR ERVK -520 41 1 3 871 1253 260 33 23 chr2 37524172 37524471 -144223616 + ORR1E LTR MaLR 7 308 -51 7 871 3236 39 15 0 chr2 37530546 37530936 -144217151 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 8 871 651 289 57 143 chr2 37535651 37536022 -144212065 - MTE2a LTR MaLR -38 341 3 1 871 1396 243 37 17 chr2 37538741 37539093 -144208994 - ORR1E LTR MaLR 0 359 1 1 871 514 108 168 58 chr2 37539177 37539314 -144208773 + RMER17B LTR ERVK 312 463 -495 1 871 2529 144 66 61 chr2 37542551 37543023 -144205064 + RMER15 LTR ERVL 35 508 -67 1 871 242 304 193 18 chr2 37574490 37574661 -144173426 - ORR1D1 LTR MaLR -7 367 167 2 871 349 244 7 134 chr2 37577778 37577806 -144170281 - MT2B LTR ERVL -451 150 141 2 871 431 198 0 126 chr2 37580935 37581062 -144167025 - MT2B LTR ERVL -337 264 154 2 871 2010 154 27 60 chr2 37584192 37584558 -144163529 + ORR1B1 LTR MaLR 41 394 0 2 871 1402 173 166 53 chr2 37588703 37589100 -144158987 + RMER10A LTR ERVL 1 442 0 2 871 1155 271 162 16 chr2 37595869 37596251 -144151836 + MLT1C LTR MaLR 28 465 -2 3 871 748 214 119 0 chr2 37596676 37596835 -144151252 + MTEa LTR MaLR 1 178 -201 3 871 626 244 103 27 chr2 37596927 37597112 -144150975 + MTEa LTR MaLR 168 366 -13 3 871 348 291 143 69 chr2 37599982 37600185 -144147902 - MTE2b LTR MaLR -8 371 154 3 871 1165 197 108 0 chr2 37602747 37602970 -144145117 + ORR1C2 LTR MaLR 138 384 0 3 871 444 358 67 58 chr2 37603347 37603813 -144144274 + LTR85b LTR Gypsy? 260 729 -55 3 871 4190 90 36 17 chr2 37605222 37605812 -144142275 - MT2B LTR ERVL 0 601 1 3 871 243 285 82 82 chr2 37612519 37612653 -144135434 + MLT1I LTR MaLR 85 236 -343 3 871 494 148 30 2 chr2 37617541 37617640 -144130447 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 276 3 872 2163 149 64 34 chr2 37634972 37635381 -144112706 + MTC LTR MaLR 1 421 0 4 872 986 282 115 46 chr2 37640889 37641238 -144106849 - MTEa LTR MaLR -4 375 3 4 872 400 250 0 87 chr2 37650447 37650574 -144097513 - MT2B LTR ERVL -338 263 148 4 872 254 285 112 71 chr2 37660124 37660294 -144087793 - MT2B2 LTR ERVL -301 283 107 4 872 796 235 91 17 chr2 37736755 37737084 -144011003 + ORR1E LTR MaLR 4 379 0 5 872 261 307 53 45 chr2 37737355 37737488 -144010599 + MLT1K LTR MaLR 372 505 -90 5 873 695 315 80 46 chr2 37748748 37749074 -143999013 + ORR1E LTR MaLR 1 337 -22 5 873 1053 182 199 29 chr2 37749518 37749834 -143998253 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 5 873 2155 84 60 25 chr2 37757916 37758232 -143989855 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 5 873 1024 195 209 45 chr2 37777579 37777934 -143970153 + MTD LTR MaLR 7 419 0 5 873 2481 198 84 92 chr2 37804276 37805050 -143943037 - RMER21B LTR ERV1 0 842 75 6 873 483 240 2 18 chr2 37814293 37814435 -143933652 + MTEb LTR MaLR 237 377 -2 6 873 2867 149 46 8 chr2 37814540 37815042 -143933045 + RLTR28 LTR ERVL 1 521 -3 6 873 1247 228 107 12 chr2 37816332 37816670 -143931417 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 6 873 407 185 12 12 chr2 37820694 37820776 -143927311 + MTC LTR MaLR 1 82 -339 6 873 1885 186 14 14 chr2 37820989 37821338 -143926749 + MTC LTR MaLR 71 419 -2 6 873 287 284 113 50 chr2 37849366 37849507 -143898580 + MLT1A0 LTR MaLR 3 152 -213 6 873 271 294 17 121 chr2 37855037 37855153 -143892934 - MT2B2 LTR ERVL -323 261 158 7 873 390 198 80 90 chr2 37862177 37862277 -143885810 - MT2B LTR ERVL -344 257 159 7 873 378 248 0 107 chr2 37865970 37866092 -143881995 + MT2B LTR ERVL 156 264 -337 7 873 3549 23 21 0 chr2 37875044 37875432 -143872655 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 7 874 5846 126 106 0 chr2 37897528 37898394 -143849693 + RMER17B LTR ERVK 1 958 0 7 874 2709 161 81 6 chr2 37902570 37903040 -143845047 + RLTR16 LTR ERVK 1 505 0 7 874 1341 228 110 53 chr2 37905484 37905920 -143842167 + RMER13A LTR ERVK 1 461 -399 7 874 977 241 97 112 chr2 37942096 37942520 -143805567 - MTD LTR MaLR -15 404 1 8 874 1463 240 69 12 chr2 37959340 37959686 -143788401 - ORR1D2 LTR MaLR -4 366 1 8 874 842 136 68 0 chr2 37959686 37959833 -143788254 - ORR1D2-int LTR MaLR 0 1370 1214 8 874 2711 243 48 53 chr2 37960337 37961040 -143787047 - ORR1D2-int LTR MaLR -136 1234 535 8 874 1275 201 203 74 chr2 37978212 37978256 -143769831 - MT2A LTR ERVL 0 533 490 8 874 1275 201 203 74 chr2 37978311 37978738 -143769349 - MT2A LTR ERVL -44 489 2 8 874 472 162 137 0 chr2 37978738 37978855 -143769232 - MERVL_2A-int LTR ERVL 0 5761 5629 8 874 5374 173 54 25 chr2 37978860 37979963 -143768124 - MERVL_2A-int LTR ERVL -71 5690 4556 8 874 1151 140 9 42 chr2 37979960 37980176 -143767911 - MERVL_2A-int LTR ERVL -5526 235 27 8 874 1065 187 129 88 chr2 37980217 37980621 -143767466 - MT2A LTR ERVL -55 546 1 8 875 278 328 128 39 chr2 38029080 38029409 -143718678 + ORR1E LTR MaLR 11 375 -4 4 875 3246 153 140 30 chr2 38040131 38040823 -143707264 + RMER19B LTR ERVK 1 771 -131 5 875 677 198 63 0 chr2 38041143 38041269 -143706818 + RMER19B LTR ERVK 757 890 -12 5 875 2565 88 115 0 chr2 38047005 38047370 -143700717 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 8 875 1635 174 57 37 chr2 38053711 38054063 -143694024 + ORR1B2 LTR MaLR 1 359 -8 9 875 1826 151 111 12 chr2 38064013 38064356 -143683731 + ORR1C1 LTR MaLR 1 377 -1 1 875 2767 305 93 85 chr2 38065080 38065933 -143682154 - MTE-int LTR MaLR -30 1550 656 1 875 2767 305 93 85 chr2 38066067 38066529 -143681558 - MTE-int LTR MaLR -925 655 226 1 875 2767 305 93 85 chr2 38066676 38066896 -143681191 - MTE-int LTR MaLR -1355 225 1 1 875 302 274 61 61 chr2 38067067 38067199 -143680888 - ORR1E LTR MaLR -163 196 65 1 875 1696 245 78 41 chr2 38068497 38069011 -143679076 + MT2A LTR ERVL 1 533 0 1 875 2465 116 18 8 chr2 38074173 38074563 -143673524 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 1 875 1500 230 156 0 chr2 38080813 38081165 -143666922 - MTD LTR MaLR 0 419 13 1 875 408 211 0 13 chr2 38092291 38092368 -143655719 + MTC LTR MaLR 45 120 -301 1 875 1579 149 60 46 chr2 38092534 38092836 -143655251 + MTC LTR MaLR 108 413 -8 1 875 2942 117 2 2 chr2 38105011 38105432 -143642655 + MTC LTR MaLR 1 421 0 2 875 1850 193 27 72 chr2 38107813 38107995 -143640092 + MTB_Mm LTR MaLR 3 194 -213 2 875 1850 193 27 72 chr2 38108137 38108368 -143639719 + MTB_Mm LTR MaLR 195 397 -10 2 875 950 114 0 135 chr2 38117209 38117401 -143630686 + ORR1C2 LTR MaLR 1 166 -218 2 875 1069 122 162 0 chr2 38117872 38118069 -143630018 + ORR1C2 LTR MaLR 154 382 -2 2 875 639 203 141 0 chr2 38120830 38120958 -143627129 - MTD LTR MaLR -49 370 225 2 875 514 174 0 0 chr2 38120951 38121037 -143627050 - MTD LTR MaLR -315 104 19 2 875 320 176 0 0 chr2 38121167 38121218 -143626869 + MTEa LTR MaLR 2 52 -327 2 875 633 317 22 122 chr2 38121424 38121744 -143626343 + MTEa LTR MaLR 89 376 -3 2 875 378 299 192 28 chr2 38124317 38124499 -143623588 - RMER15 LTR ERVL -17 558 347 2 875 2367 138 61 5 chr2 38126521 38126913 -143621174 - MTC LTR MaLR -7 414 1 2 876 408 264 33 8 chr2 38143498 38143620 -143604467 - RMER15 LTR ERVL -93 482 358 3 876 824 182 147 65 chr2 38144075 38144349 -143603738 + MTEa LTR MaLR 41 351 -28 3 876 612 363 77 71 chr2 38146787 38147294 -143600793 - MLT1J LTR MaLR -2 510 1 3 876 760 264 151 27 chr2 38161286 38161629 -143586458 - MTD LTR MaLR -14 405 1 3 876 232 360 70 0 chr2 38170372 38170472 -143577615 + MLT1I LTR MaLR 26 132 -279 3 876 403 272 57 26 chr2 38188192 38188357 -143559730 + MLT1D LTR MaLR 91 258 -209 4 876 1252 287 90 29 chr2 38189098 38189576 -143558511 - MLT1K LTR MaLR -19 576 70 4 876 1330 82 32 63 chr2 38230110 38230331 -143517756 - MTC LTR MaLR -1 420 207 4 876 262 236 58 86 chr2 38236777 38236916 -143511171 + RLTR25B LTR ERVK 365 499 -529 5 876 1969 176 27 16 chr2 38237481 38237846 -143510241 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 6 5 876 499 299 113 37 chr2 38241308 38241696 -143506391 + MLT1B LTR MaLR 31 497 -8 5 876 372 198 0 111 chr2 38243324 38243351 -143504736 + MT2B LTR ERVL 145 159 -442 5 876 241 237 46 99 chr2 38249667 38249798 -143498289 + RMER15 LTR ERVL 7 130 -445 5 876 292 185 86 71 chr2 38249895 38249965 -143498122 + MTEa LTR MaLR 286 356 -23 5 876 803 218 55 0 chr2 38250197 38250362 -143497725 - MTEa LTR MaLR -205 174 1 5 876 249 315 232 19 chr2 38256791 38256998 -143491089 + ORR1D2 LTR MaLR 117 367 -3 5 876 494 315 23 88 chr2 38260999 38261215 -143486872 + MLT1A LTR MaLR 172 373 -1 5 876 805 152 93 0 chr2 38261738 38261889 -143486198 + MTD LTR MaLR 223 387 -32 5 876 1318 221 8 27 chr2 38261877 38262137 -143485950 - MTD LTR MaLR -164 255 1 5 876 429 341 130 47 chr2 38264262 38264563 -143483524 + MLT1E1 LTR MaLR 297 622 -32 5 876 2546 152 48 0 chr2 38269457 38269853 -143478234 - MTC LTR MaLR -4 417 3 5 876 889 274 108 57 chr2 38269823 38270194 -143477893 - MLT1B LTR MaLR 0 390 1 5 877 861 166 140 22 chr2 38275060 38275239 -143472848 + MTD LTR MaLR 10 209 -210 6 877 539 235 126 0 chr2 38275344 38275463 -143472624 + MTD LTR MaLR 196 329 -90 6 877 405 200 66 57 chr2 38276769 38276875 -143471212 + MT2B LTR ERVL 158 264 -337 6 877 1227 184 255 36 chr2 38277216 38277656 -143470431 - RMER13B LTR ERVK -1 907 453 6 877 283 350 79 87 chr2 38291032 38291126 -143456961 + MER77 LTR ERVL 237 322 -285 6 877 2410 86 3 58 chr2 38291126 38291472 -143456615 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 6 877 283 292 244 41 chr2 38291472 38291660 -143456427 + MER77 LTR ERVL 279 511 -52 6 877 457 213 50 93 chr2 38295090 38295230 -143452857 - MT2B LTR ERVL -337 264 131 6 877 654 244 163 15 chr2 38295905 38296101 -143451986 - RMER15 LTR ERVL -14 561 337 6 877 303 241 22 78 chr2 38299403 38299493 -143448594 - MTEa LTR MaLR 0 379 295 6 877 2193 154 94 0 chr2 38302000 38302383 -143445704 + MTC LTR MaLR 1 419 -2 6 877 1300 201 150 148 chr2 38302619 38302792 -143445295 - MT2A LTR ERVL -78 455 224 6 877 1300 201 150 148 chr2 38303090 38303262 -143444825 - MT2A LTR ERVL -310 223 89 6 877 1300 201 150 148 chr2 38303291 38303397 -143444690 - MT2A LTR ERVL -445 88 2 6 877 472 329 37 83 chr2 38304477 38304828 -143443259 + ORR1E LTR MaLR 10 344 -15 6 877 326 288 59 92 chr2 38306880 38306915 -143441172 - MT2B LTR ERVL -441 160 131 7 877 3768 60 62 18 chr2 38307456 38307953 -143440134 - MURVY-LTR LTR ERV1 0 519 1 7 877 622 217 17 0 chr2 38308075 38308190 -143439897 + RMER2 LTR ERV1 1 117 -450 7 877 322 268 95 76 chr2 38308217 38308427 -143439660 + RMER2 LTR ERV1 327 540 -27 7 877 241 307 89 114 chr2 38309173 38309331 -143438756 - RLTR3_Mm LTR ERVK -550 778 625 7 877 937 207 102 10 chr2 38309616 38309701 -143438386 - RLTR20D LTR ERVK 0 568 477 7 877 1629 173 105 2 chr2 38309756 38310134 -143437953 - RLTR20D LTR ERVK -92 476 1 7 877 2212 107 25 19 chr2 38312748 38313071 -143435016 - ORR1A2 LTR MaLR -2 325 1 7 877 320 51 0 0 chr2 38315139 38315178 -143432909 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 346 7 877 237 220 68 0 chr2 38315184 38315243 -143432844 - ORR1D1 LTR MaLR -307 67 5 7 877 487 285 148 40 chr2 38322752 38323030 -143425057 + MLT1A LTR MaLR 64 371 -3 7 877 452 221 75 6 chr2 38324928 38325101 -143422986 + RMER17C LTR ERVK 91 275 -135 7 877 348 211 13 13 chr2 38325770 38325847 -143422240 - MTEa LTR MaLR -41 338 262 7 877 603 311 99 0 chr2 38325901 38326062 -143422025 - MTE-int LTR MaLR -609 971 795 7 877 909 310 66 41 chr2 38331139 38331533 -143416554 - MTD LTR MaLR -8 411 8 7 877 230 267 101 51 chr2 38335027 38335165 -143412922 + RMER12 LTR ERVK 735 879 -443 7 877 535 312 127 136 chr2 38339671 38340120 -143407967 + LTR33A_ LTR ERVL 81 525 -6 8 877 410 180 133 91 chr2 38342912 38342983 -143405104 - MT2B LTR ERVL -447 154 77 8 877 2103 128 62 57 chr2 38351389 38351767 -143396320 + ORR1C2 LTR MaLR 3 371 -13 8 877 262 240 13 26 chr2 38355098 38355175 -143392912 - MER34 LTR ERV1 -65 477 402 8 877 2569 131 7 26 chr2 38357978 38358393 -143389694 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 8 877 226 150 50 0 chr2 38363341 38363381 -143384706 - MTC LTR MaLR 0 421 380 8 877 2306 151 79 3 chr2 38363400 38363791 -143384296 - MTC LTR MaLR 0 421 1 8 877 2307 57 202 15 chr2 38380230 38380567 -143367520 + MTB LTR MaLR 1 400 0 8 877 280 331 114 43 chr2 38387526 38387703 -143360384 - MLT1B LTR MaLR -5 385 205 8 877 280 331 114 43 chr2 38387752 38387855 -143360232 - MLT1B LTR MaLR -186 204 86 8 877 2428 189 49 10 chr2 38398557 38399043 -143349044 - RLTR18B LTR ERVK -7 505 1 9 878 315 345 128 62 chr2 38404421 38404727 -143343360 + MLT1A1 LTR MaLR 71 396 -12 9 878 1263 224 143 18 chr2 38405491 38405819 -143342268 + ORR1D2 LTR MaLR 1 369 -1 9 878 2912 165 21 6 chr2 38412403 38412922 -143335165 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 527 0 9 878 2229 119 30 112 chr2 38416832 38417083 -143331004 - MTC LTR MaLR -8 413 206 9 878 2229 119 30 112 chr2 38417231 38417414 -143330673 - MTC LTR MaLR -216 205 15 9 878 5024 164 39 51 chr2 38417414 38417604 -143330483 - MTC-int LTR MaLR 0 1258 1094 9 878 5024 164 39 51 chr2 38417748 38418608 -143329479 - MTC-int LTR MaLR -165 1093 221 9 878 3567 15 5 0 chr2 38420192 38420586 -143327501 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 9 878 9328 35 4 1 chr2 38420586 38421681 -143326406 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 9 878 3567 15 5 0 chr2 38421681 38422075 -143326012 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 9 878 2141 162 98 15 chr2 38423530 38423919 -143324168 + MTC LTR MaLR 1 421 0 9 878 261 283 124 70 chr2 38431427 38431556 -143316531 - ORR1E LTR MaLR -218 141 6 9 878 643 174 112 20 chr2 38431613 38431734 -143316353 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 244 9 878 2396 132 106 0 chr2 38431734 38432113 -143315974 + MTC LTR MaLR 3 421 0 9 878 643 267 70 52 chr2 38432113 38432308 -143315779 - ORR1D2 LTR MaLR -127 243 1 9 878 1277 164 222 7 chr2 38480438 38480744 -143267343 - RLTR23 LTR ERV1 -58 372 1 9 878 1554 195 133 0 chr2 38481568 38481907 -143266180 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 1 878 802 247 74 93 chr2 38494075 38494180 -143253907 + MTD LTR MaLR 100 202 -217 1 878 802 247 74 93 chr2 38494290 38494496 -143253591 + MTD LTR MaLR 203 405 -14 1 878 383 263 10 0 chr2 38501139 38501238 -143246849 + MLT1B LTR MaLR 290 389 -1 4 878 1707 112 56 42 chr2 38504020 38504308 -143243779 + ORR1C1 LTR MaLR 1 292 -86 1 878 1322 228 9 78 chr2 38509503 38509850 -143238237 - MTEa LTR MaLR -53 326 4 2 878 3368 36 8 5 chr2 38520749 38521144 -143226943 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 878 9016 52 4 2 chr2 38521144 38522240 -143225847 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 5 878 3494 30 2 5 chr2 38522240 38522637 -143225450 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 878 267 280 0 39 chr2 38523103 38523181 -143224906 - MLT1A LTR MaLR -241 133 59 5 879 259 0 0 0 chr2 38554002 38554033 -143194054 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 463 9 879 2058 182 49 17 chr2 38559014 38559422 -143188665 + MTC LTR MaLR 1 421 0 9 879 3168 42 39 0 chr2 38605365 38605746 -143142341 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 879 8582 66 3 3 chr2 38605746 38606844 -143141243 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 1 879 3368 53 0 2 chr2 38606844 38607241 -143140846 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 879 769 199 0 98 chr2 38611190 38611369 -143136718 + MTC LTR MaLR 108 268 -153 1 879 528 282 173 28 chr2 38626707 38627020 -143121067 + MTEa LTR MaLR 3 360 -19 2 879 1466 141 196 39 chr2 38627715 38628047 -143120040 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 2 879 296 215 22 112 chr2 38631762 38631851 -143116236 - MT2B LTR ERVL -361 240 160 2 879 1616 233 69 32 chr2 38645522 38645926 -143102161 + MTD LTR MaLR 1 419 0 2 879 241 214 21 125 chr2 38647296 38647381 -143100706 + RLTR25B LTR ERVK 444 521 -507 2 879 534 229 92 8 chr2 38654542 38654661 -143093426 + MTEb LTR MaLR 15 143 -236 3 879 367 324 92 90 chr2 38657099 38657413 -143090674 + MLT2B4 LTR ERVL 148 546 -10 3 879 911 130 0 0 chr2 38662613 38662759 -143085328 + MurERV4_19-int LTR ERVK 1923 2068 -3712 3 879 452 140 22 55 chr2 38662759 38662850 -143085237 + RLTR11A LTR ERVK 435 522 -6 3 880 1137 182 165 40 chr2 38673186 38673507 -143074580 + ORR1D1 LTR MaLR 1 361 -13 3 880 318 207 77 21 chr2 38695850 38695993 -143052094 + RMER17C LTR ERVK 110 260 -150 4 880 1556 189 136 24 chr2 38697408 38697777 -143050310 - MTD LTR MaLR 0 419 10 4 880 257 286 9 93 chr2 38721124 38721232 -143026855 + MTEb LTR MaLR 12 110 -269 5 880 643 287 196 60 chr2 38721583 38721965 -143026122 + MTE-int LTR MaLR 43 476 -1104 5 880 365 250 22 124 chr2 38722167 38722304 -143025783 + MTE-int LTR MaLR 771 893 -687 5 880 1272 337 77 34 chr2 38722307 38722813 -143025274 + MTE-int LTR MaLR 1019 1546 -34 5 880 239 307 0 137 chr2 38729708 38729810 -143018277 + MT2B LTR ERVL 153 240 -361 5 880 351 193 22 78 chr2 38731466 38731556 -143016531 + MT2B LTR ERVL 153 237 -364 5 880 2078 158 43 27 chr2 38732559 38732929 -143015158 + MTB_Mm LTR MaLR 1 376 -31 5 880 2558 52 6 58 chr2 38734226 38734571 -143013516 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 5 880 317 138 14 58 chr2 38738651 38738720 -143009367 + RLTR25B LTR ERVK 433 498 -530 5 880 300 241 71 24 chr2 38741377 38741462 -143006625 - MLT1A0 LTR MaLR -254 111 23 5 880 281 422 49 0 chr2 38742618 38742760 -143005327 + MLT1K LTR MaLR 7 155 -440 5 880 2477 166 10 12 chr2 38750814 38751228 -142996859 + MTC LTR MaLR 1 413 -8 6 880 1465 224 62 28 chr2 38752180 38752501 -142995586 + MTD LTR MaLR 17 348 -71 6 880 340 198 20 182 chr2 38752695 38752803 -142995284 - MT2B LTR ERVL -337 264 179 6 880 3644 50 69 26 chr2 38752803 38753294 -142994793 + RLTR1B LTR ERV1 1 512 0 6 880 340 221 18 182 chr2 38753311 38753377 -142994710 - MT2B LTR ERVL -406 178 105 6 880 1389 146 134 0 chr2 38758515 38758776 -142989311 + ORR1B1 LTR MaLR 55 350 -44 6 880 830 183 121 111 chr2 38758929 38758962 -142989125 + ORR1A2 LTR MaLR 284 319 -8 6 880 412 240 28 74 chr2 38759752 38759860 -142988227 + MT2B LTR ERVL 155 257 -344 6 880 5141 142 53 13 chr2 38761346 38762207 -142985880 + RMER19B LTR ERVK 1 896 -6 6 880 898 263 121 67 chr2 38764428 38764835 -142983252 + MT2B LTR ERVL 1 601 0 6 880 258 208 214 4 chr2 38773955 38774043 -142974044 + MTE2a LTR MaLR 9 104 -315 6 880 384 231 20 59 chr2 38788366 38788518 -142959569 - RMER17C LTR ERVK -137 273 128 7 881 238 277 179 43 chr2 38798371 38798488 -142949599 - LTR40b LTR ERVL 0 462 330 7 881 227 333 0 57 chr2 38798652 38798722 -142949365 - LTR40b LTR ERVL -448 71 6 7 881 341 258 6 205 chr2 38798977 38799133 -142948954 - RLTR31A_Mm LTR ERVK -153 431 307 7 881 3712 157 57 6 chr2 38799135 38799771 -142948316 - RLTR17 LTR ERVK -23 669 2 7 881 1521 188 174 9 chr2 38805173 38805517 -142942570 - MTD LTR MaLR -18 401 1 7 881 2316 122 76 0 chr2 38812758 38813112 -142934975 + ORR1B1 LTR MaLR 6 386 -8 7 881 1353 164 0 26 chr2 38813688 38813765 -142934322 - MTC LTR MaLR 0 421 349 7 881 1353 164 0 26 chr2 38813927 38814081 -142934006 - MTC LTR MaLR -73 348 196 7 881 777 263 77 96 chr2 38814685 38814896 -142933191 - MTD LTR MaLR -12 407 210 7 881 777 263 77 96 chr2 38815046 38815158 -142932929 - MTD LTR MaLR -210 209 90 7 881 908 181 187 65 chr2 38819664 38819942 -142928145 - MTD LTR MaLR 0 419 108 7 881 3065 64 15 3 chr2 38821677 38822068 -142926019 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 8 881 615 227 23 0 chr2 38824954 38825086 -142923001 - MTD LTR MaLR -92 327 193 8 881 1094 219 133 124 chr2 38825197 38825672 -142922415 - RLTR18 LTR ERVK -123 493 15 8 881 359 344 8 16 chr2 38825685 38825809 -142922278 - MTD LTR MaLR -239 180 58 8 881 289 221 118 99 chr2 38829694 38829855 -142918232 + RMER21A LTR ERV1 694 857 -90 8 881 257 224 0 87 chr2 38832706 38832833 -142915254 + ORR1B1-int LTR MaLR 632 747 -762 8 881 380 277 95 101 chr2 38834228 38834316 -142913771 - MT2A LTR ERVL 0 493 410 8 881 380 277 95 101 chr2 38834367 38834485 -142913602 - MT2A LTR ERVL -84 409 304 8 881 567 221 18 30 chr2 38834520 38834742 -142913345 - MT2A LTR ERVL -257 344 2 8 881 283 149 21 0 chr2 38834742 38834786 -142913301 - MTD LTR MaLR -37 382 338 8 881 613 259 34 7 chr2 38835145 38835293 -142912794 - MTD LTR MaLR 0 419 268 8 881 297 180 20 0 chr2 38835408 38835458 -142912629 - ORR1D2 LTR MaLR -317 53 3 8 881 441 301 108 41 chr2 38836243 38836437 -142911650 - MLT1L LTR MaLR -92 518 312 8 881 1357 243 87 21 chr2 38837545 38837923 -142910164 - MTD LTR MaLR -14 405 3 8 881 1041 172 13 103 chr2 38838672 38838905 -142909182 - RMER19B LTR ERVK 0 902 691 8 881 911 277 120 59 chr2 38840096 38840437 -142907650 - MTE2b LTR MaLR 0 379 18 8 881 674 269 107 23 chr2 38844453 38844716 -142903371 - MLT2C1 LTR ERVL -110 287 3 8 881 236 297 0 106 chr2 38844741 38844854 -142903233 + MT2B LTR ERVL 157 257 -344 8 881 1386 191 149 25 chr2 38850773 38851181 -142896906 + RMER4B LTR ERVK 17 507 -78 8 881 2304 106 153 193 chr2 38851181 38851465 -142896622 - MT2B2 LTR ERVL -2 582 206 8 881 2304 106 153 193 chr2 38851512 38851833 -142896254 - MT2B2 LTR ERVL -379 205 1 8 881 408 192 29 118 chr2 38851833 38851907 -142896180 + RMER4B LTR ERVK 508 576 -9 8 881 1831 171 18 0 chr2 38851981 38852314 -142895773 + RLTR24 LTR ERV1 191 529 0 9 881 1595 144 18 22 chr2 38852314 38852590 -142895497 + MTC LTR MaLR 145 419 -2 9 881 2336 174 109 47 chr2 38867709 38867957 -142880130 + RLTR28 LTR ERVL 1 275 -249 9 881 2336 174 109 47 chr2 38868097 38868341 -142879746 + RLTR28 LTR ERVL 276 524 0 9 881 423 185 50 89 chr2 38877583 38877684 -142870403 - MT2B LTR ERVL -360 241 145 9 881 324 244 70 78 chr2 38877917 38878046 -142870041 + MT2B LTR ERVL 130 257 -344 9 881 230 346 75 25 chr2 38885358 38885518 -142862569 - MLT1D LTR MaLR -261 244 77 9 881 317 270 34 59 chr2 38886537 38886655 -142861432 - MT2B LTR ERVL -323 278 164 9 881 3238 53 0 8 chr2 38897738 38898137 -142849950 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 881 756 260 112 58 chr2 38898389 38898687 -142849400 + MTE2a LTR MaLR 1 324 -95 1 881 574 135 0 0 chr2 38898687 38898783 -142849304 + ORR1C2 LTR MaLR 1 96 -288 1 881 975 114 7 26 chr2 38898783 38898936 -142849151 + ORR1C2 LTR MaLR 235 384 0 1 881 1966 157 50 3 chr2 38908892 38909255 -142838832 + ORR1C2 LTR MaLR 3 382 -2 1 881 339 200 35 123 chr2 38909632 38909746 -142838341 - MT2B LTR ERVL -337 264 161 1 881 1806 168 42 65 chr2 38910436 38910819 -142837268 + ORR1C2 LTR MaLR 11 384 0 1 881 227 355 13 80 chr2 38912692 38912842 -142835245 + MT2B LTR ERVL 167 306 -295 1 881 907 264 127 16 chr2 38915249 38915565 -142832522 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 15 1 881 268 274 156 10 chr2 38915880 38915976 -142832111 + MER68 LTR ERVL 454 563 0 1 881 234 264 13 51 chr2 38918421 38918447 -142829640 + ORR1B1-int LTR MaLR 605 749 -755 1 881 393 217 32 80 chr2 38918447 38918469 -142829618 + MT2B LTR ERVL 139 154 -447 1 882 3164 46 8 8 chr2 38931662 38932056 -142816031 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 3 1 882 235 297 245 49 chr2 38942268 38942452 -142805635 + MER68 LTR ERVL 49 268 -295 1 882 424 340 51 0 chr2 38942609 38942806 -142805281 + MER68 LTR ERVL 268 474 -89 1 882 2191 114 25 20 chr2 38951119 38951476 -142796611 + RLTR15 LTR ERVK 1 359 0 1 882 1040 209 93 98 chr2 38952125 38952573 -142795514 + MT2A LTR ERVL 3 587 -14 1 882 2798 126 113 13 chr2 38963977 38964453 -142783634 + RLTR28 LTR ERVL 1 524 0 1 882 2358 110 0 3 chr2 38970150 38970478 -142777609 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 1 882 865 348 64 43 chr2 38970869 38971857 -142776230 + MuLV-int LTR ERV1 2698 3645 -3961 1 882 1591 147 53 184 chr2 38971857 38972095 -142775992 - ORR1B1 LTR MaLR -2 392 216 1 882 1591 147 53 184 chr2 38972243 38972455 -142775632 - ORR1B1 LTR MaLR -179 215 1 1 882 865 329 74 51 chr2 38972455 38973178 -142774909 + MuLV-int LTR ERV1 3646 4319 -3287 1 882 726 310 46 21 chr2 38973640 38974082 -142774005 + RLTR6-int LTR ERV1 4831 5326 -2452 1 882 1125 222 52 23 chr2 38975411 38975757 -142772330 + RLTR18-int LTR ERVK 4880 5235 -126 1 882 1071 222 236 88 chr2 38979624 38980010 -142768077 + RLTR33 LTR ERVK 175 617 -61 1 882 1991 116 58 0 chr2 38982608 38982919 -142765168 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 1 882 391 313 22 7 chr2 38983972 38984107 -142763980 + MLT1B LTR MaLR 246 382 -8 1 882 3109 127 127 0 chr2 38990460 38990979 -142757108 + RMER4B LTR ERVK 1 585 0 1 882 1911 148 276 3 chr2 38994532 38994924 -142753163 + RLTR19 LTR ERVK 1 499 0 1 882 298 197 82 0 chr2 38995565 38995626 -142752461 - MT2B LTR ERVL -357 244 179 1 882 738 290 98 18 chr2 38996012 38996339 -142751748 + MLT1C LTR MaLR 1 353 -114 1 882 908 167 12 6 chr2 38999096 38999265 -142748822 + RLTR20A LTR ERVK 270 439 -102 1 882 250 256 10 122 chr2 38999523 38999621 -142748466 + MT2B2 LTR ERVL 154 240 -344 1 882 2219 188 136 20 chr2 39000184 39000788 -142747299 + ORR1D1-int LTR MaLR 175 848 -661 2 882 616 186 174 34 chr2 39000789 39000804 -142747283 + ORR1D1 LTR MaLR 172 184 -190 2 882 616 186 174 34 chr2 39000830 39000992 -142747095 + ORR1D1 LTR MaLR 185 374 0 2 882 253 292 0 0 chr2 39002268 39002333 -142745754 + MLT1N2 LTR MaLR 493 557 -5 9 882 1516 142 111 21 chr2 39003345 39003631 -142744456 + ORR1B1 LTR MaLR 1 312 -82 1 882 2139 166 90 77 chr2 39003631 39004141 -142743946 + RLTR12B LTR ERVK 1 517 -11 1 882 557 82 29 58 chr2 39004900 39005004 -142743083 + ORR1B1 LTR MaLR 294 394 0 1 882 727 276 54 31 chr2 39006326 39006550 -142741537 + LTR16A LTR ERVL 223 451 0 1 882 587 315 93 93 chr2 39006636 39007056 -142741031 + MLT1J LTR MaLR 29 448 -64 1 882 1982 165 85 28 chr2 39010821 39011219 -142736868 + MTC LTR MaLR 1 421 0 2 882 1537 212 76 11 chr2 39014151 39014508 -142733579 - MTD LTR MaLR -3 416 37 3 882 225 56 27 27 chr2 39014721 39014758 -142733329 - MTD LTR MaLR -377 44 8 3 882 1260 130 9 42 chr2 39014919 39015136 -142732951 - MERVL_2A-int LTR ERVL -5551 210 1 3 882 316 81 1 5 chr2 39015138 39015187 -142732900 - MT2A LTR ERVL -3 552 485 3 882 254 240 19 65 chr2 39015216 39015273 -142732814 - MT2A LTR ERVL -47 508 451 3 882 462 289 100 6 chr2 39015841 39016001 -142732086 + MLT1B LTR MaLR 1 175 -215 3 882 413 125 0 0 chr2 39021237 39021301 -142726786 + ORR1D1 LTR MaLR 311 374 0 5 882 3834 178 91 71 chr2 39021428 39022173 -142725914 + ORR1D1-int LTR MaLR 452 1233 -137 5 882 3834 178 91 71 chr2 39022324 39022479 -142725608 + ORR1D1-int LTR MaLR 1234 1370 0 5 882 1530 204 84 36 chr2 39022479 39022836 -142725251 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 5 882 2241 95 35 0 chr2 39023700 39024016 -142724071 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 5 882 1851 156 40 35 chr2 39027654 39028026 -142720061 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 7 882 416 313 154 39 chr2 39028344 39028682 -142719405 - MLT1G1 LTR MaLR -76 503 101 7 882 1345 207 165 111 chr2 39029282 39029570 -142718517 + MT2B LTR ERVL 1 338 -263 7 882 1345 207 165 111 chr2 39029687 39029968 -142718119 + MT2B LTR ERVL 339 601 0 7 882 580 289 200 97 chr2 39032817 39033151 -142714936 - MLT2B4 LTR ERVL -51 505 101 8 882 580 289 200 97 chr2 39033292 39033413 -142714674 - MLT2B4 LTR ERVL -456 100 3 8 882 622 317 49 86 chr2 39034291 39034347 -142713740 - MLT1F1 LTR MaLR -152 417 365 9 882 1302 153 402 36 chr2 39034347 39034733 -142713354 + RLTR24 LTR ERV1 1 527 -2 9 882 622 317 49 86 chr2 39034733 39035107 -142712980 - MLT1F1 LTR MaLR -205 364 3 9 882 2195 141 86 0 chr2 39035115 39035476 -142712611 + ORR1B1 LTR MaLR 2 393 -1 9 882 231 295 83 83 chr2 39036746 39036938 -142711149 - ORR1E LTR MaLR -86 273 82 9 882 366 264 26 79 chr2 39037087 39037239 -142710848 + MamGypLTR1b LTR Gypsy 639 782 0 1 882 949 206 202 109 chr2 39037735 39038221 -142709866 + RLTR20C LTR ERVK 4 534 0 1 882 286 325 209 9 chr2 39038221 39038423 -142709664 + RMER5 LTR ERV1 73 317 -217 1 882 334 288 36 37 chr2 39039486 39039645 -142708442 - ORR1E LTR MaLR -261 147 1 1 883 236 206 83 157 chr2 39062842 39062963 -142685124 + MT2B LTR ERVL 152 263 -338 1 883 405 75 0 0 chr2 39068488 39068541 -142679546 + RMER15 LTR ERVL 24 76 -499 1 883 965 200 280 30 chr2 39078600 39079020 -142669067 - RLTR11A2 LTR ERVK -2 525 1 2 883 3249 41 5 5 chr2 39087622 39088018 -142660069 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 883 1296 166 33 40 chr2 39090073 39090349 -142657738 + RLTR46 LTR ERVK 42 315 -5 2 883 2063 207 59 20 chr2 39091302 39091370 -142656717 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 63 -464 2 883 2761 64 0 6 chr2 39091370 39091718 -142656369 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 2 883 2063 207 59 20 chr2 39091718 39092137 -142655950 + RLTR11A2 LTR ERVK 64 507 -20 2 883 427 141 104 42 chr2 39092192 39092288 -142655799 - RMER17C LTR ERVK 0 410 309 2 883 704 115 9 0 chr2 39092288 39092401 -142655686 - MYSERV6-int LTR ERVK -5158 3801 3688 2 883 10806 157 35 42 chr2 39092960 39093606 -142654481 - MYSERV6-int LTR ERVK -5249 3710 3090 2 883 10806 157 35 42 chr2 39093820 39094195 -142653892 - MYSERV6-int LTR ERVK -5870 3089 2708 2 883 2416 166 21 59 chr2 39094195 39094721 -142653366 + RLTR19C LTR ERVK 1 506 0 2 883 10806 157 35 42 chr2 39094721 39095999 -142652088 - MYSERV6-int LTR ERVK -6252 2707 1425 2 883 3628 196 35 16 chr2 39102539 39103315 -142644772 - MYSERV6-int LTR ERVK -7521 1438 648 2 883 1501 153 65 126 chr2 39103318 39103730 -142644357 - MYSERV6-int LTR ERVK -8516 443 57 2 883 240 293 0 0 chr2 39103965 39104023 -142644064 - RMER6B LTR ERVK -36 425 368 2 883 2017 164 6 0 chr2 39104772 39105102 -142642985 + MERVL_2A-int LTR ERVL 4593 4924 -837 2 883 227 305 0 17 chr2 39105151 39105211 -142642876 - RLTR22_Mur LTR ERVK -151 1697 1639 2 883 1140 225 44 4 chr2 39105328 39105600 -142642487 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1043 805 523 2 883 328 279 38 19 chr2 39106124 39106230 -142641857 + RLTR23 LTR ERV1 317 424 -6 2 883 2422 146 21 43 chr2 39106230 39106653 -142641434 + MERVL_2A-int LTR ERVL 4922 5335 -426 2 883 4444 163 73 73 chr2 39106653 39107555 -142640532 - RMER19B LTR ERVK 0 902 1 2 883 1186 186 60 15 chr2 39107596 39107864 -142640223 + MERVL_2A-int LTR ERVL 5402 5681 -80 2 883 2332 127 71 8 chr2 39107934 39108315 -142639772 + RLTR44A LTR ERVK 1 405 0 2 883 1926 139 24 82 chr2 39111793 39112169 -142635918 + ORR1B1 LTR MaLR 41 394 0 2 883 303 119 12 8 chr2 39112174 39112236 -142635851 + ORR1B1-int LTR MaLR 9 72 -1891 2 883 255 239 15 0 chr2 39112205 39112272 -142635815 + ORR1B1-int LTR MaLR 677 744 -1219 2 883 4006 172 36 5 chr2 39112273 39112944 -142635143 - RLTR17 LTR ERVK 0 692 1 2 883 7152 186 41 45 chr2 39112944 39114748 -142633339 - RMER3D-int LTR ERVK 0 2842 1047 2 883 1473 264 82 12 chr2 39117332 39117841 -142630246 - RMER3D-int LTR ERVK -7864 1095 551 2 883 1501 136 16 4 chr2 39124274 39124517 -142623570 + RMER16-int LTR ERVK 172 417 -4989 2 883 13701 91 6 7 chr2 39124514 39126531 -142621556 + RMER16-int LTR ERVK 3391 5404 -2 2 883 1561 159 102 99 chr2 39126564 39126990 -142621097 + RMER16 LTR ERVK 117 533 0 2 883 310 304 95 8 chr2 39130774 39130900 -142617187 + MTE2a LTR MaLR 1 137 -242 2 883 362 314 81 50 chr2 39130862 39131023 -142617064 + MT2A LTR ERVL 100 265 -268 2 883 972 171 32 9 chr2 39131216 39131434 -142616653 - MYSERV-int LTR ERVK 0 6550 6328 2 883 2562 238 94 92 chr2 39135096 39135907 -142612180 + RMER13A LTR ERVK 1 812 -48 2 883 262 286 41 62 chr2 39151639 39151736 -142596351 + MTEb LTR MaLR 242 336 -43 3 883 318 329 62 62 chr2 39152651 39152829 -142595258 + RMER13A LTR ERVK 1 178 -682 3 883 560 67 231 0 chr2 39157170 39157274 -142590813 + RLTR47_MM LTR ERV1 55 182 -350 3 883 673 146 145 7 chr2 39157329 39157481 -142590606 + RLTR47_MM LTR ERV1 353 525 -7 3 883 564 265 21 21 chr2 39157783 39157974 -142590113 + MuRRS4-int LTR ERV1 2082 2415 -5363 3 883 2021 299 43 38 chr2 39158244 39159888 -142588199 + MuRRS4-int LTR ERV1 3537 5627 -1974 3 883 341 343 22 29 chr2 39160401 39160674 -142587413 + MuRRS4-int LTR ERV1 4663 4933 -130 3 883 2344 82 143 3 chr2 39160791 39161182 -142586905 + RLTR47_MM LTR ERV1 52 497 -35 3 883 2155 117 72 14 chr2 39166879 39167246 -142580841 + RLTR33 LTR ERVK 1 422 -256 3 883 2035 125 152 13 chr2 39167633 39168014 -142580073 - RMER6C LTR ERVK -1 689 256 3 883 1081 152 122 0 chr2 39168324 39168521 -142579566 + RMER6C LTR ERVK 1 221 -469 3 883 973 242 56 17 chr2 39175602 39175833 -142572254 + RLTR19 LTR ERVK 260 499 0 3 883 792 178 27 7 chr2 39175833 39175980 -142572107 + RLTR19-int LTR ERVK 1 150 -5987 3 883 2361 102 22 44 chr2 39176130 39176490 -142571597 + RLTR19-int LTR ERVK 667 1018 -5119 3 883 1063 118 0 7 chr2 39176926 39177080 -142571007 - ORR1B2 LTR MaLR -3 364 212 3 883 2291 78 26 0 chr2 39177084 39177391 -142570696 + ORR1A2 LTR MaLR 5 319 -8 3 883 1138 182 42 9 chr2 39177390 39177606 -142570481 - ORR1B2 LTR MaLR -144 223 1 3 883 262 263 84 66 chr2 39180293 39180460 -142567627 - LTRIS5 LTR ERV1 -44 403 234 3 883 1188 315 65 71 chr2 39181754 39182944 -142565143 + SRV_MM-int LTR ERVK 943 2124 -4043 3 883 491 282 138 19 chr2 39182972 39183131 -142564956 - RMER12 LTR ERVK 0 1322 1145 3 883 1656 153 28 279 chr2 39183336 39184081 -142564006 - RMER12 LTR ERVK -178 1144 587 3 883 1909 170 61 41 chr2 39184126 39184547 -142563540 - RMER12 LTR ERVK -732 590 160 3 883 1909 171 58 31 chr2 39184600 39184665 -142563422 - RMER12 LTR ERVK -1686 162 85 3 883 1129 172 55 17 chr2 39184857 39184919 -142563168 - RMER12 LTR ERVK -1764 84 24 3 884 1240 254 81 85 chr2 39191444 39192141 -142555946 - RLTR19-int LTR ERVK -2168 3969 2607 3 884 1759 244 88 104 chr2 39192311 39193853 -142554234 - RLTR19-int LTR ERVK -2415 3722 1981 3 884 520 282 104 52 chr2 39194011 39194299 -142553788 - RodERV21-int LTR ERV1 -4223 768 466 3 884 262 339 77 0 chr2 39194319 39194449 -142553638 - RodERV21-int LTR ERV1 -4787 204 65 3 884 1843 127 2 149 chr2 39196652 39197158 -142550929 - RMER17C LTR ERVK -519 439 16 3 884 899 217 143 24 chr2 39199229 39199477 -142548610 - ORR1B2 LTR MaLR -114 253 1 3 884 8158 175 31 18 chr2 39199477 39200963 -142547124 - ORR1B2-int LTR MaLR 0 1509 5 3 884 1836 202 45 3 chr2 39200967 39201319 -142546768 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 3 884 2694 183 35 10 chr2 39201765 39202279 -142545808 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 527 0 3 884 374 347 110 40 chr2 39203112 39203385 -142544702 + MLT2B1 LTR ERVL 60 351 -169 3 884 2449 224 36 0 chr2 39203768 39204236 -142543851 - MERVK26-int LTR ERVK -38 6881 6397 3 884 378 294 10 70 chr2 39204303 39204504 -142543583 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -1894 432 244 3 884 795 258 43 33 chr2 39204516 39204792 -142543295 - MERVK26-int LTR ERVK -88 5172 4894 3 884 1803 60 5 0 chr2 39205278 39205495 -142542592 + MERVL-int LTR ERVL 3413 3630 -1855 3 884 615 223 125 71 chr2 39205652 39205734 -142542353 - RMER20B LTR ERVK -236 391 293 3 884 615 223 125 71 chr2 39205815 39206012 -142542075 - RMER20B LTR ERVK -335 292 98 3 884 393 257 28 56 chr2 39208289 39208328 -142539759 - RMER17C-int LTR ERVK -1 3237 3201 3 884 3002 143 47 5 chr2 39208328 39208756 -142539331 + RLTR41 LTR ERV1 1 446 0 3 884 393 257 28 56 chr2 39208756 39208860 -142539227 - RMER17C-int LTR ERVK -38 3200 3098 3 884 376 262 0 153 chr2 39208983 39209199 -142538888 - RLTR19-int LTR ERVK -2766 3371 3189 3 884 1462 252 32 28 chr2 39209913 39210350 -142537737 + MYSERV6-int LTR ERVK 8260 8698 -261 4 884 3918 180 98 51 chr2 39211101 39211951 -142536136 + RMER19B LTR ERVK 1 890 -12 4 884 3509 128 27 2 chr2 39212964 39213451 -142534636 - RLTR19 LTR ERVK 0 499 1 4 884 2473 161 61 14 chr2 39214023 39214463 -142533624 - RMER6B LTR ERVK 0 461 1 4 884 3114 28 42 3 chr2 39216203 39216556 -142531531 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 4 884 56210 20 20 7 chr2 39216556 39222946 -142525141 + IAPEz-int LTR ERVK 8 6481 0 4 884 2963 28 42 3 chr2 39222946 39223299 -142524788 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 4 884 259 175 31 16 chr2 39225139 39225203 -142522884 + RLTR19C LTR ERVK 33 97 -409 4 884 439 329 7 52 chr2 39225368 39225522 -142522565 + RLTR33 LTR ERVK 447 593 -85 4 884 280 309 10 40 chr2 39232705 39232806 -142515281 - RLTR42-int LTR ERVK -3727 1795 1698 4 884 3028 132 75 0 chr2 39232827 39233291 -142514796 - RLTR19 LTR ERVK 0 499 1 4 884 441 149 0 0 chr2 39233292 39233359 -142514728 - RLTR19-int LTR ERVK -1 6136 6070 4 884 305 308 50 62 chr2 39233349 39233591 -142514496 - RNERVK23-int LTR ERVK -569 7648 7410 4 884 1044 226 13 13 chr2 39233621 39233850 -142514237 - RLTR19-int LTR ERVK -76 6061 5833 4 884 1356 198 47 66 chr2 39233957 39234443 -142513644 + RMER2 LTR ERV1 1 542 -25 4 884 832 167 36 0 chr2 39234494 39234632 -142513455 - RLTR19-int LTR ERVK -523 5614 5472 4 884 2750 159 66 10 chr2 39234639 39235340 -142512747 - RLTR19-int LTR ERVK -1096 5041 4301 4 884 2353 178 65 30 chr2 39235340 39235849 -142512238 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 2 4 884 2750 134 2 7 chr2 39235849 39235897 -142512190 - RLTR19-int LTR ERVK -1837 4300 4253 4 884 241 167 0 0 chr2 39235995 39236043 -142512044 - RMER6A LTR ERVK 0 756 709 4 884 1876 152 170 16 chr2 39236485 39237031 -142511056 - RMER6A LTR ERVK -36 720 1 4 884 3093 23 0 3 chr2 39237580 39237927 -142510160 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 4 884 2537 26 96 0 chr2 39241242 39241545 -142506542 - IAPEY3_LTR LTR ERVK 0 332 1 4 884 2310 291 17 18 chr2 39247714 39248480 -142499607 - RNERVK23-int LTR ERVK -700 7517 6753 4 884 1142 200 28 0 chr2 39250716 39250931 -142497156 + RMER6-int LTR ERVK 505 725 -2452 4 884 815 226 33 9 chr2 39255397 39255611 -142492476 + MurERV4-int LTR ERVK 4841 5059 -201 4 884 1702 133 30 216 chr2 39255645 39256241 -142491846 + RMER6C LTR ERVK 206 690 0 4 884 3203 47 39 0 chr2 39260177 39260558 -142487529 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 884 2202 203 31 25 chr2 39262901 39263029 -142485058 - RLTR11A LTR ERVK -45 483 354 4 884 3473 25 2 2 chr2 39263029 39263425 -142484662 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 884 2202 203 31 25 chr2 39263425 39263776 -142484311 - RLTR11A LTR ERVK -175 353 1 4 884 293 206 0 56 chr2 39264803 39264875 -142483212 - MYSERV6-int LTR ERVK -2361 6598 6531 4 884 1678 172 33 3 chr2 39265682 39266014 -142482073 - RLTR15 LTR ERVK -17 342 1 4 884 2173 143 31 6 chr2 39266857 39267216 -142480871 + RLTR9A LTR ERVK 1 368 0 4 884 325 297 31 57 chr2 39267218 39267411 -142480676 + SRV_MM-int LTR ERVK 4 191 -3123 4 884 3883 308 52 37 chr2 39267410 39269818 -142478269 + SRV_MM-int LTR ERVK 1263 3585 -2582 4 884 3264 38 13 3 chr2 39272765 39273157 -142474930 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 884 8780 54 7 1 chr2 39273157 39274248 -142473839 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 4 884 3387 38 2 2 chr2 39274248 39274644 -142473443 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 884 1025 70 12 82 chr2 39276370 39276541 -142471546 - RLTR45-int LTR ERVK -5918 1326 1168 4 884 257 109 146 0 chr2 39276734 39276789 -142471298 - RLTR45-int LTR ERVK -6067 1177 1115 4 884 7789 185 17 18 chr2 39276833 39278213 -142469874 + ETnERV2-int LTR ERVK 4388 5765 -1641 4 884 2156 226 21 101 chr2 39284603 39285328 -142462759 + ETnERV2-int LTR ERVK 5754 6420 -986 4 884 1759 132 12 10 chr2 39285590 39285886 -142462201 + RLTR9A LTR ERVK 68 368 0 4 884 414 260 148 48 chr2 39286891 39287083 -142461004 - RMER12 LTR ERVK 0 1322 1144 4 884 1676 206 106 17 chr2 39288656 39289070 -142459017 + RLTR22_Mus LTR ERVK 1007 1457 -351 4 884 382 244 42 49 chr2 39289057 39289199 -142458888 - RLTR22_Mus LTR ERVK -195 1613 1473 4 884 275 312 248 31 chr2 39290087 39290355 -142457732 - MLT1B LTR MaLR -64 326 1 4 884 3487 185 29 14 chr2 39291786 39292418 -142455669 + RLTR26 LTR ERVK 1 641 -1 4 884 298 327 118 7 chr2 39293543 39293731 -142454356 + ORR1D2 LTR MaLR 2 207 -167 4 884 1212 271 61 20 chr2 39293915 39294258 -142453829 - MTE2b LTR MaLR -12 367 11 4 884 422 39 0 0 chr2 39297524 39297576 -142450511 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 52 -423 4 884 713 235 73 0 chr2 39303811 39303990 -142444097 + MERVL-int LTR ERVL 764 955 -4530 4 884 2149 212 22 167 chr2 39304937 39305651 -142442436 - RMER19C LTR ERVK 0 611 1 5 884 3232 108 14 4 chr2 39306156 39306638 -142441449 + RLTR1C LTR ERV1 1 487 -16 5 884 1342 85 32 0 chr2 39307908 39308097 -142439990 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 281 5 884 1750 165 16 78 chr2 39308038 39308267 -142439820 - RLTR23 LTR ERV1 -77 353 143 5 884 1750 165 16 78 chr2 39308298 39308442 -142439645 - RLTR23 LTR ERV1 -288 142 3 5 884 584 235 114 18 chr2 39308609 39308775 -142439312 - MTC-int LTR MaLR -1 1257 960 5 884 436 237 0 160 chr2 39308992 39309007 -142439080 - MTC-int LTR MaLR -139 959 945 5 885 4350 67 35 11 chr2 39323790 39324397 -142423690 + RLTR13B3 LTR ERVK 1 621 -308 5 885 3616 36 5 0 chr2 39324389 39324830 -142423257 + RLTR13B1 LTR ERVK 451 893 0 5 885 359 222 14 125 chr2 39326300 39326333 -142421754 - MT2B LTR ERVL -448 153 137 5 885 389 261 23 79 chr2 39326979 39327195 -142420892 + RLTR12B LTR ERVK 301 504 -24 5 885 821 244 28 58 chr2 39327962 39328231 -142419856 - RLTR12B LTR ERVK -244 284 42 5 885 1814 202 16 3 chr2 39328253 39328690 -142419397 - MurERV4-int LTR ERVK -56 8903 8534 5 885 2125 141 24 18 chr2 39328691 39329073 -142419014 + MYSERV6-int LTR ERVK 2878 3261 -5698 5 885 373 303 49 108 chr2 39329073 39329258 -142418829 - RMER4A LTR ERVK -12 454 281 5 885 6544 249 76 57 chr2 39329271 39329879 -142418208 - MurERV4-int LTR ERVK -1396 5154 4616 5 885 8849 244 61 17 chr2 39330023 39332222 -142415865 - MurERV4-int LTR ERVK -96 5164 2802 5 885 2098 149 8 14 chr2 39332222 39332583 -142415504 + RLTR15 LTR ERVK 1 359 0 5 885 8849 244 59 13 chr2 39332583 39332969 -142415118 - MurERV4-int LTR ERVK -2169 3091 2669 5 885 3785 187 126 39 chr2 39332982 39333928 -142414159 + RLTR25B LTR ERVK 1 1028 0 5 885 1284 255 60 12 chr2 39333933 39334240 -142413847 - MurERV4-int LTR ERVK -6879 2080 1521 5 885 4543 48 5 18 chr2 39334240 39334811 -142413276 - LTRIS2 LTR ERV1 0 564 1 5 885 1284 252 58 10 chr2 39334811 39334958 -142413129 - MurERV4-int LTR ERVK -7129 1830 1667 5 885 1351 188 38 55 chr2 39334959 39335213 -142412874 + RLTR15 LTR ERVK 1 257 -102 5 885 3122 57 31 0 chr2 39335213 39335601 -142412486 - MTB LTR MaLR 0 400 1 5 885 1351 188 38 55 chr2 39335601 39335711 -142412376 + RLTR15 LTR ERVK 258 359 0 5 885 1795 159 29 49 chr2 39336391 39336800 -142411287 - RMER17C LTR ERVK -2 408 8 5 885 9590 123 60 64 chr2 39336804 39337135 -142410952 - RMER17C-int LTR ERVK -5 3233 2900 5 885 9590 123 60 64 chr2 39337177 39338747 -142409340 - RMER17C-int LTR ERVK -339 2899 1339 5 885 863 160 27 59 chr2 39339471 39339657 -142408430 - RMER17C-int LTR ERVK -3054 184 5 5 885 355 295 60 0 chr2 39339678 39339827 -142408260 + RMER6-int LTR ERVK 2655 2812 -365 5 885 1599 283 67 55 chr2 39339834 39340675 -142407412 + MYSERV-int LTR ERVK 4373 5223 -1327 5 885 3027 239 62 69 chr2 39340677 39341022 -142407065 + MYSERV-int LTR ERVK 5436 5795 -755 5 885 3027 239 62 69 chr2 39341173 39341948 -142406139 + MYSERV-int LTR ERVK 5796 6549 -1 5 885 799 247 48 22 chr2 39341950 39342219 -142405868 + RLTR15 LTR ERVK 2 277 -82 5 885 3643 137 38 16 chr2 39342219 39342849 -142405238 + RLTR25A LTR ERVK 1 644 -459 5 885 671 214 78 21 chr2 39344499 39344690 -142403397 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 169 5 885 430 340 52 21 chr2 39344688 39344941 -142403146 - ORR1E LTR MaLR -115 255 1 5 885 2137 208 24 34 chr2 39347820 39348288 -142399799 + RLTR12B LTR ERVK 1 463 -65 5 885 1120 208 0 23 chr2 39350985 39351202 -142396885 - ORR1A3 LTR MaLR -114 212 1 5 885 3148 53 5 2 chr2 39352248 39352643 -142395444 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 885 3225 44 15 0 chr2 39358620 39359010 -142389077 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 885 240 351 44 0 chr2 39379690 39379804 -142368283 + MLT1F-int LTR MaLR 664 782 -707 5 885 297 347 74 34 chr2 39380928 39381104 -142366983 + MLT1F-int LTR MaLR 999 1181 -308 5 885 2290 88 3 57 chr2 39381470 39381821 -142366266 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 332 -5 5 885 4634 63 4 53 chr2 39381821 39382512 -142365575 + IAPEz-int LTR ERVK 6 662 -5819 5 885 898 67 0 0 chr2 39382512 39382631 -142365456 + IAPEz-int LTR ERVK 1359 1477 -5004 5 885 1791 91 8 0 chr2 39382626 39382878 -142365209 + IAPEz-int LTR ERVK 2244 2497 -5183 5 885 981 56 0 0 chr2 39382875 39383001 -142365086 + IAPEz-int LTR ERVK 4785 4910 -2770 5 885 25353 11 2 0 chr2 39383001 39385951 -142362136 + IAPEz-int LTR ERVK 3525 6481 0 5 885 3218 91 2 67 chr2 39385951 39386459 -142361628 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 5 885 606 246 165 41 chr2 39391354 39391596 -142356491 + RLTR10A LTR ERVK 140 411 0 6 885 2681 108 18 10 chr2 39392558 39392959 -142355128 + RLTR9E LTR ERVK 6 409 0 6 885 1631 189 81 48 chr2 39401931 39402303 -142345784 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 6 885 304 394 52 18 chr2 39403395 39403657 -142344430 + MLT1A LTR MaLR 88 374 0 6 885 506 198 123 6 chr2 39405252 39405415 -142342672 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 2144 2325 -1 6 885 2185 188 9 7 chr2 39405417 39405840 -142342247 + BGLII_B LTR ERVK 6 429 -12 6 885 1184 196 156 165 chr2 39408341 39408879 -142339208 - MT2A LTR ERVL 0 533 1 6 885 2138 173 48 34 chr2 39408925 39409420 -142338667 + BGLII_B LTR ERVK 3 436 -5 6 885 836 268 78 59 chr2 39409658 39410015 -142338072 + RLTR40 LTR ERVK 19 382 -435 6 885 375 262 35 109 chr2 39410049 39410250 -142337837 + RLTR40 LTR ERVK 550 735 -82 6 885 2049 80 0 55 chr2 39410402 39410694 -142337393 - ORR1A2 LTR MaLR -51 276 1 6 885 6074 193 93 19 chr2 39410694 39411691 -142336396 - ORR1A2-int LTR MaLR 0 1792 686 6 885 6074 185 75 5 chr2 39411834 39412467 -142335620 - ORR1A2-int LTR MaLR -1252 711 30 6 885 1554 87 0 0 chr2 39412465 39412672 -142335415 - ORR1A2 LTR MaLR -10 336 130 6 885 3121 190 30 56 chr2 39417026 39417684 -142330403 + RLTR26 LTR ERVK 2 642 0 6 885 1608 120 4 4 chr2 39429359 39429601 -142318486 + MT2B2 LTR ERVL 343 584 0 6 885 1253 171 104 40 chr2 39439212 39439647 -142308440 - RLTR1B LTR ERV1 -76 436 1 6 885 12947 40 26 0 chr2 39439647 39441274 -142306813 - RLTR1B-int LTR ERV1 0 3299 1631 6 885 466 60 15 0 chr2 39441272 39441339 -142306748 - RLTR1B-int LTR ERV1 -2386 913 846 6 885 433 68 0 0 chr2 39441336 39441395 -142306692 - RLTR1B-int LTR ERV1 -3240 59 1 6 885 915 169 24 0 chr2 39441395 39441561 -142306526 - RLTR1B LTR ERV1 0 512 343 6 885 389 125 0 0 chr2 39441565 39441621 -142306466 - RLTR1B LTR ERV1 -102 410 355 6 885 2162 166 53 58 chr2 39448359 39448549 -142299538 + MTC LTR MaLR 9 201 -220 6 885 2162 166 53 58 chr2 39448739 39448963 -142299124 + MTC LTR MaLR 202 421 0 6 886 996 287 62 17 chr2 39456075 39456433 -142291654 - MTE2b LTR MaLR -4 375 2 6 886 1043 139 30 6 chr2 39460678 39460844 -142287243 + RLTR9C LTR ERVK 1 170 -223 6 886 4074 252 77 69 chr2 39465994 39466316 -142281771 - MYSERV-int LTR ERVK -979 5571 5224 6 886 4074 252 77 69 chr2 39466376 39467832 -142280255 - MYSERV-int LTR ERVK -1327 5223 3779 6 886 519 265 109 73 chr2 39468987 39469188 -142278899 - RLTR15 LTR ERVK -17 342 127 6 886 519 265 109 73 chr2 39469241 39469369 -142278718 - RLTR15 LTR ERVK -233 126 1 6 886 1326 229 119 55 chr2 39469408 39469586 -142278501 - RLTR28B LTR ERVL -34 447 261 6 886 3143 63 134 11 chr2 39469586 39470033 -142278054 - RLTR44C LTR ERVK 0 502 1 6 886 1326 229 119 55 chr2 39470033 39470274 -142277813 - RLTR28B LTR ERVL -221 260 2 6 886 316 327 0 0 chr2 39470922 39471032 -142277055 - RodERV21-int LTR ERV1 -446 4545 4436 6 886 686 365 40 32 chr2 39471994 39472752 -142275335 - RodERV21-int LTR ERV1 -2852 2139 1376 6 886 820 244 82 91 chr2 39472799 39473217 -142274870 - RLTR28B LTR ERVL -119 405 3 6 886 677 294 123 60 chr2 39473527 39473943 -142274144 + RMER10A LTR ERVL 1 442 0 6 886 809 332 70 48 chr2 39475870 39476246 -142271841 + RLTR20B3 LTR ERVK 99 483 -94 7 886 809 261 80 134 chr2 39476281 39476354 -142271733 + RLTR20B3 LTR ERVK 457 523 -4 7 886 1685 145 25 0 chr2 39479209 39479492 -142268595 - ORR1A2 LTR MaLR -37 290 1 7 886 2464 188 62 67 chr2 39490004 39490346 -142257741 + RMER6C LTR ERVK 4 329 -361 7 886 2464 188 62 67 chr2 39490521 39490868 -142257219 + RMER6C LTR ERVK 330 690 0 7 886 993 229 82 88 chr2 39504830 39505292 -142242795 - MT2B LTR ERVL -14 587 1 4 886 610 209 125 62 chr2 39512973 39513441 -142234646 - RMER17C LTR ERVK 0 410 3 1 886 1605 113 72 26 chr2 39513476 39513740 -142234347 - RMER17C-int LTR ERVK -63 3175 2900 1 886 1682 149 41 10 chr2 39513915 39514207 -142233880 - RMER17C-int LTR ERVK -352 2886 2586 1 886 771 106 32 0 chr2 39514554 39514677 -142233410 - RLTR9A LTR ERVK -241 127 1 2 886 437 156 104 0 chr2 39514677 39514773 -142233314 + RMER17C LTR ERVK 305 410 0 2 886 626 262 77 34 chr2 39515020 39515253 -142232834 + RMER17C-int LTR ERVK 211 453 -2785 2 886 451 183 418 28 chr2 39527417 39527593 -142220494 + RMER3D-int LTR ERVK 1 246 -2596 3 886 1417 213 82 29 chr2 39527610 39528105 -142219982 + RLTR31_Mm LTR ERVK 20 514 -70 3 886 2598 180 68 17 chr2 39530688 39531214 -142216873 - RLTR20B2 LTR ERVK -4 556 4 3 886 6354 152 50 4 chr2 39531214 39532419 -142215668 - MYSERV16_I-int LTR ERVK 0 2326 1067 3 886 2209 214 84 9 chr2 39534439 39535127 -142212960 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -1586 740 1 3 886 256 252 0 64 chr2 39535214 39535324 -142212763 - RMER3D-int LTR ERVK -1629 1213 1111 3 886 757 170 0 39 chr2 39535783 39535945 -142212142 - RLTR20B2 LTR ERVK -399 142 1 3 886 1287 281 32 32 chr2 39537921 39538326 -142209761 + MTD LTR MaLR 1 405 -14 4 886 3947 145 42 12 chr2 39538907 39539569 -142208518 + RLTR17 LTR ERVK 1 682 -10 4 886 668 322 112 64 chr2 39553906 39554412 -142193675 + RLTR26 LTR ERVK 1 558 -69 5 886 359 288 67 9 chr2 39558211 39558316 -142189771 - MT2A LTR ERVL -410 123 13 5 886 247 287 39 10 chr2 39558367 39558469 -142189618 - ORR1A3-int LTR MaLR -1307 656 552 6 886 728 155 16 0 chr2 39558469 39558598 -142189489 - MERVL_2A-int LTR ERVL -144 5617 5487 6 886 2481 137 113 51 chr2 39558598 39559066 -142189021 + RLTR19 LTR ERVK 1 497 -2 6 886 787 220 50 88 chr2 39559079 39559318 -142188769 + RLTR19-int LTR ERVK 17 246 -5891 6 886 1608 143 10 56 chr2 39559476 39559764 -142188323 + RLTR19-int LTR ERVK 289 563 -5574 6 886 2067 127 96 35 chr2 39562333 39562708 -142185379 + RLTR19 LTR ERVK 100 497 -2 6 886 6357 211 31 5 chr2 39562740 39563982 -142184105 - MERVL_2A-int LTR ERVL -315 5446 4173 6 886 303 200 14 28 chr2 39563970 39564042 -142184045 - MERVL_2A-int LTR ERVL -5628 133 63 6 886 374 240 25 9 chr2 39564562 39564687 -142183400 - MT2B LTR ERVL -356 119 3 6 886 310 289 75 28 chr2 39565177 39565284 -142182803 - MER31A LTR ERV1 -107 378 267 6 886 969 317 80 3 chr2 39565288 39565614 -142182473 + MTEa LTR MaLR 29 379 0 6 886 332 359 75 25 chr2 39565615 39565775 -142182312 + MTEa-int LTR MaLR 2 169 -1411 6 886 458 355 5 32 chr2 39565814 39566032 -142182055 + MTEa-int LTR MaLR 1200 1411 -169 6 886 552 151 86 100 chr2 39567625 39567765 -142180322 + MTB_Mm LTR MaLR 75 212 -195 7 886 3002 18 6 3 chr2 39568914 39569259 -142178828 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 7 886 7729 68 12 3 chr2 39569259 39570568 -142177519 + ORR1A0-int LTR MaLR 1 1792 0 7 886 3126 12 0 0 chr2 39570568 39570914 -142177173 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 7 886 3047 201 79 43 chr2 39575089 39575745 -142172342 + RLTR25A LTR ERVK 3 682 -421 8 886 1310 257 37 145 chr2 39575713 39576363 -142171724 + RLTR25A LTR ERVK 449 1028 0 8 886 1414 201 45 28 chr2 39579264 39579617 -142168470 + RLTR10D LTR ERVK 1 359 0 8 886 530 214 14 51 chr2 39579627 39579765 -142168322 + IAP-d-int LTR ERVK 9 141 -6401 8 886 6397 276 15 11 chr2 39579811 39581811 -142166276 + IAP-d-int LTR ERVK 3170 5176 -1366 8 886 2298 240 3 15 chr2 39581799 39582392 -142165695 + IAP-d-int LTR ERVK 5474 6059 -483 8 886 2071 196 18 8 chr2 39582432 39582812 -142165275 + IAP-d-int LTR ERVK 6159 6542 0 8 886 1373 198 45 45 chr2 39582812 39583171 -142164916 + RLTR10D LTR ERVK 1 359 0 8 887 1698 228 42 43 chr2 39587027 39587549 -142160538 - RMER19B LTR ERVK -234 668 88 1 887 1363 202 135 33 chr2 39587593 39587766 -142160321 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 202 1 887 1363 202 135 33 chr2 39587844 39588003 -142160084 - ORR1B2 LTR MaLR -166 201 1 1 887 1898 168 29 20 chr2 39589434 39589780 -142158307 + RLTR15 LTR ERVK 11 359 0 1 887 1465 182 6 102 chr2 39589998 39590047 -142158040 + ORR1A2 LTR MaLR 1 49 -297 1 887 1579 134 11 26 chr2 39590330 39590648 -142157439 + ORR1A2 LTR MaLR 43 376 -2 1 887 3178 24 47 5 chr2 39592934 39593314 -142154773 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 887 1889 121 46 18 chr2 39595433 39595762 -142152325 - IAPEY_LTR LTR ERVK 0 385 48 1 887 1735 186 34 14 chr2 39597384 39597734 -142150353 + RLTR15 LTR ERVK 1 357 -2 1 887 419 156 0 0 chr2 39598469 39598533 -142149554 - ORR1A2 LTR MaLR 0 326 263 1 887 449 211 164 0 chr2 39598521 39598692 -142149395 - ORR1A2-int LTR MaLR -1047 916 718 1 887 703 192 6 104 chr2 39598641 39598804 -142149283 - MT2B LTR ERVL -305 296 150 1 887 2852 181 16 23 chr2 39598791 39599355 -142148732 - ORR1A2-int LTR MaLR -1403 560 1 1 887 1717 122 52 0 chr2 39599355 39599626 -142148461 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 43 1 887 293 220 0 0 chr2 39600726 39600785 -142147302 - ORR1A2 LTR MaLR -270 59 1 1 887 347 321 80 62 chr2 39606802 39607028 -142141059 - RLTR12B LTR ERVK -43 485 256 1 887 556 236 89 77 chr2 39607111 39607359 -142140728 - RLTR12B LTR ERVK -231 297 47 1 887 2092 138 6 0 chr2 39607684 39608009 -142140078 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 1 887 6880 210 68 68 chr2 39608013 39608735 -142139352 + MERVL-int LTR ERVL 5 737 -5024 1 887 6880 210 68 68 chr2 39608880 39609573 -142138514 + MERVL-int LTR ERVL 738 1421 -4340 1 887 3330 186 40 13 chr2 39609573 39610247 -142137840 + RLTR17 LTR ERVK 1 692 0 1 887 6880 210 68 68 chr2 39610247 39610808 -142137279 + MERVL-int LTR ERVL 1422 1983 -3778 1 887 1383 128 0 0 chr2 39610806 39611001 -142137086 + MERVL-int LTR ERVL 2089 2283 -3478 1 887 9262 136 23 15 chr2 39610996 39612435 -142135652 + MERVL-int LTR ERVL 2937 4387 -1098 1 887 515 133 50 10 chr2 39612524 39612623 -142135464 + MERVL-int LTR ERVL 5564 5666 -95 1 887 1897 83 4 22 chr2 39612625 39612896 -142135191 + MT2B2 LTR ERVL 319 584 0 1 887 295 148 48 16 chr2 39614705 39614767 -142133320 + MTE2a LTR MaLR 314 377 -2 1 887 536 289 104 127 chr2 39615436 39615745 -142132342 + MTE2a LTR MaLR 1 299 -80 1 887 227 378 78 88 chr2 39615784 39615881 -142132206 + MTE2a LTR MaLR 287 374 -5 1 887 1108 198 63 30 chr2 39615883 39616216 -142131871 + ORR1C2-int LTR MaLR 1257 1905 -58 1 887 1634 185 78 11 chr2 39616224 39616584 -142131503 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 1 887 1109 237 36 56 chr2 39616584 39616888 -142131199 + ORR1C2-int LTR MaLR 1 298 -1211 1 887 812 192 13 0 chr2 39616883 39617034 -142131053 + ORR1C2 LTR MaLR 215 367 0 1 887 1754 189 28 40 chr2 39617041 39617438 -142130649 + ORR1B1 LTR MaLR 1 392 -2 1 887 4361 212 43 2 chr2 39617440 39618398 -142129689 + ORR1B1-int LTR MaLR 1 997 -512 1 887 3412 242 72 42 chr2 39618398 39619363 -142128724 + ORR1C2-int LTR MaLR 363 1356 -14 1 887 1630 259 46 5 chr2 39619370 39619739 -142128348 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 1 887 1640 242 88 46 chr2 39620390 39620870 -142127217 - RLTR20B3 LTR ERVK -58 519 20 1 887 5146 169 45 3 chr2 39620875 39621869 -142126218 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -2 2324 1289 1 887 2981 176 47 11 chr2 39621899 39622518 -142125569 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -1714 612 1 1 887 1523 253 105 40 chr2 39623289 39623795 -142124292 - RLTR20B3 LTR ERVK -18 559 21 1 887 1778 156 32 84 chr2 39630049 39630221 -142117866 + ORR1B1 LTR MaLR 41 216 -178 1 887 2229 69 66 0 chr2 39630438 39630743 -142117344 + IAPLTR2b LTR ERVK 1 325 -2 1 887 1778 156 32 84 chr2 39631332 39631530 -142116557 + ORR1B1 LTR MaLR 217 392 -2 1 887 1797 230 86 54 chr2 39631800 39632264 -142115823 + RLTR28B LTR ERVL 1 479 -2 1 887 925 266 24 60 chr2 39633522 39633671 -142114416 - RLTR40 LTR ERVK -24 793 588 1 887 925 298 47 35 chr2 39633771 39634094 -142113993 - RLTR40 LTR ERVK -230 587 259 1 887 2852 33 0 3 chr2 39634094 39634432 -142113655 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 0 337 1 1 887 55357 21 18 6 chr2 39634432 39640831 -142107256 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 8 1 887 2875 27 0 3 chr2 39640831 39641169 -142106918 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 0 337 1 1 887 979 207 26 59 chr2 39641169 39641441 -142106646 - RLTR40 LTR ERVK -554 263 1 1 887 1574 279 66 127 chr2 39643649 39644503 -142103584 + RLTR22_Mur LTR ERVK 3 804 -1044 1 887 321 239 96 116 chr2 39644529 39644728 -142103359 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1152 1346 -502 1 887 299 272 41 27 chr2 39653058 39653180 -142094907 + MTD LTR MaLR 10 125 -294 1 887 266 284 63 0 chr2 39653272 39653367 -142094720 + MTD LTR MaLR 258 358 -12 1 887 1094 264 119 16 chr2 39653590 39653902 -142094185 - MTD LTR MaLR 0 419 76 1 887 3231 147 73 0 chr2 39653971 39654529 -142093558 + MT2B LTR ERVL 3 601 0 1 887 1165 290 10 83 chr2 39658252 39658659 -142089428 - MTE2b LTR MaLR 0 379 3 1 887 2267 73 132 11 chr2 39658716 39659064 -142089023 + RLTR10 LTR ERVK 1 390 0 1 887 2943 9 0 0 chr2 39661883 39662209 -142085878 + IAPLTR3 LTR ERVK 1 326 0 1 887 11936 38 7 38 chr2 39662209 39663727 -142084360 + IAPLTR3-int LTR ERVK 1 1472 -5349 1 887 13438 16 0 0 chr2 39663725 39665223 -142082864 + IAPLTR3-int LTR ERVK 5304 6801 -20 1 887 2911 18 0 0 chr2 39665223 39665549 -142082538 + IAPLTR3 LTR ERVK 1 326 0 1 887 261 390 49 58 chr2 39667669 39667892 -142080195 - MLT1H LTR MaLR -200 349 129 1 887 399 365 30 0 chr2 39669255 39669422 -142078665 - MLT-int LTR MaLR -1299 436 265 1 887 638 307 66 141 chr2 39670827 39671267 -142076820 + RMER10A LTR ERVL 12 418 -24 1 887 403 215 184 44 chr2 39671864 39672000 -142076087 - ORR1C2 LTR MaLR -55 329 175 1 887 410 206 50 30 chr2 39672139 39672239 -142075848 - RLTR24 LTR ERV1 -28 501 400 1 887 1127 329 72 48 chr2 39672379 39673357 -142074730 - RMER12B LTR ERVK -360 1044 1 1 887 2186 154 41 8 chr2 39673357 39673749 -142074338 - RLTR24 LTR ERV1 -124 405 1 2 887 232 224 86 0 chr2 39673805 39673863 -142074224 + MamGypLTR1c LTR Gypsy 149 211 -592 2 887 282 326 247 18 chr2 39678196 39678524 -142069563 + MLT-int LTR MaLR 1305 1707 -28 2 887 301 363 71 0 chr2 39678646 39678814 -142069273 + MLT1A0 LTR MaLR 183 362 -3 2 887 238 328 55 23 chr2 39679929 39680057 -142068030 - MLT1A1 LTR MaLR -3 405 274 2 887 722 262 113 35 chr2 39687818 39688075 -142060012 - MTD LTR MaLR -20 399 123 2 887 276 361 96 14 chr2 39688081 39688227 -142059860 + MTD LTR MaLR 5 162 -257 2 887 3235 187 58 42 chr2 39690097 39690771 -142057316 + RMER13B LTR ERVK 13 697 -211 2 887 1184 219 68 4 chr2 39691347 39691599 -142056488 + RMER13B LTR ERVK 632 899 -9 2 887 1921 204 77 3 chr2 39693788 39694166 -142053921 - MTC LTR MaLR 0 421 16 2 887 476 167 12 7 chr2 39708853 39708943 -142039144 - ORR1C2 LTR MaLR 0 378 279 2 887 2188 48 132 0 chr2 39711729 39712018 -142036069 + IAPLTR2b LTR ERVK 1 327 0 2 887 821 106 54 9 chr2 39712020 39712168 -142035919 + IAPEz-int LTR ERVK 3 193 -6288 2 887 228 327 0 0 chr2 39712168 39712223 -142035864 + RLTR27 LTR ERVK 221 275 -34 2 887 3415 94 20 39 chr2 39712223 39713027 -142035060 + IAPEz-int LTR ERVK 168 662 -5819 2 887 2572 82 0 3 chr2 39713027 39713370 -142034717 + IAPEz-int LTR ERVK 1359 1700 -4781 2 887 6192 71 11 19 chr2 39713365 39714201 -142033886 + IAPEz-int LTR ERVK 5653 6481 0 2 887 913 36 0 0 chr2 39714201 39714313 -142033774 + IAPLTR2b LTR ERVK 1 112 -215 2 888 1020 230 164 11 chr2 39715058 39715339 -142032748 - ORR1C2 LTR MaLR -60 324 1 2 888 2836 158 46 74 chr2 39721669 39722420 -142025667 + RLTR13D6 LTR ERVK 1 902 0 2 888 232 316 47 67 chr2 39724884 39725033 -142023054 - RMER15 LTR ERVL -415 160 15 2 888 1171 217 9 13 chr2 39727299 39727523 -142020564 - RLTR17 LTR ERVK 0 692 470 2 888 1507 169 18 4 chr2 39727517 39727790 -142020297 - RLTR17 LTR ERVK -415 277 1 2 888 1833 171 9 16 chr2 39736573 39736888 -142011199 - ORR1B2 LTR MaLR -52 315 3 2 888 566 301 78 54 chr2 39737235 39737530 -142010557 + RLTR17 LTR ERVK 125 426 -266 2 888 365 111 0 18 chr2 39740018 39740073 -142008014 - RMER17C LTR ERVK -356 54 1 2 888 3161 208 20 37 chr2 39740074 39740823 -142007264 + MYSERV6-int LTR ERVK 8222 8957 -2 2 888 802 255 43 55 chr2 39740823 39741171 -142006916 + RLTR15 LTR ERVK 1 344 -15 2 888 1930 201 29 0 chr2 39741275 39741624 -142006463 + ORR1C2 LTR MaLR 1 359 -25 2 888 1549 229 30 0 chr2 39754908 39755275 -141992812 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 2 888 1721 220 202 14 chr2 39757407 39757552 -141990535 + MT2B LTR ERVL 1 190 -411 2 888 1721 220 202 14 chr2 39757920 39758280 -141989807 + MT2B LTR ERVL 191 600 -1 2 888 5005 129 28 72 chr2 39758559 39759488 -141988599 - RLTR13D6 LTR ERVK -14 888 1 2 888 795 322 25 17 chr2 39761541 39761781 -141986306 + MTE2b LTR MaLR 58 299 -80 2 888 331 318 28 18 chr2 39763104 39763213 -141984874 - LTR80B LTR ERVL -66 518 409 2 888 995 203 249 72 chr2 39763622 39764083 -141984004 - MT2B LTR ERVL -58 543 1 2 888 2659 112 77 16 chr2 39765102 39765546 -141982541 - RLTR31B_Mm LTR ERVK -86 471 1 2 888 254 114 45 0 chr2 39775594 39775638 -141972449 + RLTR25B LTR ERVK 720 765 -263 3 888 335 214 79 30 chr2 39775623 39775724 -141972363 + RLTR25B LTR ERVK 913 1018 -10 3 888 446 234 77 68 chr2 39777307 39777527 -141970560 - MTC-int LTR MaLR -95 1163 942 3 888 733 192 70 122 chr2 39777528 39777693 -141970394 + ORR1B1 LTR MaLR 1 159 -235 3 888 733 192 70 122 chr2 39777728 39777775 -141970312 + ORR1B1 LTR MaLR 160 202 -192 3 888 236 250 90 40 chr2 39785593 39785693 -141962394 - MLT1C LTR MaLR 0 467 363 3 888 1381 191 53 25 chr2 39787300 39787683 -141960404 + RLTR20B3 LTR ERVK 1 475 -102 3 888 357 360 59 0 chr2 39788183 39788319 -141959768 - ORR1E LTR MaLR -215 144 1 3 888 1591 251 19 3 chr2 39799504 39799876 -141948211 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 3 888 2076 217 14 2 chr2 39801109 39801525 -141946562 + MTC LTR MaLR 1 421 0 3 888 231 152 0 98 chr2 39804065 39804116 -141943971 - MT2B LTR ERVL -8 576 531 3 888 701 288 0 0 chr2 39804259 39804419 -141943668 - MT2B LTR ERVL -58 543 384 3 888 3227 108 9 2 chr2 39805796 39806261 -141941826 - MT2C_Mm LTR ERVL -7 468 1 3 888 461 318 80 63 chr2 39807512 39807911 -141940176 - RMER10A LTR ERVL -25 417 12 3 888 1811 197 207 48 chr2 39820697 39821440 -141926647 - RMER6C LTR ERVK -4 716 1 3 888 587 306 7 0 chr2 39829680 39829824 -141918263 + MTD LTR MaLR 67 211 -208 3 888 1265 221 174 11 chr2 39830603 39830965 -141917122 + MTC LTR MaLR 1 421 0 3 888 5356 204 48 19 chr2 39830965 39832136 -141915951 + MTC-int LTR MaLR 2 1206 -52 3 888 1285 199 0 26 chr2 39832153 39832385 -141915702 + MTC LTR MaLR 22 247 -174 3 13 2219 103 22 3 chr2 39845636 39845957 -141902130 + IAPLTR2b LTR ERVK 1 327 0 3 889 1609 166 162 23 chr2 39854013 39854359 -141893728 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 3 889 1291 196 58 25 chr2 39855726 39856003 -141892084 + RMER5 LTR ERV1 1 286 -248 4 889 1114 196 38 30 chr2 39862107 39862344 -141885743 - MT2A LTR ERVL -294 239 1 4 889 244 329 47 12 chr2 39869995 39870081 -141878006 - ORR1E LTR MaLR -232 127 39 4 889 2552 126 52 31 chr2 39870460 39870904 -141877183 - RLTR11B LTR ERVK 0 453 1 4 889 3217 84 4 41 chr2 39873223 39873716 -141874371 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 4 889 10443 22 4 0 chr2 39873716 39874904 -141873183 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 5289 4 889 1482 62 16 0 chr2 39874901 39875095 -141872992 - IAPEz-int LTR ERVK -2699 4981 4785 4 889 1850 103 8 0 chr2 39875092 39875344 -141872743 - IAPEz-int LTR ERVK -5183 2497 2244 4 889 932 43 26 0 chr2 39875339 39875455 -141872632 - IAPEz-int LTR ERVK -5004 1477 1359 4 889 3720 50 29 18 chr2 39875455 39875945 -141872142 - IAPEz-int LTR ERVK -5819 662 168 4 889 228 327 0 0 chr2 39875945 39876000 -141872087 - RLTR27 LTR ERVK -34 275 221 4 889 1190 77 10 112 chr2 39876000 39876206 -141871881 - IAPEz-int LTR ERVK -6288 193 9 4 889 3205 74 6 56 chr2 39876207 39876707 -141871380 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 4 889 930 146 152 12 chr2 39876770 39876975 -141871112 - ORR1B1 LTR MaLR -166 228 3 4 889 776 251 0 71 chr2 39878380 39878577 -141869510 - RMER13A LTR ERVK 0 860 678 4 889 553 248 114 45 chr2 39881153 39881435 -141866652 - ORR1E LTR MaLR -4 366 65 4 889 383 207 37 0 chr2 39881478 39881560 -141866527 - ORR1E LTR MaLR -14 356 272 4 889 648 348 57 53 chr2 39881877 39882159 -141865928 - ORR1E LTR MaLR -87 283 1 4 889 266 289 221 45 chr2 39891032 39891231 -141856856 - MER34A LTR ERV1 0 571 338 4 889 1773 196 15 21 chr2 39891657 39891990 -141856097 - MTC LTR MaLR 0 421 91 4 889 2941 78 0 2 chr2 39892055 39892451 -141855636 - MTB LTR MaLR -5 395 1 4 889 442 360 87 14 chr2 39905135 39905479 -141842608 - RMER5 LTR ERV1 -78 456 88 4 889 435 325 41 6 chr2 39910116 39910286 -141837801 + RMER5 LTR ERV1 179 354 -180 4 889 3083 56 12 10 chr2 39910418 39910817 -141837270 - MTB LTR MaLR 0 400 1 4 889 428 300 26 13 chr2 39910881 39911033 -141837054 + RMER5 LTR ERV1 312 465 -69 4 889 427 250 94 24 chr2 39911297 39911424 -141836663 - MTE2a LTR MaLR -1 378 243 4 889 721 266 0 0 chr2 39912916 39913074 -141835013 + MT2A LTR ERVL 5 162 -371 4 889 520 276 265 18 chr2 39915101 39915372 -141832715 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 37 4 889 679 261 33 1 chr2 39915360 39915574 -141832513 - ORR1D1-int LTR MaLR -23 1557 1178 4 889 315 157 0 0 chr2 39920188 39920239 -141827848 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 328 4 889 1815 126 86 7 chr2 39923937 39924241 -141823846 + ORR1A4 LTR MaLR 1 328 -1 4 889 512 335 5 20 chr2 39924729 39924924 -141823163 + MT2B LTR ERVL 410 601 0 5 889 417 36 0 18 chr2 39924924 39924980 -141823107 + MERVL_2A-int LTR ERVL 1 55 -5706 5 889 760 175 0 0 chr2 39925579 39925705 -141822382 + MERVL_2A-int LTR ERVL 45 170 -5591 5 889 798 226 66 15 chr2 39925705 39925903 -141822184 - RMER19C LTR ERVK -320 291 84 5 889 2196 224 51 2 chr2 39925939 39926409 -141821678 - MERVL_2A-int LTR ERVL -320 5441 4949 5 889 1385 183 14 73 chr2 39926409 39926698 -141821389 + RMER19C LTR ERVK 1 272 -339 5 889 718 156 0 16 chr2 39926711 39926835 -141821252 - ORR1B1-int LTR MaLR -283 1226 1105 5 889 1927 200 20 59 chr2 39926819 39927223 -141820864 + RMER19C LTR ERVK 224 611 0 5 889 1284 198 47 12 chr2 39927223 39927478 -141820609 - MERVL_2A-int LTR ERVL -807 4954 4691 5 889 3434 228 73 5 chr2 39927478 39928276 -141819811 - MERVL_2A-int LTR ERVL -1205 4556 3705 5 889 7325 91 20 13 chr2 39928276 39929292 -141818795 + RLTR13D5 LTR ERVK 1 1023 0 5 889 2665 206 58 10 chr2 39929311 39929894 -141818193 - ORR1B1-int LTR MaLR -896 613 3 5 889 1011 172 17 0 chr2 39929903 39930077 -141818010 - ORR1B1 LTR MaLR -7 387 211 5 889 485 164 15 64 chr2 39930085 39930268 -141817819 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -1025 7934 7813 5 889 241 267 102 43 chr2 39931153 39931285 -141816802 - RMER4A LTR ERVK -34 551 310 5 889 530 188 35 56 chr2 39931300 39931460 -141816627 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -422 5358 5264 5 889 621 265 70 27 chr2 39931791 39932047 -141816040 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -1560 766 500 5 889 442 209 33 0 chr2 39932058 39932149 -141815938 - RLTR11A2 LTR ERVK -191 336 243 5 889 1008 172 113 5 chr2 39932151 39932355 -141815732 - ORR1B1 LTR MaLR -168 226 1 5 889 3334 195 78 2 chr2 39932355 39933522 -141814565 - MERVL_2A-int LTR ERVL -2378 3383 2128 5 889 2635 193 71 60 chr2 39933602 39933993 -141814094 - RMER17D2 LTR ERVK -15 794 404 5 889 2635 193 71 60 chr2 39934070 39934395 -141813692 - RMER17D2 LTR ERVK -406 403 70 5 889 1430 213 47 12 chr2 39934404 39934873 -141813214 - MERVL_2A-int LTR ERVL -4529 1232 650 5 889 1056 151 92 12 chr2 39935782 39936012 -141812075 + ORR1B1 LTR MaLR 92 391 -3 5 889 494 195 62 0 chr2 39948270 39948383 -141799704 - ORR1C2 LTR MaLR -17 367 248 5 889 303 251 129 101 chr2 39949590 39949807 -141798280 + MTE-int LTR MaLR 115 337 -1243 5 889 640 331 111 42 chr2 39950222 39950701 -141797386 + MTE-int LTR MaLR 411 922 -658 5 889 968 330 103 53 chr2 39951178 39951755 -141796332 + ORR1E-int LTR MaLR 799 1546 -34 5 889 563 351 62 26 chr2 39951768 39952075 -141796012 + ORR1E LTR MaLR 42 359 0 5 889 558 333 85 10 chr2 39952077 39952371 -141795716 + MER31A LTR ERV1 166 481 -4 5 889 662 283 116 74 chr2 39952865 39953228 -141794859 + MTE2b LTR MaLR 2 379 0 5 889 437 239 17 26 chr2 39953246 39953362 -141794725 + MTC LTR MaLR 3 117 -304 5 889 356 324 98 7 chr2 39958145 39958288 -141789799 - MER54A LTR ERVL -745 156 1 5 889 601 272 192 3 chr2 39959157 39959470 -141788617 - ORR1D1 LTR MaLR -2 372 1 5 889 1304 199 137 40 chr2 39964271 39964674 -141783413 + RMER10A LTR ERVL 1 442 0 5 889 1650 263 119 78 chr2 39974127 39975079 -141773008 + RMER17B LTR ERVK 2 887 -21 5 890 2543 199 40 14 chr2 39977161 39977655 -141770432 + RLTR17 LTR ERVK 1 507 -185 5 890 1625 238 64 59 chr2 39990183 39990709 -141757378 - RLTR18 LTR ERVK -8 608 5 5 890 232 213 35 128 chr2 39999914 39999932 -141748155 + MT2B LTR ERVL 139 216 -385 6 890 614 318 102 62 chr2 40002541 40003110 -141744977 - RLTR18B LTR ERVK -47 569 1 8 890 390 342 119 90 chr2 40006847 40007291 -141740796 - MLT2B3 LTR ERVL -67 487 31 1 890 660 333 75 47 chr2 40007450 40007788 -141740299 + MTE2a LTR MaLR 24 405 -14 1 890 752 251 27 112 chr2 40011904 40012200 -141735887 - RLTR23 LTR ERV1 -2 428 158 1 890 637 194 68 216 chr2 40012215 40012451 -141735636 - RLTR23 LTR ERV1 -229 201 1 1 890 485 347 38 6 chr2 40012502 40012867 -141735220 - RLTR6-int LTR ERV1 -62 7716 7340 1 890 393 299 15 15 chr2 40014453 40014585 -141733502 - MuLV-int LTR ERV1 -1996 5610 5502 1 890 4088 20 0 2 chr2 40014825 40015312 -141732775 + MT2_Mm LTR ERVL 8 493 0 1 890 1016 312 33 17 chr2 40015318 40015739 -141732348 - MuRRS4-int LTR ERV1 -1107 3956 3529 1 890 318 310 27 25 chr2 40016141 40016352 -141731735 - RLTR6-int LTR ERV1 -3274 4504 4189 2 890 461 325 141 0 chr2 40018624 40018830 -141729257 - RLTR4_MM-int LTR ERV1 -3657 3899 3665 2 890 681 313 42 52 chr2 40019164 40019572 -141728515 - RLTR4_MM-int LTR ERV1 -4548 3053 2650 2 890 1275 209 25 138 chr2 40020500 40020906 -141727181 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 71 3 890 871 220 112 76 chr2 40021194 40021470 -141726617 - RLTR25B LTR ERVK -1 1027 742 3 890 3555 181 39 69 chr2 40021948 40022735 -141725352 - RLTR25B LTR ERVK -264 764 1 3 890 1199 199 117 7 chr2 40024133 40024407 -141723680 + ORR1C2 LTR MaLR 79 382 -2 3 890 328 343 156 9 chr2 40033480 40033698 -141714389 - MER34A LTR ERV1 -259 312 63 4 890 301 193 0 17 chr2 40047256 40047314 -141700773 + MTB_Mm LTR MaLR 351 407 0 5 890 648 311 5 16 chr2 40068179 40068365 -141679722 - MTD LTR MaLR -224 195 12 7 890 2010 278 161 12 chr2 40068400 40069197 -141678890 - MTD-int LTR MaLR -28 1230 316 7 890 415 366 99 5 chr2 40072236 40072458 -141675629 - MTD-int LTR MaLR -1335 245 3 7 890 311 178 21 16 chr2 40072459 40072533 -141675554 - MTD LTR MaLR 0 421 296 7 890 785 260 128 82 chr2 40076044 40076325 -141671762 + ORR1D2 LTR MaLR 73 366 -4 8 890 385 330 188 24 chr2 40077598 40077939 -141670148 - MLT1D LTR MaLR -9 496 100 8 890 521 314 10 58 chr2 40086701 40086907 -141661180 - MTEb LTR MaLR 0 379 184 9 890 2895 27 0 6 chr2 40091122 40091461 -141656626 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 337 0 1 890 21705 31 46 10 chr2 40091461 40094110 -141653977 + IAPEz-int LTR ERVK 8 2751 -3730 1 890 7273 11 1 5 chr2 40094102 40094921 -141653166 + IAPEz-int LTR ERVK 3244 4059 -2422 1 890 7862 27 2 7 chr2 40094914 40095837 -141652250 + IAPEz-int LTR ERVK 5563 6481 0 1 890 2895 27 0 6 chr2 40095837 40096176 -141651911 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 337 0 1 890 253 319 55 0 chr2 40099573 40099664 -141648423 - RMER15 LTR ERVL -208 367 272 1 890 3689 62 23 2 chr2 40102481 40102967 -141645120 - LTRIS2 LTR ERV1 0 564 69 1 890 491 248 164 74 chr2 40105101 40105437 -141642650 - RLTR9A LTR ERVK 0 368 3 1 890 425 223 25 51 chr2 40107592 40107710 -141640377 + MTD LTR MaLR 24 138 -281 1 891 5005 140 23 68 chr2 40113391 40114334 -141633753 - RLTR13D6 LTR ERVK -1 901 1 1 891 2968 90 2 8 chr2 40115578 40115980 -141632107 + MTB LTR MaLR 1 400 0 1 891 1107 297 93 3 chr2 40128415 40128759 -141619328 - MTD LTR MaLR -44 375 1 1 891 1442 250 14 17 chr2 40140314 40140676 -141607411 - MERVL_2A-int LTR ERVL -480 5281 4921 1 891 3225 224 31 0 chr2 40140661 40141303 -141606784 - MERVL_2A-int LTR ERVL -993 4768 4107 1 891 4399 212 80 39 chr2 40141319 40141883 -141606204 - MERVL_2A-int LTR ERVL -4591 1170 627 1 891 4399 212 80 39 chr2 40141970 40142525 -141605562 - MERVL_2A-int LTR ERVL -5135 626 6 1 891 419 265 189 13 chr2 40142531 40142684 -141605403 - MT2A LTR ERVL -2 531 352 1 891 248 333 81 86 chr2 40145153 40145350 -141602737 - MT2A LTR ERVL -153 448 253 1 891 497 262 47 16 chr2 40145376 40145504 -141602583 - MT2A LTR ERVL -401 132 1 1 891 1380 187 4 0 chr2 40145728 40145963 -141602124 - RMER6D LTR ERVK 0 720 485 1 891 306 113 0 117 chr2 40156130 40156146 -141591941 + ORR1D1 LTR MaLR 322 337 -37 1 891 2229 127 147 26 chr2 40156146 40156576 -141591511 + RLTR45 LTR ERVK 1 482 0 1 891 306 113 0 117 chr2 40156576 40156619 -141591468 + ORR1D1 LTR MaLR 338 374 0 1 891 254 220 0 0 chr2 40158045 40158095 -141589992 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 325 1 891 395 181 0 14 chr2 40158156 40158229 -141589858 - ORR1D1 LTR MaLR -302 72 1 1 891 738 242 36 30 chr2 40165256 40165422 -141582665 + ORR1D1 LTR MaLR 1 167 -207 2 891 948 219 229 56 chr2 40166318 40166676 -141581411 + RMER16 LTR ERVK 1 420 -113 2 891 2324 128 0 11 chr2 40175263 40175611 -141572476 + RMER17C-int LTR ERVK 2874 3217 -21 2 891 665 212 32 16 chr2 40175731 40175918 -141572169 + RMER17C LTR ERVK 1 190 -220 2 891 2945 157 37 51 chr2 40175918 40176541 -141571546 - RMER17C-int LTR ERVK -1147 2091 1478 2 891 2787 187 82 44 chr2 40177242 40177902 -141570185 - RMER17C-int LTR ERVK -2553 685 1 2 891 1875 155 9 100 chr2 40177903 40178354 -141569733 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 2 891 353 374 59 106 chr2 40183889 40184230 -141563857 - MT2A LTR ERVL -80 453 129 2 891 1168 256 75 31 chr2 40186227 40186643 -141561444 - MYSERV-int LTR ERVK -406 6144 5711 2 891 966 198 17 38 chr2 40187344 40187580 -141560507 - MYSERV6-int LTR ERVK -2190 6769 6539 2 891 1437 177 129 0 chr2 40188564 40188881 -141559206 - RLTR15 LTR ERVK -1 358 1 2 891 840 233 276 9 chr2 40191259 40191583 -141556504 - MTD LTR MaLR -8 411 1 2 891 1410 170 230 6 chr2 40192509 40192822 -141555265 - RLTR11A LTR ERVK -72 456 74 2 891 794 280 67 130 chr2 40195302 40195493 -141552594 - MTD LTR MaLR 0 419 211 2 891 794 280 67 130 chr2 40195673 40195717 -141552370 - MTD LTR MaLR -209 210 209 2 891 794 280 67 130 chr2 40195863 40196073 -141552014 - MTD LTR MaLR -211 208 1 2 891 928 207 101 47 chr2 40198311 40198569 -141549518 - RLTR25B LTR ERVK 0 1028 757 2 891 3219 185 139 31 chr2 40198882 40199616 -141548471 - RLTR25A LTR ERVK -290 813 1 2 891 356 235 0 0 chr2 40202864 40202945 -141545142 - RMER12 LTR ERVK -472 850 770 2 891 1676 226 31 24 chr2 40205489 40205906 -141542181 + MTC LTR MaLR 2 421 0 2 891 322 125 18 0 chr2 40207697 40207753 -141540334 - MLT1A1 LTR MaLR -48 360 304 2 891 397 337 156 62 chr2 40209143 40209463 -141538624 - MTD LTR MaLR -44 375 26 2 891 495 266 94 55 chr2 40222355 40222610 -141525477 - RLTR10A LTR ERVK 0 411 147 2 891 1573 144 155 25 chr2 40231403 40231765 -141516322 + RLTR9E LTR ERVK 1 409 0 2 891 364 279 145 14 chr2 40234856 40234994 -141513093 - MTE-int LTR MaLR -10 1570 1415 3 891 1779 344 116 79 chr2 40235169 40235528 -141512559 - MTE-int LTR MaLR -189 1391 1026 3 891 1779 344 116 79 chr2 40235970 40236531 -141511556 - MTE-int LTR MaLR -555 1025 450 3 891 1779 344 116 79 chr2 40236708 40237126 -141510961 - MTE-int LTR MaLR -1131 449 3 3 891 2106 147 81 53 chr2 40237406 40237824 -141510263 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 1 3 891 660 352 99 28 chr2 40237873 40237892 -141510195 - MTE2b LTR MaLR 0 379 360 3 891 660 352 99 28 chr2 40238018 40238352 -141509735 - MTE2b LTR MaLR -20 359 2 3 892 2918 41 0 14 chr2 40240402 40240752 -141507335 - IAPLTR4 LTR ERVK 0 345 1 3 892 5866 149 15 5 chr2 40256654 40257603 -141490484 + RMER17B LTR ERVK 1 958 0 3 892 2574 202 89 25 chr2 40257935 40258583 -141489504 - RMER6C LTR ERVK 0 690 1 3 892 928 268 13 4 chr2 40264776 40265012 -141483075 - MERVL_2A-int LTR ERVL -2070 3691 3454 3 892 4316 232 14 41 chr2 40265115 40266149 -141481938 - MERVL_2A-int LTR ERVL -1666 4095 3089 3 892 2211 211 82 20 chr2 40266150 40266649 -141481438 - MERVL_2A-int LTR ERVL -3263 2498 1969 3 892 698 120 94 0 chr2 40266656 40266773 -141481314 + MERVL_2A-int LTR ERVL 2241 2368 -3393 3 892 595 176 37 0 chr2 40266774 40266882 -141481205 - MERVL_2A-int LTR ERVL -3791 1970 1859 3 892 690 254 131 5 chr2 40277144 40277358 -141470729 - ORR1D1 LTR MaLR -5 369 129 3 892 580 325 17 34 chr2 40277353 40277592 -141470495 - RMER15 LTR ERVL -63 512 278 3 892 256 301 53 68 chr2 40277620 40277752 -141470335 - RMER15 LTR ERVL -444 131 2 3 892 2058 171 111 36 chr2 40279913 40280435 -141467652 - RLTR31_Mm LTR ERVK 0 561 1 3 892 622 318 85 48 chr2 40288263 40288557 -141459530 + MTE2b LTR MaLR 1 305 -74 3 892 493 175 10 20 chr2 40292525 40292624 -141455463 + MTC LTR MaLR 1 98 -323 3 892 1241 243 66 11 chr2 40293416 40293693 -141454394 + MTC LTR MaLR 120 412 -9 3 892 1626 237 75 54 chr2 40296133 40296705 -141451382 + RLTR31A_Mm LTR ERVK 1 584 0 3 892 4704 208 65 51 chr2 40300925 40302830 -141445257 - RMER3D-int LTR ERVK -441 2401 1 3 892 1837 228 95 59 chr2 40302832 40303392 -141444695 - RLTR31A_Mm LTR ERVK -2 582 3 3 892 1328 226 53 63 chr2 40303839 40304217 -141443870 - ORR1C1 LTR MaLR -4 374 1 3 892 406 181 92 9 chr2 40309861 40310054 -141438033 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -1060 1266 1165 3 892 284 268 70 30 chr2 40310059 40310159 -141437928 - RMER4A LTR ERVK -30 436 333 3 892 1812 259 69 95 chr2 40310160 40310388 -141437699 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -1381 945 728 3 892 1812 263 69 93 chr2 40310579 40311400 -141436687 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -1599 727 3 3 892 1724 183 234 6 chr2 40312246 40312609 -141435478 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 1 4 892 357 335 30 12 chr2 40312701 40312867 -141435220 - RLTR6-int LTR ERV1 -101 7677 7509 4 892 479 205 0 0 chr2 40312880 40312963 -141435124 - RLTR41 LTR ERV1 -363 83 1 4 892 2073 211 38 40 chr2 40313197 40313725 -141434362 - RLTR11A2 LTR ERVK 0 527 1 4 892 3868 134 38 13 chr2 40322731 40323411 -141424676 + ETnERV2-int LTR ERVK 1420 2116 -5290 4 892 274 270 69 20 chr2 40332733 40332835 -141415252 + ORR1D1 LTR MaLR 268 374 0 4 892 889 302 39 71 chr2 40332835 40333198 -141414889 + MT2B LTR ERVL 221 570 -31 4 892 256 138 0 5 chr2 40333236 40333286 -141414801 - MT2A LTR ERVL -2 582 488 4 892 2829 82 15 15 chr2 40333589 40333998 -141414089 - BGLII LTR ERVK -12 409 1 4 892 2205 219 78 45 chr2 40338702 40339252 -141408835 - RLTR26 LTR ERVK -74 568 1 4 892 746 269 112 58 chr2 40340859 40341548 -141406539 - RMER13B LTR ERVK -10 948 201 4 892 1036 233 67 86 chr2 40341730 40342148 -141405939 - RMER17A2 LTR ERVK -495 411 2 4 892 2945 23 20 0 chr2 40342491 40342838 -141405249 - IAPEY2_LTR LTR ERVK -3 354 1 4 892 783 267 138 11 chr2 40343430 40343777 -141404310 + RodERV21-int LTR ERV1 570 960 -4031 4 892 352 251 61 98 chr2 40344762 40344988 -141403099 + RLTR42-int LTR ERVK 1639 1843 -3679 4 892 990 255 41 41 chr2 40345219 40345700 -141402387 + RLTR42-int LTR ERVK 1857 2568 -3569 4 892 2761 41 3 0 chr2 40345756 40346098 -141401989 + IAPEY_LTR LTR ERVK 43 385 0 4 892 555 297 46 10 chr2 40346151 40346402 -141401685 + RLTR19-int LTR ERVK 8279 8510 -449 4 892 319 195 24 24 chr2 40346678 40346762 -141401325 + RLTR19-int LTR ERVK 3163 3246 -2891 4 892 3401 25 5 0 chr2 40346960 40347354 -141400733 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 892 923 174 14 111 chr2 40348431 40348728 -141399359 + RLTR19-int LTR ERVK 3388 3655 -2482 4 892 387 306 121 74 chr2 40349157 40349362 -141398725 + RLTR42-int LTR ERVK 2659 2878 -360 4 892 387 306 121 74 chr2 40349424 40349624 -141398463 + RLTR42-int LTR ERVK 2879 3083 -155 4 892 1071 291 33 33 chr2 40350765 40351124 -141396963 - ORR1D2 LTR MaLR -4 366 8 4 892 2707 191 45 10 chr2 40353715 40354382 -141393705 - RMER6A LTR ERVK -3 753 18 4 892 864 322 38 77 chr2 40354409 40354511 -141393576 + MTEb LTR MaLR 11 104 -275 4 892 864 322 38 77 chr2 40354920 40355157 -141392930 + MTEb LTR MaLR 105 337 -42 4 892 2060 186 123 30 chr2 40360985 40361490 -141386597 + RMER6A LTR ERVK 1 552 -204 4 892 1249 296 67 16 chr2 40363985 40364434 -141383653 - MTEa-int LTR MaLR -1108 472 1 4 892 542 282 30 61 chr2 40364434 40364669 -141383418 - MTEa LTR MaLR 0 379 142 4 892 949 273 137 18 chr2 40365119 40365447 -141382640 + MTE2b LTR MaLR 1 367 -12 4 892 660 323 17 26 chr2 40365459 40365691 -141382396 + MTE2b-int LTR MaLR 2 231 -1349 4 892 666 305 75 9 chr2 40366049 40366277 -141381810 + MTEa LTR MaLR 6 248 -131 4 893 1615 193 24 97 chr2 40372040 40372282 -141375805 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 160 4 893 1615 193 24 97 chr2 40372325 40372507 -141375580 - ORR1B1 LTR MaLR -235 159 1 4 893 398 247 0 30 chr2 40377813 40377913 -141370174 - ORR1C2 LTR MaLR -8 376 280 5 893 1133 112 6 12 chr2 40378145 40378316 -141369771 - RLTR9E LTR ERVK -110 299 130 5 893 290 227 36 126 chr2 40378316 40378427 -141369660 - ETnERV-int LTR ERVK -3209 105 5 5 893 816 142 13 26 chr2 40378432 40378584 -141369503 - RLTR9E LTR ERVK 0 409 260 5 893 849 257 146 0 chr2 40378591 40378852 -141369235 - MT2A LTR ERVL -234 299 1 5 893 297 169 15 152 chr2 40381898 40382029 -141366058 + MTC-int LTR MaLR 891 1112 -146 5 893 240 344 69 23 chr2 40385249 40385380 -141362707 - RMER4B LTR ERVK -102 483 347 5 893 1103 310 56 35 chr2 40385436 40385974 -141362113 - RodERV21-int LTR ERV1 -198 4793 4245 5 893 1473 338 44 54 chr2 40386068 40387141 -141360946 - RodERV21-int LTR ERV1 -1174 3817 2756 5 893 443 338 31 31 chr2 40389726 40390215 -141357872 - RodERV21-int LTR ERV1 -3017 4074 3586 5 893 3883 283 91 50 chr2 40390323 40392182 -141355905 - RodERV21-int LTR ERV1 -2273 2718 784 5 893 310 316 0 0 chr2 40398657 40398752 -141349335 + ORR1E LTR MaLR 9 103 -256 5 893 1938 158 55 0 chr2 40398953 40399263 -141348824 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 5 893 312 343 74 23 chr2 40399486 40399662 -141348425 - MLT1A1 LTR MaLR -138 270 86 5 893 525 317 0 0 chr2 40400427 40400547 -141347540 - ORR1E LTR MaLR -239 120 1 5 893 268 315 99 53 chr2 40400547 40400675 -141347412 - ORR1E-int LTR MaLR -53 1527 1393 5 893 226 394 75 58 chr2 40401993 40402233 -141345854 + MLT1F2 LTR MaLR 303 546 -14 5 893 1277 180 49 0 chr2 40407111 40407417 -141340670 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 1978 2298 -28 5 893 1561 199 7 23 chr2 40407444 40407743 -141340344 + RLTR20B1 LTR ERVK 1 294 -269 5 893 918 238 65 16 chr2 40407872 40408150 -141339937 + RLTR20B1 LTR ERVK 207 563 0 5 893 3294 182 129 38 chr2 40417475 40418063 -141330024 + RLTR25A LTR ERVK 1 677 -426 5 893 3294 182 129 38 chr2 40418453 40418610 -141329477 + RLTR25A LTR ERVK 678 814 -289 5 893 3781 84 26 0 chr2 40420000 40420499 -141327588 - RLTR1B LTR ERV1 0 512 1 5 893 3185 42 16 0 chr2 40436671 40437050 -141311037 + IAPEY_LTR LTR ERVK 1 385 0 5 893 493 347 46 6 chr2 40437982 40438156 -141309931 + ORR1E LTR MaLR 57 237 -122 5 893 2203 128 27 112 chr2 40439725 40440244 -141307843 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 5 893 347 111 0 0 chr2 40440269 40440323 -141307764 + IAPEz-int LTR ERVK 3 56 -1931 5 893 464 120 17 138 chr2 40440386 40440502 -141307585 + IAPEz-int LTR ERVK 22 123 -6358 5 893 229 267 0 0 chr2 40440502 40440547 -141307540 + RLTR27 LTR ERVK 231 275 -34 6 893 775 83 0 9 chr2 40440547 40440656 -141307431 + IAPEz-int LTR ERVK 145 252 -7329 5 893 248 302 0 0 chr2 40440656 40440709 -141307378 + RLTR27 LTR ERVK 223 275 -34 6 893 3440 54 1 16 chr2 40440709 40441287 -141306800 + IAPEz-int LTR ERVK 168 662 -5819 5 893 2045 83 0 0 chr2 40441287 40441565 -141306522 + IAPEz-int LTR ERVK 1359 1636 -4845 5 893 5547 45 12 29 chr2 40441564 40442323 -141305764 + IAPEz-int LTR ERVK 5736 6481 0 5 893 2426 95 161 5 chr2 40442323 40442734 -141305353 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 5 893 487 330 73 11 chr2 40461185 40461443 -141286644 + ORR1D2 LTR MaLR 3 276 -94 6 893 478 324 44 6 chr2 40461436 40461616 -141286471 + ORR1D2 LTR MaLR 184 370 0 6 893 3117 32 42 0 chr2 40470534 40470914 -141277173 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 894 323 253 12 24 chr2 40531531 40531554 -141216533 + ORR1E LTR MaLR 273 296 -63 4 894 323 253 12 24 chr2 40531579 40531640 -141216447 + ORR1E LTR MaLR 297 356 -3 4 894 420 200 131 39 chr2 40539310 40539440 -141208647 + RLTR17 LTR ERVK 233 374 -318 6 894 2165 179 13 24 chr2 40539897 40540349 -141207738 + RMER3D-int LTR ERVK 1087 1533 -1309 6 894 397 122 0 39 chr2 40540351 40540428 -141207659 + RMER3D-int LTR ERVK 2769 2842 0 6 894 1713 175 55 28 chr2 40540428 40540792 -141207295 + RLTR17 LTR ERVK 1 374 -318 6 894 1845 164 3 36 chr2 40546954 40547290 -141200797 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 5 7 894 1355 188 71 47 chr2 40559684 40560024 -141188063 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 47 9 894 2083 236 149 5 chr2 40587266 40587875 -141160212 - ORR1B2-int LTR MaLR -811 698 2 1 894 1564 207 92 3 chr2 40587878 40588213 -141159874 - ORR1B2 LTR MaLR -2 365 1 1 894 1102 331 26 24 chr2 40609487 40609646 -141138441 - MTEa LTR MaLR 0 379 220 1 894 1102 331 26 24 chr2 40609679 40609897 -141138190 - MTEa LTR MaLR -160 219 1 1 894 848 307 52 7 chr2 40609902 40610207 -141137880 - MTEb-int LTR MaLR -1261 319 1 1 894 753 286 78 31 chr2 40610209 40610465 -141137622 - MTEb LTR MaLR 0 379 112 1 894 465 256 23 23 chr2 40612091 40612219 -141135868 + MTD LTR MaLR 10 137 -282 1 894 522 237 0 0 chr2 40613130 40613248 -141134839 + MTD LTR MaLR 119 236 -183 1 894 684 247 71 54 chr2 40613353 40613593 -141134494 + ORR1D-int LTR MaLR 6 249 -1009 1 894 4179 66 29 7 chr2 40613724 40614272 -141133815 + LTRIS2 LTR ERV1 5 564 0 1 894 997 317 30 102 chr2 40617366 40617725 -141130362 + ORR1D-int LTR MaLR 390 725 -645 1 894 997 317 30 102 chr2 40617762 40618007 -141130080 + ORR1D-int LTR MaLR 726 950 -420 1 894 400 323 113 54 chr2 40618953 40619192 -141128895 + LTR16C LTR ERVL 235 487 -2 1 894 824 309 62 26 chr2 40630206 40630591 -141117496 + RMER5 LTR ERV1 72 470 -64 1 894 353 216 51 128 chr2 40631226 40631343 -141116744 + MTEa LTR MaLR 272 379 0 1 895 2624 212 49 27 chr2 40634419 40634760 -141113327 + RMER6C LTR ERVK 1 345 -345 1 895 2624 212 49 27 chr2 40634911 40635242 -141112845 + RMER6C LTR ERVK 346 688 -2 1 895 836 260 77 29 chr2 40636611 40636884 -141111203 + RLTR15 LTR ERVK 1 286 -73 1 895 558 128 0 31 chr2 40636895 40636992 -141111095 - RMER6B LTR ERVK -2 459 366 1 895 257 191 0 0 chr2 40637096 40637138 -141110949 - RMER6B LTR ERVK -347 114 73 1 895 442 210 109 0 chr2 40637145 40637264 -141110823 - RMER6B LTR ERVK -329 132 1 1 895 611 214 9 129 chr2 40650370 40650595 -141097492 + RLTR15 LTR ERVK 143 340 -19 1 895 817 295 65 20 chr2 40652377 40652730 -141095357 + ORR1D2 LTR MaLR 2 370 0 2 895 1240 333 94 69 chr2 40652730 40653662 -141094425 + ORR1D2-int LTR MaLR 1 956 -414 2 895 879 227 40 9 chr2 40653657 40653884 -141094203 + ORR1D2-int LTR MaLR 1094 1327 -43 2 895 757 307 47 33 chr2 40653917 40654278 -141093809 + ORR1D2 LTR MaLR 5 370 0 2 895 2060 97 13 13 chr2 40661972 40662275 -141085812 + MTB LTR MaLR 98 400 0 2 895 1644 190 79 43 chr2 40669555 40669923 -141078164 + RMER13B LTR ERVK 1 381 -527 2 895 1864 224 59 43 chr2 40670258 40670770 -141077317 + RMER13B LTR ERVK 385 904 -4 2 895 1463 231 24 16 chr2 40682862 40683231 -141064856 + ORR1D1 LTR MaLR 1 372 -2 2 895 512 349 63 34 chr2 40701322 40701559 -141046528 + MLT1A0 LTR MaLR 122 365 0 2 895 1466 174 146 22 chr2 40719094 40719417 -141028670 + ORR1B1 LTR MaLR 13 375 -19 2 895 645 157 28 0 chr2 40728506 40728614 -141019473 + RMER6C LTR ERVK 1 111 -579 2 895 502 234 0 36 chr2 40728598 40728709 -141019378 + MT2B LTR ERVL 181 287 -314 2 895 1412 165 76 14 chr2 40728720 40728996 -141019091 + RMER6C LTR ERVK 398 690 0 2 895 591 322 149 42 chr2 40743320 40743628 -141004459 + MTE2b LTR MaLR 1 341 -38 3 895 939 272 18 51 chr2 40761519 40761794 -140986293 - ORR1D1 LTR MaLR -2 372 107 3 895 586 211 0 9 chr2 40762152 40762262 -140985825 - ORR1D1 LTR MaLR -263 111 3 3 895 383 217 12 0 chr2 40762888 40762971 -140985116 - ORR1D1 LTR MaLR -2 372 289 3 896 1026 314 64 0 chr2 40763439 40763783 -140984304 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 5 3 896 1421 223 112 8 chr2 40765088 40765445 -140982642 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 3 896 2041 215 63 9 chr2 40765445 40766022 -140982065 + ORR1B1-int LTR MaLR 1 642 -728 3 896 1632 234 54 31 chr2 40766145 40766491 -140981596 + ORR1B1-int LTR MaLR 643 994 -376 3 896 497 182 34 11 chr2 40766491 40766580 -140981507 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 91 -436 3 896 2324 161 0 24 chr2 40767944 40768363 -140979724 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 1 409 -1917 3 896 7994 173 65 11 chr2 40768366 40770004 -140978083 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 600 2325 -1 3 896 1581 241 76 66 chr2 40770004 40770489 -140977598 + RLTR20B3 LTR ERVK 1 490 -87 3 896 1150 259 146 2 chr2 40780457 40780816 -140967271 + MTD LTR MaLR 10 404 -15 3 896 663 302 181 0 chr2 40795655 40795961 -140952126 - MTEa LTR MaLR -4 375 1 3 896 1009 323 47 23 chr2 40797600 40797942 -140950145 + MTE2b LTR MaLR 6 355 -24 3 896 358 344 98 30 chr2 40798370 40798667 -140949420 + RMER5 LTR ERV1 49 365 -169 3 896 752 321 24 5 chr2 40800245 40800458 -140947629 - MTD LTR MaLR -122 297 81 3 896 838 238 83 24 chr2 40800738 40801023 -140947064 + RLTR20B3 LTR ERVK 255 525 -3 3 896 707 273 109 72 chr2 40804945 40805294 -140942793 - MTD LTR MaLR 0 419 21 3 896 1187 243 169 6 chr2 40813036 40813396 -140934691 - MTD LTR MaLR 0 419 1 3 896 774 229 263 11 chr2 40814922 40815185 -140932902 + MTD LTR MaLR 44 372 -49 4 896 4203 189 64 21 chr2 40815582 40816447 -140931640 + RMER19B LTR ERVK 1 902 0 4 896 238 339 93 0 chr2 40819066 40819184 -140928903 - LTR68 LTR ERV1 -169 571 443 4 896 999 167 45 30 chr2 40819225 40819423 -140928664 - RMER4B LTR ERVK 0 585 385 4 896 2850 49 0 3 chr2 40822322 40822668 -140925419 + IAPLTR4 LTR ERVK 1 345 0 4 896 1805 147 36 0 chr2 40823378 40823691 -140924396 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 16 4 896 4039 192 154 38 chr2 40823754 40824252 -140923835 + RLTR25A LTR ERVK 25 511 -592 4 896 4039 192 154 38 chr2 40824289 40824757 -140923330 + RLTR25A LTR ERVK 512 1103 0 4 896 2661 110 13 13 chr2 40825420 40825816 -140922271 + MTB_Mm LTR MaLR 1 396 -11 4 896 2279 89 6 36 chr2 40831314 40831651 -140916436 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 4 896 1381 278 49 19 chr2 40837850 40838220 -140909867 + MTD LTR MaLR 18 398 -21 4 896 941 220 222 31 chr2 40840404 40840756 -140907331 + MTD LTR MaLR 1 419 0 4 896 781 284 109 70 chr2 40841271 40841628 -140906459 + MTD LTR MaLR 2 356 -63 4 896 781 284 109 70 chr2 40841817 40841861 -140906226 + MTD LTR MaLR 357 419 0 4 896 2954 148 60 22 chr2 40844586 40845049 -140903038 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1 558 -1290 4 896 2954 157 67 7 chr2 40845098 40845323 -140902764 + RLTR22_Mur LTR ERVK 559 803 -1045 4 896 807 156 137 122 chr2 40845651 40845748 -140902339 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1590 1705 -143 4 896 807 156 137 122 chr2 40845946 40846103 -140901984 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1706 1848 0 4 896 909 307 41 30 chr2 40848420 40848786 -140899301 + RodERV21-int LTR ERV1 709 1078 -3913 4 896 2693 339 56 31 chr2 40848945 40850535 -140897552 + RodERV21-int LTR ERV1 3164 4793 -198 4 896 1374 249 78 12 chr2 40862289 40862541 -140885546 + ORR1D2 LTR MaLR 3 266 -104 4 896 1374 249 78 12 chr2 40862845 40862937 -140885150 + ORR1D2 LTR MaLR 267 370 0 4 896 1800 153 185 6 chr2 40870923 40871279 -140876808 + RLTR23 LTR ERV1 1 420 -10 4 896 829 290 152 32 chr2 40885773 40885810 -140862277 - MT2B LTR ERVL -2 599 555 4 896 829 290 152 32 chr2 40885915 40886326 -140861761 - MT2B LTR ERVL -47 554 90 4 896 829 290 152 32 chr2 40886349 40886433 -140861654 - MT2B LTR ERVL -512 89 4 4 896 2767 142 57 15 chr2 40890701 40891277 -140856810 - RLTR26 LTR ERVK -1 641 7 5 897 994 216 138 42 chr2 40896803 40897166 -140850921 + MTC LTR MaLR 4 380 -39 5 897 870 253 29 62 chr2 40897246 40897520 -140850567 + RLTR19-int LTR ERVK 2919 3183 -2954 5 897 1107 239 22 7 chr2 40897777 40898055 -140850032 + RLTR19-int LTR ERVK 3568 3849 -2288 5 897 380 241 131 58 chr2 40898055 40898355 -140849732 - MT2A LTR ERVL -161 332 1 5 897 1598 210 89 87 chr2 40900251 40900553 -140847534 + RMER6C LTR ERVK 2 335 -355 5 897 1598 210 89 87 chr2 40900696 40900921 -140847166 + RMER6C LTR ERVK 336 530 -160 5 897 556 237 35 88 chr2 40903181 40903352 -140844735 + ORR1D1 LTR MaLR 10 171 -203 5 897 1657 246 23 3 chr2 40911150 40911504 -140836583 + MTD LTR MaLR 3 363 -56 5 897 2950 78 5 2 chr2 40912981 40913377 -140834710 - MTB LTR MaLR -3 397 1 5 897 530 312 63 135 chr2 40916287 40916606 -140831481 - MTE2a LTR MaLR -81 298 3 5 897 1995 148 3 3 chr2 40918159 40918470 -140829617 - RLTR10E LTR ERVK 0 311 1 5 897 4205 28 0 14 chr2 40919141 40919641 -140828446 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 5 897 47762 17 0 0 chr2 40919641 40925012 -140823075 + MERVL-int LTR ERVL 1 5371 -114 5 897 371 111 26 53 chr2 40925012 40925088 -140822999 + ORR1A3-int LTR MaLR 567 640 -1323 5 897 314 0 0 0 chr2 40925088 40925126 -140822961 + MERVL-int LTR ERVL 5448 5485 0 5 897 4220 26 0 14 chr2 40925126 40925626 -140822461 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 5 897 1239 234 99 23 chr2 40935146 40935491 -140812596 + ORR1D1 LTR MaLR 4 374 0 5 897 680 270 81 37 chr2 40948936 40949232 -140798855 - MLT1B LTR MaLR -40 350 42 5 897 809 248 97 58 chr2 40973033 40973401 -140774686 + RLTR20C LTR ERVK 1 480 -88 6 897 288 243 28 28 chr2 40973574 40973646 -140774441 + RLTR20C LTR ERVK 507 578 0 6 897 1751 190 53 21 chr2 40992058 40992471 -140755616 + ORR1A4 LTR MaLR 1 421 0 6 897 355 349 18 18 chr2 40992475 40992586 -140755501 + MTD LTR MaLR 104 214 -205 6 897 3296 162 27 8 chr2 40994124 40994709 -140753378 + RLTR17 LTR ERVK 97 692 0 6 897 2221 167 17 172 chr2 40994858 40995593 -140752494 + RMER6C LTR ERVK 1 690 0 6 897 1094 247 110 24 chr2 40996245 40996627 -140751460 - MTD LTR MaLR 0 419 5 6 897 2399 123 27 20 chr2 41015157 41015563 -140732524 + RLTR9E LTR ERVK 1 409 0 3 898 544 301 112 36 chr2 41027140 41027471 -140720616 - ORR1E LTR MaLR -3 356 1 4 898 288 363 120 35 chr2 41027567 41027850 -140720237 + MLT1F2 LTR MaLR 11 317 -243 4 898 1305 258 51 92 chr2 41043410 41043653 -140704434 + RLTR40 LTR ERVK 46 285 -532 7 898 1305 258 51 92 chr2 41043677 41043901 -140704186 + RLTR40 LTR ERVK 286 491 -326 7 898 1305 285 88 68 chr2 41043925 41044231 -140703856 + RLTR40 LTR ERVK 492 776 -41 7 898 2558 192 74 7 chr2 41048307 41048848 -140699239 + RLTR20B3 LTR ERVK 1 577 0 7 898 1066 226 94 39 chr2 41050095 41050404 -140697683 + ORR1B2 LTR MaLR 42 367 0 8 898 3540 248 66 14 chr2 41050404 41050822 -140697265 + ORR1B2-int LTR MaLR 1 441 -1068 8 898 3540 254 65 15 chr2 41050901 41051557 -140696530 + ORR1B2-int LTR MaLR 442 1086 -423 8 898 424 270 138 15 chr2 41051673 41051903 -140696184 + RMER20B LTR ERVK 163 412 -215 8 898 699 211 213 15 chr2 41052032 41052234 -140695853 + ORR1B2-int LTR MaLR 1066 1307 -202 8 898 257 240 17 103 chr2 41053191 41053307 -140694780 + MLT1B LTR MaLR 10 115 -275 8 898 281 310 184 34 chr2 41056695 41056929 -140691158 + MTEa LTR MaLR 103 371 -8 9 898 249 314 34 23 chr2 41059329 41059417 -140688670 + MLT1A LTR MaLR 66 154 -220 9 898 538 299 92 67 chr2 41060016 41060497 -140687590 + MER34A LTR ERV1 52 565 -6 9 898 2287 175 47 63 chr2 41060757 41061295 -140686792 + RLTR24 LTR ERV1 1 529 0 9 898 1576 232 57 15 chr2 41063499 41063901 -140684186 + RMER10A LTR ERVL 23 441 -1 1 898 2043 175 135 77 chr2 41067969 41068539 -140679548 + RLTR6_Mm LTR ERV1 1 603 -51 1 898 62099 32 12 0 chr2 41068540 41076223 -140671864 + RLTR6-int LTR ERV1 1 7778 0 1 898 1989 172 139 79 chr2 41076223 41076777 -140671310 + RLTR6_Mm LTR ERV1 1 587 -67 1 898 1001 238 112 123 chr2 41077424 41077879 -140670208 + RMER4A LTR ERVK 17 466 0 1 898 8167 212 55 20 chr2 41081708 41083523 -140664564 + MERVK26-int LTR ERVK 5040 6917 -2 1 898 1639 172 44 52 chr2 41083780 41084235 -140663852 - RMER17C LTR ERVK -542 416 20 1 898 254 237 104 13 chr2 41084244 41084321 -140663766 + RMER20B LTR ERVK 313 396 -231 1 898 679 289 139 24 chr2 41084560 41084967 -140663120 + RMER5 LTR ERV1 38 491 -43 1 898 986 244 47 68 chr2 41085929 41086311 -140661776 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 1 898 570 282 34 34 chr2 41087496 41087751 -140660336 + MTE2a LTR MaLR 20 241 -138 1 898 1987 183 45 12 chr2 41087755 41088154 -140659933 - MTC LTR MaLR -5 416 5 1 898 313 362 21 14 chr2 41088157 41088297 -140659790 + MTE2a LTR MaLR 235 375 -4 1 898 2092 203 29 25 chr2 41088658 41089107 -140658980 + RLTR31A_Mm LTR ERVK 1 451 -133 1 898 261 182 0 52 chr2 41089098 41089156 -140658931 + RLTR17 LTR ERVK 638 692 0 1 898 1950 150 0 63 chr2 41089492 41089840 -140658247 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 1 898 2246 157 151 177 chr2 41091421 41091715 -140656372 + RMER17A2 LTR ERVK 30 377 -529 1 898 2246 157 151 177 chr2 41091891 41092485 -140655602 + RMER17A2 LTR ERVK 378 894 -12 1 898 844 258 41 47 chr2 41095221 41095538 -140652549 - RLTR15 LTR ERVK -44 315 1 1 898 1468 140 23 111 chr2 41095594 41095947 -140652140 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 322 0 1 898 782 346 128 17 chr2 41096123 41096585 -140651502 - MLT1F1 LTR MaLR -3 566 54 1 898 2762 191 42 93 chr2 41099412 41100048 -140648039 + RLTR18 LTR ERVK 13 616 0 1 898 2105 157 140 9 chr2 41103935 41104384 -140643703 + RLTR25A LTR ERVK 6 513 -590 1 898 2478 169 83 131 chr2 41105682 41106406 -140641681 + RMER6C LTR ERVK 2 690 0 1 898 314 289 123 30 chr2 41117329 41117532 -140630555 + MLT2C1 LTR ERVL 67 288 -109 1 898 1426 268 22 10 chr2 41123121 41123535 -140624552 + MTD LTR MaLR 1 419 0 1 898 1168 263 150 3 chr2 41129891 41130238 -140617849 - MTD LTR MaLR 0 419 22 2 898 257 241 125 12 chr2 41130818 41130898 -140617189 + MT2A LTR ERVL 1 89 -444 2 898 1304 221 74 0 chr2 41130954 41131225 -140616862 + MT2A LTR ERVL 84 374 -159 2 898 1088 289 58 9 chr2 41133129 41133342 -140614745 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 144 2 898 2073 204 69 24 chr2 41133342 41133848 -140614239 + RLTR24 LTR ERV1 1 529 0 2 898 1088 289 58 9 chr2 41133848 41133979 -140614108 - ORR1D2 LTR MaLR -227 143 9 2 898 258 226 81 107 chr2 41147183 41147339 -140600748 + MLT2B1 LTR ERVL 10 144 -371 2 898 1239 232 54 61 chr2 41152119 41152546 -140595541 + RMER5 LTR ERV1 1 424 -110 2 898 245 286 25 25 chr2 41152929 41153008 -140595079 - RMER4B LTR ERVK -482 103 25 2 898 572 280 64 41 chr2 41153101 41153321 -140594766 + RMER5 LTR ERV1 147 371 -163 2 898 266 200 62 0 chr2 41153345 41153410 -140594677 + RMER5 LTR ERV1 458 526 -8 2 899 865 253 160 33 chr2 41172172 41172503 -140575584 - RLTR22_Mus LTR ERVK -42 1766 1394 2 899 2403 256 131 35 chr2 41172577 41173589 -140574498 - RLTR22_Mur LTR ERVK -738 1110 1 2 899 2895 104 0 15 chr2 41175821 41176230 -140571857 + MTB_Mm LTR MaLR 5 407 0 2 899 244 246 16 32 chr2 41179732 41179795 -140568292 + RMER15 LTR ERVL 325 386 -189 2 899 1816 222 66 54 chr2 41181272 41181849 -140566238 + RLTR31A_Mm LTR ERVK 1 584 0 2 899 1927 344 71 56 chr2 41184308 41185336 -140562751 + MTE-int LTR MaLR 25 1067 -513 2 899 1186 280 49 46 chr2 41185343 41185710 -140562377 + MTE2b LTR MaLR 12 379 0 2 899 352 380 66 10 chr2 41185722 41185919 -140562168 + MTE-int LTR MaLR 1076 1283 -297 2 899 1233 214 176 8 chr2 41185949 41186308 -140561779 + RMER16 LTR ERVK 113 531 -2 2 899 6496 191 39 33 chr2 41186310 41188170 -140559917 + RMER16-int LTR ERVK 1 1517 -3889 2 899 1620 221 42 31 chr2 41188529 41188983 -140559104 + RMER16-int LTR ERVK 3521 3979 -1427 2 899 2100 194 35 20 chr2 41189195 41189685 -140558402 + RMER16-int LTR ERVK 4111 4607 -799 2 899 1862 140 134 2 chr2 41189681 41190211 -140557876 + RMER16-int LTR ERVK 4802 5401 -5 2 899 806 212 85 55 chr2 41190215 41190544 -140557543 + RMER16 LTR ERVK 1 473 -60 2 899 1659 216 75 32 chr2 41191242 41191600 -140556487 + RMER20B LTR ERVK 1 357 -270 2 899 1659 223 126 56 chr2 41191620 41191826 -140556261 + RMER20B LTR ERVK 358 623 -4 2 899 572 244 47 8 chr2 41200446 41200574 -140547513 + ETnERV2-int LTR ERVK 7070 7202 -204 2 899 324 277 45 23 chr2 41201128 41201261 -140546826 + RMER16-int LTR ERVK 169 304 -6940 2 899 2067 192 138 43 chr2 41201457 41201986 -140546101 + RMER16-int LTR ERVK 241 819 -4587 2 899 573 186 88 0 chr2 41201991 41202104 -140545983 + RMER16-int LTR ERVK 938 1060 -5077 2 899 650 235 0 102 chr2 41202117 41202339 -140545748 + ETnERV2-int LTR ERVK 2454 2753 -4653 2 899 5388 166 102 140 chr2 41202374 41202911 -140545176 + RLTR45-int LTR ERVK 4296 4841 -2403 2 899 5388 166 102 140 chr2 41203014 41204220 -140543867 + RLTR45-int LTR ERVK 4842 6071 -1173 2 899 811 276 9 6 chr2 41204222 41204505 -140543582 + RLTR45-int LTR ERVK 7506 7754 -463 2 899 3710 143 11 5 chr2 41204608 41205170 -140542917 + ETnERV2-int LTR ERVK 6495 7059 -347 3 899 291 299 34 173 chr2 41221566 41222006 -140526081 - MTEa LTR MaLR 0 379 1 3 899 1533 184 55 79 chr2 41223032 41223398 -140524689 + ORR1B1 LTR MaLR 38 394 0 3 899 8179 173 69 32 chr2 41229348 41230642 -140517445 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1 1327 -521 3 899 8179 173 69 32 chr2 41230679 41231162 -140516925 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1328 1842 -6 3 899 656 252 36 50 chr2 41234961 41235182 -140512905 + RMER13B LTR ERVK 5 222 -686 3 899 3183 242 20 6 chr2 41235188 41235893 -140512194 + RMER13A LTR ERVK 146 860 0 3 899 937 261 59 44 chr2 41258756 41259029 -140489058 + ORR1D1 LTR MaLR 5 281 -93 3 899 300 200 33 11 chr2 41262602 41262693 -140485394 + RMER17B LTR ERVK 355 447 -511 3 899 2460 149 11 0 chr2 41262824 41263206 -140484881 + ORR1B1 LTR MaLR 1 386 -8 3 899 757 267 82 23 chr2 41284551 41284873 -140463214 + MTD LTR MaLR 12 364 -43 4 900 250 232 13 78 chr2 41288399 41288501 -140459586 - MTEb LTR MaLR -24 355 260 4 900 1281 285 80 18 chr2 41295692 41296078 -140452009 - MTD LTR MaLR -9 410 1 4 900 4040 129 103 118 chr2 41297682 41298601 -140449486 + RMER17A2 LTR ERVK 1 906 0 4 900 1023 152 34 6 chr2 41301808 41301987 -140446100 + ORR1A4 LTR MaLR 1 184 -145 4 900 352 82 0 0 chr2 41301982 41302031 -140446056 + ORR1A4 LTR MaLR 346 394 0 4 900 1935 107 97 3 chr2 41320233 41320532 -140427555 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 4 900 4952 195 3 15 chr2 41322701 41323616 -140424471 - RMER13B LTR ERVK -4 904 1 4 900 441 294 144 34 chr2 41329087 41329295 -140418792 - RMER21B LTR ERV1 -275 567 337 4 900 1384 203 38 24 chr2 41336710 41337003 -140411084 + ORR1B1 LTR MaLR 90 386 -8 4 900 893 160 0 0 chr2 41337007 41337157 -140410930 + ORR1B1-int LTR MaLR 1 150 -1359 4 900 545 341 56 37 chr2 41339670 41340027 -140408060 + MLT2D LTR ERVL 9 379 -18 4 900 1949 220 7 22 chr2 41342903 41343307 -140404780 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 10 4 900 1879 161 32 56 chr2 41343582 41343956 -140404131 - ORR1B2 LTR MaLR -2 365 1 5 900 893 299 81 18 chr2 41345023 41345380 -140402707 - MTD LTR MaLR -14 405 3 5 900 1381 189 216 22 chr2 41347742 41347851 -140400236 + RLTR23 LTR ERV1 5 157 -273 5 900 1381 189 216 22 chr2 41347877 41348124 -140399963 + RLTR23 LTR ERV1 158 430 0 5 900 2390 205 19 26 chr2 41348445 41348975 -140399112 + RLTR11A LTR ERVK 1 526 -2 5 900 545 233 6 9 chr2 41350196 41350327 -140397760 - RLTR20D LTR ERVK -406 162 5 5 900 1328 241 105 16 chr2 41350441 41350727 -140397360 + RLTR20D LTR ERVK 160 465 -103 5 900 1328 241 105 16 chr2 41350775 41350860 -140397227 + RLTR20D LTR ERVK 466 563 -5 5 900 2997 193 179 20 chr2 41359708 41360585 -140387502 + RLTR25B LTR ERVK 1 1103 0 5 900 1381 216 105 77 chr2 41366115 41366506 -140381581 + MT2A LTR ERVL 61 462 -71 5 900 932 290 89 40 chr2 41371899 41372247 -140375840 + ORR1D2 LTR MaLR 6 370 0 5 900 228 321 42 90 chr2 41372376 41372520 -140375567 + MT2B2 LTR ERVL 154 290 -294 5 900 6624 106 40 2 chr2 41376851 41377798 -140370289 + RLTR13C1 LTR ERVK 1 983 0 5 900 462 297 26 52 chr2 41378816 41379008 -140369079 + MTEb LTR MaLR 189 375 -4 5 900 532 216 24 16 chr2 41381715 41381842 -140366245 + RMER15 LTR ERVL 4 131 -444 5 900 347 346 118 73 chr2 41381928 41382174 -140365913 + RMER15 LTR ERVL 305 561 -14 5 900 269 302 61 47 chr2 41382346 41382485 -140365602 + MLT2C2 LTR ERVL 66 206 -258 5 900 590 255 56 88 chr2 41383200 41383415 -140364672 + MT2A LTR ERVL 8 215 -318 5 900 954 261 153 23 chr2 41387600 41388075 -140360012 + MT2A LTR ERVL 36 508 -25 5 900 367 173 52 26 chr2 41395685 41395762 -140352325 + MTD LTR MaLR 1 79 -340 5 900 782 260 17 28 chr2 41395735 41395956 -140352131 + MTD LTR MaLR 182 409 -10 5 900 1661 221 54 61 chr2 41405551 41406135 -140341952 - RMER17B LTR ERVK -287 619 1 5 900 281 149 0 0 chr2 41406135 41406182 -140341905 + ORR1D1 LTR MaLR 328 374 0 5 900 717 228 171 38 chr2 41406874 41407084 -140341003 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 133 5 900 672 293 107 85 chr2 41411315 41411774 -140336313 - RMER2 LTR ERV1 -16 551 83 6 901 3023 74 2 10 chr2 41421162 41421560 -140326527 - MTA_Mm LTR MaLR -1 395 1 6 901 1200 305 73 11 chr2 41421651 41422032 -140326055 - MTD LTR MaLR 0 419 15 6 901 3973 242 67 62 chr2 41422084 41423280 -140324807 - MTC-int LTR MaLR -55 1203 2 6 901 448 287 57 0 chr2 41423282 41423404 -140324683 - MTC LTR MaLR -1 418 290 6 901 1268 217 52 9 chr2 41423404 41423495 -140324592 + RLTR31B_Mm LTR ERVK 1 92 -465 6 901 1268 217 52 9 chr2 41423574 41423807 -140324280 + RLTR31B_Mm LTR ERVK 93 339 -218 6 901 650 301 27 0 chr2 41423894 41424077 -140324010 - MTC LTR MaLR -123 298 111 6 901 1468 225 98 3 chr2 41424080 41424415 -140323672 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 6 901 569 224 37 15 chr2 41425610 41425718 -140322369 + RLTR16 LTR ERVK 4 114 -391 6 901 2003 111 10 22 chr2 41425718 41426032 -140322055 + RMER17A2 LTR ERVK 1 310 -596 6 901 561 237 71 19 chr2 41427787 41427998 -140320089 + RLTR16 LTR ERVK 270 491 -14 6 901 1406 224 36 88 chr2 41430151 41430513 -140317574 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 42 6 901 2289 99 69 54 chr2 41430821 41431226 -140316861 - IAPLTR2a LTR ERVK 0 411 1 6 901 649 281 76 40 chr2 41431730 41432095 -140315992 + RMER20B LTR ERVK 133 571 -56 6 901 2174 216 107 26 chr2 41432096 41432860 -140315227 - RLTR13D3 LTR ERVK 0 1114 1 6 901 993 234 328 12 chr2 41433644 41434043 -140314044 - RMER19B LTR ERVK -19 883 359 6 901 1310 194 12 20 chr2 41434049 41434302 -140313785 - RMER19B LTR ERVK -651 251 1 6 901 2858 132 124 22 chr2 41438012 41438552 -140309535 + RLTR17 LTR ERVK 98 692 0 6 901 2118 148 3 0 chr2 41439179 41439504 -140308583 - ORR1A2 LTR MaLR -1 326 1 6 901 1827 189 75 102 chr2 41446266 41447097 -140300990 + RMER6D LTR ERVK 1 720 0 6 901 718 76 25 8 chr2 41453918 41454038 -140294049 - BGLII LTR ERVK -106 315 194 6 901 1863 159 217 24 chr2 41456668 41457042 -140291045 + RLTR41 LTR ERV1 1 446 0 6 901 2263 69 34 0 chr2 41463736 41464056 -140284031 + RLTR10 LTR ERVK 1 331 -59 6 901 389 40 0 0 chr2 41464523 41464573 -140283514 + RLTR10 LTR ERVK 362 411 0 6 901 285 342 63 67 chr2 41471503 41471741 -140276346 + ORR1E LTR MaLR 18 254 -105 7 901 389 313 69 44 chr2 41473775 41473979 -140274108 - RMER15 LTR ERVL -13 562 354 7 901 1725 200 82 11 chr2 41475051 41475415 -140272672 - MTC LTR MaLR -31 390 1 7 901 536 193 140 29 chr2 41475881 41476104 -140271983 + RMER3D-int LTR ERVK 629 849 -1993 7 901 3576 184 42 8 chr2 41476151 41476820 -140271267 + RLTR17 LTR ERVK 1 692 0 7 901 1092 277 51 36 chr2 41481908 41482241 -140265846 + ORR1D2 LTR MaLR 32 369 -1 7 901 252 225 192 30 chr2 41484989 41485125 -140262962 + MLT1A0 LTR MaLR 209 379 0 7 901 267 365 20 20 chr2 41485196 41485294 -140262793 - MLT1I LTR MaLR -212 199 102 7 901 1493 146 54 18 chr2 41485326 41485605 -140262482 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 240 7 901 1519 152 325 8 chr2 41488760 41489144 -140258943 + RLTR25B LTR ERVK 518 1023 -5 7 901 372 289 22 128 chr2 41490278 41490457 -140257630 + RMER12 LTR ERVK 696 855 -467 7 901 1346 297 129 62 chr2 41495267 41496090 -140251997 + RMER17A2 LTR ERVK 1 878 -28 7 901 470 293 80 83 chr2 41497396 41497660 -140250427 + LTR40a LTR ERVL 47 309 -210 7 901 1551 221 72 0 chr2 41498166 41498501 -140249586 - ORR1C2 LTR MaLR -25 359 1 7 901 3246 217 35 14 chr2 41498501 41499236 -140248851 - ORR1C2-int LTR MaLR 0 1509 630 7 901 2985 249 54 43 chr2 41499288 41499453 -140248634 - ORR1C2-int LTR MaLR -741 629 461 7 901 1781 149 20 13 chr2 41499455 41499761 -140248326 + ORR1A4 LTR MaLR 3 310 -19 7 901 726 291 16 51 chr2 41499746 41500000 -140248087 - ORR1C2-int LTR MaLR -1046 463 219 7 901 827 213 48 5 chr2 41500000 41500189 -140247898 - ORR1C2-int LTR MaLR -1291 218 22 1 901 1381 249 30 55 chr2 41500178 41500539 -140247548 - ORR1C2 LTR MaLR -32 352 1 1 901 619 304 16 6 chr2 41501120 41501302 -140246785 + LTR40a LTR ERVL 336 519 0 3 901 1263 295 56 3 chr2 41503765 41504125 -140243962 - MTD LTR MaLR 0 419 41 5 901 1872 207 107 67 chr2 41509217 41509713 -140238374 - RMER20A LTR ERVK 0 516 1 1 901 1289 226 96 18 chr2 41510379 41510405 -140237682 + ORR1D1 LTR MaLR 7 37 -337 1 901 1289 226 96 18 chr2 41510450 41510757 -140237330 + ORR1D1 LTR MaLR 38 366 -8 1 901 1931 227 76 19 chr2 41513619 41514095 -140233992 + RLTR11A2 LTR ERVK 4 506 -21 2 901 315 276 0 0 chr2 41515018 41515094 -140232993 + ORR1D1 LTR MaLR 1 76 -298 2 901 2297 77 39 41 chr2 41520208 41520546 -140227541 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 0 337 1 3 901 3621 165 45 31 chr2 41527325 41528074 -140220013 + RMER13B LTR ERVK 3 762 -146 4 901 687 297 56 161 chr2 41529481 41529801 -140218286 + MTD LTR MaLR 6 342 -77 4 901 687 297 56 161 chr2 41529834 41529922 -140218165 + MTD LTR MaLR 303 393 -26 4 901 1062 312 61 15 chr2 41530342 41530817 -140217270 + RMER5 LTR ERV1 33 529 -5 5 901 498 296 37 0 chr2 41532791 41532960 -140215127 + MTD LTR MaLR 117 292 -129 5 901 392 296 36 24 chr2 41536108 41536274 -140211813 + MLT1B LTR MaLR 46 213 -177 5 901 434 237 28 0 chr2 41536760 41536873 -140211214 + ORR1C1 LTR MaLR 5 124 -250 5 901 656 170 0 1 chr2 41537294 41537408 -140210679 + ORR1C1 LTR MaLR 226 347 -47 5 901 275 342 99 45 chr2 41538217 41538419 -140209668 + MLT1B LTR MaLR 350 562 -7 5 901 1256 198 29 39 chr2 41543935 41544214 -140203873 + RLTR46 LTR ERVK 40 315 -5 6 901 310 260 43 86 chr2 41545686 41545825 -140202262 - RLTR25B LTR ERVK -507 521 389 6 902 680 320 111 50 chr2 41562137 41562515 -140185572 + MTE-int LTR MaLR 1153 1553 -27 8 902 253 299 108 25 chr2 41562680 41562800 -140185287 + MTEa LTR MaLR 250 379 0 8 902 562 344 18 9 chr2 41562943 41563172 -140184915 - ORR1E-int LTR MaLR -1347 233 3 8 902 492 318 173 50 chr2 41563180 41563498 -140184589 - ORR1E LTR MaLR 0 359 3 8 902 3036 177 85 43 chr2 41563969 41564625 -140183462 + RMER13B LTR ERVK 1 684 -224 8 902 458 167 51 48 chr2 41567579 41567756 -140180331 - MYSERV6-int LTR ERVK -1060 7899 7768 8 902 244 263 78 69 chr2 41567768 41567870 -140180217 - RMER4B LTR ERVK -46 539 437 9 902 854 268 62 62 chr2 41568118 41568555 -140179532 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -1567 759 323 9 902 2749 69 48 5 chr2 41579649 41580027 -140168060 - MTA_Mm LTR MaLR -2 394 1 1 902 523 283 47 8 chr2 41586147 41586275 -140161812 - ETnERV2-int LTR ERVK -204 7202 7070 1 902 2225 112 117 0 chr2 41589311 41589669 -140158418 - MTB LTR MaLR 0 400 1 1 902 4964 170 40 70 chr2 41589669 41590801 -140157286 - MTB-int LTR MaLR 0 1098 1 1 902 2726 101 16 0 chr2 41590801 41591188 -140156899 - MTB LTR MaLR 0 400 8 1 902 2322 94 3 0 chr2 41594378 41594696 -140153391 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 1 902 1058 248 29 50 chr2 41598548 41598661 -140149426 + RMER6B LTR ERVK 188 292 -169 1 902 1058 248 29 50 chr2 41598841 41599007 -140149080 + RMER6B LTR ERVK 293 461 0 1 902 2974 17 46 0 chr2 41599889 41600240 -140147847 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 1 902 55526 21 17 3 chr2 41600240 41606622 -140141465 + IAPEz-int LTR ERVK 8 6481 0 1 902 2974 17 46 0 chr2 41606622 41606973 -140141114 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 1 902 324 377 65 16 chr2 41606981 41607098 -140140989 + ORR1D2 LTR MaLR 11 135 -235 1 902 294 234 86 17 chr2 41607444 41607612 -140140475 - RMER17A2 LTR ERVK -477 429 244 1 902 664 318 58 14 chr2 41607563 41607786 -140140301 + ORR1D2 LTR MaLR 138 370 0 1 902 3345 259 128 68 chr2 41607787 41607839 -140140248 + ORR1D2-int LTR MaLR 2 45 -1325 1 902 3345 259 128 68 chr2 41607921 41609160 -140138927 + ORR1D2-int LTR MaLR 46 1370 0 1 902 657 307 102 12 chr2 41609161 41609405 -140138682 + ORR1D2 LTR MaLR 5 270 -100 1 902 3353 180 62 39 chr2 41609447 41610223 -140137864 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 156 949 -1377 1 902 4476 169 89 30 chr2 41610204 41611296 -140136791 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 1058 2213 -113 1 902 1937 218 3 11 chr2 41613427 41613807 -140134280 - MTC LTR MaLR -8 413 37 1 902 818 279 112 67 chr2 41642087 41642417 -140105670 + ORR1D2 LTR MaLR 22 366 -4 1 902 3689 62 19 8 chr2 41649404 41649874 -140098213 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 475 0 1 902 775 206 51 126 chr2 41650407 41650649 -140097438 - MurERV4-int LTR ERVK -4988 272 49 1 902 775 206 51 126 chr2 41650678 41650691 -140097396 - MurERV4-int LTR ERVK -5212 48 46 1 902 775 206 51 126 chr2 41650728 41650765 -140097322 - MurERV4-int LTR ERVK -5215 45 1 1 902 2065 192 40 9 chr2 41650767 41651213 -140096874 - RMER4A LTR ERVK -2 464 5 1 902 2002 221 68 148 chr2 41651232 41651948 -140096139 - MurERV4-int LTR ERVK -4601 659 1 1 902 1312 234 11 8 chr2 41657654 41657917 -140090170 + MTC LTR MaLR 114 377 -44 2 902 264 391 48 82 chr2 41658888 41659244 -140088843 - ORR1E LTR MaLR -15 344 1 2 902 687 249 94 145 chr2 41661035 41661447 -140086640 + MT2A LTR ERVL 2 528 -73 2 902 3819 251 45 11 chr2 41662607 41663646 -140084441 + MERVL_2A-int LTR ERVL 4683 5756 -5 2 902 370 341 80 83 chr2 41663651 41663778 -140084309 + MT2A LTR ERVL 1 135 -398 2 902 370 341 80 83 chr2 41664443 41664564 -140083523 + MT2A LTR ERVL 136 262 -271 2 902 370 341 80 83 chr2 41664594 41664859 -140083228 + MT2A LTR ERVL 263 513 -20 2 902 352 287 70 0 chr2 41671586 41671701 -140076386 + MTD-int LTR MaLR 1134 1256 -2 2 902 765 337 128 11 chr2 41671703 41672069 -140076018 + MTD LTR MaLR 1 409 -10 2 903 443 331 135 55 chr2 41682454 41682781 -140065306 + MTEa LTR MaLR 6 363 -16 2 903 580 328 84 59 chr2 41683057 41683427 -140064660 + MTD LTR MaLR 16 419 0 2 903 502 348 86 14 chr2 41683615 41683906 -140064181 + MLT1A0 LTR MaLR 4 315 -50 2 903 384 130 72 0 chr2 41688830 41688845 -140059242 + ORR1C1 LTR MaLR 305 324 -54 2 903 384 130 72 0 chr2 41688868 41688921 -140059166 + ORR1C1 LTR MaLR 325 377 -1 2 903 277 315 67 0 chr2 41689029 41689118 -140058969 - MLT1B LTR MaLR -16 374 280 2 903 1990 226 5 7 chr2 41694352 41694771 -140053316 - MTC LTR MaLR -3 418 1 2 903 4075 265 47 40 chr2 41701647 41702857 -140045230 + ORR1C1-int LTR MaLR 43 1261 -109 2 903 482 235 96 0 chr2 41703329 41703444 -140044643 + ORR1C1 LTR MaLR 127 252 -126 2 903 252 237 51 0 chr2 41706038 41706097 -140041990 - MTEa LTR MaLR 0 379 318 2 903 1234 263 24 30 chr2 41712581 41712914 -140035173 - ORR1D1 LTR MaLR -11 363 33 3 903 519 258 43 53 chr2 41732103 41732186 -140015901 + RLTR40 LTR ERVK 183 265 -552 3 903 519 258 43 53 chr2 41732358 41732462 -140015625 + RLTR40 LTR ERVK 266 368 -449 3 903 902 260 88 36 chr2 41733605 41733912 -140014175 + RLTR40 LTR ERVK 407 729 -88 3 903 909 289 74 28 chr2 41738144 41738497 -140009590 + MTEa LTR MaLR 9 377 -2 3 903 3439 45 28 5 chr2 41758961 41759387 -139988700 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 3 903 512 283 69 30 chr2 41767307 41767540 -139980547 + RLTR15 LTR ERVK 1 242 -117 3 903 702 194 16 0 chr2 41770720 41770844 -139977243 + RMER13A LTR ERVK 1 126 -734 3 903 567 274 166 11 chr2 41779361 41779542 -139968545 + ORR1E LTR MaLR 3 211 -148 3 903 489 341 56 47 chr2 41779552 41779786 -139968301 + MTE-int LTR MaLR 774 1009 -571 3 903 1282 322 29 50 chr2 41779959 41780341 -139967746 + MTE-int LTR MaLR 1022 1412 -168 3 903 1282 322 29 50 chr2 41780478 41780501 -139967586 + MTE-int LTR MaLR 1413 1429 -151 3 903 1282 322 29 50 chr2 41781123 41781233 -139966854 + MTE-int LTR MaLR 1430 1527 -53 3 903 893 281 65 68 chr2 41781236 41781591 -139966496 + ORR1E LTR MaLR 4 357 -2 3 903 2981 195 84 36 chr2 41791106 41791461 -139956626 + RMER6D LTR ERVK 1 370 -350 4 903 2981 195 84 36 chr2 41791552 41791881 -139956206 + RMER6D LTR ERVK 371 718 -2 4 903 288 364 49 81 chr2 41794075 41794359 -139953728 + MLT2B1 LTR ERVL 85 359 -161 4 903 1017 358 3 21 chr2 41794914 41795253 -139952834 + MTEa LTR MaLR 8 340 -39 4 903 548 322 70 99 chr2 41795373 41795718 -139952369 + ORR1E LTR MaLR 8 342 -17 4 903 1978 207 61 81 chr2 41798025 41798567 -139949520 + RMER5 LTR ERV1 1 531 -3 4 903 879 264 14 14 chr2 41799660 41799879 -139948208 - MTD LTR MaLR -200 219 1 4 903 1998 181 40 15 chr2 41800067 41800464 -139947623 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 4 903 259 335 60 86 chr2 41800467 41800735 -139947352 + MLT1J LTR MaLR 249 509 -3 4 903 2974 202 50 41 chr2 41802940 41803287 -139944800 + RLTR17 LTR ERVK 1 365 -327 4 903 2974 202 50 41 chr2 41803658 41803996 -139944091 + RLTR17 LTR ERVK 366 692 0 4 903 2507 340 132 23 chr2 41804931 41806287 -139941800 + MTE2b-int LTR MaLR 71 1574 -6 4 903 236 312 91 0 chr2 41806297 41806374 -139941713 + MTE2b LTR MaLR 5 88 -291 4 903 949 289 56 20 chr2 41806382 41806685 -139941402 + MTE2b LTR MaLR 54 367 -12 4 904 423 233 278 59 chr2 41826980 41827149 -139920938 + ORR1D1 LTR MaLR 3 208 -166 4 904 688 207 89 24 chr2 41827383 41827551 -139920536 + ORR1D1 LTR MaLR 196 374 0 4 904 361 328 57 28 chr2 41834558 41834699 -139913388 + MER34A LTR ERV1 20 164 -407 4 904 226 309 64 41 chr2 41835161 41835333 -139912754 + MER34A LTR ERV1 311 486 -85 4 904 766 272 176 72 chr2 41836463 41836854 -139911233 - RMER13A LTR ERVK -274 586 175 4 904 766 272 176 72 chr2 41837138 41837189 -139910898 - RMER13A LTR ERVK -686 174 98 4 904 862 307 191 6 chr2 41840847 41841188 -139906899 + MTC LTR MaLR 18 421 0 4 904 1885 149 3 25 chr2 41844482 41844799 -139903288 + RLTR10E LTR ERVK 2 311 0 4 904 724 340 92 27 chr2 41851909 41852247 -139895840 + MTE2b LTR MaLR 3 362 -17 5 904 522 320 94 23 chr2 41856817 41857082 -139891005 + MLT2B4 LTR ERVL 11 294 -262 5 904 1091 304 106 79 chr2 41867875 41868474 -139879613 + RLTR18B LTR ERVK 3 590 -26 5 904 372 318 42 24 chr2 41871158 41871303 -139876784 - MTE2a LTR MaLR -7 372 236 5 904 300 340 44 145 chr2 41871352 41871509 -139876578 - MTE2a LTR MaLR -144 235 101 5 904 239 243 70 139 chr2 41881635 41881764 -139866323 - MLT1H LTR MaLR -292 257 138 5 904 1251 305 33 38 chr2 41885124 41885523 -139862564 + MTD LTR MaLR 22 418 -1 5 904 2436 173 7 35 chr2 41885523 41885979 -139862108 + RMER13B LTR ERVK 1 443 -465 5 904 599 293 12 19 chr2 41886016 41886176 -139861911 + RMER13B LTR ERVK 750 908 0 5 904 275 319 62 75 chr2 41910005 41910151 -139837936 + ORR1E LTR MaLR 4 147 -212 5 904 258 346 22 37 chr2 41910247 41910382 -139837705 + ORR1E LTR MaLR 237 369 -10 5 904 1194 300 58 6 chr2 41927472 41927814 -139820273 + ORR1D2 LTR MaLR 1 360 -10 5 904 697 326 57 6 chr2 41937757 41938109 -139809978 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 5 905 478 276 70 139 chr2 41952112 41952566 -139795521 + RLTR23 LTR ERV1 8 430 0 6 905 4702 117 81 50 chr2 41957366 41957643 -139790444 - RMER17A2 LTR ERVK 0 906 644 6 905 4702 117 81 50 chr2 41958073 41958674 -139789413 - RMER17A2 LTR ERVK -263 643 1 6 905 902 352 52 6 chr2 41958896 41959239 -139788848 - MTE2b LTR MaLR -20 359 1 6 905 523 281 47 6 chr2 41960585 41960757 -139787330 + ORR1B1 LTR MaLR 1 179 -215 6 905 541 315 41 34 chr2 41960916 41961182 -139786905 + RLTR40 LTR ERVK 30 297 -520 6 905 657 306 85 48 chr2 41961278 41961690 -139786397 + RLTR40 LTR ERVK 303 729 -88 6 905 2150 82 139 12 chr2 41967555 41967901 -139780186 + RLTR10 LTR ERVK 1 390 0 6 905 411 271 0 0 chr2 41971243 41971339 -139776748 - RMER15 LTR ERVL -77 498 403 6 905 1217 284 43 14 chr2 41976462 41976918 -139771169 + MERVL_2A-int LTR ERVL 1689 2172 -3542 6 905 458 344 58 63 chr2 41978042 41978421 -139769666 + MLT1B LTR MaLR 1 377 -13 6 905 1845 178 35 40 chr2 41978781 41978829 -139769258 + RMER13A LTR ERVK 1 48 -812 6 905 1845 178 35 40 chr2 41979512 41979837 -139768250 + RMER13A LTR ERVK 49 372 -488 6 905 1476 206 197 9 chr2 41980383 41980804 -139767283 + RMER13A LTR ERVK 361 860 0 6 905 317 277 29 19 chr2 41988155 41988258 -139759829 + MLT1B LTR MaLR 281 384 -6 6 905 232 294 65 0 chr2 41988356 41988448 -139759639 + MLT1B-int LTR MaLR 263 360 -1011 6 905 297 323 40 8 chr2 41988585 41988710 -139759377 + MLT1B-int LTR MaLR 408 536 -835 6 905 226 111 200 0 chr2 41988745 41988790 -139759297 + MLT1B-int LTR MaLR 1192 1245 -244 6 905 416 357 16 32 chr2 41992560 41992748 -139755339 + MT2A LTR ERVL 246 430 -103 6 905 823 243 64 37 chr2 41996337 41996507 -139751580 + ORR1D1 LTR MaLR 1 179 -195 6 905 823 220 70 63 chr2 41996578 41996690 -139751397 + ORR1D1 LTR MaLR 178 319 -55 6 905 348 251 228 30 chr2 41996806 41996988 -139751099 - ORR1D1 LTR MaLR -144 230 3 6 905 319 224 3 0 chr2 41996988 41997062 -139751025 + ORR1D1 LTR MaLR 318 392 -2 6 905 304 231 33 42 chr2 42000268 42000386 -139747701 + MER57-int LTR ERV1 7156 7245 -292 2 905 937 298 86 15 chr2 42004782 42005106 -139742981 + MTC LTR MaLR 75 421 0 7 905 1498 168 38 106 chr2 42015793 42016133 -139731954 + ORR1A4 LTR MaLR 6 322 -7 2 905 542 372 47 13 chr2 42033527 42033761 -139714326 + MTE-int LTR MaLR 640 881 -699 5 905 915 320 170 10 chr2 42033755 42034143 -139713944 + MTE-int LTR MaLR 1003 1452 -128 5 905 320 310 34 27 chr2 42034430 42034576 -139713511 + MLT1B LTR MaLR 74 220 -170 5 905 1488 272 31 16 chr2 42039648 42040036 -139708051 + RLTR21 LTR ERVK 1 394 -1178 6 905 2214 221 55 65 chr2 42040157 42040835 -139707252 + RLTR21 LTR ERVK 419 1089 -483 6 905 498 223 83 28 chr2 42040868 42041042 -139707045 + RLTR21 LTR ERVK 1287 1454 -118 6 905 250 203 145 26 chr2 42045247 42045323 -139702764 - RLTR25B LTR ERVK -519 509 425 7 905 417 202 22 11 chr2 42047634 42047724 -139700363 + ORR1C2 LTR MaLR 294 384 0 7 905 287 309 147 49 chr2 42051916 42052202 -139695885 + MLT1-int LTR MaLR 18 331 -1040 7 905 3069 23 2 108 chr2 42055678 42056114 -139691973 - RLTR10 LTR ERVK 0 390 1 8 905 16643 27 4 13 chr2 42056116 42058089 -139689998 - RLTR10-int LTR ERVK -3 1984 1 8 905 3173 21 2 80 chr2 42058089 42058512 -139689575 - RLTR10 LTR ERVK 0 390 1 8 906 337 288 23 39 chr2 42081549 42081679 -139666408 + MTEa LTR MaLR 252 379 0 9 906 512 333 88 47 chr2 42084157 42084453 -139663634 + MLT1B LTR MaLR 77 384 -6 1 906 1763 130 86 0 chr2 42091211 42091512 -139656575 + IAPEY3_LTR LTR ERVK 1 327 -5 1 906 2494 223 33 20 chr2 42097928 42098469 -139649618 + RLTR20B1 LTR ERVK 1 548 -15 1 906 277 295 93 89 chr2 42102864 42103110 -139644977 + RLTR21 LTR ERVK 1033 1279 -293 1 906 1701 207 58 16 chr2 42109048 42109426 -139638661 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 1 906 906 283 52 24 chr2 42116038 42116328 -139631759 + RLTR16 LTR ERVK 1 298 -207 1 906 589 261 73 5 chr2 42124700 42124904 -139623183 + RLTR45 LTR ERVK 265 482 0 1 906 3209 116 119 30 chr2 42132535 42133167 -139614920 - RMER17D2 LTR ERVK -121 688 1 1 906 985 277 60 54 chr2 42134932 42135302 -139612785 + ORR1D1 LTR MaLR 3 374 0 1 906 365 329 89 19 chr2 42137045 42137259 -139610828 + MLT1B LTR MaLR 79 307 -83 1 906 312 355 89 19 chr2 42142751 42142909 -139605178 + MLT1A LTR MaLR 206 374 0 1 906 3260 46 5 0 chr2 42143594 42143988 -139604099 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 906 409 298 32 32 chr2 42145011 42145136 -139602951 + RMER20B LTR ERVK 1 125 -502 1 906 2778 84 8 18 chr2 42147138 42147538 -139600549 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 906 526 297 47 19 chr2 42167726 42167939 -139580148 + MLT1B LTR MaLR 45 263 -127 1 906 276 292 77 17 chr2 42168997 42169156 -139578931 + MLT1B LTR MaLR 453 621 -6 1 906 371 205 60 0 chr2 42174024 42174107 -139573980 + MTE2b LTR MaLR 1 88 -291 2 906 267 321 37 19 chr2 42174338 42174446 -139573641 + MTE2b LTR MaLR 76 185 -194 2 906 332 309 18 68 chr2 42174643 42174806 -139573281 + MLT1J LTR MaLR 212 366 -146 2 906 2168 219 10 5 chr2 42180605 42181014 -139567073 - MTC LTR MaLR -9 412 2 2 906 1107 298 51 16 chr2 42182507 42182879 -139565208 - MTD LTR MaLR -3 416 32 2 906 1754 149 42 62 chr2 42202604 42202940 -139545147 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 2 906 277 338 75 83 chr2 42204637 42204889 -139543198 + LTR85c LTR Gypsy? 434 683 -140 2 907 2314 226 62 63 chr2 42210423 42211024 -139537063 + RLTR18 LTR ERVK 16 615 -1 2 907 304 220 8 181 chr2 42222880 42223013 -139525074 + MT2B LTR ERVL 155 264 -337 2 907 585 241 186 5 chr2 42233770 42233958 -139514129 - MTD LTR MaLR -2 417 196 2 907 579 302 5 52 chr2 42234192 42234348 -139513739 - MTD LTR MaLR -209 210 64 2 907 737 287 25 30 chr2 42238553 42238790 -139509297 - MTD LTR MaLR -174 245 10 3 907 350 330 86 55 chr2 42239442 42239661 -139508426 + MTEb LTR MaLR 23 233 -146 3 907 700 270 23 11 chr2 42241858 42242034 -139506053 + ORR1E LTR MaLR 6 183 -176 3 907 340 318 35 36 chr2 42242054 42242282 -139505805 + ORR1E LTR MaLR 149 370 0 3 907 367 350 56 12 chr2 42244663 42244825 -139503262 + MTC LTR MaLR 30 198 -223 3 907 2168 116 29 15 chr2 42244881 42245030 -139503057 + MTB LTR MaLR 1 151 -249 3 907 1808 205 73 53 chr2 42245030 42245467 -139502620 + RLTR41 LTR ERV1 1 446 0 3 907 2168 116 29 15 chr2 42245467 42245657 -139502430 + MTB LTR MaLR 152 345 -55 3 907 1124 212 156 22 chr2 42245664 42245978 -139502109 + BGLII_B LTR ERVK 62 417 -24 3 907 580 272 69 34 chr2 42246221 42246396 -139501691 + MTD LTR MaLR 210 390 -29 3 907 944 306 72 24 chr2 42248074 42248449 -139499638 + MTD LTR MaLR 13 405 -14 3 907 1406 245 67 32 chr2 42253029 42253430 -139494657 + MTD LTR MaLR 1 415 -4 3 907 564 304 11 26 chr2 42265489 42265678 -139482409 + MTC-int LTR MaLR 205 390 -868 3 907 621 286 192 12 chr2 42265917 42266172 -139481915 + MTD LTR MaLR 115 415 -4 3 907 1652 224 124 72 chr2 42275659 42276477 -139471610 - RMER6C LTR ERVK -4 716 1 3 907 2481 77 3 0 chr2 42296324 42296663 -139451424 + ORR1A1 LTR MaLR 1 340 -6 3 907 324 320 236 0 chr2 42301555 42301733 -139446354 - MTD LTR MaLR -172 247 28 4 907 2697 108 8 2 chr2 42305219 42305617 -139442470 - MTB LTR MaLR 0 400 1 4 907 1001 286 11 8 chr2 42305836 42306251 -139441836 + MT2A LTR ERVL 19 561 -40 4 907 740 303 9 9 chr2 42306279 42306319 -139441768 + MT2A LTR ERVL 562 601 0 4 907 601 257 57 34 chr2 42318863 42319074 -139429013 - MTD LTR MaLR -14 405 201 4 907 232 292 0 44 chr2 42319106 42319174 -139428913 - MTD LTR MaLR -356 65 1 4 907 336 243 195 43 chr2 42319174 42319359 -139428728 - MTD-int LTR MaLR 0 1258 1046 4 907 1187 290 76 76 chr2 42319513 42320054 -139428033 - MTD-int LTR MaLR -227 1031 491 4 907 1697 261 21 46 chr2 42320229 42320710 -139427377 - MTD-int LTR MaLR -788 470 2 4 907 933 275 197 17 chr2 42320711 42321066 -139427021 - MTD LTR MaLR 0 419 1 4 908 1770 245 24 19 chr2 42339128 42339540 -139408547 + MTD LTR MaLR 1 414 -5 4 908 2286 257 55 103 chr2 42339552 42340698 -139407389 + MTD-int LTR MaLR 8 1258 0 4 908 1457 256 93 5 chr2 42340698 42341083 -139407004 + MTD LTR MaLR 1 419 0 4 908 268 140 0 20 chr2 42350290 42350341 -139397746 + RLTR41 LTR ERV1 172 221 -225 4 908 1463 198 205 16 chr2 42351864 42352239 -139395848 + RLTR41 LTR ERV1 1 446 0 4 908 1302 283 58 8 chr2 42354784 42355165 -139392922 + MTD LTR MaLR 18 417 -2 4 908 1637 242 59 32 chr2 42361777 42362186 -139385901 + MTC LTR MaLR 1 420 -1 4 908 820 320 27 24 chr2 42362417 42362551 -139385536 + ORR1E LTR MaLR 1 133 -226 4 908 820 320 27 24 chr2 42362571 42362734 -139385353 + ORR1E LTR MaLR 134 298 -61 4 908 2859 114 17 23 chr2 42363130 42363606 -139384481 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 473 -2 4 908 307 341 56 81 chr2 42373972 42374170 -139373917 + MTEb LTR MaLR 157 349 -30 4 908 268 314 38 132 chr2 42375843 42375970 -139372117 + MLT1E LTR MaLR 144 264 -389 4 908 268 314 38 132 chr2 42376383 42376468 -139371619 + MLT1E LTR MaLR 265 336 -317 4 908 991 298 49 36 chr2 42378098 42378463 -139369624 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 5 908 474 262 131 89 chr2 42391101 42391382 -139356705 + RMER4B LTR ERVK 339 583 -2 5 908 2133 214 91 16 chr2 42396218 42396735 -139351352 + RLTR12A LTR ERVK 1 556 -12 5 908 225 277 15 15 chr2 42396948 42397014 -139351073 + MLT1C LTR MaLR 24 89 -378 5 908 620 310 127 15 chr2 42398108 42398367 -139349720 + RMER15 LTR ERVL 274 561 -14 5 908 518 298 128 45 chr2 42439656 42439969 -139308118 - ORR1D2 LTR MaLR -7 363 25 5 908 422 348 91 71 chr2 42441685 42442081 -139306006 - MLT1D LTR MaLR -101 404 1 5 908 2131 109 10 0 chr2 42444906 42445217 -139302870 - ORR1A2 LTR MaLR -13 314 1 5 908 2068 214 17 12 chr2 42457486 42457897 -139290190 + MTC LTR MaLR 1 413 -8 5 908 868 259 134 3 chr2 42462893 42463222 -139284865 + RLTR42-int LTR ERVK 1116 1487 -4035 5 908 405 216 10 0 chr2 42463669 42463771 -139284316 + RLTR42-int LTR ERVK 2025 2127 -3395 5 908 435 297 59 25 chr2 42463758 42463996 -139284091 + RLTR42-int LTR ERVK 2331 2576 -3561 5 909 225 413 40 0 chr2 42478375 42478525 -139269562 + RMER12 LTR ERVK 695 850 -472 6 909 502 322 164 28 chr2 42493995 42494391 -139253696 - MT2A LTR ERVL -80 453 4 6 909 388 181 14 0 chr2 42523762 42523834 -139224253 + RLTR25A LTR ERVK 1019 1091 -12 2 909 4190 267 60 38 chr2 42532543 42533818 -139214269 - ORR1B2-int LTR MaLR -64 1306 4 3 909 954 199 268 3 chr2 42533825 42534112 -139213975 - ORR1B2 LTR MaLR -4 363 1 3 909 2867 142 9 63 chr2 42536380 42536820 -139211267 + RMER17A LTR ERVK 1 401 -350 4 909 2867 136 3 66 chr2 42536869 42537026 -139211061 + RMER17A LTR ERVK 402 552 -199 4 909 553 306 23 10 chr2 42544497 42544639 -139203448 + MTE2a LTR MaLR 10 142 -237 5 909 397 312 92 43 chr2 42544886 42545050 -139203037 + MTE2a LTR MaLR 174 345 -34 5 909 294 339 80 154 chr2 42544962 42545352 -139202735 - MTE2a LTR MaLR -15 364 4 5 909 1980 315 142 72 chr2 42546327 42547400 -139200687 + MTE-int LTR MaLR 116 1427 -153 6 909 863 271 106 35 chr2 42547844 42548192 -139199895 + MTE2a LTR MaLR 3 375 -4 6 909 254 284 131 22 chr2 42548650 42548787 -139199300 - MTE2a LTR MaLR -16 363 212 6 909 621 340 33 56 chr2 42548789 42549094 -139198993 - MTE2a LTR MaLR -81 298 1 6 909 1665 205 47 6 chr2 42564569 42564912 -139183175 + ORR1C1 LTR MaLR 1 357 -21 8 909 804 336 32 9 chr2 42565866 42566181 -139181906 + ORR1D2 LTR MaLR 1 322 -48 9 909 342 349 131 49 chr2 42570788 42571321 -139176766 + LTR80B LTR ERVL 2 578 -6 1 909 3123 267 72 38 chr2 42574248 42575159 -139172928 + ORR1D1-int LTR MaLR 413 1354 -16 1 909 1234 263 79 0 chr2 42575176 42575518 -139172569 + ORR1D1 LTR MaLR 6 374 0 1 909 1204 158 34 122 chr2 42585203 42585556 -139162531 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 322 0 1 909 752 319 71 8 chr2 42587756 42588009 -139160078 - ORR1D2 LTR MaLR -100 270 2 1 909 251 213 164 0 chr2 42593577 42593638 -139154449 - MTEb LTR MaLR -303 76 6 1 909 227 346 64 27 chr2 42593661 42593771 -139154316 - LTR33A LTR ERVL -318 202 89 1 909 2313 77 154 6 chr2 42596124 42596475 -139151612 + RLTR9D LTR ERVK 1 403 0 1 113 2094 180 12 42 chr2 42598390 42598820 -139149267 - MTC LTR MaLR 0 421 5 1 910 235 258 112 140 chr2 42599770 42599941 -139148146 - ORR1E LTR MaLR -3 367 209 1 910 247 330 33 11 chr2 42599989 42600081 -139148006 - ORR1E LTR MaLR -265 94 1 1 910 1686 233 185 40 chr2 42603011 42603530 -139144557 + RMER19B LTR ERVK 309 902 0 1 910 239 333 53 15 chr2 42605428 42605559 -139142528 + MLT1L LTR MaLR 460 595 -15 1 910 2956 21 0 0 chr2 42606228 42606565 -139141522 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 0 337 1 1 910 4441 123 70 14 chr2 42607884 42608179 -139139908 + RMER17D2 LTR ERVK 1 295 -514 1 910 4441 123 70 14 chr2 42608342 42608812 -139139275 + RMER17D2 LTR ERVK 296 809 0 1 910 538 340 51 73 chr2 42612050 42612323 -139135764 + MLT1C LTR MaLR 151 417 -50 1 910 1855 243 10 7 chr2 42622197 42622607 -139125480 + MTC LTR MaLR 1 411 -10 1 910 638 266 87 65 chr2 42632904 42633226 -139114861 - RLTR15 LTR ERVK -30 329 1 1 910 3699 229 33 33 chr2 42633229 42634211 -139113876 - MYSERV6-int LTR ERVK -3 8956 7975 1 910 288 191 107 64 chr2 42635566 42635706 -139112381 - MYSERV-int LTR ERVK -1085 5465 5320 1 910 268 291 22 65 chr2 42635706 42635798 -139112289 - RMER4B LTR ERVK -49 536 449 1 910 2365 291 39 47 chr2 42635814 42637294 -139110793 - MYSERV-int LTR ERVK -1790 4760 3797 1 910 410 281 88 132 chr2 42637973 42638338 -139109749 - RMER13A LTR ERVK -481 379 31 1 910 707 296 136 37 chr2 42645245 42645568 -139102519 + MTEb LTR MaLR 18 372 -7 1 910 1925 194 45 0 chr2 42650684 42651061 -139097026 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 1 910 279 130 39 13 chr2 42651825 42651903 -139096184 - RMER17C LTR ERVK -150 260 181 1 910 326 289 92 7 chr2 42653508 42653661 -139094426 - MLT1C LTR MaLR -299 168 3 1 910 374 324 182 8 chr2 42653971 42654192 -139093895 - MTE2b LTR MaLR -118 261 2 2 910 2116 179 40 31 chr2 42659514 42659964 -139088123 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 75 2 910 1437 194 55 103 chr2 42660943 42661323 -139086764 - ORR1B1 LTR MaLR -13 381 20 2 910 268 265 76 90 chr2 42663830 42663975 -139084112 - MLT1A1 LTR MaLR -19 389 247 2 910 413 325 9 0 chr2 42668388 42668502 -139079585 + MTEa LTR MaLR 7 121 -258 2 910 252 182 108 72 chr2 42668627 42668710 -139079377 + MLT2B1 LTR ERVL 480 565 -2 2 910 2327 213 157 3 chr2 42676918 42677226 -139070861 + RMER6C LTR ERVK 1 338 -352 2 910 3061 66 10 0 chr2 42677226 42677618 -139070469 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 910 2327 213 157 3 chr2 42677618 42677907 -139070180 + RMER6C LTR ERVK 339 690 0 2 910 1065 213 42 61 chr2 42677909 42678219 -139069868 - RMER6C LTR ERVK -114 576 273 2 910 335 306 79 24 chr2 42679087 42679251 -139068836 + MMERGLN-int LTR ERV1 2091 2263 -2427 2 910 855 355 44 51 chr2 42679514 42680658 -139067429 + MMERGLN-int LTR ERV1 2253 3813 -3743 2 910 1440 154 116 33 chr2 42680658 42680960 -139067127 + ORR1A4 LTR MaLR 3 329 0 2 910 309 342 81 37 chr2 42680960 42681389 -139066698 + MMERGLN-int LTR ERV1 4027 4290 -3311 2 910 534 124 22 0 chr2 42681922 42682011 -139066076 + RLTR22_Mur LTR ERVK 264 354 -1494 2 910 255 236 63 9 chr2 42682000 42682111 -139065976 + RLTR22_Mur LTR ERVK 652 768 -1080 2 910 6503 148 48 13 chr2 42683098 42684242 -139063845 - RLTR21 LTR ERVK -388 1184 1 2 910 330 244 12 0 chr2 42688142 42688224 -139059863 - ORR1D1 LTR MaLR 0 384 302 2 910 748 258 21 47 chr2 42690232 42690423 -139057664 - ORR1D1 LTR MaLR -188 186 1 2 910 771 225 11 15 chr2 42698390 42698576 -139049511 - MTC LTR MaLR -175 221 53 2 910 2184 212 58 46 chr2 42714373 42714912 -139033175 + RLTR20B3 LTR ERVK 1 545 -32 2 910 429 276 8 0 chr2 42716149 42716272 -139031815 + RMER3D-int LTR ERVK 1230 1353 -1489 2 910 1654 164 28 41 chr2 42716398 42716828 -139031259 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 270 737 -1589 2 910 2798 160 27 6 chr2 42716825 42717346 -139030741 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 888 1419 -907 2 910 340 309 23 64 chr2 42720980 42721153 -139026934 - MLT1B LTR MaLR -215 175 10 2 910 892 267 109 57 chr2 42723575 42723924 -139024163 - MT2A LTR ERVL -157 376 10 3 910 230 288 0 27 chr2 42726294 42726369 -139021718 + RLTR25A LTR ERVK 509 581 -522 3 910 2130 138 3 3 chr2 42728499 42728826 -139019261 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 3 911 1235 232 51 60 chr2 42731702 42732112 -139015975 - RMER19C LTR ERVK -1 610 153 3 911 923 233 27 110 chr2 42732124 42732423 -139015664 - RMER19C LTR ERVK -336 275 2 3 911 330 284 33 33 chr2 42742241 42742361 -139005726 + MLT1B LTR MaLR 31 150 -240 3 911 299 360 67 39 chr2 42742376 42742555 -139005532 + MLT1B LTR MaLR 205 388 -2 3 911 581 301 73 19 chr2 42743433 42743694 -139004393 - MER34 LTR ERV1 -240 302 28 3 911 724 237 165 16 chr2 42749571 42749820 -138998267 - MTE-int LTR MaLR -696 884 599 3 911 1915 202 57 85 chr2 42750688 42751147 -138996940 + RLTR41 LTR ERV1 1 446 0 3 911 1618 190 73 88 chr2 42754424 42754822 -138993265 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 55 3 911 636 338 73 87 chr2 42755210 42755579 -138992508 - MTD LTR MaLR -13 406 58 3 911 636 338 73 87 chr2 42755764 42755806 -138992281 - MTD LTR MaLR -362 57 2 3 911 1890 132 15 36 chr2 42756304 42756635 -138991452 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 6 3 911 1436 177 119 62 chr2 42758253 42758476 -138989611 + RMER17C LTR ERVK 1 233 -177 3 911 1436 177 119 62 chr2 42758645 42758807 -138989280 + RMER17C LTR ERVK 234 407 -3 3 911 1160 225 105 89 chr2 42758908 42759557 -138988530 - RLTR19-int LTR ERVK -2293 3844 3186 3 911 835 294 129 41 chr2 42759778 42760411 -138987676 - MYSERV6-int LTR ERVK -280 8679 8231 3 911 257 216 13 63 chr2 42760502 42760581 -138987506 - MYSERV6-int LTR ERVK -3810 2327 2253 3 911 420 330 78 107 chr2 42765344 42765680 -138982407 + MTE2a LTR MaLR 1 328 -51 3 911 420 330 78 107 chr2 42765709 42765756 -138982331 + MTE2a LTR MaLR 329 373 -6 3 911 260 312 104 67 chr2 42774549 42774683 -138973404 - RMER4B LTR ERVK -100 485 347 3 911 3530 329 47 50 chr2 42774739 42776823 -138971264 - RodERV21-int LTR ERV1 -198 4793 2718 3 911 367 196 0 35 chr2 42777147 42777260 -138970827 - RodERV21-int LTR ERV1 -1319 5772 5671 3 911 376 322 54 50 chr2 42777542 42777986 -138970101 - RodERV21-int LTR ERV1 -1985 5106 4870 3 911 559 333 52 38 chr2 42778635 42779131 -138968956 - RodERV21-int LTR ERV1 -3003 4088 3586 3 911 4185 276 16 23 chr2 42779254 42780342 -138967745 - RodERV21-int LTR ERV1 -2273 2718 1639 3 911 739 244 194 52 chr2 42780528 42780895 -138967192 - MTD LTR MaLR 0 419 1 3 911 2106 154 20 3 chr2 42783926 42784271 -138963816 + ORR1B1 LTR MaLR 44 394 0 3 911 2769 121 72 26 chr2 42836880 42837507 -138910580 + RMER17D LTR ERVK 1 889 0 4 911 1391 202 48 37 chr2 42839254 42839609 -138908478 - RLTR10D LTR ERVK 0 359 1 4 911 325 214 167 0 chr2 42842220 42842304 -138905783 - MTEb LTR MaLR -8 371 274 4 911 427 358 61 25 chr2 42842307 42842505 -138905582 - MTE2b-int LTR MaLR -825 755 551 4 911 1140 293 60 25 chr2 42844103 42844470 -138903617 - MTE2b-int LTR MaLR -1196 384 5 4 911 1105 290 44 44 chr2 42844481 42844845 -138903242 - MTE2b LTR MaLR -13 366 3 4 911 286 348 111 26 chr2 42848137 42848326 -138899761 - MLT1G LTR MaLR -97 494 290 4 911 284 233 80 23 chr2 42848363 42848451 -138899636 - MLT1G LTR MaLR -421 170 78 4 911 513 304 36 42 chr2 42849023 42849353 -138898734 - RLTR15 LTR ERVK -16 343 16 4 911 329 333 116 0 chr2 42849431 42849560 -138898527 - MT2A LTR ERVL -160 373 230 4 911 240 307 189 21 chr2 42849608 42849751 -138898336 - MTE2a LTR MaLR -207 172 6 4 911 4707 138 35 71 chr2 42851367 42852209 -138895878 + RLTR13D6 LTR ERVK 1 819 -83 4 911 3689 16 121 0 chr2 42852209 42852649 -138895438 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 4 911 4707 138 35 71 chr2 42852649 42852741 -138895346 + RLTR13D6 LTR ERVK 820 902 0 4 911 2190 234 39 53 chr2 42853094 42853711 -138894376 - RMER19C LTR ERVK -3 608 1 4 911 313 343 138 35 chr2 42859002 42859400 -138888687 - MER74A LTR ERVL -102 520 5 4 912 731 285 8 45 chr2 42865724 42866019 -138882068 + RLTR11B LTR ERVK 7 292 -235 5 912 500 270 22 60 chr2 42866123 42866308 -138881779 + RLTR11B LTR ERVK 261 438 -15 5 912 578 139 0 3 chr2 42872619 42872723 -138875364 + ORR1A2 LTR MaLR 3 104 -242 5 912 601 293 47 30 chr2 42884720 42884956 -138863131 + MLT1B LTR MaLR 6 245 -145 5 912 1216 314 24 52 chr2 42887860 42888563 -138859524 + MTC-int LTR MaLR 178 1049 -209 5 912 1191 214 153 12 chr2 42888630 42888956 -138859131 - ORR1D1 LTR MaLR -2 372 1 5 912 288 341 72 0 chr2 42890031 42890169 -138857918 + RLTR42-int LTR ERVK 1103 1250 -4272 5 912 3250 132 24 52 chr2 42900863 42901444 -138846643 + RMER2 LTR ERV1 3 567 0 5 912 279 311 86 29 chr2 42906540 42906679 -138841408 - MLT1B LTR MaLR -24 366 220 5 912 509 332 36 9 chr2 42907463 42907682 -138840405 + MLT1A1 LTR MaLR 184 408 0 5 912 334 317 136 45 chr2 42908015 42908213 -138839874 - MER110 LTR ERV1 -145 346 131 5 912 1591 163 64 22 chr2 42924190 42924503 -138823584 + ORR1A3 LTR MaLR 1 326 0 5 912 2253 201 191 14 chr2 42925173 42925758 -138822329 + RMER6C LTR ERVK 1 689 -1 5 912 2121 117 13 89 chr2 42926920 42927303 -138820784 + IAPEY2_LTR LTR ERVK 1 354 -3 5 912 1091 281 36 11 chr2 42939709 42939983 -138808104 - ORR1D2 LTR MaLR -11 359 79 6 912 730 339 54 18 chr2 42942546 42942825 -138805262 - MTE-int LTR MaLR -903 677 389 6 912 920 295 119 12 chr2 42942887 42943223 -138804864 - MTEa LTR MaLR 0 379 8 6 912 870 263 113 28 chr2 42943761 42943965 -138804122 - MTD LTR MaLR 0 419 196 6 912 870 263 113 28 chr2 42944536 42944613 -138803474 - MTD LTR MaLR -224 195 114 6 912 310 244 0 23 chr2 42946779 42946867 -138801220 + ORR1A2 LTR MaLR 1 86 -241 6 912 299 196 0 0 chr2 42946864 42946915 -138801172 + ORR1A2 LTR MaLR 344 394 0 6 912 1365 244 47 33 chr2 42949965 42950187 -138797900 - MERVL_2A-int LTR ERVL -49 5712 5483 6 912 1365 244 47 33 chr2 42950225 42950489 -138797598 - MERVL_2A-int LTR ERVL -279 5482 5219 6 912 404 332 98 14 chr2 42965378 42965592 -138782495 + MLT1B LTR MaLR 135 366 -24 6 912 975 167 159 49 chr2 42965647 42965784 -138782303 - RLTR25A LTR ERVK 0 1103 963 6 912 975 167 159 49 chr2 42965907 42966013 -138782074 - RLTR25A LTR ERVK -141 962 833 6 912 890 221 91 39 chr2 42966104 42966358 -138781729 - RLTR25A LTR ERVK -166 862 596 6 912 2482 181 116 38 chr2 42967274 42967591 -138780496 - RLTR25B LTR ERVK -378 650 328 6 912 1129 219 144 32 chr2 42967591 42967769 -138780318 + RMER17C LTR ERVK 1 180 -230 6 912 1129 219 144 32 chr2 42967943 42968133 -138779954 + RMER17C LTR ERVK 181 409 -1 6 912 2482 181 116 38 chr2 42968133 42968418 -138779669 - RLTR25B LTR ERVK -701 327 1 6 912 1826 120 80 0 chr2 42973026 42973325 -138774762 + IAPEY2_LTR LTR ERVK 35 357 0 6 912 1538 173 84 60 chr2 42979635 42980004 -138768083 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 6 912 1545 273 62 1 chr2 42982652 42983045 -138765042 - MTD LTR MaLR -14 405 1 6 912 502 211 0 37 chr2 42988549 42988657 -138759430 - MT2B LTR ERVL -344 257 154 6 912 282 218 87 16 chr2 42988657 42988670 -138759417 - ORR1B1-int LTR MaLR -755 749 620 6 14 1010 312 55 31 chr2 42991292 42991676 -138756411 - MT2A LTR ERVL -136 397 5 7 913 1090 268 56 24 chr2 42994316 42994656 -138753431 - ORR1D1 LTR MaLR -23 351 1 7 913 278 261 86 28 chr2 43010531 43010753 -138737334 - MurERV4-int LTR ERVK -3193 2974 2769 1 913 3172 153 97 22 chr2 43011635 43012275 -138735812 - RMER6C LTR ERVK 0 690 3 1 913 324 360 39 23 chr2 43015619 43015747 -138732340 + MER21B LTR ERV1 685 814 -49 1 913 621 324 42 57 chr2 43016133 43016486 -138731601 - ORR1E LTR MaLR -11 348 1 1 913 4675 178 63 21 chr2 43028875 43029972 -138718115 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 1131 2273 -53 2 913 2325 205 18 12 chr2 43030003 43030502 -138717585 + RLTR16 LTR ERVK 4 505 0 2 913 451 248 47 71 chr2 43034058 43034227 -138713860 + RLTR31_Mur LTR ERVK 389 553 0 3 913 1607 179 132 9 chr2 43038002 43038351 -138709736 - ORR1B1 LTR MaLR -2 392 1 3 913 1275 170 49 0 chr2 43041122 43041345 -138706742 - ORR1A3 LTR MaLR -92 234 1 3 913 2403 143 0 81 chr2 43041354 43041796 -138706291 + MT2B LTR ERVL 1 406 -195 4 913 2254 100 59 46 chr2 43077985 43078104 -138669983 - RLTR47_MM LTR ERV1 -87 445 322 9 913 2254 100 59 46 chr2 43078291 43078560 -138669527 - RLTR47_MM LTR ERV1 -211 321 52 9 913 572 315 19 19 chr2 43078684 43078946 -138669141 - RLTR6-int LTR ERV1 -70 7708 7447 9 913 640 56 34 0 chr2 43080332 43080421 -138667666 - MTB LTR MaLR 0 400 309 9 913 2388 73 12 3 chr2 43080557 43080885 -138667202 + MTA_Mm LTR MaLR 1 331 -65 9 913 1176 178 187 33 chr2 43082392 43082537 -138665550 + ORR1C2 LTR MaLR 2 172 -212 1 913 1176 178 187 33 chr2 43082567 43082752 -138665335 + ORR1C2 LTR MaLR 173 383 -1 1 913 3028 65 8 0 chr2 43083550 43083947 -138664140 + MTB LTR MaLR 1 400 0 1 913 1884 251 42 69 chr2 43084251 43084817 -138663270 - RMER15 LTR ERVL -22 553 3 1 913 784 267 44 10 chr2 43087518 43087722 -138660365 + ORR1D2 LTR MaLR 157 367 -3 1 913 518 333 61 86 chr2 43087725 43088004 -138660083 + ORR1D2-int LTR MaLR 1 272 -1098 1 913 2167 330 63 44 chr2 43088352 43089334 -138658753 + ORR1D2-int LTR MaLR 269 1269 -101 1 913 1088 313 54 6 chr2 43096046 43096380 -138651707 - ORR1E LTR MaLR -2 357 8 1 913 382 307 43 21 chr2 43096364 43096504 -138651583 - ORR1E-int LTR MaLR -30 1550 1408 1 913 1384 322 125 63 chr2 43096700 43097654 -138650433 - ORR1E-int LTR MaLR -155 1425 413 1 913 2595 129 0 43 chr2 43101637 43102058 -138646029 - MTB_Mm LTR MaLR -2 405 3 1 913 528 375 24 45 chr2 43102276 43102606 -138645481 - MLT1H-int LTR MaLR -988 421 99 1 913 531 338 139 21 chr2 43105497 43105835 -138642252 - MTE2a LTR MaLR -1 378 1 1 913 255 290 93 9 chr2 43107289 43107397 -138640690 + MLT2B4 LTR ERVL 368 484 -72 1 913 1826 226 25 15 chr2 43107663 43108063 -138640024 - MTD LTR MaLR -15 404 1 1 913 286 239 149 44 chr2 43108139 43108253 -138639834 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1 1847 1722 1 913 4865 188 53 11 chr2 43108356 43108614 -138639473 - RMER12 LTR ERVK -274 1048 772 1 913 4865 188 53 11 chr2 43108658 43109405 -138638682 - RMER12 LTR ERVK -551 771 3 1 913 2789 68 147 5 chr2 43116875 43117291 -138630796 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 1 914 2301 188 12 5 chr2 43125313 43125729 -138622358 - MTC LTR MaLR -2 419 1 1 914 958 328 23 29 chr2 43130454 43130762 -138617325 - MTD LTR MaLR -113 306 1 1 914 1846 93 52 0 chr2 43136399 43136697 -138611390 - ORR1A2 LTR MaLR -5 341 31 1 914 753 247 373 6 chr2 43137844 43138158 -138609929 + RMER15 LTR ERVL 147 575 0 1 914 464 301 173 0 chr2 43138853 43139026 -138609061 - MLT1D LTR MaLR -176 329 127 1 914 323 318 30 23 chr2 43139058 43139190 -138608897 + MLT1A LTR MaLR 35 167 -207 1 914 351 222 75 127 chr2 43143255 43143389 -138604698 + MT2A LTR ERVL 159 301 -232 1 914 2245 189 151 31 chr2 43145733 43146349 -138601738 + RMER6C LTR ERVK 1 690 0 1 914 490 143 24 0 chr2 43151354 43151438 -138596649 + ORR1D2 LTR MaLR 285 370 0 2 914 2038 271 22 39 chr2 43151438 43152022 -138596065 + ORR1D2-int LTR MaLR 1 574 -796 2 914 1260 250 28 9 chr2 43152161 43152484 -138595603 + ORR1D2-int LTR MaLR 1037 1365 -5 2 914 1031 287 79 20 chr2 43152497 43152838 -138595249 + ORR1D2 LTR MaLR 10 370 0 2 914 947 273 50 68 chr2 43154898 43155220 -138592867 + MTE2a LTR MaLR 64 379 0 2 914 267 262 15 15 chr2 43172123 43172189 -138575898 - MLT1K LTR MaLR -7 588 523 2 914 2606 164 35 16 chr2 43173624 43174138 -138573949 - RLTR28 LTR ERVL 0 524 1 2 914 1857 149 132 44 chr2 43184810 43184961 -138563126 + MTC LTR MaLR 1 150 -271 2 914 2719 34 158 0 chr2 43184961 43185316 -138562771 - IAPLTR2a LTR ERVK 0 411 1 2 914 1857 149 132 44 chr2 43185316 43185551 -138562536 + MTC LTR MaLR 151 421 0 2 914 546 331 52 66 chr2 43194876 43195303 -138552784 + MLT1C LTR MaLR 42 462 -5 2 914 1050 248 122 61 chr2 43195441 43195836 -138552251 - MTD LTR MaLR 0 419 1 2 914 1774 198 44 3 chr2 43202313 43202673 -138545414 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 4 2 914 302 209 119 0 chr2 43203224 43203291 -138544796 - ORR1C1-int LTR MaLR -334 1175 1101 2 914 1798 259 55 80 chr2 43212173 43212871 -138535216 - ORR1C1-int LTR MaLR -424 1156 360 2 914 1072 247 52 68 chr2 43212879 43213205 -138534882 - MT2B LTR ERVL 0 601 281 2 914 446 149 68 11 chr2 43213184 43213272 -138534815 + ORR1C2 LTR MaLR 290 382 -2 2 914 296 219 0 0 chr2 43213272 43213336 -138534751 + ORR1C2-int LTR MaLR 1 64 -1445 2 914 1550 184 6 22 chr2 43213336 43213652 -138534435 + MERVL_2A-int LTR ERVL 5362 5672 -89 2 914 1283 261 133 45 chr2 43214672 43215314 -138532773 - RMER13A LTR ERVK -93 767 1 2 914 359 355 42 14 chr2 43219713 43219856 -138528231 - MTE2b LTR MaLR -193 186 40 2 914 235 288 0 43 chr2 43219827 43219896 -138528191 - MTE2b LTR MaLR -275 104 39 2 914 1976 156 29 174 chr2 43222695 43223217 -138524870 + RLTR41 LTR ERV1 1 446 0 2 914 2563 192 51 22 chr2 43223250 43223797 -138524290 - RLTR20B1 LTR ERVK 0 563 1 2 914 406 311 27 27 chr2 43224330 43224617 -138523470 + RLTR4_MM-int LTR ERV1 416 780 -6821 2 914 1925 308 63 46 chr2 43224934 43226239 -138521848 + RLTR4_MM-int LTR ERV1 1145 2471 -5130 2 914 693 232 157 34 chr2 43226270 43226448 -138521639 + RMER15 LTR ERVL 236 435 -140 2 914 886 218 40 0 chr2 43226446 43226620 -138521467 - RLTR28B LTR ERVL -288 193 13 2 914 2427 163 48 9 chr2 43226720 43227179 -138520908 + RLTR28 LTR ERVL 37 513 -11 2 914 1175 204 26 24 chr2 43227418 43227777 -138520310 - RMER10B LTR ERVL 0 398 3 2 914 1832 205 34 43 chr2 43230811 43231229 -138516858 + RLTR31A_Mm LTR ERVK 1 414 -170 3 914 511 334 44 56 chr2 43239810 43240130 -138507957 + LTR73 LTR ERV1 36 351 -221 3 914 407 309 48 99 chr2 43240582 43240951 -138507136 - MLT1D LTR MaLR -258 369 5 3 914 1890 121 25 19 chr2 43246693 43247013 -138501074 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 3 914 324 351 80 36 chr2 43247678 43247929 -138500158 - ORR1E LTR MaLR -1 358 97 3 914 294 277 33 78 chr2 43247954 43248107 -138499980 - MLT2B3 LTR ERVL -368 147 2 3 914 505 338 75 38 chr2 43250097 43250847 -138497240 + MuRRS4-int LTR ERV1 2764 3527 -4251 3 914 333 293 41 41 chr2 43251097 43251311 -138496776 + MuRRS4-int LTR ERV1 2763 2953 -2110 3 914 510 281 27 7 chr2 43251780 43252045 -138496042 + MuRRS4-int LTR ERV1 3527 3729 -1334 3 914 339 316 18 0 chr2 43252198 43252312 -138495775 + MuRRS4-int LTR ERV1 5486 5589 -2012 3 914 394 239 102 22 chr2 43253006 43253143 -138494944 + RNERVK23-int LTR ERVK 7411 7558 -659 3 914 433 241 2 3 chr2 43253043 43253166 -138494921 + RLTR6-int LTR ERV1 7379 7476 -302 3 914 1429 186 202 19 chr2 43253288 43253650 -138494437 + RLTR23 LTR ERV1 1 428 -2 3 114 1923 201 180 99 chr2 43253673 43254394 -138493693 + RLTR22_Mus LTR ERVK 476 1266 -542 3 915 1923 201 180 99 chr2 43254441 43254640 -138493447 + RLTR22_Mus LTR ERVK 1267 1471 -337 3 915 479 280 189 46 chr2 43254978 43255259 -138492828 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1510 1830 -18 3 915 247 373 41 65 chr2 43259878 43260047 -138488040 + RMER4A LTR ERVK 6 170 -296 3 915 455 221 35 0 chr2 43272262 43272375 -138475712 + RMER10A LTR ERVL 280 396 -46 3 915 323 364 66 68 chr2 43273333 43273743 -138474344 + LTR40b LTR ERVL 5 413 -49 3 915 400 334 109 42 chr2 43274184 43274496 -138473591 + MLT1B LTR MaLR 50 382 -8 3 915 2825 19 22 0 chr2 43277364 43277684 -138470403 + IAPLTR2b LTR ERVK 1 327 0 3 915 235 282 23 34 chr2 43282538 43282626 -138465461 - MTE2a LTR MaLR -15 364 278 3 915 232 258 30 15 chr2 43283201 43283268 -138464819 - ORR1D1 LTR MaLR -299 75 8 3 915 1325 272 70 8 chr2 43291454 43291839 -138456248 - MTC LTR MaLR 0 421 13 3 915 2281 237 108 73 chr2 43296059 43296827 -138451260 - RMER13A LTR ERVK -64 796 2 3 915 2673 153 26 26 chr2 43296855 43297351 -138450736 + ORR1A3-int LTR MaLR 6 501 -1462 3 915 3012 26 2 89 chr2 43299240 43299667 -138448420 - RLTR10 LTR ERVK 0 390 1 4 915 627 331 84 15 chr2 43299772 43300045 -138448042 + RLTR18B LTR ERVK 110 401 -111 4 915 1222 285 42 52 chr2 43300599 43300818 -138447269 + MTE2a LTR MaLR 18 251 -168 4 915 2283 156 23 3 chr2 43300818 43301204 -138446883 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 4 915 1222 266 25 46 chr2 43301204 43301381 -138446706 + MTE2a LTR MaLR 204 379 0 4 915 297 184 127 38 chr2 43301582 43301661 -138446426 - RLTR25A LTR ERVK -521 582 497 4 915 1225 314 8 45 chr2 43304026 43304406 -138443681 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 5 4 915 956 256 63 97 chr2 43312667 43313017 -138435070 - MTE2a LTR MaLR -41 338 1 4 915 1320 278 52 3 chr2 43313667 43314014 -138434073 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 7 4 915 1199 202 36 75 chr2 43320024 43320427 -138427660 + ORR1D1 LTR MaLR 18 378 0 4 915 1546 199 128 155 chr2 43321223 43321468 -138426619 - MT2A LTR ERVL 0 533 284 4 915 1868 162 41 0 chr2 43321468 43321782 -138426305 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 4 915 1546 199 128 155 chr2 43321782 43322084 -138426003 - MT2A LTR ERVL -250 283 1 4 915 1883 193 76 51 chr2 43323455 43323484 -138424603 - RLTR11A2 LTR ERVK 0 527 494 4 915 1883 193 76 51 chr2 43323631 43324115 -138423972 - RLTR11A2 LTR ERVK -34 493 1 4 915 498 349 53 68 chr2 43334747 43334980 -138413107 + MER88 LTR ERVL 29 264 -200 4 915 498 349 53 68 chr2 43335086 43335246 -138412841 + MER88 LTR ERVL 265 415 -49 4 915 587 347 92 30 chr2 43338390 43338726 -138409361 + MLT1D LTR MaLR 32 388 -117 4 915 529 288 69 102 chr2 43340318 43340623 -138407464 + ORR1E LTR MaLR 48 342 -17 4 915 1835 236 92 82 chr2 43347222 43347808 -138400279 - RMER19C LTR ERVK -19 592 1 4 915 743 300 117 44 chr2 43349060 43349471 -138398616 - RMER13A LTR ERVK -406 454 14 4 915 4655 167 140 11 chr2 43349897 43350884 -138397203 - RLTR13D3 LTR ERVK 0 1114 1 4 915 520 267 90 25 chr2 43355156 43355227 -138392860 + MT2B LTR ERVL 285 368 -233 4 915 520 267 90 25 chr2 43355294 43355422 -138392665 + MT2B LTR ERVL 369 497 -104 4 915 1101 193 64 5 chr2 43375737 43375956 -138372131 + MTC LTR MaLR 4 235 -186 5 915 311 230 180 0 chr2 43375961 43376061 -138372026 + RLTR11B LTR ERVK 3 120 -333 5 915 1776 225 62 15 chr2 43380495 43380884 -138367203 - MTC LTR MaLR -10 411 5 5 915 645 274 135 59 chr2 43382832 43383173 -138364914 - RLTR9A LTR ERVK 0 368 2 5 916 585 326 42 21 chr2 43385154 43385392 -138362695 + MER34A LTR ERV1 10 252 -319 5 916 293 354 23 8 chr2 43385409 43385540 -138362547 + MER34A LTR ERV1 432 564 -7 5 916 2115 171 32 3 chr2 43387536 43387911 -138360176 + ORR1B1 LTR MaLR 1 386 -8 5 916 747 246 28 77 chr2 43389685 43389932 -138358155 + RMER10B LTR ERVL 119 353 -45 5 916 813 122 107 0 chr2 43391621 43391752 -138356335 + ORR1A2 LTR MaLR 1 145 -182 5 916 516 306 108 19 chr2 43392375 43392588 -138355499 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 177 5 916 550 326 54 99 chr2 43393188 43393543 -138354544 - MLT-int LTR MaLR -1 1734 1386 5 916 550 326 54 99 chr2 43393691 43393740 -138354347 - MLT-int LTR MaLR -350 1385 1348 5 916 270 301 122 22 chr2 43397419 43397723 -138350364 - ORR1D2 LTR MaLR -1 369 5 5 916 1378 345 57 96 chr2 43398062 43399073 -138349014 - MLT-int LTR MaLR -629 1106 135 5 916 445 309 78 104 chr2 43399308 43399615 -138348472 - MLT1A0 LTR MaLR -52 313 15 5 916 226 254 117 146 chr2 43400405 43400576 -138347511 - RLTR25A LTR ERVK -1 1102 937 5 916 397 280 68 119 chr2 43401444 43401663 -138346424 - RLTR25A LTR ERVK -895 208 1 5 916 364 338 66 0 chr2 43406312 43406448 -138341639 - RMER15-int LTR ERVL -338 4661 4517 5 916 567 305 38 5 chr2 43406652 43406863 -138341224 - RMER15-int LTR ERVL -633 4366 4149 5 916 752 291 83 93 chr2 43407076 43407491 -138340596 - MTE2a LTR MaLR 0 419 2 5 916 230 278 101 34 chr2 43414149 43414268 -138333819 - MLT1M LTR MaLR -313 359 233 5 916 3245 155 86 8 chr2 43422616 43423289 -138324798 - RMER6A LTR ERVK 0 756 30 5 916 1121 233 146 7 chr2 43425500 43425802 -138322285 - ORR1D1 LTR MaLR -22 352 9 5 916 2349 178 22 13 chr2 43430729 43431185 -138316902 - RLTR16 LTR ERVK -45 460 1 6 916 1883 187 118 94 chr2 43432218 43432720 -138315367 - RMER20A LTR ERVK -1 515 2 6 916 358 329 25 43 chr2 43434593 43434755 -138313332 - ORR1E LTR MaLR -167 192 34 6 916 916 310 43 17 chr2 43434767 43435069 -138313018 - MTE-int LTR MaLR -43 1537 1228 6 916 945 326 153 70 chr2 43435213 43435990 -138312097 - MTE-int LTR MaLR -358 1222 381 6 916 1308 166 67 64 chr2 43439619 43439993 -138308094 - RMER17C LTR ERVK 0 410 36 6 916 409 311 16 0 chr2 43444384 43444506 -138303581 - MTEa LTR MaLR 0 379 256 6 916 350 261 92 0 chr2 43444618 43444737 -138303350 - MTEa LTR MaLR -209 150 21 6 916 1173 213 134 47 chr2 43446126 43446446 -138301641 + ORR1D1 LTR MaLR 13 360 -14 6 916 703 241 139 35 chr2 43450207 43450409 -138297678 - RMER15 LTR ERVL -78 497 275 6 916 318 247 21 198 chr2 43450408 43450595 -138297492 - RMER15 LTR ERVL -416 159 6 6 916 2500 74 6 0 chr2 43461636 43461961 -138286126 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 6 916 330 344 38 15 chr2 43463298 43463431 -138284656 - MLT1A1 LTR MaLR -264 144 9 6 916 3607 186 45 53 chr2 43465517 43466333 -138281754 - RLTR40 LTR ERVK 0 817 8 6 916 902 281 73 116 chr2 43470671 43471207 -138276880 + RLTR12B LTR ERVK 11 523 -5 6 916 785 296 56 68 chr2 43479345 43479758 -138268329 + RMER5 LTR ERV1 1 408 -126 6 916 998 238 94 13 chr2 43507407 43507705 -138240382 - MTC-int LTR MaLR -858 400 79 1 916 2161 204 12 7 chr2 43507717 43508127 -138239960 + MTC LTR MaLR 1 412 -9 1 916 750 196 161 0 chr2 43508194 43508362 -138239725 - MTD LTR MaLR -2 417 223 1 916 598 202 9 0 chr2 43508347 43508456 -138239631 - MTD LTR MaLR -309 110 1 1 916 3086 61 10 2 chr2 43509783 43510176 -138237911 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 917 806 185 26 110 chr2 43517279 43517552 -138230535 - RLTR42-int LTR ERVK -2474 3663 3414 2 917 306 228 4 10 chr2 43517762 43517859 -138230228 - RLTR42-int LTR ERVK -1059 2179 2107 2 917 733 190 83 127 chr2 43518711 43519052 -138229035 - RLTR42-int LTR ERVK -3085 3052 2768 2 917 496 275 95 54 chr2 43519058 43519300 -138228787 - RLTR42-int LTR ERVK -3556 2581 2330 2 917 1135 159 57 19 chr2 43519275 43519538 -138228549 - RLTR42-int LTR ERVK -3380 2142 1870 2 917 1395 284 76 62 chr2 43519964 43520583 -138227504 - MTC-int LTR MaLR -47 1211 459 2 917 460 164 13 91 chr2 43520584 43520738 -138227349 - RLTR42-int LTR ERVK -4978 1159 1018 2 917 692 255 69 10 chr2 43521867 43522069 -138226018 - RLTR42-int LTR ERVK -4184 1338 1125 2 917 420 329 160 19 chr2 43525123 43525155 -138222932 - RMER15 LTR ERVL 0 575 540 3 917 420 329 160 19 chr2 43525190 43525464 -138222623 - RMER15 LTR ERVL -36 539 227 3 917 2718 158 53 22 chr2 43531936 43532479 -138215608 - RLTR31_Mm LTR ERVK -1 560 1 4 917 364 330 193 0 chr2 43533011 43533187 -138214900 + ORR1E LTR MaLR 5 214 -145 5 917 1624 218 65 22 chr2 43538610 43538981 -138209106 + MTD LTR MaLR 3 389 -30 6 917 1114 253 125 20 chr2 43539308 43539659 -138208428 - MTD LTR MaLR -31 388 1 6 917 1194 195 201 42 chr2 43539635 43540087 -138208000 + RLTR28 LTR ERVL 1 524 0 6 917 227 307 0 39 chr2 43541461 43541539 -138206548 + MTEa LTR MaLR 74 148 -211 6 917 345 188 0 14 chr2 43541568 43541638 -138206449 + MTEa LTR MaLR 309 377 -2 6 917 1254 158 186 19 chr2 43541940 43542198 -138205889 + ORR1B1 LTR MaLR 82 382 -12 7 917 1896 236 110 40 chr2 43542206 43543128 -138204959 + ORR1B1-int LTR MaLR 1 985 -978 7 917 1263 211 118 53 chr2 43544505 43544860 -138203227 - RLTR14 LTR ERV1 0 382 5 7 917 2196 186 24 7 chr2 43549558 43549969 -138198118 - MTC LTR MaLR -3 418 1 7 917 2732 95 30 5 chr2 43553551 43553952 -138194135 - RLTR10A LTR ERVK 0 411 1 8 917 1623 189 47 16 chr2 43558893 43559211 -138188876 - ORR1B2 LTR MaLR -39 328 1 9 917 699 354 160 6 chr2 43560154 43560498 -138187589 + MLT1H1 LTR MaLR 38 434 -121 9 917 896 208 172 85 chr2 43561576 43561918 -138186169 + ORR1D1 LTR MaLR 1 372 -2 9 917 3567 182 106 91 chr2 43562670 43563160 -138184927 - RMER17B LTR ERVK 0 958 434 9 917 3567 182 106 91 chr2 43563240 43563319 -138184768 - RMER17B LTR ERVK -525 433 403 9 917 3567 182 106 91 chr2 43563575 43563947 -138184140 - RMER17B LTR ERVK -556 402 2 9 917 275 362 87 17 chr2 43569210 43569497 -138178590 - MLT1E2 LTR MaLR -180 325 20 1 917 284 385 50 37 chr2 43583795 43584092 -138163995 - LTR40a LTR ERVL -148 371 71 1 917 2153 129 6 0 chr2 43586928 43587245 -138160842 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 1 917 1759 194 28 34 chr2 43587806 43588164 -138159923 - ORR1C1 LTR MaLR -20 358 3 1 917 515 210 57 108 chr2 43590280 43590315 -138157772 + MTC LTR MaLR 13 48 -373 1 917 4089 131 129 44 chr2 43590315 43591060 -138157027 - RLTR13C2 LTR ERVK 0 808 1 1 917 515 210 57 108 chr2 43591060 43591200 -138156887 + MTC LTR MaLR 49 179 -242 1 917 321 341 72 60 chr2 43591992 43592413 -138155674 - RLTR16 LTR ERVK -185 507 32 1 917 253 265 285 15 chr2 43597372 43597551 -138150536 - MLT1A LTR MaLR -84 290 65 1 917 1507 62 0 46 chr2 43599715 43599933 -138148154 - MTB LTR MaLR 0 400 193 1 917 1084 69 0 7 chr2 43599892 43600038 -138148049 + MTA_Mm LTR MaLR 252 396 0 1 917 7256 90 64 72 chr2 43600038 43601145 -138146942 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 1 917 3242 64 2 5 chr2 43601145 43601538 -138146549 + MTA_Mm LTR MaLR 1 392 -4 1 917 316 109 0 0 chr2 43601814 43601860 -138146227 + ORR1C2 LTR MaLR 59 104 -270 1 917 800 242 63 39 chr2 43602146 43602352 -138145735 + ORR1C2 LTR MaLR 172 382 -2 1 917 743 210 85 1 chr2 43602749 43602915 -138145172 + ORR1C2 LTR MaLR 159 381 -3 1 917 970 311 22 43 chr2 43610744 43611114 -138136973 - MTE2a LTR MaLR -2 377 16 1 917 288 177 65 0 chr2 43613021 43613083 -138135004 - ORR1D1 LTR MaLR -8 376 311 1 917 1083 214 31 137 chr2 43614257 43614408 -138133679 - ORR1D1 LTR MaLR -55 319 177 1 917 1083 214 31 137 chr2 43614499 43614704 -138133383 - ORR1D1 LTR MaLR -198 176 1 1 917 255 333 112 14 chr2 43617066 43617209 -138130878 + ORR1E LTR MaLR 36 192 -167 1 917 1258 298 63 3 chr2 43631413 43631777 -138116310 - MTD LTR MaLR -14 405 20 2 918 1773 186 170 25 chr2 43651494 43651930 -138096157 + RLTR24 LTR ERV1 31 529 0 2 918 3073 66 2 15 chr2 43653068 43653469 -138094618 - MTB LTR MaLR -4 396 1 2 918 331 403 72 27 chr2 43657370 43657592 -138090495 - MLT1G1 LTR MaLR -182 397 166 2 918 722 277 108 34 chr2 43669040 43669391 -138078696 + MTE2a LTR MaLR 3 379 0 2 918 742 325 75 47 chr2 43680535 43680978 -138067109 - MT2A LTR ERVL -78 455 1 2 918 283 341 196 40 chr2 43680981 43681277 -138066810 - MLT1G3-int LTR MaLR -95 1292 951 2 918 344 302 161 55 chr2 43682877 43683168 -138064919 - MLT1G3-int LTR MaLR -458 929 608 2 918 575 371 93 45 chr2 43683524 43683995 -138064092 - MLT1G3 LTR MaLR -51 544 51 2 918 414 312 64 50 chr2 43684321 43684540 -138063547 - MLT1E1 LTR MaLR -11 643 422 2 918 506 266 116 32 chr2 43694965 43695269 -138052818 + ORR1D2 LTR MaLR 1 359 -11 2 918 294 226 11 106 chr2 43696257 43696351 -138051736 - MTEb LTR MaLR -293 86 2 2 918 261 244 82 30 chr2 43708767 43708902 -138039185 + ORR1B1-int LTR MaLR 613 754 -755 3 918 317 303 78 68 chr2 43716321 43716512 -138031575 - MLT1A0 LTR MaLR -15 350 158 3 918 1814 133 25 0 chr2 43717422 43717707 -138030380 - ORR1A2 LTR MaLR -35 292 1 3 918 1676 166 105 3 chr2 43720502 43720834 -138027253 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 2 3 918 1236 224 150 58 chr2 43720890 43721236 -138026851 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 3 918 237 359 94 66 chr2 43731329 43731767 -138016320 - LTR16D1 LTR ERVL -54 597 148 3 918 1585 202 72 19 chr2 43733345 43733719 -138014368 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 3 918 1270 239 134 8 chr2 43734162 43734513 -138013574 + MTD LTR MaLR 23 417 -2 3 918 1670 227 28 58 chr2 43757131 43757561 -137990526 + MTD LTR MaLR 3 419 0 3 918 1900 155 23 0 chr2 43773828 43774170 -137973917 + RLTR15 LTR ERVK 6 355 -4 3 919 1881 142 9 75 chr2 43778089 43778438 -137969649 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 3 919 1124 258 89 35 chr2 43778678 43779047 -137969040 + MTD LTR MaLR 3 391 -28 3 919 664 255 50 30 chr2 43787265 43787467 -137960620 - RLTR16 LTR ERVK -299 206 1 3 919 1510 232 95 18 chr2 43794249 43794640 -137953447 + MTC LTR MaLR 1 421 0 4 919 252 366 83 42 chr2 43800472 43800737 -137947350 - MLT1E LTR MaLR 0 653 378 4 919 880 277 46 46 chr2 43811054 43811334 -137936753 - ORR1E LTR MaLR -18 341 62 4 919 1532 193 96 6 chr2 43815487 43815820 -137932267 + ORR1B2 LTR MaLR 5 367 0 4 919 580 227 170 20 chr2 43816240 43816328 -137931759 - ORR1B2 LTR MaLR -102 265 178 4 919 580 227 170 20 chr2 43816361 43816425 -137931662 - ORR1B2 LTR MaLR -190 177 91 4 919 1481 187 120 12 chr2 43826671 43827037 -137921050 - MTD LTR MaLR -12 407 8 4 919 444 271 193 115 chr2 43866386 43866811 -137881276 - MLT1C LTR MaLR -9 458 1 4 919 1357 175 149 108 chr2 43882126 43882543 -137865544 - BGLII_B LTR ERVK 0 441 8 4 919 3547 13 0 0 chr2 43903825 43904221 -137843866 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 920 4292 147 70 110 chr2 43909773 43910850 -137837237 + MTB_Mm-int LTR MaLR 225 1258 0 5 920 1294 67 179 0 chr2 43910850 43911045 -137837042 + MTB_Mm LTR MaLR 1 230 -177 5 920 1558 220 32 3 chr2 43925815 43926130 -137821957 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 71 5 920 960 275 121 16 chr2 43929112 43929426 -137818661 - MTD LTR MaLR -55 364 18 5 920 1368 235 80 27 chr2 43939801 43940291 -137807796 - RLTR11A2 LTR ERVK -25 502 10 5 920 1567 232 53 24 chr2 43946046 43946421 -137801666 + MTD LTR MaLR 34 419 0 5 920 409 226 92 53 chr2 43946661 43946792 -137801295 - MLT1E3 LTR MaLR -425 199 64 5 920 429 252 20 73 chr2 43946688 43946838 -137801249 - MLT2C1 LTR ERVL -255 142 1 5 920 2506 86 0 0 chr2 43948502 43948829 -137799258 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 5 920 291 127 17 83 chr2 43952269 43952329 -137795758 - RLTR25B LTR ERVK 0 1103 1048 5 920 1743 57 26 0 chr2 43952318 43952548 -137795539 - RMER17D LTR ERVK -653 236 1 5 920 4119 153 97 15 chr2 43952548 43953378 -137794709 - RLTR25B LTR ERVK -44 1059 3 5 920 1173 279 33 43 chr2 43953611 43954005 -137794082 - MTE2a LTR MaLR -14 405 6 5 920 1018 267 40 102 chr2 43954273 43954677 -137793410 - MTEb LTR MaLR 0 379 1 5 920 261 248 35 0 chr2 43957113 43957128 -137790959 + ORR1B1-int LTR MaLR 631 649 -860 6 920 236 315 103 64 chr2 44016037 44016193 -137731894 + MLT1C LTR MaLR 204 365 -102 1 14 654 284 154 74 chr2 44040088 44040563 -137707524 - MLT1F2 LTR MaLR -14 546 34 4 921 3964 111 26 30 chr2 44041920 44042523 -137705564 - MT2B LTR ERVL 0 601 1 5 921 530 317 82 30 chr2 44043288 44043519 -137704568 + MTD LTR MaLR 18 260 -159 5 921 450 220 66 18 chr2 44043570 44043717 -137704370 + MTD LTR MaLR 223 379 0 5 921 3435 30 0 0 chr2 44057490 44057886 -137690201 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 921 319 315 180 71 chr2 44067616 44067910 -137680177 - MLT1A0 LTR MaLR -39 326 1 8 921 273 256 24 70 chr2 44082844 44082984 -137665103 - MLT1A LTR MaLR -25 442 259 9 921 1467 188 123 9 chr2 44083057 44083374 -137664713 + MTC LTR MaLR 1 353 -68 9 921 394 203 0 13 chr2 44083461 44083536 -137664551 + MTC LTR MaLR 348 421 0 9 921 327 259 126 126 chr2 44091937 44092047 -137656040 - MLT1B LTR MaLR -34 356 232 1 921 327 259 126 126 chr2 44092120 44092270 -137655817 - MLT1B LTR MaLR -159 231 96 1 921 400 237 183 17 chr2 44100717 44100833 -137647254 + MLT1A0 LTR MaLR 21 156 -209 1 921 277 353 50 16 chr2 44101270 44101391 -137646696 + MLT1A0 LTR MaLR 143 267 -98 1 921 581 303 78 75 chr2 44102512 44102794 -137645293 - ORR1E LTR MaLR -91 283 1 1 921 304 274 151 54 chr2 44102938 44103104 -137644983 + LTR33A_ LTR ERVL 337 518 -13 1 921 253 364 11 0 chr2 44108360 44108448 -137639639 - MLT1D LTR MaLR -119 508 420 1 921 395 282 0 0 chr2 44108637 44108722 -137639365 - MLT1D LTR MaLR -408 97 13 1 921 288 275 10 99 chr2 44112561 44112662 -137635425 + MTEa LTR MaLR 1 92 -287 1 921 323 242 138 44 chr2 44114311 44114471 -137633616 - MLT1A LTR MaLR -4 370 196 1 921 288 330 11 0 chr2 44114500 44114588 -137633499 - MLT1A LTR MaLR -282 92 4 1 921 1766 239 18 15 chr2 44117632 44118023 -137630064 - MTD LTR MaLR -8 411 20 1 921 2083 198 17 12 chr2 44119571 44119990 -137628097 - MTC LTR MaLR 0 421 1 1 921 239 283 128 21 chr2 44122493 44122587 -137625500 - MLT1A1 LTR MaLR -2 406 303 1 921 472 242 108 15 chr2 44122732 44122894 -137625193 - MLT1A1 LTR MaLR -186 179 1 1 921 1210 292 36 0 chr2 44124001 44124336 -137623751 - MTEb LTR MaLR -5 374 28 1 921 256 244 43 22 chr2 44125072 44125164 -137622923 - MER34 LTR ERV1 -66 476 383 1 921 755 244 24 43 chr2 44139046 44139256 -137608831 + MTEa LTR MaLR 174 379 0 1 921 1301 219 42 63 chr2 44144548 44144929 -137603158 + ORR1D1 LTR MaLR 2 374 0 1 921 329 283 8 12 chr2 44147385 44147465 -137600622 - MLT1D LTR MaLR -106 399 333 1 921 2397 182 7 12 chr2 44147484 44147895 -137600192 - MTC LTR MaLR -12 409 1 1 921 519 339 38 21 chr2 44147895 44148125 -137599962 - MLT1D LTR MaLR -226 279 46 1 921 452 336 71 62 chr2 44150056 44150364 -137597723 - MLT1A0 LTR MaLR -54 311 1 1 922 2264 201 17 2 chr2 44175576 44175990 -137572097 - MTC LTR MaLR -1 420 1 2 922 243 247 91 0 chr2 44176878 44176955 -137571132 - MLT1J1 LTR MaLR -289 155 72 2 922 241 326 113 21 chr2 44204843 44204940 -137543147 - MLT1K LTR MaLR -463 132 27 2 922 294 291 40 95 chr2 44207994 44208142 -137539945 - LTR85a LTR Gypsy? -547 155 16 2 922 291 287 54 27 chr2 44210229 44210340 -137537747 + ORR1E LTR MaLR 246 359 0 2 922 1364 214 103 60 chr2 44221945 44222343 -137525744 + MTD LTR MaLR 5 419 0 2 922 342 382 92 12 chr2 44225305 44225554 -137522533 - LTR16A LTR ERVL -89 362 94 2 922 245 234 51 13 chr2 44228443 44228521 -137519566 - MamGypLTR2b LTR Gypsy -28 894 814 2 922 2010 176 65 2 chr2 44229462 44229879 -137518208 + BGLII_A LTR ERVK 3 445 0 2 922 2286 163 2 22 chr2 44230727 44231141 -137516946 + MTB_Mm LTR MaLR 2 407 0 2 922 654 288 92 36 chr2 44247940 44248189 -137499898 + MTEa LTR MaLR 117 379 0 2 922 371 308 21 14 chr2 44264595 44264740 -137483347 - MTD LTR MaLR -273 146 1 3 922 551 326 88 51 chr2 44268140 44268492 -137479595 + MLT1A0 LTR MaLR 1 365 0 3 922 678 384 69 10 chr2 44271910 44272328 -137475759 + LTR33A LTR ERVL 76 518 -2 3 922 1479 239 39 20 chr2 44274191 44274549 -137473538 - MLT1B LTR MaLR -11 379 15 3 922 1152 148 70 23 chr2 44295733 44295947 -137452140 - MTD LTR MaLR 0 419 196 3 922 541 257 134 16 chr2 44296665 44296851 -137451236 - MTD LTR MaLR -211 208 1 3 922 594 310 61 85 chr2 44297093 44297386 -137450701 - ORR1E LTR MaLR -53 306 21 3 923 1599 206 105 11 chr2 44306230 44306602 -137441485 + MTD LTR MaLR 13 419 0 3 923 4668 221 32 64 chr2 44306603 44307806 -137440281 + MTD-int LTR MaLR 2 1166 -92 3 923 2039 151 75 58 chr2 44307850 44308265 -137439822 - RMER20A LTR ERVK -94 422 1 3 923 276 229 92 46 chr2 44308266 44308301 -137439786 + MTD-int LTR MaLR 1168 1206 -52 3 923 276 229 92 46 chr2 44308479 44308530 -137439557 + MTD-int LTR MaLR 1207 1258 0 3 923 1777 219 13 21 chr2 44308616 44308990 -137439097 + MTD LTR MaLR 47 417 -2 3 923 1036 294 79 108 chr2 44310546 44310873 -137437214 + MLT2B2 LTR ERVL 1 303 -212 3 923 1036 294 79 108 chr2 44311646 44311772 -137436315 + MLT2B2 LTR ERVL 304 441 -74 3 923 1952 148 0 15 chr2 44327120 44327450 -137420637 + MTB_Mm LTR MaLR 1 325 -82 3 923 718 108 14 103 chr2 44327450 44327595 -137420492 + RLTR11A LTR ERVK 1 132 -396 3 923 1938 123 63 84 chr2 44328081 44328463 -137419624 + RLTR11A LTR ERVK 149 522 -6 3 923 244 244 108 60 chr2 44328469 44328552 -137419535 + MTB_Mm LTR MaLR 335 421 0 3 923 2126 158 8 27 chr2 44331049 44331414 -137416673 + ORR1B2 LTR MaLR 1 358 -9 4 923 629 346 145 6 chr2 44335006 44335372 -137412715 - MLT1F LTR MaLR 0 548 132 4 923 280 350 145 32 chr2 44335477 44335663 -137412424 + MLT1G LTR MaLR 39 245 -346 4 923 1384 232 45 108 chr2 44336004 44336206 -137411881 - MTE2b LTR MaLR -4 375 166 4 923 1961 153 45 76 chr2 44336206 44336602 -137411485 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 4 923 1384 232 45 108 chr2 44336602 44336780 -137411307 - MTE2b LTR MaLR -214 165 19 4 923 3395 52 0 2 chr2 44338985 44339407 -137408680 + BGLII LTR ERVK 1 421 0 4 923 323 261 19 107 chr2 44350253 44350269 -137397818 + MTE2a LTR MaLR 196 205 -174 4 923 344 262 20 103 chr2 44350453 44350542 -137397545 + MTE2a LTR MaLR 206 293 -86 4 923 422 250 37 52 chr2 44359325 44359460 -137388627 + RLTR28B LTR ERVL 54 186 -295 4 923 254 237 12 95 chr2 44359665 44359709 -137388378 + RLTR28B LTR ERVL 434 474 -50 4 923 2497 124 22 85 chr2 44359709 44360166 -137387921 - RLTR23 LTR ERV1 -2 428 1 4 923 254 237 12 95 chr2 44360166 44360205 -137387882 + RLTR28B LTR ERVL 475 510 -14 4 923 287 267 0 0 chr2 44360773 44360833 -137387254 + RMER15 LTR ERVL 1 60 -515 4 923 1735 225 192 18 chr2 44360852 44361305 -137386782 + RMER15 LTR ERVL 22 553 -22 4 923 1380 186 158 160 chr2 44361384 44361827 -137386260 + MT2A LTR ERVL 1 442 -91 4 923 2523 151 115 17 chr2 44361827 44362306 -137385781 - RMER4B LTR ERVK 0 585 60 4 923 848 207 6 49 chr2 44362323 44362506 -137385581 - ORR1C1 LTR MaLR -131 247 73 4 923 230 276 52 94 chr2 44362935 44363031 -137385056 + MT2B LTR ERVL 169 260 -341 4 923 1142 265 112 14 chr2 44369524 44369811 -137378276 + ORR1D2 LTR MaLR 1 315 -55 4 923 380 179 0 0 chr2 44369927 44369994 -137378093 + ORR1D2 LTR MaLR 304 370 0 4 923 2870 52 3 32 chr2 44378170 44378546 -137369541 + RLTR10B2 LTR ERVK 1 365 0 4 923 612 333 49 49 chr2 44388120 44388350 -137359737 - MLT2D LTR ERVL -82 332 98 5 923 612 333 49 49 chr2 44388510 44388607 -137359480 - MLT2D LTR ERVL -317 97 6 5 923 1573 180 39 73 chr2 44399887 44400271 -137347816 + ORR1D1 LTR MaLR 1 371 -3 5 923 1023 148 5 8 chr2 44400730 44400906 -137347181 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 167 5 923 225 250 117 0 chr2 44422531 44422591 -137325496 + LTR65 LTR ERV1 599 665 -4 5 924 2941 134 137 38 chr2 44440287 44440915 -137307172 + RMER6C LTR ERVK 1 690 0 5 924 471 328 44 33 chr2 44440944 44441127 -137306960 + MLT1I LTR MaLR 216 400 -11 5 924 2957 38 3 0 chr2 44442552 44442897 -137305190 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 5 924 1551 182 117 72 chr2 44450239 44450336 -137297751 + MTC LTR MaLR 1 105 -316 5 924 1551 182 117 72 chr2 44450493 44450797 -137297290 + MTC LTR MaLR 106 420 -1 5 924 2346 175 153 41 chr2 44457094 44457703 -137290384 + RMER6C LTR ERVK 1 677 -13 5 924 339 241 57 122 chr2 44463581 44463704 -137284383 - RMER12 LTR ERVK -471 851 737 6 924 371 268 52 66 chr2 44477006 44477142 -137270945 - MTEa LTR MaLR -203 176 43 6 924 1889 164 151 19 chr2 44477484 44477856 -137270231 - MTC LTR MaLR 0 421 1 6 924 394 310 112 24 chr2 44479147 44479352 -137268735 - MLT1J1 LTR MaLR -215 229 7 6 924 454 305 91 116 chr2 44499374 44499737 -137248350 + ORR1E LTR MaLR 4 357 -2 6 924 1561 196 89 17 chr2 44500271 44500629 -137247458 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 3 924 1895 188 30 22 chr2 44513324 44513688 -137234399 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 1 924 6027 187 84 49 chr2 44513688 44515084 -137233003 + ORR1B2-int LTR MaLR 1 1445 -64 1 924 286 100 0 0 chr2 44515093 44515133 -137232954 - ORR1A4 LTR MaLR -7 322 283 1 924 616 207 78 14 chr2 44540589 44540731 -137207356 - ORR1D2 LTR MaLR -50 320 170 4 924 263 276 31 94 chr2 44541939 44542035 -137206052 - MT2B LTR ERVL -360 241 152 4 924 261 352 63 8 chr2 44549581 44549707 -137198380 + LTR33 LTR ERVL 24 156 -359 6 925 294 304 52 65 chr2 44579661 44579816 -137168271 - MTEa LTR MaLR -226 153 1 9 925 2154 90 132 11 chr2 44587652 44588000 -137160087 + RLTR10 LTR ERVK 1 390 0 1 925 1019 278 95 12 chr2 44599918 44600256 -137147831 - MTD LTR MaLR 0 419 54 1 925 1800 228 20 12 chr2 44601692 44602100 -137145987 - BGLII_B LTR ERVK -30 411 1 1 925 1876 180 47 142 chr2 44606345 44606965 -137141122 + RLTR31_Mm LTR ERVK 1 561 0 1 925 670 271 102 24 chr2 44608621 44608956 -137139131 + MTD LTR MaLR 17 364 -15 1 925 3051 56 5 25 chr2 44624232 44624636 -137123451 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 925 1846 169 108 8 chr2 44625505 44625886 -137122201 - MTC LTR MaLR -2 419 1 1 925 526 265 119 28 chr2 44626167 44626419 -137121668 + MTEb LTR MaLR 69 379 0 1 925 3419 296 132 23 chr2 44626419 44627839 -137120248 + MTEb-int LTR MaLR 1 1574 -6 1 925 414 344 84 9 chr2 44627842 44628056 -137120031 + MTEb LTR MaLR 1 230 -149 1 925 3311 31 13 0 chr2 44633312 44633703 -137114384 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 925 1835 162 3 65 chr2 44634501 44634852 -137113235 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 1 925 4285 43 2 8 chr2 44635409 44635924 -137112163 - LTRIS3 LTR ERV1 0 512 1 1 925 1827 119 9 59 chr2 44637268 44637607 -137110480 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 322 0 1 925 2697 209 50 5 chr2 44638365 44638942 -137109145 - ORR1C1-int LTR MaLR -906 603 1 1 925 1203 167 302 34 chr2 44638942 44639240 -137108847 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 1 925 470 269 83 6 chr2 44640062 44640219 -137107868 - ORR1D1 LTR MaLR -7 367 199 1 925 449 356 102 24 chr2 44640828 44641162 -137106925 - LTR40a LTR ERVL -99 420 61 1 925 2155 171 65 7 chr2 44642154 44642584 -137105503 + RMER4A LTR ERVK 1 455 -11 1 925 2451 167 153 40 chr2 44648479 44648575 -137099512 + RLTR25A LTR ERVK 11 115 -988 1 925 2451 167 153 40 chr2 44648631 44649077 -137099010 + RLTR25A LTR ERVK 116 613 -490 1 925 1145 226 221 75 chr2 44657516 44657981 -137090106 - MT2A LTR ERVL 0 533 1 2 925 1280 280 24 129 chr2 44658082 44658661 -137089426 + RMER5 LTR ERV1 9 526 -8 2 925 270 358 124 0 chr2 44667091 44667228 -137080859 + MLT1C LTR MaLR 232 385 -82 2 925 2240 130 64 11 chr2 44673279 44673653 -137074434 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 2 925 337 308 249 0 chr2 44675166 44675367 -137072720 + MTEa LTR MaLR 1 246 -133 2 925 696 330 72 9 chr2 44679529 44679875 -137068212 - MTEb LTR MaLR -2 377 10 2 925 807 228 54 58 chr2 44684292 44684516 -137063571 - MTEb LTR MaLR -150 229 7 2 925 3860 283 115 33 chr2 44684512 44684701 -137063386 - MTEb-int LTR MaLR -5 1575 1349 2 925 3860 283 115 33 chr2 44684745 44686011 -137062076 - MTEb-int LTR MaLR -232 1348 1 2 925 696 258 196 11 chr2 44689187 44689496 -137058591 + MTD LTR MaLR 13 405 -14 2 925 2210 200 83 58 chr2 44692899 44693418 -137054669 + RMER15 LTR ERVL 1 532 -43 2 926 1458 256 87 29 chr2 44700563 44700854 -137047233 + RLTR20B2 LTR ERVK 3 307 -253 2 926 1593 123 145 40 chr2 44700854 44701150 -137046937 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 2 926 1458 256 87 29 chr2 44701150 44701385 -137046702 + RLTR20B2 LTR ERVK 308 560 0 2 926 1140 148 31 16 chr2 44703545 44703725 -137044362 - ORR1A4 LTR MaLR -10 319 135 2 926 1140 148 31 16 chr2 44703790 44703801 -137044286 - ORR1A4 LTR MaLR -195 134 125 2 926 2110 176 81 14 chr2 44704707 44705128 -137042959 - RLTR12B LTR ERVK -77 451 3 2 926 1711 189 97 3 chr2 44705517 44705877 -137042210 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 2 926 2390 153 94 18 chr2 44706891 44707349 -137040738 + RMER4B LTR ERVK 1 493 -92 2 926 2709 158 138 19 chr2 44707350 44707929 -137040158 + RMER6C LTR ERVK 43 690 0 2 926 315 333 23 0 chr2 44715347 44715479 -137032608 - RMER15 LTR ERVL -24 551 417 2 926 549 306 163 42 chr2 44716308 44716639 -137031448 + MLT1F LTR MaLR 50 420 -128 2 926 3340 30 5 0 chr2 44716924 44717318 -137030769 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 926 8363 52 28 1 chr2 44717318 44718387 -137029700 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 2 926 3736 54 19 6 chr2 44718389 44718856 -137029231 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 3 2 926 2634 85 76 5 chr2 44721263 44721643 -137026444 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 2 926 2646 124 24 20 chr2 44721643 44722095 -137025992 - MTB_Mm-int LTR MaLR 0 1098 645 2 926 1622 67 26 9 chr2 44722094 44722320 -137025767 - MTB LTR MaLR -170 230 1 2 926 1570 213 62 3 chr2 44722320 44722656 -137025431 - MTD LTR MaLR -36 383 28 2 926 301 337 89 39 chr2 44723324 44723623 -137024464 + MTE2b LTR MaLR 2 353 -26 2 926 367 39 0 0 chr2 44725403 44725455 -137022632 - ORR1A1 LTR MaLR -294 52 1 3 926 12896 62 36 5 chr2 44725455 44727193 -137020894 - ORR1A1-int LTR MaLR 0 1792 1 3 926 2470 52 58 47 chr2 44727193 44727535 -137020552 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 3 926 1211 249 61 42 chr2 44731783 44732190 -137015897 - MTD LTR MaLR -1 418 4 3 926 1660 182 43 46 chr2 44734843 44735211 -137012876 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 3 926 422 240 30 78 chr2 44737700 44737867 -137010220 + RLTR10A LTR ERVK 140 298 -113 3 926 700 266 143 24 chr2 44740443 44740755 -137007332 - MTEb LTR MaLR -32 347 1 3 926 419 273 155 39 chr2 44744758 44745043 -137003044 + MLT1A0 LTR MaLR 25 365 0 3 926 809 249 118 35 chr2 44745162 44745416 -137002671 - MTD LTR MaLR 0 419 145 3 926 449 311 50 171 chr2 44747611 44747933 -137000154 + MTEa LTR MaLR 77 359 -20 3 926 391 227 9 3 chr2 44748935 44749036 -136999051 - MTC LTR MaLR -312 107 5 3 926 3152 43 8 5 chr2 44749452 44749847 -136998240 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 926 244 354 90 24 chr2 44751822 44752033 -136996054 - LTR78 LTR ERV1 -2 1302 1078 3 926 499 295 124 16 chr2 44756364 44756550 -136991537 + MTD LTR MaLR 5 210 -209 3 926 543 243 118 27 chr2 44756658 44756878 -136991209 + MTD LTR MaLR 180 419 0 3 926 1089 226 124 18 chr2 44757870 44758208 -136989879 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 3 926 374 263 6 60 chr2 44758838 44758963 -136989124 + MTEb LTR MaLR 134 255 -124 3 926 2863 33 2 117 chr2 44762854 44763266 -136984821 + RLTR10B2 LTR ERVK 1 365 0 3 926 807 263 118 64 chr2 44764118 44764398 -136983689 - MTE2b LTR MaLR -18 361 67 3 926 575 263 219 18 chr2 44764635 44764914 -136983173 - MTE-int LTR MaLR -2 1578 1244 3 926 1411 213 95 81 chr2 44765825 44766234 -136981853 - MTD LTR MaLR -2 417 3 3 926 225 239 96 21 chr2 44767525 44767619 -136980468 - ORR1D1 LTR MaLR -10 364 264 3 926 2231 89 9 6 chr2 44789109 44789426 -136958661 - ORR1A3 LTR MaLR -8 318 1 4 926 4179 138 6 0 chr2 44790920 44791548 -136956539 + RLTR21 LTR ERVK 1 632 -940 4 926 4481 138 27 131 chr2 44798017 44799080 -136949007 + RLTR21 LTR ERVK 620 1572 0 4 926 827 209 159 5 chr2 44803579 44803835 -136944252 + MTD LTR MaLR 73 406 -13 4 926 229 308 15 0 chr2 44806088 44806153 -136941934 - MLT1K LTR MaLR -14 581 516 4 926 841 265 99 4 chr2 44815438 44815738 -136932349 - MTEb LTR MaLR 0 379 3 4 926 498 348 127 54 chr2 44822137 44822523 -136925564 - MLT1L LTR MaLR 0 610 197 4 927 1728 238 77 8 chr2 44827988 44828377 -136919710 + MTD LTR MaLR 1 416 -3 4 927 597 294 199 16 chr2 44833658 44833979 -136914108 - MLT1C LTR MaLR -23 444 65 4 927 1358 233 105 41 chr2 44867452 44867841 -136880246 + MTD LTR MaLR 6 419 0 5 927 226 243 57 32 chr2 44894119 44894276 -136853811 + RMER17D2 LTR ERVK 253 413 -396 5 927 272 267 101 25 chr2 44933607 44933726 -136814361 + MLT1A1 LTR MaLR 269 396 -12 5 928 1752 186 26 171 chr2 44977322 44977522 -136770565 + MTC LTR MaLR 1 209 -212 6 928 1752 186 26 171 chr2 44977683 44977974 -136770113 + MTC LTR MaLR 210 421 0 6 928 261 163 0 39 chr2 44984337 44984388 -136763699 - RMER17C LTR ERVK -361 49 1 6 928 517 223 164 74 chr2 44987760 44987949 -136760138 + ORR1D1 LTR MaLR 169 374 0 6 928 3198 161 23 14 chr2 44988739 44989307 -136758780 - RMER15 LTR ERVL 0 575 3 6 928 2279 213 44 36 chr2 44990688 44991213 -136756874 + MT2A LTR ERVL 5 533 0 6 928 511 178 522 0 chr2 44999847 45000000 -136748087 + ORR1B2 LTR MaLR 1 233 -134 6 928 831 99 33 0 chr2 45000001 45000122 -136747965 + ORR1B2 LTR MaLR 235 359 -8 1 928 532 159 0 0 chr2 45000134 45000222 -136747865 + ORR1B2 LTR MaLR 11 98 -269 2 928 441 356 35 30 chr2 45017101 45017301 -136730786 + LTR16E1 LTR ERVL 148 348 -190 2 928 3511 144 129 11 chr2 45030814 45031161 -136716926 - RMER6D LTR ERVK 0 720 369 3 928 3511 144 129 11 chr2 45031205 45031501 -136716586 - RMER6D LTR ERVK -352 368 1 3 928 657 339 40 43 chr2 45054275 45054628 -136693459 + ORR1E LTR MaLR 1 379 0 7 928 241 273 78 22 chr2 45078997 45079087 -136669000 + MT2B LTR ERVL 162 256 -345 1 929 288 353 16 25 chr2 45100834 45100956 -136647131 + LTR16A1 LTR ERVL 336 456 0 1 929 1259 271 55 85 chr2 45101611 45102203 -136645884 - MLT1F2 LTR MaLR -3 566 1 1 929 964 234 142 66 chr2 45106117 45106410 -136641677 + MTE2a LTR MaLR 64 366 -13 1 929 261 292 26 70 chr2 45118936 45119050 -136629037 - MT2B LTR ERVL -337 264 156 1 929 2986 36 0 71 chr2 45150875 45151268 -136596819 - RLTR10B2 LTR ERVK 0 365 1 2 929 358 230 19 39 chr2 45167958 45168062 -136580025 - MLT1A1 LTR MaLR -2 406 305 2 929 252 419 21 14 chr2 45181524 45181667 -136566420 + LTR33A_ LTR ERVL 17 160 -371 2 929 392 292 130 7 chr2 45182019 45182157 -136565930 + MLT1D LTR MaLR 1 155 -350 2 929 1074 281 123 21 chr2 45185710 45186084 -136562003 - MTD LTR MaLR 0 419 8 2 929 1610 166 128 12 chr2 45187436 45187765 -136560322 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 2 929 1939 117 8 94 chr2 45190754 45190816 -136557271 + ORR1A4 LTR MaLR 1 60 -269 2 929 1939 117 8 94 chr2 45190957 45191254 -136556833 + ORR1A4 LTR MaLR 61 329 0 2 929 694 223 123 16 chr2 45218869 45219056 -136529031 + MTD LTR MaLR 203 409 -10 2 930 816 282 119 20 chr2 45219991 45220284 -136527803 + ORR1D2 LTR MaLR 1 322 -48 2 930 1316 209 79 35 chr2 45221250 45221568 -136526519 - MTD LTR MaLR -73 346 15 2 930 620 337 48 24 chr2 45230400 45230649 -136517438 + MTD LTR MaLR 22 276 -143 3 930 251 254 17 0 chr2 45230675 45230734 -136517353 + MTD LTR MaLR 291 350 -9 3 930 3010 63 2 17 chr2 45234688 45235090 -136512997 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 930 785 306 64 9 chr2 45243402 45243697 -136504390 - MTE2a LTR MaLR -45 334 5 3 930 991 289 94 14 chr2 45252066 45252427 -136495660 - MLT1B LTR MaLR 0 390 1 3 930 645 321 85 23 chr2 45252937 45253243 -136494844 + MLT1J-int LTR MaLR 3 327 -1060 3 930 363 351 117 34 chr2 45258607 45258846 -136489241 + MLT1J1 LTR MaLR 66 324 -120 3 930 266 355 30 64 chr2 45263667 45263869 -136484218 - MLT1K LTR MaLR -17 578 384 3 930 520 346 121 44 chr2 45287787 45288150 -136459937 + MLT1F1 LTR MaLR 179 569 0 3 930 2114 110 34 16 chr2 45298129 45298452 -136449635 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 4 930 2950 38 0 0 chr2 45299647 45299993 -136448094 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 4 930 503 334 61 24 chr2 45302744 45302983 -136445104 + ORR1E LTR MaLR 1 238 -132 4 930 3315 36 5 0 chr2 45304216 45304608 -136443479 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 3 4 930 259 376 21 83 chr2 45309917 45310062 -136438025 + MTEa LTR MaLR 3 138 -241 4 930 407 380 75 8 chr2 45310208 45310447 -136437640 + MT2A LTR ERVL 279 533 0 4 930 980 151 24 24 chr2 45323355 45323606 -136424481 + RMER17C LTR ERVK 1 251 -159 4 930 727 237 42 42 chr2 45323610 45323735 -136424352 + RMER17C LTR ERVK 80 198 -212 4 930 727 237 42 42 chr2 45323920 45324125 -136423962 + RMER17C LTR ERVK 199 410 0 4 930 277 278 0 14 chr2 45325191 45325264 -136422823 + MTEb LTR MaLR 278 349 -30 4 930 1686 218 82 40 chr2 45327471 45327968 -136420119 - RLTR20B3 LTR ERVK -47 530 13 4 930 391 324 101 36 chr2 45336412 45336723 -136411364 + RMER20B LTR ERVK 136 471 -45 4 930 322 324 20 105 chr2 45344213 45344365 -136403722 + MTEa LTR MaLR 2 140 -239 4 931 676 312 48 55 chr2 45352824 45353086 -136395001 + MTC LTR MaLR 6 270 -149 4 931 651 333 80 57 chr2 45353234 45353321 -136394766 + MTC LTR MaLR 271 362 -57 4 931 495 219 70 9 chr2 45353314 45353429 -136394658 + MTD LTR MaLR 267 388 -31 4 931 1141 269 104 26 chr2 45354402 45354787 -136393300 + MTD LTR MaLR 5 419 0 5 931 1957 277 74 49 chr2 45354787 45355851 -136392236 + MTD-int LTR MaLR 1 1244 -14 5 931 228 187 0 0 chr2 45356568 45356624 -136391463 + MTD-int LTR MaLR 1056 1098 0 5 931 1250 238 136 5 chr2 45356627 45356994 -136391093 + MTD LTR MaLR 5 419 0 5 931 1386 226 114 6 chr2 45361086 45361420 -136386667 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 5 931 1693 221 19 28 chr2 45382278 45382641 -136365446 + ORR1D1 LTR MaLR 15 374 0 5 931 282 256 58 0 chr2 45383991 45384077 -136364010 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 318 5 931 226 284 34 128 chr2 45384223 45384340 -136363747 - MLT1A1 LTR MaLR -250 124 19 5 931 308 288 17 35 chr2 45400704 45400819 -136347268 - RLTR16 LTR ERVK -349 156 44 5 931 1811 191 8 68 chr2 45403586 45404070 -136344017 + MERVL_2A-int LTR ERVL 5305 5759 -2 5 931 1981 209 43 81 chr2 45404072 45404555 -136343532 + MT2A LTR ERVL 1 465 -68 5 931 1639 164 3 45 chr2 45408253 45408566 -136339521 - ORR1A4 LTR MaLR -24 305 6 5 931 2079 138 67 13 chr2 45424780 45425154 -136322933 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 5 931 229 286 0 31 chr2 45430699 45430829 -136317258 + ORR1B1-int LTR MaLR 629 754 -755 5 931 1270 219 59 11 chr2 45437725 45437998 -136310089 + MTD LTR MaLR 1 286 -133 6 931 1468 247 106 11 chr2 45437996 45438451 -136309636 + MTD-int LTR MaLR 593 1090 -168 6 931 510 211 47 20 chr2 45438724 45438874 -136309213 + MTD-int LTR MaLR 1099 1252 -6 6 931 1617 262 27 0 chr2 45438880 45439288 -136308799 + MTD LTR MaLR 1 419 0 6 931 1722 207 100 23 chr2 45448577 45448968 -136299119 - MTC LTR MaLR 0 421 1 6 931 455 315 5 82 chr2 45465550 45465744 -136282343 + MT2A LTR ERVL 1 179 -354 6 931 1929 114 0 14 chr2 45468974 45469259 -136278828 - ORR1A2 LTR MaLR -45 282 2 6 931 2256 111 40 6 chr2 45469260 45469614 -136278473 - ORR1A2-int LTR MaLR 0 1963 1598 6 931 280 302 84 0 chr2 45475169 45475283 -136272804 + MLT2C2 LTR ERVL 390 513 -50 6 931 275 339 100 55 chr2 45479504 45479704 -136268383 - MLT1H1 LTR MaLR -286 269 61 6 932 636 340 86 114 chr2 45488771 45489202 -136258885 - MLT2B1 LTR ERVL -101 419 1 6 932 234 346 78 35 chr2 45499574 45499704 -136248383 + RMER12 LTR ERVK 735 873 -449 6 932 1972 184 18 23 chr2 45501971 45502361 -136245726 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 7 4 932 1687 177 3 3 chr2 45502367 45502667 -136245420 - ORR1B1-int LTR MaLR 0 1509 1210 4 932 2567 189 82 9 chr2 45503189 45503759 -136244328 - ORR1B1-int LTR MaLR -274 1235 624 4 932 883 171 0 314 chr2 45503618 45504010 -136244077 - MT2B LTR ERVL -332 269 1 5 932 1742 181 8 157 chr2 45504052 45504523 -136243564 - ORR1B1-int LTR MaLR -1323 640 240 4 932 1129 181 16 8 chr2 45504540 45504898 -136243189 - ORR1B1-int LTR MaLR -8 386 1 4 932 2156 172 21 13 chr2 45504898 45505281 -136242806 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 1 4 932 852 231 14 33 chr2 45509644 45509859 -136238228 + MTD LTR MaLR 1 211 -208 1 932 778 257 9 59 chr2 45510372 45510591 -136237496 + MTD LTR MaLR 200 407 -12 1 932 3825 165 30 35 chr2 45515337 45516058 -136232029 - RMER6D LTR ERVK -2 718 1 2 932 500 321 104 55 chr2 45517640 45517964 -136230123 + MLT1A0 LTR MaLR 3 349 -16 2 932 1930 165 57 130 chr2 45517964 45518327 -136229760 - MTC LTR MaLR 0 421 81 2 932 1930 165 57 130 chr2 45518471 45518561 -136229526 - MTC LTR MaLR -341 80 1 2 932 500 321 104 55 chr2 45518561 45518582 -136229505 + MLT1A0 LTR MaLR 350 365 0 2 932 565 285 117 74 chr2 45518607 45518959 -136229128 + MLT1A0-int LTR MaLR 14 380 -1355 2 932 289 262 110 34 chr2 45519167 45519313 -136228774 + MT2B LTR ERVL 101 257 -344 2 932 1750 216 63 21 chr2 45521443 45521826 -136226261 - MTD LTR MaLR -3 416 18 3 932 870 289 39 50 chr2 45524148 45524308 -136223779 + MTEa LTR MaLR 1 165 -214 3 932 870 289 39 50 chr2 45524332 45524553 -136223534 + MTEa LTR MaLR 166 377 -2 3 932 3011 54 13 10 chr2 45541878 45542272 -136205815 + MTA_Mm LTR MaLR 2 396 0 5 932 235 289 93 98 chr2 45550825 45551040 -136197047 + MLT1K LTR MaLR 382 595 0 6 932 3140 144 38 18 chr2 45551927 45552478 -136195609 + RLTR17 LTR ERVK 3 564 -128 6 932 1008 261 177 14 chr2 45553438 45553788 -136194299 - MTD LTR MaLR 0 419 13 6 932 2578 158 29 4 chr2 45554262 45554712 -136193375 + RMER17B LTR ERVK 498 958 0 6 932 842 222 28 133 chr2 45555684 45555970 -136192117 + MTC LTR MaLR 3 258 -163 7 932 4033 239 63 44 chr2 45555988 45557140 -136190947 + MTC-int LTR MaLR 81 1254 -4 7 932 938 209 188 0 chr2 45557158 45557503 -136190584 + MTC LTR MaLR 10 419 0 7 932 523 279 79 28 chr2 45560320 45560497 -136187590 - MTEb LTR MaLR -13 366 181 7 932 1467 253 62 13 chr2 45560676 45561064 -136187023 - MTD LTR MaLR 0 419 13 7 932 342 286 0 71 chr2 45561660 45561759 -136186328 - MTEb LTR MaLR -193 186 95 7 932 229 333 124 29 chr2 45561926 45562031 -136186056 - MTEb LTR MaLR -259 120 6 7 932 1851 331 91 6 chr2 45562051 45562746 -136185341 - MTEb-int LTR MaLR -23 1557 804 7 932 270 246 14 28 chr2 45562746 45562817 -136185270 + MTC LTR MaLR 1 70 -351 8 932 1468 284 46 89 chr2 45562801 45563584 -136184503 + MTC-int LTR MaLR 107 861 -237 8 932 657 307 89 18 chr2 45563740 45564097 -136183990 + MTD LTR MaLR 1 404 -15 8 932 683 323 102 11 chr2 45564370 45564661 -136183426 + MTEa LTR MaLR 2 341 -38 8 932 334 293 105 86 chr2 45564661 45564870 -136183217 - RMER17C LTR ERVK -3 407 189 8 932 334 293 105 86 chr2 45564904 45565067 -136183020 - RMER17C LTR ERVK -222 188 28 8 932 252 315 25 67 chr2 45566468 45566587 -136181500 + RLTR14 LTR ERV1 267 380 -2 8 932 744 87 50 7 chr2 45574242 45574381 -136173706 - RMER17B LTR ERVK -498 460 316 9 932 706 313 44 18 chr2 45575502 45575775 -136172312 - RMER15-int LTR ERVL -3707 1292 1013 1 932 588 289 78 5 chr2 45577560 45577751 -136170336 - RMER15 LTR ERVL -90 485 281 1 932 2956 57 13 3 chr2 45588716 45589100 -136158987 + RLTR10 LTR ERVK 1 388 -2 1 932 809 226 11 37 chr2 45589108 45589296 -136158791 - MT2A LTR ERVL -170 363 181 1 932 478 300 109 31 chr2 45589297 45589617 -136158470 + RLTR15 LTR ERVK 1 345 -14 1 932 483 252 0 50 chr2 45589625 45589746 -136158341 - MT2A LTR ERVL -351 182 68 1 932 308 164 98 0 chr2 45590234 45590295 -136157792 - MTE2b LTR MaLR -312 67 1 1 932 355 323 61 55 chr2 45590514 45590678 -136157409 + MTE2a LTR MaLR 15 179 -200 1 932 870 272 5 0 chr2 45590907 45591091 -136156996 + MTE2a LTR MaLR 195 379 0 1 932 440 174 48 43 chr2 45601039 45601225 -136146862 + RMER17C LTR ERVK 88 274 -136 1 932 319 384 81 30 chr2 45604968 45605239 -136142848 - LTR16C LTR ERVL -3 486 202 1 932 234 295 27 45 chr2 45609966 45610076 -136138011 + RMER12 LTR ERVK 702 809 -513 1 933 663 293 33 137 chr2 45614997 45615420 -136132667 - MTEb LTR MaLR 0 379 1 1 933 2084 91 37 3 chr2 45616364 45616663 -136131424 + RLTR27 LTR ERVK 1 309 0 1 933 347 332 52 36 chr2 45616895 45617089 -136130998 + ORR1E LTR MaLR 6 202 -157 1 933 871 246 84 51 chr2 45620292 45620648 -136127439 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 3 1 933 2273 90 48 0 chr2 45624503 45624815 -136123272 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 1 933 1197 243 82 35 chr2 45635144 45635511 -136112576 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 1 933 288 255 77 91 chr2 45636251 45636466 -136111621 - MTEb LTR MaLR -116 263 54 2 933 439 302 8 0 chr2 45636920 45637064 -136111023 - MLT1B LTR MaLR -26 441 219 2 933 2226 106 62 40 chr2 45653558 45653960 -136094127 + RLTR10A LTR ERVK 1 411 0 2 933 447 349 28 87 chr2 45654450 45654773 -136093314 - MER70B LTR ERVL -274 304 1 2 933 3511 23 0 0 chr2 45662431 45662827 -136085260 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 933 883 289 67 104 chr2 45664303 45664689 -136083398 + MTE2a LTR MaLR 3 374 -5 2 933 2819 64 13 10 chr2 45667968 45668361 -136079726 - MTB LTR MaLR 0 400 7 2 933 1341 192 77 7 chr2 45671865 45672138 -136075949 + MTC LTR MaLR 130 421 0 2 933 734 277 58 160 chr2 45679200 45679612 -136068475 - MTE2a LTR MaLR -5 374 5 2 933 325 123 210 43 chr2 45679894 45680056 -136068031 - RMER17C LTR ERVK -141 269 81 2 933 2056 235 25 4 chr2 45680850 45681320 -136066767 - RLTR16 LTR ERVK -22 483 4 2 933 339 342 82 59 chr2 45681850 45682204 -136065883 - MLT1A0 LTR MaLR -1 364 3 2 933 1551 214 70 24 chr2 45685274 45685647 -136062440 - RMER19C LTR ERVK 0 611 222 2 933 1888 190 78 18 chr2 45686626 45687023 -136061064 - MTC LTR MaLR 0 421 1 2 933 244 316 0 38 chr2 45696970 45697049 -136051038 - MLT1C LTR MaLR -38 429 354 2 933 579 189 81 8 chr2 45709788 45709911 -136038176 - RMER4A LTR ERVK -319 147 16 2 933 4468 10 0 0 chr2 45711552 45712045 -136036042 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 3 933 2407 223 32 17 chr2 45721717 45722114 -136025973 - RMER6D LTR ERVK -1 719 316 3 933 2407 223 32 17 chr2 45722398 45722538 -136025549 - RMER6D LTR ERVK -405 315 174 3 933 359 103 0 17 chr2 45722534 45722593 -136025494 - RMER6D LTR ERVK -662 58 1 3 933 314 290 320 25 chr2 45725531 45725731 -136022356 - MTE2a LTR MaLR -25 354 96 3 933 969 264 94 35 chr2 45725925 45726267 -136021820 + MTC LTR MaLR 6 367 -54 3 933 2206 193 14 104 chr2 45726267 45726908 -136021179 - RMER6C LTR ERVK 0 690 108 3 933 244 148 16 115 chr2 45726933 45726994 -136021093 + MTC LTR MaLR 360 414 -5 3 933 2514 91 25 0 chr2 45730350 45730714 -136017373 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 24 3 934 2498 100 50 37 chr2 45748646 45749050 -135999037 + RLTR9E LTR ERVK 1 409 0 3 934 238 339 118 65 chr2 45749427 45749439 -135998648 - MER21B LTR ERV1 -505 358 329 3 934 252 348 52 26 chr2 45749439 45749554 -135998533 - MER77 LTR ERVL -257 350 233 3 934 238 339 118 65 chr2 45749554 45749613 -135998474 - MER21B LTR ERV1 -505 328 163 3 934 1361 263 45 56 chr2 45757174 45757641 -135990446 - RLTR17 LTR ERVK -126 566 105 3 934 2941 169 78 39 chr2 45762719 45763383 -135984704 + RMER6C LTR ERVK 1 690 0 3 934 317 411 40 50 chr2 45764314 45764616 -135983471 - MLT1K LTR MaLR -168 427 129 3 934 867 123 7 21 chr2 45766049 45766190 -135981897 - RLTR9E LTR ERVK 0 393 255 3 934 1533 94 63 55 chr2 45766558 45766829 -135981258 - RLTR9E LTR ERVK -136 273 1 3 934 477 298 27 27 chr2 45771436 45771622 -135976465 - MLT2B4 LTR ERVL -370 186 1 3 934 1160 225 39 8 chr2 45783269 45783529 -135964558 + ORR1C1 LTR MaLR 111 378 0 3 934 406 301 110 59 chr2 45787327 45787719 -135960368 - LTR73 LTR ERV1 -137 435 24 4 934 1901 158 41 58 chr2 45798561 45798925 -135949162 + ORR1B1 LTR MaLR 36 393 -1 4 934 890 221 183 53 chr2 45809257 45809412 -135938675 - ORR1D1 LTR MaLR -34 340 164 4 934 890 221 183 53 chr2 45809509 45809654 -135938433 - ORR1D1 LTR MaLR -211 163 2 4 934 1613 168 111 95 chr2 45820189 45820431 -135927656 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 156 4 934 1613 168 111 95 chr2 45820605 45820749 -135927338 - ORR1B1 LTR MaLR -239 155 2 4 934 462 18 0 0 chr2 45837853 45837908 -135910179 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 292 4 934 2464 29 0 13 chr2 45838504 45838815 -135909272 - ORR1A0 LTR MaLR -39 307 1 4 934 3259 33 13 0 chr2 45862241 45862632 -135885455 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 934 7857 67 8 18 chr2 45862632 45863355 -135884732 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 387 4 934 7857 67 8 18 chr2 45863822 45864207 -135883880 - MTA_Mm-int LTR MaLR -712 386 1 4 934 3149 38 13 18 chr2 45864207 45864605 -135883482 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 935 495 336 55 80 chr2 45888827 45889192 -135858895 - MT2A LTR ERVL -71 462 107 5 935 265 369 50 33 chr2 45889823 45890079 -135858008 + MLT1H1 LTR MaLR 1 307 -272 5 935 3638 193 85 65 chr2 45904059 45904941 -135843146 - RMER19B LTR ERVK 0 902 3 5 935 226 379 42 0 chr2 45912958 45913053 -135835034 - MLT1E1A LTR MaLR -259 421 323 5 935 957 303 20 13 chr2 45914345 45914643 -135833444 - RMER15 LTR ERVL 0 575 276 5 935 1425 261 79 18 chr2 45918068 45918459 -135829628 + MTD LTR MaLR 5 419 0 5 935 567 257 154 30 chr2 45931812 45932131 -135815956 + MTD LTR MaLR 61 419 0 5 935 3784 136 5 0 chr2 45937751 45938332 -135809755 - MT2B2 LTR ERVL 0 584 1 5 935 2540 180 82 68 chr2 45939034 45939714 -135808373 - RMER6C LTR ERVK 0 690 1 5 935 3350 160 87 65 chr2 45943373 45943792 -135804295 - RMER17A2 LTR ERVK 0 906 449 6 935 3350 160 87 65 chr2 45943829 45944296 -135803791 - RMER17A2 LTR ERVK -458 448 2 6 935 517 291 160 30 chr2 45950335 45950704 -135797383 + MTD LTR MaLR 3 419 0 6 935 2623 109 92 5 chr2 45955624 45956037 -135792050 + RLTR44B LTR ERVK 1 449 0 6 935 817 304 57 57 chr2 45959754 45960085 -135788002 + MTD LTR MaLR 13 343 -76 6 935 1345 246 47 30 chr2 45967760 45968155 -135779932 + RMER19A LTR ERVK 1 464 -273 6 935 227 333 97 0 chr2 45971343 45971415 -135776672 + MTEb LTR MaLR 8 86 -293 6 935 314 284 107 138 chr2 45971736 45971932 -135776155 + MTEb LTR MaLR 190 379 0 6 935 872 308 52 37 chr2 45971941 45972268 -135775819 + MTEb-int LTR MaLR 8 339 -1241 6 935 717 360 66 27 chr2 45974483 45974823 -135773264 + MTEa LTR MaLR 25 378 -1 6 935 328 259 128 43 chr2 45974979 45975120 -135772967 - RMER15 LTR ERVL -14 561 409 6 935 661 202 47 79 chr2 45976886 45977101 -135770986 + MER57A-int LTR ERV1 5813 6020 -167 6 935 2451 67 48 6 chr2 45987505 45987837 -135760250 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 6 935 347 282 72 63 chr2 45994106 45994329 -135753758 + RLTR15 LTR ERVK 70 294 -65 6 936 1437 249 136 58 chr2 46012740 46013242 -135734845 + RMER2 LTR ERV1 1 541 -26 1 936 2142 160 0 3 chr2 46013893 46014238 -135733849 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 3 1 936 1847 216 101 56 chr2 46014592 46015249 -135732838 + RMER6C LTR ERVK 5 690 0 2 936 1625 240 27 22 chr2 46016032 46016437 -135731650 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 2 936 1732 180 50 29 chr2 46026724 46027015 -135721072 - ORR1B1 LTR MaLR -4 390 90 4 936 2850 39 0 0 chr2 46027015 46027347 -135720740 + IAPEY3_LTR LTR ERVK 1 332 0 4 936 1732 180 50 29 chr2 46027347 46027398 -135720689 - ORR1B1 LTR MaLR -305 89 41 4 936 2502 94 51 120 chr2 46028921 46029431 -135718656 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 4 936 470 350 80 45 chr2 46052552 46052839 -135695248 - ORR1E LTR MaLR -41 318 22 7 936 459 251 45 167 chr2 46054264 46054526 -135693561 - RMER4B LTR ERVK -23 588 377 8 936 964 227 74 4 chr2 46054748 46054991 -135693096 - RMER4B LTR ERVK -309 276 17 8 936 455 302 11 97 chr2 46061061 46061237 -135686850 + MTD LTR MaLR 45 205 -214 8 936 1888 134 28 15 chr2 46072176 46072501 -135675586 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 9 936 5271 188 64 20 chr2 46072501 46073800 -135674287 + ORR1A4-int LTR MaLR 1 1203 -760 9 936 2866 156 87 60 chr2 46074291 46074892 -135673195 + RLTR26 LTR ERVK 1 617 -25 1 936 239 154 0 0 chr2 46077064 46077103 -135670984 + RLTR26 LTR ERVK 312 350 -292 1 936 1976 225 9 29 chr2 46077496 46077916 -135670171 + MTC LTR MaLR 1 412 -9 1 936 360 339 29 73 chr2 46085846 46085983 -135662104 - MTEb LTR MaLR -233 146 16 1 936 472 240 68 7 chr2 46104701 46104848 -135643239 - RMER6A LTR ERVK -256 500 345 1 936 372 218 18 114 chr2 46118045 46118159 -135629928 + MT2B LTR ERVL 162 264 -337 1 936 773 199 67 105 chr2 46118973 46119465 -135628622 - RMER6C LTR ERVK 0 720 293 1 936 1419 124 226 0 chr2 46120484 46120759 -135627328 - RMER6C LTR ERVK -351 339 3 1 937 4756 130 92 85 chr2 46163754 46164770 -135583317 + RLTR13D2 LTR ERVK 1 1023 0 2 937 3312 28 13 0 chr2 46164877 46165268 -135582819 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 937 9583 14 1 3 chr2 46165268 46166368 -135581719 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 2 937 3333 26 13 0 chr2 46166368 46166759 -135581328 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 937 723 331 57 40 chr2 46172271 46172721 -135575366 - MLT2B3 LTR ERVL -56 506 55 2 937 2287 188 57 123 chr2 46187970 46188709 -135559378 + RMER6C LTR ERVK 1 690 0 2 937 231 380 18 44 chr2 46192861 46192974 -135555113 - RMER12 LTR ERVK -468 854 745 2 937 3516 15 2 0 chr2 46198662 46199057 -135549030 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 937 8863 43 2 5 chr2 46199057 46200159 -135547928 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 2 937 3490 18 2 0 chr2 46200159 46200554 -135547533 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 937 8863 43 2 5 chr2 46200554 46201656 -135546431 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 2 937 3490 18 2 0 chr2 46201656 46202051 -135546036 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 937 8863 43 2 5 chr2 46202051 46203153 -135544934 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 2 937 3503 15 2 0 chr2 46203153 46203548 -135544539 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 937 918 251 140 21 chr2 46209804 46210089 -135537998 + ORR1D2 LTR MaLR 11 329 -41 2 937 273 370 47 16 chr2 46217215 46217344 -135530743 - MLT1A LTR MaLR -186 188 56 2 937 1458 193 84 89 chr2 46219249 46219602 -135528485 + MTC LTR MaLR 1 340 -81 2 937 1458 193 84 89 chr2 46219631 46219681 -135528406 + MTC LTR MaLR 341 402 -19 2 937 2417 183 55 23 chr2 46230071 46230601 -135517486 + RMER6A LTR ERVK 210 756 0 3 937 331 398 59 32 chr2 46230605 46230740 -135517347 - MT2A LTR ERVL -184 349 3 3 937 517 313 84 25 chr2 46230740 46230943 -135517144 - MTEa LTR MaLR -162 217 3 3 937 2083 82 38 65 chr2 46237179 46237520 -135510567 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK -5 332 1 3 937 54423 16 6 6 chr2 46237520 46243996 -135504091 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 6 3 937 2090 78 38 65 chr2 46243996 46244337 -135503750 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK -5 332 1 3 937 2718 189 30 123 chr2 46245768 46246089 -135501998 + RMER6C LTR ERVK 1 324 -366 3 937 2718 189 30 123 chr2 46246118 46246549 -135501538 + RMER6C LTR ERVK 325 683 -7 3 937 254 302 30 128 chr2 46247036 46247169 -135500918 - RMER20B LTR ERVK -507 120 1 3 937 717 288 56 124 chr2 46247203 46247647 -135500440 + RLTR23 LTR ERV1 8 421 -9 3 937 2629 173 36 53 chr2 46251219 46251295 -135496792 - RLTR20A LTR ERVK -10 531 441 3 937 2629 173 36 53 chr2 46251333 46251786 -135496301 - RLTR20A LTR ERVK -101 440 12 3 937 1620 130 95 66 chr2 46252003 46252308 -135495779 + ORR1A3 LTR MaLR 3 316 -10 3 937 3610 162 73 52 chr2 46252314 46253057 -135495030 + ORR1A3-int LTR MaLR 1 758 -1205 3 937 1296 160 63 63 chr2 46252913 46253166 -135494921 + MT2B LTR ERVL 35 287 -314 3 937 2422 201 42 33 chr2 46253126 46253608 -135494479 + ORR1A3-int LTR MaLR 252 1089 -874 3 937 2422 163 31 40 chr2 46253755 46254213 -135493874 + ORR1A3-int LTR MaLR 1090 1492 -471 3 937 287 295 56 35 chr2 46254653 46254797 -135493290 + ORR1A3 LTR MaLR 205 351 -19 3 937 1623 128 79 14 chr2 46257224 46257502 -135490585 - RLTR27 LTR ERVK -13 296 1 3 937 406 341 84 11 chr2 46257860 46258096 -135489991 - MLT1A0 LTR MaLR -50 315 56 3 937 3465 18 5 0 chr2 46261338 46261732 -135486355 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 937 2635 187 60 12 chr2 46263517 46264031 -135484056 + RMER15 LTR ERVL 33 571 -4 3 937 239 198 144 44 chr2 46265329 46265419 -135482668 - RLTR22_Mus LTR ERVK -229 1579 1481 3 937 429 339 78 12 chr2 46265441 46265683 -135482404 + RMER15-int LTR ERVL 4449 4706 -293 3 937 2176 108 13 0 chr2 46265723 46266038 -135482049 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 3 937 977 284 148 15 chr2 46266387 46266719 -135481368 - MTD LTR MaLR -14 405 30 3 938 1104 273 61 29 chr2 46271476 46271819 -135476268 - MTE2b LTR MaLR 0 379 26 3 938 3069 75 2 2 chr2 46271825 46272224 -135475863 - MTB LTR MaLR 0 400 2 3 938 501 277 97 76 chr2 46275596 46275885 -135472202 + RMER20B LTR ERVK 91 385 -242 3 938 229 301 68 95 chr2 46276374 46276521 -135471566 + MamGypLTR2c LTR Gypsy 464 606 -462 3 938 513 298 81 112 chr2 46283923 46284332 -135463755 - RLTR11A2 LTR ERVK -16 511 116 3 938 1260 241 80 29 chr2 46288562 46288912 -135459175 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 7 3 938 661 233 30 35 chr2 46293789 46293891 -135454196 - RLTR20D LTR ERVK 0 534 434 4 938 756 214 109 95 chr2 46293926 46294251 -135453836 - RLTR20D LTR ERVK -101 433 3 4 938 841 162 0 151 chr2 46301481 46301580 -135446507 - RMER17C LTR ERVK -157 253 181 4 938 841 162 0 151 chr2 46301674 46301872 -135446215 - RMER17C LTR ERVK -230 180 1 4 938 231 204 0 36 chr2 46302851 46302907 -135445180 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1296 1349 -499 4 938 1480 268 20 96 chr2 46310111 46310665 -135437422 - RMER13B LTR ERVK -8 900 389 4 938 936 218 80 28 chr2 46317664 46317914 -135430173 - RMER17B LTR ERVK -695 263 1 4 938 872 191 149 20 chr2 46328597 46328968 -135419119 - RMER6C LTR ERVK -240 450 1 4 938 477 341 22 0 chr2 46329215 46329394 -135418693 + RMER15 LTR ERVL 378 560 -15 4 938 951 262 52 0 chr2 46329769 46330002 -135418085 - MT2A LTR ERVL -74 459 215 4 938 644 221 24 8 chr2 46330002 46330125 -135417962 - RLTR19 LTR ERVK 0 499 375 4 938 839 131 289 0 chr2 46330126 46330372 -135417715 - RLTR19-int LTR ERVK -331 5806 5491 4 938 1469 179 35 73 chr2 46330379 46330693 -135417394 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 145 4 938 11439 135 42 47 chr2 46330695 46331706 -135416381 - RLTR19-int LTR ERVK -1550 4587 3560 4 938 2731 183 34 32 chr2 46331706 46332266 -135415821 - RLTR31_Mm LTR ERVK 0 561 1 4 938 11439 135 42 47 chr2 46332266 46332380 -135415707 - RLTR19-int LTR ERVK -2578 3559 3455 4 938 11439 135 42 47 chr2 46332425 46333472 -135414615 - RLTR19-int LTR ERVK -2683 3454 2425 4 938 3405 188 42 16 chr2 46333472 46334147 -135413940 - RLTR17 LTR ERVK 0 692 1 4 938 9216 151 67 79 chr2 46334147 46335210 -135412877 - RLTR19-int LTR ERVK -3698 2439 1365 4 938 5418 144 64 57 chr2 46335527 46336604 -135411483 - RLTR19-int LTR ERVK -4761 1376 292 4 938 323 179 34 56 chr2 46336809 46336898 -135411189 - RLTR19-int LTR ERVK -5922 215 129 4 938 449 209 124 26 chr2 46337000 46337113 -135410974 - RLTR19 LTR ERVK -7 492 369 4 938 2619 183 24 123 chr2 46343350 46344116 -135403971 + RMER6C LTR ERVK 1 690 0 4 938 1344 243 35 75 chr2 46346676 46347228 -135400859 - RMER19C LTR ERVK -213 689 1 4 938 334 284 0 0 chr2 46351400 46351474 -135396613 + MTEb LTR MaLR 5 78 -301 4 938 2028 213 130 76 chr2 46352994 46353649 -135394438 - RMER6C LTR ERVK 0 690 1 4 938 1572 181 66 0 chr2 46358574 46358861 -135389226 - RMER19B LTR ERVK 0 902 597 4 938 368 261 199 36 chr2 46359538 46359734 -135388353 - RMER4B LTR ERVK -15 570 343 4 938 839 154 72 28 chr2 46360030 46360210 -135387877 - RMER4B LTR ERVK -397 188 1 4 938 433 345 32 96 chr2 46361752 46362002 -135386085 + LTR88c LTR Genie? 146 379 -483 4 938 680 316 45 88 chr2 46374454 46374843 -135373244 - MLT1A1 LTR MaLR -59 349 4 5 938 849 277 68 11 chr2 46381536 46381831 -135366256 - MTEa LTR MaLR 0 379 54 5 938 1921 180 96 68 chr2 46382289 46382802 -135365285 - RLTR11A2 LTR ERVK 0 527 1 5 938 1711 185 23 32 chr2 46382831 46383177 -135364910 - ORR1B2 LTR MaLR -17 350 8 5 938 871 282 207 0 chr2 46389510 46389815 -135358272 - ORR1D2 LTR MaLR -2 368 1 5 938 309 232 247 43 chr2 46389818 46389980 -135358107 - ORR1D2-int LTR MaLR 0 1370 1176 5 938 863 224 153 26 chr2 46389978 46390291 -135357796 + MTC LTR MaLR 59 411 -10 5 938 381 191 48 0 chr2 46390297 46390381 -135357706 + ORR1D-int LTR MaLR 1122 1209 -161 5 938 264 131 0 21 chr2 46390389 46390436 -135357651 - MTD LTR MaLR -371 48 3 5 938 972 328 129 16 chr2 46390436 46390869 -135357218 - ORR1D2-int LTR MaLR -242 1128 647 5 938 616 323 4 42 chr2 46391545 46391781 -135356306 - ORR1D2-int LTR MaLR -837 533 307 5 938 249 328 93 36 chr2 46399337 46399476 -135348611 + MLT2B1 LTR ERVL 43 189 -331 5 939 267 358 88 26 chr2 46399539 46399731 -135348356 + MLT2B1 LTR ERVL 345 548 -19 5 939 2251 213 63 44 chr2 46399929 46400687 -135347400 + RLTR13D6 LTR ERVK 1 799 -4 5 939 471 280 70 0 chr2 46405247 46405347 -135342740 - MT2A LTR ERVL -96 437 331 5 939 634 233 15 8 chr2 46405350 46405484 -135342603 - MT2A LTR ERVL -387 146 12 5 939 301 269 26 44 chr2 46407413 46407526 -135340561 + ORR1C2 LTR MaLR 1 111 -273 5 939 547 195 150 63 chr2 46407598 46407778 -135340309 + ORR1C2 LTR MaLR 184 367 -7 5 939 718 287 91 91 chr2 46414221 46414274 -135333813 - MT2B LTR ERVL 0 601 552 5 939 718 310 85 84 chr2 46414327 46414805 -135333282 - MT2B LTR ERVL -50 551 1 5 939 2641 192 119 25 chr2 46415862 46416493 -135331594 - RMER6C LTR ERVK 0 690 1 5 939 1745 219 66 15 chr2 46420349 46420743 -135327344 + MTC LTR MaLR 2 415 -6 5 939 534 358 141 19 chr2 46421128 46421447 -135326640 + MLT1A LTR MaLR 17 374 0 5 939 736 196 21 7 chr2 46426155 46426299 -135321788 + ORR1D1-int LTR MaLR 1225 1370 0 5 939 658 271 201 16 chr2 46426300 46426439 -135321648 + ORR1D1 LTR MaLR 2 162 -212 5 939 658 271 201 16 chr2 46426523 46426690 -135321397 + ORR1D1 LTR MaLR 163 364 -10 5 939 2867 25 5 59 chr2 46429839 46430227 -135317860 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 5 939 28206 19 18 0 chr2 46430227 46433443 -135314644 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 3209 5 939 7755 85 81 29 chr2 46433441 46434682 -135313405 - IAPEz-int LTR ERVK -5168 1313 8 5 939 2867 25 5 59 chr2 46434682 46435070 -135313017 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 5 939 1267 262 76 26 chr2 46441700 46442080 -135306007 + MTD LTR MaLR 21 419 0 6 939 260 237 17 0 chr2 46442102 46442161 -135305926 + MTD-int LTR MaLR 25 84 -1174 6 939 921 271 47 98 chr2 46442148 46442557 -135305530 + MTD-int LTR MaLR 291 693 -405 6 939 338 245 71 135 chr2 46446434 46446651 -135301436 - MTEa LTR MaLR -32 347 112 6 939 1125 286 103 54 chr2 46455294 46455682 -135292405 + MTD LTR MaLR 5 411 -8 6 939 1845 146 62 0 chr2 46458195 46458503 -135289584 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 6 939 707 303 75 66 chr2 46460867 46460928 -135287159 + RMER13A LTR ERVK 2 52 -808 6 939 1990 151 3 6 chr2 46460928 46461254 -135286833 + ORR1A2 LTR MaLR 3 327 0 6 939 707 303 75 66 chr2 46461254 46461524 -135286563 + RMER13A LTR ERVK 53 336 -524 6 939 1595 164 65 50 chr2 46461477 46461817 -135286270 - RLTR15 LTR ERVK -14 345 1 6 939 344 260 28 19 chr2 46462134 46462240 -135285847 + RMER13A LTR ERVK 1 107 -753 6 939 669 301 146 6 chr2 46464794 46465115 -135282972 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 5 6 939 3335 35 5 0 chr2 46466709 46467103 -135280984 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 939 492 350 22 11 chr2 46474857 46475036 -135273051 - ORR1D2 LTR MaLR -187 183 3 6 939 735 264 133 77 chr2 46476077 46476430 -135271657 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 2 6 939 1063 202 121 8 chr2 46476838 46477170 -135270917 + ORR1B1 LTR MaLR 8 382 -2 6 939 322 377 51 88 chr2 46487309 46487373 -135260714 - MTE-int LTR MaLR -11 1359 1296 6 939 367 378 50 88 chr2 46487529 46488041 -135260046 - MTE-int LTR MaLR -75 1295 814 6 939 312 302 152 18 chr2 46489533 46489698 -135258389 - MTE-int LTR MaLR -678 902 716 6 939 1354 266 112 107 chr2 46492124 46493001 -135255086 + RMER17B LTR ERVK 1 805 -153 6 939 1020 181 17 0 chr2 46493493 46493670 -135254417 - MTC LTR MaLR -220 201 22 6 939 2247 169 107 29 chr2 46493824 46494311 -135253776 + RLTR11A LTR ERVK 1 525 -3 6 939 2134 185 35 0 chr2 46494444 46494849 -135253238 + MTC LTR MaLR 3 421 0 6 940 1606 200 113 28 chr2 46532357 46532785 -135215302 - RLTR31_Mm LTR ERVK -2 559 96 2 940 1606 200 113 28 chr2 46532829 46532868 -135215219 - RLTR31_Mm LTR ERVK -466 95 52 2 940 3494 173 72 8 chr2 46533869 46534299 -135213788 - RMER6A LTR ERVK 0 756 322 3 940 3494 173 72 8 chr2 46534339 46534566 -135213521 - RMER6A LTR ERVK -435 321 65 3 940 3494 173 72 8 chr2 46534591 46534638 -135213449 - RMER6A LTR ERVK -692 64 8 3 940 231 307 13 13 chr2 46535257 46535333 -135212754 - RLTR17 LTR ERVK -280 412 337 3 940 893 242 116 133 chr2 46536939 46537679 -135210408 - RMER6A LTR ERVK 0 720 1 4 940 2431 101 106 57 chr2 46551824 46552277 -135195810 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 5 940 939 122 70 75 chr2 46552278 46552464 -135195623 + IAPEz-int LTR ERVK 9 193 -6288 5 940 228 327 0 0 chr2 46552464 46552519 -135195568 + RLTR27 LTR ERVK 221 275 -34 5 940 3351 74 7 16 chr2 46552519 46553094 -135194993 + IAPEz-int LTR ERVK 168 662 -5819 5 940 2582 85 0 3 chr2 46553094 46553437 -135194650 + IAPEz-int LTR ERVK 1359 1700 -4781 5 940 6664 45 4 18 chr2 46553430 46554273 -135193814 + IAPEz-int LTR ERVK 5651 6481 0 5 940 2442 101 106 57 chr2 46554273 46554726 -135193361 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 5 940 919 107 29 0 chr2 46555908 46556048 -135192039 + BGLII_Mus LTR ERVK 1 144 -278 5 940 1683 78 92 0 chr2 46556464 46556735 -135191352 + BGLII_Mus LTR ERVK 127 422 0 5 940 2765 204 54 20 chr2 46563977 46564686 -135183401 - RMER19A LTR ERVK 0 737 5 6 940 1432 230 111 51 chr2 46564944 46565594 -135182493 - RMER6C LTR ERVK 0 690 2 6 940 458 316 84 21 chr2 46566876 46567327 -135180760 + MERVL_2A-int LTR ERVL 1390 1914 -3847 6 940 689 313 34 8 chr2 46567360 46567627 -135180460 + MERVL_2A-int LTR ERVL 1879 2152 -3333 6 940 433 339 6 6 chr2 46567725 46567900 -135180187 + MERVL_2A-int LTR ERVL 2284 2458 -3027 6 940 313 270 102 16 chr2 46567954 46568025 -135180062 - MTE2b LTR MaLR -2 377 296 7 940 312 317 68 72 chr2 46568025 46568238 -135179849 - RLTR25B LTR ERVK 0 1103 851 7 940 402 318 144 77 chr2 46569390 46569717 -135178370 - MTD LTR MaLR -70 349 1 7 940 2229 287 65 30 chr2 46569753 46570634 -135177453 + MERVL_2A-int LTR ERVL 2674 3585 -2176 6 940 2471 164 39 18 chr2 46570782 46571218 -135176869 + RLTR41 LTR ERV1 2 446 0 7 940 2112 301 74 28 chr2 46572846 46573932 -135174155 + MERVL_2A-int LTR ERVL 4547 5682 -75 6 940 405 352 37 37 chr2 46573989 46574231 -135173856 + MT2A LTR ERVL 1 242 -291 7 940 398 242 22 52 chr2 46578763 46578898 -135169189 - RLTR9A LTR ERVK -2 366 236 8 940 267 299 183 30 chr2 46586171 46586340 -135161747 - RLTR9A LTR ERVK -173 195 1 8 940 3207 51 179 2 chr2 46597809 46598244 -135149843 - RLTR1B LTR ERV1 0 512 1 9 940 2545 216 43 74 chr2 46609780 46610401 -135137686 - RLTR18 LTR ERVK -11 605 4 1 940 1243 251 62 27 chr2 46614654 46615056 -135133031 + MTD LTR MaLR 1 416 -3 1 940 485 345 17 6 chr2 46619355 46619527 -135128560 - MT2A LTR ERVL -88 445 272 1 940 736 256 46 23 chr2 46619540 46619756 -135128331 - MT2A LTR ERVL -312 221 1 1 940 1187 276 61 56 chr2 46624042 46624453 -135123634 - MTD LTR MaLR -5 414 2 1 940 805 290 26 9 chr2 46631649 46631875 -135116212 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 141 1 940 2206 273 40 152 chr2 46631959 46632480 -135115607 - ORR1D2-int LTR MaLR 0 1370 947 1 940 2206 273 40 152 chr2 46632573 46633113 -135114974 - ORR1D2-int LTR MaLR -424 946 428 1 940 270 146 0 0 chr2 46633256 46633304 -135114783 - RMER19A LTR ERVK -22 715 668 1 940 1731 91 55 0 chr2 46633305 46633558 -135114529 - RMER19A LTR ERVK -46 691 425 1 940 1222 286 53 62 chr2 46633568 46633944 -135114143 - ORR1D2-int LTR MaLR -938 432 48 1 940 1222 286 53 62 chr2 46633986 46634042 -135114045 - ORR1D2-int LTR MaLR -1323 47 4 1 940 610 280 10 67 chr2 46634074 46634269 -135113818 - ORR1D2 LTR MaLR -135 235 52 1 940 225 277 0 0 chr2 46634787 46634852 -135113235 - ORR1D2 LTR MaLR -314 65 1 1 940 274 289 0 53 chr2 46636050 46636145 -135111942 - MTD LTR MaLR 0 419 330 1 940 352 348 63 31 chr2 46636140 46636210 -135111877 + LTR16B LTR ERVL 196 268 -195 1 940 2175 174 81 142 chr2 46636210 46636941 -135111146 + RMER6C LTR ERVK 5 690 0 1 940 352 348 63 31 chr2 46636941 46637125 -135110962 + LTR16B LTR ERVL 269 457 -6 1 940 3422 25 2 0 chr2 46644107 46644502 -135103585 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 940 609 329 72 35 chr2 46649545 46649835 -135098252 - MLT2B1 LTR ERVL -216 304 4 1 940 1074 280 26 42 chr2 46651075 46651384 -135096703 + MTE2a LTR MaLR 68 371 -8 1 940 1161 249 119 9 chr2 46661066 46661402 -135086685 - ORR1D1 LTR MaLR -1 373 1 1 941 1140 229 53 7 chr2 46666013 46666076 -135082011 - MurERV4-int LTR ERVK -141 5119 5050 1 941 1140 229 53 7 chr2 46666133 46666373 -135081714 - MurERV4-int LTR ERVK -211 5049 4802 1 941 7946 172 50 6 chr2 46666386 46666656 -135081431 - MurERV4-int LTR ERVK -1273 3987 3705 1 941 15725 206 50 34 chr2 46666689 46670147 -135077940 - MurERV4-int LTR ERVK -1556 3704 198 1 941 252 185 185 0 chr2 46670150 46670215 -135077872 - MurERV4-int LTR ERVK -5183 77 1 1 941 305 295 45 54 chr2 46670215 46670326 -135077761 - RMER4A LTR ERVK 0 466 357 1 941 615 310 102 66 chr2 46670317 46670621 -135077466 - RMER4B LTR ERVK -150 435 121 1 941 287 352 94 47 chr2 46678533 46678682 -135069405 - MLT1E1A LTR MaLR -162 518 363 1 941 271 154 19 0 chr2 46681229 46681281 -135066806 - ORR1C2 LTR MaLR -2 392 340 2 941 2666 223 136 74 chr2 46681904 46682437 -135065650 - RLTR22_Mur LTR ERVK -224 1624 1117 2 941 2666 223 136 74 chr2 46682493 46682516 -135065571 - RLTR22_Mur LTR ERVK -732 1116 1115 2 941 2666 223 136 74 chr2 46682572 46682802 -135065285 - RLTR22_Mur LTR ERVK -734 1114 789 2 941 2666 223 136 74 chr2 46682863 46683051 -135065036 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1060 788 588 2 941 1877 230 113 20 chr2 46684379 46684917 -135063170 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1260 588 1 2 941 948 224 125 86 chr2 46685511 46685814 -135062273 - ORR1C2 LTR MaLR -68 316 2 2 941 3477 245 57 57 chr2 46685806 46686090 -135061997 - ORR1C2-int LTR MaLR -2 1368 1083 2 941 3477 258 69 53 chr2 46686236 46687393 -135060694 - ORR1C2-int LTR MaLR -299 1210 1 2 941 1376 190 22 191 chr2 46687393 46687855 -135060232 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 2 941 426 314 80 42 chr2 46689120 46689359 -135058728 - RLTR16 LTR ERVK -234 271 24 2 941 1874 96 31 31 chr2 46689894 46690216 -135057871 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 2 941 17684 147 30 21 chr2 46690216 46696926 -135051161 - ETnERV2-int LTR ERVK -204 7202 1 2 941 1885 105 28 22 chr2 46696926 46697246 -135050841 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 2 941 358 293 111 49 chr2 46701453 46701679 -135046408 + MLT2C2 LTR ERVL 26 265 -199 2 941 7009 78 14 73 chr2 46702274 46703414 -135044673 - MTA_Mm-int LTR MaLR -25 1073 1 2 941 3222 56 2 0 chr2 46703416 46703809 -135044278 - MTA_Mm LTR MaLR -2 394 1 2 941 248 158 0 0 chr2 46705653 46705710 -135042377 - MT2A LTR ERVL 0 533 477 2 941 1864 213 33 121 chr2 46719720 46720264 -135027823 - RMER20B LTR ERVK -131 496 1 2 941 246 317 0 88 chr2 46728137 46728251 -135019836 - RMER12 LTR ERVK -487 835 732 2 941 444 292 95 107 chr2 46729251 46729673 -135018414 - RMER10A LTR ERVL -14 428 12 2 941 1511 199 24 91 chr2 46732052 46732427 -135015660 - ORR1B1 LTR MaLR -4 390 41 2 941 426 312 75 21 chr2 46734770 46734964 -135013123 - MLT1B LTR MaLR 0 467 188 2 941 563 226 0 9 chr2 46736523 46736639 -135011448 - RMER4B LTR ERVK 0 585 471 2 941 1705 221 18 39 chr2 46736800 46737190 -135010897 - RMER4B LTR ERVK -196 389 8 2 941 1862 259 88 32 chr2 46737825 46738391 -135009696 - RMER19B LTR ERVK 0 902 305 2 941 1035 236 237 18 chr2 46739212 46739549 -135008538 + MTD LTR MaLR 1 411 -8 2 941 805 287 38 61 chr2 46739723 46740016 -135008071 - ORR1D2 LTR MaLR -88 286 1 2 941 280 183 139 14 chr2 46745365 46745437 -135002650 + RLTR16 LTR ERVK 425 505 0 3 941 996 202 47 105 chr2 46745437 46745709 -135002378 + RMER2 LTR ERV1 312 567 0 3 941 5777 82 73 39 chr2 46752944 46753839 -134994248 + RLTR13B3 LTR ERVK 5 929 0 3 941 754 294 61 0 chr2 46763982 46764196 -134983891 + MTE2b LTR MaLR 145 371 -8 3 941 265 174 0 104 chr2 46768184 46768261 -134979826 + RLTR25A LTR ERVK 514 582 -521 3 941 1447 257 9 15 chr2 46771221 46771545 -134976542 + MTD LTR MaLR 3 324 -95 3 941 427 339 19 68 chr2 46775868 46776074 -134972013 + RMER15 LTR ERVL 336 531 -44 3 941 414 214 155 49 chr2 46778114 46778340 -134969747 + RMER17C LTR ERVK 161 410 0 3 941 1372 297 90 96 chr2 46778460 46779017 -134969070 + RMER17C-int LTR ERVK 81 617 -2621 3 941 8661 202 121 56 chr2 46779380 46781489 -134966598 + RMER17C-int LTR ERVK 618 2871 -367 3 941 8661 159 78 38 chr2 46781521 46781863 -134966224 + RMER17C-int LTR ERVK 2872 3237 -1 3 941 455 245 143 60 chr2 46781889 46782036 -134966051 + RMER17C LTR ERVK 41 187 -223 3 941 455 245 143 60 chr2 46782121 46782189 -134965898 + RMER17C LTR ERVK 188 274 -136 3 941 2158 171 88 2 chr2 46783385 46783529 -134964558 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 1029 1183 -1143 3 941 2158 171 88 2 chr2 46783640 46783994 -134964093 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 1184 1569 -757 3 941 1433 151 8 12 chr2 46785539 46785787 -134962300 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 1568 1814 -512 3 941 2329 181 41 0 chr2 46790373 46790866 -134957221 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 1813 2325 -1 3 941 2272 229 52 15 chr2 46790867 46791391 -134956696 + RLTR20B3 LTR ERVK 17 559 -18 3 942 1267 263 110 67 chr2 46792786 46793355 -134954732 - RLTR26 LTR ERVK 0 642 19 3 942 3081 6 0 32 chr2 46793607 46793985 -134954102 - MT2_Mm LTR ERVL -127 366 1 3 942 314 0 0 0 chr2 46793985 46794023 -134954064 - MERVL-int LTR ERVL 0 5485 5448 3 942 400 123 13 40 chr2 46794023 46794099 -134953988 - ORR1A3-int LTR MaLR -1323 640 567 3 942 813 47 9 0 chr2 46794099 46794206 -134953881 - MERVL-int LTR ERVL -114 5371 5264 3 942 763 288 52 33 chr2 46794844 46795149 -134952938 - RMER5 LTR ERV1 -185 349 39 3 942 474 288 45 106 chr2 46812532 46812926 -134935161 + MTE2b LTR MaLR 25 379 0 4 942 691 273 62 48 chr2 46839217 46839509 -134908578 + RLTR15 LTR ERVK 33 328 -31 4 942 474 247 35 85 chr2 46840650 46840923 -134907164 + MYSERV-int LTR ERVK 3775 4005 -2545 4 942 497 333 26 44 chr2 46840933 46841275 -134906812 + MYSERV-int LTR ERVK 4459 4794 -1756 4 942 277 348 38 71 chr2 46841348 46841586 -134906501 + RLTR15 LTR ERVK 114 343 -16 4 942 2270 191 60 4 chr2 46843383 46843846 -134904241 - RMER20A LTR ERVK -27 489 1 4 942 266 320 37 53 chr2 46850698 46850942 -134897145 + RMER17C LTR ERVK 14 253 -157 4 942 369 321 56 30 chr2 46854483 46854854 -134893233 - MuLV-int LTR ERV1 -2461 5317 4769 4 942 602 364 40 30 chr2 46855332 46856053 -134892034 - MuLV-int LTR ERV1 -3314 4292 3601 4 942 392 324 50 73 chr2 46856461 46856570 -134891517 - RLTR6-int LTR ERV1 -4517 3261 3151 4 942 3256 31 29 0 chr2 46856570 46856955 -134891132 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 942 392 327 45 69 chr2 46856955 46857322 -134890765 - RLTR6-int LTR ERV1 -4628 3150 2663 4 942 671 279 229 30 chr2 46857343 46857845 -134890242 + RMER20B LTR ERVK 1 602 -25 4 942 250 313 116 52 chr2 46860436 46860591 -134887496 - RLTR33 LTR ERVK -85 593 429 4 942 601 308 64 12 chr2 46862141 46862391 -134885696 + RMER15-int LTR ERVL 981 1243 -3756 4 942 283 298 62 31 chr2 46863931 46864059 -134884028 + RMER15 LTR ERVL 440 571 -4 4 942 917 311 103 24 chr2 46871800 46872139 -134875948 + MTE2b LTR MaLR 13 378 -1 4 942 1168 328 151 30 chr2 46872140 46872811 -134875276 + MTE2b-int LTR MaLR 1 753 -827 4 942 856 278 59 47 chr2 46879116 46879456 -134868631 + MTEb LTR MaLR 16 359 -20 4 942 237 291 75 11 chr2 46880854 46881018 -134867069 - MTEb LTR MaLR 0 379 201 4 942 264 333 25 8 chr2 46881178 46881296 -134866791 + ORR1D-int LTR MaLR 292 411 -959 4 942 566 302 0 81 chr2 46881828 46882051 -134866036 + ORR1D-int LTR MaLR 400 604 -766 4 942 1863 144 42 60 chr2 46890163 46890496 -134857591 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 5 942 1452 241 36 26 chr2 46892091 46892353 -134855734 + RLTR20A LTR ERVK 1 261 -280 5 942 1452 242 38 24 chr2 46892590 46892788 -134855299 + RLTR20A LTR ERVK 262 541 0 5 942 1684 165 4 0 chr2 46894145 46894424 -134853663 + ORR1A2 LTR MaLR 48 327 0 5 942 2198 133 29 3 chr2 46897343 46897691 -134850396 - IAPEY2_LTR LTR ERVK 0 357 1 5 942 457 315 14 7 chr2 46902196 46902340 -134845747 - RLTR18B LTR ERVK 0 512 368 5 942 2709 99 35 5 chr2 46904204 46904598 -134843489 - MTB_Mm LTR MaLR -1 406 1 5 942 439 305 248 82 chr2 46908433 46908751 -134839336 - ORR1E LTR MaLR 0 374 4 5 942 2850 41 3 0 chr2 46918705 46919048 -134829039 - ORR1A1 LTR MaLR -2 344 1 5 943 1851 220 17 119 chr2 46924451 46925040 -134823047 + RLTR24 LTR ERV1 1 529 0 5 943 610 220 95 41 chr2 46925761 46925894 -134822193 + RLTR19-int LTR ERVK 2002 2136 -3386 5 943 610 247 125 54 chr2 46926094 46926366 -134821721 + RLTR19-int LTR ERVK 2137 2678 -3459 5 943 406 210 50 106 chr2 46926596 46926756 -134821331 + RLTR19-int LTR ERVK 2892 3042 -3095 5 943 1005 245 87 93 chr2 46927016 46927488 -134820599 + RLTR19-int LTR ERVK 3641 4109 -2028 5 943 676 252 59 67 chr2 46927552 46927807 -134820280 + RLTR19-int LTR ERVK 4128 4380 -1757 5 943 1881 211 48 79 chr2 46927969 46928140 -134819947 + RLTR24 LTR ERV1 1 165 -364 5 943 1881 211 48 79 chr2 46928172 46928546 -134819541 + RLTR24 LTR ERV1 166 529 0 5 943 362 372 59 40 chr2 46928866 46929188 -134818899 - MT2A LTR ERVL -203 330 3 5 943 289 241 11 0 chr2 46929205 46929292 -134818795 - MERVL_2A-int LTR ERVL -15 5746 5659 5 943 1790 308 42 17 chr2 46929506 46930215 -134817872 - MERVL_2A-int LTR ERVL -332 5429 4703 5 943 1138 325 40 81 chr2 46930870 46931472 -134816615 - MERVL_2A-int LTR ERVL -1044 4717 4141 5 943 1318 318 57 44 chr2 46931625 46932221 -134815866 - MERVL_2A-int LTR ERVL -1646 4115 3520 5 943 1318 318 57 44 chr2 46932805 46932878 -134815209 - MERVL_2A-int LTR ERVL -2242 3519 3447 5 943 1318 318 57 44 chr2 46933323 46933423 -134814664 - MERVL_2A-int LTR ERVL -2315 3446 3336 5 943 1732 236 23 25 chr2 46933423 46933818 -134814269 - MERVL_2A-int LTR ERVL -3352 2409 2016 5 943 717 336 70 32 chr2 46933856 46934200 -134813887 + ORR1D2 LTR MaLR 1 357 -13 5 943 740 315 58 95 chr2 46934455 46934802 -134813285 - MTE2a LTR MaLR -45 334 1 5 943 614 332 65 6 chr2 46935154 46935490 -134812597 - MERVL_2A-int LTR ERVL -4604 1157 802 5 943 1826 213 68 59 chr2 46945657 46945743 -134802344 + RLTR31A_Mm LTR ERVK 1 87 -497 5 943 1826 213 68 59 chr2 46945840 46946331 -134801756 + RLTR31A_Mm LTR ERVK 88 583 -1 5 943 1479 168 157 28 chr2 46949983 46950308 -134797779 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 6 943 1214 248 46 2 chr2 46954167 46954475 -134793612 + MTC LTR MaLR 1 318 -101 6 943 256 286 79 107 chr2 46954555 46954872 -134793215 - RMER17C LTR ERVK -70 340 33 6 943 473 274 16 39 chr2 46954943 46955072 -134793015 + MTC LTR MaLR 288 413 -8 6 943 1939 201 6 3 chr2 46956763 46957127 -134790960 + ORR1B2 LTR MaLR 3 367 0 6 943 1015 207 230 4 chr2 46964598 46964855 -134783232 + MT2B LTR ERVL 219 601 0 6 943 3403 241 32 16 chr2 46964855 46965669 -134782418 - MTC-int LTR MaLR -431 827 1 6 943 1284 241 84 3 chr2 46965669 46965989 -134782098 - MTC LTR MaLR 0 421 76 6 943 250 191 101 14 chr2 46967951 46968020 -134780067 - MTC LTR MaLR -346 75 1 6 943 2808 89 13 10 chr2 46968527 46968922 -134779165 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 943 812 353 86 10 chr2 46973265 46973674 -134774413 + MLT2B2 LTR ERVL 1 440 -75 6 943 276 323 54 0 chr2 46978113 46978206 -134769881 - LTR86A2 LTR ERVL -64 444 347 6 943 267 304 37 64 chr2 46994972 46995081 -134753006 + ORR1E LTR MaLR 3 108 -251 6 943 978 327 33 3 chr2 46995084 46995452 -134752635 - MTE2a LTR MaLR 0 379 1 6 943 428 280 117 38 chr2 46995455 46995736 -134752351 - MTE2a-int LTR MaLR -3 1577 1096 6 943 279 295 186 24 chr2 46995761 46995825 -134752262 - MTE2a-int LTR MaLR -275 1095 1028 6 943 379 338 71 18 chr2 46995883 46996109 -134751978 - MTE2a-int LTR MaLR -1341 239 2 6 943 563 328 6 6 chr2 46996110 46996291 -134751796 - MTE2a LTR MaLR 0 379 199 6 943 686 283 14 60 chr2 46996451 46996669 -134751418 - MTE2a LTR MaLR -162 217 10 6 943 1622 212 63 32 chr2 47013980 47014360 -134733727 - ORR1B1 LTR MaLR -2 392 1 1 943 5097 231 65 76 chr2 47014360 47014465 -134733622 - ORR1B1-int LTR MaLR 0 1509 1413 1 943 5097 231 65 76 chr2 47014620 47016036 -134732051 - ORR1B1-int LTR MaLR -97 1412 4 1 943 3882 194 98 18 chr2 47016833 47017487 -134730600 + RLTR25A LTR ERVK 8 689 -414 1 943 3882 194 98 18 chr2 47017701 47017925 -134730162 + RLTR25A LTR ERVK 690 956 -147 1 943 573 254 62 128 chr2 47018318 47018471 -134729616 + RLTR25B LTR ERVK 757 903 -125 1 943 573 254 62 128 chr2 47018557 47018659 -134729428 + RLTR25B LTR ERVK 904 995 -33 1 943 1477 191 169 26 chr2 47018662 47018813 -134729274 - ORR1B1 LTR MaLR -1 393 238 1 943 3768 68 51 63 chr2 47018813 47019380 -134728707 + LTRIS2 LTR ERV1 5 564 0 1 943 1477 191 169 26 chr2 47019380 47019420 -134728667 - ORR1B1 LTR MaLR -157 237 151 1 943 1477 191 169 26 chr2 47019470 47019621 -134728466 - ORR1B1 LTR MaLR -244 150 1 1 943 1268 192 181 12 chr2 47023851 47024188 -134723899 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 2 943 2071 229 145 10 chr2 47026490 47026738 -134721349 + RLTR25B LTR ERVK 327 609 -419 2 943 2071 229 145 10 chr2 47026861 47027224 -134720863 + RLTR25B LTR ERVK 610 1020 -8 2 943 1377 97 5 0 chr2 47034282 47034477 -134713610 - MTA_Mm LTR MaLR 0 400 205 3 943 1785 44 13 0 chr2 47034589 47034818 -134713269 - MTA_Mm LTR MaLR -164 232 1 3 943 8483 54 14 1 chr2 47034818 47035902 -134712185 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 3 943 3066 59 10 2 chr2 47035902 47036295 -134711792 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 943 928 299 70 49 chr2 47037722 47038091 -134709996 - MTEb LTR MaLR 0 379 3 4 943 740 280 129 41 chr2 47038268 47038610 -134709477 + MTE2a LTR MaLR 44 405 -14 4 943 1169 274 39 0 chr2 47038626 47038911 -134709176 - MTD LTR MaLR -12 407 112 4 943 236 271 157 0 chr2 47041977 47042047 -134706040 + LTR48 LTR ERV1 16 96 -691 5 943 3502 20 0 0 chr2 47044481 47044877 -134703210 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 943 1834 196 59 27 chr2 47045771 47046179 -134701908 - MTC LTR MaLR 0 421 1 5 943 1272 225 110 9 chr2 47046645 47046973 -134701114 + ORR1D1 LTR MaLR 2 362 -12 5 943 242 303 67 0 chr2 47048136 47048225 -134699862 - MLT1D LTR MaLR -399 106 12 5 943 2333 125 94 31 chr2 47051177 47051624 -134696463 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 6 943 4684 71 9 39 chr2 47051625 47052299 -134695788 + IAPEz-int LTR ERVK 9 662 -5819 6 943 2252 61 0 0 chr2 47052299 47052577 -134695510 + IAPEz-int LTR ERVK 1359 1636 -4845 6 943 6036 46 4 12 chr2 47052576 47053326 -134694761 + IAPEz-int LTR ERVK 5736 6479 -2 6 943 2354 113 85 100 chr2 47053328 47053810 -134694277 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 6 944 3044 63 5 18 chr2 47057446 47057847 -134690240 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 7 944 874 311 53 26 chr2 47058337 47058641 -134689446 + MTEa LTR MaLR 3 314 -65 7 944 1853 258 34 28 chr2 47062582 47062751 -134685336 + RLTR11A2 LTR ERVK 18 186 -341 8 944 3544 123 6 160 chr2 47062751 47063225 -134684862 + MT2B LTR ERVL 1 446 -155 8 944 3544 123 6 160 chr2 47063261 47063494 -134684593 + MT2B LTR ERVL 447 599 -2 8 944 1853 258 34 28 chr2 47063494 47063831 -134684256 + RLTR11A2 LTR ERVK 187 527 0 8 944 361 211 0 0 chr2 47067908 47067984 -134680103 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 309 9 944 2809 89 15 2 chr2 47080886 47081281 -134666806 - MTB LTR MaLR 0 400 1 1 944 1655 178 102 203 chr2 47088089 47088857 -134659230 + RMER6C LTR ERVK 1 690 0 1 944 2963 153 83 30 chr2 47091938 47092502 -134655585 + MT2B LTR ERVL 1 594 -7 1 944 1048 263 55 46 chr2 47110398 47110765 -134637322 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 1 944 667 161 101 14 chr2 47111445 47111584 -134636503 + RLTR26 LTR ERVK 492 642 0 1 944 1539 216 8 19 chr2 47115489 47115852 -134632235 + RLTR15 LTR ERVK 1 359 0 1 944 226 280 130 92 chr2 47116778 47116963 -134631124 - MTEb LTR MaLR 0 379 188 1 944 580 276 71 126 chr2 47120369 47120805 -134627282 - RLTR40 LTR ERVK -15 802 391 1 944 740 287 41 41 chr2 47120915 47121209 -134626878 - RLTR40 LTR ERVK -523 294 1 1 944 267 372 45 39 chr2 47121538 47121692 -134626395 + LTR40a LTR ERVL 186 340 -179 1 944 277 328 82 51 chr2 47138609 47138866 -134609221 - RMER2 LTR ERV1 0 567 303 1 944 2472 59 68 0 chr2 47144974 47145297 -134602790 + ORR1A1 LTR MaLR 2 346 0 1 944 3056 137 63 9 chr2 47145753 47146278 -134601809 - RLTR31_Mur LTR ERVK 0 553 1 1 944 415 330 48 67 chr2 47162723 47163009 -134585078 + MLT1A LTR MaLR 1 288 -102 2 944 227 307 79 86 chr2 47164482 47164621 -134583466 - LTR48 LTR ERV1 -648 139 2 2 944 1026 242 17 4 chr2 47169494 47169735 -134578352 - RMER6A LTR ERVK -6 750 507 2 944 1122 181 60 125 chr2 47169761 47170096 -134577991 - RMER6-int LTR ERVK -334 2843 2531 2 944 2650 203 60 10 chr2 47170126 47170724 -134577363 - RMER6-int LTR ERVK -2543 634 7 2 944 2180 189 91 34 chr2 47170774 47171241 -134576846 - RMER6A LTR ERVK -121 599 111 2 944 2973 63 5 12 chr2 47171241 47171640 -134576447 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 944 2180 176 93 34 chr2 47171640 47171756 -134576331 - RMER6A LTR ERVK -646 110 3 2 944 1610 144 30 89 chr2 47172438 47172774 -134575313 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 79 2 944 5081 119 35 80 chr2 47176196 47177145 -134570942 + RMER17A2 LTR ERVK 1 906 0 2 944 2565 68 74 25 chr2 47177146 47177538 -134570549 - IAPLTR2a LTR ERVK 0 411 1 2 944 2294 79 0 12 chr2 47181086 47181407 -134566680 + ORR1A1 LTR MaLR 1 317 -29 2 945 646 315 108 7 chr2 47202217 47202505 -134545582 - MLT1B LTR MaLR 0 390 74 2 945 1266 243 67 64 chr2 47204290 47204824 -134543263 + MT2B LTR ERVL 3 599 -2 2 945 226 291 177 0 chr2 47209999 47210078 -134538009 - MTE2a LTR MaLR -282 97 5 2 945 2009 178 70 47 chr2 47211088 47211531 -134536556 - RLTR11B LTR ERVK 0 453 1 2 945 1276 250 84 32 chr2 47213049 47213429 -134534658 - MTD LTR MaLR -15 404 5 3 945 2738 52 0 36 chr2 47216149 47216507 -134531580 - IAPLTR4 LTR ERVK 0 345 1 3 945 1758 161 178 155 chr2 47217073 47217461 -134530626 + RMER6C LTR ERVK 4 455 -235 3 945 1758 161 178 155 chr2 47218368 47218649 -134529438 + RMER6C LTR ERVK 456 688 -2 3 945 295 229 83 106 chr2 47218903 47219035 -134529052 - LTR41 LTR ERVL -635 133 5 3 945 556 275 95 121 chr2 47223499 47223772 -134524315 - MTC LTR MaLR -2 419 154 3 945 3210 139 4 4 chr2 47224824 47225323 -134522764 - RLTR33 LTR ERVK 0 678 180 3 945 1957 171 191 107 chr2 47226401 47227036 -134521051 + RMER6C LTR ERVK 1 688 -2 3 945 1704 125 95 3 chr2 47229639 47229935 -134518152 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 5 3 945 2804 123 62 39 chr2 47243621 47244072 -134504015 - RMER17A2 LTR ERVK 0 906 462 3 945 2804 123 62 39 chr2 47244204 47244287 -134503800 - RMER17A2 LTR ERVK -445 461 362 3 945 2058 127 14 47 chr2 47246006 47246370 -134501717 - RMER17A2 LTR ERVK -554 352 1 3 945 1247 188 16 48 chr2 47246724 47246975 -134501112 + ORR1B2 LTR MaLR 53 295 -72 3 945 255 350 20 0 chr2 47248266 47248366 -134499721 - RMER15 LTR ERVL -103 472 371 3 945 462 343 100 23 chr2 47251546 47251856 -134496231 - MLT1A0 LTR MaLR -31 334 1 3 945 291 384 42 51 chr2 47254773 47254987 -134493100 + MTD LTR MaLR 1 212 -207 3 945 1034 104 33 60 chr2 47255761 47255945 -134492142 + RMER17B LTR ERVK 5 183 -775 3 945 536 146 0 11 chr2 47255941 47256031 -134492056 + RMER17B LTR ERVK 866 954 -4 3 945 6412 96 17 33 chr2 47256036 47256973 -134491114 - MERVK26-int LTR ERVK -5997 922 1 3 945 1477 154 61 8 chr2 47256973 47257235 -134490852 - RLTR26 LTR ERVK 0 642 367 3 945 1917 184 33 16 chr2 47257323 47257688 -134490399 - RLTR26 LTR ERVK -271 371 1 3 945 1785 244 29 14 chr2 47259658 47260073 -134488014 - MTC LTR MaLR 0 421 1 3 945 2175 330 94 60 chr2 47264495 47264925 -134483162 + MTEa-int LTR MaLR 288 747 -833 3 945 4318 102 5 125 chr2 47264925 47265775 -134482312 + RMER17A LTR ERVK 1 748 -3 3 945 2175 330 94 60 chr2 47265775 47266588 -134481499 + MTEa-int LTR MaLR 748 1573 -7 3 945 1048 311 53 45 chr2 47266607 47266727 -134481360 + MTEa LTR MaLR 18 140 -239 3 945 3459 20 2 0 chr2 47266727 47267122 -134480965 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 945 9385 26 3 0 chr2 47267122 47268217 -134479870 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 3 945 3459 20 2 0 chr2 47268217 47268612 -134479475 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 945 1048 311 53 45 chr2 47268612 47268846 -134479241 + MTEa LTR MaLR 141 375 -4 3 945 1614 221 51 51 chr2 47296196 47296667 -134451420 + RMER6C LTR ERVK 220 690 0 4 945 1323 207 147 66 chr2 47299072 47299850 -134448237 - RMER6C LTR ERVK 0 720 1 4 946 607 244 59 43 chr2 47319560 47319813 -134428274 - MER34B-int LTR ERV1 -3105 2251 1995 4 946 282 324 67 29 chr2 47321349 47321454 -134426633 + MTE2a LTR MaLR 62 170 -209 4 946 676 237 26 13 chr2 47321472 47321626 -134426461 + MTE2a LTR MaLR 223 378 -1 4 946 589 307 73 70 chr2 47322914 47322945 -134425142 + MTEa LTR MaLR 1 32 -347 4 946 1386 147 112 115 chr2 47322945 47323149 -134424938 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 99 4 946 1386 147 112 115 chr2 47323335 47323460 -134424627 - ORR1A4 LTR MaLR -231 98 1 4 946 589 307 73 70 chr2 47323460 47323701 -134424386 + MTEa LTR MaLR 33 274 -105 4 946 1392 214 48 7 chr2 47326684 47326994 -134421093 - ORR1C1 LTR MaLR -55 323 1 4 946 284 299 103 0 chr2 47328735 47328822 -134419265 - MLT1B LTR MaLR -2 388 293 4 946 434 284 121 18 chr2 47329084 47329307 -134418780 + MTB_Mm LTR MaLR 176 402 -5 4 946 2935 32 3 0 chr2 47332711 47333056 -134415031 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 4 946 2338 32 0 0 chr2 47333056 47333338 -134414749 - ORR1A0-int LTR MaLR 0 1792 1511 4 946 3583 39 22 0 chr2 47333330 47333792 -134414295 - ORR1A0-int LTR MaLR -1320 472 1 4 946 2861 41 3 0 chr2 47333792 47334137 -134413950 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 4 946 312 301 85 47 chr2 47337507 47337636 -134410451 + ORR1C1 LTR MaLR 47 180 -194 4 946 737 261 75 0 chr2 47337763 47337962 -134410125 + ORR1C1 LTR MaLR 163 376 -2 4 946 929 257 38 3 chr2 47342747 47343036 -134405051 + RMER10A LTR ERVL 9 307 -135 4 946 422 303 48 0 chr2 47343031 47343176 -134404911 + RMER10B LTR ERVL 191 342 -56 4 946 873 182 24 29 chr2 47350910 47351080 -134397007 - RMER20B LTR ERVK -278 349 181 5 946 293 216 20 0 chr2 47351074 47351125 -134396962 - RMER20B LTR ERVK -575 52 1 5 946 1751 223 71 9 chr2 47351154 47351593 -134396494 - RLTR18-int LTR ERVK -9 5352 4887 5 946 1228 274 45 84 chr2 47352229 47352787 -134395300 - RLTR18-int LTR ERVK -497 4864 4329 5 946 601 262 75 14 chr2 47352849 47353062 -134395025 - RLTR18-int LTR ERVK -1021 4340 4115 5 946 764 288 31 5 chr2 47353791 47354014 -134394073 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 150 5 946 688 179 7 7 chr2 47354104 47354239 -134393848 - ORR1C1 LTR MaLR -232 135 1 5 946 337 206 68 27 chr2 47360883 47361052 -134387035 - RLTR42-int LTR ERVK -3380 2142 1936 5 946 303 231 15 0 chr2 47362266 47362331 -134385756 - RLTR42-int LTR ERVK -3658 1864 1799 5 946 349 294 119 64 chr2 47362377 47362628 -134385459 - RLTR42-int LTR ERVK -3727 1795 1531 5 946 946 254 16 8 chr2 47362782 47363032 -134385055 - RLTR18-int LTR ERVK -1783 3578 3327 5 946 754 193 13 13 chr2 47365312 47365464 -134382623 - RLTR18-int LTR ERVK -2033 3328 3177 5 946 773 255 22 0 chr2 47365458 47365642 -134382445 - RLTR18-int LTR ERVK -2359 3002 2815 5 946 296 217 43 21 chr2 47365650 47365744 -134382343 - RLTR18-int LTR ERVK -2688 2673 2578 5 946 352 291 10 0 chr2 47366290 47366393 -134381694 - RLTR18-int LTR ERVK -5169 192 89 5 946 424 324 77 86 chr2 47366491 47366818 -134381269 - RMER20B LTR ERVK -6 506 183 5 946 524 287 113 38 chr2 47366857 47367096 -134380991 - RLTR18 LTR ERVK -335 281 25 5 946 359 357 66 37 chr2 47370453 47370689 -134377398 + ORR1E LTR MaLR 3 233 -141 5 946 1916 176 66 124 chr2 47372019 47372679 -134375408 + RMER6C LTR ERVK 1 690 0 5 946 2652 191 106 19 chr2 47376170 47376394 -134371693 - RLTR33 LTR ERVK 0 678 441 5 946 2652 191 106 19 chr2 47376448 47376847 -134371240 - RLTR33 LTR ERVK -238 440 2 5 946 1635 175 97 29 chr2 47377479 47377862 -134370225 + RLTR9E LTR ERVK 1 409 0 5 946 3015 217 75 86 chr2 47377864 47379045 -134369042 + MMETn-int LTR ERVK 2 1169 -3675 5 946 673 243 6 51 chr2 47379044 47379222 -134368865 + ETnERV2-int LTR ERVK 2428 2597 -4809 5 946 1829 154 62 7 chr2 47383840 47384148 -134363939 + ORR1A4 LTR MaLR 1 325 -4 5 946 2986 62 10 0 chr2 47384846 47385230 -134362857 - RLTR10 LTR ERVK -2 388 1 5 946 2929 68 201 2 chr2 47385710 47386137 -134361950 + RLTR1B LTR ERV1 1 512 0 5 946 27127 28 2 9 chr2 47386137 47389399 -134358688 + MMERGLN-int LTR ERV1 1 3252 -4304 5 946 7176 17 0 0 chr2 47389397 47390209 -134357878 + MMERGLN-int LTR ERV1 6745 7556 0 5 946 928 73 75 6 chr2 47390209 47390449 -134357638 + RLTR1B LTR ERV1 1 326 -186 5 946 406 71 0 0 chr2 47390701 47390757 -134357330 + RLTR1B LTR ERV1 457 512 0 5 946 3314 181 80 15 chr2 47393447 47394097 -134353990 + RLTR17 LTR ERVK 1 692 0 5 946 3351 25 5 5 chr2 47397434 47397830 -134350257 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 946 2934 18 3 0 chr2 47401350 47401686 -134346401 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 337 0 5 946 55023 24 18 7 chr2 47401686 47408089 -134339998 + IAPEz-int LTR ERVK 8 6481 0 5 946 2921 21 3 0 chr2 47408089 47408425 -134339662 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 337 0 5 946 1353 110 43 0 chr2 47409067 47409276 -134338811 + MT2B LTR ERVL 384 601 0 5 946 2197 144 14 3 chr2 47409553 47409909 -134338178 + RLTR33 LTR ERVK 1 360 -318 5 946 972 296 90 84 chr2 47409960 47410602 -134337485 - RMER13A LTR ERVK -115 745 100 5 946 1169 244 16 4 chr2 47410705 47410948 -134337139 + RLTR33 LTR ERVK 433 678 0 5 946 471 270 175 43 chr2 47411961 47412286 -134335801 - RLTR9A LTR ERVK 0 368 1 5 946 300 342 87 59 chr2 47417907 47418230 -134329857 + MLT1C LTR MaLR 132 463 -4 5 946 2260 242 13 131 chr2 47419515 47420208 -134327879 + RMER19C LTR ERVK 1 611 0 5 946 738 348 16 39 chr2 47424904 47425212 -134322875 + MTEa LTR MaLR 1 301 -78 5 946 471 169 0 0 chr2 47432435 47432512 -134315575 + ORR1B2 LTR MaLR 283 359 -8 6 946 1191 311 12 6 chr2 47434214 47434557 -134313530 - MTE2b LTR MaLR -2 377 33 6 946 552 316 50 75 chr2 47438074 47438460 -134309627 - RLTR26 LTR ERVK -225 417 14 6 946 1000 284 78 26 chr2 47438660 47438967 -134309120 + MTD LTR MaLR 1 323 -96 6 946 233 252 47 37 chr2 47442655 47442762 -134305325 + MER72B LTR ERV1 280 387 -381 6 947 2757 67 3 0 chr2 47460862 47461206 -134286881 + IAPLTR4 LTR ERVK 1 345 0 6 947 516 339 34 124 chr2 47464813 47465136 -134282951 + MLT2B3 LTR ERVL 3 296 -258 6 947 458 271 107 6 chr2 47466195 47466373 -134281714 + RMER5 LTR ERV1 158 353 -181 6 947 778 229 15 59 chr2 47466368 47466572 -134281515 - RMER5 LTR ERV1 -339 195 1 6 947 1219 248 25 0 chr2 47466605 47466883 -134281204 - RLTR18B LTR ERVK -5 507 223 6 947 1227 333 54 30 chr2 47469448 47469983 -134278104 - MLT2B3 LTR ERVL -6 548 1 6 947 690 247 6 12 chr2 47470158 47470322 -134277765 + RMER5 LTR ERV1 47 209 -325 6 947 1248 156 36 118 chr2 47470323 47470450 -134277637 + RMER16 LTR ERVK 1 242 -291 6 947 1248 209 89 97 chr2 47470914 47471202 -134276885 + RMER16 LTR ERVK 243 533 0 6 947 3122 49 2 32 chr2 47471203 47471605 -134276482 + RLTR10 LTR ERVK 1 390 0 6 947 7107 44 33 2 chr2 47471615 47472544 -134275543 + RLTR10-int LTR ERVK 41 998 -989 6 947 307 279 31 8 chr2 47472608 47472738 -134275349 + RLTR10-int LTR ERVK 1462 1594 -5987 6 947 8257 17 3 2 chr2 47472820 47473814 -134274273 + RLTR10-int LTR ERVK 990 1984 -3 6 947 3110 52 2 32 chr2 47473816 47474218 -134273869 + RLTR10 LTR ERVK 1 390 0 6 947 1091 217 58 27 chr2 47474223 47474517 -134273570 + RMER5 LTR ERV1 205 507 -27 6 947 2153 201 26 15 chr2 47476031 47476485 -134271602 - RMER6B LTR ERVK 0 461 3 6 947 764 272 317 7 chr2 47486572 47486857 -134261230 - MTEa LTR MaLR -5 374 1 6 947 330 257 39 26 chr2 47488014 47488154 -134259933 + MLT1D LTR MaLR 320 505 0 6 947 1721 246 77 29 chr2 47488338 47488816 -134259271 + RMER20A LTR ERVK 16 516 0 6 947 457 369 68 74 chr2 47488839 47489380 -134258707 - MLT1F2 LTR MaLR 0 560 23 6 947 627 293 30 30 chr2 47489703 47489900 -134258187 - MTD LTR MaLR -29 392 196 6 947 874 195 84 35 chr2 47490363 47490565 -134257522 - MTD LTR MaLR -207 212 1 6 947 225 286 0 0 chr2 47499923 47499979 -134248108 + MTE2b LTR MaLR 58 113 -266 6 947 1199 200 65 12 chr2 47500156 47500404 -134247683 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 134 1 947 469 343 39 18 chr2 47511987 47512269 -134235818 - RodERV21-int LTR ERV1 -93 4898 4611 2 947 257 241 0 0 chr2 47512351 47512405 -134235682 - MMERGLN-int LTR ERV1 -2682 4874 4821 2 947 6219 60 17 14 chr2 47513057 47513862 -134234225 - RLTR13C2 LTR ERVK 0 808 1 2 947 435 228 0 0 chr2 47515767 47515859 -134232228 - MT2A LTR ERVL -441 92 1 2 947 299 281 24 81 chr2 47516547 47516671 -134231416 + MLT1H LTR MaLR 433 549 0 2 947 1167 333 40 6 chr2 47516676 47517157 -134230930 + MLT1H-int LTR MaLR 3 499 -910 2 947 375 383 96 22 chr2 47517939 47518209 -134229878 + MLT1H LTR MaLR 1 290 -259 2 947 229 387 13 0 chr2 47526581 47526656 -134221431 + MER77 LTR ERVL 15 90 -517 3 947 563 397 26 56 chr2 47526842 47527306 -134220781 + MER77 LTR ERVL 156 605 -2 3 947 820 261 21 8 chr2 47528747 47528983 -134219104 - MERVL-int LTR ERVL -3151 2334 2096 3 947 2291 72 119 11 chr2 47529675 47530027 -134218060 - RLTR10 LTR ERVK 0 390 1 3 947 528 373 58 50 chr2 47530266 47530630 -134217457 + MT2A LTR ERVL 6 372 -161 3 947 7999 100 74 10 chr2 47541637 47542217 -134205870 + RMER16-int LTR ERVK 87 667 -4739 5 947 7999 100 74 10 chr2 47542304 47542982 -134205105 + RMER16-int LTR ERVK 668 1424 -3982 5 947 1012 195 9 45 chr2 47543043 47543263 -134204824 + RMER16-int LTR ERVK 1327 1538 -3868 5 947 513 290 0 7 chr2 47543391 47543537 -134204550 + RMER16-int LTR ERVK 1428 1572 -1742 5 947 4978 158 98 44 chr2 47543564 47544888 -134203199 + RMER16-int LTR ERVK 1563 3735 -3671 5 947 1528 234 118 39 chr2 47544890 47545347 -134202740 - RMER16 LTR ERVK 0 533 1 5 947 11850 115 24 18 chr2 47545347 47545538 -134202549 + RMER16-int LTR ERVK 2670 2868 -2538 5 947 11850 115 24 18 chr2 47545593 47547271 -134200816 + RMER16-int LTR ERVK 2869 4548 -858 5 947 2023 52 12 100 chr2 47547676 47547996 -134200091 + RLTR10B LTR ERVK 1 292 0 6 947 1368 82 2 6 chr2 47547996 47548184 -134199903 + RLTR10-int LTR ERVK 1 210 -6271 6 947 2266 33 128 3 chr2 47548325 47548630 -134199457 + RLTR10-int LTR ERVK 569 911 -1076 6 947 333 304 46 42 chr2 47548630 47548846 -134199241 + RLTR10-int LTR ERVK 1347 1563 -6018 6 947 2676 108 10 5 chr2 47548852 47549263 -134198824 + RMER16-int LTR ERVK 5004 5810 -1771 5 947 7402 54 3 28 chr2 47549254 47550209 -134197878 + RMER16-int LTR ERVK 6651 7581 0 5 947 2135 34 0 154 chr2 47550209 47550554 -134197533 + RLTR10B LTR ERVK 1 292 0 5 947 566 308 73 82 chr2 47551232 47551656 -134196431 + RLTR23 LTR ERV1 11 430 0 6 947 1605 167 20 122 chr2 47555876 47556333 -134191754 + RMER17C LTR ERVK 1 410 0 7 947 384 235 19 29 chr2 47568721 47568826 -134179261 + MLT2C2 LTR ERVL 10 113 -351 8 947 457 328 66 21 chr2 47571180 47571423 -134176664 + MLT2C2 LTR ERVL 38 291 -173 8 947 1381 309 33 8 chr2 47576365 47576756 -134171331 + MTD LTR MaLR 1 401 -18 9 948 274 275 0 0 chr2 47585064 47585133 -134162954 + MLT2B2 LTR ERVL 1 69 -446 9 948 229 271 36 79 chr2 47586512 47586652 -134161435 - MER72B LTR ERV1 -355 413 280 1 948 5397 219 94 23 chr2 47592242 47593383 -134154704 + RLTR21 LTR ERVK 1 1206 -366 1 948 5397 219 94 23 chr2 47593417 47593480 -134154607 + RLTR21 LTR ERVK 1207 1304 -268 1 948 5397 235 76 21 chr2 47593556 47593722 -134154365 + RLTR21 LTR ERVK 1291 1434 -138 1 948 236 333 85 9 chr2 47595834 47595940 -134152147 + MTE-int LTR MaLR 1461 1574 -6 1 948 829 321 46 55 chr2 47604583 47604929 -134143158 - ORR1E LTR MaLR -9 350 8 1 948 3647 149 28 26 chr2 47612941 47613582 -134134505 + RLTR26 LTR ERVK 1 642 0 1 948 355 317 0 9 chr2 47615423 47615528 -134132559 - MT2A LTR ERVL -106 427 324 1 948 245 184 20 0 chr2 47615745 47615794 -134132293 - MTEa LTR MaLR -326 53 4 1 948 2890 70 157 5 chr2 47616669 47617114 -134130973 - MURVY-LTR LTR ERV1 0 519 7 1 948 474 336 96 33 chr2 47629762 47630125 -134117962 + MLT2B1 LTR ERVL 3 388 -132 1 948 1002 146 7 53 chr2 47632041 47632236 -134115851 + ORR1A3 LTR MaLR 152 355 -15 1 948 7621 205 36 12 chr2 47664098 47665648 -134082439 + MurERV4_19-int LTR ERVK 1 1588 -4192 2 948 3587 35 24 0 chr2 47665648 47666112 -134081975 - ORR1A0-int LTR MaLR -1317 475 1 2 948 2885 30 15 0 chr2 47666112 47666451 -134081636 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 3 2 948 8366 166 43 2 chr2 47666452 47666512 -134081575 + MurERV4_19-int LTR ERVK 1607 1682 -4098 2 948 9618 163 40 3 chr2 47666550 47668221 -134079866 + MurERV4_19-int LTR ERVK 1683 3401 -2379 2 948 1854 153 3 0 chr2 47668274 47668582 -134079505 + MurERV4_19-int LTR ERVK 3501 3809 -1971 2 948 381 143 0 0 chr2 47668661 47668724 -134079363 + MurERV4_19-int LTR ERVK 3913 3975 -1805 2 948 2086 175 141 54 chr2 47668721 47668776 -134079311 + MurERV4_19-int LTR ERVK 5080 5133 -647 2 948 2086 175 141 54 chr2 47668948 47669537 -134078550 + MurERV4_19-int LTR ERVK 5134 5780 0 2 948 941 238 160 115 chr2 47669578 47670029 -134078058 + RMER19C LTR ERVK 107 577 -34 2 948 260 100 0 0 chr2 47670282 47670322 -134077765 + RMER19C LTR ERVK 572 611 0 2 948 1216 286 51 60 chr2 47670491 47670578 -134077509 + MT2A LTR ERVL 14 96 -437 2 948 1216 286 51 60 chr2 47671022 47671347 -134076740 + MT2A LTR ERVL 97 421 -112 2 948 2710 58 0 39 chr2 47671774 47672134 -134075953 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 2 948 795 225 73 80 chr2 47697597 47697960 -134050127 - RMER16 LTR ERVK 0 533 1 2 948 406 102 0 0 chr2 47702080 47702139 -134045948 - RMER19C LTR ERVK 0 611 553 2 948 670 266 58 128 chr2 47702148 47702548 -134045539 - RMER19C LTR ERVK -229 382 11 2 948 1764 128 84 0 chr2 47707102 47707400 -134040687 + IAPEY2_LTR LTR ERVK 35 357 0 2 949 3821 203 70 14 chr2 47711784 47712050 -134036037 + RMER19B LTR ERVK 1 274 -628 2 949 3821 203 70 14 chr2 47712194 47712286 -134035801 + RMER19B LTR ERVK 275 392 -510 2 949 3821 203 70 14 chr2 47712767 47713250 -134034837 + RMER19B LTR ERVK 393 889 -13 2 949 4060 134 97 12 chr2 47717871 47718550 -134029537 - RMER19A LTR ERVK 0 737 1 2 949 2117 114 12 12 chr2 47726304 47726623 -134021464 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 2 949 3648 177 20 45 chr2 47726627 47727390 -134020697 + ORR1A2-int LTR MaLR 1 744 -1219 2 949 3107 144 90 22 chr2 47727244 47727798 -134020289 + MT2B LTR ERVL 10 601 0 2 949 227 183 46 77 chr2 47730600 47730665 -134017422 + RMER20A LTR ERVK 186 248 -268 2 949 330 241 11 46 chr2 47736727 47736814 -134011273 + MTEa LTR MaLR 288 371 -8 3 949 233 283 31 61 chr2 47740928 47741026 -134007061 - RMER20A LTR ERVK -236 280 186 3 949 225 183 46 77 chr2 47759704 47759769 -133988318 + RMER20A LTR ERVK 186 248 -268 3 949 781 258 71 188 chr2 47762651 47763076 -133985011 + MTEa LTR MaLR 5 379 0 3 949 1524 230 39 21 chr2 47765750 47766137 -133981950 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 3 949 6443 217 52 23 chr2 47766137 47767587 -133980500 + ORR1B1-int LTR MaLR 1 1492 -17 3 949 1741 231 14 16 chr2 47768138 47768508 -133979579 + ORR1B1 LTR MaLR 26 394 0 3 949 676 317 122 27 chr2 47768872 47769200 -133978887 - MLT1A0 LTR MaLR -6 359 1 3 949 2243 109 0 27 chr2 47773792 47774123 -133973964 - ORR1A2 LTR MaLR -5 322 1 3 949 268 319 64 92 chr2 47781949 47782122 -133965965 + RLTR25A LTR ERVK 936 1103 0 3 949 1959 209 11 18 chr2 47784872 47785252 -133962835 + ORR1B1 LTR MaLR 9 385 -9 3 949 3618 190 84 53 chr2 47785632 47785671 -133962416 - RLTR21 LTR ERVK -402 1170 1127 3 949 3618 190 84 53 chr2 47785736 47786608 -133961479 - RLTR21 LTR ERVK -446 1126 230 3 949 877 293 127 88 chr2 47786607 47787263 -133960824 - RMER13A LTR ERVK -150 710 30 3 949 748 262 18 6 chr2 47787310 47787475 -133960612 - RLTR21 LTR ERVK -1405 167 1 3 949 515 323 87 95 chr2 47809392 47809918 -133938169 - RLTR18B LTR ERVK -6 610 94 4 949 1072 220 72 37 chr2 47810026 47810347 -133937740 - RLTR18-int LTR ERVK -97 5264 4933 4 949 269 233 33 0 chr2 47811560 47811620 -133936467 - RLTR18-int LTR ERVK -421 4940 4879 4 949 237 340 50 20 chr2 47814745 47814844 -133933243 + MLT1A0 LTR MaLR 21 122 -243 4 949 829 244 65 58 chr2 47815084 47815362 -133932725 + RLTR12B LTR ERVK 1 298 -230 4 949 735 277 31 52 chr2 47815374 47815660 -133932427 + RLTR12B LTR ERVK 240 519 -9 4 949 728 281 37 46 chr2 47817390 47817715 -133930372 + RLTR15 LTR ERVK 1 322 -37 4 949 660 314 36 97 chr2 47818257 47818726 -133929361 - RLTR18B LTR ERVK 0 512 138 4 949 284 340 72 24 chr2 47826780 47826946 -133921141 - RLTR18B LTR ERVK -317 195 22 4 950 864 209 152 86 chr2 47844154 47844626 -133903461 - RMER4B LTR ERVK -14 452 1 4 950 699 244 32 0 chr2 47856051 47856176 -133891911 + ORR1D1 LTR MaLR 44 173 -201 4 950 699 290 28 0 chr2 47856235 47856287 -133891800 + ORR1D1 LTR MaLR 174 225 -145 4 950 565 193 136 14 chr2 47856575 47856600 -133891487 + ORR1D1 LTR MaLR 207 231 -143 4 950 565 193 136 14 chr2 47856645 47856766 -133891321 + ORR1D1 LTR MaLR 232 370 -4 4 950 1165 271 97 18 chr2 47861532 47861874 -133886213 + ORR1D2 LTR MaLR 1 369 -1 4 950 245 346 0 24 chr2 47864050 47864133 -133883954 - MLT1H LTR MaLR -359 190 110 4 950 576 325 164 63 chr2 47872256 47872632 -133875455 + MLT1E2 LTR MaLR 52 472 -155 4 950 5175 117 30 37 chr2 47872632 47873541 -133874546 + RMER17A2 LTR ERVK 1 902 -4 4 950 576 325 164 63 chr2 47873541 47873687 -133874400 + MLT1E2 LTR MaLR 473 627 0 4 950 400 287 51 25 chr2 47876675 47876793 -133871294 - LTR16C LTR ERVL -167 322 202 4 950 3375 181 45 26 chr2 47892255 47892997 -133855090 + RMER6A LTR ERVK 1 756 0 5 950 290 301 130 0 chr2 47897806 47897952 -133850135 - MLT1F-int LTR MaLR -101 1388 1224 5 950 902 341 108 42 chr2 47898002 47898669 -133849418 - MLT1F-int LTR MaLR -524 965 255 5 950 999 249 61 18 chr2 47899212 47899490 -133848597 - MTD LTR MaLR 0 419 130 5 950 492 260 85 40 chr2 47900683 47900859 -133847228 + RLTR41 LTR ERV1 263 446 0 5 950 390 136 0 0 chr2 47900894 47900953 -133847134 - ORR1A2 LTR MaLR 0 346 288 5 950 436 257 158 86 chr2 47900956 47901222 -133846865 - RLTR9A LTR ERVK -1 367 95 5 950 1895 139 40 69 chr2 47901222 47901601 -133846486 - RLTR9A LTR ERVK 0 368 1 5 950 436 257 158 86 chr2 47901601 47901670 -133846417 - RLTR9A LTR ERVK -274 94 8 5 950 1564 139 79 8 chr2 47901692 47901946 -133846141 - ORR1A2 LTR MaLR -55 272 1 5 950 8878 151 118 31 chr2 47901946 47903753 -133844334 - ORR1A2-int LTR MaLR 0 1963 1 5 950 1834 159 38 0 chr2 47903753 47904068 -133844019 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 5 950 225 311 61 102 chr2 47904389 47904536 -133843551 - MLT1G3 LTR MaLR -273 322 182 5 950 408 254 26 26 chr2 47912943 47913060 -133835027 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 314 5 950 1734 240 24 22 chr2 47914683 47915092 -133832995 - MTD LTR MaLR -8 411 2 5 950 344 302 31 118 chr2 47920102 47920331 -133827756 - MLT1B LTR MaLR -129 261 53 5 950 419 275 45 15 chr2 47935689 47935822 -133812265 + MLT1A1 LTR MaLR 272 408 0 5 950 1274 144 168 67 chr2 47939292 47939589 -133808498 + ORR1A4 LTR MaLR 1 327 -2 5 950 3455 164 8 34 chr2 47940412 47941031 -133807056 + RLTR17 LTR ERVK 90 692 0 5 950 498 217 0 0 chr2 47957710 47957802 -133790285 + MTC LTR MaLR 1 92 -329 5 950 1111 181 9 42 chr2 47957788 47958001 -133790086 + MTC LTR MaLR 216 421 0 5 950 3017 63 2 10 chr2 47971392 47971790 -133776297 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 2 6 951 734 299 54 24 chr2 47974941 47975239 -133772848 - MLT2B4 LTR ERVL -249 307 1 6 951 617 354 95 21 chr2 47979822 47980255 -133767832 + MLT1C LTR MaLR 1 465 -2 6 951 310 337 156 67 chr2 47982391 47982674 -133765413 + MER21B LTR ERV1 204 511 -352 6 951 302 288 134 15 chr2 47983548 47983682 -133764405 + MTC LTR MaLR 272 421 0 6 951 2427 151 27 118 chr2 47986145 47986595 -133761492 + RLTR19 LTR ERVK 1 415 -84 6 951 2427 151 27 118 chr2 47986741 47986839 -133761248 + RLTR19 LTR ERVK 416 499 0 6 951 1040 282 160 48 chr2 47992120 47992600 -133755487 + RMER5 LTR ERV1 1 534 0 6 951 760 72 48 35 chr2 48000582 48000727 -133747360 - RMER17B LTR ERVK -496 462 316 4 951 4523 162 82 27 chr2 48004818 48005673 -133742414 - RMER19B LTR ERVK 0 902 1 1 951 769 270 103 13 chr2 48006349 48006582 -133741505 - MTD LTR MaLR -133 286 33 1 951 519 310 56 60 chr2 48022439 48022992 -133725095 - RLTR14-int LTR ERV1 -1426 3891 3373 2 951 2399 191 117 9 chr2 48023065 48023593 -133724494 - RMER4B LTR ERVK 0 585 1 2 951 257 254 55 78 chr2 48024261 48024389 -133723698 - RLTR14-int LTR ERV1 -4156 1161 1037 2 951 252 233 38 76 chr2 48024612 48024691 -133723396 - RLTR14-int LTR ERV1 -4288 1029 954 2 951 250 302 23 23 chr2 48024773 48024861 -133723226 - RLTR14-int LTR ERV1 -6159 1397 1310 2 951 288 264 120 90 chr2 48025120 48025253 -133722834 + RLTR33 LTR ERVK 445 581 -97 2 951 539 307 96 77 chr2 48026441 48026818 -133721269 - RLTR14-int LTR ERV1 -4915 402 19 2 951 583 302 139 36 chr2 48026873 48026972 -133721115 - RLTR14 LTR ERV1 -41 341 236 2 951 583 302 139 36 chr2 48027026 48027235 -133720852 - RLTR14 LTR ERV1 -147 235 1 2 951 853 268 15 54 chr2 48046457 48046762 -133701325 - ORR1D1 LTR MaLR -2 372 3 6 951 2634 177 144 35 chr2 48050345 48051139 -133696948 + RMER6C LTR ERVK 4 716 -4 6 951 7662 165 40 24 chr2 48051151 48051379 -133696708 + RMER6-int LTR ERVK 3 225 -2952 6 951 7662 165 40 24 chr2 48051627 48052046 -133696041 + RMER6-int LTR ERVK 226 656 -2521 6 951 7662 165 40 24 chr2 48052220 48053019 -133695068 + RMER6-int LTR ERVK 657 1472 -1705 6 951 2736 181 35 61 chr2 48053083 48053789 -133694298 + RMER6C LTR ERVK 3 690 0 7 951 602 323 44 39 chr2 48063042 48063403 -133684684 + RLTR6-int LTR ERV1 2084 2469 -5137 8 951 352 313 53 0 chr2 48063579 48063710 -133684377 + RLTR6-int LTR ERV1 2929 3066 -1997 8 951 378 272 64 19 chr2 48063708 48063846 -133684241 + RLTR6-int LTR ERV1 3891 4015 -1048 8 951 276 398 0 0 chr2 48063967 48064138 -133683949 + RLTR6-int LTR ERV1 5519 5689 -2089 8 951 702 257 34 24 chr2 48064680 48064936 -133683151 + RLTR6-int LTR ERV1 7456 7685 -93 8 951 542 71 0 0 chr2 48065026 48065096 -133682991 + RLTR41 LTR ERV1 1 70 -376 8 951 1207 181 25 0 chr2 48065113 48065317 -133682770 + RLTR41 LTR ERV1 172 380 -66 8 951 326 270 203 80 chr2 48071083 48071297 -133676790 + MLT1A1 LTR MaLR 4 218 -147 9 951 521 342 105 14 chr2 48076340 48076636 -133671451 + MLT1N2 LTR MaLR 239 561 -1 1 951 765 270 137 4 chr2 48077486 48077720 -133670367 + MTD LTR MaLR 1 265 -154 1 951 1055 282 59 18 chr2 48081095 48081434 -133666653 + ORR1E LTR MaLR 1 353 -6 1 951 234 348 61 0 chr2 48082003 48082118 -133665969 + LTR16C LTR ERVL 264 385 -104 1 951 2899 43 190 2 chr2 48092375 48092775 -133655312 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 1 951 1534 220 111 8 chr2 48095368 48095730 -133652357 + MTD LTR MaLR 12 410 -9 1 951 1142 280 84 17 chr2 48095997 48096342 -133651745 + ORR1D2 LTR MaLR 1 368 -2 1 951 615 272 150 0 chr2 48096346 48096526 -133651561 + ORR1D2-int LTR MaLR 3 209 -1161 1 951 3191 178 44 38 chr2 48096908 48097546 -133650541 - RLTR26 LTR ERVK 0 642 1 1 951 3126 32 45 0 chr2 48099193 48099572 -133648515 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 951 993 249 16 4 chr2 48102094 48102344 -133645743 + ORR1D2-int LTR MaLR 195 447 -923 1 951 883 202 65 5 chr2 48102367 48102581 -133645506 + ORR1D2-int LTR MaLR 1144 1370 0 1 951 1060 276 125 0 chr2 48102586 48102897 -133645190 + ORR1D2 LTR MaLR 21 370 0 1 118 813 208 28 0 chr2 48103390 48103557 -133644530 + ORR1D1 LTR MaLR 11 191 -168 1 952 315 159 48 0 chr2 48103537 48103600 -133644487 + ORR1D1 LTR MaLR 319 384 0 1 952 1886 138 97 12 chr2 48111001 48111332 -133636755 + ORR1B2 LTR MaLR 1 359 -8 1 952 414 369 22 22 chr2 48111934 48112117 -133635970 - MLT1J1 LTR MaLR -230 214 32 1 952 1100 180 241 51 chr2 48112485 48112801 -133635286 + ORR1C1 LTR MaLR 3 378 0 1 952 1015 282 41 15 chr2 48120620 48120886 -133627201 - MTEa LTR MaLR -8 371 99 1 952 424 269 9 9 chr2 48121881 48121990 -133626097 - MTEa LTR MaLR -268 111 3 1 952 324 267 51 171 chr2 48122610 48122786 -133625301 + RMER15 LTR ERVL 6 160 -415 1 952 245 185 56 0 chr2 48126194 48126248 -133621839 + LTR33A LTR ERVL 438 494 -26 1 952 2002 224 59 56 chr2 48129454 48129541 -133618546 - RLTR20A LTR ERVK 0 541 452 1 952 2002 224 59 56 chr2 48129638 48130056 -133618031 - RLTR20A LTR ERVK -90 451 33 1 952 2002 224 59 56 chr2 48130152 48130183 -133617904 - RLTR20A LTR ERVK -509 32 3 1 952 842 237 195 150 chr2 48130552 48131053 -133617034 + MT2A LTR ERVL 1 534 -20 1 952 232 267 86 127 chr2 48131110 48131148 -133616939 + MT2A LTR ERVL 518 551 -4 1 952 2233 95 3 69 chr2 48139545 48139827 -133608260 + ORR1A2 LTR MaLR 1 276 -51 1 952 2233 95 3 69 chr2 48141642 48141699 -133606388 + ORR1A2 LTR MaLR 277 326 -1 1 952 1210 208 6 29 chr2 48148220 48148660 -133599427 + RLTR11A LTR ERVK 1 518 -9 2 952 2166 175 94 19 chr2 48155327 48155794 -133592293 - RLTR16 LTR ERVK 0 505 4 2 952 329 229 119 38 chr2 48171823 48171982 -133576105 + RLTR16 LTR ERVK 34 205 -300 2 952 1757 176 136 13 chr2 48175306 48175382 -133572705 - MTC LTR MaLR 0 421 343 2 952 1757 176 136 13 chr2 48175411 48175709 -133572378 - MTC LTR MaLR -79 342 1 2 952 488 135 0 0 chr2 48178793 48178867 -133569220 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 305 2 952 2064 194 37 5 chr2 48178872 48179277 -133568810 - ORR1C1 LTR MaLR 0 421 4 2 952 2676 232 107 76 chr2 48179275 48179718 -133568369 - ORR1C1-int LTR MaLR 0 1098 688 2 952 2816 167 66 33 chr2 48179766 48180389 -133567698 - ORR1C1-int LTR MaLR -411 687 1 2 952 2146 169 10 51 chr2 48180389 48180783 -133567304 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 2 952 1520 245 71 39 chr2 48180933 48181426 -133566661 - RLTR12B LTR ERVK -19 509 1 2 952 278 353 19 19 chr2 48182048 48182152 -133565935 + MLT1J1 LTR MaLR 1 104 -344 2 952 370 319 33 0 chr2 48182223 48182314 -133565773 + MLT1J1 LTR MaLR 203 296 -148 2 952 620 317 40 57 chr2 48182493 48182847 -133565240 + MLT1J1-int LTR MaLR 104 451 -936 2 952 917 280 61 127 chr2 48185573 48185982 -133562105 + MTD LTR MaLR 38 419 0 2 952 2141 214 20 133 chr2 48191310 48191995 -133556092 + RMER19C LTR ERVK 1 608 -3 2 952 3438 28 2 0 chr2 48207152 48207547 -133540540 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 952 4652 150 135 48 chr2 48208855 48209742 -133538345 + RLTR25B LTR ERVK 1 962 -66 2 952 4652 150 135 48 chr2 48210274 48210331 -133537756 + RLTR25B LTR ERVK 963 1027 -1 2 952 3707 60 26 62 chr2 48211392 48211923 -133536164 - RLTR1B LTR ERV1 0 512 1 2 952 2034 240 80 41 chr2 48212850 48213441 -133534646 + RLTR17 LTR ERVK 1 614 -78 2 952 3853 108 42 99 chr2 48217522 48218311 -133529776 - RMER17A LTR ERVK -7 744 1 2 952 376 273 149 0 chr2 48221017 48221138 -133526949 + MLT2B2 LTR ERVL 3 141 -374 2 952 925 210 34 34 chr2 48227000 48227238 -133520849 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 118 3 952 250 266 0 59 chr2 48227214 48227282 -133520805 - ORR1D1 LTR MaLR -94 280 217 3 952 297 243 0 54 chr2 48227268 48227342 -133520745 - ORR1D1 LTR MaLR -88 286 217 3 952 1247 234 40 15 chr2 48227334 48227607 -133520480 - ORR1D1 LTR MaLR -94 280 1 3 953 1467 142 206 61 chr2 48244763 48245107 -133502980 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 3 953 1672 141 8 111 chr2 48256911 48257263 -133490824 - RMER4A LTR ERVK 0 466 151 3 953 1313 213 94 56 chr2 48262709 48263106 -133484981 - RMER10A LTR ERVL -21 421 3 3 953 814 327 77 13 chr2 48264201 48264514 -133483573 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 33 3 953 379 342 58 62 chr2 48267977 48268236 -133479851 + MLT1L LTR MaLR 38 295 -315 3 953 328 357 138 46 chr2 48275083 48275402 -133472685 + MLT1I LTR MaLR 8 366 -45 3 953 1366 164 33 72 chr2 48275402 48275737 -133472350 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 322 0 3 953 328 357 138 46 chr2 48275737 48275787 -133472300 + MLT1I LTR MaLR 367 410 -1 3 953 1122 242 54 110 chr2 48287038 48287410 -133460677 + ORR1E LTR MaLR 9 359 0 3 953 308 292 177 0 chr2 48288131 48288244 -133459843 + MLT1G3 LTR MaLR 4 136 -459 3 953 311 297 204 21 chr2 48288470 48288656 -133459431 + MLT1G3 LTR MaLR 171 390 -205 3 953 2314 143 34 32 chr2 48290880 48291320 -133456767 - BGLII_B LTR ERVK 0 441 1 4 953 923 161 0 13 chr2 48291679 48291836 -133456251 - ORR1D1 LTR MaLR -218 156 2 4 953 514 302 129 65 chr2 48299742 48300036 -133448051 - MLT1B LTR MaLR -154 313 1 4 953 267 59 0 0 chr2 48308044 48308078 -133440009 - IAPLTR2b LTR ERVK 0 327 294 4 953 731 298 84 25 chr2 48309677 48310032 -133438055 + MTEa LTR MaLR 1 376 -3 4 953 442 252 51 22 chr2 48310954 48311092 -133436995 - RMER15 LTR ERVL -7 568 427 4 953 2500 145 165 129 chr2 48333272 48333938 -133414149 - RMER6C LTR ERVK 0 690 1 4 953 468 286 124 45 chr2 48334546 48334788 -133413299 - MLT1A0 LTR MaLR -18 347 87 4 953 3074 27 0 3 chr2 48339027 48339365 -133408722 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 0 337 1 4 953 56845 22 10 5 chr2 48339370 48345806 -133402281 - IAPEz-int LTR ERVK -5 6476 8 4 953 3074 27 0 3 chr2 48345806 48346144 -133401943 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 0 337 1 4 953 509 264 99 19 chr2 48348667 48348829 -133399258 + RMER15-int LTR ERVL 442 616 -4383 4 953 365 327 58 7 chr2 48348949 48349103 -133398984 + RMER15 LTR ERVL 414 575 0 4 953 415 257 49 18 chr2 48351188 48351310 -133396777 - MLT1C LTR MaLR 0 467 255 4 953 570 299 69 49 chr2 48351545 48351791 -133396296 - MLT1C LTR MaLR -180 287 37 4 953 2064 219 19 45 chr2 48353823 48354310 -133393777 + RMER19C LTR ERVK 138 611 0 4 953 2078 131 3 101 chr2 48355318 48355683 -133392404 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 4 953 363 301 72 99 chr2 48357023 48357396 -133390691 - RMER10A LTR ERVL -19 423 61 4 953 366 271 54 59 chr2 48364892 48365096 -133382991 + RLTR15 LTR ERVK 87 289 -70 4 954 1223 216 15 128 chr2 48368004 48368029 -133380058 - RMER17C LTR ERVK 0 410 381 4 954 1223 216 15 128 chr2 48368108 48368544 -133379543 - RMER17C LTR ERVK -30 380 1 4 954 904 324 36 9 chr2 48369828 48370161 -133377926 - MLT1A0 LTR MaLR -4 361 20 5 954 1019 204 72 21 chr2 48372901 48373136 -133374951 + RLTR11A LTR ERVK 1 247 -281 5 954 725 83 174 0 chr2 48373151 48373272 -133374815 + RLTR11A LTR ERVK 387 528 0 5 954 1753 209 210 18 chr2 48379700 48379760 -133368327 - RLTR20C LTR ERVK -25 553 435 5 954 1753 188 118 39 chr2 48379819 48380223 -133367864 - RLTR20C LTR ERVK -100 434 4 5 954 355 311 119 55 chr2 48381131 48381486 -133366601 + MLT1E1A LTR MaLR 42 515 -138 5 954 246 237 117 78 chr2 48381464 48381592 -133366495 + MLT1E1A LTR MaLR 370 502 -3 5 954 665 323 132 42 chr2 48383710 48384210 -133363877 - MLT1G3 LTR MaLR 0 595 7 5 954 933 265 35 29 chr2 48385217 48385572 -133362515 + MLT1G1 LTR MaLR 3 408 -171 5 954 275 357 8 25 chr2 48391561 48391679 -133356408 + MLT1J1 LTR MaLR 327 442 -2 5 954 1329 261 135 0 chr2 48392136 48392603 -133355484 - MT2A LTR ERVL 0 533 4 5 954 246 360 82 58 chr2 48392606 48392777 -133355310 + MLT1J LTR MaLR 22 196 -316 5 954 2905 85 46 0 chr2 48397699 48398088 -133349999 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 5 954 3112 124 46 29 chr2 48398090 48398872 -133349215 - MTB_Mm-int LTR MaLR -18 1240 1 5 954 1664 201 25 33 chr2 48401801 48402166 -133345921 + ORR1D2 LTR MaLR 1 362 -8 5 954 463 262 18 130 chr2 48406984 48407269 -133340818 - RLTR12B LTR ERVK -32 496 244 5 954 876 245 80 33 chr2 48407247 48407521 -133340566 - RLTR12B LTR ERVK -200 328 42 5 954 2212 176 24 6 chr2 48407542 48408055 -133340032 - MYSERV6-int LTR ERVK -57 8902 8469 5 954 2503 122 16 16 chr2 48410591 48410987 -133337100 + RLTR20A2 LTR ERVK 3 433 -118 5 954 1965 211 110 14 chr2 48411040 48411144 -133336943 + RLTR20A2 LTR ERVK 434 551 0 5 954 803 303 134 12 chr2 48412105 48412434 -133335653 - MER54B LTR ERVL -529 372 4 5 954 1160 234 125 21 chr2 48415462 48415838 -133332249 + MTD LTR MaLR 5 419 0 5 954 1057 204 77 58 chr2 48421698 48422145 -133325942 + RLTR20C LTR ERVK 13 577 -1 5 954 2052 130 21 12 chr2 48426284 48426610 -133321477 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 5 954 1038 311 102 35 chr2 48428190 48428650 -133319437 - MLT1D LTR MaLR 0 505 15 5 954 826 265 94 50 chr2 48430451 48430792 -133317295 + MTEa LTR MaLR 22 377 -2 5 954 776 350 11 7 chr2 48431972 48432243 -133315844 + MLT1A0 LTR MaLR 92 363 -2 5 954 568 327 67 14 chr2 48434158 48434381 -133313706 - MLT1A LTR MaLR 0 374 140 5 954 501 346 92 42 chr2 48442763 48443243 -133304844 + MLT1F1 LTR MaLR 22 558 -2 5 954 1011 214 52 38 chr2 48461637 48461856 -133286231 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 162 6 954 2062 189 62 3 chr2 48461856 48462228 -133285859 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 6 954 1011 214 52 38 chr2 48462228 48462295 -133285792 - ORR1C2 LTR MaLR -223 161 94 6 954 1554 134 66 60 chr2 48462296 48462563 -133285524 + ORR1A4 LTR MaLR 2 277 -52 6 954 3734 30 0 132 chr2 48462563 48463065 -133285022 + RLTR10C LTR ERVK 1 436 0 6 954 1554 134 66 60 chr2 48463065 48463115 -133284972 + ORR1A4 LTR MaLR 278 321 -8 6 954 317 244 81 0 chr2 48463116 48463202 -133284885 - ORR1C2 LTR MaLR -281 93 1 6 954 362 313 126 45 chr2 48471650 48471943 -133276144 - MLT2B4 LTR ERVL -73 483 81 6 954 362 316 160 72 chr2 48471970 48472028 -133276059 - MLT2B4 LTR ERVL -476 80 4 6 954 510 327 144 50 chr2 48495048 48495478 -133252609 + MLT1H LTR MaLR 3 514 -35 6 954 671 278 156 44 chr2 48495488 48495808 -133252279 - MLT1A LTR MaLR -11 363 8 6 955 998 337 92 9 chr2 48498119 48498553 -133249534 - MER21B LTR ERV1 -11 852 383 6 955 1221 228 190 9 chr2 48506662 48506999 -133241088 - MTD LTR MaLR 0 419 22 7 955 2209 142 74 37 chr2 48509265 48509645 -133238442 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 1 955 2164 155 43 64 chr2 48524750 48525170 -133222917 - MTC LTR MaLR -10 411 1 3 955 1880 106 29 11 chr2 48528700 48528976 -133219111 + ORR1A2 LTR MaLR 9 289 -38 3 955 321 325 68 0 chr2 48531202 48531319 -133216768 + MLT2B2 LTR ERVL 133 257 -258 3 955 391 250 15 52 chr2 48532024 48532159 -133215928 - MLT1A1 LTR MaLR -11 397 268 4 955 225 276 102 130 chr2 48534372 48534480 -133213607 + MamGypLTR1c LTR Gypsy 588 692 -111 4 955 274 343 39 29 chr2 48537201 48537303 -133210784 + MLT1J2 LTR MaLR 8 110 -338 5 955 2164 100 11 109 chr2 48537789 48538148 -133209939 + ORR1A4 LTR MaLR 5 328 -1 5 955 1680 226 60 5 chr2 48548693 48549082 -133199005 - MTD LTR MaLR -14 405 5 5 955 569 350 77 21 chr2 48579106 48579442 -133168645 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 11 9 955 775 306 14 46 chr2 48583813 48584097 -133163990 - MTE-int LTR MaLR -1090 490 216 9 955 929 307 38 19 chr2 48584092 48584354 -133163733 - MTE2b LTR MaLR -16 363 97 9 955 1211 195 22 52 chr2 48584596 48584867 -133163220 + ORR1D1 LTR MaLR 13 275 -99 9 955 259 188 46 15 chr2 48584887 48584952 -133163135 - MTEa LTR MaLR -3 376 310 1 955 1204 270 74 10 chr2 48584954 48585264 -133162823 - MTEa LTR MaLR 0 379 50 1 955 239 332 149 36 chr2 48585335 48585529 -133162558 - MTEa LTR MaLR -135 235 20 1 955 252 290 87 146 chr2 48587394 48587502 -133160585 + MLT1D LTR MaLR 302 422 -83 1 955 252 290 87 146 chr2 48587553 48587650 -133160437 + MLT1D LTR MaLR 423 495 -10 1 955 316 305 59 107 chr2 48610114 48610301 -133137786 - MLT1J2 LTR MaLR -199 249 72 1 955 386 312 113 28 chr2 48610410 48610657 -133137430 + MLT1B LTR MaLR 99 366 -24 1 955 469 331 66 26 chr2 48610730 48611003 -133137084 - MT2A LTR ERVL 0 533 250 1 955 296 297 45 76 chr2 48611033 48611093 -133136994 - MT2A LTR ERVL -361 172 21 1 955 331 333 0 10 chr2 48611093 48611190 -133136897 - MTEa LTR MaLR -263 116 21 1 955 536 354 90 44 chr2 48611665 48612008 -133136079 + MLT1A LTR MaLR 5 363 -11 1 955 228 231 19 19 chr2 48616104 48616157 -133131930 - ORR1E LTR MaLR -249 110 58 1 956 321 325 16 33 chr2 48629607 48629728 -133118359 - MLT1C LTR MaLR 0 467 349 1 956 1579 211 67 30 chr2 48629858 48630219 -133117868 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 1 956 345 329 76 29 chr2 48630761 48630933 -133117154 - MLT1J LTR MaLR -42 470 291 1 956 417 287 34 20 chr2 48630961 48631107 -133116980 - MLT1J LTR MaLR -334 178 31 1 956 270 246 15 0 chr2 48632102 48632167 -133115920 + LTR33 LTR ERVL 411 476 -39 1 956 1782 187 52 11 chr2 48633182 48633545 -133114542 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 1 956 549 223 147 199 chr2 48637159 48637546 -133110541 + ORR1D2 LTR MaLR 2 368 -2 1 956 1927 132 69 55 chr2 48638084 48638208 -133109879 + ORR1B2 LTR MaLR 1 111 -256 1 956 1927 132 69 55 chr2 48638253 48638490 -133109597 + ORR1B2 LTR MaLR 112 367 0 1 956 2952 26 2 172 chr2 48639756 48640226 -133107861 + RLTR10 LTR ERVK 1 390 0 1 956 7645 49 4 3 chr2 48640273 48641258 -133106829 + RLTR10-int LTR ERVK 13 998 -989 1 956 362 242 39 15 chr2 48641322 48641452 -133106635 + RLTR10-int LTR ERVK 1462 1594 -5987 1 956 7996 22 18 1 chr2 48641534 48641891 -133106196 + RLTR10-int LTR ERVK 990 1346 -641 1 956 7996 22 18 1 chr2 48641916 48642536 -133105551 + RLTR10-int LTR ERVK 1347 1982 -5 1 956 2952 26 2 172 chr2 48642538 48643008 -133105079 + RLTR10 LTR ERVK 1 390 0 1 956 1667 161 112 6 chr2 48645111 48645449 -133102638 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 1 956 2174 176 158 68 chr2 48648492 48649300 -133098787 + RMER6C LTR ERVK 1 720 0 1 956 688 338 80 24 chr2 48651784 48652123 -133095964 + MLT1A LTR MaLR 6 363 -11 2 956 2406 188 18 44 chr2 48656256 48656761 -133091326 - RLTR16 LTR ERVK -13 492 1 2 956 1617 164 25 90 chr2 48659619 48659940 -133088147 + RMER19B LTR ERVK 1 300 -602 2 956 1814 159 126 11 chr2 48659955 48660305 -133087782 + RMER19B LTR ERVK 501 890 -12 2 956 776 269 57 128 chr2 48664105 48664510 -133083577 - MTE2a LTR MaLR -1 378 3 2 956 1998 123 32 16 chr2 48681336 48681650 -133066437 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 2 956 651 179 67 7 chr2 48690275 48690410 -133057677 - ORR1D1 LTR MaLR -3 371 229 2 956 1495 198 32 109 chr2 48705826 48706229 -133041858 - RLTR20B2 LTR ERVK 0 560 189 2 956 3602 97 46 85 chr2 48707661 48708317 -133039770 - RMER6A LTR ERVK -66 690 61 3 956 305 217 49 29 chr2 48724591 48724691 -133023396 - ORR1E LTR MaLR -269 101 2 3 956 2608 181 63 65 chr2 48734988 48735562 -133012525 - RMER15 LTR ERVL 0 575 3 3 957 1382 226 45 34 chr2 48768721 48769074 -132979013 - MTEb LTR MaLR -22 357 1 3 957 340 223 55 55 chr2 48771327 48771436 -132976651 + MTE2b LTR MaLR 1 109 -270 3 957 1634 165 56 22 chr2 48771439 48771761 -132976326 + ORR1C2 LTR MaLR 51 383 -1 3 957 705 252 103 40 chr2 48771779 48772002 -132976085 + MTE2b LTR MaLR 123 359 -20 3 957 664 297 88 29 chr2 48786893 48787191 -132960896 + MTD LTR MaLR 10 405 -14 3 957 341 270 27 13 chr2 48795235 48795280 -132952807 + MTE2a-int LTR MaLR 603 649 -860 4 957 315 93 0 0 chr2 48799061 48799104 -132948983 + MTE2a LTR MaLR 1 43 -286 4 957 436 270 130 101 chr2 48799379 48799626 -132948461 + MTE2a LTR MaLR 113 366 -13 4 957 2514 29 105 0 chr2 48815015 48815328 -132932759 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 4 957 12328 64 52 3 chr2 48815328 48817036 -132931051 - ORR1A1-int LTR MaLR 0 1792 1 4 957 2561 49 65 0 chr2 48817036 48817361 -132930726 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 4 957 2149 175 88 95 chr2 48822563 48823100 -132924987 - RMER16 LTR ERVK 0 533 1 4 957 3786 59 6 0 chr2 48825810 48826282 -132921805 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 1 4 957 299 311 49 77 chr2 48833480 48833623 -132914464 - MT2B2 LTR ERVL -327 257 119 4 957 228 94 0 0 chr2 48840823 48840855 -132907232 - ORR1D1 LTR MaLR -2 382 351 4 957 1378 226 99 16 chr2 48842135 48842458 -132905629 - ORR1D1 LTR MaLR -24 350 1 4 957 738 366 128 17 chr2 48843231 48843714 -132904373 - LTR87 LTR ERVL? -87 537 1 4 957 421 250 10 10 chr2 48844100 48844197 -132903890 + MTD LTR MaLR 2 98 -321 4 957 1563 88 0 0 chr2 48851309 48851526 -132896561 + MTB LTR MaLR 1 217 -183 4 957 2659 103 22 2 chr2 48851564 48851964 -132896123 + MTB_Mm-int LTR MaLR 1 408 -690 4 957 1144 72 0 43 chr2 48851998 48852186 -132895901 + MTB_Mm-int LTR MaLR 909 1088 -10 4 957 2480 90 48 19 chr2 48852167 48852542 -132895545 + MTB_Mm LTR MaLR 14 399 -8 4 957 871 226 126 97 chr2 48853020 48853329 -132894758 + ORR1D1 LTR MaLR 1 318 -56 4 957 282 341 51 15 chr2 48869034 48869171 -132878916 - MLT1J1 LTR MaLR -237 207 66 5 957 3673 180 212 23 chr2 48874304 48874614 -132873473 + MTC-int LTR MaLR 3 346 -912 5 957 3673 180 212 23 chr2 48874648 48875393 -132872694 + MTC-int LTR MaLR 347 1257 -1 5 957 2056 206 35 5 chr2 48875393 48875797 -132872290 + MTC LTR MaLR 1 416 -5 5 957 573 348 80 34 chr2 48875791 48876115 -132871972 - MLT1G3 LTR MaLR -178 417 79 5 957 871 315 56 43 chr2 48880371 48880693 -132867394 + ORR1D2 LTR MaLR 37 362 -8 5 957 1946 169 22 19 chr2 48881330 48881699 -132866388 + ORR1D1 LTR MaLR 5 374 0 5 957 3330 45 0 2 chr2 48886556 48886953 -132861134 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 958 3658 62 2 4 chr2 48896231 48896719 -132851368 - MTA_Mm-int LTR MaLR -611 487 1 5 958 3360 35 2 0 chr2 48896719 48897113 -132850974 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 2 5 958 2104 172 56 199 chr2 48897787 48898600 -132849487 - RMER6D LTR ERVK 0 720 1 5 958 773 263 172 17 chr2 48922518 48922878 -132825209 - MTD LTR MaLR 0 419 4 5 958 904 249 195 50 chr2 48925124 48925478 -132822609 - MTD LTR MaLR 0 419 1 5 958 1323 183 42 164 chr2 48931349 48931781 -132816306 + RLTR30 LTR ERV1 1 379 0 6 958 226 299 66 44 chr2 48943516 48943607 -132804480 + LTR16C LTR ERVL 3 95 -394 6 958 426 124 18 54 chr2 48945432 48945543 -132802544 - MT2A LTR ERVL 0 533 427 6 958 10843 221 77 43 chr2 48945563 48946559 -132801528 - MERVL_2A-int LTR ERVL -1272 4489 3432 6 958 10843 221 77 43 chr2 48946611 48947097 -132800990 - MERVL_2A-int LTR ERVL -1272 3431 2914 6 958 3217 38 5 5 chr2 48947097 48947493 -132800594 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 958 10843 221 77 43 chr2 48947493 48948800 -132799287 - MERVL_2A-int LTR ERVL -2848 2913 1549 6 958 3345 35 5 0 chr2 48964089 48964483 -132783604 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 958 1963 176 70 13 chr2 48965534 48965932 -132782155 - MTC LTR MaLR 0 421 1 6 958 281 241 38 0 chr2 48976733 48976812 -132771275 - MLT1C LTR MaLR -3 502 421 6 958 450 309 38 42 chr2 48977162 48977402 -132770685 - MLT1C LTR MaLR -227 240 2 6 958 323 266 42 21 chr2 48995107 48995203 -132752884 - MLT2D LTR ERVL -4 556 459 7 958 327 188 137 105 chr2 48995198 48995293 -132752794 - MLT2D LTR ERVL -239 175 78 7 958 3372 180 50 60 chr2 48996422 48996857 -132751230 - RMER6D LTR ERVK 0 720 309 7 958 3372 180 50 60 chr2 48996922 48997190 -132750897 - RMER6D LTR ERVK -412 308 25 7 958 1272 304 78 38 chr2 49000226 49000779 -132747308 - RMER15 LTR ERVL 0 575 1 1 958 1352 202 112 10 chr2 49002389 49002694 -132745393 + ORR1D1 LTR MaLR 33 368 -6 4 958 425 267 60 8 chr2 49004389 49004506 -132743581 - ETnERV2-int LTR ERVK -210 7196 7074 8 958 319 369 46 71 chr2 49007630 49007954 -132740133 + MTEa LTR MaLR 64 379 0 1 958 250 179 0 0 chr2 49015121 49015177 -132732910 + MER65-int LTR ERV1 3413 3468 -1403 2 958 1207 218 80 7 chr2 49016874 49017161 -132730926 - ORR1D1 LTR MaLR -66 308 1 3 959 2035 165 40 8 chr2 49031708 49032087 -132716000 - ORR1B1 LTR MaLR -3 391 1 6 959 2741 89 15 18 chr2 49033063 49033464 -132714623 + MTB LTR MaLR 1 400 0 6 959 3168 51 5 0 chr2 49033914 49034308 -132713779 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 959 4421 14 0 0 chr2 49035427 49035920 -132712167 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 6 959 282 299 34 11 chr2 49051534 49051622 -132696465 - MTEa LTR MaLR -235 144 55 8 959 3254 23 98 8 chr2 49053475 49053875 -132694212 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 9 959 846 259 103 17 chr2 49059940 49060172 -132687915 - MTE2b LTR MaLR -117 262 11 1 959 332 211 82 136 chr2 49062372 49062581 -132685506 - RMER21B LTR ERV1 -411 536 271 1 959 918 252 139 24 chr2 49063585 49063923 -132684164 + MTEb LTR MaLR 1 377 -2 1 959 1758 301 73 33 chr2 49065832 49066381 -132681706 + MTE-int LTR MaLR 793 1363 -217 1 959 1418 129 3 21 chr2 49070758 49071020 -132677067 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 94 1 959 670 201 5 43 chr2 49071673 49071770 -132676317 - ORR1B1 LTR MaLR -239 155 79 1 959 3466 161 27 5 chr2 49075365 49075952 -132672135 - RLTR17 LTR ERVK -92 600 1 1 959 1556 231 82 3 chr2 49089482 49089859 -132658228 + MTD LTR MaLR 13 419 0 1 959 267 294 52 112 chr2 49090883 49091017 -132657070 - MLT1H LTR MaLR -222 327 202 1 959 355 348 120 26 chr2 49098704 49098937 -132649150 - MLT1A0 LTR MaLR -46 319 65 1 959 2269 95 3 61 chr2 49133090 49133436 -132614651 - ORR1A2 LTR MaLR -1 326 1 1 959 1053 248 48 36 chr2 49147074 49147467 -132600620 - BGLII_B LTR ERVK -5 436 40 2 959 1091 232 167 13 chr2 49149971 49150289 -132597798 - ORR1D1 LTR MaLR -7 367 1 2 960 1345 236 21 37 chr2 49157652 49157977 -132590110 - ORR1E LTR MaLR -4 355 36 2 960 1873 158 80 24 chr2 49182227 49182585 -132565502 - MTC LTR MaLR -25 396 15 2 960 1873 158 80 24 chr2 49182630 49182646 -132565441 - MTC LTR MaLR -407 14 1 2 960 4976 97 52 132 chr2 49185224 49186188 -132561899 + RMER17D LTR ERVK 1 887 -2 2 960 492 292 45 13 chr2 49186604 49186760 -132561327 - MLT1G3 LTR MaLR -220 375 215 2 960 516 251 177 42 chr2 49190587 49190824 -132557263 + MLT1B LTR MaLR 120 388 -2 2 960 374 240 72 38 chr2 49192538 49192695 -132555392 + MTEa LTR MaLR 218 379 0 2 960 703 280 32 40 chr2 49194044 49194293 -132553794 - RLTR18 LTR ERVK -73 439 193 2 960 716 254 43 60 chr2 49194401 49194635 -132553452 - RLTR18 LTR ERVK -386 230 1 2 960 1363 216 30 55 chr2 49196252 49196614 -132551473 - ORR1E LTR MaLR -6 353 1 2 960 540 239 41 59 chr2 49199806 49199975 -132548112 - RMER10B LTR ERVL 0 398 233 2 960 675 194 112 78 chr2 49199975 49200154 -132547933 + RLTR42-int LTR ERVK 1611 1795 -3727 2 960 250 180 95 32 chr2 49201029 49201092 -132546995 - RMER10A LTR ERVL -58 384 318 2 960 3486 23 5 0 chr2 49201996 49202390 -132545697 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 960 1481 235 77 40 chr2 49202446 49202943 -132545144 - MT2A LTR ERVL -14 519 5 2 960 583 103 41 0 chr2 49206655 49206752 -132541335 + RMER6A LTR ERVK 124 224 -532 3 960 3450 113 37 108 chr2 49207433 49208186 -132539901 - RMER6A LTR ERVK 0 756 57 3 960 861 255 147 3 chr2 49208199 49208506 -132539581 - MLT1B LTR MaLR -33 357 7 3 960 2065 137 5 73 chr2 49208756 49209196 -132538891 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 3 960 8579 114 128 70 chr2 49209196 49209520 -132538567 - RMER17C-int LTR ERVK 0 3238 2910 3 960 8579 114 128 70 chr2 49209577 49210146 -132537941 - RMER17C-int LTR ERVK -329 2909 2353 3 960 8579 114 128 70 chr2 49210380 49211149 -132536938 - RMER17C-int LTR ERVK -886 2352 1480 3 960 1168 145 112 12 chr2 49212553 49212811 -132535276 + RMER21A LTR ERV1 248 531 -416 3 960 1576 205 54 8 chr2 49214657 49215026 -132533061 + MTD LTR MaLR 1 386 -33 3 960 280 180 16 16 chr2 49218213 49218275 -132529812 - ORR1A3-int LTR MaLR -332 1631 1570 3 960 600 236 57 6 chr2 49218837 49218995 -132529092 + ORR1D1-int LTR MaLR 514 679 -691 3 960 277 157 39 0 chr2 49218995 49219046 -132529041 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 378 3 960 1244 170 86 113 chr2 49219046 49219463 -132528624 - RLTR23 LTR ERV1 -24 406 1 3 960 2248 207 81 76 chr2 49219463 49220155 -132527932 + ORR1D1-int LTR MaLR 676 1370 0 3 960 1093 209 136 15 chr2 49220155 49220486 -132527601 + ORR1D1 LTR MaLR 1 371 -3 3 960 533 343 147 25 chr2 49224110 49224438 -132523649 + MLT1H1 LTR MaLR 14 373 -218 3 960 1618 172 17 13 chr2 49226506 49226806 -132521281 - ORR1B2 LTR MaLR -8 359 59 3 960 586 316 158 14 chr2 49242581 49242941 -132505146 + MLT1C LTR MaLR 42 453 -14 3 960 2103 138 73 34 chr2 49245279 49245472 -132502615 - RMER10B LTR ERVL 0 398 186 3 960 2103 138 73 34 chr2 49245545 49245732 -132502355 - RMER10B LTR ERVL -213 185 1 3 960 946 188 71 12 chr2 49246199 49246551 -132501536 - MT2A LTR ERVL 0 533 111 3 960 2739 85 137 16 chr2 49248807 49249237 -132498850 - RLTR45 LTR ERVK 0 482 1 3 960 869 209 25 30 chr2 49254575 49254777 -132493310 + MTD LTR MaLR 18 218 -201 3 960 872 187 6 23 chr2 49254780 49254955 -132493132 + ORR1D1 LTR MaLR 1 172 -202 3 960 362 217 0 51 chr2 49254928 49255016 -132493071 + ORR1D1 LTR MaLR 292 421 0 3 960 285 143 49 21 chr2 49255024 49255105 -132492982 + MTD LTR MaLR 292 418 -1 3 960 294 233 82 0 chr2 49256519 49256592 -132491495 - MLT1F LTR MaLR -248 321 243 3 960 424 327 63 50 chr2 49256631 49256853 -132491234 - MLT1F LTR MaLR -323 225 1 3 960 2172 107 0 68 chr2 49256875 49257226 -132490861 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 3 960 1474 147 106 53 chr2 49258262 49258563 -132489524 - MTC LTR MaLR 0 421 105 4 960 849 311 96 32 chr2 49260085 49260523 -132487564 + MLT1E2 LTR MaLR 162 627 0 4 960 1581 204 65 16 chr2 49263033 49263433 -132484654 + MTD LTR MaLR 1 419 0 4 960 2891 88 21 3 chr2 49268797 49269186 -132478901 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 960 2697 43 65 0 chr2 49269334 49269659 -132478428 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 4 960 344 294 95 112 chr2 49269659 49270008 -132478079 - MLT1A0 LTR MaLR -22 343 1 4 960 359 303 57 118 chr2 49271076 49271199 -132476888 - MLT1G1 LTR MaLR -365 214 98 4 960 359 303 57 118 chr2 49271413 49271512 -132476575 - MLT1G1 LTR MaLR -482 97 1 4 960 3338 41 5 8 chr2 49274270 49274667 -132473420 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 960 1795 160 125 9 chr2 49277928 49278256 -132469831 + ORR1B1 LTR MaLR 1 366 -28 4 960 3282 58 8 2 chr2 49279985 49280379 -132467708 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 960 872 276 156 25 chr2 49281881 49282368 -132465719 + MLT2B3 LTR ERVL 4 554 0 4 961 295 235 103 0 chr2 49284171 49284239 -132463848 - MLT1A0 LTR MaLR -290 75 1 4 961 3168 161 29 10 chr2 49284693 49285207 -132462880 - RLTR28 LTR ERVL 0 524 1 4 961 869 175 6 18 chr2 49285625 49285794 -132462293 + RMER4B LTR ERVK 8 174 -411 4 961 603 165 130 0 chr2 49285897 49286012 -132462075 + RMER15 LTR ERVL 7 136 -439 4 961 1788 172 152 21 chr2 49286373 49286806 -132461281 + RMER15 LTR ERVL 86 575 0 4 961 334 245 42 11 chr2 49294086 49294181 -132453906 - MTEa LTR MaLR 0 379 282 4 961 1054 180 0 0 chr2 49294180 49294352 -132453735 - ORR1C1 LTR MaLR -5 373 202 4 961 3899 248 44 47 chr2 49294839 49296022 -132452065 - MYSERV-int LTR ERVK -1596 4954 3775 4 961 5447 111 18 4 chr2 49296499 49297266 -132450821 - MERVL-int LTR ERVL -949 4536 3759 4 961 21398 133 38 29 chr2 49297261 49299175 -132448912 - MERVL-int LTR ERVL -1943 3542 1603 4 961 4253 25 47 0 chr2 49299175 49299646 -132448441 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 4 961 21398 133 38 29 chr2 49299646 49301241 -132446846 - MERVL-int LTR ERVL -3883 1602 1 4 961 3883 80 20 9 chr2 49301241 49301785 -132446302 - MT2B LTR ERVL 0 601 52 4 961 1236 246 103 29 chr2 49315594 49315945 -132432142 - MTEb LTR MaLR 0 379 3 5 961 1619 154 35 47 chr2 49316899 49317367 -132430720 - RMER6A LTR ERVK 0 756 330 5 961 496 132 13 0 chr2 49317417 49317493 -132430594 - MT2B LTR ERVL -337 264 188 5 961 303 54 0 0 chr2 49317512 49317549 -132430538 - RMER6D LTR ERVK -683 37 1 5 961 1937 166 18 6 chr2 49317913 49318241 -132429846 + RLTR20B3 LTR ERVK 246 577 0 5 961 366 197 15 0 chr2 49321208 49321274 -132426813 + MTE2b LTR MaLR 6 72 -307 5 961 285 157 102 153 chr2 49321285 49321383 -132426704 - ORR1D1 LTR MaLR -281 93 1 5 961 1761 176 54 54 chr2 49321459 49321832 -132426255 - ORR1D1 LTR MaLR -1 373 1 5 961 2078 269 133 50 chr2 49327350 49328247 -132419840 - ORR1D2-int LTR MaLR -465 1115 1 5 961 1361 244 60 47 chr2 49328247 49328612 -132419475 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 5 961 762 261 183 8 chr2 49337697 49337959 -132410128 - MTD LTR MaLR -14 405 98 5 961 1968 135 3 27 chr2 49347733 49348068 -132400019 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 5 961 2048 77 91 63 chr2 49360721 49361039 -132387048 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 6 961 422 247 101 22 chr2 49361331 49361509 -132386578 - MER34 LTR ERV1 -35 507 316 6 961 310 259 62 41 chr2 49361559 49361704 -132386383 - MER34 LTR ERV1 -356 186 39 6 961 1033 204 125 43 chr2 49365189 49365470 -132382617 - ORR1B1 LTR MaLR -52 342 39 6 961 431 331 56 34 chr2 49375976 49376154 -132371933 - LTR86A1 LTR ERVL -56 457 276 6 961 4667 162 71 40 chr2 49413206 49414079 -132334008 - RMER19B LTR ERVK 0 902 3 6 962 1865 208 22 11 chr2 49415099 49415468 -132332619 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 2 6 962 1452 250 75 14 chr2 49415483 49415832 -132332255 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 6 962 265 200 0 0 chr2 49415916 49415966 -132332121 - RMER15 LTR ERVL -108 467 418 6 962 2400 75 55 0 chr2 49423311 49423619 -132324468 - ORR1A2 LTR MaLR -2 325 1 7 962 1215 158 5 20 chr2 49424328 49424528 -132323559 + MTC LTR MaLR 11 207 -214 7 962 1425 147 9 9 chr2 49424728 49424954 -132323133 + MTC LTR MaLR 196 421 0 7 962 270 321 124 75 chr2 49426225 49426636 -132321451 + MER74A LTR ERVL 97 527 -31 7 962 484 255 35 19 chr2 49432768 49432903 -132315184 - MTE2a LTR MaLR 0 379 231 7 962 804 191 33 104 chr2 49433014 49433225 -132314862 - MTE2a LTR MaLR -183 196 1 7 962 464 178 67 0 chr2 49433431 49433521 -132314566 + MLT2B3 LTR ERVL 164 259 -457 7 962 415 203 15 113 chr2 49433754 49433887 -132314200 + MLT2B3 LTR ERVL 586 705 -12 7 962 1634 167 142 9 chr2 49434233 49434572 -132313515 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 7 962 3182 65 6 103 chr2 49434771 49435237 -132312850 - BGLII LTR ERVK 0 421 1 7 962 314 306 87 108 chr2 49436760 49437093 -132310994 + ORR1E LTR MaLR 34 359 0 7 962 2367 102 35 9 chr2 49443199 49443515 -132304572 - ORR1A2 LTR MaLR -1 326 3 7 962 261 329 111 94 chr2 49445675 49445910 -132302177 + MLT1J LTR MaLR 245 483 -29 7 962 1489 236 44 6 chr2 49446803 49447166 -132300921 - MTEb LTR MaLR -2 377 1 7 962 399 316 274 0 chr2 49447836 49448110 -132299977 - MLT1A0 LTR MaLR -15 350 2 7 962 229 337 82 0 chr2 49450157 49450255 -132297832 + LTR16A1 LTR ERVL 249 354 -102 7 962 1049 249 125 29 chr2 49452417 49452760 -132295327 + MTD LTR MaLR 2 374 -5 7 962 393 219 162 35 chr2 49452751 49452893 -132295194 - MLT1A LTR MaLR -25 349 190 7 962 252 221 243 13 chr2 49453080 49453184 -132294903 - MLT1A LTR MaLR -257 133 4 7 962 382 286 148 49 chr2 49456763 49456925 -132291162 + MLT1F2 LTR MaLR 310 487 -73 7 962 1542 132 169 19 chr2 49457164 49457472 -132290615 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 41 7 962 2405 92 78 50 chr2 49459261 49459661 -132288426 + IAPLTR2a LTR ERVK 1 411 0 7 962 373 82 95 14 chr2 49459663 49459737 -132288350 + IAPEz-int LTR ERVK 3 82 -1905 7 962 499 135 17 133 chr2 49459731 49459851 -132288236 + IAPEz-int LTR ERVK 18 123 -6358 7 962 255 244 0 0 chr2 49459851 49459896 -132288191 + RLTR27 LTR ERVK 231 275 -34 7 962 3934 59 2 18 chr2 49459896 49460399 -132287688 + IAPEz-int LTR ERVK 168 662 -5819 7 962 2309 61 0 0 chr2 49460399 49460677 -132287410 + IAPEz-int LTR ERVK 1359 1636 -4845 7 962 6242 38 3 19 chr2 49460676 49461432 -132286655 + IAPEz-int LTR ERVK 5736 6479 -2 7 962 234 279 71 94 chr2 49463218 49463405 -132284682 + MLT1A1 LTR MaLR 4 179 -211 7 962 230 282 109 119 chr2 49463587 49463603 -132284484 + MLT1A1 LTR MaLR 180 194 -196 7 962 282 209 49 157 chr2 49465623 49465725 -132282362 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 288 7 962 602 261 176 14 chr2 49465708 49465918 -132282169 - MTE2b-int LTR MaLR -13 1567 1324 7 962 1672 238 57 16 chr2 49465922 49466306 -132281781 - MTD LTR MaLR -8 411 12 7 962 485 275 121 90 chr2 49466461 49466790 -132281297 + RMER20B LTR ERVK 90 423 -204 7 962 3971 276 111 15 chr2 49466843 49468022 -132280065 - MTE2b-int LTR MaLR -288 1292 1 7 962 1050 252 21 65 chr2 49468022 49468157 -132279930 - MTE2b LTR MaLR 0 379 189 7 962 1050 286 43 26 chr2 49468211 49468397 -132279690 - MTE2b LTR MaLR -191 188 4 7 962 1302 228 78 45 chr2 49478479 49478837 -132269250 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 8 962 552 325 52 21 chr2 49480084 49480317 -132267770 - MLT1E2 LTR MaLR -4 623 384 8 962 2577 83 121 0 chr2 49480368 49480731 -132267356 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 8 962 303 232 182 40 chr2 49480731 49480830 -132267257 - MLT1E2 LTR MaLR -514 113 1 8 962 1949 138 165 0 chr2 49481690 49482024 -132266063 + ORR1B1 LTR MaLR 1 389 -5 8 962 279 290 105 35 chr2 49491621 49491764 -132256323 + ORR1E LTR MaLR 32 184 -175 8 962 228 300 78 157 chr2 49493613 49493655 -132254432 - RMER10A LTR ERVL -27 415 369 8 962 228 300 78 157 chr2 49493775 49493898 -132254189 - RMER10A LTR ERVL -74 368 263 8 962 251 271 90 52 chr2 49494353 49494522 -132253565 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 178 8 962 251 308 127 70 chr2 49494572 49494646 -132253441 - MLT1A0 LTR MaLR -188 177 108 8 962 225 269 0 19 chr2 49494664 49494717 -132253370 - MLT1A0 LTR MaLR -415 52 1 8 962 1976 170 115 29 chr2 49495474 49495617 -132252470 - MTC LTR MaLR -8 413 258 8 962 1808 135 152 6 chr2 49495617 49495952 -132252135 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 8 962 1976 170 115 29 chr2 49495952 49496183 -132251904 - MTC LTR MaLR -164 257 7 8 962 297 251 59 68 chr2 49496830 49496980 -132251107 + MLT1D LTR MaLR 1 145 -482 8 962 457 292 18 127 chr2 49497013 49497233 -132250854 + MLT1D LTR MaLR 257 452 -53 8 962 238 348 59 93 chr2 49506983 49507306 -132240781 - MER87 LTR ERV1 0 541 230 1 962 467 316 174 37 chr2 49512357 49512787 -132235300 - LTR16C LTR ERVL 0 489 1 1 962 2104 128 25 0 chr2 49514357 49514676 -132233411 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 2 962 1883 210 61 2 chr2 49516519 49516915 -132231172 + MTD LTR MaLR 1 419 0 2 963 291 315 60 23 chr2 49560117 49560250 -132187837 + MLT1E3 LTR MaLR 46 183 -441 7 963 698 268 92 26 chr2 49560136 49560408 -132187679 + MLT2C1 LTR ERVL 47 336 -61 7 963 1784 156 54 3 chr2 49570226 49570522 -132177565 - MTC LTR MaLR 0 421 111 8 963 561 221 0 47 chr2 49571574 49571587 -132176500 - MTC LTR MaLR -299 122 115 8 963 2386 88 25 9 chr2 49571587 49571909 -132176178 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 8 963 561 221 0 47 chr2 49571909 49572023 -132176064 - MTC LTR MaLR -307 114 1 8 963 335 321 71 71 chr2 49572058 49572269 -132175818 + MLT1A LTR MaLR 162 372 -2 9 963 239 286 75 43 chr2 49588954 49589115 -132158972 - MLT1L LTR MaLR -121 489 324 1 963 1692 218 93 5 chr2 49598977 49599355 -132148732 - MTD LTR MaLR -8 411 1 1 963 1884 178 37 27 chr2 49608651 49609027 -132139060 + ORR1C2 LTR MaLR 5 384 0 1 963 2438 138 157 65 chr2 49609647 49610136 -132137951 - RMER4B LTR ERVK 0 585 39 1 963 2438 138 157 65 chr2 49610280 49610311 -132137776 - RMER4B LTR ERVK -547 38 17 1 963 3838 268 115 86 chr2 49610345 49611841 -132136246 - MTEa-int LTR MaLR -34 1546 8 1 963 1006 304 41 91 chr2 49611851 49612245 -132135842 - MTEa LTR MaLR -4 375 2 1 963 229 301 101 38 chr2 49616226 49616385 -132131702 - MTD LTR MaLR -6 413 245 1 963 277 305 83 28 chr2 49617819 49617964 -132130123 - RMER15-int LTR ERVL -2780 2219 2067 1 963 504 231 258 23 chr2 49618150 49618367 -132129720 - RMER15-int LTR ERVL -3364 1635 1368 1 963 1013 263 35 22 chr2 49618461 49618772 -132129315 - RMER15-int LTR ERVL -3803 1196 882 1 963 436 286 40 0 chr2 49618923 49618966 -132129121 - RMER15-int LTR ERVL -4167 832 790 1 963 436 286 40 0 chr2 49618988 49619070 -132129017 - RMER15-int LTR ERVL -4210 789 703 1 963 440 173 375 8 chr2 49619186 49619314 -132128773 - RMER15 LTR ERVL -104 471 297 1 963 399 221 33 132 chr2 49619317 49619468 -132128619 - RMER15 LTR ERVL -391 184 49 1 963 624 307 75 34 chr2 49634169 49634435 -132113652 - MLT1A0 LTR MaLR -2 363 87 1 963 1119 121 57 6 chr2 49634435 49634610 -132113477 + ORR1C2 LTR MaLR 3 186 -198 1 963 419 252 10 0 chr2 49634895 49634994 -132113093 + ORR1C2 LTR MaLR 167 266 -112 1 963 389 296 63 8 chr2 49634981 49635107 -132112980 - MLT1A0 LTR MaLR -163 202 70 1 963 618 88 55 64 chr2 49635092 49635201 -132112886 + ORR1C2 LTR MaLR 277 384 0 1 963 289 237 39 13 chr2 49635201 49635267 -132112820 - MLT1A0 LTR MaLR -272 93 26 1 963 1370 222 142 45 chr2 49636811 49637192 -132110895 + MTD LTR MaLR 2 419 0 1 963 2132 128 9 83 chr2 49639683 49640063 -132108024 + ORR1B1 LTR MaLR 2 386 -8 1 963 243 317 59 52 chr2 49645932 49646085 -132102002 + MamGypLTR1b LTR Gypsy 377 530 -252 1 963 954 211 37 90 chr2 49655758 49656003 -132092084 - RLTR20A LTR ERVK 0 541 310 2 963 533 149 35 0 chr2 49656043 49656130 -132091957 - RLTR20A LTR ERVK -451 90 1 2 963 1268 270 15 12 chr2 49663197 49663534 -132084553 + MTE2b LTR MaLR 40 377 -2 2 963 301 258 129 30 chr2 49663811 49663943 -132084144 + ORR1E LTR MaLR 2 146 -213 2 963 285 279 52 35 chr2 49664115 49664230 -132083857 + MLT1A1 LTR MaLR 291 407 -1 2 120 1613 226 28 18 chr2 49676161 49676561 -132071526 + MTD LTR MaLR 2 405 -14 2 964 711 241 100 40 chr2 49680439 49680690 -132067397 - MLT1C LTR MaLR -182 285 20 2 964 264 340 40 0 chr2 49686846 49686946 -132061141 + ORR1E LTR MaLR 1 104 -255 2 964 537 309 48 75 chr2 49687926 49688259 -132059828 - MT2A LTR ERVL -109 424 101 2 964 862 239 156 34 chr2 49697294 49697322 -132050765 + ORR1E LTR MaLR 1 38 -321 2 964 2109 168 11 13 chr2 49697322 49697701 -132050386 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 2 964 862 239 156 34 chr2 49697701 49697992 -132050095 + ORR1E LTR MaLR 39 359 0 2 964 243 290 36 45 chr2 49707787 49707899 -132040188 + MLT1A0 LTR MaLR 249 359 -6 3 964 565 279 175 8 chr2 49708666 49708923 -132039164 - MLT1F LTR MaLR -118 430 131 3 964 318 261 136 0 chr2 49713101 49713189 -132034898 + ORR1E LTR MaLR 14 113 -246 3 964 2141 203 43 39 chr2 49713878 49714436 -132033651 + RLTR20B2 LTR ERVK 1 560 0 3 964 484 175 118 163 chr2 49719619 49719865 -132028222 + RMER4B LTR ERVK 21 255 -330 3 964 318 215 72 41 chr2 49726904 49727001 -132021086 - RMER10A LTR ERVL -25 417 318 3 964 531 210 70 147 chr2 49727091 49727114 -132020973 - RMER10A LTR ERVL -142 300 283 3 964 531 210 70 147 chr2 49727197 49727486 -132020601 - RMER10A LTR ERVL -160 282 12 3 964 1473 198 133 14 chr2 49731147 49731515 -132016572 + MTD LTR MaLR 6 417 -2 3 964 4636 203 59 66 chr2 49731518 49732781 -132015306 + MTD-int LTR MaLR 2 1255 -3 3 964 1549 238 37 27 chr2 49732784 49733185 -132014902 + MTD LTR MaLR 1 405 -14 3 964 394 263 60 67 chr2 49739270 49739484 -132008603 - RMER17C LTR ERVK -72 338 87 3 964 394 239 6 97 chr2 49739536 49739623 -132008464 - RMER17C LTR ERVK -324 86 2 3 964 235 330 73 85 chr2 49739623 49739946 -132008141 - ORR1E LTR MaLR -40 319 1 3 964 331 198 24 12 chr2 49754250 49754332 -131993755 - MLT1B LTR MaLR -2 388 306 3 964 582 253 84 42 chr2 49754366 49754605 -131993482 - MLT1B LTR MaLR -140 250 2 3 964 1297 256 58 14 chr2 49755127 49755487 -131992600 - MTEa LTR MaLR 0 379 4 3 964 440 336 79 14 chr2 49757913 49758145 -131989942 - MLT2D LTR ERVL -2 557 164 3 964 476 238 45 23 chr2 49761351 49761525 -131986562 - MLT1H LTR MaLR -2 547 314 3 964 1321 147 28 24 chr2 49762009 49762260 -131985827 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 179 3 964 3508 28 0 0 chr2 49769228 49769624 -131978463 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 964 232 242 30 0 chr2 49769713 49769779 -131978308 + MLT2B1 LTR ERVL 28 95 -420 3 964 391 298 155 30 chr2 49769796 49770028 -131978059 + MLT2B1 LTR ERVL 144 404 -116 3 964 1446 167 38 236 chr2 49776995 49777466 -131970621 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 4 964 2471 176 82 4 chr2 49789800 49790312 -131957775 - RMER15 LTR ERVL 0 575 24 4 964 1350 174 156 58 chr2 49791314 49791693 -131956394 + MTD LTR MaLR 1 416 -3 4 964 2616 139 138 2 chr2 49805068 49805559 -131942528 - RMER4B LTR ERVK -11 574 17 4 965 1490 234 20 15 chr2 49809104 49809446 -131938641 + MTE2a LTR MaLR 34 377 -2 4 965 1420 220 73 21 chr2 49810509 49810894 -131937193 + MTD LTR MaLR 1 405 -14 4 965 1904 132 164 9 chr2 49811380 49811716 -131936371 - ORR1B1 LTR MaLR -4 390 3 4 965 1567 134 61 45 chr2 49817578 49817891 -131930196 + ORR1A3 LTR MaLR 1 318 -8 4 965 1170 234 71 61 chr2 49820506 49820884 -131927203 - RLTR14 LTR ERV1 0 382 1 4 965 1719 171 172 8 chr2 49827661 49827918 -131920169 - MTD LTR MaLR 0 419 122 4 965 1719 171 172 8 chr2 49827968 49828070 -131920017 - MTD LTR MaLR -298 121 2 4 965 2223 238 17 15 chr2 49830568 49831106 -131916981 - RMER15 LTR ERVL -15 560 22 4 965 306 205 0 153 chr2 49831113 49831211 -131916876 - RMER15 LTR ERVL -492 83 1 4 965 550 262 85 8 chr2 49835089 49835435 -131912652 - MTD LTR MaLR -14 405 5 4 965 482 339 40 43 chr2 49835512 49835836 -131912251 + ORR1E LTR MaLR 25 347 -12 4 965 249 239 60 0 chr2 49839183 49839250 -131908837 - LTR33A_ LTR ERVL -371 160 90 4 965 1497 244 24 32 chr2 49848938 49849307 -131898780 + ORR1D2 LTR MaLR 5 370 0 4 965 361 204 177 34 chr2 49850757 49850904 -131897183 - MER73 LTR ERVL -11 633 466 5 965 993 286 78 29 chr2 49851277 49851662 -131896425 - MER73 LTR ERVL -165 479 76 5 965 3461 35 0 0 chr2 49852365 49852761 -131895326 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 965 1282 174 200 16 chr2 49858132 49858447 -131889640 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 2 5 965 566 307 107 13 chr2 49873564 49873798 -131874289 - RMER15 LTR ERVL -14 561 306 5 965 380 333 109 53 chr2 49877062 49877382 -131870705 + ORR1E LTR MaLR 22 359 0 5 965 258 351 11 56 chr2 49877599 49877777 -131870310 - MER34 LTR ERV1 -364 178 9 5 965 248 277 81 32 chr2 49886336 49886459 -131861628 - MLT1A1 LTR MaLR -12 396 268 5 965 1715 199 45 11 chr2 49887776 49888131 -131859956 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 5 965 274 294 48 10 chr2 49890559 49890662 -131857425 + MLT1A1 LTR MaLR 302 408 0 5 965 2215 189 77 10 chr2 49898652 49899145 -131848942 - RMER5 LTR ERV1 0 534 9 5 965 374 244 117 8 chr2 49901245 49901365 -131846722 + MLT1C LTR MaLR 8 140 -327 5 965 246 314 50 17 chr2 49902172 49902292 -131845795 - MER34 LTR ERV1 -81 461 338 5 965 255 292 56 0 chr2 49903514 49903603 -131844484 + LTR37A LTR ERV1 323 416 -10 5 965 2447 190 35 6 chr2 49903673 49904180 -131843907 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 7 5 965 301 242 66 0 chr2 49905372 49905463 -131842624 - MER110 LTR ERV1 -394 97 1 5 965 280 275 44 0 chr2 49905905 49905996 -131842091 + MER89 LTR ERV1 465 559 0 5 965 230 333 13 13 chr2 49905999 49906078 -131842009 - MER110 LTR ERV1 -145 346 268 5 965 1434 221 100 22 chr2 49906130 49906500 -131841587 + MTD LTR MaLR 3 401 -18 5 965 282 329 63 0 chr2 49906589 49906732 -131841355 - MER110 LTR ERV1 -337 154 3 5 965 373 246 109 16 chr2 49908753 49908881 -131839206 - MLT1A1 LTR MaLR -1 407 268 5 965 795 219 64 41 chr2 49909463 49909682 -131838405 - MTD LTR MaLR 0 419 196 5 965 990 211 19 5 chr2 49916082 49916296 -131831791 - MTD LTR MaLR -202 217 1 5 965 1592 176 41 35 chr2 49917406 49917723 -131830364 - ORR1B2 LTR MaLR -46 321 3 5 965 469 271 13 53 chr2 49927381 49927533 -131820554 + MLT1A0 LTR MaLR 220 365 0 5 965 1070 130 68 0 chr2 49935871 49936063 -131812024 - ORR1B1 LTR MaLR -189 205 1 6 965 417 324 105 60 chr2 49936810 49937125 -131810962 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 37 6 966 4125 135 72 8 chr2 49944267 49944978 -131803109 - RMER6A LTR ERVK 0 756 1 6 966 754 262 25 57 chr2 49946027 49946369 -131801718 - MTE2a LTR MaLR -14 405 76 6 966 329 204 34 11 chr2 49949441 49949530 -131798557 - MER34A1 LTR ERV1 -69 518 428 6 966 717 279 123 57 chr2 49950250 49950374 -131797713 + MLT1D LTR MaLR 3 127 -378 6 966 1147 216 150 167 chr2 49950374 49950914 -131797173 - MT2A LTR ERVL -2 531 1 6 966 717 279 123 57 chr2 49950914 49951171 -131796916 + MLT1D LTR MaLR 128 419 -86 6 966 2043 114 8 87 chr2 49951171 49951526 -131796561 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 6 966 717 279 123 57 chr2 49951526 49951615 -131796472 + MLT1D LTR MaLR 420 505 0 6 966 660 322 144 25 chr2 49959821 49960175 -131787912 + MLT1A1 LTR MaLR 1 396 -12 6 966 1574 231 71 15 chr2 49960427 49960822 -131787265 - MTD LTR MaLR -2 417 1 6 966 251 203 31 0 chr2 49962263 49962327 -131785760 - MLT1A0 LTR MaLR 0 408 343 6 966 282 318 136 90 chr2 49962549 49962844 -131785243 - MLT1A0 LTR MaLR -52 313 5 6 966 2176 156 3 42 chr2 49962880 49963262 -131784825 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 6 966 1401 212 121 16 chr2 49968713 49969077 -131779010 - MTD LTR MaLR 0 419 18 6 966 285 258 109 62 chr2 49970134 49970262 -131777825 - MTEa LTR MaLR -45 334 201 6 966 415 269 135 36 chr2 49970359 49970552 -131777535 - MTEa LTR MaLR -163 216 5 6 966 274 279 17 43 chr2 49970813 49970929 -131777158 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 296 6 966 226 297 76 67 chr2 49971119 49971238 -131776849 - ORR1E LTR MaLR -239 120 1 6 966 1030 188 201 76 chr2 49975685 49976053 -131772034 + MTD LTR MaLR 1 414 -5 6 966 288 314 89 13 chr2 49983206 49983364 -131764723 - MLT1A LTR MaLR 0 374 205 6 966 1937 123 29 19 chr2 49987581 49987964 -131760123 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 6 966 249 246 29 116 chr2 49993207 49993223 -131754864 - MT2B LTR ERVL -324 276 152 6 966 1282 189 62 70 chr2 49996469 49996810 -131751277 - MTD LTR MaLR -14 405 68 6 966 314 117 0 178 chr2 49997972 49998045 -131750042 - MTD LTR MaLR -335 84 21 6 966 1441 107 291 7 chr2 50004612 50004904 -131743183 + MTC LTR MaLR 47 421 0 6 966 826 338 40 18 chr2 50030997 50031379 -131716708 - MLT1A1 LTR MaLR -19 389 1 2 966 559 267 81 64 chr2 50035683 50036027 -131712060 + ORR1E LTR MaLR 3 352 -7 3 966 891 282 105 3 chr2 50036875 50037227 -131710860 + MLT1B LTR MaLR 1 388 -2 3 966 247 324 43 35 chr2 50039358 50039473 -131708614 - ORR1E LTR MaLR -235 124 9 4 966 751 229 102 37 chr2 50055620 50055942 -131692145 + RLTR15 LTR ERVK 1 343 -16 5 966 1105 198 32 14 chr2 50059418 50059638 -131688449 - RMER17B LTR ERVK -174 784 561 6 967 3666 171 111 39 chr2 50077174 50078003 -131670084 - RMER19B LTR ERVK -12 890 2 8 967 523 289 73 161 chr2 50078509 50078950 -131669137 - MLT1F2 LTR MaLR 0 560 159 8 967 1502 224 59 95 chr2 50079904 50079991 -131668096 - RLTR20A LTR ERVK -3 538 456 8 967 1502 224 59 95 chr2 50080089 50080558 -131667529 - RLTR20A LTR ERVK -86 455 4 8 967 617 253 191 6 chr2 50087377 50087707 -131660380 + MLT1A1 LTR MaLR 18 408 0 9 967 3353 73 50 66 chr2 50088256 50088757 -131659330 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 9 967 391 279 69 8 chr2 50090647 50090777 -131657310 + MTE2b LTR MaLR 2 139 -240 1 967 505 179 9 36 chr2 50090826 50090936 -131657151 + MTE2b LTR MaLR 272 378 -1 1 967 954 293 50 52 chr2 50098782 50099184 -131648903 + ORR1E-int LTR MaLR 660 1027 -553 1 967 418 340 107 19 chr2 50099287 50099538 -131648549 + ORR1E-int LTR MaLR 1257 1531 -49 1 967 349 325 8 31 chr2 50099538 50099665 -131648422 + ORR1E LTR MaLR 3 126 -233 1 967 2371 163 10 0 chr2 50099748 50100135 -131647952 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 4 1 967 1240 134 0 27 chr2 50102780 50103003 -131645084 - RMER6C LTR ERVK -56 634 418 1 967 372 157 247 0 chr2 50103202 50103291 -131644796 - RMER6C LTR ERVK -579 111 1 1 967 2265 146 24 29 chr2 50115786 50116195 -131631892 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 1 967 314 280 223 29 chr2 50116845 50117051 -131631036 - RMER15 LTR ERVL -14 561 316 1 967 422 204 97 44 chr2 50117186 50117226 -131630861 - RLTR20C LTR ERVK -55 513 475 1 967 1072 179 118 68 chr2 50117271 50117617 -131630470 - RLTR20C LTR ERVK -94 474 1 1 967 446 265 14 29 chr2 50118648 50118788 -131629299 - RLTR15 LTR ERVK -221 138 1 1 967 1355 270 52 40 chr2 50118871 50119276 -131628811 - MTD LTR MaLR -8 411 2 1 967 3029 172 120 39 chr2 50121023 50121663 -131626424 + RLTR17 LTR ERVK 1 692 0 1 967 1061 184 98 49 chr2 50121960 50122206 -131625881 + ORR1D1 LTR MaLR 1 258 -116 1 967 493 301 84 50 chr2 50125547 50125892 -131622195 - MLT1A0 LTR MaLR -15 393 1 1 967 3628 151 150 62 chr2 50131693 50132574 -131615513 + RMER17B LTR ERVK 1 958 0 1 967 2979 49 31 3 chr2 50132703 50133092 -131614995 + MTB LTR MaLR 1 400 0 1 967 2648 59 0 0 chr2 50134934 50135272 -131612815 - ORR1A1 LTR MaLR -8 338 1 1 967 1804 204 82 0 chr2 50137883 50138261 -131609826 + MTD LTR MaLR 11 419 0 1 967 495 223 268 15 chr2 50139799 50140112 -131607975 + MER57D LTR ERV1 16 430 -4 1 967 311 299 37 128 chr2 50140721 50140783 -131607304 - MT2B LTR ERVL -225 359 198 1 967 311 299 37 128 chr2 50140932 50140951 -131607136 - MT2B LTR ERVL -225 197 143 1 967 2491 187 103 96 chr2 50142260 50142933 -131605154 - RLTR40 LTR ERVK -1 816 129 1 967 2491 187 103 96 chr2 50143163 50143227 -131604860 - RLTR40 LTR ERVK -689 128 74 1 967 233 295 132 81 chr2 50149029 50149339 -131598748 + MER65D LTR ERV1 96 421 -52 1 967 1121 271 49 51 chr2 50152987 50153337 -131594750 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 22 1 967 1531 242 52 34 chr2 50156676 50157120 -131590967 + RLTR20B3 LTR ERVK 2 453 -124 2 967 733 264 220 40 chr2 50157117 50157594 -131590493 + RMER21B LTR ERV1 5 567 -275 2 967 422 246 65 65 chr2 50160694 50160833 -131587254 - MTEb LTR MaLR -5 374 236 2 967 2092 141 139 19 chr2 50164757 50165132 -131582955 - RLTR9B2 LTR ERVK 0 420 1 2 967 4186 34 66 9 chr2 50165610 50166140 -131581947 - LTRIS2 LTR ERV1 0 564 5 2 967 3029 192 104 3 chr2 50167188 50167803 -131580284 + RLTR33 LTR ERVK 2 678 0 2 967 247 347 78 31 chr2 50169437 50169565 -131578522 - MLT1A LTR MaLR -240 134 1 2 967 262 232 90 104 chr2 50175061 50175104 -131572983 - RLTR25B LTR ERVK -620 408 368 2 967 4675 114 25 58 chr2 50180899 50181711 -131566376 + RLTR13B4 LTR ERVK 1 803 0 2 967 244 377 13 0 chr2 50189966 50190043 -131558044 - LTR78 LTR ERV1 -948 356 279 2 967 677 286 76 122 chr2 50190895 50191198 -131556889 + RMER15 LTR ERVL 273 561 -14 2 967 488 377 81 78 chr2 50195336 50195670 -131552417 + LTR16C LTR ERVL 155 489 0 2 967 254 321 43 111 chr2 50196400 50196635 -131551452 + RMER4B LTR ERVK 31 249 -336 2 968 1239 288 50 25 chr2 50201640 50202000 -131546087 - MTEa LTR MaLR -5 374 6 2 968 666 143 9 130 chr2 50207635 50207752 -131540335 + ORR1B1 LTR MaLR 235 337 -57 2 968 666 115 7 96 chr2 50208180 50208226 -131539861 + ORR1B1 LTR MaLR 338 379 -15 2 968 8205 158 77 38 chr2 50208223 50210036 -131538051 + ORR1B1-int LTR MaLR 15 1772 -191 2 968 1575 283 33 13 chr2 50210043 50210501 -131537586 - RMER20A LTR ERVK -39 477 11 2 968 1091 128 32 11 chr2 50210543 50210732 -131537355 + ORR1B1-int LTR MaLR 1771 1963 0 2 968 1779 197 36 36 chr2 50210732 50211083 -131537004 + ORR1B1 LTR MaLR 42 392 -2 2 968 737 277 57 32 chr2 50212463 50212787 -131535300 - MTE2b LTR MaLR -7 372 3 3 968 366 340 94 30 chr2 50216485 50216782 -131531305 + MLT1J-int LTR MaLR 82 397 -990 3 968 253 187 115 138 chr2 50218533 50218620 -131529467 - ORR1C2 LTR MaLR -83 243 159 3 968 1023 152 10 78 chr2 50218778 50218971 -131529116 - ORR1C2 LTR MaLR -191 193 14 3 968 2129 325 95 92 chr2 50219733 50220213 -131527874 + RMER15-int LTR ERVL 32 510 -4489 3 968 2129 325 95 92 chr2 50220402 50222006 -131526081 + RMER15-int LTR ERVL 511 2123 -2876 3 968 4141 139 81 8 chr2 50222055 50222809 -131525278 + RMER17D2 LTR ERVK 1 809 0 3 968 1261 252 62 9 chr2 50235046 50235382 -131512705 + ORR1D2 LTR MaLR 17 370 0 3 968 1051 226 86 123 chr2 50235695 50236078 -131512009 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 6 3 968 352 323 356 0 chr2 50238492 50238678 -131509409 + MLT1A1 LTR MaLR 135 386 -22 3 968 923 279 97 0 chr2 50255825 50256051 -131492036 + MTEa LTR MaLR 13 260 -119 3 968 240 342 142 75 chr2 50258979 50259219 -131488868 + MLT1G LTR MaLR 30 285 -306 3 968 2460 125 25 100 chr2 50262311 50262801 -131485286 - RLTR11B LTR ERVK 0 453 1 3 968 664 284 53 14 chr2 50265990 50266197 -131481890 + MLT1C LTR MaLR 244 458 -9 3 968 3127 32 59 0 chr2 50266763 50267137 -131480950 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 968 275 312 123 52 chr2 50269616 50269855 -131478232 - ORR1E LTR MaLR -8 371 91 3 968 1370 291 48 10 chr2 50273235 50273634 -131474453 + MTD LTR MaLR 5 418 -1 3 968 329 267 16 48 chr2 50274722 50274848 -131473239 + RLTR15 LTR ERVK 48 169 -190 3 968 436 161 74 0 chr2 50287465 50287546 -131460541 + RMER19B LTR ERVK 10 96 -806 4 968 2647 171 65 19 chr2 50287691 50288473 -131459614 + RMER19B LTR ERVK 55 902 0 4 968 1440 202 109 3 chr2 50290980 50291318 -131456769 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 4 968 665 272 131 86 chr2 50293449 50293785 -131454302 - RLTR12B LTR ERVK -28 500 134 4 968 665 272 131 86 chr2 50293968 50294094 -131453993 - RLTR12B LTR ERVK -395 133 14 4 968 231 319 98 11 chr2 50294654 50294746 -131453341 - MLT1D LTR MaLR -312 193 94 4 968 1246 223 111 0 chr2 50294746 50295078 -131453009 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 2 4 968 650 238 106 94 chr2 50296329 50296434 -131451653 - MLT1B LTR MaLR -74 316 222 4 968 650 238 106 94 chr2 50296579 50296728 -131451359 - MLT1B LTR MaLR -169 221 59 4 968 1046 276 76 20 chr2 50300952 50301307 -131446780 - MTE2b LTR MaLR -4 375 1 4 968 265 248 21 132 chr2 50310180 50310324 -131437763 + MT2B LTR ERVL 137 264 -337 4 968 522 304 105 102 chr2 50310382 50310821 -131437266 - MLT1C LTR MaLR -25 442 3 4 968 3996 163 69 33 chr2 50314322 50315145 -131432942 + RLTR25B LTR ERVK 1 853 -175 4 968 890 213 81 123 chr2 50315385 50315669 -131432418 + RLTR25B LTR ERVK 757 1028 0 4 968 838 262 65 40 chr2 50315881 50316097 -131431990 - MTD LTR MaLR 0 419 196 4 968 838 222 32 13 chr2 50316400 50316520 -131431567 - MTD LTR MaLR -224 195 1 4 968 1761 216 49 24 chr2 50322382 50322791 -131425296 + MTD LTR MaLR 1 419 0 4 968 3728 233 86 92 chr2 50322792 50323565 -131424522 + MTD-int LTR MaLR 2 831 -427 4 968 3728 233 86 92 chr2 50323658 50323685 -131424402 + MTD-int LTR MaLR 832 834 -424 4 968 3728 233 86 92 chr2 50324282 50324744 -131423343 + MTD-int LTR MaLR 835 1258 0 4 968 1757 231 85 8 chr2 50324744 50325133 -131422954 + MTD LTR MaLR 1 419 0 4 968 2126 119 60 136 chr2 50328219 50328733 -131419354 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 4 969 230 261 29 44 chr2 50335244 50335312 -131412775 - LTR84a LTR ERVL -194 563 497 4 969 846 313 14 50 chr2 50335633 50335912 -131412175 + MER34A LTR ERV1 36 304 -267 4 969 756 317 138 69 chr2 50338210 50338746 -131409341 - RMER13A LTR ERVK -190 670 98 4 969 242 377 63 28 chr2 50339141 50339283 -131408804 + LTR16C LTR ERVL 291 437 -52 4 969 764 311 115 53 chr2 50339375 50339715 -131408372 + ORR1D2 LTR MaLR 10 370 0 4 969 545 272 321 11 chr2 50339721 50339984 -131408103 + ORR1D2-int LTR MaLR 5 351 -1229 4 969 3494 170 140 82 chr2 50339984 50340832 -131407255 - RMER19B LTR ERVK 0 902 6 4 969 6453 118 6 5 chr2 50340919 50341871 -131406216 + RMER17B LTR ERVK 1 953 -5 4 969 3061 280 46 74 chr2 50341878 50342959 -131405128 + ORR1D2-int LTR MaLR 320 1370 0 4 969 625 282 157 28 chr2 50342959 50343277 -131404810 + ORR1D2 LTR MaLR 1 359 0 4 969 267 343 38 9 chr2 50346848 50346954 -131401133 + RMER15 LTR ERVL 424 532 -43 4 969 292 253 0 69 chr2 50348751 50348853 -131399234 + LTR83 LTR ERVL 539 633 -147 4 969 6279 46 40 0 chr2 50353621 50354398 -131393689 - RLTR13C2 LTR ERVK 0 808 1 5 969 770 263 158 67 chr2 50357203 50357533 -131390554 - MTE2b LTR MaLR -19 360 1 5 969 1742 182 94 25 chr2 50364796 50365190 -131382897 + MTC LTR MaLR 1 421 0 5 969 715 285 16 22 chr2 50365742 50365925 -131382162 - ORR1D2 LTR MaLR -50 320 139 5 969 1041 231 134 37 chr2 50366034 50366457 -131381630 - RMER4B LTR ERVK -30 555 59 5 969 591 294 199 43 chr2 50380592 50380780 -131367307 + ORR1E LTR MaLR 9 233 -126 5 969 591 294 199 43 chr2 50380808 50380921 -131367166 + ORR1E LTR MaLR 234 357 -2 5 969 2307 156 33 10 chr2 50386242 50386631 -131361456 + MTC LTR MaLR 1 398 -23 5 969 289 318 47 0 chr2 50386708 50386793 -131361294 - MTEa LTR MaLR -287 92 4 5 969 633 337 46 40 chr2 50387138 50387484 -131360603 + ORR1E LTR MaLR 1 348 -11 5 969 654 282 36 45 chr2 50387735 50387958 -131360129 + RMER15 LTR ERVL 343 563 -12 5 969 1100 236 79 65 chr2 50389560 50389914 -131358173 + MTE2b LTR MaLR 3 361 -18 5 969 3040 128 0 13 chr2 50390456 50390907 -131357180 - RLTR41 LTR ERV1 -1 445 1 5 969 714 286 56 102 chr2 50395316 50395709 -131352378 + MTEa LTR MaLR 5 379 0 5 969 250 267 37 73 chr2 50395715 50395824 -131352263 - LTR33A_ LTR ERVL -106 409 305 5 969 498 276 28 94 chr2 50396077 50396283 -131351804 - LTR33A_ LTR ERVL -338 193 1 5 969 4098 35 0 12 chr2 50401711 50402199 -131345888 - LTRIS_Mm LTR ERV1 0 482 1 5 969 1723 178 263 21 chr2 50403207 50403454 -131344633 + RMER4B LTR ERVK 1 270 -315 5 969 1723 178 263 21 chr2 50403497 50403720 -131344367 + RMER4B LTR ERVK 271 585 0 5 969 930 133 119 17 chr2 50405038 50405214 -131342873 + ORR1B1 LTR MaLR 3 196 -198 5 969 2528 244 74 79 chr2 50405237 50406197 -131341890 - RMER17B LTR ERVK -3 955 1 5 969 1423 153 4 9 chr2 50406197 50406428 -131341659 + ORR1A4 LTR MaLR 100 329 0 5 969 1391 228 42 87 chr2 50409481 50409868 -131338219 + MTD LTR MaLR 1 370 -49 5 969 2130 119 39 168 chr2 50409868 50410362 -131337725 + RLTR23 LTR ERV1 1 430 0 5 969 1391 228 42 87 chr2 50410362 50410377 -131337710 + MTD LTR MaLR 371 385 -34 5 969 260 216 0 19 chr2 50410543 50410595 -131337492 + MTD LTR MaLR 369 419 0 5 969 2950 101 2 12 chr2 50410984 50411394 -131336693 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 2 5 969 1194 202 0 0 chr2 50411821 50412034 -131336053 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 166 5 969 747 200 5 116 chr2 50412165 50412363 -131335724 - ORR1C1 LTR MaLR -197 181 6 5 969 268 259 63 101 chr2 50414132 50414291 -131333796 + MLT1E1 LTR MaLR 154 306 -348 5 969 1010 266 131 77 chr2 50420027 50420377 -131327710 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 2 5 969 231 358 93 74 chr2 50420377 50420688 -131327399 + ORR1D2 LTR MaLR 54 370 0 5 969 747 275 67 42 chr2 50435231 50435591 -131312496 + ORR1D1 LTR MaLR 2 370 -4 6 969 827 290 64 45 chr2 50440625 50440939 -131307148 - MLT2D LTR ERVL -21 393 74 6 970 375 301 178 69 chr2 50464844 50465147 -131282940 + MLT1A1 LTR MaLR 73 408 0 6 970 506 330 101 72 chr2 50471236 50471611 -131276476 + MLT1B LTR MaLR 1 386 -4 6 970 1831 159 62 10 chr2 50473109 50473471 -131274616 + RMER19B LTR ERVK 348 902 0 6 970 1009 264 51 48 chr2 50473499 50473810 -131274277 + MTEa LTR MaLR 3 314 -65 6 970 2839 197 25 66 chr2 50474695 50474782 -131273305 + RLTR18 LTR ERVK 8 95 -521 6 970 2844 53 12 0 chr2 50474782 50475124 -131272963 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 6 970 13696 59 7 2 chr2 50475124 50476907 -131271180 + ORR1A1-int LTR MaLR 1 1792 0 6 970 2784 50 15 0 chr2 50476907 50477248 -131270839 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 6 970 2839 197 25 66 chr2 50477248 50477793 -131270294 + RLTR18 LTR ERVK 96 614 -2 6 970 842 307 109 24 chr2 50481904 50482364 -131265723 - MER68 LTR ERVL -55 508 10 6 970 1236 197 8 26 chr2 50484993 50485227 -131262860 - RLTR41 LTR ERV1 -63 383 154 6 970 1897 165 62 14 chr2 50490456 50490813 -131257274 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 6 970 284 365 68 0 chr2 50490832 50490980 -131257107 + MLT1E LTR MaLR 466 623 -30 6 970 2136 177 49 27 chr2 50492944 50493138 -131254949 - MTC LTR MaLR -5 416 219 6 970 2317 163 21 3 chr2 50493138 50493525 -131254562 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 6 970 2136 177 49 27 chr2 50493525 50493737 -131254350 - MTC LTR MaLR -203 218 1 6 970 502 287 46 77 chr2 50494092 50494288 -131253799 - MLT2B2 LTR ERVL -7 555 366 6 970 468 269 154 43 chr2 50498890 50499123 -131248964 - MLT1H LTR MaLR -259 290 32 7 970 242 293 91 68 chr2 50499768 50499900 -131248187 - ORR1E LTR MaLR -224 135 1 7 970 871 258 96 79 chr2 50500710 50501064 -131247023 - MTE2b LTR MaLR 0 379 20 3 970 816 263 249 10 chr2 50501061 50501568 -131246519 - MTE2b-int LTR MaLR -31 1549 920 3 970 1248 154 133 0 chr2 50501680 50501913 -131246174 + RLTR28 LTR ERVL 3 266 -258 4 970 479 280 30 119 chr2 50507615 50508045 -131240042 + RMER10A LTR ERVL 26 417 -25 1 970 2277 137 17 74 chr2 50508336 50508754 -131239333 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 1 970 391 351 35 18 chr2 50518244 50518415 -131229672 - LTR80A LTR ERVL -237 346 173 2 970 558 211 23 38 chr2 50519263 50519396 -131228691 - MT2A LTR ERVL -400 133 3 3 970 1387 212 76 48 chr2 50521991 50522348 -131225739 - ORR1D1 LTR MaLR -7 367 1 3 970 490 325 61 14 chr2 50523469 50523765 -131224322 + MLT1B LTR MaLR 56 365 -25 4 970 2147 120 59 107 chr2 50527234 50527710 -131220377 + RLTR11B LTR ERVK 1 453 0 4 970 1855 205 83 0 chr2 50528508 50528894 -131219193 - MTC LTR MaLR -1 420 3 4 970 2129 236 97 82 chr2 50529010 50529857 -131218230 - RMER13A LTR ERVK 0 860 1 4 970 241 281 84 49 chr2 50529982 50530124 -131217963 - MER34A LTR ERV1 -423 148 2 4 970 371 233 79 24 chr2 50532594 50532748 -131215339 - MER34 LTR ERV1 -2 569 375 5 970 985 221 54 32 chr2 50533193 50533566 -131214521 + RMER10A LTR ERVL 1 398 0 5 970 4647 156 34 55 chr2 50533752 50534661 -131213426 - RMER19B LTR ERVK -12 890 1 5 970 2795 33 89 0 chr2 50535127 50535464 -131212623 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 5 970 56454 23 15 7 chr2 50535464 50541886 -131206201 + IAPEz-int LTR ERVK 8 6481 0 5 970 2795 33 89 0 chr2 50541886 50542223 -131205864 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 5 970 586 259 88 104 chr2 50547544 50547986 -131200101 - RLTR12B LTR ERVK -28 500 3 6 970 501 292 113 45 chr2 50555574 50555821 -131192266 + MTE2b LTR MaLR 1 264 -115 7 970 1023 180 113 12 chr2 50555821 50556069 -131192018 + ORR1D1 LTR MaLR 1 273 -101 7 970 262 267 58 0 chr2 50556103 50556189 -131191898 + ORR1D1 LTR MaLR 261 351 -28 7 970 296 167 0 36 chr2 50556933 50556989 -131191098 - MLT2B2 LTR ERVL 0 562 509 8 970 762 346 66 27 chr2 50557162 50557350 -131190737 - MT2A LTR ERVL -107 426 233 8 970 762 346 66 27 chr2 50557379 50557600 -131190487 - MT2A LTR ERVL -301 232 1 8 970 871 249 138 45 chr2 50558018 50558390 -131189697 - MTD LTR MaLR 0 419 1 8 970 1240 234 6 67 chr2 50562590 50562919 -131185168 + RLTR18B LTR ERVK 14 322 -294 9 970 1348 233 66 82 chr2 50562886 50563251 -131184836 + RLTR18B LTR ERVK 148 506 -6 9 970 409 346 305 42 chr2 50563415 50563677 -131184410 - MT2A LTR ERVL -98 435 105 9 970 3259 53 0 0 chr2 50564339 50564735 -131183352 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 9 970 8387 52 27 1 chr2 50564735 50565805 -131182282 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 9 970 3258 53 0 0 chr2 50565805 50566201 -131181886 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 9 970 228 265 14 14 chr2 50567926 50567995 -131180092 - MTE2b LTR MaLR -23 356 288 9 970 357 311 40 92 chr2 50583649 50583900 -131164187 - RMER2 LTR ERV1 0 567 330 1 971 1295 197 28 107 chr2 50601600 50602032 -131146055 + RMER10B LTR ERVL 1 398 0 1 971 335 369 84 63 chr2 50606171 50606455 -131141632 + ORR1E LTR MaLR 59 348 -11 1 971 265 256 156 23 chr2 50614663 50614791 -131133296 - MTEb LTR MaLR -4 375 231 1 971 1247 228 70 30 chr2 50631666 50631965 -131116122 - MTD LTR MaLR -13 406 96 1 971 575 269 90 25 chr2 50633970 50634270 -131113817 + MTEa LTR MaLR 1 342 -37 1 971 2099 80 79 50 chr2 50643601 50643919 -131104168 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 1 971 367 315 41 99 chr2 50646612 50646744 -131101343 - RLTR14 LTR ERV1 0 382 255 2 971 367 315 41 99 chr2 50646934 50647044 -131101043 - RLTR14 LTR ERV1 -128 254 154 2 971 2792 57 76 3 chr2 50647104 50647473 -131100614 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 971 982 219 66 117 chr2 50653523 50654055 -131094032 - RLTR16 LTR ERVK 0 505 1 2 971 2478 77 85 31 chr2 50656210 50656600 -131091487 - IAPLTR2a LTR ERVK 0 411 1 2 971 229 266 35 92 chr2 50660061 50660148 -131087939 - MLT1M LTR MaLR -16 656 575 2 971 403 355 86 0 chr2 50661117 50661314 -131086773 + MamGypLTR1a LTR Gypsy 56 269 -515 2 971 689 299 35 44 chr2 50662679 50663120 -131084967 + MER34A LTR ERV1 1 526 -45 2 971 465 324 137 10 chr2 50667887 50668175 -131079912 - LTR90A LTR LTR -647 329 5 2 971 322 286 83 16 chr2 50672853 50672974 -131075113 + MLT1A1 LTR MaLR 1 129 -279 2 971 254 229 0 16 chr2 50673174 50673236 -131074851 + RLTR14-int LTR ERV1 5097 5157 -160 2 971 1010 249 82 73 chr2 50673388 50673756 -131074331 + RLTR14 LTR ERV1 1 371 -11 2 971 1833 141 64 17 chr2 50679481 50679827 -131068260 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 6 2 971 256 368 43 22 chr2 50681267 50681406 -131066681 - LTR85c LTR Gypsy? -1 822 681 2 971 3131 55 35 20 chr2 50686918 50687323 -131060764 - RLTR10A LTR ERVK 0 411 1 2 971 750 288 113 43 chr2 50694712 50695013 -131053074 - MTEa LTR MaLR -57 322 1 2 971 518 315 129 52 chr2 50697085 50697510 -131050577 + MLT1C LTR MaLR 5 462 -5 2 971 641 246 227 42 chr2 50712905 50712933 -131035154 - MLT2C1 LTR ERVL 0 397 370 2 971 641 246 227 42 chr2 50713029 50713335 -131034752 - MLT2C1 LTR ERVL -28 369 1 2 971 2433 95 25 0 chr2 50713590 50713905 -131034182 - ORR1A2 LTR MaLR -1 326 4 2 971 1648 228 45 68 chr2 50714600 50715067 -131033020 + RMER19C LTR ERVK 138 593 -18 2 971 2201 192 79 43 chr2 50716917 50717423 -131030664 + RLTR28 LTR ERVL 1 524 0 2 971 519 278 33 40 chr2 50718990 50719140 -131028947 + MLT1A0 LTR MaLR 3 151 -214 2 971 357 178 109 22 chr2 50719167 50719259 -131028828 + MLT1A0 LTR MaLR 256 355 -19 2 972 2341 221 155 7 chr2 50730596 50731214 -131016873 - RMER19A LTR ERVK -27 710 1 3 972 636 237 72 7 chr2 50734601 50734754 -131013333 - MTE2a LTR MaLR 0 379 217 3 972 362 357 86 31 chr2 50736945 50737202 -131010885 - LTR84a LTR ERVL -173 584 314 3 972 559 307 235 4 chr2 50746537 50746804 -131001283 + MLT1A0 LTR MaLR 37 365 0 3 972 885 197 58 278 chr2 50750415 50750900 -130997187 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 3 972 3227 35 37 0 chr2 50754458 50754832 -130993255 + RLTR10 LTR ERVK 1 388 -2 3 972 350 395 16 0 chr2 50756123 50756252 -130991835 + MLT1A LTR MaLR 4 134 -240 3 972 628 238 119 40 chr2 50773518 50773719 -130974368 - MTE2b LTR MaLR -162 217 1 3 972 542 363 108 8 chr2 50773830 50774183 -130973904 - ERVL-B4-int LTR ERVL -1165 4549 4162 3 972 787 213 0 31 chr2 50774619 50774779 -130973308 + ORR1C2 LTR MaLR 2 156 -218 3 972 1046 196 16 57 chr2 50775679 50775923 -130972164 + ORR1C2 LTR MaLR 151 384 0 3 972 723 285 56 30 chr2 50776072 50776340 -130971747 - RMER15 LTR ERVL -14 561 287 3 972 734 322 104 18 chr2 50785327 50785662 -130962425 + MTD LTR MaLR 56 419 0 3 972 1632 183 42 66 chr2 50794701 50795082 -130953005 - ORR1D1 LTR MaLR -2 372 1 3 972 1848 219 44 8 chr2 50795106 50795493 -130952594 + MTD LTR MaLR 3 403 -16 3 972 593 298 92 30 chr2 50796614 50796950 -130951137 + MLT1A0 LTR MaLR 5 361 -4 3 972 1054 211 95 89 chr2 50797276 50797656 -130950431 - ORR1C2 LTR MaLR -2 382 1 3 972 316 246 64 46 chr2 50803031 50803166 -130944921 - RLTR12B LTR ERVK -6 522 374 3 972 288 246 97 84 chr2 50803907 50804062 -130944025 + MER57E1 LTR ERV1 194 350 -22 4 972 1600 235 36 43 chr2 50806507 50806921 -130941166 - MTD LTR MaLR -8 411 1 4 972 3105 81 0 0 chr2 50807390 50807786 -130940301 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 972 473 314 82 56 chr2 50808047 50808280 -130939807 + RMER2 LTR ERV1 329 567 0 4 972 1864 211 8 52 chr2 50812910 50813301 -130934786 + ORR1C1 LTR MaLR 1 374 -5 4 972 2418 185 12 2 chr2 50815475 50815882 -130932205 - MTC LTR MaLR -1 420 10 4 972 275 341 98 112 chr2 50816033 50816320 -130931767 + ORR1E LTR MaLR 66 348 -11 4 972 1187 243 139 43 chr2 50818180 50818562 -130929525 + MTD LTR MaLR 1 405 -14 4 972 769 284 45 129 chr2 50824951 50825277 -130922810 - MTEa LTR MaLR -29 350 56 4 972 769 284 45 129 chr2 50825316 50825369 -130922718 - MTEa LTR MaLR -324 55 3 4 972 1211 224 83 83 chr2 50831329 50831704 -130916383 + ORR1C2 LTR MaLR 3 377 -7 4 972 1112 312 99 25 chr2 50833455 50833807 -130914280 - MLT2B2 LTR ERVL -5 510 143 4 972 1653 247 60 15 chr2 50833807 50834206 -130913881 - MTD LTR MaLR 0 419 3 4 972 1112 312 99 25 chr2 50834206 50834326 -130913761 - MLT2B2 LTR ERVL -373 142 3 4 972 1003 244 73 150 chr2 50835590 50836057 -130912030 - RLTR11B LTR ERVK -22 431 1 4 972 1170 270 95 11 chr2 50837813 50838161 -130909926 + MTE2b LTR MaLR 1 377 -2 4 972 268 301 0 0 chr2 50838265 50838338 -130909749 + MLT1A0 LTR MaLR 293 365 0 4 972 348 255 0 124 chr2 50843209 50843226 -130904861 + MT2B LTR ERVL 152 153 -448 4 972 3817 66 32 2 chr2 50845989 50846457 -130901630 + RLTR45 LTR ERVK 1 482 0 4 972 4500 67 107 16 chr2 50846457 50847091 -130900996 + RLTR45-int LTR ERVK 1 692 -6552 4 972 1145 58 0 0 chr2 50847389 50847527 -130900560 + RLTR45-int LTR ERVK 681 818 -6426 4 972 12200 36 47 3 chr2 50848323 50850128 -130897959 + RLTR45-int LTR ERVK 1329 3212 -4032 4 972 3916 102 28 28 chr2 50850098 50850705 -130897382 + RLTR45-int LTR ERVK 3380 3986 -3258 4 972 8325 46 1 20 chr2 50850698 50851726 -130896361 + RLTR45-int LTR ERVK 5065 6072 -1172 4 972 2023 97 13 3 chr2 50851748 50852047 -130896040 + RLTR13B1 LTR ERVK 207 508 -385 4 972 6798 37 4 0 chr2 50852047 50852824 -130895263 + RLTR45-int LTR ERVK 6333 7112 -132 4 972 2951 44 2 119 chr2 50852830 50853267 -130894820 - RLTR10 LTR ERVK -4 386 1 4 972 16919 23 16 1 chr2 50853269 50855184 -130892903 - RLTR10-int LTR ERVK -3 1984 41 4 972 2951 44 2 119 chr2 50855200 50855637 -130892450 - RLTR10 LTR ERVK -4 386 1 4 972 1209 29 0 0 chr2 50855637 50855775 -130892312 + RLTR45-int LTR ERVK 7107 7244 0 4 121 3829 66 30 2 chr2 50855775 50856244 -130891843 + RLTR45 LTR ERVK 1 482 0 4 973 3147 70 18 55 chr2 50861162 50861599 -130886488 + BGLII LTR ERVK 1 421 0 4 973 4254 166 84 91 chr2 50862823 50863934 -130884153 - RLTR25A LTR ERVK 0 1103 1 4 973 540 296 85 65 chr2 50874178 50874518 -130873569 + MLT1B LTR MaLR 1 347 -43 4 973 733 279 96 65 chr2 50877928 50878284 -130869803 + MTEa LTR MaLR 9 375 -4 4 973 233 245 0 39 chr2 50878811 50878862 -130869225 + MamGypLTR3 LTR Gypsy 209 257 -582 4 973 1114 264 82 101 chr2 50879976 50880313 -130867774 - MTE2a LTR MaLR -14 405 57 5 973 916 264 82 102 chr2 50880523 50880603 -130867484 - MTE2a LTR MaLR -345 74 1 5 973 565 277 44 87 chr2 50881026 50881232 -130866855 + ORR1E LTR MaLR 1 197 -162 5 973 350 316 0 41 chr2 50899714 50899836 -130848251 + MLT1A0 LTR MaLR 45 161 -204 5 973 448 314 71 19 chr2 50900018 50900229 -130847858 + MLT1A0 LTR MaLR 144 365 0 5 973 326 198 21 113 chr2 50909798 50909814 -130838273 + MT2B LTR ERVL 152 158 -443 5 973 240 273 46 83 chr2 50916377 50916485 -130831602 + RMER15 LTR ERVL 64 167 -408 5 973 237 333 19 0 chr2 50916520 50916625 -130831462 + RMER15 LTR ERVL 371 477 -98 5 973 2781 177 73 16 chr2 50917907 50918223 -130829864 + RMER6A LTR ERVK 1 352 -338 5 973 2781 174 58 16 chr2 50918256 50918664 -130829423 + RMER6A LTR ERVK 323 755 -1 5 973 1846 211 12 19 chr2 50919220 50919636 -130828451 - MTC LTR MaLR -8 413 1 5 973 2073 144 9 100 chr2 50929782 50929873 -130818214 + RLTR23 LTR ERV1 11 96 -334 5 973 2073 144 9 100 chr2 50929903 50930273 -130817814 + RLTR23 LTR ERV1 97 430 0 5 973 257 231 12 93 chr2 50931632 50931718 -130816369 + RLTR25A LTR ERVK 494 572 -531 5 973 1119 250 30 101 chr2 50932335 50932740 -130815347 + MTEa LTR MaLR 2 377 -2 5 973 992 318 27 51 chr2 50932756 50933207 -130814880 + MTEa-int LTR MaLR 30 469 -1111 5 973 1389 197 25 0 chr2 50933179 50933453 -130814634 - ORR1C1 LTR MaLR -97 281 1 5 973 385 297 25 67 chr2 50933700 50933739 -130814348 + MTEa LTR MaLR 36 72 -307 5 973 2087 156 55 24 chr2 50933739 50934121 -130813966 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 5 973 385 297 25 67 chr2 50934121 50934200 -130813887 + MTEa LTR MaLR 73 149 -230 5 973 593 275 10 82 chr2 50934206 50934412 -130813675 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 180 5 973 338 260 81 29 chr2 50944169 50944343 -130803744 - RMER17D LTR ERVK -521 368 186 6 973 454 278 31 16 chr2 50949446 50949574 -130798513 - MLT1I LTR MaLR -281 130 1 6 973 871 230 73 27 chr2 50958238 50958457 -130789630 + MTE2b LTR MaLR 2 230 -149 6 973 353 361 52 66 chr2 50963474 50963779 -130784308 - MER21B LTR ERV1 -326 537 237 6 973 241 298 18 0 chr2 50964131 50964187 -130783900 - MER21B LTR ERV1 -782 81 25 6 973 355 343 62 62 chr2 50967928 50968217 -130779870 + ORR1E LTR MaLR 60 348 -11 6 973 1343 160 86 199 chr2 50969327 50969755 -130778332 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 5 6 973 434 292 70 49 chr2 50976592 50976776 -130771311 - MT2A LTR ERVL 0 601 335 6 973 316 309 134 96 chr2 50980218 50980665 -130767422 - MLT1D LTR MaLR -41 464 1 6 973 553 309 100 29 chr2 50981056 50981266 -130766821 - MLT1A1 LTR MaLR -3 405 181 6 974 380 200 29 114 chr2 51008388 51008407 -130739680 - RMER17B LTR ERVK -480 478 458 1 974 380 200 29 114 chr2 51008580 51008735 -130739352 - RMER17B LTR ERVK -501 457 319 1 974 1036 247 140 17 chr2 51012552 51012852 -130735235 + MTEa LTR MaLR 10 346 -33 1 974 902 271 28 65 chr2 51015526 51015850 -130732237 - MTEb LTR MaLR -67 312 1 2 974 1256 171 190 12 chr2 51017759 51018085 -130730002 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 2 974 495 313 79 82 chr2 51020372 51020727 -130727360 - MLT1A LTR MaLR -20 354 1 2 974 1150 285 81 3 chr2 51039520 51039868 -130708219 + MTE2b LTR MaLR 5 379 0 4 974 525 315 145 70 chr2 51042690 51042829 -130705258 + ORR1E LTR MaLR 3 160 -199 5 974 525 315 145 70 chr2 51043021 51043212 -130704875 + ORR1E LTR MaLR 161 358 -1 5 974 1804 309 110 34 chr2 51043217 51043537 -130704550 + ORR1E-int LTR MaLR 4 352 -1228 5 974 1804 309 110 34 chr2 51043591 51044041 -130704046 + ORR1E-int LTR MaLR 353 833 -747 5 974 445 251 67 45 chr2 51044076 51044255 -130703832 + RLTR15 LTR ERVK 1 183 -176 5 974 2239 214 110 10 chr2 51045514 51046025 -130702062 + RMER4B LTR ERVK 17 578 -7 5 974 242 346 23 76 chr2 51049117 51049289 -130698798 + RMER4A LTR ERVK 8 170 -296 6 974 478 332 61 20 chr2 51056924 51057170 -130690917 - MLT1D LTR MaLR -46 459 204 7 974 944 172 0 12 chr2 51059045 51059210 -130688877 - MTC LTR MaLR -12 409 247 7 974 382 154 0 0 chr2 51059267 51059332 -130688755 - MTC LTR MaLR -356 65 1 7 974 497 174 0 30 chr2 51060184 51060285 -130687802 + MTC LTR MaLR 1 98 -323 8 974 1778 160 15 51 chr2 51061094 51061429 -130686658 + MTC LTR MaLR 96 418 -3 8 974 1187 220 105 15 chr2 51066269 51066601 -130681486 - ORR1D2 LTR MaLR -8 362 1 9 974 592 286 107 102 chr2 51073434 51073836 -130674251 + MLT2C2 LTR ERVL 13 418 -46 1 974 592 286 107 102 chr2 51073968 51073997 -130674090 + MLT2C2 LTR ERVL 419 446 -18 1 974 1443 231 52 36 chr2 51080532 51080896 -130667191 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 1 974 649 271 18 29 chr2 51080897 51080944 -130667143 + ORR1D2-int LTR MaLR 2 48 -1322 1 974 649 266 38 82 chr2 51080980 51081141 -130666946 + ORR1D2-int LTR MaLR 49 220 -1360 1 974 333 356 49 15 chr2 51081267 51081472 -130666615 + RMER15 LTR ERVL 347 558 -17 1 974 1961 220 51 45 chr2 51081478 51081964 -130666123 + ORR1D2-int LTR MaLR 881 1369 -1 1 974 1149 295 48 8 chr2 51081968 51082320 -130665767 + ORR1D2 LTR MaLR 1 366 -4 1 974 2015 182 108 21 chr2 51082871 51083258 -130664829 + MTC LTR MaLR 1 421 0 1 974 323 286 144 17 chr2 51089338 51089506 -130658581 + MLT1D LTR MaLR 251 450 -55 1 974 772 329 73 33 chr2 51096495 51096894 -130651193 - MT2A LTR ERVL -8 525 111 1 974 2693 73 40 11 chr2 51098652 51099028 -130649059 - MTB LTR MaLR -13 387 1 1 974 2437 154 25 30 chr2 51101040 51101436 -130646651 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 1 974 350 311 57 75 chr2 51102270 51102482 -130645605 + MLT1J LTR MaLR 270 477 -35 1 974 235 360 83 41 chr2 51106089 51106234 -130641853 - ORR1E LTR MaLR -202 157 7 1 974 316 333 90 32 chr2 51106289 51106478 -130641609 + LTR33 LTR ERVL 42 241 -274 1 974 271 333 81 29 chr2 51108694 51108830 -130639257 + MTEb LTR MaLR 1 143 -236 1 974 322 303 139 5 chr2 51108967 51109109 -130638978 + MT2A LTR ERVL 297 457 -76 1 974 322 303 139 5 chr2 51109191 51109257 -130638830 + MT2A LTR ERVL 458 532 -1 1 974 1455 195 111 15 chr2 51116947 51117280 -130630807 - RMER15 LTR ERVL 0 575 211 1 975 1110 210 221 10 chr2 51120791 51121099 -130626988 + ORR1D1 LTR MaLR 1 373 -1 1 975 468 219 178 0 chr2 51145816 51145962 -130602125 + MLT1C LTR MaLR 6 177 -290 2 975 1178 263 42 56 chr2 51148671 51149026 -130599061 - MTD LTR MaLR -24 395 46 2 975 538 149 32 0 chr2 51156359 51156453 -130591634 + MTB_Mm LTR MaLR 3 99 -308 2 975 537 202 0 19 chr2 51156449 51156555 -130591532 + MTC LTR MaLR 318 421 0 2 975 1287 134 16 93 chr2 51165636 51165883 -130582204 - ORR1A4 LTR MaLR -101 228 1 2 975 272 290 11 11 chr2 51168444 51168538 -130579549 + MLT1B LTR MaLR 85 178 -212 2 975 232 250 71 0 chr2 51168777 51168833 -130579254 + MLT1B LTR MaLR 315 374 -16 2 975 284 377 165 14 chr2 51172527 51172805 -130575282 + MLT1A1 LTR MaLR 22 341 -67 2 975 2486 177 133 21 chr2 51172806 51173424 -130574663 + RMER6C LTR ERVK 1 687 -3 2 975 815 231 23 85 chr2 51173800 51174301 -130573786 + RMER17C LTR ERVK 30 410 0 2 975 258 297 59 52 chr2 51175737 51175872 -130572215 - RLTR26 LTR ERVK -273 354 217 2 975 1453 180 56 122 chr2 51179540 51179951 -130568136 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 2 975 2659 135 21 18 chr2 51183574 51183628 -130564459 - BGLII_B LTR ERVK 0 441 388 2 975 3204 46 21 0 chr2 51183628 51184016 -130564071 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 975 2659 135 21 18 chr2 51184016 51184398 -130563689 - BGLII_B LTR ERVK -54 387 4 2 975 2165 120 23 3 chr2 51186256 51186608 -130561479 + RLTR15 LTR ERVK 1 359 0 2 975 374 274 54 46 chr2 51193655 51193785 -130554302 - MLT1B LTR MaLR -12 378 248 2 975 1854 124 20 56 chr2 51195133 51195474 -130552613 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 2 975 423 230 185 33 chr2 51204277 51204461 -130543626 + MLT1B LTR MaLR 177 388 -2 2 975 1043 261 121 6 chr2 51207262 51207594 -130540493 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 2 975 1761 233 12 12 chr2 51207777 51208194 -130539893 - MTD LTR MaLR -2 417 1 2 975 725 291 47 74 chr2 51210419 51210510 -130537577 - ORR1E LTR MaLR -70 289 211 2 975 725 291 47 74 chr2 51210533 51210738 -130537349 - ORR1E LTR MaLR -149 210 2 2 975 368 293 108 36 chr2 51220933 51221128 -130526959 - RLTR11A2 LTR ERVK -220 307 99 3 975 871 79 0 0 chr2 51225159 51225273 -130522814 + ORR1A4 LTR MaLR 210 323 -6 3 975 1065 332 120 0 chr2 51225837 51226286 -130521801 - MER74A LTR ERVL -55 503 1 3 975 1771 253 49 76 chr2 51226805 51226952 -130521135 - RMER15 LTR ERVL -5 570 417 3 975 1771 253 49 76 chr2 51227029 51227436 -130520651 - RMER15 LTR ERVL -159 416 32 3 975 1449 264 35 6 chr2 51234239 51234282 -130513805 - ORR1D2 LTR MaLR -10 360 318 3 975 1449 264 35 6 chr2 51234324 51234623 -130513464 - ORR1D2 LTR MaLR -53 317 9 3 975 618 270 27 85 chr2 51235579 51235816 -130512271 + MTE2a LTR MaLR 18 220 -159 3 975 228 295 26 0 chr2 51235816 51235894 -130512193 + MTEb LTR MaLR 30 109 -310 3 975 330 192 79 0 chr2 51236147 51236224 -130511863 + MTEb LTR MaLR 282 367 -12 3 975 409 274 84 63 chr2 51238838 51239150 -130508937 - MTE2b LTR MaLR -8 371 1 3 975 336 305 103 40 chr2 51241941 51242115 -130505972 - LTR81B LTR ERV1? -1087 306 122 3 975 1542 168 161 3 chr2 51243351 51243668 -130504419 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 3 976 302 359 74 84 chr2 51253891 51254201 -130493886 - MLT1D LTR MaLR -40 465 159 3 976 645 327 44 65 chr2 51262319 51262640 -130485447 + MLT1E2 LTR MaLR 312 625 -2 3 976 1199 282 90 35 chr2 51262734 51263101 -130484986 + MTD LTR MaLR 19 405 -14 3 976 739 384 116 11 chr2 51265104 51265554 -130482533 + LTR16D2 LTR ERVL 17 513 -59 3 976 274 245 211 11 chr2 51269059 51269154 -130478933 + ORR1D1 LTR MaLR 21 134 -240 3 976 676 349 48 51 chr2 51272395 51272422 -130475665 - MLT1D LTR MaLR -139 366 340 4 976 676 349 48 51 chr2 51272623 51272930 -130475157 - MLT1D LTR MaLR -166 339 33 4 976 1620 236 83 10 chr2 51279794 51280180 -130467907 + MTD LTR MaLR 1 414 -5 4 976 1277 268 47 28 chr2 51283525 51283886 -130464201 + ORR1D2 LTR MaLR 3 370 0 4 976 1687 244 47 9 chr2 51283886 51284329 -130463758 + ORR1D2-int LTR MaLR 1 460 -910 4 976 319 160 33 4 chr2 51284335 51284396 -130463691 - ORR1D2 LTR MaLR -8 371 305 4 976 683 290 123 72 chr2 51290402 51290736 -130457351 - ORR1E LTR MaLR 0 359 9 4 976 230 265 0 46 chr2 51295412 51295499 -130452588 - MLT1A1 LTR MaLR -12 396 314 4 976 808 327 62 4 chr2 51300349 51300607 -130447480 - MER70A LTR ERVL 0 472 200 4 976 4020 147 101 83 chr2 51303524 51304410 -130443677 + RLTR13D6 LTR ERVK 2 902 0 4 976 230 325 39 13 chr2 51305407 51305485 -130442602 - MER70A LTR ERVL -394 184 105 4 976 349 333 33 0 chr2 51306212 51306332 -130441755 - LTR31 LTR ERV1 -285 334 211 4 976 1745 238 47 8 chr2 51306360 51306842 -130441245 + RMER20A LTR ERVK 1 516 0 4 976 604 336 62 52 chr2 51317550 51318046 -130430041 - MLT1F2 LTR MaLR 0 560 60 4 976 330 297 0 106 chr2 51330127 51330240 -130417847 + ORR1E LTR MaLR 1 101 -258 4 976 976 305 80 21 chr2 51330647 51331022 -130417065 + MTE-int LTR MaLR 2 398 -1182 4 976 402 356 68 17 chr2 51331205 51331382 -130416705 + MER74A LTR ERVL 57 242 -316 4 976 1585 162 27 93 chr2 51332361 51332694 -130415393 - ORR1B1 LTR MaLR -42 352 42 4 976 369 236 30 89 chr2 51336657 51336792 -130411295 - MT2B LTR ERVL -337 264 138 4 976 1926 113 10 10 chr2 51339061 51339355 -130408732 + RLTR10D LTR ERVK 1 294 -65 5 976 622 52 0 0 chr2 51345623 51345700 -130402387 + RLTR10D LTR ERVK 282 358 -1 5 976 3437 33 2 0 chr2 51347240 51347635 -130400452 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 976 7983 34 2 1 chr2 51347636 51348628 -130399459 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 106 5 976 265 252 72 48 chr2 51351753 51351878 -130396209 + LTR48B LTR ERV1 112 239 -405 5 976 308 368 56 0 chr2 51351883 51352027 -130396060 + LTR48 LTR ERV1 591 742 -45 5 976 717 23 0 0 chr2 51352492 51352579 -130395508 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 236 5 976 864 326 49 26 chr2 51352854 51353203 -130394884 - MLT1A0 LTR MaLR -8 357 1 5 976 246 299 22 33 chr2 51354452 51354542 -130393545 + MTEa LTR MaLR 287 375 -4 5 976 903 308 30 4 chr2 51354934 51355169 -130392918 + MTEb LTR MaLR 139 379 0 5 976 281 274 257 14 chr2 51357468 51357616 -130390471 + MER34A1 LTR ERV1 1 184 -403 5 976 2260 102 3 56 chr2 51360154 51360496 -130387591 + ORR1A2 LTR MaLR 1 324 -3 5 976 579 298 104 48 chr2 51361067 51361402 -130386685 - ORR1E LTR MaLR 0 359 6 5 976 897 299 109 9 chr2 51365996 51366343 -130381744 - MLT1B LTR MaLR -4 386 5 5 976 520 262 0 16 chr2 51367687 51367811 -130380276 - MTE-int LTR MaLR -1289 291 170 5 976 295 216 152 9 chr2 51367813 51367927 -130380160 - MTD LTR MaLR -26 393 287 5 976 366 345 7 33 chr2 51368037 51368190 -130379897 + MLT2B5 LTR ERVL 335 483 -72 5 976 291 310 127 39 chr2 51375191 51375372 -130372715 + MER54A LTR ERVL 36 232 -669 5 976 826 312 91 0 chr2 51375401 51375664 -130372423 + MER54A LTR ERVL 613 899 -2 5 976 327 313 188 27 chr2 51377128 51377351 -130370736 - MER74B LTR ERVL -139 483 225 5 976 310 289 116 0 chr2 51377388 51377509 -130370578 - MLT1A1 LTR MaLR -2 406 272 5 976 1883 155 66 25 chr2 51377662 51378025 -130370062 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 5 976 228 340 149 9 chr2 51378025 51378132 -130369955 - MLT1A1 LTR MaLR -268 140 19 5 976 457 303 133 17 chr2 51378171 51378352 -130369735 - MLT1A1-int LTR MaLR -20 1715 1514 5 976 423 292 45 120 chr2 51378540 51378832 -130369255 + ORR1E LTR MaLR 89 358 -1 5 976 470 351 75 16 chr2 51379351 51379537 -130368550 - MLT1A1-int LTR MaLR -628 1107 910 5 976 1209 240 117 12 chr2 51379537 51379879 -130368208 - MTEa LTR MaLR 0 379 2 5 976 470 351 75 16 chr2 51379879 51379944 -130368143 - MLT1A1-int LTR MaLR -826 909 842 5 15 603 330 130 33 chr2 51380119 51380426 -130367661 - MLT1G3 LTR MaLR 0 595 259 5 977 1288 208 29 142 chr2 51381171 51381586 -130366501 + ORR1C2 LTR MaLR 17 384 0 5 977 1836 125 42 10 chr2 51382143 51382449 -130365638 + IAPLTR2b LTR ERVK 1 316 -11 5 977 278 335 45 109 chr2 51383433 51383634 -130364453 + MER34A1 LTR ERV1 395 582 -5 5 977 304 238 213 123 chr2 51388039 51388274 -130359813 + LTR37A LTR ERV1 171 426 0 5 977 715 299 40 18 chr2 51393156 51393381 -130354706 - RLTR14-int LTR ERV1 -5086 231 2 5 977 1597 230 85 3 chr2 51393382 51393735 -130354352 - RLTR14 LTR ERV1 0 382 1 5 977 2281 117 6 3 chr2 51394468 51394794 -130353293 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 5 977 1244 238 45 21 chr2 51395015 51395345 -130352742 - RMER15 LTR ERVL -73 502 165 5 977 238 381 50 7 chr2 51396573 51396713 -130351374 + MER31B LTR ERV1 16 161 -305 5 977 287 158 155 19 chr2 51398633 51398736 -130349351 - RLTR31_Mm LTR ERVK 0 561 445 5 977 1787 202 22 68 chr2 51398718 51399174 -130348913 - RLTR17 LTR ERVK -152 540 106 5 977 759 239 134 12 chr2 51399181 51399427 -130348660 + MTD LTR MaLR 144 419 0 5 977 1876 168 57 37 chr2 51401609 51402010 -130346077 - RLTR9E LTR ERVK 0 409 1 5 977 358 286 97 44 chr2 51406044 51406197 -130341890 + MLT1J1 LTR MaLR 17 174 -237 5 977 1858 140 21 48 chr2 51411218 51411555 -130336532 - ORR1A4 LTR MaLR -1 328 1 6 977 748 308 61 31 chr2 51415768 51416160 -130331927 - RMER5 LTR ERV1 -74 460 57 6 977 332 358 22 22 chr2 51420821 51421004 -130327083 - ORR1E LTR MaLR -173 186 4 6 977 470 285 158 5 chr2 51428736 51428951 -130319136 - MER110A LTR ERV1 -34 434 187 6 977 1953 132 26 10 chr2 51429649 51429955 -130318132 + RLTR10E LTR ERVK 1 311 0 6 977 992 289 86 62 chr2 51430592 51431138 -130316949 - MER89 LTR ERV1 0 559 1 6 977 909 228 130 66 chr2 51435279 51435626 -130312461 - ORR1D2 LTR MaLR -1 369 1 6 977 1420 222 101 36 chr2 51453317 51453567 -130294520 - MTD LTR MaLR -14 405 136 6 977 1420 219 106 37 chr2 51453638 51453779 -130294308 - MTD LTR MaLR -284 135 2 6 977 1289 285 72 10 chr2 51454445 51454832 -130293255 + MTD LTR MaLR 1 411 -8 6 977 2046 186 65 20 chr2 51456716 51457117 -130290970 - MTD LTR MaLR 0 419 1 6 977 601 296 69 83 chr2 51457775 51457939 -130290148 + MER34A1 LTR ERV1 138 311 -276 6 977 601 296 69 83 chr2 51457991 51458162 -130289925 + MER34A1 LTR ERV1 312 478 -109 6 977 601 296 69 83 chr2 51458186 51458284 -130289803 + MER34A1 LTR ERV1 479 566 -21 6 977 1679 210 35 39 chr2 51463731 51464183 -130283904 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 6 977 1431 275 56 42 chr2 51464200 51464648 -130283439 - MT2A LTR ERVL -77 456 3 6 977 238 150 0 0 chr2 51467624 51467664 -130280423 + ORR1D1 LTR MaLR 335 374 0 6 977 401 284 165 12 chr2 51479642 51479806 -130268281 - MLT1A0 LTR MaLR -80 285 97 7 977 340 216 63 119 chr2 51486836 51486962 -130261125 + MT2B LTR ERVL 139 257 -344 7 977 2786 177 39 32 chr2 51487161 51487261 -130260826 - RLTR20B1 LTR ERVK 0 563 472 7 977 2786 177 39 32 chr2 51487283 51487741 -130260346 - RLTR20B1 LTR ERVK -92 471 3 7 977 1415 241 100 5 chr2 51489775 51490154 -130257933 + MTD LTR MaLR 5 419 0 7 977 5655 122 81 5 chr2 51493380 51494270 -130253817 - RMER17B LTR ERVK 0 958 1 7 977 3205 65 2 2 chr2 51500423 51500823 -130247264 - MTB LTR MaLR 0 400 1 2 978 526 305 73 100 chr2 51523710 51524004 -130224083 - MLT1C LTR MaLR -4 463 174 2 978 526 305 73 100 chr2 51524211 51524327 -130223760 - MLT1C LTR MaLR -294 173 64 2 978 528 257 80 69 chr2 51530841 51531041 -130217046 - MLT1A0 LTR MaLR -23 342 135 3 978 528 257 80 69 chr2 51531255 51531343 -130216744 - MLT1A0 LTR MaLR -231 134 51 3 978 259 266 16 0 chr2 51536848 51536912 -130211175 - MLT1F LTR MaLR -10 550 486 4 978 499 344 102 11 chr2 51536985 51537280 -130210807 - MLT1F LTR MaLR -209 370 2 4 978 575 376 23 35 chr2 51538742 51539169 -130208918 - MLT1E2 LTR MaLR 0 627 206 5 978 665 311 109 9 chr2 51541562 51541912 -130206175 - MTD LTR MaLR -15 404 20 5 978 569 248 37 8 chr2 51544374 51544483 -130203604 + ORR1E-int LTR MaLR 1414 1526 -54 6 978 375 309 16 8 chr2 51544483 51544607 -130203480 + ORR1E LTR MaLR 1 125 -234 6 978 226 279 59 0 chr2 51544732 51544800 -130203287 + MLT2B5 LTR ERVL 333 404 -151 6 978 3500 18 5 0 chr2 51551560 51551954 -130196133 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 7 978 240 284 30 0 chr2 51559341 51559408 -130188679 + MLT1G1 LTR MaLR 37 105 -474 8 978 523 315 90 55 chr2 51561558 51561904 -130186183 - MLT1A LTR MaLR -13 361 4 8 978 413 361 45 52 chr2 51562616 51563016 -130185071 + MER34A1 LTR ERV1 120 516 -71 8 978 514 306 17 101 chr2 51569433 51569731 -130178356 + ORR1E LTR MaLR 19 291 -68 1 978 546 219 24 24 chr2 51573131 51573257 -130174830 + RMER20B LTR ERVK 1 126 -501 1 978 384 283 100 80 chr2 51575567 51575817 -130172270 + ORR1E LTR MaLR 100 354 -5 1 978 2000 127 27 95 chr2 51585419 51585863 -130162224 - RMER6B LTR ERVK -47 414 1 1 978 2419 158 98 16 chr2 51588076 51588564 -130159523 + RLTR11A LTR ERVK 1 528 0 1 978 510 314 33 33 chr2 51611632 51611813 -130136274 + MLT1A LTR MaLR 193 373 -1 1 978 264 403 53 10 chr2 51611907 51612115 -130135972 + MLT1I LTR MaLR 192 408 -3 1 978 289 265 111 0 chr2 51622712 51622829 -130125258 + MLT1A1 LTR MaLR 279 408 0 1 978 435 255 57 0 chr2 51626159 51626265 -130121822 + MTEa LTR MaLR 1 112 -267 1 978 1263 208 35 22 chr2 51626304 51626673 -130121414 - RMER17C LTR ERVK -17 393 20 1 978 364 334 130 59 chr2 51629719 51630043 -130118044 - ORR1E LTR MaLR -4 355 9 1 978 1415 209 100 20 chr2 51630447 51630798 -130117289 - MTE2b LTR MaLR 0 379 1 1 978 276 186 0 17 chr2 51632639 51632699 -130115388 - RMER19C LTR ERVK 0 611 553 1 978 2349 211 29 14 chr2 51636658 51636752 -130111335 - RMER15 LTR ERVL -51 524 428 2 978 2349 211 29 14 chr2 51636830 51637249 -130110838 - RMER15 LTR ERVL -148 427 4 2 979 2140 148 52 18 chr2 51646967 51647125 -130100962 - RMER10B LTR ERVL 0 398 224 2 979 2140 148 52 18 chr2 51647361 51647586 -130100501 - RMER10B LTR ERVL -175 223 2 2 979 2515 89 3 0 chr2 51649017 51649343 -130098744 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 2 979 3447 30 2 10 chr2 51650233 51650632 -130097455 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 979 5195 45 4 0 chr2 51650632 51651323 -130096764 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 694 -404 2 979 1053 237 101 3 chr2 51654429 51654717 -130093370 - MTD LTR MaLR 0 419 104 2 979 4624 143 27 25 chr2 51655127 51655789 -130092298 - RMER19B LTR ERVK -6 896 233 2 979 4624 143 27 25 chr2 51655809 51655994 -130092093 - RMER19B LTR ERVK -670 232 47 2 979 763 168 7 0 chr2 51655963 51656100 -130091987 - RMER19B LTR ERVK -764 138 1 2 979 1066 139 18 15 chr2 51656198 51656384 -130091703 + ORR1B1 LTR MaLR 1 175 -219 2 979 1239 160 18 48 chr2 51656745 51657002 -130091085 + ORR1B1 LTR MaLR 164 394 0 2 979 726 229 143 137 chr2 51657844 51657977 -130090110 - RMER4B LTR ERVK -14 571 429 2 979 977 172 300 31 chr2 51657977 51658147 -130089940 + RMER17C LTR ERVK 1 176 -234 2 979 977 172 300 31 chr2 51658215 51658367 -130089720 + RMER17C LTR ERVK 177 410 0 2 979 726 229 143 137 chr2 51658367 51658728 -130089359 - RMER4B LTR ERVK -157 428 74 2 979 666 251 90 5 chr2 51658988 51659188 -130088899 - MTD LTR MaLR -30 389 173 2 979 300 292 91 8 chr2 51659270 51659391 -130088696 - MTD LTR MaLR -247 172 42 2 979 246 364 114 20 chr2 51659568 51659770 -130088317 + MLT1I LTR MaLR 64 284 -127 2 979 516 267 159 30 chr2 51660729 51660821 -130087266 + MTE2b LTR MaLR 9 127 -252 2 979 2213 167 87 26 chr2 51660821 51661318 -130086769 - RLTR11A2 LTR ERVK 0 527 1 2 979 516 267 159 30 chr2 51661318 51661418 -130086669 + MTE2b LTR MaLR 128 226 -153 2 979 343 252 146 82 chr2 51661418 51661637 -130086450 - RLTR14 LTR ERV1 0 382 150 2 979 357 94 0 0 chr2 51661637 51661690 -130086397 - ORR1C1 LTR MaLR 0 394 342 2 979 933 210 224 2 chr2 51663138 51663422 -130084665 - ORR1C1 LTR MaLR -41 337 3 2 979 615 154 73 53 chr2 51664434 51664585 -130083502 - RLTR14 LTR ERV1 -228 154 1 2 979 552 270 54 0 chr2 51664585 51664733 -130083354 + MTE2b LTR MaLR 224 379 0 2 979 298 276 41 106 chr2 51668693 51668863 -130079224 - RMER10B LTR ERVL -11 387 229 2 979 1743 153 55 71 chr2 51670739 51671119 -130076968 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 2 979 2192 189 5 7 chr2 51674276 51674691 -130073396 + MTC LTR MaLR 1 414 -7 2 979 1038 245 145 15 chr2 51675139 51675470 -130072617 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 2 979 1645 147 2 164 chr2 51675682 51676171 -130071916 + RMER17C LTR ERVK 1 410 0 2 979 2757 175 83 63 chr2 51682462 51683061 -130065026 + RMER19C LTR ERVK 1 611 0 2 979 799 213 215 54 chr2 51686071 51686369 -130061718 - MTD LTR MaLR 0 419 74 2 979 1102 249 125 12 chr2 51688504 51688841 -130059246 - MTEa LTR MaLR -2 377 3 2 979 728 219 133 20 chr2 51708302 51708498 -130039589 + MTD LTR MaLR 1 218 -201 3 979 668 286 111 104 chr2 51712681 51713114 -130034973 - MER70A LTR ERVL -25 447 12 3 979 1070 234 42 0 chr2 51716211 51716450 -130031637 - MTD LTR MaLR -56 363 115 3 979 1595 116 207 48 chr2 51719324 51719471 -130028616 - RMER17C LTR ERVK -2 408 212 3 979 1595 116 207 48 chr2 51719520 51719724 -130028363 - RMER17C LTR ERVK -199 211 1 3 979 3143 90 0 9 chr2 51722678 51723128 -130024959 + MT2B2 LTR ERVL 139 584 0 3 979 559 255 116 10 chr2 51723532 51723730 -130024357 + MLT2B4 LTR ERVL 1 219 -337 3 979 5406 104 57 10 chr2 51727299 51728199 -130019888 - RMER17B LTR ERVK -16 942 1 3 979 1027 184 193 29 chr2 51729021 51729368 -130018719 + RLTR9E LTR ERVK 6 409 0 3 979 488 235 145 21 chr2 51731900 51732135 -130015952 + RLTR10A LTR ERVK 147 410 -1 3 979 2444 124 39 7 chr2 51739821 51740252 -130007835 + BGLII_A LTR ERVK 1 445 0 3 979 2533 118 39 54 chr2 51741723 51742205 -130005882 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 3 979 4497 67 67 21 chr2 51742205 51742831 -130005256 + IAPEz-int LTR ERVK 8 662 -5819 3 979 444 82 0 32 chr2 51742831 51742894 -130005193 + IAPEz-int LTR ERVK 1359 1419 -5062 3 979 1852 115 4 4 chr2 51742883 51743145 -130004942 + IAPEz-int LTR ERVK 2236 2497 -5183 3 979 953 80 24 0 chr2 51743140 51743265 -130004822 + IAPEz-int LTR ERVK 4783 4910 -2770 3 979 20948 25 4 2 chr2 51743267 51745623 -130002464 + IAPEz-int LTR ERVK 4123 6481 0 3 979 2548 118 35 54 chr2 51745623 51746107 -130001980 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 3 979 241 270 25 83 chr2 51757081 51757202 -129990885 + RMER15 LTR ERVL 3 116 -459 3 979 667 314 60 19 chr2 51757289 51757555 -129990532 + RMER15 LTR ERVL 299 575 0 3 979 383 298 205 54 chr2 51760279 51760577 -129987510 + MLT1A1 LTR MaLR 1 343 -65 3 979 374 294 163 62 chr2 51760659 51760992 -129987095 + MLT1D LTR MaLR 49 415 -90 3 979 362 323 15 0 chr2 51763481 51763614 -129984473 + MLT1D LTR MaLR 39 173 -332 4 979 496 309 136 14 chr2 51763717 51763996 -129984091 + MLT1D LTR MaLR 178 490 -15 4 979 294 274 85 0 chr2 51764005 51764140 -129983947 + MLT1D-int LTR MaLR 1 148 -1341 4 979 370 242 79 73 chr2 51764814 51764979 -129983108 + MER34A1 LTR ERV1 14 179 -408 4 979 425 358 93 11 chr2 51765490 51765886 -129982201 + MLT1D-int LTR MaLR 115 519 -852 4 979 327 244 160 5 chr2 51766509 51766670 -129981417 + MLT1D-int LTR MaLR 704 903 -586 4 979 487 312 114 64 chr2 51767069 51767565 -129980522 + MLT1D-int LTR MaLR 923 1483 -6 4 979 610 259 32 5 chr2 51767570 51767761 -129980326 + MLT1D LTR MaLR 1 192 -435 4 979 1492 236 39 9 chr2 51771488 51771863 -129976224 - MTD LTR MaLR 0 419 1 4 979 3272 34 34 0 chr2 51772097 51772480 -129975607 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 980 330 265 24 0 chr2 51774976 51775059 -129973028 - ORR1A4 LTR MaLR 0 379 295 4 980 1848 143 36 60 chr2 51775210 51775544 -129972543 + ORR1A3 LTR MaLR 1 326 0 4 980 700 65 22 109 chr2 51775630 51775768 -129972319 - ORR1A4 LTR MaLR -203 126 1 4 980 1606 128 241 16 chr2 51775927 51776238 -129971849 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 4 4 980 2514 63 142 3 chr2 51776238 51776589 -129971498 + MTB LTR MaLR 1 400 0 4 980 1067 201 84 28 chr2 51777114 51777401 -129970686 + ORR1D2 LTR MaLR 68 370 0 4 980 1812 140 93 71 chr2 51777554 51777932 -129970155 + ORR1B1 LTR MaLR 1 386 -8 4 980 267 208 27 27 chr2 51779265 51779339 -129968748 + MLT1A0 LTR MaLR 67 140 -225 4 980 2134 119 3 10 chr2 51785939 51786252 -129961835 + RLTR10E LTR ERVK 1 311 0 4 980 292 185 234 21 chr2 51791277 51791371 -129956716 + MTD LTR MaLR 6 119 -302 4 980 351 250 0 0 chr2 51791522 51791598 -129956489 + MTD LTR MaLR 106 181 -238 4 980 315 216 34 11 chr2 51791669 51791758 -129956329 + MTD LTR MaLR 329 419 0 4 980 677 276 155 60 chr2 51792539 51792855 -129955232 - MTE2a LTR MaLR -9 370 25 4 980 2805 113 52 2 chr2 51792856 51793280 -129954807 - BGLII_A LTR ERVK 0 445 1 4 980 246 231 60 60 chr2 51797144 51797227 -129950860 + MLT2B2 LTR ERVL 31 113 -402 4 980 1079 194 293 89 chr2 51798286 51798757 -129949330 + RMER2 LTR ERV1 1 567 0 4 980 3484 134 10 113 chr2 51798807 51799583 -129948504 + RMER6A LTR ERVK 57 752 -4 4 980 1464 234 118 54 chr2 51799931 51800415 -129947672 + RMER19C LTR ERVK 97 611 0 4 980 225 143 48 0 chr2 51801312 51801354 -129946733 - MT2B LTR ERVL -314 287 244 4 980 260 253 71 31 chr2 51807391 51807489 -129940598 - RMER13A LTR ERVK -151 709 608 4 980 1309 156 338 31 chr2 51814987 51815339 -129932748 - RMER6B LTR ERVK -1 460 1 5 980 422 217 11 0 chr2 51815616 51815708 -129932379 + ORR1D2-int LTR MaLR 1278 1370 0 5 980 1006 254 39 42 chr2 51815708 51816020 -129932067 + ORR1D2 LTR MaLR 1 311 -59 5 980 313 352 42 93 chr2 51824374 51824590 -129923497 - RLTR25B LTR ERVK -821 207 3 5 980 334 328 8 16 chr2 51826338 51826459 -129921628 + MLT1D LTR MaLR 1 120 -385 5 980 1788 135 60 33 chr2 51831132 51831468 -129916619 + ORR1B1 LTR MaLR 42 386 -8 5 980 626 287 79 72 chr2 51832399 51832753 -129915334 + MLT1A0 LTR MaLR 1 404 -4 5 980 3550 40 28 7 chr2 51833052 51833479 -129914608 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 5 980 4449 144 20 20 chr2 51834626 51835379 -129912708 - RMER6A LTR ERVK 0 756 4 5 980 1957 114 90 10 chr2 51835791 51836092 -129911995 + ORR1A2 LTR MaLR 2 326 -1 5 980 277 347 10 10 chr2 51838463 51838559 -129909528 - ORR1E LTR MaLR -210 149 54 5 980 1879 33 37 0 chr2 51839900 51840145 -129907942 - MTB_Mm LTR MaLR -1 406 153 5 980 511 54 14 0 chr2 51840143 51840217 -129907870 + MTB_Mm LTR MaLR 333 407 0 5 980 1011 258 47 61 chr2 51840918 51841277 -129906810 - MTEb LTR MaLR -21 358 5 5 980 865 288 84 9 chr2 51848473 51848806 -129899281 + MLT1F1 LTR MaLR 174 531 -38 5 980 307 263 81 0 chr2 51848953 51849052 -129899035 - MLT1H-int LTR MaLR -812 597 491 5 980 510 289 85 47 chr2 51849094 51849413 -129898674 - ORR1E LTR MaLR -6 353 23 5 980 3772 133 20 64 chr2 51850822 51851586 -129896501 + RMER6A LTR ERVK 1 730 -26 5 980 3211 61 2 2 chr2 51854267 51854662 -129893425 + MTA_Mm LTR MaLR 2 396 0 6 980 3535 13 5 0 chr2 51855138 51855532 -129892555 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 980 1068 226 91 47 chr2 51857047 51857548 -129890539 - RMER13A LTR ERVK -263 645 96 6 980 485 243 191 23 chr2 51858358 51858573 -129889514 + MER21B LTR ERV1 289 539 -324 6 980 1240 186 57 141 chr2 51860374 51860530 -129887557 + RLTR20C LTR ERVK 38 152 -382 6 980 1240 186 57 141 chr2 51860699 51860964 -129887123 + RLTR20C LTR ERVK 153 426 -108 6 980 1109 270 123 37 chr2 51861400 51861889 -129886198 - RMER5 LTR ERV1 0 534 4 6 980 854 150 24 24 chr2 51867743 51867907 -129880180 - ORR1D1 LTR MaLR -210 164 1 6 980 1313 190 31 81 chr2 51870398 51870781 -129877306 - RMER17C LTR ERVK -46 364 1 6 980 235 303 40 0 chr2 51876685 51876761 -129871326 - MTE2a LTR MaLR -95 284 206 6 980 534 276 32 70 chr2 51876934 51877121 -129870966 - MTE2a LTR MaLR -183 196 17 6 980 1894 176 109 74 chr2 51882682 51883112 -129864975 + RLTR41 LTR ERV1 1 445 -1 6 980 237 226 38 0 chr2 51885730 51885783 -129862304 - MLT1I LTR MaLR -43 368 314 6 980 314 244 141 53 chr2 51888165 51888373 -129859714 + MTE2b LTR MaLR 28 325 -54 6 980 674 211 20 0 chr2 51888687 51888834 -129859253 + MTE2b LTR MaLR 217 366 -13 6 980 2770 150 108 2 chr2 51900539 51901001 -129847086 - RLTR18B LTR ERVK -1 511 1 7 981 283 284 27 107 chr2 51913769 51913813 -129834274 + MT2B LTR ERVL 120 151 -450 7 981 1549 202 101 43 chr2 51914733 51915151 -129832936 - RMER10A LTR ERVL 0 442 1 7 981 831 175 121 5 chr2 51917064 51917271 -129830816 - RMER4B LTR ERVK -338 247 17 7 981 2175 153 40 69 chr2 51917276 51917753 -129830334 - RMER15 LTR ERVL -112 463 1 7 981 1822 143 69 103 chr2 51919170 51919340 -129828747 + ORR1C1 LTR MaLR 1 176 -202 8 981 1822 143 69 103 chr2 51919480 51919645 -129828442 + ORR1C1 LTR MaLR 177 326 -52 8 981 1822 143 69 103 chr2 51919815 51919866 -129828221 + ORR1C1 LTR MaLR 327 375 -3 8 981 275 164 28 69 chr2 51919973 51920045 -129828042 + RLTR44-int LTR ERVK 1543 1611 -1201 8 981 543 199 22 58 chr2 51920290 51920429 -129827658 + RMER15 LTR ERVL 27 160 -415 8 981 1094 190 106 16 chr2 51920866 51921112 -129826975 + RMER15 LTR ERVL 174 441 -134 8 981 301 320 32 54 chr2 51921240 51921425 -129826662 - RMER21B LTR ERV1 -364 478 298 8 981 694 224 26 7 chr2 51921454 51921607 -129826480 + RMER15 LTR ERVL 420 575 0 8 981 1919 149 90 19 chr2 51924491 51924902 -129823185 - RMER10A LTR ERVL -2 440 1 8 981 260 226 59 102 chr2 51925027 51925145 -129822942 - MT2B LTR ERVL -338 263 151 8 981 333 298 9 46 chr2 51942406 51942421 -129805666 + MT2B LTR ERVL 153 163 -438 8 981 1126 200 125 37 chr2 51982540 51982836 -129765251 + MTD LTR MaLR 8 329 -90 9 981 257 167 152 0 chr2 51982840 51982906 -129765181 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 295 9 981 568 284 128 65 chr2 51986705 51986969 -129761118 - ORR1D2 LTR MaLR -61 309 27 9 981 2758 54 6 27 chr2 51986969 51987334 -129760753 + IAPEY2_LTR LTR ERVK 1 357 0 9 981 568 284 128 65 chr2 51987334 51987359 -129760728 - ORR1D2 LTR MaLR -344 26 2 9 981 1137 261 155 30 chr2 51987541 51987979 -129760108 + MTD-int LTR MaLR 1 493 -765 9 981 773 246 84 56 chr2 51987996 51988290 -129759797 + MTD-int LTR MaLR 774 1321 -259 9 981 250 220 87 39 chr2 51988376 51988480 -129759607 + MTD-int LTR MaLR 1150 1258 0 9 981 815 239 149 105 chr2 51988480 51988606 -129759481 + MTD LTR MaLR 1 108 -311 9 981 815 239 149 105 chr2 51988790 51988958 -129759129 + MTD LTR MaLR 109 308 -111 9 981 283 286 112 0 chr2 51989136 51989234 -129758853 - MLT1C LTR MaLR -208 259 151 9 981 225 291 0 0 chr2 51991009 51991064 -129757023 + MTD LTR MaLR 204 258 -161 9 981 1877 204 45 84 chr2 52026202 52026396 -129721691 + RLTR31A_Mm LTR ERVK 1 172 -389 3 981 1877 156 28 46 chr2 52026510 52026836 -129721251 + RLTR31A_Mm LTR ERVK 129 441 -143 3 981 601 205 18 128 chr2 52028052 52028270 -129719817 + RMER15 LTR ERVL 381 574 -1 3 981 311 209 132 0 chr2 52034858 52034949 -129713138 + MLT1A1 LTR MaLR 305 407 -1 3 982 236 337 48 0 chr2 52038621 52038704 -129709383 + MLT1H2 LTR MaLR 364 450 -39 4 982 916 282 64 96 chr2 52053666 52054011 -129694076 + MTE2b LTR MaLR 46 379 0 6 982 853 307 57 11 chr2 52081370 52081653 -129666434 + MLT2D LTR ERVL 119 414 0 8 982 3110 60 0 7 chr2 52083532 52083949 -129664138 + BGLII LTR ERVK 8 421 0 8 982 2360 120 125 3 chr2 52090245 52090613 -129657474 + MTC LTR MaLR 1 413 -8 9 982 2583 157 31 19 chr2 52106603 52107019 -129641068 + MTC LTR MaLR 1 421 0 1 982 778 299 124 54 chr2 52120465 52120819 -129627268 + MTEa LTR MaLR 1 379 0 1 982 1696 205 47 16 chr2 52124076 52124463 -129623624 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1 399 -1449 1 982 1725 221 165 26 chr2 52124469 52124555 -129623532 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1245 1335 -513 1 982 1725 221 165 26 chr2 52124582 52124888 -129623199 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1336 1655 -193 1 982 1725 221 165 26 chr2 52125413 52125516 -129622571 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1656 1808 -40 1 982 242 182 14 83 chr2 52155555 52155627 -129592460 + MLT1A1 LTR MaLR 339 405 -3 1 983 2127 135 57 14 chr2 52170463 52170815 -129577272 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 2 983 1489 197 124 19 chr2 52186683 52187061 -129561026 - MTD LTR MaLR 0 419 2 2 983 540 304 126 21 chr2 52193543 52193869 -129554218 + MLT1A0 LTR MaLR 1 360 -5 2 983 837 61 0 0 chr2 52194092 52194206 -129553881 - RLTR27 LTR ERVK 0 309 196 2 983 1852 59 28 0 chr2 52194246 52194500 -129553587 + RLTR10A LTR ERVK 1 261 -150 2 983 727 89 18 0 chr2 52194484 52194596 -129553491 + RLTR27 LTR ERVK 175 288 -21 2 983 1320 46 0 0 chr2 52194597 52194770 -129553317 - RLTR10A LTR ERVK -238 173 1 2 983 588 235 24 124 chr2 52195511 52195720 -129552367 + ORR1E LTR MaLR 172 359 0 2 983 287 244 34 34 chr2 52196027 52196115 -129551972 - MER34 LTR ERV1 -499 88 1 2 983 2989 84 15 0 chr2 52199682 52200076 -129548011 - MTB LTR MaLR 0 400 1 2 983 294 170 0 0 chr2 52206758 52206805 -129541282 - MMERVK10C-int LTR ERVK -973 6608 6562 2 983 429 327 68 12 chr2 52214863 52215024 -129533063 - MTE2b LTR MaLR -76 303 134 2 983 467 329 92 49 chr2 52215026 52215352 -129532735 + MLT1A0 LTR MaLR 26 365 0 2 983 351 212 55 14 chr2 52216213 52216397 -129531690 + RMER17B LTR ERVK 301 509 -397 2 983 1799 202 183 35 chr2 52216548 52217066 -129531021 + RMER19B LTR ERVK 308 902 0 2 983 799 256 124 18 chr2 52219593 52219923 -129528164 + MLT1A0 LTR MaLR 1 365 0 2 983 1655 195 81 9 chr2 52219980 52220327 -129527760 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 3 2 983 721 235 98 0 chr2 52227146 52227329 -129520758 - MTD LTR MaLR -201 218 18 2 983 628 253 107 65 chr2 52229221 52229483 -129518604 - RLTR9A LTR ERVK -95 273 1 2 983 824 238 17 67 chr2 52229986 52230225 -129517862 - ETnERV2-int LTR ERVK -1204 6202 5976 2 983 834 230 97 64 chr2 52230289 52230619 -129517468 + RLTR14 LTR ERV1 1 341 -41 2 983 692 251 111 55 chr2 52230658 52231037 -129517050 + RLTR14-int LTR ERV1 2 401 -4916 2 983 329 264 35 35 chr2 52231358 52231472 -129516615 + RLTR14-int LTR ERV1 448 561 -4756 2 983 439 299 69 57 chr2 52231741 52232211 -129515876 + RLTR14-int LTR ERV1 805 1564 -6037 2 983 455 204 151 18 chr2 52233458 52233626 -129514461 - ORR1C1 LTR MaLR -185 189 1 2 983 1906 151 92 47 chr2 52233926 52234329 -129513758 + MTC LTR MaLR 1 421 0 2 983 703 273 54 90 chr2 52235325 52235679 -129512408 - ORR1E LTR MaLR -10 349 9 2 983 486 291 25 25 chr2 52236191 52236412 -129511675 + MTD LTR MaLR 1 198 -221 2 983 2123 122 3 0 chr2 52237001 52237320 -129510767 - ORR1A3 LTR MaLR -6 320 1 2 983 11491 117 37 74 chr2 52237320 52239357 -129508730 - ORR1A3-int LTR MaLR 0 1963 2 2 983 2073 136 9 3 chr2 52239358 52239683 -129508404 - ORR1A3 LTR MaLR 0 327 1 2 983 388 320 31 0 chr2 52239701 52239829 -129508258 + MTD LTR MaLR 196 327 -52 2 983 1087 243 155 16 chr2 52242491 52242859 -129505228 - MTD LTR MaLR 0 419 1 2 983 1968 113 6 10 chr2 52245108 52245422 -129502665 + ORR1A4 LTR MaLR 9 321 -8 3 983 883 172 54 29 chr2 52245659 52245863 -129502224 + MT2A LTR ERVL 2 210 -323 3 983 1605 214 58 14 chr2 52246236 52246600 -129501487 + RLTR14 LTR ERV1 3 382 0 3 983 347 184 24 114 chr2 52247816 52247939 -129500148 - MT2B LTR ERVL -337 264 153 3 983 763 169 178 42 chr2 52264505 52264696 -129483391 - ORR1C1 LTR MaLR -146 232 5 3 983 282 202 135 18 chr2 52265154 52265265 -129482822 + RMER15 LTR ERVL 338 461 -114 3 983 956 265 90 3 chr2 52265299 52265541 -129482546 + RMER15-int LTR ERVL 1346 1608 -3391 3 983 956 265 90 3 chr2 52265582 52265627 -129482460 + RMER15-int LTR ERVL 1609 1658 -3341 3 983 281 352 114 58 chr2 52265677 52266090 -129481997 + RMER15-int LTR ERVL 1729 2164 -2835 3 983 710 246 0 49 chr2 52266130 52266314 -129481773 + MTE2b LTR MaLR 205 379 0 3 983 1489 272 74 63 chr2 52266339 52266962 -129481125 + RMER15-int LTR ERVL 4177 4806 -193 3 984 261 362 51 8 chr2 52300610 52300727 -129447360 + MLT1H1 LTR MaLR 14 135 -420 3 984 1447 195 128 8 chr2 52301242 52301609 -129446478 + MTD LTR MaLR 1 411 -8 3 984 3244 58 5 0 chr2 52314140 52314538 -129433549 + MTB LTR MaLR 1 400 0 4 984 1297 210 35 48 chr2 52315267 52315582 -129432505 + ORR1D2 LTR MaLR 19 329 -41 4 984 350 357 47 0 chr2 52318142 52318271 -129429816 + MLT1J2 LTR MaLR 28 162 -286 4 984 1479 257 25 14 chr2 52332754 52333121 -129414966 + MTD LTR MaLR 23 393 -26 4 984 570 276 92 52 chr2 52342055 52342326 -129405761 + LTR73 LTR ERV1 81 362 -210 4 984 1271 290 25 33 chr2 52342339 52342703 -129405384 - MTEa LTR MaLR 0 379 19 4 984 261 171 81 21 chr2 52344358 52344460 -129403627 - MTE2a LTR MaLR -304 115 2 4 984 323 250 21 11 chr2 52357728 52357821 -129390266 - MLT1D LTR MaLR -12 493 400 4 984 380 283 69 23 chr2 52358104 52358234 -129389853 - MLT1D LTR MaLR -103 402 267 4 984 581 217 104 170 chr2 52361665 52362059 -129386028 - RLTR9A LTR ERVK 0 368 1 4 984 1271 238 46 10 chr2 52366286 52366592 -129381495 + MTD LTR MaLR 1 317 -102 4 984 987 248 142 11 chr2 52368990 52369349 -129378738 - MTD LTR MaLR -12 407 2 4 984 332 320 0 0 chr2 52369384 52369487 -129378600 + MLT1B LTR MaLR 272 374 -16 4 984 609 244 92 27 chr2 52375592 52375777 -129372310 - MTEa LTR MaLR -181 198 2 5 984 510 238 300 38 chr2 52377125 52377418 -129370669 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 5 5 984 714 271 80 80 chr2 52378646 52378971 -129369116 + MLT1B LTR MaLR 66 390 0 5 984 475 161 83 68 chr2 52379925 52380058 -129368029 + RLTR31A_Mm LTR ERVK 1 135 -449 5 984 2487 117 52 3 chr2 52388581 52388966 -129359121 - MTB_Mm LTR MaLR -3 404 1 5 984 988 242 131 43 chr2 52399968 52400296 -129347791 + ORR1D2 LTR MaLR 1 357 -13 5 984 255 261 136 126 chr2 52408876 52409082 -129339005 + ORR1E LTR MaLR 98 305 -54 5 984 323 269 208 72 chr2 52418453 52418689 -129329398 + LTR90A LTR LTR 702 969 -7 5 984 1125 168 333 48 chr2 52419638 52419932 -129328155 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 5 984 230 238 25 44 chr2 52428070 52428120 -129319967 + ORR1B1-int LTR MaLR 600 646 -863 5 985 379 262 23 15 chr2 52428892 52429024 -129319063 - MLT1A0 LTR MaLR -227 138 6 5 985 234 269 58 29 chr2 52432381 52432450 -129315637 - LTR16E1 LTR ERVL -457 81 11 5 985 2486 152 9 19 chr2 52436879 52437156 -129310931 - MTC LTR MaLR 0 421 152 6 985 2288 81 132 11 chr2 52437156 52437504 -129310583 + RLTR10 LTR ERVK 1 390 0 6 985 2486 152 9 19 chr2 52437504 52437650 -129310437 - MTC LTR MaLR -270 151 2 6 985 253 310 35 17 chr2 52438120 52438235 -129309852 + MLT1C LTR MaLR 312 428 -39 6 985 3117 23 0 0 chr2 52441580 52441926 -129306161 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 6 985 694 317 72 14 chr2 52451672 52451963 -129296124 + MER70A LTR ERVL 163 470 -2 6 985 297 351 76 19 chr2 52452753 52452910 -129295177 + MLT1I LTR MaLR 173 338 -73 6 985 1457 190 164 22 chr2 52454176 52454536 -129293551 + MTD LTR MaLR 1 411 -8 6 985 1013 178 36 69 chr2 52459026 52459273 -129288814 - ORR1B1 LTR MaLR -44 350 112 6 985 2321 83 6 39 chr2 52462065 52462403 -129285684 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 6 985 405 197 0 0 chr2 52462829 52462900 -129285187 + RLTR33 LTR ERVK 175 245 -433 6 985 801 261 18 114 chr2 52462903 52463175 -129284912 + RLTR33 LTR ERVK 347 592 -86 6 985 292 274 57 43 chr2 52463732 52463873 -129284214 - LTR16E1 LTR ERVL -82 456 314 6 985 2636 69 3 0 chr2 52464624 52464944 -129283143 + ORR1A2 LTR MaLR 3 323 -4 6 985 302 335 117 6 chr2 52466254 52466425 -129281662 + LTR52 LTR ERVL 197 386 -35 6 985 306 317 21 0 chr2 52467540 52467649 -129280438 + MTEb LTR MaLR 27 140 -219 6 985 495 279 35 92 chr2 52468237 52468466 -129279621 + MTEb LTR MaLR 164 379 0 6 985 324 337 72 41 chr2 52468466 52468659 -129279428 + MLT1A LTR MaLR 31 229 -145 6 985 913 317 33 27 chr2 52469095 52469396 -129278691 + MLT1A0 LTR MaLR 50 352 -13 6 985 3060 154 14 14 chr2 52480366 52480880 -129267207 - RMER20A LTR ERVK 0 516 3 6 985 596 285 60 129 chr2 52481321 52481739 -129266348 + RMER20B LTR ERVK 30 462 -165 6 985 596 245 46 160 chr2 52481785 52481861 -129266226 + RMER20B LTR ERVK 463 528 -99 6 985 2074 133 35 9 chr2 52484194 52484542 -129263545 - RLTR14 LTR ERV1 -1 381 25 7 985 236 327 86 52 chr2 52491727 52491843 -129256244 - LTR85a LTR Gypsy? -2 700 581 7 985 838 209 146 9 chr2 52497191 52497403 -129250684 - MTD LTR MaLR 0 419 179 7 985 3892 163 43 52 chr2 52497408 52498212 -129249875 - RMER13B LTR ERVK -111 797 1 7 985 227 283 62 42 chr2 52498667 52498763 -129249324 + LTR16E2 LTR ERVL 21 118 -450 7 985 304 379 18 61 chr2 52498957 52499185 -129248902 + LTR16E2 LTR ERVL 312 529 -39 7 985 1018 130 123 0 chr2 52499805 52499967 -129248120 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 205 7 985 387 270 78 49 chr2 52500034 52500279 -129247808 + RLTR15 LTR ERVK 41 292 -67 1 985 799 182 144 10 chr2 52500387 52500581 -129247506 - ORR1B1 LTR MaLR -174 220 1 2 985 1323 215 152 6 chr2 52501049 52501372 -129246715 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 5 985 433 264 71 35 chr2 52510185 52510354 -129237733 + MLT1J LTR MaLR 1 175 -337 2 985 453 243 129 73 chr2 52511654 52511827 -129236260 - MLT1A LTR MaLR -21 387 217 2 985 236 258 0 46 chr2 52512620 52512685 -129235402 + LTR48 LTR ERV1 33 94 -693 2 985 1476 183 158 44 chr2 52514178 52514363 -129233724 - MTD LTR MaLR 0 419 210 3 985 1476 183 158 44 chr2 52514574 52514752 -129233335 - MTD LTR MaLR -210 209 12 3 985 253 253 59 108 chr2 52519685 52519787 -129228300 + ORR1D1 LTR MaLR 1 97 -262 4 985 507 299 201 78 chr2 52522946 52523177 -129224910 + LTR33A_ LTR ERVL 82 355 -176 5 985 507 299 201 78 chr2 52523383 52523499 -129224588 + LTR33A_ LTR ERVL 356 472 -59 5 985 642 349 46 17 chr2 52526213 52526539 -129221548 + MLT1G1 LTR MaLR 59 401 -178 6 985 385 328 65 87 chr2 52528752 52529073 -129219014 + ORR1D1 LTR MaLR 63 376 -8 7 985 1052 218 134 89 chr2 52534393 52534751 -129213336 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 8 985 359 274 61 17 chr2 52535271 52535386 -129212701 + MLT1A1 LTR MaLR 28 147 -261 8 985 428 276 77 10 chr2 52536066 52536199 -129211888 + MLT1A1 LTR MaLR 253 395 -13 8 985 1128 189 135 40 chr2 52538340 52538643 -129209444 + IAPEY3_LTR LTR ERVK 1 332 0 9 985 2466 113 59 13 chr2 52539896 52540271 -129207816 + ORR1B1 LTR MaLR 1 392 -2 9 985 483 286 92 95 chr2 52541683 52542008 -129206079 + ORR1E LTR MaLR 1 324 -35 1 985 261 239 29 43 chr2 52546239 52546309 -129201778 - MLT1J LTR MaLR -333 179 111 1 985 405 191 8 141 chr2 52550642 52550770 -129197317 - MT2B LTR ERVL -345 256 146 1 985 629 130 87 0 chr2 52559697 52559812 -129188275 + ORR1A4 LTR MaLR 205 329 0 1 986 393 253 75 79 chr2 52561681 52561934 -129186153 + ORR1E LTR MaLR 98 349 -10 1 986 626 244 197 41 chr2 52585148 52585452 -129162635 + MLT1A LTR MaLR 20 370 -4 1 986 2817 201 45 8 chr2 52586987 52587688 -129160399 - ORR1C2-int LTR MaLR -645 725 2 1 986 1242 147 169 125 chr2 52587689 52587916 -129160171 - ORR1C2 LTR MaLR -1 383 149 1 986 1242 147 169 125 chr2 52588061 52588200 -129159887 - ORR1C2 LTR MaLR -236 148 2 1 986 293 293 8 33 chr2 52588281 52588401 -129159686 - MLT1A1 LTR MaLR -4 404 288 1 986 4297 29 12 0 chr2 52596932 52597419 -129150668 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 2 986 2534 211 135 6 chr2 52604673 52605303 -129142784 + RMER12B LTR ERVK 1 711 -693 2 986 2442 202 9 104 chr2 52605333 52606008 -129142079 - RMER19C LTR ERVK 0 611 1 2 986 7302 125 41 43 chr2 52606013 52607421 -129140666 - RLTR22_Mur LTR ERVK 0 1848 444 2 986 9386 80 18 66 chr2 52607421 52609018 -129139069 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1 1521 -327 2 986 240 128 0 0 chr2 52609054 52609093 -129138994 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1810 1848 0 2 986 1974 153 49 13 chr2 52609117 52609502 -129138585 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1449 399 1 2 986 1394 140 17 73 chr2 52609503 52609956 -129138131 - MurERV4_19-int LTR ERVK 0 5780 5238 2 986 359 130 19 0 chr2 52610296 52610350 -129137737 - MurERV4_19-int LTR ERVK -539 5241 5187 2 986 1994 94 31 10 chr2 52610377 52610666 -129137421 - MurERV4_19-int LTR ERVK -564 5216 4922 2 986 15510 106 45 11 chr2 52610646 52611849 -129136238 - MurERV4_19-int LTR ERVK -2397 3383 2154 2 986 3241 48 8 5 chr2 52611849 52612244 -129135843 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 986 15510 110 36 9 chr2 52612244 52613345 -129134742 - MurERV4_19-int LTR ERVK -3627 2153 1010 2 986 267 272 32 21 chr2 52613860 52613954 -129134133 + MLT1A0 LTR MaLR 9 103 -305 2 986 1601 188 89 17 chr2 52614174 52614521 -129133566 - ORR1D1 LTR MaLR -2 372 1 2 986 396 300 75 6 chr2 52614678 52614839 -129133248 + MLT1A0 LTR MaLR 187 358 -7 2 986 301 253 0 12 chr2 52621866 52621946 -129126141 + MER74B LTR ERVL 543 621 -1 2 986 1831 157 60 22 chr2 52624155 52624519 -129123568 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 2 986 725 196 20 0 chr2 52627125 52627289 -129120798 + MTE2b LTR MaLR 202 379 0 2 986 920 269 105 36 chr2 52628878 52629241 -129118846 - MTD LTR MaLR -30 389 2 2 986 250 333 38 25 chr2 52629305 52629465 -129118622 - RMER15 LTR ERVL -7 568 407 2 986 656 200 47 138 chr2 52633863 52634095 -129113992 - MTE2a LTR MaLR 0 379 169 2 986 1445 189 119 0 chr2 52634686 52635014 -129113073 - RLTR14 LTR ERV1 -2 380 14 2 986 323 306 0 0 chr2 52635315 52635400 -129112687 - MLT2B2 LTR ERVL -430 85 1 2 986 455 167 135 0 chr2 52637161 52637257 -129110830 + ORR1B2 LTR MaLR 4 112 -255 3 986 289 140 0 50 chr2 52637280 52637340 -129110747 + ORR1B2 LTR MaLR 214 270 -124 3 986 995 216 96 81 chr2 52637477 52637895 -129110192 - RMER10A LTR ERVL -18 424 1 3 986 873 89 0 0 chr2 52637895 52638018 -129110069 + ORR1B2 LTR MaLR 240 362 -5 3 986 724 303 89 18 chr2 52639064 52639400 -129108687 - MTEb LTR MaLR -13 366 7 3 986 1913 157 83 35 chr2 52643604 52644026 -129104061 + RMER10A LTR ERVL 1 442 0 3 986 1811 202 104 19 chr2 52650737 52651210 -129096877 - RMER5 LTR ERV1 -8 526 14 3 986 3591 162 134 15 chr2 52655975 52656797 -129091290 - RMER19B LTR ERVK -12 890 21 3 986 1340 196 137 41 chr2 52657608 52657639 -129090448 + RMER4B LTR ERVK 17 43 -542 3 986 1340 207 120 58 chr2 52657853 52658302 -129089785 + RMER4B LTR ERVK 43 457 -9 3 986 2327 133 5 65 chr2 52659329 52659731 -129088356 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 3 986 1962 219 2 22 chr2 52659848 52659963 -129088124 + MTD LTR MaLR 1 109 -310 3 986 1962 219 2 22 chr2 52660147 52660441 -129087646 + MTD LTR MaLR 110 402 -17 3 986 242 223 0 163 chr2 52668581 52668704 -129079383 - ORR1E LTR MaLR -2 377 275 3 986 377 282 89 0 chr2 52668855 52668979 -129079108 - ORR1E LTR MaLR -223 136 2 3 986 299 248 57 107 chr2 52675707 52675847 -129072240 + RMER5 LTR ERV1 62 194 -340 3 986 259 234 0 15 chr2 52676111 52676176 -129071911 + ORR1D1 LTR MaLR 8 71 -303 3 986 1897 167 58 19 chr2 52677366 52677726 -129070361 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 3 986 1203 223 111 26 chr2 52679754 52680095 -129067992 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 4 986 2124 148 56 29 chr2 52682364 52682774 -129065313 + MTC LTR MaLR 1 421 0 4 986 2206 201 21 151 chr2 52682832 52683534 -129064553 - RMER19C LTR ERVK 0 611 1 4 986 926 212 152 0 chr2 52683833 52684083 -129064004 + MTD LTR MaLR 1 288 -131 4 986 433 246 81 8 chr2 52684377 52684500 -129063587 - MLT1A0 LTR MaLR -2 363 232 4 986 318 304 25 98 chr2 52684629 52684921 -129063166 + MTEa LTR MaLR 80 376 -3 4 986 335 254 65 48 chr2 52684923 52685047 -129063040 - MLT1A0 LTR MaLR -230 135 10 4 987 326 224 16 144 chr2 52693023 52693044 -129055043 + MT2B LTR ERVL 149 153 -448 4 987 406 248 13 81 chr2 52694955 52695104 -129052983 + MLT1A1 LTR MaLR 268 406 -2 4 987 1431 150 16 0 chr2 52696319 52696565 -129051522 - MTD LTR MaLR 0 419 170 4 987 443 336 91 7 chr2 52698198 52698483 -129049604 + MLT1H LTR MaLR 241 549 0 4 987 1158 243 59 100 chr2 52709209 52709745 -129038342 - MT2A LTR ERVL 0 554 1 4 987 673 280 39 26 chr2 52714472 52714773 -129033314 - RLTR12B LTR ERVK -269 299 1 4 987 1176 287 102 43 chr2 52714909 52715350 -129032737 - MLT2B1 LTR ERVL -53 467 1 4 987 2476 136 111 99 chr2 52726433 52727036 -129021051 - RMER19B LTR ERVK -292 610 1 5 987 1571 201 62 15 chr2 52739155 52739544 -129008543 - MTD LTR MaLR -12 407 1 5 987 1438 189 142 0 chr2 52743229 52743567 -129004520 + MTD LTR MaLR 1 383 -36 5 987 1438 189 142 0 chr2 52743593 52743614 -129004473 + MTD LTR MaLR 384 410 -9 5 987 809 210 61 82 chr2 52743618 52743898 -129004189 + MTD-int LTR MaLR 1 274 -984 5 987 1269 119 43 0 chr2 52743888 52744098 -129003989 + MTD LTR MaLR 201 419 0 5 987 233 320 86 47 chr2 52746950 52747183 -129000904 - MLT1A0 LTR MaLR -80 285 44 5 987 1011 255 118 18 chr2 52748077 52748408 -128999679 + MTD LTR MaLR 46 409 -10 5 987 1701 144 226 12 chr2 52748408 52748753 -128999334 - MTC LTR MaLR -2 419 1 5 987 311 271 253 4 chr2 52750270 52750507 -128997580 - MLT1F LTR MaLR -81 467 172 5 987 248 340 112 10 chr2 52764294 52764392 -128983695 - MLT1A LTR MaLR -123 251 144 5 987 2166 128 47 118 chr2 52775752 52776203 -128971884 + MTC LTR MaLR 1 419 -2 6 987 1414 191 126 26 chr2 52777946 52778295 -128969792 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 6 987 2337 97 63 11 chr2 52778378 52778745 -128969342 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 1 6 987 2022 159 28 11 chr2 52790309 52790666 -128957421 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 5 6 987 971 205 182 16 chr2 52798557 52798870 -128949217 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 10 6 987 539 236 107 33 chr2 52801203 52801553 -128946534 + MTD LTR MaLR 1 419 0 6 987 1752 131 68 89 chr2 52806548 52806918 -128941169 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 33 6 987 384 344 58 78 chr2 52813753 52814100 -128933987 - ORR1E LTR MaLR 0 359 20 6 987 356 275 38 8 chr2 52820445 52820577 -128927510 - MLT1D LTR MaLR -348 157 22 6 988 1148 229 85 16 chr2 52834919 52835226 -128912861 - MTE2a LTR MaLR -46 333 6 7 988 739 219 25 20 chr2 52838617 52838813 -128909274 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 174 7 988 355 202 17 119 chr2 52838885 52839003 -128909084 - MT2B LTR ERVL -337 264 159 7 988 580 267 34 0 chr2 52839130 52839276 -128908811 - ORR1D2 LTR MaLR -219 151 1 7 988 720 128 8 8 chr2 52849911 52850029 -128898058 + MTC LTR MaLR 304 421 0 7 988 227 274 13 52 chr2 52863174 52863251 -128884836 - RLTR14 LTR ERV1 -2 380 307 7 988 1188 205 109 18 chr2 52875349 52875632 -128872455 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 76 7 988 2557 187 58 15 chr2 52875638 52876187 -128871900 - ORR1C2-int LTR MaLR -112 1397 825 7 988 539 155 9 9 chr2 52876177 52876288 -128871799 - ORR1C2-int LTR MaLR -1398 111 1 7 988 1839 164 78 11 chr2 52876288 52876646 -128871441 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 3 7 988 1142 244 59 48 chr2 52881819 52881968 -128866119 - MTD LTR MaLR -56 363 210 7 988 1142 244 59 48 chr2 52882150 52882357 -128865730 - MTD LTR MaLR -210 209 3 7 988 242 343 129 52 chr2 52883349 52883563 -128864524 - MLT1D LTR MaLR -28 439 213 7 988 256 319 66 46 chr2 52883764 52883955 -128864132 - MLT1D LTR MaLR -255 212 3 7 988 263 282 114 66 chr2 52887720 52887887 -128860200 - MTEa LTR MaLR -11 368 194 8 988 2901 70 38 28 chr2 52891660 52892054 -128856033 + MTB LTR MaLR 3 400 0 8 988 649 294 229 19 chr2 52900632 52901065 -128847022 + MER68 LTR ERVL 25 548 -15 8 988 329 239 116 93 chr2 52939688 52939817 -128808270 - MTEa LTR MaLR -186 193 62 8 988 230 265 28 84 chr2 52940518 52940625 -128807462 - MT2B LTR ERVL -333 268 168 8 988 1095 174 96 8 chr2 52945915 52946264 -128801823 + MTD LTR MaLR 8 418 -1 8 988 866 185 213 58 chr2 52946743 52947053 -128801034 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 17 8 988 286 193 128 103 chr2 52948137 52948293 -128799794 - RLTR12A LTR ERVK -39 529 370 9 988 255 203 87 113 chr2 52948322 52948472 -128799615 - BGLII_B LTR ERVK -220 221 76 9 988 817 236 267 33 chr2 52949642 52949945 -128798142 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 9 988 930 123 45 6 chr2 52952450 52952606 -128795481 - ORR1A3 LTR MaLR -164 162 1 9 123 2346 144 95 17 chr2 52952610 52953099 -128794988 - ORR1A3-int LTR MaLR -4 1959 1487 9 989 1463 199 109 14 chr2 52968459 52968825 -128779262 - MTD LTR MaLR -1 418 18 9 989 392 129 46 39 chr2 52983848 52983944 -128764143 - ORR1D1 LTR MaLR -4 375 266 9 989 591 171 50 33 chr2 52983948 52984008 -128764079 - ORR1D1 LTR MaLR -227 147 85 9 989 1878 153 80 28 chr2 52984008 52984371 -128763716 + ORR1C2 LTR MaLR 1 382 -2 9 989 591 171 50 33 chr2 52984371 52984431 -128763656 - ORR1D1 LTR MaLR -290 84 25 9 989 837 191 360 119 chr2 53026683 53027111 -128720976 - MT2A LTR ERVL 0 533 3 3 989 568 291 210 32 chr2 53030280 53030589 -128717498 - MTEa LTR MaLR 0 379 16 4 989 1521 160 175 6 chr2 53030645 53030959 -128717128 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 4 989 275 325 0 11 chr2 53032944 53033031 -128715056 + MLT1A1 LTR MaLR 268 353 -55 5 989 2739 47 12 6 chr2 53043034 53043378 -128704709 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 7 989 231 296 11 110 chr2 53052551 53052572 -128695515 - MT2B LTR ERVL -373 227 147 8 989 1477 133 121 42 chr2 53054082 53054395 -128693692 - ORR1B2 LTR MaLR -29 338 1 8 989 254 397 107 65 chr2 53059182 53059688 -128688399 - MamGypLTR1c LTR Gypsy -158 645 119 9 989 2766 24 0 6 chr2 53067968 53068308 -128679779 - ORR1A0 LTR MaLR -8 338 1 1 989 1598 176 111 12 chr2 53069268 53069602 -128678485 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 1 989 3492 32 82 0 chr2 53070814 53071253 -128676834 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 1 989 359 65 0 0 chr2 53072441 53072487 -128675600 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 329 1 989 396 291 34 0 chr2 53072479 53072596 -128675491 + MT2B LTR ERVL 28 148 -385 1 989 911 266 61 70 chr2 53072563 53072827 -128675260 + MT2B LTR ERVL 277 544 -57 1 989 911 266 61 70 chr2 53072848 53072911 -128675176 + MT2B LTR ERVL 545 601 0 1 989 1370 171 194 21 chr2 53072911 53073225 -128674862 - MTC LTR MaLR -50 371 1 1 989 2540 179 195 22 chr2 53083291 53083878 -128664209 - RMER6C LTR ERVK 0 690 2 1 990 1132 225 203 131 chr2 53084386 53084883 -128663204 - MT2A LTR ERVL 0 533 1 1 990 278 128 0 0 chr2 53084884 53084931 -128663156 - MERVL_2A-int LTR ERVL -1 5760 5714 1 990 314 194 48 48 chr2 53084931 53085034 -128663053 - ORR1A3-int LTR MaLR -1315 648 546 1 990 3404 23 10 0 chr2 53087971 53088363 -128659724 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 990 9250 28 5 1 chr2 53088363 53089457 -128658630 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 1 990 3468 28 0 0 chr2 53089457 53089853 -128658234 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 990 1945 161 53 4 chr2 53095959 53096561 -128651526 - RLTR33 LTR ERVK -3 675 1 1 990 327 230 77 22 chr2 53111503 53111685 -128636402 + RMER17C LTR ERVK 84 275 -135 1 990 2662 149 132 93 chr2 53116594 53117258 -128630829 - RMER6C LTR ERVK 0 690 1 1 990 419 269 107 39 chr2 53120222 53120400 -128627687 - MLT1C LTR MaLR -277 190 1 1 990 1432 204 92 15 chr2 53125863 53126191 -128621896 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 22 2 990 3280 46 2 2 chr2 53129909 53130305 -128617782 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 990 299 354 79 0 chr2 53134743 53134870 -128613217 + ORR1D2 LTR MaLR 1 137 -242 2 990 343 308 45 52 chr2 53134837 53134991 -128613096 + MT2A LTR ERVL 105 257 -276 2 990 323 250 194 0 chr2 53134948 53135072 -128613015 + ORR1D2 LTR MaLR 215 362 -8 2 990 500 277 70 129 chr2 53135185 53135453 -128612634 + LTR37A LTR ERV1 92 345 -81 2 990 500 277 70 129 chr2 53135533 53135620 -128612467 + LTR37A LTR ERV1 346 426 0 2 990 942 296 23 109 chr2 53136257 53136612 -128611475 + MLT1A0 LTR MaLR 6 333 -32 2 990 1069 261 46 48 chr2 53136612 53136983 -128611104 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 2 990 942 296 23 109 chr2 53136983 53137021 -128611066 + MLT1A0 LTR MaLR 334 365 0 2 990 767 300 75 55 chr2 53138461 53138768 -128609319 - MLT1C LTR MaLR -8 459 147 2 990 313 244 65 22 chr2 53140635 53140727 -128607360 - MLT1C LTR MaLR -344 123 28 2 990 276 274 71 31 chr2 53141279 53141377 -128606710 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 307 2 990 4556 164 60 6 chr2 53143460 53144238 -128603849 + RMER13A LTR ERVK 1 820 -40 2 990 2088 214 34 70 chr2 53145671 53146319 -128601768 + RLTR31A_Mm LTR ERVK 1 572 -12 2 990 748 314 179 19 chr2 53154941 53155253 -128592834 - MLT1A0 LTR MaLR -2 363 2 2 990 2066 188 11 6 chr2 53156122 53156486 -128591601 - ORR1B1 LTR MaLR -9 385 20 2 990 2571 164 24 20 chr2 53156869 53157362 -128590725 + ORR1A1-int LTR MaLR 111 605 -1187 2 990 647 209 7 72 chr2 53157317 53157428 -128590659 + MT2B LTR ERVL 158 259 -342 2 990 653 125 19 0 chr2 53159514 53159618 -128588469 - ORR1B1-int LTR MaLR -125 1838 1733 2 990 1002 170 30 5 chr2 53159611 53159812 -128588275 + ORR1A3-int LTR MaLR 831 1036 -927 2 990 649 45 0 22 chr2 53160753 53160844 -128587243 + ORR1A3-int LTR MaLR 1034 1122 -841 2 990 2659 132 272 6 chr2 53160820 53161346 -128586741 + ORR1A3-int LTR MaLR 1298 1963 0 2 990 1821 119 71 65 chr2 53161346 53161670 -128586417 + ORR1A3 LTR MaLR 1 326 0 2 990 508 161 0 0 chr2 53161670 53161751 -128586336 - ORR1B1 LTR MaLR -313 81 1 2 990 374 330 79 11 chr2 53162740 53162930 -128585157 - MLT1G3 LTR MaLR -390 205 3 2 990 1514 195 114 12 chr2 53164677 53165020 -128583067 + RMER5 LTR ERV1 21 398 -136 2 990 2205 192 30 5 chr2 53165022 53165183 -128582904 - MTC LTR MaLR -8 413 244 2 990 2205 192 30 5 chr2 53165213 53165454 -128582633 - MTC LTR MaLR -178 243 2 2 990 925 159 0 19 chr2 53165454 53165597 -128582490 + RMER5 LTR ERV1 395 534 0 2 990 2017 164 120 0 chr2 53167003 53167370 -128580717 - MTC LTR MaLR -10 411 1 2 990 257 349 42 80 chr2 53167447 53167539 -128580548 - MER88 LTR ERVL -16 448 369 2 990 257 349 42 80 chr2 53167700 53167819 -128580268 - MER88 LTR ERVL -96 368 245 2 990 2060 173 53 23 chr2 53169784 53170181 -128577906 + MTC LTR MaLR 13 421 0 2 990 5065 136 112 14 chr2 53184919 53185488 -128562599 - RMER17B LTR ERVK 0 958 303 2 990 5065 136 112 14 chr2 53185548 53185850 -128562237 - RMER17B LTR ERVK -656 302 2 2 990 290 317 152 6 chr2 53189855 53190020 -128558067 - LTR16A LTR ERVL -165 286 98 3 990 369 232 110 0 chr2 53191977 53192059 -128556028 - MER89 LTR ERV1 -42 517 427 3 990 905 304 77 84 chr2 53192147 53192575 -128555512 - MER89 LTR ERV1 -128 431 7 3 990 355 323 104 61 chr2 53194320 53194405 -128553682 + LTR82A LTR ERVL 200 274 -598 3 990 903 246 142 6 chr2 53194405 53194728 -128553359 + ORR1D2 LTR MaLR 1 367 -3 3 990 355 322 190 53 chr2 53194728 53195164 -128552923 + LTR82A LTR ERVL 275 790 -82 3 990 319 321 153 46 chr2 53195377 53195450 -128552637 + LTR82A LTR ERVL 791 866 -6 3 990 434 349 82 79 chr2 53195700 53195743 -128552344 - MLT2C1 LTR ERVL 0 397 352 3 990 434 349 82 79 chr2 53195792 53196090 -128551997 - MLT2C1 LTR ERVL -46 351 55 3 991 230 327 125 71 chr2 53215743 53215983 -128532104 - LTR33A_ LTR ERVL -86 434 182 3 991 372 295 51 43 chr2 53216093 53216210 -128531877 - LTR33A_ LTR ERVL -367 164 47 3 991 1981 101 62 68 chr2 53217156 53217508 -128530579 + ORR1B2 LTR MaLR 10 359 -8 3 991 496 338 81 45 chr2 53217539 53217849 -128530238 - MT2A LTR ERVL -210 323 3 3 991 231 278 0 0 chr2 53218667 53218721 -128529366 - MLT1A1 LTR MaLR 0 365 312 3 991 274 200 149 30 chr2 53219103 53219170 -128528917 - MLT1A1 LTR MaLR -71 337 263 3 991 1194 359 93 21 chr2 53219609 53219703 -128528384 - MTE-int LTR MaLR -125 1455 1350 3 991 1194 359 93 21 chr2 53219726 53220308 -128527779 - MTE-int LTR MaLR -231 1349 730 3 991 612 296 174 59 chr2 53234238 53234629 -128513458 + LTR40a LTR ERVL 71 506 -13 3 991 299 147 89 51 chr2 53234745 53234824 -128513263 - RLTR25B LTR ERVK -519 509 428 3 991 3475 58 0 2 chr2 53235025 53235424 -128512663 - MTB LTR MaLR -2 398 1 3 991 2612 143 110 11 chr2 53236793 53237265 -128510822 - RLTR28 LTR ERVL -4 520 2 3 991 3116 95 28 13 chr2 53253821 53254280 -128493807 + RMER17B LTR ERVK 1 466 -492 3 991 2073 175 75 70 chr2 53254991 53255494 -128492593 + RMER17B LTR ERVK 453 958 0 3 991 1011 248 51 4 chr2 53255783 53256018 -128492069 - MTE2b LTR MaLR -7 372 127 3 991 2321 161 13 3 chr2 53258580 53258961 -128489126 - ORR1B1 LTR MaLR -9 385 1 3 991 2140 176 36 51 chr2 53260539 53260929 -128487158 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 3 991 886 198 6 0 chr2 53260929 53261086 -128487001 - ORR1C2-int LTR MaLR 0 1370 1213 3 991 2271 148 52 30 chr2 53261090 53261494 -128486593 - MTC LTR MaLR -8 413 1 3 991 1172 213 0 4 chr2 53261504 53261740 -128486347 - ORR1C2-int LTR MaLR -162 1347 1113 3 991 1286 246 86 39 chr2 53264628 53265166 -128482921 - ORR1C2-int LTR MaLR -397 1112 451 3 991 1900 177 67 118 chr2 53265166 53265641 -128482446 + RMER19B LTR ERVK 1 451 -451 4 991 476 104 0 0 chr2 53265625 53265692 -128482395 + RMER19B LTR ERVK 653 719 -183 4 991 2000 210 28 0 chr2 53265684 53266080 -128482007 - ORR1C2-int LTR MaLR -962 408 2 3 991 588 118 0 11 chr2 53266084 53266178 -128481909 - ORR1C2 LTR MaLR -2 382 290 3 991 2221 180 16 3 chr2 53266187 53266560 -128481527 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 4 991 350 159 0 14 chr2 53271800 53271870 -128476217 + RMER19B LTR ERVK 834 902 0 4 991 247 394 66 44 chr2 53273412 53273638 -128474449 + MLT1K LTR MaLR 193 423 -172 4 991 229 206 145 14 chr2 53275367 53275436 -128472651 - MLT1H-int LTR MaLR -164 1245 1168 4 991 756 245 36 73 chr2 53275463 53275683 -128472404 - MTE2a LTR MaLR 0 379 168 4 991 490 297 0 0 chr2 53276714 53276815 -128471272 - MTE2a LTR MaLR -222 157 57 4 991 315 344 0 0 chr2 53276815 53276849 -128471238 - MTE2a LTR MaLR -282 97 64 4 991 322 344 0 0 chr2 53277629 53277684 -128470403 - MTE2a LTR MaLR -316 63 9 4 991 657 219 20 17 chr2 53278436 53278617 -128469470 + MTD LTR MaLR 133 419 0 4 991 1721 153 24 51 chr2 53282116 53282447 -128465640 + ORR1A3 LTR MaLR 1 322 -4 4 991 957 173 58 16 chr2 53288074 53288262 -128459825 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 189 4 991 4454 250 45 36 chr2 53288413 53289617 -128458470 - ORR1C2-int LTR MaLR -154 1216 3 4 991 1315 196 105 55 chr2 53289618 53289979 -128458108 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 6 4 991 2434 150 129 23 chr2 53300442 53300914 -128447173 + RLTR11A2 LTR ERVK 6 527 0 4 991 1399 192 151 22 chr2 53327664 53327988 -128420099 + ORR1D1 LTR MaLR 9 374 0 4 991 5803 203 44 50 chr2 53327988 53329271 -128418816 + ORR1D1-int LTR MaLR 1 1276 -94 4 991 661 165 26 0 chr2 53329983 53330098 -128417989 + ORR1D1-int LTR MaLR 1253 1370 0 4 991 1044 250 147 6 chr2 53330098 53330424 -128417663 + ORR1D1 LTR MaLR 1 372 -6 4 991 2529 132 20 8 chr2 53333441 53333839 -128414248 - RLTR9D LTR ERVK 0 403 1 4 991 1692 175 95 50 chr2 53336319 53336617 -128411470 - MTC LTR MaLR -13 408 99 4 991 3072 58 8 5 chr2 53336617 53337012 -128411075 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 991 1692 175 95 50 chr2 53337012 53337092 -128410995 - MTC LTR MaLR -323 98 13 4 991 479 302 91 22 chr2 53338061 53338291 -128409796 + MT2A LTR ERVL 3 248 -285 5 991 439 282 86 0 chr2 53338227 53338344 -128409743 + ORR1D2 LTR MaLR 172 298 -72 5 991 2318 124 145 19 chr2 53342021 53342449 -128405638 - RLTR45 LTR ERVK 0 482 1 5 992 348 290 50 88 chr2 53354342 53354490 -128393597 - MLT1B LTR MaLR -183 191 60 5 992 3468 20 5 0 chr2 53354490 53354884 -128393203 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 992 9143 28 14 1 chr2 53354884 53355968 -128392119 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 5 992 3480 18 5 0 chr2 53355968 53356362 -128391725 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 992 348 284 54 82 chr2 53356362 53356415 -128391672 - MLT1B LTR MaLR -324 66 8 5 992 1632 221 19 26 chr2 53358641 53359018 -128389069 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 5 992 602 312 46 27 chr2 53368891 53369151 -128378936 + RMER5 LTR ERV1 160 424 -110 5 992 1414 226 61 75 chr2 53370994 53371353 -128376734 - ORR1E LTR MaLR -5 354 1 5 992 274 231 0 44 chr2 53371353 53371412 -128376675 - ORR1E LTR MaLR -298 61 6 5 992 1440 318 165 29 chr2 53371394 53372102 -128375985 - ORR1E-int LTR MaLR -30 1550 746 5 992 334 284 75 43 chr2 53372102 53372316 -128375771 + MTEa LTR MaLR 1 261 -118 5 992 1703 297 128 11 chr2 53372565 53373189 -128374898 - ORR1E-int LTR MaLR -882 698 2 5 992 634 305 92 62 chr2 53373193 53373529 -128374558 - ORR1E LTR MaLR -6 353 8 5 992 3843 239 107 44 chr2 53375616 53376125 -128371962 - ORR1B2-int LTR MaLR -204 1166 668 5 992 3843 239 107 44 chr2 53376269 53376856 -128371231 - ORR1B2-int LTR MaLR -703 667 1 5 992 1738 171 29 14 chr2 53376856 53377200 -128370887 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 38 5 992 424 111 16 0 chr2 53377405 53377468 -128370619 - ORR1B2 LTR MaLR -298 69 6 5 992 268 210 16 0 chr2 53379971 53380033 -128368054 + RLTR42-int LTR ERVK 1545 1607 -3915 5 992 3109 71 2 10 chr2 53380168 53380567 -128367520 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 992 234 324 162 0 chr2 53381471 53381539 -128366548 - LTR16A1 LTR ERVL -169 287 209 5 992 486 252 103 29 chr2 53381948 53382339 -128365748 + RLTR19-int LTR ERVK 7187 7500 -1459 5 992 340 232 49 92 chr2 53383534 53383719 -128364368 + RLTR19-int LTR ERVK 3433 3609 -2528 5 992 596 225 203 90 chr2 53383778 53384088 -128363999 + RLTR19-int LTR ERVK 4037 4381 -1756 5 992 261 304 11 21 chr2 53384607 53384701 -128363386 + RLTR24 LTR ERV1 1 93 -436 5 992 3738 153 80 135 chr2 53392255 53392536 -128355551 - RMER13A LTR ERVK -34 826 520 5 992 3738 153 80 135 chr2 53392745 53393337 -128354750 - RMER13A LTR ERVK -341 519 1 5 992 598 338 35 17 chr2 53394049 53394281 -128353806 + RMER15 LTR ERVL 321 556 -19 5 992 537 277 15 0 chr2 53397655 53397785 -128350302 + ORR1E LTR MaLR 1 132 -227 5 992 411 281 24 16 chr2 53398053 53398176 -128349911 + ORR1E LTR MaLR 250 373 -6 5 992 876 348 117 25 chr2 53398666 53399103 -128348984 - MER70B LTR ERVL -2 576 100 5 992 370 282 21 147 chr2 53399084 53399275 -128348812 - MER70B LTR ERVL -305 167 1 5 992 1725 220 57 15 chr2 53400406 53400808 -128347279 - MTD LTR MaLR 0 419 1 5 992 266 306 159 18 chr2 53402898 53403011 -128345076 + MLT2F LTR ERVL 1 129 -534 5 992 272 350 118 44 chr2 53403027 53403230 -128344857 + MLT2F LTR ERVL 192 409 -254 5 992 442 304 9 0 chr2 53403305 53403417 -128344670 - LTR31 LTR ERV1 -43 576 464 5 992 515 157 109 18 chr2 53411956 53412059 -128336028 + MTC LTR MaLR 119 231 -190 6 992 1750 244 40 46 chr2 53412059 53412536 -128335551 - RMER19C LTR ERVK 0 611 138 6 992 758 207 0 7 chr2 53412575 53412711 -128335376 + MTC LTR MaLR 222 356 -65 6 992 1630 149 35 13 chr2 53412712 53413024 -128335063 + MTC-int LTR MaLR 51 369 -889 6 992 237 167 46 77 chr2 53414683 53414748 -128333339 + RMER20A LTR ERVK 186 248 -268 6 992 4218 182 41 22 chr2 53419463 53420143 -128327944 + MTC-int LTR MaLR 380 1073 -185 6 992 4218 182 41 22 chr2 53420881 53421063 -128327024 + MTC-int LTR MaLR 1074 1258 0 6 992 877 169 78 6 chr2 53421063 53421230 -128326857 + MTC LTR MaLR 1 179 -242 6 992 232 279 120 70 chr2 53425378 53425536 -128322551 + MamGypLTR2c LTR Gypsy 2 167 -901 6 992 288 346 154 0 chr2 53425675 53425811 -128322276 + ORR1E LTR MaLR 23 179 -180 6 992 240 217 15 91 chr2 53425886 53425952 -128322135 + ORR1E LTR MaLR 319 379 0 6 992 933 281 124 19 chr2 53429390 53429705 -128318382 - ORR1E LTR MaLR -7 352 5 6 992 492 317 139 20 chr2 53431805 53432056 -128316031 + MLT1A0 LTR MaLR 85 365 0 6 992 1912 151 40 11 chr2 53432231 53432580 -128315507 + RLTR15 LTR ERVK 1 359 0 6 992 342 299 170 13 chr2 53433270 53433429 -128314658 - LTR75 LTR ERVL -332 230 47 6 992 412 346 47 34 chr2 53433505 53433741 -128314346 - LTR16E1 LTR ERVL -58 480 242 6 992 420 264 56 21 chr2 53435186 53435329 -128312758 + MLT1D LTR MaLR 255 402 -103 6 992 877 274 184 17 chr2 53445093 53445436 -128302651 - MTD LTR MaLR 0 419 19 6 992 361 330 9 26 chr2 53446670 53446785 -128301302 - MTD LTR MaLR -239 180 68 6 992 255 226 32 0 chr2 53449716 53449778 -128298309 - MTD LTR MaLR -350 71 8 6 992 1372 273 79 43 chr2 53449786 53450342 -128297745 - MTD-int LTR MaLR -4 1254 679 6 992 738 200 90 43 chr2 53450369 53450557 -128297530 - MTD LTR MaLR -14 405 209 6 992 440 350 67 31 chr2 53450855 53451079 -128297008 - MTD LTR MaLR -158 261 30 6 992 900 232 151 57 chr2 53451289 53451642 -128296445 + RMER4B LTR ERVK 33 418 -167 6 992 3540 138 52 57 chr2 53456945 53457289 -128290798 - RMER17A LTR ERVK 0 751 439 6 992 3540 138 52 57 chr2 53457581 53457987 -128290100 - RMER17A LTR ERVK -313 438 5 6 992 414 207 117 26 chr2 53458384 53458520 -128289567 + RMER4B LTR ERVK 329 585 0 6 992 4326 19 0 0 chr2 53458721 53459203 -128288884 + LTRIS_Mm LTR ERV1 1 482 0 6 993 970 200 76 5 chr2 53479029 53479240 -128268847 - MTC LTR MaLR 0 421 196 7 993 814 270 51 5 chr2 53479830 53480027 -128268060 - MTC LTR MaLR -209 210 5 7 993 3336 41 5 0 chr2 53485556 53485950 -128262137 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 7 993 404 327 101 76 chr2 53504694 53505091 -128242996 + LTR79 LTR ERVL 20 426 -101 4 993 3317 31 35 5 chr2 53513500 53513923 -128234164 + RLTR10C LTR ERVK 1 436 0 1 993 430 344 62 13 chr2 53514972 53515199 -128232888 - MER34 LTR ERV1 -6 536 299 1 993 1376 238 65 59 chr2 53516632 53517151 -128230936 + RMER4B LTR ERVK 17 585 0 1 993 2208 105 16 0 chr2 53517685 53517999 -128230088 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 1 993 2144 183 55 3 chr2 53522539 53522923 -128225164 + MTC LTR MaLR 18 421 0 2 993 229 263 16 6 chr2 53523217 53523291 -128224796 + LTRIS_Mm LTR ERV1 61 136 -451 2 993 1799 140 89 20 chr2 53526954 53527304 -128220783 + BGLII_A LTR ERVK 70 443 -2 2 993 591 343 67 41 chr2 53530437 53530850 -128217237 + MLT1C LTR MaLR 10 388 -79 3 993 664 341 83 62 chr2 53531295 53531689 -128216398 + MLT1F2 LTR MaLR 3 447 -113 3 993 664 333 96 84 chr2 53531836 53531955 -128216132 + MLT1F2 LTR MaLR 448 556 -4 3 993 2799 129 135 27 chr2 53532047 53532574 -128215513 - RLTR31A_Mm LTR ERVK 0 584 1 3 993 2035 167 54 8 chr2 53534507 53534893 -128213194 + MTC LTR MaLR 10 413 -8 3 993 2163 115 19 0 chr2 53534978 53535292 -128212795 - ORR1A4 LTR MaLR -8 321 2 4 993 1111 237 97 7 chr2 53540873 53541162 -128206925 + LTR78 LTR ERV1 983 1297 -7 4 993 1824 127 83 9 chr2 53542834 53543145 -128204942 + ORR1A2 LTR MaLR 6 327 0 4 993 316 302 123 39 chr2 53543211 53543366 -128204721 - MLT1B LTR MaLR 0 390 223 5 993 294 208 28 119 chr2 53545814 53545923 -128202164 - MTEa LTR MaLR 0 379 281 5 993 2700 194 22 31 chr2 53564297 53564836 -128183251 + RMER5 LTR ERV1 1 534 0 7 993 608 197 18 106 chr2 53567069 53567239 -128180848 + RMER13B LTR ERVK 1 155 -753 8 993 1295 240 52 49 chr2 53567232 53567600 -128180487 + RMER13B LTR ERVK 426 794 -114 8 993 666 180 54 8 chr2 53567588 53567717 -128180370 - RMER13B LTR ERVK -25 883 749 8 993 391 178 26 64 chr2 53567703 53567781 -128180306 - RMER13B LTR ERVK -408 500 426 8 993 848 183 13 7 chr2 53567774 53567928 -128180159 - RMER13B LTR ERVK -753 155 1 8 993 5126 168 35 37 chr2 53575840 53576336 -128171751 - RLTR22_Mur LTR ERVK 0 1848 1339 9 993 5126 168 35 37 chr2 53576390 53576824 -128171263 - RLTR22_Mur LTR ERVK -510 1338 920 9 993 5126 167 8 18 chr2 53577607 53578230 -128169857 - RLTR22_Mur LTR ERVK -929 919 17 9 993 475 246 0 48 chr2 53578728 53578852 -128169235 - RMER15 LTR ERVL -92 483 366 9 993 2590 38 28 3 chr2 53582486 53582805 -128165282 + IAPLTR2b LTR ERVK 1 327 0 9 993 285 338 70 78 chr2 53584697 53584954 -128163133 + MLT1F2 LTR MaLR 81 335 -225 1 993 295 125 17 67 chr2 53585008 53585068 -128163019 + MTE2a LTR MaLR 1 57 -362 1 993 526 323 92 51 chr2 53585875 53586166 -128161921 + MTE2a LTR MaLR 73 412 -7 1 993 732 305 76 99 chr2 53593542 53593641 -128154446 - MLT1-int LTR MaLR -13 1358 1268 1 993 732 305 76 99 chr2 53593962 53594118 -128153969 - MLT1-int LTR MaLR -104 1267 1113 1 993 732 309 85 125 chr2 53594234 53594619 -128153468 - MLT1-int LTR MaLR -279 1210 848 1 993 271 354 0 10 chr2 53594587 53594687 -128153400 - MLT1-int LTR MaLR -663 708 610 1 993 1656 217 16 29 chr2 53595776 53595935 -128152152 + ORR1D1 LTR MaLR 5 163 -211 1 993 1656 217 16 29 chr2 53596367 53596581 -128151506 + ORR1D1 LTR MaLR 164 373 -1 1 993 257 279 25 0 chr2 53597708 53597787 -128150300 + MLT1-int LTR MaLR 276 356 -1015 1 994 1298 201 42 121 chr2 53610249 53610605 -128137482 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 2 1 994 1900 232 80 14 chr2 53611569 53612068 -128136019 - RMER19C LTR ERVK 0 611 80 1 994 1156 197 14 0 chr2 53614005 53614218 -128133869 - MT2A LTR ERVL -226 307 92 1 994 734 218 0 0 chr2 53614211 53614344 -128133743 - MT2A LTR ERVL -400 133 1 1 994 874 346 35 12 chr2 53614494 53614813 -128133274 + MLT1A1 LTR MaLR 83 408 0 1 994 1016 302 43 64 chr2 53625543 53625924 -128122163 + MTE2a LTR MaLR 1 370 -9 1 994 481 337 28 59 chr2 53625927 53626214 -128121873 + MTE-int LTR MaLR 3 280 -1300 1 994 673 312 146 23 chr2 53633636 53633938 -128114149 + MTE-int LTR MaLR 701 1039 -541 1 994 583 292 58 12 chr2 53634781 53634954 -128113133 + MTE2a LTR MaLR 2 182 -197 1 994 695 241 59 18 chr2 53641370 53641539 -128106548 + MTE2a LTR MaLR 204 379 0 1 994 438 272 59 39 chr2 53649128 53649281 -128098806 + MTD LTR MaLR 264 419 0 1 994 731 265 263 7 chr2 53650085 53650385 -128097702 - RMER20B LTR ERVK -17 610 234 1 994 2033 171 3 64 chr2 53650861 53651237 -128096850 - ORR1B1 LTR MaLR -26 368 16 1 994 927 228 69 116 chr2 53652524 53652886 -128095201 + RLTR16 LTR ERVK 161 505 0 1 994 903 321 62 12 chr2 53654609 53654946 -128093141 - ORR1E LTR MaLR 0 359 6 1 994 2105 204 20 18 chr2 53658129 53658569 -128089518 + BGLII_B LTR ERVK 1 441 0 1 994 2924 117 177 6 chr2 53660352 53660861 -128087226 + MT2B LTR ERVL 1 596 -5 1 994 384 230 3 0 chr2 53661221 53661308 -128086779 - MTEb LTR MaLR -9 410 291 1 994 1681 208 242 10 chr2 53661744 53662240 -128085847 + RMER19C LTR ERVK 1 611 0 1 994 783 270 170 22 chr2 53665401 53665677 -128082410 - MTE2b LTR MaLR -5 374 58 1 994 1976 115 14 75 chr2 53665866 53666213 -128081874 - ORR1A2 LTR MaLR -1 326 1 1 994 370 328 47 50 chr2 53668478 53668662 -128079425 - ORR1E LTR MaLR -190 194 3 1 994 457 345 83 47 chr2 53670085 53670386 -128077701 - LTR40a LTR ERVL -114 405 94 1 994 2176 115 12 0 chr2 53682983 53683306 -128064781 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 2 994 1111 248 140 12 chr2 53696509 53696708 -128051379 - ORR1D2 LTR MaLR -1 369 133 2 994 1111 248 140 12 chr2 53696728 53696850 -128051237 - ORR1D2 LTR MaLR -238 132 8 2 994 1526 222 87 95 chr2 53697060 53697902 -128050185 + RMER17B LTR ERVK 2 888 -70 2 994 1636 266 126 41 chr2 53700386 53700927 -128047160 + RMER20B LTR ERVK 14 600 -27 2 994 1850 222 41 180 chr2 53712506 53713188 -128034899 - RMER19C LTR ERVK -13 598 12 2 994 279 305 30 30 chr2 53716174 53716309 -128031778 - ORR1C2 LTR MaLR -248 136 2 2 994 2394 199 192 5 chr2 53719120 53719741 -128028346 - RMER19A LTR ERVK 0 737 1 2 994 2003 202 8 0 chr2 53720363 53720729 -128027358 - RLTR14 LTR ERV1 0 382 14 2 994 301 338 40 20 chr2 53723033 53723184 -128024903 - MLT1A1 LTR MaLR -195 213 60 2 994 1747 152 6 66 chr2 53726305 53726637 -128021450 - MTC LTR MaLR 0 421 110 2 994 2293 170 138 8 chr2 53726864 53727172 -128020915 + RMER6D LTR ERVK 1 318 -402 2 994 2293 171 126 15 chr2 53727327 53727635 -128020452 + RMER6D LTR ERVK 301 689 -1 2 994 893 327 101 13 chr2 53731246 53731701 -128016386 + MLT1D LTR MaLR 6 500 -5 2 994 1657 195 99 40 chr2 53736808 53737232 -128010855 - ORR1B1 LTR MaLR -14 380 1 2 994 242 375 76 18 chr2 53737400 53737571 -128010516 - LTR33 LTR ERVL -6 509 329 2 995 2685 80 137 21 chr2 53741429 53741861 -128006226 + RLTR45 LTR ERVK 1 482 0 3 995 2780 187 56 63 chr2 53751980 53752931 -127995156 + RLTR13D1 LTR ERVK 1 855 0 3 995 258 318 53 26 chr2 53757508 53757621 -127990466 - MTEa LTR MaLR -8 371 256 3 995 670 278 89 0 chr2 53757634 53757803 -127990284 - MTEa LTR MaLR -178 201 18 3 995 266 306 102 31 chr2 53757689 53757817 -127990270 - MT2A LTR ERVL -396 137 1 3 995 261 314 23 11 chr2 53758584 53758671 -127989416 - MLT1A0 LTR MaLR -274 91 4 3 995 835 305 47 69 chr2 53760480 53760845 -127987242 + ORR1E LTR MaLR 1 414 -5 3 995 317 341 64 23 chr2 53761185 53761356 -127986731 + MLT1K LTR MaLR 60 237 -358 3 995 652 308 51 120 chr2 53761455 53761803 -127986284 + ORR1E LTR MaLR 1 324 -35 3 995 1929 132 10 3 chr2 53761803 53762107 -127985980 + ORR1A2 LTR MaLR 1 306 -21 3 995 286 105 0 0 chr2 53762107 53762145 -127985942 + ORR1A2 LTR MaLR 281 318 -8 3 995 1794 186 33 3 chr2 53769547 53769882 -127978205 - ORR1B2 LTR MaLR -21 346 2 3 995 887 302 16 57 chr2 53781591 53781963 -127966124 + ORR1E LTR MaLR 1 357 -2 3 995 233 277 0 0 chr2 53804097 53804162 -127943925 - MLT1A LTR MaLR -19 355 291 3 995 4436 6 6 0 chr2 53807413 53807903 -127940184 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 3 995 946 280 53 16 chr2 53811298 53811672 -127936415 + MLT1B LTR MaLR 3 390 0 4 995 1450 231 62 20 chr2 53830696 53831053 -127917034 + RLTR14 LTR ERV1 5 376 -6 4 995 618 318 49 40 chr2 53834841 53835067 -127913020 + MLT1A0 LTR MaLR 4 231 -134 4 995 330 311 103 127 chr2 53842908 53843277 -127904810 - RMER10A LTR ERVL -66 376 17 4 995 1637 229 68 0 chr2 53855875 53856211 -127891876 - ORR1B2 LTR MaLR -8 359 1 4 995 6796 197 43 30 chr2 53856211 53857683 -127890404 - ORR1B2-int LTR MaLR 0 1509 19 4 995 1056 198 20 5 chr2 53857693 53857896 -127890191 + ORR1B2 LTR MaLR 162 367 0 4 995 258 258 28 188 chr2 53858606 53858787 -127889300 + RLTR25A LTR ERVK 431 582 -521 4 995 384 209 11 44 chr2 53860986 53861076 -127887011 - MTC LTR MaLR 0 421 335 4 995 1038 259 87 37 chr2 53866302 53866623 -127881464 - MTC LTR MaLR -71 350 14 4 995 1546 191 80 75 chr2 53868204 53868404 -127879683 + ORR1C2 LTR MaLR 4 188 -196 4 995 1546 191 80 75 chr2 53868581 53868754 -127879333 + ORR1C2 LTR MaLR 189 379 -5 4 996 2684 207 50 30 chr2 53875863 53876421 -127871666 + RLTR25B LTR ERVK 1 569 -459 4 996 847 179 85 25 chr2 53876919 53877120 -127870967 + RLTR25B LTR ERVK 641 853 -175 4 996 355 271 143 36 chr2 53877450 53877659 -127870428 + RLTR25B LTR ERVK 742 933 -95 4 996 1696 163 9 133 chr2 53878570 53879036 -127869051 + RMER17C LTR ERVK 3 410 0 4 996 409 296 115 57 chr2 53880952 53881196 -127866891 + MLT1C LTR MaLR 2 259 -208 4 996 2128 169 26 24 chr2 53885907 53886326 -127861761 - RLTR25B LTR ERVK 0 1028 609 5 996 3189 199 39 14 chr2 53892503 53893125 -127854962 - RLTR25B LTR ERVK -391 637 1 5 996 1898 223 11 41 chr2 53894296 53894755 -127853332 - RMER19C LTR ERVK -164 447 3 5 996 327 146 18 0 chr2 53894756 53894811 -127853276 + MTC LTR MaLR 356 411 -10 5 996 391 340 48 74 chr2 53895801 53896112 -127851975 + MLT1B LTR MaLR 67 369 -21 5 996 1416 200 94 7 chr2 53897472 53897759 -127850328 - MTC LTR MaLR 0 421 110 5 996 284 240 133 0 chr2 53898101 53898176 -127849911 - MTC LTR MaLR -336 85 1 5 996 518 328 164 47 chr2 53912900 53913217 -127834870 - ORR1E LTR MaLR -5 354 1 5 996 1118 153 5 10 chr2 53916267 53916459 -127831628 - RMER5 LTR ERV1 -201 333 143 5 996 633 161 80 0 chr2 53916461 53916573 -127831514 + RMER5 LTR ERV1 324 444 -90 5 996 3215 47 13 0 chr2 53927666 53928046 -127820041 - IAPEY_LTR LTR ERVK 0 385 1 5 996 428 200 66 14 chr2 53931173 53931309 -127816778 - RMER17B LTR ERVK -399 507 330 5 996 1781 104 0 15 chr2 53940906 53941169 -127806918 + ORR1A2 LTR MaLR 1 259 -68 5 996 633 193 0 25 chr2 53941155 53941277 -127806810 - ORR1A3-int LTR MaLR -1844 119 1 5 996 408 106 0 19 chr2 53941277 53941347 -127806740 - ORR1A3 LTR MaLR 0 370 276 5 996 289 280 22 16 chr2 53945720 53945812 -127802275 + MLT1A LTR MaLR 263 355 -53 5 996 323 311 52 116 chr2 53945876 53946127 -127801960 + MLT1A-int LTR MaLR 20 254 -1481 5 996 960 269 25 89 chr2 53950683 53950905 -127797182 - MTE2a LTR MaLR -2 377 162 5 996 960 296 46 82 chr2 53951189 53951356 -127796731 - MTE2a LTR MaLR -230 189 25 5 996 604 245 65 29 chr2 53953596 53953869 -127794218 + MTD LTR MaLR 6 324 -95 5 996 2050 214 112 32 chr2 53953869 53954039 -127794048 + MT2B LTR ERVL 1 191 -410 5 996 2227 102 122 16 chr2 53954039 53954416 -127793671 - RLTR9B2 LTR ERVK -3 417 1 5 996 2050 214 112 32 chr2 53954416 53954746 -127793341 + MT2B LTR ERVL 192 545 -56 5 996 2050 214 112 32 chr2 53954782 53954835 -127793252 + MT2B LTR ERVL 546 597 -4 5 996 296 236 40 61 chr2 53954808 53954907 -127793180 + MTD LTR MaLR 322 418 -1 5 996 1641 153 25 213 chr2 53954907 53954993 -127793094 + RLTR23 LTR ERV1 1 79 -351 5 996 1641 153 25 213 chr2 53955027 53955470 -127792617 + RLTR23 LTR ERV1 80 430 0 5 996 1661 162 54 77 chr2 53956204 53956592 -127791495 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 6 5 996 1177 153 115 135 chr2 53958753 53959101 -127788986 + RLTR23 LTR ERV1 1 341 -89 5 996 2762 49 3 14 chr2 53961771 53962121 -127785966 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 5 996 475 242 102 36 chr2 53962674 53962841 -127785246 + ORR1D2 LTR MaLR 183 360 -10 5 996 765 224 83 70 chr2 53964530 53964825 -127783262 + RMER2 LTR ERV1 1 400 -167 5 996 2063 176 37 5 chr2 53965334 53965716 -127782371 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 5 996 501 138 0 33 chr2 53974211 53974301 -127773786 + ORR1A4 LTR MaLR 2 88 -241 6 996 1549 138 4 4 chr2 53974500 53974741 -127773346 + ORR1A4 LTR MaLR 89 329 0 6 996 435 321 82 29 chr2 53977168 53977338 -127770749 + MT2A LTR ERVL 230 408 -125 6 996 3350 38 2 0 chr2 53980192 53980587 -127767500 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 996 252 351 75 29 chr2 53982019 53982192 -127765895 - MER31A LTR ERV1 -48 418 238 6 996 1069 277 68 42 chr2 53982837 53983191 -127764896 + ORR1D2 LTR MaLR 3 365 -5 6 996 2006 152 24 31 chr2 53983382 53983795 -127764292 + RMER17C LTR ERVK 1 410 0 6 996 998 215 127 27 chr2 53983950 53984271 -127763816 - RLTR16 LTR ERVK -152 353 1 6 996 562 306 12 6 chr2 53984271 53984430 -127763657 - MER31A LTR ERV1 -325 160 1 6 996 3163 51 18 0 chr2 53985978 53986367 -127761720 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 997 2168 161 42 0 chr2 54005290 54005668 -127742419 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 1 997 2150 184 114 2 chr2 54014740 54015177 -127732910 - RLTR28 LTR ERVL -14 510 25 2 997 328 311 47 9 chr2 54017509 54017616 -127730471 + MLT1E1 LTR MaLR 532 642 -12 3 997 369 296 32 8 chr2 54028685 54028811 -127719276 - MTD LTR MaLR -274 145 17 5 997 2616 182 136 11 chr2 54030202 54030745 -127717342 + RMER19C LTR ERVK 1 611 0 5 997 1939 158 9 0 chr2 54034269 54034585 -127713502 - ORR1A3 LTR MaLR -7 319 1 6 997 1459 241 75 44 chr2 54036278 54036760 -127711327 - RMER5 LTR ERV1 -4 530 34 6 997 1899 152 18 105 chr2 54037135 54037582 -127710505 + RMER17C LTR ERVK 1 408 -2 6 997 1041 269 34 105 chr2 54040027 54040563 -127707524 + MT2B LTR ERVL 1 601 0 7 997 395 312 72 102 chr2 54043196 54043570 -127704517 + ORR1D1 LTR MaLR 9 371 -3 8 997 1380 189 61 20 chr2 54045727 54046024 -127702063 + ORR1B1 LTR MaLR 43 351 -43 8 997 336 146 0 0 chr2 54046797 54046852 -127701235 + ORR1B1 LTR MaLR 340 394 0 8 997 1075 212 92 65 chr2 54050826 54051119 -127696968 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 74 9 997 300 328 5 114 chr2 54051140 54051182 -127696905 - MT2A LTR ERVL -360 173 2 9 997 462 250 66 20 chr2 54051182 54051333 -127696754 - MTD LTR MaLR -260 159 2 9 997 2218 182 58 40 chr2 54061147 54061651 -127686436 + RMER6C LTR ERVK 50 562 -128 1 997 232 356 29 9 chr2 54062476 54062581 -127685506 + MLT1L LTR MaLR 115 221 -389 1 997 845 263 15 20 chr2 54064349 54064547 -127683540 - MTD LTR MaLR -209 210 14 1 997 517 343 78 38 chr2 54067927 54068272 -127679815 + MLT1L-int LTR MaLR 85 443 -944 1 997 1443 75 35 0 chr2 54068957 54069156 -127678931 + ORR1A2 LTR MaLR 122 327 0 1 997 9852 150 64 22 chr2 54069156 54071040 -127677047 + ORR1A2-int LTR MaLR 1 1963 0 1 997 1768 136 11 21 chr2 54071040 54071319 -127676768 + ORR1A2 LTR MaLR 1 276 -51 1 997 418 352 40 72 chr2 54073906 54074182 -127673905 + MLT1L LTR MaLR 308 574 -36 1 997 980 308 45 64 chr2 54075619 54076262 -127671825 - RLTR18B LTR ERVK -3 613 1 1 997 1347 198 118 15 chr2 54078293 54078631 -127669456 + ORR1C1 LTR MaLR 3 375 -3 1 997 476 292 126 30 chr2 54083723 54084172 -127663915 - MT2A LTR ERVL -4 529 1 1 997 984 193 25 5 chr2 54084928 54085131 -127662956 + RLTR40 LTR ERVK 11 217 -600 1 997 1454 282 47 20 chr2 54085130 54085532 -127662555 - MTD LTR MaLR -6 413 1 1 997 1448 264 83 79 chr2 54085532 54085830 -127662257 + RLTR40 LTR ERVK 217 523 -294 1 997 1448 264 83 79 chr2 54085873 54086155 -127661932 + RLTR40 LTR ERVK 524 799 -18 1 997 1266 179 22 0 chr2 54088863 54089086 -127659001 + ORR1D-int LTR MaLR 292 519 -851 1 997 473 267 211 6 chr2 54095212 54095378 -127652709 + MTD LTR MaLR 125 324 -95 1 997 610 352 24 32 chr2 54095429 54095681 -127652406 - MTEa LTR MaLR -121 258 9 1 997 486 267 0 9 chr2 54100810 54100916 -127647171 - RLTR19 LTR ERVK -7 492 388 1 997 2229 138 135 5 chr2 54100916 54101315 -127646772 - RLTR33 LTR ERVK -227 451 1 1 997 233 131 16 0 chr2 54102893 54102954 -127645133 - MT2A LTR ERVL -4 529 468 1 997 386 298 0 30 chr2 54103182 54103317 -127644770 - MT2A LTR ERVL -329 204 74 1 997 381 336 75 0 chr2 54103244 54103378 -127644709 - MTE2a LTR MaLR -233 146 3 1 997 255 265 70 35 chr2 54103558 54103644 -127644443 - MTE-int LTR MaLR -42 1538 1450 1 997 668 325 51 14 chr2 54104144 54104419 -127643668 - MTE-int LTR MaLR -140 1440 1156 1 997 1524 266 46 38 chr2 54104446 54104970 -127643117 - MERVL_2A-int LTR ERVL -152 5609 5082 1 997 3188 270 102 9 chr2 54111173 54112141 -127635946 - MERVL_2A-int LTR ERVL -672 5089 4032 1 997 341 464 49 8 chr2 54116597 54116862 -127631225 + LTR16A LTR ERVL 2 277 -174 1 997 2892 35 6 0 chr2 54120809 54121153 -127626934 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 1 997 327 336 20 60 chr2 54128548 54128697 -127619390 + MTD LTR MaLR 112 254 -165 1 997 1808 225 33 28 chr2 54128676 54129070 -127619017 - MTC LTR MaLR -6 415 20 1 997 251 315 0 67 chr2 54129134 54129253 -127618834 - MTC LTR MaLR -41 380 270 1 997 246 203 157 14 chr2 54129231 54129301 -127618786 - MTC LTR MaLR -302 94 15 1 997 337 243 116 9 chr2 54129321 54129433 -127618654 - MTC-int LTR MaLR -5 1253 1130 1 124 1878 308 57 36 chr2 54132445 54133160 -127614927 - MTC-int LTR MaLR -215 1043 314 1 998 488 288 21 42 chr2 54133144 54133336 -127614751 - MT2A LTR ERVL -345 188 1 1 998 4447 294 36 31 chr2 54133336 54134928 -127613159 - MERVL_2A-int LTR ERVL 0 5761 4162 1 998 1647 245 43 10 chr2 54141544 54141936 -127606151 + MTD LTR MaLR 1 405 -14 2 998 1424 189 206 38 chr2 54150688 54151056 -127597031 + RLTR23 LTR ERV1 1 430 0 2 998 3116 99 113 34 chr2 54153337 54153860 -127594227 - LTRIS2 LTR ERV1 0 564 1 2 998 285 325 8 39 chr2 54158049 54158177 -127589910 - MLT1H LTR MaLR -391 158 35 2 998 3144 43 5 10 chr2 54174158 54174555 -127573532 + MTA_Mm LTR MaLR 1 395 -1 2 998 2737 92 51 0 chr2 54183131 54183522 -127564565 + RLTR10A LTR ERVK 1 411 0 2 998 1280 209 97 46 chr2 54187251 54187602 -127560485 - ORR1D1 LTR MaLR -3 371 3 2 998 546 302 70 29 chr2 54196216 54196489 -127551598 + MLT1A0 LTR MaLR 77 360 -5 2 998 942 258 145 13 chr2 54201741 54202131 -127545956 - MT2A LTR ERVL -59 474 91 2 998 242 325 168 17 chr2 54206122 54206241 -127541846 + MLT1F2 LTR MaLR 190 326 -234 2 998 446 285 103 123 chr2 54206288 54206588 -127541499 + MLT1B LTR MaLR 85 378 -12 2 998 3176 53 177 2 chr2 54220602 54221038 -127527049 + RLTR1B LTR ERV1 1 512 0 3 998 2201 126 3 3 chr2 54221436 54221763 -127526324 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 3 998 1564 170 10 10 chr2 54221764 54222055 -127526032 - ORR1A2-int LTR MaLR -1 1962 1672 3 998 7246 156 52 69 chr2 54228323 54229876 -127518211 - ORR1A2-int LTR MaLR -266 1526 1 3 998 1984 115 12 58 chr2 54229876 54230107 -127517980 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 93 3 998 1984 115 12 58 chr2 54230264 54230375 -127517712 - ORR1A2 LTR MaLR -235 92 2 3 998 631 317 85 36 chr2 54233108 54233439 -127514648 + MLT1B LTR MaLR 9 355 -35 3 998 1299 214 51 122 chr2 54249163 54249556 -127498531 + ORR1D1 LTR MaLR 3 367 -7 3 998 2499 71 92 8 chr2 54250051 54250420 -127497667 + MTB LTR MaLR 1 400 0 3 998 541 339 145 56 chr2 54256957 54257460 -127490627 + MLT1E2 LTR MaLR 73 620 -4 3 998 257 352 11 32 chr2 54258950 54259021 -127489066 + LTR16C LTR ERVL 41 111 -378 3 998 257 352 11 32 chr2 54259106 54259128 -127488959 + LTR16C LTR ERVL 112 132 -357 3 998 507 307 162 37 chr2 54261317 54261669 -127486418 + LTR50 LTR ERVL 47 442 -353 3 998 471 262 59 73 chr2 54261676 54261812 -127486275 - MLT1A1 LTR MaLR -7 401 268 3 999 242 236 172 20 chr2 54265762 54266017 -127482070 - RMER17D2 LTR ERVK -303 506 213 3 999 1220 190 57 10 chr2 54265927 54266225 -127481862 - RMER10A LTR ERVL -7 435 124 3 999 537 324 23 5 chr2 54266233 54266453 -127481634 + MMERGLN-int LTR ERV1 5009 5232 -2324 3 999 286 257 0 0 chr2 54268712 54268786 -127479301 + RLTR6-int LTR ERV1 7364 7437 -341 3 999 950 195 16 21 chr2 54268862 54269051 -127479036 + RLTR23 LTR ERV1 241 428 -2 3 999 1994 142 82 29 chr2 54273205 54273583 -127474504 + RMER10B LTR ERVL 1 398 0 3 999 844 217 25 25 chr2 54275244 54275447 -127472640 + RMER17C LTR ERVK 208 410 0 3 999 265 292 0 0 chr2 54279876 54279948 -127468139 - MER52-int LTR ERV1 -3381 3710 3639 3 999 1752 215 16 3 chr2 54284154 54284523 -127463564 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 3 999 1112 225 61 80 chr2 54284625 54285002 -127463085 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 3 999 2269 143 62 5 chr2 54285351 54285724 -127462363 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 3 999 250 245 0 0 chr2 54286857 54286906 -127461181 + MLT1F2 LTR MaLR 51 99 -450 3 999 279 248 17 110 chr2 54286919 54287037 -127461050 + MLT1F2 LTR MaLR 451 557 -3 3 999 1034 168 176 9 chr2 54301929 54302151 -127445936 - ORR1A3 LTR MaLR -67 259 1 4 999 332 241 17 92 chr2 54304702 54304821 -127443266 - MT2B LTR ERVL -344 257 148 4 999 1650 239 67 22 chr2 54306651 54307016 -127441071 + MTC LTR MaLR 1 380 -41 4 999 1508 176 192 9 chr2 54307016 54307349 -127440738 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 4 999 1650 239 67 22 chr2 54307349 54307386 -127440701 + MTC LTR MaLR 381 421 0 4 999 2001 148 6 12 chr2 54309703 54310032 -127438055 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 3 4 999 269 311 0 47 chr2 54316085 54316149 -127431938 - RMER21B LTR ERV1 -113 834 774 4 999 380 240 87 68 chr2 54316229 54316390 -127431697 - RMER21B LTR ERV1 -370 472 309 4 999 1919 219 5 53 chr2 54318573 54319007 -127429080 - MTC LTR MaLR -8 413 1 4 999 2620 123 14 2 chr2 54326103 54326519 -127421568 - BGLII LTR ERVK 0 421 1 4 999 516 256 25 23 chr2 54327867 54328082 -127420005 - RLTR25B LTR ERVK -3 1025 778 4 999 2419 175 129 9 chr2 54328235 54328770 -127419317 - RLTR25B LTR ERVK -292 736 138 4 999 830 258 203 59 chr2 54341308 54341467 -127406620 + MTD LTR MaLR 1 225 -194 4 999 830 258 193 57 chr2 54341722 54341929 -127406158 + MTD LTR MaLR 226 404 -15 4 999 1340 226 24 109 chr2 54343933 54344345 -127403742 - ORR1C1 LTR MaLR -1 377 1 4 999 1417 249 28 56 chr2 54350805 54351101 -127396986 - MTD LTR MaLR -7 412 121 5 999 1417 249 28 56 chr2 54351231 54351291 -127396796 - MTD LTR MaLR -299 120 66 5 999 1613 183 57 30 chr2 54355464 54355797 -127392290 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 37 5 999 400 179 0 0 chr2 54355881 54355948 -127392139 - ORR1C1-int LTR MaLR -1 1369 1303 5 999 573 258 19 19 chr2 54355939 54356101 -127391986 + ORR1B1-int LTR MaLR 421 582 -927 5 999 1717 159 205 3 chr2 54356136 54356483 -127391604 - ORR1C1 LTR MaLR -4 417 1 5 999 2215 213 48 116 chr2 54356483 54356667 -127391420 - ORR1C1-int LTR MaLR 0 1258 1071 5 999 2215 214 46 119 chr2 54356702 54357219 -127390868 - ORR1C1-int LTR MaLR -425 1538 639 5 999 2322 206 55 12 chr2 54357652 54358162 -127389925 - ORR1C1-int LTR MaLR -726 532 1 5 999 1751 185 27 94 chr2 54358162 54358567 -127389520 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 5 999 612 325 51 120 chr2 54358779 54359247 -127388840 - LTR40c LTR ERVL -5 460 25 5 999 1528 232 65 3 chr2 54362179 54362534 -127385553 + MTD LTR MaLR 22 398 -21 5 999 301 288 143 7 chr2 54362881 54363028 -127385059 - MLT1B LTR MaLR -129 261 95 5 999 235 273 0 0 chr2 54363313 54363368 -127384719 - MLT1B LTR MaLR -309 81 27 5 999 425 251 68 135 chr2 54364387 54364668 -127383419 - RMER2 LTR ERV1 -18 549 288 5 999 311 178 26 64 chr2 54364754 54364832 -127383255 - RMER2 LTR ERV1 -464 103 29 5 999 409 250 27 18 chr2 54370646 54370756 -127377331 - MLT1A0 LTR MaLR -2 363 253 5 999 235 284 115 19 chr2 54381608 54381712 -127366375 + MLT1C LTR MaLR 9 122 -345 5 999 2133 267 21 20 chr2 54385285 54385846 -127362241 + RMER15 LTR ERVL 14 575 0 5 1000 1701 176 52 14 chr2 54407300 54407646 -127340441 - ORR1B2 LTR MaLR -8 359 1 5 1000 283 243 52 78 chr2 54408879 54408995 -127339092 - MTEa LTR MaLR -3 376 264 5 1000 1223 281 59 108 chr2 54419917 54420530 -127327557 - RMER19C LTR ERVK 0 611 29 6 1000 253 336 78 35 chr2 54429825 54429967 -127318120 + MLT1E1A LTR MaLR 190 337 -343 6 1000 625 332 28 28 chr2 54430511 54430728 -127317359 - ORR1E LTR MaLR -142 217 1 6 1000 1432 211 116 13 chr2 54431781 54432179 -127315908 - BGLII_B LTR ERVK -2 439 1 6 1000 3849 166 47 1 chr2 54432179 54432926 -127315161 - MYSERV16_I-int LTR ERVK 0 2326 1546 6 1000 1000 294 58 15 chr2 54432926 54433159 -127314928 - BGLII_B LTR ERVK -84 357 119 6 1000 1000 294 58 15 chr2 54433237 54433345 -127314742 - BGLII_B LTR ERVK -323 118 3 6 1000 287 138 34 17 chr2 54433948 54434007 -127314080 - MTE2b LTR MaLR 0 379 320 6 1000 814 302 14 99 chr2 54436750 54436881 -127311206 - MTD LTR MaLR -14 405 296 6 1000 814 302 14 99 chr2 54436993 54437144 -127310943 - MTD LTR MaLR -124 295 147 6 1000 614 222 29 15 chr2 54440618 54440755 -127307332 + ORR1B2 LTR MaLR 1 139 -228 6 1000 253 146 0 0 chr2 54440739 54440780 -127307307 + ORR1B2-int LTR MaLR 1364 1404 -105 6 1000 1767 148 9 78 chr2 54440783 54441128 -127306959 - ORR1A4 LTR MaLR -8 321 1 6 1000 451 183 11 0 chr2 54441129 54441217 -127306870 + ORR1B2-int LTR MaLR 1400 1488 -21 6 1000 1682 204 91 3 chr2 54441217 54441547 -127306540 + ORR1B2 LTR MaLR 1 359 -8 6 1000 667 272 167 19 chr2 54441945 54442215 -127305872 + ORR1D1 LTR MaLR 65 374 0 6 1000 4544 139 137 7 chr2 54455193 54456041 -127292046 - RMER17B LTR ERVK 0 958 1 6 1000 1377 255 117 58 chr2 54456073 54456593 -127291494 - RMER15 LTR ERVL -2 573 23 6 1000 4258 104 13 126 chr2 54459028 54459875 -127288212 - RMER17A LTR ERVK 0 751 1 6 1000 2780 82 26 0 chr2 54460301 54460689 -127287398 + MTB LTR MaLR 1 398 -2 6 1000 258 263 80 50 chr2 54463825 54463925 -127284162 + MLT1B LTR MaLR 286 388 -2 6 1000 2212 209 94 9 chr2 54467774 54468304 -127279783 - RMER15 LTR ERVL 0 575 1 6 1000 978 255 29 12 chr2 54469348 54469594 -127278493 + RMER5 LTR ERV1 17 266 -268 6 1000 757 167 44 44 chr2 54470680 54470867 -127277220 - ORR1B1 LTR MaLR -166 201 3 6 1000 2708 87 50 3 chr2 54472580 54472962 -127275125 + MTB LTR MaLR 1 400 0 6 1000 5143 176 84 16 chr2 54472962 54474027 -127274060 + MTB-int LTR MaLR 3 1139 -119 6 1000 378 136 0 0 chr2 54481063 54481129 -127266958 + MTB-int LTR MaLR 1033 1098 0 6 1000 2490 120 13 15 chr2 54481132 54481530 -127266557 + MTB LTR MaLR 4 400 0 6 1000 1191 197 25 17 chr2 54485132 54485370 -127262717 - ORR1B1 LTR MaLR -148 246 7 6 1000 342 302 9 0 chr2 54494173 54494279 -127253808 + MLT1A LTR MaLR 268 374 0 7 1000 227 345 83 57 chr2 54498049 54498206 -127249881 - MER76 LTR ERVL -517 174 14 7 1000 1397 262 2 77 chr2 54510932 54511387 -127236700 - MTC LTR MaLR 0 421 1 1 1001 1740 167 14 58 chr2 54526670 54527014 -127221073 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 3 1001 2386 107 99 0 chr2 54532122 54532486 -127215601 + MTB LTR MaLR 1 400 0 3 1001 2471 169 64 88 chr2 54533052 54533377 -127214710 - RMER6C LTR ERVK 0 690 399 4 1001 2471 169 64 88 chr2 54533405 54533492 -127214595 - RMER6C LTR ERVK -292 398 326 4 1001 2471 169 64 88 chr2 54533564 54533857 -127214230 - RMER6C LTR ERVK -365 325 1 4 1001 1837 113 13 66 chr2 54538418 54538720 -127209367 + ORR1A2 LTR MaLR 1 286 -41 5 1001 299 149 0 0 chr2 54540333 54540380 -127207707 + ORR1A2 LTR MaLR 274 320 -6 5 1001 3428 181 49 16 chr2 54546225 54546855 -127201232 - RMER19A LTR ERVK -86 651 1 6 1001 848 355 27 35 chr2 54547103 54547474 -127200613 - MTE2b LTR MaLR -8 371 4 6 1001 436 280 20 4 chr2 54547936 54548086 -127200001 - ORR1D-int LTR MaLR -2 1368 1248 6 1001 1301 260 35 43 chr2 54552832 54553206 -127194881 + ORR1C2 LTR MaLR 3 373 -11 7 1001 1878 274 16 10 chr2 54553209 54553714 -127194373 + ORR1C2-int LTR MaLR 1 508 -862 7 1001 475 270 28 29 chr2 54561703 54561878 -127186209 - MLT1A LTR MaLR 0 390 221 8 1001 1286 234 104 29 chr2 54566973 54567320 -127180767 - ORR1C2 LTR MaLR -11 373 1 9 1001 486 333 70 51 chr2 54592668 54593041 -127155046 + MER34A LTR ERV1 6 385 -186 1 1001 290 417 71 9 chr2 54617859 54618084 -127130003 + LTR16A LTR ERVL 39 277 -174 1 1001 442 306 206 8 chr2 54618265 54618512 -127129575 + MLT2D LTR ERVL 5 300 -114 1 1001 1181 206 212 8 chr2 54621291 54621654 -127126433 - RMER6C LTR ERVK 0 690 254 1 1001 1008 247 36 31 chr2 54633772 54634040 -127114047 - RMER19B LTR ERVK -2 900 418 1 1001 809 290 142 26 chr2 54640279 54640623 -127107464 + MTD LTR MaLR 36 419 0 1 1001 3569 54 25 62 chr2 54647168 54647680 -127100407 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 1 1001 3420 20 5 0 chr2 54656135 54656529 -127091558 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 1002 3373 23 18 0 chr2 54661149 54661538 -127086549 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 1002 387 276 20 10 chr2 54666099 54666198 -127081889 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 285 2 1002 341 320 113 28 chr2 54668594 54668799 -127079288 + MTD LTR MaLR 3 218 -201 2 1002 737 263 139 62 chr2 54668823 54668865 -127079222 - MT2B LTR ERVL 0 601 560 2 1002 737 263 139 62 chr2 54669033 54669314 -127078773 - MT2B LTR ERVL -42 559 253 2 1002 1466 237 133 106 chr2 54669335 54669796 -127078291 - RMER6C LTR ERVK 0 720 399 2 1002 2768 40 0 3 chr2 54669796 54670124 -127077963 + IAPLTR2b LTR ERVK 1 327 0 2 1002 1466 229 174 89 chr2 54670124 54670492 -127077595 - RMER6C LTR ERVK -251 439 1 2 1002 353 272 74 74 chr2 54671627 54671762 -127076325 - MERVL_2A-int LTR ERVL -801 4960 4826 2 1002 1329 230 81 96 chr2 54672456 54672529 -127075558 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 459 2 1002 1329 230 81 96 chr2 54672596 54673052 -127075035 - RLTR11A LTR ERVK -70 458 8 2 1002 3340 197 118 62 chr2 54673466 54674294 -127073793 + RMER19B LTR ERVK 1 875 -27 2 1002 268 277 80 116 chr2 54677240 54677567 -127070520 - RMER10A LTR ERVL -26 416 102 2 1002 1498 235 96 28 chr2 54677759 54678228 -127069859 + RLTR40 LTR ERVK 1 501 -316 2 1002 273 324 61 56 chr2 54678236 54678432 -127069655 + RLTR40 LTR ERVK 617 813 -4 2 1002 1271 227 88 59 chr2 54679513 54679920 -127068167 + MTD LTR MaLR 1 419 0 2 1002 7088 29 0 4 chr2 54701736 54702559 -127045528 + RLTR13B2 LTR ERVK 1 820 -2 2 1002 1106 287 13 96 chr2 54713383 54713780 -127034307 - MTE2a LTR MaLR -14 365 2 2 1002 3685 123 73 45 chr2 54727280 54728023 -127020064 - RMER17A LTR ERVK 0 751 3 3 1002 1550 134 92 70 chr2 54729161 54729475 -127018612 - ORR1A4 LTR MaLR -8 321 1 3 1002 1108 268 17 7 chr2 54751596 54751885 -126996202 - RMER4A LTR ERVK -174 292 1 3 1002 7831 158 29 82 chr2 54763346 54764442 -126983645 + RLTR21 LTR ERVK 1 1089 -483 3 1002 7831 158 29 82 chr2 54764497 54764764 -126983323 + RLTR21 LTR ERVK 1090 1288 -284 3 1002 7831 158 29 82 chr2 54764803 54765070 -126983017 + RLTR21 LTR ERVK 1289 1546 -26 3 1002 13749 73 21 1 chr2 54777188 54778973 -126969114 + IAPEY3-int LTR ERVK 1466 3285 -4395 3 1002 3602 104 17 27 chr2 54778975 54779704 -126968383 + IAPEY3-int LTR ERVK 6908 7581 0 3 1002 2659 46 15 6 chr2 54779704 54780033 -126968054 + IAPEY3_LTR LTR ERVK 1 332 0 3 1002 445 353 56 59 chr2 54780694 54781034 -126967053 + MLT1A0 LTR MaLR 17 355 -10 3 1002 964 160 101 32 chr2 54782411 54782630 -126965457 + RLTR15 LTR ERVK 126 359 0 3 1002 1889 209 46 18 chr2 54782964 54783353 -126964734 - MTB_Mm LTR MaLR -7 400 1 3 1002 1199 186 142 80 chr2 54784195 54784533 -126963554 - ORR1B2 LTR MaLR -8 359 1 3 1002 287 317 136 35 chr2 54787454 54787647 -126960440 - LTR48B LTR ERV1 -34 753 445 3 1003 634 267 91 73 chr2 54788747 54789022 -126959065 + MTE2a LTR MaLR 96 375 -4 3 1003 460 197 137 44 chr2 54789417 54789622 -126958465 - RLTR25B LTR ERVK 0 1103 742 3 1003 2727 182 93 197 chr2 54789836 54790781 -126957306 - RLTR25A LTR ERVK -256 847 1 3 1003 1397 231 82 15 chr2 54803066 54803396 -126944691 + ORR1C2 LTR MaLR 1 352 -32 4 1003 277 163 0 0 chr2 54803467 54803510 -126944577 - ORR1C2 LTR MaLR -5 379 337 4 1003 2432 98 11 43 chr2 54821987 54822358 -126925729 - RLTR10D LTR ERVK 0 359 1 4 1003 740 258 34 72 chr2 54833212 54833421 -126914666 + MTD LTR MaLR 1 201 -218 4 1003 667 301 184 9 chr2 54834117 54834432 -126913655 - MTEb LTR MaLR -9 370 1 4 1003 930 322 13 22 chr2 54838915 54839100 -126908987 - MTE2a LTR MaLR -6 373 191 4 1003 930 325 35 43 chr2 54839126 54839350 -126908737 - MTE2a LTR MaLR -205 214 7 4 1003 3382 196 16 11 chr2 54839456 54840096 -126907991 + RLTR25A LTR ERVK 28 670 -433 4 1003 682 220 44 6 chr2 54843071 54843231 -126904856 + RLTR25B LTR ERVK 616 781 -247 4 1003 610 206 36 7 chr2 54843218 54843355 -126904732 + RLTR25B LTR ERVK 888 1028 0 4 1003 981 271 182 33 chr2 54847545 54847875 -126900212 - MTE2a LTR MaLR 0 379 1 4 1003 263 291 6 73 chr2 54851918 54852096 -126895991 - ORR1B1-int LTR MaLR -755 754 589 4 1003 1094 179 17 64 chr2 54852937 54853003 -126895084 + ERVL-int LTR ERVL 2684 2748 -3013 4 1003 1094 179 17 64 chr2 54853179 54853345 -126894742 + ERVL-int LTR ERVL 2749 2905 -2856 4 1003 1656 169 33 18 chr2 54853345 54853677 -126894410 - RMER17A2 LTR ERVK 0 906 570 4 1003 2392 139 182 32 chr2 54854363 54854869 -126893218 - RMER17A2 LTR ERVK -324 582 1 4 1003 4336 260 70 10 chr2 54854871 54855968 -126892119 + ERVL-int LTR ERVL 2839 4001 -1756 4 1003 692 232 105 5 chr2 54855960 54856151 -126891936 + ERVL-int LTR ERVL 4946 5155 -606 4 1003 235 158 0 0 chr2 54856158 54856196 -126891891 + MT2A LTR ERVL 13 50 -483 4 1003 229 267 100 0 chr2 54856251 54856311 -126891776 + MT2A LTR ERVL 64 129 -404 4 1003 277 247 33 100 chr2 54856303 54856393 -126891694 + MT2B LTR ERVL 50 133 -468 4 1003 1301 260 35 43 chr2 54861552 54861926 -126886161 + ORR1C2 LTR MaLR 3 373 -11 4 1003 1878 274 16 10 chr2 54861929 54862434 -126885653 + ORR1C2-int LTR MaLR 1 508 -862 4 1003 475 270 28 29 chr2 54870423 54870598 -126877489 - MLT1A LTR MaLR 0 390 221 5 1003 1313 234 104 26 chr2 54875690 54876036 -126872051 - ORR1C2 LTR MaLR -11 373 1 5 1003 4804 188 85 24 chr2 54891645 54892254 -126855833 + RMER12 LTR ERVK 1 612 -710 5 1003 4804 188 85 24 chr2 54893065 54893395 -126854692 + RMER12 LTR ERVK 613 1013 -309 5 1003 4804 188 85 24 chr2 54893441 54893578 -126854509 + RMER12 LTR ERVK 1014 1144 -178 5 1003 300 257 40 0 chr2 54893615 54893689 -126854398 + RLTR21 LTR ERVK 1341 1417 -155 5 1003 239 194 247 0 chr2 54898421 54898514 -126849573 + MTB_Mm LTR MaLR 238 353 -54 5 1003 864 249 255 82 chr2 54899169 54899211 -126848876 - MT2A LTR ERVL 0 533 492 5 1003 864 249 255 82 chr2 54899302 54899710 -126848377 - MT2A LTR ERVL -42 491 5 5 1003 1232 166 22 13 chr2 54902511 54902743 -126845344 - ORR1A2 LTR MaLR -139 239 1 5 1003 229 254 100 154 chr2 54903329 54903459 -126844628 - MTEb LTR MaLR -205 174 52 5 1003 1552 225 75 49 chr2 54906168 54906680 -126841407 - RMER19B LTR ERVK -3 899 138 5 1003 2388 187 45 75 chr2 54907748 54907832 -126840255 + RMER15 LTR ERVL 42 126 -449 5 1003 2388 187 45 75 chr2 54907892 54908357 -126839730 + RMER15 LTR ERVL 127 575 0 5 1004 389 309 104 74 chr2 54920201 54920529 -126827558 + MTEa LTR MaLR 11 379 0 5 1004 471 346 109 27 chr2 54934764 54935058 -126813029 - MLT1A0 LTR MaLR -37 328 11 5 1004 898 226 36 20 chr2 54938163 54938490 -126809597 + RMER19B LTR ERVK 3 274 -628 5 1004 432 231 26 44 chr2 54938479 54938592 -126809495 + MTD LTR MaLR 277 387 -32 5 1004 1072 192 127 16 chr2 54938914 54939158 -126808929 - ORR1C1 LTR MaLR -8 370 100 5 1004 243 336 79 9 chr2 54940653 54940767 -126807320 - MLT1E LTR MaLR -512 141 20 5 1004 314 312 73 28 chr2 54943242 54943420 -126804667 + RMER15 LTR ERVL 372 557 -18 6 1004 301 320 79 44 chr2 54943714 54943917 -126804170 - RMER15 LTR ERVL -13 562 353 6 1004 240 286 71 12 chr2 54944230 54944315 -126803772 - MLT1C LTR MaLR -271 196 107 6 1004 1695 230 41 110 chr2 54945632 54945930 -126802157 - RLTR31_Mm LTR ERVK 0 584 315 6 1004 1695 159 77 51 chr2 54946111 54946443 -126801644 - RLTR31_Mm LTR ERVK -207 354 9 6 1004 1523 238 147 92 chr2 54961843 54962422 -126785665 - RMER19C LTR ERVK 0 611 1 6 1004 278 253 0 39 chr2 54972438 54972516 -126775571 - MLT1A1 LTR MaLR -3 405 331 6 1004 246 338 66 44 chr2 54972662 54972798 -126775289 - MLT1A1 LTR MaLR -264 144 6 6 1004 3010 136 45 52 chr2 54979071 54979936 -126768151 - RLTR13D5 LTR ERVK 0 1023 1 6 1004 340 350 112 65 chr2 54983999 54984259 -126763828 + RMER15 LTR ERVL 188 459 -116 6 1004 271 338 67 29 chr2 54984683 54984893 -126763194 + ERVL-E-int LTR ERVL 4373 4590 -1077 6 1004 1104 167 19 86 chr2 54989213 54989469 -126758618 - ORR1B2 LTR MaLR -153 241 3 6 1004 1401 214 7 31 chr2 54991259 54991548 -126756539 - ORR1B2-int LTR MaLR -1227 282 1 6 1004 1135 168 21 5 chr2 54991552 54991743 -126756344 - ORR1B2 LTR MaLR -8 359 166 6 1004 2312 136 23 53 chr2 54991746 54992181 -126755906 + RMER6B LTR ERVK 40 461 0 6 1004 481 231 28 0 chr2 54992185 54992293 -126755794 - ORR1B2 LTR MaLR -256 111 1 6 1004 449 317 83 53 chr2 54996781 54997081 -126751006 - RMER15 LTR ERVL -16 559 251 6 1004 378 323 20 42 chr2 55002084 55002307 -126745780 - MTD LTR MaLR 0 419 166 5 1004 665 291 157 36 chr2 55005970 55006333 -126741754 + MTD LTR MaLR 1 407 -12 1 1004 294 314 131 8 chr2 55008052 55008174 -126739913 - MER67D LTR ERV1 -453 258 122 1 1004 335 288 44 18 chr2 55014216 55014329 -126733758 - MER67D LTR ERV1 -393 121 6 1 1004 742 335 32 44 chr2 55014465 55014864 -126733223 + MTE2a LTR MaLR 1 405 -14 1 1004 286 375 99 61 chr2 55015357 55015499 -126732588 + MLT1L LTR MaLR 164 315 -295 1 1004 2003 140 15 56 chr2 55015499 55015839 -126732248 + ORR1A3 LTR MaLR 1 326 0 1 1004 286 375 99 61 chr2 55015839 55016008 -126732079 + MLT1L LTR MaLR 316 487 -123 1 1004 2937 71 15 27 chr2 55022227 55022632 -126725455 + MTB LTR MaLR 1 400 0 3 1004 7451 91 5 70 chr2 55022632 55023806 -126724281 + MTB-int LTR MaLR 1 1098 0 3 1004 2934 91 15 0 chr2 55023806 55024200 -126723887 + MTB LTR MaLR 1 400 0 3 1004 482 204 11 0 chr2 55026855 55026943 -126721144 - ORR1C1 LTR MaLR -120 258 170 3 1004 533 256 324 0 chr2 55026950 55027303 -126720784 - ORR1C1-int LTR MaLR -902 468 1 3 1004 1536 210 70 56 chr2 55027303 55027676 -126720411 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 3 1004 1009 309 116 51 chr2 55028679 55029238 -126718849 - RLTR40 LTR ERVK -40 777 190 3 1004 1009 309 116 51 chr2 55029282 55029370 -126718717 - RLTR40 LTR ERVK -628 189 90 3 1004 340 289 62 67 chr2 55029565 55029758 -126718329 + RMER15 LTR ERVL 372 563 -12 4 1004 1718 185 26 62 chr2 55031434 55031820 -126716267 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 7 4 1004 469 272 161 44 chr2 55031870 55032091 -126715996 + MT2A LTR ERVL 1 267 -208 4 1004 469 246 0 34 chr2 55032809 55032858 -126715229 + MT2A LTR ERVL 159 207 -326 4 1004 1909 188 87 57 chr2 55038173 55038714 -126709373 - RLTR31B_Mm LTR ERVK 0 557 1 5 1005 1055 157 0 6 chr2 55057044 55057217 -126690870 - ORR1A2 LTR MaLR -155 172 1 7 1005 2032 167 20 18 chr2 55058914 55059499 -126688588 + RLTR33 LTR ERVK 1 670 -8 7 1005 3397 190 47 10 chr2 55059525 55059861 -126688226 + RMER6D LTR ERVK 19 368 -352 7 1005 3397 190 47 10 chr2 55059919 55060011 -126688076 + RMER6D LTR ERVK 369 465 -255 7 1005 3397 190 47 10 chr2 55060075 55060322 -126687765 + RMER6D LTR ERVK 466 719 -1 7 1005 547 302 217 44 chr2 55062351 55062715 -126685372 + RLTR28B LTR ERVL 17 443 -38 8 1005 2454 141 9 76 chr2 55063613 55064073 -126684014 - RLTR23 LTR ERV1 -1 429 1 8 1005 1609 187 7 96 chr2 55064453 55064890 -126683197 - RMER10B LTR ERVL 0 398 1 9 1005 984 140 96 0 chr2 55069100 55069257 -126678830 + ORR1A3 LTR MaLR 153 324 -2 9 1005 716 233 61 25 chr2 55069771 55069969 -126678118 + ORR1B2 LTR MaLR 1 205 -173 9 1005 723 201 7 20 chr2 55069968 55070120 -126677967 + ORR1B2-int LTR MaLR 353 502 -1007 9 1005 742 197 43 1 chr2 55070678 55070840 -126677247 + ORR1B2 LTR MaLR 219 394 0 9 1005 1744 196 133 0 chr2 55070841 55071239 -126676848 + ORR1B2-int LTR MaLR 2 452 -1057 9 1005 1664 168 95 124 chr2 55074363 55074824 -126673263 - RMER16 LTR ERVK -85 448 1 1 1005 3786 99 4 13 chr2 55074824 55074865 -126673222 - RMER16-int LTR ERVK 0 5406 5372 1 1005 6685 41 24 0 chr2 55074865 55075668 -126672419 + RLTR13B2 LTR ERVK 1 822 0 1 1005 3786 99 4 13 chr2 55075668 55076148 -126671939 - RMER16-int LTR ERVK -35 5371 4890 1 1005 1856 257 147 37 chr2 55076695 55077377 -126670710 + RMER13A LTR ERVK 104 860 0 1 1005 1171 223 49 49 chr2 55082952 55083240 -126664847 + ORR1B2 LTR MaLR 80 367 0 1 1005 1358 185 86 41 chr2 55086559 55087082 -126661005 + ORR1B1 LTR MaLR 8 386 -8 1 1005 4607 134 48 29 chr2 55087092 55087981 -126660106 + RMER17A2 LTR ERVK 1 906 0 1 1005 9365 202 35 15 chr2 55087981 55089895 -126658192 - MERVL_2A-int LTR ERVL -281 5480 3528 1 1005 10969 200 45 29 chr2 55090884 55093266 -126654821 - MERVL_2A-int LTR ERVL -2227 3534 1114 1 1005 612 266 35 17 chr2 55093445 55093617 -126654470 - MERVL_2A-int LTR ERVL -4683 1078 904 1 1005 5406 243 48 50 chr2 55093615 55095267 -126652820 - MYSERV6-int LTR ERVK -6532 2427 779 1 1005 946 283 72 18 chr2 55096601 55096932 -126651155 - MYSERV6-int LTR ERVK -6027 523 175 1 1005 932 231 48 33 chr2 55096946 55097219 -126650868 - MYSERV6-int LTR ERVK -8562 397 121 1 1005 262 260 111 59 chr2 55098513 55098648 -126649439 - RLTR15 LTR ERVK -114 245 104 1 1005 398 278 97 43 chr2 55098647 55098854 -126649233 - RLTR12B LTR ERVK -310 218 1 1 1005 2480 212 132 14 chr2 55099646 55100305 -126647782 + RMER19A LTR ERVK 1 737 0 1 1005 332 371 28 0 chr2 55101918 55102061 -126646026 + ORR1E LTR MaLR 3 149 -210 1 1005 469 264 97 9 chr2 55102175 55102382 -126645705 + ORR1B1 LTR MaLR 1 227 -157 1 1005 1506 214 34 101 chr2 55102776 55103271 -126644816 + RMER6C LTR ERVK 229 690 0 1 1005 479 363 100 40 chr2 55103911 55104310 -126643777 + MER74A LTR ERVL 1 423 -135 1 1005 253 230 93 13 chr2 55104583 55104658 -126643429 + RMER6C LTR ERVK 418 498 -192 1 1005 1859 203 86 39 chr2 55105863 55106467 -126641620 - RMER6A LTR ERVK -90 666 34 1 1005 980 216 56 16 chr2 55113306 55113555 -126634532 + RLTR11A2 LTR ERVK 99 357 -170 1 1005 565 196 185 25 chr2 55116368 55116525 -126631562 + ORR1D1 LTR MaLR 1 182 -192 1 1005 494 255 79 0 chr2 55116611 55116757 -126631330 + ORR1D1 LTR MaLR 147 315 -55 1 1005 1964 249 98 63 chr2 55116886 55117648 -126630439 - RLTR40 LTR ERVK -10 807 19 1 1005 996 253 159 27 chr2 55117836 55117848 -126630239 + MTD LTR MaLR 1 13 -406 1 1005 2055 104 32 68 chr2 55117848 55118187 -126629900 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 1 1005 996 253 159 27 chr2 55118187 55118544 -126629543 + MTD LTR MaLR 14 419 0 1 1005 1974 206 40 25 chr2 55140378 55140781 -126607306 + MTC LTR MaLR 5 413 -8 2 1005 3004 132 4 35 chr2 55146346 55146834 -126601253 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 3 2 1005 249 389 0 21 chr2 55153388 55153437 -126594650 - MLT2B5 LTR ERVL -200 355 308 2 1005 1512 234 16 19 chr2 55153437 55153808 -126594279 - ORR1D1 LTR MaLR -4 370 1 2 1005 249 389 0 21 chr2 55153808 55153855 -126594232 - MLT2B5 LTR ERVL -248 307 261 2 1005 1731 195 125 95 chr2 55153992 55154313 -126593774 + RMER6C LTR ERVK 5 342 -348 2 1005 1731 212 124 93 chr2 55154376 55154774 -126593313 + RMER6C LTR ERVK 329 713 -43 2 1005 650 202 108 8 chr2 55154752 55154882 -126593205 + RMER6D LTR ERVK 574 716 -4 2 1005 602 336 78 54 chr2 55157622 55157922 -126590165 + LTR16C LTR ERVL 92 400 -89 2 1005 602 336 78 54 chr2 55158115 55158185 -126589902 + LTR16C LTR ERVL 401 471 -18 2 1005 237 406 22 22 chr2 55169067 55169203 -126578884 - LTR90B LTR LTR -520 276 141 2 1005 1769 223 156 16 chr2 55169419 55169925 -126578162 + RLTR20B3 LTR ERVK 1 577 0 2 1005 2917 86 0 8 chr2 55180684 55181081 -126567006 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 3 2 1006 282 327 9 114 chr2 55191970 55192084 -126556003 + MLT1E2 LTR MaLR 86 187 -362 2 1006 311 393 57 34 chr2 55192127 55192480 -126555607 + MLT1E2 LTR MaLR 250 610 -17 2 1006 1094 85 13 0 chr2 55196031 55196184 -126551903 - MTB LTR MaLR -54 346 192 2 1006 6124 75 4 18 chr2 55206746 55207566 -126540521 + RLTR13C2 LTR ERVK 1 808 0 2 1006 1476 176 89 18 chr2 55217783 55218166 -126529921 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 2 1006 228 228 17 17 chr2 55219360 55219418 -126528669 + RLTR25B LTR ERVK 756 813 -215 2 1006 586 232 31 49 chr2 55219439 55219602 -126528485 + RLTR25B LTR ERVK 869 1028 0 2 1006 274 257 65 56 chr2 55234535 55234642 -126513445 - MTD LTR MaLR -300 119 12 3 1006 2628 226 14 11 chr2 55235200 55235755 -126512332 - RLTR20B2 LTR ERVK 0 560 4 3 1006 10638 174 45 29 chr2 55235756 55236964 -126511123 - MYSERV16_I-int LTR ERVK 0 2326 1079 3 1006 10638 177 44 30 chr2 55237159 55238264 -126509823 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -1485 1357 1 3 1006 1835 204 35 64 chr2 55240732 55241187 -126506900 - RLTR20B2 LTR ERVK -118 442 1 3 1006 2593 184 66 8 chr2 55242817 55243305 -126504782 - RMER20A LTR ERVK 0 516 1 3 1006 465 316 62 41 chr2 55243305 55243544 -126504543 + MLT1B LTR MaLR 147 390 0 3 1006 598 306 111 67 chr2 55245923 55246221 -126501866 + RLTR14 LTR ERV1 18 328 -54 3 1006 2892 232 53 73 chr2 55260478 55261315 -126486772 - RMER13B LTR ERVK 0 908 5 3 1006 1559 197 20 7 chr2 55262093 55262395 -126485692 + ORR1B1 LTR MaLR 89 394 0 3 1006 1192 263 88 23 chr2 55263625 55264005 -126484082 + MTD LTR MaLR 13 401 -18 3 1006 3300 163 5 28 chr2 55268339 55268634 -126479453 + RMER4B LTR ERVK 1 284 -301 3 1006 2312 206 33 6 chr2 55268634 55269143 -126478944 - RLTR11A2 LTR ERVK -4 523 1 3 1006 3300 163 5 28 chr2 55269143 55269446 -126478641 + RMER4B LTR ERVK 285 585 0 3 1006 421 259 53 15 chr2 55270058 55270191 -126477896 - MER34 LTR ERV1 -24 518 381 3 1006 1893 226 5 0 chr2 55270870 55271246 -126476841 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 3 1006 228 359 82 121 chr2 55273800 55274082 -126474005 - LTR88b LTR Gypsy? -499 338 68 3 1006 1012 280 136 26 chr2 55274661 55275050 -126473037 - RMER15 LTR ERVL -117 458 27 3 1006 237 237 17 0 chr2 55275073 55275132 -126472955 - RMER15 LTR ERVL -515 60 1 3 1006 573 338 33 86 chr2 55282443 55282780 -126465307 - MTE2b LTR MaLR -7 372 54 3 1006 2017 191 24 58 chr2 55305228 55305695 -126442392 - RLTR31A_Mm LTR ERVK -133 451 1 4 1006 716 236 156 14 chr2 55305695 55305900 -126442187 + MTD LTR MaLR 165 399 -20 4 1006 2720 192 54 62 chr2 55308244 55308860 -126439227 - RMER19C LTR ERVK 0 611 1 4 1007 1121 209 207 37 chr2 55320828 55321003 -126427084 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 174 4 1007 1121 209 207 37 chr2 55321074 55321226 -126426861 - ORR1C2 LTR MaLR -211 173 3 4 1007 273 265 19 48 chr2 55324426 55324529 -126423558 - MLT1A LTR MaLR 0 374 275 4 1007 372 312 55 90 chr2 55340180 55340490 -126407597 - MLT1B LTR MaLR -2 388 90 4 1007 259 337 107 89 chr2 55354530 55354979 -126393108 + RLTR40 LTR ERVK 75 531 -286 4 1007 887 183 30 146 chr2 55355728 55356092 -126391995 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 4 1007 752 315 57 21 chr2 55357715 55358049 -126390038 + MLT1A0 LTR MaLR 20 365 0 4 1007 2197 128 3 32 chr2 55359056 55359426 -126388661 - RMER17A2 LTR ERVK -547 359 1 4 1007 553 156 33 0 chr2 55359434 55359524 -126388563 - RMER6C LTR ERVK -597 93 1 4 1007 329 346 68 21 chr2 55372203 55372395 -126375692 + MLT1D LTR MaLR 249 449 -56 5 1007 330 295 98 0 chr2 55398898 55399010 -126349077 - LTR40b LTR ERVL -25 437 315 5 1007 288 203 0 92 chr2 55402493 55402569 -126345518 + RMER15 LTR ERVL 51 119 -456 5 1007 700 327 16 20 chr2 55402585 55402838 -126345249 + RMER15 LTR ERVL 219 470 -105 5 1007 1810 156 26 0 chr2 55413383 55413685 -126334402 + RMER13B LTR ERVK 96 405 -503 5 1007 1705 184 29 3 chr2 55416121 55416431 -126331656 - ORR1A3 LTR MaLR -8 318 1 5 1007 1076 220 59 25 chr2 55420160 55420507 -126327580 - RMER6D LTR ERVK -99 621 1 5 1007 1677 147 119 7 chr2 55429447 55429847 -126318240 + MT2B2 LTR ERVL 1 584 0 6 1008 868 243 154 12 chr2 55452500 55452659 -126295428 - ORR1D1 LTR MaLR -1 373 177 6 1008 868 243 154 12 chr2 55452681 55452846 -126295241 - ORR1D1 LTR MaLR -198 176 4 6 1008 4381 256 82 8 chr2 55452848 55454124 -126293963 - ORR1D1-int LTR MaLR 0 1370 1 6 1008 5095 218 61 39 chr2 55454126 55455077 -126293010 - RMER12 LTR ERVK -2 1320 335 6 1008 5095 218 61 39 chr2 55455232 55455342 -126292745 - RMER12 LTR ERVK -988 334 229 6 1008 2061 118 57 11 chr2 55455342 55455553 -126292534 + RLTR9A LTR ERVK 1 226 -142 6 1008 2061 118 57 11 chr2 55455611 55455751 -126292336 + RLTR9A LTR ERVK 227 367 -1 6 1008 5095 218 61 39 chr2 55455751 55455979 -126292108 - RMER12 LTR ERVK -1094 228 3 6 1008 496 278 100 13 chr2 55455987 55456212 -126291875 - ORR1D1 LTR MaLR -2 372 113 6 1008 259 311 120 24 chr2 55456242 55456286 -126291801 - ORR1D1 LTR MaLR -272 112 59 6 1008 381 331 16 0 chr2 55456477 55456601 -126291486 - ORR1D1 LTR MaLR -248 126 1 6 1008 2015 165 29 73 chr2 55467268 55467680 -126280407 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 6 1008 2314 148 185 65 chr2 55491086 55491702 -126256385 - RMER6C LTR ERVK 0 690 1 6 1008 1046 261 110 18 chr2 55495904 55496240 -126251847 + ORR1D2 LTR MaLR 1 367 -3 6 1008 249 357 6 60 chr2 55496689 55496766 -126251321 + MER90a LTR ERV1 425 502 -112 6 1008 1614 190 132 0 chr2 55496766 55497114 -126250973 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 6 1008 249 357 6 60 chr2 55497114 55497203 -126250884 + MER90a LTR ERV1 503 581 -33 6 1008 2921 98 2 12 chr2 55497364 55497768 -126250319 + MTB LTR MaLR 1 400 0 6 1008 544 345 78 58 chr2 55499586 55499946 -126248141 - MTEa LTR MaLR -10 369 3 6 1008 335 298 37 37 chr2 55500161 55500269 -126247818 + MLT1A0 LTR MaLR 234 341 -24 1 1008 2006 184 151 15 chr2 55502975 55503444 -126244643 - RLTR25B LTR ERVK -175 853 321 3 1008 408 183 36 12 chr2 55503599 55503682 -126244405 + RMER4B LTR ERVK 367 451 -134 4 1008 1463 193 91 57 chr2 55520595 55521013 -126227074 + RMER6C LTR ERVK 1 432 -258 2 1008 1385 168 95 17 chr2 55521199 55521495 -126226592 + RMER6C LTR ERVK 343 661 -29 2 1008 385 331 137 39 chr2 55531857 55532222 -126215865 - MLT1E2 LTR MaLR -5 675 210 4 1008 292 348 43 0 chr2 55532280 55532395 -126215692 - MTD LTR MaLR -263 156 37 4 1008 968 281 80 25 chr2 55543948 55544419 -126203668 + RMER20A LTR ERVK 5 509 -7 6 1008 389 246 37 49 chr2 55548786 55548915 -126199172 - RLTR25A LTR ERVK -70 1033 813 7 1008 389 241 38 50 chr2 55550144 55550273 -126197814 - RLTR25A LTR ERVK -70 1033 813 7 1008 2057 100 11 70 chr2 55551729 55552085 -126196002 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 335 -2 7 1008 2422 219 11 32 chr2 55560229 55560762 -126187325 + RLTR12B LTR ERVK 5 526 -2 9 1008 2616 192 62 64 chr2 55563503 55564192 -126183895 - RMER6C LTR ERVK 0 690 3 9 1008 423 274 49 54 chr2 55566903 55567088 -126180999 + RLTR23 LTR ERV1 247 430 0 1 1008 613 172 0 25 chr2 55569781 55569900 -126178187 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -2210 116 1 1 1008 613 285 82 120 chr2 55572015 55572309 -126175778 + ORR1D1 LTR MaLR 48 316 -62 1 1009 634 283 145 35 chr2 55575912 55576230 -126171857 - ORR1E LTR MaLR -6 353 1 1 1009 232 420 36 21 chr2 55576959 55577151 -126170936 - MLT1J-int LTR MaLR -1140 247 53 1 1009 1799 194 3 11 chr2 55577259 55577548 -126170539 + ORR1A1 LTR MaLR 1 289 -57 1 1009 1799 194 3 11 chr2 55577960 55578019 -126170068 + ORR1A1 LTR MaLR 290 346 0 1 1009 2625 46 174 0 chr2 55579177 55579527 -126168560 + IAPLTR2a LTR ERVK 1 411 0 1 1009 278 362 26 26 chr2 55584489 55584642 -126163445 - LTR78 LTR ERV1 -120 1184 1032 1 1009 2892 188 20 75 chr2 55584758 55585488 -126162599 + RMER6C LTR ERVK 1 690 0 1 1009 1667 235 61 2 chr2 55596887 55597283 -126150804 - MTD LTR MaLR 0 419 1 1 1009 1493 219 121 18 chr2 55599081 55599471 -126148616 - RLTR11A LTR ERVK -98 430 1 1 1009 323 313 68 15 chr2 55604758 55604891 -126143196 - RMER12B LTR ERVK -585 819 680 1 1009 279 217 95 12 chr2 55604904 55604988 -126143099 - RMER12B LTR ERVK -788 534 444 1 1009 431 281 86 21 chr2 55610887 55611168 -126136919 + RLTR15 LTR ERVK 38 332 -27 1 1009 3522 38 5 0 chr2 55611422 55611816 -126136271 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1009 843 93 12 141 chr2 55615198 55615361 -126132726 + MTA_Mm LTR MaLR 255 396 0 1 1009 1135 178 81 31 chr2 55615452 55615713 -126132374 + RMER6C LTR ERVK 331 604 -86 1 1009 1946 265 65 34 chr2 55623676 55624441 -126123646 - RLTR40 LTR ERVK -28 789 1 1 1009 2935 75 29 52 chr2 55632203 55632624 -126115463 + RLTR10A LTR ERVK 1 411 0 1 1009 5031 85 17 24 chr2 55632624 55633320 -126114767 + RLTR10-int LTR ERVK 302 992 -995 1 1009 447 318 40 40 chr2 55633370 55633740 -126114347 + RLTR10-int LTR ERVK 1197 1566 -6015 1 1009 359 158 0 0 chr2 55633757 55633814 -126114273 + IAP-d-int LTR ERVK 447 503 -6039 1 1009 3615 67 82 12 chr2 55633814 55634301 -126113786 + IAP-d-int LTR ERVK 5007 5527 -1015 1 1009 1993 123 257 35 chr2 55634345 55634801 -126113286 - RLTR6_Mm LTR ERV1 -61 593 37 1 1009 263 224 209 0 chr2 55634841 55634908 -126113179 - RLTR6_Mm LTR ERV1 -573 81 1 1 1009 62172 38 13 0 chr2 55634908 55642476 -126105611 - RLTR6-int LTR ERV1 0 7778 1 1 1009 2012 127 251 34 chr2 55642477 55642943 -126105144 - RLTR6_Mm LTR ERV1 -51 603 37 1 1009 282 209 209 0 chr2 55642983 55643050 -126105037 - RLTR6_Mm LTR ERV1 -573 81 1 1 1009 1296 65 24 0 chr2 55643050 55643220 -126104867 + IAP-d-int LTR ERVK 5711 5884 -658 1 1009 5272 66 19 14 chr2 55643221 55643917 -126104170 + RLTR10-int LTR ERVK 1288 1986 -1 1 1009 2670 100 50 25 chr2 55643917 55644318 -126103769 + RLTR10A LTR ERVK 1 411 0 1 1009 495 247 51 51 chr2 55652408 55652558 -126095529 - MTE2a LTR MaLR -31 348 199 1 1009 529 353 30 30 chr2 55653250 55653516 -126094571 + MTE2a LTR MaLR 100 365 -14 2 1009 1231 238 56 71 chr2 55653541 55653993 -126094094 + RMER19B LTR ERVK 138 647 -255 2 1009 3072 98 10 0 chr2 55655352 55655748 -126092339 - MTB LTR MaLR 0 400 1 2 1009 376 331 50 13 chr2 55664058 55664217 -126083870 - MTE2a LTR MaLR -252 167 3 1 1009 638 219 5 28 chr2 55667368 55667524 -126080563 - MTC LTR MaLR -6 415 215 2 1009 2179 191 120 20 chr2 55685469 55685927 -126062160 + RMER6C LTR ERVK 87 586 -104 2 1009 2179 191 120 20 chr2 55685957 55686047 -126062040 + RMER6C LTR ERVK 587 689 -1 2 1009 2864 128 12 23 chr2 55689978 55690458 -126057629 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 475 0 2 1010 2987 14 42 3 chr2 55719596 55719949 -126028138 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 2 1010 43522 18 11 1 chr2 55719949 55726321 -126021766 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 8 2 1010 2987 14 42 3 chr2 55726321 55726674 -126021413 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 2 1010 404 239 60 87 chr2 55733395 55733578 -126014509 + ORR1D-int LTR MaLR 1192 1369 -1 2 1010 482 344 43 58 chr2 55733685 55733892 -126014195 + MTEa LTR MaLR 54 257 -122 3 1010 672 324 47 75 chr2 55734596 55734980 -126013107 - MTE2a LTR MaLR -2 377 5 3 1010 266 261 144 22 chr2 55735383 55735473 -126012614 + MLT1D LTR MaLR 69 169 -336 3 1010 1958 158 20 56 chr2 55736262 55736618 -126011469 - ORR1B1 LTR MaLR -51 343 1 3 1010 2206 165 25 15 chr2 55736618 55737024 -126011063 - ORR1B1-int LTR MaLR 0 1509 1100 3 1010 1975 208 22 61 chr2 55737016 55737523 -126010564 + ORR1B1-int LTR MaLR 658 1144 -365 3 1010 1071 322 63 0 chr2 55741361 55741709 -126006378 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 3 1010 3329 28 13 5 chr2 55746893 55747286 -126000801 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 1010 1776 260 82 96 chr2 55753198 55754167 -125993920 + RMER17B LTR ERVK 5 904 -54 3 1010 858 239 154 141 chr2 55773312 55773584 -125974503 + RMER6C LTR ERVK 1 363 -327 3 1010 858 243 151 130 chr2 55773734 55774225 -125973862 + RMER6C LTR ERVK 310 720 0 3 1010 2955 55 39 0 chr2 55781201 55781586 -125966501 + MTB LTR MaLR 1 400 0 3 1010 2166 85 139 12 chr2 55789094 55789440 -125958647 - RLTR10 LTR ERVK 0 390 1 3 1010 484 360 85 14 chr2 55802101 55802383 -125945704 + ORR1E LTR MaLR 44 345 -14 3 1010 636 292 113 5 chr2 55802386 55802572 -125945515 + ORR1D2 LTR MaLR 160 365 -5 3 1010 1268 206 51 66 chr2 55803413 55803636 -125944451 + ORR1B1 LTR MaLR 3 224 -170 3 1010 1268 206 51 66 chr2 55804156 55804264 -125943823 + ORR1B1 LTR MaLR 225 329 -65 3 1010 1793 218 47 7 chr2 55806741 55807144 -125940943 + MTC LTR MaLR 1 419 -2 3 1010 249 282 129 12 chr2 55809398 55809533 -125938554 - MLT2B4 LTR ERVL -404 152 2 4 1010 632 197 51 0 chr2 55812701 55812818 -125935269 + ETnERV2-int LTR ERVK 7070 7192 -214 4 1010 234 239 11 43 chr2 55813119 55813211 -125934876 + RLTR45 LTR ERVK 394 482 0 4 1010 2435 100 46 0 chr2 55817858 55818229 -125929858 - RLTR10 LTR ERVK -2 388 1 4 1011 346 397 47 34 chr2 55838068 55838389 -125909698 - MLT1C LTR MaLR -6 461 137 4 1011 2757 203 41 38 chr2 55838974 55839546 -125908541 + RMER19C LTR ERVK 1 575 -36 4 1011 1670 178 27 48 chr2 55839546 55839877 -125908210 + ORR1A3 LTR MaLR 3 326 0 4 1011 2757 203 41 38 chr2 55839877 55839912 -125908175 + RMER19C LTR ERVK 576 610 -1 4 1011 1226 265 10 41 chr2 55840228 55840618 -125907469 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 4 1011 1064 276 40 46 chr2 55840618 55840944 -125907143 - MTC LTR MaLR -50 371 48 4 1011 335 224 13 0 chr2 55842741 55842817 -125905270 + RLTR19B LTR ERVK 633 709 -6 4 1011 3345 159 14 5 chr2 55842825 55843411 -125904676 + MYSERV6-int LTR ERVK 7041 7631 -1328 4 1011 1467 106 0 81 chr2 55843930 55844176 -125903911 + ORR1A2 LTR MaLR 1 226 -101 4 1011 729 89 0 0 chr2 55844339 55844440 -125903647 + ORR1A3 LTR MaLR 226 326 0 4 1011 315 303 67 100 chr2 55845810 55846171 -125901916 + RLTR4_MM-int LTR ERV1 1159 1654 -5902 4 1011 839 333 26 28 chr2 55846186 55846773 -125901314 + RLTR4_MM-int LTR ERV1 1934 2489 -2574 4 1011 344 327 80 24 chr2 55847579 55847841 -125900246 + RLTR4_MM-int LTR ERV1 4138 4413 -3188 4 1011 873 354 23 9 chr2 55848103 55848536 -125899551 + RLTR4_MM-int LTR ERV1 4863 5301 -2300 4 1011 606 145 0 43 chr2 55862054 55862169 -125885918 + RLTR19-int LTR ERVK 3971 4080 -2057 4 1011 343 214 61 97 chr2 55862169 55862283 -125885804 - MTC LTR MaLR -311 110 1 4 1011 1613 237 8 36 chr2 55864261 55864650 -125883437 + RLTR14 LTR ERV1 1 378 -4 4 1011 557 352 90 64 chr2 55866137 55866681 -125881406 + MER90a LTR ERV1 57 614 0 4 1011 606 354 39 8 chr2 55867185 55867444 -125880643 - RMER15 LTR ERVL -13 562 296 4 1011 1579 230 51 8 chr2 55867612 55867741 -125880346 - RLTR14 LTR ERV1 -10 372 244 4 1011 1579 230 51 8 chr2 55867800 55868025 -125880062 - RLTR14 LTR ERV1 -139 243 4 4 1011 499 330 11 26 chr2 55868347 55868537 -125879550 - RMER15 LTR ERVL -50 525 339 4 1011 1288 281 22 6 chr2 55871347 55871659 -125876428 + MTE2a LTR MaLR 1 317 -62 4 1011 249 256 84 113 chr2 55871794 55871885 -125876202 + MTE2a LTR MaLR 284 370 -4 4 1011 905 300 56 24 chr2 55873781 55874198 -125873889 - ORR1E LTR MaLR -6 353 53 5 1011 252 371 81 38 chr2 55874211 55874396 -125873691 - MLT1H LTR MaLR -226 323 131 5 1011 932 299 55 75 chr2 55880095 55880590 -125867497 - MT2B LTR ERVL 0 601 26 5 1011 358 111 0 0 chr2 55880591 55880654 -125867433 - MERVL_2A-int LTR ERVL -232 5529 5467 5 1011 4488 222 110 21 chr2 55880654 55882295 -125865792 - MERVL_2A-int LTR ERVL -466 5295 3509 5 1011 237 196 0 0 chr2 55882295 55882341 -125865746 - MT2A LTR ERVL 0 533 488 5 1011 712 345 0 21 chr2 55882344 55882581 -125865506 - RLTR18B LTR ERVK -8 504 273 5 1011 2004 112 122 0 chr2 55886636 55886956 -125861131 - RLTR1B-int LTR ERV1 -942 2357 1999 5 1011 5190 154 64 22 chr2 55886951 55888521 -125859566 - RLTR1B-int LTR ERV1 -1434 1865 760 5 1011 3844 152 50 15 chr2 55888512 55889227 -125858860 - RMER16-int LTR ERVK -3962 1444 705 5 1011 906 108 69 19 chr2 55889282 55889442 -125858645 - RMER16-int LTR ERVK -5098 308 141 5 1011 1946 179 53 8 chr2 55889980 55890340 -125857747 + RLTR12B LTR ERVK 1 376 -152 5 1011 1266 191 71 71 chr2 55890348 55890564 -125857523 + RMER17C LTR ERVK 1 203 -207 5 1011 1266 191 71 71 chr2 55890663 55890855 -125857232 + RMER17C LTR ERVK 204 409 -1 5 1011 1230 321 34 40 chr2 55891202 55891995 -125856092 + MYSERV6-int LTR ERVK 161 948 -8011 5 1011 657 235 0 24 chr2 55892550 55892716 -125855371 + MYSERV6-int LTR ERVK 1572 1733 -4817 5 1011 1730 127 22 0 chr2 55900291 55900558 -125847529 - ORR1A2 LTR MaLR -50 277 5 5 1011 598 218 111 46 chr2 55909985 55910201 -125837886 + MYSERV6-int LTR ERVK 2456 2685 -3095 5 1011 1355 290 44 94 chr2 55910821 55911305 -125836782 + MYSERV-int LTR ERVK 4173 4662 -1888 5 1011 1355 290 44 94 chr2 55911534 55912055 -125836032 + MYSERV-int LTR ERVK 4663 5127 -1423 5 1011 502 233 41 115 chr2 55912057 55912266 -125835821 + RMER4A LTR ERVK 254 557 -28 5 1011 1551 216 65 46 chr2 55912266 55912805 -125835282 + MYSERV6-int LTR ERVK 7777 8325 -634 5 1011 835 29 10 0 chr2 55917036 55917139 -125830948 - IAPEY_LTR LTR ERVK 0 385 282 5 1011 2876 47 14 0 chr2 55917139 55917500 -125830587 - IAPEY_LTR LTR ERVK -19 366 1 5 1011 20854 45 3 6 chr2 55917500 55920219 -125827868 - IAPEy-int LTR ERVK 0 7513 4804 5 1011 6812 101 7 10 chr2 55920219 55921281 -125826806 - IAPEy-int LTR ERVK -6455 1058 1 5 1011 3267 44 3 0 chr2 55921281 55921665 -125826422 - IAPEY_LTR LTR ERVK 0 385 1 5 1011 253 235 43 14 chr2 55925252 55925321 -125822766 + MTEb LTR MaLR 34 104 -275 5 1011 350 308 91 55 chr2 55925580 55925745 -125822342 + MTEb LTR MaLR 131 301 -78 5 1011 1139 294 59 11 chr2 55926187 55926545 -125821542 + RLTR14 LTR ERV1 2 376 -6 5 1011 348 329 51 37 chr2 55929307 55929601 -125818486 - RLTR14-int LTR ERV1 -187 5130 4833 5 1011 1444 163 27 74 chr2 55935441 55935779 -125812308 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 5 1011 1475 214 55 44 chr2 55937589 55937950 -125810137 + ORR1C1 LTR MaLR 8 372 -6 5 1011 4336 121 52 44 chr2 55937980 55938781 -125809306 - RMER17D2 LTR ERVK -1 808 1 5 1011 1865 211 44 14 chr2 55956047 55956460 -125791627 + RMER15 LTR ERVL 151 575 0 5 1011 297 320 93 101 chr2 55957712 55957959 -125790128 + ORR1E LTR MaLR 72 316 -43 6 1011 368 145 48 0 chr2 55959399 55959461 -125788626 + RLTR13D3 LTR ERVK 526 590 -524 6 1011 3091 194 39 47 chr2 55960171 55960941 -125787146 + RLTR13D3 LTR ERVK 40 1114 0 6 1012 1541 262 27 106 chr2 55981554 55981796 -125766291 + MT2A LTR ERVL 15 258 -275 6 1012 1541 262 27 106 chr2 55981839 55982151 -125765936 + MT2A LTR ERVL 259 525 -8 6 1012 1096 290 62 6 chr2 55989406 55989746 -125758341 - MTEb LTR MaLR -18 361 3 6 1012 3584 156 48 65 chr2 55993543 55994269 -125753818 + RMER6D LTR ERVK 3 716 -4 6 1012 279 314 96 42 chr2 55999047 55999213 -125748874 - MLT1J1 LTR MaLR -266 178 4 6 1012 1325 238 108 50 chr2 56001727 56002263 -125745824 + RMER2 LTR ERV1 1 567 0 2 1012 322 274 75 58 chr2 56004058 56004178 -125743909 - MLT1A0 LTR MaLR -194 171 50 3 1012 264 258 110 30 chr2 56006677 56006777 -125741310 + RMER12 LTR ERVK 745 852 -470 1 1012 856 305 106 31 chr2 56011518 56011882 -125736205 + MTE2b LTR MaLR 3 379 0 1 1012 257 276 263 66 chr2 56018237 56018435 -125729652 - RMER15 LTR ERVL -15 560 324 3 1012 303 232 135 104 chr2 56018445 56018637 -125729450 - RMER15 LTR ERVL -367 208 11 3 1012 991 234 134 67 chr2 56019944 56020273 -125727814 + ORR1D1 LTR MaLR 1 351 -23 3 1012 265 330 82 63 chr2 56022338 56022593 -125725494 - MER31B LTR ERV1 -2 464 205 4 1012 341 367 23 17 chr2 56022922 56023094 -125724993 + MTE-int LTR MaLR 164 336 -1244 4 1012 978 251 51 58 chr2 56026484 56026797 -125721290 + ORR1D2 LTR MaLR 55 365 -5 5 1012 3463 10 8 0 chr2 56028736 56029129 -125718958 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 1012 268 305 95 0 chr2 56056079 56056174 -125691913 + RLTR28B LTR ERVL 1 104 -377 9 1012 771 243 61 0 chr2 56064471 56064652 -125683435 - ORR1C1-int LTR MaLR -1178 192 1 1 1012 1493 251 8 41 chr2 56064652 56065043 -125683044 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 1 1012 717 295 98 35 chr2 56067385 56067733 -125680354 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 1 1012 265 362 28 42 chr2 56084215 56084359 -125663728 + ORR1E LTR MaLR 22 163 -196 1 1012 332 236 14 0 chr2 56089862 56089934 -125658153 + ORR1D1 LTR MaLR 1 73 -301 1 1013 2211 62 145 12 chr2 56100649 56100993 -125647094 - RLTR10 LTR ERVK 0 390 1 1 1013 742 276 79 68 chr2 56111799 56112079 -125636008 + ORR1E LTR MaLR 42 324 -35 1 1013 2604 155 200 12 chr2 56115923 56116504 -125631583 - RMER6C LTR ERVK 0 690 1 1 1013 667 326 60 0 chr2 56117073 56117340 -125630747 - RMER15-int LTR ERVL -3441 1558 1276 1 1013 969 311 37 39 chr2 56117358 56117790 -125630297 - RMER15-int LTR ERVL -3768 1231 801 1 1013 420 321 7 15 chr2 56117883 56118019 -125630068 - RMER15-int LTR ERVL -4354 645 511 1 1013 587 328 64 50 chr2 56118488 56118867 -125629220 - RMER15 LTR ERVL -67 508 4 1 1013 388 182 30 52 chr2 56126024 56126130 -125621957 - ORR1D1 LTR MaLR -128 256 159 1 1013 678 237 85 25 chr2 56127844 56128043 -125620044 - ORR1D1 LTR MaLR -163 211 1 1 1013 2743 114 0 0 chr2 56130205 56130600 -125617487 + MTB LTR MaLR 6 400 0 1 1013 3923 145 93 232 chr2 56130599 56130869 -125617218 + MTB-int LTR MaLR 2 286 -972 1 1013 1520 133 20 110 chr2 56130869 56131223 -125616864 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 1 1013 3923 145 93 232 chr2 56131223 56131585 -125616502 + MTB-int LTR MaLR 287 406 -852 1 1013 3923 145 93 232 chr2 56131719 56132545 -125615542 + MTB-int LTR MaLR 407 1258 0 1 1013 2888 98 2 2 chr2 56132545 56132945 -125615142 + MTB LTR MaLR 1 400 0 1 1013 357 324 9 0 chr2 56133296 56133407 -125614680 - RMER15 LTR ERVL -43 532 421 1 1013 1923 359 110 63 chr2 56133412 56134565 -125613522 - RMER15-int LTR ERVL -2832 2167 914 1 1013 1923 359 110 63 chr2 56135000 56135831 -125612256 - RMER15-int LTR ERVL -4086 913 4 1 1013 550 51 12 48 chr2 56150998 56151081 -125597006 - IAPLTR2b LTR ERVK -218 109 30 2 1013 792 313 115 23 chr2 56165284 56165762 -125582325 - MLT2B4 LTR ERVL -10 546 25 2 1013 1053 270 61 28 chr2 56180342 56180704 -125567383 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 2 1013 294 282 93 37 chr2 56186587 56186749 -125561338 - MLT1H2 LTR MaLR 0 489 319 2 1013 1317 295 68 0 chr2 56204618 56204987 -125543100 + MTD LTR MaLR 18 411 -8 2 1014 246 363 112 40 chr2 56243066 56243290 -125504797 - MLT1D LTR MaLR -93 412 173 3 1014 311 291 84 96 chr2 56260434 56260787 -125487300 - MTEb LTR MaLR 0 379 12 3 1014 4291 17 0 0 chr2 56262979 56263461 -125484626 + LTRIS_Mm LTR ERV1 1 482 0 3 1014 2848 162 109 52 chr2 56267315 56268030 -125480057 - RMER6A LTR ERVK 0 756 1 3 1014 257 211 143 13 chr2 56269196 56269273 -125478814 - MTEb LTR MaLR -21 358 272 3 1014 1482 195 19 47 chr2 56271128 56271686 -125476401 - RMER6C LTR ERVK 0 690 1 3 1014 1442 267 92 68 chr2 56279483 56280186 -125467901 + RMER6D LTR ERVK 1 720 0 3 1014 1226 218 7 26 chr2 56281522 56281791 -125466296 + ORR1A4 LTR MaLR 1 264 -65 3 1014 2660 179 44 24 chr2 56291820 56292370 -125455717 + RLTR20A2 LTR ERVK 1 561 -17 4 1014 1237 238 112 37 chr2 56302295 56302671 -125445416 - MTD LTR MaLR -14 405 2 4 1014 1476 237 55 10 chr2 56314922 56315323 -125432764 - MTD LTR MaLR 0 419 1 4 1014 728 274 106 10 chr2 56325698 56325897 -125422190 - MTE2b LTR MaLR -161 218 1 4 1014 972 272 103 20 chr2 56326735 56327084 -125421003 + RMER15 LTR ERVL 198 575 0 4 1014 1511 214 51 64 chr2 56329693 56330225 -125417862 + RMER19C LTR ERVK 142 668 -234 4 1014 1571 208 40 65 chr2 56330253 56330494 -125417593 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 162 4 1014 5793 194 38 79 chr2 56330543 56332051 -125416036 - ORR1B1-int LTR MaLR 0 1963 9 4 1014 1208 198 20 116 chr2 56331850 56332153 -125415934 - MT2B LTR ERVL -327 274 1 4 1014 260 83 250 0 chr2 56332162 56332210 -125415877 - MERVL_2A-int LTR ERVL -10 5751 5692 4 1014 423 244 8 10 chr2 56332211 56332315 -125415772 - ORR1B1-int LTR MaLR -905 604 506 4 1014 404 208 0 0 chr2 56332642 56332715 -125415372 - ORR1B1-int LTR MaLR -1454 509 437 4 1014 456 301 90 55 chr2 56332715 56333059 -125415028 - RLTR15 LTR ERVK 0 359 4 4 1014 2311 188 23 0 chr2 56333061 56333491 -125414596 - ORR1B1-int LTR MaLR -1523 440 1 4 1014 1462 183 19 137 chr2 56333491 56333864 -125414223 - ORR1B1 LTR MaLR 0 329 1 4 1014 865 324 71 20 chr2 56337777 56338137 -125409950 - MTE2a LTR MaLR 0 379 1 4 1014 985 361 13 29 chr2 56340434 56340819 -125407268 + MTE2b LTR MaLR 1 379 0 4 1014 1684 203 33 78 chr2 56346204 56346600 -125401487 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 4 1014 4370 251 38 32 chr2 56346600 56347959 -125400128 - ORR1C1-int LTR MaLR 0 1370 3 4 1014 1750 207 15 3 chr2 56347959 56348289 -125399798 - ORR1C1 LTR MaLR -1 377 44 4 1014 629 334 112 27 chr2 56348764 56349093 -125398994 - MLT1B LTR MaLR -5 385 29 4 1014 3541 15 0 0 chr2 56352766 56353162 -125394925 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 1014 595 280 156 78 chr2 56359102 56359286 -125388801 + MTD LTR MaLR 17 213 -206 5 1014 2845 164 31 136 chr2 56359286 56360057 -125388030 + RMER6C LTR ERVK 1 690 0 5 1014 595 234 171 40 chr2 56360057 56360244 -125387843 + MTD LTR MaLR 214 404 -15 5 1014 816 271 80 29 chr2 56360425 56360730 -125387357 - MTC LTR MaLR -11 410 57 5 1015 3233 53 14 5 chr2 56361574 56361865 -125386222 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 146 5 1015 3453 18 5 0 chr2 56361865 56362259 -125385828 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 1015 3233 53 14 5 chr2 56362259 56362399 -125385688 - RLTR10C LTR ERVK -291 145 3 5 1015 2013 199 46 28 chr2 56363454 56363847 -125384240 - RMER6D LTR ERVK 0 720 330 5 1015 2013 199 46 28 chr2 56363928 56363968 -125384119 - RMER6D LTR ERVK -391 329 279 5 1015 318 327 108 30 chr2 56378086 56378230 -125369857 - MLT1B LTR MaLR -2 388 249 5 1015 318 327 108 30 chr2 56378276 56378465 -125369622 - MLT1B LTR MaLR -142 248 29 5 1015 279 301 88 44 chr2 56382003 56382150 -125365937 - MLT1A1 LTR MaLR -221 153 1 5 1015 2395 103 27 79 chr2 56386833 56387274 -125360813 + BGLII_Mus LTR ERVK 1 418 -4 5 1015 484 326 67 7 chr2 56388451 56388735 -125359352 + LTR48B LTR ERV1 121 421 -223 5 1015 882 309 37 32 chr2 56389181 56389555 -125358532 - MTEa LTR MaLR -1 378 3 5 1015 5176 166 65 11 chr2 56399029 56400000 -125348087 - RLTR25B LTR ERVK 0 1028 6 5 1015 371 332 79 104 chr2 56406385 56406751 -125341336 - ORR1E LTR MaLR -2 357 1 5 1015 283 255 37 64 chr2 56423258 56423367 -125324720 + MTEa LTR MaLR 268 373 -6 5 1015 468 395 71 15 chr2 56433197 56433395 -125314692 - MER70B LTR ERVL -215 363 155 5 1015 804 316 53 61 chr2 56452470 56452831 -125295256 - MLT1B LTR MaLR -3 387 30 6 1015 404 243 54 0 chr2 56455106 56455217 -125292870 + MTEa LTR MaLR 259 375 -4 6 1015 2661 59 21 0 chr2 56458819 56459158 -125288929 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 6 1015 1956 198 250 10 chr2 56466386 56466979 -125281108 - RMER19A LTR ERVK -2 735 1 6 1015 1807 198 14 35 chr2 56479057 56479428 -125268659 - ORR1B2 LTR MaLR -4 363 1 6 1015 236 239 0 69 chr2 56479579 56479651 -125268436 - RMER21B LTR ERV1 -112 835 769 6 1015 403 226 87 97 chr2 56479764 56479960 -125268127 - RMER21B LTR ERV1 -349 493 300 6 1015 274 229 100 40 chr2 56482804 56482904 -125265183 + MLT2B4 LTR ERVL 1 106 -450 6 1015 2276 215 60 23 chr2 56486395 56486915 -125261172 - RLTR31_Mur LTR ERVK -14 539 1 6 1016 468 300 111 52 chr2 56492384 56492781 -125255306 + RMER20B LTR ERVK 127 604 -23 6 1016 266 275 200 9 chr2 56496698 56496808 -125251279 + MTE2a LTR MaLR 10 140 -239 6 1016 358 258 90 68 chr2 56496742 56496875 -125251212 + MT2A LTR ERVL 64 199 -334 6 1016 919 219 37 28 chr2 56497253 56497469 -125250618 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 167 6 1016 676 300 26 21 chr2 56498130 56498317 -125249770 - ORR1C2 LTR MaLR -184 190 1 6 1016 890 293 74 31 chr2 56523108 56523460 -125224627 + ORR1D2 LTR MaLR 1 367 -3 3 1016 1526 301 69 101 chr2 56523461 56523890 -125224197 + ORR1D2-int LTR MaLR 1 400 -970 3 1016 1526 301 69 101 chr2 56524035 56524407 -125223680 + ORR1D2-int LTR MaLR 401 776 -594 3 1016 310 276 61 0 chr2 56524407 56524505 -125223582 + ORR1D2-int LTR MaLR 1267 1370 0 3 1016 721 272 122 80 chr2 56524507 56524777 -125223310 + ORR1D2 LTR MaLR 3 291 -79 3 1016 721 272 122 80 chr2 56524807 56524888 -125223199 + ORR1D2 LTR MaLR 292 369 -1 3 1016 474 287 222 9 chr2 56529835 56530060 -125218027 - RMER15 LTR ERVL -48 527 255 3 1016 674 247 79 134 chr2 56530139 56530178 -125217909 + MT2B LTR ERVL 1 31 -502 4 1016 883 235 104 80 chr2 56530210 56530576 -125217511 + MT2B LTR ERVL 32 543 -58 4 1016 883 231 113 60 chr2 56530639 56530691 -125217396 + MT2B LTR ERVL 544 599 -2 4 1016 426 301 52 78 chr2 56532535 56532657 -125215430 - MLT1A LTR MaLR -46 362 210 4 1016 2113 166 5 34 chr2 56532657 56533074 -125215013 + MTB_Mm LTR MaLR 1 405 -2 4 1016 426 287 269 50 chr2 56533074 56533238 -125214849 - MLT1A LTR MaLR -165 209 13 4 1016 269 253 24 24 chr2 56540207 56540292 -125207795 + MLT1A1 LTR MaLR 3 87 -321 5 1016 234 278 28 0 chr2 56540590 56540662 -125207425 + MTEb LTR MaLR 294 367 -12 5 1016 637 340 49 17 chr2 56542251 56542538 -125205549 - MTD LTR MaLR -105 314 19 5 1016 984 302 109 25 chr2 56553735 56554120 -125193967 + MTD LTR MaLR 1 375 -44 8 1016 476 393 58 25 chr2 56556680 56557031 -125191056 + MLT1G LTR MaLR 3 356 -199 8 1016 1728 263 19 22 chr2 56559642 56559717 -125188370 + MTC LTR MaLR 3 71 -350 8 1016 1728 263 19 22 chr2 56559876 56560212 -125187875 + MTC LTR MaLR 72 413 -8 8 1016 1944 149 32 0 chr2 56571265 56571581 -125176506 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 1 1016 1547 220 37 6 chr2 56571633 56571985 -125176102 - ORR1B2 LTR MaLR -4 363 1 1 1016 639 322 67 49 chr2 56576756 56577102 -125170985 - MLT1A LTR MaLR -19 355 4 1 1016 587 286 87 34 chr2 56580034 56580077 -125168010 - MT2A LTR ERVL -3 598 544 1 1016 674 303 43 36 chr2 56580155 56580484 -125167603 - MT2A LTR ERVL -58 543 95 1 1016 492 338 85 78 chr2 56580796 56580921 -125167166 - MT2A LTR ERVL -407 126 8 1 1016 1802 198 55 3 chr2 56580928 56581293 -125166794 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 1 1016 1787 212 14 11 chr2 56585979 56586337 -125161750 + ORR1B1 LTR MaLR 1 359 -35 1 1016 327 164 18 0 chr2 56588764 56588819 -125159268 + ORR1B1 LTR MaLR 312 367 0 1 1016 2775 166 35 92 chr2 56591473 56592069 -125156018 + RMER19B LTR ERVK 1 562 -340 1 1016 1220 296 11 26 chr2 56604576 56604923 -125143164 - MTD LTR MaLR -30 389 48 1 1016 2080 222 103 84 chr2 56616635 56616843 -125131244 - RMER6C LTR ERVK 0 690 508 1 1016 2080 222 103 84 chr2 56617687 56618155 -125129932 - RMER6C LTR ERVK -183 507 1 1 1016 3546 15 2 0 chr2 56619049 56619444 -125128643 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 1016 9673 18 0 0 chr2 56619444 56620542 -125127545 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 1 1016 3546 15 2 0 chr2 56620542 56620937 -125127150 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 1017 272 319 88 29 chr2 56626375 56626546 -125121541 + LTR33A LTR ERVL 286 466 -54 1 1017 981 308 87 3 chr2 56626584 56626952 -125121135 - MLT1C LTR MaLR -68 399 1 1 1017 2627 162 70 61 chr2 56628144 56628828 -125119259 + RMER6C LTR ERVK 1 690 0 1 1017 1942 197 108 124 chr2 56634764 56635465 -125112622 + RMER6C LTR ERVK 1 690 0 2 1017 1320 196 110 55 chr2 56654882 56655228 -125092859 + ORR1D1 LTR MaLR 10 374 0 2 1017 477 310 48 26 chr2 56685434 56685623 -125062464 - MLT1A0 LTR MaLR -172 193 1 2 1017 426 272 0 88 chr2 56686123 56686260 -125061827 + MT2B LTR ERVL 130 254 -347 2 1017 448 289 13 15 chr2 56688458 56688612 -125059475 + MLT1A0 LTR MaLR 243 381 -27 2 1017 607 271 134 30 chr2 56689841 56690115 -125057972 + RMER15 LTR ERVL 45 435 -140 2 1017 607 314 91 18 chr2 56690149 56690271 -125057816 + RMER15 LTR ERVL 436 572 -3 2 1017 605 304 108 142 chr2 56690272 56690589 -125057498 - ORR1E LTR MaLR -68 306 1 2 1017 234 245 0 20 chr2 56690750 56690800 -125057287 - RMER20A LTR ERVK -22 494 446 2 1017 2322 158 62 17 chr2 56690901 56691320 -125056767 - RMER20A LTR ERVK -69 447 10 2 1017 2304 302 37 73 chr2 56691323 56692190 -125055897 - ORR1E-int LTR MaLR -165 1415 580 2 1017 1352 294 32 62 chr2 56698442 56698674 -125049413 - ORR1E-int LTR MaLR -1015 565 341 2 1017 1352 294 32 62 chr2 56698819 56699053 -125049034 - ORR1E-int LTR MaLR -1240 340 113 2 1017 389 267 66 49 chr2 56699645 56699689 -125048398 - ORR1E-int LTR MaLR -1456 124 83 2 1017 3240 50 0 2 chr2 56699689 56700086 -125048001 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 1017 389 267 66 49 chr2 56700086 56700163 -125047924 - ORR1E-int LTR MaLR -1498 82 1 2 1017 660 306 47 67 chr2 56700163 56700534 -125047553 - ORR1E LTR MaLR 0 379 2 2 1017 307 367 94 62 chr2 56700948 56701236 -125046851 - LTR16C LTR ERVL -2 487 191 2 1017 2826 28 2 204 chr2 56705140 56705629 -125042458 + RLTR10 LTR ERVK 1 390 0 2 1017 4039 35 2 0 chr2 56705639 56706153 -125041934 + RLTR10-int LTR ERVK 41 547 -1440 2 1017 8258 20 7 1 chr2 56706193 56707184 -125040903 + RLTR10-int LTR ERVK 990 1986 -1 2 1017 2733 28 2 231 chr2 56707184 56707690 -125040397 + RLTR10 LTR ERVK 1 390 0 2 1017 363 358 37 7 chr2 56707690 56707825 -125040262 - LTR40a LTR ERVL -172 347 209 2 1017 2384 209 88 43 chr2 56736109 56736775 -125011312 + RMER19B LTR ERVK 1 902 0 3 1017 268 232 0 55 chr2 56736947 56737020 -125011067 - MLT1H2 LTR MaLR -41 448 380 3 1017 1186 275 137 78 chr2 56741802 56742291 -125005796 + RMER4B LTR ERVK 59 576 -9 3 1017 505 329 48 45 chr2 56746557 56746891 -125001196 + LTR90B LTR LTR 66 400 -396 3 1017 777 311 70 179 chr2 56749381 56749950 -124998137 + MLT2B2 LTR ERVL 1 507 -8 3 1017 2482 119 26 3 chr2 56752239 56752628 -124995459 - MTB LTR MaLR -2 398 1 3 1018 1969 142 3 6 chr2 56762366 56762678 -124985409 + RLTR10E LTR ERVK 1 311 0 3 1018 1648 222 25 22 chr2 56777905 56778269 -124969818 - ORR1D1 LTR MaLR -9 365 1 3 1018 246 350 16 33 chr2 56778570 56778691 -124969396 - RMER10B LTR ERVL -30 368 250 3 1018 532 298 88 37 chr2 56833973 56834167 -124913920 + MLT1A0 LTR MaLR 156 401 -7 4 1018 279 255 19 45 chr2 56838769 56838925 -124909162 + RMER17A2 LTR ERVK 253 404 -502 4 1018 239 296 49 39 chr2 56839525 56839627 -124908460 + MLT1J2 LTR MaLR 50 152 -292 4 1018 250 323 40 30 chr2 56839892 56839991 -124908096 + MLT1J2 LTR MaLR 296 395 -53 4 1018 3501 18 2 0 chr2 56841087 56841482 -124906605 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 1018 9282 26 4 1 chr2 56841482 56842577 -124905510 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 4 1018 3501 18 2 0 chr2 56842577 56842972 -124905115 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 1018 241 232 69 58 chr2 56853502 56853589 -124894498 + MTEb LTR MaLR 278 365 -14 4 1018 978 276 29 39 chr2 56859347 56859653 -124888434 - MTEb LTR MaLR -9 370 68 5 1018 372 197 14 0 chr2 56867254 56867325 -124880762 - MTD LTR MaLR -5 414 343 5 1018 657 179 81 27 chr2 56867318 56867467 -124880620 - MTD LTR MaLR -220 199 43 5 1018 593 332 84 28 chr2 56867536 56867787 -124880300 + MLT1A0 LTR MaLR 71 335 -30 5 1019 334 281 131 71 chr2 56897039 56897307 -124850780 - MLT1D LTR MaLR -14 491 208 5 1019 1254 214 163 62 chr2 56902100 56902306 -124845781 - MTD LTR MaLR -1 399 167 5 1019 1953 164 146 0 chr2 56902306 56902709 -124845378 + RMER4A LTR ERVK 5 466 0 5 1019 1254 207 156 53 chr2 56902709 56902860 -124845227 - MTD LTR MaLR -238 181 8 5 1019 1412 191 128 11 chr2 56906923 56907283 -124840804 - MTD LTR MaLR 0 419 18 5 1019 267 260 48 68 chr2 56937628 56937731 -124810356 - MLT1G3 LTR MaLR -53 542 442 6 1019 792 135 233 91 chr2 56942267 56942520 -124805567 - RMER6C LTR ERVK -401 289 1 6 1019 225 241 17 0 chr2 56978866 56978924 -124769163 + ORR1E LTR MaLR 1 59 -300 6 1019 271 291 98 18 chr2 56980751 56980863 -124767224 + LTR33A_ LTR ERVL 89 209 -322 6 1019 590 132 65 24 chr2 56986057 56986103 -124761984 - RLTR15 LTR ERVK -36 323 273 7 1019 1922 89 25 3 chr2 56986103 56986386 -124761701 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 39 7 1019 992 268 24 149 chr2 56992860 56993244 -124754843 + MTE2a LTR MaLR 1 336 -43 7 1019 992 268 24 149 chr2 56993400 56993430 -124754657 + MTE2a LTR MaLR 337 363 -16 7 1019 246 227 0 96 chr2 56994390 56994473 -124753614 + RLTR11A2 LTR ERVK 2 76 -451 7 1019 1409 208 116 73 chr2 56996517 56996983 -124751104 + RLTR31A_Mm LTR ERVK 2 487 -97 7 1019 247 128 0 0 chr2 56997125 56997164 -124750923 + RLTR31A_Mm LTR ERVK 519 557 0 7 1019 2351 99 12 12 chr2 56999667 56999994 -124748093 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 7 1019 988 284 53 18 chr2 57008299 57008636 -124739451 + MLT1A0 LTR MaLR 11 359 -6 1 1019 734 204 284 47 chr2 57011843 57012142 -124735945 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 2 1020 4452 14 4 0 chr2 57018843 57019334 -124728753 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 4 1020 321 0 0 0 chr2 57019334 57019372 -124728715 - MERVL-int LTR ERVL 0 5485 5448 4 1020 331 191 46 35 chr2 57019372 57019459 -124728628 - ORR1A3-int LTR MaLR -1323 640 553 4 1020 48575 14 6 0 chr2 57019459 57024785 -124723302 - MERVL-int LTR ERVL -125 5360 1 4 1020 4452 14 4 0 chr2 57024785 57025276 -124722811 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 4 1020 2577 71 9 0 chr2 57028575 57028899 -124719188 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 6 1020 1283 235 102 16 chr2 57039329 57039713 -124708374 - MTD LTR MaLR -21 398 1 8 1020 873 246 83 88 chr2 57040683 57041057 -124707030 + MTEa LTR MaLR 1 372 -7 9 1020 420 316 88 25 chr2 57043119 57043359 -124704728 - MLT1A0 LTR MaLR -4 361 107 9 1020 404 328 39 63 chr2 57043369 57043695 -124704392 - MTEa LTR MaLR -13 366 43 9 1020 269 243 39 51 chr2 57043916 57043994 -124704093 - MT2B LTR ERVL -351 250 174 9 1020 1327 168 243 106 chr2 57044701 57045362 -124702725 + RMER6C LTR ERVK 102 709 -11 1 1020 1732 224 59 5 chr2 57047581 57047972 -124700115 - MTD LTR MaLR -7 412 1 1 1020 3108 44 28 5 chr2 57056889 57057276 -124690811 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1020 1314 201 114 23 chr2 57057741 57058064 -124690023 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 31 1 1020 1314 201 114 23 chr2 57058224 57058251 -124689836 - ORR1C2 LTR MaLR -354 30 2 1 1020 304 296 84 114 chr2 57062633 57062835 -124685252 - MT2B LTR ERVL -361 240 45 1 1020 2819 169 51 58 chr2 57065723 57066345 -124681742 - RMER6C LTR ERVK 0 690 73 1 1020 5701 46 65 0 chr2 57066822 57067519 -124680568 - RLTR4_Mm LTR ERV1 0 742 1 1 1020 69715 10 2 0 chr2 57067519 57075106 -124672981 - RLTR4_MM-int LTR ERV1 0 7601 1 1 1020 5701 46 65 0 chr2 57075106 57075803 -124672284 - RLTR4_Mm LTR ERV1 0 742 1 1 1020 506 290 150 71 chr2 57076760 57077227 -124670860 + MLT2B3 LTR ERVL 1 504 -50 1 1020 663 285 93 22 chr2 57077622 57077848 -124670239 - MLT1D LTR MaLR -1 504 263 1 1020 258 309 135 9 chr2 57078534 57078645 -124669442 - MLT1D LTR MaLR -375 130 6 1 1020 1523 30 93 5 chr2 57081264 57081468 -124666619 - MT-int LTR MaLR -71 1027 806 1 1020 2343 144 25 101 chr2 57083926 57084442 -124663645 + RMER6D LTR ERVK 1 477 -243 1 1020 668 222 101 87 chr2 57085561 57085847 -124662240 - MTEb LTR MaLR 0 379 90 2 1020 1550 196 91 18 chr2 57086067 57086425 -124661662 - ORR1B2 LTR MaLR -70 297 1 2 1020 600 317 90 44 chr2 57086509 57086875 -124661212 + LTR31 LTR ERV1 237 619 0 2 1020 521 353 111 64 chr2 57094745 57095105 -124652982 + MER21B LTR ERV1 65 465 -398 2 1020 521 353 111 64 chr2 57095245 57095429 -124652658 + MER21B LTR ERV1 466 634 -229 2 1020 521 353 111 64 chr2 57095471 57095548 -124652539 + MER21B LTR ERV1 635 716 -147 2 1020 645 183 0 91 chr2 57097127 57097259 -124650828 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 409 2 1020 1949 151 140 23 chr2 57106224 57106617 -124641470 - RMER10A LTR ERVL 0 442 4 2 1020 2066 154 97 11 chr2 57110202 57110583 -124637504 - MTC LTR MaLR -5 416 3 2 1020 244 279 29 116 chr2 57121103 57121241 -124626846 - MT2B LTR ERVL -341 260 135 2 1020 2732 182 42 28 chr2 57123495 57124200 -124623887 - RMER6A LTR ERVK 0 756 4 2 1020 425 243 10 0 chr2 57139244 57139347 -124608740 + MTE2b LTR MaLR 2 105 -274 3 1020 406 242 403 13 chr2 57146814 57147088 -124600999 + MTD LTR MaLR 1 382 -37 3 1020 281 236 186 26 chr2 57147146 57147165 -124600922 + MTD LTR MaLR 383 404 -15 3 1021 232 248 133 58 chr2 57154066 57154186 -124593901 - MLT1F2 LTR MaLR -218 342 214 3 1021 1606 173 50 6 chr2 57161422 57161759 -124586328 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 43 3 1021 870 276 120 40 chr2 57168309 57168634 -124579453 - ORR1E LTR MaLR -6 353 3 3 1021 361 329 60 109 chr2 57170578 57170926 -124577161 - MLT1G LTR MaLR -192 399 69 3 1021 236 279 55 55 chr2 57182264 57182357 -124565730 - RMER3D3 LTR ERVK -408 185 90 4 1021 236 279 55 55 chr2 57182486 57182555 -124565532 - RMER3D3 LTR ERVK -504 89 23 4 1021 2362 105 25 3 chr2 57185297 57185613 -124562474 + ORR1A2 LTR MaLR 5 327 0 4 1021 1812 164 103 92 chr2 57198369 57198759 -124549328 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 4 1021 1907 189 67 8 chr2 57199391 57199781 -124548306 - MTC LTR MaLR -8 413 1 4 1021 268 373 55 12 chr2 57204905 57205068 -124543019 - MLT1L LTR MaLR -78 532 363 4 1021 313 220 23 30 chr2 57210663 57210681 -124537406 + ORR1B1-int LTR MaLR 630 646 -863 4 1021 321 320 80 26 chr2 57215419 57215570 -124532517 - MLT1H LTR MaLR -262 287 129 4 1021 290 221 0 122 chr2 57232868 57232966 -124515121 - MT2B LTR ERVL -361 240 155 4 1021 1533 214 110 11 chr2 57238450 57238716 -124509371 - MTD LTR MaLR -2 417 126 4 1021 1668 174 152 6 chr2 57238716 57239051 -124509036 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 4 1021 1533 214 110 11 chr2 57239051 57239148 -124508939 - MTD LTR MaLR -294 125 18 4 1021 840 190 38 6 chr2 57242358 57242517 -124505570 + ORR1C1 LTR MaLR 1 164 -220 5 1021 1838 156 19 12 chr2 57242519 57242838 -124505249 + ORR1A4 LTR MaLR 1 321 -8 5 1021 1173 195 31 13 chr2 57242829 57243058 -124505029 + ORR1C1 LTR MaLR 144 376 -2 5 1021 594 320 43 56 chr2 57243360 57243511 -124504576 - MTD LTR MaLR -145 274 125 5 1021 594 325 53 56 chr2 57243659 57243770 -124504317 - MTD LTR MaLR -297 124 6 5 1021 706 294 52 88 chr2 57251777 57252083 -124496004 - RMER15 LTR ERVL 0 575 281 5 1021 361 221 28 172 chr2 57252587 57252767 -124495320 - RMER15 LTR ERVL -421 154 1 5 1021 1271 216 34 43 chr2 57252879 57253203 -124494884 + ORR1D1 LTR MaLR 1 321 -53 5 1021 1020 210 57 9 chr2 57255249 57255543 -124492544 - MTD LTR MaLR 0 419 73 5 1021 875 247 91 25 chr2 57255795 57255846 -124492241 - MTD LTR MaLR -349 72 3 5 1021 251 161 140 18 chr2 57258558 57258615 -124489472 + MT2B LTR ERVL 175 238 -363 5 1021 439 300 194 56 chr2 57260982 57261286 -124486801 + MLT1A0 LTR MaLR 19 364 -1 5 1021 1997 155 25 0 chr2 57262292 57262608 -124485479 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 3 5 1021 914 284 104 18 chr2 57262736 57263016 -124485071 - MTE2a LTR MaLR -71 308 5 5 1021 1349 155 4 36 chr2 57264213 57264461 -124483626 + BGLII_B LTR ERVK 1 240 -201 5 1021 1087 261 108 9 chr2 57267914 57268258 -124479829 - MTE2a LTR MaLR -1 378 1 5 1021 241 130 0 80 chr2 57269507 57269557 -124478530 - MLT1A LTR MaLR -328 46 1 5 1021 3612 15 3 5 chr2 57269829 57270220 -124477867 - RLTR10 LTR ERVK 0 390 1 5 1021 17191 23 4 1 chr2 57270222 57272171 -124475916 - RLTR10-int LTR ERVK -3 1984 1 5 1021 3605 13 3 5 chr2 57272173 57272562 -124475525 - RLTR10 LTR ERVK -2 388 1 5 1021 438 347 105 67 chr2 57272734 57273154 -124474933 + LTR16A LTR ERVL 4 439 -12 5 1022 3069 70 5 0 chr2 57287205 57287603 -124460484 + MTB LTR MaLR 1 400 0 5 1022 1068 318 58 43 chr2 57290628 57291111 -124456976 - MER74A LTR ERVL -23 535 46 5 1022 3380 38 0 0 chr2 57296213 57296609 -124451478 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 1022 1079 207 164 41 chr2 57304956 57305298 -124442789 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 5 1022 294 344 72 31 chr2 57309084 57309279 -124438808 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 206 5 1022 363 119 90 0 chr2 57314269 57314336 -124433751 + RMER6B LTR ERVK 5 77 -384 6 1022 948 227 63 63 chr2 57314733 57315123 -124432964 + RMER6B LTR ERVK 4 458 -3 6 1022 2301 112 0 0 chr2 57320493 57320814 -124427273 + ORR1A2 LTR MaLR 1 321 -6 6 1022 2792 109 10 27 chr2 57322135 57322549 -124425538 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 6 1022 267 262 118 64 chr2 57326221 57326399 -124421688 - MLT1E2 LTR MaLR -395 259 3 6 1022 2800 162 25 29 chr2 57328507 57329034 -124419053 + RLTR11A LTR ERVK 1 525 -3 6 1022 2061 132 31 0 chr2 57332446 57332765 -124415322 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 6 1022 1077 341 66 43 chr2 57333367 57333900 -124414187 + MER74A LTR ERVL 14 558 0 6 1022 2080 88 9 53 chr2 57339206 57339543 -124408544 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 6 1022 908 325 157 50 chr2 57344690 57345811 -124402276 + MLT1G3-int LTR MaLR 228 1468 -21 6 1022 455 339 115 24 chr2 57345832 57346132 -124401955 + MLT1G3 LTR MaLR 10 377 -218 6 1022 2930 129 67 8 chr2 57346219 57346741 -124401346 - RLTR31_Mur LTR ERVK 0 553 1 6 1022 394 297 5 76 chr2 57349085 57349259 -124398828 + MLT1J2 LTR MaLR 15 282 -328 6 1022 4503 165 150 13 chr2 57366824 57367589 -124380498 + RLTR25B LTR ERVK 1 847 -181 6 1022 4503 165 150 13 chr2 57367617 57367755 -124380332 + RLTR25B LTR ERVK 848 1028 0 6 1022 709 286 132 30 chr2 57368386 57368682 -124379405 + MLT1A0 LTR MaLR 39 364 -1 6 1022 435 335 172 10 chr2 57384393 57384724 -124363363 + LTR16A LTR ERVL 73 456 0 6 1022 6144 69 17 18 chr2 57389241 57390064 -124358023 + RLTR13B2 LTR ERVK 1 822 0 6 1022 1051 241 50 65 chr2 57391995 57392333 -124355754 + RLTR14 LTR ERV1 1 333 -49 7 1022 1040 282 86 39 chr2 57392778 57393210 -124354877 + ERVL-int LTR ERVL 3548 3999 -1758 7 1022 671 287 119 0 chr2 57393388 57393656 -124354431 + ERVL-int LTR ERVL 4788 5087 -670 7 1022 737 367 116 9 chr2 57393970 57394376 -124353711 + MLT2B3 LTR ERVL 3 503 -59 7 1023 1371 215 85 25 chr2 57414632 57414985 -124333102 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 7 1023 715 288 165 8 chr2 57416809 57417051 -124331036 - MTD LTR MaLR 0 419 140 7 1023 1666 159 119 9 chr2 57422566 57422903 -124325184 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 7 1023 2357 191 52 30 chr2 57422903 57423406 -124324681 - ORR1D1-int LTR MaLR 0 1370 857 7 1023 2491 222 88 10 chr2 57423400 57423991 -124324096 - ORR1D1-int LTR MaLR -718 652 16 7 1023 1224 197 52 0 chr2 57439544 57439793 -124308294 + ORR1B2 LTR MaLR 1 262 -105 7 1023 728 340 101 50 chr2 57440912 57441416 -124306671 - MT2A LTR ERVL -3 530 1 7 1023 811 204 12 36 chr2 57441565 57441733 -124306354 + RLTR14 LTR ERV1 219 382 0 7 1023 875 213 0 0 chr2 57441771 57441935 -124306152 - ORR1D1 LTR MaLR -210 164 1 7 1023 845 280 12 27 chr2 57444271 57444528 -124303559 - MTD LTR MaLR -29 378 130 7 1023 547 220 74 4 chr2 57444956 57445161 -124302926 + RMER19C LTR ERVK 1 244 -367 7 1023 1720 19 5 0 chr2 57445160 57445366 -124302721 + ORR1A0 LTR MaLR 140 346 0 7 1023 482 291 79 3 chr2 57445370 57445553 -124302534 + RMER19C LTR ERVK 220 425 -312 7 1023 234 163 60 20 chr2 57445535 57445585 -124302502 + ORR1E LTR MaLR 304 355 -4 7 1023 240 261 177 18 chr2 57448550 57448663 -124299424 + ORR1B1-int LTR MaLR 1149 1279 -230 7 1023 1502 206 104 18 chr2 57451523 57451909 -124296178 - MTD LTR MaLR 0 419 1 7 1023 760 288 83 83 chr2 57454113 57454488 -124293599 - MTE2b LTR MaLR -4 375 1 7 1023 1151 229 92 7 chr2 57458820 57459102 -124288985 + MTD LTR MaLR 112 417 -2 7 1023 629 243 331 11 chr2 57462368 57462555 -124285532 + MTE2b LTR MaLR 13 259 -120 7 1023 2486 22 3 40 chr2 57471938 57472264 -124275823 + MTA_Mm LTR MaLR 1 314 -82 8 1023 1465 151 19 23 chr2 57473775 57474033 -124274054 - RMER6B LTR ERVK -2 459 203 8 1023 1201 123 22 74 chr2 57474626 57474855 -124273232 - RMER6B LTR ERVK -243 218 2 8 1023 335 243 20 48 chr2 57478991 57479096 -124268991 - MLT1J1 LTR MaLR 0 444 306 8 1023 1977 255 102 17 chr2 57479143 57479662 -124268425 + LTR69 LTR ERVL 2 564 -24 8 1023 1037 135 29 98 chr2 57480431 57480636 -124267451 - RMER6C LTR ERVK -16 674 484 8 1023 3050 35 59 0 chr2 57497829 57498203 -124249884 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 8 1023 308 238 28 47 chr2 57510357 57510463 -124237624 + MamGypLTR2b LTR Gypsy 776 879 -43 1 1023 481 318 4 127 chr2 57514194 57514446 -124233641 + MT2A LTR ERVL 78 298 -235 2 1023 2826 189 59 16 chr2 57518154 57518713 -124229374 - RMER4B LTR ERVK 0 585 3 3 1023 3282 28 10 0 chr2 57521789 57522181 -124225906 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 1023 2099 91 109 0 chr2 57532645 57532965 -124215122 + IAPEY2_LTR LTR ERVK 1 355 -2 6 1023 9197 126 16 7 chr2 57532967 57534375 -124213712 + IAPEY3-int LTR ERVK 1 1421 -6259 6 1023 9255 114 5 18 chr2 57534369 57535783 -124212304 + IAPEy-int LTR ERVK 6118 7513 0 6 1023 398 59 0 0 chr2 57535783 57535834 -124212253 + IAPEY3_LTR LTR ERVK 1 51 -281 6 1023 257 315 126 37 chr2 57536392 57536527 -124211560 - MLT1J LTR MaLR -332 180 34 6 1023 226 343 37 114 chr2 57538592 57538865 -124209222 - MLT1J-int LTR MaLR -970 439 188 6 1024 869 336 68 43 chr2 57542651 57543089 -124204998 - MLT2B2 LTR ERVL -64 451 3 7 1024 626 252 134 41 chr2 57544938 57545207 -124202880 + MLT1C LTR MaLR 6 299 -168 7 1024 256 299 0 22 chr2 57545231 57545320 -124202767 + MLT1C LTR MaLR 295 381 -9 7 1024 339 357 37 31 chr2 57558669 57558831 -124189256 + MLT1D LTR MaLR 23 185 -320 9 1024 1272 262 70 46 chr2 57572357 57572729 -124175358 + MTD LTR MaLR 3 383 -36 1 1024 561 279 67 16 chr2 57574434 57574627 -124173460 - MLT2C2 LTR ERVL -261 203 1 1 1024 2257 47 13 3 chr2 57581263 57581562 -124166525 - MT-int LTR MaLR -56 1042 741 1 1024 272 253 42 42 chr2 57589130 57589225 -124158862 + RMER15 LTR ERVL 436 530 -45 1 1024 258 219 31 15 chr2 57590502 57590567 -124157520 - MLT1J2 LTR MaLR -35 413 348 1 1024 243 280 25 101 chr2 57591230 57591349 -124156738 + MTD LTR MaLR 2 111 -308 1 1024 2580 175 14 99 chr2 57600248 57600855 -124147232 + RLTR20A2 LTR ERVK 21 568 -10 1 1024 357 289 39 0 chr2 57606516 57606620 -124141467 + MTC LTR MaLR 5 112 -309 1 1024 727 366 117 16 chr2 57622274 57622691 -124125396 + MLT2B3 LTR ERVL 3 456 -59 1 1024 243 279 138 62 chr2 57628020 57628215 -124119872 - MLT1K LTR MaLR 0 595 386 1 1024 817 213 124 0 chr2 57629930 57630132 -124117955 + MTD LTR MaLR 193 419 0 1 1024 227 266 42 76 chr2 57632516 57632634 -124115453 + MER92B LTR ERV1 520 633 -3 1 1024 324 311 65 103 chr2 57633884 57634146 -124113941 + MLT1J LTR MaLR 86 337 -175 1 1024 1986 110 34 61 chr2 57647056 57647384 -124100703 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 1 1024 2833 162 57 40 chr2 57649361 57649978 -124098109 - RMER6C LTR ERVK -63 627 1 2 1024 285 302 102 26 chr2 57661285 57661423 -124086664 + MLT1A0 LTR MaLR 107 261 -113 2 1024 1259 254 64 23 chr2 57664555 57664897 -124083190 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 15 2 1024 2677 63 39 25 chr2 57666488 57666846 -124081241 + RLTR10B2 LTR ERVK 3 365 0 2 1024 1020 278 152 40 chr2 57670093 57670441 -124077646 - MTD LTR MaLR 0 419 33 2 1025 2861 159 35 23 chr2 57676884 57677400 -124070687 + RLTR28 LTR ERVL 1 522 -2 2 1025 1745 176 57 20 chr2 57690681 57691035 -124057052 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 2 1025 729 323 87 29 chr2 57693663 57694110 -124053977 + RLTR12B LTR ERVK 42 514 -14 2 1025 3073 170 49 14 chr2 57696161 57696735 -124051352 + RLTR17 LTR ERVK 98 691 -1 2 1025 1660 145 33 33 chr2 57698293 57698593 -124049494 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 30 2 1025 1502 155 128 29 chr2 57698576 57698889 -124049198 - RMER6C LTR ERVK -346 344 1 2 1025 257 254 150 83 chr2 57703183 57703275 -124044812 + MLT1A0 LTR MaLR 115 217 -148 2 1025 257 254 150 83 chr2 57703300 57703387 -124044700 + MLT1A0 LTR MaLR 218 305 -60 2 1025 3199 51 5 2 chr2 57723789 57724184 -124023903 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 1025 283 344 54 50 chr2 57724241 57724480 -124023607 + MLT1J-int LTR MaLR 1108 1347 -40 3 1025 483 272 0 0 chr2 57724683 57724786 -124023301 - MTD LTR MaLR -280 139 37 3 1025 3447 115 60 54 chr2 57727539 57728134 -124019953 - MT2B LTR ERVL 0 601 3 3 1025 6784 57 7 0 chr2 57736157 57737035 -124011052 - MT-int LTR MaLR -75 1023 140 3 1025 1768 152 77 153 chr2 57745777 57746242 -124001845 + RLTR23 LTR ERV1 1 430 0 3 1025 429 339 35 29 chr2 57747445 57747676 -124000411 - MLT1E3 LTR MaLR -176 451 216 3 1025 250 262 123 79 chr2 57750675 57750878 -123997209 - MLT1E3 LTR MaLR -201 288 77 3 1025 358 284 17 33 chr2 57765794 57765914 -123982173 - ORR1D2 LTR MaLR -247 123 6 3 1025 304 291 48 19 chr2 57766323 57766428 -123981659 + MLT2B3 LTR ERVL 2 109 -445 3 1025 798 230 36 99 chr2 57775197 57775419 -123972668 - ORR1C2 LTR MaLR -3 381 174 3 1025 321 316 11 0 chr2 57775589 57775684 -123972403 - ORR1C2 LTR MaLR -180 194 99 3 1025 1620 259 39 83 chr2 57775737 57776383 -123971704 - RMER19C LTR ERVK 0 611 42 3 1025 2898 74 20 0 chr2 57784794 57785186 -123962901 - MTB LTR MaLR 0 400 1 3 1025 1653 264 23 65 chr2 57786740 57787340 -123960747 + RMER15 LTR ERVL 1 575 0 3 1026 386 357 43 0 chr2 57803644 57803784 -123944303 - ORR1E LTR MaLR -213 146 1 4 1026 459 242 47 132 chr2 57810970 57811160 -123936927 - MTD LTR MaLR -14 405 202 4 1026 3241 31 54 0 chr2 57815951 57816341 -123931746 - IAPLTR2a LTR ERVK 0 411 1 4 1026 6501 45 2 6 chr2 57816343 57817175 -123930912 - IAPEz-int LTR ERVK -2 6479 5651 4 1026 2484 76 0 3 chr2 57817168 57817511 -123930576 - IAPEz-int LTR ERVK -4781 1700 1359 4 1026 3965 93 19 22 chr2 57817511 57818266 -123929821 - IAPEz-int LTR ERVK -5819 662 9 4 1026 3272 26 54 0 chr2 57818267 57818657 -123929430 - IAPLTR2a LTR ERVK 0 411 1 4 1026 1038 296 44 22 chr2 57834554 57834914 -123913173 - ORR1D2 LTR MaLR -2 368 1 4 1026 2138 186 77 23 chr2 57835006 57835485 -123912602 + RLTR16 LTR ERVK 1 505 0 4 1026 872 273 24 0 chr2 57838388 57838593 -123909494 + MTD LTR MaLR 1 210 -209 4 1026 1057 278 181 80 chr2 57840331 57840746 -123907341 - MT2A LTR ERVL -76 457 1 4 1026 1765 192 27 11 chr2 57842240 57842608 -123905479 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 4 1026 1252 211 138 15 chr2 57844514 57844841 -123903246 + ORR1D2 LTR MaLR 1 367 -3 4 1026 334 194 29 15 chr2 57845015 57845083 -123903004 - MTD LTR MaLR -350 69 1 4 1026 774 293 73 51 chr2 57847890 57848261 -123899826 - MTE2a LTR MaLR 0 379 1 4 1026 297 298 105 78 chr2 57848440 57848593 -123899494 - MLT2B3 LTR ERVL -119 401 245 4 1026 611 218 30 0 chr2 57848796 57848929 -123899158 - MLT2B3 LTR ERVL -415 139 3 4 1026 934 277 120 16 chr2 57849083 57849391 -123898696 + MTE2b LTR MaLR 2 341 -38 5 1026 985 249 109 3 chr2 57849564 57849894 -123898193 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 1 5 1026 372 373 80 15 chr2 57857328 57857592 -123890495 + LTR78 LTR ERV1 894 1174 -130 5 1026 384 236 85 75 chr2 57862416 57862604 -123885483 + MLT1-int LTR MaLR 83 272 -1099 5 1026 694 305 107 11 chr2 57864928 57865190 -123882897 + MLT1-int LTR MaLR 264 550 -821 5 1026 1201 291 109 55 chr2 57871182 57871370 -123876717 - MT2A LTR ERVL 0 533 301 5 1026 1881 187 89 122 chr2 57871370 57871962 -123876125 - RMER15 LTR ERVL 0 575 3 5 1026 1201 291 109 55 chr2 57871962 57872279 -123875808 - MT2A LTR ERVL -233 300 1 5 1026 709 224 58 0 chr2 57876473 57876531 -123871556 + MTD LTR MaLR 53 112 -307 5 1026 709 229 366 3 chr2 57876551 57876753 -123871334 + MTD LTR MaLR 113 404 -17 5 1026 1978 119 62 45 chr2 57879522 57879925 -123868162 + RMER17C LTR ERVK 1 410 0 5 1026 738 282 72 102 chr2 57888554 57888889 -123859198 + MTE2a LTR MaLR 52 376 -3 5 1026 298 254 193 0 chr2 57910269 57910383 -123837704 + MTE-int LTR MaLR 1349 1484 -96 5 1026 379 324 30 37 chr2 57911032 57911295 -123836792 - MLT2F LTR ERVL -353 310 3 5 1026 1565 225 120 61 chr2 57912045 57912584 -123835503 + MT2B LTR ERVL 1 537 -64 5 1026 1202 205 36 47 chr2 57917863 57918230 -123829857 - RMER16 LTR ERVK 0 533 1 5 1026 4085 204 106 58 chr2 57927831 57929116 -123818971 - RMER12 LTR ERVK 0 1848 1 5 1027 1660 294 62 13 chr2 57937288 57937884 -123810203 - RMER15-int LTR ERVL -3689 1310 686 6 1027 752 356 15 3 chr2 57937881 57938213 -123809874 - RMER15-int LTR ERVL -4662 337 2 6 1027 562 256 172 39 chr2 57938908 57939111 -123808976 - RMER15 LTR ERVL -71 504 275 6 1027 245 264 48 150 chr2 57939142 57939289 -123808798 - RMER15 LTR ERVL -443 132 1 6 1027 796 277 93 8 chr2 57948492 57948729 -123799358 - MTEa LTR MaLR 0 379 123 6 1027 1178 196 62 68 chr2 57948734 57949073 -123799014 + RLTR14 LTR ERV1 2 338 -44 6 1027 430 231 106 0 chr2 57949140 57949244 -123798843 - MTEa LTR MaLR -264 115 1 6 1027 1656 166 230 53 chr2 57949294 57949747 -123798340 + MT2A LTR ERVL 1 533 0 6 1027 698 246 74 67 chr2 57950574 57950871 -123797216 - RMER17C LTR ERVK 0 410 112 6 1027 3691 181 28 10 chr2 57958332 57959012 -123789075 + RLTR17 LTR ERVK 1 692 0 6 1027 1874 170 37 22 chr2 57959113 57959468 -123788619 - RLTR14 LTR ERV1 -20 362 3 6 1027 265 273 69 20 chr2 57968112 57968213 -123779874 - MTD LTR MaLR -20 399 294 6 1027 1833 135 12 44 chr2 57975392 57975732 -123772355 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 6 1027 732 293 50 50 chr2 57977202 57977479 -123770608 - RMER15 LTR ERVL 0 575 299 6 1027 660 242 130 29 chr2 58015346 58015623 -123732464 + MLT1A LTR MaLR 37 341 -33 2 1027 228 243 50 75 chr2 58016044 58016164 -123731923 - RMER20B LTR ERVK -38 589 473 2 1027 429 267 158 22 chr2 58016202 58016386 -123731701 - RMER20B LTR ERVK -280 347 139 2 1027 531 294 29 87 chr2 58023166 58023518 -123724569 + MLT1B LTR MaLR 40 479 -26 3 1027 483 366 65 4 chr2 58035368 58035647 -123712440 + MLT1G1 LTR MaLR 257 563 -16 4 1027 244 180 39 20 chr2 58043424 58043475 -123704612 + RLTR13D1 LTR ERVK 384 435 -371 5 1028 1685 169 43 26 chr2 58069670 58070022 -123678065 + RLTR15 LTR ERVK 1 358 -1 8 1028 1447 225 114 0 chr2 58072667 58072992 -123675095 - ORR1D2 LTR MaLR -8 362 1 9 1028 359 331 14 21 chr2 58074736 58074881 -123673206 + MLT1A LTR MaLR 221 364 -10 9 1028 2174 200 52 171 chr2 58074909 58075603 -123672484 - RMER19C LTR ERVK 0 611 1 1 1028 1550 201 74 14 chr2 58090819 58091172 -123656915 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 1 1028 609 211 30 0 chr2 58091181 58091314 -123656773 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 234 1 1028 2484 55 39 3 chr2 58091316 58091646 -123656441 - IAPEY_LTR LTR ERVK 0 385 44 1 1028 789 261 93 14 chr2 58091634 58091848 -123656239 - ORR1D2 LTR MaLR -137 233 3 1 1028 378 411 64 42 chr2 58091911 58092175 -123655912 - MLT1G3 LTR MaLR -222 373 104 1 1028 1587 317 116 60 chr2 58092275 58093658 -123654429 - MLT1G3-int LTR MaLR -2 1407 2 1 1028 633 385 74 30 chr2 58093661 58094264 -123653823 - MLT1G3 LTR MaLR -2 577 1 1 1028 399 184 0 133 chr2 58099485 58099598 -123648489 + RLTR17 LTR ERVK 98 195 -497 1 1028 294 283 0 140 chr2 58102250 58102357 -123645730 + MT2B LTR ERVL 156 247 -354 1 1028 410 237 123 53 chr2 58108970 58109157 -123638930 + RMER5 LTR ERV1 48 247 -287 1 1028 576 274 84 5 chr2 58115658 58115849 -123632238 + RMER5 LTR ERV1 329 534 0 1 1028 2721 160 21 37 chr2 58129085 58129655 -123618432 + RLTR31_Mm LTR ERVK 1 561 0 1 1028 750 254 208 3 chr2 58130460 58130767 -123617320 + ORR1D1 LTR MaLR 5 374 0 1 1028 584 262 35 0 chr2 58130767 58130896 -123617191 + MTEb LTR MaLR 227 360 -19 1 1028 1366 246 81 40 chr2 58145602 58145974 -123602113 - MTD LTR MaLR -28 391 5 1 1028 865 294 11 29 chr2 58156808 58157081 -123591006 - MLT1A0 LTR MaLR -42 323 56 2 1028 494 289 84 28 chr2 58161682 58161860 -123586227 + RMER5 LTR ERV1 13 200 -334 2 1028 1662 175 131 11 chr2 58178015 58178367 -123569720 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 2 1028 903 104 77 3 chr2 58179034 58179237 -123568850 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 2 1028 845 180 153 0 chr2 58184248 58184391 -123563696 + ORR1D1 LTR MaLR 9 163 -211 2 1028 845 180 153 0 chr2 58184446 58184485 -123563602 + ORR1D1 LTR MaLR 164 218 -156 2 1028 318 227 0 0 chr2 58184860 58184926 -123563161 + ORR1D1 LTR MaLR 303 368 -6 2 1028 299 261 86 61 chr2 58187243 58187406 -123560681 - ORR1B2 LTR MaLR -190 177 11 2 1028 2788 91 126 35 chr2 58193800 58194235 -123553852 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 2 1028 953 168 15 50 chr2 58194236 58194436 -123553651 + IAPEz-int LTR ERVK 9 201 -6280 2 1028 231 267 0 0 chr2 58194438 58194483 -123553604 + RLTR27 LTR ERVK 231 275 -34 2 1028 3804 56 26 18 chr2 58194483 58194974 -123553113 + IAPEz-int LTR ERVK 168 662 -5819 2 128 6674 69 25 13 chr2 58194974 58196124 -123551963 + IAPEz-int LTR ERVK 5651 6481 0 2 1029 2781 88 129 35 chr2 58196124 58196558 -123551529 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 2 1029 235 264 24 40 chr2 58206229 58206355 -123541732 - ORR1B1-int LTR MaLR -755 754 631 2 1029 3745 43 77 5 chr2 58213122 58213565 -123534522 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 475 0 2 1029 785 298 99 18 chr2 58220494 58220778 -123527309 - MTE2a LTR MaLR -3 376 70 3 1029 3154 61 2 2 chr2 58222601 58222997 -123525090 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 1029 1368 293 22 26 chr2 58224483 58224935 -123523152 + RMER5 LTR ERV1 75 524 -10 3 1029 284 320 64 72 chr2 58225597 58225846 -123522241 - RMER17D2 LTR ERVK -411 398 152 3 1029 705 187 106 21 chr2 58244186 58244328 -123503759 + MTD LTR MaLR 1 154 -265 3 1029 328 260 62 10 chr2 58250300 58250397 -123497690 + MLT1J2 LTR MaLR 238 339 -109 3 1029 356 254 172 0 chr2 58252829 58252951 -123495136 - MTE-int LTR MaLR -1436 144 2 3 1029 1143 128 10 21 chr2 58253994 58254186 -123493901 - MTC LTR MaLR 0 421 232 3 1029 346 191 0 31 chr2 58254204 58254269 -123493818 - MTC LTR MaLR -356 65 3 3 1029 1545 183 47 76 chr2 58258600 58258943 -123489144 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 46 3 1029 337 344 120 19 chr2 58259541 58259757 -123488330 + MLT1K LTR MaLR 356 593 -2 3 1029 1899 185 27 24 chr2 58260579 58260950 -123487137 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 3 3 1029 3592 55 37 2 chr2 58266513 58266972 -123481115 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 475 0 3 1029 360 259 398 63 chr2 58268361 58268643 -123479444 - MTEa LTR MaLR 0 379 3 3 1029 279 281 0 0 chr2 58274894 58274951 -123473136 + ORR1D1 LTR MaLR 105 161 -213 4 1029 631 186 173 6 chr2 58275150 58275323 -123472764 + ORR1D1 LTR MaLR 173 374 0 4 1029 468 292 68 41 chr2 58284287 58284710 -123463377 - RLTR12B LTR ERVK -257 311 1 4 1029 258 240 201 96 chr2 58285620 58285869 -123462218 - MLT1D LTR MaLR -78 427 153 4 1029 3458 132 10 22 chr2 58296400 58296997 -123451090 - RLTR17 LTR ERVK -101 591 2 4 1029 1647 147 226 29 chr2 58324385 58324770 -123423317 - RMER6B LTR ERVK 0 461 1 4 1030 1343 113 377 8 chr2 58334914 58335182 -123412905 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 5 1030 1782 151 90 44 chr2 58343105 58343472 -123404615 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 5 1030 248 239 43 36 chr2 58345685 58345716 -123402371 + ORR1B1-int LTR MaLR 615 647 -862 5 1030 248 239 43 36 chr2 58345738 58345845 -123402242 + ORR1B1-int LTR MaLR 648 754 -755 5 1030 1117 163 95 8 chr2 58347729 58347982 -123400105 - RMER6A LTR ERVK 0 756 482 5 1030 1009 237 31 81 chr2 58350729 58351050 -123397037 + MTE2a LTR MaLR 75 379 0 5 1030 602 227 79 28 chr2 58351076 58351253 -123396834 + MLT1A0 LTR MaLR 172 357 -8 5 1030 3071 161 35 64 chr2 58364075 58364667 -123383420 + RMER15 LTR ERVL 1 575 0 5 1030 231 174 105 92 chr2 58378430 58378506 -123369581 + MTEa LTR MaLR 303 379 0 5 1030 2017 187 17 7 chr2 58379582 58379987 -123368100 + MTC LTR MaLR 5 413 -8 5 1030 426 232 93 67 chr2 58381714 58381908 -123366179 + MLT1A0 LTR MaLR 1 199 -166 5 1030 257 252 81 81 chr2 58390736 58390909 -123357178 + MLT1D LTR MaLR 71 243 -262 5 1030 630 280 72 21 chr2 58391284 58391632 -123356455 + MLT1D LTR MaLR 30 502 -3 5 1030 537 336 164 25 chr2 58394485 58394931 -123353156 + MLT1G3 LTR MaLR 84 591 -4 6 1030 2959 132 39 61 chr2 58436135 58436725 -123311362 + RMER4B LTR ERVK 1 577 -8 6 1030 1505 250 34 3 chr2 58450015 58450372 -123297715 + ORR1D2 LTR MaLR 1 368 -2 7 1030 785 301 79 23 chr2 58450923 58451266 -123296821 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 4 7 1030 687 171 45 37 chr2 58456905 58457039 -123291048 + MTC LTR MaLR 31 165 -256 7 1031 2161 97 18 61 chr2 58458647 58458989 -123289098 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 7 1031 1416 209 118 29 chr2 58461471 58461851 -123286236 - MTD LTR MaLR 0 419 6 7 1031 1649 245 113 46 chr2 58461862 58462563 -123285524 - MTD-int LTR MaLR -6 1252 384 7 1031 1898 171 74 3 chr2 58463037 58463400 -123284687 + MTC LTR MaLR 1 389 -32 7 1031 1956 134 19 0 chr2 58463400 58463713 -123284374 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 7 1031 226 229 21 135 chr2 58466764 58466779 -123281308 + MT2B LTR ERVL 154 157 -444 7 1031 2268 176 115 8 chr2 58475512 58475989 -123272098 + RLTR24 LTR ERV1 1 528 -1 7 1031 3234 53 177 2 chr2 58477318 58477754 -123270333 + RLTR1B LTR ERV1 1 512 0 8 1031 1572 170 127 132 chr2 58477970 58478418 -123269669 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 1 8 1031 248 266 0 12 chr2 58482043 58482123 -123265964 - MLT1A LTR MaLR -22 540 462 8 1031 337 243 99 36 chr2 58483015 58483126 -123264961 - MLT1A LTR MaLR -215 159 42 8 1031 509 340 16 11 chr2 58488663 58488850 -123259237 + HERV16-int LTR ERVL 2618 2805 -2191 8 1031 2411 74 3 61 chr2 58489004 58489349 -123258738 + ORR1A2 LTR MaLR 3 327 0 8 1031 735 155 165 16 chr2 58491136 58491413 -123256674 + ORR1D1 LTR MaLR 21 378 -16 8 1031 2311 205 67 17 chr2 58491413 58491954 -123256133 + ORR1D1-int LTR MaLR 2 569 -801 8 1031 1708 163 66 33 chr2 58491979 58492341 -123255746 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 8 1031 1876 245 52 4 chr2 58496186 58496690 -123251397 - MT2A LTR ERVL -3 530 3 8 1031 325 311 57 38 chr2 58510129 58510286 -123237801 - MER21B LTR ERV1 -71 792 633 1 1031 281 89 22 0 chr2 58510787 58510832 -123237255 - MT2B LTR ERVL -540 61 16 1 1031 1053 270 112 3 chr2 58510857 58511195 -123236892 - MER21B LTR ERV1 -466 397 23 1 1031 325 317 81 52 chr2 58520656 58520866 -123227221 - ORR1D2 LTR MaLR -150 220 5 2 1031 2970 58 18 180 chr2 58526514 58527081 -123221006 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 3 1031 3635 93 29 19 chr2 58527083 58527888 -123220199 + IAPEz-int LTR ERVK 3 662 -5819 3 1031 925 76 0 0 chr2 58527888 58528007 -123220080 + IAPEz-int LTR ERVK 1359 1477 -5004 3 1031 1852 85 0 0 chr2 58528019 58528254 -123219833 + IAPEz-int LTR ERVK 2263 2497 -5183 3 1031 14631 51 9 3 chr2 58528281 58530042 -123218045 + IAPEz-int LTR ERVK 4708 6479 -2 3 1031 2980 65 18 168 chr2 58530044 58530603 -123217484 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 3 1031 1108 154 122 42 chr2 58534492 58534729 -123213358 - ORR1B1 LTR MaLR -138 256 1 4 1031 456 360 66 5 chr2 58536401 58536592 -123211495 - MLT1A1 LTR MaLR -2 406 204 4 1031 2178 188 18 43 chr2 58536592 58537098 -123210989 + RLTR16 LTR ERVK 1 493 -12 5 1031 1653 220 75 5 chr2 58548220 58548608 -123199479 - MTD LTR MaLR 0 419 5 5 1031 530 331 73 85 chr2 58554127 58554563 -123193524 - MLT1C LTR MaLR -5 462 32 6 1031 1498 181 3 106 chr2 58561368 58561726 -123186361 - ORR1A4 LTR MaLR -8 321 1 6 1031 1278 217 170 24 chr2 58563066 58563396 -123184691 - RLTR14 LTR ERV1 -2 380 3 7 1031 278 340 9 0 chr2 58569633 58569739 -123178348 + RMER15 LTR ERVL 425 531 -44 7 1031 1078 256 153 16 chr2 58572185 58572551 -123175536 + MTD LTR MaLR 4 419 0 8 1031 658 300 144 17 chr2 58574203 58574495 -123173592 + MT2A LTR ERVL 100 428 -105 8 1031 1236 239 48 3 chr2 58580896 58581207 -123166880 - ORR1D2 LTR MaLR -45 325 1 9 1031 235 318 109 55 chr2 58584402 58584585 -123163502 + MLT1A LTR MaLR 173 365 -9 9 1031 2528 129 44 48 chr2 58586357 58586860 -123161227 - RLTR28 LTR ERVL -2 522 22 9 1031 1655 132 16 165 chr2 58586883 58587264 -123160823 + ORR1A2 LTR MaLR 1 324 -3 1 1031 1873 106 3 3 chr2 58587838 58588123 -123159964 + ORR1A2 LTR MaLR 43 327 0 1 1032 271 276 151 9 chr2 58589752 58589858 -123158229 + LTR41 LTR ERVL 54 174 -594 1 1032 245 359 57 93 chr2 58589945 58590191 -123157896 + LTR41 LTR ERVL 201 437 -331 1 1032 253 345 123 21 chr2 58590274 58590517 -123157570 - MLT1A0 LTR MaLR -8 357 90 1 1032 261 319 197 0 chr2 58590500 58590688 -123157399 + LTR41 LTR ERVL 506 730 -38 1 1032 243 255 41 14 chr2 58595978 58596064 -123152023 + MTEa LTR MaLR 272 354 -25 1 1032 1008 332 88 13 chr2 58602174 58602571 -123145516 - MTE-int LTR MaLR -43 1537 1111 1 1032 1648 220 85 27 chr2 58603178 58603626 -123144461 + RMER19C LTR ERVK 138 611 0 1 1032 256 325 15 54 chr2 58603943 58604073 -123144014 + LTR81B LTR ERV1? 1054 1178 -215 1 1032 245 226 32 97 chr2 58604090 58604183 -123143904 + LTR81B LTR ERV1? 1226 1312 -38 1 1032 244 214 191 0 chr2 58615159 58615248 -123132839 - MLT1J2 LTR MaLR -304 144 39 1 1032 520 337 11 6 chr2 58619540 58619722 -123128365 - MLT1J1 LTR MaLR -261 183 1 1 1032 329 250 169 0 chr2 58626969 58627093 -123120994 - MTC LTR MaLR -39 380 236 1 1032 431 228 11 0 chr2 58627093 58627185 -123120902 - MTC LTR MaLR -328 93 1 1 1032 779 251 125 81 chr2 58628519 58628879 -123119208 + MTE2a LTR MaLR 4 379 0 1 1032 1159 225 60 36 chr2 58635493 58635872 -123112215 - MTD LTR MaLR 0 379 1 1 1032 2637 117 88 15 chr2 58649745 58650222 -123097865 + RLTR28 LTR ERVL 1 512 -12 1 1032 401 366 23 18 chr2 58653999 58654219 -123093868 - MLT1N2 LTR MaLR -33 529 309 1 1032 659 256 29 107 chr2 58657526 58657836 -123090251 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 286 -167 2 1032 479 231 27 13 chr2 58657861 58658010 -123090077 + RLTR11A2 LTR ERVK 284 469 -59 2 1032 464 253 116 30 chr2 58669043 58669275 -123078812 + MLT1D LTR MaLR 254 505 0 2 1032 1027 221 98 22 chr2 58669755 58670032 -123078055 - MTD LTR MaLR -121 298 1 2 1032 2715 183 66 88 chr2 58671621 58672537 -123075550 + RLTR13D6 LTR ERVK 1 856 -46 2 1032 861 230 134 11 chr2 58682989 58683143 -123064944 + RMER17C LTR ERVK 1 174 -236 2 1032 861 230 134 11 chr2 58683299 58683509 -123064578 + RMER17C LTR ERVK 175 409 -1 2 1032 4561 124 117 21 chr2 58691349 58692175 -123055912 + RMER17A2 LTR ERVK 1 906 0 2 1032 1207 251 68 19 chr2 58693648 58693965 -123054122 + ORR1D2 LTR MaLR 1 333 -37 2 1032 1019 180 108 5 chr2 58693965 58694188 -123053899 + ORR1D1 LTR MaLR 1 246 -128 2 1032 405 301 40 34 chr2 58694199 58694347 -123053740 + MLT1K LTR MaLR 197 345 -250 2 1032 769 316 16 123 chr2 58696225 58696607 -123051480 + MTEa LTR MaLR 23 363 -16 2 1032 733 233 31 58 chr2 58699754 58699891 -123048196 + ORR1E LTR MaLR 1 138 -221 2 1032 1943 155 132 0 chr2 58699891 58700239 -123047848 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 2 1032 733 233 31 58 chr2 58700239 58700324 -123047763 + ORR1E LTR MaLR 139 217 -142 2 1032 1390 204 103 32 chr2 58701756 58702096 -123045991 + ORR1D2 LTR MaLR 1 364 -6 2 1032 559 308 90 48 chr2 58702896 58703186 -123044901 + MTEa LTR MaLR 78 379 0 2 1032 2729 51 33 0 chr2 58713393 58713728 -123034359 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 2 1033 282 279 84 91 chr2 58723774 58723928 -123024159 + MLT1F1 LTR MaLR 1 153 -416 2 1033 266 348 58 64 chr2 58724084 58724256 -123023831 + MLT1F1 LTR MaLR 112 282 -297 2 1033 253 227 26 43 chr2 58724356 58724439 -123023648 - MTEb LTR MaLR -18 361 281 2 1033 258 239 0 0 chr2 58725152 58725198 -123022889 - MTC LTR MaLR 0 421 376 2 1033 2132 112 30 9 chr2 58725199 58725531 -123022556 - ORR1A1 LTR MaLR -7 339 1 2 1033 1747 178 82 11 chr2 58725531 58725885 -123022202 - MTC LTR MaLR -41 380 1 2 1033 717 257 190 22 chr2 58726073 58726347 -123021740 - MTEb LTR MaLR -59 320 1 2 1033 1411 226 108 26 chr2 58730413 58730754 -123017333 + ORR1D2 LTR MaLR 1 369 -1 3 1033 4808 135 141 60 chr2 58744150 58745101 -123002986 + RLTR25B LTR ERVK 1 1028 0 3 1033 372 318 80 60 chr2 58755724 58755975 -122992112 + MLT1A LTR MaLR 119 374 0 3 1033 258 333 40 61 chr2 58758026 58758224 -122989863 + LTR41B LTR ERVL 557 750 -8 3 1033 4695 134 44 12 chr2 58765146 58765923 -122982164 - RMER17D2 LTR ERVK -3 806 5 3 1033 3083 161 127 18 chr2 58775581 58776132 -122971955 + RMER19C LTR ERVK 1 611 0 3 1033 653 329 182 14 chr2 58779539 58779962 -122968125 - MLT1F-int LTR MaLR -425 1064 571 3 1033 253 220 17 0 chr2 58780015 58780074 -122968013 - MLT1F-int LTR MaLR -777 594 535 3 1033 240 234 31 0 chr2 58780362 58780426 -122967661 - MLT1F-int LTR MaLR -1269 102 37 3 1033 609 351 61 28 chr2 58780449 58780816 -122967271 - MLT1E3 LTR MaLR -8 619 234 3 1033 1741 248 77 29 chr2 58781276 58781728 -122966359 - RMER19C LTR ERVK 0 611 138 3 1033 1937 191 64 28 chr2 58788543 58788617 -122959470 + MTD LTR MaLR 1 72 -347 3 1033 2677 179 107 7 chr2 58788617 58789170 -122958917 + RMER19C LTR ERVK 3 610 -1 3 1033 1937 191 64 28 chr2 58789170 58789488 -122958599 + MTD LTR MaLR 73 407 -12 3 1033 2795 130 191 2 chr2 58794808 58795015 -122953072 - RMER4B LTR ERVK 0 585 321 3 1033 2795 130 191 2 chr2 58795048 58795332 -122952755 - RMER4B LTR ERVK -265 320 2 3 1033 632 200 0 16 chr2 58802005 58802132 -122945955 - MTD LTR MaLR -1 418 294 3 1033 294 377 101 66 chr2 58803186 58803546 -122944541 + LTR16E1 LTR ERVL 130 454 -35 3 1033 1624 206 135 138 chr2 58804410 58804945 -122943142 + MT2A LTR ERVL 1 533 0 3 1033 2998 159 35 32 chr2 58806544 58807109 -122940978 + RMER4B LTR ERVK 17 583 -2 3 1033 2142 119 65 10 chr2 58807310 58807616 -122940471 + ORR1A4 LTR MaLR 4 326 -3 3 1033 1449 193 139 62 chr2 58813784 58814002 -122934085 - ORR1C2 LTR MaLR -3 381 151 4 1033 1449 193 139 62 chr2 58814265 58814396 -122933691 - ORR1C2 LTR MaLR -234 150 2 4 1033 559 291 53 51 chr2 58822502 58822746 -122925341 + ORR1E LTR MaLR 1 232 -146 4 1033 1056 273 43 50 chr2 58842990 58843417 -122904670 - MTD LTR MaLR 0 419 2 4 1033 1509 227 69 30 chr2 58847843 58848207 -122899880 - MTD LTR MaLR -41 378 1 4 129 2139 159 13 52 chr2 58851200 58851585 -122896502 + ORR1C1 LTR MaLR 1 370 -8 4 1034 3501 43 5 0 chr2 58852317 58852711 -122895376 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 1034 556 317 120 47 chr2 58862937 58863344 -122884743 + LTR33A_ LTR ERVL 84 520 -11 4 1034 327 295 128 49 chr2 58871674 58871877 -122876210 + LTR16A LTR ERVL 1 219 -232 5 1034 242 333 129 8 chr2 58871916 58872040 -122876047 + LTR16A LTR ERVL 313 451 0 5 1034 1032 246 85 48 chr2 58872623 58872918 -122875169 + MTEa LTR MaLR 1 306 -73 5 1034 1147 212 75 23 chr2 58872890 58873155 -122874932 + MTD LTR MaLR 141 419 0 5 1034 388 130 72 0 chr2 58884477 58884546 -122863541 + MT2A LTR ERVL 94 167 -366 5 1034 931 155 102 15 chr2 58885432 58885629 -122862458 + MERVL_2A-int LTR ERVL 5469 5682 -79 5 1034 742 169 7 0 chr2 58885634 58885770 -122862317 + MERVL_2A-int LTR ERVL 5618 5754 -7 5 1034 1667 195 196 90 chr2 58885772 58886251 -122861836 + MT2A LTR ERVL 4 533 0 5 1034 2368 133 14 3 chr2 58887170 58887539 -122860548 - RLTR14 LTR ERV1 -7 375 3 5 1034 661 322 108 80 chr2 58887653 58888192 -122859895 - MLT1E3 LTR MaLR -69 555 2 5 1034 1564 236 24 27 chr2 58890111 58890482 -122857605 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 5 1034 2623 236 94 48 chr2 58890485 58891152 -122856935 + ORR1D2-int LTR MaLR 4 660 -710 5 1034 2623 236 94 48 chr2 58891207 58891356 -122856731 + ORR1D2-int LTR MaLR 661 858 -512 5 1034 478 221 49 0 chr2 58891368 58891490 -122856597 + ORR1D2-int LTR MaLR 1237 1364 -6 5 1034 662 237 66 0 chr2 58891492 58891644 -122856443 + ORR1D2 LTR MaLR 1 162 -208 5 1034 344 234 53 11 chr2 58891799 58891894 -122856193 - MTD LTR MaLR -12 407 309 5 1034 4159 179 161 46 chr2 58898786 58899555 -122848532 + RMER12 LTR ERVK 1 770 -552 5 1034 4159 179 161 46 chr2 58899627 58900042 -122848045 + RMER12 LTR ERVK 771 1321 -1 5 1034 1124 239 100 15 chr2 58959113 58959452 -122788635 - MTE2a LTR MaLR -6 373 6 5 1034 1177 99 41 20 chr2 58961677 58961872 -122786215 + ORR1A4 LTR MaLR 127 325 -4 5 1034 3188 56 13 3 chr2 58964439 58964830 -122783257 - MTA_Mm LTR MaLR -1 395 1 5 1034 604 242 54 190 chr2 58965629 58965945 -122782142 + MTC LTR MaLR 1 273 -148 5 1034 4997 105 11 85 chr2 58970101 58970968 -122777119 + RLTR13B4 LTR ERVK 1 803 0 6 1034 1808 218 131 37 chr2 58976700 58977243 -122770844 + RMER19B LTR ERVK 309 902 0 6 1034 2818 64 5 13 chr2 58980619 58981015 -122767072 + MTB LTR MaLR 1 393 -7 6 1035 1060 266 91 33 chr2 58987233 58987629 -122760458 + MTD LTR MaLR 1 419 0 6 1035 480 226 92 25 chr2 58994887 58995050 -122753037 - MTE2a LTR MaLR 0 379 206 6 1035 2148 162 43 38 chr2 59003321 59003739 -122744348 - MTC LTR MaLR -1 420 1 3 1035 605 206 27 14 chr2 59017647 59017795 -122730292 - ORR1D1 LTR MaLR -201 173 24 3 1035 4038 82 66 0 chr2 59025000 59025548 -122722539 + MT2B2 LTR ERVL 1 584 0 4 1035 1296 200 173 8 chr2 59033653 59034006 -122714081 - MTD LTR MaLR -8 411 1 5 1035 1632 184 96 43 chr2 59042566 59042964 -122705123 - MTD LTR MaLR 0 419 1 6 1035 1947 152 49 5 chr2 59055905 59056275 -122691812 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 1 7 1035 2706 164 12 33 chr2 59060227 59060743 -122687344 - RLTR16 LTR ERVK 0 505 1 7 1035 296 165 116 12 chr2 59062146 59062232 -122685855 + MLT1N2 LTR MaLR 468 562 0 8 1035 2286 164 16 57 chr2 59066792 59067231 -122680856 - MTC LTR MaLR 0 421 1 8 1035 2340 122 19 43 chr2 59069314 59069733 -122678354 - RLTR9E LTR ERVK 0 409 1 8 1035 345 291 18 79 chr2 59074405 59074569 -122673518 + MLT1D LTR MaLR 96 249 -256 8 1035 798 309 128 54 chr2 59074671 59075745 -122672342 + MLT1D-int LTR MaLR 12 1258 -113 8 1035 241 336 35 9 chr2 59076230 59076344 -122671743 + MLT1D-int LTR MaLR 1247 1363 -8 8 1035 2103 112 27 24 chr2 59076660 59076988 -122671099 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 9 1035 3254 55 2 5 chr2 59085508 59085908 -122662179 - MTB LTR MaLR 0 400 2 1 1035 1112 182 50 21 chr2 59093579 59093888 -122654199 - RLTR12B LTR ERVK -15 553 238 1 1035 1082 218 98 10 chr2 59093930 59094226 -122653861 - RLTR12A LTR ERVK -246 322 1 1 1035 264 281 67 10 chr2 59098154 59098258 -122649829 + ORR1E LTR MaLR 2 111 -248 1 1036 1599 180 130 0 chr2 59167646 59167962 -122580125 - ORR1B2 LTR MaLR -8 359 3 1 1036 3579 118 142 34 chr2 59173547 59174228 -122573859 + RMER6A LTR ERVK 2 756 0 1 1036 529 245 123 97 chr2 59174901 59174947 -122573140 - MT2A LTR ERVL -7 594 559 1 1036 886 213 68 126 chr2 59174979 59175392 -122572695 - MT2A LTR ERVL -43 558 1 1 1036 710 283 41 40 chr2 59183219 59183434 -122564653 - MLT1A0 LTR MaLR -17 488 179 1 1036 1676 327 97 12 chr2 59199411 59200212 -122547875 + MTE-int LTR MaLR 672 1540 -40 2 1036 243 325 105 87 chr2 59200204 59200376 -122547711 + ORR1E LTR MaLR 6 180 -179 2 1036 1582 169 48 203 chr2 59204476 59204973 -122543114 - MTC LTR MaLR -1 420 1 2 1036 3692 173 144 147 chr2 59204975 59205721 -122542366 - MTC-int LTR MaLR -2 1256 398 2 1036 3692 173 144 147 chr2 59205893 59206063 -122542024 - MTC-int LTR MaLR -861 397 255 2 1036 3692 173 144 147 chr2 59206212 59206250 -122541837 - MTC-int LTR MaLR -1004 254 254 2 1036 3692 173 144 147 chr2 59206397 59206526 -122541561 - MTC-int LTR MaLR -1004 254 154 2 1036 3692 173 144 147 chr2 59206714 59206887 -122541200 - MTC-int LTR MaLR -1105 153 1 2 1036 2102 174 70 5 chr2 59206891 59207279 -122540808 - MTC LTR MaLR -8 413 1 2 1036 1776 140 39 135 chr2 59207933 59208347 -122539740 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 2 1036 1562 84 31 9 chr2 59214005 59214233 -122533854 - RLTR13B1 LTR ERVK 0 893 661 2 1036 468 260 165 82 chr2 59216335 59216675 -122531412 + RLTR9A LTR ERVK 1 368 0 2 1036 3144 58 13 0 chr2 59217149 59217529 -122530558 + IAPEY_LTR LTR ERVK 1 385 0 2 1036 396 322 98 70 chr2 59222083 59222410 -122525677 + RMER17C LTR ERVK 15 350 -60 2 1036 257 340 33 15 chr2 59224167 59224284 -122523803 + MLT1G3 LTR MaLR 2 160 -419 2 1036 279 358 171 0 chr2 59224463 59224586 -122523501 + MLT1G3 LTR MaLR 364 507 -88 2 1036 1597 181 104 23 chr2 59229479 59229621 -122518466 + ORR1D1 LTR MaLR 1 166 -208 2 1036 1597 181 104 23 chr2 59229720 59229923 -122518164 + ORR1D1 LTR MaLR 167 374 0 2 1036 1741 166 103 6 chr2 59230931 59231282 -122516805 - BGLII_B LTR ERVK 0 441 57 2 1036 1336 244 36 6 chr2 59231452 59231811 -122516276 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 2 1036 7241 64 18 89 chr2 59232876 59233934 -122514153 + RLTR13C1 LTR ERVK 1 983 0 2 1036 507 289 122 59 chr2 59235586 59235840 -122512247 - RMER15 LTR ERVL -43 532 263 2 1036 285 240 97 80 chr2 59235893 59236006 -122512081 - RMER15 LTR ERVL -458 117 3 2 1036 308 279 41 41 chr2 59241636 59241733 -122506354 - MLT1D LTR MaLR -49 500 404 2 129 1991 191 23 10 chr2 59244424 59244811 -122503276 + MTD LTR MaLR 1 392 -27 3 1037 544 280 182 3 chr2 59245047 59245355 -122502732 - MLT1D LTR MaLR -54 451 89 2 1037 4245 124 49 43 chr2 59250528 59251279 -122496808 + RMER6A LTR ERVK 1 756 0 3 1037 1080 221 47 8 chr2 59251596 59251852 -122496235 - MTD LTR MaLR -3 416 151 3 1037 237 252 89 103 chr2 59260945 59261091 -122486996 + RLTR42 LTR ERVK 69 212 -27 3 1037 313 279 282 47 chr2 59264168 59264474 -122483613 + ORR1D2 LTR MaLR 1 378 -1 3 1037 4638 186 59 62 chr2 59266118 59266860 -122481227 + RLTR18-int LTR ERVK 4125 4911 -450 3 1037 2318 98 6 33 chr2 59266860 59267196 -122480891 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 3 1037 4638 186 59 62 chr2 59267196 59267248 -122480839 + RLTR18-int LTR ERVK 4912 4958 -403 3 1037 2173 139 69 26 chr2 59267248 59267386 -122480701 + ORR1B1 LTR MaLR 1 138 -256 3 1037 2173 139 69 26 chr2 59267579 59267818 -122480269 + ORR1B1 LTR MaLR 139 394 0 3 1037 4638 186 59 62 chr2 59267818 59268056 -122480031 + RLTR18-int LTR ERVK 4959 5155 -206 3 1037 857 206 94 0 chr2 59268250 59268420 -122479667 + RLTR18-int LTR ERVK 5172 5357 -4 3 1037 2325 213 88 9 chr2 59268427 59268892 -122479195 + RLTR18B LTR ERVK 3 504 -8 3 1037 289 327 92 76 chr2 59269600 59269838 -122478249 + MLT1J LTR MaLR 171 412 -100 3 1037 491 312 93 45 chr2 59270292 59270624 -122477463 + LTR84b LTR ERVL 41 388 -373 3 1037 2554 83 0 12 chr2 59273309 59273640 -122474447 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 3 1037 2069 145 88 34 chr2 59274072 59274458 -122473629 - MTC LTR MaLR -2 419 13 3 1037 238 354 0 12 chr2 59275227 59275310 -122472777 + MLT1L LTR MaLR 396 477 -133 3 1037 887 253 136 38 chr2 59281899 59282244 -122465843 - MLT1B LTR MaLR -8 382 4 3 1037 387 284 97 74 chr2 59283480 59283738 -122464349 + MLT1B LTR MaLR 103 366 -24 3 1037 1842 198 29 27 chr2 59286934 59287351 -122460736 - MTD LTR MaLR -14 405 2 3 1037 551 330 77 37 chr2 59294096 59294395 -122453692 + MLT1J LTR MaLR 9 319 -193 3 1037 1766 128 122 3 chr2 59294399 59294720 -122453367 - ORR1B2 LTR MaLR -8 359 1 3 1037 226 244 62 62 chr2 59294872 59294968 -122453119 - MTEb LTR MaLR 0 379 284 3 1037 2240 139 49 26 chr2 59295294 59295679 -122452408 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 3 1037 835 197 67 77 chr2 59296159 59296364 -122451723 + MT2B LTR ERVL 84 286 -315 3 1037 6655 139 5 75 chr2 59296324 59297663 -122450424 + ORR1B1-int LTR MaLR 718 1963 0 3 1037 1431 153 10 87 chr2 59297663 59297963 -122450124 + ORR1B1 LTR MaLR 1 277 -52 3 1037 369 173 84 12 chr2 59298423 59298524 -122449563 + ORR1B1 LTR MaLR 270 368 -11 3 1037 737 167 14 7 chr2 59298672 59298811 -122449276 - MTD LTR MaLR -12 407 268 3 1037 299 183 167 24 chr2 59298866 59298950 -122449137 - MTD LTR MaLR -149 270 175 3 1037 234 281 0 109 chr2 59299081 59299173 -122448914 - MTD LTR MaLR -257 162 81 3 1037 663 293 166 63 chr2 59300031 59300490 -122447597 - MLT2B2 LTR ERVL -9 506 1 3 1037 566 290 93 93 chr2 59303319 59303548 -122444539 + MLT1B LTR MaLR 29 257 -133 3 1037 566 290 93 93 chr2 59303593 59303717 -122444370 + MLT1B LTR MaLR 258 382 -8 3 1037 2319 78 63 141 chr2 59304177 59304623 -122443464 - RLTR10A LTR ERVK 0 411 1 4 1037 262 409 12 12 chr2 59306460 59306621 -122441466 - LTR40a LTR ERVL -172 347 187 4 1037 1004 200 221 62 chr2 59314956 59315096 -122432991 + ORR1C1 LTR MaLR 1 169 -209 4 1037 1004 200 221 62 chr2 59315153 59315337 -122432750 + ORR1C1 LTR MaLR 170 376 -2 4 1037 5342 124 94 6 chr2 59316855 59317734 -122430353 - RMER17B LTR ERVK -1 957 1 4 1037 345 170 29 154 chr2 59321717 59321821 -122426266 - MT2B LTR ERVL -361 240 150 4 1037 1947 198 41 10 chr2 59332852 59333240 -122414847 + MTD LTR MaLR 1 400 -19 4 1037 500 323 80 33 chr2 59335477 59335752 -122412335 - LTR48 LTR ERV1 -23 764 477 4 1037 1669 185 154 0 chr2 59339871 59340234 -122407853 + MTD LTR MaLR 1 419 0 4 1037 2338 81 48 0 chr2 59344464 59344774 -122403313 - ORR1A2 LTR MaLR -2 325 1 4 1037 1092 146 103 23 chr2 59344989 59345355 -122402732 - RMER6B LTR ERVK -10 451 1 4 1037 1150 249 108 37 chr2 59352663 59353014 -122395073 + MTE2b LTR MaLR 1 376 -3 5 1037 1723 223 95 10 chr2 59353095 59353579 -122394508 + RLTR11A2 LTR ERVK 2 526 -1 5 1037 663 276 222 41 chr2 59355448 59355812 -122392275 - MLT1D LTR MaLR -62 443 14 5 1037 2193 132 58 0 chr2 59356345 59356554 -122391533 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 169 5 1037 2193 132 58 0 chr2 59357056 59357211 -122390876 - ORR1B1 LTR MaLR -226 168 3 5 1037 2957 119 38 17 chr2 59357209 59357689 -122390398 - ORR1B1-int LTR MaLR -3 1506 1017 5 1037 3315 83 21 64 chr2 59357690 59358220 -122389867 - RMER2 LTR ERV1 0 567 61 5 1037 2565 184 127 20 chr2 59362514 59363067 -122385020 - RMER20B LTR ERVK -13 614 3 5 1037 438 271 108 20 chr2 59364565 59364768 -122383319 - MLT1D LTR MaLR -237 268 48 5 1037 339 270 14 0 chr2 59368199 59368273 -122379814 - MTE-int LTR MaLR -486 1094 1020 5 1037 482 313 79 36 chr2 59369803 59370055 -122378032 - MER110 LTR ERV1 -183 308 46 5 1037 304 398 56 9 chr2 59374020 59374233 -122373854 - MLT1A LTR MaLR 0 390 168 5 1037 430 273 92 21 chr2 59374960 59375102 -122372985 - MLT1A LTR MaLR -214 160 9 5 1037 279 319 83 30 chr2 59375312 59375480 -122372607 + MER110 LTR ERV1 183 359 -132 5 1038 341 255 0 109 chr2 59381180 59381206 -122366881 - MT2B LTR ERVL -444 157 144 5 1038 262 302 120 55 chr2 59383702 59383993 -122364094 + RMER12 LTR ERVK 699 1008 -314 5 1038 2182 107 3 36 chr2 59387250 59387580 -122360507 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 5 1038 1235 247 107 57 chr2 59390721 59391228 -122356859 + MTC-int LTR MaLR 31 562 -696 6 1038 515 116 63 0 chr2 59391227 59391322 -122356765 - ORR1A4-int LTR MaLR -1862 101 1 6 1038 2044 110 6 6 chr2 59391327 59391647 -122356440 - ORR1A4 LTR MaLR -9 320 1 6 1038 1029 275 55 52 chr2 59391647 59392035 -122356052 + MTC-int LTR MaLR 763 1151 -107 6 1038 251 269 152 9 chr2 59392627 59392732 -122355355 - LTR33 LTR ERVL -5 510 391 6 1038 510 287 61 130 chr2 59398594 59398987 -122349100 + LTR37A LTR ERV1 48 413 -13 6 1038 311 331 64 35 chr2 59400057 59400229 -122347858 - MLT1I LTR MaLR -194 217 41 6 1038 1494 205 8 53 chr2 59403121 59403312 -122344775 + ORR1D2 LTR MaLR 1 177 -193 6 1038 1494 205 8 53 chr2 59403343 59403511 -122344576 + ORR1D2 LTR MaLR 178 344 -26 6 1038 1847 179 169 20 chr2 59405510 59406006 -122342081 + RMER15 LTR ERVL 1 570 -5 6 1038 643 167 0 0 chr2 59410955 59411063 -122337024 + RLTR19-int LTR ERVK 3519 3626 -2511 6 1038 442 157 16 129 chr2 59411294 59411418 -122336669 + RLTR19-int LTR ERVK 3594 3703 -2434 6 1038 2954 169 45 53 chr2 59411430 59411551 -122336536 + RLTR19-int LTR ERVK 3801 3921 -2216 6 1038 2954 169 45 53 chr2 59411698 59412176 -122335911 + RLTR19-int LTR ERVK 3922 4395 -1742 6 1038 1307 226 155 146 chr2 59419559 59420087 -122328000 - MT2A LTR ERVL 0 533 1 6 1038 1591 145 126 9 chr2 59421356 59421689 -122326398 + ORR1D1 LTR MaLR 1 372 -2 6 1038 1057 240 90 119 chr2 59424883 59425008 -122323079 + MTD LTR MaLR 8 127 -292 7 1038 1057 240 90 119 chr2 59425193 59425488 -122322599 + MTD LTR MaLR 128 416 -3 7 1038 447 332 78 20 chr2 59425571 59425866 -122322221 - MLT1I LTR MaLR 0 411 100 7 1038 467 327 84 12 chr2 59426277 59426713 -122321374 - MLT1F LTR MaLR -19 560 31 7 1038 230 269 31 51 chr2 59429096 59429194 -122318893 + RLTR14 LTR ERV1 286 381 -1 7 1038 613 265 229 15 chr2 59429787 59430119 -122317968 + MLT1F LTR MaLR 142 544 -4 7 1038 687 266 49 66 chr2 59430229 59430652 -122317435 - RLTR11A2 LTR ERVK -26 427 19 7 1038 362 337 52 30 chr2 59439036 59439233 -122308854 + LTR50 LTR ERVL 1 210 -321 7 1038 3228 50 2 27 chr2 59444098 59444506 -122303581 - MTB LTR MaLR -2 398 1 7 1038 226 220 71 71 chr2 59444642 59444740 -122303347 + MTB LTR MaLR 198 295 -105 7 1038 247 212 72 187 chr2 59461571 59461710 -122286377 - MT2B2 LTR ERVL -329 255 133 7 1038 1213 221 110 7 chr2 59461908 59462218 -122285869 - ORR1D2 LTR MaLR -3 367 26 7 1038 1843 185 69 39 chr2 59465233 59465639 -122282448 - MTC LTR MaLR -3 418 1 7 1038 748 214 119 5 chr2 59469506 59469699 -122278388 - MTD LTR MaLR -6 413 199 8 1038 2644 56 144 19 chr2 59469960 59470322 -122277765 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 8 1038 587 247 129 22 chr2 59470440 59470618 -122277469 - MTD LTR MaLR -222 197 1 8 1038 840 197 94 22 chr2 59472560 59472793 -122275294 - ORR1D2 LTR MaLR 0 374 122 8 1038 603 120 234 14 chr2 59472793 59472938 -122275149 - RMER6D LTR ERVK 0 720 544 8 1038 3589 138 2 12 chr2 59473228 59473789 -122274298 - RMER6D LTR ERVK -165 555 1 8 1038 562 207 16 8 chr2 59473790 59473912 -122274175 - ORR1D2 LTR MaLR -243 127 5 8 1038 910 228 179 25 chr2 59474358 59474677 -122273410 + MTD LTR MaLR 39 406 -13 8 1038 632 279 78 117 chr2 59474717 59474833 -122273254 - RMER10A LTR ERVL -13 429 310 8 1038 632 279 78 117 chr2 59475015 59475333 -122272754 - RMER10A LTR ERVL -133 309 12 8 1038 1476 138 116 119 chr2 59475592 59475979 -122272108 + ORR1B1 LTR MaLR 1 386 -8 8 1038 1405 236 29 46 chr2 59488808 59489155 -122258932 + ORR1D2 LTR MaLR 1 341 -29 8 1038 311 71 0 0 chr2 59489506 59489548 -122258539 + ORR1D2 LTR MaLR 329 370 0 8 1038 828 218 271 20 chr2 59490543 59490838 -122257249 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 2 8 1038 290 323 12 76 chr2 59493359 59493530 -122254557 - MLT1A LTR MaLR -214 160 1 8 1038 426 282 84 64 chr2 59495965 59496215 -122251872 - MLT1B LTR MaLR -16 374 120 8 1038 260 279 218 16 chr2 59500231 59500355 -122247732 - MLT1A1 LTR MaLR -127 281 133 1 1038 233 347 61 83 chr2 59503310 59503442 -122244645 + LTR33A_ LTR ERVL 254 382 -149 1 1038 1895 146 127 14 chr2 59504568 59504922 -122243165 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 1 1038 285 303 64 10 chr2 59505151 59505282 -122242805 - ORR1E LTR MaLR -3 416 239 1 1038 368 284 73 0 chr2 59505361 59505470 -122242617 - ORR1E LTR MaLR -242 117 1 1 1038 1739 106 113 23 chr2 59505522 59505822 -122242265 + ORR1A4 LTR MaLR 1 327 -2 1 1038 374 259 89 0 chr2 59505888 59506000 -122242087 + MTD LTR MaLR 284 405 -14 1 1039 1948 214 50 90 chr2 59516256 59516872 -122231215 - RMER13B LTR ERVK -365 543 1 3 1039 250 324 74 129 chr2 59519905 59520107 -122227980 + MLT1A1 LTR MaLR 1 191 -217 4 1039 232 272 43 21 chr2 59525673 59525767 -122222320 + RMER15 LTR ERVL 422 517 -58 5 1039 253 230 68 0 chr2 59532509 59532583 -122215504 - RLTR25B LTR ERVK -440 588 510 6 1039 1661 122 150 3 chr2 59532588 59532875 -122215212 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 6 1039 1738 157 80 88 chr2 59532875 59533288 -122214799 - ORR1A4-int LTR MaLR -192 1600 1119 6 1039 1846 191 91 18 chr2 59544108 59544491 -122203596 + MTD LTR MaLR 1 411 -8 9 1039 577 293 33 14 chr2 59546376 59546587 -122201500 - MLT1A LTR MaLR -3 371 157 9 1039 238 189 66 124 chr2 59548070 59548191 -122199896 - RLTR40 LTR ERVK -161 656 543 1 1039 328 331 58 40 chr2 59554193 59554366 -122193721 + MLT1C LTR MaLR 1 176 -291 1 1039 593 316 90 35 chr2 59554486 59554742 -122193345 + MLT1C LTR MaLR 188 457 -10 1 1039 951 294 85 31 chr2 59564538 59564984 -122183103 + MER31A LTR ERV1 12 481 -4 1 1039 892 205 0 0 chr2 59567406 59567567 -122180520 + MERVL_2A-int LTR ERVL 3869 4029 -1732 1 1039 974 129 26 0 chr2 59567567 59567722 -122180365 + ORR1D1 LTR MaLR 1 159 -215 1 1039 312 259 112 203 chr2 59568000 59568159 -122179928 + ORR1D1 LTR MaLR 164 318 -56 1 1039 312 259 112 203 chr2 59568305 59568377 -122179710 + ORR1D1 LTR MaLR 319 374 0 1 1039 1651 167 80 0 chr2 59568377 59568665 -122179422 + MERVL_2A-int LTR ERVL 4028 4338 -1423 1 1039 475 217 0 0 chr2 59568665 59568748 -122179339 + MERVL_2A-int LTR ERVL 4280 4362 -1123 1 1039 299 276 343 46 chr2 59576073 59576340 -122171747 + MLT1A0 LTR MaLR 11 356 -18 1 1039 1491 260 93 15 chr2 59580044 59580516 -122167571 - RMER20A LTR ERVK -1 515 7 1 1039 274 234 71 47 chr2 59582867 59582952 -122165135 - MT2B LTR ERVL -362 239 153 1 1039 1947 110 60 19 chr2 59589683 59589998 -122158089 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 2 1 1039 655 314 72 75 chr2 59601314 59601404 -122146683 - MLT1A0 LTR MaLR -5 360 287 1 1039 655 314 72 75 chr2 59601453 59601723 -122146364 - MLT1A0 LTR MaLR -79 286 1 1 1039 1194 241 138 29 chr2 59602945 59603321 -122144766 + MTD LTR MaLR 3 419 0 1 1039 1845 166 86 52 chr2 59615215 59615634 -122132453 - RLTR20A LTR ERVK -108 433 1 2 1039 330 238 83 38 chr2 59615634 59615785 -122132302 + RLTR21 LTR ERVK 1093 1250 -322 2 1040 294 298 109 11 chr2 59657330 59657513 -122090574 - MLT1D LTR MaLR -117 388 188 2 1040 379 243 106 116 chr2 59659418 59659574 -122088513 - MLT1E1A LTR MaLR -60 620 423 2 1040 444 328 79 68 chr2 59670769 59671047 -122077040 - MLT1G1 LTR MaLR -75 504 224 2 1040 620 214 110 22 chr2 59675793 59675975 -122072112 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 177 2 1040 628 148 9 0 chr2 59675990 59676098 -122071989 - ORR1D1 LTR MaLR -264 110 2 2 1040 580 271 98 25 chr2 59698354 59698558 -122049529 + MLT1A0 LTR MaLR 147 365 0 3 1040 1064 214 190 9 chr2 59701254 59701575 -122046512 - MTC LTR MaLR 0 421 43 3 1040 257 246 24 16 chr2 59715965 59715982 -122032105 + ORR1B1-int LTR MaLR 630 647 -862 3 1040 1433 202 107 21 chr2 59718042 59718380 -122029707 - ORR1D1 LTR MaLR -7 367 1 3 1040 1413 214 100 20 chr2 59721664 59722013 -122026074 + MTE2b LTR MaLR 2 378 -1 3 1040 1317 201 122 21 chr2 59723016 59723352 -122024735 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 5 3 1040 580 250 196 56 chr2 59727914 59728236 -122019851 + RLTR9A LTR ERVK 2 368 0 4 1040 315 315 36 9 chr2 59728246 59728358 -122019729 - MLT1I LTR MaLR -8 403 289 4 1040 269 291 161 48 chr2 59733000 59733249 -122014838 + MLT2B4 LTR ERVL 16 292 -264 4 1040 395 265 50 25 chr2 59733345 59733465 -122014622 - MLT1F1 LTR MaLR -44 525 403 4 1040 327 284 176 7 chr2 59733516 59733658 -122014429 - MLT1F1 LTR MaLR -343 205 40 4 1040 4344 123 105 1 chr2 59734234 59734902 -122013185 + RMER19A LTR ERVK 1 737 0 4 1041 263 244 107 24 chr2 59789398 59789482 -121958605 - MT2B LTR ERVL -336 265 175 4 1041 327 246 8 149 chr2 59799552 59799686 -121948401 - MT2B LTR ERVL -332 269 155 5 1041 810 131 0 8 chr2 59829332 59829455 -121918632 + ORR1A4 LTR MaLR 200 321 -8 5 1041 470 264 128 6 chr2 59832077 59832233 -121915854 - MLT2B1 LTR ERVL -345 175 1 5 1041 343 260 93 47 chr2 59838145 59838274 -121909813 + MLT1A0 LTR MaLR 13 147 -218 5 1041 444 303 71 18 chr2 59838414 59838582 -121909505 + RMER15 LTR ERVL 275 451 -124 5 1041 229 267 34 144 chr2 59839160 59839278 -121908809 + MLT1A0 LTR MaLR 1 105 -303 5 1041 644 248 7 0 chr2 59839551 59839692 -121908395 + MLT1A0 LTR MaLR 224 365 0 5 1041 231 191 123 31 chr2 59841099 59841164 -121906923 + MLT1L LTR MaLR 212 282 -328 5 1041 1423 219 50 85 chr2 59857531 59857983 -121890104 - MTD LTR MaLR -11 410 1 6 1041 242 338 99 25 chr2 59858079 59858172 -121889915 + MTE2b LTR MaLR 205 311 -68 6 1041 242 338 99 25 chr2 59858349 59858416 -121889671 + MTE2b LTR MaLR 312 376 -3 6 1041 1265 204 152 36 chr2 59861284 59861644 -121886443 - MTD LTR MaLR -41 378 1 6 1041 1444 140 281 28 chr2 59890656 59891009 -121857078 - RMER10A LTR ERVL 0 442 1 6 1041 295 323 140 49 chr2 59895267 59895596 -121852491 + ORR1E LTR MaLR 1 359 0 6 1041 1338 142 9 9 chr2 59897561 59897774 -121850313 + MT2B2 LTR ERVL 265 477 -107 6 1041 2094 68 0 0 chr2 59897740 59898003 -121850084 - MT2B2 LTR ERVL -321 263 1 6 1042 2110 184 57 12 chr2 59900342 59900743 -121847344 + MTC LTR MaLR 3 421 0 7 1042 2285 154 8 14 chr2 59902478 59902839 -121845248 + ORR1B2 LTR MaLR 1 359 -8 7 1042 1419 231 121 14 chr2 59903429 59903794 -121844293 - MTD LTR MaLR -14 405 2 7 1042 330 279 10 31 chr2 59906641 59906737 -121841350 - MTE2a LTR MaLR -13 366 273 7 1042 441 269 65 78 chr2 59909050 59909263 -121838824 - MTE-int LTR MaLR -704 876 559 7 1042 590 329 47 4 chr2 59909348 59909580 -121838507 - MTE-int LTR MaLR -1218 362 121 7 1042 830 199 57 24 chr2 59918981 59919304 -121828783 - RMER10A LTR ERVL -63 379 4 7 1042 423 273 86 0 chr2 59921314 59921442 -121826645 - MER57D LTR ERV1 -12 399 261 7 1042 363 295 61 106 chr2 59922522 59922768 -121825319 + MER21B LTR ERV1 13 247 -616 7 1042 2882 162 19 32 chr2 59923016 59923550 -121824537 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 527 0 7 1042 1045 222 209 15 chr2 59925735 59926074 -121822013 + MTD LTR MaLR 1 405 -14 7 1042 2425 149 97 32 chr2 59926243 59926747 -121821340 - RMER19B LTR ERVK -18 884 348 7 1042 961 153 22 201 chr2 59926761 59927030 -121821057 - RMER19B LTR ERVK -679 223 3 7 1042 290 339 124 48 chr2 59932764 59932950 -121815137 + MER77 LTR ERVL 406 605 -2 7 1042 227 376 109 14 chr2 59932950 59933012 -121815075 + MER21B LTR ERV1 553 635 -228 7 1042 3134 80 5 5 chr2 59933154 59933554 -121814533 - MTB LTR MaLR 0 400 1 7 1042 1279 180 111 100 chr2 59937505 59937694 -121810393 + ORR1C1 LTR MaLR 5 199 -179 7 1042 1279 180 111 100 chr2 59937739 59937919 -121810168 + ORR1C1 LTR MaLR 200 378 0 7 1042 693 271 97 41 chr2 59971196 59971515 -121776572 - ORR1E LTR MaLR 0 359 23 8 1042 1159 186 122 15 chr2 59973953 59974215 -121773872 - ORR1C2 LTR MaLR -94 290 1 8 1042 1148 292 21 53 chr2 59976574 59976950 -121771137 + MLT1A0 LTR MaLR 1 364 -1 8 1042 1014 204 29 50 chr2 59984224 59984565 -121763522 - RMER17C LTR ERVK 0 410 77 8 1042 753 188 36 66 chr2 59984560 59984858 -121763229 - RMER17C LTR ERVK -327 482 1 8 1042 328 321 42 12 chr2 59986018 59986185 -121761902 + MER52-int LTR ERV1 1694 1865 -5226 8 1042 1426 144 72 27 chr2 59987194 59987457 -121760630 - ORR1A4 LTR MaLR -53 276 2 8 1042 1303 145 92 17 chr2 59987492 59987723 -121760364 + MT2A LTR ERVL 6 254 -279 8 1042 1576 148 189 3 chr2 59987723 59988041 -121760046 - ORR1C1 LTR MaLR -1 377 1 8 1042 439 196 225 12 chr2 59988042 59988222 -121759865 + MT2A LTR ERVL 371 598 -3 8 1042 347 315 30 30 chr2 59988474 59988605 -121759482 + MER52-int LTR ERV1 4504 4634 -2457 8 1042 263 303 0 100 chr2 59991343 59991453 -121756634 - ORR1E LTR MaLR -164 195 97 8 1042 250 230 187 13 chr2 59991507 59991582 -121756505 - MLT1A1 LTR MaLR -300 108 21 8 1042 247 272 0 176 chr2 59992344 59992469 -121755618 - MT2B2 LTR ERVL -303 281 179 8 1042 230 277 94 0 chr2 59992652 59992811 -121755276 - ORR1E-int LTR MaLR -755 754 581 8 1042 902 233 130 136 chr2 60001724 60002340 -121745747 + RLTR18 LTR ERVK 1 612 -4 9 1042 1174 182 58 72 chr2 60007764 60008094 -121739993 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 41 2 1042 572 172 40 7 chr2 60008096 60008236 -121739851 - ORR1C2 LTR MaLR -257 137 1 2 1042 3610 114 142 11 chr2 60012027 60012689 -121735398 - RMER6A LTR ERVK -7 749 1 3 1042 288 328 74 21 chr2 60025705 60025886 -121722201 - MLT1D LTR MaLR -4 463 286 7 1042 447 306 98 17 chr2 60025943 60026116 -121721971 - MLT1D LTR MaLR -313 192 6 7 1042 539 352 32 84 chr2 60028746 60029093 -121718994 + MER21B LTR ERV1 13 341 -522 8 1042 254 328 126 23 chr2 60029330 60029505 -121718582 + MER21B LTR ERV1 505 697 -166 8 1043 431 305 91 27 chr2 60031485 60031748 -121716339 + MLT1B LTR MaLR 30 309 -81 9 1043 1894 115 45 10 chr2 60032082 60032390 -121715697 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 9 1043 1176 225 50 82 chr2 60032438 60032815 -121715272 - MTEa LTR MaLR -4 375 11 9 1043 501 222 0 0 chr2 60040052 60040160 -121707927 - MLT1A1 LTR MaLR -2 406 299 1 1043 404 289 154 0 chr2 60040165 60040321 -121707766 - MLT1A1 LTR MaLR -26 382 203 1 1043 1971 158 336 0 chr2 60041052 60041490 -121706597 + RMER4B LTR ERVK 1 585 0 1 1043 1242 268 18 66 chr2 60042183 60042578 -121705509 - MTE2a LTR MaLR 0 379 4 1 1043 1026 237 44 27 chr2 60042859 60043154 -121704933 + MTEa LTR MaLR 2 301 -78 1 1043 1511 202 142 6 chr2 60043168 60043527 -121704560 - MTD LTR MaLR -8 411 4 1 1043 324 233 4 4 chr2 60043527 60043602 -121704485 + MTEa LTR MaLR 305 379 0 1 1043 1109 247 64 49 chr2 60043670 60044061 -121704026 + MLT2C1 LTR ERVL 1 397 0 1 1043 355 231 75 19 chr2 60059375 60059481 -121688606 + MTEa LTR MaLR 39 150 -209 1 1043 386 182 97 131 chr2 60059498 60059643 -121688444 + MTEa LTR MaLR 232 371 -8 1 1043 1862 161 22 21 chr2 60093564 60093944 -121654143 + RMER13B LTR ERVK 1 297 -611 2 1043 2165 125 40 11 chr2 60096402 60096751 -121651336 + ORR1C1 LTR MaLR 1 359 -19 2 1043 1819 173 69 0 chr2 60098424 60098770 -121649317 + ORR1D1 LTR MaLR 3 372 -2 2 1043 6068 173 40 74 chr2 60098775 60100189 -121647898 - ORR1D1-int LTR MaLR -2 1368 3 2 1043 1568 175 129 6 chr2 60100191 60100524 -121647563 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 2 1043 2033 147 101 8 chr2 60101239 60101616 -121646471 - MTC LTR MaLR 0 421 10 2 1043 2109 158 73 103 chr2 60101671 60102216 -121645871 - RLTR24 LTR ERV1 0 529 1 2 1043 618 316 161 61 chr2 60104921 60105380 -121642707 - MLT2B3 LTR ERVL -47 507 3 2 1043 2937 61 200 9 chr2 60106647 60107077 -121641010 + RLTR1B LTR ERV1 1 512 0 2 1043 273 303 81 18 chr2 60107609 60107720 -121640367 - MLT1H1 LTR MaLR -380 175 58 2 1043 344 285 22 65 chr2 60108093 60108232 -121639855 + RLTR40 LTR ERVK 34 166 -651 2 1043 630 273 80 52 chr2 60109221 60109339 -121638748 + RLTR40 LTR ERVK 174 286 -531 2 1043 630 273 80 52 chr2 60109397 60109664 -121638423 + RLTR40 LTR ERVK 287 570 -247 2 1043 1919 139 75 39 chr2 60111526 60111885 -121636202 + ORR1B1 LTR MaLR 21 392 -2 2 1043 708 239 284 37 chr2 60114822 60115109 -121632978 - MTE2b LTR MaLR 0 379 22 2 1043 349 311 164 8 chr2 60115128 60115378 -121632709 - MLT1F LTR MaLR 0 548 260 2 1043 331 253 65 11 chr2 60115401 60115493 -121632594 + ORR1E LTR MaLR 1 97 -262 2 1043 264 301 38 61 chr2 60115567 60115698 -121632389 + ORR1E LTR MaLR 246 373 -6 2 1043 532 241 268 29 chr2 60115713 60116128 -121631959 + ORR1E-int LTR MaLR 14 527 -1053 2 1043 1924 274 127 24 chr2 60116110 60116813 -121631274 + ORR1E-int LTR MaLR 779 1553 -27 2 1043 436 231 80 62 chr2 60116801 60117070 -121631017 + ORR1E LTR MaLR 34 352 -27 2 1043 989 268 62 87 chr2 60117389 60117409 -121630678 - MLT2B1 LTR ERVL -82 438 419 2 1043 989 268 62 87 chr2 60117452 60117880 -121630207 - MLT2B1 LTR ERVL -102 418 1 2 1043 2276 98 3 60 chr2 60124198 60124547 -121623540 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 2 1043 2752 177 21 23 chr2 60125547 60126009 -121622078 + RLTR20B2 LTR ERVK 1 463 -97 2 1043 2752 177 21 23 chr2 60126049 60126147 -121621940 + RLTR20B2 LTR ERVK 464 559 -1 2 1043 669 143 67 0 chr2 60128034 60128153 -121619934 + ORR1B1 LTR MaLR 260 386 -8 3 1043 3389 33 0 50 chr2 60134327 60134744 -121613343 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 1043 7773 16 2 1 chr2 60134744 60135714 -121612373 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 971 -127 3 1043 2290 28 3 0 chr2 60135714 60136001 -121612086 + MTA_Mm LTR MaLR 109 396 0 3 1043 538 291 86 45 chr2 60136388 60136701 -121611386 + ORR1D2 LTR MaLR 1 326 -44 3 1043 853 232 128 69 chr2 60148750 60149055 -121599032 + ORR1E LTR MaLR 2 324 -35 3 1044 856 270 122 33 chr2 60165077 60165406 -121582681 - MER57C2 LTR ERV1 -25 409 52 3 1044 955 246 59 73 chr2 60175689 60176114 -121571973 + RMER16 LTR ERVK 113 531 -2 3 1044 418 301 112 5 chr2 60182954 60183151 -121564936 + LTR82A LTR ERVL 99 316 -556 4 1044 2070 151 0 0 chr2 60197874 60198211 -121549876 + ORR1B1 LTR MaLR 1 337 -57 4 1044 301 330 125 32 chr2 60203327 60203606 -121544481 - LTR84b LTR ERVL -2 759 455 4 1044 2124 196 14 5 chr2 60205463 60205879 -121542208 + MTC LTR MaLR 2 421 0 4 1044 382 288 9 9 chr2 60215311 60215423 -121532664 + MamGypLTR1a LTR Gypsy 673 784 0 4 1044 1175 211 114 7 chr2 60219661 60220002 -121528085 - MTD LTR MaLR 0 419 22 4 1044 588 282 75 23 chr2 60228252 60228517 -121519570 + LTR33A LTR ERVL 1 279 -241 4 1044 1023 228 137 22 chr2 60234929 60235270 -121512817 + MTD LTR MaLR 8 405 -14 5 1044 316 345 21 63 chr2 60240031 60240220 -121507867 + LTR33B LTR ERVL 321 501 -2 5 1044 277 312 35 84 chr2 60240261 60240464 -121507623 - MLT1N2 LTR MaLR -6 556 364 5 1044 3261 66 14 5 chr2 60240994 60241435 -121506652 - BGLII_A LTR ERVK 0 445 1 5 1044 3450 33 2 0 chr2 60261552 60261947 -121486140 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 1044 738 202 57 17 chr2 60266975 60267151 -121480936 + ORR1D1 LTR MaLR 5 187 -187 5 1044 231 284 62 35 chr2 60267625 60267738 -121480349 + RMER12 LTR ERVK 741 856 -466 5 1044 283 225 93 50 chr2 60285051 60285169 -121462918 + MLT1A0 LTR MaLR 12 129 -279 5 1044 1596 189 63 11 chr2 60287841 60288188 -121459899 + ORR1B2 LTR MaLR 3 367 0 5 1045 653 321 88 11 chr2 60295707 60295981 -121452106 + MER70B LTR ERVL 141 435 -143 6 1045 3464 25 5 0 chr2 60298068 60298462 -121449625 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 1045 1161 223 61 30 chr2 60299704 60300000 -121448087 + MTB_Mm LTR MaLR 50 354 -53 6 1045 1167 218 137 16 chr2 60302431 60302753 -121445334 + MTD LTR MaLR 2 362 -57 6 1045 1893 145 30 81 chr2 60302763 60303132 -121444955 - ORR1B1 LTR MaLR -44 350 1 6 1045 3910 48 2 34 chr2 60305719 60306217 -121441870 + LTRIS_Mm LTR ERV1 1 482 0 6 1045 1854 162 99 3 chr2 60308904 60309238 -121438849 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 2 6 1045 4490 115 49 19 chr2 60309844 60310578 -121437509 - RMER6A LTR ERVK 0 756 1 6 1045 2430 214 24 12 chr2 60315360 60315861 -121432226 + RLTR18B LTR ERVK 1 507 -5 6 1045 1022 122 34 196 chr2 60319098 60319425 -121428662 - RMER6C LTR ERVK 0 690 417 6 1045 225 167 71 0 chr2 60319455 60319497 -121428590 - MT2B2 LTR ERVL -386 198 154 6 1045 528 136 0 11 chr2 60319511 60319600 -121428487 - MT2B LTR ERVL -342 259 172 6 1045 238 143 71 0 chr2 60319852 60319894 -121428193 + MT2B2 LTR ERVL 154 198 -386 6 1045 743 184 34 7 chr2 60320268 60320435 -121427652 - ORR1D1 LTR MaLR -56 318 124 6 1045 576 202 99 99 chr2 60320518 60320699 -121427388 - ORR1D1 LTR MaLR -193 181 1 6 1045 945 109 86 129 chr2 60322250 60322482 -121425605 + ORR1B1 LTR MaLR 3 224 -170 6 1045 1222 96 0 0 chr2 60328588 60328766 -121419321 + ORR1A4 LTR MaLR 152 329 0 6 1045 2411 147 13 13 chr2 60328918 60329311 -121418776 - ORR1B1 LTR MaLR -1 393 1 6 1045 2081 182 24 17 chr2 60330477 60330895 -121417192 + MTC LTR MaLR 1 421 0 6 1045 242 326 97 0 chr2 60331760 60331904 -121416183 + RMER15 LTR ERVL 403 560 -15 6 1045 2303 104 62 5 chr2 60337580 60337965 -121410122 - MTC LTR MaLR -3 418 12 6 1045 1324 190 182 6 chr2 60344857 60345175 -121402912 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 6 1045 1698 150 37 96 chr2 60346558 60346934 -121401153 + ORR1B1 LTR MaLR 41 394 0 6 1045 7635 140 114 162 chr2 60346934 60348996 -121399091 + ORR1B1-int LTR MaLR 1 1963 0 6 1045 1735 133 73 76 chr2 60349000 60349357 -121398730 + ORR1B1 LTR MaLR 39 394 0 6 1045 1378 173 145 27 chr2 60356985 60357323 -121390764 + MTD LTR MaLR 21 398 -21 6 1045 553 266 7 0 chr2 60364262 60364405 -121383682 + MTD LTR MaLR 1 144 -275 7 1045 1252 187 118 14 chr2 60364988 60365276 -121382811 + ORR1D1 LTR MaLR 57 374 0 7 1045 1429 158 163 6 chr2 60366402 60366740 -121381347 + MTD LTR MaLR 1 391 -28 7 1045 1514 158 67 15 chr2 60369134 60369553 -121378534 + RMER17C LTR ERVK 16 439 -519 7 1045 378 288 82 28 chr2 60369707 60369889 -121378198 + RMER15 LTR ERVL 384 575 0 7 1045 1742 111 64 82 chr2 60375639 60375981 -121372106 + ORR1A1 LTR MaLR 2 337 -9 7 1045 1694 208 60 103 chr2 60378747 60379122 -121368965 + RMER5 LTR ERV1 1 382 -152 7 1045 1694 208 60 103 chr2 60379154 60379314 -121368773 + RMER5 LTR ERV1 383 513 -21 7 1045 534 261 91 97 chr2 60382905 60383244 -121364843 - MLT1B LTR MaLR -32 358 22 7 1045 980 242 158 30 chr2 60383262 60383590 -121364497 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 7 1045 364 306 16 0 chr2 60387310 60387431 -121360656 + LTR16C LTR ERVL 359 481 -8 7 1045 1258 242 105 22 chr2 60387864 60388235 -121359852 + MTD LTR MaLR 18 419 0 7 1045 1591 229 29 29 chr2 60388913 60389323 -121358764 + MTD LTR MaLR 3 412 -7 7 1045 3459 28 2 2 chr2 60394490 60394886 -121353201 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 7 1045 1020 265 103 14 chr2 60396407 60396696 -121351391 - MTE2a LTR MaLR 0 379 65 7 1045 657 146 0 0 chr2 60396696 60396806 -121351281 - BGLII_B LTR ERVK 0 441 332 7 1045 2476 99 11 22 chr2 60402314 60402677 -121345410 - RLTR10D LTR ERVK 0 359 1 7 1045 51933 63 12 12 chr2 60402677 60403769 -121344318 - IAP-d-int LTR ERVK 0 6542 5468 7 1045 2699 31 31 0 chr2 60403769 60404086 -121344001 + IAPLTR2b LTR ERVK 1 327 0 7 1045 51933 63 12 12 chr2 60404086 60409537 -121338550 - IAP-d-int LTR ERVK -1075 5467 1 7 1045 2527 101 6 16 chr2 60409537 60409900 -121338187 - RLTR10D LTR ERVK 0 359 1 7 1045 618 329 27 31 chr2 60411904 60412196 -121335891 + MLT1C LTR MaLR 175 465 -2 7 1045 857 117 15 6 chr2 60415314 60415472 -121332615 + ORR1A2 LTR MaLR 110 317 -57 7 1045 1114 235 140 15 chr2 60419974 60420303 -121327784 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 7 1045 4302 27 0 0 chr2 60422849 60423331 -121324756 - LTRIS_Mm LTR ERV1 0 482 1 7 1045 374 237 17 26 chr2 60423609 60423726 -121324361 - LTR16D LTR ERVL 0 651 536 7 1046 1915 147 6 3 chr2 60433242 60433583 -121314504 + RLTR16 LTR ERVK 11 352 -153 7 1046 278 287 23 11 chr2 60434398 60434486 -121313601 + RLTR16 LTR ERVK 405 493 -12 7 1046 532 260 132 30 chr2 60435945 60436179 -121311908 - MLT1B LTR MaLR -132 258 1 7 1046 2641 68 3 0 chr2 60448784 60449110 -121298977 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 8 1046 2782 19 68 0 chr2 60456311 60456635 -121291452 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 8 1046 2470 80 9 0 chr2 60456956 60457280 -121290807 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 8 1046 4062 126 43 20 chr2 60458898 60459610 -121288477 + RMER19A LTR ERVK 9 737 0 8 1046 508 240 27 27 chr2 60471992 60472142 -121275945 + MTE2a LTR MaLR 230 379 0 8 1046 1651 169 182 25 chr2 60473459 60473822 -121274265 + MTC LTR MaLR 1 420 -1 8 1046 635 239 45 6 chr2 60476381 60476537 -121271550 - ORR1D2 LTR MaLR -208 162 1 8 1046 282 290 81 139 chr2 60479943 60480324 -121267763 + ORR1E LTR MaLR 1 359 0 8 1046 1570 241 55 15 chr2 60495212 60495612 -121252475 - MTD LTR MaLR -1 418 3 8 1046 3081 59 25 5 chr2 60499285 60499677 -121248410 + MTB LTR MaLR 1 400 0 8 1046 231 263 118 29 chr2 60504852 60504954 -121243133 + MLT1J LTR MaLR 291 401 -111 9 1046 730 297 58 107 chr2 60515281 60515502 -121232585 + LTR40a LTR ERVL 10 208 -311 2 1046 730 297 58 107 chr2 60515586 60515842 -121232245 + LTR40a LTR ERVL 209 464 -55 2 1046 227 269 87 63 chr2 60526071 60526198 -121221889 - MLT1C LTR MaLR -124 343 214 4 1046 4005 150 66 25 chr2 60531779 60532578 -121215509 - RMER13B LTR ERVK -76 832 1 5 1046 291 294 137 105 chr2 60532578 60532844 -121215243 - MTEb LTR MaLR -104 275 1 6 1046 1561 182 126 8 chr2 60543979 60544344 -121203743 + MTC LTR MaLR 12 419 -2 7 1046 293 247 0 13 chr2 60544441 60544519 -121203568 + MTC LTR MaLR 84 160 -261 7 1046 2318 88 19 12 chr2 60545581 60545904 -121202183 - ORR1A2 LTR MaLR -2 325 1 7 1046 720 299 110 13 chr2 60550132 60550440 -121197647 - MLT2C1 LTR ERVL -57 340 3 8 1047 1394 260 69 0 chr2 60562139 60562489 -121185598 + MTEa LTR MaLR 1 374 -5 9 1047 1317 123 139 83 chr2 60576214 60576387 -121171700 - ORR1A3 LTR MaLR -8 318 108 1 1047 1317 137 148 72 chr2 60576576 60576738 -121171349 - ORR1A3 LTR MaLR -221 173 1 1 1047 753 255 113 141 chr2 60576777 60577096 -121170991 - MTE2b LTR MaLR -69 310 1 1 1047 430 305 158 23 chr2 60577786 60578051 -121170036 - MLT1B LTR MaLR -44 346 46 1 1047 254 284 56 22 chr2 60578132 60578222 -121169865 - MLT1B LTR MaLR -297 93 1 1 1047 243 291 12 12 chr2 60578455 60578535 -121169552 - MTE2b LTR MaLR -57 322 243 1 1047 2354 99 12 0 chr2 60580993 60581315 -121166772 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 1 1047 302 299 116 66 chr2 60602877 60603180 -121144907 + MLT1A1 LTR MaLR 50 408 0 1 1047 1057 253 111 24 chr2 60607494 60607871 -121140216 + MTD LTR MaLR 10 419 0 1 1047 417 289 139 84 chr2 60615320 60615652 -121132435 + MLT1B LTR MaLR 34 383 -7 1 1047 848 272 70 68 chr2 60615940 60616295 -121131792 + MTE2a LTR MaLR 19 374 -5 1 1047 2983 93 15 2 chr2 60616878 60617278 -121130809 + MTB_Mm LTR MaLR 1 405 -2 1 1047 292 300 154 60 chr2 60646918 60647342 -121100745 + MLT1C LTR MaLR 2 623 -4 1 1047 826 272 36 15 chr2 60647730 60648025 -121100062 + ORR1E LTR MaLR 2 296 -74 1 1047 1605 184 102 31 chr2 60662888 60663280 -121084807 - MTC LTR MaLR 0 421 2 2 1047 3072 75 10 19 chr2 60668445 60668856 -121079231 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 2 1047 2095 102 41 6 chr2 60673695 60674011 -121074076 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 2 1047 1875 192 56 3 chr2 60685574 60685950 -121062137 - MTD LTR MaLR -5 414 19 2 1048 1019 203 118 22 chr2 60687828 60688100 -121059987 - MTD LTR MaLR 0 419 122 2 1048 259 222 127 0 chr2 60688335 60688398 -121059689 - MTD LTR MaLR -348 73 3 2 1048 320 241 47 6 chr2 60695256 60695362 -121052725 - ORR1D2 LTR MaLR 0 379 267 2 1048 468 218 112 75 chr2 60695352 60695486 -121052601 - ORR1D2 LTR MaLR -227 143 5 2 1048 276 231 187 28 chr2 60695505 60695612 -121052475 - MLT1C LTR MaLR -338 129 6 2 1048 2959 152 37 68 chr2 60695833 60696426 -121051661 - RMER15 LTR ERVL 0 575 1 2 1048 818 194 187 11 chr2 60696428 60696712 -121051375 - RMER15-int LTR ERVL -28 4971 4638 2 1048 311 213 53 13 chr2 60696720 60696796 -121051291 - RMER15 LTR ERVL -3 572 494 2 1048 2105 223 39 81 chr2 60696797 60697406 -121050681 + RMER15-int LTR ERVL 39 622 -4377 2 1048 6150 239 63 10 chr2 60697412 60698963 -121049124 + RMER15-int LTR ERVL 767 2399 -2600 2 1048 2289 252 99 21 chr2 60699106 60699499 -121048588 + RMER15-int LTR ERVL 4213 4630 -369 2 1048 2289 252 99 21 chr2 60699544 60699856 -121048231 + RMER15-int LTR ERVL 4631 4973 -26 2 1048 1890 230 70 45 chr2 60699858 60700417 -121047670 + RMER15 LTR ERVL 3 575 0 2 1048 1902 127 106 78 chr2 60700614 60701076 -121047011 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 2 1048 1476 225 119 11 chr2 60712056 60712434 -121035653 + MTD LTR MaLR 1 419 0 2 1048 905 283 59 55 chr2 60721878 60722349 -121025738 + MLT1M LTR MaLR 48 520 -152 2 1048 3602 57 28 9 chr2 60734870 60735298 -121012789 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 2 1048 331 282 113 15 chr2 60749450 60749583 -120998504 + MLT1H2 LTR MaLR 322 467 -22 3 1048 449 334 55 70 chr2 60754400 60754728 -120993359 + MLT1A LTR MaLR 20 342 -32 3 1048 225 268 239 9 chr2 60757012 60757125 -120990962 - MLT1J1 LTR MaLR -279 165 27 3 1048 272 323 10 20 chr2 60776127 60776228 -120971859 + MLT1B LTR MaLR 281 380 -10 3 1048 379 176 104 38 chr2 60807788 60807894 -120940193 + MLT1A1 LTR MaLR 1 113 -295 4 1048 812 270 143 25 chr2 60807905 60808294 -120939793 - MLT1F1 LTR MaLR 0 569 116 4 1049 785 287 115 64 chr2 60817871 60818340 -120929747 - MLT1D LTR MaLR 0 505 13 4 1049 1881 171 12 18 chr2 60819266 60819600 -120928487 - RMER15 LTR ERVL -243 332 1 4 1049 835 249 186 62 chr2 60820233 60820421 -120927666 + MTD LTR MaLR 2 198 -221 4 1049 835 249 186 62 chr2 60820462 60820645 -120927442 + MTD LTR MaLR 199 419 0 4 1049 304 356 10 67 chr2 60828278 60828471 -120919616 - RMER4A LTR ERVK -280 186 5 4 1049 328 277 186 88 chr2 60828765 60828959 -120919128 + MLT2C1 LTR ERVL 108 320 -77 4 1049 554 345 114 49 chr2 60840992 60841515 -120906572 - MLT2B5 LTR ERVL 0 515 1 4 1049 360 258 41 102 chr2 60845896 60846043 -120902044 - ORR1E LTR MaLR -221 138 1 4 1049 2399 115 12 3 chr2 60847001 60847324 -120900763 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 4 1049 1352 221 149 16 chr2 60853055 60853377 -120894710 + ORR1D2 LTR MaLR 4 368 -2 4 1049 2639 132 13 3 chr2 60856315 60856695 -120891392 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 4 1049 1347 261 61 6 chr2 60856794 60857153 -120890934 + MTE2b LTR MaLR 1 379 0 4 1049 290 274 153 27 chr2 60857199 60857349 -120890738 - LTR50 LTR ERVL -185 610 442 4 1049 723 308 172 29 chr2 60857803 60858321 -120889766 - ERVL-E-int LTR ERVL -448 5266 4675 4 1049 491 307 40 35 chr2 60858950 60859149 -120888938 - MER110-int LTR ERV1 -30 4617 4418 5 1049 345 317 42 3 chr2 60859481 60859635 -120888452 - ERVL-E-int LTR ERVL -2587 3170 2934 4 1049 2283 206 12 5 chr2 60863118 60863532 -120884555 - MTD LTR MaLR 0 419 3 5 1049 273 345 77 48 chr2 60872529 60872736 -120875351 + MLT1I LTR MaLR 7 219 -293 5 1049 320 284 108 20 chr2 60873326 60873484 -120874603 - MT2A LTR ERVL -1 600 344 5 1049 950 329 20 66 chr2 60873486 60873925 -120874162 - MT2A LTR ERVL -105 428 10 5 1049 352 326 13 77 chr2 60881046 60881202 -120866885 + MLT1I LTR MaLR 263 408 -3 5 1049 1019 195 174 63 chr2 60881745 60882112 -120865975 + RLTR9E LTR ERVK 2 409 0 5 1049 1068 318 134 14 chr2 60887770 60888353 -120859734 - MLT1E1A LTR MaLR -17 663 11 5 1049 1408 214 109 24 chr2 60889158 60889497 -120858590 - ORR1C1 LTR MaLR -8 370 3 5 1049 926 223 178 63 chr2 60890460 60890791 -120857296 + ORR1D2 LTR MaLR 2 370 0 5 1049 2882 155 46 28 chr2 60899030 60899342 -120848745 + RMER4B LTR ERVK 13 332 -253 5 1049 2882 155 46 28 chr2 60899514 60899764 -120848323 + RMER4B LTR ERVK 333 584 -1 5 1049 530 331 66 45 chr2 60909607 60909861 -120838226 - MLT1F1 LTR MaLR -305 264 3 5 1049 238 311 0 13 chr2 60912992 60913067 -120835020 - MLT1J2 LTR MaLR -20 428 355 5 1049 1335 255 63 41 chr2 60914484 60914974 -120833113 + RLTR16 LTR ERVK 1 501 -4 5 1049 319 275 54 149 chr2 60916029 60916251 -120831836 + LTR48 LTR ERV1 577 777 -10 5 1049 1758 201 48 19 chr2 60922994 60923370 -120824717 + MTD LTR MaLR 33 419 0 5 1049 437 277 209 8 chr2 60927266 60927552 -120820535 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 8 5 1049 300 262 187 0 chr2 60928025 60928132 -120819955 + MLT1A0 LTR MaLR 104 230 -135 6 1049 238 358 68 62 chr2 60929795 60929956 -120818131 - ORR1E LTR MaLR -123 236 75 6 1049 236 300 25 12 chr2 60929981 60930062 -120818025 - MLT1A LTR MaLR -268 106 25 6 1049 232 250 21 0 chr2 60930110 60930158 -120817929 + MT2B2 LTR ERVL 190 238 -346 6 1049 1669 210 42 69 chr2 60933657 60934029 -120814058 + MTD LTR MaLR 22 383 -36 6 1049 1255 179 151 76 chr2 60934029 60934386 -120813701 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 6 1049 1128 250 99 56 chr2 60938118 60938512 -120809575 - MTD LTR MaLR 0 419 9 6 1049 422 278 55 16 chr2 60940906 60941054 -120807033 - MTD LTR MaLR -128 293 141 6 1049 228 170 35 86 chr2 60941052 60941110 -120806977 + MTD LTR MaLR 300 354 -65 6 1049 315 331 30 0 chr2 60946460 60946471 -120801616 - MT2A LTR ERVL -43 541 531 6 1049 2273 186 84 2 chr2 60946500 60946928 -120801159 - MT2A LTR ERVL -54 530 1 6 1050 952 315 94 28 chr2 60952265 60952699 -120795388 + MLT1C LTR MaLR 1 463 -4 6 1050 2007 125 55 20 chr2 60957563 60957840 -120790247 - MTC LTR MaLR -52 369 81 6 1050 2007 125 55 20 chr2 60958077 60958143 -120789944 - MTC LTR MaLR -341 80 14 6 1050 1098 242 48 91 chr2 60964484 60964880 -120783207 - MTE2a LTR MaLR 0 379 1 6 1050 526 287 64 116 chr2 60964935 60965262 -120782825 + ORR1E LTR MaLR 1 310 -49 6 1050 1126 266 72 49 chr2 60968033 60968381 -120779706 + MTEa LTR MaLR 4 359 -20 6 1050 1009 294 92 45 chr2 60968445 60968954 -120779133 + MT2A LTR ERVL 1 533 0 6 1050 807 249 28 6 chr2 60969464 60969642 -120778445 + ORR1E LTR MaLR 1 182 -177 6 1050 891 126 105 13 chr2 60969653 60969806 -120778281 - ORR1A3 LTR MaLR -159 167 1 6 1050 1756 170 59 6 chr2 60970013 60970350 -120777737 + MTC LTR MaLR 1 355 -66 6 1050 506 178 93 0 chr2 60973397 60973515 -120774572 - MT2A LTR ERVL 0 533 405 6 1050 445 145 17 17 chr2 60981850 60981966 -120766121 - ORR1B1 LTR MaLR -254 140 1 6 1050 326 291 9 46 chr2 60984128 60984236 -120763851 - ORR1E LTR MaLR -255 104 1 7 1050 795 264 241 20 chr2 60985266 60985607 -120762480 - MTD LTR MaLR -3 416 1 7 1050 241 281 154 10 chr2 60987503 60987607 -120760480 - ORR1D1 LTR MaLR -237 137 19 7 1050 258 298 78 115 chr2 60987622 60987865 -120760222 - MLT1H2 LTR MaLR -98 391 158 7 1050 791 241 78 10 chr2 60989564 60989770 -120758317 - MTD LTR MaLR -14 405 196 7 1050 280 293 31 108 chr2 60992849 60992979 -120755108 - MTEa LTR MaLR -20 359 240 7 1050 962 251 64 143 chr2 60993983 60994360 -120753727 + ORR1E LTR MaLR 7 353 -6 7 1050 492 285 173 136 chr2 60996894 60997195 -120750892 - MTE2b LTR MaLR -60 319 8 7 1050 240 269 154 0 chr2 60999845 60999923 -120748164 - MLT1G LTR MaLR -9 582 493 7 1050 570 54 0 0 chr2 60999926 61000000 -120748087 + MTB_Mm LTR MaLR 1 74 -333 7 1050 2475 62 3 18 chr2 61000000 61000331 -120747756 + MTB LTR MaLR 75 400 0 1 1050 722 331 115 43 chr2 61000333 61000772 -120747315 - MLT1G LTR MaLR -110 481 40 2 1050 1299 213 179 0 chr2 61006167 61006491 -120741596 + RLTR14 LTR ERV1 1 382 0 1 1050 714 299 145 39 chr2 61009493 61009830 -120738257 - MTEa LTR MaLR -4 375 3 1 1050 256 167 0 20 chr2 61009981 61010030 -120738057 - MTEa LTR MaLR -331 48 1 2 1050 3197 16 61 15 chr2 61016383 61016776 -120731311 - IAPLTR2a LTR ERVK 0 411 1 2 1050 311 366 140 60 chr2 61021445 61021929 -120726158 - MamGypLTR1c LTR Gypsy -54 759 236 3 1050 317 288 116 81 chr2 61027006 61027313 -120720774 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 66 4 1050 232 340 20 20 chr2 61027380 61027479 -120720608 - MLT2B3 LTR ERVL -454 100 2 4 1050 345 325 92 0 chr2 61027825 61027945 -120720142 + MLT1A0 LTR MaLR 10 140 -225 4 1050 1443 277 21 35 chr2 61027946 61028320 -120719767 - MTE2a LTR MaLR -5 374 6 4 1050 3252 145 6 19 chr2 61028354 61028889 -120719198 + RLTR12B LTR ERVK 1 528 0 4 1050 248 296 0 101 chr2 61032767 61032876 -120715211 - MLT1E2 LTR MaLR 0 627 530 5 1050 1110 216 67 19 chr2 61033138 61033471 -120714616 + ORR1D1 LTR MaLR 1 359 0 5 1050 394 351 64 64 chr2 61035966 61036249 -120711838 - MLT1E2 LTR MaLR -286 341 59 5 1050 429 355 107 18 chr2 61036579 61036803 -120711284 + LTR33A LTR ERVL 86 329 -191 5 1050 421 264 0 0 chr2 61040327 61040414 -120707673 + MTE2b LTR MaLR 17 103 -276 6 1050 2366 85 3 0 chr2 61040423 61040741 -120707346 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 6 1050 740 332 91 12 chr2 61040743 61040996 -120707091 + MTE2b LTR MaLR 107 379 0 6 1050 276 307 59 34 chr2 61041567 61041685 -120706402 + MLT1L LTR MaLR 490 610 0 6 1050 2178 256 60 17 chr2 61049540 61050072 -120698015 - MTEa-int LTR MaLR -224 1356 802 8 1050 1416 279 148 36 chr2 61052061 61052616 -120695471 - MTEa-int LTR MaLR -788 792 176 8 1050 584 312 0 6 chr2 61052877 61053035 -120695052 - MTEa-int LTR MaLR -1423 157 1 8 1050 850 286 45 109 chr2 61053039 61053416 -120694671 - MTEa LTR MaLR -4 375 23 8 1050 2031 181 33 0 chr2 61057990 61058349 -120689738 + ORR1C1 LTR MaLR 3 373 -5 8 1050 1805 136 85 66 chr2 61058881 61059258 -120688829 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 8 1050 839 267 143 36 chr2 61060943 61061250 -120686837 - MLT1A0 LTR MaLR -25 340 1 8 1050 570 268 124 55 chr2 61061747 61061948 -120686139 + MTEa LTR MaLR 1 215 -164 9 1050 1649 169 20 7 chr2 61061949 61062253 -120685834 + MTC LTR MaLR 1 308 -113 9 1050 238 361 113 26 chr2 61063454 61063605 -120684482 + MTEa LTR MaLR 202 365 -14 9 1050 576 240 31 39 chr2 61063664 61063859 -120684228 - ORR1E LTR MaLR -162 208 15 9 1050 271 292 0 127 chr2 61070618 61070728 -120677359 + MTEb LTR MaLR 13 108 -271 1 1050 306 289 31 66 chr2 61070920 61071146 -120676941 + MTEb LTR MaLR 157 379 0 1 1050 1731 244 34 66 chr2 61074583 61075080 -120673007 + RLTR28B LTR ERVL 1 481 0 1 1050 789 276 76 127 chr2 61075662 61076032 -120672055 - ORR1D2 LTR MaLR -19 351 1 1 1050 3964 173 16 4 chr2 61076733 61077417 -120670670 + RLTR17 LTR ERVK 1 692 0 1 131 2037 135 11 86 chr2 61079194 61079576 -120668511 + ORR1B1 LTR MaLR 42 394 0 1 1051 668 161 16 56 chr2 61079786 61079911 -120668176 - MTEa LTR MaLR 0 379 260 1 1051 395 395 25 5 chr2 61083190 61083386 -120664701 + MLT1H1 LTR MaLR 197 396 -159 1 1051 2155 168 33 35 chr2 61086759 61087154 -120660933 - MTD LTR MaLR 0 419 26 1 1051 241 271 219 45 chr2 61090603 61090781 -120657306 + ORR1D1 LTR MaLR 5 213 -161 1 1051 1131 195 199 29 chr2 61100604 61100916 -120647171 - ORR1D1 LTR MaLR -9 365 1 1 1051 316 333 14 49 chr2 61103418 61103560 -120644527 + MLT1J LTR MaLR 1 137 -375 1 1051 4880 132 4 106 chr2 61138292 61139113 -120608974 - RMER19A LTR ERVK 0 737 1 2 1051 781 281 166 45 chr2 61140400 61140849 -120607238 - MLT1D LTR MaLR -2 503 1 2 1051 254 335 167 44 chr2 61147214 61147442 -120600645 - MLT1K LTR MaLR -56 539 284 2 1051 392 399 34 11 chr2 61148332 61148507 -120599580 + LTR16C LTR ERVL 73 251 -238 2 1051 4378 91 33 35 chr2 61151420 61152022 -120596065 + MT2B LTR ERVL 1 601 0 2 1051 334 267 96 64 chr2 61152780 61152936 -120595151 + RMER15 LTR ERVL 1 161 -414 2 1051 1392 261 99 0 chr2 61153082 61153435 -120594652 + MTD LTR MaLR 18 405 -14 2 1051 496 325 97 77 chr2 61157488 61157902 -120590185 - RLTR26 LTR ERVK -189 453 32 2 1051 1356 176 82 29 chr2 61157917 61158197 -120589890 + MTD LTR MaLR 125 419 0 2 1051 459 290 123 105 chr2 61159941 61160197 -120587890 - ORR1E LTR MaLR -2 357 97 2 1051 320 264 11 33 chr2 61160444 61160534 -120587553 - ORR1E LTR MaLR -269 90 3 2 1051 825 276 132 12 chr2 61160686 61161050 -120587037 - MTD LTR MaLR -21 398 4 2 1051 534 327 95 110 chr2 61163897 61164152 -120583935 - MLT2B4 LTR ERVL -7 407 191 2 1051 534 236 186 12 chr2 61164181 61164339 -120583748 - MLT2B4 LTR ERVL -366 190 4 2 1051 3091 30 0 3 chr2 61175482 61175815 -120572272 + IAPEY3_LTR LTR ERVK 1 332 0 2 1051 385 298 27 54 chr2 61176071 61176220 -120571867 - LTR48 LTR ERV1 -642 145 1 2 1051 839 231 81 146 chr2 61181661 61182046 -120566041 - MTE2a LTR MaLR -14 365 6 2 1051 331 287 74 0 chr2 61186981 61187089 -120560998 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 250 2 1051 494 274 23 25 chr2 61187122 61187269 -120560818 - MLT1A0 LTR MaLR -263 145 1 2 1051 1807 230 26 39 chr2 61189011 61189427 -120558660 + MTD LTR MaLR 1 411 -8 2 1051 271 289 75 50 chr2 61195786 61195906 -120552181 + MLT1G LTR MaLR 119 241 -350 2 1051 435 333 63 73 chr2 61196862 61197238 -120550849 + MLT1G3 LTR MaLR 1 353 -202 2 1051 424 299 83 87 chr2 61198175 61198198 -120549889 - MT2A LTR ERVL -1 532 510 2 1051 424 299 83 87 chr2 61198398 61198663 -120549424 - MT2A LTR ERVL -24 509 245 2 1051 279 208 51 13 chr2 61199038 61199116 -120548971 - MERVL_2A-int LTR ERVL -27 5734 5654 3 1051 2204 244 55 17 chr2 61199126 61199667 -120548420 - MERVL_2A-int LTR ERVL -2126 3635 3074 3 1051 432 281 60 8 chr2 61199675 61199911 -120548176 - RMER15 LTR ERVL -13 562 287 3 1051 3334 283 104 38 chr2 61199980 61201328 -120546759 - MERVL_2A-int LTR ERVL -3238 2523 1087 3 1051 916 200 42 24 chr2 61201398 61201621 -120546466 - ORR1D1 LTR MaLR -160 214 4 3 1051 360 301 132 48 chr2 61202150 61202377 -120545710 - MLT1L LTR MaLR -364 246 1 3 1051 244 328 16 72 chr2 61207065 61207190 -120540897 + RMER12 LTR ERVK 734 851 -471 3 1052 1039 303 76 14 chr2 61211290 61211658 -120536429 - MLT2C1 LTR ERVL -1 396 6 3 1052 285 402 18 24 chr2 61211692 61211860 -120536227 - MLT1L LTR MaLR -329 281 115 3 1052 2519 153 12 2 chr2 61218926 61219331 -120528756 + MTC LTR MaLR 13 421 0 3 1052 408 271 55 78 chr2 61220340 61220648 -120527439 - RLTR15 LTR ERVK -14 345 45 3 1052 273 297 142 21 chr2 61221113 61221254 -120526833 + ERVL-E-int LTR ERVL 2195 2352 -3315 3 1052 301 336 92 70 chr2 61221707 61221934 -120526153 + ERVL-E-int LTR ERVL 2859 3090 -2577 3 1052 813 295 85 13 chr2 61222291 61222575 -120525512 + MLT1A1 LTR MaLR 110 374 0 3 1052 303 332 64 35 chr2 61222693 61222896 -120525191 + ERVL-E-int LTR ERVL 3516 3724 -1943 3 1052 1285 251 43 29 chr2 61230090 61230439 -120517648 - ORR1E LTR MaLR -5 354 1 3 1052 2132 150 73 13 chr2 61231116 61231488 -120516599 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 3 1052 3372 32 74 0 chr2 61245548 61245954 -120502133 + RLTR10C LTR ERVK 1 436 0 3 1052 1406 117 300 3 chr2 61248158 61248441 -120499646 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 3 1052 552 311 54 49 chr2 61250578 61250781 -120497306 + MTEa LTR MaLR 58 261 -118 3 1052 3428 305 122 38 chr2 61250862 61252294 -120495793 + MTE-int LTR MaLR 1 1552 -28 3 1052 270 259 26 160 chr2 61253645 61253801 -120494286 - RMER15 LTR ERVL -16 559 425 3 1052 1306 276 92 54 chr2 61254156 61254806 -120493281 - RMER15-int LTR ERVL -7 4992 4318 3 1052 323 307 9 0 chr2 61255058 61255172 -120492915 - RMER15-int LTR ERVL -4369 630 516 3 1052 344 287 59 146 chr2 61255393 61255613 -120492474 - RMER15 LTR ERVL -4 571 371 3 1052 1444 246 99 59 chr2 61255885 61256390 -120491697 + MER34A LTR ERV1 30 554 -17 3 1052 3198 61 2 0 chr2 61264289 61264684 -120483403 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 1052 1929 233 43 78 chr2 61268044 61268649 -120479438 + RLTR31A_Mm LTR ERVK 1 584 0 4 1052 961 315 69 42 chr2 61273482 61273843 -120474244 - MTE2b LTR MaLR -4 375 5 4 1052 622 336 56 53 chr2 61286101 61286456 -120461631 - MTEa LTR MaLR -23 356 1 4 1052 394 323 47 18 chr2 61286497 61286667 -120461420 + LTR33 LTR ERVL 1 175 -340 4 1052 230 284 124 16 chr2 61289870 61289908 -120458179 + MLT2B5 LTR ERVL 78 122 -479 4 1052 3508 74 2 71 chr2 61289908 61290418 -120457669 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 475 0 4 1052 230 284 124 16 chr2 61290418 61290508 -120457579 + MLT2B5 LTR ERVL 123 220 -381 4 1052 233 328 142 8 chr2 61290688 61290808 -120457279 - MLT1A1 LTR MaLR -270 138 3 4 1052 1456 243 49 65 chr2 61305634 61306123 -120441964 - RLTR28B LTR ERVL 0 481 1 4 1052 2509 132 49 10 chr2 61310904 61311309 -120436778 + MTC LTR MaLR 1 421 0 4 1052 240 276 150 43 chr2 61315374 61315514 -120432573 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 211 4 1052 700 317 99 54 chr2 61315547 61316064 -120432023 + MLT1E2 LTR MaLR 60 622 -5 4 1052 1231 118 378 4 chr2 61316754 61317012 -120431075 + RMER6C LTR ERVK 1 355 -335 4 1052 1753 291 59 30 chr2 61317990 61318567 -120429520 + MTE-int LTR MaLR 953 1546 -34 4 1052 370 322 36 79 chr2 61318724 61319056 -120429031 + ORR1E LTR MaLR 52 378 -1 4 1052 478 278 136 6 chr2 61324927 61325104 -120422983 - MER57C2 LTR ERV1 -229 205 6 4 1052 863 292 181 11 chr2 61325211 61325665 -120422422 + MT2A LTR ERVL 1 531 -2 4 1052 779 226 41 122 chr2 61325673 61326016 -120422071 - RMER10A LTR ERVL -127 315 1 4 1052 277 338 65 52 chr2 61338785 61338938 -120409149 + MLT1I LTR MaLR 8 162 -249 5 1053 579 283 128 69 chr2 61352684 61353003 -120395084 - MLT1B LTR MaLR -49 341 4 5 1053 2531 145 164 9 chr2 61355893 61356735 -120391352 - RLTR25A LTR ERVK 0 1028 1 5 1053 3117 18 2 116 chr2 61363107 61363545 -120384542 + RLTR10 LTR ERVK 1 388 -2 5 1053 362 109 46 15 chr2 61366825 61366890 -120381197 - RMER6C LTR ERVK 0 690 624 5 1053 4638 140 92 1 chr2 61366890 61367712 -120380375 - RMER17B LTR ERVK 0 958 62 5 1053 675 257 35 102 chr2 61367710 61367966 -120380121 + RMER17B LTR ERVK 8 246 -712 5 1053 1273 151 44 172 chr2 61367798 61368141 -120379946 - RMER6C LTR ERVK -391 299 1 5 1053 330 258 133 0 chr2 61368895 61369015 -120379072 + RMER15 LTR ERVL 426 561 -14 5 1053 2274 162 12 30 chr2 61372842 61373229 -120374858 + RMER20B LTR ERVK 1 380 -247 5 1053 875 159 21 4 chr2 61373229 61373393 -120374694 - ORR1A4 LTR MaLR 0 346 184 5 1053 796 239 87 150 chr2 61373391 61373838 -120374249 + RLTR23 LTR ERV1 8 426 -4 5 1053 1084 177 21 5 chr2 61373842 61374029 -120374058 - ORR1A4 LTR MaLR -139 190 1 5 1053 9636 137 38 117 chr2 61374029 61376160 -120371927 - ORR1A4-int LTR MaLR 0 1963 2 5 1053 2087 156 3 0 chr2 61376161 61376489 -120371598 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 5 1053 950 175 66 152 chr2 61376491 61376794 -120371293 + RMER20B LTR ERVK 351 627 0 5 1053 3880 94 89 2 chr2 61380271 61380824 -120367263 - MT2B LTR ERVL 0 601 1 5 1053 245 274 153 45 chr2 61389501 61389677 -120358410 + MamGypLTR2c LTR Gypsy 874 1068 0 6 1053 3097 115 60 25 chr2 61391012 61391494 -120356593 + RLTR19 LTR ERVK 1 499 0 6 1053 609 347 102 48 chr2 61396904 61397054 -120351033 - LTR40b LTR ERVL -16 446 298 6 1053 609 347 102 48 chr2 61397080 61397283 -120350804 - LTR40b LTR ERVL -165 297 74 6 1053 342 217 0 0 chr2 61398724 61398784 -120349303 - LTR40b LTR ERVL -459 60 1 6 1053 2064 97 26 7 chr2 61402165 61402475 -120345612 + IAPLTR2b LTR ERVK 1 316 -11 6 1053 409 278 28 0 chr2 61402618 61402726 -120345361 + MLT2B3 LTR ERVL 20 130 -424 6 1053 818 233 258 20 chr2 61402988 61403294 -120344793 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 6 6 1053 965 322 17 64 chr2 61404032 61404453 -120343634 + MT2A LTR ERVL 18 418 -115 6 1053 409 326 32 89 chr2 61408109 61408355 -120339732 + LTR41B LTR ERVL 524 755 -3 6 1053 352 355 6 55 chr2 61411292 61411456 -120336631 - RMER4A LTR ERVK -303 163 8 6 1053 248 311 69 99 chr2 61413255 61413556 -120334531 + MTEa LTR MaLR 11 379 0 6 1053 1858 130 30 72 chr2 61413729 61414061 -120334026 - ORR1A3 LTR MaLR -8 318 1 6 1053 3486 25 0 0 chr2 61423253 61423649 -120324438 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 1053 249 298 23 116 chr2 61425794 61425923 -120322164 - MT2B LTR ERVL -323 278 162 6 1053 1246 246 34 75 chr2 61426917 61427303 -120320784 - MTE2a LTR MaLR 0 379 10 6 1053 1378 279 55 16 chr2 61432764 61433143 -120314944 + MTD LTR MaLR 13 406 -13 6 1053 1074 179 212 29 chr2 61434030 61434341 -120313746 + ORR1D1 LTR MaLR 5 372 -2 6 1053 2125 153 71 37 chr2 61435564 61435970 -120312117 + MTC LTR MaLR 2 421 0 6 1053 782 322 99 24 chr2 61443345 61443679 -120304408 - ORR1E LTR MaLR 0 359 1 6 1053 1765 85 72 120 chr2 61448189 61448522 -120299565 - ORR1A3 LTR MaLR -8 318 2 7 1053 912 235 60 21 chr2 61448895 61449130 -120298957 + RMER15 LTR ERVL 134 377 -198 7 1053 405 299 125 38 chr2 61452572 61452756 -120295331 - MER68 LTR ERVL -343 220 21 7 1053 673 116 16 89 chr2 61454915 61454954 -120293133 + ORR1C2 LTR MaLR 1 31 -353 7 1053 673 116 16 89 chr2 61454991 61455074 -120293013 + ORR1C2 LTR MaLR 32 114 -270 7 1053 234 200 47 62 chr2 61456703 61456767 -120291320 + RMER20A LTR ERVK 186 248 -268 7 1053 243 212 70 70 chr2 61457182 61457253 -120290834 - RMER15 LTR ERVL -415 160 90 7 1053 1098 324 126 5 chr2 61457415 61457812 -120290275 - MLT-int LTR MaLR -236 1499 1055 7 1053 1031 207 210 143 chr2 61458144 61458640 -120289447 - MT2A LTR ERVL -4 529 1 7 1053 527 132 44 0 chr2 61458640 61458731 -120289356 - MERVL_2A-int LTR ERVL 0 5761 5667 7 1053 3845 109 141 8 chr2 61458826 61459492 -120288595 - RMER6A LTR ERVK 0 756 2 7 1053 2903 164 73 16 chr2 61459493 61460056 -120288031 - RLTR17 LTR ERVK 0 692 98 7 1053 3477 141 74 15 chr2 61460084 61460689 -120287398 - MERVL_2A-int LTR ERVL -132 5629 4989 7 1053 1221 261 214 31 chr2 61471070 61471490 -120276597 - MLT1F1 LTR MaLR -27 542 46 7 1053 439 180 185 8 chr2 61471826 61471939 -120276148 - MTD-int LTR MaLR -1388 121 1 7 1053 1637 213 95 3 chr2 61471952 61472319 -120275768 - MTD LTR MaLR -14 405 5 7 1054 236 361 107 38 chr2 61474893 61475155 -120272932 - LTR40b LTR ERVL -164 298 19 7 1054 655 246 115 32 chr2 61476419 61476637 -120271450 - MTEb LTR MaLR -143 236 1 7 1054 663 188 613 2 chr2 61512697 61512869 -120235218 + ORR1D1 LTR MaLR 97 392 -2 2 1054 227 234 43 0 chr2 61516520 61516533 -120231554 + MT2C_Mm LTR ERVL 192 206 -269 4 1054 409 219 0 111 chr2 61518328 61518436 -120229651 + MT2B LTR ERVL 169 264 -337 4 1054 1037 266 60 45 chr2 61527989 61528390 -120219697 - BGLII_B LTR ERVK -30 411 5 7 1054 357 217 94 17 chr2 61532646 61532763 -120215324 + LTR33 LTR ERVL 371 496 -19 7 1054 518 280 293 29 chr2 61533291 61533630 -120214457 + MLT1D LTR MaLR 28 460 -45 8 1054 2820 58 0 0 chr2 61533630 61533976 -120214111 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 8 1054 518 264 87 43 chr2 61533976 61534022 -120214065 + MLT1D LTR MaLR 461 505 0 8 1054 1618 204 102 9 chr2 61535739 61535971 -120212116 + ORR1D1 LTR MaLR 1 261 -113 8 1054 3268 156 126 19 chr2 61535971 61536637 -120211450 - RMER19A LTR ERVK 0 737 1 8 1054 1618 204 102 9 chr2 61536637 61536746 -120211341 + ORR1D1 LTR MaLR 262 374 0 8 1054 1719 121 42 89 chr2 61537845 61538182 -120209905 + ORR1A4 LTR MaLR 1 321 -8 8 1054 2943 55 44 3 chr2 61543177 61543561 -120204526 - MTB LTR MaLR 0 400 1 1 1054 373 203 0 0 chr2 61543760 61543824 -120204263 + MTEb LTR MaLR 2 65 -314 1 1054 2086 70 42 119 chr2 61548213 61548567 -120199520 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 1 1054 1501 121 202 13 chr2 61550797 61551099 -120196988 + ORR1B2 LTR MaLR 1 359 -8 1 1054 1021 284 28 53 chr2 61556235 61556608 -120191479 - MTE2a LTR MaLR -13 406 25 1 1054 268 350 136 52 chr2 61562412 61562662 -120185425 - MER21B LTR ERV1 -553 310 40 1 1054 1649 180 94 15 chr2 61567888 61568227 -120179860 + ORR1D1 LTR MaLR 1 366 -8 1 1054 1341 235 122 12 chr2 61573774 61574102 -120173985 - ORR1D2 LTR MaLR -4 366 3 1 1054 1667 229 88 10 chr2 61576777 61577266 -120170821 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 527 0 1 1054 266 125 32 0 chr2 61577848 61577906 -120170181 - MTC LTR MaLR -356 63 3 1 1054 248 318 149 43 chr2 61577996 61578298 -120169789 - ORR1E LTR MaLR -4 355 22 1 1054 235 293 40 71 chr2 61578985 61579084 -120169003 - RMER4B LTR ERVK -474 111 16 1 1054 3732 156 119 15 chr2 61584424 61585204 -120162883 + RLTR25A LTR ERVK 25 885 -218 1 1054 241 250 124 90 chr2 61585438 61585583 -120162504 + RLTR25A LTR ERVK 742 891 -137 1 1054 837 211 90 26 chr2 61585596 61585829 -120162258 + RLTR25A LTR ERVK 856 1103 0 1 1054 2197 136 8 14 chr2 61586960 61587319 -120160768 - RLTR15 LTR ERVK 0 359 3 1 1055 790 330 33 40 chr2 61609380 61609765 -120138322 - LTR16B1 LTR ERVL 0 480 1 2 1055 240 344 47 31 chr2 61627142 61627271 -120120816 - MLT1J LTR MaLR -266 246 116 2 1055 1524 165 68 15 chr2 61630100 61630426 -120117661 - RMER4A LTR ERVK -123 343 1 2 1055 448 215 102 9 chr2 61678227 61678335 -120069752 + MTD LTR MaLR 294 411 -8 3 1055 319 222 132 11 chr2 61678339 61678430 -120069657 + MTD-int LTR MaLR 1 102 -1156 3 1055 1414 181 116 7 chr2 61695160 61695462 -120052625 - MTD LTR MaLR -8 411 70 3 1055 1086 189 153 36 chr2 61695485 61695516 -120052571 - MTD LTR MaLR -338 69 35 3 1055 283 292 65 33 chr2 61695621 61695643 -120052444 - MTD LTR MaLR -326 95 68 3 1055 283 292 65 33 chr2 61695705 61695774 -120052313 - MTD LTR MaLR -354 67 2 3 1055 504 218 90 22 chr2 61695774 61695952 -120052135 - MTD-int LTR MaLR 0 1258 1069 3 1055 3315 239 103 78 chr2 61696133 61697259 -120050828 - MTD-int LTR MaLR -165 1093 6 3 1055 549 194 93 0 chr2 61697268 61697376 -120050711 - MTD LTR MaLR -8 411 294 3 1055 544 164 20 32 chr2 61699096 61699205 -120048882 - MTD LTR MaLR -290 106 1 3 1055 4765 55 3 2 chr2 61700763 61701349 -120046738 - LTRIS_Mus LTR ERV1 0 587 1 3 1055 21295 100 31 38 chr2 61701349 61706137 -120041950 - MuRRS-int LTR ERV1 -2001 5555 695 3 1055 21295 60 35 42 chr2 61706187 61706220 -120041867 - MuRRS-int LTR ERV1 -3996 694 662 3 1055 1813 104 11 0 chr2 61706243 61706512 -120041575 - MuRRS-int LTR ERV1 -4418 272 1 3 1055 4719 60 3 2 chr2 61706512 61707098 -120040989 - LTRIS_Mus LTR ERV1 0 587 1 3 1055 1155 182 86 45 chr2 61713387 61713681 -120034406 - ORR1B1 LTR MaLR -73 321 44 3 1055 2099 187 43 25 chr2 61714070 61714513 -120033574 - RLTR12B LTR ERVK -77 451 1 3 1055 2105 116 6 48 chr2 61719959 61720294 -120027793 + ORR1A4 LTR MaLR 1 321 -8 4 1055 582 53 0 0 chr2 61722400 61722476 -120025611 + MTB_Mm LTR MaLR 332 407 0 4 1055 4508 54 24 9 chr2 61722503 61723081 -120025006 + LTRIS_Mus LTR ERV1 1 587 0 4 1055 3107 58 5 5 chr2 61724041 61724441 -120023646 - MTB LTR MaLR 0 400 1 4 1055 2068 142 25 22 chr2 61724952 61725313 -120022774 + ORR1B1 LTR MaLR 33 394 0 4 1055 337 222 132 11 chr2 61729144 61729235 -120018852 - MTD-int LTR MaLR -1156 102 1 4 1055 362 259 93 0 chr2 61729239 61729347 -120018740 - MTD LTR MaLR -8 411 294 4 1055 1134 274 71 37 chr2 61733657 61734036 -120014051 - MTE2a LTR MaLR 0 419 18 4 1056 255 297 47 0 chr2 61735005 61735069 -120013018 - MLT1N2 LTR MaLR -492 70 4 4 1056 2020 155 11 82 chr2 61735421 61735801 -120012286 - ORR1B1 LTR MaLR -1 393 41 4 1056 355 250 53 82 chr2 61738405 61738575 -120009512 - RMER10A LTR ERVL -24 418 254 4 1056 437 323 112 52 chr2 61740346 61740614 -120007473 - MTEa LTR MaLR -95 284 1 4 1056 2002 66 75 20 chr2 61742021 61742306 -120005781 - ORR1A1 LTR MaLR -43 303 3 4 1056 1487 169 26 15 chr2 61744077 61744348 -120003739 - RMER4B LTR ERVK -7 578 305 4 1056 752 287 133 15 chr2 61744381 61744720 -120003367 - MTE2a LTR MaLR 0 379 1 4 1056 726 227 60 50 chr2 61746832 61747050 -120001037 - ORR1D2 LTR MaLR -2 368 149 4 1056 505 341 17 40 chr2 61747063 61747240 -120000847 - ORR1D2 LTR MaLR -187 183 11 4 1056 796 223 37 149 chr2 61748546 61748788 -119999299 + MT2A LTR ERVL 4 218 -315 4 1056 2460 203 36 27 chr2 61748784 61748870 -119999217 - RLTR20B3 LTR ERVK -7 570 478 4 1056 2460 203 36 27 chr2 61748925 61749360 -119998727 - RLTR20B3 LTR ERVK -100 477 45 4 1056 666 246 4 34 chr2 61749380 61749557 -119998530 + MT2A LTR ERVL 242 539 -62 4 1056 317 130 0 0 chr2 61756086 61756132 -119991955 - RMER6B LTR ERVK -12 449 404 4 1056 253 299 91 149 chr2 61758444 61758652 -119989435 - RMER6B LTR ERVK -43 418 223 4 1056 1101 179 30 13 chr2 61759703 61759935 -119988152 - RMER6B LTR ERVK -143 318 83 4 1056 1402 242 102 8 chr2 61760489 61760872 -119987215 + MTD LTR MaLR 1 419 0 4 1056 252 280 79 10 chr2 61762465 61762566 -119985521 + ORR1E LTR MaLR 4 111 -248 4 1056 1896 119 14 116 chr2 61763991 61764353 -119983734 + ORR1A4 LTR MaLR 1 325 -4 4 1056 2187 50 30 20 chr2 61772617 61772921 -119975166 + IAPLTR2b LTR ERVK 1 307 -20 5 1056 2559 159 86 6 chr2 61775546 61776034 -119972053 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 527 0 5 1056 435 221 0 131 chr2 61776837 61776967 -119971120 - MT2B LTR ERVL -337 264 152 5 1056 1635 170 35 98 chr2 61790447 61790877 -119957210 + RMER6C LTR ERVK 288 690 0 5 1056 1170 275 78 31 chr2 61807503 61807863 -119940224 + MTD LTR MaLR 43 419 0 5 1056 672 157 28 0 chr2 61810463 61810571 -119937516 + RMER6C LTR ERVK 1 111 -579 5 1056 445 83 0 0 chr2 61810555 61810615 -119937472 + MT2B LTR ERVL 181 240 -361 5 1056 2895 206 30 29 chr2 61810627 61810924 -119937163 + MurERV4-int LTR ERVK 3429 3726 -1534 5 1056 2895 206 30 29 chr2 61811107 61811499 -119936588 + MurERV4-int LTR ERVK 3727 4119 -1141 5 1056 502 224 90 0 chr2 61811503 61811637 -119936450 + ORR1D1-int LTR MaLR 1225 1370 0 5 1056 1002 268 8 4 chr2 61811637 61811868 -119936219 + ORR1D1 LTR MaLR 1 232 -142 5 1056 1748 176 35 32 chr2 61811868 61811969 -119936118 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 287 5 1056 1748 176 35 32 chr2 61812639 61812883 -119935204 - ORR1C2 LTR MaLR -98 286 38 5 1056 1495 193 52 16 chr2 61813047 61813357 -119934730 - RMER6C LTR ERVK 0 690 370 5 1056 1857 174 44 15 chr2 61814356 61814792 -119933295 + RMER6A LTR ERVK 272 706 -14 5 1056 363 127 0 0 chr2 61814818 61814873 -119933214 - ORR1C2 LTR MaLR -329 55 1 5 1056 398 198 124 10 chr2 61814877 61814974 -119933113 + ORR1D1 LTR MaLR 267 374 0 5 1056 899 265 57 37 chr2 61816399 61816786 -119931301 - MT2A LTR ERVL 0 601 98 5 1056 1775 156 39 9 chr2 61816755 61817085 -119931002 + ORR1D1 LTR MaLR 34 373 -1 5 1056 1921 143 47 32 chr2 61818193 61818407 -119929680 - RMER17C LTR ERVK 0 410 198 5 1056 1921 143 47 32 chr2 61818512 61818701 -119929386 - RMER17C LTR ERVK -213 197 1 5 1056 3117 34 26 13 chr2 61820011 61820402 -119927685 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 1056 4698 131 24 89 chr2 61822655 61823620 -119924467 - RLTR13D6 LTR ERVK 0 902 1 5 1056 4132 61 40 9 chr2 61826386 61826929 -119921158 - LTRIS2 LTR ERV1 0 564 5 5 1056 830 255 5 20 chr2 61832829 61833025 -119915062 + MTD LTR MaLR 1 193 -226 6 1056 3308 130 7 30 chr2 61838419 61838957 -119909130 - RLTR1D LTR ERV1 -16 589 64 6 1056 353 170 78 78 chr2 61838994 61839096 -119908991 + RMER15 LTR ERVL 369 470 -105 6 1056 2358 114 12 43 chr2 61839306 61839728 -119908359 + RLTR9E LTR ERVK 1 409 0 6 1056 309 304 36 119 chr2 61840436 61840630 -119907457 + RMER4B LTR ERVK 10 187 -398 6 1056 1540 141 102 27 chr2 61856865 61857236 -119890851 - RMER17C LTR ERVK -11 399 1 6 1056 3195 38 5 13 chr2 61859479 61859875 -119888212 + MTA_Mm LTR MaLR 4 396 0 6 1056 8730 51 4 2 chr2 61859875 61860971 -119887116 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 6 1056 2564 73 32 21 chr2 61860971 61861351 -119886736 + MTA_Mm LTR MaLR 1 384 -12 6 1056 236 297 0 45 chr2 61864319 61864386 -119883701 - MLT1M LTR MaLR -478 194 131 6 1057 2433 152 40 2 chr2 61879608 61880037 -119868050 - RLTR11B LTR ERVK 0 453 9 6 1057 318 248 106 35 chr2 61892224 61892337 -119855750 - MLT1C LTR MaLR -1 466 346 6 1057 1559 181 106 25 chr2 61896684 61897091 -119850996 - RMER10A LTR ERVL -1 441 2 7 1057 2693 150 69 56 chr2 61901249 61901854 -119846233 + RMER6-int LTR ERVK 2652 3177 0 7 1057 1956 170 167 60 chr2 61901854 61902636 -119845451 + RMER6C LTR ERVK 1 718 -38 7 1057 896 237 73 116 chr2 61903615 61904011 -119844076 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 7 1057 3352 28 2 12 chr2 61918083 61918483 -119829604 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 7 1057 2326 163 128 13 chr2 61920009 61920476 -119827611 - RLTR11A LTR ERVK -7 521 1 7 1057 2832 228 94 77 chr2 61920624 61920913 -119827174 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -134 6416 6124 7 1057 5150 208 31 46 chr2 61921058 61922376 -119825711 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -425 1901 604 7 1057 1916 176 29 10 chr2 61923798 61924206 -119823881 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -1715 611 196 7 1057 279 121 31 108 chr2 61924224 61924289 -119823798 - RLTR11A LTR ERVK -468 60 1 7 1057 550 356 70 33 chr2 61932181 61932422 -119815665 + MLT1A1 LTR MaLR 159 408 0 7 1057 693 188 172 24 chr2 61932481 61932650 -119815437 + ORR1C2 LTR MaLR 1 194 -190 7 1057 870 164 109 16 chr2 61932775 61932967 -119815120 + ORR1C2 LTR MaLR 175 384 0 7 1057 1921 195 49 32 chr2 61939842 61940308 -119807779 - RLTR31_Mm LTR ERVK -87 474 1 7 1057 893 169 114 100 chr2 61973750 61974039 -119774048 + RMER17C LTR ERVK 111 403 -7 7 1057 714 122 201 0 chr2 61974831 61974970 -119773117 - RLTR11B LTR ERVK 0 453 287 7 1057 233 355 78 108 chr2 61975568 61975874 -119772213 - ORR1D2 LTR MaLR -2 357 61 7 1057 237 250 18 0 chr2 61975950 61976006 -119772081 - ORR1D2 LTR MaLR -309 61 5 7 1057 256 194 13 130 chr2 61976745 61976822 -119771265 - ORR1B1 LTR MaLR -82 312 245 8 1057 337 345 34 20 chr2 61978207 61978355 -119769732 + MLT1A1 LTR MaLR 259 408 0 8 1057 322 260 51 13 chr2 61978707 61978785 -119769302 - MLT1A1 LTR MaLR -78 330 250 8 1057 617 322 39 52 chr2 61994969 61995274 -119752813 - ERVL-int LTR ERVL -3989 1768 1468 8 1058 258 375 13 59 chr2 62002699 62002763 -119745324 - MLT1H LTR MaLR -20 529 467 4 1058 1018 264 98 26 chr2 62002763 62003151 -119744936 + MTD LTR MaLR 1 416 -3 5 1058 258 375 13 59 chr2 62003151 62003239 -119744848 - MLT1H LTR MaLR -83 466 384 4 1058 245 250 56 56 chr2 62019236 62019308 -119728779 - RLTR31_Mur LTR ERVK -1 552 481 1 1058 2073 116 141 26 chr2 62019596 62019987 -119728100 - BGLII_B LTR ERVK -5 436 1 1 1058 241 179 54 0 chr2 62020932 62020988 -119727099 + RLTR15 LTR ERVK 1 59 -300 2 1058 2672 131 159 21 chr2 62021001 62021517 -119726570 - RLTR13D3 LTR ERVK 0 1114 528 2 1058 768 176 112 24 chr2 62021496 62021665 -119726422 - RLTR13D3 LTR ERVK -558 248 65 2 1058 394 278 160 6 chr2 62024694 62024875 -119723212 - MLT1B LTR MaLR 0 390 182 2 1058 1339 113 0 5 chr2 62042531 62042735 -119705352 - MT2C_Mm LTR ERVL -272 203 1 4 1058 2888 41 3 0 chr2 62043837 62044182 -119703905 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 4 1058 243 407 19 68 chr2 62044899 62045060 -119703027 - LTR78 LTR ERV1 -355 949 797 4 1058 462 139 101 34 chr2 62045120 62045209 -119702878 - RMER12B LTR ERVK -6 1398 1304 4 1058 1399 182 16 43 chr2 62045211 62045533 -119702554 - RLTR21 LTR ERVK -526 1046 734 4 1058 922 289 37 23 chr2 62046902 62047252 -119700835 - ORR1E LTR MaLR -4 355 1 4 1058 894 311 51 19 chr2 62047983 62048298 -119699789 - RMER15-int LTR ERVL -3483 1516 1192 5 1058 1041 290 74 32 chr2 62048358 62048761 -119699326 - RMER15-int LTR ERVL -3738 1261 842 5 1058 2404 98 62 35 chr2 62056159 62056559 -119691528 - IAPLTR2a LTR ERVK 0 411 1 6 1058 309 379 6 71 chr2 62060362 62060544 -119687543 - MLT1I LTR MaLR -164 247 78 7 1058 242 276 48 58 chr2 62068941 62069045 -119679042 + MT2B LTR ERVL 161 263 -338 8 1058 8104 23 0 2 chr2 62086651 62087582 -119660505 - RLTR13B3 LTR ERVK 0 929 1 1 1059 734 323 97 46 chr2 62137370 62137909 -119610178 - MLT1F1 LTR MaLR 0 569 4 1 1059 598 245 118 141 chr2 62138087 62138400 -119609687 - ORR1E LTR MaLR -47 312 7 1 1059 454 303 147 29 chr2 62138470 62138674 -119609413 + MLT1D LTR MaLR 278 505 0 1 1059 394 263 0 0 chr2 62149743 62149819 -119598268 + ORR1E LTR MaLR 1 76 -283 1 1059 383 318 119 130 chr2 62188624 62188993 -119559094 + MTEa LTR MaLR 1 365 -14 2 1059 1097 335 24 71 chr2 62189007 62189514 -119558573 + MTEa-int LTR MaLR 5 487 -1093 2 1059 2748 192 73 40 chr2 62190501 62191158 -119556929 + RMER6C LTR ERVK 1 679 -11 2 1059 1802 130 144 64 chr2 62203578 62203939 -119544148 + ORR1B1 LTR MaLR 5 394 0 2 1059 239 236 64 77 chr2 62206322 62206400 -119541687 - MLT1J-int LTR MaLR -310 1077 1001 2 1059 296 320 102 108 chr2 62213393 62213708 -119534379 + ORR1E LTR MaLR 5 317 -42 2 1059 625 276 50 30 chr2 62230481 62230792 -119517295 + MLT1A1 LTR MaLR 40 396 -12 2 1059 1293 344 30 9 chr2 62230835 62231396 -119516691 + MLT-int LTR MaLR 54 626 -1109 2 1059 1030 253 48 42 chr2 62231404 62231783 -119516304 + RMER17C LTR ERVK 1 381 -29 2 1059 268 299 0 25 chr2 62231894 62231973 -119516114 - MLT1A0 LTR MaLR -30 335 259 2 1059 871 317 155 36 chr2 62232562 62233149 -119514938 + MLT-int LTR MaLR 1104 1721 -14 2 1059 410 271 59 22 chr2 62233699 62233835 -119514252 + MLT1A1 LTR MaLR 268 408 0 3 1059 437 289 19 88 chr2 62239119 62239324 -119508763 - MLT1E2 LTR MaLR 0 627 437 3 1059 289 254 109 47 chr2 62245206 62245334 -119502753 + MLT1F2 LTR MaLR 415 550 -10 3 1059 576 246 125 99 chr2 62251592 62251944 -119496143 + MLT1C LTR MaLR 27 464 -3 3 1059 289 388 63 12 chr2 62252519 62252772 -119495315 - ERVL-E-int LTR ERVL -2581 3086 2821 3 1059 354 356 27 0 chr2 62252933 62253082 -119495005 + MLT1D LTR MaLR 298 450 -55 3 1059 380 330 59 79 chr2 62253531 62253886 -119494201 + MLT1A0 LTR MaLR 1 348 -17 3 1059 239 287 95 9 chr2 62253995 62254111 -119493976 + ORR1E LTR MaLR 19 144 -215 3 1059 2855 30 0 21 chr2 62254190 62254524 -119493563 - IAPLTR2b LTR ERVK 0 327 1 3 1059 768 304 32 24 chr2 62256403 62256743 -119491344 + MER89 LTR ERV1 217 559 0 3 1060 432 293 124 56 chr2 62260577 62260756 -119487331 + MTEa LTR MaLR 1 201 -178 3 1060 432 293 124 56 chr2 62260829 62261004 -119487083 + MTEa LTR MaLR 202 378 -1 3 1060 2058 159 119 3 chr2 62263229 62263582 -119484505 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 3 1060 3925 185 76 26 chr2 62263833 62264719 -119483368 - RMER19B LTR ERVK -8 894 6 3 1060 603 79 0 0 chr2 62264715 62264804 -119483283 - RMER19B LTR ERVK -813 89 1 3 1060 243 192 58 0 chr2 62265726 62265778 -119482309 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 311 3 1060 763 339 47 19 chr2 62270728 62271136 -119476951 - MLT2B1 LTR ERVL -47 473 52 3 1060 284 252 132 28 chr2 62271579 62271685 -119476402 + MTD LTR MaLR 21 137 -282 3 1060 1672 190 14 38 chr2 62273361 62273727 -119474360 - ORR1B2 LTR MaLR -8 359 3 3 1060 539 191 65 39 chr2 62276750 62276903 -119471184 - RLTR14 LTR ERV1 -133 249 93 3 1060 304 256 12 0 chr2 62277771 62277853 -119470234 - RLTR14 LTR ERV1 -293 89 7 3 1060 253 327 160 33 chr2 62280392 62280604 -119467483 - MLT1J LTR MaLR -204 308 70 3 1060 2181 150 62 13 chr2 62281769 62282141 -119465946 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 5 3 1060 314 311 20 23 chr2 62282322 62282481 -119465606 + MLT1G LTR MaLR 18 183 -408 3 1060 337 250 28 0 chr2 62282874 62282946 -119465141 - ORR1E LTR MaLR -278 81 8 3 1060 985 316 141 29 chr2 62282947 62283423 -119464664 - MTE-int LTR MaLR -58 1522 994 3 1060 925 206 84 19 chr2 62283436 62283649 -119464438 + ORR1D1 LTR MaLR 1 227 -147 3 1060 825 261 149 53 chr2 62284124 62284147 -119463940 - ORR1E LTR MaLR -2 357 337 3 1060 3643 51 2 81 chr2 62284147 62284663 -119463424 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 1 3 1060 825 261 149 53 chr2 62284663 62284962 -119463125 - ORR1E LTR MaLR -23 336 4 3 1060 241 315 93 112 chr2 62289238 62289399 -119458688 - MLT1G3 LTR MaLR -89 506 349 3 1060 342 356 86 23 chr2 62289457 62289759 -119458328 + MLT1A0 LTR MaLR 45 365 0 3 1060 545 329 45 49 chr2 62290037 62290261 -119457826 - MLT1G3 LTR MaLR -372 223 1 3 1060 627 257 172 8 chr2 62299056 62299311 -119448776 + MLT1D LTR MaLR 24 320 -185 4 1060 1445 126 236 10 chr2 62304322 62304635 -119443452 - ORR1B1 LTR MaLR -10 384 1 4 1060 726 290 56 26 chr2 62360587 62360898 -119387189 + ORR1E LTR MaLR 1 378 -1 4 1060 358 231 103 0 chr2 62363994 62364111 -119383976 + LTR79 LTR ERVL 323 451 -76 4 1060 235 272 49 0 chr2 62372821 62372902 -119375185 + MER57C2 LTR ERV1 350 434 0 4 1060 530 188 26 86 chr2 62373227 62373378 -119374709 + RMER10B LTR ERVL 198 339 -59 5 1060 498 355 94 70 chr2 62376024 62376396 -119371691 + MLT1J1 LTR MaLR 41 421 -23 5 1061 1498 239 28 11 chr2 62395385 62395748 -119352339 - ORR1D2 LTR MaLR -1 369 1 5 1061 552 312 17 25 chr2 62396481 62396670 -119351417 + ORR1E LTR MaLR 13 189 -170 5 1061 2673 93 64 0 chr2 62401445 62401821 -119346266 - MTB LTR MaLR 0 400 1 5 1061 1033 299 66 55 chr2 62404323 62404780 -119343307 + MT2A LTR ERVL 7 468 -65 5 1061 829 276 78 26 chr2 62407259 62407561 -119340526 + MLT1B LTR MaLR 41 369 -5 5 1061 348 352 90 52 chr2 62414816 62415186 -119332901 + ORR1E LTR MaLR 1 370 0 5 1061 3043 86 0 8 chr2 62418129 62418528 -119329559 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 1061 7430 78 16 68 chr2 62418528 62419687 -119328400 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 5 1061 3194 53 2 8 chr2 62419687 62420085 -119328002 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 1061 314 354 75 66 chr2 62420100 62420312 -119327775 + MLT2B3 LTR ERVL 5 218 -336 5 1061 1614 186 78 0 chr2 62420630 62420839 -119327248 + RLTR14 LTR ERV1 3 224 -158 5 1061 1614 186 78 0 chr2 62420898 62420995 -119327092 + RLTR14 LTR ERV1 225 332 -50 5 1061 656 269 69 66 chr2 62423342 62423720 -119324367 - MTEb LTR MaLR 0 379 1 5 1061 402 357 56 26 chr2 62424113 62424383 -119323704 - LTR16A LTR ERVL -88 363 86 5 1061 493 305 159 56 chr2 62424424 62424744 -119323343 - MLT1A0 LTR MaLR -10 355 3 5 1061 251 307 18 84 chr2 62425653 62425774 -119322313 - MLT1A LTR MaLR -17 373 260 5 1061 250 252 165 31 chr2 62428480 62428607 -119319480 - LTR41 LTR ERVL -364 404 261 5 1061 318 291 205 20 chr2 62428620 62428771 -119319316 - LTR41 LTR ERVL -579 189 11 5 1061 4581 121 25 45 chr2 62429031 62429856 -119318231 + RMER17D2 LTR ERVK 1 809 0 5 1061 515 284 133 33 chr2 62434700 62434940 -119313147 + MLT1E1A LTR MaLR 286 549 -131 5 1061 937 258 132 21 chr2 62435452 62435793 -119312294 - MTE2a LTR MaLR 0 379 1 5 1061 243 325 25 50 chr2 62437906 62438026 -119310061 + MTEa LTR MaLR 263 379 0 5 1061 1460 290 52 22 chr2 62445495 62446038 -119302049 + RLTR20A2 LTR ERVK 8 566 -12 6 1061 409 293 120 95 chr2 62457861 62458211 -119289876 + MTEa LTR MaLR 1 377 -2 6 1061 1150 56 0 0 chr2 62476100 62476243 -119271844 + RLTR13B1 LTR ERVK 353 495 -308 6 1061 3462 59 7 0 chr2 62476235 62476675 -119271412 + RLTR13B1 LTR ERVK 451 893 0 6 1061 558 294 92 35 chr2 62489448 62489709 -119258378 + MTEa LTR MaLR 80 355 -24 6 1061 833 206 139 126 chr2 62494532 62494920 -119253167 + RLTR9C LTR ERVK 1 393 0 6 1061 427 380 119 27 chr2 62495611 62496022 -119252065 + LTR33 LTR ERVL 15 463 -52 6 1061 2241 145 0 3 chr2 62496928 62497267 -119250820 - ORR1A1 LTR MaLR -8 338 1 6 1061 346 326 69 17 chr2 62498133 62498335 -119249752 + MLT1A LTR MaLR 1 205 -203 6 1061 822 273 193 23 chr2 62498479 62498860 -119249227 - RLTR16 LTR ERVK -57 448 3 7 1061 325 284 90 21 chr2 62498860 62498994 -119249093 + MLT1A LTR MaLR 193 336 -38 6 1061 592 324 108 20 chr2 62500693 62500989 -119247098 - LTR40a LTR ERVL -15 504 183 2 1061 321 293 46 139 chr2 62512398 62512592 -119235495 + MTEb LTR MaLR 204 379 0 1 1061 1964 150 126 16 chr2 62513636 62514008 -119234079 + MTC LTR MaLR 1 413 -8 2 1062 640 278 209 5 chr2 62521900 62522110 -119225977 + MTEa LTR MaLR 1 253 -126 3 1062 2154 163 42 8 chr2 62544567 62544944 -119203143 + MTC LTR MaLR 1 390 -31 6 1062 272 315 18 53 chr2 62546722 62546836 -119201251 + RLTR14 LTR ERV1 271 380 -2 6 1062 237 286 27 158 chr2 62547334 62547517 -119200570 + MER110 LTR ERV1 108 266 -225 6 1062 227 329 56 111 chr2 62547661 62547931 -119200156 + ORR1E LTR MaLR 64 318 -41 6 1062 276 234 51 25 chr2 62551010 62551089 -119196998 - ORR1E LTR MaLR 0 379 299 7 1062 3194 26 18 5 chr2 62551090 62551473 -119196614 + RLTR10 LTR ERVK 1 388 -2 7 1062 2057 31 4 0 chr2 62551485 62551745 -119196342 + RLTR10-int LTR ERVK 41 301 -1686 7 1062 281 312 53 122 chr2 62551747 62551785 -119196302 - ORR1E LTR MaLR -87 287 252 7 1062 2298 148 40 0 chr2 62551785 62552164 -119195923 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 7 1062 347 302 90 103 chr2 62552164 62552428 -119195659 - ORR1E LTR MaLR -123 251 6 7 1062 792 264 138 42 chr2 62562238 62562581 -119185506 + MTD LTR MaLR 13 403 -18 9 1062 446 279 25 81 chr2 62570139 62570299 -119177788 - RMER10B LTR ERVL 0 398 248 1 1062 3546 61 6 101 chr2 62582581 62583106 -119164981 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 475 0 1 1062 1984 181 74 5 chr2 62583227 62583621 -119164466 + MTC LTR MaLR 1 421 0 1 1062 314 321 0 0 chr2 62586392 62586476 -119161611 - ERVL-B4-int LTR ERVL -3900 1814 1731 1 1062 370 341 54 9 chr2 62586526 62586748 -119161339 - ERVL-B4-int LTR ERVL -3994 1720 1489 1 1062 2989 183 70 24 chr2 62589075 62589735 -119158352 + RMER6C LTR ERVK 1 690 0 1 1062 375 279 64 37 chr2 62589797 62589956 -119158131 + RMER20B LTR ERVK 1 160 -356 1 1062 710 266 71 0 chr2 62590068 62590252 -119157835 + RMER20B LTR ERVK 169 365 -262 1 1062 274 263 9 104 chr2 62597578 62597684 -119150403 + MT2B LTR ERVL 162 257 -344 1 1062 1342 285 59 80 chr2 62598053 62598682 -119149405 + RLTR18 LTR ERVK 1 616 0 1 1062 551 257 139 40 chr2 62605622 62605845 -119142242 + MLT2B4 LTR ERVL 7 251 -305 1 1062 989 249 43 77 chr2 62624489 62624881 -119123206 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 1 1062 3167 56 2 8 chr2 62633586 62633984 -119114103 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 1062 295 239 30 0 chr2 62640804 62640871 -119107216 - MLT1A0 LTR MaLR -41 324 256 2 1062 1904 207 13 42 chr2 62642547 62643001 -119105086 + BGLII_B LTR ERVK 1 441 0 2 1062 1577 237 104 42 chr2 62643065 62643404 -119104683 - RLTR20B3 LTR ERVK -56 521 157 2 1062 1577 237 104 42 chr2 62643475 62643607 -119104480 - RLTR20B3 LTR ERVK -421 156 21 2 1062 680 331 149 72 chr2 62644300 62644817 -119103270 + MLT1F2 LTR MaLR 1 557 -3 2 1062 1255 215 103 7 chr2 62649959 62650249 -119097838 - MTD LTR MaLR -42 377 60 2 1062 234 311 9 45 chr2 62650330 62650355 -119097732 + RMER12 LTR ERVK 750 772 -550 2 1062 234 311 9 45 chr2 62650535 62650620 -119097467 + RMER12 LTR ERVK 773 856 -466 2 1063 720 97 62 19 chr2 62665341 62665535 -119082552 - RMER17B LTR ERVK -396 510 298 2 1063 363 302 20 80 chr2 62668366 62668517 -119079570 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 224 2 1063 3016 70 5 5 chr2 62670421 62670821 -119077266 - MTB LTR MaLR 0 400 1 2 1063 372 293 152 98 chr2 62706729 62707085 -119041002 - MTEa LTR MaLR -4 375 1 2 1063 293 262 185 37 chr2 62708118 62708253 -119039834 + RLTR14 LTR ERV1 226 380 -2 2 1063 1129 293 63 6 chr2 62712163 62712510 -119035577 - ORR1D2 LTR MaLR -2 368 2 2 1063 1047 259 58 37 chr2 62719948 62720307 -119027780 - MTD LTR MaLR -14 393 1 3 1063 1173 225 227 78 chr2 62721380 62721791 -119026296 + MT2A LTR ERVL 3 485 -48 3 1063 1173 225 227 78 chr2 62721891 62721940 -119026147 + MT2A LTR ERVL 486 532 -1 3 1063 2713 105 19 16 chr2 62724915 62725342 -119022745 + RLTR31B_Mm LTR ERVK 1 428 -129 3 1063 707 294 36 18 chr2 62726872 62727094 -119020993 + RMER15 LTR ERVL 336 561 -14 3 1063 3379 33 2 0 chr2 62727911 62728306 -119019781 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 1063 264 344 75 38 chr2 62735268 62735559 -119012528 + MLT1E1A LTR MaLR 270 620 -60 3 1063 1084 251 68 31 chr2 62737275 62737628 -119010459 + ORR1D2 LTR MaLR 5 370 0 3 1063 417 257 32 27 chr2 62737879 62738042 -119010045 - MLT1D LTR MaLR -11 494 291 3 1063 230 353 78 43 chr2 62740727 62740958 -119007129 - MLT1I LTR MaLR -109 302 64 3 1063 1027 223 272 37 chr2 62749209 62749646 -118998441 + MT2B LTR ERVL 1 540 -61 3 1063 308 175 0 31 chr2 62749752 62749817 -118998270 + MLT2B1 LTR ERVL 505 567 0 3 1063 3056 175 93 31 chr2 62760651 62761329 -118986758 - RMER6D LTR ERVK 0 720 1 3 1063 1664 253 105 12 chr2 62761909 62762394 -118985693 + MT2A LTR ERVL 4 533 0 3 1063 528 362 63 43 chr2 62771544 62771893 -118976194 + ORR1E LTR MaLR 1 356 -3 3 1063 1617 204 169 82 chr2 62773497 62774132 -118973955 + RMER6C LTR ERVK 1 690 0 3 1063 1981 127 42 10 chr2 62777077 62777388 -118970699 - ORR1A4 LTR MaLR -8 321 1 3 1064 739 290 78 152 chr2 62784490 62785043 -118963044 + RLTR18B LTR ERVK 1 512 0 4 1064 809 190 33 196 chr2 62785096 62785586 -118962501 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 4 1064 619 322 5 65 chr2 62788229 62788388 -118959699 - MTE-int LTR MaLR -1250 330 184 4 1064 619 322 5 65 chr2 62788638 62788693 -118959394 - MTE-int LTR MaLR -1397 183 129 4 1064 3003 151 127 16 chr2 62788867 62789488 -118958599 + RMER6C LTR ERVK 1 690 0 4 1064 1913 174 113 13 chr2 62816630 62817009 -118931078 + MTC LTR MaLR 5 421 0 4 1064 1328 267 102 11 chr2 62818598 62818969 -118929118 + MTD LTR MaLR 1 405 -14 4 1064 228 287 109 47 chr2 62825040 62825168 -118922919 + RMER19C LTR ERVK 79 214 -397 4 1064 257 137 39 0 chr2 62826495 62826546 -118921541 + RLTR21 LTR ERVK 364 416 -1156 4 1064 646 319 60 27 chr2 62830171 62830538 -118917549 - MTE2b LTR MaLR 0 379 1 4 1064 523 341 70 29 chr2 62854123 62854395 -118893692 - ORR1E LTR MaLR -73 286 4 5 1064 541 358 76 17 chr2 62857753 62858043 -118890044 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 59 5 1064 769 352 51 22 chr2 62864895 62865209 -118882878 + MTE2b LTR MaLR 16 338 -41 5 1064 290 104 104 0 chr2 62865425 62865473 -118882614 + MTE2b LTR MaLR 325 377 -2 5 1064 2484 131 355 2 chr2 62910653 62911182 -118836905 + RMER6D LTR ERVK 1 716 -4 5 1065 2819 52 3 0 chr2 62924356 62924701 -118823386 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 5 1065 3177 147 16 27 chr2 62952103 62952704 -118795383 + RMER6-int LTR ERVK 2652 3176 -1 6 1065 3235 165 68 16 chr2 62952705 62953339 -118794748 + RMER6C LTR ERVK 1 667 -23 6 1065 957 202 254 28 chr2 62957374 62957796 -118790291 - RMER21B LTR ERV1 -275 567 51 6 1065 666 307 138 79 chr2 62958566 62958909 -118789178 - MTD LTR MaLR 0 379 48 6 1065 255 266 43 90 chr2 62961562 62961773 -118786314 + RMER17C LTR ERVK 49 249 -161 6 1065 1835 167 12 58 chr2 62963919 62964262 -118783825 - ORR1A4 LTR MaLR -2 327 1 6 1065 267 346 14 45 chr2 62972627 62972772 -118775315 + MLT2E LTR ERVL 80 218 -411 6 1065 464 311 118 93 chr2 62977199 62977459 -118770628 + MTD LTR MaLR 1 278 -141 6 1065 3263 33 8 5 chr2 62977459 62977854 -118770233 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 1065 464 311 118 93 chr2 62977854 62978001 -118770086 + MTD LTR MaLR 279 418 -1 6 1065 782 236 71 5 chr2 62978157 62978353 -118769734 + ORR1D1 LTR MaLR 166 374 0 6 1065 1154 278 69 11 chr2 62979017 62979366 -118768721 - MTD LTR MaLR -38 381 13 6 1065 2177 227 56 135 chr2 62979404 62979671 -118768416 - MTD-int LTR MaLR -5 1253 1045 6 1065 2177 227 56 135 chr2 62979975 62980470 -118767617 - MTD-int LTR MaLR -214 1044 547 6 1065 1254 293 86 3 chr2 62980481 62980830 -118767257 - MTD LTR MaLR -23 396 19 6 1065 825 270 132 9 chr2 62982389 62982722 -118765365 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 6 1065 366 183 94 35 chr2 62994503 62994673 -118753414 - RMER17C LTR ERVK -141 269 90 6 1065 535 283 16 107 chr2 63006575 63006828 -118741259 - MT2B LTR ERVL -76 525 296 1 1065 258 316 12 25 chr2 63006880 63006961 -118741126 - MT2B LTR ERVL -424 109 30 1 1065 227 94 0 0 chr2 63007003 63007035 -118741052 - MT2_Mm LTR ERVL -461 32 1 1 1065 2884 152 43 125 chr2 63007797 63008534 -118739553 - RMER6C LTR ERVK -13 677 1 1 1065 356 383 54 44 chr2 63029101 63029489 -118718598 - MER77 LTR ERVL -40 567 176 3 1065 435 349 0 15 chr2 63034011 63034142 -118713945 + MTE2a LTR MaLR 15 143 -236 3 1065 912 322 25 10 chr2 63034145 63034459 -118713628 + MTE2a LTR MaLR 1 319 -60 3 1065 686 273 53 35 chr2 63034494 63034722 -118713365 + MTE2a LTR MaLR 148 379 0 3 1065 886 142 7 7 chr2 63036364 63036506 -118711581 - RMER15 LTR ERVL 0 575 434 4 1065 612 121 50 33 chr2 63036504 63036624 -118711463 - RMER15 LTR ERVL -289 286 165 4 1065 748 204 51 56 chr2 63038354 63038551 -118709536 - RMER15 LTR ERVL -379 196 1 4 1065 432 373 47 16 chr2 63039344 63039665 -118708422 - HERV16-int LTR ERVL -2209 2787 2457 4 1065 835 314 15 4 chr2 63040895 63041154 -118706933 + MTE2b LTR MaLR 2 263 -116 4 1065 226 329 123 39 chr2 63042212 63042367 -118705720 - MLT1D LTR MaLR -317 188 21 4 1066 333 305 175 39 chr2 63059368 63059661 -118688426 + MLT1A LTR MaLR 1 343 -22 7 1066 8163 21 0 4 chr2 63061243 63062176 -118685911 - RLTR13B3 LTR ERVK 0 929 1 7 1066 295 324 33 18 chr2 63062399 63062539 -118685548 + MLT1C LTR MaLR 214 434 -33 7 1066 1038 286 52 44 chr2 63065206 63065568 -118682519 + MTE2a LTR MaLR 1 365 -14 8 1066 3062 304 100 37 chr2 63066006 63067251 -118680836 + MTE2b-int LTR MaLR 27 1350 -230 8 1066 278 299 0 0 chr2 63067252 63067339 -118680748 + MTE2b-int LTR MaLR 1488 1574 -6 8 1066 479 263 156 13 chr2 63067350 63067504 -118680583 + MTE2b LTR MaLR 8 183 -196 8 1066 1734 348 29 47 chr2 63068747 63069474 -118678613 + MTEa-int LTR MaLR 862 1575 -5 8 1066 1127 302 65 6 chr2 63069485 63069821 -118678266 + MTEa LTR MaLR 11 366 -13 8 1066 464 341 58 41 chr2 63070133 63070546 -118677541 + HERV16-int LTR ERVL 83 502 -4494 8 1066 379 345 65 30 chr2 63072059 63072289 -118675798 + HERV16-int LTR ERVL 2597 2834 -2162 8 1066 901 271 120 79 chr2 63072416 63072809 -118675278 - MTD LTR MaLR -8 411 3 9 1066 633 248 46 25 chr2 63072811 63073030 -118675057 - MTD-int LTR MaLR 0 1258 902 9 1066 275 388 48 29 chr2 63074161 63074368 -118673719 - MLT2F LTR ERVL -64 599 389 9 1066 276 268 0 0 chr2 63075806 63075862 -118672225 - ORR1C1 LTR MaLR -1 377 322 9 1066 1487 223 50 0 chr2 63076252 63076571 -118671516 - ORR1C1 LTR MaLR -43 335 1 9 1066 292 354 35 0 chr2 63082203 63082316 -118665771 + MER74A LTR ERVL 209 325 -233 1 1066 756 292 122 51 chr2 63085550 63085904 -118662183 + MTEa LTR MaLR 1 379 0 1 1066 1234 228 97 31 chr2 63103152 63103501 -118644586 - ORR1D1 LTR MaLR -2 372 1 1 1066 1933 215 14 11 chr2 63103994 63104361 -118643726 + MTD LTR MaLR 52 419 0 1 1066 1637 206 117 167 chr2 63106188 63106830 -118641257 - RMER19C LTR ERVK -1 610 1 1 1066 255 375 84 55 chr2 63106922 63107159 -118640928 - MTE2a LTR MaLR -40 339 96 1 1066 446 286 203 6 chr2 63109720 63109915 -118638172 - MTD LTR MaLR 0 419 181 1 1066 964 307 77 3 chr2 63113857 63114210 -118633877 - MTE2b LTR MaLR 0 379 1 1 1066 3281 297 68 44 chr2 63114219 63115420 -118632667 - MTE2b-int LTR MaLR -10 1570 341 1 1066 832 305 36 18 chr2 63116932 63117263 -118630824 - MTE2b-int LTR MaLR -1226 354 18 1 1066 250 325 0 0 chr2 63117273 63117353 -118630734 - MTE2b LTR MaLR 0 379 300 1 1066 535 272 44 0 chr2 63117776 63117912 -118630175 - MTE2b LTR MaLR -73 306 165 1 1066 578 309 98 19 chr2 63118882 63119191 -118628896 - MTD LTR MaLR -14 405 42 1 1066 866 262 93 12 chr2 63123988 63124332 -118623755 + ORR1D1 LTR MaLR 3 374 0 1 1066 2494 92 12 211 chr2 63126977 63127570 -118620517 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 1 1066 2866 34 42 6 chr2 63135431 63135785 -118612302 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 1 1066 8930 27 2 5 chr2 63135785 63136824 -118611263 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 5446 1 1066 30342 27 33 11 chr2 63136823 63140451 -118607636 - IAPEz-int LTR ERVK -2764 3717 8 1 1066 2866 34 42 6 chr2 63140451 63140805 -118607282 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 1 1066 2256 228 76 29 chr2 63142994 63143672 -118604415 + RMER6C LTR ERVK 6 686 -70 1 1066 660 238 55 24 chr2 63143668 63143832 -118604255 + RMER6D LTR ERVK 552 720 0 1 1066 254 427 105 17 chr2 63143904 63144085 -118604002 + LTR81B LTR ERV1? 720 916 -477 1 1066 6428 70 19 2 chr2 63150510 63151387 -118596700 + RMER17A-int LTR ERVK 837 1728 0 1 1066 3672 138 25 75 chr2 63151387 63152177 -118595910 + RMER17A LTR ERVK 1 751 0 1 1066 655 352 59 6 chr2 63152838 63153178 -118594909 + MLT-int LTR MaLR 250 607 -1128 1 1066 246 336 40 67 chr2 63153486 63153636 -118594451 + MLT1B-int LTR MaLR 886 1031 -340 1 1066 295 267 115 52 chr2 63153975 63154149 -118593938 + MLT1B LTR MaLR 165 349 -41 1 1066 953 303 92 26 chr2 63161001 63161347 -118586740 + MTEa LTR MaLR 8 376 -3 2 1066 1889 163 12 15 chr2 63163840 63164170 -118583917 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 2 1066 384 293 49 0 chr2 63168938 63169061 -118579026 + MLT1B LTR MaLR 25 153 -237 2 1067 246 343 0 0 chr2 63177874 63177941 -118570146 - MTE2b LTR MaLR -312 67 1 2 1067 356 210 0 0 chr2 63182659 63182721 -118565366 + ORR1D1 LTR MaLR 266 327 -47 2 1067 2209 139 0 3 chr2 63187188 63187528 -118560559 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 8 2 1067 3050 68 2 2 chr2 63192584 63192980 -118555107 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 1067 1445 180 23 23 chr2 63195258 63195560 -118552527 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -2023 303 2 2 1067 342 206 0 38 chr2 63195620 63195726 -118552361 - RMER3D-int LTR ERVK -1629 1213 1112 2 1067 1585 230 37 52 chr2 63196548 63196578 -118551509 - RLTR20A1 LTR ERVK -73 478 449 2 1067 1585 230 37 52 chr2 63196681 63197114 -118550973 - RLTR20A1 LTR ERVK -103 448 22 2 1067 3373 35 0 2 chr2 63201389 63201786 -118546301 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 1067 2406 106 3 75 chr2 63202001 63202388 -118545699 + RLTR10D LTR ERVK 1 359 0 2 1067 300 252 144 0 chr2 63204191 63204302 -118543785 - MTEa LTR MaLR -4 375 249 2 1067 244 264 99 45 chr2 63226908 63227011 -118521076 - RMER15 LTR ERVL -24 551 443 3 1067 337 318 165 10 chr2 63227865 63228065 -118520022 + RMER20B LTR ERVK 180 410 -217 3 1067 822 263 5 11 chr2 63231565 63231753 -118516334 + ORR1D1 LTR MaLR 1 187 -187 3 1067 489 287 16 169 chr2 63231775 63232018 -118516069 + ORR1D1 LTR MaLR 169 374 0 3 1067 231 310 14 0 chr2 63232570 63232641 -118515446 - MTEb LTR MaLR -14 365 294 3 1067 232 326 40 86 chr2 63245610 63245808 -118502279 - MLT1H-int LTR MaLR -638 771 583 3 1067 1329 120 29 0 chr2 63247924 63248132 -118499955 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 114 3 1067 3252 151 89 85 chr2 63251430 63252183 -118495904 + RMER6A LTR ERVK 1 756 0 3 1067 3130 58 5 2 chr2 63259998 63260393 -118487694 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 1067 302 346 36 73 chr2 63261894 63262031 -118486056 - MTEb LTR MaLR -247 132 1 3 1067 291 228 0 0 chr2 63271573 63271630 -118476457 - MTD LTR MaLR -362 57 1 3 1067 615 268 70 93 chr2 63271637 63271950 -118476137 - MTD-int LTR MaLR -8 1250 945 3 1067 1162 251 63 58 chr2 63271986 63272367 -118475720 - MTD-int LTR MaLR -745 513 131 3 1067 1588 234 9 103 chr2 63272450 63272898 -118475189 - MTD LTR MaLR -8 411 6 3 1067 3200 139 104 20 chr2 63280985 63281593 -118466494 - RMER6C LTR ERVK -31 659 1 3 1067 1310 241 97 3 chr2 63283168 63283497 -118464590 + ORR1D1 LTR MaLR 6 365 -9 3 1067 1381 254 83 27 chr2 63283507 63283916 -118464171 + ORR1D1-int LTR MaLR 3 434 -936 3 1067 372 332 97 68 chr2 63284033 63284470 -118463617 + RMER20B LTR ERVK 99 612 -15 3 1067 2830 268 81 26 chr2 63284657 63285551 -118462536 + ORR1D1-int LTR MaLR 426 1368 -2 3 1067 861 317 127 3 chr2 63285553 63285876 -118462211 + ORR1D1 LTR MaLR 1 363 -7 3 1067 3319 37 135 9 chr2 63298334 63298772 -118449315 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 4 1067 5305 31 48 0 chr2 63300423 63301104 -118446983 + MTA_Mm-int LTR MaLR 385 1098 0 4 1067 2676 39 27 3 chr2 63301104 63301440 -118446647 + MTA_Mm LTR MaLR 1 344 -52 4 1067 5504 124 51 138 chr2 63303806 63304635 -118443452 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1 841 -1007 4 1067 5504 124 51 138 chr2 63304813 63305135 -118442952 + RLTR22_Mur LTR ERVK 842 1041 -807 4 1067 5504 124 51 138 chr2 63305258 63305336 -118442751 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1042 1123 -725 4 1067 292 212 15 29 chr2 63306504 63306572 -118441515 - RLTR25B LTR ERVK -530 498 432 4 133 4853 122 18 3 chr2 63307194 63307926 -118440161 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1106 1848 0 4 1068 274 205 48 60 chr2 63313335 63313418 -118434669 + RMER15 LTR ERVL 48 129 -446 4 1068 461 286 193 5 chr2 63313509 63313706 -118434381 + RMER15 LTR ERVL 342 575 0 4 1068 668 297 111 48 chr2 63324317 63324650 -118423437 - MTD LTR MaLR -11 368 40 4 1068 996 285 175 37 chr2 63324702 63325435 -118422652 - MT-int LTR MaLR -59 1199 285 4 1068 255 316 70 9 chr2 63325572 63325687 -118422400 - MT-int LTR MaLR -1431 149 28 4 1068 1542 289 33 5 chr2 63336978 63337374 -118410713 + MTD LTR MaLR 13 419 0 4 1068 992 209 75 11 chr2 63339907 63340181 -118407906 - RMER19C LTR ERVK 0 611 355 4 1068 525 214 59 89 chr2 63340176 63340345 -118407742 - RMER19C LTR ERVK -444 458 295 4 1068 441 255 0 0 chr2 63340599 63340693 -118407394 - ORR1D1 LTR MaLR -59 315 222 4 1068 1494 286 75 26 chr2 63353398 63353890 -118394197 - RMER15 LTR ERVL -16 559 44 4 1068 342 181 106 78 chr2 63357213 63357393 -118390694 - RMER17C LTR ERVK -137 273 89 4 1068 227 326 59 30 chr2 63362727 63362828 -118385259 + MLT1A1 LTR MaLR 15 118 -290 4 1068 383 133 17 0 chr2 63377841 63377927 -118370160 - ORR1C1 LTR MaLR -253 76 1 5 1068 1135 198 4 16 chr2 63377927 63378169 -118369918 - ORR1C1-int LTR MaLR 0 1509 1271 5 1068 1599 226 22 22 chr2 63378211 63378582 -118369505 - ORR1C1-int LTR MaLR -1138 371 1 5 1068 972 243 106 28 chr2 63378595 63378838 -118369249 - ORR1C1 LTR MaLR -13 365 112 5 1068 972 243 106 28 chr2 63378908 63378948 -118369139 - ORR1C1 LTR MaLR -267 111 60 5 1068 4712 142 54 35 chr2 63379624 63380509 -118367578 + RLTR13D6 LTR ERVK 1 902 0 5 1068 1135 222 178 19 chr2 63385851 63385979 -118362108 + ORR1C2 LTR MaLR 11 157 -227 5 1068 1135 222 178 19 chr2 63386015 63386207 -118361880 + ORR1C2 LTR MaLR 158 382 -2 5 1068 2923 79 34 0 chr2 63386376 63386783 -118361304 - BGLII LTR ERVK 0 421 1 5 1068 470 352 28 0 chr2 63387315 63387497 -118360590 + MTEa LTR MaLR 164 350 -29 5 1068 2836 109 17 0 chr2 63389204 63389618 -118358469 - BGLII LTR ERVK 0 421 1 5 1068 1975 152 35 17 chr2 63390285 63390633 -118357454 + ORR1B1 LTR MaLR 41 394 0 5 1068 235 349 65 49 chr2 63391381 63391565 -118356522 - ORR1E LTR MaLR -165 194 8 5 1068 4583 167 36 62 chr2 63396360 63397299 -118350788 + MurERV4-int LTR ERVK 1415 2329 -2931 5 1068 937 261 72 66 chr2 63397327 63397798 -118350289 + RLTR12B LTR ERVK 47 520 -8 5 1068 4053 262 30 31 chr2 63398784 63400368 -118347719 + MYSERV6-int LTR ERVK 1 1461 -5089 5 1068 4070 176 58 24 chr2 63400407 63401296 -118346791 + MYSERV6-int LTR ERVK 7991 8905 -54 5 1068 228 290 104 118 chr2 63402055 63402266 -118345821 - LTR32 LTR ERVL -9 462 255 5 1068 11289 154 65 11 chr2 63402527 63404850 -118343237 + MurERV4-int LTR ERVK 2812 5260 0 5 1068 1085 164 51 0 chr2 63404851 63405046 -118343041 + RMER4B LTR ERVK 3 207 -378 5 1068 958 107 21 0 chr2 63405053 63405193 -118342894 - ORR1A3 LTR MaLR -8 318 176 5 1068 628 118 22 12 chr2 63405188 63405311 -118342776 - ORR1A3-int LTR MaLR -446 1517 1423 5 1068 504 335 48 0 chr2 63405346 63405513 -118342574 + MTC LTR MaLR 204 378 -43 5 1068 2319 160 33 40 chr2 63406278 63406734 -118341353 + RMER13B LTR ERVK 1 453 -455 5 1068 451 296 39 34 chr2 63410276 63410482 -118337605 + RMER15 LTR ERVL 356 562 -13 5 1068 255 322 96 0 chr2 63418604 63418719 -118329368 - LTR16C LTR ERVL 0 489 364 5 1068 777 308 92 49 chr2 63431368 63431757 -118316330 - MTD LTR MaLR -13 406 1 5 1068 3671 268 50 47 chr2 63433027 63434357 -118313730 - MERVL-int LTR ERVL -4146 1339 5 5 1068 1013 218 205 50 chr2 63434360 63434404 -118313683 - MT2A LTR ERVL 0 533 490 5 1068 1013 199 182 68 chr2 63434462 63434835 -118313252 - MT2A LTR ERVL -44 489 94 5 1068 2344 113 148 7 chr2 63437865 63438285 -118309802 + RLTR44D LTR ERVK 1 479 -7 5 1069 3295 164 17 23 chr2 63438929 63439614 -118308473 + RMER6A LTR ERVK 1 756 0 5 1069 254 328 68 8 chr2 63460108 63460225 -118287862 - ORR1E LTR MaLR -1 358 235 6 1069 951 332 39 7 chr2 63461268 63461574 -118286513 + MTE2b LTR MaLR 1 316 -63 6 1069 751 265 98 89 chr2 63461929 63462298 -118285789 - MTEa LTR MaLR -3 376 5 6 1069 3099 183 119 11 chr2 63468956 63469655 -118278432 + RMER19A LTR ERVK 27 732 -5 6 1069 256 372 73 98 chr2 63469655 63470024 -118278063 + MLT1A LTR MaLR 15 374 0 6 1069 2458 200 29 97 chr2 63476114 63476763 -118271324 + RLTR18 LTR ERVK 12 616 0 6 1069 2335 173 40 147 chr2 63494977 63495601 -118252486 + RLTR31B_Mm LTR ERVK 1 557 0 6 1069 265 324 104 9 chr2 63499008 63499114 -118248973 + MLT1A0 LTR MaLR 29 144 -221 6 1069 447 355 95 90 chr2 63502118 63502709 -118245378 + MER90a LTR ERV1 11 604 -10 3 1069 1747 190 65 0 chr2 63519092 63519429 -118228658 + ORR1B2 LTR MaLR 1 359 -8 1 1069 815 299 108 35 chr2 63523521 63523927 -118224160 + MLT2C2 LTR ERVL 8 443 -21 2 1069 235 337 33 22 chr2 63535575 63535666 -118212421 - MLT1N2 LTR MaLR -17 545 454 4 1069 1660 147 21 75 chr2 63545777 63546108 -118201979 - ORR1A3 LTR MaLR -13 313 1 5 1069 887 278 39 112 chr2 63550001 63550410 -118197677 - MTE2a LTR MaLR 0 379 1 5 1069 889 333 149 78 chr2 63550411 63551405 -118196682 - MTE2a-int LTR MaLR -2 1578 31 5 1069 805 252 67 125 chr2 63551403 63551747 -118196340 - MTE2a LTR MaLR -55 324 1 5 1069 484 174 30 148 chr2 63565869 63566004 -118182083 + ORR1B1 LTR MaLR 1 119 -275 7 1070 679 255 62 75 chr2 63570265 63570692 -118177395 - RMER2 LTR ERV1 -36 531 5 7 1070 2450 183 148 16 chr2 63570857 63571467 -118176620 - RMER6C LTR ERVK 0 690 1 8 1070 1852 149 32 13 chr2 63574559 63574872 -118173215 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 8 1070 2940 91 2 2 chr2 63576920 63577327 -118170760 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 8 1070 3360 165 58 17 chr2 63578599 63579258 -118168829 - RMER6C LTR ERVK -4 686 1 8 1070 6007 68 35 0 chr2 63585255 63586036 -118162051 - RLTR13C2 LTR ERVK 0 808 1 9 1070 326 377 40 0 chr2 63590000 63590175 -118157912 - LTR16B1 LTR ERVL -15 465 284 1 1070 257 275 0 28 chr2 63591673 63591744 -118156343 - ORR1E LTR MaLR -24 355 287 1 1070 308 328 112 11 chr2 63591806 63591985 -118156102 - ORR1E LTR MaLR -162 197 1 1 1070 254 324 133 33 chr2 63597970 63598120 -118149967 + MLT1I LTR MaLR 19 183 -228 1 1070 381 263 52 9 chr2 63605549 63605664 -118142423 + MLT1B LTR MaLR 271 390 0 1 1070 1596 270 67 27 chr2 63629690 63630216 -118117871 + RMER15 LTR ERVL 22 568 -7 1 1070 245 164 73 0 chr2 63634163 63634218 -118113869 - MLT2C1 LTR ERVL 0 563 505 1 1070 520 308 55 20 chr2 63651162 63651364 -118096723 + MTEa LTR MaLR 10 218 -161 1 1070 469 298 53 66 chr2 63651368 63651587 -118096500 + MT2A LTR ERVL 293 552 -2 1 1070 1155 267 40 0 chr2 63652642 63652938 -118095149 + MERVL_2A-int LTR ERVL 5122 5429 -332 1 1070 349 171 29 0 chr2 63655306 63655376 -118092711 + MERVL_2A-int LTR ERVL 5689 5760 -1 1 1070 657 284 36 107 chr2 63656113 63656421 -118091666 + MT2A LTR ERVL 148 433 -100 1 1070 3053 49 23 3 chr2 63656626 63657012 -118091075 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 3 1 1070 314 299 243 31 chr2 63664018 63664348 -118083739 - MLT1A1 LTR MaLR -8 400 1 1 1070 363 291 62 68 chr2 63665235 63665412 -118082675 - MTE2a LTR MaLR 0 379 204 1 1070 773 77 0 0 chr2 63672411 63672515 -118075572 - MTB LTR MaLR 0 400 297 1 1070 3400 40 0 0 chr2 63672515 63672911 -118075176 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 1070 6997 95 16 72 chr2 63672911 63674075 -118074012 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 1 1070 482 65 0 0 chr2 63674075 63674137 -118073950 + ORR1A3 LTR MaLR 257 318 -8 1 1070 2076 95 3 69 chr2 63676171 63676521 -118071566 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 327 -10 2 1070 55365 10 5 2 chr2 63676523 63682985 -118065102 + IAPEz-int LTR ERVK 3 6481 0 2 1070 2068 95 3 69 chr2 63682985 63683334 -118064753 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 326 -11 2 1070 306 311 95 27 chr2 63698630 63698915 -118049172 + MTEb LTR MaLR 61 372 -7 2 1071 1534 246 44 66 chr2 63720744 63721202 -118026885 - RLTR20C LTR ERVK 0 534 97 2 1071 1534 246 44 66 chr2 63721234 63721272 -118026815 - RLTR20C LTR ERVK -438 96 50 2 1071 351 191 0 0 chr2 63723328 63723391 -118024696 - MYSERV6-int LTR ERVK -4776 4183 4121 2 1071 1269 273 7 76 chr2 63723399 63723862 -118024225 + BGLII_B LTR ERVK 2 432 -9 2 1071 1391 244 55 55 chr2 63727921 63728338 -118019749 - MTD LTR MaLR -1 418 2 2 1071 1332 209 33 38 chr2 63729017 63729385 -118018702 - RMER6C LTR ERVK 0 690 325 2 1071 670 122 0 137 chr2 63729482 63729578 -118018509 - MT2B LTR ERVL -342 259 181 2 1071 273 128 0 0 chr2 63729588 63729627 -118018460 - RMER6C LTR ERVK -681 39 1 2 1071 246 322 169 81 chr2 63730190 63730450 -118017637 - MLT1A0 LTR MaLR -10 355 73 2 1071 2177 298 41 40 chr2 63730721 63731739 -118016348 - MTC-int LTR MaLR -342 916 2 2 1071 1125 257 176 6 chr2 63731811 63732140 -118015947 - MTD LTR MaLR -34 385 1 2 1071 266 379 31 31 chr2 63732591 63732719 -118015368 - LTR33 LTR ERVL -377 138 11 2 1071 3452 118 183 92 chr2 63733463 63734293 -118013794 + RMER17A2 LTR ERVK 1 906 0 2 1071 622 138 0 0 chr2 63735992 63736086 -118012001 + RMER17C-int LTR ERVK 3143 3236 -2 2 1071 482 236 125 19 chr2 63736088 63736304 -118011783 + RMER17C LTR ERVK 1 239 -171 2 1071 506 335 127 12 chr2 63746598 63746843 -118001244 - MLT1F1 LTR MaLR -3 566 294 2 1071 2864 87 14 2 chr2 63749746 63750162 -117997925 - BGLII LTR ERVK 0 421 1 2 1071 566 191 377 0 chr2 63751244 63751427 -117996660 + RMER19B LTR ERVK 1 252 -359 2 1071 815 194 7 4 chr2 63751425 63751593 -117996494 + RMER19B LTR ERVK 753 898 -4 2 1071 1787 240 38 34 chr2 63753441 63753938 -117994149 + RLTR16 LTR ERVK 7 505 0 3 1071 465 105 26 13 chr2 63754137 63754214 -117993873 + RMER6C LTR ERVK 609 686 -4 3 1071 1289 178 12 12 chr2 63754253 63754498 -117993589 - RMER6D LTR ERVK -471 249 5 3 1071 411 275 67 0 chr2 63756270 63756390 -117991697 + MTEa LTR MaLR 248 375 -4 3 1071 277 338 50 92 chr2 63760938 63761265 -117986822 - LTR48B LTR ERV1 -66 721 171 3 1071 1358 168 35 151 chr2 63766595 63767059 -117981028 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 3 1071 9234 155 94 83 chr2 63767059 63767663 -117980424 - RMER17C-int LTR ERVK 0 3238 2610 3 1071 9234 155 94 83 chr2 63767708 63768965 -117979122 - RMER17C-int LTR ERVK 0 2609 1298 3 1071 9234 155 94 83 chr2 63769154 63769367 -117978720 - RMER17C-int LTR ERVK -1941 1297 1097 3 1071 4970 75 64 16 chr2 63769544 63770294 -117977793 - RLTR13C2 LTR ERVK -26 782 1 3 1071 490 254 33 129 chr2 63770308 63770611 -117977476 - RMER17C-int LTR ERVK -2501 737 464 3 1071 1686 234 64 56 chr2 63770607 63771124 -117976963 - RMER17C-int LTR ERVK -2717 521 1 3 1071 696 196 56 19 chr2 63771201 63771362 -117976725 - RMER17C LTR ERVK -230 180 14 3 1071 491 335 64 101 chr2 63778902 63779247 -117968840 + MLT1B LTR MaLR 3 334 -56 3 1071 586 334 151 39 chr2 63779291 63779596 -117968491 + MLT1A0 LTR MaLR 9 347 -18 3 1071 269 319 37 125 chr2 63779883 63780180 -117967907 - ORR1E LTR MaLR -13 346 76 3 1071 241 375 62 0 chr2 63785502 63785614 -117962473 - MLT1A0 LTR MaLR -187 178 60 3 1071 511 266 163 25 chr2 63788393 63788632 -117959455 + RLTR10A LTR ERVK 140 411 0 3 1071 251 350 10 39 chr2 63792955 63793059 -117955028 + LTR33 LTR ERVL 362 462 -53 3 1071 246 300 130 12 chr2 63803799 63803961 -117944126 - RLTR21 LTR ERVK -318 1254 1074 3 1071 247 224 0 0 chr2 63804079 63804128 -117943959 + LTR78 LTR ERV1 166 214 -1090 3 1072 722 242 276 17 chr2 63851266 63851560 -117896527 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 4 1072 282 29 0 0 chr2 63894434 63894468 -117853619 + RMER6D LTR ERVK 1 34 -686 4 1072 2078 192 42 104 chr2 63894711 63895257 -117852830 + RMER6D LTR ERVK 209 720 0 4 1072 720 234 11 67 chr2 63944819 63944998 -117803089 - RMER15 LTR ERVL -164 411 243 5 1072 1398 169 106 4 chr2 63952203 63952476 -117795611 - MTC LTR MaLR -120 301 1 5 1072 2925 83 10 0 chr2 63953303 63953699 -117794388 + MTB LTR MaLR 1 400 0 5 1072 499 308 72 50 chr2 63954233 63954455 -117793632 - MTEa LTR MaLR -147 232 6 5 1072 1418 236 57 6 chr2 63958960 63959310 -117788777 - ORR1D1 LTR MaLR -5 369 2 5 1073 262 329 24 0 chr2 63973001 63973083 -117775004 - MTEa LTR MaLR -8 371 288 5 1073 506 100 0 194 chr2 63989746 63989870 -117758217 + ORR1A3 LTR MaLR 1 100 -226 5 1073 1440 243 96 11 chr2 63990744 63991119 -117756968 + MTD LTR MaLR 5 411 -8 5 1073 1073 264 52 81 chr2 63994577 63994961 -117753126 + MTEa LTR MaLR 1 373 -6 5 1073 276 272 56 37 chr2 63995145 63995252 -117752835 + MLT2B4 LTR ERVL 6 114 -442 5 1073 1410 175 15 31 chr2 63995694 63995953 -117752134 - RMER19B LTR ERVK -12 890 636 6 1073 1023 204 85 66 chr2 63995959 63996252 -117751835 - RMER19B LTR ERVK -425 312 1 6 1073 1045 272 53 41 chr2 64001755 64002101 -117745986 - ORR1E LTR MaLR 0 379 2 2 1073 3857 47 19 0 chr2 64004977 64005442 -117742645 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 2 6 1073 1561 104 5 0 chr2 64006569 64006790 -117741297 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 98 1 1073 651 151 0 0 chr2 64007864 64007970 -117740117 - ORR1A2 LTR MaLR -220 106 1 1 1073 3152 168 186 16 chr2 64014236 64014994 -117733093 + RMER19B LTR ERVK 4 890 -12 1 1073 1465 291 57 11 chr2 64023407 64023866 -117724221 - MTE2b-int LTR MaLR -1100 480 1 3 1073 363 309 176 120 chr2 64023866 64024223 -117723864 - MTE2b LTR MaLR 0 379 3 3 1073 2030 143 16 0 chr2 64047817 64048139 -117699948 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 5 1073 9169 163 38 73 chr2 64048139 64049977 -117698110 + ORR1A2-int LTR MaLR 1 1772 -191 5 1073 3620 16 119 14 chr2 64049977 64050423 -117697664 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 5 1073 9169 163 38 73 chr2 64050423 64050618 -117697469 + ORR1A2-int LTR MaLR 1773 1963 0 5 1073 2035 124 16 0 chr2 64050618 64050932 -117697155 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 5 1073 1284 203 130 56 chr2 64058840 64059216 -117688871 - MTD LTR MaLR -14 405 2 6 1073 976 256 94 12 chr2 64061959 64062299 -117685788 + ORR1D2 LTR MaLR 1 368 -2 7 1073 1213 232 37 122 chr2 64073688 64074091 -117673996 - MTE2a LTR MaLR -1 378 10 8 1073 233 347 40 30 chr2 64074571 64074672 -117673415 - RMER15 LTR ERVL -198 377 276 8 1073 2028 193 259 2 chr2 64075153 64075404 -117672683 + RMER6C LTR ERVK 1 325 -365 8 1073 2028 193 259 2 chr2 64075470 64075767 -117672320 + RMER6C LTR ERVK 326 689 -1 8 1073 3783 175 87 87 chr2 64076606 64077496 -117670591 + RMER19B LTR ERVK 1 890 -12 9 1073 2508 85 56 0 chr2 64079809 64080149 -117667938 - RLTR10D LTR ERVK 0 359 1 9 1073 657 333 58 67 chr2 64090653 64091116 -117656971 + LTR40b LTR ERVL 4 462 0 1 1074 232 300 102 55 chr2 64094819 64094946 -117653141 - MLT1C LTR MaLR -334 133 1 1 1074 1167 231 239 3 chr2 64114229 64114577 -117633510 + RMER4B LTR ERVK 151 580 -5 1 1074 1945 181 72 133 chr2 64124062 64124686 -117623401 + RMER6C LTR ERVK 103 688 -2 1 1074 2612 300 114 101 chr2 64127545 64128969 -117619118 - MTE-int LTR MaLR -2 1578 137 1 1074 612 306 154 28 chr2 64129371 64129690 -117618397 - MTEa LTR MaLR -13 366 8 1 1074 1854 239 60 19 chr2 64134222 64134717 -117613370 + RLTR16 LTR ERVK 1 496 -9 1 1074 239 239 67 53 chr2 64134706 64134781 -117613306 + RLTR16 LTR ERVK 430 505 0 1 1074 604 342 32 0 chr2 64138318 64138505 -117609582 - ORR1E LTR MaLR -165 194 2 1 1074 519 302 65 13 chr2 64144271 64144470 -117603617 - MTC LTR MaLR -133 288 74 1 1074 419 293 6 39 chr2 64150498 64150654 -117597433 + LTR83 LTR ERVL 263 413 -367 1 1074 862 298 101 19 chr2 64158004 64158322 -117589765 - ORR1E LTR MaLR 0 359 16 1 1074 458 298 14 0 chr2 64166621 64166762 -117581325 - MLT1L LTR MaLR 0 610 468 1 1074 1223 249 162 73 chr2 64172434 64172910 -117575177 + RMER15 LTR ERVL 57 574 -1 2 1074 998 215 44 5 chr2 64173699 64173905 -117574182 + ORR1B1 LTR MaLR 173 386 -8 2 1074 5216 196 106 70 chr2 64173909 64175363 -117572724 + ORR1B1-int LTR MaLR 1 1507 -2 2 1074 1189 201 90 70 chr2 64175365 64175708 -117572379 + ORR1B1 LTR MaLR 1 376 -2 2 1074 1356 219 44 78 chr2 64175904 64176291 -117571796 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 2 1074 661 221 55 34 chr2 64177077 64177334 -117570753 + ORR1C2 LTR MaLR 1 327 -57 2 1074 402 333 17 51 chr2 64177870 64178047 -117570040 - MLT1C LTR MaLR -7 460 290 2 1074 890 326 16 96 chr2 64178073 64178413 -117569674 + MTE2b LTR MaLR 16 331 -48 2 1074 890 326 16 96 chr2 64179224 64179235 -117568852 + MTE2b LTR MaLR 332 340 -39 2 1074 890 326 16 96 chr2 64179291 64179314 -117568773 + MTE2b LTR MaLR 341 361 -18 2 1074 3745 317 88 23 chr2 64179337 64179618 -117568469 + MTE2b-int LTR MaLR 2 283 -1297 2 1074 3745 317 88 23 chr2 64179645 64180840 -117567247 + MTE2b-int LTR MaLR 284 1574 -6 2 1074 507 322 113 15 chr2 64180844 64181181 -117566906 + MTE2b LTR MaLR 2 371 -8 2 1074 439 315 11 62 chr2 64181378 64181554 -117566533 - MLT1C LTR MaLR -294 173 7 2 1074 403 260 0 0 chr2 64182916 64183012 -117565075 + MTD LTR MaLR 92 187 -232 2 1074 1729 132 8 135 chr2 64192432 64192489 -117555598 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 287 2 1074 1729 132 8 135 chr2 64193375 64193688 -117554399 - ORR1A4 LTR MaLR -43 286 1 2 1074 327 306 99 61 chr2 64194108 64194320 -117553767 + MLT1D LTR MaLR 278 497 -8 2 1074 1547 254 25 11 chr2 64199093 64199460 -117548627 - MTD LTR MaLR -45 374 3 2 1074 1514 234 68 129 chr2 64199768 64200372 -117547715 - RLTR31A_Mm LTR ERVK -16 568 2 2 1074 1412 190 142 19 chr2 64202414 64202730 -117545357 - ORR1B2 LTR MaLR -12 355 1 2 1074 479 216 56 132 chr2 64213027 64213224 -117534863 - RLTR11B LTR ERVK -22 431 250 2 1074 240 125 100 67 chr2 64213414 64213474 -117534613 - RLTR11B LTR ERVK -390 63 2 2 1074 683 327 128 48 chr2 64217413 64217758 -117530329 + MTD LTR MaLR 21 365 -14 2 1074 306 346 71 53 chr2 64221921 64222147 -117525940 - MamGypLTR1b LTR Gypsy -546 236 7 2 1074 624 324 40 14 chr2 64223920 64224142 -117523945 + LTR90A LTR LTR 749 976 0 2 1075 886 265 48 89 chr2 64226870 64227242 -117520845 - ORR1E LTR MaLR 0 359 3 3 1075 1365 259 84 41 chr2 64235258 64235724 -117512363 - RMER19C LTR ERVK 0 611 126 3 1075 430 301 98 27 chr2 64245102 64245351 -117502736 - MLT1J1 LTR MaLR -184 264 1 3 1075 3055 26 0 0 chr2 64256223 64256569 -117491518 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 3 1075 1386 236 27 24 chr2 64257680 64258053 -117490034 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 3 1075 476 284 104 30 chr2 64264214 64264552 -117483535 - MTD LTR MaLR -7 412 1 3 1075 1222 176 185 73 chr2 64267437 64267767 -117480320 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 3 1075 1105 179 40 32 chr2 64277155 64277690 -117470397 + RMER17C LTR ERVK 1 410 0 3 1075 258 289 51 26 chr2 64282582 64282660 -117465427 + MER77 LTR ERVL 56 135 -472 3 1075 310 257 13 26 chr2 64283026 64283102 -117464985 + MER77 LTR ERVL 520 594 -13 3 1075 1318 164 139 51 chr2 64283421 64283716 -117464371 + ORR1A4 LTR MaLR 1 321 -8 3 1075 346 219 0 27 chr2 64286174 64286249 -117461838 + MTC LTR MaLR 335 407 -14 3 1075 806 340 64 23 chr2 64287216 64287700 -117460387 - MLT1D LTR MaLR 0 505 2 3 1075 1857 180 108 125 chr2 64301700 64302285 -117445802 + RMER15 LTR ERVL 1 575 0 3 1075 433 315 80 71 chr2 64311463 64311702 -117436385 + MER21B LTR ERV1 360 600 -263 3 1075 274 207 17 0 chr2 64317289 64317347 -117430740 + RMER6D LTR ERVK 1 59 -661 3 1075 1798 178 23 100 chr2 64317361 64317607 -117430480 + RMER6D LTR ERVK 1 396 -324 4 1075 1798 185 110 3 chr2 64317657 64317963 -117430124 + RMER6D LTR ERVK 397 701 -19 4 1075 265 302 99 14 chr2 64321861 64322002 -117426085 - MLT1L LTR MaLR -318 292 140 4 1075 937 328 20 43 chr2 64326799 64326933 -117421154 + MTE2a LTR MaLR 29 159 -220 4 1075 937 328 20 43 chr2 64327005 64327220 -117420867 + MTE2a LTR MaLR 160 370 -9 4 1075 974 284 68 24 chr2 64327295 64327591 -117420496 + MTE2a LTR MaLR 62 370 -9 4 1075 362 245 91 10 chr2 64328288 64328387 -117419700 - MLT1J1 LTR MaLR -288 156 50 4 1075 1538 234 65 26 chr2 64328400 64328786 -117419301 - MTD LTR MaLR -5 414 14 4 1075 1122 141 0 6 chr2 64332094 64332265 -117415822 - ORR1B2 LTR MaLR -39 328 159 4 1075 820 208 104 47 chr2 64332529 64332721 -117415366 - ORR1B2 LTR MaLR -191 203 1 4 1075 979 268 44 84 chr2 64333238 64333541 -117414546 - ORR1E LTR MaLR 0 359 70 4 1075 979 268 44 84 chr2 64333581 64333620 -117414467 - ORR1E LTR MaLR -290 69 31 4 1075 771 296 101 52 chr2 64343093 64343518 -117404569 + MT2A LTR ERVL 1 446 -87 4 1075 248 381 113 53 chr2 64344924 64345190 -117402897 + LTR16B1 LTR ERVL 177 458 -22 4 1076 1043 325 86 22 chr2 64360193 64360703 -117387384 - MLT1H LTR MaLR -6 543 1 4 1076 841 315 68 63 chr2 64364303 64364657 -117383430 - MTD LTR MaLR -12 388 31 4 1076 2247 116 0 55 chr2 64365100 64365446 -117382641 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 4 1076 9161 157 82 14 chr2 64365446 64367284 -117380803 - ORR1A2-int LTR MaLR 0 1963 1 4 1076 1922 153 3 55 chr2 64367284 64367629 -117380458 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 4 1076 261 203 31 15 chr2 64369701 64369766 -117378321 - ORR1D2 LTR MaLR -297 73 8 4 1076 1758 213 91 77 chr2 64371406 64371910 -117376177 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 511 -16 4 1076 808 256 43 89 chr2 64383433 64383690 -117364397 - MTD LTR MaLR -174 245 1 4 1076 1447 208 187 31 chr2 64391499 64392005 -117356082 - RMER4B LTR ERVK 0 585 1 5 1076 988 253 88 104 chr2 64402345 64402729 -117345358 - MTE2b LTR MaLR -1 378 1 5 1076 417 276 138 0 chr2 64406696 64406841 -117341246 - LTR90B LTR LTR 0 796 632 5 1076 1790 182 18 57 chr2 64418410 64418799 -117329288 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 5 1076 1889 190 10 70 chr2 64429438 64429823 -117318264 - ORR1D1 LTR MaLR -12 362 1 5 1076 604 374 56 46 chr2 64430183 64430615 -117317472 + LTR79 LTR ERVL 81 516 -11 5 1076 250 338 89 63 chr2 64433522 64433759 -117314328 - MLT2E LTR ERVL -244 419 177 5 1076 270 349 23 23 chr2 64434020 64434152 -117313935 - MLT2E LTR ERVL -487 141 10 5 1076 1981 207 77 16 chr2 64435495 64436044 -117312043 - RMER4B LTR ERVK -3 582 1 5 1076 1151 266 71 34 chr2 64439487 64439838 -117308249 - MTE2a LTR MaLR 0 379 16 5 1076 1630 323 170 24 chr2 64439853 64440586 -117307501 - MTE2a-int LTR MaLR 0 1580 727 5 1076 1630 323 170 24 chr2 64440609 64440734 -117307353 - MTE2a-int LTR MaLR -854 726 597 5 1076 842 304 44 24 chr2 64440810 64441107 -117306980 - MTE2a-int LTR MaLR -1275 305 3 5 1076 327 272 62 39 chr2 64441108 64441238 -117306849 - MTE2a LTR MaLR 0 379 247 5 1076 551 278 76 27 chr2 64441292 64441477 -117306610 - MTE2a LTR MaLR -185 194 1 5 1076 673 302 14 6 chr2 64457314 64457533 -117290554 - MTD LTR MaLR -188 233 1 5 1076 226 224 86 107 chr2 64460287 64460427 -117287660 - MLT1-int LTR MaLR -871 500 364 5 1076 1636 150 67 142 chr2 64460560 64461025 -117287062 + RLTR23 LTR ERV1 1 430 0 5 1076 3599 46 5 0 chr2 64462908 64463342 -117284745 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 5 1076 69349 3 0 0 chr2 64463342 64470923 -117277164 - MMERVK10C-int LTR ERVK 0 7581 1 5 1076 3599 46 5 0 chr2 64470923 64471357 -117276730 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 5 1076 1871 222 24 19 chr2 64471839 64472252 -117275835 - MTC LTR MaLR -1 420 6 5 1076 278 167 0 0 chr2 64479090 64479144 -117268943 + MTEa LTR MaLR 3 56 -323 6 1076 494 355 21 64 chr2 64479246 64479526 -117268561 + MTE-int LTR MaLR 448 715 -865 6 1076 476 295 23 8 chr2 64481668 64481798 -117266289 - MT2A LTR ERVL -401 132 1 6 1076 1796 328 100 47 chr2 64481806 64482686 -117265401 + MTE-int LTR MaLR 540 1466 -114 6 1076 441 237 67 17 chr2 64482688 64482808 -117265279 + MTEb LTR MaLR 251 376 -3 6 1077 314 353 74 34 chr2 64495829 64496005 -117252082 + LTR16B1 LTR ERVL 298 480 0 6 1077 3103 61 30 12 chr2 64497556 64497956 -117250131 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 6 1077 349 396 65 48 chr2 64498316 64498653 -117249434 + LTR33 LTR ERVL 40 382 -133 6 1077 330 270 19 48 chr2 64502976 64503081 -117245006 - MTD LTR MaLR -208 211 110 5 1077 676 269 162 33 chr2 64503266 64503533 -117244554 + MTD LTR MaLR 45 355 -64 6 1077 230 316 12 25 chr2 64503595 64503676 -117244411 - MTD LTR MaLR -322 97 18 5 1077 1240 196 29 20 chr2 64504173 64504437 -117243650 - RLTR20B1 LTR ERVK -1 562 291 8 1077 266 331 113 24 chr2 64510541 64510665 -117237422 - ORR1E LTR MaLR -224 135 1 1 1077 3887 118 103 150 chr2 64512399 64513374 -117234713 + RLTR13B3 LTR ERVK 1 929 0 1 1077 383 324 129 18 chr2 64516038 64516255 -117231832 + MLT1C LTR MaLR 11 251 -216 2 1077 256 278 63 143 chr2 64516981 64517170 -117230917 + MTEb LTR MaLR 206 379 0 2 1077 1848 122 74 7 chr2 64520293 64520591 -117227496 - ORR1A3 LTR MaLR -8 318 1 3 1077 383 312 81 28 chr2 64526937 64527148 -117220939 + MER57C2 LTR ERV1 52 273 -161 3 1077 548 307 165 0 chr2 64527988 64528200 -117219887 - RMER15 LTR ERVL -54 521 275 4 1077 383 263 15 212 chr2 64528202 64528400 -117219687 - RMER15 LTR ERVL -416 159 1 4 1077 376 340 81 13 chr2 64535046 64535195 -117212892 + MTD LTR MaLR 28 186 -233 5 1077 471 301 77 41 chr2 64535366 64535612 -117212475 + MTE2a LTR MaLR 121 375 -4 5 1077 2956 15 3 0 chr2 64536946 64537282 -117210805 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 0 337 1 6 1077 21115 11 2 2 chr2 64537282 64539642 -117208445 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 4123 6 1077 901 89 24 0 chr2 64539644 64539767 -117208320 - IAPEz-int LTR ERVK -2770 4910 4785 6 1077 1797 123 4 4 chr2 64539764 64540026 -117208061 - IAPEz-int LTR ERVK -5183 2497 2236 6 1077 442 66 0 32 chr2 64540015 64540078 -117208009 - IAPEz-int LTR ERVK -5062 1419 1359 6 1077 4831 50 46 16 chr2 64540078 64540714 -117207373 - IAPEz-int LTR ERVK -5819 662 8 6 1077 2943 18 3 0 chr2 64540714 64541050 -117207037 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 0 337 1 6 1077 3411 165 93 2 chr2 64552437 64553069 -117195018 - RLTR17 LTR ERVK 0 692 3 7 1077 3419 20 13 0 chr2 64558458 64558849 -117189238 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 8 1077 4464 12 0 0 chr2 64568449 64568942 -117179145 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 9 1077 1822 185 44 3 chr2 64570824 64570866 -117177221 + RLTR12A LTR ERVK 204 256 -312 9 1077 1822 185 44 3 chr2 64570975 64571274 -117176813 + RLTR12A LTR ERVK 257 559 -9 9 1077 588 354 89 33 chr2 64579296 64579655 -117168432 + MT2A LTR ERVL 1 379 -154 1 1077 2676 74 48 10 chr2 64588396 64588730 -117159357 - RLTR10A LTR ERVK 0 411 62 1 1077 2676 74 48 10 chr2 64589241 64589302 -117158785 - RLTR10A LTR ERVK -350 61 1 1 1077 406 294 22 76 chr2 64591150 64591334 -117156753 + RMER4A LTR ERVK 8 181 -285 1 1077 265 295 12 25 chr2 64597456 64597536 -117150551 + MLT1B LTR MaLR 7 85 -305 1 1077 2255 176 8 3 chr2 64601930 64602322 -117145765 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 1 1077 596 292 25 30 chr2 64606063 64606261 -117141826 - MLT1C LTR MaLR -262 205 9 1 1077 1739 158 37 7 chr2 64608698 64608998 -117139089 + RLTR27 LTR ERVK 1 309 0 1 1078 289 300 23 84 chr2 64618576 64618707 -117129380 + ORR1E LTR MaLR 13 135 -224 1 1078 1816 123 29 7 chr2 64619399 64619677 -117128410 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 44 1 1078 322 328 60 146 chr2 64635531 64635799 -117112288 + ORR1E LTR MaLR 97 341 -18 1 1078 545 332 154 46 chr2 64636021 64636457 -117111630 + MER21B LTR ERV1 127 609 -254 1 1078 880 332 70 20 chr2 64646741 64647143 -117100944 + RMER5 LTR ERV1 113 534 0 1 1078 803 107 40 45 chr2 64647505 64647682 -117100405 + RMER17B LTR ERVK 304 479 -479 1 1078 899 292 9 72 chr2 64647759 64647823 -117100264 + MTE-int LTR MaLR 182 244 -1336 1 1078 899 292 9 72 chr2 64648076 64648346 -117099741 + MTE-int LTR MaLR 245 495 -1085 1 1078 2423 174 10 10 chr2 64648358 64648771 -117099316 + MTC LTR MaLR 1 413 -8 1 1078 933 333 80 98 chr2 64648779 64649318 -117098769 + MTE-int LTR MaLR 523 1051 -529 1 1078 604 302 38 6 chr2 64649403 64649567 -117098520 + MTE-int LTR MaLR 1358 1527 -53 1 1078 559 339 69 54 chr2 64649567 64649916 -117098171 + ORR1E LTR MaLR 1 354 -5 1 1078 369 345 86 45 chr2 64664179 64664603 -117083484 + MLT1G LTR MaLR 46 533 -62 2 1078 2463 187 9 162 chr2 64665941 64666619 -117081468 + RMER15 LTR ERVL 2 575 0 2 1078 3999 50 0 0 chr2 64669611 64670086 -117078001 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 1 2 1078 242 319 29 0 chr2 64670895 64670964 -117077123 + MLT1H1 LTR MaLR 313 383 -172 2 1078 237 290 140 0 chr2 64671001 64671094 -117076993 + MLT1H1 LTR MaLR 471 576 -3 2 1078 630 341 83 63 chr2 64671222 64671936 -117076151 + MLT1H1-int LTR MaLR 173 900 -589 2 1078 810 315 39 35 chr2 64672148 64672434 -117075653 + MTD LTR MaLR 5 291 -128 2 1078 419 265 90 56 chr2 64672463 64672607 -117075480 + MTD LTR MaLR 268 416 -3 2 1078 273 203 28 186 chr2 64675557 64675702 -117072385 + MT2A LTR ERVL 1 122 -411 2 1078 840 260 131 82 chr2 64675593 64675936 -117072151 + MTD LTR MaLR 46 405 -14 2 1078 416 298 89 52 chr2 64681722 64682054 -117066033 + MLT2B4 LTR ERVL 5 477 -79 2 1078 1056 295 29 29 chr2 64682150 64682499 -117065588 - LTR40a LTR ERVL -170 349 1 2 1078 251 291 148 86 chr2 64682814 64682976 -117065111 - MLT1A0 LTR MaLR -122 243 72 2 1078 448 331 59 80 chr2 64685856 64686214 -117061873 - ORR1E LTR MaLR -6 353 4 2 1078 2726 51 3 0 chr2 64711715 64712046 -117036041 + IAPEY3_LTR LTR ERVK 1 332 0 2 1078 2535 130 36 18 chr2 64719152 64719597 -117028490 - RLTR11B LTR ERVK 0 453 1 2 1078 258 132 0 0 chr2 64729372 64729410 -117018677 + RLTR41 LTR ERV1 409 446 0 3 1078 265 301 62 31 chr2 64731153 64731303 -117016784 - MLT1A0 LTR MaLR -193 215 62 3 1079 720 296 127 76 chr2 64755486 64756067 -116992020 - RLTR18 LTR ERVK -5 611 1 3 1079 267 307 76 34 chr2 64771913 64772031 -116976056 + MLT1H1 LTR MaLR 3 125 -454 3 1079 274 295 54 62 chr2 64772272 64772402 -116975685 + MLT1H1 LTR MaLR 414 542 -13 3 1079 1711 229 63 77 chr2 64773535 64774056 -116974031 + RLTR11A LTR ERVK 1 514 -14 3 1079 351 322 132 50 chr2 64781446 64781786 -116966301 + MLT1D LTR MaLR 7 374 -131 3 1079 596 321 84 33 chr2 64783881 64784216 -116963871 + ORR1E LTR MaLR 8 359 0 3 1079 346 274 79 24 chr2 64789495 64789622 -116958465 + RMER15 LTR ERVL 1 134 -441 3 1079 586 241 78 0 chr2 64789802 64789968 -116958119 + RMER15 LTR ERVL 397 575 0 3 1079 315 312 173 47 chr2 64790567 64790971 -116957116 + MLT1D LTR MaLR 51 505 0 3 1079 668 311 121 22 chr2 64791822 64791996 -116956091 - MTEb LTR MaLR 0 379 201 3 1079 668 311 121 22 chr2 64792128 64792266 -116955821 - MTEb LTR MaLR -179 200 36 3 1079 288 284 93 56 chr2 64793568 64793676 -116954411 + MLT1J2 LTR MaLR 81 192 -256 3 1079 319 281 73 0 chr2 64822375 64822471 -116925616 + RMER15 LTR ERVL 367 469 -106 4 1079 799 320 54 46 chr2 64827363 64827713 -116920374 - ORR1E LTR MaLR 0 359 7 4 1079 432 233 14 85 chr2 64829137 64829278 -116918809 - MLT1A0 LTR MaLR -225 140 10 4 1079 996 216 106 32 chr2 64836916 64837232 -116910855 + MTD LTR MaLR 10 380 -39 4 1079 492 325 62 46 chr2 64838986 64839345 -116908742 + RLTR16 LTR ERVK 31 442 -250 4 1079 250 392 79 28 chr2 64840863 64841115 -116906972 - MLT1H1 LTR MaLR -288 267 3 4 1079 308 331 76 88 chr2 64846581 64846922 -116901165 + ORR1E LTR MaLR 8 344 -15 4 1079 311 400 8 0 chr2 64848429 64848559 -116899528 + LTR16A LTR ERVL 211 341 -110 4 1079 1138 263 134 8 chr2 64848564 64848921 -116899166 - MTD LTR MaLR 0 419 18 4 1079 1066 247 112 31 chr2 64856566 64856888 -116891199 - MTE2a LTR MaLR -10 369 22 4 1079 2014 144 19 44 chr2 64862643 64863006 -116885081 + ORR1B1 LTR MaLR 41 394 0 4 1079 2198 111 0 58 chr2 64867384 64867728 -116880359 + ORR1A3 LTR MaLR 1 324 -2 5 1079 1517 178 115 0 chr2 64868299 64868585 -116879502 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 49 5 1079 1239 210 54 133 chr2 64871497 64871845 -116876242 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 39 5 1079 1239 210 54 133 chr2 64871992 64872049 -116876038 - ORR1D1 LTR MaLR -336 38 1 5 1079 2589 147 203 14 chr2 64873850 64874430 -116873657 + RMER6C LTR ERVK 1 690 0 5 1079 1795 170 40 72 chr2 64876011 64876467 -116871620 - RLTR28 LTR ERVL -16 508 68 5 1079 2154 159 67 65 chr2 64877148 64877593 -116870494 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 1 5 1079 1318 163 287 41 chr2 64877840 64877953 -116870134 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 308 5 1079 1318 163 287 41 chr2 64878000 64878231 -116869856 - RLTR23 LTR ERV1 -123 307 1 5 1080 281 376 79 95 chr2 64881194 64881511 -116866576 - ORR1E LTR MaLR -47 312 1 5 1080 509 191 11 57 chr2 64881601 64881798 -116866289 - ORR1D1 LTR MaLR -155 229 1 5 1080 302 350 21 7 chr2 64883060 64883201 -116864886 - MLT1B LTR MaLR -2 388 246 5 1080 336 337 92 10 chr2 64883284 64883479 -116864608 - MLT1B LTR MaLR -174 216 6 5 1080 471 289 6 54 chr2 64888076 64888252 -116859835 + MLT1A1 LTR MaLR 199 374 -34 5 1080 601 252 146 176 chr2 64892901 64893373 -116854714 - RMER4B LTR ERVK -8 458 1 5 1080 1641 133 122 10 chr2 64894755 64895051 -116853036 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 5 1080 3433 173 32 128 chr2 64895051 64895948 -116852139 - ORR1A4-int LTR MaLR 0 1792 982 5 1080 361 231 151 19 chr2 64895906 64896012 -116852075 - MT2B LTR ERVL -328 273 154 5 1080 4228 147 12 56 chr2 64900535 64901299 -116846788 - ORR1A4-int LTR MaLR -1232 731 2 5 1080 1431 130 61 174 chr2 64901304 64901666 -116846421 - ORR1A4 LTR MaLR -8 321 1 5 1080 1742 224 40 124 chr2 64903264 64903931 -116844156 - RMER19C LTR ERVK 0 611 1 5 1080 659 375 55 7 chr2 64904144 64904434 -116843653 + MLT1G LTR MaLR 280 583 -8 5 1080 1907 129 3 92 chr2 64906309 64906667 -116841420 + ORR1A3 LTR MaLR 1 326 0 5 1080 2596 38 31 0 chr2 64914391 64914708 -116833379 + IAPLTR2b LTR ERVK 1 327 0 5 1080 536 334 55 90 chr2 64914932 64915297 -116832790 - MTEa LTR MaLR -8 371 20 5 1080 239 242 0 43 chr2 64920418 64920487 -116827600 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 343 5 1080 890 304 61 0 chr2 64920849 64921096 -116826991 - MTE2b LTR MaLR -117 262 1 5 1080 438 190 69 48 chr2 64924333 64924521 -116823566 + RMER17C LTR ERVK 84 275 -135 6 1080 1787 204 93 8 chr2 64929007 64929393 -116818694 + MTD LTR MaLR 1 419 0 6 1080 2968 124 11 19 chr2 64937841 64938316 -116809771 + RLTR31B_Mm LTR ERVK 1 471 -86 6 1080 8109 153 117 23 chr2 64946789 64947303 -116800784 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1 577 -1271 6 1080 8109 153 117 23 chr2 64947376 64947559 -116800528 + RLTR22_Mur LTR ERVK 578 776 -1072 6 1080 8109 153 117 23 chr2 64947588 64948578 -116799509 + RLTR22_Mur LTR ERVK 777 1848 0 6 1080 1279 231 72 47 chr2 64967453 64967839 -116780248 + MTD LTR MaLR 10 405 -14 6 1080 2721 151 156 47 chr2 64969032 64969654 -116778433 + RMER6C LTR ERVK 1 690 0 6 1080 3759 147 27 93 chr2 64980983 64981807 -116766280 + RLTR25B LTR ERVK 5 773 -255 6 1080 811 218 115 84 chr2 64982125 64982386 -116765701 + RLTR25B LTR ERVK 758 1026 -2 6 1080 504 232 0 0 chr2 64982503 64982602 -116765485 + MTC LTR MaLR 1 99 -322 6 1080 1848 198 0 37 chr2 64982985 64983337 -116764750 + MTC LTR MaLR 83 421 0 6 1080 2171 126 6 6 chr2 64987841 64988168 -116759919 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 6 1080 466 280 75 39 chr2 64990625 64990886 -116757201 + MTEa LTR MaLR 52 375 -4 6 1080 3498 279 80 43 chr2 64990920 64992065 -116756022 + MTE-int LTR MaLR 41 1227 -353 6 1080 488 276 16 0 chr2 64992066 64992189 -116755898 + MTE-int LTR MaLR 567 691 -889 6 1080 1009 251 83 42 chr2 64992196 64992508 -116755579 + MTE-int LTR MaLR 1254 1578 -2 6 1080 579 301 11 33 chr2 64992577 64992759 -116755328 + MTEb LTR MaLR 51 228 -151 6 1080 899 243 146 81 chr2 64997228 64997550 -116750537 - MTEa LTR MaLR -8 371 29 7 1080 1773 189 186 3 chr2 65000427 65000782 -116747305 - MTC LTR MaLR -1 420 1 1 1080 2802 43 65 0 chr2 65007650 65007975 -116740112 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 1 1081 1152 245 112 11 chr2 65012684 65012969 -116735118 - MTD LTR MaLR -92 327 14 2 1081 2871 152 73 11 chr2 65016106 65016637 -116731450 + RMER15 LTR ERVL 4 567 -8 2 1081 1271 210 14 36 chr2 65018322 65018599 -116729488 + MTD LTR MaLR 1 271 -148 3 1081 1552 208 73 47 chr2 65018644 65019053 -116729034 - RMER10A LTR ERVL -22 420 1 3 1081 544 254 44 15 chr2 65019053 65019182 -116728905 + MTD LTR MaLR 279 411 -8 3 1081 455 240 191 15 chr2 65020562 65020759 -116727328 + MLT1A0 LTR MaLR 127 358 -7 3 1081 660 290 50 45 chr2 65021886 65022243 -116725844 + RLTR15 LTR ERVK 1 359 0 3 1081 1082 304 95 26 chr2 65023318 65023706 -116724381 + MTD LTR MaLR 1 415 -4 3 1081 244 246 55 55 chr2 65033991 65034064 -116714023 + LTR41B LTR ERVL 21 93 -665 5 1081 331 250 165 13 chr2 65034581 65034739 -116713348 + LTR41B LTR ERVL 577 758 0 5 1081 726 147 26 7 chr2 65039624 65039775 -116708312 - RMER17B LTR ERVK -498 460 307 6 1081 2656 158 162 10 chr2 65051092 65051591 -116696496 + RMER15 LTR ERVL 1 575 0 8 1081 954 223 176 10 chr2 65059770 65060104 -116687983 + MTD LTR MaLR 28 405 -14 1 1081 360 306 85 40 chr2 65064444 65064689 -116683398 - ORR1E LTR MaLR -120 250 6 1 1081 577 288 101 14 chr2 65066978 65067196 -116680891 + MTE2a LTR MaLR 136 372 -7 1 1081 241 238 70 23 chr2 65069062 65069148 -116678939 + MT2B LTR ERVL 155 244 -357 1 1081 228 344 46 39 chr2 65073551 65073681 -116674406 - MLT1A1 LTR MaLR -13 395 265 1 1081 582 311 65 76 chr2 65079240 65079623 -116668464 - MTEa LTR MaLR 0 379 1 1 1081 2425 154 118 117 chr2 65079763 65080337 -116667750 - RMER15 LTR ERVL 0 575 1 1 1081 874 219 290 0 chr2 65080696 65080979 -116667108 - MT2A LTR ERVL -74 459 95 1 1081 292 185 0 264 chr2 65080982 65081041 -116667046 - MT2A LTR ERVL -407 126 89 1 1081 292 185 0 264 chr2 65081245 65081295 -116666792 - MT2A LTR ERVL -445 88 46 1 1081 363 136 37 12 chr2 65081376 65081458 -116666629 + ORR1B2 LTR MaLR 1 84 -283 1 1081 2464 151 59 16 chr2 65081444 65081937 -116666150 + ORR1B2-int LTR MaLR 996 1509 0 1 1081 1752 175 70 45 chr2 65081937 65082066 -116666021 + ORR1B2 LTR MaLR 1 150 -217 1 1081 1752 175 70 45 chr2 65082098 65082326 -116665761 + ORR1B2 LTR MaLR 151 366 -1 1 1081 1732 167 18 173 chr2 65082458 65082908 -116665179 + ORR1C2 LTR MaLR 2 381 -3 1 1081 880 237 62 24 chr2 65082912 65083202 -116664885 + ORR1C2-int LTR MaLR 2 302 -1207 1 1081 597 273 43 60 chr2 65083200 65083500 -116664587 + RLTR15 LTR ERVK 33 327 -32 1 1081 3729 189 175 19 chr2 65083529 65084487 -116663600 + ORR1C2-int LTR MaLR 224 1331 -178 1 1081 3125 78 0 0 chr2 65084723 65085123 -116662964 + MTB LTR MaLR 1 400 0 1 1081 622 257 232 82 chr2 65086069 65086384 -116661703 - ORR1D2 LTR MaLR -8 362 1 1 1081 430 329 74 16 chr2 65090343 65090599 -116657488 + RMER15 LTR ERVL 305 575 0 1 1081 921 169 45 0 chr2 65092981 65093158 -116654929 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 200 1 1081 2083 77 3 55 chr2 65098830 65099160 -116648927 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 7 1 1081 268 241 79 22 chr2 65106721 65106810 -116641277 + LTR37B LTR ERV1 1 94 -374 2 1081 355 171 13 26 chr2 65107105 65107183 -116640904 + LTR37B LTR ERV1 241 317 -151 2 1081 2024 140 47 3 chr2 65111005 65111348 -116636739 - RLTR15 LTR ERVK -1 358 1 2 1081 1833 171 103 16 chr2 65111958 65112338 -116635749 + MTC LTR MaLR 1 413 -8 2 1081 501 346 47 88 chr2 65114347 65114390 -116633697 - ORR1E LTR MaLR -52 307 266 2 1081 1958 241 62 29 chr2 65114390 65114902 -116633185 + MT2A LTR ERVL 1 529 -4 2 1081 501 346 47 88 chr2 65114902 65115178 -116632909 - ORR1E LTR MaLR -94 265 1 2 1081 714 264 181 0 chr2 65115178 65115374 -116632713 - ORR1E-int LTR MaLR -53 1527 1291 2 1081 1559 174 65 47 chr2 65121485 65121888 -116626199 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 2 1081 1570 81 18 31 chr2 65121888 65122117 -116625970 - RMER17C-int LTR ERVK 0 3238 3013 2 1081 244 132 0 0 chr2 65122117 65122155 -116625932 - RMER17C LTR ERVK -371 39 2 2 1081 1585 183 17 7 chr2 65125755 65126047 -116622040 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 84 2 1081 2432 201 67 46 chr2 65127398 65127920 -116620167 - MT2A LTR ERVL 0 533 1 2 1081 2367 97 6 0 chr2 65129996 65130316 -116617771 + ORR1A2 LTR MaLR 6 327 0 2 1081 276 305 113 48 chr2 65131391 65131515 -116616572 + MTE2a LTR MaLR 6 137 -242 2 1081 436 301 196 54 chr2 65131465 65131725 -116616362 + MT2A LTR ERVL 88 384 -149 2 1081 264 284 0 0 chr2 65131809 65131876 -116616211 + MT2A LTR ERVL 332 398 -135 2 1081 2966 173 45 10 chr2 65134720 65135211 -116612876 + RLTR18B LTR ERVK 1 508 -4 2 1081 779 141 0 311 chr2 65138092 65138298 -116609789 + ORR1B1 LTR MaLR 10 208 -186 2 1081 1238 276 31 23 chr2 65138324 65138676 -116609411 - ORR1E LTR MaLR 0 359 5 2 1082 1719 133 70 138 chr2 65143587 65143970 -116604117 + RLTR15 LTR ERVK 3 359 0 2 1082 2076 147 6 27 chr2 65150081 65150417 -116597670 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 2 1082 748 181 111 50 chr2 65162211 65162391 -116585696 + ORR1E LTR MaLR 1 191 -168 3 1082 398 237 131 77 chr2 65162485 65162668 -116585419 + ORR1E LTR MaLR 163 355 -4 3 1082 1670 83 0 73 chr2 65166573 65166832 -116581255 + ORR1A2 LTR MaLR 1 240 -87 3 1082 538 260 21 136 chr2 65167862 65168200 -116579887 - RMER10A LTR ERVL -142 300 2 3 1082 4467 125 45 4 chr2 65169853 65170566 -116577521 - RMER6A LTR ERVK 0 756 15 3 1082 985 232 181 96 chr2 65177812 65177925 -116570162 + MT2A LTR ERVL 1 91 -442 3 1082 985 232 181 96 chr2 65178133 65178510 -116569577 + MT2A LTR ERVL 92 533 0 3 1082 324 301 55 83 chr2 65184212 65184393 -116563694 + MLT1K LTR MaLR 406 581 -14 3 1082 304 299 51 10 chr2 65187284 65187382 -116560705 + MLT1A LTR MaLR 21 122 -252 3 1082 1076 75 0 0 chr2 65193600 65193746 -116554341 + RLTR11B LTR ERVK 1 146 -307 3 1082 1921 117 19 3 chr2 65194595 65194903 -116553184 + RLTR11B LTR ERVK 141 453 0 3 1082 572 270 92 32 chr2 65204802 65205021 -116543066 + MLT1F LTR MaLR 336 579 0 4 1082 906 223 6 6 chr2 65205776 65205952 -116542135 - MTD LTR MaLR 0 419 244 4 1082 4174 49 10 4 chr2 65206742 65207251 -116540836 + RLTR1B LTR ERV1 1 512 0 4 1082 6371 56 4 32 chr2 65207659 65207826 -116540261 - RLTR13C2 LTR ERVK 0 808 650 4 1082 6371 56 4 32 chr2 65207972 65208636 -116539451 - RLTR13C2 LTR ERVK -159 649 1 4 1082 1738 225 62 3 chr2 65208914 65209302 -116538785 + MTD LTR MaLR 1 411 -8 4 1082 2407 192 193 25 chr2 65210264 65210895 -116537192 - RMER19A LTR ERVK 0 737 1 4 1082 1880 193 224 20 chr2 65212815 65213306 -116534781 + RMER19B LTR ERVK 312 902 0 4 1082 2819 206 24 38 chr2 65215358 65215988 -116532099 + RLTR17 LTR ERVK 3 623 -69 4 1082 1831 231 49 18 chr2 65225071 65225411 -116522676 + ORR1D2-int LTR MaLR 716 1229 -141 4 1082 4598 14 0 0 chr2 65225411 65225893 -116522194 + LTRIS_Mm LTR ERV1 1 482 0 4 1082 1831 221 43 18 chr2 65225893 65226020 -116522067 + ORR1D2-int LTR MaLR 1230 1370 0 4 1082 799 214 60 65 chr2 65229457 65229672 -116518415 + ORR1D2 LTR MaLR 3 216 -154 4 1082 2185 127 0 3 chr2 65230529 65230852 -116517235 + ORR1A3 LTR MaLR 1 322 -4 4 1082 1746 203 41 28 chr2 65231772 65232136 -116515951 - RLTR14 LTR ERV1 -3 379 11 4 1082 671 226 23 34 chr2 65232415 65232601 -116515486 + ORR1D2 LTR MaLR 178 366 -4 4 1082 3103 186 11 12 chr2 65232843 65233404 -116514683 - RLTR20D LTR ERVK 0 568 9 4 1082 455 275 101 35 chr2 65233762 65234048 -116514039 + RLTR14-int LTR ERV1 93 397 -4920 4 1082 800 231 79 35 chr2 65234686 65234861 -116513226 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 198 4 1082 800 231 79 35 chr2 65234900 65234926 -116513161 - ORR1C2 LTR MaLR -187 197 174 4 1082 449 136 10 77 chr2 65235059 65235192 -116512895 - ORR1C2 LTR MaLR -190 194 70 4 1082 697 298 32 26 chr2 65240214 65240555 -116507532 + RLTR15 LTR ERVK 1 343 -16 4 1082 1471 203 35 55 chr2 65255612 65255956 -116492131 + ORR1B1 LTR MaLR 58 394 0 4 1082 1623 251 67 73 chr2 65256194 65256641 -116491446 + RMER19C LTR ERVK 78 537 -74 4 1082 699 256 154 42 chr2 65256641 65256972 -116491115 - RLTR9A LTR ERVK 0 368 1 4 1082 1623 251 67 73 chr2 65256972 65257061 -116491026 + RMER19C LTR ERVK 538 611 0 4 1082 379 333 91 0 chr2 65257601 65257733 -116490354 - MER74A LTR ERVL -2 556 413 4 1082 288 254 0 27 chr2 65257977 65258050 -116490037 - MER74A LTR ERVL -487 71 1 4 1082 5333 106 195 74 chr2 65264290 65265211 -116482876 - RLTR13D4 LTR ERVK 0 1033 1 5 1082 3644 23 10 0 chr2 65269008 65269400 -116478687 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 1083 2994 174 120 44 chr2 65274831 65275582 -116472505 - RLTR13C2 LTR ERVK 0 808 1 5 1083 3155 44 29 0 chr2 65282057 65282442 -116465645 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 1083 1847 222 50 2 chr2 65283833 65284231 -116463856 + MTD LTR MaLR 1 417 -2 5 1083 1397 239 21 27 chr2 65284234 65284570 -116463517 + ORR1D2 LTR MaLR 5 338 -32 5 1083 1162 231 159 0 chr2 65285999 65286294 -116461793 + RMER15 LTR ERVL 233 574 -1 5 1083 882 193 57 0 chr2 65287258 65287417 -116460670 + ORR1B2 LTR MaLR 1 169 -198 5 1083 2693 112 5 10 chr2 65287417 65287821 -116460266 - RLTR9E LTR ERVK 0 409 8 5 1083 240 161 32 97 chr2 65287791 65287853 -116460234 + ORR1B2 LTR MaLR 185 242 -84 5 1083 507 252 123 43 chr2 65289662 65289742 -116458345 + RMER15-int LTR ERVL 4523 4616 -383 5 1083 3631 65 19 2 chr2 65289742 65290216 -116457871 + RLTR45 LTR ERVK 1 482 0 5 1083 507 252 123 43 chr2 65290216 65290346 -116457741 + RMER15-int LTR ERVL 4617 4750 -249 5 1083 1285 296 69 6 chr2 65291065 65291428 -116456659 + MTD LTR MaLR 18 403 -16 5 1083 1487 291 105 81 chr2 65291443 65292308 -116455779 + MTD-int LTR MaLR 1 886 -372 5 1083 540 203 1 65 chr2 65300364 65300519 -116447568 + ORR1C2 LTR MaLR 8 146 -248 5 1083 672 196 146 32 chr2 65301796 65301838 -116446249 + ORR1C2 LTR MaLR 136 187 -197 5 1083 672 196 146 32 chr2 65302008 65302150 -116445937 + ORR1C2 LTR MaLR 188 341 -43 5 1083 809 324 44 24 chr2 65302244 65302585 -116445502 + ORR1E LTR MaLR 3 350 -9 5 1083 345 135 16 5 chr2 65312652 65312725 -116435362 + MTD LTR MaLR 240 316 -105 5 1083 1712 90 0 8 chr2 65319681 65319927 -116428160 - RLTR22_Mur LTR ERVK -590 1258 1015 5 1083 699 120 0 0 chr2 65336001 65336101 -116411986 - RLTR13B1 LTR ERVK 0 893 794 6 1083 244 250 0 40 chr2 65348694 65348769 -116399318 + MLT1A1 LTR MaLR 29 100 -308 6 1083 235 241 35 35 chr2 65348886 65348955 -116399132 + MLT1A1 LTR MaLR 297 367 -23 6 1083 235 241 35 35 chr2 65349014 65349030 -116399057 + MLT1A1 LTR MaLR 368 382 -8 6 1083 1117 249 65 73 chr2 65350731 65351113 -116396974 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 6 1083 2861 75 29 3 chr2 65366264 65366650 -116381437 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 1083 231 345 80 40 chr2 65384383 65384782 -116363305 + MLT1L LTR MaLR 177 591 -19 6 1083 261 300 128 113 chr2 65386666 65387001 -116361086 + ORR1E LTR MaLR 14 353 -6 6 1084 234 192 0 0 chr2 65408975 65409027 -116339060 - MT2A LTR ERVL -481 52 1 6 1084 2365 82 6 0 chr2 65413532 65413849 -116334238 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 6 1084 6226 152 87 10 chr2 65413849 65415006 -116333081 - ORR1A2-int LTR MaLR 0 1963 718 6 1084 490 225 17 132 chr2 65414882 65415056 -116333031 - MT2B LTR ERVL -332 269 116 6 1084 2275 114 28 3 chr2 65415054 65415406 -116332681 - ORR1A2-int LTR MaLR -1602 361 1 6 1084 2451 117 6 0 chr2 65415406 65415731 -116332356 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 6 1084 5081 104 38 12 chr2 65416905 65417693 -116330394 - RLTR13C2 LTR ERVK 0 1033 1 6 1084 3373 22 0 0 chr2 65417894 65418251 -116329836 - IAPEY2_LTR LTR ERVK 0 357 1 6 1084 3406 120 15 31 chr2 65418251 65418987 -116329100 - IAPEY3-int LTR ERVK 0 7581 6907 6 1084 510 34 0 0 chr2 65418987 65419046 -116329041 - IAPEY3-int LTR ERVK -2770 4910 4852 6 1084 3235 66 37 28 chr2 65419039 65419189 -116328898 - IAPEY3-int LTR ERVK -4991 2689 2536 6 1084 3235 66 37 28 chr2 65419340 65419623 -116328464 - IAPEY3-int LTR ERVK -5145 2535 2252 6 1084 9317 120 16 42 chr2 65419612 65421110 -116326977 - IAPEY3-int LTR ERVK -5698 1982 524 6 1084 749 132 50 50 chr2 65421109 65421268 -116326819 - IAPLTR4_I LTR ERVK -1290 180 22 6 1084 3129 40 29 0 chr2 65421268 65421615 -116326472 - IAPEY2_LTR LTR ERVK 0 357 1 6 1084 3712 30 0 0 chr2 65423310 65423706 -116324381 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 7 1084 2412 237 117 47 chr2 65423855 65424573 -116323514 - RMER13A LTR ERVK 0 860 93 7 1084 545 319 96 23 chr2 65427131 65427473 -116320614 - MLT2B1 LTR ERVL -51 363 25 7 1084 258 341 75 71 chr2 65428199 65428439 -116319648 - MLT1K LTR MaLR -177 418 178 7 1084 1680 189 59 0 chr2 65442755 65443062 -116305025 + MTC LTR MaLR 1 325 -96 7 1084 826 300 35 35 chr2 65443047 65443303 -116304784 - ORR1D2 LTR MaLR -100 270 15 7 1084 626 271 45 11 chr2 65444330 65444509 -116303578 - MLT1A0 LTR MaLR -51 314 130 7 1084 2256 113 3 33 chr2 65446665 65446948 -116301139 + ORR1A2 LTR MaLR 1 284 -43 7 1084 2256 113 3 33 chr2 65447115 65447168 -116300919 + ORR1A2 LTR MaLR 285 327 0 7 1084 1327 340 24 64 chr2 65452052 65452368 -116295719 - MLT2B3 LTR ERVL -24 693 390 7 1084 1327 340 19 60 chr2 65452434 65452700 -116295387 - MLT2B3 LTR ERVL -281 389 123 7 1084 1143 241 18 40 chr2 65456172 65456445 -116291642 + MTD LTR MaLR 30 296 -123 7 1084 1050 260 120 9 chr2 65462699 65463025 -116285062 + ORR1D1 LTR MaLR 5 366 -8 7 1084 2113 181 13 10 chr2 65465620 65466016 -116282071 + RMER5 LTR ERV1 1 397 -137 7 1084 259 292 0 0 chr2 65468411 65468476 -116279611 - MLT2B5 LTR ERVL -652 65 1 7 1084 1792 210 57 26 chr2 65468819 65469205 -116278882 - MTD LTR MaLR 0 419 22 7 1084 360 283 6 138 chr2 65472967 65473018 -116275069 - MT2B LTR ERVL -447 154 125 7 1084 1036 283 78 19 chr2 65482869 65483190 -116264897 - MTE2b LTR MaLR -39 340 1 7 1084 970 270 202 28 chr2 65493075 65493518 -116254569 - RMER20B LTR ERVK -38 589 89 8 1084 241 280 150 70 chr2 65499884 65499984 -116248103 - MT2B2 LTR ERVL -344 240 133 8 1084 739 256 52 83 chr2 65504959 65505249 -116242838 - MTEb LTR MaLR -86 293 13 1 1085 246 326 7 79 chr2 65536077 65536217 -116211870 - RMER4B LTR ERVK -442 143 14 5 1085 1256 205 102 72 chr2 65537325 65537688 -116210399 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 5 1085 774 188 59 27 chr2 65538065 65538261 -116209826 + ORR1C2-int LTR MaLR 1195 1369 -1 6 1085 1607 191 72 53 chr2 65538262 65538639 -116209448 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 6 1085 446 309 85 24 chr2 65538701 65538913 -116209174 - MLT1K LTR MaLR -217 378 154 6 1085 2273 108 9 0 chr2 65542492 65542816 -116205271 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 6 1085 701 302 40 85 chr2 65544785 65545161 -116202926 + ORR1E LTR MaLR 1 359 0 7 1085 1038 266 135 0 chr2 65562165 65562499 -116185588 - MTEa LTR MaLR 0 379 1 8 1085 1620 228 70 16 chr2 65564765 65565149 -116182938 - MTD LTR MaLR -14 405 1 8 1085 477 132 0 0 chr2 65580352 65580420 -116167667 + MTD LTR MaLR 200 267 -152 9 1085 3419 23 5 0 chr2 65592915 65593309 -116154778 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 1085 9175 30 6 1 chr2 65593309 65594402 -116153685 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 1 1085 3419 23 5 0 chr2 65594402 65594796 -116153291 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 1085 2712 51 174 24 chr2 65607231 65607610 -116140477 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 1 1085 1570 175 44 40 chr2 65610208 65610659 -116137428 - RMER6A LTR ERVK 0 720 395 1 1085 336 172 0 0 chr2 65610656 65610720 -116137367 + ORR1C2 LTR MaLR 275 338 -46 1 1085 2574 127 35 85 chr2 65610867 65611374 -116136713 - RLTR45 LTR ERVK 0 482 1 1 1085 3549 60 44 9 chr2 65611847 65612281 -116135806 - RLTR44B LTR ERVK 0 449 1 1 1085 2955 75 5 5 chr2 65622220 65622636 -116125451 - BGLII LTR ERVK 0 421 6 1 1085 554 218 9 0 chr2 65623008 65623118 -116124969 + ORR1D2 LTR MaLR 1 111 -259 1 1085 1504 232 112 6 chr2 65623130 65623486 -116124601 - MTD LTR MaLR -14 405 12 1 1085 288 209 94 21 chr2 65623560 65623655 -116124432 + ORR1D2 LTR MaLR 128 236 -148 1 1085 549 197 12 6 chr2 65624233 65624349 -116123738 + ORR1D2 LTR MaLR 258 371 -8 1 1085 2182 195 5 27 chr2 65625334 65625744 -116122343 + MTD LTR MaLR 19 419 0 1 1085 351 301 57 62 chr2 65625744 65625919 -116122168 - MTE2b LTR MaLR -195 184 11 1 1085 5705 125 81 28 chr2 65628504 65629410 -116118677 - RMER17B LTR ERVK 0 958 5 1 1085 3177 67 28 0 chr2 65629460 65629849 -116118238 + MTB LTR MaLR 1 400 0 1 1085 864 334 74 41 chr2 65632083 65632344 -116115743 + MTE-int LTR MaLR 1 278 -1302 1 1085 864 334 74 41 chr2 65632546 65632771 -116115316 + MTE-int LTR MaLR 279 502 -1078 1 1085 836 162 192 7 chr2 65632797 65633099 -116114988 + RMER6A LTR ERVK 1 358 -332 1 1085 282 170 0 0 chr2 65635201 65635254 -116112833 + RMER6A LTR ERVK 500 552 -138 1 1085 927 190 39 33 chr2 65636464 65636792 -116111295 + RMER6A LTR ERVK 517 720 0 1 1085 1829 317 72 36 chr2 65637092 65637831 -116110256 + MTE-int LTR MaLR 788 1552 -28 1 1085 1812 251 64 23 chr2 65639014 65639440 -116108647 + RLTR20A2 LTR ERVK 43 490 -88 1 1085 1812 251 64 23 chr2 65639486 65639574 -116108513 + RLTR20A2 LTR ERVK 491 577 -1 1 1085 1569 189 81 45 chr2 65644615 65645067 -116103020 - RMER19B LTR ERVK -234 668 138 1 1085 317 328 79 43 chr2 65647130 65647270 -116100817 + MER77 LTR ERVL 275 419 -188 2 1085 1104 185 379 38 chr2 65648688 65648973 -116099114 - ORR1D1 LTR MaLR -2 382 1 2 1085 237 211 87 9 chr2 65651312 65651326 -116096761 + ORR1B1-int LTR MaLR 624 646 -863 2 1085 1794 144 174 60 chr2 65652953 65653337 -116094750 - MT2B2 LTR ERVL 0 584 157 2 1085 3043 142 20 63 chr2 65653330 65653915 -116094172 - ORR1A4-int LTR MaLR -1403 560 1 2 1085 2366 87 25 12 chr2 65653915 65654240 -116093847 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 2 1085 290 221 197 75 chr2 65663158 65663305 -116084782 - MLT1A0 LTR MaLR -15 350 186 2 135 1284 252 82 17 chr2 65666875 65667230 -116080857 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 2 1086 340 240 102 55 chr2 65672944 65673072 -116075015 - MTE2a LTR MaLR 0 379 246 2 1086 1954 171 73 102 chr2 65673072 65673535 -116074552 - RLTR24 LTR ERV1 0 529 80 2 1086 1056 259 20 8 chr2 65675549 65675794 -116072293 - MTE2a LTR MaLR -130 249 2 2 1086 676 299 31 13 chr2 65678085 65678522 -116069565 - RMER5 LTR ERV1 0 534 56 2 1086 791 195 0 72 chr2 65678944 65679079 -116069008 - RMER10B LTR ERVL 0 398 275 2 1086 4161 35 0 0 chr2 65679079 65679559 -116068528 - LTRIS_Mm LTR ERV1 -2 480 1 2 1086 1026 173 70 22 chr2 65679559 65679589 -116068498 - RMER10B LTR ERVL -177 221 195 2 1086 1026 168 88 10 chr2 65679651 65679831 -116068256 - RMER10B LTR ERVL -204 194 2 2 1086 1232 300 45 53 chr2 65681114 65681372 -116066715 - RMER5 LTR ERV1 -10 524 279 2 1086 1232 300 45 53 chr2 65681761 65682028 -116066059 - RMER5 LTR ERV1 -256 278 1 2 1086 2768 64 3 0 chr2 65688231 65688576 -116059511 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 2 1086 278 311 122 39 chr2 65692009 65692213 -116055874 - MLT1E1 LTR MaLR -81 573 353 3 1086 259 335 113 86 chr2 65695601 65695823 -116052264 - MLT1E1 LTR MaLR -92 273 46 3 1086 1980 212 17 30 chr2 65700402 65700805 -116047282 - MTD LTR MaLR -17 402 5 3 1086 2148 167 40 13 chr2 65705921 65706297 -116041790 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 1 3 1086 2451 249 75 96 chr2 65710542 65711420 -116036667 - RMER13A LTR ERVK 0 860 1 3 1086 229 281 0 17 chr2 65720430 65720488 -116027599 - LTR86A2 LTR ERVL -212 296 240 3 1086 1754 185 62 23 chr2 65722800 65723188 -116024899 - MTB_Mm LTR MaLR -4 403 1 3 1086 443 281 50 29 chr2 65724244 65724383 -116023704 + ORR1E LTR MaLR 4 145 -214 3 1086 1491 199 137 16 chr2 65732556 65732929 -116015158 - MTD LTR MaLR 0 419 2 3 1086 808 282 69 57 chr2 65736424 65736752 -116011335 + ORR1E LTR MaLR 6 366 -8 3 1086 792 226 245 3 chr2 65742465 65742786 -116005301 - MTD LTR MaLR -14 405 8 4 1086 347 83 0 0 chr2 65781577 65781625 -115966462 - ORR1A4-int LTR MaLR -1461 48 1 4 1086 1728 121 69 31 chr2 65781625 65781942 -115966145 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 4 1086 4403 20 0 0 chr2 65784207 65784700 -115963387 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 4 1086 1721 144 40 67 chr2 65785902 65786229 -115961858 - ORR1A3 LTR MaLR -8 318 1 4 1087 2217 72 68 0 chr2 65799677 65799970 -115948117 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 7 4 1087 1104 152 6 0 chr2 65804189 65804367 -115943720 - ORR1A2 LTR MaLR -148 179 1 4 1087 1301 258 63 43 chr2 65805335 65805735 -115942352 + MTD LTR MaLR 3 405 -14 4 1087 272 238 125 0 chr2 65807519 65807599 -115940488 - MTEb LTR MaLR -12 367 278 4 1087 2338 167 12 12 chr2 65810761 65811180 -115936907 - MTC LTR MaLR -2 419 1 4 1087 1324 247 60 20 chr2 65821346 65821697 -115926390 - ORR1D2 LTR MaLR -5 365 1 5 1087 970 290 30 36 chr2 65824006 65824367 -115923720 + MTEb LTR MaLR 1 359 -20 5 1087 486 343 125 33 chr2 65828118 65828510 -115919577 + LTR40c LTR ERVL 4 431 -34 5 1087 466 310 142 24 chr2 65829949 65830154 -115917933 - MLT1A0 LTR MaLR -3 362 134 5 1087 461 300 49 127 chr2 65830214 65830600 -115917487 - ORR1E LTR MaLR -2 357 2 5 1087 369 286 91 111 chr2 65838784 65838992 -115909095 - MLT1B LTR MaLR -204 263 60 5 1087 872 288 151 16 chr2 65854455 65854773 -115893314 + MTEa LTR MaLR 3 363 -16 5 1087 254 227 84 70 chr2 65867485 65867556 -115880531 - MT2B LTR ERVL -337 264 193 5 1087 1123 296 27 37 chr2 65873902 65874277 -115873810 - MTEa LTR MaLR -8 371 1 5 1087 352 361 47 28 chr2 65875484 65875843 -115872244 - HERV16-int LTR ERVL -2902 2094 1729 5 1087 239 333 152 22 chr2 65886272 65886410 -115861677 + MLT1D LTR MaLR 336 491 -14 6 1087 407 325 54 30 chr2 65890376 65890544 -115857543 + MTE-int LTR MaLR 1162 1333 -247 6 1087 423 179 162 20 chr2 65891145 65891293 -115856794 + MTD-int LTR MaLR 1090 1258 0 6 1087 1340 251 104 3 chr2 65891295 65891670 -115856417 + MTD LTR MaLR 3 415 -4 6 1087 764 338 58 10 chr2 65892620 65892913 -115855174 + MLT1A0 LTR MaLR 1 307 -58 6 1087 1520 245 8 65 chr2 65893130 65893532 -115854555 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 6 1087 856 301 121 51 chr2 65904245 65904717 -115843370 + MLT1D LTR MaLR 1 505 0 6 1087 1458 169 16 258 chr2 65908611 65909049 -115839038 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 101 6 1087 1458 169 16 258 chr2 65909076 65909204 -115838883 - RLTR23 LTR ERV1 -330 100 1 6 1087 2012 123 69 61 chr2 65909352 65909557 -115838530 + RMER17C LTR ERVK 1 182 -228 6 1087 2012 123 69 61 chr2 65909582 65909783 -115838304 + RMER17C LTR ERVK 183 410 0 6 1087 1497 145 71 150 chr2 65910865 65911272 -115836815 + RMER10B LTR ERVL 17 391 -7 6 1087 281 360 17 17 chr2 65912542 65912658 -115835429 + MLT1N2 LTR MaLR 443 558 -4 6 1087 1951 143 57 114 chr2 65916736 65917138 -115830949 + RLTR14 LTR ERV1 4 382 0 6 1087 1079 258 49 61 chr2 65917998 65918324 -115829763 - MTE2a LTR MaLR -14 365 44 6 1087 495 280 223 10 chr2 65918450 65918652 -115829435 + MTD LTR MaLR 161 405 -14 6 1088 270 324 57 66 chr2 65951478 65951716 -115796371 - LTR41B LTR ERVL -490 278 44 6 1088 485 317 141 72 chr2 65951819 65952442 -115795645 - ERVL-E-int LTR ERVL -1513 4154 3489 6 1088 470 323 112 11 chr2 65956953 65957213 -115790874 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 80 7 1088 1633 203 58 33 chr2 65967614 65967627 -115780460 + ORR1C1 LTR MaLR 1 13 -365 7 1088 1168 188 129 58 chr2 65967627 65967937 -115780150 - IAPEY3_LTR LTR ERVK 0 332 1 7 1088 1633 203 58 33 chr2 65967937 65968285 -115779802 + ORR1C1 LTR MaLR 14 371 -7 7 1088 913 281 110 101 chr2 65968296 65968615 -115779472 + MTE2b LTR MaLR 3 325 -54 7 1088 913 281 110 101 chr2 65968717 65968762 -115779325 + MTE2b LTR MaLR 326 370 -9 7 1088 243 340 62 54 chr2 65969472 65969584 -115778503 + MLT1H2 LTR MaLR 59 171 -378 7 1088 411 284 102 107 chr2 65969734 65969931 -115778156 + MLT1H2 LTR MaLR 262 457 -32 7 1088 872 271 109 12 chr2 65971294 65971626 -115776461 - MTD LTR MaLR -15 364 41 7 1088 4041 52 21 0 chr2 65974189 65974654 -115773433 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 1 7 1088 304 290 17 93 chr2 65986474 65986592 -115761495 + MER34 LTR ERV1 24 132 -410 7 1088 541 313 124 42 chr2 65995516 65995896 -115752191 + MLT1J LTR MaLR 88 498 -14 7 1088 1961 225 63 13 chr2 66003068 66003545 -115744542 - RMER19C LTR ERVK 0 611 111 9 1088 2854 160 64 16 chr2 66005633 66006136 -115741951 - RLTR12B LTR ERVK 0 528 2 1 1088 494 275 53 49 chr2 66011014 66011198 -115736889 + MLT1D LTR MaLR 344 627 0 2 1088 291 312 0 31 chr2 66014104 66014200 -115733887 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 316 3 1088 1780 206 25 47 chr2 66020262 66020669 -115727418 - RMER10B LTR ERVL 0 398 1 3 1088 642 248 20 14 chr2 66021303 66021450 -115726637 - ORR1E LTR MaLR -207 152 5 4 1088 313 254 135 28 chr2 66031038 66031216 -115716871 - ORR1B1-int LTR MaLR -755 754 558 5 1088 1307 218 112 37 chr2 66038253 66038518 -115709569 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 83 6 1088 3141 93 0 2 chr2 66038518 66038915 -115709172 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 1088 1307 218 112 37 chr2 66038915 66038997 -115709090 - ORR1D1 LTR MaLR -292 82 1 6 1088 1977 189 102 34 chr2 66057184 66057833 -115690254 + RLTR31_Mm LTR ERVK 2 561 0 9 1089 1166 233 53 7 chr2 66067521 66067806 -115680281 + ORR1D2 LTR MaLR 1 298 -72 1 1089 937 65 0 8 chr2 66067815 66067940 -115680147 - ORR1A3 LTR MaLR -6 320 197 1 1089 1072 247 159 34 chr2 66070201 66070490 -115677597 + MTE2b LTR MaLR 1 332 -47 1 1089 1072 247 159 34 chr2 66070660 66070697 -115677390 + MTE2b LTR MaLR 333 368 -11 1 1089 769 213 10 41 chr2 66078586 66078782 -115669305 - RMER10B LTR ERVL -15 383 194 1 1089 1161 130 12 8 chr2 66078826 66079066 -115669021 - RMER10B LTR ERVL -133 265 25 1 1089 589 311 63 32 chr2 66082461 66082799 -115665288 + MLT1A1 LTR MaLR 1 381 -27 1 1089 257 192 116 64 chr2 66084019 66084191 -115663896 + RMER17D LTR ERVK 186 366 -523 1 1089 502 289 17 44 chr2 66087862 66088043 -115660044 + MTD-int LTR MaLR 1080 1255 -3 1 1089 1734 218 68 21 chr2 66088044 66088429 -115659658 + MTD LTR MaLR 6 408 -11 1 1089 1029 200 41 171 chr2 66090679 66090975 -115657112 + MTD LTR MaLR 6 257 -162 1 1089 1053 218 105 77 chr2 66090975 66091338 -115656749 + ORR1D1 LTR MaLR 1 373 -1 1 1089 1029 200 41 171 chr2 66091338 66091385 -115656702 + MTD LTR MaLR 258 304 -115 1 1089 888 227 121 20 chr2 66091370 66091687 -115656400 - MTC LTR MaLR -12 407 1 1 1089 337 248 89 0 chr2 66095310 66095411 -115652676 + ORR1E LTR MaLR 1 110 -249 1 1089 4330 24 0 0 chr2 66098534 66099026 -115649061 + MT2_Mm LTR ERVL 1 492 -1 1 1089 1881 144 9 60 chr2 66101181 66101528 -115646559 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 1 1089 2144 74 94 0 chr2 66106515 66106814 -115641273 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 1 1089 358 322 120 33 chr2 66107227 66107410 -115640677 - LTR33 LTR ERVL -296 219 21 1 1089 848 225 29 158 chr2 66108351 66108725 -115639362 + RLTR12B LTR ERVK 117 442 -86 1 1089 329 261 24 40 chr2 66152589 66152713 -115595374 - MTEa LTR MaLR -2 377 256 2 1089 600 313 16 58 chr2 66153045 66153235 -115594852 - MTEa LTR MaLR -197 182 1 2 1089 457 341 24 88 chr2 66155087 66155338 -115592749 + MLT1B LTR MaLR 133 367 -23 2 1089 717 253 18 18 chr2 66175542 66175707 -115572380 + MTE2a LTR MaLR 1 165 -214 2 1089 1271 250 97 26 chr2 66178379 66178536 -115569551 + ORR1D1 LTR MaLR 1 178 -196 2 1089 1271 250 97 26 chr2 66178683 66178872 -115569215 + ORR1D1 LTR MaLR 179 372 -2 2 1089 386 313 46 7 chr2 66183467 66183618 -115564469 + MLT1K LTR MaLR 259 415 -180 2 1089 313 305 62 57 chr2 66184998 66185301 -115562786 + MLT1A1 LTR MaLR 1 406 -2 2 1089 2195 135 13 60 chr2 66186809 66187195 -115560892 + ORR1C1 LTR MaLR 1 368 -10 2 1089 1908 210 45 12 chr2 66187665 66188066 -115560021 + MTD LTR MaLR 6 419 0 2 1090 1857 14 0 0 chr2 66200443 66200659 -115547428 - MT2_Mm LTR ERVL -277 216 1 3 1090 302 0 0 0 chr2 66200659 66200697 -115547390 - MERVL-int LTR ERVL 0 5485 5448 3 1090 357 202 46 35 chr2 66200697 66200784 -115547303 - ORR1A3-int LTR MaLR -1323 640 553 3 1090 234 314 43 0 chr2 66201076 66201146 -115546941 + MLT1I LTR MaLR 205 277 -134 3 1090 318 252 45 75 chr2 66209738 66209871 -115538216 + RMER5 LTR ERV1 1 129 -405 3 1090 1137 213 90 14 chr2 66210598 66210888 -115537199 + RMER5 LTR ERV1 195 506 -28 3 1090 1007 281 71 60 chr2 66210892 66211256 -115536831 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 3 3 1090 1346 122 29 5 chr2 66219953 66220159 -115527928 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 174 3 1090 652 173 111 0 chr2 66220325 66220487 -115527600 - ORR1C2 LTR MaLR -194 180 1 3 1090 882 346 35 44 chr2 66229755 66230184 -115517903 + MT2A LTR ERVL 1 425 -108 3 1090 315 335 94 21 chr2 66233585 66233777 -115514310 - MLT1L LTR MaLR -235 375 170 3 1090 362 270 255 7 chr2 66236710 66236863 -115511224 + RLTR28B LTR ERVL 1 191 -290 3 1090 345 284 114 107 chr2 66242420 66242700 -115505387 + MLT1B LTR MaLR 11 292 -98 3 1090 4110 101 129 57 chr2 66252853 66253680 -115494407 + RMER17D LTR ERVK 1 887 -2 3 1090 2535 204 35 66 chr2 66257551 66258145 -115489942 + RMER13B LTR ERVK 1 575 -333 3 1090 305 288 12 0 chr2 66258195 66258275 -115489812 + RMER13B LTR ERVK 828 908 0 3 1090 236 259 0 18 chr2 66258804 66258859 -115489228 + RLTR14 LTR ERV1 1 54 -328 3 1090 1513 167 110 10 chr2 66259067 66259369 -115488718 + RLTR14 LTR ERV1 50 382 0 3 1090 2694 78 83 0 chr2 66276107 66276481 -115471606 + MTB_Mm LTR MaLR 3 407 0 4 1090 962 289 94 23 chr2 66281606 66281956 -115466131 - MTE2b LTR MaLR -4 375 1 4 1090 3214 38 8 10 chr2 66285644 66286041 -115462046 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 1090 2009 172 19 11 chr2 66287142 66287506 -115460581 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 4 1090 2262 190 70 129 chr2 66298979 66299621 -115448466 + RMER19C LTR ERVK 8 611 0 4 1090 1832 257 99 65 chr2 66299905 66300077 -115448010 - RLTR16 LTR ERVK 0 568 387 4 1090 1832 193 120 35 chr2 66300123 66300481 -115447606 - RLTR16 LTR ERVK -119 386 6 4 1090 2596 126 28 5 chr2 66303138 66303538 -115444549 + MTC LTR MaLR 1 409 -12 4 1090 1035 247 99 149 chr2 66303536 66304160 -115443927 + RLTR22_Mur LTR ERVK 211 803 -1045 4 1090 759 241 126 101 chr2 66304186 66304341 -115443746 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1164 1309 -539 4 1090 759 241 126 101 chr2 66304380 66304630 -115443457 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1310 1579 -269 4 1090 298 235 182 16 chr2 66304699 66304820 -115443267 + RLTR21 LTR ERVK 1335 1475 -97 4 1090 320 159 16 23 chr2 66309865 66309940 -115438147 + ORR1C2 LTR MaLR 1 72 -302 4 1090 354 250 18 88 chr2 66310194 66310308 -115437779 + MT2B LTR ERVL 152 257 -344 4 1090 1025 178 84 24 chr2 66314546 66314759 -115433328 - MTD LTR MaLR 0 421 196 4 1090 1041 144 93 26 chr2 66314973 66315166 -115432921 - MTD LTR MaLR -208 211 6 4 1091 416 296 32 82 chr2 66330092 66330511 -115417576 + MLT1C LTR MaLR 4 627 0 4 1091 2400 189 79 10 chr2 66341210 66341701 -115406386 + RLTR24 LTR ERV1 1 525 -4 5 1091 251 233 17 0 chr2 66346474 66346534 -115401553 + LTR85a LTR Gypsy? 368 428 -274 5 1091 2000 208 35 5 chr2 66352720 66353116 -115394971 + MTC LTR MaLR 2 409 -12 5 1091 250 194 111 61 chr2 66362893 66362992 -115385095 + MLT1C LTR MaLR 20 123 -344 5 1091 503 299 84 22 chr2 66365858 66366084 -115382003 + MTEa LTR MaLR 139 378 -1 5 1091 254 250 0 26 chr2 66396944 66397022 -115351065 + LTR23-int LTR ERV1 2385 2460 -2663 5 1091 2017 175 61 79 chr2 66398024 66398545 -115349542 + RMER6C LTR ERVK 152 663 -27 5 1091 3011 168 68 21 chr2 66398955 66399568 -115348519 + RLTR26 LTR ERVK 1 642 0 5 1091 1087 321 12 24 chr2 66406547 66406888 -115341199 + MTEa LTR MaLR 42 378 -1 5 1091 815 316 38 0 chr2 66415545 66415782 -115332305 + ORR1D2 LTR MaLR 125 370 0 5 1091 5340 91 17 25 chr2 66417003 66417814 -115330273 + RLTR13D1 LTR ERVK 1 805 -1 5 1091 378 281 126 33 chr2 66420367 66420518 -115327569 + MTEb LTR MaLR 162 326 -53 6 1091 1133 290 104 80 chr2 66421153 66421550 -115326537 + MTE-int LTR MaLR 1 445 -1135 6 1091 1133 290 104 80 chr2 66421730 66421954 -115326133 + MTE-int LTR MaLR 446 637 -943 6 1091 242 277 31 0 chr2 66422646 66422711 -115325376 + RLTR25A LTR ERVK 515 581 -522 6 1091 424 261 11 0 chr2 66424559 66424651 -115323436 - RLTR40 LTR ERVK -9 808 716 6 1091 2288 104 6 9 chr2 66425131 66425461 -115322626 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 6 1091 2944 32 3 0 chr2 66433307 66433652 -115314435 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 6 1091 804 299 107 32 chr2 66434267 66434613 -115313474 + MTEb LTR MaLR 1 372 -7 6 1091 1181 213 43 129 chr2 66441979 66442399 -115305688 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 6 1091 2179 96 6 80 chr2 66447418 66447470 -115300617 - ORR1A2 LTR MaLR -1 326 280 6 1091 2179 96 6 80 chr2 66447812 66448111 -115299976 - ORR1A2 LTR MaLR -48 279 1 6 1091 3194 46 5 5 chr2 66449874 66450268 -115297819 - MTA_Mm LTR MaLR -2 394 1 6 1091 433 269 0 0 chr2 66452368 66452461 -115295626 - MTD LTR MaLR -278 141 49 6 1092 2477 103 52 16 chr2 66454822 66455206 -115292881 - MTB LTR MaLR -2 398 1 6 1092 1018 308 84 3 chr2 66455385 66455695 -115292392 - MTD LTR MaLR -14 405 71 6 1092 2456 53 78 0 chr2 66462249 66462569 -115285518 + ORR1A1 LTR MaLR 1 345 -1 6 1092 3940 105 47 0 chr2 66475916 66476486 -115271601 - MT2B LTR ERVL 0 601 5 7 1092 376 304 80 15 chr2 66483243 66483313 -115264774 - RLTR25A LTR ERVK -499 604 526 7 1092 594 159 0 144 chr2 66483215 66483340 -115264747 - MT2B LTR ERVL -314 287 181 7 1092 710 129 32 0 chr2 66483294 66483430 -115264657 - RMER6C LTR ERVK -576 144 3 7 1092 2840 98 41 0 chr2 66484514 66484903 -115263184 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 3 7 1092 3099 172 109 5 chr2 66485551 66486165 -115261922 - RLTR33 LTR ERVK 0 678 1 7 1092 420 323 181 25 chr2 66528913 66529151 -115218936 - MLT1D LTR MaLR -221 284 10 4 1092 409 222 35 113 chr2 66554603 66554745 -115193342 - MT2B LTR ERVL -323 278 148 7 1092 291 354 125 12 chr2 66565192 66565352 -115182735 + MLT1H2 LTR MaLR 1 178 -311 8 1092 330 364 54 25 chr2 66566364 66566407 -115181680 + MLT1A0 LTR MaLR 10 55 -310 8 1092 330 364 54 25 chr2 66566684 66566843 -115181244 + MLT1A0 LTR MaLR 56 217 -148 8 1092 231 264 45 22 chr2 66566858 66566947 -115181140 + MLT1A0 LTR MaLR 275 365 0 8 1093 999 276 54 34 chr2 66595831 66595968 -115152119 - RMER12B LTR ERVK 0 1404 1261 1 1093 1649 197 85 36 chr2 66596050 66596461 -115151626 - RLTR21 LTR ERVK -392 1180 750 1 1093 3165 183 33 43 chr2 66597518 66598186 -115149901 - RLTR21 LTR ERVK -803 769 109 1 1093 301 258 113 25 chr2 66599250 66599409 -115148678 + RLTR21 LTR ERVK 1087 1259 -313 1 1093 3273 38 8 13 chr2 66613354 66613752 -115134335 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1093 232 277 148 26 chr2 66617208 66617323 -115130764 + RLTR11A2 LTR ERVK 76 204 -323 1 1093 428 346 37 42 chr2 66627590 66627804 -115120283 - RMER12 LTR ERVK 0 1322 1110 1 1093 1296 101 9 24 chr2 66628045 66628258 -115119829 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1082 766 557 1 1093 3796 37 42 0 chr2 66634872 66635328 -115112759 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 475 0 1 1093 249 327 160 98 chr2 66638596 66638840 -115109247 - MLT2B1 LTR ERVL -244 276 18 1 1093 1552 273 13 117 chr2 66646270 66646809 -115101278 - RMER15 LTR ERVL -40 535 53 1 1093 2568 246 164 104 chr2 66648325 66648406 -115099681 - RLTR22_Mus LTR ERVK -212 1596 1526 2 1093 2568 246 164 104 chr2 66648518 66648536 -115099551 - RLTR22_Mus LTR ERVK -283 1525 1510 2 1093 2568 246 164 104 chr2 66648923 66650326 -115097761 - RLTR22_Mus LTR ERVK -299 1509 3 2 1093 362 322 99 42 chr2 66659085 66659276 -115088811 - MLT1A LTR MaLR 0 374 173 2 1093 836 283 110 41 chr2 66668365 66668656 -115079431 + ORR1D2 LTR MaLR 48 358 -12 2 1093 294 275 12 36 chr2 66668781 66668864 -115079223 - MTE-int LTR MaLR -1228 352 272 2 1093 1522 211 10 17 chr2 66670881 66671180 -115076907 - MTC LTR MaLR -114 307 11 2 1093 1190 221 189 92 chr2 66674826 66675239 -115072848 - MT2A LTR ERVL -80 453 1 2 1093 269 271 40 30 chr2 66675888 66675987 -115072100 + ORR1D2 LTR MaLR 82 181 -189 2 1093 2084 99 3 67 chr2 66683159 66683517 -115064570 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 335 -2 2 1093 57728 11 4 2 chr2 66683526 66689961 -115058126 + IAPEz-int LTR ERVK 35 6481 0 2 1093 2084 99 3 67 chr2 66689961 66690319 -115057768 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 335 -2 2 1093 7734 75 14 3 chr2 66692162 66693174 -115054913 + RLTR13D5 LTR ERVK 1 1023 0 2 1093 2159 120 9 0 chr2 66697684 66698000 -115050087 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 2 1093 278 327 63 19 chr2 66699230 66699389 -115048698 + ORR1D2 LTR MaLR 1 166 -204 2 1093 623 186 6 185 chr2 66699561 66699739 -115048348 + RLTR20B3 LTR ERVK 236 381 -196 2 1093 3104 47 3 0 chr2 66699738 66700125 -115047962 + MTA_Mm LTR MaLR 9 396 0 2 1093 5936 145 48 14 chr2 66700125 66701247 -115046840 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 1068 2227 -99 2 1093 2269 233 22 22 chr2 66703930 66704430 -115043657 + RLTR20B3 LTR ERVK 71 570 -7 2 1093 313 361 18 37 chr2 66706102 66706266 -115041821 + LTR41 LTR ERVL 277 437 -331 2 1093 851 296 131 26 chr2 66710274 66710617 -115037470 + MTEa LTR MaLR 1 379 0 2 1093 2121 198 35 10 chr2 66711795 66712198 -115035889 + MTC LTR MaLR 1 413 -8 2 1094 1571 135 49 21 chr2 66722645 66723034 -115025053 + LTRIS5 LTR ERV1 1 447 0 2 1094 1002 174 6 0 chr2 66723508 66723675 -115024412 - RMER6C LTR ERVK -5 685 518 2 1094 2502 74 43 3 chr2 66723672 66724024 -115024063 - MTB LTR MaLR -34 366 1 2 1094 3541 145 51 11 chr2 66724180 66724787 -115023300 - RLTR33 LTR ERVK -47 631 1 2 1094 965 300 99 70 chr2 66736536 66736696 -115011391 - MTD LTR MaLR -54 365 191 3 1094 965 300 99 70 chr2 66736909 66737103 -115010984 - MTD LTR MaLR -229 190 1 3 1094 689 312 137 56 chr2 66741315 66741346 -115006741 - MTD LTR MaLR 0 419 385 3 1094 689 312 137 56 chr2 66741385 66741459 -115006628 - MTD LTR MaLR -35 384 316 3 1094 689 312 137 56 chr2 66741951 66742217 -115005870 - MTD LTR MaLR -104 315 17 3 1094 1082 231 57 109 chr2 66742250 66742786 -115005301 - RMER6A LTR ERVK 0 720 345 3 1094 391 219 154 42 chr2 66746750 66746893 -115001194 + MLT1A0 LTR MaLR 13 171 -194 3 1094 261 164 54 18 chr2 66746970 66747026 -115001061 + RMER19A LTR ERVK 1 58 -553 3 1094 942 283 137 96 chr2 66747092 66747748 -115000339 + RMER19A LTR ERVK 47 729 -8 3 1094 545 329 60 53 chr2 66748506 66748935 -114999152 - MLT2B1 LTR ERVL -39 528 3 3 1094 553 274 208 67 chr2 66749588 66749667 -114998420 + ORR1D2 LTR MaLR 1 83 -287 3 1094 1075 234 176 9 chr2 66749667 66749986 -114998101 + ORR1D1 LTR MaLR 1 372 -2 3 1094 553 274 208 67 chr2 66749986 66750219 -114997868 + ORR1D2 LTR MaLR 84 357 -13 3 1094 2561 37 16 0 chr2 66755886 66756207 -114991880 - IAPEY2_LTR LTR ERVK 0 357 32 3 1094 2401 134 181 87 chr2 66756601 66757232 -114990855 - RMER6C LTR ERVK 0 690 1 3 1094 918 264 134 22 chr2 66760789 66761103 -114986984 + ORR1E LTR MaLR 1 349 -10 3 1094 1159 134 11 21 chr2 66761338 66761528 -114986559 - MMETn-int LTR ERVK -1263 2051 1864 3 1094 12879 57 13 42 chr2 66761527 66763331 -114984756 - MMETn-int LTR ERVK -3090 1754 2 3 1094 1428 157 53 41 chr2 66763332 66763650 -114984437 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 3 1094 491 246 41 91 chr2 66764948 66765145 -114982942 + RLTR23 LTR ERV1 244 430 0 3 1094 259 86 0 0 chr2 66772820 66772855 -114975232 + RMER19C LTR ERVK 1 35 -576 3 1094 233 222 0 0 chr2 66782763 66782808 -114965279 - MT2A LTR ERVL -1 532 488 3 1094 277 367 0 0 chr2 66790437 66790535 -114957552 + MTE2a LTR MaLR 1 98 -281 3 1094 240 274 0 31 chr2 66790512 66790576 -114957511 + MTE2a LTR MaLR 37 98 -281 3 1094 412 326 102 63 chr2 66790577 66790783 -114957304 + MTE2a LTR MaLR 59 272 -107 3 1094 891 184 64 0 chr2 66798093 66798296 -114949791 + RMER6D LTR ERVK 1 171 -549 3 1094 281 133 0 0 chr2 66798291 66798336 -114949751 + RMER6D LTR ERVK 122 166 -554 3 1094 2461 198 49 37 chr2 66798336 66798606 -114949481 + RMER6D LTR ERVK 122 383 -337 3 1094 2461 198 49 37 chr2 66798690 66799011 -114949076 + RMER6D LTR ERVK 384 720 0 3 1094 2103 220 28 25 chr2 66802792 66803323 -114944764 + MYSERV-int LTR ERVK 6015 6547 -3 4 1094 2437 194 38 7 chr2 66803327 66803779 -114944308 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 466 -61 4 1094 465 265 41 72 chr2 66804184 66804379 -114943708 - RLTR19-int LTR ERVK -5921 216 28 4 1094 1649 225 66 35 chr2 66804404 66804888 -114943199 - RLTR19 LTR ERVK 0 499 1 4 1094 1501 304 97 28 chr2 66804989 66805567 -114942520 + MTE2b-int LTR MaLR 963 1580 0 4 1094 541 203 16 223 chr2 66805567 66805751 -114942336 + MTE2b LTR MaLR 1 146 -233 4 1094 248 318 33 33 chr2 66805670 66805761 -114942326 + MT2A LTR ERVL 63 153 -380 4 1094 1412 241 56 95 chr2 66806699 66807063 -114941024 - RLTR11A LTR ERVK -31 497 153 4 1094 1412 241 56 95 chr2 66807403 66807555 -114940532 - RLTR11A LTR ERVK -376 152 1 4 1094 288 284 49 0 chr2 66825431 66825512 -114922575 + MLT2B3 LTR ERVL 1 85 -469 4 1094 1896 176 9 164 chr2 66827745 66828095 -114919992 + RMER6B LTR ERVK 1 274 -187 4 1094 1896 176 9 164 chr2 66828254 66828446 -114919641 + RMER6B LTR ERVK 275 459 -2 4 1094 1565 208 46 123 chr2 66829365 66829903 -114918184 + RLTR31_Mm LTR ERVK 1 561 0 4 1095 367 354 85 100 chr2 66865926 66866325 -114881762 + MLT1F2 LTR MaLR 24 416 -144 4 1095 244 294 123 25 chr2 66866853 66866975 -114881112 + LTR50 LTR ERVL 82 215 -580 4 1095 1941 186 65 5 chr2 66873905 66874277 -114873810 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 5 1095 3462 187 43 7 chr2 66883169 66883864 -114864223 + RMER6D LTR ERVK 1 720 0 5 1095 776 322 132 29 chr2 66885654 66885996 -114862091 + MTE2b LTR MaLR 3 379 0 5 1095 1956 217 29 7 chr2 66888492 66888900 -114859187 - MTC LTR MaLR -4 417 1 5 1095 2818 64 0 0 chr2 66891104 66891449 -114856638 + ORR1A1 LTR MaLR 2 346 0 5 1095 707 214 0 0 chr2 66892205 66892336 -114855751 - MTD LTR MaLR -286 133 3 5 1095 2462 223 11 15 chr2 66901843 66902367 -114845720 - RLTR12B LTR ERVK 0 528 7 5 1095 1496 210 46 20 chr2 66903209 66903559 -114844528 + RLTR15 LTR ERVK 1 359 0 5 1095 2534 173 57 141 chr2 66905120 66905787 -114842300 - RMER19C LTR ERVK 0 611 1 5 1095 429 366 83 25 chr2 66911560 66911732 -114836355 - MTEa LTR MaLR -4 375 209 5 1095 429 276 220 11 chr2 66911912 66912048 -114836039 - MTEa LTR MaLR -171 208 28 5 1095 1703 202 14 12 chr2 66912130 66912475 -114835612 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 5 1095 1345 217 19 113 chr2 66915568 66915719 -114832368 + ORR1B1 LTR MaLR 50 201 -193 5 1095 1345 217 19 113 chr2 66916074 66916301 -114831786 + ORR1B1 LTR MaLR 202 392 -2 5 1095 598 231 102 23 chr2 66917352 66917529 -114830558 - MTD LTR MaLR -16 403 213 5 1095 709 235 24 18 chr2 66919101 66919266 -114828821 - MTD LTR MaLR -253 166 1 5 1095 310 364 0 0 chr2 66931969 66932068 -114816019 - MTEa LTR MaLR -272 107 9 5 1095 3433 35 0 0 chr2 66934318 66934714 -114813373 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 1095 1281 266 112 14 chr2 66944263 66944629 -114803458 + MTD LTR MaLR 3 404 -15 5 1095 1111 260 26 56 chr2 66957053 66957375 -114790712 + ORR1D1 LTR MaLR 75 374 0 6 1095 2920 94 2 12 chr2 66961528 66961937 -114786150 + MTB_Mm LTR MaLR 3 407 0 6 1095 1298 272 94 30 chr2 66962077 66962318 -114785769 + MTD LTR MaLR 1 272 -147 6 1095 4946 112 53 44 chr2 66962318 66963197 -114784890 - RMER17D LTR ERVK -2 887 1 6 1095 1298 272 94 30 chr2 66963197 66963349 -114784738 + MTD LTR MaLR 273 419 0 6 1095 1630 232 34 3 chr2 66969893 66970247 -114777840 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 10 6 1095 802 242 92 121 chr2 66971982 66972353 -114775734 - MTE2a LTR MaLR 0 379 20 6 1095 545 259 147 20 chr2 66974217 66974414 -114773673 + MLT1E3 LTR MaLR 117 338 -286 6 1096 3724 30 7 0 chr2 66978096 66978529 -114769558 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 6 1096 3625 191 69 34 chr2 66980263 66981099 -114766988 - RMER19B LTR ERVK 0 902 69 6 1096 412 113 70 0 chr2 66982189 66982260 -114765827 - RMER19B LTR ERVK -826 76 1 6 1096 3215 53 99 7 chr2 66985312 66985747 -114762340 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 6 1096 1329 127 62 19 chr2 66989332 66989619 -114758468 - IAPLTR4 LTR ERVK -23 304 1 6 1096 626 319 47 109 chr2 66991478 66991882 -114756205 - MTE2b LTR MaLR 0 379 1 6 1096 695 303 30 4 chr2 66992923 66993155 -114754932 + MLT1D LTR MaLR 10 247 -258 6 1096 577 329 88 33 chr2 66993160 66993490 -114754597 - MLT2C1 LTR ERVL -48 349 2 6 1096 1600 149 39 57 chr2 66995246 66995571 -114752516 - RMER6C LTR ERVK 0 690 369 6 1096 1447 150 150 35 chr2 66995571 66995938 -114752149 - RLTR9E LTR ERVK 0 409 1 6 1096 455 44 14 56 chr2 66995946 66996018 -114752069 - ETnERV2-int LTR ERVK -9 7397 7329 6 1096 1648 221 148 15 chr2 66996018 66996082 -114752005 - RLTR13B1 LTR ERVK -365 537 468 6 1096 1665 182 40 32 chr2 66996265 66996674 -114751413 - RLTR13B1 LTR ERVK -435 467 1 6 1096 1663 126 12 0 chr2 66996687 66996934 -114751153 - ETnERV3-int LTR ERVK -30 5778 5529 6 1096 1493 92 5 5 chr2 66996910 66997106 -114750981 - ETnERV2-int LTR ERVK -957 6449 6254 6 1096 5761 93 8 12 chr2 66997237 66998103 -114749984 - ETnERV2-int LTR ERVK -1179 6227 5453 6 1096 543 170 43 14 chr2 66998132 66998279 -114749808 - RMER6D LTR ERVK -516 204 1 6 1096 1703 134 46 64 chr2 67000862 67001189 -114746898 + ORR1A4 LTR MaLR 1 321 -8 5 1096 3163 161 17 67 chr2 67001793 67002454 -114745633 + RLTR5_Mm LTR ERV1 1 628 0 6 1096 414 262 21 134 chr2 67004172 67004252 -114743835 + RMER17C LTR ERVK 1 78 -332 9 1096 414 262 21 134 chr2 67004335 67004448 -114743639 + RMER17C LTR ERVK 79 172 -238 9 1096 321 277 61 68 chr2 67006125 67006272 -114741815 - MLT1B LTR MaLR 0 390 245 1 1096 241 313 64 58 chr2 67023299 67023472 -114724615 - LTR48 LTR ERV1 -5 782 609 3 1096 259 241 83 37 chr2 67027933 67028064 -114720023 - MLT1F2 LTR MaLR -15 545 382 4 1096 2961 67 183 14 chr2 67033879 67034317 -114713770 + RLTR1B LTR ERV1 1 512 0 5 1096 1378 257 92 3 chr2 67036541 67036912 -114711175 + MTD LTR MaLR 2 405 -14 6 1096 940 290 134 73 chr2 67036924 67037754 -114710333 + MTD-int LTR MaLR 1 970 -288 6 1096 940 313 17 101 chr2 67038121 67038157 -114709930 + MTD-int LTR MaLR 971 1005 -253 6 1096 335 248 67 25 chr2 67038154 67038274 -114709813 + MTD-int LTR MaLR 1134 1258 0 6 1096 1520 263 64 0 chr2 67038274 67038651 -114709436 + MTD LTR MaLR 1 401 -18 6 1096 308 262 35 23 chr2 67049140 67049226 -114698861 + RMER12B LTR ERVK 722 808 -596 8 1096 735 296 118 29 chr2 67062770 67063153 -114684934 + MTD LTR MaLR 1 417 -2 9 1096 821 193 180 23 chr2 67063929 67064146 -114683941 - MTC LTR MaLR -145 276 26 9 1096 496 245 229 11 chr2 67064140 67064314 -114683773 + ORR1D1 LTR MaLR 163 374 0 1 1096 348 238 20 1 chr2 67064366 67064459 -114683628 - MLT1D LTR MaLR -1 504 424 1 1096 409 386 88 38 chr2 67071019 67071358 -114676729 + MLT1E1A LTR MaLR 288 643 -37 1 1096 990 312 28 28 chr2 67076464 67076781 -114671306 - ORR1E LTR MaLR -42 317 1 1 1096 1155 115 33 11 chr2 67083975 67084211 -114663876 - ORR1A4 LTR MaLR -2 344 96 1 1096 7285 52 7 0 chr2 67084984 67085871 -114662216 - RLTR13B1 LTR ERVK 0 893 1 1 1096 302 306 118 15 chr2 67086506 67086642 -114661445 - RMER15 LTR ERVL 0 575 426 1 1096 1742 246 84 57 chr2 67088323 67088668 -114659419 - RLTR40 LTR ERVK -166 651 284 1 1096 1742 246 84 57 chr2 67088707 67088995 -114659092 - RLTR40 LTR ERVK -534 283 1 1 1097 3309 79 5 2 chr2 67119948 67120390 -114627697 - RLTR13B1 LTR ERVK 0 893 451 1 1097 4339 78 28 7 chr2 67120382 67120990 -114627097 - RLTR13B3 LTR ERVK -308 621 1 1 1097 3183 51 4 134 chr2 67121580 67122081 -114626006 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 1 1097 663 133 10 0 chr2 67124745 67124843 -114623244 + RLTR44B LTR ERVK 1 99 -350 1 1097 1013 294 42 13 chr2 67131612 67131919 -114616168 + MTEa LTR MaLR 64 379 0 1 1097 2515 75 14 31 chr2 67146317 67146677 -114601410 - IAPEY2_LTR LTR ERVK -3 354 1 2 1097 259 211 0 165 chr2 67146760 67146845 -114601242 + MT2B LTR ERVL 169 239 -362 2 1097 533 328 26 21 chr2 67149950 67150140 -114597947 - MTD LTR MaLR -217 202 12 2 1097 293 415 72 11 chr2 67155804 67156188 -114591899 - LTR16B LTR ERVL -2 461 67 2 1097 236 167 46 77 chr2 67161924 67161989 -114586098 - RMER20A LTR ERVK -268 248 186 2 1097 2989 71 5 5 chr2 67163895 67164291 -114583796 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 1097 448 290 101 0 chr2 67166085 67166223 -114581864 - MTD LTR MaLR -250 169 18 2 1097 318 311 156 22 chr2 67185705 67185929 -114562158 + ORR1E LTR MaLR 1 254 -105 2 1097 4216 137 21 31 chr2 67197379 67198140 -114549947 + RMER6A LTR ERVK 1 753 -3 2 1097 1771 179 46 54 chr2 67201042 67201415 -114546672 + ORR1C1 LTR MaLR 1 370 -8 2 1097 2604 203 48 6 chr2 67201419 67201958 -114546129 + ORR1C1-int LTR MaLR 1 562 -947 2 1097 852 207 22 22 chr2 67202001 67202184 -114545903 + ORR1C1 LTR MaLR 196 378 0 2 1097 360 257 58 42 chr2 67206400 67206660 -114541427 - RMER17D LTR ERVK -345 544 281 2 1097 1063 271 46 19 chr2 67207746 67208114 -114539973 - MTEa LTR MaLR -1 378 1 2 1097 1685 222 79 5 chr2 67224263 67224644 -114523443 - MTD LTR MaLR -8 411 3 3 1097 260 152 61 87 chr2 67225797 67225912 -114522175 - RLTR25B LTR ERVK -520 508 397 3 1097 238 252 90 72 chr2 67232517 67232628 -114515459 - MTE2a LTR MaLR -68 311 199 3 1098 1236 125 5 5 chr2 67255849 67256042 -114492045 - RLTR15 LTR ERVK -4 355 163 3 1098 607 331 9 55 chr2 67256045 67256432 -114491655 - MYSERV6-int LTR ERVK -4661 4298 3813 3 1098 777 182 0 14 chr2 67257539 67257684 -114490403 - RLTR11B LTR ERVK 0 453 311 3 1098 427 258 141 6 chr2 67266230 67266386 -114481701 + MER77 LTR ERVL 424 600 -7 3 1098 1179 278 74 43 chr2 67271862 67272212 -114475875 - MTE2b LTR MaLR -16 363 3 3 1098 1087 232 160 74 chr2 67276402 67276941 -114471146 + RMER4B LTR ERVK 1 585 0 4 1098 1434 263 69 94 chr2 67277791 67278329 -114469758 - RLTR40 LTR ERVK -10 807 292 4 1098 1434 263 69 94 chr2 67278375 67278503 -114469584 - RLTR40 LTR ERVK -526 291 158 4 1098 625 248 32 0 chr2 67279000 67279157 -114468930 - RLTR40 LTR ERVK -655 162 1 4 1098 2175 159 14 5 chr2 67292314 67292681 -114455406 - ORR1C1 LTR MaLR -8 370 1 4 1098 4242 171 34 129 chr2 67293163 67294160 -114453927 + RMER19B LTR ERVK 1 902 0 4 1098 643 279 167 15 chr2 67294943 67295267 -114452820 - ORR1D1 LTR MaLR -1 373 1 4 1098 3983 181 126 18 chr2 67295688 67296506 -114451581 - RMER13B LTR ERVK -2 906 1 4 1098 1678 236 60 0 chr2 67304856 67305238 -114442849 - MTD LTR MaLR 0 419 15 4 1098 408 355 8 83 chr2 67305832 67306084 -114442003 - MLT1D LTR MaLR -260 245 13 4 1098 1456 262 124 6 chr2 67307294 67307771 -114440316 - MT2A LTR ERVL 0 533 1 4 1098 568 313 50 78 chr2 67323595 67323917 -114424170 - ORR1E LTR MaLR -15 344 32 4 1098 2517 70 12 0 chr2 67335369 67335696 -114412391 - IAPEY_LTR LTR ERVK 0 385 55 4 1098 1720 142 20 30 chr2 67341853 67342158 -114405929 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 28 4 1098 374 378 54 36 chr2 67342496 67342773 -114405314 + MLT1D LTR MaLR 208 489 -16 4 1098 237 246 35 169 chr2 67359726 67359868 -114388219 - ORR1A1-int LTR MaLR -811 981 859 4 1098 3213 48 2 5 chr2 67360136 67360533 -114387554 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 1098 327 239 250 15 chr2 67365496 67365632 -114382455 + MTD LTR MaLR 195 362 -57 5 1098 707 300 59 48 chr2 67366828 67367185 -114380902 - MLT1B LTR MaLR -28 362 2 5 1099 246 386 23 16 chr2 67373166 67373295 -114374792 + LTR16A LTR ERVL 13 142 -309 5 1099 1847 170 118 3 chr2 67374869 67375235 -114372852 + MTC LTR MaLR 1 408 -13 5 1099 4458 180 49 22 chr2 67377107 67377969 -114370118 + RMER13B LTR ERVK 1 885 -23 5 1099 383 310 122 11 chr2 67385423 67385612 -114362475 - MLT1D LTR MaLR -16 489 280 5 1099 534 196 39 0 chr2 67388799 67388901 -114359186 - ORR1D1 LTR MaLR -225 149 44 5 1099 1385 219 120 0 chr2 67389374 67389708 -114358379 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 5 1099 1793 164 69 79 chr2 67391675 67392079 -114356008 - MTC LTR MaLR -21 400 1 5 1099 1447 214 120 11 chr2 67393745 67394094 -114353993 - MTD LTR MaLR -14 405 19 5 1099 288 344 111 21 chr2 67413128 67413363 -114334724 - MLT2B1 LTR ERVL -260 260 5 5 1099 312 303 84 13 chr2 67429044 67429198 -114318889 - MTEa LTR MaLR -72 307 143 6 1099 256 277 37 112 chr2 67434309 67434443 -114313644 - MT2B LTR ERVL -284 317 194 6 1099 430 198 117 37 chr2 67466561 67466724 -114281363 - RLTR16 LTR ERVK -329 176 1 6 1099 979 220 216 50 chr2 67469623 67470198 -114277889 - RMER6A LTR ERVK -59 697 1 6 1099 1926 109 202 40 chr2 67470618 67470970 -114277117 + RLTR9E LTR ERVK 1 409 0 6 1099 3212 152 65 21 chr2 67477213 67477873 -114270214 - RMER6C LTR ERVK -1 689 1 6 1099 868 282 97 52 chr2 67490576 67490960 -114257127 + RMER5 LTR ERV1 34 435 -99 7 1099 1374 260 98 26 chr2 67490960 67491450 -114256637 + RMER5 LTR ERV1 1 525 -9 7 1099 1677 205 58 0 chr2 67499668 67499995 -114248092 - RMER6D LTR ERVK -8 712 367 7 1099 979 186 239 33 chr2 67500009 67500315 -114247772 - RMER6D LTR ERVK -351 369 1 1 1100 2229 178 247 10 chr2 67502435 67503040 -114245047 - RMER6A LTR ERVK -4 752 4 4 1100 1701 220 28 0 chr2 67504287 67504651 -114243436 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 7 1100 228 426 15 15 chr2 67505568 67505699 -114242388 + MLT1F-int LTR MaLR 961 1091 -280 8 1100 241 300 43 22 chr2 67505965 67506057 -114242030 + MLT1F-int LTR MaLR 1176 1269 -102 8 1100 1231 261 30 65 chr2 67506063 67506497 -114241590 - MTD LTR MaLR 0 419 1 1 1100 344 296 15 0 chr2 67506505 67506616 -114241471 + MLT1F-int LTR MaLR 1285 1481 -8 8 1100 232 219 54 14 chr2 67517609 67517683 -114230404 - MTEa LTR MaLR -26 353 277 2 1100 286 295 105 86 chr2 67517758 67517910 -114230177 - MTEa LTR MaLR -223 156 2 2 1100 225 268 99 0 chr2 67518357 67518428 -114229659 - MLT1H-int LTR MaLR -150 1259 1182 2 1100 417 298 148 28 chr2 67523766 67524056 -114224031 + MLT1A LTR MaLR 32 356 -18 3 1100 1470 273 19 42 chr2 67530749 67531173 -114216914 + MTD LTR MaLR 6 419 0 3 1100 285 319 120 41 chr2 67532808 67533013 -114215074 - MamGypLTR1d LTR Gypsy -567 246 30 4 1100 597 189 101 7 chr2 67552061 67552200 -114195887 - ORR1C1 LTR MaLR -226 152 1 7 1100 1113 267 80 57 chr2 67552407 67552796 -114195291 + MTD LTR MaLR 1 398 -21 7 1100 238 352 66 53 chr2 67553012 67553315 -114194772 - RMER17C LTR ERVK -38 372 66 7 1100 266 327 230 32 chr2 67560336 67560614 -114187473 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 76 8 1100 612 369 42 76 chr2 67572298 67572773 -114175314 - MLT1C LTR MaLR -8 459 1 9 1100 459 267 60 0 chr2 67573813 67573929 -114174158 + MLT1A0 LTR MaLR 178 300 -65 9 1100 1458 208 105 11 chr2 67574800 67575170 -114172917 - MTD LTR MaLR -12 407 3 9 1100 900 189 44 16 chr2 67595449 67595632 -114152455 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 197 1 1100 781 258 18 64 chr2 67598921 67599182 -114148905 - ORR1C2 LTR MaLR -123 271 1 1 1100 265 335 73 85 chr2 67601405 67601735 -114146352 + ORR1D1 LTR MaLR 6 331 -43 1 1100 1206 249 77 27 chr2 67602111 67602449 -114145638 - ORR1B2 LTR MaLR -12 355 1 1 1100 3028 76 8 0 chr2 67603636 67604031 -114144056 + MTB LTR MaLR 3 400 0 1 1100 225 336 119 56 chr2 67606025 67606151 -114141936 - MLT1A0 LTR MaLR -184 181 48 1 1100 1348 276 27 55 chr2 67606967 67607442 -114140645 - RMER5 LTR ERV1 0 534 73 1 1100 942 278 45 86 chr2 67617690 67617763 -114130324 - MTE2a LTR MaLR -13 366 295 1 1100 716 277 74 69 chr2 67617763 67618127 -114129960 + ORR1D2 LTR MaLR 5 370 0 1 1100 942 278 45 86 chr2 67618127 67618435 -114129652 - MTE2a LTR MaLR -85 294 1 1 1100 2822 125 58 35 chr2 67622641 67622960 -114125127 + RMER17D2 LTR ERVK 1 338 -471 1 1100 2822 125 58 35 chr2 67623067 67623311 -114124776 + RMER17D2 LTR ERVK 339 577 -232 1 1100 1356 232 42 25 chr2 67623312 67623665 -114124422 + RLTR10D LTR ERVK 1 359 0 1 1100 1354 145 34 0 chr2 67623665 67623894 -114124193 + RMER17D2 LTR ERVK 573 809 0 1 1101 2269 193 55 7 chr2 67633797 67634244 -114113843 + RMER13A LTR ERVK 3 572 -386 1 1101 351 321 33 74 chr2 67634319 67634440 -114113647 + RMER13A LTR ERVK 745 860 0 1 1101 238 312 61 24 chr2 67635013 67635095 -114112992 - MLT1J LTR MaLR -94 418 334 1 1101 301 278 56 0 chr2 67641344 67641434 -114106653 - MLT1J1 LTR MaLR -349 95 1 1 1101 225 311 66 26 chr2 67657275 67657351 -114090736 + RMER15 LTR ERVL 243 321 -254 2 1101 448 291 62 104 chr2 67684112 67684468 -114063619 - RLTR15 LTR ERVK -18 341 1 2 1101 1578 172 21 63 chr2 67691104 67691439 -114056648 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 6 2 1101 1923 165 30 19 chr2 67692274 67692638 -114055449 - RLTR20B2 LTR ERVK -56 504 137 2 1101 3190 172 53 119 chr2 67702279 67702626 -114045461 - RMER6D LTR ERVK 0 720 376 2 1101 3190 172 53 119 chr2 67702685 67703108 -114044979 - RMER6D LTR ERVK -345 375 1 2 1101 621 287 72 50 chr2 67704790 67705069 -114043018 - RMER15 LTR ERVL -269 306 22 2 1101 797 319 17 38 chr2 67705188 67705475 -114042612 - ORR1E LTR MaLR -4 355 75 2 1101 310 322 68 20 chr2 67712988 67713134 -114034953 - MLT1A LTR MaLR -39 335 183 3 1101 270 319 321 80 chr2 67713502 67713781 -114034306 - MTEb LTR MaLR -30 349 3 3 1101 246 309 58 23 chr2 67715327 67715413 -114032674 + LTR81B LTR ERV1? 315 403 -990 3 1101 1336 249 82 8 chr2 67732702 67733079 -114015008 + MTD LTR MaLR 15 419 0 3 1101 1223 178 26 48 chr2 67734244 67734515 -114013572 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 103 3 1101 979 287 61 46 chr2 67744066 67744395 -114003692 + ORR1D2 LTR MaLR 1 334 -36 3 1101 564 321 22 5 chr2 67751151 67751336 -113996751 - RMER15 LTR ERVL -16 559 372 3 1101 1115 287 81 25 chr2 67758303 67758700 -113989387 - MTD LTR MaLR 0 419 1 3 1101 600 187 209 19 chr2 67760872 67761030 -113987057 - MTD LTR MaLR -40 379 192 3 1102 1426 248 79 0 chr2 67764466 67764809 -113983278 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 3 1102 281 246 29 0 chr2 67786472 67786541 -113961546 - MLT2B5 LTR ERVL -646 71 1 4 1102 226 346 74 99 chr2 67788099 67788491 -113959596 - MLT1A1 LTR MaLR -1 407 26 4 1102 317 329 55 20 chr2 67788916 67789062 -113959025 - MLT1H2 LTR MaLR -57 432 282 4 1102 1728 175 124 9 chr2 67797758 67798104 -113949983 + ORR1B1 LTR MaLR 1 386 -8 4 1102 653 268 35 129 chr2 67803685 67804002 -113944085 + MT2B2 LTR ERVL 1 287 -297 4 1102 7388 153 85 15 chr2 67803740 67805166 -113942921 + ORR1A2-int LTR MaLR 439 1963 0 4 1102 2331 95 22 0 chr2 67805170 67805486 -113942601 + ORR1A2 LTR MaLR 5 327 0 4 1102 1809 136 14 69 chr2 67806794 67807142 -113940945 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 4 1102 840 329 45 69 chr2 67807490 67807937 -113940150 + MLT1G1 LTR MaLR 136 571 -8 4 1102 343 294 110 8 chr2 67808016 67808143 -113939944 - MLT1D LTR MaLR -93 412 273 4 1102 233 360 34 26 chr2 67814245 67814362 -113933725 - MER34 LTR ERV1 -45 497 380 4 1102 267 282 119 8 chr2 67821142 67821260 -113926827 - MLT1-int LTR MaLR -8 1363 1233 4 1102 906 234 0 138 chr2 67822469 67822751 -113925336 - ORR1D2 LTR MaLR -4 366 124 4 1102 270 204 0 20 chr2 67824872 67824922 -113923165 - RLTR20A2 LTR ERVK -16 562 514 4 1102 269 312 8 92 chr2 67826921 67827041 -113921046 - MTEa LTR MaLR -267 112 3 4 1102 2234 165 82 25 chr2 67827763 67828241 -113919846 - RLTR16 LTR ERVK 0 505 1 4 1102 1394 199 79 73 chr2 67832647 67832733 -113915354 + ORR1D1 LTR MaLR 5 89 -285 4 1102 1394 199 79 73 chr2 67832945 67833015 -113915072 + ORR1D1 LTR MaLR 90 148 -226 4 1102 1394 199 79 73 chr2 67833181 67833389 -113914698 + ORR1D1 LTR MaLR 149 372 -2 4 1102 1476 240 16 19 chr2 67838693 67839016 -113909071 - MTC LTR MaLR 0 421 100 4 1102 230 322 84 34 chr2 67844832 67844886 -113903201 + MTE2b LTR MaLR 11 66 -293 4 1102 230 322 84 34 chr2 67844966 67845030 -113903057 + MTE2b LTR MaLR 67 135 -224 4 1102 291 270 14 0 chr2 67845038 67845112 -113902975 + MTE2b LTR MaLR 262 336 -43 4 1102 501 315 92 89 chr2 67858300 67858614 -113889473 - ORR1E LTR MaLR -44 315 1 5 1102 2843 47 6 0 chr2 67872173 67872517 -113875570 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 5 1102 4787 152 10 44 chr2 67874341 67875244 -113872843 + RMER12 LTR ERVK 1 872 -450 5 1102 1124 276 40 35 chr2 67893188 67893563 -113854524 - MTEa LTR MaLR -2 377 1 5 1103 2852 90 26 3 chr2 67896724 67897115 -113850972 + MTB LTR MaLR 1 400 0 5 1103 647 221 15 40 chr2 67898876 67899051 -113849036 - MTC LTR MaLR -62 359 199 5 1103 1110 255 107 25 chr2 67904865 67905216 -113842871 + MTE2b LTR MaLR 1 370 0 5 1103 566 106 7 210 chr2 67913139 67913282 -113834805 + ORR1B1 LTR MaLR 1 152 -242 5 1103 320 140 35 0 chr2 67913992 67914049 -113834038 - ORR1A3-int LTR MaLR -1271 692 634 5 1103 930 210 65 56 chr2 67914008 67914258 -113833829 + MT2B LTR ERVL 31 287 -297 5 1103 1801 152 23 6 chr2 67914216 67914567 -113833520 + ORR1B1-int LTR MaLR 718 1074 -889 5 1103 530 152 0 48 chr2 67921707 67921811 -113826276 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 221 5 1103 1043 246 0 13 chr2 67937852 67938079 -113810008 - MT2A LTR ERVL -88 445 222 6 1103 568 298 178 27 chr2 67943108 67943367 -113804720 + MLT1C LTR MaLR 38 335 -132 6 1103 280 248 192 7 chr2 67948536 67948682 -113799405 - MLT2B1 LTR ERVL -346 174 2 6 1103 351 176 26 13 chr2 67965441 67965526 -113782561 + MTE2a LTR MaLR 271 364 -15 6 1103 1763 125 269 49 chr2 67967910 67968363 -113779724 + RLTR6_Mm LTR ERV1 37 589 -65 6 1103 62889 34 16 0 chr2 67968363 67975959 -113772128 + RLTR6-int LTR ERV1 1 7778 0 6 1103 1723 127 272 49 chr2 67976072 67976520 -113771567 + RLTR6_Mm LTR ERV1 37 584 -70 6 1103 752 295 20 29 chr2 67980211 67980455 -113767632 - MTEb LTR MaLR -104 275 34 6 1103 2270 120 7 73 chr2 67981812 67982225 -113765862 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 1 6 1103 306 361 30 0 chr2 67988792 67988925 -113759162 - MLT1D LTR MaLR -11 494 358 6 1103 1806 139 58 20 chr2 67993848 67994194 -113753893 - RLTR15 LTR ERVK 0 359 1 6 1103 726 157 157 5 chr2 68002143 68002299 -113745788 - RLTR26 LTR ERVK -479 163 1 4 1103 465 195 31 10 chr2 68002372 68002476 -113745611 + MTD LTR MaLR 290 406 -13 5 1103 3493 31 26 0 chr2 68007940 68008326 -113739761 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 1103 239 273 65 75 chr2 68015995 68016209 -113731878 + RLTR15 LTR ERVK 71 282 -77 2 1103 1184 301 74 10 chr2 68018456 68018859 -113729228 + MLT1C LTR MaLR 34 462 -5 2 1103 406 270 73 115 chr2 68019197 68019457 -113728630 + MLT2B2 LTR ERVL 6 254 -261 3 1103 398 281 271 0 chr2 68020307 68020506 -113727581 + MLT2B2 LTR ERVL 301 553 -3 3 1103 666 326 95 42 chr2 68022803 68023139 -113724948 - ORR1E LTR MaLR -5 354 1 3 1104 801 215 52 32 chr2 68030527 68030867 -113717220 + MTD LTR MaLR 12 419 0 4 1104 529 324 113 40 chr2 68036706 68037034 -113711053 - ORR1E LTR MaLR -6 353 2 5 1104 1238 148 57 0 chr2 68038486 68038695 -113709392 + RMER6B LTR ERVK 2 222 -239 6 1104 450 144 241 8 chr2 68038703 68038836 -113709251 + MYSERV6-int LTR ERVK 261 424 -8535 6 1104 4753 165 36 36 chr2 68038831 68039731 -113708356 - MYSERV6-int LTR ERVK -6782 2177 1278 6 1104 4608 119 30 20 chr2 68041247 68041991 -113706096 + MYSERV6-int LTR ERVK 2705 3455 -5504 6 1104 957 133 165 20 chr2 68041988 68042188 -113705899 + MYSERV6-int LTR ERVK 4816 5044 -3915 6 1104 4614 145 29 42 chr2 68042227 68043032 -113705055 + MYSERV6-int LTR ERVK 4993 5786 -3173 6 1104 1522 209 146 20 chr2 68043038 68043439 -113704648 + RLTR19 LTR ERVK 12 499 0 7 1104 2253 175 53 31 chr2 68043441 68043953 -113704134 + MYSERV6-int LTR ERVK 5802 6324 -2635 6 1104 5574 133 162 6 chr2 68044552 68045490 -113702597 + MYSERV6-int LTR ERVK 6370 7455 -1504 6 1104 5574 139 49 5 chr2 68045532 68045823 -113702264 + MYSERV6-int LTR ERVK 7456 7757 -1202 6 1104 1869 144 147 120 chr2 68045832 68046281 -113701806 + RMER6B LTR ERVK 1 461 0 7 1104 713 264 108 113 chr2 68050433 68050886 -113697201 + RLTR12B LTR ERVK 47 497 -31 8 1104 409 243 98 12 chr2 68054899 68055104 -113692983 - ORR1D1 LTR MaLR -8 362 98 9 1104 339 338 39 13 chr2 68064108 68064261 -113683826 + LTR16A LTR ERVL 57 213 -238 9 1104 805 271 97 22 chr2 68072259 68072579 -113675508 + MTEb LTR MaLR 36 379 0 1 1104 1684 176 141 6 chr2 68072904 68073292 -113674795 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 436 -92 1 1104 553 157 17 42 chr2 68073389 68073500 -113674587 + RLTR11A2 LTR ERVK 412 519 -8 1 1104 3566 20 0 0 chr2 68073654 68074050 -113674037 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1104 279 261 107 16 chr2 68097734 68097855 -113650232 + MTEb LTR MaLR 206 337 -42 1 1104 882 245 63 45 chr2 68111870 68112139 -113635948 + ORR1D2 LTR MaLR 1 274 -96 1 1104 585 267 42 23 chr2 68119954 68120209 -113627878 + MTEb LTR MaLR 1 319 -60 1 1104 717 185 49 14 chr2 68120218 68120477 -113627610 + ORR1D1 LTR MaLR 5 346 -28 1 1104 271 333 0 0 chr2 68134268 68134355 -113613732 + MLT1E2 LTR MaLR 529 615 -12 1 1104 1812 155 30 54 chr2 68135347 68135715 -113612372 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 9 1 1104 4484 142 72 28 chr2 68136101 68137058 -113611029 + RLTR25A LTR ERVK 6 1028 0 1 1104 1846 111 32 58 chr2 68141749 68142094 -113605993 + RLTR24 LTR ERV1 194 529 0 2 1104 1832 187 36 8 chr2 68142416 68142772 -113605315 - ORR1B2 LTR MaLR -1 366 1 2 1104 2093 155 70 25 chr2 68143527 68143930 -113604157 - MTC LTR MaLR 0 421 1 2 1105 433 312 81 65 chr2 68159260 68159630 -113588457 + MLT2C1 LTR ERVL 18 393 -4 2 1105 2031 167 93 81 chr2 68159996 68160503 -113587584 + RLTR28 LTR ERVL 1 513 -11 2 1105 248 301 0 14 chr2 68161478 68161552 -113586535 - LTR79 LTR ERVL -2 525 453 2 1105 597 236 26 103 chr2 68180514 68180708 -113567379 + MTEb LTR MaLR 1 179 -200 2 1105 442 288 68 59 chr2 68186449 68186750 -113561337 - MTEa LTR MaLR -6 373 43 2 1105 1185 254 105 51 chr2 68188084 68188436 -113559651 + MTD LTR MaLR 18 388 -31 2 1105 349 333 118 24 chr2 68212688 68212857 -113535230 + LTR82A LTR ERVL 498 682 -190 2 1105 770 259 67 29 chr2 68221347 68221586 -113526501 + RMER20B LTR ERVK 117 364 -263 3 1105 324 329 54 77 chr2 68222050 68222271 -113525816 - MLT1A LTR MaLR -21 353 138 3 1105 373 314 22 159 chr2 68230868 68231050 -113517037 + MTEa LTR MaLR 1 157 -222 3 1105 380 343 14 108 chr2 68231064 68231342 -113516745 + MT2A LTR ERVL 280 531 -2 3 1105 265 209 267 0 chr2 68251902 68251988 -113496099 + MLT1C LTR MaLR 359 467 0 3 1105 1177 170 111 171 chr2 68252174 68252383 -113495704 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 171 3 1105 1177 170 111 171 chr2 68252414 68252602 -113495485 - ORR1D1 LTR MaLR -204 170 1 3 1105 841 284 155 13 chr2 68260121 68260431 -113487656 + ORR1D2 LTR MaLR 14 367 -3 3 1105 1226 233 146 8 chr2 68276794 68277157 -113470930 + MTD LTR MaLR 3 415 -4 3 1106 933 217 144 53 chr2 68299107 68299448 -113448639 + MTEa LTR MaLR 4 375 -4 4 1106 316 320 52 52 chr2 68299583 68299774 -113448313 + ORR1E LTR MaLR 2 192 -167 4 1106 225 275 96 72 chr2 68315869 68316077 -113432010 - RMER10A LTR ERVL -19 423 211 4 1106 1094 323 39 29 chr2 68320425 68320945 -113427142 + ERVL-int LTR ERVL 1728 2252 -3505 4 1106 1331 282 56 14 chr2 68320975 68321475 -113426612 + ERVL-int LTR ERVL 3431 3951 -1806 4 1106 1033 167 48 108 chr2 68323204 68323473 -113424614 - ORR1B2 LTR MaLR -114 253 1 4 1106 229 217 49 16 chr2 68333012 68333073 -113415014 + RMER15 LTR ERVL 407 469 -106 4 1106 1809 138 35 38 chr2 68335013 68335330 -113412757 + ORR1B1 LTR MaLR 79 394 0 4 1106 460 292 34 58 chr2 68336137 68336344 -113411743 - RMER15 LTR ERVL -63 512 311 4 1106 494 342 176 15 chr2 68339051 68339381 -113408706 + MLT1H LTR MaLR 117 499 -50 4 1106 883 317 57 14 chr2 68340600 68340952 -113407135 + MLT2C1 LTR ERVL 28 394 -3 4 1106 682 304 44 97 chr2 68344468 68344678 -113403409 - MTEa LTR MaLR 0 379 185 5 1106 682 304 52 91 chr2 68344859 68345014 -113403073 - MTEa LTR MaLR -205 214 59 5 1106 257 265 79 105 chr2 68345640 68345792 -113402295 + MLT1A LTR MaLR 208 355 -19 5 1106 250 109 83 42 chr2 68349347 68349395 -113398692 - MT2B2 LTR ERVL 0 584 535 5 1106 1243 256 33 11 chr2 68349795 68350162 -113397925 - MTE2b LTR MaLR -4 375 1 5 1106 309 342 99 25 chr2 68352224 68352386 -113395701 - MLT1H1 LTR MaLR -89 466 293 5 1106 273 368 43 43 chr2 68352475 68352614 -113395473 - MLT1H1 LTR MaLR -401 154 16 5 1106 349 282 12 0 chr2 68353043 68353128 -113394959 + MTD LTR MaLR 25 110 -309 5 1106 1065 265 62 94 chr2 68353190 68353531 -113394556 + MTD LTR MaLR 89 418 -1 5 1106 609 268 110 56 chr2 68361633 68362024 -113386063 + RLTR12B LTR ERVK 96 507 -21 5 1106 2208 104 3 66 chr2 68362914 68363263 -113384824 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 5 1106 1446 203 101 9 chr2 68367422 68367770 -113380317 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 5 5 1106 229 289 37 56 chr2 68368031 68368192 -113379895 - RLTR15 LTR ERVK -154 205 48 5 1106 310 310 105 65 chr2 68368384 68368664 -113379423 + MTEb LTR MaLR 57 371 -8 5 1106 1900 223 46 5 chr2 68372716 68373108 -113374979 + MTD LTR MaLR 12 419 0 5 1106 647 206 28 0 chr2 68373110 68373251 -113374836 + MTD-int LTR MaLR 2 146 -1112 5 1106 254 343 20 47 chr2 68373913 68374063 -113374024 + LTR48 LTR ERV1 7 152 -635 5 1106 231 257 26 51 chr2 68375831 68375909 -113372178 + LTR48 LTR ERV1 3 78 -709 5 1106 253 301 11 46 chr2 68376529 68376616 -113371471 + LTR48 LTR ERV1 111 194 -450 5 1106 275 322 98 19 chr2 68376684 68376899 -113371188 + LTR48 LTR ERV1 508 739 -48 5 1106 1307 221 66 106 chr2 68380911 68380967 -113367120 - MTE2b LTR MaLR 0 379 308 5 1106 1307 221 66 106 chr2 68381001 68381304 -113366783 - MTE2b LTR MaLR -72 307 39 5 1106 2260 86 119 11 chr2 68381304 68381656 -113366431 - RLTR10 LTR ERVK 0 390 1 5 1106 1307 221 66 106 chr2 68381656 68381690 -113366397 - MTE2b LTR MaLR -341 38 1 5 1106 2105 164 39 26 chr2 68381770 68382159 -113365928 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 5 1106 457 274 48 0 chr2 68382842 68382966 -113365121 + ORR1E LTR MaLR 3 132 -227 5 1106 1891 122 134 31 chr2 68384621 68385081 -113363006 + RLTR6_Mm LTR ERV1 37 604 -50 5 1106 47260 13 9 1 chr2 68385082 68392557 -113355530 + RLTR6-int LTR ERV1 1 7552 -226 5 1106 2114 80 28 0 chr2 68393789 68394075 -113354012 + RLTR6-int LTR ERV1 7485 7778 0 5 1106 1851 105 145 22 chr2 68394184 68394616 -113353471 + RLTR6_Mm LTR ERV1 37 584 -70 5 1106 293 310 27 66 chr2 68395832 68396015 -113352072 + RMER4B LTR ERVK 12 187 -398 5 1106 4367 139 70 43 chr2 68403042 68403862 -113344225 - RMER21B LTR ERV1 0 842 1 5 1106 2707 143 128 10 chr2 68404027 68404544 -113343543 + MTC-int LTR MaLR 574 1151 -107 5 1106 3146 41 5 0 chr2 68404543 68404932 -113343155 + MTA_Mm LTR MaLR 6 396 0 5 1106 1931 168 98 3 chr2 68405837 68406214 -113341873 - MTC LTR MaLR -8 413 1 5 1107 375 196 30 71 chr2 68422716 68422815 -113325272 + MTD LTR MaLR 116 210 -209 6 1107 427 226 12 204 chr2 68426151 68426323 -113321764 + MTD LTR MaLR 199 337 -82 6 1107 3223 54 8 15 chr2 68428257 68428654 -113319433 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 3 6 1107 487 135 0 0 chr2 68447683 68447757 -113300330 + MTC LTR MaLR 25 98 -323 6 1107 1600 147 94 14 chr2 68449526 68449803 -113298284 + MTC LTR MaLR 108 406 -15 6 1107 3749 167 42 14 chr2 68461650 68462349 -113285738 + RMER6D LTR ERVK 3 720 0 6 1107 711 237 15 0 chr2 68464038 68464169 -113283918 - ETnERV2-int LTR ERVK -204 7202 7070 6 1107 524 250 44 68 chr2 68464549 68464755 -113283332 - ORR1E LTR MaLR -158 201 1 6 1107 396 204 79 73 chr2 68467226 68467390 -113280697 - RLTR15 LTR ERVK -194 165 1 6 1107 2237 108 3 32 chr2 68474899 68475244 -113272843 - MTB_Mm LTR MaLR -72 335 1 6 1107 393 351 57 3 chr2 68479020 68479304 -113268783 + ORR1E LTR MaLR 53 375 -4 6 1107 512 309 130 25 chr2 68484837 68485113 -113262974 + MTE2a LTR MaLR 1 305 -74 6 1107 2474 54 41 13 chr2 68495849 68496167 -113251920 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 6 1107 1195 189 176 24 chr2 68506280 68506616 -113241471 - MTD LTR MaLR -32 387 1 3 1107 1999 286 63 31 chr2 68519004 68519695 -113228392 + MTE-int LTR MaLR 801 1741 -51 1 1107 354 260 114 25 chr2 68519861 68520019 -113228068 + MTEa LTR MaLR 205 376 -3 1 1107 719 160 115 29 chr2 68522155 68522329 -113225758 - RMER12 LTR ERVK 0 1322 1134 2 1107 236 358 38 57 chr2 68522330 68522362 -113225725 + RMER12 LTR ERVK 718 745 -577 2 1107 236 358 38 57 chr2 68522416 68522540 -113225547 + RMER12 LTR ERVK 746 871 -451 2 1107 3769 171 77 59 chr2 68522417 68523276 -113224811 - RMER12 LTR ERVK -448 874 1 2 1107 602 243 66 29 chr2 68529991 68530283 -113217804 - RLTR15 LTR ERVK -27 501 45 3 1107 2578 131 182 19 chr2 68532757 68533340 -113214747 - RMER6A LTR ERVK -78 678 1 3 1107 267 299 25 38 chr2 68534884 68534964 -113213123 + MTE2b-int LTR MaLR 1502 1580 0 3 1107 294 289 53 38 chr2 68534976 68535109 -113212978 + MTE2b LTR MaLR 18 152 -227 3 1107 267 257 14 0 chr2 68535130 68535200 -113212887 + MTE2b LTR MaLR 309 379 0 3 1107 2687 75 73 0 chr2 68545887 68546258 -113201829 - MTB LTR MaLR -2 398 1 4 1107 369 320 75 25 chr2 68546987 68547147 -113200940 + MTEa LTR MaLR 212 379 0 4 1108 710 263 116 35 chr2 68555682 68555993 -113192094 - RLTR15 LTR ERVK -23 336 1 6 1108 242 249 124 40 chr2 68556311 68556457 -113191630 + RMER17C LTR ERVK 97 263 -147 6 1108 242 249 124 40 chr2 68556488 68556542 -113191545 + RMER17C LTR ERVK 264 313 -97 6 1108 3473 111 4 2 chr2 68563978 68564494 -113183593 - ORR1A1-int LTR MaLR -313 1650 1134 7 1108 5072 170 82 8 chr2 68565097 68566160 -113181927 - ORR1A1-int LTR MaLR -821 1142 1 7 1108 2117 148 6 3 chr2 68566160 68566505 -113181582 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 7 1108 509 301 66 96 chr2 68572263 68572627 -113175460 - ORR1E LTR MaLR -6 353 1 7 1108 1869 202 73 133 chr2 68574912 68575557 -113172530 - RMER19C LTR ERVK -5 606 1 8 1108 356 325 84 65 chr2 68576167 68576381 -113171706 - MLT1G1 LTR MaLR -33 546 329 8 1108 4113 160 53 61 chr2 68578453 68579387 -113168700 + RLTR25B LTR ERVK 3 1103 0 9 1108 328 337 67 47 chr2 68580959 68581152 -113166935 - MLT1G1 LTR MaLR -28 551 355 9 1108 2249 118 0 59 chr2 68581219 68581590 -113166497 - MTB_Mm LTR MaLR -58 349 1 9 1108 264 336 30 118 chr2 68590765 68590900 -113157187 - RMER13B LTR ERVK -736 172 50 1 1108 594 226 70 103 chr2 68596236 68596575 -113151512 - RMER10A LTR ERVL -77 365 1 1 1108 900 216 110 48 chr2 68603627 68604004 -113144083 - RMER20B LTR ERVK -38 589 129 1 1108 1735 116 34 11 chr2 68606756 68607018 -113141069 + ORR1A3 LTR MaLR 1 268 -58 1 1108 399 127 0 0 chr2 68607212 68607275 -113140812 + ORR1A3 LTR MaLR 263 325 -2 1 1108 358 329 121 21 chr2 68617364 68617603 -113130484 - MLT1G LTR MaLR -314 277 15 1 1108 293 376 34 24 chr2 68620210 68620417 -113127670 - MLT1J2 LTR MaLR -183 265 57 1 1108 471 225 35 48 chr2 68630392 68630537 -113117550 + ORR1E LTR MaLR 1 143 -216 1 1108 794 248 168 53 chr2 68631230 68631570 -113116517 + MTEa LTR MaLR 1 379 0 1 1108 1518 227 60 10 chr2 68631985 68632368 -113115719 - MTD LTR MaLR 0 419 18 1 1108 599 291 51 23 chr2 68633833 68634048 -113114039 + RMER15 LTR ERVL 336 556 -19 1 1108 3122 138 69 7 chr2 68636513 68637076 -113111011 - RLTR17 LTR ERVK 0 692 95 1 1108 230 337 82 33 chr2 68639478 68639662 -113108425 + LTR84b LTR ERVL 66 258 -503 1 1108 339 327 42 54 chr2 68645748 68645987 -113102100 + MLT1D LTR MaLR 1 236 -269 1 1108 227 286 57 9 chr2 68653871 68653977 -113094110 + RMER15 LTR ERVL 422 532 -43 1 1108 300 200 76 101 chr2 68654017 68654081 -113094006 + MT2B LTR ERVL 91 151 -450 1 1108 3444 38 0 2 chr2 68654713 68655110 -113092977 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 1108 1923 118 3 7 chr2 68656477 68656777 -113091310 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 29 2 1108 451 154 0 62 chr2 68656786 68656883 -113091204 - ORR1A2 LTR MaLR -236 91 1 2 1108 480 290 166 24 chr2 68657469 68657630 -113090457 + MTEa LTR MaLR 1 178 -201 2 1108 480 290 166 24 chr2 68657700 68657870 -113090217 + MTEa LTR MaLR 179 378 -1 2 1108 463 316 78 20 chr2 68657932 68658187 -113089900 + LTR83 LTR ERVL 37 306 -474 2 1108 262 281 34 42 chr2 68668190 68668309 -113079778 - MTE2b LTR MaLR -15 364 247 2 1108 258 305 22 74 chr2 68670281 68670482 -113077605 - MLT1G1 LTR MaLR -2 652 442 2 1108 444 339 91 29 chr2 68670466 68670773 -113077314 - MLT1G1 LTR MaLR -243 336 11 2 1108 1250 257 81 20 chr2 68671618 68671963 -113076124 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 5 2 1108 2524 130 33 53 chr2 68677228 68677658 -113070429 + MTC LTR MaLR 1 421 0 2 1108 959 142 22 11 chr2 68678451 68678629 -113069458 + MTC LTR MaLR 242 421 0 2 1108 575 256 62 28 chr2 68678881 68679058 -113069029 - MTEb LTR MaLR -196 183 1 2 1108 2096 296 95 60 chr2 68679058 68679319 -113068768 - MTEb-int LTR MaLR 0 1580 1304 2 1108 2096 296 95 60 chr2 68679469 68680130 -113067957 - MTEb-int LTR MaLR -277 1303 625 2 1109 2170 84 3 12 chr2 68690520 68690845 -113057242 - ORR1A2 LTR MaLR -5 322 1 2 1109 3419 36 52 19 chr2 68694925 68695347 -113052740 + RLTR10C LTR ERVK 1 436 0 2 1109 260 345 77 80 chr2 68698292 68698604 -113049483 + MLT1A0 LTR MaLR 1 311 -54 2 1109 534 204 27 70 chr2 68713812 68713997 -113034090 + MYSERV6-int LTR ERVK 8211 8387 -572 2 1109 529 252 178 117 chr2 68716681 68717023 -113031064 + ORR1D1 LTR MaLR 10 372 -2 3 1109 1128 271 26 70 chr2 68717146 68717534 -113030553 - MTEa LTR MaLR -8 371 1 3 1109 495 318 71 77 chr2 68717659 68717845 -113030242 - MLT1A LTR MaLR -4 370 173 3 1109 495 318 71 77 chr2 68717884 68718021 -113030066 - MLT1A LTR MaLR -202 172 50 3 1109 1912 179 107 5 chr2 68721418 68721800 -113026287 + MTC LTR MaLR 1 421 0 3 1109 2213 101 21 106 chr2 68724104 68724538 -113023549 - RMER10B LTR ERVL 0 398 2 3 1109 1577 217 43 25 chr2 68724767 68725159 -113022928 + MTD LTR MaLR 21 419 0 3 1109 3017 195 79 22 chr2 68730507 68731380 -113016707 - RMER13A LTR ERVK 0 908 33 3 1109 1231 194 159 56 chr2 68736569 68736908 -113011179 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 3 1109 260 264 152 18 chr2 68737518 68737630 -113010457 - MTE2b LTR MaLR -13 366 240 3 1109 941 234 120 7 chr2 68739932 68740233 -113007854 + MTD LTR MaLR 71 405 -14 3 1109 2092 167 105 11 chr2 68741998 68742465 -113005622 - RMER5 LTR ERV1 -11 523 13 3 1109 1191 208 82 39 chr2 68744472 68744561 -113003526 - ORR1D1 LTR MaLR -30 344 256 3 1109 1191 208 82 39 chr2 68744600 68744840 -113003247 - ORR1D1 LTR MaLR -119 255 2 3 1109 334 127 0 31 chr2 68745679 68745744 -113002343 - ORR1C2 LTR MaLR -54 330 268 3 1109 807 270 48 54 chr2 68746169 68746521 -113001566 - RMER15 LTR ERVL 0 575 226 3 1109 1186 174 12 56 chr2 68753819 68754069 -112994018 - RLTR42 LTR ERVK 0 239 1 3 1109 3837 9 121 0 chr2 68755860 68756300 -112991787 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 3 1109 41318 17 14 0 chr2 68756300 68761587 -112986500 + MERVL-int LTR ERVL 1 5360 -125 3 1109 331 191 46 35 chr2 68761587 68761674 -112986413 + ORR1A3-int LTR MaLR 553 640 -1323 3 1109 321 0 0 0 chr2 68761674 68761712 -112986375 + MERVL-int LTR ERVL 5448 5485 0 3 1109 3837 9 121 0 chr2 68761712 68762152 -112985935 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 3 1109 1035 203 11 102 chr2 68769612 68769897 -112978190 + MTD LTR MaLR 1 259 -160 3 1109 365 316 38 28 chr2 68775314 68775526 -112972561 - RMER15 LTR ERVL -15 560 347 3 1109 337 295 22 52 chr2 68783966 68784102 -112963985 - MLT1B LTR MaLR 0 374 243 4 1109 1433 238 66 18 chr2 68788807 68789038 -112959049 + MTD LTR MaLR 21 255 -164 4 1109 2288 134 88 3 chr2 68789038 68789426 -112958661 + MTC LTR MaLR 1 421 0 4 1109 1433 238 66 18 chr2 68789426 68789575 -112958512 + MTD LTR MaLR 256 419 0 4 1109 2994 241 96 57 chr2 68789574 68790726 -112957361 + MTD-int LTR MaLR 2 1258 0 4 1109 491 239 45 0 chr2 68790726 68790860 -112957227 + MTD LTR MaLR 1 140 -279 4 1109 461 264 71 7 chr2 68794717 68794858 -112953229 - MLT1B LTR MaLR -4 386 237 4 1109 1423 251 92 22 chr2 68808125 68808540 -112939547 - ORR1E-int LTR MaLR -1122 458 15 4 1109 979 241 126 31 chr2 68808566 68808883 -112939204 - ORR1E LTR MaLR -9 350 4 4 1109 3287 41 8 0 chr2 68811040 68811433 -112936654 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 1109 299 234 0 0 chr2 68811965 68812029 -112936058 + ORR1E LTR MaLR 108 171 -188 4 1109 483 294 33 16 chr2 68812086 68812269 -112935818 + ORR1E LTR MaLR 163 348 -11 4 1110 335 282 84 7 chr2 68817356 68817499 -112930588 - MLT1D LTR MaLR 0 505 352 4 1110 283 225 23 70 chr2 68817898 68818027 -112930060 - MLT1D LTR MaLR -270 235 113 4 1110 1618 219 91 3 chr2 68825068 68825453 -112922634 + MTD LTR MaLR 1 419 0 4 1110 1561 226 85 57 chr2 68830599 68831095 -112916992 - RLTR18B LTR ERVK 0 512 3 4 1110 589 220 53 49 chr2 68832334 68832561 -112915526 + MT2A LTR ERVL 355 584 0 4 1110 3890 139 95 35 chr2 68834005 68834718 -112913369 + RMER6A LTR ERVK 1 756 0 4 1110 924 282 117 44 chr2 68866322 68866589 -112881498 - MTE2b LTR MaLR -13 366 86 5 1110 2586 141 187 24 chr2 68866589 68867092 -112880995 + RMER4B LTR ERVK 1 585 0 5 1110 924 282 117 44 chr2 68867092 68867165 -112880922 - MTE2b LTR MaLR -294 85 1 5 1110 251 268 39 58 chr2 68872028 68872131 -112875956 + RMER4A LTR ERVK 8 108 -358 5 1110 3498 49 8 115 chr2 68877953 68878441 -112869646 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 5 1110 315 282 113 73 chr2 68880847 68881043 -112867044 - MLT1A0 LTR MaLR -7 383 180 5 1110 2241 133 90 3 chr2 68882398 68882775 -112865312 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 5 1110 874 224 40 20 chr2 68883899 68884099 -112863988 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 171 5 1110 402 265 62 58 chr2 68884086 68884294 -112863793 - ORR1D1 LTR MaLR -137 230 36 5 1110 241 275 39 55 chr2 68887679 68887806 -112860281 - MLT1A0 LTR MaLR -240 125 1 5 1110 265 262 101 97 chr2 68893632 68893839 -112854248 + MLT1I LTR MaLR 196 403 -8 5 1110 251 73 0 0 chr2 68894171 68894212 -112853875 - ORR1A1-int LTR MaLR -1751 41 1 5 1110 533 335 6 0 chr2 68905074 68905247 -112842840 - MLT1A0 LTR MaLR -63 302 129 5 1110 237 203 0 123 chr2 68913580 68913653 -112834434 - RMER5 LTR ERV1 -26 508 445 5 1111 350 331 115 54 chr2 68953362 68953675 -112794412 + ORR1E LTR MaLR 8 339 -20 6 1111 463 203 111 33 chr2 68956083 68956236 -112791851 + MLT1B LTR MaLR 168 332 -58 6 1111 312 291 18 0 chr2 68956938 68957048 -112791039 - MLT1B LTR MaLR -219 171 60 6 1111 3061 80 18 2 chr2 68964264 68964664 -112783423 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 2 6 1111 1065 245 94 32 chr2 68966348 68966689 -112781398 - MTD LTR MaLR -16 403 42 6 1111 2584 101 68 16 chr2 68969100 68969525 -112778562 - RMER6B LTR ERVK -11 450 4 6 1111 1448 248 27 8 chr2 68973067 68973437 -112774650 - MTEa LTR MaLR 0 379 3 6 1111 925 187 70 235 chr2 68982162 68982617 -112765470 + ORR1C2 LTR MaLR 5 384 0 6 1111 1202 106 164 0 chr2 68985341 68985549 -112762538 + ORR1A3 LTR MaLR 77 318 -8 6 1111 670 283 114 57 chr2 68989178 68989563 -112758524 - MLT1C LTR MaLR -4 463 58 6 1111 938 289 81 22 chr2 68989563 68989920 -112758167 + MTEa LTR MaLR 2 379 0 6 1111 670 283 114 57 chr2 68989920 68989972 -112758115 - MLT1C LTR MaLR -410 57 1 6 1111 4262 25 2 0 chr2 68991032 68991513 -112756574 - LTRIS_Mm LTR ERV1 0 482 1 6 1111 1500 180 71 6 chr2 68996307 68996643 -112751444 - ORR1C2 LTR MaLR -26 358 1 6 1111 379 273 18 9 chr2 68996643 68996754 -112751333 - MLT1A0 LTR MaLR -227 138 27 6 1111 302 213 27 0 chr2 69001157 69001232 -112746855 - MLT1A0 LTR MaLR -2 372 296 1 1111 429 272 120 18 chr2 69001382 69001599 -112746488 - MLT1A0 LTR MaLR -101 264 26 1 1111 2624 67 12 6 chr2 69004831 69005175 -112742912 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 7 1111 1561 224 86 21 chr2 69005857 69006240 -112741847 - MTD LTR MaLR 0 419 12 8 1111 244 263 51 31 chr2 69014242 69014340 -112733747 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 266 2 1111 257 273 43 43 chr2 69014932 69015024 -112733063 - MLT1F2 LTR MaLR -167 393 302 2 1111 2884 75 2 7 chr2 69016990 69017394 -112730693 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 6 3 1111 1107 208 70 158 chr2 69022408 69022661 -112725426 - RLTR20B3 LTR ERVK -55 522 187 3 1111 1107 120 14 57 chr2 69022726 69022930 -112725157 - RLTR20B3 LTR ERVK -378 199 4 3 1111 236 268 22 44 chr2 69025304 69025394 -112722693 - ORR1E LTR MaLR 0 359 272 4 1111 569 200 29 22 chr2 69031150 69031288 -112716799 - RLTR25B LTR ERVK 0 1028 890 5 1111 2923 115 53 76 chr2 69031297 69031879 -112716208 - RLTR25B LTR ERVK -459 569 1 5 1111 493 306 111 27 chr2 69031932 69032391 -112715696 - MER34A1 LTR ERV1 -77 510 3 5 1111 963 221 143 35 chr2 69034043 69034385 -112713702 - MTE2a LTR MaLR 0 379 1 5 1111 451 172 0 22 chr2 69036677 69036766 -112711321 - RMER19B LTR ERVK -7 895 809 5 1111 270 209 119 0 chr2 69036759 69036826 -112711261 + RMER19A LTR ERVK 90 164 -573 6 1111 290 125 0 0 chr2 69036836 69036892 -112711195 - RMER19B LTR ERVK -846 56 1 5 1111 242 279 58 0 chr2 69036997 69037083 -112711004 - MER21B LTR ERV1 -306 557 467 6 1111 2285 141 134 102 chr2 69039218 69039883 -112708204 - RMER6C LTR ERVK -3 687 2 6 1111 353 216 108 55 chr2 69047170 69047332 -112700755 + RLTR13D3 LTR ERVK 849 1114 0 8 1111 4614 93 40 41 chr2 69048239 69048991 -112699096 + RMER17A LTR ERVK 1 751 0 8 1111 3729 97 20 62 chr2 69049681 69050273 -112697814 - RMER2 LTR ERV1 0 567 1 9 1111 3369 30 5 25 chr2 69051362 69051766 -112696321 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 9 1111 4255 151 153 15 chr2 69052300 69053098 -112694989 - RMER13B LTR ERVK 0 908 1 9 1111 498 288 40 36 chr2 69055379 69055602 -112692485 + MLT1B LTR MaLR 165 388 -2 1 1111 682 210 60 106 chr2 69069115 69069541 -112678546 - ORR1D1 LTR MaLR -6 368 4 1 1111 386 250 130 14 chr2 69069558 69069704 -112678383 + MTD LTR MaLR 243 405 -14 1 1111 489 299 41 51 chr2 69070142 69070339 -112677748 - ORR1E LTR MaLR -164 195 1 1 1112 2540 105 6 0 chr2 69078293 69078618 -112669469 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 1 1112 2056 135 32 59 chr2 69096413 69096751 -112651336 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 1 1112 2197 87 22 37 chr2 69100390 69100714 -112647373 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 1 1112 772 325 72 31 chr2 69103078 69103427 -112644660 + MLT1A0 LTR MaLR 3 365 0 1 1112 3029 21 0 21 chr2 69106442 69106776 -112641311 + IAPLTR2b LTR ERVK 1 327 0 1 1112 3503 45 0 5 chr2 69109438 69109836 -112638251 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1112 333 343 71 86 chr2 69112532 69112800 -112635287 + LTR40b LTR ERVL 199 462 0 1 1112 964 112 84 63 chr2 69124259 69124434 -112623653 + ORR1B2 LTR MaLR 9 184 -183 2 1112 964 112 84 63 chr2 69124498 69124512 -112623575 + ORR1B2 LTR MaLR 185 201 -166 2 1112 1521 215 52 3 chr2 69132037 69132205 -112615882 + ORR1D1 LTR MaLR 1 171 -203 2 1112 1521 215 52 3 chr2 69132330 69132488 -112615599 + ORR1D1 LTR MaLR 172 342 -32 2 1112 1421 220 131 56 chr2 69132503 69132893 -112615194 - MTD LTR MaLR 0 419 1 2 1112 7398 53 3 0 chr2 69138603 69139493 -112608594 - RLTR13B1 LTR ERVK 0 893 1 2 1112 2404 89 9 0 chr2 69147821 69148145 -112599942 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 2 1112 348 254 142 26 chr2 69158542 69158648 -112589439 - MLT1D LTR MaLR -386 119 1 2 1112 427 217 14 92 chr2 69162499 69162641 -112585446 + MT2B LTR ERVL 139 269 -332 2 1112 234 246 48 0 chr2 69165746 69165767 -112582320 + ORR1B1-int LTR MaLR 623 649 -860 2 1112 3220 26 7 121 chr2 69169270 69169710 -112578377 - RLTR10 LTR ERVK 0 390 1 2 1112 339 289 196 73 chr2 69169798 69170018 -112578069 + ORR1E LTR MaLR 98 344 -15 2 1112 978 113 39 13 chr2 69170494 69170647 -112577440 + ORR1A4 LTR MaLR 165 321 -8 2 1112 765 277 16 16 chr2 69171133 69171320 -112576767 - MTE2b LTR MaLR -154 225 39 2 1112 303 213 103 39 chr2 69171305 69171383 -112576704 - MTE2b LTR MaLR -287 92 10 2 1112 669 273 107 0 chr2 69177107 69177294 -112570793 - MER90a LTR ERV1 -2 612 406 3 1112 330 256 88 68 chr2 69177334 69177481 -112570606 - MER90a LTR ERV1 -425 150 1 3 1112 3503 45 2 2 chr2 69182363 69182761 -112565326 + MTB LTR MaLR 3 400 0 3 1112 932 302 117 34 chr2 69182779 69183105 -112564982 - MLT1J1 LTR MaLR -84 360 8 3 1112 835 204 121 9 chr2 69188100 69188323 -112559764 - MT2A LTR ERVL 0 533 286 3 1112 5501 157 30 6 chr2 69188363 69189263 -112558824 + MERVL_2A-int LTR ERVL 2395 3316 -2445 3 1112 1474 250 57 54 chr2 69189263 69189669 -112558418 - MTD LTR MaLR 0 419 13 3 1112 747 263 181 14 chr2 69190903 69191252 -112556835 - RMER21B LTR ERV1 -107 840 321 3 1112 496 370 65 8 chr2 69191314 69191559 -112556528 + MLT1L LTR MaLR 350 608 -2 3 1112 265 133 22 0 chr2 69191841 69191886 -112556201 + RMER15 LTR ERVL 14 59 -516 3 1112 1092 196 155 48 chr2 69194481 69194808 -112553279 + RMER15 LTR ERVL 22 386 -189 3 1112 1385 266 112 31 chr2 69194808 69194964 -112553123 + RLTR20D LTR ERVK 1 149 -419 3 1112 1385 266 112 31 chr2 69195131 69195490 -112552597 + RLTR20D LTR ERVK 150 557 -11 3 1112 700 249 118 6 chr2 69195504 69195682 -112552405 + RMER15 LTR ERVL 378 575 0 3 1112 668 89 0 0 chr2 69198314 69198404 -112549683 - ORR1A4 LTR MaLR -12 317 228 3 1112 404 195 0 12 chr2 69199763 69199846 -112548241 + RLTR42-int LTR ERVK 896 977 -5160 3 1112 441 281 213 18 chr2 69199852 69200077 -112548010 + RLTR42-int LTR ERVK 1527 1795 -3727 3 1112 252 161 214 0 chr2 69200122 69200178 -112547909 + RLTR42-int LTR ERVK 1797 1864 -3658 3 1112 1268 154 44 16 chr2 69200363 69200614 -112547473 + RLTR42-int LTR ERVK 1870 2127 -3395 3 1112 285 273 8 68 chr2 69200655 69200773 -112547314 + MYSERV-int LTR ERVK 5594 5704 -846 3 1112 440 242 24 54 chr2 69200849 69200951 -112547136 + RMER17C LTR ERVK 8 106 -304 3 1112 440 242 24 54 chr2 69201080 69201143 -112546944 + RMER17C LTR ERVK 107 168 -242 3 1112 542 271 61 82 chr2 69201145 69201475 -112546612 + RLTR19-int LTR ERVK 3579 3901 -2236 3 1112 399 260 64 75 chr2 69201474 69201661 -112546426 + RLTR42-int LTR ERVK 2695 2879 -359 3 1112 239 271 87 96 chr2 69201978 69202333 -112545754 + RMER10A LTR ERVL 12 363 -79 3 1112 250 260 73 110 chr2 69202308 69202472 -112545615 + RMER10A LTR ERVL 260 417 -25 3 1112 1748 165 89 28 chr2 69202632 69203024 -112545063 - RMER10A LTR ERVL -26 416 1 3 1113 2470 122 117 20 chr2 69208402 69208794 -112539293 + RLTR23 LTR ERV1 1 430 0 3 1113 1194 246 100 31 chr2 69211315 69211705 -112536382 + RMER5 LTR ERV1 33 449 -85 3 1113 234 244 121 12 chr2 69212013 69212096 -112535991 + RMER5 LTR ERV1 443 534 0 3 1113 272 325 85 31 chr2 69214095 69214225 -112533862 - LTR48 LTR ERV1 -650 137 1 3 1113 248 299 39 13 chr2 69214405 69214483 -112533604 - MLT1H2 LTR MaLR -341 148 69 3 1113 2536 92 6 12 chr2 69221164 69221493 -112526594 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 3 1113 261 329 64 0 chr2 69233071 69233211 -112514876 - LTR33 LTR ERVL -4 511 363 4 1113 2378 106 9 0 chr2 69245419 69245741 -112502346 + ORR1A2 LTR MaLR 3 327 0 4 1113 3367 43 5 2 chr2 69249270 69249665 -112498422 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 1113 5831 86 155 84 chr2 69249665 69250690 -112497397 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 4 1113 509 226 32 0 chr2 69250801 69250925 -112497162 + MLT1C LTR MaLR 6 133 -257 4 1113 522 310 147 4 chr2 69251065 69251337 -112496750 + MLT1C LTR MaLR 112 422 -45 4 1113 3239 58 0 5 chr2 69251611 69252009 -112496078 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 1113 1759 107 31 10 chr2 69259341 69259634 -112488453 + ORR1A2 LTR MaLR 25 323 -4 4 1113 2561 89 3 0 chr2 69262000 69262326 -112485761 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 4 1113 236 272 46 130 chr2 69284821 69284952 -112463135 + MT2B LTR ERVL 145 264 -337 4 1113 235 232 138 40 chr2 69286356 69286472 -112461615 + MLT1J LTR MaLR 67 198 -314 4 1113 249 267 0 0 chr2 69286689 69286749 -112461338 + MLT1J-int LTR MaLR 14 73 -1314 4 1113 269 316 123 23 chr2 69286793 69287013 -112461074 + MLT1J-int LTR MaLR 173 414 -973 4 1113 265 288 190 31 chr2 69288022 69288248 -112459839 + MLT1J-int LTR MaLR 780 1041 -346 4 1113 487 253 189 51 chr2 69290017 69290213 -112457874 + MTE2a LTR MaLR 157 379 0 4 1113 1674 171 107 0 chr2 69296814 69297142 -112450945 + ORR1B2 LTR MaLR 5 367 0 5 1113 736 175 20 27 chr2 69299963 69300234 -112447853 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -1152 1174 812 5 1113 5279 141 74 34 chr2 69300232 69301301 -112446786 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 1215 2326 0 5 1113 1334 227 108 39 chr2 69301301 69301434 -112446653 + RLTR20A2 LTR ERVK 1 151 -427 5 1113 1334 227 108 39 chr2 69301593 69301894 -112446193 + RLTR20A2 LTR ERVK 152 464 -114 5 1113 2264 95 38 3 chr2 69318372 69318688 -112429399 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 5 1113 362 240 18 80 chr2 69335351 69335464 -112412623 - MT2B LTR ERVL -344 257 152 5 1114 358 343 55 10 chr2 69342083 69342283 -112405804 + MLT1J LTR MaLR 1 209 -303 5 1114 380 230 0 103 chr2 69349450 69349576 -112398511 + MT2B LTR ERVL 152 264 -337 5 1114 403 207 0 128 chr2 69365144 69365277 -112382810 + MT2B LTR ERVL 149 264 -337 5 1114 266 316 128 35 chr2 69374189 69374415 -112373672 + RLTR16 LTR ERVK 24 270 -235 6 1114 911 83 0 19 chr2 69407795 69407954 -112340133 + RMER17B LTR ERVK 308 463 -495 6 1114 382 161 0 131 chr2 69416776 69416883 -112331204 + MT2B LTR ERVL 172 264 -337 7 1114 3170 77 5 2 chr2 69431964 69432370 -112315717 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 7 1114 354 80 0 0 chr2 69432390 69432440 -112315647 + MTB LTR MaLR 351 400 0 7 1114 2492 130 65 0 chr2 69433823 69434193 -112313894 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 7 1114 331 215 96 106 chr2 69446497 69446601 -112301486 - MT2B LTR ERVL -344 257 155 8 1114 2868 83 13 0 chr2 69462811 69463198 -112284889 - MTB LTR MaLR -8 392 1 8 1114 556 285 127 57 chr2 69463929 69464339 -112283748 + MLT1G3 LTR MaLR 104 595 0 8 1115 1175 216 147 4 chr2 69469332 69469611 -112278476 + ORR1D1 LTR MaLR 4 322 -52 8 1115 2483 122 20 10 chr2 69474832 69475222 -112272865 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 9 1115 284 252 22 142 chr2 69480214 69480348 -112267739 + MT2B LTR ERVL 155 272 -329 9 1115 2254 121 9 0 chr2 69480734 69481057 -112267030 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 9 1115 2357 163 3 10 chr2 69482389 69482774 -112265313 - RLTR14 LTR ERV1 0 382 1 9 1115 387 286 0 39 chr2 69490432 69490472 -112257615 - MTE2b LTR MaLR -29 390 314 9 1115 387 250 0 36 chr2 69490556 69490620 -112257467 - MTE2b LTR MaLR -66 313 250 9 1115 993 189 83 2 chr2 69496516 69496718 -112251369 + MTD LTR MaLR 176 411 -8 9 1115 815 194 133 0 chr2 69497972 69498137 -112249950 - MTD LTR MaLR -14 405 219 1 1115 552 206 48 0 chr2 69498140 69498266 -112249821 - MTC-int LTR MaLR -1126 132 1 1 1115 1754 184 120 5 chr2 69498268 69498644 -112249443 - MTC LTR MaLR -2 419 1 1 1115 289 151 120 27 chr2 69515511 69515586 -112232501 + RLTR25B LTR ERVK 428 509 -519 2 1115 292 243 45 36 chr2 69525469 69525580 -112222507 + MLT1A0 LTR MaLR 187 298 -67 6 1115 1160 225 131 33 chr2 69528425 69528760 -112219327 + ORR1D2 LTR MaLR 1 368 -2 7 1115 702 216 132 8 chr2 69530680 69530981 -112217106 + MTD LTR MaLR 5 409 -10 8 1115 365 150 0 0 chr2 69544979 69545039 -112203048 - MTD LTR MaLR 0 419 360 1 1115 3942 49 66 0 chr2 69548981 69549468 -112198619 + MURVY-LTR LTR ERV1 1 519 0 1 1115 1726 178 93 6 chr2 69552621 69552965 -112195122 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 1 1115 1395 215 41 17 chr2 69553176 69553596 -112194491 + RLTR20B3 LTR ERVK 143 563 0 1 1115 460 266 178 17 chr2 69554712 69554953 -112193134 - RMER15 LTR ERVL 0 575 296 1 1115 362 101 0 13 chr2 69555546 69555617 -112192470 - ORR1C2 LTR MaLR -25 359 249 1 1115 561 201 32 7 chr2 69555614 69555765 -112192322 + MT2C_Mm LTR ERVL 170 335 -249 1 1115 1638 91 3 25 chr2 69556281 69556553 -112191534 + ORR1A2 LTR MaLR 107 394 0 1 1115 2428 296 32 12 chr2 69556954 69557759 -112190328 - RMER15-int LTR ERVL -3422 1577 757 1 1115 330 290 94 6 chr2 69557841 69558011 -112190076 - RMER15-int LTR ERVL -4359 640 456 1 1115 699 277 189 4 chr2 69558115 69558353 -112189734 - MTD LTR MaLR 0 419 138 1 1115 352 261 23 8 chr2 69558726 69558857 -112189230 - RMER15-int LTR ERVL -4861 138 6 1 1115 758 303 39 13 chr2 69558862 69559096 -112188991 - RMER15 LTR ERVL 0 575 336 1 1115 335 406 51 6 chr2 69559958 69560134 -112187953 - MLT1J2 LTR MaLR -65 383 200 1 1115 400 292 68 72 chr2 69563167 69563409 -112184678 - ORR1E LTR MaLR -131 247 8 1 1115 429 210 101 101 chr2 69564034 69564193 -112183894 - MT2B LTR ERVL -276 325 167 1 1115 4384 12 0 12 chr2 69566928 69567427 -112180660 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 1 1115 2466 171 116 4 chr2 69579999 69580516 -112167571 - RMER15 LTR ERVL 0 575 1 2 1115 1617 161 68 80 chr2 69594869 69595221 -112152866 + ORR1B1 LTR MaLR 39 386 -8 2 1116 2161 100 52 0 chr2 69600601 69600911 -112147176 + ORR1A3 LTR MaLR 1 326 0 2 1116 663 262 100 22 chr2 69601854 69601940 -112146147 - RLTR20D LTR ERVK 0 568 482 2 1116 663 260 124 89 chr2 69601988 69602239 -112145848 - RLTR20D LTR ERVK -87 481 156 2 1116 677 189 185 19 chr2 69602376 69602538 -112145549 - RLTR20D LTR ERVK -379 189 1 2 1116 355 116 118 40 chr2 69609670 69609822 -112138265 - RMER17A LTR ERVK -312 439 276 2 1116 4785 53 3 0 chr2 69610681 69611266 -112136821 + LTRIS_Mus LTR ERV1 1 587 0 2 1116 264 259 42 67 chr2 69612365 69612485 -112135602 - MTEa LTR MaLR -12 367 251 2 1116 927 241 53 109 chr2 69613364 69613704 -112134383 + MTEa LTR MaLR 51 371 -8 2 1116 4220 27 0 8 chr2 69620492 69620978 -112127109 - LTRIS_Mm LTR ERV1 0 482 1 3 1116 2240 134 98 0 chr2 69622465 69622824 -112125263 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 3 1116 1079 240 52 62 chr2 69623530 69623836 -112124251 - MTD LTR MaLR -15 404 102 3 1116 1240 105 0 5 chr2 69626521 69626713 -112121374 + RMER6C LTR ERVK 500 690 0 3 1116 1650 155 14 87 chr2 69630897 69631243 -112116844 + ORR1A4 LTR MaLR 1 321 -8 3 1116 417 359 72 19 chr2 69634412 69634676 -112113411 - MLT1J LTR MaLR -164 348 71 3 1116 432 306 94 25 chr2 69640178 69640379 -112107708 - MLT1F1 LTR MaLR -88 481 267 3 1116 1283 253 121 40 chr2 69641405 69641886 -112106201 + RMER21A LTR ERV1 162 681 -266 3 1116 2305 104 7 99 chr2 69642726 69642940 -112105147 + RLTR9A LTR ERVK 1 206 -162 3 1116 2305 104 7 99 chr2 69643087 69643277 -112104810 + RLTR9A LTR ERVK 207 368 0 3 1116 5452 150 61 38 chr2 69643821 69644332 -112103755 + ETnERV2-int LTR ERVK 1046 1574 -5832 3 1116 5452 150 61 38 chr2 69644514 69645122 -112102965 + ETnERV2-int LTR ERVK 1575 2191 -5215 3 1116 7698 226 58 67 chr2 69645217 69645906 -112102181 + RMER16-int LTR ERVK 1402 2682 -4724 3 1116 9380 152 43 35 chr2 69646055 69647303 -112100784 + RMER16-int LTR ERVK 1775 3926 -3480 3 1116 9380 144 42 27 chr2 69647350 69647741 -112100346 + RMER16-int LTR ERVK 2871 3252 -2154 3 1116 6661 88 20 23 chr2 69647741 69648702 -112099385 + RMER17B LTR ERVK 1 958 0 3 1116 9380 148 63 26 chr2 69648702 69649010 -112099077 + RMER16-int LTR ERVK 3253 3457 -1949 3 1116 1479 207 108 39 chr2 69648976 69649338 -112098749 + ETnERV2-int LTR ERVK 5762 6148 -1258 3 1116 317 184 25 50 chr2 69649347 69649427 -112098660 + ETnERV2-int LTR ERVK 7327 7404 -2 3 1116 2612 93 11 32 chr2 69649428 69649804 -112098283 + RLTR9A LTR ERVK 1 368 0 3 1116 4153 237 40 25 chr2 69650451 69651089 -112096998 - ORR1C2-int LTR MaLR -165 1205 564 3 1116 4153 237 40 25 chr2 69651133 69651681 -112096406 - ORR1C2-int LTR MaLR -807 563 2 3 1116 1341 181 68 36 chr2 69651681 69651961 -112096126 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 96 3 1116 237 164 53 107 chr2 69656706 69656723 -112091364 + MT2B LTR ERVL 152 164 -437 4 1116 680 261 103 119 chr2 69659698 69660085 -112088002 - MER89 LTR ERV1 0 559 179 4 1116 241 246 8 136 chr2 69674752 69674884 -112073203 - MT2B LTR ERVL -326 275 161 4 1116 239 317 0 0 chr2 69675107 69675167 -112072920 + MLT1A LTR MaLR 4 63 -311 4 1116 229 259 0 0 chr2 69675786 69675840 -112072247 + MLT1A LTR MaLR 337 390 0 4 1116 2188 144 29 19 chr2 69676813 69677187 -112070900 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 4 1116 2408 173 124 29 chr2 69679293 69679900 -112068187 - RMER12 LTR ERVK -186 1136 472 4 1116 1494 176 85 6 chr2 69680103 69680446 -112067641 - RMER12 LTR ERVK -1493 355 1 4 1116 516 288 275 19 chr2 69680539 69680761 -112067326 - ORR1E LTR MaLR -59 320 42 4 1116 2149 100 6 0 chr2 69681588 69681907 -112066180 + ORR1A4 LTR MaLR 1 321 -8 4 1116 2354 89 9 12 chr2 69683978 69684308 -112063779 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 4 1116 1696 187 63 14 chr2 69685228 69685591 -112062496 - RLTR14 LTR ERV1 -1 381 1 4 1116 1736 137 4 11 chr2 69691229 69691510 -112056577 + ORR1A2 LTR MaLR 1 279 -48 5 1116 1628 113 124 0 chr2 69695650 69695941 -112052146 + IAPEY3_LTR LTR ERVK 1 327 -5 5 1116 641 191 0 58 chr2 69701780 69701936 -112046151 + RMER10B LTR ERVL 204 350 -48 5 1116 724 260 104 58 chr2 69714913 69715191 -112032896 + MTE2a LTR MaLR 76 366 -13 5 1116 2973 84 23 5 chr2 69727135 69727575 -112020512 + RMER16 LTR ERVK 1 533 0 6 1117 310 262 105 16 chr2 69744808 69744932 -112003155 - RLTR15 LTR ERVK -68 291 157 6 1117 3835 145 23 62 chr2 69745460 69745724 -112002363 - MYSERV6-int LTR ERVK 0 8959 8730 6 1117 3835 145 23 62 chr2 69745916 69746429 -112001658 - MYSERV6-int LTR ERVK -230 8729 8212 6 1117 817 170 145 0 chr2 69746519 69746719 -112001368 - MYSERV-int LTR ERVK -760 5790 5562 6 1117 230 281 0 0 chr2 69755161 69755218 -111992869 - RLTR20C LTR ERVK -449 85 29 6 1117 1306 199 186 28 chr2 69761016 69761414 -111986673 - RMER6B LTR ERVK 0 461 1 7 1117 247 276 34 22 chr2 69770217 69770306 -111977781 - MTD LTR MaLR -23 398 309 7 1117 356 264 42 68 chr2 69771549 69771667 -111976420 - MTD LTR MaLR -293 126 12 7 1117 259 240 16 24 chr2 69772578 69772681 -111975406 - ORR1B1-int LTR MaLR -755 754 653 7 1117 259 240 16 24 chr2 69772825 69772845 -111975242 - ORR1B1-int LTR MaLR -857 652 632 7 1117 327 238 104 24 chr2 69790444 69790569 -111957518 + RLTR15 LTR ERVK 157 291 -68 7 1117 335 340 66 66 chr2 69791000 69791347 -111956740 - MER74A LTR ERVL -54 504 158 8 1117 437 161 25 0 chr2 69802129 69802210 -111945877 - RMER13B LTR ERVK -825 83 1 8 1117 649 304 42 45 chr2 69812553 69812675 -111935412 - MTD LTR MaLR -110 309 193 8 1117 649 304 42 45 chr2 69812732 69812919 -111935168 - MTD LTR MaLR -227 192 2 8 1117 468 238 107 73 chr2 69828582 69828759 -111919328 - MTEa LTR MaLR -2 377 195 8 1117 443 268 96 48 chr2 69828793 69829001 -111919086 - MTEa LTR MaLR -159 220 3 8 1117 1228 162 126 180 chr2 69830004 69830449 -111917638 - MTC LTR MaLR 0 421 1 8 1117 1666 197 108 11 chr2 69840870 69841250 -111906837 + MTD LTR MaLR 3 419 0 9 1117 801 273 149 0 chr2 69843036 69843311 -111904776 - MTEa LTR MaLR -39 340 25 9 1117 313 304 66 36 chr2 69843164 69843331 -111904756 - MT2A LTR ERVL -357 176 5 9 1117 375 243 26 70 chr2 69845201 69845236 -111902851 - MT2B2 LTR ERVL -426 158 129 9 1117 521 321 64 58 chr2 69847314 69847606 -111900481 + MTEb LTR MaLR 47 328 -51 9 1117 292 246 14 0 chr2 69850936 69851005 -111897082 + MTEb LTR MaLR 301 370 -9 9 1117 1226 200 229 39 chr2 69851529 69851882 -111896205 - MTC LTR MaLR -1 420 1 9 1118 1773 189 40 20 chr2 69867203 69867554 -111880533 - ORR1D1 LTR MaLR -16 358 1 9 1118 3567 131 20 10 chr2 69868114 69868661 -111879426 + RLTR17 LTR ERVK 114 661 -31 9 1118 2940 161 27 6 chr2 69868687 69869198 -111878889 - RLTR31_Mm LTR ERVK -39 522 1 9 1118 2781 207 6 110 chr2 69870527 69870864 -111877223 - RMER19C LTR ERVK 0 611 311 9 1118 2781 207 6 110 chr2 69871037 69871374 -111876713 - RMER19C LTR ERVK -301 310 3 9 1118 572 326 132 6 chr2 69875284 69875602 -111872485 - MTEb LTR MaLR -14 365 8 9 1118 668 295 83 125 chr2 69880062 69880469 -111867618 - MT2A LTR ERVL -140 393 4 1 1118 2534 50 6 0 chr2 69880906 69881227 -111866860 - IAPEY2_LTR LTR ERVK -3 354 32 1 1118 365 289 165 31 chr2 69885893 69886147 -111861940 - MLT1H2 LTR MaLR -131 358 71 1 1118 246 191 0 0 chr2 69887120 69887162 -111860925 - MLT1E1 LTR MaLR -213 441 400 1 1118 1347 141 0 18 chr2 69894321 69894545 -111853542 - MTC LTR MaLR 0 421 202 1 1118 1026 188 27 49 chr2 69895942 69896205 -111851882 - MTB_Mm LTR MaLR -150 257 1 1 1118 439 240 276 0 chr2 69896411 69896607 -111851480 + MLT1D LTR MaLR 253 502 -3 1 1118 277 282 83 77 chr2 69917392 69917692 -111830395 + RMER10A LTR ERVL 122 423 -19 1 1118 545 241 85 5 chr2 69927371 69927515 -111820572 - MTD LTR MaLR -229 190 15 1 1118 464 281 23 32 chr2 69929332 69929525 -111818562 - MLT1B LTR MaLR -258 209 9 1 1118 650 177 196 44 chr2 69929841 69930066 -111818021 - RLTR14 LTR ERV1 0 382 124 1 1118 669 246 194 14 chr2 69930048 69930336 -111817751 - RLTR28B LTR ERVL -30 451 112 1 1118 631 164 0 72 chr2 69930337 69930462 -111817625 + RLTR21 LTR ERVK 1 116 -1456 1 1118 1327 109 56 13 chr2 69930464 69930696 -111817391 + RLTR21 LTR ERVK 521 762 -810 1 1118 526 243 82 42 chr2 69930736 69930809 -111817278 - MTEb LTR MaLR -14 365 61 1 1118 289 249 161 39 chr2 69930809 69930989 -111817098 - MLT2B1 LTR ERVL -248 272 71 1 1118 342 269 129 9 chr2 69931253 69931369 -111816718 - RMER20B LTR ERVK -329 298 169 1 1118 3180 58 5 5 chr2 69931597 69931997 -111816090 + MTB LTR MaLR 1 400 0 1 1118 2067 172 62 22 chr2 69940403 69940808 -111807279 + MTC LTR MaLR 1 421 0 1 1118 262 316 75 37 chr2 69963268 69963429 -111784658 - MLT1A0 LTR MaLR -176 189 23 1 1118 270 347 0 10 chr2 69968795 69968891 -111779196 - MLT1B LTR MaLR -6 384 290 1 1118 377 289 184 76 chr2 69972044 69972332 -111775755 - MLT1H LTR MaLR 0 549 231 1 1118 704 291 74 32 chr2 69974851 69975275 -111772812 + MLT1B LTR MaLR 2 498 -7 1 1118 1761 153 53 64 chr2 69978524 69978665 -111769422 - ORR1D1 LTR MaLR -2 372 244 1 1118 1761 153 53 64 chr2 69978716 69978780 -111769307 - ORR1D1 LTR MaLR -131 243 167 1 1118 1761 153 53 64 chr2 69978848 69979017 -111769070 - ORR1D1 LTR MaLR -208 166 4 1 1118 1514 214 47 72 chr2 69983708 69983953 -111764134 - MTD LTR MaLR 0 419 189 1 1118 1514 214 47 72 chr2 69984213 69984384 -111763703 - MTD LTR MaLR -231 188 3 1 1118 1509 236 85 13 chr2 69985113 69985500 -111762587 + MTD LTR MaLR 5 419 0 1 1119 237 294 117 18 chr2 69995962 69996125 -111751962 + MLT1I LTR MaLR 33 211 -200 1 1119 247 285 156 52 chr2 69999783 69999994 -111748093 - MLT1H1 LTR MaLR -15 540 308 1 1119 596 172 283 5 chr2 70001926 70002113 -111745974 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 136 2 1119 560 256 94 58 chr2 70002842 70003033 -111745054 - ORR1E LTR MaLR -3 367 170 5 1119 804 226 22 11 chr2 70003089 70003272 -111744815 - ORR1E LTR MaLR -163 196 12 5 1119 343 299 52 7 chr2 70004771 70004906 -111743181 + ORR1E LTR MaLR 6 146 -213 1 1119 864 220 47 144 chr2 70009091 70009495 -111738592 - MTE2a LTR MaLR -14 365 1 1 1119 1981 144 41 28 chr2 70012575 70012938 -111735149 - ORR1C1 LTR MaLR -10 368 1 2 1119 348 202 60 0 chr2 70017933 70018017 -111730070 + LTR41B LTR ERVL 72 160 -598 3 1119 238 287 120 24 chr2 70018207 70018332 -111729755 + LTR41 LTR ERVL 513 649 -119 3 1119 1405 251 9 105 chr2 70023975 70024394 -111723693 + MTE2b LTR MaLR 1 379 0 4 1119 873 296 100 35 chr2 70025339 70025710 -111722377 - MLT1E2 LTR MaLR 0 627 233 4 1119 291 397 7 14 chr2 70026053 70026201 -111721886 - MLT1E2 LTR MaLR -273 239 93 4 1119 231 337 129 0 chr2 70026347 70026448 -111721639 - MamGypLTR2c LTR Gypsy 0 1068 955 5 1119 1871 141 78 17 chr2 70030464 70030810 -111717277 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 5 1119 1024 231 34 158 chr2 70031408 70031789 -111716298 + MTE2a LTR MaLR 1 334 -45 5 1119 501 273 84 65 chr2 70033356 70033618 -111714469 - ORR1E LTR MaLR -71 288 22 6 1119 417 291 79 0 chr2 70036710 70036899 -111711188 + MLT1C LTR MaLR 7 210 -257 7 1119 373 300 109 52 chr2 70044907 70045118 -111702969 + MLT1A1 LTR MaLR 186 408 0 8 1119 238 246 41 73 chr2 70045529 70045652 -111702435 + RMER5 LTR ERV1 1 119 -415 8 1119 359 254 0 119 chr2 70045785 70045814 -111702273 - MT2B LTR ERVL -451 150 139 8 1119 1332 223 51 25 chr2 70045807 70046161 -111701926 + RMER5 LTR ERV1 157 519 -15 8 1119 1964 160 76 8 chr2 70047775 70048129 -111699958 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 9 1119 2527 169 0 2 chr2 70057475 70057896 -111690191 - MTC LTR MaLR -1 420 1 1 1119 594 286 99 104 chr2 70064042 70064627 -111683460 - RLTR18 LTR ERVK -4 612 31 1 1119 1021 257 90 20 chr2 70073263 70073609 -111674478 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 1 1119 446 304 108 61 chr2 70073847 70074208 -111673879 - MER21B LTR ERV1 -134 729 352 1 1119 305 259 15 114 chr2 70074720 70074851 -111673236 - MER21B LTR ERV1 -615 248 131 1 1119 1154 243 39 16 chr2 70077639 70077945 -111670142 - ORR1E LTR MaLR -5 354 42 1 1119 901 182 328 43 chr2 70078756 70079049 -111669038 - MTC LTR MaLR -33 388 13 1 1119 1711 150 124 139 chr2 70079894 70079949 -111668138 + RMER6C LTR ERVK 111 165 -525 1 1119 943 234 245 51 chr2 70079949 70080422 -111667665 - RMER2 LTR ERV1 0 567 3 1 1119 1711 150 124 139 chr2 70080422 70080638 -111667449 + RMER6C LTR ERVK 166 369 -321 1 1119 1711 150 124 139 chr2 70080678 70080994 -111667093 + RMER6C LTR ERVK 370 689 -1 1 1119 1611 232 102 10 chr2 70084925 70085309 -111662778 - MTD LTR MaLR 0 419 1 1 1119 561 281 79 0 chr2 70088550 70088728 -111659359 - MER21B LTR ERV1 -180 683 492 1 1119 290 274 155 58 chr2 70088785 70088865 -111659222 - MER21B LTR ERV1 -485 378 289 1 1119 290 274 155 58 chr2 70088885 70088978 -111659109 - MER21B LTR ERV1 -575 288 190 1 1119 399 211 0 111 chr2 70090475 70090592 -111657495 + MT2B LTR ERVL 153 256 -345 1 1119 1010 193 300 17 chr2 70095140 70095273 -111652814 - ORR1D1 LTR MaLR -2 372 211 1 1119 1010 193 300 17 chr2 70095333 70095489 -111652598 - ORR1D1 LTR MaLR -164 210 2 1 1119 851 62 23 15 chr2 70101152 70101283 -111646804 - RLTR10 LTR ERVK 0 390 259 1 1119 258 137 0 64 chr2 70101312 70101390 -111646697 - RLTR10 LTR ERVK -59 331 259 1 1119 2141 50 3 106 chr2 70101391 70101749 -111646338 - RLTR10 LTR ERVK -69 321 1 1 1119 13322 25 6 1 chr2 70101751 70103613 -111644474 - RLTR10-int LTR ERVK -3 1984 39 1 1119 2354 109 91 0 chr2 70103626 70104001 -111644086 - IAPLTR2a LTR ERVK -2 409 1 1 1119 7599 21 3 0 chr2 70104003 70104850 -111643237 - IAPEz-int LTR ERVK -2 6479 5630 1 1119 24876 29 39 25 chr2 70104836 70107863 -111640224 - IAPEz-int LTR ERVK -3405 3076 1 1 1119 851 62 23 15 chr2 70107863 70107994 -111640093 - RLTR10 LTR ERVK 0 390 259 1 1119 258 137 0 64 chr2 70108023 70108101 -111639986 - RLTR10 LTR ERVK -59 331 259 1 1119 2081 51 3 109 chr2 70108102 70108452 -111639635 - RLTR10 LTR ERVK -69 321 9 1 1119 2151 102 14 46 chr2 70108475 70108846 -111639241 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 9 1 1119 3387 40 2 2 chr2 70113899 70114295 -111633792 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 1120 1637 202 68 0 chr2 70125117 70125469 -111622618 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 3 2 1120 1719 168 14 97 chr2 70130539 70130960 -111617127 - RMER10B LTR ERVL 0 398 13 2 1120 781 244 125 100 chr2 70130991 70131568 -111616519 - RMER17C-int LTR ERVK -59 3179 2607 2 1120 284 176 86 86 chr2 70131561 70131654 -111616433 - RMER17C-int LTR ERVK -2579 3558 3466 2 1120 1399 221 119 44 chr2 70131783 70132224 -111615863 - RMER17C-int LTR ERVK -1265 1973 1495 2 1120 1399 217 68 26 chr2 70132305 70132384 -111615703 - RMER17C-int LTR ERVK -1744 1494 1459 2 1120 471 241 28 67 chr2 70132387 70132565 -111615522 - RLTR42-int LTR ERVK -3482 2040 1870 2 1120 320 257 0 0 chr2 70132666 70132740 -111615347 - RLTR42-int LTR ERVK -1997 1241 1168 2 1120 2300 113 27 3 chr2 70134085 70134423 -111613664 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 2 1120 546 253 48 81 chr2 70137371 70137681 -111610406 - BGLII_B LTR ERVK -106 335 36 2 1120 1093 232 52 61 chr2 70137701 70138027 -111610060 + ORR1D2 LTR MaLR 48 370 0 2 1120 422 245 29 0 chr2 70138901 70139003 -111609084 - MTE-int LTR MaLR -1193 387 283 2 1120 871 260 155 24 chr2 70139210 70139545 -111608542 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 2 1120 392 271 137 55 chr2 70143680 70143953 -111604134 - LTR37A LTR ERV1 -1 425 133 2 1120 392 271 137 55 chr2 70144026 70144131 -111603956 - LTR37A LTR ERV1 -294 132 16 2 1120 381 333 7 28 chr2 70150629 70150771 -111597316 + MER34 LTR ERV1 339 477 -65 2 1120 2692 67 0 0 chr2 70162084 70162411 -111585676 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 2 1120 532 288 50 6 chr2 70164584 70164745 -111583342 - MLT1C LTR MaLR -1 466 299 2 1120 783 279 83 65 chr2 70165321 70165693 -111582394 - MTE2a LTR MaLR 0 379 1 2 1120 372 207 0 136 chr2 70178178 70178215 -111569872 - MT2B LTR ERVL -446 155 138 3 1120 527 261 265 63 chr2 70180603 70180871 -111567216 - MTEa LTR MaLR -51 328 7 3 1120 809 226 9 64 chr2 70189335 70189553 -111558534 - MTEb LTR MaLR -109 270 65 3 1120 951 264 80 55 chr2 70190839 70191200 -111556887 + MTEa LTR MaLR 2 371 -8 3 1120 872 157 147 26 chr2 70192549 70192739 -111555348 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 172 3 1120 1050 109 0 115 chr2 70192918 70193126 -111554961 - ORR1C2 LTR MaLR -200 184 1 3 1120 1847 171 49 30 chr2 70193735 70193866 -111554221 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 229 3 1120 1847 171 49 30 chr2 70193888 70194123 -111553964 - ORR1D1 LTR MaLR -146 228 1 3 1120 899 134 57 0 chr2 70194649 70194806 -111553281 - RLTR24 LTR ERV1 -363 166 1 3 1120 567 221 11 220 chr2 70194806 70194927 -111553160 - MTD LTR MaLR -197 222 129 3 1120 567 221 11 220 chr2 70195080 70195220 -111552867 - MTD LTR MaLR -291 128 18 3 1120 1684 189 120 0 chr2 70196128 70196494 -111551593 + MTD LTR MaLR 1 410 -9 3 1120 1209 112 24 0 chr2 70198579 70198785 -111549302 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 157 3 1120 234 336 32 32 chr2 70201661 70201787 -111546300 + MLT1A1 LTR MaLR 270 395 -13 3 1120 438 251 106 51 chr2 70202669 70202943 -111545144 + MTEb LTR MaLR 28 379 0 3 1120 2046 159 41 36 chr2 70204111 70204503 -111543584 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 3 1120 314 347 16 60 chr2 70205437 70205621 -111542466 - MTEa LTR MaLR -201 178 3 3 1120 273 242 87 48 chr2 70208990 70209060 -111539027 + ORR1E LTR MaLR 1 76 -283 3 1120 273 242 87 48 chr2 70209097 70209130 -111538957 + ORR1E LTR MaLR 77 108 -251 3 1120 228 212 105 57 chr2 70209209 70209314 -111538773 + ORR1E LTR MaLR 204 313 -57 3 1120 1467 185 24 29 chr2 70209365 70209705 -111538382 - RLTR15 LTR ERVK -19 340 3 3 1120 3322 57 0 5 chr2 70213139 70213548 -111534539 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 3 1120 550 112 45 0 chr2 70214004 70214093 -111533994 - MTD LTR MaLR -289 130 38 3 1120 285 304 39 19 chr2 70214520 70214624 -111533463 - LTR48B LTR ERV1 -538 106 1 3 1120 390 292 193 19 chr2 70215225 70215494 -111532593 - LTR50 LTR ERVL -3 792 477 3 1120 227 247 74 0 chr2 70215539 70215620 -111532467 - LTR50 LTR ERVL -574 221 135 3 1120 495 294 135 50 chr2 70215772 70216188 -111531899 - ERVL-E-int LTR ERVL -364 5303 4853 3 1120 710 185 205 44 chr2 70216979 70217228 -111530859 - RMER13A LTR ERVK -481 379 91 3 1120 2287 215 2 5 chr2 70220483 70220903 -111527184 + MTD LTR MaLR 1 419 0 4 1120 1330 214 108 39 chr2 70222200 70222589 -111525498 - MTC LTR MaLR -1 420 5 4 1120 367 324 100 48 chr2 70223098 70223348 -111524739 + MLT1F LTR MaLR 1 263 -285 4 1120 346 280 0 106 chr2 70227642 70227656 -111520431 + MLT1A LTR MaLR 20 30 -344 4 1120 346 280 0 106 chr2 70227719 70227864 -111520223 + MLT1A LTR MaLR 31 162 -212 4 1120 2354 73 40 25 chr2 70230886 70231208 -111516879 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 4 1120 602 302 107 52 chr2 70231792 70232138 -111515949 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 1 4 1120 3614 82 4 6 chr2 70233564 70234040 -111514047 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 475 0 4 1120 241 212 14 43 chr2 70234405 70234474 -111513613 - RLTR20B1 LTR ERVK -394 169 103 4 1120 262 228 18 0 chr2 70247067 70247124 -111500963 - ORR1D1 LTR MaLR -316 58 1 4 1121 1016 235 40 150 chr2 70256273 70256699 -111491388 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 4 1121 242 328 0 0 chr2 70260782 70260843 -111487244 - MTC LTR MaLR -165 256 196 4 1121 388 162 95 0 chr2 70261163 70261237 -111486850 - MTC LTR MaLR -213 208 128 4 1121 345 327 157 55 chr2 70271104 70271486 -111476601 - MLT1H LTR MaLR -128 421 1 5 1121 829 275 68 26 chr2 70272201 70272466 -111475621 - ORR1E LTR MaLR 0 359 84 5 1121 292 160 197 13 chr2 70272611 70272687 -111475400 - ORR1E LTR MaLR -262 97 8 5 1121 627 82 0 10 chr2 70275697 70275796 -111472291 + ORR1B1 LTR MaLR 1 98 -296 5 1121 2111 147 30 0 chr2 70275829 70276197 -111471890 + RMER16 LTR ERVK 155 533 0 5 1121 1561 168 31 10 chr2 70276197 70276476 -111471611 + ORR1B1 LTR MaLR 110 394 0 5 1121 741 239 0 21 chr2 70277324 70277533 -111470554 + ORR1D2 LTR MaLR 102 368 -2 5 1121 1457 185 95 95 chr2 70283474 70283916 -111464171 - RMER10A LTR ERVL 0 442 1 5 1121 1988 192 46 26 chr2 70284658 70285015 -111463072 + RLTR20B1 LTR ERVK 101 456 -107 5 1121 1988 192 46 26 chr2 70285072 70285168 -111462919 + RLTR20B1 LTR ERVK 457 562 -1 5 1121 335 352 94 37 chr2 70286722 70287105 -111460982 - LTR40a LTR ERVL -63 456 52 5 1121 3255 48 177 2 chr2 70287698 70288134 -111459953 + RLTR1B LTR ERV1 1 512 0 5 1121 388 280 92 59 chr2 70291975 70292282 -111455805 + MTEb LTR MaLR 30 379 0 5 1121 318 317 92 14 chr2 70298576 70298717 -111449370 - MLT1G LTR MaLR -181 410 259 5 1121 2636 95 44 16 chr2 70300760 70301188 -111446899 - RMER17B LTR ERVK -518 440 1 5 1121 385 320 7 33 chr2 70304175 70304327 -111443760 - RMER15 LTR ERVL -6 569 422 5 1121 230 227 133 0 chr2 70304692 70304767 -111443320 - MTEa LTR MaLR -17 362 278 5 1121 1972 113 55 6 chr2 70319226 70319556 -111428531 - RLTR15 LTR ERVK -13 346 1 6 1121 2007 143 113 3 chr2 70322314 70322651 -111425436 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 6 1121 1328 149 41 28 chr2 70322955 70323272 -111424815 - RMER16 LTR ERVK -39 494 1 6 1121 3185 42 34 3 chr2 70323810 70324196 -111423891 + MTB LTR MaLR 1 398 -2 6 1121 671 80 26 26 chr2 70325148 70325263 -111422824 - ORR1B1 LTR MaLR -239 155 41 6 1121 847 111 21 7 chr2 70325725 70325870 -111422217 - RLTR11A2 LTR ERVK 0 527 381 6 1121 320 192 0 13 chr2 70325884 70325963 -111422124 - RLTR11A2 LTR ERVK -375 78 1 6 1121 1028 241 99 38 chr2 70325973 70326318 -111421769 + ORR1D2 LTR MaLR 5 370 0 6 1121 245 225 0 91 chr2 70326533 70326621 -111421466 - RLTR25B LTR ERVK -522 506 427 6 1121 379 240 89 51 chr2 70327001 70327080 -111421007 - MER65-int LTR ERV1 -225 4646 4570 6 1121 379 240 89 51 chr2 70327111 70327189 -111420898 - MER65-int LTR ERV1 -302 4569 4483 6 1121 227 260 60 40 chr2 70329285 70329385 -111418702 - LTR45C LTR ERV1 -11 528 427 6 1121 1347 160 168 10 chr2 70330261 70330571 -111417516 + RLTR15 LTR ERVK 1 359 0 6 1121 2041 57 3 11 chr2 70330999 70331281 -111416806 + MTB_Mm LTR MaLR 1 280 -127 6 1121 280 222 56 0 chr2 70336098 70336170 -111411917 - RMER5 LTR ERV1 -457 77 2 6 1121 2118 162 40 23 chr2 70336518 70336916 -111411171 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 3 6 1121 355 300 163 20 chr2 70338669 70338822 -111409265 + MLT1A0 LTR MaLR 4 178 -196 6 1121 623 314 23 67 chr2 70338861 70339206 -111408881 - MT2A LTR ERVL -77 456 127 6 1121 259 65 0 21 chr2 70339656 70339703 -111408384 + RMER17C LTR ERVK 230 275 -135 6 1121 2869 173 13 30 chr2 70348788 70349325 -111398762 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 1 6 1121 2084 247 131 34 chr2 70349328 70350408 -111397679 - MYSERV6-int LTR ERVK -70 8889 7813 6 1121 1745 234 117 27 chr2 70350541 70350575 -111397512 - MYSERV6-int LTR ERVK -1233 1093 1058 6 1121 2344 182 49 26 chr2 70351408 70351915 -111396172 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 10 6 1121 2300 142 34 17 chr2 70354235 70354278 -111393809 - MTC LTR MaLR 0 421 384 6 1121 2517 84 12 3 chr2 70354278 70354602 -111393485 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 6 1121 2300 142 34 17 chr2 70354602 70354972 -111393115 - MTC LTR MaLR -38 383 1 6 1121 4930 136 47 24 chr2 70355611 70356259 -111391828 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -347 1979 1321 6 1121 4930 136 47 24 chr2 70356445 70356688 -111391399 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -1006 1320 1067 6 1121 4728 188 28 49 chr2 70356693 70357811 -111390276 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -1487 1355 2 6 1121 264 261 21 54 chr2 70358035 70358128 -111389959 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -1731 1111 1022 6 1121 1679 163 41 24 chr2 70358515 70358611 -111389476 - RLTR20A LTR ERVK 0 541 443 6 1121 1679 163 41 24 chr2 70358669 70358912 -111389175 - RLTR20A LTR ERVK -99 442 196 6 1121 566 175 0 10 chr2 70358972 70359070 -111389017 - RLTR20A LTR ERVK -443 98 2 6 1121 524 180 45 0 chr2 70364173 70364284 -111383803 - MTEa LTR MaLR 0 379 264 6 1121 1963 128 75 6 chr2 70367424 70367755 -111380332 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 41 7 1121 1396 202 44 72 chr2 70368064 70368449 -111379638 - ORR1D1 LTR MaLR 0 421 1 7 1121 3668 185 52 29 chr2 70379455 70380042 -111368045 + RLTR25B LTR ERVK 18 607 -421 7 1121 3668 185 52 29 chr2 70380222 70380460 -111367627 + RLTR25B LTR ERVK 608 861 -167 7 1121 2300 118 129 16 chr2 70380696 70381082 -111367005 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 1 7 1121 1049 171 24 136 chr2 70381086 70381255 -111366832 + RLTR25A LTR ERVK 810 947 -156 7 1121 1049 171 24 136 chr2 70381286 70381447 -111366640 + RLTR25A LTR ERVK 948 1103 0 7 1121 2713 174 17 142 chr2 70383135 70383833 -111364254 + RMER19C LTR ERVK 1 611 0 7 1121 391 209 0 11 chr2 70385477 70385558 -111362529 + MTC LTR MaLR 1 81 -340 7 1122 561 228 106 35 chr2 70385789 70386016 -111362071 + MTC LTR MaLR 68 310 -111 7 1122 2238 166 120 19 chr2 70388803 70389269 -111358818 + RLTR11A2 LTR ERVK 2 514 -13 7 1122 2140 162 13 16 chr2 70389452 70389834 -111358253 + RLTR14 LTR ERV1 2 382 0 7 1122 6070 103 3 18 chr2 70391233 70392101 -111355986 - MERVK26-int LTR ERVK -3675 3244 2390 7 1122 761 200 38 36 chr2 70392101 70392322 -111355765 + RMER4B LTR ERVK 268 532 -53 7 1122 229 232 43 14 chr2 70407916 70407986 -111340101 + RLTR33 LTR ERVK 52 123 -555 7 1122 958 321 68 25 chr2 70412777 70413173 -111334914 - MLT1C LTR MaLR -54 413 1 7 1122 235 250 75 19 chr2 70434754 70434860 -111313227 - RMER17D2 LTR ERVK -456 353 242 8 1122 300 284 76 28 chr2 70440674 70440819 -111307268 - LTR78 LTR ERV1 -14 1290 1139 8 1122 2011 124 97 16 chr2 70441663 70441982 -111306105 + ORR1B1 LTR MaLR 41 385 -9 8 1122 9532 142 39 126 chr2 70441987 70444138 -111303949 + ORR1B1-int LTR MaLR 1 1963 0 8 1122 1812 147 11 88 chr2 70444146 70444520 -111303567 + ORR1B1 LTR MaLR 42 386 -8 8 1122 2396 145 213 38 chr2 70444884 70445471 -111302616 - RMER6C LTR ERVK 0 690 1 8 1122 1441 170 72 7 chr2 70446722 70447012 -111301075 - MTC LTR MaLR 0 421 113 8 1122 314 285 124 107 chr2 70447023 70447232 -111300855 - RMER12B LTR ERVK -2 1402 1200 8 1122 4248 176 80 63 chr2 70447297 70448362 -111299725 - RLTR21 LTR ERVK -483 1089 7 8 1122 792 310 60 30 chr2 70451491 70451860 -111296227 - MT2A LTR ERVL -78 455 76 8 1122 722 180 0 41 chr2 70455933 70456078 -111292009 + ORR1D1 LTR MaLR 3 141 -233 8 1122 856 186 24 52 chr2 70456231 70456441 -111291646 + ORR1D1 LTR MaLR 146 349 -25 8 1122 533 346 55 33 chr2 70460149 70460478 -111287609 + MLT1E3 LTR MaLR 288 623 -1 8 1122 3335 31 10 0 chr2 70461186 70461577 -111286510 + MTA_Mm LTR MaLR 2 396 0 8 1122 271 321 103 21 chr2 70464439 70464633 -111283454 + LTR16C LTR ERVL 280 489 0 8 1122 346 255 122 43 chr2 70464797 70465053 -111283034 - MTEb LTR MaLR -3 376 75 8 1122 1873 131 7 7 chr2 70465358 70465659 -111282428 + ORR1C1 LTR MaLR 1 301 -77 8 1122 961 103 83 13 chr2 70465660 70465817 -111282270 + ORR1C1 LTR MaLR 254 421 0 8 1122 254 262 35 12 chr2 70468181 70468266 -111279821 + MLT1M LTR MaLR 84 170 -502 8 1122 413 294 129 58 chr2 70468591 70468955 -111279132 + MLT1F1 LTR MaLR 14 403 -166 8 1122 3084 33 0 2 chr2 70469065 70469458 -111278629 + MTB LTR MaLR 1 392 -8 8 1122 1355 171 104 64 chr2 70469462 70469855 -111278232 + RMER10A LTR ERVL 34 442 0 8 1122 1930 139 42 81 chr2 70469855 70470125 -111277962 - MTC LTR MaLR -30 391 107 8 1122 1930 139 42 81 chr2 70470315 70470450 -111277637 - MTC LTR MaLR -315 106 2 8 1122 592 216 82 0 chr2 70471390 70471524 -111276563 + MLT1F1 LTR MaLR 403 547 -22 8 1122 1655 201 60 11 chr2 70473073 70473455 -111274632 - MTD LTR MaLR -16 403 3 8 1122 1135 140 40 8 chr2 70474773 70475016 -111273071 - RMER6C LTR ERVK 0 756 472 8 1122 1686 130 87 12 chr2 70475940 70476274 -111271813 - RMER6C LTR ERVK -331 359 1 8 1122 452 288 172 6 chr2 70477162 70477430 -111270657 - MTE2b LTR MaLR -29 350 1 8 1122 1489 214 52 35 chr2 70485010 70485379 -111262708 + MTE2a LTR MaLR 2 376 -3 9 1122 288 336 89 9 chr2 70485838 70486051 -111262036 + LTR33 LTR ERVL 63 292 -223 9 1122 274 308 47 70 chr2 70486123 70486252 -111261835 - LTR33 LTR ERVL -338 177 52 9 1122 293 229 35 35 chr2 70487795 70487881 -111260206 - RMER5 LTR ERV1 -217 317 232 9 1122 1191 176 47 152 chr2 70488793 70489194 -111258893 - ORR1E LTR MaLR 0 359 1 9 1122 1642 122 67 114 chr2 70492276 70492331 -111255756 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 288 9 1122 1642 122 67 114 chr2 70492516 70492802 -111255285 - ORR1A2 LTR MaLR -40 287 2 9 1122 497 333 25 20 chr2 70496699 70496895 -111251192 + MT2A LTR ERVL 243 439 -94 9 1122 303 289 77 61 chr2 70508188 70508440 -111239647 + ORR1E LTR MaLR 107 414 -5 1 1123 388 189 0 139 chr2 70517268 70517397 -111230690 - MT2B LTR ERVL -337 264 154 3 1123 627 263 133 32 chr2 70518531 70518784 -111229303 - MTE2a LTR MaLR 0 379 125 3 1123 1995 182 79 36 chr2 70524316 70524861 -111223226 - RLTR31A_Mm LTR ERVK -2 555 1 4 1123 703 232 64 107 chr2 70531783 70531982 -111216105 - RMER15-int LTR ERVL -18 4981 4796 5 1123 3298 40 2 12 chr2 70531982 70532382 -111215705 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 1123 703 232 64 107 chr2 70532382 70532462 -111215625 - RMER15-int LTR ERVL -204 4795 4714 5 1123 616 167 132 7 chr2 70532641 70532792 -111215295 - RMER15-int LTR ERVL -592 4407 4238 5 1123 1961 141 101 11 chr2 70532934 70533292 -111214795 + ORR1B1 LTR MaLR 5 394 0 6 1123 1184 101 116 0 chr2 70533600 70533789 -111214298 + RMER6A LTR ERVK 1 211 -545 6 1123 638 203 90 40 chr2 70534002 70534224 -111213863 - RMER2 LTR ERV1 -231 336 1 6 1123 2495 145 133 10 chr2 70534224 70534713 -111213374 + RMER6A LTR ERVK 208 756 0 6 1123 3368 146 78 8 chr2 70534741 70535330 -111212757 + RMER6-int LTR ERVK 7 636 -2541 6 1123 1205 127 38 76 chr2 70535330 70535568 -111212519 + RMER6-int LTR ERVK 2522 2750 -427 6 1123 730 186 44 70 chr2 70535584 70535855 -111212232 + RMER6-int LTR ERVK 2880 3143 -34 6 1123 306 60 0 20 chr2 70535839 70535890 -111212197 + MYSERV6-int LTR ERVK 7707 7756 -1203 6 1123 3737 111 172 15 chr2 70535900 70536552 -111211535 + RMER6A LTR ERVK 3 756 0 6 1123 423 302 114 30 chr2 70536649 70536850 -111211237 - RMER15-int LTR ERVL -3155 1844 1627 5 1123 915 275 220 28 chr2 70536901 70537407 -111210680 - RMER15-int LTR ERVL -3475 1524 922 5 1123 1986 123 49 71 chr2 70538239 70538302 -111209785 + RLTR15 LTR ERVK 1 53 -306 6 1123 1986 123 49 71 chr2 70538491 70538794 -111209293 + RLTR15 LTR ERVK 54 359 0 6 1123 842 166 7 0 chr2 70538823 70538968 -111209119 - RLTR12A LTR ERVK -4 564 419 7 1123 498 249 110 83 chr2 70538989 70539243 -111208844 - RMER2 LTR ERV1 -27 540 280 7 1123 2358 175 74 7 chr2 70539197 70539629 -111208458 - RLTR12A LTR ERVK -107 461 1 7 1123 568 271 117 66 chr2 70540013 70540270 -111207817 - RMER15 LTR ERVL -3 572 303 7 1123 2161 184 48 24 chr2 70548626 70549089 -111198998 + RMER20A LTR ERVK 1 474 -42 8 1123 2135 156 54 11 chr2 70549092 70549462 -111198625 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 1 8 1123 628 249 270 22 chr2 70555072 70555360 -111192727 + MTD LTR MaLR 23 399 -20 1 1123 1171 209 46 60 chr2 70557134 70557481 -111190606 + RLTR20A LTR ERVK 198 539 -2 1 1123 610 217 33 0 chr2 70558364 70558484 -111189603 + MTC LTR MaLR 290 413 -8 1 1123 638 250 115 16 chr2 70561530 70561774 -111186313 + MTD LTR MaLR 152 419 0 1 1123 1820 149 35 12 chr2 70575525 70575844 -111172243 + ORR1A3 LTR MaLR 1 326 0 1 1123 249 336 81 15 chr2 70584462 70584598 -111163489 + MLT1L LTR MaLR 9 153 -457 1 1123 226 306 56 45 chr2 70585236 70585325 -111162762 + MLT1J LTR MaLR 39 128 -384 1 1123 342 341 90 86 chr2 70585336 70585615 -111162472 + MLT1J LTR MaLR 188 467 -45 1 1123 332 221 9 104 chr2 70587675 70587693 -111160394 - MT2B2 LTR ERVL -325 259 166 1 1123 308 251 18 108 chr2 70604253 70604377 -111143710 + MTEb LTR MaLR 258 377 -2 2 1123 3133 44 18 0 chr2 70612168 70612558 -111135529 - MTB LTR MaLR 0 400 4 2 1123 3095 59 23 0 chr2 70615624 70616015 -111132072 + MTB LTR MaLR 1 400 0 2 1123 3309 107 171 15 chr2 70618353 70618908 -111129179 + RLTR26 LTR ERVK 1 642 0 2 1123 389 243 94 44 chr2 70622719 70622900 -111125187 - ORR1E LTR MaLR -169 190 1 2 1123 3232 101 153 20 chr2 70625479 70626075 -111122012 + RMER6C LTR ERVK 1 675 -15 2 1123 1648 216 31 94 chr2 70631366 70631392 -111116695 + ORR1D-int LTR MaLR 748 766 -604 2 1123 1648 216 31 94 chr2 70631428 70631846 -111116241 + ORR1D-int LTR MaLR 767 1164 -206 2 1123 2887 139 77 86 chr2 70632684 70633298 -111114789 + RMER19C LTR ERVK 1 608 -3 2 1123 3485 125 128 51 chr2 70634838 70635503 -111112584 - RMER6A LTR ERVK 0 756 41 2 1123 3485 125 128 51 chr2 70635676 70635712 -111112375 - RMER6A LTR ERVK -716 40 1 2 1123 2508 72 52 26 chr2 70641794 70641979 -111106108 + MTB LTR MaLR 1 186 -214 2 1123 2508 72 52 26 chr2 70642117 70642130 -111105957 + MTB LTR MaLR 187 191 -209 2 1123 2508 72 52 26 chr2 70642202 70642385 -111105702 + MTB LTR MaLR 192 392 -8 2 1123 7255 83 13 76 chr2 70642388 70643559 -111104528 + MTB-int LTR MaLR 1 1097 -1 2 1123 3086 70 5 0 chr2 70643560 70643958 -111104129 + MTB LTR MaLR 1 400 0 2 1123 262 257 43 0 chr2 70644137 70644207 -111103880 + MTEb LTR MaLR 107 179 -200 2 1123 2677 90 47 0 chr2 70644245 70644646 -111103441 + BGLII LTR ERVK 2 421 0 2 1123 225 209 134 0 chr2 70644676 70644743 -111103344 + MTEb LTR MaLR 281 356 -14 2 1123 325 339 127 16 chr2 70645815 70645941 -111102146 - MLT1E2 LTR MaLR -187 440 301 2 1124 321 156 50 2 chr2 70648712 70648787 -111099300 - MTEa LTR MaLR -44 335 256 2 1124 2134 145 6 0 chr2 70666751 70667076 -111081011 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 3 1124 1499 245 30 17 chr2 70670540 70670947 -111077140 + MTD LTR MaLR 8 419 0 3 1124 1179 209 43 23 chr2 70675870 70676174 -111071913 - MT2A LTR ERVL -143 390 81 3 1124 385 121 0 0 chr2 70676635 70676693 -111071394 - MT2A LTR ERVL -474 59 2 3 1124 2845 136 147 52 chr2 70681450 70681836 -111066251 + RMER19C LTR ERVK 1 462 -149 3 1124 2845 136 147 52 chr2 70681906 70682077 -111066010 + RMER19C LTR ERVK 463 611 0 3 1124 665 240 71 155 chr2 70683983 70684377 -111063710 - MTE2a LTR MaLR 0 379 19 3 1124 3256 26 42 0 chr2 70684394 70684774 -111063313 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 1124 658 306 105 38 chr2 70685303 70685703 -111062384 + MLT1D LTR MaLR 5 431 -74 3 1124 295 274 0 0 chr2 70691731 70691815 -111056272 + MLT1A1 LTR MaLR 325 408 0 4 1124 448 151 48 75 chr2 70705561 70705747 -111042340 + RMER17C LTR ERVK 91 271 -139 4 1124 804 287 97 0 chr2 70709570 70709901 -111038186 + MLT1B LTR MaLR 28 390 0 4 1124 535 265 174 24 chr2 70711445 70711739 -111036348 + RMER5 LTR ERV1 41 378 -156 4 1124 895 189 26 31 chr2 70712964 70713155 -111034932 + MTC LTR MaLR 232 421 0 4 1124 241 244 127 13 chr2 70715004 70715083 -111033004 - MLT1A0 LTR MaLR -254 111 24 4 1124 249 304 75 103 chr2 70715607 70715820 -111032267 - MLT1A LTR MaLR -160 214 8 4 1124 2188 127 15 3 chr2 70718229 70718562 -111029525 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 0 337 1 4 1124 6902 50 12 6 chr2 70718564 70719409 -111028678 - IAPEz-int LTR ERVK -2 6479 5630 4 1124 24622 50 21 20 chr2 70719395 70722458 -111025629 - IAPEz-int LTR ERVK -3405 3076 8 4 1124 2188 127 15 3 chr2 70722458 70722791 -111025296 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 0 337 1 4 1124 236 306 138 46 chr2 70727130 70727325 -111020762 + MLT1K LTR MaLR 326 538 -57 5 1124 820 339 87 52 chr2 70733347 70733958 -111014129 + MER21B LTR ERV1 98 729 -134 5 1124 2029 112 109 24 chr2 70734851 70735189 -111012898 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 5 1124 473 312 107 29 chr2 70740333 70740362 -111007725 - MLT1A LTR MaLR -30 344 305 5 1124 473 312 107 29 chr2 70740383 70740633 -111007454 - MLT1A LTR MaLR -70 304 44 5 1124 2207 144 73 5 chr2 70740935 70741304 -111006783 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 5 1124 1750 154 77 62 chr2 70742778 70743166 -111004921 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 5 1124 934 273 64 27 chr2 70744382 70744710 -111003377 + MTE2a LTR MaLR 40 379 0 5 1124 819 234 112 27 chr2 70746502 70746761 -111001326 - LTR84b LTR ERVL -438 323 43 5 1124 614 277 119 71 chr2 70747298 70747653 -111000434 - ORR1E LTR MaLR 0 370 1 5 1124 1073 187 176 22 chr2 70748047 70748359 -110999728 + ORR1C2 LTR MaLR 25 384 0 5 1124 959 255 48 61 chr2 70748359 70748749 -110999338 + MTE2a LTR MaLR 25 419 0 5 1124 2535 147 16 0 chr2 70751269 70751657 -110996430 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 5 1124 398 254 59 44 chr2 70752624 70752760 -110995327 - LTR33 LTR ERVL 0 515 378 5 1124 2001 135 11 32 chr2 70755441 70755815 -110992272 + RLTR28 LTR ERVL 135 500 -24 5 1124 684 275 162 11 chr2 70756046 70756403 -110991684 + MER34A LTR ERV1 1 411 -160 5 1124 584 227 182 29 chr2 70757453 70757631 -110990456 + ORR1E LTR MaLR 9 221 -138 5 1124 584 227 182 29 chr2 70757669 70757699 -110990388 + ORR1E LTR MaLR 222 249 -110 5 1124 280 237 0 0 chr2 70758130 70758189 -110989898 + ORR1E LTR MaLR 290 348 -31 5 1124 469 320 58 55 chr2 70758221 70758551 -110989536 - MLT1G3 LTR MaLR -158 437 107 5 1124 2162 116 6 3 chr2 70762238 70762575 -110985512 + ORR1A1 LTR MaLR 1 338 -8 5 1124 277 325 63 88 chr2 70767347 70767678 -110980409 - ORR1D2 LTR MaLR -30 340 18 5 1124 282 276 36 121 chr2 70776996 70777161 -110970926 - MTEb LTR MaLR -10 369 219 6 1124 292 270 96 82 chr2 70777275 70777582 -110970505 + ORR1E LTR MaLR 67 364 -10 6 1124 495 266 70 0 chr2 70778357 70778500 -110969587 + MTEa LTR MaLR 1 153 -226 6 1125 3278 53 2 15 chr2 70782006 70782411 -110965676 - MTB LTR MaLR 0 400 1 6 1125 501 305 79 9 chr2 70784578 70784695 -110963392 + MLT1A0 LTR MaLR 122 256 -109 6 1125 501 305 79 9 chr2 70784901 70785011 -110963076 + MLT1A0 LTR MaLR 257 364 -1 6 1125 1422 228 16 6 chr2 70785635 70785949 -110962138 - MTD LTR MaLR -102 317 1 6 1125 2170 136 136 29 chr2 70786113 70786232 -110961855 + RLTR16 LTR ERVK 1 151 -354 6 1125 2170 136 136 29 chr2 70786281 70786617 -110961470 + RLTR16 LTR ERVK 152 505 0 6 1125 2030 142 16 78 chr2 70787038 70787421 -110960666 - RLTR15 LTR ERVK 0 359 1 6 1125 1126 122 27 62 chr2 70789807 70790070 -110958017 - ORR1A4 LTR MaLR -8 359 104 6 1125 1114 268 102 22 chr2 70790446 70790882 -110957205 - MLT2B3 LTR ERVL -44 518 1 6 1125 1124 228 174 3 chr2 70792424 70792780 -110955307 - MTD LTR MaLR 0 419 3 6 1125 2913 144 122 8 chr2 70801922 70802438 -110945649 + RMER15 LTR ERVL 1 575 0 6 1125 1367 210 34 57 chr2 70802603 70802952 -110945135 - MTE2a LTR MaLR -38 341 1 6 1125 991 203 35 18 chr2 70808498 70808724 -110939363 - MTE2a LTR MaLR 0 379 150 6 1125 1339 196 167 53 chr2 70808729 70809161 -110938926 + RLTR11A2 LTR ERVK 47 527 0 6 1125 2224 127 62 43 chr2 70820550 70820921 -110927166 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 7 1125 414 312 91 25 chr2 70824622 70824819 -110923268 + LTR73 LTR ERV1 3 212 -360 7 1125 2044 164 92 25 chr2 70833127 70833520 -110914567 - MTC LTR MaLR 0 421 3 7 1125 2025 134 81 6 chr2 70847080 70847424 -110900663 + ORR1B1 LTR MaLR 17 386 -8 7 1125 1642 160 116 20 chr2 70861207 70861552 -110886535 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 8 1125 588 240 126 99 chr2 70864858 70865270 -110882817 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 8 8 1125 382 239 88 35 chr2 70866228 70866341 -110881746 - MTE-int LTR MaLR -1301 279 161 8 1125 1134 252 52 24 chr2 70867379 70867709 -110880378 + MTEb LTR MaLR 41 379 0 8 1125 913 228 21 0 chr2 70867709 70867898 -110880189 + MTEb-int LTR MaLR 1 193 -1387 8 1125 398 288 72 27 chr2 70875625 70875846 -110872241 - MLT1L LTR MaLR -209 401 171 8 1125 1794 160 118 13 chr2 70881223 70881597 -110866490 + MTD LTR MaLR 7 419 0 8 1125 321 178 88 47 chr2 70887387 70887487 -110860600 + MLT1A1 LTR MaLR 271 395 -13 8 1125 2144 183 98 43 chr2 70888306 70888838 -110859249 + RLTR31_Mm LTR ERVK 1 561 0 8 1125 391 138 37 12 chr2 70890628 70890709 -110857378 + MTC LTR MaLR 2 84 -337 8 1125 470 103 0 33 chr2 70890909 70890999 -110857088 + MTC LTR MaLR 105 191 -230 8 1125 231 139 0 65 chr2 70891001 70891047 -110857040 + MTC LTR MaLR 332 374 0 8 1125 1646 149 71 3 chr2 70897141 70897451 -110850636 - MTC LTR MaLR -8 413 83 9 1125 439 186 41 0 chr2 70897682 70897779 -110850308 - MTC LTR MaLR -320 101 1 9 1125 4479 16 2 0 chr2 70902868 70903360 -110844727 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 9 1125 321 0 0 0 chr2 70903360 70903398 -110844689 - MERVL-int LTR ERVL 0 5485 5448 9 1125 360 167 46 35 chr2 70903398 70903485 -110844602 - ORR1A3-int LTR MaLR -1323 640 553 9 1125 48487 14 6 0 chr2 70903485 70908811 -110839276 - MERVL-int LTR ERVL -125 5360 1 9 1125 4479 16 2 0 chr2 70908811 70909303 -110838784 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 9 1126 968 143 78 37 chr2 70934418 70934671 -110813416 - ORR1A4 LTR MaLR -103 271 1 9 1126 1243 183 12 139 chr2 70937221 70937558 -110810529 + MTD LTR MaLR 1 294 -125 9 1126 264 291 125 7 chr2 70937627 70937779 -110810308 - MLT1K LTR MaLR -27 568 399 9 1126 1490 190 88 3 chr2 70939725 70940068 -110808019 - RLTR14 LTR ERV1 -2 380 9 9 1126 234 255 94 21 chr2 70941996 70942092 -110805995 - MLT1J1 LTR MaLR -278 166 64 9 1126 4719 139 121 6 chr2 70944344 70945153 -110802934 - RMER19B LTR ERVK 0 902 1 9 1126 348 270 104 22 chr2 70952169 70952305 -110795782 + MER74B LTR ERVL 1 166 -456 1 1126 291 330 112 77 chr2 70952953 70953239 -110794848 - LTR33 LTR ERVL 0 520 225 1 1126 352 207 102 59 chr2 70953730 70953848 -110794239 + LTR33 LTR ERVL 45 167 -348 1 1126 284 256 128 43 chr2 70953999 70954093 -110793994 + LTR33 LTR ERVL 414 515 0 1 1126 392 253 38 10 chr2 70961502 70961633 -110786454 + MLT1D LTR MaLR 416 654 0 1 1126 243 371 46 13 chr2 70961648 70961801 -110786286 + LTR87 LTR ERVL? 381 538 -86 1 1126 1416 138 238 7 chr2 70970925 70971223 -110776864 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 1 1126 937 271 19 0 chr2 70972926 70973136 -110774951 + MTD LTR MaLR 206 419 0 1 1126 1010 255 85 13 chr2 70974995 70975156 -110772931 - ORR1D1 LTR MaLR -12 362 185 1 1126 1010 255 85 13 chr2 70975238 70975382 -110772705 - ORR1D1 LTR MaLR -190 184 35 1 1126 1980 244 52 30 chr2 70978397 70978959 -110769128 - RLTR20A2 LTR ERVK 0 578 5 1 1126 314 299 0 94 chr2 70982100 70982196 -110765891 + MTEa LTR MaLR 11 97 -282 1 1126 724 287 79 106 chr2 70982196 70982607 -110765480 + MLT2B3 LTR ERVL 11 509 -45 1 1126 743 268 68 51 chr2 70989267 70989746 -110758341 + MTE2a LTR MaLR 1 367 -12 1 1126 367 339 129 65 chr2 70989760 70989802 -110758285 + MLT1F1 LTR MaLR 173 202 -377 1 1126 367 339 129 65 chr2 70989923 70990221 -110757866 + MLT1F1 LTR MaLR 203 535 -44 1 1126 232 298 107 0 chr2 70990225 70990309 -110757778 + MLT1F1-int LTR MaLR 29 121 -1368 1 1126 270 320 231 30 chr2 70990832 70991096 -110756991 + MLT1F1-int LTR MaLR 547 863 -546 1 1126 395 338 12 53 chr2 70991470 70991639 -110756448 + MLT1F1-int LTR MaLR 1233 1394 -15 1 1126 398 380 69 46 chr2 70991653 70991792 -110756295 + MLT1F1 LTR MaLR 1 141 -428 1 1126 2585 124 68 8 chr2 70991792 70992189 -110755898 + MTC LTR MaLR 1 421 0 1 1126 398 380 69 46 chr2 70992189 70992311 -110755776 + MLT1F1 LTR MaLR 142 268 -301 1 1126 2595 77 3 3 chr2 70992478 70992805 -110755282 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 1 1126 333 48 0 0 chr2 70996457 70996499 -110751588 + RLTR10B LTR ERVK 1 42 -250 1 1126 2069 84 83 46 chr2 70996584 70996932 -110751155 + RLTR10B2 LTR ERVK 5 365 0 1 1126 1039 272 124 33 chr2 70998019 70998136 -110749951 - MT2A LTR ERVL -2 531 404 1 1126 1039 272 124 33 chr2 70998167 70998312 -110749775 - MT2A LTR ERVL -130 403 241 1 1126 1039 272 124 33 chr2 70998339 70998558 -110749529 - MT2A LTR ERVL -293 240 6 1 1126 1087 236 188 11 chr2 70999648 71000000 -110748087 - MTD LTR MaLR 0 419 6 1 1126 440 296 55 12 chr2 71002632 71002796 -110745291 - MLT1A0 LTR MaLR -48 317 147 5 1126 1013 231 87 21 chr2 71005242 71005529 -110742558 + MTD LTR MaLR 48 353 -66 1 1126 984 199 181 31 chr2 71010741 71010797 -110737290 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 316 3 1126 3067 50 44 0 chr2 71010797 71011180 -110736907 - MTB LTR MaLR 0 400 1 3 1126 984 199 181 31 chr2 71011180 71011444 -110736643 - ORR1D1 LTR MaLR -59 315 6 3 1126 1004 201 194 0 chr2 71012705 71012984 -110735103 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 196 3 1126 241 215 15 15 chr2 71016403 71016469 -110731618 - RMER6D LTR ERVK -100 620 555 4 1126 1709 197 89 12 chr2 71016632 71017124 -110730963 - RMER4B LTR ERVK -6 579 16 4 1126 2012 145 40 34 chr2 71017278 71017644 -110730443 + RLTR19 LTR ERVK 1 368 -131 4 1126 349 277 314 34 chr2 71018846 71019120 -110728967 - MER67B LTR ERV1 -196 465 116 5 1126 290 197 91 0 chr2 71023585 71023651 -110724436 + MLT1A0 LTR MaLR 3 74 -291 6 1126 1649 179 43 35 chr2 71025471 71025637 -110722450 + ORR1D1 LTR MaLR 2 166 -208 6 1126 1649 179 43 35 chr2 71025698 71025901 -110722186 + ORR1D1 LTR MaLR 167 374 0 6 1126 1093 191 148 53 chr2 71026943 71027161 -110720926 + MTD LTR MaLR 6 226 -193 7 1126 1686 163 68 101 chr2 71027161 71027617 -110720470 + BGLII_B LTR ERVK 1 441 0 7 1126 1093 191 148 53 chr2 71027617 71027702 -110720385 + MTD LTR MaLR 227 338 -81 7 1126 542 236 426 0 chr2 71032304 71032548 -110715539 + ORR1E LTR MaLR 3 350 -9 7 1126 309 277 36 12 chr2 71033653 71033737 -110714350 + MLT1D LTR MaLR 254 339 -166 8 1126 433 260 55 33 chr2 71034007 71034190 -110713897 + MLT1D LTR MaLR 315 501 -4 8 1126 1551 173 11 102 chr2 71037105 71037556 -110710531 + RMER17C LTR ERVK 1 410 0 9 1126 298 235 49 57 chr2 71038561 71038683 -110709404 + LTR79 LTR ERVL 46 166 -361 9 1126 2407 206 7 144 chr2 71038704 71039412 -110708675 + RMER19C LTR ERVK 1 611 0 9 1126 1922 210 28 0 chr2 71040404 71040800 -110707287 - MTD LTR MaLR 0 419 13 9 1127 1169 198 194 6 chr2 71042963 71043303 -110704784 - MTD LTR MaLR -15 404 1 1 1127 3118 59 20 2 chr2 71053796 71054189 -110693898 + MTB LTR MaLR 1 400 0 1 1127 7168 79 25 74 chr2 71054189 71055343 -110692744 + MTB-int LTR MaLR 1 1098 0 1 1127 3050 76 8 2 chr2 71055343 71055741 -110692346 + MTB LTR MaLR 1 400 0 1 1127 298 240 9 103 chr2 71058469 71058576 -110689511 - MT2B2 LTR ERVL -336 248 152 1 1127 1993 149 55 48 chr2 71060831 71061246 -110686841 - MTC LTR MaLR -3 418 1 1 1127 455 202 73 73 chr2 71075363 71075486 -110672601 - MT2B LTR ERVL -344 257 135 1 1127 259 259 99 0 chr2 71092751 71092832 -110655255 - MLT1C LTR MaLR 0 505 417 1 1127 386 291 6 75 chr2 71092853 71093013 -110655074 - MLT1C LTR MaLR -144 323 175 1 1127 1870 53 390 17 chr2 71097152 71097498 -110650589 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 2 1127 915 256 184 17 chr2 71106704 71107057 -110641030 - MTD LTR MaLR 0 419 8 2 1127 822 257 120 30 chr2 71125832 71126165 -110621922 + MLT1A0 LTR MaLR 1 363 -2 2 1127 432 206 49 44 chr2 71130521 71130704 -110617383 + RMER17C LTR ERVK 92 275 -135 2 1127 1955 181 59 3 chr2 71141984 71142355 -110605732 + ORR1B1 LTR MaLR 3 394 0 3 1127 1302 160 134 14 chr2 71156066 71156357 -110591730 + ORR1D1 LTR MaLR 48 373 -1 3 1128 2635 134 48 8 chr2 71172172 71172646 -110575441 + RLTR17 LTR ERVK 98 590 -102 3 1128 943 294 24 68 chr2 71185909 71186377 -110561710 + RLTR17 LTR ERVK 105 551 -141 4 1128 1339 215 85 20 chr2 71186809 71187151 -110560936 + ORR1D2 LTR MaLR 7 370 0 4 1128 292 151 29 157 chr2 71191707 71191809 -110556278 + MT2B LTR ERVL 153 241 -360 4 1128 2015 157 30 28 chr2 71194981 71195381 -110552706 - MTB_Mm LTR MaLR -6 401 1 4 1128 325 277 8 51 chr2 71199655 71199773 -110548314 + MT2B LTR ERVL 164 276 -325 4 1128 840 277 50 15 chr2 71213009 71213269 -110534818 - MTD LTR MaLR -144 275 7 5 1128 1288 156 87 50 chr2 71214649 71214947 -110533140 - ORR1A4 LTR MaLR -20 309 1 5 1128 538 186 153 33 chr2 71215552 71215702 -110532385 - ORR1B1 LTR MaLR -186 208 41 5 1128 1261 103 74 0 chr2 71216199 71216402 -110531685 - MTC LTR MaLR -8 413 196 5 1128 1227 159 14 10 chr2 71216596 71216805 -110531282 - MTC LTR MaLR -210 211 2 5 1128 371 304 55 69 chr2 71218709 71218739 -110529348 + MT2A LTR ERVL 279 308 -225 5 1128 371 304 55 69 chr2 71219127 71219241 -110528846 + MT2A LTR ERVL 309 421 -112 5 1128 2594 166 14 0 chr2 71219281 71219696 -110528391 - MTC LTR MaLR 0 421 1 5 1128 1856 130 138 0 chr2 71219973 71220350 -110527737 - RMER19B LTR ERVK -38 864 436 5 1128 791 213 52 73 chr2 71221910 71222199 -110525888 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 40 5 1128 1013 275 137 27 chr2 71225501 71225706 -110522381 + MT2A LTR ERVL 32 238 -295 5 1128 2488 120 32 57 chr2 71225706 71226147 -110521940 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 1 5 1128 1013 275 137 27 chr2 71226147 71226386 -110521701 + MT2A LTR ERVL 239 525 -8 5 1128 358 234 130 9 chr2 71229634 71229742 -110518345 + MTD LTR MaLR 298 418 -1 5 1128 1632 154 35 14 chr2 71230841 71231125 -110516962 + ORR1B1 LTR MaLR 1 290 -104 5 1128 925 139 75 8 chr2 71231174 71231377 -110516710 + ORR1B1 LTR MaLR 101 394 0 5 1128 1842 188 32 22 chr2 71234115 71234485 -110513602 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 5 1128 4649 194 131 16 chr2 71234486 71234510 -110513577 - ORR1D1-int LTR MaLR -1 1369 1340 5 1128 4649 194 131 16 chr2 71234535 71235738 -110512349 - ORR1D1-int LTR MaLR -31 1339 1 5 1128 910 191 127 5 chr2 71235795 71235984 -110512103 - RLTR42 LTR ERVK -27 212 1 5 1128 13807 135 78 43 chr2 71235984 71236430 -110511657 - RLTR42-int LTR ERVK 0 5522 5028 5 1128 13807 135 78 43 chr2 71236602 71236792 -110511295 - RLTR42-int LTR ERVK -495 5027 4861 5 1128 13807 135 78 43 chr2 71236981 71237085 -110511002 - RLTR42-int LTR ERVK -662 4860 4770 5 1128 2149 161 60 15 chr2 71237085 71237488 -110510599 + MTC LTR MaLR 1 421 0 5 1128 13807 135 78 43 chr2 71237488 71238209 -110509878 - RLTR42-int LTR ERVK -753 4769 4017 5 1128 13807 135 78 43 chr2 71238356 71238602 -110509485 - RLTR42-int LTR ERVK -1506 4016 3776 5 1128 13807 135 78 43 chr2 71238794 71239953 -110508134 - RLTR42-int LTR ERVK -1747 3775 2554 5 1128 4968 193 119 117 chr2 71239947 71240256 -110507831 - RLTR42-int LTR ERVK -3674 1848 1520 5 1128 4968 193 119 117 chr2 71240392 71240796 -110507291 - RLTR42-int LTR ERVK -4003 1519 1203 5 1128 4968 193 119 117 chr2 71241568 71242698 -110505389 - RLTR42-int LTR ERVK -4320 1202 1 5 1128 1138 151 122 5 chr2 71242699 71242912 -110505175 - RLTR42 LTR ERVK -1 238 1 5 1128 1384 201 100 22 chr2 71242912 71243220 -110504867 - ORR1D1 LTR MaLR -41 333 1 5 1128 3400 43 0 0 chr2 71254289 71254685 -110493402 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 1128 231 203 15 45 chr2 71268849 71268916 -110479171 - MER67C LTR ERV1 -54 657 593 6 1128 694 148 0 90 chr2 71273587 71273721 -110474366 - RLTR33 LTR ERVK -155 523 402 6 1128 1651 130 148 103 chr2 71285885 71286070 -110462017 + ORR1B1 LTR MaLR 1 217 -177 7 1128 1651 130 148 103 chr2 71286217 71286408 -110461679 + ORR1B1 LTR MaLR 218 394 0 7 1128 1822 180 85 5 chr2 71287377 71287752 -110460335 - MTD LTR MaLR -2 417 13 7 1128 861 218 140 29 chr2 71287780 71288059 -110460028 + ORR1D2 LTR MaLR 1 310 -60 7 1128 415 186 55 110 chr2 71288134 71288279 -110459808 - MT2B LTR ERVL -346 255 119 7 1128 274 191 0 0 chr2 71288250 71288313 -110459774 + ORR1D2 LTR MaLR 308 370 0 7 1128 1809 181 8 25 chr2 71294550 71294912 -110453175 - MTC LTR MaLR -65 356 1 7 1128 2591 128 0 0 chr2 71295210 71295592 -110452495 - RLTR14 LTR ERV1 0 382 1 7 1128 4425 147 77 41 chr2 71299483 71300313 -110447774 - RMER13A LTR ERVK 0 860 1 7 1128 305 298 114 0 chr2 71302262 71302376 -110445711 - MLT1F LTR MaLR -421 127 1 7 17 399 282 16 0 chr2 71303094 71303218 -110444869 - RMER15 LTR ERVL -18 557 432 7 1129 775 163 24 153 chr2 71308665 71309024 -110439063 - ORR1D1 LTR MaLR -96 271 1 7 1129 1651 221 72 8 chr2 71309915 71310302 -110437785 - MTD LTR MaLR -3 416 5 7 1129 2453 162 43 17 chr2 71319835 71320356 -110427731 + RMER19C LTR ERVK 1 599 -12 8 1129 359 152 0 15 chr2 71329461 71329528 -110418559 - MTC LTR MaLR 0 421 356 8 1129 247 196 72 103 chr2 71343962 71344059 -110404028 - MT2B LTR ERVL -360 241 148 8 1129 996 174 25 87 chr2 71388918 71389456 -110358631 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 9 1129 344 214 14 0 chr2 71394630 71394700 -110353387 + MTC LTR MaLR 50 120 -301 9 1129 1889 179 27 114 chr2 71397429 71397903 -110350184 + RMER19C LTR ERVK 179 611 0 9 1129 3145 115 16 18 chr2 71398934 71399396 -110348691 + RLTR20A1 LTR ERVK 1 461 -90 9 1129 3145 115 16 18 chr2 71399446 71399471 -110348616 + RLTR20A1 LTR ERVK 462 487 -64 9 1129 226 193 68 34 chr2 71399795 71399806 -110348281 - MT2B LTR ERVL -389 212 152 9 1129 251 224 56 56 chr2 71399985 71400075 -110348012 + MLT1C LTR MaLR 1 90 -377 9 1129 1587 136 8 12 chr2 71404007 71404260 -110343827 + MTC LTR MaLR 170 421 0 9 1129 1885 189 41 19 chr2 71406368 71406734 -110341353 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 9 1129 4398 132 147 25 chr2 71407068 71407136 -110340951 - RMER13B LTR ERVK 0 908 792 9 1129 4398 132 147 25 chr2 71407173 71407913 -110340174 - RMER13B LTR ERVK -117 791 2 9 1129 2026 163 79 11 chr2 71410766 71410983 -110337104 + RLTR14 LTR ERV1 6 242 -140 9 1129 2026 163 79 11 chr2 71411067 71411202 -110336885 + RLTR14 LTR ERV1 243 381 -1 9 1129 2451 141 29 0 chr2 71413582 71413965 -110334122 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 9 1129 404 299 33 25 chr2 71415820 71415940 -110332147 - MLT1C LTR MaLR 0 467 347 9 1129 362 252 117 41 chr2 71420917 71421062 -110327025 - MLT1A1 LTR MaLR -4 404 249 1 1129 320 346 41 86 chr2 71423400 71423621 -110324466 + MLT1A1 LTR MaLR 155 408 0 1 1129 1234 228 108 10 chr2 71424367 71424664 -110323423 + ORR1D2 LTR MaLR 45 370 0 1 1130 304 330 39 10 chr2 71436575 71436679 -110311408 - ORR1E LTR MaLR 0 562 456 1 1130 236 246 88 34 chr2 71437988 71438091 -110309996 - ORR1E LTR MaLR -12 396 279 1 1130 312 305 53 72 chr2 71438285 71438437 -110309650 - ORR1E LTR MaLR -187 172 24 1 1130 302 273 125 18 chr2 71441408 71441503 -110306584 - MTEa LTR MaLR -2 377 271 1 1130 307 261 14 0 chr2 71441922 71441991 -110306096 - MTEa LTR MaLR -97 282 213 1 1130 739 216 88 108 chr2 71442024 71442284 -110305803 - MTEa LTR MaLR -124 255 1 1 1130 1851 151 27 48 chr2 71443775 71444109 -110303978 + ORR1A4 LTR MaLR 1 327 -2 1 1130 332 302 73 99 chr2 71444330 71444375 -110303712 + MT2B LTR ERVL 175 356 -245 1 1130 362 324 83 0 chr2 71444348 71444456 -110303631 + MLT1H1 LTR MaLR 49 165 -390 1 1130 229 291 37 25 chr2 71450041 71450122 -110297965 + LTR33A_ LTR ERVL 298 379 -152 1 1130 2167 143 43 24 chr2 71453750 71454123 -110293964 + RMER20B LTR ERVK 1 380 -247 1 1130 573 179 27 36 chr2 71454127 71454237 -110293850 + RMER20B LTR ERVK 499 607 -20 1 1130 581 292 103 29 chr2 71458326 71458598 -110289489 + MLT1E3 LTR MaLR 148 439 -185 1 1130 294 266 45 75 chr2 71459290 71459465 -110288622 - MTEb LTR MaLR 0 379 192 1 1130 268 325 97 114 chr2 71459510 71459699 -110288388 - MTEb LTR MaLR -168 191 3 1 1130 1049 244 51 160 chr2 71461507 71461669 -110286418 - MTD LTR MaLR -39 380 213 1 1130 1049 244 51 160 chr2 71461772 71461805 -110286282 - MTD LTR MaLR -207 212 212 1 1130 1049 244 51 160 chr2 71461981 71462140 -110285947 - MTD LTR MaLR -207 212 64 1 1130 380 326 113 54 chr2 71470269 71470473 -110277614 + MLT1K LTR MaLR 30 245 -350 1 1130 411 257 120 63 chr2 71475360 71475512 -110272575 + MLT1B LTR MaLR 4 159 -231 1 1130 411 257 120 63 chr2 71475700 71475738 -110272349 + MLT1B LTR MaLR 160 204 -186 1 1130 1905 105 114 10 chr2 71477850 71478148 -110269939 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 1 1130 315 314 8 75 chr2 71479421 71479555 -110268532 - LTR33B LTR ERVL -321 182 58 1 1130 2720 94 30 35 chr2 71480320 71480726 -110267361 - RLTR23 LTR ERV1 -26 404 1 1 1130 544 209 306 28 chr2 71483091 71483307 -110264780 - RMER15 LTR ERVL 0 575 300 1 1130 634 115 85 19 chr2 71491792 71491898 -110256189 + RMER16-int LTR ERVK 141 253 -5153 1 1130 403 150 12 0 chr2 71492567 71492647 -110255440 + RMER16-int LTR ERVK 277 357 -1969 1 1130 1878 148 58 45 chr2 71496627 71496942 -110251145 + ORR1C1 LTR MaLR 1 297 -81 1 1130 1883 144 46 17 chr2 71496942 71497288 -110250799 + RLTR15 LTR ERVK 1 356 -3 1 1130 1878 144 55 43 chr2 71497288 71497338 -110250749 + ORR1C1 LTR MaLR 298 351 -27 1 1130 1362 153 85 15 chr2 71498084 71498338 -110249749 - ORR1C1 LTR MaLR 0 379 136 1 1130 435 309 57 67 chr2 71505379 71505573 -110242514 - MLT1J LTR MaLR -237 275 84 1 1130 313 326 125 51 chr2 71506540 71506876 -110241211 + MLT1J LTR MaLR 136 496 -16 1 1130 4555 144 73 6 chr2 71511735 71512512 -110235575 + RMER13A LTR ERVK 1 829 -31 2 1130 283 256 0 71 chr2 71512572 71512599 -110235488 - MTEb LTR MaLR -24 355 334 3 1130 3274 55 0 8 chr2 71512599 71512998 -110235089 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 1130 283 256 0 71 chr2 71512998 71513054 -110235033 - MTEb LTR MaLR -46 333 278 3 1130 1624 181 66 63 chr2 71513904 71514269 -110233818 + ORR1D1 LTR MaLR 1 366 -8 3 1130 1097 231 128 44 chr2 71517654 71517820 -110230267 - MT2A LTR ERVL -5 528 332 4 1130 4888 112 32 11 chr2 71517820 71518560 -110229527 - RMER6A LTR ERVK 0 756 1 4 1130 1097 231 128 44 chr2 71518560 71518714 -110229373 - MT2A LTR ERVL -202 331 173 4 1130 1097 231 128 44 chr2 71518735 71518757 -110229330 - MT2A LTR ERVL -361 172 156 4 1130 1408 144 54 146 chr2 71518757 71519085 -110229002 - RMER6B LTR ERVK -16 445 128 4 1130 383 98 0 0 chr2 71519086 71519137 -110228950 - ORR1A4 LTR MaLR -12 317 267 4 1130 1038 62 0 0 chr2 71519148 71519276 -110228811 - RMER6B LTR ERVK -333 128 1 4 1130 854 250 5 0 chr2 71519276 71519454 -110228633 - MT2A LTR ERVL -354 179 1 4 1130 2424 108 5 22 chr2 71520063 71520431 -110227656 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 33 5 1130 2400 93 3 12 chr2 71522459 71522787 -110225300 + ORR1A2 LTR MaLR 1 325 -2 5 1130 582 261 171 40 chr2 71523263 71523698 -110224389 - RMER20B LTR ERVK 0 516 1 5 1130 1286 212 129 18 chr2 71524484 71524810 -110223277 - ORR1D1 LTR MaLR -7 367 6 6 1130 1968 158 42 48 chr2 71525306 71525685 -110222402 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 2 6 1130 4127 78 81 0 chr2 71525691 71526245 -110221842 + MT2B LTR ERVL 1 599 -2 6 1130 603 249 54 69 chr2 71530194 71530397 -110217690 + MTEa LTR MaLR 17 216 -163 7 1130 1250 190 190 0 chr2 71530975 71531286 -110216801 + ORR1D1 LTR MaLR 5 374 0 7 1130 290 274 167 0 chr2 71531906 71532008 -110216079 + MLT1B LTR MaLR 1 119 -271 7 1130 465 303 88 42 chr2 71534617 71534806 -110213281 - MLT1C LTR MaLR -85 382 187 8 1130 465 303 88 42 chr2 71535010 71535082 -110213005 - MLT1C LTR MaLR -281 186 109 8 1130 279 309 40 30 chr2 71537936 71538036 -110210051 - RMER15 LTR ERVL -2 573 473 9 1130 570 299 105 77 chr2 71538657 71539020 -110209067 + MTEb LTR MaLR 5 377 -2 9 1130 657 203 123 7 chr2 71539337 71539491 -110208596 - MTEa LTR MaLR -3 376 205 1 1130 436 303 78 78 chr2 71539860 71539876 -110208211 - MTEa LTR MaLR -200 179 163 1 1130 436 303 78 78 chr2 71539913 71540075 -110208012 - MTEa LTR MaLR -217 162 1 1 1130 621 308 103 65 chr2 71543766 71544106 -110203981 - ORR1E LTR MaLR -4 355 3 1 1130 1812 305 78 18 chr2 71544106 71544694 -110203393 - MTE-int LTR MaLR -51 1529 906 1 1130 1950 203 40 27 chr2 71544714 71545106 -110202981 - MTD LTR MaLR -14 405 18 1 1130 1950 203 40 25 chr2 71545132 71545151 -110202936 - MTD LTR MaLR -402 17 1 1 1130 769 305 140 27 chr2 71545151 71545195 -110202892 - MTE-int LTR MaLR -707 873 827 1 1130 769 305 140 27 chr2 71545341 71545700 -110202387 - MTE-int LTR MaLR -754 826 424 1 1130 229 312 111 61 chr2 71546536 71546635 -110201452 + RMER15 LTR ERVL 360 463 -112 1 1130 815 350 56 23 chr2 71546957 71547299 -110200788 - MTE-int LTR MaLR -1166 414 62 1 1130 420 292 54 31 chr2 71547343 71547518 -110200569 - ORR1E LTR MaLR -14 405 213 1 1130 702 291 74 30 chr2 71547530 71547799 -110200288 - ORR1E LTR MaLR -77 282 2 1 1130 3397 33 13 2 chr2 71550404 71550800 -110197287 + MTB LTR MaLR 1 400 0 1 1130 1038 271 95 54 chr2 71552512 71552846 -110195241 + RLTR23 LTR ERV1 5 362 -68 1 1130 1038 271 95 54 chr2 71553036 71553110 -110194977 + RLTR23 LTR ERV1 363 430 0 1 1130 430 288 93 139 chr2 71553383 71553685 -110194402 - ORR1E LTR MaLR -11 348 61 1 1130 1377 105 291 48 chr2 71556465 71556754 -110191333 - RLTR15 LTR ERVK 0 359 1 1 1130 1818 133 91 12 chr2 71556925 71557245 -110190842 - ORR1B2 LTR MaLR -20 347 3 1 1130 2251 78 3 111 chr2 71558721 71559080 -110189007 + ORR1A2 LTR MaLR 1 320 -7 1 1130 1284 189 25 23 chr2 71559459 71559717 -110188370 - MTC LTR MaLR -8 413 104 1 1130 442 297 147 76 chr2 71559899 71559911 -110188176 - MTC LTR MaLR -276 103 92 1 1130 463 219 0 0 chr2 71560054 71560136 -110187951 - MTC LTR MaLR -339 82 1 1 1130 375 278 142 15 chr2 71562809 71563006 -110185081 - RMER15 LTR ERVL -1 574 353 1 1130 1577 199 66 88 chr2 71563657 71564075 -110184012 + RMER10A LTR ERVL 1 421 -21 1 1130 1577 199 66 88 chr2 71564267 71564300 -110183787 + RMER10A LTR ERVL 422 442 0 1 1130 1955 147 9 170 chr2 71564410 71564756 -110183331 + RLTR28 LTR ERVL 1 290 -234 1 1130 1955 147 9 170 chr2 71565007 71565119 -110182968 + RLTR28 LTR ERVL 291 385 -139 1 1131 271 246 8 39 chr2 71566149 71566276 -110181811 - ORR1B1-int LTR MaLR -755 754 632 1 1131 440 236 0 11 chr2 71566983 71567077 -110181010 + LTR85b LTR Gypsy? 687 779 -5 1 1131 886 246 242 20 chr2 71568006 71568362 -110179725 - RMER5 LTR ERV1 -67 467 33 1 1131 2553 60 25 6 chr2 71572298 71572619 -110175468 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 1 1131 344 221 67 87 chr2 71578838 71578942 -110169145 + MT2B LTR ERVL 156 257 -344 1 1131 780 156 67 81 chr2 71583855 71584065 -110164022 + RMER10A LTR ERVL 234 440 -2 2 1131 730 177 93 40 chr2 71584672 71584919 -110163168 - RMER17C LTR ERVK -150 260 1 2 1131 270 349 111 26 chr2 71590754 71590907 -110157180 + RMER15 LTR ERVL 405 570 -5 2 1131 1548 178 389 57 chr2 71591367 71591825 -110156262 + RMER19C LTR ERVK 2 611 0 2 1131 1212 103 16 11 chr2 71599100 71599287 -110148800 - RLTR20D LTR ERVK -376 192 5 2 1131 569 84 0 0 chr2 71599291 71599374 -110148713 - ORR1A3 LTR MaLR -243 83 1 2 1131 275 274 206 21 chr2 71606317 71606414 -110141673 + MLT1A0 LTR MaLR 156 270 -95 2 1131 1053 324 26 56 chr2 71614675 71615103 -110132984 - MLT1H1 LTR MaLR -2 553 139 2 1131 378 350 64 64 chr2 71619890 71620186 -110127901 + ORR1E LTR MaLR 64 359 0 2 1131 400 233 22 11 chr2 71621827 71621918 -110126169 - MTD LTR MaLR -208 211 120 2 1131 779 262 185 9 chr2 71623561 71623829 -110124258 + MTD LTR MaLR 75 404 -15 2 1131 4317 112 119 8 chr2 71630239 71630902 -110117185 - RMER19A LTR ERVK 0 737 1 2 1131 1554 197 176 6 chr2 71635408 71635765 -110112322 + MTD LTR MaLR 1 418 -1 3 1131 234 274 59 82 chr2 71645301 71645436 -110102651 + LTR81C LTR ERV1? 1007 1138 -15 3 1131 3390 142 68 32 chr2 71647840 71648430 -110099657 - RMER19C LTR ERVK 0 611 1 3 1131 3283 53 5 2 chr2 71653881 71654280 -110093807 - MTB LTR MaLR 0 400 1 3 1131 1246 203 69 16 chr2 71683096 71683338 -110064749 + MTE2b LTR MaLR 57 317 -62 3 1131 2372 95 3 35 chr2 71683338 71683676 -110064411 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 3 1131 1246 203 69 16 chr2 71683676 71683738 -110064349 + MTE2b LTR MaLR 318 377 -2 3 1131 1320 85 0 0 chr2 71690230 71690419 -110057668 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 138 3 1131 283 286 50 66 chr2 71690547 71690745 -110057342 + RLTR46 LTR ERVK 126 320 0 3 1131 875 134 0 0 chr2 71690746 71690888 -110057199 - ORR1A3 LTR MaLR -184 142 1 4 1132 245 327 45 9 chr2 71700966 71701077 -110047010 + ORR1E LTR MaLR 1 115 -244 4 1132 225 122 49 0 chr2 71701223 71701264 -110046823 + MTEa LTR MaLR 335 377 -2 4 1132 379 298 133 20 chr2 71701812 71702007 -110046080 - MER34A1 LTR ERV1 -197 390 174 4 1132 561 227 139 25 chr2 71702212 71702370 -110045717 - MTD LTR MaLR -75 344 169 4 1132 458 323 117 33 chr2 71702349 71702708 -110045379 + RMER5 LTR ERV1 134 522 -12 4 1132 276 297 45 30 chr2 71702691 71702823 -110045264 - MER34A1 LTR ERV1 -377 210 77 4 1132 3238 63 2 0 chr2 71703313 71703712 -110044375 - MTB LTR MaLR 0 400 1 4 1132 291 172 31 0 chr2 71704454 71704518 -110043569 + RMER5 LTR ERV1 48 113 -421 4 1132 952 226 63 92 chr2 71706334 71706800 -110041287 + RLTR11B LTR ERVK 1 494 -34 4 1132 2306 101 3 24 chr2 71707819 71708153 -110039934 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 4 1132 450 200 0 0 chr2 71718222 71718297 -110029790 - RLTR41 LTR ERV1 -63 383 309 4 1132 1811 83 95 40 chr2 71720171 71720496 -110027591 - RLTR10B2 LTR ERVK -5 360 18 4 1132 1560 162 27 42 chr2 71728418 71728752 -110019335 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 4 1132 758 282 101 17 chr2 71729431 71729727 -110018360 - MTE2b LTR MaLR 0 379 59 4 1132 309 231 76 13 chr2 71729827 71729906 -110018181 - MTE2b LTR MaLR -293 86 3 4 1132 468 179 56 56 chr2 71733987 71734165 -110013922 - RMER17C LTR ERVK -138 272 95 5 1132 2891 50 3 62 chr2 71744375 71744763 -110003324 - RLTR10B2 LTR ERVK 0 365 1 5 1132 2853 16 0 6 chr2 71746097 71746421 -110001666 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 322 0 5 1132 298 284 0 0 chr2 71751697 71751778 -109996309 + MT2A LTR ERVL 1 81 -452 5 1132 281 250 108 39 chr2 71752820 71752949 -109995138 - LTR81B LTR ERV1? -1247 146 9 5 1132 1140 281 35 53 chr2 71754254 71754306 -109993781 - MTEa LTR MaLR -8 371 320 5 1132 2490 80 3 3 chr2 71754306 71754633 -109993454 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 5 1132 1140 281 35 53 chr2 71754633 71754956 -109993131 - MTEa LTR MaLR -60 319 3 5 1132 2711 190 102 35 chr2 71756007 71756749 -109991338 + RLTR40 LTR ERVK 1 792 -25 5 1132 389 282 68 47 chr2 71756851 71757041 -109991046 + MLT1K LTR MaLR 399 592 -3 5 1132 630 261 6 12 chr2 71757897 71758060 -109990027 + MER74B LTR ERVL 4 165 -457 5 1132 225 294 85 23 chr2 71758268 71758397 -109989690 + MER74B LTR ERVL 228 364 -258 5 1132 1127 252 43 38 chr2 71758461 71758807 -109989280 - ORR1E LTR MaLR 0 359 12 5 1132 676 252 15 0 chr2 71759997 71760128 -109987959 - ETnERV2-int LTR ERVK -204 7202 7070 5 1132 3219 29 42 0 chr2 71760695 71761075 -109987012 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 1132 424 154 132 19 chr2 71763066 71763172 -109984915 + ORR1B2 LTR MaLR 1 118 -249 5 1132 1665 175 18 75 chr2 71763172 71763278 -109984809 + ORR1B2 LTR MaLR 1 92 -275 5 1132 1665 175 18 75 chr2 71763458 71763740 -109984347 + ORR1B2 LTR MaLR 93 367 0 5 1132 312 216 135 11 chr2 71764909 71764998 -109983089 - MER57E1 LTR ERV1 -224 148 49 5 1132 2534 197 15 124 chr2 71765268 71765952 -109982135 - RMER19C LTR ERVK -2 609 1 5 1132 458 271 9 0 chr2 71768532 71768639 -109979448 - RMER20B LTR ERVK -24 603 496 5 1132 235 301 124 41 chr2 71768660 71768757 -109979330 + MER74A LTR ERVL 67 171 -387 5 1132 333 274 76 23 chr2 71768826 71768957 -109979130 + MER74A LTR ERVL 294 431 -127 5 1132 1061 252 90 11 chr2 71769083 71769455 -109978632 + MTD LTR MaLR 1 406 -15 5 1132 366 329 54 40 chr2 71769515 71769737 -109978350 - RMER5 LTR ERV1 -21 513 289 5 1132 6035 265 34 34 chr2 71769946 71771553 -109976534 - RodERV21-int LTR ERV1 -2277 2714 1107 5 1132 537 302 58 99 chr2 71771637 71771932 -109976155 - RodERV21-int LTR ERV1 -3903 1088 804 5 1132 537 302 58 99 chr2 71772079 71772147 -109975940 - RodERV21-int LTR ERV1 -4188 803 740 5 1132 590 209 140 6 chr2 71772868 71773032 -109975055 - MTE2a LTR MaLR 0 379 194 5 1132 1594 108 161 66 chr2 71773163 71773510 -109974577 + RMER10B LTR ERVL 19 398 0 5 1132 501 208 0 84 chr2 71773510 71773558 -109974529 - MTE2a LTR MaLR -244 130 87 5 1132 2745 86 47 71 chr2 71773558 71774022 -109974065 - RLTR11B LTR ERVK 0 453 1 5 1132 501 208 0 84 chr2 71774022 71774115 -109973972 - MTE2a LTR MaLR -288 86 1 5 1132 243 339 65 0 chr2 71774115 71774229 -109973858 - RMER5 LTR ERV1 -370 164 43 5 1132 825 183 130 22 chr2 71774901 71775085 -109973002 - MTD LTR MaLR -215 204 1 5 1132 1598 140 37 103 chr2 71775863 71776336 -109971751 + RMER17C LTR ERVK 19 435 -523 5 1132 7225 60 7 1 chr2 71777441 71778329 -109969758 + RLTR13B1 LTR ERVK 1 893 0 6 1132 2183 153 5 69 chr2 71779245 71779356 -109968731 - RLTR14 LTR ERV1 0 382 283 6 1132 2183 153 5 69 chr2 71779546 71779842 -109968245 - RLTR14 LTR ERV1 -100 282 1 6 1132 2017 82 38 59 chr2 71780196 71780535 -109967552 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK -5 332 1 6 1132 58215 16 6 7 chr2 71780535 71787014 -109961073 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 6 6 1132 2018 82 38 59 chr2 71787014 71787353 -109960734 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK -5 332 1 6 1132 366 276 114 48 chr2 71787913 71788215 -109959872 + MLT1E1A LTR MaLR 308 680 0 6 1132 311 310 58 90 chr2 71790532 71790688 -109957399 - MTEb LTR MaLR -164 215 65 6 1132 369 272 380 70 chr2 71790697 71790966 -109957121 - RMER12 LTR ERVK 0 1322 967 6 1132 369 239 52 124 chr2 71791078 71791110 -109956977 - RMER12 LTR ERVK -356 966 940 6 1132 499 208 11 172 chr2 71791516 71791702 -109956385 - RLTR22_Mur LTR ERVK -499 1349 1194 6 1132 319 271 19 77 chr2 71791750 71791906 -109956181 - RLTR22_Mus LTR ERVK -997 811 665 6 1132 1231 278 68 51 chr2 71792478 71793051 -109955036 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1265 583 1 6 1132 2417 135 14 0 chr2 71794533 71794903 -109953184 + RLTR30 LTR ERV1 5 379 0 6 1132 2275 108 12 6 chr2 71799161 71799488 -109948599 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 6 1132 3607 13 2 0 chr2 71800048 71800443 -109947644 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 1132 229 325 194 10 chr2 71802286 71802482 -109945605 + MLT1F1 LTR MaLR 338 569 0 6 1132 2292 192 7 24 chr2 71804220 71804646 -109943441 - MTC LTR MaLR -2 419 1 6 1132 407 161 25 3 chr2 71804950 71805039 -109943048 - LTR16D2 LTR ERVL 0 572 449 6 1132 705 266 68 99 chr2 71805047 71805460 -109942627 - MLT1C LTR MaLR 0 467 68 6 1132 2351 122 43 38 chr2 71805503 71805946 -109942141 - RLTR11B LTR ERVK -8 445 1 6 1132 409 76 8 0 chr2 71806856 71806922 -109941165 + MTC LTR MaLR 1 69 -338 6 1132 1295 104 0 15 chr2 71806921 71807110 -109940977 + MTC LTR MaLR 215 401 -20 6 1132 1735 192 140 18 chr2 71807110 71807228 -109940859 + RLTR16 LTR ERVK 1 153 -352 6 1132 1735 192 140 18 chr2 71807279 71807610 -109940477 + RLTR16 LTR ERVK 154 504 -1 6 1132 1295 176 3541 35 chr2 71807610 71807625 -109940462 + MTC LTR MaLR 402 407 -14 6 1132 790 270 53 77 chr2 71810318 71810732 -109937355 + RMER10A LTR ERVL 12 415 -27 6 1132 232 206 127 0 chr2 71811515 71811578 -109936509 + MLT2B2 LTR ERVL 70 140 -416 6 1132 1571 103 171 157 chr2 71812682 71813051 -109935036 + ORR1C1 LTR MaLR 5 378 0 6 1132 501 291 174 15 chr2 71813064 71813329 -109934758 - ORR1E LTR MaLR -52 307 1 6 1132 1846 194 129 34 chr2 71813517 71814014 -109934073 + RMER19B LTR ERVK 357 900 -2 6 1132 1901 124 36 54 chr2 71814015 71814348 -109933739 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 6 1132 612 304 134 11 chr2 71814473 71814756 -109933331 + MLT2B2 LTR ERVL 120 437 -78 6 1132 2331 113 0 0 chr2 71815200 71815526 -109932561 + ORR1A3 LTR MaLR 1 326 0 6 1133 263 284 21 124 chr2 71829997 71830142 -109917945 - MT2B LTR ERVL -323 278 149 6 1133 1054 229 68 10 chr2 71830286 71830582 -109917505 - MTEa LTR MaLR -14 365 53 6 1133 1609 159 49 101 chr2 71832805 71833210 -109914877 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 7 1133 831 283 76 29 chr2 71835682 71836129 -109911958 - RLTR12B LTR ERVK -14 514 47 7 1133 670 236 58 61 chr2 71838596 71838926 -109909161 - RLTR15 LTR ERVK -30 329 1 7 1133 2057 142 88 32 chr2 71840273 71840680 -109907407 + RMER19B LTR ERVK 470 899 -3 7 1133 1714 144 20 161 chr2 71840882 71841322 -109906765 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 7 1133 2619 189 53 81 chr2 71843674 71844331 -109903756 - RMER13A LTR ERVK -221 639 1 7 1133 2304 155 31 87 chr2 71847114 71847560 -109900527 + MTC LTR MaLR 1 421 0 7 1133 619 228 43 35 chr2 71848602 71848743 -109899344 - RLTR19-int LTR ERVK -1758 4379 4238 7 1133 1144 152 33 59 chr2 71848748 71849020 -109899067 - RLTR19-int LTR ERVK -2427 3710 3446 7 1133 265 282 49 38 chr2 71849105 71849214 -109898873 - MYSERV6-int LTR ERVK -434 8525 8428 7 1133 909 240 93 72 chr2 71849205 71849648 -109898439 - RLTR19-int LTR ERVK -3414 2723 2050 7 1133 274 241 22 33 chr2 71852471 71852561 -109895526 - RLTR19-int LTR ERVK -5153 984 896 7 1133 634 247 81 16 chr2 71852647 71852832 -109895255 - RLTR42-int LTR ERVK -4197 1325 1129 7 1133 247 274 162 63 chr2 71853790 71853981 -109894106 - RLTR24 LTR ERV1 0 529 320 7 1133 906 306 32 10 chr2 71855827 71856137 -109891950 - MLT1A0 LTR MaLR -41 324 8 7 1133 552 235 0 69 chr2 71857027 71857185 -109890902 + RLTR11B LTR ERVK 1 147 -306 7 1133 2028 74 3 63 chr2 71857386 71857702 -109890385 + ORR1A2 LTR MaLR 29 325 -2 7 1133 1845 164 93 9 chr2 71862742 71863087 -109885000 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 7 1133 413 300 82 76 chr2 71868206 71868523 -109879564 - MLT1A1 LTR MaLR -14 394 76 7 1133 231 245 0 0 chr2 71870035 71870088 -109877999 - MLT1L LTR MaLR -352 258 206 7 1133 1862 197 47 7 chr2 71878905 71879310 -109868777 + MTC LTR MaLR 1 421 0 7 1133 3242 51 10 0 chr2 71890588 71890982 -109857105 + MTB LTR MaLR 1 398 -2 8 1133 2020 69 12 62 chr2 71911253 71911577 -109836510 + ORR1A4 LTR MaLR 1 308 -21 8 1133 363 317 42 31 chr2 71913027 71913219 -109834868 - MLT1G3 LTR MaLR -244 351 158 8 1133 2226 134 28 8 chr2 71937537 71937897 -109810190 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 8 1133 3181 73 0 5 chr2 71942275 71942673 -109805414 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 8 1133 590 292 94 139 chr2 71950449 71950831 -109797256 + MTE2a LTR MaLR 1 365 -14 9 1133 255 228 78 128 chr2 71952607 71952748 -109795339 + MLT1A1 LTR MaLR 1 134 -274 9 1133 465 226 0 10 chr2 71957333 71957436 -109790651 - MTC LTR MaLR -1 420 319 9 1133 230 349 150 32 chr2 71957575 71957821 -109790266 + LTR16E1 LTR ERVL 52 326 -212 9 1134 360 264 132 28 chr2 71959116 71959260 -109788827 - MLT1A1 LTR MaLR -3 405 247 9 1134 2002 125 23 76 chr2 71968732 71969165 -109778922 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 9 1134 320 336 378 16 chr2 71970907 71971208 -109776879 - MLT1G LTR MaLR -30 561 152 9 1134 530 309 138 40 chr2 71971330 71971707 -109776380 - MLT1G-int LTR MaLR -28 1381 968 9 1134 425 383 100 6 chr2 71972026 71972504 -109775583 - MLT1G-int LTR MaLR -886 523 1 9 1134 426 335 65 71 chr2 71972502 71972811 -109775276 - MLT1G LTR MaLR -2 589 283 9 1134 2000 202 45 5 chr2 71999551 71999954 -109748133 - MTC LTR MaLR -2 419 1 9 1134 1904 128 54 118 chr2 72004290 72004697 -109743390 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 4 9 1134 3412 33 5 0 chr2 72005108 72005502 -109742585 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 1134 266 254 44 26 chr2 72008335 72008448 -109739639 + LTR33A LTR ERVL 405 519 -1 1 1134 1570 165 118 6 chr2 72008522 72008852 -109739235 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 1 1134 411 315 75 31 chr2 72011262 72011407 -109736680 - MLT1D LTR MaLR -18 487 340 1 1134 411 315 75 31 chr2 72011447 72011527 -109736560 - MLT1D LTR MaLR -166 339 254 1 1134 299 282 85 8 chr2 72011578 72011696 -109736391 - MLT1D LTR MaLR -366 139 13 1 1134 1165 218 4 36 chr2 72015185 72015437 -109732650 + RLTR20B2 LTR ERVK 1 244 -316 2 1134 2196 166 75 137 chr2 72029326 72029977 -109718110 - RMER19C LTR ERVK 0 611 1 4 1134 712 260 142 60 chr2 72044183 72044613 -109703474 - MLT1C LTR MaLR 0 467 3 5 1134 311 261 8 83 chr2 72046442 72046563 -109701524 - MLT1A1 LTR MaLR -2 406 295 6 1134 267 180 16 16 chr2 72058908 72058970 -109689117 - MLT1A1 LTR MaLR -41 367 306 8 1134 2939 52 0 0 chr2 72075510 72075856 -109672231 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 9 1134 267 271 81 30 chr2 72082925 72083024 -109665063 - MLT1J LTR MaLR -405 107 4 9 1135 1259 86 0 0 chr2 72095894 72096069 -109652018 + MTB_Mm LTR MaLR 1 175 -232 1 1135 2951 101 86 14 chr2 72096071 72096581 -109651506 + MTB-int LTR MaLR 552 1098 0 1 1135 3191 53 18 2 chr2 72096581 72096975 -109651112 + MTB LTR MaLR 1 400 0 1 1135 280 240 69 20 chr2 72098681 72098783 -109649304 + ORR1E LTR MaLR 44 150 -209 1 1135 332 281 19 19 chr2 72102177 72102282 -109645805 + MLT1A1 LTR MaLR 268 372 -36 1 1135 365 271 38 83 chr2 72103184 72103341 -109644746 - MLT2B4 LTR ERVL -4 552 403 1 1135 1789 138 63 27 chr2 72103997 72104331 -109643756 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 41 1 1135 2286 98 22 25 chr2 72108418 72108786 -109639301 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 1 1135 29132 20 9 0 chr2 72108790 72112032 -109636055 - IAPEz-int LTR ERVK -3 6478 3210 1 1135 7274 84 111 72 chr2 72112031 72113288 -109634799 - IAPEz-int LTR ERVK -5168 1313 8 1 1135 2286 98 22 25 chr2 72113288 72113656 -109634431 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 1 1135 273 287 55 18 chr2 72141342 72141452 -109606635 - MTEa LTR MaLR -16 363 250 1 1135 919 243 176 31 chr2 72143287 72143605 -109604482 + MTE2b LTR MaLR 1 364 -15 1 1135 304 238 8 137 chr2 72152194 72152311 -109595776 + MT2B LTR ERVL 156 257 -344 1 1135 278 236 133 11 chr2 72153421 72153511 -109594576 + RLTR12B LTR ERVK 117 217 -311 1 1135 753 277 78 41 chr2 72154335 72154760 -109593327 - RLTR12B LTR ERVK -31 497 48 2 1135 318 329 26 40 chr2 72155609 72155837 -109592250 - ERVL-int LTR ERVL -371 5390 5166 2 1135 582 281 38 51 chr2 72156581 72156874 -109591213 - ERVL-int LTR ERVL -1071 4686 4398 2 1135 526 256 62 48 chr2 72156926 72157135 -109590952 - ERVL-int LTR ERVL -1392 4369 4158 2 1135 497 329 97 47 chr2 72157208 72157549 -109590538 - ERVL-int LTR ERVL -1774 3893 3536 2 1135 283 364 97 0 chr2 72157566 72157742 -109590345 - ERVL-int LTR ERVL -3766 1901 1709 2 1135 1183 251 39 94 chr2 72158237 72158620 -109589467 - MTE2a LTR MaLR -13 366 5 2 1135 514 302 20 35 chr2 72158645 72158844 -109589243 - ERVL-int LTR ERVL -4463 1204 1009 2 1135 254 277 57 25 chr2 72159985 72160107 -109587980 - LTR41 LTR ERVL -642 126 1 2 1135 1451 216 52 51 chr2 72166398 72166810 -109581277 + MTD LTR MaLR 3 405 -14 2 1135 16306 114 28 23 chr2 72177334 72179946 -109568141 + MurERV4_19-int LTR ERVK 2999 5779 -1 2 1135 1843 203 86 48 chr2 72179986 72180441 -109567646 + RMER19C LTR ERVK 140 611 0 2 1135 3730 23 0 0 chr2 72180913 72181309 -109566778 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 1135 984 214 305 12 chr2 72182300 72182621 -109565466 - MTD LTR MaLR -2 417 3 2 1135 1890 236 75 43 chr2 72182626 72183201 -109564886 - MTD-int LTR MaLR -3 1255 663 2 1135 313 291 48 56 chr2 72188628 72188842 -109559245 - ORR1D1 LTR MaLR -14 365 173 2 1135 1132 199 50 88 chr2 72192072 72192391 -109555696 - MTC-int LTR MaLR -950 308 2 2 1135 2617 149 47 5 chr2 72192392 72192796 -109555291 - MTC LTR MaLR 0 421 1 2 1135 1629 203 87 20 chr2 72195241 72195597 -109552490 - MTD LTR MaLR -15 404 25 2 1135 322 148 37 0 chr2 72202535 72202589 -109545498 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 329 2 1136 741 128 8 0 chr2 72230877 72230994 -109517093 - ORR1C1 LTR MaLR -8 370 253 3 1136 1099 246 53 42 chr2 72256632 72256988 -109491099 - MTEa LTR MaLR -15 364 5 3 1136 386 328 39 115 chr2 72259964 72260340 -109487747 - ORR1E LTR MaLR -1 369 14 3 1136 2930 40 78 3 chr2 72282538 72282910 -109465177 + MTB LTR MaLR 1 400 0 3 1136 1924 124 42 60 chr2 72283401 72283736 -109464351 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 3 1136 371 295 8 30 chr2 72286563 72286696 -109461391 - MLT1F LTR MaLR 0 548 419 3 1136 615 310 106 18 chr2 72286927 72287200 -109460887 - MLT1F LTR MaLR -249 299 3 3 1136 290 173 51 51 chr2 72287341 72287389 -109460698 + MLT1A1 LTR MaLR 292 338 -70 3 1136 2411 119 154 83 chr2 72287389 72287797 -109460290 + RLTR24 LTR ERV1 1 426 -103 4 1136 2411 119 154 83 chr2 72287832 72287917 -109460170 + RLTR24 LTR ERV1 427 529 0 4 1136 290 183 49 49 chr2 72287917 72287956 -109460131 + MLT1A1 LTR MaLR 296 370 -38 3 1136 752 148 22 95 chr2 72292689 72292743 -109455344 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 354 4 1136 752 148 22 95 chr2 72292935 72293059 -109455028 - ORR1B1 LTR MaLR -41 353 229 4 1136 2048 94 22 0 chr2 72295107 72295426 -109452661 - IAPEY2_LTR LTR ERVK 0 357 32 4 1136 821 333 68 18 chr2 72295605 72296043 -109452044 - MT2A LTR ERVL -73 460 1 4 1136 2837 95 5 5 chr2 72296102 72296525 -109451562 + MT2B2 LTR ERVL 162 584 0 4 1136 14750 130 29 27 chr2 72296525 72298232 -109449855 + MERVL-int LTR ERVL 1 1680 -3805 4 1136 14750 130 29 27 chr2 72298276 72298912 -109449175 + MERVL-int LTR ERVL 1681 2349 -3136 4 1136 5586 81 0 0 chr2 72298908 72299603 -109448484 + MERVL-int LTR ERVL 3027 3721 -1764 4 1136 1306 98 30 0 chr2 72299610 72299813 -109448274 - MT2B2 LTR ERVL 0 584 376 4 1136 3558 109 62 0 chr2 72299813 72300309 -109447778 + MERVL-int LTR ERVL 4451 4977 -508 4 1136 1578 121 184 6 chr2 72302184 72302493 -109445594 + RLTR28 LTR ERVL 86 450 -74 4 1136 700 243 72 76 chr2 72302493 72302893 -109445194 + RMER16 LTR ERVK 1 533 0 4 1136 350 148 0 0 chr2 72302893 72302945 -109445142 + RLTR28 LTR ERVL 445 496 -28 4 1136 2573 119 29 17 chr2 72303367 72303776 -109444311 - MTC LTR MaLR -2 419 6 4 1136 4109 88 59 16 chr2 72306531 72307107 -109440980 + MT2B LTR ERVL 1 601 0 4 1136 2797 160 25 11 chr2 72307395 72307921 -109440166 - RMER15 LTR ERVL -42 533 1 4 1136 366 250 64 35 chr2 72310476 72310617 -109437470 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 286 4 1136 311 252 46 83 chr2 72311570 72311678 -109436409 + MTEa LTR MaLR 2 105 -274 4 1136 560 179 0 0 chr2 72327663 72327758 -109420329 + MTE2a LTR MaLR 265 359 -20 4 1136 912 216 151 31 chr2 72329655 72329947 -109418140 - MTD LTR MaLR -11 408 82 4 1136 287 229 0 41 chr2 72331256 72331329 -109416758 + MTE2a LTR MaLR 2 71 -308 4 1136 400 216 173 16 chr2 72331344 72331471 -109416616 + MTE2a LTR MaLR 229 375 -4 4 1136 680 310 58 24 chr2 72334779 72335070 -109413017 - MTE2a LTR MaLR -4 375 75 4 1136 373 331 103 52 chr2 72335391 72335779 -109412308 + MLT1G3 LTR MaLR 144 551 -44 5 1136 634 256 93 16 chr2 72335992 72336238 -109411849 - MLT1B LTR MaLR -37 353 89 5 1136 266 238 56 56 chr2 72340866 72340955 -109407132 - MT2B LTR ERVL -346 255 167 5 1137 300 315 65 36 chr2 72357654 72357822 -109390265 - MLT1M LTR MaLR -375 297 125 5 1137 2613 140 48 78 chr2 72363606 72364147 -109383940 - RLTR24 LTR ERV1 -4 525 1 5 1137 260 167 33 16 chr2 72371250 72371311 -109376776 + MTC LTR MaLR 1 62 -359 5 1137 2035 163 48 16 chr2 72371599 72371973 -109376114 + MTC LTR MaLR 36 421 0 5 1137 278 246 0 0 chr2 72375892 72375957 -109372130 - ORR1E LTR MaLR 0 379 315 5 1137 3084 308 81 62 chr2 72376732 72378510 -109369577 - ORR1E-int LTR MaLR -16 1564 1 5 1137 424 218 107 19 chr2 72378544 72378647 -109369440 - ORR1E LTR MaLR 0 379 268 5 1137 786 243 175 88 chr2 72380255 72380343 -109367744 - MTEa LTR MaLR -6 373 299 5 1137 786 243 175 88 chr2 72380487 72380741 -109367346 - MTEa LTR MaLR -81 298 1 5 1137 3227 36 26 3 chr2 72382508 72382895 -109365192 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 1137 879 319 64 42 chr2 72396287 72396742 -109351345 - MLT1C LTR MaLR -2 465 1 6 1137 3091 38 2 116 chr2 72415315 72415762 -109332325 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 1137 584 250 83 84 chr2 72415979 72416311 -109331776 + ORR1E LTR MaLR 1 349 -30 6 1137 234 337 22 22 chr2 72422736 72422827 -109325260 - ORR1E LTR MaLR 0 359 269 6 1137 843 221 31 40 chr2 72423204 72423430 -109324657 - ORR1D1 LTR MaLR -2 372 149 6 1137 746 209 21 58 chr2 72423477 72423630 -109324457 - ORR1D1 LTR MaLR -193 181 35 6 1137 3110 104 25 35 chr2 72423630 72424110 -109323977 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 475 0 6 1137 746 209 21 58 chr2 72424110 72424144 -109323943 - ORR1D1 LTR MaLR -340 34 1 6 1137 285 344 122 0 chr2 72428553 72428733 -109319354 - MLT1L LTR MaLR -53 557 356 6 1137 320 310 22 37 chr2 72432059 72432193 -109315894 - MLT1J LTR MaLR -4 508 377 6 1137 1904 126 75 28 chr2 72432886 72433092 -109314995 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 182 6 1137 1904 126 75 28 chr2 72433195 72433346 -109314741 - ORR1C2 LTR MaLR -203 181 8 6 1137 547 129 88 8 chr2 72441460 72441585 -109306502 - MTD LTR MaLR -18 401 267 6 1137 3811 147 95 68 chr2 72445678 72446545 -109301542 - RMER19B LTR ERVK -12 890 1 6 1137 6321 60 32 5 chr2 72448450 72449348 -109298739 + RLTR13B3 LTR ERVK 7 929 0 6 1137 395 286 25 25 chr2 72456314 72456436 -109291651 - MTEa LTR MaLR -12 367 246 7 1137 4508 42 67 7 chr2 72462554 72463108 -109284979 - LTRIS_Mus LTR ERV1 0 587 1 7 1137 457 309 25 107 chr2 72464559 72464649 -109283438 + MER21B LTR ERV1 8 97 -766 7 1137 457 309 25 107 chr2 72464681 72464833 -109283254 + MER21B LTR ERV1 98 230 -633 7 1137 370 232 130 27 chr2 72465193 72465363 -109282724 - MTD LTR MaLR -16 403 198 7 1137 281 257 183 128 chr2 72473998 72474288 -109273799 - ORR1E LTR MaLR -2 357 52 7 1137 360 306 39 24 chr2 72477977 72478104 -109269983 + MLT1A0 LTR MaLR 2 130 -235 7 1137 267 273 87 43 chr2 72478765 72478903 -109269184 + MER77 LTR ERVL 453 596 -11 7 1137 1151 265 49 49 chr2 72478810 72479159 -109268928 + MER21B LTR ERV1 466 814 -49 7 1137 267 213 16 0 chr2 72479844 72479905 -109268182 + RMER15 LTR ERVL 428 489 -86 7 1138 369 321 177 9 chr2 72483905 72484125 -109263962 + MTE-int LTR MaLR 18 274 -1306 7 1138 1017 161 48 10 chr2 72500344 72500551 -109247536 + MTD LTR MaLR 205 419 0 2 1138 338 344 63 66 chr2 72504281 72504614 -109243473 + ORR1E LTR MaLR 26 357 -2 1 1138 480 245 38 19 chr2 72504616 72504774 -109243313 + ORR1E-int LTR MaLR 1 161 -1419 1 1138 2283 70 13 7 chr2 72505434 72505737 -109242350 - RLTR27 LTR ERVK -4 305 1 1 1138 263 330 18 0 chr2 72518042 72518151 -109229936 - RMER15 LTR ERVL -58 517 407 3 1138 4651 122 16 24 chr2 72522679 72523441 -109224646 - RMER6A LTR ERVK 0 756 1 4 1138 3547 162 80 22 chr2 72523701 72524054 -109224033 + RMER6D LTR ERVK 3 372 -348 4 1138 3547 162 80 22 chr2 72524120 72524441 -109223646 + RMER6D LTR ERVK 373 715 -5 4 1138 292 267 16 0 chr2 72531757 72531869 -109216218 + MLT1A0 LTR MaLR 247 357 -51 5 1138 537 278 50 20 chr2 72536696 72536894 -109211193 + RLTR11B LTR ERVK 235 438 -15 7 1138 3240 48 5 2 chr2 72550672 72551067 -109197020 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 9 1138 2515 80 6 6 chr2 72552614 72552941 -109195146 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 9 1138 3296 43 5 2 chr2 72555370 72555765 -109192322 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 9 1138 234 234 49 49 chr2 72556279 72556360 -109191727 - RMER15 LTR ERVL -159 416 336 9 1138 2261 107 40 144 chr2 72557317 72557420 -109190667 + RLTR23 LTR ERV1 1 100 -330 1 1138 2261 107 40 144 chr2 72557464 72557840 -109190247 + RLTR23 LTR ERV1 101 430 0 1 1138 291 339 25 0 chr2 72561236 72561354 -109186733 - LTR48 LTR ERV1 -509 278 158 1 1138 644 329 94 29 chr2 72561989 72562296 -109185791 - MLT1G1 LTR MaLR -1 578 252 1 1138 288 310 50 25 chr2 72563008 72563122 -109184965 + LTR16E2 LTR ERVL 441 557 -11 1 1138 295 291 119 77 chr2 72566318 72566512 -109181575 - MLT1K LTR MaLR -11 584 383 1 1138 501 304 64 37 chr2 72566856 72567044 -109181043 - MLT1G1 LTR MaLR -38 541 349 1 1138 1266 214 68 63 chr2 72568379 72568838 -109179249 - RMER6B LTR ERVK 0 461 1 1 1138 232 257 12 75 chr2 72571400 72571480 -109176607 + RMER15 LTR ERVL 1 75 -500 1 1138 867 216 91 37 chr2 72571599 72571695 -109176392 + RMER15 LTR ERVL 306 406 -169 1 1138 2507 136 77 3 chr2 72571695 72572087 -109176000 + MTC LTR MaLR 1 421 0 1 1138 867 216 91 37 chr2 72572087 72572231 -109175856 + RMER15 LTR ERVL 407 559 -16 1 1138 3424 134 106 13 chr2 72580910 72581582 -109166505 - RMER6A LTR ERVK -21 735 2 1 1138 313 291 99 50 chr2 72587322 72587503 -109160584 - MLT1D LTR MaLR 0 505 316 1 1138 1286 181 97 36 chr2 72587503 72587881 -109160206 - RMER16 LTR ERVK 0 533 1 1 1138 895 279 86 23 chr2 72588137 72588279 -109159808 - MTE2b LTR MaLR -59 320 180 1 1138 895 279 86 23 chr2 72588314 72588472 -109159615 - MTE2b LTR MaLR -200 179 1 1 1138 328 276 90 65 chr2 72588472 72588627 -109159460 - MLT1D LTR MaLR -219 286 128 1 1138 2143 180 31 5 chr2 72591292 72591682 -109156405 - MTC LTR MaLR -21 400 1 1 1138 3072 78 8 5 chr2 72596120 72596519 -109151568 - MTB LTR MaLR 0 400 1 1 1138 3594 69 48 2 chr2 72607353 72607833 -109140254 + RLTR44C LTR ERVK 1 502 0 1 1138 1436 207 137 13 chr2 72608721 72609094 -109138993 - MTD LTR MaLR 0 419 1 1 1138 775 292 72 9 chr2 72609386 72609704 -109138383 + RMER5 LTR ERV1 40 377 -157 1 1138 443 258 31 50 chr2 72609773 72609932 -109138155 + RMER5 LTR ERV1 379 534 0 1 1138 1104 244 18 71 chr2 72611355 72611691 -109136396 + MTE2a LTR MaLR 62 379 0 1 142 551 244 22 121 chr2 72613845 72614069 -109134018 + ORR1E LTR MaLR 147 348 -11 1 1139 2292 112 38 136 chr2 72617182 72617659 -109130428 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 1 2 1139 960 221 88 8 chr2 72617761 72618012 -109130075 - RMER19B LTR ERVK -275 627 357 2 1139 1238 221 149 0 chr2 72625666 72626014 -109122073 - MTD LTR MaLR 0 419 20 2 1139 518 271 196 14 chr2 72626516 72626812 -109121275 + MLT1A1 LTR MaLR 1 350 -58 2 1139 267 200 0 16 chr2 72626936 72626997 -109121090 + MLT1A1 LTR MaLR 332 391 -17 2 1139 343 292 162 95 chr2 72627316 72627600 -109120487 - MTE2a LTR MaLR -76 303 1 2 1139 363 359 66 32 chr2 72629922 72630270 -109117817 + LTR78 LTR ERV1 945 1304 0 2 1139 337 255 71 0 chr2 72635318 72635416 -109112671 + ORR1B1-int LTR MaLR 1393 1497 -12 2 1139 975 288 38 32 chr2 72636369 72636648 -109111439 + MLT1A0 LTR MaLR 1 280 -85 2 1139 975 288 38 32 chr2 72636875 72636936 -109111151 + MLT1A0 LTR MaLR 281 343 -22 2 1139 969 141 18 0 chr2 72637938 72638108 -109109979 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 222 2 1139 1068 174 235 24 chr2 72638098 72638468 -109109619 - RMER4B LTR ERVK -137 448 1 2 1139 1863 171 53 173 chr2 72639916 72640516 -109107571 - RMER19C LTR ERVK 0 611 84 2 1139 1810 140 17 88 chr2 72640856 72641209 -109106878 + ORR1A4 LTR MaLR 1 328 -1 2 1139 4224 108 94 19 chr2 72642147 72642533 -109105554 - RMER6A LTR ERVK 0 756 357 2 1139 4224 108 94 19 chr2 72642615 72642929 -109105158 - RMER6A LTR ERVK -400 356 5 2 1139 710 152 7 64 chr2 72645476 72645617 -109102470 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 262 2 1139 2368 132 29 10 chr2 72645621 72646004 -109102083 - RMER19C LTR ERVK -5 606 217 2 1139 233 108 0 0 chr2 72646019 72646056 -109102031 - ORR1B1 LTR MaLR -357 37 1 2 1139 240 242 137 29 chr2 72646548 72646650 -109101437 + MER34 LTR ERV1 384 496 -46 2 1139 1739 192 84 107 chr2 72647351 72647604 -109100483 + RMER4B LTR ERVK 19 262 -323 2 1139 1739 192 84 107 chr2 72647784 72647811 -109100276 + RMER4B LTR ERVK 263 263 -322 2 1139 1739 192 84 107 chr2 72647991 72648279 -109099808 + RMER4B LTR ERVK 263 575 -10 2 1139 448 230 16 31 chr2 72648664 72648803 -109099284 + MLT1A1 LTR MaLR 260 396 -12 2 1139 1973 193 83 34 chr2 72653262 72653312 -109094775 + RLTR20B3 LTR ERVK 88 143 -434 2 1139 1973 193 83 34 chr2 72653458 72653782 -109094305 + RLTR20B3 LTR ERVK 144 471 -106 2 1139 1973 193 83 34 chr2 72653831 72653922 -109094165 + RLTR20B3 LTR ERVK 472 576 -1 2 1139 3116 154 88 134 chr2 72656174 72656402 -109091685 - RMER6D LTR ERVK -4 716 498 2 1139 3116 154 88 134 chr2 72656596 72657117 -109090970 - RMER6D LTR ERVK -223 497 2 2 1139 4030 36 125 10 chr2 72658615 72659119 -109088968 + LTRIS2 LTR ERV1 3 564 0 2 1139 2705 88 61 29 chr2 72659742 72660151 -109087936 + BGLII_Mus LTR ERVK 1 422 0 2 1139 399 215 188 62 chr2 72662210 72662282 -109085805 - RLTR20A2 LTR ERVK 0 578 496 2 1139 399 215 188 62 chr2 72662353 72662423 -109085664 - RLTR20A2 LTR ERVK -83 495 418 2 1139 564 193 18 0 chr2 72662462 72662571 -109085516 - MTC LTR MaLR -228 193 83 2 1139 544 196 0 0 chr2 72662737 72662834 -109085253 - MTC LTR MaLR -324 97 1 2 1139 2396 91 142 29 chr2 72667105 72667491 -109080596 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 1 3 1139 641 303 42 42 chr2 72673621 72673910 -109074177 - MT2A LTR ERVL -160 373 85 3 1139 240 204 37 0 chr2 72673917 72673971 -109074116 - MTC LTR MaLR -353 68 13 3 1139 334 356 114 18 chr2 72674075 72674347 -109073740 - MLT1H1 LTR MaLR -257 298 1 3 1139 798 239 69 27 chr2 72676904 72677133 -109070954 + ORR1D1 LTR MaLR 4 280 -90 3 1139 3013 115 99 216 chr2 72677133 72677519 -109070568 + RMER6A LTR ERVK 1 323 -433 3 1139 3013 115 99 216 chr2 72677690 72678159 -109069928 + RMER6A LTR ERVK 324 756 0 3 1139 440 219 90 25 chr2 72678159 72678239 -109069848 + ORR1D1 LTR MaLR 281 369 -1 3 1139 1435 264 41 11 chr2 72678772 72679139 -109068948 + MTE2a LTR MaLR 1 378 -1 3 1139 338 355 33 44 chr2 72682415 72682595 -109065492 - MLT1M LTR MaLR -388 284 107 3 1139 2698 58 3 0 chr2 72682827 72683153 -109064934 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 3 1139 468 248 42 147 chr2 72683236 72683414 -109064673 - MLT1C LTR MaLR -1 466 224 3 1139 2653 142 14 97 chr2 72685188 72685757 -109062330 - RLTR24 LTR ERV1 -7 522 1 3 1139 2017 134 103 5 chr2 72688700 72689067 -109059020 - MTC LTR MaLR -18 403 1 3 1139 1347 174 79 164 chr2 72689660 72690080 -109058007 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 3 1139 504 169 0 11 chr2 72690081 72690171 -109057916 + MERVL_2A-int LTR ERVL 5540 5628 -133 3 1139 294 219 0 27 chr2 72690171 72690246 -109057841 + ORR1C2-int LTR MaLR 567 639 -1324 3 1139 277 151 38 0 chr2 72690247 72690300 -109057787 + MERVL_2A-int LTR ERVL 5707 5761 0 3 1139 558 158 49 24 chr2 72690300 72690423 -109057664 + MT2A LTR ERVL 1 126 -407 3 1139 1329 139 39 12 chr2 72695230 72695484 -109052603 - ORR1A4 LTR MaLR -68 261 1 3 1139 3547 42 28 7 chr2 72696451 72696878 -109051209 + RLTR10C LTR ERVK 1 436 0 3 1139 6928 98 54 4 chr2 72697866 72698963 -109049124 + ORR1A2-int LTR MaLR 809 1960 -3 3 1139 2647 56 9 3 chr2 72698968 72699293 -109048794 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 3 1139 4358 160 59 67 chr2 72705413 72706322 -109041765 - RMER19B LTR ERVK 0 902 1 3 1139 250 220 0 0 chr2 72706471 72706521 -109041566 - LTR48 LTR ERV1 -588 199 150 3 1139 693 329 97 27 chr2 72711274 72711792 -109036295 - MLT2B3 LTR ERVL 0 554 1 3 1139 1264 171 65 4 chr2 72715977 72716224 -109031863 - MTC LTR MaLR -159 262 1 3 1139 279 233 120 63 chr2 72719914 72720056 -109028031 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 101 250 -2592 4 1139 770 193 71 44 chr2 72720647 72720925 -109027162 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 1 158 -2168 4 1139 4210 163 195 86 chr2 72720909 72721587 -109026500 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 277 1079 -1247 4 1139 4210 163 195 86 chr2 72721665 72722107 -109025980 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 1080 1605 -721 4 1139 2799 49 5 13 chr2 72722107 72722496 -109025591 + MTA_Mm LTR MaLR 1 386 -10 4 1139 3557 152 54 18 chr2 72722498 72723204 -109024883 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 1596 2326 0 4 1139 643 259 78 85 chr2 72723204 72723474 -109024613 + RLTR20D LTR ERVK 1 278 -290 4 1139 344 299 97 52 chr2 72723450 72723511 -109024576 + RLTR20D LTR ERVK 407 465 -103 4 1139 344 299 97 52 chr2 72723557 72723576 -109024511 + RLTR20D LTR ERVK 466 483 -85 4 1139 344 299 97 52 chr2 72723605 72723678 -109024409 + RLTR20D LTR ERVK 484 568 0 4 1139 1794 109 88 3 chr2 72724722 72725016 -109023071 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 4 1139 513 221 8 38 chr2 72725722 72725854 -109022233 + MLT1A1 LTR MaLR 281 408 0 4 1139 12863 243 58 41 chr2 72730109 72733728 -109014359 + MYSERV6-int LTR ERVK 452 4130 -4829 4 1139 388 91 0 0 chr2 72733728 72733783 -109014304 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 272 4 1139 853 100 170 0 chr2 72735195 72735413 -109012674 - ORR1A3-int LTR MaLR -42 284 30 4 1139 3031 118 28 51 chr2 72735618 72736183 -109011904 - RLTR19-int LTR ERVK -2321 3816 3265 4 1139 1039 143 24 11 chr2 72737146 72737383 -109010704 - RMER6A LTR ERVK -59 697 474 4 1139 561 125 31 0 chr2 72737446 72737542 -109010545 - RMER6A LTR ERVK -341 349 251 4 1139 1984 137 0 3 chr2 72740049 72740363 -109007724 - MTC LTR MaLR -3 418 106 4 1139 1657 148 46 39 chr2 72740363 72740762 -109007325 + RMER16 LTR ERVK 2 533 0 4 1139 398 189 0 0 chr2 72740762 72740836 -109007251 - MTC LTR MaLR -309 112 39 4 1139 3363 43 53 2 chr2 72741108 72741523 -109006564 + RLTR10C LTR ERVK 1 436 0 4 1139 436 192 10 39 chr2 72741547 72741650 -109006437 + MER57A-int LTR ERV1 5813 5912 -275 4 1139 1236 66 44 0 chr2 72743127 72743309 -109004778 + MT2C_Mm LTR ERVL 286 475 0 4 1140 3239 114 43 16 chr2 72747274 72747784 -109000303 - RLTR28 LTR ERVL 0 524 1 4 1140 1381 249 74 5 chr2 72748328 72748720 -108999367 - MTD LTR MaLR 0 419 1 4 1140 1750 99 14 68 chr2 72752279 72752571 -108995516 + ORR1A4 LTR MaLR 1 276 -53 4 1140 252 325 39 62 chr2 72753341 72753469 -108994618 - ORR1D2 LTR MaLR -245 125 1 4 1140 474 354 35 57 chr2 72755688 72756003 -108992084 + MLT1K LTR MaLR 68 375 -220 4 1140 852 282 51 76 chr2 72757284 72757718 -108990369 + BGLII_B LTR ERVK 1 423 -18 4 1140 2178 211 19 36 chr2 72757979 72758511 -108989576 - MT2A LTR ERVL -2 531 9 4 1140 1351 169 129 11 chr2 72758511 72758798 -108989289 + ORR1B1 LTR MaLR 1 321 -73 4 1140 1991 115 63 9 chr2 72758926 72759259 -108988828 + ORR1B1 LTR MaLR 42 392 -2 4 1140 2048 91 3 62 chr2 72762571 72762910 -108985177 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 4 1140 1357 169 71 7 chr2 72764089 72764358 -108983729 - ORR1C2 LTR MaLR -4 380 95 4 1140 566 120 0 10 chr2 72764552 72764653 -108983434 - ORR1C2 LTR MaLR -284 100 1 4 1140 239 343 59 0 chr2 72769082 72769184 -108978903 + ORR1E LTR MaLR 25 132 -227 4 1140 749 219 248 47 chr2 72798196 72798474 -108949613 + ORR1D2 LTR MaLR 1 338 -32 5 1140 236 286 57 89 chr2 72806579 72806702 -108941385 + RMER12 LTR ERVK 701 819 -503 5 1140 995 262 71 127 chr2 72820983 72821377 -108926710 + MTE2a LTR MaLR 8 379 0 6 1140 2224 135 35 95 chr2 72825881 72826363 -108921724 + RLTR11B LTR ERVK 1 453 0 6 1140 679 247 28 81 chr2 72827137 72827387 -108920700 + LTRIS5 LTR ERV1 237 512 -116 6 1140 1283 102 63 0 chr2 72828384 72828589 -108919498 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 177 6 1140 684 194 108 9 chr2 72830273 72830474 -108917613 - MTD LTR MaLR 0 419 180 6 1140 269 246 35 0 chr2 72830659 72830716 -108917371 - MTD LTR MaLR -201 218 160 6 1140 2129 214 19 63 chr2 72830716 72831292 -108916795 - RLTR31_Mur LTR ERVK 0 553 1 6 1140 293 150 131 16 chr2 72831292 72831353 -108916734 - MTD LTR MaLR -254 165 98 6 1140 2514 121 26 40 chr2 72831353 72831775 -108916312 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 584 61 6 1140 2023 155 163 89 chr2 72831922 72832038 -108916049 - MT2C_Mm LTR ERVL -490 94 6 6 1140 518 114 33 22 chr2 72832035 72832125 -108915962 - MTD LTR MaLR -312 109 19 6 1140 271 294 107 16 chr2 72833765 72833886 -108914201 + LTR88c LTR Genie? 9 140 -722 6 1140 1244 256 51 59 chr2 72836417 72836863 -108911224 - RMER19B LTR ERVK -19 883 223 6 1140 787 183 61 117 chr2 72836862 72836959 -108911128 + RMER19C LTR ERVK 379 471 -140 6 1140 787 183 61 117 chr2 72837146 72837295 -108910792 + RMER19C LTR ERVK 472 611 0 6 1140 364 168 88 125 chr2 72837570 72837650 -108910437 - RLTR15 LTR ERVK -228 131 62 6 1140 364 168 88 125 chr2 72837815 72837870 -108910217 - RLTR15 LTR ERVK -298 61 1 6 1140 1281 149 76 50 chr2 72838843 72839146 -108908941 - RMER4A LTR ERVK 0 466 156 6 1140 713 148 0 24 chr2 72839200 72839325 -108908762 - RMER4A LTR ERVK -312 154 33 6 1140 594 252 60 37 chr2 72848603 72848821 -108899266 + LTRIS4 LTR ERV1 285 507 0 6 1140 444 246 29 70 chr2 72848823 72849113 -108898974 + MuRRS4-int LTR ERV1 5 265 -7513 6 1140 1069 209 67 19 chr2 72849586 72849941 -108898146 + MuRRS4-int LTR ERV1 342 875 -6903 6 1140 5033 111 22 16 chr2 72849948 72850705 -108897382 + RMER16-int LTR ERVK 678 1439 -3967 7 1140 308 129 505 0 chr2 72850697 72850790 -108897297 + MuRRS4-int LTR ERV1 750 889 -4174 6 1140 1702 225 117 18 chr2 72851001 72851503 -108896584 + MuRRS4-int LTR ERV1 893 1444 -3619 6 1140 4843 179 86 55 chr2 72851528 72853763 -108894324 + MuRRS4-int LTR ERV1 1140 4271 -792 6 1140 738 226 125 0 chr2 72853754 72853962 -108894125 + MuRRS4-int LTR ERV1 4788 5021 -42 6 1140 1420 98 28 0 chr2 72853963 72854178 -108893909 + LTRIS2 LTR ERV1 1 221 -343 7 1140 1010 277 12 27 chr2 72854184 72854522 -108893565 + MuRRS4-int LTR ERV1 4700 5032 -31 7 1140 618 263 43 14 chr2 72854681 72854889 -108893198 + LTRIS4 LTR ERV1 294 507 0 7 1140 2656 148 9 20 chr2 72855550 72856004 -108892083 + RLTR11B LTR ERVK 5 453 0 7 1140 308 266 218 13 chr2 72860228 72860384 -108887703 + MTD LTR MaLR 232 419 0 7 1140 393 202 50 20 chr2 72862398 72862499 -108885588 + RMER19C LTR ERVK 145 248 -363 7 1140 935 268 74 82 chr2 72863051 72863417 -108884670 + RMER19C LTR ERVK 246 608 -3 7 1140 2107 132 109 63 chr2 72863437 72863689 -108884398 + RLTR23 LTR ERV1 1 274 -156 7 1140 2107 132 109 63 chr2 72863836 72863994 -108884093 + RLTR23 LTR ERV1 275 430 0 7 1140 339 156 0 15 chr2 72864026 72864091 -108883996 - MT2B LTR ERVL -537 64 1 7 1140 855 191 24 39 chr2 72864838 72865045 -108883042 - RMER10B LTR ERVL 0 398 195 7 1140 799 162 9 50 chr2 72865029 72865250 -108882837 - RMER10B LTR ERVL -135 263 52 7 1140 328 315 33 154 chr2 72866173 72866413 -108881674 - MLT1B LTR MaLR 0 390 180 7 1140 1606 132 75 4 chr2 72866624 72866905 -108881182 + IAPEY3_LTR LTR ERVK 27 327 -5 7 1140 1505 160 23 131 chr2 72867202 72867544 -108880543 + ORR1B1 LTR MaLR 41 342 -52 7 1140 1505 160 23 131 chr2 72867723 72867768 -108880319 + ORR1B1 LTR MaLR 343 386 -8 7 1140 377 307 57 104 chr2 72867917 72868215 -108879872 + MLT1A LTR MaLR 13 296 -78 7 1140 4394 80 21 0 chr2 72868236 72868808 -108879279 + MT2B2 LTR ERVL 1 584 0 7 1140 1008 259 86 33 chr2 72868819 72869179 -108878908 - MTE2a LTR MaLR 0 379 1 7 1140 2770 269 57 72 chr2 72869181 72870078 -108878009 - MTE2a-int LTR MaLR -2 1578 701 7 1140 2770 269 57 72 chr2 72870223 72870234 -108877853 - MTE2a-int LTR MaLR -880 700 695 7 1140 2770 269 57 72 chr2 72870422 72870514 -108877573 - MTE2a-int LTR MaLR -886 694 605 7 1140 2770 269 57 72 chr2 72870551 72870582 -108877505 - MTE2a-int LTR MaLR -976 604 562 7 1140 497 288 0 0 chr2 72870593 72870711 -108877376 - MTE2a-int LTR MaLR -1179 401 284 7 1140 405 217 56 9 chr2 72870764 72870871 -108877216 - MTE2b LTR MaLR -267 112 1 7 1140 2171 108 39 6 chr2 72873030 72873366 -108874721 - RLTR20A2 LTR ERVK -230 348 2 7 1141 482 315 49 59 chr2 72882163 72882470 -108865617 - ORR1E LTR MaLR -31 328 25 7 1141 396 260 59 91 chr2 72886499 72886549 -108861538 + MTE2a LTR MaLR 227 277 -142 7 1141 494 206 41 26 chr2 72886732 72886870 -108861217 + MTE2a LTR MaLR 257 406 -13 7 1141 1860 176 40 32 chr2 72891117 72891279 -108856808 + ORR1D1 LTR MaLR 2 169 -205 7 1141 1860 176 40 32 chr2 72891302 72891509 -108856578 + ORR1D1 LTR MaLR 170 374 0 7 1141 2668 35 0 0 chr2 72896676 72897014 -108851073 - ORR1A1 LTR MaLR -8 338 1 8 1141 499 154 46 59 chr2 72901853 72902040 -108846047 + RMER19B LTR ERVK 1 174 -728 8 1141 377 296 295 53 chr2 72910747 72911122 -108836965 + MLT1F2 LTR MaLR 95 560 0 8 1141 361 342 88 7 chr2 72913913 72914060 -108834027 - ORR1E LTR MaLR -186 173 15 8 1141 1805 146 21 9 chr2 72914375 72914707 -108833380 - ORR1B2 LTR MaLR -31 336 1 8 1141 292 281 0 0 chr2 72916430 72916519 -108831568 - MLT1L LTR MaLR -10 600 512 8 1141 1946 230 121 55 chr2 72917049 72917862 -108830225 + RMER17B LTR ERVK 1 879 -27 8 1141 1073 198 55 25 chr2 72917982 72918210 -108829877 + RMER4B LTR ERVK 17 253 -332 8 1141 1073 198 55 25 chr2 72918237 72918283 -108829804 + RMER4B LTR ERVK 254 299 -286 8 1141 341 239 89 5 chr2 72918426 72918578 -108829509 + RMER4B LTR ERVK 352 548 -37 8 1141 1666 159 18 59 chr2 72920031 72920372 -108827715 + ORR1A4 LTR MaLR 3 329 0 8 1141 756 266 48 74 chr2 72922451 72922763 -108825324 + MTEa LTR MaLR 19 322 -57 8 1141 325 59 98 0 chr2 72926092 72926143 -108821944 - ORR1A4 LTR MaLR -65 264 209 8 1141 1509 183 29 61 chr2 72954002 72954328 -108793759 + ORR1C1 LTR MaLR 35 370 -8 9 1141 1590 174 133 20 chr2 72956412 72956757 -108791330 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 9 1141 1182 209 171 13 chr2 72957099 72957434 -108790653 - MTD LTR MaLR -9 410 1 9 1141 247 214 53 116 chr2 72973706 72973801 -108774286 - MT2B LTR ERVL -359 242 154 9 1141 869 309 67 38 chr2 72984202 72984545 -108763542 + ORR1E LTR MaLR 1 353 -6 9 1141 389 288 0 0 chr2 72984561 72984638 -108763449 + MTE-int LTR MaLR 41 117 -1463 9 1141 552 272 78 189 chr2 72985630 72986133 -108761954 + MTE-int LTR MaLR 137 583 -997 9 1141 1572 159 138 21 chr2 72989359 72989686 -108758401 + ORR1D1 LTR MaLR 1 365 -9 9 1141 247 319 24 133 chr2 72992126 72992253 -108755834 + MT2B LTR ERVL 55 158 -443 1 1141 265 291 71 18 chr2 72992605 72992717 -108755370 + MLT1C LTR MaLR 106 223 -244 1 1141 2236 83 3 0 chr2 72992750 72993052 -108755035 + ORR1A2 LTR MaLR 1 303 -24 1 1141 1605 247 19 19 chr2 72998966 72999333 -108748754 - ORR1D2 LTR MaLR -3 367 1 1 1142 740 143 48 0 chr2 73015147 73015273 -108732814 + RMER6B LTR ERVK 3 134 -327 1 1142 512 70 230 0 chr2 73015273 73015373 -108732714 + RMER6B LTR ERVK 67 189 -272 1 1142 1490 191 90 26 chr2 73022290 73022635 -108725452 + ORR1B1 LTR MaLR 28 394 0 2 1142 1921 184 66 10 chr2 73048111 73048506 -108699581 + MTC LTR MaLR 5 421 0 9 1142 2409 79 22 9 chr2 73056047 73056368 -108691719 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 3 1 1142 271 331 22 52 chr2 73056744 73056878 -108691209 + MT2B LTR ERVL 140 269 -332 1 1142 769 153 0 74 chr2 73057731 73057879 -108690208 - ORR1C2 LTR MaLR -247 137 1 1 1142 1696 172 54 12 chr2 73057879 73058215 -108689872 - ORR1D1 LTR MaLR -22 352 3 1 1142 1904 209 64 8 chr2 73061085 73061476 -108686611 - MTC LTR MaLR -8 413 1 1 1142 311 286 279 50 chr2 73062176 73062434 -108685653 - MLT1H2-int LTR MaLR 0 1409 1093 1 1142 318 248 97 67 chr2 73062586 73062720 -108685367 - MLT1H2 LTR MaLR -7 482 345 1 1142 479 281 81 14 chr2 73062738 73062886 -108685201 + MLT1A LTR MaLR 1 158 -216 1 1142 439 283 123 25 chr2 73063510 73063673 -108684414 - MLT2B3 LTR ERVL -50 504 326 1 1142 467 271 0 16 chr2 73066080 73066204 -108681883 + MLT1B LTR MaLR 4 125 -265 1 1142 470 215 0 40 chr2 73066208 73066336 -108681751 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 245 1 1142 318 229 170 9 chr2 73068192 73068298 -108679789 - MLT1F1 LTR MaLR -169 400 278 1 1142 546 264 201 14 chr2 73068517 73068736 -108679351 - MLT1F1 LTR MaLR -245 324 65 1 1142 1078 209 223 13 chr2 73068856 73069157 -108678930 - ORR1D1 LTR MaLR -7 367 4 1 1142 2347 73 66 0 chr2 73072138 73072455 -108675632 + ORR1A1 LTR MaLR 1 338 -8 1 1142 14206 54 7 1 chr2 73072459 73074241 -108673846 + ORR1A1-int LTR MaLR 1 1792 0 1 1142 2335 75 62 6 chr2 73074241 73074561 -108673526 + ORR1A1 LTR MaLR 1 338 -8 1 1142 288 174 31 102 chr2 73080337 73080465 -108667622 - RMER17C LTR ERVK -135 275 157 1 1142 265 341 15 52 chr2 73081035 73081171 -108666916 - RMER15 LTR ERVL -164 411 281 1 1142 2522 122 52 7 chr2 73084218 73084621 -108663466 + MTC LTR MaLR 1 421 0 1 1142 628 309 85 71 chr2 73084931 73085220 -108662867 + ORR1E LTR MaLR 3 300 -59 1 1142 1533 231 42 14 chr2 73085220 73085580 -108662507 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 1 1142 628 309 85 71 chr2 73085580 73085642 -108662445 + ORR1E LTR MaLR 301 359 0 1 1142 731 312 66 19 chr2 73085644 73085902 -108662185 + ORR1E-int LTR MaLR 1 270 -1310 1 1142 1713 112 34 11 chr2 73085957 73086219 -108661868 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 59 1 1142 773 241 6 0 chr2 73086224 73086382 -108661705 - ORR1E-int LTR MaLR -1421 159 1 1 1142 1077 248 98 39 chr2 73086386 73086721 -108661366 - ORR1E LTR MaLR -2 357 3 1 1142 475 340 54 105 chr2 73087991 73088418 -108659669 - MLT1A1 LTR MaLR -3 405 1 1 1142 2320 204 49 121 chr2 73090619 73091272 -108656815 + RMER19C LTR ERVK 1 606 -5 2 1142 1356 314 95 38 chr2 73093755 73094314 -108653773 + MLT1G3 LTR MaLR 5 595 0 2 1142 1268 222 129 22 chr2 73094374 73094737 -108653350 - MTD LTR MaLR 0 419 18 2 1142 1120 247 16 7 chr2 73094766 73095001 -108653086 + MTE2b LTR MaLR 29 247 -132 2 1142 302 271 31 10 chr2 73121759 73121856 -108626231 + MLT1D LTR MaLR 354 452 -53 2 1142 1000 171 46 32 chr2 73132052 73132269 -108615818 - ORR1C1 LTR MaLR -2 376 157 2 1142 366 207 115 45 chr2 73135629 73135786 -108612301 + RLTR15 LTR ERVK 1 168 -191 2 1143 764 189 72 26 chr2 73140922 73141117 -108606970 + ORR1D1 LTR MaLR 171 374 0 2 1143 3330 53 2 2 chr2 73143002 73143402 -108604685 + MTB LTR MaLR 1 400 0 2 1143 1704 180 222 27 chr2 73143405 73143809 -108604278 + MT2A LTR ERVL 1 488 -45 2 1143 1704 180 222 27 chr2 73143830 73143871 -108604216 + MT2A LTR ERVL 489 533 0 2 1143 2324 140 42 3 chr2 73146953 73147332 -108600755 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 3 1143 1096 210 21 108 chr2 73160818 73161143 -108586944 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 88 3 1143 272 100 0 0 chr2 73176910 73176950 -108571137 - RMER19C LTR ERVK -3 608 569 3 1143 2697 130 145 55 chr2 73178732 73179262 -108568825 - RMER19C LTR ERVK -33 578 1 3 1143 4032 133 102 17 chr2 73182106 73182802 -108565285 - RMER6A LTR ERVK -1 755 1 3 1143 2858 58 3 0 chr2 73196052 73196378 -108551709 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 4 1143 1285 176 139 0 chr2 73197159 73197397 -108550690 + MTD LTR MaLR 149 419 0 4 1143 5041 182 60 134 chr2 73197397 73198755 -108549332 + MTD-int LTR MaLR 1 1258 0 4 1143 1253 201 37 87 chr2 73198757 73199056 -108549031 + MTD LTR MaLR 3 286 -133 4 1143 964 277 109 62 chr2 73233526 73233958 -108514129 - MLT1D LTR MaLR -4 501 50 4 1143 1088 261 47 133 chr2 73235846 73236230 -108511857 - MTE2a LTR MaLR -20 359 9 4 1143 248 347 125 81 chr2 73236466 73236786 -108511301 - MLT1K LTR MaLR -100 495 162 4 1143 2947 131 36 36 chr2 73238431 73238955 -108509132 - RLTR28 LTR ERVL 0 524 1 4 1143 332 345 78 78 chr2 73239078 73239424 -108508663 + MLT1A1 LTR MaLR 61 406 -2 4 1143 866 339 48 38 chr2 73239507 73239903 -108508184 - MLT1C LTR MaLR 0 467 68 4 1143 3549 114 104 11 chr2 73242970 73243486 -108504601 - RMER19C LTR ERVK 0 611 54 4 1143 3549 114 104 11 chr2 73243526 73243568 -108504519 - RMER19C LTR ERVK -558 53 3 4 1143 640 206 0 22 chr2 73243797 73243925 -108504162 + RLTR11B LTR ERVK 1 125 -328 4 1143 2758 146 30 32 chr2 73243925 73244450 -108503637 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 524 -3 4 1143 840 111 16 0 chr2 73244921 73245047 -108503040 - RMER15 LTR ERVL -5 570 443 4 1143 1182 128 28 60 chr2 73245004 73245220 -108502867 + RLTR28 LTR ERVL 162 370 -154 4 1143 269 290 28 12 chr2 73246748 73246856 -108501231 + MLT1D LTR MaLR 37 149 -356 4 1143 378 261 110 15 chr2 73247000 73247136 -108500951 + MLT1D LTR MaLR 349 497 -8 4 1143 265 324 170 23 chr2 73257485 73257744 -108490343 + LTR78 LTR ERV1 564 860 -444 5 1143 252 268 111 44 chr2 73257891 73257981 -108490106 + LTR78 LTR ERV1 1116 1211 -93 5 1143 1959 147 73 17 chr2 73260004 73260358 -108487729 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 5 1143 1620 230 76 0 chr2 73262571 73262953 -108485134 + MTD LTR MaLR 1 411 -8 5 1143 243 270 102 74 chr2 73264728 73264746 -108483341 + MT2B LTR ERVL 145 165 -436 5 1143 897 226 139 20 chr2 73266808 73267052 -108481035 + MTEa LTR MaLR 30 302 -77 5 1144 2989 51 3 11 chr2 73270565 73270943 -108477144 + MTB LTR MaLR 1 375 -25 5 1144 278 309 108 23 chr2 73280267 73280396 -108467691 + ORR1E LTR MaLR 4 143 -216 5 1144 279 271 11 23 chr2 73280597 73280684 -108467403 + MLT1A1 LTR MaLR 311 396 -12 5 1144 325 284 23 0 chr2 73294776 73294864 -108453223 + MTD LTR MaLR 18 107 -312 5 1144 379 325 72 13 chr2 73295971 73296124 -108451963 + MLT1K LTR MaLR 123 284 -311 5 1144 276 254 22 44 chr2 73299622 73299758 -108448329 + ORR1B1-int LTR MaLR 622 754 -755 5 1144 1042 319 70 72 chr2 73313525 73314011 -108434076 - MLT1F2 LTR MaLR 0 560 76 6 1144 665 284 60 5 chr2 73318947 73319131 -108428956 + MER21B LTR ERV1 446 639 -224 6 1144 428 306 84 26 chr2 73319200 73319391 -108428696 + MER21B LTR ERV1 629 830 -33 6 1144 304 370 0 9 chr2 73321422 73321531 -108426556 + MLT1A1 LTR MaLR 22 129 -279 6 1144 243 311 22 11 chr2 73321769 73321860 -108426227 + MTEb LTR MaLR 278 369 -10 6 1144 275 297 88 5 chr2 73333577 73333708 -108414379 + MER74B LTR ERVL 43 229 -393 6 1144 537 317 46 63 chr2 73333702 73333962 -108414125 + MER74B LTR ERVL 129 517 -105 6 1144 536 127 0 44 chr2 73335197 73335288 -108412799 - RMER4A LTR ERVK -2 464 378 6 1144 1767 104 34 15 chr2 73335286 73335549 -108412538 - RMER4A LTR ERVK -198 268 1 6 1144 2084 111 6 60 chr2 73335835 73336171 -108411916 + ORR1A3 LTR MaLR 1 318 -8 6 1144 512 338 87 74 chr2 73336983 73337293 -108410794 - MLT1G LTR MaLR 0 591 278 6 1144 491 309 40 87 chr2 73337725 73337994 -108410093 - MLT1G LTR MaLR -359 232 8 6 1144 295 209 89 37 chr2 73341363 73341467 -108406620 + MLT1H LTR MaLR 1 109 -380 6 1144 349 284 85 47 chr2 73341551 73341680 -108406407 + MLT1H LTR MaLR 408 541 -8 6 1144 1125 260 62 81 chr2 73341694 73342037 -108406050 + ORR1D2 LTR MaLR 9 353 -17 6 1144 1125 260 62 81 chr2 73342220 73342244 -108405843 + ORR1D2 LTR MaLR 354 369 -1 6 1144 1044 271 44 65 chr2 73351531 73351917 -108396170 + RMER17C LTR ERVK 1 378 -32 7 1144 226 281 118 35 chr2 73352389 73352474 -108395613 + MLT1H2 LTR MaLR 276 367 -122 7 1144 2145 160 11 87 chr2 73352478 73352950 -108395137 + RMER17C-int LTR ERVK 1206 1641 -1597 7 1144 314 244 131 48 chr2 73361289 73361457 -108386630 - LTR77 LTR ERV1 -32 590 409 7 1144 258 189 24 129 chr2 73363407 73363492 -108384595 + MT2B2 LTR ERVL 175 250 -334 7 1144 638 294 209 24 chr2 73370303 73370763 -108377324 - MLT1E3 LTR MaLR 0 653 61 7 1144 840 282 73 19 chr2 73371770 73372030 -108376057 - MLT1F LTR MaLR -3 545 272 7 1144 801 316 60 60 chr2 73372031 73372398 -108375689 + MTEa LTR MaLR 13 379 0 7 1144 1089 291 147 15 chr2 73372398 73372792 -108375295 + MTEa-int LTR MaLR 1 446 -1134 7 1144 577 270 166 32 chr2 73372807 73373128 -108374959 + MTD LTR MaLR 8 419 0 7 1144 1677 282 168 25 chr2 73373934 73374643 -108373444 + MTEa-int LTR MaLR 736 1545 -35 7 1144 234 287 54 54 chr2 73375283 73375375 -108372712 + MTEb LTR MaLR 287 378 -1 7 1144 309 268 87 87 chr2 73375435 73375535 -108372552 - MLT1F LTR MaLR -356 204 117 7 1144 309 268 87 87 chr2 73375647 73375718 -108372369 - MLT1F LTR MaLR -444 116 33 7 1144 226 363 76 6 chr2 73375999 73376157 -108371930 - LTR33 LTR ERVL -14 501 333 7 1144 535 308 95 64 chr2 73378565 73378988 -108369099 - MER74B LTR ERVL -93 529 94 7 1144 244 207 67 33 chr2 73379887 73379947 -108368140 + MER50B LTR ERV1 99 160 -537 7 1144 2327 77 29 0 chr2 73382720 73383030 -108365057 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 7 1144 297 298 62 45 chr2 73384466 73384642 -108363445 - BGLII_B LTR ERVK -154 287 109 7 1144 3166 58 7 15 chr2 73392025 73392428 -108355659 + MTB LTR MaLR 1 400 0 7 1144 1118 179 31 0 chr2 73395697 73395893 -108352194 - RLTR40 LTR ERVK -615 202 1 8 1144 2330 206 35 77 chr2 73396377 73396799 -108351288 + RMER19C LTR ERVK 1 393 -218 8 1144 2330 206 35 77 chr2 73396993 73397207 -108350880 + RMER19C LTR ERVK 394 610 -1 8 1144 383 260 22 80 chr2 73397227 73397239 -108350848 + ORR1E LTR MaLR 64 75 -284 8 1144 5020 41 3 2 chr2 73397239 73397825 -108350262 - LTRIS_Mus LTR ERV1 0 587 1 8 1144 383 251 327 70 chr2 73397825 73398029 -108350058 + ORR1E LTR MaLR 76 332 -47 8 1144 445 307 0 74 chr2 73398108 73398256 -108349831 - MTEa LTR MaLR -242 137 1 8 1144 2644 201 54 37 chr2 73398496 73399090 -108348997 + RMER20B LTR ERVK 10 613 -14 8 1144 378 296 39 46 chr2 73399424 73399597 -108348490 - MLT1A0 LTR MaLR -185 180 4 8 1145 516 303 119 34 chr2 73406446 73406682 -108341405 + MLT1B LTR MaLR 120 375 -15 8 1145 740 269 73 95 chr2 73411517 73411916 -108336171 + MLT1B LTR MaLR 1 390 0 8 1145 251 325 13 44 chr2 73412019 73412177 -108335910 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1308 1460 -388 8 1145 391 316 112 37 chr2 73419919 73420080 -108328007 - MLT1J1-int LTR MaLR -1171 216 44 8 1145 372 286 80 36 chr2 73420371 73420509 -108327578 - MLT1J1 LTR MaLR -19 425 282 8 1145 1905 179 14 73 chr2 73423566 73423989 -108324098 + RMER10B LTR ERVL 1 398 0 8 1145 1141 209 8 39 chr2 73424598 73424852 -108323235 + MTC LTR MaLR 176 421 0 8 1145 1790 105 70 118 chr2 73433392 73433640 -108314447 - RMER17C LTR ERVK 0 410 185 8 1145 1790 105 70 118 chr2 73433805 73433987 -108314100 - RMER17C LTR ERVK -226 184 1 8 1145 1983 103 6 59 chr2 73435439 73435779 -108312308 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 8 1145 3567 20 2 0 chr2 73437570 73437965 -108310122 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 8 1145 416 311 98 43 chr2 73437998 73438259 -108309828 - MLT1B LTR MaLR -89 301 15 8 1145 1633 229 100 9 chr2 73443653 73444093 -108303994 - RLTR11A2 LTR ERVK 0 527 48 9 1145 1237 211 53 17 chr2 73444157 73444590 -108303497 + RLTR20B3 LTR ERVK 80 559 -1 9 1145 248 228 217 49 chr2 73447171 73447397 -108300690 + MER74B LTR ERVL 124 387 -235 9 1145 1421 228 69 31 chr2 73458797 73459187 -108288900 - MTD LTR MaLR -10 409 5 9 1145 279 213 145 72 chr2 73463562 73463714 -108284373 + MLT1A1 LTR MaLR 51 213 -195 9 1145 1386 190 174 28 chr2 73474494 73474856 -108273231 + MTD LTR MaLR 3 417 -2 9 1145 3056 32 0 0 chr2 73481245 73481591 -108266496 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 9 1145 231 220 121 60 chr2 73487051 73487167 -108260920 - MT2B LTR ERVL -342 259 137 9 1145 1004 257 127 24 chr2 73491767 73492146 -108255941 - MTD LTR MaLR -1 418 1 1 1145 929 198 0 6 chr2 73503257 73503420 -108244667 - MTD LTR MaLR -240 179 18 9 1145 3351 46 2 0 chr2 73503724 73504119 -108243968 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 1145 1900 71 21 7 chr2 73504119 73504403 -108243684 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 811 1 1145 738 268 189 26 chr2 73505179 73505486 -108242601 + MTC LTR MaLR 13 369 -52 1 1145 269 153 0 106 chr2 73510881 73510947 -108237140 + RLTR25B LTR ERVK 440 498 -530 2 1145 4537 143 19 2 chr2 73510908 73511698 -108236389 + ORR1B1-int LTR MaLR 707 1509 0 2 1145 363 207 24 12 chr2 73511698 73511781 -108236306 + ORR1B1 LTR MaLR 1 84 -283 2 1145 926 157 38 6 chr2 73511793 73511953 -108236134 + ORR1B1 LTR MaLR 222 386 -8 2 1145 2284 149 85 5 chr2 73513183 73513573 -108234514 + MTC LTR MaLR 1 421 0 2 1145 1058 252 83 18 chr2 73527349 73527688 -108220399 + MTE2b LTR MaLR 19 379 0 4 1146 275 347 31 83 chr2 73538003 73538263 -108209824 + RMER4A LTR ERVK 12 266 -319 6 1146 3036 118 6 27 chr2 73540603 73541082 -108207005 + RLTR31B_Mm LTR ERVK 1 469 -88 6 1146 2163 183 22 17 chr2 73561755 73562166 -108185921 - MTC LTR MaLR -8 413 1 1 1146 240 339 90 58 chr2 73562788 73562976 -108185111 + MER77 LTR ERVL 328 521 -86 1 1146 1503 224 87 6 chr2 73573592 73573924 -108174163 - MTD LTR MaLR 0 419 61 1 1146 1111 243 107 61 chr2 73577350 73577845 -108170242 - RMER5 LTR ERV1 0 534 17 1 1146 291 217 20 89 chr2 73580944 73581045 -108167042 + RLTR25B LTR ERVK 428 521 -507 1 1146 2360 97 3 9 chr2 73585849 73586183 -108161904 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 332 -5 1 1146 56159 22 14 11 chr2 73586183 73592639 -108155448 + IAPEz-int LTR ERVK 6 6479 -2 1 1146 2591 93 3 9 chr2 73592641 73592978 -108155109 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 335 -2 1 1146 240 292 32 89 chr2 73596555 73596581 -108151506 + MER31B LTR ERV1 23 48 -418 1 1146 240 292 32 89 chr2 73596762 73596893 -108151194 + MER31B LTR ERV1 49 170 -296 1 1146 475 257 56 41 chr2 73596954 73597149 -108150938 - RLTR12B LTR ERVK -24 504 307 1 1146 593 280 25 94 chr2 73597233 73597437 -108150650 - RLTR11A2 LTR ERVK -270 257 65 1 1146 593 280 25 94 chr2 73597584 73597655 -108150432 - RLTR11A2 LTR ERVK -463 64 1 1 1146 4696 181 51 74 chr2 73597655 73598695 -108149392 - MYSERV6-int LTR ERVK -2 8957 7914 1 1146 4696 181 51 74 chr2 73598883 73599074 -108149013 - MYSERV6-int LTR ERVK -1046 7913 7754 1 1146 317 342 79 24 chr2 73599102 73599267 -108148820 - RMER4A LTR ERVK -42 424 251 1 1146 486 221 28 42 chr2 73599272 73599414 -108148673 - MurERV4_19-int LTR ERVK -414 5366 5227 1 1146 269 240 71 141 chr2 73599783 73599908 -108148179 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -1595 731 608 1 1146 330 149 149 0 chr2 73606053 73606120 -108141967 - ORR1D1 LTR MaLR -2 372 296 1 1146 639 124 15 83 chr2 73606119 73606251 -108141836 - ORR1D1 LTR MaLR -249 125 3 1 1146 3777 239 131 38 chr2 73606251 73607501 -108140586 - ORR1D1-int LTR MaLR -3 1367 1 1 1146 1050 217 145 82 chr2 73607501 73607570 -108140517 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 308 1 1146 1050 217 145 82 chr2 73607823 73608063 -108140024 - ORR1D1 LTR MaLR -67 307 35 1 1146 1050 217 145 82 chr2 73608089 73608123 -108139964 - ORR1D1 LTR MaLR -340 34 3 1 1146 1427 170 8 26 chr2 73622324 73622590 -108125497 - RMER19B LTR ERVK 0 902 642 2 1146 2424 92 124 3 chr2 73624928 73625276 -108122811 - RLTR10 LTR ERVK 0 390 1 2 1146 3773 149 121 75 chr2 73627064 73627910 -108120177 - RMER19B LTR ERVK -17 885 1 2 1146 831 301 67 73 chr2 73632129 73632470 -108115617 + MTEa LTR MaLR 1 339 -40 2 1146 1458 211 25 22 chr2 73632705 73633024 -108115063 - RLTR46 LTR ERVK 0 320 1 2 1146 845 174 66 0 chr2 73636833 73637000 -108111087 - RLTR30 LTR ERV1 0 379 202 2 1146 3520 76 19 82 chr2 73637979 73638493 -108109594 + RLTR45 LTR ERVK 1 482 0 2 1146 953 266 109 17 chr2 73638885 73639179 -108108908 + MTEa LTR MaLR 47 367 -12 2 1146 1945 133 58 64 chr2 73639625 73639986 -108108101 + RLTR15 LTR ERVK 1 359 0 2 1146 867 257 60 155 chr2 73642260 73642679 -108105408 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 2 1146 2544 142 140 16 chr2 73644627 73645135 -108102952 + RMER4B LTR ERVK 15 585 0 2 1146 338 143 29 0 chr2 73647097 73647167 -108100920 - RLTR14 LTR ERV1 -140 242 171 2 1146 2273 116 0 3 chr2 73647675 73647995 -108100092 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 2 1146 1432 205 107 71 chr2 73649593 73649788 -108098299 + MTD LTR MaLR 5 193 -226 2 1146 1432 205 107 71 chr2 73649936 73650133 -108097954 + MTD LTR MaLR 194 411 -8 2 1146 624 280 133 66 chr2 73650929 73650975 -108097112 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 328 2 1146 624 280 133 66 chr2 73651119 73651298 -108096789 - ORR1D2 LTR MaLR -43 327 130 2 1146 617 221 30 0 chr2 73651420 73651551 -108096536 - ORR1D2 LTR MaLR -235 135 1 2 1147 2528 81 46 3 chr2 73664943 73665313 -108082774 + BGLII LTR ERVK 1 386 -35 3 1147 239 200 101 58 chr2 73669024 73669093 -108078994 + MT2B LTR ERVL 167 238 -363 3 1147 704 273 45 31 chr2 73675384 73675671 -108072416 + RLTR15 LTR ERVK 53 343 -16 3 1147 1205 61 42 0 chr2 73678734 73678899 -108069188 + MTA_Mm LTR MaLR 225 396 0 3 1147 4470 73 115 17 chr2 73678898 73679785 -108068302 + MTA_Mm-int LTR MaLR 2 1136 -122 3 1147 312 260 18 99 chr2 73699697 73699808 -108048279 - MLT1A1 LTR MaLR -306 102 1 3 1147 392 316 167 17 chr2 73704814 73704988 -108043099 + MLT1G LTR MaLR 3 202 -389 4 1147 470 332 105 17 chr2 73718923 73719162 -108028925 - MLT1J LTR MaLR -138 374 115 4 1147 786 229 74 11 chr2 73720836 73721026 -108027061 + ORR1C1 LTR MaLR 1 202 -176 4 1147 517 290 167 28 chr2 73721090 73721342 -108026745 + MLT1E2 LTR MaLR 1 287 -340 4 1147 341 308 22 0 chr2 73721421 73721512 -108026575 + MLT1E2 LTR MaLR 403 495 -132 4 1147 1759 172 40 17 chr2 73724929 73725372 -108022715 + RMER17C LTR ERVK 16 439 -519 4 1147 280 265 28 93 chr2 73725447 73725555 -108022532 + MT2B LTR ERVL 156 256 -345 4 1147 258 169 208 14 chr2 73733638 73733710 -108014377 + RMER10A LTR ERVL 119 204 -238 4 1147 601 187 21 37 chr2 73733671 73733816 -108014271 - RMER10A LTR ERVL -236 162 10 4 1147 637 281 122 45 chr2 73736799 73737134 -108010953 + RMER13A LTR ERVK 19 379 -481 5 1147 1739 159 115 9 chr2 73737623 73737953 -108010134 + ORR1B2 LTR MaLR 3 367 0 5 1147 283 266 17 29 chr2 73739794 73739915 -108008172 + RLTR43A LTR ERVK 243 365 0 5 1147 431 84 32 126 chr2 73740277 73740328 -108007759 + MTD LTR MaLR 333 381 -38 5 1147 431 84 32 126 chr2 73740517 73740560 -108007527 + MTD LTR MaLR 382 418 -1 5 1147 2897 21 42 0 chr2 73741195 73741527 -108006560 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 5 1147 2079 98 3 138 chr2 73742862 73743164 -108004923 + ORR1A2 LTR MaLR 1 275 -52 5 1147 2079 98 3 138 chr2 73743483 73743555 -108004532 + ORR1A2 LTR MaLR 276 327 0 5 1147 433 143 0 0 chr2 73745008 73745078 -108003009 + RMER15 LTR ERVL 4 73 -502 5 1147 1040 183 136 0 chr2 73745081 73745316 -108002771 + RMER15 LTR ERVL 309 575 0 5 1147 1548 156 53 58 chr2 73750264 73750624 -107997463 - ORR1B2 LTR MaLR -8 359 2 5 1147 1188 280 71 50 chr2 73756864 73757327 -107990760 + MLT1D LTR MaLR 29 501 -4 5 1147 4364 102 118 16 chr2 73758375 73759109 -107988978 - RMER17D2 LTR ERVK 0 809 1 5 1147 646 249 46 0 chr2 73765246 73765419 -107982668 + MTD LTR MaLR 239 419 0 5 1147 3412 43 2 0 chr2 73766783 73767182 -107980905 - MTB LTR MaLR 0 400 1 5 1147 7392 90 4 75 chr2 73767183 73768362 -107979725 - MTB-int LTR MaLR -2 1096 1 5 1147 3181 58 8 5 chr2 73768362 73768761 -107979326 - MTB LTR MaLR 0 400 1 5 1147 317 356 81 0 chr2 73769794 73769943 -107978144 + LTR16A LTR ERVL 12 172 -279 5 1147 252 297 0 0 chr2 73770032 73770106 -107977981 + LTR16A LTR ERVL 319 392 -59 5 1147 3288 53 53 10 chr2 73774242 73774660 -107973427 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 6 1147 704 280 50 10 chr2 73775021 73775223 -107972864 - MTD LTR MaLR -209 210 1 6 1147 439 255 66 13 chr2 73775375 73775526 -107972561 + MLT1C LTR MaLR 3 161 -306 6 1147 3024 86 46 52 chr2 73776376 73776854 -107971233 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 6 1147 1315 239 61 72 chr2 73779108 73779483 -107968604 + MTE2a LTR MaLR 2 372 -7 6 1147 2275 142 78 78 chr2 73779483 73779904 -107968183 - MTC LTR MaLR 0 421 1 6 1147 1428 182 21 39 chr2 73781817 73782102 -107965985 - ORR1B2 LTR MaLR -87 280 1 6 1147 1167 257 109 52 chr2 73783189 73783629 -107964458 + RMER13A LTR ERVK 1 465 -395 6 1147 236 318 130 67 chr2 73787134 73787373 -107960714 + MLT1J1 LTR MaLR 69 322 -122 6 1148 3048 40 0 31 chr2 73799805 73800162 -107947925 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 6 1148 2211 229 25 54 chr2 73822563 73823118 -107924969 - RLTR20A LTR ERVK -2 539 1 6 1148 1271 141 116 25 chr2 73823118 73823402 -107924685 - MYSERV16_I-int LTR ERVK 0 2326 2017 6 1148 847 141 0 15 chr2 73823402 73823532 -107924555 + RLTR20A LTR ERVK 414 541 0 6 1148 263 315 43 0 chr2 73830949 73831041 -107917046 + MLT1B LTR MaLR 16 111 -279 7 1148 240 193 95 74 chr2 73831401 73831496 -107916591 + MLT1B LTR MaLR 132 228 -162 7 1148 231 283 0 0 chr2 73831603 73831663 -107916424 + MLT1B LTR MaLR 327 386 -4 7 1148 398 323 42 18 chr2 73831680 73831847 -107916240 - RMER17C LTR ERVK -34 376 206 7 1148 227 213 0 0 chr2 73832032 73832079 -107916008 - RMER17C LTR ERVK -363 47 1 7 1148 332 156 62 0 chr2 73835512 73835576 -107912511 - MER34 LTR ERV1 -71 471 404 7 1148 2974 19 0 0 chr2 73838880 73839247 -107908840 - MT2_Mm LTR ERVL -126 367 1 7 1148 309 26 0 0 chr2 73839247 73839285 -107908802 - MERVL-int LTR ERVL 0 5485 5448 7 1148 336 179 46 35 chr2 73839285 73839372 -107908715 - ORR1A3-int LTR MaLR -1323 640 553 7 1148 5279 29 69 0 chr2 73839376 73840002 -107908085 - MERVL-int LTR ERVL -130 5355 4687 7 1148 3166 144 0 0 chr2 73840001 73840466 -107907621 - MERVL_2A-int LTR ERVL -3795 1966 1502 7 1148 608 231 153 50 chr2 73842407 73842648 -107905439 + MTD LTR MaLR 153 418 -1 7 1148 2826 198 192 44 chr2 73843295 73844059 -107904028 + RMER13B LTR ERVK 1 877 -31 7 1148 1120 177 214 20 chr2 73844969 73845165 -107902922 + RMER17C LTR ERVK 1 211 -199 7 1148 1120 177 214 20 chr2 73845273 73845416 -107902671 + RMER17C LTR ERVK 212 406 -4 7 1148 1141 160 91 212 chr2 73847996 73848408 -107899679 + MTD LTR MaLR 2 361 -58 7 1148 3295 123 10 60 chr2 73848408 73848995 -107899092 + RMER19C LTR ERVK 3 560 -51 7 1148 1988 212 68 148 chr2 73850744 73851408 -107896679 - RMER19C LTR ERVK 0 611 1 7 1148 405 332 153 8 chr2 73854185 73854442 -107893645 - MER21B LTR ERV1 -546 317 23 7 1148 2287 111 12 0 chr2 73885967 73886292 -107861795 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 7 1148 2014 151 24 0 chr2 73886292 73886539 -107861548 + ORR1A4-int LTR MaLR 1 256 -1707 7 1148 2521 199 6 159 chr2 73886539 73887261 -107860826 - RMER19C LTR ERVK 0 611 1 7 1148 2014 151 24 0 chr2 73887261 73887384 -107860703 + ORR1A4-int LTR MaLR 257 379 -1584 7 1148 965 103 83 18 chr2 73887488 73887656 -107860431 + ORR1A4 LTR MaLR 151 329 0 7 1148 544 318 55 55 chr2 73890933 73891259 -107856828 - MLT1C LTR MaLR -9 458 133 8 1148 503 276 124 84 chr2 73892987 73893416 -107854671 - MLT1C LTR MaLR -8 459 6 8 1148 1429 202 76 25 chr2 73896320 73896508 -107851579 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 177 8 1148 1429 202 76 25 chr2 73896576 73896597 -107851490 - ORR1D1 LTR MaLR -198 176 139 8 1148 1429 202 76 25 chr2 73896800 73896945 -107851142 - ORR1D1 LTR MaLR -236 138 1 8 1148 1033 249 54 14 chr2 73920748 73921102 -107826985 + MTD LTR MaLR 21 419 0 8 1149 1514 158 90 23 chr2 73930923 73931266 -107816821 - ORR1D1 LTR MaLR -8 366 1 8 1149 1434 248 31 17 chr2 73933528 73933885 -107814202 - MTD LTR MaLR 0 419 58 8 1149 1089 212 4 31 chr2 73940974 73941203 -107806884 + RMER19B LTR ERVK 107 329 -573 8 1149 2613 137 25 0 chr2 73941207 73941638 -107806449 + RMER19B LTR ERVK 449 890 -12 8 1149 2210 109 15 9 chr2 73944156 73944481 -107803606 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 8 1149 326 319 50 25 chr2 73945449 73945568 -107802519 - MLT1J1 LTR MaLR -284 160 39 8 1149 375 348 80 80 chr2 73945712 73946049 -107802038 + MLT1A LTR MaLR 38 374 0 8 1149 1081 256 4 17 chr2 73947960 73948198 -107799889 + ORR1D2 LTR MaLR 40 274 -96 8 1149 2695 99 2 81 chr2 73948204 73948687 -107799400 + RLTR11B LTR ERVK 1 445 -8 8 1149 290 304 160 38 chr2 73960862 73961074 -107787013 + MLT1H2 LTR MaLR 1 238 -251 9 1149 375 279 219 33 chr2 73962391 73962665 -107785422 - MLT1C LTR MaLR -78 389 65 9 1149 894 165 47 93 chr2 73963432 73963646 -107784441 - MTD LTR MaLR -20 399 196 9 1149 1009 275 44 52 chr2 73975495 73975901 -107772186 + MLT1A1 LTR MaLR 1 403 -5 9 1149 480 351 84 33 chr2 73976660 73977087 -107771000 - LTR81B LTR ERV1? -921 472 24 9 1149 3071 125 42 4 chr2 73978874 73979379 -107768708 - RLTR28 LTR ERVL 0 524 1 9 1149 1092 151 11 16 chr2 73988017 73988195 -107759892 - MTB_Mm LTR MaLR 0 421 245 9 1149 2073 127 72 6 chr2 73988195 73988543 -107759544 - ORR1B1 LTR MaLR -1 393 23 9 1149 1227 152 0 57 chr2 73988539 73988784 -107759303 - MTB_Mm LTR MaLR -176 231 1 9 1149 236 306 101 10 chr2 73989722 73989821 -107758266 - MLT1I LTR MaLR -303 108 1 9 1149 2580 120 29 0 chr2 73996527 73996910 -107751177 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 9 1149 243 281 79 40 chr2 73997986 73998112 -107749975 - ORR1E LTR MaLR -228 131 1 9 1149 382 275 141 60 chr2 73998259 73998422 -107749665 - MLT1B LTR MaLR -34 356 201 9 1149 382 275 141 60 chr2 73998461 73998545 -107749542 - MLT1B LTR MaLR -190 200 90 9 1149 408 224 12 12 chr2 74002185 74002271 -107745816 - RLTR28B LTR ERVL -395 86 1 4 1149 1505 211 94 0 chr2 74014463 74014805 -107733282 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 2 1149 989 295 98 57 chr2 74014995 74015524 -107732563 - MLT1F2 LTR MaLR -7 553 3 2 1149 1341 94 28 0 chr2 74018621 74018833 -107729254 - ORR1B1 LTR MaLR -176 218 1 3 1149 275 315 50 83 chr2 74020036 74020371 -107727716 - MTEb LTR MaLR -2 377 32 3 1149 265 350 63 88 chr2 74020560 74020594 -107727493 - MTEb LTR MaLR -328 31 1 3 1149 412 160 58 124 chr2 74022352 74022473 -107725614 + MT2B LTR ERVL 144 256 -345 4 1149 623 286 49 91 chr2 74023187 74023537 -107724550 - ORR1E LTR MaLR 0 359 25 4 1149 1993 71 261 8 chr2 74023707 74024090 -107723997 - RLTR44C LTR ERVK -19 483 4 4 1149 237 234 75 38 chr2 74028048 74028128 -107719959 + MLT2D LTR ERVL 396 478 -82 5 1149 1707 214 48 20 chr2 74030336 74030736 -107717351 + MTD LTR MaLR 1 411 -8 5 1150 392 243 89 41 chr2 74061989 74062135 -107685952 + MLT1A LTR MaLR 15 167 -207 8 1150 352 282 233 7 chr2 74062743 74062893 -107685194 + MLT1A LTR MaLR 191 374 0 8 1150 907 244 78 72 chr2 74066445 74066790 -107681297 - ORR1E LTR MaLR -12 347 1 9 1150 254 246 0 0 chr2 74071695 74071752 -107676335 + MLT1J2 LTR MaLR 92 148 -300 9 1150 2052 162 50 0 chr2 74073741 74074100 -107673987 + MTC LTR MaLR 1 377 -44 1 1150 278 325 242 17 chr2 74087281 74087527 -107660560 - MLT1I LTR MaLR -20 391 91 1 1150 380 329 64 21 chr2 74087578 74087856 -107660231 + MLT1J LTR MaLR 22 277 -171 1 1150 278 287 88 24 chr2 74087882 74088007 -107660080 + MLT1J LTR MaLR 372 504 -8 1 1150 927 179 0 43 chr2 74088833 74089020 -107659067 + MTC LTR MaLR 1 179 -242 1 1150 535 157 11 0 chr2 74096542 74096631 -107651456 - ORR1D1 LTR MaLR -284 90 1 1 1150 294 321 26 9 chr2 74100822 74100935 -107647152 + MLT2B2 LTR ERVL 7 121 -394 1 1150 329 281 0 0 chr2 74105774 74105863 -107642224 + ORR1E LTR MaLR 33 121 -238 1 1150 1754 220 18 18 chr2 74106382 74106780 -107641307 + MTD LTR MaLR 1 398 -21 1 1150 439 168 103 78 chr2 74114154 74114270 -107633817 - ORR1C2 LTR MaLR -2 376 258 1 1150 647 158 114 0 chr2 74114266 74114380 -107633707 - ORR1C2 LTR MaLR -257 127 1 1 1150 412 313 87 13 chr2 74115537 74115686 -107632401 + MLT1E2 LTR MaLR 29 188 -439 1 1150 274 333 25 34 chr2 74117230 74117348 -107630739 - MLT1J LTR MaLR -338 174 58 1 1150 1356 238 88 54 chr2 74121637 74122060 -107626027 + RMER13A LTR ERVK 1 437 -423 1 1150 292 332 97 66 chr2 74129650 74129876 -107618211 + MLT1J2 LTR MaLR 213 445 -3 1 1150 1722 193 23 17 chr2 74132157 74132510 -107615577 - ORR1D2 LTR MaLR -9 361 7 1 1150 371 337 49 49 chr2 74147089 74147354 -107600733 + LTR37A LTR ERV1 147 411 -15 2 1150 692 201 7 27 chr2 74152138 74152286 -107595801 + MLT1B LTR MaLR 24 168 -222 2 1150 500 276 95 47 chr2 74152594 74152784 -107595303 + MLT1B LTR MaLR 192 390 0 2 1150 1834 216 30 23 chr2 74155861 74156254 -107591833 + MTD LTR MaLR 12 407 -12 2 1150 292 280 160 71 chr2 74160488 74160657 -107587430 + MLT1D LTR MaLR 289 472 -33 2 1150 2121 197 60 191 chr2 74176660 74177363 -107570724 + RMER19C LTR ERVK 1 611 0 2 1150 2004 229 61 107 chr2 74184410 74185014 -107563073 - RMER19C LTR ERVK -14 597 28 2 1150 2004 229 61 107 chr2 74185046 74185067 -107563020 - RMER19C LTR ERVK -584 27 1 2 1151 241 286 16 82 chr2 74197018 74197140 -107550947 + MLT1H2 LTR MaLR 37 150 -339 2 1151 356 211 67 42 chr2 74198841 74198960 -107549127 + MLT2D LTR ERVL 1 122 -292 2 1151 714 343 30 54 chr2 74201854 74202224 -107545863 - MLT1A LTR MaLR -5 369 9 2 1151 3318 25 0 11 chr2 74202507 74202878 -107545209 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 2 1151 57090 20 15 0 chr2 74202878 74209259 -107538828 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 8 2 1151 3318 25 0 11 chr2 74209259 74209630 -107538457 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 2 1151 341 347 32 8 chr2 74216546 74216671 -107531416 - ORR1E LTR MaLR -214 145 18 2 1151 1838 247 11 51 chr2 74217610 74218045 -107530042 - MTD LTR MaLR 0 419 2 2 1151 226 294 14 14 chr2 74228204 74228273 -107519814 - MLT1B LTR MaLR -54 413 345 3 1151 445 318 61 28 chr2 74228518 74228697 -107519390 - MLT1B LTR MaLR -205 185 1 3 1151 455 328 94 55 chr2 74232040 74232369 -107515718 + MLT1A0 LTR MaLR 21 362 -3 3 1151 564 345 106 38 chr2 74232995 74233493 -107514594 + MLT1G LTR MaLR 36 567 -24 3 1151 4428 14 2 12 chr2 74234386 74234884 -107513203 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 3 1151 321 0 0 0 chr2 74234884 74234922 -107513165 - MERVL-int LTR ERVL 0 5485 5448 3 1151 336 179 46 35 chr2 74234922 74235009 -107513078 - ORR1A3-int LTR MaLR -1323 640 553 3 1151 20664 22 0 0 chr2 74235009 74237306 -107510781 - MERVL-int LTR ERVL -125 5360 3063 3 1151 25882 14 12 0 chr2 74237294 74240151 -107507936 - MERVL-int LTR ERVL -2595 2890 1 3 1151 4428 14 2 12 chr2 74240151 74240649 -107507438 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 3 1151 578 350 73 35 chr2 74249749 74250173 -107497914 - MLT1C LTR MaLR -7 460 21 3 1151 558 306 111 12 chr2 74250879 74251223 -107496864 - MLT1D LTR MaLR -2 503 126 3 1151 1643 201 85 26 chr2 74252218 74252607 -107495480 + MTD LTR MaLR 1 412 -7 3 1151 2077 162 67 25 chr2 74252611 74252731 -107495356 + MTC LTR MaLR 1 131 -290 3 1151 2262 192 139 20 chr2 74252731 74253085 -107495002 - RMER19C LTR ERVK 0 611 249 3 1151 2262 192 139 20 chr2 74253232 74253423 -107494664 - RMER19C LTR ERVK -363 248 2 3 1151 2077 162 67 25 chr2 74253423 74253706 -107494381 + MTC LTR MaLR 132 421 0 3 1151 1414 254 28 22 chr2 74255015 74255377 -107492710 + MTE2b LTR MaLR 3 366 -13 3 1151 1687 204 72 5 chr2 74255395 74255784 -107492303 - MTD LTR MaLR 0 419 5 3 1151 1349 181 128 6 chr2 74258009 74258336 -107489751 - ORR1D1 LTR MaLR -7 367 1 3 1151 439 350 12 28 chr2 74258336 74258540 -107489547 - MLT1E LTR MaLR -18 636 445 3 1151 1236 247 16 83 chr2 74260661 74261045 -107487042 - ORR1E LTR MaLR -1 358 1 3 1151 2254 133 29 3 chr2 74262049 74262425 -107485662 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 1 3 1151 1977 139 74 11 chr2 74270775 74271138 -107476949 + ORR1B1 LTR MaLR 1 386 -8 3 1151 3011 18 0 0 chr2 74275736 74276073 -107472014 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 337 0 3 1151 52986 18 2 8 chr2 74276073 74282555 -107465532 + IAPEz-int LTR ERVK 8 6481 0 3 1151 3011 21 0 0 chr2 74282555 74282892 -107465195 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 337 0 3 1151 295 365 35 0 chr2 74296617 74296787 -107451300 - LTR16A LTR ERVL -20 431 256 3 1151 3402 35 0 12 chr2 74297387 74297788 -107450299 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 1151 335 263 58 58 chr2 74298650 74298771 -107449316 + MT2B LTR ERVL 137 257 -344 3 1151 497 282 171 43 chr2 74303411 74303855 -107444232 + MLT1D LTR MaLR 1 501 -4 4 1151 1684 151 127 0 chr2 74306313 74306637 -107441450 + MTC LTR MaLR 1 365 -56 4 1151 1463 162 87 96 chr2 74306644 74306999 -107441088 + ORR1B1 LTR MaLR 41 392 -2 4 1151 333 194 0 0 chr2 74307001 74307063 -107441024 + MTC LTR MaLR 358 419 0 4 1151 283 215 0 0 chr2 74307785 74307850 -107440237 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 301 4 1151 477 285 24 37 chr2 74308045 74308209 -107439878 - MLT1A0 LTR MaLR -203 162 1 4 1151 253 326 31 0 chr2 74308583 74308681 -107439406 + MLT1A0 LTR MaLR 218 318 -47 4 1152 295 307 156 109 chr2 74318175 74318533 -107429554 - MTEa LTR MaLR -3 376 2 4 1152 2019 88 26 10 chr2 74348800 74349111 -107398976 + IAPLTR2b LTR ERVK 1 316 -11 4 1152 942 188 6 6 chr2 74360606 74360777 -107387310 + MTD LTR MaLR 154 324 -95 4 1152 2364 148 26 31 chr2 74381777 74382188 -107365899 + MTC LTR MaLR 1 399 -22 5 1152 243 248 151 71 chr2 74395761 74395887 -107352200 + MLT1F LTR MaLR 113 248 -321 5 1152 728 232 96 45 chr2 74396239 74396438 -107351649 + MLT1F LTR MaLR 340 548 0 5 1152 1770 167 67 31 chr2 74399369 74399728 -107348359 + ORR1D1 LTR MaLR 1 372 -2 5 1152 1963 212 70 128 chr2 74401454 74401921 -107346166 + RMER17B LTR ERVK 1 489 -417 5 1152 1963 202 49 120 chr2 74401942 74402507 -107345580 + RMER17B LTR ERVK 372 899 -9 5 1152 1182 255 90 21 chr2 74402702 74403078 -107345009 - MTD LTR MaLR 0 419 18 5 1152 527 271 175 13 chr2 74405729 74405970 -107342117 + MTEa LTR MaLR 5 284 -95 5 1152 332 225 47 4 chr2 74406081 74406183 -107341904 + MLT1E3 LTR MaLR 71 172 -452 5 1152 394 254 82 4 chr2 74406234 74406372 -107341715 + MLT1E3 LTR MaLR 465 611 -43 5 1152 286 347 0 59 chr2 74407745 74407759 -107340328 + MT2B LTR ERVL 152 159 -442 5 1152 2098 181 73 14 chr2 74419989 74420427 -107327660 + RMER16 LTR ERVK 70 533 0 6 1152 708 139 292 34 chr2 74421028 74421172 -107326915 + RLTR9A2 LTR ERVK 1 191 -192 6 1152 708 139 292 34 chr2 74421251 74421319 -107326768 + RLTR9A2 LTR ERVK 192 262 -121 6 1152 658 152 61 68 chr2 74422756 74422904 -107325183 - RMER19C LTR ERVK 0 611 465 6 1152 1039 222 31 9 chr2 74430007 74430234 -107317853 - RMER19C LTR ERVK -128 483 252 6 1152 263 185 252 71 chr2 74430235 74430334 -107317753 - RMER19C LTR ERVK -493 118 2 6 1152 710 341 77 83 chr2 74433131 74433649 -107314438 + MLT1E2 LTR MaLR 80 594 -33 6 1152 2517 179 4 184 chr2 74436043 74436788 -107311299 - RMER19C LTR ERVK 0 611 1 6 1152 1461 186 234 9 chr2 74438915 74439257 -107308830 + MTD LTR MaLR 1 419 0 6 1152 655 170 78 7 chr2 74447267 74447409 -107300678 + ORR1C2 LTR MaLR 18 169 -215 6 1152 932 202 2 58 chr2 74447504 74447730 -107300357 + ORR1C2 LTR MaLR 148 366 -18 6 1153 2656 200 27 54 chr2 74449396 74450024 -107298063 - RMER19C LTR ERVK 0 611 1 6 1153 3247 63 14 0 chr2 74450028 74450443 -107297644 - BGLII LTR ERVK 0 421 1 6 1153 2536 123 52 15 chr2 74451560 74451965 -107296122 + MTC LTR MaLR 2 421 0 6 1153 536 161 132 7 chr2 74451965 74452159 -107295928 + MTC-int LTR MaLR 3 237 -861 6 1153 870 141 130 0 chr2 74452159 74452336 -107295751 + MTC-int LTR MaLR 554 753 -505 6 1153 245 307 33 22 chr2 74452535 74452625 -107295462 + MTEa LTR MaLR 275 365 -14 6 1153 2037 121 47 6 chr2 74463253 74463593 -107284494 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 41 7 1153 528 178 28 0 chr2 74465633 74465740 -107282347 + ORR1C2 LTR MaLR 275 384 0 7 1153 423 324 76 0 chr2 74466155 74466365 -107281722 + MLT1H1 LTR MaLR 278 503 -52 7 1153 2484 153 30 0 chr2 74467308 74467713 -107280374 - MTC LTR MaLR -4 417 1 7 1153 1804 162 89 17 chr2 74469441 74469635 -107278452 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 183 7 1153 1804 162 89 17 chr2 74469694 74469857 -107278230 - ORR1C2 LTR MaLR -202 182 2 7 1153 1528 214 59 90 chr2 74472080 74472495 -107275592 - RMER19C LTR ERVK 0 611 208 7 1153 1528 214 59 90 chr2 74472683 74472756 -107275331 - RMER19C LTR ERVK -404 207 138 7 1153 3074 137 121 41 chr2 74477272 74477834 -107270253 - RMER19C LTR ERVK 0 611 5 7 1153 344 174 105 44 chr2 74478916 74479030 -107269057 + RLTR15 LTR ERVK 1 121 -238 7 1153 310 242 50 88 chr2 74479368 74479549 -107268538 + RLTR15 LTR ERVK 186 359 0 7 1154 380 211 90 86 chr2 74607849 74608062 -107140025 + MTE2b LTR MaLR 159 374 0 1 1154 339 304 63 52 chr2 74609459 74609730 -107138357 - RLTR15 LTR ERVK -9 350 77 1 1154 3511 145 27 72 chr2 74610854 74611494 -107136593 + RMER19C LTR ERVK 1 611 0 1 1154 1535 194 52 52 chr2 74620359 74620724 -107127363 - ORR1D2 LTR MaLR -5 365 1 1 1154 451 280 81 26 chr2 74626004 74626267 -107121820 - MLT1D LTR MaLR 0 505 247 1 1154 992 115 19 0 chr2 74626405 74626561 -107121526 + ORR1A3-int LTR MaLR 1029 1187 -776 1 1154 1429 185 114 24 chr2 74629143 74629333 -107118754 - RMER17C LTR ERVK 0 410 184 1 1154 1429 185 114 24 chr2 74629435 74629620 -107118467 - RMER17C LTR ERVK -227 183 2 1 1154 1176 253 76 12 chr2 74631087 74631431 -107116656 + ORR1D2 LTR MaLR 1 366 -4 1 1154 1663 184 40 14 chr2 74635618 74635971 -107112116 + ORR1C2 LTR MaLR 1 362 -22 1 1154 268 266 124 0 chr2 74637359 74637472 -107110615 + MTD LTR MaLR 172 298 -121 1 1154 3277 56 0 2 chr2 74637492 74637888 -107110199 + MTA_Mm LTR MaLR 1 395 -1 1 1154 737 241 35 0 chr2 74641398 74641568 -107106519 + MTEa LTR MaLR 3 178 -201 1 1154 331 259 17 59 chr2 74642044 74642163 -107105924 + MTEa LTR MaLR 257 370 -9 1 1154 784 204 94 10 chr2 74644715 74644918 -107103169 - MTD LTR MaLR -5 414 195 2 1154 1152 224 81 91 chr2 74653374 74653757 -107094330 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 2 1154 357 214 22 33 chr2 74661046 74661138 -107086949 + MLT1A0 LTR MaLR 3 93 -272 2 1154 307 295 42 0 chr2 74661368 74661463 -107086624 + MLT1A0 LTR MaLR 229 327 -38 2 1154 908 315 52 12 chr2 74662417 74662822 -107085265 + MLT1C LTR MaLR 47 467 0 2 1154 1441 188 169 25 chr2 74667304 74667670 -107080417 - MTD LTR MaLR 0 419 1 2 1154 275 277 55 44 chr2 74668872 74669060 -107079027 + MTEa LTR MaLR 197 377 -2 2 1154 254 322 152 33 chr2 74670300 74670357 -107077730 - MLT1E3 LTR MaLR -400 224 91 2 1154 280 235 62 0 chr2 74670357 74670438 -107077649 - MLT2C1 LTR ERVL -259 138 53 2 1154 254 322 152 33 chr2 74670438 74670451 -107077636 - MLT1E3 LTR MaLR -400 90 56 2 1154 330 296 217 0 chr2 74673995 74674110 -107073977 - MTD LTR MaLR -54 365 226 2 1154 474 263 0 8 chr2 74674641 74674760 -107073327 - MLT2B3 LTR ERVL -436 118 1 2 1154 1559 134 31 16 chr2 74678408 74678665 -107069422 - RLTR11A2 LTR ERVK -266 261 1 2 1154 463 342 20 7 chr2 74679677 74679824 -107068263 - ORR1E LTR MaLR -210 149 1 2 1154 281 77 0 0 chr2 74680491 74680530 -107067557 - RMER19C LTR ERVK -2 609 571 2 1154 3318 118 94 2 chr2 74680678 74681189 -107066898 - RMER19C LTR ERVK -53 558 1 2 1154 1377 235 40 180 chr2 74681697 74682403 -107065684 - RMER19C LTR ERVK -4 607 1 2 1154 1630 147 72 93 chr2 74701515 74701890 -107046197 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 3 1154 301 255 67 117 chr2 74701904 74702024 -107046063 - MT2B LTR ERVL -338 263 150 3 1154 1699 204 124 135 chr2 74702588 74703315 -107044772 + RMER6D LTR ERVK 2 720 0 3 1155 1031 203 176 71 chr2 74733521 74733844 -107014243 - ORR1D1 LTR MaLR -17 357 1 3 1155 1087 201 162 6 chr2 74734231 74734546 -107013541 + ORR1D1 LTR MaLR 1 364 -10 3 1155 1327 230 117 11 chr2 74735337 74735700 -107012387 - MTD LTR MaLR 0 419 18 3 1155 1406 226 88 3 chr2 74746755 74747096 -107000991 - ORR1C1 LTR MaLR -4 374 5 3 1155 681 226 157 9 chr2 74755266 74755476 -106992611 - ORR1D2 LTR MaLR -32 338 98 4 1155 559 269 226 35 chr2 74762228 74762542 -106985545 + MLT1B LTR MaLR 7 380 -10 4 1155 396 250 92 52 chr2 74775907 74776080 -106972007 - ORR1E LTR MaLR -192 182 1 4 1155 613 134 49 32 chr2 74782485 74782608 -106965479 + RMER4B LTR ERVK 17 141 -444 4 1155 586 185 231 11 chr2 74782626 74782879 -106965208 + RMER4B LTR ERVK 277 585 0 4 1155 500 298 85 36 chr2 74784514 74784761 -106963326 + MLT1G LTR MaLR 70 328 -263 4 1155 602 240 44 44 chr2 74787874 74788079 -106960008 - MLT1C LTR MaLR -8 459 255 4 1155 862 205 226 26 chr2 74788104 74788409 -106959678 + ORR1D1 LTR MaLR 2 367 -7 4 1155 251 304 77 26 chr2 74788414 74788565 -106959522 - MLT1C LTR MaLR -161 229 82 4 1155 321 132 19 0 chr2 74788929 74788982 -106959105 - MLT1C LTR MaLR -372 95 42 4 1155 1474 209 41 64 chr2 74790231 74790624 -106957463 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 4 1155 362 269 125 20 chr2 74794794 74794946 -106953141 + MLT1J LTR MaLR 101 268 -244 4 1155 289 292 143 110 chr2 74799033 74799425 -106948662 - MLT1H LTR MaLR -79 470 66 4 1155 1190 198 101 91 chr2 74810108 74810514 -106937573 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 4 1155 295 326 68 20 chr2 74821377 74821524 -106926563 + ORR1E LTR MaLR 20 173 -186 5 1155 2482 119 24 93 chr2 74822278 74822398 -106925689 - MTC LTR MaLR 0 421 309 5 1155 2482 119 24 93 chr2 74822559 74822889 -106925198 - MTC LTR MaLR -113 308 2 5 1156 477 230 256 17 chr2 74852691 74852921 -106895166 - MLT1B LTR MaLR -98 292 8 5 1156 671 330 86 9 chr2 74855917 74856253 -106891834 + MLT1A0 LTR MaLR 4 365 0 5 1156 1156 225 109 53 chr2 74857388 74857444 -106890643 - LTR52 LTR ERVL -2 419 348 5 1156 1156 225 109 53 chr2 74857487 74857824 -106890263 - LTR52 LTR ERVL -74 347 4 5 1156 1772 178 16 124 chr2 74871352 74871794 -106876293 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 5 1156 322 339 161 11 chr2 74879053 74879313 -106868774 + MLT1J2 LTR MaLR 24 322 -126 5 1156 1076 213 113 24 chr2 74879432 74879643 -106868444 + ORR1D1 LTR MaLR 4 228 -146 5 1156 1076 213 113 24 chr2 74879668 74879793 -106868294 + ORR1D1 LTR MaLR 229 369 -5 5 1156 1845 125 113 84 chr2 74887987 74888449 -106859638 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 5 1156 1255 156 160 84 chr2 74891846 74892203 -106855884 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 5 1156 285 321 23 101 chr2 74900257 74900475 -106847612 - MLT1M LTR MaLR -333 339 139 6 1156 228 324 43 35 chr2 74916195 74916336 -106831751 - MLT1L LTR MaLR -130 480 339 6 1156 1167 224 119 12 chr2 74929278 74929613 -106818474 - ORR1D1 LTR MaLR -1 373 3 6 1156 1582 153 0 0 chr2 74931332 74931586 -106816501 + RMER19B LTR ERVK 1 254 -648 6 1156 1119 255 111 13 chr2 74931916 74932293 -106815794 - MTD LTR MaLR -5 414 1 6 1156 351 330 81 16 chr2 74943726 74943911 -106804176 + ORR1E LTR MaLR 1 197 -162 6 1156 282 254 56 0 chr2 74943940 74944011 -106804076 + MTEa LTR MaLR 12 86 -293 6 1156 411 288 96 14 chr2 74944875 74945083 -106803004 + MT2A LTR ERVL 307 531 -2 6 1156 260 242 15 29 chr2 74945141 74945209 -106802878 + ORR1E LTR MaLR 275 341 -38 6 1156 2281 88 82 0 chr2 74959228 74959558 -106788529 + IAPEY2_LTR LTR ERVK 1 357 0 6 1156 280 214 54 33 chr2 74959994 74960086 -106788001 - MTEb LTR MaLR -7 372 279 6 1156 575 252 120 62 chr2 74965450 74965759 -106782328 + ORR1E LTR MaLR 10 336 -23 7 1157 236 224 0 0 chr2 74979298 74979347 -106768740 - MLT2B1 LTR ERVL -3 564 516 7 1157 453 331 54 96 chr2 75027449 75027803 -106720284 - ORR1E LTR MaLR -9 350 12 3 1157 1232 212 98 106 chr2 75028562 75028979 -106719108 - MTD LTR MaLR 0 419 6 3 1157 956 209 195 3 chr2 75042302 75042600 -106705487 - MTD LTR MaLR 0 419 65 4 1157 1952 158 45 103 chr2 75052363 75052808 -106695279 - MTC LTR MaLR -2 419 1 5 1157 342 313 14 78 chr2 75056605 75056747 -106691340 - LTR16A LTR ERVL -198 253 121 6 1157 594 272 11 48 chr2 75072226 75072415 -106675672 - MLT1C LTR MaLR -2 465 284 7 1157 429 323 125 50 chr2 75075427 75075844 -106672243 + LTR16A LTR ERVL 3 450 -1 8 1157 285 232 48 38 chr2 75080945 75081055 -106667032 - MLT2B2 LTR ERVL -2 560 416 8 1157 226 167 92 77 chr2 75081556 75081621 -106666466 - MLT2B2 LTR ERVL -651 66 1 8 1157 1776 130 16 54 chr2 75097092 75097408 -106650679 + ORR1A4 LTR MaLR 26 329 0 1 1158 1274 233 122 15 chr2 75112808 75113144 -106634943 + ORR1D1 LTR MaLR 1 372 -2 1 1158 1613 136 179 0 chr2 75113537 75113816 -106634271 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 1 1158 1189 279 58 3 chr2 75116566 75116925 -106631162 - MTEa LTR MaLR 0 379 1 1 1158 640 270 189 38 chr2 75125835 75126174 -106621913 + MLT1A1 LTR MaLR 19 408 0 1 1158 319 318 50 71 chr2 75128505 75128790 -106619297 - ORR1D2 LTR MaLR -32 347 63 1 1158 232 271 14 41 chr2 75128850 75128923 -106619164 - ORR1D2 LTR MaLR -292 82 12 1 1158 239 243 14 41 chr2 75129787 75129860 -106618227 + ORR1D1 LTR MaLR 12 82 -292 1 1158 2973 169 140 45 chr2 75136833 75137504 -106610583 - RMER19A LTR ERVK -2 735 1 1 1158 963 289 23 4 chr2 75142971 75143228 -106604859 - MTEa LTR MaLR -117 262 1 1 1158 307 289 131 78 chr2 75143724 75143968 -106604119 - ORR1E LTR MaLR -102 257 1 1 1158 1857 131 7 20 chr2 75146345 75146649 -106601438 + ORR1A3 LTR MaLR 27 326 0 1 1158 470 272 71 0 chr2 75158306 75158488 -106589599 + MLT1I LTR MaLR 240 422 -22 1 1158 2037 165 57 25 chr2 75160113 75160517 -106587570 + MTC LTR MaLR 5 421 0 1 1158 1558 143 49 18 chr2 75164350 75164635 -106583452 + MTC LTR MaLR 65 358 -63 1 1158 2629 70 21 3 chr2 75175108 75175482 -106572605 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 16 2 1158 1213 209 145 18 chr2 75197233 75197565 -106550522 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 2 1158 280 258 56 0 chr2 75198484 75198573 -106549514 - MER21B LTR ERV1 -141 722 629 2 1158 522 327 94 28 chr2 75198888 75199143 -106548944 - MT2A LTR ERVL -6 527 256 2 1158 1707 121 14 11 chr2 75202902 75203178 -106544909 + RMER15 LTR ERVL 200 476 -99 2 1158 350 346 162 26 chr2 75222378 75222755 -106525332 + MT2A LTR ERVL 1 428 -105 2 1158 481 354 19 22 chr2 75229763 75230032 -106518055 - RMER15 LTR ERVL -10 565 298 2 1158 564 164 335 0 chr2 75230984 75231142 -106516945 - RMER4B LTR ERVK 0 585 375 2 1159 292 335 26 26 chr2 75238595 75238751 -106509336 - MLT1L LTR MaLR -311 299 144 2 1159 1030 279 109 29 chr2 75243605 75243955 -106504132 + MTEa LTR MaLR 2 379 0 2 1159 264 352 61 45 chr2 75243958 75244205 -106503882 + MLT1H LTR MaLR 57 307 -242 2 1159 288 253 0 46 chr2 75252227 75252314 -106495773 + LTR48 LTR ERV1 4 86 -701 3 1159 268 269 21 0 chr2 75255588 75255622 -106492465 - ORR1B1-int LTR MaLR -862 647 611 3 1159 2851 204 14 49 chr2 75269855 75270488 -106477599 + RMER19C LTR ERVK 1 611 0 3 1159 1840 202 85 5 chr2 75274953 75275341 -106472746 + MTD LTR MaLR 1 419 0 3 1159 422 278 160 75 chr2 75275730 75276061 -106472026 - ORR1E LTR MaLR 0 359 1 3 1159 360 207 95 56 chr2 75288850 75288989 -106459098 + MLT2B4 LTR ERVL 1 146 -410 3 1159 288 26 0 0 chr2 75295361 75295400 -106452687 - RLTR13B1 LTR ERVK -854 39 1 3 1159 482 320 113 40 chr2 75301209 75301580 -106446507 - MLT1D LTR MaLR -107 398 1 3 1159 295 235 9 113 chr2 75309023 75309138 -106438949 + MT2B LTR ERVL 155 257 -344 3 1159 1452 87 5 5 chr2 75314572 75314781 -106433306 + ORR1A2 LTR MaLR 1 209 -118 4 1159 292 325 59 7 chr2 75323231 75323383 -106424704 - MLT1J1 LTR MaLR -250 194 35 4 1159 1441 219 9 146 chr2 75326618 75327051 -106421036 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 4 1159 1090 258 29 32 chr2 75333990 75334330 -106413757 + ORR1D2 LTR MaLR 32 370 0 4 1159 742 327 62 24 chr2 75334456 75334797 -106413290 + ORR1E LTR MaLR 6 359 0 4 1159 3156 60 20 5 chr2 75335737 75336138 -106411949 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 4 1159 644 316 130 25 chr2 75336576 75336891 -106411196 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 18 4 1159 278 300 36 48 chr2 75344231 75344315 -106403772 + MLT1J LTR MaLR 108 190 -322 4 1159 1298 159 84 22 chr2 75346872 75347194 -106400893 + RLTR15 LTR ERVK 1 342 -17 4 1159 1856 174 25 77 chr2 75365600 75365842 -106382245 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 161 4 1160 1856 174 25 77 chr2 75366413 75366574 -106381513 - ORR1C2 LTR MaLR -224 160 2 4 1160 268 234 47 141 chr2 75369427 75369570 -106378517 - RLTR25B LTR ERVK -142 886 757 4 1160 3015 177 164 27 chr2 75369873 75370621 -106377466 - RLTR25B LTR ERVK -175 853 3 4 1160 365 261 16 40 chr2 75388413 75388537 -106359550 + MTEa LTR MaLR 256 376 -3 5 1160 2612 196 73 40 chr2 75394071 75394746 -106353341 + RLTR40 LTR ERVK 14 710 -107 5 1160 259 250 32 116 chr2 75413113 75413124 -106334963 + MT2B LTR ERVL 154 156 -445 5 1160 1409 133 76 8 chr2 75417367 75417618 -106330469 + MTD LTR MaLR 144 411 -8 5 1160 847 224 261 20 chr2 75448209 75448695 -106299392 - RMER20B LTR ERVK -14 613 10 6 1160 357 286 61 18 chr2 75449180 75449294 -106298793 - LTR31 LTR ERV1 -295 324 206 6 1160 1206 156 77 20 chr2 75450236 75450484 -106297603 + RMER10B LTR ERVL 3 264 -134 6 1160 885 226 0 60 chr2 75450542 75450759 -106297328 + RMER10B LTR ERVL 194 397 -1 6 1160 432 236 60 37 chr2 75453021 75453153 -106294934 + MLT1A LTR MaLR 1 140 -250 6 1160 1276 217 55 97 chr2 75454724 75454914 -106293173 - ORR1D2 LTR MaLR -3 367 195 6 1160 1276 217 55 97 chr2 75455062 75455254 -106292833 - ORR1D2 LTR MaLR -176 194 1 6 1160 252 346 0 103 chr2 75455466 75455611 -106292476 + MLT1A LTR MaLR 86 215 -159 6 1160 1921 196 57 12 chr2 75457176 75457579 -106290508 + MTC LTR MaLR 1 421 0 6 1160 659 301 43 131 chr2 75459877 75459982 -106288105 + ORR1E LTR MaLR 8 104 -255 6 1160 659 301 43 131 chr2 75460187 75460456 -106287631 + ORR1E LTR MaLR 105 349 -10 6 1160 999 180 196 133 chr2 75460691 75460857 -106287230 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 173 6 1160 999 180 196 133 chr2 75460954 75461028 -106287059 - ORR1D1 LTR MaLR -202 172 96 6 1160 999 180 196 133 chr2 75461181 75461291 -106286796 - ORR1D1 LTR MaLR -279 95 2 6 1160 2990 131 41 6 chr2 75461639 75462130 -106285957 + RLTR28 LTR ERVL 13 520 -4 6 1160 245 301 39 88 chr2 75468544 75468646 -106279441 - MT2B2 LTR ERVL -344 240 144 7 1160 2784 177 36 101 chr2 75471476 75472137 -106275950 + RMER20B LTR ERVK 1 618 -9 7 1160 353 264 0 52 chr2 75472292 75472388 -106275699 + MERVK26-int LTR ERVK 100 190 -6729 7 1160 1649 211 66 82 chr2 75472390 75472902 -106275185 + RLTR1B LTR ERV1 1 504 -8 7 1160 791 253 116 23 chr2 75473116 75473375 -106274712 + MERVK26-int LTR ERVK 189 471 -6448 7 1160 268 229 0 62 chr2 75473879 75473944 -106274143 - RLTR19 LTR ERVK 0 499 439 7 1160 2940 137 153 35 chr2 75473971 75474574 -106273513 - RLTR33 LTR ERVK -36 642 1 7 1160 296 169 152 25 chr2 75475492 75475571 -106272516 + RLTR19-int LTR ERVK 3865 3953 -2184 7 1160 326 222 14 0 chr2 75475619 75475691 -106272396 + MERVK26-int LTR ERVK 1008 1080 -648 7 1160 259 125 0 0 chr2 75475713 75475753 -106272334 + MERVK26-int LTR ERVK 5531 5570 -1349 7 1160 3513 74 171 21 chr2 75476159 75476728 -106271359 + RLTR6_Mm LTR ERV1 1 654 0 7 1160 34642 5 0 1 chr2 75476728 75480428 -106267659 + MMVL30-int LTR ERV1 1 3698 0 7 1160 4871 14 0 9 chr2 75480428 75481002 -106267085 + RLTR6_Mm LTR ERV1 1 569 -85 7 1160 308 361 42 55 chr2 75481274 75481549 -106266538 - LTR16D2 LTR ERVL -318 333 67 7 1160 2309 212 59 54 chr2 75483074 75483682 -106264405 - RMER19C LTR ERVK 0 611 1 7 1160 6949 121 29 70 chr2 75484323 75485018 -106263069 - MurERV4-int LTR ERVK -1231 4029 3325 7 1160 6949 121 29 70 chr2 75485195 75485563 -106262524 - MurERV4-int LTR ERVK -1936 3324 2971 7 1160 6949 121 29 70 chr2 75485710 75485836 -106262251 - MurERV4-int LTR ERVK -2290 2970 2874 7 1160 6949 121 29 70 chr2 75485974 75486017 -106262070 - MurERV4-int LTR ERVK -2387 2873 2836 7 1160 10056 145 35 2 chr2 75486220 75487829 -106260258 - MurERV4-int LTR ERVK -2439 2821 1161 7 1160 749 196 268 0 chr2 75487815 75488009 -106260078 - MurERV4-int LTR ERVK -5014 246 1 7 1160 3138 144 49 30 chr2 75488009 75488583 -106259504 - RMER4B LTR ERVK 0 585 1 7 1160 348 278 95 81 chr2 75490700 75490911 -106257176 + RMER2 LTR ERV1 327 540 -27 7 1160 1516 222 155 107 chr2 75494255 75494576 -106253511 - RMER2 LTR ERV1 0 567 274 7 1160 1516 222 155 107 chr2 75494723 75494891 -106253196 - RMER2 LTR ERV1 -294 273 51 7 1160 1516 222 155 107 chr2 75495056 75495105 -106252982 - RMER2 LTR ERV1 -517 50 2 7 1160 438 218 118 24 chr2 75495189 75495316 -106252771 + MTD LTR MaLR 279 417 -2 7 1160 840 185 239 27 chr2 75495979 75496201 -106251886 + RLTR23 LTR ERV1 1 269 -161 7 1160 1311 122 41 61 chr2 75496181 75496426 -106251661 + RLTR23 LTR ERV1 171 410 -20 7 1161 919 96 8 0 chr2 75503085 75503210 -106244877 + RLTR19-int LTR ERVK 1467 1592 -4545 8 1161 423 102 0 14 chr2 75503289 75503359 -106244728 + RLTR19-int LTR ERVK 1589 1657 -4480 8 1161 2644 59 5 35 chr2 75503449 75503820 -106244267 + RLTR19-int LTR ERVK 1653 2012 -4125 8 1161 249 315 0 98 chr2 75524634 75524757 -106223330 - MT2B LTR ERVL -316 285 175 4 1161 750 265 143 86 chr2 75545411 75545969 -106202118 - RLTR19-int LTR ERVK -1665 4472 3883 8 1161 317 240 96 104 chr2 75546198 75546333 -106201754 - RLTR19-int LTR ERVK -3100 3037 2904 8 1161 335 231 110 8 chr2 75546421 75546539 -106201548 - RLTR19-int LTR ERVK -3251 2886 2757 8 1161 314 268 101 85 chr2 75546549 75546737 -106201350 - MYSERV6-int LTR ERVK -1521 7438 7248 8 1161 609 253 74 6 chr2 75546742 75546905 -106201182 + RLTR26 LTR ERVK 1 174 -468 8 1161 811 211 22 67 chr2 75546898 75547122 -106200965 + RLTR26 LTR ERVK 429 642 0 8 1161 451 264 56 28 chr2 75547125 75547304 -106200783 - RLTR19-int LTR ERVK -3630 2507 2324 8 1161 2589 202 15 90 chr2 75547319 75547973 -106200114 - RMER19C LTR ERVK -6 605 1 8 1161 457 242 74 42 chr2 75547980 75548170 -106199917 - RLTR19-int LTR ERVK -3457 2065 1870 8 1161 257 171 93 47 chr2 75549176 75549262 -106198825 - RLTR19-int LTR ERVK -5023 1114 1025 8 1161 299 260 0 25 chr2 75549276 75549355 -106198732 - RLTR19-int LTR ERVK -3909 1613 1537 8 1161 301 197 64 26 chr2 75549365 75549443 -106198644 - RLTR19-int LTR ERVK -5158 979 899 8 1161 1182 206 29 8 chr2 75549573 75549813 -106198274 - RLTR42-int LTR ERVK -4173 1349 1105 8 1161 493 133 184 0 chr2 75551100 75551198 -106196889 - RMER15 LTR ERVL -50 525 410 9 1161 293 243 48 19 chr2 75551639 75551744 -106196343 + RMER10B LTR ERVL 270 377 -21 9 1161 1356 195 36 161 chr2 75551788 75552265 -106195822 - RMER15 LTR ERVL -158 417 1 9 1161 937 187 53 228 chr2 75570300 75570707 -106177380 + ORR1D1 LTR MaLR 3 340 -34 1 1161 937 187 53 228 chr2 75570900 75570938 -106177149 + ORR1D1 LTR MaLR 341 374 0 1 1161 227 327 113 0 chr2 75577555 75577714 -106170373 - MLT1I LTR MaLR -234 177 1 1 1161 1266 200 68 26 chr2 75579084 75579392 -106168695 + MTD LTR MaLR 99 419 0 1 1161 286 252 146 53 chr2 75607282 75607433 -106140654 - ORR1E LTR MaLR -170 189 25 2 1161 1066 176 0 23 chr2 75612313 75612528 -106135559 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 175 2 1161 798 189 17 29 chr2 75612620 75612794 -106135293 - ORR1C2 LTR MaLR -207 177 6 2 1161 612 302 181 39 chr2 75615667 75616183 -106131904 - MER21B LTR ERV1 -72 791 203 2 1161 313 267 11 11 chr2 75616188 75616279 -106131808 + MTEa LTR MaLR 1 91 -288 2 1161 484 216 191 35 chr2 75616333 75616506 -106131581 + MTEa LTR MaLR 167 366 -13 2 1161 369 303 98 8 chr2 75616508 75616641 -106131446 - MER21B LTR ERV1 -705 158 14 2 1161 289 154 104 30 chr2 75618283 75618350 -106129737 - RLTR25B LTR ERVK -519 509 438 2 1161 279 299 53 79 chr2 75625918 75626107 -106121980 + MLT1N2 LTR MaLR 372 555 -7 2 1162 289 132 84 42 chr2 75634601 75634672 -106113415 - RLTR25B LTR ERVK -519 509 436 3 1162 5242 118 77 20 chr2 75635627 75636484 -106111603 + RMER17A2 LTR ERVK 1 906 0 3 1162 236 372 117 44 chr2 75639716 75639921 -106108166 + LTR84b LTR ERVL 23 242 -519 3 1162 493 182 43 59 chr2 75640735 75640922 -106107165 + RMER17C LTR ERVK 92 275 -135 3 1162 428 258 0 10 chr2 75644992 75645090 -106102997 + RLTR21 LTR ERVK 1 97 -1475 3 1162 2874 174 69 83 chr2 75645086 75645882 -106102205 + RLTR21 LTR ERVK 419 1203 -369 3 1162 306 264 34 11 chr2 75649146 75649234 -106098853 + MTEa LTR MaLR 53 142 -217 3 1162 362 253 107 67 chr2 75649368 75649563 -106098524 + MTEa LTR MaLR 148 375 -4 3 1162 289 293 65 113 chr2 75656540 75656829 -106091258 + MLT1F1 LTR MaLR 1 279 -290 3 1162 1492 249 41 38 chr2 75663607 75663637 -106084450 + MTD LTR MaLR 1 18 -401 3 1162 1492 249 41 38 chr2 75663710 75664097 -106083990 + MTD LTR MaLR 19 419 0 3 1162 3241 43 5 15 chr2 75673325 75673729 -106074358 - MTB LTR MaLR 0 400 1 3 1162 1958 108 58 61 chr2 75677730 75678057 -106070030 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 4 1162 245 327 0 65 chr2 75685059 75685075 -106063012 - MT2B LTR ERVL -351 218 150 4 1162 1251 159 77 9 chr2 75703065 75703287 -106044800 + MTC LTR MaLR 1 237 -184 4 1162 335 262 69 28 chr2 75707400 75707545 -106040542 - RMER20B LTR ERVK -272 355 205 4 1162 1933 100 73 3 chr2 75707533 75707833 -106040254 - ORR1A2 LTR MaLR -6 321 1 4 1162 247 262 35 35 chr2 75707836 75707923 -106040164 - RMER20B LTR ERVK -296 220 134 4 1162 1308 167 269 25 chr2 75708107 75708427 -106039660 + RMER10B LTR ERVL 1 398 0 4 1162 773 263 41 0 chr2 75710180 75710351 -106037736 - ORR1E-int LTR MaLR -1400 180 3 4 1162 541 296 156 41 chr2 75710353 75710667 -106037420 - ORR1E LTR MaLR 0 359 10 4 1162 336 192 75 25 chr2 75719007 75719087 -106029000 - RLTR25B LTR ERVK -519 509 426 4 1162 299 260 0 88 chr2 75725698 75725812 -106022275 - MT2B LTR ERVL -337 264 161 5 1162 2178 154 16 11 chr2 75738336 75738703 -106009384 - ORR1D1 LTR MaLR -5 369 1 5 1162 253 339 98 72 chr2 75742364 75742711 -106005376 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 10 5 1162 564 170 445 7 chr2 75745013 75745299 -106002788 - MTD LTR MaLR -8 411 1 5 1162 709 238 110 19 chr2 75746116 75746398 -106001689 - MTE2b LTR MaLR -55 324 1 5 1162 1602 172 131 36 chr2 75752549 75752886 -105995201 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 6 5 1162 1913 145 125 26 chr2 75757975 75758358 -105989729 - MTC LTR MaLR 0 421 1 5 1163 1724 207 55 14 chr2 75769994 75770357 -105977730 + MTD LTR MaLR 30 407 -12 5 1163 2137 142 137 7 chr2 75773267 75773677 -105974410 - RMER4A LTR ERVK 0 466 4 5 1163 4355 28 0 2 chr2 75778768 75779262 -105968825 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 5 1163 705 287 134 86 chr2 75780739 75781090 -105966997 + MTE2b LTR MaLR 12 379 0 5 1163 282 250 37 83 chr2 75783512 75783621 -105964466 + MLT1B LTR MaLR 19 122 -252 5 1163 1872 86 7 65 chr2 75783728 75784035 -105964052 + ORR1A2 LTR MaLR 1 289 -38 5 1163 338 130 0 0 chr2 75784221 75784275 -105963812 + ORR1A2 LTR MaLR 273 326 0 5 1163 376 208 98 16 chr2 75784275 75784375 -105963712 + MLT1B LTR MaLR 281 390 0 5 1163 2291 144 142 190 chr2 75784461 75785102 -105962985 - RMER19C LTR ERVK -1 610 1 5 1163 861 250 59 52 chr2 75785417 75785687 -105962400 - MTE2a LTR MaLR 0 379 108 5 1163 614 275 100 69 chr2 75790477 75790837 -105957250 - RLTR14 LTR ERV1 0 382 12 6 1163 536 254 89 81 chr2 75799276 75799524 -105948563 - MER67C LTR ERV1 -315 396 147 6 1163 463 232 0 21 chr2 75802342 75802439 -105945648 + MTE2b LTR MaLR 223 317 -62 6 1163 942 281 64 44 chr2 75807160 75807630 -105940457 - MER31A LTR ERV1 -4 481 16 6 1163 262 385 102 17 chr2 75807662 75807839 -105940248 - MLT1L LTR MaLR -11 599 408 6 1163 227 283 111 35 chr2 75807886 75808058 -105940029 - MLT1L LTR MaLR -276 334 150 6 1163 314 282 258 0 chr2 75808560 75808730 -105939357 + MER34 LTR ERV1 53 267 -275 6 1163 241 282 28 0 chr2 75808905 75808976 -105939111 + MER34 LTR ERV1 324 396 -146 6 1163 643 213 146 6 chr2 75820848 75821013 -105927074 - ORR1D1 LTR MaLR -186 188 1 6 1163 323 219 14 0 chr2 75834698 75834771 -105913316 - MTEa LTR MaLR -2 377 304 6 1163 293 263 26 0 chr2 75834784 75834860 -105913227 + MTEb LTR MaLR 204 281 -98 6 1163 333 268 83 14 chr2 75846751 75846895 -105901192 + MLT1C LTR MaLR 14 167 -300 6 1163 331 224 83 53 chr2 75847386 75847518 -105900569 + MLT1C LTR MaLR 250 385 -82 6 1163 1327 175 80 22 chr2 75850657 75850932 -105897155 + MTD LTR MaLR 1 291 -128 6 1163 333 286 132 92 chr2 75857159 75857440 -105890647 - MLT1A LTR MaLR -7 367 76 6 1163 368 102 0 17 chr2 75862747 75862807 -105885280 - MTC LTR MaLR 0 419 361 6 1163 1087 115 143 15 chr2 75862809 75863012 -105885075 - MTC LTR MaLR -192 229 1 6 1163 405 333 106 23 chr2 75863655 75863919 -105884168 + MLT1J-int LTR MaLR 174 459 -928 7 1163 320 330 9 19 chr2 75864877 75864985 -105883102 + MLT1J-int LTR MaLR 1221 1327 -60 7 1163 247 364 30 20 chr2 75875950 75876051 -105872036 - MT2B2 LTR ERVL -327 257 156 7 1163 301 368 56 39 chr2 75879707 75879939 -105868148 + LTR16E2 LTR ERVL 330 565 -3 7 1163 664 311 126 39 chr2 75883130 75883488 -105864599 + MLT1J LTR MaLR 1 389 -123 7 1164 441 237 71 7 chr2 75917139 75917279 -105830808 + MTD LTR MaLR 271 419 0 7 1164 387 266 48 42 chr2 75919935 75920100 -105827987 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 265 7 1164 2176 107 38 73 chr2 75921743 75922168 -105825919 + RMER17C LTR ERVK 1 410 0 7 1164 701 277 106 36 chr2 75925600 75925960 -105822127 - MLT1B LTR MaLR -4 386 2 7 1164 2298 216 75 75 chr2 75927807 75928418 -105819669 + RMER19C LTR ERVK 1 611 0 7 1164 579 208 33 40 chr2 75943410 75943560 -105804527 + RMER13A LTR ERVK 712 860 0 8 1164 1590 196 19 3 chr2 75943902 75943937 -105804150 + RLTR14 LTR ERV1 60 94 -288 8 1164 1590 196 19 3 chr2 75943966 75944248 -105803839 + RLTR14 LTR ERV1 95 381 -1 8 1164 875 251 29 48 chr2 75947313 75947627 -105800460 + MTE2b LTR MaLR 58 365 -14 8 1164 333 319 85 85 chr2 75949787 75950017 -105798070 + MLT1A0 LTR MaLR 1 230 -135 8 1164 333 319 85 85 chr2 75950078 75950210 -105797877 + MLT1A0 LTR MaLR 231 362 -3 8 1164 351 294 78 47 chr2 75954675 75954868 -105793219 + ORR1E LTR MaLR 5 203 -156 8 1164 1102 268 38 60 chr2 75955568 75955965 -105792122 + MLT1B LTR MaLR 1 388 -2 8 1164 1205 227 95 32 chr2 75958035 75958381 -105789706 + ORR1D2 LTR MaLR 3 370 0 8 1164 1966 157 72 11 chr2 75959854 75960214 -105787873 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 3 8 1164 2172 136 33 61 chr2 75963766 75964159 -105783928 + ORR1C2 LTR MaLR 3 384 0 8 1164 811 221 14 64 chr2 75969527 75969745 -105778342 + RLTR11A LTR ERVK 322 528 0 8 1164 309 256 60 12 chr2 75980935 75981018 -105767069 - RLTR20A1 LTR ERVK -6 545 459 8 1164 338 200 220 0 chr2 75981019 75981119 -105766968 + RMER3D-int LTR ERVK 2735 2812 -30 8 1164 1235 223 35 13 chr2 75981119 75981528 -105766559 + BGLII_B LTR ERVK 1 422 0 8 1164 269 290 58 116 chr2 75982725 75982975 -105765112 + RMER10A LTR ERVL 25 261 -181 8 1164 269 290 58 116 chr2 75983106 75983269 -105764818 + RMER10A LTR ERVL 262 414 -28 8 1164 272 307 135 75 chr2 75985828 75986162 -105761925 + ORR1E LTR MaLR 6 359 0 8 1164 361 282 104 8 chr2 75990121 75990246 -105757841 + RMER15 LTR ERVL 425 561 -14 8 1164 481 312 120 5 chr2 75991976 75992185 -105755902 + MLT1E3 LTR MaLR 390 622 -2 8 1164 241 317 27 34 chr2 75992480 75992627 -105755460 + RLTR14 LTR ERV1 224 369 -13 8 1164 1227 178 124 96 chr2 75993793 75994221 -105753866 + RMER10A LTR ERVL 3 442 0 8 1164 3409 48 8 0 chr2 76007532 76007924 -105740163 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 2 8 1164 2247 146 55 75 chr2 76009709 76010124 -105737963 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 9 1164 257 337 0 21 chr2 76011446 76011543 -105736544 + MTEb LTR MaLR 272 366 -13 1 1164 1894 142 31 6 chr2 76013864 76014182 -105733905 + MTC LTR MaLR 91 416 -5 1 1164 401 250 234 38 chr2 76015456 76015558 -105732529 + MTE-int LTR MaLR 1358 1496 -84 1 1164 2079 116 26 81 chr2 76015558 76015906 -105732181 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 1 1164 401 250 234 38 chr2 76015906 76015961 -105732126 + MTE-int LTR MaLR 1497 1545 -35 1 1164 932 285 103 3 chr2 76015950 76016260 -105731827 + ORR1E LTR MaLR 9 349 -10 2 1164 240 301 71 41 chr2 76017230 76017400 -105730687 - LTR86C LTR ERVL -398 223 49 2 1164 455 322 34 6 chr2 76018769 76018947 -105729140 - MLT1E2 LTR MaLR -4 623 441 2 1164 1445 175 46 0 chr2 76019421 76019727 -105728360 + ORR1B2 LTR MaLR 2 363 -15 2 1164 2594 133 14 9 chr2 76019760 76020191 -105727896 + ORR1B2-int LTR MaLR 1 433 -1076 2 1164 516 217 42 16 chr2 76020191 76020332 -105727755 + MTC LTR MaLR 249 419 -2 2 1164 288 303 154 50 chr2 76020931 76021168 -105726919 - MLT1E2 LTR MaLR -332 295 61 2 1165 230 321 139 59 chr2 76023866 76024068 -105724019 - MLT1C LTR MaLR -198 269 52 3 1165 543 297 81 45 chr2 76024742 76024964 -105723123 - MLT1D LTR MaLR -159 346 117 4 1165 238 263 53 0 chr2 76025212 76025269 -105722818 - RMER15 LTR ERVL -113 462 403 4 1165 494 294 166 33 chr2 76027040 76027371 -105720716 + MER34A LTR ERV1 4 378 -193 4 1165 297 352 62 12 chr2 76028273 76028434 -105719653 + LTR88b LTR Gypsy? 669 837 0 4 1165 1642 185 49 64 chr2 76028975 76029363 -105718724 + RMER16 LTR ERVK 152 533 0 5 1165 616 272 80 44 chr2 76030710 76030960 -105717127 + MTEa LTR MaLR 1 259 -120 5 1165 1014 286 76 24 chr2 76031378 76031758 -105716329 - MTD LTR MaLR -14 405 6 5 1165 1359 158 283 12 chr2 76034318 76034641 -105713446 - MTD LTR MaLR -8 411 1 6 1165 519 283 91 132 chr2 76036653 76036971 -105711116 + MER77 LTR ERVL 77 381 -226 6 1165 251 263 0 17 chr2 76036977 76037035 -105711052 + MER77 LTR ERVL 547 603 -4 6 1165 710 272 118 30 chr2 76037278 76037643 -105710444 + MLT2B2 LTR ERVL 5 438 -77 7 1165 243 352 163 73 chr2 76040980 76041421 -105706666 - LTR33 LTR ERVL -14 501 21 8 1165 1123 262 54 65 chr2 76044424 76044775 -105703312 - ORR1E LTR MaLR -10 349 3 8 1165 327 293 37 43 chr2 76046773 76046937 -105701150 - MamGypLTR2b LTR Gypsy -21 901 739 9 1165 432 305 178 50 chr2 76057020 76057341 -105690746 + LTR40b LTR ERVL 89 450 -12 1 1165 231 281 204 30 chr2 76059827 76059959 -105688128 + LTR40a LTR ERVL 99 253 -266 1 1165 582 254 65 0 chr2 76065854 76065992 -105682095 + MTD LTR MaLR 5 151 -268 1 1165 1986 159 141 62 chr2 76068236 76068732 -105679355 - RMER19C LTR ERVK 0 611 77 1 1165 578 305 131 17 chr2 76077073 76077423 -105670664 + MLT1B LTR MaLR 1 390 0 1 1165 327 48 0 0 chr2 76079454 76079496 -105668591 + ORR1A4 LTR MaLR 280 321 -8 1 1165 861 264 55 55 chr2 76089032 76089344 -105658743 + ORR1E LTR MaLR 48 359 0 1 1165 334 304 29 19 chr2 76089756 76089860 -105658227 - MLT1A1 LTR MaLR -279 129 25 1 1165 505 311 142 25 chr2 76091621 76092023 -105656064 - MLT1C LTR MaLR -2 465 17 1 1165 530 288 15 66 chr2 76094735 76094932 -105653155 - MTD LTR MaLR -5 414 228 1 1165 330 362 20 49 chr2 76096239 76096486 -105651601 + LTR88c LTR Genie? 65 304 -558 1 1165 2138 140 95 3 chr2 76098211 76098570 -105649517 + ORR1B1 LTR MaLR 3 394 0 1 1165 1103 215 21 21 chr2 76100288 76100530 -105647557 + MTD LTR MaLR 82 323 -96 1 1165 1123 83 115 6 chr2 76104700 76104882 -105643205 - RMER19A LTR ERVK 0 737 536 1 1165 2134 120 50 32 chr2 76104878 76105256 -105642831 - RMER19A LTR ERVK -352 385 1 1 1165 581 176 9 0 chr2 76109876 76109995 -105638092 + ORR1B2 LTR MaLR 5 115 -214 1 1165 305 87 43 0 chr2 76110013 76110059 -105638028 + ORR1B2 LTR MaLR 320 367 0 1 1165 228 303 213 0 chr2 76124278 76124433 -105623654 - MER89 LTR ERV1 -7 552 365 2 1165 1138 168 4 104 chr2 76125875 76126154 -105621933 + ORR1A4 LTR MaLR 1 251 -78 2 1165 988 113 0 44 chr2 76126135 76126293 -105621794 - ORR1A4 LTR MaLR -178 151 1 2 1165 1173 191 57 38 chr2 76131076 76131338 -105616749 - MTD LTR MaLR -4 415 149 2 1165 529 304 75 91 chr2 76136403 76136505 -105611582 + ORR1E LTR MaLR 1 92 -267 2 1165 529 304 75 91 chr2 76136727 76136877 -105611210 + ORR1E LTR MaLR 93 248 -111 2 1165 227 262 69 35 chr2 76136930 76137017 -105611070 + ORR1E LTR MaLR 270 359 0 2 1165 2486 127 43 34 chr2 76138028 76138139 -105609948 + MTC LTR MaLR 1 110 -311 2 1165 2486 127 43 34 chr2 76138338 76138643 -105609444 + MTC LTR MaLR 111 421 0 2 1165 560 370 5 5 chr2 76141988 76142173 -105605914 - RMER15 LTR ERVL -20 555 371 2 1165 579 186 211 45 chr2 76143109 76143374 -105604713 - RLTR6_Mm LTR ERV1 -70 584 276 2 1165 853 136 6 99 chr2 76143387 76143559 -105604528 - RLTR6_Mm LTR ERV1 -498 156 1 2 1165 245 207 86 0 chr2 76150114 76150172 -105597915 + MLT1D LTR MaLR 110 172 -333 2 1166 264 287 60 135 chr2 76157788 76157921 -105590166 + MLT1A1 LTR MaLR 2 124 -241 2 1166 320 297 79 28 chr2 76157938 76158096 -105589991 + MLT1A1 LTR MaLR 190 391 -17 2 1166 520 311 53 37 chr2 76165227 76165471 -105582616 - MER74A LTR ERVL -52 506 259 2 1166 229 236 30 110 chr2 76165830 76165930 -105582157 + MTEa LTR MaLR 279 370 -9 2 1166 352 186 236 85 chr2 76165942 76166048 -105582039 - MER74A LTR ERVL -429 129 8 2 1166 328 344 93 46 chr2 76167007 76167309 -105580778 + LTR33 LTR ERVL 18 333 -182 2 1166 364 306 90 7 chr2 76183458 76183603 -105564484 - MLT1H2 LTR MaLR -21 468 312 3 1166 237 308 136 15 chr2 76186719 76186851 -105561236 + MLT1J-int LTR MaLR 1 148 -1239 3 1166 669 271 170 42 chr2 76189209 76189516 -105558571 - MER31B LTR ERV1 -79 406 43 3 1166 669 268 183 46 chr2 76189861 76189911 -105558176 - MER31B LTR ERV1 -424 42 2 3 1166 273 328 158 16 chr2 76190054 76190308 -105557779 - MLT2F LTR ERVL -368 295 6 3 1166 371 212 16 103 chr2 76192442 76192455 -105555632 + MT2B LTR ERVL 155 156 -445 3 1166 547 303 26 11 chr2 76200091 76200281 -105547806 + MTE-int LTR MaLR 1 193 -1387 3 1166 699 338 69 59 chr2 76200946 76201595 -105546492 + MTE-int LTR MaLR 685 1232 -138 3 1166 354 304 169 26 chr2 76204502 76204775 -105543312 + LTR73 LTR ERV1 37 348 -224 3 1166 1249 173 97 17 chr2 76206867 76207156 -105540931 - ORR1B2 LTR MaLR -15 352 41 3 1166 419 351 56 25 chr2 76207163 76207357 -105540730 + MER31A LTR ERV1 1 191 -294 3 1166 419 351 105 50 chr2 76207505 76207745 -105540342 + MER31A LTR ERV1 192 440 -45 3 1166 381 259 39 6 chr2 76223417 76223526 -105524561 + MTE-int LTR MaLR 62 167 -1203 3 1166 857 292 276 21 chr2 76224601 76224972 -105523115 + MTE-int LTR MaLR 192 656 -924 3 1166 482 365 78 34 chr2 76225001 76225071 -105523016 + MTE-int LTR MaLR 657 724 -856 3 1166 482 365 78 34 chr2 76225218 76225449 -105522638 + MTE-int LTR MaLR 725 972 -608 3 1166 708 299 141 35 chr2 76231554 76231950 -105516137 - LTR40a LTR ERVL -4 515 78 3 1166 572 294 34 23 chr2 76232566 76232761 -105515326 + MTE2a LTR MaLR 4 233 -188 3 1166 697 211 128 16 chr2 76233595 76233783 -105514304 + MTE2b LTR MaLR 168 376 -3 3 1166 1480 203 124 6 chr2 76234174 76234536 -105513551 + MTD LTR MaLR 1 405 -14 3 1166 986 209 246 0 chr2 76236523 76236820 -105511267 + ORR1D1 LTR MaLR 3 372 -2 4 1166 3138 163 65 97 chr2 76237692 76237708 -105510379 - RLTR17 LTR ERVK 0 692 677 4 1166 3138 163 65 97 chr2 76237744 76238440 -105509647 - RLTR17 LTR ERVK -16 676 5 4 1166 238 292 0 0 chr2 76242336 76242408 -105505679 - MLT2E LTR ERVL -556 72 1 4 1166 1122 228 104 16 chr2 76249326 76249634 -105498453 - MTD LTR MaLR -25 394 60 4 1166 1914 118 37 26 chr2 76260205 76260554 -105487533 - RLTR15 LTR ERVK -6 353 1 4 1166 231 250 0 30 chr2 76264048 76264114 -105483973 - MLT1A0 LTR MaLR -31 334 271 4 1166 335 208 26 0 chr2 76265521 76265598 -105482489 - MTE2a LTR MaLR -11 368 290 4 1166 236 273 0 108 chr2 76265853 76265964 -105482123 - MTE2a LTR MaLR -280 99 1 4 1166 228 324 95 34 chr2 76269218 76269365 -105478722 + ORR1E LTR MaLR 96 251 -108 4 1166 322 302 28 19 chr2 76269663 76269771 -105478316 - MLT2C1 LTR ERVL -266 131 23 4 1166 300 294 27 9 chr2 76270341 76270451 -105477636 + MTD LTR MaLR 4 115 -304 4 1166 1982 133 22 51 chr2 76270901 76271070 -105477017 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 226 4 1166 1982 133 22 51 chr2 76271257 76271458 -105476629 - ORR1B1 LTR MaLR -169 225 27 4 1166 407 161 331 0 chr2 76271457 76271587 -105476500 + MTD LTR MaLR 233 405 -14 4 1166 1903 201 62 3 chr2 76274024 76274413 -105473674 + MTD LTR MaLR 1 412 -7 4 1166 2013 142 40 20 chr2 76277693 76278095 -105469992 + RMER17C LTR ERVK 1 410 0 4 1166 272 396 66 9 chr2 76281969 76282196 -105465891 - LTR33 LTR ERVL -241 274 35 4 145 1513 180 55 26 chr2 76283633 76283976 -105464111 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 34 4 1167 908 40 0 32 chr2 76298768 76298922 -105449165 + RMER17B LTR ERVK 312 460 -498 5 1167 2035 132 107 8 chr2 76302658 76303033 -105445054 + MTC LTR MaLR 1 412 -9 5 1167 6113 125 136 19 chr2 76303037 76304163 -105443924 + MTC-int LTR MaLR 2 1258 0 5 1167 2355 143 74 2 chr2 76304163 76304556 -105443531 + MTC LTR MaLR 1 421 0 5 1167 328 242 21 10 chr2 76309533 76309629 -105438458 + MTEb LTR MaLR 283 379 0 5 1167 471 62 0 0 chr2 76310824 76310889 -105437198 - MTB LTR MaLR -127 273 209 5 1167 972 83 0 7 chr2 76310872 76311017 -105437070 + ORR1A2 LTR MaLR 256 399 -1 5 1167 9516 152 33 13 chr2 76311017 76312773 -105435314 + ORR1A2-int LTR MaLR 2 1792 0 5 1167 2544 80 3 0 chr2 76312773 76313099 -105434988 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 5 1167 597 235 19 32 chr2 76324727 76324885 -105423202 - ORR1D2 LTR MaLR -3 367 212 5 1167 2209 110 19 3 chr2 76325310 76325630 -105422457 + ORR1A2 LTR MaLR 3 327 0 5 1167 261 276 82 82 chr2 76326924 76327169 -105420918 - RMER2 LTR ERV1 0 567 323 5 1167 1764 113 11 0 chr2 76335556 76335838 -105412249 - RLTR28 LTR ERVL -191 333 49 5 1167 225 57 0 0 chr2 76340878 76340904 -105407183 - RMER6C LTR ERVK 0 690 665 5 1167 1852 173 19 166 chr2 76340904 76341265 -105406822 - RMER6D LTR ERVK 0 720 373 5 1167 1852 173 19 166 chr2 76341308 76341520 -105406567 - RMER6D LTR ERVK -348 372 231 5 1167 248 349 8 23 chr2 76343537 76343666 -105404421 + RMER12 LTR ERVK 726 852 -470 5 1167 1595 192 65 20 chr2 76345729 76346085 -105402002 + ORR1D1 LTR MaLR 1 372 -2 5 1167 1654 162 132 18 chr2 76346965 76347297 -105400790 - ORR1B1 LTR MaLR -20 374 5 5 1167 1189 202 245 93 chr2 76349985 76350456 -105397631 + MT2B LTR ERVL 2 526 -75 5 1167 1189 202 245 93 chr2 76350496 76350542 -105397545 + MT2B LTR ERVL 527 598 -3 5 1167 2175 101 31 0 chr2 76350559 76350876 -105397211 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 5 1167 4157 82 42 32 chr2 76351692 76352285 -105395802 - MT2B LTR ERVL -2 599 1 5 1167 1326 268 63 24 chr2 76353958 76354012 -105394075 - RLTR11A2 LTR ERVK -1 526 471 5 1167 3571 15 2 0 chr2 76354012 76354407 -105393680 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 1167 1326 268 63 24 chr2 76354407 76354857 -105393230 - RLTR11A2 LTR ERVK -57 470 2 5 1167 433 191 35 43 chr2 76359828 76359943 -105388144 + RMER15 LTR ERVL 11 124 -451 6 1167 617 266 87 77 chr2 76359971 76360269 -105387818 + RMER15 LTR ERVL 275 575 0 6 1167 867 282 137 6 chr2 76368039 76368374 -105379713 - MTEa LTR MaLR 0 379 1 6 1167 2220 79 3 9 chr2 76369469 76369790 -105378297 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 6 1167 1482 258 35 8 chr2 76374619 76375018 -105373069 + MTD LTR MaLR 10 419 0 6 1168 452 290 76 84 chr2 76438947 76439184 -105308903 - RLTR11B LTR ERVK -198 255 21 7 1168 1965 221 20 22 chr2 76440250 76440744 -105307343 - RLTR16 LTR ERVK -12 493 1 7 1168 3487 88 11 4 chr2 76442437 76442907 -105305180 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 3 7 1168 658 260 56 15 chr2 76444151 76444461 -105303626 - MTD LTR MaLR -15 404 42 7 1168 225 163 0 0 chr2 76444796 76444839 -105303248 - MT2A LTR ERVL -490 43 1 7 1168 2007 207 14 5 chr2 76445812 76446229 -105301858 - MTC LTR MaLR 0 421 1 7 1168 2167 170 14 70 chr2 76446346 76446777 -105301310 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 7 1168 391 326 42 11 chr2 76447657 76447846 -105300241 - MER89 LTR ERV1 -194 365 171 7 1168 441 298 137 27 chr2 76451288 76451581 -105296506 - MLT1D LTR MaLR -1 504 180 7 1168 226 296 54 40 chr2 76451937 76452011 -105296076 - MLT1D LTR MaLR -547 80 6 7 1168 1207 148 30 108 chr2 76455329 76455624 -105292463 + RLTR18 LTR ERVK 1 272 -344 7 1168 369 286 20 0 chr2 76455625 76455723 -105292364 + RLTR18 LTR ERVK 517 616 0 7 1168 2293 138 17 52 chr2 76457714 76458119 -105289968 - ORR1B1 LTR MaLR -1 393 3 7 1168 3141 70 5 2 chr2 76460234 76460633 -105287454 - MTB LTR MaLR 0 400 1 7 1168 257 308 32 42 chr2 76460782 76460877 -105287210 - RMER13A LTR ERVK -202 658 565 7 1168 1268 246 72 59 chr2 76460903 76461375 -105286712 - RMER13A LTR ERVK -382 478 1 7 1168 2001 125 3 86 chr2 76461398 76461757 -105286330 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 7 1168 407 130 39 0 chr2 76463244 76463321 -105284766 + MTC LTR MaLR 230 309 -112 7 1168 1297 121 7 137 chr2 76463319 76463626 -105284461 + LTRIS5 LTR ERV1 171 437 -10 7 1168 752 187 32 0 chr2 76464210 76464333 -105283754 + ETnERV2-int LTR ERVK 7070 7196 -210 7 1168 1878 198 52 42 chr2 76464981 76465460 -105282627 + RLTR19C LTR ERVK 23 506 0 7 1168 353 271 199 57 chr2 76467016 76467227 -105280860 - LTR16A LTR ERVL -161 290 50 7 1168 3540 13 13 0 chr2 76470725 76471116 -105276971 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 7 1168 1073 213 101 36 chr2 76492494 76492773 -105255314 - RMER17C LTR ERVK 0 410 110 8 1168 1073 213 101 36 chr2 76492840 76492945 -105255142 - RMER17C LTR ERVK -301 109 2 8 1168 3482 175 92 19 chr2 76496862 76497655 -105250432 + RLTR25B LTR ERVK 3 853 -175 8 1168 2077 110 6 0 chr2 76499641 76499958 -105248129 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 8 1168 533 199 133 13 chr2 76502209 76502367 -105245720 + MTD LTR MaLR 243 419 0 9 1168 1181 296 77 24 chr2 76507659 76508117 -105239970 + MT2A LTR ERVL 1 466 -67 2 1168 1181 296 77 24 chr2 76508175 76508222 -105239865 + MT2A LTR ERVL 467 532 -1 2 1168 725 260 77 11 chr2 76516323 76516584 -105231503 - MTE2a LTR MaLR -15 364 87 3 1168 687 187 43 7 chr2 76521906 76522046 -105226041 - RLTR25A LTR ERVK 0 1028 884 4 1168 3254 148 35 16 chr2 76522363 76522983 -105225104 - RLTR25A LTR ERVK -255 848 217 4 1168 1086 152 45 45 chr2 76524932 76525025 -105223062 - RLTR20A LTR ERVK -1 540 439 5 1168 1086 152 45 45 chr2 76525073 76525200 -105222887 - RLTR20A LTR ERVK -103 438 320 5 1168 1856 199 35 56 chr2 76535981 76536209 -105211878 - MTC LTR MaLR -29 392 208 7 1168 1856 184 35 60 chr2 76536356 76536551 -105211536 - MTC LTR MaLR -210 211 3 7 1168 1140 197 119 50 chr2 76537212 76537259 -105210828 + MTD LTR MaLR 1 45 -374 8 1168 2877 127 38 56 chr2 76537259 76537793 -105210294 - RLTR28 LTR ERVL 0 524 1 8 1168 1140 197 119 50 chr2 76537793 76538124 -105209963 + MTD LTR MaLR 46 405 -14 8 1168 374 236 116 20 chr2 76539394 76539541 -105208546 + MLT1C LTR MaLR 304 464 -3 8 1169 351 227 0 118 chr2 76638763 76638873 -105109214 - MT2B LTR ERVL -337 264 168 1 1170 1605 192 53 42 chr2 76773290 76773670 -104974417 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 2 1171 1203 165 4 21 chr2 76825352 76825593 -104922494 - RMER10B LTR ERVL -132 266 30 2 1171 781 251 173 71 chr2 76825607 76825959 -104922128 - MTD LTR MaLR -24 395 8 2 1171 3330 65 5 2 chr2 76826095 76826494 -104921593 + MTB LTR MaLR 1 400 0 2 1171 2667 118 11 18 chr2 76827512 76827952 -104920135 + RLTR11B LTR ERVK 1 437 -16 2 1171 2134 156 31 47 chr2 76830410 76830794 -104917293 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 2 1171 344 250 82 10 chr2 76843360 76843457 -104904630 + MTEb LTR MaLR 1 104 -275 2 1171 596 224 148 16 chr2 76843495 76843677 -104904410 + MTEb LTR MaLR 169 374 -5 2 1171 355 340 92 57 chr2 76844473 76844735 -104903352 - MLT1C LTR MaLR -10 457 187 2 1171 477 311 94 26 chr2 76859396 76859630 -104888457 + MLT1A LTR MaLR 124 373 -1 3 1171 259 337 48 95 chr2 76862022 76862232 -104885855 + ORR1E LTR MaLR 38 237 -122 3 1171 1562 246 73 9 chr2 76863208 76863589 -104884498 - MTD LTR MaLR -16 403 12 3 1171 5500 30 0 2 chr2 76913897 76914523 -104833564 - MERVL-int LTR ERVL -375 5110 4486 3 1171 1441 229 141 3 chr2 76916788 76917156 -104830931 - MTD LTR MaLR 0 419 1 3 1171 598 273 89 19 chr2 76919702 76919915 -104828172 - RMER15 LTR ERVL 0 575 348 3 1171 530 237 96 18 chr2 76924159 76924378 -104823709 + LTR40c LTR ERVL 25 260 -205 3 1171 244 338 62 21 chr2 76926038 76926183 -104821904 - MLT1A LTR MaLR -51 323 173 3 1171 635 273 114 61 chr2 76927365 76927708 -104820379 + MLT1A0 LTR MaLR 5 365 0 3 1172 276 288 126 47 chr2 76952129 76952344 -104795743 + MER57C2 LTR ERV1 145 376 -58 4 1172 2458 142 31 29 chr2 76953054 76953135 -104794952 + MTC LTR MaLR 1 80 -341 4 1172 2458 142 31 29 chr2 76953282 76953620 -104794467 + MTC LTR MaLR 81 421 0 4 1172 1315 214 68 41 chr2 76954134 76954515 -104793572 + ORR1D1 LTR MaLR 7 370 -14 4 1172 402 364 128 19 chr2 76963201 76963467 -104784620 + RMER15 LTR ERVL 245 539 -36 4 1172 3341 35 5 2 chr2 76975978 76976373 -104771714 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 1172 2929 65 55 5 chr2 76985133 76985534 -104762553 + BGLII LTR ERVK 1 421 0 4 1172 3982 134 85 18 chr2 76990808 76991514 -104756573 + RMER6A LTR ERVK 1 753 -3 4 1172 1868 96 112 64 chr2 76994742 76995054 -104753033 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 4 1172 773 265 169 36 chr2 76999231 76999591 -104748496 + MLT1A1 LTR MaLR 1 408 0 4 1172 479 213 11 0 chr2 77000394 77000488 -104747599 + MT2A LTR ERVL 258 352 -181 1 1172 670 280 45 79 chr2 77000482 77000806 -104747281 - MT2A LTR ERVL -248 285 1 2 1172 1716 215 74 5 chr2 77001424 77001803 -104746284 - MTD LTR MaLR -14 405 1 6 1172 1035 191 207 36 chr2 77017637 77017946 -104730141 + ORR1D1 LTR MaLR 1 362 -12 2 1172 227 314 37 80 chr2 77057582 77057769 -104690318 - RMER5 LTR ERV1 -5 529 351 6 1172 681 211 142 0 chr2 77057785 77057975 -104690112 - RMER5 LTR ERV1 -264 270 54 6 1172 6624 48 18 0 chr2 77060331 77061125 -104686962 + RLTR13C2 LTR ERVK 1 808 0 7 1172 4401 20 0 12 chr2 77062054 77062553 -104685534 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 7 1172 41399 16 14 0 chr2 77062553 77067840 -104680247 + MERVL-int LTR ERVL 1 5360 -125 7 1172 331 191 46 35 chr2 77067840 77067927 -104680160 + ORR1A3-int LTR MaLR 553 640 -1323 7 1172 321 0 0 0 chr2 77067927 77067965 -104680122 + MERVL-int LTR ERVL 5448 5485 0 7 1172 4401 20 0 12 chr2 77067965 77068464 -104679623 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 7 1173 588 231 125 21 chr2 77077232 77077500 -104670587 + MTD LTR MaLR 46 405 -14 8 1173 1047 261 122 42 chr2 77077610 77077784 -104670303 + MTC-int LTR MaLR 55 245 -1013 8 1173 1047 261 122 42 chr2 77077969 77078270 -104669817 + MTC-int LTR MaLR 246 567 -691 8 1173 263 282 158 83 chr2 77090352 77090580 -104657507 - MLT1A1 LTR MaLR -79 329 85 9 1173 550 104 40 26 chr2 77093311 77093425 -104654662 + ORR1B1 LTR MaLR 30 147 -212 1 1173 432 322 28 36 chr2 77094979 77095223 -104652864 + MLT2B1 LTR ERVL 170 498 -69 1 1173 1777 165 16 3 chr2 77098948 77099270 -104648817 - MTD LTR MaLR -93 326 1 1 1173 760 242 143 19 chr2 77101535 77101842 -104646245 + MTE2b LTR MaLR 20 364 -15 1 1173 869 227 242 19 chr2 77101958 77102268 -104645819 - MTE2a LTR MaLR 0 379 1 1 1173 578 263 114 6 chr2 77104456 77104632 -104643455 + MTEa LTR MaLR 28 222 -157 1 1173 326 280 164 13 chr2 77106388 77106547 -104641540 + MLT1A0 LTR MaLR 133 315 -50 1 1173 1348 221 132 9 chr2 77108915 77109349 -104638738 + MT2A LTR ERVL 7 529 -4 1 1173 996 229 162 25 chr2 77116508 77116866 -104631221 - MTD LTR MaLR -12 407 1 1 1173 1488 143 141 18 chr2 77127908 77128235 -104619852 + RLTR17 LTR ERVK 1 367 -325 1 1173 1783 199 20 65 chr2 77131711 77132113 -104615974 + MTD LTR MaLR 22 405 -14 1 1173 1052 251 95 58 chr2 77132571 77132917 -104615170 - MTEa LTR MaLR -1 378 20 1 1173 234 375 48 0 chr2 77138318 77138422 -104609665 - LTR16A LTR ERVL -221 230 122 1 1173 468 267 163 42 chr2 77142402 77142691 -104605396 + MLT1B LTR MaLR 61 384 -6 1 1173 248 254 80 116 chr2 77145033 77145078 -104603009 + RMER15 LTR ERVL 443 485 -90 1 1173 1129 220 111 64 chr2 77145078 77145438 -104602649 + ORR1C2 LTR MaLR 4 380 -4 1 1173 248 254 80 116 chr2 77145438 77145530 -104602557 + RMER15 LTR ERVL 486 575 0 1 1173 823 203 49 10 chr2 77150086 77150146 -104597941 - MT2A LTR ERVL -4 529 467 1 1173 823 203 49 10 chr2 77150174 77150317 -104597770 - MT2A LTR ERVL -67 466 320 1 1173 553 193 36 27 chr2 77150433 77150545 -104597542 - MT2A LTR ERVL -420 113 1 1 1173 2525 150 30 30 chr2 77152040 77152514 -104595573 + RLTR20B1 LTR ERVK 60 533 -30 2 1173 289 243 59 67 chr2 77156116 77156235 -104591852 - MLT1J LTR MaLR -8 504 387 2 1173 277 343 0 10 chr2 77156376 77156479 -104591608 - MLT1J LTR MaLR -300 212 111 2 1173 942 204 204 134 chr2 77156776 77157178 -104590909 + MT2A LTR ERVL 1 430 -103 2 1173 431 179 2 29 chr2 77157196 77157309 -104590778 - ORR1A1 LTR MaLR -234 112 1 2 1173 1442 231 29 15 chr2 77163569 77164020 -104584067 - MT2A LTR ERVL 0 533 29 2 1173 1548 231 38 20 chr2 77165761 77166159 -104581928 + MTD LTR MaLR 15 419 0 2 1173 268 283 64 21 chr2 77166855 77166996 -104581091 - RMER15 LTR ERVL -7 568 422 2 1173 2017 134 104 31 chr2 77174805 77175160 -104572927 - RLTR9A2 LTR ERVK -2 381 1 2 1173 456 257 28 49 chr2 77175912 77176055 -104572032 - RLTR25A LTR ERVK 0 1103 964 2 1173 2338 134 85 30 chr2 77176031 77176619 -104571468 - RLTR25A LTR ERVK -224 804 165 2 1173 596 169 8 16 chr2 77176862 77176988 -104571099 - RLTR25A LTR ERVK -903 125 1 2 1173 5286 95 154 21 chr2 77182143 77182989 -104565098 - RMER17B LTR ERVK 0 958 1 2 1173 1992 138 72 58 chr2 77185005 77185382 -104562705 + ORR1C2 LTR MaLR 3 384 0 2 1173 261 264 55 0 chr2 77188068 77188159 -104559928 + RMER15 LTR ERVL 427 522 -53 2 1173 507 319 43 19 chr2 77190327 77190535 -104557552 - RMER15 LTR ERVL -16 559 347 2 1173 3079 35 64 3 chr2 77190997 77191370 -104556717 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 1173 727 272 86 36 chr2 77192296 77192632 -104555455 - ORR1E LTR MaLR -4 355 3 2 1173 261 327 20 10 chr2 77197007 77197109 -104550978 - ORR1E LTR MaLR -11 348 246 2 1173 326 262 95 19 chr2 77197232 77197337 -104550750 - ORR1E LTR MaLR -168 191 79 2 1173 690 228 158 106 chr2 77197943 77198291 -104549796 + MTEa LTR MaLR 1 366 -13 2 1173 810 266 156 44 chr2 77199484 77199654 -104548433 - ORR1E LTR MaLR -4 355 138 2 1173 810 266 156 44 chr2 77199800 77199944 -104548143 - ORR1E LTR MaLR -222 137 6 2 1174 808 303 126 38 chr2 77201515 77202092 -104545995 - RMER13A LTR ERVK -231 677 21 2 1174 633 239 78 16 chr2 77205385 77205576 -104542511 + MLT1B LTR MaLR 23 225 -165 2 1174 570 315 95 0 chr2 77208125 77208347 -104539740 - MLT1F1 LTR MaLR 0 569 327 2 1174 921 270 76 32 chr2 77208381 77208722 -104539365 - RMER15 LTR ERVL -16 559 204 2 1174 483 320 65 15 chr2 77208847 77209047 -104539040 - MLT1F1 LTR MaLR -269 300 91 2 1174 450 363 67 31 chr2 77211554 77211941 -104536146 + MER90 LTR ERV1 169 569 -6 2 1174 395 278 42 76 chr2 77213636 77213780 -104534307 + MTEa LTR MaLR 14 152 -227 2 1174 249 190 52 0 chr2 77213896 77213954 -104534133 + MTEa LTR MaLR 305 365 -14 2 1174 226 288 56 112 chr2 77214703 77214731 -104533356 - MT2B LTR ERVL -447 154 134 3 1174 1824 171 105 5 chr2 77216325 77216707 -104531380 - MTC LTR MaLR -1 420 1 3 1174 1897 140 10 78 chr2 77219038 77219425 -104528662 + ORR1D1 LTR MaLR 11 371 -3 3 1174 269 289 50 50 chr2 77221564 77221724 -104526363 - MLT1A LTR MaLR -211 163 4 3 1174 399 322 112 75 chr2 77226427 77226883 -104521204 + RMER5 LTR ERV1 50 522 -12 3 1174 270 284 22 12 chr2 77228896 77228998 -104519089 + MTEb LTR MaLR 278 379 0 3 1174 1090 162 5 5 chr2 77233795 77234006 -104514081 + MTC LTR MaLR 2 212 -209 3 1174 664 246 94 10 chr2 77234787 77234988 -104513099 + MTC LTR MaLR 196 413 -8 3 1174 361 293 35 47 chr2 77237570 77237742 -104510345 - RMER15 LTR ERVL -70 505 336 3 1174 288 252 70 112 chr2 77247952 77248211 -104499876 + MLT1H1 LTR MaLR 273 520 -35 3 1174 892 301 120 59 chr2 77261294 77261943 -104486144 + LTR48 LTR ERV1 33 721 -66 3 1174 352 319 71 21 chr2 77280260 77280401 -104467686 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 218 3 1174 301 295 89 8 chr2 77280493 77280616 -104467471 - MLT-int LTR MaLR 0 1735 1603 3 1174 239 242 130 11 chr2 77280753 77280845 -104467242 - MLT-int LTR MaLR -207 1528 1426 3 1174 976 245 134 36 chr2 77291030 77291365 -104456722 + MTD LTR MaLR 52 419 0 3 1174 1651 178 114 12 chr2 77299810 77300135 -104447952 + RLTR15 LTR ERVK 2 359 0 3 1174 259 274 8 64 chr2 77303532 77303657 -104444430 - RMER17C LTR ERVK -108 302 185 3 1174 307 280 43 43 chr2 77312288 77312426 -104435661 - MLT1D LTR MaLR -50 455 318 4 1174 337 304 112 19 chr2 77317699 77317904 -104430183 + ORR1E LTR MaLR 4 227 -132 4 1174 385 269 127 52 chr2 77325760 77325972 -104422115 - ORR1E LTR MaLR -122 237 10 4 1175 232 200 0 20 chr2 77333369 77333420 -104414667 + RMER19B LTR ERVK 853 902 0 4 1175 341 270 34 0 chr2 77336675 77336764 -104411323 - MLT1B LTR MaLR -15 375 284 4 1175 1341 228 123 33 chr2 77345760 77346127 -104401960 + MTD LTR MaLR 1 400 -19 4 1175 2437 150 56 5 chr2 77348163 77348538 -104399549 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 4 1175 682 134 9 9 chr2 77377959 77378072 -104370015 - MT2C_Mm LTR ERVL -73 402 290 5 1175 576 268 127 6 chr2 77379696 77379869 -104368218 + MLT1A LTR MaLR 181 374 0 5 1175 333 314 84 51 chr2 77380762 77380940 -104367147 + MLT1J LTR MaLR 106 289 -223 5 1175 3566 152 157 40 chr2 77381928 77382775 -104365312 + RLTR25A LTR ERVK 2 947 -156 5 1175 227 138 15 147 chr2 77385434 77385502 -104362585 + RLTR25B LTR ERVK 742 800 -228 5 1175 293 220 113 120 chr2 77388688 77388838 -104359249 - MT2B LTR ERVL -323 278 130 5 1175 225 287 139 0 chr2 77400968 77401069 -104347018 + MLT1N2 LTR MaLR 448 562 0 5 1175 365 346 57 6 chr2 77401853 77402010 -104346077 - MLT1E2 LTR MaLR -14 613 449 5 1175 394 332 98 28 chr2 77402019 77402304 -104345783 - MLT1E2-int LTR MaLR -527 962 658 5 1175 581 320 145 31 chr2 77402406 77402854 -104345233 - MLT1E2-int LTR MaLR -987 502 4 5 1175 954 261 87 45 chr2 77404052 77404409 -104343678 + MTEa LTR MaLR 2 373 -6 5 1175 2849 153 77 110 chr2 77415469 77416167 -104331920 + RMER6A LTR ERVK 82 756 0 5 1175 1999 158 61 24 chr2 77422027 77422403 -104325684 + ORR1B1 LTR MaLR 1 390 -4 5 1175 897 230 121 28 chr2 77424527 77424809 -104323278 - RLTR25B LTR ERVK 0 1028 721 5 1175 3424 163 115 15 chr2 77425091 77425812 -104322275 - RLTR25A LTR ERVK -296 807 15 5 1175 866 98 13 0 chr2 77431022 77431175 -104316912 + RMER17B LTR ERVK 309 463 -495 5 1175 228 326 59 59 chr2 77443453 77443554 -104304533 - RLTR45 LTR ERVK -378 104 4 6 1175 236 351 167 58 chr2 77453122 77453554 -104294533 + LTR33A LTR ERVL 18 496 -24 6 1175 1624 252 24 21 chr2 77460212 77460630 -104287457 - MTD LTR MaLR 0 419 1 6 1175 975 255 93 78 chr2 77461425 77461643 -104286444 + MLT2B3 LTR ERVL 1 222 -332 6 1175 975 255 93 78 chr2 77461692 77462000 -104286087 + MLT2B3 LTR ERVL 223 534 -20 6 1176 626 320 192 16 chr2 77464616 77464924 -104283163 + MTEb LTR MaLR 10 371 -8 6 1176 285 83 61 20 chr2 77471578 77471627 -104276460 + MTD LTR MaLR 369 419 0 6 1176 534 254 21 31 chr2 77475501 77475696 -104272391 - MTE2b LTR MaLR -94 285 98 6 1176 1566 223 82 17 chr2 77491058 77491414 -104256673 - MTE2b LTR MaLR 0 379 1 6 1176 477 380 82 52 chr2 77492536 77492999 -104255088 + LTR33 LTR ERVL 36 512 -3 6 1176 1707 170 110 3 chr2 77497452 77497789 -104250298 + ORR1C2 LTR MaLR 12 384 0 6 1176 1861 157 151 3 chr2 77510145 77510516 -104237571 + RMER15 LTR ERVL 1 426 -149 1 1176 565 237 40 70 chr2 77518974 77519174 -104228913 + MLT1B LTR MaLR 191 384 -6 3 1176 2058 191 71 39 chr2 77522755 77523163 -104224924 - MTC LTR MaLR 0 421 1 4 1176 388 326 14 7 chr2 77530379 77530518 -104217569 + RMER15 LTR ERVL 423 562 -13 4 1176 797 284 33 86 chr2 77533655 77534017 -104214070 - MTEa LTR MaLR -9 370 28 5 1176 520 271 133 23 chr2 77535423 77535739 -104212348 - MLT1A1 LTR MaLR -1 407 5 5 1176 1206 294 60 16 chr2 77551446 77551829 -104196258 + MTD LTR MaLR 10 409 -10 7 1176 296 360 23 58 chr2 77554572 77554746 -104193341 - MLT1B LTR MaLR -2 388 221 7 1176 1401 137 116 44 chr2 77567727 77568002 -104180085 + ORR1A3 LTR MaLR 32 326 0 9 1176 3123 140 40 49 chr2 77588515 77589047 -104159040 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 527 0 1 1176 580 235 343 32 chr2 77589142 77589391 -104158696 + ORR1E LTR MaLR 8 321 -58 1 1176 1280 97 18 40 chr2 77589396 77589622 -104158465 + BGLII LTR ERVK 39 259 -162 1 1176 1431 123 7 47 chr2 77589629 77589720 -104158367 + BGLII LTR ERVK 159 243 -178 1 1176 1431 123 7 47 chr2 77590110 77590288 -104157799 + BGLII LTR ERVK 244 420 -1 1 1177 325 258 49 88 chr2 77604718 77604820 -104143267 + MTEa LTR MaLR 3 100 -279 1 1177 262 374 48 64 chr2 77604812 77604863 -104143224 + MTEa LTR MaLR 41 88 -271 1 1177 2591 127 42 5 chr2 77604863 77605243 -104142844 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 1 1177 288 344 37 54 chr2 77605243 77605517 -104142570 + MTEa LTR MaLR 89 379 0 1 1177 344 204 39 39 chr2 77614259 77614361 -104133726 - MLT1K LTR MaLR 0 595 494 1 1177 3108 71 2 5 chr2 77617707 77618104 -104129983 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1177 262 167 95 27 chr2 77623360 77623434 -104124653 + RLTR25B LTR ERVK 431 509 -519 1 1177 1237 226 80 29 chr2 77624224 77624575 -104123512 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 2 1 1177 308 333 37 9 chr2 77631491 77631600 -104116487 - LTR33 LTR ERVL -301 214 103 1 1177 288 310 35 17 chr2 77637217 77637332 -104110755 - RLTR42-int LTR ERVK -4253 1269 1153 1 1177 575 263 51 47 chr2 77658218 77658453 -104089634 + RMER5 LTR ERV1 33 268 -266 2 1177 406 262 36 129 chr2 77659274 77659498 -104088589 + RMER5 LTR ERV1 253 455 -79 2 1177 1722 230 52 30 chr2 77659499 77659960 -104088127 - RMER19C LTR ERVK 0 611 141 2 1177 2857 140 160 27 chr2 77661829 77662423 -104085664 + RMER19A LTR ERVK 1 673 -64 2 1177 2483 95 3 0 chr2 77665345 77665671 -104082416 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 2 1177 715 265 68 148 chr2 77676521 77676933 -104071154 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 2 1177 1251 288 17 84 chr2 77676997 77677403 -104070684 - MTEa LTR MaLR 0 379 1 2 1177 2632 107 92 51 chr2 77677515 77677949 -104070138 - RLTR44E LTR ERVK 0 452 1 2 1177 698 305 98 54 chr2 77683406 77683794 -104064293 - MTD LTR MaLR -14 405 1 2 1177 752 236 169 60 chr2 77685614 77685862 -104062225 + MT2A LTR ERVL 259 533 0 2 1177 1401 275 28 8 chr2 77688246 77688602 -104059485 - MTEb LTR MaLR -16 363 1 2 1177 236 296 106 91 chr2 77692213 77692421 -104055666 + MLT1A0 LTR MaLR 29 239 -169 2 1177 242 343 38 9 chr2 77692453 77692559 -104055528 + MLT1A0 LTR MaLR 257 365 0 2 1177 406 327 66 40 chr2 77693947 77694173 -104053914 - MLT1A LTR MaLR -112 262 31 2 1177 1127 276 57 42 chr2 77694432 77694784 -104053303 + ORR1E LTR MaLR 5 379 0 2 1177 294 213 50 60 chr2 77698482 77698582 -104049505 + MTEb LTR MaLR 281 379 0 2 1177 767 319 82 25 chr2 77699110 77699476 -104048611 + MLT1C LTR MaLR 31 417 -50 2 1177 1537 194 80 50 chr2 77699728 77700030 -104048057 + ORR1D1 LTR MaLR 1 322 -52 2 1177 1537 194 80 50 chr2 77700063 77700123 -104047964 + ORR1D1 LTR MaLR 323 374 0 2 1177 284 250 163 20 chr2 77702371 77702396 -104045691 - MTE2a-int LTR MaLR -699 881 857 2 1177 284 250 163 20 chr2 77702422 77702494 -104045593 - MTE2a-int LTR MaLR -724 856 770 2 1177 465 278 114 19 chr2 77702514 77702672 -104045415 - MTE2a-int LTR MaLR -882 698 526 2 1177 994 273 109 17 chr2 77702665 77703015 -104045072 - MTE2a-int LTR MaLR -1197 383 2 2 1177 272 130 0 0 chr2 77703019 77703065 -104045022 - MTE2a LTR MaLR -2 377 332 2 1177 12649 166 40 13 chr2 77703065 77705249 -104042838 + MERVL_2A-int LTR ERVL 3447 5690 -71 2 1177 237 178 0 52 chr2 77705257 77705334 -104042753 + ORR1A3-int LTR MaLR 567 639 -1324 2 1177 354 143 0 0 chr2 77705334 77705390 -104042697 + MERVL_2A-int LTR ERVL 5706 5761 0 2 1177 1180 244 96 35 chr2 77705537 77705851 -104042236 - MTE2a LTR MaLR -44 335 3 2 1177 281 333 21 0 chr2 77707210 77707306 -104040781 + MLT1F LTR MaLR 289 386 -162 2 1177 1069 309 8 34 chr2 77713614 77713966 -104034121 - MTEb LTR MaLR 0 379 37 2 1177 3883 283 120 56 chr2 77714008 77715445 -104032642 - MTEb-int LTR MaLR -51 1529 1 2 1177 1145 274 116 12 chr2 77715445 77715781 -104032306 - MTEb LTR MaLR 0 379 9 2 1177 257 208 155 83 chr2 77720004 77720088 -104027999 + RMER15-int LTR ERVL 844 933 -4066 3 1177 1227 285 27 9 chr2 77720116 77720449 -104027638 + RMER15-int LTR ERVL 2218 2556 -2443 3 1177 2290 136 67 6 chr2 77721304 77721660 -104026427 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 3 1177 312 294 48 20 chr2 77721989 77722135 -104025952 + RMER15 LTR ERVL 351 500 -75 3 1178 315 247 130 0 chr2 77728519 77728596 -104019491 - RMER15 LTR ERVL 0 575 489 3 1178 884 269 229 22 chr2 77728676 77729083 -104019004 + RMER15 LTR ERVL 48 538 -37 3 1178 399 322 146 26 chr2 77729107 77729340 -104018747 - RMER15 LTR ERVL -42 533 273 3 1178 924 303 61 48 chr2 77731114 77731654 -104016433 - RLTR18 LTR ERVK -95 521 1 3 1178 1735 171 95 23 chr2 77736964 77737311 -104010776 + ORR1D1 LTR MaLR 3 374 0 3 1178 543 202 0 39 chr2 77737458 77737548 -104010539 + RLTR21 LTR ERVK 1 86 -1486 3 1178 1903 190 118 56 chr2 77737548 77738016 -104010071 - RLTR16 LTR ERVK 0 505 9 3 1178 7701 141 65 85 chr2 77738000 77739540 -104008547 + RLTR21 LTR ERVK 64 1572 0 3 1178 1983 136 110 11 chr2 77773929 77774293 -103973794 + MTC LTR MaLR 1 400 -21 3 1178 1766 179 133 8 chr2 77776036 77776403 -103971684 + MTC LTR MaLR 1 413 -8 3 1178 4327 12 2 58 chr2 77781088 77781610 -103966477 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 4 1178 1963 196 90 2 chr2 77782490 77782935 -103965152 - RLTR28 LTR ERVL -14 510 27 4 1178 286 234 48 105 chr2 77783117 77783222 -103964865 + MT2B LTR ERVL 158 256 -345 4 1178 1295 212 93 54 chr2 77785705 77785766 -103962321 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 309 4 1178 1295 212 93 54 chr2 77785796 77786087 -103962000 - ORR1B2 LTR MaLR -59 308 1 4 1178 1674 230 92 19 chr2 77786426 77786517 -103961570 - MT2A LTR ERVL 0 533 428 4 1178 2006 143 120 3 chr2 77786517 77786868 -103961219 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 3 4 1178 1674 230 92 19 chr2 77786868 77787245 -103960842 - MT2A LTR ERVL -106 427 31 4 1178 1060 255 52 95 chr2 77787247 77787526 -103960561 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 140 4 1178 1060 255 52 95 chr2 77787633 77787795 -103960292 - RLTR23 LTR ERV1 -291 139 9 4 1178 598 211 7 0 chr2 77787867 77788009 -103960078 + ORR1D2-int LTR MaLR 253 395 -863 4 1178 2860 261 42 25 chr2 77788054 77788887 -103959200 + ORR1D2-int LTR MaLR 519 1365 -5 4 1178 1139 249 79 16 chr2 77788891 77789209 -103958878 + ORR1D2 LTR MaLR 1 338 -32 4 1178 868 252 122 75 chr2 77797796 77798024 -103950063 + MTEa LTR MaLR 1 223 -156 4 1178 2318 96 9 58 chr2 77798024 77798367 -103949720 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 4 1178 868 252 122 75 chr2 77798367 77798498 -103949589 + MTEa LTR MaLR 224 376 -3 4 1178 2671 139 78 19 chr2 77799737 77800259 -103947828 - RMER4B LTR ERVK 0 585 33 4 1178 1588 189 114 0 chr2 77801289 77801623 -103946464 - ORR1D1 LTR MaLR -2 372 1 4 1178 921 249 165 32 chr2 77808762 77809132 -103938955 - MTD LTR MaLR 0 419 1 4 1178 987 235 143 45 chr2 77809952 77810394 -103937693 + MT2B LTR ERVL 1 543 -58 4 1178 987 200 122 56 chr2 77810439 77810487 -103937600 + MT2B LTR ERVL 544 595 -6 4 1178 624 203 93 19 chr2 77811363 77811524 -103936563 - MTD LTR MaLR -215 204 32 4 1178 298 248 39 35 chr2 77814603 77814714 -103933373 - MLT1F2 LTR MaLR -73 487 405 4 1178 496 228 6 51 chr2 77814745 77814902 -103933185 + MLT1A0 LTR MaLR 1 150 -215 4 1178 940 177 23 24 chr2 77815098 77815320 -103932767 - MTC LTR MaLR 0 421 145 4 1178 296 243 13 13 chr2 77815297 77815372 -103932715 - MLT1F2 LTR MaLR -215 150 76 4 1178 504 129 0 12 chr2 77815379 77815465 -103932622 - MTB_Mm LTR MaLR -157 264 180 4 1178 3241 52 128 36 chr2 77815616 77816091 -103931996 + MURVY-LTR LTR ERV1 1 519 0 4 1178 1060 117 6 22 chr2 77816125 77816308 -103931779 - MTB_Mm LTR MaLR -227 180 1 4 1178 1552 240 31 48 chr2 77819379 77819404 -103928683 - RMER19C LTR ERVK -12 599 580 4 1178 3394 40 2 2 chr2 77819404 77819800 -103928287 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 1178 1552 240 31 48 chr2 77819800 77820256 -103927831 - RMER19C LTR ERVK -32 579 126 4 1178 236 318 92 8 chr2 77822373 77822503 -103925584 + MTEa LTR MaLR 239 379 0 4 1178 637 277 50 16 chr2 77823583 77823785 -103924302 + ORR1E LTR MaLR 1 195 -179 4 1178 1557 199 59 34 chr2 77827483 77827837 -103920250 - ORR1D2 LTR MaLR -7 363 1 4 1178 629 286 23 0 chr2 77828878 77829053 -103919034 - ORR1E LTR MaLR -178 181 3 4 1178 1175 232 199 8 chr2 77832499 77832851 -103915236 - MTD LTR MaLR 0 419 1 4 1178 1027 195 165 43 chr2 77832933 77833255 -103914832 + ORR1D2 LTR MaLR 7 367 -3 4 1178 286 273 0 139 chr2 77847539 77847654 -103900433 - MT2B LTR ERVL -337 264 166 4 1178 4346 56 30 0 chr2 77850265 77850839 -103897248 + RLTR22_Mus LTR ERVK 3 593 -1215 4 1179 4480 55 36 2 chr2 77857826 77858432 -103889655 + RLTR22_Mus LTR ERVK 577 1203 -605 4 1179 2554 98 19 3 chr2 77858441 77858811 -103889276 - RMER16 LTR ERVK -88 445 70 4 1179 446 200 23 91 chr2 77860670 77860802 -103887285 + MT2B LTR ERVL 156 278 -323 5 1179 752 221 94 139 chr2 77862424 77862755 -103885332 - MTE2a LTR MaLR -58 321 6 5 1179 555 284 47 24 chr2 77862762 77862975 -103885112 + MERVL_2A-int LTR ERVL 4265 4482 -1279 5 1179 1201 279 87 49 chr2 77863973 77864481 -103883606 - RLTR26 LTR ERVK -53 589 63 5 1179 1701 202 77 138 chr2 77867432 77868082 -103880005 - RMER19C LTR ERVK 0 611 2 5 1179 240 286 47 19 chr2 77877163 77877270 -103870817 + ORR1C2 LTR MaLR 106 215 -169 5 1179 349 328 116 39 chr2 77880142 77880323 -103867764 - MER21B LTR ERV1 -54 809 615 5 1179 559 214 68 4 chr2 77881645 77881797 -103866290 + ORR1D1 LTR MaLR 2 166 -228 5 1179 280 261 14 0 chr2 77881877 77881946 -103866141 - RMER10A LTR ERVL -49 393 324 5 1179 694 330 27 23 chr2 77881945 77882263 -103865824 - ORR1E-int LTR MaLR -1218 362 23 5 1179 254 246 46 0 chr2 77882309 77882374 -103865713 - ORR1E LTR MaLR -6 353 286 5 1179 411 289 89 65 chr2 77882611 77882816 -103865271 + LTR16A1 LTR ERVL 227 442 -14 5 1179 295 367 121 59 chr2 77884029 77884336 -103863751 + LTR33A_ LTR ERVL 30 355 -176 5 1179 1157 262 86 20 chr2 77885578 77885929 -103862158 - MTEa LTR MaLR -5 374 1 5 1179 1259 156 8 19 chr2 77890717 77890961 -103857126 - MTC LTR MaLR -171 248 2 5 1179 671 273 128 51 chr2 77891906 77892257 -103855830 - MER34A LTR ERV1 -193 378 1 5 1179 3011 148 87 31 chr2 77900059 77900665 -103847422 - RLTR26 LTR ERVK 0 642 3 5 1179 377 296 0 50 chr2 77905901 77906022 -103842065 + MLT1A1 LTR MaLR 294 408 0 5 1179 2768 172 19 28 chr2 77907681 77908212 -103839875 - RLTR11A LTR ERVK -2 526 1 5 1179 360 322 101 75 chr2 77912166 77912527 -103835560 - ORR1E LTR MaLR -4 370 1 5 1179 2577 73 19 53 chr2 77913455 77913833 -103834254 + RLTR8 LTR ERVK 1 365 0 5 1179 2260 99 96 0 chr2 77914470 77914813 -103833274 - MT2B2 LTR ERVL 0 584 209 6 1179 344 343 48 72 chr2 77927835 77927998 -103820089 + MLT1G LTR MaLR 14 171 -420 6 1179 344 369 85 45 chr2 77928139 77928449 -103819638 + MLT1G LTR MaLR 172 515 -54 6 1179 498 326 72 0 chr2 77929066 77929247 -103818840 - MLT1F1 LTR MaLR -72 497 304 6 1179 1028 243 5 22 chr2 77929445 77929668 -103818419 - MTC LTR MaLR 0 421 203 6 1179 809 207 127 5 chr2 77929849 77930038 -103818049 - MTC LTR MaLR -207 212 1 6 1179 889 267 169 3 chr2 77933554 77933855 -103814232 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 6 6 1179 570 338 83 38 chr2 77941324 77941673 -103806414 - MLT1C LTR MaLR -53 414 38 6 1179 560 307 137 68 chr2 77941694 77942030 -103806057 + ORR1E LTR MaLR 1 359 0 6 1179 1916 165 12 0 chr2 77949809 77950130 -103797957 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 2 6 1179 2125 156 39 8 chr2 77950986 77951349 -103796738 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 5 6 1179 2762 98 13 5 chr2 77957766 77958157 -103789930 - MTB_Mm LTR MaLR -5 402 9 6 1179 2003 95 42 27 chr2 77960168 77960506 -103787581 + IAPLTR2b LTR ERVK 1 357 0 6 1179 1017 131 33 0 chr2 77987531 77987714 -103760373 - RMER6D LTR ERVK -370 350 162 6 1180 2265 235 50 18 chr2 77993728 77994287 -103753800 + RLTR20B3 LTR ERVK 1 577 0 6 1180 1967 145 9 58 chr2 77995492 77995836 -103752251 - ORR1A4 LTR MaLR -2 327 1 6 1180 2402 90 12 0 chr2 77997035 77997358 -103750729 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 6 1180 286 278 103 0 chr2 78001534 78001631 -103746456 - LTR16A LTR ERVL -329 122 16 2 1180 531 362 80 42 chr2 78015035 78015421 -103732666 - MLT2B3 LTR ERVL -148 406 6 2 1180 2444 163 25 2 chr2 78016819 78017225 -103730862 + MTC LTR MaLR 1 415 -6 2 1180 245 318 11 23 chr2 78018109 78018196 -103729891 + MTEa LTR MaLR 279 364 -15 2 1180 293 347 39 31 chr2 78018249 78018377 -103729710 - MLT1E1 LTR MaLR -518 136 8 2 1180 274 346 90 40 chr2 78018497 78018774 -103729313 - ERVL-E-int LTR ERVL -846 4821 4531 3 1180 390 354 56 37 chr2 78020628 78020898 -103727189 - LTR33C LTR ERVL -15 614 340 3 1180 1914 190 160 9 chr2 78021625 78022270 -103725817 + MTC-int LTR MaLR 1 795 -463 3 1180 667 194 44 15 chr2 78022268 78022404 -103725683 + MTC LTR MaLR 228 367 -54 3 1180 252 336 21 35 chr2 78027601 78027743 -103720344 - LTR79 LTR ERVL -54 473 334 4 1180 802 279 61 69 chr2 78033119 78033497 -103714590 + MTEa LTR MaLR 1 375 -4 4 1180 1201 253 95 21 chr2 78036560 78036948 -103711139 + MTD LTR MaLR 3 419 0 5 1180 510 274 271 10 chr2 78046334 78046533 -103701554 + MTEa LTR MaLR 19 269 -110 5 1180 394 384 30 67 chr2 78048458 78048787 -103699300 - LTR16A1 LTR ERVL -87 369 53 6 1180 325 299 72 0 chr2 78050136 78050233 -103697854 - MTEa LTR MaLR 0 359 256 6 1180 685 234 0 74 chr2 78050332 78050521 -103697566 - MTEa LTR MaLR -203 176 2 6 1180 339 313 97 55 chr2 78051125 78051362 -103696725 - RMER15 LTR ERVL -24 551 305 6 1180 483 50 0 0 chr2 78062030 78062090 -103685997 - MTB LTR MaLR 0 407 348 8 1180 1324 79 0 0 chr2 78062087 78062265 -103685822 - MTB LTR MaLR -222 178 1 8 1180 309 324 63 0 chr2 78072085 78072196 -103675891 + MT2A LTR ERVL 3 120 -413 1 1180 1250 238 46 79 chr2 78072098 78072467 -103675620 + MTE2b LTR MaLR 23 379 0 1 1180 430 346 44 52 chr2 78075404 78075675 -103672412 - LTR53 LTR ERVL -71 448 180 1 1180 541 342 57 89 chr2 78075748 78076120 -103671967 + MTD LTR MaLR 32 391 -28 1 1180 598 209 9 0 chr2 78078787 78078902 -103669185 + MT2B LTR ERVL 3 118 -483 1 1180 1330 143 10 0 chr2 78078899 78079108 -103668979 + ORR1B1 LTR MaLR 184 394 0 1 1180 1045 312 35 9 chr2 78100515 78100858 -103647229 - MTE2b LTR MaLR -27 352 1 1 1180 872 218 33 57 chr2 78102747 78102954 -103645133 - RMER17C LTR ERVK 0 410 206 1 1180 872 218 33 57 chr2 78102985 78103112 -103644975 - RMER17C LTR ERVK -205 205 85 1 1180 911 199 44 18 chr2 78103115 78103435 -103644652 - RMER17C LTR ERVK -417 489 1 1 1180 1474 166 173 12 chr2 78106315 78106645 -103641442 + ORR1C2 LTR MaLR 2 384 0 1 1180 2801 142 7 93 chr2 78108306 78108864 -103639223 - RLTR28 LTR ERVL -14 510 1 1 1180 1651 199 32 24 chr2 78111146 78111517 -103636570 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 1 1180 300 284 19 29 chr2 78113411 78113516 -103634571 - ORR1E LTR MaLR 0 359 256 1 1180 370 270 35 26 chr2 78113777 78113891 -103634196 - MLT1A1 LTR MaLR -288 120 6 1 1180 462 400 72 42 chr2 78117007 78117412 -103630675 - MLT1H1 LTR MaLR -94 461 45 1 147 502 320 152 47 chr2 78118822 78119163 -103628924 - MLT1J2 LTR MaLR -69 379 3 1 1181 2385 75 118 11 chr2 78121990 78122354 -103625733 - RLTR9D LTR ERVK 0 403 1 1 1181 1675 256 32 79 chr2 78122391 78122887 -103625200 - RMER19C LTR ERVK -4 607 135 1 1181 2759 147 178 0 chr2 78133237 78133754 -103614333 + RMER19C LTR ERVK 1 609 -2 1 1181 290 290 73 79 chr2 78133946 78134248 -103613839 + ORR1E LTR MaLR 49 356 -23 1 1181 5260 118 33 71 chr2 78142806 78143748 -103604339 + RMER17A2 LTR ERVK 1 906 0 1 1181 1313 214 126 7 chr2 78144514 78144859 -103603228 - ORR1D1 LTR MaLR 0 384 1 1 1181 2094 183 67 22 chr2 78144936 78145339 -103602748 - MTC LTR MaLR 0 421 1 1 1181 768 364 75 16 chr2 78145938 78146365 -103601722 + LTR40b LTR ERVL 11 462 0 1 1181 1125 188 84 34 chr2 78149672 78149970 -103598117 + ORR1C1 LTR MaLR 5 317 -61 2 1181 560 228 60 16 chr2 78155638 78155810 -103592277 - ORR1D1 LTR MaLR 0 384 124 2 1181 758 235 67 11 chr2 78156065 78156281 -103591806 - ORR1D1 LTR MaLR -132 227 1 2 1181 330 345 18 18 chr2 78156518 78156630 -103591457 - ORR1E LTR MaLR -222 137 26 2 1181 839 273 131 15 chr2 78156644 78156800 -103591287 + ORR1D1 LTR MaLR 9 191 -183 2 1181 839 273 131 15 chr2 78156870 78156972 -103591115 + ORR1D1 LTR MaLR 192 297 -77 2 1181 2893 79 99 5 chr2 78156972 78157406 -103590681 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 2 1181 252 82 98 0 chr2 78157430 78157491 -103590596 + IAPEz-int LTR ERVK 15 81 -1906 2 1181 915 102 67 67 chr2 78157501 78157679 -103590408 + IAPEz-int LTR ERVK 18 195 -6286 2 1181 239 321 0 0 chr2 78157679 78157732 -103590355 + RLTR27 LTR ERVK 223 275 -34 2 1181 3246 58 22 16 chr2 78157732 78158298 -103589789 + IAPEz-int LTR ERVK 168 662 -5819 2 1181 2072 72 0 0 chr2 78158298 78158576 -103589511 + IAPEz-int LTR ERVK 1359 1636 -4845 2 1181 5782 47 4 12 chr2 78158575 78159327 -103588760 + IAPEz-int LTR ERVK 5736 6481 0 2 1181 2914 84 84 5 chr2 78159327 78159767 -103588320 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 2 1181 304 282 0 0 chr2 78159767 78159838 -103588249 + ORR1D1 LTR MaLR 291 361 -9 2 1181 333 320 101 22 chr2 78163696 78163875 -103584212 + MLT1F2 LTR MaLR 364 556 -4 2 1181 1408 220 82 10 chr2 78169884 78170187 -103577900 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 46 2 1181 359 311 44 7 chr2 78170922 78171058 -103577029 - HERV16-int LTR ERVL -4818 178 38 2 1181 226 286 18 101 chr2 78193168 78193182 -103554905 + MT2B2 LTR ERVL 155 159 -425 2 1181 2324 91 22 0 chr2 78194504 78194824 -103553263 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 2 1181 1639 236 49 94 chr2 78195777 78196311 -103551776 + RLTR18B LTR ERVK 1 510 -2 2 1181 257 307 40 13 chr2 78199302 78199378 -103548709 + MLT1K LTR MaLR 514 591 -4 2 1181 249 390 41 28 chr2 78200947 78201092 -103546995 - MLT1G3 LTR MaLR -32 563 417 2 1181 232 368 62 21 chr2 78201221 78201318 -103546769 - MLT1G3 LTR MaLR -459 120 20 2 1181 487 296 85 96 chr2 78206376 78206739 -103541348 + ORR1E LTR MaLR 1 359 0 2 1181 782 370 39 34 chr2 78207604 78207959 -103540128 - MLT1A0 LTR MaLR -8 357 1 2 1181 1934 91 8 107 chr2 78213383 78213739 -103534348 - ORR1A4 LTR MaLR -8 321 1 2 1181 232 312 20 88 chr2 78217206 78217308 -103530779 - MT2B LTR ERVL -347 254 160 2 1181 1108 294 77 34 chr2 78221355 78221810 -103526277 - RMER15 LTR ERVL 0 575 39 2 1181 2051 170 18 70 chr2 78223263 78223662 -103524425 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 2 1181 386 348 118 37 chr2 78224828 78225150 -103522937 - ORR1E LTR MaLR -11 348 1 2 1181 333 329 61 31 chr2 78231040 78231203 -103516884 + MLT1C LTR MaLR 272 439 -28 3 1181 332 304 40 8 chr2 78234760 78234886 -103513201 + MLT1C LTR MaLR 466 595 0 3 1181 286 377 151 52 chr2 78242725 78243030 -103505057 + ORR1D2 LTR MaLR 14 348 -22 3 1181 1401 251 16 64 chr2 78244109 78244497 -103503590 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 2 3 1181 310 261 57 127 chr2 78246407 78246565 -103501522 - RLTR8 LTR ERVK 0 365 218 3 1181 10701 109 37 46 chr2 78247342 78248993 -103499094 - RMER16-int LTR ERVK -856 4550 2862 3 1181 10701 109 37 46 chr2 78249039 78249101 -103498986 - RMER16-int LTR ERVK -2545 2861 2821 3 1181 10701 109 37 46 chr2 78249247 78249431 -103498656 - RMER16-int LTR ERVK -2586 2820 2670 3 1181 1619 232 116 37 chr2 78249458 78249888 -103498199 + RMER16 LTR ERVK 70 533 0 3 147 4820 157 71 44 chr2 78249889 78250968 -103497119 - RMER16-int LTR ERVK -2732 2674 1566 3 1182 243 25 24 24 chr2 78251046 78251087 -103497000 - RLTR41 LTR ERV1 -43 403 363 3 1182 446 202 39 123 chr2 78251092 78251222 -103496865 - RLTR41 LTR ERV1 -250 196 78 3 1182 850 163 73 39 chr2 78251258 78251437 -103496650 - RMER16-int LTR ERVK -3894 1512 1328 3 1182 7213 100 71 23 chr2 78251496 78252771 -103495316 - RMER16-int LTR ERVK -3981 1425 89 3 1182 241 372 30 66 chr2 78253088 78253255 -103494832 - RLTR8 LTR ERVK 0 365 205 3 1182 2923 38 3 3 chr2 78253970 78254316 -103493771 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 3 1182 1267 211 167 15 chr2 78257820 78258161 -103489926 + MTD LTR MaLR 12 404 -15 3 1182 3746 165 117 81 chr2 78261477 78262347 -103485740 + RMER19B LTR ERVK 1 902 0 3 1182 282 253 165 0 chr2 78263272 78263351 -103484736 - ORR1E LTR MaLR 0 359 268 3 1182 867 326 60 12 chr2 78265972 78266304 -103481783 + MLT1A0 LTR MaLR 1 348 -17 3 1182 792 365 64 50 chr2 78269181 78269680 -103478407 - MLT2B3 LTR ERVL -45 509 4 3 1182 741 340 89 30 chr2 78272346 78272752 -103475335 - MLT1D LTR MaLR -75 430 1 3 1182 355 242 123 16 chr2 78277516 78277638 -103470449 + RMER5 LTR ERV1 1 135 -399 3 1182 627 291 66 19 chr2 78277696 78277955 -103470132 + RMER5 LTR ERV1 224 494 -40 3 1182 642 364 96 39 chr2 78293858 78294347 -103453740 + LTR40a LTR ERVL 3 519 0 4 1182 398 349 107 65 chr2 78307316 78307720 -103440367 - MLT1F2 LTR MaLR -145 482 8 4 1182 451 322 179 11 chr2 78308196 78308475 -103439612 - MLT2C1 LTR ERVL -48 349 24 4 1182 432 291 215 29 chr2 78308489 78308800 -103439287 - MLT1C LTR MaLR -5 462 94 4 1182 319 385 28 16 chr2 78310873 78311055 -103437032 - MLT1C LTR MaLR 0 467 284 4 1182 294 364 104 6 chr2 78311088 78311251 -103436836 - MLT1C LTR MaLR -251 216 38 4 1182 716 333 40 45 chr2 78311532 78311909 -103436178 - MLT1A1 LTR MaLR -2 406 32 4 1182 3395 156 99 11 chr2 78315923 78316559 -103431528 - RLTR17 LTR ERVK 0 692 1 4 1182 642 226 50 114 chr2 78316778 78316998 -103431089 - MTE2a LTR MaLR -9 370 165 4 1182 407 295 59 24 chr2 78317051 78317221 -103430866 - MTE2a LTR MaLR -243 176 1 4 1182 331 312 0 26 chr2 78328549 78328664 -103419423 - LTR85a LTR Gypsy? -575 127 16 4 1182 481 273 47 0 chr2 78331099 78331227 -103416860 - MLT1A0 LTR MaLR -229 136 3 4 1182 1034 147 67 6 chr2 78351235 78351399 -103396688 + MTC LTR MaLR 196 369 -52 4 1182 2861 94 7 15 chr2 78357083 78357495 -103390592 - RLTR9E LTR ERVK 0 409 1 4 1182 2275 167 7 50 chr2 78357881 78358284 -103389803 + ORR1B1 LTR MaLR 1 386 -8 4 1182 975 330 29 106 chr2 78360272 78360821 -103387266 - MLT2B1 LTR ERVL -11 509 3 4 1182 769 267 40 43 chr2 78361591 78361869 -103386218 - MLT1B LTR MaLR -92 298 22 4 1182 286 275 76 11 chr2 78362463 78362555 -103385532 + MLT1C LTR MaLR 370 467 0 4 1182 1355 264 54 27 chr2 78368664 78369072 -103379015 - MTD LTR MaLR 0 419 1 4 1182 892 242 60 147 chr2 78373871 78374052 -103374035 + MTC LTR MaLR 12 184 -237 5 1182 892 242 60 147 chr2 78374200 78374448 -103373639 + MTC LTR MaLR 185 404 -17 5 1182 236 331 8 68 chr2 78374787 78374920 -103373167 + LTR81B LTR ERV1? 187 311 -1082 5 1182 1360 213 9 27 chr2 78378763 78379091 -103368996 + RLTR15 LTR ERVK 33 354 -5 5 1183 1601 156 16 202 chr2 78391748 78392199 -103355888 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 5 1183 2296 184 68 14 chr2 78399163 78399660 -103348427 + RLTR28 LTR ERVL 1 524 0 5 1183 1787 229 40 108 chr2 78400012 78400401 -103347686 + RLTR18B LTR ERVK 1 354 -158 5 1183 2906 49 3 29 chr2 78400401 78400776 -103347311 + RLTR10B2 LTR ERVK 1 365 0 5 1183 1787 229 40 108 chr2 78400776 78400930 -103347157 + RLTR18B LTR ERVK 355 507 -5 5 1183 356 270 47 68 chr2 78401234 78401425 -103346662 + RMER15 LTR ERVL 2 188 -387 5 1183 500 282 66 24 chr2 78401485 78401652 -103346435 + RMER15 LTR ERVL 388 561 -14 5 1183 2497 153 159 16 chr2 78404150 78404648 -103343439 - RMER4B LTR ERVK 0 585 17 5 1183 343 360 73 42 chr2 78407641 78408024 -103340063 + LTR16B1 LTR ERVL 3 452 -11 5 1183 351 252 108 16 chr2 78411346 78411475 -103336612 - LTR37B LTR ERV1 -124 344 204 5 1183 456 259 175 17 chr2 78412799 78412976 -103335111 - RMER15 LTR ERVL -18 557 353 5 1183 336 263 52 10 chr2 78414757 78414853 -103333234 + MLT1A1 LTR MaLR 308 407 -1 5 1183 351 372 32 76 chr2 78424454 78424704 -103323383 + LTR16C LTR ERVL 193 431 -58 5 1183 623 329 36 60 chr2 78425460 78425793 -103322294 - ORR1E LTR MaLR -20 339 15 5 1183 3428 28 5 0 chr2 78433644 78434038 -103314049 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 1183 226 308 63 36 chr2 78435549 78435660 -103312427 + ORR1E LTR MaLR 22 135 -224 6 1183 265 329 245 17 chr2 78443500 78443741 -103304346 - MLT1K LTR MaLR -68 527 232 6 1183 387 268 65 115 chr2 78447534 78447829 -103300258 + MTEb LTR MaLR 95 375 -4 6 1183 1536 197 71 99 chr2 78449922 78450135 -103297952 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 167 6 1183 1536 197 71 99 chr2 78450171 78450352 -103297735 - ORR1C2 LTR MaLR -218 166 1 6 1183 256 359 91 8 chr2 78452731 78452863 -103295224 + LTR41 LTR ERVL 6 148 -610 6 1183 369 325 68 11 chr2 78453113 78453303 -103294784 + LTR41 LTR ERVL 557 757 -11 6 1183 1231 264 69 29 chr2 78453743 78453877 -103294210 - ORR1D2 LTR MaLR -9 361 231 6 1183 898 203 84 149 chr2 78453877 78454293 -103293794 + RLTR9C LTR ERVK 5 393 0 6 1183 1231 264 69 29 chr2 78454293 78454505 -103293582 - ORR1D2 LTR MaLR -140 230 2 6 1183 890 290 28 100 chr2 78454794 78455227 -103292860 + MTE2a LTR MaLR 2 398 -21 6 1183 245 192 6 36 chr2 78456301 78456385 -103291702 - MT2A LTR ERVL 0 601 523 6 1183 644 274 97 39 chr2 78456593 78457005 -103291082 - MT2A LTR ERVL -124 477 2 6 1183 729 105 24 0 chr2 78463611 78463735 -103284352 - MERVL_2A-int LTR ERVL 0 5761 5635 6 1183 782 118 43 106 chr2 78463763 78463924 -103284163 - ORR1C2 LTR MaLR -4 380 230 6 1183 535 242 51 72 chr2 78463922 78464060 -103284027 - ORR1C2 LTR MaLR -74 310 176 6 1183 455 300 99 12 chr2 78469904 78470066 -103278021 - MTEb LTR MaLR -3 376 201 6 1183 1467 245 93 44 chr2 78473347 78473850 -103274237 + MT2A LTR ERVL 3 530 -3 6 1183 1951 143 47 25 chr2 78476278 78476637 -103271450 + ORR1B1 LTR MaLR 28 394 0 6 1183 492 358 76 134 chr2 78478669 78478689 -103269398 - MLT2B3 LTR ERVL -19 698 677 6 1183 492 358 76 134 chr2 78478744 78478764 -103269323 - MLT2B3 LTR ERVL -41 676 659 6 1183 602 350 97 114 chr2 78478944 78479485 -103268602 - MLT2B3 LTR ERVL -59 658 126 6 1183 2033 173 194 87 chr2 78482303 78482855 -103265232 - RMER19C LTR ERVK 0 611 1 6 1183 256 256 0 151 chr2 78486524 78486630 -103261457 - ORR1E LTR MaLR 0 359 270 6 1183 300 356 111 74 chr2 78489389 78489874 -103258213 + MLT1D LTR MaLR 3 505 0 6 1183 291 299 38 70 chr2 78497687 78497845 -103250242 + RLTR25B LTR ERVK 441 593 -435 6 1183 2033 163 105 5 chr2 78500426 78500815 -103247272 + RLTR20B3 LTR ERVK 1 428 -149 2 1183 699 206 16 8 chr2 78508899 78509026 -103239061 + RLTR20B3 LTR ERVK 450 577 0 2 1183 225 268 49 0 chr2 78509050 78509132 -103238955 + LTR37B LTR ERV1 379 464 -4 5 1184 667 325 66 71 chr2 78528074 78528270 -103219817 + MTE2a LTR MaLR 17 201 -178 3 1184 667 325 66 71 chr2 78528314 78528482 -103219605 + MTE2a LTR MaLR 202 379 0 3 1184 317 211 56 0 chr2 78530635 78530706 -103217381 - MTE2b LTR MaLR 0 379 305 3 1184 652 263 157 106 chr2 78532252 78532583 -103215504 - MTE2b LTR MaLR -27 352 1 3 1184 820 309 89 100 chr2 78533214 78533574 -103214513 + MLT1A1 LTR MaLR 10 408 0 4 1184 899 353 34 24 chr2 78547421 78547836 -103200251 - MLT1C LTR MaLR -4 463 45 6 1184 354 322 102 36 chr2 78550251 78550525 -103197562 + MLT1J LTR MaLR 216 507 -5 6 1184 1986 104 101 0 chr2 78551237 78551534 -103196553 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 6 1184 229 287 30 50 chr2 78556748 78556847 -103191240 + LTR33A_ LTR ERVL 421 517 -14 7 1184 767 199 14 14 chr2 78560420 78560566 -103187521 - RMER15 LTR ERVL -1 574 429 8 1184 247 337 28 74 chr2 78560566 78560742 -103187345 - RLTR25A LTR ERVK 0 1103 936 8 1184 1891 202 28 13 chr2 78562648 78563035 -103185052 - RMER15 LTR ERVL -169 406 14 8 1184 702 319 215 3 chr2 78569676 78569979 -103178108 + ORR1E LTR MaLR 3 369 -10 9 1184 3425 77 19 13 chr2 78572953 78573425 -103174662 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 1 9 1184 699 322 46 75 chr2 78579014 78579360 -103168727 + ORR1E LTR MaLR 1 336 -23 1 1184 284 364 136 0 chr2 78587479 78587641 -103160446 + LTR33 LTR ERVL 7 190 -325 1 1184 1013 274 78 49 chr2 78598147 78598492 -103149595 - MTD LTR MaLR -59 360 6 1 1184 681 279 32 12 chr2 78599675 78599922 -103148165 + RLTR15 LTR ERVK 1 252 -107 1 1184 1661 138 63 30 chr2 78607070 78607369 -103140718 - RLTR27 LTR ERVK 0 309 1 1 1184 744 253 93 86 chr2 78627209 78627342 -103120745 - RLTR18 LTR ERVK -1 615 476 1 1184 744 292 94 77 chr2 78628147 78628384 -103119703 - RLTR18 LTR ERVK -141 475 120 1 1184 766 206 64 43 chr2 78628529 78628717 -103119370 - RLTR18 LTR ERVK -424 192 1 1 1184 1045 241 180 30 chr2 78641789 78642122 -103105965 - MTB LTR MaLR 0 400 18 1 1185 790 316 13 21 chr2 78644935 78645174 -103102913 - MTE2b LTR MaLR 0 379 143 1 1185 825 251 193 16 chr2 78647525 78647841 -103100246 + MTEa LTR MaLR 8 379 0 2 1185 3570 39 13 103 chr2 78649814 78650336 -103097751 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 2 1185 534 303 266 21 chr2 78652272 78652646 -103095441 + LTR16D LTR ERVL 56 593 -58 2 1185 923 329 90 53 chr2 78665310 78665721 -103082366 - MLT1F2 LTR MaLR -1 559 122 2 1185 2439 171 45 6 chr2 78667020 78667408 -103080679 + RLTR16 LTR ERVK 6 401 -104 2 1185 2439 171 45 6 chr2 78667431 78667512 -103080575 + RLTR16 LTR ERVK 402 492 -13 2 1185 307 254 0 40 chr2 78667510 78667584 -103080503 + RLTR16 LTR ERVK 431 501 -4 2 1185 961 176 53 25 chr2 78668754 78669154 -103078933 + RMER6B LTR ERVK 1 457 -4 2 1185 306 156 156 0 chr2 78669298 78669362 -103078725 - MTD LTR MaLR 0 419 346 2 1185 488 208 56 19 chr2 78674069 78674231 -103073856 - RMER17B LTR ERVK -498 460 293 2 1185 414 211 73 29 chr2 78675224 78675361 -103072726 + LTR37A LTR ERV1 284 426 0 2 1185 289 329 97 89 chr2 78676123 78676370 -103071717 - MLT1J LTR MaLR -28 484 236 2 1185 335 190 78 20 chr2 78677094 78677196 -103070891 + MLT1A LTR MaLR 267 374 0 2 1185 417 275 178 35 chr2 78680329 78680605 -103067482 + MLT1C LTR MaLR 5 301 -89 2 1185 714 337 52 39 chr2 78681839 78682316 -103065771 + MLT1F1 LTR MaLR 17 561 -8 2 1185 378 342 98 77 chr2 78683894 78684230 -103063857 - MLT1J LTR MaLR 0 512 170 2 1185 377 211 92 56 chr2 78684514 78684710 -103063377 - RMER17C LTR ERVK -165 245 43 2 1185 245 213 21 0 chr2 78684745 78684792 -103063295 - MLT1J LTR MaLR -368 144 97 2 1185 1318 232 70 17 chr2 78690797 78691152 -103056935 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 2 1185 676 314 79 54 chr2 78692024 78692465 -103055622 + MLT1D LTR MaLR 52 503 -2 2 1185 1317 282 37 42 chr2 78694919 78695300 -103052787 - MTEa LTR MaLR 0 379 1 2 1185 3717 102 62 4 chr2 78703773 78704325 -103043762 + MT2B2 LTR ERVL 1 584 0 2 1185 607 200 37 30 chr2 78715125 78715259 -103032828 - MTEa LTR MaLR -235 144 10 3 1185 1803 146 161 14 chr2 78721627 78721987 -103026100 + MTC LTR MaLR 1 413 -8 3 1185 538 306 42 68 chr2 78722314 78722623 -103025464 + ORR1E LTR MaLR 40 340 -19 3 1185 366 233 14 0 chr2 78724624 78724697 -103023390 - ORR1D1 LTR MaLR -300 74 1 3 1185 1589 223 39 65 chr2 78730329 78730713 -103017374 - MTE2b LTR MaLR -5 374 1 3 1185 1736 113 120 0 chr2 78749613 78749897 -102998190 + ORR1A3 LTR MaLR 1 318 -8 3 1185 478 304 90 71 chr2 78768736 78769002 -102979085 + LTR89 LTR ERVL? 591 861 -18 3 1186 2271 98 6 58 chr2 78784742 78785087 -102963000 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 4 1186 311 249 109 105 chr2 78786033 78786090 -102961997 - LTR85a LTR Gypsy? -462 240 191 4 1186 311 249 109 105 chr2 78786114 78786294 -102961793 - LTR85a LTR Gypsy? -512 190 2 4 1186 973 266 69 20 chr2 78787160 78787463 -102960624 - MLT2D LTR ERVL -56 358 41 4 1186 238 223 198 28 chr2 78796796 78796902 -102951185 + RLTR13D3 LTR ERVK 232 355 -759 4 1186 2294 212 82 13 chr2 78814734 78815269 -102932818 - RMER20B LTR ERVK -24 603 32 4 1186 1830 144 174 37 chr2 78824196 78824761 -102923326 + RLTR26 LTR ERVK 1 642 0 4 1186 1840 220 14 12 chr2 78825355 78825773 -102922314 - MTD LTR MaLR 0 419 1 4 1186 1403 140 199 3 chr2 78828374 78828661 -102919426 - ORR1B2 LTR MaLR -8 359 17 4 1186 307 281 119 38 chr2 78842672 78842845 -102905242 - MLT2B3 LTR ERVL -109 445 251 4 1186 4753 182 50 9 chr2 78854194 78855053 -102893034 - RMER19B LTR ERVK -8 894 1 4 1186 236 255 136 36 chr2 78859250 78859360 -102888727 + MamGypLTR2b LTR Gypsy 784 904 -18 4 1186 779 319 75 20 chr2 78879228 78879522 -102868565 + MLT1F LTR MaLR 58 367 -181 5 1186 1262 276 46 19 chr2 78880663 78881029 -102867058 + MLT1B LTR MaLR 12 387 -3 5 1186 1114 313 36 6 chr2 78882357 78882688 -102865399 + MTE2b LTR MaLR 3 343 -36 5 1186 308 253 103 49 chr2 78893785 78893946 -102854141 + MER34 LTR ERV1 334 535 -36 5 1186 298 256 10 91 chr2 78898911 78899010 -102849077 - LTR16A LTR ERVL -211 240 150 5 1187 240 327 61 80 chr2 78907769 78907982 -102840105 - MLT1A1 LTR MaLR -196 212 4 5 1187 610 303 149 18 chr2 78911724 78912077 -102836010 + MLT2D LTR ERVL 9 381 -16 5 1187 320 302 126 45 chr2 78920422 78920620 -102827467 + MLT1A1 LTR MaLR 1 214 -194 5 1187 382 334 78 62 chr2 78921378 78921758 -102826329 - LTR33 LTR ERVL -52 468 43 5 1187 327 310 90 65 chr2 78930282 78930527 -102817560 - MLT1A LTR MaLR -116 258 8 5 1187 2926 63 32 12 chr2 78931105 78931506 -102816581 + IAPLTR2a LTR ERVK 1 409 -2 5 1187 706 289 65 115 chr2 78932697 78932975 -102815112 + MTEb LTR MaLR 103 366 -13 5 1187 607 298 96 57 chr2 78933031 78933447 -102814640 - MLT2B4 LTR ERVL -21 546 6 5 1187 247 350 12 0 chr2 78933843 78933923 -102814164 + ORR1E LTR MaLR 8 88 -271 5 1187 328 328 92 51 chr2 78937753 78937949 -102810138 + MLT2F LTR ERVL 148 351 -312 5 1187 495 0 0 0 chr2 78956998 78957054 -102791033 - MTB LTR MaLR 0 400 345 6 1187 811 0 0 0 chr2 78957048 78957140 -102790947 - MTA_Mm LTR MaLR -304 92 1 6 1187 9258 29 5 1 chr2 78957140 78958234 -102789853 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 6 1187 495 0 0 0 chr2 78958234 78958290 -102789797 - MTA_Mm LTR MaLR 0 400 345 6 1187 811 0 0 0 chr2 78958284 78958376 -102789711 - MTA_Mm LTR MaLR -304 92 1 6 1187 467 192 86 38 chr2 78970948 78971095 -102776992 - MTC LTR MaLR -8 413 155 6 1187 1677 201 39 3 chr2 78971604 78971913 -102776174 - MTC LTR MaLR -101 320 1 6 1187 4291 121 55 6 chr2 78974982 78975675 -102772412 + RMER6A LTR ERVK 9 735 -21 6 1187 356 327 12 65 chr2 78977002 78977172 -102770915 - RMER4A LTR ERVK -298 168 8 6 1187 1142 285 70 42 chr2 79000012 79000371 -102747716 - MTEa LTR MaLR -8 371 3 1 1187 1664 189 146 6 chr2 79003469 79003825 -102744262 + MTD LTR MaLR 9 414 -5 4 1187 461 155 184 0 chr2 79015602 79015705 -102732382 - RMER15 LTR ERVL -55 520 399 2 1187 483 238 178 31 chr2 79015713 79015904 -102732183 - RMER15 LTR ERVL -329 246 28 2 1187 362 327 136 44 chr2 79021101 79021373 -102726714 - MLT1J LTR MaLR -96 416 120 3 1188 1171 234 54 52 chr2 79039591 79039960 -102708127 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 5 1188 1773 250 60 7 chr2 79039960 79040407 -102707680 + ORR1D2-int LTR MaLR 1 471 -899 5 1188 421 344 166 45 chr2 79045813 79046258 -102701829 - MLT1F LTR MaLR -49 499 1 6 1188 1567 185 25 90 chr2 79048151 79048329 -102699758 + ORR1C2 LTR MaLR 1 178 -206 6 1188 1567 185 25 90 chr2 79048386 79048563 -102699524 + ORR1C2 LTR MaLR 179 333 -51 6 1188 429 147 0 0 chr2 79050047 79050115 -102697972 + ORR1C2 LTR MaLR 308 375 -3 6 1188 1958 58 4 11 chr2 79053890 79054152 -102693935 - MTA_Mm LTR MaLR -136 260 1 7 1188 232 360 132 92 chr2 79054907 79055451 -102692636 + LTR78 LTR ERV1 22 587 -717 7 1188 1026 264 54 19 chr2 79068842 79069101 -102678986 - MTD LTR MaLR 0 419 152 9 1188 2127 98 27 48 chr2 79070625 79070958 -102677129 + ORR1A3 LTR MaLR 1 326 0 9 1188 421 279 23 15 chr2 79072355 79072486 -102675601 + MLT1C LTR MaLR 332 463 -4 9 1188 2634 45 42 0 chr2 79072956 79073288 -102674799 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 1 1188 227 356 0 22 chr2 79087967 79088056 -102660031 + BGLII_Mus LTR ERVK 36 122 -300 1 1188 345 218 21 84 chr2 79089065 79089076 -102659011 + MT2B LTR ERVL 152 156 -445 1 1188 1663 185 60 86 chr2 79093303 79093735 -102654352 + MTC LTR MaLR 1 421 0 1 1188 230 200 127 0 chr2 79123649 79123704 -102624383 - RLTR13D3 LTR ERVK -368 746 685 1 1188 3169 70 0 0 chr2 79136340 79136740 -102611347 - MTB LTR MaLR 0 400 1 1 1188 1508 208 131 16 chr2 79144314 79144680 -102603407 + MTD LTR MaLR 10 417 -2 1 1188 243 347 106 48 chr2 79148581 79148808 -102599279 - MLT1L LTR MaLR -351 259 20 1 1188 3223 56 5 0 chr2 79166086 79166480 -102581607 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 1189 3170 74 0 7 chr2 79169271 79169695 -102578392 - BGLII LTR ERVK 0 421 1 2 1189 2841 202 48 39 chr2 79169700 79170605 -102577482 - RMER3D-int LTR ERVK -5 2837 1925 2 1189 2615 156 92 72 chr2 79170606 79171292 -102576795 - RMER3D-int LTR ERVK -1148 1694 470 2 1189 714 194 31 40 chr2 79171357 79171751 -102576336 - RMER3D-int LTR ERVK -1991 851 358 2 1189 495 143 44 0 chr2 79171763 79171854 -102576233 - RMER3D-int LTR ERVK -2259 583 489 2 1189 2902 83 29 2 chr2 79172247 79172657 -102575430 - BGLII LTR ERVK 0 421 1 2 1189 262 296 18 18 chr2 79174382 79174492 -102573595 - MLT1B LTR MaLR -280 110 1 2 1189 454 251 9 62 chr2 79174952 79175096 -102572991 + MLT1B LTR MaLR 15 147 -227 2 1189 1512 195 187 11 chr2 79193353 79193701 -102554386 + MTD LTR MaLR 1 409 -10 2 1189 1036 226 207 34 chr2 79194687 79195044 -102553043 + MTD LTR MaLR 1 419 0 2 1189 1417 251 22 54 chr2 79196819 79197189 -102550898 + MTEb LTR MaLR 12 369 -10 2 1189 1229 7 0 0 chr2 79205281 79205430 -102542657 + ORR1A0 LTR MaLR 1 149 -197 2 1189 1430 193 182 12 chr2 79208273 79208614 -102539473 - MTB_Mm LTR MaLR -8 399 1 2 1189 460 260 23 47 chr2 79217424 79217553 -102530534 - MTE2a LTR MaLR 0 379 254 2 1189 1637 225 34 196 chr2 79221521 79222250 -102525837 - RMER19C LTR ERVK 0 611 1 2 1189 365 220 68 27 chr2 79222517 79222670 -102525417 + MTEb LTR MaLR 210 372 -7 2 1189 615 318 89 57 chr2 79243844 79244160 -102503927 - ORR1E LTR MaLR -33 346 3 3 1189 1509 180 146 15 chr2 79249170 79249513 -102498574 - MTD LTR MaLR -19 400 13 3 1189 337 292 159 12 chr2 79252500 79252670 -102495417 + MLT1B LTR MaLR 188 382 -8 3 1189 317 253 26 13 chr2 79262421 79262577 -102485510 + RMER17B LTR ERVK 301 458 -500 3 1189 657 322 136 19 chr2 79271200 79271510 -102476577 - MLT1D LTR MaLR -119 386 41 3 1189 1570 221 63 45 chr2 79273223 79273251 -102474836 - MTD LTR MaLR -14 405 379 3 1189 806 290 83 3 chr2 79273251 79273590 -102474497 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 5 3 1189 1570 221 63 45 chr2 79273590 79273940 -102474147 - MTD LTR MaLR -41 378 20 3 1189 1069 259 118 17 chr2 79284015 79284382 -102463705 - MTD LTR MaLR -6 413 13 3 1189 572 270 61 102 chr2 79284464 79284728 -102463359 - MLT1H2 LTR MaLR -11 478 226 3 1189 347 351 40 7 chr2 79286771 79286920 -102461167 - MLT1C LTR MaLR -4 463 310 3 1189 3038 165 50 4 chr2 79287221 79287725 -102460362 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 527 0 3 1190 1524 225 36 70 chr2 79303692 79304079 -102444008 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 3 1190 1258 276 21 50 chr2 79314723 79314953 -102433134 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 147 3 1190 1858 145 146 16 chr2 79314953 79315275 -102432812 + ORR1B2 LTR MaLR 2 365 -2 3 1190 1258 276 21 50 chr2 79315275 79315425 -102432662 - ORR1D2 LTR MaLR -224 146 2 3 1190 326 356 26 19 chr2 79317045 79317245 -102430842 + MLT1J LTR MaLR 10 174 -274 3 1190 333 355 60 21 chr2 79317745 79317978 -102430109 + ERVL-int LTR ERVL 2658 2899 -2858 3 1190 3130 75 39 0 chr2 79318282 79318667 -102429420 + MTB LTR MaLR 1 400 0 3 1190 7518 92 16 70 chr2 79318667 79319827 -102428260 + MTB-int LTR MaLR 1 1098 0 3 1190 3141 90 2 5 chr2 79319827 79320228 -102427859 + MTB LTR MaLR 1 400 0 3 1190 1185 254 76 39 chr2 79323506 79323863 -102424224 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 4 1190 3699 20 2 0 chr2 79328001 79328396 -102419691 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 1190 9803 33 2 1 chr2 79328396 79329493 -102418594 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 4 1190 3679 23 2 0 chr2 79329493 79329888 -102418199 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 1190 673 279 68 27 chr2 79334493 79334714 -102413373 - LTR40a LTR ERVL -15 504 275 4 1190 1583 107 88 48 chr2 79338110 79338404 -102409683 + MTC LTR MaLR 1 306 -115 4 1190 395 192 23 15 chr2 79338461 79338558 -102409529 + MTC LTR MaLR 296 413 -8 4 1190 347 226 35 70 chr2 79346402 79346516 -102401571 + MamGypLTR1d LTR Gypsy 37 146 -667 4 1190 1864 145 15 41 chr2 79347158 79347496 -102400591 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 4 1190 230 322 56 0 chr2 79347642 79347732 -102400355 - MLT2B3 LTR ERVL -455 99 5 4 1190 2708 25 0 18 chr2 79375809 79376137 -102371950 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 4 1190 605 269 102 46 chr2 79387100 79387343 -102360744 + MLT1D LTR MaLR 220 505 0 4 1190 690 326 150 10 chr2 79400308 79400702 -102347385 - MLT1C LTR MaLR -14 453 5 4 1190 244 246 31 0 chr2 79416972 79417037 -102331050 + RLTR13D5 LTR ERVK 178 244 -779 5 1190 623 294 0 0 chr2 79418027 79418170 -102329917 - MTE2b LTR MaLR -48 331 189 5 1190 258 143 61 0 chr2 79420270 79420319 -102327768 - RLTR28 LTR ERVL -24 500 449 5 1190 507 310 89 41 chr2 79422219 79422488 -102325599 - MLT1G-int LTR MaLR -908 501 220 5 1190 242 370 7 43 chr2 79422642 79422783 -102325304 - MLT1G LTR MaLR -12 537 402 5 1190 435 356 91 9 chr2 79422868 79423078 -102325009 - MLT1G LTR MaLR -279 312 86 5 1191 1579 167 11 0 chr2 79435331 79435600 -102312487 + MTC LTR MaLR 150 421 0 5 1191 1446 269 46 9 chr2 79461590 79461935 -102286152 - ORR1D2 LTR MaLR -12 358 1 5 1191 296 397 76 48 chr2 79519411 79519702 -102228385 + MLT1G1 LTR MaLR 206 504 -75 3 1191 266 261 89 40 chr2 79519804 79519928 -102228159 + MLT1F-int LTR MaLR 96 225 -1264 3 1191 303 311 152 26 chr2 79521293 79521524 -102226563 + MLT1F-int LTR MaLR 555 814 -675 3 1191 1553 221 56 42 chr2 79533443 79533796 -102214291 + ORR1C2 LTR MaLR 27 384 0 5 1191 267 284 122 36 chr2 79540985 79541125 -102206962 + ORR1D2 LTR MaLR 220 370 -4 6 1191 2792 344 76 41 chr2 79541127 79542600 -102205487 + ORR1D2-int LTR MaLR 2 1527 -53 6 1191 264 379 42 77 chr2 79542600 79542937 -102205150 + ORR1D1 LTR MaLR 1 325 -49 6 1191 2790 156 26 26 chr2 79544834 79545362 -102202725 + RLTR11A LTR ERVK 1 528 0 6 1191 313 345 25 16 chr2 79554343 79554464 -102193623 + ORR1E LTR MaLR 1 122 -237 7 1192 414 313 158 134 chr2 79564288 79564423 -102183664 - MTE2b LTR MaLR -35 344 176 9 1192 414 313 158 134 chr2 79564634 79564834 -102183253 - MTE2b LTR MaLR -204 175 1 9 1192 3543 166 163 13 chr2 79577069 79577927 -102170160 - RLTR25A LTR ERVK -2 1101 7 1 1192 1688 196 139 52 chr2 79578123 79578618 -102169469 + RMER19C LTR ERVK 138 664 -238 1 1192 444 303 58 58 chr2 79578732 79578956 -102169131 + RLTR18 LTR ERVK 1 224 -392 1 1192 1744 188 10 98 chr2 79581158 79581501 -102166586 + ORR1D1 LTR MaLR 1 317 -57 1 1192 1744 188 10 98 chr2 79582013 79582077 -102166010 + ORR1D1 LTR MaLR 318 372 -2 1 1192 446 311 145 9 chr2 79585054 79585268 -102162819 - LTR16E1 LTR ERVL -31 507 265 1 1192 963 294 98 52 chr2 79585498 79585957 -102162130 - RMER5 LTR ERV1 0 534 55 1 1192 1244 129 0 89 chr2 79597201 79597447 -102150640 - ORR1A4 LTR MaLR -105 224 1 1 1192 3035 41 8 37 chr2 79606855 79607257 -102140830 + RLTR10 LTR ERVK 1 390 0 1 1192 481 300 100 105 chr2 79613109 79613294 -102134793 - ORR1E LTR MaLR 0 359 179 1 1192 481 300 100 105 chr2 79613397 79613572 -102134515 - ORR1E LTR MaLR -181 178 1 1 1192 1502 164 92 0 chr2 79616152 79616445 -102131642 - IAPEY3_LTR LTR ERVK -12 320 1 1 1192 304 392 66 86 chr2 79620044 79620348 -102127739 + LTR88b LTR Gypsy? 125 422 -415 1 1192 518 286 37 13 chr2 79626417 79626604 -102121483 - MTEb LTR MaLR -7 372 182 1 1192 422 337 11 42 chr2 79627160 79627349 -102120738 - MTEb LTR MaLR -196 183 1 1 1192 1064 251 234 20 chr2 79628811 79629205 -102118882 + RLTR11A2 LTR ERVK 18 495 -32 2 1192 5190 129 40 17 chr2 79635224 79636106 -102111981 - RMER17A2 LTR ERVK -4 902 1 2 1192 2516 192 36 28 chr2 79640537 79641040 -102107047 + RLTR18B LTR ERVK 1 507 -5 2 1192 3312 155 71 17 chr2 79662282 79662873 -102085214 - RLTR25A LTR ERVK -480 623 1 2 1192 1943 244 58 31 chr2 79664156 79664675 -102083412 - RLTR17 LTR ERVK -82 610 78 2 1192 3600 135 102 19 chr2 79664694 79665320 -102082767 - RLTR33 LTR ERVK 0 678 1 2 1192 3214 53 2 8 chr2 79671216 79671614 -102076473 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 1192 225 389 89 6 chr2 79688354 79688522 -102059565 + ORR1E LTR MaLR 56 237 -122 2 1192 278 316 47 87 chr2 79688750 79688899 -102059188 + MTE-int LTR MaLR 1 143 -1437 2 1192 279 341 133 35 chr2 79689953 79690096 -102057991 + RMER20A LTR ERVK 9 165 -351 2 1192 713 385 59 16 chr2 79690560 79690935 -102057152 + MTE-int LTR MaLR 734 1124 -456 2 1193 1227 254 70 80 chr2 79694060 79694487 -102053600 + RLTR23 LTR ERV1 8 430 0 2 1193 711 95 42 125 chr2 79695453 79695597 -102052490 + ORR1A3 LTR MaLR 187 318 -8 2 1193 1745 131 60 81 chr2 79696074 79696407 -102051680 + ORR1A3 LTR MaLR 1 326 0 3 1193 8522 160 88 58 chr2 79696411 79698313 -102049774 + ORR1A3-int LTR MaLR 5 1963 0 3 1193 1361 138 204 76 chr2 79698313 79698602 -102049485 + ORR1A3 LTR MaLR 1 326 0 3 1193 868 213 188 2 chr2 79702983 79703278 -102044809 + ORR1D1 LTR MaLR 15 362 -12 3 1193 2059 111 3 71 chr2 79703508 79703859 -102044228 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 3 3 1193 530 226 345 16 chr2 79711702 79711960 -102036127 + MTD LTR MaLR 23 365 -54 3 1193 263 370 120 16 chr2 79714176 79714426 -102033661 + MER21B LTR ERV1 428 703 -160 3 1193 247 306 84 24 chr2 79714568 79714667 -102033420 + MLT1J LTR MaLR 60 189 -323 3 1193 412 328 128 55 chr2 79719153 79719482 -102028605 - MLT1A0 LTR MaLR -12 353 1 3 1193 1193 292 92 20 chr2 79719936 79720394 -102027693 - RMER5 LTR ERV1 -11 523 33 3 1193 1681 189 108 8 chr2 79722758 79723136 -102024951 + MTD LTR MaLR 1 416 -3 3 1193 999 257 58 58 chr2 79727001 79727364 -102020723 + MLT1B LTR MaLR 28 390 0 3 1193 361 314 84 42 chr2 79729160 79729373 -102018714 - RMER12 LTR ERVK -334 988 767 3 1193 587 297 99 79 chr2 79749027 79749279 -101998808 + MLT2D LTR ERVL 29 301 -113 3 1193 3906 199 53 60 chr2 79757386 79758260 -101989827 + RMER19B LTR ERVK 19 886 -16 3 1193 406 361 112 29 chr2 79760453 79760793 -101987294 + MLT1K LTR MaLR 191 558 -37 3 1193 3441 25 2 0 chr2 79768755 79769149 -101978938 + MTA_Mm LTR MaLR 2 396 0 4 1193 230 348 47 94 chr2 79770298 79770425 -101977662 + MTEa LTR MaLR 33 153 -226 4 1193 477 212 99 51 chr2 79770438 79770607 -101977480 + MTEa LTR MaLR 192 379 0 4 1193 1374 208 91 10 chr2 79772086 79772383 -101975704 + ORR1D1 LTR MaLR 3 323 -51 4 1193 260 329 71 110 chr2 79776228 79776382 -101971705 + MTE2a LTR MaLR 21 168 -211 4 1193 460 312 59 59 chr2 79776441 79776727 -101971360 - MLT1A0 LTR MaLR -56 309 24 4 1193 234 258 56 102 chr2 79787608 79787716 -101960371 + MT2B LTR ERVL 138 240 -361 4 1193 4081 171 63 15 chr2 79803929 79804707 -101943380 + RLTR25B LTR ERVK 3 808 -220 4 1193 4081 208 84 5 chr2 79804751 79804883 -101943204 + RLTR25B LTR ERVK 809 865 -163 4 1193 441 268 80 19 chr2 79815640 79815853 -101932234 - RLTR15 LTR ERVK -89 270 45 4 1194 1454 133 177 78 chr2 79824847 79825181 -101922906 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 4 1194 833 192 312 14 chr2 79828151 79828436 -101919651 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 4 1194 230 306 16 0 chr2 79848593 79848655 -101899432 - ORR1E LTR MaLR -41 318 256 4 1194 472 313 43 104 chr2 79852031 79852359 -101895728 + ORR1E LTR MaLR 1 308 -51 5 1194 758 294 88 52 chr2 79867052 79867415 -101880672 + MTE2b LTR MaLR 4 379 0 5 1194 2475 173 85 9 chr2 79867794 79868231 -101879856 - RLTR17 LTR ERVK -8 684 215 5 1194 274 339 73 61 chr2 79884152 79884413 -101863674 - LTR81C LTR ERV1? -137 1016 753 5 1194 461 241 18 9 chr2 79885191 79885304 -101862783 - LTR81A LTR ERV1? -1204 146 33 5 1194 427 261 79 14 chr2 79885984 79886124 -101861963 - MLT1A1 LTR MaLR -2 406 258 5 1194 253 253 102 57 chr2 79886166 79886254 -101861833 - MLT1A1 LTR MaLR -237 171 80 5 1194 985 259 43 149 chr2 79903159 79903257 -101844830 + MTC LTR MaLR 12 108 -313 5 1194 985 259 43 149 chr2 79903310 79903655 -101844432 + MTC LTR MaLR 109 408 -13 5 1194 1597 237 131 36 chr2 79905041 79905536 -101842551 - RMER19C LTR ERVK 0 611 70 5 1194 313 298 47 58 chr2 79905557 79905728 -101842359 + RLTR42-int LTR ERVK 1227 1395 -4127 5 1194 561 163 0 30 chr2 79912819 79912920 -101835167 + MTC LTR MaLR 1 98 -323 5 1194 1728 186 60 38 chr2 79913023 79913370 -101834717 + MTC LTR MaLR 59 413 -8 5 1194 354 262 146 47 chr2 79915539 79915751 -101832336 - RMER20B LTR ERVK -271 356 124 5 1194 778 218 170 16 chr2 79919933 79920180 -101827907 - MER31A LTR ERV1 -200 285 1 6 1194 402 208 115 0 chr2 79921510 79921606 -101826481 + MTD LTR MaLR 291 397 -22 6 1194 404 309 35 35 chr2 79921613 79921757 -101826330 - MER31A LTR ERV1 -133 352 209 6 1194 227 295 96 116 chr2 79923552 79923905 -101824182 + ORR1E LTR MaLR 12 357 -2 6 1194 655 243 40 0 chr2 79933558 79933724 -101814363 - MTE2a LTR MaLR -15 364 168 6 1194 2998 76 13 0 chr2 79939796 79940191 -101807896 - MTB LTR MaLR 0 400 1 6 1194 3126 73 0 2 chr2 79941517 79941914 -101806173 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 1194 912 262 84 125 chr2 79942292 79942685 -101805402 + MTE2a LTR MaLR 3 379 0 6 1194 280 307 56 11 chr2 79951645 79951734 -101796353 - MLT1H2 LTR MaLR -360 129 37 6 1195 260 383 67 0 chr2 79955182 79955331 -101792756 + LTR79 LTR ERVL 369 527 0 6 1195 582 331 73 89 chr2 79962488 79962992 -101785095 - MLT1D LTR MaLR -5 500 5 6 1195 427 200 217 13 chr2 79981549 79981706 -101766381 + MTD LTR MaLR 227 415 -4 6 1195 1705 117 124 0 chr2 79982119 79982410 -101765677 + IAPEY3_LTR LTR ERVK 1 327 -5 6 1195 566 307 206 12 chr2 79995581 79995928 -101752159 + MT2A LTR ERVL 1 414 -119 7 1195 2894 149 122 31 chr2 80000030 80000953 -101747134 - RLTR13D1 LTR ERVK 0 1023 1 1 1195 660 309 87 47 chr2 80002275 80002597 -101745490 - ORR1E LTR MaLR 0 359 25 5 1195 1975 168 84 13 chr2 80008825 80009218 -101738869 + MTC LTR MaLR 1 421 0 1 1195 709 308 122 18 chr2 80012746 80013130 -101734957 + MLT1C LTR MaLR 39 462 -5 3 1195 268 254 189 39 chr2 80013364 80013453 -101734634 - MLT1B LTR MaLR -34 356 258 3 1195 268 254 189 39 chr2 80013514 80013551 -101734536 - MLT1B LTR MaLR -133 257 211 3 1195 1526 172 128 19 chr2 80022269 80022589 -101725498 - ORR1C2 LTR MaLR -13 371 17 4 1195 310 307 76 38 chr2 80027153 80027258 -101720829 + MLT1G1 LTR MaLR 354 462 -117 5 1195 518 241 215 18 chr2 80031268 80031496 -101716591 - RMER20B LTR ERVK -215 412 140 6 1195 228 312 31 142 chr2 80032935 80033062 -101715025 + LTR88b LTR Gypsy? 707 819 -18 6 1195 787 292 48 45 chr2 80036157 80036515 -101711572 + RLTR10D LTR ERVK 1 359 0 6 1195 552 343 48 80 chr2 80036606 80037011 -101711076 - MLT1G LTR MaLR -187 408 3 7 1195 1926 162 44 9 chr2 80048355 80048697 -101699390 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 41 8 1195 1068 248 47 100 chr2 80052194 80052575 -101695512 + ORR1D1 LTR MaLR 1 361 -13 9 1195 686 302 78 40 chr2 80052664 80053120 -101694967 + RLTR12B LTR ERVK 1 345 -14 9 1195 860 243 31 131 chr2 80055804 80056225 -101691862 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 1 1195 2976 22 0 0 chr2 80056526 80056848 -101691239 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 322 0 1 1195 401 365 128 8 chr2 80065956 80066199 -101681888 + MLT1E1A LTR MaLR 282 553 -127 1 1195 2233 122 41 43 chr2 80066233 80066601 -101681486 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 1 1195 26846 16 1 0 chr2 80066601 80069554 -101678533 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 3525 1 1195 955 80 24 0 chr2 80069554 80069679 -101678408 - IAPEz-int LTR ERVK -2770 4910 4783 1 1195 1881 111 4 4 chr2 80069674 80069936 -101678151 - IAPEz-int LTR ERVK -5183 2497 2236 1 1195 446 66 0 32 chr2 80069925 80069988 -101678099 - IAPEz-int LTR ERVK -5062 1419 1359 1 1195 4570 35 89 21 chr2 80069988 80070593 -101677494 - IAPEz-int LTR ERVK -5819 662 17 1 1195 2259 119 41 43 chr2 80070616 80070984 -101677103 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 1 1195 323 277 80 9 chr2 80071011 80071124 -101676963 + MLT1E1A LTR MaLR 525 645 -9 1 1195 646 302 112 80 chr2 80072740 80073240 -101674847 - MLT2B1 LTR ERVL -4 516 1 1 1195 226 314 0 55 chr2 80074981 80075072 -101673015 - RMER6B LTR ERVK -9 452 367 1 1196 3189 77 9 17 chr2 80086939 80087361 -101660726 - BGLII LTR ERVK 0 421 3 1 1196 340 326 13 16 chr2 80088348 80088515 -101659572 + MER57D LTR ERV1 266 434 0 1 1196 339 291 103 39 chr2 80088533 80088737 -101659350 + MER57A-int LTR ERV1 17 233 -5954 1 1196 989 240 72 127 chr2 80090173 80090574 -101657513 - MTE2a LTR MaLR 0 379 1 1 1196 1322 261 36 69 chr2 80090696 80091115 -101656972 + MTD LTR MaLR 1 405 -14 1 1196 275 285 105 40 chr2 80098331 80098544 -101649543 + MER57A-int LTR ERV1 2913 3127 -2229 1 1196 382 297 75 52 chr2 80099106 80099566 -101648521 + MER57A-int LTR ERV1 3483 3908 -2279 1 1196 1865 158 27 88 chr2 80099709 80100083 -101648004 - ORR1B1 LTR MaLR -3 391 41 1 1196 10421 133 41 142 chr2 80100090 80102274 -101645813 - ORR1B1-int LTR MaLR 0 1963 1 1 1196 1557 145 75 97 chr2 80102274 80102634 -101645453 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 43 1 1196 806 284 82 47 chr2 80102948 80103313 -101644774 + MER57A-int LTR ERV1 5431 5808 -379 1 1196 2045 182 54 15 chr2 80103336 80103785 -101644302 - RLTR31_Mm LTR ERVK -138 423 1 1 1196 320 285 161 56 chr2 80103852 80104138 -101643949 + MER57D LTR ERV1 119 434 0 1 1196 921 128 86 32 chr2 80110839 80110877 -101637210 - RMER16 LTR ERVK 0 533 496 1 1196 921 128 86 32 chr2 80110901 80111048 -101637039 - RMER16 LTR ERVK -38 495 340 1 1196 425 268 71 20 chr2 80111391 80111586 -101636501 - MLT1C LTR MaLR -185 205 6 1 1196 700 321 32 91 chr2 80111683 80112056 -101636031 + ORR1E LTR MaLR 9 359 0 1 1196 480 341 28 28 chr2 80112058 80112275 -101635812 + ORR1E-int LTR MaLR 1 217 -1363 1 1196 1367 335 100 72 chr2 80112292 80113355 -101634732 + ORR1E-int LTR MaLR 285 1376 -204 1 1196 1294 254 118 18 chr2 80113361 80113750 -101634337 - MER68 LTR ERVL -90 473 46 1 1196 3381 63 2 2 chr2 80114968 80115368 -101632719 + MTB LTR MaLR 1 400 0 1 1196 555 351 53 64 chr2 80115416 80115775 -101632312 + ORR1E LTR MaLR 4 358 -1 1 1196 521 344 179 3 chr2 80118641 80119005 -101629082 + MLT1E1A LTR MaLR 208 635 -45 1 1196 381 302 184 97 chr2 80125207 80125589 -101622498 + MTE-int LTR MaLR 787 1533 -47 1 1196 2333 130 64 15 chr2 80128537 80128929 -101619158 + IAPLTR2a LTR ERVK 1 411 0 1 1196 2392 84 122 11 chr2 80128933 80129284 -101618803 - RLTR10 LTR ERVK 0 390 1 1 1196 1137 271 123 71 chr2 80130577 80131351 -101616736 + RMER13A LTR ERVK 1 865 -43 1 1196 654 250 108 15 chr2 80138778 80138981 -101609106 - ORR1D-int LTR MaLR -1 1369 1148 2 1196 3060 73 143 11 chr2 80144621 80145091 -101602996 - RLTR47_MM LTR ERV1 0 532 1 2 1196 707 153 57 12 chr2 80146553 80146706 -101601381 + ORR1B1 LTR MaLR 1 152 -226 2 1196 963 301 127 26 chr2 80148528 80148914 -101599173 + MLT2B3 LTR ERVL 1 425 -129 2 1196 238 174 0 0 chr2 80150741 80150787 -101597300 + MT2A LTR ERVL 488 533 0 2 1196 1096 317 59 27 chr2 80151089 80151527 -101596560 + MER68 LTR ERVL 4 455 -108 2 1196 1026 237 94 113 chr2 80169383 80169896 -101578191 - RLTR12B LTR ERVK -9 519 17 2 1196 967 254 95 24 chr2 80175729 80176023 -101572064 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 56 2 1196 1402 207 70 26 chr2 80176475 80176818 -101571269 - ORR1C1 LTR MaLR -15 363 6 2 1196 288 323 180 35 chr2 80178381 80178670 -101569417 - MLT1F LTR MaLR -132 416 86 2 1196 2256 125 42 16 chr2 80181575 80181957 -101566130 - ORR1B1 LTR MaLR -2 392 1 2 1196 718 238 84 25 chr2 80192524 80192761 -101555326 - MTE2b LTR MaLR 0 379 129 2 1196 2473 74 12 0 chr2 80198173 80198496 -101549591 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 2 1196 510 318 40 29 chr2 80200254 80200429 -101547658 + MLT1A0 LTR MaLR 188 364 -1 2 1196 1644 218 87 16 chr2 80204332 80204710 -101543377 - MTC LTR MaLR -12 409 5 3 1196 2576 41 6 0 chr2 80205161 80205480 -101542607 - MTB LTR MaLR 0 400 80 3 1197 4082 36 36 6 chr2 80217445 80217942 -101530145 - RLTR1B LTR ERV1 0 512 1 3 1197 1318 200 7 227 chr2 80218993 80219557 -101528530 + RMER10A LTR ERVL 2 441 -1 3 1197 310 328 73 28 chr2 80224816 80224995 -101523092 + RMER15 LTR ERVL 300 486 -89 3 1197 2782 153 39 46 chr2 80225970 80226512 -101521575 - RLTR20B2 LTR ERVK -22 538 1 3 1197 7722 46 10 5 chr2 80231935 80232823 -101515264 + RLTR13B1 LTR ERVK 1 893 0 3 1197 1519 230 35 13 chr2 80233975 80234288 -101513799 + ORR1D2 LTR MaLR 50 369 -1 3 1197 916 157 199 10 chr2 80235242 80235448 -101512639 - MTD LTR MaLR -5 414 170 3 1197 947 34 0 0 chr2 80235440 80235557 -101512530 - RLTR1C LTR ERV1 -386 117 1 3 1197 419 314 14 14 chr2 80242274 80242416 -101505671 - RMER15 LTR ERVL -14 561 420 3 1197 759 275 32 48 chr2 80242682 80242934 -101505153 + MTEa LTR MaLR 132 379 0 3 1197 925 327 77 71 chr2 80243185 80243695 -101504392 - RMER15-int LTR ERVL -6 4993 4481 3 1197 582 367 20 33 chr2 80243704 80244003 -101504084 - RMER15-int LTR ERVL -2883 2116 1822 3 1197 582 224 64 26 chr2 80244073 80244229 -101503858 - RMER15-int LTR ERVL -3629 1370 1209 3 1197 1428 220 117 48 chr2 80247007 80247399 -101500688 - MTC LTR MaLR 0 421 3 3 1197 389 294 92 42 chr2 80248649 80248791 -101499296 + ORR1E LTR MaLR 2 150 -209 3 1197 368 234 65 105 chr2 80255526 80255679 -101492408 + MT2B LTR ERVL 111 257 -344 3 1197 3213 61 21 24 chr2 80261226 80261648 -101486439 + BGLII LTR ERVK 1 421 0 3 1197 1774 174 10 3 chr2 80265937 80266237 -101481850 + ORR1B1 LTR MaLR 3 304 -90 4 1197 2277 135 106 6 chr2 80269638 80269996 -101478091 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 4 1197 1138 79 12 0 chr2 80283100 80283264 -101464823 + RLTR13B3 LTR ERVK 764 929 0 4 1197 1171 253 48 16 chr2 80292077 80292386 -101455701 + RMER15 LTR ERVL 257 575 0 4 1197 607 239 48 84 chr2 80292448 80292699 -101455388 + RLTR11B LTR ERVK 1 242 -211 4 1197 351 266 102 55 chr2 80292823 80293058 -101455029 + RLTR11B LTR ERVK 200 445 -8 4 1197 1879 154 127 39 chr2 80299432 80299817 -101448270 + MTD LTR MaLR 1 419 0 4 1197 901 289 96 6 chr2 80302257 80302623 -101445464 + RMER5 LTR ERV1 37 435 -99 4 1197 932 214 16 61 chr2 80305605 80305888 -101442199 - RLTR12B LTR ERVK -227 300 47 4 1197 339 214 46 35 chr2 80306501 80306588 -101441499 + LTR85a LTR Gypsy? 22 109 -593 4 1197 523 315 24 34 chr2 80309000 80309207 -101438880 - MER21B LTR ERV1 -57 806 602 5 1197 233 281 43 26 chr2 80309286 80309403 -101438684 + RLTR15 LTR ERVK 45 163 -196 5 1197 1533 176 60 6 chr2 80314560 80314874 -101433213 - RMER20A LTR ERVK -185 331 1 5 1197 729 260 29 24 chr2 80314900 80315107 -101432980 + MTEa LTR MaLR 1 208 -171 5 1197 1065 221 96 63 chr2 80315107 80315536 -101432551 + MT2A LTR ERVL 1 575 -26 5 1197 327 238 60 0 chr2 80315828 80315912 -101432175 + MTEa LTR MaLR 291 379 0 5 1197 1538 157 244 40 chr2 80317549 80317999 -101430088 - RMER15 LTR ERVL 0 575 34 5 1197 437 252 9 0 chr2 80318234 80318349 -101429738 + ORR1E LTR MaLR 5 120 -239 5 1197 231 293 0 8 chr2 80319264 80319293 -101428794 + ORR1B1-int LTR MaLR 620 647 -862 5 1197 427 267 47 56 chr2 80319425 80319532 -101428555 + ETnERV2-int LTR ERVK 7097 7202 -204 5 1197 1014 216 167 12 chr2 80323720 80323993 -101424094 - RMER4B LTR ERVK 0 585 221 5 1197 1014 223 249 8 chr2 80324017 80324193 -101423894 - RMER4B LTR ERVK -365 220 18 5 1197 1138 176 280 0 chr2 80324438 80324727 -101423360 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 5 1197 1128 243 140 40 chr2 80325050 80325551 -101422536 + RLTR20A1 LTR ERVK 1 551 0 5 1197 1967 201 22 10 chr2 80326089 80326491 -101421596 + MTC LTR MaLR 7 413 -8 5 1197 261 343 56 65 chr2 80334929 80335144 -101412943 - ORR1E LTR MaLR -43 316 104 5 1197 4090 60 2 2 chr2 80335144 80335647 -101412440 + RLTR1C LTR ERV1 1 503 0 5 1197 326 202 47 23 chr2 80335731 80335817 -101412270 + MTEa LTR MaLR 1 88 -291 5 1197 248 125 0 0 chr2 80335830 80335870 -101412217 - MT2A LTR ERVL -7 526 487 5 1197 1520 206 41 62 chr2 80336094 80336519 -101411568 - MT2A LTR ERVL -40 561 1 5 1197 347 269 284 5 chr2 80338054 80338254 -101409833 - MLT1A0 LTR MaLR -101 264 9 5 1197 244 330 60 27 chr2 80344824 80345008 -101403079 + RMER12 LTR ERVK 662 851 -471 5 1198 1913 150 155 3 chr2 80358691 80359053 -101389034 + MTC LTR MaLR 3 419 -2 6 1198 283 200 126 53 chr2 80364236 80364331 -101383756 + MTEa LTR MaLR 1 102 -277 6 1198 428 208 177 0 chr2 80364382 80364512 -101383575 + MTEa LTR MaLR 210 362 -17 6 1198 279 265 11 88 chr2 80366318 80366331 -101381756 - MT2B LTR ERVL -367 234 151 6 1198 283 402 74 12 chr2 80371299 80371543 -101376544 + LTR40c LTR ERVL 3 261 -204 6 1198 1531 170 84 29 chr2 80378439 80378748 -101369339 + RMER4B LTR ERVK 1 326 -259 6 1198 1145 140 203 0 chr2 80379048 80379270 -101368817 + RMER4B LTR ERVK 319 585 0 6 1198 1730 178 56 18 chr2 80383064 80383401 -101364686 + ORR1B1 LTR MaLR 41 390 -4 6 1198 1376 181 218 3 chr2 80386260 80386604 -101361483 + MTD LTR MaLR 2 419 0 6 1198 226 250 0 175 chr2 80392681 80392705 -101355382 - MT2B LTR ERVL -389 212 133 6 1198 1891 174 210 65 chr2 80399694 80400228 -101347859 + RMER19C LTR ERVK 1 611 0 6 1198 228 287 75 0 chr2 80416456 80416480 -101331607 + RMER12 LTR ERVK 741 767 -555 7 1198 228 287 75 0 chr2 80416604 80416673 -101331414 + RMER12 LTR ERVK 768 840 -482 7 1198 1671 196 62 14 chr2 80423395 80423752 -101324335 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 7 1198 1400 153 18 26 chr2 80423868 80423886 -101324201 - MTC LTR MaLR 0 421 409 7 1198 2166 147 45 21 chr2 80423886 80424261 -101323826 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 7 1198 1400 153 18 26 chr2 80424261 80424470 -101323617 - MTC LTR MaLR -13 408 196 7 1198 895 188 99 45 chr2 80424611 80424739 -101323348 + ORR1C2 LTR MaLR 227 365 -19 7 1198 235 245 154 36 chr2 80424810 80424920 -101323167 - RLTR12A LTR ERVK -437 131 9 7 1198 2305 149 66 64 chr2 80431735 80432295 -101315792 - RLTR31_Mm LTR ERVK 0 561 1 7 1198 602 234 126 42 chr2 80441815 80442029 -101306058 + MT2A LTR ERVL 302 533 0 7 1198 359 305 63 95 chr2 80444766 80444987 -101303100 - RMER15 LTR ERVL 0 575 362 7 1198 1551 201 39 98 chr2 80445511 80445919 -101302168 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 7 1198 230 242 29 29 chr2 80446744 80446812 -101301275 + RMER5 LTR ERV1 47 114 -420 7 1198 884 148 6 13 chr2 80447066 80447223 -101300864 + ORR1C2 LTR MaLR 7 162 -222 8 1198 1376 171 175 119 chr2 80447222 80447440 -101300647 - RMER12 LTR ERVK -268 1054 787 8 1198 1376 171 175 119 chr2 80447516 80447709 -101300378 - RMER12 LTR ERVK -536 786 620 8 1198 2526 47 3 0 chr2 80447713 80448031 -101300056 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 8 1198 3656 143 33 5 chr2 80448034 80448639 -101299448 - RMER12 LTR ERVK -700 622 1 8 1198 566 287 30 6 chr2 80448793 80448961 -101299126 + RMER5 LTR ERV1 352 523 -11 7 1198 395 266 20 67 chr2 80450224 80450373 -101297714 - RMER15-int LTR ERVL -3386 1613 1472 8 1198 316 313 149 48 chr2 80450778 80450986 -101297101 - RMER15 LTR ERVL -33 542 314 8 1198 347 267 45 45 chr2 80451513 80451623 -101296464 + MTD LTR MaLR 1 110 -309 8 1198 2224 133 98 16 chr2 80452429 80452817 -101295270 - MTC LTR MaLR -1 420 1 8 1198 616 375 131 9 chr2 80453787 80454123 -101293964 - LTR16A LTR ERVL -69 382 6 8 1198 544 174 37 0 chr2 80454516 80454625 -101293462 + RLTR40 LTR ERVK 3 115 -702 8 1198 1783 207 102 42 chr2 80454966 80455466 -101292621 + RLTR40 LTR ERVK 158 687 -130 8 1198 856 205 20 195 chr2 80455437 80455650 -101292437 + RLTR40 LTR ERVK 566 741 -76 8 1198 856 205 20 195 chr2 80455770 80455853 -101292234 + RLTR40 LTR ERVK 742 810 -7 8 1198 518 289 37 12 chr2 80456234 80456395 -101291692 - MLT1A LTR MaLR -13 361 197 8 1198 956 165 241 27 chr2 80462501 80462763 -101285324 + ORR1D1 LTR MaLR 55 372 -2 8 1198 3338 132 69 2 chr2 80465689 80466237 -101281850 + RMER4B LTR ERVK 1 585 0 8 1198 381 344 79 9 chr2 80476945 80477174 -101270913 + MLT1D LTR MaLR 181 425 -80 8 1199 354 202 52 103 chr2 80481032 80481148 -101266939 - MT2B LTR ERVL -337 264 155 8 1199 425 338 69 44 chr2 80487574 80487849 -101260238 - MLT1D LTR MaLR 0 505 224 8 1199 270 302 18 62 chr2 80488074 80488187 -101259900 - MLT1D LTR MaLR -397 108 1 8 1199 999 248 0 22 chr2 80488747 80488978 -101259109 - MTD LTR MaLR -161 258 33 8 1199 740 237 17 28 chr2 80491712 80491890 -101256197 - MTE2a LTR MaLR 0 379 204 9 1199 291 250 165 41 chr2 80507731 80507852 -101240235 - LTR50 LTR ERVL -637 158 23 9 1199 243 238 164 47 chr2 80514117 80514245 -101233842 + LTR81A LTR ERV1? 1195 1337 -13 1 1199 676 288 134 48 chr2 80514408 80514743 -101233344 + MTEa LTR MaLR 15 378 -1 1 1199 422 352 76 62 chr2 80517119 80517476 -101230611 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 9 2 1199 243 211 80 53 chr2 80517761 80517836 -101230251 - MTEa LTR MaLR -14 365 289 2 1199 472 287 75 32 chr2 80519014 80519201 -101228886 + MLT1F1 LTR MaLR 108 302 -267 2 1199 375 264 155 0 chr2 80519228 80519357 -101228730 + MLT1F1 LTR MaLR 367 515 -33 2 1199 1606 215 90 58 chr2 80520382 80520475 -101227612 + MTD LTR MaLR 8 107 -312 3 1199 4507 91 14 63 chr2 80520475 80521107 -101226980 + MT2B LTR ERVL 1 601 0 3 1199 1606 215 90 58 chr2 80521107 80521412 -101226675 + MTD LTR MaLR 108 419 0 3 1199 400 271 105 132 chr2 80523093 80523463 -101224624 - ORR1E LTR MaLR -1 369 10 3 1199 2592 107 95 49 chr2 80524558 80524989 -101223098 - RLTR11B LTR ERVK 0 453 3 4 1199 295 306 36 108 chr2 80525144 80525283 -101222804 - RLTR24 LTR ERV1 -80 449 321 4 1199 275 293 0 0 chr2 80525446 80525521 -101222566 - RLTR24 LTR ERV1 -454 75 1 4 1199 3063 78 0 0 chr2 80538741 80539176 -101208911 - ORR1A1-int LTR MaLR -763 1029 595 5 1199 2180 89 82 10 chr2 80539352 80539657 -101208430 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 5 1199 3640 28 5 0 chr2 80550243 80550637 -101197450 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 7 1199 471 172 0 0 chr2 80551415 80551502 -101196585 - ORR1A2 LTR MaLR -240 87 1 7 1199 260 200 69 81 chr2 80551554 80551641 -101196446 - MLT1A1 LTR MaLR -322 86 1 7 1199 437 314 95 47 chr2 80556061 80556272 -101191815 - LTR16A LTR ERVL -184 267 47 8 1199 1563 152 64 0 chr2 80556492 80556756 -101191331 + ORR1A1 LTR MaLR 1 281 -65 8 1199 394 238 146 80 chr2 80557475 80557612 -101190475 + MT2B LTR ERVL 114 259 -342 8 1199 1019 123 14 11 chr2 80559146 80559404 -101188683 - ORR1A4 LTR MaLR -8 321 1 9 1199 2070 175 16 59 chr2 80562461 80562899 -101185188 + MTD LTR MaLR 1 419 0 1 1199 2237 85 24 56 chr2 80563040 80563377 -101184710 + ORR1A3 LTR MaLR 1 326 0 1 1199 349 296 74 17 chr2 80567495 80567670 -101180417 - RLTR12B LTR ERVK -77 451 267 1 1199 3994 194 87 40 chr2 80568064 80569331 -101178756 - RMER12 LTR ERVK -4 1844 1 1 1199 2416 191 99 65 chr2 80569408 80570250 -101177837 + RMER6C LTR ERVK 1 716 -4 1 1199 2639 104 74 37 chr2 80572500 80572958 -101175129 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 1 1199 635 217 60 44 chr2 80573357 80573540 -101174547 + RLTR20B2 LTR ERVK 94 279 -281 1 1199 555 224 19 0 chr2 80575502 80575609 -101172478 - RMER20A LTR ERVK 0 516 408 1 1199 521 219 26 0 chr2 80575611 80575725 -101172362 - MERVK26-int LTR ERVK -30 6889 6773 1 1199 397 175 144 10 chr2 80577498 80577602 -101170485 - MERVK26-int LTR ERVK -6564 355 238 1 1199 2612 152 37 7 chr2 80577878 80578340 -101169747 - RMER20A LTR ERVK -40 476 1 1 1199 430 315 25 71 chr2 80581343 80581541 -101166546 - MLT1B LTR MaLR -5 385 197 1 1199 2307 185 62 156 chr2 80581748 80582422 -101165665 + RMER19C LTR ERVK 1 611 0 1 1199 4794 112 13 9 chr2 80583695 80584386 -101163701 + RMER19A LTR ERVK 3 696 -41 1 1199 464 321 89 40 chr2 80589654 80589878 -101158209 - MLT1A0 LTR MaLR -130 235 1 1 1199 2987 160 69 43 chr2 80594991 80595838 -101152249 - RMER6C LTR ERVK 0 720 1 1 1199 289 277 55 98 chr2 80597221 80597385 -101150702 - RLTR24 LTR ERV1 -91 438 282 1 1199 227 333 32 0 chr2 80604263 80604356 -101143731 - MLT1M LTR MaLR 0 672 577 1 1199 556 275 114 112 chr2 80604667 80605200 -101142887 - RMER20B LTR ERVK -15 612 30 1 1200 260 370 103 92 chr2 80611220 80611753 -101136334 + MLT1M LTR MaLR 123 661 -11 1 1200 396 338 51 24 chr2 80612559 80612892 -101135195 - HERV16-int LTR ERVL -4629 367 26 1 1200 465 281 126 17 chr2 80616363 80616602 -101131485 + RMER20B LTR ERVK 161 408 -108 1 1200 443 281 23 0 chr2 80620414 80620542 -101127545 - MTEb LTR MaLR -1 378 248 1 1200 1739 214 21 50 chr2 80624719 80625142 -101122945 - MTC LTR MaLR -10 411 1 2 1200 1227 273 65 3 chr2 80625225 80625581 -101122506 + MTE2a LTR MaLR 2 379 0 2 1200 458 240 106 101 chr2 80631081 80631299 -101116788 + MLT1E2 LTR MaLR 20 238 -389 2 1200 503 349 98 3 chr2 80631557 80631842 -101116245 + MLT1E2 LTR MaLR 316 627 0 2 1200 285 378 55 8 chr2 80632617 80632745 -101115342 - MLT1H LTR MaLR -344 205 72 2 1200 3105 20 0 0 chr2 80635755 80636101 -101111986 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 2 1200 3935 38 35 14 chr2 80636267 80636750 -101111337 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 2 1200 387 333 57 21 chr2 80638542 80638735 -101109352 - MLT2B2 LTR ERVL -306 209 10 2 1200 1694 196 15 91 chr2 80643145 80643554 -101104533 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 2 1200 537 261 98 18 chr2 80666015 80666199 -101081888 - ORR1D2 LTR MaLR -50 329 137 2 1200 238 305 59 59 chr2 80671986 80672087 -101076000 - RLTR45 LTR ERVK -378 104 4 2 1200 2516 102 5 81 chr2 80680515 80680908 -101067179 + RLTR8 LTR ERVK 3 365 0 2 1200 461 282 123 24 chr2 80682347 80682558 -101065529 - MLT1C LTR MaLR -23 444 213 2 1200 351 331 54 58 chr2 80684574 80684868 -101063219 + MTEa LTR MaLR 73 372 -7 2 1200 248 270 33 11 chr2 80688737 80688827 -101059260 - MLT1H2 LTR MaLR -301 188 97 2 1200 1518 208 230 15 chr2 80694516 80694856 -101053231 + MTC LTR MaLR 1 413 -8 2 1200 1850 242 20 134 chr2 80703327 80703924 -101044163 - RMER15 LTR ERVL -19 556 28 2 1200 278 231 0 0 chr2 80704022 80704074 -101044013 - RMER15 LTR ERVL -523 52 1 2 1200 2699 149 128 6 chr2 80704296 80704763 -101043324 + RLTR28 LTR ERVL 1 524 0 2 1200 252 333 52 32 chr2 80705650 80705805 -101042282 + LTRIS2 LTR ERV1 354 511 -53 2 1200 2991 124 86 21 chr2 80721908 80721982 -101026105 - RLTR20B2 LTR ERVK 0 560 451 3 1200 2991 124 86 21 chr2 80722025 80722476 -101025611 - RLTR20B2 LTR ERVK -110 450 1 3 1200 397 308 176 69 chr2 80724863 80725296 -101022791 + MLT1K LTR MaLR 115 593 -2 3 1200 566 321 119 12 chr2 80727572 80727909 -101020178 + MT2A LTR ERVL 6 378 -155 3 1201 1163 301 60 8 chr2 80744909 80745262 -101002825 - MTE2b LTR MaLR -1 420 2 3 1201 1922 124 40 101 chr2 80749059 80749436 -100998651 + ORR1B1 LTR MaLR 41 394 0 3 1201 239 382 6 106 chr2 80750744 80750905 -100997182 + MTEa LTR MaLR 46 190 -189 3 1201 640 338 66 73 chr2 80750766 80751283 -100996804 + MLT2B5 LTR ERVL 77 589 -12 3 1201 627 328 77 60 chr2 80752086 80752450 -100995637 - MLT1D LTR MaLR -135 370 1 3 1201 325 269 109 55 chr2 80755693 80755858 -100992229 - ORR1E LTR MaLR -5 374 201 3 1201 408 288 112 25 chr2 80756386 80756546 -100991541 - ORR1E LTR MaLR -183 176 3 3 1201 3574 200 31 70 chr2 80759011 80759915 -100988172 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 1 1353 -1489 3 1201 3574 182 36 55 chr2 80760084 80760232 -100987855 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 740 865 -1461 3 1201 463 80 11 11 chr2 80760400 80760488 -100987599 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 852 939 -1387 3 1201 5315 142 73 10 chr2 80766860 80768016 -100980071 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 1077 2305 -21 3 1201 3005 153 55 4 chr2 80768061 80768224 -100979863 + RLTR20A LTR ERVK 3 166 -375 3 1201 3005 153 55 4 chr2 80768304 80768405 -100979682 + RLTR20A LTR ERVK 167 288 -253 3 1201 3005 153 55 4 chr2 80768447 80768694 -100979393 + RLTR20A LTR ERVK 289 539 -2 3 1201 273 384 70 41 chr2 80771769 80771940 -100976147 + MLT1K LTR MaLR 70 245 -350 3 1201 253 273 77 77 chr2 80775543 80775698 -100972389 + MLT1H2-int LTR MaLR 995 1226 -263 3 1201 555 295 108 89 chr2 80775856 80776236 -100971851 - MLT1A1 LTR MaLR -21 387 1 3 1201 278 284 0 13 chr2 80777035 80777110 -100970977 + MLT1H2 LTR MaLR 80 153 -336 3 1201 342 226 301 6 chr2 80777427 80777583 -100970504 + ORR1D1 LTR MaLR 132 333 -41 3 1201 240 330 17 68 chr2 80790368 80790485 -100957602 + LTR48B LTR ERV1 1 111 -533 4 1201 276 287 100 18 chr2 80806185 80806295 -100941792 - LTR84a LTR ERVL -34 723 605 4 1201 1298 201 36 154 chr2 80811959 80812167 -100935920 - ORR1D1 LTR MaLR -30 344 158 4 1201 1298 201 36 154 chr2 80812348 80812528 -100935559 - ORR1D1 LTR MaLR -217 157 2 4 1201 2246 84 15 45 chr2 80816392 80816729 -100931358 + IAPLTR2b LTR ERVK 1 327 0 4 1201 2838 28 2 184 chr2 80816754 80817228 -100930859 - RLTR10 LTR ERVK -2 388 1 4 1201 8298 17 5 0 chr2 80817230 80818220 -100929867 - RLTR10-int LTR ERVK -3 1984 990 4 1201 7464 34 13 6 chr2 80818299 80819241 -100928846 - RLTR10-int LTR ERVK -999 988 41 4 1201 2884 26 2 183 chr2 80819251 80819727 -100928360 - RLTR10 LTR ERVK 0 390 1 4 1201 441 219 279 0 chr2 80819880 80820099 -100927988 + MTD-int LTR MaLR 972 1251 -7 4 1201 836 263 148 31 chr2 80820126 80820444 -100927643 + MTD LTR MaLR 10 364 -55 4 1201 235 263 20 40 chr2 80821063 80821162 -100926925 + MLT1A0 LTR MaLR 9 105 -260 4 1201 1090 264 134 72 chr2 80821135 80821596 -100926491 + RLTR19 LTR ERVK 10 499 0 4 1201 872 297 49 30 chr2 80821606 80821870 -100926217 + MLT1A0 LTR MaLR 93 361 -4 4 1201 1962 214 27 0 chr2 80831343 80831749 -100916338 - MTC LTR MaLR 0 421 5 4 1201 5384 197 40 32 chr2 80831753 80833000 -100915087 - MTC-int LTR MaLR 0 1258 2 4 1201 339 381 38 0 chr2 80838199 80838304 -100909783 + MLT1F2 LTR MaLR 328 436 -124 4 1201 237 367 34 61 chr2 80838313 80838434 -100909653 + MLT1F2 LTR MaLR 413 532 -28 4 1201 2114 153 92 15 chr2 80838434 80838825 -100909262 - MTC LTR MaLR 0 421 1 4 1201 237 367 34 61 chr2 80838825 80838851 -100909236 + MLT1F2 LTR MaLR 533 556 -4 4 1201 821 301 146 50 chr2 80850066 80850545 -100897542 - RMER5 LTR ERV1 -9 525 1 4 1201 2382 223 6 89 chr2 80861000 80861534 -100886553 - RMER19C LTR ERVK 0 611 114 4 1201 2382 223 6 89 chr2 80861569 80861699 -100886388 - RMER19C LTR ERVK -498 113 2 4 1201 394 230 100 11 chr2 80865171 80865336 -100882751 - RMER4B LTR ERVK -9 576 343 4 1201 2164 211 96 25 chr2 80865441 80866024 -100882063 + RMER19B LTR ERVK 1 557 -345 4 1201 1069 164 82 0 chr2 80866446 80866629 -100881458 + RMER19B LTR ERVK 544 741 -161 4 1201 947 211 82 0 chr2 80867772 80867966 -100880121 - RMER4B LTR ERVK -344 241 32 4 1201 445 319 69 54 chr2 80867955 80868272 -100879815 - RLTR12B LTR ERVK -220 348 14 5 1201 503 231 15 89 chr2 80868235 80868423 -100879664 - ORR1C1 LTR MaLR -232 162 2 5 1202 265 313 25 75 chr2 80877703 80877862 -100870225 - MamGypLTR2b LTR Gypsy -28 894 744 5 1202 3183 113 13 11 chr2 80905810 80906284 -100841803 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 1 5 1202 5355 152 28 18 chr2 80927042 80927933 -100820154 + RMER19B LTR ERVK 3 902 0 5 1202 4907 132 107 8 chr2 80930290 80931162 -100816925 - RMER17B LTR ERVK 0 958 1 5 1202 293 320 98 0 chr2 80939169 80939291 -100808796 + MLT1D LTR MaLR 1 134 -371 5 1202 466 316 76 6 chr2 80939323 80939533 -100808554 + MLT1D LTR MaLR 226 505 0 5 1202 909 304 81 38 chr2 80945264 80945448 -100802639 - MLT1C LTR MaLR 0 467 285 5 1202 909 304 81 38 chr2 80945497 80945757 -100802330 - MLT1C LTR MaLR -183 284 4 5 1202 562 359 74 37 chr2 80953203 80953556 -100794531 + LTR40a LTR ERVL 122 487 -32 5 1202 262 271 48 152 chr2 80954047 80954212 -100793875 + MT2B LTR ERVL 134 281 -320 5 1202 881 304 85 19 chr2 80958435 80958813 -100789274 + MLT1A1 LTR MaLR 4 406 -2 5 1202 2709 54 96 0 chr2 80962504 80962858 -100785229 + RLTR10 LTR ERVK 1 388 -2 5 1202 451 358 68 10 chr2 80963569 80963775 -100784312 - MLT1D LTR MaLR -16 489 272 6 1202 236 309 102 9 chr2 80963809 80963917 -100784170 - MLT1D LTR MaLR -461 166 49 6 1202 753 281 96 74 chr2 80967514 80967879 -100780208 - MT2A LTR ERVL 0 533 161 6 1202 273 304 118 7 chr2 80967965 80968101 -100779986 - MER54A LTR ERVL -742 159 9 6 1202 225 274 16 0 chr2 80969077 80969139 -100778948 + MTD LTR MaLR 33 95 -326 6 1202 759 267 28 28 chr2 80969179 80969391 -100778696 + MTD LTR MaLR 207 418 -1 6 1202 439 294 43 41 chr2 80972671 80972883 -100775204 - MTEb LTR MaLR 0 379 158 6 1202 3087 329 106 25 chr2 80972893 80974189 -100773898 - ORR1E-int LTR MaLR -180 1400 1 6 1202 537 333 55 76 chr2 80974205 80974549 -100773538 - ORR1E LTR MaLR -17 342 6 6 1202 289 348 26 0 chr2 80979828 80979943 -100768144 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 248 6 1202 409 171 53 0 chr2 80985947 80986023 -100762064 - MTD LTR MaLR -8 411 332 6 1202 1093 235 132 14 chr2 80986830 80987111 -100760976 - MTD LTR MaLR -105 314 1 6 1202 1439 242 39 85 chr2 80998234 80998859 -100749228 + RMER12 LTR ERVK 1 808 -596 6 1202 4419 190 42 63 chr2 80998882 80999797 -100748290 - RMER19B LTR ERVK -7 895 1 6 1202 321 304 34 34 chr2 80999797 80999960 -100748127 + RLTR22_Mus LTR ERVK 577 739 -1109 6 1202 317 261 75 67 chr2 81000028 81000307 -100747780 + RMER12B LTR ERVK 1078 1364 -208 1 1202 430 219 45 54 chr2 81000301 81000412 -100747675 + RMER12 LTR ERVK 1080 1189 -133 2 1203 246 346 42 55 chr2 81022117 81022282 -100725805 + LTR41 LTR ERVL 1 163 -605 4 1203 634 330 121 44 chr2 81022572 81022936 -100725151 - MLT1E1A LTR MaLR -2 678 287 4 1203 2257 73 158 0 chr2 81023080 81023435 -100724652 + IAPLTR2a LTR ERVK 1 411 0 4 1203 1511 168 125 75 chr2 81025556 81025916 -100722171 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 4 1203 4682 236 70 24 chr2 81025916 81027226 -100720861 - ORR1C1-int LTR MaLR 0 1370 1 4 1203 1910 198 23 49 chr2 81027226 81027614 -100720473 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 4 1203 537 333 84 29 chr2 81037810 81038153 -100709934 - MLT2F LTR ERVL -11 652 291 6 1203 255 297 68 38 chr2 81038187 81038320 -100709767 - MLT2F LTR ERVL -526 137 1 6 1203 462 372 85 61 chr2 81039217 81039592 -100708495 - MLT1F2 LTR MaLR -81 479 96 6 1203 228 326 54 0 chr2 81052181 81052273 -100695814 + RMER4B LTR ERVK 459 555 -30 8 1203 570 330 17 6 chr2 81056529 81056706 -100691381 - MLT2B1 LTR ERVL -339 181 3 8 1203 1183 289 44 33 chr2 81061625 81062105 -100685982 - RMER15 LTR ERVL -1 574 34 8 1203 239 253 88 44 chr2 81062186 81062277 -100685810 - MLT1E2 LTR MaLR -186 441 347 8 1203 1180 226 22 109 chr2 81062701 81063059 -100685028 - RMER19C LTR ERVK -1 610 284 9 1203 1043 232 45 99 chr2 81063586 81063948 -100684139 - RMER19C LTR ERVK -404 333 1 9 1203 422 275 101 0 chr2 81072620 81072769 -100675318 + MLT1D LTR MaLR 342 505 0 9 1203 270 343 161 55 chr2 81074383 81074654 -100673433 + MLT1J LTR MaLR 79 369 -143 9 1203 270 343 161 55 chr2 81074678 81074736 -100673351 + MLT1J LTR MaLR 370 442 -70 9 1203 1563 254 45 2 chr2 81089255 81089657 -100658430 - MTD LTR MaLR 0 419 1 1 1203 1632 161 30 65 chr2 81095795 81096133 -100651954 - ORR1A4 LTR MaLR -3 326 1 1 1203 493 278 8 0 chr2 81102966 81103092 -100644995 + MLT2C1 LTR ERVL 13 139 -258 1 1203 704 216 118 46 chr2 81105728 81105925 -100642162 - MTD LTR MaLR -201 218 6 1 1203 1157 296 62 0 chr2 81113712 81114020 -100634067 + MTE2b LTR MaLR 13 339 -40 1 1203 233 223 38 63 chr2 81115866 81116024 -100632063 + RMER17D2 LTR ERVK 390 543 -266 1 1203 265 295 91 55 chr2 81128974 81129139 -100618948 + LTR41 LTR ERVL 435 605 -163 1 1203 1421 141 125 16 chr2 81130621 81130931 -100617156 + IAPLTR4 LTR ERVK 1 471 -4 1 1203 3610 125 14 9 chr2 81132115 81132681 -100615406 + RLTR1D LTR ERV1 37 605 0 1 1204 274 125 0 0 chr2 81134705 81134745 -100613342 + ORR1C2 LTR MaLR 1 40 -344 1 1204 540 173 31 5 chr2 81134731 81134840 -100613247 + ORR1C2 LTR MaLR 267 384 0 1 1204 450 255 122 20 chr2 81139980 81140128 -100607959 + MTD LTR MaLR 196 358 -61 1 1204 267 287 31 21 chr2 81140260 81140356 -100607731 + RLTR12B LTR ERVK 41 137 -391 1 1204 568 263 89 67 chr2 81140426 81140695 -100607392 + RLTR12B LTR ERVK 245 519 -9 1 1204 279 343 88 29 chr2 81144392 81144563 -100603524 - MLT1A0 LTR MaLR -173 192 12 1 1204 728 313 27 18 chr2 81173030 81173251 -100574836 + MLT1D LTR MaLR 283 505 0 2 1204 287 243 67 4 chr2 81175655 81175750 -100572337 + MTE2a LTR MaLR 273 373 -6 2 1204 1365 236 237 15 chr2 81177155 81177632 -100570455 + MER67C LTR ERV1 125 707 -4 2 1204 340 281 88 29 chr2 81177851 81178015 -100570072 - MTEa LTR MaLR -14 365 182 2 1204 3623 167 141 17 chr2 81183424 81184191 -100563896 + RMER19B LTR ERVK 1 862 -40 2 1204 279 362 183 42 chr2 81190946 81191208 -100556879 - MLT2B5 LTR ERVL -261 456 158 2 1204 677 380 96 3 chr2 81191857 81192190 -100555897 + MLT-int LTR MaLR 1114 1477 -258 2 1204 327 264 53 105 chr2 81192623 81192830 -100555257 + MTEb LTR MaLR 201 379 0 2 1204 1642 272 118 56 chr2 81193135 81193804 -100554283 + RMER19B LTR ERVK 3 654 -248 2 1204 271 305 166 28 chr2 81193906 81194051 -100554036 + LTR80A LTR ERVL 419 583 0 2 1204 1363 261 61 26 chr2 81197815 81198275 -100549812 + RMER5 LTR ERV1 1 476 -58 2 1204 3952 210 61 40 chr2 81203173 81204045 -100544042 + RMER19B LTR ERVK 1 890 -12 2 1204 267 291 40 66 chr2 81204149 81204300 -100543787 - MER90 LTR ERV1 -424 151 5 2 1204 3175 52 3 0 chr2 81206911 81207292 -100540795 - IAPEY_LTR LTR ERVK -3 382 1 2 1204 612 200 53 46 chr2 81214099 81214230 -100533857 - RLTR25A LTR ERVK 0 1103 972 2 1204 3358 190 171 78 chr2 81214418 81215077 -100533010 + RLTR25B LTR ERVK 1 811 -217 2 1204 3358 190 171 78 chr2 81215102 81215382 -100532705 + RLTR25B LTR ERVK 812 1028 0 2 1204 621 326 124 32 chr2 81219709 81220114 -100527973 + MER77 LTR ERVL 129 607 0 2 1204 888 325 43 24 chr2 81220773 81221157 -100526930 + MTE2b LTR MaLR 18 373 -6 2 1204 1351 278 28 3 chr2 81221334 81221695 -100526392 + ORR1D1 LTR MaLR 1 370 -4 2 1204 252 103 0 0 chr2 81225488 81225527 -100522560 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -1003 1323 1285 3 1204 1510 234 101 19 chr2 81237282 81237660 -100510427 + MTD LTR MaLR 11 419 0 3 1204 686 183 96 27 chr2 81241361 81241507 -100506580 - RLTR24 LTR ERV1 -368 161 6 3 1204 1684 186 21 26 chr2 81243936 81244316 -100503771 - ORR1C1 LTR MaLR -8 376 1 3 1204 597 152 57 0 chr2 81247639 81247744 -100500343 + RMER6B LTR ERVK 1 111 -350 3 1204 2071 164 91 16 chr2 81247746 81248175 -100499912 + RMER6B LTR ERVK 1 461 0 3 1204 230 437 25 17 chr2 81250272 81250507 -100497580 - MLT1H1 LTR MaLR -10 545 309 3 1204 2683 155 23 25 chr2 81253306 81253868 -100494219 - RMER17D2 LTR ERVK -1 808 248 3 1204 2439 45 58 0 chr2 81253868 81254181 -100493906 + IAPEY_LTR LTR ERVK 55 385 0 3 1204 1714 113 0 36 chr2 81254181 81254442 -100493645 - RMER17D2 LTR ERVK -556 253 3 3 1204 1547 238 60 5 chr2 81254561 81254958 -100493129 - MTD LTR MaLR 0 419 1 3 1204 1833 170 137 5 chr2 81263038 81263410 -100484677 - MTC LTR MaLR 0 421 1 3 1205 1531 249 76 10 chr2 81265928 81266321 -100481766 + MTD LTR MaLR 1 419 0 3 1205 405 118 162 0 chr2 81268280 81268348 -100479739 + RMER6D LTR ERVK 1 79 -641 3 1205 2177 180 35 57 chr2 81268332 81268791 -100479296 + RMER6D LTR ERVK 272 720 0 3 1205 1711 180 77 15 chr2 81271117 81271455 -100476632 + ORR1B2 LTR MaLR 1 359 -8 3 1205 1853 199 70 15 chr2 81272562 81272961 -100475126 - MTC LTR MaLR 0 421 1 3 1205 399 280 142 57 chr2 81275657 81275869 -100472218 + MLT1E1 LTR MaLR 418 647 -7 3 1205 393 271 101 54 chr2 81276520 81276688 -100471399 - MLT2B1 LTR ERVL -173 347 172 3 1205 1053 309 62 19 chr2 81280777 81281258 -100466829 + RMER5 LTR ERV1 33 534 0 3 1205 402 338 99 47 chr2 81289980 81290213 -100457874 + ORR1E LTR MaLR 9 253 -106 3 1205 303 289 171 13 chr2 81292459 81292617 -100455470 + MLT2B5 LTR ERVL 9 191 -526 3 1205 585 320 148 27 chr2 81292631 81293004 -100455083 + MLT2B5 LTR ERVL 122 539 -62 3 1205 2589 114 38 46 chr2 81300467 81300946 -100447141 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 4 1205 24249 10 7 6 chr2 81300946 81303686 -100444401 + IAPEz-int LTR ERVK 8 2751 -3730 4 1205 28186 15 15 0 chr2 81303678 81306867 -100441220 + IAPEz-int LTR ERVK 3244 6481 0 4 1205 2030 92 3 77 chr2 81306867 81307219 -100440868 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 326 -11 4 1205 591 315 188 22 chr2 81309427 81309580 -100438507 + MTD LTR MaLR 1 163 -256 4 1205 4826 111 21 68 chr2 81309580 81310422 -100437665 + RLTR13B4 LTR ERVK 1 803 0 4 1205 591 315 188 22 chr2 81310422 81310625 -100437462 + MTD LTR MaLR 164 416 -3 4 1205 603 287 147 92 chr2 81316766 81317320 -100430767 - RLTR18 LTR ERVK -24 592 33 4 1205 2128 186 54 13 chr2 81317343 81317806 -100430281 - RLTR18-int LTR ERVK 0 5361 4880 4 1205 1823 224 75 90 chr2 81320291 81320849 -100427238 - RLTR18-int LTR ERVK -498 4863 4314 4 1205 1158 230 14 32 chr2 81320862 81321036 -100427051 + RMER10A LTR ERVL 1 170 -272 4 1205 4724 121 21 69 chr2 81321036 81321879 -100426208 - RLTR13B4 LTR ERVK 0 803 1 4 1205 1158 230 14 32 chr2 81321879 81321983 -100426104 + RMER10A LTR ERVL 171 274 -168 4 1205 3038 199 61 18 chr2 81321986 81322645 -100425442 - RMER6C LTR ERVK -3 687 1 4 1205 6606 153 66 48 chr2 81322645 81323249 -100424838 - RMER6-int LTR ERVK 0 3177 2537 4 1205 6606 153 66 48 chr2 81323322 81325037 -100423050 - RMER6-int LTR ERVK 0 2536 712 4 1205 3152 230 64 44 chr2 81325037 81325189 -100422898 + RLTR25B LTR ERVK 170 317 -711 4 1205 3152 230 64 44 chr2 81325236 81325726 -100422361 + RLTR25B LTR ERVK 318 824 -204 4 1205 3152 230 64 44 chr2 81325821 81325839 -100422248 + RLTR25B LTR ERVK 825 842 -186 4 1205 3152 230 64 44 chr2 81325907 81326086 -100422001 + RLTR25B LTR ERVK 843 1026 -2 4 1205 385 265 43 62 chr2 81326945 81327106 -100420981 - MYSERV6-int LTR ERVK -1639 7320 7163 4 1205 592 195 66 12 chr2 81327181 81327347 -100420740 - RLTR42-int LTR ERVK -3395 2127 1953 4 1205 553 248 255 9 chr2 81327687 81327903 -100420184 - RLTR42-int LTR ERVK -3727 1795 1527 4 1205 254 148 130 0 chr2 81327903 81327957 -100420130 - RLTR42-int LTR ERVK -3925 1597 1537 4 1205 1216 243 21 36 chr2 81328125 81328462 -100419625 - RLTR18-int LTR ERVK -1792 3569 3238 4 1205 619 206 23 8 chr2 81328588 81328720 -100419367 - RLTR18-int LTR ERVK -2392 2969 2836 4 1205 299 278 43 50 chr2 81328749 81328889 -100419198 - RLTR18-int LTR ERVK -2694 2667 2529 4 1205 474 273 43 54 chr2 81329370 81329556 -100418531 - RLTR18-int LTR ERVK -5146 215 32 4 1205 444 325 86 82 chr2 81329615 81329907 -100418180 - RLTR18B LTR ERVK 0 512 220 4 1205 1593 169 86 3 chr2 81330198 81330500 -100417587 - RLTR12A LTR ERVK -4 564 238 4 1205 397 175 12 24 chr2 81330717 81330799 -100417288 - MTD LTR MaLR 0 419 339 4 1205 458 271 8 8 chr2 81330803 81330922 -100417165 - MTD LTR MaLR -300 119 1 4 1205 1258 294 134 25 chr2 81338804 81339401 -100408686 + LTR65 LTR ERV1 7 668 -1 4 1205 2677 31 47 0 chr2 81347659 81347981 -100400106 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 0 337 1 4 1205 9374 22 2 6 chr2 81347981 81349064 -100399023 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 5403 4 1205 20943 34 42 15 chr2 81349042 81351637 -100396450 - IAPEz-int LTR ERVK -3807 2674 8 4 1205 2677 31 47 0 chr2 81351637 81351959 -100396128 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 0 337 1 4 1205 2993 80 12 5 chr2 81355470 81355887 -100392200 - BGLII LTR ERVK 0 421 2 4 1205 334 290 93 57 chr2 81358915 81359109 -100388978 - MamGypLTR2b LTR Gypsy -17 905 705 4 1205 333 247 62 0 chr2 81362346 81362427 -100385660 + MTE2b LTR MaLR 1 86 -293 4 1205 1286 227 119 30 chr2 81375490 81375826 -100372261 - MTD LTR MaLR 0 419 54 4 1205 801 329 70 13 chr2 81378902 81379191 -100368896 - MTD LTR MaLR -36 385 77 4 1205 327 338 80 80 chr2 81379149 81379451 -100368636 + LTR40b LTR ERVL 141 442 -20 4 1205 543 343 44 68 chr2 81381424 81381762 -100366325 - MER77 LTR ERVL 0 607 278 5 1205 1890 182 39 76 chr2 81382880 81383315 -100364772 - MTC LTR MaLR 0 421 3 5 1205 529 285 122 9 chr2 81383690 81383920 -100364167 + RMER15 LTR ERVL 295 550 -25 5 1206 622 221 22 22 chr2 81403200 81403334 -100344753 + RLTR25B LTR ERVK 1 134 -894 5 1206 1089 254 124 43 chr2 81403403 81403848 -100344239 + RLTR25B LTR ERVK 117 597 -431 5 1206 1122 329 128 28 chr2 81418826 81419546 -100328541 + MLT1H-int LTR MaLR 30 821 -588 5 1206 1088 265 13 52 chr2 81420162 81420472 -100327615 - MTD LTR MaLR -121 298 1 5 1206 374 314 80 67 chr2 81420617 81420842 -100327245 - ORR1E LTR MaLR -123 236 9 5 1206 526 293 102 11 chr2 81423125 81423301 -100324786 - ORR1E LTR MaLR -121 238 47 5 1206 238 385 44 93 chr2 81444081 81444307 -100303780 - LTR16A LTR ERVL -96 355 141 5 1206 253 205 244 0 chr2 81454571 81454649 -100293438 + MLT1A1 LTR MaLR 310 406 -2 6 1206 765 236 85 17 chr2 81456150 81456327 -100291760 + ORR1C1 LTR MaLR 188 376 -2 6 1206 528 328 20 29 chr2 81456648 81456852 -100291235 - MTEa LTR MaLR -4 375 174 6 1206 399 352 21 7 chr2 81457088 81457228 -100290859 - MTEa LTR MaLR -237 142 1 6 1206 537 361 76 7 chr2 81457285 81457589 -100290498 + MTE-int LTR MaLR 2 326 -1254 6 1206 1914 143 0 48 chr2 81461258 81461589 -100286498 + ORR1A4 LTR MaLR 7 321 -8 6 1206 8529 137 54 82 chr2 81461593 81463282 -100284805 + ORR1A4-int LTR MaLR 1 1642 -321 6 1206 901 266 56 45 chr2 81468839 81469053 -100279034 - MTD LTR MaLR 0 419 206 6 1206 1307 226 167 34 chr2 81469053 81469520 -100278567 - MT2A LTR ERVL 0 533 5 6 1206 901 266 56 45 chr2 81469520 81469592 -100278495 - MTD LTR MaLR -214 205 131 6 1206 3314 53 0 0 chr2 81471691 81472087 -100276000 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 1206 2097 183 173 124 chr2 81489473 81490131 -100257956 - RMER6C LTR ERVK 0 690 1 6 1206 1121 243 75 36 chr2 81493630 81493989 -100254098 + RMER13A LTR ERVK 122 494 -366 6 1206 243 267 51 39 chr2 81494354 81494432 -100253655 - MTE2b LTR MaLR -14 365 287 6 1206 563 155 199 45 chr2 81494460 81494580 -100253507 + RMER17A-int LTR ERVK 3 134 -1594 6 1206 563 155 199 45 chr2 81494659 81494714 -100253373 + RMER17A-int LTR ERVK 135 204 -1524 6 1206 441 182 8 69 chr2 81495012 81495142 -100252945 + RMER17A-int LTR ERVK 787 908 -820 6 1206 225 316 9 95 chr2 81495826 81495931 -100252156 + LTR77 LTR ERV1 508 603 -19 6 1206 291 339 52 42 chr2 81497501 81497692 -100250395 - RMER15 LTR ERVL -109 466 274 6 1206 1038 237 50 63 chr2 81513147 81513449 -100234638 + RMER15 LTR ERVL 3 300 -275 2 1206 458 246 8 66 chr2 81513454 81513576 -100234511 + RMER15 LTR ERVL 456 570 -5 2 1206 1948 201 82 20 chr2 81518452 81518949 -100229138 + RLTR12B LTR ERVK 1 528 0 2 1206 227 302 82 48 chr2 81521290 81521436 -100226651 + RLTR13D2 LTR ERVK 551 701 -322 2 1206 2071 187 39 95 chr2 81522511 81523071 -100225016 + RLTR24 LTR ERV1 1 529 0 2 1207 228 365 81 20 chr2 81527463 81527611 -100220476 - LTR16A LTR ERVL -288 163 7 3 1207 1966 237 61 93 chr2 81535085 81535444 -100212643 - RMER17B LTR ERVK -147 811 456 4 1207 1966 237 61 93 chr2 81536189 81536648 -100211439 - RMER17B LTR ERVK -503 455 20 4 1207 249 272 320 34 chr2 81543097 81543328 -100204759 - MLT1A LTR MaLR -71 303 7 6 1207 933 309 63 56 chr2 81552885 81553316 -100194771 - MT2A LTR ERVL 0 533 100 6 1207 402 304 10 0 chr2 81553480 81553582 -100194505 - MTE2b LTR MaLR -276 103 1 6 1207 2277 101 83 88 chr2 81554742 81555164 -100192923 - RLTR9B2 LTR ERVK 0 420 1 7 1207 333 71 0 0 chr2 81556509 81556551 -100191536 + RMER6A LTR ERVK 101 142 -614 7 1207 407 125 9 77 chr2 81559364 81559479 -100188608 + RMER6A LTR ERVK 136 244 -446 7 1207 1843 201 11 30 chr2 81560120 81560485 -100187602 + ORR1B1 LTR MaLR 3 360 -34 7 1207 315 133 0 0 chr2 81561047 81561092 -100186995 + ORR1B1 LTR MaLR 341 385 -9 7 1207 3020 55 34 0 chr2 81565367 81565750 -100182337 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 8 1207 228 392 32 0 chr2 81566756 81566881 -100181206 + LTR16E2 LTR ERVL 426 554 -14 8 1207 431 230 25 64 chr2 81569673 81569877 -100178210 - RMER17C LTR ERVK -135 275 80 9 1207 3116 68 5 0 chr2 81570080 81570478 -100177609 - MTB LTR MaLR 0 400 1 1 1207 2326 169 5 13 chr2 81577524 81577914 -100170173 - ORR1B1 LTR MaLR -7 387 1 1 1207 288 301 87 60 chr2 81584272 81584456 -100163631 - HERVL40-int LTR ERVL -41 5489 5301 1 1207 2705 233 107 14 chr2 81586674 81587504 -100160583 - RMER17B LTR ERVK 0 958 1 1 1207 588 263 73 19 chr2 81588618 81588909 -100159178 + RMER6A LTR ERVK 428 720 0 1 1207 2333 68 0 50 chr2 81597515 81597854 -100150233 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 322 0 1 1207 2641 63 3 6 chr2 81616507 81616885 -100131202 - IAPEY2_LTR LTR ERVK -12 373 20 1 1207 260 271 155 28 chr2 81622304 81622517 -100125570 + MER67C LTR ERV1 86 325 -386 1 1207 738 309 38 48 chr2 81625519 81625799 -100122288 - MTE2a LTR MaLR -10 369 90 1 1207 738 319 74 94 chr2 81625846 81625939 -100122148 - MTE2a LTR MaLR -296 123 53 1 1207 276 326 95 123 chr2 81626560 81626588 -100121499 - MTE2a LTR MaLR -367 52 18 1 1207 269 340 9 9 chr2 81627757 81627867 -100120220 - MTE-int LTR MaLR 0 1580 1471 1 1207 676 325 45 8 chr2 81627913 81628155 -100119932 - MTE-int LTR MaLR -192 1388 1138 1 1207 2206 119 39 8 chr2 81630195 81630551 -100117536 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 1 1207 5875 62 13 18 chr2 81630553 81631328 -100116759 - IAPEz-int LTR ERVK -2 6479 5709 1 1207 35825 34 21 6 chr2 81631319 81635603 -100112484 - IAPEz-int LTR ERVK -2124 4357 8 1 1207 2206 119 39 8 chr2 81635603 81635959 -100112128 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 1 1207 1014 356 100 14 chr2 81636803 81637321 -100110766 + MER68 LTR ERVL 1 563 0 1 1207 1613 211 146 68 chr2 81639690 81639794 -100108293 + RMER6C LTR ERVK 5 150 -540 1 1207 1613 217 135 81 chr2 81640536 81641206 -100106881 + RMER6C LTR ERVK 151 668 -52 1 1207 689 237 199 62 chr2 81644131 81644423 -100103664 - RLTR28B LTR ERVL -133 348 17 1 1207 260 260 55 0 chr2 81646285 81646358 -100101729 - RMER17C-int LTR ERVK -535 2703 2627 1 1207 621 136 48 0 chr2 81655552 81655653 -100092434 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 273 2 1207 1219 250 57 43 chr2 81655744 81656122 -100091965 - ORR1C1 LTR MaLR -2 365 1 2 150 2166 173 51 68 chr2 81657398 81657930 -100090157 + RLTR28 LTR ERVL 1 523 -1 2 1208 495 265 151 30 chr2 81659759 81660018 -100088069 + RLTR10A LTR ERVK 104 411 0 2 1208 4779 165 100 71 chr2 81661473 81662543 -100085544 - RLTR25A LTR ERVK 0 1103 3 2 1208 244 203 179 60 chr2 81666033 81666117 -100081970 + MER67C LTR ERV1 208 301 -410 2 1208 2327 212 117 21 chr2 81675208 81675781 -100072306 + RMER6C LTR ERVK 1 628 -62 2 1208 242 271 149 23 chr2 81675775 81675862 -100072225 - MLT2B2 LTR ERVL -264 251 154 2 1208 1689 203 106 27 chr2 81675849 81675895 -100072192 + RMER6D LTR ERVK 284 327 -393 2 1208 1689 203 106 27 chr2 81675960 81675983 -100072104 + RMER6D LTR ERVK 328 352 -368 2 1208 1689 203 106 27 chr2 81676163 81676497 -100071590 + RMER6D LTR ERVK 353 720 0 2 1208 356 310 111 68 chr2 81683055 81683335 -100064752 - MLT1A LTR MaLR -21 353 62 2 1208 277 235 48 36 chr2 81683568 81683652 -100064435 - MTEb LTR MaLR -23 356 272 2 1208 355 333 122 27 chr2 81690067 81690262 -100057825 + MTC LTR MaLR 2 221 -200 2 1208 692 280 51 14 chr2 81690330 81690547 -100057540 + MTD LTR MaLR 181 405 -14 2 1208 600 316 90 14 chr2 81700917 81701261 -100046826 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 2 1208 1015 300 41 47 chr2 81705521 81705885 -100042202 + ORR1D1 LTR MaLR 13 374 0 3 1208 3198 196 42 85 chr2 81707901 81708643 -100039444 + RMER13A LTR ERVK 1 710 -150 3 1208 343 324 101 0 chr2 81709751 81709890 -100038197 + MER70B LTR ERVL 414 566 -12 3 1208 432 0 19 0 chr2 81732780 81732834 -100015253 + RLTR1 LTR ERV1 1 55 -457 3 1208 1306 285 34 49 chr2 81732873 81733345 -100014742 + RLTR1 LTR ERV1 160 624 0 3 1208 2829 93 12 2 chr2 81735095 81735504 -100012583 + BGLII LTR ERVK 1 413 -8 3 1208 2948 184 74 11 chr2 81737887 81738535 -100009552 + RMER6C LTR ERVK 2 690 0 3 1208 841 362 38 15 chr2 81738659 81739052 -100009035 + MT2A LTR ERVL 24 425 -108 3 1208 1623 221 77 0 chr2 81740060 81740426 -100007661 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 3 1208 5626 215 76 33 chr2 81740426 81740927 -100007160 + ORR1B1-int LTR MaLR 1 506 -1003 3 1208 5626 215 76 33 chr2 81741155 81742097 -100005990 + ORR1B1-int LTR MaLR 507 1506 -3 3 1208 829 219 144 19 chr2 81742104 81742421 -100005666 + ORR1B1 LTR MaLR 5 327 -2 3 1208 998 175 22 22 chr2 81754430 81754611 -99993476 - RLTR17 LTR ERVK -321 371 191 3 1208 1483 211 6 16 chr2 81755583 81755896 -99992191 + RLTR10E LTR ERVK 1 310 -1 3 1208 4122 168 55 30 chr2 81757563 81758432 -99989655 - RLTR13D6 LTR ERVK -56 846 1 3 1208 4968 69 130 8 chr2 81759405 81760121 -99987966 - RLTR13B4 LTR ERVK 0 803 1 3 1208 2670 43 9 3 chr2 81779052 81779377 -99968710 + IAPLTR2b LTR ERVK 1 327 0 4 1208 1603 140 62 31 chr2 81781626 81781914 -99966173 + RLTR26 LTR ERVK 1 297 -345 4 1208 1004 168 62 113 chr2 81784333 81784608 -99963479 + RLTR26 LTR ERVK 382 642 0 4 1208 3383 120 12 10 chr2 81786783 81787297 -99960790 - LTRIS2 LTR ERV1 0 564 50 4 1208 236 347 61 44 chr2 81788075 81788256 -99959831 + MLT1E2 LTR MaLR 210 393 -234 4 1209 285 312 13 164 chr2 81790825 81791063 -99957024 + MTE2a LTR MaLR 1 202 -177 4 1209 2424 93 85 26 chr2 81800541 81800929 -99947158 - IAPLTR2a LTR ERVK 0 411 1 4 1209 2772 196 45 9 chr2 81805317 81805847 -99942240 + RLTR17 LTR ERVK 144 692 0 4 1209 1792 147 42 42 chr2 81810111 81810501 -99937586 + RMER16 LTR ERVK 1 519 -14 4 1209 1556 239 23 183 chr2 81825078 81825805 -99922282 - RMER19C LTR ERVK 0 611 1 4 1209 1146 231 226 8 chr2 81826619 81826977 -99921110 - RMER6C LTR ERVK -243 447 12 4 1209 769 271 35 9 chr2 81827314 81827541 -99920546 + MT2A LTR ERVL 84 316 -217 4 1209 238 260 0 14 chr2 81827660 81827734 -99920353 + MLT2B5 LTR ERVL 479 551 -4 4 1209 2370 178 24 129 chr2 81829004 81829680 -99918407 + RLTR6_Mm LTR ERV1 1 605 -49 4 1209 4355 111 55 45 chr2 81829680 81830999 -99917088 + MMVL30-int LTR ERV1 22 1468 -2230 4 1209 16581 60 20 35 chr2 81831075 81833472 -99914615 + MMVL30-int LTR ERV1 960 3698 0 4 1209 2209 108 162 121 chr2 81833472 81834033 -99914054 + RLTR6_Mm LTR ERV1 1 584 -70 4 1209 274 253 29 29 chr2 81838418 81838593 -99909494 + RMER17C LTR ERVK 69 243 -167 4 1209 396 291 95 65 chr2 81840358 81840514 -99907573 - MLT1B LTR MaLR -6 384 247 4 1209 2422 217 46 22 chr2 81840514 81840833 -99907254 + RMER15 LTR ERVL 1 322 -253 4 1209 2903 162 19 2 chr2 81840833 81841347 -99906740 + RLTR28 LTR ERVL 2 524 0 4 1209 2422 217 46 22 chr2 81841347 81841574 -99906513 + RMER15 LTR ERVL 323 560 -15 4 1209 1785 126 104 14 chr2 81842921 81843268 -99904819 - RLTR47_MM LTR ERV1 -154 378 1 5 1209 505 108 29 97 chr2 81843321 81843424 -99904663 + RMER6C LTR ERVK 1 96 -624 5 1209 728 163 32 9 chr2 81843578 81843714 -99904373 + ORR1B1 LTR MaLR 220 385 -9 5 1209 249 277 60 98 chr2 81844135 81844319 -99903768 + RLTR17 LTR ERVK 117 293 -399 5 1209 761 184 109 6 chr2 81845147 81845322 -99902765 + MTC LTR MaLR 16 208 -213 5 1209 427 355 129 53 chr2 81846082 81846493 -99901594 + MLT1F2 LTR MaLR 11 452 -108 5 1209 665 344 41 29 chr2 81847396 81847710 -99900377 - MT2A LTR ERVL -108 425 108 5 1209 468 261 36 3 chr2 81849000 81849137 -99898950 - MT2A LTR ERVL -162 313 99 5 1209 338 276 11 0 chr2 81849909 81849996 -99898091 - MT2A LTR ERVL -445 88 1 5 1209 743 267 70 31 chr2 81850060 81850419 -99897668 - ORR1D1 LTR MaLR -1 373 1 5 1209 605 268 56 67 chr2 81851379 81851559 -99896528 - MTD LTR MaLR -59 360 183 5 1209 1084 284 99 6 chr2 81853090 81853434 -99894653 + MTD LTR MaLR 7 382 -37 5 1209 325 342 108 51 chr2 81856279 81856650 -99891437 - MLT1B LTR MaLR -73 394 9 5 1209 584 239 0 0 chr2 81859300 81859409 -99888678 + MTE2b LTR MaLR 6 114 -265 5 1209 279 267 0 0 chr2 81859439 81859499 -99888588 - RLTR30 LTR ERV1 -319 60 1 5 1209 593 276 71 51 chr2 81859499 81859731 -99888356 + MTE2b LTR MaLR 139 370 0 5 1209 912 302 83 6 chr2 81862310 81862623 -99885464 - MTE2b LTR MaLR -39 340 4 5 1209 339 370 50 59 chr2 81885083 81885321 -99862766 + MLT1A0 LTR MaLR 10 245 -120 5 1209 333 397 25 10 chr2 81900643 81900839 -99847248 + MLT2C1 LTR ERVL 162 360 -37 5 1209 1578 137 20 113 chr2 81904393 81904747 -99843340 + ORR1A4 LTR MaLR 1 321 -8 6 1209 689 262 126 67 chr2 81915822 81916194 -99831893 + RMER13A LTR ERVK 14 407 -453 6 1210 429 312 53 29 chr2 81927147 81927355 -99820732 + MLT1D LTR MaLR 283 495 -10 6 1210 361 237 92 186 chr2 81929303 81929546 -99818541 - RLTR21 LTR ERVK -4 1400 1204 6 1210 361 224 170 125 chr2 81929599 81929740 -99818347 - RLTR21 LTR ERVK -324 1248 1097 6 1210 7145 132 22 24 chr2 81929840 81929864 -99818223 - RMER12B LTR ERVK -181 1223 1200 6 1210 7145 132 22 24 chr2 81929910 81931110 -99816977 - RMER12B LTR ERVK -205 1199 1 6 1210 252 330 105 59 chr2 81947287 81947377 -99800710 - MER89-int LTR ERV1 -4341 2460 2375 6 1210 252 330 105 59 chr2 81947422 81947550 -99800537 - MER89-int LTR ERV1 -4427 2374 2232 6 1210 1861 204 43 17 chr2 81980196 81980610 -99767477 - RMER6A LTR ERVK 0 756 332 7 1210 2982 42 0 0 chr2 81988733 81989090 -99758997 + IAPEY2_LTR LTR ERVK 1 357 0 7 1210 400 206 108 0 chr2 81989141 81989243 -99758844 - ORR1C2 LTR MaLR -1 383 271 7 1210 365 167 0 40 chr2 81989298 81989373 -99758714 - ORR1C2 LTR MaLR -312 72 1 7 1210 1996 173 124 95 chr2 81990772 81991443 -99756644 - RMER6C LTR ERVK 0 690 1 7 1210 586 273 20 66 chr2 81992990 81993164 -99754923 + RMER5 LTR ERV1 187 356 -178 7 1210 586 273 20 66 chr2 81993380 81993401 -99754686 + RMER5 LTR ERV1 357 373 -161 7 1210 527 322 130 20 chr2 81994529 81994776 -99753311 - MER77 LTR ERVL -22 585 312 7 1210 260 336 53 8 chr2 81997769 81997901 -99750186 - RMER15 LTR ERVL 0 575 438 7 1210 3322 131 20 11 chr2 82004965 82005511 -99742576 - RLTR31B_Mm LTR ERVK -6 551 1 9 1210 390 228 21 11 chr2 82019655 82019748 -99728339 - RMER15 LTR ERVL -453 122 29 2 1210 275 264 0 40 chr2 82020401 82020476 -99727611 - RMER15 LTR ERVL -503 72 1 2 1210 430 354 75 60 chr2 82020697 82020949 -99727138 - MLT1E1 LTR MaLR -71 583 328 2 1210 2153 150 11 17 chr2 82021049 82021409 -99726678 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 29 2 1210 2446 238 17 4 chr2 82024849 82025368 -99722719 - RLTR12B LTR ERVK -2 526 1 2 1210 585 276 241 22 chr2 82026078 82026191 -99721896 + MTD LTR MaLR 83 242 -179 2 1210 677 210 87 1 chr2 82026223 82026387 -99721700 + MTD LTR MaLR 243 421 0 2 1210 900 262 134 31 chr2 82026389 82026680 -99721407 + MTD-int LTR MaLR 3 323 -935 2 1210 1423 268 97 58 chr2 82026679 82027175 -99720912 + MTD-int LTR MaLR 520 1034 -224 2 1210 1794 161 132 6 chr2 82039367 82039716 -99708371 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 2 4 1210 1717 198 60 11 chr2 82039999 82040352 -99707735 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 9 4 1211 1290 213 145 97 chr2 82055482 82056207 -99691880 - RMER6C LTR ERVK -8 712 5 5 1211 533 360 55 12 chr2 82066438 82066691 -99681396 - MER21B LTR ERV1 -583 280 17 7 1211 500 319 33 49 chr2 82108710 82108954 -99639133 + LTR40b LTR ERVL 19 258 -204 1 1211 3303 23 2 27 chr2 82108999 82109405 -99638682 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 1211 235 308 0 0 chr2 82109422 82109487 -99638600 + LTR40b LTR ERVL 387 451 -11 1 1211 345 261 53 21 chr2 82112040 82112134 -99635953 + MLT1B LTR MaLR 210 306 -84 1 1211 453 288 0 0 chr2 82117340 82117458 -99630629 + MTD LTR MaLR 82 199 -220 1 1211 988 222 37 57 chr2 82124133 82124482 -99623605 + RLTR15 LTR ERVK 1 342 -17 1 1211 450 339 85 67 chr2 82125324 82125653 -99622434 - ORR1E LTR MaLR -17 342 8 1 1211 484 351 170 10 chr2 82125637 82125948 -99622139 - ORR1E-int LTR MaLR -30 1550 1190 1 1211 674 265 92 106 chr2 82126244 82126603 -99621484 + RMER20B LTR ERVK 64 417 -210 1 1211 2687 201 92 17 chr2 82129218 82129567 -99618520 + RMER6C LTR ERVK 1 373 -317 1 1211 2687 201 92 17 chr2 82129614 82129906 -99618181 + RMER6C LTR ERVK 374 690 0 1 1211 1946 137 14 96 chr2 82136433 82136789 -99611298 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 1 1211 709 110 0 9 chr2 82136789 82136899 -99611188 + ORR1A2-int LTR MaLR 1 109 -1854 1 1211 2000 167 153 7 chr2 82138486 82138890 -99609197 + ORR1A2-int LTR MaLR 98 560 -1403 1 1211 735 215 6 110 chr2 82138883 82139080 -99609007 + MT2B LTR ERVL 75 287 -314 1 1211 2476 98 3 72 chr2 82140034 82140420 -99607667 + RLTR10D LTR ERVK 1 359 0 1 1211 919 167 38 204 chr2 82148654 82148918 -99599169 + RMER19B LTR ERVK 1 220 -682 1 1211 2290 204 73 19 chr2 82148938 82149457 -99598630 + RMER19B LTR ERVK 349 895 -7 1 1211 502 347 51 0 chr2 82150508 82150724 -99597363 - MLT-int LTR MaLR -1426 309 83 1 1211 242 275 38 29 chr2 82150846 82150951 -99597136 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 303 2 1211 943 296 25 49 chr2 82151245 82151611 -99596476 - ORR1E LTR MaLR -2 357 1 2 1211 1628 253 29 91 chr2 82152179 82152731 -99595356 - RMER19C LTR ERVK 0 611 94 2 1211 1654 182 21 83 chr2 82166539 82166958 -99581129 + ORR1B1 LTR MaLR 1 393 -1 2 1211 1604 208 24 15 chr2 82166960 82167301 -99580786 + ORR1B1-int LTR MaLR 2 345 -1618 2 1211 633 204 7 21 chr2 82167282 82167422 -99580665 + ORR1B1-int LTR MaLR 837 974 -989 2 1211 237 239 7 0 chr2 82167600 82167658 -99580429 + ORR1A3-int LTR MaLR 963 1009 -954 2 1211 2727 15 0 0 chr2 82175479 82175805 -99572282 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK -11 326 1 2 1211 21256 11 1 0 chr2 82175805 82178161 -99569926 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 4123 2 1211 899 89 24 0 chr2 82178163 82178286 -99569801 - IAPEz-int LTR ERVK -2770 4910 4785 2 1211 1811 115 4 4 chr2 82178283 82178545 -99569542 - IAPEz-int LTR ERVK -5183 2497 2236 2 1211 442 66 0 32 chr2 82178534 82178597 -99569490 - IAPEz-int LTR ERVK -5062 1419 1359 2 1211 4499 48 99 2 chr2 82178597 82179200 -99568887 - IAPEz-int LTR ERVK -5819 662 1 2 1211 2660 16 0 0 chr2 82179201 82179519 -99568568 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK -11 326 9 2 1211 1980 147 10 0 chr2 82180741 82181047 -99567040 + RLTR27 LTR ERVK 1 309 0 2 1211 777 106 0 0 chr2 82181143 82181247 -99566840 + IAP-d-int LTR ERVK 54 157 -6385 2 151 669 341 31 36 chr2 82181857 82182432 -99565655 + MMERVK10C-int LTR ERVK 6494 7065 -516 2 1212 1614 135 4 26 chr2 82182570 82182837 -99565250 + MMERVK10C-int LTR ERVK 7321 7581 0 2 1212 1983 150 10 0 chr2 82182837 82183143 -99564944 + RLTR27 LTR ERVK 1 309 0 2 1212 3001 84 9 7 chr2 82184273 82184693 -99563394 - BGLII LTR ERVK 0 421 1 2 1212 232 294 29 115 chr2 82189068 82189091 -99558996 + MT2B LTR ERVL 143 237 -364 2 1212 1208 258 112 18 chr2 82192242 82192520 -99555567 + MTD LTR MaLR 49 355 -64 2 1212 1208 258 112 18 chr2 82192551 82192611 -99555476 + MTD LTR MaLR 356 419 0 2 1212 5449 138 57 12 chr2 82200328 82200855 -99547232 - RMER17B LTR ERVK 0 958 440 2 1212 5449 138 57 12 chr2 82200957 82201346 -99546741 - RMER17B LTR ERVK -519 439 2 2 1212 525 182 39 13 chr2 82210759 82210875 -99537212 + RMER17B LTR ERVK 301 421 -537 2 1212 525 182 39 13 chr2 82210931 82210970 -99537117 + RMER17B LTR ERVK 422 460 -498 2 1212 778 275 99 148 chr2 82214000 82214384 -99533703 - MTE2a LTR MaLR -14 365 1 2 1212 525 390 61 11 chr2 82216405 82216682 -99531405 + MTE-int LTR MaLR 1 291 -1289 2 1212 355 321 0 19 chr2 82218304 82218412 -99529675 - MT2A LTR ERVL -363 170 65 3 1212 341 318 12 0 chr2 82218341 82218426 -99529661 - MTE2a LTR MaLR -244 135 50 3 1212 231 302 117 132 chr2 82218658 82219051 -99529036 + MLT1H2 LTR MaLR 101 487 -2 3 1212 538 229 160 0 chr2 82221780 82221911 -99526176 + ORR1D2 LTR MaLR 8 159 -211 3 1212 2734 230 89 97 chr2 82221912 82222634 -99525453 + RMER19B LTR ERVK 1 720 -182 3 1212 2734 230 89 97 chr2 82222810 82222868 -99525219 + RMER19B LTR ERVK 721 764 -138 3 1212 2734 230 89 97 chr2 82223345 82223460 -99524627 + RMER19B LTR ERVK 765 889 -13 3 1212 598 201 58 41 chr2 82223515 82223686 -99524401 + ORR1D2 LTR MaLR 188 361 -9 3 1212 1372 165 8 23 chr2 82226838 82227098 -99520989 + RLTR11A LTR ERVK 273 528 0 3 1212 235 233 43 65 chr2 82227536 82227628 -99520459 + MLT2B3 LTR ERVL 1 90 -464 3 1212 597 304 56 56 chr2 82227747 82228033 -99520054 + MTEb LTR MaLR 85 370 -9 3 1212 682 334 112 9 chr2 82233931 82234278 -99513809 + MTC LTR MaLR 13 395 -26 3 1212 240 248 36 43 chr2 82234277 82234416 -99513671 + ORR1B1-int LTR MaLR 617 754 -755 3 1212 768 318 42 4 chr2 82236828 82237090 -99510997 - MER31A LTR ERV1 -37 448 177 3 1212 1381 260 25 89 chr2 82237246 82237687 -99510400 - RMER19C LTR ERVK 0 611 138 3 1212 2539 162 42 2 chr2 82237731 82238189 -99509898 - MurERV4_19-int LTR ERVK -3474 2306 1831 3 1212 1905 90 54 24 chr2 82247044 82247339 -99500748 + IAPLTR2b LTR ERVK 1 304 -23 3 1212 14728 123 38 26 chr2 82247358 82249802 -99498285 + IAPEz-int LTR ERVK 21 2665 -3816 3 1212 11579 131 13 8 chr2 82249798 82252284 -99495803 + IAPEz-int LTR ERVK 4067 6801 -20 3 1212 1966 68 53 23 chr2 82252284 82252583 -99495504 + IAPLTR2b LTR ERVK 1 308 -19 3 1212 2754 38 24 3 chr2 82253071 82253410 -99494677 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 3 1212 1204 283 59 33 chr2 82255676 82256062 -99492025 - MTD LTR MaLR -16 403 27 3 1212 1204 301 43 15 chr2 82256101 82256126 -99491961 - MTD LTR MaLR -393 26 1 3 1212 1044 326 20 20 chr2 82257916 82258260 -99489827 - MTEa LTR MaLR -27 352 9 3 1212 324 232 49 0 chr2 82261507 82261589 -99486498 + RMER19A LTR ERVK 19 104 -633 3 1212 1425 210 133 75 chr2 82261622 82262141 -99485946 + RLTR31_Mur LTR ERVK 1 549 -4 3 1212 519 296 44 13 chr2 82264204 82264453 -99483634 + MTEa LTR MaLR 99 379 0 3 1212 273 303 59 20 chr2 82272070 82272171 -99475916 + MLT1E1 LTR MaLR 534 638 -16 3 1212 3150 180 50 15 chr2 82274556 82275223 -99472864 - RMER6C LTR ERVK 0 690 1 3 1212 2733 167 29 52 chr2 82275223 82275836 -99472251 - RMER6-int LTR ERVK 0 3177 2579 3 1212 1987 214 63 63 chr2 82276998 82277582 -99470505 + RLTR31A_Mm LTR ERVK 1 584 0 4 1212 2394 173 142 22 chr2 82279072 82279579 -99468508 + RMER4B LTR ERVK 18 585 0 4 1212 4083 196 49 64 chr2 82281495 82282396 -99465691 + RMER19B LTR ERVK 1 887 -15 4 1212 989 295 91 35 chr2 82282656 82282997 -99465090 + ORR1D2 LTR MaLR 11 370 0 4 1212 253 304 14 28 chr2 82291963 82292034 -99456053 - MTEa LTR MaLR -54 325 256 4 1212 640 323 5 41 chr2 82292140 82292337 -99455750 - MTEa LTR MaLR -189 190 1 4 1212 3369 25 8 0 chr2 82294277 82294670 -99453417 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 1212 2773 55 0 17 chr2 82299521 82299873 -99448214 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 4 1212 1842 175 169 57 chr2 82305666 82306174 -99441913 + RMER16-int LTR ERVK 255 819 -4587 4 1212 654 183 25 0 chr2 82306179 82306299 -99441788 + RMER16-int LTR ERVK 938 1060 -5077 4 1212 1093 250 55 27 chr2 82306312 82306604 -99441483 + ETnERV2-int LTR ERVK 2454 2753 -4653 4 1212 10202 135 42 6 chr2 82306632 82307297 -99440790 + ETnERV2-int LTR ERVK 2935 3628 -3778 4 1212 10202 135 42 6 chr2 82307908 82308926 -99439161 + ETnERV2-int LTR ERVK 3629 4678 -2728 4 1212 3197 64 0 0 chr2 82308924 82309331 -99438756 + ETnERV2-int LTR ERVK 5356 5762 -1644 4 1212 2627 192 111 68 chr2 82309319 82310228 -99437859 + RLTR45-int LTR ERVK 4672 5619 -1625 4 1213 740 312 70 6 chr2 82313993 82314338 -99433749 - ORR1D2 LTR MaLR -1 369 3 4 1213 2657 159 37 37 chr2 82314523 82315084 -99433003 - RLTR31_Mm LTR ERVK 0 561 1 4 1213 2766 32 108 3 chr2 82319989 82320361 -99427726 - IAPLTR2a LTR ERVK 0 411 1 4 1213 2844 16 0 0 chr2 82322780 82323102 -99424985 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 322 0 4 1213 838 206 34 14 chr2 82324014 82324210 -99423877 - RMER6A LTR ERVK -164 592 393 4 1213 3225 120 19 11 chr2 82324210 82324724 -99423363 - RLTR13D2 LTR ERVK 0 1023 433 4 1213 2582 221 88 62 chr2 82324876 82325168 -99422919 - RLTR13D2 LTR ERVK -551 432 1 4 1213 506 191 8 127 chr2 82325531 82325635 -99422452 - MT2B LTR ERVL -383 218 154 4 1213 439 232 63 0 chr2 82325616 82325711 -99422376 - RMER6D LTR ERVK -619 101 1 4 1213 2873 184 42 37 chr2 82328022 82328155 -99419932 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -1703 623 481 4 1213 2873 185 41 36 chr2 82328637 82329137 -99418950 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -1846 480 1 4 1213 859 329 93 12 chr2 82337464 82337796 -99410291 - MTE-int LTR MaLR -196 1384 1026 4 1213 512 376 48 35 chr2 82351752 82352152 -99395935 - MTE-int LTR MaLR -1082 498 94 4 1213 251 252 55 94 chr2 82362021 82362148 -99385939 - MT2B LTR ERVL -337 264 143 5 1213 367 290 99 52 chr2 82363254 82363487 -99384600 + MLT2B4 LTR ERVL 54 297 -259 5 1213 273 246 0 10 chr2 82363698 82363771 -99384316 - MLT1A LTR MaLR -17 373 305 5 1213 2911 143 131 61 chr2 82387909 82388228 -99359859 + RMER17A LTR ERVK 1 349 -402 5 1213 2911 143 131 61 chr2 82388405 82388787 -99359300 + RMER17A LTR ERVK 350 750 -1 5 1213 372 317 143 34 chr2 82399278 82399572 -99348515 + MLT2D LTR ERVL 1 326 -88 5 1213 336 290 56 9 chr2 82402199 82402307 -99345780 - MLT1D LTR MaLR -89 416 304 5 1213 571 279 129 47 chr2 82412399 82412655 -99335432 + RMER15 LTR ERVL 274 550 -25 5 1213 498 364 45 16 chr2 82416343 82416653 -99331434 + MLT1C LTR MaLR 3 321 -146 5 1213 648 238 43 153 chr2 82427369 82427718 -99320369 + RLTR9E LTR ERVK 15 409 0 6 1213 1130 300 106 15 chr2 82434413 82434877 -99313210 - RMER15 LTR ERVL -14 561 56 6 1213 234 286 150 9 chr2 82435197 82435310 -99312777 + MER67C LTR ERV1 81 209 -502 6 1213 4212 193 113 13 chr2 82436810 82436964 -99311123 - RLTR25B LTR ERVK 0 1028 815 6 1213 4212 193 113 13 chr2 82437037 82437804 -99310283 - RLTR25B LTR ERVK -214 814 17 6 1213 659 201 41 52 chr2 82439655 82439803 -99308284 + RMER19C LTR ERVK 3 155 -456 6 1213 659 201 41 52 chr2 82439831 82439876 -99308211 + RMER19C LTR ERVK 156 194 -417 6 1213 1157 265 123 57 chr2 82439932 82440488 -99307599 + RMER19C LTR ERVK 110 736 -1 6 1214 339 292 64 28 chr2 82449853 82449994 -99298093 - RMER12 LTR ERVK -467 855 710 6 1214 548 277 49 147 chr2 82450578 82451090 -99296997 + RLTR4_MM-int LTR ERV1 1966 2427 -5129 6 1214 1754 306 77 62 chr2 82451260 82452743 -99295344 + MuRRS4-int LTR ERV1 2860 5701 -2077 6 1214 961 309 22 30 chr2 82452984 82453416 -99294671 + MuRRS4-int LTR ERV1 7088 7703 -75 6 1214 790 151 212 0 chr2 82453502 82453681 -99294406 + RLTR47_MM LTR ERV1 1 217 -315 6 1214 1472 185 50 42 chr2 82463687 82463846 -99284241 + RMER6C LTR ERVK 308 465 -225 6 1214 1472 185 50 42 chr2 82464144 82464362 -99283725 + RMER6C LTR ERVK 466 687 -3 6 1214 506 321 74 16 chr2 82478960 82479204 -99268883 + MLT2D LTR ERVL 59 316 -98 6 1214 424 263 0 0 chr2 82485935 82486030 -99262057 - MTE2b LTR MaLR -272 107 13 6 1214 526 361 34 42 chr2 82493411 82493674 -99254413 - MTEa LTR MaLR -118 261 1 7 1214 399 216 10 40 chr2 82499886 82499987 -99248100 - MTE2a LTR MaLR 0 379 282 7 1214 2765 50 12 0 chr2 82505722 82506064 -99242023 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 1 1214 1226 253 133 21 chr2 82513404 82513780 -99234307 - MTD LTR MaLR -1 418 1 2 1214 2843 33 0 3 chr2 82513935 82514273 -99233814 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 337 0 2 1214 31128 24 23 10 chr2 82514273 82517948 -99230139 + IAPEz-int LTR ERVK 8 3729 -2752 2 1214 14394 25 1 3 chr2 82517934 82519592 -99228495 + IAPEz-int LTR ERVK 4827 6481 0 2 1214 2845 33 0 3 chr2 82519592 82519930 -99228157 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 337 0 2 1214 5846 60 5 0 chr2 82526152 82526901 -99221186 - RLTR13B1 LTR ERVK 0 893 141 3 1214 1030 222 111 48 chr2 82542641 82542911 -99205176 - RLTR28B LTR ERVL -89 392 106 6 1214 490 353 116 16 chr2 82548446 82548809 -99199278 - MLT1A1 LTR MaLR -3 405 7 6 1214 689 215 139 10 chr2 82550092 82550114 -99197973 + RMER6C LTR ERVK 331 352 -368 7 1214 1775 139 77 0 chr2 82550294 82550605 -99197482 + RMER6C LTR ERVK 353 690 0 7 1214 266 346 62 62 chr2 82556655 82556911 -99191176 - RMER5 LTR ERV1 0 534 279 8 1214 574 259 146 17 chr2 82557887 82558127 -99189960 - RMER5 LTR ERV1 -259 275 5 8 1214 4373 18 2 0 chr2 82562136 82562628 -99185459 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 9 1214 314 0 0 0 chr2 82562628 82562666 -99185421 - MERVL-int LTR ERVL 0 5485 5448 9 1214 392 167 46 35 chr2 82562666 82562753 -99185334 - ORR1A3-int LTR MaLR -1323 640 553 9 1214 47493 18 0 1 chr2 82562753 82568117 -99179970 - MERVL-int LTR ERVL -125 5360 1 9 1214 4373 18 2 0 chr2 82568117 82568609 -99179478 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 9 1214 249 332 71 49 chr2 82569201 82569426 -99178661 + MLT1C LTR MaLR 45 274 -193 9 1215 769 234 85 9 chr2 82575854 82576065 -99172022 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 148 1 1215 338 283 98 164 chr2 82577413 82577700 -99170387 - ORR1E LTR MaLR 0 359 92 1 1215 425 315 55 18 chr2 82581008 82581173 -99166914 - MTD LTR MaLR -248 171 1 1 1215 2350 142 32 52 chr2 82584823 82585262 -99162825 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 1 1 1215 1596 208 82 6 chr2 82597972 82598301 -99149786 + ORR1B2 LTR MaLR 1 354 -13 1 1215 372 283 84 110 chr2 82599783 82599823 -99148264 - RMER10A LTR ERVL -6 436 398 1 1215 372 283 84 110 chr2 82600201 82600588 -99147499 - RMER10A LTR ERVL -45 397 20 1 1215 2234 191 17 0 chr2 82612579 82612993 -99135094 + MTC LTR MaLR 1 421 0 1 1215 4389 209 103 29 chr2 82613017 82613923 -99134164 + MTC-int LTR MaLR 2 946 -312 1 1215 4389 209 103 29 chr2 82613943 82614206 -99133881 + MTC-int LTR MaLR 947 1258 0 1 1215 1679 240 28 5 chr2 82614206 82614604 -99133483 + MTC LTR MaLR 1 407 0 1 1215 1410 292 50 0 chr2 82617169 82617532 -99130555 - MTD LTR MaLR 0 419 39 1 1215 562 251 58 12 chr2 82617691 82617864 -99130223 - MTC-int LTR MaLR -2 1256 1076 1 1215 869 298 112 12 chr2 82617990 82618010 -99130077 - MTC-int LTR MaLR -225 1033 1016 1 1215 869 298 112 12 chr2 82618073 82618375 -99129712 - MTC-int LTR MaLR -243 1015 679 1 1215 635 278 16 21 chr2 82618384 82618575 -99129512 - MTC-int LTR MaLR -1067 191 2 1 1215 652 218 5 201 chr2 82618639 82618863 -99129224 + ORR1D1 LTR MaLR 2 181 -193 1 1215 439 333 214 14 chr2 82623232 82623521 -99124566 + ORR1E LTR MaLR 1 347 -23 1 1215 235 260 111 30 chr2 82623534 82623633 -99124454 + RLTR40 LTR ERVK 1 107 -710 1 1215 1707 266 63 91 chr2 82629796 82630529 -99117558 + RLTR40 LTR ERVK 93 804 -13 1 1215 1300 267 82 22 chr2 82630914 82631281 -99116806 + MTD LTR MaLR 13 401 -18 1 1215 1926 206 114 2 chr2 82631288 82631761 -99116326 - RLTR11A LTR ERVK -2 526 1 1 1215 227 315 76 33 chr2 82633604 82633696 -99114391 + MLT1A LTR MaLR 242 337 -37 1 1215 621 327 79 45 chr2 82633709 82634039 -99114048 + MLT-int LTR MaLR 305 645 -1090 1 1215 981 226 43 201 chr2 82635899 82636342 -99111745 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 2 1 1215 3806 198 81 58 chr2 82641146 82642021 -99106066 + RMER19B LTR ERVK 8 902 0 2 1215 5875 174 55 53 chr2 82653954 82655239 -99092848 + RLTR21 LTR ERVK 1 1287 -285 2 1215 1906 185 27 162 chr2 82655218 82655511 -99092576 + RLTR21 LTR ERVK 1065 1295 -277 2 1215 1906 185 27 162 chr2 82655566 82655859 -99092228 + RLTR21 LTR ERVK 1296 1571 -1 2 1215 408 258 203 10 chr2 82660356 82660548 -99087539 + MER76 LTR ERVL 1 229 -462 2 1215 304 264 97 122 chr2 82660570 82660807 -99087280 - RMER2 LTR ERV1 -28 539 309 2 1215 1007 329 55 51 chr2 82661194 82661627 -99086460 + MER76 LTR ERVL 255 689 -2 2 1215 727 267 80 40 chr2 82662505 82662755 -99085332 - RLTR40 LTR ERVK -13 804 545 2 1215 1518 224 148 24 chr2 82663433 82663932 -99084155 - RLTR40 LTR ERVK -252 565 5 2 1215 418 349 6 26 chr2 82685596 82685752 -99062335 + MTEb LTR MaLR 227 379 0 2 1215 2738 106 48 59 chr2 82686207 82686647 -99061440 + RLTR9B LTR ERVK 3 437 0 2 1215 665 319 55 84 chr2 82686989 82687356 -99060731 + MTE2a LTR MaLR 1 356 -23 2 1215 1913 139 133 21 chr2 82690348 82690775 -99057312 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 2 1215 362 338 49 89 chr2 82691223 82691266 -99056821 - RLTR25B LTR ERVK -716 312 269 2 1215 1751 105 27 66 chr2 82691266 82691601 -99056486 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 2 1215 362 338 49 89 chr2 82691601 82691882 -99056205 - RLTR25B LTR ERVK -760 268 1 2 1215 2036 119 3 78 chr2 82694752 82695097 -99052990 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 2 1215 236 262 11 87 chr2 82696583 82696675 -99051412 - LTR68 LTR ERV1 -118 622 538 2 1215 2060 159 7 97 chr2 82697955 82698379 -99049708 + ORR1B1 LTR MaLR 1 386 -8 2 1215 1214 300 83 13 chr2 82699711 82700180 -99047907 - RMER5 LTR ERV1 -32 502 1 2 1216 3691 31 83 0 chr2 82707487 82707932 -99040155 - LTRIS_Mm LTR ERV1 0 482 1 2 1216 6016 87 4 16 chr2 82707932 82708628 -99039459 - MuRRS-int LTR ERV1 0 4690 4000 2 1216 6016 106 3 18 chr2 82708670 82708829 -99039258 - MuRRS-int LTR ERV1 -691 3999 3875 2 1216 1256 74 0 6 chr2 82714884 82715047 -99033040 - MuRRS-int LTR ERV1 -862 3828 3667 2 1216 3401 28 2 0 chr2 82716362 82716757 -99031330 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 1216 276 376 101 34 chr2 82718049 82718370 -99029717 - MLT2B2 LTR ERVL -188 332 2 2 1216 610 221 35 21 chr2 82719542 82719685 -99028402 - MTD LTR MaLR -2 417 273 2 1216 770 250 91 29 chr2 82719696 82719906 -99028181 - MTD LTR MaLR -191 228 6 2 1216 782 266 97 9 chr2 82732786 82733014 -99015073 + ORR1D2 LTR MaLR 121 368 -2 3 1216 1418 251 96 48 chr2 82736781 82737280 -99010807 + RMER5 LTR ERV1 10 532 -2 3 1216 798 286 71 94 chr2 82737571 82737996 -99010091 + MLT1C LTR MaLR 53 467 0 3 1216 843 263 74 31 chr2 82738671 82738997 -99009090 + RLTR15 LTR ERVK 1 340 -19 3 1216 3066 20 0 0 chr2 82739640 82739986 -99008101 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 3 1216 4454 185 30 22 chr2 82748095 82748986 -98999101 + RMER13B LTR ERVK 11 908 0 3 1216 3981 157 53 15 chr2 82749557 82750269 -98997818 + RMER13B LTR ERVK 34 772 -136 3 1216 5924 63 25 10 chr2 82750254 82751043 -98997044 + RLTR13C2 LTR ERVK 8 808 0 3 1216 509 268 25 56 chr2 82751043 82751205 -98996882 + RMER13B LTR ERVK 752 908 0 3 1216 4067 57 6 2 chr2 82752436 82752946 -98995141 - RLTR1B LTR ERV1 0 512 1 3 1216 4581 176 52 29 chr2 82753692 82754580 -98993507 - RMER13B LTR ERVK 0 908 1 3 1216 1051 304 94 64 chr2 82754792 82755429 -98992658 + RMER13A LTR ERVK 2 657 -203 3 1216 398 164 0 0 chr2 82755573 82755634 -98992453 + ORR1D2 LTR MaLR 26 86 -292 3 1216 547 59 0 0 chr2 82755637 82755705 -98992382 - ORR1A3 LTR MaLR -8 318 251 3 1216 2106 260 89 46 chr2 82755701 82756374 -98991713 + ORR1C1-int LTR MaLR 282 983 -387 3 1216 1766 203 52 8 chr2 82763064 82763447 -98984640 + ORR1C1-int LTR MaLR 1110 1509 0 3 1216 1832 195 7 76 chr2 82763447 82763853 -98984234 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 3 1216 865 241 132 30 chr2 82765686 82765921 -98982166 + ORR1D2 LTR MaLR 111 369 -1 3 1216 341 280 24 16 chr2 82766106 82766233 -98981854 - LTR80A LTR ERVL 0 583 456 3 1216 1480 277 22 24 chr2 82780491 82780902 -98967185 - MTD LTR MaLR -4 415 6 3 1216 1591 256 102 29 chr2 82787263 82787745 -98960342 - RMER5 LTR ERV1 -2 532 16 3 1216 1231 269 26 77 chr2 82793565 82793955 -98954132 - MTEa LTR MaLR -2 377 8 3 1216 400 328 6 160 chr2 82835631 82835943 -98912144 + RMER15 LTR ERVL 300 563 -12 4 1217 893 277 75 67 chr2 82849347 82849720 -98898367 - MTD LTR MaLR 0 419 8 4 1217 234 343 40 10 chr2 82849882 82849982 -98898105 + MTE2a LTR MaLR 36 138 -241 4 1217 492 267 55 55 chr2 82849969 82850151 -98897936 + MT2A LTR ERVL 141 322 -211 4 1217 2005 201 48 33 chr2 82851719 82852238 -98895849 - RLTR11A2 LTR ERVK 0 527 1 4 1217 307 289 95 17 chr2 82866130 82866246 -98881841 + MLT1A0 LTR MaLR 17 141 -224 4 1217 245 400 89 15 chr2 82874805 82875008 -98873079 + MLT1F2 LTR MaLR 29 246 -314 4 1217 1105 289 28 58 chr2 82875008 82875424 -98872663 + MTE2b LTR MaLR 1 369 -10 4 1217 3117 316 38 80 chr2 82875434 82876830 -98871257 + MTE2b-int LTR MaLR 2 1338 -242 4 1217 588 274 47 24 chr2 82893156 82893359 -98854728 - ORR1C2 LTR MaLR -49 335 85 4 1217 292 267 182 44 chr2 82894398 82894535 -98853552 + MTEa LTR MaLR 211 366 -13 4 1217 338 345 32 43 chr2 82895764 82895952 -98852135 + MTE-int LTR MaLR 1 186 -1394 4 1217 253 315 410 43 chr2 82900576 82900827 -98847260 - MLT1A0 LTR MaLR -11 397 55 4 1217 313 318 53 15 chr2 82906719 82906850 -98841237 + ORR1E LTR MaLR 222 357 -2 5 1217 336 250 83 46 chr2 82908881 82908990 -98839097 + RLTR9E LTR ERVK 291 403 -6 5 1217 345 318 71 0 chr2 82909941 82910094 -98837993 - MTE2a LTR MaLR -211 168 2 5 1217 325 266 25 0 chr2 82910101 82910180 -98837907 - MLT1A LTR MaLR -271 103 23 5 1217 231 254 29 29 chr2 82910487 82910556 -98837531 + ORR1D2 LTR MaLR 72 140 -230 5 1217 327 292 142 70 chr2 82921810 82922141 -98825946 + ORR1E LTR MaLR 1 355 -4 5 1217 233 293 137 8 chr2 82925648 82925772 -98822315 + MLT1D LTR MaLR 363 502 -3 5 1217 2534 209 44 43 chr2 82928383 82928993 -98819094 + RMER19C LTR ERVK 1 611 0 5 1217 438 306 115 67 chr2 82944814 82945021 -98803066 - MLT2B1 LTR ERVL -2 552 8 5 1217 461 341 7 66 chr2 82945021 82945278 -98802809 - MTEa LTR MaLR -131 248 8 5 1217 457 232 0 10 chr2 82948463 82948559 -98799528 + MTC LTR MaLR 1 95 -326 5 1217 2997 73 89 2 chr2 82958194 82958631 -98789456 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 5 1217 6813 59 69 5 chr2 82958633 82959642 -98788445 - IAPEz-int LTR ERVK -2 6479 5406 5 1217 18333 44 28 44 chr2 82959634 82962331 -98785756 - IAPEz-int LTR ERVK -3919 2562 9 5 1217 2916 68 110 2 chr2 82962332 82962761 -98785326 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 5 1217 1237 281 55 14 chr2 82967710 82968057 -98780030 + MTE2a LTR MaLR 19 379 0 5 1218 294 247 0 80 chr2 82968691 82968779 -98779308 + LTR48 LTR ERV1 3 83 -704 5 1218 737 282 41 116 chr2 82995831 82996206 -98751881 + MTE2a LTR MaLR 60 418 -1 6 1218 2262 131 3 3 chr2 83000718 83001064 -98747023 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 1 1218 659 110 0 35 chr2 83002374 83002487 -98745600 + RMER17A2 LTR ERVK 1 109 -797 7 1218 1651 76 21 12 chr2 83003543 83003784 -98744303 - MTA_Mm LTR MaLR -57 339 97 1 1218 1214 257 15 105 chr2 83005429 83005820 -98742267 - MTE2a LTR MaLR 0 379 24 1 1218 1141 277 79 5 chr2 83006924 83007268 -98740819 - MTD LTR MaLR -20 399 37 1 1218 259 305 11 89 chr2 83007927 83008017 -98740070 + MT2B2 LTR ERVL 162 244 -340 1 1218 2267 200 3 168 chr2 83010430 83011162 -98736925 - RMER19C LTR ERVK 0 611 1 2 1218 1110 225 168 6 chr2 83012862 83013016 -98735071 + ORR1D1 LTR MaLR 1 176 -198 2 1218 1110 225 168 6 chr2 83013070 83013237 -98734850 + ORR1D1 LTR MaLR 177 373 -1 2 1218 1144 239 119 61 chr2 83017967 83018342 -98729745 + RMER19B LTR ERVK 138 664 -238 3 1218 1001 286 29 40 chr2 83021612 83021975 -98726112 + ORR1E LTR MaLR 1 379 0 3 1218 1141 285 34 25 chr2 83021976 83022303 -98725784 + ORR1E-int LTR MaLR 2 331 -1039 3 1218 287 200 0 26 chr2 83022295 83022372 -98725715 + ORR1E-int LTR MaLR 1124 1198 -172 3 1218 478 288 88 6 chr2 83022442 83022613 -98725474 + ORR1E-int LTR MaLR 1351 1535 -45 3 1218 1799 139 17 77 chr2 83022617 83022967 -98725120 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 3 1218 814 310 19 85 chr2 83022971 83023288 -98724799 + ORR1E LTR MaLR 12 307 -52 3 1218 1108 219 40 152 chr2 83024299 83024720 -98723367 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 4 1218 4430 12 2 0 chr2 83025342 83025834 -98722253 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 4 1218 302 0 0 0 chr2 83025834 83025872 -98722215 - MERVL-int LTR ERVL 0 5485 5448 4 1218 390 167 46 35 chr2 83025872 83025959 -98722128 - ORR1D1-int LTR MaLR -1323 640 553 4 1218 38710 16 14 0 chr2 83025959 83031246 -98716841 - MERVL-int LTR ERVL -125 5360 1 4 1218 4414 14 2 0 chr2 83031246 83031738 -98716349 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 4 1218 276 331 91 32 chr2 83043550 83043737 -98704350 - LTR86A1 LTR ERVL -315 198 1 4 1218 1208 261 42 3 chr2 83044704 83045011 -98703076 - ORR1A2 LTR MaLR -55 319 1 5 1218 1028 206 90 112 chr2 83045348 83045616 -98702471 + ORR1B1 LTR MaLR 41 302 -92 5 1218 540 247 11 107 chr2 83045702 83045851 -98702236 - MT2B LTR ERVL -342 259 128 5 1218 3176 130 67 4 chr2 83045813 83046339 -98701748 - ORR1A2-int LTR MaLR -1403 560 2 5 1218 1759 158 55 6 chr2 83046340 83046652 -98701435 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 5 1218 283 29 0 0 chr2 83046656 83046691 -98701396 + MT2B LTR ERVL 497 531 -70 5 1218 576 213 9 1 chr2 83046685 83046794 -98701293 + ORR1A4-int LTR MaLR 893 990 -973 5 1218 4652 189 58 35 chr2 83047804 83048788 -98699299 + ORR1A4-int LTR MaLR 957 1963 0 5 1218 1607 171 3 123 chr2 83048788 83049162 -98698925 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 5 1218 409 374 118 41 chr2 83052858 83053298 -98694789 - MER77 LTR ERVL -8 599 126 6 1218 865 209 84 66 chr2 83059243 83059469 -98688618 + RLTR20A2 LTR ERVK 1 230 -348 7 1218 762 216 6 53 chr2 83059479 83059650 -98688437 + RLTR20A2 LTR ERVK 416 578 0 7 1218 2513 176 64 10 chr2 83059887 83060388 -98687699 + RLTR11A LTR ERVK 1 528 0 7 1218 2009 236 102 105 chr2 83065386 83066375 -98681712 - RMER13B LTR ERVK -4 904 1 8 1218 263 269 0 0 chr2 83066816 83066868 -98681219 + MTEa LTR MaLR 1 52 -327 8 1218 630 310 89 14 chr2 83066920 83067133 -98680954 + MTEa LTR MaLR 149 377 -2 8 1218 1859 137 34 6 chr2 83072497 83072821 -98675266 - IAPEY_LTR LTR ERVK 0 385 53 8 1218 1181 198 16 0 chr2 83075105 83075347 -98672740 + ETnERV3-int LTR ERVK 5539 5784 -24 8 1218 575 252 47 16 chr2 83089981 83090110 -98657977 + ETnERV2-int LTR ERVK 7070 7202 -204 1 1218 5110 89 43 8 chr2 83091038 83091805 -98656282 + RLTR22_Mus LTR ERVK 1 794 -1014 1 1218 365 311 44 70 chr2 83091845 83092073 -98656014 + RMER12 LTR ERVK 1101 1322 0 1 1218 289 196 106 75 chr2 83093585 83093679 -98654408 - MT2B LTR ERVL -337 264 168 1 1218 1466 156 38 90 chr2 83097867 83098331 -98649756 - RMER17C LTR ERVK -519 439 16 1 152 1465 186 129 57 chr2 83099563 83099967 -98648120 - RMER10A LTR ERVL 0 442 10 1 1219 1088 273 19 121 chr2 83101457 83101861 -98646226 - MTE2a LTR MaLR 0 379 17 1 1219 951 172 31 118 chr2 83111519 83111761 -98636326 + ORR1D1 LTR MaLR 149 372 -2 1 1219 1495 184 60 13 chr2 83113028 83113330 -98634757 - MTC LTR MaLR -2 419 104 1 1219 554 256 6 67 chr2 83114748 83114805 -98633282 - MTC LTR MaLR -261 135 89 1 1219 554 184 0 0 chr2 83115689 83115775 -98632312 - MTC LTR MaLR -332 89 4 1 1219 1333 181 176 25 chr2 83117144 83117467 -98630620 - ORR1D1 LTR MaLR -2 372 1 1 1219 332 206 16 0 chr2 83118649 83118712 -98629375 + ORR1C1 LTR MaLR 1 64 -314 1 1219 230 262 22 56 chr2 83129091 83129180 -98618907 - RMER17D LTR ERVK -561 328 243 1 1219 315 229 189 16 chr2 83131293 83131484 -98616603 - RLTR21 LTR ERVK -265 1307 1084 1 1219 1554 157 92 0 chr2 83131490 83131783 -98616304 - IAPEY3_LTR LTR ERVK -12 320 1 1 1219 1073 205 128 36 chr2 83132597 83132901 -98615186 + IAPEY3_LTR LTR ERVK 1 332 0 1 1219 1220 113 80 54 chr2 83138773 83138826 -98609261 + RMER17A2 LTR ERVK 395 444 -462 1 1219 1220 113 80 54 chr2 83138896 83139066 -98609021 + RMER17A2 LTR ERVK 445 624 -282 1 1219 1093 233 125 31 chr2 83141609 83141936 -98606151 + MTE2a LTR MaLR 1 358 -21 1 1219 297 241 101 0 chr2 83142285 83142364 -98605723 - MTEa LTR MaLR 0 379 293 1 1219 267 368 56 25 chr2 83147458 83147656 -98600431 - LTR16B1 LTR ERVL -14 466 263 1 1219 1747 202 16 16 chr2 83150025 83150392 -98597695 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 1 1219 1353 158 65 23 chr2 83154640 83154950 -98593137 - RMER6C LTR ERVK -45 645 323 2 1219 1945 111 52 31 chr2 83156013 83156338 -98591749 - RMER6C LTR ERVK -358 332 1 2 1219 288 332 106 25 chr2 83157843 83158041 -98590046 + LTR53 LTR ERVL 282 495 -24 2 1219 2699 164 61 61 chr2 83161948 83162637 -98585450 + RMER6C LTR ERVK 2 690 0 2 1219 241 151 0 70 chr2 83172540 83172597 -98575490 - RMER12B LTR ERVK -178 1226 1174 2 1219 364 253 0 0 chr2 83177572 83177651 -98570436 + MLT2B4 LTR ERVL 266 344 -212 2 1219 277 312 39 0 chr2 83177657 83177785 -98570302 + ERVL-B4-int LTR ERVL 715 847 -4867 2 1219 1301 232 116 19 chr2 83178108 83178357 -98569730 - MTD LTR MaLR -2 417 144 2 1219 1301 232 116 19 chr2 83178424 83178552 -98569535 - MTD LTR MaLR -276 143 5 2 1219 400 380 29 11 chr2 83178889 83179163 -98568924 + ERVL-B4-int LTR ERVL 1339 1617 -4097 2 1219 350 306 127 89 chr2 83182280 83182674 -98565413 + MLT1G1 LTR MaLR 7 415 -164 2 1219 600 330 39 28 chr2 83183132 83183490 -98564597 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 4 2 1219 397 272 0 0 chr2 83187727 83187808 -98560279 - MTE2b LTR MaLR -298 81 1 2 1219 2067 113 0 40 chr2 83189226 83189548 -98558539 + ORR1A3 LTR MaLR 1 309 -17 2 1219 2145 173 65 53 chr2 83189518 83190163 -98557924 + ORR1A3-int LTR MaLR 183 837 -672 2 1219 360 177 10 50 chr2 83190163 83190264 -98557823 + RMER17B LTR ERVK 361 457 -501 2 1219 253 83 0 0 chr2 83190515 83190551 -98557536 + ORR1A3-int LTR MaLR 1029 1064 -899 2 1219 861 214 90 14 chr2 83195870 83196160 -98551927 - ORR1D1 LTR MaLR -3 381 31 2 1219 338 331 53 40 chr2 83197192 83197343 -98550744 - MLT1A0 LTR MaLR -127 238 86 2 1219 265 262 125 0 chr2 83223657 83223737 -98524350 + MLT1E1A LTR MaLR 3 92 -588 2 1219 343 192 55 0 chr2 83227055 83227128 -98520959 - RLTR21 LTR ERVK -155 1417 1341 2 1219 1642 266 96 107 chr2 83227192 83228150 -98519937 - RLTR22_Mur LTR ERVK -276 1046 1 3 1220 304 250 15 0 chr2 83231225 83231293 -98516794 - ORR1D2 LTR MaLR -301 69 1 3 1220 661 223 86 99 chr2 83242594 83243054 -98505033 - RLTR25B LTR ERVK 0 1028 442 3 1220 1839 167 95 73 chr2 83242858 83243310 -98504777 - ORR1A3-int LTR MaLR -999 964 503 3 1220 1116 156 16 10 chr2 83243236 83243430 -98504657 - RLTR25A LTR ERVK -579 524 330 3 1220 1641 224 21 12 chr2 83245084 83245414 -98502673 - RLTR25A LTR ERVK -770 333 1 3 1220 295 270 67 0 chr2 83247443 83247532 -98500555 + MER34 LTR ERV1 383 477 -65 3 1220 2563 220 3 95 chr2 83248689 83249362 -98498725 - RMER19C LTR ERVK 0 611 1 3 1220 467 277 30 15 chr2 83249862 83249994 -98498093 + MTEa LTR MaLR 3 136 -243 3 1220 334 323 124 26 chr2 83249994 83250056 -98498031 + MT2A LTR ERVL 3 215 -318 3 1220 798 307 84 20 chr2 83251596 83251942 -98496145 + MER67C LTR ERV1 35 402 -309 3 1220 283 326 82 14 chr2 83262727 83262873 -98485214 + MER21B LTR ERV1 111 266 -597 3 1220 781 367 51 24 chr2 83262947 83263318 -98484769 + MER21B LTR ERV1 435 815 -48 3 1220 1964 254 85 46 chr2 83265249 83265721 -98482366 + RLTR40 LTR ERVK 1 499 -318 3 1220 1964 254 85 46 chr2 83265759 83265879 -98482208 + RLTR40 LTR ERVK 500 619 -198 3 1220 1964 254 85 46 chr2 83265925 83266107 -98481980 + RLTR40 LTR ERVK 620 805 -12 3 1220 648 276 75 31 chr2 83269346 83269574 -98478513 + MLT1B LTR MaLR 147 384 -6 3 1220 1979 211 27 12 chr2 83277406 83277814 -98470273 + MTD LTR MaLR 1 414 -5 3 1220 3524 25 0 0 chr2 83285129 83285525 -98462562 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 1220 3695 163 30 32 chr2 83287292 83287982 -98460105 + RLTR17 LTR ERVK 4 692 0 3 1220 527 361 25 71 chr2 83289956 83290236 -98457851 + MLT1A0 LTR MaLR 99 365 0 3 1220 1081 234 74 14 chr2 83291088 83291452 -98456635 - RLTR31A_Mm LTR ERVK -167 417 32 3 1220 553 153 56 4 chr2 83291483 83291623 -98456464 - RLTR31A_Mm LTR ERVK -410 151 6 3 1220 3020 58 153 0 chr2 83304886 83305298 -98442789 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 475 0 3 1220 464 293 50 127 chr2 83306418 83306628 -98441459 + MTE2b LTR MaLR 152 343 -16 3 1220 1376 268 31 55 chr2 83321804 83322187 -98425900 - MTEb LTR MaLR -5 374 1 3 1220 1225 260 25 25 chr2 83324993 83325348 -98422739 - ORR1E LTR MaLR 0 359 5 4 1220 444 307 131 35 chr2 83325590 83325850 -98422237 + MTEa LTR MaLR 1 285 -94 4 1220 605 306 13 34 chr2 83325780 83326017 -98422070 + MT2A LTR ERVL 227 458 -75 4 1220 1157 270 37 66 chr2 83326087 83326436 -98421651 - MTE2b LTR MaLR -40 339 1 4 1220 261 303 13 0 chr2 83326984 83327060 -98421027 + MER68-int LTR ERVL 2870 2946 -44 4 1220 1133 269 22 60 chr2 83332402 83332718 -98415369 - ORR1E LTR MaLR -49 310 7 4 1220 245 311 78 0 chr2 83338809 83338912 -98409175 - MLT1H1 LTR MaLR -2 558 448 4 1220 306 298 95 41 chr2 83339019 83339166 -98408921 - MLT1H1 LTR MaLR -291 264 110 4 1220 357 200 0 167 chr2 83339422 83339542 -98408545 + MT2B LTR ERVL 165 264 -337 4 1220 378 338 59 0 chr2 83340219 83340355 -98407732 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 222 4 1220 426 304 18 71 chr2 83340378 83340458 -98407629 - MLT1A0 LTR MaLR -202 163 91 4 1220 1080 302 13 11 chr2 83340458 83340833 -98407254 + MTEa LTR MaLR 4 379 0 4 1220 426 304 18 71 chr2 83340833 83340922 -98407165 - MLT1A0 LTR MaLR -275 90 3 4 1220 3071 150 142 7 chr2 83346193 83346777 -98401310 + RMER6D LTR ERVK 58 720 0 4 1220 574 184 26 29 chr2 83346780 83346919 -98401168 - MTD LTR MaLR -279 140 3 4 1220 4940 149 105 71 chr2 83349510 83350262 -98397825 + RLTR25A LTR ERVK 1 808 -295 4 1220 4940 149 105 71 chr2 83351158 83351472 -98396615 + RLTR25A LTR ERVK 809 1103 0 4 1220 855 220 71 5 chr2 83357450 83357660 -98390427 - ORR1D1 LTR MaLR -128 246 23 4 1220 1725 172 99 9 chr2 83357660 83358005 -98390082 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 3 4 1221 1870 196 52 3 chr2 83366194 83366558 -98381529 - MTC LTR MaLR 0 421 40 4 1221 507 304 117 7 chr2 83367705 83367911 -98380176 - MLT1E1 LTR MaLR -22 632 422 4 1221 270 224 59 15 chr2 83368063 83368131 -98379956 - MLT1E3 LTR MaLR -552 72 2 4 1221 318 394 136 25 chr2 83368764 83368962 -98379125 - LTR16E1 LTR ERVL -184 354 135 4 1221 235 348 124 52 chr2 83369228 83369422 -98378665 - MLT1E1 LTR MaLR 0 444 237 4 1221 635 261 124 52 chr2 83369704 83370107 -98377980 + MLT2B4 LTR ERVL 41 558 -9 4 1221 232 268 25 101 chr2 83378865 83378944 -98369143 - MT2B LTR ERVL -376 225 153 4 1221 1441 191 123 12 chr2 83380302 83380621 -98367466 - MTC LTR MaLR 0 421 67 4 1221 409 121 0 0 chr2 83380621 83380679 -98367408 + RMER6B LTR ERVK 1 58 -403 4 1221 790 211 0 26 chr2 83380683 83380834 -98367253 + RMER6A LTR ERVK 610 756 0 4 1221 433 153 0 0 chr2 83380834 83380906 -98367181 - MTC LTR MaLR -349 72 1 4 1221 1821 251 54 54 chr2 83389033 83389568 -98358519 + RMER19C LTR ERVK 77 611 0 5 1221 1107 239 66 58 chr2 83391744 83392121 -98355966 + RLTR14 LTR ERV1 3 382 0 5 1221 2350 304 44 68 chr2 83392943 83393889 -98354198 - MTE-int LTR MaLR -692 888 19 5 1221 748 319 38 0 chr2 83393939 83394152 -98353935 - MTE2b LTR MaLR -101 278 58 5 1221 1210 202 120 75 chr2 83408378 83408475 -98339612 + ORR1D1 LTR MaLR 1 94 -280 5 1221 1210 202 120 75 chr2 83408879 83409139 -98338948 + ORR1D1 LTR MaLR 95 374 0 5 1221 1447 207 68 31 chr2 83410642 83410967 -98337120 + ORR1C1 LTR MaLR 1 348 -31 5 1221 267 140 0 91 chr2 83417525 83417580 -98330507 + ORR1C1 LTR MaLR 312 361 -6 5 1221 3737 134 153 2 chr2 83418441 83419030 -98329057 - RLTR33 LTR ERVK 0 678 1 5 1221 3374 19 3 3 chr2 83420455 83420822 -98327265 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 5 1221 57163 18 15 3 chr2 83420822 83427224 -98320863 + IAPEz-int LTR ERVK 8 6481 0 5 1221 3374 19 3 3 chr2 83427224 83427591 -98320496 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 5 1221 2353 100 58 0 chr2 83430334 83430643 -98317444 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 5 1221 1864 230 39 5 chr2 83433745 83434134 -98313953 + MTD LTR MaLR 3 404 -15 5 1221 2430 186 88 17 chr2 83441974 83442500 -98305587 - RMER15 LTR ERVL 0 575 13 5 1221 1788 195 132 3 chr2 83442630 83443001 -98305086 + MTD LTR MaLR 1 419 0 5 1221 418 213 63 11 chr2 83443813 83443908 -98304179 - MTE2a LTR MaLR -79 300 201 5 1221 2810 162 69 85 chr2 83444297 83444923 -98303164 + RLTR18 LTR ERVK 1 616 0 5 1221 815 279 92 11 chr2 83445121 83445404 -98302683 + MLT1F LTR MaLR 233 538 -10 5 1221 4142 29 0 4 chr2 83452669 83453153 -98294934 + LTRIS_Mm LTR ERV1 1 482 0 5 1221 1509 218 70 53 chr2 83454648 83454839 -98293248 + MTD LTR MaLR 1 195 -224 5 1221 1509 218 70 53 chr2 83454984 83455190 -98292897 + MTD LTR MaLR 196 405 -14 5 1221 2418 55 3 3 chr2 83455350 83455663 -98292424 - ORR1A1 LTR MaLR -15 331 19 5 1221 640 319 80 62 chr2 83462753 83463091 -98284996 + MLT1E3 LTR MaLR 38 381 -243 5 1221 804 337 95 56 chr2 83466646 83466801 -98281286 + MLT1E LTR MaLR 94 269 -384 5 1221 804 337 95 56 chr2 83466977 83467352 -98280735 + MLT1E LTR MaLR 275 650 -3 5 1221 2343 148 52 7 chr2 83468141 83468544 -98279543 + MTC LTR MaLR 1 421 0 6 1221 1291 234 19 143 chr2 83468587 83469000 -98279087 + ORR1D2 LTR MaLR 3 364 -6 6 1221 398 224 24 87 chr2 83471112 83471239 -98276848 + RMER15 LTR ERVL 351 469 -106 6 1221 230 302 16 0 chr2 83471667 83471730 -98276357 - MLT1F1 LTR MaLR -3 362 299 6 1221 245 344 116 61 chr2 83472462 83472660 -98275427 - RMER2 LTR ERV1 -27 540 332 6 1221 506 230 0 106 chr2 83472630 83472771 -98275316 - RMER2 LTR ERV1 -441 126 1 6 1221 758 227 65 82 chr2 83474036 83474281 -98273806 + RLTR11B LTR ERVK 1 241 -212 6 1221 318 285 58 49 chr2 83474274 83474551 -98273536 + RLTR11B LTR ERVK 201 490 -38 6 1221 239 299 97 124 chr2 83476224 83476369 -98271718 - MLT1F1 LTR MaLR -373 196 56 6 1221 390 245 36 36 chr2 83476407 83476499 -98271588 - RLTR18 LTR ERVK 0 616 525 6 1221 3125 151 173 10 chr2 83476499 83477129 -98270958 - RLTR33 LTR ERVK 0 678 1 6 1221 3495 172 64 6 chr2 83477427 83478081 -98270006 + RLTR17 LTR ERVK 1 692 0 6 1221 932 294 70 97 chr2 83478105 83478632 -98269455 - RLTR18 LTR ERVK -103 513 1 6 1221 282 321 102 22 chr2 83480319 83480456 -98267631 - LTR89 LTR ERVL? -379 500 353 6 1221 300 196 18 0 chr2 83482481 83482537 -98265550 - MLT1B LTR MaLR -1 389 333 6 1221 601 220 97 36 chr2 83483008 83483173 -98264914 - MLT1B LTR MaLR -215 175 1 6 1221 312 340 68 31 chr2 83490881 83491042 -98257045 - MLT1C LTR MaLR -105 362 196 6 1221 1220 194 269 9 chr2 83491820 83492143 -98255944 + MTD LTR MaLR 1 407 -12 6 152 3532 86 92 15 chr2 83492467 83493009 -98255078 - MT2B2 LTR ERVL 0 584 1 6 1222 1431 271 55 26 chr2 83512188 83512695 -98235392 - RLTR20A2 LTR ERVK -12 566 45 1 1222 463 302 126 0 chr2 83514967 83515149 -98232938 + ORR1D2 LTR MaLR 1 205 -165 2 1222 265 210 161 0 chr2 83515205 83515286 -98232801 + ORR1D2 LTR MaLR 277 370 0 2 1222 294 267 47 0 chr2 83517046 83517132 -98230955 + MTE2b LTR MaLR 16 105 -274 2 1222 309 171 71 0 chr2 83517219 83517289 -98230798 + MTE2b LTR MaLR 298 372 -7 2 1222 2397 177 23 68 chr2 83524100 83524627 -98223460 - RLTR18B LTR ERVK -5 507 5 4 1222 2647 80 143 139 chr2 83526723 83527233 -98220854 - RLTR1B LTR ERV1 0 512 1 4 1222 2783 59 17 25 chr2 83527443 83527561 -98220526 + MTB LTR MaLR 1 125 -275 4 1222 2776 28 6 27 chr2 83527561 83527895 -98220192 + IAPLTR2b LTR ERVK 1 327 0 5 1222 2783 59 17 25 chr2 83527895 83528179 -98219908 + MTB LTR MaLR 126 400 0 4 1222 623 204 48 18 chr2 83528694 83528859 -98219228 + ORR1D1 LTR MaLR 117 286 -88 5 1222 2156 92 9 3 chr2 83528861 83529178 -98218909 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 5 1222 377 169 79 0 chr2 83529178 83529266 -98218821 + ORR1D1 LTR MaLR 280 374 0 5 1222 474 135 34 0 chr2 83529281 83529370 -98218717 - ORR1D1 LTR MaLR -245 129 38 5 1222 1814 133 66 38 chr2 83529487 83529806 -98218281 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 2 5 1222 879 147 60 0 chr2 83532060 83532208 -98215879 - MTC LTR MaLR 0 421 265 6 1222 1397 132 13 4 chr2 83532208 83532436 -98215651 + RLTR20A LTR ERVK 1 230 -311 6 1222 759 135 218 0 chr2 83533146 83533316 -98214771 + RMER10A LTR ERVL 1 207 -235 6 1222 494 281 73 43 chr2 83533310 83533753 -98214334 - RLTR12B LTR ERVK -27 332 1 6 1222 874 194 54 33 chr2 83533753 83533809 -98214278 + RMER10A LTR ERVL 197 258 -184 6 1222 1879 177 61 83 chr2 83533809 83534030 -98214057 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 224 6 1222 1879 177 61 83 chr2 83534217 83534451 -98213636 - RLTR41 LTR ERV1 -223 223 1 6 1222 874 194 54 33 chr2 83534451 83534633 -98213454 + RMER10A LTR ERVL 259 440 -2 6 1222 341 253 203 49 chr2 83535718 83536073 -98212014 + MLT2B2 LTR ERVL 6 506 -56 7 1222 3362 48 0 5 chr2 83536244 83536646 -98211441 + MTB LTR MaLR 1 400 0 7 1222 1358 207 23 46 chr2 83539485 83539596 -98208491 - RMER6C LTR ERVK -194 496 387 8 1222 1358 198 275 40 chr2 83539680 83539994 -98208093 - RMER6C LTR ERVK -304 386 1 8 1222 252 288 0 40 chr2 83541375 83541451 -98206636 - MER21B LTR ERV1 -92 771 699 9 1222 721 303 168 21 chr2 83541472 83541806 -98206281 - MER21B LTR ERV1 -227 636 254 9 1222 443 261 61 8 chr2 83542353 83542484 -98205603 - MER21B LTR ERV1 -712 151 14 9 1222 613 194 70 33 chr2 83543663 83543905 -98204182 - RMER12 LTR ERVK -5 1317 1015 1 1222 613 222 81 62 chr2 83543947 83543963 -98204124 - RMER12 LTR ERVK -308 1014 1001 1 1222 1411 255 32 42 chr2 83544019 83544651 -98203436 - RMER12 LTR ERVK -596 808 1 1 1222 455 267 39 33 chr2 83545158 83545301 -98202786 - RMER15 LTR ERVL 0 575 432 1 1222 455 267 39 33 chr2 83545487 83545525 -98202562 - RMER15 LTR ERVL -144 431 393 1 1222 393 130 413 9 chr2 83545560 83545669 -98202418 - ORR1B2 LTR MaLR -241 153 1 1 1222 879 138 50 129 chr2 83545669 83545897 -98202190 - ORR1B2-int LTR MaLR 0 1509 1301 1 1222 2065 135 109 14 chr2 83545897 83546318 -98201769 + RMER6B LTR ERVK 1 461 0 1 1222 5357 177 84 30 chr2 83546318 83547549 -98200538 - ORR1B2-int LTR MaLR -211 1298 1 1 1222 867 153 6 6 chr2 83549878 83550036 -98198051 + RMER10B LTR ERVL 239 396 -2 1 1222 717 256 139 29 chr2 83551131 83551405 -98196682 - MTD LTR MaLR 0 419 116 1 1222 407 318 52 7 chr2 83551430 83551477 -98196610 - MTD LTR MaLR -257 162 116 1 1222 411 244 3 10 chr2 83551497 83551604 -98196483 - MTD LTR MaLR -304 115 1 1 1222 3138 44 18 10 chr2 83552112 83552505 -98195582 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 1222 434 156 100 0 chr2 83552505 83552595 -98195492 - RMER10B LTR ERVL -299 99 1 1 1222 576 297 14 41 chr2 83557196 83557414 -98190673 + RMER5 LTR ERV1 9 220 -314 1 1222 264 253 0 13 chr2 83557434 83557510 -98190577 + RMER5 LTR ERV1 187 261 -273 1 1222 744 236 59 114 chr2 83557770 83558076 -98190011 + RMER5 LTR ERV1 246 534 0 1 1222 1770 170 70 11 chr2 83558370 83558727 -98189360 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 1 1222 410 255 0 0 chr2 83559039 83559133 -98188954 - MT2A LTR ERVL -150 383 290 1 1222 3288 24 42 0 chr2 83560291 83560671 -98187416 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 1222 232 180 14 129 chr2 83567830 83567841 -98180246 - MT2B LTR ERVL -385 216 155 1 1222 1085 270 37 58 chr2 83572856 83573234 -98174853 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 1 1222 284 244 13 13 chr2 83578706 83578783 -98169304 - MLT1D LTR MaLR -43 462 386 2 1222 1671 176 89 38 chr2 83594460 83594851 -98153236 - MTD LTR MaLR -5 414 4 2 1222 234 239 53 53 chr2 83611007 83611082 -98137005 + MT2B LTR ERVL 183 257 -344 2 1222 981 233 142 88 chr2 83612931 83612976 -98135111 - ORR1E LTR MaLR -2 357 301 2 1222 2031 122 49 46 chr2 83612976 83613302 -98134785 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 2 1222 981 233 142 88 chr2 83613302 83613595 -98134492 - ORR1E LTR MaLR -59 300 1 2 1223 426 194 126 0 chr2 83648365 83648468 -98099619 - MYSERV6-int LTR ERVK -8727 232 117 3 1223 814 269 90 31 chr2 83649261 83649651 -98098436 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 408 -33 3 1223 231 254 0 73 chr2 83663595 83663663 -98084424 - MER76 LTR ERVL -349 342 280 3 1223 361 259 0 0 chr2 83664551 83664636 -98083451 - MTEb LTR MaLR 0 379 295 3 1223 402 136 0 15 chr2 83664731 83664798 -98083289 - MTD LTR MaLR -353 66 1 3 1223 1813 230 30 60 chr2 83679055 83679485 -98068602 - MTD LTR MaLR -2 417 1 3 1223 658 252 83 57 chr2 83681455 83681803 -98066284 - MTEa LTR MaLR -2 377 1 3 1223 1702 161 51 73 chr2 83685556 83685582 -98062505 - RMER10A LTR ERVL -42 400 385 4 1223 2870 144 85 12 chr2 83685582 83686007 -98062080 + RLTR11A LTR ERVK 1 444 -84 4 1223 2870 144 85 12 chr2 83686041 83686107 -98061980 + RLTR11A LTR ERVK 445 527 -1 4 1223 1702 161 51 73 chr2 83686107 83686489 -98061598 - RMER10A LTR ERVL -58 384 1 4 1223 2781 139 42 0 chr2 83686510 83686914 -98061173 - MTC LTR MaLR 0 421 1 4 1223 726 308 70 49 chr2 83693909 83694193 -98053894 - MLT1A0 LTR MaLR -4 361 72 4 1223 1517 216 57 51 chr2 83700922 83701293 -98046794 - MTE2b LTR MaLR -2 377 5 4 1223 4358 20 0 95 chr2 83705836 83706381 -98041706 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 4 1223 322 0 0 0 chr2 83706381 83706419 -98041668 - MERVL-int LTR ERVL 0 5485 5448 4 1223 387 167 46 35 chr2 83706419 83706506 -98041581 - ORR1A3-int LTR MaLR -1323 640 553 4 1223 48347 15 6 0 chr2 83706506 83711832 -98036255 - MERVL-int LTR ERVL -125 5360 1 4 1223 4358 20 0 95 chr2 83711832 83712377 -98035710 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 4 1223 1067 268 93 55 chr2 83717382 83717564 -98030523 - RLTR40 LTR ERVK -46 771 494 4 1223 1067 261 110 97 chr2 83717610 83718079 -98030008 - RLTR40 LTR ERVK -324 493 21 4 1223 2354 104 125 12 chr2 83737503 83737910 -98010177 + RLTR11B LTR ERVK 1 453 0 4 1223 3212 48 5 8 chr2 83739353 83739750 -98008337 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 1223 7476 66 67 4 chr2 83739750 83740783 -98007304 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 4 1223 3288 36 8 2 chr2 83740783 83741177 -98006910 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 1223 368 156 24 61 chr2 83743056 83743138 -98004949 - MTC LTR MaLR -5 416 338 4 1223 2431 133 29 0 chr2 83743727 83744110 -98003977 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 4 1223 5187 110 50 49 chr2 83744424 83744847 -98003240 - RMER17A2 LTR ERVK 0 906 478 4 1223 5187 110 50 49 chr2 83744867 83745348 -98002739 - RMER17A2 LTR ERVK -429 477 1 4 1223 1813 174 51 105 chr2 83745999 83746308 -98001779 + RMER6C LTR ERVK 1 278 -412 4 1223 1813 174 51 105 chr2 83746569 83746707 -98001380 + RMER6C LTR ERVK 279 424 -266 4 1223 833 169 7 7 chr2 83752985 83753134 -97994953 - RMER6-int LTR ERVK -249 2928 2780 4 1223 1214 163 43 4 chr2 83753128 83753362 -97994725 - RMER6-int LTR ERVK -2913 264 22 4 1223 2359 174 26 17 chr2 83753362 83753782 -97994305 - RMER6B LTR ERVK -37 424 1 4 1223 1087 168 53 29 chr2 83753782 83753989 -97994098 + RMER6B LTR ERVK 240 451 -10 4 1224 643 316 38 21 chr2 83761020 83761256 -97986831 - MLT1D LTR MaLR -4 501 262 4 1224 1371 178 142 0 chr2 83769704 83770013 -97978074 + ORR1C2 LTR MaLR 32 384 0 4 1224 1726 175 94 47 chr2 83783484 83783690 -97964397 + MTC LTR MaLR 1 207 -214 5 1224 2274 147 50 8 chr2 83783690 83784068 -97964019 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 5 1224 1726 175 94 47 chr2 83784068 83784263 -97963824 + MTC LTR MaLR 208 421 0 5 1224 870 261 93 23 chr2 83784689 83784991 -97963096 + MTE2a LTR MaLR 57 379 0 5 1224 4468 14 0 12 chr2 83787481 83787980 -97960107 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 5 1224 321 0 0 0 chr2 83787980 83788018 -97960069 - MERVL-int LTR ERVL 0 5485 5448 5 1224 362 167 46 35 chr2 83788018 83788105 -97959982 - ORR1A3-int LTR MaLR -1323 640 553 5 1224 48480 14 6 0 chr2 83788105 83793431 -97954656 - MERVL-int LTR ERVL -125 5360 1 5 1224 4468 14 0 12 chr2 83793431 83793930 -97954157 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 5 1224 2818 44 10 18 chr2 83795374 83795765 -97952322 + MT2_Mm LTR ERVL 32 419 -74 5 1224 2818 44 10 18 chr2 83801184 83801575 -97946512 + MT2_Mm LTR ERVL 32 419 -74 5 1224 2818 44 10 18 chr2 83806994 83807385 -97940702 + MT2_Mm LTR ERVL 32 419 -74 5 1224 2818 44 10 18 chr2 83812804 83813195 -97934892 + MT2_Mm LTR ERVL 32 419 -74 5 1224 2818 44 10 18 chr2 83818614 83819005 -97929082 + MT2_Mm LTR ERVL 32 419 -74 5 1224 2818 44 10 18 chr2 83824424 83824815 -97923272 + MT2_Mm LTR ERVL 32 419 -74 5 1224 2818 44 10 18 chr2 83830234 83830625 -97917462 + MT2_Mm LTR ERVL 32 419 -74 5 1224 572 189 197 0 chr2 83837971 83838098 -97909989 + ORR1C1 LTR MaLR 5 156 -222 5 1224 2041 46 45 8 chr2 83841546 83841811 -97906276 + MTA_Mm LTR MaLR 1 275 -121 5 1224 4519 72 11 3 chr2 83841814 83842445 -97905642 + MTA_Mm-int LTR MaLR 463 1098 0 5 1224 3150 29 36 5 chr2 83842445 83842829 -97905258 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 1224 522 245 107 40 chr2 83843913 83844062 -97904025 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 250 5 1224 375 316 20 0 chr2 83846859 83846957 -97901130 - MLT1A1 LTR MaLR -260 148 49 5 1224 260 376 102 30 chr2 83847267 83847533 -97900554 - MLT1J LTR MaLR -197 315 31 5 1224 1780 204 38 33 chr2 83861287 83861682 -97886405 + MTD LTR MaLR 12 408 -11 5 1224 3095 146 17 8 chr2 83861700 83862216 -97885871 - RLTR28 LTR ERVL -3 521 1 5 1224 2151 222 8 87 chr2 83871911 83872181 -97875906 - RMER6D LTR ERVK -157 563 325 5 1224 2151 222 8 87 chr2 83872360 83872481 -97875606 - RMER6D LTR ERVK -396 324 220 5 1224 2151 222 8 87 chr2 83872621 83872839 -97875248 - RMER6D LTR ERVK -501 219 1 5 1224 2293 177 12 19 chr2 83873349 83873763 -97874324 + MTD LTR MaLR 1 411 -8 5 2 2373 186 30 0 chr2 83886050 83886453 -97861634 - MTC LTR MaLR -6 415 1 6 1225 276 338 48 88 chr2 83887897 83888124 -97859963 + RMER2 LTR ERV1 308 525 -42 6 1225 2467 111 97 125 chr2 83897030 83897574 -97850513 - RLTR24 LTR ERV1 0 529 1 6 1225 666 262 36 125 chr2 83904625 83904961 -97843126 - ORR1E LTR MaLR -53 306 1 6 1225 312 254 57 98 chr2 83914185 83914419 -97833668 - MTE2a LTR MaLR 0 379 163 6 1225 569 318 156 17 chr2 83916191 83916549 -97831538 + MLT1A1 LTR MaLR 1 408 0 6 1225 789 280 75 65 chr2 83918604 83918975 -97829112 + MTEb LTR MaLR 1 375 -4 6 1225 1493 293 96 19 chr2 83918979 83919172 -97828915 + MTEb-int LTR MaLR 1 197 -1383 6 1225 1493 293 96 19 chr2 83919381 83919779 -97828308 + MTEb-int LTR MaLR 198 637 -943 6 1225 227 297 24 119 chr2 83927935 83928061 -97820026 - MT2B LTR ERVL -332 269 156 6 1225 477 269 46 0 chr2 83933227 83933357 -97814730 + RMER15 LTR ERVL 400 535 -40 6 1225 3167 34 39 0 chr2 83933711 83934092 -97813995 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 1225 1547 226 21 9 chr2 83941202 83941533 -97806554 - RMER15 LTR ERVL -54 521 187 6 1225 737 210 23 47 chr2 83941572 83941787 -97806300 - RMER15 LTR ERVL -351 224 15 6 1225 1425 92 5 0 chr2 83942290 83942485 -97805602 + RLTR8 LTR ERVK 1 196 -169 6 1225 1082 148 0 71 chr2 83943574 83943771 -97804316 + RLTR8 LTR ERVK 183 365 0 6 1225 527 179 0 21 chr2 83948338 83948435 -97799652 - RMER6D LTR ERVK -26 694 600 6 1225 3076 156 85 2 chr2 83948824 83949401 -97798686 + RMER6-int LTR ERVK 10 634 -2543 6 1225 3392 125 27 24 chr2 83949459 83950056 -97798031 + RMER6-int LTR ERVK 2579 3177 0 6 1225 3003 131 67 86 chr2 83950056 83950757 -97797330 + RMER6C LTR ERVK 1 688 -2 6 1225 306 297 119 45 chr2 83951281 83951415 -97796672 + RMER20B LTR ERVK 129 272 -355 6 1225 3386 43 40 2 chr2 83951551 83951971 -97796116 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 6 1225 673 131 37 0 chr2 83952143 83952250 -97795837 + RMER6C LTR ERVK 1 111 -579 6 1225 329 244 35 172 chr2 83952197 83952314 -97795773 + MT2B LTR ERVL 69 158 -443 6 1225 763 277 15 5 chr2 83955492 83955695 -97792392 + MTD LTR MaLR 5 209 -210 6 1225 1109 197 47 0 chr2 83955928 83956141 -97791946 + MTD LTR MaLR 197 419 0 6 1225 396 364 14 14 chr2 83958269 83958414 -97789673 - LTR16A LTR ERVL -73 378 234 6 1225 2602 57 36 3 chr2 83959166 83959501 -97788586 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 6 1225 291 235 0 29 chr2 83960443 83960513 -97787574 - MLT1H2 LTR MaLR -211 278 211 6 1225 1476 222 72 44 chr2 83971633 83972020 -97776067 + RMER19C LTR ERVK 180 577 -34 7 1225 3567 15 0 0 chr2 83981173 83981569 -97766518 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 7 1225 2950 53 44 10 chr2 83988666 83989049 -97759038 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 7 1225 8462 63 6 1 chr2 83989049 83990140 -97757947 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1097 -1 7 1225 3246 51 2 5 chr2 83990141 83990537 -97757550 + MTA_Mm LTR MaLR 1 395 -1 7 1225 328 291 67 25 chr2 84001071 84001191 -97746896 + ORR1D1 LTR MaLR 130 254 -120 3 1225 3558 18 0 0 chr2 84005609 84006005 -97742082 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 1225 336 349 80 7 chr2 84013099 84013249 -97734838 + MLT1A0 LTR MaLR 62 222 -143 1 1225 3787 169 39 3 chr2 84014411 84015106 -97732981 - RMER6D LTR ERVK 0 720 1 2 1226 3561 40 28 0 chr2 84018445 84018869 -97729218 + RLTR10C LTR ERVK 1 436 0 2 1226 303 286 20 39 chr2 84019716 84019818 -97728269 + MLT1A1 LTR MaLR 1 100 -308 2 1226 618 286 41 15 chr2 84027582 84027777 -97720310 - MLT1C LTR MaLR -1 466 267 3 1226 1211 200 41 0 chr2 84033881 84034101 -97713986 + MTC LTR MaLR 1 229 -192 4 1226 1303 129 5 0 chr2 84034567 84034758 -97713329 + MTC LTR MaLR 229 420 -1 4 1226 628 193 65 20 chr2 84057613 84057766 -97690321 + RLTR12B LTR ERVK 360 519 -9 7 1226 433 344 90 79 chr2 84059241 84059607 -97688480 + ORR1E LTR MaLR 1 370 0 7 1226 1297 195 210 0 chr2 84062546 84062987 -97685100 - RMER5 LTR ERV1 0 534 1 7 1226 3148 51 8 2 chr2 84063860 84064254 -97683833 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 7 1226 4630 57 9 2 chr2 84066606 84067189 -97680898 - LTRIS_Mus LTR ERV1 0 587 1 8 1226 407 322 46 151 chr2 84067794 84068032 -97680055 + MLT2D LTR ERVL 147 360 -104 8 1226 1292 248 54 10 chr2 84068085 84068383 -97679704 + ORR1E LTR MaLR 1 312 -47 8 1226 2779 133 0 48 chr2 84068383 84068756 -97679331 - MTC LTR MaLR 0 421 63 8 1226 2779 133 0 48 chr2 84069008 84069076 -97679011 - MTC LTR MaLR -359 62 1 8 1226 249 178 22 0 chr2 84069087 84069132 -97678955 + ORR1E LTR MaLR 312 357 -2 8 1226 319 284 82 129 chr2 84069295 84069489 -97678598 - MTEb LTR MaLR -18 361 177 8 1226 269 274 47 12 chr2 84069533 84069618 -97678469 - MTE-int LTR MaLR -1298 282 195 9 1226 972 280 118 9 chr2 84071407 84071746 -97676341 + MTD LTR MaLR 30 405 -14 9 1226 530 308 78 35 chr2 84072424 84072680 -97675407 - MLT1A0 LTR MaLR -66 299 33 9 1226 1472 126 3 109 chr2 84075341 84075626 -97672461 + ORR1A4 LTR MaLR 1 255 -74 1 1226 1900 261 10 53 chr2 84075647 84075941 -97672146 + RMER19C LTR ERVK 126 409 -202 1 1226 5117 113 53 53 chr2 84075941 84076847 -97671240 - RMER17A2 LTR ERVK 0 906 1 1 1226 1900 261 10 53 chr2 84076847 84077057 -97671030 + RMER19C LTR ERVK 410 608 -3 1 1226 385 232 20 29 chr2 84077057 84077144 -97670943 + ORR1A2 LTR MaLR 240 326 -3 1 1226 1935 161 30 81 chr2 84079667 84080073 -97668014 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 62 1 1226 323 286 0 84 chr2 84093238 84093345 -97654742 - MTEa LTR MaLR -281 98 1 1 1226 493 300 60 56 chr2 84093678 84093911 -97654176 + MLT2B1 LTR ERVL 5 238 -282 1 1226 2043 163 67 0 chr2 84095774 84096117 -97651970 + ORR1B1 LTR MaLR 29 394 0 1 1226 602 349 57 75 chr2 84098963 84099433 -97648654 - MLT2B4 LTR ERVL -16 540 79 1 1226 546 294 170 21 chr2 84104464 84104752 -97643335 + MLT1C LTR MaLR 137 467 0 1 1226 838 266 36 5 chr2 84105253 84105472 -97642615 - MLT1D LTR MaLR -3 502 277 1 1226 2394 152 7 15 chr2 84107000 84107408 -97640679 - MTB_Mm LTR MaLR -2 405 1 1 1226 1468 207 118 11 chr2 84123712 84124059 -97624028 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 1 1226 1641 234 45 5 chr2 84128280 84128683 -97619404 + MTD LTR MaLR 1 419 0 1 1226 401 186 36 89 chr2 84131001 84131113 -97616974 - MT2B LTR ERVL -344 257 152 1 1226 6582 176 44 10 chr2 84143036 84143729 -97604358 - MERVL_2A-int LTR ERVL -1399 4362 3641 2 1226 2389 89 9 0 chr2 84143729 84144053 -97604034 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 2 1226 6582 176 44 10 chr2 84144053 84144551 -97603536 - MERVL_2A-int LTR ERVL -2121 3640 3131 2 1226 3005 142 22 0 chr2 84144567 84145031 -97603056 - MERVL_2A-int LTR ERVL -3025 2736 2263 2 1226 3234 154 47 13 chr2 84145146 84145703 -97602384 - MERVL_2A-int LTR ERVL -4114 1647 1072 2 1227 289 213 100 23 chr2 84170404 84170534 -97577553 + LTR37A LTR ERV1 282 421 -5 2 1227 1314 145 18 39 chr2 84174147 84174453 -97573634 - RMER6D LTR ERVK -368 352 3 2 1227 1197 288 75 23 chr2 84180952 84181300 -97566787 - MTE2b LTR MaLR -8 371 6 2 1227 226 389 77 46 chr2 84184708 84184902 -97563185 + LTR33A_ LTR ERVL 47 246 -285 2 1227 1855 191 37 26 chr2 84195455 84195832 -97552255 - MTB_Mm LTR MaLR -4 403 23 2 1227 3206 164 12 41 chr2 84201533 84202124 -97545963 + RMER15 LTR ERVL 1 574 -1 2 1227 950 334 30 85 chr2 84215636 84216002 -97532085 + MTE2b LTR MaLR 34 379 0 3 1227 302 259 54 101 chr2 84218423 84218552 -97529535 + MT2B LTR ERVL 154 276 -325 3 1227 226 280 79 71 chr2 84223230 84223357 -97524730 - RLTR13D1 LTR ERVK -518 288 161 3 1227 2241 158 31 10 chr2 84235130 84235523 -97512564 + RLTR20C LTR ERVK 1 470 -93 3 1227 823 301 163 21 chr2 84235574 84235659 -97512428 + RLTR20C LTR ERVK 471 560 -3 3 1227 728 217 243 11 chr2 84240598 84240775 -97507312 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 167 3 1227 2871 197 100 56 chr2 84253860 84254543 -97493544 + RMER6D LTR ERVK 1 713 -7 3 1227 249 368 67 25 chr2 84276631 84276751 -97471336 - LTR33A_ LTR ERVL -159 372 248 4 1228 1801 142 60 43 chr2 84287347 84287694 -97460393 + RMER6B LTR ERVK 1 353 -108 4 1228 3606 117 85 7 chr2 84287696 84288827 -97459260 + MYSERV6-int LTR ERVK 956 2174 -6785 4 1228 10347 122 54 94 chr2 84288848 84289201 -97458886 + MYSERV6-int LTR ERVK 4712 5073 -3886 4 1228 10347 122 54 94 chr2 84289255 84290469 -97457618 + MYSERV6-int LTR ERVK 5074 6318 -2641 4 1228 10347 122 54 94 chr2 84290557 84291021 -97457066 + MYSERV6-int LTR ERVK 6319 6796 -2163 4 1228 1890 146 9 43 chr2 84291157 84291507 -97456580 + RMER6B LTR ERVK 122 459 -2 4 1228 237 297 16 0 chr2 84295131 84295195 -97452892 + MTE2b LTR MaLR 10 74 -305 4 1228 274 361 67 11 chr2 84307650 84307829 -97440258 - MLT1B LTR MaLR -12 378 190 4 1228 249 263 120 27 chr2 84307852 84307980 -97440107 - MLT1B LTR MaLR -240 134 1 4 1228 266 256 138 11 chr2 84316524 84316565 -97431522 + RMER10A LTR ERVL 318 365 -77 4 1228 266 256 138 11 chr2 84316653 84316698 -97431389 + RMER10A LTR ERVL 366 415 -27 4 1228 1692 89 8 0 chr2 84316782 84317019 -97431068 - RLTR42 LTR ERVK 0 239 1 4 1228 7539 162 16 24 chr2 84317024 84318538 -97429549 - RLTR42-int LTR ERVK -5 5517 4015 4 1228 3821 179 111 28 chr2 84318536 84319945 -97428142 + RLTR18-int LTR ERVK 2917 4443 -918 4 1228 994 199 35 35 chr2 84320216 84320331 -97427756 + RLTR18-int LTR ERVK 4851 4969 -392 4 1228 994 199 35 35 chr2 84320355 84320499 -97427588 + RLTR18-int LTR ERVK 4970 5109 -252 4 1228 2041 129 42 171 chr2 84320504 84321023 -97427064 - RLTR42-int LTR ERVK -3354 2168 1723 4 1228 2064 175 27 34 chr2 84321023 84321466 -97426621 + RMER10A LTR ERVL 1 440 -2 4 1228 2041 129 42 171 chr2 84321466 84321536 -97426551 - RLTR42-int LTR ERVK -3800 1722 1655 4 1228 1371 164 111 10 chr2 84321550 84321839 -97426248 - RLTR42-int LTR ERVK -4631 891 574 4 1228 558 275 108 108 chr2 84321951 84322220 -97425867 + RLTR18 LTR ERVK 345 613 -3 4 1228 360 123 42 84 chr2 84322205 84322221 -97425866 - RLTR42 LTR ERVK -164 75 65 4 1228 360 123 42 84 chr2 84322245 84322299 -97425788 - RLTR42 LTR ERVK -175 64 8 4 1228 2172 192 43 28 chr2 84329337 84329804 -97418283 + RMER19C LTR ERVK 138 611 0 5 1228 301 217 120 0 chr2 84334833 84334925 -97413162 + MLT1B LTR MaLR 286 388 -2 5 1228 1288 250 40 35 chr2 84335221 84335598 -97412489 + MTE2b LTR MaLR 1 379 0 5 1228 588 313 104 12 chr2 84335944 84336193 -97411894 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 94 5 1228 957 122 143 11 chr2 84337478 84337660 -97410427 + ORR1A4 LTR MaLR 119 324 -2 5 1228 10233 133 48 104 chr2 84337662 84339742 -97408345 + ORR1A4-int LTR MaLR 1 1963 0 5 1228 1466 143 42 64 chr2 84339742 84340025 -97408062 + ORR1A4 LTR MaLR 1 277 -52 5 1228 2360 149 55 39 chr2 84340160 84340670 -97407417 + RLTR11A LTR ERVK 7 524 -4 5 1228 3570 89 75 11 chr2 84341918 84342451 -97405636 - RMER2 LTR ERV1 0 567 1 5 1228 3052 68 2 8 chr2 84343997 84344395 -97403692 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 1228 806 289 65 56 chr2 84344403 84344726 -97403361 + MTEa LTR MaLR 51 376 -3 5 1228 2056 76 116 21 chr2 84345366 84345701 -97402386 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 5 1228 7434 84 98 71 chr2 84345701 84346973 -97401114 + IAPEz-int LTR ERVK 8 1313 -5168 5 1228 29411 22 1 1 chr2 84346971 84350239 -97397848 + IAPEz-int LTR ERVK 3209 6478 -3 5 1228 2056 76 116 21 chr2 84350243 84350578 -97397509 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 5 1228 1887 197 82 9 chr2 84351664 84352130 -97395957 - RLTR28 LTR ERVL -4 520 21 5 1228 710 259 59 130 chr2 84352350 84352657 -97395430 - MTE2a LTR MaLR -94 285 1 5 1228 377 264 123 19 chr2 84352657 84352819 -97395268 - MTE2a-int LTR MaLR 0 1580 1402 5 1228 2120 112 3 0 chr2 84352831 84353151 -97394936 + ORR1A4 LTR MaLR 1 321 -8 5 1228 9348 130 45 115 chr2 84353155 84353465 -97394622 + ORR1A4-int LTR MaLR 1 363 -1600 5 1228 9348 130 45 115 chr2 84353817 84355615 -97392472 + ORR1A4-int LTR MaLR 364 1963 0 5 1228 863 126 195 16 chr2 84355619 84355804 -97392283 + ORR1A4 LTR MaLR 5 222 -107 5 1228 553 139 130 0 chr2 84355804 84355919 -97392168 + ORR1A4-int LTR MaLR 1305 1434 -75 5 1228 651 118 45 0 chr2 84355896 84356006 -97392081 + ORR1A4 LTR MaLR 207 321 -8 5 1228 1528 277 159 46 chr2 84355979 84356615 -97391472 - MTE2a-int LTR MaLR -172 1408 701 5 1228 1319 268 34 31 chr2 84356642 84357016 -97391071 - MTE2a-int LTR MaLR -1179 401 26 5 1228 917 202 128 196 chr2 84357016 84357415 -97390672 - ORR1D1 LTR MaLR -2 372 1 5 1228 1319 221 1539 7 chr2 84357415 84357556 -97390531 - MTE2a-int LTR MaLR -1555 25 16 5 1228 1936 125 169 118 chr2 84360729 84361352 -97386735 - RMER6A LTR ERVK 0 756 57 5 1228 303 185 0 30 chr2 84363589 84363656 -97384431 - RLTR25A LTR ERVK -531 572 508 5 1228 300 250 103 10 chr2 84364868 84364965 -97383122 + MLT1H2 LTR MaLR 215 320 -259 5 1228 353 280 57 51 chr2 84364993 84365151 -97382936 + MLT1H2 LTR MaLR 331 489 0 5 1228 592 265 196 40 chr2 84371383 84371709 -97376378 - MTEa LTR MaLR -2 377 1 5 1228 2026 120 3 15 chr2 84372601 84372807 -97375280 + ORR1A3 LTR MaLR 1 207 -119 5 1228 3496 23 5 0 chr2 84372807 84373201 -97374886 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 1228 9304 30 6 1 chr2 84373201 84374293 -97373794 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 5 1228 3482 25 5 0 chr2 84374293 84374687 -97373400 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 1228 2026 120 3 15 chr2 84374687 84374808 -97373279 + ORR1A3 LTR MaLR 208 324 -2 5 1228 304 238 25 12 chr2 84385554 84385635 -97362452 - MLT1A0 LTR MaLR -8 459 378 6 1228 611 266 51 25 chr2 84387814 84388011 -97360076 - MLT1A0 LTR MaLR -29 336 135 6 1228 276 222 55 14 chr2 84388041 84388114 -97359973 - MLT1A0 LTR MaLR -289 76 1 6 1228 553 226 35 141 chr2 84388790 84389017 -97359070 - MTE2a LTR MaLR -161 218 16 6 1228 1788 256 74 26 chr2 84389022 84389169 -97358918 - MTE2a-int LTR MaLR 0 1580 1428 6 1228 1788 256 74 26 chr2 84389309 84389727 -97358360 - MTE2a-int LTR MaLR -153 1427 989 6 1228 661 203 154 0 chr2 84392981 84393124 -97354963 - MTEb LTR MaLR -214 165 1 6 1228 521 310 58 4 chr2 84395598 84395908 -97352179 + MLT1C LTR MaLR 133 426 -41 6 1228 267 234 117 0 chr2 84395951 84396045 -97352042 - MLT1F1 LTR MaLR -463 106 2 6 1228 373 222 53 53 chr2 84399046 84399160 -97348927 + MTEa LTR MaLR 259 372 -7 6 1228 2048 142 10 47 chr2 84402402 84402787 -97345300 + ORR1C1 LTR MaLR 6 376 -2 6 1228 2984 153 51 9 chr2 84403553 84404087 -97344000 + RMER13B LTR ERVK 1 556 -352 6 1228 2826 33 0 53 chr2 84405158 84405514 -97342573 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 337 0 6 153 56368 22 17 7 chr2 84405514 84411921 -97336166 + IAPEz-int LTR ERVK 8 6481 0 6 1229 2826 33 0 53 chr2 84411921 84412277 -97335810 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 337 0 6 1229 2707 78 2 25 chr2 84412667 84412689 -97335398 + MTA_Mm LTR MaLR 1 17 -379 6 1229 3516 28 0 0 chr2 84412689 84413085 -97335002 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 1229 2707 78 2 25 chr2 84413085 84413467 -97334620 + MTA_Mm LTR MaLR 18 396 0 6 1229 2978 55 31 8 chr2 84415045 84415432 -97332655 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 1229 6098 79 47 9 chr2 84415432 84416377 -97331710 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 980 -118 6 1229 804 63 24 0 chr2 84416907 84417034 -97331053 + MTA_Mm-int LTR MaLR 969 1098 0 6 1229 864 0 0 9 chr2 84417034 84417141 -97330946 + MTA_Mm LTR MaLR 1 106 -290 6 1229 1158 48 257 5 chr2 84417153 84417363 -97330724 + MTA_Mm-int LTR MaLR 836 1098 0 6 1229 3132 36 7 75 chr2 84417363 84417553 -97330534 + MTA_Mm LTR MaLR 1 191 -205 6 1229 3132 36 7 75 chr2 84417723 84417957 -97330130 + MTA_Mm LTR MaLR 192 396 0 6 1229 1462 226 3 71 chr2 84418877 84419284 -97328803 + RMER19C LTR ERVK 173 611 0 6 1229 397 214 108 14 chr2 84419552 84419682 -97328405 - ORR1D1 LTR MaLR -232 138 1 6 1229 1645 160 34 44 chr2 84420190 84420508 -97327579 + MTC LTR MaLR 105 419 -2 6 1229 607 260 60 67 chr2 84514912 84515415 -97232672 - RLTR11B LTR ERVK -38 490 6 4 1229 1304 135 289 13 chr2 84524721 84525022 -97223065 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 6 1229 316 195 10 139 chr2 84531651 84531668 -97216419 + MT2B LTR ERVL 153 156 -445 7 1230 2273 109 100 38 chr2 84557626 84558045 -97190042 + RMER4A LTR ERVK 14 458 -8 1 1230 271 372 37 31 chr2 84559481 84559642 -97188445 + RMER12 LTR ERVK 715 876 -446 1 1230 1145 287 17 118 chr2 84569182 84569386 -97178701 + MTEa LTR MaLR 7 186 -193 1 1230 1145 287 17 118 chr2 84569556 84569765 -97178322 + MTEa LTR MaLR 187 378 -1 1 1230 694 365 127 38 chr2 84590482 84590640 -97157447 + MLT1K LTR MaLR 6 163 -432 2 1230 824 294 87 116 chr2 84590640 84591217 -97156870 - MLT1F2 LTR MaLR 0 560 1 2 1230 694 365 127 38 chr2 84591217 84591482 -97156605 + MLT1K LTR MaLR 164 467 -128 2 1230 1727 131 93 13 chr2 84594692 84594994 -97153093 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 2 1230 1129 303 37 44 chr2 84596465 84596786 -97151301 - MLT2B3 LTR ERVL -46 508 190 2 1230 2827 111 9 46 chr2 84597188 84597624 -97150463 + RLTR9B2 LTR ERVK 1 420 0 2 1230 514 307 150 6 chr2 84597651 84597817 -97150270 - MLT2B3 LTR ERVL -354 200 9 2 1230 2862 134 17 84 chr2 84598302 84598825 -97149262 - RLTR24 LTR ERV1 -41 488 1 2 1230 228 320 39 0 chr2 84599042 84599120 -97148967 + MamGypLTR3 LTR Gypsy 501 581 -258 2 1230 4401 97 134 11 chr2 84600718 84601374 -97146713 + RMER19A LTR ERVK 1 737 0 2 1230 284 356 0 0 chr2 84601544 84601634 -97146453 + MLT1H LTR MaLR 12 101 -448 2 1230 244 288 120 56 chr2 84601753 84601857 -97146230 + MLT1H LTR MaLR 65 172 -383 2 1230 244 288 120 56 chr2 84601991 84602011 -97146076 + MLT1H LTR MaLR 173 196 -359 2 1230 977 183 5 27 chr2 84602629 84602814 -97145273 + ORR1D1 LTR MaLR 1 181 -193 2 1230 862 206 139 0 chr2 84602914 84603108 -97144979 + ORR1D1 LTR MaLR 154 374 0 2 1230 227 346 82 15 chr2 84604666 84604801 -97143286 + MLT1H2 LTR MaLR 4 147 -342 2 1230 2291 126 56 5 chr2 84604901 84605276 -97142811 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 2 1230 362 246 7 103 chr2 84606579 84606614 -97141473 - MT2B LTR ERVL -445 156 135 2 1230 265 311 19 28 chr2 84617010 84617116 -97130971 + ORR1E LTR MaLR 275 379 0 2 1230 1056 301 72 25 chr2 84617116 84617696 -97130391 + ORR1E-int LTR MaLR 1 669 -911 2 1230 506 247 192 107 chr2 84617713 84617896 -97130191 - RMER17C LTR ERVK -66 344 165 2 1230 506 247 192 107 chr2 84617987 84618120 -97129967 - RMER17C LTR ERVK -246 164 1 2 1230 1474 303 121 42 chr2 84618237 84618821 -97129266 + ORR1E-int LTR MaLR 738 1287 -293 2 1230 345 313 96 82 chr2 84618843 84619146 -97128941 + ORR1E LTR MaLR 51 357 -2 2 1230 254 109 45 50 chr2 84621309 84621376 -97126711 - MTEb LTR MaLR 0 379 313 3 1230 1227 221 38 63 chr2 84622810 84623129 -97124958 + RMER19B LTR ERVK 592 902 0 3 1230 614 235 258 19 chr2 84623942 84624198 -97123889 + MLT2C1 LTR ERVL 81 397 0 3 1230 1252 301 109 15 chr2 84624198 84624663 -97123424 + LTR53 LTR ERVL 11 519 0 3 1230 605 178 56 9 chr2 84624852 84624958 -97123129 - RMER5 LTR ERV1 -13 521 411 3 1230 2180 86 58 13 chr2 84624958 84625266 -97122821 + ORR1A2 LTR MaLR 1 322 -5 3 1230 1246 252 26 76 chr2 84625266 84625743 -97122344 - RMER5 LTR ERV1 -119 415 1 3 1230 1549 152 123 72 chr2 84626545 84626657 -97121430 + RMER17C LTR ERVK 1 109 -301 3 1230 1549 152 123 72 chr2 84626851 84626940 -97121147 + RMER17C LTR ERVK 110 182 -228 3 1230 1549 152 123 72 chr2 84626984 84627171 -97120916 + RMER17C LTR ERVK 183 410 0 3 1230 465 234 110 1 chr2 84627974 84628110 -97119977 + ORR1D2 LTR MaLR 8 162 -222 3 1230 285 238 97 52 chr2 84629841 84629959 -97118128 + RMER17D LTR ERVK 319 496 -410 3 1230 285 238 97 52 chr2 84630070 84630192 -97117895 + RMER17D LTR ERVK 497 683 -223 3 1230 3589 83 54 0 chr2 84634106 84634587 -97113500 + LTRIS4 LTR ERV1 1 507 0 3 1230 3725 122 74 26 chr2 84634833 84635489 -97112598 + RMER17D2 LTR ERVK 1 688 -121 3 1230 2002 151 70 89 chr2 84635489 84635998 -97112089 - RLTR1B LTR ERV1 0 512 1 3 1230 798 134 0 8 chr2 84635998 84636124 -97111963 + RMER17D2 LTR ERVK 685 809 0 3 1230 298 236 42 0 chr2 84647892 84647964 -97100123 + MTD LTR MaLR 1 75 -304 4 1230 736 180 378 4 chr2 84648145 84648374 -97099713 + MTD LTR MaLR 105 419 0 4 1230 3743 68 14 6 chr2 84649749 84650241 -97097846 + LTRIS2 LTR ERV1 69 564 0 4 1230 239 320 0 93 chr2 84654248 84654260 -97093827 - MT2B2 LTR ERVL -347 237 160 4 1230 326 272 0 12 chr2 84658246 84658328 -97089759 + MTEb LTR MaLR 280 360 -19 4 1230 1195 319 28 0 chr2 84665323 84665683 -97082404 + MTEa LTR MaLR 1 370 -9 4 1230 299 260 19 103 chr2 84668567 84668674 -97079413 - MT2B LTR ERVL -348 253 156 4 1231 565 277 164 48 chr2 84673230 84673480 -97074607 + MLT1F2 LTR MaLR 3 281 -279 4 1231 341 317 57 16 chr2 84673501 84673623 -97074464 + MLT1F2 LTR MaLR 333 459 -101 4 1231 1391 170 174 12 chr2 84684933 84685255 -97062832 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 4 1231 3303 216 72 19 chr2 84685260 84686102 -97061985 - ORR1D1-int LTR MaLR -6 1364 478 4 1231 371 365 156 30 chr2 84698132 84698533 -97049554 - MLT1F2 LTR MaLR -2 558 84 5 1231 371 226 0 142 chr2 84701088 84701222 -97046865 - MT2B LTR ERVL -337 264 150 5 1231 1441 204 74 17 chr2 84704102 84704452 -97043635 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 5 5 1231 303 173 0 0 chr2 84713653 84713705 -97034382 - MTE2b LTR MaLR -327 52 1 5 1231 269 336 58 0 chr2 84738198 84738302 -97009785 - MLT1L LTR MaLR -98 512 403 5 1231 276 343 65 88 chr2 84738375 84738669 -97009418 - ORR1D2 LTR MaLR -4 366 80 5 1231 2341 102 244 48 chr2 84738802 84739277 -97008810 + RLTR6_Mm LTR ERV1 37 604 -50 5 1231 63622 29 12 5 chr2 84739279 84747001 -97001086 + RLTR6-int LTR ERV1 2 7778 0 5 1231 2222 102 256 48 chr2 84747109 84747563 -97000524 + RLTR6_Mm LTR ERV1 37 584 -70 5 1231 263 279 44 0 chr2 84747561 84747629 -97000458 - ORR1D2 LTR MaLR -288 71 1 5 1231 398 169 35 0 chr2 84748011 84748092 -96999995 + MTEa LTR MaLR 289 374 -5 5 1231 1914 164 142 0 chr2 84754295 84754660 -96993427 + MTC LTR MaLR 5 421 0 6 1231 407 273 102 77 chr2 84754714 84754960 -96993127 + MTEa LTR MaLR 125 376 -3 6 1231 334 257 51 40 chr2 84755106 84755382 -96992705 + RMER17D LTR ERVK 293 571 -318 6 1231 422 248 181 0 chr2 84755525 84755658 -96992429 + MLT2F LTR ERVL 4 160 -503 6 1231 461 291 149 63 chr2 84755700 84756001 -96992086 + MLT2F LTR ERVL 275 601 -62 6 1231 1215 238 64 41 chr2 84756104 84756543 -96991544 + MT2A LTR ERVL 9 588 -13 6 1231 250 260 0 0 chr2 84760376 84760449 -96987638 - RLTR42-int LTR ERVK -4494 1028 956 6 1231 2065 172 221 7 chr2 84761446 84761880 -96986207 - RLTR11A2 LTR ERVK 0 527 1 6 1231 718 224 87 12 chr2 84761880 84762133 -96985954 - MYSERV-int LTR ERVK 0 6550 6279 6 1231 4581 175 24 61 chr2 84763972 84764467 -96983620 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -273 2053 1564 6 1231 4581 175 24 61 chr2 84764610 84764855 -96983232 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -763 1563 1326 6 1231 4581 175 24 61 chr2 84765034 84765372 -96982715 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -1001 1325 1014 6 1231 3560 15 5 0 chr2 84766673 84767067 -96981020 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 1231 9503 28 3 1 chr2 84767067 84768163 -96979924 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 6 1231 3531 25 2 0 chr2 84768163 84768558 -96979529 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 1231 2214 292 61 67 chr2 84769614 84770446 -96977641 + MTE-int LTR MaLR 1 827 -753 6 1231 442 248 71 98 chr2 84770472 84770655 -96977432 + MTEa LTR MaLR 202 379 0 6 1231 692 171 24 8 chr2 84771606 84771730 -96976357 + MT2A LTR ERVL 1 126 -407 6 1231 3534 35 58 152 chr2 84772645 84773218 -96974869 + MURVY-LTR LTR ERV1 1 519 0 6 1231 652 251 196 44 chr2 84779776 84780097 -96967990 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 6 1231 797 306 152 12 chr2 84780610 84780938 -96967149 - MTE2a LTR MaLR -5 374 1 6 1231 2041 169 30 16 chr2 84782169 84782542 -96965545 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 6 1231 299 362 55 6 chr2 84785885 84786049 -96962038 + MLT1L LTR MaLR 108 279 -331 6 1231 463 343 106 8 chr2 84787564 84787799 -96960288 - MLT1H LTR MaLR -185 364 107 6 1231 3349 33 8 2 chr2 84794077 84794471 -96953616 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 7 1231 2173 165 76 20 chr2 84800015 84800410 -96947677 - MTC LTR MaLR -2 419 3 7 1232 912 250 181 16 chr2 84806679 84806994 -96941093 + MTEa LTR MaLR 1 367 -12 7 1232 479 233 168 20 chr2 84807219 84807363 -96940724 + MTE-int LTR MaLR 66 231 -1349 7 1232 686 80 10 39 chr2 84808475 84808579 -96939508 - RMER19B LTR ERVK 0 902 802 7 1232 522 141 12 0 chr2 84808576 84808661 -96939426 - RMER19B LTR ERVK -816 86 1 7 1232 732 347 109 6 chr2 84815910 84816318 -96931769 - MLT1E3 LTR MaLR -2 622 216 7 1232 785 247 253 0 chr2 84824092 84824392 -96923695 - MTEa LTR MaLR -2 377 2 7 1232 309 289 24 59 chr2 84824441 84824610 -96923477 + LTR16E1 LTR ERVL 317 533 -5 7 1232 2293 185 17 15 chr2 84827400 84827812 -96920275 - MTC LTR MaLR -8 413 1 7 1232 308 327 75 87 chr2 84831929 84832321 -96915766 - ORR1D2 LTR MaLR -4 366 1 7 1232 301 198 326 67 chr2 84845163 84845298 -96902789 + MLT1J2 LTR MaLR 279 448 0 8 1232 337 223 117 87 chr2 84845855 84845958 -96902129 + MLT1A1 LTR MaLR 22 127 -281 8 1232 477 200 27 18 chr2 84854928 84855040 -96893047 + LTR33 LTR ERVL 403 515 0 8 1232 1431 241 49 16 chr2 84857782 84858149 -96889938 + MTEa LTR MaLR 1 379 0 8 1232 710 215 80 7 chr2 84858151 84858301 -96889786 + MTEa-int LTR MaLR 2 162 -1418 8 1232 3603 274 32 46 chr2 84858300 84859298 -96888789 + MTEa-int LTR MaLR 429 1412 -168 8 1232 2971 35 0 25 chr2 84859372 84859727 -96888360 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 8 1232 247 286 57 100 chr2 84860143 84860283 -96887804 + RLTR41 LTR ERV1 251 384 -62 8 1232 635 286 19 0 chr2 84860338 84860492 -96887595 + MTEa-int LTR MaLR 1414 1570 -10 8 1232 546 252 97 7 chr2 84860502 84860646 -96887441 + MTEa LTR MaLR 1 157 -222 8 1232 3225 131 116 20 chr2 84868612 84869197 -96878890 + RMER6D LTR ERVK 1 641 -79 8 1232 675 79 409 0 chr2 84869292 84869419 -96878668 + RMER6D LTR ERVK 1 179 -541 8 1232 365 214 57 0 chr2 84869416 84869486 -96878601 + RMER6D LTR ERVK 641 714 -6 8 1232 3136 54 15 8 chr2 84871708 84872101 -96875986 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 8 1232 496 217 34 81 chr2 84881925 84881958 -96866129 - MT2B LTR ERVL -326 257 125 8 1232 235 330 52 21 chr2 84883517 84883613 -96864474 - MLT1K LTR MaLR -72 523 425 8 1232 362 322 142 54 chr2 84913316 84913648 -96834439 - MTEa LTR MaLR 0 379 19 9 1232 330 279 148 0 chr2 84913734 84913856 -96834231 - MLT1J2 LTR MaLR -10 438 299 9 1232 853 288 60 29 chr2 84913871 84914186 -96833901 - MLT1A0 LTR MaLR -1 364 40 9 1232 1786 316 122 77 chr2 84914223 84915205 -96832882 - MLT-int LTR MaLR -114 1621 596 9 1232 286 281 22 11 chr2 84915226 84915316 -96832771 - MTEa LTR MaLR -43 336 246 9 1232 260 254 30 0 chr2 84915401 84915468 -96832619 - MTEa LTR MaLR -248 111 43 9 1232 339 290 43 51 chr2 84915526 84915664 -96832423 - MLT1A0-int LTR MaLR -829 542 391 9 1232 624 303 91 5 chr2 84915646 84915865 -96832222 - MER21B LTR ERV1 -258 605 368 9 1232 274 215 108 48 chr2 84915878 84915961 -96832126 - MTE2a LTR MaLR -14 365 278 9 1232 248 297 30 99 chr2 84916162 84916293 -96831794 - MTE2a LTR MaLR -150 209 88 9 1232 383 289 46 15 chr2 84916326 84916456 -96831631 - MLT1A0 LTR MaLR -274 134 1 9 1232 419 258 20 20 chr2 84916456 84916555 -96831532 - MER21B LTR ERV1 -491 372 274 9 1232 499 265 28 62 chr2 84916949 84917126 -96830961 - MTD LTR MaLR -54 365 195 9 1232 1502 175 93 19 chr2 84917527 84917844 -96830243 + ORR1B2 LTR MaLR 2 308 -59 9 1232 4835 104 49 38 chr2 84917896 84918693 -96829394 - ORR1A3-int LTR MaLR -191 1772 974 9 1232 3183 182 53 35 chr2 84925382 84926113 -96821974 - ORR1A3-int LTR MaLR -918 874 147 9 1232 2695 152 89 17 chr2 84926113 84926594 -96821493 - RLTR17 LTR ERVK 0 692 177 9 1232 638 285 30 35 chr2 84926578 84926778 -96821309 - MLT1A0 LTR MaLR -164 201 3 9 1232 595 218 81 25 chr2 84927024 84927184 -96820903 + MTD LTR MaLR 251 419 0 9 1232 238 278 10 82 chr2 84928238 84928336 -96819751 + RMER12 LTR ERVK 750 840 -482 9 1232 230 151 56 19 chr2 84931970 84932024 -96816063 - RMER17A LTR ERVK -573 178 123 9 1233 903 289 107 36 chr2 84938518 84938881 -96809206 - MLT1B LTR MaLR 0 390 2 9 1233 479 301 121 68 chr2 84940169 84940433 -96807654 + MLT1A LTR MaLR 35 312 -62 9 1233 2094 222 58 47 chr2 84941075 84941606 -96806481 - RMER19C LTR ERVK 0 611 46 9 1233 337 376 0 78 chr2 84941624 84941777 -96806310 + MLT1A LTR MaLR 446 586 -9 9 1233 1496 214 148 8 chr2 84941958 84942317 -96805770 + MTD LTR MaLR 11 419 0 9 1233 619 149 0 0 chr2 84943064 84943158 -96804929 + RMER13A LTR ERVK 1 94 -766 9 1233 279 188 21 0 chr2 84943163 84943211 -96804876 + RMER13A LTR ERVK 860 908 0 9 1233 1386 218 9 25 chr2 84945329 84945644 -96802443 - ORR1D1 LTR MaLR -6 368 59 9 1233 3730 39 5 2 chr2 84948416 84948851 -96799236 + RLTR10C LTR ERVK 1 436 0 9 1233 228 326 31 10 chr2 84973703 84973799 -96774288 - LTR82A LTR ERVL -310 562 465 1 1233 1132 262 69 30 chr2 84994315 84994677 -96753410 - MTEb LTR MaLR -3 376 1 1 1233 3201 51 5 5 chr2 85016054 85016450 -96731637 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 1233 325 288 0 9 chr2 85016618 85016723 -96731364 + MLT1A1 LTR MaLR 305 408 0 4 1233 294 373 79 29 chr2 85025247 85025526 -96722561 + MLT1J2-int LTR MaLR 541 833 -554 6 1233 396 279 52 104 chr2 85025550 85025742 -96722345 + MLT1J2-int LTR MaLR 1035 1216 -171 6 1233 303 297 245 20 chr2 85025900 85026096 -96721991 + MLT1J2 LTR MaLR 84 323 -125 6 1233 708 310 125 30 chr2 85045817 85046153 -96701934 + MLT1D LTR MaLR 138 505 0 9 1233 271 200 0 0 chr2 85046174 85046224 -96701863 + MLT1E LTR MaLR 84 133 -520 1 1233 616 269 53 32 chr2 85051490 85051736 -96696351 + ORR1E LTR MaLR 104 354 -5 1 1233 1559 141 28 21 chr2 85060308 85060591 -96687496 - RLTR31B_Mm LTR ERVK 0 557 273 1 1233 1905 64 18 0 chr2 85060708 85060990 -96687097 - RLTR31B_Mm LTR ERVK -270 287 1 1 1234 2372 164 96 14 chr2 85071943 85072034 -96676053 - RLTR20A LTR ERVK 0 541 441 1 1234 2372 164 96 14 chr2 85072072 85072480 -96675607 - RLTR20A LTR ERVK -101 440 2 1 1234 3553 13 5 0 chr2 85073397 85073791 -96674296 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 1234 1017 250 197 9 chr2 85082969 85083284 -96664803 + MTEa LTR MaLR 3 376 -3 1 1234 425 306 86 89 chr2 85083790 85084195 -96663892 + MLT1C LTR MaLR 64 467 0 1 1234 710 295 101 18 chr2 85085251 85085638 -96662449 - MLT1D LTR MaLR -58 447 29 1 1234 2378 81 9 59 chr2 85094645 85094985 -96653102 + ORR1A2 LTR MaLR 5 327 0 1 1234 2835 139 16 8 chr2 85094985 85095477 -96652610 + ORR1A2-int LTR MaLR 1 496 -1467 1 1234 1926 82 49 76 chr2 85095507 85095835 -96652252 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 1 1234 364 317 181 9 chr2 85096608 85096923 -96651164 - MER21B LTR ERV1 -61 802 434 1 1234 729 332 103 20 chr2 85097521 85098065 -96650022 - MLT1L LTR MaLR -9 601 13 1 1234 356 267 94 8 chr2 85098088 85098205 -96649882 - MLT1C LTR MaLR -4 463 337 1 1234 759 231 84 93 chr2 85098943 85099389 -96648698 - RMER2 LTR ERV1 -27 540 1 1 1234 2045 116 3 33 chr2 85100965 85101294 -96646793 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 1 1234 2880 107 37 11 chr2 85106858 85107294 -96640793 - RLTR44B LTR ERVK 0 449 3 2 1234 356 310 10 0 chr2 85109555 85109655 -96638432 - MLT1A0 LTR MaLR -54 311 211 2 1234 2705 211 40 4 chr2 85116282 85116834 -96631253 - RMER15 LTR ERVL -3 572 1 2 1234 3624 44 5 2 chr2 85122258 85122693 -96625394 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 2 1234 649 340 76 73 chr2 85126110 85126424 -96621663 + MLT1K LTR MaLR 182 496 -99 2 1234 327 240 35 80 chr2 85126474 85126587 -96621500 - MLT1C LTR MaLR 0 467 360 2 1234 674 307 125 44 chr2 85127773 85128069 -96620018 + MLT1A LTR MaLR 44 363 -11 2 1234 247 358 103 40 chr2 85145655 85145908 -96602179 - LTR88b LTR Gypsy? -558 279 11 2 1234 1525 246 75 6 chr2 85153120 85153467 -96594620 + MTEa LTR MaLR 1 371 -8 2 1234 378 316 81 162 chr2 85155520 85155618 -96592469 - MLT1F2 LTR MaLR 0 560 460 2 1234 378 316 81 162 chr2 85155698 85155882 -96592205 - MLT1F2 LTR MaLR -101 459 301 2 1234 753 279 133 101 chr2 85161564 85161939 -96586148 + MLT1B LTR MaLR 1 387 -3 2 1234 2889 168 91 31 chr2 85162099 85162459 -96585628 + RMER6C LTR ERVK 1 385 -305 2 1234 2889 168 91 31 chr2 85162539 85162829 -96585258 + RMER6C LTR ERVK 386 689 -1 2 1234 1931 122 28 25 chr2 85164437 85164764 -96583323 + ORR1A4 LTR MaLR 2 329 0 2 1234 4531 95 186 34 chr2 85165016 85165803 -96582284 + RMER17A2 LTR ERVK 1 906 0 2 1234 1032 182 22 0 chr2 85166343 85166524 -96581563 + RMER19C LTR ERVK 427 611 0 2 1234 951 243 95 76 chr2 85180161 85180477 -96567610 - ORR1E LTR MaLR 0 359 38 3 1234 318 311 40 24 chr2 85180949 85181074 -96567013 + MLT1-int LTR MaLR 161 287 -1084 3 1234 573 327 40 133 chr2 85181065 85181495 -96566592 + MLT-int LTR MaLR 374 763 -972 3 1234 358 256 169 22 chr2 85181607 85181662 -96566425 + MTC LTR MaLR 3 64 -357 3 1234 358 256 169 22 chr2 85181877 85181957 -96566130 + MTC LTR MaLR 65 158 -263 3 1235 958 236 98 76 chr2 85203973 85204289 -96543798 - ORR1E LTR MaLR 0 359 37 3 1235 234 312 10 31 chr2 85204754 85204850 -96543237 + MLT1-int LTR MaLR 161 254 -1117 3 1235 455 312 40 11 chr2 85204885 85205060 -96543027 + MLT-int LTR MaLR 385 564 -1171 3 1235 250 356 44 0 chr2 85212169 85212259 -96535828 + MLT-int LTR MaLR 675 768 -967 3 1235 714 212 96 6 chr2 85212366 85212424 -96535663 + MTC LTR MaLR 3 60 -361 3 1235 714 212 96 6 chr2 85212655 85212762 -96535325 + MTC LTR MaLR 61 183 -238 3 1235 403 372 21 21 chr2 85213683 85213870 -96534217 + LTR16B LTR ERVL 126 312 -151 3 1235 2013 104 184 0 chr2 85218638 85219014 -96529073 + RLTR47_MM LTR ERV1 2 446 -86 3 1235 2491 199 58 52 chr2 85219595 85220086 -96528001 - RMER6A LTR ERVK -13 743 354 3 1235 2491 193 61 46 chr2 85220141 85220366 -96527721 - RMER6A LTR ERVK -403 353 109 3 1235 1202 241 77 58 chr2 85227240 85227605 -96520482 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 3 3 1235 402 202 28 83 chr2 85259257 85259365 -96488722 - MT2B LTR ERVL -345 256 155 4 1235 394 241 17 17 chr2 85266159 85266277 -96481810 - MLT1A0-int LTR MaLR -1617 118 1 4 1235 469 323 18 15 chr2 85266282 85266474 -96481613 - MLT1A0 LTR MaLR -11 363 173 4 1235 289 324 0 0 chr2 85267079 85267153 -96480934 + RMER15 LTR ERVL 284 357 -218 4 1235 708 246 97 93 chr2 85277874 85278301 -96469786 - RLTR11B LTR ERVK -11 430 1 4 1235 778 299 147 17 chr2 85285467 85285827 -96462260 + MTD LTR MaLR 1 407 -12 4 1235 2409 197 126 24 chr2 85288727 85289355 -96458732 - RLTR17 LTR ERVK 0 692 1 4 1235 610 242 31 182 chr2 85291455 85291713 -96456374 - MTD LTR MaLR -193 226 4 4 1235 6498 58 60 2 chr2 85295435 85296279 -96451808 + RLTR13B1 LTR ERVK 1 893 0 4 1235 1269 209 199 9 chr2 85296760 85297102 -96450985 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 4 1235 1110 182 121 21 chr2 85297590 85297852 -96450235 - RLTR22_Mur LTR ERVK 0 1848 1558 4 1235 1110 182 121 21 chr2 85298031 85298049 -96450038 - RLTR22_Mur LTR ERVK -291 1557 1541 4 1235 316 289 107 8 chr2 85299647 85299769 -96448318 + MLT1A1 LTR MaLR 263 396 -12 5 1235 3976 57 20 0 chr2 85300478 85300971 -96447116 + RLTR1C LTR ERV1 1 503 0 5 1235 4050 145 15 86 chr2 85307097 85307887 -96440200 + RLTR25B LTR ERVK 1 734 -294 5 1235 2963 45 3 0 chr2 85311783 85312136 -96435951 + IAPLTR4_I LTR ERVK 1 354 -3 5 1235 3343 128 8 8 chr2 85312136 85312808 -96435279 + IAPLTR4_I LTR ERVK 17 1057 -413 5 1235 1860 103 113 0 chr2 85312842 85313152 -96434935 + IAPLTR4 LTR ERVK 1 345 0 5 1235 1092 78 32 25 chr2 85313152 85313309 -96434778 + IAPLTR4_I LTR ERVK 19 176 -1294 5 1235 1194 145 24 50 chr2 85313308 85313705 -96434382 + IAPLTR4_I LTR ERVK 407 952 -6629 5 1235 1368 213 107 34 chr2 85313824 85314256 -96433831 + RMER16-int LTR ERVK 255 623 -4783 5 1235 373 236 118 0 chr2 85314293 85314403 -96433684 + RLTR19-int LTR ERVK 938 1060 -5077 5 1235 10425 92 31 12 chr2 85314508 85315741 -96432346 + ETnERV3-int LTR ERVK 2735 3976 -1832 5 1235 10425 92 31 12 chr2 85315779 85316154 -96431933 + ETnERV3-int LTR ERVK 3977 4373 -1435 5 1235 10847 104 11 9 chr2 85316146 85317338 -96430749 + MMERVK10C-int LTR ERVK 3102 4291 -3290 5 1235 10847 104 11 9 chr2 85317367 85317739 -96430348 + MMERVK10C-int LTR ERVK 4292 4669 -2912 5 1235 6303 250 53 36 chr2 85317848 85320342 -96427745 + IAPLTR3-int LTR ERVK 3468 7329 -351 5 1235 1879 97 113 0 chr2 85320342 85320652 -96427435 + IAPLTR4 LTR ERVK 1 345 0 5 1235 6801 105 6 1 chr2 85320668 85321613 -96426474 + IAPEY3-int LTR ERVK 1033 1982 -5698 5 1235 3539 65 7 0 chr2 85321593 85322038 -96426049 + IAPEY3-int LTR ERVK 2242 2689 -4991 5 1235 454 68 0 0 chr2 85322031 85322090 -96425997 + IAPEY3-int LTR ERVK 4852 4910 -2770 5 1235 3415 114 15 29 chr2 85322090 85322823 -96425264 + IAPEY3-int LTR ERVK 6907 7581 0 5 1235 2706 36 78 0 chr2 85322823 85323154 -96424933 + IAPEY2_LTR LTR ERVK 1 357 0 5 1236 399 315 81 113 chr2 85331265 85331789 -96416298 + MER67A LTR ERV1 12 504 -10 5 1236 2861 49 0 17 chr2 85354119 85354471 -96393616 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 5 1236 351 212 18 13 chr2 85368465 85368549 -96379538 - MTE2b LTR MaLR -14 407 305 6 1236 1268 269 119 30 chr2 85369220 85369692 -96378395 - RLTR20B3 LTR ERVK -43 534 21 6 1236 251 400 50 0 chr2 85401753 85401893 -96346194 - LTR16C LTR ERVL -204 285 139 6 1236 2046 138 3 0 chr2 85404596 85404914 -96343173 + ORR1A4 LTR MaLR 3 321 -8 6 1236 4432 179 73 36 chr2 85404920 85406135 -96341952 + ORR1A4-int LTR MaLR 2 1826 -137 6 1236 1484 152 119 68 chr2 85407411 85407721 -96340366 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 6 1236 747 172 0 7 chr2 85407721 85407856 -96340231 - ORR1A3-int LTR MaLR 0 1963 1830 6 1236 1380 193 68 88 chr2 85412473 85412926 -96335161 + RMER6A LTR ERVK 327 719 -1 6 1236 1009 217 92 46 chr2 85457146 85457527 -96290560 - RMER6A LTR ERVK -38 718 396 7 1237 6826 55 5 3 chr2 85481276 85482130 -96265957 + RLTR13A LTR ERVK 1 855 0 7 1237 287 345 35 21 chr2 85486367 85486512 -96261575 - MER67D LTR ERV1 -362 152 6 7 1237 264 352 98 36 chr2 85502146 85502370 -96245717 - MER67D LTR ERV1 -255 259 22 4 1237 468 349 76 32 chr2 85519262 85519632 -96228455 + MLT1B LTR MaLR 3 388 -2 2 1237 2060 217 20 36 chr2 85534234 85534735 -96213352 - RMER13B LTR ERVK 0 908 416 4 1237 2831 27 0 9 chr2 85534735 85535075 -96213012 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 337 0 4 1237 55443 22 14 7 chr2 85535075 85541505 -96206582 + IAPEz-int LTR ERVK 8 6481 0 4 1237 2819 30 0 9 chr2 85541505 85541845 -96206242 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 337 0 4 1237 2314 167 32 10 chr2 85541845 85542257 -96205830 - RMER13B LTR ERVK -487 421 1 4 1237 846 168 6 6 chr2 85547321 85547477 -96200610 + RMER6-int LTR ERVK 237 392 -2785 5 1237 1982 183 8 5 chr2 85548571 85548940 -96199147 + RMER6-int LTR ERVK 434 803 -2374 5 1237 1072 164 5 5 chr2 85549151 85549335 -96198752 + RMER6-int LTR ERVK 795 978 -2199 5 1237 5919 74 9 0 chr2 85550556 85551356 -96196731 + RLTR22_Mus LTR ERVK 1 807 -1001 6 1237 425 279 81 81 chr2 85551571 85551793 -96196294 + RMER12 LTR ERVK 1101 1322 0 6 1237 347 182 15 15 chr2 85552522 85552589 -96195498 + ORR1A3 LTR MaLR 5 71 -299 7 1237 9685 151 61 30 chr2 85552622 85553070 -96195017 + ORR1A3-int LTR MaLR 1 457 -1506 7 1237 9685 151 61 30 chr2 85553250 85554706 -96193381 + ORR1A3-int LTR MaLR 458 1963 0 7 1237 2138 132 0 3 chr2 85554706 85555033 -96193054 + ORR1A3 LTR MaLR 1 326 0 7 1237 2216 211 34 67 chr2 85555981 85556515 -96191572 - RMER20A LTR ERVK 0 516 1 7 1237 4607 273 31 40 chr2 85556518 85557801 -96190286 - MERVK26-int LTR ERVK -3 6916 5645 7 1237 1603 233 58 0 chr2 85557803 85558146 -96189941 - MERVK26-int LTR ERVK -1432 5487 5125 7 1237 1125 169 11 0 chr2 85558407 85558590 -96189497 - RMER20A LTR ERVK -331 185 1 7 1237 709 274 142 25 chr2 85559900 85560260 -96187827 - LTR65 LTR ERV1 -267 402 1 7 1237 2227 177 27 22 chr2 85573824 85574235 -96173852 + MTC LTR MaLR 1 413 -8 9 1238 1891 163 3 7 chr2 85597468 85597777 -96150310 - RLTR10E LTR ERVK -3 308 1 1 1238 264 260 154 37 chr2 85611469 85611657 -96136430 - RLTR12B LTR ERVK -187 341 132 1 1238 531 351 40 18 chr2 85619887 85620113 -96127974 + MER70A LTR ERVL 242 472 0 1 1238 294 236 0 3 chr2 85620605 85620672 -96127415 - MLT1C LTR MaLR -36 431 372 1 1238 709 220 37 41 chr2 85620682 85620902 -96127185 + MTD LTR MaLR 14 303 -116 1 1238 1057 169 27 5 chr2 85628677 85628861 -96119226 + ORR1C2 LTR MaLR 192 379 -5 1 1238 627 280 67 33 chr2 85631337 85631581 -96116506 - LTRIS4 LTR ERV1 0 507 254 1 1238 1979 111 87 44 chr2 85632610 85632977 -96115110 + RLTR9A2 LTR ERVK 1 383 0 1 1238 1355 266 37 14 chr2 85647011 85647428 -96100659 + MT2A LTR ERVL 1 460 -73 2 1238 518 230 99 35 chr2 85647645 85647816 -96100271 + MERVL_2A-int LTR ERVL 249 430 -5331 2 1238 782 197 7 7 chr2 85648974 85649112 -96098975 + RLTR25A LTR ERVK 966 1103 0 2 1238 396 277 92 5 chr2 85664174 85664370 -96083717 + LTR65 LTR ERV1 41 253 -416 2 1238 270 365 43 16 chr2 85664991 85665175 -96082912 + LTR65 LTR ERV1 263 451 -218 2 1238 3764 149 130 20 chr2 85667879 85668261 -96079826 - RMER17A2 LTR ERVK -11 895 447 2 1238 3764 149 130 20 chr2 85668325 85668748 -96079339 - RMER17A2 LTR ERVK -460 446 2 2 1238 2893 49 0 0 chr2 85676178 85676524 -96071563 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 2 1238 272 238 0 125 chr2 85685933 85686029 -96062058 - MT2B LTR ERVL -362 239 156 2 1238 2649 180 105 84 chr2 85712254 85712958 -96035129 + RLTR40 LTR ERVK 1 719 -98 2 1238 576 202 54 0 chr2 85713042 85713171 -96034916 + RLTR40 LTR ERVK 98 233 -584 2 1238 459 271 14 27 chr2 85716447 85716595 -96031492 + MLT1A1 LTR MaLR 261 406 -2 3 1239 3818 167 10 28 chr2 85724212 85724932 -96023155 - RMER6A LTR ERVK -49 707 1 3 1239 2632 229 105 62 chr2 85731043 85731130 -96016957 - RLTR22_Mur LTR ERVK 0 1848 1751 3 1239 2632 229 105 62 chr2 85731431 85731838 -96016249 - RLTR22_Mur LTR ERVK -98 1750 1349 3 1239 2632 229 105 62 chr2 85731909 85732078 -96016009 - RLTR22_Mur LTR ERVK -500 1348 1163 3 1239 2632 229 105 62 chr2 85732103 85732245 -96015842 - RLTR22_Mur LTR ERVK -686 1162 1006 3 1239 1420 17 0 0 chr2 85733679 85733851 -96014236 + MTA_Mm LTR MaLR 1 172 -224 3 1239 3170 53 5 2 chr2 85734359 85734754 -96013333 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 1239 9093 36 2 3 chr2 85734754 85735853 -96012234 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 3 1239 3368 38 2 0 chr2 85735853 85736248 -96011839 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 1239 364 121 265 0 chr2 85741559 85741642 -96006445 - RLTR22_Mur LTR ERVK -812 1036 932 3 1239 322 152 12 12 chr2 85741738 85741818 -96006269 - RLTR22_Mus LTR ERVK -1052 756 677 3 1239 2979 134 103 25 chr2 85741933 85742490 -96005597 + RLTR1D LTR ERV1 1 605 0 3 1239 980 246 60 19 chr2 85745421 85745686 -96002401 + RMER5 LTR ERV1 156 431 -103 3 1239 2177 194 141 51 chr2 85749388 85749988 -95998099 - RMER6C LTR ERVK 0 690 33 3 1239 1953 219 88 32 chr2 85749988 85750525 -95997562 + RMER2 LTR ERV1 1 567 0 3 1239 2177 194 141 51 chr2 85750525 85750554 -95997533 - RMER6C LTR ERVK -658 32 4 3 1239 321 325 12 77 chr2 85770340 85770510 -95977577 + RMER10B LTR ERVL 194 352 -46 3 1239 1171 121 9 66 chr2 85771176 85771388 -95976699 - RLTR9E LTR ERVK -19 390 191 3 1239 651 36 0 12 chr2 85771390 85771475 -95976612 - RLTR9E LTR ERVK -325 84 1 3 1239 2612 123 30 0 chr2 85773049 85773456 -95974631 + BGLII LTR ERVK 1 419 -2 3 1239 465 331 57 38 chr2 85773787 85774157 -95973930 + MTEa LTR MaLR 3 379 0 3 1239 3224 13 59 10 chr2 85776515 85776907 -95971180 + IAPLTR2a LTR ERVK 1 411 0 3 1239 631 268 14 7 chr2 85777522 85777665 -95970422 - ETnERV2-int LTR ERVK -204 7202 7059 3 1239 2588 86 11 5 chr2 85780521 85780894 -95967193 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 22 3 1239 1054 237 25 95 chr2 85782105 85782422 -95965665 + RMER10B LTR ERVL 19 313 -85 3 1239 397 338 118 6 chr2 85792335 85792674 -95955413 + MTEa LTR MaLR 3 379 0 4 1239 312 419 0 6 chr2 85793057 85793218 -95954869 + MTEa LTR MaLR 2 161 -218 4 1239 1540 108 35 4 chr2 85793514 85793746 -95954341 + RLTR9C LTR ERVK 1 239 -154 4 1239 862 119 16 24 chr2 85794191 85794369 -95953718 + RLTR9C LTR ERVK 234 409 0 4 1239 2670 64 0 14 chr2 85798219 85798569 -95949518 + IAPLTR4 LTR ERVK 1 345 0 4 1239 2221 271 63 70 chr2 85798569 85799519 -95948568 + IAPLTR3-int LTR ERVK 1 944 -5877 4 1239 327 144 7 163 chr2 85799495 85799636 -95948451 + IAPLTR3-int LTR ERVK 834 952 -6629 4 1239 1000 215 115 53 chr2 85799863 85800293 -95947794 + RMER16-int LTR ERVK 312 668 -5469 4 1239 445 259 86 0 chr2 85800293 85800409 -95947678 + RMER16-int LTR ERVK 935 1060 -5077 4 1239 6861 112 53 4 chr2 85800539 85801921 -95946166 + ETnERV3-int LTR ERVK 2735 4271 -3135 4 1239 472 187 9 36 chr2 85801926 85802037 -95946050 + MMETn-int LTR ERVK 2357 2464 -2380 4 1239 712 132 35 49 chr2 85802063 85802206 -95945881 + ETnERV3-int LTR ERVK 4530 4670 -2911 4 1239 2104 207 12 22 chr2 85802315 85802885 -95945202 + IAPLTR3-int LTR ERVK 5098 5745 -1076 4 1239 720 264 32 43 chr2 85803174 85803455 -95944632 + IAPLTR3-int LTR ERVK 5466 5743 -799 4 1239 6254 185 0 8 chr2 85803775 85804835 -95943252 + IAPLTR3-int LTR ERVK 5750 6801 -20 4 1239 2635 70 0 14 chr2 85804835 85805185 -95942902 + IAPLTR4 LTR ERVK 1 345 0 4 1239 3143 56 5 2 chr2 85811342 85811737 -95936350 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 1239 510 345 52 16 chr2 85816515 85816878 -95931209 + MTEa LTR MaLR 3 378 -1 4 1239 849 287 48 34 chr2 85827583 85827887 -95920200 + MTEb LTR MaLR 93 379 0 4 1239 880 340 70 6 chr2 85828576 85828905 -95919182 + MTEa LTR MaLR 18 367 -12 4 1240 265 304 83 95 chr2 85852807 85853030 -95895057 - RLTR25A LTR ERVK 0 1103 813 4 1240 2838 61 59 19 chr2 85858615 85859096 -95888991 + RLTR6_Mm LTR ERV1 39 604 -50 4 1240 3849 41 19 16 chr2 85859096 85859865 -95888222 + MMVL30-int LTR ERV1 1 829 -6949 4 1240 393 183 108 49 chr2 85859859 85860025 -95888062 + MMVL30-int LTR ERV1 280 533 -7023 4 1240 6263 56 7 57 chr2 85860351 85861229 -95886858 + MMVL30-int LTR ERV1 772 1605 -2093 4 1240 16235 23 33 14 chr2 85861231 85863187 -95884900 + MMVL30-int LTR ERV1 1707 3698 0 4 1240 2735 63 61 20 chr2 85863280 85863747 -95884340 + RLTR6_Mm LTR ERV1 39 590 -64 4 1240 804 267 41 18 chr2 85875310 85875531 -95872556 + MTC LTR MaLR 196 421 0 5 1240 2189 221 37 12 chr2 85876457 85876948 -95871139 + RLTR28 LTR ERVL 1 503 -21 5 1240 285 330 71 50 chr2 85878317 85878499 -95869588 + MLT1A1 LTR MaLR 215 400 -8 5 1240 225 331 80 51 chr2 85888918 85889093 -95858994 + ORR1D2 LTR MaLR 1 180 -190 5 1240 3161 159 75 36 chr2 85891042 85891653 -95856434 + RLTR26 LTR ERVK 8 642 0 5 1240 360 109 62 0 chr2 85892039 85892103 -95855984 + RLTR22_Mur LTR ERVK 269 336 -1512 5 1240 2402 104 0 19 chr2 85894007 85894370 -95853717 + RLTR22_Mur LTR ERVK 326 681 -1167 5 1240 1381 191 87 12 chr2 85894428 85894761 -95853326 + RMER6C LTR ERVK 399 756 0 5 1240 574 349 82 16 chr2 85894761 85895017 -95853070 - MLT2B2 LTR ERVL -242 273 1 5 1240 250 305 43 79 chr2 85898862 85899001 -95849086 - RLTR41 LTR ERV1 -62 384 251 5 1240 6328 86 24 5 chr2 85901580 85902456 -95845631 - RLTR13B1 LTR ERVK 0 893 1 5 1240 1328 155 83 54 chr2 85907708 85908021 -95840066 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 5 1240 6263 144 4 40 chr2 85908021 85909103 -95838984 - MMETn-int LTR ERVK 0 4844 3802 5 1240 3296 132 15 0 chr2 85909119 85909589 -95838498 + ETnERV2-int LTR ERVK 4199 4675 -2731 5 1240 12138 176 36 21 chr2 85909598 85911982 -95836105 - ETnERV-int LTR ERVK -3873 2294 2 5 1240 652 129 0 101 chr2 85912059 85912188 -95835899 - RLTRETN_Mm LTR ERVK -206 116 1 5 1240 477 329 71 42 chr2 85917113 85917421 -95830666 + ORR1E LTR MaLR 1 317 -42 5 1240 1352 219 80 9 chr2 85919901 85920228 -95827859 + RMER6C LTR ERVK 1 350 -370 5 1240 3672 154 17 34 chr2 85920333 85920986 -95827101 + RLTR26 LTR ERVK 1 642 0 5 1240 448 103 0 0 chr2 85921371 85921439 -95826648 + RLTR22_Mur LTR ERVK 269 336 -1512 5 1240 2402 104 0 19 chr2 85922876 85923239 -95824848 + RLTR22_Mur LTR ERVK 326 681 -1167 5 1240 1357 198 87 12 chr2 85923297 85923630 -95824457 + RMER6C LTR ERVK 399 756 0 5 1240 593 335 90 12 chr2 85923641 85923886 -95824201 - MLT2B2 LTR ERVL -251 264 1 5 1240 265 285 40 93 chr2 85927756 85927907 -95820180 - RLTR41 LTR ERV1 -53 393 251 5 1240 853 312 80 17 chr2 85939687 85940098 -95807989 + MER31A LTR ERV1 6 442 -43 6 1240 283 401 72 7 chr2 85943536 85943689 -95804398 - LTR33A_ LTR ERVL -322 209 47 6 1240 2852 71 42 5 chr2 85945929 85946313 -95801774 - MTB LTR MaLR 0 400 3 6 1240 1225 188 105 14 chr2 85949354 85949650 -95798437 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -372 1954 1632 6 1240 908 191 9 19 chr2 85956320 85956533 -95791554 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -1547 1295 1085 6 1240 1280 260 30 3 chr2 85960536 85960898 -95787189 + ORR1D1 LTR MaLR 3 374 0 6 1240 8818 281 43 25 chr2 85978064 85978718 -95769369 - RNERVK23-int LTR ERVK -943 7274 6633 6 1240 8818 281 43 25 chr2 85978752 85981147 -95766940 - RNERVK23-int LTR ERVK -1585 6632 4172 6 1240 1203 268 20 17 chr2 85982233 85982590 -95765497 - RNERVK23-int LTR ERVK -7678 539 182 6 1240 395 234 23 81 chr2 85982750 85982922 -95765165 - RNLTR23 LTR ERVK -1 641 480 6 1241 382 265 0 0 chr2 85985420 85985503 -95762584 + ORR1D1 LTR MaLR 32 114 -260 6 1241 2593 211 30 122 chr2 85989742 85990543 -95757544 - RMER12 LTR ERVK 0 1322 596 6 1241 3332 186 32 57 chr2 85990545 85991370 -95756717 + RLTR13D3 LTR ERVK 1 1114 0 6 1241 1428 151 67 3 chr2 85991370 85991654 -95756433 - RMER12 LTR ERVK -725 597 296 6 1241 4782 187 61 9 chr2 85991865 85992292 -95755795 + RLTR25B LTR ERVK 1 430 -598 6 1241 4782 187 61 9 chr2 85992315 85992864 -95755223 + RLTR25B LTR ERVK 431 1027 -1 6 1241 556 263 7 14 chr2 85993193 85993332 -95754755 + RMER17C LTR ERVK 244 381 -29 6 1241 1023 138 417 6 chr2 85993342 85993555 -95754532 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 137 6 1241 461 208 229 19 chr2 85993577 85993677 -95754410 - RLTR23 LTR ERV1 -294 136 11 6 1241 298 50 0 24 chr2 85993677 85993718 -95754369 - RLTR23 LTR ERV1 -390 40 1 6 1241 566 275 144 87 chr2 85995740 85996039 -95752048 + RMER21B LTR ERV1 250 565 -277 7 1241 273 194 0 88 chr2 85996098 85996166 -95751921 + RMER21B LTR ERV1 773 834 -113 7 1241 402 333 23 17 chr2 86007242 86007419 -95740668 + ERVL-E-int LTR ERVL 3204 3381 -2286 1 1241 378 328 150 85 chr2 86007685 86007978 -95740109 + LTR40a LTR ERVL 204 515 -4 1 1241 2360 179 15 40 chr2 86008672 86009149 -95738938 + RMER6A LTR ERVK 1 465 -291 1 1241 1768 148 13 13 chr2 86009307 86009608 -95738479 + RMER6A LTR ERVK 447 747 -9 1 1241 1934 212 44 33 chr2 86013059 86013581 -95734506 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 1 1 1241 2767 113 28 51 chr2 86015576 86016069 -95732018 + RLTR45 LTR ERVK 1 482 0 2 1241 352 298 123 33 chr2 86019194 86019437 -95728650 + MER67C LTR ERV1 250 514 -197 3 1241 1657 124 72 123 chr2 86020143 86020574 -95727513 + RLTR9E LTR ERVK 1 409 0 3 1241 6936 99 30 1 chr2 86022326 86023320 -95724767 + RLTR13D5 LTR ERVK 1 1023 0 3 1241 3214 39 18 0 chr2 86029204 86029591 -95718496 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 3 4 1241 9005 30 18 0 chr2 86029593 86030672 -95717415 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 4 1241 1492 53 0 0 chr2 86030672 86030859 -95717228 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 210 4 1241 360 0 0 0 chr2 86030854 86030896 -95717191 - MTA_Mm LTR MaLR -354 42 1 4 1241 234 252 217 28 chr2 86034593 86034699 -95713388 + RMER21B LTR ERV1 442 567 -275 5 1241 946 281 126 6 chr2 86035992 86036318 -95711769 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 6 5 1241 470 291 37 72 chr2 86045146 86045377 -95702710 - RLTR9B LTR ERVK 0 437 119 7 1241 258 105 26 0 chr2 86045387 86045425 -95702662 - RLTR9A LTR ERVK -329 39 1 7 1241 311 304 0 19 chr2 86048841 86048945 -95699142 - RodERV21-int LTR ERV1 -1319 5772 5671 8 1241 274 182 18 0 chr2 86050254 86050309 -95697778 - RodERV21-int LTR ERV1 -3196 3895 3840 8 1241 5145 276 40 46 chr2 86050782 86051537 -95696550 - RodERV21-int LTR ERV1 -2286 2705 1963 8 1241 3618 62 2 110 chr2 86051537 86052101 -95695986 - RLTR1C LTR ERV1 0 503 1 8 1241 5145 289 40 43 chr2 86052101 86053395 -95694692 - RodERV21-int LTR ERV1 -3029 1962 729 8 1241 559 235 92 64 chr2 86053442 86053660 -95694427 - RMER17C-int LTR ERVK -2792 446 223 8 1241 2219 203 132 27 chr2 86054260 86054882 -95693205 - RMER6C LTR ERVK -3 687 1 8 1241 2822 67 77 0 chr2 86063178 86063569 -95684518 - BGLII LTR ERVK 0 421 1 9 1241 1020 249 136 6 chr2 86074022 86074353 -95673734 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 1 1241 2330 146 39 52 chr2 86086736 86087198 -95660889 + RLTR45 LTR ERVK 1 456 -26 1 1241 337 277 0 8 chr2 86100467 86100594 -95647493 - RLTR6-int LTR ERV1 -2723 5055 4979 1 1241 306 321 12 31 chr2 86101040 86101201 -95646886 - RLTR6-int LTR ERV1 -1964 5127 4970 1 1241 4896 275 34 45 chr2 86102411 86103882 -95644205 - RodERV21-int LTR ERV1 -2273 2718 1265 1 1241 1101 306 42 36 chr2 86103990 86104465 -95643622 - RodERV21-int LTR ERV1 -3785 1206 729 1 1241 497 283 81 52 chr2 86104443 86104715 -95643372 - RMER17C-int LTR ERVK -2714 524 245 1 1241 2195 201 131 26 chr2 86105368 86105987 -95642100 - RMER6C LTR ERVK -6 684 1 1 1241 1606 119 36 72 chr2 86110742 86111076 -95637011 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 1 1241 2768 72 77 0 chr2 86112730 86113120 -95634967 - BGLII LTR ERVK -1 420 1 1 1242 2899 84 12 12 chr2 86128837 86129258 -95618829 + BGLII LTR ERVK 1 421 0 1 1242 2129 132 3 6 chr2 86129666 86129994 -95618093 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 1 1242 613 275 15 0 chr2 86163979 86164110 -95583977 + ETnERV2-int LTR ERVK 7070 7202 -204 2 1242 240 317 48 16 chr2 86176529 86176654 -95571433 - MLT2B1 LTR ERVL -391 129 1 2 1242 3069 8 43 0 chr2 86179903 86180255 -95567832 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 2 1242 55354 23 17 2 chr2 86180255 86186630 -95561457 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 8 2 1242 3069 8 43 0 chr2 86186630 86186982 -95561105 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 2 1242 388 358 60 106 chr2 86189109 86189478 -95558609 - ORR1E LTR MaLR 0 359 8 2 1242 2305 144 117 136 chr2 86192386 86192974 -95555113 + RLTR13D6 LTR ERVK 321 897 -5 2 1242 698 270 11 16 chr2 86205217 86205405 -95542682 + MTE-int LTR MaLR 177 363 -1217 2 1242 2011 77 31 16 chr2 86206312 86206629 -95541458 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 2 1242 12389 61 21 18 chr2 86206629 86208308 -95539779 - MMETn-int LTR ERVK -2503 5714 3219 2 1242 1453 214 57 80 chr2 86209333 86209811 -95538276 + RMER6C LTR ERVK 220 686 -4 2 1242 1819 152 3 16 chr2 86230414 86230729 -95517358 + RLTR10E LTR ERVK 1 311 0 3 1242 3097 159 90 47 chr2 86234167 86235175 -95512912 + RLTR13D1 LTR ERVK 1 1023 0 3 1243 2025 150 142 21 chr2 86248342 86248772 -95499315 - RLTR45 LTR ERVK 0 482 1 3 1243 271 380 58 58 chr2 86259063 86259136 -95488951 - MLT2B3 LTR ERVL -259 295 58 3 1243 308 356 15 137 chr2 86259136 86259341 -95488746 - MTEa LTR MaLR -182 197 18 3 1243 271 380 58 58 chr2 86259341 86259356 -95488731 - MLT2B3 LTR ERVL -259 57 3 3 1243 2136 128 142 21 chr2 86268613 86269043 -95479044 - RLTR45 LTR ERVK 0 482 1 3 1243 1864 134 16 16 chr2 86279304 86279615 -95468472 + RLTR10E LTR ERVK 1 311 0 3 1243 3161 161 91 46 chr2 86282112 86283117 -95464970 + RLTR13D1 LTR ERVK 1 1022 -1 3 1243 1787 219 94 0 chr2 86292961 86293354 -95454733 + RMER12 LTR ERVK 4 433 -889 4 1243 2602 140 33 120 chr2 86302010 86302701 -95445386 - RMER17D2 LTR ERVK -178 631 1 4 1243 307 149 75 75 chr2 86303669 86303749 -95444338 - RLTR25B LTR ERVK -519 509 430 4 1243 266 323 71 89 chr2 86304765 86305091 -95442996 - RLTR46 LTR ERVK 0 320 1 4 1243 295 236 43 86 chr2 86329338 86329446 -95418641 - RLTR43A LTR ERVK -61 303 199 4 1243 3248 99 23 55 chr2 86336100 86336624 -95411463 + RLTR13D3 LTR ERVK 608 1114 0 4 1243 674 281 59 56 chr2 86339053 86339411 -95408676 + RLTR10D LTR ERVK 1 359 0 4 1243 457 193 25 146 chr2 86339413 86339571 -95408516 + IAP-d-int LTR ERVK 3 141 -6401 4 1243 1174 302 5 5 chr2 86339595 86340014 -95408073 + IAP-d-int LTR ERVK 3148 3566 -2976 4 1243 3217 290 17 15 chr2 86340026 86341099 -95406988 + IAP-d-int LTR ERVK 4320 5394 -1148 4 1243 3042 227 22 14 chr2 86341147 86342168 -95405919 + IAP-d-int LTR ERVK 5402 6542 0 4 1243 794 260 57 57 chr2 86342168 86342519 -95405568 + RLTR10D LTR ERVK 1 351 -8 4 1243 339 201 6 89 chr2 86345435 86345593 -95402494 + RMER17A LTR ERVK 310 454 -297 4 1243 274 217 14 42 chr2 86352455 86352527 -95395560 + RLTR14 LTR ERV1 273 342 -40 4 1243 243 264 172 21 chr2 86357993 86358086 -95390001 - RMER21A LTR ERV1 -464 483 377 5 1243 2446 59 68 3 chr2 86358747 86359072 -95389015 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 5 1243 5334 76 24 1 chr2 86359072 86359851 -95388236 + ORR1A1-int LTR MaLR 1 797 -995 5 1243 3063 65 5 5 chr2 86359849 86360263 -95387824 + ORR1A1-int LTR MaLR 1379 1792 0 5 1243 2512 58 65 0 chr2 86360263 86360588 -95387499 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 5 1243 2242 112 3 26 chr2 86361147 86361497 -95386590 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 66 5 1243 2816 212 56 11 chr2 86370816 86371478 -95376609 + RLTR17 LTR ERVK 1 692 0 5 1243 279 295 31 109 chr2 86372640 86372915 -95375172 - RMER17B LTR ERVK -9 899 653 5 1243 1860 241 121 62 chr2 86373210 86373890 -95374197 - RMER17B LTR ERVK -238 720 1 5 1244 1291 272 100 8 chr2 86383350 86383720 -95364367 + MTC LTR MaLR 1 404 -17 5 1244 4519 164 79 24 chr2 86390999 86391505 -95356582 - RMER17B LTR ERVK 0 958 432 5 1244 4519 164 79 24 chr2 86391593 86391994 -95356093 - RMER17B LTR ERVK -527 431 3 5 1244 357 335 56 51 chr2 86404873 86405068 -95343019 - RMER12 LTR ERVK 0 1322 1127 5 1244 1205 151 58 8 chr2 86405583 86405824 -95342263 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1062 786 534 5 1244 422 269 45 0 chr2 86412308 86412442 -95335645 + ORR1D-int LTR MaLR 1219 1358 -12 5 1244 1903 288 70 52 chr2 86412455 86413169 -95334918 - ORR1D-int LTR MaLR -382 988 262 5 1244 4619 68 2 3 chr2 86422599 86423187 -95324900 - LTRIS_Mus LTR ERV1 0 587 1 6 1244 1699 147 85 0 chr2 86424178 86424484 -95323603 - IAPEY3_LTR LTR ERVK 0 332 1 6 1244 4727 67 53 1 chr2 86424484 86425376 -95322711 - IAPEY3-int LTR ERVK 0 7680 6743 6 1244 3458 86 0 2 chr2 86425366 86425821 -95322266 - IAPEY3-int LTR ERVK -1367 6214 5761 6 1244 3247 96 0 18 chr2 86425812 86426260 -95321827 - IAPEY3-int LTR ERVK -1939 5642 5203 6 1244 741 131 28 42 chr2 86426515 86426658 -95321429 - IAPEY3-int LTR ERVK -2911 4670 4530 6 1244 459 179 18 36 chr2 86426680 86426790 -95321297 - MMETn-int LTR ERVK -2380 2464 2357 6 1244 3330 139 155 5 chr2 86426795 86427408 -95320679 - IAPEY3-int LTR ERVK -3135 4271 3567 6 1244 588 239 0 102 chr2 86427434 86427656 -95320431 - IAPEY3-int LTR ERVK -4653 2753 2454 6 1244 425 184 97 0 chr2 86427673 86427787 -95320300 - IAPEY3-int LTR ERVK -5563 1843 1719 6 1244 1382 200 104 76 chr2 86427785 86428273 -95319814 - IAPEY3-int LTR ERVK -4783 623 251 6 1244 11427 72 11 6 chr2 86428372 86430006 -95318081 - IAPLTR4_I LTR ERVK -5880 1633 1 6 1244 1658 154 85 0 chr2 86430006 86430312 -95317775 - IAPLTR4_I LTR ERVK 0 332 1 6 1244 383 339 58 42 chr2 86444332 86444523 -95303564 - RMER12 LTR ERVK -2 1320 1127 6 1244 1037 162 132 16 chr2 86445058 86445309 -95302778 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1035 813 534 6 1244 431 263 8 0 chr2 86452016 86452134 -95295953 + ORR1D-int LTR MaLR 1239 1357 -13 6 1244 3564 32 121 0 chr2 86452134 86452574 -95295513 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 6 1244 292 26 0 0 chr2 86452574 86452612 -95295475 - MERVL-int LTR ERVL 0 5485 5448 6 1244 364 125 26 53 chr2 86452612 86452688 -95295399 - ORR1A3-int LTR MaLR -1323 640 567 6 1244 47087 19 2 11 chr2 86452688 86458105 -95289982 - MERVL-int LTR ERVL -114 5371 1 6 1244 3662 18 121 0 chr2 86458105 86458545 -95289542 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 6 1244 2031 280 55 85 chr2 86458564 86459314 -95288773 - ORR1D-int LTR MaLR -382 988 262 6 1244 2100 84 30 20 chr2 86461523 86461827 -95286260 - IAPLTR2b LTR ERVK -20 307 1 6 1244 7985 231 22 32 chr2 86461831 86463743 -95284344 - IAPLTR3-int LTR ERVK -23 6798 4906 6 1244 1870 71 4 0 chr2 86463740 86463979 -95284108 - IAPEY3-int LTR ERVK -5183 2497 2258 6 1244 4126 113 66 13 chr2 86464041 86464805 -95283282 - IAPLTR4_I LTR ERVK -288 1182 15 6 1244 2147 77 30 20 chr2 86464817 86465121 -95282966 - IAPLTR4_I LTR ERVK -20 307 1 6 1244 678 277 118 59 chr2 86470674 86470962 -95277125 - ORR1D1 LTR MaLR -51 323 19 6 1244 390 315 77 72 chr2 86495214 86495409 -95252678 - RMER12 LTR ERVK 0 1322 1127 7 1244 1314 154 69 8 chr2 86495914 86496176 -95251911 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1037 811 534 7 1244 437 276 45 0 chr2 86502665 86502799 -95245288 + ORR1D-int LTR MaLR 1219 1358 -12 5 1244 428 315 34 27 chr2 86502797 86502944 -95245143 - ORR1D-int LTR MaLR -370 1000 853 6 1245 355 233 0 0 chr2 86510627 86510700 -95237387 + RMER5 LTR ERV1 26 98 -436 1 1245 1184 270 41 20 chr2 86510699 86511043 -95237044 - RMER5 LTR ERV1 -92 442 92 1 1245 1124 313 29 34 chr2 86511942 86512326 -95235761 - MTD LTR MaLR -30 389 8 1 1245 1274 81 20 14 chr2 86514621 86514830 -95233257 + IAPEY3_LTR LTR ERVK 1 315 -17 1 1245 729 207 22 7 chr2 86520342 86520478 -95227609 + RLTR25A LTR ERVK 1 138 -965 3 1245 593 278 26 7 chr2 86520509 86520524 -95227563 + RLTR25A LTR ERVK 140 154 -874 3 1245 1836 205 65 0 chr2 86522492 86522837 -95225250 + RLTR25A LTR ERVK 148 503 -600 3 1245 1836 205 65 0 chr2 86522861 86522901 -95225186 + RLTR25A LTR ERVK 504 557 -546 3 1245 712 318 43 9 chr2 86523018 86523364 -95224723 - RLTR6-int LTR ERV1 -5795 1983 1626 3 1245 364 282 36 18 chr2 86538048 86538160 -95209927 - RLTR21 LTR ERVK -297 1275 1162 6 1245 296 174 74 43 chr2 86543925 86544024 -95204063 + RMER10B LTR ERVL 9 114 -284 7 1245 471 304 24 34 chr2 86544040 86544248 -95203839 + RMER10B LTR ERVL 193 398 0 7 1245 662 222 0 0 chr2 86551419 86551545 -95196542 - RMER6C LTR ERVK 0 690 565 8 1245 256 166 211 25 chr2 86551883 86552044 -95196043 + RMER17C LTR ERVK 88 278 -132 9 1245 1537 22 0 0 chr2 86553635 86553818 -95194269 + MT2_Mm LTR ERVL 311 493 0 9 1245 3078 56 5 5 chr2 86555466 86555862 -95192225 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 9 1245 449 326 59 71 chr2 86572593 86572831 -95175256 - MTEb LTR MaLR -13 366 132 1 1245 487 382 49 39 chr2 86585425 86585733 -95162354 + MTE-int LTR MaLR 1032 1342 -238 1 1245 383 351 57 21 chr2 86585841 86586033 -95162054 + MTE-int LTR MaLR 1379 1577 -3 1 1245 1157 257 29 107 chr2 86587096 86587471 -95160616 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 41 1 1245 5279 89 12 48 chr2 86592689 86592852 -95155235 - RLTR13D1 LTR ERVK 0 806 651 1 1245 5279 89 12 48 chr2 86593079 86593751 -95154336 - RLTR13D1 LTR ERVK -156 650 1 1 1245 926 262 68 134 chr2 86599875 86600308 -95147779 + RLTR22_Mur LTR ERVK 218 618 -1230 1 1245 926 262 68 134 chr2 86600612 86600751 -95147336 + RLTR22_Mur LTR ERVK 619 752 -1096 1 1245 1220 218 55 71 chr2 86600806 86600842 -95147245 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1051 1084 -764 1 1245 1220 218 55 71 chr2 86600874 86601132 -95146955 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1085 1343 -505 1 1245 1220 218 55 71 chr2 86601225 86601348 -95146739 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1344 1462 -386 1 1245 501 309 21 64 chr2 86607740 86607927 -95140160 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1463 1641 -207 1 1245 340 297 99 0 chr2 86608407 86608508 -95139579 + RMER12 LTR ERVK 1145 1255 -67 1 1245 289 234 12 83 chr2 86612619 86612703 -95135384 + RMER12 LTR ERVK 1245 1322 0 1 1245 1036 202 148 59 chr2 86618178 86618639 -95129448 - RMER6D LTR ERVK -247 509 3 1 1245 254 436 31 63 chr2 86630400 86630559 -95117528 - MLT-int LTR MaLR -467 1268 1115 2 1245 498 252 24 54 chr2 86631507 86631675 -95116412 + RodERV21-int LTR ERV1 453 615 -4376 2 1245 624 226 0 0 chr2 86631708 86631841 -95116246 + RodERV21-int LTR ERV1 732 864 -4127 2 1245 281 244 0 35 chr2 86631873 86631958 -95116129 + RLTR42-int LTR ERVK 896 977 -5160 2 1245 284 152 0 21 chr2 86632125 86632172 -95115915 + RLTR42-int LTR ERVK 1748 1793 -3729 2 1245 3576 258 31 36 chr2 86632318 86633239 -95114848 + RodERV21-int LTR ERV1 1384 2300 -2691 2 1246 4000 173 43 14 chr2 86642133 86642964 -95105123 + RLTR13A LTR ERVK 1 855 0 2 1246 456 309 109 44 chr2 86645333 86645654 -95102433 + MLT1B LTR MaLR 49 390 0 2 1246 1095 176 16 0 chr2 86671979 86672167 -95075920 + RMER6A LTR ERVK 3 193 -563 2 1246 2600 160 27 44 chr2 86672903 86673466 -95074621 + RMER6A LTR ERVK 178 730 -26 2 1246 300 320 58 74 chr2 86675627 86675870 -95072217 + RMER2 LTR ERV1 329 567 0 2 1246 378 295 47 7 chr2 86682532 86682682 -95065405 + MLT1B LTR MaLR 62 217 -173 2 1246 442 155 31 65 chr2 86708038 86708185 -95039902 - RLTR22_Mur LTR ERVK -185 1663 1479 3 1246 3217 53 5 0 chr2 86718529 86718923 -95029164 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 1246 8579 58 4 5 chr2 86718923 86720022 -95028065 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 3 1246 3320 28 8 0 chr2 86720022 86720415 -95027672 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 1246 1964 179 51 64 chr2 86734454 86734520 -95013567 + RMER4A LTR ERVK 1 52 -414 3 1246 1964 179 51 64 chr2 86735096 86735501 -95012586 + RMER4A LTR ERVK 53 466 0 3 1246 240 309 0 0 chr2 86738782 86738837 -95009250 - RMER12B LTR ERVK -1347 57 3 3 1246 264 213 0 0 chr2 86739429 86739476 -95008611 + RLTR42-int LTR ERVK 1748 1794 -3728 3 1246 1470 218 54 15 chr2 86740011 86740346 -95007741 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 47 3 1246 6211 214 29 82 chr2 86740361 86742363 -95005724 - ORR1B1-int LTR MaLR 0 1963 183 3 1246 1043 195 0 5 chr2 86742735 86742936 -95005151 - ORR1B1-int LTR MaLR -1763 200 1 3 1246 1097 192 140 106 chr2 86742936 86743285 -95004802 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 34 3 1246 451 219 88 23 chr2 86758037 86758180 -94989907 + RNLTR23 LTR ERVK 529 642 0 3 1246 401 165 22 11 chr2 86766738 86766830 -94981257 + RMER4A LTR ERVK 1 93 -492 3 1246 922 233 112 82 chr2 86767170 86767452 -94980635 + RMER4A LTR ERVK 61 343 -123 3 1246 922 233 112 82 chr2 86767560 86767669 -94980418 + RMER4A LTR ERVK 344 463 -3 3 1247 697 240 77 88 chr2 86772768 86772976 -94975111 - RMER12 LTR ERVK -111 1211 1001 3 1247 2942 214 35 88 chr2 86773221 86774062 -94974025 - RMER12 LTR ERVK -322 1000 1 3 1247 1336 226 66 16 chr2 86774864 86775183 -94972904 - ORR1B1 LTR MaLR -13 381 47 4 1247 4694 221 33 82 chr2 86775198 86776150 -94971937 - ORR1B1-int LTR MaLR 0 1963 1096 4 1247 4694 221 33 82 chr2 86776173 86776530 -94971557 - ORR1B1-int LTR MaLR -868 1095 720 4 1247 803 266 75 61 chr2 86776485 86776765 -94971322 - MT2B LTR ERVL -309 292 9 4 1247 2178 207 17 12 chr2 86776666 86777146 -94970941 - ORR1B1-int LTR MaLR -1245 718 237 4 1247 352 282 102 73 chr2 86780072 86780347 -94967740 + RLTR42-int LTR ERVK 4261 4543 -979 4 1247 752 301 54 16 chr2 86780516 86780833 -94967254 + RLTR42-int LTR ERVK 4569 4897 -625 4 1247 371 261 0 32 chr2 86782592 86782687 -94965400 + RLTR23 LTR ERV1 8 99 -331 4 1247 650 342 42 22 chr2 86782777 86783088 -94964999 + RLTR23 LTR ERV1 114 430 0 4 1247 2710 41 3 0 chr2 86785775 86786115 -94961972 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 6 4 1247 296 227 38 76 chr2 86809566 86809671 -94938416 - RMER13B LTR ERVK -289 619 519 4 1247 553 195 31 47 chr2 86832422 86832551 -94915536 + MTC LTR MaLR 13 139 -282 4 1247 866 180 52 15 chr2 86835926 86836160 -94911927 + MTC LTR MaLR 114 415 -4 4 1247 2689 102 123 2 chr2 86854729 86855159 -94892928 + RLTR45 LTR ERVK 1 482 0 4 1247 6795 78 7 4 chr2 86859174 86860074 -94888013 - RLTR13D6 LTR ERVK 0 902 1 4 1247 2429 196 32 75 chr2 86864945 86865569 -94882518 - RLTR42-int LTR ERVK -1899 3623 3027 5 1247 4408 216 68 32 chr2 86865577 86866694 -94881393 + RLTR42-int LTR ERVK 1868 3024 -2498 5 1247 1732 215 29 12 chr2 86870589 86871003 -94877084 - MTC LTR MaLR 0 421 1 5 1247 294 140 20 0 chr2 86874885 86874935 -94873152 + ORR1D1 LTR MaLR 324 374 0 5 1247 3186 31 18 0 chr2 86877414 86877803 -94870284 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 1247 2969 86 8 0 chr2 86886850 86887247 -94860840 - MTB LTR MaLR 0 400 1 5 1247 3438 134 47 0 chr2 86887284 86887822 -94860265 - MT2B LTR ERVL -38 563 1 5 1247 2609 224 56 15 chr2 86889799 86890462 -94857625 + RMER6C LTR ERVK 1 690 0 5 1247 760 235 81 16 chr2 86890655 86890841 -94857246 + ORR1C1 LTR MaLR 119 316 -62 5 1247 1520 227 172 84 chr2 86895040 86895825 -94852262 - RMER6C LTR ERVK -36 720 1 5 1247 1576 234 34 29 chr2 86897847 86898226 -94849861 + ORR1B1 LTR MaLR 4 384 -10 5 1247 2620 230 37 16 chr2 86898236 86898863 -94849224 + ORR1B1-int LTR MaLR 1 640 -1323 5 1247 744 216 59 62 chr2 86898911 86899136 -94848951 + MT2B LTR ERVL 2 287 -314 5 1247 401 258 12 24 chr2 86899233 86899267 -94848820 + ORR1B1-int LTR MaLR 750 887 -1076 5 1248 3355 33 2 0 chr2 86901011 86901404 -94846683 + MTA_Mm LTR MaLR 3 396 0 5 1248 386 250 0 22 chr2 86904007 86904097 -94843990 + RMER12 LTR ERVK 1 88 -1234 5 1248 2499 92 0 87 chr2 86917554 86917947 -94830140 + RLTR10D LTR ERVK 1 359 0 5 1248 2334 48 152 0 chr2 86925028 86925338 -94822749 - IAPEY2_LTR LTR ERVK 0 357 1 5 1248 3545 244 148 56 chr2 86926883 86927438 -94820649 - RLTR21 LTR ERVK -228 1344 764 5 1248 3269 48 0 2 chr2 86927438 86927835 -94820252 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 1248 3545 244 148 56 chr2 86927835 86928509 -94819578 - RLTR21 LTR ERVK -809 763 2 5 1248 5240 122 25 11 chr2 86928884 86929727 -94818360 - RLTR13A LTR ERVK 0 855 1 6 1248 268 382 30 61 chr2 86934408 86934606 -94813481 - MLT1D LTR MaLR -9 496 305 6 1248 1405 277 51 53 chr2 86938135 86938646 -94809441 + RLTR20B3 LTR ERVK 12 521 -56 6 1248 326 355 18 31 chr2 86951210 86951373 -94796714 - MLT1D LTR MaLR -17 488 328 6 1248 1889 224 55 18 chr2 86965030 86965520 -94782567 + MERVL_2A-int LTR ERVL 2 509 -5252 6 1248 432 63 32 0 chr2 86965572 86965635 -94782452 + ORR1A2 LTR MaLR 128 192 -135 6 1248 242 277 12 24 chr2 86972078 86972163 -94775924 - ORR1B1-int LTR MaLR -1424 85 2 6 1248 265 367 42 66 chr2 86977607 86977820 -94770267 - MLT1D LTR MaLR -31 474 267 6 1248 4290 59 7 28 chr2 87007847 87008419 -94739668 + LTRIS2 LTR ERV1 5 564 0 9 1248 6034 241 27 8 chr2 87010897 87011453 -94736634 + MERVL_2A-int LTR ERVL 1743 2298 -3463 1 1248 1384 161 153 7 chr2 87011453 87011740 -94736347 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 1 1248 6034 241 27 8 chr2 87011740 87012587 -94735500 + MERVL_2A-int LTR ERVL 2299 3172 -2589 1 1248 2740 122 14 17 chr2 87012617 87013033 -94735054 - RMER17D LTR ERVK -2 887 473 1 1248 587 193 0 0 chr2 87013048 87013157 -94734930 + MERVL_2A-int LTR ERVL 2359 2467 -3294 1 1248 2487 139 34 78 chr2 87013157 87013724 -94734363 - RMER17D LTR ERVK -347 542 1 1 1248 3604 235 34 2 chr2 87013726 87014515 -94733572 + MERVL_2A-int LTR ERVL 3225 4038 -1723 1 1248 1535 241 65 122 chr2 87014519 87015306 -94732781 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1030 778 47 1 1248 2489 226 18 18 chr2 87015336 87015894 -94732193 + MERVL_2A-int LTR ERVL 4906 5463 -298 1 1248 819 195 36 5 chr2 87017284 87017480 -94730607 + MERVL_2A-int LTR ERVL 5475 5676 -85 1 1248 420 226 0 0 chr2 87017563 87017647 -94730440 + MT2A LTR ERVL 1 84 -449 2 1248 648 251 53 39 chr2 87018451 87018658 -94729429 - RLTR25A LTR ERVK 0 1103 894 2 1248 491 286 8 0 chr2 87019753 87019872 -94728215 - MTD LTR MaLR -299 120 1 2 1248 1035 217 0 64 chr2 87019897 87020133 -94727954 + MTE2a LTR MaLR 150 370 -9 3 1248 883 35 26 0 chr2 87021960 87022073 -94726014 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 231 3 1248 1723 173 34 131 chr2 87022073 87022546 -94725541 - RLTR23 LTR ERV1 -3 427 1 3 1248 1432 206 57 13 chr2 87024185 87024499 -94723588 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 2 3 1248 552 258 61 36 chr2 87024504 87024647 -94723440 + MT2A LTR ERVL 69 301 -192 4 1248 552 266 106 30 chr2 87024710 87024836 -94723251 + MT2A LTR ERVL 193 220 -313 4 1249 1626 212 226 18 chr2 87033910 87034481 -94713606 + RMER6C LTR ERVK 1 690 0 5 1249 2194 221 17 31 chr2 87034489 87034807 -94713280 + RMER6-int LTR ERVK 1 314 -2863 5 1249 2194 221 17 31 chr2 87034859 87035059 -94713028 + RMER6-int LTR ERVK 315 512 -2665 5 1249 2099 200 41 8 chr2 87035131 87035619 -94712468 + RMER6-int LTR ERVK 487 990 -2187 5 1249 529 219 23 64 chr2 87035619 87035790 -94712297 - RLTR43A LTR ERVK 0 364 201 5 1249 3714 167 60 31 chr2 87035964 87036700 -94711387 + RMER6-int LTR ERVK 984 1740 -1437 5 1249 2904 161 38 9 chr2 87036791 87037338 -94710749 + RMER6-int LTR ERVK 2579 3141 -36 5 1249 2102 190 62 130 chr2 87037350 87038089 -94709998 + RMER6C LTR ERVK 2 690 0 5 1249 595 250 149 95 chr2 87047589 87047938 -94700149 + RLTR9A LTR ERVK 1 368 0 7 1249 2381 202 75 90 chr2 87055155 87056022 -94692065 + RMER6C LTR ERVK 9 708 -12 8 1249 250 300 100 0 chr2 87056420 87056540 -94691547 - MTE-int LTR MaLR -71 1509 1378 8 1249 1967 245 67 23 chr2 87056550 87057076 -94691011 - RMER15 LTR ERVL -5 570 22 8 1249 634 401 58 38 chr2 87057317 87057633 -94690454 - MTE-int LTR MaLR -201 1379 1052 8 1249 4503 72 3 3 chr2 87057633 87058220 -94689867 - LTRIS_Mus LTR ERV1 0 587 1 9 1249 634 401 58 38 chr2 87058220 87058528 -94689559 - MTE-int LTR MaLR -529 1051 744 8 1249 327 270 137 128 chr2 87058624 87058785 -94689302 + RMER21A LTR ERV1 534 700 -247 9 1249 327 270 137 128 chr2 87058941 87058983 -94689104 + RMER21A LTR ERV1 701 739 -208 9 1249 4828 129 51 119 chr2 87064174 87065281 -94682806 + RLTR45-int LTR ERVK 5041 6071 -1173 1 1249 812 284 20 17 chr2 87065283 87065640 -94682447 + RLTR45-int LTR ERVK 7506 7828 -389 1 1249 1477 161 13 4 chr2 87065673 87065910 -94682177 + ETnERV2-int LTR ERVK 6506 6744 -662 1 1249 784 221 0 0 chr2 87068238 87068392 -94679695 - RMER6D LTR ERVK -10 710 557 1 1249 2210 146 46 23 chr2 87071236 87071629 -94676458 + RLTR9D LTR ERVK 1 402 -1 1 1249 5459 246 38 18 chr2 87071638 87073286 -94674801 + ETnERV-int LTR ERVK 3 1656 -1658 1 1249 10021 225 75 50 chr2 87073366 87075003 -94673084 + ETnERV2-int LTR ERVK 1704 3817 -3589 1 1249 10021 225 75 50 chr2 87075075 87076654 -94671433 + ETnERV2-int LTR ERVK 3818 5858 -1548 1 1249 2402 201 23 51 chr2 87078834 87079491 -94668596 + ETnERV2-int LTR ERVK 5836 6429 -977 1 1249 414 122 27 13 chr2 87079699 87079774 -94668313 + ETnERV2-int LTR ERVK 7331 7406 0 1 1249 2323 147 14 46 chr2 87079774 87080189 -94667898 + RLTR9D LTR ERVK 1 402 -1 1 1249 784 250 45 122 chr2 87086691 87086978 -94661109 + RLTR9A LTR ERVK 104 368 0 1 1249 1577 231 62 92 chr2 87094187 87095069 -94653018 + RMER6C LTR ERVK 9 708 -12 1 1249 229 300 100 0 chr2 87095479 87095599 -94652488 - MTE-int LTR MaLR -71 1509 1378 1 1249 1733 233 118 21 chr2 87095609 87096091 -94651996 - RMER15 LTR ERVL -5 570 42 1 1249 501 283 46 23 chr2 87096751 87096881 -94651206 + ETnERV2-int LTR ERVK 7070 7202 -204 1 1249 1214 58 0 0 chr2 87099973 87100128 -94647959 + RLTR1B LTR ERV1 1 155 -357 1 1249 937 97 0 121 chr2 87100125 87100290 -94647797 + RLTR1B LTR ERV1 366 510 -2 1 1249 828 195 99 9 chr2 87114934 87115146 -94632941 - RMER6C LTR ERVK 0 690 460 1 1249 1256 161 109 45 chr2 87121826 87122252 -94625835 - RLTR1B LTR ERV1 -86 426 1 1 1249 2129 34 104 0 chr2 87122252 87122520 -94625567 - RLTR1B-int LTR ERV1 0 3299 3004 1 1249 1618 73 20 0 chr2 87122515 87122719 -94625368 - RLTR1B-int LTR ERV1 -1190 2109 1902 1 1249 522 68 14 0 chr2 87122716 87122790 -94625297 - RLTR1B-int LTR ERV1 -2386 913 839 1 1249 446 68 0 0 chr2 87122780 87122839 -94625248 - RLTR1B-int LTR ERV1 -3240 59 1 1 1249 1053 129 29 0 chr2 87122839 87123009 -94625078 - RLTR1B LTR ERV1 0 512 338 1 1249 387 56 19 0 chr2 87123009 87123063 -94625024 - RLTR1B LTR ERV1 -102 410 356 1 1249 234 280 54 92 chr2 87124861 87124991 -94623096 - MLT1F-int LTR MaLR -457 1032 908 1 1249 2173 207 66 37 chr2 87132366 87132958 -94615129 - RMER6C LTR ERVK -4 686 1 1 1250 277 206 60 78 chr2 87164712 87164828 -94583259 - RLTR14 LTR ERV1 -45 337 224 2 1250 1479 151 39 46 chr2 87165418 87165703 -94582384 + ORR1A4 LTR MaLR 3 285 -44 2 1250 431 289 14 0 chr2 87165701 87165843 -94582244 + RMER10B LTR ERVL 189 332 -66 2 1250 603 172 248 4 chr2 87176265 87176421 -94571666 - RMER19B LTR ERVK -205 697 525 2 1250 1901 222 98 28 chr2 87178113 87178651 -94569436 - RMER19B LTR ERVK -418 484 1 2 1250 989 199 224 31 chr2 87179129 87179512 -94568575 - MT2A LTR ERVL -35 498 42 2 1250 289 312 22 45 chr2 87185657 87185835 -94562252 - SRV_MM-int LTR ERVK -3091 3076 2903 2 1250 272 304 73 97 chr2 87190273 87190519 -94557568 - RMER21B LTR ERV1 -340 607 280 2 1250 2370 239 11 18 chr2 87201282 87201841 -94546246 + RMER4B LTR ERVK 31 585 0 2 1250 2965 28 61 10 chr2 87217477 87217868 -94530219 - IAPLTR2a LTR ERVK 0 411 1 2 1250 1520 66 19 0 chr2 87233402 87233614 -94514473 + BGLII LTR ERVK 1 216 -205 2 1250 1371 112 49 9 chr2 87236462 87236687 -94511400 + BGLII LTR ERVK 188 421 0 2 1250 1667 150 88 0 chr2 87277877 87278171 -94469916 - RLTR46 LTR ERVK 0 320 1 3 1250 3261 46 2 15 chr2 87280743 87281144 -94466943 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 1250 1009 250 79 105 chr2 87285576 87286307 -94461780 - RMER6A LTR ERVK 0 720 1 3 1251 534 236 19 31 chr2 87302158 87302320 -94445767 + RNLTR23 LTR ERVK 483 642 0 3 1251 343 328 37 43 chr2 87304836 87305024 -94443063 + MER57C2 LTR ERV1 188 374 -60 3 1251 2840 87 20 0 chr2 87311256 87311648 -94436439 - MTB LTR MaLR 0 400 1 4 1251 3026 78 5 8 chr2 87311788 87312189 -94435898 - MTB LTR MaLR 0 400 1 4 1251 343 146 0 18 chr2 87322857 87322913 -94425174 + RLTR23 LTR ERV1 259 313 -117 4 1251 263 294 0 0 chr2 87322944 87323012 -94425075 - RLTR4_MM-int LTR ERV1 -2036 5570 5503 4 1251 868 279 40 30 chr2 87323194 87323622 -94424465 - RLTR4_MM-int LTR ERV1 -2366 5235 4804 4 1251 672 327 0 11 chr2 87324690 87324953 -94423134 - RLTR4_MM-int LTR ERV1 -3755 3801 3542 4 1251 1184 176 14 27 chr2 87324999 87325221 -94422866 - RLTR17 LTR ERVK -321 371 153 4 1251 289 306 0 115 chr2 87325319 87325537 -94422550 - RLTR4_MM-int LTR ERV1 -4248 3530 3338 4 1251 411 331 48 37 chr2 87325936 87326285 -94421802 - RLTR4_MM-int LTR ERV1 -6062 1716 1310 4 1251 1406 173 137 105 chr2 87327150 87327551 -94420536 - RLTR23 LTR ERV1 -16 414 1 4 1251 260 246 40 92 chr2 87331845 87331921 -94416166 - MT2B LTR ERVL -359 242 171 4 1251 378 228 0 144 chr2 87332171 87332289 -94415798 - MT2B LTR ERVL -344 257 157 4 1251 1659 78 5 0 chr2 87333763 87333981 -94414106 + MTA_Mm LTR MaLR 178 396 0 4 1251 877 83 0 15 chr2 87341920 87342055 -94406032 - ORR1A3-int LTR MaLR -1829 134 2 4 1251 2083 169 46 119 chr2 87342055 87342546 -94405541 + ORR1A2-int LTR MaLR 999 1792 0 4 1251 406 165 22 66 chr2 87342535 87342626 -94405461 + ORR1A2 LTR MaLR 1 87 -240 4 1251 1584 116 121 15 chr2 87342578 87342850 -94405237 - MT2B2 LTR ERVL -283 301 1 4 1251 1461 190 102 18 chr2 87345180 87345522 -94402565 - RLTR14 LTR ERV1 0 382 12 5 1251 247 93 0 0 chr2 87347496 87347543 -94400544 + MTB_Mm LTR MaLR 354 407 0 5 1251 365 256 30 11 chr2 87352017 87352126 -94395961 + RLTR18 LTR ERVK 1 124 -388 5 1251 291 170 0 36 chr2 87352916 87352971 -94395116 + RLTR18 LTR ERVK 128 180 -436 5 1251 2075 156 109 12 chr2 87353001 87353404 -94394683 + RLTR18 LTR ERVK 147 588 -28 5 1251 435 272 34 45 chr2 87353428 87353605 -94394482 + RLTR18-int LTR ERVK 2 176 -5185 5 1251 345 236 101 48 chr2 87353869 87354078 -94394009 + RLTR42-int LTR ERVK 2039 2258 -3264 5 1251 2866 136 81 39 chr2 87356327 87356871 -94391216 - RMER2 LTR ERV1 0 567 1 5 1251 739 280 58 72 chr2 87358886 87359315 -94388772 - MuRRS4-int LTR ERV1 -1172 3891 3471 5 1251 387 316 35 13 chr2 87360672 87360903 -94387184 - RLTR4_MM-int LTR ERV1 -3370 4408 4019 5 1251 409 309 160 0 chr2 87367472 87367647 -94380440 + MTB LTR MaLR 147 349 -51 5 1251 314 365 61 30 chr2 87367743 87367907 -94380180 + MTE-int LTR MaLR 1133 1301 -279 5 1251 401 316 107 34 chr2 87368082 87368344 -94379743 + MTE-int LTR MaLR 1253 1533 -47 5 1251 1328 284 18 112 chr2 87368650 87369194 -94378893 - RLTR19 LTR ERVK 0 499 7 5 1251 2260 143 45 15 chr2 87374778 87375175 -94372912 - RLTR9E LTR ERVK 0 409 1 5 1251 295 371 9 0 chr2 87377591 87377707 -94370380 - MLT1A0 LTR MaLR -184 181 65 5 1251 653 193 237 10 chr2 87383784 87383978 -94364109 - BGLII_B LTR ERVK -203 238 1 6 1251 308 176 0 0 chr2 87399298 87399349 -94348738 + RMER6D LTR ERVK 2 52 -668 6 1251 641 322 72 23 chr2 87399364 87399648 -94348439 - RLTR26 LTR ERVK -208 419 95 6 1251 1040 78 14 0 chr2 87413116 87413258 -94334829 - MT2B2 LTR ERVL -440 144 1 6 1251 427 325 140 50 chr2 87418661 87418982 -94329105 + MLT1A0 LTR MaLR 4 353 -12 6 1251 3024 61 5 10 chr2 87419364 87419762 -94328325 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 1252 2270 131 158 0 chr2 87431372 87431829 -94316258 - RLTR47_MM LTR ERV1 0 532 4 6 1252 2415 87 86 13 chr2 87434319 87434702 -94313385 - IAPLTR2a LTR ERVK 0 411 1 6 1252 5803 44 4 12 chr2 87434702 87435454 -94312633 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 5736 6 1252 494 62 0 0 chr2 87435453 87435517 -94312570 - IAPEz-int LTR ERVK -4845 1636 1573 6 1252 814 65 0 0 chr2 87435511 87435618 -94312469 - IAPEz-int LTR ERVK -5016 1465 1359 6 1252 3507 58 26 18 chr2 87435618 87436109 -94311978 - IAPEz-int LTR ERVK -5819 662 168 6 1252 226 321 0 0 chr2 87436109 87436162 -94311925 - RLTR27 LTR ERVK -34 275 223 6 1252 226 327 0 0 chr2 87436190 87436245 -94311842 - RLTR27 LTR ERVK -34 275 221 6 1252 835 125 99 18 chr2 87436245 87436416 -94311671 - IAPEz-int LTR ERVK -6288 193 9 6 1252 2415 87 86 13 chr2 87436417 87436800 -94311287 - IAPLTR2a LTR ERVK 0 411 1 6 1252 241 271 80 46 chr2 87440287 87440427 -94307660 + MTD LTR MaLR 259 404 -17 6 1252 2194 160 22 24 chr2 87440427 87440837 -94307250 - RMER16 LTR ERVK 0 533 125 6 1252 748 73 87 16 chr2 87440768 87440894 -94307193 - RLTR47_MM LTR ERV1 -397 135 1 6 1252 391 207 0 171 chr2 87442604 87442624 -94305463 + MT2B LTR ERVL 149 238 -363 6 1252 2921 91 30 126 chr2 87442704 87443235 -94304852 + RLTR45 LTR ERVK 1 480 -2 6 1252 391 207 0 171 chr2 87443235 87443274 -94304813 + MT2B LTR ERVL 239 264 -337 6 1252 1015 92 14 0 chr2 87445415 87445557 -94302530 - MT2B2 LTR ERVL -440 144 1 6 1252 343 337 25 30 chr2 87450751 87450950 -94297137 + MER57C2 LTR ERV1 177 374 -60 6 1252 2389 68 6 3 chr2 87455234 87455556 -94292531 + IAPEY2_LTR LTR ERVK 32 354 -3 7 1252 2303 143 133 0 chr2 87459124 87459591 -94288496 - RLTR47_MM LTR ERV1 0 532 4 7 1252 393 348 87 69 chr2 87463629 87463847 -94284240 + MTD LTR MaLR 14 252 -167 7 1252 393 348 87 69 chr2 87464035 87464213 -94283874 + MTD LTR MaLR 253 419 0 7 1252 510 305 99 88 chr2 87464314 87464672 -94283415 + ORR1D-int LTR MaLR 1043 1533 -47 7 1252 1480 288 50 29 chr2 87464965 87465136 -94282951 - RLTR19 LTR ERVK 0 499 320 7 1252 1480 288 50 29 chr2 87465166 87465473 -94282614 - RLTR19 LTR ERVK -180 319 11 7 1252 249 367 75 53 chr2 87472460 87472647 -94275440 - MLT1A0 LTR MaLR -72 293 103 7 1252 339 146 0 0 chr2 87505186 87505241 -94242846 + RLTR19-int LTR ERVK 3537 3591 -2546 7 1252 622 297 57 114 chr2 87505265 87505668 -94242419 + RLTR23 LTR ERV1 47 426 -4 8 1252 1184 190 32 0 chr2 87505669 87505712 -94242375 + RMER6D LTR ERVK 489 531 -189 9 1252 1184 190 32 0 chr2 87505735 87505912 -94242175 + RMER6D LTR ERVK 532 715 -5 9 1252 283 330 0 18 chr2 87507610 87507721 -94240366 + MERVK26-int LTR ERVK 6525 6633 -286 1 1252 1005 262 134 28 chr2 87507779 87508062 -94240025 + RLTR21 LTR ERVK 10 322 -1250 1 1252 1230 204 69 48 chr2 87523876 87524141 -94223946 - RMER6D LTR ERVK -3 717 350 2 1252 1230 198 42 70 chr2 87524223 87524370 -94223717 - RMER6D LTR ERVK -370 350 216 2 1252 1230 213 128 68 chr2 87524530 87524670 -94223417 - RMER6D LTR ERVK -505 215 4 2 1252 366 190 54 28 chr2 87531195 87531290 -94216797 + MTC LTR MaLR 1 99 -308 3 1252 1447 223 33 7 chr2 87531478 87531785 -94216302 - RLTR19C LTR ERVK -191 315 1 3 1252 1168 247 63 20 chr2 87532216 87532517 -94215570 + MTC LTR MaLR 108 421 0 3 1252 261 336 128 49 chr2 87549538 87549866 -94198221 - MLT2B3 LTR ERVL -200 354 1 5 1253 2454 56 3 45 chr2 87556794 87557130 -94190957 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 322 0 6 1253 38393 48 7 15 chr2 87557134 87559215 -94188872 + MMETn-int LTR ERVK 5 2079 -2765 6 1253 38393 48 7 15 chr2 87559244 87561776 -94186311 + MMETn-int LTR ERVK 2080 4597 -247 6 1253 38393 48 7 15 chr2 87561968 87562233 -94185854 + MMETn-int LTR ERVK 4598 4843 -1 6 1253 2427 62 3 48 chr2 87562233 87562570 -94185517 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 322 0 6 1253 454 299 153 30 chr2 87575139 87575401 -94172686 + MTE-int LTR MaLR 1 294 -1286 7 1253 800 354 119 35 chr2 87575467 87576032 -94172055 + MTE-int LTR MaLR 925 1536 -44 7 1253 1443 217 68 27 chr2 87581954 87582290 -94165797 + RMER6D LTR ERVK 3 352 -368 9 1253 2581 230 36 77 chr2 87587767 87588656 -94159431 - RLTR21 LTR ERVK -5 1399 445 9 1253 466 371 68 0 chr2 87589351 87589556 -94158531 - MTE-int LTR MaLR -1357 223 5 9 1253 249 164 84 56 chr2 87597346 87597417 -94150670 + RLTR25B LTR ERVK 437 509 -519 1 1253 5851 165 121 33 chr2 87602151 87603458 -94144629 - ORR1A2-int LTR MaLR -541 1422 1 1 1253 1960 126 30 59 chr2 87603458 87603795 -94144292 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 1 1253 2335 226 132 16 chr2 87608864 87609495 -94138592 - RMER19A LTR ERVK 0 737 34 1 1253 3007 14 0 87 chr2 87609495 87609897 -94138190 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 1 1253 22967 27 12 1 chr2 87609897 87612871 -94135216 + IAPEz-int LTR ERVK 8 3076 -3405 1 1253 7406 19 3 2 chr2 87612857 87613706 -94134381 + IAPEz-int LTR ERVK 5630 6479 -2 1 1253 268 103 0 0 chr2 87613706 87613745 -94134342 - RMER19A LTR ERVK -698 39 1 1 1253 245 122 24 0 chr2 87613850 87613891 -94134196 - RLTR31A_Mm LTR ERVK 0 584 543 1 1253 432 282 98 131 chr2 87614627 87615146 -94132941 - RLTR11A2 LTR ERVK -9 519 18 1 1253 1776 244 17 15 chr2 87621831 87622243 -94125844 - MTC LTR MaLR -8 413 1 1 1253 778 268 20 70 chr2 87624744 87625053 -94123034 + RLTR12B LTR ERVK 8 314 -254 1 1253 571 229 16 8 chr2 87638120 87638243 -94109844 - ORR1B2 LTR MaLR -12 355 232 1 1253 1571 234 72 33 chr2 87638243 87638662 -94109425 + RMER10A LTR ERVL 1 435 -7 1 1253 946 217 113 0 chr2 87638688 87638900 -94109187 - ORR1B2 LTR MaLR -131 236 1 1 1253 1394 218 58 58 chr2 87639122 87639502 -94108585 + ORR1C2 LTR MaLR 1 380 -4 1 1254 2301 109 85 89 chr2 87691616 87692100 -94055987 - RLTR45 LTR ERVK 0 482 1 2 1254 3085 156 92 25 chr2 87700322 87701015 -94047072 - RLTR13D1 LTR ERVK 0 1023 252 2 1254 4127 69 41 7 chr2 87701728 87702270 -94045817 + LTRIS2 LTR ERV1 5 564 0 2 1254 1479 145 76 7 chr2 87702539 87702816 -94045271 - RLTR13D1 LTR ERVK -597 296 1 2 1254 2340 97 111 3 chr2 87712714 87713085 -94035002 + IAPLTR2a LTR ERVK 1 411 0 2 1254 3328 84 25 32 chr2 87713087 87713855 -94034232 + IAPEz-int LTR ERVK 3 662 -5819 2 1254 2613 85 0 3 chr2 87713855 87714198 -94033889 + IAPEz-int LTR ERVK 1359 1700 -4781 2 1254 6694 31 26 11 chr2 87714191 87715008 -94033079 + IAPEz-int LTR ERVK 5651 6479 -2 2 1254 2296 95 113 3 chr2 87715010 87715380 -94032707 + IAPLTR2a LTR ERVK 1 411 0 2 1254 2674 279 69 28 chr2 87753123 87753950 -93994137 + ORR1D1-int LTR MaLR 510 1370 0 2 1254 896 254 150 12 chr2 87753950 87754277 -93993810 + ORR1D1 LTR MaLR 1 372 -2 2 1254 842 263 127 51 chr2 87754459 87754775 -93993312 - ORR1D2 LTR MaLR -30 340 1 2 1254 4589 185 48 12 chr2 87759384 87760214 -93987873 + RMER13A LTR ERVK 1 860 0 2 1254 1931 212 17 26 chr2 87760290 87760712 -93987375 - RMER10A LTR ERVL -24 418 1 2 1254 1311 220 153 2 chr2 87761897 87762299 -93985788 + RLTR19 LTR ERVK 1 463 -36 2 1254 3013 15 0 0 chr2 87774373 87774710 -93973377 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 337 0 2 1254 40024 17 9 3 chr2 87774710 87781116 -93966971 + IAPEz-int LTR ERVK 8 6481 0 2 1254 2979 15 0 0 chr2 87781116 87781453 -93966634 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 337 0 2 1254 225 286 42 28 chr2 87786619 87786691 -93961396 - RLTR22_Mus LTR ERVK -508 1300 1228 2 1254 1486 170 74 5 chr2 87788197 87788499 -93959588 + IAPEY3_LTR LTR ERVK 14 363 -4 2 1254 2092 82 32 7 chr2 87797086 87797394 -93950693 - IAPLTR2b LTR ERVK -11 316 1 3 1254 1591 217 3 18 chr2 87803579 87803921 -93944166 + RMER6C LTR ERVK 1 337 -353 3 1254 1172 182 183 12 chr2 87805209 87805257 -93942830 + RMER6C LTR ERVK 295 360 -330 3 1254 1172 182 183 12 chr2 87805443 87805722 -93942365 + RMER6C LTR ERVK 361 678 -12 3 1255 2069 179 69 29 chr2 87824419 87824521 -93923566 + RLTR19 LTR ERVK 1 93 -406 3 1255 2069 179 69 29 chr2 87824620 87824991 -93923096 + RLTR19 LTR ERVK 94 489 -10 3 1255 389 243 18 18 chr2 87826533 87826627 -93921460 + RMER6D LTR ERVK 1 95 -595 3 1255 389 243 18 18 chr2 87826686 87826700 -93921387 + RMER6D LTR ERVK 96 109 -581 3 1255 772 210 13 6 chr2 87827017 87827175 -93920912 + RMER6D LTR ERVK 368 526 -194 3 1255 1962 283 49 38 chr2 87833985 87834620 -93913467 - RLTR26 LTR ERVK 0 642 1 3 1255 1892 218 78 16 chr2 87850518 87851159 -93896928 - RMER6A LTR ERVK -1 755 102 3 1255 1304 254 117 43 chr2 87851227 87851319 -93896768 - RMER6A LTR ERVK -589 101 3 3 1255 388 367 77 39 chr2 87872341 87872627 -93875460 - RMER15 LTR ERVL -2 573 277 3 1255 646 252 15 0 chr2 87884135 87884266 -93863821 - ETnERV2-int LTR ERVK -204 7202 7070 4 1255 829 226 56 10 chr2 87888094 87888291 -93859796 - ORR1D1 LTR MaLR -3 371 166 4 1255 802 249 11 11 chr2 87888394 87888581 -93859506 - ORR1D1 LTR MaLR -187 187 1 4 1255 513 350 39 39 chr2 87891550 87891862 -93856225 + ERVL-E-int LTR ERVL 2905 3216 -2451 4 1255 5062 151 15 24 chr2 87900725 87901461 -93846626 - MurERV4_19-int LTR ERVK -1581 4199 3459 4 1255 2946 62 203 2 chr2 87901461 87901884 -93846203 + RLTR1B LTR ERV1 1 508 -4 4 1255 5062 151 15 24 chr2 87901884 87902092 -93845995 - MurERV4_19-int LTR ERVK -2322 3458 3264 4 1255 13833 197 16 22 chr2 87902099 87902232 -93845855 - MurERV4_19-int LTR ERVK -3006 2774 2644 4 1255 13833 197 16 22 chr2 87902266 87903830 -93844257 - MurERV4_19-int LTR ERVK -3137 2643 1077 4 1255 1382 169 103 76 chr2 87903830 87904239 -93843848 + RLTR9B2 LTR ERVK 1 420 0 4 1255 13833 197 16 22 chr2 87904239 87905316 -93842771 - MurERV4_19-int LTR ERVK -4704 1076 16 4 1255 1056 265 19 135 chr2 87908841 87909264 -93838823 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 4 1255 1428 191 14 54 chr2 87920943 87921220 -93826867 - RLTR26 LTR ERVK 0 642 377 4 1255 356 255 30 10 chr2 87921653 87921752 -93826335 + RLTR21 LTR ERVK 1467 1567 -5 4 1255 532 250 132 0 chr2 87927583 87927735 -93820352 + MTC LTR MaLR 242 413 -8 4 1255 1316 285 73 89 chr2 87937793 87938101 -93809986 + RMER13A LTR ERVK 1 309 -551 4 1255 3020 137 159 21 chr2 87938101 87938630 -93809457 + RLTR1D LTR ERV1 4 605 0 4 1255 1316 285 73 89 chr2 87938630 87938964 -93809123 + RMER13A LTR ERVK 310 633 -227 4 1256 320 250 90 0 chr2 87952286 87952386 -93795701 - MTEb LTR MaLR -1 378 270 5 1256 234 276 225 47 chr2 87952413 87952431 -93795656 - MTEb LTR MaLR -186 193 173 5 1256 234 276 225 47 chr2 87952501 87952611 -93795476 - MTEb LTR MaLR -207 172 43 5 1256 456 247 0 10 chr2 87978202 87978300 -93769787 + MT2A LTR ERVL 365 461 -72 5 1256 334 302 346 12 chr2 87983083 87983337 -93764750 - MTEb LTR MaLR -1 378 40 5 1256 2335 159 7 78 chr2 87996762 87997213 -93750874 + RLTR26 LTR ERVK 1 419 -223 5 1256 4934 173 30 15 chr2 87998897 87999353 -93748734 - RLTR22_Mur LTR ERVK -40 1808 1341 5 1256 4934 173 30 15 chr2 87999390 87999871 -93748216 - RLTR22_Mur LTR ERVK -508 1340 858 5 1256 245 167 0 0 chr2 87999867 87999909 -93748178 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1797 51 10 5 1256 545 191 0 0 chr2 87999911 88000000 -93748087 + ORR1A2 LTR MaLR 3 91 -236 5 1256 1226 185 4 13 chr2 88000000 88000230 -93747857 + ORR1A2 LTR MaLR 92 319 -8 1 1256 1705 193 15 15 chr2 88000737 88001063 -93747024 - RMER6D LTR ERVK -4 716 391 2 1256 3079 73 2 0 chr2 88002414 88002809 -93745278 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 1256 3088 11 0 80 chr2 88012110 88012509 -93735578 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 9 1256 55214 20 16 1 chr2 88012560 88018867 -93729220 + IAPEz-int LTR ERVK 85 6481 0 1 1256 3117 8 0 76 chr2 88018867 88019264 -93728823 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 1 1256 3435 18 5 0 chr2 88030284 88030678 -93717409 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 1256 9276 27 3 1 chr2 88030678 88031774 -93716313 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 2 1256 3359 25 5 0 chr2 88031776 88032168 -93715919 + MTA_Mm LTR MaLR 3 396 0 2 1256 555 216 43 12 chr2 88035269 88035433 -93712654 - MT2A LTR ERVL 0 533 365 3 1256 525 342 65 29 chr2 88037926 88038203 -93709884 + MLT1A0 LTR MaLR 39 325 -40 3 1256 7789 191 52 47 chr2 88041440 88041902 -93706185 - RLTR22_Mur LTR ERVK -40 1808 1327 4 1256 7789 191 52 47 chr2 88041982 88043302 -93704785 - RLTR22_Mur LTR ERVK -522 1326 14 4 1256 1908 170 9 0 chr2 88043302 88043626 -93704461 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 4 1256 7789 191 52 47 chr2 88043626 88043640 -93704447 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1835 13 1 4 1256 1407 235 76 16 chr2 88044198 88044565 -93703522 - RMER6D LTR ERVK -4 716 328 4 1256 1518 239 20 8 chr2 88046314 88046665 -93701422 - RMER6D LTR ERVK -362 358 4 4 1256 2846 71 42 3 chr2 88053037 88053418 -93694669 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 1256 454 214 0 12 chr2 88075896 88075981 -93672106 + MT2A LTR ERVL 365 448 -85 7 1257 292 311 366 16 chr2 88080853 88081104 -93666983 - MTE2a LTR MaLR -1 378 40 8 1257 2272 173 7 80 chr2 88100258 88100710 -93647377 + RLTR26 LTR ERVK 1 419 -223 9 1257 4700 184 34 19 chr2 88102384 88102848 -93645239 - RLTR22_Mur LTR ERVK -40 1808 1341 1 1257 4700 184 34 19 chr2 88102890 88103363 -93644724 - RLTR22_Mur LTR ERVK -508 1340 859 1 1257 233 176 0 121 chr2 88103359 88103402 -93644685 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1797 51 15 1 1257 1849 184 0 6 chr2 88103402 88103730 -93644357 + ORR1A2 LTR MaLR 2 327 0 1 1257 233 176 0 121 chr2 88103730 88103744 -93644343 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1834 14 1 1 1257 568 216 43 12 chr2 88106728 88106892 -93641195 + MT2A LTR ERVL 365 533 0 1 1257 3024 32 50 0 chr2 88115888 88116265 -93631822 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 1257 9136 31 3 0 chr2 88116265 88117360 -93630727 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 1 1257 3067 34 45 0 chr2 88117360 88117739 -93630348 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 1257 4060 23 4 0 chr2 88122532 88123011 -93625076 - LTRIS_Mm LTR ERV1 0 482 2 1 1257 503 375 80 4 chr2 88148689 88148927 -93599160 - MTC LTR MaLR -24 397 142 1 1257 235 209 110 134 chr2 88152953 88153080 -93595007 + RMER5 LTR ERV1 21 144 -390 1 1257 10211 67 14 5 chr2 88156982 88158214 -93589873 - ORR1A1-int LTR MaLR -356 1436 190 1 1257 4717 56 2 2 chr2 88158214 88158801 -93589286 - LTRIS_Mus LTR ERV1 0 587 1 1 1257 10211 67 14 5 chr2 88158801 88158991 -93589096 - ORR1A1-int LTR MaLR -1603 189 1 1 1257 2447 61 51 6 chr2 88158991 88159055 -93589032 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 279 1 1257 2447 61 51 6 chr2 88159115 88159381 -93588706 - ORR1A1 LTR MaLR -68 278 1 1 1257 986 197 103 4 chr2 88159474 88159708 -93588379 - RLTR22_Mur LTR ERVK -2 1846 1590 1 1257 3952 167 26 30 chr2 88159873 88160681 -93587406 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1043 805 1 1 1257 1730 205 160 89 chr2 88169450 88170093 -93577994 - RMER6C LTR ERVK 0 690 2 1 1257 661 310 106 27 chr2 88171093 88171385 -93576702 - RLTR18B LTR ERVK -86 426 112 1 1257 310 351 40 11 chr2 88174865 88175041 -93573046 + RMER15 LTR ERVL 297 477 -98 1 1257 2919 81 5 10 chr2 88195140 88195538 -93552549 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 1257 312 347 31 0 chr2 88197961 88198059 -93550028 - MTEa LTR MaLR -195 184 84 2 1257 1439 228 152 45 chr2 88202693 88203221 -93544866 + RLTR31A_Mm LTR ERVK 1 584 0 2 1257 2161 121 15 6 chr2 88203598 88203932 -93544155 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 0 337 1 2 1257 5825 62 13 18 chr2 88203934 88204709 -93543378 - IAPEz-int LTR ERVK -2 6479 5709 2 1257 36554 22 25 7 chr2 88204700 88208973 -93539114 - IAPEz-int LTR ERVK -2124 4357 8 2 1257 2172 118 15 6 chr2 88208973 88209307 -93538780 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 0 337 1 2 1258 253 146 146 0 chr2 88214895 88214943 -93533144 - RMER6D LTR ERVK -665 55 1 2 1258 1324 229 158 65 chr2 88216892 88217523 -93530564 + RMER6C LTR ERVK 1 690 0 2 1258 822 306 58 22 chr2 88230147 88230421 -93517666 + MTD LTR MaLR 3 286 -133 2 1258 433 287 125 103 chr2 88230494 88230579 -93517508 + MTD LTR MaLR 288 378 -1 2 1258 3788 174 25 11 chr2 88236513 88237258 -93510829 - RMER6A LTR ERVK 0 756 1 2 1258 2810 55 14 0 chr2 88237348 88237711 -93510376 + MTA_Mm LTR MaLR 24 391 -5 2 1258 2846 82 8 8 chr2 88248373 88248765 -93499322 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 5 2 1258 313 390 33 14 chr2 88249453 88249666 -93498421 + ERVL-E-int LTR ERVL 4174 4390 -1277 2 1258 248 332 112 56 chr2 88249764 88249978 -93498109 + MLT1B LTR MaLR 1 226 -164 2 1258 1612 181 105 74 chr2 88250481 88251160 -93496927 - RMER6A LTR ERVK 0 756 88 2 1258 240 333 46 0 chr2 88267040 88267127 -93480960 + ORR1E LTR MaLR 1 91 -268 3 1258 818 215 28 138 chr2 88268885 88269247 -93478840 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 3 1258 351 158 24 73 chr2 88269249 88269331 -93478756 - ETnERV2-int LTR ERVK -3 7403 7326 3 1258 242 213 64 39 chr2 88269389 88269467 -93478620 - RLTR13D6 LTR ERVK -462 440 361 3 1258 2781 62 16 19 chr2 88271800 88272179 -93475908 + MT2_Mm LTR ERVL 1 378 -115 3 1258 234 61 0 0 chr2 88272167 88272200 -93475887 + ORR1E LTR MaLR 294 326 0 3 1258 426 188 113 86 chr2 88275875 88276026 -93472061 - RLTR13B1 LTR ERVK -584 309 155 3 1258 5329 131 12 0 chr2 88276027 88276776 -93471311 - MMETn-int LTR ERVK -203 7203 6452 3 1258 4464 182 51 38 chr2 88277526 88277778 -93470309 - MMETn-int LTR ERVK -1106 3738 3487 3 1258 4765 131 26 19 chr2 88277780 88278589 -93469498 - MMETn-int LTR ERVK -1668 3176 2378 3 1258 4350 211 71 90 chr2 88278612 88280372 -93467715 - MMETn-int LTR ERVK -3321 4085 1566 3 1258 387 177 47 0 chr2 88280363 88280467 -93467620 - MMETn-int LTR ERVK -3714 1130 1059 3 1258 5382 160 21 69 chr2 88280468 88280948 -93467139 - MMETn-int LTR ERVK -3745 1099 631 3 1258 5382 160 21 69 chr2 88280983 88281138 -93466949 - MMETn-int LTR ERVK -4214 630 480 3 1258 5382 160 21 69 chr2 88281220 88281736 -93466351 - MMETn-int LTR ERVK -4365 479 4 3 1258 916 212 58 94 chr2 88281740 88282075 -93466012 - RLTRETN_Mm LTR ERVK -9 394 33 3 1258 267 310 46 0 chr2 88289943 88290030 -93458057 + ORR1E LTR MaLR 1 91 -268 3 1258 1093 234 49 4 chr2 88304076 88304153 -93443934 - RLTR20C LTR ERVK -13 521 434 3 1258 1093 244 51 14 chr2 88304201 88304404 -93443683 - RLTR20C LTR ERVK -101 440 244 3 1258 792 292 63 63 chr2 88304549 88304665 -93443422 - RLTR20C LTR ERVK -298 243 131 3 1258 602 217 13 150 chr2 88304693 88304795 -93443292 - RLTR20B2 LTR ERVK -355 205 117 3 1258 602 217 13 150 chr2 88305058 88305188 -93442899 - RLTR20B2 LTR ERVK -444 116 5 3 1258 1020 301 55 21 chr2 88305429 88305758 -93442329 + MTE2b LTR MaLR 10 349 -30 3 1258 381 225 150 18 chr2 88311163 88311276 -93436811 + ORR1E LTR MaLR 1 128 -231 3 1258 315 290 111 30 chr2 88312341 88312476 -93435611 + RLTR21 LTR ERVK 1427 1572 0 3 1258 3169 52 3 0 chr2 88313322 88313706 -93434381 - IAPEY_LTR LTR ERVK 0 385 1 3 1258 1251 249 170 28 chr2 88315459 88315859 -93432228 - RMER15 LTR ERVL -36 539 83 3 1258 824 318 18 11 chr2 88316304 88316584 -93431503 - RMER15 LTR ERVL -119 456 175 3 1258 603 286 31 48 chr2 88316565 88316793 -93431294 - RMER15 LTR ERVL -324 251 28 3 1258 343 280 120 51 chr2 88341485 88341643 -93406444 + MTE2b LTR MaLR 8 176 -203 4 1259 360 238 42 0 chr2 88343263 88343362 -93404725 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1671 1822 -26 4 1259 2786 22 0 0 chr2 88348399 88348721 -93399366 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 322 0 4 1259 40145 42 3 5 chr2 88348721 88353576 -93394511 + MMETn-int LTR ERVK 1 4844 0 4 1259 2774 22 0 0 chr2 88353576 88353898 -93394189 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 322 0 4 1259 818 343 53 18 chr2 88368908 88369249 -93378838 + MTE2b LTR MaLR 13 365 -14 4 1259 228 282 21 86 chr2 88383747 88383840 -93364247 - MLT2B5 LTR ERVL -563 154 68 4 1259 245 342 0 25 chr2 88384756 88384876 -93363211 - MTEb LTR MaLR -8 371 255 4 1259 414 329 74 74 chr2 88386476 88386788 -93361299 - RLTR25B LTR ERVK -716 312 1 4 1259 843 387 64 54 chr2 88386802 88387605 -93360482 - MTE-int LTR MaLR -99 1481 657 4 1259 843 387 64 54 chr2 88388250 88388356 -93359731 - MTE-int LTR MaLR -924 656 563 4 1259 797 139 0 0 chr2 88389463 88389585 -93358502 - RMER6-int LTR ERVK -2278 899 778 4 1259 744 212 19 6 chr2 88389582 88389739 -93358348 - RMER6-int LTR ERVK -2769 408 250 4 1259 632 274 26 19 chr2 88395968 88396124 -93351963 + ORR1D1 LTR MaLR 1 157 -217 4 1259 3227 192 29 43 chr2 88400642 88401409 -93346678 + RMER6A LTR ERVK 1 756 0 4 1259 1417 265 59 104 chr2 88401602 88402094 -93345993 - RLTR18B LTR ERVK -42 470 1 4 1259 6151 122 35 17 chr2 88408336 88409334 -93338753 + RLTR13D5 LTR ERVK 8 1023 0 4 1259 1980 158 3 3 chr2 88412849 88413160 -93334927 + RLTR10E LTR ERVK 1 311 0 4 1259 446 165 33 0 chr2 88413160 88413251 -93334836 + MMERVK10C-int LTR ERVK 1 94 -7487 4 1259 4844 158 0 0 chr2 88413249 88414016 -93334071 + MMERVK10C-int LTR ERVK 275 1041 -6540 4 1259 40483 82 2 2 chr2 88414005 88419284 -93328803 + MMERVK10C-int LTR ERVK 1405 6682 -899 4 1259 1850 166 13 3 chr2 88419392 88419700 -93328387 + RLTR10E LTR ERVK 1 311 0 5 1259 311 363 55 29 chr2 88423762 88423785 -93324302 - MYSERV-int LTR ERVK -1169 5381 5357 5 1259 311 363 55 29 chr2 88423818 88424140 -93323947 - MYSERV-int LTR ERVK -1194 5356 5027 5 1259 321 278 65 82 chr2 88424312 88424496 -93323591 + RLTR15 LTR ERVK 35 215 -144 5 1259 290 224 26 13 chr2 88424669 88424682 -93323405 + RMER6C LTR ERVK 213 225 -495 5 1259 1795 167 59 3 chr2 88424682 88425019 -93323068 - RLTR15 LTR ERVK -3 356 1 5 1259 290 224 26 13 chr2 88425019 88425082 -93323005 + RMER6C LTR ERVK 226 289 -431 5 1259 486 250 37 15 chr2 88425164 88425298 -93322789 + RMER6C LTR ERVK 398 534 -156 5 1259 800 131 75 7 chr2 88426024 88426170 -93321917 + RMER6C LTR ERVK 535 690 0 5 1259 1575 164 48 72 chr2 88434021 88434355 -93313732 + ORR1A3 LTR MaLR 1 326 0 5 1259 3382 203 52 70 chr2 88434665 88435585 -93312502 + RLTR13C1 LTR ERVK 1 903 -80 5 1259 2200 68 97 0 chr2 88435585 88435893 -93312194 + ORR1A1 LTR MaLR 1 338 -8 5 1259 2761 56 48 8 chr2 88435897 88436276 -93311811 + ORR1A1-int LTR MaLR 1 394 -1398 5 1259 230 183 46 77 chr2 88437928 88437993 -93310094 + RMER20A LTR ERVK 186 248 -268 5 1259 601 140 19 0 chr2 88442141 88442248 -93305839 + ORR1A1-int LTR MaLR 379 487 -1305 5 1259 3651 110 93 28 chr2 88442270 88442645 -93305442 - RMER17A LTR ERVK -17 734 353 5 1259 3651 110 93 28 chr2 88442810 88443123 -93304964 - RMER17A LTR ERVK -399 352 1 5 1259 4774 111 3 19 chr2 88443123 88443906 -93304181 + ORR1A1-int LTR MaLR 466 1235 -557 5 1259 2679 74 31 23 chr2 88443874 88444263 -93303824 + ORR1A1-int LTR MaLR 1401 1792 0 5 1259 2560 71 30 0 chr2 88444263 88444599 -93303488 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 5 1259 357 265 24 0 chr2 88444601 88444684 -93303403 + RLTR13C1 LTR ERVK 899 983 0 5 1259 1663 255 37 52 chr2 88446272 88446756 -93301331 + RMER19C LTR ERVK 126 602 -9 5 1259 2592 48 3 3 chr2 88453623 88453954 -93294133 - IAPEY_LTR LTR ERVK 0 385 55 5 1259 21753 47 3 6 chr2 88453954 88456674 -93291413 - IAPEy-int LTR ERVK 0 7513 4804 5 1259 2844 131 11 24 chr2 88456674 88457353 -93290734 - IAPEy-int LTR ERVK -6455 1058 1 5 1259 3208 39 5 0 chr2 88457353 88457736 -93290351 - IAPEY_LTR LTR ERVK 0 385 1 5 1259 997 311 75 29 chr2 88466730 88467114 -93280973 + MTD LTR MaLR 18 419 0 5 1260 1117 326 30 20 chr2 88494825 88495223 -93252864 + MTD LTR MaLR 18 419 0 6 1260 5843 67 62 0 chr2 88495454 88496215 -93251872 + RLTR13C2 LTR ERVK 1 808 0 6 1260 2767 240 54 16 chr2 88533704 88534385 -93213702 - RMER6D LTR ERVK -13 707 1 4 1260 1514 231 112 67 chr2 88534869 88535361 -93212726 - RLTR24 LTR ERV1 0 529 16 4 1260 2591 179 102 40 chr2 88552428 88553078 -93195009 - RMER6C LTR ERVK 0 690 1 6 1260 1833 186 8 19 chr2 88553083 88553445 -93194642 - RMER6-int LTR ERVK -6 3171 2814 6 1260 4056 188 36 18 chr2 88553456 88554735 -93193352 - RMER6-int LTR ERVK -1442 1735 282 6 1260 833 196 0 0 chr2 88555240 88555393 -93192694 + ORR1B1 LTR MaLR 242 394 0 6 1260 463 257 62 56 chr2 88555511 88555655 -93192432 + MT2A LTR ERVL 1 145 -388 6 1260 230 367 21 35 chr2 88555653 88555797 -93192290 + MT2A LTR ERVL 101 242 -291 6 1260 2541 249 53 0 chr2 88562663 88563343 -93184744 - RMER6D LTR ERVK -4 716 1 7 1260 1469 240 107 53 chr2 88563837 88564325 -93183762 - RLTR24 LTR ERV1 -2 527 14 7 1260 423 246 8 76 chr2 88566814 88566957 -93181130 + MT2B LTR ERVL 125 257 -327 7 1260 2564 216 91 8 chr2 88573888 88574517 -93173570 - RMER6C LTR ERVK -9 681 1 9 1260 1838 181 14 19 chr2 88574522 88574883 -93173204 - RMER6-int LTR ERVK -6 3171 2813 9 1260 5138 174 46 13 chr2 88574914 88575892 -93172195 - RMER6-int LTR ERVK -1434 1743 734 9 1260 332 147 133 0 chr2 88575891 88575966 -93172121 - RMER6-int LTR ERVK -2573 604 520 9 1260 868 226 47 5 chr2 88575970 88576161 -93171926 - RMER6-int LTR ERVK -2925 252 54 9 1260 696 230 0 19 chr2 88577672 88577827 -93170260 + ORR1B1 LTR MaLR 243 394 0 9 1260 454 234 80 66 chr2 88577952 88578089 -93169998 + MT2A LTR ERVL 1 139 -394 9 1260 345 314 24 24 chr2 88578094 88578218 -93169869 + MT2A LTR ERVL 101 224 -309 9 1260 259 336 107 45 chr2 88580515 88580627 -93167460 + RMER20B LTR ERVK 461 579 -48 9 1260 239 268 114 61 chr2 88581659 88581790 -93166297 - RMER17B LTR ERVK -392 566 429 1 1260 269 264 79 79 chr2 88581795 88581816 -93166271 - RMER13A LTR ERVK -254 373 355 1 1260 2538 58 148 3 chr2 88581816 88582160 -93165927 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 3 1 1260 420 249 88 24 chr2 88582160 88582300 -93165787 - RMER13A LTR ERVK -156 360 187 1 1260 814 241 42 74 chr2 88583478 88583858 -93164229 - RLTR9A LTR ERVK 0 368 1 1 1260 3706 95 42 16 chr2 88584011 88584514 -93163573 - LTRIS2 LTR ERV1 0 564 44 1 1260 3366 38 2 0 chr2 88584514 88584909 -93163178 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 1260 3706 95 42 16 chr2 88584909 88584951 -93163136 - LTRIS2 LTR ERV1 -521 43 5 1 1260 661 303 77 28 chr2 88593478 88593726 -93154361 - MLT1C LTR MaLR -29 438 179 1 1260 2605 215 64 16 chr2 88601747 88602057 -93146030 - RMER6D LTR ERVK -4 716 393 1 1260 2605 215 64 16 chr2 88602108 88602360 -93145727 - RMER6D LTR ERVK -328 392 127 1 1260 3602 153 44 7 chr2 88602363 88602981 -93145106 - RLTR26 LTR ERVK 0 642 2 1 1260 710 163 65 0 chr2 88602981 88603103 -93144984 - RMER6D LTR ERVK -590 130 1 1 1260 1947 185 75 98 chr2 88603586 88604119 -93143968 - RLTR24 LTR ERV1 0 529 9 1 1260 642 304 28 79 chr2 88604347 88604665 -93143422 - RMER15-int LTR ERVL -196 4803 4502 1 1261 1475 133 42 81 chr2 88612456 88612791 -93135296 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 322 0 1 1261 438 258 98 33 chr2 88627106 88627290 -93120797 + MTD LTR MaLR 211 406 -13 1 1261 639 229 78 10 chr2 88641232 88641459 -93106628 - RLTR25A LTR ERVK 0 1103 757 1 1261 2496 192 79 38 chr2 88641556 88642166 -93105921 - RLTR25A LTR ERVK -201 902 268 1 1261 940 253 66 83 chr2 88642273 88642562 -93105525 - RLTR25A LTR ERVK -819 284 1 1 1261 2035 149 3 0 chr2 88644882 88645205 -93102882 + ORR1A2 LTR MaLR 1 324 -3 1 1261 276 323 67 6 chr2 88659346 88659511 -93088576 - ERVL-B4-int LTR ERVL -4531 1183 1009 1 1261 468 296 122 11 chr2 88659533 88659714 -93088373 - ERVL-B4-int LTR ERVL -4775 939 739 1 1261 225 245 0 0 chr2 88663777 88663826 -93084261 + MT2A LTR ERVL 11 59 -474 1 1261 388 288 108 0 chr2 88663885 88664024 -93084063 + MTD LTR MaLR 266 419 0 1 1261 634 216 71 38 chr2 88676240 88676423 -93071664 - RLTR25B LTR ERVK 0 1028 840 2 1261 2115 218 55 75 chr2 88676574 88677174 -93070913 - RLTR25B LTR ERVK -175 853 266 2 1261 1051 225 69 77 chr2 88677279 88677553 -93070534 - RLTR25B LTR ERVK -831 272 1 2 1261 2269 117 3 0 chr2 88682396 88682722 -93065365 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 2 1261 1591 223 19 141 chr2 88685087 88685676 -93062411 + RLTR28 LTR ERVL 7 523 -1 2 1261 271 324 102 25 chr2 88693399 88693722 -93054365 - ERVL-B4-int LTR ERVL -4144 1570 1223 2 1261 354 308 64 6 chr2 88694230 88694403 -93053684 - ERVL-B4-int LTR ERVL -4523 1191 1009 2 1261 494 265 134 12 chr2 88694442 88694606 -93053481 - ERVL-B4-int LTR ERVL -4792 922 739 2 1261 225 269 43 77 chr2 88697623 88697740 -93050347 - RLTR40 LTR ERVK -434 383 271 2 1261 247 228 18 0 chr2 88698674 88698731 -93049356 + MT2A LTR ERVL 2 59 -474 2 1261 226 343 100 0 chr2 88698785 88698925 -93049162 + MTD LTR MaLR 266 419 0 2 1261 2323 128 92 7 chr2 88701628 88702031 -93046056 + RLTR9B LTR ERVK 1 437 0 2 1261 638 254 113 37 chr2 88708960 88709227 -93038860 - RLTR25A LTR ERVK 0 1103 742 2 1261 2630 208 38 44 chr2 88713116 88713755 -93034332 - RLTR25A LTR ERVK -201 902 268 2 1261 947 229 67 112 chr2 88713865 88714150 -93033937 - RLTR25A LTR ERVK -831 272 1 2 1261 1775 136 7 24 chr2 88716452 88716745 -93031342 + ORR1A2 LTR MaLR 40 327 0 2 1261 1997 179 24 120 chr2 88718152 88718235 -93029852 + RLTR28 LTR ERVL 16 90 -434 2 1261 1997 179 24 120 chr2 88718260 88718727 -93029360 + RLTR28 LTR ERVL 91 513 -11 2 1261 2105 168 42 2 chr2 88733248 88733654 -93014433 - BGLII_Mus LTR ERVK 0 422 1 2 1262 719 329 42 4 chr2 88746248 88746486 -93001601 - MLT1C LTR MaLR -29 438 192 2 1262 1860 113 9 59 chr2 88758357 88758696 -92989391 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 322 0 3 1262 1015 167 40 40 chr2 88766394 88766594 -92981493 - MTC LTR MaLR 0 421 222 3 1262 2330 180 57 2 chr2 88766594 88767083 -92981004 - MYSERV6-int LTR ERVK -4402 4557 4042 3 1262 850 247 18 0 chr2 88767099 88767269 -92980818 - MTC LTR MaLR -228 193 21 3 1262 424 133 0 0 chr2 88779236 88779296 -92968791 + RMER6D LTR ERVK 1 60 -660 3 1262 338 292 15 77 chr2 88779272 88779402 -92968685 + MT2B LTR ERVL 170 291 -310 3 1262 1658 183 36 28 chr2 88779486 88779846 -92968241 + RMER6C LTR ERVK 327 689 -1 3 1262 5829 66 95 8 chr2 88789499 88790321 -92957766 + RLTR13B1 LTR ERVK 1 893 0 3 1262 837 160 28 56 chr2 88791210 88791389 -92956698 - RLTR15 LTR ERVK -4 355 182 3 1262 587 286 88 74 chr2 88799740 88800103 -92947984 + ORR1D2 LTR MaLR 1 368 -2 3 1262 768 315 58 40 chr2 88801253 88801531 -92946556 + ORR1D2 LTR MaLR 88 370 0 3 1262 1297 333 41 52 chr2 88824157 88824323 -92923764 - MTE-int LTR MaLR -185 1395 1234 4 1262 1253 250 87 39 chr2 88824323 88824806 -92923281 + RLTR19C LTR ERVK 1 506 0 4 1262 1297 333 41 52 chr2 88824806 88825123 -92922964 - MTE-int LTR MaLR -347 1233 920 4 1262 1297 333 41 52 chr2 88825310 88825453 -92922634 - MTE-int LTR MaLR -661 919 775 4 1262 257 335 21 57 chr2 88825452 88825645 -92922442 - MTE-int LTR MaLR -787 583 398 4 1262 610 219 41 136 chr2 88825930 88826226 -92921861 - MT2A LTR ERVL -75 526 99 4 1262 1819 206 63 16 chr2 88840560 88841076 -92907011 - RLTR31A_Mm LTR ERVK -2 559 2 4 1262 1081 322 22 3 chr2 88849318 88849676 -92898411 - MTD LTR MaLR -43 376 12 4 1262 268 286 100 48 chr2 88851485 88851789 -92896298 + RLTR40 LTR ERVK 499 764 -53 4 1262 722 261 32 23 chr2 88861932 88862148 -92885939 + RLTR45 LTR ERVK 265 482 0 4 1262 329 267 21 36 chr2 88863092 88863232 -92884855 - RLTR15 LTR ERVK -196 163 26 4 1263 3035 26 0 0 chr2 88867362 88867708 -92880379 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 4 1263 3071 74 5 0 chr2 88869948 88870342 -92877745 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 1263 315 219 92 23 chr2 88870774 88870905 -92877182 - RMER17B LTR ERVK -499 459 320 4 1263 227 258 19 123 chr2 88871111 88871217 -92876870 - LTR81A LTR ERV1? -804 546 452 4 1263 1320 243 174 64 chr2 88875821 88876233 -92871854 + RMER19C LTR ERVK 1 456 -155 4 1263 1320 243 174 64 chr2 88876257 88876394 -92871693 + RMER19C LTR ERVK 457 610 -1 4 1263 4479 67 8 20 chr2 88876827 88877421 -92870666 - LTRIS_Mus LTR ERV1 0 587 1 4 1263 4074 139 84 44 chr2 88877433 88878210 -92869877 + RLTR13C2 LTR ERVK 1 808 0 4 1263 3815 76 2 4 chr2 88879511 88880015 -92868072 + RLTR1C LTR ERV1 1 503 0 4 1263 2199 113 3 55 chr2 88880838 88881183 -92866904 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 4 1263 1127 379 49 18 chr2 88881780 88882582 -92865505 - MTE-int LTR MaLR -193 1387 561 4 1263 2137 240 61 6 chr2 88882658 88883181 -92864906 + RLTR12A LTR ERVK 1 552 -16 4 1263 568 323 84 69 chr2 88883195 88883601 -92864486 - MTE-int LTR MaLR -1078 502 91 4 1263 1284 301 25 3 chr2 88884243 88884606 -92863481 - MTD LTR MaLR -39 380 10 4 1263 607 272 90 38 chr2 88892665 88892955 -92855132 + RLTR40 LTR ERVK 283 587 -230 5 1263 711 67 0 0 chr2 88898590 88898679 -92849408 + ETnERV2-int LTR ERVK 3184 3272 -4134 5 1263 280 73 0 68 chr2 88898676 88898720 -92849367 - ETnERV2-int LTR ERVK -1521 5885 5845 5 1263 306 320 19 19 chr2 88924078 88924183 -92823904 - MTE-int LTR MaLR -1259 321 217 5 1263 460 330 100 86 chr2 88925049 88925420 -92822667 - RLTR23 LTR ERV1 -7 423 48 5 1263 1585 50 59 0 chr2 88925420 88925640 -92822447 - RLTR10-int LTR ERVK -1074 913 681 5 1263 350 47 0 0 chr2 88925902 88925945 -92822142 - RLTR10-int LTR ERVK -7314 267 225 5 1263 992 188 67 9 chr2 88925944 88926154 -92821933 - RLTR19-int LTR ERVK -1755 4382 4161 5 1263 565 116 0 87 chr2 88926144 88926248 -92821839 - RLTR19-int LTR ERVK -2543 3594 3500 5 1263 1014 61 8 8 chr2 88926250 88926383 -92821704 - RLTR10-int LTR ERVK -7448 133 1 5 1263 2643 58 2 137 chr2 88926383 88926805 -92821282 - RLTR10B2 LTR ERVK 0 365 1 5 1263 1075 191 68 16 chr2 88927255 88927505 -92820582 - RLTR19-int LTR ERVK -1714 4423 4161 5 1263 944 189 189 110 chr2 88927495 88927762 -92820325 - RLTR19-int LTR ERVK -2543 3594 3289 5 1263 3373 28 5 0 chr2 88927762 88928156 -92819931 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 1263 944 189 189 110 chr2 88928156 88928323 -92819764 - RLTR19-int LTR ERVK -2849 3288 3126 5 1263 3713 176 45 7 chr2 88929442 88930161 -92817926 - RLTR19-int LTR ERVK -3032 3105 2360 5 1263 1609 157 62 67 chr2 88930163 88930565 -92817522 + RMER17C LTR ERVK 1 400 -10 5 1263 383 224 16 53 chr2 88930646 88930817 -92817270 - RLTR19-int LTR ERVK -3811 2326 2228 5 1263 1992 159 27 11 chr2 88931430 88931805 -92816282 - RLTR19-int LTR ERVK -4931 1206 826 5 1263 313 309 79 73 chr2 88932935 88933286 -92814801 + RLTR12B LTR ERVK 60 412 -29 5 1263 2587 34 2 236 chr2 88939345 88939849 -92808238 - RLTR10 LTR ERVK -4 386 1 5 1263 17036 20 2 1 chr2 88939851 88941792 -92806295 - RLTR10-int LTR ERVK -3 1984 41 5 1263 2609 31 2 236 chr2 88941808 88942312 -92805775 - RLTR10 LTR ERVK -4 386 1 5 1263 4974 114 71 15 chr2 88950644 88951502 -92796585 + RMER17A2 LTR ERVK 1 906 0 5 1263 1368 337 69 46 chr2 88958415 88959625 -92788462 - MTE-int LTR MaLR -185 1395 22 5 1263 237 372 7 65 chr2 88959630 88959695 -92788392 - MTE2b LTR MaLR -42 337 273 5 1263 1368 139 146 0 chr2 88959695 88959982 -92788105 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 5 1263 237 372 7 65 chr2 88959982 88960054 -92788033 - MTE2b LTR MaLR -107 272 208 5 1263 2356 186 66 6 chr2 88960862 88961360 -92786727 + RLTR11A LTR ERVK 1 528 0 5 1263 1238 329 102 48 chr2 88974727 88975456 -92772631 - MTE-int LTR MaLR -185 1395 628 6 1263 1374 350 70 67 chr2 88993582 88993980 -92754107 - MTE2b-int LTR MaLR -707 873 475 6 1263 1374 350 70 67 chr2 88994005 88994475 -92753612 - MTE2b-int LTR MaLR -1106 474 2 6 1263 787 300 68 29 chr2 88994476 88994809 -92753278 - MTE2b LTR MaLR 0 359 39 6 1263 330 308 0 32 chr2 88994786 88994880 -92753207 - MTE2b LTR MaLR -279 100 10 6 1264 1112 369 19 30 chr2 89002446 89002918 -92745169 - MTE-int LTR MaLR -221 1359 893 5 1264 659 174 26 0 chr2 89002962 89003077 -92745010 - RLTR23 LTR ERV1 -1 429 312 7 1264 603 81 35 0 chr2 89004035 89004121 -92743966 + MMERVK10C-int LTR ERVK 43 131 -1856 1 1264 253 244 0 0 chr2 89004122 89004167 -92743920 + RLTR27 LTR ERVK 231 275 -34 1 1264 12695 85 1 33 chr2 89004167 89005970 -92742117 + MMERVK10C-int LTR ERVK 225 1968 -5613 1 1264 1370 99 0 0 chr2 89005963 89006145 -92741942 + MMERVK10C-int LTR ERVK 7400 7581 0 1 1264 2443 85 190 0 chr2 89006145 89006509 -92741578 + RLTR10C LTR ERVK 1 433 -3 1 1264 250 253 135 10 chr2 89008132 89008228 -92739859 + RMER10B LTR ERVL 271 378 -20 1 1264 716 358 76 67 chr2 89016845 89017369 -92730718 - MTE-int LTR MaLR -218 1362 834 2 1264 469 313 81 17 chr2 89018773 89019007 -92729080 + RLTR15 LTR ERVK 14 262 -97 3 1264 247 263 76 50 chr2 89019451 89019578 -92728509 + MTC LTR MaLR 246 400 -21 3 1264 2869 52 9 79 chr2 89019742 89020183 -92727904 + RLTR10A LTR ERVK 1 410 -1 3 1264 590 236 0 63 chr2 89020214 89020404 -92727683 + RMER17C LTR ERVK 1 178 -232 3 1264 1162 225 0 26 chr2 89022557 89022785 -92725302 - MTC LTR MaLR -4 417 196 4 1264 599 227 78 0 chr2 89024719 89024860 -92723227 - MTC LTR MaLR -227 194 43 4 1264 742 236 36 63 chr2 89024860 89025195 -92722892 - RMER17C LTR ERVK 0 410 85 4 1264 228 234 0 0 chr2 89025702 89025749 -92722338 - MTC LTR MaLR -374 47 1 4 1264 698 44 11 0 chr2 89047431 89047521 -92700566 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 256 7 1264 721 97 161 0 chr2 89047507 89047631 -92700456 - ORR1A1 LTR MaLR -202 144 1 7 1264 2835 190 15 44 chr2 89049317 89049902 -92698185 + RLTR12A LTR ERVK 1 568 0 7 1264 1917 175 14 8 chr2 89049929 89050286 -92697801 - RLTR15 LTR ERVK 0 359 1 8 1264 698 44 11 0 chr2 89055449 89055539 -92692548 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 256 8 1264 721 97 161 0 chr2 89055525 89055649 -92692438 - ORR1A1 LTR MaLR -202 144 1 8 1264 2835 190 15 44 chr2 89057335 89057920 -92690167 + RLTR12A LTR ERVK 1 568 0 8 1264 1917 175 14 8 chr2 89057947 89058304 -92689783 - RLTR15 LTR ERVK 0 359 1 9 1264 698 44 11 0 chr2 89063455 89063545 -92684542 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 256 9 1264 721 97 161 0 chr2 89063531 89063655 -92684432 - ORR1A1 LTR MaLR -202 144 1 9 1264 2835 190 15 44 chr2 89065340 89065925 -92682162 + RLTR12A LTR ERVK 1 568 0 9 1264 1917 175 14 8 chr2 89065952 89066309 -92681778 - RLTR15 LTR ERVK 0 359 1 1 1264 698 44 11 0 chr2 89071459 89071549 -92676538 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 256 1 1264 721 97 161 0 chr2 89071535 89071659 -92676428 - ORR1A1 LTR MaLR -202 144 1 1 1264 2835 190 15 44 chr2 89073344 89073929 -92674158 + RLTR12A LTR ERVK 1 568 0 1 1264 1917 175 14 8 chr2 89073956 89074313 -92673774 - RLTR15 LTR ERVK 0 359 1 1 1264 698 44 11 0 chr2 89079482 89079572 -92668515 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 256 1 1264 721 97 161 0 chr2 89079558 89079682 -92668405 - ORR1A1 LTR MaLR -202 144 1 1 1264 2835 190 15 44 chr2 89081368 89081953 -92666134 + RLTR12A LTR ERVK 1 568 0 1 1264 1917 175 14 8 chr2 89081980 89082337 -92665750 - RLTR15 LTR ERVK 0 359 1 1 1264 1491 169 29 21 chr2 89088442 89088721 -92659366 - RMER6D LTR ERVK -401 319 39 1 1264 446 345 76 5 chr2 89096002 89096200 -92651887 - MLT1A0 LTR MaLR -6 359 148 1 1264 2141 148 38 57 chr2 89104768 89105221 -92642866 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 32 475 0 1 1264 4761 58 4 65 chr2 89105221 89105541 -92642546 + IAPEz-int LTR ERVK 8 299 -6182 1 1264 3437 18 5 0 chr2 89105541 89105935 -92642152 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1264 9042 36 4 1 chr2 89105935 89107030 -92641057 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 1 1264 3460 15 5 0 chr2 89107030 89107424 -92640663 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1264 4761 58 4 65 chr2 89107424 89107798 -92640289 + IAPEz-int LTR ERVK 300 660 -5821 1 1264 433 82 0 32 chr2 89107798 89107861 -92640226 + IAPEz-int LTR ERVK 1359 1419 -5062 1 1264 1811 123 4 4 chr2 89107850 89108112 -92639975 + IAPEz-int LTR ERVK 2236 2497 -5183 1 1264 932 73 24 0 chr2 89108109 89108232 -92639855 + IAPEz-int LTR ERVK 4785 4910 -2770 1 1264 21263 11 1 0 chr2 89108234 89110590 -92637497 + IAPEz-int LTR ERVK 4123 6481 0 1 1264 2321 148 35 54 chr2 89110590 89111074 -92637013 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 1 1264 6244 62 32 4 chr2 89113806 89114637 -92633450 - RLTR13A LTR ERVK 0 855 1 1 1264 1500 172 85 77 chr2 89119401 89119791 -92628296 + RLTR9C LTR ERVK 1 393 0 1 1265 1683 182 3 69 chr2 89132522 89132871 -92615216 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 1 1265 805 281 49 97 chr2 89133546 89133971 -92614116 - RLTR12B LTR ERVK -77 451 47 1 1265 1632 163 63 95 chr2 89147779 89148146 -92599941 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 32 1 1265 2605 129 61 5 chr2 89150914 89151326 -92596761 + RLTR10C LTR ERVK 1 435 -1 1 1265 419 208 41 129 chr2 89151987 89152158 -92595929 - RLTR19-int LTR ERVK -2453 3684 3529 1 1265 353 209 59 124 chr2 89152244 89152413 -92595674 - RLTR19-int LTR ERVK -2791 3346 3189 1 1265 1897 251 33 39 chr2 89152642 89153370 -92594717 - MYSERV6-int LTR ERVK -280 8679 8092 1 1265 292 150 0 111 chr2 89153358 89153448 -92594639 - RLTR19-int LTR ERVK -3928 2209 2130 1 1265 2327 108 9 0 chr2 89154697 89155021 -92593066 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 1 1265 451 250 14 72 chr2 89155053 89155191 -92592896 - RMER10B LTR ERVL 0 398 269 1 1265 1012 256 41 30 chr2 89156616 89156886 -92591201 + MTD LTR MaLR 147 419 0 1 1265 1034 205 19 30 chr2 89162119 89162450 -92585637 + RMER6D LTR ERVK 1 366 -354 2 1265 3244 48 2 2 chr2 89170382 89170778 -92577309 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 1265 565 104 96 80 chr2 89192535 89192660 -92555427 - RMER19C LTR ERVK -484 127 1 2 1265 3383 20 10 0 chr2 89193951 89194341 -92553746 - MTA_Mm LTR MaLR -2 394 1 2 1265 298 167 70 70 chr2 89194719 89194790 -92553297 - RMER19C LTR ERVK -540 71 1 2 1265 1150 204 165 3 chr2 89194880 89195226 -92552861 - RMER19B LTR ERVK -500 402 1 2 1265 4340 136 38 88 chr2 89198726 89199604 -92548483 + RMER12 LTR ERVK 1 834 -488 2 1265 512 225 19 112 chr2 89199688 89199848 -92548239 + RMER12 LTR ERVK 988 1132 -190 2 1265 444 347 71 75 chr2 89201203 89201443 -92546644 + MLT1H1 LTR MaLR 45 283 -272 2 1265 2092 181 91 28 chr2 89205800 89206328 -92541759 - RLTR31_Mm LTR ERVK 0 561 1 2 1265 1996 240 2 12 chr2 89207357 89207774 -92540313 - MTC LTR MaLR -8 413 1 2 1265 1201 265 0 0 chr2 89212380 89212629 -92535458 - MTC LTR MaLR -100 321 73 2 1265 803 234 28 34 chr2 89240395 89240722 -92507365 - RMER17C LTR ERVK -9 401 77 3 1265 4299 134 49 1 chr2 89240831 89241550 -92506537 + RLTR22_Mur LTR ERVK 38 790 -1058 3 1265 623 171 30 23 chr2 89241555 89241687 -92506400 + RLTR22_Mur LTR ERVK 673 805 -1043 3 1265 467 251 166 37 chr2 89241868 89242040 -92506047 + RMER12 LTR ERVK 1101 1258 -64 3 1265 467 309 68 55 chr2 89242348 89242411 -92505676 + RMER12 LTR ERVK 1259 1322 0 3 1265 955 220 0 50 chr2 89244727 89244928 -92503159 - RLTR25B LTR ERVK 0 1028 838 3 1265 1603 179 92 32 chr2 89245218 89245469 -92502618 - RLTR25A LTR ERVK -125 978 726 3 1265 1603 179 92 32 chr2 89245512 89245693 -92502394 - RLTR25A LTR ERVK -378 725 521 3 1265 1422 185 60 26 chr2 89245696 89245962 -92502125 - RLTR25A LTR ERVK -828 275 1 3 1266 1327 253 32 37 chr2 89261708 89262162 -92485925 - MT2A LTR ERVL 0 601 10 3 1266 1664 226 93 22 chr2 89275012 89275505 -92472582 + RLTR11A LTR ERVK 1 528 0 3 1266 2572 116 130 23 chr2 89275778 89276057 -92472030 + RMER17A2 LTR ERVK 1 293 -613 3 1266 2572 132 122 25 chr2 89276136 89276409 -92471678 + RMER17A2 LTR ERVK 294 586 -223 3 1266 2360 211 31 16 chr2 89277415 89277929 -92470158 - RLTR11A2 LTR ERVK 0 527 6 3 1266 8712 90 44 94 chr2 89292739 89294149 -92453938 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1 1365 -483 3 1266 8712 90 44 94 chr2 89294204 89294370 -92453717 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1366 1497 -351 3 1266 1418 251 115 12 chr2 89297496 89297975 -92450112 + RLTR11A LTR ERVK 1 528 0 3 1266 494 336 38 27 chr2 89298475 89298738 -92449349 - RLTR16 LTR ERVK -238 267 2 3 1266 2336 185 47 8 chr2 89299877 89300384 -92447703 - RLTR11A2 LTR ERVK 0 527 1 3 1266 2893 91 5 2 chr2 89318244 89318639 -92429448 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 1266 2377 280 32 16 chr2 89341083 89341906 -92406181 + MYSERV6-int LTR ERVK 368 1203 -7756 4 1266 229 272 31 61 chr2 89355776 89355874 -92392213 + RMER20A LTR ERVK 186 280 -236 4 1266 1916 174 8 11 chr2 89378402 89378762 -92369325 - RLTR15 LTR ERVK 0 359 1 4 1266 1874 208 165 25 chr2 89379930 89380188 -92367899 - RMER19B LTR ERVK 0 902 576 4 1266 1874 208 165 25 chr2 89380234 89380454 -92367633 - RMER19B LTR ERVK -327 575 357 4 1266 340 260 22 59 chr2 89383410 89383545 -92364542 + RLTR15 LTR ERVK 167 296 -63 4 1266 519 349 39 16 chr2 89384979 89385288 -92362799 + MurERV4-int LTR ERVK 706 1021 -4239 4 1267 1273 137 160 31 chr2 89395040 89395333 -92352754 + RLTR9E LTR ERVK 76 406 -3 4 1267 805 330 86 14 chr2 89396135 89396705 -92351382 + MYSERV6-int LTR ERVK 856 1466 -7493 4 1267 3825 259 52 23 chr2 89396956 89398108 -92349979 + MYSERV-int LTR ERVK 3937 5122 -1428 4 1267 544 251 28 59 chr2 89398111 89398315 -92349772 + RMER4A LTR ERVK 251 553 -32 4 1267 447 149 131 0 chr2 89398315 89398422 -92349665 + MYSERV-int LTR ERVK 5323 5443 -1107 4 1267 1481 146 135 95 chr2 89398439 89398817 -92349270 + RLTR9C LTR ERVK 1 393 0 4 1267 331 226 27 54 chr2 89398818 89398930 -92349157 + ETnERV2-int LTR ERVK 1 109 -4735 4 1267 3604 165 91 71 chr2 89398960 89400111 -92347976 + ETnERV2-int LTR ERVK 108 2085 -5321 4 1267 2521 178 29 8 chr2 89400136 89400628 -92347459 + ETnERV2-int LTR ERVK 2496 2997 -4409 4 1267 816 194 0 24 chr2 89400628 89400797 -92347290 + RLTR13D1 LTR ERVK 486 650 -156 4 1267 4155 176 23 44 chr2 89401243 89403293 -92344794 + ETnERV2-int LTR ERVK 2356 6422 -984 4 1267 488 107 0 0 chr2 89403509 89403584 -92344503 + ETnERV2-int LTR ERVK 7331 7405 -1 4 1267 1703 175 54 88 chr2 89403585 89403992 -92344095 + RLTR9C LTR ERVK 1 393 0 4 1267 2452 204 71 0 chr2 89404035 89404556 -92343531 + MYSERV6-int LTR ERVK 8348 8905 -54 4 1267 474 323 45 57 chr2 89404661 89405074 -92343013 + RLTR12B LTR ERVK 10 294 -65 4 1267 1812 224 30 3 chr2 89405508 89405879 -92342208 + ORR1B1 LTR MaLR 1 381 -13 4 1267 4076 65 42 9 chr2 89409782 89410324 -92337763 + LTRIS2 LTR ERV1 5 564 0 4 1267 728 258 31 26 chr2 89422028 89422223 -92325864 + MTD LTR MaLR 224 419 0 5 1267 256 239 22 0 chr2 89422451 89422497 -92325590 + MYSERV-int LTR ERVK 5064 5110 -1440 5 1267 512 266 36 56 chr2 89422502 89422697 -92325390 + RMER4A LTR ERVK 246 436 -30 5 1267 846 192 46 17 chr2 89424245 89424483 -92323604 + MYSERV-int LTR ERVK 5334 5578 -972 5 1267 1063 161 180 0 chr2 89424497 89424839 -92323248 + RLTR17 LTR ERVK 227 629 -63 5 1267 5045 231 82 86 chr2 89424884 89427212 -92320875 + RMER3D-int LTR ERVK 1 2727 -115 5 1267 1297 43 0 0 chr2 89438768 89438932 -92309155 - MTA_Mm LTR MaLR -54 342 179 5 1267 1377 229 93 8 chr2 89456244 89456610 -92291477 - MTD-int LTR MaLR -854 404 8 5 1267 979 291 74 0 chr2 89456614 89456899 -92291188 - MTD LTR MaLR 0 419 114 5 1267 4173 138 6 44 chr2 89459618 89460338 -92287749 + RLTR13D1 LTR ERVK 5 696 -110 5 1267 1892 191 209 90 chr2 89482230 89482776 -92265311 + RMER19C LTR ERVK 1 611 0 5 1267 4308 163 27 14 chr2 89488505 89489349 -92258738 + RLTR13A LTR ERVK 1 855 0 5 1267 1980 299 22 21 chr2 89493942 89494574 -92253513 - MTD-int LTR MaLR -608 650 18 5 1267 700 309 53 15 chr2 89494587 89494842 -92253245 - MTD LTR MaLR 0 419 134 5 1267 1404 128 188 10 chr2 89515545 89515838 -92232249 - IAPLTR4 LTR ERVK 0 345 1 1 1267 6314 257 44 33 chr2 89515838 89518354 -92229733 - IAPLTR3-int LTR ERVK -351 7329 3468 1 1267 761 118 35 49 chr2 89518463 89518606 -92229481 - MMERVK10C-int LTR ERVK -2911 4670 4530 1 1267 489 178 9 36 chr2 89518632 89518743 -92229344 - IAPLTR3-int LTR ERVK -2380 2464 2357 1 1267 6453 106 92 4 chr2 89518748 89520090 -92227997 - ETnERV3-int LTR ERVK -3135 4271 2735 1 1267 487 221 88 0 chr2 89520195 89520308 -92227779 - RMER16-int LTR ERVK -5077 1060 938 1 1267 1340 220 113 47 chr2 89520311 89520794 -92227293 - RMER16-int LTR ERVK -4783 623 255 1 1267 1221 118 184 31 chr2 89520915 89521309 -92226778 - IAPLTR4_I LTR ERVK -6633 948 407 1 1267 1059 68 33 27 chr2 89521308 89521458 -92226629 - IAPLTR4_I LTR ERVK -1294 176 26 1 1267 1340 141 188 10 chr2 89521465 89521758 -92226329 - IAPLTR4 LTR ERVK 0 345 1 2 1267 273 330 52 26 chr2 89521758 89521865 -92226222 - MLT1J LTR MaLR -315 197 88 2 1268 900 213 69 0 chr2 89523947 89524135 -92223952 + MTC LTR MaLR 1 201 -220 2 1268 267 135 0 28 chr2 89525087 89525153 -92222934 + MTC LTR MaLR 189 264 -157 2 1268 234 167 16 115 chr2 89525190 89525251 -92222836 + RMER6A LTR ERVK 109 163 -593 2 1268 1781 211 199 86 chr2 89528907 89529456 -92218631 + RMER19C LTR ERVK 1 611 0 3 1268 4699 116 30 30 chr2 89532252 89533061 -92215026 - RMER17D2 LTR ERVK 0 809 1 4 1268 2129 106 29 62 chr2 89538685 89539069 -92209018 + RLTR9F LTR ERVK 1 371 -44 4 1268 1056 259 46 57 chr2 89539076 89539464 -92208623 + ETnERV2-int LTR ERVK 3 386 -2928 5 1268 6594 118 62 24 chr2 89539532 89540651 -92207436 + ETnERV2-int LTR ERVK 1083 2244 -5162 5 1268 1236 142 30 0 chr2 89540642 89540839 -92207248 + ETnERV2-int LTR ERVK 2494 2696 -4710 5 1268 1042 138 122 14 chr2 89547207 89547428 -92200659 - RLTR9F LTR ERVK 0 415 171 5 1268 2024 318 12 19 chr2 89559894 89560535 -92187552 - MTD-int LTR MaLR -604 654 18 6 1268 735 279 49 18 chr2 89560548 89560771 -92187316 - MTD LTR MaLR 0 419 190 6 1268 4904 122 11 66 chr2 89565609 89566459 -92181628 + RLTR13B4 LTR ERVK 1 803 0 6 1268 4426 82 49 40 chr2 89587906 89588602 -92159485 + RMER17A-int LTR ERVK 1027 1728 0 8 1268 3131 136 30 144 chr2 89588602 89589128 -92158959 + RMER17A LTR ERVK 1 498 -253 8 1268 3131 136 30 144 chr2 89589156 89589477 -92158610 + RMER17A LTR ERVK 499 751 0 8 1268 2148 131 31 114 chr2 89600421 89600939 -92147148 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 9 1268 649 244 16 0 chr2 89622171 89622294 -92125793 + ETnERV2-int LTR ERVK 7072 7196 -210 1 1268 580 147 25 25 chr2 89624119 89624238 -92123849 - MurERV4-int LTR ERVK -819 4441 4323 1 1268 2718 112 170 8 chr2 89624271 89624751 -92123336 - MurERV4_19-int LTR ERVK -1150 4630 4073 1 1268 2104 123 3 0 chr2 89627440 89627748 -92120339 - RLTR27 LTR ERVK 0 309 1 1 1268 967 271 52 92 chr2 89635352 89635713 -92112374 - MT2A LTR ERVL -123 478 5 1 1268 1008 158 6 29 chr2 89635761 89635931 -92112156 + ORR1D1 LTR MaLR 1 166 -208 1 1268 455 312 83 56 chr2 89635933 89636193 -92111894 + MT2B LTR ERVL 20 286 -189 1 1268 242 125 80 40 chr2 89636199 89636249 -92111838 + MT2B2 LTR ERVL 533 584 0 1 1268 295 223 130 0 chr2 89636262 89636398 -92111689 + ORR1D1 LTR MaLR 205 372 -2 1 1268 1995 120 32 0 chr2 89641079 89641395 -92106692 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 1 1268 1454 195 142 14 chr2 89650253 89650633 -92097454 + RMER19B LTR ERVK 199 902 0 1 1269 5589 99 29 60 chr2 89664130 89665061 -92083026 + RLTR13D6 LTR ERVK 1 902 0 1 1269 492 241 6 132 chr2 89665287 89665469 -92082618 - RLTR9A2 LTR ERVK 0 383 225 1 1269 2736 286 54 45 chr2 89666173 89666764 -92081323 - SRV_MM-int LTR ERVK -2472 3695 3100 1 1269 1784 148 113 21 chr2 89666764 89667144 -92080943 + RLTR9F LTR ERVK 1 415 0 1 1269 3833 292 64 41 chr2 89667144 89668399 -92079688 - SRV_MM-int LTR ERVK -3068 3099 1807 1 1269 1632 296 27 46 chr2 89668385 89669138 -92078949 - SRV_MM-int LTR ERVK -1658 1656 1167 1 1269 1488 309 41 63 chr2 89669434 89670212 -92077875 - SRV_MM-int LTR ERVK -2427 887 47 1 1269 583 242 174 69 chr2 89670262 89670595 -92077492 - RLTR9A LTR ERVK 0 368 1 1 1269 729 322 96 35 chr2 89676710 89676829 -92071258 - MLT1C-int LTR MaLR -1003 368 246 1 1269 729 322 96 35 chr2 89676951 89677066 -92071021 - MLT1C-int LTR MaLR -1126 245 111 1 1269 729 322 96 35 chr2 89677094 89677202 -92070885 - MLT1C-int LTR MaLR -1261 110 5 1 1269 286 314 37 28 chr2 89678441 89678549 -92069538 - MT2B LTR ERVL -339 262 154 1 1269 253 278 182 27 chr2 89678535 89678683 -92069404 - MLT1C LTR MaLR -277 190 20 1 1269 480 173 29 0 chr2 89695062 89695166 -92052921 - RMER15 LTR ERVL -117 407 301 2 1269 999 249 0 0 chr2 89695525 89695726 -92052361 - RMER15 LTR ERVL 0 575 375 2 1269 1700 161 54 13 chr2 89695728 89696042 -92052045 - RLTR28 LTR ERVL -1 523 197 2 1269 506 144 113 0 chr2 89696042 89696139 -92051948 + RLTR11B LTR ERVK 1 108 -345 2 1269 7323 41 10 40 chr2 89696139 89696526 -92051561 + RLTR13A3 LTR ERVK 1 387 -591 2 1269 3544 10 2 0 chr2 89696526 89696921 -92051166 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 1269 8983 36 7 1 chr2 89696921 89698012 -92050075 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 2 1269 3544 10 2 0 chr2 89698012 89698407 -92049680 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 1269 7323 41 10 40 chr2 89698407 89699025 -92049062 + RLTR13A3 LTR ERVK 388 976 -2 2 1269 2152 129 3 31 chr2 89699025 89699381 -92048706 + RLTR11B LTR ERVK 103 448 -5 2 1269 1741 128 24 92 chr2 89699382 89699718 -92048369 + RLTR23 LTR ERV1 1 313 -117 2 1269 2321 128 71 44 chr2 89699736 89700046 -92048041 + RLTR1D LTR ERV1 59 385 -220 2 1269 3391 30 2 0 chr2 89700046 89700441 -92047646 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 1269 2321 179 75 89 chr2 89700441 89700609 -92047478 + RLTR1D LTR ERV1 365 503 0 2 1269 856 99 15 30 chr2 89700609 89700727 -92047360 + RLTR23 LTR ERV1 314 429 -1 2 1269 2871 170 23 37 chr2 89700727 89701295 -92046792 + RLTR31_Mm LTR ERVK 1 560 -1 2 1269 1559 206 45 54 chr2 89701311 89701886 -92046201 - RMER15 LTR ERVL -108 467 1 2 1269 349 325 15 68 chr2 89702260 89702392 -92045695 - ORR1D2 LTR MaLR -27 343 219 2 1269 656 191 61 0 chr2 89704775 89704906 -92043181 + RMER19B LTR ERVK 1 139 -763 2 1269 1343 203 82 105 chr2 89704881 89705233 -92042854 + RMER19B LTR ERVK 55 398 -504 2 1269 592 276 61 57 chr2 89705237 89705483 -92042604 + RLTR16 LTR ERVK 25 271 -234 2 1269 420 253 95 84 chr2 89705715 89705905 -92042182 + RMER19B LTR ERVK 296 487 -415 2 1269 1413 206 53 32 chr2 89707641 89707994 -92040093 + RMER19B LTR ERVK 262 737 -165 2 1269 1133 271 77 86 chr2 89709183 89709648 -92038439 - RMER6B LTR ERVK 0 461 1 2 1269 2047 118 15 51 chr2 89722277 89722608 -92025479 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 2 1269 1090 330 63 8 chr2 89723179 89723530 -92024557 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 2 1269 8536 29 0 0 chr2 89725270 89726297 -92021790 + MERVL-int LTR ERVL 4329 5355 -130 2 1269 323 131 115 0 chr2 89726301 89726362 -92021725 + ORR1A3-int LTR MaLR 553 620 -1343 2 1269 663 299 164 14 chr2 89726504 89726796 -92021291 + MLT2B4 LTR ERVL 139 474 -82 2 1269 1102 230 167 59 chr2 89726931 89727287 -92020800 + RMER6C LTR ERVK 1 376 -314 2 1269 1102 230 167 59 chr2 89727386 89727652 -92020435 + RMER6C LTR ERVK 377 689 -1 2 1269 2329 188 2 5 chr2 89728241 89728663 -92019424 + MTC LTR MaLR 1 421 0 2 1269 3524 25 0 128 chr2 89729664 89730164 -92017923 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 2 1269 7221 36 2 52 chr2 89730164 89731149 -92016938 - MMERVK10C-int LTR ERVK 0 7581 6646 2 1269 17040 33 6 1 chr2 89731135 89733230 -92014857 - MMERVK10C-int LTR ERVK -1771 5810 3705 2 1269 22632 46 1 3 chr2 89739899 89742755 -92005332 - MMERVK10C-int LTR ERVK -3862 3719 870 2 1269 2437 95 55 3 chr2 89742753 89743132 -92004955 - MMERVK10C-int LTR ERVK -7182 399 1 2 1269 3484 28 0 132 chr2 89743132 89743634 -92004453 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 2 1269 261 218 0 0 chr2 89746919 89746974 -92001113 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 320 2 1269 1210 283 48 84 chr2 89747005 89747346 -92000741 - ORR1D1-int LTR MaLR -618 752 434 2 1269 1210 283 48 84 chr2 89747443 89747518 -92000569 - ORR1D1-int LTR MaLR -937 433 351 2 1269 1507 254 32 39 chr2 89747579 89748003 -92000084 - ORR1D1-int LTR MaLR -1135 445 2 2 1269 387 236 15 167 chr2 89748018 89748150 -91999937 - ORR1D1 LTR MaLR -12 362 251 2 1269 2209 164 0 3 chr2 89748152 89748506 -91999581 + RLTR28 LTR ERVL 3 355 -169 2 1269 2653 95 125 2 chr2 89749378 89749801 -91998286 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 2 1269 238 0 0 0 chr2 89751145 89751174 -91996913 - RMER19C LTR ERVK -2 609 581 2 1269 836 284 158 16 chr2 89751252 89751638 -91996449 + RLTR45 LTR ERVK 42 482 0 2 1269 1319 267 37 17 chr2 89751638 89752121 -91995966 + RLTR45-int LTR ERVK 1 493 -6751 2 1269 610 202 0 0 chr2 89752237 89752361 -91995726 + RLTR45-int LTR ERVK 569 692 -6552 2 1269 488 214 62 0 chr2 89752739 89752851 -91995236 + RLTR45-int LTR ERVK 693 811 -6433 2 1269 2769 322 58 48 chr2 89753564 89756573 -91991514 + RNERVK23-int LTR ERVK 2671 5707 -2510 2 1269 631 321 4 4 chr2 89757576 89757820 -91990267 + RLTR45-int LTR ERVK 1333 1576 -5668 2 1269 294 302 33 83 chr2 89758067 89758309 -91989778 + RLTR6-int LTR ERV1 7149 7378 -400 2 1269 941 272 34 14 chr2 89760327 89760767 -91987320 + ETnERV2-int LTR ERVK 7453 7797 -420 2 1269 1532 241 24 64 chr2 89760838 89761290 -91986797 + ETnERV2-int LTR ERVK 6647 7080 -326 2 1269 637 296 45 32 chr2 89761350 89761736 -91986351 + RLTR45 LTR ERVK 42 482 0 2 1269 1769 239 119 36 chr2 89761736 89762253 -91985834 - RMER19B LTR ERVK -32 870 311 2 1269 2007 160 229 59 chr2 89779477 89780067 -91968020 - RMER6C LTR ERVK 0 690 1 3 1270 552 219 14 21 chr2 89789475 89789615 -91958472 - RLTR1 LTR ERV1 -434 190 52 3 1270 1950 101 41 69 chr2 89789840 89790158 -91957929 - RLTR27 LTR ERVK 0 309 1 3 1270 292 194 41 14 chr2 89791532 89791605 -91956482 - RLTR25A LTR ERVK 0 1103 1029 3 1270 4620 115 196 77 chr2 89797522 89798445 -91949642 + RLTR13D4 LTR ERVK 1 1033 0 3 1270 1842 196 79 10 chr2 89800085 89800491 -91947596 - RLTR28 LTR ERVL -90 434 1 3 1270 444 258 36 62 chr2 89800759 89800953 -91947134 - RMER17C-int LTR ERVK -366 2872 2684 3 1270 583 288 84 68 chr2 89804261 89804641 -91943446 - RLTR42-int LTR ERVK -3299 2838 2453 3 1270 628 220 6 34 chr2 89804811 89804990 -91943097 - RLTR42-int LTR ERVK -3395 2127 1954 3 1270 1895 164 105 11 chr2 89808151 89808533 -91939554 - RLTR28 LTR ERVL -3 521 104 3 1270 1611 176 84 3 chr2 89808550 89808846 -91939241 + ORR1B1 LTR MaLR 1 320 -74 3 1270 967 206 43 9 chr2 89808855 89809066 -91939021 + RMER13B LTR ERVK 5 222 -686 3 1270 3050 199 24 40 chr2 89809075 89809625 -91938462 + RMER13A LTR ERVK 146 681 -179 3 1270 3050 199 24 40 chr2 89809646 89809765 -91938322 + RMER13A LTR ERVK 682 804 -56 3 1270 508 232 56 8 chr2 89809746 89809872 -91938215 + ORR1B1 LTR MaLR 188 319 -8 3 1270 5316 189 79 24 chr2 89809876 89811052 -91937035 + ORR1B1-int LTR MaLR 1 1241 -268 3 1270 521 256 49 53 chr2 89811117 89811360 -91936727 + RLTR15 LTR ERVK 50 291 -68 3 1270 232 35 0 0 chr2 89811366 89811395 -91936692 + RMER19A LTR ERVK 1 29 -708 3 1270 1164 199 121 5 chr2 89811393 89811713 -91936374 + RMER19A LTR ERVK 186 712 -25 3 1270 549 262 71 32 chr2 89812044 89812060 -91936027 + RMER19A LTR ERVK 878 890 -12 3 1270 1703 177 34 22 chr2 89812139 89812462 -91935625 + ORR1B1-int LTR MaLR 1181 1507 -2 3 1270 1799 193 70 5 chr2 89812464 89812834 -91935253 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 3 1270 562 238 1 12 chr2 89812904 89813035 -91935052 + ORR1D2 LTR MaLR 254 379 0 3 1270 2831 210 7 50 chr2 89813149 89813750 -91934337 + RMER15 LTR ERVL 1 575 0 3 1270 2821 61 0 0 chr2 89819689 89820035 -91928052 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 3 1270 410 300 189 79 chr2 89825481 89825789 -91922298 - RLTR17 LTR ERVK -75 453 116 3 1270 7130 154 46 11 chr2 89827461 89828920 -91919167 + ORR1A3-int LTR MaLR 427 1860 -103 3 1270 1925 198 66 27 chr2 89834678 89835119 -91912968 + RLTR11A2 LTR ERVK 3 460 -67 3 1270 2075 186 18 92 chr2 89836028 89836531 -91911556 + RMER4A LTR ERVK 1 466 0 3 1270 470 241 0 49 chr2 89888149 89888271 -91859816 + RLTR43A LTR ERVK 249 364 0 4 1270 1501 168 49 104 chr2 89889421 89889846 -91858241 - RMER16 LTR ERVK 0 533 1 4 1270 226 250 50 111 chr2 89891190 89891289 -91856798 - MER77 LTR ERVL -93 514 422 4 1270 934 243 118 75 chr2 89899358 89899733 -91848354 + MT2A LTR ERVL 1 513 -71 4 1270 520 245 132 108 chr2 89899800 89899841 -91848246 + MT2A LTR ERVL 514 567 -17 4 1270 259 362 81 48 chr2 89901961 89902170 -91845917 - MER21B LTR ERV1 -103 760 545 4 1270 2238 113 0 3 chr2 89913565 89913892 -91834195 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 4 1270 1662 146 11 0 chr2 89913892 89914160 -91833927 - ORR1A3-int LTR MaLR 0 1963 1693 4 158 4186 108 29 9 chr2 89914925 89915579 -91832508 - ORR1A3-int LTR MaLR -268 1695 1029 4 1271 2699 186 74 35 chr2 89916412 89916955 -91831132 - ORR1A3-int LTR MaLR -757 1206 636 5 1271 2699 186 74 35 chr2 89917619 89917761 -91830326 - ORR1A3-int LTR MaLR -1328 635 495 5 1271 783 242 2 66 chr2 89944593 89944831 -91803256 + ORR1C2 LTR MaLR 1 221 -157 5 1271 298 346 81 45 chr2 89946221 89946442 -91801645 - MER21B LTR ERV1 -103 760 532 5 1271 2878 82 23 0 chr2 89963046 89963437 -91784650 - MTB LTR MaLR 0 400 1 5 1271 1239 241 47 44 chr2 89973028 89973411 -91774676 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 5 1271 1119 242 109 51 chr2 89977708 89978121 -91769966 + RMER5 LTR ERV1 80 516 -18 5 1271 246 356 81 20 chr2 89986460 89986609 -91761478 + MLT1J LTR MaLR 87 244 -268 5 1271 482 292 72 102 chr2 89994342 89994674 -91753413 - RLTR17 LTR ERVK -256 436 115 5 1271 2946 33 0 0 chr2 90018625 90018962 -91729125 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 337 0 1 1271 56760 19 20 4 chr2 90018962 90025338 -91722749 + IAPEz-int LTR ERVK 8 6481 0 1 1271 2946 33 0 0 chr2 90025338 90025675 -91722412 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 337 0 1 1271 881 255 119 16 chr2 90027120 90027423 -91720664 + ORR1E LTR MaLR 26 359 0 1 1271 654 302 82 52 chr2 90027615 90027650 -91720437 - MTEa LTR MaLR 0 379 352 2 1271 654 302 82 52 chr2 90027796 90028127 -91719960 - MTEa LTR MaLR -28 351 2 2 1271 549 259 213 8 chr2 90032379 90032670 -91715417 - MLT1B LTR MaLR 0 467 40 2 1271 679 227 285 21 chr2 90033692 90033976 -91714111 - ORR1E LTR MaLR 0 359 1 2 1271 486 177 10 49 chr2 90039558 90039672 -91708415 - MTE2a LTR MaLR -19 360 241 3 1271 248 264 79 35 chr2 90040468 90040582 -91707505 + RMER10B LTR ERVL 269 387 -11 3 1271 2557 135 31 68 chr2 90041094 90041372 -91706715 + RLTR11A2 LTR ERVK 8 270 -257 4 1271 1859 240 117 104 chr2 90041372 90042219 -91705868 + RMER13A LTR ERVK 3 860 0 4 1271 2557 135 31 68 chr2 90042219 90042480 -91705607 + RLTR11A2 LTR ERVK 271 527 0 4 1271 1583 162 24 63 chr2 90045283 90045618 -91702469 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 322 0 4 1272 1770 136 17 85 chr2 90046758 90047112 -91700975 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 65 5 1272 2019 170 35 11 chr2 90051603 90051972 -91696115 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 6 1272 887 174 84 0 chr2 90059467 90059622 -91688465 + RLTR20D LTR ERVK 1 168 -400 7 1272 938 150 153 11 chr2 90059616 90059805 -91688282 + RLTR19 LTR ERVK 280 495 -4 7 1272 4257 30 0 2 chr2 90060919 90061413 -91686674 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 7 1272 247 363 55 75 chr2 90066778 90066924 -91681163 + MLT1J LTR MaLR 206 348 -164 8 1272 291 246 0 92 chr2 90067265 90067341 -91680746 + MTEa LTR MaLR 5 73 -306 8 1272 501 325 23 56 chr2 90073544 90073759 -91674328 + MTEa LTR MaLR 62 269 -110 8 1272 1067 301 70 36 chr2 90073905 90074373 -91673714 + MTE-int LTR MaLR 17 500 -1080 9 1272 2002 158 22 11 chr2 90075854 90076218 -91671869 - RLTR9A LTR ERVK 0 368 1 9 1272 330 111 0 36 chr2 90076237 90076293 -91671794 - ETnERV2-int LTR ERVK -22 7384 7331 9 1272 536 270 25 119 chr2 90076495 90076856 -91671231 - ETnERV2-int LTR ERVK -983 6423 6097 9 1272 6717 127 55 34 chr2 90076867 90077861 -91670226 - RMER16-int LTR ERVK -1233 4173 3149 9 1272 2313 72 119 11 chr2 90077861 90078213 -91669874 + RLTR10 LTR ERVK 1 390 0 9 1272 6717 127 55 34 chr2 90078213 90078496 -91669591 - RMER16-int LTR ERVK -2258 3148 2869 9 1272 1113 123 102 101 chr2 90078513 90078806 -91669281 - RMER16-int LTR ERVK -4903 2341 2069 9 1272 242 281 110 0 chr2 90079436 90079518 -91668569 - MLT1C LTR MaLR -330 137 47 9 1272 3168 68 17 0 chr2 90080108 90080522 -91667565 - BGLII LTR ERVK 0 421 1 1 1272 1177 237 43 139 chr2 90090863 90091279 -91656808 - MTE2a LTR MaLR 0 379 4 1 1272 318 208 14 31 chr2 90093683 90093783 -91654304 - MLT1A1 LTR MaLR -52 415 300 1 1272 443 254 59 199 chr2 90102371 90102642 -91645445 - MTD LTR MaLR -143 236 4 1 1272 296 218 14 31 chr2 90107127 90107227 -91640860 - MLT1A1 LTR MaLR -52 415 300 1 1272 2576 122 33 104 chr2 90139975 90140494 -91607593 - RLTR45 LTR ERVK 0 482 1 1 1272 7171 102 9 2 chr2 90140494 90141631 -91606456 - RLTR45-int LTR ERVK -492 7725 6331 1 1272 2649 39 0 6 chr2 90141977 90142311 -91605776 - RLTR45-int LTR ERVK -5596 1648 1317 1 1272 358 319 18 18 chr2 90142563 90142732 -91605355 - SRV_MM-int LTR ERVK -3623 2544 2376 1 1272 751 92 0 0 chr2 90143178 90143297 -91604790 - RLTR45-int LTR ERVK -6213 1031 913 1 1272 1631 82 0 0 chr2 90143416 90143635 -91604452 - RLTR45-int LTR ERVK -6334 910 692 1 1272 4316 71 16 19 chr2 90143991 90144610 -91603477 - RLTR45-int LTR ERVK -6552 692 76 1 1272 2489 111 139 19 chr2 90144634 90145064 -91603023 - RLTR45 LTR ERVK 0 482 1 1 1272 1691 117 58 90 chr2 90147610 90147975 -91600112 + RLTR9A LTR ERVK 16 368 0 1 1272 1090 122 132 59 chr2 90148569 90148853 -91599234 + RMER16-int LTR ERVK 2077 2341 -4903 1 1272 6780 127 57 27 chr2 90148870 90150137 -91597950 + RMER16-int LTR ERVK 2869 4173 -1233 1 1272 536 270 25 119 chr2 90150148 90150509 -91597578 + ETnERV2-int LTR ERVK 6097 6423 -983 1 1272 330 111 0 36 chr2 90150711 90150767 -91597320 + ETnERV2-int LTR ERVK 7331 7384 -22 1 1272 2033 155 16 11 chr2 90150786 90151152 -91596935 + RLTR9A LTR ERVK 1 368 0 1 1272 1067 301 70 36 chr2 90152633 90153101 -91594986 - MTE-int LTR MaLR -1080 500 17 1 1272 501 325 23 56 chr2 90153247 90153462 -91594625 - MTEa LTR MaLR -110 269 62 1 1272 291 246 0 92 chr2 90159665 90159741 -91588346 - MTEa LTR MaLR -306 73 5 1 1272 247 363 55 75 chr2 90160082 90160228 -91587859 - MLT1J LTR MaLR -164 348 206 1 1272 4257 30 0 2 chr2 90165593 90166087 -91582000 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 1 1272 870 150 153 11 chr2 90167201 90167390 -91580697 - RLTR19 LTR ERVK -4 495 280 1 1272 832 174 84 0 chr2 90167384 90167539 -91580548 - RLTR20D LTR ERVK -400 168 1 1 1272 2019 170 35 11 chr2 90175034 90175403 -91572684 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 2 1273 1770 136 17 85 chr2 90179894 90180248 -91567839 + ORR1B1 LTR MaLR 65 394 0 2 1273 1583 162 24 63 chr2 90181388 90181723 -91566364 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 2 1273 2557 135 31 68 chr2 90184526 90184787 -91563300 - RLTR11A2 LTR ERVK 0 527 271 2 1273 1859 240 117 104 chr2 90184787 90185634 -91562453 - RMER13A LTR ERVK 0 860 3 2 1273 2557 135 31 68 chr2 90185634 90185912 -91562175 - RLTR11A2 LTR ERVK -257 270 8 2 1273 248 264 79 35 chr2 90186424 90186538 -91561549 - RMER10B LTR ERVL -11 387 269 2 1273 486 177 10 49 chr2 90187334 90187448 -91560639 + MTE2a LTR MaLR 241 360 -19 2 1273 679 227 285 21 chr2 90193030 90193314 -91554773 + ORR1E LTR MaLR 1 359 0 2 1273 549 259 213 8 chr2 90194336 90194627 -91553460 + MLT1B LTR MaLR 40 467 0 2 1273 654 302 82 52 chr2 90198879 90199210 -91548877 + MTEa LTR MaLR 2 351 -28 2 1273 654 302 82 52 chr2 90199356 90199391 -91548696 + MTEa LTR MaLR 352 379 0 2 1273 881 255 119 16 chr2 90199583 90199886 -91548201 - ORR1E LTR MaLR 0 359 26 2 1273 2946 33 0 0 chr2 90201331 90201668 -91546419 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 0 337 1 2 1273 56760 19 20 4 chr2 90201668 90208044 -91540043 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 8 2 1273 2946 33 0 0 chr2 90208044 90208381 -91539706 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 0 337 1 2 1273 3381 68 17 0 chr2 90222435 90222849 -91525238 + BGLII LTR ERVK 1 421 0 2 1273 245 281 110 0 chr2 90223439 90223521 -91524566 + MLT1C LTR MaLR 47 137 -330 2 1273 1240 123 102 101 chr2 90224151 90224444 -91523643 + RMER16-int LTR ERVK 2069 2341 -4903 2 1273 7342 128 62 34 chr2 90224459 90224744 -91523343 + RMER16-int LTR ERVK 2867 3148 -2258 2 1273 2478 72 119 11 chr2 90224744 90225096 -91522991 - RLTR10 LTR ERVK 0 390 1 2 1273 7342 128 62 34 chr2 90225096 90226123 -91521964 + RMER16-int LTR ERVK 3149 4215 -1191 2 1273 666 270 25 119 chr2 90226101 90226462 -91521625 + ETnERV2-int LTR ERVK 6097 6423 -983 2 1273 360 111 0 36 chr2 90226664 90226720 -91521367 + ETnERV2-int LTR ERVK 7331 7384 -22 2 1273 2196 155 16 11 chr2 90226739 90227105 -91520982 + RLTR9A LTR ERVK 1 368 0 2 1273 1021 297 73 39 chr2 90228590 90229056 -91519031 - MTE-int LTR MaLR -1082 498 17 2 1273 494 335 23 56 chr2 90229202 90229417 -91518670 - MTEa LTR MaLR -110 269 62 2 1273 3197 23 2 117 chr2 90235368 90235804 -91512283 - RLTR10 LTR ERVK -4 386 1 2 1273 274 160 0 0 chr2 90236166 90236216 -91511871 - MTEa LTR MaLR -325 54 5 2 1273 250 343 62 82 chr2 90236558 90236704 -91511383 - MLT1J LTR MaLR -164 348 206 2 1273 316 256 67 34 chr2 90244219 90244308 -91503779 + RMER12B LTR ERVK 1313 1404 0 3 1273 873 185 141 11 chr2 90245343 90245534 -91502553 - RLTR19 LTR ERVK -4 495 280 3 1273 931 155 84 0 chr2 90245528 90245683 -91502404 - RLTR20D LTR ERVK -400 168 1 3 1273 2103 173 35 14 chr2 90252441 90252811 -91495276 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 3 1273 1892 138 19 92 chr2 90257318 90257693 -91490394 + ORR1B1 LTR MaLR 9 394 0 3 1273 1676 166 24 63 chr2 90259607 90259942 -91488145 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 3 1273 2724 133 33 70 chr2 90262764 90263025 -91485062 - RLTR11A2 LTR ERVK 0 527 271 3 1273 2215 240 113 101 chr2 90263025 90263873 -91484214 - RMER13A LTR ERVK 0 860 3 3 1273 2724 133 33 70 chr2 90263873 90264151 -91483936 - RLTR11A2 LTR ERVK -257 270 8 3 1273 259 264 111 44 chr2 90264671 90264806 -91483281 - RMER10B LTR ERVL -11 387 244 3 1273 519 177 10 49 chr2 90265579 90265693 -91482394 + MTE2a LTR MaLR 241 360 -19 3 1273 771 227 285 21 chr2 90271265 90271549 -91476538 + ORR1E LTR MaLR 1 359 0 3 1273 279 328 33 8 chr2 90272575 90272695 -91475392 + MLT1B LTR MaLR 40 162 -228 3 1273 453 253 71 26 chr2 90272712 90272866 -91475221 + MLT1B LTR MaLR 230 390 0 3 1273 784 285 80 44 chr2 90277118 90277453 -91470634 + MTEa LTR MaLR 2 334 -25 3 1273 272 290 77 105 chr2 90277600 90277628 -91470459 + MTEa LTR MaLR 335 354 -5 3 1273 1008 247 133 25 chr2 90277826 90278150 -91469937 - ORR1E LTR MaLR 0 359 1 3 1273 3191 63 17 2 chr2 90287422 90287837 -91460250 + BGLII LTR ERVK 1 421 0 3 1273 429 298 119 11 chr2 90288432 90288539 -91459548 + MLT1C LTR MaLR 47 187 -280 3 1273 429 325 98 25 chr2 90289078 90289326 -91458761 + MLT1C LTR MaLR 188 453 -14 3 1273 1410 192 98 20 chr2 90294863 90295209 -91452878 + ORR1D1 LTR MaLR 2 374 0 3 1273 297 207 22 99 chr2 90296853 90296944 -91451143 + RLTR25A LTR ERVK 493 576 -527 3 1273 807 297 79 29 chr2 90304210 90304585 -91443502 + MTD LTR MaLR 1 407 -14 4 1273 294 239 55 86 chr2 90305826 90305954 -91442133 + MLT1A0 LTR MaLR 36 159 -206 4 1273 368 292 19 71 chr2 90305978 90306133 -91441954 + MLT1A0 LTR MaLR 219 365 0 4 1273 2930 50 58 25 chr2 90307258 90307652 -91440435 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 4 1274 602 271 55 55 chr2 90313324 90313543 -91434544 + MLT1B LTR MaLR 2 220 -170 4 1274 340 207 119 73 chr2 90317085 90317236 -91430851 + LTR16D LTR ERVL 456 613 -38 4 1274 232 245 92 41 chr2 90319737 90319835 -91428252 - LTR33 LTR ERVL -370 145 43 4 1274 475 284 10 67 chr2 90323904 90324113 -91423974 - RLTR11B LTR ERVK -42 486 284 4 1274 764 301 14 18 chr2 90324193 90324470 -91423617 - RLTR11B LTR ERVK -177 276 1 4 1274 702 202 198 38 chr2 90334379 90334697 -91413390 + MTE2b LTR MaLR 1 369 -10 4 1274 344 224 13 0 chr2 90337743 90337819 -91410268 - RMER15 LTR ERVL -47 528 452 4 1274 700 310 141 28 chr2 90339283 90339638 -91408449 + LTR83 LTR ERVL 9 403 -377 4 1274 247 312 30 61 chr2 90340135 90340234 -91407853 + LTR83 LTR ERVL 685 780 0 4 1274 1062 186 0 93 chr2 90341110 90341324 -91406763 + ORR1C2 LTR MaLR 1 194 -190 4 1274 1005 121 95 50 chr2 90341403 90341603 -91406484 + ORR1C2 LTR MaLR 171 379 -5 4 1274 320 298 0 133 chr2 90348803 90348923 -91399164 + MT2B LTR ERVL 153 256 -345 4 1274 245 305 73 10 chr2 90361595 90361691 -91386396 + LTR79 LTR ERVL 342 443 -84 5 1274 1452 211 142 5 chr2 90391841 90392208 -91355879 - MTD LTR MaLR 0 419 3 5 1274 3324 48 2 2 chr2 90396689 90397087 -91351000 - MTB LTR MaLR 0 400 3 5 1274 1214 168 63 22 chr2 90424968 90425256 -91322831 + ORR1C1 LTR MaLR 48 378 0 6 1274 457 339 94 52 chr2 90426166 90426399 -91321688 - MLT1I LTR MaLR 0 411 169 6 1274 292 268 36 24 chr2 90429210 90429294 -91318793 + ORR1E LTR MaLR 1 85 -274 6 1274 3038 47 36 10 chr2 90430080 90430470 -91317617 - MTB LTR MaLR 0 400 1 6 1274 3272 36 26 5 chr2 90431302 90431690 -91316397 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 1274 2076 103 27 0 chr2 90437033 90437333 -91310754 - ORR1A3 LTR MaLR -18 308 1 6 1274 852 208 140 70 chr2 90437481 90437823 -91310264 - RMER10A LTR ERVL 0 442 77 6 1275 2333 95 6 30 chr2 90439933 90440270 -91307817 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 7 1275 360 236 65 19 chr2 90440912 90441020 -91307067 + MLT1J1 LTR MaLR 16 128 -316 7 1275 2513 166 20 192 chr2 90442770 90443464 -91304623 - RMER15 LTR ERVL 0 575 1 7 1275 376 285 15 37 chr2 90453348 90453483 -91294604 - MER57A-int LTR ERV1 -255 5932 5801 7 1275 303 314 0 0 chr2 90477238 90477308 -91270779 + MLT1K LTR MaLR 156 225 -370 7 1275 563 309 124 19 chr2 90480325 90480648 -91267439 - LTR33 LTR ERVL -5 510 154 7 1275 691 347 42 14 chr2 90486753 90487042 -91261045 - MLT1A0 LTR MaLR -67 298 2 8 1275 835 60 7 26 chr2 90488128 90488282 -91259805 - RMER17B LTR ERVK -495 463 313 8 1275 268 340 37 14 chr2 90496335 90496482 -91251605 + MLT1E2 LTR MaLR 314 485 -195 8 1275 336 271 133 84 chr2 90497308 90497508 -91250579 + MER74B LTR ERVL 251 463 -159 8 1275 2962 66 58 0 chr2 90497508 90497886 -91250201 - MTB LTR MaLR 0 400 1 8 1275 336 271 133 84 chr2 90497886 90497911 -91250176 + MER74B LTR ERVL 464 487 -135 8 1275 1165 281 79 8 chr2 90501710 90502066 -91246021 + LTR53 LTR ERVL 139 519 0 9 1275 290 243 83 135 chr2 90505714 90505731 -91242356 + MT2B LTR ERVL 151 196 -405 2 1275 290 243 83 135 chr2 90505821 90505847 -91242240 + MT2B LTR ERVL 197 276 -325 2 1275 3046 30 30 0 chr2 90509045 90509381 -91238706 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 3 1275 322 240 20 134 chr2 90512293 90512418 -91235669 - MT2B LTR ERVL -337 264 155 4 1275 322 240 20 134 chr2 90512451 90512474 -91235613 - MT2B LTR ERVL -447 154 133 4 1275 250 355 57 0 chr2 90517702 90517826 -91230261 - LTR16A LTR ERVL -15 436 306 7 1275 1818 178 83 6 chr2 90520909 90521260 -91226827 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 8 1275 327 303 81 0 chr2 90523025 90523124 -91224963 - ORR1E LTR MaLR -249 110 4 8 1275 282 301 80 122 chr2 90527581 90528008 -91220079 - RLTR11A LTR ERVK -15 513 128 1 1275 260 290 55 188 chr2 90528155 90528246 -91219841 - RLTR11A LTR ERVK -401 127 47 1 1275 393 286 146 28 chr2 90544274 90544418 -91203669 - MTEa LTR MaLR -43 336 176 1 1275 552 270 101 70 chr2 90544535 90544734 -91203353 - MTEa LTR MaLR -174 205 1 1 1275 1178 227 68 53 chr2 90547694 90548076 -91200011 - MTE2a LTR MaLR -8 371 18 1 1275 258 265 57 38 chr2 90550446 90550552 -91197535 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 217 324 -43 1 1275 449 330 36 117 chr2 90550706 90550961 -91197126 - RLTR18 LTR ERVK -306 310 65 1 1275 449 330 36 117 chr2 90551136 90551213 -91196874 - RLTR18 LTR ERVK -552 64 5 1 1275 297 299 36 27 chr2 90552787 90552897 -91195190 - MT2B LTR ERVL -323 278 168 1 1275 230 215 19 19 chr2 90567632 90567705 -91180382 - MLT1C LTR MaLR -51 416 359 2 1276 2004 104 31 6 chr2 90572062 90572380 -91175707 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 2 1276 614 285 134 22 chr2 90580047 90580323 -91167764 + MER21B LTR ERV1 1 307 -556 2 1276 984 242 177 34 chr2 90583254 90583672 -91164415 - ERVL-B4-int LTR ERVL -3964 1750 1273 2 1276 226 235 0 56 chr2 90584183 90584255 -91163832 - RLTR25B LTR ERVK -526 502 435 2 1276 494 215 142 30 chr2 90584509 90584643 -91163444 - ERVL-B4-int LTR ERVL -4808 949 801 2 1276 1251 158 94 117 chr2 90589723 90590074 -91158013 - ORR1B1 LTR MaLR -11 383 41 3 1276 876 204 160 0 chr2 90592422 90592653 -91155434 - MYSERV6-int LTR ERVK -5440 3519 3252 3 1276 449 256 83 71 chr2 90593542 90593782 -91154305 + RLTR42-int LTR ERVK 1156 1398 -4124 3 1276 553 239 53 23 chr2 90597999 90598132 -91149955 - MTEa LTR MaLR -242 137 1 3 1276 2671 44 38 0 chr2 90616714 90617080 -91131007 + MTA_Mm LTR MaLR 17 396 0 3 1276 359 224 200 1 chr2 90626471 90626602 -91121485 - ORR1D1 LTR MaLR -222 156 1 4 1276 284 148 18 36 chr2 90626661 90626717 -91121370 - MTC LTR MaLR -1 420 366 4 1276 528 137 160 38 chr2 90626744 90626838 -91121249 + MTC LTR MaLR 237 347 -74 4 1276 528 137 160 38 chr2 90626985 90626996 -91121091 + MTC LTR MaLR 348 355 -66 4 1276 610 136 67 8 chr2 90627229 90627348 -91120739 - MTC LTR MaLR -291 130 5 4 1276 525 225 108 68 chr2 90627381 90627699 -91120388 - RMER17C LTR ERVK -30 380 1 4 1276 234 266 64 64 chr2 90628580 90628603 -91119484 + MT2B LTR ERVL 154 261 -340 4 1276 2845 129 9 16 chr2 90633126 90633550 -91114537 - MTC LTR MaLR 0 421 1 4 1276 2275 70 16 73 chr2 90643472 90643841 -91104246 - RLTR1B LTR ERV1 0 512 165 4 1276 2459 71 3 82 chr2 90656914 90657196 -91090891 + ORR1A2 LTR MaLR 1 272 -55 5 1276 2459 71 3 82 chr2 90657391 90657463 -91090624 + ORR1A2 LTR MaLR 273 327 0 5 1276 478 200 11 0 chr2 90658130 90658225 -91089862 - MTC LTR MaLR -325 96 1 5 1276 1747 139 26 61 chr2 90661092 90661436 -91086651 - ORR1B2 LTR MaLR -15 352 21 5 1276 1264 198 87 17 chr2 90663030 90663328 -91084759 - ORR1D1 LTR MaLR -55 319 1 5 1276 3345 166 28 51 chr2 90664649 90665292 -91082795 + RLTR5_Mm LTR ERV1 1 628 0 5 1276 3438 162 186 74 chr2 90665579 90666390 -91081697 + RMER19B LTR ERVK 1 902 0 5 1276 1073 187 5 18 chr2 90668561 90668784 -91079303 - MYSERV-int LTR ERVK 0 6550 6331 5 1276 6800 254 112 108 chr2 90668817 90670446 -91077641 - MYSERV-int LTR ERVK -201 6349 4762 5 1276 6800 258 116 112 chr2 90670591 90671284 -91076803 - MYSERV-int LTR ERVK -1789 4761 4045 5 1276 6800 258 116 112 chr2 90671478 90672223 -91075864 - MYSERV-int LTR ERVK -2506 4044 3295 5 1276 6800 258 116 112 chr2 90672370 90672825 -91075262 - MYSERV-int LTR ERVK -3256 3294 2812 5 1276 772 247 43 28 chr2 90674608 90674862 -91073225 + RLTR11B LTR ERVK 5 262 -191 5 1276 1795 162 19 63 chr2 90675434 90675863 -91072224 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 5 1276 728 134 6 118 chr2 90677299 90677468 -91070619 + ORR1C2 LTR MaLR 1 150 -234 5 1276 1392 203 47 9 chr2 90680348 90680666 -91067421 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 45 6 1276 802 221 99 187 chr2 90681057 90681276 -91066811 - ORR1D2 LTR MaLR -1 378 136 6 1276 3463 76 41 2 chr2 90681276 90681740 -91066347 - RLTR45 LTR ERVK 0 482 1 6 1276 802 215 102 199 chr2 90681933 90682102 -91065985 - ORR1D2 LTR MaLR -235 135 18 6 1276 940 147 147 0 chr2 90683345 90683542 -91064545 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 159 6 1276 359 41 20 0 chr2 90683538 90683587 -91064500 - ORR1C2 LTR MaLR -334 50 1 6 1276 299 169 21 117 chr2 90683911 90684005 -91064082 - MT2B LTR ERVL -362 239 155 6 1277 899 106 7 0 chr2 90712776 90712917 -91035170 + ORR1C2 LTR MaLR 1 142 -242 6 1277 276 253 33 33 chr2 90713272 90713283 -91034804 + ORR1C2 LTR MaLR 100 108 -266 6 1277 322 237 28 3 chr2 90713324 90713402 -91034685 + ORR1C2 LTR MaLR 109 195 -189 6 1277 884 187 36 73 chr2 90713540 90713759 -91034328 + ORR1C2 LTR MaLR 172 382 -2 6 1277 2211 127 149 159 chr2 90716363 90716954 -91031133 - RMER4B LTR ERVK 0 585 1 7 1277 2567 130 47 10 chr2 90721844 90722249 -91025838 - MTC LTR MaLR -1 420 1 7 1277 2041 191 38 10 chr2 90723509 90723927 -91024160 - RMER19C LTR ERVK -44 567 138 7 1277 440 305 168 101 chr2 90723986 90724117 -91023970 - LTR16C LTR ERVL -41 448 316 7 1277 440 305 168 101 chr2 90724292 90724576 -91023511 - LTR16C LTR ERVL -174 315 5 7 1277 404 163 0 148 chr2 90740279 90740387 -91007700 - MT2B LTR ERVL -337 264 173 7 1277 2744 119 25 55 chr2 90740783 90741002 -91007085 + RMER6B LTR ERVK 1 202 -259 7 1277 2744 119 25 55 chr2 90741144 90741397 -91006690 + RMER6B LTR ERVK 203 459 -2 7 1277 254 29 0 0 chr2 90756902 90756937 -90991150 - ORR1A4 LTR MaLR -294 35 1 8 1277 357 269 71 78 chr2 90759471 90759612 -90988475 + MT2B LTR ERVL 128 267 -334 8 1277 2383 161 56 18 chr2 90760943 90761392 -90986695 - RMER4A LTR ERVK 0 466 1 8 1277 994 222 96 86 chr2 90763570 90764033 -90984054 + RLTR20C LTR ERVK 1 551 0 8 1277 917 283 43 59 chr2 90765236 90765657 -90982430 - BGLII_B LTR ERVK -27 414 1 8 1277 589 298 16 53 chr2 90766532 90766720 -90981367 + MER21B LTR ERV1 328 508 -355 8 1277 480 304 57 35 chr2 90769629 90770167 -90977920 + RLTR4_MM-int LTR ERV1 1156 1643 -5958 8 1277 298 333 68 50 chr2 90770351 90770632 -90977455 + RLTR4_MM-int LTR ERV1 2129 2414 -5364 8 1277 1039 323 46 45 chr2 90771590 90772465 -90975622 + RLTR6-int LTR ERV1 3619 4455 -3151 8 1277 452 179 59 12 chr2 90772828 90772939 -90975148 - RLTR13D5 LTR ERVK -7 1026 914 8 1277 7365 63 3 27 chr2 90772939 90773031 -90975056 - RLTR13D5 LTR ERVK -70 953 878 8 1277 7365 63 3 27 chr2 90773198 90774080 -90974007 - RLTR13D5 LTR ERVK -146 877 2 8 1277 1105 276 58 6 chr2 90774104 90774468 -90973619 + RLTR6-int LTR ERV1 4937 5319 -2459 8 1277 341 344 76 10 chr2 90775088 90775285 -90972802 + RLTR19-int LTR ERVK 4353 4562 -1575 8 1277 2613 88 0 0 chr2 90776169 90776512 -90971575 - ORR1A1 LTR MaLR -3 343 1 8 1277 297 334 26 14 chr2 90777189 90777360 -90970727 + RLTR6-int LTR ERV1 7165 7469 -309 8 1277 4329 129 51 1 chr2 90777617 90778263 -90969824 + RLTR33 LTR ERVK 1 678 0 8 1277 1083 186 51 5 chr2 90787579 90787782 -90960305 - MTC LTR MaLR 0 421 209 9 1277 1083 186 51 5 chr2 90787803 90787815 -90960272 - MTC LTR MaLR -213 208 197 9 1278 246 279 12 25 chr2 90861965 90862046 -90886041 + MT2B LTR ERVL 160 239 -362 1 1278 1965 155 88 3 chr2 90864029 90864392 -90883695 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 1 1278 1048 239 78 17 chr2 90865479 90865773 -90882314 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 63 1 1278 1679 179 103 3 chr2 90866646 90866994 -90881093 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 12 1 1278 2317 77 73 22 chr2 90866989 90867359 -90880728 - MTB_Mm LTR MaLR -18 389 1 1 1278 1986 156 149 5 chr2 90867373 90867797 -90880290 - MTB_Mm-int LTR MaLR 0 1509 1025 1 1278 2013 207 79 84 chr2 90868479 90869135 -90878952 - MTB_Mm-int LTR MaLR -474 1035 393 1 1278 2013 245 63 95 chr2 90869306 90869828 -90878259 - MTB_Mm-int LTR MaLR -1485 478 1 1 1278 385 21 0 0 chr2 90869828 90869875 -90878212 - MTB_Mm LTR MaLR -8 386 340 1 1278 1979 131 29 23 chr2 90871364 90871715 -90876372 - MTB_Mm LTR MaLR -41 353 1 1 1278 268 127 73 0 chr2 90871726 90871781 -90876306 - ORR1B1 LTR MaLR -360 59 1 1 1278 332 251 225 16 chr2 90872591 90872773 -90875314 + RMER15 LTR ERVL 306 525 -50 1 1278 283 198 55 55 chr2 90874009 90874100 -90873987 - MLT1B LTR MaLR -280 110 20 1 1278 324 296 55 36 chr2 90887477 90887642 -90860445 - RLTR15 LTR ERVK -6 353 186 1 1278 233 212 14 83 chr2 90890414 90890486 -90857601 + MT2B LTR ERVL 185 251 -350 1 1278 2021 133 53 123 chr2 90891780 90891863 -90856224 - MYSERV6-int LTR ERVK -17 8942 8893 1 1278 2021 133 53 123 chr2 90892003 90892406 -90855681 - MYSERV6-int LTR ERVK -67 8892 8490 1 1278 2448 211 20 65 chr2 90892484 90893029 -90855058 - MYSERV-int LTR ERVK -490 6060 5516 1 1278 2448 211 20 65 chr2 90893336 90893447 -90854640 - MYSERV-int LTR ERVK -1035 5515 5434 1 1278 462 202 29 95 chr2 90944265 90944285 -90803802 - MT2B LTR ERVL -332 267 142 1 1278 2932 18 9 0 chr2 90945782 90946125 -90801962 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 1 1279 2208 152 63 8 chr2 90966578 90966977 -90781110 - MTC LTR MaLR 0 421 1 1 1279 388 233 75 62 chr2 90967576 90967736 -90780351 - MT2B LTR ERVL -323 278 117 1 1279 234 242 136 0 chr2 90987857 90987923 -90760164 + MT2B LTR ERVL 167 241 -360 1 1279 1193 203 141 32 chr2 90993155 90993531 -90754556 + MTD LTR MaLR 3 419 0 1 1279 347 205 60 96 chr2 91015111 91015278 -90732809 + MER67C LTR ERV1 1 161 -550 3 1279 389 249 61 10 chr2 91025774 91026018 -90722069 + MTE2b LTR MaLR 2 369 -10 5 1279 325 222 18 132 chr2 91041901 91042015 -90706072 - MT2B LTR ERVL -344 257 157 1 1279 297 159 108 153 chr2 91047226 91047290 -90700797 - MT2B LTR ERVL -379 222 168 1 1279 297 159 108 153 chr2 91047475 91047521 -90700566 - MT2B LTR ERVL -434 167 117 1 1279 232 305 58 122 chr2 91056512 91056684 -90691403 + MT2B LTR ERVL 177 337 -264 1 1279 300 175 0 100 chr2 91065442 91065453 -90682634 + MT2B LTR ERVL 155 217 -384 1 1279 232 227 35 118 chr2 91073273 91073358 -90674729 + ORR1E LTR MaLR 6 83 -291 2 1279 401 267 153 93 chr2 91073430 91073678 -90674409 + ORR1E LTR MaLR 97 359 0 2 1279 228 282 0 124 chr2 91074497 91074594 -90673493 + MT2B LTR ERVL 156 240 -361 2 1279 247 323 42 31 chr2 91075836 91075932 -90672155 + MT2B LTR ERVL 155 251 -350 2 1279 261 296 8 25 chr2 91079883 91079967 -90668120 - MER34A LTR ERV1 -486 101 14 2 1279 255 255 0 0 chr2 91079967 91080018 -90668069 + MER90a LTR ERV1 372 422 -192 2 1279 2132 149 23 17 chr2 91080019 91080373 -90667714 + ORR1B1 LTR MaLR 1 356 -38 2 1279 318 127 17 83 chr2 91080741 91080761 -90667326 + ORR1B1 LTR MaLR 312 331 -36 2 1279 4988 39 3 2 chr2 91080761 91081347 -90666740 - LTRIS_Mus LTR ERV1 0 587 1 2 1279 318 127 17 83 chr2 91081347 91081386 -90666701 + ORR1B1 LTR MaLR 332 367 0 2 1279 1920 156 272 32 chr2 91087487 91087878 -90660209 - RMER15 LTR ERVL 0 575 93 2 1279 1920 156 272 32 chr2 91088008 91088080 -90660007 - RMER15 LTR ERVL -483 92 1 2 1279 271 281 35 58 chr2 91088081 91088168 -90659919 - MTC LTR MaLR -38 381 297 2 1279 461 215 97 0 chr2 91088412 91088505 -90659582 - MTC LTR MaLR -319 102 1 2 1279 460 260 69 23 chr2 91088965 91089095 -90658992 + MTE2a LTR MaLR 238 373 -6 2 1279 3274 53 2 8 chr2 91089626 91090024 -90658063 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 1279 328 190 22 77 chr2 91090742 91090833 -90657254 + MLT1C LTR MaLR 34 119 -348 3 1280 228 115 66 148 chr2 91102515 91102576 -90645511 + MamGypLTR2c LTR Gypsy 883 938 -130 3 1280 356 220 74 130 chr2 91137994 91138156 -90609931 - MT2B LTR ERVL -323 278 126 4 1280 1107 246 152 3 chr2 91151321 91151611 -90596476 + ORR1E LTR MaLR 1 333 -26 4 1280 2008 139 87 3 chr2 91155019 91155366 -90592721 + ORR1C1 LTR MaLR 3 378 0 4 1280 2009 134 3 65 chr2 91156803 91157154 -90590933 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 4 1280 348 279 57 72 chr2 91177584 91177652 -90570435 + MT2B LTR ERVL 166 352 -249 5 1280 4500 155 65 65 chr2 91182157 91183059 -90565028 - RMER19B LTR ERVK 0 902 1 5 1280 1463 224 48 14 chr2 91186682 91187040 -90561047 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 5 1280 398 297 47 0 chr2 91188549 91188697 -90559390 + MLT1F1 LTR MaLR 415 569 0 5 1280 2507 164 127 93 chr2 91206806 91207397 -90540690 + RMER19C LTR ERVK 1 611 0 6 1280 244 350 120 33 chr2 91207839 91208114 -90539973 - MLT1A LTR MaLR -75 299 1 6 1281 2374 138 2 30 chr2 91228387 91228791 -90519296 + RLTR20A LTR ERVK 1 393 -148 6 1281 1265 169 51 0 chr2 91228958 91229194 -90518893 + RLTR11A LTR ERVK 281 528 0 6 1281 2325 161 255 8 chr2 91235943 91236433 -90511654 + RMER19C LTR ERVK 1 611 0 7 1281 410 252 49 0 chr2 91239170 91239293 -90508794 + MLT1A1 LTR MaLR 1 129 -279 7 1281 451 351 44 10 chr2 91242694 91242898 -90505189 + MLT1K LTR MaLR 148 358 -237 7 1281 2387 102 79 8 chr2 91243278 91243633 -90504454 + RLTR14 LTR ERV1 3 382 0 7 1281 1780 141 58 63 chr2 91246635 91246866 -90501221 - MTC LTR MaLR 0 421 197 7 1281 1780 141 58 63 chr2 91247056 91247203 -90500884 - MTC LTR MaLR -225 196 45 7 1281 226 33 0 0 chr2 91247350 91247380 -90500707 - MTC LTR MaLR -389 30 1 7 1281 1824 187 13 132 chr2 91260199 91260661 -90487426 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 7 1281 298 0 0 0 chr2 91260661 91260696 -90487391 - MERVL_2A-int LTR ERVL -8 5753 5719 7 1281 3091 146 16 105 chr2 91260696 91260720 -90487367 - ORR1B1-int LTR MaLR -1323 640 625 7 1281 3091 146 16 105 chr2 91260912 91261590 -90486497 - ORR1B1-int LTR MaLR -1339 624 1 7 1281 1969 138 67 11 chr2 91261591 91261951 -90486136 - ORR1B1 LTR MaLR -14 380 1 7 1281 236 280 180 0 chr2 91274059 91274159 -90473928 + MLT1J LTR MaLR 99 216 -296 7 1281 251 188 74 0 chr2 91280340 91280409 -90467678 - LTR16B2 LTR ERVL -4 476 397 8 1281 506 133 12 12 chr2 91282455 91282539 -90465548 + MTC LTR MaLR 3 86 -335 8 1281 257 312 41 41 chr2 91289784 91289881 -90458206 - MT2B2 LTR ERVL -345 239 143 8 1281 360 253 0 105 chr2 91291575 91291698 -90456389 + RMER17A LTR ERVK 300 414 -337 8 1281 360 253 0 105 chr2 91291724 91291756 -90456331 + RMER17A LTR ERVK 415 434 -317 8 1281 641 293 98 73 chr2 91293484 91293852 -90454235 - MTD LTR MaLR -30 389 13 8 1281 327 264 117 65 chr2 91311602 91311756 -90436331 + MT2B LTR ERVL 95 256 -345 8 1281 1283 229 66 6 chr2 91339106 91339426 -90408661 - MTE2b LTR MaLR -38 341 3 9 1281 226 128 0 0 chr2 91343062 91343101 -90404986 + RLTR11A2 LTR ERVK 489 527 0 9 1281 1653 175 89 67 chr2 91346690 91346884 -90401203 - MTC LTR MaLR -8 413 200 9 1281 1653 175 89 67 chr2 91347028 91347161 -90400926 - MTC LTR MaLR -222 199 85 9 1281 1653 175 89 67 chr2 91347610 91347685 -90400402 - MTC LTR MaLR -337 84 1 9 1281 357 331 8 24 chr2 91347819 91347943 -90400144 - MLT1F2 LTR MaLR -78 482 361 9 1281 645 280 109 78 chr2 91348228 91348549 -90399538 - MLT1F2 LTR MaLR -229 331 1 9 1282 2150 95 62 3 chr2 91359704 91360041 -90388046 - RLTR9A LTR ERVK 0 368 12 1 1282 10093 184 63 45 chr2 91360651 91362114 -90385973 - RMER16-int LTR ERVK -1583 3823 2817 1 1282 10093 158 63 32 chr2 91362298 91363222 -90384865 - RMER16-int LTR ERVK -2590 2816 1830 1 1282 10093 158 63 32 chr2 91363249 91363294 -90384793 - RMER16-int LTR ERVK -3577 1829 1781 1 1282 1988 196 26 80 chr2 91364055 91364515 -90383572 - ETnERV2-int LTR ERVK -4562 2844 2410 1 1282 498 224 66 0 chr2 91364509 91364646 -90383441 - ETnERV2-int LTR ERVK -1733 1581 1473 1 1282 1448 108 0 9 chr2 91365001 91365226 -90382861 + MT2B LTR ERVL 1 223 -378 1 1282 320 258 22 22 chr2 91365688 91365779 -90382308 - MT2B LTR ERVL -323 278 188 1 1282 2206 101 3 0 chr2 91369494 91369812 -90378275 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 1 1282 2873 184 149 8 chr2 91369816 91370208 -90377879 + ORR1A2-int LTR MaLR 1 407 -1556 1 1282 2873 184 149 8 chr2 91370387 91370814 -90377273 + ORR1A2-int LTR MaLR 408 935 -1028 1 1282 1869 137 15 56 chr2 91389493 91389834 -90358253 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 3 1 1282 432 119 15 0 chr2 91394140 91394207 -90353880 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 307 1 1282 309 237 124 25 chr2 91394380 91394433 -90353654 - ORR1D1 LTR MaLR -72 298 239 1 1282 437 245 288 25 chr2 91394550 91394742 -90353345 - ORR1D1 LTR MaLR -55 319 61 1 1282 480 227 241 31 chr2 91409328 91409590 -90338497 - MT2A LTR ERVL -2 599 302 1 1282 430 241 199 77 chr2 91409784 91409808 -90338279 - MT2A LTR ERVL -300 301 278 1 1282 295 211 26 66 chr2 91410050 91410126 -90337961 - MT2A LTR ERVL -445 88 16 1 1282 1978 142 99 16 chr2 91411464 91411828 -90336259 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 1 1282 478 153 129 0 chr2 91422534 91422619 -90325468 - RMER6D LTR ERVK -624 96 1 1 1282 855 303 71 17 chr2 91423396 91423691 -90324396 + MTE2b LTR MaLR 18 328 -51 1 1282 354 262 8 54 chr2 91429168 91429217 -90318870 + MT2B LTR ERVL 118 160 -441 1 1282 245 174 135 68 chr2 91433305 91433379 -90314708 + MT2B LTR ERVL 186 264 -337 1 1282 267 294 47 47 chr2 91443265 91443372 -90304715 + MT2B LTR ERVL 151 257 -344 1 1282 342 243 59 111 chr2 91444688 91444841 -90303246 + MT2B LTR ERVL 120 264 -337 1 1282 350 235 0 133 chr2 91453690 91453788 -90294299 - MT2B LTR ERVL -364 237 153 1 1282 1373 204 88 62 chr2 91464219 91464653 -90283434 + MT2A LTR ERVL 1 584 -17 1 1282 283 301 226 19 chr2 91472250 91472409 -90275678 + MLT1H LTR MaLR 35 226 -323 1 1282 327 330 10 10 chr2 91479037 91479141 -90268946 + RMER10B LTR ERVL 269 372 -26 1 1282 1182 236 29 123 chr2 91480460 91480876 -90267211 - MTE2a LTR MaLR 0 379 3 1 1282 1687 92 52 11 chr2 91482935 91483221 -90264866 - ORR1A2 LTR MaLR -41 285 2 1 1283 257 311 26 70 chr2 91488335 91488449 -90259638 - RLTR25A LTR ERVK -473 630 522 1 1283 1285 123 58 24 chr2 91503024 91503232 -90244855 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 170 1 1283 579 151 56 9 chr2 91503438 91503545 -90244542 - ORR1C2 LTR MaLR -270 114 3 1 1283 333 226 16 145 chr2 91505885 91505904 -90242183 + MT2B LTR ERVL 150 257 -344 1 1283 302 210 16 0 chr2 91527230 91527292 -90220795 + MTEa LTR MaLR 317 379 0 5 1283 670 194 69 25 chr2 91531232 91531446 -90216641 - RLTR11A2 LTR ERVK 0 527 315 6 1283 1416 98 175 161 chr2 91531750 91532030 -90216057 + RLTR15 LTR ERVK 1 298 -61 6 1283 1416 98 175 161 chr2 91532163 91532236 -90215851 + RLTR15 LTR ERVK 299 359 0 6 1283 225 257 133 13 chr2 91538023 91538070 -90210017 - MT2B2 LTR ERVL -325 259 204 8 1283 329 278 73 18 chr2 91545337 91545447 -90202640 - MTD LTR MaLR -31 388 273 1 1283 3384 38 2 0 chr2 91565455 91565850 -90182237 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 1283 274 265 0 88 chr2 91566509 91566529 -90181558 - MT2B LTR ERVL -374 227 145 1 1283 656 181 182 50 chr2 91566897 91567095 -90180992 - MTD LTR MaLR 0 419 196 1 1283 283 157 39 0 chr2 91567337 91567388 -90180699 - RMER15-int LTR ERVL -4062 937 885 2 1283 3116 58 7 15 chr2 91576387 91576790 -90171297 + MTB LTR MaLR 1 400 0 2 1283 304 165 39 69 chr2 91584931 91585061 -90163026 - RLTR15 LTR ERVK -206 153 28 2 1283 404 223 8 89 chr2 91592052 91592175 -90155912 - MT2B LTR ERVL -337 264 152 3 1283 235 270 26 123 chr2 91593356 91593439 -90154648 - MT2B LTR ERVL -345 256 185 3 1283 4121 97 34 0 chr2 91595106 91595671 -90152416 + MT2B2 LTR ERVL 1 584 0 3 1283 2256 128 131 16 chr2 91601490 91601942 -90146145 - RLTR28 LTR ERVL -20 504 1 3 1283 1429 192 101 26 chr2 91605436 91605621 -90142466 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 177 3 1283 1429 192 101 26 chr2 91605662 91605824 -90142263 - ORR1D1 LTR MaLR -198 176 1 3 1284 367 250 42 92 chr2 91621534 91621653 -90126434 - MT2B LTR ERVL -336 265 153 4 1284 274 327 0 98 chr2 91646825 91646849 -90101238 + MT2B LTR ERVL 150 257 -342 4 1284 2373 28 0 0 chr2 91657573 91657857 -90090230 - MT2_Mm LTR ERVL -209 284 1 5 1284 275 229 30 96 chr2 91657857 91657900 -90090187 - ORR1A3-int LTR MaLR -1350 613 580 5 1284 362 125 26 53 chr2 91657895 91657971 -90090116 - ORR1A3-int LTR MaLR -1323 640 567 5 1284 553 76 0 0 chr2 91657971 91658050 -90090037 - MERVL-int LTR ERVL -114 5371 5293 5 1284 1269 171 199 67 chr2 91675298 91675625 -90072462 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 5 1284 1701 218 79 0 chr2 91675789 91676170 -90071917 + MTD LTR MaLR 1 411 -8 5 1284 2977 50 99 0 chr2 91679343 91679707 -90068380 + MTB LTR MaLR 1 400 0 5 1284 291 260 59 59 chr2 91682636 91682738 -90065349 + MLT1D LTR MaLR 12 113 -392 5 1284 1373 278 32 16 chr2 91682778 91683148 -90064939 - MTE2b LTR MaLR 0 379 4 5 1284 388 205 197 0 chr2 91683321 91683443 -90064644 + MLT1D LTR MaLR 322 467 -38 5 1284 1022 245 126 95 chr2 91689192 91689299 -90058788 - MTD LTR MaLR -8 411 290 5 1284 1022 245 126 95 chr2 91689469 91689637 -90058450 - MTD LTR MaLR -130 289 117 5 1284 1022 245 126 95 chr2 91689826 91689937 -90058150 - MTD LTR MaLR -303 116 12 5 1284 395 312 157 29 chr2 91691863 91692137 -90055950 - MER74A LTR ERVL -16 542 234 5 1284 316 239 44 33 chr2 91692190 91692281 -90055806 - MER74A LTR ERVL -475 147 56 5 1284 2038 140 63 96 chr2 91698737 91699132 -90048955 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 3 6 1284 1012 283 103 26 chr2 91701504 91701852 -90046235 - MTE2b LTR MaLR -4 375 1 6 1284 240 267 31 113 chr2 91703759 91703856 -90044231 - MT2B LTR ERVL -341 260 172 6 1284 423 259 55 60 chr2 91706760 91706961 -90041126 - RLTR14 LTR ERV1 -16 366 167 6 1284 245 214 125 28 chr2 91708785 91708857 -90039230 - RMER10A LTR ERVL -46 396 318 6 1284 283 256 35 58 chr2 91741820 91741907 -90006180 + MT2B LTR ERVL 155 239 -362 7 1284 622 279 86 34 chr2 91747114 91747381 -90000706 - MLT1A LTR MaLR 0 374 94 7 1285 250 331 78 42 chr2 91755475 91755617 -89992470 + RLTR25A LTR ERVK 427 573 -530 7 1285 2697 56 9 0 chr2 91832393 91832717 -89915370 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 9 1285 295 259 33 112 chr2 91840517 91840669 -89907418 - MT2B LTR ERVL -337 264 125 9 1285 337 182 15 29 chr2 91879969 91880037 -89868050 - MLT1C LTR MaLR -3 464 398 1 1285 230 283 105 57 chr2 91880166 91880271 -89867816 - MLT1A0 LTR MaLR -226 139 30 1 1286 2176 142 67 22 chr2 91882011 91882414 -89865673 + MTC LTR MaLR 1 421 0 1 1286 337 296 159 24 chr2 91890070 91890278 -89857809 - LTR33A LTR ERVL -278 242 7 1 1286 415 340 138 42 chr2 91890776 91891037 -89857050 - MLT1J LTR MaLR -174 338 53 1 1286 2684 171 40 103 chr2 91893151 91893771 -89854316 + RLTR18 LTR ERVK 1 581 -35 1 1286 641 299 0 0 chr2 91911290 91911437 -89836650 - MLT1F2 LTR MaLR -400 160 14 1 1286 367 304 87 25 chr2 91916599 91916795 -89831292 + MTEa LTR MaLR 172 379 0 1 1286 2313 179 20 10 chr2 91925619 91926014 -89822073 - MTD LTR MaLR 0 419 21 1 1286 2062 98 5 109 chr2 91929104 91929471 -89818616 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 1 1286 272 303 26 68 chr2 91933074 91933191 -89814896 + MT2B LTR ERVL 152 263 -338 1 1286 621 162 0 71 chr2 91933368 91933494 -89814593 - ORR1D1 LTR MaLR 0 370 254 1 1286 611 187 25 10 chr2 91933569 91933695 -89814392 + RMER19B LTR ERVK 2 200 -702 1 1286 686 254 50 10 chr2 91933941 91934140 -89813947 - ORR1D1 LTR MaLR -163 211 5 1 1286 679 236 103 0 chr2 91936188 91936353 -89811734 + MTEa LTR MaLR 13 194 -185 1 1286 2327 161 80 3 chr2 91940119 91940506 -89807581 - MTC LTR MaLR -2 419 3 1 1286 1129 213 176 163 chr2 91941751 91942207 -89805880 + MT2A LTR ERVL 5 539 -45 1 1286 812 262 99 89 chr2 91942275 91942304 -89805783 + MT2A LTR ERVL 540 583 -1 1 1286 2050 156 142 92 chr2 91946552 91947158 -89800929 + RMER12 LTR ERVK 554 1189 -133 1 1286 1334 144 65 8 chr2 91952685 91952930 -89795157 + ORR1B1 LTR MaLR 1 259 -135 1 1286 4364 153 87 11 chr2 91952943 91953770 -89794317 - RMER19B LTR ERVK -12 890 1 1 1286 390 164 0 0 chr2 91953780 91953847 -89794240 + ORR1B1 LTR MaLR 260 326 -68 1 1286 268 303 56 0 chr2 91954676 91954765 -89793322 - MLT1H2 LTR MaLR -279 316 223 1 1286 320 359 76 13 chr2 91955072 91955230 -89792857 - MLT1H2 LTR MaLR -319 170 3 1 1286 1637 209 58 16 chr2 91957265 91957418 -89790669 - MTD LTR MaLR -15 404 238 1 1286 2193 145 132 22 chr2 91957418 91957820 -89790267 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 1 1 1286 1637 209 58 16 chr2 91957820 91958046 -89790041 - MTD LTR MaLR -182 237 9 1 1286 415 328 90 109 chr2 91959314 91959735 -89788352 - LTR16A LTR ERVL -8 443 31 1 1286 1202 164 7 172 chr2 91959753 91960055 -89788032 - RMER19B LTR ERVK -626 276 25 1 1286 1715 193 20 31 chr2 91960603 91960961 -89787126 + ORR1E LTR MaLR 1 354 -5 1 1286 828 307 31 105 chr2 91961369 91961615 -89786472 + MT2A LTR ERVL 1 231 -302 1 1286 828 307 31 105 chr2 91961682 91961941 -89786146 + MT2A LTR ERVL 232 467 -66 1 1286 828 307 31 105 chr2 91962165 91962230 -89785857 + MT2A LTR ERVL 468 530 -3 1 1286 1865 189 46 5 chr2 91962584 91962973 -89785114 + MTD LTR MaLR 14 418 -1 1 1286 447 318 66 66 chr2 91963433 91963843 -89784244 + MLT1F2 LTR MaLR 1 400 -148 1 1286 724 335 44 40 chr2 91963889 91964384 -89783703 - HERV16-int LTR ERVL -4440 556 60 1 1286 654 319 59 53 chr2 91965445 91965783 -89782304 + ORR1E LTR MaLR 3 342 -17 1 1286 621 322 112 38 chr2 91966462 91966801 -89781286 - MLT1A0 LTR MaLR -1 364 1 1 1286 1123 256 35 57 chr2 91966936 91967304 -89780783 - MTE2a LTR MaLR -14 365 6 1 1286 2640 121 42 7 chr2 91968628 91969035 -89779052 + MTC LTR MaLR 1 421 0 1 1286 2396 218 131 14 chr2 91970154 91970810 -89777277 - RMER19A LTR ERVK 0 737 5 1 1286 1968 153 77 74 chr2 91977967 91978248 -89769839 - MTC LTR MaLR -3 418 117 1 1286 1968 153 77 74 chr2 91978444 91978467 -89769620 - MTC LTR MaLR -305 116 109 1 1286 1968 153 77 74 chr2 91978657 91978768 -89769319 - MTC LTR MaLR -313 108 1 1 1286 396 73 0 0 chr2 91988245 91988300 -89759787 - ORR1A2 LTR MaLR 0 326 272 1 1286 1481 154 40 0 chr2 91988507 91988780 -89759307 - ORR1A2 LTR MaLR -43 284 1 1 1286 2253 228 70 69 chr2 91990410 91990965 -89757122 + MTC-int LTR MaLR 521 1007 -251 1 1286 2253 223 69 70 chr2 91991186 91991399 -89756688 + MTC-int LTR MaLR 1008 1258 0 1 1286 505 216 30 7 chr2 91991772 91991907 -89756180 + MTD LTR MaLR 2 139 -280 1 1286 465 309 139 22 chr2 91992215 91992582 -89755505 - MTD LTR MaLR -9 410 1 1 1286 2091 188 24 14 chr2 92001340 92001760 -89746327 + RMER15 LTR ERVL 6 429 -146 8 1286 589 296 141 55 chr2 92002028 92002410 -89745677 - RLTR26 LTR ERVK -225 417 3 1 1286 611 186 114 0 chr2 92002410 92002545 -89745542 + RMER15 LTR ERVL 425 575 0 8 1287 1309 213 75 39 chr2 92013137 92013294 -89734793 - MTD LTR MaLR -2 417 246 4 1287 1309 234 77 42 chr2 92013499 92013747 -89734340 - MTD LTR MaLR -168 253 1 4 1287 281 267 97 65 chr2 92044216 92044249 -89703838 - MT2B LTR ERVL -444 157 121 1 1287 1853 107 99 122 chr2 92072290 92072462 -89675625 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 195 1 1287 1853 107 99 122 chr2 92072521 92072741 -89675346 - ORR1C2 LTR MaLR -190 194 1 1 1287 817 314 135 10 chr2 92074949 92075364 -89672723 - MLT1J LTR MaLR -2 510 44 1 1287 4049 166 78 61 chr2 92076103 92076974 -89671113 - RMER19B LTR ERVK -16 886 1 1 1287 235 288 112 114 chr2 92079262 92079450 -89668637 - ORR1D2 LTR MaLR -111 248 19 1 1287 519 316 112 17 chr2 92084165 92084406 -89663681 - MLT1L LTR MaLR -124 486 223 2 1287 2907 141 77 27 chr2 92087860 92088408 -89659679 - RMER15 LTR ERVL 0 575 1 2 1287 241 289 65 13 chr2 92093094 92093171 -89654916 - RMER17A LTR ERVK -243 508 428 2 1287 243 275 84 102 chr2 92094717 92094883 -89653204 - MLT1K LTR MaLR -304 291 129 2 1287 368 255 223 39 chr2 92103933 92104157 -89643930 - MLT1A1 LTR MaLR -59 306 13 2 1287 248 220 85 0 chr2 92109437 92109496 -89638591 - MLT1K LTR MaLR -16 579 516 2 1287 294 248 0 103 chr2 92110103 92110220 -89637867 + MT2B2 LTR ERVL 175 279 -305 2 1287 2374 187 9 9 chr2 92121484 92121811 -89626276 - MTC LTR MaLR 0 421 96 2 1287 2374 187 9 9 chr2 92122011 92122104 -89625983 - MTC LTR MaLR -326 95 1 2 1287 423 174 69 60 chr2 92123174 92123290 -89624797 - MLT1A1 LTR MaLR -284 124 8 2 1287 1928 149 186 0 chr2 92134326 92134681 -89613406 + MTC LTR MaLR 1 421 0 3 1288 1252 226 28 82 chr2 92151259 92151649 -89596438 + ORR1D1 LTR MaLR 6 374 0 3 1288 243 220 20 0 chr2 92162305 92162355 -89585732 - MT2B LTR ERVL -361 240 190 3 1288 1102 228 70 51 chr2 92163304 92163618 -89584469 - ORR1D1 LTR MaLR -1 373 54 3 1288 386 239 0 148 chr2 92170340 92170404 -89577683 + LTR87 LTR ERVL? 2 55 -569 3 1288 386 239 0 148 chr2 92170572 92170614 -89577473 + LTR87 LTR ERVL? 56 92 -532 3 1288 2574 80 3 3 chr2 92180451 92180778 -89567309 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 3 1288 792 294 132 4 chr2 92182545 92182811 -89565276 - MLT1F1 LTR MaLR -106 463 164 3 1288 415 215 22 117 chr2 92199928 92200065 -89548022 - MT2B LTR ERVL -323 278 155 4 1288 872 297 45 48 chr2 92213598 92213976 -89534111 - MTEa LTR MaLR -2 377 1 4 1288 663 290 200 40 chr2 92249186 92249635 -89498452 + MT2A LTR ERVL 1 521 -12 4 1288 391 272 83 88 chr2 92257336 92257675 -89490412 - RMER10A LTR ERVL -19 423 87 4 1288 868 360 54 21 chr2 92260201 92260629 -89487458 + MLT1K LTR MaLR 90 531 -64 4 1289 2111 175 22 14 chr2 92276596 92276966 -89471121 - ORR1D1 LTR MaLR -1 373 1 4 1289 1034 225 126 106 chr2 92281073 92281669 -89466418 - MYSERV6-int LTR ERVK -2 8957 8350 5 1289 846 205 32 11 chr2 92281725 92281912 -89466175 - RMER4A LTR ERVK -29 437 247 5 1289 402 277 26 18 chr2 92281918 92282032 -89466055 - MYSERV-int LTR ERVK -1440 5110 4996 5 1289 2128 155 12 46 chr2 92284823 92285038 -89463049 - RMER10B LTR ERVL 0 398 198 5 1289 2128 155 12 46 chr2 92285218 92285414 -89462673 - RMER10B LTR ERVL -201 197 1 5 1289 259 313 19 39 chr2 92286664 92286767 -89461320 + MLT1A1 LTR MaLR 306 406 -2 5 1289 2898 100 13 0 chr2 92287218 92287607 -89460480 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 5 1289 490 242 189 0 chr2 92288230 92288352 -89459735 - RMER12B LTR ERVK 0 1404 1261 5 1289 1236 230 68 47 chr2 92288405 92288770 -89459317 - RLTR21 LTR ERVK -484 1088 716 5 1289 3240 185 7 37 chr2 92289112 92289729 -89458358 - RMER12B LTR ERVK -806 598 1 5 1289 409 310 26 65 chr2 92290340 92290571 -89457516 - MER89 LTR ERV1 -18 541 320 5 1289 250 238 45 45 chr2 92290641 92290729 -89457358 - MER89 LTR ERV1 -458 101 14 5 1289 455 268 221 7 chr2 92293164 92293450 -89454637 + MLT1A0 LTR MaLR 6 352 -13 5 1289 1079 288 46 61 chr2 92295146 92295604 -89452483 + RLTR12B LTR ERVK 47 497 -31 5 1289 1994 154 52 10 chr2 92301849 92302235 -89445852 + RMER17C LTR ERVK 1 402 -8 5 1289 233 265 0 56 chr2 92303602 92303674 -89444413 + MLT1J LTR MaLR 58 125 -319 5 1289 243 310 99 73 chr2 92303685 92303918 -89444169 + MLT1J LTR MaLR 224 462 -50 5 1289 2460 110 77 6 chr2 92305154 92305520 -89442567 + ORR1B1 LTR MaLR 3 394 0 5 1289 2032 124 12 30 chr2 92306952 92307284 -89440803 + ORR1A3 LTR MaLR 1 326 0 5 1289 2131 115 86 73 chr2 92307319 92307384 -89440703 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 350 5 1289 2131 115 86 73 chr2 92307535 92307854 -89440233 - ORR1B1 LTR MaLR -45 349 5 5 1289 519 238 122 162 chr2 92310838 92311109 -89436978 - MTE2b LTR MaLR -1 378 119 5 1289 244 122 0 24 chr2 92311104 92311146 -89436941 + MTE2b LTR MaLR 338 378 -1 5 1289 1034 217 116 126 chr2 92311892 92312392 -89435695 - RLTR12B LTR ERVK -23 505 11 5 1289 1386 149 262 7 chr2 92314437 92314624 -89433463 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 140 5 1289 1386 149 262 7 chr2 92314754 92314864 -89433223 - ORR1D1 LTR MaLR -235 139 1 5 1289 859 123 6 105 chr2 92315226 92315407 -89432680 + ORR1A4 LTR MaLR 1 163 -166 5 1289 745 266 177 38 chr2 92315832 92316148 -89431939 - RLTR9A LTR ERVK -8 360 1 5 1289 3916 62 90 10 chr2 92316610 92317132 -89430955 - LTRIS2 LTR ERV1 0 564 1 5 1289 2394 127 51 26 chr2 92323612 92324001 -89424086 + MTB_Mm LTR MaLR 9 407 0 6 1289 568 294 132 68 chr2 92330126 92330442 -89417645 - MLT1C LTR MaLR -24 443 107 6 1289 672 308 109 98 chr2 92334271 92334902 -89413185 + RLTR26 LTR ERVK 1 638 -4 6 1289 1779 199 29 9 chr2 92340372 92340716 -89407371 + ORR1D2 LTR MaLR 14 364 -6 6 1289 227 273 65 83 chr2 92343950 92344058 -89404029 + MT2B2 LTR ERVL 152 257 -327 6 1289 3962 43 19 0 chr2 92353914 92354380 -89393707 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 475 0 6 1289 862 156 65 0 chr2 92355484 92355638 -89392449 - RLTR30 LTR ERV1 -8 371 208 6 1289 3219 26 45 0 chr2 92356322 92356701 -89391386 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 1289 328 250 223 0 chr2 92356898 92357010 -89391077 + ORR1E LTR MaLR 1 137 -222 6 1289 2582 151 87 2 chr2 92357993 92358476 -89389611 - RLTR28 LTR ERVL 0 524 1 6 1289 317 320 42 90 chr2 92359010 92359199 -89388888 - MLT1H2 LTR MaLR -8 541 362 6 1289 453 307 26 19 chr2 92359208 92359364 -89388723 - MLT1H2 LTR MaLR -330 159 3 6 1289 690 259 143 73 chr2 92362097 92362467 -89385620 + RLTR28B LTR ERVL 45 440 -41 7 1289 299 333 57 80 chr2 92364134 92364434 -89383653 + MLT1H LTR MaLR 106 398 -151 7 1289 320 278 137 47 chr2 92365503 92365779 -89382308 - MLT1G3 LTR MaLR -62 486 213 7 1289 424 278 35 0 chr2 92366968 92367083 -89381004 + LTR33 LTR ERVL 40 158 -357 7 1289 245 246 185 0 chr2 92367475 92367540 -89380547 - MTE2b LTR MaLR -5 354 278 7 1289 803 202 117 15 chr2 92367565 92367761 -89380326 - MTE2b LTR MaLR -145 234 19 7 1289 273 246 123 0 chr2 92367809 92367874 -89380213 + MLT1A1 LTR MaLR 192 264 -144 7 1289 261 264 271 31 chr2 92368094 92368223 -89379864 - MLT1A1 LTR MaLR -11 397 238 7 1289 4115 87 188 82 chr2 92400596 92401415 -89346672 + RMER17A2 LTR ERVK 1 906 0 7 1289 1149 165 120 39 chr2 92404632 92404891 -89343196 + RLTR24 LTR ERV1 2 281 -248 7 1289 510 270 137 109 chr2 92404959 92405101 -89342986 - RLTR9A LTR ERVK 0 368 244 7 1289 510 270 137 109 chr2 92405247 92405462 -89342625 - RLTR9A LTR ERVK -125 243 1 7 1290 1547 141 66 39 chr2 92405793 92406125 -89341962 + RLTR24 LTR ERV1 189 529 0 7 1290 477 276 103 41 chr2 92418843 92419085 -89329002 - MER90a LTR ERV1 0 614 358 7 1290 940 239 99 84 chr2 92427378 92427534 -89320553 - ORR1D2 LTR MaLR -20 350 177 7 1290 940 239 99 84 chr2 92427592 92427769 -89320318 - ORR1D2 LTR MaLR -194 176 14 7 1290 418 219 36 62 chr2 92431447 92431559 -89316528 - ORR1E LTR MaLR -52 307 199 7 1290 373 160 13 13 chr2 92431755 92431831 -89316256 + RLTR13D1 LTR ERVK 1 76 -730 7 1290 1406 58 5 0 chr2 92456197 92456388 -89291699 + MTA_Mm LTR MaLR 205 396 0 8 1290 2420 121 26 3 chr2 92456342 92456731 -89291356 - MTB LTR MaLR -2 398 1 8 1290 241 369 0 39 chr2 92457087 92457214 -89290873 + MLT1H2 LTR MaLR 1 122 -367 8 1290 693 193 34 7 chr2 92459649 92459795 -89288292 - MTE2a LTR MaLR 0 379 230 8 1290 1647 227 31 6 chr2 92460011 92460366 -89287721 - MTD LTR MaLR -46 373 10 8 1290 1702 152 105 9 chr2 92461795 92462120 -89285967 - ORR1C2 LTR MaLR -28 356 1 8 1290 1689 156 57 3 chr2 92463402 92463718 -89284369 + ORR1C1-int LTR MaLR 1176 1508 -1 8 1290 1565 191 79 14 chr2 92463719 92463938 -89284149 + ORR1C1 LTR MaLR 1 226 -152 8 1290 1565 191 79 14 chr2 92463962 92464097 -89283990 + ORR1C1 LTR MaLR 227 378 0 8 1290 408 243 56 0 chr2 92464236 92464343 -89283744 - MTE2a LTR MaLR -1 378 266 8 1290 761 292 8 67 chr2 92464811 92464854 -89283233 - MTE2a LTR MaLR -141 238 201 8 1290 2029 147 13 13 chr2 92464854 92465226 -89282861 + ORR1D1 LTR MaLR 1 372 -2 8 1290 761 292 8 67 chr2 92465226 92465435 -89282652 - MTE2a LTR MaLR -179 200 1 8 1290 2340 133 8 5 chr2 92465785 92466169 -89281918 - RLTR28B LTR ERVL -8 473 89 8 1290 425 167 90 0 chr2 92466227 92466305 -89281782 - RLTR28B LTR ERVL -394 87 3 8 1290 381 312 16 16 chr2 92470410 92470537 -89277550 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 282 8 1290 321 301 131 23 chr2 92473978 92474192 -89273895 - LTR16A LTR ERVL -59 392 156 8 1290 741 294 98 8 chr2 92476362 92476626 -89271461 - MLT1A0 LTR MaLR -77 288 1 8 1290 794 251 0 6 chr2 92478690 92478862 -89269225 + ORR1E LTR MaLR 1 171 -188 8 1290 1913 131 92 97 chr2 92479108 92479198 -89268889 + MTC LTR MaLR 1 89 -332 8 1290 1913 131 92 97 chr2 92479344 92479676 -89268411 + MTC LTR MaLR 90 421 0 8 1290 1694 215 33 40 chr2 92481250 92481672 -89266415 - MTD LTR MaLR 0 419 1 8 1290 347 340 103 55 chr2 92482514 92482862 -89265225 + MLT1A0 LTR MaLR 1 365 0 8 1290 1217 254 70 6 chr2 92482958 92483314 -89264773 - MTEa LTR MaLR 0 379 1 8 1290 763 324 56 22 chr2 92484730 92485143 -89262944 + LTR16A LTR ERVL 1 427 -24 8 1290 251 253 59 59 chr2 92493042 92493143 -89254944 + MLT1A1 LTR MaLR 22 122 -286 9 1290 425 254 67 30 chr2 92493469 92493603 -89254484 + MLT1A1 LTR MaLR 270 408 0 9 1290 420 242 10 17 chr2 92495086 92495221 -89252866 + MTE2b LTR MaLR 244 379 0 9 1290 374 226 267 39 chr2 92500772 92500899 -89247188 - RMER21B LTR ERV1 -275 567 424 3 1290 374 226 267 39 chr2 92501383 92501431 -89246656 - RMER21B LTR ERV1 -419 423 349 3 1290 380 352 55 51 chr2 92501529 92501804 -89246283 - MLT1D LTR MaLR -224 281 6 5 1290 2740 22 0 0 chr2 92508341 92508663 -89239424 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 2 1290 10588 49 9 17 chr2 92508663 92510059 -89238028 - MMETn-int LTR ERVK 0 4844 3461 2 1290 517 294 49 22 chr2 92510782 92510966 -89237121 - ORR1E LTR MaLR -164 195 7 2 1290 536 310 91 33 chr2 92511160 92511467 -89236620 + MLT1A1 LTR MaLR 4 328 -80 2 1290 633 269 37 66 chr2 92520390 92520661 -89227426 + MTD LTR MaLR 1 263 -156 3 1290 2574 94 108 27 chr2 92521104 92521550 -89226537 + RLTR45 LTR ERVK 1 482 0 3 1290 1350 199 54 108 chr2 92522673 92523079 -89225008 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 4 1290 2073 85 42 13 chr2 92524157 92524467 -89223620 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 4 1290 274 274 118 0 chr2 92525633 92525735 -89222352 + MTEa LTR MaLR 260 373 -6 4 1290 1036 256 98 3 chr2 92525803 92526120 -89221967 + MTE2a LTR MaLR 1 347 -32 5 1290 430 241 159 6 chr2 92526119 92526282 -89221805 + MTE-int LTR MaLR 66 253 -1327 5 1290 366 262 176 100 chr2 92526249 92526499 -89221588 + ORR1E LTR MaLR 91 359 0 5 1290 1723 180 121 41 chr2 92526666 92527054 -89221033 + MTC LTR MaLR 3 421 0 5 1290 457 206 29 29 chr2 92527079 92527184 -89220903 + MTEa LTR MaLR 12 116 -263 5 1290 235 196 0 0 chr2 92530138 92530184 -89217903 - MLT1I LTR MaLR 0 411 366 6 1290 252 284 136 0 chr2 92530946 92531034 -89217053 - MLT1I LTR MaLR 0 411 312 6 1290 429 354 92 20 chr2 92531560 92531811 -89216276 - MLT1I LTR MaLR -101 310 42 6 1290 1000 190 5 11 chr2 92536014 92536191 -89211896 - MTEb LTR MaLR -200 179 4 6 1291 244 232 10 104 chr2 92537670 92537766 -89210321 - MT2B2 LTR ERVL -343 241 155 6 1291 1046 251 94 7 chr2 92537862 92538139 -89209948 - RMER15 LTR ERVL 0 575 275 7 1291 307 258 13 195 chr2 92538164 92538318 -89209769 - RMER15 LTR ERVL -444 131 6 7 1291 2501 261 67 28 chr2 92538323 92539114 -89208973 - RMER15-int LTR ERVL -26 4973 4152 7 1291 607 347 40 5 chr2 92539452 92539652 -89208435 - RMER15-int LTR ERVL -2779 2220 2014 7 1291 282 330 0 76 chr2 92539733 92539838 -89208249 - RMER15-int LTR ERVL -3136 1863 1767 7 1291 435 305 59 13 chr2 92539941 92540094 -89207993 - RMER15-int LTR ERVL -3390 1609 1450 7 1291 372 267 14 69 chr2 92540095 92540240 -89207847 + RMER15 LTR ERVL 35 171 -404 7 1291 782 231 252 0 chr2 92542615 92542913 -89205174 - MTE2b LTR MaLR -2 377 5 7 1291 592 242 82 33 chr2 92548686 92548870 -89199217 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 178 9 1291 366 317 75 19 chr2 92549884 92550096 -89197991 + RMER15 LTR ERVL 339 562 -13 9 1291 508 187 31 2 chr2 92552216 92552324 -89195763 + MTC LTR MaLR 1 125 -271 1 1291 1000 178 0 11 chr2 92552324 92552500 -89195587 + MTC LTR MaLR 248 421 0 1 1291 916 248 23 9 chr2 92553833 92554049 -89194038 + MTEa LTR MaLR 107 325 -54 1 1291 401 134 15 0 chr2 92555009 92555076 -89193011 + MTEa LTR MaLR 312 379 0 1 1291 2720 193 31 75 chr2 92562067 92562706 -89185381 - RMER19C LTR ERVK 0 611 1 1 1291 1289 255 39 89 chr2 92571389 92571772 -89176315 - MTEa LTR MaLR -15 364 1 1 1291 3251 51 185 2 chr2 92572938 92573371 -89174716 + RLTR1B LTR ERV1 1 512 0 1 1291 1011 240 105 91 chr2 92574472 92574899 -89173188 + RMER4A LTR ERVK 20 452 -14 1 1291 1085 169 91 55 chr2 92574977 92575284 -89172803 + RMER17C LTR ERVK 93 410 0 1 1291 2368 97 22 0 chr2 92581241 92581561 -89166526 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 1 1291 297 336 26 9 chr2 92589803 92589917 -89158170 - LTR33 LTR ERVL -164 351 236 1 1291 290 326 45 0 chr2 92595998 92596087 -89152000 - LTR16A1 LTR ERVL -326 130 38 1 1291 1300 229 115 6 chr2 92596327 92596648 -89151439 - ORR1D2 LTR MaLR -8 362 7 1 1291 722 280 45 0 chr2 92598501 92598701 -89149386 + MLT1F1 LTR MaLR 1 209 -360 1 1291 1059 221 155 31 chr2 92599968 92600290 -89147797 + RMER16 LTR ERVK 172 533 0 1 1291 1451 185 112 42 chr2 92600293 92600734 -89147353 + RLTR19-int LTR ERVK 4 475 -5662 1 1291 3414 130 40 29 chr2 92600739 92601395 -89146692 + RLTR19-int LTR ERVK 726 1388 -4749 1 1291 756 149 0 0 chr2 92601379 92601500 -89146587 + RLTR19-int LTR ERVK 3568 3688 -2449 1 1291 2055 146 52 49 chr2 92601524 92601929 -89146158 + RMER16-int LTR ERVK 3567 3972 -1434 1 1291 6914 157 37 14 chr2 92602235 92603562 -89144525 + RMER16-int LTR ERVK 4036 5393 -13 1 1291 971 156 178 40 chr2 92603672 92603925 -89144162 + RMER16 LTR ERVK 242 529 -4 1 1291 717 332 73 15 chr2 92608427 92608757 -89139330 - MLT2D LTR ERVL -63 351 3 2 1291 234 148 107 36 chr2 92609154 92609210 -89138877 - RLTR26 LTR ERVK -77 565 506 2 1291 806 311 33 25 chr2 92611052 92611326 -89136761 + MT2A LTR ERVL 1 276 -257 2 1291 246 259 93 106 chr2 92613460 92613611 -89134476 + RLTR41 LTR ERV1 89 237 -209 2 1291 355 111 13 40 chr2 92615097 92615172 -89132915 - RMER3D-int LTR ERVK -2090 752 680 2 1291 536 198 26 35 chr2 92615160 92615275 -89132812 + RMER3D-int LTR ERVK 1549 1662 -1180 2 1291 3028 175 10 35 chr2 92615341 92615916 -89132171 + RLTR31_Mm LTR ERVK 1 561 0 2 1291 1073 251 27 33 chr2 92616175 92616512 -89131575 + RLTR15 LTR ERVK 4 338 -21 2 1291 4679 219 94 113 chr2 92617390 92618417 -89129670 + MYSERV6-int LTR ERVK 3785 5724 -3235 2 1291 4679 219 94 113 chr2 92618470 92620180 -89127907 + MYSERV6-int LTR ERVK 5725 8959 0 2 1291 1306 217 33 24 chr2 92620180 92620511 -89127576 + RLTR15 LTR ERVK 1 334 -25 2 1291 291 246 31 0 chr2 92620525 92620590 -89127497 + MTE2a LTR MaLR 313 379 0 2 1291 732 296 82 110 chr2 92623331 92623821 -89124266 - RLTR18 LTR ERVK -88 528 53 2 1291 429 262 79 8 chr2 92627091 92627218 -89120869 + MTE2a LTR MaLR 1 136 -243 2 1291 1366 194 43 72 chr2 92627104 92627541 -89120546 + MT2A LTR ERVL 26 591 -10 2 1291 324 322 110 48 chr2 92629902 92630130 -89117957 - MLT1A0 LTR MaLR -38 327 86 2 1291 3362 50 2 2 chr2 92631671 92632071 -89116016 + MTB LTR MaLR 1 400 0 2 1291 1770 220 35 80 chr2 92632127 92632622 -89115465 + RLTR1B LTR ERV1 1 512 0 2 1291 3337 43 5 2 chr2 92632678 92633073 -89115014 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 1291 5665 60 20 18 chr2 92633073 92633223 -89114864 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 957 2 1291 5665 82 78 19 chr2 92633610 92634436 -89113651 - MTA_Mm-int LTR MaLR -142 956 3 2 1291 3438 35 5 0 chr2 92634436 92634830 -89113257 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 1291 2304 155 34 3 chr2 92636989 92637371 -89110716 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 2 1291 925 280 232 7 chr2 92643541 92643997 -89104090 + RMER15 LTR ERVL 2 560 -15 2 1291 257 302 10 102 chr2 92652353 92652493 -89095594 + MLT1J1 LTR MaLR 109 273 -239 2 1291 239 310 59 42 chr2 92655433 92655551 -89092536 + RMER15 LTR ERVL 446 565 -10 2 1291 364 373 59 0 chr2 92657203 92657372 -89090715 + MER21B LTR ERV1 19 197 -666 2 1291 1060 323 25 22 chr2 92657494 92657849 -89090238 + MER21B LTR ERV1 379 734 -129 2 1291 703 288 72 69 chr2 92657852 92658199 -89089888 + ORR1E LTR MaLR 3 350 -9 2 1291 1155 194 221 25 chr2 92658436 92658753 -89089334 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 2 1291 256 261 146 73 chr2 92667547 92667725 -89080362 - MLT1H2 LTR MaLR -256 233 43 2 1292 391 140 0 0 chr2 92671308 92671365 -89076722 - MTC LTR MaLR 0 421 365 3 1292 2543 167 17 5 chr2 92671371 92671787 -89076300 - MTC LTR MaLR 0 421 1 3 1292 501 315 46 76 chr2 92673848 92674203 -89073884 + ORR1E LTR MaLR 7 367 -12 3 1292 229 351 0 13 chr2 92676118 92676196 -89071891 + MLT2D LTR ERVL 18 94 -320 3 1292 1035 324 20 20 chr2 92676310 92676653 -89071434 + MLT2D LTR ERVL 72 414 0 3 1292 2276 123 26 41 chr2 92692006 92692021 -89056066 - RMER17C LTR ERVK 0 410 388 3 1292 2276 123 26 41 chr2 92692054 92692274 -89055813 - RMER17C LTR ERVK -23 387 182 3 1292 2276 123 26 41 chr2 92692449 92692628 -89055459 - RMER17C LTR ERVK -229 181 2 3 1292 1705 126 142 43 chr2 92696580 92696770 -89051317 - RMER17C LTR ERVK 0 410 175 3 1292 1705 126 142 43 chr2 92696902 92697084 -89051003 - RMER17C LTR ERVK -236 174 1 3 1292 1471 177 34 209 chr2 92697752 92698230 -89049857 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 3 1292 2121 155 40 20 chr2 92698240 92698635 -89049452 - ORR1B1-int LTR MaLR 0 1509 1107 3 1292 425 286 242 24 chr2 92699763 92699965 -89048122 - RMER5 LTR ERV1 -51 483 238 3 1292 7057 137 18 7 chr2 92702467 92703569 -89044518 + RLTR13D3 LTR ERVK 1 1114 0 3 1292 472 269 50 63 chr2 92703980 92704199 -89043888 - MTE2a LTR MaLR -149 230 40 3 1292 922 214 99 31 chr2 92707538 92707760 -89040327 + MTE2b LTR MaLR 1 237 -142 3 1292 1653 170 146 14 chr2 92708358 92708727 -89039360 - MTD LTR MaLR 0 419 2 3 1292 425 278 146 42 chr2 92709646 92709924 -89038163 + MLT2C2 LTR ERVL 3 314 -83 3 1292 401 327 28 26 chr2 92714142 92714330 -89033757 + MTD LTR MaLR 10 203 -216 3 1292 709 225 95 45 chr2 92714394 92714594 -89033493 + MTD LTR MaLR 194 403 -16 3 1292 257 257 88 114 chr2 92717174 92717198 -89030889 - MT2B LTR ERVL -332 269 248 4 1292 257 257 88 114 chr2 92717510 92717591 -89030496 - MT2B LTR ERVL -354 247 82 4 1292 372 330 196 27 chr2 92720025 92720209 -89027878 + MER70B LTR ERVL 225 439 -139 4 1292 403 264 199 59 chr2 92721502 92721723 -89026364 - ORR1E LTR MaLR -105 254 3 4 1292 261 278 64 43 chr2 92722075 92722169 -89025918 + MTE2a LTR MaLR 1 96 -323 4 1292 974 256 42 62 chr2 92722229 92722613 -89025474 - RMER17C LTR ERVK -34 376 1 4 1292 1052 211 75 53 chr2 92722614 92722895 -89025192 + MTE2a LTR MaLR 72 358 -21 4 1292 288 271 104 78 chr2 92724396 92724588 -89023499 - MLT1D LTR MaLR -227 278 82 4 1292 1116 128 56 0 chr2 92724915 92725095 -89022992 - RMER10B LTR ERVL -205 193 4 4 1292 541 197 148 0 chr2 92726148 92726270 -89021817 + RMER5 LTR ERV1 15 154 -380 4 1292 2111 159 8 26 chr2 92726297 92726679 -89021408 + RMER10B LTR ERVL 1 375 -23 4 1292 1427 217 63 68 chr2 92726670 92726829 -89021258 + RMER5 LTR ERV1 154 293 -241 4 1292 1427 217 63 68 chr2 92726857 92727078 -89021009 + RMER5 LTR ERV1 294 531 -3 4 1292 239 299 108 36 chr2 92727674 92727785 -89020302 - MLT2B2 LTR ERVL -261 254 136 4 1292 299 263 198 20 chr2 92729910 92730011 -89018076 - ORR1E LTR MaLR -2 377 259 4 1292 303 369 74 0 chr2 92730463 92730585 -89017502 - ORR1E LTR MaLR -228 131 1 4 1292 832 262 14 112 chr2 92731147 92731443 -89016644 - RMER15 LTR ERVL -4 571 305 4 1292 435 289 138 60 chr2 92732052 92732269 -89015818 - MER21B LTR ERV1 -209 654 421 4 1292 346 182 0 43 chr2 92732270 92732339 -89015748 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 305 4 1292 229 107 246 18 chr2 92732415 92732472 -89015615 - ORR1D2 LTR MaLR -222 156 87 4 1292 249 315 55 22 chr2 92732464 92732555 -89015532 - MER21B LTR ERV1 -751 112 19 4 1292 307 273 15 0 chr2 92732577 92732643 -89015444 - MER21B LTR ERV1 -773 90 24 4 1292 1505 240 82 15 chr2 92732932 92733321 -89014766 - MTD LTR MaLR 0 419 5 4 1292 441 215 132 110 chr2 92733378 92733514 -89014573 + MTEa LTR MaLR 2 140 -239 4 1292 437 313 111 49 chr2 92733404 92733710 -89014377 + MLT2B5 LTR ERVL 175 499 -218 4 1292 249 241 181 0 chr2 92733714 92733797 -89014290 + MTC LTR MaLR 1 98 -321 4 1292 758 223 148 27 chr2 92733782 92734079 -89014008 + MT2B LTR ERVL 88 553 -48 4 1292 2450 213 139 13 chr2 92734079 92734683 -89013404 + RMER13A LTR ERVK 1 680 -180 4 1292 260 300 0 54 chr2 92734669 92734743 -89013344 + RMER13A LTR ERVK 604 673 -235 4 1292 1836 164 0 7 chr2 92734910 92735204 -89012883 + MTC LTR MaLR 125 416 -5 4 1292 357 305 74 54 chr2 92735189 92735338 -89012749 + MT2A LTR ERVL 310 461 -72 4 1292 1091 276 140 56 chr2 92737933 92738540 -89009547 - RMER13A LTR ERVK -189 671 14 4 1292 1200 147 61 0 chr2 92739700 92739898 -89008189 - ORR1A4 LTR MaLR 0 394 185 4 1292 1993 118 20 0 chr2 92739883 92740180 -89007907 - ORR1A4-int LTR MaLR -1660 303 1 4 1292 1774 107 100 65 chr2 92740184 92740494 -89007593 - ORR1A4 LTR MaLR -8 321 1 4 1292 512 270 99 36 chr2 92747630 92747822 -89000265 - MLT1H LTR MaLR 0 549 346 4 1292 3096 127 105 24 chr2 92748211 92748752 -88999335 + RMER4B LTR ERVK 1 585 0 4 1292 887 263 174 52 chr2 92750861 92751092 -88996995 + RMER5 LTR ERV1 31 296 -238 4 1292 1128 184 144 121 chr2 92751092 92751439 -88996648 - ORR1E LTR MaLR -4 355 1 4 1292 887 263 174 52 chr2 92751439 92751645 -88996442 + RMER5 LTR ERV1 297 521 -13 4 1292 385 221 84 158 chr2 92753543 92753828 -88994259 + MLT1H2 LTR MaLR 192 455 -34 4 1292 1425 234 101 14 chr2 92761302 92761649 -88986438 + MTE2b LTR MaLR 1 377 -2 4 1292 1178 251 60 46 chr2 92763941 92764292 -88983795 + ORR1E LTR MaLR 2 357 -2 4 1292 1160 274 18 94 chr2 92767917 92768256 -88979831 + MTE2b LTR MaLR 1 313 -66 5 1292 346 271 45 162 chr2 92774110 92774234 -88973853 - MT2B LTR ERVL -337 264 171 5 1292 346 271 45 162 chr2 92774300 92774422 -88973665 - MT2B LTR ERVL -431 170 47 5 1292 1661 160 21 7 chr2 92777155 92777439 -88970648 - MTD LTR MaLR -131 288 1 5 1292 3324 33 30 0 chr2 92778687 92779086 -88969001 - IAPLTR2a LTR ERVK 0 411 1 5 1292 399 360 120 17 chr2 92783514 92783805 -88964282 - MLT1J2 LTR MaLR -125 323 3 5 1292 247 352 117 82 chr2 92784045 92784302 -88963785 - ORR1E LTR MaLR 0 359 94 5 1292 935 252 140 74 chr2 92784369 92784720 -88963367 - MTE2b LTR MaLR -4 375 2 5 1292 263 324 35 107 chr2 92785414 92785611 -88962476 + ORR1E LTR MaLR 177 359 0 5 1292 2146 152 26 31 chr2 92797464 92797879 -88950208 - MTC LTR MaLR -8 413 1 5 1292 1220 110 0 5 chr2 92798314 92798506 -88949581 - RMER6D LTR ERVK 0 690 500 5 1292 2199 115 14 9 chr2 92798563 92798913 -88949174 - RMER6D LTR ERVK -367 353 2 5 1293 2953 122 12 20 chr2 92799239 92799492 -88948595 + RLTR28 LTR ERVL 1 258 -266 5 1293 2953 122 12 20 chr2 92799675 92799929 -88948158 + RLTR28 LTR ERVL 259 504 -20 5 1293 657 289 53 73 chr2 92801869 92802181 -88945906 + RMER15 LTR ERVL 3 456 -119 5 1293 416 311 106 128 chr2 92802373 92802487 -88945600 + RMER15 LTR ERVL 298 575 0 5 1293 699 342 26 49 chr2 92802488 92802838 -88945249 + RMER15-int LTR ERVL 2 343 -4656 5 1293 304 368 75 46 chr2 92802892 92803131 -88944956 + RMER15-int LTR ERVL 1979 2224 -2775 5 1293 963 271 47 8 chr2 92803418 92803675 -88944412 + RMER15-int LTR ERVL 4348 4614 -385 5 1293 430 229 30 96 chr2 92803675 92803810 -88944277 + MT2B LTR ERVL 132 257 -344 5 1293 912 233 122 66 chr2 92803875 92804210 -88943877 + RMER15-int LTR ERVL 4631 4984 -15 5 1293 345 222 32 43 chr2 92804257 92804351 -88943736 + RMER15 LTR ERVL 39 131 -444 5 1293 1031 289 27 3 chr2 92804369 92804661 -88943426 + RMER15 LTR ERVL 277 575 0 5 1293 338 240 45 85 chr2 92835445 92835646 -88912441 + MTEb LTR MaLR 176 374 -5 5 1293 294 328 58 8 chr2 92836410 92836530 -88911557 + ORR1E LTR MaLR 232 357 -2 5 1293 299 328 79 14 chr2 92837462 92837601 -88910486 + ORR1E LTR MaLR 10 157 -202 5 1293 1400 193 137 5 chr2 92838078 92838440 -88909647 + RMER10A LTR ERVL 6 415 -27 5 1293 1400 193 137 5 chr2 92838516 92838539 -88909548 + RMER10A LTR ERVL 416 441 -1 5 1293 2127 134 88 6 chr2 92839646 92839999 -88908088 - ORR1C2 LTR MaLR -2 382 1 6 1293 5049 235 68 28 chr2 92839999 92841315 -88906772 - ORR1C2-int LTR MaLR 0 1370 3 6 1293 754 95 17 0 chr2 92841318 92841434 -88906653 - ORR1C2 LTR MaLR -1 383 266 6 1293 240 264 94 34 chr2 92847330 92847479 -88900608 - RMER10A LTR ERVL -15 427 270 6 1293 473 328 45 0 chr2 92847546 92847723 -88900364 - MLT1D LTR MaLR -297 208 24 6 1293 1112 237 87 87 chr2 92847726 92847785 -88900302 - MTE2a LTR MaLR 0 379 312 6 1293 1112 237 87 87 chr2 92847979 92848289 -88899798 - MTE2a LTR MaLR -68 311 10 6 1293 469 149 11 33 chr2 92850017 92850107 -88897980 + MT2B LTR ERVL 1 88 -445 6 1293 937 211 139 38 chr2 92850759 92851060 -88897027 + MT2B LTR ERVL 84 540 -61 6 1293 385 299 163 0 chr2 92855703 92855850 -88892237 + MLT1A LTR MaLR 183 353 -21 6 1293 1932 209 55 36 chr2 92855872 92856310 -88891777 + RLTR41 LTR ERV1 1 446 0 6 1293 384 226 0 124 chr2 92856524 92856541 -88891546 + MT2B LTR ERVL 152 153 -448 6 1293 503 292 90 65 chr2 92863306 92863628 -88884459 + ORR1E LTR MaLR 24 353 -6 6 1293 296 316 213 39 chr2 92864811 92865018 -88883069 + MER21B LTR ERV1 4 246 -617 6 1293 361 349 109 22 chr2 92865461 92865728 -88882359 + MER21B LTR ERV1 412 701 -162 6 1293 373 269 155 40 chr2 92868874 92869048 -88879039 + MLT1K LTR MaLR 372 565 -30 6 1293 3362 50 0 7 chr2 92878759 92879162 -88868925 + MTB LTR MaLR 1 400 0 6 1293 344 360 9 0 chr2 92883324 92883435 -88864652 - MLT1I LTR MaLR -19 392 281 6 1293 978 292 71 7 chr2 92889923 92890220 -88857867 - MTE2a LTR MaLR -2 377 62 7 1293 387 286 42 8 chr2 92890221 92890341 -88857746 - MTE-int LTR MaLR -2 1578 1455 7 1293 356 163 29 3 chr2 92890537 92890614 -88857473 - MTE2a-int LTR MaLR -55 1315 1253 7 1293 3190 44 43 13 chr2 92890665 92891060 -88857027 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 7 1293 2197 268 188 9 chr2 92891770 92892257 -88855830 - MTE2a-int LTR MaLR -243 1337 814 7 1293 2197 268 188 9 chr2 92892281 92892468 -88855619 - MTE2a-int LTR MaLR -767 813 543 7 1293 1459 240 56 48 chr2 92892477 92892871 -88855216 - MTE2a-int LTR MaLR -1181 399 3 7 1293 519 151 12 0 chr2 92892872 92892958 -88855129 - MTE2a LTR MaLR 0 379 293 7 1293 2501 99 0 0 chr2 92893418 92893741 -88854346 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 5 7 1293 458 298 129 100 chr2 92893877 92894227 -88853860 + MTEa LTR MaLR 1 360 -19 7 1293 2054 190 52 30 chr2 92895273 92895675 -88852412 + MTD LTR MaLR 1 411 -8 7 1293 1594 206 75 30 chr2 92901056 92901417 -88846670 + MTE2b LTR MaLR 1 377 -2 7 1293 444 339 102 23 chr2 92906704 92907009 -88841078 + MLT1A0 LTR MaLR 37 365 0 7 1293 528 337 24 0 chr2 92914678 92914844 -88833243 - MLT1J LTR MaLR -340 172 3 7 1293 1859 217 52 12 chr2 92920800 92921201 -88826886 - MTD LTR MaLR 0 419 3 7 1293 1678 154 129 9 chr2 92928655 92928989 -88819098 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 7 1294 229 318 11 64 chr2 92931591 92931685 -88816402 + RLTR13D1 LTR ERVK 621 709 -97 7 1294 302 276 58 79 chr2 92932943 92933132 -88814955 - RMER15 LTR ERVL -48 527 343 7 1294 298 264 36 45 chr2 92933172 92933283 -88814804 - RMER15 LTR ERVL -444 131 22 7 1294 337 283 150 0 chr2 92935096 92935216 -88812871 + MLT1E2 LTR MaLR 282 419 -208 7 1294 794 288 40 92 chr2 92935248 92935461 -88812626 + ORR1E LTR MaLR 8 217 -142 7 1294 3895 109 40 29 chr2 92935461 92936055 -88812032 - MT2B LTR ERVL 0 601 1 7 1294 794 288 40 92 chr2 92936055 92936212 -88811875 + ORR1E LTR MaLR 218 359 0 7 1294 273 217 17 0 chr2 92936947 92937007 -88811080 - MLT1H LTR MaLR -1 548 488 8 1294 471 274 67 56 chr2 92940870 92941048 -88807039 - RMER15 LTR ERVL -49 526 347 8 1294 625 101 1 3 chr2 92943143 92943240 -88804847 + ORR1A2 LTR MaLR 5 92 -235 8 1294 1439 146 14 32 chr2 92946119 92946396 -88801691 + ORR1A2 LTR MaLR 54 325 -2 8 1294 2236 217 66 23 chr2 92948097 92948190 -88799897 - RLTR20B1 LTR ERVK 0 563 469 8 1294 2236 217 66 23 chr2 92948273 92948708 -88799379 - RLTR20B1 LTR ERVK -95 468 13 8 1294 302 295 41 8 chr2 92954638 92954761 -88793326 - MLT1A LTR MaLR -247 127 1 8 1294 460 236 22 111 chr2 92956906 92956999 -88791088 - RLTR20C LTR ERVK 0 551 459 8 1294 460 236 22 111 chr2 92957023 92957051 -88791036 - RLTR20C LTR ERVK -93 458 446 8 1294 1242 162 91 64 chr2 92957095 92957452 -88790635 - RLTR20C LTR ERVK -210 368 1 8 1294 252 358 47 38 chr2 92959627 92959839 -88788248 - MLT1H LTR MaLR -312 237 24 8 1294 231 276 17 0 chr2 92960362 92960420 -88787667 + MLT1A1 LTR MaLR 155 213 -195 8 1294 237 339 22 88 chr2 92960435 92960571 -88787516 + MLT1A1 LTR MaLR 280 406 -2 8 1294 291 257 57 38 chr2 92961361 92961466 -88786621 - LTR85a LTR Gypsy? -576 126 20 8 1294 282 266 31 0 chr2 92962622 92962686 -88785401 + MLT1J LTR MaLR 254 319 -193 8 1294 618 177 40 172 chr2 92967467 92967665 -88780422 + MT2A LTR ERVL 1 172 -361 8 1294 237 105 26 0 chr2 92967681 92967719 -88780368 + MT2A LTR ERVL 436 474 -1 8 1294 234 280 87 39 chr2 92968753 92968857 -88779230 - MLT1H LTR MaLR -376 173 65 8 1294 1074 201 174 22 chr2 92970138 92970302 -88777785 + ORR1D2 LTR MaLR 1 176 -194 8 1294 1074 201 174 22 chr2 92970353 92970509 -88777578 + ORR1D2 LTR MaLR 177 370 0 8 1294 902 247 52 4 chr2 92974936 92975168 -88772919 + MTEb LTR MaLR 137 379 0 8 1294 649 276 113 65 chr2 92977261 92977306 -88770781 - MT2A LTR ERVL 0 601 560 8 1294 1303 208 104 36 chr2 92977329 92977709 -88770378 - MT2A LTR ERVL -42 559 1 8 1294 1787 146 16 7 chr2 92977724 92978027 -88770060 - ORR1B2 LTR MaLR -8 359 54 8 1294 390 188 19 34 chr2 92978096 92978198 -88769889 - ORR1C1 LTR MaLR -272 112 8 8 1294 244 330 10 14 chr2 92981253 92981355 -88766732 + MTE2a LTR MaLR 271 365 -14 9 1294 1807 139 14 75 chr2 92986235 92986672 -88761415 + RMER17C LTR ERVK 1 410 0 9 1294 925 240 99 55 chr2 92996409 92996796 -88751291 + MTE2a LTR MaLR 23 406 -13 9 1294 350 244 37 0 chr2 92996970 92997052 -88751035 + MLT1A LTR MaLR 12 96 -278 9 1294 655 339 110 38 chr2 92997709 92998181 -88749906 + MTE-int LTR MaLR 174 679 -901 9 1294 445 253 107 18 chr2 92999503 92999672 -88748415 - MLT1D LTR MaLR -21 484 301 9 1294 253 289 72 0 chr2 92999643 92999740 -88748347 - MLT1D LTR MaLR -390 115 12 9 1294 417 319 7 21 chr2 93000062 93000203 -88747884 + MLT1A1 LTR MaLR 268 406 -2 1 1294 527 320 99 75 chr2 93001740 93002078 -88746009 + ORR1E LTR MaLR 7 354 -5 3 1294 1070 289 79 31 chr2 93002078 93002431 -88745656 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 4 1294 407 231 165 0 chr2 93007809 93007930 -88740157 - RMER15 LTR ERVL -13 562 422 1 1294 941 207 85 0 chr2 93012495 93012683 -88735404 + RMER19B LTR ERVK 687 890 -12 1 1294 246 308 36 71 chr2 93021340 93021452 -88726635 - MT2B LTR ERVL -343 258 151 3 1294 2432 71 51 0 chr2 93025461 93025772 -88722315 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 4 1294 1080 243 136 18 chr2 93058274 93058613 -88689474 + MTEa LTR MaLR 1 379 0 8 1295 811 282 30 74 chr2 93071383 93071682 -88676405 + MTE2a LTR MaLR 75 360 -19 1 1295 394 189 178 0 chr2 93075249 93075339 -88672748 + ORR1D2 LTR MaLR 263 368 -2 1 1295 984 156 292 17 chr2 93075457 93075745 -88672342 + ORR1D1 LTR MaLR 1 367 -7 1 1295 287 299 31 196 chr2 93077790 93078111 -88669976 + ORR1E LTR MaLR 39 306 -53 1 1295 1347 189 178 22 chr2 93081213 93081533 -88666554 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 1 1295 325 207 18 53 chr2 93083078 93083303 -88664784 - RMER17D LTR ERVK -367 522 306 1 1295 268 313 60 38 chr2 93094447 93094580 -88653507 - MLT1D LTR MaLR -302 203 68 1 1295 3337 43 8 0 chr2 93100704 93101097 -88646990 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 1295 235 218 55 0 chr2 93108964 93109019 -88639068 + MLT1H2 LTR MaLR 86 143 -346 1 1295 2403 77 3 69 chr2 93116789 93117137 -88630950 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 3 1 1295 289 292 265 35 chr2 93117741 93117978 -88630109 + MLT1C LTR MaLR 1 302 -165 1 1295 289 292 265 35 chr2 93118002 93118111 -88629976 + MLT1C LTR MaLR 303 426 -41 1 1295 963 235 70 6 chr2 93129119 93129356 -88618731 + MTEa LTR MaLR 99 379 0 1 1295 1903 133 106 6 chr2 93129558 93129907 -88618180 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 3 1 1295 1375 196 12 117 chr2 93132490 93132831 -88615256 + MTEb LTR MaLR 57 361 -18 2 1295 2941 47 7 82 chr2 93134838 93135255 -88612832 + RLTR10 LTR ERVK 1 386 -4 2 1295 15423 31 14 29 chr2 93135271 93136625 -88611462 + RLTR10-int LTR ERVK 41 1346 -641 2 1295 15423 31 14 29 chr2 93136650 93137271 -88610816 + RLTR10-int LTR ERVK 1347 1985 -2 2 1295 2942 47 7 82 chr2 93137271 93137688 -88610399 + RLTR10 LTR ERVK 1 386 -4 2 1295 853 230 233 42 chr2 93142009 93142211 -88605876 - MTD LTR MaLR -8 411 170 2 1295 853 230 233 42 chr2 93142242 93142370 -88605717 - MTD LTR MaLR -250 169 18 2 1295 1792 181 136 5 chr2 93142869 93143236 -88604851 - MTC LTR MaLR -6 415 1 2 1295 238 272 79 97 chr2 93146287 93146401 -88601686 + MLT2B4 LTR ERVL 212 323 -233 2 1295 622 247 96 6 chr2 93160827 93160994 -88587093 + MTEa LTR MaLR 1 182 -197 2 1295 348 218 86 38 chr2 93161621 93161726 -88586361 - MER57A-int LTR ERV1 -270 5917 5808 2 1295 1651 161 127 30 chr2 93163425 93163764 -88584323 - ORR1D1 LTR MaLR -2 372 1 2 1295 288 261 117 16 chr2 93165839 93165940 -88582147 + MTD LTR MaLR 3 107 -289 2 1295 1080 249 106 12 chr2 93177099 93177420 -88570667 + MTEa LTR MaLR 21 371 -8 2 1295 310 333 0 0 chr2 93184579 93184672 -88563415 - RMER15 LTR ERVL -112 463 371 2 1295 310 257 212 0 chr2 93185649 93185762 -88562325 - MLT1B LTR MaLR -135 475 339 2 1295 377 236 25 91 chr2 93186165 93186286 -88561801 - MLT1B LTR MaLR -256 134 22 2 1295 239 266 62 0 chr2 93186515 93186579 -88561508 - MTC LTR MaLR -248 173 106 2 1295 296 318 176 12 chr2 93188539 93188784 -88559303 + MLT1F2 LTR MaLR 276 560 0 2 1295 267 250 124 10 chr2 93189166 93189263 -88558824 - MLT1A1 LTR MaLR -4 404 297 3 1296 980 175 53 87 chr2 93201418 93201782 -88546305 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 409 6 3 1296 1595 184 81 9 chr2 93202007 93202342 -88545745 + ORR1B2 LTR MaLR 1 359 -8 3 1296 369 322 62 14 chr2 93203721 93203866 -88544221 + MLT1J LTR MaLR 94 245 -267 3 1296 275 182 27 96 chr2 93204098 93204171 -88543916 + MLT1J LTR MaLR 345 412 -198 3 1296 1132 240 86 49 chr2 93204228 93204578 -88543509 - ORR1D2 LTR MaLR -2 368 6 3 1296 1169 254 51 36 chr2 93213974 93214116 -88533971 - MTD LTR MaLR -1 418 277 3 1296 1169 254 51 36 chr2 93214174 93214443 -88533644 - MTD LTR MaLR -143 276 2 3 1296 362 371 41 38 chr2 93215442 93215708 -88532379 - RLTR12B LTR ERVK -250 278 12 3 1296 281 293 95 124 chr2 93225403 93225613 -88522474 - ORR1E LTR MaLR -40 319 116 3 1296 243 333 108 0 chr2 93226235 93226337 -88521750 - ORR1E LTR MaLR -207 152 40 3 1296 2202 182 63 44 chr2 93227254 93227347 -88520740 - RLTR20C LTR ERVK 0 534 444 3 1296 2202 182 63 44 chr2 93227381 93227811 -88520276 - RLTR20C LTR ERVK -91 443 3 3 1296 295 194 75 0 chr2 93227824 93227891 -88520196 + RMER15 LTR ERVL 376 447 -128 3 1296 380 210 25 0 chr2 93227927 93228008 -88520079 + RMER15 LTR ERVL 407 489 -86 3 1296 3258 43 5 41 chr2 93235006 93235421 -88512666 - MTB LTR MaLR 0 400 1 3 1296 324 227 47 0 chr2 93235823 93235946 -88512141 - RLTR20D LTR ERVK -99 435 207 3 1296 690 183 22 22 chr2 93235957 93236091 -88511996 - RLTR20D LTR ERVK -434 134 1 3 1296 2662 143 19 7 chr2 93238507 93238923 -88509164 - MTC LTR MaLR 0 421 1 4 1296 1889 171 14 11 chr2 93239144 93239499 -88508588 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 19 4 1296 303 207 50 121 chr2 93241634 93241733 -88506354 - MT2B LTR ERVL -337 264 173 4 1296 1807 175 45 8 chr2 93242565 93242917 -88505170 - ORR1C1 LTR MaLR -12 366 2 4 1296 232 263 0 0 chr2 93269428 93269485 -88478602 + MLT1L LTR MaLR 338 394 -216 4 1296 912 266 74 26 chr2 93274338 93274650 -88473437 + RMER5 LTR ERV1 30 356 -178 4 1296 1184 245 102 33 chr2 93274856 93275219 -88472868 + MTD LTR MaLR 1 388 -31 4 1296 307 327 72 61 chr2 93294989 93295253 -88452834 + LTR79 LTR ERVL 9 275 -252 4 1296 1172 279 53 17 chr2 93297022 93297337 -88450750 + MTE2b LTR MaLR 1 328 -51 4 1296 1172 279 53 17 chr2 93297385 93297426 -88450661 + MTE2b LTR MaLR 329 369 -10 4 1296 310 330 61 26 chr2 93304608 93304723 -88443364 - RMER10B LTR ERVL -11 387 269 4 1296 2029 179 247 4 chr2 93305412 93305873 -88442214 - RMER15 LTR ERVL -2 573 1 4 1296 2191 160 33 14 chr2 93307282 93307649 -88440438 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 5 4 1296 262 312 129 11 chr2 93307800 93307978 -88440109 - MLT1G1 LTR MaLR -245 334 136 4 1296 292 288 76 35 chr2 93310409 93310553 -88437534 - RMER15 LTR ERVL -153 422 273 5 1296 1959 114 21 10 chr2 93312773 93313156 -88434931 - ORR1A2 LTR MaLR 0 394 1 5 1296 418 304 43 64 chr2 93314552 93314787 -88433300 - MTEb LTR MaLR -99 280 51 5 1296 455 302 113 58 chr2 93322924 93323181 -88424906 + LTR33A LTR ERVL 42 312 -208 5 1297 2221 126 100 2 chr2 93323810 93324319 -88423768 + RLTR17 LTR ERVK 98 656 -36 5 1297 350 266 52 61 chr2 93327016 93327215 -88420872 - MTEa LTR MaLR -1 378 170 5 1297 426 347 92 63 chr2 93331848 93332165 -88415922 - MLT1A LTR MaLR -29 345 20 5 1297 396 231 143 17 chr2 93332415 93332534 -88415553 + RMER20B LTR ERVK 472 605 -22 5 1297 281 151 38 0 chr2 93336160 93336213 -88411874 - MTE2b LTR MaLR -1 378 324 5 1297 415 210 103 16 chr2 93336217 93336343 -88411744 - MTE2b LTR MaLR -240 139 3 5 1297 1390 239 50 15 chr2 93339133 93339473 -88408614 - ORR1E LTR MaLR -1 358 7 5 1297 782 305 90 24 chr2 93339899 93340232 -88407855 + MTE2b LTR MaLR 2 356 -23 5 1297 359 214 61 0 chr2 93340606 93340709 -88407378 - MLT1C LTR MaLR -71 396 256 5 1297 855 210 33 52 chr2 93340749 93340996 -88407091 - MLT1C LTR MaLR -132 335 95 5 1297 501 269 29 155 chr2 93341183 93341307 -88406780 - MLT1C LTR MaLR -296 94 1 5 1297 299 321 132 81 chr2 93343357 93343652 -88404435 - ORR1E LTR MaLR -4 355 46 5 1297 346 277 85 0 chr2 93344427 93344521 -88403566 + MTEa LTR MaLR 1 102 -277 5 1297 240 219 46 15 chr2 93344559 93344624 -88403463 + MTE2b LTR MaLR 313 379 0 5 1297 2134 285 150 36 chr2 93345085 93346385 -88401702 - MTE2b-int LTR MaLR -31 1549 3 5 1297 967 263 57 3 chr2 93346393 93346715 -88401372 - MTE2b LTR MaLR -3 356 40 5 1297 237 354 43 59 chr2 93350204 93350390 -88397697 + MER21B LTR ERV1 491 673 -190 5 1297 1262 192 52 140 chr2 93350878 93351284 -88396803 + ORR1D1 LTR MaLR 3 372 -2 5 1297 4288 14 0 0 chr2 93353703 93354196 -88393891 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 5 1297 246 280 90 60 chr2 93356824 93356957 -88391130 - MLT1A0 LTR MaLR -38 327 191 5 1297 1254 279 47 0 chr2 93358589 93358951 -88389136 - MTE2a LTR MaLR 0 379 1 5 1297 296 268 14 0 chr2 93367340 93367411 -88380676 + MTEa LTR MaLR 5 76 -303 6 1297 351 343 27 77 chr2 93370739 93370960 -88377127 + LTR33 LTR ERVL 75 284 -231 6 1297 585 346 39 16 chr2 93389382 93389640 -88358447 + MLT1B LTR MaLR 29 292 -98 6 1297 1672 207 56 13 chr2 93390858 93391254 -88356833 + MTD LTR MaLR 5 417 -2 6 1297 694 226 118 149 chr2 93395026 93395416 -88352671 + MTE2a LTR MaLR 1 378 -1 6 1297 1961 133 3 33 chr2 93397500 93397834 -88350253 + ORR1B1 LTR MaLR 41 364 -30 6 1297 2983 74 92 0 chr2 93399127 93399562 -88348525 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 6 1297 302 239 24 14 chr2 93400860 93400973 -88347114 + MLT1J LTR MaLR 95 201 -311 6 1297 1903 156 30 69 chr2 93406251 93406644 -88341443 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 6 1297 907 263 34 44 chr2 93413896 93414194 -88333893 + MLT1A LTR MaLR 66 360 -14 6 1297 321 203 33 32 chr2 93414203 93414303 -88333784 - MTEb LTR MaLR -11 368 249 6 1297 341 342 31 99 chr2 93421498 93421871 -88326216 - MTE2a LTR MaLR -8 371 4 7 1297 246 338 133 15 chr2 93425989 93426124 -88321963 - MLT1B LTR MaLR -43 347 197 7 1297 606 304 57 18 chr2 93444815 93445043 -88303044 + MT2A LTR ERVL 297 533 0 7 1297 318 292 22 0 chr2 93445165 93445254 -88302833 + MLT1K LTR MaLR 153 243 -352 7 1298 1097 272 31 34 chr2 93466622 93467033 -88281054 - MTE2a LTR MaLR -15 404 1 7 1298 1281 251 63 22 chr2 93467656 93468018 -88280069 + MTEa LTR MaLR 3 379 0 7 1298 500 273 21 7 chr2 93525975 93526119 -88221968 - MLT1A0 LTR MaLR -2 363 218 4 1298 257 283 10 80 chr2 93527451 93527551 -88220536 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 273 4 1298 2131 122 19 0 chr2 93546378 93546699 -88201388 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 7 1298 330 217 238 16 chr2 93549223 93549345 -88198742 + RMER15 LTR ERVL 338 486 -89 7 1298 623 297 128 17 chr2 93549893 93550308 -88197779 - MLT1C LTR MaLR -6 461 1 7 1298 775 182 88 66 chr2 93562772 93562954 -88185133 - MTE2a LTR MaLR 0 379 194 8 1298 438 275 30 0 chr2 93563493 93563624 -88184463 - MTE2a LTR MaLR -224 135 1 8 1298 1324 297 184 5 chr2 93563624 93564193 -88183894 - MTE2a-int LTR MaLR -53 1527 853 8 1298 1577 292 133 32 chr2 93564861 93565483 -88182604 - MTE2a-int LTR MaLR -895 685 1 8 1298 409 231 22 5 chr2 93565483 93565595 -88182492 - MTE2a LTR MaLR 0 379 268 8 1298 394 279 100 0 chr2 93567110 93567250 -88180837 + RMER15 LTR ERVL 422 575 0 1 1298 233 167 24 122 chr2 93570565 93570647 -88177440 - LTR41 LTR ERVL -340 428 355 1 1298 1501 218 117 12 chr2 93575076 93575410 -88172677 + ORR1D1 LTR MaLR 6 374 0 1 1299 3245 184 43 16 chr2 93589101 93589726 -88158361 + RLTR26 LTR ERVK 1 642 0 1 1299 694 238 49 125 chr2 93592603 93592880 -88155207 + MT2B LTR ERVL 222 475 0 1 1299 1908 166 157 6 chr2 93596457 93596821 -88151266 - MTD LTR MaLR 0 419 1 1 1299 521 292 33 62 chr2 93605789 93606030 -88142057 + ORR1E LTR MaLR 1 234 -125 1 1299 231 246 33 0 chr2 93608326 93608387 -88139700 - MTE2a LTR MaLR -3 376 314 1 1299 243 254 14 27 chr2 93609066 93609139 -88138948 + MTE2a LTR MaLR 125 196 -183 1 1299 660 253 100 105 chr2 93614277 93614657 -88133430 + MLT1B LTR MaLR 9 386 -4 1 1299 253 315 83 64 chr2 93627268 93627424 -88120663 + ORR1E LTR MaLR 23 181 -178 2 1299 253 309 79 93 chr2 93629219 93629433 -88118654 + ORR1E LTR MaLR 160 370 0 2 1299 1226 190 146 22 chr2 93632654 93632897 -88115190 + ORR1D2 LTR MaLR 8 287 -83 2 1299 1226 190 146 22 chr2 93633129 93633208 -88114879 + ORR1D2 LTR MaLR 288 369 -1 2 1299 641 228 83 6 chr2 93642110 93642278 -88105809 + MER68 LTR ERVL 1 181 -382 2 1299 251 297 40 48 chr2 93643197 93643321 -88104766 + MLT1B LTR MaLR 67 189 -201 2 1299 706 245 174 88 chr2 93649492 93649832 -88098255 + MTE2a LTR MaLR 11 379 0 2 1299 1558 218 86 35 chr2 93650928 93651359 -88096728 + RLTR20A LTR ERVK 21 482 -95 2 1299 1558 213 83 34 chr2 93651398 93651489 -88096598 + RLTR20A LTR ERVK 450 541 0 2 1299 2885 22 0 0 chr2 93659107 93659429 -88088658 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 322 0 2 1299 3144 11 43 0 chr2 93664937 93665289 -88082798 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 2 1299 48217 21 12 1 chr2 93665289 93671661 -88076426 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 8 2 1299 3144 11 43 0 chr2 93671661 93672013 -88076074 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 2 1299 1521 156 186 9 chr2 93673154 93673472 -88074615 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 2 1299 1533 146 193 34 chr2 93680793 93681119 -88066968 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 2 1299 972 273 154 62 chr2 93686959 93687439 -88060648 + MLT1F1 LTR MaLR 46 569 0 3 1299 366 247 136 40 chr2 93690314 93690491 -88057596 - MER34A1 LTR ERV1 -75 512 319 3 1299 298 387 13 13 chr2 93690719 93690829 -88057258 - MT2A LTR ERVL -99 434 325 3 1299 1046 172 165 8 chr2 93690829 93691143 -88056944 + ORR1D1 LTR MaLR 1 383 -1 3 1299 1529 147 39 14 chr2 93691143 93691427 -88056660 + MERVL_2A-int LTR ERVL 5332 5622 -139 3 1299 250 250 42 42 chr2 93691436 93691507 -88056580 + ORR1A3-int LTR MaLR 569 639 -1324 3 1299 314 94 57 0 chr2 93691507 93691560 -88056527 + MERVL_2A-int LTR ERVL 5706 5761 0 3 1299 1493 205 42 65 chr2 93691560 93692026 -88056061 + MT2A LTR ERVL 1 593 -8 3 1299 602 314 52 174 chr2 93691975 93692395 -88055692 - MT2A LTR ERVL -162 371 3 3 1299 1332 207 42 109 chr2 93693213 93693571 -88054516 + MTEa LTR MaLR 1 334 -45 3 1299 715 238 278 29 chr2 93694007 93694250 -88053837 + MLT1A0 LTR MaLR 16 329 -36 3 1299 715 238 278 29 chr2 93694432 93694464 -88053623 + MLT1A0 LTR MaLR 330 360 -5 3 1299 349 233 0 122 chr2 93697715 93697732 -88050355 + MT2B LTR ERVL 153 157 -444 3 1299 1130 258 88 48 chr2 93700270 93700434 -88047653 + MTE2b LTR MaLR 12 176 -203 3 1299 1130 258 88 48 chr2 93700518 93700707 -88047380 + MTE2b LTR MaLR 177 379 0 3 1299 447 278 140 58 chr2 93714779 93715107 -88032980 + MLT1H2 LTR MaLR 67 421 -68 3 162 396 280 70 23 chr2 93716364 93716536 -88031551 + RMER15 LTR ERVL 310 489 -86 3 1300 287 202 42 73 chr2 93720036 93720132 -88027955 - MLT2B1 LTR ERVL -52 515 423 3 1300 540 347 38 54 chr2 93734296 93734610 -88013477 + RLTR26 LTR ERVK 168 476 -166 4 1300 980 205 67 4 chr2 93735563 93735788 -88012299 - RLTR42 LTR ERVK 0 239 1 4 1300 573 293 42 37 chr2 93737463 93737654 -88010433 - ORR1E LTR MaLR -167 192 1 4 1300 406 226 165 0 chr2 93737654 93737758 -88010329 - MTE-int LTR MaLR -53 1527 1405 4 1300 328 337 53 35 chr2 93737766 93737935 -88010152 - MTE-int LTR MaLR -544 1036 865 4 1300 962 346 129 13 chr2 93738582 93739030 -88009057 - MTE-int LTR MaLR -1080 500 1 4 1300 1585 180 50 0 chr2 93739039 93739317 -88008770 - MTD LTR MaLR -85 334 43 4 1300 1049 268 21 16 chr2 93739371 93739647 -88008440 - ORR1E LTR MaLR -98 272 2 4 1300 590 257 53 40 chr2 93739647 93739794 -88008293 - ORR1E LTR MaLR -210 149 1 4 1300 381 282 56 88 chr2 93741808 93742057 -88006030 + ORR1E LTR MaLR 91 331 -28 4 1300 541 294 65 7 chr2 93742808 93742962 -88005125 + MLT1A1 LTR MaLR 167 329 -79 4 1300 260 223 106 88 chr2 93745796 93745909 -88002178 + RLTR25B LTR ERVK 400 514 -514 4 1300 637 283 88 28 chr2 93748533 93748817 -87999270 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 65 4 1300 519 334 66 69 chr2 93756815 93757194 -87990893 - MLT1D LTR MaLR -76 429 52 4 1300 295 327 55 27 chr2 93757589 93757699 -87990388 + RMER20B LTR ERVK 477 589 -38 4 1300 335 312 15 29 chr2 93758100 93758232 -87989855 - MLT1A1 LTR MaLR -5 403 225 4 1300 3655 15 0 0 chr2 93759974 93760370 -87987717 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 1300 362 324 102 54 chr2 93761770 93761956 -87986131 + MLT1L LTR MaLR 403 597 -13 4 1300 2195 112 25 11 chr2 93762607 93762961 -87985126 - RLTR15 LTR ERVK 0 359 1 4 1300 950 296 176 45 chr2 93771160 93771406 -87976681 - MLT1F1-int LTR MaLR -37 1452 1172 4 1300 950 296 176 45 chr2 93771593 93772005 -87976082 - MLT1F1-int LTR MaLR -318 1171 708 4 1300 271 318 54 23 chr2 93772213 93772342 -87975745 - MLT1F1-int LTR MaLR -789 700 568 4 1300 388 241 26 43 chr2 93772446 93772563 -87975524 - MLT1F1-int LTR MaLR -957 532 418 4 1300 322 281 176 19 chr2 93772970 93773217 -87974870 - MLT1F1 LTR MaLR -38 531 207 4 1300 540 285 61 31 chr2 93774105 93774268 -87973819 + MLT1C LTR MaLR 193 360 -107 4 1300 1463 228 69 0 chr2 93776237 93776570 -87971517 + ORR1E LTR MaLR 2 357 -2 5 1300 3201 52 17 10 chr2 93777769 93778177 -87969910 + RLTR10A LTR ERVK 1 411 0 5 1300 2067 147 127 14 chr2 93779884 93780311 -87967776 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 5 1300 543 271 68 122 chr2 93782540 93782968 -87965119 + RMER10A LTR ERVL 12 416 -26 5 1300 1203 231 124 44 chr2 93783777 93784116 -87963971 + MTEa LTR MaLR 12 377 -2 5 1300 1243 256 36 57 chr2 93786387 93786773 -87961314 - MTE2b LTR MaLR -1 378 1 5 1300 426 299 101 6 chr2 93787232 93787400 -87960687 - ORR1E LTR MaLR 0 359 176 5 1300 2222 95 69 0 chr2 93789132 93789436 -87958651 + ORR1A2 LTR MaLR 1 325 -2 5 1300 1583 111 69 15 chr2 93789438 93789712 -87958375 + ORR1A2-int LTR MaLR 1 289 -1674 5 1300 1313 187 18 177 chr2 93789791 93790232 -87957855 + ORR1A2 LTR MaLR 4 374 0 5 1300 288 325 80 12 chr2 93790514 93790676 -87957411 - MLT1J-int LTR MaLR 0 1387 1215 5 1300 307 306 24 16 chr2 93790883 93791009 -87957078 - MLT1J-int LTR MaLR -182 1205 1079 5 1300 452 354 100 30 chr2 93791031 93791419 -87956668 - MLT1J-int LTR MaLR -444 943 474 5 1300 1345 217 23 11 chr2 93791657 93791923 -87956164 + MTD LTR MaLR 1 269 -150 5 1300 241 303 211 22 chr2 93792675 93792898 -87955189 - MLT1J-int LTR MaLR -722 665 401 5 1300 257 250 33 115 chr2 93798299 93798421 -87949666 + MT2B LTR ERVL 145 256 -345 5 1300 915 284 140 89 chr2 93800035 93800701 -87947386 + MLT1J-int LTR MaLR 4 746 -641 5 1300 498 254 190 61 chr2 93813238 93813551 -87934536 - ORR1E LTR MaLR 0 379 1 5 1300 3126 27 65 0 chr2 93818545 93818917 -87929170 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 1300 2057 151 114 11 chr2 93829603 93829972 -87918115 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 5 1300 1386 208 161 3 chr2 93843974 93844321 -87903766 + MTD LTR MaLR 18 419 0 6 1301 4294 53 2 2 chr2 93853795 93854307 -87893780 + RLTR1B LTR ERV1 1 512 0 6 1301 329 332 93 55 chr2 93856562 93856630 -87891457 + ERVL-E-int LTR ERVL 1662 1723 -3991 6 1301 414 326 109 9 chr2 93856812 93857033 -87891054 + ERVL-E-int LTR ERVL 1661 1962 -3752 6 1301 273 336 8 86 chr2 93857458 93857575 -87890512 + ERVL-E-int LTR ERVL 1909 2016 -3651 6 1301 1032 304 61 31 chr2 93857925 93858370 -87889717 + ERVL-E-int LTR ERVL 4033 4490 -1177 6 1301 766 312 39 41 chr2 93858410 93858798 -87889289 + ERVL-E-int LTR ERVL 4813 5199 -468 6 1301 498 253 82 137 chr2 93859366 93859426 -87888661 + ORR1E LTR MaLR 1 54 -305 6 1301 498 253 82 137 chr2 93859449 93859768 -87888319 + ORR1E LTR MaLR 55 359 0 6 1301 1627 214 69 20 chr2 93859967 93860118 -87887969 - MTC LTR MaLR -8 413 241 6 1301 1627 214 69 20 chr2 93860160 93860399 -87887688 - MTC LTR MaLR -181 240 5 6 1301 247 264 13 77 chr2 93869871 93869949 -87878138 - RMER15 LTR ERVL -104 471 399 6 1301 342 253 0 0 chr2 93870046 93870129 -87877958 - MLT1D LTR MaLR 0 505 423 6 1301 374 140 122 51 chr2 93870287 93870385 -87877702 - MLT1D LTR MaLR -337 168 64 6 1301 1009 223 76 23 chr2 93878894 93879213 -87868874 - MTD LTR MaLR 0 419 26 6 1301 614 291 214 45 chr2 93890207 93890581 -87857506 + MLT1J2 LTR MaLR 12 448 0 6 1301 1520 188 120 35 chr2 93897067 93897408 -87850679 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 6 1301 346 255 159 44 chr2 93900139 93900431 -87847656 + MLT1A1 LTR MaLR 5 408 0 6 1301 270 311 67 19 chr2 93901885 93901990 -87846097 + LTR89 LTR ERVL? 770 879 0 7 1301 359 304 86 33 chr2 93908896 93909182 -87838905 + LTR48 LTR ERV1 241 734 -53 7 1301 1624 191 152 29 chr2 93909266 93909707 -87838380 - RMER19C LTR ERVK -12 599 144 7 1301 1032 293 36 60 chr2 93910334 93910719 -87837368 - MTE2b LTR MaLR -3 376 1 7 1301 307 268 10 10 chr2 93913453 93913551 -87834536 + MER57C2 LTR ERV1 8 105 -329 7 1301 630 286 57 119 chr2 93913578 93913998 -87834089 + RMER10A LTR ERVL 24 417 -25 7 1301 469 304 112 26 chr2 93914045 93914278 -87833809 + MER57C2 LTR ERV1 154 429 -5 7 1301 924 146 224 7 chr2 93915590 93915871 -87832216 + ORR1C2 LTR MaLR 36 377 -7 7 1301 641 128 119 8 chr2 93926607 93926725 -87821362 + RLTR20C LTR ERVK 1 131 -403 7 1301 310 214 7 13 chr2 93926715 93926826 -87821261 + RLTR20C LTR ERVK 236 287 -281 7 1301 1781 167 82 25 chr2 93929920 93930276 -87817811 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 3 7 1301 514 243 182 11 chr2 93935031 93935218 -87812869 + RMER20B LTR ERVK 217 435 -192 7 1301 1704 188 90 34 chr2 93937360 93937773 -87810314 + RMER10A LTR ERVL 1 436 -6 7 1301 1449 119 151 0 chr2 93939960 93940211 -87807876 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 98 7 1301 587 286 274 7 chr2 93950349 93950645 -87797442 + MLT1H1 LTR MaLR 89 463 -92 7 1301 275 331 0 38 chr2 93953421 93953553 -87794534 + ERVL-E-int LTR ERVL 1146 1272 -4395 7 1301 545 195 263 20 chr2 93955676 93955828 -87792259 + MTEb LTR MaLR 6 194 -185 7 1301 438 286 20 54 chr2 93958573 93958776 -87789311 + RLTR15 LTR ERVK 33 228 -131 8 1301 616 279 125 19 chr2 93961006 93961375 -87786712 + MLT1A1 LTR MaLR 1 408 0 8 1301 428 307 69 92 chr2 93967966 93968314 -87779773 + MLT1A0 LTR MaLR 3 342 -23 8 1301 344 337 85 42 chr2 93971308 93971497 -87776590 + MLT1A0 LTR MaLR 399 595 0 8 1301 1594 310 178 25 chr2 93971858 93972748 -87775339 + MLT1A0-int LTR MaLR 270 1295 -114 8 1301 316 289 96 48 chr2 93972820 93972987 -87775100 + MLT1A0 LTR MaLR 1 175 -404 8 1301 330 280 8 98 chr2 93973810 93973951 -87774136 + MLT1A0 LTR MaLR 408 555 0 8 1301 4432 97 10 63 chr2 93975138 93975452 -87772635 + RMER17A LTR ERVK 1 290 -461 8 1301 4432 97 10 63 chr2 93976034 93976512 -87771575 + RMER17A LTR ERVK 291 750 -1 8 1301 1936 157 157 19 chr2 93977660 93978030 -87770057 - MTC LTR MaLR 0 421 1 8 1302 471 294 206 13 chr2 93979997 93980304 -87767783 + MLT1A LTR MaLR 1 366 -8 8 1302 1086 211 225 4 chr2 93990696 93990963 -87757124 - MTD LTR MaLR 0 419 94 8 1302 1047 218 237 9 chr2 93995397 93995739 -87752348 - MTC LTR MaLR 0 421 2 8 1302 1288 160 4 29 chr2 93999756 94000000 -87748087 + ORR1D1 LTR MaLR 3 240 -134 8 1302 790 169 15 0 chr2 94000000 94000136 -87747951 + ORR1C2 LTR MaLR 247 384 0 1 1302 814 346 77 22 chr2 94003106 94003522 -87744565 + LTR16A LTR ERVL 1 439 -12 1 1302 379 339 93 47 chr2 94003528 94003828 -87744259 + MLT1C LTR MaLR 1 314 -153 1 1302 303 223 103 31 chr2 94004730 94004827 -87743260 + MLT1C LTR MaLR 369 472 -33 1 1302 4719 171 62 13 chr2 94007761 94008621 -87739466 - RMER19B LTR ERVK 0 902 1 2 1302 259 258 16 32 chr2 94009006 94009130 -87738957 - ORR1A4-int LTR MaLR -755 754 633 3 1302 2077 106 16 3 chr2 94009833 94010157 -87737930 - ORR1A4 LTR MaLR -2 376 1 3 1302 267 280 13 0 chr2 94012050 94012125 -87735962 - MLT1G1 LTR MaLR -503 76 1 3 1302 243 268 27 151 chr2 94026976 94027060 -87721027 - MT2B LTR ERVL -451 150 90 6 1302 3177 56 5 2 chr2 94043729 94044124 -87703963 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 9 1302 2330 119 88 33 chr2 94100371 94100770 -87647317 - MTC LTR MaLR 0 421 1 1 1302 275 210 16 180 chr2 94102843 94102971 -87645116 + MT2B LTR ERVL 152 258 -343 1 1302 618 353 46 32 chr2 94108122 94108403 -87639684 + LTR33 LTR ERVL 14 298 -217 1 1303 299 331 74 57 chr2 94115647 94115823 -87632264 - MLT1I LTR MaLR 0 411 233 2 1303 289 267 86 14 chr2 94115869 94115974 -87632113 - MLT1I LTR MaLR -358 191 40 2 1303 229 318 0 29 chr2 94123121 94123189 -87624898 - LTR33B LTR ERVL -62 441 376 2 1303 586 253 42 101 chr2 94138233 94138446 -87609641 - MTE2b LTR MaLR -180 220 4 2 1303 247 301 103 83 chr2 94138551 94138696 -87609391 + MLT2B1 LTR ERVL 373 520 -47 2 1303 649 205 259 5 chr2 94145953 94146154 -87601933 + ORR1D2 LTR MaLR 119 370 0 2 1303 928 150 17 23 chr2 94147974 94148151 -87599936 + ORR1B2 LTR MaLR 1 176 -191 2 1303 467 236 125 5 chr2 94148732 94148924 -87599163 + LTR50 LTR ERVL 9 223 -572 2 1303 330 312 64 17 chr2 94149078 94149251 -87598836 + LTR33A LTR ERVL 336 516 -4 2 1303 365 167 64 0 chr2 94152467 94152545 -87595542 - LTR87 LTR ERVL? -112 512 430 2 1303 1059 234 69 0 chr2 94153218 94153449 -87594638 + MT2A LTR ERVL 4 250 -283 2 1303 529 281 68 45 chr2 94153727 94153947 -87594140 + MT2A LTR ERVL 309 533 0 2 1303 320 308 63 42 chr2 94158238 94158428 -87589659 - MLT1C LTR MaLR -3 464 271 3 1303 237 344 83 8 chr2 94158485 94158617 -87589470 - MLT1C LTR MaLR -316 189 48 3 1303 1432 153 236 3 chr2 94163727 94164062 -87584025 - MTD LTR MaLR 0 419 7 3 1303 1464 190 133 14 chr2 94174854 94175222 -87572865 + MTD LTR MaLR 8 419 0 3 1303 2244 82 12 12 chr2 94184446 94184779 -87563308 + MTA_Mm LTR MaLR 1 333 -63 3 1303 293 256 65 22 chr2 94191561 94191653 -87556434 - RMER10A LTR ERVL -29 413 318 3 1303 1800 223 37 15 chr2 94193719 94194129 -87553958 - MTC LTR MaLR 0 421 3 3 1303 1840 138 52 30 chr2 94205188 94205554 -87542533 + ORR1C2 LTR MaLR 1 374 -10 3 1303 1246 196 155 9 chr2 94212800 94213149 -87534938 + MTD LTR MaLR 1 400 -19 3 1303 1293 213 49 43 chr2 94214071 94214399 -87533688 + ORR1D1 LTR MaLR 45 374 0 3 1303 1050 231 167 12 chr2 94223501 94223843 -87524244 + MTD LTR MaLR 13 407 -12 4 1303 1336 192 164 0 chr2 94229713 94230025 -87518062 + MTD LTR MaLR 52 414 -5 4 1303 3513 32 0 128 chr2 94230974 94231474 -87516613 + RLTR10C LTR ERVK 1 436 0 4 1303 543 282 93 93 chr2 94235975 94236170 -87511917 + MLT1D LTR MaLR 2 188 -317 4 1303 543 282 93 93 chr2 94236213 94236497 -87511590 + MLT1D LTR MaLR 189 481 -24 4 1303 543 282 93 93 chr2 94236524 94236539 -87511548 + MLT1D LTR MaLR 482 496 -9 4 162 4079 78 2 5 chr2 94240527 94241106 -87506981 + MT2B2 LTR ERVL 1 577 -7 4 1304 1188 220 49 114 chr2 94243046 94243451 -87504636 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 4 1304 2041 145 146 40 chr2 94248340 94248743 -87499344 + RLTR41 LTR ERV1 1 446 0 4 1304 231 261 174 0 chr2 94249374 94249466 -87498621 - MLT1E LTR MaLR -8 672 565 4 1304 396 306 148 20 chr2 94249502 94249746 -87498341 - MLT1E LTR MaLR -269 384 110 4 1304 282 288 84 8 chr2 94250763 94250882 -87497205 - MLT1E LTR MaLR -279 129 2 4 1304 3200 53 15 0 chr2 94259788 94260182 -87487905 + MTB LTR MaLR 1 400 0 4 1304 771 257 74 25 chr2 94266541 94266784 -87481303 + MTE2a LTR MaLR 125 379 0 4 1304 283 255 63 11 chr2 94273301 94273396 -87474691 + RMER15 LTR ERVL 371 470 -105 4 1304 1779 103 129 9 chr2 94279375 94279762 -87468325 - RLTR44D LTR ERVK -11 441 2 4 1304 317 275 98 29 chr2 94280051 94280241 -87467846 - MLT2B4 LTR ERVL -134 280 80 4 1304 271 271 116 45 chr2 94280246 94280358 -87467729 + MLT1A1 LTR MaLR 1 120 -288 4 1304 1486 93 0 14 chr2 94282193 94282411 -87465676 + ORR1A2 LTR MaLR 132 346 0 5 1304 6782 193 86 45 chr2 94282411 94283071 -87465016 + ORR1A2-int LTR MaLR 1 618 -1345 5 1304 3962 43 19 0 chr2 94283071 94283537 -87464550 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 475 0 5 1304 6782 193 86 45 chr2 94283537 94284760 -87463327 + ORR1A2-int LTR MaLR 619 1961 -2 5 1304 1990 117 9 19 chr2 94284762 94285022 -87463065 + ORR1A2 LTR MaLR 1 263 -64 5 1304 4495 180 72 11 chr2 94285022 94285877 -87462210 + RMER13B LTR ERVK 1 908 0 5 1304 1990 117 9 19 chr2 94285877 94285938 -87462149 + ORR1A2 LTR MaLR 264 319 -8 5 1304 738 220 39 17 chr2 94288232 94288412 -87459675 + MTD LTR MaLR 2 185 -234 5 1304 288 371 11 28 chr2 94290005 94290185 -87457902 + MLT1H2 LTR MaLR 10 186 -303 5 1304 337 127 0 0 chr2 94290444 94290499 -87457588 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 272 5 1304 1359 96 9 19 chr2 94303169 94303381 -87444706 - ORR1A2 LTR MaLR -41 286 77 5 1304 613 148 59 0 chr2 94304199 94304334 -87443753 + ORR1D1 LTR MaLR 1 143 -231 5 1304 513 158 9 38 chr2 94304333 94304438 -87443649 + ORR1D1 LTR MaLR 283 384 0 5 1304 232 271 62 10 chr2 94305283 94305380 -87442707 - MER57E1 LTR ERV1 -220 152 51 5 1304 233 277 10 96 chr2 94306691 94306795 -87441292 + MLT1A1 LTR MaLR 35 129 -279 5 1304 283 242 0 0 chr2 94306984 94307050 -87441037 - MTEa LTR MaLR 0 379 314 5 1304 576 302 135 0 chr2 94307107 94307373 -87440714 + MTE2b LTR MaLR 72 373 -6 5 1304 484 255 144 86 chr2 94307377 94307634 -87440453 - MTEa LTR MaLR -87 292 21 5 1304 358 195 120 61 chr2 94312302 94312475 -87435612 - MLT1C LTR MaLR -185 205 27 5 1304 1026 236 115 62 chr2 94315680 94315826 -87432261 + ORR1E LTR MaLR 1 155 -204 5 1304 1969 172 74 0 chr2 94315826 94316193 -87431894 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 5 1304 6638 182 42 57 chr2 94316193 94317344 -87430743 + ORR1B1-int LTR MaLR 1 1122 -387 5 1304 6638 182 42 57 chr2 94317405 94317786 -87430301 + ORR1B1-int LTR MaLR 1123 1509 0 5 1304 1213 174 284 20 chr2 94317786 94318085 -87430002 + ORR1B1 LTR MaLR 1 378 0 5 1304 1026 236 115 62 chr2 94318085 94318275 -87429812 + ORR1E LTR MaLR 156 355 -4 5 1304 868 243 107 48 chr2 94323095 94323385 -87424702 + ORR1D2 LTR MaLR 64 370 0 5 1304 760 222 254 14 chr2 94323723 94324015 -87424072 + ORR1D2 LTR MaLR 7 368 -2 5 1304 334 256 101 17 chr2 94326356 94326475 -87421612 - ORR1E LTR MaLR -230 129 1 5 1304 568 344 102 68 chr2 94330832 94331244 -87416843 + MLT1H LTR MaLR 14 439 -110 5 1304 313 372 72 7 chr2 94332480 94332618 -87415469 - ORR1E LTR MaLR -210 149 3 5 1304 225 123 62 0 chr2 94333338 94333403 -87414684 - MT2A LTR ERVL 0 533 465 5 1304 1116 221 32 91 chr2 94333511 94333997 -87414090 - MT2A LTR ERVL -40 561 1 5 1304 244 286 0 77 chr2 94340350 94340441 -87407646 - MLT1H LTR MaLR -319 230 147 5 1304 2148 150 137 19 chr2 94343780 94344153 -87403934 - MTC LTR MaLR 0 421 5 6 1304 414 289 63 215 chr2 94344697 94344896 -87403191 + MTE2a LTR MaLR 1 152 -227 6 1304 414 289 63 215 chr2 94345029 94345225 -87402862 + MTE2a LTR MaLR 153 336 -43 6 1304 342 195 0 47 chr2 94345852 94345938 -87402149 + MTEb LTR MaLR 283 364 -15 6 1304 661 326 177 16 chr2 94352171 94352611 -87395476 - MLT1H LTR MaLR 0 549 39 6 1304 310 258 27 25 chr2 94368537 94368633 -87379454 - MLT1A0 LTR MaLR -19 346 265 6 1304 657 189 47 4 chr2 94368725 94368882 -87379205 - MTD LTR MaLR -14 405 203 6 1305 1035 251 148 47 chr2 94375545 94375992 -87372095 + LTR40a LTR ERVL 19 510 -9 6 1305 237 315 0 0 chr2 94377554 94377608 -87370479 + MLT1G LTR MaLR 226 279 -312 6 1305 2040 167 85 14 chr2 94380554 94380757 -87367330 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 167 6 1305 2040 167 85 14 chr2 94380861 94381010 -87367077 - ORR1C1 LTR MaLR -212 166 1 6 1305 496 178 22 0 chr2 94381821 94381911 -87366176 - MTE2b LTR MaLR -10 369 278 6 1305 262 160 139 128 chr2 94383408 94383494 -87364593 - MT2B LTR ERVL -296 305 219 6 1305 331 303 52 41 chr2 94389997 94390169 -87357918 - MLT1C LTR MaLR -291 176 3 6 1305 929 296 85 47 chr2 94392137 94392583 -87355504 - MLT1D LTR MaLR -18 487 25 6 1305 329 257 18 54 chr2 94393568 94393679 -87354408 - RMER5 LTR ERV1 -8 526 420 6 1305 540 278 257 16 chr2 94394173 94394434 -87353653 - RMER5 LTR ERV1 -178 356 33 6 1305 1272 254 65 3 chr2 94408100 94408439 -87339648 + ORR1D2 LTR MaLR 1 360 -10 7 1305 357 355 53 96 chr2 94410085 94410459 -87337628 + ORR1E LTR MaLR 1 358 -1 7 1305 440 151 0 0 chr2 94410612 94410685 -87337402 + ORR1B2 LTR MaLR 295 367 0 7 1305 300 242 128 69 chr2 94415915 94416017 -87332070 - MER54A LTR ERVL -10 891 784 7 1305 744 323 154 9 chr2 94417008 94417358 -87330729 - MER54A LTR ERVL -432 469 69 7 1305 622 276 123 67 chr2 94419774 94420132 -87327955 + MTEa LTR MaLR 2 379 0 7 1305 697 217 87 39 chr2 94424381 94424611 -87323476 - MTD LTR MaLR -7 412 172 7 1305 1479 208 110 16 chr2 94424819 94425200 -87322887 + MTD LTR MaLR 3 419 0 7 1305 809 285 56 42 chr2 94426569 94426946 -87321141 - MT2A LTR ERVL -151 382 1 7 1305 1127 247 156 27 chr2 94428334 94428705 -87319382 - MTD LTR MaLR 0 419 1 7 1305 381 247 116 7 chr2 94435746 94435893 -87312194 + RMER15 LTR ERVL 403 565 -10 7 1305 356 425 0 0 chr2 94435899 94436073 -87312014 + RMER15-int LTR ERVL 4 177 -4822 7 1305 1744 180 48 22 chr2 94436116 94436474 -87311613 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 7 1305 436 255 124 68 chr2 94436546 94436723 -87311364 + RMER15-int LTR ERVL 225 411 -4588 7 1305 2833 55 0 42 chr2 94443214 94443597 -87304490 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 7 1305 7405 29 2 7 chr2 94443597 94444454 -87303633 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 5629 7 1305 25678 31 25 9 chr2 94444439 94447458 -87300629 - IAPEz-int LTR ERVK -3405 3076 8 7 1305 2982 55 0 42 chr2 94447458 94447841 -87300246 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 7 1305 1780 315 55 46 chr2 94454234 94454980 -87293107 + RMER15-int LTR ERVL 801 1553 -3446 7 1305 544 328 50 43 chr2 94456312 94456570 -87291517 + RMER15-int LTR ERVL 2296 2555 -2444 7 1305 623 229 153 6 chr2 94457312 94457488 -87290599 + RMER15 LTR ERVL 372 573 -2 7 1305 2539 183 85 49 chr2 94461279 94461831 -87286256 + RMER20B LTR ERVK 1 572 -55 8 1305 484 316 104 57 chr2 94469219 94469259 -87278828 + RLTR17 LTR ERVK 115 145 -547 8 1305 484 316 104 57 chr2 94469381 94469639 -87278448 + RLTR17 LTR ERVK 146 427 -265 8 1305 4167 170 45 125 chr2 94470357 94471336 -87276751 + RMER19B LTR ERVK 1 901 -1 8 1305 917 324 55 14 chr2 94472142 94472487 -87275600 - ORR1E LTR MaLR 0 359 1 8 1305 271 298 107 0 chr2 94472487 94472558 -87275529 - MTE-int LTR MaLR -53 1527 1448 8 1305 840 326 95 42 chr2 94473138 94473538 -87274549 - MTE-int LTR MaLR -236 1344 924 8 1305 645 327 175 72 chr2 94479706 94480058 -87268029 - MTE-int LTR MaLR -759 821 476 8 1305 645 327 175 72 chr2 94480375 94480661 -87267426 - MTE-int LTR MaLR -1105 475 117 8 1305 253 344 30 30 chr2 94480658 94480757 -87267330 - LTR33C LTR ERVL -509 120 22 8 1305 272 297 78 19 chr2 94482859 94482962 -87265125 - LTR16C LTR ERVL -11 478 370 8 1305 305 352 93 57 chr2 94487359 94487606 -87260481 - MLT1H LTR MaLR -211 338 83 8 1305 363 324 9 44 chr2 94489494 94489607 -87258480 + MLT1J LTR MaLR 136 244 -268 8 1305 882 301 21 8 chr2 94489810 94490051 -87258036 + MTE2b LTR MaLR 134 377 -2 8 1305 308 289 40 0 chr2 94500717 94500793 -87247294 - ORR1E LTR MaLR -280 79 1 1 1305 1183 299 73 44 chr2 94500793 94501183 -87246904 - ORR1E-int LTR MaLR -53 1527 1126 1 1305 1202 262 78 52 chr2 94501183 94501630 -87246457 - RMER5 LTR ERV1 -1 533 75 2 1305 948 335 56 3 chr2 94501684 94501989 -87246098 - ORR1E-int LTR MaLR -457 1123 803 1 1306 504 210 21 32 chr2 94506479 94506666 -87241421 + RMER17C LTR ERVK 91 275 -135 8 1306 828 118 14 75 chr2 94507522 94507669 -87240418 - RMER17B LTR ERVK -820 138 1 1 1306 233 277 132 0 chr2 94509775 94509858 -87238229 + IAPLTR2a LTR ERVK 106 199 -212 1 1306 1281 260 104 26 chr2 94512107 94512490 -87235597 + MTD LTR MaLR 7 419 0 2 1306 536 371 22 22 chr2 94514290 94514516 -87233571 + MER70A LTR ERVL 243 468 -4 2 1306 249 358 95 0 chr2 94517745 94517882 -87230205 + MLT1A1 LTR MaLR 41 190 -218 2 1306 486 388 76 88 chr2 94518512 94519146 -87228941 + MamGypLTR3 LTR Gypsy 18 643 -196 3 1306 4148 176 72 15 chr2 94519505 94520260 -87227827 - RMER19B LTR ERVK -12 890 93 3 1306 1190 284 24 19 chr2 94520881 94521258 -87226829 - MTEa LTR MaLR 0 379 1 3 1306 5163 119 110 13 chr2 94522397 94523270 -87224817 - RMER17B LTR ERVK 0 958 1 3 1306 474 324 36 80 chr2 94524104 94524379 -87223708 - MLT2B4 LTR ERVL -291 265 3 4 1306 2567 90 121 16 chr2 94525477 94525907 -87222180 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 4 1306 281 326 63 49 chr2 94529676 94529818 -87218269 + MLT1J2 LTR MaLR 1 144 -304 4 1306 434 330 5 68 chr2 94530224 94530416 -87217671 + ORR1E LTR MaLR 18 197 -162 5 1306 895 217 55 5 chr2 94536926 94537060 -87211027 - RLTR14 LTR ERV1 -2 380 244 6 1306 895 154 237 12 chr2 94537092 94537287 -87210800 - RLTR14 LTR ERV1 -139 243 1 6 1306 478 298 53 142 chr2 94538834 94539213 -87208874 + MTEa LTR MaLR 27 371 -8 6 1306 620 262 32 32 chr2 94541401 94541618 -87206469 - RMER15 LTR ERVL -72 503 287 7 1306 304 332 127 71 chr2 94558852 94559105 -87188982 + LTR33 LTR ERVL 85 351 -164 8 1306 591 313 49 53 chr2 94559454 94559695 -87188392 + MER74B LTR ERVL 367 606 -16 8 1306 2181 244 60 12 chr2 94561320 94561823 -87186264 + RMER15-int LTR ERVL 1863 2389 -2610 9 1306 352 180 0 47 chr2 94561819 94561883 -87186204 + RMER15-int LTR ERVL 4033 4093 -906 9 1306 886 238 33 19 chr2 94561895 94562109 -87185978 + RMER15-int LTR ERVL 4147 4363 -636 9 1306 542 232 139 14 chr2 94562369 94562513 -87185574 + RMER15-int LTR ERVL 4812 4973 -26 9 1306 2042 194 113 5 chr2 94562513 94562938 -87185149 + RMER15 LTR ERVL 1 471 -104 9 1306 478 305 61 33 chr2 94566235 94566560 -87181527 + MTD LTR MaLR 50 419 0 9 1306 389 295 21 21 chr2 94584057 94584199 -87163888 - MLT1B LTR MaLR -218 172 31 1 1306 518 291 42 42 chr2 94584317 94584507 -87163580 - RLTR18 LTR ERVK -176 336 147 1 1306 694 335 22 60 chr2 94584490 94584808 -87163279 - RLTR18 LTR ERVK -310 306 1 1 1306 461 304 31 105 chr2 94584832 94585089 -87162998 - ORR1E LTR MaLR -20 339 102 1 1306 4540 189 63 45 chr2 94586126 94587014 -87161073 + RMER13B LTR ERVK 5 908 0 1 1306 384 321 27 48 chr2 94590249 94590396 -87157691 + MLT1L LTR MaLR 260 403 -207 1 1306 2384 236 77 46 chr2 94594622 94594801 -87153286 - RLTR40 LTR ERVK -38 779 571 1 1306 2384 236 77 46 chr2 94594845 94595421 -87152666 - RLTR40 LTR ERVK -247 570 2 1 1306 1252 273 23 35 chr2 94596174 94596568 -87151519 - MTE2a LTR MaLR 0 419 19 1 1306 482 276 83 117 chr2 94603667 94603897 -87144190 - MLT1B LTR MaLR -12 378 157 1 1306 1779 167 161 38 chr2 94606965 94607310 -87140777 - MTD LTR MaLR 0 419 20 1 1306 1779 167 161 38 chr2 94607403 94607430 -87140657 - MTD LTR MaLR -400 19 1 1 1306 1191 214 45 101 chr2 94613899 94614274 -87133813 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 21 1 1306 2215 210 7 103 chr2 94615013 94615603 -87132484 - MT2A LTR ERVL 0 533 1 1 1306 449 261 121 50 chr2 94620057 94620255 -87127832 + MLT1D LTR MaLR 20 231 -274 1 1306 235 290 124 39 chr2 94626249 94626378 -87121709 + MLT1K LTR MaLR 426 565 -30 1 1306 692 313 96 30 chr2 94627695 94628028 -87120059 + MT2A LTR ERVL 105 459 -74 1 1307 2876 144 50 29 chr2 94636092 94636608 -87111479 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 527 0 2 1307 527 304 82 82 chr2 94639268 94639680 -87108407 - MLT1J-int LTR MaLR -633 754 343 2 1307 763 187 26 7 chr2 94639893 94640044 -87108043 + MTE2b LTR MaLR 3 156 -223 2 1307 2979 61 200 9 chr2 94641220 94641650 -87106437 + RLTR1B LTR ERV1 1 512 0 2 1307 68310 18 1 0 chr2 94641650 94649204 -87098883 + MMERGLN-int LTR ERV1 1 7556 0 2 1307 2979 61 200 9 chr2 94649204 94649634 -87098453 + RLTR1B LTR ERV1 1 512 0 2 1307 269 345 35 0 chr2 94650208 94650324 -87097763 - MLT1B LTR MaLR -59 331 212 2 1307 5954 127 16 26 chr2 94650467 94651435 -87096652 + RMER17B LTR ERVK 1 958 0 2 1307 226 301 74 21 chr2 94651583 94651678 -87096409 - MLT1B LTR MaLR -274 100 1 2 1307 1652 215 21 49 chr2 94652532 94652963 -87095124 + RLTR11A LTR ERVK 26 444 -84 2 1307 365 298 219 31 chr2 94653949 94654243 -87093844 - MLT1G LTR MaLR -73 522 191 2 1307 410 324 9 56 chr2 94656080 94656296 -87091791 - LTR16B LTR ERVL -2 461 256 2 1307 1236 246 84 49 chr2 94656631 94657083 -87091004 - RMER13A LTR ERVK -392 468 1 2 1307 1944 92 6 62 chr2 94663825 94664148 -87083939 + ORR1A2 LTR MaLR 23 327 0 2 1307 3293 121 3 45 chr2 94664148 94664745 -87083342 + ORR1A2-int LTR MaLR 1 572 -1391 2 1307 611 164 7 111 chr2 94664729 94664845 -87083242 + MT2B LTR ERVL 159 259 -342 2 1307 586 309 113 23 chr2 94670069 94670371 -87077716 + MTE2a LTR MaLR 20 348 -31 2 1307 1465 218 75 14 chr2 94683720 94684065 -87064022 + ORR1D1 LTR MaLR 6 371 -3 2 1307 1494 257 95 40 chr2 94685141 94685319 -87062768 + RLTR20B3 LTR ERVK 1 188 -389 2 1307 3329 23 21 3 chr2 94685319 94685708 -87062379 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 1307 1494 257 95 40 chr2 94685708 94686023 -87062064 + RLTR20B3 LTR ERVK 189 520 -57 2 1307 1563 219 16 25 chr2 94695740 94695778 -87052309 + MTC LTR MaLR 111 147 -274 2 1307 1067 220 168 12 chr2 94695778 94696100 -87051987 + ORR1D1 LTR MaLR 1 372 -2 2 1307 1563 219 16 25 chr2 94696100 94696375 -87051712 + MTC LTR MaLR 148 421 0 2 1307 2068 191 27 81 chr2 94696688 94697132 -87050955 + MTC LTR MaLR 1 420 -1 2 1307 1170 254 131 6 chr2 94697516 94697837 -87050250 + ORR1D2 LTR MaLR 3 363 -7 2 1307 416 130 195 0 chr2 94699974 94700051 -87048036 + MTC LTR MaLR 1 92 -329 2 1307 1205 250 31 9 chr2 94700252 94700581 -87047506 - RMER12 LTR ERVK -1516 332 1 3 1307 2912 78 32 0 chr2 94701844 94702252 -87045835 - BGLII LTR ERVK 0 421 1 3 1307 255 315 138 33 chr2 94703992 94704235 -87043852 + MLT1G3 LTR MaLR 264 587 -8 3 1307 282 389 79 19 chr2 94712042 94712257 -87035830 - LTR81B LTR ERV1? -720 673 446 3 1307 303 353 133 26 chr2 94712076 94712271 -87035816 - MamGypLTR2 LTR Gypsy -773 416 201 3 1307 1906 233 65 28 chr2 94716657 94717172 -87030915 + RLTR11A2 LTR ERVK 6 556 -4 3 1307 589 274 122 39 chr2 94718119 94718324 -87029763 - MLT1A0 LTR MaLR -2 363 142 3 1307 291 307 97 19 chr2 94720070 94720173 -87027914 - MLT1A0 LTR MaLR -252 113 3 3 1307 473 324 149 19 chr2 94733008 94733317 -87014770 - MLT1L LTR MaLR -23 587 239 3 1307 421 265 50 20 chr2 94746000 94746100 -87001987 - RMER12 LTR ERVK 0 1322 1220 3 1307 313 175 65 140 chr2 94746306 94746399 -87001688 - RMER12 LTR ERVK -234 1088 1003 3 1307 2939 151 60 21 chr2 94749369 94749987 -86998100 - RMER12 LTR ERVK -217 1187 126 3 1307 657 312 72 49 chr2 94756970 94757333 -86990754 + MLT2D LTR ERVL 1 378 -36 3 1307 657 312 72 49 chr2 94757397 94757438 -86990649 + MLT2D LTR ERVL 379 414 0 3 1307 775 297 43 106 chr2 94757471 94757867 -86990220 + MTE2a LTR MaLR 9 379 0 3 1307 1391 184 92 50 chr2 94762195 94762498 -86985589 + MTC LTR MaLR 104 419 -2 3 1308 267 329 79 25 chr2 94770621 94770794 -86977293 + MLT1H LTR MaLR 9 232 -347 4 1308 292 297 50 75 chr2 94770831 94770991 -86977096 + MLT1H LTR MaLR 375 530 -19 4 1308 954 237 28 32 chr2 94773307 94773637 -86974450 - RMER15 LTR ERVL -154 421 33 4 1308 429 294 95 14 chr2 94776650 94776798 -86971289 - MTEb LTR MaLR -215 164 5 4 1308 419 330 46 76 chr2 94780450 94780860 -86967227 + ERVL-B4-int LTR ERVL 2037 2434 -3280 4 1308 391 297 19 71 chr2 94787592 94787802 -86960285 + MamGypLTR2b LTR Gypsy 711 909 -13 4 1308 1905 182 79 8 chr2 94788713 94789079 -86959008 + ORR1B1 LTR MaLR 1 392 -2 4 1308 3108 266 141 35 chr2 94789084 94790301 -86957786 + ORR1B1-int LTR MaLR 25 1370 0 4 1308 2047 143 80 27 chr2 94790301 94790675 -86957412 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 4 1308 337 140 0 0 chr2 94791707 94791757 -86956330 + ORR1B2 LTR MaLR 318 367 0 4 1308 1341 190 12 12 chr2 94794015 94794255 -86953832 - RMER12 LTR ERVK -1082 240 1 4 1308 568 288 43 5 chr2 94801453 94801638 -86946449 + RMER15 LTR ERVL 380 571 -4 4 1308 269 244 57 86 chr2 94804214 94804389 -86943698 + RLTR21 LTR ERVK 1085 1254 -318 4 1308 491 276 47 16 chr2 94808494 94808623 -86939464 - ETnERV2-int LTR ERVK -204 7202 7070 4 1308 391 170 374 9 chr2 94813311 94813371 -86934716 - RLTR20A2 LTR ERVK 0 578 511 4 1308 391 170 374 9 chr2 94813420 94813466 -86934621 - RLTR20A2 LTR ERVK -68 510 435 4 1308 2644 142 48 7 chr2 94814690 94815123 -86932964 - RLTR20A2 LTR ERVK -126 452 2 4 1308 327 309 91 23 chr2 94815683 94815922 -86932165 - MTEb LTR MaLR -23 356 77 4 1308 2291 267 58 5 chr2 94821489 94822159 -86925928 + MER67C LTR ERV1 1 706 -5 4 1308 303 333 69 8 chr2 94824364 94824494 -86923593 - LTR16B LTR ERVL -230 233 96 4 1308 1242 215 57 54 chr2 94831069 94831384 -86916703 + ORR1C1 LTR MaLR 1 316 -62 5 1308 372 337 145 24 chr2 94833091 94833298 -86914789 - MLT1G3 LTR MaLR -182 413 182 5 1308 841 323 88 50 chr2 94863672 94864128 -86883959 - MLT1D LTR MaLR 0 505 33 5 1308 781 228 81 11 chr2 94868304 94868490 -86879597 - ORR1D2 LTR MaLR -2 368 170 5 1308 527 324 44 11 chr2 94868961 94869142 -86878945 - ORR1D2 LTR MaLR -183 187 1 5 1308 1057 326 75 3 chr2 94870165 94870500 -86877587 - MTEb LTR MaLR -20 359 1 5 1308 2242 150 46 25 chr2 94871443 94871875 -86876212 + RLTR11B LTR ERVK 3 443 -10 5 1308 232 208 57 0 chr2 94873291 94873344 -86874743 + RLTR42 LTR ERVK 1 56 -183 5 1308 297 279 42 67 chr2 94873464 94873583 -86874504 + RLTR42 LTR ERVK 124 239 0 5 1308 253 307 68 26 chr2 94874207 94874324 -86873763 + RMER12 LTR ERVK 730 851 -471 5 1308 227 336 123 62 chr2 94882185 94882315 -86865772 - RMER12 LTR ERVK -472 850 713 5 1308 1032 186 261 15 chr2 94885638 94885906 -86862181 - ORR1C1 LTR MaLR -44 334 1 5 1308 935 243 257 6 chr2 94890263 94890586 -86857501 - MTD LTR MaLR -14 405 2 5 163 6224 71 11 0 chr2 94896017 94896816 -86851271 + RLTR13C2 LTR ERVK 1 808 0 5 1309 1089 251 77 74 chr2 94897308 94897725 -86850362 - MTD LTR MaLR -1 418 1 5 1309 275 380 33 0 chr2 94898768 94898889 -86849198 + LTR16A1 LTR ERVL 332 456 0 5 1309 304 416 40 0 chr2 94899368 94899642 -86848445 + ERVL-E-int LTR ERVL 2981 3265 -2402 5 1309 244 311 51 94 chr2 94904789 94904906 -86843181 + MT2B2 LTR ERVL 175 286 -298 6 1309 2907 6 5 121 chr2 94904924 94905339 -86842748 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 6 1309 27321 18 10 1 chr2 94905339 94908585 -86839502 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 3210 6 1309 5832 103 119 91 chr2 94908584 94909855 -86838232 - IAPEz-int LTR ERVK -5168 1313 8 6 1309 2896 8 5 121 chr2 94909855 94910270 -86837817 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 6 1309 273 345 56 68 chr2 94914012 94914261 -86833826 - LTR81B LTR ERV1? -1116 277 32 6 1309 2591 178 17 57 chr2 94914619 94915150 -86832937 - RLTR28 LTR ERVL -14 510 1 6 1309 260 197 43 43 chr2 94921157 94921226 -86826861 + RMER15 LTR ERVL 1 69 -506 6 1309 1587 223 40 25 chr2 94921362 94921716 -86826371 + RMER15 LTR ERVL 71 429 -146 6 1309 428 332 137 25 chr2 94938330 94938534 -86809553 - MLT1D LTR MaLR -8 497 271 6 1309 1521 226 30 58 chr2 94939164 94939597 -86808490 - MTC LTR MaLR 0 421 1 6 1309 225 385 29 46 chr2 94941950 94942124 -86805963 - LTR84b LTR ERVL -354 407 237 6 1309 1489 262 59 13 chr2 94950060 94950454 -86797633 - MTD LTR MaLR -14 405 2 6 1309 298 297 85 50 chr2 94950991 94951179 -86796908 + ORR1D2 LTR MaLR 1 200 -159 6 1309 419 315 377 16 chr2 94951323 94951584 -86796503 + MTE-int LTR MaLR 3 357 -1223 6 1309 454 281 84 132 chr2 94951798 94952085 -86796002 + ORR1E LTR MaLR 5 277 -82 6 1309 405 231 35 0 chr2 94953698 94953813 -86794274 + MLT1A1 LTR MaLR 256 406 -2 6 1309 243 325 75 0 chr2 94953910 94953990 -86794097 - MLT2F LTR ERVL -128 535 450 6 1309 1326 269 43 6 chr2 94954336 94954661 -86793426 - ORR1E LTR MaLR -22 337 1 6 1309 695 326 111 36 chr2 94955506 94956002 -86792085 + MT2A LTR ERVL 1 533 0 6 1309 1156 251 84 0 chr2 94956522 94956945 -86791142 - MT2A LTR ERVL -74 459 1 6 1309 760 291 54 78 chr2 94957923 94958255 -86789832 - ORR1E LTR MaLR 0 359 36 6 1309 1019 283 74 61 chr2 94958240 94958566 -86789521 - ORR1E-int LTR MaLR -68 1512 1200 6 1309 682 254 103 19 chr2 94958607 94958820 -86789267 + RMER5 LTR ERV1 33 263 -271 6 1309 465 246 21 56 chr2 94959303 94959340 -86788747 - ORR1E-int LTR MaLR -1443 137 108 6 1309 1548 238 46 29 chr2 94959340 94959752 -86788335 - MTC LTR MaLR -2 419 1 6 1309 465 246 21 56 chr2 94959752 94959856 -86788231 - ORR1E-int LTR MaLR -1473 107 1 6 1309 539 344 61 73 chr2 94959858 94960187 -86787900 - ORR1E LTR MaLR 0 359 35 6 1309 1289 215 100 0 chr2 94968006 94968346 -86779741 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 6 1309 1278 254 90 0 chr2 94972514 94972857 -86775230 - MT2A LTR ERVL 0 533 160 7 1309 757 239 37 0 chr2 94973454 94973617 -86774470 - MT2A LTR ERVL -361 172 4 7 1309 272 130 0 0 chr2 94977378 94977424 -86770663 - ORR1C1 LTR MaLR -63 315 270 7 1309 1742 210 13 32 chr2 94977894 94978268 -86769819 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 7 1309 2309 84 123 3 chr2 95001130 95001487 -86746600 + MTB LTR MaLR 1 400 0 4 1309 273 156 0 0 chr2 95002360 95002405 -86745682 + RMER6C LTR ERVK 110 154 -602 6 1309 2592 201 16 49 chr2 95002389 95002654 -86745433 + RMER6C LTR ERVK 96 358 -332 6 1309 2592 176 19 70 chr2 95002702 95003161 -86744926 + RMER6C LTR ERVK 347 689 -67 6 1309 517 133 3 5 chr2 95003148 95003236 -86744851 + RMER6C LTR ERVK 566 670 -20 6 1309 819 159 0 7 chr2 95003237 95003383 -86744704 + RMER6-int LTR ERVK 8 152 -3025 6 1309 2422 89 6 21 chr2 95005262 95005594 -86742493 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 8 1309 4366 177 38 77 chr2 95012976 95013440 -86734647 - RMER19B LTR ERVK 0 902 436 1 1309 3162 54 23 0 chr2 95013440 95013831 -86734256 + MTB LTR MaLR 1 400 0 1 1309 4366 177 38 77 chr2 95013831 95014290 -86733797 - RMER19B LTR ERVK -467 435 15 1 1309 638 306 87 18 chr2 95017322 95017608 -86730479 + MLT1E1A LTR MaLR 5 310 -370 2 1309 1105 166 94 10 chr2 95024174 95024375 -86723712 - ORR1A3 LTR MaLR -57 269 52 3 1309 2983 75 19 2 chr2 95024516 95024928 -86723159 - BGLII LTR ERVK -2 419 1 3 1309 642 193 105 0 chr2 95024928 95025156 -86722931 - MYSERV16_I-int LTR ERVK 0 2326 2075 3 163 2321 197 48 48 chr2 95026699 95027370 -86720717 - RMER3D-int LTR ERVK -246 2596 1926 3 1310 2355 182 98 47 chr2 95027390 95027647 -86720440 - RMER3D-int LTR ERVK -1163 1679 1439 3 1310 2355 174 92 40 chr2 95027744 95028138 -86719949 - RMER3D-int LTR ERVK -1404 1438 1015 3 1310 332 125 0 111 chr2 95028630 95028658 -86719429 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -5148 2096 2073 3 1310 558 100 39 20 chr2 95028818 95028910 -86719177 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -2259 583 489 3 1310 638 186 0 47 chr2 95029043 95029235 -86718852 - RMER3D-int LTR ERVK -1991 851 669 4 1310 1281 72 6 0 chr2 95029282 95029448 -86718639 - BGLII LTR ERVK 0 421 255 4 1310 443 309 24 0 chr2 95030933 95031059 -86717028 + MTE2b LTR MaLR 13 141 -238 4 1310 359 351 45 60 chr2 95039952 95040152 -86707935 + LTR33 LTR ERVL 319 515 0 5 1310 946 286 16 0 chr2 95046260 95046512 -86701575 - MTEa LTR MaLR -123 256 1 6 1310 1116 266 29 128 chr2 95053962 95054376 -86693711 + MTE2a LTR MaLR 1 373 -6 7 1310 552 209 248 43 chr2 95069509 95069808 -86678279 - MTD LTR MaLR -20 399 20 9 1310 3479 18 5 0 chr2 95102832 95103226 -86644861 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1310 9141 33 4 1 chr2 95103226 95104321 -86643766 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 1 1310 3479 18 5 0 chr2 95104321 95104715 -86643372 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1310 287 164 49 0 chr2 95104897 95104958 -86643129 + ORR1A3 LTR MaLR 31 94 -232 1 1310 348 304 30 16 chr2 95105087 95105235 -86642852 - MTEb LTR MaLR 0 379 223 1 1310 597 348 89 54 chr2 95111705 95111985 -86636102 - MTEb LTR MaLR -87 292 3 1 1310 248 370 61 20 chr2 95155998 95156194 -86591893 - MLT1K LTR MaLR -26 569 366 1 1310 572 296 33 21 chr2 95157063 95157289 -86590798 + RLTR16 LTR ERVK 31 283 -285 1 1311 3220 166 59 4 chr2 95163353 95163914 -86584173 - RLTR17 LTR ERVK -3 689 98 1 1311 1728 217 8 6 chr2 95182623 95182975 -86565112 - RLTR16 LTR ERVK 0 505 153 1 1311 806 168 42 0 chr2 95183080 95183223 -86564864 - RLTR16 LTR ERVK -356 149 1 1 1311 2020 130 12 64 chr2 95189675 95190019 -86558068 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 2 1311 3245 61 0 0 chr2 95191021 95191417 -86556670 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 1311 9049 44 0 0 chr2 95191417 95192515 -86555572 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 2 1311 3110 55 34 0 chr2 95192515 95192898 -86555189 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 1311 593 289 28 88 chr2 95194886 95195102 -86552985 + ORR1E LTR MaLR 5 207 -152 2 1311 725 304 58 68 chr2 95195430 95195811 -86552276 + MTE2a LTR MaLR 3 379 0 2 1311 648 334 43 81 chr2 95196758 95197152 -86550935 + MTEa LTR MaLR 1 379 0 2 1311 4260 157 94 32 chr2 95198071 95198971 -86549116 + RMER17B LTR ERVK 2 957 -1 2 1311 2058 175 137 121 chr2 95199386 95199967 -86548120 + RMER6C LTR ERVK 3 612 -78 2 1311 2058 175 137 121 chr2 95200409 95200487 -86547600 + RMER6C LTR ERVK 613 674 -16 2 1311 2058 175 137 121 chr2 95200634 95200650 -86547437 + RMER6C LTR ERVK 675 690 0 2 1311 1084 222 28 60 chr2 95203967 95203991 -86544096 - RMER19C LTR ERVK 0 611 594 2 1311 1084 222 28 60 chr2 95204646 95204904 -86543183 - RMER19C LTR ERVK -18 593 338 2 1311 1115 96 42 6 chr2 95204905 95205073 -86543014 + MYSERV6-int LTR ERVK 7595 7768 -1191 2 1311 2353 147 20 102 chr2 95205073 95205573 -86542514 + RMER6B LTR ERVK 1 459 -2 2 1311 775 283 96 28 chr2 95205705 95205956 -86542131 + MTE2b LTR MaLR 102 369 -10 2 1311 355 299 49 121 chr2 95206760 95206984 -86541103 + MTEa LTR MaLR 158 365 -14 2 1311 400 200 25 0 chr2 95210749 95210829 -86537258 + MER89 LTR ERV1 428 509 -50 2 1311 915 258 73 113 chr2 95212927 95213368 -86534719 + RLTR23 LTR ERV1 8 430 0 2 1311 231 374 33 60 chr2 95214902 95215084 -86533003 + MLT1H1 LTR MaLR 2 178 -377 2 1311 708 265 54 53 chr2 95217460 95217688 -86530399 + MTE2a-int LTR MaLR 1364 1729 -63 2 1311 417 212 50 0 chr2 95217690 95217770 -86530317 + MTE2a LTR MaLR 1 84 -295 2 1311 307 304 46 43 chr2 95217787 95217990 -86530097 + MTD LTR MaLR 1 225 -196 2 1311 621 259 89 45 chr2 95218281 95218483 -86529604 + MTD LTR MaLR 209 419 0 2 1311 622 291 59 52 chr2 95218483 95218763 -86529324 + MTEa LTR MaLR 98 379 0 2 1311 588 333 123 8 chr2 95218787 95219023 -86529064 - MLT1D LTR MaLR -35 470 208 2 1311 1476 184 129 55 chr2 95231464 95231799 -86516288 + RMER6-int LTR ERVK 1 376 -2801 2 1311 6385 151 108 17 chr2 95232057 95233322 -86514765 + RMER6-int LTR ERVK 377 1742 -1435 2 1311 2988 139 45 48 chr2 95233428 95234026 -86514061 + RMER6-int LTR ERVK 2579 3174 -3 2 1311 1090 198 389 20 chr2 95234028 95234532 -86513555 + RMER6C LTR ERVK 1 690 0 2 1311 621 157 43 0 chr2 95235124 95235239 -86512848 + RMER19B LTR ERVK 1 120 -782 2 1311 1029 289 41 102 chr2 95238281 95238724 -86509363 - MTD LTR MaLR 0 419 4 2 1311 462 330 51 51 chr2 95251397 95251633 -86496454 - MLT1H LTR MaLR -305 244 9 3 1311 624 269 123 75 chr2 95264184 95264582 -86483505 - RMER10A LTR ERVL -25 417 1 3 1311 3106 14 0 3 chr2 95265186 95265533 -86482554 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 3 1311 1406 255 52 18 chr2 95266457 95266850 -86481237 + MTD LTR MaLR 8 401 -18 3 1311 724 281 64 30 chr2 95280111 95280346 -86467741 + MLT1B LTR MaLR 143 385 -5 3 1312 988 144 6 11 chr2 95292603 95292778 -86455309 + LTRIS3 LTR ERV1 339 512 0 3 1312 2226 107 3 58 chr2 95298971 95299317 -86448770 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 3 1312 309 286 102 28 chr2 95304296 95304401 -86443686 - MLT1C LTR MaLR -15 452 266 3 1312 296 313 82 116 chr2 95304461 95304709 -86443378 - MLT1C LTR MaLR -125 265 34 3 1312 2410 176 142 2 chr2 95308486 95308999 -86439088 + RMER4B LTR ERVK 1 585 0 3 1312 3269 38 8 5 chr2 95309239 95309633 -86438454 + MTA_Mm LTR MaLR 1 395 -1 3 1312 425 311 71 35 chr2 95314382 95314579 -86433508 + RMER15 LTR ERVL 355 558 -17 4 1312 303 239 0 15 chr2 95318001 95318069 -86430018 + MLT1J1 LTR MaLR 74 140 -304 4 1312 548 349 37 32 chr2 95318563 95318809 -86429278 - MLT2C1 LTR ERVL -124 273 27 4 1312 490 383 29 18 chr2 95321941 95322215 -86425872 + MTE-int LTR MaLR 2 278 -1302 4 1312 1205 221 90 133 chr2 95323505 95323578 -86424509 - RLTR11A LTR ERVK -3 525 457 4 1312 1205 221 90 133 chr2 95323624 95323979 -86424108 - RLTR11A LTR ERVK -72 456 148 4 1312 1205 221 90 133 chr2 95324193 95324305 -86423782 - RLTR11A LTR ERVK -381 147 9 4 1312 1068 98 26 20 chr2 95325275 95325555 -86422532 + RMER17D2 LTR ERVK 1 136 -673 4 1312 296 347 53 64 chr2 95327036 95327224 -86420863 + MTE-int LTR MaLR 348 533 -1047 4 1312 1447 289 129 47 chr2 95327910 95328568 -86419519 + MTE-int LTR MaLR 867 1578 -2 4 1312 1898 161 60 135 chr2 95329420 95329873 -86418214 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 12 4 1312 499 248 429 5 chr2 95331763 95331959 -86416128 - RMER20A LTR ERVK 0 627 349 4 1312 1029 244 129 10 chr2 95334550 95334852 -86413235 - RMER20A LTR ERVK -164 352 15 4 1312 1901 176 54 130 chr2 95334923 95335406 -86412681 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 1 4 1312 248 317 12 12 chr2 95336307 95336390 -86411697 - LTR33 LTR ERVL -16 499 417 4 1312 256 308 80 75 chr2 95339378 95339578 -86408509 - MLT1A0 LTR MaLR -35 330 130 4 1312 759 250 99 27 chr2 95359015 95359278 -86388809 + RMER20B LTR ERVK 129 410 -217 4 1312 296 344 16 16 chr2 95371495 95371619 -86376468 - RMER12 LTR ERVK -466 856 733 4 1312 651 357 68 36 chr2 95375632 95376016 -86372071 - LTR80B LTR ERVL -7 577 182 4 1312 3394 23 5 0 chr2 95376657 95377051 -86371036 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 1312 9169 30 4 1 chr2 95377051 95378146 -86369941 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 4 1312 3394 23 5 0 chr2 95378146 95378540 -86369547 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 1312 2004 154 27 3 chr2 95378987 95379325 -86368762 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 4 1312 1926 116 12 75 chr2 95385771 95386116 -86361971 + ORR1A2 LTR MaLR 5 327 0 5 1312 592 116 44 9 chr2 95410085 95410198 -86337889 - ORR1A1-int LTR MaLR -285 1507 1391 5 1312 2391 175 136 16 chr2 95414424 95414923 -86333164 - RLTR12A LTR ERVK -5 563 5 5 1312 254 170 0 36 chr2 95414955 95415010 -86333077 - MTC LTR MaLR -39 382 330 5 1312 308 352 130 15 chr2 95416625 95416870 -86331217 - MLT1G3 LTR MaLR -75 516 241 5 1312 382 316 47 44 chr2 95418157 95418368 -86329719 - MLT1G3 LTR MaLR -53 526 302 5 1312 383 291 39 93 chr2 95419516 95419610 -86328477 + MLT2B4 LTR ERVL 24 109 -447 5 1312 383 291 39 93 chr2 95419698 95419785 -86328302 + MLT2B4 LTR ERVL 110 195 -361 5 1313 2258 182 32 106 chr2 95420468 95421027 -86327060 + RLTR11A LTR ERVK 11 528 0 5 1313 242 315 25 67 chr2 95426538 95426657 -86321430 - MTD LTR MaLR -245 174 61 5 1313 997 273 112 12 chr2 95426587 95426910 -86321177 + MTD LTR MaLR 57 411 -8 5 1313 448 353 62 8 chr2 95428630 95428873 -86319214 + MLT1A0 LTR MaLR 36 291 -74 5 1313 254 250 26 123 chr2 95432743 95432857 -86315230 - MT2B LTR ERVL -323 278 176 5 1313 1856 103 70 110 chr2 95434393 95434820 -86313267 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 5 1313 525 307 125 56 chr2 95435314 95435618 -86312469 + MLT1A0 LTR MaLR 5 329 -36 5 1313 739 167 48 34 chr2 95437749 95437949 -86310138 - RMER6B LTR ERVK -599 157 1 5 1313 957 273 74 53 chr2 95439728 95439936 -86308151 + RMER10A LTR ERVL 1 214 -228 5 1313 957 273 74 53 chr2 95439994 95440218 -86307869 + RMER10A LTR ERVL 215 442 0 5 1313 237 301 41 100 chr2 95442190 95442360 -86305727 - RMER4A LTR ERVK -253 213 54 5 1313 252 331 54 136 chr2 95447600 95447647 -86300440 - ORR1E LTR MaLR -36 323 277 5 1313 252 331 54 136 chr2 95447821 95448053 -86300034 - ORR1E LTR MaLR -83 276 67 5 1313 415 316 0 34 chr2 95456065 95456183 -86291904 + ORR1E LTR MaLR 1 114 -245 6 1313 1611 264 44 56 chr2 95460212 95460733 -86287354 + ORR1E-int LTR MaLR 22 536 -834 6 1313 461 215 15 265 chr2 95460730 95460904 -86287183 + ORR1E-int LTR MaLR 1297 1426 -154 6 1313 461 234 0 43 chr2 95461051 95461148 -86286939 + ORR1E-int LTR MaLR 1427 1519 -61 6 1313 850 278 96 67 chr2 95461152 95461495 -86286592 + ORR1E LTR MaLR 5 357 -2 6 1313 540 302 107 54 chr2 95462262 95462672 -86285415 + LTR37B LTR ERV1 12 443 -25 6 1313 1649 220 193 7 chr2 95462959 95463416 -86284671 - RMER20B LTR ERVK -85 542 1 6 1313 1734 158 17 75 chr2 95463950 95464299 -86283788 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 6 1313 225 308 55 18 chr2 95467925 95468034 -86280053 + MLT1D LTR MaLR 20 132 -373 6 1313 849 316 39 39 chr2 95471956 95472292 -86275795 + MTEa LTR MaLR 5 340 -39 6 1313 685 257 38 25 chr2 95479390 95479625 -86268462 - RLTR16 LTR ERVK -24 510 298 6 1313 1004 293 36 25 chr2 95480555 95480915 -86267172 - RLTR16 LTR ERVK -142 409 6 6 1313 1705 179 41 84 chr2 95482922 95483336 -86264751 + RLTR41 LTR ERV1 51 446 0 6 1313 1215 236 21 0 chr2 95483455 95483696 -86264391 + ORR1B1 LTR MaLR 141 386 -8 6 1313 4720 168 51 31 chr2 95483711 95484728 -86263359 - RLTR25A LTR ERVK 0 1028 1 6 1313 1495 182 60 179 chr2 95485049 95485108 -86262979 + RLTR23 LTR ERV1 7 68 -362 6 1313 1495 182 60 179 chr2 95485333 95485754 -86262333 + RLTR23 LTR ERV1 69 430 0 6 1313 239 183 46 77 chr2 95492815 95492880 -86255207 - RMER20A LTR ERVK -268 248 186 6 1313 392 369 90 4 chr2 95501537 95501782 -86246305 + MLT1B LTR MaLR 123 388 -2 6 1313 434 336 146 27 chr2 95504703 95504997 -86243090 + RMER15 LTR ERVL 244 572 -3 1 1313 264 281 148 119 chr2 95505680 95505890 -86242197 - RMER2 LTR ERV1 -64 503 288 1 1313 448 228 0 47 chr2 95505947 95506053 -86242034 - RMER2 LTR ERV1 -466 101 1 1 1313 245 191 0 0 chr2 95508483 95508530 -86239557 - LTR85a LTR Gypsy? -614 88 42 1 1313 3214 43 10 2 chr2 95510404 95510820 -86237267 - RLTR13B3 LTR ERVK 0 929 511 2 1313 1767 237 51 40 chr2 95514215 95514604 -86233483 + RLTR20A LTR ERVK 72 448 -93 2 1313 1767 231 52 39 chr2 95514653 95514748 -86233339 + RLTR20A LTR ERVK 449 541 0 2 1313 440 195 68 113 chr2 95516846 95516876 -86231211 + MT2B LTR ERVL 131 154 -447 3 1313 3129 61 2 2 chr2 95528770 95529166 -86218921 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 1313 5563 49 6 3 chr2 95529166 95529886 -86218201 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 377 5 1313 2921 32 6 0 chr2 95532179 95532523 -86215564 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 5 1313 3571 56 0 0 chr2 95532525 95532988 -86215099 + ORR1A0-int LTR MaLR 1 463 -635 5 1313 3014 120 0 2 chr2 95535877 95536312 -86211775 + RLTR10C LTR ERVK 1 434 -2 6 1313 588 79 11 33 chr2 95536314 95536406 -86211681 + MMERVK10C-int LTR ERVK 1 90 -7491 6 1313 241 255 0 19 chr2 95536409 95536461 -86211626 + RLTR27 LTR ERVK 222 272 -37 6 1313 4915 87 21 1 chr2 95536461 95537128 -86210959 + MMERVK10C-int LTR ERVK 222 901 -6680 6 1313 456 187 19 0 chr2 95537173 95537280 -86210807 + MMERVK10C-int LTR ERVK 844 952 -6629 6 1313 1309 189 159 17 chr2 95537372 95537810 -86210277 + RMER16-int LTR ERVK 193 668 -5469 6 1313 19483 75 5 1 chr2 95538193 95540815 -86207272 + MMERVK10C-int LTR ERVK 4768 7420 -260 6 1313 3787 133 53 11 chr2 95540845 95541080 -86207007 + MMERVK10C-int LTR ERVK 7421 7680 0 6 1313 2238 130 185 0 chr2 95541080 95541448 -86206639 + RLTR10C LTR ERVK 1 436 0 6 1314 284 365 102 60 chr2 95552517 95552733 -86195354 + MLT1G LTR MaLR 72 296 -259 8 1314 2874 86 5 10 chr2 95561926 95562324 -86185763 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 9 1314 3319 48 0 0 chr2 95563206 95563602 -86184485 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 9 1314 284 235 45 45 chr2 95563747 95563836 -86184251 - MTE2a LTR MaLR 0 379 291 9 1314 390 287 82 14 chr2 95568784 95568937 -86179150 - MTE2a LTR MaLR -30 349 195 1 1314 1871 121 124 0 chr2 95579352 95579642 -86168445 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 1 1314 826 205 140 63 chr2 95582047 95582396 -86165691 - RLTR40 LTR ERVK -9 808 433 1 1314 514 323 39 39 chr2 95583359 95583588 -86164499 - MLT1B LTR MaLR -159 231 3 1 1314 273 288 14 0 chr2 95589461 95589534 -86158553 - LTR16A LTR ERVL -62 389 316 1 1314 340 389 57 9 chr2 95589556 95589766 -86158321 - LTR16A LTR ERVL -179 272 53 1 1314 4454 141 39 14 chr2 95594746 95595185 -86152902 + RMER17D2 LTR ERVK 1 455 -354 1 1314 4454 141 39 14 chr2 95595208 95595557 -86152530 + RMER17D2 LTR ERVK 456 809 0 1 1314 345 333 32 24 chr2 95608252 95608375 -86139712 + LTR40a LTR ERVL 11 134 -385 1 1314 3709 37 5 0 chr2 95610085 95610519 -86137568 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 1 1314 390 316 82 101 chr2 95611703 95612009 -86136078 + RLTR25B LTR ERVK 1 300 -803 1 1314 318 329 53 105 chr2 95614749 95615072 -86133015 + ORR1E LTR MaLR 44 349 -10 1 1314 875 355 135 24 chr2 95621251 95621783 -86126304 + MLT1E1A LTR MaLR 1 591 -89 1 1314 1754 207 33 31 chr2 95626564 95626983 -86121104 - MTC LTR MaLR 0 421 2 1 1314 2836 188 94 19 chr2 95628552 95629148 -86118939 - RLTR26 LTR ERVK -1 641 1 1 1314 2757 54 2 114 chr2 95630637 95631074 -86117013 + RLTR10 LTR ERVK 1 388 -2 1 1314 6833 111 7 9 chr2 95631653 95632678 -86115409 + RLTR13D2 LTR ERVK 1 1023 0 1 1314 756 260 4 68 chr2 95647561 95647796 -86100291 + RMER10A LTR ERVL 223 442 0 2 1314 3162 170 92 5 chr2 95648932 95649554 -86098533 - RLTR17 LTR ERVK -16 676 1 2 1314 290 330 77 0 chr2 95650937 95651028 -86097059 + MLT1L LTR MaLR 138 235 -375 2 1314 2303 66 119 11 chr2 95653560 95653912 -86094175 - RLTR10 LTR ERVK 0 390 1 2 1314 1049 334 52 25 chr2 95658403 95658885 -86089202 - MLT1D LTR MaLR -2 503 9 2 1314 291 341 50 36 chr2 95666632 95666772 -86081315 + MTD LTR MaLR 18 159 -260 2 1314 489 223 45 68 chr2 95670772 95670947 -86077140 + ORR1D1 LTR MaLR 30 201 -193 2 1314 370 276 37 68 chr2 95670857 95671020 -86077067 - ORR1D1 LTR MaLR -50 324 167 2 1314 1112 288 34 14 chr2 95678017 95678366 -86069721 + MLT1A0 LTR MaLR 2 357 -8 2 1315 920 269 39 41 chr2 95682661 95682999 -86065088 - RLTR15 LTR ERVK -17 342 6 2 1315 3681 115 47 0 chr2 95690931 95691479 -86056608 - MT2B2 LTR ERVL 0 584 11 2 1315 259 228 17 17 chr2 95700239 95700297 -86047790 + RMER15 LTR ERVL 516 573 -2 2 1315 1410 281 66 8 chr2 95707595 95707961 -86040126 - MTD LTR MaLR -8 411 25 2 1315 444 288 47 58 chr2 95719808 95720101 -86027986 + MTEa LTR MaLR 5 379 0 3 1315 283 308 41 77 chr2 95720208 95720302 -86027785 - MLT1E1A LTR MaLR -9 671 588 3 1315 283 308 41 77 chr2 95720366 95720440 -86027647 - MLT1E1A LTR MaLR -93 587 509 3 1315 582 245 18 1 chr2 95730243 95730411 -86017676 - MLT2B2 LTR ERVL -383 173 1 3 1315 478 341 81 52 chr2 95732714 95733023 -86015064 - MLT1D LTR MaLR -60 445 128 3 1315 2921 96 12 0 chr2 95734322 95734738 -86013349 - BGLII LTR ERVK 0 421 1 3 1315 1027 269 104 21 chr2 95737808 95738146 -86009941 - ORR1D1 LTR MaLR -8 366 1 3 1315 259 310 119 40 chr2 95751725 95751876 -85996211 - MLT1D LTR MaLR -308 197 35 3 1315 2889 168 94 19 chr2 95753278 95753861 -85994226 + RMER6D LTR ERVK 1 627 -93 3 1315 2614 243 75 45 chr2 95754238 95754483 -85993604 - RLTR33 LTR ERVK 0 678 443 3 1315 2614 243 75 45 chr2 95754623 95754640 -85993447 - RLTR33 LTR ERVK -236 442 442 3 1315 2614 243 75 45 chr2 95754787 95755166 -85992921 - RLTR33 LTR ERVK -236 442 17 3 1315 1570 188 103 3 chr2 95757183 95757514 -85990573 - ORR1B1 LTR MaLR -2 392 29 3 1315 356 217 0 46 chr2 95759933 95760020 -85988067 + MLT1A1 LTR MaLR 326 408 0 3 1315 354 336 112 68 chr2 95777572 95777895 -85970192 + ORR1E LTR MaLR 23 359 0 3 1315 249 393 46 39 chr2 95778439 95778722 -85969365 - MLT2C1 LTR ERVL -97 300 16 4 1315 390 237 30 126 chr2 95784126 95784261 -85963826 + MT2B LTR ERVL 144 265 -336 4 1315 1047 173 5 30 chr2 95793025 95793222 -85954865 + ORR1A4 LTR MaLR 1 192 -137 4 1315 2650 180 94 20 chr2 95808722 95809233 -85938854 + RLTR20B3 LTR ERVK 23 571 -6 4 1316 805 313 47 112 chr2 95822965 95823589 -85924498 + RLTR18 LTR ERVK 5 504 -112 4 1316 1289 242 70 55 chr2 95827925 95828309 -85919778 - RLTR28B LTR ERVL 0 481 92 4 1316 1844 144 110 66 chr2 95828634 95829089 -85918998 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 4 1316 2970 201 101 48 chr2 95829373 95830133 -85917954 - RLTR25B LTR ERVK -5 1023 133 4 1316 2970 199 107 50 chr2 95830166 95830290 -85917797 - RLTR25B LTR ERVK -896 132 2 4 1316 826 229 135 180 chr2 95830704 95831259 -85916828 - MT2A LTR ERVL 0 533 4 4 1316 360 316 78 32 chr2 95833921 95834075 -85914012 - MTEa LTR MaLR -12 367 207 4 1316 390 337 27 6 chr2 95834068 95834248 -85913839 - MTEa LTR MaLR -134 245 53 4 1316 267 317 9 96 chr2 95836458 95836573 -85911514 - MTE-int LTR MaLR -1467 113 9 4 1316 352 236 104 0 chr2 95842009 95842115 -85905972 + RMER4B LTR ERVK 17 133 -452 5 1316 451 174 53 122 chr2 95847190 95847230 -85900857 - RLTR31A_Mm LTR ERVK -457 127 87 5 1316 591 118 0 11 chr2 95847291 95847385 -85900702 - RLTR31_Mm LTR ERVK -468 93 1 5 1316 1835 168 3 10 chr2 95849024 95849337 -85898750 - RLTR10E LTR ERVK 0 311 1 5 1316 236 342 116 11 chr2 95849662 95849851 -85898236 + MLT1H-int LTR MaLR 320 528 -881 5 1316 3473 25 0 0 chr2 95854889 95855285 -85892802 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 1316 533 301 119 61 chr2 95876048 95876414 -85871673 + ORR1E LTR MaLR 1 369 -1 5 1316 895 311 10 66 chr2 95877138 95877441 -85870646 - MTEa LTR MaLR -92 287 2 5 1316 385 273 234 26 chr2 95878385 95878611 -85869476 + RMER20B LTR ERVK 234 506 -121 5 1316 3017 144 53 33 chr2 95880534 95881079 -85867008 + MT2B LTR ERVL 1 556 -45 5 1316 349 235 18 89 chr2 95882044 95882156 -85865931 - RMER4A LTR ERVK -3 463 360 5 1316 7576 196 18 53 chr2 95883012 95883174 -85864913 - MurERV4-int LTR ERVK -3663 1597 1427 5 1316 1953 140 11 80 chr2 95883174 95883524 -85864563 + ORR1A2 LTR MaLR 1 326 -1 5 1316 7576 196 18 53 chr2 95883524 95883823 -85864264 - MurERV4-int LTR ERVK -3834 1426 1155 5 1316 7576 196 18 53 chr2 95883871 95885064 -85863023 - MurERV4-int LTR ERVK -4106 1154 1 5 1316 1871 230 17 26 chr2 95885064 95885189 -85862898 - RMER4A LTR ERVK 0 466 350 5 1316 1871 230 17 26 chr2 95885333 95885623 -85862464 - RMER4A LTR ERVK -117 349 55 5 1316 360 330 134 48 chr2 95889092 95889411 -85858676 + MLT1C LTR MaLR 5 352 -115 5 1316 1771 149 42 57 chr2 95892524 95892858 -85855229 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 5 1316 288 324 50 27 chr2 95895357 95895490 -85852597 + MLT1A1 LTR MaLR 231 406 -2 5 1316 1010 275 154 46 chr2 95903735 95904253 -85843834 - RMER15 LTR ERVL 0 575 2 5 1316 1953 201 44 15 chr2 95907581 95907970 -85840117 + MTC LTR MaLR 22 421 0 6 1316 333 274 0 87 chr2 95909536 95909640 -85838447 + MER21B LTR ERV1 221 315 -548 6 1316 2426 54 3 6 chr2 95910075 95910394 -85837693 + RLTR10 LTR ERVK 1 318 -72 6 1316 253 85 43 0 chr2 95910415 95910462 -85837625 + RLTR10 LTR ERVK 259 307 -83 6 1316 829 114 11 28 chr2 95910467 95910633 -85837454 + RLTR10 LTR ERVK 227 384 -6 6 1316 285 130 0 85 chr2 95910635 95910694 -85837393 + RLTR10-int LTR ERVK 3 56 -1931 6 1316 4258 46 0 2 chr2 95910708 95911625 -85836462 + RLTR10-int LTR ERVK 11 998 -989 6 1316 367 232 62 39 chr2 95911689 95911819 -85836268 + RLTR10-int LTR ERVK 1462 1594 -5987 6 1316 8853 15 0 1 chr2 95911899 95912897 -85835190 + RLTR10-int LTR ERVK 990 1986 -1 6 1316 2426 54 3 6 chr2 95912897 95913216 -85834871 + RLTR10 LTR ERVK 1 318 -72 6 1316 272 143 0 0 chr2 95913222 95913278 -85834809 + RLTR10 LTR ERVK 259 314 -76 6 1316 845 116 11 39 chr2 95913306 95913474 -85834613 + RLTR10 LTR ERVK 227 387 -3 6 1316 830 342 55 16 chr2 95923565 95923928 -85824159 + MLT1D LTR MaLR 129 505 0 6 1316 850 279 25 103 chr2 95928919 95929326 -85818761 - MTEb LTR MaLR -4 375 1 6 1316 2304 16 0 0 chr2 95929951 95930218 -85817869 - MERVL-int LTR ERVL -3546 1939 1634 6 1316 1815 153 25 111 chr2 95931795 95932059 -85816028 + ORR1A4 LTR MaLR 1 238 -91 6 1316 950 214 131 58 chr2 95932059 95932402 -85815685 + RLTR9A LTR ERVK 1 368 0 6 1316 1815 153 25 111 chr2 95932402 95932497 -85815590 + ORR1A4 LTR MaLR 239 329 0 6 1316 2018 198 106 103 chr2 95933553 95934241 -85813846 - RMER6C LTR ERVK 0 690 1 6 1316 3317 104 4 11 chr2 95935272 95935749 -85812338 - MT2C_Mm LTR ERVL -1 474 1 6 1316 1555 252 82 12 chr2 95943828 95944314 -85803773 - RMER5 LTR ERV1 0 534 15 6 1317 239 350 63 82 chr2 95954631 95954899 -85793188 + MLT1D LTR MaLR 13 275 -230 6 1317 297 312 86 57 chr2 95960495 95960740 -85787347 - LTR48B LTR ERV1 -11 633 382 6 1317 469 304 150 13 chr2 95961314 95961611 -85786476 - MTEb LTR MaLR -27 352 5 6 1317 1964 115 72 99 chr2 95967029 95967404 -85780683 + RLTR8 LTR ERVK 1 365 0 6 1317 320 301 9 64 chr2 95983140 95983250 -85764837 + ORR1E LTR MaLR 6 109 -250 6 1317 718 365 48 39 chr2 95986849 95987185 -85760902 + MTEa LTR MaLR 41 379 0 7 1317 318 261 0 0 chr2 95988200 95988269 -85759818 - ORR1D1 LTR MaLR -4 370 302 7 1317 647 276 180 58 chr2 95989329 95989785 -85758302 - RMER20B LTR ERVK -31 596 96 7 1317 5691 261 34 18 chr2 95989899 95991383 -85756704 - MERVK26-int LTR ERVK -2 6917 5409 7 1317 439 275 54 23 chr2 95991390 95991579 -85756508 - MYSERV-int LTR ERVK -2255 4295 4124 7 1317 1763 160 48 40 chr2 95992640 95992992 -85755095 + ORR1B1 LTR MaLR 40 394 0 7 1317 477 199 218 10 chr2 95993100 95993271 -85754816 - RMER17C-int LTR ERVK -702 2536 2415 7 1317 1519 169 52 64 chr2 95993428 95993757 -85754330 + ORR1A4 LTR MaLR 1 325 -4 7 1317 4980 143 65 3 chr2 95993758 95994487 -85753600 + ORR1A4-int LTR MaLR 1044 1806 -157 7 1317 4980 143 65 3 chr2 95995461 95995578 -85752509 + ORR1A4-int LTR MaLR 1807 1942 -21 7 1317 1400 186 84 59 chr2 95995589 95995910 -85752177 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 7 1317 787 279 47 68 chr2 95996857 95997242 -85750845 - MERVK26-int LTR ERVK -6446 473 97 7 1317 528 249 72 12 chr2 95997419 95997586 -85750501 - RMER20B LTR ERVK -305 322 146 7 1317 231 250 40 27 chr2 96002356 96002430 -85745657 + LTR86A1 LTR ERVL 122 196 -317 8 1317 360 312 51 17 chr2 96006940 96007116 -85740971 + MLT1A0 LTR MaLR 8 189 -176 1 1317 384 310 57 66 chr2 96008348 96008805 -85739282 - RLTR15 LTR ERVK -23 336 8 2 1317 1654 195 87 9 chr2 96009981 96010327 -85737760 - RMER20A LTR ERVK -133 383 11 2 1317 1868 157 40 6 chr2 96015143 96015490 -85732597 - RLTR15 LTR ERVK 0 359 1 3 1317 1905 199 123 7 chr2 96016339 96016793 -85731294 + RLTR28 LTR ERVL 18 524 0 3 1317 1448 181 78 94 chr2 96025332 96025692 -85722395 + ORR1B1 LTR MaLR 41 394 0 4 1317 861 357 43 19 chr2 96029635 96030003 -85718084 - MLT1A1 LTR MaLR -28 380 4 5 1317 2963 21 0 0 chr2 96031667 96032004 -85716083 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 0 337 1 5 1317 19951 11 3 1 chr2 96032004 96034224 -85713863 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 4256 5 1317 34514 28 23 9 chr2 96034218 96038308 -85709779 - IAPEz-int LTR ERVK -2328 4153 8 5 1317 2963 21 0 0 chr2 96038308 96038645 -85709442 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 0 337 1 5 1317 295 294 134 64 chr2 96040584 96040755 -85707332 + MLT1C LTR MaLR 282 464 -3 6 1317 970 149 226 0 chr2 96049853 96050074 -85698013 + RMER6D LTR ERVK 1 271 -449 7 1317 1633 76 4 0 chr2 96050074 96050299 -85697788 + MT2B2 LTR ERVL 1 226 -358 7 1317 1122 303 17 21 chr2 96052694 96053115 -85694972 - MTD LTR MaLR 0 419 1 7 1317 227 419 20 7 chr2 96057489 96057638 -85690449 - MLT1H-int LTR MaLR -258 1151 1001 8 1317 232 409 57 28 chr2 96068027 96068203 -85679884 + LTR16B2 LTR ERVL 3 183 -279 9 1317 1141 290 57 75 chr2 96071197 96071880 -85676207 + RMER12 LTR ERVK 3 652 -1196 9 1317 1021 307 77 123 chr2 96072055 96072125 -85675962 + RMER12 LTR ERVK 653 721 -1127 9 1317 713 268 225 40 chr2 96072332 96072814 -85675273 + RMER12 LTR ERVK 741 1696 -152 9 1318 313 183 0 16 chr2 96083495 96083556 -85664531 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 311 1 1318 899 270 100 23 chr2 96085912 96086227 -85661860 - ORR1D2 LTR MaLR -26 353 1 1 1318 228 226 43 106 chr2 96086381 96086475 -85661612 + MLT1B LTR MaLR 303 390 0 1 1318 1029 215 71 12 chr2 96090830 96091070 -85657017 - RMER20B LTR ERVK -67 560 307 1 1318 748 254 74 47 chr2 96091072 96091458 -85656629 - RMER2 LTR ERV1 -69 498 1 1 1318 1213 188 124 29 chr2 96091458 96091732 -85656355 - RMER20B LTR ERVK -327 300 1 1 1318 358 339 101 18 chr2 96092026 96092194 -85655893 + RMER20B LTR ERVK 124 305 -322 1 1318 1012 254 113 43 chr2 96095149 96095495 -85652592 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 1 1318 1512 272 40 16 chr2 96096219 96096596 -85651491 + MTD LTR MaLR 18 403 -16 1 1318 6611 106 13 60 chr2 96097320 96097661 -85650426 + RLTR13D5 LTR ERVK 1 330 -693 1 1318 6611 106 13 60 chr2 96097803 96097836 -85650251 + RLTR13D5 LTR ERVK 331 331 -692 1 1318 6611 106 13 60 chr2 96097865 96098563 -85649524 + RLTR13D5 LTR ERVK 331 1023 0 1 1318 546 287 222 46 chr2 96112199 96112401 -85635686 + MTC LTR MaLR 1 205 -216 1 1318 546 287 222 46 chr2 96112448 96112592 -85635495 + MTC LTR MaLR 206 408 -13 1 1318 295 304 11 21 chr2 96112861 96112955 -85635132 + MLT1A0 LTR MaLR 254 346 -19 1 1318 1157 212 15 202 chr2 96116419 96116673 -85631414 + ORR1D1 LTR MaLR 5 176 -198 1 1318 1157 212 15 202 chr2 96116728 96116928 -85631159 + ORR1D1 LTR MaLR 177 374 0 1 1318 271 285 105 50 chr2 96130958 96131139 -85616948 + RMER17D2 LTR ERVK 391 581 -228 1 1318 478 271 18 48 chr2 96131880 96132047 -85616040 - RMER15 LTR ERVL -77 498 337 1 1318 4102 155 39 1 chr2 96135817 96136502 -85611585 + RLTR21 LTR ERVK 56 766 -806 1 1318 2859 152 64 118 chr2 96136486 96137201 -85610886 + RLTR21 LTR ERVK 896 1572 0 1 1318 561 299 14 0 chr2 96140308 96140455 -85607632 + MTEb LTR MaLR 5 153 -226 1 1318 562 254 19 125 chr2 96140596 96140692 -85607395 + MTEb LTR MaLR 185 262 -117 1 1318 562 254 19 125 chr2 96140745 96140864 -85607223 + MTEb LTR MaLR 263 377 -2 1 1318 4036 337 46 16 chr2 96140866 96142399 -85605688 + MTEb-int LTR MaLR 1 1578 -2 1 1318 3125 37 48 0 chr2 96142793 96143171 -85604916 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 1318 9120 36 6 0 chr2 96143171 96144263 -85603824 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 2 1318 3400 25 2 8 chr2 96144263 96144661 -85603426 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 1318 384 330 85 55 chr2 96154497 96154696 -85593391 - MLT1A LTR MaLR -42 332 128 2 1318 1626 213 106 8 chr2 96176937 96177306 -85570781 + MTD LTR MaLR 1 405 -14 2 1318 380 299 99 72 chr2 96182814 96183037 -85565050 + MLT1H2 LTR MaLR 261 489 0 2 1318 869 318 95 25 chr2 96183707 96184033 -85564054 - ORR1E LTR MaLR -10 349 1 2 1319 340 288 59 0 chr2 96225323 96225441 -85522646 - MLT1C LTR MaLR -290 177 53 3 1319 375 293 59 30 chr2 96252405 96252574 -85495513 - MLT1B LTR MaLR -130 260 87 3 1319 747 311 68 26 chr2 96253786 96254020 -85494067 - MTE2b LTR MaLR -134 245 2 3 1319 362 269 86 43 chr2 96257911 96258051 -85490036 + MTC LTR MaLR 276 421 0 3 1319 261 315 94 61 chr2 96266454 96266667 -85481420 - MLT1B LTR MaLR 0 390 171 3 1319 258 305 130 33 chr2 96277473 96277620 -85470467 + MLT1H1 LTR MaLR 159 351 -244 3 1319 541 276 62 34 chr2 96279170 96279346 -85468741 + MTD LTR MaLR 224 404 -15 3 1319 405 295 42 77 chr2 96280751 96281052 -85467035 + MTD LTR MaLR 18 411 -8 3 1319 1896 203 19 3 chr2 96297898 96298264 -85449823 + ORR1B1 LTR MaLR 1 372 -22 4 1319 235 343 102 27 chr2 96302865 96303033 -85445054 + MLT1E3 LTR MaLR 362 568 -86 4 1319 2067 141 0 9 chr2 96305255 96305585 -85442502 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 4 1319 576 336 34 21 chr2 96308720 96308957 -85439130 - RLTR16 LTR ERVK -234 271 32 4 1319 2285 114 6 0 chr2 96322033 96322358 -85425729 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 4 1319 227 360 96 30 chr2 96332279 96332445 -85415642 - MLT1I LTR MaLR -39 372 196 4 1319 2356 88 113 16 chr2 96332685 96333056 -85415031 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 4 1319 552 336 60 23 chr2 96336552 96336851 -85411236 - MLT1B LTR MaLR -15 375 66 4 1320 1018 317 11 48 chr2 96343733 96344084 -85404003 - ORR1E LTR MaLR -2 357 20 4 1320 283 316 0 0 chr2 96346027 96346103 -85401984 - LTR16A1 LTR ERVL -6 450 375 4 1320 339 356 8 41 chr2 96353483 96353606 -85394481 - MLT1E LTR MaLR -71 582 464 4 1320 247 271 30 30 chr2 96356930 96357029 -85391058 + ORR1A2-int LTR MaLR 1742 1840 -123 4 1320 2114 133 16 0 chr2 96357243 96357565 -85390522 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 4 1320 477 298 57 168 chr2 96359758 96360056 -85388031 + MTE2a LTR MaLR 2 266 -113 4 1320 2075 129 6 41 chr2 96362329 96362668 -85385419 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 4 1320 258 281 40 50 chr2 96363090 96363191 -85384896 - RLTR25A LTR ERVK 0 1028 929 5 1320 265 343 93 77 chr2 96364039 96364339 -85383748 - RLTR25A LTR ERVK -789 314 10 5 1320 1341 141 0 9 chr2 96366826 96367041 -85381046 + RLTR10E LTR ERVK 99 311 0 5 1320 426 269 140 92 chr2 96373512 96373894 -85374193 + MER67D LTR ERV1 56 437 -77 5 1320 253 312 63 21 chr2 96379898 96379993 -85368094 - MLT1J LTR MaLR -208 304 206 5 1320 310 278 0 93 chr2 96419640 96419747 -85328340 - MLT1B LTR MaLR -12 378 282 5 1320 571 365 73 4 chr2 96420072 96420347 -85327740 - MLT1B-int LTR MaLR -126 1245 952 5 1320 240 282 114 35 chr2 96421438 96421550 -85326537 - MLT-int LTR MaLR -1454 281 161 5 1320 248 367 96 61 chr2 96431644 96431937 -85316150 - MLT1E1A LTR MaLR 0 680 378 5 1320 1934 187 58 10 chr2 96432064 96432463 -85315624 + MTC LTR MaLR 1 418 -3 5 1320 937 299 114 35 chr2 96456832 96457314 -85290773 - RMER5 LTR ERV1 -4 530 11 6 1320 434 306 57 75 chr2 96458036 96458329 -85289758 - MLT1A1 LTR MaLR -34 374 42 6 1320 296 269 141 12 chr2 96459509 96459643 -85288444 - MTEa LTR MaLR -20 359 202 6 1320 547 332 38 9 chr2 96459726 96459936 -85288151 - MTEa LTR MaLR -163 216 1 6 1320 514 356 140 16 chr2 96462470 96462841 -85285246 - MLT1D LTR MaLR -16 489 73 6 1320 593 215 39 59 chr2 96467306 96467459 -85280628 + MT2A LTR ERVL 1 150 -383 6 1320 647 228 133 34 chr2 96467473 96467640 -85280447 + MT2B LTR ERVL 99 404 -197 6 1320 647 229 62 154 chr2 96467893 96468016 -85280071 + MT2B LTR ERVL 405 525 -76 6 1321 1275 266 80 32 chr2 96469086 96469242 -85278845 - MTD LTR MaLR 0 419 253 6 1321 1275 266 80 32 chr2 96469274 96469517 -85278570 - MTD LTR MaLR -167 252 3 6 1321 3350 38 2 0 chr2 96479180 96479575 -85268512 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 1321 406 336 63 73 chr2 96480111 96480397 -85267690 - MER92B LTR ERV1 -68 568 286 6 1321 259 293 62 54 chr2 96480446 96480576 -85267511 - MER92B LTR ERV1 -441 195 65 6 1321 262 278 0 77 chr2 96484819 96484897 -85263190 - MT2B2 LTR ERVL -319 265 194 6 1321 794 355 63 42 chr2 96486203 96486723 -85261364 - MT2A LTR ERVL 0 533 3 6 1321 913 216 292 0 chr2 96486803 96487120 -85260967 - MTD LTR MaLR 0 419 10 6 1321 235 386 85 37 chr2 96488370 96488534 -85259553 + MLT1C LTR MaLR 293 464 -3 6 1321 2005 152 80 39 chr2 96488835 96489246 -85258841 - RLTR23 LTR ERV1 -2 428 1 6 1321 3299 151 21 18 chr2 96490733 96491299 -85256788 + RLTR12A LTR ERVK 1 568 0 6 1321 263 279 71 9 chr2 96493989 96494101 -85253986 + MTE-int LTR MaLR 1287 1405 -175 6 1321 460 276 74 20 chr2 96495722 96495870 -85252217 - MLT1H-int LTR MaLR -3 1406 1251 6 1321 3658 132 16 39 chr2 96515590 96516205 -85231882 - MT2B LTR ERVL 0 601 1 2 1321 1058 302 76 9 chr2 96518791 96518811 -85229276 - ORR1D2 LTR MaLR -1 369 340 2 1321 1058 302 76 9 chr2 96519437 96519760 -85228327 - ORR1D2 LTR MaLR -31 339 3 2 1321 309 311 25 75 chr2 96521091 96521251 -85226836 - ORR1D2 LTR MaLR -55 315 164 3 1321 3355 127 16 23 chr2 96523395 96523952 -85224135 - RLTR31B_Mm LTR ERVK 0 557 5 4 1321 3923 175 101 43 chr2 96526447 96527300 -85220787 - RMER19B LTR ERVK 0 902 1 4 1321 451 290 151 11 chr2 96527980 96528158 -85219929 + MTD LTR MaLR 202 406 -13 4 1321 474 225 45 55 chr2 96535290 96535509 -85212578 - RLTR43A LTR ERVK 0 642 216 6 1321 248 348 0 11 chr2 96543564 96543657 -85204430 - ORR1E LTR MaLR -267 92 1 7 1321 339 343 102 58 chr2 96545717 96546042 -85202045 - MLT1E LTR MaLR -9 644 306 7 1321 1003 265 97 38 chr2 96548460 96548853 -85199234 - MTD LTR MaLR -3 416 1 8 1321 1384 226 37 6 chr2 96559518 96559843 -85188244 - ORR1D2 LTR MaLR -30 340 6 9 1321 337 323 61 73 chr2 96561239 96561486 -85186601 - MER31B LTR ERV1 -72 394 151 9 1321 296 261 31 61 chr2 96561855 96561953 -85186134 - MER34 LTR ERV1 -66 476 382 1 1321 684 139 0 0 chr2 96571584 96571685 -85176402 + RMER6C LTR ERVK 1 101 -619 1 1321 938 200 110 43 chr2 96571686 96572231 -85175856 + RMER6C LTR ERVK 249 716 -4 1 1321 326 317 47 97 chr2 96577389 96577738 -85170349 - MLT1B LTR MaLR -42 425 85 1 1321 1601 206 152 50 chr2 96578931 96579362 -85168725 + RLTR20B3 LTR ERVK 5 468 -109 1 1321 1601 206 152 50 chr2 96579421 96579469 -85168618 + RLTR20B3 LTR ERVK 469 532 -45 1 1321 1931 176 170 7 chr2 96580435 96580893 -85167194 - RMER16 LTR ERVK 0 533 1 1 1321 270 296 219 34 chr2 96591654 96591832 -85156255 + MLT1A0 LTR MaLR 155 365 0 1 1321 686 206 156 14 chr2 96592702 96592914 -85155173 - MTC LTR MaLR 0 421 180 1 1321 2330 199 50 108 chr2 96592916 96593580 -85154507 - RMER20B LTR ERVK -1 626 2 1 1321 600 250 94 4 chr2 96593580 96593748 -85154339 - MTC LTR MaLR -241 178 1 1 1321 417 316 40 40 chr2 96596689 96596887 -85151200 - MLT1B LTR MaLR -182 208 11 1 1322 5484 139 45 11 chr2 96609456 96609656 -85138431 + ORR1A3-int LTR MaLR 1009 1217 -746 1 1322 2044 139 3 0 chr2 96609656 96609966 -85138121 - RLTR10E LTR ERVK 0 311 1 1 1322 5484 139 45 11 chr2 96609966 96610688 -85137399 + ORR1A3-int LTR MaLR 1218 1963 0 1 1322 1386 141 107 110 chr2 96610688 96610815 -85137272 + ORR1A3 LTR MaLR 1 102 -224 1 1322 1386 141 107 110 chr2 96610977 96611175 -85136912 + ORR1A3 LTR MaLR 103 325 -1 1 1322 259 290 34 101 chr2 96614169 96614288 -85133799 - MT2B LTR ERVL -323 278 168 1 1322 556 197 50 50 chr2 96615547 96615686 -85132401 - RLTR25B LTR ERVK 0 1028 890 1 1322 275 157 20 0 chr2 96615686 96615737 -85132350 - RLTR25B LTR ERVK -269 759 708 1 1322 594 289 38 0 chr2 96615830 96615989 -85132098 + MTE2a LTR MaLR 215 379 0 1 1322 962 216 88 7 chr2 96621461 96621745 -85126342 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -2 2324 2018 1 1322 3600 179 83 0 chr2 96621745 96622408 -85125679 + RMER19A LTR ERVK 1 718 -19 1 1322 1621 172 93 12 chr2 96624333 96624657 -85123430 - ORR1B2 LTR MaLR -8 359 10 1 1322 836 166 56 149 chr2 96636769 96637124 -85110963 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 2 1322 2081 174 167 41 chr2 96641458 96641701 -85106386 - RMER6C LTR ERVK -62 628 386 2 1322 2081 174 167 41 chr2 96641729 96642043 -85106044 - RMER6C LTR ERVK -305 385 1 2 1322 1751 107 60 63 chr2 96647878 96648197 -85099890 - ORR1A3 LTR MaLR -2 324 7 2 1322 363 331 83 67 chr2 96650360 96650687 -85097400 - MLT1A0 LTR MaLR -3 362 31 2 1322 2467 129 45 0 chr2 96654620 96655023 -85093064 - BGLII LTR ERVK 0 421 1 2 1322 3338 211 32 46 chr2 96655023 96655988 -85092099 - RMER3D-int LTR ERVK 0 2842 1891 2 1322 563 212 39 52 chr2 96655956 96656110 -85091977 - RMER3D-int LTR ERVK -1148 1694 1543 2 1322 318 381 79 50 chr2 96660220 96660538 -85087549 + LTR16B LTR ERVL 43 369 -94 2 1322 411 118 44 0 chr2 96664491 96664559 -85083528 - RLTR24 LTR ERV1 0 529 459 2 1322 1365 194 92 7 chr2 96666145 96666451 -85081636 - RLTR24 LTR ERV1 -81 448 117 2 1322 423 208 21 0 chr2 96667497 96667593 -85080494 - RLTR24 LTR ERV1 -431 98 1 2 1322 1602 187 81 14 chr2 96677179 96677548 -85070539 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 2 1322 4387 179 86 102 chr2 96677548 96678765 -85069322 - ORR1B1-int LTR MaLR 0 1963 767 2 1322 336 264 133 63 chr2 96678706 96678864 -85069223 - MT2B LTR ERVL -344 257 89 2 1322 3334 173 92 124 chr2 96680027 96680617 -85067470 - RMER17B LTR ERVK 0 958 399 2 1322 3334 173 92 124 chr2 96680732 96680746 -85067341 - RMER17B LTR ERVK -560 398 398 2 1322 3334 173 92 124 chr2 96680791 96681174 -85066913 - RMER17B LTR ERVK -560 398 2 2 1322 785 247 65 57 chr2 96681218 96681449 -85066638 - MT2B LTR ERVL -58 543 316 2 1322 1874 168 48 11 chr2 96681449 96681828 -85066259 + ORR1B1 LTR MaLR 1 393 -1 2 1322 785 208 95 103 chr2 96681828 96681995 -85066092 - MT2B LTR ERVL -286 315 1 2 1322 384 186 46 52 chr2 96682093 96682189 -85065898 + MTC LTR MaLR 1 94 -302 2 1322 1335 250 54 24 chr2 96682337 96682673 -85065414 + MTC LTR MaLR 68 413 -8 2 1322 509 141 12 0 chr2 96688953 96689038 -85059049 + MTC LTR MaLR 17 102 -319 3 1322 259 143 0 75 chr2 96689042 96689095 -85058992 + MTC LTR MaLR 368 419 -2 3 1322 1398 181 123 29 chr2 96705333 96705639 -85042448 + RMER6C LTR ERVK 1 336 -354 3 1322 1398 237 131 19 chr2 96705813 96705924 -85042163 + RMER6C LTR ERVK 337 467 -253 3 1322 1262 181 90 4 chr2 96706228 96706483 -85041604 + RMER6C LTR ERVK 414 690 0 3 1322 302 325 16 62 chr2 96713916 96714044 -85034043 - MLT1H2 LTR MaLR -13 476 355 3 1322 273 287 173 6 chr2 96714173 96714332 -85033755 - MLT1H2 LTR MaLR -425 166 16 3 1322 414 311 35 59 chr2 96719417 96719619 -85028468 + RMER10B LTR ERVL 192 388 -10 3 1322 1512 196 53 84 chr2 96719779 96720158 -85027929 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 3 1322 1596 156 44 79 chr2 96728388 96728660 -85019427 + ORR1A4 LTR MaLR 1 274 -55 3 1322 1596 156 44 79 chr2 96729495 96729563 -85018524 + ORR1A4 LTR MaLR 275 329 0 3 1323 1780 220 34 65 chr2 96731622 96732069 -85016018 + RLTR40 LTR ERVK 385 817 0 3 1323 1187 154 5 62 chr2 96735396 96735616 -85012471 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 177 3 1323 1052 251 18 183 chr2 96735761 96735784 -85012303 - ORR1B1 LTR MaLR -198 176 172 3 1323 1052 251 18 183 chr2 96735809 96736012 -85012075 - ORR1B1 LTR MaLR -203 171 1 3 1323 243 331 54 23 chr2 96736082 96736212 -85011875 - ORR1B1-int LTR MaLR -28 1552 1419 3 1323 1394 296 77 37 chr2 96736348 96736857 -85011230 - ORR1B1-int LTR MaLR -1049 531 3 3 1323 479 345 89 20 chr2 96736874 96737176 -85010911 - ORR1B1 LTR MaLR -2 377 55 3 1323 2764 34 0 21 chr2 96739934 96740268 -85007819 - IAPLTR2b LTR ERVK 0 327 1 3 1323 541 339 38 89 chr2 96741196 96741565 -85006522 - MLT1A LTR MaLR -10 364 15 3 1323 1718 238 42 58 chr2 96746430 96746611 -85001476 + MT2A LTR ERVL 3 177 -356 3 1323 1718 238 42 58 chr2 96746642 96746959 -85001128 + MT2A LTR ERVL 178 493 -40 3 1323 378 77 0 0 chr2 96748536 96748588 -84999499 - RMER13B LTR ERVK -856 52 1 4 1323 2857 52 0 0 chr2 96758844 96759190 -84988897 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 4 1323 323 307 62 62 chr2 96763503 96763680 -84984407 + ERVL-B4-int LTR ERVL 4138 4314 -1400 4 1323 1429 180 58 151 chr2 96770812 96771030 -84977057 - ORR1C1 LTR MaLR -4 374 206 4 1323 1429 180 58 151 chr2 96771177 96771370 -84976717 - ORR1C1 LTR MaLR -173 205 1 4 1323 2064 189 56 7 chr2 96777267 96777537 -84970550 - RLTR11A LTR ERVK -7 521 244 4 1323 2064 189 56 7 chr2 96777913 96778085 -84970002 - RLTR11A LTR ERVK -285 243 58 4 1323 609 154 0 9 chr2 96793312 96793417 -84954670 - ORR1B1 LTR MaLR -40 354 251 4 1323 840 298 96 70 chr2 96803994 96804762 -84943325 + MTD-int LTR MaLR 305 1098 0 4 1323 1264 268 93 11 chr2 96804773 96805149 -84942938 + MTD LTR MaLR 7 402 -17 4 1323 2592 184 73 28 chr2 96813436 96813972 -84934115 - RMER17B LTR ERVK 0 958 399 4 1323 709 347 63 45 chr2 96827364 96827699 -84920388 - MTEa LTR MaLR -31 348 8 5 1323 685 235 26 13 chr2 96839599 96839750 -84908337 + MT2A LTR ERVL 261 413 -120 5 1323 2157 243 113 0 chr2 96840434 96840990 -84907097 + MERVL_2A-int LTR ERVL 3335 3953 -1808 5 1323 1491 230 140 89 chr2 96840990 96841429 -84906658 + MT2A LTR ERVL 14 449 -84 5 1323 1491 230 140 89 chr2 96841528 96841579 -84906508 + MT2A LTR ERVL 450 529 -4 5 1323 249 345 82 63 chr2 96843503 96843772 -84904315 - MLT1A0 LTR MaLR -77 288 15 5 1323 263 366 74 7 chr2 96851189 96851324 -84896763 - MLT1F LTR MaLR -254 294 151 5 1324 358 258 19 47 chr2 96879447 96879553 -84868534 + MLT1D LTR MaLR 323 425 -80 5 1324 745 332 42 14 chr2 96887380 96887664 -84860423 + MER89 LTR ERV1 258 549 -10 5 1324 517 306 79 38 chr2 96891918 96892183 -84855904 - MLT1A0 LTR MaLR -11 354 79 6 1324 1833 199 165 15 chr2 96897146 96897269 -84850818 - RLTR12B LTR ERVK -6 522 369 6 1324 1833 199 165 15 chr2 96897460 96897790 -84850297 - RLTR12B LTR ERVK -160 368 1 6 1324 686 229 87 168 chr2 96909486 96910064 -84838023 + RLTR19-int LTR ERVK 3420 3950 -2187 6 1324 301 304 21 86 chr2 96910327 96910514 -84837573 + RMER17C-int LTR ERVK 2698 2872 -366 6 1324 630 309 71 25 chr2 96918713 96918952 -84829135 + MTE2b LTR MaLR 10 259 -120 6 1324 732 304 45 76 chr2 96922459 96922747 -84825340 + MTE2b LTR MaLR 1 279 -100 6 1324 558 346 92 62 chr2 96933244 96933614 -84814473 + MTD LTR MaLR 18 398 -21 6 1324 1679 221 75 31 chr2 96958905 96959422 -84788665 - BGLII_B LTR ERVK -106 455 16 6 1324 715 264 169 54 chr2 96960585 96960917 -84787170 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 5 6 1324 421 363 49 0 chr2 96962238 96962442 -84785645 + ORR1C1 LTR MaLR 1 214 -164 6 1324 633 283 68 71 chr2 96967293 96967616 -84780471 - RLTR11B LTR ERVK -131 322 1 7 1324 516 341 88 67 chr2 96971933 96972276 -84775811 + ORR1E LTR MaLR 10 359 0 7 1325 660 280 88 12 chr2 96995380 96995711 -84752376 - MT2A LTR ERVL -71 462 60 7 1325 581 372 52 85 chr2 96998258 96998754 -84749333 - LTR16B1 LTR ERVL 0 480 1 7 1325 526 274 148 30 chr2 97001156 97001487 -84746600 + ORR1D1 LTR MaLR 5 374 0 1 1325 282 412 66 15 chr2 97001705 97001902 -84746185 - LTR16B1 LTR ERVL -184 296 90 2 1325 1304 173 18 4 chr2 97007905 97008131 -84739956 - ORR1A3 LTR MaLR -2 324 96 6 1325 568 135 22 0 chr2 97018909 97018998 -84729089 - ORR1A2 LTR MaLR 0 326 236 2 1325 3756 181 39 28 chr2 97019000 97019974 -84728113 - ORR1A2-int LTR MaLR -546 1417 372 2 1325 2237 152 62 51 chr2 97024994 97025464 -84722623 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 2 1325 21176 12 2 0 chr2 97025464 97027819 -84720268 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 4123 2 1325 932 73 24 0 chr2 97027821 97027944 -84720143 - IAPEz-int LTR ERVK -2770 4910 4785 2 1325 1859 107 4 4 chr2 97027941 97028203 -84719884 - IAPEz-int LTR ERVK -5183 2497 2236 2 1325 442 66 0 32 chr2 97028192 97028255 -84719832 - IAPEz-int LTR ERVK -5062 1419 1359 2 1325 4360 60 65 44 chr2 97028255 97028896 -84719191 - IAPEz-int LTR ERVK -5819 662 8 2 1325 2231 146 62 51 chr2 97028896 97029366 -84718721 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 2 1325 2340 118 8 3 chr2 97029366 97029730 -84718357 - ORR1A2-int LTR MaLR -1597 366 1 2 1325 1049 45 8 0 chr2 97029734 97029868 -84718219 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 185 2 1325 1992 147 16 0 chr2 97034883 97035197 -84712890 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 3 1325 282 257 86 0 chr2 97046630 97046700 -84701387 - RMER15 LTR ERVL 0 575 500 5 1325 2711 107 7 26 chr2 97054946 97055369 -84692718 - BGLII LTR ERVK -6 415 1 7 1325 545 204 0 10 chr2 97059734 97059833 -84688254 + MTC LTR MaLR 1 98 -323 8 1325 1291 227 53 7 chr2 97060275 97060559 -84687528 + MTC LTR MaLR 113 409 -12 8 1325 303 340 76 58 chr2 97060847 97061122 -84686965 - MLT1F-int LTR MaLR -384 1105 826 8 1325 1799 196 15 56 chr2 97063304 97063698 -84684389 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 8 1325 269 359 30 60 chr2 97068060 97068226 -84679861 + LTR78 LTR ERV1 908 1068 -236 9 1325 3379 25 15 2 chr2 97070293 97070699 -84677388 + IAPLTR2a LTR ERVK 1 411 0 9 1325 1339 229 72 169 chr2 97071625 97072301 -84675786 - RMER19C LTR ERVK 0 611 1 9 1325 1742 189 14 8 chr2 97074995 97075352 -84672735 + RLTR15 LTR ERVK 1 359 0 1 1325 2455 183 87 23 chr2 97075382 97075912 -84672175 - RLTR12A LTR ERVK -4 564 1 1 1325 627 354 106 63 chr2 97076607 97077053 -84671034 - MT2B LTR ERVL -55 546 1 1 1325 475 379 76 40 chr2 97087319 97087621 -84660466 - LTR33 LTR ERVL -202 313 1 1 1325 1168 233 115 24 chr2 97087781 97087948 -84660139 + ORR1D1 LTR MaLR 1 182 -192 1 1325 1168 233 115 24 chr2 97088039 97088209 -84659878 + ORR1D1 LTR MaLR 183 369 -5 1 1325 4307 266 74 29 chr2 97088282 97089545 -84658542 + ORR1D1-int LTR MaLR 47 1367 -3 1 1325 809 233 132 47 chr2 97089552 97089809 -84658278 + ORR1D1 LTR MaLR 5 283 -91 1 1325 553 300 67 43 chr2 97089926 97090208 -84657879 - RLTR40 LTR ERVK -5 812 524 1 1325 245 280 17 87 chr2 97090718 97090890 -84657197 - RLTR40 LTR ERVK -589 228 69 1 1325 701 286 41 55 chr2 97090869 97091188 -84656899 + ORR1D2 LTR MaLR 36 370 -4 1 1325 315 291 101 54 chr2 97091246 97091337 -84656750 + MLT1E1A LTR MaLR 522 610 -70 1 1325 315 291 101 54 chr2 97091389 97091446 -84656641 + MLT1E1A LTR MaLR 611 677 -3 1 1325 264 294 84 62 chr2 97102815 97103077 -84645010 + MTEa LTR MaLR 88 364 -15 1 1325 4229 158 34 0 chr2 97106443 97107156 -84640931 - RMER19A LTR ERVK 0 737 1 1 1325 769 205 87 0 chr2 97111219 97111380 -84636707 + MTC LTR MaLR 3 177 -244 1 1325 234 387 47 51 chr2 97122331 97122546 -84625541 - MLT1J LTR MaLR -292 220 7 1 1326 816 218 46 21 chr2 97128279 97128562 -84619525 + ORR1C1 LTR MaLR 10 368 -10 1 1326 1355 245 76 9 chr2 97129742 97130071 -84618016 - ORR1C1 LTR MaLR -2 376 26 1 1326 435 220 7 136 chr2 97130444 97130717 -84617370 - RMER17C LTR ERVK -172 238 1 1 1326 1071 147 30 6 chr2 97138008 97138188 -84609899 - BGLII LTR ERVK 0 421 204 1 1326 1071 134 28 0 chr2 97138335 97138350 -84609737 - BGLII LTR ERVK -168 253 239 1 1326 558 261 8 0 chr2 97182556 97182675 -84565412 + MTC LTR MaLR 1 120 -301 2 1326 1619 190 20 3 chr2 97182771 97183066 -84565021 + MTC LTR MaLR 114 413 -8 2 1326 1616 175 44 3 chr2 97198569 97198912 -84549175 - RLTR15 LTR ERVK 0 359 3 2 1326 237 296 53 59 chr2 97202187 97202264 -84545823 + RMER17C LTR ERVK 1 80 -330 2 1326 630 267 10 114 chr2 97202370 97202619 -84545468 + RMER17C LTR ERVK 81 378 -32 2 1326 327 324 9 54 chr2 97215237 97215390 -84532697 + MLT1E2 LTR MaLR 1 142 -485 2 1326 1812 212 128 53 chr2 97228224 97228756 -84519331 - RMER4B LTR ERVK -11 574 3 3 1326 781 318 84 29 chr2 97232363 97232671 -84515416 - MTD LTR MaLR -53 366 42 3 1326 2099 255 35 11 chr2 97247205 97247749 -84500338 + RLTR20B3 LTR ERVK 1 557 -20 3 1326 348 303 33 40 chr2 97254144 97254295 -84493792 - MLT2B1 LTR ERVL -373 181 31 3 1327 2920 69 10 10 chr2 97259015 97259411 -84488676 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 1327 6890 96 16 72 chr2 97259411 97260574 -84487513 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 3 1327 2786 101 2 5 chr2 97260574 97260971 -84487116 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 1327 1126 256 106 12 chr2 97269680 97270020 -84478067 - ORR1D1 LTR MaLR -2 372 1 3 1327 5444 229 36 16 chr2 97270020 97271285 -84476802 - ORR1D1-int LTR MaLR 0 1370 80 3 1327 852 249 81 9 chr2 97274059 97274282 -84473805 + ORR1C2 LTR MaLR 146 384 0 3 1327 4255 32 0 0 chr2 97278766 97279259 -84468828 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 3 1327 299 327 58 0 chr2 97282721 97282825 -84465262 + MLT1A1 LTR MaLR 236 345 -63 4 1327 1240 317 64 27 chr2 97283195 97283979 -84464108 + ERVL-B4-int LTR ERVL 862 1674 -4040 4 1327 388 340 21 0 chr2 97283983 97284127 -84463960 + MLT-int LTR MaLR 13 159 -1576 4 1327 405 336 97 39 chr2 97284455 97284734 -84463353 + MLT-int LTR MaLR 304 598 -1137 4 1327 446 348 12 35 chr2 97286308 97286478 -84461609 - MLT1D LTR MaLR -328 177 12 4 1327 1084 281 91 14 chr2 97312994 97313358 -84434729 + MTD LTR MaLR 17 408 -11 4 1327 1575 217 48 7 chr2 97321053 97321474 -84426613 - RLTR11A2 LTR ERVK 0 528 1 4 1327 1030 172 35 31 chr2 97321535 97321763 -84426324 + RLTR11A2 LTR ERVK 299 527 0 4 1327 238 277 172 25 chr2 97331389 97331511 -84416576 + MT2B LTR ERVL 139 278 -323 4 1327 644 358 97 89 chr2 97335071 97335393 -84412694 - ORR1E LTR MaLR -8 371 8 4 1327 1702 232 69 33 chr2 97343862 97344312 -84403775 - RLTR12A LTR ERVK -91 477 12 4 1327 748 284 121 23 chr2 97352589 97352922 -84395165 - RLTR40 LTR ERVK -4 813 446 4 1327 748 284 121 23 chr2 97352953 97353008 -84395079 - RLTR40 LTR ERVK -372 445 388 4 1327 1386 268 12 32 chr2 97353222 97353565 -84394522 - ORR1C1 LTR MaLR -42 336 1 5 1327 767 250 36 103 chr2 97353565 97353837 -84394250 - RLTR40 LTR ERVK -428 389 137 4 1327 246 303 57 96 chr2 97370700 97370857 -84377230 - RLTR8 LTR ERVK 0 365 215 5 1327 726 268 0 98 chr2 97383121 97383377 -84364710 - RLTR11B LTR ERVK -222 231 1 5 1327 225 326 10 61 chr2 97384869 97384967 -84363120 - MLT1C LTR MaLR -28 439 347 5 1328 1217 224 32 124 chr2 97387602 97387801 -84360286 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 166 5 1328 1217 224 32 124 chr2 97387849 97388061 -84360026 - ORR1D1 LTR MaLR -209 165 1 5 1328 798 250 80 117 chr2 97391713 97392139 -84355948 + MT2A LTR ERVL 3 460 -73 5 1328 1473 243 38 25 chr2 97394124 97394517 -84353570 + MTD LTR MaLR 1 398 -21 5 1328 229 342 85 26 chr2 97396108 97396261 -84351826 - MER67D LTR ERV1 -23 491 330 5 1328 407 296 145 32 chr2 97396268 97396574 -84351513 - MER67C LTR ERV1 -271 390 77 5 1328 502 261 84 0 chr2 97401842 97401984 -84346103 + MTD LTR MaLR 8 161 -258 5 1328 747 266 93 111 chr2 97411126 97411460 -84336627 - RLTR18 LTR ERVK -5 611 284 5 1328 252 309 10 31 chr2 97411640 97411737 -84336350 - RLTR18 LTR ERVK -443 173 79 5 1328 236 309 71 20 chr2 97419835 97419934 -84328153 - MLT1A0 LTR MaLR -261 104 1 6 1328 999 271 54 48 chr2 97426971 97427324 -84320763 - ORR1E LTR MaLR -4 355 1 6 1328 553 250 34 7 chr2 97430799 97430948 -84317139 + MLT1A1 LTR MaLR 256 408 0 6 1328 2447 151 27 24 chr2 97460040 97460506 -84287581 - RLTR13D3 LTR ERVK 0 1114 496 6 1328 665 306 69 86 chr2 97460957 97461433 -84286654 - MT2B LTR ERVL 0 601 5 6 1328 323 279 215 59 chr2 97462118 97462579 -84285508 - MT2A LTR ERVL 0 533 1 6 1328 250 351 0 13 chr2 97466852 97466927 -84281160 - MER74A LTR ERVL -454 104 31 6 1328 795 260 86 4 chr2 97482700 97482932 -84265155 - RMER15 LTR ERVL -47 528 278 6 1328 317 216 44 22 chr2 97483011 97483101 -84264986 - RMER15 LTR ERVL -462 113 22 6 1328 4857 119 74 64 chr2 97484284 97485208 -84262879 - RMER16-int LTR ERVK -1115 4291 3359 6 1328 12111 130 39 10 chr2 97485227 97487198 -84260889 - RMER16-int LTR ERVK -3378 2028 1 6 1328 528 147 71 87 chr2 97487198 97487325 -84260762 - RMER16 LTR ERVK 0 533 409 6 1328 5370 141 37 18 chr2 97488153 97489093 -84258994 + RMER17B LTR ERVK 1 958 0 7 1328 3035 82 55 4 chr2 97501048 97501502 -84246585 + RLTR44C LTR ERVK 1 477 -25 3 1328 496 271 5 101 chr2 97502164 97502353 -84245734 + RMER5 LTR ERV1 215 385 -149 6 1328 517 311 25 95 chr2 97507594 97507829 -84240258 - MLT1F2 LTR MaLR -53 627 298 1 1328 3110 317 45 33 chr2 97508434 97510479 -84237608 - MMERVK10C-int LTR ERVK -2364 5217 3149 1 20 2913 325 49 41 chr2 97517129 97519092 -84228995 - MMERVK10C-int LTR ERVK -3790 2752 763 1 1329 2913 325 49 41 chr2 97519687 97519786 -84228301 - MMERVK10C-int LTR ERVK -5780 762 673 1 1329 304 278 118 18 chr2 97519937 97520047 -84228040 - RLTR10-int LTR ERVK -6765 915 795 2 1329 656 236 88 0 chr2 97520161 97520343 -84227744 - RLTR10-int LTR ERVK -1135 852 655 2 1329 325 130 0 0 chr2 97520375 97520421 -84227666 - RLTR10-int LTR ERVK -7314 267 222 2 1329 1894 161 13 7 chr2 97520453 97520760 -84227327 - RLTR27 LTR ERVK 0 309 1 2 1329 493 137 105 0 chr2 97527435 97527482 -84220605 + RMER15 LTR ERVL 5 51 -524 3 1329 493 137 105 0 chr2 97527753 97527800 -84220287 + RMER15 LTR ERVL 52 108 -467 3 1329 760 284 5 20 chr2 97528232 97528433 -84219654 - MTD LTR MaLR -209 210 13 3 1329 663 229 67 6 chr2 97528479 97528659 -84219428 + RLTR40 LTR ERVK 470 660 -157 3 1329 3316 43 5 0 chr2 97529720 97530114 -84217973 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 1329 3253 146 175 48 chr2 97538947 97539310 -84208777 - RMER17A2 LTR ERVK 0 906 447 4 1329 3253 146 175 48 chr2 97539415 97539855 -84208232 - RMER17A2 LTR ERVK -460 446 2 4 1329 771 259 257 3 chr2 97542675 97542963 -84205124 - MTEb LTR MaLR -1 378 18 5 1329 580 319 104 17 chr2 97544371 97544697 -84203390 + ORR1E LTR MaLR 5 370 0 6 1329 1761 221 10 60 chr2 97548800 97548882 -84199205 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 319 6 1329 3815 160 90 3 chr2 97548882 97549560 -84198527 + RMER19A LTR ERVK 1 737 0 6 1329 8221 188 44 101 chr2 97549560 97551916 -84196171 - ORR1B1-int LTR MaLR -4 1959 1 6 1329 851 179 9 21 chr2 97551916 97552096 -84195991 - ORR1B1 LTR MaLR 0 421 249 6 1329 281 377 89 16 chr2 97553678 97553802 -84194285 - MLT1J2 LTR MaLR -244 204 72 6 1329 263 344 0 0 chr2 97554274 97554367 -84193720 - MLT2D LTR ERVL -321 93 1 7 1329 1050 231 36 69 chr2 97556870 97557260 -84190827 + RMER10A LTR ERVL 65 441 -1 7 1329 397 219 28 28 chr2 97558276 97558384 -84189703 - RLTR23 LTR ERV1 -7 423 316 8 1329 909 170 69 0 chr2 97562888 97563047 -84185040 + RLTR25A LTR ERVK 1 170 -858 8 1329 1672 242 87 0 chr2 97563051 97563418 -84184669 - RMER20A LTR ERVK -3 513 115 9 1329 2493 209 189 78 chr2 97563450 97564130 -84183957 + RLTR25A LTR ERVK 168 798 -305 8 1329 2493 209 189 78 chr2 97564176 97564338 -84183749 + RLTR25A LTR ERVK 799 1102 -1 8 1329 240 167 46 77 chr2 97578335 97578400 -84169687 - RMER20A LTR ERVK -268 248 186 9 1329 226 233 267 19 chr2 97580168 97580273 -84167814 - RMER15 LTR ERVL -90 485 355 1 1329 1952 215 23 23 chr2 97580272 97580671 -84167416 - MTC LTR MaLR -22 399 1 1 1329 365 64 0 0 chr2 97582203 97582250 -84165837 + ORR1A3 LTR MaLR 280 326 0 1 1329 351 285 45 71 chr2 97583918 97584091 -84163996 + RMER12 LTR ERVK 868 993 -411 1 1329 840 229 64 172 chr2 97584140 97584182 -84163905 + RMER12 LTR ERVK 960 990 -332 1 1329 840 229 64 172 chr2 97584263 97584627 -84163460 + RMER12 LTR ERVK 991 1322 0 1 1329 2910 93 0 5 chr2 97587131 97587529 -84160558 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1329 7019 97 14 70 chr2 97587529 97588692 -84159395 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 1 1329 2708 112 5 2 chr2 97588692 97589087 -84159000 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1329 638 264 14 12 chr2 97590325 97590493 -84157594 + ORR1D2 LTR MaLR 163 333 -51 1 1329 2626 32 35 0 chr2 97593703 97594017 -84154070 - IAPLTR2b LTR ERVK -2 325 1 1 1329 254 338 32 13 chr2 97594426 97594582 -84153505 + MER67D LTR ERV1 22 180 -334 1 1329 290 191 63 0 chr2 97599832 97599895 -84148192 - MTE2a LTR MaLR 0 379 313 1 1329 651 303 99 51 chr2 97599975 97600309 -84147778 - MTE2a LTR MaLR -28 351 2 1 1329 4121 33 12 2 chr2 97607305 97607793 -84140294 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 1 1329 353 293 42 60 chr2 97608111 97608278 -84139809 - MLT1D LTR MaLR -333 172 9 1 1329 3590 107 54 82 chr2 97620003 97620981 -84127106 - RLTR13B1 LTR ERVK 0 929 1 1 1329 1052 235 66 77 chr2 97632164 97632542 -84115545 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 1 1329 4049 147 50 30 chr2 97634080 97634895 -84113192 - RMER17B LTR ERVK -59 899 4 1 1329 263 293 90 95 chr2 97637724 97637924 -84110163 - RMER20B LTR ERVK 0 516 318 1 1329 311 284 41 49 chr2 97640608 97640730 -84107357 - RMER20B LTR ERVK -502 125 5 1 1330 287 307 94 8 chr2 97659233 97659361 -84088726 + RMER5 LTR ERV1 396 534 0 2 1330 299 274 35 65 chr2 97660742 97660972 -84087115 + RMER17D2 LTR ERVK 156 378 -431 2 1330 345 278 90 73 chr2 97670108 97670353 -84077734 - RLTR15 LTR ERVK -66 293 45 2 1330 434 379 78 16 chr2 97673082 97673339 -84074748 + MLT1A0 LTR MaLR 81 353 -12 2 1330 1018 269 145 102 chr2 97687971 97688397 -84059690 + MT2A LTR ERVL 2 461 -72 2 1330 1018 269 145 102 chr2 97688500 97688581 -84059506 + MT2A LTR ERVL 462 532 -1 2 1330 270 245 0 0 chr2 97692268 97692328 -84055759 - ORR1E LTR MaLR -277 82 22 2 1330 623 315 18 69 chr2 97693881 97694157 -84053930 + MT2B LTR ERVL 293 554 -47 2 1330 1801 209 13 51 chr2 97698227 97698620 -84049467 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 2 1330 2207 221 70 14 chr2 97699264 97699779 -84048308 - RLTR20B2 LTR ERVK -14 546 3 2 1330 3463 47 31 0 chr2 97701576 97701999 -84046088 + RLTR10C LTR ERVK 1 436 0 2 1330 989 298 36 66 chr2 97702164 97702527 -84045560 + ORR1E LTR MaLR 4 355 -4 2 1330 1700 217 19 6 chr2 97702690 97703052 -84045035 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 2 1330 225 183 46 77 chr2 97725565 97725630 -84022457 + RMER20A LTR ERVK 186 248 -268 2 1330 812 323 48 25 chr2 97727235 97727591 -84020496 - MT2A LTR ERVL -75 458 95 2 1330 797 272 113 46 chr2 97727916 97728332 -84019755 - RMER5 LTR ERV1 -10 524 81 2 1330 1577 152 33 10 chr2 97734197 97734496 -84013591 - RMER10B LTR ERVL -48 350 45 3 1330 606 318 71 20 chr2 97746660 97746856 -84001231 + ORR1E LTR MaLR 32 237 -122 3 1330 329 356 43 48 chr2 97747336 97747522 -84000565 - ORR1E LTR MaLR -121 238 54 3 1330 311 215 146 27 chr2 97756512 97756622 -83991465 - RMER12B LTR ERVK 0 1404 1282 3 1330 491 228 11 51 chr2 97757244 97757420 -83990667 - RLTR21 LTR ERVK -505 1067 899 3 1330 4125 199 25 52 chr2 97758911 97759828 -83988259 - RLTR21 LTR ERVK -680 892 1 3 1330 291 250 45 36 chr2 97766204 97766337 -83981750 - MLT1C LTR MaLR -15 452 237 3 1330 280 357 63 0 chr2 97766768 97766894 -83981193 - ORR1E LTR MaLR -225 134 1 3 1330 4137 146 159 64 chr2 97771657 97772591 -83975496 - RLTR13D2 LTR ERVK 0 1023 1 3 1330 3381 28 2 2 chr2 97773970 97774366 -83973721 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 1330 9181 32 2 1 chr2 97774366 97775463 -83972624 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 3 1330 3387 25 2 2 chr2 97775463 97775859 -83972228 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 1330 2782 61 9 71 chr2 97779124 97779546 -83968541 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 1331 252 322 11 11 chr2 97780092 97780183 -83967904 + MLT1E1 LTR MaLR 562 652 -2 3 1331 3443 25 2 0 chr2 97782944 97783339 -83964748 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 1331 9616 17 0 0 chr2 97783339 97784437 -83963650 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 3 1331 3443 25 2 0 chr2 97784437 97784832 -83963255 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 1331 237 322 143 30 chr2 97792651 97792952 -83955135 + LTR37B LTR ERV1 11 345 -123 3 1331 437 215 187 16 chr2 97793146 97793269 -83954818 + MTC LTR MaLR 58 201 -220 3 1331 878 249 0 21 chr2 97793789 97793982 -83954105 + MTC LTR MaLR 232 420 -1 3 1331 1286 246 86 19 chr2 97793983 97794343 -83953744 + MTC-int LTR MaLR 3 386 -872 3 1331 594 261 7 14 chr2 97796265 97796405 -83951682 + MTC-int LTR MaLR 380 518 -740 3 1331 1600 245 95 45 chr2 97798527 97799062 -83949025 + MTC-int LTR MaLR 695 1256 -2 3 1331 912 244 68 17 chr2 97799064 97799298 -83948789 + MTC LTR MaLR 1 246 -175 3 1331 4130 169 51 57 chr2 97805009 97805917 -83942170 + RLTR13D6 LTR ERVK 1 902 0 4 1331 1814 150 18 60 chr2 97808903 97809236 -83938851 - ORR1A4 LTR MaLR -8 321 3 4 1331 2256 122 74 112 chr2 97814192 97814692 -83933395 - RLTR45 LTR ERVK -1 481 1 4 1331 226 341 0 45 chr2 97818097 97818186 -83929901 + MTE2a LTR MaLR 55 139 -240 4 1331 239 397 95 0 chr2 97821692 97821818 -83926269 + MLT1G LTR MaLR 362 499 -92 4 1331 1586 192 3 11 chr2 97822071 97822355 -83925732 - MTC LTR MaLR -57 364 83 4 1331 432 374 22 5 chr2 97832827 97833050 -83915037 - MLT1A1 LTR MaLR -5 403 177 4 1331 2861 76 8 13 chr2 97835134 97835532 -83912555 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 1331 453 354 72 4 chr2 97839452 97839730 -83908357 - MLT1B LTR MaLR -67 323 27 4 1331 2531 142 18 18 chr2 97865496 97865933 -83882154 + RLTR9B LTR ERVK 1 437 0 5 1331 257 345 43 29 chr2 97866051 97866260 -83881827 + ETnERV2-int LTR ERVK 112 323 -2991 5 1331 11163 154 63 49 chr2 97866284 97866312 -83881775 + ETnERV2-int LTR ERVK 1056 1080 -6326 5 1331 11163 154 63 49 chr2 97866422 97866766 -83881321 + ETnERV2-int LTR ERVK 1081 1417 -5989 5 1331 11163 154 63 49 chr2 97866803 97868802 -83879285 + ETnERV2-int LTR ERVK 1418 3461 -3945 5 1331 332 211 62 10 chr2 97871245 97871258 -83876829 + RMER16-int LTR ERVK 2367 2384 -2460 5 1331 4243 164 61 23 chr2 97871300 97872125 -83875962 + RMER16-int LTR ERVK 3323 4176 -1230 5 1331 395 299 62 25 chr2 97872228 97872500 -83875587 + ETnERV2-int LTR ERVK 6223 6425 -981 5 1331 1313 169 68 12 chr2 97872556 97872808 -83875279 - RLTR9B LTR ERVK -11 426 161 5 1331 344 127 40 40 chr2 97872954 97873028 -83875059 + ETnERV2-int LTR ERVK 7331 7404 -2 5 1331 2457 140 35 21 chr2 97873029 97873410 -83874677 + RLTR9B LTR ERVK 1 386 -51 5 1331 2546 82 145 139 chr2 97873410 97873919 -83874168 + RLTR1B LTR ERV1 1 512 0 5 1331 2457 140 35 21 chr2 97873919 97873967 -83874120 + RLTR9B LTR ERVK 387 436 -1 5 1331 2850 77 51 0 chr2 97876305 97876696 -83871391 + RLTR10A LTR ERVK 1 411 0 5 1331 2944 58 45 5 chr2 97878431 97878810 -83869277 - MTA_Mm LTR MaLR -2 394 1 5 1331 2152 207 159 13 chr2 97883620 97884153 -83863934 + RMER19C LTR ERVK 1 611 0 5 1331 757 336 63 37 chr2 97892217 97892516 -83855571 + MTEa LTR MaLR 9 317 -62 5 1331 757 336 63 37 chr2 97892563 97892612 -83855475 + MTEa LTR MaLR 318 366 -13 5 1331 1214 268 73 60 chr2 97893287 97893835 -83854252 + MYSERV-int LTR ERVK 3768 4322 -2228 5 1331 480 294 69 15 chr2 97900545 97900749 -83847338 - LTR48 LTR ERV1 -41 746 532 5 1331 781 332 139 16 chr2 97904706 97905137 -83842950 + MLT1D LTR MaLR 22 505 0 5 1331 230 281 61 0 chr2 97905560 97905642 -83842445 + MER34 LTR ERV1 385 471 -71 5 1332 280 302 52 0 chr2 97916013 97916109 -83831978 - MTD LTR MaLR -31 388 288 5 1332 618 294 198 76 chr2 97917374 97917805 -83830282 - MT2A LTR ERVL -35 549 1 5 1332 5636 236 26 4 chr2 97917805 97919108 -83828979 - MERVL_2A-int LTR ERVL 0 5761 4430 5 1332 2490 256 68 25 chr2 97920700 97921175 -83826912 - MERVL_2A-int LTR ERVL -1340 4421 3911 5 1332 2411 188 23 148 chr2 97921175 97921960 -83826127 + RMER6C LTR ERVK 1 687 -3 5 1332 2490 256 68 25 chr2 97921960 97922192 -83825895 - MERVL_2A-int LTR ERVL -1851 3910 3684 5 1332 1082 212 152 54 chr2 97922565 97922954 -83825133 - MERVL_2A-int LTR ERVL -5334 427 1 5 1332 700 257 68 112 chr2 97923097 97923466 -83824621 - MT2B LTR ERVL -77 524 9 5 1332 539 295 30 30 chr2 97924728 97924896 -83823191 - MTD LTR MaLR -218 201 38 5 1332 583 320 50 10 chr2 97927645 97927847 -83820240 + MTEa LTR MaLR 150 377 -2 5 1332 1583 211 55 6 chr2 97934634 97934977 -83813110 + ORR1B2 LTR MaLR 1 360 -7 6 1332 512 302 72 19 chr2 97935694 97935903 -83812184 + MT2A LTR ERVL 308 527 -6 6 1332 796 249 94 55 chr2 97938597 97938944 -83809143 - MTD LTR MaLR 0 421 21 6 1332 316 250 102 7 chr2 97938970 97939107 -83808980 - MTD-int LTR MaLR -2 1256 1107 6 1332 864 319 34 67 chr2 97939159 97939546 -83808541 - MTD-int LTR MaLR -673 585 212 6 1332 782 322 56 19 chr2 97943548 97943814 -83804273 + ORR1E LTR MaLR 1 276 -83 6 1332 3273 188 119 44 chr2 97946638 97947529 -83800558 + RMER17B LTR ERVK 1 958 0 6 1332 1519 249 158 64 chr2 97951014 97951034 -83797053 + RMER19B LTR ERVK 308 324 -578 6 1332 1519 249 158 64 chr2 97951077 97951600 -83796487 + RMER19B LTR ERVK 325 902 0 6 1332 670 280 8 0 chr2 97955020 97955152 -83792935 - ETnERV2-int LTR ERVK -204 7202 7070 6 1332 407 331 152 36 chr2 97968827 97969349 -83778738 - MLT2B5 LTR ERVL -6 595 13 6 1332 243 326 109 0 chr2 97974518 97974610 -83773477 - RMER13A LTR ERVK -103 805 704 6 1332 2309 256 84 21 chr2 97974645 97975310 -83772777 - RMER13A LTR ERVK -153 707 1 6 1332 286 328 30 141 chr2 97983317 97983516 -83764571 - MLT2B1 LTR ERVL -18 549 373 6 1332 257 261 141 16 chr2 97983600 97983721 -83764366 - MLT2B1 LTR ERVL -367 153 18 6 1332 327 212 0 0 chr2 98008003 98008069 -83740018 - MTE2a LTR MaLR 0 379 314 8 1332 1221 178 103 26 chr2 98020475 98020746 -83727341 + ORR1B1 LTR MaLR 1 292 -102 2 1332 2484 130 4 10 chr2 98021948 98022420 -83725667 - IAPEY3-int LTR ERVK -222 7458 6965 2 1332 1029 138 12 0 chr2 98022485 98022645 -83725442 - IAP-d-int LTR ERVK -1374 5168 5007 3 1332 335 193 0 0 chr2 98022645 98022702 -83725385 - IAP-d-int LTR ERVK -6039 503 447 3 1332 2007 269 51 16 chr2 98022719 98023632 -83724455 - IAPEY3-int LTR ERVK -6015 1566 535 2 1332 474 250 29 122 chr2 98023628 98023833 -83724254 - IAPEY3-int LTR ERVK -7494 186 1 2 1332 1217 179 73 44 chr2 98023833 98024155 -83723932 - RLTR46 LTR ERVK -12 373 42 2 1332 334 94 19 0 chr2 98039111 98039164 -83708923 + RMER17C-int LTR ERVK 3185 3238 0 4 1332 489 292 94 73 chr2 98039164 98039357 -83708730 + RMER17C LTR ERVK 1 193 -217 4 1332 489 292 94 73 chr2 98039569 98039704 -83708383 + RMER17C LTR ERVK 194 336 -74 4 1332 784 304 49 52 chr2 98040643 98040990 -83707097 + RMER15 LTR ERVL 218 563 -12 4 1333 449 327 89 49 chr2 98051032 98051389 -83696698 + MTE2a LTR MaLR 48 405 -14 5 1333 556 348 59 23 chr2 98051852 98052108 -83695979 + MLT1A0 LTR MaLR 11 275 -90 5 1333 3345 85 37 4 chr2 98053599 98053883 -83694204 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 282 -193 6 1333 3345 85 37 4 chr2 98053932 98054107 -83693980 + MT2C_Mm LTR ERVL 283 473 -2 6 1333 1424 197 48 45 chr2 98054606 98055005 -83693082 + RMER17C LTR ERVK 2 401 -9 6 1333 247 364 53 15 chr2 98055839 98055970 -83692117 - MER77 LTR ERVL 0 607 472 6 1333 401 268 162 32 chr2 98056126 98056280 -83691807 - MER77 LTR ERVL -419 188 15 6 1333 1339 223 41 64 chr2 98059710 98060054 -83688033 - RLTR25B LTR ERVK -255 773 438 7 1333 1676 85 50 291 chr2 98060054 98060205 -83687882 + RLTR44D LTR ERVK 4 154 -332 7 1333 1676 85 50 291 chr2 98060260 98060703 -83687384 + RLTR44D LTR ERVK 155 454 -32 7 1333 1228 211 69 38 chr2 98060895 98061185 -83686902 - RLTR25B LTR ERVK -579 449 151 7 1333 362 152 76 0 chr2 98073782 98073839 -83674248 + MTD-int LTR MaLR 867 928 -330 8 1333 1402 145 51 4 chr2 98073839 98074115 -83673972 - BGLII_Mus LTR ERVK 0 422 134 8 1333 738 314 129 16 chr2 98076676 98076997 -83671090 + MTD LTR MaLR 1 371 -50 8 1333 511 322 144 11 chr2 98077020 98077061 -83671026 + MTD LTR MaLR 372 417 -4 8 1333 2872 133 0 7 chr2 98077736 98078175 -83669912 + RLTR10C LTR ERVK 1 436 0 9 1333 377 365 45 41 chr2 98087142 98087408 -83660679 + RMER15 LTR ERVL 292 558 -17 9 1333 1594 221 3 8 chr2 98088651 98089012 -83659075 - RLTR15 LTR ERVK 0 359 1 9 1333 1670 219 26 33 chr2 98089014 98089472 -83658615 - MYSERV-int LTR ERVK -2 6548 6094 9 1333 300 109 0 72 chr2 98089473 98089542 -83658545 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -1212 1114 1051 1 1333 252 277 129 35 chr2 98089547 98089663 -83658424 - RMER4A LTR ERVK -30 436 310 1 1333 1484 282 65 65 chr2 98091826 98092785 -83655302 - MYSERV-int LTR ERVK -1557 769 13 9 1333 766 222 34 51 chr2 98093311 98093548 -83654539 - MYSERV6-int LTR ERVK -2196 6763 6531 1 1333 1625 206 8 3 chr2 98094312 98094667 -83653420 - RLTR15 LTR ERVK 0 359 3 1 1333 352 285 26 65 chr2 98098826 98098980 -83649107 + RLTR15 LTR ERVK 1 148 -211 1 1333 272 286 81 54 chr2 98106279 98106390 -83641697 + MT2B LTR ERVL 144 257 -344 1 1333 1350 249 36 12 chr2 98117214 98117547 -83630540 + RMER15 LTR ERVL 92 432 -143 1 1333 1808 164 39 10 chr2 98118562 98118909 -83629178 - ORR1A2 LTR MaLR -8 386 1 1 1333 1934 220 94 13 chr2 98119313 98119937 -83628150 - RMER6A LTR ERVK 0 756 60 1 1333 1171 256 184 28 chr2 98119982 98120049 -83628038 - RMER6A LTR ERVK -631 59 1 1 1333 3720 64 19 0 chr2 98120288 98120754 -83627333 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 475 0 1 1333 424 380 66 57 chr2 98121100 98121449 -83626638 - ORR1E LTR MaLR -2 357 6 1 1333 556 336 60 62 chr2 98122304 98122653 -83625434 - MLT1A0 LTR MaLR -12 362 1 1 1333 373 295 29 0 chr2 98122681 98122786 -83625301 - MLT1C LTR MaLR -359 108 1 1 1333 5295 136 73 5 chr2 98124023 98124918 -83623169 - RMER17B LTR ERVK -2 956 1 1 1333 382 264 47 47 chr2 98135214 98135341 -83612746 + MTD LTR MaLR 269 395 -24 1 1333 2522 169 39 117 chr2 98138367 98139035 -83609052 + RMER6C LTR ERVK 75 690 0 1 1333 1536 216 42 13 chr2 98156618 98156927 -83591160 + RLTR25A LTR ERVK 1 318 -785 2 1333 2080 178 70 112 chr2 98157843 98158201 -83589886 + RLTR25A LTR ERVK 306 679 -424 2 1333 2080 178 70 112 chr2 98158281 98158317 -83589770 + RLTR25A LTR ERVK 680 680 -423 2 1333 2080 188 85 116 chr2 98158497 98158736 -83589351 + RLTR25A LTR ERVK 606 858 -170 2 1333 522 157 0 0 chr2 98159053 98159142 -83588945 + RLTR23 LTR ERV1 10 98 -332 2 1333 937 211 52 165 chr2 98159443 98159807 -83588280 + RLTR23 LTR ERV1 108 430 0 2 1333 870 206 93 85 chr2 98159901 98160171 -83587916 + RLTR25A LTR ERVK 757 1028 0 2 1333 269 201 12 112 chr2 98160549 98160625 -83587462 + MTD LTR MaLR 287 385 -34 2 1333 1052 258 96 13 chr2 98163261 98163575 -83584512 + ORR1C2 LTR MaLR 1 340 -44 2 1333 246 216 0 0 chr2 98163864 98163915 -83584172 + ORR1A3 LTR MaLR 272 322 -4 2 1333 334 239 15 0 chr2 98167079 98167146 -83580941 + RLTR20D LTR ERVK 501 568 0 2 1333 316 294 159 14 chr2 98167865 98168010 -83580077 + MLT-int LTR MaLR 379 544 -1191 2 1333 1560 188 118 6 chr2 98168029 98168367 -83579720 + ORR1C1 LTR MaLR 3 378 0 2 1333 308 316 0 0 chr2 98168832 98168908 -83579179 + MLT-int LTR MaLR 665 740 -995 2 1333 2036 111 3 66 chr2 98169770 98170118 -83577969 + IAPLTR3 LTR ERVK 1 326 0 2 166 46679 96 19 8 chr2 98170118 98177715 -83570372 + IAPLTR3-int LTR ERVK 1 7257 -423 2 1334 2004 105 9 67 chr2 98177715 98178061 -83570026 + IAPLTR3 LTR ERVK 1 326 0 2 1334 2130 177 200 32 chr2 98178861 98179452 -83568635 - RMER6C LTR ERVK 0 690 1 2 1334 344 381 69 60 chr2 98180559 98180908 -83567179 - MLT1A LTR MaLR -8 366 15 2 1334 369 235 0 0 chr2 98188127 98188212 -83559875 - MLT1N2 LTR MaLR -15 547 463 2 1334 2519 194 105 11 chr2 98191115 98191746 -83556341 - RMER6C LTR ERVK 0 690 1 2 1334 254 352 57 8 chr2 98192731 98192854 -83555233 + MER92B LTR ERV1 249 377 -259 2 1334 736 294 161 8 chr2 98195428 98195457 -83552630 - MTD LTR MaLR -3 416 374 2 1334 736 294 161 8 chr2 98196103 98196426 -83551661 - MTD LTR MaLR -46 373 11 2 1334 314 261 21 54 chr2 98196918 98197011 -83551076 + MTC LTR MaLR 10 99 -322 2 1334 2732 58 3 0 chr2 98200758 98201103 -83546984 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 2 1334 3403 23 5 0 chr2 98201919 98202313 -83545774 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 1334 8990 36 4 1 chr2 98202313 98203408 -83544679 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 2 1334 3403 23 5 0 chr2 98203408 98203802 -83544285 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 1334 1288 209 106 41 chr2 98210915 98211378 -83536709 + RMER13B LTR ERVK 5 497 -411 2 1334 2372 123 101 11 chr2 98211378 98211814 -83536273 - RLTR10 LTR ERVK 0 475 1 2 1334 6049 43 5 12 chr2 98211814 98212565 -83535522 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 5736 2 1334 2058 64 41 0 chr2 98212564 98212831 -83535256 - IAPEz-int LTR ERVK -4845 1636 1359 2 1334 3709 56 26 18 chr2 98212831 98213322 -83534765 - IAPEz-int LTR ERVK -5819 662 168 2 1334 227 273 0 0 chr2 98213322 98213366 -83534721 - RLTR27 LTR ERVK -34 275 232 2 1334 286 81 0 0 chr2 98213366 98213403 -83534684 - IAPEz-int LTR ERVK -7400 181 145 2 1334 227 267 0 0 chr2 98213403 98213448 -83534639 - RLTR27 LTR ERVK -34 275 231 2 1334 595 121 15 121 chr2 98213448 98213580 -83534507 - IAPEz-int LTR ERVK -6358 123 6 2 1334 3082 44 2 47 chr2 98213580 98213986 -83534101 - RLTR10 LTR ERVK -2 388 1 2 1334 418 244 111 18 chr2 98213986 98214200 -83533887 + RMER13B LTR ERVK 492 843 -65 2 1334 4340 157 14 18 chr2 98215296 98216016 -83532071 + RMER19A LTR ERVK 19 735 -2 2 1334 718 287 26 23 chr2 98218969 98219276 -83528811 + RLTR15 LTR ERVK 1 308 -51 2 1334 8229 244 39 32 chr2 98220298 98223645 -83524442 + MYSERV6-int LTR ERVK 681 3998 -4961 2 1334 2204 230 48 2 chr2 98230129 98230716 -83517371 + MYSERV6-int LTR ERVK 3988 4601 -4358 2 1334 354 375 25 20 chr2 98231429 98231633 -83516454 - MLT1A0 LTR MaLR -160 205 1 2 1334 251 320 76 49 chr2 98233566 98233750 -83514337 + MLT1G LTR MaLR 7 195 -396 2 1334 260 302 169 11 chr2 98234383 98234567 -83513520 + MER67C LTR ERV1 122 334 -377 2 1334 486 260 8 45 chr2 98234638 98234771 -83513316 - MTD LTR MaLR -19 400 273 3 1334 899 310 78 15 chr2 98236583 98236914 -83511173 + ORR1E LTR MaLR 6 357 -2 3 1334 244 345 18 9 chr2 98236979 98237093 -83510994 + ORR1D2-int LTR MaLR 88 202 -1378 3 1334 706 284 88 102 chr2 98237079 98237463 -83510624 + ORR1D2-int LTR MaLR 805 1183 -187 3 1334 935 225 16 175 chr2 98237778 98238150 -83509937 + MTD LTR MaLR 104 416 -3 3 1334 372 344 14 122 chr2 98238161 98238259 -83509828 + ORR1D2 LTR MaLR 108 181 -189 3 1334 372 344 14 122 chr2 98238327 98238523 -83509564 + ORR1D2 LTR MaLR 182 370 0 3 1334 1516 228 37 29 chr2 98258143 98258491 -83489596 + ORR1B2 LTR MaLR 4 354 -13 3 1334 864 292 84 8 chr2 98258500 98258762 -83489325 - MTD LTR MaLR -54 365 84 3 1334 278 93 70 0 chr2 98275969 98276006 -83472081 + RMER13A LTR ERVK 1 40 -820 3 1334 763 198 22 198 chr2 98276006 98276419 -83471668 + RMER17A2 LTR ERVK 1 322 -584 3 1334 763 198 22 198 chr2 98276550 98276640 -83471447 + RMER17A2 LTR ERVK 323 415 -491 3 1334 1354 155 26 9 chr2 98276660 98276888 -83471199 + RMER13A LTR ERVK 165 396 -464 3 1334 795 256 70 20 chr2 98276885 98277135 -83470952 + RMER13A LTR ERVK 568 908 0 3 1334 410 366 64 25 chr2 98291768 98292082 -83456005 + MLT1A LTR MaLR 26 351 -23 3 1334 248 363 109 43 chr2 98294404 98294614 -83453473 - MLT1F2 LTR MaLR -243 317 94 3 1334 1760 146 43 20 chr2 98294995 98295296 -83452791 + RLTR10E LTR ERVK 1 308 -3 3 1334 2846 196 88 60 chr2 98295301 98296149 -83451938 + MMERVK10C-int LTR ERVK 1 872 -6709 3 1334 1519 156 116 10 chr2 98296124 98296435 -83451652 + RMER16-int LTR ERVK 313 656 -4750 3 1334 2780 97 0 16 chr2 98296480 98296866 -83451221 + MMERVK10C-int LTR ERVK 5293 5672 -1909 3 1334 12673 92 12 43 chr2 98296861 98298714 -83449373 + MMERVK10C-int LTR ERVK 5786 7581 0 3 1334 1994 129 0 16 chr2 98298714 98299030 -83449057 + RLTR10E LTR ERVK 1 311 0 3 1334 256 333 0 0 chr2 98299699 98299771 -83448316 + MLT1H LTR MaLR 60 131 -418 3 1334 1210 248 96 3 chr2 98301781 98302084 -83446003 + ORR1B1 LTR MaLR 1 331 -63 3 1334 342 371 51 52 chr2 98302877 98303198 -83444889 + MLT1E2 LTR MaLR 302 608 -19 3 1335 1749 182 23 26 chr2 98307047 98307391 -83440696 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1443 1785 -63 3 1335 1891 116 23 10 chr2 98317099 98317396 -83430691 + RMER17A2 LTR ERVK 1 301 -605 4 1335 2234 169 11 41 chr2 98317468 98317906 -83430181 + RMER17A2 LTR ERVK 482 906 0 4 1335 308 325 111 24 chr2 98318703 98318829 -83429258 + MTEb LTR MaLR 15 151 -228 4 1335 2114 223 39 79 chr2 98320998 98321453 -83426634 + ORR1B1-int LTR MaLR 931 1387 -122 4 1335 2114 223 39 79 chr2 98321689 98321752 -83426335 + ORR1B1-int LTR MaLR 1388 1436 -73 4 1335 2114 223 39 79 chr2 98322131 98322170 -83425917 + ORR1B1-int LTR MaLR 1437 1467 -42 4 1335 1775 165 41 74 chr2 98324834 98325252 -83422835 + RLTR9F LTR ERVK 1 404 -11 4 1335 1509 153 135 30 chr2 98347494 98347864 -83400223 + RLTR9E LTR ERVK 1 409 0 4 1335 421 321 62 31 chr2 98355227 98355420 -83392667 + MLT2B4 LTR ERVL 10 208 -348 4 1335 1636 185 6 55 chr2 98357643 98357986 -83390101 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 4 1335 872 218 40 35 chr2 98365324 98365552 -83382535 + MTC LTR MaLR 1 229 -192 4 1335 399 221 106 0 chr2 98365513 98365617 -83382470 - MTC LTR MaLR -111 310 196 4 1335 897 214 69 5 chr2 98366508 98366710 -83381377 + MTC LTR MaLR 199 413 -8 4 1335 347 405 117 8 chr2 98374340 98374606 -83373481 - MLT1E LTR MaLR -46 607 313 5 1335 1568 149 42 67 chr2 98387985 98388316 -83359771 - RMER6A LTR ERVK -433 323 1 5 1335 2272 181 13 22 chr2 98388950 98389407 -83358680 - RLTR11B LTR ERVK 0 453 1 5 1335 1233 197 34 19 chr2 98396420 98396689 -83351398 - RMER6D LTR ERVK 0 690 418 5 1335 542 288 94 117 chr2 98396707 98397143 -83350944 + RLTR23 LTR ERV1 5 430 0 5 1335 1399 219 46 12 chr2 98397146 98397178 -83350909 - RMER6D LTR ERVK -316 404 372 5 1335 1399 219 46 12 chr2 98397292 98397588 -83350499 - RMER6D LTR ERVK -349 371 65 5 1335 392 259 26 0 chr2 98398034 98398150 -83349937 + MER57A-int LTR ERV1 5825 5943 -244 5 1335 548 190 7 141 chr2 98408471 98408606 -83339481 - ORR1A4 LTR MaLR -212 117 1 5 1335 308 343 52 7 chr2 98412745 98412880 -83335207 - MLT1C LTR MaLR -291 176 36 5 1335 236 362 46 37 chr2 98419429 98419538 -83328549 - LTR82A LTR ERVL 0 872 763 5 1335 280 367 34 56 chr2 98419718 98419952 -83328135 - LTR82A LTR ERVL -396 476 248 5 1335 1287 185 39 58 chr2 98421777 98422091 -83325996 + RMER6C LTR ERVK 415 752 -4 5 1336 3314 199 69 27 chr2 98435420 98436193 -83311894 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1 805 -1043 5 1336 1100 172 70 9 chr2 98436381 98436610 -83311477 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1591 1833 -15 5 1336 2427 159 37 37 chr2 98445046 98445528 -83302559 + RLTR45 LTR ERVK 1 482 0 6 1336 3481 173 60 72 chr2 98452757 98453591 -83294496 - RLTR13C1 LTR ERVK -159 824 1 6 1336 3232 121 11 61 chr2 98453867 98454406 -83293681 - RLTR1B LTR ERV1 0 512 1 6 1336 412 178 81 91 chr2 98464631 98464730 -83283357 - MT2B LTR ERVL -344 257 160 6 1336 848 230 21 16 chr2 98486123 98486317 -83261770 - MTB_Mm LTR MaLR -5 402 208 6 1336 1198 201 66 7 chr2 98486317 98486588 -83261499 - MERVL_2A-int LTR ERVL -2157 3604 3318 6 1336 1024 185 41 0 chr2 98486591 98486786 -83261301 - MERVL_2A-int LTR ERVL -2780 2981 2779 6 1336 2915 170 16 0 chr2 98487077 98487576 -83260511 - MERVL_2A-int LTR ERVL -2979 2782 2276 6 1336 2416 242 36 7 chr2 98487570 98488120 -83259967 - MERVL_2A-int LTR ERVL -796 4965 4400 6 1336 620 248 77 7 chr2 98488122 98488414 -83259673 - MT2B LTR ERVL -214 387 1 6 1336 2358 207 19 21 chr2 98489040 98489568 -83258519 - RLTR11A2 LTR ERVK 0 527 1 6 1336 561 220 134 45 chr2 98491916 98492073 -83256014 - MTD LTR MaLR -55 364 194 6 1336 393 149 30 0 chr2 98504513 98504580 -83243507 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 302 1 1336 463 248 68 0 chr2 98504584 98504701 -83243386 + RMER4A LTR ERVK 313 437 -29 1 1336 388 201 138 41 chr2 98504715 98504860 -83243227 + MYSERV6-int LTR ERVK 7767 7925 -1034 1 1336 3022 39 24 0 chr2 98509266 98509647 -83238440 - MTA_Mm LTR MaLR -1 395 6 2 1336 7405 81 38 8 chr2 98509651 98510718 -83237369 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 2 1336 1783 50 0 0 chr2 98510718 98510936 -83237151 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 179 2 1336 1199 51 90 0 chr2 98511688 98511865 -83236222 - MTA_Mm LTR MaLR -203 193 1 2 1336 594 233 33 75 chr2 98517897 98518126 -83229961 - ORR1B1 LTR MaLR -115 259 41 3 1336 2208 252 45 176 chr2 98518643 98518900 -83229187 - RLTR25B LTR ERVK 0 1103 887 4 1336 2208 252 45 176 chr2 98518960 98519080 -83229007 - RLTR25B LTR ERVK -217 886 765 4 1336 3540 198 75 26 chr2 98519645 98520530 -83227557 - RLTR25B LTR ERVK -169 859 6 4 1336 346 359 126 9 chr2 98521036 98521258 -83226829 + MTEb LTR MaLR 3 250 -129 4 1336 797 225 28 0 chr2 98521447 98521625 -83226462 + MTC LTR MaLR 29 211 -210 4 1336 677 123 40 1 chr2 98521680 98521802 -83226285 - ORR1A3 LTR MaLR -199 147 5 4 1336 318 306 82 53 chr2 98538319 98538526 -83209561 + RLTR12B LTR ERVK 18 230 -298 7 1336 1207 107 32 11 chr2 98539774 98539963 -83208124 + MTB_Mm LTR MaLR 215 407 0 8 1336 4123 98 2 27 chr2 98544976 98545575 -83202512 + MT2B2 LTR ERVL 1 584 0 9 1336 840 204 153 16 chr2 98548065 98548254 -83199833 - RLTR20B3 LTR ERVK 0 577 363 9 1336 692 243 27 55 chr2 98555149 98555332 -83192755 - ORR1C1 LTR MaLR -16 362 185 1 1336 1501 211 191 39 chr2 98555510 98555762 -83192325 - RMER6C LTR ERVK -3 687 419 1 1336 1501 211 191 39 chr2 98555812 98556155 -83191932 - RMER6C LTR ERVK -272 418 1 1 1336 704 303 63 46 chr2 98558349 98558698 -83189389 - ORR1E LTR MaLR 0 359 5 1 1337 977 247 105 8 chr2 98566784 98567041 -83181046 - MTC LTR MaLR 0 421 140 1 1337 294 192 187 28 chr2 98569835 98569942 -83178145 - MTC LTR MaLR -270 126 3 1 1337 292 350 48 74 chr2 98579881 98580112 -83167975 + MTD LTR MaLR 22 246 -173 1 1337 697 349 24 24 chr2 98581815 98582106 -83165981 + MTD LTR MaLR 1 291 -128 1 1337 1496 304 51 111 chr2 98582108 98582990 -83165097 + MTC-int LTR MaLR 43 1439 -524 1 1337 366 236 44 35 chr2 98588453 98588567 -83159520 + RMER6-int LTR ERVK 215 329 -2848 1 1337 5273 228 47 12 chr2 98589028 98590420 -83157667 + RMER6-int LTR ERVK 316 1792 -1385 1 1337 672 269 72 5 chr2 98590482 98590691 -83157396 + RMER6-int LTR ERVK 2645 2867 -2393 1 1337 2762 171 69 10 chr2 98591671 98592252 -83155835 - RMER17B LTR ERVK -25 933 319 1 1337 1951 175 6 3 chr2 98597331 98597664 -83150423 - RMER17B LTR ERVK -624 334 1 1 1337 2171 257 36 33 chr2 98600817 98601007 -83147080 + RMER6-int LTR ERVK 3881 4057 -4902 1 1337 2171 243 62 19 chr2 98601189 98602017 -83146070 + RMER6-int LTR ERVK 4058 4610 -4349 1 1337 760 211 107 13 chr2 98602021 98602259 -83145828 + RMER6C LTR ERVK 4 302 -388 1 1337 965 276 157 49 chr2 98614827 98615215 -83132872 + RLTR20D LTR ERVK 139 568 0 1 1337 2530 115 44 3 chr2 98616090 98616474 -83131613 - MTB LTR MaLR 0 400 1 1 1337 3095 291 10 12 chr2 98624188 98625202 -83122885 - RMER6-int LTR ERVK -1603 3657 2646 1 1337 5943 217 38 10 chr2 98625363 98626762 -83121325 - RMER6-int LTR ERVK -3532 1728 215 1 1337 740 320 53 49 chr2 98631396 98631794 -83116293 + RLTR26 LTR ERVK 1 417 -225 1 1337 11013 223 62 36 chr2 98632097 98635678 -83112409 + MERVK26-int LTR ERVK 13 3732 -3187 1 1337 11013 223 62 36 chr2 98635737 98636787 -83111300 + MERVK26-int LTR ERVK 3733 4824 -2095 1 1337 2914 14 3 57 chr2 98636787 98637175 -83110912 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 1 1337 28775 22 1 1 chr2 98637175 98640446 -83107641 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 3210 1 1337 7447 94 95 22 chr2 98640445 98641662 -83106425 - IAPEz-int LTR ERVK -5168 1313 8 1 1337 2914 14 3 57 chr2 98641662 98642050 -83106037 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 1 1337 8895 192 152 29 chr2 98642050 98642392 -83105695 + MERVK26-int LTR ERVK 4819 5201 -1718 1 1337 8895 198 33 13 chr2 98642450 98642661 -83105426 + MERVK26-int LTR ERVK 5202 5436 -1483 1 1337 8895 198 33 13 chr2 98642704 98643572 -83104515 + MERVK26-int LTR ERVK 5437 6319 -600 1 1337 8895 198 33 13 chr2 98643640 98644239 -83103848 + MERVK26-int LTR ERVK 6320 6915 -4 1 1337 484 252 73 51 chr2 98644242 98644540 -83103547 + RLTR26 LTR ERVK 1 337 -305 1 1337 404 272 38 95 chr2 98648894 98649163 -83098924 + RLTR22_Mur LTR ERVK 626 889 -919 2 1337 1485 278 124 45 chr2 98649432 98650077 -83098010 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1116 1811 -37 2 1337 558 348 109 17 chr2 98659398 98659736 -83088351 + MTD LTR MaLR 13 381 -38 2 1337 289 266 37 89 chr2 98665181 98665371 -83082716 - RMER17B LTR ERVK -502 456 277 2 1337 312 326 48 87 chr2 98670832 98671040 -83077047 + ORR1E LTR MaLR 3 202 -157 2 1337 270 354 54 0 chr2 98671099 98671229 -83076858 + ORR1E LTR MaLR 236 372 -7 2 1337 1202 349 65 36 chr2 98671239 98671931 -83076156 + ORR1E-int LTR MaLR 9 720 -860 2 1337 2320 227 45 13 chr2 98683635 98684170 -83063917 - RLTR12A LTR ERVK -12 556 5 2 1337 3780 160 87 45 chr2 98684206 98685061 -83063026 - RLTR13D6 LTR ERVK -2 927 1 2 1337 322 261 106 69 chr2 98686789 98687007 -83061080 + MTE-int LTR MaLR 1316 1541 -39 2 1337 389 330 89 9 chr2 98687036 98687319 -83060768 + MTEa LTR MaLR 44 379 0 2 1337 2229 125 0 0 chr2 98688082 98688401 -83059686 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 2 1337 5947 131 15 14 chr2 98688401 98689382 -83058705 - ORR1A2-int LTR MaLR 0 1963 982 2 1337 1508 216 42 90 chr2 98691734 98692136 -83055951 + ORR1C2 LTR MaLR 1 383 -1 2 1337 941 328 30 24 chr2 98692827 98693196 -83054891 + MTE2b LTR MaLR 2 372 -7 2 1337 412 359 13 52 chr2 98693991 98694223 -83053864 + MLT1C LTR MaLR 59 281 -186 2 167 414 344 64 0 chr2 98697097 98697254 -83050833 + MLT1B LTR MaLR 1 167 -223 2 1338 2999 78 27 5 chr2 98697271 98697683 -83050404 + BGLII LTR ERVK 1 421 0 2 1338 364 294 18 121 chr2 98716435 98716785 -83031302 + RLTR22_Mur LTR ERVK 483 789 -1019 2 1338 840 249 97 73 chr2 98716891 98717220 -83030867 + RMER12 LTR ERVK 958 1294 -28 2 1338 542 318 65 57 chr2 98718768 98719135 -83028952 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 3 1338 476 346 31 19 chr2 98719199 98719458 -83028629 + ERVL-int LTR ERVL 4837 5098 -659 3 1338 713 291 120 47 chr2 98731535 98732044 -83016043 + RLTR20A1 LTR ERVK 6 551 0 3 1338 387 265 79 7 chr2 98735027 98735179 -83012908 - MTD LTR MaLR 0 419 257 3 1338 241 315 41 0 chr2 98735424 98735497 -83012590 - MTD LTR MaLR -340 79 4 3 1338 1721 250 42 2 chr2 98735856 98736261 -83011826 + MTC LTR MaLR 1 421 0 3 1338 281 382 29 14 chr2 98740947 98741085 -83007002 + MTD LTR MaLR 40 179 -240 3 1338 657 326 62 72 chr2 98756184 98756574 -82991513 + MLT1D LTR MaLR 1 386 -119 3 1338 2978 68 2 15 chr2 98763007 98763408 -82984679 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 1338 857 150 9 28 chr2 98766684 98766905 -82981182 + RMER17A LTR ERVK 7 186 -720 3 1338 1379 51 0 0 chr2 98769533 98769708 -82978379 - MT-int LTR MaLR -543 555 381 3 1338 1101 218 80 133 chr2 98780436 98781133 -82966954 - RMER19B LTR ERVK -7 895 1 4 1338 1338 233 53 51 chr2 98782638 98783013 -82965074 + ORR1C1 LTR MaLR 3 378 0 4 1338 893 227 34 24 chr2 98783698 98783906 -82964181 + RMER4A LTR ERVK 6 215 -251 4 1338 1073 220 60 0 chr2 98786495 98786745 -82961342 + RMER4A LTR ERVK 202 466 0 4 1338 268 302 31 20 chr2 98787176 98787274 -82960813 + MLT1F2 LTR MaLR 462 560 0 4 1338 356 304 79 60 chr2 98787573 98787825 -82960262 + MLT1F2-int LTR MaLR 368 624 -865 4 1338 1523 259 48 36 chr2 98789204 98789680 -82958407 - RLTR11A2 LTR ERVK -27 500 19 4 1338 332 280 111 8 chr2 98790917 98791043 -82957044 + MT2A LTR ERVL 392 530 -3 4 1338 317 304 121 35 chr2 98794256 98794298 -82953789 - MT2B LTR ERVL -18 583 541 4 1338 520 245 82 192 chr2 98794403 98794879 -82953208 - MT2B LTR ERVL -74 459 1 4 1338 238 253 61 37 chr2 98796117 98796199 -82951888 + LTR52 LTR ERVL 287 370 -51 4 1338 636 280 57 60 chr2 98796622 98796937 -82951150 - RLTR15 LTR ERVK -42 317 4 4 1338 1057 182 72 5 chr2 98797257 98797450 -82950637 - MTC LTR MaLR -13 408 203 4 1338 577 295 26 47 chr2 98798193 98798385 -82949702 + MTEa LTR MaLR 185 372 -7 4 1338 1487 27 0 0 chr2 98800611 98800795 -82947292 + ORR1A0 LTR MaLR 1 184 -162 4 1338 3707 56 2 0 chr2 98800797 98801260 -82946827 - MERVL-int LTR ERVL -5019 466 3 4 1338 3202 56 0 0 chr2 98801260 98801656 -82946431 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 1338 292 359 64 23 chr2 98807910 98808081 -82940006 + HERVL74-int LTR ERVL 2498 2675 -3010 4 1338 228 298 198 19 chr2 98810537 98810643 -82937444 + RLTR21 LTR ERVK 1357 1481 -91 4 1338 2378 224 83 26 chr2 98815792 98816370 -82931717 + RMER19C LTR ERVK 1 611 0 4 1338 1801 85 7 41 chr2 98820239 98820509 -82927578 + RMER17B LTR ERVK 3 263 -695 4 1338 2636 43 12 0 chr2 98820509 98820838 -82927249 - IAPEY_LTR LTR ERVK 0 385 53 4 1338 3799 163 46 4 chr2 98820827 98821518 -82926569 + RMER17B LTR ERVK 239 958 0 4 1338 3390 179 97 37 chr2 98824441 98825038 -82923049 + RLTR13D3 LTR ERVK 1 878 -236 4 1338 3390 154 107 18 chr2 98825064 98825292 -82922795 + RLTR13D3 LTR ERVK 879 1113 -1 4 1339 330 339 15 8 chr2 98828942 98829073 -82919014 - RMER15 LTR ERVL -65 510 379 4 1339 678 301 61 19 chr2 98841603 98841867 -82906220 - RMER15 LTR ERVL -2 573 299 5 1339 2905 43 67 5 chr2 98850059 98850432 -82897655 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 1339 812 204 37 155 chr2 98853983 98854310 -82893777 + RLTR1B LTR ERV1 1 307 -196 5 1339 928 146 7 0 chr2 98854307 98854458 -82893629 + RLTR1B LTR ERV1 256 407 -105 5 1339 5645 84 1 120 chr2 98854588 98855121 -82892966 + RLTR13C2 LTR ERVK 1 502 -306 5 1339 5645 84 1 120 chr2 98855152 98855535 -82892552 + RLTR13C2 LTR ERVK 503 808 0 5 1339 766 222 0 78 chr2 98856919 98857124 -82890963 - RMER6C LTR ERVK 0 690 502 5 1339 1408 166 305 0 chr2 98859652 98859954 -82888133 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 5 1339 310 288 116 52 chr2 98868196 98868368 -82879719 - RLTR12B LTR ERVK -331 197 15 5 1339 450 394 43 22 chr2 98879834 98880158 -82867929 + MTE-int LTR MaLR 752 1082 -498 5 1339 4365 12 0 12 chr2 98891129 98891628 -82856459 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 5 1339 47915 15 0 0 chr2 98891628 98896987 -82851100 + MERVL-int LTR ERVL 1 5360 -125 5 1339 362 191 46 35 chr2 98896987 98897074 -82851013 + ORR1A3-int LTR MaLR 553 640 -1323 5 1339 314 0 0 0 chr2 98897074 98897112 -82850975 + MERVL-int LTR ERVL 5448 5485 0 5 1339 4365 12 0 12 chr2 98897112 98897611 -82850476 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 5 1339 1053 264 111 112 chr2 98897846 98898428 -82849659 + RMER19C LTR ERVK 1 612 -125 5 1339 3097 50 16 0 chr2 98898428 98898807 -82849280 + IAPEY_LTR LTR ERVK 1 385 0 5 1339 1053 250 71 109 chr2 98898807 98898940 -82849147 + RMER19C LTR ERVK 479 611 0 5 1339 2763 25 16 0 chr2 98904780 98905102 -82842985 - IAPLTR2b LTR ERVK 0 327 1 6 1339 1301 211 183 40 chr2 98918667 98919038 -82829049 + RLTR33 LTR ERVK 175 598 -80 6 1339 677 311 78 23 chr2 98923503 98923844 -82824243 + MTE2a LTR MaLR 17 419 0 6 1339 630 265 163 27 chr2 98930009 98930266 -82817821 - MER67C LTR ERV1 -307 404 107 6 1339 630 311 88 63 chr2 98930308 98930412 -82817675 - MER67C LTR ERV1 -406 108 1 6 1339 852 215 6 6 chr2 98931655 98931814 -82816273 - RLTR24 LTR ERV1 -322 207 49 6 1339 529 361 79 10 chr2 98941933 98942238 -82805849 + MLT2D LTR ERVL 6 331 -83 6 1340 645 211 109 138 chr2 98963337 98963612 -82784475 - RMER16 LTR ERVK -130 403 137 6 1340 360 198 22 90 chr2 98964439 98964545 -82783542 - RMER16 LTR ERVK -368 165 1 6 1340 333 255 194 44 chr2 98964862 98965022 -82783065 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 263 6 1340 613 284 44 35 chr2 98966847 98967073 -82781014 - LTRIS4 LTR ERV1 0 507 280 6 1340 248 367 53 29 chr2 98972549 98972720 -82775367 + MTEa LTR MaLR 1 175 -204 6 1340 401 347 71 50 chr2 98972758 98973095 -82774992 + MT2A LTR ERVL 180 523 -10 6 1340 2850 99 15 2 chr2 98974619 98975014 -82773073 - MTB LTR MaLR 0 400 1 6 1340 2419 204 25 58 chr2 98977495 98977726 -82770361 - RMER6C LTR ERVK 0 690 458 6 1340 3066 179 104 11 chr2 98977726 98978380 -82769707 - RLTR19B LTR ERVK 0 715 1 7 1340 2419 199 31 50 chr2 98978380 98978780 -82769307 - RMER6C LTR ERVK -233 457 1 6 1340 1856 178 20 6 chr2 98978932 98979276 -82768811 + RMER6D LTR ERVK 4 352 -368 7 1340 1625 228 19 28 chr2 98979425 98979786 -82768301 + RMER6D LTR ERVK 363 720 0 7 1340 5324 104 22 19 chr2 99012483 99012637 -82735450 - RLTR13C2 LTR ERVK 0 808 664 9 1340 5324 104 22 19 chr2 99013039 99013689 -82734398 - RLTR13C2 LTR ERVK -145 663 1 9 1340 257 170 21 0 chr2 99015662 99015709 -82732378 + MTE2a LTR MaLR 280 327 -52 1 1340 1303 294 66 8 chr2 99024799 99025196 -82722891 + MTD LTR MaLR 6 403 -16 3 1340 230 276 93 17 chr2 99026799 99026917 -82721170 + MER67C LTR ERV1 1 127 -584 3 1340 1564 241 46 0 chr2 99026937 99027282 -82720805 + ORR1B2 LTR MaLR 1 361 -6 3 1340 2799 305 81 60 chr2 99027285 99028023 -82720064 + ORR1B2-int LTR MaLR 2 768 -602 3 1340 2799 305 81 60 chr2 99028067 99028669 -82719418 + ORR1B2-int LTR MaLR 769 1370 0 3 1340 1531 228 40 29 chr2 99028669 99028957 -82719130 + ORR1B2 LTR MaLR 1 293 -74 3 1340 1531 228 40 29 chr2 99029003 99029062 -82719025 + ORR1B2 LTR MaLR 294 352 -15 3 1340 1580 211 48 129 chr2 99029068 99029526 -82718561 + RLTR23 LTR ERV1 10 430 0 4 1340 291 295 126 40 chr2 99032108 99032306 -82715781 + MLT1C LTR MaLR 10 224 -243 4 1340 379 372 39 74 chr2 99041452 99041763 -82706324 + MT2A LTR ERVL 148 447 -86 6 1340 1145 137 11 21 chr2 99065556 99065743 -82682344 - ORR1A3 LTR MaLR -48 278 94 9 1340 301 225 33 83 chr2 99065811 99065841 -82682246 + ORR1A3-int LTR MaLR 591 614 -1349 9 1340 1731 95 139 0 chr2 99065841 99066114 -82681973 + MT2B2 LTR ERVL 2 312 -272 9 1340 2197 132 92 57 chr2 99066114 99066573 -82681514 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 9 1340 6848 34 2 24 chr2 99066573 99067422 -82680665 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 5651 9 1340 2707 67 0 3 chr2 99067415 99067758 -82680329 - IAPEz-int LTR ERVK -4781 1700 1359 9 1340 4139 76 5 24 chr2 99067758 99068338 -82679749 - IAPEz-int LTR ERVK -5819 662 94 9 1340 245 309 0 0 chr2 99068341 99068396 -82679691 - RLTR27 LTR ERVK -34 275 221 1 1340 842 130 71 36 chr2 99068396 99068564 -82679523 - IAPEz-int LTR ERVK -6288 193 20 9 1340 377 275 86 43 chr2 99068568 99068591 -82679496 + MT2C_Mm LTR ERVL 316 339 -194 1 1340 2196 125 94 59 chr2 99068591 99069050 -82679037 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 1 1340 1091 120 14 15 chr2 99069050 99069235 -82678852 + MT2C_Mm LTR ERVL 310 532 -1 1 1340 651 274 197 49 chr2 99073855 99074220 -82673867 + MTD LTR MaLR 1 419 0 1 1340 463 294 160 18 chr2 99075353 99075578 -82672509 - RMER15 LTR ERVL -15 560 304 1 1340 366 245 133 20 chr2 99078256 99078406 -82669681 + LTR37A LTR ERV1 257 423 -3 1 1340 687 333 68 10 chr2 99079773 99080067 -82668020 + MTEa LTR MaLR 35 345 -34 1 1340 272 315 101 80 chr2 99081728 99082066 -82666021 + LTR37B LTR ERV1 109 453 -15 1 1340 553 225 161 52 chr2 99083723 99083972 -82664115 + RLTR10A LTR ERVK 136 411 0 1 167 1120 328 26 6 chr2 99090297 99090644 -82657443 - MTD LTR MaLR -46 373 20 1 1341 396 322 22 8 chr2 99091226 99091371 -82656716 - ORR1E LTR MaLR -79 300 130 1 1341 867 301 4 13 chr2 99095697 99095923 -82652164 + MTE2b LTR MaLR 153 376 -3 1 1341 399 341 39 50 chr2 99105763 99105945 -82642142 + MTD LTR MaLR 224 403 -16 1 1341 1042 262 80 34 chr2 99110777 99111129 -82636958 - ORR1D1 LTR MaLR -2 372 5 1 1341 2767 103 190 0 chr2 99115447 99115883 -82632204 + MURVY-LTR LTR ERV1 1 519 0 1 1341 2894 34 148 33 chr2 99123170 99123367 -82624720 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 197 -278 1 1341 2894 34 148 33 chr2 99123820 99124048 -82624039 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 198 473 -2 1 1341 1346 211 110 19 chr2 99126959 99127278 -82620809 + ORR1B1 LTR MaLR 39 386 -8 1 1341 264 236 50 79 chr2 99129160 99129261 -82618826 + MER57D LTR ERV1 161 258 -153 1 1341 240 255 40 69 chr2 99131126 99131227 -82616860 + MER34 LTR ERV1 4 101 -470 2 1341 1463 236 20 0 chr2 99132172 99132477 -82615610 + MER34 LTR ERV1 218 528 -14 2 1341 554 289 66 43 chr2 99136099 99136449 -82611638 + LTR37A LTR ERV1 68 425 -1 2 1341 1535 244 84 58 chr2 99146661 99146848 -82601239 + RLTR20B3 LTR ERVK 20 203 -374 2 1341 1535 232 84 46 chr2 99147418 99147725 -82600362 + RLTR20B3 LTR ERVK 204 530 -47 2 1341 2595 184 96 48 chr2 99150511 99151156 -82596931 - RMER6C LTR ERVK -12 678 3 2 1341 262 308 28 0 chr2 99151830 99151937 -82596150 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 299 2 1341 1282 279 52 87 chr2 99151938 99152571 -82595516 - RMER19C LTR ERVK 0 611 1 2 1341 1876 191 168 32 chr2 99157679 99158214 -82589873 + RMER6C LTR ERVK 29 636 -54 2 1341 253 286 21 82 chr2 99158329 99158475 -82589612 + RLTR40 LTR ERVK 566 697 -120 2 1341 253 286 21 82 chr2 99158620 99158654 -82589433 + RLTR40 LTR ERVK 698 734 -83 2 1341 1061 124 0 6 chr2 99158654 99158816 -82589271 + ORR1A1 LTR MaLR 1 161 -185 2 1341 1253 130 33 0 chr2 99161382 99161597 -82586490 + ORR1A1 LTR MaLR 117 338 -8 2 1341 2448 124 16 0 chr2 99161601 99161981 -82586106 + ORR1A1-int LTR MaLR 1 386 -1577 2 1341 1944 129 0 0 chr2 99163251 99163593 -82584494 + ORR1A1-int LTR MaLR 382 723 -1069 2 1341 7863 75 5 3 chr2 99164035 99165115 -82582972 + ORR1A1-int LTR MaLR 711 1792 0 2 1341 2437 104 3 0 chr2 99165115 99165460 -82582627 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 2 1341 242 244 83 62 chr2 99171978 99172074 -82576013 - MLT1J2 LTR MaLR -314 134 37 2 1341 343 340 42 64 chr2 99185704 99185968 -82562119 + MER31A LTR ERV1 14 271 -214 2 1341 333 354 95 47 chr2 99190756 99191115 -82556972 - MT2A LTR ERVL -157 376 1 2 1341 7007 179 32 17 chr2 99191844 99192342 -82555745 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 289 804 -1522 2 1341 7007 179 32 17 chr2 99192442 99193355 -82554732 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 805 1721 -605 2 1341 2551 194 35 28 chr2 99193566 99194185 -82553902 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 1703 2326 0 2 1341 1854 224 89 34 chr2 99194189 99194717 -82553370 + RLTR20B3 LTR ERVK 21 577 0 2 1341 259 310 33 44 chr2 99218100 99218191 -82529896 + MLT1B LTR MaLR 6 95 -295 3 1341 1175 243 67 22 chr2 99220853 99221211 -82526876 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 3 1342 593 311 22 6 chr2 99222884 99223062 -82525025 + RMER15-int LTR ERVL 4404 4584 -415 3 1342 845 140 320 5 chr2 99224639 99224861 -82523226 + RLTR25A LTR ERVK 812 1103 0 3 1342 3941 164 24 7 chr2 99227872 99228553 -82519534 + RLTR17 LTR ERVK 1 692 0 3 1342 614 305 129 24 chr2 99239498 99239753 -82508334 + RMER20B LTR ERVK 132 413 -214 3 1342 304 298 44 101 chr2 99244767 99244995 -82503092 - RLTR15 LTR ERVK -96 263 49 3 1342 1125 223 71 38 chr2 99245086 99245352 -82502735 - ORR1B1 LTR MaLR -119 275 1 3 1342 279 384 46 7 chr2 99249202 99249354 -82498733 + MLT1E3 LTR MaLR 403 560 -64 3 1342 356 404 69 26 chr2 99250930 99251278 -82496809 - MLT1F LTR MaLR -4 544 182 3 1342 287 346 8 8 chr2 99261340 99261468 -82486619 - RMER5 LTR ERV1 -29 505 378 3 1342 2595 131 5 0 chr2 99266288 99266686 -82481401 + MTB LTR MaLR 1 400 0 3 1342 311 294 92 0 chr2 99273286 99273395 -82474692 + RMER12 LTR ERVK 733 851 -471 3 1342 2643 68 11 5 chr2 99275767 99276135 -82471952 - RLTR10 LTR ERVK -20 370 1 4 1342 2337 111 57 0 chr2 99276150 99276539 -82471548 + IAPLTR2a LTR ERVK 1 411 0 4 1342 3446 83 28 32 chr2 99276571 99277459 -82470628 + IAPEz-int LTR ERVK 10 662 -5819 4 1342 2142 79 0 0 chr2 99277459 99277737 -82470350 + IAPEz-int LTR ERVK 1359 1636 -4845 4 1342 5978 41 5 19 chr2 99277736 99278490 -82469597 + IAPEz-int LTR ERVK 5736 6479 -2 4 1342 2386 108 57 0 chr2 99278492 99278881 -82469206 + IAPLTR2a LTR ERVK 1 411 0 4 1342 1545 205 196 26 chr2 99280237 99280375 -82467712 - RMER6D LTR ERVK -188 532 342 4 1342 1545 205 196 26 chr2 99280424 99280740 -82467347 - RMER6D LTR ERVK -379 341 2 4 1342 2219 188 71 127 chr2 99284049 99284696 -82463391 - RMER19C LTR ERVK 0 611 1 4 1342 343 342 38 67 chr2 99285689 99286045 -82462042 - MLT1A-int LTR MaLR -1209 526 174 4 1342 367 296 61 0 chr2 99286144 99286259 -82461828 - MLT1A LTR MaLR -34 340 219 4 1342 272 282 88 25 chr2 99286341 99286421 -82461666 - MLT1A LTR MaLR -289 85 1 4 1342 1679 284 112 35 chr2 99286797 99287393 -82460694 + RLTR26 LTR ERVK 1 642 0 4 1342 4018 52 80 26 chr2 99295431 99295966 -82452121 - LTRIS2 LTR ERV1 0 564 1 4 1342 1375 252 64 66 chr2 99296117 99296665 -82451422 + RLTR25B LTR ERVK 5 583 -445 4 1342 231 295 24 60 chr2 99296596 99296679 -82451408 + ORR1D-int LTR MaLR 555 634 -736 4 1342 467 208 57 24 chr2 99307108 99307231 -82440856 + RLTR25B LTR ERVK 890 1016 -12 4 1342 2006 166 3 0 chr2 99309642 99309968 -82438119 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 4 1342 2059 233 15 84 chr2 99313189 99313840 -82434247 + RMER19C LTR ERVK 3 608 -3 4 1342 1849 195 154 125 chr2 99317274 99317689 -82430398 - RMER6D LTR ERVK -4 716 309 4 1342 1849 195 154 125 chr2 99317836 99318116 -82429971 - RMER6D LTR ERVK -412 308 1 4 1342 2552 202 29 38 chr2 99318126 99318913 -82429174 - RMER6-int LTR ERVK -5 3172 2459 4 1342 1253 135 58 0 chr2 99318942 99319150 -82428937 + RMER6C LTR ERVK 113 332 -358 4 1342 355 275 12 0 chr2 99322162 99322242 -82425845 + MT2A LTR ERVL 1 81 -452 4 1342 337 315 37 0 chr2 99323021 99323129 -82424958 + MT2A LTR ERVL 85 196 -337 4 1342 1974 188 31 18 chr2 99323096 99323481 -82424606 + RLTR19 LTR ERVK 20 409 -90 4 1342 3197 161 113 10 chr2 99323615 99324242 -82423845 + RLTR17 LTR ERVK 1 692 0 4 1342 1493 232 182 79 chr2 99326612 99327388 -82420699 - RMER6C LTR ERVK -4 716 4 4 1342 313 95 57 100 chr2 99327387 99327457 -82420630 + RMER6A LTR ERVK 1 67 -394 4 1342 1314 180 47 0 chr2 99327749 99328005 -82420082 + RMER6A LTR ERVK 49 316 -440 4 1342 1849 141 49 0 chr2 99329985 99330289 -82417798 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 4 1342 2505 162 14 0 chr2 99330293 99330726 -82417361 + ORR1A2-int LTR MaLR 1 439 -1524 4 1342 833 168 18 30 chr2 99333466 99333538 -82414549 + RMER6A LTR ERVK 515 584 -172 4 1342 833 185 34 30 chr2 99333563 99333694 -82414393 + RMER6A LTR ERVK 585 756 0 4 1342 583 291 44 34 chr2 99337314 99337520 -82410567 - RMER15 LTR ERVL 0 575 368 4 1342 1457 186 105 0 chr2 99347267 99347563 -82400524 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 4 1342 6575 179 95 18 chr2 99347563 99349018 -82399069 - ORR1A2-int LTR MaLR 0 1963 409 4 167 1972 78 4 4 chr2 99352330 99352599 -82395488 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 128 5 167 1981 114 31 25 chr2 99352563 99352887 -82395200 + ORR1A1-int LTR MaLR 1467 1792 0 5 1343 2744 64 3 0 chr2 99352887 99353232 -82394855 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 5 1343 1637 200 13 7 chr2 99354156 99354463 -82393624 - RLTR27 LTR ERVK 0 309 1 5 1343 1434 216 317 2 chr2 99355829 99356248 -82391839 - RMER6C LTR ERVK -138 552 1 5 1343 967 298 65 31 chr2 99358674 99359027 -82389060 - MT2A LTR ERVL -60 473 109 5 1343 675 277 82 47 chr2 99359092 99359410 -82388677 - RLTR15 LTR ERVK -30 329 1 5 1343 226 240 0 0 chr2 99359448 99359498 -82388589 - MT2A LTR ERVL -551 50 1 5 1343 1024 253 285 36 chr2 99359595 99360045 -82388042 + RMER2 LTR ERV1 2 562 -5 5 1343 1073 272 66 20 chr2 99362236 99362829 -82385258 + MYSERV-int LTR ERVK 4310 4562 -1988 5 1343 1487 238 83 5 chr2 99362830 99363264 -82384823 + MYSERV-int LTR ERVK 5966 6433 -117 5 1343 1581 259 62 46 chr2 99363361 99363862 -82384225 + RLTR11A2 LTR ERVK 3 511 -16 5 1343 1901 173 35 11 chr2 99364804 99365280 -82382807 - RLTR17 LTR ERVK -22 670 98 5 1343 355 192 261 39 chr2 99365594 99365724 -82382363 - RMER16 LTR ERVK -374 159 1 5 1343 445 141 0 0 chr2 99365724 99365795 -82382292 - RMER16-int LTR ERVK 0 5406 5336 5 1343 1890 195 26 79 chr2 99365796 99366224 -82381863 + RMER4A LTR ERVK 60 464 -2 5 1343 372 133 0 32 chr2 99367630 99367692 -82380395 + RLTR17 LTR ERVK 1 60 -632 5 1343 2147 187 74 5 chr2 99367692 99368111 -82379976 + RLTR17 LTR ERVK 243 690 -2 5 1343 998 302 91 5 chr2 99371329 99371715 -82376372 + MTD LTR MaLR 1 419 0 5 1343 359 262 163 8 chr2 99383557 99383680 -82364407 + MLT1H LTR MaLR 385 526 -23 5 1343 2416 136 38 40 chr2 99385381 99385857 -82362230 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 5 1343 45133 7 3 3 chr2 99385857 99392330 -82355757 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 8 5 1343 2447 131 38 40 chr2 99392330 99392806 -82355281 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 5 1343 657 300 58 18 chr2 99394666 99394890 -82353197 + MLT1A0 LTR MaLR 132 364 -1 5 1343 284 331 91 69 chr2 99398202 99398377 -82349710 - MTEb LTR MaLR -33 346 168 5 1343 731 184 128 30 chr2 99398330 99398558 -82349529 - RLTR25B LTR ERVK -118 985 647 5 1343 304 213 93 0 chr2 99398551 99398626 -82349461 + RLTR41 LTR ERV1 365 446 0 5 1343 229 347 63 0 chr2 99402157 99402252 -82345835 + MTE2b LTR MaLR 267 367 -12 5 1343 256 287 51 65 chr2 99403698 99403836 -82344251 - MER67C LTR ERV1 -2 709 574 5 1343 387 322 34 34 chr2 99406464 99406583 -82341504 + MTEa LTR MaLR 61 179 -200 5 1343 251 368 21 0 chr2 99406499 99406594 -82341493 + MLT2B5 LTR ERVL 124 220 -381 5 1343 591 27 0 39 chr2 99406952 99407029 -82341058 - MTB LTR MaLR 0 400 327 5 1343 2453 93 26 0 chr2 99407036 99407381 -82340706 - IAPEY2_LTR LTR ERVK -3 354 1 5 1343 5437 104 3 8 chr2 99407381 99408164 -82339923 - IAPEy-int LTR ERVK 0 7513 6735 5 1343 3418 79 0 24 chr2 99408154 99408619 -82339468 - IAPEy-int LTR ERVK -1367 6214 5761 5 1343 3176 109 0 16 chr2 99408610 99409057 -82339030 - IAPEy-int LTR ERVK -1939 5642 5203 5 1343 567 81 47 66 chr2 99409312 99409418 -82338669 - IAPEy-int LTR ERVK -2911 4670 4567 5 1343 424 102 0 0 chr2 99409417 99409481 -82338606 - ETnERV2-int LTR ERVK -3784 3622 3567 5 1343 652 230 0 102 chr2 99409499 99409721 -82338366 - ETnERV2-int LTR ERVK -4653 2753 2454 5 1343 450 239 88 0 chr2 99409734 99409847 -82338240 - RMER16-int LTR ERVK -5077 1060 938 5 1343 1620 187 219 33 chr2 99409851 99410331 -82337756 - RMER16-int LTR ERVK -4587 819 251 5 1343 1790 142 45 6 chr2 99410443 99410840 -82337247 - IAPEy-int LTR ERVK -6629 952 409 5 1343 2503 149 5 18 chr2 99411283 99411721 -82336366 - IAPEy-int LTR ERVK -7081 432 1 5 1343 2378 98 54 0 chr2 99411726 99412062 -82336025 - IAPEY2_LTR LTR ERVK -3 354 1 5 1343 2194 99 6 3 chr2 99412062 99412387 -82335700 - MTA_Mm LTR MaLR -70 326 1 5 1343 324 366 47 11 chr2 99413924 99414116 -82333971 + MLT1D LTR MaLR 323 619 -8 5 1343 322 143 0 18 chr2 99424405 99424462 -82323625 - ORR1C1 LTR MaLR -18 360 305 6 1343 246 288 0 0 chr2 99425646 99425705 -82322382 + ORR1D2 LTR MaLR 5 63 -307 6 1343 369 233 83 33 chr2 99425765 99425885 -82322202 - MTE2b LTR MaLR -2 377 252 6 1343 419 209 0 129 chr2 99427249 99427267 -82320820 - MT2B LTR ERVL -336 263 151 6 1343 416 318 117 8 chr2 99429433 99429680 -82318407 - MTE2b LTR MaLR -93 286 13 6 1343 1211 174 57 105 chr2 99453921 99454060 -82294027 - RMER16 LTR ERVK 0 533 396 6 1343 1211 156 56 115 chr2 99454236 99454481 -82293606 - RMER16 LTR ERVK -138 395 1 6 1343 271 378 66 53 chr2 99460066 99460217 -82287870 + RMER15 LTR ERVL 228 380 -195 6 1343 235 297 61 99 chr2 99463956 99464087 -82284000 + RMER15 LTR ERVL 398 523 -52 6 1343 2285 75 119 11 chr2 99465072 99465424 -82282663 - RLTR10 LTR ERVK 0 390 1 6 1343 2517 245 81 48 chr2 99472351 99473101 -82274986 + RMER17B LTR ERVK 1 775 -183 6 1343 275 311 117 29 chr2 99473087 99473292 -82274795 + RMER17B LTR ERVK 665 887 -71 6 1343 2397 127 198 0 chr2 99479148 99479582 -82268505 - MT2B LTR ERVL -81 520 1 7 1344 7732 100 8 27 chr2 99487106 99488231 -82259856 - RLTR13D3 LTR ERVK 0 1114 11 7 1344 506 284 29 40 chr2 99498618 99498791 -82249296 - MTC LTR MaLR 0 421 243 7 1344 574 313 26 65 chr2 99501570 99501802 -82246285 - MTEa LTR MaLR -139 240 18 6 1344 1587 211 81 60 chr2 99504369 99504803 -82243284 - RMER6B LTR ERVK -10 451 9 1 1344 239 338 12 0 chr2 99505753 99505833 -82242254 + RMER15 LTR ERVL 275 355 -220 1 1344 1494 175 30 65 chr2 99505821 99506158 -82241929 + ORR1A4 LTR MaLR 5 329 0 1 1344 480 233 36 58 chr2 99506158 99506293 -82241794 + RMER15 LTR ERVL 352 483 -92 1 1344 2350 205 39 21 chr2 99510191 99510704 -82237383 - RMER19C LTR ERVK -12 599 10 2 1344 1914 265 35 121 chr2 99510702 99511363 -82236724 - RMER19C LTR ERVK -7 604 1 2 1344 416 242 123 12 chr2 99513389 99513552 -82234535 + RLTR22_Mur LTR ERVK 567 747 -1101 2 1344 260 130 55 164 chr2 99513611 99513708 -82234379 + RLTR22_Mur LTR ERVK 922 1011 -837 2 1344 3879 160 55 3 chr2 99513708 99514366 -82233721 + RLTR17 LTR ERVK 1 692 0 2 1344 260 130 55 164 chr2 99514366 99514378 -82233709 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1012 1019 -829 2 1344 2937 18 3 0 chr2 99516517 99516853 -82231234 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 0 337 1 3 1344 493 314 6 19 chr2 99521001 99521157 -82226930 + MTD LTR MaLR 1 154 -265 3 1344 268 254 16 16 chr2 99521264 99521328 -82226759 + MTD LTR MaLR 290 353 -6 3 1344 307 169 130 0 chr2 99529655 99529732 -82218355 - ORR1D1 LTR MaLR -287 87 1 3 1344 3683 202 113 101 chr2 99532292 99533307 -82214780 + RLTR25A LTR ERVK 1 1028 0 4 1344 663 326 99 40 chr2 99539306 99539494 -82208593 + MTEa LTR MaLR 2 198 -181 5 1344 663 326 99 40 chr2 99539555 99539654 -82208433 + MTEa LTR MaLR 199 305 -74 5 1344 2221 226 52 63 chr2 99539654 99539967 -82208120 - RMER6C LTR ERVK 0 690 368 5 1344 2221 226 52 63 chr2 99539996 99540380 -82207707 - RMER6C LTR ERVK -323 367 1 5 1344 663 326 99 40 chr2 99540380 99540445 -82207642 + MTEa LTR MaLR 306 375 -4 5 1344 2202 122 0 6 chr2 99540626 99540939 -82207148 - RLTR10E LTR ERVK 0 311 1 5 1344 646 270 67 12 chr2 99541752 99541917 -82206170 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 201 6 1344 1710 232 19 10 chr2 99551078 99551495 -82196592 + MTC LTR MaLR 1 421 0 7 1344 771 298 5 5 chr2 99552148 99552347 -82195740 - MTC LTR MaLR -9 412 214 7 1344 1245 116 10 0 chr2 99552941 99553139 -82194948 - BGLII LTR ERVK 0 421 222 7 1344 313 332 215 5 chr2 99553780 99553975 -82194112 + ORR1D2 LTR MaLR 1 236 -134 7 1344 948 210 29 91 chr2 99563674 99564168 -82183919 - RMER17C LTR ERVK -8 402 1 9 1344 2615 124 2 8 chr2 99573648 99574046 -82174041 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1344 1311 218 0 16 chr2 99574152 99574399 -82173688 - MTC LTR MaLR -55 366 124 1 1344 308 425 23 0 chr2 99575806 99575980 -82172107 + MTE2b LTR MaLR 15 192 -187 1 1344 664 314 64 36 chr2 99576066 99576317 -82171770 + MTEa-int LTR MaLR 1 258 -1322 1 1344 340 308 37 0 chr2 99578966 99579073 -82169014 + MTEa-int LTR MaLR 287 397 -1183 1 1344 1008 316 134 20 chr2 99579086 99579593 -82168494 + MTEa-int LTR MaLR 1003 1567 -13 1 1344 320 385 35 59 chr2 99579596 99579850 -82168237 + MTEa LTR MaLR 1 248 -131 1 1344 1431 169 107 13 chr2 99584295 99584594 -82163493 + ORR1A4 LTR MaLR 1 327 -2 1 1344 1730 189 84 31 chr2 99584597 99585012 -82163075 + ORR1A4-int LTR MaLR 2 438 -1525 1 1344 993 220 181 0 chr2 99586066 99586331 -82161756 + ORR1A4-int LTR MaLR 403 705 -1258 1 1344 332 202 174 23 chr2 99586257 99586343 -82161744 + MT2B LTR ERVL 6 104 -497 1 1344 2394 230 68 27 chr2 99586384 99586973 -82161114 - RLTR17 LTR ERVK -79 613 1 1 1344 284 136 0 0 chr2 99586974 99587018 -82161069 + ORR1A4-int LTR MaLR 690 733 -1230 1 1344 559 200 45 119 chr2 99588675 99588851 -82159236 + MT2B LTR ERVL 155 317 -284 1 1344 4636 186 78 18 chr2 99588783 99589068 -82159019 + ORR1A4-int LTR MaLR 718 1066 -897 1 1344 4636 185 73 13 chr2 99589294 99590121 -82157966 + ORR1A4-int LTR MaLR 1001 1769 -194 1 1344 1053 106 0 12 chr2 99591506 99591668 -82156419 + ORR1A4-int LTR MaLR 1791 1950 -13 1 1344 1223 202 20 28 chr2 99591673 99591922 -82156165 + ORR1A4 LTR MaLR 1 247 -82 1 1344 3214 161 33 5 chr2 99591949 99592522 -82155565 + RLTR17 LTR ERVK 104 692 0 1 1344 393 113 48 0 chr2 99592529 99592591 -82155496 + ORR1A4 LTR MaLR 254 318 -11 1 1344 1674 180 46 29 chr2 99603473 99603687 -82144400 + RMER17C LTR ERVK 16 419 -539 1 1344 1674 176 47 26 chr2 99603784 99603975 -82144112 + RMER17C LTR ERVK 213 406 -4 1 1344 294 302 25 8 chr2 99605127 99605247 -82142840 - MERVL-int LTR ERVL -448 5037 4916 1 1344 366 254 105 16 chr2 99606182 99606267 -82141820 - MT2A LTR ERVL -252 281 184 1 1344 366 254 105 16 chr2 99606300 99606338 -82141749 - MT2A LTR ERVL -350 183 148 1 1344 530 266 7 40 chr2 99606637 99606786 -82141301 - MT2A LTR ERVL -384 149 6 1 1344 12267 230 84 45 chr2 99606786 99610244 -82137843 - MERVL_2A-int LTR ERVL 0 5761 2168 1 1345 1228 195 112 15 chr2 99618327 99618661 -82129426 + RMER16 LTR ERVK 1 533 0 1 1345 769 378 82 16 chr2 99630071 99630585 -82117502 - MER21B LTR ERV1 -315 548 1 1 1345 408 331 8 0 chr2 99630737 99630867 -82117220 + MLT1A1 LTR MaLR 273 403 -5 1 1345 1384 228 57 7 chr2 99636020 99636316 -82111771 + MTC LTR MaLR 111 421 0 2 1345 1396 285 71 11 chr2 99637154 99637533 -82110554 + MTD LTR MaLR 18 419 0 2 1345 451 204 39 45 chr2 99640154 99640308 -82107779 - RLTR43A LTR ERVK 0 364 212 2 1345 573 305 96 39 chr2 99644718 99644998 -82103089 + RMER15 LTR ERVL 262 557 -18 2 1345 381 259 78 94 chr2 99645910 99646038 -82102049 - RMER12 LTR ERVK -240 1082 957 2 1345 1243 215 85 22 chr2 99646011 99646377 -82101710 - RMER12 LTR ERVK -542 780 392 2 1345 2806 117 2 5 chr2 99656181 99656603 -82091484 - BGLII LTR ERVK 0 421 1 2 1345 2535 70 12 0 chr2 99667509 99667836 -82080251 - IAPEY_LTR LTR ERVK 0 385 55 2 1345 309 51 0 0 chr2 99668484 99668523 -82079564 + RMER6B LTR ERVK 2 40 -421 2 1345 427 319 138 0 chr2 99672344 99672532 -82075555 - MLT2B4 LTR ERVL -165 391 178 2 1345 2649 125 27 10 chr2 99678580 99678993 -82069094 + BGLII_Mus LTR ERVK 3 422 0 2 1345 457 333 80 0 chr2 99679085 99679247 -82068840 - ORR1D2 LTR MaLR -195 175 1 2 1345 2289 156 13 5 chr2 99692461 99692854 -82055233 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 1345 600 175 33 16 chr2 99707009 99707131 -82040956 + IAPLTR4_I LTR ERVK 729 852 -618 3 1345 1765 146 0 10 chr2 99707129 99707488 -82040599 - IAPEz-int LTR ERVK -5927 554 1 3 1345 2651 46 0 0 chr2 99707488 99707814 -82040273 - IAPEY2_LTR LTR ERVK 0 357 32 3 1345 3499 103 14 34 chr2 99719988 99720572 -82027515 - RMER17A LTR ERVK -179 572 1 3 1345 1093 193 0 10 chr2 99724369 99724573 -82023514 - MTC LTR MaLR 0 421 220 3 1345 1222 261 41 99 chr2 99726319 99726866 -82021221 + RMER12 LTR ERVK 1 540 -1308 3 1345 1108 144 0 34 chr2 99737107 99737286 -82010801 - RLTR31B_Mm LTR ERVK 0 557 385 3 1346 608 294 36 59 chr2 99760269 99760522 -81987565 - MTE2a LTR MaLR 0 379 133 3 1346 1000 271 70 28 chr2 99765667 99766050 -81982037 + ORR1B2 LTR MaLR 5 378 0 3 1346 579 265 29 29 chr2 99766148 99766323 -81981764 + RLTR11A2 LTR ERVK 7 181 -346 3 1346 313 272 80 75 chr2 99770118 99770305 -81977782 + RLTR12B LTR ERVK 297 484 -44 4 1346 4402 142 18 55 chr2 99777429 99777585 -81970502 - RLTR13D1 LTR ERVK 0 806 659 4 1346 4402 142 18 55 chr2 99777638 99778318 -81969769 - RLTR13D1 LTR ERVK -148 658 3 4 1346 239 239 25 101 chr2 99783330 99783409 -81964678 - MT2B LTR ERVL -361 240 168 4 1346 271 345 54 7 chr2 99790575 99790728 -81957359 + MER67C LTR ERV1 162 314 -397 4 1346 305 381 55 11 chr2 99794494 99794677 -81953410 - LTR40c LTR ERVL -14 451 261 4 1346 940 296 68 43 chr2 99796174 99796805 -81951282 - ERVL-int LTR ERVL -106 5651 5005 4 1346 299 305 102 0 chr2 99796805 99796923 -81951164 - MTEb LTR MaLR -4 375 246 4 1346 1457 250 54 37 chr2 99801301 99801802 -81946285 + RMER19B LTR ERVK 142 679 -223 4 1346 619 152 140 32 chr2 99815901 99816057 -81932030 + ORR1A2-int LTR MaLR 1814 1963 0 4 1346 1524 181 8 0 chr2 99816057 99816323 -81931764 + ORR1A2 LTR MaLR 1 268 -59 4 1346 628 282 21 16 chr2 99817683 99817874 -81930213 - RLTR16 LTR ERVK -313 192 1 4 1346 233 300 23 62 chr2 99827957 99828085 -81920002 - RLTR13D5 LTR ERVK -192 831 709 4 1346 1367 265 104 3 chr2 99828210 99828585 -81919502 - MTC LTR MaLR -8 413 1 4 1346 249 296 0 0 chr2 99828880 99828934 -81919153 + MTEa LTR MaLR 12 65 -314 4 1346 428 305 177 39 chr2 99835807 99836039 -81912048 - MTE2b LTR MaLR -49 330 67 5 1346 394 335 80 35 chr2 99846704 99846905 -81901182 + ORR1E LTR MaLR 142 351 -19 5 1346 667 309 58 64 chr2 99847002 99847344 -81900743 + ORR1E-int LTR MaLR 1 340 -1030 5 1346 557 229 38 8 chr2 99848818 99848950 -81899137 + ORR1E LTR MaLR 1 136 -223 5 1346 1665 185 136 14 chr2 99848958 99849319 -81898768 - RMER6B LTR ERVK -2 459 55 5 1346 617 159 53 0 chr2 99849382 99849495 -81898592 - RMER6B LTR ERVK -342 119 1 5 1346 232 353 35 108 chr2 99849505 99849737 -81898350 + ORR1E LTR MaLR 145 359 0 5 1346 2904 316 51 67 chr2 99849740 99851121 -81896966 + ORR1E-int LTR MaLR 2 1360 -10 5 1346 618 353 27 0 chr2 99851130 99851317 -81896770 + ORR1E LTR MaLR 1 192 -167 5 1346 335 236 22 11 chr2 99851340 99851430 -81896657 + ORR1E LTR MaLR 256 346 -13 5 1346 576 141 17 3 chr2 99852050 99852156 -81895931 + ORR1A4 LTR MaLR 14 137 -241 5 1346 313 183 17 0 chr2 99852138 99852198 -81895889 - ORR1A4 LTR MaLR -268 61 1 5 1346 874 332 62 26 chr2 99856120 99856621 -81891466 + RMER5 LTR ERV1 1 519 -15 5 1346 317 252 142 31 chr2 99859299 99859426 -81888661 - RMER20A LTR ERVK -253 374 234 5 1346 415 284 21 93 chr2 99860322 99860420 -81887667 - ORR1D1 LTR MaLR -116 258 170 5 1346 415 284 21 93 chr2 99860467 99860562 -81887525 - ORR1D1 LTR MaLR -205 169 79 5 1346 1486 215 45 53 chr2 99860567 99860925 -81887162 + ORR1B2 LTR MaLR 5 359 -8 5 1346 394 235 12 0 chr2 99860925 99861010 -81887077 - ORR1D1 LTR MaLR -288 86 1 5 1346 3104 111 11 92 chr2 99864248 99864554 -81883533 + RLTR1B LTR ERV1 1 265 -247 5 1346 3104 111 11 92 chr2 99864794 99865044 -81883043 + RLTR1B LTR ERV1 266 512 0 5 1346 6023 70 25 1 chr2 99867227 99868016 -81880071 + RLTR13C2 LTR ERVK 1 808 0 5 1346 870 229 75 67 chr2 99874546 99874972 -81873115 - RMER12B LTR ERVK -5 1399 1024 5 1347 5217 189 21 11 chr2 99880210 99881229 -81866858 - RMER12B LTR ERVK -375 1029 1 5 1347 2138 192 10 18 chr2 99881900 99882297 -81865790 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 5 1347 239 300 87 71 chr2 99883637 99883820 -81864267 + MLT2C1 LTR ERVL 26 211 -186 5 1347 307 328 82 118 chr2 99886395 99886675 -81861412 + MLT1G3 LTR MaLR 125 394 -201 5 1347 2271 216 39 31 chr2 99897525 99898293 -81849794 - RMER19B LTR ERVK 0 902 24 5 1347 299 201 82 44 chr2 99902538 99902673 -81845414 + MYSERV6-int LTR ERVK 4843 4982 -3977 5 1347 279 244 11 95 chr2 99902674 99902769 -81845318 + MT2B LTR ERVL 153 239 -362 5 1347 506 197 156 53 chr2 99902902 99903127 -81844960 + MYSERV6-int LTR ERVK 6408 6655 -2304 5 1347 790 246 54 23 chr2 99904195 99904453 -81843634 - MYSERV-int LTR ERVK -1991 4559 4294 5 1347 1773 227 70 92 chr2 99904507 99905236 -81842851 + MYSERV6-int LTR ERVK 8147 8859 -100 5 1347 673 237 167 38 chr2 99911051 99911333 -81836754 + ORR1C2 LTR MaLR 51 361 -13 6 1347 3308 39 53 2 chr2 99912634 99912839 -81835248 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 233 6 1347 3308 39 53 2 chr2 99912863 99913072 -81835015 - RLTR10C LTR ERVK -204 232 2 6 1347 3290 72 7 29 chr2 99913291 99913737 -81834350 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 6 1347 415 301 94 66 chr2 99917289 99917577 -81830510 + RMER20B LTR ERVK 97 392 -235 6 1347 499 244 40 58 chr2 99918259 99918433 -81829654 - RMER5 LTR ERV1 -36 498 328 6 1347 924 285 80 4 chr2 99920708 99920972 -81827115 - RMER5 LTR ERV1 -236 298 15 6 1347 1847 235 21 3 chr2 99928527 99928907 -81819180 + RLTR19A LTR ERVK 15 401 -95 6 1347 324 299 77 94 chr2 99932914 99933084 -81815003 + MT2B LTR ERVL 91 257 -344 6 1347 690 288 93 70 chr2 99944710 99945054 -81803033 + MTEa LTR MaLR 1 352 -27 6 1347 694 321 66 26 chr2 99947360 99947664 -81800423 - MLT1A0 LTR MaLR -2 363 48 6 1347 903 235 229 36 chr2 99948577 99949002 -81799085 + RMER6B LTR ERVK 1 451 -10 6 1347 799 301 62 20 chr2 99949431 99949736 -81798351 + MLT1B LTR MaLR 73 390 0 6 1347 1569 209 111 18 chr2 99949928 99950308 -81797779 - MTC LTR MaLR -2 419 5 6 1347 394 288 92 35 chr2 99964436 99964663 -81783424 - MLT1F1 LTR MaLR -8 561 322 6 1347 343 324 54 65 chr2 99968904 99969089 -81778998 - MLT1J1 LTR MaLR -192 252 70 6 1347 415 171 13 0 chr2 99969796 99969868 -81778219 - ORR1B2 LTR MaLR -8 386 314 7 1347 3445 165 44 17 chr2 99969868 99970589 -81777498 + RMER6A LTR ERVK 1 741 -15 7 1347 1234 244 17 17 chr2 99970609 99970909 -81777178 - ORR1B2 LTR MaLR -67 300 1 7 1347 488 308 24 131 chr2 99971706 99972035 -81776052 + RLTR15 LTR ERVK 1 294 -65 7 1347 1348 270 84 47 chr2 99972742 99973667 -81774420 + MYSERV-int LTR ERVK 4005 4558 -1992 7 1347 1318 201 41 9 chr2 99973664 99974005 -81774082 + MYSERV-int LTR ERVK 6199 6550 0 7 1347 362 316 59 63 chr2 99974005 99974292 -81773795 + RLTR15 LTR ERVK 1 286 -73 7 1347 906 214 79 28 chr2 99981318 99981534 -81766553 + MTB_Mm LTR MaLR 181 407 0 7 1347 525 278 14 27 chr2 99981534 99981665 -81766422 - RLTR40 LTR ERVK -688 129 1 7 1347 2678 98 55 55 chr2 99984596 99985071 -81763016 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 7 1347 2264 102 6 23 chr2 99986740 99986863 -81761224 + ORR1A1 LTR MaLR 1 123 -223 7 1347 1777 158 26 7 chr2 99986863 99987168 -81760919 + RLTR10E LTR ERVK 1 311 0 7 1347 2264 102 6 23 chr2 99987168 99987396 -81760691 + ORR1A1 LTR MaLR 124 346 0 7 1347 863 284 142 12 chr2 99987853 99988198 -81759889 - MTD LTR MaLR -15 404 15 7 1348 456 266 9 0 chr2 100010900 100011009 -81737078 - RMER20B LTR ERVK -517 110 1 1 1348 1511 236 104 52 chr2 100026761 100027036 -81721051 - RMER6C LTR ERVK 0 690 419 3 1348 1511 236 104 52 chr2 100027155 100027535 -81720552 - RMER6C LTR ERVK -272 418 2 3 1348 3751 174 98 25 chr2 100028492 100029333 -81718754 + RLTR13D6 LTR ERVK 1 902 0 3 1348 1178 194 57 24 chr2 100041434 100041721 -81706366 + ORR1B1 LTR MaLR 13 302 -92 4 1348 643 212 88 21 chr2 100042268 100042461 -81705626 + MYSERV-int LTR ERVK 6339 6544 -6 4 1348 1972 165 58 21 chr2 100042468 100042902 -81705185 + RLTR11B LTR ERVK 1 450 -3 4 1348 1413 172 0 8 chr2 100046644 100046888 -81701199 - RMER13A LTR ERVK -629 279 1 5 1348 698 316 43 70 chr2 100050243 100050623 -81697464 + MTE2b LTR MaLR 1 342 -37 6 1348 2068 215 78 107 chr2 100050627 100051256 -81696831 - RMER19C LTR ERVK 0 611 1 6 1348 711 279 57 101 chr2 100053997 100054404 -81693683 - RLTR23 LTR ERV1 -34 396 8 6 1348 981 309 94 33 chr2 100054735 100054808 -81693279 + MT2A LTR ERVL 5 88 -445 6 1348 981 309 94 33 chr2 100054855 100055176 -81692911 + MT2A LTR ERVL 89 423 -110 6 1348 320 319 121 0 chr2 100056042 100056199 -81691888 + MER67C LTR ERV1 534 709 -2 7 1348 1265 219 31 0 chr2 100065328 100065584 -81682503 + RMER6C LTR ERVK 4 267 -423 7 1348 1005 283 47 122 chr2 100083762 100084592 -81663495 + RMER19C LTR ERVK 1 725 -12 1 1348 679 233 27 0 chr2 100088206 100088352 -81659735 + RLTR25B LTR ERVK 7 156 -947 1 1348 2474 195 111 33 chr2 100090586 100090754 -81657333 + RLTR25B LTR ERVK 142 318 -710 1 1348 2474 195 111 33 chr2 100090849 100091339 -81656748 + RLTR25B LTR ERVK 319 851 -177 1 1348 597 236 25 193 chr2 100091835 100091993 -81656094 + RLTR25B LTR ERVK 833 968 -135 1 1348 597 236 25 193 chr2 100092144 100092311 -81655776 + RLTR25B LTR ERVK 969 1103 0 1 1348 685 305 200 51 chr2 100094565 100094880 -81653207 - RMER15 LTR ERVL 0 575 214 1 1348 527 277 132 91 chr2 100099909 100100251 -81647836 + MLT1A0 LTR MaLR 19 374 0 1 1348 299 193 0 54 chr2 100118115 100118208 -81629879 - MT2A LTR ERVL -5 528 441 1 1348 504 313 123 21 chr2 100118212 100118447 -81629640 + MER67D LTR ERV1 155 413 -101 1 1348 653 288 188 17 chr2 100121697 100121937 -81626150 - MTE2b LTR MaLR -64 315 35 1 1348 1148 186 386 20 chr2 100126175 100126680 -81621407 + RMER6C LTR ERVK 1 690 0 1 1348 912 354 65 18 chr2 100135941 100136375 -81611712 + MTE-int LTR MaLR 2 455 -1125 1 1348 287 170 0 19 chr2 100136650 100136704 -81611383 - MTEa LTR MaLR -326 53 1 1 1348 400 336 97 41 chr2 100136873 100137140 -81610947 + MTE-int LTR MaLR 777 1058 -522 1 1348 368 369 0 0 chr2 100137135 100137246 -81610841 + MTE-int LTR MaLR 1399 1509 -71 1 1349 1649 267 89 93 chr2 100146456 100147448 -81600639 - RMER17B LTR ERVK -15 943 1 1 1349 2123 129 6 0 chr2 100149480 100149805 -81598282 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 2 1349 3887 186 94 16 chr2 100151188 100152024 -81596063 - RMER19B LTR ERVK 0 902 1 2 1349 492 300 60 74 chr2 100152175 100152474 -81595613 + RLTR15 LTR ERVK 8 302 -57 2 1349 545 306 29 97 chr2 100162995 100163274 -81584813 - MTE2a LTR MaLR -119 260 1 2 1349 228 222 95 0 chr2 100166561 100166624 -81581463 - MLT1E1A LTR MaLR -5 675 607 2 1349 2651 81 3 8 chr2 100167452 100167827 -81580260 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 24 2 1349 2076 114 3 64 chr2 100168850 100169196 -81578891 + ORR1A4 LTR MaLR 5 329 0 2 1349 2545 81 78 0 chr2 100175016 100175386 -81572701 - MTB LTR MaLR 0 400 2 2 1349 576 265 198 53 chr2 100177727 100177990 -81570097 + ORR1D1 LTR MaLR 32 332 -42 2 1349 429 268 208 43 chr2 100178706 100178913 -81569174 + MTD LTR MaLR 177 417 -2 2 1349 247 387 19 9 chr2 100189071 100189178 -81558909 - ORR1E LTR MaLR -227 132 25 2 1349 683 334 62 28 chr2 100189313 100189636 -81558451 + MTEa LTR MaLR 42 375 -4 2 1349 273 320 29 49 chr2 100198290 100198392 -81549695 - MLT1K LTR MaLR -142 453 354 2 1349 239 314 55 31 chr2 100199223 100199351 -81548736 + ORR1E LTR MaLR 61 191 -168 2 1349 1208 154 75 139 chr2 100201328 100201659 -81546428 - ORR1A4 LTR MaLR -19 310 1 2 1349 1161 252 87 25 chr2 100202765 100203123 -81544964 + ORR1C2 LTR MaLR 1 380 -4 2 1349 3612 42 12 0 chr2 100206000 100206431 -81541656 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 2 1349 1252 264 9 51 chr2 100207337 100207668 -81540419 + MTEa LTR MaLR 5 321 -58 2 1349 354 306 20 0 chr2 100213882 100213980 -81534107 - MTEa LTR MaLR -14 365 266 3 1349 1453 257 89 38 chr2 100213981 100214195 -81533892 - RMER19C LTR ERVK 0 611 388 3 1349 1453 231 123 38 chr2 100214258 100214528 -81533559 - RMER19C LTR ERVK -224 387 25 3 1349 330 366 83 77 chr2 100215304 100215692 -81532395 - MLT1F2 LTR MaLR -54 599 118 3 1349 421 319 40 49 chr2 100231438 100231685 -81516402 + LTR80A LTR ERVL 62 306 -277 3 1349 295 328 70 9 chr2 100242559 100242673 -81505414 + MLT1D LTR MaLR 323 443 -62 3 1349 2961 168 60 38 chr2 100250233 100250820 -81497267 + MT2B LTR ERVL 2 601 0 3 1349 313 317 110 99 chr2 100254352 100254534 -81493553 + MER21B LTR ERV1 1 184 -679 3 1349 547 331 116 4 chr2 100254893 100255151 -81492936 + MER21B LTR ERV1 422 708 -155 3 1349 2781 47 0 3 chr2 100258542 100258880 -81489207 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 337 0 3 1349 25447 30 35 12 chr2 100258880 100261967 -81486120 + IAPEz-int LTR ERVK 8 3165 -3316 3 1349 9706 25 2 5 chr2 100261956 100263084 -81485003 + IAPEz-int LTR ERVK 5345 6468 -13 3 1349 2806 42 0 3 chr2 100263097 100263435 -81484652 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 337 0 3 1349 325 324 104 66 chr2 100265274 100265456 -81482631 + MTD LTR MaLR 79 267 -112 3 1349 278 246 61 43 chr2 100266079 100266194 -81481893 + MTD LTR MaLR 263 379 0 3 1349 1430 304 116 26 chr2 100266194 100267159 -81480928 + MTD-int LTR MaLR 1 697 -883 3 1349 1956 316 84 45 chr2 100267144 100267803 -81480284 + MTD-int LTR MaLR 639 1344 -236 3 1349 1956 316 84 45 chr2 100267859 100268080 -81480007 + MTD-int LTR MaLR 1345 1553 -27 3 1349 390 295 20 117 chr2 100268906 100269102 -81478985 + MTEa LTR MaLR 201 377 -2 3 1350 254 141 58 72 chr2 100270638 100270707 -81477380 + RLTR9A2 LTR ERVK 316 383 0 4 1350 934 216 101 20 chr2 100271288 100271626 -81476461 + MTC LTR MaLR 20 416 -5 4 1350 1597 276 77 10 chr2 100273363 100273843 -81474244 - RLTR18B LTR ERVK 0 512 1 4 1350 392 305 101 31 chr2 100286906 100287163 -81460924 - RMER20B LTR ERVK -228 399 125 4 1350 773 274 78 12 chr2 100291175 100291419 -81456668 - RMER15 LTR ERVL 0 575 316 4 1350 559 282 62 43 chr2 100291438 100291649 -81456438 - RMER15 LTR ERVL -334 241 27 4 1350 269 297 103 42 chr2 100293451 100293616 -81454471 - MLT1F2 LTR MaLR -381 179 5 4 1350 3607 63 33 0 chr2 100295892 100296352 -81451735 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 475 0 4 1350 946 336 45 34 chr2 100305767 100306210 -81441877 + MT2A LTR ERVL 13 460 -73 4 1350 2404 192 41 18 chr2 100312555 100313069 -81435018 + RLTR20B3 LTR ERVK 34 559 -18 4 1350 549 315 15 13 chr2 100314288 100314501 -81433586 + MLT1A LTR MaLR 184 374 -16 4 1350 273 326 106 44 chr2 100325602 100325782 -81422305 - MLT1A0 LTR MaLR -19 346 156 4 1350 950 238 65 85 chr2 100328736 100329185 -81418902 - RMER2 LTR ERV1 -27 540 1 4 1350 2032 143 15 6 chr2 100330574 100330898 -81417189 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 4 1350 1172 177 11 136 chr2 100335265 100335552 -81412535 + RMER19C LTR ERVK 361 611 0 4 1350 3470 23 2 0 chr2 100347031 100347424 -81400663 + MTA_Mm LTR MaLR 1 394 -2 5 1350 8993 36 7 1 chr2 100347426 100348517 -81399570 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 5 1350 3392 35 2 0 chr2 100348517 100348912 -81399175 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 1350 3407 84 128 16 chr2 100358547 100359054 -81389033 + LTRIS2 LTR ERV1 1 564 0 5 1350 3852 151 82 107 chr2 100359792 100360394 -81387693 + RLTR13D4 LTR ERVK 1 653 -380 5 1350 3852 151 82 107 chr2 100360428 100360884 -81387203 + RLTR13D4 LTR ERVK 654 1033 0 5 1350 237 384 120 28 chr2 100362461 100362678 -81385409 - MLT2B2 LTR ERVL -94 421 185 5 1350 506 333 83 28 chr2 100362715 100362931 -81385156 - MLT1A0 LTR MaLR -29 336 109 5 1350 398 353 151 16 chr2 100363267 100363572 -81384515 - MLT1D LTR MaLR -34 471 126 5 1350 540 301 56 15 chr2 100364855 100365051 -81383036 - MTEa LTR MaLR -8 371 168 5 1350 326 300 0 43 chr2 100365085 100365179 -81382908 - MTEa LTR MaLR -289 90 1 5 1350 378 308 63 111 chr2 100379677 100379929 -81368158 + MTE2a LTR MaLR 138 377 -2 5 1350 381 270 22 60 chr2 100393591 100393725 -81354362 - RLTR31_Mm LTR ERVK 0 561 433 5 1350 1310 213 37 40 chr2 100393727 100394104 -81353983 - RLTR31_Mur LTR ERVK -177 376 1 5 1350 265 280 98 41 chr2 100396749 100396872 -81351215 - RMER15 LTR ERVL -14 561 432 5 1350 2163 193 103 63 chr2 100400479 100401022 -81347065 - RLTR18 LTR ERVK 0 616 52 5 1351 1211 194 16 4 chr2 100408017 100408260 -81339827 + RLTR40 LTR ERVK 2 247 -570 5 1351 1567 270 51 35 chr2 100408320 100408869 -81339218 + RLTR40 LTR ERVK 253 810 -7 5 1351 286 332 42 33 chr2 100411525 100411828 -81336259 + MLT1A1 LTR MaLR 6 336 -29 5 1351 968 177 30 25 chr2 100413443 100413640 -81334447 + ORR1B1 LTR MaLR 186 383 -11 6 1351 269 289 43 86 chr2 100420043 100420183 -81327904 + RLTR41 LTR ERV1 251 384 -62 6 1351 3779 67 36 4 chr2 100421542 100422038 -81326049 + RLTR1B LTR ERV1 1 512 0 6 1351 1899 140 116 14 chr2 100424826 100425189 -81322898 - RLTR9D LTR ERVK -3 400 1 6 1351 2207 129 21 103 chr2 100429306 100429780 -81318307 - RLTR22_Mur LTR ERVK -722 1126 692 6 1351 1964 133 27 18 chr2 100429791 100430120 -81317967 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1092 1423 -425 6 1351 3633 107 154 67 chr2 100430600 100431342 -81316745 + RLTR13D6 LTR ERVK 1 806 0 6 1351 291 362 65 30 chr2 100437008 100437176 -81310911 + MLT1K LTR MaLR 389 562 -33 6 1351 4658 191 132 46 chr2 100442721 100443345 -81304742 - RMER12 LTR ERVK 0 1322 588 6 1351 4658 191 132 46 chr2 100443487 100444064 -81304023 - RMER12 LTR ERVK -735 587 17 6 1351 444 220 30 10 chr2 100458060 100458161 -81289926 - RMER15 LTR ERVL -446 129 27 6 1351 269 297 103 42 chr2 100459963 100460128 -81287959 - MLT1F2 LTR MaLR -381 179 5 6 1351 3607 63 33 0 chr2 100462404 100462864 -81285223 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 475 0 6 1351 946 336 45 34 chr2 100472277 100472720 -81275367 + MT2A LTR ERVL 13 460 -73 6 1351 2404 192 41 18 chr2 100479065 100479579 -81268508 + RLTR20B3 LTR ERVK 34 559 -18 6 1351 549 315 15 13 chr2 100480798 100481011 -81267076 + MLT1A LTR MaLR 184 374 -16 6 1351 273 326 106 44 chr2 100492112 100492292 -81255795 - MLT1A0 LTR MaLR -19 346 156 7 1351 950 238 65 85 chr2 100495246 100495695 -81252392 - RMER2 LTR ERV1 -27 540 1 7 1351 2032 143 15 6 chr2 100497082 100497406 -81250681 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 7 1351 1172 177 11 136 chr2 100501774 100502061 -81246026 + RMER19C LTR ERVK 361 611 0 3 1351 3470 23 2 0 chr2 100513540 100513933 -81234154 + MTA_Mm LTR MaLR 1 394 -2 1 1351 8993 36 7 1 chr2 100513935 100515026 -81233061 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 1 1351 3392 35 2 0 chr2 100515026 100515421 -81232666 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1351 3407 84 128 16 chr2 100525056 100525563 -81222524 + LTRIS2 LTR ERV1 1 564 0 2 1351 3852 151 82 107 chr2 100526301 100526903 -81221184 + RLTR13D4 LTR ERVK 1 653 -380 3 1351 3852 151 82 107 chr2 100526937 100527393 -81220694 + RLTR13D4 LTR ERVK 654 1033 0 3 1351 237 384 120 28 chr2 100528970 100529187 -81218900 - MLT2B2 LTR ERVL -94 421 185 3 1351 506 333 83 28 chr2 100529224 100529440 -81218647 - MLT1A0 LTR MaLR -29 336 109 3 1351 398 353 151 16 chr2 100529776 100530081 -81218006 - MLT1D LTR MaLR -34 471 126 3 1351 540 301 56 15 chr2 100531364 100531560 -81216527 - MTEa LTR MaLR -8 371 168 4 1351 326 300 0 43 chr2 100531594 100531688 -81216399 - MTEa LTR MaLR -289 90 1 4 1352 2797 25 0 0 chr2 100545377 100545698 -81202389 + MERVL-int LTR ERVL 4691 5011 -474 5 1352 2937 31 3 0 chr2 100545705 100546064 -81202023 + MT-int LTR MaLR 678 1037 -61 5 1352 2911 25 3 3 chr2 100549112 100549475 -81198612 + MT-int LTR MaLR 676 1038 -60 6 1352 1016 136 21 21 chr2 100549467 100549675 -81198412 - MT-int LTR MaLR -333 925 660 6 1352 4658 191 132 46 chr2 100549849 100550426 -81197661 + RMER12 LTR ERVK 17 587 -735 6 1352 4658 191 132 46 chr2 100550568 100551192 -81196895 + RMER12 LTR ERVK 588 1322 0 6 1352 291 362 65 30 chr2 100556737 100556905 -81191182 - MLT1K LTR MaLR -33 562 389 7 1352 3633 107 154 67 chr2 100562573 100563315 -81184772 - RLTR13D6 LTR ERVK 0 806 1 8 1352 1964 133 27 18 chr2 100563795 100564124 -81183963 - RLTR22_Mur LTR ERVK -425 1423 1092 8 1352 2207 129 21 103 chr2 100564135 100564609 -81183478 + RLTR22_Mur LTR ERVK 692 1126 -722 8 1352 1899 140 116 14 chr2 100568726 100569089 -81178998 + RLTR9D LTR ERVK 1 400 -3 9 1352 3779 67 36 4 chr2 100571874 100572370 -81175717 - RLTR1B LTR ERV1 0 512 1 1 1352 269 289 43 86 chr2 100573729 100573869 -81174218 - RLTR41 LTR ERV1 -62 384 251 1 1352 968 177 30 25 chr2 100580270 100580467 -81167620 - ORR1B1 LTR MaLR -11 383 186 1 1352 286 332 42 33 chr2 100582082 100582385 -81165702 - MLT1A1 LTR MaLR -29 336 6 1 1352 1567 270 51 35 chr2 100585041 100585590 -81162497 - RLTR40 LTR ERVK -7 810 253 1 1352 1211 194 16 4 chr2 100585650 100585893 -81162194 - RLTR40 LTR ERVK -570 247 2 1 1352 2163 193 103 63 chr2 100592874 100593417 -81154670 + RLTR18 LTR ERVK 52 616 0 1 1352 265 280 98 41 chr2 100597025 100597148 -81150939 + RMER15 LTR ERVL 432 561 -14 1 1352 1310 213 37 40 chr2 100599791 100600168 -81147919 + RLTR31_Mur LTR ERVK 1 376 -177 1 1352 381 270 22 60 chr2 100600170 100600304 -81147783 + RLTR31_Mm LTR ERVK 433 561 0 1 1352 2369 88 9 20 chr2 100615734 100616146 -81131941 - MT-int LTR MaLR -239 1019 538 1 1352 1110 289 32 29 chr2 100625430 100625805 -81122282 - MTEb LTR MaLR -3 376 1 1 1352 344 411 48 9 chr2 100626516 100626744 -81121343 + MLT1F1 LTR MaLR 11 247 -301 1 1352 394 330 139 0 chr2 100627743 100627937 -81120150 + MLT1F1 LTR MaLR 341 561 -8 1 1352 967 309 31 54 chr2 100627949 100628335 -81119752 - MTEa LTR MaLR -2 377 1 1 1352 235 256 26 48 chr2 100631565 100631754 -81116333 - RMER17D LTR ERVK -462 427 243 1 1352 335 227 9 76 chr2 100637106 100637211 -81110876 + MLT1I LTR MaLR 1 98 -313 1 1352 1099 256 47 65 chr2 100641913 100642314 -81105773 - RMER19C LTR ERVK -14 597 153 2 1352 937 226 10 102 chr2 100642326 100642621 -81105466 - RMER19C LTR ERVK -336 275 8 2 1352 744 284 29 38 chr2 100646029 100646267 -81101820 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 135 2 1352 402 210 0 12 chr2 100648686 100648768 -81099319 + MTD LTR MaLR 1 81 -340 2 1352 1075 267 112 22 chr2 100649299 100649621 -81098466 + MTD LTR MaLR 42 392 -27 2 1352 1491 234 67 12 chr2 100655062 100655408 -81092679 - ORR1D1 LTR MaLR -2 372 8 2 1352 437 339 61 39 chr2 100655932 100656162 -81091925 + MLT1A0 LTR MaLR 91 325 -40 2 1352 3106 205 27 39 chr2 100659047 100659682 -81088405 - RMER20B LTR ERVK 0 627 1 2 1352 1177 221 31 30 chr2 100661708 100662045 -81086042 + RLTR20B1 LTR ERVK 1 318 -233 2 1353 2051 163 27 34 chr2 100674291 100674703 -81073384 + RLTR9E LTR ERVK 1 409 0 2 1353 545 356 31 43 chr2 100684518 100684841 -81063246 - MLT1C LTR MaLR -141 326 8 2 1353 442 233 30 23 chr2 100692815 100692947 -81055140 - RMER5 LTR ERV1 -21 513 381 2 1353 226 269 59 78 chr2 100696841 100696994 -81051093 + RLTR22_Mur LTR ERVK 345 494 -1354 2 1353 2423 189 19 32 chr2 100705218 100705752 -81042335 - RLTR11A2 LTR ERVK 0 527 1 2 1353 3263 94 2 99 chr2 100709032 100709655 -81038432 - RMER17A2 LTR ERVK -344 562 1 3 1353 762 339 34 17 chr2 100710333 100710684 -81037403 + MLT1A0 LTR MaLR 1 357 -8 3 1353 1529 271 16 25 chr2 100712262 100712625 -81035462 + ORR1D1 LTR MaLR 3 362 -12 3 1353 239 262 45 80 chr2 100718286 100718398 -81029689 - RMER15 LTR ERVL -466 109 2 3 1353 3941 180 90 24 chr2 100719007 100719853 -81028234 + RMER19B LTR ERVK 1 902 0 3 1353 650 284 99 55 chr2 100729334 100729484 -81018603 + MER21B LTR ERV1 85 254 -609 3 1353 3255 38 10 0 chr2 100729484 100729876 -81018211 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 1353 650 284 99 55 chr2 100729876 100729978 -81018109 + MER21B LTR ERV1 255 348 -515 3 1353 2849 192 79 14 chr2 100733611 100734259 -81013828 - RMER6C LTR ERVK 0 690 1 3 1353 1363 361 110 75 chr2 100744483 100746158 -81001929 - MLT1A1-int LTR MaLR 0 1735 2 3 1353 271 267 47 56 chr2 100746162 100746269 -81001818 - MLT1A1 LTR MaLR -2 406 301 3 1353 695 306 77 0 chr2 100747198 100747394 -81000693 - MER31A LTR ERV1 -255 230 20 3 1353 383 327 54 12 chr2 100748103 100748270 -80999817 + MER34 LTR ERV1 1 174 -368 3 1353 406 283 60 40 chr2 100748282 100748433 -80999654 - RMER15 LTR ERVL -1 574 421 3 1353 1689 156 11 92 chr2 100749728 100750174 -80997913 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 3 1353 3483 93 90 19 chr2 100752154 100752678 -80995409 + LTRIS2 LTR ERV1 1 561 -3 3 1353 302 336 11 163 chr2 100760664 100760934 -80987153 + MER34A LTR ERV1 4 232 -339 3 1353 1198 163 15 71 chr2 100762995 100763291 -80984796 + RMER17B LTR ERVK 1 258 -648 3 1353 2167 162 90 5 chr2 100763292 100763702 -80984385 + RMER17B LTR ERVK 514 958 0 3 1353 373 335 113 60 chr2 100763773 100764189 -80983898 + MLT1H LTR MaLR 29 466 -83 3 1353 266 302 62 54 chr2 100769518 100769630 -80978457 - MLT1E2 LTR MaLR -18 609 497 3 1353 301 281 16 0 chr2 100785559 100785623 -80962464 + MTEa LTR MaLR 63 127 -252 4 1353 283 313 0 39 chr2 100788147 100788250 -80959837 + MER67D LTR ERV1 1 99 -415 4 1353 408 297 136 41 chr2 100793867 100794183 -80953904 - LTR48 LTR ERV1 -47 740 395 4 1354 1661 168 67 38 chr2 100796450 100796821 -80951266 + ORR1C2 LTR MaLR 3 384 0 4 1354 2876 82 0 10 chr2 100797992 100798388 -80949699 + MTB LTR MaLR 1 392 -8 4 1354 2062 119 18 9 chr2 100798403 100798743 -80949344 + RMER17D LTR ERVK 419 761 -128 4 1354 653 364 53 23 chr2 100799028 100799332 -80948755 + MLT1A0 LTR MaLR 12 324 -41 4 1354 241 341 29 58 chr2 100799358 100799532 -80948555 + MLT-int LTR MaLR 4 172 -1563 4 1354 237 342 89 0 chr2 100799544 100799623 -80948464 - MLT1A0 LTR MaLR -134 231 146 4 1354 1760 131 82 177 chr2 100803130 100803251 -80944836 + RLTR23 LTR ERV1 1 103 -327 4 1354 1760 131 82 177 chr2 100803275 100803628 -80944459 + RLTR23 LTR ERV1 104 430 0 4 1354 1615 180 75 65 chr2 100818135 100818220 -80929867 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 341 4 1354 1615 180 75 65 chr2 100818250 100818563 -80929524 - MTB_Mm LTR MaLR -67 340 5 4 1354 289 309 0 0 chr2 100819060 100819128 -80928959 + MTEa LTR MaLR 22 89 -290 4 1354 354 315 53 35 chr2 100824440 100824611 -80923476 + MTEa LTR MaLR 206 379 0 4 1354 2851 135 226 12 chr2 100831223 100831480 -80916607 + RMER17D2 LTR ERVK 1 276 -533 4 1354 2851 135 226 12 chr2 100831655 100832062 -80916025 + RMER17D2 LTR ERVK 277 806 -3 4 1354 229 342 62 37 chr2 100848751 100848912 -80899175 - MLT2B2 LTR ERVL -34 528 364 5 1354 776 251 170 18 chr2 100849592 100849921 -80898166 - MTE2b LTR MaLR 0 379 1 5 1354 1770 197 60 3 chr2 100852635 100852982 -80895105 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 5 1354 233 234 15 45 chr2 100863156 100863223 -80884864 + RMER15 LTR ERVL 403 467 -108 5 1354 442 321 22 0 chr2 100866391 100866528 -80881559 - MYSERV-int LTR ERVK -1460 5090 4951 5 1354 558 214 66 122 chr2 100866625 100866882 -80881205 - MYSERV6-int LTR ERVK -453 2785 2627 5 1354 1216 263 121 86 chr2 100867057 100868379 -80879708 - MYSERV6-int LTR ERVK -276 8683 8148 5 1354 260 191 30 45 chr2 100868454 100868520 -80879567 - RLTR19-int LTR ERVK -3808 2329 2265 5 1354 1044 261 76 113 chr2 100869583 100870149 -80877938 - RodERV21-int LTR ERV1 -3985 1006 462 5 1354 492 299 135 60 chr2 100877880 100878264 -80869823 + MLT1D LTR MaLR 68 480 -25 5 1354 302 322 39 128 chr2 100885807 100886010 -80862077 - LTR16A LTR ERVL -262 189 5 5 1354 1616 206 15 91 chr2 100888404 100888799 -80859288 + ORR1B2 LTR MaLR 1 365 -2 5 1354 3510 15 2 0 chr2 100891139 100891534 -80856553 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 1354 487 315 47 36 chr2 100892776 100893014 -80855073 + MTEb LTR MaLR 1 247 -132 5 1354 434 358 54 72 chr2 100893057 100893149 -80854938 + MTEb LTR MaLR 248 325 -54 5 1354 241 244 98 105 chr2 100898431 100898564 -80849523 + MTE-int LTR MaLR 756 887 -693 5 1354 276 313 109 56 chr2 100902657 100902908 -80845179 + MamGypLTR1c LTR Gypsy 74 329 -484 5 1354 2901 83 2 34 chr2 100905552 100905963 -80842124 + MTB LTR MaLR 1 398 -2 5 1354 9786 100 15 50 chr2 100907488 100908707 -80839380 - RLTR22_Mur LTR ERVK -301 1547 375 5 1354 9786 100 15 50 chr2 100908728 100909112 -80838975 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1474 374 1 5 1354 1394 345 80 13 chr2 100914051 100914806 -80833281 - ERVL-B4-int LTR ERVL -1563 4151 3347 6 1355 300 275 8 128 chr2 100928909 100928932 -80819155 + MT2B LTR ERVL 147 154 -447 6 1355 2554 68 124 0 chr2 100929445 100929799 -80818288 - MTB LTR MaLR -2 398 1 6 1355 7854 80 6 6 chr2 100929799 100930896 -80817191 - MTB-int LTR MaLR 0 1098 1 6 1355 3060 78 5 0 chr2 100930896 100931294 -80816793 - MTB LTR MaLR 0 400 1 6 1355 2685 77 41 19 chr2 100935697 100936109 -80811978 + BGLII LTR ERVK 1 421 0 6 1355 1031 169 199 32 chr2 100936508 100936819 -80811268 + RMER3D-int LTR ERVK 486 848 -1994 6 1355 2630 212 94 108 chr2 100936837 100937914 -80810173 + RMER3D-int LTR ERVK 633 1694 -1148 6 1355 3090 205 33 79 chr2 100937882 100938709 -80809378 + RMER3D-int LTR ERVK 1891 2685 -157 6 1355 3090 205 33 79 chr2 100938856 100939025 -80809062 + RMER3D-int LTR ERVK 2686 2841 -1 6 1355 3066 76 2 14 chr2 100939025 100939451 -80808636 + BGLII LTR ERVK 1 421 0 6 1355 283 375 113 65 chr2 100944032 100944446 -80803641 - LTR16A LTR ERVL -2 449 16 6 1355 486 350 46 0 chr2 100951649 100951843 -80796244 - MLT1H LTR MaLR -316 233 31 6 1355 1985 169 60 3 chr2 100951997 100952347 -80795740 - ORR1C1 LTR MaLR -8 370 1 6 1355 2154 118 56 64 chr2 100952414 100952822 -80795265 + RLTR44A LTR ERVK 1 405 0 6 1355 1212 96 250 0 chr2 100958600 100958820 -80789267 + RLTR10A LTR ERVK 137 411 0 6 1355 1136 85 0 13 chr2 100958822 100959075 -80789012 + IAP-d-int LTR ERVK 101 602 -1385 6 1355 688 209 26 0 chr2 100959069 100959222 -80788865 + IAP-d-int LTR ERVK 347 503 -6039 6 1355 2899 77 16 0 chr2 100959222 100959610 -80788477 + IAP-d-int LTR ERVK 5007 5400 -1142 6 1355 805 96 316 0 chr2 100959608 100959802 -80788285 + IAP-d-int LTR ERVK 5766 6021 -521 6 1355 1393 85 80 0 chr2 100959805 100960005 -80788082 + IAP-d-int LTR ERVK 6128 6343 -199 6 1355 2911 94 19 12 chr2 100960180 100960644 -80787443 + RLTR10-int LTR ERVK 1305 1739 -248 6 1355 1591 133 55 29 chr2 100960669 100960978 -80787109 + RLTR10A LTR ERVK 95 411 0 6 1355 342 120 0 0 chr2 100964711 100964761 -80783326 - MTEa LTR MaLR -329 50 1 6 1355 2742 75 0 0 chr2 100965367 100965713 -80782374 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 6 1355 313 364 124 9 chr2 100975276 100975509 -80772578 - MLT1C LTR MaLR -176 291 32 6 1355 538 313 166 52 chr2 100980172 100980479 -80767608 + MLT1H LTR MaLR 190 531 -18 7 1355 320 270 112 129 chr2 100983304 100983474 -80764613 - MTEa LTR MaLR -2 377 211 7 1355 347 351 26 13 chr2 100983500 100983656 -80764431 + MTE-int LTR MaLR 113 270 -1310 7 1355 675 314 71 0 chr2 100985665 100985891 -80762196 + MTE-int LTR MaLR 262 503 -1077 7 1355 482 306 67 67 chr2 100985921 100986145 -80761942 - MTEa LTR MaLR -144 235 12 7 1355 3000 44 0 5 chr2 100986500 100986869 -80761218 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 7 1355 53344 20 17 1 chr2 100986869 100993241 -80754846 + IAPEz-int LTR ERVK 8 6481 0 7 1355 3014 41 0 5 chr2 100993241 100993610 -80754477 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 7 1355 520 269 53 18 chr2 100996692 100996862 -80751225 + LTR81A LTR ERV1? 43 218 -1132 7 1355 894 267 175 94 chr2 101002632 101002883 -80745204 + RMER20B LTR ERVK 21 341 -286 5 1355 894 267 175 94 chr2 101002927 101003080 -80745007 + RMER20B LTR ERVK 342 457 -170 5 1355 324 97 31 31 chr2 101003081 101003145 -80744942 + RMER20B LTR ERVK 564 627 0 5 1355 335 390 27 32 chr2 101003633 101003821 -80744266 + ORR1E LTR MaLR 1 187 -172 9 1355 457 350 40 40 chr2 101014037 101014284 -80733803 - MLT1H LTR MaLR -13 536 290 2 1355 464 308 70 37 chr2 101022517 101022787 -80725300 + RLTR15 LTR ERVK 58 336 -23 3 1355 1108 212 69 42 chr2 101023436 101023697 -80724390 + MTD LTR MaLR 1 268 -151 3 1355 1182 287 36 25 chr2 101025853 101026210 -80721877 + MTE2b LTR MaLR 19 379 0 3 1355 1255 249 101 6 chr2 101036313 101036641 -80711446 - ORR1E LTR MaLR 0 359 1 4 1355 498 256 26 125 chr2 101036641 101036768 -80711319 - ORR1E-int LTR MaLR -53 1527 1418 4 1355 498 250 19 210 chr2 101037070 101037133 -80710954 - ORR1E-int LTR MaLR -163 1417 1380 4 1355 336 345 50 14 chr2 101044916 101045057 -80703030 - ORR1E LTR MaLR -211 148 3 5 1355 1542 212 109 14 chr2 101048902 101049280 -80698807 + MTD LTR MaLR 5 405 -14 5 1355 914 243 64 46 chr2 101053803 101054062 -80694025 + RMER15 LTR ERVL 276 536 -39 6 1355 914 243 64 46 chr2 101054110 101054130 -80693957 + RMER15 LTR ERVL 537 559 -16 6 1355 233 315 26 40 chr2 101055309 101055385 -80692702 - MLT1H1 LTR MaLR -156 399 325 6 1355 585 293 174 50 chr2 101055983 101056276 -80691811 + MTEa LTR MaLR 1 327 -52 6 1355 245 280 10 70 chr2 101056392 101056430 -80691657 + MTEa LTR MaLR 328 366 -13 6 1356 233 317 25 142 chr2 101056696 101056858 -80691229 + LTR16D LTR ERVL 266 408 -243 6 1356 375 375 22 29 chr2 101064365 101064615 -80683472 - MLT1E LTR MaLR -370 284 31 8 1356 256 207 17 0 chr2 101064778 101064836 -80683251 + MLT1A1 LTR MaLR 350 408 0 8 1356 2893 118 75 20 chr2 101072172 101072664 -80675423 + MURVY-LTR LTR ERV1 1 519 0 1 1356 1751 182 15 9 chr2 101082709 101083036 -80665051 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 1 1356 900 183 6 0 chr2 101083036 101083205 -80664882 + ORR1A4-int LTR MaLR 1 170 -1793 1 1356 1189 165 70 31 chr2 101083178 101083435 -80664652 - ORR1A4 LTR MaLR -61 268 2 1 1356 697 317 86 67 chr2 101088974 101089346 -80658741 - MTEa LTR MaLR 0 379 1 1 1356 708 273 142 68 chr2 101093322 101093766 -80654321 + MLT1D LTR MaLR 6 482 -23 1 1356 570 332 59 106 chr2 101103255 101103642 -80644445 - MLT1A LTR MaLR -5 369 1 1 1356 3083 69 7 2 chr2 101105167 101105586 -80642501 - BGLII LTR ERVK 0 421 1 1 1356 1062 298 63 50 chr2 101107880 101108244 -80639843 - MTEb LTR MaLR -6 373 5 1 1356 227 338 39 0 chr2 101108411 101108488 -80639599 + MLT1D LTR MaLR 13 92 -413 1 1356 380 346 96 44 chr2 101108551 101108823 -80639264 + MLT1D LTR MaLR 196 481 -24 1 1356 3071 112 67 4 chr2 101109020 101109559 -80638528 - RMER12B LTR ERVK -143 1261 689 1 1356 999 107 40 0 chr2 101110488 101110638 -80637449 - RMER12B LTR ERVK -673 731 576 1 1356 759 221 152 54 chr2 101112605 101112971 -80635116 - MTD LTR MaLR 0 421 18 1 1356 751 263 97 32 chr2 101120649 101120992 -80627095 + MLT2D LTR ERVL 14 467 -89 1 1356 1473 248 15 48 chr2 101121748 101122146 -80625941 - MTC LTR MaLR 0 421 37 1 1356 320 265 126 61 chr2 101127748 101128071 -80620016 - MLT1D LTR MaLR -46 421 74 1 1356 384 290 260 17 chr2 101130339 101130574 -80617513 - RMER15 LTR ERVL 0 575 284 1 1356 1846 196 20 2 chr2 101139113 101139511 -80608576 + ORR1B2-int LTR MaLR 686 1090 -419 2 1356 998 149 0 12 chr2 101139488 101139651 -80608436 + ORR1B2-int LTR MaLR 1349 1509 0 2 1356 1774 163 73 24 chr2 101139653 101139993 -80608094 + ORR1B2 LTR MaLR 3 359 -8 2 1356 1282 254 6 62 chr2 101140012 101140335 -80607752 + ORR1E LTR MaLR 49 353 -6 2 1356 484 377 14 28 chr2 101150920 101151133 -80596954 + RMER15 LTR ERVL 325 534 -41 2 1356 1158 359 67 16 chr2 101151171 101152026 -80596061 + RMER15-int LTR ERVL 5 902 -4097 2 1356 3452 28 2 0 chr2 101153325 101153720 -80594367 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 1356 9719 15 0 0 chr2 101153720 101154818 -80593269 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 2 1356 3465 25 2 0 chr2 101154818 101155213 -80592874 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 1356 380 298 69 12 chr2 101159123 101159283 -80588804 - MLT2B4 LTR ERVL -382 174 6 2 1356 1300 228 162 11 chr2 101179388 101179752 -80568335 - MTD LTR MaLR 0 419 1 2 1357 276 325 75 78 chr2 101195158 101195485 -80552602 - MTEb LTR MaLR -19 360 31 2 1357 1691 218 261 7 chr2 101197481 101197906 -80550181 - MT2A LTR ERVL 0 533 1 2 1357 1672 156 125 13 chr2 101198490 101198801 -80549286 + ORR1B1 LTR MaLR 41 386 -8 2 1357 1457 243 49 44 chr2 101200802 101201207 -80546880 - MTD LTR MaLR 0 419 13 2 1357 499 356 12 29 chr2 101206733 101206973 -80541114 + MLT1D LTR MaLR 270 505 0 2 1357 399 282 92 55 chr2 101207015 101207233 -80540854 + MLT2C1 LTR ERVL 40 265 -132 2 1357 313 375 33 0 chr2 101212216 101212336 -80535751 - LTR16A LTR ERVL -194 257 134 2 1357 1306 246 18 45 chr2 101217661 101217993 -80530094 - ORR1B1 LTR MaLR -71 323 1 2 1357 3345 38 5 0 chr2 101224503 101224897 -80523190 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 1357 232 454 59 0 chr2 101226278 101226430 -80521657 + LTR33A_ LTR ERVL 17 177 -354 3 1357 600 327 147 79 chr2 101236819 101237337 -80510750 - MLT1F2 LTR MaLR -7 553 1 3 1357 2934 101 69 13 chr2 101238392 101238842 -80509245 + RLTR21 LTR ERVK 1 475 -1097 3 1357 463 159 114 0 chr2 101239667 101239755 -80508332 + ORR1A2 LTR MaLR 3 100 -227 3 1357 2664 153 37 213 chr2 101244342 101244467 -80503620 + RLTR21 LTR ERVK 481 609 -963 3 1357 2664 153 37 213 chr2 101244911 101245159 -80502928 + RLTR21 LTR ERVK 617 717 -855 3 1357 2664 153 37 213 chr2 101245716 101245921 -80502166 + RLTR21 LTR ERVK 718 923 -649 3 1357 2664 153 37 213 chr2 101246123 101246396 -80501691 + RLTR21 LTR ERVK 924 1190 -382 3 1357 235 226 0 184 chr2 101246364 101246440 -80501647 + RMER12B LTR ERVK 1192 1253 -151 3 1357 263 178 0 0 chr2 101246414 101246459 -80501628 + RLTR21 LTR ERVK 1064 1108 -464 3 1357 1147 179 46 102 chr2 101246432 101246643 -80501444 + RLTR21 LTR ERVK 1054 1253 -151 3 1357 1147 214 50 69 chr2 101246744 101247093 -80500994 + RLTR21 LTR ERVK 1128 1569 -3 3 1357 1861 229 29 22 chr2 101248590 101249006 -80499081 - MTD LTR MaLR 0 419 1 3 1357 1827 138 79 0 chr2 101249952 101250257 -80497830 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 3 1357 288 240 18 0 chr2 101251259 101251340 -80496747 - MTEb LTR MaLR -16 363 281 3 1357 883 155 187 20 chr2 101254816 101255014 -80493073 - ORR1C2 LTR MaLR -3 381 151 3 1357 632 221 35 166 chr2 101255533 101255787 -80492300 - ORR1D1 LTR MaLR -138 246 1 3 1357 543 343 130 65 chr2 101260122 101260477 -80487610 + MLT1E2 LTR MaLR 232 609 -18 3 1357 2736 212 43 25 chr2 101261411 101262058 -80486029 + RMER6C LTR ERVK 32 690 0 3 1357 259 275 72 64 chr2 101264062 101264277 -80483810 + MURVY-LTR LTR ERV1 199 461 -58 3 1357 1455 268 47 6 chr2 101267456 101267820 -80480267 + MTEa LTR MaLR 1 379 0 3 1357 3085 18 2 106 chr2 101277233 101277666 -80470421 + RLTR10 LTR ERVK 1 388 -2 3 1357 490 275 72 67 chr2 101277669 101277864 -80470223 + RMER2 LTR ERV1 344 539 -28 3 1357 3866 153 129 63 chr2 101279202 101279854 -80468233 + RMER19B LTR ERVK 11 703 -199 3 1357 3866 153 129 63 chr2 101279875 101280059 -80468028 + RMER19B LTR ERVK 704 901 -1 3 1357 3157 55 24 2 chr2 101288442 101288862 -80459225 - ORR1A1-int LTR MaLR -1216 576 148 3 1357 3291 58 8 5 chr2 101291956 101292351 -80455736 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 1357 434 51 34 0 chr2 101292526 101292585 -80455502 + MTA_Mm LTR MaLR 1 61 -346 4 1357 1759 59 0 0 chr2 101292577 101292796 -80455291 + MTA_Mm LTR MaLR 178 396 0 4 1357 1702 120 124 0 chr2 101293092 101293383 -80454704 + IAPEY3_LTR LTR ERVK 1 327 -5 4 1357 233 308 132 19 chr2 101297888 101297994 -80450093 - MamGypLTR1b LTR Gypsy -385 397 280 4 1357 497 321 89 24 chr2 101301046 101301447 -80446640 + MLT1D LTR MaLR 40 485 -20 4 1357 1395 227 75 45 chr2 101301447 101301806 -80446281 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 4 1357 497 315 96 30 chr2 101301806 101301827 -80446260 + MLT1D LTR MaLR 486 503 -2 4 1357 281 309 147 61 chr2 101306697 101306928 -80441159 - MLT1K LTR MaLR -55 540 290 4 1357 3851 110 143 15 chr2 101308136 101308737 -80439350 + RLTR33 LTR ERVK 1 678 0 4 1357 862 321 141 16 chr2 101308766 101309193 -80438894 + MLT1D LTR MaLR 1 480 -25 4 1357 267 165 152 80 chr2 101317213 101317282 -80430805 + RMER17C LTR ERVK 128 188 -222 4 1357 267 165 152 80 chr2 101317346 101317414 -80430673 + RMER17C LTR ERVK 189 275 -135 4 1358 301 227 62 26 chr2 101319039 101319152 -80428935 + MTEb LTR MaLR 261 377 -2 4 1358 662 257 136 5 chr2 101319667 101319851 -80428236 + MTD LTR MaLR 211 418 -1 4 1358 431 238 10 29 chr2 101321575 101321679 -80426408 - MTD LTR MaLR -317 102 1 4 1358 489 306 136 64 chr2 101331510 101331838 -80416249 - MLT1G LTR MaLR -196 359 21 4 1358 1589 133 150 8 chr2 101332862 101333128 -80414959 - ORR1B1 LTR MaLR -88 306 3 4 1358 1027 292 21 50 chr2 101333260 101333421 -80414666 + MLT1B LTR MaLR 1 163 -227 4 1358 1027 292 21 50 chr2 101333876 101334096 -80413991 + MLT1B LTR MaLR 164 371 -19 4 1358 352 306 172 79 chr2 101334625 101335083 -80413004 - MLT1D LTR MaLR -1 504 4 4 1358 1678 181 206 20 chr2 101336835 101337291 -80410796 - MT2B LTR ERVL -60 541 1 4 1358 411 266 107 28 chr2 101338667 101338845 -80409242 + LTR50 LTR ERVL 13 204 -591 4 1358 773 297 91 16 chr2 101356505 101356868 -80391219 - MLT1B LTR MaLR 0 390 1 4 1358 229 320 130 0 chr2 101357286 101357386 -80390701 - MLT1M LTR MaLR -497 175 63 5 1358 398 308 8 17 chr2 101359825 101359944 -80388143 - MTEa LTR MaLR -3 376 259 5 1358 378 241 64 9 chr2 101371757 101371866 -80376221 + MLT1A0 LTR MaLR 42 156 -209 5 1358 1486 166 61 3 chr2 101371866 101372157 -80375930 + ORR1B1 LTR MaLR 1 309 -85 5 1358 2367 138 56 18 chr2 101377138 101377528 -80370559 + RLTR44A LTR ERVK 1 405 0 5 1358 2490 74 3 58 chr2 101378887 101379233 -80368854 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 5 1358 1777 270 55 22 chr2 101380961 101381583 -80366504 + MER67C LTR ERV1 55 696 -15 5 1358 275 292 112 55 chr2 101385552 101385863 -80362224 + ORR1E LTR MaLR 40 379 0 5 1358 1922 191 79 13 chr2 101389593 101389985 -80358102 - MTD LTR MaLR 0 419 2 5 1358 322 253 0 92 chr2 101396976 101397063 -80351024 + MTEa LTR MaLR 137 215 -164 5 1358 515 235 27 7 chr2 101398576 101398750 -80349337 - MTEa LTR MaLR -108 271 102 5 1358 727 227 167 21 chr2 101399753 101399962 -80348125 + MTEa LTR MaLR 117 323 -36 5 1358 641 306 33 107 chr2 101405990 101406261 -80341826 - MTE2a LTR MaLR -49 330 80 6 1358 371 259 56 35 chr2 101409005 101409149 -80338938 - ORR1E LTR MaLR 0 379 233 6 1358 900 260 68 34 chr2 101409461 101409742 -80338345 - ORR1E LTR MaLR -89 285 1 6 1358 832 231 112 12 chr2 101409742 101409982 -80338105 - MTE-int LTR MaLR -53 1527 1262 6 1358 570 254 109 11 chr2 101410042 101410217 -80337870 - ORR1E LTR MaLR -167 192 1 6 1358 1199 216 32 43 chr2 101410277 101410557 -80337530 + MT2A LTR ERVL 186 462 -71 6 1358 2783 185 36 31 chr2 101412164 101412629 -80335458 + RLTR20B1 LTR ERVK 1 461 -102 6 1358 2783 185 36 31 chr2 101412673 101412759 -80335328 + RLTR20B1 LTR ERVK 462 554 -9 6 1358 2331 178 188 13 chr2 101418886 101419514 -80328573 - ORR1A3-int LTR MaLR -778 1185 448 6 1358 1097 227 33 98 chr2 101419259 101419566 -80328521 - MT2B LTR ERVL -314 287 1 6 1358 1593 251 45 3 chr2 101424990 101425345 -80322742 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 6 1358 1440 258 30 35 chr2 101427827 101428196 -80319891 + MTE2b LTR MaLR 1 367 -12 6 1358 1289 189 74 43 chr2 101428857 101429099 -80318988 + ORR1C2 LTR MaLR 7 255 -129 6 1358 4952 52 26 0 chr2 101429099 101429671 -80318416 - LTRIS_Mus LTR ERV1 0 587 1 6 1358 1289 189 74 43 chr2 101429671 101429727 -80318360 + ORR1C2 LTR MaLR 256 313 -71 6 1358 505 238 99 62 chr2 101429725 101429886 -80318201 + ORR1C2-int LTR MaLR 135 301 -1208 6 1358 1188 236 13 46 chr2 101429875 101430182 -80317905 + ORR1C2-int LTR MaLR 840 1136 -234 6 1358 445 312 73 119 chr2 101434029 101434440 -80313647 - LTR86A1 LTR ERVL 0 513 122 6 1358 322 269 106 10 chr2 101442354 101442490 -80305597 - MLT1C LTR MaLR -15 452 199 6 1358 2980 158 66 87 chr2 101443124 101443732 -80304355 + RMER19C LTR ERVK 1 595 -16 6 1358 324 248 110 110 chr2 101445249 101445385 -80302702 - MLT1A1 LTR MaLR -5 403 268 6 1358 302 250 83 33 chr2 101445552 101445672 -80302415 - ORR1E LTR MaLR -230 129 4 6 1359 592 285 34 34 chr2 101452227 101452405 -80295682 - RMER12 LTR ERVK 0 1322 1145 6 1359 4375 200 83 52 chr2 101452692 101453856 -80294231 - RMER12 LTR ERVK -122 1200 1 6 1359 3027 146 41 16 chr2 101471661 101472176 -80275911 + RLTR11A LTR ERVK 1 528 0 6 1359 228 288 124 25 chr2 101472230 101472351 -80275736 - RMER4B LTR ERVK -417 168 36 6 1359 809 287 146 3 chr2 101477973 101478295 -80269792 - MTE2a LTR MaLR -11 368 1 7 1359 279 247 22 45 chr2 101494587 101494676 -80253411 + MLT1A1 LTR MaLR 310 396 -12 7 1359 758 288 115 28 chr2 101495455 101495880 -80252207 - MLT2B1 LTR ERVL 0 562 1 7 1359 269 216 0 0 chr2 101495881 101495932 -80252155 + MLT1B LTR MaLR 91 141 -249 7 1359 301 288 48 48 chr2 101502293 101502439 -80245648 - MLT1D LTR MaLR -283 222 77 5 1359 373 359 57 51 chr2 101503040 101503392 -80244695 + MLT1A0 LTR MaLR 10 363 -2 8 1359 268 264 103 9 chr2 101514926 101515033 -80233054 - MLT1E1A LTR MaLR -12 668 565 3 1359 229 356 0 44 chr2 101515194 101515285 -80232802 - MLT1E1A LTR MaLR -416 132 46 3 1359 378 245 70 55 chr2 101515349 101515621 -80232466 + RMER10A LTR ERVL 112 387 -55 3 1359 361 293 95 12 chr2 101516747 101516916 -80231171 + ORR1E LTR MaLR 177 359 0 3 1359 249 195 62 38 chr2 101521359 101521439 -80226648 - RLTR25B LTR ERVK -519 509 428 4 1359 1707 134 76 3 chr2 101527721 101528035 -80220052 + RMER4A LTR ERVK 38 374 -92 6 1359 1190 205 26 20 chr2 101528052 101528395 -80219692 - RLTR15 LTR ERVK -13 346 2 6 1359 577 131 55 18 chr2 101528395 101528494 -80219593 + RMER4A LTR ERVK 364 466 0 6 1359 499 220 298 18 chr2 101529824 101530116 -80217971 - MTE2a LTR MaLR -2 417 9 6 1359 1471 236 66 40 chr2 101541991 101542490 -80205597 - RLTR18B LTR ERVK 0 512 1 8 1359 3262 39 13 5 chr2 101544162 101544553 -80203534 + MTA_Mm LTR MaLR 3 396 0 8 1359 1905 36 0 0 chr2 101544553 101544805 -80203282 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 252 -846 8 1359 252 213 16 0 chr2 101545528 101545589 -80202498 - LTR37A LTR ERV1 -91 335 274 8 1359 325 261 63 74 chr2 101547433 101547623 -80200464 - LTR37B LTR ERV1 -23 445 258 9 1359 485 143 0 125 chr2 101550964 101551092 -80196995 - MT2B LTR ERVL -337 264 153 1 1359 324 278 174 0 chr2 101551778 101552039 -80196048 - LTR50 LTR ERVL -119 676 286 1 1359 444 267 53 7 chr2 101553441 101553592 -80194495 - MLT1D LTR MaLR -71 434 277 1 1359 5637 107 45 94 chr2 101566186 101567194 -80180893 + RMER17B LTR ERVK 1 958 0 1 1359 425 255 53 33 chr2 101567503 101567653 -80180434 + MER34A1 LTR ERV1 355 507 -80 1 1359 2433 181 17 7 chr2 101568859 101569276 -80178811 + MTC LTR MaLR 1 421 0 1 1359 285 195 74 49 chr2 101570718 101570799 -80177288 + RLTR25B LTR ERVK 427 509 -519 1 1359 1122 244 138 25 chr2 101572891 101573210 -80174877 + MTEb LTR MaLR 24 378 -1 1 1359 800 231 27 42 chr2 101579393 101579605 -80168482 - RMER17C LTR ERVK -30 380 177 1 1359 800 200 12 49 chr2 101579690 101579816 -80168271 - RMER17C LTR ERVK -234 176 1 1 1360 1963 185 21 16 chr2 101588241 101588615 -80159472 - MTC LTR MaLR -7 414 39 1 1360 1200 162 138 13 chr2 101600252 101600564 -80147523 + RMER17C LTR ERVK 42 392 -18 1 1360 225 244 67 44 chr2 101604339 101604429 -80143658 + RLTR25B LTR ERVK 407 498 -530 2 1360 1256 218 155 32 chr2 101607767 101608109 -80139978 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 2 1360 703 300 152 54 chr2 101608513 101608848 -80139239 + MLT1A LTR MaLR 2 369 -5 2 1360 1815 196 14 29 chr2 101616665 101617069 -80131018 + RLTR28 LTR ERVL 6 502 -22 2 1360 886 263 168 28 chr2 101619622 101620036 -80128051 + MLT1D LTR MaLR 34 504 -1 2 1360 925 329 79 22 chr2 101620542 101620909 -80127178 - MLT1B LTR MaLR -2 388 1 2 1360 1366 249 61 32 chr2 101622010 101622417 -80125670 + MTD LTR MaLR 1 419 0 2 1360 1118 232 170 21 chr2 101629959 101630289 -80117798 - MTE2b LTR MaLR 0 379 1 2 1360 3447 28 5 0 chr2 101630996 101631390 -80116697 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 1360 273 279 114 60 chr2 101631545 101631694 -80116393 + RMER15 LTR ERVL 6 162 -413 2 1360 547 243 213 43 chr2 101631694 101631948 -80116139 + RMER15 LTR ERVL 279 575 0 2 1360 4548 60 10 5 chr2 101633665 101634246 -80113841 - MT2B2 LTR ERVL 0 584 1 2 1360 247 238 61 79 chr2 101639532 101639646 -80108441 + MT2B LTR ERVL 128 239 -362 2 1360 229 318 246 43 chr2 101641025 101641281 -80106806 + MLT1M LTR MaLR 3 310 -362 2 1360 2271 106 15 6 chr2 101641801 101642125 -80105962 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 2 1360 385 127 127 0 chr2 101642128 101642199 -80105888 - ORR1B2 LTR MaLR -284 83 4 2 1360 946 290 51 34 chr2 101643187 101643537 -80104550 - ORR1E LTR MaLR -2 357 2 2 1360 257 276 0 17 chr2 101644135 101644194 -80103893 - RMER15 LTR ERVL -7 568 511 2 1360 1151 179 294 21 chr2 101644221 101644507 -80103580 + ORR1B2 LTR MaLR 1 364 -3 2 1360 324 287 0 75 chr2 101647004 101647098 -80100989 + MT2B LTR ERVL 153 239 -362 2 1360 227 255 53 97 chr2 101658600 101658713 -80089374 - MLT1-int LTR MaLR -131 1240 1133 3 1360 267 317 79 101 chr2 101661838 101662066 -80086021 + LTR85c LTR Gypsy? 1 223 -600 3 1360 2404 147 51 64 chr2 101664053 101664505 -80083582 + RLTR41 LTR ERV1 1 446 0 3 1360 980 224 184 38 chr2 101665768 101666084 -80082003 - ORR1D2 LTR MaLR -8 362 1 3 1360 328 317 128 25 chr2 101669628 101669832 -80078255 - LTR82A LTR ERVL -638 234 10 3 1360 405 214 134 0 chr2 101675898 101676010 -80072077 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 282 3 1360 289 293 135 24 chr2 101676094 101676220 -80071867 - MLT1A1 LTR MaLR -246 162 23 3 1360 709 254 41 12 chr2 101681214 101681505 -80066582 + MLT1A1 LTR MaLR 25 375 -33 3 1360 1102 271 116 81 chr2 101683072 101683679 -80064408 + MER31-int LTR ERV1 3384 4079 -1277 3 1360 1002 265 111 35 chr2 101684225 101684569 -80063518 + MTEa LTR MaLR 1 370 -9 3 1360 1331 284 94 47 chr2 101684575 101685255 -80062832 + MER31-int LTR ERV1 3970 4681 -255 3 1360 471 153 30 30 chr2 101685669 101685770 -80062317 + ORR1B2 LTR MaLR 5 105 -262 3 1360 860 293 103 9 chr2 101687941 101688272 -80059815 + MTE2b LTR MaLR 1 362 -17 3 1360 507 275 106 38 chr2 101689426 101689691 -80058396 - MLT1C LTR MaLR -23 444 162 3 1360 237 193 53 0 chr2 101689739 101689796 -80058291 + RMER15 LTR ERVL 1 60 -515 4 1360 1162 106 23 28 chr2 101690033 101690254 -80057833 - MTD LTR MaLR -5 414 179 4 1360 661 211 103 66 chr2 101690309 101690326 -80057761 + RMER12 LTR ERVK 995 1011 -311 4 1360 661 211 103 66 chr2 101690443 101690638 -80057449 + RMER12 LTR ERVK 1012 1214 -108 4 1360 1047 218 88 8 chr2 101690757 101691020 -80057067 + RMER15 LTR ERVL 225 508 -67 4 1360 344 260 10 29 chr2 101691044 101691147 -80056940 - MTEb LTR MaLR 0 379 279 4 1360 250 278 40 30 chr2 101692471 101692571 -80055516 - MTEb LTR MaLR -239 120 20 4 1360 293 317 15 54 chr2 101692593 101692723 -80055364 - MLT1C LTR MaLR -340 127 3 3 1360 546 258 133 79 chr2 101693746 101694024 -80054063 + MLT1B LTR MaLR 96 388 -2 4 1360 424 318 25 30 chr2 101696482 101696683 -80051404 + RMER15 LTR ERVL 336 535 -40 4 1360 1737 200 47 18 chr2 101698736 101699123 -80048964 + MTB_Mm LTR MaLR 10 407 0 4 1360 592 306 118 92 chr2 101700594 101700940 -80047147 - ORR1E LTR MaLR 0 359 5 4 1360 1570 167 58 137 chr2 101705485 101705902 -80042185 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 4 1360 354 319 9 17 chr2 101706897 101707012 -80041075 + LTR16C LTR ERVL 193 306 -183 4 1360 1167 181 51 14 chr2 101707078 101707353 -80040734 + RLTR15 LTR ERVK 1 285 -74 4 1360 407 377 37 9 chr2 101707644 101707858 -80040229 + LTR16C LTR ERVL 169 388 -101 4 1361 325 261 21 52 chr2 101718152 101718249 -80029838 + MLT1B LTR MaLR 11 104 -286 4 1361 300 328 72 0 chr2 101718929 101719054 -80029033 + MLT1B LTR MaLR 179 312 -78 4 1361 673 259 102 140 chr2 101723858 101723939 -80024148 + MTE2a LTR MaLR 13 74 -305 4 1361 673 259 102 140 chr2 101723997 101724279 -80023808 + MTE2a LTR MaLR 75 362 -17 4 1361 612 335 87 21 chr2 101725237 101725572 -80022515 - ORR1E LTR MaLR -2 357 1 4 1361 1754 161 106 49 chr2 101734324 101734691 -80013396 + MTD LTR MaLR 18 405 -14 4 1361 245 333 137 14 chr2 101736085 101736231 -80011856 - LTR16E2 LTR ERVL -3 565 402 4 1361 445 302 138 87 chr2 101736355 101736455 -80011632 + LTR87 LTR ERVL? 9 106 -518 4 1361 445 302 138 87 chr2 101736514 101736747 -80011340 + LTR87 LTR ERVL? 107 359 -265 4 1361 562 244 23 8 chr2 101736815 101736943 -80011144 + LTR87 LTR ERVL? 495 624 0 4 1361 1432 258 25 22 chr2 101750481 101750842 -79997245 + MTEa LTR MaLR 18 379 0 5 1361 408 304 197 10 chr2 101751994 101752187 -79995900 - RMER15 LTR ERVL -2 573 345 5 1361 899 113 23 0 chr2 101752189 101752322 -79995765 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 259 5 1361 1627 182 14 4 chr2 101752321 101752597 -79995490 - RMER19B LTR ERVK -570 332 54 5 1361 890 144 0 0 chr2 101752571 101752710 -79995377 - RMER19B LTR ERVK -763 139 1 5 1361 1045 238 56 41 chr2 101753888 101754155 -79993932 + RLTR18B LTR ERVK 24 294 -218 5 1361 949 258 12 16 chr2 101754178 101754411 -79993676 + RLTR18B LTR ERVK 300 512 -104 5 1361 898 303 172 25 chr2 101755658 101756128 -79991959 + MLT1F LTR MaLR 1 539 -9 5 1361 1082 325 83 42 chr2 101761186 101761264 -79986823 - MLT1F2 LTR MaLR 0 560 484 5 1361 2947 45 2 153 chr2 101761264 101761735 -79986352 + MTB LTR MaLR 1 400 0 5 1361 1082 325 83 42 chr2 101761735 101762186 -79985901 - MLT1F2 LTR MaLR -77 483 9 5 1361 685 288 32 75 chr2 101764285 101764563 -79983524 + MLT1B LTR MaLR 40 305 -85 5 1361 241 269 12 37 chr2 101765131 101765212 -79982875 + MTE2a LTR MaLR 278 356 -23 5 1361 637 304 66 18 chr2 101767715 101767943 -79980144 + RMER15 LTR ERVL 337 575 0 5 1361 235 244 228 13 chr2 101768753 101768832 -79979255 + MLT1D LTR MaLR 15 110 -395 5 1361 638 261 22 49 chr2 101768962 101769147 -79978940 + MLT1D LTR MaLR 298 477 -28 5 1361 1025 300 132 29 chr2 101769365 101769777 -79978310 + LTR33A LTR ERVL 19 476 -44 5 1361 1025 300 132 29 chr2 101769969 101770002 -79978085 + LTR33A LTR ERVL 477 510 -10 5 1361 368 339 70 23 chr2 101775122 101775294 -79972793 - MLT1N2 LTR MaLR -344 218 39 5 1361 263 324 46 28 chr2 101776678 101776786 -79971301 + LTR33C LTR ERVL 41 150 -479 5 1361 267 316 93 49 chr2 101776799 101777045 -79971042 + LTR33C LTR ERVL 324 580 -49 5 1361 1668 57 305 19 chr2 101781423 101781692 -79966395 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 5 1361 1650 128 117 10 chr2 101783253 101783544 -79964543 - ORR1A4 LTR MaLR -7 322 1 5 1361 8885 136 137 80 chr2 101783544 101785400 -79962687 - ORR1A4-int LTR MaLR 0 1963 1 5 1361 1587 153 12 0 chr2 101785404 101785646 -79962441 - ORR1A4 LTR MaLR -8 321 77 5 1361 447 326 79 96 chr2 101785642 101786100 -79961987 - RLTR11A LTR ERVK -73 455 6 5 1361 1632 170 29 16 chr2 101795592 101795903 -79952184 + RMER4A LTR ERVK 1 315 -151 6 1361 246 324 0 0 chr2 101797963 101798034 -79950053 + MLT1A LTR MaLR 75 145 -229 6 1361 3758 16 121 0 chr2 101800007 101800447 -79947640 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 6 1361 519 352 59 0 chr2 101802564 101802817 -79945270 - MER89 LTR ERV1 -164 395 128 6 1361 1906 139 20 3 chr2 101805108 101805412 -79942675 + RLTR27 LTR ERVK 1 309 0 6 1361 766 265 92 40 chr2 101808795 101809150 -79938937 + MLT1A1 LTR MaLR 3 408 0 6 1361 350 321 103 31 chr2 101809397 101809575 -79938512 + MLT1F1 LTR MaLR 276 461 -99 6 1361 431 296 25 19 chr2 101815197 101815359 -79932728 - MLT1A LTR MaLR -211 163 1 6 1361 928 310 84 3 chr2 101816125 101816445 -79931642 + MLT1A LTR MaLR 8 353 -21 6 1361 655 227 72 51 chr2 101824394 101824631 -79923456 + RMER5 LTR ERV1 13 254 -280 6 1361 694 247 54 21 chr2 101825103 101825289 -79922798 + RMER5 LTR ERV1 326 517 -17 6 1361 1201 293 24 65 chr2 101831908 101832280 -79915807 + ORR1E LTR MaLR 1 357 -2 6 1361 322 289 79 83 chr2 101835997 101836250 -79911837 - ORR1E LTR MaLR -26 333 82 6 1361 324 246 112 128 chr2 101838091 101838342 -79909745 - MLT1B LTR MaLR -29 361 115 6 1361 572 258 131 56 chr2 101838347 101838614 -79909473 + MLT2C2 LTR ERVL 7 293 -171 6 1361 235 175 35 17 chr2 101838703 101838761 -79909326 - MLT1B LTR MaLR -342 125 67 6 1361 1013 229 162 15 chr2 101839929 101840257 -79907830 + MTEa LTR MaLR 2 377 -2 6 1362 285 210 12 36 chr2 101850366 101850450 -79897637 + MLT1A1 LTR MaLR 327 408 0 6 1362 685 268 185 18 chr2 101852624 101853063 -79895024 - MER68 LTR ERVL -52 511 1 7 1362 689 264 183 52 chr2 101853577 101853905 -79894182 + RMER13A LTR ERVK 95 465 -395 7 1362 609 306 101 76 chr2 101858074 101858481 -79889606 + MLT1C LTR MaLR 5 421 -46 7 1362 257 273 64 86 chr2 101858912 101859052 -79889035 + MLT1B LTR MaLR 32 168 -222 7 1362 453 224 20 10 chr2 101859095 101859194 -79888893 + MLT1B LTR MaLR 248 347 -43 7 1362 2297 128 27 0 chr2 101872175 101872512 -79875575 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 7 1362 242 331 7 73 chr2 101878975 101879027 -79869060 + MLT1H LTR MaLR 27 77 -472 7 1362 242 331 7 73 chr2 101879212 101879296 -79868791 + MLT1H LTR MaLR 78 154 -395 7 1362 369 255 312 14 chr2 101881204 101881428 -79866659 - MLT1A0 LTR MaLR -9 356 68 7 1362 1334 252 39 96 chr2 101881438 101881824 -79866263 - MTE2b LTR MaLR -15 364 1 7 1362 1443 165 101 156 chr2 101882942 101883358 -79864729 - ORR1B1 LTR MaLR -1 393 1 7 1362 3283 51 5 2 chr2 101883637 101884032 -79864055 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 7 1362 1532 146 108 35 chr2 101884589 101884922 -79863165 - MTC LTR MaLR 0 421 1 7 1362 253 220 0 0 chr2 101885315 101885365 -79862722 + ORR1E LTR MaLR 1 50 -329 7 1362 311 290 159 101 chr2 101885485 101885742 -79862345 + ORR1E LTR MaLR 88 359 0 7 1362 254 312 72 10 chr2 101887680 101887777 -79860310 - MLT1G3 LTR MaLR -1 594 492 7 1362 2327 150 26 13 chr2 101887933 101888318 -79859769 + ORR1B1 LTR MaLR 5 394 0 7 1362 246 337 20 10 chr2 101888469 101888568 -79859519 - MLT1G3 LTR MaLR -467 102 3 7 1362 298 298 107 60 chr2 101889295 101889445 -79858642 + MLT1J LTR MaLR 1 157 -355 7 1362 234 314 27 54 chr2 101891349 101891423 -79856664 + MTD LTR MaLR 55 126 -253 7 1362 452 194 176 0 chr2 101891991 101892099 -79855988 + MTD LTR MaLR 278 404 -15 7 1362 1191 272 82 30 chr2 101892559 101892960 -79855127 - MLT1C LTR MaLR -43 424 3 7 1362 670 316 80 8 chr2 101893797 101894046 -79854041 - MLT1F2 LTR MaLR -195 365 99 7 1362 445 215 27 27 chr2 101895808 101895918 -79852169 - MTE2b LTR MaLR 0 379 270 7 1362 1037 303 113 48 chr2 101911454 101911673 -79836414 + MER68 LTR ERVL 3 241 -322 8 1362 855 212 295 10 chr2 101911673 101911968 -79836119 + MTE2b LTR MaLR 1 379 0 8 1362 1037 303 113 48 chr2 101911968 101912271 -79835816 + MER68 LTR ERVL 242 559 -4 8 1362 329 237 133 56 chr2 101913344 101913487 -79834600 + RMER15 LTR ERVL 422 575 0 8 1362 2068 128 72 0 chr2 101914703 101915008 -79833079 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 8 1362 565 270 161 50 chr2 101915044 101915367 -79832720 - ORR1E LTR MaLR 0 359 1 8 1362 255 212 89 116 chr2 101917050 101917162 -79830925 + RMER21B LTR ERV1 719 827 -15 8 1362 291 272 22 88 chr2 101917156 101917315 -79830772 + MLT1A1 LTR MaLR 225 408 0 8 1362 1696 186 71 34 chr2 101921712 101922062 -79826025 + ORR1D1 LTR MaLR 4 366 -8 8 1362 965 272 82 44 chr2 101923660 101923796 -79824291 + ORR1E LTR MaLR 2 141 -218 8 1362 2586 158 252 25 chr2 101923796 101924395 -79823692 - RMER19A LTR ERVK 0 737 3 8 1362 965 272 82 44 chr2 101924395 101924573 -79823514 + ORR1E LTR MaLR 142 328 -31 8 1362 4355 142 123 74 chr2 101927742 101928602 -79819485 + RMER19B LTR ERVK 1 902 0 8 1362 1364 241 25 34 chr2 101928602 101928929 -79819158 + MTEb LTR MaLR 55 378 -1 8 1362 1059 274 51 32 chr2 101929906 101930219 -79817868 - MTD LTR MaLR -99 320 2 8 1362 841 86 39 1 chr2 101933921 101934052 -79814035 + ORR1A2 LTR MaLR 1 188 -206 8 1362 1133 122 193 0 chr2 101934172 101934369 -79813718 + ORR1A2 LTR MaLR 93 327 0 8 1362 628 201 77 35 chr2 101936882 101937052 -79811035 + MTEa LTR MaLR 163 356 -23 8 1362 379 307 47 8 chr2 101938477 101938605 -79809482 + MLT1A0 LTR MaLR 18 150 -215 8 1362 306 316 29 71 chr2 101938607 101938777 -79809310 + LTR16B LTR ERVL 151 313 -150 8 1362 449 350 31 57 chr2 101939424 101939651 -79808436 + MLT1A0 LTR MaLR 86 306 -59 8 1362 1397 232 85 6 chr2 101940215 101940545 -79807542 + ORR1E LTR MaLR 2 357 -2 8 1362 326 320 90 0 chr2 101944468 101944568 -79803519 + MLT1C LTR MaLR 357 465 -2 8 1362 721 345 97 13 chr2 101946061 101946452 -79801635 - MLT1C LTR MaLR -8 459 36 8 1362 719 313 113 0 chr2 101946579 101946844 -79801243 - MLT1B LTR MaLR 0 390 96 8 1362 441 260 177 56 chr2 101947005 101947237 -79800850 + ORR1E LTR MaLR 98 357 -2 8 1362 911 255 172 10 chr2 101958020 101958189 -79789898 + MLT1B LTR MaLR 1 196 -194 8 1362 911 204 192 11 chr2 101958234 101958372 -79789715 + MLT1B LTR MaLR 197 437 -30 8 1363 1704 215 9 15 chr2 101985019 101985350 -79762737 - MTD LTR MaLR -71 348 20 9 1363 380 259 117 180 chr2 101988811 101988866 -79759221 + MLT1B LTR MaLR 46 103 -287 9 1363 380 259 117 180 chr2 101989008 101989095 -79758992 + MLT1B LTR MaLR 104 164 -226 9 1363 380 259 117 180 chr2 101989123 101989346 -79758741 + MLT1B LTR MaLR 165 389 -1 9 1363 275 280 26 26 chr2 101990109 101990186 -79757901 + MLT1J2 LTR MaLR 79 155 -293 9 1363 409 326 17 2 chr2 101992047 101992179 -79755908 - MLT1B LTR MaLR -9 381 235 9 1363 251 277 24 118 chr2 101992244 101992371 -79755716 - MLT1B LTR MaLR -287 218 104 9 1363 532 315 178 12 chr2 101993047 101993368 -79754719 + MLT1C LTR MaLR 80 453 -14 9 1363 357 262 179 13 chr2 101997876 101998027 -79750060 + MLT1A0 LTR MaLR 1 176 -189 9 1363 255 197 63 38 chr2 101998028 101998107 -79749980 + MLT1A0 LTR MaLR 289 369 -39 9 1363 1326 282 61 11 chr2 101998109 101998136 -79749951 - MTEa LTR MaLR -2 377 344 9 1363 1496 205 157 6 chr2 101998136 101998499 -79749588 + MTD LTR MaLR 2 419 0 9 1363 1326 282 61 11 chr2 101998499 101998830 -79749257 - MTEa LTR MaLR -36 343 2 9 1363 2028 126 147 0 chr2 101998966 101999307 -79748780 + ORR1B1 LTR MaLR 1 391 -3 9 1363 376 314 120 17 chr2 101999424 101999599 -79748488 + MLT1J LTR MaLR 108 300 -212 9 1363 610 299 36 45 chr2 102003816 102004040 -79744047 - MLT1B LTR MaLR -166 224 3 8 1363 320 331 108 69 chr2 102005361 102005451 -79742636 - MLT1C LTR MaLR -141 326 226 1 1363 320 331 108 69 chr2 102005495 102005532 -79742555 - MLT1C LTR MaLR -242 225 179 1 1363 320 331 108 69 chr2 102006129 102006295 -79741792 - MLT1C LTR MaLR -297 170 11 1 1363 1391 201 126 45 chr2 102028725 102029106 -79718981 - MTD LTR MaLR -5 414 3 5 1363 2910 176 47 27 chr2 102030935 102031491 -79716596 + RMER15 LTR ERVL 9 575 0 5 1363 305 293 155 76 chr2 102034538 102034815 -79713272 + MLT1A LTR MaLR 54 352 -22 6 1363 291 265 178 38 chr2 102035402 102035559 -79712528 - LTR16E1 LTR ERVL -27 511 333 6 1363 681 296 87 26 chr2 102040088 102040435 -79707652 - MLT1A LTR MaLR -6 368 1 8 1363 511 191 72 33 chr2 102046911 102047063 -79701024 - LTR37A LTR ERV1 -12 414 257 9 1363 704 281 130 23 chr2 102047151 102047413 -79700674 + MLT1E1A LTR MaLR 32 321 -359 9 1363 445 320 66 6 chr2 102048620 102048802 -79699285 + MLT1E1A LTR MaLR 460 652 -2 9 1363 1119 293 31 57 chr2 102054581 102054904 -79693183 + MTE2b LTR MaLR 1 319 -100 1 1363 1119 286 16 51 chr2 102055124 102055222 -79692865 + MTE2b LTR MaLR 281 371 -8 1 1363 2042 158 8 75 chr2 102055596 102055994 -79692093 - ORR1C1 LTR MaLR -7 371 1 1 1363 1074 208 81 71 chr2 102057712 102058007 -79690080 + ORR1D1 LTR MaLR 1 298 -76 1 1363 1472 221 64 15 chr2 102059215 102059542 -79688545 + ORR1D2 LTR MaLR 1 343 -27 1 1363 1453 237 81 14 chr2 102061318 102061665 -79686422 + MTEb LTR MaLR 6 375 -4 1 1363 326 263 89 20 chr2 102069152 102069253 -79678834 - MLT1B LTR MaLR -4 386 279 1 1363 919 302 70 38 chr2 102069257 102069598 -79678489 + ORR1E LTR MaLR 1 352 -7 1 1363 716 288 95 12 chr2 102069936 102070189 -79677898 - MLT1F1 LTR MaLR -7 562 289 1 1363 238 333 94 55 chr2 102070216 102070343 -79677744 - MLT1F1 LTR MaLR -391 178 47 1 1363 254 243 42 14 chr2 102074895 102074966 -79673121 + ORR1D2 LTR MaLR 294 366 -4 1 1363 396 312 107 56 chr2 102075342 102075539 -79672548 - MER21B LTR ERV1 -210 653 447 1 1363 636 309 133 11 chr2 102075624 102075902 -79672185 - MER21B LTR ERV1 -531 332 21 1 1363 699 314 31 18 chr2 102081532 102081759 -79666328 - MTE2a LTR MaLR -12 367 138 1 1363 342 260 0 0 chr2 102081783 102081856 -79666231 - MTE2a LTR MaLR -306 73 1 1 1363 406 316 183 46 chr2 102083803 102084055 -79664032 - MLT1K LTR MaLR -116 479 207 1 1363 2176 160 24 181 chr2 102084055 102084683 -79663404 - RLTR24 LTR ERV1 0 529 1 1 1363 406 316 183 46 chr2 102084683 102084824 -79663263 - MLT1K LTR MaLR -389 206 33 1 1363 982 288 62 27 chr2 102085658 102085994 -79662093 - RMER15 LTR ERVL -12 563 216 1 1363 354 309 69 52 chr2 102096186 102096360 -79651727 + MLT1A0 LTR MaLR 189 365 0 2 1363 229 262 33 77 chr2 102100096 102100187 -79647900 - MT2C_Mm LTR ERVL -273 202 116 2 1363 269 319 88 0 chr2 102100695 102100857 -79647230 - LTR81B LTR ERV1? -234 1116 926 2 1363 266 322 23 0 chr2 102101603 102101690 -79646397 + MLT1B LTR MaLR 3 91 -299 2 1363 778 264 95 30 chr2 102101852 102102058 -79646029 + MLT1B LTR MaLR 98 318 -72 2 1363 2473 36 131 0 chr2 102102058 102102364 -79645723 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 2 1363 778 264 95 30 chr2 102102364 102102419 -79645668 + MLT1B LTR MaLR 319 376 -14 2 1363 328 310 61 17 chr2 102104544 102104659 -79643428 - LTR16D LTR ERVL -2 649 530 2 1364 260 351 65 7 chr2 102105430 102105585 -79642502 - ERVL-E-int LTR ERVL -827 4930 4767 2 1364 382 383 84 15 chr2 102105907 102106180 -79641907 - ERVL-E-int LTR ERVL -1380 4287 3996 2 1364 612 295 119 62 chr2 102106279 102106615 -79641472 - MLT1A1 LTR MaLR -6 402 48 2 1364 495 321 98 54 chr2 102109208 102109412 -79638675 + MLT1I LTR MaLR 76 288 -123 2 1364 3047 149 48 80 chr2 102111220 102111824 -79636263 - RMER20B LTR ERVK -42 585 1 2 1364 1546 172 157 6 chr2 102111988 102112344 -79635743 - MTD LTR MaLR 0 419 10 2 1364 477 297 196 24 chr2 102113802 102114021 -79634066 + MLT1D LTR MaLR 118 379 -126 2 1364 1160 232 114 15 chr2 102114021 102114345 -79633742 - ORR1E LTR MaLR 0 359 4 2 1364 477 297 196 24 chr2 102114345 102114456 -79633631 + MLT1D LTR MaLR 380 505 0 2 1364 2084 174 30 0 chr2 102115077 102115440 -79632647 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 2 1364 459 337 56 0 chr2 102115851 102116047 -79632040 - MLT1E2 LTR MaLR -69 558 352 2 1364 333 263 61 0 chr2 102118258 102118357 -79629730 - MLT1E2 LTR MaLR -125 240 136 2 1364 230 355 151 11 chr2 102121058 102121323 -79626764 + MER21B LTR ERV1 148 449 -414 2 1364 1161 227 100 58 chr2 102126332 102126692 -79621395 - MTE2b LTR MaLR 0 379 5 2 1364 261 332 47 60 chr2 102127427 102127772 -79620315 - MTE2a LTR MaLR -14 365 9 2 1364 1514 206 101 17 chr2 102153879 102154224 -79593863 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 3 1364 3484 25 2 0 chr2 102155835 102156230 -79591857 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 1364 426 184 19 58 chr2 102163778 102163882 -79584205 + RLTR25B LTR ERVK 929 1028 0 3 1364 247 135 38 19 chr2 102166802 102166855 -79581232 - MTD LTR MaLR 0 419 366 3 1364 905 234 55 55 chr2 102166971 102167206 -79580881 - MTD LTR MaLR -167 252 18 3 1364 310 239 21 164 chr2 102167083 102167223 -79580864 - MT2A LTR ERVL -411 122 3 3 1364 1913 146 3 47 chr2 102173682 102174026 -79574061 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 3 1364 564 220 180 6 chr2 102174026 102174209 -79573878 + ORR1A4-int LTR MaLR 2 216 -1747 3 1364 671 224 61 24 chr2 102174142 102174319 -79573768 - ORR1B1 LTR MaLR -143 251 1 3 1364 1108 221 270 10 chr2 102185824 102186124 -79561963 + MTE2a LTR MaLR 1 378 -1 3 1364 386 286 53 53 chr2 102207069 102207239 -79540848 + RMER15 LTR ERVL 395 564 -11 3 1364 1608 247 124 73 chr2 102213677 102214250 -79533837 - RMER20B LTR ERVK -25 602 1 4 1364 994 247 134 42 chr2 102219792 102220105 -79527982 - MTD LTR MaLR -76 343 2 4 1364 582 271 62 48 chr2 102235852 102236061 -79512026 + RMER5 LTR ERV1 54 265 -269 4 1365 558 271 154 12 chr2 102236214 102236461 -79511626 + RMER5 LTR ERV1 246 527 -7 4 1365 512 340 153 24 chr2 102236657 102237076 -79511011 + MLT1J LTR MaLR 38 510 -2 4 1365 391 303 0 32 chr2 102243602 102243728 -79504359 - MLT1F LTR MaLR -10 550 429 4 1365 466 337 94 21 chr2 102243859 102244050 -79504037 - MLT1F LTR MaLR -333 215 11 4 1365 305 340 109 36 chr2 102244056 102244248 -79503839 - MLT1F-int LTR MaLR 0 1489 1284 4 1365 1210 291 196 61 chr2 102244342 102244605 -79503482 - MLT1F-int LTR MaLR -342 1147 842 4 1365 1210 291 196 61 chr2 102244788 102245348 -79502739 - MLT1F-int LTR MaLR -648 841 166 4 1365 2027 143 28 11 chr2 102245348 102245701 -79502386 + RLTR15 LTR ERVK 1 359 0 4 1365 1210 291 196 61 chr2 102245701 102245745 -79502342 - MLT1F-int LTR MaLR -1324 165 137 4 1365 1210 291 196 61 chr2 102246074 102246182 -79501905 - MLT1F-int LTR MaLR -1366 123 26 4 1365 693 280 179 39 chr2 102249559 102249876 -79498211 - RMER5 LTR ERV1 -11 523 154 4 1365 693 280 179 39 chr2 102250066 102250179 -79497908 - RMER5 LTR ERV1 -381 153 33 4 1365 497 252 52 0 chr2 102251907 102252022 -79496065 + MER21B LTR ERV1 274 394 -469 4 1365 778 268 93 39 chr2 102252578 102252889 -79495198 + MER21B LTR ERV1 457 784 -79 4 1365 508 306 117 52 chr2 102256285 102256805 -79491282 - MLT1H2 LTR MaLR -25 530 1 4 1365 715 277 119 52 chr2 102256814 102257141 -79490946 + MTEa LTR MaLR 1 349 -30 4 1365 305 318 0 33 chr2 102258743 102258834 -79489253 + MLT1E2 LTR MaLR 1 88 -539 4 1365 1688 178 186 83 chr2 102258856 102259339 -79488748 - MT2A LTR ERVL 0 533 1 4 1365 728 130 9 0 chr2 102259339 102259454 -79488633 - MERVL_2A-int LTR ERVL 0 5761 5646 4 1365 236 193 0 50 chr2 102259489 102259549 -79488538 - ORR1A3-int LTR MaLR -1340 623 567 4 1365 3433 179 35 26 chr2 102259578 102259620 -79488467 - MERVL_2A-int LTR ERVL -190 5571 5525 4 1365 1656 136 182 10 chr2 102259620 102259933 -79488154 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 4 1365 3433 179 35 26 chr2 102259933 102260091 -79487996 - MERVL_2A-int LTR ERVL -237 5524 5373 4 1365 3433 183 94 30 chr2 102260323 102261303 -79486784 - MERVL_2A-int LTR ERVL -389 5372 4325 4 1365 377 260 32 101 chr2 102261303 102261583 -79486504 + MLT1E2 LTR MaLR 50 312 -193 4 1365 276 273 11 54 chr2 102262428 102262521 -79485566 + MLT1E2 LTR MaLR 308 396 -109 4 1365 672 309 62 79 chr2 102262779 102263148 -79484939 + MLT1A0 LTR MaLR 1 363 -2 5 1365 245 332 64 25 chr2 102268025 102268208 -79479879 - MLT2E LTR ERVL -418 210 32 5 1365 1445 228 92 0 chr2 102278714 102278882 -79469205 - MTEb LTR MaLR 0 379 210 5 1365 1445 228 92 0 chr2 102278939 102279117 -79468970 - MTEb LTR MaLR -170 209 3 5 1365 3256 36 29 0 chr2 102283294 102283679 -79464408 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 1365 1122 264 41 22 chr2 102286161 102286486 -79461601 + MTEa LTR MaLR 20 389 -30 5 1365 820 305 48 25 chr2 102295850 102296207 -79451880 + MLT1A0 LTR MaLR 1 365 0 5 1365 242 258 29 67 chr2 102296989 102297093 -79450994 + MTEa LTR MaLR 275 374 -5 5 1365 2776 123 53 16 chr2 102301145 102301631 -79446456 + RLTR28 LTR ERVL 1 504 -20 5 1365 307 257 0 0 chr2 102305313 102305387 -79442700 + MTEb LTR MaLR 287 360 -19 5 1365 366 324 27 32 chr2 102310044 102310232 -79437855 + ORR1E LTR MaLR 52 238 -121 6 1365 322 292 148 45 chr2 102311628 102311872 -79436215 + MLT1D LTR MaLR 125 393 -112 6 1365 288 331 127 66 chr2 102313996 102314374 -79433713 - MLT1H LTR MaLR -66 483 83 6 1365 266 253 0 102 chr2 102318661 102318749 -79429338 + MT2B2 LTR ERVL 162 240 -344 6 1365 2893 49 3 0 chr2 102319678 102320023 -79428064 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 6 1365 2022 118 14 70 chr2 102324470 102324815 -79423272 + ORR1A3 LTR MaLR 1 326 0 6 1365 316 363 46 21 chr2 102326628 102326822 -79421265 + LTR16B2 LTR ERVL 17 215 -247 6 1365 228 365 32 13 chr2 102326866 102327024 -79421063 + LTR16B2 LTR ERVL 293 453 -10 6 1365 322 303 124 11 chr2 102327664 102327722 -79420365 - MLT1F2 LTR MaLR -3 557 491 6 1365 322 303 124 11 chr2 102327932 102328049 -79420038 - MLT1F2 LTR MaLR -70 490 362 6 1365 2722 121 10 0 chr2 102328062 102328451 -79419636 - ORR1B1 LTR MaLR -1 393 1 6 1365 2308 131 104 65 chr2 102329772 102330058 -79418029 - RLTR19 LTR ERVK 0 499 197 6 1365 2308 131 104 65 chr2 102330636 102330829 -79417258 - RLTR19 LTR ERVK -303 196 1 6 1365 610 162 42 91 chr2 102335109 102335191 -79412896 - RLTR15 LTR ERVK 0 359 279 6 1365 3138 31 0 0 chr2 102335191 102335545 -79412542 + IAPEY2_LTR LTR ERVK 1 354 -3 6 1365 720 208 218 31 chr2 102335545 102335781 -79412306 - RLTR15 LTR ERVK -81 278 1 6 1365 327 142 28 29 chr2 102337899 102337976 -79410111 + MTE2a LTR MaLR 306 407 -14 6 1365 265 208 19 0 chr2 102337981 102338034 -79410053 - MLT1A0 LTR MaLR -45 320 267 6 1365 1064 188 48 17 chr2 102338015 102338253 -79409834 + RMER19B LTR ERVK 54 289 -613 6 1365 1919 169 121 2 chr2 102338248 102338663 -79409424 + RMER19B LTR ERVK 410 873 -29 6 1365 442 168 252 0 chr2 102338680 102338799 -79409288 - RMER19B LTR ERVK -470 432 284 6 1365 548 225 40 83 chr2 102338795 102338993 -79409094 - RMER19B LTR ERVK -570 167 1 6 1365 679 230 92 45 chr2 102338995 102339322 -79408765 - ORR1D1 LTR MaLR -14 353 1 6 1365 617 320 50 8 chr2 102339323 102339581 -79408506 - MLT1A0 LTR MaLR -95 270 2 6 1365 328 290 89 0 chr2 102339599 102339723 -79408364 - MLT1F2 LTR MaLR -417 143 9 6 1365 237 311 88 11 chr2 102341941 102342032 -79406055 + MamGypLTR2b LTR Gypsy 609 706 -216 6 1365 553 312 30 0 chr2 102343174 102343373 -79404714 - LTR48B LTR ERV1 -40 747 543 6 1365 710 217 66 44 chr2 102343658 102343770 -79404317 - LTR48B LTR ERV1 -318 326 277 6 1365 710 252 36 132 chr2 102343969 102344193 -79403894 - LTR48B LTR ERV1 -368 276 54 6 1365 601 315 61 26 chr2 102344217 102344481 -79403606 - MLT1A0 LTR MaLR -45 320 48 6 1365 5145 133 78 27 chr2 102349037 102349895 -79398192 - RMER19B LTR ERVK 0 902 1 6 1365 1423 249 21 16 chr2 102352127 102352502 -79395585 - MTEb LTR MaLR 0 379 3 6 1365 1014 254 63 84 chr2 102352930 102353109 -79394978 - MTE2a LTR MaLR 0 379 185 6 1365 1014 254 63 84 chr2 102353133 102353335 -79394752 - MTE2a LTR MaLR -195 184 7 6 1365 328 230 64 118 chr2 102353413 102353600 -79394487 + ORR1E LTR MaLR 183 359 0 6 1365 837 217 12 105 chr2 102363943 102364190 -79383897 + RMER19C LTR ERVK 56 279 -332 7 1365 1496 236 14 77 chr2 102364206 102364624 -79383463 + RMER19C LTR ERVK 220 611 0 7 1365 299 248 0 110 chr2 102366867 102366985 -79381102 - MT2B LTR ERVL -344 257 153 7 1366 281 338 23 15 chr2 102369526 102369658 -79378429 + MT2A LTR ERVL 8 140 -393 7 1366 1198 219 67 25 chr2 102369554 102369881 -79378206 + MTEb LTR MaLR 37 377 -2 7 1366 705 252 106 25 chr2 102372777 102373013 -79375074 + MTE2a LTR MaLR 1 255 -124 7 1366 547 286 64 12 chr2 102373104 102373277 -79374810 + MTE2a LTR MaLR 198 379 0 7 1366 313 298 40 8 chr2 102382062 102382187 -79365900 - ERVL-B4-int LTR ERVL -1479 4235 4107 7 1366 307 298 0 12 chr2 102386311 102386396 -79361691 - MER34A1 LTR ERV1 -22 565 482 7 1366 411 271 164 17 chr2 102386661 102387014 -79361073 - MER34A1 LTR ERV1 -183 404 1 7 1366 3042 46 2 0 chr2 102387043 102387437 -79360650 + RLTR13B2 LTR ERVK 428 822 0 7 1366 1675 186 53 14 chr2 102393220 102393580 -79354507 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 7 1366 724 271 112 57 chr2 102394061 102394560 -79353527 + RMER13A LTR ERVK 1 534 -93 7 1366 246 326 60 8 chr2 102394915 102395048 -79353039 + LTR85a LTR Gypsy? 519 658 -44 7 1366 2273 109 19 0 chr2 102399811 102400131 -79347956 + ORR1A3 LTR MaLR 1 326 0 7 1366 375 244 131 139 chr2 102402211 102402577 -79345510 + MLT1A0 LTR MaLR 3 365 0 7 1366 7589 139 58 73 chr2 102402869 102404465 -79343622 - RLTR21 LTR ERVK 0 1572 1 7 1366 620 286 188 22 chr2 102410352 102410720 -79337367 - MLT1D LTR MaLR 0 505 77 7 1366 1716 268 37 14 chr2 102414344 102414833 -79333254 - RLTR16 LTR ERVK 0 505 6 7 1366 3006 163 184 61 chr2 102433996 102434788 -79313299 - RMER19B LTR ERVK -12 890 1 8 1366 1174 238 24 119 chr2 102435100 102435519 -79312568 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 8 1366 266 252 311 20 chr2 102440891 102441049 -79307038 - RMER15 LTR ERVL 0 575 372 8 1366 308 288 27 0 chr2 102454417 102454528 -79293559 - RMER15 LTR ERVL -58 517 404 8 1366 1028 250 31 121 chr2 102456525 102456981 -79291106 + MTD LTR MaLR 3 405 -14 8 1366 267 256 200 0 chr2 102465889 102465979 -79282108 - MLT2B1 LTR ERVL -84 483 376 8 1366 1197 265 112 17 chr2 102465986 102466404 -79281683 + MTE-int LTR MaLR 1117 1574 -6 8 1366 944 306 36 50 chr2 102471196 102471560 -79276527 - MLT1A0 LTR MaLR -2 363 5 8 1366 502 288 86 80 chr2 102483384 102483758 -79264329 + MTEb LTR MaLR 1 376 -3 8 1366 232 302 11 44 chr2 102484833 102484923 -79263164 - LTR81C LTR ERV1? -942 211 125 8 1366 1133 284 98 5 chr2 102485227 102485644 -79262443 + RMER5 LTR ERV1 79 534 0 8 1366 331 345 71 9 chr2 102485822 102486033 -79262054 - MLT2F LTR ERVL -19 644 421 8 1366 315 296 102 24 chr2 102486753 102486919 -79261168 + MER90a LTR ERV1 47 225 -389 8 1366 859 188 5 61 chr2 102488024 102488222 -79259865 + ORR1B2 LTR MaLR 1 187 -180 8 1366 375 317 150 52 chr2 102492273 102492579 -79255508 - ORR1E LTR MaLR 0 359 24 8 1367 255 319 0 87 chr2 102505271 102505456 -79242631 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1311 1479 -369 5 1367 328 339 165 30 chr2 102508766 102509003 -79239084 - LTR16A LTR ERVL 0 451 183 1 1367 2634 140 29 2 chr2 102512112 102512520 -79235567 - MTC LTR MaLR -2 419 1 2 1367 979 292 97 26 chr2 102518844 102519185 -79228902 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 1 2 1367 1793 221 93 13 chr2 102531396 102531782 -79216305 - MTD LTR MaLR 0 419 3 4 1367 225 351 83 79 chr2 102533318 102533547 -79214540 - MLT1K LTR MaLR -235 360 131 5 1367 2745 158 94 35 chr2 102537980 102538282 -79209805 + RMER4B LTR ERVK 3 307 -278 5 1367 2745 158 94 35 chr2 102538315 102538562 -79209525 + RMER4B LTR ERVK 308 584 -1 5 1367 225 317 12 35 chr2 102542349 102542434 -79205653 - MLT1I LTR MaLR -198 213 131 6 1367 2149 163 48 5 chr2 102561084 102561478 -79186609 + MTC LTR MaLR 11 421 0 8 1367 1874 216 89 15 chr2 102563703 102563742 -79184345 - RLTR20B1 LTR ERVK -54 509 457 9 1367 1874 216 89 15 chr2 102563788 102564222 -79183865 - RLTR20B1 LTR ERVK -107 456 2 9 1367 2108 197 30 0 chr2 102569679 102570086 -79178001 + MTD LTR MaLR 1 419 0 9 1367 283 314 48 0 chr2 102589039 102589144 -79158943 - MLT1A0 LTR MaLR -17 348 239 1 1367 381 295 138 103 chr2 102589239 102589587 -79158500 - MLT1A0 LTR MaLR -5 360 1 1 1367 702 276 58 28 chr2 102591495 102591925 -79156162 - MER31A LTR ERV1 0 485 5 1 1367 488 184 17 17 chr2 102610403 102610519 -79137568 + MLT1A1 LTR MaLR 293 408 0 1 1368 732 271 64 11 chr2 102634943 102635208 -79112879 - MLT1A0 LTR MaLR -25 340 62 1 1368 1006 280 26 54 chr2 102642694 102643099 -79104988 + MTE2a LTR MaLR 1 404 -15 1 1368 377 319 107 35 chr2 102647742 102648140 -79099947 + MLT1H LTR MaLR 101 549 0 1 1368 1499 222 90 13 chr2 102665123 102665510 -79082577 + MTD LTR MaLR 1 417 -2 2 1368 1955 179 73 18 chr2 102667973 102668370 -79079717 - MTC LTR MaLR 0 421 3 2 1368 964 68 0 0 chr2 102669370 102669487 -79078600 - MERVL-int LTR ERVL -2100 3385 3269 2 1368 411 345 81 88 chr2 102694626 102694934 -79053153 - MLT1A LTR MaLR -51 323 18 2 1368 2353 203 5 12 chr2 102717256 102717680 -79030407 - MTC LTR MaLR 0 421 1 2 1368 246 341 14 55 chr2 102719015 102719161 -79028926 + MT2A LTR ERVL 1 140 -393 2 1368 1148 292 48 23 chr2 102719032 102719386 -79028701 + MTEa LTR MaLR 17 379 0 2 1368 273 366 129 26 chr2 102726167 102726554 -79021533 + MLT1L LTR MaLR 55 481 -129 2 1368 1044 238 43 147 chr2 102747303 102747726 -79000361 - MTE2a LTR MaLR 0 379 1 3 1368 270 237 39 13 chr2 102756772 102756849 -78991238 + ORR1E LTR MaLR 270 348 -11 3 1368 443 250 24 8 chr2 102760216 102760341 -78987746 + MTEa LTR MaLR 253 379 0 3 1369 370 326 178 62 chr2 102765534 102765904 -78982183 - MLT1N2 LTR MaLR -30 532 120 3 1369 736 279 81 42 chr2 102767406 102767765 -78980322 - MTEa LTR MaLR -5 374 2 3 1369 1235 314 114 6 chr2 102768225 102768700 -78979387 + MLT1F2 LTR MaLR 21 546 -14 3 1369 282 338 83 25 chr2 102768854 102769094 -78978993 - MERVL-int LTR ERVL -1064 4421 4168 3 1369 1649 193 169 107 chr2 102769371 102769922 -78978165 - RMER4B LTR ERVK 0 585 1 3 1369 266 310 52 37 chr2 102770412 102770546 -78977541 - MERVL-int LTR ERVL -1954 3713 3578 3 1369 621 347 67 36 chr2 102771108 102771373 -78976714 - LTR33 LTR ERVL -117 398 112 3 1369 621 347 67 36 chr2 102771602 102771722 -78976365 - LTR33 LTR ERVL -404 111 1 3 1369 1048 204 190 11 chr2 102772023 102772340 -78975747 - MTD LTR MaLR 0 419 22 3 1369 510 144 0 0 chr2 102778684 102778774 -78969313 - ORR1A4 LTR MaLR -239 90 1 3 1369 448 290 102 80 chr2 102780361 102780635 -78967452 - MLT1H LTR MaLR -9 540 261 3 1369 429 270 54 175 chr2 102781908 102782280 -78965807 + MLT1C LTR MaLR 56 459 -8 3 1369 252 266 296 8 chr2 102787848 102787973 -78960114 - MLT1A0 LTR MaLR -165 200 40 3 1369 307 380 72 46 chr2 102788032 102788338 -78959749 - LTR16B1 LTR ERVL -161 319 6 3 1369 1347 194 137 39 chr2 102790336 102790542 -78957545 + ORR1D1 LTR MaLR 5 228 -146 3 1369 1347 194 137 39 chr2 102790565 102790695 -78957392 + ORR1D1 LTR MaLR 229 373 -1 3 1369 918 257 153 6 chr2 102797279 102797467 -78950620 + MTEb LTR MaLR 1 196 -183 3 1369 918 257 153 6 chr2 102797527 102797659 -78950428 + MTEb LTR MaLR 197 367 -12 3 1369 600 319 128 10 chr2 102799529 102799833 -78948254 - MER74A LTR ERVL -116 442 103 3 1369 1594 199 55 13 chr2 102806406 102806803 -78941284 + MTD LTR MaLR 16 419 0 3 1369 1139 269 62 15 chr2 102806991 102807316 -78940771 - MTEb LTR MaLR 0 379 40 4 1369 247 340 29 10 chr2 102807933 102808037 -78940050 + ORR1E LTR MaLR 19 124 -235 4 1369 442 342 145 17 chr2 102808867 102809102 -78938985 - LTR16D2 LTR ERVL -264 308 44 4 1369 1268 170 122 43 chr2 102813844 102814006 -78934081 + ORR1C2 LTR MaLR 1 171 -213 4 1369 1268 170 122 43 chr2 102814076 102814258 -78933829 + ORR1C2 LTR MaLR 172 371 -13 4 1369 250 256 43 22 chr2 102814954 102815046 -78933041 + MTD LTR MaLR 3 96 -323 4 1369 2000 193 38 0 chr2 102816293 102816666 -78931421 + MTD LTR MaLR 21 407 -12 4 1369 1512 204 75 28 chr2 102817210 102817598 -78930489 + MTD LTR MaLR 1 406 -13 4 1369 915 169 10 7 chr2 102828458 102828737 -78919350 - ORR1C1 LTR MaLR -37 341 1 4 1369 2936 196 37 8 chr2 102828737 102829361 -78918726 - ORR1C1-int LTR MaLR 0 1509 868 4 1369 442 127 12 9 chr2 102829469 102829553 -78918534 - ORR1C1 LTR MaLR -10 364 286 4 1369 376 257 39 10 chr2 102829812 102829914 -78918173 - RLTR12B LTR ERVK -317 211 107 4 1369 297 100 222 48 chr2 102833824 102833887 -78914200 + ORR1E LTR MaLR 282 355 -4 4 1369 241 296 158 27 chr2 102834800 102834946 -78913141 - RLTR22_Mur LTR ERVK -388 1460 1296 4 1369 1512 183 130 58 chr2 102845946 102846324 -78901763 + MTD LTR MaLR 1 405 -14 4 1369 416 253 280 29 chr2 102850090 102850265 -78897822 + MTEb LTR MaLR 125 343 -36 4 1369 240 358 35 35 chr2 102852134 102852247 -78895840 - MT2B LTR ERVL -323 278 166 4 1369 3559 33 5 0 chr2 102854438 102854832 -78893255 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 1369 937 296 71 76 chr2 102855430 102855579 -78892508 - MTE2a LTR MaLR 0 379 231 4 1369 2000 168 72 8 chr2 102855579 102855940 -78892147 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 4 1369 937 296 71 76 chr2 102855940 102856171 -78891916 - MTE2a LTR MaLR -149 230 1 4 1369 275 289 69 69 chr2 102856255 102856385 -78891702 + LTR41B LTR ERVL 22 151 -607 4 1369 271 361 26 20 chr2 102856448 102856614 -78891473 + LTR41B LTR ERVL 306 519 -239 4 1369 262 264 111 74 chr2 102861088 102861223 -78886864 - MT2B LTR ERVL -339 262 123 5 1369 2230 149 68 25 chr2 102867760 102868159 -78879928 + MTC LTR MaLR 6 421 0 5 1369 3538 45 0 0 chr2 102874942 102875338 -78872749 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 1369 602 291 31 80 chr2 102876223 102876447 -78871640 + MTD LTR MaLR 12 224 -195 5 1369 3278 42 45 3 chr2 102882730 102883110 -78864977 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 1369 2285 192 63 45 chr2 102887907 102888487 -78859600 - RLTR31_Mm LTR ERVK 0 590 1 5 1370 1408 206 115 36 chr2 102894132 102894550 -78853537 - RMER20B LTR ERVK -15 612 162 5 1370 2055 159 190 19 chr2 102907048 102907427 -78840660 - RLTR41 LTR ERV1 -2 444 1 5 1370 2426 165 52 5 chr2 102908618 102909038 -78839049 + RMER4B LTR ERVK 146 585 0 5 1370 861 302 60 97 chr2 102911504 102911822 -78836265 + MLT1D LTR MaLR 9 313 -192 5 1370 861 294 185 45 chr2 102911846 102912013 -78836074 + MLT1D LTR MaLR 314 456 -49 5 1370 2233 149 48 15 chr2 102915162 102915556 -78832531 - MTC LTR MaLR -11 410 4 5 1370 270 276 45 62 chr2 102916967 102917079 -78831008 + MTEb LTR MaLR 269 378 -1 5 1370 509 310 85 18 chr2 102918101 102918344 -78829743 - MLT1F1 LTR MaLR -4 565 297 5 1370 2135 168 81 20 chr2 102921330 102921725 -78826362 - MTD LTR MaLR 0 419 1 5 1370 2178 174 50 5 chr2 102929011 102929410 -78818677 + MTD LTR MaLR 3 419 0 5 1370 228 271 14 41 chr2 102938472 102938545 -78809542 + MLT1A LTR MaLR 22 92 -282 6 1370 466 293 112 41 chr2 102946235 102946502 -78801585 + MLT2D LTR ERVL 35 320 -94 6 1370 1384 222 124 107 chr2 102950439 102951010 -78797077 - RMER4B LTR ERVK 0 585 5 6 1370 1554 184 103 6 chr2 102962808 102963157 -78784930 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 25 6 1370 1773 229 70 22 chr2 102963470 102963969 -78784118 + RLTR11A2 LTR ERVK 2 524 -3 6 1370 328 354 106 50 chr2 102964217 102964520 -78783567 - HERV16-int LTR ERVL -3536 1460 1141 6 1370 409 348 62 18 chr2 102965457 102965682 -78782405 - LTR16A1 LTR ERVL -2 454 220 6 1370 1813 184 48 91 chr2 102966988 102967448 -78780639 + BGLII_B LTR ERVK 1 440 -1 6 1370 513 386 66 25 chr2 102969392 102969758 -78778329 + MLT1J LTR MaLR 11 391 -121 6 1370 420 321 73 59 chr2 102980775 102981185 -78766902 + MLT1B LTR MaLR 29 462 -5 6 1370 1310 260 47 6 chr2 102986364 102986727 -78761360 - MTEb LTR MaLR -1 378 1 6 1370 766 315 80 16 chr2 102989880 102990245 -78757842 + LTR75 LTR ERVL 1 388 -174 6 1370 3498 137 151 2 chr2 103003630 103003925 -78744162 + RMER6C LTR ERVK 4 368 -322 8 1370 3498 137 151 2 chr2 103004007 103004308 -78743779 + RMER6C LTR ERVK 369 688 -2 8 1370 1174 302 98 37 chr2 103004959 103005478 -78742609 + MER89 LTR ERV1 5 555 -4 1 1370 239 266 62 21 chr2 103012783 103012879 -78735208 + LTR79 LTR ERVL 402 501 -26 2 1370 264 290 108 20 chr2 103019606 103019708 -78728379 - MLT1G1 LTR MaLR -95 484 374 3 1371 377 339 110 79 chr2 103023153 103023534 -78724553 - MER65D LTR ERV1 -64 409 17 3 1371 231 385 78 31 chr2 103025533 103025726 -78722361 + MLT1K LTR MaLR 217 418 -177 4 1371 805 286 209 0 chr2 103032929 103033240 -78714847 + MTEa LTR MaLR 2 377 -2 5 1371 939 186 255 51 chr2 103033577 103034003 -78714084 + RMER20B LTR ERVK 1 568 -59 5 1371 227 274 139 41 chr2 103035156 103035278 -78712809 - MLT1A1 LTR MaLR -7 401 268 5 1371 246 297 123 33 chr2 103043920 103044042 -78704045 - MLT1K LTR MaLR -24 571 439 7 1371 360 335 63 31 chr2 103055863 103056054 -78692033 - MLT1I LTR MaLR -8 403 207 8 1371 241 375 23 23 chr2 103056121 103056252 -78691835 - MLT1I LTR MaLR -270 141 11 8 1371 784 313 55 83 chr2 103056521 103057026 -78691061 - MLT1D LTR MaLR -2 503 13 8 1371 2197 161 116 30 chr2 103059970 103060236 -78687851 + RMER4B LTR ERVK 17 336 -249 9 1371 2197 161 116 30 chr2 103060332 103060473 -78687614 + RMER4B LTR ERVK 337 474 -111 9 1371 2197 161 116 30 chr2 103060614 103060729 -78687358 + RMER4B LTR ERVK 475 583 -2 9 1371 263 298 43 9 chr2 103073685 103073800 -78674287 + MTD LTR MaLR 1 119 -300 1 1371 708 190 159 5 chr2 103076636 103076837 -78671250 - MTEa LTR MaLR -10 369 138 1 1371 432 315 12 24 chr2 103089825 103089994 -78658093 - RLTR42-int LTR ERVK -4129 1393 1227 1 1372 1749 211 88 13 chr2 103155886 103156271 -78591816 + MTD LTR MaLR 1 414 -5 2 1372 1336 297 83 39 chr2 103158610 103159101 -78588986 - MER21B LTR ERV1 -176 687 175 2 1372 412 331 13 33 chr2 103159572 103159722 -78588365 - MER21B LTR ERV1 -716 147 1 2 1372 1520 213 25 36 chr2 103168000 103168298 -78579789 + MTD LTR MaLR 42 334 -85 2 1372 1520 213 25 36 chr2 103168522 103168584 -78579503 + MTD LTR MaLR 335 398 -21 2 1372 920 274 77 30 chr2 103168587 103168925 -78579162 + RMER15-int LTR ERVL 4229 4582 -417 2 1372 1206 221 109 53 chr2 103172374 103172732 -78575355 - MTE2b LTR MaLR -1 378 1 2 1372 555 328 123 31 chr2 103173474 103173833 -78574254 + LTR33A_ LTR ERVL 140 531 0 2 1372 1390 256 16 33 chr2 103174382 103174750 -78573337 - MLT1A0 LTR MaLR -3 362 1 2 1372 253 307 20 0 chr2 103183873 103183974 -78564113 + MLT1I LTR MaLR 40 142 -269 3 1372 310 306 51 22 chr2 103191831 103191968 -78556119 + ORR1E LTR MaLR 1 141 -218 3 1372 225 239 101 50 chr2 103192146 103192265 -78555822 + ORR1E LTR MaLR 250 374 -5 3 1372 2181 106 21 27 chr2 103199704 103200035 -78548052 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 3 1372 2167 153 53 10 chr2 103203121 103203518 -78544569 + MTC LTR MaLR 8 421 0 3 1372 373 305 82 36 chr2 103213383 103213604 -78534483 + LTR33A_ LTR ERVL 15 244 -271 3 1372 370 313 37 0 chr2 103217565 103217699 -78530388 + MLT1I LTR MaLR 273 411 0 3 1372 2764 122 22 12 chr2 103225295 103225710 -78522377 - MTC LTR MaLR -2 419 1 3 1372 265 304 9 47 chr2 103227662 103227769 -78520318 + MLT1A1 LTR MaLR 302 404 -4 3 1372 1637 224 94 16 chr2 103234815 103235129 -78512958 - MTD LTR MaLR 0 419 74 4 1372 2937 46 0 0 chr2 103235129 103235475 -78512612 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 4 1372 1637 224 94 16 chr2 103235475 103235532 -78512555 - MTD LTR MaLR -346 73 19 4 1372 1191 234 90 27 chr2 103236046 103236387 -78511700 - MTEb LTR MaLR -16 403 1 4 1372 323 276 97 69 chr2 103241383 103241527 -78506560 - MLT1G1 LTR MaLR 0 595 448 4 1372 433 233 16 48 chr2 103241938 103242064 -78506023 - MLT1G1 LTR MaLR -451 128 7 4 1372 333 328 62 0 chr2 103243103 103243231 -78504856 + MLT1A LTR MaLR 1 136 -238 4 1372 564 291 85 88 chr2 103244346 103244651 -78503436 - MLT1B LTR MaLR 0 390 87 4 1372 1251 242 69 15 chr2 103244659 103244994 -78503093 - ORR1E LTR MaLR -6 353 1 4 1372 369 186 76 76 chr2 103244994 103245080 -78503007 - MLT1B LTR MaLR -381 86 1 4 1372 456 292 34 34 chr2 103248472 103248649 -78499438 - MLT1C LTR MaLR 0 467 291 4 1372 256 282 94 137 chr2 103249208 103249463 -78498624 - MLT1C LTR MaLR -261 244 1 4 1373 1133 318 140 14 chr2 103295572 103296206 -78451881 + MER21B LTR ERV1 17 730 -133 5 1373 277 265 157 0 chr2 103299145 103299247 -78448840 + MLT1M LTR MaLR 138 255 -417 5 1373 2577 65 9 0 chr2 103299861 103300185 -78447902 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 5 1373 908 81 0 0 chr2 103312869 103312993 -78435094 + ORR1B1 LTR MaLR 271 394 0 5 1373 326 272 76 0 chr2 103321467 103321559 -78426528 + MLT1J1 LTR MaLR 45 143 -301 5 1373 928 214 64 121 chr2 103329685 103330073 -78418014 - ORR1D2 LTR MaLR -3 367 2 5 1373 2352 162 28 126 chr2 103335240 103335592 -78412495 + MTC LTR MaLR 1 359 -62 6 1373 2352 162 28 126 chr2 103335738 103335852 -78412235 + MTC LTR MaLR 360 421 0 6 1373 3688 164 138 32 chr2 103337386 103338191 -78409896 - RMER19B LTR ERVK -12 890 1 6 1373 226 330 11 54 chr2 103339589 103339682 -78408405 + MLT1K LTR MaLR 507 595 0 6 1373 623 247 49 25 chr2 103339919 103340010 -78408077 - RLTR20C LTR ERVK -2 576 490 6 1373 912 219 127 28 chr2 103340052 103340389 -78407698 - RLTR20C LTR ERVK -89 489 1 6 1373 361 272 32 21 chr2 103344207 103344301 -78403786 + LTR78 LTR ERV1 286 380 -924 6 1373 445 382 121 23 chr2 103344456 103344721 -78403366 + LTR78 LTR ERV1 737 1027 -277 6 1373 248 218 205 0 chr2 103344800 103344878 -78403209 + LTR78 LTR ERV1 1177 1270 -34 6 1373 304 261 128 68 chr2 103345713 103345861 -78402226 - MER21B LTR ERV1 -274 589 433 6 1373 1278 219 44 104 chr2 103346802 103347168 -78400919 + MTE2a LTR MaLR 1 344 -35 6 1373 318 271 14 28 chr2 103347452 103347524 -78400563 - ORR1D2 LTR MaLR -203 167 97 6 1373 756 250 35 39 chr2 103347525 103347717 -78400370 - RLTR18B LTR ERVK 0 512 322 6 1373 276 262 72 231 chr2 103347717 103347771 -78400316 - RMER10B LTR ERVL 0 442 374 6 1373 304 258 69 191 chr2 103347806 103348276 -78399811 - RMER10B LTR ERVL -69 373 1 6 1373 1548 191 72 121 chr2 103348276 103348723 -78399364 - RLTR18 LTR ERVK -187 429 5 6 1373 288 191 189 67 chr2 103348726 103348816 -78399271 - ORR1D2 LTR MaLR -269 101 1 6 1373 4051 76 26 0 chr2 103349166 103349665 -78398422 + RLTR1B LTR ERV1 1 512 0 6 1373 902 216 142 60 chr2 103355658 103355939 -78392148 + MTEa LTR MaLR 1 304 -75 6 1373 269 179 42 42 chr2 103356477 103356564 -78391523 + MTEa LTR MaLR 271 379 0 6 1373 2287 144 84 8 chr2 103358404 103358795 -78389292 + MTC LTR MaLR 1 421 0 6 1373 358 376 50 53 chr2 103362917 103363240 -78384847 + MLT1K LTR MaLR 49 370 -225 6 1373 699 317 67 55 chr2 103366349 103366679 -78381408 + ORR1E LTR MaLR 26 359 0 6 1373 2071 140 27 54 chr2 103376884 103377253 -78370834 - RLTR15 LTR ERVK 0 359 1 6 1373 949 248 59 115 chr2 103379096 103379470 -78368617 + MTE2a LTR MaLR 1 353 -26 6 1373 1389 205 124 3 chr2 103380033 103380332 -78367755 - MTC LTR MaLR -4 417 83 6 1373 536 188 0 0 chr2 103380427 103380523 -78367564 - MTC LTR MaLR -325 96 1 6 1373 251 294 89 27 chr2 103381900 103382012 -78366075 - RMER15 LTR ERVL -23 552 434 6 1373 2630 91 91 6 chr2 103384158 103384521 -78363566 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 7 1373 1261 185 75 105 chr2 103392079 103392411 -78355676 - ORR1D1 LTR MaLR -49 325 4 7 1373 1272 174 136 45 chr2 103393174 103393566 -78354521 + RMER17C LTR ERVK 1 406 -403 7 1373 399 292 97 43 chr2 103398051 103398380 -78349707 + MER52-int LTR ERV1 3641 3987 -3104 7 1373 401 255 27 18 chr2 103399551 103399663 -78348424 + RMER10B LTR ERVL 286 398 0 7 1373 2962 156 30 70 chr2 103400165 103400764 -78347323 + RMER15 LTR ERVL 1 575 0 7 1373 439 277 58 8 chr2 103401436 103401556 -78346531 + RMER10B LTR ERVL 271 396 -2 7 1373 1772 259 209 37 chr2 103409003 103409730 -78338357 + MER21B LTR ERV1 1 852 -11 7 1374 232 306 207 0 chr2 103430721 103430832 -78317255 - MLT1K LTR MaLR -8 587 454 7 1374 284 333 0 94 chr2 103430928 103431034 -78317053 - MLT1K LTR MaLR -307 288 193 7 1374 325 270 32 112 chr2 103438334 103438459 -78309628 - MLT1A1 LTR MaLR -38 370 256 7 1374 492 246 31 23 chr2 103453226 103453355 -78294732 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 279 7 1374 464 297 244 50 chr2 103454784 103455086 -78293001 + MLT1A0 LTR MaLR 1 388 -20 7 1374 1775 145 180 0 chr2 103455765 103456076 -78292011 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 7 1374 679 331 102 40 chr2 103461925 103462403 -78285684 - MER34A LTR ERV1 -62 509 2 8 1374 678 308 74 56 chr2 103468417 103468754 -78279333 + MLT1A0 LTR MaLR 23 365 0 8 1374 272 283 43 95 chr2 103474648 103474859 -78273228 - RMER17D LTR ERVK -345 544 345 8 1374 2379 109 0 6 chr2 103477190 103477521 -78270566 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 8 1374 401 331 0 30 chr2 103478463 103478597 -78269490 + MLT1C LTR MaLR 45 174 -293 8 1374 1928 133 60 14 chr2 103504263 103504615 -78243472 + RLTR9A LTR ERVK 1 368 0 6 1374 1734 196 37 3 chr2 103507702 103508055 -78240032 - ORR1D2 LTR MaLR -5 365 1 9 1374 1050 249 178 12 chr2 103537236 103537598 -78210489 - MTD LTR MaLR -14 405 1 5 1374 364 306 18 9 chr2 103538705 103538817 -78209270 - LTR33B LTR ERVL -1 502 390 5 1374 3210 139 28 19 chr2 103540107 103540643 -78207444 - RLTR20A LTR ERVK 0 541 1 6 1375 282 321 104 22 chr2 103551764 103551898 -78196189 - RMER15 LTR ERVL -4 571 427 7 1375 410 88 0 34 chr2 103591068 103591127 -78156960 + ORR1C2 LTR MaLR 6 62 -322 1 1375 2576 164 0 21 chr2 103591125 103591549 -78156538 + MTC LTR MaLR 7 421 0 1 1375 1357 152 183 7 chr2 103591549 103591833 -78156254 + ORR1C2 LTR MaLR 51 384 0 1 1375 233 308 85 32 chr2 103621853 103621947 -78126140 + MLT1B LTR MaLR 275 373 -17 1 1375 654 174 145 17 chr2 103621956 103622240 -78125847 + ORR1C1 LTR MaLR 23 384 0 1 1375 254 61 0 0 chr2 103633818 103633851 -78114236 + RMER6B LTR ERVK 1 33 -428 2 1375 2344 104 75 85 chr2 103644965 103645301 -78102786 + ORR1B1 LTR MaLR 1 345 -49 2 1375 2344 104 75 85 chr2 103645329 103645390 -78102697 + ORR1B1 LTR MaLR 346 394 0 2 1375 1735 131 106 10 chr2 103648028 103648321 -78099766 + ORR1B2 LTR MaLR 32 352 -15 2 1375 412 289 112 31 chr2 103650354 103650515 -78097572 + MER21B LTR ERV1 429 602 -261 2 1375 915 210 343 6 chr2 103650528 103650863 -78097224 - RLTR16 LTR ERVK -22 483 36 2 1375 453 206 34 120 chr2 103653083 103653132 -78094955 - MT2B LTR ERVL -306 261 123 2 1375 2798 169 35 23 chr2 103655995 103656516 -78091571 - RLTR11A2 LTR ERVK 0 527 1 2 1375 2927 128 68 45 chr2 103657282 103657798 -78090289 + RLTR12B LTR ERVK 1 528 0 2 1375 472 217 112 0 chr2 103660087 103660230 -78087857 - RLTR28 LTR ERVL -14 510 352 3 1375 1742 158 21 6 chr2 103660225 103660550 -78087537 - ORR1B1 LTR MaLR -9 385 19 3 1375 1740 164 43 67 chr2 103660553 103660826 -78087261 - RLTR28 LTR ERVL -158 366 93 3 1375 1740 164 43 67 chr2 103660974 103661072 -78087015 - RLTR28 LTR ERVL -432 92 4 3 1375 2841 123 28 37 chr2 103665814 103665972 -78082115 - RMER6B LTR ERVK -2 459 298 3 1375 2841 123 28 37 chr2 103666000 103666304 -78081783 - RMER6B LTR ERVK -164 297 2 3 1375 237 32 0 0 chr2 103667002 103667033 -78081054 + RMER2 LTR ERV1 1 31 -536 3 1375 3137 75 60 21 chr2 103668113 103668592 -78079495 - RMER2 LTR ERV1 0 567 70 3 1375 2466 172 59 20 chr2 103669628 103670167 -78077920 - RLTR20B2 LTR ERVK 0 560 1 3 1375 1655 159 26 75 chr2 103670534 103670880 -78077207 + ORR1C1 LTR MaLR 1 329 -49 3 1375 2207 196 103 30 chr2 103671967 103672462 -78075625 - RMER16 LTR ERVK -2 531 1 3 1375 282 281 196 35 chr2 103673658 103673831 -78074256 - LTR81B LTR ERV1? -1178 215 15 3 1375 237 244 112 112 chr2 103675425 103675568 -78072519 - MLT1H2 LTR MaLR -150 339 197 3 1375 273 298 21 21 chr2 103675843 103675939 -78072148 + MLT1K LTR MaLR 331 426 -169 3 1376 374 177 38 0 chr2 103678908 103678987 -78069100 + MTEa LTR MaLR 298 379 0 3 1376 517 250 0 0 chr2 103679853 103679965 -78068122 + MTE-int LTR MaLR 23 134 -1446 3 1376 758 222 220 27 chr2 103679982 103680278 -78067809 + MTD LTR MaLR 18 370 -49 3 1376 1085 251 88 25 chr2 103680746 103681094 -78066993 + MTE-int LTR MaLR 104 456 -914 3 1376 622 304 70 73 chr2 103681296 103681330 -78066757 + MTE-int LTR MaLR 457 485 -885 3 1376 247 247 52 0 chr2 103681335 103681412 -78066675 + MTE-int LTR MaLR 604 684 -896 3 1376 1593 213 93 17 chr2 103681494 103681914 -78066173 - MTEb-int LTR MaLR -1128 452 1 3 1376 352 200 0 13 chr2 103681914 103681990 -78066097 - MTEb LTR MaLR 0 379 305 3 1376 300 195 141 13 chr2 103682263 103682341 -78065746 - MTEb LTR MaLR -101 278 191 3 1376 327 271 12 0 chr2 103682573 103682658 -78065429 - MTEb LTR MaLR -293 86 1 3 1376 4538 95 57 54 chr2 103687439 103688193 -78059894 + RMER6A LTR ERVK 1 756 0 3 1376 2192 162 20 5 chr2 103689923 103690326 -78057761 - MTC LTR MaLR 0 421 13 3 1376 1512 261 44 12 chr2 103690873 103691358 -78056729 + MTEa-int LTR MaLR 2 527 -1053 3 1376 433 271 75 6 chr2 103698020 103698180 -78049907 + MTEa-int LTR MaLR 543 713 -867 3 1376 2642 133 17 101 chr2 103698281 103698679 -78049408 + RLTR11A LTR ERVK 1 360 -168 3 1376 4294 56 42 7 chr2 103698679 103699220 -78048867 - LTRIS2 LTR ERV1 0 564 5 3 1376 2642 133 17 101 chr2 103699220 103699397 -78048690 + RLTR11A LTR ERVK 361 528 0 3 1376 2304 248 49 76 chr2 103699397 103699803 -78048284 + MTEa-int LTR MaLR 882 1292 -288 3 1376 2643 75 145 139 chr2 103699803 103700312 -78047775 + RLTR1B LTR ERV1 1 512 0 3 1376 2304 248 49 76 chr2 103700312 103700412 -78047675 + MTEa-int LTR MaLR 1293 1372 -208 3 1376 2304 248 49 76 chr2 103700560 103700762 -78047325 + MTEa-int LTR MaLR 1373 1572 -8 3 1376 880 236 113 91 chr2 103700770 103700952 -78047135 + MTEa LTR MaLR 1 180 -199 3 1376 880 236 113 91 chr2 103701129 103701309 -78046778 + MTEa LTR MaLR 181 371 -8 3 1376 3176 50 34 0 chr2 103701671 103702054 -78046033 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 1376 9427 26 2 2 chr2 103702054 103703152 -78044935 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 4 1376 3176 50 34 0 chr2 103703152 103703535 -78044552 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 1376 2010 189 53 43 chr2 103704633 103704985 -78043102 - MTD LTR MaLR 0 419 53 4 1376 2010 189 53 43 chr2 103705157 103705219 -78042868 - MTD LTR MaLR -367 52 1 4 1376 1944 172 93 3 chr2 103705237 103705580 -78042507 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 4 1376 260 325 0 0 chr2 103709837 103709920 -78038167 + MTEa LTR MaLR 1 83 -296 4 1376 959 296 47 13 chr2 103709936 103710237 -78037850 + MTEa LTR MaLR 59 369 -10 4 1376 828 266 115 64 chr2 103717098 103717455 -78030632 - MTEa LTR MaLR -4 375 1 4 1376 226 157 77 19 chr2 103726179 103726231 -78021856 - LTR79 LTR ERVL -32 495 441 4 1376 1191 194 100 55 chr2 103733223 103733513 -78014574 - ORR1B1 LTR MaLR -51 343 41 4 1376 1826 168 145 6 chr2 103738007 103738372 -78009715 - MTD LTR MaLR -1 418 3 4 1376 3131 20 0 0 chr2 103738740 103739086 -78009001 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 4 1376 249 239 95 40 chr2 103739275 103739349 -78008738 - MLT1E2 LTR MaLR -549 78 1 4 1376 943 219 132 115 chr2 103748977 103749333 -77998754 - MTE2a LTR MaLR -17 362 1 5 1376 530 321 38 64 chr2 103749566 103749881 -77998206 + MLT1H LTR MaLR 1 300 -295 5 1376 685 331 95 46 chr2 103750932 103751280 -77996807 - MLT1G LTR MaLR -226 365 1 5 1376 1136 274 59 51 chr2 103758215 103758391 -77989696 + MTD LTR MaLR 1 179 -240 5 1376 3171 161 61 4 chr2 103758391 103758935 -77989152 + RMER15 LTR ERVL 1 575 0 5 1376 1136 272 66 44 chr2 103758935 103759164 -77988923 + MTD LTR MaLR 180 394 -25 5 1376 412 345 114 66 chr2 103760520 103760992 -77987095 - MLT1J LTR MaLR -17 495 1 5 1376 248 296 71 120 chr2 103762767 103762951 -77985136 + MLT1B LTR MaLR 1 175 -215 5 1376 300 264 0 32 chr2 103764640 103764734 -77983353 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 318 5 1376 337 215 21 23 chr2 103764752 103764840 -77983247 - MTD LTR MaLR -15 404 298 5 1376 768 284 170 18 chr2 103764952 103765242 -77982845 - MTD LTR MaLR -57 322 18 5 1376 869 300 156 31 chr2 103766458 103766522 -77981565 - MLT1D LTR MaLR -65 440 357 5 1376 869 300 156 31 chr2 103766723 103767043 -77981044 - MLT1D LTR MaLR -149 356 8 5 1376 2260 116 3 0 chr2 103767378 103767696 -77980391 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 5 1376 556 293 57 6 chr2 103770277 103770435 -77977652 - MLT1J LTR MaLR -250 262 97 5 1376 248 350 73 24 chr2 103783308 103783431 -77964656 - LTR88b LTR Gypsy? -687 150 22 5 1376 2340 150 15 42 chr2 103784414 103784824 -77963263 - MTB_Mm LTR MaLR -8 399 1 5 1376 1516 271 74 0 chr2 103789457 103789889 -77958198 - MT2A LTR ERVL 0 533 70 6 1376 363 207 11 22 chr2 103790096 103790185 -77957902 - MT2A LTR ERVL -445 88 1 6 1376 1109 261 81 38 chr2 103797270 103797616 -77950471 + MTE2a LTR MaLR 19 379 0 6 1377 250 240 67 48 chr2 103818901 103819006 -77929081 + LTR16A1 LTR ERVL 348 454 -2 6 1377 2197 156 31 19 chr2 103826806 103827219 -77920868 + MTC LTR MaLR 1 418 -3 6 1377 2897 16 0 0 chr2 103827980 103828302 -77919785 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 322 0 6 1377 1041 359 77 18 chr2 103829563 103830054 -77918033 + MLT1F LTR MaLR 3 522 -26 6 1377 1133 212 219 4 chr2 103830091 103830356 -77917731 + MTEa LTR MaLR 58 379 0 6 1377 1188 177 134 14 chr2 103838315 103838615 -77909472 - ORR1D1 LTR MaLR -1 369 16 7 1377 278 157 20 0 chr2 103846028 103846079 -77902008 + MLT1D LTR MaLR 377 428 -77 7 1377 297 214 14 0 chr2 103846562 103846632 -77901455 + MTD LTR MaLR 349 419 0 7 1377 335 269 0 37 chr2 103846692 103846800 -77901287 + MTEb LTR MaLR 276 379 0 7 1377 894 126 73 142 chr2 103859347 103859413 -77888674 + MTA_Mm LTR MaLR 1 54 -367 7 1377 1061 83 6 11 chr2 103859560 103859725 -77888362 + MTA_Mm LTR MaLR 47 216 -205 7 1377 2302 75 86 0 chr2 103859740 103860089 -77887998 - MTB LTR MaLR -21 379 1 7 1377 7574 84 7 68 chr2 103860089 103861258 -77886829 - MTB-int LTR MaLR 0 1098 1 7 1377 2922 62 41 18 chr2 103861258 103861649 -77886438 - MTB LTR MaLR 0 400 1 7 1377 3012 95 116 32 chr2 103863925 103864417 -77883670 - RMER16 LTR ERVK 0 533 1 7 1377 345 325 89 0 chr2 103864445 103864568 -77883519 - LTR33 LTR ERVL -338 177 44 7 1377 1915 65 259 0 chr2 103866944 103867234 -77880853 + RLTR8 LTR ERVK 1 365 0 7 1377 808 298 84 40 chr2 103880460 103880806 -77867281 + MLT1E1 LTR MaLR 216 576 -78 7 1377 679 133 58 29 chr2 103883967 103884077 -77864010 - RMER4A LTR ERVK 0 466 358 7 1377 679 133 58 29 chr2 103884161 103884188 -77863899 - RMER4A LTR ERVK -109 357 325 7 1377 239 350 33 79 chr2 103886430 103886582 -77861505 - RMER15 LTR ERVL -7 568 424 7 1377 437 211 73 0 chr2 103888433 103888542 -77859545 - MTD LTR MaLR -30 389 273 7 1377 368 324 85 62 chr2 103899109 103899556 -77848531 + MLT1G LTR MaLR 54 518 -42 8 1377 285 309 73 0 chr2 103902758 103902868 -77845219 - RMER15 LTR ERVL -36 539 422 8 1377 2350 132 24 47 chr2 103904320 103904743 -77843344 - MTC LTR MaLR -8 413 1 8 1377 694 298 106 35 chr2 103906107 103906574 -77841513 - MuLV-int LTR ERV1 -3210 4396 3875 8 1377 351 323 19 69 chr2 103907265 103907341 -77840746 + MuRRS4-int LTR ERV1 1250 1326 -3737 8 1377 2752 44 24 0 chr2 103907341 103907619 -77840468 + ORR1A0 LTR MaLR 1 278 -68 8 1377 2752 44 24 0 chr2 103907640 103907699 -77840388 + ORR1A0 LTR MaLR 279 344 -2 8 1377 351 331 37 71 chr2 103907699 103907972 -77840115 + MuRRS4-int LTR ERV1 1327 1842 -5936 8 1377 389 321 147 26 chr2 103918290 103918603 -77829484 - MLT1E2 LTR MaLR -8 619 269 8 1377 820 248 187 19 chr2 103920197 103920616 -77827471 - RMER5 LTR ERV1 -7 527 39 8 1377 26102 28 6 14 chr2 103928040 103931140 -77816947 + MMETn-int LTR ERVK 1770 4844 0 8 1377 2891 9 0 0 chr2 103931140 103931462 -77816625 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 322 0 8 1377 1072 328 57 48 chr2 103932274 103933546 -77814541 - MuLV-int LTR ERV1 -4327 3274 1990 8 1377 494 306 38 51 chr2 103933786 103934130 -77813957 - MuLV-int LTR ERV1 -5936 1842 1250 8 1377 371 325 146 25 chr2 103938404 103938720 -77809367 - MLT1E2 LTR MaLR -5 622 269 8 1378 978 248 187 19 chr2 103949068 103949487 -77798600 - RMER5 LTR ERV1 -7 527 39 8 1378 305 268 0 0 chr2 103960774 103960845 -77787242 + ORR1E LTR MaLR 53 123 -236 9 1378 1816 151 84 71 chr2 103966911 103967122 -77780965 + RMER10B LTR ERVL 1 228 -170 9 1378 1816 151 84 71 chr2 103967328 103967508 -77780579 + RMER10B LTR ERVL 229 397 -1 9 1378 858 263 85 48 chr2 103968461 103968756 -77779331 - MLT1A1 LTR MaLR -92 316 11 9 1378 348 324 73 59 chr2 103975854 103976074 -77772013 + ORR1E LTR MaLR 72 294 -65 9 1378 320 245 48 29 chr2 103977118 103977223 -77770864 + ORR1E LTR MaLR 250 366 -13 9 1378 1849 154 56 51 chr2 103978778 103978901 -77769186 - ORR1C2 LTR MaLR -7 377 252 9 1378 1849 154 56 51 chr2 103978930 103979181 -77768906 - ORR1C2 LTR MaLR -133 251 3 9 1378 8386 17 0 4 chr2 103980075 103981008 -77767079 - RLTR13B3 LTR ERVK 0 929 1 9 1378 324 324 67 27 chr2 103981698 103981847 -77766240 - MLT1C LTR MaLR -4 463 232 9 1378 232 317 48 29 chr2 103981886 103981990 -77766097 - MLT1C LTR MaLR -290 118 13 9 1378 566 290 30 44 chr2 103982019 103982268 -77765819 + ORR1E LTR MaLR 90 379 0 9 1378 341 300 225 11 chr2 103984797 103984979 -77763108 + MLT1M LTR MaLR 33 253 -419 9 1378 696 254 203 64 chr2 103990491 103990822 -77757265 - MLT1A0 LTR MaLR -6 461 8 9 1378 236 309 24 24 chr2 103991837 103991920 -77756167 + ORR1D1 LTR MaLR 1 83 -291 9 1378 299 313 40 20 chr2 104003504 104003605 -77744482 + ORR1E LTR MaLR 79 181 -178 7 1378 236 325 121 0 chr2 104003618 104003701 -77744386 + ORR1E LTR MaLR 287 379 0 7 1378 325 263 13 13 chr2 104003956 104004033 -77744054 + MamGypLTR1a LTR Gypsy 663 739 -45 8 1378 336 240 228 51 chr2 104008448 104008606 -77739481 + LTR82A LTR ERVL 94 279 -593 1 1378 415 277 77 42 chr2 104008632 104008775 -77739312 + LTR82A LTR ERVL 396 543 -329 1 1378 2190 150 96 13 chr2 104009559 104009945 -77738142 + MTC LTR MaLR 1 418 -3 1 1378 551 223 8 8 chr2 104011371 104011493 -77736594 + MTC LTR MaLR 300 421 0 2 1378 1372 254 44 20 chr2 104013093 104013498 -77734589 - MTD LTR MaLR -2 417 3 2 1378 719 283 82 56 chr2 104015880 104016258 -77731829 + MLT1B LTR MaLR 3 390 0 3 1378 1509 178 75 33 chr2 104018907 104019238 -77728849 - MTD LTR MaLR 0 419 75 3 1378 2255 144 31 16 chr2 104019242 104019639 -77728448 - ORR1A2 LTR MaLR -8 411 1 3 1378 291 261 91 53 chr2 104019840 104020071 -77728016 + MLT1L LTR MaLR 251 608 -2 3 1378 390 314 153 6 chr2 104021419 104021595 -77726492 + LTR16A LTR ERVL 179 380 -71 4 1378 1080 243 95 48 chr2 104022774 104023132 -77724955 + MTEb LTR MaLR 4 378 -1 4 1378 2435 250 128 13 chr2 104023148 104023850 -77724237 + MTEb-int LTR MaLR 17 799 -781 4 1378 3595 108 81 6 chr2 104029850 104030392 -77717695 - RMER4B LTR ERVK 0 585 3 5 1378 616 318 150 31 chr2 104034229 104034642 -77713445 + MLT1K LTR MaLR 132 593 -2 6 1378 5351 128 86 0 chr2 104035044 104035926 -77712161 + RMER17B LTR ERVK 1 958 0 6 1378 1064 278 74 43 chr2 104036610 104037027 -77711060 - MER74A LTR ERVL -52 506 77 6 1378 1263 169 127 172 chr2 104039905 104040306 -77707781 + ORR1C2 LTR MaLR 2 384 0 7 1378 502 204 0 53 chr2 104040405 104040519 -77707568 + MLT1A1 LTR MaLR 293 400 -8 7 1378 1283 200 163 6 chr2 104041676 104042008 -77706079 + ORR1B1 LTR MaLR 3 386 -8 7 1378 1821 153 77 22 chr2 104043757 104044158 -77703929 + RMER17C LTR ERVK 1 410 0 7 1378 256 345 68 34 chr2 104044809 104044956 -77703131 - LTR89 LTR ERVL? -137 742 591 8 1378 1001 150 66 57 chr2 104046643 104046855 -77701232 + RMER15 LTR ERVL 283 496 -79 8 1378 651 318 120 37 chr2 104051551 104051933 -77696154 + MLT1H2 LTR MaLR 72 485 -4 8 1378 705 317 109 11 chr2 104060584 104060868 -77687219 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 54 1 1378 3168 63 5 2 chr2 104062588 104062983 -77685104 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1378 895 132 0 53 chr2 104065715 104065867 -77682220 + MTD LTR MaLR 1 144 -275 1 1379 1402 225 43 0 chr2 104077885 104078209 -77669878 + MLT1B LTR MaLR 2 339 -51 1 1379 2063 131 95 6 chr2 104081707 104082045 -77666042 + ORR1B1 LTR MaLR 27 394 0 1 1379 580 290 103 45 chr2 104085647 104085871 -77662216 + MLT1K LTR MaLR 30 266 -329 1 1379 305 297 70 13 chr2 104086266 104086423 -77661664 + MLT1K LTR MaLR 401 566 -29 1 1379 283 248 143 17 chr2 104089761 104089880 -77658207 + RLTR12B LTR ERVK 138 271 -257 1 1379 1798 199 27 37 chr2 104103716 104104092 -77643995 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 3 1 1379 3334 26 22 213 chr2 104104515 104105101 -77642986 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 474 -1 1 1379 489 339 86 32 chr2 104107244 104107678 -77640409 + MLT1G1 LTR MaLR 3 504 -75 1 1379 682 281 149 83 chr2 104109390 104109906 -77638181 + MLT1F2 LTR MaLR 10 559 -1 1 1379 284 178 0 0 chr2 104111147 104111192 -77636895 - MT2B LTR ERVL -556 45 1 1 1379 1755 77 8 0 chr2 104113712 104113946 -77634141 + MTB_Mm LTR MaLR 1 236 -171 2 1379 342 106 0 0 chr2 104113945 104113992 -77634095 + MTB_Mm LTR MaLR 354 400 0 2 1379 573 198 99 43 chr2 104114312 104114473 -77633614 - MTD LTR MaLR -2 419 243 2 1379 1092 219 84 4 chr2 104114968 104115207 -77632880 - MTD LTR MaLR -161 258 1 2 1379 747 255 176 29 chr2 104115967 104116274 -77631813 + ORR1E LTR MaLR 6 357 -2 2 1379 395 261 17 35 chr2 104116650 104116765 -77631322 - ORR1E LTR MaLR -246 113 1 2 1379 1018 286 71 0 chr2 104121323 104121603 -77626484 + ORR1D2 LTR MaLR 71 370 0 2 1379 225 262 119 0 chr2 104134531 104134615 -77613472 + MER110A LTR ERV1 232 325 -143 2 1379 1329 155 53 203 chr2 104146674 104146818 -77601269 - ORR1C1 LTR MaLR -12 355 266 2 1379 1421 155 53 203 chr2 104146951 104147219 -77600868 - ORR1C1 LTR MaLR -98 280 5 2 1379 358 359 36 75 chr2 104150620 104150951 -77597136 + MLT1J1 LTR MaLR 1 318 -126 2 1379 376 315 83 130 chr2 104151250 104151508 -77596579 + ORR1E LTR MaLR 10 247 -112 2 1379 376 315 83 130 chr2 104151569 104151671 -77596416 + ORR1E LTR MaLR 248 353 -6 2 1379 323 264 53 32 chr2 104151681 104151775 -77596312 + MLT1J1 LTR MaLR 279 374 0 2 1379 228 348 82 61 chr2 104153603 104153750 -77594337 - RLTR1 LTR ERV1 -293 331 182 2 1379 300 208 160 0 chr2 104157142 104157156 -77590931 + ORR1A3-int LTR MaLR 585 703 -1256 2 1379 651 68 23 0 chr2 104157156 104157244 -77590843 + MT2B LTR ERVL 1 90 -511 2 1379 1093 110 0 0 chr2 104157235 104157390 -77590697 + MT2B LTR ERVL 424 578 -23 2 1379 248 348 70 26 chr2 104157941 104158056 -77590031 + MamGypLTR1b LTR Gypsy 661 780 -2 3 1379 249 200 0 0 chr2 104165098 104165148 -77582939 - RMER15 LTR ERVL -105 470 421 3 1379 226 281 15 15 chr2 104165334 104165399 -77582688 - MTEb LTR MaLR -21 358 294 3 1379 237 277 9 168 chr2 104170363 104170476 -77577611 + MTEa LTR MaLR 217 311 -68 3 1379 873 269 128 42 chr2 104171935 104172272 -77575815 + MTEb LTR MaLR 1 366 -13 3 1379 602 304 90 12 chr2 104181429 104181685 -77566402 + MTD LTR MaLR 1 276 -143 3 1379 308 322 57 57 chr2 104188601 104188831 -77559256 - ORR1E LTR MaLR -129 230 1 3 1379 288 265 9 67 chr2 104189212 104189317 -77558770 + MTEa LTR MaLR 1 99 -280 3 1379 522 335 26 20 chr2 104189672 104189757 -77558330 + MLT1F LTR MaLR 41 128 -420 3 1379 2306 122 0 9 chr2 104189757 104190089 -77557998 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 3 1379 583 304 61 65 chr2 104190089 104190460 -77557627 + MLT1F LTR MaLR 129 545 -3 3 1379 1585 216 84 18 chr2 104190943 104191335 -77556752 + MTD LTR MaLR 2 419 0 3 1379 936 216 24 63 chr2 104192581 104192833 -77555254 + MTD LTR MaLR 41 282 -137 3 1379 740 224 29 6 chr2 104192830 104193005 -77555082 + MTE-int LTR MaLR 223 401 -1179 3 1379 481 217 238 21 chr2 104194498 104194691 -77553396 + MLT2B4 LTR ERVL 5 239 -317 3 1380 1096 308 78 24 chr2 104205129 104205539 -77542548 + MER70A LTR ERVL 20 451 -21 3 1380 850 257 62 124 chr2 104206160 104206564 -77541523 - MTE2a LTR MaLR 0 379 1 3 1380 347 250 22 43 chr2 104212352 104212444 -77535643 + MTEa LTR MaLR 3 92 -287 3 1380 298 315 65 61 chr2 104212504 104212751 -77535336 + MTEa LTR MaLR 77 324 -35 3 1380 233 167 0 0 chr2 104219028 104219070 -77529017 + LTR85a LTR Gypsy? 519 560 -142 4 1380 3212 174 130 42 chr2 104222692 104223510 -77524577 - RMER19B LTR ERVK -12 890 1 4 1380 3132 58 8 2 chr2 104228730 104229125 -77518962 - MTB LTR MaLR 0 400 4 4 1380 3133 131 107 11 chr2 104239972 104240506 -77507581 + RMER4B LTR ERVK 1 585 0 4 1380 843 223 94 16 chr2 104280711 104280902 -77467185 + MTD LTR MaLR 1 206 -213 5 1380 1071 247 79 32 chr2 104286166 104286509 -77461578 + ORR1D2 LTR MaLR 1 359 -11 5 1380 248 252 92 75 chr2 104293129 104293249 -77454838 - MT2B LTR ERVL -323 278 157 5 1380 658 216 159 0 chr2 104299951 104300127 -77447960 + MTD LTR MaLR 208 411 -8 5 1380 2407 78 19 0 chr2 104303110 104303431 -77444656 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 5 1380 235 337 56 44 chr2 104316158 104316248 -77431839 + MLT1A1 LTR MaLR 238 328 -80 6 1380 1122 165 62 47 chr2 104317662 104317936 -77430151 - RMER15 LTR ERVL 0 575 298 6 1380 487 135 74 90 chr2 104317962 104318084 -77430003 - RMER15 LTR ERVL -362 213 94 6 1380 3014 23 0 9 chr2 104319831 104320180 -77427907 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 6 1381 402 292 52 47 chr2 104340070 104340282 -77407805 - RMER5 LTR ERV1 -57 477 265 7 1381 341 209 55 0 chr2 104340850 104340941 -77407146 - RMER5 LTR ERV1 -248 286 191 7 1381 951 226 98 85 chr2 104341713 104342183 -77405904 - RLTR12B LTR ERVK -12 516 41 7 1381 1084 187 80 61 chr2 104345475 104345737 -77402350 + RLTR20A2 LTR ERVK 1 267 -311 7 1381 2556 123 36 33 chr2 104347293 104347713 -77400374 - MTC LTR MaLR 0 421 1 7 1381 3954 90 48 4 chr2 104348859 104349416 -77398671 - MT2B2 LTR ERVL -2 582 1 7 1381 443 244 26 19 chr2 104350565 104350711 -77397376 + MLT1F1 LTR MaLR 436 588 -3 7 1381 1884 165 62 17 chr2 104351261 104351618 -77396469 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 2 7 1381 1787 224 120 15 chr2 104351619 104352085 -77396002 - ORR1D1-int LTR MaLR 0 1370 856 7 1381 397 304 35 0 chr2 104353376 104353491 -77394596 - ORR1D1-int LTR MaLR -504 866 748 7 1381 2387 255 55 99 chr2 104353661 104354041 -77394046 - ORR1D1-int LTR MaLR -611 898 541 7 1381 2387 209 48 72 chr2 104354226 104354487 -77393600 - ORR1D1-int LTR MaLR -828 542 299 7 1381 2387 209 48 72 chr2 104354669 104354967 -77393120 - ORR1D1-int LTR MaLR -1072 298 3 7 1381 1483 199 41 21 chr2 104354967 104355305 -77392782 - ORR1D1 LTR MaLR -29 345 1 7 1381 709 221 32 48 chr2 104356311 104356644 -77391443 + RMER2 LTR ERV1 2 428 -139 7 1381 1355 183 132 61 chr2 104357673 104358051 -77390036 - MTD LTR MaLR -14 405 1 7 1381 305 160 77 39 chr2 104362146 104362224 -77385863 - RLTR25B LTR ERVK -519 509 429 7 1381 238 250 84 53 chr2 104363516 104363647 -77384440 + RMER10A LTR ERVL 127 261 -181 7 1381 285 191 110 73 chr2 104363755 104363919 -77384168 + RMER10A LTR ERVL 258 427 -15 7 1381 1909 171 31 82 chr2 104364264 104364609 -77383478 + ORR1B1 LTR MaLR 1 343 -51 8 1381 1909 171 31 82 chr2 104364788 104364857 -77383230 + ORR1B1 LTR MaLR 344 394 0 8 1381 501 285 111 111 chr2 104366605 104366678 -77381409 - MTE2b LTR MaLR 0 379 305 8 1381 699 256 196 29 chr2 104366828 104367133 -77380954 - MTE2b LTR MaLR -58 321 1 8 1381 1342 242 151 55 chr2 104375456 104375967 -77372120 - MT2B LTR ERVL -41 560 1 8 1381 284 255 0 117 chr2 104377356 104377467 -77370620 - MT2B LTR ERVL -343 258 161 8 1381 1503 130 20 4 chr2 104383089 104383336 -77364751 + MTC LTR MaLR 1 251 -170 8 1381 4470 132 16 25 chr2 104383336 104384099 -77363988 - RMER6A LTR ERVK 0 756 1 8 1381 245 250 43 14 chr2 104386519 104386588 -77361499 - LTR16A LTR ERVL -357 94 24 8 1381 263 290 0 0 chr2 104387732 104387794 -77360293 - MLT1J LTR MaLR -318 194 133 8 1381 269 304 81 86 chr2 104388454 104388652 -77359435 + RMER2 LTR ERV1 371 567 0 8 1381 1653 144 198 3 chr2 104395562 104395895 -77352192 + RMER10B LTR ERVL 1 398 0 9 1381 408 212 20 10 chr2 104398591 104398691 -77349396 + RMER15 LTR ERVL 370 470 -105 9 1381 315 214 0 0 chr2 104398787 104398857 -77349230 + ORR1D1 LTR MaLR 301 370 -4 9 1381 244 91 0 43 chr2 104399033 104399079 -77349008 - ORR1D2 LTR MaLR -29 341 298 9 1381 3796 148 35 19 chr2 104399134 104399815 -77348272 + RLTR17 LTR ERVK 1 692 0 9 1381 3012 49 0 0 chr2 104400758 104401149 -77346938 + MTB LTR MaLR 10 400 0 9 1381 571 231 173 0 chr2 104401640 104401813 -77346274 + MTEa LTR MaLR 68 270 -109 9 1381 314 146 0 18 chr2 104403165 104403221 -77344866 - RMER10B LTR ERVL -2 396 342 9 1381 978 191 21 21 chr2 104403511 104403745 -77344342 - RMER10B LTR ERVL -136 262 29 9 1381 361 61 0 0 chr2 104403745 104403794 -77344293 + RMER17A LTR ERVK 1 49 -702 9 1381 1017 122 25 50 chr2 104403763 104403962 -77344125 + RMER17A LTR ERVK 558 751 0 9 1381 231 83 0 27 chr2 104403962 104403997 -77344090 - RMER10B LTR ERVL -364 34 1 9 1381 1615 234 27 7 chr2 104404160 104404564 -77343523 - MTD LTR MaLR -14 405 4 9 1381 954 124 7 0 chr2 104408100 104408253 -77339834 - RMER19B LTR ERVK -5 897 744 9 1381 2660 188 31 94 chr2 104408243 104408882 -77339205 - RMER19B LTR ERVK -294 608 10 9 1381 249 317 135 40 chr2 104409074 104409102 -77338985 - RMER19B LTR ERVK -578 33 3 9 1381 3369 167 64 5 chr2 104410726 104411303 -77336784 + RMER19C LTR ERVK 1 611 0 9 1381 342 250 50 0 chr2 104416575 104416675 -77331412 - MTE2b LTR MaLR -110 269 165 9 1381 1053 228 81 124 chr2 104417322 104417692 -77330395 + MTE2b LTR MaLR 16 369 -10 1 1381 2102 135 33 11 chr2 104418061 104418420 -77329667 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 1 1381 738 266 115 72 chr2 104423332 104423749 -77324338 + RLTR28B LTR ERVL 9 443 -38 1 1381 930 159 84 18 chr2 104426577 104426798 -77321289 + MTC LTR MaLR 47 303 -118 1 1381 1451 194 50 52 chr2 104428712 104429309 -77318778 + RLTR24 LTR ERV1 3 529 0 1 1381 231 167 48 0 chr2 104448605 104448647 -77299440 - MT2B LTR ERVL -309 292 249 1 1381 880 139 162 15 chr2 104456194 104456391 -77291696 + RMER6A LTR ERVK 3 228 -233 1 1381 1968 196 56 23 chr2 104456416 104456859 -77291228 + RMER6A LTR ERVK 293 750 -6 1 1381 287 191 64 160 chr2 104458406 104458531 -77289556 - MT2B LTR ERVL -344 257 145 1 1382 305 296 0 94 chr2 104486372 104486499 -77261588 - MT2B LTR ERVL -305 296 182 1 1382 1236 209 278 2 chr2 104496578 104496996 -77251091 - MT2A LTR ERVL 0 533 1 1 1382 478 264 98 127 chr2 104510520 104510928 -77237159 + RLTR11B LTR ERVK 1 453 -75 3 1382 354 278 154 70 chr2 104511075 104511132 -77236955 + RLTR11B LTR ERVK 454 508 -20 3 1382 2271 145 94 14 chr2 104511945 104512372 -77235715 + RMER4A LTR ERVK 6 466 0 3 1382 8223 201 86 53 chr2 104512372 104514561 -77233526 + MurERV4-int LTR ERVK 1 2261 -2999 3 1382 325 288 128 87 chr2 104514608 104514996 -77233091 - RLTR11A2 LTR ERVK -18 509 126 3 1382 2390 94 10 102 chr2 104515041 104515344 -77232743 + RLTR8 LTR ERVK 1 267 -98 3 1382 2390 94 10 102 chr2 104515480 104515578 -77232509 + RLTR8 LTR ERVK 268 365 0 3 1382 1629 201 9 35 chr2 104515612 104515922 -77232165 + MurERV4-int LTR ERVK 2245 2551 -2709 3 1382 1629 201 9 35 chr2 104516750 104516784 -77231303 + MurERV4-int LTR ERVK 2552 2580 -2680 3 1382 538 177 22 197 chr2 104516930 104517113 -77230974 + MurERV4-int LTR ERVK 2556 2706 -2554 3 1382 3479 122 24 1 chr2 104517116 104517171 -77230916 + RMER12B LTR ERVK 9 106 -1298 4 1382 3479 147 60 10 chr2 104517194 104517772 -77230315 + RMER12B LTR ERVK 107 714 -690 4 1382 3396 142 64 14 chr2 104517931 104518509 -77229578 + MurERV4-int LTR ERVK 4570 5176 -84 3 1382 5298 187 45 16 chr2 104519379 104520434 -77227653 + MurERV4-int LTR ERVK 1246 2331 -2929 4 1382 1297 164 79 38 chr2 104520454 104520720 -77227367 + RMER4A LTR ERVK 188 464 -2 4 1382 263 252 81 94 chr2 104523696 104523738 -77224349 - MT2B2 LTR ERVL -423 161 122 5 1382 425 196 92 10 chr2 104523748 104523846 -77224241 + MTD LTR MaLR 14 119 -300 5 1382 1258 181 120 4 chr2 104523955 104524221 -77223866 + MTD LTR MaLR 123 419 0 5 1382 547 201 142 103 chr2 104531034 104531122 -77216965 + MTC LTR MaLR 253 353 -68 7 1382 547 201 142 103 chr2 104531309 104531375 -77216712 + MTC LTR MaLR 354 413 -8 7 1382 6696 154 45 25 chr2 104531378 104532610 -77215477 + MTC-int LTR MaLR 2 1258 0 7 1382 396 108 62 0 chr2 104532610 104532675 -77215412 + MTC LTR MaLR 1 69 -352 7 1382 2188 123 15 6 chr2 104534480 104534814 -77213273 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 337 0 8 1382 1441 47 0 0 chr2 104534824 104534996 -77213091 + RLTR10-int LTR ERVK 41 212 -1775 8 1382 351 158 38 95 chr2 104535021 104535126 -77212961 + RLTR10 LTR ERVK 292 390 0 8 1382 4273 48 0 4 chr2 104535126 104535753 -77212334 + RLTR10-int LTR ERVK 302 998 -989 8 1382 359 266 39 15 chr2 104535817 104535947 -77212140 + RLTR10-int LTR ERVK 1462 1594 -5987 8 1382 8994 20 2 0 chr2 104536029 104537022 -77211065 + RLTR10-int LTR ERVK 990 1984 -3 8 1382 2621 47 6 208 chr2 104537024 104537510 -77210577 + RLTR10 LTR ERVK 1 388 -2 8 1382 1718 259 68 127 chr2 104543561 104544188 -77203899 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1 602 -1246 1 1382 1718 259 68 127 chr2 104544368 104544389 -77203698 + RLTR22_Mur LTR ERVK 603 608 -1240 1 1382 1718 259 68 127 chr2 104544561 104544741 -77203346 + RLTR22_Mur LTR ERVK 609 781 -1067 1 1382 781 314 56 56 chr2 104544809 104545086 -77203001 + RLTR22_Mus LTR ERVK 1145 1431 -377 1 1382 781 251 336 53 chr2 104545277 104545534 -77202553 + RLTR22_Mus LTR ERVK 1432 1539 -269 1 1382 1817 168 75 28 chr2 104548623 104549099 -77198988 + RLTR20D LTR ERVK 6 568 0 1 1382 606 300 18 93 chr2 104549871 104550150 -77197937 + MTE2b LTR MaLR 1 258 -121 1 1382 1470 172 107 163 chr2 104553055 104553187 -77194900 - RMER4A LTR ERVK -9 457 348 1 1382 1470 172 107 163 chr2 104553333 104553635 -77194452 - RMER4A LTR ERVK -119 347 44 1 1382 1470 172 107 163 chr2 104553972 104554014 -77194073 - RMER4A LTR ERVK -423 43 7 1 1382 4036 108 32 2 chr2 104556405 104556972 -77191115 - MT2B2 LTR ERVL 0 584 1 1 1382 1005 121 337 11 chr2 104564404 104564670 -77183417 + RMER4A LTR ERVK 115 466 0 1 1382 329 200 0 126 chr2 104574766 104574869 -77173218 - MT2B LTR ERVL -360 241 152 2 1382 303 191 43 29 chr2 104575667 104575737 -77172350 + RMER15 LTR ERVL 39 109 -466 2 1382 1372 147 153 33 chr2 104583903 104584268 -77163819 - RMER17C LTR ERVK 0 410 2 2 1382 1133 179 202 3 chr2 104586524 104586821 -77161266 + MTC LTR MaLR 66 421 0 2 1382 279 298 53 11 chr2 104591923 104592018 -77156069 - MLT1B LTR MaLR -67 323 225 2 1383 3744 10 5 0 chr2 104615477 104615871 -77132216 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 1383 3352 63 8 0 chr2 104621395 104621792 -77126295 - MTB LTR MaLR 0 400 1 3 1383 2213 175 81 32 chr2 104622987 104623482 -77124605 + RLTR28 LTR ERVL 6 524 0 3 1383 2141 158 48 0 chr2 104624667 104625040 -77123047 + RMER4A LTR ERVK 32 422 -44 3 1383 303 214 16 16 chr2 104626281 104626301 -77121786 + ORR1B1-int LTR MaLR 627 646 -863 3 1383 352 256 76 83 chr2 104626341 104626486 -77121601 + RLTR25B LTR ERVK 441 584 -444 3 1383 7681 163 37 29 chr2 104631649 104633111 -77114976 - MurERV4-int LTR ERVK -2333 2927 1454 3 1383 1715 250 36 38 chr2 104633120 104633346 -77114741 - MurERV4-int LTR ERVK -4293 967 754 3 1383 1715 250 36 38 chr2 104633527 104633745 -77114342 - MurERV4-int LTR ERVK -4507 753 524 3 1383 2115 104 19 7 chr2 104633748 104634057 -77114030 + ORR1A2 LTR MaLR 15 327 0 3 1383 314 259 0 12 chr2 104634057 104634139 -77113948 - MurERV4-int LTR ERVK -4741 519 439 3 1383 795 224 99 46 chr2 104638219 104638542 -77109545 + RLTR15 LTR ERVK 1 340 -19 4 1383 853 236 137 80 chr2 104638900 104639237 -77108850 - MTE2a LTR MaLR -2 377 22 4 1383 3218 58 5 48 chr2 104641094 104641323 -77106764 - MTB LTR MaLR 0 400 191 4 1383 3218 58 5 48 chr2 104641470 104641656 -77106431 - MTB LTR MaLR -210 190 3 4 1383 633 209 38 15 chr2 104642020 104642151 -77105936 + MTD LTR MaLR 12 145 -274 4 1383 685 277 74 5 chr2 104642166 104642355 -77105732 + MTD LTR MaLR 200 401 -18 4 1383 1990 160 19 96 chr2 104643200 104643326 -77104761 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 278 4 1383 1990 160 19 96 chr2 104643422 104643723 -77104364 - MTB_Mm LTR MaLR -130 277 13 4 1383 456 257 280 20 chr2 104648148 104648395 -77099692 + MTEb LTR MaLR 54 364 -15 4 1383 332 240 0 152 chr2 104654277 104654294 -77093793 + MT2B LTR ERVL 177 272 -329 4 1383 301 272 97 56 chr2 104663573 104663717 -77084370 - MLT1D LTR MaLR -287 218 69 4 1383 1489 219 100 46 chr2 104664192 104664541 -77083546 + ORR1D2 LTR MaLR 3 370 0 4 1383 603 295 62 125 chr2 104665222 104665315 -77082772 + MER77 LTR ERVL 22 103 -504 4 1383 603 295 62 125 chr2 104665519 104665681 -77082406 + MER77 LTR ERVL 104 261 -346 4 1383 539 261 66 31 chr2 104665704 104665960 -77082127 - MTEb LTR MaLR -10 369 8 4 1383 281 275 101 63 chr2 104666315 104666474 -77081613 - RLTR12B LTR ERVK -199 329 165 4 1383 2239 138 42 0 chr2 104666594 104666949 -77081138 + ORR1B1 LTR MaLR 4 373 -21 4 1383 940 126 0 0 chr2 104696972 104697115 -77050972 + RMER10A LTR ERVL 1 143 -299 5 1383 270 271 107 34 chr2 104697948 104698097 -77049990 + RMER15 LTR ERVL 409 568 -7 5 1383 338 235 9 113 chr2 104699110 104699225 -77048862 + MT2B LTR ERVL 155 257 -344 6 1383 3100 61 13 0 chr2 104703039 104703431 -77044656 - MTB LTR MaLR -3 397 1 6 1383 1709 236 77 37 chr2 104703964 104704509 -77043578 - RMER2 LTR ERV1 0 567 1 6 1383 3049 138 124 24 chr2 104705401 104705951 -77042136 + RMER19C LTR ERVK 3 607 -4 6 1383 3860 164 80 65 chr2 104707278 104708156 -77039931 + RMER19B LTR ERVK 1 891 -11 6 1383 446 88 0 14 chr2 104711153 104711222 -77036865 + LTRIS2 LTR ERV1 418 485 -79 6 1383 1368 190 137 19 chr2 104712511 104712870 -77035217 - MTD LTR MaLR -16 403 3 6 1383 268 194 0 0 chr2 104718370 104718432 -77029655 + MLT1N2 LTR MaLR 463 524 -38 6 1383 998 118 504 4 chr2 104722532 104722788 -77025299 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 6 1383 868 119 0 8 chr2 104724563 104724690 -77023397 + MTC LTR MaLR 296 421 0 6 1384 339 299 46 99 chr2 104730108 104730150 -77017937 - MT2B LTR ERVL -449 152 119 7 1384 801 289 42 39 chr2 104738753 104739109 -77008978 - ORR1E LTR MaLR 0 359 3 7 1384 289 258 121 22 chr2 104742353 104742444 -77005643 + MTD LTR MaLR 1 100 -319 7 1384 1413 251 162 16 chr2 104742447 104742942 -77005145 - RMER2 LTR ERV1 0 567 1 7 1384 508 235 148 16 chr2 104742942 104743196 -77004891 + MTD LTR MaLR 99 419 0 7 1384 579 217 207 17 chr2 104748168 104748346 -76999741 + MTD LTR MaLR 98 309 -110 7 1384 751 194 91 59 chr2 104748825 104749011 -76999076 + MTC LTR MaLR 1 192 -229 7 1384 1250 202 214 7 chr2 104753225 104753534 -76994553 + MTD LTR MaLR 47 419 0 7 1384 268 357 42 0 chr2 104754258 104754401 -76993686 + MLT1L LTR MaLR 138 286 -324 7 1384 381 302 110 38 chr2 104757169 104757461 -76990626 - MER110 LTR ERV1 -18 473 161 7 1384 338 290 78 50 chr2 104758914 104759132 -76988955 - MER110-int LTR ERV1 -2594 2053 1830 7 1384 552 150 28 152 chr2 104768668 104768911 -76979176 - RMER17C LTR ERVK -402 487 98 7 1384 1564 192 47 55 chr2 104771469 104771850 -76976237 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 7 1384 376 247 0 110 chr2 104773958 104774058 -76974029 - MT2B LTR ERVL -361 240 152 8 1384 299 277 0 122 chr2 104781984 104782012 -76966075 - MT2B LTR ERVL -444 157 143 8 1384 402 240 9 80 chr2 104790994 104791107 -76956980 - MT2B LTR ERVL -344 257 153 8 1384 1352 260 27 21 chr2 104792504 104792838 -76955249 - MTE2a LTR MaLR 0 379 44 8 1384 661 210 51 0 chr2 104792850 104792988 -76955099 + MTD LTR MaLR 267 411 -8 8 1384 360 174 55 15 chr2 104793080 104793167 -76954920 + MTC LTR MaLR 1 91 -316 8 1384 1578 153 58 58 chr2 104800570 104800625 -76947462 - MTC LTR MaLR -8 413 367 8 1384 1578 153 58 58 chr2 104800848 104801104 -76946983 - MTC LTR MaLR -55 366 102 8 1384 246 264 78 92 chr2 104801452 104801594 -76946493 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK -100 267 128 8 1384 684 165 0 0 chr2 104801507 104801610 -76946477 - MTC LTR MaLR -318 103 1 8 1384 422 355 96 37 chr2 104810352 104810522 -76937565 - LTR33 LTR ERVL -24 491 317 8 1384 5230 137 42 64 chr2 104810522 104811444 -76936643 - RMER19B LTR ERVK 0 902 1 8 1384 422 355 96 37 chr2 104811444 104811545 -76936542 - LTR33 LTR ERVL -199 316 205 8 1384 462 193 0 0 chr2 104817037 104817120 -76930967 + MTC LTR MaLR 11 93 -326 8 1384 909 171 74 6 chr2 104817119 104817295 -76930792 + MTC LTR MaLR 234 421 0 8 1384 840 233 169 5 chr2 104826030 104826333 -76921754 + MTD LTR MaLR 8 382 -39 9 1384 403 304 31 111 chr2 104833013 104833122 -76914965 - MT2B LTR ERVL -440 161 71 9 1384 258 214 62 31 chr2 104845739 104845869 -76902218 + RMER17C LTR ERVK 141 274 -136 9 1385 1486 204 68 6 chr2 104858021 104858361 -76889726 + MTD LTR MaLR 59 419 0 9 1385 2104 168 90 5 chr2 104859199 104859587 -76888500 - MTC LTR MaLR 0 421 1 9 1385 344 294 120 16 chr2 104860640 104860823 -76887264 + MLT1J LTR MaLR 307 508 -4 9 1385 263 299 72 72 chr2 104861497 104861663 -76886424 - MLT2B3 LTR ERVL 0 554 389 9 1385 336 358 67 48 chr2 104863470 104863784 -76884303 + MLT1J-int LTR MaLR 14 333 -1054 9 1385 317 282 32 49 chr2 104863814 104863937 -76884150 - MLT1A1 LTR MaLR -2 406 286 9 1385 374 286 0 0 chr2 104864199 104864304 -76883783 - LTR40b LTR ERVL -262 200 96 9 1385 1913 165 25 17 chr2 104864798 104865154 -76882933 + MTC LTR MaLR 1 359 -62 9 1385 932 151 21 113 chr2 104865154 104865393 -76882694 + ORR1C1 LTR MaLR 1 217 -161 9 1385 1016 134 11 45 chr2 104866263 104866442 -76881645 + ORR1C1 LTR MaLR 202 374 -4 9 1385 261 250 0 0 chr2 104866438 104866490 -76881597 + MTD LTR MaLR 363 414 -5 9 1385 510 324 85 43 chr2 104875158 104875487 -76872600 + MLT1D LTR MaLR 151 493 -12 1 1385 796 335 107 41 chr2 104880644 104881151 -76866936 + MLT1H1 LTR MaLR 1 540 -15 1 1385 1296 161 19 30 chr2 104888830 104889028 -76859059 + RMER10B LTR ERVL 1 195 -203 1 1385 1296 161 19 30 chr2 104889063 104889132 -76858955 + RMER10B LTR ERVL 196 265 -133 1 1385 910 170 23 83 chr2 104889234 104889452 -76858635 + RMER10B LTR ERVL 194 398 0 1 1385 546 184 77 5 chr2 104892187 104892329 -76855758 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 204 1 1385 352 358 71 29 chr2 104895573 104895881 -76852206 - LTR16A LTR ERVL 0 451 131 1 1385 245 247 104 0 chr2 104897878 104897955 -76850132 + MTD LTR MaLR 315 399 -20 1 1385 3812 189 89 23 chr2 104901327 104902271 -76845816 - RMER19B LTR ERVK -6 896 1 1 1385 3021 67 13 10 chr2 104910447 104910842 -76837245 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 1385 253 275 142 66 chr2 104917462 104917645 -76830442 - LTR16A LTR ERVL -16 435 239 1 1385 3746 152 112 83 chr2 104921346 104922223 -76825864 - RMER19B LTR ERVK 0 902 1 1 1385 266 375 7 35 chr2 104922806 104922947 -76825140 - MLT1I LTR MaLR -204 207 71 1 1385 2021 187 203 2 chr2 104927615 104928059 -76820028 + MT2A LTR ERVL 1 533 0 1 1385 393 139 135 29 chr2 104933245 104933349 -76814738 - MTE2b LTR MaLR 0 379 265 1 1385 249 192 70 14 chr2 104933346 104933419 -76814668 - MTE2b LTR MaLR -293 77 1 1 1385 3208 144 62 15 chr2 104933682 104934230 -76813857 - RMER15 LTR ERVL -1 574 1 1 1385 231 191 97 56 chr2 104944647 104944719 -76803368 + LTR48B LTR ERV1 196 270 -374 1 1385 865 307 109 50 chr2 104945429 104945563 -76802524 - MLT1D LTR MaLR 0 505 368 1 1385 865 307 109 50 chr2 104945736 104946076 -76802011 - MLT1D LTR MaLR -138 367 1 1 1385 387 246 15 136 chr2 104946653 104946752 -76801335 - MT2B LTR ERVL -344 257 171 1 1385 387 246 15 136 chr2 104946947 104946971 -76801116 - MT2B LTR ERVL -431 170 142 1 1385 346 109 0 0 chr2 104971858 104971913 -76776174 - RMER19C LTR ERVK -556 55 1 1 1386 231 89 41 82 chr2 104991002 104991051 -76757036 - MLT1K LTR MaLR -193 402 356 1 1386 402 262 123 62 chr2 104996010 104996189 -76751898 + MLT1D LTR MaLR 1 190 -315 1 1386 275 289 0 57 chr2 104996501 104996589 -76751498 + MLT1D LTR MaLR 420 502 -3 1 1386 576 320 59 121 chr2 105007795 105008159 -76739928 - ORR1E LTR MaLR 0 379 3 1 1386 351 235 26 6 chr2 105016549 105016650 -76731437 - ORR1D1-int LTR MaLR -1860 103 3 2 1386 1418 219 124 6 chr2 105016650 105016979 -76731108 - ORR1D1 LTR MaLR -6 368 1 2 1386 1952 152 161 14 chr2 105017055 105017422 -76730665 - MTC LTR MaLR 0 421 1 2 1386 420 332 65 25 chr2 105020062 105020263 -76727824 - RMER15 LTR ERVL -4 571 363 3 1386 739 346 49 51 chr2 105021551 105021962 -76726125 - RMER15-int LTR ERVL -2852 2147 1738 3 1386 907 104 0 22 chr2 105021972 105022109 -76725978 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 196 3 1386 1277 267 118 25 chr2 105025645 105025895 -76722192 - MT2A LTR ERVL 0 533 245 4 1386 1277 267 118 25 chr2 105025932 105026112 -76721975 - MT2A LTR ERVL -289 244 63 4 1386 490 293 22 54 chr2 105026025 105026209 -76721878 - MTD LTR MaLR -241 178 1 4 1386 854 306 118 20 chr2 105027617 105028000 -76720087 - LTR41B LTR ERVL 0 758 338 4 1386 675 287 113 60 chr2 105028419 105028738 -76719349 - LTR41B LTR ERVL -422 336 1 4 1386 732 290 89 40 chr2 105029061 105029407 -76718680 + MLT1C LTR MaLR 17 388 -79 4 1386 413 336 22 7 chr2 105030195 105030333 -76717754 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 226 5 1386 496 355 48 70 chr2 105033862 105034217 -76713870 + ORR1E LTR MaLR 6 352 -7 6 1386 249 325 210 6 chr2 105035029 105035196 -76712891 + MLT1D LTR MaLR 3 203 -302 6 1386 3609 13 2 0 chr2 105037914 105038309 -76709778 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 7 1386 338 233 15 2 chr2 105041649 105041719 -76706368 + ORR1E LTR MaLR 4 73 -286 7 1386 323 289 65 177 chr2 105041766 105041780 -76706307 + ORR1E LTR MaLR 59 64 -310 7 1386 323 291 75 158 chr2 105042045 105042290 -76705797 + ORR1E LTR MaLR 51 317 -53 7 1386 292 260 205 31 chr2 105048444 105048571 -76699516 + MLT1H2 LTR MaLR 33 181 -388 9 1386 293 346 59 72 chr2 105048607 105048828 -76699259 + MLT1H2 LTR MaLR 264 481 -8 9 1386 248 338 33 100 chr2 105058879 105059119 -76688968 - MLT1J LTR MaLR -207 305 82 1 1386 1210 223 101 73 chr2 105059281 105059639 -76688448 - ORR1D2 LTR MaLR -2 368 1 1 1386 305 271 133 61 chr2 105061423 105061604 -76686483 + MLT1K LTR MaLR 400 593 -2 1 1386 936 255 111 89 chr2 105069918 105070288 -76677799 + MTE2a LTR MaLR 1 378 -1 1 1386 1550 238 50 14 chr2 105082013 105082371 -76665716 - MTE2b LTR MaLR -8 371 1 1 1386 367 332 95 48 chr2 105099922 105100153 -76647934 + MLT1H LTR MaLR 49 290 -259 1 1386 539 172 11 0 chr2 105118565 105118658 -76629429 + MTD LTR MaLR 3 96 -325 2 1386 1506 194 53 6 chr2 105119282 105119603 -76628484 + MTD LTR MaLR 84 419 0 2 1387 658 308 79 91 chr2 105120287 105120605 -76627482 + MLT1F2 LTR MaLR 15 328 -232 2 1387 760 272 77 40 chr2 105129052 105129324 -76618763 - MLT1A1 LTR MaLR -54 354 73 2 1387 534 320 48 77 chr2 105130796 105131172 -76616915 - MTEa LTR MaLR -12 367 3 2 1387 568 279 68 6 chr2 105133886 105134048 -76614039 + MTD LTR MaLR 88 259 -160 2 1387 517 374 65 9 chr2 105138859 105139091 -76608996 + LTR16C LTR ERVL 82 326 -163 2 1387 265 309 59 40 chr2 105143968 105144069 -76604018 - LTR33B LTR ERVL -301 202 100 2 1387 301 264 24 46 chr2 105144989 105145127 -76602960 + MLT1A1 LTR MaLR 242 404 -4 2 1387 1147 232 32 109 chr2 105145716 105146127 -76601960 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 2 1387 393 269 85 52 chr2 105149018 105149171 -76598916 - MLT1J1 LTR MaLR -19 425 268 2 1387 245 273 0 25 chr2 105151826 105151905 -76596182 - RMER15 LTR ERVL -163 412 336 2 1387 568 188 180 6 chr2 105152950 105153136 -76594951 + MTD LTR MaLR 201 405 -14 2 1387 375 247 11 0 chr2 105153360 105153449 -76594638 - MTD LTR MaLR -328 91 2 2 1387 324 243 0 0 chr2 105156334 105156404 -76591683 + RMER6A LTR ERVK 687 756 0 2 1387 227 236 21 73 chr2 105156455 105156551 -76591536 - MLT2B3 LTR ERVL -7 547 457 2 1387 847 288 54 22 chr2 105156930 105157127 -76590960 - MLT2B3 LTR ERVL -248 306 102 2 1387 847 288 54 22 chr2 105157177 105157256 -76590831 - MLT2B3 LTR ERVL -453 101 21 2 1387 867 145 84 0 chr2 105159212 105159378 -76588709 + ORR1B1 LTR MaLR 215 394 0 2 1387 1521 249 53 0 chr2 105159933 105160291 -76587796 + MTE2b LTR MaLR 3 379 0 2 1387 1617 163 147 3 chr2 105163072 105163254 -76584833 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 169 2 1387 1617 163 147 3 chr2 105163309 105163453 -76584634 - ORR1D1 LTR MaLR -206 168 2 2 1387 248 164 71 0 chr2 105163477 105163535 -76584552 - ORR1B2 LTR MaLR -110 284 209 2 1387 1064 282 88 24 chr2 105164623 105165033 -76583054 - MLT1C LTR MaLR 0 467 32 2 1387 281 298 26 78 chr2 105166898 105167051 -76581036 + RMER15 LTR ERVL 5 149 -426 2 1387 473 298 82 72 chr2 105171511 105171829 -76576258 - ORR1E LTR MaLR -35 324 4 3 1387 277 238 139 0 chr2 105172086 105172187 -76575900 - MLT1J LTR MaLR -34 478 364 3 1387 254 312 53 66 chr2 105179350 105179501 -76568586 + MLT1K LTR MaLR 167 315 -280 3 1387 334 319 96 69 chr2 105190074 105190315 -76557772 - ORR1E LTR MaLR -94 265 6 3 1387 3532 197 122 44 chr2 105190979 105191927 -76556160 - RMER19B LTR ERVK -12 890 1 3 1387 336 220 38 48 chr2 105195465 105195570 -76552517 + ORR1E LTR MaLR 20 123 -236 3 1387 355 284 171 73 chr2 105198307 105198581 -76549506 + MLT1K LTR MaLR 164 464 -131 3 1387 1008 243 28 41 chr2 105200881 105201199 -76546888 - RLTR15 LTR ERVK -45 314 1 3 1387 3171 149 169 131 chr2 105201199 105201586 -76546501 - MYSERV6-int LTR ERVK 0 8959 8537 3 1387 3171 149 169 131 chr2 105201638 105202187 -76545900 - MYSERV6-int LTR ERVK 0 8536 7934 3 1387 2244 248 88 57 chr2 105202750 105203013 -76545074 - MYSERV-int LTR ERVK -1837 4713 4431 3 1387 2244 248 88 57 chr2 105203191 105203833 -76544254 - MYSERV-int LTR ERVK -2120 4430 3781 3 1387 736 231 15 25 chr2 105205066 105205270 -76542817 - RLTR15 LTR ERVK -154 205 4 3 1387 517 338 112 43 chr2 105206336 105206614 -76541473 - MLT1H LTR MaLR -122 427 131 3 1387 1711 182 145 88 chr2 105206614 105207091 -76540996 + MT2A LTR ERVL 1 504 -29 3 1387 288 128 21 0 chr2 105207163 105207210 -76540877 + MLT2D LTR ERVL 513 560 0 3 1387 262 365 17 12 chr2 105207835 105208007 -76540080 - LTR16C LTR ERVL -21 468 296 3 1387 291 315 18 27 chr2 105208161 105208272 -76539815 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 299 3 1387 273 342 21 0 chr2 105208589 105208685 -76539402 + MLT1K LTR MaLR 139 253 -342 3 1387 1512 205 54 131 chr2 105209630 105210074 -76538013 + MTD LTR MaLR 8 417 -2 3 1387 411 298 48 16 chr2 105216471 105216597 -76531490 + MLT1A0 LTR MaLR 11 140 -225 3 1387 469 298 18 36 chr2 105216617 105216784 -76531303 + MLT1A0 LTR MaLR 202 365 0 3 1387 940 248 100 97 chr2 105217887 105218272 -76529815 + MTE2a LTR MaLR 1 359 0 3 1387 678 191 156 0 chr2 105221100 105221241 -76526846 + ORR1C1 LTR MaLR 1 163 -215 3 1387 611 121 22 0 chr2 105221322 105221413 -76526674 + ORR1C1 LTR MaLR 292 384 0 3 1387 527 296 132 61 chr2 105221905 105222232 -76525855 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 16 3 1387 1384 221 45 36 chr2 105224342 105224651 -76523436 + MTD LTR MaLR 100 411 -8 3 1387 2225 152 29 39 chr2 105226064 105226475 -76521612 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 3 1387 316 247 38 85 chr2 105230455 105230561 -76517526 + MT2B LTR ERVL 157 257 -344 3 1387 862 103 136 1 chr2 105231600 105231822 -76516265 + ORR1A2 LTR MaLR 75 326 0 4 1387 243 325 108 60 chr2 105233429 105233596 -76514491 + MLT1J2 LTR MaLR 265 439 -9 4 1387 2206 89 3 63 chr2 105240562 105240896 -76507191 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 6 4 1387 346 331 110 7 chr2 105241487 105241633 -76506454 + MT2A LTR ERVL 371 531 -2 4 1387 295 289 63 47 chr2 105242695 105242822 -76505265 - MLT1L LTR MaLR -363 247 119 4 1387 236 277 60 52 chr2 105246826 105247074 -76501013 - RLTR21 LTR ERVK -243 1329 1080 4 1387 260 352 11 0 chr2 105248810 105248898 -76499189 - MLT1H LTR MaLR -113 436 348 4 1387 408 246 16 71 chr2 105249295 105249422 -76498665 - RLTR15 LTR ERVK 0 359 240 4 1387 823 159 0 0 chr2 105249929 105250055 -76498032 + RMER15 LTR ERVL 450 575 0 4 1388 255 335 128 39 chr2 105256130 105256310 -76491777 + MLT1K LTR MaLR 391 586 -9 4 1388 657 300 56 63 chr2 105260080 105260181 -76487906 + MLT2B1 LTR ERVL 1 103 -417 4 1388 1857 159 99 12 chr2 105260181 105260525 -76487562 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 4 1388 657 312 84 67 chr2 105260525 105260797 -76487290 + MLT2B1 LTR ERVL 103 396 -68 4 1388 277 353 83 44 chr2 105261236 105261464 -76486623 + MLT1L LTR MaLR 208 444 -166 4 1388 403 277 109 7 chr2 105262888 105263026 -76485061 - MLT1I LTR MaLR -66 345 194 4 1388 1539 241 54 16 chr2 105263594 105263983 -76484104 - MTD LTR MaLR -14 405 15 4 1388 357 309 39 107 chr2 105270779 105271030 -76477057 + ORR1E LTR MaLR 96 357 -22 4 1388 327 239 74 40 chr2 105271655 105271803 -76476284 - RMER17D LTR ERVK -355 534 382 4 1388 323 307 184 60 chr2 105274150 105274368 -76473719 + MLT1J LTR MaLR 107 351 -161 4 1388 359 304 181 66 chr2 105276847 105277150 -76470937 + MLT1G LTR MaLR 44 381 -210 4 1388 321 278 64 101 chr2 105279115 105279303 -76468784 + MLT1A LTR MaLR 185 374 0 4 1388 385 147 0 14 chr2 105280082 105280151 -76467936 + ORR1D2 LTR MaLR 1 68 -302 4 1388 244 146 20 20 chr2 105280149 105280198 -76467889 + ORR1D2 LTR MaLR 322 370 0 4 1388 1379 185 269 18 chr2 105284903 105285238 -76462849 + MTD LTR MaLR 1 419 0 5 1388 488 293 90 59 chr2 105297890 105298222 -76449865 - ORR1E LTR MaLR -16 363 1 5 1388 633 206 111 152 chr2 105300344 105300733 -76447354 - MTEb LTR MaLR -1 378 6 5 1388 933 246 189 18 chr2 105319797 105320140 -76427947 - MTD LTR MaLR 0 419 18 5 1388 473 273 147 83 chr2 105325446 105325773 -76422314 - ORR1E LTR MaLR -11 348 1 5 1388 739 150 64 0 chr2 105325811 105325951 -76422136 - MTD LTR MaLR -64 357 209 5 1388 793 204 5 120 chr2 105326203 105326420 -76421667 - MTD LTR MaLR -224 195 4 5 1388 412 283 151 0 chr2 105334017 105334183 -76413904 - MT2A LTR ERVL -78 455 265 5 1388 563 293 149 33 chr2 105342359 105342694 -76405393 + MLT1A0 LTR MaLR 1 374 0 6 1388 533 205 8 32 chr2 105343628 105343754 -76404333 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 248 6 1388 1346 222 20 94 chr2 105345446 105345849 -76402238 + ORR1D1 LTR MaLR 1 373 -1 6 1388 301 262 12 0 chr2 105353436 105353520 -76394567 - MTD LTR MaLR -2 417 333 6 1388 1383 205 22 38 chr2 105354392 105354712 -76393375 + ORR1D1 LTR MaLR 52 366 -8 6 1388 791 296 68 104 chr2 105360163 105360556 -76387531 + MLT1D LTR MaLR 22 399 -106 6 1388 791 296 68 104 chr2 105360626 105360734 -76387353 + MLT1D LTR MaLR 400 505 0 6 1388 264 274 98 38 chr2 105372550 105372683 -76375404 - MLT1J LTR MaLR -303 209 69 6 1388 257 315 101 93 chr2 105373244 105373629 -76374458 + MER92B LTR ERV1 240 627 -9 6 1388 347 204 61 51 chr2 105374249 105374334 -76373753 - MTD LTR MaLR -8 411 326 6 1388 487 181 11 11 chr2 105374334 105374429 -76373658 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 280 6 1388 995 229 5 0 chr2 105374454 105374655 -76373432 + MTD LTR MaLR 1 202 -217 6 1388 490 182 0 20 chr2 105374660 105374761 -76373326 - MTD LTR MaLR 0 419 321 6 1388 2085 119 55 0 chr2 105374826 105375138 -76372949 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 6 1388 243 299 409 0 chr2 105375217 105375371 -76372716 + MER70B LTR ERVL 216 432 -146 6 1389 394 240 41 10 chr2 105387223 105387320 -76360767 + ORR1C1 LTR MaLR 186 285 -93 6 1389 427 181 43 20 chr2 105387713 105387849 -76360238 + ORR1C2 LTR MaLR 149 332 -52 6 1389 1439 266 63 3 chr2 105390307 105390688 -76357399 - MTD LTR MaLR -2 417 14 6 1389 2905 14 48 14 chr2 105398063 105398418 -76349669 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 7 1389 7519 93 96 23 chr2 105398428 105399620 -76348467 + IAPEz-int LTR ERVK 35 1313 -5168 7 1389 19989 19 18 0 chr2 105399619 105402834 -76345253 + IAPEz-int LTR ERVK 3210 6481 0 7 1389 2905 14 48 14 chr2 105402834 105403189 -76344898 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 7 1389 794 230 348 22 chr2 105407739 105408153 -76339934 + RMER15 LTR ERVL 27 575 0 7 1389 334 284 106 48 chr2 105408872 105409079 -76339008 + MLT1G LTR MaLR 28 246 -309 7 1389 2640 34 161 3 chr2 105409373 105409728 -76338359 - IAPLTR2a LTR ERVK 0 411 1 7 1389 1777 139 122 45 chr2 105411613 105411780 -76336307 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 191 7 1389 1777 139 122 45 chr2 105411858 105412043 -76336044 - ORR1C2 LTR MaLR -194 190 5 7 1389 419 338 95 18 chr2 105413906 105414180 -76333907 + MLT1I LTR MaLR 98 392 -19 7 1389 948 211 215 0 chr2 105416562 105416813 -76331274 - MTD LTR MaLR -14 405 101 7 1389 589 291 193 8 chr2 105422092 105422373 -76325714 + MLT1A0 LTR MaLR 39 365 0 7 1389 2722 158 134 13 chr2 105428066 105428611 -76319476 - RMER19C LTR ERVK 0 611 1 7 1389 1015 229 87 35 chr2 105430505 105430794 -76317293 - MTD LTR MaLR -51 368 65 7 1389 279 302 191 19 chr2 105445418 105445580 -76302507 + MLT1J LTR MaLR 121 310 -202 7 1389 2154 140 69 13 chr2 105449987 105450378 -76297709 - MTC LTR MaLR -8 413 1 7 1389 707 295 86 18 chr2 105461203 105461483 -76286604 + MLT1G LTR MaLR 13 311 -280 8 1389 609 281 34 88 chr2 105466517 105466837 -76281250 + MTE2a LTR MaLR 3 305 -74 8 1389 2882 80 0 0 chr2 105469040 105469440 -76278647 + MTB LTR MaLR 1 400 0 8 1389 698 258 116 32 chr2 105469442 105469719 -76278368 - MLT1A0 LTR MaLR -42 323 24 8 1389 1889 183 25 219 chr2 105474738 105475472 -76272615 + RMER19C LTR ERVK 4 594 -17 8 1389 1308 246 29 9 chr2 105475991 105476331 -76271756 + MTEa LTR MaLR 33 379 0 8 1389 1489 198 118 6 chr2 105482361 105482726 -76265361 - MTD LTR MaLR 0 419 14 8 1390 260 108 0 0 chr2 105535997 105536034 -76212053 - RLTR15 LTR ERVK 0 359 323 2 1390 1272 220 129 15 chr2 105547858 105548190 -76199897 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 3 1390 314 275 195 100 chr2 105549291 105549481 -76198606 - MLT1J LTR MaLR -303 209 2 4 1390 583 276 32 0 chr2 105550700 105550856 -76197231 + MLT1J LTR MaLR 1 161 -351 4 1390 308 264 28 0 chr2 105552050 105552122 -76195965 + MLT1J LTR MaLR 287 360 -152 4 1390 318 286 10 71 chr2 105552376 105552474 -76195613 + MLT1J-int LTR MaLR 485 576 -811 4 1390 257 341 0 0 chr2 105553005 105553087 -76195000 + MLT1J-int LTR MaLR 628 709 -678 4 1390 445 191 85 0 chr2 105553304 105553398 -76194689 + MLT1J-int LTR MaLR 707 808 -579 4 1390 560 274 96 17 chr2 105553915 105554093 -76193994 + MLT1J LTR MaLR 3 194 -318 4 1390 310 259 0 128 chr2 105567771 105567789 -76180298 + MT2B LTR ERVL 152 156 -445 5 1390 475 357 89 44 chr2 105577553 105577846 -76170241 + MLT1A0 LTR MaLR 50 355 -10 7 1390 3249 43 2 8 chr2 105582186 105582584 -76165503 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 7 1390 3795 127 60 11 chr2 105584186 105584469 -76163618 + RMER6A LTR ERVK 1 321 -435 8 1390 3795 127 60 11 chr2 105584490 105584860 -76163227 + RMER6A LTR ERVK 322 686 -70 8 1390 788 320 80 47 chr2 105591710 105592199 -76155888 + MLT1D LTR MaLR 1 505 0 9 1390 3990 110 103 22 chr2 105599069 105599765 -76148322 - RMER6A LTR ERVK 0 756 4 1 1390 3333 123 82 12 chr2 105600400 105600422 -76147665 + RLTR33 LTR ERVK 77 96 -582 1 1390 3333 123 82 12 chr2 105600449 105600984 -76147103 + RLTR33 LTR ERVK 97 673 -5 1 1390 1851 153 95 17 chr2 105606808 105607167 -76140920 - ORR1B1 LTR MaLR -7 387 1 1 1391 728 283 59 28 chr2 105660643 105660897 -76087190 + MLT1A0 LTR MaLR 92 353 -12 1 1391 383 302 14 35 chr2 105661947 105662105 -76085982 + MLT1A0 LTR MaLR 274 449 -18 1 1391 439 309 98 62 chr2 105662157 105662350 -76085737 - ORR1E LTR MaLR -159 200 1 1 1391 3148 42 37 0 chr2 105662376 105662758 -76085329 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1391 1137 226 118 6 chr2 105662806 105663135 -76084952 + ORR1D2 LTR MaLR 5 370 0 1 1391 498 310 44 20 chr2 105676344 105676548 -76071539 - ORR1E LTR MaLR -147 212 4 2 1391 940 289 126 18 chr2 105680446 105680788 -76067299 - MTEa LTR MaLR 0 379 1 2 1391 1112 151 68 0 chr2 105680804 105680996 -76067091 + MTC LTR MaLR 2 206 -215 2 1391 1374 156 9 4 chr2 105681528 105681753 -76066334 + MTC LTR MaLR 196 421 0 2 1391 757 256 25 20 chr2 105681750 105681949 -76066138 - MTE-int LTR MaLR 0 1580 1381 2 1391 295 231 120 9 chr2 105682203 105682326 -76065761 - MTE-int LTR MaLR -217 1363 1268 2 1391 1163 115 11 11 chr2 105683057 105683242 -76064845 + RLTR15 LTR ERVK 175 359 0 2 1391 3389 43 0 0 chr2 105683866 105684262 -76063825 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 1391 1371 128 92 4 chr2 105693134 105693385 -76054702 + RMER6C LTR ERVK 418 690 0 2 1391 1246 209 12 16 chr2 105693385 105693638 -76054449 + MTC LTR MaLR 146 397 -24 2 1391 225 264 70 43 chr2 105714551 105714666 -76033421 - RMER17C LTR ERVK -115 295 178 2 1391 460 339 45 22 chr2 105717241 105717419 -76030668 + MTD LTR MaLR 1 182 -237 2 1391 1557 195 96 12 chr2 105717409 105717741 -76030346 + RMER6D LTR ERVK 357 716 -4 2 1391 837 276 33 29 chr2 105718177 105718450 -76029637 + MTE-int LTR MaLR 1 274 -1096 2 1391 2135 100 19 0 chr2 105720094 105720413 -76027674 + IAPEY2_LTR LTR ERVK 33 357 0 2 1391 1562 299 149 79 chr2 105728798 105729476 -76018611 + MTE-int LTR MaLR 720 1551 -412 2 1391 419 295 133 43 chr2 105731014 105731395 -76016692 + MLT1E1A LTR MaLR 91 680 0 2 1391 301 358 18 35 chr2 105731761 105731874 -76016213 + MLT1A0 LTR MaLR 1 111 -254 2 1391 268 244 71 24 chr2 105732128 105732212 -76015875 + MTEa LTR MaLR 276 363 -16 2 1391 1974 131 32 0 chr2 105735215 105735528 -76012559 + ORR1A2 LTR MaLR 3 325 -2 2 1391 1139 264 29 60 chr2 105738506 105738853 -76009234 - RLTR18 LTR ERVK -4 612 277 2 1391 935 254 95 4 chr2 105739017 105739258 -76008829 - RLTR18 LTR ERVK -249 263 1 2 1391 1616 212 123 3 chr2 105755525 105755898 -75992189 - MTD LTR MaLR 0 419 2 3 1391 247 197 28 70 chr2 105761837 105761908 -75986179 - MTE2a LTR MaLR -158 221 154 3 1391 1546 183 44 128 chr2 105762163 105762571 -75985516 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 3 1391 233 324 27 0 chr2 105765190 105765264 -75982823 + RMER12B LTR ERVK 23 98 -1306 3 1391 806 138 151 0 chr2 105765431 105765583 -75982504 - MTC LTR MaLR -246 175 1 3 1391 237 203 154 51 chr2 105766739 105766817 -75981270 - MT2B LTR ERVL -362 239 154 3 1391 2135 164 19 65 chr2 105767313 105767775 -75980312 - RMER10A LTR ERVL -1 441 1 3 1391 316 335 168 16 chr2 105768949 105769134 -75978953 - MER21B LTR ERV1 -221 642 430 3 1392 1447 235 71 9 chr2 105778242 105778568 -75969519 - MTD LTR MaLR -24 395 50 3 1392 624 266 102 0 chr2 105778615 105778792 -75969295 - RMER15-int LTR ERVL -259 4740 4546 3 1392 446 231 47 29 chr2 105781759 105781961 -75966126 - RMER4B LTR ERVK -9 576 343 3 1392 928 162 137 5 chr2 105781951 105782178 -75965909 - RMER4B LTR ERVK -198 268 3 3 1392 852 286 53 7 chr2 105794211 105794496 -75953591 - RLTR16 LTR ERVK -207 298 1 3 1392 1663 206 26 228 chr2 105808957 105809722 -75938365 - RMER19C LTR ERVK 0 611 1 4 1392 480 257 99 7 chr2 105810852 105810993 -75937094 + MLT1A LTR MaLR 217 370 -4 4 1392 864 193 4 88 chr2 105826190 105826417 -75921670 + RMER5 LTR ERV1 49 256 -278 4 1392 365 202 83 0 chr2 105826425 105826509 -75921578 + RMER5 LTR ERV1 427 517 -17 4 1392 1928 166 142 11 chr2 105830313 105830679 -75917408 + MTC LTR MaLR 8 421 0 4 1392 935 301 90 60 chr2 105831221 105831687 -75916400 + MER21B LTR ERV1 2 481 -382 4 1392 1819 175 61 80 chr2 105831740 105832151 -75915936 - MTD LTR MaLR -14 405 3 4 1392 317 234 13 13 chr2 105833639 105833717 -75914370 - MLT1A1 LTR MaLR -2 406 329 4 1392 238 367 86 92 chr2 105837309 105837657 -75910430 + ORR1E LTR MaLR 14 359 0 4 1392 6609 101 18 83 chr2 105848536 105849711 -75898376 + MTB-int LTR MaLR 1 1098 0 4 1392 2934 91 8 2 chr2 105849711 105850109 -75897978 + MTB LTR MaLR 1 400 0 4 1392 2007 144 17 43 chr2 105858712 105859133 -75888954 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 4 1392 1931 140 24 63 chr2 105867985 105868367 -75879720 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 5 1392 437 298 140 108 chr2 105868497 105868839 -75879248 - MLT1A1 LTR MaLR -8 357 5 5 1392 3392 33 5 0 chr2 105872489 105872883 -75875204 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 1392 363 393 38 17 chr2 105873247 105873485 -75874602 - MLT1L LTR MaLR -362 248 6 5 1392 880 235 99 66 chr2 105876671 105877098 -75870989 + MT2A LTR ERVL 17 456 -77 5 1392 856 257 102 71 chr2 105877128 105877152 -75870935 + MT2A LTR ERVL 457 481 -52 5 1392 1978 178 41 19 chr2 105895047 105895459 -75852628 + MTC LTR MaLR 1 421 0 5 1392 768 96 0 0 chr2 105897140 105897244 -75850843 - BGLII LTR ERVK 0 421 318 5 1392 557 136 48 10 chr2 105898488 105898592 -75849495 - RMER17B LTR ERVK -495 463 356 5 1392 2047 335 71 97 chr2 105899214 105899641 -75848446 - ORR1E-int LTR MaLR -16 1564 1181 5 1392 2047 335 71 97 chr2 105899675 105900852 -75847235 - ORR1E-int LTR MaLR -400 1180 1 5 1392 413 362 34 94 chr2 105900859 105901210 -75846877 - ORR1E LTR MaLR -7 352 23 5 1392 3091 101 14 9 chr2 105901493 105901934 -75846153 - MT2B LTR ERVL -158 443 1 5 1393 1899 164 139 81 chr2 105911541 105912045 -75836042 - RMER16 LTR ERVK 0 533 1 5 1393 1459 269 38 20 chr2 105928751 105929145 -75818942 + MTD LTR MaLR 19 419 0 5 1393 423 218 161 18 chr2 105929883 105930051 -75818036 + MTEa LTR MaLR 188 379 0 5 1393 1198 172 245 45 chr2 105931315 105931650 -75816437 - MT2A LTR ERVL -2 531 130 6 1393 353 270 144 78 chr2 105939800 105940161 -75807926 - RLTR12B LTR ERVK -18 510 126 6 1393 339 322 42 34 chr2 105943014 105943133 -75804954 - RMER20B LTR ERVK -38 589 470 6 1393 383 304 150 14 chr2 105943267 105943487 -75804600 - RMER20B LTR ERVK -110 517 268 6 1393 2057 153 0 6 chr2 105943493 105943816 -75804271 - ORR1A4 LTR MaLR -8 321 1 6 1393 270 268 33 99 chr2 105952483 105952574 -75795513 + MER21B LTR ERV1 17 101 -762 6 1393 595 311 18 12 chr2 105952672 105952835 -75795252 + MER21B LTR ERV1 138 301 -562 6 1393 531 316 95 111 chr2 105952931 105953468 -75794619 - RMER20B LTR ERVK -15 612 30 6 1393 228 255 20 0 chr2 105958379 105958430 -75789657 + MLT1J LTR MaLR 138 189 -323 6 1393 269 213 0 0 chr2 105964022 105964069 -75784018 + ORR1C2 LTR MaLR 1 47 -337 6 1393 850 250 93 23 chr2 105965278 105965536 -75782551 - RMER20B LTR ERVK -228 399 124 6 1393 1363 225 77 19 chr2 105967593 105967906 -75780181 + ORR1D1 LTR MaLR 44 374 0 6 1393 971 218 206 67 chr2 105968107 105968573 -75779514 - MT2A LTR ERVL 0 533 3 6 1393 2454 119 43 60 chr2 105969438 105969921 -75778166 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 6 1393 660 47 0 0 chr2 105969934 105970019 -75778068 - IAPEz-int LTR ERVK -746 5735 5651 6 1393 401 116 0 14 chr2 105970012 105970082 -75778005 - IAPEz-int LTR ERVK -4781 1700 1632 6 1393 840 294 131 14 chr2 105979578 105979875 -75768212 + ORR1D2 LTR MaLR 24 355 -15 6 1393 3060 23 0 0 chr2 105987418 105987764 -75760323 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 6 1393 240 315 112 52 chr2 105995829 105995963 -75752124 + MT2B LTR ERVL 119 260 -341 6 1393 262 363 58 23 chr2 106004054 106004226 -75743861 - MLT1I LTR MaLR -132 279 102 8 1393 1671 211 75 16 chr2 106004837 106005208 -75742879 + MTD LTR MaLR 13 405 -14 1 1393 270 364 32 32 chr2 106011730 106011855 -75736232 + RMER12 LTR ERVK 732 856 -466 2 1393 2051 138 41 0 chr2 106025090 106025431 -75722656 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 32 4 1393 284 353 150 35 chr2 106026098 106026412 -75721675 + LTR16A LTR ERVL 102 451 0 4 1394 273 265 90 83 chr2 106052438 106052739 -75695348 - ORR1E LTR MaLR 0 379 64 7 1394 246 302 0 102 chr2 106054994 106055112 -75692975 - MT2B LTR ERVL -344 257 152 8 1394 225 333 14 14 chr2 106065640 106065710 -75682377 - MLT1F1 LTR MaLR -115 454 385 1 1394 561 242 190 6 chr2 106077172 106077330 -75670757 + MTE-int LTR MaLR 109 295 -1285 1 1394 663 292 132 30 chr2 106082995 106083260 -75664827 - MLT1E2 LTR MaLR -8 619 328 1 1394 243 312 154 29 chr2 106083288 106083463 -75664624 - MLT1E2 LTR MaLR -428 199 3 1 1394 1640 262 108 37 chr2 106083781 106084272 -75663815 - RMER15 LTR ERVL -49 526 1 1 1394 1122 275 100 9 chr2 106089034 106089375 -75658712 - MTEa LTR MaLR -7 372 1 1 1394 526 295 57 5 chr2 106105108 106105302 -75642785 + MLT1C LTR MaLR 3 206 -261 1 1394 557 291 121 52 chr2 106112766 106113096 -75634991 - MLT1F LTR MaLR -22 526 174 1 1394 407 195 0 99 chr2 106113225 106113316 -75634771 + MTEa LTR MaLR 1 82 -297 1 1394 1717 227 37 8 chr2 106115338 106115715 -75632372 + RMER15 LTR ERVL 188 575 0 1 1394 287 296 12 12 chr2 106115716 106115798 -75632289 - MTE-int LTR MaLR -1263 317 236 1 1394 989 194 34 0 chr2 106122635 106122810 -75625277 - RMER15 LTR ERVL 0 575 395 1 1394 826 280 138 23 chr2 106144441 106144839 -75603248 - RMER5 LTR ERV1 -16 518 75 2 1394 273 308 152 36 chr2 106153486 106153624 -75594463 - MLT1E2 LTR MaLR -473 154 1 2 1394 564 308 45 71 chr2 106159510 106159871 -75588216 - ORR1E LTR MaLR -14 365 4 2 1394 284 230 26 26 chr2 106159880 106159956 -75588131 - ORR1E-int LTR MaLR -9 1361 1286 2 1394 2263 293 103 59 chr2 106160096 106161166 -75586921 - ORR1E-int LTR MaLR -120 1460 342 2 1394 806 284 120 23 chr2 106161419 106161718 -75586369 - ORR1E-int LTR MaLR -1243 337 10 2 1394 362 278 202 38 chr2 106161722 106161984 -75586103 - ORR1E LTR MaLR -6 353 49 2 1395 1228 215 158 6 chr2 106172117 106172440 -75575647 - ORR1D1 LTR MaLR -2 372 1 2 1395 2115 150 243 5 chr2 106180922 106181325 -75566762 - RLTR19 LTR ERVK 0 499 1 2 1395 1960 159 107 6 chr2 106185884 106186390 -75561697 - RLTR26 LTR ERVK 0 642 1 2 1395 420 313 85 35 chr2 106188300 106188558 -75559529 - RLTR15 LTR ERVK 0 359 89 2 1395 641 209 48 11 chr2 106188554 106188743 -75559344 - RLTR15 LTR ERVK -131 228 33 2 1395 2216 11 81 50 chr2 106190843 106191126 -75556961 + RLTR10B LTR ERVK 1 292 0 2 1395 351 269 9 9 chr2 106201913 106202022 -75546065 - LTR41B LTR ERVL -3 755 647 2 1395 540 330 83 87 chr2 106206888 106207346 -75540741 - MLT1H LTR MaLR -81 468 13 3 1395 1766 132 62 7 chr2 106213344 106213650 -75534437 - ORR1A4 LTR MaLR -2 327 5 3 1395 908 206 83 30 chr2 106213817 106214047 -75534040 - RMER5 LTR ERV1 0 534 293 3 1395 1303 201 41 37 chr2 106214277 106214571 -75533516 - RMER5 LTR ERV1 -238 296 2 3 1395 344 328 117 8 chr2 106215100 106215220 -75532867 - MLT1A1 LTR MaLR -171 237 105 3 1395 1373 232 104 13 chr2 106219402 106219786 -75528301 + MTD LTR MaLR 1 419 0 3 1395 720 327 33 60 chr2 106219923 106220320 -75527767 - LTR73 LTR ERV1 -19 553 168 3 1395 541 294 161 51 chr2 106235913 106236186 -75511901 - ORR1E LTR MaLR -54 305 3 3 1395 769 275 47 9 chr2 106236949 106237162 -75510925 + ORR1E LTR MaLR 24 244 -115 3 1395 390 329 77 40 chr2 106237159 106237381 -75510706 - MLT1B LTR MaLR -139 251 22 3 1395 380 289 101 77 chr2 106237926 106238095 -75509992 + MLT1A LTR MaLR 11 183 -207 3 1395 851 273 212 16 chr2 106242457 106242773 -75505314 - MTEa LTR MaLR -1 378 1 3 1395 759 246 136 70 chr2 106253805 106254106 -75493981 - MLT1A0 LTR MaLR -16 349 29 3 1395 364 322 50 8 chr2 106254160 106254279 -75493808 - MLT1C LTR MaLR -62 405 282 3 1395 972 300 54 6 chr2 106254325 106254660 -75493427 + MLT1A0 LTR MaLR 15 365 0 3 1395 588 257 7 7 chr2 106254777 106254926 -75493161 - MLT1C LTR MaLR -318 149 1 3 1395 835 361 53 31 chr2 106259966 106260381 -75487706 + ORR1E-int LTR MaLR 6 429 -1151 3 1395 919 359 88 25 chr2 106260400 106260524 -75487563 + ORR1E-int LTR MaLR 1047 1170 -410 3 1395 919 359 88 25 chr2 106260628 106260953 -75487134 + ORR1E-int LTR MaLR 1171 1526 -54 3 1395 395 333 62 0 chr2 106260953 106261082 -75487005 + ORR1E LTR MaLR 2 138 -221 3 1395 492 152 11 51 chr2 106261130 106261268 -75486819 + ORR1A4 LTR MaLR 1 160 -234 3 1395 1902 114 14 0 chr2 106263467 106263747 -75484340 + ORR1A4 LTR MaLR 46 329 0 3 1395 264 271 58 12 chr2 106263895 106263981 -75484106 + ORR1A4 LTR MaLR 260 349 -10 3 1395 1934 178 64 0 chr2 106264578 106264920 -75483167 + ORR1B2 LTR MaLR 4 367 0 3 1395 536 195 51 135 chr2 106271785 106271963 -75476124 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 246 3 1395 263 249 57 106 chr2 106272357 106272520 -75475567 + MER31A LTR ERV1 1 277 -208 3 1395 465 301 112 4 chr2 106272501 106272751 -75475336 + MER31A LTR ERV1 200 476 -9 3 1395 519 319 62 82 chr2 106283590 106283973 -75464114 + LTR33A_ LTR ERVL 91 525 -6 4 1395 2841 167 44 18 chr2 106290530 106291079 -75457008 - RLTR20B1 LTR ERVK 0 563 1 4 1395 1525 186 116 3 chr2 106293914 106294249 -75453838 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 2 4 1395 1780 138 128 6 chr2 106296223 106296543 -75451544 + ORR1B2 LTR MaLR 1 359 -8 4 1395 241 302 81 69 chr2 106297553 106297713 -75450374 - ORR1E LTR MaLR -180 179 18 4 1396 290 337 142 33 chr2 106304661 106304991 -75443096 + MLT1K LTR MaLR 63 428 -167 4 1396 478 313 153 82 chr2 106305354 106305817 -75442270 - MLT1F1 LTR MaLR 0 569 18 4 1396 1657 133 111 17 chr2 106306114 106306411 -75441676 + ORR1B2 LTR MaLR 1 325 -42 4 1396 427 242 25 8 chr2 106307761 106307882 -75440205 + MT2A LTR ERVL 94 216 -317 4 1396 1402 260 88 36 chr2 106314655 106315158 -75432929 + MT2A LTR ERVL 5 533 0 4 1396 422 308 16 6 chr2 106315216 106315400 -75432687 + MTEb LTR MaLR 1 186 -173 4 1396 437 269 0 9 chr2 106315423 106315528 -75432559 + MTEb LTR MaLR 265 368 -11 4 1396 1100 263 62 94 chr2 106320773 106321146 -75426941 - MTE2b LTR MaLR -18 361 1 4 1396 969 229 78 26 chr2 106323155 106323424 -75424663 - MER21B LTR ERV1 -158 705 423 4 1396 331 345 36 0 chr2 106323513 106323623 -75424464 - MER21B LTR ERV1 -605 258 145 4 1396 1553 198 57 48 chr2 106324023 106324205 -75423882 + ORR1D1 LTR MaLR 1 167 -207 4 1396 1553 198 57 48 chr2 106324263 106324384 -75423703 + ORR1D1 LTR MaLR 168 302 -72 4 1396 1553 198 57 48 chr2 106324528 106324594 -75423493 + ORR1D1 LTR MaLR 303 372 -2 4 1396 314 346 91 27 chr2 106329256 106329443 -75418644 + MLT1J2 LTR MaLR 43 241 -207 4 1396 498 214 273 17 chr2 106335428 106335604 -75412483 + MLT1A1 LTR MaLR 176 396 -12 4 1396 712 318 82 50 chr2 106335629 106336007 -75412080 + MLT1B LTR MaLR 1 390 0 4 1396 1554 291 132 28 chr2 106336173 106336887 -75411200 + MER21B LTR ERV1 1 789 -74 4 1396 238 342 41 0 chr2 106341377 106341450 -75406637 - MTEb LTR MaLR -67 312 237 5 1396 509 298 20 47 chr2 106341888 106342036 -75406051 - MTEb LTR MaLR -226 153 10 5 1396 331 366 154 34 chr2 106342319 106342701 -75405386 + MamGypLTR1b LTR Gypsy 346 773 -9 5 1396 1964 232 14 26 chr2 106342776 106343200 -75404887 - MTD LTR MaLR 0 419 1 5 1396 2088 113 60 25 chr2 106349618 106349935 -75398152 - ORR1A4 LTR MaLR -1 328 1 5 1396 2029 214 32 0 chr2 106351163 106351569 -75396518 - MTD LTR MaLR 0 419 1 5 1396 597 320 70 80 chr2 106355478 106355852 -75392235 + MLT1A LTR MaLR 5 374 0 5 1396 804 312 96 17 chr2 106359391 106359739 -75388348 + MLT1B LTR MaLR 16 467 0 5 1396 2057 178 86 7 chr2 106360161 106360568 -75387519 - BGLII_B LTR ERVK -2 439 1 5 1396 6828 148 49 4 chr2 106360568 106361803 -75386284 - MYSERV16_I-int LTR ERVK 0 2326 1036 5 1396 287 251 99 36 chr2 106362268 106362395 -75385692 - RMER4A LTR ERVK -53 532 287 5 1396 1519 284 87 62 chr2 106362395 106363211 -75384876 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -1430 896 61 5 1396 269 336 30 46 chr2 106371046 106371105 -75376982 - MLT1N2 LTR MaLR -2 560 503 5 1396 269 336 30 46 chr2 106371134 106371205 -75376882 - MLT1N2 LTR MaLR -60 502 432 5 1396 546 324 40 84 chr2 106374460 106374864 -75373223 + LTR33 LTR ERVL 130 515 0 5 1396 1864 156 81 17 chr2 106379630 106379975 -75368112 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 5 1396 514 300 66 96 chr2 106380337 106380669 -75367418 - MLT2C2 LTR ERVL -12 452 131 5 1396 387 241 14 76 chr2 106380794 106380938 -75367149 - MLT2C2 LTR ERVL -418 138 4 5 1396 2147 157 59 18 chr2 106388455 106388844 -75359243 - MTB_Mm LTR MaLR -2 405 1 5 1396 391 375 49 24 chr2 106389534 106389722 -75358365 - MLT1I LTR MaLR -2 409 216 5 1396 391 375 49 24 chr2 106389758 106389774 -75358313 - MLT1I LTR MaLR -196 215 200 5 1396 2693 135 11 22 chr2 106393267 106393715 -75354372 + RLTR11B LTR ERVK 11 453 0 5 1396 1089 312 62 37 chr2 106394733 106395295 -75352792 + MurERV4-int LTR ERVK 4539 5114 -146 5 1396 507 250 100 61 chr2 106396068 106396298 -75351789 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 500 738 -1588 5 1396 436 188 77 43 chr2 106396311 106396364 -75351723 + RLTR11A LTR ERVK 400 447 -81 5 1396 436 188 77 43 chr2 106396388 106396451 -75351636 + RLTR11A LTR ERVK 448 519 -9 5 1396 279 331 58 69 chr2 106400450 106400726 -75347361 - RMER17C LTR ERVK -72 338 66 6 1396 2352 173 72 81 chr2 106403223 106403752 -75344335 - RLTR24 LTR ERV1 0 529 6 6 1396 229 350 40 54 chr2 106404617 106404765 -75343322 - MLT1C LTR MaLR -135 332 187 6 1396 231 279 104 117 chr2 106406179 106406333 -75341754 - MLT1C LTR MaLR -277 190 39 6 1396 307 360 130 6 chr2 106406358 106406520 -75341567 + MLT1F LTR MaLR 63 244 -304 6 1396 2391 124 108 16 chr2 106406927 106407362 -75340725 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 6 1396 6017 31 4 0 chr2 106407364 106408105 -75339982 - IAPEz-int LTR ERVK -2 6479 5736 6 1396 2045 79 0 0 chr2 106408104 106408382 -75339705 - IAPEz-int LTR ERVK -4845 1636 1359 6 1396 3406 59 1 16 chr2 106408382 106408960 -75339127 - IAPEz-int LTR ERVK -5819 662 168 6 1396 254 244 0 0 chr2 106408960 106409005 -75339082 - RLTR27 LTR ERVK -34 275 231 6 1396 556 106 16 124 chr2 106409005 106409134 -75338953 - IAPEz-int LTR ERVK -6358 123 9 6 1396 2318 101 67 15 chr2 106409135 106409526 -75338561 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 411 1 6 1396 620 349 80 71 chr2 106410683 106411106 -75336981 - MT2A LTR ERVL 0 533 107 6 1396 280 343 39 0 chr2 106411066 106411168 -75336919 - MTEa LTR MaLR -233 146 41 6 1396 353 354 58 42 chr2 106411548 106411737 -75336350 - LTR16C LTR ERVL 0 489 298 6 1396 2387 152 47 5 chr2 106419536 106419959 -75328128 - BGLII_B LTR ERVK 0 441 1 6 1396 2278 189 40 23 chr2 106422998 106423522 -75324565 + MT2A LTR ERVL 1 533 0 6 1396 521 348 107 19 chr2 106426951 106427259 -75320828 + MLT1A0 LTR MaLR 21 355 -10 6 1396 262 229 25 125 chr2 106427977 106428057 -75320030 + MLT1K LTR MaLR 229 300 -295 6 1396 708 318 45 62 chr2 106428354 106428646 -75319441 + MLT1K LTR MaLR 287 573 -22 6 1396 444 331 48 12 chr2 106429550 106429718 -75318369 + ORR1E LTR MaLR 1 174 -185 6 1397 970 247 150 32 chr2 106431454 106431793 -75316294 + MTEa LTR MaLR 1 379 0 6 1397 1458 265 93 0 chr2 106432654 106432997 -75315090 + MTD LTR MaLR 1 375 -44 6 1397 244 238 32 0 chr2 106433935 106433998 -75314089 + MTD LTR MaLR 354 418 -1 6 1397 245 338 339 13 chr2 106434281 106434508 -75313579 + RMER15 LTR ERVL 275 575 0 6 1397 5097 79 35 23 chr2 106436495 106437292 -75310795 - RLTR13C2 LTR ERVK 0 1033 1 6 1397 4994 197 82 27 chr2 106442357 106442707 -75305380 - RMER12 LTR ERVK -31 1291 892 6 1397 4994 197 82 27 chr2 106442732 106443557 -75304530 - RMER12 LTR ERVK -431 891 54 6 1397 4507 184 73 45 chr2 106443669 106443906 -75304181 - RLTR25B LTR ERVK 0 1028 811 6 1397 4507 184 73 45 chr2 106443972 106444733 -75303354 - RLTR25B LTR ERVK -218 810 2 6 1397 1387 256 42 36 chr2 106446219 106446616 -75301471 - MTD LTR MaLR -23 396 10 6 1397 1020 292 113 6 chr2 106448253 106448590 -75299497 + MTEa LTR MaLR 1 373 -6 6 1397 625 286 55 74 chr2 106450776 106451234 -75296853 + MTD LTR MaLR 1 407 -14 6 1397 367 281 7 102 chr2 106452196 106452336 -75295751 - MLT1D LTR MaLR -503 124 1 6 1397 566 302 50 14 chr2 106453368 106453586 -75294501 - LTR16E2 LTR ERVL -13 555 330 6 1397 1302 237 148 16 chr2 106456680 106457045 -75291042 - MTD LTR MaLR -6 413 1 6 1397 2755 138 26 52 chr2 106458271 106458736 -75289351 + RLTR11B LTR ERVK 1 453 0 6 1397 1364 181 136 76 chr2 106459542 106459742 -75288345 - RMER17C LTR ERVK 0 410 172 6 1397 1364 181 136 76 chr2 106459828 106460010 -75288077 - RMER17C LTR ERVK -239 171 5 6 1397 1674 240 60 3 chr2 106461607 106461991 -75286096 - MTD LTR MaLR 0 419 14 6 1397 2575 182 61 28 chr2 106463145 106463683 -75284404 - RLTR12A LTR ERVK -12 556 1 6 1397 244 279 68 125 chr2 106464522 106464698 -75283389 - MTE2a LTR MaLR -13 366 201 7 1397 1238 315 70 17 chr2 106464831 106465299 -75282788 - ORR1E-int LTR MaLR -27 1553 1061 7 1397 751 347 143 55 chr2 106465410 106466060 -75282027 - ORR1E-int LTR MaLR -666 914 208 7 1397 601 293 29 19 chr2 106466586 106466795 -75281292 - ORR1E-int LTR MaLR -1369 211 1 7 1397 240 222 52 72 chr2 106466796 106466893 -75281194 - ORR1E LTR MaLR -7 372 278 7 1397 310 311 5 183 chr2 106467055 106467189 -75280898 - ORR1E LTR MaLR -195 164 45 7 1397 310 311 5 183 chr2 106467389 106467451 -75280636 - ORR1E LTR MaLR -315 44 3 7 1397 299 331 103 88 chr2 106468933 106469264 -75278823 + MLT1A1 LTR MaLR 71 406 -2 7 1397 497 323 188 30 chr2 106473542 106473877 -75274210 + MLT1C LTR MaLR 4 391 -76 7 1397 300 306 179 51 chr2 106474536 106474887 -75273200 - MLT1A1 LTR MaLR -12 396 1 7 1397 1693 177 129 15 chr2 106475778 106476155 -75271932 + MT2B LTR ERVL 1 543 -58 7 1397 1693 146 116 7 chr2 106476302 106476346 -75271741 + MT2B LTR ERVL 544 600 -1 7 1397 547 241 0 8 chr2 106482320 106482437 -75265650 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 250 7 1397 991 248 178 20 chr2 106482673 106483027 -75265060 + MTD LTR MaLR 10 419 0 7 1397 621 318 63 85 chr2 106496574 106497021 -75251066 + MLT1D LTR MaLR 4 440 -65 7 1397 246 314 64 75 chr2 106502405 106502684 -75245403 - MTEa LTR MaLR -3 376 90 6 1397 266 238 83 53 chr2 106508741 106508874 -75239213 + RLTR42-int LTR ERVK 1147 1283 -4239 1 1397 2053 159 58 10 chr2 106510963 106511357 -75236730 + MTC LTR MaLR 1 413 -8 2 1397 3086 103 92 43 chr2 106513418 106513776 -75234311 + RMER16 LTR ERVK 1 398 -135 2 1397 3086 103 92 43 chr2 106514044 106514191 -75233896 + RMER16 LTR ERVK 399 533 0 2 1397 495 181 93 7 chr2 106517382 106517521 -75230566 + RMER20B LTR ERVK 210 360 -267 3 1397 919 275 121 18 chr2 106519632 106519972 -75228115 - MTD LTR MaLR -44 375 1 4 1397 237 359 54 47 chr2 106521249 106521398 -75226689 - MLT1G1 LTR MaLR -421 158 9 4 1397 294 285 102 62 chr2 106544989 106545165 -75202922 + ORR1E LTR MaLR 11 193 -166 7 1397 322 330 11 0 chr2 106549916 106550004 -75198083 + MLT1A LTR MaLR 11 99 -275 8 1398 827 318 65 21 chr2 106566737 106567170 -75180917 - MT2A LTR ERVL -77 456 5 1 1398 288 256 92 30 chr2 106572858 106573023 -75175064 + MER34A LTR ERV1 10 263 -524 1 1398 2732 151 134 13 chr2 106573616 106574013 -75174074 - RMER4B LTR ERVK 0 585 161 1 1398 2732 151 134 13 chr2 106574037 106574099 -75173988 - RMER4B LTR ERVK -425 160 74 1 1398 2732 151 134 13 chr2 106574137 106574198 -75173889 - RMER4B LTR ERVK -512 73 5 1 1398 280 307 23 46 chr2 106580024 106580198 -75167889 + ORR1E LTR MaLR 6 175 -184 1 1398 1860 173 137 8 chr2 106588826 106589199 -75158888 - MTC LTR MaLR 0 421 1 1 1398 810 208 242 35 chr2 106589247 106589561 -75158526 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 1 1398 1283 226 130 8 chr2 106592861 106593222 -75154865 - MTD LTR MaLR -14 405 1 1 1398 900 233 39 138 chr2 106594022 106594355 -75153732 - MTE2a LTR MaLR -72 307 8 1 1398 504 265 245 26 chr2 106611385 106611695 -75136392 - MLT1B LTR MaLR -8 382 5 1 1398 272 181 43 117 chr2 106639410 106639504 -75108583 - MT2B LTR ERVL -362 239 153 2 1398 246 128 0 0 chr2 106642850 106642889 -75105198 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 336 2 1398 1409 156 13 47 chr2 106642937 106643254 -75104833 - RMER17C LTR ERVK -104 306 1 2 1398 1560 146 104 0 chr2 106643254 106643562 -75104525 - ORR1D1 LTR MaLR -34 340 1 2 1398 390 311 68 46 chr2 106655409 106655672 -75092415 - MER57C2 LTR ERV1 -131 280 4 2 1398 3255 192 95 9 chr2 106655733 106656481 -75091606 + RLTR25B LTR ERVK 1 889 -214 2 1398 717 202 28 173 chr2 106656810 106656951 -75091136 + RLTR25A LTR ERVK 832 933 -170 2 1398 717 202 28 173 chr2 106656983 106657159 -75090928 + RLTR25A LTR ERVK 934 1103 0 2 1398 3628 117 153 0 chr2 106657271 106657859 -75090228 - RLTR33 LTR ERVK 0 678 1 2 1398 1457 170 48 17 chr2 106658933 106659226 -75088861 + ORR1C1 LTR MaLR 75 376 -2 2 1398 361 295 44 78 chr2 106667273 106667479 -75080608 - MER34A LTR ERV1 -3 568 370 2 1398 553 370 82 14 chr2 106667749 106668113 -75079974 - MER34A LTR ERV1 -182 389 1 2 1398 810 237 27 89 chr2 106679543 106679835 -75068252 - MTEa LTR MaLR -105 274 1 2 1398 2245 117 6 3 chr2 106682786 106683112 -75064975 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 2 1398 533 324 23 9 chr2 106684516 106684734 -75063353 + MLT1D LTR MaLR 1 221 -284 2 1398 3288 46 5 8 chr2 106687453 106687850 -75060237 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 1399 3077 61 5 30 chr2 106692828 106693234 -75054853 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 1399 367 292 158 59 chr2 106699163 106699436 -75048651 - MLT1D LTR MaLR -185 320 21 3 1399 315 360 192 19 chr2 106699565 106699981 -75048106 - MLT1K LTR MaLR -100 495 8 3 1399 1438 242 24 26 chr2 106720316 106720672 -75027415 - MTD LTR MaLR -20 399 51 3 1399 2079 195 105 6 chr2 106727582 106728024 -75020063 + RLTR20B3 LTR ERVK 1 481 -96 3 1399 2079 195 105 6 chr2 106728066 106728148 -75019939 + RLTR20B3 LTR ERVK 482 577 0 3 1399 790 304 59 84 chr2 106728359 106728919 -75019168 - MLT2B3 LTR ERVL -8 546 1 3 1399 364 258 53 38 chr2 106731620 106731753 -75016334 + MLT1H2 LTR MaLR 353 487 -2 3 1399 431 282 94 31 chr2 106732245 106732468 -75015619 + RLTR42-int LTR ERVK 1164 1400 -4122 3 1399 3492 35 0 0 chr2 106738324 106738720 -75009367 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 1399 409 215 59 44 chr2 106744971 106745107 -75002980 - MTEa LTR MaLR 0 379 242 3 1399 6381 51 16 28 chr2 106745242 106746055 -75002032 + RLTR13B4 LTR ERVK 1 803 0 3 1399 1719 209 24 18 chr2 106751338 106751718 -74996369 - MTC LTR MaLR -36 385 4 3 1399 259 312 64 75 chr2 106757740 106757913 -74990174 - MER21B LTR ERV1 -691 172 2 3 1399 1672 208 73 23 chr2 106758166 106758181 -74989906 + MTD LTR MaLR 1 12 -407 3 1399 1672 208 73 23 chr2 106758208 106758590 -74989497 + MTD LTR MaLR 13 418 -1 3 1399 250 287 96 0 chr2 106768009 106768103 -74979984 - MLT2B4 LTR ERVL -452 104 2 3 1399 1488 229 15 3 chr2 106774135 106774463 -74973624 + MTD LTR MaLR 20 351 -68 4 1399 288 191 0 31 chr2 106774645 106774710 -74973377 + MTD LTR MaLR 349 411 -8 4 1399 1378 201 8 0 chr2 106774837 106775101 -74972986 + ORR1D1-int LTR MaLR 841 1106 -403 4 1399 330 270 57 28 chr2 106775050 106775191 -74972896 - ORR1B2-int LTR MaLR -1010 953 809 4 1399 2705 185 35 6 chr2 106775267 106775810 -74972277 - ORR1B2-int LTR MaLR -950 559 1 4 1399 998 210 59 243 chr2 106775813 106776253 -74971834 - ORR1B2 LTR MaLR -8 359 1 4 1399 1489 208 62 57 chr2 106776833 106777161 -74970926 + ORR1D1 LTR MaLR 1 329 -45 4 1399 1489 208 62 57 chr2 106777295 106777338 -74970749 + ORR1D1 LTR MaLR 330 374 0 4 1399 727 127 119 60 chr2 106777845 106777996 -74970091 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 219 4 1399 1300 149 9 5 chr2 106778489 106778712 -74969375 - ORR1C1 LTR MaLR -154 224 1 4 1399 5335 170 110 104 chr2 106778712 106780173 -74967914 - ORR1C1-int LTR MaLR 0 1509 40 4 1399 2061 177 0 31 chr2 106780197 106780587 -74967500 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 4 1399 576 322 58 62 chr2 106784324 106784527 -74963560 + MTE2b LTR MaLR 3 220 -159 4 1399 576 322 58 62 chr2 106784670 106784757 -74963330 + MTE2b LTR MaLR 221 291 -88 4 1399 4581 6 0 0 chr2 106784757 106785250 -74962837 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 4 1399 1321 299 60 49 chr2 106787097 106787650 -74960437 + MLT1F2 LTR MaLR 1 559 -1 4 1399 502 140 118 0 chr2 106787722 106787813 -74960274 + ORR1B1 LTR MaLR 148 249 -145 4 1399 2111 162 86 35 chr2 106787813 106788268 -74959819 + RLTR20B1 LTR ERVK 1 478 -85 4 1399 2111 162 86 35 chr2 106788306 106788336 -74959751 + RLTR20B1 LTR ERVK 479 510 -53 4 1399 967 92 19 38 chr2 106788375 106788534 -74959553 + ORR1B1 LTR MaLR 239 394 0 4 1399 468 303 95 46 chr2 106790514 106790858 -74957229 + ORR1E LTR MaLR 1 379 0 4 1399 510 256 16 80 chr2 106796901 106797088 -74950999 + MLT1A0 LTR MaLR 189 363 -2 4 1399 393 306 233 30 chr2 106797211 106797511 -74950576 + MLT1A0 LTR MaLR 5 365 0 4 1399 2495 173 64 17 chr2 106797639 106798173 -74949914 + RLTR20B1 LTR ERVK 1 559 -4 4 1399 913 285 91 21 chr2 106798380 106798799 -74949288 + RMER5 LTR ERV1 72 519 -15 4 1399 239 268 18 110 chr2 106800958 106801067 -74947020 - RLTR18 LTR ERVK -3 613 515 4 1399 1198 216 154 12 chr2 106801378 106801710 -74946377 - RLTR30 LTR ERV1 0 379 1 4 1399 1614 165 130 20 chr2 106803822 106804168 -74943919 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 4 1399 423 143 39 39 chr2 106808439 106808541 -74939546 + RMER10B LTR ERVL 238 339 -59 4 1399 249 105 259 17 chr2 106808538 106808596 -74939491 - RMER10B LTR ERVL -326 72 1 4 1399 281 279 12 152 chr2 106810681 106810846 -74937241 + RMER15 LTR ERVL 422 563 -12 4 1399 291 339 15 38 chr2 106810858 106810990 -74937097 + RMER15-int LTR ERVL 332 460 -4539 4 1399 811 146 192 22 chr2 106819271 106819453 -74928634 + ORR1A2 LTR MaLR 1 213 -114 4 1399 2733 127 52 15 chr2 106819446 106819966 -74928121 - ORR1A1-int LTR MaLR -1159 633 95 4 1399 1913 156 32 77 chr2 106820433 106820837 -74927250 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 1 4 1399 1516 218 70 49 chr2 106820977 106821445 -74926642 - MT2B LTR ERVL 0 601 1 4 1399 310 173 65 26 chr2 106821719 106821796 -74926291 - MT2B LTR ERVL -516 85 6 4 1400 701 270 169 3 chr2 106825624 106825932 -74922155 + MLT1A0 LTR MaLR 1 359 -6 4 1400 690 315 28 51 chr2 106826320 106826574 -74921513 + MTE2a LTR MaLR 59 306 -73 4 1400 1479 111 265 20 chr2 106826754 106827048 -74921039 - RLTR9A LTR ERVK -2 366 1 4 1400 311 203 16 0 chr2 106827537 106827601 -74920486 + MTE2a LTR MaLR 313 377 -2 4 1400 574 251 58 34 chr2 106828913 106829119 -74918968 - RMER20B LTR ERVK -291 336 126 5 1400 895 287 82 16 chr2 106831366 106831418 -74916669 - MTEa LTR MaLR 0 379 326 5 1400 895 287 82 16 chr2 106831438 106831704 -74916383 - MTEa LTR MaLR -54 325 42 5 1400 263 236 0 0 chr2 106831705 106831760 -74916327 - MTEa LTR MaLR -302 77 23 5 1400 3009 331 80 36 chr2 106835051 106836815 -74911272 - MERVK26-int LTR ERVK -3831 3088 1247 5 1400 528 335 23 28 chr2 106838143 106838361 -74909726 + RMER15 LTR ERVL 347 563 -12 5 1400 506 217 71 48 chr2 106838559 106838730 -74909357 + MTE2a LTR MaLR 202 369 -10 5 1400 3581 28 5 2 chr2 106842162 106842557 -74905530 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 1400 664 265 51 23 chr2 106845943 106846159 -74901928 - RLTR45 LTR ERVK 0 482 261 5 1400 1382 187 113 88 chr2 106848537 106848704 -74899383 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 182 5 1400 1382 187 113 88 chr2 106848745 106848940 -74899147 - ORR1D1 LTR MaLR -193 181 3 5 1400 687 323 73 42 chr2 106852493 106852877 -74895210 + LTR87 LTR ERVL? 229 624 0 5 1400 1042 298 60 14 chr2 106855258 106855622 -74892465 - MLT2B4 LTR ERVL -175 381 1 5 1400 4722 192 130 56 chr2 106856594 106857110 -74890977 - RMER12 LTR ERVK -150 1172 769 5 1400 4722 184 73 51 chr2 106857141 106857465 -74890622 - RMER12 LTR ERVK -554 768 438 5 1400 4722 184 73 51 chr2 106857645 106858067 -74890020 - RMER12 LTR ERVK -885 437 5 5 1400 1427 245 212 30 chr2 106860571 106861004 -74887083 - RLTR18B LTR ERVK 0 512 1 5 1400 968 276 71 60 chr2 106864995 106865346 -74882741 - MTE2a LTR MaLR -17 362 8 5 1400 566 291 71 114 chr2 106867317 106867685 -74880402 + ORR1E LTR MaLR 2 353 -6 5 1400 533 228 24 16 chr2 106869041 106869166 -74878921 + MTD LTR MaLR 2 127 -294 5 1400 1291 261 42 4 chr2 106869298 106869592 -74878495 + MTD LTR MaLR 114 405 -14 5 1400 4429 228 31 71 chr2 106869636 106870655 -74877432 + MTD-int LTR MaLR 1 1004 -254 5 1400 4429 228 31 71 chr2 106870680 106870861 -74877226 + MTD-int LTR MaLR 1005 1153 -105 5 1400 322 248 42 76 chr2 106871125 106871269 -74876818 + MTD-int LTR MaLR 1102 1240 -18 5 1400 1521 254 55 25 chr2 106871280 106871393 -74876694 + MTD LTR MaLR 1 120 -299 5 1400 1521 254 55 25 chr2 106871583 106871868 -74876219 + MTD LTR MaLR 121 411 -8 5 1400 3579 38 5 0 chr2 106873354 106873748 -74874339 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 1400 9670 47 0 2 chr2 106873748 106874848 -74873239 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 5 1400 3594 35 5 0 chr2 106874848 106875242 -74872845 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 1400 669 278 81 98 chr2 106879444 106879578 -74868509 - MLT1B LTR MaLR -58 332 192 5 1400 901 225 149 115 chr2 106879578 106879724 -74868363 + ORR1D2 LTR MaLR 1 149 -221 5 1400 901 225 149 115 chr2 106879882 106880022 -74868065 + ORR1D2 LTR MaLR 150 302 -68 5 1400 901 225 149 115 chr2 106880069 106880136 -74867951 + ORR1D2 LTR MaLR 303 367 -3 5 1400 669 278 81 98 chr2 106880136 106880336 -74867751 - MLT1B LTR MaLR -199 191 4 5 1400 427 316 82 87 chr2 106881738 106881946 -74866141 - MLT1I LTR MaLR -139 272 66 5 1400 1221 236 68 4 chr2 106882149 106882413 -74865674 - MTD LTR MaLR -136 283 3 5 1400 565 186 99 118 chr2 106882415 106882677 -74865410 - MTD-int LTR MaLR 0 1258 1002 5 1400 2715 229 157 75 chr2 106883689 106884618 -74863469 - MTD-int LTR MaLR -253 1005 1 5 1400 1708 236 70 8 chr2 106884622 106885006 -74863081 - MTD LTR MaLR -8 411 4 5 1400 2114 165 17 79 chr2 106886588 106887008 -74861079 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 6 1400 282 325 33 0 chr2 106890627 106890747 -74857340 - MLT1E2 LTR MaLR 0 505 382 6 1400 362 275 89 24 chr2 106891522 106891645 -74856442 - MLT1E2 LTR MaLR -491 136 6 6 1400 576 282 34 67 chr2 106891858 106892067 -74856020 + MLT1A LTR MaLR 162 363 -11 6 1400 398 333 55 6 chr2 106893521 106893684 -74854403 + LTR78 LTR ERV1 1134 1304 0 6 1400 1586 163 20 96 chr2 106903564 106904031 -74844056 + RMER17C LTR ERVK 16 439 -519 6 1400 284 283 118 11 chr2 106908319 106908412 -74839675 + MLT1J LTR MaLR 2 104 -408 6 1400 235 298 77 69 chr2 106908737 106908867 -74839220 + MLT1J LTR MaLR 286 416 -28 6 1400 930 326 99 26 chr2 106919125 106919591 -74828496 - MLT2B1 LTR ERVL -20 500 1 6 1400 858 286 142 24 chr2 106921073 106921488 -74826599 - MLT1D LTR MaLR -41 464 1 6 1400 371 311 153 66 chr2 106921726 106922046 -74826041 + MLT1B LTR MaLR 3 350 -40 6 1400 396 324 74 39 chr2 106924511 106924742 -74823345 - MLT1G LTR MaLR -13 578 340 6 1400 1037 282 73 20 chr2 106924747 106925105 -74822982 + MTE2b LTR MaLR 1 377 -2 6 1400 234 294 0 105 chr2 106925114 106925190 -74822897 - MLT1G LTR MaLR -307 272 205 6 1400 1350 264 42 14 chr2 106933305 106933658 -74814429 - MTE2b LTR MaLR -12 367 5 6 1400 414 155 0 27 chr2 106934474 106934547 -74813540 + MLT1A1 LTR MaLR 320 390 -18 6 1400 486 242 268 0 chr2 106939663 106939820 -74808267 + MTD LTR MaLR 221 419 0 6 1400 1899 219 30 10 chr2 106947517 106947919 -74800168 - MTD LTR MaLR -7 412 3 6 1400 1215 237 38 17 chr2 106948566 106948854 -74799233 - ORR1D1 LTR MaLR -1 373 80 6 1400 261 276 168 22 chr2 106951964 106952101 -74795986 - MLT1H2 LTR MaLR 0 489 333 6 1400 2090 97 24 61 chr2 106952717 106953047 -74795040 - ORR1A3 LTR MaLR -8 318 1 6 1400 618 284 42 57 chr2 106954243 106954615 -74793472 - MTD LTR MaLR -15 404 5 6 1401 273 299 106 106 chr2 106957500 106957803 -74790284 + MLT1D LTR MaLR 21 339 -166 7 1401 246 299 92 0 chr2 106970790 106970877 -74777210 - RMER15 LTR ERVL -110 465 371 7 1401 985 303 68 12 chr2 106973910 106974247 -74773840 - MLT1C LTR MaLR 0 467 112 7 1401 326 319 26 8 chr2 106981038 106981155 -74766932 - MLT1C LTR MaLR -339 128 10 7 1401 244 120 71 107 chr2 106982348 106982404 -74765683 - MT2B LTR ERVL 0 584 531 7 1401 768 230 130 107 chr2 106982782 106983219 -74764868 - MT2B LTR ERVL -78 523 1 7 1401 2100 71 33 17 chr2 106986249 106986551 -74761536 - IAPLTR2b LTR ERVK -20 307 1 7 1401 2121 118 36 44 chr2 106992044 106992406 -74755681 - RLTR15 LTR ERVK 0 359 1 7 1401 1169 259 76 31 chr2 106996367 106996721 -74751366 + MTE2b LTR MaLR 5 374 -5 7 1401 2986 29 0 3 chr2 106998996 106999342 -74748745 + IAPLTR4 LTR ERVK 1 345 0 7 1401 1132 286 60 9 chr2 107004820 107005138 -74742949 - MTE2b LTR MaLR 0 379 46 1 1401 1580 206 72 11 chr2 107005349 107005698 -74742389 - MTD LTR MaLR 0 419 50 1 1401 331 210 97 29 chr2 107011908 107012011 -74736076 - MTD LTR MaLR -307 112 3 1 1401 298 336 70 106 chr2 107016671 107016944 -74731143 + MLT2C1 LTR ERVL 133 395 -2 2 1401 815 314 86 52 chr2 107016946 107017540 -74730547 + MLT1-int LTR MaLR 1 614 -757 2 1401 1419 226 53 19 chr2 107017550 107017910 -74730177 + MTD LTR MaLR 1 405 -14 2 1401 251 271 87 71 chr2 107017917 107018044 -74730043 + MLT1-int LTR MaLR 538 666 -823 2 1401 1103 265 85 10 chr2 107018541 107018835 -74729252 - MTD LTR MaLR 0 419 104 2 1401 2269 104 28 0 chr2 107026675 107026993 -74721094 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 3 1401 268 364 92 7 chr2 107037032 107037184 -74710903 + MLT1J2 LTR MaLR 1 165 -283 5 1401 846 253 70 92 chr2 107040220 107040577 -74707510 - MT2B LTR ERVL 0 601 253 5 1401 759 154 4 21 chr2 107040929 107041063 -74707024 - MT2B LTR ERVL -478 123 1 5 1401 286 224 38 38 chr2 107041368 107041447 -74706640 + MLT1B LTR MaLR 4 82 -308 6 1401 510 311 109 35 chr2 107041629 107041658 -74706429 + MLT1B LTR MaLR 92 120 -270 6 1401 3152 74 0 12 chr2 107041658 107042070 -74706017 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 6 1401 510 311 109 35 chr2 107042070 107042297 -74705790 + MLT1B LTR MaLR 121 367 -23 6 1401 227 278 98 87 chr2 107045964 107046137 -74701950 - MER65D LTR ERV1 0 473 299 7 1401 733 319 63 69 chr2 107053752 107054102 -74693985 + ORR1E LTR MaLR 1 348 -11 7 1401 547 330 90 82 chr2 107054268 107054644 -74693443 - MLT1J1 LTR MaLR -8 436 58 8 1401 685 249 54 22 chr2 107061329 107061514 -74686573 + MTD LTR MaLR 227 417 -2 9 1401 2862 82 14 19 chr2 107062645 107062927 -74685160 - BGLII LTR ERVK -2 419 136 9 1401 2862 82 14 19 chr2 107062951 107063089 -74684998 - BGLII LTR ERVK -286 135 1 9 1401 251 365 59 32 chr2 107066615 107066802 -74681285 + MLT1A0 LTR MaLR 8 199 -209 1 1401 716 278 105 40 chr2 107075929 107076285 -74671802 + MTD LTR MaLR 1 379 0 1 1401 1841 179 58 3 chr2 107076882 107077230 -74670857 + RMER5 LTR ERV1 162 528 -6 1 1401 241 302 96 85 chr2 107078434 107078611 -74669476 + MTEb LTR MaLR 201 379 0 1 1401 1498 233 59 22 chr2 107082237 107082641 -74665446 - MTC LTR MaLR 0 421 3 1 1402 295 353 126 26 chr2 107093331 107093561 -74654526 + LTR90B LTR LTR 5 257 -539 1 1402 697 311 35 83 chr2 107094498 107094850 -74653237 - MLT1F1 LTR MaLR 0 569 235 1 1402 226 235 131 85 chr2 107109409 107109539 -74638548 + RLTR14 LTR ERV1 238 373 -9 1 1402 1433 211 87 84 chr2 107112271 107112639 -74635448 + ORR1C2 LTR MaLR 16 384 0 1 1402 394 247 102 41 chr2 107116121 107116295 -74631792 - MTEa LTR MaLR 0 379 189 1 1402 1008 295 94 21 chr2 107119790 107120174 -74627913 - MTD LTR MaLR -14 405 5 1 1402 1367 245 74 0 chr2 107120261 107120612 -74627475 + MTEb LTR MaLR 3 379 0 1 1402 327 353 31 68 chr2 107122148 107122370 -74625717 - MLT1A0 LTR MaLR -142 223 10 1 1402 1530 186 62 64 chr2 107125815 107126188 -74621899 + ORR1D1 LTR MaLR 2 373 -1 2 1402 904 323 52 20 chr2 107126574 107126922 -74621165 + MLT1A0 LTR MaLR 1 359 -6 2 1402 2603 179 24 118 chr2 107150681 107150771 -74597316 - RLTR20D LTR ERVK 0 568 479 2 1402 2603 179 24 118 chr2 107150865 107151393 -74596694 - RLTR20D LTR ERVK -92 476 1 2 1402 234 337 124 15 chr2 107154163 107154365 -74593722 - MLT1H LTR MaLR -82 467 244 2 1402 703 305 150 7 chr2 107160881 107161240 -74586847 - MLT1D LTR MaLR -2 678 79 2 1402 383 385 111 31 chr2 107182510 107182899 -74565188 + LTR33 LTR ERVL 96 515 0 2 1402 1161 285 115 16 chr2 107208820 107209184 -74538903 + MTC LTR MaLR 8 407 -14 3 1402 262 349 96 17 chr2 107210899 107211077 -74537010 + MLT1D LTR MaLR 26 217 -288 3 1402 651 342 72 58 chr2 107215448 107215811 -74532276 - MLT1A LTR MaLR -6 368 1 3 1403 293 346 53 23 chr2 107218462 107218595 -74529492 - MLT1G LTR MaLR -348 243 107 3 1403 546 304 32 26 chr2 107220053 107220242 -74527845 - MLT1G-int LTR MaLR -1043 446 257 3 1403 1545 280 32 12 chr2 107227753 107228155 -74519932 + MTD LTR MaLR 10 419 0 3 1403 412 368 168 11 chr2 107231057 107231414 -74516673 + LTR16C LTR ERVL 69 481 -8 3 1403 10375 151 36 17 chr2 107234595 107235638 -74512449 - MurERV4_19-int LTR ERVK -1875 3905 2837 3 1403 10375 151 36 17 chr2 107235658 107236491 -74511596 - MurERV4_19-int LTR ERVK -2944 2836 1994 3 1403 1081 149 0 6 chr2 107238136 107238318 -74509769 - MurERV4_19-int LTR ERVK -3807 1973 1793 3 1403 542 295 30 40 chr2 107238325 107238526 -74509561 - RLTR26 LTR ERVK -5 637 439 3 1403 4816 196 11 6 chr2 107238556 107239440 -74508647 - MurERV4_19-int LTR ERVK -4566 1214 326 3 1403 1412 162 181 92 chr2 107239440 107239766 -74508321 - RMER19C LTR ERVK -256 355 1 3 1403 1708 201 8 62 chr2 107239766 107240137 -74507950 + ORR1C1 LTR MaLR 27 377 -1 3 1403 806 262 21 87 chr2 107241306 107241492 -74506595 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 203 3 1403 806 262 21 87 chr2 107242207 107242262 -74505825 - ORR1D2 LTR MaLR -168 202 145 3 1403 402 292 22 37 chr2 107243485 107243620 -74504467 - ORR1D2 LTR MaLR -237 133 1 3 1403 281 335 77 73 chr2 107243778 107244026 -74504061 - ORR1C2 LTR MaLR -81 303 55 3 1403 339 328 132 28 chr2 107249935 107250186 -74497901 - LTR16C LTR ERVL 0 489 213 3 1403 1756 247 16 57 chr2 107254112 107254606 -74493481 - RMER19C LTR ERVK 0 611 138 4 1403 1100 228 142 39 chr2 107255000 107255338 -74492749 - MTEb LTR MaLR -4 375 3 4 1403 1726 149 42 7 chr2 107261563 107261873 -74486214 - RMER6-int LTR ERVK -278 2899 2579 4 1403 303 106 0 0 chr2 107261934 107261981 -74486106 - RMER6-int LTR ERVK -660 2517 2471 4 1403 5938 145 52 9 chr2 107261988 107263214 -74484873 - RMER6-int LTR ERVK -1574 1603 326 4 1403 1519 131 82 21 chr2 107263214 107263495 -74484592 + RLTR10E LTR ERVK 1 298 -13 4 1403 1521 176 93 0 chr2 107263511 107263812 -74484275 - RMER6-int LTR ERVK -2846 331 3 4 1403 1899 207 60 111 chr2 107263814 107264541 -74483546 - RMER6C LTR ERVK 0 690 1 4 1403 372 326 52 15 chr2 107269568 107269702 -74478385 + MER74A LTR ERVL 356 494 -64 4 1403 917 77 15 0 chr2 107277212 107277342 -74470745 - BGLII_Mus LTR ERVK -3 419 288 4 1403 755 78 0 0 chr2 107277350 107277452 -74470635 - BGLII_Mus LTR ERVK -293 129 28 4 1403 266 57 0 0 chr2 107277724 107277759 -74470328 - BGLII_Mus LTR ERVK -387 35 1 4 1403 1613 207 24 40 chr2 107278699 107278962 -74469125 - ORR1D1 LTR MaLR -1 373 115 4 1403 2847 166 19 39 chr2 107278962 107279534 -74468553 - RLTR31_Mm LTR ERVK 0 561 1 4 1403 1613 207 24 40 chr2 107279534 107279647 -74468440 - ORR1D1 LTR MaLR -260 114 3 4 1403 549 348 66 17 chr2 107283214 107283515 -74464572 + MLT1E LTR MaLR 338 653 0 4 1403 3221 168 16 10 chr2 107284112 107284694 -74463393 - RMER4B LTR ERVK 0 585 1 4 1403 415 296 27 53 chr2 107287999 107288149 -74459938 - RMER13A LTR ERVK -602 258 113 4 1403 2926 93 5 2 chr2 107290487 107290907 -74457180 + BGLII LTR ERVK 1 421 0 4 1403 2654 209 26 39 chr2 107300779 107301396 -74446691 + RMER19C LTR ERVK 3 611 0 4 1403 893 217 68 18 chr2 107305776 107305997 -74442090 + RLTR15 LTR ERVK 1 232 -127 4 1403 466 222 17 17 chr2 107306882 107307001 -74441086 + RLTR15 LTR ERVK 222 340 -19 4 1403 348 321 55 0 chr2 107307326 107307435 -74440652 + MTE2b LTR MaLR 1 115 -264 4 1403 1010 308 42 19 chr2 107307420 107307731 -74440356 + MTEb LTR MaLR 58 375 -4 4 1403 1549 234 54 3 chr2 107312754 107313088 -74434999 + MTC LTR MaLR 69 419 -2 5 1403 257 167 0 0 chr2 107314619 107314667 -74433420 - RMER16 LTR ERVK 0 533 486 5 1403 661 170 0 0 chr2 107314667 107314773 -74433314 - RMER16-int LTR ERVK -310 5096 4991 5 1403 2279 165 24 28 chr2 107315267 107315729 -74432358 - RMER16-int LTR ERVK -837 4569 4110 5 1403 13031 162 26 21 chr2 107316202 107318661 -74429426 - RMER16-int LTR ERVK -1534 3872 1513 5 1403 2532 216 91 26 chr2 107318680 107319089 -74428998 + RLTR26 LTR ERVK 1 441 -201 5 1403 4106 111 121 56 chr2 107319089 107319922 -74428165 - RMER17D LTR ERVK -2 887 1 5 1403 2532 216 91 26 chr2 107319922 107320115 -74427972 + RLTR26 LTR ERVK 442 642 0 5 1403 295 333 40 44 chr2 107320344 107320595 -74427492 - RMER16-int LTR ERVK -4779 2802 2553 5 1403 1286 322 21 21 chr2 107321379 107321814 -74426273 - MTEb-int LTR MaLR -1145 435 1 5 1403 628 240 232 13 chr2 107321814 107322042 -74426045 - MTEb LTR MaLR 0 379 102 5 1403 4018 186 58 58 chr2 107325055 107326114 -74421973 + MYSERV6-int LTR ERVK 7848 8906 -53 5 1403 943 197 29 141 chr2 107326161 107326509 -74421578 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 14 322 0 5 1403 713 223 162 10 chr2 107326600 107326804 -74421283 + RMER4B LTR ERVK 17 251 -334 5 1403 568 277 67 56 chr2 107327521 107327716 -74420371 - RMER15 LTR ERVL -106 469 273 5 1403 298 345 77 22 chr2 107328468 107328649 -74419438 + LTR16A1 LTR ERVL 266 456 0 5 1403 482 380 42 86 chr2 107328867 107329227 -74418860 - MLT1J1 LTR MaLR -2 442 99 5 1403 236 389 11 0 chr2 107336892 107336982 -74411105 + MLT1H2 LTR MaLR 38 128 -361 5 1403 2473 203 20 6 chr2 107338789 107339279 -74408808 - ORR1B2-int LTR MaLR -1012 497 1 5 1403 1434 187 161 3 chr2 107339279 107339596 -74408491 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 5 1403 286 121 33 49 chr2 107340118 107340179 -74407908 - ORR1C2 LTR MaLR -8 376 317 5 1403 627 244 261 156 chr2 107340340 107340549 -74407538 + MT2A LTR ERVL 1 163 -370 5 1403 627 244 261 156 chr2 107340729 107340937 -74407150 + MT2A LTR ERVL 164 462 -71 5 1403 686 281 122 59 chr2 107344215 107344536 -74403551 - ORR1E LTR MaLR 0 359 19 5 1403 1949 184 2 58 chr2 107344549 107344947 -74403140 - ORR1C1 LTR MaLR -2 376 1 5 1403 1433 221 96 6 chr2 107345889 107346221 -74401866 + ORR1D1 LTR MaLR 9 370 -4 5 1404 584 210 2 7 chr2 107350858 107350994 -74397093 - ORR1D2 LTR MaLR -14 405 265 5 1404 4295 154 95 21 chr2 107355370 107356210 -74391877 + RLTR13D6 LTR ERVK 1 902 0 5 1404 260 250 42 0 chr2 107361414 107361486 -74386601 - MTE2a LTR MaLR 0 379 305 5 1404 1347 323 8 19 chr2 107361573 107361948 -74386139 + MTEb LTR MaLR 1 371 -8 5 1404 1694 272 161 38 chr2 107361991 107362617 -74385470 + MTEb-int LTR MaLR 1 703 -877 5 1404 3626 192 69 81 chr2 107366298 107367142 -74380945 + RMER19B LTR ERVK 1 834 -68 5 1404 1485 331 115 41 chr2 107367140 107367331 -74380756 + MTEb-int LTR MaLR 790 970 -610 5 1404 1485 331 115 41 chr2 107367616 107367628 -74380459 + MTEb-int LTR MaLR 971 976 -604 5 1404 1485 331 115 41 chr2 107367664 107368096 -74379991 + MTEb-int LTR MaLR 977 1473 -107 5 1404 946 308 83 6 chr2 107368321 107368648 -74379439 + MTEb LTR MaLR 20 371 -8 5 1404 974 305 61 14 chr2 107377229 107377591 -74370496 + MTE2b LTR MaLR 1 379 0 5 1404 404 338 27 0 chr2 107378541 107378689 -74369398 - MLT1F1 LTR MaLR -115 454 303 5 1404 540 308 73 157 chr2 107379508 107379904 -74368183 + ORR1D2-int LTR MaLR 465 827 -543 5 1404 1120 213 57 33 chr2 107379923 107380224 -74367863 + ORR1D2-int LTR MaLR 1063 1370 0 5 1404 1022 245 114 57 chr2 107380224 107380574 -74367513 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 5 1404 306 358 42 83 chr2 107389432 107389792 -74358295 - MLT1B LTR MaLR -4 386 42 6 1404 866 325 50 30 chr2 107394180 107394580 -74353507 + MLT1C LTR MaLR 58 465 -2 6 1404 3320 199 145 55 chr2 107395648 107395784 -74352303 - RLTR25B LTR ERVK 0 1028 883 6 1404 3320 199 145 55 chr2 107395844 107396650 -74351437 - RLTR25B LTR ERVK -146 882 2 6 1404 434 309 89 65 chr2 107396729 107396975 -74351112 + MLT1C LTR MaLR 216 467 0 6 1404 6988 94 18 15 chr2 107404244 107405257 -74342830 + RLTR13D5 LTR ERVK 1 1016 -7 6 1404 669 222 7 7 chr2 107405263 107405399 -74342688 + MTC LTR MaLR 235 370 -51 6 1404 249 57 29 0 chr2 107411318 107411353 -74336734 + MTD LTR MaLR 3 38 -381 6 1404 446 259 68 7 chr2 107411999 107412147 -74335940 + MTC-int LTR MaLR 1102 1258 0 6 1404 749 261 57 92 chr2 107412238 107412500 -74335587 + MTD LTR MaLR 167 419 0 6 1404 1134 249 30 95 chr2 107415450 107415819 -74332268 - MT2B LTR ERVL 0 601 257 6 1404 508 159 0 14 chr2 107417421 107417524 -74330563 - MT2B LTR ERVL -436 97 1 6 1404 2430 112 128 5 chr2 107419734 107420157 -74327930 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 6 1404 943 264 149 59 chr2 107421049 107421560 -74326527 - RMER4B LTR ERVK -13 572 16 6 1404 323 352 77 30 chr2 107429212 107429446 -74318641 - MLT1C LTR MaLR -3 464 220 6 1404 1813 175 6 3 chr2 107430075 107430391 -74317696 - ORR1A3 LTR MaLR -8 318 2 6 1404 1941 133 99 53 chr2 107431694 107432148 -74315939 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 6 1404 2927 25 42 6 chr2 107434209 107434563 -74313524 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 6 1404 53082 23 16 2 chr2 107434563 107440948 -74307139 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 8 6 1404 2927 25 42 6 chr2 107440948 107441302 -74306785 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 6 1404 575 319 88 51 chr2 107444794 107445148 -74302939 - MER57E1 LTR ERV1 0 372 6 6 1404 2021 159 0 6 chr2 107449036 107449364 -74298723 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 7 1404 1820 167 114 9 chr2 107456458 107456790 -74291297 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 7 1404 2120 100 29 0 chr2 107463318 107463629 -74284458 - ORR1A2 LTR MaLR -7 320 1 7 1404 2109 122 22 6 chr2 107463629 107463950 -74284137 - ORR1A2-int LTR MaLR 0 1963 1638 7 1404 2477 117 66 12 chr2 107463950 107464374 -74283713 + LTRIS5 LTR ERV1 1 447 0 7 1404 4956 157 47 17 chr2 107464374 107465321 -74282766 - ORR1A2-int LTR MaLR -322 1641 667 7 1404 635 199 7 113 chr2 107465216 107465358 -74282729 - MT2B LTR ERVL -314 287 161 7 1404 241 247 0 147 chr2 107465325 107465420 -74282667 - MT2B LTR ERVL -315 286 206 7 1404 533 321 113 35 chr2 107467647 107467989 -74280098 - MLT1G1 LTR MaLR -160 419 7 7 1404 1190 276 82 3 chr2 107475460 107475791 -74272296 - MTE2a LTR MaLR -22 357 1 7 175 1663 219 104 79 chr2 107478738 107479334 -74268753 + RMER19C LTR ERVK 1 611 0 7 1405 248 278 41 14 chr2 107479342 107479415 -74268672 - MLT1H-int LTR MaLR -26 1383 1309 7 1405 538 239 65 7 chr2 107480808 107480942 -74267145 - MTD LTR MaLR 0 419 278 7 1405 374 215 109 27 chr2 107480942 107481052 -74267035 + RLTR15 LTR ERVK 3 121 -238 7 1405 1107 289 4 11 chr2 107481417 107481690 -74266397 - MTD LTR MaLR -148 271 1 7 1405 1942 207 6 11 chr2 107494459 107494815 -74253272 + MTC LTR MaLR 1 354 -67 7 1405 1643 164 26 10 chr2 107495343 107495650 -74252437 - RLTR11A2 LTR ERVK 0 527 216 7 1405 873 272 44 20 chr2 107495777 107496028 -74252059 - RLTR11A2 LTR ERVK -270 257 1 7 1405 804 332 113 16 chr2 107504994 107505376 -74242711 + MTD LTR MaLR 1 419 0 1 1405 488 212 34 14 chr2 107513327 107513475 -74234612 + RMER17B LTR ERVK 312 462 -496 1 1405 1685 253 33 5 chr2 107513995 107514384 -74233703 - MTD LTR MaLR -1 418 18 2 1405 1158 201 71 99 chr2 107522314 107522508 -74225579 + ORR1D1 LTR MaLR 1 168 -206 3 1405 1158 201 71 99 chr2 107522613 107522800 -74225287 + ORR1D1 LTR MaLR 169 371 -3 3 1405 1251 249 95 16 chr2 107524928 107525307 -74222780 - MTD LTR MaLR 0 419 11 3 1405 484 321 35 23 chr2 107525503 107525675 -74222412 - MTEa LTR MaLR -201 178 5 4 1405 289 306 35 163 chr2 107529848 107530106 -74217981 - MTEb-int LTR MaLR -26 1554 1330 4 1405 1547 276 17 43 chr2 107530141 107530541 -74217546 + MT2A LTR ERVL 15 405 -128 4 1405 1547 276 17 43 chr2 107530635 107530744 -74217343 + MT2A LTR ERVL 406 509 -24 4 1405 1547 276 17 43 chr2 107530773 107530795 -74217292 + MT2A LTR ERVL 510 532 -1 4 1405 1536 318 67 32 chr2 107530804 107531402 -74216685 - MTEb-int LTR MaLR -302 1278 660 4 1405 1135 327 92 16 chr2 107531430 107531940 -74216147 - MTEb-int LTR MaLR -1031 549 1 4 1405 365 287 135 60 chr2 107531940 107532140 -74215947 - MTEb LTR MaLR 0 379 165 4 1405 303 265 29 39 chr2 107537234 107537336 -74210751 + RLTR40 LTR ERVK 216 316 -501 6 1405 462 352 68 9 chr2 107537395 107537616 -74210471 + MLT1A0 LTR MaLR 117 350 -15 6 1405 2476 50 3 48 chr2 107542606 107542943 -74205144 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 322 0 6 1405 1247 244 47 7 chr2 107546192 107546489 -74201598 - MTC LTR MaLR 0 421 113 7 1405 457 223 45 0 chr2 107552690 107552802 -74195285 - MTC LTR MaLR -301 120 4 7 1405 354 326 97 62 chr2 107562260 107562600 -74185487 - MLT1A0 LTR MaLR -10 355 4 9 1405 1047 289 114 21 chr2 107564280 107564661 -74183426 + MTD LTR MaLR 1 380 -39 9 1405 2937 82 15 0 chr2 107575766 107576167 -74171920 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 1 1405 333 404 46 7 chr2 107578921 107579073 -74169014 + LTR33 LTR ERVL 10 167 -348 1 1405 303 381 8 0 chr2 107592090 107592208 -74155879 - MLT1F2 LTR MaLR -436 124 6 1 1405 1136 288 81 8 chr2 107602644 107603025 -74145062 - MTD LTR MaLR -6 413 5 1 1406 472 355 65 41 chr2 107610824 107611118 -74136969 + MLT1A0 LTR MaLR 24 324 -41 1 1406 612 311 148 21 chr2 107619840 107620212 -74127875 + MTD LTR MaLR 1 419 0 1 1406 238 348 32 32 chr2 107629980 107630075 -74118012 - MLT1B LTR MaLR -26 364 270 1 1406 672 234 138 21 chr2 107632229 107632417 -74115670 - MTD LTR MaLR -14 405 196 1 1406 297 211 12 72 chr2 107636712 107636769 -74111318 - MTD LTR MaLR -327 92 39 1 1406 1959 247 30 43 chr2 107636769 107637344 -74110743 + RMER2 LTR ERV1 1 567 0 2 1406 297 183 13 78 chr2 107637344 107637383 -74110704 - MTD LTR MaLR -383 38 1 1 1406 1333 197 196 36 chr2 107648417 107648473 -74099614 - RLTR20B3 LTR ERVK -27 550 485 2 1406 1333 197 196 36 chr2 107648520 107648906 -74099181 - RLTR20B3 LTR ERVK -93 484 38 2 1406 310 326 134 7 chr2 107654214 107654356 -74093731 - MLT2F LTR ERVL -232 431 272 2 1406 1337 198 49 109 chr2 107655927 107656312 -74091775 - ORR1B2 LTR MaLR -4 363 2 2 1406 2774 108 52 22 chr2 107657257 107657721 -74090366 + RLTR45 LTR ERVK 1 478 -4 2 1406 876 331 67 34 chr2 107660467 107660795 -74087292 - MTE2b LTR MaLR -12 367 29 2 1406 619 345 119 25 chr2 107664032 107664133 -74083954 - MTE-int LTR MaLR -20 1560 1462 2 1406 619 345 119 25 chr2 107664326 107664618 -74083469 - MTE-int LTR MaLR -119 1461 1130 2 1406 1103 317 16 69 chr2 107676952 107677306 -74070781 - MTEa LTR MaLR -2 377 42 2 1406 1103 317 16 69 chr2 107677461 107677485 -74070602 - MTEa LTR MaLR -338 41 19 2 1406 272 299 15 0 chr2 107680762 107680829 -74067258 + MLT1D LTR MaLR 311 378 -127 2 1406 2599 85 3 11 chr2 107689767 107690137 -74057950 - MTB LTR MaLR 0 400 34 2 1406 606 217 127 0 chr2 107693348 107693505 -74054582 - MTD LTR MaLR -15 404 228 2 1406 372 356 50 11 chr2 107693788 107693967 -74054120 - MTD LTR MaLR -216 203 18 2 1406 931 242 224 60 chr2 107698402 107698885 -74049202 + RMER2 LTR ERV1 2 563 -4 2 1406 1841 138 100 71 chr2 107701834 107702296 -74045791 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 2 1406 704 169 30 28 chr2 107702756 107702913 -74045174 + RLTR9C LTR ERVK 163 393 0 2 1406 388 326 14 21 chr2 107703351 107703492 -74044595 + MLT1B LTR MaLR 41 180 -210 2 1406 255 300 67 48 chr2 107703543 107703648 -74044439 + MLT1B LTR MaLR 278 384 -121 2 1406 242 336 157 31 chr2 107705594 107705731 -74042356 - MLT1B LTR MaLR -26 364 196 3 1406 3249 28 0 64 chr2 107708144 107708371 -74039716 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 194 3 1406 3249 28 0 64 chr2 107708551 107708746 -74039341 - MTA_Mm LTR MaLR -203 193 1 3 1406 337 284 110 84 chr2 107708869 107709023 -74039064 - MLT1E3 LTR MaLR -16 608 451 3 1406 255 263 18 0 chr2 107709309 107709366 -74038721 - MLT1E3 LTR MaLR -511 143 86 3 1406 1253 322 3 8 chr2 107710179 107710548 -74037539 + MTEa LTR MaLR 1 367 -12 3 1406 822 351 38 31 chr2 107710672 107711092 -74036995 - RMER5 LTR ERV1 0 534 112 3 1406 2239 131 67 86 chr2 107711814 107712305 -74035782 - RLTR45 LTR ERVK 0 482 1 3 1406 520 372 86 49 chr2 107714876 107715201 -74032886 + MLT1E2 LTR MaLR 206 542 -85 3 1406 334 359 48 43 chr2 107717488 107717695 -74030392 + MLT1D LTR MaLR 32 239 -266 3 1406 846 346 43 33 chr2 107720709 107721101 -74026986 - MER74A LTR ERVL -2 556 161 3 1406 304 304 176 0 chr2 107721775 107721900 -74026187 + MTD LTR MaLR 259 405 -14 3 1406 638 212 70 6 chr2 107732334 107732491 -74015596 - RLTR12B LTR ERVK -17 511 345 3 1406 632 261 24 107 chr2 107733354 107733607 -74014480 + RLTR20D LTR ERVK 52 283 -285 3 1406 422 239 11 21 chr2 107734924 107735018 -74013069 + RLTR20D LTR ERVK 476 568 0 3 1406 244 373 56 0 chr2 107736210 107736336 -74011751 + MLT1J1 LTR MaLR 32 164 -280 3 1406 2435 192 135 40 chr2 107736336 107737027 -74011060 - RMER6A LTR ERVK 0 756 1 3 1406 3459 28 2 0 chr2 107740097 107740492 -74007595 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 1407 420 330 151 27 chr2 107741741 107741893 -74006194 + MLT1C LTR MaLR 1 168 -299 3 1407 420 330 151 27 chr2 107742258 107742476 -74005611 + MLT1C LTR MaLR 169 417 -50 3 1407 226 239 28 69 chr2 107747304 107747376 -74000711 + LTR81A LTR ERV1? 260 328 -1022 3 1407 5762 61 70 5 chr2 107749591 107750416 -73997671 + MT-int LTR MaLR 147 1025 -73 3 1407 277 386 58 7 chr2 107753917 107754071 -73994016 + MLT1I LTR MaLR 18 179 -232 3 1407 4056 116 33 53 chr2 107761446 107762213 -73985874 + RMER17A LTR ERVK 1 751 0 3 1407 313 303 36 9 chr2 107763052 107763162 -73984925 - MLT1A1 LTR MaLR -290 118 6 3 1407 329 218 89 106 chr2 107768671 107768794 -73979293 + MTD LTR MaLR 252 403 -16 3 1407 3201 21 61 15 chr2 107772576 107772969 -73975118 - IAPLTR2a LTR ERVK 0 411 1 3 1407 6326 65 11 5 chr2 107774085 107774888 -73973199 + RLTR13C2 LTR ERVK 1 808 0 3 1407 871 317 51 24 chr2 107779358 107779652 -73968435 + ORR1E LTR MaLR 16 317 -42 3 1407 1516 187 150 6 chr2 107784071 107784231 -73963856 + ORR1C2 LTR MaLR 3 171 -213 3 1407 1516 187 150 6 chr2 107784338 107784511 -73963576 + ORR1C2 LTR MaLR 172 382 -2 3 1407 251 311 125 10 chr2 107789037 107789141 -73958946 + MLT1A LTR MaLR 76 191 -183 3 1407 3273 133 44 7 chr2 107790570 107791267 -73956820 + RLTR13D4 LTR ERVK 1 1033 0 3 1407 226 91 0 0 chr2 107792505 107792538 -73955549 + RLTR45 LTR ERVK 1 33 -449 4 1407 1521 139 44 10 chr2 107795907 107796310 -73951777 + RLTR45 LTR ERVK 18 482 0 4 1407 3097 137 34 15 chr2 107796310 107796844 -73951243 + RLTR45-int LTR ERVK 1 544 -6700 4 1407 2618 70 161 141 chr2 107797251 107797753 -73950334 - RLTR1B LTR ERV1 0 512 1 4 1407 1082 41 0 39 chr2 107798134 107798288 -73949799 + RLTR45-int LTR ERVK 549 696 -6548 4 1407 1749 46 0 0 chr2 107798643 107798862 -73949225 + RLTR45-int LTR ERVK 692 910 -6334 4 1407 682 144 8 0 chr2 107798979 107799097 -73948990 + RLTR45-int LTR ERVK 913 1031 -6213 4 1407 677 324 43 35 chr2 107799414 107800071 -73948016 + RLTR45-int LTR ERVK 2246 2865 -3302 4 1407 1094 294 42 33 chr2 107800072 107800479 -73947608 + RLTR45-int LTR ERVK 5106 5509 -2708 4 1407 1094 294 42 33 chr2 107801091 107801320 -73946767 + RLTR45-int LTR ERVK 5510 5747 -2470 4 1407 303 186 0 0 chr2 107801865 107801924 -73946163 + RLTR45-int LTR ERVK 6276 6334 -1883 4 1407 2661 25 0 0 chr2 107802279 107802599 -73945488 + RLTR45-int LTR ERVK 1329 1648 -5596 4 1407 7464 93 3 2 chr2 107802950 107804092 -73943995 + RLTR45-int LTR ERVK 6331 7761 -456 4 1407 1787 122 300 21 chr2 107804092 107804469 -73943618 + RLTR45 LTR ERVK 1 482 0 4 1407 582 256 42 71 chr2 107804650 107804893 -73943194 - MLT2B4 LTR ERVL -287 233 5 4 1407 1308 284 27 8 chr2 107805053 107805419 -73942668 + MTEa LTR MaLR 6 378 -1 4 1407 705 291 74 79 chr2 107807897 107808318 -73939769 + MER67D LTR ERV1 24 436 -107 4 1407 763 313 137 25 chr2 107812966 107813287 -73934800 + MTE2b LTR MaLR 5 361 -18 4 1407 1000 261 67 126 chr2 107816317 107816375 -73931712 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 317 4 1407 1000 261 67 126 chr2 107816649 107816980 -73931107 - ORR1D1 LTR MaLR -58 316 10 4 1407 430 189 63 53 chr2 107838458 107838553 -73909534 + LTR65 LTR ERV1 300 395 -274 4 1407 1223 163 23 14 chr2 107842773 107842991 -73905096 + RLTR12A LTR ERVK 1 220 -348 4 1407 4332 125 101 23 chr2 107842975 107843890 -73904197 - RMER17B LTR ERVK -5 953 88 4 1407 1398 244 88 96 chr2 107844671 107845252 -73902835 - RMER4B LTR ERVK -9 576 1 4 1407 583 345 94 71 chr2 107853483 107853876 -73894211 - MTC LTR MaLR -14 407 6 4 1407 1010 228 0 27 chr2 107859242 107859467 -73888620 - MTC LTR MaLR -202 219 1 4 1407 238 286 0 0 chr2 107869399 107869455 -73878632 - MTEa LTR MaLR -52 327 272 4 1408 343 355 45 21 chr2 107877220 107877419 -73870668 - MLT1A0 LTR MaLR -8 400 186 4 1408 232 355 29 29 chr2 107879343 107879482 -73868605 - MLT2C1 LTR ERVL -53 344 206 5 1408 884 322 76 11 chr2 107884020 107884375 -73863712 - RLTR18B LTR ERVK -6 506 129 5 1408 472 273 142 23 chr2 107884377 107884553 -73863534 - RLTR18B LTR ERVK -313 199 3 5 1408 2391 182 58 120 chr2 107886104 107886839 -73861248 + RMER6C LTR ERVK 1 690 0 5 1408 2212 109 92 104 chr2 107886993 107887474 -73860613 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 5 1408 2181 93 32 0 chr2 107887474 107887786 -73860301 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 6160 5 1408 4057 40 0 27 chr2 107887770 107888281 -73859806 - IAPEz-int LTR ERVK -249 6232 5736 5 1408 2041 71 41 0 chr2 107888280 107888547 -73859540 - IAPEz-int LTR ERVK -4845 1636 1359 5 1408 4233 88 25 25 chr2 107888547 107889359 -73858728 - IAPEz-int LTR ERVK -5819 662 10 5 1408 327 111 0 0 chr2 107889360 107889414 -73858673 - IAPEz-int LTR ERVK -1931 56 3 5 1408 2178 119 69 82 chr2 107889416 107889892 -73858195 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 6 5 1408 3662 149 74 59 chr2 107891009 107892064 -73856023 + RLTR13D1 LTR ERVK 1 1023 0 5 1408 254 315 22 22 chr2 107912029 107912120 -73835967 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 275 5 1408 362 379 72 21 chr2 107934082 107934276 -73813811 + RMER15 LTR ERVL 321 524 -51 5 1408 794 327 31 56 chr2 107935954 107936313 -73811774 - ORR1E LTR MaLR -2 357 8 5 1408 1047 314 45 14 chr2 107936763 107937118 -73810969 + MTEb LTR MaLR 5 370 -9 5 1408 427 307 34 43 chr2 107948431 107948559 -73799528 - MLT2B3 LTR ERVL -55 507 364 5 1408 427 349 80 101 chr2 107948655 107948863 -73799224 - MLT2B3 LTR ERVL -191 363 173 5 1408 427 349 80 101 chr2 107948885 107949001 -73799086 - MLT2B3 LTR ERVL -382 172 69 5 1408 1501 251 132 61 chr2 107952112 107952714 -73795373 - RMER19C LTR ERVK 0 611 1 5 1408 1676 277 113 33 chr2 107957544 107958758 -73789329 + MYSERV-int LTR ERVK 3813 5123 -1427 5 1408 473 255 56 94 chr2 107958758 107958969 -73789118 + RMER4A LTR ERVK 243 557 -28 5 1408 286 178 99 84 chr2 107958987 107959189 -73788898 + MYSERV6-int LTR ERVK 7770 7974 -985 6 1408 1585 180 65 101 chr2 107965564 107966009 -73782078 + MYSERV6-int LTR ERVK 7963 8391 -568 6 1408 1292 210 81 40 chr2 107966013 107966312 -73781775 + ORR1B1 LTR MaLR 39 359 -35 6 1408 1292 210 81 40 chr2 107966605 107966627 -73781460 + ORR1B1 LTR MaLR 360 373 -21 6 1408 324 309 164 71 chr2 107967369 107967581 -73780506 + MTEb LTR MaLR 26 275 -104 6 1408 1753 175 10 98 chr2 107967673 107968060 -73780027 + ORR1B1 LTR MaLR 39 391 -3 6 1408 4760 50 7 2 chr2 107968081 107968665 -73779422 - LTRIS_Mus LTR ERV1 0 587 1 6 1408 911 285 65 62 chr2 107969447 107969764 -73778323 + MTE2a LTR MaLR 42 361 -18 6 1408 911 285 65 62 chr2 107969792 107969811 -73778276 + MTE2a LTR MaLR 362 378 -1 6 1408 387 305 112 30 chr2 107973240 107973420 -73774667 - ORR1D1 LTR MaLR -94 273 78 6 1408 2015 197 35 15 chr2 107973419 107973815 -73774272 + MTC LTR MaLR 18 421 0 6 1408 529 192 19 0 chr2 107973815 107973907 -73774180 - ORR1D1 LTR MaLR -280 94 1 6 1408 2860 192 37 26 chr2 107980830 107981402 -73766685 + RMER4B LTR ERVK 2 579 -6 6 1408 285 364 132 29 chr2 107984748 107985020 -73763067 - MLT1L LTR MaLR -2 608 309 6 1408 983 256 36 53 chr2 107992179 107992389 -73755698 + RMER10A LTR ERVL 2 211 -231 6 1408 983 256 36 53 chr2 107992451 107992541 -73755546 + RMER10A LTR ERVL 212 297 -145 6 1408 1626 184 26 108 chr2 107993349 107993731 -73754356 - ORR1B1 LTR MaLR -7 387 40 6 1408 654 82 265 7 chr2 107993731 107993867 -73754220 - ORR1B1-int LTR MaLR -2 1961 1791 6 1408 1928 157 63 9 chr2 107994415 107994763 -73753324 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 6 1408 5141 212 76 8 chr2 107994763 107995035 -73753052 + ORR1B2-int LTR MaLR 14 286 -1223 6 1408 5141 212 76 8 chr2 107995081 107996004 -73752083 + ORR1B2-int LTR MaLR 287 1290 -219 6 1408 1116 125 88 58 chr2 107996162 107996405 -73751682 + ORR1B2-int LTR MaLR 1126 1509 0 6 1408 1934 186 16 22 chr2 107996406 107996774 -73751313 + ORR1B2 LTR MaLR 2 367 0 6 1409 505 196 170 79 chr2 108006862 108007137 -73740950 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 1 1409 1276 239 104 14 chr2 108007137 108007488 -73740599 - MTC LTR MaLR -38 383 1 1 1409 376 345 66 39 chr2 108011181 108011313 -73736774 + RMER15-int LTR ERVL 300 442 -4557 1 1409 2003 129 6 95 chr2 108011313 108011672 -73736415 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 2 1409 376 345 66 39 chr2 108011672 108011795 -73736292 + RMER15-int LTR ERVL 443 562 -4437 1 1409 256 337 49 10 chr2 108012070 108012172 -73735915 + RMER15-int LTR ERVL 747 852 -4147 1 1409 977 306 59 11 chr2 108012438 108012811 -73735276 + RMER15-int LTR ERVL 884 1274 -3725 1 1409 819 340 26 21 chr2 108012842 108013181 -73734906 + RMER15-int LTR ERVL 1360 1700 -3299 1 1409 2062 294 59 39 chr2 108013678 108014031 -73734056 + RMER15-int LTR ERVL 4203 4566 -433 1 1409 2062 294 59 39 chr2 108014084 108014508 -73733579 + RMER15-int LTR ERVL 4567 4996 -3 1 1409 850 290 28 25 chr2 108014660 108014943 -73733144 + RMER15 LTR ERVL 279 562 -13 1 1409 819 316 80 9 chr2 108020392 108020731 -73727356 - MTEa LTR MaLR -16 363 1 3 1409 629 259 15 0 chr2 108027440 108027571 -73720516 - ETnERV2-int LTR ERVK -204 7202 7070 4 1409 2843 190 33 11 chr2 108031952 108032500 -73715587 + RLTR20B2 LTR ERVK 1 560 0 4 1409 618 197 23 8 chr2 108048982 108049115 -73698972 + MTEb LTR MaLR 244 378 -1 7 1409 3236 36 8 5 chr2 108059561 108059956 -73688131 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 8 1409 6458 62 92 126 chr2 108059956 108061092 -73686995 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 8 1409 3198 38 13 5 chr2 108061092 108061485 -73686602 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 8 1409 1174 288 26 54 chr2 108083458 108083810 -73664277 - MTD LTR MaLR -14 405 64 1 1409 308 198 17 16 chr2 108087876 108087962 -73660125 + MTD LTR MaLR 273 391 -16 1 1409 383 310 87 81 chr2 108095225 108095397 -73652690 + ORR1E LTR MaLR 9 181 -189 1 1409 3262 24 39 0 chr2 108101102 108101483 -73646604 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1409 9256 17 17 3 chr2 108101483 108102566 -73645521 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 1 1409 3260 24 39 0 chr2 108102566 108102947 -73645140 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1409 292 256 137 71 chr2 108102981 108103149 -73644938 + MTEb LTR MaLR 201 379 0 1 1409 1175 238 11 28 chr2 108104256 108104511 -73643576 - MTC LTR MaLR -12 409 190 1 1409 868 276 41 171 chr2 108104866 108105045 -73643042 - MTC LTR MaLR -211 189 10 1 1409 357 265 41 0 chr2 108105049 108105147 -73642940 - MTC-int LTR MaLR -10 1248 1147 1 1409 382 320 26 62 chr2 108106992 108107185 -73640902 + ORR1E LTR MaLR 1 186 -173 1 1409 3025 37 3 0 chr2 108119919 108120272 -73627815 + IAPEY2_LTR LTR ERVK 1 354 -3 1 1409 334 199 239 0 chr2 108123522 108123636 -73624451 - MTEa LTR MaLR 0 379 240 1 1409 3300 35 5 0 chr2 108124076 108124470 -73623617 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1409 3435 85 6 2 chr2 108124818 108125291 -73622796 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 475 0 1 1409 9796 154 58 27 chr2 108125291 108126850 -73621237 + ORR1A4-int LTR MaLR 1 1630 -333 1 1409 9796 154 58 27 chr2 108127329 108127670 -73620417 + ORR1A4-int LTR MaLR 1631 1962 -1 1 1409 1633 145 85 10 chr2 108127670 108127976 -73620111 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 1 1409 3736 173 97 71 chr2 108131153 108132031 -73616056 + RMER19B LTR ERVK 2 902 0 1 1410 1124 262 157 18 chr2 108135287 108135651 -73612436 - MTC LTR MaLR -39 382 8 1 1410 2811 15 3 3 chr2 108136857 108137195 -73610892 + ORR1A0 LTR MaLR 1 338 -8 1 1410 245 323 91 30 chr2 108142164 108142263 -73605824 - LTR48B LTR ERV1 -538 106 2 1 1410 516 319 105 21 chr2 108146756 108147093 -73600994 - MLT2B1 LTR ERVL -3 517 154 1 1410 231 302 31 10 chr2 108151778 108151875 -73596212 + RMER20B LTR ERVK 222 320 -307 2 1410 574 290 55 191 chr2 108154660 108155057 -73593030 + MTE2a LTR MaLR 7 349 -30 2 1410 3321 88 24 11 chr2 108178510 108178979 -73569108 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 475 0 2 1410 737 292 63 110 chr2 108178987 108179449 -73568638 + RLTR12B LTR ERVK 46 485 -43 2 1410 2669 167 109 36 chr2 108180817 108181458 -73566629 - RMER6C LTR ERVK 0 690 3 2 1410 3283 33 5 10 chr2 108182225 108182623 -73565464 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 1410 230 279 36 79 chr2 108185937 108186077 -73562010 + MER72B LTR ERV1 280 413 -355 2 1410 1352 207 7 106 chr2 108193798 108194203 -73553884 + RMER6C LTR ERVK 326 690 0 2 1410 264 318 165 103 chr2 108203469 108203760 -73544327 - MLT2D LTR ERVL -2 412 104 2 1410 255 274 33 87 chr2 108207537 108207629 -73540458 + MLT1A LTR MaLR 35 121 -253 3 1410 318 279 13 198 chr2 108211430 108211667 -73536420 - RLTR11A2 LTR ERVK -133 320 128 3 1410 359 279 44 18 chr2 108213992 108214105 -73533982 - RLTR11A2 LTR ERVK -393 134 19 3 1410 883 139 0 7 chr2 108228636 108228774 -73519313 + RMER17B LTR ERVK 822 958 0 3 1410 469 371 72 69 chr2 108239650 108240111 -73507976 - MLT1F LTR MaLR -84 464 3 3 1410 1989 223 38 106 chr2 108242149 108242800 -73505287 + RMER19C LTR ERVK 1 607 -4 3 1410 893 323 48 53 chr2 108242874 108243211 -73504876 - MTE2b LTR MaLR -38 341 7 3 1410 251 269 71 51 chr2 108246587 108246783 -73501304 + RMER17A2 LTR ERVK 233 432 -474 3 1410 1045 305 29 29 chr2 108247505 108247849 -73500238 + ORR1D2 LTR MaLR 9 352 -18 3 1410 2425 88 35 62 chr2 108260621 108261022 -73487065 + RLTR10 LTR ERVK 1 390 0 3 1410 4049 44 13 35 chr2 108261031 108261931 -73486156 + RLTR10-int LTR ERVK 41 992 -995 3 1410 586 287 94 26 chr2 108262067 108262375 -73485712 + IAP-d-int LTR ERVK 822 1150 -5392 3 1410 8286 39 2 3 chr2 108262457 108263452 -73484635 + RLTR10-int LTR ERVK 993 1986 -1 3 1410 2369 96 32 62 chr2 108263452 108263854 -73484233 + RLTR10 LTR ERVK 1 390 0 3 1411 6097 66 2 7 chr2 108273495 108274305 -73473782 - RLTR13D1 LTR ERVK 0 806 1 3 1411 1224 254 47 20 chr2 108275619 108275920 -73472167 - MTE2a LTR MaLR -13 366 58 3 1411 3034 58 2 30 chr2 108278136 108278543 -73469544 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 1411 5204 267 18 21 chr2 108278722 108279971 -73468116 - RodERV21-int LTR ERV1 -2288 2703 1459 3 1411 1682 291 60 57 chr2 108280002 108280769 -73467318 - RodERV21-int LTR ERV1 -3690 1301 533 3 1411 936 297 54 39 chr2 108280784 108281120 -73466967 - RodERV21-int LTR ERV1 -4644 347 7 3 1411 1542 215 51 11 chr2 108282243 108282596 -73465491 + ORR1C2 LTR MaLR 1 367 -17 4 1411 525 356 62 48 chr2 108285107 108285464 -73462623 + MLT1A LTR MaLR 1 362 -12 4 1411 1107 291 92 14 chr2 108288289 108288522 -73459565 + MTD LTR MaLR 44 299 -120 4 1411 1339 228 27 107 chr2 108288522 108288732 -73459355 - ORR1D1 LTR MaLR -1 373 173 4 1411 1339 228 27 107 chr2 108288807 108288999 -73459088 - ORR1D1 LTR MaLR -202 172 3 4 1411 1107 291 92 14 chr2 108288999 108289114 -73458973 + MTD LTR MaLR 300 419 0 4 1411 322 291 93 39 chr2 108292482 108292686 -73455401 + MLT1B LTR MaLR 18 232 -158 4 1411 1652 70 0 0 chr2 108303778 108303991 -73444096 + IAPLTR2b LTR ERVK 1 213 -114 4 1411 801 52 78 0 chr2 108310156 108310272 -73437815 + IAPLTR2b LTR ERVK 203 327 0 4 1411 4826 99 63 49 chr2 108310282 108311305 -73436782 + IAPEz-int LTR ERVK 35 995 -5486 4 1411 1820 80 4 4 chr2 108311367 108311607 -73436480 + IAPEY3-int LTR ERVK 2258 2497 -5183 4 1411 13779 78 9 8 chr2 108311606 108313429 -73434658 + IAPEz-int LTR ERVK 4656 6481 0 4 1411 2565 53 28 0 chr2 108313429 108313747 -73434340 + IAPLTR2b LTR ERVK 1 327 0 4 1411 704 291 52 49 chr2 108314355 108314622 -73433465 - MTEa LTR MaLR -111 268 1 4 1411 1836 202 34 16 chr2 108319954 108320337 -73427750 - ORR1B1 LTR MaLR -2 392 3 4 1411 914 271 60 110 chr2 108336623 108337175 -73410912 - RLTR12B LTR ERVK -2 526 2 4 1411 3771 200 75 34 chr2 108337194 108338186 -73409901 - MYSERV6-int LTR ERVK -56 8903 7927 4 1411 3771 202 88 39 chr2 108338219 108338337 -73409750 - MYSERV6-int LTR ERVK -1033 7926 7796 4 1411 3193 182 21 127 chr2 108338337 108339193 -73408894 + RMER12 LTR ERVK 1 765 -557 4 1411 254 138 0 79 chr2 108339251 108339314 -73408773 + RMER12 LTR ERVK 988 1045 -277 4 1411 346 169 31 0 chr2 108339408 108339473 -73408614 + RMER12 LTR ERVK 1099 1165 -157 4 1411 239 310 0 53 chr2 108339560 108339635 -73408452 - RMER4B LTR ERVK -53 532 462 4 1411 523 292 82 24 chr2 108339635 108339842 -73408245 - MYSERV-int LTR ERVK -1328 5222 5004 4 1411 1450 284 32 65 chr2 108340219 108340935 -73407152 - MYSERV-int LTR ERVK -1781 4769 4199 4 1411 584 328 44 29 chr2 108348755 108349028 -73399059 + MLT1A LTR MaLR 84 360 -14 4 1411 387 343 84 18 chr2 108351374 108351709 -73396378 + MER110A LTR ERV1 108 464 -4 5 1411 403 278 68 45 chr2 108352144 108352321 -73395766 - MLT1C LTR MaLR -228 239 59 5 1411 607 93 119 9 chr2 108353965 108354074 -73394013 - RLTR12A LTR ERVK -3 565 445 5 1411 1732 148 74 0 chr2 108354074 108354371 -73393716 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 5 1411 10156 152 18 5 chr2 108354375 108356143 -73391944 + ORR1A2-int LTR MaLR 1 1792 0 5 1411 382 171 0 0 chr2 108356143 108356219 -73391868 + ORR1A2 LTR MaLR 1 76 -251 5 1411 1242 313 77 21 chr2 108363946 108364377 -73383710 - MT2A LTR ERVL -2 531 77 5 1411 308 331 54 0 chr2 108364304 108364479 -73383608 - MTD LTR MaLR -234 185 1 5 1411 1562 133 147 0 chr2 108370316 108370602 -73377485 - ORR1A4 LTR MaLR -1 328 1 5 1411 564 289 65 27 chr2 108375253 108375438 -73372649 - ORR1E LTR MaLR -167 192 1 5 1411 1189 299 50 28 chr2 108377032 108377393 -73370694 - MTE2a LTR MaLR -10 369 1 5 1411 2990 66 8 5 chr2 108377910 108378305 -73369782 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 1411 7511 86 28 3 chr2 108378305 108379376 -73368711 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 5 1411 2611 63 16 6 chr2 108379385 108379749 -73368338 - MTA_Mm LTR MaLR -28 368 1 5 1411 1591 246 16 30 chr2 108380436 108380808 -73367279 + ORR1D1 LTR MaLR 8 374 0 5 1412 930 321 27 7 chr2 108405174 108405466 -73342621 - MTE2a LTR MaLR 0 379 82 5 1412 1797 252 7 17 chr2 108421682 108422097 -73325990 - MTD LTR MaLR -8 411 1 5 1412 563 326 146 6 chr2 108422682 108422997 -73325090 - MLT1F2 LTR MaLR 0 560 202 6 1412 248 287 267 43 chr2 108428694 108428952 -73319135 + MLT1D LTR MaLR 6 321 -306 6 1412 438 278 97 0 chr2 108428978 108429122 -73318965 + MLT1D LTR MaLR 348 505 0 6 1412 306 345 131 45 chr2 108434112 108434288 -73313799 - MLT1F1 LTR MaLR -160 409 219 6 1412 829 294 63 112 chr2 108434402 108434630 -73313457 + MTE2a LTR MaLR 5 201 -178 6 1412 829 294 63 112 chr2 108435268 108435423 -73312664 + MTE2a LTR MaLR 229 379 0 6 1412 2431 178 2 10 chr2 108439459 108439873 -73308214 + MTC LTR MaLR 11 421 0 6 1412 311 306 78 39 chr2 108443450 108443579 -73304508 + MTEa LTR MaLR 244 377 -2 6 1412 300 267 84 122 chr2 108444063 108444276 -73303811 - RMER10A LTR ERVL -235 207 3 6 1412 286 324 0 0 chr2 108444722 108444793 -73303294 + ORR1E LTR MaLR 3 73 -286 6 1412 238 360 8 116 chr2 108445113 108445242 -73302845 + MLT1J LTR MaLR 167 281 -231 6 1412 1730 205 62 5 chr2 108459402 108459775 -73288312 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 6 1412 902 358 142 16 chr2 108460425 108460919 -73287168 - MER54A LTR ERVL -35 866 311 6 1412 569 292 68 15 chr2 108460919 108461124 -73286963 - MER73 LTR ERVL -428 216 1 6 1412 1268 246 97 60 chr2 108474466 108474868 -73273219 + MTD LTR MaLR 1 417 -2 6 1412 3529 179 148 7 chr2 108476364 108477112 -73270975 - RMER13B LTR ERVK -53 855 2 6 1412 3140 60 50 57 chr2 108477998 108478476 -73269611 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 6 1412 248 302 34 23 chr2 108487381 108487469 -73260618 - MLT1C LTR MaLR -85 382 294 6 1412 697 237 22 17 chr2 108493304 108493484 -73254603 - MTD LTR MaLR -238 181 1 6 1412 314 258 51 10 chr2 108497992 108498090 -73249997 + MLT1A1 LTR MaLR 7 108 -300 6 1412 244 309 108 43 chr2 108501098 108501284 -73246803 + MLT1B LTR MaLR 158 355 -35 2 1412 337 236 14 0 chr2 108510381 108510453 -73237634 + ORR1D2 LTR MaLR 1 73 -297 2 1412 711 287 24 186 chr2 108510466 108510723 -73237364 + ORR1E LTR MaLR 3 189 -170 3 1412 711 287 24 186 chr2 108510780 108510946 -73237141 + ORR1E LTR MaLR 190 357 -2 3 1412 1972 207 59 0 chr2 108519801 108520188 -73227899 - MTC LTR MaLR 0 421 12 4 1412 5181 192 81 16 chr2 108520230 108521410 -73226677 - MTC-int LTR MaLR 0 1258 2 4 1412 462 239 64 0 chr2 108521410 108521519 -73226568 - MTC LTR MaLR -1 420 305 4 1412 606 213 173 28 chr2 108521531 108521623 -73226464 - MTC LTR MaLR -205 216 113 4 1412 606 213 173 28 chr2 108521671 108521757 -73226330 - MTC LTR MaLR -309 112 12 4 1412 1855 130 133 21 chr2 108524131 108524461 -73223626 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 5 1413 1091 275 38 57 chr2 108529327 108529693 -73218394 + ORR1E LTR MaLR 1 359 0 6 1413 310 322 120 26 chr2 108538638 108538979 -73209108 - MER110A LTR ERV1 -50 418 46 7 1413 341 395 41 33 chr2 108540470 108540740 -73207347 - LTR79 LTR ERVL -2 525 254 7 1413 3268 46 5 0 chr2 108543457 108543851 -73204236 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 7 1413 668 230 8 0 chr2 108555656 108555782 -73192305 + ETnERV2-int LTR ERVK 7070 7196 -210 1 1413 3449 166 89 19 chr2 108561998 108562702 -73185385 + RMER6A LTR ERVK 2 755 -1 1 1413 607 392 84 27 chr2 108562711 108563198 -73184889 - MER77 LTR ERVL -25 582 68 1 1413 2008 224 15 191 chr2 108565059 108565776 -73182311 + RMER19C LTR ERVK 15 605 -6 1 1413 408 278 160 6 chr2 108582560 108582741 -73165346 - LTR16B1 LTR ERVL -2 478 270 1 1413 258 414 16 8 chr2 108582791 108582920 -73165167 - LTR16B1 LTR ERVL -328 135 6 1 1413 5457 150 20 22 chr2 108586305 108587209 -73160878 + RMER19B LTR ERVK 1 902 0 1 1413 401 280 106 19 chr2 108587671 108587831 -73160256 - LTR33 LTR ERVL -341 174 1 1 1413 764 229 92 15 chr2 108596072 108596267 -73151820 - MTE2b-int LTR MaLR -88 1492 1283 1 1413 2091 328 46 21 chr2 108597291 108597989 -73150098 - MTE2b-int LTR MaLR -269 1311 597 1 1413 1154 283 122 18 chr2 108598094 108598536 -73149551 - MTE2b-int LTR MaLR -1092 488 1 1 1413 257 228 36 60 chr2 108598543 108598627 -73149460 - MTE2b LTR MaLR -3 376 295 1 1413 473 240 31 0 chr2 108598633 108598729 -73149358 + MTC LTR MaLR 1 99 -322 1 1413 258 299 0 25 chr2 108598713 108598792 -73149295 + MTC LTR MaLR 331 407 -14 1 1413 726 300 36 6 chr2 108598814 108599076 -73149011 - MTE2b LTR MaLR -92 287 3 1 1413 422 268 21 48 chr2 108599175 108599320 -73148767 + MLT1A0 LTR MaLR 6 146 -219 1 1413 279 312 30 46 chr2 108600057 108600188 -73147899 + MLT1A0 LTR MaLR 214 342 -23 1 1413 416 293 8 17 chr2 108602244 108602362 -73145725 + MLT1A1 LTR MaLR 291 407 -1 1 1413 2486 178 85 15 chr2 108602539 108603059 -73145028 - RMER19B LTR ERVK 0 902 347 1 1413 1277 142 0 84 chr2 108603078 108603317 -73144770 - RMER19B LTR ERVK -683 219 1 1 1413 1534 245 86 5 chr2 108605468 108605841 -73142246 + MTD LTR MaLR 1 403 -16 1 1413 837 211 33 85 chr2 108623677 108623889 -73124198 - MTD LTR MaLR -27 392 192 2 1413 580 282 5 69 chr2 108623912 108624114 -73123973 - MTD LTR MaLR -208 211 23 2 1413 256 381 50 50 chr2 108626505 108626687 -73121400 + MLT1C LTR MaLR 128 309 -158 2 1413 342 316 119 25 chr2 108631084 108631243 -73116844 - MTEa LTR MaLR 0 379 206 2 1413 298 298 127 16 chr2 108632784 108632910 -73115177 - MLT1C LTR MaLR -184 283 144 2 1413 243 306 0 31 chr2 108633347 108633411 -73114676 - MLT1C LTR MaLR -337 152 91 2 1413 1585 236 26 34 chr2 108637277 108637629 -73110458 + MTD LTR MaLR 36 389 -30 2 1413 1585 236 26 34 chr2 108637659 108637692 -73110395 + MTD LTR MaLR 390 418 -1 2 1413 300 253 161 7 chr2 108642606 108642748 -73105339 + MLT1F-int LTR MaLR 429 627 -744 2 1414 3227 51 2 0 chr2 108677021 108677416 -73070671 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 1414 7727 58 59 3 chr2 108677416 108678456 -73069631 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 2 1414 3323 36 10 0 chr2 108678456 108678848 -73069239 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 1414 3008 83 0 8 chr2 108679613 108680012 -73068075 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 1414 7073 76 40 71 chr2 108680012 108681145 -73066942 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 2 1414 3150 56 0 10 chr2 108681145 108681545 -73066542 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 1414 228 330 152 38 chr2 108682426 108682637 -73065450 + MLT1E2 LTR MaLR 20 254 -373 2 1414 3948 140 33 64 chr2 108682941 108683721 -73064366 + RMER6A LTR ERVK 1 756 0 2 1414 4826 116 91 26 chr2 108683795 108684642 -73063445 + RLTR13D6 LTR ERVK 1 902 0 2 1414 2824 68 31 18 chr2 108685115 108685506 -73062581 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 1414 1787 199 86 5 chr2 108685851 108686259 -73061828 - BGLII_B LTR ERVK 0 441 1 2 1414 735 319 98 85 chr2 108686481 108686951 -73061136 + MLT1D LTR MaLR 28 503 -2 2 1414 419 320 110 13 chr2 108695483 108695711 -73052376 - MLT1D LTR MaLR -8 497 248 3 1414 3098 117 186 0 chr2 108701737 108702242 -73045845 - MT2B LTR ERVL 0 601 3 3 1414 304 333 3 33 chr2 108721080 108721225 -73026862 - MLT1B LTR MaLR -4 463 251 3 1414 323 382 125 3 chr2 108721742 108722039 -73026048 - MLT1B-int LTR MaLR -675 712 380 3 1414 283 345 86 8 chr2 108722794 108722911 -73025176 - MLT1B LTR MaLR -238 206 81 3 1414 407 395 71 29 chr2 108725371 108725578 -73022509 + MLT2D LTR ERVL 7 228 -186 3 1414 407 395 71 29 chr2 108725627 108725729 -73022358 + MLT2D LTR ERVL 229 328 -86 3 1414 763 333 79 40 chr2 108726598 108726951 -73021136 + ORR1D2 LTR MaLR 1 367 -3 3 1414 512 295 77 0 chr2 108727808 108727991 -73020096 - LTR33 LTR ERVL 0 515 319 3 1414 335 288 9 9 chr2 108734775 108734887 -73013200 + MTEb LTR MaLR 268 379 0 3 1414 1520 209 109 11 chr2 108745161 108745337 -73002750 - ORR1C2 LTR MaLR -1 383 173 3 1414 1520 209 109 11 chr2 108745425 108745597 -73002490 - ORR1C2 LTR MaLR -212 172 1 3 1414 3203 243 127 25 chr2 108745616 108746559 -73001528 - ORR1C2-int LTR MaLR -5 1365 298 3 1414 1120 233 164 115 chr2 108749489 108749916 -72998171 + MT2A LTR ERVL 3 450 -83 3 1414 557 224 28 0 chr2 108751263 108751392 -72996695 + MTC LTR MaLR 5 137 -282 3 1414 602 247 118 114 chr2 108751906 108752176 -72995911 + MLT1A1 LTR MaLR 1 302 -106 3 1414 371 316 18 0 chr2 108752640 108752754 -72995333 + MLT1A0 LTR MaLR 248 363 -2 3 1414 6055 118 25 8 chr2 108755289 108756224 -72991863 - RMER17B LTR ERVK -1 957 7 3 1414 470 244 92 154 chr2 108757751 108758153 -72989934 + MTE2b LTR MaLR 3 379 0 3 1414 1471 158 8 4 chr2 108766182 108766423 -72981664 + ORR1B2 LTR MaLR 126 367 0 4 1414 236 388 14 56 chr2 108775942 108776084 -72972003 - MLT1M LTR MaLR -488 184 49 4 1414 480 372 44 70 chr2 108782248 108782592 -72965495 - ORR1E LTR MaLR -24 335 1 4 1414 345 397 64 28 chr2 108782760 108783009 -72965078 - MLT1J LTR MaLR -145 367 110 4 1415 371 278 41 10 chr2 108810081 108810179 -72937908 - MLT1I LTR MaLR -225 186 86 4 1415 3320 33 5 2 chr2 108823298 108823693 -72924394 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 1415 2305 86 25 77 chr2 108826487 108826783 -72921304 + ORR1A1 LTR MaLR 1 291 -55 5 1415 2305 86 25 77 chr2 108826933 108827001 -72921086 + ORR1A1 LTR MaLR 292 346 0 5 1415 1025 275 35 42 chr2 108828238 108828523 -72919564 - ORR1D1 LTR MaLR -91 283 1 5 1415 328 313 125 83 chr2 108832834 108833123 -72914964 - MLT1H1 LTR MaLR -35 520 220 5 1415 2079 175 65 20 chr2 108839471 108839874 -72908213 + MTC LTR MaLR 1 421 0 5 1415 1984 155 11 11 chr2 108843318 108843677 -72904410 - RLTR15 LTR ERVK 0 359 1 5 1415 1598 174 74 6 chr2 108845241 108845553 -72902534 + RLTR17 LTR ERVK 98 430 -262 5 1415 1397 158 40 40 chr2 108845901 108846177 -72901910 + RLTR17 LTR ERVK 417 692 0 5 1415 1588 255 45 13 chr2 108847459 108847833 -72900254 - MTD LTR MaLR -14 405 20 5 1415 263 296 163 7 chr2 108848282 108848392 -72899695 - RMER12 LTR ERVK -467 855 746 5 1415 243 292 168 7 chr2 108848427 108848477 -72899610 - RMER12 LTR ERVK -440 1132 1074 5 1415 314 331 95 50 chr2 108848633 108848874 -72899213 + MLT1H LTR MaLR 296 533 -16 5 1415 476 367 87 19 chr2 108848903 108849390 -72898697 + MLT1H-int LTR MaLR 37 592 -817 5 1415 263 353 28 77 chr2 108849405 108849586 -72898501 + MLT1H-int LTR MaLR 676 847 -562 5 1415 294 380 151 19 chr2 108853290 108853663 -72894424 + MLT1H-int LTR MaLR 987 1409 0 5 1415 2746 34 0 3 chr2 108854519 108854846 -72893241 + IAPLTR2b LTR ERVK 1 326 -1 5 1415 480 200 29 29 chr2 108856434 108856537 -72891550 - RMER20B LTR ERVK -5 622 520 5 1415 1957 186 38 3 chr2 108856542 108856908 -72891179 - RMER20B LTR ERVK -239 388 10 5 1415 254 322 121 70 chr2 108862452 108862609 -72885478 - MLT1I LTR MaLR 0 411 247 5 1415 416 277 218 0 chr2 108862619 108862793 -72885294 - MTE2b LTR MaLR -159 220 9 5 1415 335 383 86 51 chr2 108864832 108865066 -72883021 + LTR33A LTR ERVL 118 359 -161 5 1415 909 305 133 7 chr2 108868038 108868332 -72879755 + MLT1A0 LTR MaLR 1 331 -34 5 1415 1597 208 52 12 chr2 108868443 108868769 -72879318 - RMER15 LTR ERVL -10 565 227 5 1415 499 393 78 68 chr2 108871975 108872125 -72875962 + MER21B LTR ERV1 1 144 -719 5 1415 499 393 78 68 chr2 108872326 108872848 -72875239 + MER21B LTR ERV1 145 680 -183 5 1415 667 223 23 126 chr2 108873883 108874098 -72873989 - ORR1E LTR MaLR -2 357 165 5 1415 541 284 12 43 chr2 108874360 108874522 -72873565 - ORR1E LTR MaLR -202 157 1 5 1415 486 340 94 69 chr2 108877081 108877444 -72870643 - LTR16A LTR ERVL -55 396 25 5 1415 1195 294 31 69 chr2 108878811 108879202 -72868885 + MTEa LTR MaLR 1 376 -3 5 1415 919 334 106 35 chr2 108879732 108880166 -72867921 + MLT1F LTR MaLR 1 465 -83 5 1415 3185 176 82 47 chr2 108881133 108881465 -72866622 + RMER6D LTR ERVK 1 363 -357 5 1415 3185 176 82 47 chr2 108881493 108881856 -72866231 + RMER6D LTR ERVK 364 720 0 5 1415 4478 182 105 14 chr2 108888755 108889697 -72858390 + RLTR25B LTR ERVK 1 1028 0 6 1415 1729 124 47 185 chr2 108889804 108890268 -72857819 + RLTR23 LTR ERV1 31 430 0 6 1415 1057 211 101 27 chr2 108890723 108890766 -72857321 - ORR1D1 LTR MaLR -90 284 246 6 1415 4046 59 12 2 chr2 108890766 108891273 -72856814 - RLTR1B LTR ERV1 0 512 1 6 1415 1057 211 101 27 chr2 108891273 108891487 -72856600 - ORR1D1 LTR MaLR -129 245 8 6 1415 1565 60 0 0 chr2 108897033 108897233 -72850854 + MTB LTR MaLR 1 200 -200 6 1415 1576 67 5 0 chr2 108899693 108899903 -72848184 + MTB LTR MaLR 188 398 -2 6 1415 321 390 77 0 chr2 108901322 108901491 -72846596 - LTR16B2 LTR ERVL -212 250 69 6 1416 942 9 0 0 chr2 108951267 108951376 -72796711 + MTA_Mm LTR MaLR 288 396 0 6 1416 3090 199 63 26 chr2 108960811 108961489 -72786598 + RMER6D LTR ERVK 1 703 -17 6 1416 361 232 0 58 chr2 108963136 108963223 -72784864 - RMER6C LTR ERVK -128 562 481 6 1416 1262 223 50 26 chr2 108971973 108972471 -72775616 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 1086 1595 -731 6 1416 2937 52 39 8 chr2 108972805 108973189 -72774898 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 1416 949 332 65 13 chr2 108979430 108979817 -72768270 - LTR53 LTR ERVL -43 476 70 7 1416 680 264 57 7 chr2 108980601 108980804 -72767283 + MLT2C1 LTR ERVL 152 522 -37 7 1416 256 337 67 18 chr2 108981300 108981451 -72766636 + MLT1K LTR MaLR 123 303 -292 7 1416 3453 321 60 25 chr2 108982973 108984262 -72763825 - MTEa-int LTR MaLR -232 1348 15 7 1416 304 319 80 0 chr2 108984280 108984393 -72763694 - MTEa LTR MaLR -10 369 248 7 1416 729 318 18 18 chr2 108984483 108984701 -72763386 - MTEa LTR MaLR -157 222 5 7 1416 822 303 79 18 chr2 108985061 108985390 -72762697 - ORR1E LTR MaLR -3 356 8 7 1416 1045 260 75 9 chr2 108986562 108986911 -72761176 + ORR1D1 LTR MaLR 1 372 -2 7 1416 510 291 47 16 chr2 108988546 108988675 -72759412 + ETnERV2-int LTR ERVK 7070 7202 -204 7 1416 646 310 178 38 chr2 108997673 108998116 -72749971 + MTC-int LTR MaLR 347 851 -407 7 1416 805 234 40 35 chr2 109000343 109000569 -72747518 - RMER15 LTR ERVL -348 227 1 3 1416 349 308 93 79 chr2 109004269 109004508 -72743579 - MTE2a LTR MaLR -115 264 54 1 1416 1791 194 17 25 chr2 109005980 109006335 -72741752 + ORR1B1 LTR MaLR 41 392 -2 1 1416 746 268 47 53 chr2 109021221 109021578 -72726509 - RLTR10D LTR ERVK 0 411 1 3 1416 268 376 59 0 chr2 109024829 109025015 -72723072 - MLT1A0 LTR MaLR -2 372 176 3 1416 333 193 23 0 chr2 109026055 109026129 -72721958 - MLT1A0 LTR MaLR -245 163 84 3 1416 246 242 80 50 chr2 109029048 109029148 -72718939 + MLT2B5 LTR ERVL 110 212 -389 4 1416 258 349 60 90 chr2 109029065 109029232 -72718855 + MTEa LTR MaLR 96 257 -122 4 1416 3720 69 34 20 chr2 109039627 109040132 -72707955 + RLTR1B LTR ERV1 1 512 0 5 1416 2987 86 7 2 chr2 109040272 109040691 -72707396 + BGLII LTR ERVK 1 421 0 5 1416 265 248 58 58 chr2 109046972 109047109 -72700978 + RLTR42-int LTR ERVK 4260 4396 -1126 6 1416 2603 157 34 26 chr2 109048434 109048938 -72699149 - RMER6D LTR ERVK -6 714 207 7 1416 3994 93 10 26 chr2 109050501 109051108 -72696979 + RLTR13D6 LTR ERVK 1 597 -305 7 1416 894 239 51 16 chr2 109051253 109051408 -72696679 + RLTR13D6 LTR ERVK 654 808 0 7 1417 1974 154 230 68 chr2 109054114 109054706 -72693381 + RMER6C LTR ERVK 1 688 -2 8 1417 1260 264 83 9 chr2 109067460 109067808 -72680279 + MTE2b LTR MaLR 6 379 0 1 1417 3190 63 0 2 chr2 109069552 109069949 -72678138 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1417 1574 206 69 92 chr2 109080284 109080706 -72667381 - MTC LTR MaLR -9 412 1 1 1417 330 333 60 8 chr2 109089476 109089609 -72658478 - MLT1F LTR MaLR -57 512 373 1 1417 390 294 156 17 chr2 109089780 109089953 -72658134 - MLT1F LTR MaLR -292 256 60 1 1417 1605 234 36 178 chr2 109094439 109095151 -72652936 + RMER19C LTR ERVK 1 611 0 1 1417 373 260 84 75 chr2 109095338 109095615 -72652472 - MTC LTR MaLR -14 405 110 1 1417 924 286 55 78 chr2 109097539 109097846 -72650241 + MTE2a LTR MaLR 80 379 0 1 1417 1212 223 103 95 chr2 109105773 109106220 -72641867 + MT2B LTR ERVL 13 593 -8 1 1417 744 157 8 0 chr2 109149511 109149632 -72598455 + MTD LTR MaLR 1 122 -297 2 1417 2903 38 0 3 chr2 109152350 109152697 -72595390 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 2 1417 11989 60 10 6 chr2 109152702 109154336 -72593751 + ORR1A1-int LTR MaLR 152 1792 0 2 1417 2658 44 0 20 chr2 109154336 109154681 -72593406 + ORR1A1 LTR MaLR 1 338 -8 2 1417 1164 258 152 6 chr2 109160069 109160424 -72587663 + MTD LTR MaLR 1 407 -12 2 1417 238 293 64 100 chr2 109170553 109170663 -72577424 - MT2B2 LTR ERVL -329 255 150 2 177 632 249 206 13 chr2 109182926 109183235 -72564852 - MTEa LTR MaLR -1 378 10 2 1418 297 180 0 20 chr2 109184534 109184585 -72563502 - MLT1A0 LTR MaLR -68 297 248 2 1418 1005 325 99 86 chr2 109189823 109190553 -72557534 - MER21B LTR ERV1 -123 740 2 2 1418 428 344 31 31 chr2 109194703 109194909 -72553178 - MLT2D LTR ERVL -105 292 78 3 1418 2372 176 45 0 chr2 109201838 109202236 -72545851 + MTC LTR MaLR 6 421 0 3 1418 2088 124 28 3 chr2 109203639 109203962 -72544125 - ORR1B1 LTR MaLR -4 390 60 3 1418 1552 157 11 32 chr2 109206087 109206370 -72541717 - ORR1A4 LTR MaLR -52 277 1 3 1418 1093 267 54 39 chr2 109214066 109214116 -72533971 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 320 3 1418 1093 267 54 39 chr2 109214395 109214679 -72533408 - ORR1D2 LTR MaLR -51 319 32 3 1418 1227 227 129 21 chr2 109215237 109215570 -72532517 + ORR1D1 LTR MaLR 6 374 0 3 1418 3162 53 0 8 chr2 109231572 109231971 -72516116 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 1418 425 349 85 15 chr2 109234636 109234837 -72513250 - LTR33 LTR ERVL 0 515 301 3 1418 812 305 79 45 chr2 109234869 109235223 -72512864 + MTEb LTR MaLR 14 379 0 3 1418 645 378 52 23 chr2 109236133 109236482 -72511605 - ORR1E LTR MaLR 0 359 1 3 1418 879 278 83 114 chr2 109239464 109239992 -72508095 - RLTR18 LTR ERVK 0 616 105 3 1418 732 230 58 89 chr2 109244444 109244668 -72503419 - RMER15 LTR ERVL -78 497 281 3 1418 2257 198 9 24 chr2 109249667 109249755 -72498332 - MTC LTR MaLR 0 421 335 4 1418 1948 137 74 6 chr2 109249755 109250079 -72498008 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 4 1418 2257 198 9 24 chr2 109250079 109250414 -72497673 - MTC LTR MaLR -87 334 4 4 1418 876 293 162 64 chr2 109252275 109252695 -72495392 - MLT2B1 LTR ERVL -40 480 20 4 1418 3046 103 8 19 chr2 109255368 109255841 -72492246 + RLTR31B_Mm LTR ERVK 4 471 -86 4 1418 963 279 54 65 chr2 109258889 109259261 -72488826 - MLT1B LTR MaLR 0 390 23 4 1418 439 285 86 14 chr2 109260367 109260506 -72487581 - RMER15 LTR ERVL -154 421 273 4 1418 1940 221 0 21 chr2 109260698 109261086 -72487001 + RMER20B LTR ERVK 1 380 -247 4 1418 1250 162 39 139 chr2 109261085 109261394 -72486693 + RMER20B LTR ERVK 350 627 0 4 1418 315 200 11 101 chr2 109261573 109261662 -72486425 + MT2B LTR ERVL 184 264 -337 4 1418 289 333 126 40 chr2 109274117 109274292 -72473795 - MLT1G1 LTR MaLR -3 576 387 4 1418 246 395 70 41 chr2 109274343 109274586 -72473501 - MLT1G1 LTR MaLR -320 271 22 4 1418 810 344 56 77 chr2 109281209 109281675 -72466412 - LTR16B2 LTR ERVL -2 460 5 4 1418 862 375 36 30 chr2 109284376 109284846 -72463241 + LTR33C LTR ERVL 96 568 -61 4 1418 1398 203 185 48 chr2 109310342 109310617 -72437470 - RMER2 LTR ERV1 0 567 277 4 1418 1398 203 185 48 chr2 109310638 109310860 -72437227 - RMER2 LTR ERV1 -291 276 3 4 1418 304 366 98 6 chr2 109313290 109313463 -72434624 - MLT1D LTR MaLR -13 492 304 4 1419 1207 294 39 0 chr2 109315393 109315753 -72432334 - MTE2b LTR MaLR -5 374 1 4 1419 1444 238 57 20 chr2 109322888 109323239 -72424848 - MTE2b LTR MaLR -13 366 3 4 1419 1404 229 140 6 chr2 109325208 109325227 -72422860 + MTD LTR MaLR 1 18 -401 4 1419 1404 229 140 6 chr2 109325316 109325661 -72422426 + MTD LTR MaLR 19 413 -6 4 1419 411 237 74 30 chr2 109327255 109327390 -72420697 + MLT1B LTR MaLR 244 384 -6 5 1419 366 264 84 9 chr2 109334134 109334241 -72413846 + MLT1A0 LTR MaLR 3 117 -248 5 1419 871 318 171 13 chr2 109343911 109344373 -72403714 - MLT1F LTR MaLR 0 548 14 5 1419 768 272 112 96 chr2 109351876 109352250 -72395837 + MLT1B LTR MaLR 1 380 -10 5 1419 950 261 156 16 chr2 109361411 109361726 -72386361 + MTE2b LTR MaLR 1 359 -20 5 1419 277 330 18 9 chr2 109370104 109370214 -72377873 - RMER15 LTR ERVL -58 517 407 5 1419 961 319 60 11 chr2 109371831 109372294 -72375793 + RMER15-int LTR ERVL 730 1215 -3784 5 1419 267 247 0 90 chr2 109373486 109373575 -72374512 + RMER15-int LTR ERVL 4254 4334 -665 5 1419 493 308 124 40 chr2 109374389 109374663 -72373424 + RMER15 LTR ERVL 279 575 0 5 1419 270 330 42 34 chr2 109377731 109377850 -72370237 + MTEa LTR MaLR 54 173 -197 5 1419 302 272 89 95 chr2 109377918 109378097 -72369990 + MTEa LTR MaLR 202 379 0 5 1419 485 309 71 54 chr2 109382857 109383137 -72364950 + MLT1D LTR MaLR 25 309 -196 5 1419 1630 220 112 8 chr2 109393270 109393627 -72354460 + MTD LTR MaLR 1 394 -25 6 1419 529 239 0 8 chr2 109393885 109394003 -72354084 + MTD LTR MaLR 1 117 -302 6 1419 416 246 292 6 chr2 109400654 109400822 -72347265 + RMER15 LTR ERVL 346 561 -14 6 1419 228 340 43 50 chr2 109403846 109404007 -72344080 - MLT1C LTR MaLR -57 538 379 6 1419 421 299 60 65 chr2 109413928 109414188 -72333899 - MLT1C LTR MaLR -49 418 87 6 1419 1112 235 124 24 chr2 109414399 109414778 -72333309 + MTD LTR MaLR 3 419 0 6 1419 1306 223 96 6 chr2 109415847 109416065 -72332022 + ORR1D1 LTR MaLR 1 242 -132 6 1419 1306 223 96 6 chr2 109416169 109416293 -72331794 + ORR1D1 LTR MaLR 243 373 -1 6 1419 499 355 104 65 chr2 109418075 109418407 -72329680 + MLT1F LTR MaLR 85 437 -123 6 1419 336 250 62 77 chr2 109422180 109422310 -72325777 + MLT1E1 LTR MaLR 16 143 -511 6 1419 263 361 53 69 chr2 109422333 109422464 -72325623 + MLT1E1 LTR MaLR 259 387 -237 6 1419 232 343 130 62 chr2 109422705 109422851 -72325236 + MLT1E1 LTR MaLR 440 595 -29 6 1419 292 250 0 45 chr2 109423080 109423168 -72324919 - MLT1C LTR MaLR -4 404 321 6 1419 374 290 32 8 chr2 109423885 109424010 -72324077 + LTR16A1 LTR ERVL 306 433 -23 6 1419 717 306 169 15 chr2 109424521 109424793 -72323294 - MTE2b LTR MaLR -1 378 65 6 1419 227 231 45 15 chr2 109425206 109425272 -72322815 - MLT1C-int LTR MaLR -521 888 821 6 1419 1457 307 30 97 chr2 109426678 109427381 -72320706 - MLT1C-int LTR MaLR -710 661 6 6 1419 603 268 148 62 chr2 109427385 109427628 -72320459 - MLT1C LTR MaLR 0 467 204 6 1419 250 294 139 25 chr2 109427692 109427814 -72320273 - MLT1C LTR MaLR -367 138 3 6 1419 326 315 18 36 chr2 109432885 109432997 -72315090 - RMER15 LTR ERVL -154 421 312 6 1419 1006 327 52 36 chr2 109433011 109433326 -72314761 + MTE2b LTR MaLR 5 315 -64 6 1419 1006 327 52 36 chr2 109433372 109433421 -72314666 + MTE2b LTR MaLR 316 374 -5 6 1419 664 186 27 68 chr2 109433436 109433672 -72314415 - ORR1A2 LTR MaLR 0 326 37 6 1419 231 240 219 0 chr2 109433726 109433822 -72314265 - RMER15 LTR ERVL -458 117 1 6 1419 925 344 68 61 chr2 109434002 109434689 -72313398 - RMER15-int LTR ERVL -2943 2056 1365 6 1419 1619 214 55 37 chr2 109434941 109435324 -72312763 + MTD LTR MaLR 22 411 -8 6 1419 400 236 36 18 chr2 109435327 109435439 -72312648 + MTC LTR MaLR 308 421 0 6 1419 1507 296 117 16 chr2 109435803 109436479 -72311608 - RMER15-int LTR ERVL -3674 1325 582 6 1419 330 332 227 10 chr2 109436972 109437179 -72310908 - RMER15 LTR ERVL 0 575 324 6 1419 1970 229 32 5 chr2 109444140 109444543 -72303544 + MTD LTR MaLR 1 414 -5 6 1420 1639 133 95 98 chr2 109445974 109446332 -72301755 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 38 6 1420 1749 251 41 35 chr2 109446741 109447224 -72300863 - RMER19C LTR ERVK 0 611 126 6 1420 522 340 45 51 chr2 109447845 109448180 -72299907 - ORR1E LTR MaLR -8 351 19 6 1420 366 358 37 63 chr2 109448214 109448405 -72299682 - MLT1K LTR MaLR -360 235 50 6 1420 614 182 14 49 chr2 109450306 109450450 -72297637 - BGLII LTR ERVK -68 353 215 7 1420 3344 67 2 14 chr2 109452014 109452440 -72295647 - BGLII LTR ERVK 0 421 1 7 1420 362 268 41 0 chr2 109452466 109452563 -72295524 + MTEb LTR MaLR 278 378 -1 7 1420 2265 163 85 35 chr2 109480259 109480660 -72267427 + MTC LTR MaLR 1 421 0 7 1420 3159 35 0 0 chr2 109496122 109496468 -72251619 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 7 1420 257 280 36 27 chr2 109502383 109502493 -72245594 - MTEb LTR MaLR 0 379 269 5 1420 229 326 53 53 chr2 109502900 109502994 -72245093 + MLT1J LTR MaLR 46 139 -373 6 1420 435 314 113 31 chr2 109504473 109504667 -72243420 - MLT1H1 LTR MaLR -108 447 238 1 1420 390 297 28 73 chr2 109504839 109505017 -72243070 - MLT1H1 LTR MaLR -220 170 1 1 1420 608 302 38 70 chr2 109506493 109506795 -72241292 - MTE2a LTR MaLR -70 309 50 1 1420 253 333 29 88 chr2 109507225 109507396 -72240691 + MLT1F1 LTR MaLR 372 532 -37 1 1420 1937 115 12 85 chr2 109555964 109556306 -72191781 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 3 6 1420 10123 137 66 33 chr2 109556308 109558208 -72189879 - ORR1A2-int LTR MaLR 0 1963 1 6 1420 2385 105 12 0 chr2 109558208 109558531 -72189556 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 6 1420 317 282 25 30 chr2 109558973 109559085 -72189002 - MLT1A1 LTR MaLR -276 132 17 6 1420 480 327 78 78 chr2 109559826 109560071 -72188016 - ORR1E LTR MaLR -129 245 1 6 1421 1026 282 45 43 chr2 109578825 109579214 -72168873 - MLT1A1 LTR MaLR -6 402 1 1 1421 817 247 80 79 chr2 109584689 109585014 -72163073 - ORR1D2 LTR MaLR -45 329 1 1 1421 421 288 62 41 chr2 109586325 109586470 -72161617 - RMER15 LTR ERVL -3 572 425 1 1421 547 228 102 16 chr2 109588460 109588716 -72159371 + ORR1D1 LTR MaLR 1 367 -3 1 1421 263 346 74 15 chr2 109589152 109589287 -72158800 + LTR16C LTR ERVL 328 470 -19 1 1421 594 230 55 40 chr2 109590079 109590278 -72157809 + RMER17C LTR ERVK 180 381 -29 1 1421 267 337 128 37 chr2 109591257 109591445 -72156642 + MamGypLTR1b LTR Gypsy 1 205 -577 1 1421 847 166 17 107 chr2 109591906 109592317 -72155770 + RMER17B LTR ERVK 1 439 -519 1 1421 736 249 72 59 chr2 109592320 109592489 -72155598 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 197 1 1421 3622 98 182 53 chr2 109592489 109592862 -72155225 - RMER17A LTR ERVK 0 751 312 1 1421 3622 98 182 53 chr2 109593024 109593315 -72154772 - RMER17A LTR ERVK -440 311 2 1 1421 736 249 72 59 chr2 109593315 109593367 -72154720 - ORR1D2 LTR MaLR -174 196 146 1 1421 333 130 0 0 chr2 109593377 109593431 -72154656 + RLTR12A LTR ERVK 12 65 -503 1 1421 390 250 171 12 chr2 109594178 109594348 -72153739 + RLTR12B LTR ERVK 301 497 -31 1 1421 444 346 6 44 chr2 109595478 109595638 -72152449 - MLT2C2 LTR ERVL -63 401 248 1 1421 1910 231 31 17 chr2 109595650 109596063 -72152024 + MTD LTR MaLR 1 419 0 1 1421 1258 179 170 51 chr2 109601143 109601240 -72146847 + MTD LTR MaLR 5 98 -321 1 1421 1258 179 170 51 chr2 109601429 109601702 -72146385 + MTD LTR MaLR 99 419 0 1 1421 1767 174 16 91 chr2 109606270 109606656 -72141431 + ORR1B1 LTR MaLR 38 394 0 1 1421 1709 182 56 8 chr2 109606656 109607011 -72141076 + ORR1B1-int LTR MaLR 1 372 -1591 1 1421 1144 239 150 0 chr2 109610849 109611175 -72136912 + MTEa LTR MaLR 5 379 0 1 1421 1136 266 90 31 chr2 109612519 109612876 -72135211 - MTE2b LTR MaLR 0 379 2 1 1421 595 314 197 7 chr2 109616849 109617144 -72130943 - MLT1A0 LTR MaLR -4 361 11 1 1421 524 368 79 14 chr2 109619853 109620145 -72127942 + LTR16A LTR ERVL 141 451 0 1 1421 674 377 60 16 chr2 109621024 109621409 -72126678 + MER74B LTR ERVL 127 528 -94 1 1421 1024 261 90 62 chr2 109621909 109622199 -72125888 - ORR1E LTR MaLR -52 307 10 1 1421 736 339 77 6 chr2 109630740 109631052 -72117035 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 32 1 1421 703 295 97 36 chr2 109632867 109633212 -72114875 - RMER15 LTR ERVL -14 561 74 2 1421 1107 247 34 93 chr2 109633298 109633708 -72114379 - RMER15-int LTR ERVL -3 4996 4611 2 1421 326 339 200 62 chr2 109636911 109637251 -72110836 - MLT1J LTR MaLR -125 387 1 2 1421 4335 39 2 10 chr2 109642404 109642920 -72105167 + LTRIS3 LTR ERV1 1 512 0 2 1421 1009 64 62 25 chr2 109651526 109651608 -72096479 + RLTR47_MM LTR ERV1 283 366 -166 2 1421 1009 64 62 25 chr2 109651743 109651821 -72096266 + RLTR47_MM LTR ERV1 367 449 -83 2 1421 1824 180 102 0 chr2 109654632 109654965 -72093122 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 2 1421 401 272 75 25 chr2 109658684 109658823 -72089264 - MLT1E2 LTR MaLR -102 525 302 2 1421 645 258 66 33 chr2 109658827 109659268 -72088819 - RMER5 LTR ERV1 -11 523 40 2 1421 500 308 53 22 chr2 109659319 109659512 -72088575 - MLT1E1A LTR MaLR -238 442 255 2 1421 595 294 80 29 chr2 109660321 109660559 -72087528 - MLT1E1A LTR MaLR -428 252 3 2 1421 2403 143 8 18 chr2 109668587 109668985 -72079102 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 2 1421 2020 152 106 34 chr2 109671538 109671982 -72076105 - RMER6C LTR ERVK 0 690 215 2 1421 1726 159 73 84 chr2 109671994 109672352 -72075735 + ORR1B1 LTR MaLR 41 394 0 2 1421 668 170 142 0 chr2 109672360 109672501 -72075586 - RMER6C LTR ERVK -529 161 1 2 1421 400 329 14 54 chr2 109675841 109675989 -72072098 + MLT1L LTR MaLR 149 290 -320 2 1421 983 315 38 21 chr2 109677767 109678107 -72069980 + MLT1A0 LTR MaLR 1 346 -19 2 1421 303 281 131 48 chr2 109678638 109678806 -72069281 + MLT1L LTR MaLR 354 535 -75 2 1421 470 233 75 0 chr2 109679431 109679551 -72068536 + MTD LTR MaLR 291 419 0 2 1421 1914 173 29 29 chr2 109681683 109682063 -72066024 + RLTR14 LTR ERV1 3 382 0 2 1421 579 265 147 122 chr2 109682682 109683043 -72065044 - MTEa LTR MaLR -1 378 9 2 1421 2600 295 72 16 chr2 109683094 109683154 -72064933 + ERVL-int LTR ERVL 3651 3712 -2045 2 1421 2230 84 55 0 chr2 109683154 109683464 -72064623 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 2 1421 2600 295 72 16 chr2 109683464 109684437 -72063650 + ERVL-int LTR ERVL 3713 4742 -1015 2 1421 1692 271 92 5 chr2 109684482 109685116 -72062971 + ERVL-int LTR ERVL 4851 5539 -218 2 1421 324 264 48 24 chr2 109685246 109685370 -72062717 + ERVL-int LTR ERVL 5477 5603 -111 2 1421 1060 237 122 7 chr2 109685713 109686048 -72062039 - MTE2b LTR MaLR -3 376 1 2 1421 2302 130 74 2 chr2 109697327 109697537 -72050550 - MTC LTR MaLR 0 421 198 3 1421 2302 130 74 2 chr2 109697564 109697746 -72050341 - MTC LTR MaLR -224 197 2 3 1421 1350 255 40 12 chr2 109700265 109700587 -72047500 - MTE2b LTR MaLR -4 375 45 3 1421 338 253 21 62 chr2 109702451 109702548 -72045539 + RMER15 LTR ERVL 39 131 -444 3 1421 1038 119 97 0 chr2 109702627 109702812 -72045275 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 127 3 1421 954 240 35 40 chr2 109702813 109703117 -72044970 + RLTR20D LTR ERVK 3 413 -92 3 1421 398 295 86 20 chr2 109703158 109703249 -72044838 + RLTR20D LTR ERVK 414 504 -1 3 1421 784 191 0 18 chr2 109703249 109703396 -72044691 - ORR1A1 LTR MaLR -202 144 1 3 1421 919 230 34 17 chr2 109706714 109706946 -72041141 + RLTR20B1 LTR ERVK 346 568 0 3 1422 2461 144 113 60 chr2 109709572 109710074 -72038013 + RLTR24 LTR ERV1 1 529 0 3 1422 2012 97 19 16 chr2 109714115 109714428 -72033659 - IAPEY_LTR LTR ERVK -17 368 55 3 1422 586 337 44 54 chr2 109722041 109722393 -72025694 + ORR1E LTR MaLR 6 370 -9 3 1422 275 370 64 35 chr2 109728174 109728345 -72019742 + MLT2B1 LTR ERVL 151 326 -194 3 1422 371 315 6 88 chr2 109728398 109728579 -72019508 + MLT2B1 LTR ERVL 387 552 -15 3 1422 762 286 85 53 chr2 109728977 109729114 -72018973 + MLT1C LTR MaLR 110 241 -226 3 1422 2237 96 3 61 chr2 109729114 109729459 -72018628 + ORR1A2 LTR MaLR 1 325 -2 3 1422 762 286 85 53 chr2 109729459 109729661 -72018426 + MLT1C LTR MaLR 242 459 -8 3 1422 303 236 119 112 chr2 109733818 109733848 -72014239 - MT2B2 LTR ERVL -433 151 121 3 1422 255 369 59 59 chr2 109745966 109746185 -72001902 + LTR16B2 LTR ERVL 233 451 -11 4 1422 1829 149 40 76 chr2 109752293 109752715 -71995372 - RMER4A LTR ERVK -2 464 58 4 1422 248 176 102 56 chr2 109762777 109762885 -71985202 - RLTR25B LTR ERVK -519 509 397 4 1422 268 289 0 80 chr2 109767303 109767416 -71980671 - MT2B LTR ERVL -344 257 154 4 1422 477 291 68 100 chr2 109784582 109784903 -71963184 - ORR1E LTR MaLR -48 311 1 4 1422 3703 23 2 0 chr2 109788999 109789394 -71958693 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 1422 380 378 65 28 chr2 109819753 109820077 -71928010 - MLT1J LTR MaLR -37 475 140 5 1422 486 290 24 0 chr2 109827806 109827928 -71920159 - MER57F LTR ERV1 -33 403 279 5 1422 622 204 42 65 chr2 109827972 109828140 -71919947 - MER57F LTR ERV1 -244 192 29 5 1423 1184 242 47 93 chr2 109844843 109845230 -71902857 - MTE2a LTR MaLR 0 379 11 5 1423 2188 171 89 2 chr2 109872742 109872919 -71875168 - RMER4B LTR ERVK -134 451 250 5 1423 2188 171 89 2 chr2 109872944 109873181 -71874906 - RMER4B LTR ERVK -336 249 2 5 1423 1719 155 0 10 chr2 109873185 109873484 -71874603 - MurERV4-int LTR ERVK -21 5239 4944 5 1423 1934 132 82 31 chr2 109873510 109873900 -71874187 - MurERV4-int LTR ERVK -4811 449 40 5 1423 2276 151 108 43 chr2 109873928 109874391 -71873696 - RMER4B LTR ERVK 0 585 93 5 1423 349 346 42 42 chr2 109878133 109878374 -71869713 - MLT1B LTR MaLR -50 340 100 6 1423 1411 161 191 28 chr2 109889439 109889764 -71858323 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 6 1423 1756 183 31 49 chr2 109896536 109896927 -71851160 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 6 1423 879 163 0 126 chr2 109900238 109900428 -71847659 + RMER15 LTR ERVL 393 558 -17 6 1423 3172 167 10 52 chr2 109900511 109901105 -71846982 - RMER15 LTR ERVL 0 575 7 6 1423 227 344 31 62 chr2 109902906 109903036 -71845051 - LTR81B LTR ERV1? -244 1149 1024 6 1423 882 251 43 19 chr2 109904547 109904758 -71843329 - MTEb LTR MaLR 0 379 164 6 1423 494 339 27 16 chr2 109905076 109905262 -71842825 - MTEb LTR MaLR -191 188 1 6 1423 571 199 39 67 chr2 109910397 109910575 -71837512 + MTC-int LTR MaLR 1086 1258 0 6 1423 587 182 45 0 chr2 109910575 109910653 -71837434 + MTC LTR MaLR 1 78 -343 6 1423 587 182 45 0 chr2 109910963 109910994 -71837093 + MTC LTR MaLR 79 113 -308 6 1423 1224 159 114 4 chr2 109911296 109911524 -71836563 + MTC LTR MaLR 116 368 -53 6 1423 2288 180 106 10 chr2 109911967 109912445 -71835642 + RLTR28 LTR ERVL 1 524 0 6 1423 348 218 0 147 chr2 109913856 109913874 -71834213 + MT2B LTR ERVL 153 155 -446 6 1423 1028 81 11 139 chr2 109914014 109914201 -71833886 - RMER17C LTR ERVK 0 410 248 6 1423 702 272 93 29 chr2 109916217 109916544 -71831543 + ORR1E LTR MaLR 1 377 -2 6 1423 4347 134 21 15 chr2 109922027 109922778 -71825309 + RMER6A LTR ERVK 1 756 0 6 1423 319 302 82 74 chr2 109924754 109925170 -71822917 - RLTR12B LTR ERVK -25 334 46 6 1423 1828 196 37 8 chr2 109944159 109944514 -71803573 + ORR1B2 LTR MaLR 3 367 0 7 1423 377 281 77 77 chr2 109953144 109953325 -71794762 - LTR16E2 LTR ERVL -12 556 376 7 1423 878 245 148 57 chr2 109955294 109955700 -71792387 + MT2A LTR ERVL 1 531 -70 7 1423 379 373 179 39 chr2 109955812 109956147 -71791940 - LTR33 LTR ERVL -86 429 48 7 1424 423 262 76 21 chr2 109972202 109972346 -71775741 + RMER15 LTR ERVL 424 575 0 7 1424 328 248 56 28 chr2 109976949 109977057 -71771030 + MTEb LTR MaLR 251 361 -18 7 1424 426 379 29 6 chr2 109991607 109991782 -71756305 + MLT1H LTR MaLR 23 201 -348 7 1424 352 381 82 12 chr2 109991994 109992164 -71755923 + MLT1H LTR MaLR 167 348 -201 7 1424 2660 167 43 82 chr2 109996356 109997014 -71751073 + RMER6C LTR ERVK 1 632 -58 7 1424 1025 259 70 34 chr2 110005791 110006146 -71741941 + ORR1D2 LTR MaLR 1 368 -2 7 1424 516 293 68 16 chr2 110007374 110007565 -71740522 + MLT1A0 LTR MaLR 1 201 -164 1 1424 3163 174 62 56 chr2 110007585 110008391 -71739696 + RLTR40 LTR ERVK 3 813 -4 1 1424 356 318 160 45 chr2 110011500 110011681 -71736406 - RLTR12B LTR ERVK -14 514 333 2 1424 2529 142 15 3 chr2 110011681 110012070 -71736017 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 2 1424 356 318 160 45 chr2 110012070 110012139 -71735948 - RLTR12B LTR ERVK -196 332 270 2 1424 356 318 160 45 chr2 110012231 110012398 -71735689 - RLTR12B LTR ERVK -259 269 48 2 1424 1362 165 222 26 chr2 110018962 110019122 -71728965 - RMER17C LTR ERVK 0 410 234 3 1424 1362 165 222 26 chr2 110019219 110019401 -71728686 - RMER17C LTR ERVK -177 233 2 3 1424 645 298 82 35 chr2 110031306 110031588 -71716499 - MLT1E1 LTR MaLR -13 641 347 5 1424 1022 262 125 58 chr2 110058775 110058788 -71689299 + MTD LTR MaLR 1 17 -402 9 1424 1022 262 125 58 chr2 110058813 110058957 -71689130 + MTD LTR MaLR 18 164 -255 9 1424 1022 262 125 58 chr2 110058984 110058995 -71689092 + MTD LTR MaLR 165 165 -254 9 1424 1022 262 125 58 chr2 110059136 110059358 -71688729 + MTD LTR MaLR 165 418 -1 9 1424 1148 220 134 47 chr2 110061526 110061869 -71686218 - ORR1D1 LTR MaLR -1 373 1 1 1424 1982 140 2 142 chr2 110064061 110064244 -71683843 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 202 1 1424 2413 80 0 24 chr2 110064244 110064579 -71683508 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 1 1424 1982 140 2 142 chr2 110064579 110064819 -71683268 - ORR1B2 LTR MaLR -166 201 3 1 1424 408 272 134 51 chr2 110064912 110065216 -71682871 - MLT1A1 LTR MaLR -3 405 19 1 1424 4659 171 34 15 chr2 110065454 110066298 -71681789 - RMER13A LTR ERVK 0 860 1 1 1424 407 311 113 130 chr2 110068444 110068774 -71679313 - MLT1G LTR MaLR -280 311 1 1 1424 1367 266 92 42 chr2 110071140 110071638 -71676449 - RMER5 LTR ERV1 -11 523 1 1 1424 4265 138 25 30 chr2 110087813 110088573 -71659514 + RMER6A LTR ERVK 1 756 0 1 1424 374 244 0 44 chr2 110088573 110088663 -71659424 + MTD LTR MaLR 99 184 -235 1 1424 541 130 0 0 chr2 110088663 110088740 -71659347 + RLTR31_Mm LTR ERVK 1 77 -484 1 1424 434 198 109 65 chr2 110088740 110088924 -71659163 + RMER3D-int LTR ERVK 658 849 -1993 1 1424 6263 201 36 63 chr2 110089015 110090800 -71657287 + RMER3D-int LTR ERVK 1015 2751 -91 1 1424 350 115 49 37 chr2 110091049 110091130 -71656957 + RMER3D-int LTR ERVK 2759 2840 -2 1 1424 2469 189 38 71 chr2 110091132 110091712 -71656375 + RLTR31_Mm LTR ERVK 1 561 0 1 1424 1100 200 47 21 chr2 110091712 110091947 -71656140 + MTD LTR MaLR 179 419 0 1 1424 1869 171 30 108 chr2 110095227 110095654 -71652433 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 1 1425 1055 173 22 61 chr2 110100589 110100817 -71647270 + RMER10B LTR ERVL 176 394 -4 1 1425 235 350 160 63 chr2 110109560 110109798 -71638289 + MLT1K LTR MaLR 97 357 -238 1 1425 845 345 132 3 chr2 110114285 110114648 -71633439 + MLT1H LTR MaLR 43 452 -97 1 1425 1420 271 68 0 chr2 110116258 110116598 -71631489 + ORR1D2 LTR MaLR 1 363 -7 1 1425 2947 86 0 12 chr2 110117848 110118249 -71629838 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1425 7732 66 10 71 chr2 110118249 110119418 -71628669 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 1 1425 3078 68 0 12 chr2 110119418 110119819 -71628268 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1425 3397 28 5 0 chr2 110120564 110120958 -71627129 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1425 3010 125 9 6 chr2 110124391 110124858 -71623229 - ORR1A3-int LTR MaLR -1495 468 1 1 1425 1592 198 137 14 chr2 110150337 110150696 -71597391 - MTD LTR MaLR -14 405 3 2 1425 741 252 183 12 chr2 110156300 110156576 -71591511 - MTD LTR MaLR 0 421 98 2 1425 1642 224 34 27 chr2 110156576 110156985 -71591102 - MTD LTR MaLR 0 419 8 2 1425 385 242 11 21 chr2 110157002 110157095 -71590992 - MTD LTR MaLR -328 93 2 2 1425 660 242 203 12 chr2 110158300 110158551 -71589536 + RMER21B LTR ERV1 269 567 -275 2 1425 1049 321 69 43 chr2 110168071 110168536 -71579551 - MLT2B2 LTR ERVL 0 515 39 2 1425 550 281 99 91 chr2 110170945 110171130 -71576957 - ORR1C2 LTR MaLR -22 362 172 2 1425 550 281 99 91 chr2 110171229 110171285 -71576802 - ORR1C2 LTR MaLR -213 171 119 2 1425 849 304 33 56 chr2 110171904 110172557 -71575530 - RLTR18B LTR ERVK -24 488 11 2 1425 364 246 60 51 chr2 110173204 110173407 -71574680 + MLT1A0 LTR MaLR 3 243 -122 2 1425 332 347 105 0 chr2 110174642 110174766 -71573321 + ORR1E LTR MaLR 6 142 -217 2 1425 278 231 38 25 chr2 110174760 110174840 -71573247 + ORR1E LTR MaLR 290 370 0 2 1425 732 291 124 44 chr2 110174840 110175177 -71572910 + MTEa LTR MaLR 12 375 -4 2 1425 410 73 0 0 chr2 110179286 110179341 -71568746 - RMER2 LTR ERV1 -512 55 1 2 1425 548 333 44 29 chr2 110179786 110180061 -71568026 - MLT1H2 LTR MaLR -15 474 196 2 1425 850 199 28 11 chr2 110195578 110195756 -71552331 - RMER13B LTR ERVK -3 905 725 2 1425 3151 134 11 2 chr2 110195758 110196228 -71551859 - RMER13B LTR ERVK -434 474 1 2 1425 294 323 30 0 chr2 110199710 110199809 -71548278 + ORR1E LTR MaLR 256 357 -2 2 1425 2249 144 37 16 chr2 110206612 110206994 -71541093 - ORR1B1 LTR MaLR -4 390 1 2 1425 1075 284 69 30 chr2 110208343 110208514 -71539573 - MTE2b LTR MaLR 0 379 214 2 1425 1075 284 69 30 chr2 110208588 110208779 -71539308 - MTE2b LTR MaLR -166 213 4 2 1425 457 269 77 18 chr2 110216041 110216211 -71531876 - RMER15 LTR ERVL -1 574 395 2 1425 298 377 25 55 chr2 110223512 110223675 -71524412 + MLT1A0 LTR MaLR 197 354 -11 3 1425 1156 254 74 69 chr2 110225111 110225488 -71522599 - MTE2b LTR MaLR 0 379 1 3 1426 826 187 45 201 chr2 110234134 110234440 -71513647 - ORR1B1 LTR MaLR -115 279 20 3 1426 1255 115 16 0 chr2 110234913 110235095 -71512992 + RMER19B LTR ERVK 1 185 -717 3 1426 2617 198 44 20 chr2 110235098 110235603 -71512484 + RMER19B LTR ERVK 368 884 -18 3 1426 485 323 82 70 chr2 110238785 110239141 -71508946 - MLT1A LTR MaLR -5 360 1 3 1426 2012 193 16 0 chr2 110240497 110240865 -71507222 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 3 1426 634 192 8 24 chr2 110244735 110244858 -71503229 + MT2B LTR ERVL 1 121 -412 3 1426 978 249 30 92 chr2 110246779 110247158 -71500929 + MT2B LTR ERVL 87 600 -1 3 1426 266 222 0 0 chr2 110247250 110247304 -71500783 - RLTR24 LTR ERV1 0 529 476 3 1426 799 329 45 74 chr2 110247293 110247782 -71500305 + RLTR17 LTR ERVK 133 607 -85 3 1426 1199 195 63 22 chr2 110247814 110248082 -71500005 - RLTR24 LTR ERV1 -46 483 205 3 1426 3347 30 8 0 chr2 110257328 110257721 -71490366 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 1426 2993 86 9 9 chr2 110262387 110262808 -71485279 - BGLII LTR ERVK 0 421 1 3 1426 2912 189 113 21 chr2 110262808 110263746 -71484341 - MYSERV16_I-int LTR ERVK 0 2326 1303 3 1426 514 167 69 42 chr2 110263762 110263906 -71484181 - RMER3D-int LTR ERVK -1163 1679 1532 3 1426 1786 152 121 17 chr2 110263938 110264408 -71483679 - RMER3D-int LTR ERVK -1309 1533 1015 3 1426 695 222 22 51 chr2 110264445 110264720 -71483367 - RMER3D-int LTR ERVK -1907 935 669 3 1426 2768 76 36 29 chr2 110264767 110264874 -71483213 - BGLII LTR ERVK 0 421 314 3 1426 3203 51 2 10 chr2 110264874 110265273 -71482814 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 1426 2768 76 36 29 chr2 110265273 110265583 -71482504 - BGLII LTR ERVK -108 313 1 3 1426 1543 211 108 25 chr2 110290234 110290642 -71457445 - RMER16 LTR ERVK 0 533 92 3 1426 443 298 84 106 chr2 110291736 110292010 -71456077 - ORR1D2-int LTR MaLR -670 700 433 4 1426 1464 233 52 50 chr2 110292269 110292707 -71455380 - ORR1D2-int LTR MaLR -930 440 2 4 1426 922 281 119 9 chr2 110292722 110293042 -71455045 - ORR1D2 LTR MaLR -13 357 3 4 1426 2187 211 139 22 chr2 110295089 110295636 -71452451 - RMER19C LTR ERVK 0 611 1 4 1426 2537 40 18 0 chr2 110298546 110298872 -71449215 - IAPEY_LTR LTR ERVK 0 385 54 4 1426 2878 6 0 0 chr2 110302182 110302504 -71445583 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 4 1426 42123 17 1 4 chr2 110302504 110307366 -71440721 - MMETn-int LTR ERVK 0 4844 1 4 1426 2878 6 0 0 chr2 110307366 110307688 -71440399 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 4 1426 3139 53 8 0 chr2 110315860 110316253 -71431834 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 1426 1274 283 29 48 chr2 110317404 110317816 -71430271 - MTD LTR MaLR -15 404 1 4 1426 266 196 0 0 chr2 110323392 110323438 -71424649 - ORR1E LTR MaLR -308 51 6 4 1426 253 327 77 82 chr2 110334117 110334287 -71413800 + MLT1F2 LTR MaLR 386 554 -6 4 1426 307 315 15 95 chr2 110335041 110335178 -71412909 + RMER15 LTR ERVL 277 402 -173 4 1426 278 381 89 22 chr2 110335199 110335379 -71412708 + RMER15-int LTR ERVL 4 195 -4804 4 1426 1160 146 140 25 chr2 110335381 110335742 -71412345 + LTRIS5 LTR ERV1 1 447 0 4 1426 925 335 69 3 chr2 110335743 110336078 -71412009 + RMER15-int LTR ERVL 195 551 -4448 4 1426 3265 78 6 39 chr2 110337855 110338346 -71409741 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 4 1426 445 314 95 7 chr2 110341636 110341847 -71406240 + MLT2B4 LTR ERVL 10 237 -227 4 1426 1123 263 94 3 chr2 110354123 110354462 -71393625 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 4 1426 726 293 68 26 chr2 110354462 110354717 -71393370 + MLT1C LTR MaLR 11 276 -191 4 1426 3147 196 44 3 chr2 110355749 110356408 -71391679 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 1641 2326 0 4 1426 2095 248 37 51 chr2 110356410 110356976 -71391111 + RLTR20B3 LTR ERVK 6 563 -14 4 1426 2455 205 40 31 chr2 110357655 110358174 -71389913 - RLTR28 LTR ERVL 0 524 1 4 1427 457 277 240 13 chr2 110365925 110366219 -71381868 + MLT1E1A LTR MaLR 292 652 -2 5 1427 343 271 14 0 chr2 110379444 110379514 -71368573 - MTD LTR MaLR -269 150 80 5 1427 242 189 0 0 chr2 110396731 110396768 -71351319 + MLT1J2 LTR MaLR 266 302 -146 5 1427 421 246 55 143 chr2 110404636 110404944 -71343143 - RLTR21 LTR ERVK -112 1460 1180 5 1427 576 241 0 8 chr2 110415132 110415249 -71332838 - MTD LTR MaLR -299 120 5 5 1427 376 272 30 111 chr2 110415252 110415485 -71332602 + MTEa-int LTR MaLR 1187 1358 -12 5 1427 396 280 0 29 chr2 110424309 110424428 -71323659 + MTEa LTR MaLR 260 379 0 5 1427 522 268 88 16 chr2 110427279 110427461 -71320626 + MTD LTR MaLR 5 199 -220 5 1427 2720 167 100 111 chr2 110431132 110431477 -71316610 - RMER6D LTR ERVK -4 716 363 5 1427 2720 167 100 111 chr2 110431543 110431919 -71316168 - RMER6D LTR ERVK -358 362 3 5 1427 2095 202 30 15 chr2 110432992 110433394 -71314693 - MTC LTR MaLR -9 412 5 5 1427 421 270 17 17 chr2 110439611 110439728 -71308359 - RMER5 LTR ERV1 -1 533 417 5 1427 351 343 54 77 chr2 110440775 110440985 -71307102 + MLT1H LTR MaLR 91 296 -253 5 1427 887 223 170 76 chr2 110441290 110441673 -71306414 - MTD LTR MaLR 0 419 1 5 1427 285 324 67 39 chr2 110442979 110443159 -71304928 + MLT1D LTR MaLR 276 460 -45 5 1427 389 256 59 82 chr2 110444145 110444315 -71303772 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 265 5 1427 2200 155 5 18 chr2 110445459 110445840 -71302247 + ORR1C1 LTR MaLR 3 378 0 5 1427 3376 35 2 0 chr2 110448427 110448822 -71299265 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 1427 1519 189 51 13 chr2 110452214 110452525 -71295562 - RLTR17 LTR ERVK -83 609 287 5 1427 1980 106 29 68 chr2 110454494 110454877 -71293210 - RLTR9A LTR ERVK 0 368 1 5 1427 441 194 0 112 chr2 110455013 110455129 -71292958 - MT2B LTR ERVL -338 263 161 5 1427 983 275 63 21 chr2 110458128 110458507 -71289580 - MER57F LTR ERV1 -8 428 34 5 1427 490 324 161 62 chr2 110462303 110462688 -71285399 - MTE-int LTR MaLR -108 1472 1050 6 1427 501 295 186 26 chr2 110466644 110466950 -71281137 - MTE-int LTR MaLR -782 798 444 6 1427 1803 212 17 17 chr2 110467738 110468156 -71279931 - MTC LTR MaLR 0 421 4 6 1427 1145 252 60 106 chr2 110471685 110471934 -71276153 - MTE2a LTR MaLR 0 379 125 6 1427 1145 252 60 106 chr2 110471969 110472105 -71275982 - MTE2a LTR MaLR -255 124 12 6 1427 921 223 5 5 chr2 110482848 110483033 -71265054 + RLTR28 LTR ERVL 2 186 -338 6 1427 254 167 67 0 chr2 110483174 110483234 -71264853 + RLTR28 LTR ERVL 427 490 -34 6 1427 238 196 53 18 chr2 110485884 110485941 -71262146 - ORR1E LTR MaLR -241 118 60 6 1427 2008 131 75 54 chr2 110489444 110489680 -71258407 + RMER10B LTR ERVL 1 249 -149 6 1427 2008 131 75 54 chr2 110489727 110489877 -71258210 + RMER10B LTR ERVL 250 395 -3 6 1427 1093 70 25 12 chr2 110490808 110490968 -71257119 - RLTR45 LTR ERVK -124 358 197 6 1427 880 267 68 118 chr2 110491729 110492196 -71255891 + RLTR12B LTR ERVK 42 485 -43 6 1427 429 178 32 32 chr2 110493330 110493423 -71254664 + RLTR23 LTR ERV1 338 430 0 6 1428 1124 271 45 42 chr2 110494050 110494358 -71253729 + ORR1E LTR MaLR 1 309 -50 6 1428 245 394 35 42 chr2 110523357 110523500 -71224587 + MLT1H2 LTR MaLR 22 163 -326 4 1428 2679 155 44 23 chr2 110541405 110541887 -71206200 + RLTR19 LTR ERVK 1 492 -7 8 1428 1226 256 48 131 chr2 110546467 110547211 -71200876 + RMER19B LTR ERVK 1 902 0 8 1428 2465 194 45 16 chr2 110567736 110568248 -71179839 - RLTR11A2 LTR ERVK 0 527 1 1 1428 342 375 59 16 chr2 110600890 110601145 -71146942 + LTR33 LTR ERVL 203 468 -47 1 1428 1176 247 114 0 chr2 110608580 110608912 -71139175 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 1 1428 1353 272 24 3 chr2 110621967 110622295 -71125792 - MTD LTR MaLR 0 419 85 2 1428 630 338 30 4 chr2 110622490 110622722 -71125365 + MT2A LTR ERVL 227 464 -69 2 1429 1753 163 312 11 chr2 110626859 110627470 -71120617 - RMER6C LTR ERVK -59 697 1 2 1429 653 345 126 38 chr2 110629075 110629527 -71118560 + MLT1E3 LTR MaLR 133 624 0 2 1429 246 327 83 9 chr2 110631741 110631849 -71116238 + MTEa LTR MaLR 35 150 -229 2 1429 586 209 0 0 chr2 110634347 110634457 -71113630 + ETnERV2-int LTR ERVK 2637 2746 -4660 2 1429 1211 186 65 15 chr2 110634458 110634720 -71113367 + ETnERV2-int LTR ERVK 3299 3573 -3833 2 1429 431 323 51 5 chr2 110635577 110635773 -71112314 + MER110 LTR ERV1 4 208 -283 2 1429 509 308 149 34 chr2 110640132 110640455 -71107632 + MT2A LTR ERVL 1 360 -173 2 1429 512 315 120 22 chr2 110641183 110641532 -71106555 - MTD LTR MaLR 0 419 25 2 1429 1055 268 66 25 chr2 110643474 110643806 -71104281 + MTD LTR MaLR 1 340 -67 2 1429 2584 122 146 37 chr2 110646909 110647394 -71100693 - RMER20B LTR ERVK -87 540 3 2 1429 428 324 113 33 chr2 110647557 110647892 -71100195 + MERVK26-int LTR ERVK 95 456 -6463 2 1429 6587 322 60 47 chr2 110648750 110652559 -71095528 + MERVK26-int LTR ERVK 2112 5972 -947 2 1429 556 149 58 6 chr2 110653760 110653961 -71094126 + ORR1A3 LTR MaLR 1 248 -81 2 1429 694 112 52 47 chr2 110658220 110658404 -71089683 + RMER17B LTR ERVK 301 502 -404 2 1429 259 152 150 17 chr2 110658847 110658907 -71089180 + RLTR19 LTR ERVK 1 68 -431 2 1429 879 232 6 11 chr2 110668173 110668352 -71079735 + RLTR19 LTR ERVK 322 499 0 2 1429 729 228 0 30 chr2 110669445 110669612 -71078475 + RMER6B LTR ERVK 286 447 -14 2 1429 288 361 26 77 chr2 110693782 110693938 -71054149 - MLT1H LTR MaLR -223 326 179 3 1429 1040 275 32 27 chr2 110694411 110694781 -71053306 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 3 3 1429 1944 67 7 11 chr2 110695582 110695854 -71052233 - MTA_Mm LTR MaLR -125 271 1 3 1429 4659 77 8 103 chr2 110695854 110696634 -71051453 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 393 3 1429 1534 206 22 12 chr2 110698228 110698552 -71049535 + ORR1A4 LTR MaLR 1 327 -2 3 1429 8344 169 69 106 chr2 110698554 110698686 -71049401 + ORR1A4-int LTR MaLR 1 133 -1830 3 1429 8344 169 69 106 chr2 110698829 110700735 -71047352 + ORR1A4-int LTR MaLR 134 1963 0 3 1429 1633 187 21 12 chr2 110700736 110701061 -71047026 + ORR1A4 LTR MaLR 2 329 0 3 1429 1045 254 44 11 chr2 110701473 110701744 -71046343 + RLTR11A2 LTR ERVK 204 483 -44 3 1429 2048 138 29 156 chr2 110701744 110702226 -71045861 + RLTR23 LTR ERV1 1 421 -9 3 1429 1008 303 36 28 chr2 110711763 110712123 -71035964 + MTE2b LTR MaLR 1 363 -16 3 1429 431 234 96 34 chr2 110716018 110716164 -71031923 + MTEb LTR MaLR 225 379 0 3 1429 3403 160 76 46 chr2 110718672 110719017 -71029070 + RMER6A LTR ERVK 1 325 -431 3 1429 3403 160 76 46 chr2 110719223 110719610 -71028477 + RMER6A LTR ERVK 326 755 -1 3 1429 1718 232 99 96 chr2 110729389 110730350 -71017737 - RMER13B LTR ERVK -4 904 1 3 1429 470 253 218 74 chr2 110733079 110733353 -71014734 + MTEa LTR MaLR 19 376 -3 3 1429 313 317 99 43 chr2 110737844 110738055 -71010032 - RMER15 LTR ERVL 0 575 353 3 178 1803 217 38 6 chr2 110755733 110756099 -70991988 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 4 1430 274 184 15 47 chr2 110756099 110756173 -70991914 + ORR1C1-int LTR MaLR 1 71 -1892 4 1430 839 299 97 32 chr2 110756798 110757140 -70990947 - MTE2b LTR MaLR 0 379 16 4 1430 312 328 26 0 chr2 110761868 110761984 -70986103 + RLTR15 LTR ERVK 129 247 -112 4 1430 2032 211 50 36 chr2 110761990 110762492 -70985595 + RLTR17 LTR ERVK 105 613 -79 4 1430 807 321 69 0 chr2 110765122 110765368 -70982719 + MTEb LTR MaLR 11 273 -106 4 1430 791 319 48 38 chr2 110768506 110768796 -70979291 - MTE2a LTR MaLR 0 379 87 4 1430 298 348 34 41 chr2 110781791 110781938 -70966149 + MER52-int LTR ERV1 109 254 -6837 4 1430 233 163 22 0 chr2 110798136 110798182 -70949905 + ORR1C1 LTR MaLR 186 232 -146 4 1430 3189 52 3 0 chr2 110801258 110801642 -70946445 - IAPEY_LTR LTR ERVK 0 385 1 4 1430 432 305 99 10 chr2 110801937 110802139 -70945948 - RMER20B LTR ERVK -228 399 180 4 1430 1542 191 0 76 chr2 110804000 110804329 -70943758 - ORR1C1 LTR MaLR -70 308 5 4 1430 540 338 91 5 chr2 110807336 110807556 -70940531 + LTR33C LTR ERVL 40 278 -351 4 1430 354 318 81 54 chr2 110807618 110807804 -70940283 + LTR33C LTR ERVL 424 614 -15 4 1430 246 319 10 50 chr2 110810973 110811072 -70937015 - MTD LTR MaLR -59 360 266 5 1430 727 164 55 0 chr2 110814851 110814979 -70933108 + RLTR14 LTR ERV1 9 143 -239 5 1430 243 365 46 40 chr2 110820826 110821000 -70927087 + LTR79 LTR ERVL 353 527 0 5 1430 714 259 73 14 chr2 110831624 110831870 -70916217 + MTD LTR MaLR 163 421 0 5 1430 231 208 42 0 chr2 110835880 110835928 -70912159 + MER21B LTR ERV1 127 176 -687 5 1430 547 288 83 101 chr2 110840664 110841000 -70907087 + MT2A LTR ERVL 131 460 -73 5 1430 2655 52 0 27 chr2 110849803 110850139 -70897948 + IAPLTR2b LTR ERVK 1 327 0 5 1430 2666 49 0 27 chr2 110855517 110855853 -70892234 + IAPLTR2b LTR ERVK 1 327 0 5 1430 3488 45 28 9 chr2 110861252 110861680 -70886407 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 5 1430 6809 52 5 56 chr2 110861680 110862621 -70885466 - MMERVK10C-int LTR ERVK 0 7581 6692 5 1430 6809 52 5 56 chr2 110862652 110862696 -70885391 - MMERVK10C-int LTR ERVK -890 6691 6647 5 1430 38926 51 2 1 chr2 110862682 110867618 -70880469 - MMERVK10C-int LTR ERVK -1771 5810 870 5 1430 2476 114 34 3 chr2 110867616 110868003 -70880084 - MMERVK10C-int LTR ERVK -7182 399 1 5 1430 3479 45 28 9 chr2 110868003 110868431 -70879656 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 5 1430 1822 210 32 3 chr2 110873831 110874204 -70873883 - MTC LTR MaLR -35 386 3 5 1430 948 332 29 50 chr2 110875249 110875629 -70872458 + MTE2a LTR MaLR 3 374 -5 5 1430 239 250 76 43 chr2 110878402 110878494 -70869593 - MTEb LTR MaLR -12 367 273 5 1430 257 315 0 89 chr2 110878772 110878873 -70869214 - MTEb LTR MaLR -287 92 1 5 1431 512 290 50 62 chr2 110892964 110892984 -70855103 - RLTR20A LTR ERVK -157 394 376 5 1431 731 254 53 44 chr2 110893165 110893464 -70854623 - RLTR20A LTR ERVK -176 375 71 5 1431 1050 143 5 38 chr2 110907305 110907516 -70840571 + RMER17A-int LTR ERVK 788 991 -737 6 1431 2648 152 101 124 chr2 110907552 110907767 -70840320 + RMER17A-int LTR ERVK 982 1177 -551 6 1431 2648 152 101 124 chr2 110907823 110907839 -70840248 + RMER17A-int LTR ERVK 1178 1178 -550 6 1431 2648 152 101 124 chr2 110908331 110908774 -70839313 + RMER17A-int LTR ERVK 1178 1641 -87 6 1431 316 319 113 94 chr2 110913525 110913843 -70834244 - RMER12 LTR ERVK -5 1317 994 6 1431 5049 117 25 10 chr2 110913873 110914666 -70833421 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1043 805 1 6 1431 1344 211 79 98 chr2 110916236 110916603 -70831484 + ORR1C2 LTR MaLR 1 360 -24 6 1431 1400 182 117 63 chr2 110918787 110918936 -70829151 + ORR1B1 LTR MaLR 41 210 -184 6 1431 1400 182 117 63 chr2 110919461 110919645 -70828442 + ORR1B1 LTR MaLR 211 392 -2 6 1431 258 293 17 0 chr2 110922543 110922601 -70825486 + RLTR18B LTR ERVK 448 506 -6 6 1431 268 217 31 62 chr2 110936006 110936070 -70812017 + RLTR18 LTR ERVK 552 613 -3 6 1431 1446 218 68 7 chr2 110966027 110966337 -70781750 + MTC LTR MaLR 1 329 -92 6 1431 927 154 82 6 chr2 110966485 110966668 -70781419 + MTC LTR MaLR 1 197 -224 6 1431 638 264 12 47 chr2 110967422 110967593 -70780494 + MTC LTR MaLR 205 369 -52 6 1431 294 233 19 42 chr2 110967581 110967694 -70780393 + MTD LTR MaLR 313 421 0 6 1431 227 221 35 115 chr2 110974310 110974397 -70773690 - RLTR19 LTR ERVK -312 187 108 7 1431 2790 196 154 27 chr2 110976134 110976811 -70771276 + RMER21B LTR ERV1 2 764 -78 7 1431 249 249 89 84 chr2 110977933 110978164 -70769923 + RLTR15 LTR ERVK 42 293 -284 7 1431 423 208 21 138 chr2 110991070 110991098 -70756989 - MT2B LTR ERVL -440 161 151 7 1431 454 340 116 60 chr2 111003752 111004037 -70744050 - MTD LTR MaLR -108 311 1 9 1432 386 369 5 20 chr2 111032129 111032328 -70715759 - MTEa LTR MaLR -179 200 5 3 1432 1037 206 91 9 chr2 111033132 111033362 -70714725 + RLTR12B LTR ERVK 1 249 -279 3 1432 594 225 39 13 chr2 111033359 111033512 -70714575 + RLTR12B LTR ERVK 372 528 0 3 1432 918 262 106 28 chr2 111058999 111059359 -70688728 - MTE2a LTR MaLR -15 404 18 6 1432 2196 138 142 19 chr2 111064355 111064784 -70683303 + RLTR45 LTR ERVK 1 482 0 7 1432 818 251 60 10 chr2 111078825 111079026 -70669061 - RLTR18B LTR ERVK -5 507 297 8 1432 1167 228 0 4 chr2 111079066 111079291 -70668796 - RLTR18B LTR ERVK -216 296 73 8 1432 711 187 28 35 chr2 111079293 111079448 -70668639 - RLTR13C2 LTR ERVK -20 788 655 9 1432 1315 147 8 19 chr2 111079784 111080169 -70667918 - RLTR13D5 LTR ERVK -832 191 1 9 1432 1606 138 124 0 chr2 111085281 111085572 -70662515 - IAPEY3_LTR LTR ERVK -5 327 1 9 1432 1352 201 55 20 chr2 111085572 111085917 -70662170 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 6125 9 1432 1729 142 48 0 chr2 111085935 111086266 -70661821 - MMERVK10C-int LTR ERVK -343 7337 6965 9 1432 1339 146 102 0 chr2 111086266 111086492 -70661595 - IAPEz-int LTR ERVK -1287 5255 5007 9 1432 312 164 36 0 chr2 111086492 111086547 -70661540 - IAPEz-int LTR ERVK -6039 503 447 9 1432 448 333 35 35 chr2 111086564 111086959 -70661128 - IAP-d-int LTR ERVK -6015 1566 822 1 1432 338 135 58 0 chr2 111086975 111087027 -70661060 - RMER16-int LTR ERVK -983 1004 950 1 1432 1615 196 122 23 chr2 111087022 111087516 -70660571 - RMER16-int LTR ERVK -5475 662 192 1 1432 1030 119 24 99 chr2 111087638 111087988 -70660099 - IAPEY3-int LTR ERVK -6629 952 538 1 1432 865 132 21 7 chr2 111087986 111088131 -70659956 - IAPEY3-int LTR ERVK -7531 149 3 1 1432 1597 152 122 0 chr2 111088131 111088426 -70659661 - IAPEY3_LTR LTR ERVK -1 331 1 1 1432 3386 234 42 70 chr2 111117971 111118980 -70629107 - RLTR25A LTR ERVK 0 1028 1 1 1432 4221 32 0 2 chr2 111121650 111122144 -70625943 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 1 1432 314 0 0 0 chr2 111122144 111122182 -70625905 - MERVL-int LTR ERVL 0 5485 5448 1 1432 371 111 26 53 chr2 111122182 111122258 -70625829 - ORR1A3-int LTR MaLR -1323 640 567 1 1432 47485 20 0 0 chr2 111122258 111127629 -70620458 - MERVL-int LTR ERVL -114 5371 1 1 1432 4245 30 0 2 chr2 111127629 111128123 -70619964 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 1 1432 2434 207 106 78 chr2 111133825 111134558 -70613529 + RLTR40 LTR ERVK 42 795 -22 1 1433 687 263 128 38 chr2 111149781 111150101 -70597986 + RMER5 LTR ERV1 181 529 -5 1 1433 3548 209 79 48 chr2 111157187 111157397 -70590690 - RLTR25A LTR ERVK 0 1103 867 2 1433 3548 209 79 48 chr2 111157516 111158216 -70589871 - RLTR25A LTR ERVK -237 866 166 2 1433 333 294 41 25 chr2 111158999 111159121 -70588966 - RLTR22_Mur LTR ERVK -133 1715 1592 2 1433 1232 246 67 24 chr2 111159148 111159523 -70588564 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1043 805 415 2 1433 333 294 36 18 chr2 111159571 111159682 -70588405 + RLTR23 LTR ERV1 317 429 -1 2 1433 266 342 36 61 chr2 111160275 111160440 -70587647 + RLTR8 LTR ERVK 205 365 0 2 1433 2913 129 69 8 chr2 111160786 111161262 -70586825 + RMER16-int LTR ERVK 87 591 -4815 2 1433 234 298 11 77 chr2 111161897 111161932 -70586155 + MT2B LTR ERVL 131 215 -386 2 1433 295 257 38 117 chr2 111168390 111168518 -70579569 + RMER17A LTR ERVK 287 404 -347 2 1433 295 257 38 117 chr2 111168544 111168706 -70579381 + RMER17A LTR ERVK 405 553 -198 2 1433 1290 199 57 178 chr2 111172070 111172559 -70575528 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 1 2 1433 662 297 0 0 chr2 111173266 111173421 -70574666 - ORR1D1 LTR MaLR -210 164 10 2 1433 410 313 9 9 chr2 111173403 111173519 -70574568 - ORR1D1 LTR MaLR -254 120 5 2 1433 351 229 190 16 chr2 111173509 111173683 -70574404 - ORR1D1-int LTR MaLR -39 1541 1216 2 1433 1659 68 0 0 chr2 111198944 111199163 -70548924 + MTB LTR MaLR 182 400 0 2 1433 6011 101 29 72 chr2 111199174 111200263 -70547824 + MTB-int LTR MaLR 58 1098 0 2 1433 2604 64 6 0 chr2 111200263 111200607 -70547480 + MTB LTR MaLR 1 346 -54 2 1433 2139 68 78 34 chr2 111200911 111201231 -70546856 + LTRIS2 LTR ERV1 1 334 -230 2 1433 2723 99 10 10 chr2 111202286 111202682 -70545405 - LTRIS2 LTR ERV1 0 564 169 2 1433 233 86 0 0 chr2 111205614 111205649 -70542438 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 344 2 1433 679 145 105 105 chr2 111205674 111205836 -70542251 - RMER6C LTR ERVK -526 164 3 2 1433 2654 130 53 5 chr2 111224636 111225052 -70523035 + RLTR10C LTR ERVK 1 436 0 3 1433 44494 72 2 1 chr2 111225062 111230776 -70517311 + MMERVK10C-int LTR ERVK 41 5810 -1771 3 1433 4614 102 11 7 chr2 111230762 111231764 -70516323 + MMERVK10C-int LTR ERVK 6646 7677 -3 3 1433 2325 106 184 5 chr2 111231773 111232143 -70515944 + RLTR10C LTR ERVK 1 436 0 3 1433 2029 189 37 6 chr2 111234938 111235338 -70512749 + RLTR33 LTR ERVK 230 678 0 3 1433 2087 211 6 0 chr2 111242966 111243331 -70504756 - ORR1C1 LTR MaLR -2 376 10 3 1433 4634 236 77 38 chr2 111243330 111243651 -70504436 - ORR1C1-int LTR MaLR -20 1350 1029 3 1433 1484 220 29 37 chr2 111243651 111244028 -70504059 + ORR1C1 LTR MaLR 5 378 0 3 1433 4634 236 77 38 chr2 111244028 111245002 -70503085 - ORR1C1-int LTR MaLR -342 1028 4 3 1433 1275 201 81 145 chr2 111245006 111245413 -70502674 - ORR1C1 LTR MaLR -1 383 3 3 1433 1195 196 55 179 chr2 111256995 111257486 -70490601 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 1 3 1433 680 285 13 0 chr2 111258237 111258395 -70489692 - ORR1D1 LTR MaLR -210 164 5 3 1433 397 261 143 15 chr2 111258385 111258580 -70489507 - ORR1D1-int LTR MaLR -39 1541 1165 3 1433 313 276 22 66 chr2 111274127 111274263 -70473824 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1 130 -1718 3 1433 4443 190 47 46 chr2 111276632 111277608 -70470479 - RLTR25B LTR ERVK 0 1028 52 3 1433 4064 84 3 16 chr2 111277659 111278224 -70469863 - LTRIS2 LTR ERV1 -1 563 6 3 1433 3302 211 35 60 chr2 111278262 111279139 -70468948 + RLTR13A LTR ERVK 1 855 0 3 1433 1124 106 28 11 chr2 111279143 111279324 -70468763 + ETnERV3-int LTR ERVK 3 186 -5622 3 179 11078 103 17 37 chr2 111279489 111281287 -70466800 + ETnERV3-int LTR ERVK 186 1845 -3963 3 1434 2475 81 26 0 chr2 111281293 111281638 -70466449 - IAPEY2_LTR LTR ERVK -3 354 1 3 1434 5602 88 4 8 chr2 111281638 111282420 -70465667 - IAPEy-int LTR ERVK 0 7513 6735 3 1434 3547 77 0 2 chr2 111282409 111282865 -70465222 - IAPEy-int LTR ERVK -1366 6215 5761 3 1434 3176 109 0 16 chr2 111282856 111283303 -70464784 - IAPEy-int LTR ERVK -1939 5642 5203 3 1434 577 71 47 66 chr2 111283562 111283668 -70464419 - IAPEy-int LTR ERVK -2911 4670 4567 3 1434 439 86 0 0 chr2 111283665 111283723 -70464364 - IAPEy-int LTR ERVK -3782 3624 3567 3 1434 667 202 0 0 chr2 111283749 111283868 -70464219 - IAPEy-int LTR ERVK -4653 2753 2635 3 1434 290 256 0 65 chr2 111283880 111283972 -70464115 - IAPEy-int LTR ERVK -4867 2539 2454 3 1434 496 212 88 0 chr2 111283985 111284098 -70463989 - RMER16-int LTR ERVK -5077 1060 938 3 1434 1750 183 216 33 chr2 111284103 111284584 -70463503 - RMER16-int LTR ERVK -4587 819 251 3 1434 1276 156 150 17 chr2 111284767 111285061 -70463026 - IAPEy-int LTR ERVK -6748 765 433 3 1434 606 184 101 102 chr2 111286158 111286350 -70461737 - RMER6C LTR ERVK -480 240 1 3 1434 2266 160 122 2 chr2 111302116 111302518 -70445569 + RLTR33 LTR ERVK 229 678 0 3 1434 2081 208 6 0 chr2 111309595 111309960 -70438127 - ORR1C1 LTR MaLR -2 376 10 4 1434 3130 257 77 105 chr2 111309959 111311490 -70436597 - ORR1C1-int LTR MaLR -20 1489 2 4 1434 1740 194 69 28 chr2 111311492 111311852 -70436235 - ORR1C1 LTR MaLR -1 377 3 4 1434 3948 167 12 17 chr2 111316463 111317223 -70430864 - RMER6A LTR ERVK 0 756 1 4 1434 483 128 58 0 chr2 111328497 111328583 -70419504 + RLTR21 LTR ERVK 715 805 -767 4 1434 237 235 20 0 chr2 111328566 111328617 -70419470 + RMER12 LTR ERVK 734 785 -537 4 1434 3094 203 10 121 chr2 111345390 111345897 -70402190 + RLTR21 LTR ERVK 7 458 -1114 4 1434 3094 203 10 121 chr2 111346066 111346366 -70401721 + RLTR21 LTR ERVK 459 724 -848 4 1434 1385 220 30 52 chr2 111347560 111347967 -70400120 + RLTR21 LTR ERVK 715 1112 -460 4 1434 1798 151 52 117 chr2 111355165 111355585 -70392502 + RLTR9C LTR ERVK 1 393 0 4 1434 4190 189 45 91 chr2 111355586 111356800 -70391287 + MMETn-int LTR ERVK 1 1159 -3685 4 1434 2734 160 29 8 chr2 111356857 111357349 -70390738 + ETnERV2-int LTR ERVK 2496 2997 -4409 4 1434 1027 104 0 18 chr2 111357349 111357515 -70390572 + RLTR13D1 LTR ERVK 486 648 -158 4 1434 4113 178 21 40 chr2 111358028 111360072 -70388015 + MMETn-int LTR ERVK 2356 6425 -981 4 1434 475 111 0 0 chr2 111360286 111360358 -70387729 + MMETn-int LTR ERVK 7331 7402 -4 4 1434 1955 138 59 96 chr2 111360370 111360778 -70387309 + RLTR9C LTR ERVK 1 393 0 4 1434 424 293 133 37 chr2 111372806 111372994 -70375093 + MLT2D LTR ERVL 6 211 -203 4 1434 2301 98 81 36 chr2 111373408 111373801 -70374286 - IAPLTR2a LTR ERVK 0 411 1 4 1434 555 269 126 67 chr2 111387366 111387739 -70360348 - RMER10A LTR ERVL 0 442 23 4 1434 641 199 38 142 chr2 111388053 111388369 -70359718 - RMER17C-int LTR ERVK -372 2866 2584 4 1434 2531 101 108 36 chr2 111388374 111388817 -70359270 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 4 1434 3429 66 15 29 chr2 111388818 111389558 -70358529 + IAPEz-int LTR ERVK 9 662 -5819 4 1434 957 59 0 0 chr2 111389558 111389677 -70358410 + IAPEz-int LTR ERVK 1359 1477 -5004 4 1434 1789 115 8 0 chr2 111389672 111389924 -70358163 + IAPEz-int LTR ERVK 2244 2497 -5183 4 1434 932 73 24 0 chr2 111389921 111390044 -70358043 + IAPEz-int LTR ERVK 4785 4910 -2770 4 1434 26340 13 4 0 chr2 111390044 111392991 -70355096 + IAPEz-int LTR ERVK 3525 6481 0 4 1434 2577 96 108 36 chr2 111392991 111393434 -70354653 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 4 1434 850 235 39 121 chr2 111393460 111393866 -70354221 - RLTR19-int LTR ERVK -2343 3794 3422 4 1434 1194 282 72 73 chr2 111393974 111394644 -70353443 - RLTR19-int LTR ERVK -3116 3021 2353 4 1434 841 150 92 46 chr2 111394662 111394900 -70353187 - RLTR19-int LTR ERVK -3404 2118 1870 4 1434 474 219 122 203 chr2 111395248 111395494 -70352593 - RLTR19-int LTR ERVK -3658 1864 1639 4 1434 337 271 125 99 chr2 111397383 111397695 -70350392 - RMER10A LTR ERVL 0 442 123 5 1434 1465 120 150 68 chr2 111400191 111400485 -70347602 + ORR1A3 LTR MaLR 1 318 -8 5 1434 352 333 90 0 chr2 111402180 111402357 -70345730 + MLT2D LTR ERVL 8 200 -214 5 1434 290 169 128 13 chr2 111410664 111410742 -70337345 + MTE-int LTR MaLR 285 371 -1209 5 1435 3472 18 2 0 chr2 111413647 111414042 -70334045 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 1435 242 360 25 38 chr2 111428087 111428246 -70319841 + RLTR17 LTR ERVK 281 437 -255 5 1435 437 271 50 112 chr2 111428455 111428758 -70319329 + RMER3D-int LTR ERVK 16 299 -2543 5 1435 2338 89 76 40 chr2 111437077 111437474 -70310613 - IAPLTR2a LTR ERVK 0 411 1 5 1435 9900 99 22 58 chr2 111438017 111439669 -70308418 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1 1594 -254 5 1435 11765 103 13 45 chr2 111440959 111442867 -70305220 - RLTR22_Mur LTR ERVK 0 1848 1 5 1435 486 316 79 0 chr2 111443407 111443584 -70304503 + MTEb LTR MaLR 165 355 -24 5 1435 965 256 123 27 chr2 111443714 111444047 -70304040 + MTEb-int LTR MaLR 2 366 -1214 5 1435 583 276 78 79 chr2 111445670 111446016 -70302071 + RLTR26 LTR ERVK 1 376 -266 5 1435 566 198 0 40 chr2 111450873 111450999 -70297088 + RMER10A LTR ERVL 39 159 -283 5 1435 12620 155 27 15 chr2 111450999 111453376 -70294711 + MYSERV6-int LTR ERVK 2207 4612 -4347 5 1435 1018 150 54 0 chr2 111453376 111453543 -70294544 - RMER19B LTR ERVK 0 902 727 5 1435 697 103 14 49 chr2 111454382 111454525 -70293562 - MYSERV6-int LTR ERVK -4007 4952 4815 5 1435 2872 203 59 28 chr2 111454525 111455137 -70292950 - RMER19B LTR ERVK -186 716 86 5 1435 394 219 0 0 chr2 111455138 111455220 -70292867 + MYSERV6-int LTR ERVK 4608 4689 -4270 5 1435 1384 165 59 13 chr2 111455291 111455313 -70292774 + MYSERV6-int LTR ERVK 4711 4732 -4227 5 1435 1384 165 59 13 chr2 111455341 111455625 -70292462 + MYSERV6-int LTR ERVK 4733 5030 -3929 5 1435 420 222 0 0 chr2 111455731 111455821 -70292266 + MYSERV6-int LTR ERVK 5046 5135 -3824 5 1435 519 227 64 0 chr2 111455828 111455938 -70292149 - RLTR33 LTR ERVK -8 670 554 5 1435 2561 229 17 20 chr2 111455972 111456565 -70291522 - MYSERV6-int LTR ERVK -3233 5726 5136 5 1435 452 255 55 30 chr2 111467466 111467628 -70280459 + ORR1D2 LTR MaLR 9 182 -177 6 1435 492 344 20 15 chr2 111468806 111469004 -70279083 + ORR1D2 LTR MaLR 123 321 -49 6 1435 954 173 0 12 chr2 111469451 111469621 -70278466 - MYSERV6-int LTR ERVK -3655 5304 5137 6 1435 4262 184 85 1 chr2 111507186 111508013 -70240074 + RMER19B LTR ERVK 1 896 -6 1 1435 614 303 23 0 chr2 111523494 111523669 -70224418 + ORR1D2 LTR MaLR 137 315 -55 2 1435 464 219 131 0 chr2 111541060 111541197 -70206890 - MYSERV-int LTR ERVK -811 5739 5585 5 1436 1102 172 92 27 chr2 111543141 111543433 -70204654 - MYSERV6-int LTR ERVK -858 8101 7791 5 1436 480 311 23 55 chr2 111543434 111543652 -70204435 - RMER4A LTR ERVK -5 461 251 5 1436 721 277 50 83 chr2 111543656 111544009 -70204078 - MYSERV-int LTR ERVK -1457 5093 4843 5 1436 1059 243 19 59 chr2 111545456 111545779 -70202308 - MYSERV-int LTR ERVK -2474 4076 3767 6 1436 1942 195 45 34 chr2 111553317 111553799 -70194288 + BGLII_B LTR ERVK 5 432 -9 7 1436 4687 153 50 15 chr2 111564372 111565271 -70182816 - RMER17B LTR ERVK 0 958 62 8 1436 825 242 72 5 chr2 111566143 111566338 -70181749 + MTD LTR MaLR 1 208 -211 9 1436 727 274 61 24 chr2 111566566 111566779 -70181308 + MTD LTR MaLR 199 419 0 9 1436 2479 83 105 0 chr2 111574462 111574834 -70173253 + RLTR9F LTR ERVK 1 411 -4 1 1436 4247 60 12 33 chr2 111575574 111576146 -70171941 - LTRIS2 LTR ERV1 0 564 5 1 1436 863 229 30 4 chr2 111576146 111576378 -70171709 - MuRRS4-int LTR ERV1 -38 5025 4788 1 1436 336 348 22 31 chr2 111576369 111576597 -70171490 - MuRRS4-int LTR ERV1 -792 4271 4046 1 1436 252 263 0 0 chr2 111576638 111576695 -70171392 - MURVY-int LTR ERV1 -2303 5149 5093 1 1436 1125 44 0 0 chr2 111576919 111577056 -70171031 - LTRIS2 LTR ERV1 -390 174 38 1 1436 2819 49 3 0 chr2 111580513 111580858 -70167229 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 1 1436 2870 64 50 5 chr2 111600189 111600568 -70147519 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1436 2922 79 0 22 chr2 111600568 111600982 -70147105 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 405 -693 1 1436 4242 89 36 103 chr2 111602606 111603380 -70144707 + MTA_Mm-int LTR MaLR 377 1098 0 1 1436 3123 53 5 8 chr2 111603380 111603777 -70144310 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1436 574 147 11 0 chr2 111613153 111613248 -70134839 + RLTR33 LTR ERVK 583 678 0 1 1436 227 310 0 0 chr2 111622895 111622953 -70125134 - MTC LTR MaLR -351 70 13 1 1436 3815 177 28 72 chr2 111623921 111624766 -70123321 + RLTR13C2 LTR ERVK 1 808 0 1 1436 379 320 52 11 chr2 111626643 111626817 -70121270 + RMER15 LTR ERVL 377 557 -18 1 1436 3399 248 93 75 chr2 111633239 111634535 -70113552 - RMER12 LTR ERVK -2 1320 1 1 1436 1820 281 45 24 chr2 111641926 111642624 -70105463 + MYSERV-int LTR ERVK 3828 5128 -132 2 1436 3229 202 71 69 chr2 111642666 111642899 -70105188 + MYSERV6-int LTR ERVK 7920 8143 -816 2 1436 3229 202 71 69 chr2 111642942 111643745 -70104342 + MYSERV6-int LTR ERVK 8144 8958 -1 2 1436 2754 177 29 17 chr2 111643745 111644267 -70103820 + RLTR12B LTR ERVK 1 528 0 2 1436 604 244 47 0 chr2 111652699 111652826 -70095261 - ETnERV2-int LTR ERVK -204 7202 7070 2 1436 4150 173 68 31 chr2 111652997 111653850 -70094237 - RMER19B LTR ERVK 0 902 49 2 1436 3875 63 20 4 chr2 111666315 111666810 -70081277 + RLTR1C LTR ERV1 1 503 0 2 1437 2761 206 77 85 chr2 111683525 111684311 -70063776 - RMER19B LTR ERVK -223 679 1 2 1437 226 183 46 77 chr2 111686756 111686821 -70061266 + RMER20A LTR ERVK 186 248 -268 2 1437 3419 23 5 0 chr2 111697489 111697883 -70050204 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 1437 9220 30 4 1 chr2 111697883 111698978 -70049109 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 2 1437 3419 23 5 0 chr2 111698978 111699372 -70048715 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 1437 3080 6 2 83 chr2 111701150 111701549 -70046538 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 2 1437 965 85 152 0 chr2 111701549 111701713 -70046374 + IAPEz-int LTR ERVK 8 196 -6285 2 1437 7086 73 111 28 chr2 111701684 111702888 -70045199 + IAPEz-int LTR ERVK 67 1313 -5168 2 1437 27552 21 1 1 chr2 111702887 111706161 -70041926 + IAPEz-int LTR ERVK 3210 6481 0 2 1437 3070 8 2 83 chr2 111706161 111706560 -70041527 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 2 1437 2488 215 55 25 chr2 111707307 111707722 -70040365 - RLTR12A LTR ERVK -4 564 126 2 1437 2488 215 55 25 chr2 111708292 111708424 -70039663 - RLTR12A LTR ERVK -443 125 1 2 1437 316 352 83 17 chr2 111749462 111749702 -69998385 - LTR33 LTR ERVL -3 512 257 3 1437 421 258 11 0 chr2 111757086 111757179 -69990908 + ORR1A2 LTR MaLR 1 94 -276 3 1437 808 113 0 0 chr2 111766417 111766532 -69981555 + ORR1A2 LTR MaLR 127 241 -86 3 1437 7643 48 3 2 chr2 111779693 111780621 -69967466 + RLTR13B3 LTR ERVK 1 929 0 3 1437 2188 191 128 20 chr2 111786019 111786525 -69961562 - RLTR31_Mm LTR ERVK 0 561 1 3 1437 1147 288 97 9 chr2 111790189 111790529 -69957558 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 3 1437 1016 281 79 47 chr2 111799161 111799504 -69948583 + ORR1E LTR MaLR 1 354 -5 3 1438 937 133 103 6 chr2 111805762 111805936 -69942151 - RMER6C LTR ERVK 0 690 500 3 1438 504 173 20 39 chr2 111806029 111806146 -69941941 - RMER6C LTR ERVK -472 248 87 3 1438 5881 157 22 8 chr2 111806146 111807175 -69940912 + MurERV4-int LTR ERVK 4170 5213 -47 3 1438 1298 181 77 28 chr2 111814685 111814970 -69933117 + RMER4B LTR ERVK 1 299 -286 3 1438 528 231 90 26 chr2 111815019 111815300 -69932787 + RMER4B LTR ERVK 246 585 0 3 1438 2284 155 47 25 chr2 111824843 111825247 -69922840 + MTC LTR MaLR 1 413 -8 4 1438 816 351 83 13 chr2 111826964 111827362 -69920725 - MLT1D LTR MaLR -79 426 1 4 1438 2344 108 28 35 chr2 111836575 111836999 -69911088 + BGLII LTR ERVK 1 421 0 4 1438 373 336 76 0 chr2 111837141 111837352 -69910735 + RMER5 LTR ERV1 306 532 -2 4 1438 565 221 26 0 chr2 111839115 111839228 -69908859 + ORR1C2 LTR MaLR 1 116 -258 4 1438 226 171 0 0 chr2 111839195 111839236 -69908851 + ORR1C2 LTR MaLR 40 80 -266 4 1438 1178 214 108 4 chr2 111841735 111841993 -69906094 + ORR1C2 LTR MaLR 100 384 0 4 1438 1383 220 25 14 chr2 111844440 111844779 -69903308 - MTD LTR MaLR 0 419 1 4 1438 1086 266 85 13 chr2 111846346 111846639 -69901448 + MTD LTR MaLR 83 397 -22 4 1438 2813 102 40 34 chr2 111846639 111847086 -69901001 + RMER16 LTR ERVK 1 450 -83 4 1438 343 333 19 9 chr2 111855767 111855910 -69892177 - MLT1H LTR MaLR -380 199 24 4 1438 3112 96 4 49 chr2 111865265 111865320 -69882767 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 426 4 1438 3612 23 121 0 chr2 111865320 111865760 -69882327 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 4 1438 3112 96 4 49 chr2 111865760 111866196 -69881891 - MT2C_Mm LTR ERVL -50 425 6 4 1438 2989 185 73 41 chr2 111866610 111867478 -69880609 - RLTR13D1 LTR ERVK 0 855 1 4 1438 597 135 0 0 chr2 111868899 111868995 -69879092 - RMER6C LTR ERVK -127 563 468 4 1438 269 239 79 11 chr2 111869109 111869198 -69878889 - RMER6C LTR ERVK -321 435 341 4 1438 3288 37 22 7 chr2 111873130 111873535 -69874552 - RLTR10A LTR ERVK 0 411 1 4 1438 444 299 63 86 chr2 111877415 111877781 -69870306 + RLTR17 LTR ERVK 105 451 -241 5 1438 4126 149 38 107 chr2 111878077 111879046 -69869041 - RLTR13D6 LTR ERVK 0 902 1 5 1438 3197 61 2 2 chr2 111880859 111881255 -69866832 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 1438 2983 90 2 0 chr2 111884907 111885306 -69862781 - MTB LTR MaLR 0 400 1 5 1438 269 281 69 17 chr2 111891732 111891848 -69856239 - RMER15 LTR ERVL -20 555 434 5 1438 254 245 19 0 chr2 111907148 111907201 -69840886 + MTE2a LTR MaLR 58 111 -268 5 1438 409 319 79 24 chr2 111910291 111910455 -69837632 - MTE-int LTR MaLR -317 1263 1091 5 1438 228 183 46 77 chr2 111924629 111924694 -69823393 + RMER20A LTR ERVK 186 248 -268 5 1439 1791 152 3 77 chr2 111952334 111952670 -69795417 - ORR1A3 LTR MaLR -8 318 8 5 1439 1799 152 3 77 chr2 111971938 111972274 -69775813 - ORR1A3 LTR MaLR -8 318 8 6 1439 2076 108 6 9 chr2 111985668 111985985 -69762102 - IAPLTR2b LTR ERVK -11 316 1 6 1439 2724 223 33 30 chr2 111989836 111989935 -69758152 - MYSERV-int LTR ERVK -145 6405 6332 6 1439 2724 224 34 31 chr2 111990358 111991091 -69756996 - MYSERV-int LTR ERVK -219 6331 5676 6 1439 238 183 46 77 chr2 112005572 112005637 -69742450 - RMER20A LTR ERVK -268 248 186 4 1439 7513 142 81 28 chr2 112014924 112015532 -69732555 + RLTR21 LTR ERVK 1 636 -936 1 1439 3634 30 107 2 chr2 112015532 112015962 -69732125 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 1 1439 7513 142 81 28 chr2 112015962 112016585 -69731502 + RLTR21 LTR ERVK 637 1301 -271 1 1439 7513 142 81 28 chr2 112016634 112016798 -69731289 + RLTR21 LTR ERVK 1302 1471 -101 1 1439 781 157 255 4 chr2 112039238 112039490 -69708597 - RLTR19 LTR ERVK 0 499 185 4 1439 727 172 22 0 chr2 112047735 112047869 -69700218 + ORR1A4-int LTR MaLR 1827 1963 0 5 1439 2068 126 58 61 chr2 112047869 112048198 -69699889 + ORR1A4 LTR MaLR 1 328 -1 5 1439 361 228 0 0 chr2 112055490 112055569 -69692518 + RLTR19C LTR ERVK 18 96 -410 8 1439 1496 236 133 48 chr2 112056969 112057464 -69690623 + RMER4B LTR ERVK 49 585 0 8 1439 1487 176 23 12 chr2 112057634 112058142 -69689945 + RMER6B LTR ERVK 1 454 -7 8 1439 2707 198 22 18 chr2 112061184 112061687 -69686400 - RLTR18B LTR ERVK -7 505 1 9 1439 2622 26 0 0 chr2 112065726 112066034 -69682053 + ORR1A0 LTR MaLR 1 308 -38 1 1440 463 36 0 0 chr2 112067461 112067516 -69680571 + ORR1A0 LTR MaLR 292 346 0 1 1440 844 202 173 5 chr2 112069451 112069665 -69678422 - ORR1D1 LTR MaLR -123 251 2 1 1440 2788 70 40 40 chr2 112070331 112070735 -69677352 + MTB_Mm LTR MaLR 1 404 -3 1 1440 274 298 76 61 chr2 112071578 112071710 -69676377 + MLT1E LTR MaLR 469 602 -51 1 1440 694 222 142 89 chr2 112071800 112071956 -69676131 + MER31B LTR ERV1 78 242 -224 1 1440 2321 138 116 3 chr2 112071956 112072334 -69675753 - MTC LTR MaLR 0 421 1 1 1440 694 222 142 89 chr2 112072334 112072493 -69675594 + MER31B LTR ERV1 243 410 -56 1 1440 1644 213 91 8 chr2 112072496 112072685 -69675402 + MTD LTR MaLR 1 196 -223 1 1440 1644 213 91 8 chr2 112072836 112073020 -69675067 + MTD LTR MaLR 197 404 -15 1 1440 1692 241 76 22 chr2 112074177 112074666 -69673421 - RLTR12B LTR ERVK -13 515 1 1 1440 1750 192 107 82 chr2 112076443 112076610 -69671477 + RLTR19 LTR ERVK 1 197 -302 1 1440 1750 192 107 82 chr2 112076802 112077121 -69670966 + RLTR19 LTR ERVK 198 499 0 1 1440 417 366 69 0 chr2 112077868 112078043 -69670044 - MLT1A0 LTR MaLR -1 364 178 1 1440 1344 218 83 33 chr2 112078146 112078483 -69669604 + MTEb LTR MaLR 2 355 -24 1 1440 253 262 33 77 chr2 112078491 112078582 -69669505 - MLT1A0 LTR MaLR -278 96 10 1 1440 551 91 0 0 chr2 112090530 112090607 -69657480 + RLTR12A LTR ERVK 1 77 -491 1 1440 452 196 0 138 chr2 112101332 112101462 -69646625 - MT2B LTR ERVL -337 264 153 1 1440 1791 109 91 10 chr2 112133822 112134119 -69613968 - ORR1A4 LTR MaLR -8 321 1 2 1440 238 238 0 0 chr2 112135298 112135340 -69612747 - MLT1A1 LTR MaLR -74 334 293 2 1440 639 285 148 59 chr2 112136868 112137192 -69610895 + ORR1E LTR MaLR 2 354 -5 2 1440 3153 291 137 34 chr2 112137199 112138484 -69609603 + ORR1E-int LTR MaLR 1 1418 -162 2 1440 539 242 96 53 chr2 112138486 112138674 -69609413 + ORR1E-int LTR MaLR 1312 1507 -73 2 1440 492 276 101 69 chr2 112138677 112139023 -69609064 + ORR1E LTR MaLR 3 359 0 2 1440 1674 216 83 21 chr2 112139586 112139973 -69608114 + MTD LTR MaLR 1 411 -8 2 1440 3826 53 17 0 chr2 112144130 112144597 -69603490 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 1 2 1440 4143 172 81 51 chr2 112144910 112145788 -69602299 - RMER13B LTR ERVK -4 904 1 2 1440 4490 10 0 0 chr2 112159919 112160412 -69587675 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 3 1440 302 0 0 0 chr2 112160412 112160450 -69587637 - MERVL-int LTR ERVL 0 5485 5448 3 1440 373 179 46 35 chr2 112160450 112160537 -69587550 - ORR1A3-int LTR MaLR -1323 640 553 3 1440 45375 14 6 0 chr2 112160537 112165863 -69582224 - MERVL-int LTR ERVL -125 5360 1 3 1440 4490 10 0 0 chr2 112165863 112166356 -69581731 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 3 1440 366 206 27 14 chr2 112182680 112182754 -69565333 - RMER15-int LTR ERVL -274 4725 4651 3 1440 328 226 73 31 chr2 112195763 112195859 -69552228 - MER21B LTR ERV1 -84 779 680 3 1441 228 241 10 135 chr2 112199816 112199912 -69548175 + RLTR25B LTR ERVK 441 524 -504 4 1441 362 273 26 0 chr2 112210499 112210576 -69537511 - MT2B LTR ERVL -360 241 163 4 1441 1048 299 33 33 chr2 112213792 112214152 -69533935 + MLT1A LTR MaLR 5 364 -10 4 1441 645 255 214 42 chr2 112216976 112217406 -69530681 - RLTR12B LTR ERVK -14 514 11 4 1441 282 131 65 16 chr2 112224466 112224528 -69523559 - MTEa LTR MaLR 0 379 315 4 1441 343 275 57 121 chr2 112226593 112226717 -69521370 - MT2B LTR ERVL -344 257 142 4 1441 452 216 449 7 chr2 112228143 112228429 -69519658 + MTD LTR MaLR 6 417 -2 4 1441 1539 239 44 22 chr2 112228573 112228937 -69519150 + MTE2b LTR MaLR 3 374 -5 4 1441 1989 145 114 5 chr2 112233589 112233956 -69514131 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 5 1441 288 270 72 142 chr2 112236828 112237120 -69510967 - ORR1E LTR MaLR 0 379 98 5 1441 2273 176 124 6 chr2 112237677 112238151 -69509936 - MT2A LTR ERVL 0 533 4 5 1441 288 242 0 180 chr2 112241656 112241684 -69506403 - MT2B2 LTR ERVL -427 157 150 5 1441 3047 55 36 5 chr2 112241739 112242123 -69505964 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 1441 4356 14 2 12 chr2 112256835 112257333 -69490754 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 5 1441 302 0 0 0 chr2 112257333 112257371 -69490716 - MERVL-int LTR ERVL 0 5485 5448 5 1441 390 167 46 35 chr2 112257371 112257458 -69490629 - ORR1A3-int LTR MaLR -1323 640 553 5 1441 38591 17 14 0 chr2 112257458 112262743 -69485344 - MERVL-int LTR ERVL -125 5360 1 5 1441 4356 14 2 12 chr2 112262743 112263241 -69484846 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 5 1441 289 274 212 45 chr2 112264260 112264505 -69483582 - MLT1A LTR MaLR -64 326 41 5 1441 307 117 99 154 chr2 112275905 112275996 -69472091 + RLTR25B LTR ERVK 424 509 -519 5 1441 931 178 46 16 chr2 112278437 112278631 -69469456 + ORR1D1 LTR MaLR 170 369 -5 5 1441 3227 76 2 15 chr2 112279365 112279766 -69468321 + MTB LTR MaLR 5 400 0 5 1441 1213 108 202 65 chr2 112280507 112280754 -69467333 + RMER6A LTR ERVK 1 281 -475 5 1441 1608 191 42 48 chr2 112281912 112282347 -69465740 + RMER6A LTR ERVK 275 756 0 5 1441 327 162 0 39 chr2 112286454 112286531 -69461556 + RMER4B LTR ERVK 1 74 -511 6 1441 3433 46 5 5 chr2 112291165 112291561 -69456526 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 1441 310 321 98 25 chr2 112291715 112291971 -69456116 + RMER20B LTR ERVK 134 414 -102 6 1441 482 292 95 17 chr2 112292032 112292356 -69455731 - MLT1B LTR MaLR 0 390 1 6 1441 1535 229 52 182 chr2 112309828 112310409 -69437678 - RLTR18B LTR ERVK -7 505 1 6 1441 582 264 120 15 chr2 112326083 112326283 -69421804 - MTEa LTR MaLR -1 378 158 7 1442 1558 123 14 43 chr2 112329280 112329560 -69418527 + RMER4B LTR ERVK 1 272 -313 7 1442 668 255 163 45 chr2 112330736 112331208 -69416879 + RMER17C-int LTR ERVK 2629 3155 -83 7 1442 1103 146 14 72 chr2 112331259 112331481 -69416606 + RMER10B LTR ERVL 13 221 -177 7 1442 231 105 184 0 chr2 112331490 112331528 -69416559 + RMER10B LTR ERVL 354 398 0 7 1442 357 181 9 105 chr2 112335781 112335886 -69412201 - MT2B LTR ERVL -344 257 163 7 1442 1871 167 58 136 chr2 112337669 112337878 -69410209 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 224 7 1442 1871 167 58 136 chr2 112338055 112338327 -69409760 - RLTR41 LTR ERV1 -223 223 1 7 1442 1572 187 71 39 chr2 112342925 112343331 -69404756 + MTD LTR MaLR 1 419 0 7 1442 2737 173 193 8 chr2 112344113 112344735 -69403352 - RMER19A LTR ERVK 0 737 1 7 1442 705 85 28 0 chr2 112347844 112347950 -69400137 + RMER6B LTR ERVK 1 109 -352 7 1442 411 267 75 28 chr2 112348293 112348554 -69399533 + MLT1-int LTR MaLR 15 400 -971 7 1442 1443 187 35 152 chr2 112359889 112360324 -69387763 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 7 1442 228 346 0 0 chr2 112364637 112364715 -69383372 - RMER15 LTR ERVL -125 450 373 8 1442 2267 92 6 60 chr2 112367766 112368114 -69379973 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 8 1442 501 325 13 7 chr2 112377658 112377813 -69370274 - MTEa LTR MaLR -199 180 25 8 1442 1558 182 117 3 chr2 112383154 112383496 -69364591 + MTD LTR MaLR 6 385 -34 8 1442 1558 182 117 3 chr2 112383550 112383566 -69364521 + MTD LTR MaLR 386 404 -15 8 1442 1563 186 87 0 chr2 112386928 112387250 -69360837 - MTC LTR MaLR 0 421 72 8 1442 1054 213 184 92 chr2 112387607 112388099 -69359988 - RLTR20C LTR ERVK 0 568 1 8 1442 479 144 12 3 chr2 112388255 112388348 -69359739 - MTC LTR MaLR -327 92 1 8 1442 1973 106 3 70 chr2 112389111 112389467 -69358620 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK -5 332 1 8 1442 26675 18 4 0 chr2 112389467 112392411 -69355676 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 3525 8 1442 950 80 24 0 chr2 112392411 112392536 -69355551 - IAPEz-int LTR ERVK -2770 4910 4783 8 1442 1877 111 4 4 chr2 112392531 112392793 -69355294 - IAPEz-int LTR ERVK -5183 2497 2236 8 1442 454 66 0 32 chr2 112392782 112392845 -69355242 - IAPEz-int LTR ERVK -5062 1419 1359 8 1442 3470 54 5 11 chr2 112392845 112393585 -69354502 - IAPEz-int LTR ERVK -5819 662 3 8 1442 1960 103 6 70 chr2 112393588 112393950 -69354137 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK -11 326 1 8 1442 950 160 48 11 chr2 112395953 112396142 -69351945 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 189 8 1442 272 152 0 0 chr2 112396170 112396216 -69351871 - ORR1C2 LTR MaLR -338 46 1 8 1442 1817 232 44 21 chr2 112401486 112401961 -69346126 - RMER19C LTR ERVK 0 611 126 8 1442 284 300 22 0 chr2 112402249 112402339 -69345748 - ORR1E LTR MaLR 0 359 268 8 1442 471 216 59 44 chr2 112406685 112406855 -69341232 - ORR1E LTR MaLR -198 172 1 8 1442 285 259 11 66 chr2 112406873 112406964 -69341123 + MTE-int LTR MaLR 907 992 -588 8 1442 990 271 54 17 chr2 112407036 112407389 -69340698 + MTE-int LTR MaLR 1127 1492 -88 8 1442 358 329 84 0 chr2 112407524 112407679 -69340408 - MLT1B LTR MaLR -7 383 216 8 1442 3569 13 5 0 chr2 112408491 112408885 -69339202 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 8 1442 9849 15 1 0 chr2 112408885 112409982 -69338105 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 8 1442 3539 15 5 0 chr2 112409982 112410376 -69337711 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 8 1442 488 175 39 10 chr2 112412156 112412260 -69335827 - RLTR40 LTR ERVK -710 107 1 8 1442 354 103 29 29 chr2 112414998 112415068 -69333019 - ORR1D1 LTR MaLR -140 244 175 8 1442 617 200 90 6 chr2 112415134 112415290 -69332797 - ORR1D1 LTR MaLR -190 184 16 8 1442 2587 81 77 21 chr2 112419340 112419719 -69328368 + MTB LTR MaLR 1 400 0 8 1442 225 309 61 12 chr2 112423324 112423406 -69324681 - RMER13A LTR ERVK -212 696 611 8 1442 877 229 109 77 chr2 112423436 112423786 -69324301 - RMER13A LTR ERVK -469 391 31 8 1442 533 252 13 13 chr2 112428851 112429004 -69319083 - ORR1D2 LTR MaLR -4 366 214 9 1442 524 155 14 0 chr2 112434291 112434388 -69313699 - RLTR19-int LTR ERVK -5160 977 890 9 1442 560 238 69 7 chr2 112434410 112434554 -69313533 - RLTR42-int LTR ERVK -4265 1257 1105 9 1442 280 310 98 25 chr2 112442697 112442932 -69305155 - MLT1N2 LTR MaLR -6 556 305 9 1442 257 324 98 71 chr2 112445203 112445499 -69302588 - ORR1E LTR MaLR 0 359 56 9 1442 1158 266 50 22 chr2 112445907 112446307 -69301780 - MTD LTR MaLR -8 411 1 9 1442 1163 236 117 6 chr2 112450756 112451097 -69296990 + MTEa LTR MaLR 1 379 0 9 1442 444 260 81 43 chr2 112451297 112451421 -69296666 + MLT1C LTR MaLR 6 138 -329 9 1442 2710 140 32 0 chr2 112451421 112451829 -69296258 + MTC LTR MaLR 1 421 0 9 1442 444 260 81 43 chr2 112451829 112451889 -69296198 + MLT1C LTR MaLR 139 197 -270 9 1442 2302 41 70 0 chr2 112456388 112456704 -69291383 - ORR1A1 LTR MaLR -8 338 1 9 1442 3995 130 80 28 chr2 112457105 112457889 -69290198 + RMER21B LTR ERV1 1 825 -17 9 1442 1891 21 0 0 chr2 112458116 112458351 -69289736 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 112 9 1443 234 271 11 86 chr2 112463386 112463405 -69284682 + MT2B LTR ERVL 153 164 -437 9 1443 609 273 111 34 chr2 112478532 112478885 -69269202 + MLT1B LTR MaLR 1 380 -10 9 1443 865 174 176 73 chr2 112485788 112486061 -69262026 + MTEb LTR MaLR 72 372 -7 9 1443 367 258 15 78 chr2 112486136 112486336 -69261751 + MLT1G LTR MaLR 9 239 -356 9 1443 260 283 133 0 chr2 112486548 112486661 -69261426 + MLT1G LTR MaLR 362 489 0 9 1443 2042 100 32 0 chr2 112491342 112491651 -69256436 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 9 1443 1832 148 67 39 chr2 112502197 112502556 -69245531 + ORR1D1 LTR MaLR 2 370 -4 3 1443 286 345 97 71 chr2 112514304 112514654 -69233433 + ORR1E LTR MaLR 1 359 0 1 1443 2194 29 3 14 chr2 112516659 112516942 -69231145 + LTRIS3 LTR ERV1 1 280 -232 1 1443 287 281 62 62 chr2 112517090 112517234 -69230853 + RLTR14 LTR ERV1 225 368 -14 1 1443 1600 155 21 3 chr2 112531546 112531831 -69216256 + RMER5 LTR ERV1 245 534 0 3 1443 233 414 0 0 chr2 112531836 112531964 -69216123 - MER21B LTR ERV1 -453 410 283 4 1443 1051 274 101 35 chr2 112532002 112532350 -69215737 + MTD LTR MaLR 49 419 0 4 1443 446 292 97 50 chr2 112532356 112532594 -69215493 - MER21B LTR ERV1 -575 288 40 4 1443 3746 172 53 19 chr2 112536460 112537240 -69210847 - RLTR40 LTR ERVK -9 808 3 4 1443 528 291 50 93 chr2 112540225 112540736 -69207351 + RLTR11A2 LTR ERVK 7 500 -28 5 1443 239 220 17 0 chr2 112541255 112541314 -69206773 + MTEa-int LTR MaLR 1519 1578 -2 5 1443 236 216 0 0 chr2 112541316 112541367 -69206720 + MTEa LTR MaLR 1 51 -328 5 1443 4479 14 2 0 chr2 112541562 112542054 -69206033 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 5 1443 47955 19 8 0 chr2 112542054 112547372 -69200715 + MERVL-int LTR ERVL 1 5360 -125 5 1443 354 167 46 35 chr2 112547372 112547459 -69200628 + ORR1A3-int LTR MaLR 553 640 -1323 5 1443 321 0 0 0 chr2 112547459 112547497 -69200590 + MERVL-int LTR ERVL 5448 5485 0 5 1443 4479 14 2 0 chr2 112547497 112547989 -69200098 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 5 1443 939 251 62 77 chr2 112548034 112548358 -69199729 + MTEa LTR MaLR 61 379 0 5 1443 3292 41 5 12 chr2 112553126 112553525 -69194562 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 1443 271 279 28 37 chr2 112556621 112556729 -69191358 + RLTR14 LTR ERV1 276 382 0 6 1443 1079 257 97 53 chr2 112557375 112557736 -69190351 + MTEa LTR MaLR 1 377 -2 6 1443 2448 175 35 65 chr2 112558839 112559382 -69188705 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 527 0 6 1443 1997 139 40 9 chr2 112561511 112561859 -69186228 + ORR1B2 LTR MaLR 1 359 -8 7 1443 2826 81 32 2 chr2 112567068 112567477 -69180610 - BGLII LTR ERVK 0 421 1 8 1443 3227 48 8 12 chr2 112573923 112574325 -69173762 - MTB LTR MaLR 0 400 1 9 1443 1638 107 48 65 chr2 112589771 112590062 -69158025 - ORR1A2 LTR MaLR -41 286 1 1 1444 1275 153 58 38 chr2 112593644 112593936 -69154151 + RMER10A LTR ERVL 1 298 -144 1 1444 328 228 119 63 chr2 112604234 112604393 -69143694 - MTEb LTR MaLR 0 379 212 1 1444 7204 26 0 0 chr2 112606673 112607476 -69140611 + RLTR13B4 LTR ERVK 1 803 0 1 1444 1665 179 102 28 chr2 112609245 112609637 -69138450 + MTC LTR MaLR 1 421 0 1 1444 2499 133 35 40 chr2 112610249 112610672 -69137415 - MTC LTR MaLR 0 421 1 1 1444 932 328 33 128 chr2 112613175 112613837 -69134250 + RLTR18 LTR ERVK 5 603 -13 1 1444 1928 183 16 39 chr2 112617393 112617756 -69130331 + ORR1B1 LTR MaLR 40 394 0 1 1444 1407 286 84 12 chr2 112622435 112622920 -69125167 - MLT1F1 LTR MaLR -46 523 4 1 1444 568 293 46 0 chr2 112628398 112628572 -69119515 + MLT1A0 LTR MaLR 2 183 -182 1 1444 5181 188 31 42 chr2 112629517 112630696 -69117391 + MYSERV6-int LTR ERVK 7813 8959 0 1 1444 832 247 63 93 chr2 112630696 112631190 -69116897 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 494 -34 1 1444 1000 286 79 38 chr2 112636830 112637197 -69110890 + MLT1B LTR MaLR 9 390 0 1 1444 2585 166 76 49 chr2 112638752 112639266 -69108821 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 1 1 1444 542 306 52 41 chr2 112655243 112655437 -69092650 + MLT1D LTR MaLR 6 201 -304 1 1444 298 303 46 29 chr2 112655510 112655641 -69092446 + MLT1D LTR MaLR 388 621 -6 1 1444 1236 141 236 33 chr2 112659508 112659809 -69088278 + ORR1D1 LTR MaLR 12 373 -1 2 1444 2911 145 88 20 chr2 112661009 112661608 -69086479 + RMER13A LTR ERVK 1 860 0 2 1444 491 212 101 0 chr2 112664185 112664284 -69083803 + RMER6D LTR ERVK 2 110 -610 2 1444 589 306 133 83 chr2 112678278 112678810 -69069277 + MLT1E2 LTR MaLR 44 654 0 2 1444 3439 16 45 0 chr2 112681032 112681411 -69066676 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 1444 4421 145 201 5 chr2 112690728 112691587 -69056500 + RLTR25B LTR ERVK 1 1028 0 2 1444 618 303 67 62 chr2 112702729 112703070 -69045017 + ORR1E LTR MaLR 8 350 -9 2 1444 913 234 106 159 chr2 112712076 112712473 -69035614 - MTE2b LTR MaLR -3 376 1 2 1444 265 297 93 43 chr2 112712714 112712876 -69035211 + MER34A LTR ERV1 1 170 -372 2 1445 831 245 121 115 chr2 112733090 112733397 -69014690 - RMER12 LTR ERVK -104 1468 976 3 1445 1439 227 164 66 chr2 112739653 112740381 -69007706 - RMER12 LTR ERVK -1147 701 1 3 1445 840 287 80 57 chr2 112740398 112740749 -69007338 - ORR1E LTR MaLR 0 359 1 3 1445 405 344 156 35 chr2 112770732 112770988 -68977099 + MER74A LTR ERVL 75 361 -261 3 1445 1138 367 39 6 chr2 112771235 112771576 -68976511 + MER74A LTR ERVL 31 381 -177 3 1445 1603 205 84 15 chr2 112771576 112771968 -68976119 + MTD LTR MaLR 1 419 0 3 1445 1138 367 39 6 chr2 112771968 112772133 -68975954 + MER74A LTR ERVL 382 554 -4 3 1445 4128 46 2 16 chr2 112772861 112773371 -68974716 - RLTR1C LTR ERV1 0 503 1 3 1445 2409 162 66 37 chr2 112775674 112776186 -68971901 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 527 0 3 1445 246 260 107 27 chr2 112791485 112791560 -68956527 - LTR81B LTR ERV1? -824 569 489 3 1445 280 306 32 40 chr2 112802848 112802974 -68945113 + MLT1N2 LTR MaLR 436 560 -2 3 1445 2012 205 49 64 chr2 112812405 112812937 -68935150 - RLTR11A LTR ERVK -4 524 1 4 1445 4230 168 75 71 chr2 112825624 112826578 -68921509 + RMER17B LTR ERVK 1 958 0 4 1445 3303 18 31 0 chr2 112845388 112845772 -68902315 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 1445 260 284 72 72 chr2 112846120 112846245 -68901842 + MLT1A1 LTR MaLR 272 396 -12 4 1445 1490 225 89 15 chr2 112850446 112850838 -68897249 - MTC LTR MaLR 0 421 1 4 1446 777 276 11 0 chr2 112857058 112857243 -68890844 - ORR1E LTR MaLR -168 191 5 4 1446 2614 167 47 17 chr2 112857861 112858398 -68889689 + RLTR31_Mur LTR ERVK 1 553 0 4 1446 1617 209 32 32 chr2 112861362 112861733 -68886354 + ORR1D1 LTR MaLR 4 374 0 4 1446 603 333 129 8 chr2 112864338 112864851 -68883236 - LTR87 LTR ERVL? -27 597 23 4 1446 1051 277 78 55 chr2 112866518 112866862 -68881225 + ORR1D2 LTR MaLR 19 370 0 4 1446 248 269 30 0 chr2 112867837 112867904 -68880183 + MLT2C1 LTR ERVL 64 132 -265 4 1446 251 293 15 141 chr2 112867983 112868118 -68879969 + MLT2C1 LTR ERVL 445 562 -1 4 1446 2421 203 45 26 chr2 112880453 112880984 -68867103 + RLTR20A LTR ERVK 1 541 0 4 1446 881 302 103 21 chr2 112889478 112889924 -68858163 - MLT2B2 LTR ERVL 0 556 1 4 1446 478 202 231 29 chr2 112894725 112894898 -68853189 - MTE2b LTR MaLR 0 379 172 4 1446 587 267 73 0 chr2 112895111 112895261 -68852826 - MTE2b LTR MaLR -218 161 1 4 1446 1040 302 147 3 chr2 112901138 112901513 -68846574 + MLT1F2 LTR MaLR 19 447 -113 4 1446 282 316 90 33 chr2 112901798 112901921 -68846166 + MLT1F2 LTR MaLR 423 557 -3 4 1446 1983 110 42 63 chr2 112904368 112904699 -68843388 - ORR1A3 LTR MaLR -2 324 1 4 1446 10677 141 54 24 chr2 112904699 112906604 -68841483 - ORR1A3-int LTR MaLR 0 1963 1 4 1446 1824 199 6 6 chr2 112906608 112906946 -68841141 - ORR1A3 LTR MaLR -8 338 1 4 1446 245 202 122 75 chr2 112911656 112911763 -68836324 + MLT1B LTR MaLR 1 112 -278 5 1446 436 224 132 26 chr2 112911814 112911965 -68836122 + MLT1B LTR MaLR 96 262 -128 5 1446 744 285 131 37 chr2 112926949 112927270 -68820817 + MLT1A0 LTR MaLR 15 365 0 5 1446 690 309 68 48 chr2 112930679 112931015 -68817072 - ORR1E LTR MaLR -8 351 9 5 1446 4477 8 0 0 chr2 112935945 112936438 -68811649 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 5 1446 45950 14 0 0 chr2 112936438 112941797 -68806290 + MERVL-int LTR ERVL 1 5360 -125 5 1446 380 179 46 35 chr2 112941797 112941884 -68806203 + ORR1A3-int LTR MaLR 553 640 -1323 5 1446 291 26 0 0 chr2 112941884 112941922 -68806165 + MERVL-int LTR ERVL 5448 5485 0 5 1446 4477 8 0 0 chr2 112941922 112942415 -68805672 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 5 1446 1018 89 242 11 chr2 112946469 112946750 -68801337 + RLTR15 LTR ERVK 3 348 -11 5 1446 1594 140 27 31 chr2 112951727 112952021 -68796066 + RLTR11A2 LTR ERVK 235 527 0 5 1446 932 323 34 54 chr2 112959543 112959952 -68788135 + MLT1A1 LTR MaLR 8 408 0 5 1446 657 380 78 35 chr2 112960788 112961222 -68786865 + MLT1K LTR MaLR 125 577 -18 5 1446 3279 144 19 58 chr2 112962140 112962390 -68785697 + RLTR12A LTR ERVK 1 235 -333 5 1446 3279 144 19 58 chr2 112962560 112962900 -68785187 + RLTR12A LTR ERVK 236 567 -1 5 1446 677 326 87 73 chr2 112981708 112982078 -68766009 + LTR16C LTR ERVL 96 470 -19 5 1446 335 341 123 27 chr2 112982926 112983146 -68764941 - MER68 LTR ERVL -284 279 39 5 1447 2593 180 51 20 chr2 112986977 112987487 -68760600 + RLTR11A2 LTR ERVK 2 527 0 5 1447 302 284 62 10 chr2 112995295 112995391 -68752696 + MLT1J2 LTR MaLR 336 436 -12 5 1447 3121 140 9 19 chr2 112996554 112997019 -68751068 + RMER6B LTR ERVK 2 461 0 6 1447 2427 156 133 22 chr2 113029424 113029929 -68718158 - RLTR31_Mm LTR ERVK 0 561 1 4 1447 1798 84 119 0 chr2 113031266 113031551 -68716536 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 4 1447 3868 158 40 43 chr2 113031645 113031999 -68716088 - RMER6A LTR ERVK 0 756 378 5 1447 3868 158 40 43 chr2 113032117 113032521 -68715566 - RMER6A LTR ERVK -379 377 2 5 1447 1013 258 91 32 chr2 113041266 113041606 -68706481 + MTE2b LTR MaLR 15 374 -5 6 1447 273 202 32 195 chr2 113043336 113043490 -68704597 + RMER15 LTR ERVL 1 129 -446 6 1447 634 309 93 12 chr2 113043554 113043813 -68704274 + RMER15 LTR ERVL 277 556 -19 6 1447 477 296 60 68 chr2 113044816 113045176 -68702911 - MLT1A LTR MaLR 0 408 19 6 1447 260 257 27 0 chr2 113045363 113045437 -68702650 + MTE2b LTR MaLR 1 76 -303 6 1447 1297 267 20 14 chr2 113045486 113045832 -68702255 + MTE2b LTR MaLR 28 375 -4 6 1447 3231 188 49 14 chr2 113046741 113047374 -68700713 + RMER13A LTR ERVK 2 656 -204 7 1447 981 178 0 6 chr2 113047373 113047537 -68700550 - RMER13A LTR ERVK -697 163 1 7 1447 936 266 73 12 chr2 113059375 113059597 -68688490 + MTD LTR MaLR 42 278 -141 8 1447 644 190 8 16 chr2 113059597 113059720 -68688367 - MTC LTR MaLR 0 421 300 8 1447 646 208 50 0 chr2 113059722 113059842 -68688245 + ETnERV2-int LTR ERVK 7070 7195 -211 8 1447 1004 168 21 5 chr2 113059936 113060052 -68688035 - MTC LTR MaLR -232 189 74 8 1447 1004 168 21 5 chr2 113060090 113060159 -68687928 - MTC LTR MaLR -348 73 2 8 1447 1459 231 67 30 chr2 113060543 113060753 -68687334 + MTEa LTR MaLR 1 210 -169 8 1447 1459 231 67 30 chr2 113060791 113060941 -68687146 + MTEa LTR MaLR 211 374 -5 8 1447 607 324 120 15 chr2 113066227 113066533 -68681554 - LTR16C LTR ERVL -1 537 127 9 1447 2406 147 22 10 chr2 113067418 113067818 -68680269 + RMER13B LTR ERVK 1 405 -503 1 1447 2309 243 39 19 chr2 113067947 113068459 -68679628 + RMER13B LTR ERVK 384 905 -3 1 1447 555 306 99 112 chr2 113069321 113069615 -68678472 - MLT1F2 LTR MaLR -269 291 2 1 1447 243 268 80 9 chr2 113070149 113070262 -68677825 + MLT2C1 LTR ERVL 61 181 -216 1 1447 1450 259 46 15 chr2 113076560 113076953 -68671134 + MTD LTR MaLR 1 405 -14 1 1447 3815 206 22 19 chr2 113087698 113088507 -68659580 + RLTR40 LTR ERVK 1 812 -5 1 1447 1499 165 173 27 chr2 113089773 113090103 -68657984 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 1 1447 1191 153 11 0 chr2 113092809 113092998 -68655089 - RMER6A LTR ERVK 0 756 566 1 1447 1504 123 17 8 chr2 113092998 113093236 -68654851 + RLTR9A LTR ERVK 1 240 -128 1 1447 237 375 199 35 chr2 113098322 113098871 -68649216 - LTR81C LTR ERV1? -158 995 357 1 1447 2472 167 44 10 chr2 113103100 113103505 -68644582 + MTC LTR MaLR 1 419 -2 1 1447 3201 83 2 2 chr2 113111220 113111620 -68636467 - MTB LTR MaLR 0 400 1 1 1447 2430 174 110 33 chr2 113113394 113114127 -68633960 + RMER17A2 LTR ERVK 1 725 -26 1 1447 810 212 77 34 chr2 113114230 113114464 -68633623 + MTD LTR MaLR 176 419 0 1 1448 1309 167 8 0 chr2 113117593 113117827 -68630260 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1 236 -1612 1 1448 1776 239 33 8 chr2 113120565 113120957 -68627130 - MTD LTR MaLR -8 411 10 1 1448 738 175 140 24 chr2 113122899 113123163 -68624924 - RLTR25A LTR ERVK -567 461 293 1 1448 4464 18 0 0 chr2 113124168 113124661 -68623426 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 1 1448 1401 177 45 0 chr2 113124927 113125193 -68622894 - RLTR25A LTR ERVK -820 283 6 1 1448 2077 196 7 19 chr2 113134776 113135202 -68612885 + MTC LTR MaLR 1 421 0 1 1448 1704 219 23 62 chr2 113143291 113143725 -68604362 + MTC LTR MaLR 3 419 -2 1 1448 1100 236 49 49 chr2 113145189 113145518 -68602569 + ORR1E LTR MaLR 2 330 -29 2 1448 473 250 17 20 chr2 113145514 113145690 -68602397 - MTD LTR MaLR -6 415 245 2 1448 311 284 70 39 chr2 113149036 113149164 -68598923 - ORR1E LTR MaLR -149 210 79 2 1448 407 319 23 56 chr2 113149395 113149611 -68598476 + RMER4B LTR ERVK 7 215 -370 2 1448 3552 18 2 0 chr2 113171280 113171675 -68576412 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 1448 9464 25 3 1 chr2 113171675 113172771 -68575316 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 2 1448 3552 18 2 0 chr2 113172771 113173166 -68574921 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 1448 2104 167 25 35 chr2 113183011 113183409 -68564678 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 2 1448 917 221 88 58 chr2 113183442 113183909 -68564178 + MT2B LTR ERVL 1 530 -71 2 1448 242 182 18 18 chr2 113184097 113184153 -68563934 - RMER5 LTR ERV1 0 534 479 2 1448 802 110 51 7 chr2 113187244 113187381 -68560706 - RLTR23 LTR ERV1 -53 377 235 2 1448 319 62 234 0 chr2 113187421 113187485 -68560602 - RLTR23 LTR ERV1 -325 105 27 2 1448 331 234 53 11 chr2 113188975 113189070 -68559017 - RMER15 LTR ERVL -46 529 431 2 1448 237 262 173 39 chr2 113193174 113193301 -68554786 - LTR84b LTR ERVL -552 209 66 2 1448 291 354 47 47 chr2 113196592 113196761 -68551326 + MLT1A1 LTR MaLR 1 169 -239 2 1448 485 354 58 43 chr2 113197686 113198014 -68550073 - LTR33 LTR ERVL -169 346 14 2 1448 1301 235 131 14 chr2 113198858 113199216 -68548871 - MTD LTR MaLR -16 403 4 2 1448 1076 282 80 60 chr2 113199556 113200116 -68547971 - RMER13A LTR ERVK -304 604 1 2 1448 1275 263 58 99 chr2 113200137 113200795 -68547292 - RMER17A-int LTR ERVK -1 1727 1097 2 1448 446 209 11 0 chr2 113200941 113201032 -68547055 - RMER17A-int LTR ERVK -655 1073 982 2 1448 285 302 179 73 chr2 113201512 113201730 -68546357 - RMER13A LTR ERVK -231 629 389 2 1448 1538 219 60 25 chr2 113207542 113207907 -68540180 + MTE2a LTR MaLR 1 378 -1 2 1448 295 282 0 0 chr2 113214723 113214794 -68533293 + LTR88c LTR Genie? 35 105 -757 2 1448 404 331 20 13 chr2 113217722 113217875 -68530212 - MLT1E1A LTR MaLR -499 181 28 2 1448 355 273 142 73 chr2 113225408 113225641 -68522446 - ORR1E LTR MaLR -101 258 10 3 1448 745 152 73 7 chr2 113225888 113226035 -68522052 + ORR1D1-int LTR MaLR 1216 1528 -52 3 1448 1730 204 41 30 chr2 113226035 113226404 -68521683 + ORR1D1 LTR MaLR 1 373 -1 3 1448 612 219 0 62 chr2 113233973 113234119 -68513968 - MLT1B LTR MaLR 0 390 254 3 1448 281 214 105 63 chr2 113235096 113235191 -68512896 - MLT1B LTR MaLR -291 99 1 3 1448 306 382 69 13 chr2 113240240 113240399 -68507688 + MLT1K LTR MaLR 237 404 -191 3 1448 3575 25 8 0 chr2 113240402 113240795 -68507292 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 1449 777 291 121 59 chr2 113258366 113259071 -68489016 + RMER13A LTR ERVK 1 865 -43 3 1449 327 314 44 44 chr2 113260983 113261163 -68486924 + ERVL-E-int LTR ERVL 2231 2410 -3257 3 1449 2546 173 9 16 chr2 113272505 113272928 -68475159 - MTC LTR MaLR -1 420 1 3 1449 1552 192 122 64 chr2 113273442 113273776 -68474311 - MTD LTR MaLR -26 393 58 3 1449 1670 173 90 66 chr2 113273776 113274141 -68473946 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 5 3 1449 1552 184 124 62 chr2 113274141 113274204 -68473883 - MTD LTR MaLR -362 57 1 3 1449 1619 140 45 24 chr2 113290722 113291014 -68457073 + MTC LTR MaLR 1 298 -123 4 1449 1116 254 46 76 chr2 113293745 113294115 -68453972 + ORR1E LTR MaLR 1 359 0 4 1449 451 55 0 4 chr2 113295220 113295288 -68452799 + RLTR13C2 LTR ERVK 1 66 -967 4 1449 279 164 0 68 chr2 113295258 113295317 -68452770 + RLTR13C2 LTR ERVK 848 902 0 4 1449 1487 214 70 54 chr2 113296570 113297054 -68451033 - RMER5 LTR ERV1 -10 524 33 4 1449 1170 224 268 18 chr2 113303615 113304052 -68444035 - RMER15 LTR ERVL -3 572 27 4 1449 881 205 201 99 chr2 113307032 113307406 -68440681 - MTD LTR MaLR -7 412 1 4 1449 305 197 13 201 chr2 113307518 113307677 -68440410 - RMER15 LTR ERVL -446 129 1 4 1449 506 242 34 85 chr2 113307781 113307957 -68440130 - RMER15-int LTR ERVL -166 4833 4667 4 1449 752 268 55 97 chr2 113311049 113311379 -68436708 - MLT1A0 LTR MaLR -8 357 42 4 1449 524 320 89 81 chr2 113311780 113312161 -68435926 - LTR52 LTR ERVL -15 406 23 4 1449 1269 214 73 68 chr2 113324035 113324446 -68423641 - MTD LTR MaLR -14 405 1 4 1449 708 272 106 34 chr2 113331885 113332178 -68415909 - MTD LTR MaLR -69 350 37 4 1449 358 346 105 72 chr2 113343091 113343424 -68404663 - ORR1E LTR MaLR -15 344 1 4 1449 4670 18 2 0 chr2 113358624 113359116 -68388971 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 4 1449 322 0 0 0 chr2 113359116 113359154 -68388933 - MERVL-int LTR ERVL 0 5485 5448 4 1449 387 167 46 35 chr2 113359154 113359241 -68388846 - ORR1A3-int LTR MaLR -1323 640 553 4 1449 41324 16 14 0 chr2 113359241 113364528 -68383559 - MERVL-int LTR ERVL -125 5360 1 4 1449 4670 18 2 0 chr2 113364528 113365020 -68383067 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 4 1449 402 325 194 22 chr2 113366541 113366778 -68381309 - MTEa LTR MaLR -50 329 51 4 1449 1966 205 90 3 chr2 113369803 113370190 -68377897 - MTC LTR MaLR 0 421 1 4 1449 225 276 53 0 chr2 113371429 113371505 -68376582 + MTEb LTR MaLR 300 379 0 5 1450 289 197 27 27 chr2 113387155 113387228 -68360859 - MTC LTR MaLR 0 400 328 5 1450 1754 171 43 0 chr2 113387396 113387700 -68360387 - MTC LTR MaLR -104 317 1 5 1450 735 276 93 66 chr2 113391218 113391582 -68356505 - MTE2b LTR MaLR -2 377 4 5 1450 1378 195 182 3 chr2 113401382 113401690 -68346397 - MTD LTR MaLR 0 419 57 5 1450 1907 203 3 36 chr2 113401982 113402371 -68345716 - ORR1C1 LTR MaLR -2 376 1 5 1450 1676 193 300 37 chr2 113409892 113410590 -68337497 + RMER6C LTR ERVK 1 719 -1 5 1450 1624 172 22 16 chr2 113430251 113430588 -68317499 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 5 1450 8476 176 21 52 chr2 113430589 113432678 -68315409 - ORR1B1-int LTR MaLR -1 1791 1 5 1450 314 113 57 0 chr2 113432682 113432735 -68315352 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 331 5 1450 1348 188 82 24 chr2 113432845 113433139 -68314948 - ORR1B1 LTR MaLR -36 358 48 5 1450 3194 49 31 0 chr2 113439699 113440084 -68308003 - MTB LTR MaLR 0 400 4 5 1450 908 294 75 62 chr2 113447922 113448375 -68299712 + MLT1D LTR MaLR 44 502 -3 6 1450 1529 174 99 35 chr2 113449228 113449573 -68298514 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 6 1450 1973 198 45 5 chr2 113455003 113455404 -68292683 + MTD LTR MaLR 3 419 0 6 1450 896 280 36 18 chr2 113462697 113462977 -68285110 - ORR1E LTR MaLR -57 302 18 6 1450 466 308 0 20 chr2 113483662 113483808 -68264279 - MTE2b LTR MaLR -236 143 1 6 1450 393 265 237 20 chr2 113497235 113497535 -68250552 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 1 6 1450 662 243 16 135 chr2 113502990 113503242 -68244845 + MTE2b LTR MaLR 1 222 -157 4 1451 1074 239 95 25 chr2 113509671 113509988 -68238099 - MTD LTR MaLR -40 379 41 1 1451 718 257 20 65 chr2 113524143 113524343 -68223744 - MTD LTR MaLR -224 195 5 3 1451 1450 213 274 46 chr2 113539216 113539257 -68208830 - MT2A LTR ERVL 0 533 465 4 1451 1450 213 274 46 chr2 113539317 113539709 -68208378 - MT2A LTR ERVL -69 464 1 4 1451 1803 219 10 79 chr2 113548680 113549087 -68199000 - MTE2b LTR MaLR 0 379 1 6 1451 230 291 101 0 chr2 113558201 113558280 -68189807 - MLT1A1 LTR MaLR -321 87 1 6 1451 802 249 220 23 chr2 113568251 113568551 -68179536 - MTE2b LTR MaLR -11 368 10 7 1451 1812 209 64 18 chr2 113568671 113569060 -68179027 - MTD LTR MaLR -1 418 12 7 1451 294 253 69 0 chr2 113576072 113576159 -68171928 - MLT1K LTR MaLR -2 593 501 8 1451 640 260 239 22 chr2 113576162 113576441 -68171646 + MLT1F1 LTR MaLR 3 325 -223 8 1451 252 328 86 26 chr2 113576460 113576576 -68171511 + MLT1F1 LTR MaLR 425 547 -13 8 1451 450 271 154 32 chr2 113576852 113577008 -68171079 + MLT1F1 LTR MaLR 45 219 -350 8 1451 329 299 147 47 chr2 113584245 113584456 -68163631 - LTR52 LTR ERVL -132 289 58 9 1451 1006 265 193 6 chr2 113611597 113611950 -68136137 + MTD LTR MaLR 1 419 0 1 1451 601 318 38 54 chr2 113629171 113629484 -68118603 + MLT1J1 LTR MaLR 3 310 -134 1 1451 1557 146 74 86 chr2 113636142 113636278 -68111809 + ORR1C1 LTR MaLR 1 124 -254 1 1451 1929 108 25 22 chr2 113636278 113636599 -68111488 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 322 0 1 1451 1557 146 74 86 chr2 113636599 113636813 -68111274 + ORR1C1 LTR MaLR 125 347 -31 1 1452 3156 6 43 0 chr2 113650098 113650450 -68097637 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 1 1452 56254 23 19 2 chr2 113650450 113656811 -68091276 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 8 1 1452 3146 8 43 0 chr2 113656811 113657163 -68090924 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 1 1452 3006 77 23 0 chr2 113661888 113662279 -68085808 + MTB LTR MaLR 1 400 0 2 1452 243 222 37 0 chr2 113662578 113662632 -68085455 + MLT1A LTR MaLR 9 64 -310 2 1452 2218 150 88 3 chr2 113662899 113663287 -68084800 + MTC LTR MaLR 1 421 0 2 1452 296 329 97 17 chr2 113666131 113666369 -68081718 + MLT1E1A LTR MaLR 396 652 -28 2 1452 344 273 40 52 chr2 113670298 113670433 -68077654 - ORR1E LTR MaLR -238 121 8 2 1452 320 178 81 14 chr2 113681531 113681605 -68066482 + RMER6C LTR ERVK 492 570 -120 2 1452 2038 191 52 10 chr2 113689920 113690322 -68057765 + ORR1C2 LTR MaLR 1 419 -2 2 1452 4291 235 84 43 chr2 113690325 113690537 -68057550 + ORR1C2-int LTR MaLR 1 230 -1140 2 1452 1465 150 319 28 chr2 113690537 113690894 -68057193 + RMER6B LTR ERVK 1 461 0 2 1452 4291 235 84 43 chr2 113690894 113691870 -68056217 + ORR1C2-int LTR MaLR 231 1237 -133 2 1452 542 120 119 10 chr2 113698626 113698727 -68049360 + ORR1C2-int LTR MaLR 1395 1506 -3 2 1452 2300 133 32 101 chr2 113698730 113698805 -68049282 + ORR1C2 LTR MaLR 1 52 -332 2 1452 2300 133 32 101 chr2 113698942 113699274 -68048813 + ORR1C2 LTR MaLR 53 380 -4 2 1452 567 272 95 14 chr2 113700024 113700210 -68047877 + MTE2a LTR MaLR 1 196 -223 2 1452 472 327 21 168 chr2 113700391 113700428 -68047659 + MTE2a LTR MaLR 182 195 -212 2 1452 902 211 44 53 chr2 113700572 113700812 -68047275 + MTE2a LTR MaLR 166 392 -15 2 1452 1119 276 185 108 chr2 113700812 113700878 -68047209 + MTE2a-int LTR MaLR 1 50 -1208 2 1452 2260 152 51 6 chr2 113700878 113701229 -68046858 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 2 1452 1400 276 185 108 chr2 113701229 113702188 -68045899 + MTE2a-int LTR MaLR 51 1474 -106 2 1452 1119 276 185 108 chr2 113702359 113702392 -68045695 + MTE2a-int LTR MaLR 1098 1126 -132 2 1452 1119 276 185 108 chr2 113702577 113702660 -68045427 + MTE2a-int LTR MaLR 1127 1231 -27 2 1452 1688 196 75 17 chr2 113702701 113703049 -68045038 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 7 2 1452 909 266 152 30 chr2 113703260 113703639 -68044448 + MTE2a LTR MaLR 1 378 -1 2 1452 601 309 171 4 chr2 113703730 113703987 -68044100 - LTR16B1 LTR ERVL 0 480 181 2 1452 1322 241 91 18 chr2 113707391 113707776 -68040311 + MTD LTR MaLR 5 417 -2 2 1452 253 308 15 0 chr2 113710751 113710836 -68037251 - ORR1E LTR MaLR -263 107 22 2 1452 2678 305 91 70 chr2 113710850 113711054 -68037033 - MTE-int LTR MaLR -46 1534 1347 2 1452 2678 305 91 70 chr2 113711195 113711363 -68036724 - MTE-int LTR MaLR -234 1346 1175 2 1452 2678 305 91 70 chr2 113711570 113712529 -68035558 - MTE-int LTR MaLR -406 1174 175 2 1452 260 308 103 54 chr2 113714211 113714434 -68033653 - RMER20B LTR ERVK -36 480 243 2 1452 380 275 160 85 chr2 113718834 113719140 -68028947 - MLT1A1 LTR MaLR -61 347 19 2 1452 276 260 66 19 chr2 113719431 113719537 -68028550 + MLT1H2 LTR MaLR 306 416 -73 2 1452 874 276 97 16 chr2 113720760 113721069 -68027018 - MTE2a LTR MaLR -7 372 39 2 1452 646 275 144 52 chr2 113721253 113721544 -68026543 - MLT1A0 LTR MaLR -34 331 14 2 1452 335 299 42 49 chr2 113722660 113722804 -68025283 - MLT1F1 LTR MaLR -27 542 400 2 1452 626 162 9 0 chr2 113723090 113723201 -68024886 - MLT1A LTR MaLR -8 366 255 2 1452 246 255 99 35 chr2 113723386 113723502 -68024585 - MLT1A LTR MaLR -243 122 6 2 1452 2254 114 31 0 chr2 113728864 113729181 -68018906 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 2 1453 2136 142 22 335 chr2 113786853 113787636 -67960451 - RLTR21 LTR ERVK -11 1561 1094 3 1453 2136 142 22 335 chr2 113787702 113787915 -67960172 - RLTR21 LTR ERVK -479 1093 877 3 1453 927 191 54 40 chr2 113787917 113788141 -67959946 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1616 1842 -6 3 1453 308 274 147 26 chr2 113789047 113789163 -67958924 - ORR1D1 LTR MaLR -244 130 1 3 1453 4262 179 62 47 chr2 113797018 113797895 -67950192 + RMER19B LTR ERVK 1 890 -12 3 1453 336 280 25 85 chr2 113812762 113812902 -67935185 - MLT2B4 LTR ERVL -117 450 274 3 1453 235 322 105 24 chr2 113813502 113813626 -67934461 + ORR1E LTR MaLR 58 191 -168 3 1453 574 252 25 25 chr2 113813807 113813970 -67934117 - MLT2B4 LTR ERVL -393 163 1 3 1453 542 347 145 21 chr2 113817861 113818344 -67929743 - MLT2E LTR ERVL -5 623 81 3 1453 1000 292 53 55 chr2 113819067 113819447 -67928640 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 3 1453 442 328 97 29 chr2 113827998 113828231 -67919856 - ORR1E LTR MaLR -100 270 24 3 1453 364 277 18 0 chr2 113832974 113833086 -67915001 + MLT1B LTR MaLR 14 127 -263 3 1453 373 251 177 56 chr2 113833220 113833452 -67914635 + MLT1B LTR MaLR 127 386 -4 3 1453 679 299 95 48 chr2 113847816 113848153 -67899934 - ORR1E LTR MaLR -6 353 1 3 1453 879 266 154 0 chr2 113852489 113852794 -67895293 + MTEa LTR MaLR 20 371 -8 3 1453 450 249 119 94 chr2 113856823 113857058 -67891029 - MTE2a LTR MaLR -4 375 119 4 1453 782 257 256 15 chr2 113860616 113860940 -67887147 - MTD LTR MaLR 0 419 18 4 1453 3340 46 2 0 chr2 113860986 113861381 -67886706 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 1453 408 259 131 0 chr2 113865536 113865663 -67882424 - MTEa LTR MaLR -237 142 1 4 1453 283 363 0 0 chr2 113867174 113867265 -67880822 - MT2A LTR ERVL -160 373 283 4 1453 492 298 107 30 chr2 113869240 113869538 -67878549 - MLT1B LTR MaLR -2 388 68 4 1453 601 165 10 0 chr2 113897972 113898069 -67850018 + RLTR20A LTR ERVK 1 98 -443 4 181 2562 169 35 58 chr2 113901119 113901658 -67846429 - RLTR11A2 LTR ERVK 0 527 1 4 1454 563 284 90 70 chr2 113904769 113905002 -67843085 + MER89 LTR ERV1 1 329 -230 4 1454 563 274 112 94 chr2 113905417 113905623 -67842464 + MER89 LTR ERV1 330 547 -12 4 1454 1657 191 42 66 chr2 113907695 113907725 -67840362 + ORR1D1 LTR MaLR 1 30 -344 5 1454 1657 191 42 66 chr2 113907872 113908221 -67839866 + ORR1D1 LTR MaLR 31 371 -3 5 1454 1025 197 21 5 chr2 113908362 113908551 -67839536 + MTC LTR MaLR 230 421 0 5 1454 626 296 127 23 chr2 113909850 113910158 -67837929 - MLT1A0 LTR MaLR -22 343 4 5 1454 2312 110 115 3 chr2 113912559 113912923 -67835164 + RLTR23 LTR ERV1 26 430 0 5 1454 761 145 0 0 chr2 113914764 113914881 -67833206 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 268 5 1454 765 258 80 9 chr2 113915288 113915463 -67832624 - ORR1C2 LTR MaLR -115 269 80 5 1454 1309 253 113 11 chr2 113916725 113917105 -67830982 + MTD LTR MaLR 1 419 0 5 1454 643 231 206 29 chr2 113919468 113919740 -67828347 + LTR40c LTR ERVL 78 397 -68 5 1454 882 160 19 6 chr2 113920083 113920240 -67827847 - ORR1D1 LTR MaLR -211 163 5 5 1454 599 314 130 22 chr2 113942754 113943024 -67805063 - LTR33A LTR ERVL 0 520 222 5 1454 280 263 15 126 chr2 113963885 113964020 -67784067 - MT2B LTR ERVL -337 264 145 5 1454 4131 53 22 59 chr2 113973182 113973721 -67774366 + MURVY-LTR LTR ERV1 1 519 0 5 1454 1848 114 100 0 chr2 113974283 113974573 -67773514 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 5 1454 423 267 3 63 chr2 113975185 113975333 -67772754 + MTC LTR MaLR 264 407 -14 5 1454 875 267 94 103 chr2 113987677 113988028 -67760059 + MTEa LTR MaLR 32 379 0 6 1454 364 253 90 89 chr2 113989129 113989351 -67758736 - MTE2b LTR MaLR -147 232 12 6 1454 360 345 56 82 chr2 113989480 113989783 -67758304 + ORR1E LTR MaLR 8 302 -57 6 1454 2013 218 21 14 chr2 113990073 113990491 -67757596 + MTC LTR MaLR 1 421 0 6 1454 1993 214 89 15 chr2 113990492 113991015 -67757072 + MTC-int LTR MaLR 2 498 -760 6 1454 591 239 133 91 chr2 114003342 114003627 -67744460 + RMER20B LTR ERVK 101 397 -230 5 1454 1625 147 103 179 chr2 114003902 114004367 -67743720 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 1 7 1454 3247 30 2 17 chr2 114004935 114005067 -67743020 + MTA_Mm LTR MaLR 1 131 -265 8 1454 3132 66 200 9 chr2 114005067 114005497 -67742590 - RLTR1B LTR ERV1 0 512 1 9 1454 3247 30 2 17 chr2 114005497 114005766 -67742321 + MTA_Mm LTR MaLR 132 396 0 8 1454 4743 8 2 0 chr2 114006607 114007099 -67740988 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 1 1454 322 0 0 0 chr2 114007099 114007137 -67740950 - MERVL-int LTR ERVL 0 5485 5448 1 1454 380 137 13 40 chr2 114007137 114007213 -67740874 - ORR1A3-int LTR MaLR -1323 640 567 1 1454 48961 15 0 0 chr2 114007213 114012583 -67735504 - MERVL-int LTR ERVL -114 5371 1 1 1454 4743 8 2 0 chr2 114012583 114013075 -67735012 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 1 1454 236 236 18 0 chr2 114015963 114016018 -67732069 + MLT1L LTR MaLR 543 598 -12 1 1454 390 271 31 0 chr2 114025795 114025891 -67722196 - MER76 LTR ERVL -547 144 46 2 1454 438 234 17 43 chr2 114027764 114027880 -67720207 - RLTR19 LTR ERVK 0 499 387 2 1454 505 322 8 15 chr2 114028107 114028369 -67719718 - RLTR4_MM-int LTR ERV1 -307 7294 7147 2 1454 2061 123 48 3 chr2 114029572 114029905 -67718182 - RLTR15 LTR ERVK -11 348 1 2 1454 631 319 11 0 chr2 114030153 114030341 -67717746 - RLTR19-int LTR ERVK -1585 4552 4363 2 1454 295 341 65 48 chr2 114030209 114030551 -67717536 - MuRRS4-int LTR ERV1 -721 4342 4169 2 1454 274 254 53 9 chr2 114030574 114030672 -67717415 - MURVY-int LTR ERV1 -2333 5119 5048 3 1454 317 300 80 34 chr2 114030674 114030850 -67717237 + MTE2a LTR MaLR 196 379 0 3 1455 1022 238 90 20 chr2 114033387 114033743 -67714344 + RMER17C LTR ERVK 1 381 -29 3 1455 430 224 104 68 chr2 114033663 114034028 -67714059 - RMER17C LTR ERVK -64 346 1 3 1455 726 128 34 19 chr2 114034615 114034769 -67713318 - ORR1A3 LTR MaLR -9 318 168 3 1455 269 139 0 0 chr2 114035782 114035825 -67712262 - ORR1B1 LTR MaLR -2 392 350 4 1455 1650 136 29 74 chr2 114036855 114037164 -67710923 - ORR1B1 LTR MaLR -59 335 41 4 1455 1734 206 53 17 chr2 114037393 114037748 -67710339 - ORR1D2 LTR MaLR -2 368 1 4 1455 400 301 124 25 chr2 114049927 114050169 -67697918 - MLT1H LTR MaLR -3 546 281 6 1455 276 389 29 29 chr2 114050196 114050368 -67697719 - MLT1H LTR MaLR -328 221 50 6 1455 1029 271 46 116 chr2 114059523 114059911 -67688176 - MTE2a LTR MaLR -18 361 1 8 1455 610 408 77 34 chr2 114062243 114062713 -67685374 - LTR33 LTR ERVL -2 513 24 8 1455 304 276 22 109 chr2 114083631 114083769 -67664318 + RMER15 LTR ERVL 273 398 -177 1 1455 259 277 77 29 chr2 114083780 114083884 -67664203 + RMER15 LTR ERVL 452 560 -15 1 1455 246 367 133 77 chr2 114090204 114090399 -67657688 + MLT1K LTR MaLR 47 252 -343 1 1455 446 403 47 25 chr2 114104641 114104959 -67643128 + MLT1H1 LTR MaLR 208 532 -23 1 1455 2345 110 3 0 chr2 114105024 114105350 -67642737 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 1 1455 1031 280 116 17 chr2 114105402 114105747 -67642340 + MTD LTR MaLR 41 419 0 1 1455 4424 14 0 0 chr2 114109867 114110360 -67637727 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 1 1455 3401 67 40 21 chr2 114122139 114122612 -67625475 + RLTR45 LTR ERVK 1 482 0 1 1455 1148 251 54 94 chr2 114123055 114123534 -67624553 + MT2A LTR ERVL 1 588 -13 1 1455 470 368 62 60 chr2 114127822 114128175 -67619912 + ORR1E LTR MaLR 1 354 -5 1 1455 781 327 62 68 chr2 114134974 114135456 -67612631 + MLT1D LTR MaLR 6 484 -21 1 1455 249 288 8 141 chr2 114136429 114136550 -67611537 + MT2B LTR ERVL 153 257 -344 1 1455 703 299 62 32 chr2 114136801 114137109 -67610978 + MLT2D LTR ERVL 2 318 -96 1 1455 3302 31 3 0 chr2 114139133 114139517 -67608570 + IAPEY_LTR LTR ERVK 1 385 0 1 1455 814 264 27 6 chr2 114153334 114153517 -67594570 + ORR1D2 LTR MaLR 1 187 -183 1 1455 1111 244 84 57 chr2 114156907 114157241 -67590846 - ORR1E LTR MaLR -6 353 11 1 1456 2748 187 15 6 chr2 114171872 114172395 -67575692 + RLTR12B LTR ERVK 1 528 0 2 1456 2362 123 84 10 chr2 114179702 114179898 -67568189 + RLTR44B LTR ERVK 1 196 -253 2 1456 2362 123 84 10 chr2 114179951 114180172 -67567915 + RLTR44B LTR ERVK 197 447 -2 2 1456 1226 238 124 19 chr2 114188650 114189014 -67559073 - MTD LTR MaLR 0 419 18 2 1456 768 259 40 96 chr2 114202722 114203211 -67544876 + RLTR11B LTR ERVK 1 494 -34 2 1456 990 213 26 34 chr2 114206314 114206547 -67541540 - ORR1D2 LTR MaLR -8 362 132 2 1456 3026 35 184 2 chr2 114209220 114209622 -67538465 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 2 1456 829 298 130 49 chr2 114212361 114212707 -67535380 + MTD LTR MaLR 46 419 0 2 1456 230 304 89 52 chr2 114214118 114214309 -67533778 - MLT1D LTR MaLR 0 505 308 2 1456 459 241 61 61 chr2 114214619 114214800 -67533287 + MTEa LTR MaLR 197 377 -2 2 1456 237 319 274 0 chr2 114223503 114223638 -67524449 + LTR90B LTR LTR 511 682 -114 2 1456 1811 181 22 125 chr2 114226729 114227146 -67520941 + ORR1C1 LTR MaLR 5 378 0 2 1456 6307 204 26 77 chr2 114227146 114228735 -67519352 + ORR1C1-int LTR MaLR 1 1509 0 2 1456 1423 213 111 9 chr2 114229844 114230176 -67517911 + ORR1C1 LTR MaLR 13 384 0 2 1456 1446 194 79 12 chr2 114241020 114241360 -67506727 - RMER6C LTR ERVK 0 690 328 3 1456 364 187 24 85 chr2 114241375 114241457 -67506630 - MT2B LTR ERVL -371 230 154 3 1456 273 206 0 14 chr2 114241403 114241477 -67506610 - ORR1B1-int LTR MaLR -819 690 618 3 1456 3509 176 51 185 chr2 114244372 114245537 -67502550 + RLTR25B LTR ERVK 21 1028 0 3 1456 2605 52 9 3 chr2 114251531 114251856 -67496231 - IAPLTR2b LTR ERVK 0 327 1 3 1456 2100 157 109 5 chr2 114254166 114254490 -67493597 + RMER4A LTR ERVK 1 343 -123 3 1456 2100 157 109 5 chr2 114254527 114254624 -67493463 + RMER4A LTR ERVK 344 466 0 3 1456 755 150 23 0 chr2 114254624 114254757 -67493330 + MurERV4-int LTR ERVK 1 136 -5124 3 1456 505 111 0 12 chr2 114254757 114254839 -67493248 + RMER4A LTR ERVK 386 466 0 3 1456 801 246 148 78 chr2 114256568 114256926 -67491161 + MLT1B LTR MaLR 6 388 -2 3 1456 380 215 43 48 chr2 114258342 114258528 -67489559 - RMER17C LTR ERVK -137 273 89 3 1456 394 184 92 0 chr2 114261271 114261347 -67486740 - RLTR23 LTR ERV1 -340 90 8 3 1456 439 119 36 32 chr2 114261346 114261447 -67486640 + MTC LTR MaLR 280 416 -5 3 1456 226 352 46 52 chr2 114272118 114272271 -67475816 + MLT1A1 LTR MaLR 1 152 -256 3 1456 433 242 228 98 chr2 114272653 114272868 -67475219 - MTD LTR MaLR -39 380 138 3 1457 2968 48 3 0 chr2 114297653 114298006 -67450081 - IAPEY2_LTR LTR ERVK -3 354 1 3 1457 365 263 65 48 chr2 114319576 114319700 -67428387 - LTR16E1 LTR ERVL 0 538 413 4 1457 1772 187 68 9 chr2 114337475 114337814 -67410273 - ORR1B2 LTR MaLR -8 359 1 4 1457 265 137 19 56 chr2 114338389 114338443 -67409644 + ORR1B2 LTR MaLR 118 169 -198 4 1457 410 285 73 0 chr2 114341889 114342012 -67406075 + MTE2a LTR MaLR 205 336 -43 4 1457 241 260 49 49 chr2 114356139 114356220 -67391867 - LTR29 LTR ERV1 -541 81 1 4 1457 890 244 175 0 chr2 114384668 114384959 -67363128 - MTD LTR MaLR 0 419 78 4 1457 235 179 41 11 chr2 114385721 114385781 -67362306 - LTR80A LTR ERVL -383 200 139 4 1457 1077 287 71 14 chr2 114387356 114387709 -67360378 + ORR1D-int LTR MaLR 998 1370 0 4 1457 2004 162 11 32 chr2 114392161 114392214 -67355873 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 314 4 1457 2004 162 11 32 chr2 114392402 114392723 -67355364 - ORR1B2 LTR MaLR -54 313 1 4 1457 1302 227 17 24 chr2 114402667 114402956 -67345131 + ORR1D1 LTR MaLR 88 374 0 5 1457 1653 215 59 25 chr2 114403800 114404158 -67343929 - ORR1D1 LTR MaLR -4 370 1 5 1457 3728 11 121 0 chr2 114407941 114408381 -67339706 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 5 1457 299 264 112 9 chr2 114409159 114409266 -67338821 + MLT1A1 LTR MaLR 291 408 0 5 1457 278 291 41 33 chr2 114413910 114414031 -67334056 - MLT1B LTR MaLR -57 333 212 5 1457 516 279 68 169 chr2 114417767 114418176 -67329911 - MLT2B1 LTR ERVL -179 377 10 5 1457 1271 231 119 8 chr2 114418184 114418547 -67329540 - MTD LTR MaLR -14 405 1 5 1457 1276 60 0 0 chr2 114419968 114420134 -67327953 + MTA_Mm LTR MaLR 1 166 -230 5 1457 1758 37 5 0 chr2 114421445 114421663 -67326424 + MTA_Mm LTR MaLR 178 396 0 5 1457 1622 152 62 73 chr2 114422868 114423223 -67324864 - ORR1B1 LTR MaLR -42 352 2 5 182 806 334 71 15 chr2 114425596 114425936 -67322151 + ORR1E LTR MaLR 1 359 0 5 1458 855 275 53 108 chr2 114432386 114432763 -67315324 - MTE2a LTR MaLR -12 367 15 5 1458 255 268 102 96 chr2 114444465 114444622 -67303465 - MT2B LTR ERVL -336 265 108 5 1458 7075 131 38 23 chr2 114459145 114460351 -67287736 + RLTR21 LTR ERVK 1 1251 -153 5 1458 1104 265 93 75 chr2 114460379 114460832 -67287255 + RLTR21 LTR ERVK 1112 1572 0 5 1458 3362 33 2 2 chr2 114478076 114478472 -67269615 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 1458 346 396 44 31 chr2 114483674 114483833 -67264254 - LTR16B1 LTR ERVL -245 235 75 6 1458 1191 305 11 89 chr2 114485964 114486543 -67261544 - MT2A LTR ERVL 0 556 1 6 1458 384 315 59 87 chr2 114488404 114488727 -67259360 - RLTR25A LTR ERVK -789 314 1 6 1458 525 399 37 31 chr2 114496250 114496571 -67251516 - LTR33 LTR ERVL -169 346 24 6 1458 626 353 90 33 chr2 114497547 114497913 -67250174 - MLT1F2 LTR MaLR 0 560 174 6 1458 480 384 56 74 chr2 114498078 114498394 -67249693 + LTR33 LTR ERVL 81 393 -122 6 1458 836 259 98 43 chr2 114498394 114498741 -67249346 + ORR1D2 LTR MaLR 1 366 -4 6 1458 480 384 56 74 chr2 114498741 114498815 -67249272 + LTR33 LTR ERVL 394 464 -51 6 1458 306 302 52 64 chr2 114500027 114500200 -67247887 + RLTR25B LTR ERVK 858 1028 0 1 1458 860 162 74 18 chr2 114506480 114506643 -67241444 + ORR1A2 LTR MaLR 1 172 -155 9 1458 3854 187 30 35 chr2 114506629 114508039 -67240048 - ORR1A2-int LTR MaLR -484 1479 1 1 1458 2208 117 6 0 chr2 114508039 114508364 -67239723 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 1 1458 325 286 70 25 chr2 114508474 114508603 -67239484 + MLT1D LTR MaLR 332 505 0 1 1458 662 337 86 3 chr2 114510266 114510468 -67237619 - MLT1B LTR MaLR -2 388 165 1 1458 662 337 86 3 chr2 114510509 114510645 -67237442 - MLT1B LTR MaLR -226 164 23 1 1458 1720 194 49 0 chr2 114522042 114522392 -67225695 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 3 1458 512 325 42 116 chr2 114525295 114525727 -67222360 - MLT1J LTR MaLR -96 416 17 3 1458 231 394 76 35 chr2 114541162 114541333 -67206754 - LTR33 LTR ERVL -145 370 193 6 1458 1496 228 16 42 chr2 114542019 114542403 -67205684 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 7 1458 285 317 48 9 chr2 114542601 114542706 -67205381 - LTR80A LTR ERVL -19 564 456 7 1458 811 263 116 30 chr2 114543662 114543929 -67204158 - ORR1D1 LTR MaLR -84 290 1 7 1458 311 372 70 0 chr2 114544599 114544728 -67203359 - MLT2B2 LTR ERVL -72 484 347 7 1458 716 270 153 45 chr2 114544739 114545073 -67203014 + MTD LTR MaLR 18 387 -32 7 1458 443 360 89 9 chr2 114545036 114545249 -67202838 - MLT2B2 LTR ERVL -120 395 166 7 1459 2018 226 34 12 chr2 114570766 114571174 -67176913 - MTC LTR MaLR 0 421 5 1 1459 976 311 62 36 chr2 114576785 114576809 -67171278 - MT2A LTR ERVL 0 533 510 1 1459 976 311 62 36 chr2 114576865 114577360 -67170727 - MT2A LTR ERVL -24 509 2 1 1459 1777 130 86 0 chr2 114599604 114599905 -67148182 + IAPEY3_LTR LTR ERVK 1 327 -5 1 1459 893 297 181 42 chr2 114612401 114612760 -67135327 + MTD LTR MaLR 9 379 0 1 1459 867 229 271 46 chr2 114612768 114613043 -67135044 + MTD LTR MaLR 5 361 -58 1 1459 3100 147 53 100 chr2 114613043 114613684 -67134403 - RMER19C LTR ERVK 0 611 1 1 1459 867 229 271 46 chr2 114613684 114613737 -67134350 + MTD LTR MaLR 362 407 -12 1 1459 751 286 118 32 chr2 114617005 114617319 -67130768 + MLT1H LTR MaLR 69 409 -140 1 1459 2633 162 60 47 chr2 114617960 114618510 -67129577 + RLTR20B3 LTR ERVK 21 577 0 1 1459 295 320 103 32 chr2 114619086 114619241 -67128846 - LTR16C LTR ERVL -289 200 35 1 1459 254 338 86 31 chr2 114621865 114622027 -67126060 - ORR1E LTR MaLR -120 239 69 1 1459 289 320 22 66 chr2 114643288 114643425 -67104662 + MT2B LTR ERVL 167 297 -304 1 1459 299 351 32 51 chr2 114646285 114646441 -67101646 + MLT1B LTR MaLR 208 360 -30 2 1459 244 330 107 29 chr2 114650837 114650940 -67097147 - MLT1I LTR MaLR -294 117 7 2 1459 227 275 29 14 chr2 114652372 114652442 -67095645 + LTR83 LTR ERVL 342 412 -368 2 1459 521 348 68 34 chr2 114656443 114656735 -67091352 + MLT1A0 LTR MaLR 10 311 -54 2 1459 2276 149 65 0 chr2 114657362 114657732 -67090355 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 2 1459 6619 182 64 13 chr2 114657732 114659168 -67088919 - ORR1B1-int LTR MaLR 0 1509 1 2 1459 1479 132 53 0 chr2 114659193 114659421 -67088666 - ORR1B1 LTR MaLR -14 380 141 2 1459 711 314 28 31 chr2 114659415 114659701 -67088386 + MLT1B LTR MaLR 98 382 -8 2 1459 229 318 0 12 chr2 114665920 114666006 -67082081 + MTE2b LTR MaLR 97 181 -193 2 1459 705 269 16 26 chr2 114668073 114668264 -67079823 + MLT1A0 LTR MaLR 1 189 -176 2 1459 562 266 93 26 chr2 114669033 114669226 -67078861 + MTE2b LTR MaLR 169 374 -5 2 1459 915 127 7 27 chr2 114670922 114671068 -67077019 - RLTR33 LTR ERVK -535 143 1 2 1459 616 152 0 0 chr2 114683963 114684075 -67064012 + ORR1A4 LTR MaLR 1 112 -217 2 1459 1087 132 54 3 chr2 114684044 114684340 -67063747 - ORR1A4-int LTR MaLR -1602 361 2 2 1459 1692 177 3 68 chr2 114684341 114684693 -67063394 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 2 1459 237 251 102 30 chr2 114685533 114685673 -67062414 - RMER20A LTR ERVK -276 240 90 2 1459 2663 88 128 2 chr2 114686040 114686462 -67061625 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 2 1460 1448 162 222 42 chr2 114690187 114690521 -67057566 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 2 1460 511 349 0 0 chr2 114691468 114691614 -67056473 + MTE2b LTR MaLR 1 146 -233 2 1460 609 297 61 19 chr2 114692298 114692511 -67055576 + MTE2b LTR MaLR 158 379 0 2 1460 429 310 42 65 chr2 114693985 114694202 -67053885 + LTR41 LTR ERVL 3 214 -554 2 1460 1695 191 91 191 chr2 114695952 114696631 -67051456 - RMER19C LTR ERVK 0 611 1 2 1460 577 299 50 38 chr2 114711655 114711916 -67036171 - MLT1B LTR MaLR -117 273 10 2 1460 477 278 81 29 chr2 114717971 114718145 -67029942 - MLT1A0 LTR MaLR -114 251 69 3 1460 525 305 191 8 chr2 114723106 114723347 -67024740 - LTR16A1 LTR ERVL 0 456 172 3 1460 1568 181 304 4 chr2 114726715 114727175 -67020912 + RMER6C LTR ERVK 1 598 -92 3 1460 347 350 88 66 chr2 114741551 114741823 -67006264 + MLT1J1 LTR MaLR 16 293 -151 3 1460 1237 222 153 6 chr2 114787066 114787231 -66960856 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 181 3 1460 1237 222 153 6 chr2 114787303 114787463 -66960624 - ORR1D1 LTR MaLR -194 180 1 3 1460 2625 220 79 45 chr2 114789945 114790650 -66957437 + RMER19B LTR ERVK 174 902 0 4 1460 1715 212 91 25 chr2 114794964 114795176 -66952911 - RLTR31_Mm LTR ERVK 0 561 332 4 1460 1715 212 91 25 chr2 114795227 114795540 -66952547 - RLTR31_Mm LTR ERVK -230 331 1 4 1460 637 264 54 18 chr2 114805690 114805856 -66942231 - MTE2a LTR MaLR -39 340 169 4 1460 234 275 87 0 chr2 114806050 114806119 -66941968 - MTE2a LTR MaLR -298 81 7 4 1460 712 321 57 68 chr2 114817440 114817821 -66930266 - MTE2a LTR MaLR -21 398 11 4 1460 3260 194 75 24 chr2 114818277 114818958 -66929129 - RMER6D LTR ERVK -4 716 1 4 1461 326 363 30 40 chr2 114821762 114821960 -66926127 + LTR82A LTR ERVL 240 435 -437 4 1461 297 241 72 0 chr2 114829971 114830054 -66918033 - MTD LTR MaLR -312 107 19 4 1461 2945 178 85 35 chr2 114831959 114832616 -66915471 + RMER6C LTR ERVK 1 690 0 4 1461 499 111 0 0 chr2 114834246 114834318 -66913769 + RLTR31_Mm LTR ERVK 1 72 -489 4 1461 2892 88 10 8 chr2 114834623 114835022 -66913065 - MTB LTR MaLR 0 400 1 4 1461 2573 178 19 42 chr2 114835808 114836382 -66911705 + RLTR31_Mm LTR ERVK 1 561 0 4 1461 1514 195 85 12 chr2 114841026 114841368 -66906719 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 4 1461 627 301 42 14 chr2 114842088 114842304 -66905783 + ORR1E LTR MaLR 4 225 -134 4 1461 460 277 31 49 chr2 114844108 114844271 -66903816 + ORR1E LTR MaLR 210 369 -1 4 1461 826 310 101 15 chr2 114844274 114844611 -66903476 + ORR1E-int LTR MaLR 4 369 -1211 4 1461 459 269 107 27 chr2 114844884 114845071 -66903016 + ORR1E-int LTR MaLR 322 523 -847 4 1461 2540 298 141 8 chr2 114845593 114846503 -66901584 + ORR1E-int LTR MaLR 493 1527 -53 4 1461 767 277 10 22 chr2 114846503 114846729 -66901358 + ORR1E LTR MaLR 1 327 -92 4 1461 364 237 21 56 chr2 114846905 114846983 -66901104 + ORR1E LTR MaLR 328 404 -15 4 1461 392 333 85 0 chr2 114849677 114849806 -66898281 + MLT1G3 LTR MaLR 230 369 -226 4 1461 310 250 157 0 chr2 114860826 114860966 -66887121 + MLT1D LTR MaLR 70 231 -274 5 1461 270 158 112 56 chr2 114861404 114861511 -66886576 - RLTR25B LTR ERVK -519 509 397 5 1461 2535 50 25 3 chr2 114870822 114871142 -66876945 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 5 1461 820 297 84 94 chr2 114874582 114874965 -66873122 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 5 1461 407 289 45 32 chr2 114888190 114888344 -66859743 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 210 5 1461 492 333 51 25 chr2 114890471 114890628 -66857459 + MLT1H2 LTR MaLR 23 183 -306 5 1461 1300 257 51 3 chr2 114898899 114899254 -66848833 - MTE2b LTR MaLR -5 374 3 5 1461 1072 308 22 25 chr2 114899943 114900303 -66847784 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 7 5 1461 1139 290 18 75 chr2 114917676 114918064 -66830023 + MTEa LTR MaLR 10 375 -4 5 1461 1158 267 98 6 chr2 114930196 114930531 -66817556 - MTEa LTR MaLR -13 366 1 5 1461 1095 264 72 19 chr2 114931767 114932087 -66816000 - ORR1D2 LTR MaLR -32 338 2 5 1461 517 325 73 84 chr2 114935373 114935729 -66812358 + ORR1E LTR MaLR 8 359 0 5 1461 2347 165 3 0 chr2 114940098 114940473 -66807614 + MERVL_2A-int LTR ERVL 1555 1930 -3831 6 1461 718 100 10 0 chr2 114940475 114940575 -66807512 + MT2C_Mm LTR ERVL 375 475 0 6 1461 251 348 49 37 chr2 114944467 114944631 -66803456 + LTR33 LTR ERVL 282 447 -68 6 1462 1488 287 74 74 chr2 114966772 114967566 -66780521 + MTE-int LTR MaLR 79 1311 -269 6 1462 773 282 72 57 chr2 114968994 114969329 -66778758 + MTE2a LTR MaLR 17 356 -23 6 1462 1548 197 111 6 chr2 114972244 114972348 -66775739 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 261 6 1462 1548 197 111 6 chr2 114972385 114972612 -66775475 - ORR1B2 LTR MaLR -107 260 2 6 1462 1691 157 69 15 chr2 114989741 114990083 -66758004 + RMER16 LTR ERVK 44 533 0 6 1462 352 355 161 15 chr2 114990106 114990366 -66757721 + LTR16C LTR ERVL 168 465 -24 6 1462 1875 184 22 27 chr2 114998657 114999026 -66749061 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 6 1462 355 368 0 19 chr2 115014539 115014697 -66733390 - MLT1A0 LTR MaLR -65 300 146 1 1462 242 332 96 50 chr2 115020735 115020954 -66727133 + RMER15 LTR ERVL 347 575 0 2 1462 310 379 24 96 chr2 115022128 115022461 -66725626 + ORR1E LTR MaLR 51 359 0 2 1462 416 236 48 24 chr2 115030313 115030439 -66717648 - MLT2B4 LTR ERVL -384 172 44 3 1462 1503 199 6 67 chr2 115033423 115033767 -66714320 + ORR1A4 LTR MaLR 6 328 -1 4 1462 2477 125 29 38 chr2 115034692 115035142 -66712945 - RMER6A LTR ERVK -1 755 310 5 1462 1087 172 228 3 chr2 115036015 115036300 -66711787 - RMER6A LTR ERVK -349 371 1 5 1462 231 213 12 118 chr2 115040921 115041006 -66707081 + MER90a LTR ERV1 123 198 -416 5 1462 468 309 97 34 chr2 115041041 115041309 -66706778 + MER90a LTR ERV1 320 604 -10 5 1462 314 277 35 26 chr2 115044177 115044292 -66703795 - ORR1E LTR MaLR -169 190 75 5 1462 519 167 29 0 chr2 115047753 115047855 -66700232 + ORR1D1 LTR MaLR 1 105 -269 6 1462 719 236 0 0 chr2 115047855 115047995 -66700092 + ORR1D1 LTR MaLR 228 367 -7 6 1462 833 296 45 41 chr2 115048669 115048937 -66699150 - MLT1A1 LTR MaLR -139 269 1 6 1462 385 316 169 82 chr2 115050138 115050435 -66697652 + MLT1A1 LTR MaLR 21 368 -40 6 1462 385 316 169 82 chr2 115050649 115050706 -66697381 + MLT1A1 LTR MaLR 369 406 -2 6 1462 449 305 23 0 chr2 115050934 115051065 -66697022 - MLT1A LTR MaLR -240 134 1 6 1462 1420 285 60 13 chr2 115053539 115053937 -66694150 + MTD LTR MaLR 3 419 0 7 1462 1474 197 50 25 chr2 115057084 115057401 -66690686 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 60 7 1462 276 336 134 0 chr2 115060881 115061015 -66687072 + LTR40a LTR ERVL 1 152 -367 8 1462 3243 24 39 0 chr2 115078018 115078399 -66669688 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1462 1355 221 34 89 chr2 115078996 115079421 -66668666 + RMER19C LTR ERVK 1 387 -350 1 1462 1158 212 71 17 chr2 115079694 115079934 -66668153 + RMER19C LTR ERVK 359 611 0 1 1463 631 200 198 12 chr2 115085111 115085273 -66662814 + ORR1B1 LTR MaLR 51 242 -152 1 1463 1264 234 82 50 chr2 115086036 115086440 -66661647 - MTD LTR MaLR -2 417 1 1 1463 631 314 158 18 chr2 115086449 115086777 -66661310 - MTEa LTR MaLR -4 375 2 1 1463 1102 271 107 51 chr2 115088101 115088493 -66659594 + MTC LTR MaLR 8 421 0 1 1463 478 304 65 61 chr2 115089529 115089774 -66658313 - MLT2B5 LTR ERVL -278 323 78 1 1463 829 304 35 72 chr2 115093572 115093945 -66654142 - ORR1E LTR MaLR 0 359 1 1 1463 552 272 141 18 chr2 115098925 115099213 -66648874 + MTEb LTR MaLR 1 323 -56 1 1463 262 315 26 18 chr2 115099487 115099600 -66648487 + MLT2B1 LTR ERVL 28 141 -379 1 1463 293 370 45 17 chr2 115119093 115119269 -66628818 - LTR85c LTR Gypsy? 0 823 643 1 1463 1727 196 49 42 chr2 115120090 115120521 -66627566 + RLTR20B3 LTR ERVK 1 434 -143 1 1463 723 304 40 79 chr2 115139708 115140062 -66608025 + ORR1E LTR MaLR 1 340 -19 1 1463 1364 194 245 11 chr2 115142944 115143303 -66604784 + RMER19B LTR ERVK 1 443 -459 1 1463 1177 200 37 4 chr2 115151475 115151716 -66596371 + ORR1B2 LTR MaLR 119 367 0 2 1463 227 310 31 94 chr2 115158020 115158116 -66589971 + MLT1A0 LTR MaLR 19 108 -300 2 1463 423 279 94 14 chr2 115158309 115158447 -66589640 + MLT1A0 LTR MaLR 217 365 0 2 1463 519 296 91 77 chr2 115160779 115161249 -66586838 - RLTR11A2 LTR ERVK -28 500 3 2 1463 344 343 0 53 chr2 115167789 115167903 -66580184 - RMER15 LTR ERVL -105 470 363 2 1463 1762 195 67 5 chr2 115175746 115176117 -66571970 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 2 1463 239 354 75 23 chr2 115177534 115177667 -66570420 + MLT2F LTR ERVL 1 140 -523 2 1463 349 262 70 51 chr2 115177681 115177853 -66570234 + MLT1E1 LTR MaLR 72 299 -355 2 1463 299 321 59 65 chr2 115180244 115180414 -66567673 - MTEa LTR MaLR -13 366 198 2 1463 318 232 75 60 chr2 115181897 115182030 -66566057 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 274 2 1463 1337 161 189 19 chr2 115186275 115186592 -66561495 + ORR1D1 LTR MaLR 4 374 0 2 1463 1003 325 73 24 chr2 115190472 115190936 -66557151 + MLT1D LTR MaLR 4 490 -15 2 1463 297 270 42 59 chr2 115193323 115193441 -66554646 - MT2B2 LTR ERVL -329 255 140 2 1464 234 298 42 126 chr2 115216727 115216846 -66531241 + MT2B LTR ERVL 149 257 -344 3 1464 598 251 90 78 chr2 115242284 115242552 -66505535 + RLTR12B LTR ERVK 1 271 -257 3 1464 424 259 30 85 chr2 115242559 115242829 -66505258 + RLTR15 LTR ERVK 72 326 -33 3 1464 632 349 71 50 chr2 115245885 115246365 -66501722 + MLT2B3 LTR ERVL 1 490 -64 3 1464 1768 151 101 26 chr2 115251692 115252068 -66496019 + MTC LTR MaLR 18 421 0 3 1464 780 301 82 24 chr2 115252777 115253032 -66495055 - MTE2b LTR MaLR 0 379 110 3 1464 431 202 25 0 chr2 115253378 115253457 -66494630 - MTE2b LTR MaLR -268 111 31 3 1464 1311 208 198 17 chr2 115255693 115256046 -66492041 - MTD LTR MaLR 0 419 3 3 1464 258 350 53 48 chr2 115264175 115264364 -66483723 - ORR1E LTR MaLR -162 197 8 3 1464 2184 162 57 19 chr2 115267061 115267621 -66480466 - RMER4A LTR ERVK 0 585 1 3 1464 258 246 194 30 chr2 115287142 115287276 -66460811 - LTR78 LTR ERV1 -211 1093 938 4 1464 401 195 67 147 chr2 115290446 115290596 -66457491 + ORR1D2 LTR MaLR 187 324 -46 4 1464 956 215 97 58 chr2 115304363 115304814 -66443273 + RLTR20C LTR ERVK 1 578 0 4 1464 418 266 29 83 chr2 115307589 115307807 -66440280 - MTEa LTR MaLR -1 378 159 4 1464 283 255 17 128 chr2 115311101 115311218 -66436869 + MT2B LTR ERVL 155 258 -343 4 1464 293 255 107 18 chr2 115317673 115317785 -66430302 + MTEa LTR MaLR 258 379 0 4 1464 1312 274 8 6 chr2 115318695 115319059 -66429028 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 1 4 1464 1166 201 111 7 chr2 115319876 115320146 -66427941 + MTD LTR MaLR 122 419 0 4 1464 2946 163 57 18 chr2 115320945 115321508 -66426579 - RMER4B LTR ERVK 0 585 1 4 1464 553 312 97 67 chr2 115323770 115324069 -66424018 + ORR1E LTR MaLR 9 316 -43 4 1464 781 224 254 51 chr2 115331114 115331429 -66416658 + MTEa LTR MaLR 1 379 0 5 1465 468 288 8 0 chr2 115358237 115358355 -66389732 - MTEa LTR MaLR 0 379 261 5 1465 435 252 16 32 chr2 115358471 115358594 -66389493 - MTEa LTR MaLR -200 159 39 5 1465 980 205 147 169 chr2 115359198 115359743 -66388344 - MT2A LTR ERVL 0 533 1 5 1465 327 350 48 8 chr2 115389423 115389547 -66358540 + MLT1L LTR MaLR 348 476 -134 5 1465 3470 45 28 12 chr2 115391095 115391524 -66356563 + RLTR10C LTR ERVK 1 436 0 5 1465 1898 157 40 6 chr2 115393978 115394305 -66353782 + ORR1A1 LTR MaLR 9 346 0 5 1465 345 211 66 0 chr2 115395425 115395501 -66352586 - LTR33 LTR ERVL -5 510 430 5 1465 319 382 89 57 chr2 115395528 115395775 -66352312 - LTR33 LTR ERVL -154 361 107 5 1465 373 221 170 72 chr2 115399228 115399417 -66348670 - LTR16B2 LTR ERVL -2 478 274 6 1465 1537 224 122 45 chr2 115402766 115403272 -66344815 - RMER2 LTR ERV1 -22 545 1 6 1465 1186 181 151 26 chr2 115409861 115410133 -66337954 + MTD LTR MaLR 107 412 -7 6 1465 1923 148 132 14 chr2 115441044 115441408 -66306679 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 6 1465 493 377 24 38 chr2 115441884 115442223 -66305864 - MLT1A LTR MaLR -2 372 39 6 1465 396 317 34 25 chr2 115442707 115442911 -66305176 + MLT-int LTR MaLR 1529 1734 -1 6 1465 346 347 68 88 chr2 115442914 115443265 -66304822 + MLT1D LTR MaLR 3 346 -159 6 1465 429 342 110 44 chr2 115447538 115447856 -66300231 + ORR1E LTR MaLR 15 353 -6 6 1465 673 291 131 50 chr2 115460620 115460963 -66287124 - MTEa LTR MaLR -8 371 1 6 1465 583 303 99 62 chr2 115461171 115461523 -66286564 + MTEb LTR MaLR 1 365 -14 6 1466 1347 263 45 9 chr2 115490634 115490968 -66257119 - MTEa LTR MaLR 0 379 34 7 1466 646 299 112 19 chr2 115502270 115502539 -66245548 - RMER15-int LTR ERVL -4446 553 260 2 1466 472 276 189 42 chr2 115502605 115502870 -66245217 - RMER15 LTR ERVL 0 575 272 2 1466 373 87 23 4 chr2 115506925 115506992 -66241095 + ORR1B1 LTR MaLR 1 97 -297 5 1466 2961 44 18 13 chr2 115515853 115516242 -66231845 - MTA_Mm LTR MaLR -5 391 1 1 1466 955 249 80 122 chr2 115526376 115526851 -66221236 - RMER4A LTR ERVK -11 455 1 3 1466 1299 165 9 5 chr2 115540171 115540390 -66207697 + MTC LTR MaLR 201 420 -1 5 1466 4244 72 12 16 chr2 115545851 115546417 -66201670 + LTRIS2 LTR ERV1 1 564 0 5 1466 483 301 64 27 chr2 115560368 115560694 -66187393 - MLT2C1 LTR ERVL -36 524 23 7 1466 358 269 31 63 chr2 115560793 115560920 -66187167 - MTD LTR MaLR -228 191 69 7 1466 1847 163 193 22 chr2 115587883 115588241 -66159846 + MTC LTR MaLR 3 421 0 1 1466 536 254 186 29 chr2 115594801 115595082 -66153005 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 1 1466 289 311 65 9 chr2 115596050 115596157 -66151930 - MLT1F2 LTR MaLR 0 624 512 1 1466 447 329 106 44 chr2 115596262 115596484 -66151603 - MLT1F2 LTR MaLR -245 315 75 1 1466 1035 251 128 27 chr2 115596484 115596820 -66151267 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 1 1466 447 329 106 44 chr2 115596820 115596890 -66151197 - MLT1F2 LTR MaLR -486 74 6 1 1467 844 181 92 72 chr2 115609976 115610039 -66138048 + MTD LTR MaLR 151 209 -210 1 1467 844 181 92 72 chr2 115610189 115610387 -66137700 + MTD LTR MaLR 210 417 -2 1 1467 3973 156 134 15 chr2 115614199 115614817 -66133270 + RMER19B LTR ERVK 3 707 -195 1 1467 3431 62 12 2 chr2 115614817 115615220 -66132867 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 1 1467 3973 156 134 15 chr2 115615220 115615391 -66132696 + RMER19B LTR ERVK 708 886 -16 1 1467 1696 148 24 17 chr2 115620097 115620392 -66127695 - RMER4B LTR ERVK -8 577 281 1 1467 879 279 114 74 chr2 115620488 115621030 -66127057 + MLT1L LTR MaLR 47 610 0 1 1467 2526 123 3 38 chr2 115623418 115623789 -66124298 + RLTR10D LTR ERVK 1 358 -1 1 1467 1331 274 21 40 chr2 115624011 115624384 -66123703 - MTE2b LTR MaLR -13 366 1 1 1467 475 265 43 0 chr2 115625139 115625256 -66122831 + ORR1D2 LTR MaLR 156 277 -93 1 1467 1330 217 96 62 chr2 115627071 115627425 -66120662 + ORR1D2 LTR MaLR 1 366 -4 1 1467 497 329 79 17 chr2 115628589 115628830 -66119257 - MLT1C LTR MaLR -18 449 194 1 1467 3808 13 0 0 chr2 115632583 115632979 -66115108 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1467 2459 141 65 5 chr2 115633256 115633627 -66114460 + ORR1B1 LTR MaLR 2 394 0 1 1467 917 286 115 38 chr2 115634051 115634476 -66113611 - MLT1C LTR MaLR 0 467 10 1 1467 1252 265 46 49 chr2 115641096 115641421 -66106666 + MTE2b LTR MaLR 1 324 -55 2 1467 387 153 11 76 chr2 115641443 115641535 -66106552 + RMER4B LTR ERVK 1 86 -499 2 1467 1769 156 6 86 chr2 115641565 115641924 -66106163 + RMER4B LTR ERVK 256 585 0 2 1467 231 267 16 62 chr2 115643366 115643430 -66104657 + MamGypLTR1b LTR Gypsy 302 362 -420 2 1467 1575 203 74 20 chr2 115648461 115648641 -66099446 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 175 2 1467 1575 203 74 20 chr2 115648700 115648870 -66099217 - ORR1D1 LTR MaLR -200 174 5 2 1467 1465 230 86 3 chr2 115649125 115649474 -66098613 - MTD LTR MaLR 0 419 42 2 1467 249 274 40 105 chr2 115653538 115653715 -66094372 - LTR81B LTR ERV1? -1006 344 172 2 1467 385 293 122 51 chr2 115664129 115664384 -66083703 - ORR1E LTR MaLR 0 359 87 2 1467 629 316 39 22 chr2 115666299 115666529 -66081558 + MTD LTR MaLR 3 236 -183 2 1467 1667 261 36 62 chr2 115666493 115667109 -66080978 + RMER19C LTR ERVK 58 611 0 2 1467 1005 56 84 0 chr2 115707605 115707748 -66040339 + MURVY-LTR LTR ERV1 365 519 0 3 1468 266 270 24 98 chr2 115766195 115766318 -65981769 + MLT1I LTR MaLR 293 406 -5 3 1468 823 121 23 0 chr2 115771558 115771690 -65976397 + ORR1B1 LTR MaLR 260 394 0 4 1468 423 294 159 7 chr2 115795172 115795471 -65952616 + MLT1A0 LTR MaLR 3 365 0 4 1468 269 362 25 69 chr2 115812007 115812283 -65935804 + MLT1B LTR MaLR 66 329 -61 4 1468 350 226 30 79 chr2 115812745 115812846 -65935241 - MT2B LTR ERVL -361 240 145 4 1468 228 184 59 84 chr2 115819101 115819220 -65928867 + RLTR25B LTR ERVK 397 512 -516 4 1468 425 262 23 69 chr2 115832323 115832454 -65915633 - MT2B LTR ERVL -323 278 154 4 1469 557 115 10 0 chr2 115905496 115905592 -65842495 + RMER19C LTR ERVK 1 97 -514 5 1469 1992 177 154 39 chr2 115908580 115909114 -65838973 + RMER19B LTR ERVK 308 902 0 5 1469 259 250 71 71 chr2 115909366 115909521 -65838566 + LTR33 LTR ERVL 352 506 -9 5 1469 531 182 16 52 chr2 115913748 115913834 -65834253 - RMER17C LTR ERVK -136 274 186 5 1469 531 182 16 52 chr2 115913957 115914061 -65834026 - RMER17C LTR ERVK -225 185 91 5 1469 1575 223 152 82 chr2 115940401 115940972 -65807115 + RMER20B LTR ERVK 6 616 -11 6 1469 233 375 106 46 chr2 115952141 115952423 -65795664 - ORR1E LTR MaLR -53 306 8 6 1469 401 376 63 5 chr2 115955394 115955600 -65792487 + LTR16A LTR ERVL 234 451 0 6 1469 707 321 132 13 chr2 115959440 115959970 -65788117 + ERVL-int LTR ERVL 1608 2250 -3507 6 1469 312 368 8 16 chr2 115962289 115962416 -65785671 - MLT1E LTR MaLR -61 592 467 6 1469 1088 261 97 15 chr2 115962877 115963219 -65784868 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 6 1469 1282 296 64 8 chr2 115964850 115965242 -65782845 - MTD LTR MaLR -5 414 1 6 1469 1444 232 21 55 chr2 115975600 115975983 -65772104 - RLTR17 LTR ERVK -320 372 3 7 1469 673 259 85 88 chr2 115986025 115986304 -65761783 + MTD LTR MaLR 1 244 -135 7 1469 598 310 62 44 chr2 115986637 115986863 -65761224 - MTD LTR MaLR -189 230 1 7 1470 1905 92 88 3 chr2 116005866 116006151 -65741936 + RLTR27 LTR ERVK 1 309 0 1 1470 311 316 20 0 chr2 116006231 116006329 -65741758 - MLT1D LTR MaLR -6 499 400 1 1470 918 199 157 62 chr2 116015289 116015452 -65732635 + ORR1D1 LTR MaLR 5 165 -209 3 1470 918 199 157 62 chr2 116015508 116015682 -65732405 + ORR1D1 LTR MaLR 166 373 -1 3 1470 1894 187 44 16 chr2 116016146 116016483 -65731604 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 27 3 1470 3478 23 2 0 chr2 116016483 116016878 -65731209 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 1470 1894 187 44 16 chr2 116016878 116016904 -65731183 - ORR1D1 LTR MaLR -348 26 1 3 1470 510 310 49 103 chr2 116020896 116021265 -65726822 + ORR1E LTR MaLR 1 349 -25 4 1470 341 219 55 15 chr2 116022846 116022955 -65725132 - ORR1E LTR MaLR 0 379 269 4 1470 1956 121 9 48 chr2 116036071 116036402 -65711685 + ORR1A3 LTR MaLR 1 318 -8 7 1470 856 265 102 71 chr2 116043299 116043657 -65704430 - MLT2B1 LTR ERVL -54 502 1 8 1470 659 333 106 31 chr2 116050817 116051270 -65696817 - MLT1D LTR MaLR -12 493 7 9 1470 301 337 60 55 chr2 116053819 116054001 -65694086 - MLT1J LTR MaLR -252 260 78 9 1470 648 319 101 68 chr2 116056215 116056742 -65691345 + MLT2F LTR ERVL 9 663 0 9 1470 232 209 23 0 chr2 116062300 116062343 -65685744 - MT2B2 LTR ERVL -297 287 244 1 1470 260 349 47 0 chr2 116062329 116062435 -65685652 - MLT1D LTR MaLR -385 120 10 1 1470 989 284 113 42 chr2 116063362 116063741 -65684346 + MTD LTR MaLR 14 419 0 1 1470 1731 195 95 119 chr2 116063860 116064484 -65683603 + RMER19C LTR ERVK 1 609 -2 1 1470 5692 90 51 52 chr2 116068726 116069629 -65678458 + RLTR13D6 LTR ERVK 1 902 0 1 1470 2840 51 70 0 chr2 116074622 116074992 -65673095 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 1470 278 338 93 43 chr2 116085329 116085490 -65662597 - MLT1A0 LTR MaLR -79 286 118 1 1470 404 301 154 10 chr2 116090574 116090771 -65657316 - MLT2B3 LTR ERVL -20 534 309 1 1470 906 231 45 99 chr2 116090771 116091179 -65656908 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 21 1 1470 2699 186 47 53 chr2 116103676 116104300 -65643787 - RMER20B LTR ERVK 0 627 8 1 1470 320 304 75 35 chr2 116108689 116108863 -65639224 + RMER15 LTR ERVL 336 516 -59 1 1470 3309 96 4 23 chr2 116120837 116121315 -65626772 + MT2C_Mm LTR ERVL 7 475 0 1 1471 2211 251 28 13 chr2 116155925 116156461 -65591626 - RMER15 LTR ERVL -5 570 27 2 1471 271 337 121 46 chr2 116170998 116171172 -65576915 - MLT1A1 LTR MaLR -211 197 11 2 1471 3078 129 2 39 chr2 116174878 116175371 -65572716 + RLTR21 LTR ERVK 1 475 -1097 2 1471 4279 137 26 66 chr2 116180622 116181419 -65566668 + RLTR21 LTR ERVK 460 1234 -338 2 1471 4279 137 26 66 chr2 116181491 116181548 -65566539 + RLTR21 LTR ERVK 1235 1286 -286 2 1471 4279 136 66 187 chr2 116181594 116182132 -65565955 + RLTR21 LTR ERVK 1111 1571 -1 2 1471 372 330 25 17 chr2 116183649 116183769 -65564318 + MLT1G1 LTR MaLR 432 552 -27 2 1471 2009 109 48 60 chr2 116184723 116185056 -65563031 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 2 1471 775 298 61 80 chr2 116190318 116190745 -65557342 + MTD LTR MaLR 1 419 0 2 1471 3187 183 70 23 chr2 116191682 116192341 -65555746 - RLTR17 LTR ERVK -2 690 1 2 1471 231 226 81 68 chr2 116202343 116202447 -65545640 - MTE2a LTR MaLR -9 350 260 3 1471 915 254 39 160 chr2 116206482 116206695 -65541392 - ORR1D2 LTR MaLR -7 363 166 3 1471 915 254 39 160 chr2 116206868 116206894 -65541193 - ORR1D2 LTR MaLR -205 165 165 3 1471 915 254 39 160 chr2 116206994 116207166 -65540921 - ORR1D2 LTR MaLR -205 165 1 3 1471 319 159 13 80 chr2 116210000 116210075 -65538012 + RMER19C LTR ERVK 1 70 -541 3 1471 1535 251 46 22 chr2 116210059 116210430 -65537657 + RMER19C LTR ERVK 232 611 0 3 1471 2853 89 8 5 chr2 116210960 116211355 -65536732 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 1471 1939 209 50 31 chr2 116212266 116212710 -65535377 + RLTR17 LTR ERVK 1 452 -240 3 1471 493 228 11 0 chr2 116224866 116224958 -65523129 + MTE2a LTR MaLR 209 301 -78 3 1471 2501 128 52 5 chr2 116225589 116226014 -65522073 - BGLII_A LTR ERVK 0 445 1 3 1471 568 252 12 72 chr2 116241194 116241361 -65506726 - ORR1E LTR MaLR -194 165 9 3 1471 2202 167 39 17 chr2 116249179 116249587 -65498500 - MTC LTR MaLR 0 421 5 3 1471 814 176 15 0 chr2 116253205 116253341 -65494746 + RMER2 LTR ERV1 1 138 -429 3 1472 1526 209 124 3 chr2 116263557 116263913 -65484174 - MTD LTR MaLR 0 419 21 4 1472 907 209 47 0 chr2 116270734 116270925 -65477162 - MTD LTR MaLR -218 201 2 4 1472 277 339 75 102 chr2 116270939 116271205 -65476882 - MLT1C LTR MaLR -5 462 204 4 1472 2414 186 101 15 chr2 116272124 116272648 -65475439 + RMER4B LTR ERVK 17 585 0 4 1472 328 266 198 16 chr2 116274932 116275058 -65473029 + MTE2b LTR MaLR 20 168 -211 4 1472 538 202 98 26 chr2 116275259 116275405 -65472682 + MTE2b LTR MaLR 240 381 -38 4 1472 2305 220 44 76 chr2 116275731 116275796 -65472291 + RMER19C LTR ERVK 1 67 -544 4 1472 3489 23 2 0 chr2 116275796 116276191 -65471896 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 1472 2305 220 44 76 chr2 116276191 116276756 -65471331 + RMER19C LTR ERVK 68 611 0 4 1472 2637 170 137 19 chr2 116279500 116280040 -65468047 - RMER19C LTR ERVK 0 611 8 4 1472 618 277 145 47 chr2 116286575 116286919 -65461168 - MLT1B LTR MaLR 0 390 13 4 1472 1144 199 224 0 chr2 116289188 116289505 -65458582 + MTD LTR MaLR 27 414 -5 4 1472 575 308 60 120 chr2 116292267 116292617 -65455470 - MTE2b LTR MaLR 0 379 51 4 1472 636 205 48 14 chr2 116303871 116304031 -65444056 + ORR1D1 LTR MaLR 1 177 -182 4 1472 2870 95 69 47 chr2 116309920 116310385 -65437702 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 4 1472 3101 24 3 0 chr2 116314670 116315006 -65433081 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 337 0 4 1472 23140 30 18 10 chr2 116315006 116317728 -65430359 + IAPEz-int LTR ERVK 8 2751 -3730 4 1472 19302 11 2 0 chr2 116317720 116319819 -65428268 + IAPEz-int LTR ERVK 3244 5346 -1135 4 1472 10504 11 2 0 chr2 116326716 116327864 -65420223 + IAPEz-int LTR ERVK 5332 6481 0 4 1472 3101 24 3 0 chr2 116327864 116328200 -65419887 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 337 0 4 1472 1733 87 3 100 chr2 116349911 116350230 -65397857 - MT2_Mm LTR ERVL -205 288 1 4 1472 325 106 0 0 chr2 116350230 116350277 -65397810 - MERVL-int LTR ERVL 0 5485 5439 4 1472 290 143 15 60 chr2 116350277 116350344 -65397743 - ORR1A3-int LTR MaLR -1333 630 567 4 1472 2241 26 90 0 chr2 116357698 116357966 -65390121 + RLTR10B LTR ERVK 1 292 0 4 1472 233 191 0 0 chr2 116358223 116358265 -65389822 + RLTR27 LTR ERVK 231 272 -37 4 1472 2313 26 86 0 chr2 116358597 116358866 -65389221 + RLTR10B LTR ERVK 1 292 0 4 1472 1887 139 254 0 chr2 116363941 116364287 -65383800 + RLTR10C LTR ERVK 1 434 -2 4 1472 1295 121 1 25 chr2 116364296 116364581 -65383506 + RLTR10-int LTR ERVK 41 372 -7209 4 1472 1188 118 8 112 chr2 116364589 116364857 -65383230 + RLTR10-int LTR ERVK 713 952 -6629 4 1472 1739 171 182 43 chr2 116364946 116365392 -65382695 + MMERVK10C-int LTR ERVK 312 819 -4587 4 1472 405 173 123 0 chr2 116365397 116365478 -65382609 + MMERVK10C-int LTR ERVK 938 1028 -5109 4 1472 398 111 0 0 chr2 116365469 116365532 -65382555 + MMERVK10C-int LTR ERVK 1885 1947 -5634 4 1472 475 96 0 14 chr2 116365538 116365612 -65382475 + MMERVK10C-int LTR ERVK 2552 2624 -4957 4 1472 36789 72 11 18 chr2 116365610 116370392 -65377695 + MMERVK10C-int LTR ERVK 2832 7581 0 4 1472 2781 143 14 5 chr2 116370392 116370822 -65377265 + RLTR10C LTR ERVK 1 434 -2 4 1473 1812 183 70 0 chr2 116400735 116401080 -65347007 + ORR1C1 LTR MaLR 10 378 0 5 1473 256 244 12 206 chr2 116424383 116424543 -65323544 - RMER15 LTR ERVL -444 131 3 5 1473 225 288 107 25 chr2 116437790 116437911 -65310176 - RLTR11A LTR ERVK -336 192 62 5 1473 547 306 75 23 chr2 116439656 116439870 -65308217 - MER90a LTR ERV1 -6 608 384 5 1473 254 274 103 26 chr2 116440008 116440124 -65307963 - MER90a LTR ERV1 -441 134 10 5 1473 3005 70 2 10 chr2 116446987 116447390 -65300697 - MTB LTR MaLR 0 400 1 5 1473 253 278 82 10 chr2 116453717 116453815 -65294272 - MLT1A1 LTR MaLR -8 400 296 5 1473 1931 163 137 116 chr2 116455367 116455708 -65292379 + RMER4B LTR ERVK 1 393 -192 5 1473 1931 163 137 116 chr2 116455900 116456119 -65291968 + RMER4B LTR ERVK 394 573 -12 5 1473 234 231 34 114 chr2 116461755 116461843 -65286244 - RLTR1D LTR ERV1 -491 114 34 5 1473 1233 235 66 14 chr2 116463058 116463347 -65284740 - MTD LTR MaLR 0 419 116 5 1473 1785 176 76 3 chr2 116463448 116463778 -65284309 - ORR1C2 LTR MaLR -4 380 27 5 1473 429 169 202 0 chr2 116464923 116465012 -65283075 - MTD LTR MaLR -311 108 2 5 1473 419 166 3 8 chr2 116466454 116466528 -65281559 - RMER13B LTR ERVK -566 76 8 5 1473 615 286 7 7 chr2 116469541 116469682 -65278405 + MTEa LTR MaLR 2 142 -237 5 1473 363 217 12 0 chr2 116469682 116469765 -65278322 + MTEa LTR MaLR 292 375 -4 5 1473 416 261 37 61 chr2 116469682 116469704 -65278383 + MT2A LTR ERVL 2 160 -373 5 1473 524 248 145 37 chr2 116478318 116478568 -65269519 + RLTR10A LTR ERVK 114 411 0 6 1473 1540 41 5 10 chr2 116484543 116484741 -65263346 - MTB LTR MaLR 0 400 204 6 1473 1534 68 45 14 chr2 116484728 116484950 -65263137 - ORR1A3-int LTR MaLR -663 1300 1072 6 1473 288 311 175 0 chr2 116494243 116494346 -65253741 + MTEa LTR MaLR 1 121 -258 6 1473 276 287 10 31 chr2 116494460 116494557 -65253530 + MT2A LTR ERVL 229 323 -210 6 1473 486 348 103 35 chr2 116494561 116494901 -65253186 + LTR16C LTR ERVL 69 431 -58 6 1473 260 361 95 63 chr2 116503279 116503501 -65244586 - MLT1C LTR MaLR -186 281 53 6 1474 2827 103 30 55 chr2 116528518 116529012 -65219075 + RLTR45 LTR ERVK 1 482 0 3 1474 273 373 75 49 chr2 116529681 116529946 -65218141 - ORR1E LTR MaLR -12 347 76 4 1474 763 239 51 70 chr2 116530075 116530332 -65217755 - MTE-int LTR MaLR -45 1535 1284 4 1474 1039 252 29 136 chr2 116538081 116538499 -65209588 + MTE2a LTR MaLR 7 379 0 5 1474 3092 155 59 20 chr2 116557445 116557986 -65190101 + RMER15 LTR ERVL 12 573 -2 8 1474 2356 182 2 5 chr2 116559253 116559672 -65188415 + MTC LTR MaLR 4 421 0 8 1474 489 111 2 0 chr2 116566399 116566482 -65181605 - ORR1A2 LTR MaLR 0 384 258 9 1474 1542 81 62 102 chr2 116566650 116566925 -65181162 - ORR1A2 LTR MaLR -63 264 1 9 1474 337 248 39 110 chr2 116567294 116567324 -65180763 + MT2B2 LTR ERVL 136 156 -428 9 1474 295 389 30 132 chr2 116569110 116569513 -65178574 - MER21B LTR ERV1 -485 378 17 9 1474 282 301 206 22 chr2 116569951 116570087 -65178000 + RMER15 LTR ERVL 347 507 -68 1 1474 269 239 75 0 chr2 116575670 116575737 -65172350 + ORR1E LTR MaLR 256 327 -32 1 1474 2306 314 80 130 chr2 116575760 116577421 -65170666 + ORR1E-int LTR MaLR 1 1578 -2 1 1474 585 327 10 24 chr2 116583087 116583319 -65164768 + MTD LTR MaLR 54 267 -133 1 1474 613 188 36 18 chr2 116583531 116583667 -65164420 + MTD LTR MaLR 207 399 -20 1 1474 973 284 84 22 chr2 116600629 116600949 -65147138 + MLT1A0 LTR MaLR 23 362 -3 1 1474 2027 112 14 75 chr2 116604567 116604913 -65143174 + ORR1A2 LTR MaLR 3 327 0 1 1474 440 245 9 9 chr2 116609153 116609264 -65138823 - LTR33C LTR ERVL -48 581 471 1 1474 229 307 33 22 chr2 116611292 116611382 -65136705 + MLT2E LTR ERVL 490 580 -48 1 1474 1302 239 80 11 chr2 116619686 116620049 -65128038 + MLT2C1 LTR ERVL 1 388 -9 1 1474 251 282 124 77 chr2 116621739 116621897 -65126190 + LTR81B LTR ERV1? 33 198 -1195 1 1474 1909 188 21 40 chr2 116625028 116625404 -65122683 + ORR1D1 LTR MaLR 1 369 -5 1 1474 824 195 137 6 chr2 116630517 116630692 -65117395 - MTEb LTR MaLR 0 379 182 1 1474 698 265 11 17 chr2 116630749 116630922 -65117165 + MTC LTR MaLR 43 216 -205 1 1474 416 259 375 34 chr2 116631546 116631839 -65116248 - MTD LTR MaLR -20 399 5 1 1475 3656 30 2 0 chr2 116654081 116654476 -65093611 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 1475 899 275 171 39 chr2 116656077 116656433 -65091654 - MTC LTR MaLR -14 407 5 2 1475 1096 210 115 7 chr2 116659386 116659677 -65088410 + ORR1D1 LTR MaLR 10 374 0 2 1475 1111 216 122 0 chr2 116665147 116665425 -65082662 - MTD LTR MaLR -2 417 106 2 1475 446 223 62 9 chr2 116665720 116665833 -65082254 - MTD LTR MaLR -300 119 1 2 1475 639 288 120 60 chr2 116666449 116666782 -65081305 - ORR1E LTR MaLR -5 354 2 2 1475 2040 305 114 48 chr2 116666782 116668154 -65079933 - ORR1E-int LTR MaLR -52 1528 15 2 1475 1326 209 52 0 chr2 116671294 116671581 -65076506 + MTD LTR MaLR 104 405 -14 2 1475 575 299 132 32 chr2 116672596 116672907 -65075180 - MLT1C LTR MaLR -8 459 118 2 1475 622 298 12 55 chr2 116678917 116679173 -65068914 - MLT1A1 LTR MaLR -14 394 150 2 1475 1162 218 184 17 chr2 116685771 116686130 -65061957 + MTD LTR MaLR 1 419 0 2 1475 225 250 54 99 chr2 116686765 116686876 -65061211 + MLT1A1 LTR MaLR 302 407 -1 2 1475 3093 41 7 55 chr2 116690264 116690680 -65057407 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 1475 282 339 39 0 chr2 116690681 116690808 -65057279 - MLT1A LTR MaLR -222 152 21 2 1475 2333 96 48 0 chr2 116691595 116691907 -65056180 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 2 1475 438 205 88 24 chr2 116692220 116692345 -65055742 - RLTR12B LTR ERVK -395 133 1 2 1475 1354 246 57 62 chr2 116692777 116693198 -65054889 + MTD LTR MaLR 1 419 0 2 1475 1519 155 83 35 chr2 116698522 116698836 -65049251 + ORR1C1 LTR MaLR 1 329 -49 2 1475 292 235 58 23 chr2 116700780 116700867 -65047220 + MLT1B LTR MaLR 3 92 -298 2 1475 3536 28 0 0 chr2 116701152 116701548 -65046539 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 1475 248 347 46 17 chr2 116718724 116718897 -65029190 - MLT1K LTR MaLR -266 329 152 3 1475 227 279 49 0 chr2 116719770 116719831 -65028256 - MamGypLTR3 LTR Gypsy -231 608 545 3 1475 746 259 184 26 chr2 116727370 116727675 -65020412 - ORR1E LTR MaLR -2 357 5 3 1475 295 312 34 54 chr2 116731316 116731465 -65016622 + MLT1D LTR MaLR 47 192 -313 3 1475 277 323 68 0 chr2 116731666 116731799 -65016288 + MLT1D LTR MaLR 355 496 -9 3 1475 363 324 50 27 chr2 116732000 116732222 -65015865 - RMER15 LTR ERVL -73 502 276 3 1475 564 82 0 23 chr2 116732953 116733040 -65015047 - MTC LTR MaLR 0 421 337 3 1475 1474 187 125 74 chr2 116733042 116733434 -65014653 + MTD LTR MaLR 1 412 -7 3 1475 310 262 11 45 chr2 116741531 116741619 -65006468 + ORR1E LTR MaLR 3 87 -272 3 1475 556 343 16 20 chr2 116742038 116742282 -65005805 + MTE-int LTR MaLR 248 490 -1090 3 1475 493 279 150 78 chr2 116742522 116742868 -65005219 + MTE-int LTR MaLR 1157 1527 -53 3 1475 1015 304 71 68 chr2 116742886 116743253 -65004834 - MTE2b LTR MaLR -11 368 1 3 1475 952 274 100 6 chr2 116743889 116744230 -65003857 - MLT1A1 LTR MaLR -34 374 2 3 1475 313 343 136 7 chr2 116745191 116745470 -65002617 - LTR16E1 LTR ERVL 0 538 224 3 1475 995 277 9 51 chr2 116747487 116747818 -65000269 + MTEa LTR MaLR 63 379 0 3 1475 525 270 127 57 chr2 116749448 116749731 -64998356 - MLT1E1 LTR MaLR 0 654 352 3 1475 333 308 108 44 chr2 116750690 116751067 -64997020 + RLTR12B LTR ERVK 15 339 -189 3 1475 1226 200 68 81 chr2 116752692 116752955 -64995132 + ORR1B2 LTR MaLR 46 327 -40 3 1475 1226 200 68 81 chr2 116753481 116753536 -64994551 + ORR1B2 LTR MaLR 328 362 -5 3 1475 2901 60 47 3 chr2 116757094 116757477 -64990610 - MTB LTR MaLR 0 400 1 3 1475 1150 231 87 45 chr2 116759894 116759951 -64988136 - MTD LTR MaLR -11 408 358 3 1475 1150 231 87 45 chr2 116760092 116760415 -64987672 - MTD LTR MaLR -62 357 12 3 1475 701 268 99 97 chr2 116760659 116761031 -64987056 + MTEb LTR MaLR 1 373 -6 4 1475 893 289 65 29 chr2 116766718 116767134 -64980953 + MER110A LTR ERV1 28 458 -10 4 1475 3258 18 31 8 chr2 116770938 116771325 -64976762 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 1475 697 342 75 18 chr2 116773979 116774363 -64973724 - MLT1J-int LTR MaLR -361 1026 621 4 1475 1713 199 51 8 chr2 116776368 116776758 -64971329 + MTD LTR MaLR 4 410 -9 4 1475 318 207 33 33 chr2 116777418 116777508 -64970579 + RMER15 LTR ERVL 42 131 -444 4 1475 504 289 175 21 chr2 116777571 116777811 -64970276 + RMER15 LTR ERVL 299 575 0 4 1475 814 208 103 76 chr2 116778287 116778578 -64969509 + RMER21B LTR ERV1 269 567 -275 4 1475 241 273 65 92 chr2 116778585 116778738 -64969349 + RMER21B LTR ERV1 753 901 -46 4 1475 3082 61 18 0 chr2 116780375 116780768 -64967319 - MTB LTR MaLR 0 400 1 4 1476 490 279 23 17 chr2 116787489 116787664 -64960423 + MLT1B LTR MaLR 1 176 -214 4 1476 622 339 32 62 chr2 116787683 116788023 -64960064 + ORR1E LTR MaLR 20 349 -10 4 1476 1308 252 57 3 chr2 116789366 116789716 -64958371 + MTEb LTR MaLR 4 372 -7 4 1476 249 258 12 107 chr2 116792165 116792281 -64955806 + LTR85b LTR Gypsy? 548 710 -74 4 1476 2269 169 22 5 chr2 116808438 116808843 -64939244 + MTC LTR MaLR 2 413 -8 5 1476 313 230 67 33 chr2 116812921 116813011 -64935076 - MLT1H2 LTR MaLR -14 535 443 5 1476 322 255 32 11 chr2 116813222 116813317 -64934770 - MLT1H2 LTR MaLR -300 189 93 5 1476 1496 76 34 3 chr2 116822937 116823282 -64924805 - BGLII LTR ERVK 0 422 16 5 1476 1603 197 106 3 chr2 116825232 116825609 -64922478 - MTD LTR MaLR -3 416 1 5 1476 730 235 22 6 chr2 116826174 116826374 -64921713 - MTEa LTR MaLR -147 232 32 5 1476 367 294 103 64 chr2 116826663 116826977 -64921110 + ORR1E LTR MaLR 3 344 -35 5 1476 666 327 108 36 chr2 116830007 116830588 -64917499 + MLT1E3 LTR MaLR 2 624 0 5 1476 1000 285 66 49 chr2 116846749 116847099 -64900988 - RMER15 LTR ERVL 0 575 220 5 1476 1198 246 71 59 chr2 116848877 116849222 -64898865 - ORR1E LTR MaLR -17 342 7 5 1476 2232 166 31 151 chr2 116850452 116851056 -64897031 - RMER19C LTR ERVK 0 611 80 5 1476 982 220 224 10 chr2 116853800 116854108 -64893979 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 6 1476 1000 285 66 49 chr2 116856376 116856726 -64891361 - RMER15 LTR ERVL 0 575 220 6 1476 2654 142 47 2 chr2 116860505 116860700 -64887387 + MTC LTR MaLR 1 195 -226 6 1476 2654 142 47 2 chr2 116860779 116860986 -64887101 + MTC LTR MaLR 196 419 -2 6 1476 3553 20 10 5 chr2 116863369 116863763 -64884324 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 1476 1184 256 104 17 chr2 116869754 116870100 -64877987 - MTD LTR MaLR -43 376 1 6 1476 386 331 73 42 chr2 116871398 116871657 -64876430 - LTR78 LTR ERV1 -2 1302 1036 6 1476 651 326 60 34 chr2 116871744 116872093 -64875994 - MER57C2 LTR ERV1 -65 369 12 6 1476 327 274 99 23 chr2 116872503 116872634 -64875453 - LTR78 LTR ERV1 -983 321 181 6 1476 1823 152 48 31 chr2 116875655 116876008 -64872079 + RMER15 LTR ERVL 4 362 -213 6 1476 3374 69 0 16 chr2 116876170 116876598 -64871489 + BGLII LTR ERVK 1 421 0 6 1476 573 89 45 0 chr2 116877004 116877092 -64870995 + RMER3D-int LTR ERVK 489 572 -2270 6 1476 753 208 14 50 chr2 116877106 116877324 -64870763 + RMER3D-int LTR ERVK 652 861 -1981 6 1476 358 179 90 50 chr2 116877326 116877426 -64870661 + RMER3D-int LTR ERVK 633 736 -2106 6 1476 2557 164 114 66 chr2 116877646 116878413 -64869674 + RMER3D-int LTR ERVK 359 1690 -1152 6 1476 3019 195 28 38 chr2 116878417 116879120 -64868967 + RMER3D-int LTR ERVK 1925 2620 -222 6 1476 242 315 11 22 chr2 116880241 116880332 -64867755 + MamGypLTR1d LTR Gypsy 656 745 -68 6 1476 2113 122 25 9 chr2 116894443 116894765 -64853322 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 6 1476 464 305 166 24 chr2 116897312 116897641 -64850446 - MLT1G3 LTR MaLR -27 568 165 6 1476 569 284 77 70 chr2 116898349 116898730 -64849357 - MLT2B4 LTR ERVL -70 450 49 6 1476 471 272 6 81 chr2 116898761 116898921 -64849166 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 261 6 1476 296 278 77 31 chr2 116898932 116899062 -64849025 - MLT1A1 LTR MaLR -262 146 11 6 1476 354 345 59 59 chr2 116899221 116899526 -64848561 + LTR16B1 LTR ERVL 122 426 -54 6 1476 498 296 120 0 chr2 116909239 116909455 -64838632 - MLT2D LTR ERVL -154 260 19 7 1476 608 316 46 5 chr2 116911052 116911268 -64836819 - LTR33 LTR ERVL -276 239 15 7 1476 1438 254 32 3 chr2 116915325 116915673 -64832414 - MTEb LTR MaLR -4 375 18 7 1476 300 191 0 0 chr2 116915690 116915753 -64832334 - MTEb-int LTR MaLR 0 1580 1518 7 1477 357 298 141 46 chr2 116918121 116918490 -64829597 - LTR73 LTR ERV1 -124 448 45 7 1477 729 249 221 18 chr2 116920332 116920671 -64827416 + MLT1A1 LTR MaLR 1 408 0 7 1477 1171 201 191 0 chr2 116925595 116925904 -64822183 + ORR1D1 LTR MaLR 1 368 -6 7 1477 230 233 99 55 chr2 116931911 116932002 -64816085 + MT2B LTR ERVL 153 247 -354 7 1477 1417 249 53 8 chr2 116932570 116932930 -64815157 - MTE2b LTR MaLR -3 376 1 7 1477 892 264 104 40 chr2 116937033 116937072 -64811015 - MTE2b LTR MaLR -31 348 312 7 1477 1014 246 119 1 chr2 116937695 116937982 -64810105 - MTE2b LTR MaLR -68 311 1 7 1477 1115 279 88 9 chr2 116940775 116941118 -64806969 - MTE2b LTR MaLR -4 375 6 7 1477 280 178 147 27 chr2 116941253 116941328 -64806759 - MTD LTR MaLR -14 405 322 7 1477 2185 118 19 3 chr2 116942167 116942489 -64805598 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 7 1477 1947 184 84 16 chr2 116963442 116963823 -64784264 - MTD LTR MaLR -7 412 6 7 1477 418 296 181 21 chr2 116973628 116973821 -64774266 + MLT1E2 LTR MaLR 18 241 -386 8 1477 377 246 171 8 chr2 116973879 116974002 -64774085 + MLT1E2 LTR MaLR 335 477 -28 8 1477 735 205 88 19 chr2 116974965 116975279 -64772808 + MTD LTR MaLR 48 419 0 8 1477 1809 148 92 92 chr2 116975973 116976418 -64771669 - BGLII_A LTR ERVK 0 445 1 8 1477 369 270 22 15 chr2 116976621 116976740 -64771347 - MLT1D LTR MaLR -2 503 409 8 1477 276 270 44 22 chr2 116977922 116978013 -64770074 - MTEb LTR MaLR 0 379 287 8 1477 393 348 132 55 chr2 116982918 116983207 -64764880 - MLT1A LTR MaLR -9 365 55 8 1477 824 244 39 6 chr2 116986848 116987029 -64761058 - MTE2a LTR MaLR -187 192 6 8 1477 1108 256 68 13 chr2 116987306 116987615 -64760472 + MTEb LTR MaLR 25 350 -29 8 1477 3330 33 5 2 chr2 116991016 116991411 -64756676 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 8 1477 277 283 68 34 chr2 116991621 116991738 -64756349 - MLT2C2 LTR ERVL -343 121 1 8 1477 616 302 35 35 chr2 117001349 117001705 -64746382 - MLT-int LTR MaLR -61 1674 985 4 1477 251 290 111 30 chr2 117002769 117002904 -64745183 - MLT2D LTR ERVL -110 304 159 7 1477 874 314 70 32 chr2 117009896 117010399 -64737688 - RMER5 LTR ERV1 -2 532 11 1 1477 653 239 178 62 chr2 117011786 117012062 -64736025 + MTEb LTR MaLR 3 310 -69 1 1477 1118 226 61 81 chr2 117013120 117013564 -64734523 + RMER10A LTR ERVL 1 435 -7 1 1477 1478 93 14 0 chr2 117017881 117018097 -64729990 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 128 2 1477 490 278 103 60 chr2 117024594 117024778 -64723309 + MTE2a LTR MaLR 27 218 -161 3 1477 863 245 94 104 chr2 117025748 117026131 -64721956 - MTE2b LTR MaLR 0 379 1 3 1477 1038 246 128 12 chr2 117027467 117027788 -64720299 + MTE2a LTR MaLR 18 375 -4 4 1477 1130 221 107 170 chr2 117027777 117027836 -64720251 - MT2A LTR ERVL -20 513 468 4 1477 1130 219 96 153 chr2 117027875 117028355 -64719732 - MT2A LTR ERVL -66 467 8 4 1477 2413 60 119 11 chr2 117032612 117032964 -64715123 - RLTR10 LTR ERVK 0 390 1 5 1477 1408 193 163 35 chr2 117033470 117033899 -64714188 + RMER19C LTR ERVK 183 585 -26 5 1477 1408 218 95 47 chr2 117034074 117034100 -64713987 + RMER19C LTR ERVK 586 611 0 5 1477 248 274 87 19 chr2 117035621 117035725 -64712362 + MER34A1 LTR ERV1 477 587 0 5 1477 2948 154 13 186 chr2 117038044 117038873 -64709214 + RMER19B LTR ERVK 1 686 -216 6 1477 624 213 57 19 chr2 117038837 117038995 -64709092 - ORR1D2 LTR MaLR -206 164 1 7 1477 339 323 68 68 chr2 117039365 117039469 -64708618 - MLT1J LTR MaLR -290 222 110 7 1477 339 323 68 68 chr2 117040016 117040117 -64707970 - MLT1J LTR MaLR -403 109 18 7 1477 425 187 70 94 chr2 117045332 117045503 -64702584 - RLTR15 LTR ERVK -192 167 1 8 1478 2180 119 43 3 chr2 117051390 117051719 -64696368 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 5 1 1478 259 259 88 18 chr2 117052943 117053057 -64695030 - MLT1A1 LTR MaLR -19 389 268 1 1478 1812 206 52 15 chr2 117053110 117053510 -64694577 - MTD LTR MaLR 0 419 5 1 1478 2730 173 35 12 chr2 117053647 117054162 -64693925 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 527 0 1 1478 2128 110 47 29 chr2 117062309 117062694 -64685393 - RLTR11B LTR ERVK -61 392 1 1 1478 3032 44 20 37 chr2 117065111 117065514 -64682573 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 1478 1102 138 15 44 chr2 117069040 117069095 -64678992 + MTC LTR MaLR 219 271 -150 1 1478 2260 142 88 39 chr2 117069095 117069527 -64678560 - RLTR11B LTR ERVK 0 453 1 1 1478 1102 138 15 44 chr2 117069527 117069675 -64678412 + MTC LTR MaLR 272 416 -5 1 1478 5974 167 62 18 chr2 117069675 117070375 -64677712 + MTC-int LTR MaLR 2 711 -547 1 1478 5974 167 62 18 chr2 117070396 117070898 -64677189 + MTC-int LTR MaLR 712 1258 0 1 1478 2118 170 35 10 chr2 117070898 117071301 -64676786 + MTC LTR MaLR 1 413 -8 1 1478 2589 86 7 54 chr2 117071407 117071444 -64676643 + BGLII_Mus LTR ERVK 1 37 -385 1 1478 3763 50 16 62 chr2 117071444 117071961 -64676126 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 1 1478 2589 86 7 54 chr2 117071961 117072366 -64675721 + BGLII_Mus LTR ERVK 38 422 0 1 1478 3272 98 192 0 chr2 117072489 117072979 -64675108 - MT2B2 LTR ERVL 0 584 1 1 1478 259 370 46 0 chr2 117073162 117073270 -64674817 - MLT1G3 LTR MaLR -248 347 235 1 1478 3332 59 4 41 chr2 117073824 117074006 -64674081 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 182 -293 1 1478 3332 59 4 41 chr2 117074169 117074479 -64673608 + MT2C_Mm LTR ERVL 183 475 0 1 1478 234 298 10 41 chr2 117074706 117074804 -64673283 - MT2B LTR ERVL -338 263 169 1 1478 235 163 0 0 chr2 117090725 117090768 -64657319 + MLT1A1 LTR MaLR 354 396 -12 1 1478 583 212 22 14 chr2 117095694 117095833 -64652254 - RMER15 LTR ERVL -430 145 6 1 1478 2240 128 60 22 chr2 117097731 117098177 -64649910 + RLTR28 LTR ERVL 5 467 -57 1 1478 989 191 113 113 chr2 117098672 117098973 -64649114 - MT2A LTR ERVL -232 301 1 1 1478 776 269 82 45 chr2 117098985 117099316 -64648771 - MTEa LTR MaLR -25 354 12 1 1478 1649 150 57 24 chr2 117099734 117100126 -64647961 + RMER6C LTR ERVK 2 419 -301 1 1478 279 216 29 81 chr2 117100023 117100159 -64647928 - RMER17A2 LTR ERVK -522 384 256 1 1478 1562 168 148 0 chr2 117103839 117104142 -64643945 + RMER6C LTR ERVK 369 716 -4 1 1478 2892 63 39 8 chr2 117123059 117123443 -64624644 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 1478 2018 175 58 65 chr2 117130432 117130987 -64617100 + RLTR31B_Mm LTR ERVK 7 557 0 2 1478 2448 95 3 0 chr2 117132710 117133035 -64615052 + ORR1A2 LTR MaLR 1 326 -1 2 1478 310 338 85 58 chr2 117135205 117135428 -64612659 - MLT1H LTR MaLR -183 366 138 2 1478 2118 165 104 8 chr2 117149311 117149695 -64598392 + MTC LTR MaLR 1 421 0 2 1478 289 308 29 9 chr2 117152466 117152571 -64595516 + LTR16C LTR ERVL 383 489 0 2 1479 365 320 98 15 chr2 117184580 117184783 -64563304 - MLT1D LTR MaLR 0 505 286 2 1479 796 271 190 43 chr2 117187000 117187284 -64560803 - MTE2b LTR MaLR -4 375 35 2 1479 796 271 190 43 chr2 117187486 117187528 -64560559 - MTE2b LTR MaLR -345 34 1 2 1479 379 240 37 46 chr2 117191182 117191291 -64556796 + LTR48 LTR ERV1 678 785 -2 2 1479 2538 138 99 30 chr2 117194671 117195164 -64552923 - RLTR24 LTR ERV1 0 529 3 3 1479 2304 101 3 58 chr2 117195406 117195752 -64552335 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 3 1479 517 279 27 69 chr2 117199365 117199636 -64548451 - MTEb LTR MaLR 0 379 105 3 1479 3649 159 108 11 chr2 117200573 117201242 -64546845 - RMER19A LTR ERVK 0 737 4 3 1479 235 197 27 96 chr2 117212479 117212552 -64535535 + MLT1H-int LTR MaLR 1003 1070 -339 3 1479 669 243 50 100 chr2 117216846 117217207 -64530880 + RLTR15 LTR ERVK 1 343 -16 3 1479 1253 256 62 40 chr2 117217268 117217676 -64530411 + MTE2b LTR MaLR 6 418 -1 3 1479 884 274 127 25 chr2 117222890 117223205 -64524882 + MTEa LTR MaLR 7 353 -26 3 1479 888 298 119 35 chr2 117223279 117223731 -64524356 + MLT1F LTR MaLR 15 504 -44 3 1479 3835 122 32 35 chr2 117227184 117227785 -64520302 + MT2B LTR ERVL 1 599 -2 3 1479 1616 198 65 17 chr2 117227795 117228149 -64519938 - ORR1D1 LTR MaLR -3 371 1 3 1479 686 323 54 16 chr2 117230467 117230782 -64517305 - ERVL-E-int LTR ERVL -4913 754 428 3 1479 257 221 20 101 chr2 117230945 117231076 -64517011 - LTR33C LTR ERVL -2 661 533 3 1479 248 267 104 9 chr2 117246179 117246285 -64501802 - MLT1I LTR MaLR -7 404 289 3 1479 447 258 134 38 chr2 117246807 117247123 -64500964 + MLT1A LTR MaLR 7 375 -15 3 1479 1715 202 23 0 chr2 117251717 117252068 -64496019 + ORR1D1 LTR MaLR 7 365 -9 4 1479 255 354 32 22 chr2 117256371 117256556 -64491531 - MLT1K LTR MaLR -68 527 341 4 1479 225 333 10 61 chr2 117256842 117256941 -64491146 - MLT1K LTR MaLR -343 267 174 4 1479 1015 192 168 11 chr2 117259541 117259809 -64488278 + MTD LTR MaLR 110 419 0 4 1479 473 293 86 9 chr2 117267844 117268054 -64480033 + MTE-int LTR MaLR 8 233 -1347 4 1479 538 301 85 10 chr2 117273484 117273685 -64474402 + MLT1E2 LTR MaLR 1 216 -411 4 1479 1246 124 86 9 chr2 117279305 117279525 -64468562 + ORR1A4 LTR MaLR 93 329 0 4 1479 988 229 103 41 chr2 117289505 117289824 -64458263 - ORR1D2 LTR MaLR -12 358 20 4 1479 759 266 136 24 chr2 117300602 117300744 -64447343 - MTE2b LTR MaLR -11 368 202 5 1479 759 266 136 24 chr2 117300802 117300990 -64447097 - MTE2b LTR MaLR -178 201 2 5 1479 491 259 32 81 chr2 117301237 117301422 -64446665 + MLT1E1A LTR MaLR 144 319 -361 5 1479 421 276 135 25 chr2 117302312 117302557 -64445530 + RMER20B LTR ERVK 124 395 -232 5 1479 3899 49 19 0 chr2 117307343 117307809 -64440278 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 475 0 5 1479 419 315 14 79 chr2 117308324 117308538 -64439549 - MLT2B1 LTR ERVL -318 202 3 5 1480 1631 197 108 5 chr2 117309623 117310056 -64438031 + RLTR11A2 LTR ERVK 18 495 -32 5 1480 1657 113 44 112 chr2 117319400 117319740 -64428347 - ORR1A4 LTR MaLR -12 317 1 5 1480 1229 216 31 11 chr2 117325658 117325944 -64422143 + RLTR46 LTR ERVK 1 292 -28 5 1480 6820 94 26 25 chr2 117331292 117332414 -64415673 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1 1123 -725 5 1480 2588 31 12 0 chr2 117332414 117332741 -64415346 - IAPEY_LTR LTR ERVK 0 385 55 5 1480 18072 60 2 4 chr2 117332741 117334989 -64413098 - IAPEy-int LTR ERVK 0 7513 5271 5 1480 308 11 4 0 chr2 117334989 117335030 -64413057 - IAPEY_LTR LTR ERVK -124 261 227 5 1480 339 243 74 131 chr2 117342433 117342533 -64405554 - MTEa LTR MaLR -11 368 270 5 1480 3648 141 165 20 chr2 117342533 117343193 -64404894 + RMER6A LTR ERVK 1 756 0 5 1480 339 280 65 107 chr2 117343193 117343350 -64404737 - MTEa LTR MaLR -110 269 108 5 1480 481 348 142 11 chr2 117343480 117343931 -64404156 + LTR33 LTR ERVL 3 512 -3 5 1480 1383 196 23 232 chr2 117344912 117345442 -64402645 - MTD LTR MaLR 0 419 1 5 1480 603 384 129 0 chr2 117345828 117346130 -64401957 + LTR33 LTR ERVL 2 342 -173 5 1480 1331 188 75 11 chr2 117346531 117346811 -64401276 + RMER21B LTR ERV1 270 567 -275 5 1480 2465 145 32 12 chr2 117352525 117352623 -64395464 - RMER13A LTR ERVK -448 412 314 5 1480 3425 58 2 2 chr2 117352623 117353019 -64395068 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 1480 2465 145 32 12 chr2 117353019 117353324 -64394763 - RMER13A LTR ERVK -547 313 1 5 1480 1115 291 117 11 chr2 117359417 117359785 -64388302 - MTD LTR MaLR 0 419 13 6 1480 441 279 111 35 chr2 117369599 117369770 -64378317 - MLT1D LTR MaLR -58 447 264 6 1480 246 321 51 134 chr2 117369789 117370005 -64378082 - MLT1D LTR MaLR -304 201 4 6 1480 2068 152 134 18 chr2 117370315 117370710 -64377377 - BGLII_B LTR ERVK 0 441 1 6 1480 251 273 159 0 chr2 117375694 117375782 -64372305 - ORR1E LTR MaLR 0 379 278 6 1480 268 339 41 41 chr2 117375893 117376016 -64372071 - ORR1E LTR MaLR -168 191 69 6 1480 1014 304 50 15 chr2 117384636 117384977 -64363110 - ORR1E LTR MaLR -3 356 4 6 1480 1421 250 97 9 chr2 117385630 117385969 -64362118 + ORR1D2 LTR MaLR 2 370 0 6 1480 2246 165 14 14 chr2 117392256 117392625 -64355462 - ORR1C1 LTR MaLR -1 377 9 6 1480 1929 107 45 64 chr2 117393279 117393554 -64354533 + ORR1A3 LTR MaLR 3 265 -61 6 1480 1929 107 45 64 chr2 117394128 117394182 -64353905 + ORR1A3 LTR MaLR 266 325 -1 6 1480 2417 180 2 24 chr2 117397673 117398095 -64349992 + MTC LTR MaLR 1 413 -8 6 1480 3904 181 135 43 chr2 117399996 117400129 -64347958 - RLTR25A LTR ERVK -46 1057 808 6 1480 3904 173 76 54 chr2 117400165 117400956 -64347131 - RLTR25A LTR ERVK -296 807 20 6 1480 275 327 106 12 chr2 117403305 117403466 -64344621 + LTR84b LTR ERVL 316 491 -270 6 1480 1029 247 61 79 chr2 117403722 117404184 -64343903 - RLTR11B LTR ERVK -46 482 1 6 1480 422 280 140 17 chr2 117404477 117404655 -64343432 - LTR50 LTR ERVL -525 270 71 6 1480 228 267 73 57 chr2 117404667 117404790 -64343297 + LTR84b LTR ERVL 605 729 -28 6 1480 1478 217 155 3 chr2 117408632 117408993 -64339094 - MTD LTR MaLR -3 416 1 6 1480 696 125 34 27 chr2 117411298 117411446 -64336641 - RMER17B LTR ERVK -498 460 312 6 1480 293 240 28 83 chr2 117412495 117412604 -64335483 + MT2B LTR ERVL 152 254 -347 6 1480 747 204 294 28 chr2 117419177 117419459 -64328628 - RMER20B LTR ERVK -37 590 234 6 1480 3121 130 27 35 chr2 117428421 117428900 -64319187 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 475 0 6 1480 700 294 94 102 chr2 117429041 117429404 -64318683 - MLT1A1 LTR MaLR -5 403 1 7 1480 1795 214 10 44 chr2 117438014 117438401 -64309686 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 7 1481 353 348 50 17 chr2 117446932 117447052 -64301035 - MLT1D LTR MaLR -381 124 1 7 1481 304 268 67 67 chr2 117447550 117447714 -64300373 - RMER15 LTR ERVL -7 568 405 7 1481 2206 99 9 55 chr2 117450577 117450862 -64297225 + ORR1A2 LTR MaLR 1 286 -41 7 1481 2206 99 9 55 chr2 117451047 117451103 -64296984 + ORR1A2 LTR MaLR 287 326 -1 7 1481 999 251 64 41 chr2 117458926 117459192 -64288895 - RLTR20C LTR ERVK 0 534 263 7 1481 946 147 0 7 chr2 117459179 117459323 -64288764 - RLTR20C LTR ERVK -398 143 1 7 1481 2028 190 22 12 chr2 117465779 117466194 -64281893 + MTD LTR MaLR 1 419 0 7 1481 2229 224 20 18 chr2 117467343 117467835 -64280252 - RLTR16 LTR ERVK -12 493 1 7 1481 966 246 41 32 chr2 117469630 117469970 -64278117 + RLTR15 LTR ERVK 1 343 -16 7 1481 234 304 33 52 chr2 117474080 117474233 -64273854 - RLTR16 LTR ERVK -12 493 344 7 1481 654 296 36 27 chr2 117474260 117474479 -64273608 - RLTR16 LTR ERVK -261 244 24 7 1481 454 309 226 4 chr2 117476537 117476790 -64271297 + MLT1A0 LTR MaLR 55 364 -1 7 1481 272 308 0 13 chr2 117481761 117481840 -64266247 + MER68 LTR ERVL 327 404 -159 7 1481 256 341 78 43 chr2 117484501 117484642 -64263445 - MLT1N2 LTR MaLR -9 553 408 7 1481 252 273 15 0 chr2 117488244 117488310 -64259777 - RMER15 LTR ERVL -106 469 403 7 1481 1484 229 65 38 chr2 117493295 117493667 -64254420 - MTD LTR MaLR -8 411 30 7 1481 380 295 15 37 chr2 117495381 117495515 -64252572 - LTR40b LTR ERVL -5 457 327 8 1481 331 322 49 94 chr2 117495533 117495756 -64252331 - LTR40b LTR ERVL -123 339 127 8 1481 1583 277 75 32 chr2 117496291 117496798 -64251289 + MT2A LTR ERVL 1 529 -4 8 1481 429 419 28 6 chr2 117506992 117507172 -64240915 - MLT-int LTR MaLR -413 1322 1139 1 1481 1146 349 73 81 chr2 117507182 117507678 -64240409 - MLT-int LTR MaLR -707 1028 532 1 1481 1146 349 73 81 chr2 117508143 117508390 -64239697 - MLT-int LTR MaLR -1204 531 291 1 1481 1928 142 35 13 chr2 117509320 117509634 -64238453 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 6 1 1481 770 283 147 15 chr2 117512830 117513156 -64234931 - MER110 LTR ERV1 -15 476 108 2 1481 697 281 42 52 chr2 117517080 117517376 -64230711 + MTD LTR MaLR 1 347 -12 2 1481 432 327 59 32 chr2 117518034 117518255 -64229832 + RMER15 LTR ERVL 347 573 -2 3 1481 687 335 55 34 chr2 117518267 117518684 -64229403 + RMER15-int LTR ERVL 18 443 -4556 3 1481 1312 305 37 15 chr2 117518922 117519465 -64228622 + RMER15-int LTR ERVL 456 1010 -3989 3 1481 584 301 48 26 chr2 117519469 117519742 -64228345 - RMER15-int LTR ERVL -545 4454 4176 3 1481 468 303 228 24 chr2 117520406 117520656 -64227431 - RMER15 LTR ERVL 0 575 275 3 1481 432 318 102 83 chr2 117524934 117525308 -64222779 + MLT1C LTR MaLR 73 453 -14 4 1481 366 291 51 8 chr2 117528427 117528545 -64219542 + ORR1E LTR MaLR 4 126 -233 4 1481 251 208 75 0 chr2 117529604 117529657 -64218430 + ORR1E LTR MaLR 318 374 -5 4 1481 497 304 76 73 chr2 117533549 117533865 -64214222 - MLT2C1 LTR ERVL -2 395 79 5 1481 828 262 52 56 chr2 117533887 117534154 -64213933 - MLT1A0 LTR MaLR -1 364 99 5 1481 446 308 54 85 chr2 117534403 117534610 -64213477 - RLTR15 LTR ERVK -20 339 133 5 1481 2061 103 26 23 chr2 117534610 117534918 -64213169 + RLTR27 LTR ERVK 1 309 0 5 1481 446 298 77 31 chr2 117534918 117535137 -64212950 - RLTR15 LTR ERVK -296 232 34 5 1481 2999 78 13 2 chr2 117541951 117542347 -64205740 - MTB LTR MaLR 0 400 1 6 1481 749 261 33 27 chr2 117544242 117544567 -64203520 + RLTR20D LTR ERVK 1 480 -98 6 1481 320 253 0 39 chr2 117544608 117544620 -64203467 + RLTR20D LTR ERVK 435 444 -90 6 1481 233 286 13 13 chr2 117562286 117562364 -64185723 - MER34 LTR ERV1 -410 132 55 9 1481 499 384 27 40 chr2 117566806 117567134 -64180953 + LTR16A LTR ERVL 52 375 -76 9 1481 802 312 44 116 chr2 117568609 117569040 -64179047 - MT2A LTR ERVL -133 400 1 1 1482 429 268 30 30 chr2 117571807 117571938 -64176149 + MLT1E3 LTR MaLR 49 179 -445 1 1482 2083 166 22 6 chr2 117577730 117578087 -64170000 + ORR1D1 LTR MaLR 12 374 0 1 1482 334 305 68 52 chr2 117584372 117584612 -64163475 + ORR1E LTR MaLR 1 261 -98 1 1482 692 189 30 0 chr2 117587118 117587285 -64160802 + RMER21B LTR ERV1 708 947 0 1 1482 552 284 55 12 chr2 117587804 117587960 -64160127 - MLT1D LTR MaLR -43 462 298 1 1482 348 289 145 45 chr2 117587971 117588192 -64159895 - MLT1D LTR MaLR -251 254 12 1 1482 785 262 74 86 chr2 117588230 117588600 -64159487 + RLTR12B LTR ERVK 1 341 -187 1 1482 553 306 64 96 chr2 117588693 117589037 -64159050 - MTD LTR MaLR -25 394 62 1 1482 1775 196 58 43 chr2 117593019 117593434 -64154653 - MTC LTR MaLR 0 421 1 1 1482 1794 192 116 29 chr2 117593915 117594296 -64153791 - MTD LTR MaLR -5 414 1 1 1482 4786 103 15 65 chr2 117598159 117599010 -64149077 + RMER17D2 LTR ERVK 1 809 0 1 1482 268 235 14 56 chr2 117599134 117599206 -64148881 - ORR1D1 LTR MaLR -305 69 1 1 1482 1175 223 171 53 chr2 117599944 117600044 -64148043 - RMER20B LTR ERVK -194 433 335 1 1482 1175 223 171 53 chr2 117600070 117600348 -64147739 - RMER20B LTR ERVK -293 334 10 1 1482 731 309 81 35 chr2 117607897 117608182 -64139905 - ORR1E LTR MaLR 0 359 62 1 1482 2031 104 33 62 chr2 117608593 117608930 -64139157 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 1 1482 4266 148 74 6 chr2 117608930 117609865 -64138222 + ORR1A2-int LTR MaLR 1 1010 -782 1 1482 1162 229 23 83 chr2 117609865 117610213 -64137874 - RMER17A2 LTR ERVK 0 906 580 1 1482 1617 131 17 45 chr2 117610367 117610656 -64137431 + RLTR9F LTR ERVK 134 414 -1 1 1482 3909 118 2 12 chr2 117610657 117611239 -64136848 + ORR1A2-int LTR MaLR 1388 1963 0 1 1482 1794 112 25 80 chr2 117611239 117611632 -64136455 + ORR1A2 LTR MaLR 1 346 0 1 1482 968 259 123 46 chr2 117611824 117612213 -64135874 - MTD LTR MaLR 0 419 1 1 1482 746 247 113 124 chr2 117616958 117617337 -64130750 + MTE2a LTR MaLR 1 375 -4 1 1482 3342 43 5 0 chr2 117617864 117618258 -64129829 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 1482 9063 40 3 2 chr2 117618258 117619355 -64128732 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 1 1482 3185 36 29 0 chr2 117619355 117619740 -64128347 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 1482 1722 194 113 0 chr2 117624739 117625111 -64122976 - MTD LTR MaLR -3 416 3 1 1482 310 212 22 66 chr2 117625931 117626022 -64122065 + MTD LTR MaLR 5 91 -328 1 1482 713 214 32 0 chr2 117626021 117626175 -64121912 - MTD LTR MaLR -258 161 3 1 1482 714 234 133 71 chr2 117626179 117626404 -64121683 + MTD LTR MaLR 167 405 -14 1 1482 1576 242 28 14 chr2 117632056 117632420 -64115667 - MTD LTR MaLR -49 370 2 1 1482 869 310 146 14 chr2 117637361 117637730 -64110357 - MLT1D LTR MaLR -17 488 71 1 1482 1632 188 144 0 chr2 117643314 117643675 -64104412 - MTD LTR MaLR 0 419 7 2 1482 2103 166 18 56 chr2 117645016 117645431 -64102656 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 1 2 1482 650 267 87 32 chr2 117647350 117647672 -64100415 + MLT2B1 LTR ERVL 155 559 -8 2 1482 1419 276 138 46 chr2 117647689 117648343 -64099744 + MLT1-int LTR MaLR 14 727 -644 2 1482 1058 238 158 14 chr2 117651304 117651670 -64096417 + MTD LTR MaLR 1 419 0 2 1482 263 209 43 75 chr2 117652511 117652604 -64095483 + LTR50 LTR ERVL 705 794 -1 2 1482 573 340 62 56 chr2 117662590 117662927 -64085160 + MLT1A0 LTR MaLR 21 359 -6 2 1482 347 308 62 12 chr2 117665571 117665732 -64082355 + MamGypLTR1c LTR Gypsy 14 182 -621 2 1482 326 239 20 89 chr2 117666503 117666604 -64081483 + MER67A LTR ERV1 1 94 -449 2 1482 909 193 88 12 chr2 117668397 117668723 -64079364 + RMER20B LTR ERVK 1 418 -209 2 1482 253 341 12 0 chr2 117668769 117668854 -64079233 + MER67A LTR ERV1 129 214 -447 2 1482 2046 136 33 36 chr2 117669122 117669481 -64078606 + RLTR15 LTR ERVK 1 358 -1 2 1482 285 289 161 15 chr2 117681233 117681370 -64066717 - MLT1A0 LTR MaLR -1 364 208 2 1482 3705 15 5 0 chr2 117683537 117683931 -64064156 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 1482 9764 33 4 1 chr2 117683931 117685026 -64063061 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 2 1482 3671 20 5 0 chr2 117685026 117685420 -64062667 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 1482 229 287 62 115 chr2 117685981 117686111 -64061976 - MLT1E2 LTR MaLR -268 359 237 2 1482 508 266 0 8 chr2 117694346 117694475 -64053612 + MLT1B LTR MaLR 263 390 0 2 1482 1171 230 132 15 chr2 117696251 117696578 -64051509 + MTD LTR MaLR 5 369 -50 2 1482 818 264 92 38 chr2 117699284 117699582 -64048505 + MTC-int LTR MaLR 705 1103 -155 2 1482 1605 216 102 3 chr2 117699659 117700040 -64048047 + MTD LTR MaLR 1 419 0 2 1482 2154 169 26 32 chr2 117701735 117702113 -64045974 + ORR1C1 LTR MaLR 3 378 0 2 1483 345 286 92 8 chr2 117707019 117707139 -64040948 - MTD LTR MaLR -266 153 24 2 1483 612 233 85 49 chr2 117710375 117710606 -64037481 - MTD LTR MaLR -5 374 84 2 1483 1939 114 107 11 chr2 117728009 117728382 -64019705 + RMER17C LTR ERVK 2 410 0 3 1483 254 288 27 0 chr2 117730601 117730674 -64017413 - ORR1E LTR MaLR -282 77 3 3 1483 1098 292 72 37 chr2 117733311 117733716 -64014371 + MTD LTR MaLR 1 419 0 3 1483 2217 189 31 3 chr2 117739104 117739487 -64008600 - MTC LTR MaLR 0 421 28 3 1483 656 265 23 36 chr2 117740100 117740319 -64007768 - RMER15 LTR ERVL -13 562 347 3 1483 1465 224 47 22 chr2 117742357 117742718 -64005369 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 3 1483 349 189 149 43 chr2 117753611 117753705 -63994382 + ORR1E LTR MaLR 250 353 -6 3 1483 2352 180 155 25 chr2 117759181 117759710 -63988377 + RMER19B LTR ERVK 304 901 -1 3 1483 351 240 103 39 chr2 117760469 117760673 -63987414 - RLTR21 LTR ERVK -259 1313 1097 3 1483 2354 141 60 103 chr2 117769933 117770486 -63977601 + RLTR24 LTR ERV1 1 529 0 3 1483 5433 92 24 15 chr2 117772443 117773244 -63974843 + RLTR13C2 LTR ERVK 1 808 0 3 1483 3522 166 105 6 chr2 117779951 117780581 -63967506 - RLTR17 LTR ERVK 0 692 1 3 1483 1507 234 73 25 chr2 117784653 117785048 -63963039 - MTD LTR MaLR -5 414 1 3 1483 605 260 7 0 chr2 117786135 117786285 -63961802 + ORR1D1 LTR MaLR 1 151 -223 3 1483 268 370 8 0 chr2 117788446 117788573 -63959514 + MLT1B LTR MaLR 9 136 -254 3 1483 991 241 162 14 chr2 117788573 117788930 -63959157 - MTD LTR MaLR 0 419 10 3 1483 227 364 54 27 chr2 117788979 117789126 -63958961 + MLT1B LTR MaLR 181 331 -59 3 1483 2269 234 4 112 chr2 117792926 117793611 -63954476 + RMER19C LTR ERVK 1 611 0 3 1483 1485 243 64 3 chr2 117795839 117796215 -63951872 - MTD LTR MaLR -1 418 20 3 1483 880 174 8 248 chr2 117797276 117797627 -63950460 + MT2B LTR ERVL 3 269 -332 3 1483 796 256 30 47 chr2 117797445 117797787 -63950300 + ORR1B1-int LTR MaLR 653 972 -991 4 1483 274 143 20 0 chr2 117797782 117797831 -63950256 + ORR1B1-int LTR MaLR 1460 1509 0 4 1483 1483 208 67 3 chr2 117797831 117798145 -63949942 + ORR1B1 LTR MaLR 1 334 -60 4 1483 1508 231 76 15 chr2 117803069 117803464 -63944623 + MTD LTR MaLR 1 419 0 4 1483 337 250 26 18 chr2 117804835 117804949 -63943138 - MTD LTR MaLR -304 115 1 4 1483 331 402 33 5 chr2 117817977 117818187 -63929900 - LTR16C LTR ERVL -3 486 271 4 1483 3483 30 2 0 chr2 117824536 117824931 -63923156 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 1483 474 316 82 27 chr2 117830204 117830549 -63917538 + ORR1E LTR MaLR 1 370 0 4 1483 298 273 129 23 chr2 117831928 117832121 -63915966 + MLT2B3 LTR ERVL 120 330 -340 4 1483 573 313 71 57 chr2 117832400 117832681 -63915406 + MLT2B3 LTR ERVL 380 664 -6 4 1484 1474 211 132 0 chr2 117835056 117835421 -63912666 + MTD LTR MaLR 7 419 0 4 1484 1177 275 39 12 chr2 117841605 117841943 -63906144 - ORR1D2 LTR MaLR -4 366 20 4 1484 258 358 117 0 chr2 117846729 117846908 -63901179 - LTR16D LTR ERVL 0 651 452 4 1484 728 290 56 30 chr2 117860504 117860774 -63887313 + MTE2a LTR MaLR 5 281 -98 4 1484 1240 195 102 114 chr2 117860777 117861200 -63886887 + MTD LTR MaLR 1 405 -14 4 1484 1280 230 45 39 chr2 117871620 117871978 -63876109 + ORR1D2 LTR MaLR 11 370 0 4 1484 522 297 154 80 chr2 117877312 117877663 -63870424 - MER57C2 LTR ERV1 -9 425 49 5 1484 273 305 128 30 chr2 117879438 117879641 -63868446 - LTR41B LTR ERVL -9 749 527 5 1484 1086 276 58 37 chr2 117881810 117882137 -63865950 + MTE2b LTR MaLR 27 360 -19 5 1484 273 250 51 26 chr2 117882396 117882474 -63865613 - MTEa LTR MaLR -38 341 262 5 1484 315 314 24 24 chr2 117886955 117887082 -63861005 - RLTR42-int LTR ERVK -4207 1315 1189 5 1484 342 226 10 51 chr2 117887482 117887580 -63860507 + MTEa LTR MaLR 256 349 -30 5 1484 3097 59 13 3 chr2 117888867 117889259 -63858828 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 1484 2239 143 57 15 chr2 117889633 117890038 -63858049 - BGLII_Mus LTR ERVK 0 422 1 5 1484 371 345 87 37 chr2 117898642 117898883 -63849204 - ORR1E LTR MaLR -105 254 2 5 1484 230 306 57 34 chr2 117901536 117901624 -63846463 - MLT1A1 LTR MaLR -137 271 182 5 1484 575 277 78 66 chr2 117902435 117902706 -63845381 - MLT1B LTR MaLR -104 286 13 5 1484 537 323 81 48 chr2 117902732 117903064 -63845023 - MLT1A1 LTR MaLR -63 345 3 5 1484 252 259 202 97 chr2 117903273 117903521 -63844566 + LTR81C LTR ERV1? 866 1139 -14 5 1484 1174 239 70 41 chr2 117905331 117905672 -63842415 + ORR1E LTR MaLR 1 351 -8 5 1484 1106 258 82 13 chr2 117909644 117909977 -63838110 - ORR1E LTR MaLR 0 384 2 5 1484 826 302 102 113 chr2 117913700 117914189 -63833898 - MLT1D LTR MaLR -49 578 1 5 1484 304 346 60 8 chr2 117914191 117914325 -63833762 + LTR16A1 LTR ERVL 83 223 -233 5 1484 2177 161 16 64 chr2 117915022 117915274 -63832813 - RLTR28B LTR ERVL 0 481 236 5 1484 2269 95 35 0 chr2 117915274 117915590 -63832497 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 5 1484 2177 161 16 64 chr2 117915590 117915774 -63832313 - RLTR28B LTR ERVL -246 235 66 5 1484 493 187 33 0 chr2 117915885 117915976 -63832111 - RLTR28B LTR ERVL -370 111 18 5 1484 904 232 49 107 chr2 117917529 117917978 -63830109 + RMER10A LTR ERVL 12 434 -8 5 1484 395 273 167 45 chr2 117918023 117918311 -63829776 + HERV16-int LTR ERVL 1714 2036 -2960 5 1484 992 251 63 17 chr2 117920069 117920393 -63827694 + MTD LTR MaLR 2 419 0 5 1484 1155 263 91 26 chr2 117923068 117923419 -63824668 - MTEa LTR MaLR -5 374 1 5 1484 876 268 92 51 chr2 117923929 117924368 -63823719 - RMER15 LTR ERVL 0 575 1 5 1484 265 302 35 70 chr2 117926624 117926738 -63821349 - MLT1I LTR MaLR -8 440 331 5 1484 417 328 0 44 chr2 117926736 117926873 -63821214 - MLT1I LTR MaLR -235 176 46 5 1484 1557 308 54 61 chr2 117927457 117927996 -63820091 + MLT2B3 LTR ERVL 12 546 -8 5 1484 1443 208 174 95 chr2 117930426 117930921 -63817166 - RLTR20C LTR ERVK 0 534 1 5 1485 5674 104 86 11 chr2 117966783 117966990 -63781097 + RMER17B LTR ERVK 1 209 -749 6 1485 5674 104 86 11 chr2 117967013 117967200 -63780887 + RMER17B LTR ERVK 210 398 -560 6 1485 5674 104 86 11 chr2 117967301 117967793 -63780294 + RMER17B LTR ERVK 399 951 -7 6 1485 499 332 96 8 chr2 117979925 117980174 -63767913 - ERVL-E-int LTR ERVL -4531 1136 866 6 1485 343 338 48 73 chr2 117980948 117981264 -63766823 - MLT1N2 LTR MaLR -3 559 252 6 1485 2670 144 42 83 chr2 117981595 117982147 -63765940 + RLTR24 LTR ERV1 1 529 0 6 1485 871 207 195 8 chr2 117982903 117983214 -63764873 - MTD LTR MaLR -5 414 22 6 1485 605 293 93 34 chr2 117991195 117991365 -63756722 - MTD LTR MaLR -39 380 241 6 1485 605 305 78 59 chr2 117991516 117991749 -63756338 - MTD LTR MaLR -168 251 1 6 1485 4340 83 46 15 chr2 117991859 117992571 -63755516 + RMER17A LTR ERVK 1 734 -17 6 1485 4581 206 97 24 chr2 117992984 117994154 -63753933 + ORR1C2-int LTR MaLR 116 1370 0 6 1485 1972 174 29 31 chr2 117994154 117994539 -63753548 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 6 1485 2013 182 74 5 chr2 117996187 117996579 -63751508 - MTD LTR MaLR 0 419 1 6 1485 675 271 7 10 chr2 117997841 117998050 -63750037 + MTD LTR MaLR 6 211 -210 6 1485 604 250 57 6 chr2 117998349 117998506 -63749581 + MTD LTR MaLR 196 360 -59 6 1485 1640 161 71 34 chr2 118003887 118004241 -63743846 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 18 3 1485 2900 94 10 7 chr2 118005983 118006389 -63741698 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 5 1485 403 285 136 64 chr2 118006986 118007067 -63741020 + MTE2b LTR MaLR 95 190 -189 6 1485 403 285 136 64 chr2 118007125 118007294 -63740793 + MTE2b LTR MaLR 191 362 -17 6 1485 558 290 124 25 chr2 118007305 118007627 -63740460 + MTE2b-int LTR MaLR 1 354 -1226 6 1485 994 161 109 10 chr2 118009562 118009763 -63738324 + RMER4A LTR ERVK 2 222 -244 1 1485 624 134 16 78 chr2 118009772 118009901 -63738186 + RMER4A LTR ERVK 346 466 0 1 1485 9373 153 67 6 chr2 118009930 118011488 -63736599 + MurERV4-int LTR ERVK 83 1735 -3525 1 1485 1679 167 16 19 chr2 118011490 118011807 -63736280 + MurERV4-int LTR ERVK 4944 5259 -1 1 1485 2594 130 58 22 chr2 118011807 118012254 -63735833 + RMER4A LTR ERVK 1 463 -3 1 1485 406 209 8 106 chr2 118014954 118015077 -63733010 + MT2B LTR ERVL 154 264 -337 1 1485 3455 199 84 50 chr2 118022826 118023697 -63724390 - RMER13B LTR ERVK -4 904 5 3 1485 2111 106 55 0 chr2 118023888 118024200 -63723887 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 3 1485 2074 140 14 11 chr2 118024668 118025029 -63723058 + ORR1B2 LTR MaLR 1 362 -5 3 1485 1298 228 74 21 chr2 118026142 118026478 -63721609 + ORR1D2 LTR MaLR 9 362 -8 4 1485 245 167 79 53 chr2 118026795 118026871 -63721216 - RLTR25B LTR ERVK -519 509 432 4 1485 2105 129 9 63 chr2 118045665 118046013 -63702074 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 7 1485 255 323 59 15 chr2 118046815 118046950 -63701137 + RMER15 LTR ERVL 343 483 -92 7 1485 373 220 0 71 chr2 118047437 118047535 -63700552 + MTEa LTR MaLR 237 327 -52 7 1485 1234 273 85 57 chr2 118053089 118053288 -63694799 + RLTR17 LTR ERVK 111 297 -395 8 1485 1234 273 85 57 chr2 118053419 118053785 -63694302 + RLTR17 LTR ERVK 298 691 -1 8 1485 260 214 14 28 chr2 118054985 118055057 -63693030 - RLTR31_Mm LTR ERVK 0 561 491 8 1485 269 100 0 0 chr2 118055056 118055096 -63692991 - RLTR17 LTR ERVK -96 596 557 8 1485 2696 118 23 5 chr2 118055097 118055539 -63692548 - RLTR17 LTR ERVK -242 450 1 8 1485 282 308 67 25 chr2 118059126 118059246 -63688841 + MER57C2 LTR ERV1 32 156 -278 9 1485 1707 176 112 5 chr2 118068890 118068986 -63679101 + MTC LTR MaLR 1 96 -325 1 1485 1707 176 112 5 chr2 118069182 118069461 -63678626 + MTC LTR MaLR 97 415 -6 1 1485 513 240 45 96 chr2 118070077 118070275 -63677812 + MTE2a LTR MaLR 3 190 -189 1 1485 452 370 102 9 chr2 118071267 118071600 -63676487 + MLT1F1 LTR MaLR 204 567 -2 1 1485 657 203 208 38 chr2 118081250 118081486 -63666601 + ORR1D1 LTR MaLR 49 324 -50 1 1485 1666 166 29 58 chr2 118081482 118081860 -63666227 + ORR1D1-int LTR MaLR 77 443 -927 1 1485 1244 222 40 57 chr2 118091328 118091681 -63656406 - MTEa LTR MaLR -27 352 6 1 1485 2319 110 7 59 chr2 118093739 118094164 -63653923 - RLTR11A2 LTR ERVK -10 517 115 1 1485 1827 209 35 9 chr2 118094250 118094680 -63653407 + BGLII_B LTR ERVK 1 441 0 1 1486 3467 133 27 12 chr2 118097029 118097615 -63650472 - RLTR17 LTR ERVK 0 692 98 1 1486 2522 220 8 96 chr2 118098600 118099268 -63648819 - RMER19C LTR ERVK 0 611 3 1 1486 740 273 72 35 chr2 118099525 118099844 -63648243 + MLT1A1 LTR MaLR 78 408 0 1 1486 460 360 53 30 chr2 118102036 118102339 -63645748 - LTR16E1 LTR ERVL -9 529 220 1 1486 1456 221 49 13 chr2 118110752 118111141 -63636946 - MTD LTR MaLR -5 414 12 1 1486 1638 93 123 55 chr2 118116075 118116383 -63631704 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 1 1486 288 295 151 20 chr2 118118631 118118791 -63629296 - MLT1A1 LTR MaLR -193 172 1 2 1486 367 267 33 11 chr2 118126823 118126914 -63621173 + MLT1F LTR MaLR 29 121 -427 2 1486 1838 139 107 25 chr2 118130960 118131315 -63616772 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 2 1486 290 293 81 0 chr2 118131497 118131596 -63616491 - RMER5 LTR ERV1 -2 532 426 2 1486 615 262 121 75 chr2 118132335 118132706 -63615381 - RMER5 LTR ERV1 -114 420 33 2 1486 1448 159 301 18 chr2 118133918 118134250 -63613837 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 5 2 1486 340 241 94 122 chr2 118141846 118142129 -63605958 - MLT1D LTR MaLR -148 357 20 2 1486 1092 294 77 20 chr2 118146855 118147310 -63600777 + RMER5 LTR ERV1 44 524 -10 2 1486 1335 254 19 9 chr2 118147416 118147738 -63600349 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 46 2 1486 458 231 110 0 chr2 118157747 118157886 -63590201 - MLT1D LTR MaLR -466 161 8 2 1486 537 310 145 3 chr2 118157885 118158167 -63589920 + MLT1E1A LTR MaLR 354 675 -5 2 1486 677 206 213 109 chr2 118163511 118163849 -63584238 + MTEb LTR MaLR 5 377 -2 2 1486 1816 91 78 75 chr2 118164381 118164715 -63583372 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 52 2 1486 806 238 173 37 chr2 118170698 118170969 -63577118 - MTE2b LTR MaLR -14 365 58 2 1486 377 300 52 20 chr2 118173927 118174080 -63574007 + MER34A1 LTR ERV1 294 451 -136 3 1486 726 320 23 103 chr2 118178108 118178230 -63569857 + MLT1C LTR MaLR 65 156 -311 3 1486 726 320 23 103 chr2 118178281 118178586 -63569501 + MLT1C LTR MaLR 157 458 -9 3 1486 641 271 6 11 chr2 118180695 118180878 -63567209 - MTE-int LTR MaLR -28 1552 1371 3 1486 347 377 56 24 chr2 118190507 118190844 -63557243 + ORR1E LTR MaLR 1 348 -11 3 1486 237 277 17 144 chr2 118191689 118191807 -63556280 + MTE-int LTR MaLR 583 685 -895 3 1486 385 151 170 14 chr2 118192078 118192159 -63555928 + RMER17C LTR ERVK 113 206 -204 3 1486 385 151 170 14 chr2 118192291 118192350 -63555737 + RMER17C LTR ERVK 207 274 -136 3 1486 1456 233 50 40 chr2 118192392 118192425 -63555662 + MTE-int LTR MaLR 716 744 -836 3 1486 2693 117 50 2 chr2 118192425 118192827 -63555260 - MTC LTR MaLR 0 421 1 3 1486 1456 233 50 40 chr2 118192827 118193169 -63554918 + MTE-int LTR MaLR 745 1095 -485 3 1486 484 238 66 94 chr2 118195147 118195328 -63552759 - MLT1A LTR MaLR -5 369 194 3 1486 340 319 171 28 chr2 118200666 118200988 -63547099 - MLT1G3 LTR MaLR -203 392 25 3 1486 435 309 65 0 chr2 118201086 118201225 -63546862 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 218 3 1486 525 311 62 83 chr2 118201644 118202030 -63546057 + MLT1I LTR MaLR 33 410 -1 3 1486 2435 167 96 5 chr2 118204504 118205065 -63543022 + RLTR40 LTR ERVK 5 616 -201 3 1486 1846 173 62 14 chr2 118206045 118206227 -63541860 + ORR1D1 LTR MaLR 1 179 -195 3 1486 1846 173 62 14 chr2 118206260 118206434 -63541653 + ORR1D1 LTR MaLR 180 373 -1 3 1486 4327 97 25 3 chr2 118206765 118207353 -63540734 - MT2B LTR ERVL 0 601 1 3 1486 263 261 68 0 chr2 118209330 118209418 -63538669 + RMER10B LTR ERVL 269 362 -36 3 1486 2025 120 55 0 chr2 118210041 118210350 -63537737 + ORR1A3 LTR MaLR 1 326 0 3 1486 1889 182 33 3 chr2 118210537 118210900 -63537187 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 3 1486 1885 180 120 9 chr2 118211073 118211533 -63536554 - RMER5 LTR ERV1 -8 526 16 3 1486 679 212 34 34 chr2 118212276 118212481 -63535606 + RMER15 LTR ERVL 295 499 -76 3 1486 418 241 76 64 chr2 118217815 118217970 -63530117 - MLT1A0 LTR MaLR -2 406 204 4 1486 1701 197 173 69 chr2 118219692 118219735 -63528352 - MT2A LTR ERVL -2 531 478 4 1486 1701 197 173 69 chr2 118219791 118220226 -63527861 - MT2A LTR ERVL -56 477 4 4 1486 260 171 36 84 chr2 118220310 118220393 -63527694 - RMER20B LTR ERVK -280 347 269 4 1486 290 234 221 24 chr2 118221303 118221430 -63526657 - MLT1A0 LTR MaLR -354 158 7 4 1487 887 329 75 123 chr2 118227443 118228150 -63519937 - MER21B LTR ERV1 -180 683 11 4 1487 521 262 149 105 chr2 118238201 118238563 -63509524 + MTE2a LTR MaLR 1 378 -1 4 1487 445 200 84 72 chr2 118257688 118257844 -63490243 - ORR1D1 LTR MaLR -232 142 1 4 1487 1079 137 359 39 chr2 118262142 118262423 -63485664 + ORR1D1 LTR MaLR 4 374 0 4 1487 2073 213 96 28 chr2 118263056 118263478 -63484609 - RLTR20A2 LTR ERVK 0 578 137 4 1487 2073 213 96 28 chr2 118263520 118263638 -63484449 - RLTR20A2 LTR ERVK -442 136 2 4 1487 498 200 37 19 chr2 118266244 118266351 -63481736 - ORR1D2 LTR MaLR -259 111 3 4 1487 235 311 59 112 chr2 118279430 118279600 -63468487 + LTR9 LTR ERV1 64 224 -388 5 1487 295 232 0 55 chr2 118279972 118280045 -63468042 - MTC LTR MaLR -241 180 112 5 1487 604 176 265 8 chr2 118285639 118285863 -63462224 - MTD LTR MaLR 0 419 24 5 1487 342 245 534 7 chr2 118288645 118288795 -63459292 - MER21B LTR ERV1 -172 691 463 5 1487 520 258 184 10 chr2 118288857 118289053 -63459034 - MER21B LTR ERV1 -486 377 148 5 1487 263 345 82 14 chr2 118290822 118290969 -63457118 - MLT1C LTR MaLR 0 467 311 5 1487 847 243 227 3 chr2 118298877 118299216 -63448871 - MTD LTR MaLR 0 419 5 5 1487 386 271 16 116 chr2 118306183 118306199 -63441888 + MT2B LTR ERVL 153 196 -405 5 1487 4577 130 138 19 chr2 118306282 118306472 -63441615 + RMER19B LTR ERVK 1 235 -667 5 1487 386 271 16 116 chr2 118306283 118306304 -63441783 + MT2B LTR ERVL 197 261 -340 5 1487 4577 130 138 19 chr2 118306502 118307111 -63440976 + RMER19B LTR ERVK 236 894 -8 5 1487 2199 157 48 25 chr2 118307406 118307804 -63440283 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 5 1487 498 294 96 106 chr2 118308118 118308201 -63439886 - MLT1D LTR MaLR 0 505 420 5 1487 498 294 96 106 chr2 118308385 118308602 -63439485 - MLT1D LTR MaLR -86 419 208 5 1487 345 252 93 0 chr2 118310544 118310651 -63437436 - LTR37A LTR ERV1 -73 353 237 5 1487 314 245 26 155 chr2 118315168 118315284 -63432803 - MT2B LTR ERVL -344 257 157 6 1487 473 339 84 102 chr2 118322471 118322911 -63425176 - MER21B LTR ERV1 -415 448 17 6 1487 660 274 67 169 chr2 118323020 118323411 -63424676 + LTR48B LTR ERV1 1 351 -293 6 1487 251 389 106 8 chr2 118328569 118328701 -63419386 + LTR16E2 LTR ERVL 29 173 -395 6 1487 1783 179 97 3 chr2 118330197 118330538 -63417549 + ORR1D1 LTR MaLR 2 374 0 6 1487 597 149 19 9 chr2 118330727 118330835 -63417252 - RLTR9F LTR ERVK 0 415 307 6 1487 916 116 6 62 chr2 118330838 118331002 -63417085 - RLTR9F LTR ERVK -231 172 1 6 1487 286 293 35 70 chr2 118333929 118334072 -63414015 + RLTR25A LTR ERVK 521 658 -445 6 1487 771 233 110 86 chr2 118334772 118335073 -63413014 + RMER10A LTR ERVL 8 319 -123 6 1487 771 233 110 86 chr2 118335211 118335318 -63412769 + RMER10A LTR ERVL 320 426 -16 6 1487 593 227 155 43 chr2 118341005 118341212 -63406875 + RMER15 LTR ERVL 346 575 0 6 1487 319 344 24 58 chr2 118349939 118350139 -63397948 + MLT1F2 LTR MaLR 363 551 -18 7 1487 437 211 21 121 chr2 118352021 118352161 -63395926 + MT2B LTR ERVL 153 278 -323 7 1487 2032 176 17 61 chr2 118353344 118353805 -63394282 - RLTR31_Mur LTR ERVK 0 553 113 7 1487 277 169 49 33 chr2 118353807 118353868 -63394219 + RLTR31_Mm LTR ERVK 500 561 0 7 1488 2216 149 62 0 chr2 118377829 118378185 -63369902 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 7 7 1488 1124 239 119 27 chr2 118379145 118379480 -63368607 + ORR1D2 LTR MaLR 1 366 -4 7 1488 2338 142 48 55 chr2 118380501 118380977 -63367110 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 473 -2 7 1488 4277 56 68 23 chr2 118381005 118381623 -63366464 + IAPEz-int LTR ERVK 17 662 -5819 7 1488 434 66 0 32 chr2 118381623 118381686 -63366401 + IAPEz-int LTR ERVK 1359 1419 -5062 7 1488 1718 110 0 0 chr2 118381691 118381937 -63366150 + IAPEz-int LTR ERVK 2252 2497 -5183 7 1488 903 80 24 0 chr2 118381932 118382057 -63366030 + IAPEz-int LTR ERVK 4783 4910 -2770 7 1488 4377 10 0 0 chr2 118382059 118382560 -63365527 + IAPEz-int LTR ERVK 4123 4623 -1858 7 1488 9171 22 3 1 chr2 118382555 118383635 -63364452 + IAPEz-int LTR ERVK 5400 6481 0 7 1488 2348 140 48 55 chr2 118383635 118384111 -63363976 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 473 -2 7 1488 1487 252 89 77 chr2 118386659 118386798 -63361289 - RMER5 LTR ERV1 -2 532 368 7 1488 1487 252 89 77 chr2 118386989 118387343 -63360744 - RMER5 LTR ERV1 -167 367 33 7 1488 1847 65 0 0 chr2 118389195 118389424 -63358663 - ORR1A1 LTR MaLR -51 295 67 7 1488 2300 134 86 25 chr2 118389680 118390077 -63358010 - MTC LTR MaLR 0 421 1 7 1488 560 246 62 88 chr2 118393558 118393785 -63354302 - MER57A-int LTR ERV1 -169 6018 5798 8 1488 265 232 9 147 chr2 118396150 118396266 -63351821 + MLT1A1 LTR MaLR 1 100 -308 8 1488 235 356 36 50 chr2 118397751 118397890 -63350197 + MLT1J LTR MaLR 361 497 -15 8 1488 3763 164 176 60 chr2 118398013 118398872 -63349215 + RMER17B LTR ERVK 1 958 0 8 1488 495 338 144 27 chr2 118399249 118399693 -63348394 + LTR33 LTR ERVL 20 515 0 8 1488 610 216 472 5 chr2 118400658 118400868 -63347219 + MTD LTR MaLR 113 419 0 8 1488 2701 169 24 38 chr2 118402670 118403192 -63344895 + RMER19C LTR ERVK 1 611 0 8 1488 346 337 50 17 chr2 118404413 118404594 -63343493 - RMER5 LTR ERV1 -38 496 310 8 1488 225 217 65 32 chr2 118405254 118405316 -63342771 - RLTR16 LTR ERVK -12 493 430 8 1488 584 199 38 15 chr2 118405312 118405445 -63342642 - RLTR16 LTR ERVK -12 493 358 8 1488 2313 131 25 6 chr2 118407682 118408035 -63340052 + ORR1C1 LTR MaLR 19 378 0 8 1488 699 284 49 52 chr2 118408057 118408343 -63339744 - RMER5 LTR ERV1 -249 285 1 8 1488 675 298 101 40 chr2 118409021 118409349 -63338738 - LTR48B LTR ERV1 -296 348 1 8 1488 1628 177 33 95 chr2 118409390 118409789 -63338298 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 8 1488 4781 112 87 55 chr2 118410264 118410728 -63337359 - RMER17A2 LTR ERVK 0 906 463 8 1488 4781 112 87 55 chr2 118410763 118411176 -63336911 - RMER17A2 LTR ERVK -444 462 3 8 1488 2731 221 27 56 chr2 118412977 118413687 -63334400 - RLTR17 LTR ERVK 0 692 4 8 1488 970 271 16 130 chr2 118413844 118414221 -63333866 + ORR1D2 LTR MaLR 1 334 -36 8 1488 2742 117 142 17 chr2 118414257 118414735 -63333352 - RLTR20A LTR ERVK -3 538 1 8 1488 2452 59 21 59 chr2 118416296 118416636 -63331451 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 8 1488 1335 175 66 12 chr2 118417283 118417370 -63330717 - RLTR20A LTR ERVK 0 541 441 8 1488 1335 175 66 12 chr2 118417418 118417573 -63330514 - RLTR20A LTR ERVK -101 440 287 8 1488 1020 193 48 72 chr2 118417590 118417880 -63330207 + RLTR20D LTR ERVK 1 283 -285 8 1488 593 240 66 33 chr2 118417870 118417928 -63330159 + RLTR20D LTR ERVK 423 479 -99 8 1488 593 240 66 33 chr2 118417989 118418081 -63330006 + RLTR20D LTR ERVK 480 576 -2 8 1488 1155 217 17 74 chr2 118418081 118418379 -63329708 - RLTR20A LTR ERVK -259 282 2 8 1488 1882 178 61 63 chr2 118419031 118419426 -63328661 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 8 1488 275 245 214 10 chr2 118419448 118419549 -63328538 + MLT1D LTR MaLR 1 122 -383 8 1488 1401 112 5 0 chr2 118419549 118419745 -63328342 + RMER6A LTR ERVK 1 197 -559 8 1488 2921 161 57 42 chr2 118420874 118420929 -63327158 + RMER6A LTR ERVK 132 181 -575 8 1488 2921 161 57 42 chr2 118421107 118421667 -63326420 + RMER6A LTR ERVK 182 756 0 8 1488 573 359 75 16 chr2 118421667 118422042 -63326045 + MLT1D LTR MaLR 108 505 0 8 1488 2325 152 30 111 chr2 118422575 118423143 -63324944 + RMER6A LTR ERVK 235 756 0 8 1488 522 292 83 49 chr2 118429885 118430151 -63317936 - RLTR12B LTR ERVK -242 286 12 9 1488 1439 177 70 3 chr2 118430564 118430865 -63317222 + ORR1D1 LTR MaLR 54 374 0 9 1488 693 67 55 37 chr2 118432568 118432677 -63315410 + RMER6B LTR ERVK 1 111 -350 9 1488 2705 106 57 18 chr2 118432678 118433118 -63314969 + RMER6B LTR ERVK 1 457 -4 9 1488 1394 109 5 5 chr2 118434809 118435003 -63313084 + ORR1A2 LTR MaLR 1 194 -133 9 1488 351 237 41 51 chr2 118444689 118444787 -63303300 + RLTR15 LTR ERVK 14 110 -249 9 1488 1540 135 232 19 chr2 118445724 118446034 -63302053 - ORR1C1 LTR MaLR -2 376 1 9 1488 2043 162 105 28 chr2 118446043 118446443 -63301644 + BGLII_B LTR ERVK 1 431 -10 9 1488 907 235 73 45 chr2 118448347 118448677 -63299410 - RLTR15 LTR ERVK -20 339 1 9 1488 757 213 19 19 chr2 118460572 118460730 -63287357 - RLTR16 LTR ERVK -347 158 1 9 1488 603 81 7 0 chr2 118470256 118470349 -63277738 + ORR1B1 LTR MaLR 271 394 0 9 1488 3074 25 22 8 chr2 118471369 118471729 -63276358 + RLTR10B2 LTR ERVK 1 365 0 1 1488 1155 191 37 0 chr2 118472322 118472537 -63275550 + RMER19B LTR ERVK 1 223 -679 1 1488 2675 143 70 32 chr2 118472545 118473073 -63275014 + RMER19B LTR ERVK 349 896 -6 1 1488 1143 102 12 6 chr2 118475291 118475458 -63272629 + RMER4A LTR ERVK 1 168 -298 1 1488 2059 148 7 131 chr2 118475455 118475882 -63272205 - ORR1B1 LTR MaLR -20 374 1 1 1488 773 128 25 57 chr2 118475882 118476040 -63272047 + MurERV4-int LTR ERVK 5106 5258 -2 1 1488 1461 167 58 7 chr2 118476041 118476319 -63271768 + RMER4A LTR ERVK 1 292 -174 1 1488 1974 97 23 107 chr2 118476310 118476657 -63271430 - ORR1A3 LTR MaLR -8 318 1 1 1488 374 114 42 14 chr2 118476657 118476726 -63271361 + RMER4A LTR ERVK 274 344 -122 1 1488 291 136 58 43 chr2 118476792 118476861 -63271226 + RMER4A LTR ERVK 397 466 0 1 1488 255 234 78 0 chr2 118477560 118477624 -63270463 - MLT2B3 LTR ERVL 0 554 486 1 1488 567 333 99 22 chr2 118477717 118478039 -63270048 - MT2A LTR ERVL -110 423 77 1 1488 256 328 98 25 chr2 118477974 118478096 -63269991 - MTE2a LTR MaLR -239 140 10 1 1488 3416 171 147 73 chr2 118478608 118479433 -63268654 + RMER19B LTR ERVK 1 886 -16 1 1488 255 259 34 45 chr2 118481280 118481369 -63266718 - MLT1L LTR MaLR -173 437 350 1 1488 261 307 114 67 chr2 118481388 118481643 -63266444 - MLT1L LTR MaLR -328 282 16 1 1488 250 221 162 0 chr2 118485786 118485854 -63262233 + MLT1K LTR MaLR 129 207 -388 1 1489 372 302 126 104 chr2 118492584 118492619 -63255468 - MLT1A0 LTR MaLR -4 361 332 1 1489 1075 211 229 36 chr2 118492619 118493003 -63255084 - RMER6B LTR ERVK 0 461 4 1 1489 372 286 144 52 chr2 118493003 118493261 -63254826 - MLT1A0 LTR MaLR -34 331 47 1 1489 769 292 57 5 chr2 118499036 118499246 -63248841 - MLT1A0 LTR MaLR -26 339 119 1 1489 269 299 53 38 chr2 118504981 118505113 -63242974 + RLTR25A LTR ERVK 522 655 -448 6 1489 3164 157 16 67 chr2 118509300 118509541 -63238546 + RMER4B LTR ERVK 1 239 -346 1 1489 3164 157 16 67 chr2 118509687 118510016 -63238071 + RMER4B LTR ERVK 240 541 -44 1 1489 3164 157 16 67 chr2 118510206 118510250 -63237837 + RMER4B LTR ERVK 542 585 0 1 1489 1719 178 145 0 chr2 118512156 118512515 -63235572 - MTD LTR MaLR -6 413 3 2 1489 337 339 147 30 chr2 118552036 118552505 -63195582 + LTR78 LTR ERV1 701 1271 -33 5 1489 437 149 14 0 chr2 118560230 118560304 -63187783 - ORR1C1 LTR MaLR -66 312 238 6 1489 4107 112 56 32 chr2 118560305 118561034 -63187053 + RMER6A LTR ERVK 6 752 -4 6 1489 963 148 208 0 chr2 118561036 118561238 -63186849 - ORR1C1 LTR MaLR -134 244 1 6 1489 1970 207 105 11 chr2 118561644 118562122 -63185965 + MT2A LTR ERVL 1 523 -10 6 1489 341 338 75 38 chr2 118568281 118568573 -63179514 - HERV16-int LTR ERVL -3952 1044 742 8 1489 2319 63 38 9 chr2 118596340 118596658 -63151429 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 1 1490 1607 129 0 4 chr2 118623683 118623917 -63124170 - MTC LTR MaLR 0 421 189 1 1490 1442 167 95 15 chr2 118624978 118625251 -63122836 - ORR1B2 LTR MaLR -71 296 2 1 1490 2399 192 82 25 chr2 118628333 118628845 -63119242 + RLTR20A LTR ERVK 1 541 0 1 1490 941 163 64 30 chr2 118629669 118629948 -63118139 + MTC LTR MaLR 1 371 -50 1 1490 387 256 180 71 chr2 118631890 118631990 -63116097 + RLTR15 LTR ERVK 1 113 -246 1 1490 387 256 180 71 chr2 118632103 118632313 -63115774 + RLTR15 LTR ERVK 114 345 -14 1 1490 1920 332 22 7 chr2 118633529 118634429 -63113658 + MYSERV6-int LTR ERVK 532 1603 -1574 1 1490 1577 254 8 21 chr2 118634559 118635033 -63113054 + MYSERV6-int LTR ERVK 1525 1992 -6967 1 1490 4839 198 35 43 chr2 118635303 118636412 -63111675 + MYSERV6-int LTR ERVK 1977 3076 -5883 1 1490 457 175 0 0 chr2 118636414 118636494 -63111593 + RLTR20C LTR ERVK 3 82 -469 2 1490 598 255 6 47 chr2 118637023 118637192 -63110895 - RLTR11B LTR ERVK -15 438 277 2 1490 884 225 111 50 chr2 118637193 118637643 -63110444 + RLTR20C LTR ERVK 1 528 -13 2 1490 572 249 125 118 chr2 118637653 118637940 -63110147 - RLTR11B LTR ERVK -164 289 1 2 1490 1585 159 80 64 chr2 118638536 118639003 -63109084 - RMER4B LTR ERVK -2 464 3 2 1490 1585 141 220 26 chr2 118642993 118643379 -63104708 + RMER6B LTR ERVK 1 461 0 2 1490 1999 159 16 0 chr2 118645171 118645491 -63102596 + MTC LTR MaLR 6 330 -91 2 1490 1867 111 93 3 chr2 118645493 118645782 -63102305 - ORR1A3 LTR MaLR -8 318 4 2 1490 2250 216 52 73 chr2 118645808 118646383 -63101704 + RMER19C LTR ERVK 49 611 0 2 1490 5247 118 26 16 chr2 118646383 118647252 -63100835 - ORR1A3-int LTR MaLR -686 1277 416 2 1490 2389 174 16 16 chr2 118647770 118648207 -63099880 - ORR1A3-int LTR MaLR -1526 437 1 2 1490 990 108 424 0 chr2 118648207 118648438 -63099649 - ORR1A3 LTR MaLR 0 329 1 2 1490 507 181 53 0 chr2 118648438 118648529 -63099558 + MTC LTR MaLR 324 419 -2 2 1490 3870 109 36 2 chr2 118649632 118650193 -63097894 + MT2B2 LTR ERVL 1 580 -4 2 1490 1377 149 106 152 chr2 118651024 118651411 -63096676 - ORR1C2 LTR MaLR -13 371 3 2 1490 2005 162 22 11 chr2 118651552 118651915 -63096172 - MYSERV6-int LTR ERVK -426 8533 8167 2 1490 4116 124 37 82 chr2 118651915 118652638 -63095449 - RMER6A LTR ERVK 0 756 53 2 1490 4116 124 37 82 chr2 118652786 118652854 -63095233 - RMER6A LTR ERVK -704 52 1 2 1490 718 106 19 96 chr2 118652868 118652974 -63095113 - MYSERV6-int LTR ERVK -1002 7957 7863 2 1490 1816 220 93 28 chr2 118652974 118653469 -63094618 - RLTR11A2 LTR ERVK 0 527 1 2 1490 718 164 14 43 chr2 118653469 118653580 -63094507 - MYSERV6-int LTR ERVK -1097 7862 7813 2 1490 355 319 31 59 chr2 118653580 118653782 -63094305 - RMER4A LTR ERVK -31 554 251 2 1490 520 283 68 25 chr2 118653782 118653945 -63094142 - MYSERV6-int LTR ERVK -1424 5126 4957 2 1490 2757 138 26 38 chr2 118653982 118654485 -63093602 - RLTR16 LTR ERVK -4 501 5 2 1490 259 281 199 48 chr2 118654796 118655002 -63093085 - RLTR24 LTR ERV1 0 529 293 2 1490 308 243 28 14 chr2 118655157 118655228 -63092859 - RLTR24 LTR ERV1 -457 72 1 2 1490 2595 153 93 2 chr2 118660544 118661008 -63087079 - RLTR19C LTR ERVK 0 506 1 2 1490 233 238 143 0 chr2 118662055 118662118 -63085969 - RLTR20A1 LTR ERVK -400 151 80 2 1490 390 190 37 37 chr2 118662213 118662225 -63085862 - MT2B LTR ERVL -353 248 167 2 1490 1876 138 30 20 chr2 118664994 118665298 -63082789 - MTB_Mm LTR MaLR -100 307 1 2 1490 608 307 67 4 chr2 118666173 118666412 -63081675 - RLTR42-int LTR ERVK -4122 1400 1147 2 1490 551 188 20 0 chr2 118666492 118666593 -63081494 + ORR1C2 LTR MaLR 281 383 -1 2 1490 2861 151 91 61 chr2 118667321 118667445 -63080642 + RMER19C LTR ERVK 1 104 -507 2 1490 2861 151 91 61 chr2 118667503 118667971 -63080116 + RMER19C LTR ERVK 105 611 0 2 1490 302 311 113 0 chr2 118668741 118668847 -63079240 - RMER5 LTR ERV1 -17 517 400 2 1490 769 194 52 13 chr2 118669575 118669770 -63078317 - ORR1D2 LTR MaLR -154 220 1 2 1490 1803 142 9 139 chr2 118670256 118670688 -63077399 + RLTR14 LTR ERV1 3 378 -4 2 1490 592 306 41 58 chr2 118672594 118672837 -63075250 - ORR1D2 LTR MaLR -54 316 78 2 1490 773 227 6 35 chr2 118673108 118673277 -63074810 - ORR1E LTR MaLR -195 164 1 2 1490 2019 228 116 37 chr2 118673277 118673819 -63074268 - ORR1E-int LTR MaLR 0 1370 786 2 1490 292 269 58 16 chr2 118673796 118673917 -63074170 - ORR1E LTR MaLR -74 296 171 2 1490 362 241 98 49 chr2 118674497 118674619 -63073468 + RMER15 LTR ERVL 336 463 -112 2 1490 329 229 137 70 chr2 118674641 118674941 -63073146 - RMER10A LTR ERVL -52 390 71 2 1490 256 289 60 12 chr2 118674975 118675059 -63073028 + RMER15 LTR ERVL 452 539 -36 2 1490 1578 204 92 112 chr2 118677571 118677887 -63070200 - RLTR21 LTR ERVK 0 1572 1305 2 1490 1578 204 92 112 chr2 118677935 118678109 -63069978 - RLTR21 LTR ERVK -268 1304 1092 2 1490 385 169 0 78 chr2 118678182 118678259 -63069828 - RLTR21 LTR ERVK -177 1227 1157 2 1490 390 202 19 57 chr2 118678283 118678322 -63069765 - RLTR21 LTR ERVK -149 1255 1217 2 1490 2496 157 64 43 chr2 118678363 118678888 -63069199 - RLTR21 LTR ERVK -333 1239 717 2 1490 292 361 65 38 chr2 118680911 118681095 -63066992 - LTR73 LTR ERV1 -376 196 8 3 1490 236 329 44 106 chr2 118681759 118681939 -63066148 + MT2B2 LTR ERVL 171 339 -245 3 1490 504 305 67 126 chr2 118683182 118683523 -63064564 + MTE2a LTR MaLR 15 335 -44 3 1490 285 219 15 15 chr2 118683554 118683619 -63064468 + MTE2a LTR MaLR 315 379 0 3 1490 533 277 147 54 chr2 118686576 118686866 -63061221 - RMER5 LTR ERV1 -8 526 208 3 1490 300 335 48 39 chr2 118686983 118687191 -63060896 - RMER5 LTR ERV1 -309 225 16 3 1490 5184 175 37 30 chr2 118689120 118690099 -63057988 - MTC-int LTR MaLR -272 986 1 3 1490 2099 176 13 96 chr2 118690099 118690422 -63057665 - MTC LTR MaLR 0 421 107 3 1490 2099 176 13 96 chr2 118690613 118690647 -63057440 - MTC LTR MaLR -315 106 97 3 1490 2099 176 13 96 chr2 118690833 118690933 -63057154 - MTC LTR MaLR -325 96 1 3 1490 509 178 9 0 chr2 118694173 118694280 -63053807 - MurERV4-int LTR ERVK -5054 206 99 3 1490 1849 162 135 21 chr2 118694619 118694997 -63053090 - MTC LTR MaLR 0 421 1 3 1490 240 264 134 67 chr2 118697845 118697979 -63050108 + RLTR25B LTR ERVK 360 502 -526 3 1490 332 317 7 84 chr2 118707776 118707836 -63040251 - MT2B LTR ERVL -445 156 109 3 1490 385 204 67 120 chr2 118716529 118716679 -63031408 + MT2B LTR ERVL 137 278 -323 4 1490 574 104 84 9 chr2 118724265 118724299 -63023788 + RLTR11A LTR ERVK 414 447 -81 4 1490 574 104 84 9 chr2 118724389 118724461 -63023626 + RLTR11A LTR ERVK 448 528 0 4 1491 239 248 145 34 chr2 118754534 118754549 -62993538 + MT2B LTR ERVL 149 176 -425 4 1491 2396 152 106 14 chr2 118768875 118769357 -62978730 + RMER19B LTR ERVK 1 526 -376 5 1491 1609 146 3 45 chr2 118769352 118769639 -62978448 + RMER19B LTR ERVK 628 902 0 5 1491 326 210 11 108 chr2 118771708 118771721 -62976366 + MT2B LTR ERVL 156 194 -390 5 1491 326 210 11 108 chr2 118771810 118771834 -62976253 + MT2B LTR ERVL 195 276 -308 5 1491 889 190 0 6 chr2 118772788 118772947 -62975140 - MTC LTR MaLR -17 404 247 5 1491 3032 154 30 9 chr2 118773130 118773694 -62974393 - MTC-int LTR MaLR -682 576 1 5 1491 1288 170 87 65 chr2 118773694 118773913 -62974174 - MTC LTR MaLR 0 421 210 5 1491 1288 170 87 65 chr2 118774060 118774149 -62973938 - MTC LTR MaLR -212 209 106 5 1491 500 188 21 0 chr2 118775428 118775524 -62972563 - MTC LTR MaLR -323 98 1 5 1491 257 250 41 74 chr2 118777998 118778119 -62969968 - MTEa LTR MaLR -59 320 204 5 1491 2169 90 55 87 chr2 118778909 118779275 -62968812 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 41 5 1491 502 302 64 96 chr2 118782848 118783222 -62964865 + MLT2B1 LTR ERVL 103 567 0 5 1491 473 328 138 64 chr2 118791879 118792286 -62955801 - MLT1J2 LTR MaLR -8 440 4 5 1491 953 295 29 26 chr2 118793014 118793327 -62954760 + ORR1D2 LTR MaLR 3 316 -54 5 1491 3208 118 58 94 chr2 118795322 118795920 -62952167 + RLTR20A2 LTR ERVK 2 578 0 5 1491 362 313 107 61 chr2 118805356 118805666 -62942421 - MLT1I LTR MaLR -52 359 36 6 1491 343 239 20 71 chr2 118805984 118805997 -62942090 + MT2B2 LTR ERVL 181 250 -334 6 1491 279 266 84 163 chr2 118806972 118807058 -62941029 - MT2B2 LTR ERVL -211 373 188 6 1491 342 206 110 0 chr2 118807417 118807490 -62940597 + MTD LTR MaLR 115 195 -224 6 1491 1755 136 166 0 chr2 118807519 118807781 -62940306 + ORR1B2 LTR MaLR 1 313 -54 6 1491 2164 160 61 37 chr2 118807781 118808189 -62939898 - MTC LTR MaLR -3 418 1 6 1491 1109 197 69 0 chr2 118808189 118808410 -62939677 + MTD LTR MaLR 183 419 0 6 1491 1909 147 6 59 chr2 118809045 118809384 -62938703 + ORR1A4 LTR MaLR 1 321 -8 6 1491 286 244 141 0 chr2 118809388 118809466 -62938621 - MT2B LTR ERVL -361 240 152 6 1491 231 254 93 107 chr2 118809759 118809909 -62938178 + ORR1C1 LTR MaLR 227 374 -4 6 1491 2400 118 48 43 chr2 118811775 118812123 -62935964 - MTC LTR MaLR 0 421 81 6 1491 2400 118 48 43 chr2 118812320 118812387 -62935700 - MTC LTR MaLR -341 80 4 6 1491 319 284 52 10 chr2 118812831 118812927 -62935160 + LTR82A LTR ERVL 164 263 -609 6 1491 1551 194 116 71 chr2 118812941 118813319 -62934768 - MTD LTR MaLR -13 406 12 6 1491 2584 106 20 42 chr2 118813366 118813769 -62934318 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 6 1491 2033 168 25 30 chr2 118816162 118816524 -62931563 + ORR1D1 LTR MaLR 15 374 0 6 1491 936 286 76 32 chr2 118820674 118821017 -62927070 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 8 6 1491 314 278 55 119 chr2 118829239 118829492 -62918595 - ORR1E LTR MaLR -26 333 97 7 1491 1418 217 147 97 chr2 118834826 118835331 -62912756 + MT2A LTR ERVL 1 530 -3 7 1491 3610 122 80 54 chr2 118836512 118836972 -62911115 - RMER6A LTR ERVK 0 756 291 7 1491 4303 80 3 16 chr2 118836972 118837542 -62910545 + RMER2 LTR ERV1 1 563 -4 7 1491 3610 122 80 54 chr2 118837542 118837769 -62910318 - RMER6A LTR ERVK -466 290 42 7 1491 3610 122 80 54 chr2 118837839 118837887 -62910200 - RMER6A LTR ERVK -715 41 1 7 1491 651 286 40 13 chr2 118839895 118840122 -62907965 - MLT1G1 LTR MaLR -346 233 1 7 1491 883 152 55 0 chr2 118846870 118847035 -62901052 + ORR1D2-int LTR MaLR 1197 1370 0 7 1491 1784 194 24 40 chr2 118847036 118847407 -62900680 + ORR1D2 LTR MaLR 1 365 -5 7 1491 390 243 124 33 chr2 118849720 118849873 -62898214 + RMER15 LTR ERVL 394 560 -15 7 1491 1006 198 196 70 chr2 118851937 118852268 -62895819 + ORR1D1 LTR MaLR 1 373 -1 7 1491 236 367 18 0 chr2 118859303 118859412 -62888675 + MLT1N2 LTR MaLR 445 555 -7 7 1491 916 138 121 142 chr2 118867382 118867672 -62880415 - RLTR45-int LTR ERVK -4881 2363 2092 7 1491 294 277 52 83 chr2 118867832 118868025 -62880062 - RLTR45-int LTR ERVK -3081 233 47 7 1491 2335 116 63 3 chr2 118868067 118868414 -62879673 - RLTR9A LTR ERVK 0 368 1 8 1491 473 222 86 29 chr2 118869330 118869469 -62878618 - MTD LTR MaLR 0 419 273 8 1491 295 229 9 119 chr2 118870561 118870670 -62877417 - MT2B LTR ERVL -350 251 155 8 1491 772 185 128 39 chr2 118873556 118873848 -62874239 + ORR1C2 LTR MaLR 9 384 0 8 1491 1090 162 72 38 chr2 118880595 118880858 -62867229 - RLTR22_Mur LTR ERVK -3 1845 1574 8 1491 3817 114 63 106 chr2 118881095 118881690 -62866397 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1043 805 171 8 1491 3817 114 63 106 chr2 118881869 118881885 -62866202 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1678 170 170 8 1491 3817 114 63 106 chr2 118881962 118882106 -62865981 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1678 170 74 8 186 3817 114 63 106 chr2 118882242 118882325 -62865762 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1775 73 1 8 1492 225 209 0 0 chr2 118882340 118882352 -62865735 + MT2B2 LTR ERVL 156 167 -417 8 1492 485 113 0 0 chr2 118890280 118890351 -62857736 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 300 8 1492 1618 193 89 20 chr2 118891194 118891586 -62856501 - MTD LTR MaLR 0 419 1 8 1492 244 349 11 23 chr2 118908364 118908452 -62839635 + RLTR25B LTR ERVK 442 528 -500 9 1492 232 227 43 43 chr2 118924314 118924383 -62823704 - MT2B LTR ERVL -365 236 168 1 1492 428 300 16 16 chr2 118927841 118927963 -62820124 - MLT1C LTR MaLR 0 467 346 1 1492 293 217 63 45 chr2 118931340 118931451 -62816636 - RLTR25B LTR ERVK -526 502 390 1 1492 1888 193 89 184 chr2 118933854 118934034 -62814053 - RMER21A LTR ERV1 -283 664 506 1 1492 1888 193 89 184 chr2 118934182 118934706 -62813381 - RMER21A LTR ERV1 -442 505 27 1 1492 841 205 40 14 chr2 118935006 118935229 -62812858 - MYSERV-int LTR ERVK 0 6550 6322 1 1492 331 285 64 83 chr2 118935411 118935517 -62812570 + MLT1D LTR MaLR 1 108 -397 1 1492 331 285 64 83 chr2 118935618 118935668 -62812419 + MLT1D LTR MaLR 109 154 -351 1 1492 1757 200 143 30 chr2 118943588 118944062 -62804025 + RLTR12B LTR ERVK 1 528 0 1 1492 247 300 40 100 chr2 118948288 118948307 -62799780 - MT2B2 LTR ERVL -336 248 201 1 1492 247 300 40 100 chr2 118948372 118948388 -62799699 - MT2B2 LTR ERVL -336 200 155 1 1492 227 262 126 36 chr2 118956442 118956553 -62791534 - LTR39 LTR ERV1 -349 434 314 1 1492 238 283 9 83 chr2 118956616 118956630 -62791457 + MT2B LTR ERVL 152 157 -444 1 1492 295 204 50 120 chr2 118958562 118958588 -62789499 + MT2B LTR ERVL 151 213 -388 1 1492 232 265 123 51 chr2 118958958 118959136 -62788951 - RLTR13D3 LTR ERVK -613 195 1 1 1492 1147 182 86 36 chr2 118990443 118990765 -62757322 + RLTR20A2 LTR ERVK 1 308 -226 1 1492 353 229 14 28 chr2 118990825 118990897 -62757190 + RLTR20A2 LTR ERVK 445 515 -19 1 1492 291 158 0 274 chr2 118992317 118992430 -62755657 - MTE2a LTR MaLR -14 365 284 1 1492 600 211 50 72 chr2 118995954 118996278 -62751809 - ORR1D1 LTR MaLR 0 384 77 1 1492 421 230 11 22 chr2 118996478 118996567 -62751520 - ORR1D1 LTR MaLR -288 90 3 1 1492 1570 178 50 16 chr2 118996567 118996885 -62751202 - ORR1D1 LTR MaLR -45 329 1 1 1492 1561 137 372 30 chr2 119003380 119003816 -62744271 + RMER4B LTR ERVK 1 585 0 6 1492 1794 174 72 20 chr2 119003874 119004219 -62743868 + ORR1D1 LTR MaLR 11 373 -1 7 1492 4079 186 48 106 chr2 119007092 119007468 -62740619 + MYSERV6-int LTR ERVK 7848 8214 -745 1 1492 4079 186 48 106 chr2 119007648 119007677 -62740410 + MYSERV6-int LTR ERVK 8215 8227 -732 1 1492 4079 186 48 106 chr2 119007864 119008637 -62739450 + MYSERV6-int LTR ERVK 8228 8958 -1 1 1492 1134 218 236 60 chr2 119008646 119009130 -62738957 + RMER4B LTR ERVK 17 585 0 1 1492 269 317 33 99 chr2 119012997 119013179 -62734908 - RLTR25B LTR ERVK -648 380 211 2 1493 1113 272 190 35 chr2 119026490 119027091 -62720996 + RMER13A LTR ERVK 107 800 -60 8 1493 764 149 56 7 chr2 119030202 119030353 -62717734 - ORR1D2 LTR MaLR -224 146 1 9 1493 2699 179 48 2 chr2 119038740 119039265 -62708822 - RMER4B LTR ERVK -53 532 4 1 1493 859 191 81 108 chr2 119041467 119041847 -62706240 + RMER4A LTR ERVK 1 466 0 1 1493 2638 190 58 30 chr2 119046142 119046204 -62701883 + RMER19C LTR ERVK 5 55 -556 1 1493 2638 190 58 30 chr2 119046351 119046879 -62701208 + RMER19C LTR ERVK 56 611 0 1 1493 3335 40 2 10 chr2 119049016 119049415 -62698672 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 1493 1570 173 10 164 chr2 119051702 119052117 -62695970 + RMER19B LTR ERVK 1 351 -551 1 1493 1450 199 184 3 chr2 119057661 119058004 -62690083 - MTD LTR MaLR -14 405 1 1 1493 271 259 48 104 chr2 119058336 119058367 -62689720 + MT2B2 LTR ERVL 134 157 -427 1 1493 936 211 65 14 chr2 119058807 119059026 -62689061 - ORR1D1 LTR MaLR -162 212 1 1 1493 403 272 72 72 chr2 119060202 119060396 -62687691 - MLT1A1 LTR MaLR -214 194 1 1 1493 227 315 101 0 chr2 119070177 119070266 -62677821 - MLT1D LTR MaLR -364 141 44 2 1493 836 218 182 9 chr2 119080066 119080349 -62667738 + MTD LTR MaLR 1 323 -98 2 1493 3199 43 9 59 chr2 119083876 119084068 -62664019 + MTB LTR MaLR 1 195 -205 2 1493 3199 43 9 59 chr2 119084207 119084222 -62663865 + MTB LTR MaLR 196 196 -204 2 1493 3199 43 9 59 chr2 119084403 119084615 -62663472 + MTB LTR MaLR 196 400 0 2 1493 239 309 74 86 chr2 119100592 119100755 -62647332 - MT2B LTR ERVL -316 285 125 3 1493 240 303 46 112 chr2 119103014 119103211 -62644876 + RLTR25B LTR ERVK 357 540 -488 3 1493 549 214 7 85 chr2 119106754 119106804 -62641283 + BGLII_B LTR ERVK 301 342 -99 3 1493 549 214 7 85 chr2 119107033 119107135 -62640952 + BGLII_B LTR ERVK 343 441 0 3 1493 1054 294 56 41 chr2 119108479 119108873 -62639214 - MTD LTR MaLR -1 418 19 3 1493 2600 258 61 18 chr2 119108887 119109538 -62638549 + ORR1D-int LTR MaLR 505 1183 -187 3 1493 2331 194 65 81 chr2 119133006 119133588 -62614499 - RMER15 LTR ERVL 0 575 3 4 1493 3138 131 33 31 chr2 119133926 119134447 -62613640 + RLTR28 LTR ERVL 1 522 -2 4 1494 2194 106 45 0 chr2 119166115 119166427 -62581660 + ORR1A3 LTR MaLR 1 326 0 4 1494 915 295 39 0 chr2 119167421 119167655 -62580432 - ORR1D2 LTR MaLR -127 243 1 4 1494 1241 213 70 61 chr2 119168264 119168551 -62579536 + ORR1D1 LTR MaLR 15 304 -70 4 1494 1241 213 70 61 chr2 119168703 119168760 -62579327 + ORR1D1 LTR MaLR 305 362 -12 4 1494 764 287 92 8 chr2 119169150 119169399 -62578688 - MTE2a LTR MaLR -35 344 75 4 1494 2193 175 143 46 chr2 119172059 119172267 -62575820 - RMER4B LTR ERVK -6 579 337 5 1494 2193 175 143 46 chr2 119172413 119172730 -62575357 - RMER4B LTR ERVK -249 336 3 5 1494 304 222 75 59 chr2 119183067 119183106 -62564981 + ORR1B1-int LTR MaLR 565 601 -908 5 1494 304 222 75 59 chr2 119183130 119183167 -62564920 + ORR1B1-int LTR MaLR 602 644 -865 5 1494 426 220 9 98 chr2 119183501 119183544 -62564543 - MT2B LTR ERVL -430 154 116 5 1494 1328 229 36 51 chr2 119184067 119184532 -62563555 + RMER19A LTR ERVK 175 736 -1 5 1494 232 212 56 70 chr2 119185572 119185643 -62562444 - RMER10A LTR ERVL -355 87 18 5 1494 225 294 94 63 chr2 119205735 119205862 -62542225 - RMER21A LTR ERV1 -118 829 699 5 1494 313 175 33 111 chr2 119207162 119207252 -62540835 - MT2B LTR ERVL -364 237 155 5 1494 1941 187 91 82 chr2 119210104 119210640 -62537447 - RLTR20A LTR ERVK 0 541 1 6 1494 1711 173 126 30 chr2 119210644 119211008 -62537079 + MTB_Mm LTR MaLR 1 399 -8 6 1494 355 250 0 118 chr2 119215848 119215984 -62532103 - MT2B LTR ERVL -347 254 135 6 1494 1865 134 185 65 chr2 119217282 119217698 -62530389 + RMER4A LTR ERVK 1 466 0 6 1494 451 113 25 185 chr2 119217729 119217848 -62530239 + RMER4A LTR ERVK 367 466 0 6 1494 1647 97 274 3 chr2 119227438 119227748 -62520339 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 6 1494 1478 211 22 43 chr2 119233074 119233396 -62514691 + ORR1D1 LTR MaLR 55 369 -5 6 1494 1391 150 46 61 chr2 119234745 119234795 -62513292 + MTC LTR MaLR 1 45 -376 6 1494 1391 167 80 61 chr2 119234979 119235292 -62512795 + MTC LTR MaLR 46 397 -10 6 1494 929 252 90 23 chr2 119254530 119254640 -62493447 + MTD LTR MaLR 1 109 -310 7 1494 929 252 90 23 chr2 119254782 119255061 -62493026 + MTD LTR MaLR 110 415 -4 7 1494 1883 166 87 22 chr2 119255956 119256326 -62491761 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 7 1494 257 104 42 0 chr2 119264480 119264528 -62483559 + MTD LTR MaLR 47 96 -325 7 1494 1006 268 76 30 chr2 119264744 119265059 -62483028 + MTD LTR MaLR 52 419 0 7 1495 262 244 63 0 chr2 119283339 119283466 -62464621 - ORR1B1-int LTR MaLR -755 754 620 8 1495 1080 233 103 24 chr2 119287790 119288120 -62459967 - ORR1C2 LTR MaLR -6 378 23 8 1495 674 160 8 0 chr2 119289719 119289844 -62458243 + RLTR11B LTR ERVK 1 126 -327 8 1495 1847 164 201 18 chr2 119289848 119290290 -62457797 + RLTR11A2 LTR ERVK 4 526 -1 8 1495 316 211 20 82 chr2 119290781 119290793 -62457294 + MT2B LTR ERVL 152 157 -444 8 1495 3371 56 18 92 chr2 119307603 119308116 -62439971 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 475 0 9 1495 571 108 5 43 chr2 119313383 119313567 -62434520 + RMER17D LTR ERVK 318 494 -395 9 1495 1190 239 88 6 chr2 119316091 119316419 -62431668 - ORR1D2 LTR MaLR -2 368 14 9 1495 254 196 0 19 chr2 119317103 119317155 -62430932 - RMER10B LTR ERVL -347 51 1 9 1495 1328 136 7 19 chr2 119317687 119317952 -62430135 - MTC LTR MaLR -33 388 18 9 1495 294 309 59 24 chr2 119325414 119325584 -62422503 - MERVL-int LTR ERVL -2370 3115 2934 9 1495 4301 70 21 56 chr2 119325644 119326252 -62421835 + LTRIS_Mus LTR ERV1 1 587 0 9 1495 342 215 0 0 chr2 119326915 119326984 -62421103 + MTE2b LTR MaLR 1 69 -310 9 1495 987 299 70 70 chr2 119327414 119327870 -62420217 + MT2A LTR ERVL 78 533 0 1 1495 990 282 29 3 chr2 119336716 119337032 -62411055 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 47 1 1495 1939 130 141 6 chr2 119358270 119358603 -62389484 + RLTR14 LTR ERV1 3 380 -2 1 1495 1457 169 95 15 chr2 119359734 119360059 -62388028 - ORR1C2 LTR MaLR -10 374 24 1 1495 709 281 79 41 chr2 119361108 119361236 -62386851 + MT2A LTR ERVL 105 246 -287 1 1495 709 281 79 41 chr2 119361265 119361452 -62386635 + MT2A LTR ERVL 247 432 -101 1 1495 273 214 8 169 chr2 119370130 119370248 -62377839 - MT2B LTR ERVL -337 264 166 1 1495 270 306 0 14 chr2 119370234 119370307 -62377780 - MTC LTR MaLR -238 183 112 1 1495 228 248 24 24 chr2 119377447 119377571 -62370516 + ORR1B1-int LTR MaLR 631 754 -755 1 1495 2842 166 35 14 chr2 119381183 119381733 -62366354 + RLTR31_Mm LTR ERVK 1 561 0 1 1495 1410 209 79 72 chr2 119392851 119393121 -62354966 - MTD LTR MaLR -25 394 99 1 1495 1410 209 79 72 chr2 119393294 119393346 -62354741 - MTD LTR MaLR -321 98 68 1 1495 1410 209 79 72 chr2 119393538 119393604 -62354483 - MTD LTR MaLR -352 67 3 1 1495 270 245 0 125 chr2 119406142 119406254 -62341833 + MT2B LTR ERVL 153 250 -351 1 1496 1142 240 140 11 chr2 119416523 119416894 -62331193 - MTD LTR MaLR 0 419 1 1 1496 857 218 10 5 chr2 119421688 119421886 -62326201 + ORR1D1 LTR MaLR 6 204 -170 1 1496 303 235 0 3 chr2 119421893 119421966 -62326121 + ORR1D1 LTR MaLR 311 384 0 1 1496 1389 157 121 25 chr2 119422811 119423125 -62324962 + ORR1B2 LTR MaLR 16 359 -8 1 1496 248 290 53 11 chr2 119424517 119424611 -62323476 - MLT1C LTR MaLR -10 457 360 1 1496 3587 130 59 64 chr2 119436052 119436105 -62311982 + RMER6A LTR ERVK 1 48 -708 1 1496 3587 130 59 64 chr2 119436128 119436820 -62311267 + RMER6A LTR ERVK 49 742 -14 1 1496 332 190 12 60 chr2 119437880 119437964 -62310123 + MT2B LTR ERVL 185 264 -337 1 1496 1077 143 108 0 chr2 119440297 119440520 -62307567 + RMER6B LTR ERVK 1 247 -214 1 1496 235 297 36 98 chr2 119447294 119447406 -62300681 - RMER10B LTR ERVL -2 396 292 1 1496 301 248 112 20 chr2 119457013 119457165 -62290922 - MLT1B LTR MaLR -223 167 2 1 1496 237 211 11 156 chr2 119457522 119457612 -62290475 + MT2B LTR ERVL 180 256 -345 1 1496 608 226 208 59 chr2 119462502 119462873 -62285214 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 5 1 1496 281 275 108 21 chr2 119462967 119463060 -62285027 - MT2B LTR ERVL -341 260 160 1 1496 1758 169 93 19 chr2 119464745 119465120 -62282967 - MTC LTR MaLR -18 403 1 1 1496 286 247 20 40 chr2 119470538 119470639 -62277448 - MTE2b LTR MaLR -63 316 218 1 1496 234 279 61 37 chr2 119473035 119473117 -62274970 - MLT1A1 LTR MaLR -6 402 319 1 1496 1398 184 87 25 chr2 119476434 119476757 -62271330 - ORR1D1 LTR MaLR -29 345 3 1 1496 1155 172 231 10 chr2 119478079 119478378 -62269709 - RLTR33 LTR ERVK -138 540 176 1 1496 330 82 14 116 chr2 119479759 119479828 -62268259 + RLTR25B LTR ERVK 710 771 -257 1 1496 565 181 45 8 chr2 119479826 119479960 -62268127 + RLTR25B LTR ERVK 890 1028 0 1 1496 3168 14 0 0 chr2 119480433 119480779 -62267308 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 1 1496 2148 154 65 8 chr2 119483273 119483671 -62264416 + MTC LTR MaLR 1 421 0 1 1496 4634 129 35 27 chr2 119492671 119493226 -62254861 + ORR1A2-int LTR MaLR 1117 1690 -273 1 1496 4634 129 35 27 chr2 119493416 119493552 -62254535 + ORR1A2-int LTR MaLR 1691 1818 -145 1 1496 4634 129 35 27 chr2 119493695 119493843 -62254244 + ORR1A2-int LTR MaLR 1819 1963 0 1 1496 2487 62 18 59 chr2 119493843 119494184 -62253903 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 1 1496 620 186 159 6 chr2 119494240 119494397 -62253690 + ORR1B1 LTR MaLR 1 181 -213 1 1496 362 127 0 0 chr2 119495792 119495847 -62252240 + ORR1B1 LTR MaLR 340 394 0 1 1496 1817 123 64 16 chr2 119507339 119507653 -62240434 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 2 1496 1176 261 73 45 chr2 119529015 119529372 -62218715 - MTE2b LTR MaLR -12 367 1 9 1496 454 276 34 41 chr2 119531673 119531880 -62216207 - RLTR12B LTR ERVK -250 278 81 9 1496 1835 136 74 3 chr2 119535693 119536018 -62212069 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 47 1 1497 301 234 12 47 chr2 119539286 119539348 -62208739 - RMER15 LTR ERVL -86 489 430 1 1497 1189 234 174 82 chr2 119539348 119539836 -62208251 - MT2A LTR ERVL 0 533 1 1 1497 301 234 12 47 chr2 119539836 119539858 -62208229 - RMER15 LTR ERVL -146 429 408 1 1497 432 308 253 0 chr2 119542249 119542522 -62205565 - MER21B LTR ERV1 -41 822 481 1 1497 1410 221 116 93 chr2 119542659 119543142 -62204945 - MER21B LTR ERV1 -369 494 1 1 1497 1062 246 124 30 chr2 119546076 119546407 -62201680 - MTD LTR MaLR -57 362 1 1 1497 465 266 99 17 chr2 119588003 119588175 -62159912 + RMER20B LTR ERVK 178 363 -264 2 1497 276 206 71 29 chr2 119607855 119607925 -62140162 - RLTR25A LTR ERVK -531 572 500 2 1497 1619 135 288 3 chr2 119608029 119608355 -62139732 + MTC LTR MaLR 1 419 -2 2 1497 458 151 11 21 chr2 119608488 119608583 -62139504 - MTC LTR MaLR -106 315 222 2 1497 3523 113 151 33 chr2 119611625 119611758 -62136329 + RLTR33 LTR ERVK 1 164 -514 3 1497 3471 113 151 33 chr2 119611957 119612427 -62135660 + RLTR33 LTR ERVK 165 675 -3 3 1497 277 239 186 52 chr2 119614163 119614260 -62133827 - MT2B LTR ERVL -337 264 155 3 1497 389 212 22 56 chr2 119614293 119614383 -62133704 + MT2B LTR ERVL 178 264 -337 3 1497 2731 133 73 11 chr2 119618523 119618973 -62129114 - RLTR20A2 LTR ERVK -98 480 3 3 1497 425 262 7 91 chr2 119620979 119621122 -62126965 - MT2B LTR ERVL -325 276 146 3 1497 3499 25 5 0 chr2 119621360 119621754 -62126333 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 1497 412 149 0 0 chr2 119648228 119648295 -62099792 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 462 4 1497 325 283 144 70 chr2 119650648 119650891 -62097196 + MLT1D LTR MaLR 51 311 -194 4 1497 2907 56 50 5 chr2 119650927 119651306 -62096781 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 1497 2923 147 60 123 chr2 119651388 119651738 -62096349 + RMER6C LTR ERVK 1 339 -351 4 1497 2923 147 60 123 chr2 119652077 119652242 -62095845 + RMER6C LTR ERVK 340 484 -206 4 1497 2923 147 60 123 chr2 119652389 119652607 -62095480 + RMER6C LTR ERVK 485 690 0 4 1497 1374 209 179 25 chr2 119652776 119653134 -62094953 - RLTR24 LTR ERV1 -2 527 115 4 1497 245 259 0 0 chr2 119653193 119653251 -62094836 - RLTR24 LTR ERV1 -471 58 1 4 1497 792 195 8 34 chr2 119660176 119660293 -62087794 + MTD LTR MaLR 1 226 -193 4 1497 792 196 144 16 chr2 119660479 119660644 -62087443 + MTD LTR MaLR 227 417 -2 4 1497 977 79 108 0 chr2 119665156 119665295 -62082792 + MT2B LTR ERVL 1 154 -447 4 1497 273 169 24 134 chr2 119665455 119665619 -62082468 + RMER17A LTR ERVK 340 485 -266 4 1497 1012 179 113 127 chr2 119665675 119665776 -62082311 + ORR1D1 LTR MaLR 1 86 -288 4 1497 1012 179 113 127 chr2 119665965 119666163 -62081924 + ORR1D1 LTR MaLR 87 296 -78 4 1498 295 111 0 0 chr2 119669273 119669318 -62078769 - ORR1A2 LTR MaLR 0 326 282 5 1498 1384 169 15 93 chr2 119669443 119669775 -62078312 + RLTR41 LTR ERV1 91 396 -50 5 1498 1975 88 0 17 chr2 119670246 119670428 -62077659 - ORR1A2 LTR MaLR -42 285 107 5 1498 1975 88 0 17 chr2 119670565 119670672 -62077415 - ORR1A2 LTR MaLR -221 106 1 5 1498 2520 140 107 14 chr2 119673791 119674270 -62073817 - RMER15 LTR ERVL 0 575 52 5 1498 1625 160 71 39 chr2 119674270 119674384 -62073703 - MTC LTR MaLR 0 421 299 5 1498 3457 40 0 0 chr2 119674384 119674780 -62073307 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 1498 1625 160 71 39 chr2 119674780 119675003 -62073084 - MTC LTR MaLR -123 298 73 5 1498 1766 145 56 131 chr2 119675925 119676256 -62071831 + ORR1C2 LTR MaLR 3 309 -75 5 1498 1766 145 56 131 chr2 119676441 119676522 -62071565 + ORR1C2 LTR MaLR 310 384 0 5 1498 5138 204 49 61 chr2 119676522 119677057 -62071030 + ORR1C2-int LTR MaLR 1 525 -845 5 1498 5138 204 49 61 chr2 119677245 119677805 -62070282 + ORR1C2-int LTR MaLR 526 1092 -278 5 1498 5138 204 49 61 chr2 119677843 119678002 -62070085 + ORR1C2-int LTR MaLR 1093 1231 -139 5 1498 5138 204 49 61 chr2 119678509 119678639 -62069448 + ORR1C2-int LTR MaLR 1232 1370 0 5 1498 1056 85 12 0 chr2 119678639 119678803 -62069284 + ORR1C2 LTR MaLR 1 166 -218 5 1498 1037 163 72 36 chr2 119678968 119679191 -62068896 + ORR1C2 LTR MaLR 151 381 -3 5 1498 2800 132 12 9 chr2 119681110 119681539 -62066548 + RLTR23 LTR ERV1 1 430 0 5 1498 594 237 130 19 chr2 119683285 119683500 -62064587 + RLTR12B LTR ERVK 47 285 -243 5 1498 234 111 0 0 chr2 119685851 119685887 -62062200 - RMER15 LTR ERVL -3 572 537 5 1498 3633 242 126 117 chr2 119687279 119689084 -62059003 + MYSERV-int LTR ERVK 3772 5575 -975 5 1498 3633 242 126 117 chr2 119689287 119689482 -62058605 + MYSERV-int LTR ERVK 5576 5785 -765 5 1498 3633 242 126 117 chr2 119689669 119689839 -62058248 + MYSERV-int LTR ERVK 5786 5961 -589 5 1498 1087 148 69 0 chr2 119689841 119690043 -62058044 + RMER4B LTR ERVK 370 585 0 5 1498 441 253 135 0 chr2 119691635 119691805 -62056282 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 178 5 1498 296 78 98 0 chr2 119691932 119691983 -62056104 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 312 5 1498 304 51 0 0 chr2 119693718 119693757 -62054330 + MTC LTR MaLR 329 367 -54 6 1498 600 349 49 25 chr2 119694306 119694632 -62053455 - MLT1I LTR MaLR -22 389 56 6 1498 3493 20 2 10 chr2 119709611 119710010 -62038077 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 1498 4849 20 3 0 chr2 119710010 119710619 -62037468 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 488 6 1498 1645 214 84 5 chr2 119712230 119712601 -62035486 - MTD LTR MaLR -14 405 6 6 1498 235 274 17 102 chr2 119722264 119722382 -62025705 - MT2B LTR ERVL -338 263 156 7 1498 263 200 28 28 chr2 119726471 119726543 -62021544 + RMER21B LTR ERV1 88 159 -683 7 1498 260 254 58 29 chr2 119726604 119726673 -62021414 + RMER21B LTR ERV1 394 464 -378 7 1498 249 279 108 70 chr2 119735338 119735496 -62012591 - MT2B2 LTR ERVL -326 258 95 7 1498 1047 282 22 68 chr2 119736573 119736896 -62011191 - MTEa LTR MaLR -63 316 9 7 1498 295 349 53 38 chr2 119739432 119739563 -62008524 - RMER12 LTR ERVK -470 852 720 7 1498 639 288 8 93 chr2 119746649 119746917 -62001170 - MLT1E1A LTR MaLR -4 676 432 8 1498 382 153 36 117 chr2 119754753 119754864 -61993223 - MT2B LTR ERVL -337 264 163 8 1498 230 241 0 36 chr2 119755415 119755471 -61992616 - RLTR17 LTR ERVK -1 691 638 8 1498 420 184 16 99 chr2 119755499 119755620 -61992467 - RLTR31A_Mm LTR ERVK -471 113 3 8 1498 310 228 0 124 chr2 119760625 119760730 -61987357 + MT2B LTR ERVL 148 239 -362 8 1498 458 271 23 23 chr2 119768417 119768549 -61979538 - MTEb LTR MaLR -26 353 222 8 1498 722 220 26 13 chr2 119768562 119768714 -61979373 - MTEb LTR MaLR -208 171 18 8 1498 717 160 25 0 chr2 119780698 119780817 -61967270 - MurERV4-int LTR ERVK -80 5180 5059 8 1498 3832 161 59 26 chr2 119781345 119782073 -61966014 - MurERV4-int LTR ERVK -188 5072 4321 8 1498 451 171 0 0 chr2 119782072 119782148 -61965939 - MurERV4-int LTR ERVK -2397 2863 2788 8 1498 942 142 7 0 chr2 119782257 119782405 -61965682 - MurERV4-int LTR ERVK -2992 2268 2120 8 1498 279 224 14 56 chr2 119788374 119788445 -61959642 - RLTR10-int LTR ERVK -1685 302 235 9 1498 348 257 26 85 chr2 119788450 119788603 -61959484 - RLTR10A LTR ERVK -121 290 147 9 1499 292 270 9 99 chr2 119812750 119812861 -61935226 - MT2B LTR ERVL -343 258 158 9 1499 1274 173 105 4 chr2 119819057 119819324 -61928763 - MTD LTR MaLR -65 354 61 9 1499 566 261 94 124 chr2 119827485 119827760 -61920327 - MTEa LTR MaLR -112 267 1 1 1499 960 249 173 45 chr2 119829634 119829970 -61918117 - MTEa LTR MaLR 0 379 1 1 1499 2423 255 86 39 chr2 119829970 119831387 -61916700 - MTEa-int LTR MaLR 0 1580 11 1 1499 1631 132 235 0 chr2 119831403 119831714 -61916373 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 1 1499 365 140 0 0 chr2 119831714 119831771 -61916316 - MTEa LTR MaLR -7 372 316 1 1499 524 247 198 22 chr2 119832206 119832438 -61915649 - MTEa LTR MaLR -95 284 12 1 1499 259 234 0 115 chr2 119839788 119839875 -61908212 - MER90 LTR ERV1 -306 269 193 1 1499 502 333 22 31 chr2 119839957 119839974 -61908113 - MER90 LTR ERV1 -338 237 219 1 1499 502 333 22 31 chr2 119840051 119840262 -61907825 - MER90 LTR ERV1 -357 218 12 1 1499 1179 190 285 3 chr2 119855345 119855640 -61892447 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 1 1499 267 271 8 116 chr2 119868216 119868234 -61879853 + MT2B LTR ERVL 150 154 -447 1 1499 737 250 244 23 chr2 119877777 119878084 -61870003 + MLT1B LTR MaLR 16 390 0 1 1499 292 314 42 35 chr2 119913609 119913751 -61834336 - MLT1L LTR MaLR -399 211 69 1 1499 1394 198 95 12 chr2 119920187 119920586 -61827501 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 1895 2326 0 1 1499 2720 74 34 17 chr2 119920586 119921000 -61827087 + BGLII LTR ERVK 1 421 0 1 1500 1512 160 205 6 chr2 119942086 119942437 -61805650 - MTC LTR MaLR 0 421 1 1 1500 1676 192 120 3 chr2 119946370 119946745 -61801342 + MTD LTR MaLR 1 419 0 1 1500 403 284 9 18 chr2 119965725 119965836 -61782251 - RLTR18 LTR ERVK -21 491 382 1 1500 919 257 44 24 chr2 119968037 119968332 -61779755 - RLTR18B LTR ERVK -4 508 208 1 1500 671 261 45 80 chr2 119968383 119968577 -61779510 - RLTR18 LTR ERVK -301 315 122 1 1500 671 261 45 80 chr2 119968716 119968833 -61779254 - RLTR18 LTR ERVK -495 121 15 1 1500 502 191 44 39 chr2 119986777 119986957 -61761130 + RMER17C LTR ERVK 95 275 -135 1 1500 486 268 91 7 chr2 119987820 119987963 -61760124 + MLT1J LTR MaLR 71 225 -287 1 1500 262 261 10 93 chr2 119987959 119988056 -61760031 - MT2B LTR ERVL -338 263 175 1 1500 241 327 57 51 chr2 120003144 120003302 -61744785 + LTR84b LTR ERVL 232 390 -371 9 1500 4829 120 5 12 chr2 120017348 120018077 -61730010 + RMER12 LTR ERVK 1 726 -596 4 1500 4829 213 24 13 chr2 120018227 120018369 -61729718 + RMER12 LTR ERVK 727 739 -583 4 1500 2397 197 33 66 chr2 120018373 120018448 -61729639 + MT2A LTR ERVL 8 70 -463 4 1500 2397 197 33 66 chr2 120018803 120018820 -61729267 + MT2A LTR ERVL 71 73 -460 4 1500 2397 197 33 66 chr2 120018989 120019436 -61728651 + MT2A LTR ERVL 74 533 0 4 1500 1707 210 122 11 chr2 120022152 120022528 -61725559 + MTD LTR MaLR 2 419 0 5 1500 1621 224 51 17 chr2 120040884 120041239 -61706848 + MTEa LTR MaLR 10 376 -3 8 1500 6750 33 0 0 chr2 120041335 120042145 -61705942 - MT-int LTR MaLR -76 1022 213 8 1500 2862 50 0 0 chr2 120043236 120043573 -61704514 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 0 337 1 9 1500 53843 24 15 6 chr2 120043573 120049988 -61698099 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 8 9 1500 2862 50 0 0 chr2 120049988 120050325 -61697762 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 0 337 1 9 1500 900 264 21 29 chr2 120052220 120052462 -61695625 + MTEb LTR MaLR 16 255 -124 9 1500 240 347 184 23 chr2 120053813 120053987 -61694100 + MLT1H1 LTR MaLR 207 408 -147 1 1500 570 269 132 104 chr2 120055486 120055888 -61692199 + RMER10A LTR ERVL 5 417 -25 1 1501 2002 184 30 114 chr2 120067528 120067970 -61680117 - RMER4A LTR ERVK -16 450 48 1 1501 2002 184 30 114 chr2 120068117 120068165 -61679922 - RMER4A LTR ERVK -419 47 1 1 1501 1934 171 15 67 chr2 120069535 120069937 -61678150 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 4 1 1501 425 298 144 70 chr2 120073187 120073443 -61674644 + ORR1E LTR MaLR 4 278 -81 1 1501 229 301 132 79 chr2 120076941 120077168 -61670919 - ORR1B2 LTR MaLR -81 286 48 1 1501 462 298 117 89 chr2 120080810 120081204 -61666883 + MLT1A1 LTR MaLR 1 405 -3 1 1501 431 259 32 77 chr2 120082409 120082564 -61665523 + RLTR23 LTR ERV1 283 430 0 1 1501 413 283 28 9 chr2 120085555 120085662 -61662425 - MLT1K LTR MaLR -363 232 124 1 1501 241 222 92 53 chr2 120086443 120086519 -61661568 + MLT1E1 LTR MaLR 507 585 -69 1 1501 922 288 99 19 chr2 120087743 120088108 -61659979 - MLT2D LTR ERVL -20 394 1 2 1501 2448 89 3 3 chr2 120088155 120088482 -61659605 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 2 1501 920 311 93 30 chr2 120090342 120090816 -61657271 - MER90a LTR ERV1 -1 613 110 2 1501 235 349 76 41 chr2 120094095 120094292 -61653795 + MamGypLTR2c LTR Gypsy 51 254 -814 2 1501 277 274 27 77 chr2 120107988 120108209 -61639878 + RMER17D LTR ERVK 234 443 -446 2 1501 226 329 138 40 chr2 120117142 120117316 -61630771 + MLT1K LTR MaLR 156 346 -249 2 1501 1093 195 175 91 chr2 120117485 120117674 -61630413 - MTD LTR MaLR 0 419 211 2 1501 1093 195 175 91 chr2 120117821 120118014 -61630073 - MTD LTR MaLR -209 210 5 2 1501 296 292 41 20 chr2 120119440 120119538 -61628549 - MT2B2 LTR ERVL -329 255 156 2 1501 3090 23 0 0 chr2 120124043 120124389 -61623698 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 2 1501 1685 111 133 192 chr2 120126938 120127328 -61620759 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 2 1501 459 241 104 8 chr2 120132113 120132247 -61615840 + MLT1B LTR MaLR 27 173 -217 2 1501 236 278 74 57 chr2 120132352 120132371 -61615716 + MT2B2 LTR ERVL 166 286 -298 3 1501 322 231 29 146 chr2 120132369 120132393 -61615694 + MT2B LTR ERVL 143 150 -451 3 1501 336 239 28 7 chr2 120132631 120132759 -61615328 + MLT1B LTR MaLR 189 379 -11 2 1501 328 405 0 17 chr2 120136277 120136395 -61611692 + MLT1H2 LTR MaLR 71 186 -303 3 1501 442 308 57 94 chr2 120144664 120144785 -61603302 + MTE2b LTR MaLR 2 105 -274 3 1501 442 286 375 64 chr2 120144928 120145124 -61602963 + MTE2b LTR MaLR 106 375 -4 3 1501 231 230 10 164 chr2 120148257 120148361 -61599726 - MT2B LTR ERVL -361 240 153 3 1501 416 283 38 94 chr2 120153587 120153747 -61594340 - MT2B LTR ERVL -322 279 129 3 1501 391 284 69 21 chr2 120158012 120158156 -61589931 + MLT1F LTR MaLR 184 334 -214 3 1501 690 262 76 0 chr2 120158934 120159106 -61588981 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 186 3 1501 229 344 91 65 chr2 120159031 120159230 -61588857 + MLT1F-int LTR MaLR 67 270 -1117 3 1501 860 254 44 57 chr2 120160251 120160666 -61587421 + RLTR33 LTR ERVK 175 666 -12 3 1501 2182 138 209 25 chr2 120176353 120176842 -61571245 - RMER4B LTR ERVK 0 585 7 3 1501 457 60 4 0 chr2 120180402 120180468 -61567619 + ORR1A1 LTR MaLR 251 338 -8 3 1501 928 184 84 26 chr2 120180590 120180780 -61567307 + MTD LTR MaLR 1 201 -218 3 1501 1804 176 267 12 chr2 120186036 120186455 -61561632 - RLTR12B LTR ERVK -2 526 1 4 1501 374 216 58 83 chr2 120192113 120192234 -61555853 - MT2B LTR ERVL -323 278 161 4 1501 446 351 132 12 chr2 120192327 120192661 -61555426 + MER77 LTR ERVL 214 587 -20 4 187 3271 142 42 66 chr2 120192902 120193491 -61554596 + RMER15 LTR ERVL 1 575 0 4 1502 2714 155 51 53 chr2 120194305 120194830 -61553257 + RLTR28 LTR ERVL 1 524 0 4 1502 776 123 18 0 chr2 120211219 120211333 -61536754 + ORR1B1 LTR MaLR 228 343 -51 4 1502 353 218 0 122 chr2 120216325 120216440 -61531647 - MT2B LTR ERVL -361 240 140 4 1502 1016 254 97 111 chr2 120226590 120226961 -61521126 - MTE2a LTR MaLR -12 367 2 5 1502 1437 194 193 6 chr2 120236798 120237151 -61510936 - MTD LTR MaLR 0 419 1 5 1502 344 251 250 41 chr2 120240226 120240445 -61507642 - MLT1B LTR MaLR 0 390 99 5 1502 1595 231 87 0 chr2 120243022 120243368 -61504719 + MTD LTR MaLR 35 410 -9 5 1502 417 272 259 0 chr2 120246105 120246333 -61501754 + MLT1B LTR MaLR 104 390 0 5 1502 1713 191 51 3 chr2 120248187 120248538 -61499549 + ORR1D2 LTR MaLR 1 368 -2 5 1502 2022 136 69 9 chr2 120254654 120254988 -61493099 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 41 5 1502 393 204 121 26 chr2 120255129 120255245 -61492842 + MTE2b LTR MaLR 253 379 0 5 1502 3331 65 8 0 chr2 120262475 120262872 -61485215 - MTB LTR MaLR 0 400 1 6 1502 714 196 0 0 chr2 120266058 120266104 -61481983 - ORR1D1 LTR MaLR -5 389 334 6 1502 954 224 105 65 chr2 120266146 120266486 -61481601 - ORR1D1 LTR MaLR -51 333 2 6 1502 1748 151 120 95 chr2 120267724 120268082 -61480005 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 6 1502 1865 148 16 6 chr2 120269190 120269503 -61478584 + ORR1A4 LTR MaLR 6 321 -8 6 1502 335 179 157 56 chr2 120278856 120278945 -61469142 - MLT1A LTR MaLR -290 100 3 6 1502 2134 134 86 11 chr2 120279612 120279960 -61468127 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 11 6 1502 1347 191 177 14 chr2 120280781 120281131 -61466956 + MTD LTR MaLR 1 407 -12 6 1502 3201 60 2 0 chr2 120284846 120285245 -61462842 - MTB LTR MaLR 0 400 1 6 1502 1173 259 30 30 chr2 120287122 120287453 -61460634 + ORR1E LTR MaLR 1 331 -28 6 1502 1529 168 160 12 chr2 120296870 120297213 -61450874 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 6 1502 2677 111 36 15 chr2 120304967 120305379 -61442708 - MTC LTR MaLR 0 421 1 7 1502 235 134 41 163 chr2 120306158 120306256 -61441831 - MT2B2 LTR ERVL -343 241 156 7 1502 366 233 14 14 chr2 120307495 120307569 -61440518 - RLTR41 LTR ERV1 -64 382 309 7 1502 1848 231 102 66 chr2 120308162 120308260 -61439827 - RLTR40 LTR ERVK -153 664 576 7 1502 1848 231 102 66 chr2 120308302 120308843 -61439244 - RLTR40 LTR ERVK -242 575 2 7 1502 1077 152 340 42 chr2 120319219 120319540 -61428547 - MTC LTR MaLR -5 416 1 7 1503 287 350 88 54 chr2 120324705 120324965 -61423122 + RMER12 LTR ERVK 720 988 -334 7 1503 1082 235 176 27 chr2 120331296 120331717 -61416370 - RMER4B LTR ERVK -9 576 57 7 1503 699 242 85 99 chr2 120343953 120344367 -61403720 + MTE2a LTR MaLR 1 406 -13 7 1503 1163 264 47 25 chr2 120346327 120346688 -61401399 + ORR1D2 LTR MaLR 1 369 -1 8 1503 3078 42 5 33 chr2 120374910 120375307 -61372780 + RLTR10 LTR ERVK 1 386 -4 8 1503 17244 24 4 1 chr2 120375323 120377261 -61370826 + RLTR10-int LTR ERVK 41 1984 -3 8 1503 3078 42 5 33 chr2 120377263 120377660 -61370427 + RLTR10 LTR ERVK 1 386 -4 8 1503 3143 20 0 0 chr2 120380366 120380712 -61367375 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 8 1503 282 281 41 70 chr2 120382654 120382826 -61365261 + RLTR12B LTR ERVK 3 169 -359 8 1503 1020 174 54 136 chr2 120384522 120384854 -61363233 - ORR1C2 LTR MaLR -62 322 18 8 1503 475 204 257 17 chr2 120395355 120395530 -61352557 + ORR1D1 LTR MaLR 158 374 0 9 1503 1749 195 41 22 chr2 120396895 120397262 -61350825 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 9 1503 378 264 31 9 chr2 120407672 120407777 -61340310 - ORR1E LTR MaLR -236 138 21 9 1503 1613 186 112 60 chr2 120408338 120408626 -61339461 + ORR1B2 LTR MaLR 1 324 -43 9 1503 1613 186 112 60 chr2 120408772 120408832 -61339255 + ORR1B2 LTR MaLR 325 367 0 9 1503 758 242 81 61 chr2 120412831 120413024 -61335063 - MTE2a LTR MaLR 0 379 171 9 1503 2157 103 19 135 chr2 120413024 120413301 -61334786 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 58 9 1503 2157 103 19 135 chr2 120413681 120413714 -61334373 - ORR1A2 LTR MaLR -270 57 57 1 1503 2157 103 19 135 chr2 120413908 120413965 -61334122 - ORR1A2 LTR MaLR -270 57 2 9 1503 758 242 81 61 chr2 120413965 120414017 -61334070 - MTE2a LTR MaLR -209 170 129 9 1503 283 354 73 18 chr2 120420824 120420988 -61327099 - ORR1E LTR MaLR -54 305 133 1 1503 1299 239 20 49 chr2 120435584 120435928 -61312159 - RLTR1D LTR ERV1 0 605 272 1 1503 257 262 0 32 chr2 120436233 120436296 -61311791 - MT2B LTR ERVL -350 251 191 1 1503 1040 224 116 62 chr2 120436962 120437267 -61310820 + ORR1D1 LTR MaLR 1 313 -61 1 1503 2838 136 0 5 chr2 120437267 120437680 -61310407 + MERVL_2A-int LTR ERVL 2128 2538 -3223 1 1503 238 331 6 128 chr2 120439701 120439857 -61308230 - MLT1A0 LTR MaLR -228 137 1 1 1503 2345 47 27 0 chr2 120441159 120441455 -61306632 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 24 1 1503 253 218 288 9 chr2 120443279 120443390 -61304697 - ORR1E LTR MaLR 0 379 238 1 1503 508 273 78 6 chr2 120443436 120443597 -61304490 - ORR1E LTR MaLR -211 159 1 1 1503 444 317 167 19 chr2 120445709 120445973 -61302114 + MER68 LTR ERVL 18 320 -243 1 1503 474 146 138 0 chr2 120450196 120450326 -61297761 + RMER17B LTR ERVK 309 456 -502 1 1503 263 135 39 0 chr2 120451668 120451720 -61296367 - RMER15 LTR ERVL -116 459 406 1 1504 3209 63 102 0 chr2 120461555 120461986 -61286101 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 1 1504 6490 64 15 1 chr2 120461988 120462806 -61285281 - IAPEz-int LTR ERVK -2 6479 5651 1 1504 12213 56 35 81 chr2 120462799 120464573 -61283514 - IAPEz-int LTR ERVK -4781 1700 9 1 1504 3241 65 97 0 chr2 120464574 120465007 -61283080 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 1 1504 2364 90 25 0 chr2 120472252 120472573 -61275514 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 1 1504 1612 266 138 64 chr2 120481644 120482004 -61266083 + RMER13A LTR ERVK 1 393 -467 1 1504 1612 266 138 64 chr2 120482121 120482383 -61265704 + RMER13A LTR ERVK 394 669 -191 1 1504 888 215 81 13 chr2 120482566 120482802 -61265285 - ORR1B1 LTR MaLR -142 252 1 1 1504 486 281 18 30 chr2 120484976 120485145 -61262942 + LTR33 LTR ERVL 1 167 -348 1 1504 1302 194 123 3 chr2 120487202 120487487 -61260600 - MTD LTR MaLR -11 408 90 1 1504 512 189 0 10 chr2 120487646 120487742 -61260345 - MTD LTR MaLR -320 99 5 1 1504 250 180 29 103 chr2 120493395 120493463 -61254624 - ORR1D2 LTR MaLR -315 63 1 1 1504 363 226 31 72 chr2 120493463 120493561 -61254526 - ORR1D2 LTR MaLR -281 93 1 1 1504 1041 194 21 109 chr2 120494645 120494929 -61253158 - RLTR14 LTR ERV1 -122 260 2 1 1504 577 147 117 7 chr2 120501360 120501479 -61246608 + ORR1A2 LTR MaLR 1 128 -246 9 1504 1821 62 71 0 chr2 120501473 120501713 -61246374 - MT2B2 LTR ERVL -327 257 1 1 1504 2021 134 120 20 chr2 120501900 120502251 -61245836 + ORR1B1 LTR MaLR 1 386 -8 1 1504 1307 223 164 19 chr2 120506078 120506142 -61241945 - MTD LTR MaLR 0 419 347 2 1504 1657 184 92 3 chr2 120506142 120506480 -61241607 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 3 2 1504 1307 223 164 19 chr2 120506480 120506749 -61241338 - MTD LTR MaLR -73 346 32 2 1504 3501 79 13 56 chr2 120506749 120507284 -61240803 - RLTR1B LTR ERV1 0 512 1 2 1504 1307 223 164 19 chr2 120507284 120507315 -61240772 - MTD LTR MaLR -388 31 2 2 1504 557 233 30 111 chr2 120510180 120510315 -61237772 - ORR1E LTR MaLR -246 124 1 3 1504 1213 187 149 55 chr2 120511371 120511413 -61236674 - ORR1D1 LTR MaLR -25 359 328 3 1504 1213 187 149 55 chr2 120511559 120511622 -61236465 - ORR1D1 LTR MaLR -57 327 266 3 1504 1244 151 45 14 chr2 120511649 120511870 -61236217 - ORR1D1 LTR MaLR -146 228 1 3 1504 596 192 0 124 chr2 120511870 120512006 -61236081 - MT2A LTR ERVL -413 120 2 3 1504 654 304 75 66 chr2 120514882 120515231 -61232856 + ORR1E LTR MaLR 1 352 -7 4 1504 2745 123 59 18 chr2 120536933 120537389 -61210698 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 1 6 1504 1702 126 212 30 chr2 120537484 120537819 -61210268 - RMER10B LTR ERVL -2 396 1 6 1504 1728 167 113 58 chr2 120537914 120538276 -61209811 - ORR1C2 LTR MaLR -2 382 1 6 1504 249 254 58 112 chr2 120566824 120566999 -61181088 + MLT1B LTR MaLR 36 214 -176 1 1504 482 199 19 64 chr2 120568432 120568588 -61179499 - RMER10B LTR ERVL -55 343 195 1 1504 280 338 159 21 chr2 120577796 120577941 -61170146 + MLT1A0 LTR MaLR 2 166 -199 1 1504 409 141 12 37 chr2 120577957 120578038 -61170049 + MLT1A0 LTR MaLR 285 363 -2 1 1504 732 179 92 14 chr2 120578360 120578502 -61169585 + RLTR41 LTR ERV1 230 382 -64 1 1504 3414 38 13 5 chr2 120579280 120579673 -61168414 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1505 242 299 40 40 chr2 120587938 120588039 -61160048 + RMER15 LTR ERVL 405 505 -70 1 1505 1952 156 51 91 chr2 120594637 120595046 -61153041 + RLTR9C LTR ERVK 1 393 0 1 1505 2927 142 5 2 chr2 120596527 120596943 -61151144 + MTC LTR MaLR 1 417 -4 1 1505 2007 147 75 0 chr2 120597075 120597381 -61150706 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 1 1505 557 266 70 51 chr2 120608498 120608712 -61139375 + MER31B LTR ERV1 7 224 -242 2 1505 690 236 157 120 chr2 120613740 120613824 -61134263 - MTE2a LTR MaLR -8 371 274 2 1505 690 236 157 120 chr2 120613919 120614191 -61133896 - MTE2a LTR MaLR -106 273 3 2 1505 835 97 241 11 chr2 120619139 120619326 -61128761 - RMER6A LTR ERVK -320 436 207 2 1505 1140 169 50 0 chr2 120619326 120619527 -61128560 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 211 -316 2 1505 992 245 194 53 chr2 120621545 120621886 -61126201 + MTD LTR MaLR 14 376 -3 2 1505 2594 47 73 0 chr2 120622058 120622358 -61125729 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 322 0 2 1505 41556 35 3 6 chr2 120622358 120627214 -61120873 + MMETn-int LTR ERVK 1 4844 0 2 1505 3055 6 0 0 chr2 120627214 120627536 -61120551 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 322 0 2 1505 3639 28 5 0 chr2 120636013 120636407 -61111680 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 1505 10186 17 2 0 chr2 120636407 120637503 -61110584 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 2 1505 3666 23 5 0 chr2 120637503 120637897 -61110190 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 1505 869 158 38 6 chr2 120638461 120638620 -61109467 + ORR1D1 LTR MaLR 1 164 -210 2 1505 1255 145 17 13 chr2 120638644 120638874 -61109213 + ORR1D1-int LTR MaLR 1140 1370 0 2 1505 1742 202 78 31 chr2 120638874 120639231 -61108856 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 2 1505 2351 91 3 9 chr2 120639660 120639994 -61108093 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 332 -5 2 1505 56635 23 11 7 chr2 120639994 120646441 -61101646 + IAPEz-int LTR ERVK 6 6479 -2 2 1505 2336 89 3 9 chr2 120646443 120646773 -61101314 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 328 -9 2 1505 2592 128 17 12 chr2 120649395 120649806 -61098281 + MTC LTR MaLR 1 413 -8 2 1505 319 299 164 56 chr2 120651474 120651739 -61096348 + MLT1F2 LTR MaLR 13 315 -254 3 1505 877 178 146 27 chr2 120652763 120652982 -61095105 - ORR1B1 LTR MaLR -149 245 1 3 1505 960 299 67 92 chr2 120654416 120654881 -61093206 - MLT1D LTR MaLR -52 453 1 3 1505 914 185 122 0 chr2 120662521 120662710 -61085377 + MTD LTR MaLR 196 407 -12 3 1505 335 266 86 13 chr2 120669760 120669894 -61078193 + MLT2B3 LTR ERVL 1 140 -416 3 1505 306 259 176 0 chr2 120669982 120670067 -61078020 + MTEa LTR MaLR 265 364 -15 3 1505 1715 316 104 37 chr2 120670068 120670795 -61077292 + MTEa-int LTR MaLR 761 1536 -44 3 1505 239 157 39 0 chr2 120671247 120671298 -61076789 + MTEa-int LTR MaLR 1526 1578 -2 3 1505 298 277 0 108 chr2 120671300 120671393 -61076694 + MTEa LTR MaLR 1 83 -296 3 1505 238 311 107 16 chr2 120671428 120671549 -61076538 + MTEa LTR MaLR 225 356 -23 3 1505 464 312 31 18 chr2 120677775 120677938 -61070149 + MLT1F1 LTR MaLR 360 524 -45 3 1505 541 229 9 98 chr2 120678726 120678905 -61069182 + MTE2b LTR MaLR 1 166 -213 3 1505 340 217 83 173 chr2 120679011 120679167 -61068920 + MTE2b LTR MaLR 234 375 -4 3 1505 4779 52 27 27 chr2 120682745 120683332 -61064755 + LTRIS_Mus LTR ERV1 1 587 0 3 1505 2232 128 57 0 chr2 120683798 120684150 -61063937 + RLTR30 LTR ERV1 7 378 -1 3 1505 1126 236 172 30 chr2 120684678 120685010 -61063077 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 3 1505 238 296 201 27 chr2 120697213 120697362 -61050725 - LTR33A_ LTR ERVL -220 311 137 4 1505 1634 208 131 54 chr2 120710267 120710965 -61037122 + RLTR40 LTR ERVK 16 807 -10 4 1505 2000 129 11 90 chr2 120712264 120712621 -61035466 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 4 1505 1605 160 29 39 chr2 120713896 120714202 -61033885 + RMER4A LTR ERVK 164 466 0 4 1505 494 218 26 149 chr2 120714281 120714475 -61033612 - MT2B2 LTR ERVL -248 336 167 4 1505 1607 178 225 0 chr2 120716965 120717307 -61030780 + MTD LTR MaLR 1 419 0 4 1506 608 264 113 62 chr2 120719062 120719353 -61028734 - MTEa LTR MaLR 0 379 74 4 1506 287 247 46 110 chr2 120731799 120731812 -61016275 + MT2B LTR ERVL 156 161 -440 5 1506 1853 165 64 11 chr2 120737247 120737621 -61010466 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 5 1506 240 283 9 124 chr2 120747749 120747862 -61000225 + MT2B LTR ERVL 161 260 -341 5 1506 1145 177 32 31 chr2 120758356 120758721 -60989366 + RLTR28 LTR ERVL 46 518 -6 5 1506 2539 147 24 32 chr2 120764710 120765173 -60982914 + RMER6B LTR ERVK 2 460 -1 6 1506 1600 174 105 52 chr2 120777988 120778407 -60969680 + RMER6C LTR ERVK 1 441 -249 6 1506 331 191 86 98 chr2 120778540 120778703 -60969384 + RMER6C LTR ERVK 327 487 -203 6 1506 2333 81 21 56 chr2 120780942 120781281 -60966806 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 6 1506 1899 141 16 19 chr2 120798692 120799004 -60949083 - MTC LTR MaLR -8 413 103 6 1506 671 148 35 9 chr2 120799073 120799189 -60948898 - MTC LTR MaLR -301 120 2 6 1506 1170 140 34 80 chr2 120799233 120799497 -60948590 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 71 322 0 6 1506 979 174 197 38 chr2 120807988 120808227 -60939860 - RLTR18 LTR ERVK -339 277 1 7 1506 655 260 123 26 chr2 120812931 120813236 -60934851 - MTE2b LTR MaLR -8 371 13 7 1506 3799 123 48 65 chr2 120814029 120814414 -60933673 - RMER6A LTR ERVK 0 756 345 7 1506 3799 123 48 65 chr2 120814442 120814768 -60933319 - RMER6A LTR ERVK -412 344 57 7 1506 280 308 82 27 chr2 120816494 120816604 -60931483 + RMER12 LTR ERVK 745 860 -462 7 1506 258 331 31 47 chr2 120816502 120816629 -60931458 - RMER12 LTR ERVK -463 859 735 7 1506 4515 112 27 58 chr2 120820004 120820781 -60927306 - RMER6A LTR ERVK -3 753 1 7 1506 804 294 116 73 chr2 120823990 120824540 -60923547 - MER21B LTR ERV1 -176 687 114 7 1506 542 257 98 36 chr2 120827279 120827473 -60920614 - MLT1B LTR MaLR -2 388 183 7 1506 435 164 34 175 chr2 120842664 120842683 -60905404 - ORR1C1-int LTR MaLR -132 966 952 8 1506 1125 136 8 14 chr2 120842822 120843017 -60905070 - ORR1C1-int LTR MaLR -194 1064 815 8 1506 2090 198 59 17 chr2 120843035 120843575 -60904512 - ORR1C1-int LTR MaLR -522 576 1 8 1506 2239 141 27 5 chr2 120843575 120843945 -60904142 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 8 1506 311 175 7 27 chr2 120847328 120847423 -60900664 - ORR1D1 LTR MaLR -246 138 40 8 1507 1972 174 78 18 chr2 120853991 120854388 -60893699 + MTC LTR MaLR 1 421 0 8 1507 1784 184 86 29 chr2 120861667 120862057 -60886030 - MTD LTR MaLR -14 405 2 8 1507 3154 73 20 0 chr2 120869640 120870039 -60878048 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 8 1507 750 168 90 23 chr2 120872624 120872801 -60875286 + MER34A1 LTR ERV1 11 199 -388 8 1507 1243 201 115 14 chr2 120872809 120873097 -60874990 + MTD LTR MaLR 1 317 -102 8 1507 229 122 48 24 chr2 120873123 120873165 -60874922 + MTD LTR MaLR 323 365 -5 8 1507 463 287 19 130 chr2 120873191 120873244 -60874843 + MER34A1 LTR ERV1 216 250 -337 8 1507 463 287 19 130 chr2 120873436 120873590 -60874497 + MER34A1 LTR ERV1 251 400 -187 8 1507 1698 167 201 21 chr2 120879392 120879727 -60868360 + BGLII_B LTR ERVK 1 393 -48 8 1507 1698 167 201 21 chr2 120879770 120879808 -60868279 + BGLII_B LTR ERVK 394 440 -1 8 1507 1658 242 50 144 chr2 120886773 120887655 -60860432 + RMER12 LTR ERVK 1 800 -1048 8 1507 818 212 88 103 chr2 120887671 120887720 -60860367 + RMER12 LTR ERVK 958 1009 -313 8 1507 818 212 88 103 chr2 120887743 120887956 -60860131 + RMER12 LTR ERVK 1010 1216 -106 8 1507 973 87 0 0 chr2 120889216 120889366 -60858721 + RMER12 LTR ERVK 232 381 -941 8 1507 3443 140 96 65 chr2 120889686 120890395 -60857692 + RMER12 LTR ERVK 360 1090 -232 8 1507 283 277 73 51 chr2 120890416 120890553 -60857534 + RMER12 LTR ERVK 1178 1317 -5 8 1507 226 143 0 0 chr2 120898203 120898238 -60849849 + RMER15 LTR ERVL 1 35 -540 9 1507 2404 189 103 18 chr2 120898292 120898798 -60849289 + RMER15 LTR ERVL 27 575 0 9 1507 2115 159 65 10 chr2 120904481 120904868 -60843219 + MTD LTR MaLR 10 417 -2 9 1507 2171 181 79 60 chr2 120931456 120931498 -60816589 + RLTR12B LTR ERVK 1 42 -486 9 1507 2171 181 79 60 chr2 120931679 120932140 -60815947 + RLTR12B LTR ERVK 43 514 -14 9 1507 286 294 76 56 chr2 120937105 120937249 -60810838 + RMER15 LTR ERVL 405 551 -24 1 1507 235 167 53 53 chr2 120944835 120944911 -60803176 + MLT1A1 LTR MaLR 333 408 0 1 1507 495 231 41 0 chr2 120949842 120949963 -60798124 - RMER10B LTR ERVL -3 395 270 1 1507 335 308 67 44 chr2 120951012 120951192 -60796895 + LTR16C LTR ERVL 166 349 -140 1 1507 1506 218 3 3 chr2 120951451 120951756 -60796331 - MTD LTR MaLR -96 323 18 1 1507 875 214 164 68 chr2 120962689 120962999 -60785088 + ORR1D2 LTR MaLR 1 340 -30 1 1507 1560 197 118 34 chr2 120970602 120970985 -60777102 + MTD LTR MaLR 5 419 0 1 1507 472 284 62 72 chr2 120972073 120972468 -60775619 - RLTR11A2 LTR ERVK -82 371 1 1 1507 302 207 0 121 chr2 120978732 120978748 -60769339 + MT2B LTR ERVL 153 156 -445 1 1508 1152 217 205 0 chr2 120982065 120982406 -60765681 + MTD LTR MaLR 1 411 -8 1 1508 406 221 73 9 chr2 120982444 120982653 -60765434 - RMER17C LTR ERVK -132 278 95 1 1508 1214 183 104 67 chr2 120990256 120990602 -60757485 + MTEb LTR MaLR 8 366 -13 1 1508 571 223 26 26 chr2 121000082 121000234 -60747853 + RMER15 LTR ERVL 100 251 -324 1 1508 261 217 0 0 chr2 121000433 121000493 -60747594 + RMER15 LTR ERVL 46 105 -470 3 1508 1304 140 212 46 chr2 121000525 121000831 -60747256 + RMER15 LTR ERVL 219 575 0 3 1508 1423 196 76 53 chr2 121003878 121004234 -60743853 + MTD LTR MaLR 14 377 -42 8 1508 648 194 391 0 chr2 121015869 121016117 -60731970 - MTD LTR MaLR -4 415 71 2 1508 346 248 221 6 chr2 121016979 121017137 -60730950 - MTD LTR MaLR -6 413 222 2 1508 323 227 7 138 chr2 121032491 121032515 -60715572 + MT2B LTR ERVL 145 150 -451 4 1508 613 181 158 24 chr2 121037726 121037935 -60710152 + MTC LTR MaLR 4 240 -181 5 1508 529 230 147 16 chr2 121038075 121038265 -60709822 + MTC LTR MaLR 204 418 -1 5 1508 1754 158 24 39 chr2 121038969 121039383 -60708704 + RMER17C LTR ERVK 3 410 0 5 1508 251 337 0 24 chr2 121042143 121042228 -60705859 + MLT1A LTR MaLR 83 165 -209 6 1508 1352 183 104 59 chr2 121043386 121043442 -60704645 - MTD LTR MaLR 0 419 364 6 1508 1352 183 104 59 chr2 121043624 121043922 -60704165 - MTD LTR MaLR -56 363 49 6 1508 862 247 153 14 chr2 121044132 121044419 -60703668 - MTD LTR MaLR -85 334 8 6 1508 2582 159 94 6 chr2 121051345 121051826 -60696261 + RLTR28 LTR ERVL 1 523 -1 9 1508 2389 107 52 68 chr2 121058402 121058802 -60689285 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 1 1508 2567 278 112 101 chr2 121074549 121076110 -60671977 + MTEa-int LTR MaLR 1 1579 -1 1 1508 807 214 130 97 chr2 121076116 121076418 -60671669 + MTEa LTR MaLR 6 328 -51 1 1508 807 214 130 97 chr2 121076607 121076638 -60671449 + MTEa LTR MaLR 329 353 -26 1 1508 807 214 130 97 chr2 121076659 121076686 -60671401 + MTEa LTR MaLR 354 379 0 1 1508 3553 20 2 0 chr2 121084214 121084609 -60663478 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1508 773 138 152 45 chr2 121089766 121089964 -60658123 - MTC LTR MaLR -125 296 78 2 1508 1878 82 105 96 chr2 121102068 121102392 -60645695 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 3 2 1508 1508 185 87 80 chr2 121110080 121110406 -60637681 - MTC LTR MaLR -2 419 92 2 1509 1508 185 87 80 chr2 121110584 121110669 -60637418 - MTC LTR MaLR -330 91 5 2 1509 857 236 39 51 chr2 121144782 121144973 -60603114 + MTD LTR MaLR 14 201 -218 3 1509 427 232 255 16 chr2 121145361 121145545 -60602542 + MTD LTR MaLR 192 419 0 3 1509 262 276 38 121 chr2 121164144 121164276 -60583811 - MT2B LTR ERVL -338 263 143 3 1509 237 259 17 0 chr2 121165862 121165920 -60582167 + MLT1F1 LTR MaLR 373 431 -138 3 1509 375 322 53 67 chr2 121181766 121182042 -60566045 - ORR1E LTR MaLR -14 345 70 4 1509 227 345 8 81 chr2 121197604 121197727 -60550360 - RMER4A LTR ERVK -15 451 338 4 1509 1827 210 57 22 chr2 121208623 121209028 -60539059 + MTD LTR MaLR 1 419 0 4 1509 2645 160 117 19 chr2 121211108 121211631 -60536456 - RMER15 LTR ERVL 0 575 2 4 1509 2381 82 3 6 chr2 121212810 121213129 -60534958 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK -19 318 1 4 1509 1210 243 116 17 chr2 121213648 121213992 -60534095 + MTE2b LTR MaLR 1 378 -1 4 1509 798 337 44 32 chr2 121214096 121214439 -60533648 + MT2A LTR ERVL 71 417 -116 4 1509 1559 198 94 26 chr2 121223951 121224293 -60523794 + ORR1D2 LTR MaLR 4 368 -2 5 1509 1845 174 13 57 chr2 121228255 121228407 -60519680 + ORR1B2 LTR MaLR 1 144 -223 5 1509 1845 174 13 57 chr2 121228605 121228836 -60519251 + ORR1B2 LTR MaLR 145 367 0 5 1509 270 241 10 121 chr2 121238515 121238533 -60509554 + MT2B LTR ERVL 153 159 -442 5 1510 3105 64 13 5 chr2 121249604 121249997 -60498090 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 1510 309 252 0 142 chr2 121250469 121250589 -60497498 - MT2B LTR ERVL -344 257 155 5 1510 342 267 24 79 chr2 121286491 121286518 -60461569 - MT2B LTR ERVL -443 158 139 6 1510 290 323 30 15 chr2 121292090 121292225 -60455862 + MLT1H LTR MaLR 77 213 -336 7 1510 1171 225 83 96 chr2 121296365 121296739 -60451348 + ORR1D2 LTR MaLR 2 370 0 7 1510 1730 158 6 12 chr2 121296844 121297164 -60450923 - ORR1A2 LTR MaLR -9 318 1 7 1510 4669 125 33 5 chr2 121297164 121297952 -60450135 - ORR1A2-int LTR MaLR 0 1963 1154 7 1510 6643 150 61 55 chr2 121303766 121304314 -60443773 - RMER16-int LTR ERVK -1540 3866 3417 7 1510 6643 125 59 47 chr2 121304461 121305176 -60442911 - RMER16-int LTR ERVK -1990 3416 2686 7 1510 255 184 28 46 chr2 121305176 121305234 -60442853 + RMER17A LTR ERVK 360 417 -334 7 1510 255 184 28 46 chr2 121305382 121305431 -60442656 + RMER17A LTR ERVK 418 465 -286 7 1510 403 225 79 134 chr2 121312687 121312851 -60435236 - MTE2a LTR MaLR -201 178 24 7 1510 236 250 63 38 chr2 121318549 121318628 -60429459 + RLTR25B LTR ERVK 429 509 -519 7 1510 290 323 30 15 chr2 121324640 121324775 -60423312 + MLT1H LTR MaLR 77 213 -336 8 1510 937 249 115 29 chr2 121328918 121329258 -60418829 + ORR1D2 LTR MaLR 2 370 0 8 1510 1720 161 6 12 chr2 121329363 121329683 -60418404 - ORR1A2 LTR MaLR -9 318 1 8 1510 4670 128 34 2 chr2 121329683 121330475 -60417612 - ORR1A2-int LTR MaLR 0 1963 1147 8 1510 3017 148 79 25 chr2 121336903 121337513 -60410574 - RMER6A LTR ERVK 0 756 114 8 1510 461 239 79 124 chr2 121353412 121353589 -60394498 - MTE2b LTR MaLR -201 178 10 9 1510 2527 142 34 69 chr2 121369329 121369807 -60378280 + RMER4A LTR ERVK 6 466 0 9 1510 1570 172 65 71 chr2 121369866 121370204 -60377883 - RMER4A LTR ERVK -127 339 4 9 1511 624 251 206 0 chr2 121378581 121378804 -60369283 + ORR1D2 LTR MaLR 6 274 -96 9 1511 448 156 78 59 chr2 121378843 121378945 -60369142 - MT2B LTR ERVL -344 257 154 9 1511 354 171 43 0 chr2 121378932 121379002 -60369085 + ORR1D2 LTR MaLR 298 370 0 9 1511 837 281 97 69 chr2 121393524 121393884 -60354203 + MLT1B LTR MaLR 9 378 -12 1 1511 492 316 26 52 chr2 121395473 121395703 -60352384 + RMER2 LTR ERV1 344 567 0 1 1511 304 298 44 20 chr2 121403822 121403951 -60344136 + MLT1F1 LTR MaLR 2 134 -435 1 1511 388 272 93 101 chr2 121403994 121404224 -60343863 + MLT1F1 LTR MaLR 271 562 -7 1 1511 233 266 34 84 chr2 121409763 121409779 -60338308 + MLT1E1A LTR MaLR 543 558 -122 1 1511 233 266 34 84 chr2 121409904 121410004 -60338083 + MLT1E1A LTR MaLR 559 655 -25 1 1511 229 284 39 87 chr2 121424575 121424702 -60323385 + RLTR11B LTR ERVK 140 260 -193 1 1511 1954 169 44 42 chr2 121424751 121424941 -60323146 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 184 1 1511 1954 169 44 42 chr2 121424965 121425157 -60322930 - ORR1C2 LTR MaLR -201 183 1 1 1511 549 310 116 26 chr2 121425742 121425974 -60322113 - LTR16A LTR ERVL 0 451 199 1 1511 498 270 139 73 chr2 121429102 121429423 -60318664 + MLT1B LTR MaLR 2 346 -28 1 1511 1404 232 80 94 chr2 121433235 121433577 -60314510 - MTD LTR MaLR 0 419 71 1 1511 1404 232 80 94 chr2 121433724 121433795 -60314292 - MTD LTR MaLR -349 70 12 1 1511 1897 143 110 3 chr2 121438903 121439043 -60309044 + ORR1C1 LTR MaLR 1 162 -216 1 1511 1897 143 110 3 chr2 121439093 121439289 -60308798 + ORR1C1 LTR MaLR 163 373 -5 1 1511 275 233 117 124 chr2 121443342 121443448 -60304639 - MT2B2 LTR ERVL -328 256 152 1 1511 2016 169 52 3 chr2 121445389 121445774 -60302313 + MTC LTR MaLR 10 413 -8 1 1511 1204 184 25 0 chr2 121449078 121449317 -60298770 - MTD LTR MaLR -174 245 1 1 1511 1553 194 127 9 chr2 121449492 121449854 -60298233 - MTD LTR MaLR -34 385 1 1 1511 1588 150 25 7 chr2 121450738 121451013 -60297074 - MTC LTR MaLR 0 421 142 1 1511 342 231 8 111 chr2 121452881 121452998 -60295089 + MT2B LTR ERVL 172 276 -325 1 1511 240 184 88 50 chr2 121462951 121463031 -60285056 - MLT1A1 LTR MaLR -18 390 308 1 1511 2822 121 15 38 chr2 121463125 121463597 -60284490 + RMER6B LTR ERVK 1 461 0 1 1511 887 197 7 0 chr2 121468730 121468872 -60279215 + ETnERV2-int LTR ERVK 7066 7208 -198 1 1511 399 218 167 56 chr2 121468876 121469128 -60278959 + RLTR13D6 LTR ERVK 162 441 -461 1 1511 461 227 8 25 chr2 121469128 121469250 -60278837 + MMETn-int LTR ERVK 4698 4817 -27 1 1511 484 106 0 45 chr2 121469260 121469349 -60278738 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 238 322 0 1 1511 1628 167 227 28 chr2 121475073 121475505 -60272582 + MT2A LTR ERVL 16 533 0 1 1511 231 329 92 14 chr2 121493364 121493506 -60254581 - MLT1I LTR MaLR -26 385 233 1 1511 678 265 67 79 chr2 121496571 121496899 -60251188 - MLT1A0 LTR MaLR -16 349 26 1 1511 2815 61 3 0 chr2 121498141 121498486 -60249601 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 1 1512 3550 123 96 19 chr2 121507948 121508256 -60239831 - RMER6C LTR ERVK 0 690 364 1 1512 3550 123 96 19 chr2 121508309 121508639 -60239448 - RMER6C LTR ERVK -327 363 4 1 1512 1093 228 46 77 chr2 121512080 121512431 -60235656 - MTD LTR MaLR -20 399 60 1 1512 3673 206 46 139 chr2 121512506 121513840 -60234247 - MTD-int LTR MaLR -49 1209 1 1 1512 1877 210 17 17 chr2 121513844 121514255 -60233832 - MTD LTR MaLR -8 411 1 1 1512 384 236 60 24 chr2 121522089 121522237 -60225850 - MLT1A0 LTR MaLR 0 408 247 3 1512 2575 161 62 14 chr2 121531004 121531507 -60216580 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 527 0 4 1512 2488 194 61 62 chr2 121533941 121534584 -60213503 - RLTR26 LTR ERVK 0 642 1 5 1512 2045 87 34 49 chr2 121537393 121537720 -60210367 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 6 1512 500 271 83 67 chr2 121538964 121539276 -60208811 + MTEa LTR MaLR 18 334 -45 6 1512 446 246 26 9 chr2 121541662 121541777 -60206310 + MTEa LTR MaLR 187 303 -76 6 1512 1606 155 249 15 chr2 121547842 121548183 -60199904 - MTC LTR MaLR 0 421 1 8 1512 886 294 86 0 chr2 121551070 121551349 -60196738 + MTE2b LTR MaLR 1 303 -76 8 1512 236 221 92 105 chr2 121563113 121563189 -60184898 + ORR1B1 LTR MaLR 119 193 -166 1 1512 281 160 0 0 chr2 121563327 121563377 -60184710 + ORR1B1 LTR MaLR 345 394 0 1 1512 1614 297 36 41 chr2 121564211 121564780 -60183307 - RMER15-int LTR ERVL -229 4770 4202 1 1512 1614 297 36 41 chr2 121565015 121565059 -60183028 - RMER15-int LTR ERVL -798 4201 4160 1 1512 1936 164 19 19 chr2 121565151 121565523 -60182564 - MTC LTR MaLR -49 372 1 1 1512 1704 288 69 19 chr2 121565525 121566482 -60181605 - RMER15-int LTR ERVL -3106 1893 867 1 1512 1203 298 87 21 chr2 121566772 121567132 -60180955 - RMER15-int LTR ERVL -4456 543 161 1 1512 1203 298 87 21 chr2 121567183 121567306 -60180781 - RMER15-int LTR ERVL -4839 160 29 1 1512 288 310 172 34 chr2 121567891 121568095 -60179992 + ORR1E LTR MaLR 8 239 -120 1 1512 3287 26 31 0 chr2 121576393 121576777 -60171310 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 1512 2369 176 100 47 chr2 121578291 121578829 -60169258 + RMER2 LTR ERV1 1 567 0 1 1512 1995 167 72 13 chr2 121593361 121593749 -60154338 - MTD LTR MaLR -8 411 1 1 1512 256 164 18 0 chr2 121597173 121597228 -60150859 + RLTR12B LTR ERVK 10 65 -463 1 1512 1104 245 144 6 chr2 121604339 121604692 -60143395 + MTD LTR MaLR 18 419 0 1 1512 309 276 15 114 chr2 121606838 121606969 -60141118 + MT2B LTR ERVL 140 257 -344 1 1512 358 277 46 46 chr2 121613683 121613857 -60134230 + MTE2a LTR MaLR 57 230 -149 2 1512 470 140 46 83 chr2 121625225 121625334 -60122753 + MT2B LTR ERVL 152 256 -345 2 1513 1100 223 45 100 chr2 121635819 121636178 -60111909 - MTE2a LTR MaLR -37 342 4 2 1513 226 260 92 46 chr2 121637101 121637210 -60110877 + LTRIS4 LTR ERV1 344 457 -50 2 1513 741 295 73 70 chr2 121644865 121645383 -60102704 + MT2A LTR ERVL 5 524 -9 2 1513 2598 186 101 31 chr2 121646749 121646804 -60101283 - RLTR18 LTR ERVK 0 616 553 2 1513 2598 186 101 31 chr2 121646983 121647360 -60100727 - RLTR18 LTR ERVK -64 552 143 2 1513 2305 203 52 118 chr2 121647360 121648014 -60100073 - RMER19C LTR ERVK 0 611 1 3 1513 2598 186 101 31 chr2 121648014 121648156 -60099931 - RLTR18 LTR ERVK -474 142 1 2 1513 676 10 222 0 chr2 121655395 121655494 -60092593 + RLTR1B LTR ERV1 1 121 -391 3 1513 1251 67 0 11 chr2 121655494 121655676 -60092411 + RLTR1B LTR ERV1 333 512 0 3 1513 1884 190 72 60 chr2 121656341 121656827 -60091260 - RMER20B LTR ERVK -24 603 80 3 1513 1884 181 75 35 chr2 121657016 121657094 -60090993 - RMER20B LTR ERVK -548 79 3 3 1513 556 148 63 27 chr2 121659326 121659437 -60088650 - RLTR20B3 LTR ERVK 0 577 463 3 1513 613 101 10 0 chr2 121659642 121659737 -60088350 - RLTR20B3 LTR ERVK -111 466 371 3 1513 579 137 36 12 chr2 121659737 121659885 -60088202 + RLTR31A_Mm LTR ERVK 1 151 -410 3 1513 1401 211 62 37 chr2 121659971 121660481 -60087606 + RLTR31A_Mm LTR ERVK 61 557 0 3 1513 832 167 161 0 chr2 121660481 121660610 -60087477 - RLTR20B3 LTR ERVK -201 376 246 3 1513 832 136 514 7 chr2 121660674 121660824 -60087263 - RLTR20B3 LTR ERVK -332 245 1 3 1513 1420 209 107 13 chr2 121661524 121661907 -60086180 + MTD LTR MaLR 1 419 0 3 1513 362 242 48 39 chr2 121663203 121663305 -60084782 + ORR1D2 LTR MaLR 1 103 -256 3 1513 1706 163 104 3 chr2 121663305 121663631 -60084456 + ORR1B2 LTR MaLR 1 359 -8 3 1513 832 278 47 40 chr2 121663634 121663703 -60084384 + ORR1D2 LTR MaLR 88 150 -220 3 1513 2038 200 62 123 chr2 121663703 121663718 -60084369 - RMER19C LTR ERVK 0 611 598 3 1513 2038 200 62 123 chr2 121663745 121664378 -60083709 - RMER19C LTR ERVK -14 597 3 3 1513 832 278 47 40 chr2 121664378 121664585 -60083502 + ORR1D2 LTR MaLR 151 366 -4 3 1513 725 261 13 47 chr2 121665105 121665338 -60082749 + ORR1D2-int LTR MaLR 135 359 -1011 3 1513 1186 238 95 59 chr2 121665338 121665695 -60082392 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 3 1513 3393 241 81 149 chr2 121665695 121667157 -60080930 + ORR1D2-int LTR MaLR 1 1363 -7 3 1513 521 236 9 0 chr2 121667336 121667442 -60080645 + ORR1D2 LTR MaLR 18 124 -235 3 1513 658 280 37 33 chr2 121667912 121668126 -60079961 + ORR1D2 LTR MaLR 145 359 0 3 1513 578 304 44 40 chr2 121673926 121674065 -60074022 + RMER15-int LTR ERVL 188 327 -4672 3 1513 2799 140 65 39 chr2 121674065 121674584 -60073503 + RMER16 LTR ERVK 1 533 0 3 1513 578 304 44 40 chr2 121674584 121674694 -60073393 + RMER15-int LTR ERVL 328 438 -4561 3 1513 3219 65 2 2 chr2 121674898 121675298 -60072789 + MTB LTR MaLR 1 400 0 3 1513 3856 258 59 19 chr2 121675540 121676980 -60071107 + RMER15-int LTR ERVL 562 2096 -2903 3 1513 421 314 0 8 chr2 121677042 121677161 -60070926 + RMER15-int LTR ERVL 2209 2326 -2673 3 1513 366 252 61 0 chr2 121677179 121677278 -60070809 + RMER15-int LTR ERVL 2386 2490 -2509 3 1513 950 222 65 30 chr2 121677358 121677590 -60070497 + RMER15-int LTR ERVL 4160 4399 -600 3 1513 469 335 87 50 chr2 121677676 121677997 -60070090 + RMER15-int LTR ERVL 4379 4711 -288 3 1513 286 260 28 19 chr2 121678251 121678357 -60069730 + RMER15-int LTR ERVL 4890 4996 -3 3 1513 275 317 42 0 chr2 121678615 121678735 -60069352 + RMER15 LTR ERVL 393 517 -58 3 1513 351 259 60 8 chr2 121680743 121680854 -60067233 - LTR83 LTR ERVL -348 432 316 3 1513 2530 168 14 168 chr2 121682453 121683175 -60064912 - RMER19C LTR ERVK 0 611 1 3 1513 383 232 0 0 chr2 121695037 121695119 -60052968 - ORR1D1 LTR MaLR -8 366 285 4 1513 992 132 30 6 chr2 121695295 121695463 -60052624 - ORR1D1 LTR MaLR -202 172 1 4 1513 687 226 53 58 chr2 121695669 121695894 -60052193 - MLT1B LTR MaLR 0 390 167 4 1513 254 293 50 10 chr2 121696114 121696214 -60051873 + RMER15 LTR ERVL 368 471 -104 4 1513 322 287 148 0 chr2 121696261 121696369 -60051718 - MLT1B LTR MaLR -256 134 11 4 1513 1553 139 15 0 chr2 121702455 121702714 -60045373 - RLTR14 LTR ERV1 0 382 120 4 1513 536 317 39 43 chr2 121703612 121703820 -60044267 + MTD LTR MaLR 5 211 -208 4 1513 721 194 116 25 chr2 121704067 121704268 -60043819 + MTD LTR MaLR 200 403 -16 4 1513 266 260 26 13 chr2 121706379 121706457 -60041630 + RMER15 LTR ERVL 396 474 -101 4 1513 2230 137 58 16 chr2 121706560 121706938 -60041149 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 4 1513 367 232 119 32 chr2 121711107 121711378 -60036709 + MTD LTR MaLR 39 361 -58 4 1513 707 180 22 18 chr2 121715767 121715975 -60032112 + RLTR17 LTR ERVK 1 263 -429 4 1513 229 208 74 49 chr2 121716044 121716125 -60031962 - RLTR25B LTR ERVK -519 509 427 4 1513 1706 149 26 52 chr2 121716190 121716547 -60031540 + RLTR17 LTR ERVK 275 610 -82 4 1513 374 262 31 16 chr2 121717041 121717169 -60030918 + ORR1E LTR MaLR 8 137 -222 4 1513 2131 132 73 35 chr2 121718774 121719142 -60028945 - ORR1C2 LTR MaLR -2 382 1 4 1513 3959 159 83 7 chr2 121720758 121721596 -60026491 + RLTR13D6 LTR ERVK 1 902 0 4 1513 616 189 65 17 chr2 121725164 121725326 -60022761 - MTD LTR MaLR -4 417 213 5 1513 770 224 0 13 chr2 121725437 121725586 -60022501 + MTEa LTR MaLR 1 147 -232 5 1513 2734 117 55 7 chr2 121735350 121735790 -60012297 - RMER4A LTR ERVK -1 465 5 5 1513 749 269 211 0 chr2 121738806 121739118 -60008969 - MTEa LTR MaLR -1 378 1 5 1513 230 281 61 9 chr2 121743205 121743320 -60004767 - ORR1B1-int LTR MaLR -762 747 627 5 1513 884 231 269 15 chr2 121745316 121745642 -60002445 - MTD LTR MaLR -4 417 5 5 1513 943 200 58 7 chr2 121762147 121762369 -59985718 - ORR1C1 LTR MaLR -137 230 2 6 1513 3503 20 2 0 chr2 121764603 121764998 -59983089 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 189 9670 16 0 0 chr2 121764998 121766096 -59981991 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 6 1514 3503 20 2 0 chr2 121766096 121766491 -59981596 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 1514 779 153 6 123 chr2 121767606 121767649 -59980438 - MTC LTR MaLR -270 151 122 6 1514 779 153 6 123 chr2 121767795 121767922 -59980165 - MTC LTR MaLR -300 121 1 6 1514 3045 26 0 0 chr2 121770191 121770537 -59977550 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 6 1514 10291 124 96 30 chr2 121770537 121771164 -59976923 + ORR1A0-int LTR MaLR 1 732 -1231 6 1514 10291 124 96 30 chr2 121771716 121771997 -59976090 + ORR1A0-int LTR MaLR 733 1041 -922 6 1514 10291 124 96 30 chr2 121772144 121772698 -59975389 + ORR1A0-int LTR MaLR 1042 1598 -365 6 1514 10291 124 96 30 chr2 121772892 121773269 -59974818 + ORR1A0-int LTR MaLR 1599 1962 -1 6 1514 2806 33 33 3 chr2 121773269 121773605 -59974482 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 6 1514 3744 49 20 8 chr2 121773819 121774309 -59973778 + LTRIS2 LTR ERV1 69 564 0 6 1514 535 361 15 15 chr2 121774763 121774960 -59973127 - MT2A LTR ERVL -138 395 199 6 1514 241 238 0 0 chr2 121775001 121775042 -59973045 - MTE2a LTR MaLR -259 120 80 6 1514 867 153 301 41 chr2 121775616 121775931 -59972156 + RMER6A LTR ERVK 65 461 0 6 1514 505 134 12 12 chr2 121775931 121776014 -59972073 + RMER6-int LTR ERVK 1 83 -8876 6 1514 781 50 54 54 chr2 121776041 121776188 -59971899 + RMER6-int LTR ERVK 488 634 -2543 6 1514 2410 135 95 72 chr2 121776246 121776814 -59971273 + RMER6-int LTR ERVK 2579 3159 -18 6 1514 3985 128 44 59 chr2 121776832 121777023 -59971064 + RMER6A LTR ERVK 3 194 -562 6 1514 3985 128 44 59 chr2 121777163 121777736 -59970351 + RMER6A LTR ERVK 195 756 0 6 1514 295 252 72 72 chr2 121809490 121809601 -59938486 + MT2B2 LTR ERVL 152 262 -322 7 1514 716 254 37 73 chr2 121811829 121811909 -59936178 - MTD LTR MaLR -235 184 112 7 1514 716 254 37 73 chr2 121812055 121812165 -59935922 - MTD LTR MaLR -308 111 1 7 1514 370 237 126 21 chr2 121828904 121828999 -59919088 + MT2B LTR ERVL 153 257 -344 8 1514 281 267 111 29 chr2 121831696 121831939 -59916148 + RMER17D LTR ERVK 175 437 -452 8 1514 462 181 62 94 chr2 121835824 121835952 -59912135 - MT2B LTR ERVL -323 278 155 8 1514 866 111 322 11 chr2 121842765 121843023 -59905064 - ORR1A3 LTR MaLR -8 338 1 8 1514 4586 121 79 54 chr2 121843023 121843890 -59904197 - ORR1A3-int LTR MaLR 0 1963 308 8 1514 2153 121 38 9 chr2 121843890 121844207 -59903880 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 8 1514 875 280 136 77 chr2 121844207 121844328 -59903759 - ORR1A3-int LTR MaLR -791 307 198 8 1514 369 196 141 115 chr2 121844449 121844605 -59903482 - RLTR22_Mus LTR ERVK 0 1848 1641 8 1514 1147 230 88 16 chr2 121844583 121844888 -59903199 - RMER12 LTR ERVK -132 1190 864 8 1514 2130 151 117 41 chr2 121844898 121845289 -59902798 - RMER12 LTR ERVK -744 578 141 8 1514 2130 151 117 41 chr2 121845536 121845606 -59902481 - RMER12 LTR ERVK -1182 140 82 8 1514 522 197 85 62 chr2 121852574 121852704 -59895383 - MLT2D LTR ERVL -277 137 5 8 1514 1731 127 128 79 chr2 121860219 121860587 -59887500 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 1 9 1514 228 152 132 29 chr2 121873940 121874008 -59874079 - MTD LTR MaLR 0 419 345 9 1514 1183 207 176 10 chr2 121874342 121874649 -59873438 - MTD LTR MaLR -61 358 1 9 1514 400 234 21 111 chr2 121890316 121890345 -59857742 - MT2B LTR ERVL -447 154 139 9 1514 6890 81 14 34 chr2 121892677 121893671 -59854416 + RLTR13A3 LTR ERVK 5 978 0 9 1515 604 187 26 9 chr2 121915152 121915265 -59832822 - MTC LTR MaLR -10 411 297 1 1515 1165 146 85 10 chr2 121915248 121915449 -59832638 + MTC LTR MaLR 198 413 -8 1 1515 286 149 0 0 chr2 121915451 121915498 -59832589 - MTC LTR MaLR -374 47 1 1 1515 986 146 112 0 chr2 121930390 121930568 -59817519 - MTD LTR MaLR -20 399 202 1 1515 890 201 34 24 chr2 121930764 121930949 -59817138 - MTD LTR MaLR -232 187 1 1 1515 289 216 40 129 chr2 121936449 121936550 -59811537 + MT2B LTR ERVL 173 264 -337 1 1515 225 289 0 23 chr2 121940825 121940956 -59807131 - ORR1B1-int LTR MaLR -749 760 633 1 1515 1303 273 109 32 chr2 121959505 121959946 -59788141 + RLTR18B LTR ERVK 38 512 0 1 1515 312 324 92 9 chr2 121959946 121960024 -59788063 + ORR1D2 LTR MaLR 101 187 -187 1 1515 589 238 113 0 chr2 121962267 121962435 -59785652 + ORR1D2 LTR MaLR 173 359 -11 1 1515 3507 33 0 0 chr2 121965978 121966374 -59781713 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 1515 528 343 33 17 chr2 121967411 121967651 -59780436 - MLT1D LTR MaLR -60 445 202 1 1515 482 167 51 20 chr2 121968682 121968780 -59779307 - MT2A LTR ERVL -432 101 1 1 1515 1296 232 151 19 chr2 121969422 121969787 -59778300 - MTD LTR MaLR 0 419 7 1 1515 236 231 19 0 chr2 121979932 121979984 -59768103 + MTEb LTR MaLR 307 359 -20 1 1515 465 270 56 0 chr2 121980834 121980960 -59767127 - LTR48B LTR ERV1 -333 311 179 1 1515 313 305 215 0 chr2 121988379 121988556 -59759531 - MLT1M LTR MaLR -402 270 56 1 1515 1389 135 125 150 chr2 121991625 121991723 -59756364 - ORR1C1 LTR MaLR 0 384 340 1 1515 1545 160 139 0 chr2 121992105 121992399 -59755688 - ORR1C1 LTR MaLR -42 336 2 1 1515 2198 115 106 11 chr2 121994624 121994984 -59753103 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 1 1515 308 234 62 21 chr2 122002489 122002585 -59745502 - MT2B LTR ERVL -346 255 156 1 1515 3072 123 30 43 chr2 122008738 122009272 -59738815 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 527 0 2 1515 848 176 174 96 chr2 122009714 122010048 -59738039 + RLTR28B LTR ERVL 2 361 -120 3 1515 773 203 103 27 chr2 122010123 122010407 -59737680 + RLTR26 LTR ERVK 2 337 -305 3 1515 1561 91 71 36 chr2 122010467 122010810 -59737277 - ORR1A2 LTR MaLR -12 334 3 3 1515 498 267 138 96 chr2 122010820 122011102 -59736985 + RLTR26 LTR ERVK 344 637 -5 3 1515 286 269 23 78 chr2 122017073 122017084 -59731003 + MT2B LTR ERVL 167 258 -343 5 1515 248 221 62 113 chr2 122026662 122026759 -59721328 - MLT1F LTR MaLR -448 100 9 8 1515 629 256 132 25 chr2 122027631 122027791 -59720296 - RMER5 LTR ERV1 -9 525 355 8 189 629 256 132 25 chr2 122027938 122028058 -59720029 - RMER5 LTR ERV1 -180 354 215 8 1516 238 330 11 22 chr2 122028121 122028211 -59719876 - RMER5 LTR ERV1 -445 89 1 8 1516 2951 163 89 33 chr2 122028432 122029015 -59719072 - RLTR18 LTR ERVK 0 616 1 8 1516 404 163 70 0 chr2 122032249 122032335 -59715752 - MTE2b LTR MaLR 0 379 288 9 1516 337 301 100 80 chr2 122032353 122032743 -59715344 - RMER10A LTR ERVL -27 415 18 9 1516 643 262 47 138 chr2 122032874 122033171 -59714916 - MTE2b LTR MaLR -102 277 8 9 1516 658 276 37 41 chr2 122033174 122033349 -59714738 - MTE2b-int LTR MaLR -2 1578 1405 9 1516 658 276 37 41 chr2 122033513 122033579 -59714508 - MTE2b-int LTR MaLR -176 1404 1338 9 1516 1447 178 144 64 chr2 122036237 122036627 -59711460 + MTC LTR MaLR 1 421 0 1 1516 1209 166 22 196 chr2 122037011 122037228 -59710859 - RMER17C LTR ERVK 0 410 231 1 1516 1209 166 22 196 chr2 122037401 122037679 -59710408 - RMER17C LTR ERVK -180 230 1 1 1516 2890 90 54 2 chr2 122038538 122039004 -59709083 + RMER16 LTR ERVK 1 533 0 1 1516 627 268 166 51 chr2 122039004 122039121 -59708966 + RMER5 LTR ERV1 64 185 -349 1 1516 627 268 166 51 chr2 122039163 122039451 -59708636 + RMER5 LTR ERV1 186 518 -16 1 1516 546 231 8 8 chr2 122041729 122041851 -59706236 - RLTR18B LTR ERVK -8 504 383 1 1516 465 235 112 15 chr2 122041849 122041983 -59706104 - RLTR18B LTR ERVK -275 237 91 1 1516 584 248 7 44 chr2 122041988 122042123 -59705964 + MurERV4-int LTR ERVK 4878 5007 -253 1 1516 3318 48 66 149 chr2 122042633 122042821 -59705266 - RLTR1B LTR ERV1 0 512 321 1 1516 3318 48 66 149 chr2 122042849 122043218 -59704869 - RLTR1B LTR ERV1 -192 320 3 1 1516 326 197 0 32 chr2 122043246 122043309 -59704778 + MTE-int LTR MaLR 1365 1425 -155 1 1516 808 293 135 28 chr2 122043679 122044101 -59703986 - MLT1D LTR MaLR -35 470 4 1 1516 293 246 0 0 chr2 122045584 122045645 -59702442 - MTD LTR MaLR -249 170 110 1 1516 448 214 30 10 chr2 122046147 122046246 -59701841 - MTD LTR MaLR -299 120 20 1 1516 1743 167 85 0 chr2 122047708 122048025 -59700062 + RMER19B LTR ERVK 547 890 -12 1 1516 700 199 299 27 chr2 122048634 122048928 -59699159 + ORR1D2 LTR MaLR 1 374 0 1 1516 1286 121 113 36 chr2 122049630 122049878 -59698209 - RMER4B LTR ERVK 0 585 319 1 1516 1810 118 77 0 chr2 122050874 122051185 -59696902 - RMER4B LTR ERVK -250 335 1 1 1516 264 280 130 9 chr2 122054069 122054177 -59693910 - MTE2b LTR MaLR -55 324 204 1 1516 325 321 74 19 chr2 122054202 122054310 -59693777 - MTE2b LTR MaLR -218 161 48 1 1516 430 206 109 8 chr2 122055882 122056099 -59691988 + RLTR40 LTR ERVK 408 714 -103 1 1516 294 266 157 37 chr2 122068288 122068479 -59679608 - RMER12 LTR ERVK -466 856 750 1 1516 503 294 64 57 chr2 122073768 122074092 -59673995 - MLT2D LTR ERVL -3 394 72 2 1516 627 241 43 109 chr2 122074110 122074320 -59673767 - MLT2D LTR ERVL -218 196 1 2 1516 389 273 15 97 chr2 122075261 122075395 -59672692 - MT2B LTR ERVL -354 247 125 2 1516 8284 20 2 4 chr2 122079522 122080453 -59667634 - RLTR13B3 LTR ERVK 0 929 1 2 1516 265 239 71 71 chr2 122097862 122097961 -59650126 - MT2B2 LTR ERVL -328 256 158 2 1516 277 263 145 16 chr2 122099872 122100065 -59648022 + RLTR21 LTR ERVK 1089 1306 -266 2 1516 498 182 45 90 chr2 122136065 122136198 -59611889 - MT2B LTR ERVL -323 278 152 2 1516 232 221 224 26 chr2 122158368 122158484 -59589603 + LTR48 LTR ERV1 9 147 -640 3 1517 729 270 87 13 chr2 122162379 122162711 -59585376 - MTD LTR MaLR 0 400 1 3 1517 299 354 75 48 chr2 122184166 122184353 -59563734 + LTR79 LTR ERVL 271 462 -65 3 1517 239 245 190 21 chr2 122185474 122185616 -59562471 - LTR33A_ LTR ERVL -7 524 359 3 1517 1496 156 6 106 chr2 122196266 122196596 -59551491 + ORR1C2 LTR MaLR 88 384 0 3 1517 357 292 112 16 chr2 122204925 122205113 -59542974 - RMER15 LTR ERVL -19 556 351 4 1517 2128 126 12 36 chr2 122208549 122208886 -59539201 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 4 1517 372 259 167 77 chr2 122209842 122210064 -59538023 - MLT1B LTR MaLR -146 244 3 4 1517 1254 223 128 15 chr2 122210183 122210511 -59537576 + ORR1D2 LTR MaLR 6 370 0 4 1517 578 240 8 8 chr2 122212458 122212580 -59535507 - RLTR18B LTR ERVK -8 504 383 4 1517 533 227 112 15 chr2 122212577 122212711 -59535376 - RLTR18B LTR ERVK -275 237 91 4 1517 569 240 7 44 chr2 122212716 122212851 -59535236 + MurERV4-int LTR ERVK 4878 5007 -253 4 1517 388 218 11 76 chr2 122213345 122213448 -59534639 + MTE-int LTR MaLR 1328 1425 -155 4 1517 313 189 12 98 chr2 122213596 122213612 -59534475 + MTE-int LTR MaLR 1267 1279 -91 4 1517 3360 37 25 0 chr2 122215719 122216120 -59531967 + RLTR10A LTR ERVK 1 411 0 4 1517 834 226 95 146 chr2 122218095 122218980 -59529107 - RLTR42-int LTR ERVK -3114 3023 1932 4 1517 335 154 0 0 chr2 122222748 122222800 -59525287 - RLTR42-int LTR ERVK -4424 1098 1047 4 1517 1115 255 50 0 chr2 122223120 122223402 -59524685 - RLTR42-int LTR ERVK -4122 1400 1105 4 1517 697 256 129 155 chr2 122224618 122224881 -59523206 - MTD LTR MaLR 0 419 165 4 1517 697 256 129 155 chr2 122225466 122225618 -59522469 - MTD LTR MaLR -255 164 11 4 1517 419 339 25 51 chr2 122231520 122231716 -59516371 + MLT1A0 LTR MaLR 48 238 -127 4 1517 3214 50 10 2 chr2 122232846 122233243 -59514844 + MTB LTR MaLR 1 400 0 4 1517 926 198 34 6 chr2 122243108 122243286 -59504801 + MERVL_2A-int LTR ERVL 2902 3084 -2677 4 1517 1011 147 135 18 chr2 122243286 122243515 -59504572 + RMER6A LTR ERVK 249 504 -252 4 1517 1132 135 21 0 chr2 122243784 122243976 -59504111 + RMER6A LTR ERVK 496 686 -70 4 1517 589 296 77 40 chr2 122244352 122244824 -59503263 + MERVL_2A-int LTR ERVL 1526 2091 -3666 5 1517 1859 233 78 2 chr2 122244972 122245439 -59502648 + MERVL_2A-int LTR ERVL 2051 2604 -3157 5 1517 1827 259 11 34 chr2 122245450 122245727 -59502360 + MERVL_2A-int LTR ERVL 2726 3004 -2757 5 1517 1827 259 11 34 chr2 122245923 122246116 -59501971 + MERVL_2A-int LTR ERVL 3005 3185 -2576 5 1517 712 263 11 0 chr2 122246368 122246547 -59501540 + MERVL_2A-int LTR ERVL 3088 3268 -2446 5 1517 3792 171 47 20 chr2 122246548 122247298 -59500789 + RLTR25B LTR ERVK 1 770 -258 5 1517 515 168 22 51 chr2 122247305 122247443 -59500644 + RLTR25B LTR ERVK 895 1028 0 5 1517 3407 270 69 33 chr2 122247866 122249051 -59499036 + MERVL_2A-int LTR ERVL 3395 4623 -1138 5 1517 1332 241 36 28 chr2 122249053 122249416 -59498671 - ORR1D2 LTR MaLR -2 368 3 5 1517 1291 220 62 19 chr2 122251100 122251424 -59496663 + MERVL_2A-int LTR ERVL 4605 4942 -772 5 1517 1904 256 84 3 chr2 122251444 122252017 -59496070 + MERVL_2A-int LTR ERVL 5040 5658 -99 5 1517 571 269 115 81 chr2 122252056 122252404 -59495683 + MT2A LTR ERVL 114 473 -60 5 1517 265 308 107 16 chr2 122256866 122256988 -59491099 - LTR33 LTR ERVL -371 144 12 5 1517 3891 162 83 5 chr2 122257314 122257700 -59490387 - RLTR25B LTR ERVK -200 828 401 5 1517 3891 162 83 5 chr2 122257727 122258108 -59489979 - RLTR25B LTR ERVK -628 400 3 5 1517 2108 281 47 26 chr2 122258150 122258837 -59489250 + MERVL_2A-int LTR ERVL 3722 4422 -1339 5 1517 1137 229 89 16 chr2 122265477 122265792 -59482295 + MERVL_2A-int LTR ERVL 4605 4942 -772 5 1517 1838 259 84 3 chr2 122265812 122266385 -59481702 + MERVL_2A-int LTR ERVL 5040 5658 -99 5 1517 605 261 144 77 chr2 122266424 122266814 -59481273 + MT2A LTR ERVL 114 529 -4 5 1517 2243 152 25 5 chr2 122276145 122276541 -59471546 - MTC LTR MaLR -17 404 1 5 1517 723 246 211 78 chr2 122278908 122279230 -59468857 - MTE2b LTR MaLR -10 369 5 5 1517 773 273 91 24 chr2 122288402 122288743 -59459344 + MLT1A0 LTR MaLR 1 364 -1 5 1517 1142 206 40 30 chr2 122289848 122290148 -59457939 + MYSERV6-int LTR ERVK 8121 8423 -536 5 1518 289 143 0 113 chr2 122290623 122290694 -59457393 - MYSERV6-int LTR ERVK -1146 7813 7751 5 1518 386 303 7 43 chr2 122290718 122290856 -59457231 - RMER4A LTR ERVK -84 382 250 5 1518 253 321 25 59 chr2 122290856 122290975 -59457112 - MYSERV6-int LTR ERVK -1424 5126 5012 5 1518 603 250 15 68 chr2 122290972 122291239 -59456848 - MYSERV6-int LTR ERVK -1837 4713 4526 5 1518 2046 137 12 3 chr2 122291239 122291582 -59456505 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 5 1518 2562 236 36 18 chr2 122291601 122292334 -59455753 - MYSERV6-int LTR ERVK -4344 4615 3755 5 1518 4497 189 30 46 chr2 122294362 122295278 -59452809 - RMER19B LTR ERVK 0 902 2 5 1518 831 226 8 49 chr2 122295467 122295706 -59452381 + MERVL_2A-int LTR ERVL 5511 5755 -6 5 1518 711 209 5 53 chr2 122295714 122295895 -59452192 + MT2A LTR ERVL 3 174 -359 5 1518 3536 305 77 25 chr2 122296403 122296679 -59451408 + MERVL_2A-int LTR ERVL 2222 2538 -3129 5 1518 2676 98 36 0 chr2 122296679 122297065 -59451022 + MTB LTR MaLR 1 400 0 5 1518 4443 257 35 32 chr2 122297065 122298304 -59449783 + MERVL_2A-int LTR ERVL 2740 3984 -1777 5 1518 471 282 128 0 chr2 122305214 122305370 -59442717 + MTD LTR MaLR 11 186 -233 6 1518 640 256 145 18 chr2 122306120 122306347 -59441740 + MTD LTR MaLR 164 419 0 6 1518 959 244 26 42 chr2 122306717 122306982 -59441105 + ERVL-int LTR ERVL 3773 4033 -1728 6 1518 2430 196 116 75 chr2 122306982 122307844 -59440243 - RLTR13D6 LTR ERVK 0 1033 1 6 1518 502 254 193 14 chr2 122307844 122308067 -59440020 + ERVL-int LTR ERVL 3920 4188 -1297 6 1518 652 293 66 29 chr2 122308068 122308344 -59439743 + ERVL-int LTR ERVL 4238 4647 -1114 6 1518 1278 236 41 30 chr2 122308344 122308706 -59439381 - ORR1D2 LTR MaLR -2 368 3 6 1518 635 307 121 6 chr2 122308706 122308760 -59439327 + ERVL-int LTR ERVL 4648 4707 -1054 6 1518 1679 271 113 5 chr2 122310564 122311470 -59436617 + ERVL-int LTR ERVL 4607 5658 -99 6 1518 614 264 144 75 chr2 122311509 122311898 -59436189 + MT2A LTR ERVL 114 529 -4 6 1518 349 233 4 12 chr2 122314879 122315006 -59433081 - RLTR11B LTR ERVK -68 377 237 6 1518 1219 201 26 0 chr2 122315006 122315274 -59432813 + RLTR11A2 LTR ERVK 228 502 -25 6 1518 235 269 96 11 chr2 122320141 122320235 -59427852 - MTEb LTR MaLR 0 379 278 6 1518 2118 153 44 2 chr2 122320332 122320532 -59427555 - BGLII_Mus LTR ERVK 0 422 219 6 1518 2118 153 44 2 chr2 122320885 122321079 -59427008 - BGLII_Mus LTR ERVK -213 209 3 6 1518 6412 189 83 75 chr2 122321079 122321363 -59426724 - RMER3D-int LTR ERVK 0 2842 2553 6 1518 6412 192 76 73 chr2 122321659 122323350 -59424737 - RMER3D-int LTR ERVK -290 2552 377 6 1518 501 189 29 36 chr2 122323359 122323496 -59424591 - RMER3D-int LTR ERVK -1692 1150 1015 6 1518 3489 30 2 0 chr2 122327901 122328296 -59419791 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 1518 591 152 62 31 chr2 122336329 122336458 -59411629 - RMER3D-int LTR ERVK -2234 608 476 6 1518 2129 154 99 28 chr2 122337995 122338389 -59409698 - BGLII_Mus LTR ERVK 0 422 1 6 1518 4773 168 59 24 chr2 122340611 122341525 -59406562 + RLTR25A LTR ERVK 9 954 -149 6 1518 898 199 148 29 chr2 122341618 122341722 -59406365 + RLTR25A LTR ERVK 832 963 -140 6 1518 898 199 148 29 chr2 122341779 122341917 -59406170 + RLTR25A LTR ERVK 964 1102 -1 6 1518 397 236 11 11 chr2 122341975 122342065 -59406022 - MTC LTR MaLR -8 413 324 6 1518 275 273 52 0 chr2 122342065 122342142 -59405945 + ORR1B1 LTR MaLR 38 118 -276 6 1518 620 105 10 10 chr2 122342153 122342249 -59405838 + ORR1B1 LTR MaLR 299 394 0 6 1518 1813 176 37 12 chr2 122342249 122342569 -59405518 - MTC LTR MaLR -93 328 1 6 1518 355 229 27 45 chr2 122345156 122345224 -59402863 - MTE2b LTR MaLR -10 369 304 6 1518 418 235 66 78 chr2 122345224 122345390 -59402697 - RNLTR23 LTR ERVK 0 642 479 6 1518 684 269 203 83 chr2 122345679 122345955 -59402132 - MTE2b LTR MaLR -70 309 1 6 1518 232 263 70 50 chr2 122351350 122351450 -59396637 + RLTR17 LTR ERVK 91 192 -500 6 1518 844 253 102 22 chr2 122356014 122356329 -59391758 + MLT1A0 LTR MaLR 1 340 -25 6 1518 3621 155 91 57 chr2 122358799 122359543 -59388544 + RMER19B LTR ERVK 1 770 -132 6 1518 737 158 64 14 chr2 122360213 122360354 -59387733 + RMER19B LTR ERVK 754 901 -1 6 1518 2255 135 23 14 chr2 122361247 122361600 -59386487 - RLTR15 LTR ERVK -3 356 1 6 1518 2055 128 6 56 chr2 122372542 122372881 -59375206 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 322 0 6 1518 19066 68 1 47 chr2 122372882 122375569 -59372518 + MMETn-int LTR ERVK 2 2565 -2279 6 1518 1303 102 23 46 chr2 122378480 122378696 -59369391 + LTRIS3 LTR ERV1 302 512 0 6 1518 1083 197 61 65 chr2 122380319 122380596 -59367491 + RMER16 LTR ERVK 242 517 -16 6 1518 1486 315 41 25 chr2 122380693 122381205 -59366882 + ORR1E-int LTR MaLR 406 925 -655 6 1518 1544 230 57 13 chr2 122381204 122381564 -59366523 + ORR1E-int LTR MaLR 1154 1530 -50 6 1518 474 300 112 51 chr2 122381564 122381891 -59366196 + ORR1E LTR MaLR 4 357 -13 6 1518 273 153 48 48 chr2 122382144 122382206 -59365881 + MTEb LTR MaLR 306 367 -12 6 1518 4593 93 13 109 chr2 122384673 122385504 -59362583 + RMER17A LTR ERVK 1 751 0 7 1518 2195 122 127 46 chr2 122385689 122386145 -59361942 - RLTR11A2 LTR ERVK 0 527 35 7 1518 2333 144 94 21 chr2 122386141 122386609 -59361478 + RMER17B LTR ERVK 339 833 -125 7 1518 279 307 109 24 chr2 122396106 122396334 -59351753 - MLT1G1 LTR MaLR -206 349 109 7 1518 1950 192 40 17 chr2 122397791 122398193 -59349894 - MTD LTR MaLR -8 411 1 7 1518 948 267 168 30 chr2 122405231 122405636 -59342451 + MLT2C2 LTR ERVL 4 464 0 7 1518 1676 152 124 27 chr2 122410553 122410925 -59337162 + RLTR9E LTR ERVK 1 408 -1 7 1518 249 354 131 15 chr2 122411158 122411356 -59336731 - MER74B LTR ERVL -270 352 132 7 1518 253 302 33 117 chr2 122412712 122412832 -59335255 - MTE2b LTR MaLR -121 258 149 7 1518 1318 162 79 0 chr2 122416474 122416714 -59331373 - MTC LTR MaLR 0 421 163 7 1519 409 326 48 99 chr2 122426871 122427164 -59320923 + ORR1E LTR MaLR 77 354 -5 7 1519 473 109 0 0 chr2 122446316 122446380 -59301707 + RLTR41 LTR ERV1 307 370 -76 7 1519 1069 277 56 49 chr2 122446449 122446833 -59301254 + MTE2a LTR MaLR 21 419 0 7 1519 428 269 106 138 chr2 122446894 122447140 -59300947 - RMER15 LTR ERVL -2 573 336 8 1519 2081 262 34 75 chr2 122447597 122448201 -59299886 - RMER15-int LTR ERVL -7 4992 4403 8 1519 2081 262 34 75 chr2 122448393 122448469 -59299618 - RMER15-int LTR ERVL -597 4402 4340 8 1519 7238 138 48 3 chr2 122448469 122449639 -59298448 + RMER12B LTR ERVK 1 1222 -182 8 1519 302 175 193 36 chr2 122449715 122449798 -59298289 - RMER15-int LTR ERVL -655 4344 4249 8 1519 526 328 74 21 chr2 122449834 122450077 -59298010 - RMER15-int LTR ERVL -2777 2222 1967 8 1519 570 368 20 54 chr2 122450496 122450792 -59297295 - RMER15 LTR ERVL -16 559 274 8 1519 289 215 164 75 chr2 122450793 122450939 -59297148 - RMER15 LTR ERVL -416 159 1 8 1519 321 281 94 0 chr2 122453143 122453239 -59294848 - MTC-int LTR MaLR -1055 203 99 8 1519 5135 139 27 4 chr2 122453239 122454055 -59294032 - RMER12 LTR ERVK -487 835 1 8 1519 1231 223 57 27 chr2 122454055 122454312 -59293775 - MTD LTR MaLR -111 308 44 8 1519 513 303 48 0 chr2 122454337 122454502 -59293585 + MLT1A0 LTR MaLR 133 305 -60 8 1519 1718 119 105 12 chr2 122459748 122460071 -59288016 - BGLII_B LTR ERVK 0 441 89 8 1519 887 109 65 7 chr2 122479913 122480052 -59268035 + ORR1B1 LTR MaLR 181 327 0 8 1519 4786 150 72 41 chr2 122480052 122481070 -59267017 + ORR1B1-int LTR MaLR 1 1049 -914 8 1519 2109 139 40 9 chr2 122481081 122481428 -59266659 + ORR1B1 LTR MaLR 37 394 0 8 1519 362 341 107 75 chr2 122484178 122484552 -59263535 - MER21B LTR ERV1 -142 721 336 8 1519 5881 82 64 46 chr2 122485800 122486364 -59261723 + RLTR13B1 LTR ERVK 1 584 -309 8 1519 5881 82 64 46 chr2 122486511 122486823 -59261264 + RLTR13B1 LTR ERVK 585 893 0 8 1519 1733 184 52 133 chr2 122487048 122487130 -59260957 + MTC LTR MaLR 1 79 -342 8 1519 1733 184 52 133 chr2 122487296 122487370 -59260717 + MTC LTR MaLR 80 107 -314 8 1519 1733 184 52 133 chr2 122488257 122488557 -59259530 + MTC LTR MaLR 108 421 0 8 1519 1305 162 83 36 chr2 122489654 122490065 -59258022 - RMER17C LTR ERVK -520 438 19 8 1519 550 118 0 34 chr2 122493550 122493638 -59254449 - RLTR18-int LTR ERVK -595 4766 4682 8 1519 2936 32 24 0 chr2 122496257 122496595 -59251492 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 8 1519 994 237 174 17 chr2 122498604 122498892 -59249195 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 38 8 1519 1969 203 40 38 chr2 122500712 122501132 -59246955 + MTC LTR MaLR 1 421 0 1 1519 375 296 88 29 chr2 122521334 122521470 -59226617 + MLT1A1 LTR MaLR 252 395 -13 3 1519 1136 265 123 11 chr2 122529776 122530264 -59217823 + MLT1F LTR MaLR 9 560 0 4 1519 2473 57 6 0 chr2 122531075 122531392 -59216695 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 5 1519 623 286 67 45 chr2 122538779 122539002 -59209085 - MLT1A0 LTR MaLR -66 299 72 6 1519 1216 305 51 27 chr2 122540491 122540939 -59207148 - ORR1E-int LTR MaLR -945 635 177 6 1519 2496 148 20 24 chr2 122541106 122541515 -59206572 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 6 1519 546 288 8 0 chr2 122541994 122542112 -59205975 - ORR1E-int LTR MaLR -1461 119 1 6 1519 423 283 136 59 chr2 122542117 122542431 -59205656 - ORR1E LTR MaLR -3 356 1 6 1519 864 268 93 51 chr2 122546912 122547223 -59200864 + ORR1E LTR MaLR 26 349 -10 7 1519 2286 136 117 0 chr2 122548030 122548382 -59199705 + ORR1B1 LTR MaLR 2 394 0 7 1519 359 342 98 33 chr2 122550304 122550549 -59197538 + LTR16A1 LTR ERVL 190 450 -6 8 1519 420 321 99 50 chr2 122551226 122551488 -59196599 + MLT1E1A LTR MaLR 404 678 -2 8 1519 392 250 86 73 chr2 122551498 122551649 -59196438 + LTR41 LTR ERVL 101 253 -515 8 1519 563 340 76 7 chr2 122551770 122552060 -59196027 + LTR41 LTR ERVL 450 759 -9 8 1519 335 345 73 101 chr2 122552048 122552296 -59195791 - LTR33A_ LTR ERVL -216 315 75 8 1520 1314 214 138 142 chr2 122556334 122556869 -59191218 + MT2A LTR ERVL 1 533 0 8 1520 469 288 66 138 chr2 122560732 122561139 -59186948 - MTEa LTR MaLR 0 379 2 9 1520 422 199 160 32 chr2 122561327 122561483 -59186604 + RLTR42-int LTR ERVK 1231 1406 -4116 1 1520 272 283 86 26 chr2 122563275 122563391 -59184696 - MLT1D LTR MaLR -135 370 248 1 1520 518 244 57 6 chr2 122579071 122579228 -59168859 - MLT2D LTR ERVL -249 165 1 1 1520 242 305 49 0 chr2 122581271 122581353 -59166734 + MLT1M LTR MaLR 144 229 -443 1 1520 2033 88 24 0 chr2 122581948 122582244 -59165843 + ORR1A2 LTR MaLR 25 327 0 1 1520 284 331 56 16 chr2 122582902 122583028 -59165059 - LTR31 LTR ERV1 -15 604 474 1 1520 461 266 32 0 chr2 122583823 122583947 -59164140 + HERV16-int LTR ERVL 1843 1970 -3026 1 1520 292 360 112 30 chr2 122584636 122584805 -59163282 + LTR16B2 LTR ERVL 1 183 -279 1 1520 593 221 21 102 chr2 122585558 122585744 -59162343 - MTEa LTR MaLR -8 371 201 1 1520 425 266 21 0 chr2 122585748 122585842 -59162245 - MTEa LTR MaLR -263 96 1 1 1520 433 287 42 0 chr2 122586517 122586660 -59161427 - MLT1A1 LTR MaLR -259 149 1 1 1520 2334 89 35 0 chr2 122588194 122588510 -59159577 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 1 1520 358 233 54 35 chr2 122595167 122595332 -59152755 + RLTR13D3 LTR ERVK 983 1072 -42 1 1520 842 223 50 75 chr2 122597786 122597840 -59150247 - MT2B LTR ERVL 0 601 544 1 1520 842 230 124 76 chr2 122597890 122598285 -59149802 - MT2B LTR ERVL -58 543 19 1 1520 1451 89 19 0 chr2 122599431 122599645 -59148442 - MT2B LTR ERVL 0 601 384 1 1520 4106 106 29 20 chr2 122599725 122600321 -59147766 + MT2B LTR ERVL 1 601 0 1 1520 717 332 28 25 chr2 122600400 122600724 -59147363 - MLT1D LTR MaLR -54 451 127 1 1520 269 273 184 14 chr2 122600729 122600870 -59147217 - MLT1D-int LTR MaLR -1510 225 61 1 1520 628 359 93 43 chr2 122602103 122602639 -59145448 - MER74B LTR ERVL -4 618 56 1 1520 543 233 33 0 chr2 122602885 122603035 -59145052 + MLT2B4 LTR ERVL 2 156 -400 1 1520 1405 215 138 0 chr2 122603214 122603539 -59144548 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 1 1520 287 265 12 24 chr2 122606719 122606804 -59141283 - MER21B LTR ERV1 -314 549 466 1 1520 295 253 12 74 chr2 122606956 122607037 -59141050 - MER21B LTR ERV1 -628 235 160 1 1520 275 303 36 18 chr2 122608005 122608116 -59139971 - ORR1E LTR MaLR -221 138 26 1 1520 343 341 48 82 chr2 122611197 122611488 -59136599 - MLT1C LTR MaLR -13 454 174 1 1520 3489 28 2 0 chr2 122614386 122614781 -59133306 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 1520 975 108 104 81 chr2 122621487 122621708 -59126379 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 250 1 1520 1226 95 18 59 chr2 122621713 122622052 -59126035 - MMERVK10C-int LTR ERVK -6203 278 10 1 1520 3372 78 6 39 chr2 122622062 122622553 -59125534 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 1 1520 261 308 64 57 chr2 122635711 122635852 -59112235 + LTR16B LTR ERVL 294 435 -28 2 1520 494 257 146 24 chr2 122642239 122642486 -59105601 - RLTR10A LTR ERVK 0 411 135 2 1520 1864 236 70 50 chr2 122643704 122644307 -59103780 - RLTR17 LTR ERVK -77 615 1 2 1520 2929 99 7 2 chr2 122647217 122647622 -59100465 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 2 1520 1534 146 243 17 chr2 122648493 122648912 -59099175 - RMER15 LTR ERVL 0 575 62 2 1520 1053 259 48 21 chr2 122653064 122653399 -59094688 + MLT1B LTR MaLR 47 390 0 2 1520 2957 198 90 69 chr2 122659432 122660264 -59087823 - RMER13B LTR ERVK 0 860 12 2 1520 381 217 0 0 chr2 122662844 122662936 -59085151 + ORR1E LTR MaLR 1 92 -278 2 1520 732 261 96 21 chr2 122664385 122664624 -59083463 + ORR1E LTR MaLR 101 357 -2 2 1520 537 280 171 8 chr2 122664631 122664876 -59083211 + MLT1F2 LTR MaLR 276 560 0 2 1520 1130 278 137 11 chr2 122672594 122672951 -59075136 - MTD LTR MaLR 0 419 18 2 1520 2707 138 62 12 chr2 122675493 122675990 -59072097 + RLTR11A LTR ERVK 7 528 0 2 1520 986 302 27 99 chr2 122676574 122676949 -59071138 - ORR1E LTR MaLR -10 349 2 2 1521 2216 100 26 0 chr2 122686483 122686794 -59061293 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 2 1521 351 351 148 8 chr2 122687879 122688123 -59059964 - MLT1C LTR MaLR -3 464 187 2 1521 771 315 18 25 chr2 122688542 122688816 -59059271 + MLT1B LTR MaLR 40 311 -79 2 1521 2179 75 39 0 chr2 122691481 122691788 -59056299 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 2 1521 228 351 160 23 chr2 122693531 122693706 -59054381 - LTR33 LTR ERVL -303 212 14 2 1521 1654 194 33 82 chr2 122701159 122701516 -59046571 - ORR1B1 LTR MaLR -1 393 55 3 1521 4047 160 1 92 chr2 122701516 122702109 -59045978 - RMER6A LTR ERVK 0 756 201 3 1521 4047 160 1 92 chr2 122702285 122702523 -59045564 - RMER6A LTR ERVK -556 200 1 3 1521 1654 194 33 82 chr2 122702523 122702557 -59045530 - ORR1B1 LTR MaLR -340 54 21 3 1521 228 336 70 38 chr2 122705426 122705584 -59042503 + ORR1E LTR MaLR 92 254 -105 3 1521 1537 326 41 24 chr2 122705713 122706342 -59041745 + MTE-int LTR MaLR 1 640 -940 3 1521 1020 245 70 121 chr2 122712211 122712657 -59035430 + RLTR23 LTR ERV1 8 430 0 3 1521 2431 198 105 57 chr2 122713264 122714015 -59034072 + RLTR19-int LTR ERVK 449 1235 -4902 3 1521 2976 167 83 62 chr2 122714018 122715429 -59032658 + RLTR19-int LTR ERVK 1349 2886 -3251 3 1521 1148 140 45 9 chr2 122715461 122715684 -59032403 + RLTR19-int LTR ERVK 2960 3190 -2947 3 1521 1103 192 39 13 chr2 122721565 122721797 -59026290 + RLTR19-int LTR ERVK 4133 4370 -1767 3 1521 595 244 102 159 chr2 122721936 122722389 -59025698 + RLTR23 LTR ERV1 2 428 -2 3 1521 771 246 102 53 chr2 122729282 122729600 -59018487 - MT2B LTR ERVL -333 268 1 3 1521 543 233 9 19 chr2 122729605 122729710 -59018377 - ORR1E LTR MaLR -232 127 24 3 1521 504 32 0 0 chr2 122736894 122736957 -59011130 + RLTR10C LTR ERVK 38 100 -336 3 1521 3432 52 0 16 chr2 122736957 122737316 -59010771 - MMERVK10C-int LTR ERVK -3927 3654 3302 3 1521 7438 34 29 1 chr2 122737316 122738148 -59009939 + RLTR13A LTR ERVK 1 855 0 3 1521 3432 52 0 16 chr2 122738148 122738215 -59009872 - MMERVK10C-int LTR ERVK -4280 3301 3235 3 1521 2646 50 8 64 chr2 122738200 122738561 -59009526 + MMERVK10C-int LTR ERVK 7241 7581 0 3 1521 3721 38 33 0 chr2 122738561 122738983 -59009104 + RLTR10C LTR ERVK 1 436 0 3 1521 1036 330 57 49 chr2 122739188 122739820 -59008267 - HERV16-int LTR ERVL -3616 1380 744 3 1521 1711 240 59 10 chr2 122743452 122743843 -59004244 + MTD LTR MaLR 2 411 -8 3 1521 647 250 84 24 chr2 122747003 122747216 -59000871 - MT2A LTR ERVL -2 531 306 3 1521 399 200 28 65 chr2 122759894 122760001 -58988086 + MTD LTR MaLR 131 233 -186 3 1521 5574 105 8 82 chr2 122760717 122761675 -58986412 - RMER17D LTR ERVK -2 887 1 3 1521 1878 158 83 9 chr2 122761733 122762083 -58986004 - ORR1B1 LTR MaLR -18 376 1 3 1521 334 317 133 20 chr2 122764832 122765080 -58983007 + LTR33 LTR ERVL 62 337 -178 3 1521 234 337 18 117 chr2 122771751 122771862 -58976225 + LTR88c LTR Genie? 16 115 -747 3 1521 396 374 135 54 chr2 122772350 122772833 -58975254 + LTR16E2 LTR ERVL 40 561 -7 3 1521 436 260 159 58 chr2 122773256 122773464 -58974623 + LTR89 LTR ERVL? 2 230 -649 3 1521 2027 164 17 17 chr2 122773690 122774038 -58974049 + ORR1B1 LTR MaLR 41 388 -6 3 1521 1910 187 73 16 chr2 122775725 122776106 -58971981 + RMER15 LTR ERVL 7 409 -166 3 1521 911 194 53 6 chr2 122782526 122782665 -58965422 + RMER15 LTR ERVL 397 543 -32 3 1521 911 194 53 6 chr2 122782707 122782738 -58965349 + RMER15 LTR ERVL 544 575 0 3 1521 907 236 6 0 chr2 122783299 122783473 -58964614 + RMER15 LTR ERVL 245 419 -156 3 1521 1183 273 47 81 chr2 122786714 122787080 -58961007 + ORR1E LTR MaLR 1 359 0 4 1521 365 350 78 36 chr2 122787871 122788064 -58960023 + LTR89 LTR ERVL? 429 629 -250 4 1521 1843 216 6 14 chr2 122789767 122790129 -58957958 - ORR1B2 LTR MaLR -8 359 1 4 1521 338 389 47 68 chr2 122791487 122791766 -58956321 - MER21B LTR ERV1 -279 584 312 4 1521 283 228 0 17 chr2 122792390 122792448 -58955639 - MER21B LTR ERV1 -536 327 271 4 1521 575 352 114 59 chr2 122794983 122795420 -58952667 - LTR84a LTR ERVL -12 745 284 4 1521 575 352 114 59 chr2 122795451 122795707 -58952380 - LTR84a LTR ERVL -474 283 15 4 1521 471 314 6 70 chr2 122795815 122795986 -58952101 - MER74A LTR ERVL -2 556 397 4 1521 241 321 73 77 chr2 122808042 122808088 -58939999 - LTR16B2 LTR ERVL -151 311 265 4 1521 241 321 73 77 chr2 122808178 122808418 -58939669 - LTR16B2 LTR ERVL -198 264 27 4 1521 379 283 24 24 chr2 122811208 122811331 -58936756 - RMER12 LTR ERVK -101 1221 1099 4 1521 466 285 27 92 chr2 122811364 122811759 -58936328 - RMER12 LTR ERVK -177 1227 555 4 1521 1534 224 45 72 chr2 122811741 122812355 -58935732 - RMER12 LTR ERVK -596 808 1 4 1522 377 237 134 8 chr2 122818557 122818676 -58929411 + MLT1F1 LTR MaLR 282 415 -154 4 1522 229 261 0 44 chr2 122818840 122818908 -58929179 + MLT1F1-int LTR MaLR 1342 1406 -3 4 1522 230 200 60 0 chr2 122828698 122828748 -58919339 + LTR65 LTR ERV1 342 394 -275 4 1522 236 310 11 65 chr2 122828724 122828817 -58919270 - LTR16E2 LTR ERVL -13 638 551 4 1522 243 381 123 43 chr2 122828866 122829143 -58918944 - LTR16E2 LTR ERVL -195 373 75 4 1522 817 227 57 14 chr2 122833313 122833523 -58914564 - RMER15 LTR ERVL -51 524 306 4 1522 1155 275 18 57 chr2 122834278 122834610 -58913477 - MTEb LTR MaLR -57 322 4 4 1522 243 298 35 35 chr2 122846881 122846968 -58901119 + MLT1H LTR MaLR 8 94 -455 4 1522 2832 19 0 0 chr2 122851721 122852043 -58896044 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 4 1522 677 161 0 221 chr2 122852554 122852753 -58895334 + ORR1C1 LTR MaLR 1 155 -223 4 1522 1001 219 66 35 chr2 122854134 122854361 -58893726 + ORR1C1 LTR MaLR 143 376 -2 4 1522 445 159 0 0 chr2 122857085 122857150 -58890937 + MT2B LTR ERVL 1 65 -536 4 1522 2781 188 30 6 chr2 122857150 122857654 -58890433 - RMER20A LTR ERVK 0 516 1 4 1522 608 239 150 39 chr2 122857716 122858030 -58890057 + MT2B LTR ERVL 87 545 -56 4 1522 849 212 4 143 chr2 122858282 122858519 -58889568 + MERVL_2A-int LTR ERVL 760 963 -4798 4 1522 424 204 11 0 chr2 122858515 122858608 -58889479 + MERVL_2A-int LTR ERVL 1305 1398 -4363 4 1522 7725 164 40 21 chr2 122858611 122859319 -58888768 + MERVL_2A-int LTR ERVL 1536 2256 -3505 4 1522 7725 164 40 21 chr2 122859360 122859922 -58888165 + MERVL_2A-int LTR ERVL 2257 2837 -2924 4 1522 2509 99 61 20 chr2 122859922 122860313 -58887774 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 4 1522 7725 164 40 21 chr2 122860313 122860516 -58887571 + MERVL_2A-int LTR ERVL 2838 3038 -2723 4 1522 716 289 55 80 chr2 122860541 122860943 -58887144 + RLTR12B LTR ERVK 47 438 -90 4 1522 957 247 12 46 chr2 122862004 122862327 -58885760 + MYSERV6-int LTR ERVK 127 438 -8521 4 1522 1934 132 6 70 chr2 122862424 122862767 -58885320 - ORR1A4 LTR MaLR -8 321 1 4 1522 733 231 5 5 chr2 122862774 122862961 -58885126 + MYSERV6-int LTR ERVK 715 901 -8058 4 1522 4554 239 48 34 chr2 122863111 122864389 -58883698 + MYSERV6-int LTR ERVK 884 2180 -6779 4 1522 2182 215 122 28 chr2 122864525 122865057 -58883030 - RMER20B LTR ERVK -16 611 30 4 1522 1165 312 97 53 chr2 122865079 122865806 -58882281 + RMER13A LTR ERVK 14 865 -43 4 1522 5732 135 24 62 chr2 122865830 122866894 -58881193 - RLTR13D2 LTR ERVK 0 1023 1 5 1522 248 179 0 0 chr2 122866913 122866952 -58881135 - RMER20B LTR ERVK -477 39 1 4 1522 11478 184 48 18 chr2 122866952 122870033 -58878054 + MYSERV6-int LTR ERVK 1891 5077 -1473 4 1522 428 267 122 28 chr2 122870042 122870223 -58877864 + RMER4A LTR ERVK 239 436 -30 5 1522 2185 186 38 137 chr2 122870227 122870973 -58877114 + MYSERV6-int LTR ERVK 7765 8436 -523 4 1522 675 269 130 68 chr2 122871231 122871714 -58876373 - RLTR12B LTR ERVK -15 513 1 5 1522 1953 102 56 62 chr2 122872608 122872931 -58875156 + ORR1A4 LTR MaLR 1 321 -8 5 1522 646 332 103 13 chr2 122878192 122878494 -58869593 + RMER15 LTR ERVL 247 575 0 5 1522 2463 113 3 37 chr2 122880215 122880593 -58867494 - RLTR8 LTR ERVK 0 365 1 5 1522 2321 129 37 8 chr2 122880764 122881139 -58866948 + ORR1B1 LTR MaLR 1 386 -8 5 1522 537 209 19 0 chr2 122881441 122881546 -58866541 - RLTR25B LTR ERVK 0 1028 922 5 1522 3946 152 26 78 chr2 122881563 122882367 -58865720 - RLTR25B LTR ERVK -266 762 1 5 1522 440 362 48 65 chr2 122886253 122886590 -58861497 - RLTR25A LTR ERVK -772 331 1 5 1522 469 329 96 79 chr2 122886590 122887118 -58860969 - RLTR18 LTR ERVK -47 569 33 5 1522 232 312 53 44 chr2 122893393 122893507 -58854580 + MLT1A1 LTR MaLR 21 135 -273 5 1522 571 197 20 60 chr2 122895680 122895831 -58852256 + RLTR20B3 LTR ERVK 290 434 -143 5 1522 497 335 27 48 chr2 122899431 122899619 -58848468 - MTEa LTR MaLR -195 184 1 5 1522 366 303 98 61 chr2 122900737 122900951 -58847136 + LTR16A1 LTR ERVL 215 436 -20 5 1522 396 174 0 0 chr2 122902894 122902963 -58845124 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 299 5 1522 502 111 99 0 chr2 122902959 122903040 -58845047 - ORR1B2 LTR MaLR -275 92 4 5 1522 4198 171 64 62 chr2 122911721 122912702 -58835385 - RLTR13C1 LTR ERVK 0 983 1 5 1522 369 318 77 77 chr2 122921226 122921420 -58826667 - RMER2 LTR ERV1 -44 523 330 5 1522 536 315 87 71 chr2 122928039 122928433 -58819654 + MLT1E1A LTR MaLR 289 656 -24 5 1522 422 304 118 84 chr2 122928462 122928785 -58819302 + LTR16D2 LTR ERVL 124 457 -115 5 1522 1569 162 88 10 chr2 122930419 122930724 -58817363 + IAPEY3_LTR LTR ERVK 1 329 -3 5 1523 421 316 8 0 chr2 122946955 122947072 -58801015 + RLTR14 LTR ERV1 1 118 -264 6 1523 471 300 107 36 chr2 122948940 122949165 -58798922 + RLTR14 LTR ERV1 142 382 0 6 1523 284 315 106 72 chr2 122949165 122949552 -58798535 + RLTR14-int LTR ERV1 2 401 -4916 6 1523 3211 67 2 9 chr2 122950357 122950781 -58797306 - BGLII LTR ERVK 0 421 1 6 1523 404 331 47 35 chr2 122952674 122952843 -58795244 + LTR16A LTR ERVL 1 171 -280 6 1523 307 358 64 46 chr2 122952895 122953068 -58795019 + LTR16A LTR ERVL 276 451 0 6 1523 288 357 124 97 chr2 122956455 122956830 -58791257 + MLT1H LTR MaLR 29 403 -146 6 1523 1795 209 33 195 chr2 122956830 122957559 -58790528 - RMER19C LTR ERVK 0 611 1 6 1523 288 357 124 97 chr2 122957559 122957689 -58790398 + MLT1H LTR MaLR 404 548 -1 6 1523 2262 78 119 11 chr2 122958397 122958749 -58789338 - RLTR10 LTR ERVK 0 390 1 6 1523 967 327 97 43 chr2 122960076 122960632 -58787455 - MER21B LTR ERV1 -213 650 65 6 1523 266 257 66 74 chr2 122964391 122964571 -58783516 - LTR16B1 LTR ERVL -62 418 207 6 1523 290 383 45 60 chr2 122964887 122965087 -58783000 + LTR16E2 LTR ERVL 150 346 -222 6 1523 1206 236 47 11 chr2 122965767 122966041 -58782046 - MTD LTR MaLR -135 284 1 6 1523 268 424 111 17 chr2 122968509 122968744 -58779343 + LTR16E2 LTR ERVL 192 448 -120 6 1523 403 333 133 50 chr2 122968753 122969173 -58778914 - LTR86C LTR ERVL -140 481 27 6 1523 989 274 110 24 chr2 122969372 122969708 -58778379 - MTE2b LTR MaLR 0 379 15 6 1523 2123 114 10 19 chr2 122971085 122971397 -58776690 + RLTR27 LTR ERVK 1 309 0 6 1523 1305 203 164 117 chr2 122977869 122978315 -58769772 - MT2A LTR ERVL -66 467 1 6 1523 281 438 0 54 chr2 122989092 122989297 -58758790 + MLT1F LTR MaLR 34 227 -321 6 1523 920 312 135 0 chr2 122990394 122990727 -58757360 - MLT1E LTR MaLR -174 479 102 6 1523 1225 270 101 11 chr2 122991205 122991572 -58756515 - MTD LTR MaLR 0 419 20 6 1523 695 226 165 21 chr2 122991929 122992123 -58755964 - MTE2b LTR MaLR -7 372 151 6 1523 1945 258 75 61 chr2 122992252 122993004 -58755083 - RLTR40 LTR ERVK -55 762 1 6 1523 897 288 119 62 chr2 122993833 122994185 -58753902 + MTE2b LTR MaLR 6 377 -2 6 1523 374 312 78 8 chr2 122997841 122997970 -58750117 + LTR16C LTR ERVL 352 489 0 6 1523 321 330 88 19 chr2 122998675 122998855 -58749232 + LTR16D1 LTR ERVL 36 333 -342 6 1523 230 387 83 6 chr2 122998963 122999119 -58748968 + LTR16D1 LTR ERVL 405 572 0 6 1523 1817 125 85 7 chr2 123000996 123001303 -58746784 - IAPEY3_LTR LTR ERVK -1 331 1 5 1523 1035 269 152 98 chr2 123002929 123003410 -58744677 + MT2A LTR ERVL 3 509 -24 1 1523 1836 233 58 38 chr2 123005915 123006419 -58741668 + RMER19C LTR ERVK 98 611 0 1 1523 287 321 94 82 chr2 123012333 123012577 -58735510 - RMER15 LTR ERVL -6 569 323 1 1523 235 243 93 67 chr2 123017318 123017393 -58730694 + MamGypLTR3 LTR Gypsy 218 294 -545 2 1523 776 281 133 62 chr2 123023851 123024210 -58723877 + MTE2a LTR MaLR 8 379 0 3 1523 975 301 110 4 chr2 123025205 123025478 -58722609 - MTE2b LTR MaLR -71 308 7 3 1523 228 412 50 22 chr2 123027090 123027229 -58720858 + LTR16E2 LTR ERVL 24 166 -402 3 1523 249 402 0 10 chr2 123027494 123027597 -58720490 + LTR16E2 LTR ERVL 440 541 -27 3 1523 2023 125 6 107 chr2 123028045 123028495 -58719592 + ORR1A4 LTR MaLR 1 353 -41 4 1523 2023 103 0 113 chr2 123028899 123028971 -58719116 + ORR1A4 LTR MaLR 288 329 0 4 1523 655 242 96 67 chr2 123040026 123040234 -58707853 + ORR1E LTR MaLR 14 227 -132 5 1523 240 315 136 59 chr2 123044377 123044495 -58703592 + MTEa LTR MaLR 43 169 -210 5 1523 388 290 121 0 chr2 123046138 123046262 -58701825 - RMER15 LTR ERVL -34 541 403 5 1523 293 385 174 28 chr2 123046916 123047306 -58700781 - LTR16B LTR ERVL -2 461 15 5 1523 371 371 53 35 chr2 123047577 123048119 -58699968 - HERV16-int LTR ERVL -2405 2591 1972 6 1523 2457 125 40 48 chr2 123050803 123051282 -58696805 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 6 1523 4692 58 5 32 chr2 123051307 123051971 -58696116 + IAPEz-int LTR ERVK 17 662 -5819 6 1523 424 38 0 0 chr2 123051971 123052024 -58696063 + IAPEz-int LTR ERVK 1359 1411 -5070 6 1523 1728 115 4 4 chr2 123052023 123052285 -58695802 + IAPEz-int LTR ERVK 2236 2497 -5183 6 1523 873 81 24 0 chr2 123052282 123052405 -58695682 + IAPEz-int LTR ERVK 4785 4910 -2770 6 1523 19568 21 6 3 chr2 123052407 123054758 -58693329 + IAPEz-int LTR ERVK 4123 6481 0 6 1523 2525 116 40 48 chr2 123054758 123055237 -58692850 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 6 1523 7640 88 6 7 chr2 123060100 123061124 -58686963 - RLTR13D5 LTR ERVK 0 1023 1 6 1523 1885 134 14 90 chr2 123065647 123066001 -58682086 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 7 1523 857 209 10 60 chr2 123072018 123072217 -58675870 + MTC LTR MaLR 1 189 -232 8 1523 1547 192 94 20 chr2 123072231 123072397 -58675690 + ORR1D1 LTR MaLR 1 184 -190 8 1523 1547 192 94 20 chr2 123072463 123072637 -58675450 + ORR1D1 LTR MaLR 185 365 -9 8 1523 1998 147 52 17 chr2 123072876 123073223 -58674864 - ORR1B2 LTR MaLR -8 359 1 8 1524 3060 70 5 0 chr2 123076970 123077368 -58670719 + MTB LTR MaLR 1 400 0 8 1524 913 291 75 64 chr2 123077502 123077876 -58670211 - LTR55 LTR ERV -170 378 1 9 1524 341 322 49 118 chr2 123078274 123078316 -58669771 - ORR1E LTR MaLR -169 190 158 9 1524 341 322 49 118 chr2 123078359 123078520 -58669567 - ORR1E LTR MaLR -202 157 1 9 1524 1374 309 116 13 chr2 123081821 123082366 -58665721 + MTE-int LTR MaLR 302 902 -678 1 1524 674 229 63 13 chr2 123082375 123082534 -58665553 - MTD LTR MaLR -14 405 239 1 1524 1049 309 7 40 chr2 123082773 123083073 -58665014 - MTEa LTR MaLR -84 295 6 1 1524 1831 194 55 17 chr2 123088516 123088920 -58659167 + MTD LTR MaLR 1 419 0 1 1524 285 345 25 16 chr2 123095164 123095285 -58652802 - RMER5 LTR ERV1 -30 504 383 1 1524 288 344 53 15 chr2 123095340 123095473 -58652614 - RMER5 LTR ERV1 -285 249 112 1 1524 1675 201 4 111 chr2 123096887 123097326 -58650761 - MTD LTR MaLR 0 419 21 1 1524 1675 201 4 111 chr2 123097349 123097378 -58650709 - MTD LTR MaLR -399 20 1 1 1524 276 28 0 0 chr2 123097718 123097754 -58650333 + RLTR10B LTR ERVK 1 36 -256 1 1524 1894 87 102 40 chr2 123097771 123098096 -58649991 + RLTR10B LTR ERVK 21 365 0 1 1524 1364 79 0 6 chr2 123098096 123098275 -58649812 + MMERVK10C-int LTR ERVK 1 178 -7403 1 1524 2468 35 115 0 chr2 123098431 123098769 -58649318 + MMERVK10C-int LTR ERVK 553 916 -1071 1 1524 381 305 38 38 chr2 123098752 123098987 -58649100 + MMERVK10C-int LTR ERVK 1332 1566 -6015 1 1524 2544 110 39 10 chr2 123098971 123099386 -58648701 + MMERVK10C-int LTR ERVK 5001 5804 -1777 1 1524 7597 46 0 33 chr2 123099378 123099433 -58648654 + MMERVK10C-int LTR ERVK 6646 6697 -884 1 1524 7597 46 0 33 chr2 123099466 123100378 -58647709 + MMERVK10C-int LTR ERVK 6698 7581 0 1 1524 2338 31 0 49 chr2 123100378 123100685 -58647402 + RLTR10B LTR ERVK 1 292 0 1 1524 387 253 23 0 chr2 123105810 123105897 -58642190 + MTE2b LTR MaLR 30 118 -261 1 1524 510 259 7 73 chr2 123107114 123107264 -58640823 + MTE2b LTR MaLR 210 349 -30 1 1524 2001 194 26 49 chr2 123110431 123110860 -58637227 - MTC LTR MaLR -2 419 1 1 1524 546 241 138 125 chr2 123111338 123111570 -58636517 - ORR1E LTR MaLR 0 370 136 1 1524 2038 145 5 78 chr2 123111654 123112066 -58636021 + RLTR11B LTR ERVK 1 382 -71 1 1524 1291 227 14 41 chr2 123112066 123112429 -58635658 + MYSERV-int LTR ERVK 6172 6524 -26 1 1524 2337 150 29 29 chr2 123112603 123113056 -58635031 + RLTR11B LTR ERVK 1 453 0 1 1524 3755 11 121 0 chr2 123113668 123114108 -58633979 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 1 1524 302 0 0 0 chr2 123114108 123114146 -58633941 - MERVL-int LTR ERVL 0 5485 5448 1 1524 366 179 46 35 chr2 123114146 123114233 -58633854 - ORR1A3-int LTR MaLR -1323 640 553 1 1524 45333 17 0 0 chr2 123114233 123119569 -58628518 - MERVL-int LTR ERVL -125 5360 25 1 1524 347 324 45 34 chr2 123119569 123119593 -58628494 - ORR1E LTR MaLR -206 178 152 1 1524 3770 9 121 0 chr2 123119593 123120033 -58628054 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 1 1524 608 237 40 5 chr2 123120033 123120184 -58627903 - ORR1E LTR MaLR -233 151 1 1 1524 4470 122 33 1 chr2 123124411 123125076 -58623011 + RMER19A LTR ERVK 52 737 0 1 1524 1906 142 92 53 chr2 123126643 123127022 -58621065 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 1 1524 775 340 59 12 chr2 123131061 123131383 -58616704 + MLT1A0 LTR MaLR 1 337 -28 1 1524 475 256 14 15 chr2 123132736 123132874 -58615213 - ORR1B2 LTR MaLR -227 140 12 1 1524 1752 116 94 19 chr2 123132879 123133187 -58614900 + IAPEY_LTR LTR ERVK 55 385 0 1 1524 239 228 83 42 chr2 123133948 123134044 -58614043 - MLT1A0 LTR MaLR -265 100 1 1 1524 1064 279 39 53 chr2 123139587 123139922 -58608165 + ORR1E LTR MaLR 20 377 -2 1 1524 775 290 103 60 chr2 123139986 123140470 -58607617 - MLT1D LTR MaLR 0 505 1 1 1524 1723 114 14 84 chr2 123142286 123142630 -58605457 + RLTR15 LTR ERVK 37 356 -3 1 1524 235 309 29 128 chr2 123145041 123145245 -58602842 + LTR90B LTR LTR 609 792 -4 1 1524 289 386 33 46 chr2 123153274 123153426 -58594661 - MLT2F LTR ERVL -243 420 271 2 1524 267 364 21 0 chr2 123153871 123154011 -58594076 - MERVL_2A-int LTR ERVL -329 5432 5290 2 1524 1114 280 41 19 chr2 123155583 123155900 -58592187 - MTEa LTR MaLR 0 379 56 2 1524 1227 204 18 66 chr2 123156391 123156664 -58591423 - MTC LTR MaLR -2 419 160 2 1524 701 189 217 21 chr2 123156656 123156845 -58591242 - MTC-int LTR MaLR -1032 226 1 2 1524 437 191 32 12 chr2 123156845 123156946 -58591141 - MTC LTR MaLR 0 421 268 2 1524 1463 240 55 52 chr2 123161421 123161860 -58586227 - RMER15 LTR ERVL -5 570 131 2 1524 3682 213 83 25 chr2 123171323 123172189 -58575898 - RMER19B LTR ERVK 0 902 25 2 1524 1953 204 33 196 chr2 123179672 123180402 -58567685 + RMER19C LTR ERVK 1 611 0 2 1524 560 345 88 0 chr2 123187759 123188066 -58560021 - MLT2B4 LTR ERVL -218 338 5 2 1524 406 109 94 0 chr2 123198819 123198883 -58549204 + MT2B LTR ERVL 273 342 -259 2 1524 340 359 65 23 chr2 123199184 123199492 -58548595 - ERVL-B4-int LTR ERVL -1470 4244 3924 2 1524 1757 135 347 50 chr2 123199611 123200072 -58548015 + MT2B LTR ERVL 3 600 -1 2 1524 407 220 138 57 chr2 123206148 123206307 -58541780 - RLTR40 LTR ERVK -348 469 298 2 1524 280 324 56 91 chr2 123206371 123206568 -58541519 - RMER12 LTR ERVK -466 856 667 2 1525 3455 70 25 8 chr2 123214538 123215012 -58533075 - RLTR45 LTR ERVK 0 482 1 2 1525 6544 51 14 0 chr2 123218436 123219233 -58528854 + RLTR13C2 LTR ERVK 1 808 0 3 1525 251 359 22 44 chr2 123219368 123219505 -58528582 + MTEb LTR MaLR 240 373 -6 3 1525 1540 216 40 43 chr2 123221743 123221935 -58526152 - ORR1D1 LTR MaLR -2 372 185 3 1525 1540 216 40 43 chr2 123222114 123222291 -58525796 - ORR1D1 LTR MaLR -190 184 2 3 1525 457 277 0 0 chr2 123224099 123224211 -58523876 - ORR1D1 LTR MaLR -261 113 2 3 1525 247 323 40 20 chr2 123228215 123228316 -58519771 + MLT1B LTR MaLR 17 119 -255 3 1525 276 213 40 13 chr2 123228340 123228416 -58519671 + MLT1B LTR MaLR 76 153 -237 3 1525 506 311 107 52 chr2 123228408 123228699 -58519388 + MLT1B LTR MaLR 68 374 -16 3 1525 598 288 44 80 chr2 123235436 123235799 -58512288 + RLTR15 LTR ERVK 1 350 -9 3 1525 638 248 341 4 chr2 123250169 123250453 -58497634 - ORR1D2 LTR MaLR 0 379 1 3 1525 231 418 84 15 chr2 123253222 123253555 -58494532 - LTR16A LTR ERVL -13 438 83 3 1525 3065 23 0 0 chr2 123257199 123257545 -58490542 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 3 1525 412 277 184 24 chr2 123258692 123258899 -58489188 + RMER15 LTR ERVL 336 575 0 3 1525 360 223 62 21 chr2 123262686 123262782 -58485305 - RMER4A LTR ERVK 0 466 367 3 1525 514 280 76 0 chr2 123263318 123263450 -58484637 - RMER4B LTR ERVK -101 484 343 3 1525 1275 179 13 9 chr2 123263622 123263853 -58484234 - RMER4B LTR ERVK -337 248 17 3 1525 1089 192 18 5 chr2 123263861 123264081 -58484006 - MurERV4-int LTR ERVK -1 5259 5037 3 1525 1327 251 9 0 chr2 123264077 123264396 -58483691 - MurERV4-int LTR ERVK -3561 1699 1378 3 1525 584 226 0 0 chr2 123264396 123264511 -58483576 - MurERV4-int LTR ERVK -4585 675 561 3 1525 1311 254 8 41 chr2 123264545 123264751 -58483336 - MurERV4-int LTR ERVK -4844 416 210 3 1525 1311 254 8 41 chr2 123264888 123265071 -58483016 - MurERV4-int LTR ERVK -5051 209 40 3 1525 321 147 100 62 chr2 123265105 123265185 -58482902 - RMER4B LTR ERVK -24 561 479 3 1525 295 221 17 14 chr2 123265190 123265259 -58482828 + ORR1D2 LTR MaLR 245 357 -13 3 1525 706 294 132 39 chr2 123272134 123272392 -58475695 - RMER15 LTR ERVL -14 561 280 3 1525 1354 260 47 37 chr2 123272527 123272931 -58475156 - RMER15-int LTR ERVL -9 4990 4583 3 1525 3231 158 56 62 chr2 123272971 123273617 -58474470 - RLTR26 LTR ERVK 0 642 1 3 1525 2278 300 46 50 chr2 123273617 123274694 -58473393 - RMER15-int LTR ERVL -458 4541 3469 3 1525 526 306 6 23 chr2 123275060 123275237 -58472850 - RMER15-int LTR ERVL -2489 2510 2337 3 1525 1246 216 118 15 chr2 123276877 123277215 -58470872 + ORR1D1 LTR MaLR 1 373 -1 3 1525 246 321 127 22 chr2 123279434 123279568 -58468519 - LTR33 LTR ERVL -367 148 1 3 1525 361 334 160 25 chr2 123281496 123281821 -58466266 - MER34A1 LTR ERV1 -154 433 65 4 1525 419 254 82 82 chr2 123281975 123282074 -58466013 - RLTR9A2 LTR ERVK 0 383 295 4 1525 419 268 128 90 chr2 123282347 123282588 -58465499 - RLTR9A2 LTR ERVK -89 294 1 4 1525 1830 167 35 125 chr2 123288098 123288529 -58459558 - RLTR25B LTR ERVK -632 396 5 4 1525 323 295 98 8 chr2 123289658 123289781 -58458306 + MLT1A1 LTR MaLR 268 401 -7 4 1525 2470 122 3 3 chr2 123293669 123294029 -58454058 + MTB_Mm LTR MaLR 48 407 0 4 1525 2764 50 3 6 chr2 123294397 123294740 -58453347 - ORR1A1 LTR MaLR -4 342 1 4 1525 2298 110 13 56 chr2 123304259 123304634 -58443453 + RLTR10D LTR ERVK 1 359 0 4 1525 925 254 125 29 chr2 123306430 123306774 -58441313 + MTEb LTR MaLR 1 377 -2 4 1525 649 91 163 16 chr2 123306904 123307027 -58441060 - RMER17B LTR ERVK -495 463 323 4 1525 377 399 61 26 chr2 123312390 123312619 -58435468 - MTEa LTR MaLR -96 283 47 4 1525 369 335 99 58 chr2 123315978 123316313 -58431774 + MLT1H1 LTR MaLR 23 370 -185 4 1525 287 323 79 62 chr2 123330352 123330593 -58417494 - MLT1B LTR MaLR -82 308 64 4 1526 3071 81 8 85 chr2 123339362 123339877 -58408210 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 4 1526 4410 49 65 24 chr2 123339878 123340506 -58407581 + IAPEz-int LTR ERVK 9 662 -5819 4 1526 931 50 0 0 chr2 123340506 123340625 -58407462 + IAPEz-int LTR ERVK 1359 1477 -5004 4 1526 1766 95 8 0 chr2 123340620 123340872 -58407215 + IAPEz-int LTR ERVK 2244 2497 -5183 4 1526 3964 77 6 2 chr2 123340891 123341437 -58406650 + IAPEz-int LTR ERVK 4676 5223 -1258 4 1526 6129 20 4 0 chr2 123341435 123342172 -58405915 + IAPEz-int LTR ERVK 5742 6481 0 4 1526 3071 81 8 85 chr2 123342172 123342687 -58405400 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 4 1526 4410 49 65 24 chr2 123342688 123343316 -58404771 + IAPEz-int LTR ERVK 9 662 -5819 4 1526 931 50 0 0 chr2 123343316 123343435 -58404652 + IAPEz-int LTR ERVK 1359 1477 -5004 4 1526 1748 99 8 0 chr2 123343430 123343682 -58404405 + IAPEz-int LTR ERVK 2244 2497 -5183 4 1526 3964 77 6 2 chr2 123343701 123344247 -58403840 + IAPEz-int LTR ERVK 4676 5223 -1258 4 1526 6129 20 4 0 chr2 123344245 123344982 -58403105 + IAPEz-int LTR ERVK 5742 6481 0 4 1526 3231 81 8 25 chr2 123344982 123345465 -58402622 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 4 1526 4410 49 65 24 chr2 123345466 123346094 -58401993 + IAPEz-int LTR ERVK 9 662 -5819 4 1526 931 50 0 0 chr2 123346094 123346213 -58401874 + IAPEz-int LTR ERVK 1359 1477 -5004 4 1526 1748 99 8 0 chr2 123346208 123346460 -58401627 + IAPEz-int LTR ERVK 2244 2497 -5183 4 1526 3964 77 6 2 chr2 123346479 123347025 -58401062 + IAPEz-int LTR ERVK 4676 5223 -1258 4 1526 6129 20 4 0 chr2 123347023 123347760 -58400327 + IAPEz-int LTR ERVK 5742 6481 0 4 1526 3194 78 23 23 chr2 123347760 123348235 -58399852 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 4 1526 4410 49 65 24 chr2 123348236 123348864 -58399223 + IAPEz-int LTR ERVK 9 662 -5819 4 1526 931 50 0 0 chr2 123348864 123348983 -58399104 + IAPEz-int LTR ERVK 1359 1477 -5004 4 1526 1748 99 8 0 chr2 123348978 123349230 -58398857 + IAPEz-int LTR ERVK 2244 2497 -5183 4 1526 3964 77 6 2 chr2 123349249 123349795 -58398292 + IAPEz-int LTR ERVK 4676 5223 -1258 4 1526 6129 20 4 0 chr2 123349793 123350530 -58397557 + IAPEz-int LTR ERVK 5742 6481 0 4 1526 3231 81 8 25 chr2 123350530 123351013 -58397074 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 4 1526 257 175 0 66 chr2 123353751 123353812 -58394275 - MTE2b LTR MaLR -8 371 315 4 1526 1012 274 28 45 chr2 123353892 123354179 -58393908 - MTE2b LTR MaLR -55 324 43 4 1526 418 364 61 31 chr2 123355944 123356243 -58391844 - MTE2a LTR MaLR -71 308 1 4 1526 1120 276 118 19 chr2 123363532 123363898 -58384189 + MTD LTR MaLR 11 412 -7 5 1526 10423 224 48 52 chr2 123382213 123385051 -58363036 - MERVL_2A-int LTR ERVL -2379 3382 559 5 1526 240 289 109 82 chr2 123387120 123387267 -58360820 - RMER13A LTR ERVK -12 848 698 5 1526 797 266 87 54 chr2 123387270 123387604 -58360483 - RMER13A LTR ERVK -495 365 21 5 1526 1573 272 52 10 chr2 123396065 123396466 -58351621 + MTD LTR MaLR 2 419 0 5 1526 1715 172 88 9 chr2 123400471 123400799 -58347288 + ORR1B2 LTR MaLR 14 367 0 5 1526 1197 260 71 98 chr2 123401191 123401823 -58346264 + RLTR18B LTR ERVK 1 559 -57 5 1526 957 293 35 31 chr2 123404350 123404639 -58343448 - MTD LTR MaLR -45 374 85 5 1526 1293 146 17 8 chr2 123408074 123408356 -58339731 - ORR1B2 LTR MaLR -8 359 1 5 1526 250 316 119 13 chr2 123414578 123414729 -58333358 + MLT2F LTR ERVL 36 202 -461 5 1526 250 352 66 9 chr2 123418075 123418181 -58329906 - ORR1E LTR MaLR -13 366 255 5 1526 318 298 42 11 chr2 123418273 123418368 -58329719 - ORR1E LTR MaLR -255 104 7 5 1526 971 262 230 56 chr2 123419157 123419566 -58328521 + MT2A LTR ERVL 1 480 -53 5 1526 945 185 311 31 chr2 123424113 123424462 -58323625 + LTRIS5 LTR ERV1 1 512 0 5 1526 231 67 0 0 chr2 123424452 123424482 -58323605 + LTRIS5 LTR ERV1 610 639 -15 5 1526 6033 229 25 36 chr2 123424635 123427519 -58320568 + MuRRS-int LTR ERV1 12 2795 -1895 5 1526 324 212 0 0 chr2 123427513 123427579 -58320508 + MuRRS4-int LTR ERV1 2010 2075 -2988 5 1526 3098 184 39 28 chr2 123427579 123428229 -58319858 + MuRRS-int LTR ERV1 3793 4449 -241 5 1526 994 178 72 0 chr2 123431994 123432202 -58315885 + MuRRS-int LTR ERV1 4468 4690 0 5 1526 1067 204 62 17 chr2 123432202 123432519 -58315568 + LTRIS5 LTR ERV1 1 447 0 5 1526 1257 270 58 133 chr2 123437712 123438266 -58309821 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 513 -14 5 1526 508 246 65 8 chr2 123448631 123448754 -58299333 + ORR1D1 LTR MaLR 1 130 -244 6 1526 510 238 58 62 chr2 123448810 123448944 -58299143 - ORR1D1 LTR MaLR -188 186 62 6 1526 2954 88 8 0 chr2 123448944 123449341 -58298746 - MTB LTR MaLR 0 400 1 6 1526 510 227 60 66 chr2 123449341 123449370 -58298717 - ORR1D1 LTR MaLR -313 61 37 6 1526 510 191 21 11 chr2 123449368 123449463 -58298624 + ORR1D1 LTR MaLR 279 374 0 6 1527 304 299 63 22 chr2 123473294 123473473 -58274614 + MTEa LTR MaLR 179 364 -15 6 1527 351 353 34 0 chr2 123477000 123477119 -58270968 - MT2A LTR ERVL -182 351 229 6 1527 806 268 97 22 chr2 123488206 123488527 -58259560 - RMER5 LTR ERV1 -156 378 34 6 1527 274 254 121 16 chr2 123492658 123492782 -58255305 + MLT1A0 LTR MaLR 10 146 -219 6 1527 235 315 142 14 chr2 123497357 123497505 -58250582 - MER110A LTR ERV1 -27 441 275 6 1527 1477 271 95 70 chr2 123504272 123504891 -58243196 + RLTR26 LTR ERVK 1 635 -7 8 1527 464 323 49 25 chr2 123508688 123508891 -58239196 + MTD LTR MaLR 5 212 -209 1 1527 520 219 67 0 chr2 123508917 123509036 -58239051 + MTD LTR MaLR 293 419 0 1 1527 3307 161 169 89 chr2 123515960 123516480 -58231607 - RMER19B LTR ERVK -12 890 247 2 1527 3307 161 169 89 chr2 123516660 123516963 -58231124 - RMER19B LTR ERVK -656 246 1 2 1527 303 345 8 8 chr2 123517337 123517454 -58230633 - MLT1E1A LTR MaLR -420 260 144 2 1527 370 267 201 20 chr2 123519912 123520111 -58227976 - MLT1D LTR MaLR -20 485 251 3 1527 281 286 26 0 chr2 123520614 123520691 -58227396 - ORR1E LTR MaLR 0 370 292 3 1527 865 243 87 22 chr2 123520691 123520922 -58227165 - ORR1D1 LTR MaLR -2 372 127 3 1527 805 269 80 13 chr2 123521792 123522029 -58226058 - ORR1E LTR MaLR -73 286 34 3 1527 1277 196 47 46 chr2 123524355 123524690 -58223397 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 3 1527 485 104 0 0 chr2 123531309 123531376 -58216711 + RMER6D LTR ERVK 1 67 -653 5 1527 461 317 144 83 chr2 123539485 123539812 -58208275 - RMER15 LTR ERVL -39 536 190 6 1527 1568 164 142 9 chr2 123544718 123544876 -58203211 + ORR1C2 LTR MaLR 1 194 -190 7 1527 1568 164 142 9 chr2 123544973 123545153 -58202934 + ORR1C2 LTR MaLR 195 384 0 7 1527 483 351 117 16 chr2 123556966 123557334 -58190753 + LTR78 LTR ERV1 887 1291 -13 9 1527 312 355 70 87 chr2 123567496 123567841 -58180246 - ORR1E LTR MaLR 0 359 21 1 1527 3318 35 2 10 chr2 123579132 123579531 -58168556 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 1527 236 355 62 53 chr2 123579815 123580041 -58168046 - MLT1B LTR MaLR 0 390 163 1 1527 2369 134 45 38 chr2 123580256 123580728 -58167359 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 1 1527 1335 267 35 22 chr2 123582688 123583023 -58165064 + MTEb LTR MaLR 1 341 -38 1 1527 1335 267 35 22 chr2 123583047 123583078 -58165009 + MTEb LTR MaLR 342 371 -8 1 1527 333 226 34 45 chr2 123595941 123596029 -58152058 + MTD LTR MaLR 5 91 -328 1 1527 3143 148 101 22 chr2 123596530 123597125 -58150962 - RLTR26 LTR ERVK 0 642 1 1 1528 533 264 0 0 chr2 123605144 123605250 -58142837 + RLTR18B LTR ERVK 403 508 -4 1 1528 1469 194 143 14 chr2 123621764 123622135 -58125952 + MTD LTR MaLR 1 419 0 1 1528 2387 216 25 21 chr2 123622137 123622645 -58125442 + MTD-int LTR MaLR 3 850 -730 1 1528 919 331 40 14 chr2 123622684 123622981 -58125106 + MTD LTR MaLR 19 323 -96 1 1528 485 214 1 28 chr2 123624510 123624626 -58123461 - MTE2a LTR MaLR 0 419 275 1 1528 433 305 70 106 chr2 123626585 123626799 -58121288 + RMER15 LTR ERVL 275 487 -88 1 1528 433 305 70 106 chr2 123626870 123626967 -58121120 + RMER15 LTR ERVL 488 575 0 1 1528 2793 217 75 104 chr2 123627677 123628572 -58119515 + RMER13B LTR ERVK 2 870 -38 2 1528 347 387 82 42 chr2 123629405 123629831 -58118256 - MLT2F LTR ERVL -1 662 220 2 1528 412 304 37 7 chr2 123629875 123630011 -58118076 - LTR33C LTR ERVL -485 144 5 2 1528 2112 262 46 63 chr2 123649152 123649864 -58098223 + MTEa-int LTR MaLR 146 845 -735 2 1528 522 320 45 55 chr2 123649866 123649930 -58098157 - MT2A LTR ERVL -1 532 468 2 1528 522 320 45 55 chr2 123650022 123650247 -58097840 - MT2A LTR ERVL -66 467 246 2 1528 278 355 66 61 chr2 123650451 123650527 -58097560 - MT2A LTR ERVL -299 234 6 2 1528 320 344 99 7 chr2 123650527 123650679 -58097408 - MTE2a LTR MaLR -208 171 6 2 1528 1780 362 15 42 chr2 123650633 123651428 -58096659 + MTEa-int LTR MaLR 798 1571 -9 2 1528 773 307 127 21 chr2 123651436 123651775 -58096312 + MTEa LTR MaLR 1 375 -4 2 1528 400 254 17 17 chr2 123663689 123663805 -58084282 + MTD LTR MaLR 5 120 -299 2 1528 977 294 93 14 chr2 123664295 123664574 -58083513 + MTD LTR MaLR 119 419 0 2 1528 611 158 507 18 chr2 123667252 123667402 -58080685 + RMER6C LTR ERVK 1 223 -533 2 1528 294 207 98 90 chr2 123667406 123667539 -58080548 + RMER6C LTR ERVK 347 480 -210 2 1528 1170 148 11 0 chr2 123672944 123673133 -58074954 + RMER6C LTR ERVK 500 690 0 2 1528 234 339 56 16 chr2 123675876 123676002 -58072085 - RMER5 LTR ERV1 -356 178 48 2 1528 3289 48 5 0 chr2 123679029 123679427 -58068660 - MTB LTR MaLR 0 400 1 2 1528 531 291 33 38 chr2 123680815 123681026 -58067061 - RMER5 LTR ERV1 -90 444 235 2 1528 240 382 69 36 chr2 123688106 123688383 -58059704 - ORR1E LTR MaLR -23 336 51 3 1528 784 326 159 22 chr2 123690518 123690982 -58057105 - MTEa-int LTR MaLR -1051 529 2 3 1528 884 269 24 146 chr2 123690985 123691411 -58056676 - MTEa LTR MaLR -4 375 2 3 1528 1159 287 30 62 chr2 123691696 123692064 -58056023 + MTE2b LTR MaLR 5 360 -19 3 1528 2651 49 0 0 chr2 123717330 123717656 -58030431 - IAPEY2_LTR LTR ERVK 0 357 32 3 1528 1399 243 33 8 chr2 123722271 123722632 -58025455 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 3 1528 2898 80 15 8 chr2 123729244 123729645 -58018442 - RLTR44A LTR ERVK 0 405 2 3 1528 5575 51 0 0 chr2 123729646 123730314 -58017773 - RLTR44-int LTR ERVK 0 2812 2145 3 1528 2940 155 14 29 chr2 123730387 123730989 -58017098 - RLTR44-int LTR ERVK -1323 1489 600 3 1529 2054 72 0 4 chr2 123736879 123737156 -58010931 - RLTR44-int LTR ERVK -1660 1152 877 3 1529 584 142 0 142 chr2 123737176 123737324 -58010763 - RLTR44-int LTR ERVK -1867 945 819 3 1529 986 171 35 20 chr2 123737327 123737524 -58010563 - RLTR44-int LTR ERVK -2612 200 1 3 1529 2821 94 18 5 chr2 123737524 123737921 -58010166 - RLTR44A LTR ERVK 0 405 4 3 1529 1200 244 88 54 chr2 123745858 123746244 -58001843 - MTD LTR MaLR -1 418 20 3 1529 950 291 78 17 chr2 123747865 123748225 -57999862 - RMER15-int LTR ERVL -3576 1423 1042 3 1529 517 411 56 23 chr2 123748568 123749084 -57999003 - RMER15-int LTR ERVL -4456 543 11 3 1529 297 332 136 60 chr2 123749091 123749290 -57998797 - RMER15 LTR ERVL -3 572 359 3 1529 2475 109 2 116 chr2 123749309 123749784 -57998303 + BGLII LTR ERVK 1 421 0 3 1529 685 202 103 42 chr2 123749806 123750100 -57997987 + RMER3D-int LTR ERVK 354 610 -2232 3 1529 2142 199 102 46 chr2 123750121 123750752 -57997335 + RMER3D-int LTR ERVK 1014 1679 -1163 3 1529 3202 189 115 8 chr2 123750771 123751692 -57996395 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 1306 2325 -1 3 1529 2777 99 22 5 chr2 123751693 123752107 -57995980 + BGLII LTR ERVK 1 421 0 3 1529 356 318 15 31 chr2 123761412 123761542 -57986545 + MTEb LTR MaLR 248 375 -4 3 1529 1187 278 94 0 chr2 123790313 123790658 -57957429 - MTE2b LTR MaLR 0 359 1 4 1529 1234 277 206 48 chr2 123790666 123791250 -57956837 - MTE2b-int LTR MaLR -7 1573 898 4 1529 1814 276 62 44 chr2 123791278 123791889 -57956198 - MTE2b-int LTR MaLR -958 622 1 4 1529 1158 280 45 9 chr2 123791902 123792234 -57955853 - MTE2b LTR MaLR -10 349 6 4 1529 2965 91 5 0 chr2 123795867 123796265 -57951822 + MTB LTR MaLR 1 400 0 4 1529 1984 132 24 89 chr2 123800783 123801208 -57946879 + RLTR44B LTR ERVK 53 449 0 4 1529 3023 20 0 3 chr2 123802421 123802768 -57945319 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 4 1529 676 319 115 52 chr2 123804188 123804711 -57943376 + MLT1E2 LTR MaLR 72 627 0 4 1529 651 358 109 25 chr2 123805250 123805734 -57942353 - MT2A LTR ERVL -8 525 1 4 1529 302 202 11 53 chr2 123808450 123808544 -57939543 + RLTR15 LTR ERVK 234 323 -36 4 1529 310 321 52 22 chr2 123814472 123814606 -57933481 - MLT1B LTR MaLR -4 386 249 4 1529 2312 136 12 31 chr2 123815363 123815780 -57932307 - RLTR9E LTR ERVK 0 409 1 4 1529 1926 205 91 69 chr2 123819427 123820234 -57927853 - RMER19B LTR ERVK 0 902 1 4 1529 2939 26 9 0 chr2 123830782 123831125 -57916962 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 4 1529 230 301 172 14 chr2 123831289 123831434 -57916653 + MLT1A LTR MaLR 196 363 -11 4 1529 1430 259 26 63 chr2 123833398 123833823 -57914264 - MTD LTR MaLR 0 419 11 4 1529 2842 186 32 18 chr2 123835627 123836181 -57911906 + RLTR12A LTR ERVK 7 568 0 4 1529 961 215 41 63 chr2 123838041 123838309 -57909778 + RMER10B LTR ERVL 1 262 -136 4 1529 414 205 81 122 chr2 123838305 123838527 -57909560 + RMER10B LTR ERVL 186 398 0 4 1529 2952 129 125 0 chr2 123849071 123849575 -57898512 - RMER2 LTR ERV1 0 567 1 5 1529 330 358 67 52 chr2 123850826 123851156 -57896931 - MER52-int LTR ERV1 -6652 439 105 5 1529 3398 194 9 65 chr2 123861147 123861526 -57886561 - RMER6D LTR ERVK -12 708 354 5 1529 3398 194 9 65 chr2 123861559 123861929 -57886158 - RMER6D LTR ERVK -367 353 1 5 1530 731 295 18 40 chr2 123863260 123863486 -57884601 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 154 5 1530 720 204 76 0 chr2 123863593 123863750 -57884337 - ORR1D1 LTR MaLR -191 183 15 5 1530 1119 304 36 13 chr2 123865080 123865433 -57882654 + MTE2b LTR MaLR 22 369 -1 5 1530 419 189 48 30 chr2 123866461 123866574 -57881513 + ORR1E LTR MaLR 244 365 -9 5 1530 2768 288 48 157 chr2 123866576 123867939 -57880148 + ORR1E-int LTR MaLR 1 1199 -171 5 1530 2768 288 48 157 chr2 123868004 123868169 -57879918 + ORR1E-int LTR MaLR 1200 1362 -8 5 1530 751 296 152 11 chr2 123868180 123868334 -57879753 + ORR1E LTR MaLR 5 161 -198 5 1530 751 296 152 11 chr2 123868555 123868669 -57879418 + ORR1E LTR MaLR 162 311 -48 5 1530 1102 232 161 6 chr2 123876696 123877026 -57871061 + MTD LTR MaLR 25 405 -14 5 1530 2149 151 128 98 chr2 123877228 123877792 -57870295 + RMER6C LTR ERVK 1 581 -109 5 1530 2346 228 26 51 chr2 123878294 123878919 -57869168 + RMER19C LTR ERVK 1 609 -2 5 1530 255 236 41 14 chr2 123885543 123885616 -57862471 - RMER15 LTR ERVL -66 509 435 5 1530 381 286 59 22 chr2 123891219 123891355 -57856732 + ORR1E LTR MaLR 4 144 -215 5 1530 718 322 84 19 chr2 123893653 123893963 -57854124 - MTD LTR MaLR -72 347 18 5 1530 571 333 73 76 chr2 123898609 123898950 -57849137 - MLT1A LTR MaLR -34 340 1 5 1530 683 341 70 42 chr2 123900060 123900443 -57847644 + MLT1H2 LTR MaLR 96 489 0 5 1530 1261 178 9 8 chr2 123901714 123901957 -57846130 + ORR1C1 LTR MaLR 97 378 0 5 1530 1239 274 48 3 chr2 123901957 123902271 -57845816 - MTE2a LTR MaLR -51 328 1 5 1530 2155 185 81 83 chr2 123903004 123903094 -57844993 - RLTR12A LTR ERVK -3 565 475 5 1530 2155 185 81 83 chr2 123903123 123903424 -57844663 - RLTR12A LTR ERVK -94 474 139 5 1530 2155 185 81 83 chr2 123903569 123903742 -57844345 - RLTR12A LTR ERVK -430 138 1 5 1530 4608 134 39 14 chr2 123905487 123906276 -57841811 - RMER17D2 LTR ERVK 0 809 1 5 1530 292 246 0 0 chr2 123913228 123913285 -57834802 - RMER15 LTR ERVL 0 575 519 6 1530 1122 186 232 29 chr2 123913276 123913591 -57834496 - RMER15 LTR ERVL -196 379 1 6 1530 436 246 115 54 chr2 123913761 123913963 -57834124 - MLT1D LTR MaLR -290 215 2 6 1530 2786 86 34 3 chr2 123932094 123932478 -57815609 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 1530 228 176 17 50 chr2 123933897 123933957 -57814130 + ORR1D1 LTR MaLR 1 58 -316 6 1530 241 179 14 69 chr2 123933964 123934036 -57814051 + ORR1B1 LTR MaLR 1 68 -326 6 1530 1202 267 72 29 chr2 123934088 123934435 -57813652 + ORR1D2 LTR MaLR 1 362 -8 6 1530 1776 217 57 20 chr2 123938856 123939260 -57808827 + MTD LTR MaLR 1 419 0 6 1530 427 259 60 40 chr2 123947214 123947363 -57800724 + MLT1A0 LTR MaLR 7 158 -207 6 1530 238 314 23 23 chr2 123947957 123948045 -57800042 + MLT1A0 LTR MaLR 297 384 -6 6 1530 549 322 108 9 chr2 123950693 123950906 -57797181 + MLT1C LTR MaLR 173 406 -61 6 1530 225 373 121 23 chr2 123953814 123953987 -57794100 - LTR33A LTR ERVL -228 292 103 6 1530 859 311 90 39 chr2 123954846 123955201 -57792886 + MLT1H LTR MaLR 177 549 0 6 1530 1128 252 112 12 chr2 123960801 123961129 -57786958 + ORR1D2 LTR MaLR 3 363 -7 6 1530 2706 93 24 43 chr2 123961129 123961172 -57786915 - MTA_Mm LTR MaLR 0 407 382 6 1530 3098 23 0 1 chr2 123961400 123961771 -57786316 - MTA_Mm LTR MaLR -26 381 1 6 1530 818 108 0 0 chr2 123961771 123961891 -57786196 - MTB_Mm LTR MaLR -287 120 1 6 1530 1017 222 185 13 chr2 123972644 123972958 -57775129 + ORR1D2 LTR MaLR 3 370 0 6 1530 592 312 69 82 chr2 123973447 123973843 -57774244 - MLT1D LTR MaLR -103 402 5 6 1530 471 289 138 64 chr2 123973959 123974163 -57773924 - ORR1D2 LTR MaLR -3 367 140 6 1530 277 319 112 0 chr2 123986702 123986862 -57761225 - MER31-int LTR ERV1 -849 4087 3910 6 1531 2841 87 18 0 chr2 123995184 123995577 -57752510 + MTB LTR MaLR 1 400 0 7 1531 587 285 93 113 chr2 124011863 124012358 -57735729 + MLT1D LTR MaLR 13 497 -8 1 1531 1369 168 192 13 chr2 124013756 124014069 -57734018 - ORR1D1 LTR MaLR -5 369 1 1 1531 415 200 43 71 chr2 124014380 124014520 -57733567 - ORR1D1-int LTR MaLR -161 1209 1074 1 1531 383 256 11 11 chr2 124014487 124014578 -57733509 + MT2A LTR ERVL 37 127 -406 1 1531 982 187 11 6 chr2 124014581 124014758 -57733329 - MT2A LTR ERVL -355 178 1 1 1531 1396 275 31 51 chr2 124023159 124023573 -57724514 + MTD LTR MaLR 1 406 -13 2 1531 250 265 71 12 chr2 124036920 124037004 -57711083 + MER57E1 LTR ERV1 40 128 -244 3 1531 230 259 0 17 chr2 124045277 124045336 -57702751 - MLT1A1 LTR MaLR -350 58 1 4 1531 307 115 0 0 chr2 124054467 124054519 -57693568 - MT2A LTR ERVL 0 533 482 5 1531 953 252 55 65 chr2 124054641 124054677 -57693410 - MT2A LTR ERVL -24 577 544 5 1531 1187 219 72 103 chr2 124054737 124055154 -57692933 - MT2A LTR ERVL -58 543 2 5 1531 1028 254 141 10 chr2 124059254 124059615 -57688472 + MTD LTR MaLR 1 405 -14 6 1531 824 305 68 84 chr2 124059714 124060140 -57687947 - MTD LTR MaLR 0 419 1 6 1531 1763 154 145 0 chr2 124067282 124067626 -57680461 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 7 1531 1482 260 60 13 chr2 124073584 124073952 -57674135 - MTE2b LTR MaLR 0 370 3 7 1531 467 352 123 11 chr2 124085813 124086172 -57661915 - LTR16B2 LTR ERVL -15 447 49 8 1531 1327 231 8 34 chr2 124086512 124086824 -57661263 + MTD LTR MaLR 113 404 -15 8 1531 226 242 9 120 chr2 124089827 124089935 -57658152 - MLT1H LTR MaLR -24 525 430 9 1531 429 312 115 107 chr2 124096076 124096442 -57651645 + MLT1D LTR MaLR 137 505 0 1 1531 402 339 45 22 chr2 124097343 124097521 -57650566 + LTR87 LTR ERVL? 19 200 -424 1 1531 337 296 82 55 chr2 124097540 124097722 -57650365 + LTR87 LTR ERVL? 282 468 -156 1 1531 1721 211 30 170 chr2 124105061 124105597 -57642490 - RLTR18B LTR ERVK -51 461 1 1 1531 266 333 57 29 chr2 124105637 124105742 -57642345 + MLT1A0 LTR MaLR 204 311 -54 1 1531 601 308 65 56 chr2 124106352 124106618 -57641469 + MTE2b LTR MaLR 45 313 -106 1 1531 677 161 85 51 chr2 124111637 124111814 -57636273 + RLTR15 LTR ERVK 1 183 -176 1 1531 340 283 35 35 chr2 124111892 124112064 -57636023 + RLTR15 LTR ERVK 171 342 -17 1 1531 1274 248 32 42 chr2 124112117 124112496 -57635591 - MTE2b LTR MaLR -4 375 1 1 1531 932 206 275 24 chr2 124115157 124115455 -57632632 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 2 1 1531 6303 69 11 92 chr2 124120612 124121583 -57626504 - RLTR13B1 LTR ERVK 0 893 1 1 1532 296 274 28 47 chr2 124130799 124130906 -57617181 - MLT1A0 LTR MaLR -260 105 1 1 1532 1408 211 103 37 chr2 124138840 124139190 -57608897 - MTD LTR MaLR -12 407 35 1 1532 1414 249 124 3 chr2 124142428 124142518 -57605569 - MTD LTR MaLR -2 417 317 1 1532 1801 159 63 17 chr2 124142518 124142869 -57605218 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 1 1532 1414 249 124 3 chr2 124142869 124143149 -57604938 - MTD LTR MaLR -103 316 2 1 1532 2262 22 1 0 chr2 124144538 124144811 -57603276 - MT2_Mm LTR ERVL -230 263 1 1 1532 302 0 0 0 chr2 124144811 124144849 -57603238 - MERVL-int LTR ERVL 0 5485 5448 1 1532 390 167 46 35 chr2 124144849 124144936 -57603151 - ORR1A3-int LTR MaLR -1323 640 553 1 1532 460 78 0 0 chr2 124144936 124145000 -57603087 - MERVL-int LTR ERVL -125 5360 5297 1 1532 817 277 11 0 chr2 124151511 124151688 -57596399 + ORR1D2 LTR MaLR 3 181 -189 1 1532 540 281 111 35 chr2 124151893 124152092 -57595995 + ORR1D2 LTR MaLR 149 362 -8 1 1532 423 312 161 6 chr2 124157539 124157700 -57590387 - RMER15 LTR ERVL 0 575 390 1 1532 338 267 82 49 chr2 124157816 124157938 -57590149 - RMER15 LTR ERVL -449 126 1 1 1532 473 290 171 32 chr2 124158800 124159108 -57588979 + MLT1G1 LTR MaLR 1 299 -292 1 1532 293 250 108 20 chr2 124159170 124159272 -57588815 + MLT1G1 LTR MaLR 432 542 -18 1 1532 2434 77 132 3 chr2 124175824 124176188 -57571899 - IAPLTR2a LTR ERVK 0 411 1 2 1532 5591 45 12 19 chr2 124176190 124176939 -57571148 - IAPEz-int LTR ERVK -2 6479 5736 2 1532 2132 61 0 0 chr2 124176938 124177216 -57570871 - IAPEz-int LTR ERVK -4845 1636 1359 2 1532 3293 47 0 20 chr2 124177216 124177656 -57570431 - IAPEz-int LTR ERVK -5819 662 232 2 1532 559 77 13 0 chr2 124178414 124178492 -57569595 - IAPEz-int LTR ERVK -6235 246 168 2 1532 226 321 0 0 chr2 124178492 124178545 -57569542 - RLTR27 LTR ERVK -34 275 223 2 1532 229 267 0 0 chr2 124178573 124178618 -57569469 - RLTR27 LTR ERVK -34 275 231 2 1532 520 97 105 97 chr2 124178618 124178732 -57569355 - IAPEz-int LTR ERVK -6358 123 9 2 1532 2444 74 132 3 chr2 124178733 124179097 -57568990 - IAPLTR2a LTR ERVK 0 411 1 2 1532 383 315 105 35 chr2 124180837 124181123 -57566964 - MLT1C LTR MaLR -8 459 154 2 1532 1527 247 76 15 chr2 124184202 124184597 -57563490 + MTD LTR MaLR 1 419 0 2 1532 1138 211 171 63 chr2 124204094 124204586 -57543501 + RMER4B LTR ERVK 17 561 -24 2 1532 268 257 8 114 chr2 124233219 124233342 -57514745 - MT2B LTR ERVL -337 264 155 2 1532 279 343 96 7 chr2 124246047 124246182 -57501905 - MLT1J LTR MaLR -272 240 94 2 1533 253 148 56 0 chr2 124263392 124263446 -57484641 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 2270 2326 0 2 1533 2076 239 43 39 chr2 124263446 124264004 -57484083 + RLTR20B2 LTR ERVK 1 560 0 2 1533 960 216 160 41 chr2 124269412 124269750 -57478337 - MTEa LTR MaLR -1 378 1 2 1533 1905 196 65 23 chr2 124270786 124271070 -57477017 + MTC LTR MaLR 8 310 -111 2 1533 3393 63 5 0 chr2 124271070 124271464 -57476623 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 1533 1905 196 65 23 chr2 124271464 124271576 -57476511 + MTC LTR MaLR 311 421 0 2 1533 342 341 102 17 chr2 124276441 124276728 -57471359 + MLT1C LTR MaLR 108 467 0 2 1533 1529 205 103 11 chr2 124279008 124279387 -57468700 + MTD LTR MaLR 1 414 -5 3 1533 1124 233 48 122 chr2 124283212 124283604 -57464483 + MTE2b LTR MaLR 1 363 -16 3 1533 3016 147 48 4 chr2 124297822 124298337 -57449750 + RMER15 LTR ERVL 12 541 -34 3 1533 3016 147 48 4 chr2 124298440 124298464 -57449623 + RMER15 LTR ERVL 542 574 -1 3 1533 3475 25 8 0 chr2 124300026 124300419 -57447668 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 1533 2629 162 2 7 chr2 124304590 124305013 -57443074 + MTC LTR MaLR 1 421 0 3 1533 239 239 95 41 chr2 124306835 124306966 -57441121 - MLT1H2 LTR MaLR -9 560 373 3 1533 335 331 140 57 chr2 124307025 124307410 -57440677 + MLT1C LTR MaLR 42 458 -9 3 1533 226 237 68 0 chr2 124307414 124307473 -57440614 - MLT1F1 LTR MaLR -128 441 379 3 1533 327 358 44 88 chr2 124307479 124307601 -57440486 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 236 3 1533 327 358 44 88 chr2 124307785 124308005 -57440082 - MLT1A0 LTR MaLR -130 235 38 3 1533 727 299 69 35 chr2 124311758 124312077 -57436010 + RMER13A LTR ERVK 2 331 -529 3 1533 245 208 97 0 chr2 124312722 124312794 -57435293 + MTEa LTR MaLR 301 379 0 3 1533 226 320 26 13 chr2 124318280 124318356 -57429731 - MTE2a LTR MaLR -17 362 286 3 1533 414 376 18 12 chr2 124318682 124318849 -57429238 - MER21B LTR ERV1 -574 289 122 3 1533 292 283 32 21 chr2 124319181 124319275 -57428812 - MLT1F LTR MaLR -421 127 33 3 1533 1667 189 95 25 chr2 124326729 124327088 -57420999 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 3 1533 317 220 9 57 chr2 124334432 124334538 -57413549 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 308 3 1533 911 211 157 33 chr2 124341103 124341336 -57406751 + ORR1D2 LTR MaLR 4 278 -92 3 1533 4497 122 38 25 chr2 124341336 124342083 -57406004 - RMER6A LTR ERVK 0 756 1 3 1533 911 211 157 33 chr2 124342083 124342148 -57405939 + ORR1D2 LTR MaLR 279 339 -31 3 1533 417 325 77 59 chr2 124344618 124344942 -57403145 + MLT1D LTR MaLR 14 343 -162 3 1533 230 412 61 15 chr2 124346239 124346436 -57401651 - MER74A LTR ERVL -298 260 55 4 1533 1934 105 68 59 chr2 124351329 124351652 -57396435 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 4 1533 571 228 90 54 chr2 124355746 124356080 -57392007 + MLT1A1 LTR MaLR 1 395 -13 4 1533 902 323 60 34 chr2 124356829 124357242 -57390845 - MER21B LTR ERV1 -37 826 403 4 1533 508 300 138 42 chr2 124357306 124357567 -57390520 - MER21B LTR ERV1 -569 294 9 4 1533 291 202 0 110 chr2 124360193 124360293 -57387794 - MT2B LTR ERVL 0 601 513 4 1533 1917 177 52 40 chr2 124360278 124360807 -57387280 - MTC-int LTR MaLR -224 1034 393 4 1533 2531 151 241 20 chr2 124366325 124366880 -57381207 - RLTR33 LTR ERVK 0 678 1 4 1533 331 100 0 0 chr2 124367659 124367709 -57380378 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 335 4 1533 3023 169 47 67 chr2 124367709 124368364 -57379723 - RLTR26 LTR ERVK 0 642 1 4 1533 575 185 152 1 chr2 124368472 124368623 -57379464 - ORR1C2 LTR MaLR -54 330 153 4 1533 613 228 9 102 chr2 124368640 124368855 -57379232 - ORR1C2 LTR MaLR -189 195 1 4 1533 1282 235 99 18 chr2 124369113 124369455 -57378632 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 4 1533 1077 195 352 22 chr2 124370075 124370390 -57377697 - MTD LTR MaLR 0 419 1 4 1533 2007 157 78 8 chr2 124374288 124374674 -57373413 - MTC LTR MaLR -8 413 1 4 1533 644 306 121 24 chr2 124381621 124381952 -57366135 + MLT1G LTR MaLR 229 591 0 4 1533 619 315 50 36 chr2 124382076 124382435 -57365652 - MLT1A0 LTR MaLR -1 364 1 4 1534 923 255 29 32 chr2 124389076 124389420 -57358667 + RLTR15 LTR ERVK 1 343 -16 4 1534 225 350 42 48 chr2 124390498 124390666 -57357421 - MLT1G3 LTR MaLR -239 356 190 4 1534 252 291 76 0 chr2 124398433 124398512 -57349575 - MTE2b LTR MaLR 0 379 295 4 1534 1199 254 62 0 chr2 124398854 124399129 -57348958 - MTE2b LTR MaLR -87 292 1 4 1534 797 276 31 156 chr2 124408128 124408423 -57339664 + MLT1B LTR MaLR 26 264 -126 4 1534 797 276 31 156 chr2 124408452 124408573 -57339514 + MLT1B LTR MaLR 265 390 0 4 1534 236 186 0 0 chr2 124413566 124413609 -57334478 - MTE2b LTR MaLR -19 360 318 4 1534 695 236 149 50 chr2 124414115 124414356 -57333731 - MTE2b LTR MaLR -114 265 1 4 1534 3056 246 58 79 chr2 124416676 124417177 -57330910 + RMER19B LTR ERVK 1 337 -565 5 1534 3056 215 87 28 chr2 124417359 124417927 -57330160 + RMER19B LTR ERVK 338 901 -1 5 1534 325 359 69 60 chr2 124428118 124428468 -57319619 + LTR33 LTR ERVL 11 363 -152 5 1534 265 228 172 11 chr2 124428487 124428580 -57319507 + LTR33 LTR ERVL 406 513 -2 5 1534 2462 169 89 8 chr2 124428811 124429337 -57318750 + RMER15 LTR ERVL 1 569 -6 5 1534 235 339 101 36 chr2 124445493 124445741 -57302346 - MLT1D LTR MaLR -26 479 216 5 1534 674 209 145 70 chr2 124447916 124448143 -57299944 - MTE2a LTR MaLR 0 379 136 5 1534 225 283 34 109 chr2 124449361 124449480 -57298607 - MLT1L LTR MaLR -344 266 157 5 1534 320 251 56 116 chr2 124459758 124459956 -57288131 - MLT1G3 LTR MaLR -291 304 119 5 1534 895 156 6 6 chr2 124460461 124460622 -57287465 + MTC LTR MaLR 7 167 -254 5 1534 598 311 41 67 chr2 124463473 124463787 -57284300 - MT2A LTR ERVL -215 318 13 5 1534 1858 218 136 8 chr2 124474858 124475300 -57272787 - RMER15 LTR ERVL 0 575 71 5 1534 1858 218 136 8 chr2 124475340 124475382 -57272705 - RMER15 LTR ERVL -505 70 29 5 1534 1163 69 199 0 chr2 124500084 124500300 -57247787 - RLTR47_MM LTR ERV1 -83 449 191 1 1534 1574 191 51 126 chr2 124500375 124500555 -57247532 + RMER10B LTR ERVL 1 197 -201 2 1534 1574 191 51 126 chr2 124500624 124500873 -57247214 + RMER10B LTR ERVL 198 398 0 2 1535 1618 215 14 191 chr2 124519087 124519365 -57228722 - RMER19C LTR ERVK -67 544 295 3 1535 1618 215 14 191 chr2 124519728 124520110 -57227977 - RMER19C LTR ERVK -317 294 1 3 1535 416 304 203 37 chr2 124525799 124526178 -57221909 - MER21B LTR ERV1 0 863 422 4 1535 1534 155 69 66 chr2 124529075 124529393 -57218694 - ORR1A4 LTR MaLR -8 321 3 5 1535 256 306 48 117 chr2 124530113 124530409 -57217678 - MTEa LTR MaLR -27 352 41 5 1535 1551 212 56 11 chr2 124533632 124533860 -57214227 + ORR1D1 LTR MaLR 1 228 -146 6 1535 1551 212 56 11 chr2 124533887 124534016 -57214071 + ORR1D1 LTR MaLR 229 373 -1 6 1535 2169 120 0 66 chr2 124538629 124538978 -57209109 + ORR1A3 LTR MaLR 1 326 0 7 1535 252 274 65 9 chr2 124542981 124543088 -57204999 + LTR48 LTR ERV1 622 734 -53 8 1535 248 312 45 30 chr2 124545361 124545493 -57202594 + LTR16A1 LTR ERVL 25 158 -298 9 1535 680 245 102 20 chr2 124545837 124546152 -57201935 - ORR1E LTR MaLR -9 370 6 9 1535 308 305 105 23 chr2 124549308 124549479 -57198608 - MLT1I LTR MaLR -11 400 216 9 1535 1029 298 150 12 chr2 124551643 124552143 -57195944 + MLT1F1 LTR MaLR 1 569 0 1 1535 2476 155 54 19 chr2 124560329 124560809 -57187278 + RMER4B LTR ERVK 1 497 -88 1 1535 586 179 59 39 chr2 124560844 124561047 -57187040 - RMER17C LTR ERVK -135 275 69 1 1535 806 182 48 12 chr2 124561027 124561194 -57186893 + RMER4B LTR ERVK 413 585 0 1 1535 251 359 49 0 chr2 124566421 124566563 -57181524 + MLT1H LTR MaLR 156 304 -245 1 1535 1154 220 92 58 chr2 124568327 124568722 -57179365 - MTD LTR MaLR -14 405 1 1 1535 441 320 145 18 chr2 124568938 124569221 -57178866 + MLT1A0 LTR MaLR 10 328 -37 1 1535 1149 215 68 99 chr2 124574270 124574428 -57173659 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 223 1 1535 1149 215 68 99 chr2 124574574 124574797 -57173290 - ORR1D2 LTR MaLR -148 222 1 1 1535 304 328 39 60 chr2 124575808 124575990 -57172097 + MLT1A LTR MaLR 7 184 -190 1 1535 360 300 69 78 chr2 124577123 124577482 -57170605 - MTEb LTR MaLR -2 357 1 1 1535 2458 83 9 3 chr2 124582297 124582622 -57165465 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 1 1535 291 208 28 0 chr2 124586856 124586928 -57161159 - MTD LTR MaLR 0 419 346 1 1535 1965 141 6 58 chr2 124587222 124587569 -57160518 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 1 1535 585 268 65 17 chr2 124588810 124589042 -57159045 + MLT2B1 LTR ERVL 1 243 -277 1 1535 351 205 7 159 chr2 124589062 124589207 -57158880 + MLT2B1 LTR ERVL 357 479 -77 1 1535 237 325 30 53 chr2 124591254 124591387 -57156700 + MLT1L LTR MaLR 479 608 -2 1 1535 631 300 37 5 chr2 124594297 124594488 -57153599 + MLT1A0 LTR MaLR 27 223 -142 1 1535 286 267 18 114 chr2 124596403 124596444 -57151643 - LTR16A1 LTR ERVL -112 344 310 1 1535 2894 68 28 8 chr2 124596444 124596832 -57151255 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1535 286 267 18 114 chr2 124596832 124596904 -57151183 - LTR16A1 LTR ERVL -147 309 242 1 1535 1833 211 33 6 chr2 124597205 124597567 -57150520 + ORR1D1 LTR MaLR 3 374 0 1 1535 1154 296 49 36 chr2 124604582 124604993 -57143094 + MTD LTR MaLR 1 416 -3 1 1535 578 238 124 21 chr2 124604993 124605185 -57142902 + MTD-int LTR MaLR 9 220 -1038 1 1535 2797 249 83 43 chr2 124605651 124606637 -57141450 + MTD-int LTR MaLR 233 1258 0 1 1535 1535 229 121 3 chr2 124606639 124607012 -57141075 + MTD LTR MaLR 3 419 0 1 1535 417 318 91 66 chr2 124607591 124607941 -57140146 + ORR1E LTR MaLR 1 359 0 1 1535 2428 311 80 37 chr2 124607945 124608878 -57139209 + ORR1E-int LTR MaLR 1 986 -594 1 1535 2428 311 80 37 chr2 124609448 124609569 -57138518 + ORR1E-int LTR MaLR 987 1100 -480 1 1535 1889 221 5 7 chr2 124609577 124609983 -57138104 - MTD LTR MaLR -14 405 1 1 1535 941 291 60 35 chr2 124609987 124610370 -57137717 + ORR1E-int LTR MaLR 992 1544 -36 1 1535 636 360 35 66 chr2 124610364 124610712 -57137375 + ORR1E LTR MaLR 19 355 -4 1 1535 3420 38 2 0 chr2 124610896 124611295 -57136792 + MTB LTR MaLR 1 400 0 1 1535 1325 257 35 52 chr2 124612408 124612634 -57135453 - MTD LTR MaLR 0 419 188 1 1535 1325 257 35 52 chr2 124613592 124613791 -57134296 - MTD LTR MaLR -232 187 1 1 1535 2023 272 159 13 chr2 124613793 124614617 -57133470 - MTD-int LTR MaLR -2 1256 313 1 1535 453 228 30 0 chr2 124614614 124614715 -57133372 - MTD LTR MaLR -189 230 127 1 1535 1076 201 175 7 chr2 124614893 124615173 -57132914 - ORR1D1 LTR MaLR -5 369 43 1 1535 316 215 80 45 chr2 124615177 124615289 -57132798 - MTD LTR MaLR -295 124 9 1 1535 482 289 42 0 chr2 124621647 124621789 -57126298 - MER57D LTR ERV1 0 411 264 2 1535 1214 234 87 21 chr2 124624003 124624335 -57123752 - MT2A LTR ERVL -152 381 28 2 1535 722 192 13 20 chr2 124624504 124624653 -57123434 - RMER5 LTR ERV1 0 534 387 2 1535 3180 8 0 76 chr2 124624653 124625050 -57123037 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 2 1535 56763 21 18 2 chr2 124625050 124631422 -57116665 + IAPEz-int LTR ERVK 8 6481 0 2 1535 2953 35 0 76 chr2 124631422 124631819 -57116268 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 2 1535 2135 144 26 10 chr2 124631819 124632205 -57115882 - RMER5 LTR ERV1 -142 392 1 2 1535 1879 188 77 8 chr2 124635832 124636224 -57111863 - MTD LTR MaLR 0 419 1 2 1535 496 246 134 0 chr2 124638941 124639120 -57108967 - MT2A LTR ERVL -1 532 330 2 1535 967 257 36 17 chr2 124645840 124646141 -57101946 + LTR84b LTR ERVL 6 312 -449 2 1535 704 266 57 80 chr2 124647696 124647890 -57100197 + ORR1E LTR MaLR 1 178 -181 2 1535 704 266 57 80 chr2 124648011 124648078 -57100009 + ORR1E LTR MaLR 179 256 -103 2 1535 1376 205 108 34 chr2 124648151 124648504 -57099583 + MTD LTR MaLR 18 396 -23 2 1535 458 206 18 18 chr2 124648521 124648630 -57099457 + ORR1E LTR MaLR 257 365 -5 2 1535 266 312 9 35 chr2 124648938 124649054 -57099033 - MLT1A1 LTR MaLR -295 113 1 2 1535 239 239 0 15 chr2 124649150 124649218 -57098869 - MLT1A0 LTR MaLR 0 408 342 2 191 301 341 59 7 chr2 124649373 124649509 -57098578 - MLT1A0 LTR MaLR -222 143 1 2 1536 3010 21 0 0 chr2 124652323 124652660 -57095427 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 0 337 1 2 1536 9797 18 2 0 chr2 124652660 124653740 -57094347 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 5400 2 1536 22891 20 17 24 chr2 124653715 124656400 -57091687 - IAPEz-int LTR ERVK -3807 2674 8 2 1536 3010 21 0 0 chr2 124656400 124656737 -57091350 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 0 337 1 2 1536 605 191 0 9 chr2 124663674 124663789 -57084298 - MTC LTR MaLR -2 419 306 2 1536 1570 130 90 23 chr2 124663789 124664089 -57083998 + ORR1A4 LTR MaLR 2 321 -8 2 1536 9548 148 50 98 chr2 124664093 124666155 -57081932 + ORR1A4-int LTR MaLR 1 1963 0 2 1536 2106 93 48 68 chr2 124666155 124666491 -57081596 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 2 1536 1377 198 33 16 chr2 124666491 124666794 -57081293 - MTC LTR MaLR -113 308 1 2 1536 3236 64 0 19 chr2 124667217 124667632 -57080455 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 2 1536 238 361 50 25 chr2 124673683 124673842 -57074245 + MTEa LTR MaLR 22 184 -175 2 1536 254 359 56 45 chr2 124674071 124674249 -57073838 + MTEa LTR MaLR 200 379 0 2 1536 275 299 132 16 chr2 124674250 124674379 -57073708 + LTR16A LTR ERVL 287 430 -21 2 1536 2754 139 50 8 chr2 124679275 124679755 -57068332 - RMER15 LTR ERVL -73 502 3 2 1536 3136 148 14 2 chr2 124680639 124681155 -57066932 + RLTR28 LTR ERVL 1 522 -2 2 1536 297 298 32 32 chr2 124688207 124688332 -57059755 + RLTR42-int LTR ERVK 4115 4239 -1283 2 1536 453 262 6 68 chr2 124690817 124690983 -57057104 - MLT1A1 LTR MaLR -16 392 231 2 1536 252 241 37 0 chr2 124691062 124691116 -57056971 - MLT1A1 LTR MaLR -291 74 19 2 1536 1650 169 181 0 chr2 124693248 124693573 -57054514 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 2 1536 772 276 174 11 chr2 124695637 124695999 -57052088 - MER57C2 LTR ERV1 0 434 14 2 1536 263 358 107 36 chr2 124696134 124696470 -57051617 - LTR79 LTR ERVL 0 527 168 2 1536 350 246 94 39 chr2 124704548 124704675 -57043412 - MTD LTR MaLR -12 407 274 2 1536 691 248 55 125 chr2 124704750 124705022 -57043065 - MTD LTR MaLR -166 253 1 2 1536 254 271 191 22 chr2 124705747 124705883 -57042204 + MLT1A LTR MaLR 210 368 -6 3 1536 317 292 47 104 chr2 124722785 124723013 -57025074 - MLT1D LTR MaLR -283 222 5 3 1536 3472 40 0 0 chr2 124724352 124724748 -57023339 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 1536 233 294 12 12 chr2 124732385 124732471 -57015616 - MLT1B LTR MaLR -4 386 301 3 1536 331 319 65 40 chr2 124734654 124734853 -57013234 - MamGypLTR1d LTR Gypsy -602 211 8 3 1536 408 317 59 90 chr2 124741036 124741258 -57006829 + MLT1D LTR MaLR 2 216 -411 3 1536 421 287 90 38 chr2 124741504 124741855 -57006232 + MLT1D LTR MaLR 235 505 0 3 1536 298 269 0 0 chr2 124748920 124748998 -56999089 - LTR37A LTR ERV1 -271 155 78 3 1536 1591 215 24 27 chr2 124761548 124761921 -56986166 + MTD LTR MaLR 1 372 -47 3 1536 1567 166 103 34 chr2 124762509 124762858 -56985229 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 2 3 1536 1670 222 55 13 chr2 124767898 124768295 -56979792 + MTD LTR MaLR 1 414 -5 3 1536 520 223 186 100 chr2 124770319 124770598 -56977489 + MTD LTR MaLR 28 348 -11 3 1536 294 338 49 94 chr2 124771585 124771830 -56976257 + LTR16A1 LTR ERVL 173 406 -50 3 1537 278 281 82 38 chr2 124790068 124790227 -56957860 + MLT1B LTR MaLR 217 382 -8 4 1537 2510 173 74 8 chr2 124791349 124791874 -56956213 - RLTR20B2 LTR ERVK 0 560 1 4 1537 1134 226 79 67 chr2 124799138 124799508 -56948579 - MTE2b LTR MaLR -4 355 1 4 1537 476 241 51 90 chr2 124801480 124801658 -56946429 - RLTR28B LTR ERVL 0 481 311 4 1537 1313 224 58 93 chr2 124804651 124805049 -56943038 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 4 1537 258 287 26 77 chr2 124817816 124817933 -56930154 - MTD LTR MaLR -300 119 9 4 1537 451 267 133 22 chr2 124821858 124822038 -56926049 + MLT1H2 LTR MaLR 231 430 -59 4 1537 980 227 56 36 chr2 124825971 124826222 -56921865 - MT2A LTR ERVL 0 533 278 4 1537 2033 250 115 24 chr2 124826230 124826907 -56921180 - MERVL_2A-int LTR ERVL -4985 776 31 4 1537 450 345 101 24 chr2 124827749 124828037 -56920050 + LTR16A LTR ERVL 3 312 -139 4 1537 694 242 47 101 chr2 124830784 124831060 -56917027 - MLT2B1 LTR ERVL -255 265 5 4 1537 452 343 118 34 chr2 124831635 124832076 -56916011 + MLT1F2-int LTR MaLR 1012 1489 0 4 1537 272 338 69 31 chr2 124832358 124832517 -56915570 + MLT1F2 LTR MaLR 392 556 -4 4 1537 2986 74 5 27 chr2 124833163 124833568 -56914519 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 1537 1877 173 91 0 chr2 124843906 124844258 -56903829 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 4 1537 1915 172 79 6 chr2 124845941 124846297 -56901790 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 3 4 1537 751 308 54 14 chr2 124847261 124847538 -56900549 - MTEa LTR MaLR -31 348 61 4 1537 498 212 0 48 chr2 124855118 124855242 -56892845 + MT2A LTR ERVL 180 297 -236 5 1537 3116 144 159 1 chr2 124862739 124863093 -56884994 - RMER6A LTR ERVK -6 750 337 5 1537 3116 144 159 1 chr2 124863128 124863421 -56884666 - RMER6A LTR ERVK -420 336 1 5 1537 3497 104 87 14 chr2 124865036 124865303 -56882784 - RMER6C LTR ERVK -23 667 376 5 1537 3497 104 87 14 chr2 124865352 124865367 -56882720 - RMER6C LTR ERVK -315 375 338 5 1537 3497 104 87 14 chr2 124865422 124865760 -56882327 - RMER6C LTR ERVK -353 337 3 5 1537 2164 147 9 0 chr2 124865760 124866106 -56881981 - RMER6-int LTR ERVK 0 3177 2829 5 1537 375 326 53 15 chr2 124866337 124866468 -56881619 + MTE2a LTR MaLR 52 187 -192 5 1537 317 247 0 23 chr2 124866515 124866602 -56881485 + MTE2a LTR MaLR 276 360 -19 5 1537 543 77 0 0 chr2 124866748 124866826 -56881261 + RMER6C LTR ERVK 540 617 -73 5 1537 919 293 80 44 chr2 124868071 124868460 -56879627 + MLT2D LTR ERVL 1 403 -11 5 1537 2337 114 6 3 chr2 124869341 124869703 -56878384 - MTB LTR MaLR 0 400 38 5 1537 393 292 52 52 chr2 124873236 124873295 -56874792 - MLT1A1 LTR MaLR -6 402 351 5 1537 393 292 52 52 chr2 124873315 124873410 -56874677 - MLT1A1 LTR MaLR -58 350 249 5 1537 282 281 89 52 chr2 124875430 124875565 -56872522 - MamGypLTR1b LTR Gypsy -635 147 8 5 1537 253 343 122 28 chr2 124879971 124880184 -56867903 - LTR16A LTR ERVL -161 290 58 5 1537 293 270 30 17 chr2 124884216 124884353 -56863734 - ORR1E LTR MaLR -18 361 206 5 1537 433 227 104 26 chr2 124887177 124887331 -56860756 - ORR1E LTR MaLR -138 221 56 5 1537 2062 103 153 8 chr2 124888144 124888496 -56859591 - RLTR9D LTR ERVK 0 403 1 5 1537 4212 29 0 0 chr2 124889981 124890463 -56857624 + LTRIS_Mm LTR ERV1 1 482 0 5 1537 6322 46 10 0 chr2 124890623 124891412 -56856675 - RLTR13C2 LTR ERVK -11 797 1 5 1537 392 308 77 114 chr2 124903880 124904326 -56843761 - MLT1H1 LTR MaLR -172 383 1 5 1537 1905 128 100 27 chr2 124905606 124905976 -56842111 + MTB_Mm LTR MaLR 1 397 -10 5 1538 1981 161 71 8 chr2 124916132 124916526 -56831561 - MTC LTR MaLR 0 421 3 5 1538 1798 178 61 66 chr2 124918535 124918710 -56829377 + MTB_Mm LTR MaLR 1 194 -213 5 1538 1798 178 61 66 chr2 124918857 124919090 -56828997 + MTB_Mm LTR MaLR 195 407 0 5 1538 229 216 18 73 chr2 124919436 124919491 -56828596 - RLTR44D LTR ERVK -34 452 401 5 1538 245 293 93 0 chr2 124927005 124927080 -56821007 + RMER15 LTR ERVL 403 484 -91 6 1538 1163 186 30 87 chr2 124930129 124930429 -56817658 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 40 322 0 6 1538 1359 132 6 129 chr2 124930431 124930738 -56817349 + MMETn-int LTR ERVK 3 270 -4574 6 1538 1359 132 6 129 chr2 124931087 124931128 -56816959 + MMETn-int LTR ERVK 271 308 -4536 6 1538 1818 75 0 46 chr2 124931116 124931397 -56816690 + MMETn-int LTR ERVK 2874 3141 -1703 6 1538 5746 151 32 39 chr2 124931366 124932409 -56815678 + ETnERV2-int LTR ERVK 6127 7161 -245 6 1538 368 220 312 9 chr2 124932425 124932643 -56815444 + RLTR13B1 LTR ERVK 155 438 -464 6 1538 231 178 133 0 chr2 124932655 124932700 -56815387 + RLTR13B1 LTR ERVK 481 531 -371 6 1538 464 67 25 74 chr2 124932703 124932784 -56815303 + ETnERV2-int LTR ERVK 7327 7403 -3 6 1538 1590 215 134 66 chr2 124933238 124933777 -56814310 - RLTR40 LTR ERVK -19 798 223 6 1538 920 197 46 14 chr2 124933995 124934211 -56813876 - RLTR40 LTR ERVK -588 229 7 6 1538 272 231 19 0 chr2 124937630 124937682 -56810405 + MTE2a LTR MaLR 49 101 -278 6 1538 1542 196 62 45 chr2 124950819 124951242 -56796845 - BGLII_B LTR ERVK -10 431 2 6 1538 1315 191 38 90 chr2 124951591 124951937 -56796150 + ORR1D2 LTR MaLR 43 370 0 6 1538 2502 86 6 3 chr2 124953297 124953623 -56794464 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 6 1538 4691 140 102 19 chr2 124953623 124954642 -56793445 + ORR1A2-int LTR MaLR 1 1104 -859 6 1538 1175 127 283 13 chr2 124955067 124955371 -56792716 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 1 6 1538 1574 194 47 63 chr2 124959866 124960246 -56787841 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 6 1538 257 351 37 30 chr2 124966696 124966831 -56781256 + ORR1E LTR MaLR 14 149 -210 6 1538 423 333 29 0 chr2 124968905 124969076 -56779011 - LTR16A LTR ERVL -18 433 258 6 1538 1228 200 153 96 chr2 124973845 124974271 -56773816 - RMER15 LTR ERVL -125 450 1 6 1538 453 307 174 32 chr2 124990125 124990591 -56757496 - MER34A1 LTR ERV1 -4 583 52 6 1538 275 326 40 40 chr2 125000171 125000321 -56747766 - MLT1J LTR MaLR -321 191 42 1 1538 2398 182 120 41 chr2 125017391 125017957 -56730130 - RMER19C LTR ERVK 0 611 1 2 1538 278 229 181 0 chr2 125027134 125027217 -56720870 - RMER5 LTR ERV1 -422 112 15 3 1539 531 292 91 51 chr2 125043121 125043417 -56704670 - ORR1E LTR MaLR -51 308 1 6 1539 626 338 60 12 chr2 125045988 125046320 -56701767 - MLT1A LTR MaLR -26 348 1 6 1539 321 310 72 29 chr2 125056074 125056283 -56691804 - LTR16A LTR ERVL -87 364 147 7 1539 426 112 12 48 chr2 125056744 125056828 -56691259 - RMER4A LTR ERVK 0 466 386 7 1539 616 89 129 0 chr2 125056885 125056986 -56691101 - RMER4A LTR ERVK -123 343 230 7 1539 345 333 66 10 chr2 125057987 125058184 -56689903 - RMER15-int LTR ERVL -3032 1967 1760 8 1539 769 301 34 84 chr2 125058174 125058497 -56689590 - RMER15-int LTR ERVL -3156 1843 1537 8 1539 3411 252 80 42 chr2 125058794 125059879 -56688208 - RMER15-int LTR ERVL -3457 1542 417 8 1539 1446 225 67 46 chr2 125060526 125060898 -56687189 - RMER15-int LTR ERVL -4616 383 4 8 1539 826 264 13 70 chr2 125060899 125061197 -56686890 - RMER15 LTR ERVL 0 575 295 8 1539 369 247 43 151 chr2 125062842 125063028 -56685059 + MTE2a LTR MaLR 207 372 -7 9 1539 3463 115 89 2 chr2 125063138 125063676 -56684411 + RMER4B LTR ERVK 1 585 0 9 1539 1570 116 147 0 chr2 125065400 125065685 -56682402 - RLTR22_Mur LTR ERVK -12 1836 1510 9 1539 4326 54 41 9 chr2 125065815 125066357 -56681730 + LTRIS2 LTR ERV1 5 563 -1 9 1539 9055 103 35 8 chr2 125066649 125066821 -56681266 - RLTR22_Mur LTR ERVK -335 1513 1341 9 1539 9055 103 35 8 chr2 125066853 125067164 -56680923 - RLTR22_Mur LTR ERVK -508 1340 1014 9 1539 9055 103 35 8 chr2 125067202 125068189 -56679898 - RLTR22_Mur LTR ERVK -835 1013 3 9 1539 2269 190 54 49 chr2 125068516 125068590 -56679497 - RLTR40 LTR ERVK -4 813 749 1 1539 2269 190 54 49 chr2 125068785 125069303 -56678784 - RLTR40 LTR ERVK -69 748 218 1 1539 2658 130 58 0 chr2 125071163 125071595 -56676492 - RMER6B LTR ERVK -4 457 1 1 1539 818 92 137 0 chr2 125072025 125072178 -56675909 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 211 1 1539 1194 138 320 36 chr2 125077507 125077816 -56670271 - RMER10B LTR ERVL 0 398 2 1 1539 3530 145 101 79 chr2 125080406 125080822 -56667265 - RMER6D LTR ERVK 0 720 338 1 1539 3530 145 101 79 chr2 125080968 125081256 -56666831 - RMER6D LTR ERVK -383 337 1 1 1539 417 208 157 30 chr2 125083678 125083812 -56664275 - RMER15 LTR ERVL -126 449 299 1 1539 858 192 88 31 chr2 125087289 125087515 -56660572 + RMER4B LTR ERVK 17 255 -330 1 1539 270 263 55 62 chr2 125087530 125087745 -56660342 + RMER4B LTR ERVK 320 532 -79 1 1539 398 198 93 9 chr2 125087716 125087823 -56660264 + RMER4B LTR ERVK 465 580 -5 1 1539 297 192 0 141 chr2 125090549 125090634 -56657453 + MT2B LTR ERVL 185 257 -344 1 1539 2046 121 21 24 chr2 125095533 125095863 -56652224 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 1 1539 727 160 8 0 chr2 125096237 125096368 -56651719 - MTC LTR MaLR -141 280 149 1 1539 474 125 0 12 chr2 125096367 125096448 -56651639 + ORR1B1 LTR MaLR 307 386 -8 1 1539 4885 171 68 20 chr2 125096452 125097431 -56650656 - MTC-int LTR MaLR -230 1028 3 1 1539 2111 160 50 45 chr2 125097431 125097850 -56650237 - MTC LTR MaLR 0 421 1 1 1539 553 282 184 19 chr2 125107460 125107666 -56640421 + MER70A LTR ERVL 221 460 -12 1 1539 255 294 64 77 chr2 125114121 125114396 -56633691 + MTEa LTR MaLR 77 361 -18 1 1539 700 271 56 49 chr2 125161881 125162168 -56585919 + RMER15 LTR ERVL 272 560 -15 2 1540 935 285 98 23 chr2 125175517 125175865 -56572222 - MTE2b LTR MaLR -5 374 1 2 1540 348 279 54 9 chr2 125179253 125179365 -56568722 + MTEb LTR MaLR 255 371 -8 2 1540 391 256 248 27 chr2 125187059 125187374 -56560713 + MLT1A1 LTR MaLR 13 396 -12 2 1540 349 317 94 88 chr2 125188557 125188875 -56559212 + LTR16A1 LTR ERVL 1 320 -136 2 1540 1505 164 160 58 chr2 125214527 125214870 -56533217 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 2 1540 312 341 114 24 chr2 125250491 125250788 -56497299 + MLT1L LTR MaLR 195 518 -92 2 1540 885 295 46 57 chr2 125256364 125256734 -56491353 + MTEb LTR MaLR 14 379 0 3 1540 3815 158 60 13 chr2 125259289 125260040 -56488047 - RMER19B LTR ERVK -116 786 1 3 1540 810 276 109 55 chr2 125276188 125276910 -56471177 + RMER13A LTR ERVK 14 800 -108 3 1540 825 280 28 24 chr2 125281789 125282078 -56466009 + ORR1E LTR MaLR 2 291 -68 3 1540 227 230 86 65 chr2 125292888 125292981 -56455106 + RLTR20B1 LTR ERVK 107 201 -362 3 1540 677 250 84 60 chr2 125299348 125299599 -56448488 + MTE2a LTR MaLR 123 379 0 3 1540 331 167 69 0 chr2 125301932 125302004 -56446083 - LTR16C LTR ERVL -9 480 404 3 1541 361 283 152 35 chr2 125313559 125313757 -56434330 - RMER21B LTR ERV1 -275 567 347 3 1541 2181 132 6 16 chr2 125317225 125317588 -56430499 + ORR1B2 LTR MaLR 1 359 -8 3 1541 689 332 135 16 chr2 125336697 125337170 -56410917 + MLT1F2 LTR MaLR 9 539 -21 4 1541 689 332 135 16 chr2 125337226 125337242 -56410845 + MLT1F2 LTR MaLR 540 555 -5 4 1541 387 306 41 20 chr2 125342489 125342636 -56405451 + LTR16A1 LTR ERVL 4 153 -303 4 1541 967 161 119 15 chr2 125343849 125344009 -56404078 + ORR1D1 LTR MaLR 1 180 -194 4 1541 967 161 119 15 chr2 125344085 125344126 -56403961 + ORR1D1 LTR MaLR 181 222 -152 4 1541 2075 108 9 69 chr2 125345129 125345477 -56402610 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 4 1541 1206 235 122 8 chr2 125345479 125345840 -56402247 + MTD LTR MaLR 18 419 0 4 1541 464 237 79 7 chr2 125347095 125347235 -56400852 + MTEb LTR MaLR 227 376 -3 4 1541 606 301 61 94 chr2 125350719 125351049 -56397038 + MTEa LTR MaLR 9 327 -52 4 1541 259 284 50 25 chr2 125355482 125355601 -56392486 - ORR1D2 LTR MaLR -1 369 264 4 1541 386 250 18 18 chr2 125355769 125355879 -56392208 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 299 4 1541 2387 149 24 3 chr2 125358008 125358391 -56389696 + ORR1B1 LTR MaLR 3 393 -1 4 1541 1228 132 66 0 chr2 125369303 125369515 -56378572 - ORR1A2 LTR MaLR -101 226 1 4 1541 384 336 9 0 chr2 125370052 125370162 -56377925 - MLT1H LTR MaLR -249 300 190 4 1541 830 269 166 31 chr2 125370290 125370736 -56377351 - RMER20B LTR ERVK -31 596 91 4 1541 2013 151 24 8 chr2 125371069 125371442 -56376645 - RMER6A LTR ERVK 0 756 378 4 1541 491 214 114 122 chr2 125371463 125371718 -56376369 - RMER2 LTR ERV1 -27 540 288 4 1541 484 214 34 59 chr2 125371775 125371894 -56376193 - RMER2 LTR ERV1 -451 116 1 4 1541 2026 136 21 24 chr2 125371894 125372256 -56375831 - RMER6A LTR ERVK -395 361 1 4 1541 241 291 83 46 chr2 125373729 125373837 -56374250 + ORR1E LTR MaLR 24 135 -224 4 1541 1192 187 146 24 chr2 125376304 125376633 -56371454 - ORR1D1 LTR MaLR -5 369 1 4 1541 237 196 22 0 chr2 125379936 125379982 -56368105 - MTC LTR MaLR -8 413 367 5 1541 369 265 56 49 chr2 125382965 125383108 -56364979 + MLT2F LTR ERVL 3 146 -517 5 1541 274 311 22 0 chr2 125383130 125383220 -56364867 + MLT1E3 LTR MaLR 87 178 -446 5 1541 842 282 21 18 chr2 125398316 125398598 -56349489 + RLTR6-int LTR ERV1 7406 7688 -90 5 1541 1239 150 223 28 chr2 125398715 125399033 -56349054 + RLTR41 LTR ERV1 1 380 -66 5 1541 1832 209 66 21 chr2 125414191 125414660 -56333427 + RLTR11A2 LTR ERVK 22 514 -13 5 1541 1832 209 66 21 chr2 125414840 125414854 -56333233 + RLTR11A2 LTR ERVK 515 527 0 5 1541 1412 277 68 35 chr2 125417045 125417588 -56330499 + MTEa-int LTR MaLR 14 574 -1006 5 1541 250 224 30 0 chr2 125417636 125417703 -56330384 + MTEa-int LTR MaLR 1510 1578 -2 5 1541 551 276 46 60 chr2 125417708 125417924 -56330163 + MTEa LTR MaLR 4 216 -163 5 1541 2772 108 36 12 chr2 125435381 125435792 -56312295 - MTC LTR MaLR 0 421 1 5 1542 3404 38 5 0 chr2 125436209 125436603 -56311484 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 1542 1248 192 131 40 chr2 125442285 125442438 -56305649 + ORR1C2 LTR MaLR 1 177 -207 6 1542 1248 192 131 40 chr2 125442469 125442667 -56305420 + ORR1C2 LTR MaLR 178 384 0 6 1542 421 314 194 39 chr2 125452737 125453124 -56294963 + LTR33 LTR ERVL 61 507 -8 6 1542 2558 88 151 33 chr2 125456565 125456990 -56291097 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 6 1542 3426 86 16 31 chr2 125456992 125457795 -56290292 + IAPEz-int LTR ERVK 3 662 -5819 6 1542 450 82 0 32 chr2 125457795 125457858 -56290229 + IAPEz-int LTR ERVK 1359 1419 -5062 6 1542 1877 107 4 4 chr2 125457847 125458109 -56289978 + IAPEz-int LTR ERVK 2236 2497 -5183 6 1542 931 88 24 0 chr2 125458104 125458229 -56289858 + IAPEz-int LTR ERVK 4783 4910 -2770 6 1542 26886 15 2 0 chr2 125458229 125461179 -56286908 + IAPEz-int LTR ERVK 3525 6481 0 6 1542 2568 85 151 33 chr2 125461179 125461604 -56286483 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 6 1542 675 202 31 0 chr2 125464122 125464251 -56283836 + MT2A LTR ERVL 1 133 -400 6 1542 2804 148 159 158 chr2 125466344 125466765 -56281322 - RMER17A2 LTR ERVK 0 906 472 6 1542 2804 148 159 158 chr2 125466850 125466913 -56281174 - RMER17A2 LTR ERVK -435 471 395 6 1542 2804 148 159 158 chr2 125467046 125467465 -56280622 - RMER17A2 LTR ERVK -512 394 2 6 1542 378 381 86 21 chr2 125470647 125470985 -56277102 + MLT1J1-int LTR MaLR 704 1063 -324 6 1542 281 250 151 5 chr2 125471218 125471332 -56276755 + MLT1J1 LTR MaLR 42 157 -355 6 1542 4054 115 0 60 chr2 125475502 125476141 -56271946 + MT2B LTR ERVL 1 601 0 6 1542 332 295 0 103 chr2 125483536 125483551 -56264536 + MT2B LTR ERVL 152 154 -447 6 1542 309 286 69 75 chr2 125483595 125483754 -56264333 + RLTR25A LTR ERVK 522 679 -424 6 1542 1627 169 93 23 chr2 125484285 125484630 -56263457 + ORR1D1 LTR MaLR 1 369 -5 6 1542 970 170 35 58 chr2 125485459 125485699 -56262388 - ORR1D1 LTR MaLR -49 335 104 6 1542 946 238 165 15 chr2 125489651 125489979 -56258108 + MTE2b LTR MaLR 3 379 0 6 1542 4381 123 35 24 chr2 125494662 125495410 -56252677 - RMER6A LTR ERVK 0 756 1 6 1542 422 287 117 10 chr2 125501161 125501358 -56246729 + RMER15 LTR ERVL 340 557 -18 3 1542 555 287 61 104 chr2 125501941 125502221 -56245866 + RMER15 LTR ERVL 308 575 0 7 1542 234 296 24 24 chr2 125511064 125511147 -56236940 + MTE-int LTR MaLR 621 703 -877 3 1542 1885 185 25 16 chr2 125515450 125515818 -56232269 + ORR1D1 LTR MaLR 4 374 0 3 1542 1486 217 57 41 chr2 125516355 125516721 -56231366 + ORR1D1 LTR MaLR 1 372 -2 3 1542 768 295 81 29 chr2 125518569 125518915 -56229172 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 2 4 1542 1616 213 68 20 chr2 125523562 125523916 -56224171 - MTE2b LTR MaLR -8 371 1 5 1542 1464 221 171 0 chr2 125525260 125525604 -56222483 + MTD LTR MaLR 1 403 -16 5 1542 301 284 0 34 chr2 125529736 125529846 -56218241 + MLT1A1 LTR MaLR 248 387 -21 5 1542 333 250 78 29 chr2 125532674 125532777 -56215310 + LTR86A1 LTR ERVL 401 508 -5 6 1542 786 295 104 39 chr2 125535405 125535761 -56212326 + MTEa LTR MaLR 1 379 0 7 1542 867 136 0 35 chr2 125536728 125536873 -56211214 - RMER6B LTR ERVK -286 175 36 7 1542 1440 167 4 48 chr2 125537558 125537829 -56210258 + RMER6B LTR ERVK 163 421 -40 7 1542 2413 130 58 60 chr2 125537881 125538348 -56209739 - RMER4A LTR ERVK 0 466 1 7 1542 2222 156 83 5 chr2 125541378 125541764 -56206323 + MTC LTR MaLR 6 421 0 8 1542 600 154 519 64 chr2 125541972 125542236 -56205851 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 8 1542 252 321 30 77 chr2 125543785 125543954 -56204133 + MLT1A1 LTR MaLR 248 408 0 9 1542 537 279 167 90 chr2 125545120 125545374 -56202713 + MLT1C LTR MaLR 97 391 -76 9 1542 537 279 167 90 chr2 125545552 125545632 -56202455 + MLT1C LTR MaLR 392 457 -10 9 1542 3020 100 2 87 chr2 125552090 125552223 -56195864 + RLTR11B LTR ERVK 1 133 -320 9 1542 3020 100 2 87 chr2 125552351 125552710 -56195377 + RLTR11B LTR ERVK 134 451 -2 9 1542 651 339 59 113 chr2 125555802 125556228 -56191859 + MLT1-int LTR MaLR 969 1371 0 1 1542 3256 53 10 2 chr2 125559719 125560112 -56187975 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 1543 677 258 58 26 chr2 125567520 125567617 -56180470 + MTE2b LTR MaLR 82 175 -204 1 1543 3302 58 0 0 chr2 125567617 125568013 -56180074 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1543 677 234 282 11 chr2 125568013 125568175 -56179912 + MTE2b LTR MaLR 176 359 0 1 1543 1795 168 88 30 chr2 125568550 125568913 -56179174 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 1 1543 1884 197 58 5 chr2 125572384 125572782 -56175305 + MTC LTR MaLR 1 419 -2 1 1543 572 271 154 26 chr2 125586992 125587303 -56160784 + MLT1A0 LTR MaLR 15 365 0 1 1543 270 319 18 65 chr2 125595420 125595588 -56152499 + RLTR15 LTR ERVK 48 207 -152 1 1543 346 224 92 0 chr2 125614746 125614822 -56133265 + ORR1D1 LTR MaLR 1 83 -291 2 1543 2058 163 48 33 chr2 125614822 125615215 -56132872 - MTC LTR MaLR 0 421 23 2 1543 1060 165 14 127 chr2 125615237 125615528 -56132559 + ORR1D1 LTR MaLR 79 336 -38 2 1543 1709 195 87 14 chr2 125623617 125623975 -56124112 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 2 1543 307 340 38 38 chr2 125626883 125627042 -56121045 - MLT1G1 LTR MaLR -17 562 404 2 1543 495 256 194 59 chr2 125631522 125631846 -56116241 - RLTR9A LTR ERVK 0 368 1 2 1543 291 214 62 125 chr2 125631942 125632086 -56116001 - ETnERV2-int LTR ERVK -31 6511 6377 2 1543 551 230 73 73 chr2 125632338 125632516 -56115571 - ETnERV2-int LTR ERVK -1205 6201 6024 2 1543 945 188 133 137 chr2 125632497 125632982 -56115105 - RLTR45-int LTR ERVK -4736 2508 2083 2 1543 594 242 187 75 chr2 125633445 125633776 -56114311 - RLTR9A LTR ERVK 0 368 1 2 1543 238 227 10 120 chr2 125634177 125634277 -56113810 - MT2B2 LTR ERVL -343 241 153 2 1543 265 214 33 87 chr2 125645838 125645849 -56102238 + MT2B LTR ERVL 155 160 -441 2 1543 1528 216 139 3 chr2 125652497 125652864 -56095223 - MTC LTR MaLR 0 421 5 3 1543 755 179 312 26 chr2 125658951 125659220 -56088867 + ORR1D1 LTR MaLR 25 370 -4 3 1543 254 244 9 143 chr2 125664056 125664161 -56083926 - MT2B LTR ERVL -356 245 155 3 1543 630 222 21 62 chr2 125671884 125672028 -56076059 + MTE2b LTR MaLR 229 366 -13 3 1543 436 319 90 48 chr2 125674453 125674614 -56073473 + ORR1E LTR MaLR 39 207 -152 3 1543 603 277 12 24 chr2 125674614 125674784 -56073303 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 207 3 1543 915 174 17 17 chr2 125675070 125675251 -56072836 - ORR1D1 LTR MaLR -193 181 1 3 1543 3297 137 189 8 chr2 125687517 125688157 -56059930 - RMER6A LTR ERVK 0 756 1 3 1543 463 218 0 0 chr2 125689347 125689434 -56058653 + MTE2b LTR MaLR 7 93 -286 3 1543 291 312 0 20 chr2 125689434 125689445 -56058642 + MT2A LTR ERVL 7 102 -431 3 1543 334 336 14 29 chr2 125689469 125689607 -56058480 + MLT1E1A LTR MaLR 545 680 0 3 1543 312 263 84 68 chr2 125690799 125690993 -56057094 + MTE2b LTR MaLR 171 376 -3 3 1543 355 261 65 65 chr2 125691294 125691417 -56056670 - RMER10A LTR ERVL -13 429 307 3 1543 1432 175 121 46 chr2 125693943 125694291 -56053796 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 3 1543 2308 62 26 0 chr2 125697183 125697492 -56050595 + ORR1A2 LTR MaLR 3 319 -8 4 1544 307 190 128 23 chr2 125699373 125699459 -56048628 - MTD LTR MaLR -53 366 272 4 1544 3051 51 7 1 chr2 125699930 125700317 -56047770 - RLTR10C LTR ERVK -1 435 60 4 1544 432 298 57 45 chr2 125700896 125700943 -56047144 - RLTR10C LTR ERVK -316 120 67 4 1544 432 298 57 45 chr2 125701588 125701652 -56046435 - RLTR10C LTR ERVK -370 66 3 4 1544 1032 284 98 62 chr2 125712471 125712664 -56035423 - RMER5 LTR ERV1 -28 506 314 4 1544 2775 158 24 50 chr2 125712664 125713238 -56034849 - RLTR31_Mm LTR ERVK -2 559 1 4 1544 1032 284 98 62 chr2 125713238 125713532 -56034555 - RMER5 LTR ERV1 -221 313 1 4 1544 1195 192 100 71 chr2 125715035 125715390 -56032697 - ORR1C2 LTR MaLR -2 392 1 4 1544 958 153 34 6 chr2 125727891 125728069 -56020018 + RLTR11A2 LTR ERVK 3 185 -342 4 1544 3685 116 102 35 chr2 125733045 125733734 -56014353 + RMER19A LTR ERVK 1 735 -2 4 1544 1900 129 6 6 chr2 125735301 125735614 -56012473 + ORR1A3 LTR MaLR 1 313 -13 4 1544 285 200 73 112 chr2 125746265 125746406 -56001681 - MLT1A1 LTR MaLR -2 567 432 4 1544 463 265 77 0 chr2 125747067 125747248 -56000839 - MTE-int LTR MaLR -184 1396 1202 4 1544 350 256 29 23 chr2 125747915 125748028 -56000059 - MLT1A1 LTR MaLR -12 396 233 4 1544 1238 199 70 49 chr2 125753477 125753513 -55994574 - MT2B LTR ERVL -6 595 545 4 1544 1238 198 81 29 chr2 125753625 125754020 -55994067 - MT2B LTR ERVL -57 544 1 4 1544 3189 57 5 0 chr2 125782909 125783292 -55964795 - IAPEY_LTR LTR ERVK 0 385 1 5 1544 22049 52 5 7 chr2 125783292 125786008 -55962079 - IAPEy-int LTR ERVK 0 7513 4804 5 1544 7154 112 11 12 chr2 125786008 125787067 -55961020 - IAPEy-int LTR ERVK -6455 1058 1 5 1544 3236 47 5 0 chr2 125787067 125787450 -55960637 - IAPEY_LTR LTR ERVK 0 385 1 5 1544 527 200 245 50 chr2 125797768 125798028 -55950059 - ORR1E LTR MaLR 0 370 60 5 1544 4486 14 2 0 chr2 125820640 125821132 -55926955 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 5 1544 41483 16 14 0 chr2 125821132 125826430 -55921657 + MERVL-int LTR ERVL 1 5371 -114 5 1544 347 111 26 53 chr2 125826430 125826506 -55921581 + ORR1A3-int LTR MaLR 567 640 -1323 5 1544 321 0 0 0 chr2 125826506 125826544 -55921543 + MERVL-int LTR ERVL 5448 5485 0 5 1544 4486 14 2 0 chr2 125826544 125827036 -55921051 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 5 1545 453 163 32 11 chr2 125832010 125832103 -55915984 + RMER5 LTR ERV1 1 95 -439 5 1545 1925 162 25 25 chr2 125832149 125832555 -55915532 + RMER5 LTR ERV1 101 506 -28 5 1545 1306 212 95 44 chr2 125839685 125840075 -55908012 - RMER10A LTR ERVL -6 436 27 5 1545 528 280 78 120 chr2 125842404 125842688 -55905399 - MTEa LTR MaLR -45 334 63 5 1545 232 236 111 0 chr2 125843045 125843117 -55904970 - MTE2a LTR MaLR -145 234 155 5 1545 1200 195 108 61 chr2 125844258 125844449 -55903638 - ORR1D1 LTR MaLR -12 362 158 5 1545 1200 195 108 61 chr2 125844526 125844678 -55903409 - ORR1D1 LTR MaLR -217 157 3 5 1545 1052 224 153 24 chr2 125869740 125870087 -55878000 + MTD LTR MaLR 1 403 -16 6 1545 1446 185 129 35 chr2 125892194 125892536 -55855551 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 6 1545 227 268 57 68 chr2 125920331 125920419 -55827668 - MLT1F2 LTR MaLR -113 447 361 6 1545 315 323 32 8 chr2 125936964 125937089 -55810998 - RMER15 LTR ERVL -69 506 379 7 1545 2373 266 140 17 chr2 125937873 125938702 -55809385 + MTE-int LTR MaLR 596 1526 -54 7 1545 375 327 26 35 chr2 125938696 125938810 -55809277 + ORR1E LTR MaLR 33 145 -214 7 1545 420 354 62 41 chr2 125943890 125944182 -55803905 + MLT1D LTR MaLR 206 503 -2 7 1545 1692 162 103 6 chr2 125949203 125949544 -55798543 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 7 1545 2801 196 32 4 chr2 125954851 125955487 -55792600 + RLTR31_Mm LTR ERVK 1 560 -1 7 1545 5260 129 42 72 chr2 125956941 125957871 -55790216 - RMER19B LTR ERVK 0 902 1 7 1545 1181 216 64 4 chr2 125958142 125958375 -55789712 + RMER19B LTR ERVK 149 395 -507 7 1546 373 358 50 26 chr2 125974694 125974917 -55773170 + MLT1G LTR MaLR 3 227 -352 7 1546 1718 206 85 5 chr2 125975023 125975399 -55772688 + MTD LTR MaLR 4 409 -10 7 1546 237 307 8 0 chr2 125975770 125975850 -55772237 + MLT1G LTR MaLR 467 595 0 7 1546 777 350 80 37 chr2 125979209 125979696 -55768391 - MER21B LTR ERV1 -160 703 196 7 1546 339 203 101 0 chr2 125980704 125980773 -55767314 + ORR1D1 LTR MaLR 214 289 -85 7 1546 1779 196 21 27 chr2 125981085 125981457 -55766630 + ORR1D1 LTR MaLR 5 374 0 7 1546 3420 33 2 5 chr2 125991636 125992033 -55756054 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 7 1546 371 331 95 40 chr2 125992696 125992948 -55755139 + LTR16D LTR ERVL 359 624 -27 7 1546 750 250 48 65 chr2 125995434 125995682 -55752405 - RMER15 LTR ERVL -93 482 239 7 1546 1507 184 72 16 chr2 125996482 125996786 -55751301 + ORR1B1 LTR MaLR 74 394 0 7 1546 3164 177 3 28 chr2 125996786 125997384 -55750703 + ORR1B1-int LTR MaLR 1 583 -926 7 1546 1443 214 109 82 chr2 125997550 125998135 -55749952 + MT2B LTR ERVL 1 601 0 7 1546 232 296 40 30 chr2 125999521 125999622 -55748465 - RLTR22_Mus LTR ERVK -166 1642 1541 7 1546 855 295 26 32 chr2 125999657 126000000 -55748087 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1041 807 467 7 1546 296 261 21 54 chr2 126000124 126000217 -55747870 + RLTR23 LTR ERV1 341 430 0 1 1546 336 175 63 0 chr2 126006681 126006744 -55741343 - RMER15 LTR ERVL -105 470 404 1 1546 891 217 75 58 chr2 126011950 126012190 -55735897 + MERVL_2A-int LTR ERVL 2478 2721 -3040 2 1546 239 226 62 31 chr2 126012461 126012557 -55735530 + MTEb LTR MaLR 279 377 -2 2 1546 899 232 0 6 chr2 126014328 126014510 -55733577 + ORR1D1 LTR MaLR 1 181 -193 2 1546 512 214 149 70 chr2 126014541 126014742 -55733345 + ORR1D1 LTR MaLR 157 373 -1 2 1546 514 91 0 61 chr2 126017532 126017550 -55730537 + ORR1A3 LTR MaLR 250 264 -62 3 1546 514 91 0 61 chr2 126017591 126017654 -55730433 + ORR1A3 LTR MaLR 265 326 0 3 1546 720 115 9 0 chr2 126017655 126017768 -55730319 + ORR1A3-int LTR MaLR 2 115 -1848 3 1546 1716 158 4 0 chr2 126017757 126018035 -55730052 - ORR1A1 LTR MaLR -67 279 1 3 1546 3407 35 2 0 chr2 126018968 126019363 -55728724 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 1546 1475 232 145 15 chr2 126022381 126022465 -55725622 - MT2A LTR ERVL -2 531 433 4 1546 1475 232 145 15 chr2 126022508 126022892 -55725195 - MT2A LTR ERVL -101 432 2 4 1546 331 224 30 0 chr2 126025857 126025924 -55722163 - MLT1E1A LTR MaLR -45 635 567 4 1546 2007 211 51 87 chr2 126025975 126026608 -55721479 - RMER19C LTR ERVK 0 611 2 4 1546 327 240 61 30 chr2 126026616 126026715 -55721372 - MLT1E LTR MaLR -387 266 165 5 1546 244 225 48 48 chr2 126026723 126026807 -55721280 - MLT1E1A LTR MaLR -11 397 314 4 1546 297 313 24 24 chr2 126026939 126027024 -55721063 - MLT1E1A LTR MaLR -581 99 15 5 1546 1717 172 99 14 chr2 126030177 126030531 -55717556 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 5 1546 567 185 16 56 chr2 126031334 126031460 -55716627 + RLTR33 LTR ERVK 1 121 -557 6 1546 551 167 10 0 chr2 126031484 126031586 -55716501 + RLTR33 LTR ERVK 107 209 -469 6 1546 1794 153 41 0 chr2 126031587 126031901 -55716186 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 6 1546 7233 108 11 6 chr2 126031901 126032970 -55715117 - ORR1A2-int LTR MaLR 0 1963 889 6 1546 1733 277 40 41 chr2 126032978 126033530 -55714557 + RLTR17 LTR ERVK 105 619 -73 6 1546 3353 158 59 28 chr2 126033530 126034338 -55713749 - ORR1A3-int LTR MaLR -688 821 1 6 1546 1936 140 38 0 chr2 126034338 126034652 -55713435 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 6 1546 1807 189 68 9 chr2 126034652 126035064 -55713023 + RLTR33 LTR ERVK 206 678 0 6 1546 351 282 231 58 chr2 126035428 126035693 -55712394 - MER74A LTR ERVL -279 343 59 6 1546 488 290 20 70 chr2 126037555 126037583 -55710504 + MLT1E2 LTR MaLR 45 72 -555 6 1546 2589 148 7 14 chr2 126037583 126038007 -55710080 - MTC LTR MaLR 0 421 1 6 1546 488 290 20 70 chr2 126038007 126038178 -55709909 + MLT1E2 LTR MaLR 73 234 -393 6 1546 440 136 83 36 chr2 126038815 126038899 -55709188 + RLTR47_MM LTR ERV1 354 441 -91 7 1546 3697 148 94 11 chr2 126049817 126050038 -55698049 - RMER6D LTR ERVK -4 716 493 8 1546 3697 148 94 11 chr2 126050472 126050911 -55697176 - RMER6D LTR ERVK -228 492 1 8 1546 2775 160 126 6 chr2 126054756 126055264 -55692823 + RMER4B LTR ERVK 17 585 0 9 1546 970 247 225 0 chr2 126072587 126072928 -55675159 + MTD LTR MaLR 1 403 -16 1 1546 450 244 151 98 chr2 126074809 126075054 -55673033 + MTEa LTR MaLR 120 377 -2 1 1546 276 51 0 0 chr2 126076023 126076062 -55672025 + RMER17A LTR ERVK 1 39 -712 1 1546 3245 82 44 0 chr2 126076062 126076513 -55671574 + RMER17A-int LTR ERVK 1257 1727 -1 1 1546 4410 100 56 55 chr2 126076515 126077265 -55670822 + RMER17A LTR ERVK 1 751 0 1 1546 628 137 64 8 chr2 126077777 126077902 -55670185 + ORR1D1 LTR MaLR 1 132 -242 1 1546 878 175 244 0 chr2 126077995 126078212 -55669875 - ORR1B2 LTR MaLR -97 270 1 1 1546 465 206 0 0 chr2 126078215 126078307 -55669780 + ORR1D1 LTR MaLR 281 372 -2 1 1547 246 331 99 26 chr2 126095077 126095229 -55652858 - ORR1E LTR MaLR -196 163 1 1 1547 934 248 220 9 chr2 126097890 126098326 -55649761 + RMER5 LTR ERV1 5 532 -2 1 1547 340 350 92 57 chr2 126099287 126099514 -55648573 - MT2A LTR ERVL -71 462 228 1 1547 2896 65 48 0 chr2 126102528 126102944 -55645143 - RLTR1B LTR ERV1 -76 436 1 1 1547 22426 39 21 3 chr2 126102944 126105922 -55642165 - RLTR1B-int LTR ERV1 0 3299 188 1 1547 2975 73 13 5 chr2 126123915 126124312 -55623775 + MTB LTR MaLR 1 400 0 1 1547 878 289 110 16 chr2 126125411 126125728 -55622359 + MLT1A0 LTR MaLR 16 362 -3 1 1547 1279 232 110 62 chr2 126126113 126126513 -55621574 - MTD LTR MaLR 0 419 1 1 1547 2380 158 26 35 chr2 126126832 126127257 -55620830 - MTC LTR MaLR 0 421 1 1 1547 2571 126 58 2 chr2 126128041 126128439 -55619648 - RLTR9B2 LTR ERVK 0 420 1 1 1547 238 254 16 0 chr2 126131990 126132053 -55616034 - RMER15 LTR ERVL -109 466 403 1 1547 321 104 0 0 chr2 126136620 126136668 -55611419 - MTC LTR MaLR -373 48 1 2 1547 273 143 20 0 chr2 126139253 126139302 -55608785 + MTD LTR MaLR 362 411 -8 2 1547 2167 230 23 43 chr2 126140883 126141442 -55606645 - RMER15 LTR ERVL 0 575 28 2 1547 401 259 35 26 chr2 126143136 126143251 -55604836 + RLTR14 LTR ERV1 267 382 0 2 1547 349 240 170 0 chr2 126153172 126153272 -55594815 + MTD LTR MaLR 4 120 -299 2 1547 1501 216 3 13 chr2 126155616 126155921 -55592166 + MTD LTR MaLR 118 419 0 2 1547 425 249 258 17 chr2 126166135 126166375 -55581712 + RMER10A LTR ERVL 132 429 -13 2 1547 492 226 35 109 chr2 126176249 126176423 -55571664 + RMER13A LTR ERVK 113 273 -587 2 1547 225 330 0 93 chr2 126176740 126176847 -55571240 + RMER20B LTR ERVK 513 609 -18 2 1547 1104 243 87 23 chr2 126176904 126177249 -55570838 + RMER15 LTR ERVL 207 573 -2 2 1547 370 186 23 3 chr2 126177277 126177349 -55570738 + MTC LTR MaLR 1 79 -317 2 1547 2491 127 24 13 chr2 126179833 126180207 -55567880 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 2 1547 852 252 109 13 chr2 126195694 126195994 -55552093 + MTD LTR MaLR 51 377 -42 2 1547 952 278 123 33 chr2 126202454 126202755 -55545332 + MTD LTR MaLR 18 345 -74 2 1547 2949 88 0 2 chr2 126205359 126205760 -55542327 + MTB_Mm LTR MaLR 1 400 -7 2 1547 1951 216 86 10 chr2 126215403 126215913 -55532174 + RMER15 LTR ERVL 27 575 0 3 1547 744 300 47 9 chr2 126220608 126220816 -55527271 + ORR1E-int LTR MaLR 1311 1527 -53 3 1547 377 247 34 0 chr2 126220816 126220905 -55527182 + ORR1E LTR MaLR 1 92 -267 3 1547 2005 160 162 3 chr2 126221489 126221852 -55526235 + MTC LTR MaLR 1 421 0 3 1548 3437 53 8 10 chr2 126225800 126226201 -55521886 + MTB LTR MaLR 1 400 0 3 1548 1420 254 32 8 chr2 126229576 126229946 -55518141 + MTEa LTR MaLR 1 379 0 3 1548 1339 168 88 19 chr2 126249572 126249833 -55498254 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 48 3 1548 1231 215 191 6 chr2 126264620 126264971 -55483116 - MTD LTR MaLR -2 417 2 3 1548 298 354 91 94 chr2 126268146 126268455 -55479632 + ORR1E LTR MaLR 52 359 0 3 1548 3743 15 2 0 chr2 126271204 126271599 -55476488 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 1548 9409 40 11 1 chr2 126271599 126272686 -55475401 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 3 1548 3757 13 2 0 chr2 126272686 126273081 -55475006 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 1548 1974 116 25 63 chr2 126281953 126282320 -55465767 + ORR1B1 LTR MaLR 42 394 0 4 1548 1339 204 62 62 chr2 126310320 126310742 -55437345 - RMER6C LTR ERVK 0 690 269 4 1548 1605 175 110 0 chr2 126329282 126329619 -55418468 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 4 1548 367 254 23 30 chr2 126333355 126333496 -55414591 + ORR1D1 LTR MaLR 164 302 -92 4 1548 1072 213 170 13 chr2 126334693 126334993 -55413094 + ORR1D2 LTR MaLR 15 361 -9 5 1548 827 147 40 80 chr2 126336034 126336054 -55412033 + ORR1D1 LTR MaLR 3 17 -357 5 1548 6013 79 69 7 chr2 126336054 126336895 -55411192 + RLTR13B1 LTR ERVK 1 893 0 5 1548 827 147 40 80 chr2 126336895 126337048 -55411039 + ORR1D1 LTR MaLR 18 168 -206 5 1548 2511 156 70 34 chr2 126337048 126337546 -55410541 - RMER20A LTR ERVK 0 516 1 5 1548 563 190 274 6 chr2 126337546 126337710 -55410377 + ORR1D1 LTR MaLR 177 384 0 5 1548 1994 204 158 72 chr2 126348751 126349567 -55398520 + RLTR13D6 LTR ERVK 10 853 -49 5 1548 2880 139 36 74 chr2 126349776 126350357 -55397730 + RLTR31_Mm LTR ERVK 3 561 0 5 1548 2612 54 72 0 chr2 126351670 126352005 -55396082 - RLTR10D LTR ERVK 0 359 1 5 1549 3654 62 0 14 chr2 126354098 126354601 -55393486 - LTRIS2 LTR ERV1 0 564 69 5 1549 962 211 66 0 chr2 126354608 126354836 -55393251 - RLTR1B-int LTR ERV1 -33 5030 4788 5 1549 1230 282 92 24 chr2 126354920 126355334 -55392753 - RLTR1B-int LTR ERV1 -917 4146 3705 5 1549 7686 61 52 84 chr2 126355321 126356473 -55391614 - RLTR1B-int LTR ERV1 -744 2555 1441 5 1549 380 232 261 5 chr2 126358090 126358289 -55389798 - RMER20B LTR ERVK -235 392 143 5 1549 355 264 9 28 chr2 126359452 126359561 -55388526 + MLT1A1 LTR MaLR 290 396 -12 5 1549 4379 94 3 27 chr2 126359858 126360459 -55387628 - LTRIS_Mus LTR ERV1 0 587 1 5 1549 1152 211 271 34 chr2 126361779 126362226 -55385861 + MT2B LTR ERVL 1 553 -48 5 1549 257 151 18 36 chr2 126362268 126362323 -55385764 + MT2B LTR ERVL 531 584 0 5 1549 364 296 152 53 chr2 126375442 126375685 -55372402 + MLT1A0 LTR MaLR 86 352 -13 5 1549 279 339 138 55 chr2 126385267 126385629 -55362458 + LTR16A LTR ERVL 5 396 -55 5 1549 511 311 80 57 chr2 126392238 126392501 -55355586 + MLT1A0 LTR MaLR 91 359 -6 5 1549 746 299 129 25 chr2 126392781 126393157 -55354930 - MLT1D LTR MaLR 0 505 59 6 1549 256 244 80 68 chr2 126399212 126399229 -55348858 + MT2B LTR ERVL 152 169 -432 6 1549 588 269 182 4 chr2 126404117 126404419 -55343668 - MTEa LTR MaLR 0 379 1 6 1549 2956 163 14 17 chr2 126407528 126408045 -55340042 - RMER15 LTR ERVL -1 574 60 6 1549 2204 143 21 40 chr2 126414222 126414600 -55333487 - ORR1D1 LTR MaLR -3 371 1 6 1549 1389 165 77 7 chr2 126414700 126414974 -55333113 - RLTR11A LTR ERVK -3 525 233 6 1549 351 170 81 36 chr2 126414972 126415084 -55333003 - RLTR11A LTR ERVK -465 112 1 6 1549 1353 150 32 5 chr2 126415498 126415719 -55332368 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 181 6 1549 973 141 79 6 chr2 126416099 126416277 -55331810 - MTB_Mm LTR MaLR -211 210 20 6 1549 28981 91 29 36 chr2 126434569 126439137 -55308950 + MuRRS-int LTR ERV1 1 4690 0 6 1549 4438 6 2 0 chr2 126439137 126439618 -55308469 + LTRIS_Mm LTR ERV1 1 482 0 6 1549 230 191 212 45 chr2 126445043 126445109 -55302978 + LTR69 LTR ERVL 326 402 -186 6 1549 520 291 146 34 chr2 126445748 126446015 -55302072 + MER21B LTR ERV1 493 789 -74 7 1549 1962 231 41 27 chr2 126447908 126448420 -55299667 - RMER5 LTR ERV1 -15 519 1 7 1549 268 293 82 15 chr2 126450999 126451134 -55296953 + RMER15 LTR ERVL 274 417 -158 7 1549 320 262 150 42 chr2 126466530 126466697 -55281390 + MLT1B LTR MaLR 2 186 -204 7 1549 235 287 23 76 chr2 126481429 126481561 -55266526 - RMER6C LTR ERVK -121 569 445 7 1550 302 186 102 23 chr2 126490817 126490890 -55257197 - ORR1D1 LTR MaLR -250 124 45 7 1550 247 143 0 0 chr2 126490982 126491017 -55257070 - ORR1D1 LTR MaLR -339 35 1 7 1550 2278 179 188 18 chr2 126491017 126491585 -55256502 - ORR1D1-int LTR MaLR 0 1370 706 7 1550 1210 186 25 17 chr2 126491698 126491938 -55256149 + ORR1B2-int LTR MaLR 355 596 -774 8 1550 394 191 34 56 chr2 126492138 126492149 -55255938 + ORR1B2-int LTR MaLR 622 631 -739 8 1550 394 191 34 56 chr2 126492333 126492410 -55255677 + ORR1B2-int LTR MaLR 632 708 -662 8 1550 263 159 39 192 chr2 126492400 126492478 -55255609 + ORR1B2 LTR MaLR 296 361 -9 8 1550 1709 258 58 47 chr2 126492484 126492539 -55255548 + ORR1B2-int LTR MaLR 2 52 -1318 8 1550 1709 258 58 47 chr2 126492623 126493079 -55255008 + ORR1B2-int LTR MaLR 53 519 -851 8 1550 1477 185 114 8 chr2 126493214 126493504 -55254583 + ORR1B2 LTR MaLR 5 334 -44 8 1550 242 214 0 0 chr2 126493820 126493862 -55254225 + ORR1B2 LTR MaLR 312 353 -14 8 1550 627 297 102 54 chr2 126508117 126508451 -55239636 + ORR1E LTR MaLR 10 359 0 1 1550 511 150 64 50 chr2 126508555 126508695 -55239392 - RMER15 LTR ERVL 0 575 434 2 1550 673 309 0 32 chr2 126508706 126508923 -55239164 - RMER15 LTR ERVL -194 381 172 2 1550 417 205 21 139 chr2 126509034 126509221 -55238866 - RMER15 LTR ERVL -384 191 27 2 1550 227 246 0 44 chr2 126509235 126509303 -55238784 - RMER15 LTR ERVL -510 65 1 2 1550 641 194 64 13 chr2 126510026 126510183 -55237904 + RMER5 LTR ERV1 355 519 -15 2 1550 1046 182 25 0 chr2 126510337 126510535 -55237552 + ORR1B2 LTR MaLR 157 359 -8 2 1550 673 205 226 21 chr2 126511120 126511359 -55236728 - ORR1E LTR MaLR -15 344 57 3 1550 824 235 198 78 chr2 126513814 126514133 -55233954 - ORR1E LTR MaLR 0 359 3 3 1550 1620 117 14 120 chr2 126514145 126514504 -55233583 - ORR1A4 LTR MaLR -8 321 1 3 1550 1462 198 135 8 chr2 126517642 126517998 -55230089 + MTD LTR MaLR 1 401 -18 5 1550 544 352 72 49 chr2 126518078 126518523 -55229564 + MLT2B3 LTR ERVL 1 455 -99 5 1550 636 241 157 0 chr2 126518618 126518809 -55229278 - MTD LTR MaLR 0 419 199 5 1550 1027 165 82 5 chr2 126518969 126519164 -55228923 - MTD LTR MaLR -209 210 1 5 1550 1067 165 23 19 chr2 126521886 126522102 -55225985 + RMER15 LTR ERVL 2 218 -357 6 1550 246 178 0 0 chr2 126522505 126522550 -55225537 - RMER15 LTR ERVL -44 531 487 6 1550 243 203 119 0 chr2 126522557 126522616 -55225471 + RMER5 LTR ERV1 3 68 -466 7 1550 237 167 21 0 chr2 126522953 126523001 -55225086 + RMER5 LTR ERV1 62 110 -424 7 1550 1313 188 107 19 chr2 126525798 126526145 -55221942 - RLTR16 LTR ERVK 0 568 130 8 1550 2078 185 122 20 chr2 126526153 126526843 -55221244 - RMER13A LTR ERVK 0 860 1 8 1550 805 148 0 7 chr2 126526843 126526979 -55221108 - RLTR16 LTR ERVK -370 135 1 8 1550 889 179 6 12 chr2 126528142 126528312 -55219775 - ORR1C2 LTR MaLR -215 169 1 8 1550 1313 213 56 11 chr2 126528420 126528703 -55219384 + MTD LTR MaLR 1 296 -123 8 1550 1893 153 21 3 chr2 126528703 126529038 -55219049 + ORR1A1 LTR MaLR 1 341 -5 8 1550 274 222 212 0 chr2 126529040 126529139 -55218948 + MTD LTR MaLR 302 421 0 8 1550 240 179 149 0 chr2 126529173 126529240 -55218847 - RMER2 LTR ERV1 -2 565 489 8 1550 1407 226 206 57 chr2 126529746 126530304 -55217783 + MTC-int LTR MaLR 243 883 -375 9 1550 257 390 79 14 chr2 126535517 126535733 -55212354 - MLT1G3 LTR MaLR -239 356 127 1 1550 431 300 92 76 chr2 126536479 126536807 -55211280 + ORR1E LTR MaLR 15 347 -12 1 1550 3084 26 0 0 chr2 126540216 126540562 -55207525 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 1 1550 1560 199 73 17 chr2 126544400 126544758 -55203329 + MTC LTR MaLR 10 387 -34 1 1550 811 262 129 4 chr2 126558131 126558410 -55189677 - MTE2b LTR MaLR -63 316 3 1 1550 794 167 10 18 chr2 126582814 126582998 -55165089 - ORR1A4 LTR MaLR 0 384 201 2 1550 398 127 0 0 chr2 126596901 126596964 -55151123 + ORR1B2 LTR MaLR 1 63 -304 2 1550 685 307 29 69 chr2 126597001 126597421 -55150666 + BGLII_B LTR ERVK 7 409 -32 2 1550 1528 159 133 0 chr2 126598150 126598451 -55149636 + ORR1B1 LTR MaLR 1 341 -53 2 1550 442 175 0 34 chr2 126598753 126598856 -55149231 - MTC LTR MaLR -140 260 164 2 1550 724 119 17 17 chr2 126599187 126599307 -55148780 - MTC LTR MaLR -301 120 1 2 1550 1250 199 80 7 chr2 126599411 126599685 -55148402 - MTC-int LTR MaLR -598 660 367 2 1550 1707 188 46 16 chr2 126599686 126600208 -55147879 + RLTR12A LTR ERVK 2 562 -6 2 1550 1307 216 37 61 chr2 126600215 126600590 -55147497 - MTC-int LTR MaLR -888 370 5 2 1550 1756 166 96 11 chr2 126600596 126600973 -55147114 - MTC LTR MaLR -12 409 1 2 1550 1793 122 53 3 chr2 126609555 126609859 -55138228 - ORR1A3 LTR MaLR -7 319 1 2 1550 946 224 85 0 chr2 126610110 126610356 -55137731 - RMER15 LTR ERVL -48 527 261 2 1550 344 233 217 68 chr2 126613593 126613856 -55134231 + RMER20B LTR ERVK 89 390 -237 2 1551 708 240 105 148 chr2 126615890 126616282 -55131805 - MTE2a LTR MaLR -2 377 3 2 1551 645 206 51 6 chr2 126641405 126641561 -55106526 - RMER5 LTR ERV1 -36 498 336 3 1551 688 255 114 66 chr2 126641578 126641851 -55106236 - RMER5 LTR ERV1 -248 286 1 3 1551 250 181 65 65 chr2 126666150 126666227 -55081860 + MT2B LTR ERVL 188 264 -337 4 1551 1464 204 66 17 chr2 126666720 126667069 -55081018 + ORR1D1 LTR MaLR 9 374 0 4 1551 2331 87 3 0 chr2 126683560 126683872 -55064215 + ORR1A2 LTR MaLR 7 319 -8 4 1551 1157 235 186 12 chr2 126685417 126685761 -55062326 - MTD LTR MaLR -39 380 10 4 1551 684 271 201 25 chr2 126689281 126689565 -55058522 + MTD LTR MaLR 31 364 -55 5 1551 267 111 67 0 chr2 126689763 126689808 -55058279 + MTD LTR MaLR 364 411 -8 5 1551 1406 240 27 48 chr2 126689812 126690188 -55057899 + MTD-int LTR MaLR 1 368 -890 5 1551 2480 225 111 71 chr2 126691271 126692081 -55056006 + MTD-int LTR MaLR 361 1138 -120 5 1551 1728 189 97 6 chr2 126692096 126692458 -55055629 + MTD LTR MaLR 17 411 -8 5 1551 1518 151 125 93 chr2 126692759 126693102 -55054985 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 41 5 1551 350 254 110 14 chr2 126693201 126693365 -55054722 + ORR1D2 LTR MaLR 152 333 -46 5 1551 3095 49 23 0 chr2 126694607 126694998 -55053089 - MTB LTR MaLR 0 400 1 5 1551 803 268 124 15 chr2 126696025 126696316 -55051771 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 22 5 1551 438 179 42 0 chr2 126699617 126699712 -55048375 - MT2B LTR ERVL -351 250 152 5 1551 616 134 18 6 chr2 126704065 126704193 -55043894 - MT2B LTR ERVL -401 132 1 5 1551 298 200 43 76 chr2 126704122 126704214 -55043873 - ORR1A3-int LTR MaLR -1281 682 594 5 1551 804 262 203 49 chr2 126704609 126705039 -55043048 + MLT1F LTR MaLR 6 561 -8 5 1551 1110 255 45 85 chr2 126706296 126706701 -55041386 - RMER15 LTR ERVL -18 557 85 5 1551 1985 217 41 50 chr2 126711420 126711959 -55036128 - RMER5 LTR ERV1 0 534 1 5 1551 1141 171 159 28 chr2 126714158 126714441 -55033646 - ORR1D1 LTR MaLR -54 320 1 5 1551 228 250 79 88 chr2 126715465 126715579 -55032508 + MT2B LTR ERVL 145 257 -344 5 1551 691 242 159 4 chr2 126724237 126724482 -55023605 - ORR1D1 LTR MaLR -91 283 1 6 1551 1108 246 74 52 chr2 126725506 126725877 -55022210 + MTE2a LTR MaLR 25 413 -6 6 1551 960 299 32 37 chr2 126744536 126744936 -55003151 + MTE2a LTR MaLR 3 405 -14 6 1552 228 229 18 0 chr2 126751807 126751916 -54996171 + ORR1B1-int LTR MaLR 644 754 -755 6 1552 1944 93 169 0 chr2 126754526 126754892 -54993195 + RLTR47_MM LTR ERV1 76 503 -29 6 1552 1044 315 58 42 chr2 126756095 126756616 -54991471 + MTE-int LTR MaLR 3 531 -1049 6 1552 7004 70 11 5 chr2 126761888 126762900 -54985187 - MTA_Mm-int LTR MaLR -80 1018 1 7 1552 1533 31 0 0 chr2 126762900 126763093 -54984994 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 204 7 1552 228 254 0 0 chr2 126765578 126765637 -54982450 - RMER6B LTR ERVK -35 426 368 7 1552 3709 70 47 0 chr2 126767582 126768069 -54980018 - RLTR1B LTR ERV1 0 512 3 7 1552 1680 146 28 79 chr2 126771735 126772166 -54975921 + RMER17C LTR ERVK 2 410 0 7 1552 293 177 16 31 chr2 126773763 126773827 -54974260 - RLTR25B LTR ERVK -525 503 441 7 1552 1965 196 132 23 chr2 126774583 126774771 -54973316 - RLTR25B LTR ERVK 0 1028 796 7 1552 1965 196 132 23 chr2 126774901 126775232 -54972855 - RLTR25B LTR ERVK -233 795 452 7 1552 3507 28 2 0 chr2 126778722 126779117 -54968970 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 7 1552 2669 181 12 12 chr2 126780067 126780582 -54967505 + RLTR12B LTR ERVK 1 515 -13 7 1552 324 257 0 0 chr2 126783607 126783681 -54964406 - ORR1D2 LTR MaLR -296 74 1 7 1552 2801 73 141 139 chr2 126784064 126784575 -54963512 - RLTR1B LTR ERV1 0 512 1 7 1552 692 251 66 86 chr2 126785759 126786022 -54962065 - RMER17C LTR ERVK -68 342 76 7 1552 692 251 66 86 chr2 126786063 126786148 -54961939 - RMER17C LTR ERVK -335 75 1 7 1552 2046 137 78 3 chr2 126786955 126787314 -54960773 + ORR1B1 LTR MaLR 1 386 -8 7 1552 733 277 236 18 chr2 126788144 126788479 -54959608 + MER21B LTR ERV1 56 463 -400 7 1552 773 242 65 39 chr2 126788500 126788732 -54959355 + MT2A LTR ERVL 1 238 -295 7 1552 577 277 40 162 chr2 126788778 126788940 -54959147 + MTE2b LTR MaLR 212 348 -31 7 1552 1091 224 62 59 chr2 126788985 126789289 -54958798 + ORR1D-int LTR MaLR 47 351 -1019 7 1552 2216 175 56 21 chr2 126789312 126789739 -54958348 - RMER10A LTR ERVL 0 442 1 7 1552 1176 244 32 99 chr2 126789951 126790387 -54957700 + ORR1D-int LTR MaLR 398 804 -566 7 1552 316 218 13 13 chr2 126790408 126790487 -54957600 + ORR1D-int LTR MaLR 360 438 -932 7 1552 3184 6 37 0 chr2 126790738 126791092 -54956995 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 7 1552 56760 23 15 3 chr2 126791092 126797487 -54950600 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 8 7 1552 3184 6 37 0 chr2 126797487 126797841 -54950246 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 7 1552 263 292 79 48 chr2 126805141 126805267 -54942820 + LTR50 LTR ERVL 1 130 -665 8 1552 1781 130 68 18 chr2 126813099 126813501 -54934586 - RLTR28 LTR ERVL 0 524 1 8 1552 3265 45 10 2 chr2 126813738 126814135 -54933952 + MTB LTR MaLR 1 400 0 8 1552 286 293 83 45 chr2 126816444 126816601 -54931486 + MLT1A0 LTR MaLR 144 306 -59 8 1552 643 292 32 14 chr2 126825257 126825476 -54922611 - LTRIS4 LTR ERV1 0 507 285 8 1552 463 45 15 0 chr2 126825667 126825734 -54922353 - MT2B2 LTR ERVL 0 584 517 8 1552 2366 165 17 12 chr2 126829014 126829431 -54918656 + MTD LTR MaLR 1 419 0 8 1552 630 216 44 118 chr2 126830303 126830558 -54917529 + ORR1E LTR MaLR 107 371 -8 8 1552 1558 203 3 0 chr2 126841891 126842192 -54905895 - MT2A LTR ERVL -231 302 1 9 1552 1025 174 229 16 chr2 126842193 126842503 -54905584 - MTD LTR MaLR -39 380 5 9 1552 343 296 55 79 chr2 126842593 126842727 -54905360 + MTEa LTR MaLR 195 324 -55 9 1552 343 296 55 79 chr2 126842879 126842909 -54905178 + MTEa LTR MaLR 325 355 -24 9 1552 3341 116 20 82 chr2 126848003 126848686 -54899401 + RLTR6_Mm LTR ERV1 1 641 -13 9 1552 288 244 45 45 chr2 126849809 126849975 -54898112 - RLTR13D3 LTR ERVK -42 1072 989 9 1552 236 267 129 32 chr2 126850767 126850860 -54897227 - RLTR13D3 LTR ERVK -1012 102 1 9 1552 1591 148 126 0 chr2 126850883 126851200 -54896887 - ORR1D1 LTR MaLR -1 373 17 9 1552 5116 147 71 25 chr2 126854722 126854831 -54893256 - RMER12 LTR ERVK -231 1091 990 9 1552 5116 147 71 25 chr2 126854861 126854920 -54893167 - RMER12 LTR ERVK -333 989 904 9 1552 5116 147 71 25 chr2 126855009 126855868 -54892219 - RMER12 LTR ERVK -419 903 18 9 1552 355 237 66 80 chr2 126857567 126857718 -54890369 - MT2A LTR ERVL -279 254 106 9 1552 1519 59 0 0 chr2 126865227 126865430 -54882657 - MURVY-LTR LTR ERV1 0 519 317 9 1552 2132 31 66 0 chr2 126865712 126866001 -54882086 - MURVY-LTR LTR ERV1 -210 309 2 9 1552 2115 154 25 150 chr2 126876440 126876839 -54871248 - MTC LTR MaLR 0 421 82 1 1552 2115 154 25 150 chr2 126876980 126877061 -54871026 - MTC LTR MaLR -340 81 1 1 1553 482 339 83 35 chr2 126881060 126881314 -54866773 - MLT1J LTR MaLR -108 404 139 1 1553 1141 174 183 11 chr2 126882735 126882997 -54865090 + MTC LTR MaLR 80 386 -35 1 1553 275 194 85 75 chr2 126883352 126883458 -54864629 - MTD LTR MaLR -4 415 309 1 1553 675 159 45 0 chr2 126899416 126899548 -54848539 - RMER16 LTR ERVK 0 533 396 1 1553 327 169 4 78 chr2 126899557 126899659 -54848428 - RMER16 LTR ERVK -266 267 199 1 1553 935 86 156 33 chr2 126900225 126900405 -54847682 + RMER6B LTR ERVK 1 202 -259 1 1553 808 151 129 86 chr2 126902259 126902367 -54845720 + RMER6B LTR ERVK 193 283 -178 1 1553 808 151 129 86 chr2 126902574 126902689 -54845398 + RMER6B LTR ERVK 291 434 -27 1 1553 485 133 20 39 chr2 126904479 126904581 -54843506 - RLTR28 LTR ERVL -187 337 238 1 1553 1658 109 0 0 chr2 126904779 126905036 -54843051 - RLTR28 LTR ERVL -267 257 1 1 1553 531 233 47 186 chr2 126905033 126905053 -54843034 - MTD LTR MaLR -92 327 310 1 1553 2676 56 112 3 chr2 126905053 126905410 -54842677 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1553 531 233 47 186 chr2 126905410 126905562 -54842525 - MTD LTR MaLR -110 309 204 1 1553 531 233 47 186 chr2 126905693 126905836 -54842251 - MTD LTR MaLR -216 203 55 1 1553 393 248 29 87 chr2 126906052 126906224 -54841863 + RMER15 LTR ERVL 380 541 -34 1 1553 317 214 16 2 chr2 126912270 126912339 -54835748 + MTD LTR MaLR 306 404 -15 1 1553 2736 132 42 24 chr2 126912957 126913409 -54834678 - RMER6B LTR ERVK -1 460 1 1 1553 241 231 303 9 chr2 126916321 126916430 -54831657 + ORR1D2 LTR MaLR 216 356 -14 1 1553 1489 204 204 54 chr2 126917093 126917534 -54830553 - RLTR18B LTR ERVK -4 508 2 1 1553 503 230 86 12 chr2 126919303 126919466 -54828621 - MTEa LTR MaLR -201 178 4 1 1553 1830 213 39 37 chr2 126924526 126925039 -54823048 + ORR1D1-int LTR MaLR 435 948 -422 1 1553 1836 172 34 61 chr2 126925419 126925745 -54822342 + ORR1D1-int LTR MaLR 938 1252 -118 1 1553 1836 172 34 61 chr2 126925891 126926009 -54822078 + ORR1D1-int LTR MaLR 1253 1370 0 1 1553 521 168 20 10 chr2 126926009 126926111 -54821976 + ORR1D1 LTR MaLR 1 103 -271 1 1553 516 140 21 0 chr2 126926882 126926975 -54821112 + ORR1B1-int LTR MaLR 1414 1508 -1 1 1553 345 74 37 0 chr2 126927099 126927153 -54820934 + ORR1D1 LTR MaLR 319 374 0 1 1553 2478 45 21 0 chr2 126927158 126927436 -54820651 + ORR1A1 LTR MaLR 1 278 -68 1 1553 2478 45 21 0 chr2 126927457 126927509 -54820578 + ORR1A1 LTR MaLR 279 336 -10 1 1553 8318 120 21 29 chr2 126935033 126937289 -54810798 + MuRRS4-int LTR ERV1 1936 4271 -792 1 1553 863 200 100 0 chr2 126937288 126937498 -54810589 + MuRRS4-int LTR ERV1 4791 5021 -42 1 1553 3466 89 93 23 chr2 126937499 126938026 -54810061 + LTRIS2 LTR ERV1 1 564 0 1 1553 720 182 127 6 chr2 126938029 126938195 -54809892 + ORR1B2 LTR MaLR 182 367 0 1 1553 2230 102 38 0 chr2 126938818 126939133 -54808954 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 1 1553 4833 42 6 4 chr2 126945306 126945943 -54802144 + MTA_Mm-int LTR MaLR 496 1154 -638 1 1553 3062 50 5 0 chr2 126945943 126946322 -54801765 + MTA_Mm LTR MaLR 1 381 -15 1 1553 1987 147 47 107 chr2 126961362 126961601 -54786486 + RLTR14 LTR ERV1 4 255 -127 1 1553 1987 147 47 107 chr2 126961739 126961902 -54786185 + RLTR14 LTR ERV1 256 382 0 1 1553 2140 231 50 28 chr2 126971440 126971835 -54776252 + RLTR18B LTR ERVK 3 412 -100 1 1553 2140 231 50 28 chr2 126972023 126972122 -54775965 + RLTR18B LTR ERVK 413 508 -4 1 1553 4356 118 33 74 chr2 126973255 126974040 -54774047 + RMER6A LTR ERVK 4 756 0 1 1553 1525 135 68 135 chr2 126975179 126975438 -54772649 - RLTR15 LTR ERVK 0 359 116 1 1553 1525 135 68 135 chr2 126975629 126975754 -54772333 - RLTR15 LTR ERVK -244 115 1 1 1553 4279 192 39 30 chr2 126975755 126976720 -54771367 - MYSERV6-int LTR ERVK 0 8959 7986 1 1553 404 270 28 109 chr2 126976720 126976935 -54771152 + MT2B LTR ERVL 54 257 -327 1 1553 389 194 12 75 chr2 126976995 126977165 -54770922 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -1119 5431 5311 1 1553 289 312 119 13 chr2 126977170 126977329 -54770758 - RMER4A LTR ERVK -30 436 261 1 1553 1240 276 63 75 chr2 126977329 126977703 -54770384 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -1448 878 492 1 1553 1240 276 63 75 chr2 126977895 126978159 -54769928 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -1835 491 248 1 1553 317 159 63 0 chr2 126978304 126978367 -54769720 - MYSERV-int LTR ERVK -2132 4418 4352 1 1553 1749 141 23 20 chr2 126979238 126979541 -54768546 - RLTR15 LTR ERVK 0 359 56 1 1553 839 287 79 52 chr2 126980142 126980624 -54767463 + RMER5 LTR ERV1 5 499 -35 1 1553 462 300 100 73 chr2 126982438 126982697 -54765390 - RMER2 LTR ERV1 0 567 302 1 1553 285 323 35 60 chr2 126983197 126983398 -54764689 + MER4B-int LTR ERV1 5 200 -6558 1 1553 3376 132 158 30 chr2 126984067 126984737 -54763350 + RMER6A LTR ERVK 1 756 0 1 1553 363 250 0 11 chr2 126990860 126990953 -54757134 - ORR1E LTR MaLR -2 377 286 1 1553 228 333 86 32 chr2 126991990 126992176 -54755911 + RMER5 LTR ERV1 328 523 -11 1 1553 1351 221 52 18 chr2 126993245 126993608 -54754479 - MT2B LTR ERVL -84 517 25 1 1553 652 240 130 0 chr2 126995074 126995228 -54752859 + ORR1B1 LTR MaLR 1 174 -220 1 1553 433 73 0 0 chr2 126995284 126995339 -54752748 + ORR1B1 LTR MaLR 272 326 0 1 1553 446 337 79 46 chr2 126995767 126996047 -54752040 - ORR1E LTR MaLR -67 292 4 1 1553 500 263 45 26 chr2 126996057 126996213 -54751874 - ORR1E-int LTR MaLR -30 1340 1182 1 1553 961 179 40 0 chr2 126996230 126996403 -54751684 - RMER6A LTR ERVK 0 756 577 1 1553 569 127 82 0 chr2 126996734 126996844 -54751243 - RMER6A LTR ERVK -67 623 505 1 1553 373 235 62 0 chr2 126999919 127000000 -54748087 - RMER12B LTR ERVK -5 1399 1314 1 1553 266 172 15 30 chr2 127000139 127000205 -54747882 - RLTR21 LTR ERVK -517 1055 991 1 1553 417 299 73 0 chr2 127000256 127000420 -54747667 - MTE-int LTR MaLR -246 1334 1159 2 1553 553 318 63 0 chr2 127001062 127001251 -54746836 + MTD LTR MaLR 6 206 -213 3 1553 3196 58 5 8 chr2 127001998 127002395 -54745692 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 8 1553 7829 67 14 70 chr2 127002395 127003559 -54744528 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 8 1553 3198 61 2 8 chr2 127003559 127003957 -54744130 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 8 1553 531 89 0 0 chr2 127004211 127004290 -54743797 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 306 9 1553 1390 143 109 0 chr2 127005229 127005494 -54742593 - ORR1A4 LTR MaLR -35 294 1 1 1553 6759 170 159 11 chr2 127005494 127007125 -54740962 - ORR1A4-int LTR MaLR 0 1963 92 1 1553 918 170 15 35 chr2 127007168 127007369 -54740718 + RLTR25A LTR ERVK 643 839 -264 1 1553 861 223 28 86 chr2 127007719 127008009 -54740078 + RLTR25A LTR ERVK 831 1103 0 1 1554 315 211 16 148 chr2 127010222 127010350 -54737737 - MT2B LTR ERVL -337 264 154 1 1554 3240 132 1 176 chr2 127011140 127011296 -54736791 + MT2B LTR ERVL 1 119 -482 1 1554 3240 132 1 176 chr2 127011433 127011456 -54736631 + MT2B LTR ERVL 120 131 -470 1 1554 3240 132 1 176 chr2 127011616 127012162 -54735925 + MT2B LTR ERVL 132 600 -1 1 1554 239 274 12 12 chr2 127014674 127014759 -54733328 - MTEa LTR MaLR -7 372 288 2 1554 894 292 41 112 chr2 127015092 127015531 -54732556 - RMER21A LTR ERV1 -390 557 150 2 1554 314 204 65 87 chr2 127016027 127016197 -54731890 - RLTR13D3 LTR ERVK -62 1052 943 2 1554 307 210 148 0 chr2 127016876 127016957 -54731130 - RLTR13D3 LTR ERVK -1021 93 1 2 1554 2305 199 12 98 chr2 127026426 127027016 -54721071 - RMER15 LTR ERVL -15 560 22 3 1554 2713 215 97 108 chr2 127027020 127027328 -54720759 - RMER15-int LTR ERVL -22 4977 4686 3 1554 2713 215 97 108 chr2 127027602 127028248 -54719839 - RMER15-int LTR ERVL -314 4685 4033 3 1554 5531 278 40 32 chr2 127028234 127029862 -54718225 - RMER15-int LTR ERVL -2600 2399 758 3 1554 259 326 0 0 chr2 127031125 127031217 -54716870 + MER110-int LTR ERV1 2749 2840 -1807 4 1554 1916 108 101 10 chr2 127071711 127072009 -54676078 + ORR1A4 LTR MaLR 5 329 0 1 1554 2943 152 120 32 chr2 127089142 127090019 -54658068 - RLTR13D1 LTR ERVK 0 1023 1 1 1554 2508 155 50 11 chr2 127090091 127090535 -54657552 - RMER4A LTR ERVK 0 466 6 1 1554 428 282 123 30 chr2 127090779 127091037 -54657050 + ERVL-E-int LTR ERVL 2304 2522 -3145 1 1554 261 265 207 57 chr2 127091454 127091594 -54656493 + ERVL-E-int LTR ERVL 2575 2735 -2932 1 1554 593 154 86 9 chr2 127092230 127092335 -54655752 + ERVL-E-int LTR ERVL 2831 2943 -2724 1 1554 2402 153 84 92 chr2 127094496 127095029 -54653058 - RLTR24 LTR ERV1 0 529 1 1 1554 350 255 19 133 chr2 127102280 127102334 -54645753 + MT2B LTR ERVL 119 154 -447 1 1554 484 271 92 59 chr2 127105052 127105270 -54642817 - RLTR15 LTR ERVK -68 291 65 2 1554 484 271 92 59 chr2 127105436 127105456 -54642631 - RLTR15 LTR ERVK -295 64 45 2 1554 1323 220 143 70 chr2 127111757 127111847 -54636240 - RLTR20C LTR ERVK 0 534 419 2 1554 1323 220 143 70 chr2 127112029 127112436 -54635651 - RLTR20C LTR ERVK -116 418 1 2 1554 861 115 6 6 chr2 127112744 127112901 -54635186 - RMER17B LTR ERVK -495 463 307 2 1554 426 173 211 12 chr2 127113139 127113265 -54634822 - MTD LTR MaLR -15 404 272 2 1554 398 266 60 83 chr2 127113965 127114133 -54633954 - MER34A1 LTR ERV1 -403 184 21 2 1554 285 160 0 0 chr2 127114621 127114671 -54633416 - RLTR20A2 LTR ERVK -422 156 107 2 1554 242 217 25 148 chr2 127114879 127114960 -54633127 - MTD LTR MaLR -225 154 84 2 1554 3307 36 13 5 chr2 127117238 127117631 -54630456 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 1554 309 167 50 0 chr2 127118611 127118671 -54629416 + MTEb LTR MaLR 195 257 -122 2 1554 246 259 0 0 chr2 127118807 127118861 -54629226 + MTEb LTR MaLR 204 257 -122 2 1554 1239 241 76 24 chr2 127122292 127122651 -54625436 - MTD LTR MaLR 0 419 35 2 1554 518 223 17 35 chr2 127122693 127122809 -54625278 - MTD LTR MaLR -307 114 1 2 1554 2382 129 56 5 chr2 127124964 127125339 -54622748 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 2 1554 2956 142 60 3 chr2 127125339 127125957 -54622130 - ORR1B1-int LTR MaLR -191 1772 1001 2 1554 468 277 79 62 chr2 127125864 127126041 -54622046 + MTC LTR MaLR 237 416 -5 2 1554 1149 238 68 35 chr2 127126415 127126755 -54621332 - ORR1E LTR MaLR -8 351 1 2 1554 1711 172 152 41 chr2 127131898 127131948 -54616139 + RMER6B LTR ERVK 3 56 -405 2 1554 1711 172 152 41 chr2 127132117 127132479 -54615608 + RMER6B LTR ERVK 57 461 0 2 1554 494 184 55 68 chr2 127132628 127132791 -54615296 + RLTR15 LTR ERVK 3 163 -196 2 1554 883 296 57 45 chr2 127132793 127133129 -54614958 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 91 2 1554 265 276 68 17 chr2 127133269 127133387 -54614700 + RLTR15 LTR ERVK 183 306 -53 2 1554 334 189 108 0 chr2 127135739 127135813 -54612274 - RMER15 LTR ERVL -86 489 408 3 1554 1787 117 142 38 chr2 127135979 127136325 -54611762 - ORR1C2 LTR MaLR -2 382 1 3 1554 1496 147 76 14 chr2 127137685 127137736 -54610351 - ORR1D1 LTR MaLR -77 297 230 3 1554 1496 147 76 14 chr2 127137788 127138013 -54610074 - ORR1D1 LTR MaLR -145 229 5 3 1555 371 323 32 19 chr2 127141849 127142007 -54606080 + RMER15 LTR ERVL 405 564 -11 3 1555 783 170 1 22 chr2 127142817 127142972 -54605115 + ORR1C2 LTR MaLR 90 289 -95 3 1555 794 294 83 66 chr2 127144125 127144413 -54603674 + MLT1J LTR MaLR 115 407 -105 3 1555 256 281 169 14 chr2 127144458 127144606 -54603481 + MLT1A1 LTR MaLR 1 171 -237 3 1555 291 220 51 71 chr2 127144691 127144789 -54603298 + MLT1A1 LTR MaLR 312 407 -1 3 1555 421 267 68 8 chr2 127144875 127145007 -54603080 - MER90a LTR ERV1 0 614 475 3 1555 3377 101 0 4 chr2 127146557 127147025 -54601062 + MT2B2 LTR ERVL 1 466 -118 3 1555 1120 167 34 21 chr2 127147021 127147361 -54600726 - RMER17C LTR ERVK -5 405 1 3 1555 3695 85 66 33 chr2 127147361 127147967 -54600120 - RMER17C-int LTR ERVK 0 3238 2613 3 1555 945 175 58 54 chr2 127147967 127148191 -54599896 + MT2B LTR ERVL 377 601 0 3 1555 2446 153 9 26 chr2 127156209 127156637 -54591450 - MTC LTR MaLR 0 421 1 3 1555 284 270 0 0 chr2 127156679 127156742 -54591345 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 346 3 1555 362 249 60 115 chr2 127169944 127170126 -54577961 + MT2B LTR ERVL 93 264 -337 3 1555 3211 58 13 5 chr2 127172440 127172837 -54575250 - MTB LTR MaLR 0 400 1 3 1555 3942 122 111 34 chr2 127176656 127177358 -54570729 - RMER6A LTR ERVK 0 756 1 3 1555 304 280 21 160 chr2 127184620 127184858 -54563229 + MT2B2 LTR ERVL 54 258 -326 3 1555 1033 215 72 41 chr2 127202819 127203242 -54544845 + RMER4B LTR ERVK 51 466 0 4 1555 235 260 219 38 chr2 127205870 127206030 -54542057 - MTEb LTR MaLR 0 379 191 4 1555 576 262 84 36 chr2 127206198 127206504 -54541583 + ORR1E LTR MaLR 1 368 -2 4 1555 1909 155 51 3 chr2 127209177 127209527 -54538560 - ORR1C1 LTR MaLR -11 367 1 4 1555 330 302 15 67 chr2 127212521 127212656 -54535431 + RMER15 LTR ERVL 421 548 -27 4 1555 1299 235 126 11 chr2 127215662 127216036 -54532051 + MTD LTR MaLR 3 419 0 4 1555 966 235 49 26 chr2 127216036 127216293 -54531794 + MTD-int LTR MaLR 1 263 -995 4 1555 3820 194 72 49 chr2 127216662 127217650 -54530437 + MTD-int LTR MaLR 248 1258 0 4 1555 851 248 110 13 chr2 127217650 127217726 -54530361 + MTD LTR MaLR 41 117 -302 4 1555 851 249 142 39 chr2 127218247 127218475 -54529612 + MTD LTR MaLR 108 383 -17 4 1555 1072 256 191 6 chr2 127218775 127219094 -54528993 - MTEa LTR MaLR -1 378 1 4 1555 594 322 93 15 chr2 127219152 127219261 -54528826 - MLT1B LTR MaLR -7 383 277 4 1555 594 322 93 15 chr2 127219282 127219431 -54528656 - MLT1B LTR MaLR -114 276 105 4 1555 1854 181 111 77 chr2 127222641 127223072 -54525015 + RLTR41 LTR ERV1 1 446 0 4 1555 315 175 0 0 chr2 127223491 127223548 -54524539 + MLT1I LTR MaLR 352 408 -3 4 1555 305 289 66 11 chr2 127230581 127230672 -54517415 - MLT1L LTR MaLR -205 405 310 4 1555 403 212 23 131 chr2 127231159 127231191 -54516896 - MT2B LTR ERVL -442 159 142 4 1555 1351 237 63 3 chr2 127231389 127231723 -54516364 - ORR1E LTR MaLR -5 354 1 4 1555 443 315 130 32 chr2 127233005 127233320 -54514767 - ORR1D2 LTR MaLR -14 356 11 4 1555 2079 157 6 6 chr2 127239090 127239435 -54508652 + MTC LTR MaLR 69 413 -8 4 1555 992 245 50 106 chr2 127240385 127240764 -54507323 - MTE2a LTR MaLR 0 379 22 4 1555 257 329 161 0 chr2 127246610 127246771 -54501316 + MLT1K LTR MaLR 397 583 -12 5 1555 458 304 82 0 chr2 127248445 127248603 -54499484 - MLT2B3 LTR ERVL -296 258 88 5 1555 873 237 15 5 chr2 127250038 127250237 -54497850 - MTEa LTR MaLR -10 369 169 5 1555 281 304 31 86 chr2 127250522 127250684 -54497403 - MT2B2 LTR ERVL -324 260 108 5 1556 1065 308 55 9 chr2 127272409 127272756 -54475331 - MTE2b LTR MaLR -11 368 6 5 1556 254 298 70 60 chr2 127273790 127273846 -54474241 + MER92B LTR ERV1 3 62 -574 5 1556 254 298 70 60 chr2 127274039 127274082 -54474005 + MER92B LTR ERV1 63 103 -533 5 1556 519 317 159 25 chr2 127274317 127274541 -54473546 + MER21B LTR ERV1 452 693 -170 5 1556 519 317 159 25 chr2 127274593 127274688 -54473399 + MER21B LTR ERV1 694 813 -50 5 1556 572 203 59 59 chr2 127276204 127276340 -54471747 + RMER5 LTR ERV1 9 144 -390 5 1556 4412 132 50 22 chr2 127277610 127278343 -54469744 - RMER6A LTR ERVK -1 755 2 5 1556 3666 199 60 20 chr2 127300002 127300787 -54447300 - ORR1D1-int LTR MaLR -495 875 60 5 1556 482 125 57 0 chr2 127300801 127300889 -54447198 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 282 5 1556 510 243 305 14 chr2 127302868 127303235 -54444852 + MLT1D LTR MaLR 1 474 -31 5 1556 533 234 143 41 chr2 127311775 127311971 -54436116 + MLT1K LTR MaLR 379 594 -1 6 1556 674 239 74 0 chr2 127312060 127312223 -54435864 - MTEa LTR MaLR -204 175 1 6 1556 264 324 45 9 chr2 127312976 127313088 -54434999 + MTD LTR MaLR 2 117 -242 6 1556 1143 193 86 0 chr2 127313101 127313334 -54434753 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 115 6 1556 295 336 50 146 chr2 127314179 127314246 -54433841 + ORR1E LTR MaLR 20 75 -284 6 1556 295 336 50 146 chr2 127314323 127314631 -54433456 + ORR1E LTR MaLR 76 359 0 6 1556 384 306 81 64 chr2 127316280 127316411 -54431676 + MT2B LTR ERVL 20 154 -447 6 1556 588 216 149 49 chr2 127316688 127316896 -54431191 + MTD LTR MaLR 209 389 -30 6 1556 996 261 170 17 chr2 127323678 127324036 -54424051 + MTD LTR MaLR 5 417 -2 6 1556 237 370 82 29 chr2 127328406 127328712 -54419375 + LTR37B LTR ERV1 147 468 0 6 1556 271 353 19 29 chr2 127337702 127337807 -54410280 - RMER12 LTR ERVK -472 850 747 6 1556 1109 170 237 7 chr2 127349803 127350094 -54397993 - MTD LTR MaLR 0 419 62 6 1556 445 285 94 44 chr2 127371913 127372093 -54375994 - MLT1A1 LTR MaLR -1 407 219 6 1556 3649 104 47 55 chr2 127375371 127375950 -54372137 + RMER15 LTR ERVL 2 575 0 6 1556 2032 151 128 8 chr2 127379773 127380148 -54367939 + MTC LTR MaLR 2 421 0 7 1556 395 332 77 41 chr2 127381587 127381807 -54366280 + MER34 LTR ERV1 62 289 -253 7 1556 317 311 36 50 chr2 127382253 127382392 -54365695 + MER34 LTR ERV1 372 508 -34 7 1556 295 303 26 35 chr2 127387717 127387830 -54360257 - MLT1A0 LTR MaLR -253 112 1 7 1556 283 120 0 74 chr2 127390992 127391046 -54357041 - MT2A LTR ERVL 0 584 535 7 1556 553 261 7 40 chr2 127391117 127391265 -54356822 - MT2A LTR ERVL -69 464 322 7 1556 859 261 82 31 chr2 127391291 127391548 -54356539 + MLT1B LTR MaLR 117 386 -4 7 1556 1217 321 85 77 chr2 127391554 127392746 -54355341 + MLT1B-int LTR MaLR 8 1366 -5 7 1556 451 300 116 53 chr2 127392759 127392984 -54355103 + MLT1B LTR MaLR 7 245 -145 7 1556 4887 117 48 1 chr2 127396327 127396550 -54351537 + RMER19A LTR ERVK 1 228 -509 7 1556 4887 117 48 1 chr2 127396651 127397131 -54350956 + RMER19A LTR ERVK 229 735 -2 7 1556 241 267 136 19 chr2 127400326 127400429 -54347658 - LTR83 LTR ERVL -92 688 574 7 1556 1625 155 65 89 chr2 127401587 127401970 -54346117 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 7 1557 245 304 126 58 chr2 127406247 127406453 -54341634 + LTR79 LTR ERVL 129 348 -179 7 1557 1129 269 151 11 chr2 127407797 127408147 -54339940 - MTD LTR MaLR -11 408 10 7 1557 238 281 47 0 chr2 127408429 127408493 -54339594 + MLT1M LTR MaLR 603 669 -3 7 1557 469 166 96 33 chr2 127412499 127412637 -54335450 - ORR1D1 LTR MaLR -14 380 250 7 1557 908 254 69 23 chr2 127414741 127415047 -54333040 + ORR1E LTR MaLR 34 353 -6 7 1557 290 285 66 158 chr2 127415333 127415529 -54332558 - MT2B LTR ERVL -337 264 87 7 1557 441 250 25 8 chr2 127416059 127416180 -54331907 - RMER15 LTR ERVL -29 546 424 7 1557 758 258 103 25 chr2 127419581 127419851 -54328236 + MTD LTR MaLR 94 405 -14 7 1557 586 246 16 126 chr2 127420674 127420865 -54327222 + MTE2a LTR MaLR 17 186 -193 7 1557 380 186 6 2 chr2 127427254 127427342 -54320745 - MTC LTR MaLR -330 91 1 8 1557 1611 152 151 24 chr2 127431173 127431504 -54316583 + ORR1D1 LTR MaLR 1 373 -1 8 1557 3444 143 16 73 chr2 127438441 127439073 -54309014 - MT2B LTR ERVL -5 596 1 8 1557 1376 251 28 18 chr2 127439427 127439825 -54308262 - RLTR20A2 LTR ERVK -131 447 46 8 1557 285 234 103 13 chr2 127439882 127439960 -54308127 + RMER20B LTR ERVK 315 399 -228 8 1557 596 302 37 48 chr2 127443665 127443933 -54304154 + MLT1B LTR MaLR 10 274 -116 8 1557 344 256 138 16 chr2 127445550 127445673 -54302414 + MLT1A1 LTR MaLR 1 138 -270 8 1557 440 225 27 128 chr2 127445997 127446145 -54301942 + MT2B LTR ERVL 125 257 -344 8 1557 398 270 141 7 chr2 127447913 127448062 -54300025 + MTE2a LTR MaLR 5 173 -206 8 1557 387 310 99 23 chr2 127448062 127448074 -54300013 + MT2A LTR ERVL 5 178 -355 8 1557 387 310 99 23 chr2 127448121 127448180 -54299907 + MT2A LTR ERVL 179 241 -292 8 1557 4178 71 28 23 chr2 127448186 127448750 -54299337 - RMER2 LTR ERV1 0 567 1 8 1557 592 333 21 16 chr2 127448965 127449154 -54298933 + MT2A LTR ERVL 243 432 -101 8 1557 349 287 171 0 chr2 127449150 127449273 -54298814 + MT2A LTR ERVL 342 487 -46 8 1557 349 287 171 0 chr2 127449329 127449369 -54298718 + MT2A LTR ERVL 488 532 -1 8 1557 342 242 21 42 chr2 127452777 127452872 -54295215 + MTEb LTR MaLR 273 365 -14 8 1557 2500 86 6 0 chr2 127454640 127454965 -54293122 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 8 1557 10961 127 38 4 chr2 127454965 127456699 -54291388 + ORR1A2-int LTR MaLR 1 1792 0 8 1557 2425 79 13 0 chr2 127456699 127457014 -54291073 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 8 1557 1589 227 41 14 chr2 127464710 127465076 -54283011 + MTEa LTR MaLR 2 377 -2 8 1557 2148 149 54 91 chr2 127472910 127473339 -54274748 + MTC LTR MaLR 1 413 -8 8 1557 1278 226 39 91 chr2 127476469 127476854 -54271233 + MTE2a LTR MaLR 1 365 -14 8 1557 324 278 51 25 chr2 127479027 127479145 -54268942 - LTR78 LTR ERV1 -138 1166 1046 8 1557 254 200 55 176 chr2 127485588 127485679 -54262408 - MLT1A1 LTR MaLR -328 80 1 9 1557 1803 132 138 3 chr2 127487239 127487550 -54260537 + ORR1B2 LTR MaLR 1 353 -14 9 1557 2273 128 63 15 chr2 127489127 127489523 -54258564 + RMER17C-int LTR ERVK 2824 3238 0 9 1557 396 221 106 0 chr2 127489523 127489557 -54258530 + RMER17C LTR ERVK 1 34 -376 9 1557 396 221 106 0 chr2 127489587 127489656 -54258431 + RMER17C LTR ERVK 35 113 -297 9 1557 3005 62 30 20 chr2 127491068 127491462 -54256625 - MTB LTR MaLR -2 398 1 9 1557 275 356 27 0 chr2 127491982 127492131 -54255956 - HERVL74-int LTR ERVL -5532 153 1 9 1557 513 231 162 0 chr2 127492131 127492291 -54255796 - MER74C LTR ERVL 0 460 275 9 1557 414 250 73 104 chr2 127493618 127493810 -54254277 - MT2B LTR ERVL -323 278 93 9 1557 2472 66 3 3 chr2 127503991 127504310 -54243777 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 6 1557 1225 286 40 38 chr2 127504313 127504515 -54243572 - MTEa LTR MaLR -6 373 179 7 1557 1225 286 40 38 chr2 127504540 127504707 -54243380 - MTEa LTR MaLR -201 178 4 7 1557 519 235 106 101 chr2 127504744 127504910 -54243177 - MTD LTR MaLR 0 419 251 9 1557 519 235 106 101 chr2 127505056 127505116 -54242971 - MTD LTR MaLR -169 250 192 9 1557 857 289 89 9 chr2 127506935 127507284 -54240803 + MTEa LTR MaLR 3 379 0 1 1557 1135 152 270 32 chr2 127507314 127507474 -54240613 - ORR1C2 LTR MaLR -31 353 188 2 1557 1135 152 270 32 chr2 127507525 127507649 -54240438 - ORR1C2 LTR MaLR -197 187 2 2 1557 335 195 132 12 chr2 127510976 127511059 -54237028 - MER21B LTR ERV1 -123 740 648 2 1557 312 250 22 33 chr2 127511247 127511338 -54236749 + MTEb LTR MaLR 290 379 0 2 1557 942 202 72 0 chr2 127511640 127511833 -54236254 + MTD LTR MaLR 3 209 -210 3 1557 506 242 0 70 chr2 127512036 127512165 -54235922 + MTD LTR MaLR 197 316 -103 3 1557 1931 128 45 45 chr2 127512891 127513227 -54234860 - ORR1C1 LTR MaLR -42 336 1 4 1557 261 286 35 125 chr2 127513397 127513541 -54234546 + MTEa LTR MaLR 231 361 -18 4 1557 2247 165 84 24 chr2 127524447 127524944 -54223143 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 527 0 5 1557 1931 152 82 6 chr2 127529116 127529446 -54218641 + ORR1B1 LTR MaLR 40 394 0 6 1557 561 161 16 16 chr2 127529832 127529961 -54218126 + ORR1C2 LTR MaLR 61 186 -192 6 1557 261 152 0 42 chr2 127529971 127530019 -54218068 + ORR1C2 LTR MaLR 332 377 -1 6 1558 2688 116 79 23 chr2 127541446 127541887 -54206200 + RMER4A LTR ERVK 1 466 0 9 1558 832 122 74 7 chr2 127541902 127542050 -54206037 + RMER4A LTR ERVK 309 466 0 9 1558 3614 18 0 0 chr2 127557693 127558089 -54189998 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 1558 9319 36 2 1 chr2 127558089 127559186 -54188901 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 1 1558 3601 20 0 0 chr2 127559186 127559582 -54188505 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 1558 476 189 0 22 chr2 127560070 127560162 -54187925 - RMER5 LTR ERV1 -9 525 436 1 1558 1690 216 58 22 chr2 127560177 127560542 -54187545 - RMER5 LTR ERV1 -144 390 13 1 1558 861 272 73 62 chr2 127560542 127560883 -54187204 + MTEa LTR MaLR 13 357 -22 1 1558 240 188 62 0 chr2 127563265 127563313 -54184774 + MTEb LTR MaLR 307 357 -22 1 1558 2716 158 127 15 chr2 127565122 127565648 -54182439 - RMER4B LTR ERVK 0 585 1 1 1558 328 277 62 9 chr2 127569994 127570107 -54177980 + MLT1J2 LTR MaLR 26 144 -304 1 1558 2155 112 18 56 chr2 127577079 127577421 -54170666 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 1 1558 1967 157 132 5 chr2 127580664 127581036 -54167051 + MTC LTR MaLR 3 421 0 1 1558 315 217 25 11 chr2 127581707 127581787 -54166300 + ORR1E LTR MaLR 256 340 -30 1 1558 973 213 84 44 chr2 127584877 127585220 -54162867 + ORR1E LTR MaLR 3 359 0 1 1558 365 64 0 0 chr2 127590469 127590516 -54157571 + MTD LTR MaLR 365 411 -8 1 1558 483 206 256 31 chr2 127590662 127590857 -54157230 + RMER15 LTR ERVL 337 575 0 1 1558 240 266 32 16 chr2 127592025 127592053 -54156034 + ORR1B1-int LTR MaLR 619 648 -861 1 1558 903 172 52 23 chr2 127597090 127597263 -54150824 + RLTR33 LTR ERVK 494 671 -7 2 1558 268 270 66 57 chr2 127601652 127601669 -54146418 - MT2B LTR ERVL -316 285 165 2 1558 1088 211 161 28 chr2 127604361 127604725 -54143362 + MTD LTR MaLR 6 406 -13 2 1558 3293 46 10 0 chr2 127607506 127607901 -54140186 + MTB LTR MaLR 1 399 -1 2 1558 1727 203 122 16 chr2 127608018 127608454 -54139633 + RLTR42-int LTR ERVK 125 606 -4916 2 1558 2540 179 49 49 chr2 127608486 127608844 -54139243 + RLTR42-int LTR ERVK 690 1042 -4480 2 1558 3331 64 2 2 chr2 127608844 127609251 -54138836 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 2 1558 2540 179 49 49 chr2 127609251 127609445 -54138642 + RLTR42-int LTR ERVK 1043 1241 -4281 2 1558 2540 179 49 49 chr2 127609470 127609527 -54138560 + RLTR42-int LTR ERVK 1242 1300 -4222 2 1558 11283 154 84 44 chr2 127609560 127611887 -54136200 + RLTR42-int LTR ERVK 2825 5243 -279 2 1558 1313 160 191 15 chr2 127615546 127615875 -54132212 + RMER10B LTR ERVL 12 398 0 2 1558 3526 25 0 0 chr2 127648624 127649020 -54099067 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 1558 227 335 41 123 chr2 127652677 127652847 -54095240 + MLT1A1 LTR MaLR 41 196 -212 3 1558 964 327 45 18 chr2 127661459 127661857 -54086230 + MLT1C LTR MaLR 59 467 0 3 1558 291 278 0 53 chr2 127662392 127662468 -54085619 - MLT1D LTR MaLR -553 74 3 3 1558 374 293 101 67 chr2 127662711 127662890 -54085197 + MLT1D-int LTR MaLR 1171 1355 -32 3 1558 1345 290 37 33 chr2 127663519 127663947 -54084140 + MLT1D LTR MaLR 1 430 -75 3 1559 2763 139 7 5 chr2 127666638 127667058 -54081029 - MTC LTR MaLR 0 421 1 3 1559 1078 223 25 50 chr2 127669730 127670009 -54078078 - MTD LTR MaLR 0 419 148 3 1559 745 99 0 76 chr2 127670740 127670871 -54077216 - RMER6A LTR ERVK -632 124 4 3 1559 1498 160 122 111 chr2 127672200 127672232 -54075855 - RLTR11A LTR ERVK -38 490 448 3 1559 1498 160 122 111 chr2 127672305 127672756 -54075331 - RLTR11A LTR ERVK -81 447 3 3 1559 300 250 0 23 chr2 127674226 127674315 -54073772 - LTR16B LTR ERVL -17 463 378 3 1559 427 314 96 84 chr2 127677180 127677535 -54070552 + ORR1E LTR MaLR 1 359 0 3 1559 319 279 51 58 chr2 127681910 127682018 -54066069 + MLT1A1 LTR MaLR 9 118 -290 3 1559 1906 178 211 27 chr2 127682018 127682468 -54065619 - MT2A LTR ERVL 0 533 1 3 1559 319 279 51 58 chr2 127682468 127682496 -54065591 + MLT1A1 LTR MaLR 119 144 -264 3 1559 5667 143 81 47 chr2 127682506 127683157 -54064930 - RMER12 LTR ERVK -4 1318 559 3 1559 5667 143 86 49 chr2 127683348 127683919 -54064168 - RMER12 LTR ERVK -764 558 4 3 1559 413 200 38 60 chr2 127683919 127683997 -54064090 + MLT1A1 LTR MaLR 326 400 -8 3 1559 356 304 22 0 chr2 127684693 127684785 -54063302 - MTEa LTR MaLR -267 112 19 3 1559 3041 52 39 3 chr2 127690867 127691249 -54056838 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 1559 325 269 82 126 chr2 127693922 127694105 -54053982 - MTEa LTR MaLR -1 378 204 3 1559 1516 221 76 18 chr2 127696370 127696766 -54051321 + MTD LTR MaLR 1 419 0 4 1559 702 280 42 108 chr2 127704846 127705178 -54042909 - MLT1B LTR MaLR -70 320 11 4 1559 1191 266 21 54 chr2 127711403 127711792 -54036295 - MTEa LTR MaLR 0 379 4 4 1559 248 318 109 16 chr2 127713390 127713518 -54034569 + MLT1B LTR MaLR 215 354 -36 4 1559 1248 224 98 10 chr2 127724432 127724738 -54023349 - MTEa LTR MaLR -6 373 41 4 1559 508 324 52 48 chr2 127725086 127725336 -54022751 - ORR1E LTR MaLR -105 254 4 4 1559 753 254 67 115 chr2 127725871 127726244 -54021843 - ORR1E LTR MaLR -4 355 1 4 1559 1944 135 3 0 chr2 127727477 127727795 -54020292 - ORR1A4 LTR MaLR -9 320 2 4 1559 737 291 78 3 chr2 127729675 127729971 -54018116 - MTE2b LTR MaLR -4 375 58 4 1559 282 227 120 60 chr2 127738323 127738473 -54009614 - MER34A LTR ERV1 -3 568 410 4 1559 1045 225 54 48 chr2 127739580 127739874 -54008213 - MTE2a LTR MaLR 0 379 84 4 1559 312 309 45 18 chr2 127739959 127740071 -54008016 - MLT1G3 LTR MaLR -63 532 418 4 1559 2305 172 34 7 chr2 127743315 127743725 -54004362 + MTC LTR MaLR 1 421 0 4 1559 592 286 116 54 chr2 127745263 127745522 -54002565 - MTEa LTR MaLR -6 373 99 4 1559 1674 254 47 58 chr2 127745542 127746080 -54002007 - MTE-int LTR MaLR -789 791 260 4 1559 581 276 14 0 chr2 127746240 127746385 -54001702 - MTEa LTR MaLR -232 147 1 4 1559 319 256 109 47 chr2 127746510 127746650 -54001437 - MTEb LTR MaLR -2 377 238 4 1559 1071 179 234 6 chr2 127750786 127751114 -53996973 - MTD LTR MaLR -14 405 3 5 1559 676 340 61 30 chr2 127752161 127752589 -53995498 - MLT1L LTR MaLR -19 591 151 5 1559 1709 152 150 9 chr2 127758319 127758465 -53989622 + ORR1D1 LTR MaLR 3 176 -198 5 1559 1709 152 150 9 chr2 127758539 127758718 -53989369 + ORR1D1 LTR MaLR 177 374 0 5 1559 2092 125 31 3 chr2 127772527 127772847 -53975240 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 5 1559 2734 124 33 47 chr2 127782306 127782820 -53965267 - RLTR20B3 LTR ERVK -49 528 22 5 1559 2010 117 41 3 chr2 127783632 127783949 -53964138 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 5 1559 253 336 131 44 chr2 127785482 127785619 -53962468 - ORR1E LTR MaLR -192 167 19 5 1559 801 251 40 74 chr2 127787725 127788048 -53960039 - MER74A LTR ERVL -216 342 31 5 1559 2219 123 50 16 chr2 127788248 127788611 -53959476 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 18 5 1559 2087 138 91 8 chr2 127788611 127788975 -53959112 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 5 1559 2219 123 50 16 chr2 127788975 127788990 -53959097 - ORR1B1 LTR MaLR -377 17 3 5 1559 3565 146 74 20 chr2 127788990 127789691 -53958396 - ORR1B1-int LTR MaLR 0 1509 771 5 1559 698 131 309 0 chr2 127789762 127789930 -53958157 - ORR1B1-int LTR MaLR -1289 220 1 5 1559 1909 135 106 0 chr2 127789934 127790283 -53957804 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 1 5 1559 319 136 136 0 chr2 127790561 127790627 -53957460 + ORR1C1 LTR MaLR 304 378 0 5 1559 285 160 75 62 chr2 127791021 127791101 -53956986 - MTE2b LTR MaLR 0 379 299 5 1559 804 219 265 8 chr2 127791947 127792200 -53955887 - MTE2b LTR MaLR -60 319 2 5 1559 667 273 133 24 chr2 127794322 127794652 -53953435 - MLT1A LTR MaLR -6 368 3 5 194 2005 95 9 60 chr2 127795118 127795454 -53952633 + ORR1A4 LTR MaLR 3 321 -8 5 1560 9961 126 109 37 chr2 127795458 127797289 -53950798 + ORR1A4-int LTR MaLR 1 1963 0 5 1560 430 120 6 6 chr2 127797289 127797380 -53950707 + ORR1A4 LTR MaLR 1 124 -270 5 1560 1868 94 34 56 chr2 127798692 127799146 -53948941 - ORR1A4 LTR MaLR -8 386 1 5 1560 1334 219 176 8 chr2 127800206 127800565 -53947522 - MTD LTR MaLR 0 419 1 5 1560 296 273 158 43 chr2 127803812 127804065 -53944022 - MLT1D LTR MaLR -215 290 9 5 1560 334 306 0 27 chr2 127805089 127805200 -53942887 - RMER15 LTR ERVL -43 532 425 5 1560 416 316 47 75 chr2 127806945 127807157 -53940930 - MER21B LTR ERV1 -639 224 19 5 1560 1601 137 39 60 chr2 127810570 127810904 -53937183 + ORR1A4 LTR MaLR 1 327 -2 5 1560 3850 52 19 0 chr2 127832125 127832591 -53915496 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 1 6 1560 557 250 34 14 chr2 127832849 127832995 -53915092 + ORR1E LTR MaLR 1 149 -210 6 1560 669 94 19 0 chr2 127833196 127833302 -53914785 - ORR1A3 LTR MaLR -218 108 1 6 1560 753 182 212 14 chr2 127833302 127833514 -53914573 + RMER20B LTR ERVK 258 511 -116 6 1560 1966 151 19 0 chr2 127837265 127837584 -53910503 - ORR1A4 LTR MaLR -4 325 1 6 1560 5486 146 63 74 chr2 127837584 127839116 -53908971 - ORR1A4-int LTR MaLR -208 1755 568 6 1560 1107 201 108 25 chr2 127840516 127840802 -53907285 + MTD LTR MaLR 96 405 -14 6 1560 274 286 44 0 chr2 127846192 127846283 -53901804 - LTR84a LTR ERVL -340 417 323 6 1560 294 280 238 0 chr2 127846310 127846453 -53901634 - LTR84a LTR ERVL -414 343 167 6 1560 3400 121 8 64 chr2 127856912 127857506 -53890581 - RLTR31_Mm LTR ERVK 0 561 1 6 1560 493 297 72 123 chr2 127859761 127860251 -53887836 - RMER20B LTR ERVK -1 626 113 6 1560 3476 25 2 2 chr2 127860670 127861066 -53887021 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 1560 1022 247 36 133 chr2 127863116 127863536 -53884551 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 6 1560 2251 126 48 3 chr2 127864579 127864937 -53883150 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 6 1560 1815 211 37 15 chr2 127867816 127868221 -53879866 + MTD LTR MaLR 1 414 -5 6 1560 395 260 81 43 chr2 127871880 127872041 -53876046 - MTEa LTR MaLR 0 379 213 6 1560 696 269 129 5 chr2 127872592 127872786 -53875301 - MTEa LTR MaLR -96 283 66 6 1560 2171 155 16 24 chr2 127874919 127875295 -53872792 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 2 7 1560 2384 145 17 15 chr2 127875433 127875839 -53872248 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 7 1560 413 322 42 42 chr2 127881250 127881464 -53866623 - RMER15 LTR ERVL -15 560 347 7 1560 442 296 76 70 chr2 127884374 127884716 -53863371 - ORR1E LTR MaLR -12 347 4 7 1560 1299 258 100 25 chr2 127891117 127891587 -53856500 - RLTR16 LTR ERVK 0 505 1 7 1560 371 300 39 56 chr2 127893603 127893842 -53854245 + MLT1B LTR MaLR 1 242 -263 7 1560 796 260 137 20 chr2 127906054 127906360 -53841727 - MTE2b LTR MaLR -37 342 1 7 1560 310 317 75 113 chr2 127910805 127911097 -53836990 - ORR1E LTR MaLR -72 287 7 7 1560 285 297 49 33 chr2 127916205 127916327 -53831760 + MTEa LTR MaLR 255 378 -1 7 1561 394 163 23 11 chr2 127926749 127926836 -53821251 + MTD LTR MaLR 324 411 -8 7 1561 431 245 33 47 chr2 127929767 127929917 -53818170 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 261 7 1561 578 257 135 31 chr2 127938702 127938979 -53809108 + MTD LTR MaLR 48 371 -8 8 1561 1139 102 68 0 chr2 127939427 127939603 -53808484 - MT2B LTR ERVL 0 601 414 8 1561 849 120 8 0 chr2 127939636 127939761 -53808326 - MT2B LTR ERVL -471 130 5 8 1561 1811 240 41 16 chr2 127940126 127940614 -53807473 - RLTR16 LTR ERVK 0 505 6 8 1561 325 312 129 78 chr2 127945452 127945800 -53802287 - MLT1H LTR MaLR -38 511 146 8 1561 1151 218 159 20 chr2 127972293 127972644 -53775443 + MTD LTR MaLR 20 419 0 8 1561 229 236 193 35 chr2 127979783 127979897 -53768190 - ORR1A1-int LTR MaLR -661 1131 1000 8 1561 249 265 97 48 chr2 127992610 127992713 -53755374 + MLT1N2 LTR MaLR 452 559 -3 8 1561 487 342 57 92 chr2 127996212 127996350 -53751737 + MLT1A LTR MaLR 1 123 -251 8 1561 1325 209 122 52 chr2 127996350 127996693 -53751394 - ORR1D2 LTR MaLR -3 367 1 8 1561 487 298 53 64 chr2 127996693 127996939 -53751148 + MLT1A LTR MaLR 124 367 -3 8 1561 1141 234 77 80 chr2 128001487 128001849 -53746238 - MTEa LTR MaLR -17 362 2 2 1561 318 367 49 37 chr2 128004997 128005161 -53742926 - MLT1I LTR MaLR -129 282 117 6 1561 2052 102 8 82 chr2 128007251 128007380 -53740707 + ORR1A3 LTR MaLR 1 113 -213 1 1561 2052 102 8 82 chr2 128007568 128007790 -53740297 + ORR1A3 LTR MaLR 114 325 -1 1 1561 707 237 15 0 chr2 128007897 128008028 -53740059 + ETnERV2-int LTR ERVK 7070 7202 -204 1 1561 318 346 14 83 chr2 128009134 128009279 -53738808 + MLT1A1 LTR MaLR 272 406 -2 2 1561 631 184 188 1 chr2 128009362 128009538 -53738549 - MTD LTR MaLR -13 406 213 2 1561 1316 135 82 9 chr2 128009538 128009769 -53738318 + RLTR12A LTR ERVK 1 248 -320 2 1561 653 115 161 192 chr2 128009773 128009821 -53738266 + RLTR12A LTR ERVK 382 429 -139 2 1561 653 115 161 192 chr2 128009968 128010112 -53737975 + RLTR12A LTR ERVK 430 568 0 2 1561 627 180 54 54 chr2 128010200 128010347 -53737740 - MTD LTR MaLR -272 147 1 2 1561 2303 110 18 88 chr2 128016012 128016410 -53731677 + ORR1B1 LTR MaLR 25 394 0 3 1561 323 317 43 73 chr2 128017032 128017199 -53730888 + MLT1G3 LTR MaLR 215 391 -188 4 1561 3578 108 79 42 chr2 128018087 128018666 -53729421 + MT2B LTR ERVL 1 601 0 4 1561 838 274 160 60 chr2 128020403 128020734 -53727353 + MTE2a LTR MaLR 1 364 -15 4 1561 275 300 38 0 chr2 128021761 128021841 -53726246 + MLT2C2 LTR ERVL 406 488 -71 5 1561 329 339 130 95 chr2 128022055 128022401 -53725686 - ORR1D2 LTR MaLR -4 366 9 5 1561 1259 265 95 91 chr2 128027131 128027879 -53720208 - RMER13A LTR ERVK -96 764 14 6 1561 338 265 325 10 chr2 128028477 128028683 -53719404 - MT2A LTR ERVL -67 466 196 7 1561 316 305 9 87 chr2 128039570 128039685 -53708402 + MT2B LTR ERVL 155 260 -341 8 1561 837 282 111 47 chr2 128039692 128040034 -53708053 - MLT1A0 LTR MaLR -1 364 1 9 1561 642 303 105 127 chr2 128040241 128040604 -53707483 - MTD LTR MaLR -15 404 50 9 1561 268 182 0 0 chr2 128040773 128040817 -53707270 - MTD LTR MaLR -330 49 6 9 1561 470 234 169 15 chr2 128042607 128042737 -53705350 + ORR1E LTR MaLR 3 152 -207 9 1561 1153 175 42 17 chr2 128042757 128043049 -53705038 - ORR1B2 LTR MaLR -5 362 25 9 1561 375 284 78 61 chr2 128043126 128043306 -53704781 + ORR1E LTR MaLR 197 379 0 9 1562 876 320 162 9 chr2 128057646 128058084 -53690003 + MLT2B3 LTR ERVL 1 505 -49 1 1562 948 285 98 75 chr2 128063164 128063672 -53684415 - MT2A LTR ERVL 0 533 14 1 1562 798 272 137 115 chr2 128067582 128067706 -53680381 - RLTR18 LTR ERVK 0 616 491 1 1562 798 272 137 115 chr2 128067732 128068205 -53679882 - RLTR18 LTR ERVK -126 490 7 1 1562 2031 126 34 6 chr2 128068552 128068872 -53679215 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 1 1562 598 274 191 56 chr2 128069281 128069627 -53678460 + MTD LTR MaLR 9 369 -10 1 1562 400 178 26 70 chr2 128070023 128070138 -53677949 + MLT1A1 LTR MaLR 293 402 -6 1 1562 1393 225 39 128 chr2 128074567 128074974 -53673113 + MTEa LTR MaLR 8 378 -1 1 1562 1442 216 34 96 chr2 128075664 128076048 -53672039 + MTE2a LTR MaLR 6 365 -14 1 1562 473 206 27 36 chr2 128078210 128078321 -53669766 + RMER15 LTR ERVL 28 137 -438 1 1562 843 224 20 32 chr2 128078328 128078508 -53669579 + RMER17C LTR ERVK 1 180 -230 1 1562 843 224 20 32 chr2 128078691 128078759 -53669328 + RMER17C LTR ERVK 181 246 -164 1 1562 978 222 30 44 chr2 128078729 128079068 -53669019 + RMER17C LTR ERVK 77 410 0 1 1562 826 261 24 28 chr2 128079076 128079289 -53668798 + RMER15 LTR ERVL 215 426 -149 1 1562 553 247 135 15 chr2 128080631 128080864 -53667223 - MTD LTR MaLR -39 380 107 1 1562 239 256 10 91 chr2 128081014 128081113 -53666974 - MTD LTR MaLR -280 139 49 1 1562 991 180 77 119 chr2 128085220 128085518 -53662569 - MT2A LTR ERVL -245 288 1 1 1562 542 290 129 68 chr2 128086329 128086577 -53661510 + MLT2D LTR ERVL 152 414 0 1 1562 371 271 28 29 chr2 128086582 128086708 -53661379 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 226 1 1562 230 238 95 48 chr2 128097059 128097143 -53650944 + ORR1D2 LTR MaLR 283 370 0 2 1562 279 254 126 0 chr2 128102756 128102847 -53645240 - MTEb LTR MaLR -2 377 275 2 1562 1016 264 86 21 chr2 128103140 128103477 -53644610 + MER89 LTR ERV1 172 530 -29 2 1562 444 274 96 50 chr2 128108454 128108761 -53639326 - MLT2B4 LTR ERVL -41 513 126 2 1562 408 121 15 29 chr2 128117078 128117146 -53630941 + ORR1B1 LTR MaLR 3 69 -325 2 1562 227 185 70 53 chr2 128117146 128117203 -53630884 - RLTR25B LTR ERVK -87 941 884 2 1562 4449 124 40 52 chr2 128117182 128117967 -53630120 - RLTR25B LTR ERVK -253 775 1 2 1562 434 274 56 49 chr2 128118026 128118168 -53629919 - RMER15 LTR ERVL -158 417 275 2 1562 261 184 20 0 chr2 128118239 128118288 -53629799 - RMER15 LTR ERVL -525 50 1 2 1562 912 188 121 2 chr2 128120048 128120241 -53627846 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 98 2 1562 572 188 75 83 chr2 128120318 128120409 -53627678 - ORR1C2 LTR MaLR -230 97 1 2 1562 260 264 24 127 chr2 128136968 128137133 -53610954 - RMER12 LTR ERVK -461 861 714 2 1562 322 311 120 63 chr2 128142529 128142687 -53605400 + MT2B LTR ERVL 98 264 -337 2 1562 235 321 132 63 chr2 128143884 128144142 -53603945 - MLT1A1 LTR MaLR -6 402 70 2 1562 600 246 8 0 chr2 128145494 128145616 -53602471 - MTEb LTR MaLR -196 183 61 2 1562 1248 205 171 3 chr2 128148281 128148585 -53599502 - ORR1D1 LTR MaLR -2 372 18 3 1562 2944 33 0 3 chr2 128148651 128148989 -53599098 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 0 337 1 3 1562 946 266 127 4 chr2 128152346 128152614 -53595473 + MTD LTR MaLR 18 318 -101 3 1562 1093 241 90 40 chr2 128159540 128159886 -53588201 + MTE2b LTR MaLR 13 375 -4 3 1562 239 247 86 86 chr2 128160156 128160249 -53587838 + MT2A LTR ERVL 6 98 -435 3 1562 958 228 185 38 chr2 128167115 128167215 -53580872 - MTD LTR MaLR -45 374 264 3 1562 958 228 185 38 chr2 128167261 128167479 -53580608 - MTD LTR MaLR -156 263 9 3 1562 664 324 89 24 chr2 128167494 128167785 -53580302 + MLT1C LTR MaLR 33 342 -125 3 1562 3296 38 2 37 chr2 128169226 128169636 -53578451 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 1562 2061 195 60 0 chr2 128169668 128170052 -53578035 + MTD LTR MaLR 13 419 0 3 1562 363 287 0 0 chr2 128175393 128175480 -53572607 + MTEa LTR MaLR 4 90 -289 3 1562 228 357 10 10 chr2 128175480 128175492 -53572595 + MT2A LTR ERVL 4 102 -431 3 1562 715 285 52 70 chr2 128175674 128175982 -53572105 + MTEa LTR MaLR 73 371 -8 3 1562 858 254 78 108 chr2 128178639 128179010 -53569077 + MTE2a LTR MaLR 1 360 -19 3 1562 2833 149 6 41 chr2 128181434 128181917 -53566170 - RMER4A LTR ERVK 0 466 1 3 1562 225 204 45 0 chr2 128182149 128182193 -53565894 + MTEa LTR MaLR 110 155 -224 3 1562 348 236 111 0 chr2 128182301 128182373 -53565714 + MTEa LTR MaLR 269 348 -31 3 1562 1139 277 62 3 chr2 128182817 128183125 -53564962 - MTEb LTR MaLR -53 326 1 3 1562 879 253 106 75 chr2 128184544 128184722 -53563365 + ORR1D2 LTR MaLR 1 182 -188 3 1562 879 253 106 75 chr2 128184909 128185089 -53562998 + ORR1D2 LTR MaLR 183 370 0 3 1563 1533 235 80 38 chr2 128188704 128189134 -53558953 - MT2A LTR ERVL 0 601 6 3 1563 344 236 135 45 chr2 128226394 128226505 -53521582 - MLT1B LTR MaLR -217 173 53 4 1563 382 278 35 208 chr2 128231505 128231986 -53516101 - MLT2C2 LTR ERVL -3 461 64 4 1563 1077 221 260 3 chr2 128234037 128234364 -53513723 - MTD LTR MaLR -8 411 1 4 1563 2931 86 5 10 chr2 128236874 128237272 -53510815 + MTB LTR MaLR 5 400 0 4 1563 377 274 79 9 chr2 128241512 128241626 -53506461 - MLT1C LTR MaLR -69 398 277 4 1563 285 316 128 0 chr2 128241898 128242015 -53506072 - MLT1C LTR MaLR -329 138 7 4 1563 1061 256 113 27 chr2 128244444 128244781 -53503306 - MTEa LTR MaLR 0 379 14 4 1563 455 224 55 41 chr2 128245114 128245279 -53502808 + MTD LTR MaLR 270 421 0 4 1563 303 272 67 129 chr2 128249972 128250166 -53497921 + MLT1J LTR MaLR 191 372 -140 4 1563 2616 61 0 58 chr2 128250770 128251117 -53496970 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 4 1563 262 314 140 19 chr2 128256262 128256369 -53491718 + MLT1E2 LTR MaLR 419 538 -89 4 1563 2577 121 13 0 chr2 128261307 128261680 -53486407 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 4 1563 711 89 10 0 chr2 128262142 128262243 -53485844 - ORR1C1 LTR MaLR -251 127 26 4 1563 268 254 17 0 chr2 128265437 128265496 -53482591 + MERVL_2A-int LTR ERVL 3833 3892 -1869 4 1563 400 284 60 79 chr2 128265523 128265771 -53482316 + MLT1F2 LTR MaLR 52 286 -283 4 1563 1776 165 34 73 chr2 128265797 128266182 -53481905 + ORR1D1 LTR MaLR 1 370 -4 4 1563 320 136 0 47 chr2 128266168 128266253 -53481834 + MT2A LTR ERVL 453 533 0 4 1563 537 229 80 54 chr2 128266464 128266684 -53481403 - MT2A LTR ERVL -61 523 292 5 1563 322 310 91 131 chr2 128269435 128269710 -53478377 - MTEa LTR MaLR -14 365 102 5 1563 242 271 0 79 chr2 128270938 128271014 -53477073 - RMER19B LTR ERVK -12 890 821 5 1563 231 284 28 120 chr2 128283494 128283602 -53464485 + LTR48 LTR ERV1 67 164 -623 5 1563 245 339 67 50 chr2 128288142 128288322 -53459765 + MTEb LTR MaLR 197 379 0 5 1563 329 333 0 49 chr2 128294908 128295031 -53453056 + MTEa LTR MaLR 11 127 -232 5 1563 667 272 81 32 chr2 128295417 128295664 -53452423 - MT2A LTR ERVL -86 447 189 5 1563 407 261 130 0 chr2 128295919 128296034 -53452053 + MTEa LTR MaLR 237 366 -13 5 1563 4234 136 75 16 chr2 128301243 128301271 -53446816 - RMER19A LTR ERVK 0 737 713 5 1563 4234 136 75 16 chr2 128302010 128302676 -53445411 - RMER19A LTR ERVK -25 712 2 5 1563 1320 260 35 27 chr2 128303130 128303502 -53444585 + MTEb LTR MaLR 2 376 -3 5 1563 1609 209 56 12 chr2 128304674 128305013 -53443074 - ORR1D2 LTR MaLR -15 355 2 5 1563 262 295 155 72 chr2 128305564 128305842 -53442245 + MLT1B LTR MaLR 66 366 -24 5 1563 4515 16 0 0 chr2 128306217 128306710 -53441377 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 5 1563 319 0 0 0 chr2 128306710 128306748 -53441339 - MERVL-int LTR ERVL 0 5485 5448 5 1563 384 179 46 35 chr2 128306748 128306835 -53441252 - ORR1D2-int LTR MaLR -1323 640 553 5 1563 48502 15 6 0 chr2 128306835 128312161 -53435926 - MERVL-int LTR ERVL -125 5360 1 5 1563 4515 16 0 0 chr2 128312161 128312654 -53435433 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 5 1563 681 295 108 19 chr2 128318540 128318801 -53429286 - MLT1C LTR MaLR -46 421 151 5 1564 230 293 67 57 chr2 128320158 128320263 -53427824 - MTEb LTR MaLR -5 374 269 5 1564 225 339 10 111 chr2 128321895 128322094 -53425993 - LTR41 LTR ERVL -100 668 490 5 1564 445 264 7 81 chr2 128322926 128323062 -53425025 - MTEb LTR MaLR -73 306 181 5 1564 1278 245 62 33 chr2 128323677 128324014 -53424073 - MTEb LTR MaLR 0 379 33 6 1564 1119 209 56 190 chr2 128324951 128325383 -53422704 + MTE2a LTR MaLR 6 379 0 6 1564 297 217 0 55 chr2 128325988 128326061 -53422026 - MTE2a LTR MaLR 0 379 311 6 1564 2672 25 36 12 chr2 128327794 128328124 -53419963 + RLTR10C LTR ERVK 1 338 -98 6 1564 2910 173 81 25 chr2 128330390 128331037 -53417050 - RMER19B LTR ERVK -202 700 135 6 1564 396 323 40 51 chr2 128331036 128331212 -53416875 - RMER15 LTR ERVL -39 536 363 6 1564 2698 131 24 10 chr2 128331963 128332378 -53415709 + MTC LTR MaLR 1 421 0 6 1564 1146 263 104 16 chr2 128340205 128340522 -53407565 + MTEa LTR MaLR 4 348 -31 6 1564 419 314 57 47 chr2 128340564 128340775 -53407312 + MER21B LTR ERV1 123 335 -528 6 1564 1259 204 46 32 chr2 128344020 128344304 -53403783 + MTD LTR MaLR 3 290 -129 6 1564 760 268 123 60 chr2 128345686 128346004 -53402083 - ORR1E LTR MaLR -16 343 6 6 1564 691 288 116 45 chr2 128346007 128346342 -53401745 - MTE-int LTR MaLR -59 1521 1163 6 1564 1019 328 148 45 chr2 128348665 128349221 -53398866 - MLT1E3 LTR MaLR 0 624 12 6 1564 335 345 88 57 chr2 128349890 128350207 -53397880 + MLT1A LTR MaLR 1 327 -47 6 1564 460 279 74 20 chr2 128362253 128362409 -53385678 - MLT1A0 LTR MaLR -3 405 223 6 1564 285 287 203 14 chr2 128364805 128364943 -53383144 + MLT1G3 LTR MaLR 305 468 -127 6 1564 4649 151 74 73 chr2 128365514 128366415 -53381672 - RMER19B LTR ERVK 0 902 1 6 1564 1164 267 47 25 chr2 128369192 128369511 -53378576 - ORR1E LTR MaLR -2 357 32 7 1564 966 248 147 19 chr2 128378196 128378509 -53369578 + ORR1E LTR MaLR 3 355 -4 7 1564 1278 232 90 23 chr2 128382472 128382772 -53365315 - MTEa LTR MaLR -11 368 49 7 1564 405 178 14 0 chr2 128384034 128384107 -53363980 - MTEa LTR MaLR -305 74 1 7 1564 536 302 76 92 chr2 128385477 128386062 -53362025 + RMER20B LTR ERVK 186 751 -109 7 1564 243 250 43 43 chr2 128390830 128390922 -53357165 - LTR37B LTR ERV1 -179 289 198 7 1564 373 322 47 94 chr2 128391816 128392049 -53356038 + RMER5 LTR ERV1 118 339 -195 7 1564 2041 178 37 58 chr2 128394725 128395155 -53352932 - MTC LTR MaLR 0 421 1 7 1564 2207 117 6 9 chr2 128395467 128395795 -53352292 + ORR1A4 LTR MaLR 1 327 -2 7 1564 1066 287 99 14 chr2 128397479 128397829 -53350258 - MLT2B2 LTR ERVL -140 380 1 7 1564 318 225 24 24 chr2 128401714 128401796 -53346291 - MTD LTR MaLR -2 417 336 7 1564 298 284 101 13 chr2 128402480 128402620 -53345467 - MTD LTR MaLR -258 150 5 7 1564 651 299 52 31 chr2 128406430 128406717 -53341370 - RLTR6-int LTR ERV1 -1342 6214 5922 7 1564 7953 309 54 50 chr2 128407075 128412255 -53335832 - RLTR6-int LTR ERV1 -2003 5775 523 7 1564 457 300 143 58 chr2 128412646 128412954 -53335133 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 113 7 1564 2856 148 40 38 chr2 128415412 128415944 -53332143 - RMER16 LTR ERVK 0 533 1 7 1564 416 222 59 20 chr2 128416139 128416240 -53331847 + RMER10A LTR ERVL 320 424 -18 7 1564 316 179 23 55 chr2 128424992 128425084 -53323003 + RMER21A LTR ERV1 457 542 -405 7 1564 1538 95 22 18 chr2 128425335 128425561 -53322526 + RLTR28 LTR ERVL 1 227 -297 7 1564 5864 143 31 23 chr2 128431613 128432660 -53315427 - MYSERV6-int LTR ERVK -5518 3441 2387 7 1564 3343 288 66 48 chr2 128433077 128434539 -53313548 - MYSERV6-int LTR ERVK -6560 2399 912 7 1564 625 220 88 6 chr2 128435613 128435773 -53312314 - RLTR15 LTR ERVK -186 173 1 8 1564 854 253 157 18 chr2 128435773 128436044 -53312043 - RMER15 LTR ERVL -37 538 230 8 1564 303 367 139 7 chr2 128437858 128438152 -53309935 - MLT1B LTR MaLR -6 384 45 8 1565 228 301 8 127 chr2 128453000 128453118 -53294969 + MTB LTR MaLR 152 255 -145 8 1565 1329 169 63 45 chr2 128457212 128457498 -53290589 + RLTR28 LTR ERVL 220 510 -14 8 1565 1293 215 116 46 chr2 128460937 128461308 -53286779 + MTD LTR MaLR 23 419 0 8 1565 1866 189 187 10 chr2 128463590 128464087 -53284000 + RMER4B LTR ERVK 1 585 0 8 1565 2622 138 109 45 chr2 128465237 128465785 -53282302 - RMER4B LTR ERVK 0 585 1 8 1565 380 270 64 44 chr2 128470544 128470736 -53277351 + MTEa LTR MaLR 159 371 -8 8 1565 252 321 59 15 chr2 128473237 128473373 -53274714 + ORR1E LTR MaLR 218 359 0 8 1565 232 267 26 137 chr2 128473649 128473766 -53274321 - MTE2a LTR MaLR -273 106 3 8 1565 1046 258 82 48 chr2 128480752 128481082 -53267005 + MTE2a LTR MaLR 35 375 -4 8 1565 908 115 216 39 chr2 128487252 128487433 -53260654 + RMER6A LTR ERVK 2 214 -542 9 1565 2555 181 37 49 chr2 128487625 128487680 -53260407 + RMER6A LTR ERVK 203 251 -505 9 1565 2555 181 37 49 chr2 128487759 128488267 -53259820 + RMER6A LTR ERVK 252 708 -48 9 1565 324 234 52 82 chr2 128496887 128497022 -53251065 + MT2B LTR ERVL 134 264 -337 9 1565 1525 209 53 58 chr2 128499400 128499780 -53248307 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 9 1565 369 261 240 80 chr2 128504109 128504396 -53243691 + ORR1E LTR MaLR 11 343 -16 1 1565 3194 53 8 2 chr2 128509489 128509883 -53238204 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 1565 246 164 53 35 chr2 128514196 128514253 -53233834 - RMER10A LTR ERVL -24 418 361 3 1565 1176 73 261 13 chr2 128514248 128514478 -53233609 - MURVY-LTR LTR ERV1 -230 289 3 3 1565 327 256 89 137 chr2 128514583 128514896 -53233191 - RMER10A LTR ERVL -144 298 1 3 1565 463 222 302 6 chr2 128515365 128515537 -53232550 - MTD LTR MaLR 0 419 197 3 1565 815 149 401 58 chr2 128516210 128516487 -53231600 + RMER19C LTR ERVK 1 372 -239 3 1565 2498 151 24 5 chr2 128519036 128519449 -53228638 + MTC LTR MaLR 1 421 0 4 1565 345 316 148 20 chr2 128522173 128522376 -53225711 + MLT1G LTR MaLR 1 229 -362 5 1565 1145 192 161 0 chr2 128523347 128523607 -53224480 - MTD LTR MaLR 0 419 118 6 1565 350 250 115 9 chr2 128528167 128528280 -53219807 + MTD LTR MaLR 11 135 -284 7 1565 1783 150 82 43 chr2 128528378 128528769 -53219318 - RMER20B LTR ERVK -221 406 1 7 1565 1073 204 87 8 chr2 128528769 128529035 -53219052 + MTD LTR MaLR 133 419 0 7 1565 617 214 0 8 chr2 128531402 128531529 -53216558 + ORR1B1 LTR MaLR 39 164 -230 7 1565 12674 137 65 27 chr2 128531529 128532050 -53216037 - MERVL_2A-int LTR ERVL -3176 2585 2051 7 1565 12674 143 65 31 chr2 128532196 128534119 -53213968 - MERVL_2A-int LTR ERVL -3711 2050 1 7 1565 1887 137 28 44 chr2 128534119 128534479 -53213608 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 41 8 1565 1023 168 41 0 chr2 128538691 128538888 -53209199 - MT2A LTR ERVL -326 207 3 9 1565 1876 157 24 87 chr2 128542476 128542822 -53205265 + ORR1B1 LTR MaLR 1 354 -40 9 1565 1876 157 24 87 chr2 128543004 128543069 -53205018 + ORR1B1 LTR MaLR 355 386 -8 9 1565 228 275 0 70 chr2 128545343 128545397 -53202690 - LTR48B LTR ERV1 -41 746 693 1 1565 228 275 0 70 chr2 128545865 128545896 -53202191 - LTR48B LTR ERV1 -95 692 667 1 1565 330 257 17 69 chr2 128545944 128546100 -53201987 - LTR48B LTR ERV1 -298 346 220 1 1565 1396 196 198 3 chr2 128547007 128547320 -53200767 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 1 1565 1334 175 231 16 chr2 128552456 128552764 -53195323 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 1 1565 624 232 177 0 chr2 128562028 128562209 -53185878 - MLT2D LTR ERVL -196 218 6 1 1566 1302 212 204 26 chr2 128582742 128583169 -53164918 + MT2A LTR ERVL 4 506 -27 1 1566 244 260 0 0 chr2 128583484 128583534 -53164553 + RMER15 LTR ERVL 403 452 -123 1 1566 503 195 46 23 chr2 128585672 128585803 -53162284 + MTD LTR MaLR 272 405 -14 1 1566 2756 122 45 0 chr2 128586535 128586936 -53161151 + MTC LTR MaLR 1 419 -2 1 1566 896 190 200 23 chr2 128588410 128588662 -53159425 + MTD LTR MaLR 85 399 -20 1 1566 2124 153 22 122 chr2 128594866 128595366 -53152721 - RLTR11B LTR ERVK 0 453 4 2 1566 3469 23 5 0 chr2 128598354 128598748 -53149339 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 1566 9302 36 2 4 chr2 128598748 128599848 -53148239 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 2 1566 3469 23 5 0 chr2 128599848 128600242 -53147845 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 1566 257 224 14 29 chr2 128603425 128603494 -53144593 - MT2B2 LTR ERVL -329 255 188 2 1566 3135 20 0 0 chr2 128606761 128607107 -53140980 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 2 1566 1417 251 67 49 chr2 128616443 128616953 -53131134 - RMER5 LTR ERV1 -15 519 1 2 1566 1101 264 45 18 chr2 128621151 128621486 -53126601 - MTE2b LTR MaLR -34 345 2 2 1566 635 166 425 0 chr2 128625889 128626140 -53121947 - ORR1D1 LTR MaLR 0 384 27 2 1566 1604 182 93 12 chr2 128627461 128627806 -53120281 - ORR1D1 LTR MaLR -1 373 1 2 1566 399 314 103 28 chr2 128641534 128641786 -53106301 - MLT1B LTR MaLR -8 382 112 3 1566 267 244 96 12 chr2 128646528 128646611 -53101476 - RMER15 LTR ERVL -63 512 423 3 1566 846 191 20 36 chr2 128652776 128652971 -53095116 + MTD LTR MaLR 19 210 -209 3 1566 871 176 97 14 chr2 128653279 128653486 -53094601 + MTD LTR MaLR 196 419 0 3 1566 232 238 11 91 chr2 128662037 128662125 -53085962 + MT2B LTR ERVL 161 241 -360 3 1566 703 170 207 24 chr2 128664501 128664670 -53083417 + RLTR20A LTR ERVK 340 539 -2 3 1566 794 286 87 134 chr2 128668499 128669029 -53079058 + RLTR18B LTR ERVK 2 506 -6 3 1566 2039 77 48 0 chr2 128683447 128683720 -53064367 + ORR1A2 LTR MaLR 1 286 -41 4 1566 839 150 335 3 chr2 128684494 128684723 -53063364 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 4 1566 666 229 13 141 chr2 128686892 128686995 -53061092 - MTEa LTR MaLR -175 204 115 4 1566 666 229 13 141 chr2 128687124 128687254 -53060833 - MTEa LTR MaLR -265 114 1 4 1566 431 296 31 31 chr2 128688118 128688247 -53059840 + MLT1A0 LTR MaLR 235 363 -2 4 1566 232 192 77 0 chr2 128692781 128692833 -53055254 - MTD LTR MaLR 0 419 364 4 1566 240 231 0 0 chr2 128697318 128697371 -53050716 + MLT2B2 LTR ERVL 507 562 0 4 1567 225 278 60 30 chr2 128723232 128723332 -53024755 - MTD LTR MaLR 0 419 317 5 1567 241 255 47 75 chr2 128726845 128726871 -53021216 + MT2B2 LTR ERVL 138 160 -424 5 1567 1893 154 37 10 chr2 128727525 128727907 -53020180 + MTC LTR MaLR 31 421 0 5 1567 884 278 133 12 chr2 128728501 128728839 -53019248 - MTD LTR MaLR -39 380 2 5 1567 312 278 22 0 chr2 128729489 128729579 -53018508 - MLT1G LTR MaLR -288 303 212 5 1567 3311 181 101 7 chr2 128730333 128731007 -53017080 - RMER19A LTR ERVK 0 737 1 5 1567 457 293 114 39 chr2 128731828 128732134 -53015953 + MLT1B LTR MaLR 1 329 -61 5 1567 288 261 67 11 chr2 128734374 128734463 -53013624 + MLT1C LTR MaLR 71 164 -303 5 1567 257 242 76 0 chr2 128735750 128735816 -53012271 - RLTR40 LTR ERVK -7 810 740 5 1567 1760 200 25 37 chr2 128737151 128737582 -53010505 - RLTR40 LTR ERVK -106 711 286 5 1567 1539 166 48 7 chr2 128738246 128738556 -53009531 - RLTR40 LTR ERVK -494 323 1 5 1567 948 278 0 59 chr2 128739327 128739617 -53008470 - MTEa LTR MaLR -88 291 19 5 1567 234 317 13 88 chr2 128739477 128739636 -53008451 - MT2A LTR ERVL -386 147 1 5 1567 338 242 22 11 chr2 128739806 128739898 -53008189 + MTEa LTR MaLR 287 379 0 5 1567 638 249 104 22 chr2 128739898 128740120 -53007967 + MLT1A0 LTR MaLR 89 328 -37 5 1567 496 253 19 25 chr2 128744927 128745089 -53002998 - RLTR15 LTR ERVK -18 341 181 5 1567 1057 267 114 22 chr2 128746800 128747168 -53000919 - MTD LTR MaLR 0 419 18 5 1567 480 264 45 67 chr2 128747767 128747946 -53000141 - MTEa LTR MaLR 0 379 205 5 1567 279 273 75 66 chr2 128747998 128748104 -52999983 - MTEa LTR MaLR -252 107 1 5 1567 1081 301 164 28 chr2 128748104 128749044 -52999043 - MTEa-int LTR MaLR -53 1527 403 5 1567 1013 116 468 16 chr2 128749568 128749814 -52998273 - ORR1B2 LTR MaLR -1 366 10 5 1567 1192 207 163 30 chr2 128759500 128759868 -52988219 + MTD LTR MaLR 3 419 0 6 1567 269 270 18 83 chr2 128764954 128765063 -52983024 + MLT1C LTR MaLR 1 102 -365 6 1567 435 277 50 37 chr2 128765105 128765266 -52982821 + MLT1C LTR MaLR 302 464 -3 6 1567 1270 109 5 0 chr2 128770291 128770484 -52977603 + ORR1A2 LTR MaLR 132 325 -2 6 1567 11313 114 71 10 chr2 128770654 128772505 -52975582 + ORR1A2-int LTR MaLR 1 1963 0 6 1567 909 146 20 0 chr2 128772505 128772656 -52975431 + ORR1A2 LTR MaLR 1 154 -173 6 1567 583 251 77 24 chr2 128772742 128772950 -52975137 - RMER21A LTR ERV1 -263 684 466 6 1567 231 326 0 10 chr2 128772986 128773082 -52975005 - RMER21A LTR ERV1 -661 181 87 6 1567 986 215 22 22 chr2 128779275 128779499 -52968588 - RLTR17 LTR ERVK -266 426 203 6 1567 1091 65 13 13 chr2 128779804 128779959 -52968128 + MT2C_Mm LTR ERVL 321 475 0 6 1567 244 208 57 0 chr2 128780001 128780054 -52968033 + MLT2F LTR ERVL 3 58 -605 6 1567 4247 16 16 0 chr2 128780365 128780850 -52967237 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 6 1567 245 332 242 10 chr2 128782285 128782483 -52965604 + LTR33 LTR ERVL 7 250 -265 6 1567 3361 46 0 128 chr2 128786072 128786572 -52961515 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 6 1567 2665 179 9 80 chr2 128789902 128790449 -52957638 - RLTR18B LTR ERVK -4 508 1 6 1567 1293 248 89 96 chr2 128791217 128791788 -52956299 - RMER21B LTR ERV1 -275 567 1 6 1567 228 312 26 68 chr2 128795292 128795312 -52952775 + MT2B2 LTR ERVL 148 256 -325 6 1567 4122 114 133 34 chr2 128806568 128807304 -52940783 - RMER17D2 LTR ERVK 0 809 1 7 1567 3115 59 10 0 chr2 128808293 128808685 -52939402 + MTB LTR MaLR 1 396 -4 7 1567 742 365 82 17 chr2 128810640 128811055 -52937032 - LTR75 LTR ERVL -119 443 2 7 1567 1826 143 41 92 chr2 128814967 128815359 -52932728 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 3 7 1567 355 287 70 0 chr2 128819903 128820018 -52928069 - MLT1C LTR MaLR -56 411 289 7 1567 462 288 52 52 chr2 128820101 128820168 -52927919 - MLT1C LTR MaLR -292 175 112 7 1567 462 288 52 52 chr2 128820315 128820419 -52927668 - MLT1C LTR MaLR -356 111 4 7 1567 237 140 20 20 chr2 128822811 128822862 -52925225 - RMER21B LTR ERV1 -437 405 355 7 1567 601 234 101 27 chr2 128827641 128827790 -52920297 + MTD LTR MaLR 196 355 -64 7 1567 823 286 62 97 chr2 128838093 128838236 -52909851 + MTD LTR MaLR 1 126 -295 7 1567 1003 231 63 44 chr2 128838384 128838518 -52909569 + MTD LTR MaLR 127 253 -168 7 1567 1003 228 63 41 chr2 128838713 128838856 -52909231 + MTD LTR MaLR 254 405 -14 7 1567 3362 48 2 0 chr2 128839584 128839979 -52908108 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 7 1568 2118 139 25 60 chr2 128845070 128845138 -52902949 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 322 8 1568 2118 139 25 60 chr2 128845327 128845656 -52902431 - ORR1C2 LTR MaLR -63 321 1 8 1568 549 277 44 28 chr2 128845922 128846104 -52901983 + ORR1D2 LTR MaLR 19 203 -167 8 1568 320 336 9 36 chr2 128854683 128854794 -52893293 + MER74A LTR ERVL 46 153 -405 8 1568 305 307 80 40 chr2 128854810 128854953 -52893134 + MER74A LTR ERVL 313 462 -96 8 1568 305 307 80 40 chr2 128854991 128855047 -52893040 + MER74A LTR ERVL 463 520 -38 8 1568 2606 164 19 11 chr2 128857274 128857761 -52890326 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -1865 461 1 8 1568 301 268 52 66 chr2 128858528 128858664 -52889423 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -2545 297 164 8 1568 885 152 7 14 chr2 128858925 128859072 -52889015 + RLTR20A LTR ERVK 395 540 -1 8 1568 1107 198 119 24 chr2 128860266 128860599 -52887488 + ORR1D1 LTR MaLR 1 417 -4 8 1568 925 149 126 78 chr2 128869634 128869808 -52878279 + ORR1C2 LTR MaLR 1 187 -197 8 1568 925 149 126 78 chr2 128869852 128869932 -52878155 + ORR1C2 LTR MaLR 188 266 -118 8 1568 1566 175 180 3 chr2 128870205 128870561 -52877526 + MTD LTR MaLR 1 419 0 8 1568 932 271 153 14 chr2 128872566 128872933 -52875154 + MTD LTR MaLR 2 419 0 8 1568 1990 155 42 11 chr2 128873028 128873417 -52874670 + ORR1C2 LTR MaLR 11 384 0 8 1568 571 155 0 0 chr2 128874500 128874597 -52873490 + ORR1C2 LTR MaLR 1 97 -277 8 1568 1132 225 101 58 chr2 128874597 128875251 -52872836 - RLTR22_Mur LTR ERVK 0 1848 655 8 1568 1096 184 339 24 chr2 128875252 128875597 -52872490 + RLTR20C LTR ERVK 1 457 -94 8 1568 702 225 31 18 chr2 128875643 128875738 -52872349 + RLTR20C LTR ERVK 458 550 -1 8 1568 1096 155 50 9 chr2 128875738 128875960 -52872127 - RLTR22_Mur LTR ERVK -663 659 429 8 1568 1218 198 35 21 chr2 128876236 128876610 -52871477 - RLTR22_Mur LTR ERVK -937 385 1 8 1568 907 183 15 46 chr2 128876610 128876801 -52871286 + ORR1C2 LTR MaLR 92 276 -98 8 1568 338 208 26 0 chr2 128876934 128877011 -52871076 + ORR1C2 LTR MaLR 273 351 -23 8 1568 382 274 74 0 chr2 128878629 128878764 -52869323 + MLT1F-int LTR MaLR 572 716 -773 8 1568 714 149 266 20 chr2 128882524 128882723 -52865364 + RLTR17 LTR ERVK 1 248 -444 8 1568 849 196 117 5 chr2 128882729 128882934 -52865153 - MTD LTR MaLR -184 235 8 8 1568 974 147 62 20 chr2 128884340 128884535 -52863552 - RLTR22_Mus LTR ERVK -63 1745 1543 8 1568 5639 64 8 38 chr2 128884754 128885604 -52862483 - RLTR22_Mus LTR ERVK -983 825 1 8 1568 262 237 0 0 chr2 128886348 128886407 -52861680 - ETnERV3-int LTR ERVK -613 5195 5137 8 1568 1164 294 52 48 chr2 128889254 128889804 -52858283 - MMTV-int LTR ERVK -3108 3713 2875 8 1568 339 302 58 85 chr2 128890912 128891136 -52856951 - RMER12 LTR ERVK -4 1318 1101 9 1568 1116 63 7 0 chr2 128891156 128891298 -52856789 - RLTR22_Mus LTR ERVK -1665 143 1 9 1568 553 249 137 64 chr2 128894879 128895128 -52852959 - LTR16A1 LTR ERVL -2 454 188 9 1568 1028 123 141 6 chr2 128898240 128898438 -52849649 - MTC LTR MaLR -203 204 1 9 1568 309 241 0 102 chr2 128901003 128901091 -52846996 - MT2B LTR ERVL -362 239 161 9 1568 1527 251 27 19 chr2 128905031 128905405 -52842682 - MTE2b LTR MaLR 0 379 3 9 1568 266 331 16 78 chr2 128911524 128911548 -52836539 - RMER4B LTR ERVK -370 215 191 9 1568 4611 53 2 12 chr2 128911548 128912118 -52835969 - LTRIS2 LTR ERV1 0 564 1 9 1568 266 331 16 78 chr2 128912118 128912286 -52835801 - RMER4B LTR ERVK -395 190 35 9 1568 336 326 92 136 chr2 128934132 128934246 -52813841 - MLT1F LTR MaLR -33 515 410 1 1568 336 325 264 84 chr2 128934416 128934736 -52813351 - MLT1F LTR MaLR -139 409 28 1 1568 3240 103 48 103 chr2 128936437 128937138 -52810949 - RLTR13B4 LTR ERVK -282 701 1 1 1568 401 249 74 22 chr2 128937891 128938049 -52810038 - MTEb LTR MaLR -8 371 206 1 1568 1447 178 103 52 chr2 128947528 128947877 -52800210 - ORR1C1 LTR MaLR -11 367 1 1 1568 426 242 340 4 chr2 128947878 128948105 -52799982 - MTEa LTR MaLR -57 322 20 1 1568 309 290 123 91 chr2 128950023 128950215 -52797872 - MLT1A0 LTR MaLR -73 292 94 1 1568 309 290 123 91 chr2 128950393 128950420 -52797667 - MLT1A0 LTR MaLR -272 93 66 1 1568 288 235 14 14 chr2 128958327 128958396 -52789691 - LTR83 LTR ERVL -431 349 281 1 1568 314 290 50 0 chr2 128959616 128959716 -52788371 - LTR79 LTR ERVL -11 516 412 1 1568 280 192 128 0 chr2 128959952 128960030 -52788057 - LTR16C LTR ERVL -74 415 328 1 1568 394 266 146 15 chr2 128965869 128965999 -52782088 - LTR16C LTR ERVL -62 427 281 1 1568 1076 238 195 55 chr2 128968641 128968821 -52779266 + MTD LTR MaLR 5 193 -226 1 1568 1076 238 195 55 chr2 128968852 128969035 -52779052 + MTD LTR MaLR 194 418 -1 1 1568 738 288 174 10 chr2 128969944 128970340 -52777747 + MER31B LTR ERV1 6 466 0 1 1568 1028 245 100 0 chr2 128971864 128972105 -52775982 - MTEb LTR MaLR -9 370 106 1 1568 342 143 18 18 chr2 128972181 128972238 -52775849 + ORR1A2 LTR MaLR 1 57 -270 1 1568 2005 108 3 7 chr2 128972450 128972739 -52775348 + ORR1A2 LTR MaLR 32 319 -8 1 1568 1556 175 23 80 chr2 128973798 128974228 -52773859 + RMER16 LTR ERVK 1 531 -2 1 1569 395 274 85 8 chr2 128977986 128978104 -52769983 + HERVL40-int LTR ERVL 3451 3577 -1953 1 1569 250 339 22 59 chr2 128978276 128978411 -52769676 + HERVL40-int LTR ERVL 3765 3894 -1636 1 1569 282 245 71 50 chr2 128978626 128978725 -52769362 + MLT2F LTR ERVL 9 109 -554 1 1569 514 321 71 39 chr2 128978909 128979291 -52768796 - ERVL-B4-int LTR ERVL -3325 2389 1996 1 1569 360 350 79 21 chr2 128982501 128982880 -52765207 + ERVL-int LTR ERVL 1341 1741 -3926 1 1569 368 246 137 58 chr2 128983292 128983482 -52764605 + ERVL-int LTR ERVL 2305 2509 -3248 1 1569 2996 87 30 14 chr2 128984319 128984748 -52763339 - RLTR9B LTR ERVK -1 436 1 1 1569 502 307 101 66 chr2 128984919 128985264 -52762823 - ORR1E LTR MaLR 0 419 1 1 1569 2325 113 0 35 chr2 128985901 128985949 -52762138 - MTB-int LTR MaLR -743 355 317 1 1569 2325 113 0 35 chr2 128986097 128986416 -52761671 - MTB-int LTR MaLR -782 316 1 1 1569 1433 49 32 0 chr2 128986416 128986600 -52761487 - MTB LTR MaLR 0 400 211 1 1569 552 241 52 68 chr2 128986600 128986840 -52761247 + RLTR31_Mur LTR ERVK 1 326 -96 1 1569 357 314 24 16 chr2 128987021 128987147 -52760940 + RMER15 LTR ERVL 418 544 -31 1 1569 452 311 73 66 chr2 128989630 128989947 -52758140 - HERV16-int LTR ERVL -3869 1127 809 1 1569 247 359 89 54 chr2 128990022 128990190 -52757897 - LTR75 LTR ERVL -94 468 295 1 1569 443 268 70 7 chr2 128993107 128993250 -52754837 + ORR1E LTR MaLR 1 152 -207 1 1569 899 222 25 49 chr2 128999491 128999695 -52748392 - MTEb LTR MaLR -180 199 1 1 1569 1034 245 66 8 chr2 128999723 128999966 -52748121 - MTD LTR MaLR -8 411 155 1 1569 1908 193 38 36 chr2 129002189 129002609 -52745478 - MTC LTR MaLR 0 421 1 8 1569 1902 155 176 140 chr2 129004598 129004901 -52743186 + RMER4B LTR ERVK 2 323 -262 1 1569 1902 155 176 140 chr2 129005042 129005302 -52742785 + RMER4B LTR ERVK 324 585 0 1 1569 957 298 98 6 chr2 129008275 129008593 -52739494 + MLT1A0 LTR MaLR 19 365 0 2 1569 2571 137 37 8 chr2 129010402 129010910 -52737177 - RMER4B LTR ERVK -11 574 17 2 1569 438 204 17 100 chr2 129014875 129014995 -52733092 + MT2B LTR ERVL 155 264 -337 4 1569 515 211 15 54 chr2 129015259 129015389 -52732698 - RLTR22_Mur LTR ERVK -134 1714 1590 4 1569 1908 207 8 13 chr2 129015451 129015848 -52732239 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1039 809 415 4 1569 311 234 61 41 chr2 129015903 129016001 -52732086 + RLTR23 LTR ERV1 331 430 0 4 1569 791 258 77 162 chr2 129021308 129021511 -52726576 - MTE2a LTR MaLR -6 373 172 6 1569 791 258 77 162 chr2 129021704 129021740 -52726347 - MTE2a LTR MaLR -208 171 147 6 1569 2156 138 113 8 chr2 129021740 129021815 -52726272 + MTC LTR MaLR 3 98 -323 6 1569 2156 138 113 8 chr2 129022001 129022304 -52725783 + MTC LTR MaLR 99 420 -1 6 1569 791 258 77 162 chr2 129022304 129022460 -52725627 - MTE2a LTR MaLR -233 146 11 6 1569 311 268 156 39 chr2 129046091 129046219 -52701868 - MLT1J LTR MaLR -64 448 306 9 1569 233 252 141 16 chr2 129046664 129046785 -52701302 - LTR50 LTR ERVL -43 752 617 9 1569 242 174 22 0 chr2 129050622 129050668 -52697419 + MLT1F LTR MaLR 304 350 -198 1 1569 387 288 168 37 chr2 129056388 129056579 -52691508 - MLT1N2 LTR MaLR -344 218 3 1 1569 352 268 78 21 chr2 129060483 129060624 -52687463 - MLT1A0 LTR MaLR -199 166 18 1 1569 2201 132 140 76 chr2 129060948 129061449 -52686638 + RMER16 LTR ERVK 1 533 0 1 1569 1104 128 0 0 chr2 129061521 129061693 -52686394 + RMER16-int LTR ERVK 1968 2139 -3267 1 1569 3137 83 14 0 chr2 129061693 129062112 -52685975 + RMER16-int LTR ERVK 2357 2781 -2625 1 1569 447 211 31 10 chr2 129066159 129066255 -52681832 - MTEb LTR MaLR -4 375 278 1 1569 731 290 107 43 chr2 129071823 129072263 -52675824 + RLTR12B LTR ERVK 47 514 -14 1 1569 4840 112 42 48 chr2 129079570 129080319 -52667768 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1 747 -1101 1 1569 4840 112 42 48 chr2 129080467 129080527 -52667560 + RLTR22_Mur LTR ERVK 748 805 -1043 1 1569 462 330 56 33 chr2 129080933 129081146 -52666941 + RMER12 LTR ERVK 1101 1318 -4 1 1569 2922 12 0 0 chr2 129088352 129088674 -52659413 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 322 0 1 1569 257 284 0 90 chr2 129090422 129090511 -52657576 - RMER19B LTR ERVK -774 128 48 1 1569 268 306 7 47 chr2 129090512 129090666 -52657421 - RMER19A LTR ERVK -573 164 43 1 1569 268 306 5 46 chr2 129090667 129090852 -52657235 - RMER19A LTR ERVK -573 164 43 1 1569 268 306 8 47 chr2 129090822 129090949 -52657138 - RMER19A LTR ERVK -573 164 43 1 1569 1574 136 128 16 chr2 129091846 129092152 -52655935 - ORR1D1 LTR MaLR -8 366 27 2 1569 296 374 134 26 chr2 129092569 129092838 -52655249 - MLT1K LTR MaLR -208 387 90 2 1569 1945 148 101 25 chr2 129097540 129097906 -52650181 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 2 1569 410 200 0 145 chr2 129102871 129102988 -52645099 + MT2B LTR ERVL 158 257 -344 2 1569 1130 260 109 21 chr2 129104550 129104888 -52643199 + MER21B LTR ERV1 1 368 -495 2 1569 3008 95 64 93 chr2 129105155 129105690 -52642397 + MURVY-LTR LTR ERV1 1 519 0 2 1570 646 246 119 6 chr2 129112943 129113119 -52634968 + MTD LTR MaLR 13 208 -211 2 1570 386 222 302 0 chr2 129113344 129113506 -52634581 + MTD LTR MaLR 209 419 0 2 1570 404 120 0 0 chr2 129123419 129123487 -52624600 - RMER21B LTR ERV1 -64 883 765 2 1570 1711 172 12 21 chr2 129123487 129123820 -52624267 - RMER21A LTR ERV1 0 947 618 2 1570 530 182 220 0 chr2 129124269 129124401 -52623686 - RMER15 LTR ERVL -2 573 413 2 1570 227 275 14 28 chr2 129141612 129141683 -52606404 + MLT1J2 LTR MaLR 73 142 -306 3 1570 820 253 156 23 chr2 129144827 129145160 -52602927 - MLT1A0 LTR MaLR 0 374 1 3 1570 1153 221 30 108 chr2 129146474 129146880 -52601207 + MTE2a LTR MaLR 3 376 -3 3 1570 1651 191 35 9 chr2 129152960 129153303 -52594784 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 23 3 1570 410 265 18 85 chr2 129160542 129160765 -52587322 - LTR37B LTR ERV1 0 468 261 3 1570 1570 198 14 29 chr2 129165105 129165309 -52582778 - RMER5 LTR ERV1 -2 532 332 3 1570 2119 156 8 104 chr2 129165309 129165797 -52582290 - RMER10A LTR ERVL 0 442 2 3 1570 1570 198 14 29 chr2 129165797 129165941 -52582146 - RMER5 LTR ERV1 -203 331 189 3 1570 422 213 62 68 chr2 129166319 129166465 -52581622 - RMER5 LTR ERV1 -370 164 20 3 1570 2006 127 27 3 chr2 129169005 129169306 -52578781 + RLTR10E LTR ERVK 1 308 -3 3 1570 3072 186 69 81 chr2 129169311 129170193 -52577894 + MMERVK10C-int LTR ERVK 1 872 -6709 3 1570 1585 161 141 23 chr2 129170168 129170623 -52577464 + RMER16-int LTR ERVK 192 688 -5449 3 1570 574 168 88 0 chr2 129170610 129170723 -52577364 + RMER16-int LTR ERVK 938 1060 -5077 3 1570 1143 242 66 21 chr2 129170736 129171023 -52577064 + ETnERV2-int LTR ERVK 2454 2753 -4653 3 1570 2217 141 38 3 chr2 129171049 129171680 -52576407 + ETnERV2-int LTR ERVK 3567 4271 -3135 3 1570 399 208 13 10 chr2 129171677 129171790 -52576297 + MMETn-int LTR ERVK 2367 2454 -2390 3 1570 784 92 36 51 chr2 129171786 129171923 -52576164 + MMERVK10C-int LTR ERVK 4536 4670 -2911 3 1570 22315 85 10 27 chr2 129172594 129175603 -52572484 + MMERVK10C-int LTR ERVK 4623 7580 -1 3 1570 1779 147 0 10 chr2 129175604 129175906 -52572181 + RLTR10E LTR ERVK 1 299 -12 3 1570 388 178 39 52 chr2 129182766 129182920 -52565167 - RMER17B LTR ERVK -501 457 306 3 1570 2144 155 81 107 chr2 129182934 129183435 -52564652 - RLTR24 LTR ERV1 0 529 42 3 1570 3172 51 8 2 chr2 129183435 129183829 -52564258 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 1570 2144 155 81 107 chr2 129183829 129183870 -52564217 - RLTR24 LTR ERV1 -488 41 1 3 1570 955 207 138 20 chr2 129183921 129184168 -52563919 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 95 3 1570 2753 143 25 24 chr2 129184173 129184682 -52563405 - RLTR28 LTR ERVL -14 510 1 3 1570 473 200 10 0 chr2 129184682 129184781 -52563306 - ORR1D2 LTR MaLR -270 100 1 3 1570 2587 148 2 0 chr2 129199722 129200140 -52547947 + MTC LTR MaLR 1 419 -2 3 1570 5649 156 84 17 chr2 129200142 129201294 -52546793 + MTC-int LTR MaLR 3 1231 -27 3 1570 243 53 0 0 chr2 129201497 129201535 -52546552 + MTC-int LTR MaLR 1221 1258 0 3 1570 2663 165 7 0 chr2 129201535 129201953 -52546134 + MTC LTR MaLR 1 421 0 3 1570 1873 134 56 12 chr2 129202783 129203123 -52544964 - RLTR15 LTR ERVK -4 355 1 4 1570 3182 64 166 2 chr2 129204422 129204862 -52543225 + RLTR1B LTR ERV1 1 512 0 4 1570 1140 258 129 58 chr2 129205595 129206162 -52541925 + RLTR18 LTR ERVK 1 607 -9 4 1570 1015 205 248 55 chr2 129208392 129208831 -52539256 - RMER4B LTR ERVK -3 582 59 4 1570 513 315 112 21 chr2 129210515 129210755 -52537332 + MER31A LTR ERV1 76 337 -148 4 1570 2419 92 3 3 chr2 129211782 129212109 -52535978 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 4 1570 274 321 133 50 chr2 129212967 129213246 -52534841 + MER21B LTR ERV1 415 716 -147 4 1570 3813 216 118 43 chr2 129221408 129222647 -52525440 - RMER12 LTR ERVK -30 1818 1 4 1570 1372 232 73 53 chr2 129223768 129224259 -52523828 - RLTR16 LTR ERVK -4 501 1 4 1570 460 155 24 12 chr2 129228468 129228553 -52519534 + MTEb LTR MaLR 206 291 -88 4 1570 737 294 57 59 chr2 129233298 129233739 -52514348 - MER31B LTR ERV1 -24 442 3 4 1571 357 251 20 55 chr2 129242151 129242269 -52505818 + MLT1A1 LTR MaLR 306 408 0 4 1571 2461 120 83 0 chr2 129243362 129243713 -52504374 - RLTR14 LTR ERV1 0 382 3 4 1571 2027 129 138 80 chr2 129246668 129247081 -52501006 + RLTR9B LTR ERVK 1 437 0 4 1571 3042 129 8 30 chr2 129247356 129247827 -52500260 - RMER6B LTR ERVK 0 461 1 4 1571 2398 197 41 9 chr2 129248195 129248655 -52499432 + RLTR21 LTR ERVK 1 475 -1097 4 1571 3471 135 16 60 chr2 129249583 129250268 -52497819 + RLTR21 LTR ERVK 457 1111 -461 4 1571 757 233 145 66 chr2 129250316 129250490 -52497597 + RMER12B LTR ERVK 1214 1403 -1 4 1571 835 214 34 62 chr2 129258119 129258328 -52489759 + RLTR18B LTR ERVK 1 203 -309 4 1571 338 290 66 69 chr2 129258353 129258672 -52489415 - RMER17C LTR ERVK -60 350 33 4 1571 1351 214 6 80 chr2 129258745 129259081 -52489006 + RLTR18B LTR ERVK 198 508 -4 4 1571 2162 184 17 20 chr2 129259142 129259546 -52488541 + RLTR18-int LTR ERVK 34 436 -4925 4 1571 2099 143 36 3 chr2 129259669 129259977 -52488110 + RLTR18-int LTR ERVK 2116 2433 -2928 4 1571 6283 156 29 9 chr2 129260015 129261063 -52487024 + RLTR18-int LTR ERVK 2753 3820 -1541 4 1571 1901 151 44 3 chr2 129261080 129261398 -52486689 + RLTR18-int LTR ERVK 3911 4241 -1120 4 1571 1887 203 13 42 chr2 129261424 129261809 -52486278 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 4 1571 3287 11 0 3 chr2 129264774 129265121 -52482966 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 4 1571 1119 198 48 16 chr2 129265716 129265958 -52482129 - RLTR28B LTR ERVL -11 470 221 5 1571 614 202 214 22 chr2 129265958 129266140 -52481947 - RLTR22_Mur LTR ERVK 0 1848 1632 5 1571 3795 184 42 27 chr2 129266259 129267087 -52481000 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1007 841 1 5 1571 970 166 38 57 chr2 129267118 129267329 -52480758 - RLTR28B LTR ERVL -274 207 1 5 1571 429 109 16 0 chr2 129270143 129270207 -52477880 - MTC LTR MaLR -356 65 1 5 1571 1900 249 94 109 chr2 129270291 129271250 -52476837 + RMER17B LTR ERVK 2 945 -13 5 1571 799 226 33 33 chr2 129271228 129271438 -52476649 - MTD-int LTR MaLR -846 524 315 5 1571 2664 214 29 48 chr2 129271581 129272204 -52475883 + RMER19C LTR ERVK 1 611 0 5 1571 1122 255 74 42 chr2 129272270 129272592 -52475495 - MTD-int LTR MaLR -1037 333 1 5 1571 1844 213 48 25 chr2 129272605 129273000 -52475087 - MTD LTR MaLR -15 404 1 5 1571 5150 98 7 62 chr2 129273022 129273882 -52474205 - RLTR13A3 LTR ERVK 0 978 166 5 1571 1293 74 11 6 chr2 129280831 129281008 -52467079 - RLTR13A3 LTR ERVK -800 178 1 5 1571 292 304 50 78 chr2 129281030 129281312 -52466775 - RLTR12B LTR ERVK -15 513 240 5 1571 323 231 168 40 chr2 129281324 129281473 -52466614 - RLTR12B LTR ERVK -351 177 10 5 1571 1012 283 56 0 chr2 129281477 129281728 -52466359 - ORR1D2 LTR MaLR -31 339 75 5 1571 5082 108 46 53 chr2 129282032 129282841 -52465246 + RLTR13B4 LTR ERVK 1 803 0 5 1571 2934 219 176 14 chr2 129287142 129287882 -52460205 - RMER13A LTR ERVK 0 860 1 5 1571 498 195 26 21 chr2 129290908 129291022 -52457065 + MT2A LTR ERVL 351 513 -71 5 1571 751 277 27 64 chr2 129305112 129305382 -52442705 + MT2B LTR ERVL 161 477 -124 5 1571 376 287 89 117 chr2 129305430 129305443 -52442644 + MT2B LTR ERVL 424 437 -38 5 1571 376 287 89 117 chr2 129305496 129305535 -52442552 + MT2B LTR ERVL 438 475 0 5 1571 1594 138 8 0 chr2 129305535 129305781 -52442306 + MERVL_2A-int LTR ERVL 1 248 -5513 5 1571 614 304 58 62 chr2 129305785 129306059 -52442028 - RMER15 LTR ERVL -9 566 294 5 1571 3440 55 8 2 chr2 129306281 129306679 -52441408 - MTB LTR MaLR 0 400 1 5 1571 376 346 22 61 chr2 129307213 129307444 -52440643 + MERVK26-int LTR ERVK 6522 6743 -176 5 1571 260 231 58 0 chr2 129308096 129308148 -52439939 - RLTR18B LTR ERVK -47 465 411 5 1571 1367 236 7 26 chr2 129308209 129308513 -52439574 - RLTR18B LTR ERVK -214 298 1 5 1571 252 180 19 13 chr2 129309129 129309192 -52438895 - MTB LTR MaLR -282 139 76 5 1571 652 124 80 0 chr2 129309199 129309312 -52438775 + MTC LTR MaLR 1 122 -299 5 1571 1071 168 16 48 chr2 129314152 129314402 -52433685 + MTC-int LTR MaLR 1014 1255 -3 5 1571 2783 131 39 15 chr2 129314405 129314816 -52433271 + MTC LTR MaLR 1 421 0 5 1571 1385 273 76 47 chr2 129316089 129316626 -52431461 + RLTR42-int LTR ERVK 2314 2866 -2656 5 1571 1692 192 29 8 chr2 129316921 129317317 -52430770 + MT2A LTR ERVL 1 449 -84 5 1571 1035 266 110 58 chr2 129317517 129318122 -52429965 - RMER13A LTR ERVK -227 681 2 5 1571 1819 189 111 11 chr2 129319472 129319851 -52428236 + MTC LTR MaLR 5 421 0 5 1571 1607 223 63 86 chr2 129322235 129322726 -52425361 + RLTR28B LTR ERVL 2 481 0 5 1571 1928 206 77 87 chr2 129326663 129327168 -52420919 - RLTR18B LTR ERVK -8 504 5 5 1571 3934 161 7 19 chr2 129327172 129327869 -52420218 - RLTR18-int LTR ERVK 0 5361 4673 5 1571 27761 137 40 25 chr2 129327902 129332423 -52415664 - RLTR18-int LTR ERVK -768 4593 5 5 1571 1266 188 10 96 chr2 129332430 129332731 -52415356 - RLTR18B LTR ERVK -7 505 231 5 1571 1100 208 15 10 chr2 129338417 129338621 -52409466 + ORR1D1 LTR MaLR 166 370 -4 5 1571 2437 121 86 59 chr2 129344508 129345018 -52403069 - RLTR28 LTR ERVL 0 524 1 5 1571 966 237 105 9 chr2 129346302 129346638 -52401449 + MTD LTR MaLR 1 404 -15 6 1571 3107 86 77 0 chr2 129347011 129347452 -52400635 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 6 1571 14817 59 9 3 chr2 129347454 129349267 -52398820 - IAPEz-int LTR ERVK -2 6479 4656 6 1571 1898 78 8 0 chr2 129349266 129349510 -52398577 - IAPEz-int LTR ERVK -5183 2497 2252 6 1571 973 59 0 0 chr2 129349511 129349630 -52398457 - IAPEz-int LTR ERVK -5004 1477 1359 6 1571 3637 61 1 16 chr2 129349630 129350208 -52397879 - IAPEz-int LTR ERVK -5819 662 168 6 1571 225 273 0 0 chr2 129350208 129350252 -52397835 - RLTR27 LTR ERVK -34 275 232 6 1571 294 81 0 0 chr2 129350252 129350289 -52397798 - IAPEz-int LTR ERVK -7400 181 145 6 1571 239 321 0 0 chr2 129350289 129350345 -52397742 - RLTR27 LTR ERVK -34 275 220 6 1571 431 111 151 32 chr2 129350345 129350438 -52397649 - IAPEz-int LTR ERVK -6369 112 9 6 1571 3121 84 77 0 chr2 129350439 129350880 -52397207 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 6 1571 1942 152 117 19 chr2 129351788 129352164 -52395923 - MTC LTR MaLR -8 413 1 6 1571 593 301 42 88 chr2 129357014 129357369 -52390718 - RLTR12B LTR ERVK -254 274 1 6 1571 8596 225 77 79 chr2 129357404 129357831 -52390256 - MYSERV-int LTR ERVK -46 6504 6070 6 1571 8596 225 77 79 chr2 129357875 129359655 -52388432 - MYSERV-int LTR ERVK -46 6069 4255 6 1571 8596 228 75 81 chr2 129359705 129360224 -52387863 - MYSERV-int LTR ERVK -2296 4254 3750 6 1571 522 280 95 69 chr2 129361375 129361822 -52386265 - RLTR12B LTR ERVK -20 339 9 6 1572 1439 209 124 71 chr2 129373915 129374311 -52373776 - MTD LTR MaLR 0 419 3 6 1572 229 388 44 91 chr2 129376794 129377069 -52371018 + MLT1L LTR MaLR 218 479 -131 6 1572 371 342 64 16 chr2 129380035 129380222 -52367865 + RMER20B LTR ERVK 206 401 -226 6 1572 238 194 43 29 chr2 129383923 129383992 -52364095 + MLT1A1 LTR MaLR 336 405 -3 6 1572 2317 104 3 0 chr2 129388368 129388696 -52359391 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 6 1572 358 353 83 40 chr2 129390844 129391087 -52357000 + LTR40b LTR ERVL 113 347 -115 6 1572 356 306 57 40 chr2 129391218 129391395 -52356692 - RMER15 LTR ERVL -7 568 389 6 1572 2453 172 71 44 chr2 129393016 129393540 -52354547 - RMER15 LTR ERVL -1 574 37 6 1572 230 324 20 111 chr2 129393732 129393885 -52354202 + MLT1K LTR MaLR 265 403 -192 6 1572 363 312 71 0 chr2 129394694 129394835 -52353252 + MLT1J2 LTR MaLR 154 304 -144 6 1572 1219 226 40 92 chr2 129395711 129396111 -52351976 + MTE2b LTR MaLR 1 379 0 6 1572 1207 292 37 16 chr2 129396783 129397159 -52350928 - MLT1B LTR MaLR -2 388 5 6 1572 1025 286 63 33 chr2 129403529 129403894 -52344193 - MTEa LTR MaLR 0 379 4 6 1572 1575 153 89 52 chr2 129409937 129410363 -52337724 - RMER10A LTR ERVL 0 442 1 6 1572 526 314 76 115 chr2 129428880 129429236 -52318851 - MTEa LTR MaLR -30 349 8 7 1572 3065 29 42 0 chr2 129437440 129437820 -52310267 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 7 1572 9038 24 4 1 chr2 129437820 129438915 -52309172 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 7 1572 3065 29 42 0 chr2 129438915 129439295 -52308792 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 7 1572 2609 141 38 0 chr2 129451968 129452365 -52295722 + MTC LTR MaLR 1 412 -9 7 1572 467 262 159 12 chr2 129458385 129458555 -52289532 - MTB_Mm LTR MaLR -10 397 203 7 1572 326 327 108 59 chr2 129458655 129458941 -52289146 - ORR1E LTR MaLR -11 348 49 7 1572 485 323 38 43 chr2 129459532 129459742 -52288345 - LTR37B LTR ERV1 -259 209 1 7 1572 2952 159 70 9 chr2 129471134 129471666 -52276421 + RLTR12A LTR ERVK 1 564 -4 7 1572 1987 127 99 0 chr2 129471912 129472236 -52275851 - ORR1B2 LTR MaLR -10 357 2 7 1572 788 262 113 38 chr2 129475496 129475762 -52272325 + RLTR12B LTR ERVK 47 332 -196 7 1572 440 254 56 95 chr2 129475740 129475871 -52272216 + RLTR12B LTR ERVK 256 379 -149 7 1572 6320 99 52 16 chr2 129475871 129476796 -52271291 + RMER17B LTR ERVK 1 958 0 7 1572 440 254 56 95 chr2 129476796 129476916 -52271171 + RLTR12B LTR ERVK 380 497 -31 7 1572 1671 166 107 29 chr2 129477102 129477449 -52270638 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 7 1572 449 265 131 29 chr2 129481049 129481224 -52266863 - MT2A LTR ERVL 0 533 341 8 1572 1057 277 56 26 chr2 129483450 129483754 -52264333 - ORR1D2 LTR MaLR -55 315 3 8 1572 306 348 48 24 chr2 129483755 129483923 -52264164 + LTR31 LTR ERV1 448 619 0 8 1572 246 256 33 22 chr2 129484806 129484898 -52263189 + MTC LTR MaLR 48 140 -230 8 1572 593 168 0 0 chr2 129487738 129487833 -52260254 + MTC LTR MaLR 168 262 -159 8 1572 2133 138 141 3 chr2 129489397 129489767 -52258320 + MTC LTR MaLR 1 421 0 8 1572 828 288 108 27 chr2 129489809 129490141 -52257946 - ORR1E LTR MaLR 0 359 1 8 1572 2566 118 45 0 chr2 129496815 129497189 -52250898 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 4 8 1572 1104 274 67 56 chr2 129497215 129497590 -52250497 - MTEa LTR MaLR 0 379 1 8 196 355 347 17 62 chr2 129499108 129499286 -52248801 + MER31A LTR ERV1 180 349 -136 8 1573 382 332 32 72 chr2 129502698 129502904 -52245183 + MLT1J LTR MaLR 28 217 -231 3 1573 308 276 0 11 chr2 129504684 129504772 -52243315 + MTE2b LTR MaLR 43 129 -250 6 1573 536 332 154 20 chr2 129504704 129504853 -52243234 + MT2A LTR ERVL 62 247 -286 7 1573 536 332 154 20 chr2 129504873 129505073 -52243014 + MT2A LTR ERVL 248 458 -75 7 1573 2493 160 57 22 chr2 129520120 129520625 -52227462 + RMER5 LTR ERV1 1 523 -11 2 1573 1110 247 82 76 chr2 129529084 129529119 -52218968 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 340 3 1573 1931 153 58 0 chr2 129529119 129529427 -52218660 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 3 1573 1110 247 82 76 chr2 129529427 129529759 -52218328 - ORR1D2 LTR MaLR -31 339 1 3 1573 1856 213 35 50 chr2 129529759 129530155 -52217932 - ORR1D2-int LTR MaLR 0 1370 981 3 1573 1856 269 50 28 chr2 129530204 129530473 -52217614 - ORR1D2-int LTR MaLR -390 980 684 3 1573 263 279 0 0 chr2 129530498 129530559 -52217528 + ORR1D-int LTR MaLR 740 800 -570 4 1573 699 282 140 58 chr2 129530551 129531107 -52216980 - MTD-int LTR MaLR -434 936 335 4 1573 960 242 157 23 chr2 129531360 129531665 -52216422 - MTD-int LTR MaLR -1024 346 1 4 1573 428 259 244 11 chr2 129531667 129531847 -52216240 - MTD LTR MaLR -2 417 196 4 1573 894 223 20 0 chr2 129532122 129532319 -52215768 - MTD LTR MaLR -218 201 1 4 1573 551 293 21 77 chr2 129535802 129536035 -52212052 - MT2A LTR ERVL -209 324 105 5 1573 650 268 138 14 chr2 129544642 129545085 -52203002 - MLT1G LTR MaLR -8 583 52 6 1573 846 247 28 36 chr2 129546302 129546550 -52201537 - ORR1E LTR MaLR -4 355 110 6 1573 525 139 12 0 chr2 129546708 129546802 -52201285 - ORR1E LTR MaLR -263 96 2 6 1573 2910 157 9 25 chr2 129557787 129558311 -52189776 + RMER19C LTR ERVK 93 608 -3 8 1573 770 97 468 0 chr2 129565784 129566008 -52182079 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 1 1573 660 290 17 0 chr2 129566258 129566434 -52181653 + MTEb LTR MaLR 1 179 -200 1 1573 752 214 10 65 chr2 129566538 129566738 -52181349 + MTEb LTR MaLR 191 379 0 1 1573 819 327 32 146 chr2 129569011 129569268 -52178819 + LTR41 LTR ERVL 1 225 -543 1 1573 819 327 32 146 chr2 129569320 129569875 -52178212 + LTR41 LTR ERVL 226 720 -48 1 1573 1303 188 36 11 chr2 129576801 129577080 -52171007 + MTD LTR MaLR 3 288 -131 1 1573 885 244 173 93 chr2 129577320 129577845 -52170242 - RMER2 LTR ERV1 0 567 1 1 1573 512 279 143 11 chr2 129578055 129578327 -52169760 + MER110 LTR ERV1 172 479 -12 1 1573 565 283 146 36 chr2 129578567 129578868 -52169219 - MLT1G1 LTR MaLR -16 563 230 1 1573 1308 218 110 3 chr2 129579143 129579470 -52168617 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 9 1 1573 1638 234 50 10 chr2 129580612 129581013 -52167074 - MTD LTR MaLR -2 417 1 1 1573 1623 135 118 0 chr2 129593092 129593389 -52154698 + ORR1B1 LTR MaLR 1 332 -62 1 1573 266 189 19 0 chr2 129593605 129593658 -52154429 + ORR1B1 LTR MaLR 340 393 -1 1 1573 1627 209 111 63 chr2 129595927 129596468 -52151619 - RMER2 LTR ERV1 0 567 1 1 1573 2660 47 6 200 chr2 129598183 129598664 -52149423 - RLTR10 LTR ERVK -2 388 1 1 1573 17535 20 9 1 chr2 129598666 129600634 -52147453 - RLTR10-int LTR ERVK -3 1984 1 1 1573 2681 47 6 199 chr2 129600634 129601117 -52146970 - RLTR10 LTR ERVK 0 390 1 1 1573 933 240 96 50 chr2 129602438 129602719 -52145368 - MTE2a LTR MaLR 0 379 86 1 1573 1094 292 43 20 chr2 129604137 129604486 -52143601 - MTEa LTR MaLR 0 379 23 1 1573 1217 215 66 78 chr2 129604948 129605296 -52142791 - MTE2a LTR MaLR 0 379 36 1 1573 639 199 0 15 chr2 129608414 129608547 -52139540 - MTE2b LTR MaLR -16 363 233 1 1573 454 242 99 50 chr2 129608963 129609124 -52138963 - MTE2b LTR MaLR -153 226 58 1 1573 979 198 51 14 chr2 129609553 129609768 -52138319 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 162 2 1573 520 265 8 25 chr2 129611583 129611703 -52136384 + ORR1E LTR MaLR 35 152 -207 2 1573 563 311 24 52 chr2 129611887 129612097 -52135990 + ORR1E LTR MaLR 139 342 -17 2 1573 285 219 146 0 chr2 129613756 129613838 -52134249 + RMER15 LTR ERVL 417 510 -65 2 1573 360 205 30 28 chr2 129618726 129618839 -52129248 - MTD LTR MaLR 0 419 265 2 1573 523 250 50 31 chr2 129619003 129619164 -52128923 + RMER15 LTR ERVL 407 570 -5 2 1573 772 237 254 43 chr2 129619145 129619366 -52128721 - MTD LTR MaLR -59 360 86 2 1573 2298 95 81 74 chr2 129619366 129619786 -52128301 + RMER2 LTR ERV1 1 423 -144 2 1573 561 279 38 109 chr2 129620035 129620467 -52127620 + MTEa LTR MaLR 37 377 -2 2 1573 355 217 61 78 chr2 129624489 129624604 -52123483 + MLT1B LTR MaLR 10 122 -268 2 1574 1636 141 79 16 chr2 129640658 129640993 -52107094 - ORR1A4 LTR MaLR 0 394 1 2 1574 267 256 115 0 chr2 129659569 129659647 -52088440 - MTE2a LTR MaLR -261 118 32 2 1574 1160 274 197 38 chr2 129659911 129660142 -52087945 - MTE2b-int LTR MaLR -279 1301 1034 2 1574 1160 274 197 38 chr2 129660178 129660293 -52087794 - MTE2b-int LTR MaLR -547 1033 898 2 1574 1160 281 153 42 chr2 129660338 129660544 -52087543 - MTE2b-int LTR MaLR -683 897 785 2 1574 1148 240 174 0 chr2 129660529 129660846 -52087241 - MTE2b-int LTR MaLR -1206 374 3 2 1574 987 225 170 45 chr2 129660847 129661182 -52086905 - MTE2b LTR MaLR 0 379 3 2 1574 878 255 150 7 chr2 129663476 129663756 -52084331 - MTD LTR MaLR 0 419 100 2 1574 2357 76 6 57 chr2 129663754 129664090 -52083997 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 2 1574 4927 102 24 19 chr2 129664090 129664832 -52083255 - ORR1A2-int LTR MaLR 0 1963 1218 2 1574 972 256 72 69 chr2 129666679 129666998 -52081089 - ORR1E LTR MaLR -36 323 4 3 1574 428 315 157 54 chr2 129671980 129672254 -52075833 - MLT1J LTR MaLR -36 476 169 3 1574 428 307 23 62 chr2 129672403 129672489 -52075598 - MLT1J LTR MaLR -344 168 48 3 1574 234 229 0 16 chr2 129673891 129673937 -52074150 + MT2A LTR ERVL 1 46 -487 3 1574 234 229 0 16 chr2 129674152 129674167 -52073920 + MT2A LTR ERVL 47 61 -472 3 1574 2934 183 102 35 chr2 129676513 129677265 -52070822 + RLTR40 LTR ERVK 1 803 -14 3 1574 762 219 201 99 chr2 129685182 129685319 -52062768 - ORR1D1 LTR MaLR -3 371 184 3 1574 762 219 201 99 chr2 129685436 129685622 -52062465 - ORR1D1 LTR MaLR -191 183 15 3 1574 1924 186 129 31 chr2 129685629 129686152 -52061935 - ORR1D1-int LTR MaLR -271 1099 706 3 1574 323 145 0 0 chr2 129686159 129686228 -52061859 - ORR1D1 LTR MaLR -235 139 71 3 1574 399 194 0 0 chr2 129686285 129686357 -52061730 - ORR1D1 LTR MaLR -302 72 1 3 1574 3006 152 43 11 chr2 129687173 129687712 -52060375 - RMER15 LTR ERVL 0 575 20 3 1574 1092 220 203 6 chr2 129687725 129688040 -52060047 + MTE2b LTR MaLR 1 377 -2 3 1574 2176 187 98 28 chr2 129692247 129692775 -52055312 + RMER15 LTR ERVL 11 575 0 3 1574 284 244 26 0 chr2 129695296 129695374 -52052713 + MT2A LTR ERVL 342 421 -112 3 1574 2833 97 117 17 chr2 129695508 129695980 -52052107 - MURVY-LTR LTR ERV1 0 519 1 3 1574 245 214 18 0 chr2 129700823 129700879 -52047208 - LTR16C LTR ERVL 0 489 433 3 1574 2536 170 73 82 chr2 129701385 129701484 -52046603 - RLTR40 LTR ERVK -155 662 573 3 1574 3308 21 39 0 chr2 129701484 129701865 -52046222 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 1574 2536 170 73 82 chr2 129701865 129702433 -52045654 - RLTR40 LTR ERVK -245 572 2 3 1574 385 253 53 0 chr2 129703228 129703323 -52044764 + MLT2B2 LTR ERVL 1 100 -415 3 1574 1935 120 72 41 chr2 129706099 129706490 -52041597 + RLTR9E LTR ERVK 2 404 -5 3 1574 1105 231 40 50 chr2 129709997 129710375 -52037712 + RMER5 LTR ERV1 57 430 -104 3 1574 1274 236 91 12 chr2 129710379 129710718 -52037369 + ORR1D2 LTR MaLR 3 368 -2 3 1574 445 163 103 43 chr2 129711277 129711397 -52036690 - MTD LTR MaLR -8 411 252 3 1574 782 273 84 11 chr2 129712188 129712462 -52035625 + RMER5 LTR ERV1 204 497 -37 3 1574 313 219 27 135 chr2 129715031 129715142 -52032945 + MLT1A1 LTR MaLR 294 392 -16 3 1574 2026 168 141 63 chr2 129715941 129716493 -52031594 - RMER19B LTR ERVK 0 902 308 3 1574 271 175 35 0 chr2 129723798 129723855 -52024232 - MTD LTR MaLR 0 419 361 3 1574 260 280 95 99 chr2 129723911 129724153 -52023934 - RLTR14 LTR ERV1 -53 329 89 3 1574 16995 185 45 22 chr2 129724539 129726073 -52022014 + MERVL_2A-int LTR ERVL 2342 3905 -1856 3 1574 2249 168 21 5 chr2 129726073 129726451 -52021636 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 3 1574 16995 185 45 22 chr2 129726451 129728143 -52019944 + MERVL_2A-int LTR ERVL 3906 5644 -117 3 1574 540 178 33 33 chr2 129728616 129728738 -52019349 + MERVL_2A-int LTR ERVL 5640 5761 0 3 1574 1912 128 88 0 chr2 129728738 129729057 -52019030 + MT2A LTR ERVL 1 347 -186 3 1574 250 209 194 21 chr2 129731562 129731655 -52016432 + ORR1D2 LTR MaLR 256 364 -6 4 1574 1029 211 102 76 chr2 129732211 129732554 -52015533 - ORR1E LTR MaLR -5 354 3 4 1574 381 290 198 31 chr2 129733266 129733585 -52014502 - MER90a LTR ERV1 -12 602 230 4 1574 381 290 198 31 chr2 129733610 129733745 -52014342 - MER90a LTR ERV1 -385 229 72 4 1574 880 146 93 27 chr2 129735747 129735930 -52012157 + MTC LTR MaLR 1 195 -226 4 1574 853 213 70 14 chr2 129736722 129736936 -52011151 + MTC LTR MaLR 196 421 0 4 1574 823 254 100 14 chr2 129740122 129740401 -52007686 - MTD LTR MaLR -112 307 5 4 1574 2000 259 214 26 chr2 129740481 129741380 -52006707 - MTD-int LTR MaLR -172 1086 19 4 1574 669 199 53 54 chr2 129741401 129741625 -52006462 - MTD LTR MaLR -1 418 211 4 1574 1100 244 86 43 chr2 129741716 129742067 -52006020 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 5 4 1574 1395 219 27 39 chr2 129746784 129747173 -52000914 + MTD LTR MaLR 31 410 -9 4 1574 2097 163 13 21 chr2 129749166 129749542 -51998545 + ORR1D1 LTR MaLR 2 374 0 4 1574 1812 207 26 18 chr2 129750356 129750744 -51997343 - MTD LTR MaLR -19 400 10 4 1574 1033 164 32 100 chr2 129751986 129752237 -51995850 + ORR1D1 LTR MaLR 13 246 -128 4 1574 2695 208 40 68 chr2 129752241 129752932 -51995155 + ORR1D1-int LTR MaLR 132 803 -567 4 1574 516 221 82 22 chr2 129752932 129753066 -51995021 - ORR1D1-int LTR MaLR -1228 142 1 4 1574 1322 180 25 28 chr2 129753066 129753352 -51994735 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 90 4 1574 2432 185 75 8 chr2 129753341 129753847 -51994240 + ORR1D1-int LTR MaLR 831 1370 0 4 1574 1190 196 207 7 chr2 129753847 129753991 -51994096 + ORR1D1 LTR MaLR 1 175 -199 4 1574 1190 196 207 7 chr2 129754071 129754235 -51993852 + ORR1D1 LTR MaLR 176 370 -4 4 1574 527 205 35 0 chr2 129756013 129756140 -51991947 + MTD LTR MaLR 10 139 -280 4 1574 1764 164 134 0 chr2 129756251 129756610 -51991477 + MTD LTR MaLR 5 411 -8 4 1574 3755 39 5 0 chr2 129757631 129758065 -51990022 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 4 1575 1897 216 80 26 chr2 129765749 129766234 -51981853 - RMER5 LTR ERV1 -14 520 9 4 1575 1819 151 71 58 chr2 129767954 129768347 -51979740 - RMER10B LTR ERVL 0 398 1 4 1575 542 306 66 94 chr2 129771410 129771728 -51976359 + MTE2a LTR MaLR 1 309 -70 4 1575 2996 133 31 12 chr2 129772319 129772837 -51975250 + RLTR1D LTR ERV1 62 589 -16 4 1575 1144 57 7 0 chr2 129772853 129772994 -51975093 + MMVL30-int LTR ERV1 1 142 -7414 4 1575 2325 145 0 10 chr2 129772982 129773372 -51974715 + MMVL30-int LTR ERV1 74 459 -6993 4 1575 625 147 28 85 chr2 129773357 129773498 -51974589 + MMVL30-int LTR ERV1 370 502 -2797 4 1575 2410 119 22 24 chr2 129773990 129774361 -51973726 + MMVL30-int LTR ERV1 1109 1478 -2220 4 1575 449 196 12 150 chr2 129774413 129774653 -51973434 + MMVL30-int LTR ERV1 993 1199 -2100 4 1575 16400 78 14 19 chr2 129774875 129777084 -51971003 + MMVL30-int LTR ERV1 1501 3698 0 4 1575 2963 139 31 12 chr2 129777114 129777632 -51970455 + RLTR1D LTR ERV1 62 589 -16 4 1575 579 317 109 28 chr2 129780904 129781261 -51966826 - MER68 LTR ERVL -10 553 168 4 1575 283 265 0 14 chr2 129781280 129781349 -51966738 - MER68 LTR ERVL -469 94 27 4 1575 499 385 85 6 chr2 129786884 129787203 -51960884 + LTR31 LTR ERV1 150 493 -126 4 1575 928 331 89 40 chr2 129794094 129794597 -51953490 - MER68 LTR ERVL -24 539 12 5 1575 317 288 37 22 chr2 129794602 129794737 -51953350 - MER68-int LTR ERVL -5 2985 2849 5 1575 309 293 185 42 chr2 129794814 129795074 -51953013 - MER68-int LTR ERVL -249 2741 2445 5 1575 508 279 77 26 chr2 129795330 129795525 -51952562 - MER68-int LTR ERVL -852 2138 1934 5 1575 929 239 101 7 chr2 129796624 129796910 -51951177 - RMER5 LTR ERV1 -49 485 173 5 1575 492 236 77 49 chr2 129797478 129797661 -51950426 - RMER5 LTR ERV1 -342 192 5 5 1575 644 296 103 47 chr2 129803359 129803699 -51944388 + ORR1E LTR MaLR 1 359 0 5 1575 883 264 184 10 chr2 129815416 129815827 -51932260 - MTE-int LTR MaLR -171 1409 622 5 1575 2413 154 45 5 chr2 129816148 129816552 -51931535 - MTC LTR MaLR -1 420 1 5 1575 401 248 144 7 chr2 129818504 129818650 -51929437 - MTE-int LTR MaLR -729 851 686 5 1575 237 282 60 52 chr2 129830112 129830228 -51917859 + MLT1J LTR MaLR 385 501 -11 5 1575 424 363 35 45 chr2 129842283 129842569 -51905518 - MLT1J LTR MaLR -9 503 221 6 1575 228 264 52 94 chr2 129844448 129844531 -51903556 - MER21B LTR ERV1 -126 737 659 6 1575 335 141 109 0 chr2 129844531 129844595 -51903492 - RLTR24 LTR ERV1 0 529 459 6 1575 676 318 57 66 chr2 129844599 129844916 -51903171 - MER21B LTR ERV1 -549 314 1 6 1575 233 192 57 19 chr2 129845873 129845926 -51902161 - MT2B2 LTR ERVL -327 257 203 6 1575 244 240 34 119 chr2 129868657 129868775 -51879312 - RMER15 LTR ERVL -459 116 9 6 1575 303 339 54 23 chr2 129877763 129877893 -51870194 - MLT1J LTR MaLR -306 206 73 6 1575 262 314 75 86 chr2 129878352 129878526 -51869561 - LTR16B2 LTR ERVL -27 453 282 6 1575 1112 272 83 13 chr2 129880400 129880713 -51867374 - MTE2b LTR MaLR -4 375 41 6 1575 1256 236 62 86 chr2 129884529 129884900 -51863187 + MTEb LTR MaLR 16 377 -2 6 1575 452 331 40 27 chr2 129884900 129885059 -51863028 + MTE-int LTR MaLR 135 296 -1284 6 1575 695 280 83 0 chr2 129885238 129885431 -51862656 + MTE-int LTR MaLR 286 494 -1086 6 1575 1284 193 129 0 chr2 129885510 129885774 -51862313 - ORR1D1 LTR MaLR -76 298 1 6 1575 2092 147 17 70 chr2 129885775 129886191 -51861896 - ORR1D1-int LTR MaLR -1 1369 976 6 1576 723 254 21 69 chr2 129894930 129895165 -51852922 + MTE2a LTR MaLR 129 351 -28 6 1576 2023 145 80 55 chr2 129895345 129895709 -51852378 + ORR1C1 LTR MaLR 2 374 -4 6 1576 1859 186 22 94 chr2 129896875 129897083 -51851004 + ORR1D1 LTR MaLR 1 178 -196 6 1576 1859 186 22 94 chr2 129897121 129897315 -51850772 + ORR1D1 LTR MaLR 179 374 0 6 1576 2196 142 26 3 chr2 129902554 129902901 -51845186 + ORR1B2 LTR MaLR 5 359 -8 6 1576 3330 46 28 3 chr2 129905157 129905547 -51842540 - MTB LTR MaLR 0 400 1 7 1576 587 78 0 0 chr2 129906220 129906297 -51841790 + ORR1A3 LTR MaLR 248 324 -2 7 1576 2167 105 13 0 chr2 129917130 129917443 -51830644 + ORR1A4 LTR MaLR 5 321 -8 7 1576 5158 112 47 3 chr2 129917626 129918332 -51829755 + RMER19A LTR ERVK 1 737 0 7 1576 308 70 0 23 chr2 129925429 129925468 -51822619 + MT2B2 LTR ERVL 17 54 -421 7 1576 3872 54 4 2 chr2 129925468 129925967 -51822120 + LTRIS_Mus LTR ERV1 1 500 -87 7 1576 1353 148 59 30 chr2 129925967 129926238 -51821849 + MT2B2 LTR ERVL 179 457 -127 7 1576 2790 92 6 0 chr2 129930252 129930663 -51817424 + MT2B2 LTR ERVL 1 492 -109 7 1576 5263 41 2 3 chr2 129931824 129932412 -51815675 + LTRIS_Mus LTR ERV1 1 587 0 7 1576 320 404 17 6 chr2 129940047 129940219 -51807868 - LTR81A LTR ERV1? -351 999 826 7 1576 272 228 149 138 chr2 129954745 129954933 -51793154 - RMER10A LTR ERVL -235 207 18 8 1576 1517 212 29 50 chr2 129955388 129955766 -51792321 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 8 1576 4495 248 36 64 chr2 129955766 129957331 -51790756 - ORR1D2-int LTR MaLR 0 1509 1 8 1576 1667 245 8 34 chr2 129957345 129957725 -51790362 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 8 1576 365 236 34 11 chr2 129958158 129958269 -51789818 - MTD LTR MaLR -2 377 257 8 1576 905 288 0 17 chr2 129958401 129958631 -51789456 - MTD LTR MaLR -181 238 13 8 1576 4824 114 28 9 chr2 129959096 129959838 -51788249 - RMER6A LTR ERVK 0 756 1 8 1576 3301 124 64 45 chr2 129959838 129960419 -51787668 - RMER6-int LTR ERVK 0 3177 2586 8 1576 457 146 0 24 chr2 129960419 129960503 -51787584 - RMER6B LTR ERVK -379 82 1 8 1576 451 266 108 138 chr2 129964795 129965035 -51783052 - MLT1G3 LTR MaLR -11 584 326 8 1576 3128 55 31 3 chr2 129965795 129966180 -51781907 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 8 1576 655 261 69 30 chr2 129976004 129976237 -51771850 - RLTR42-int LTR ERVK -4128 1394 1153 8 1576 1479 220 107 13 chr2 129982309 129982692 -51765395 - MTD LTR MaLR 0 419 1 8 1576 4780 109 45 4 chr2 129984981 129985691 -51762396 + RMER17A-int LTR ERVK 982 1720 -8 8 1576 4820 91 6 138 chr2 129985700 129986632 -51761455 + RMER17D2 LTR ERVK 1 809 0 8 1576 277 279 162 0 chr2 129986853 129986964 -51761123 - MLT1G1 LTR MaLR -15 564 436 8 1576 619 206 257 15 chr2 129987070 129987272 -51760815 - MLT2B4 LTR ERVL -305 251 1 8 1576 2112 147 103 15 chr2 129989055 129989462 -51758625 - RLTR20A LTR ERVK -97 444 2 8 1576 504 291 79 70 chr2 129991922 129992151 -51755936 - LTR41 LTR ERVL -95 673 443 8 1576 302 264 59 68 chr2 129992268 129992386 -51755701 - LTR41 LTR ERVL -564 204 88 8 1576 868 236 101 93 chr2 129996079 129996499 -51751588 + MT2B LTR ERVL 1 590 -11 8 1576 432 97 0 16 chr2 130008961 130009024 -51739063 + ORR1B1 LTR MaLR 333 394 0 2 1576 275 136 0 13 chr2 130010181 130010240 -51737847 - ORR1D1 LTR MaLR -2 382 326 2 1576 263 259 67 59 chr2 130013252 130013371 -51734716 - ORR1D1 LTR MaLR -231 143 24 2 1576 2621 128 226 18 chr2 130015439 130016010 -51732077 + RMER6C LTR ERVK 1 690 0 2 1576 993 226 63 87 chr2 130018794 130019080 -51729007 + MTD LTR MaLR 1 279 -140 3 1576 3390 48 125 38 chr2 130019148 130019627 -51728460 + RLTR10-int LTR ERVK 5007 5527 -1015 3 1576 4938 96 24 21 chr2 130019632 130020379 -51727708 + RLTR10-int LTR ERVK 1288 1986 -1 3 1576 2989 62 59 0 chr2 130020379 130020767 -51727320 + RLTR10A LTR ERVK 1 411 0 3 1577 1358 233 70 52 chr2 130025963 130026348 -51721739 + MTD LTR MaLR 28 419 0 5 1577 845 130 89 0 chr2 130026803 130026949 -51721138 + MTC LTR MaLR 1 159 -262 5 1577 326 272 9 193 chr2 130027386 130027500 -51720587 - MER34A LTR ERV1 -459 112 1 5 1577 1711 176 65 63 chr2 130030060 130030287 -51717800 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 165 5 1577 1711 176 65 63 chr2 130030472 130030627 -51717460 - ORR1C2 LTR MaLR -220 164 1 5 1577 1621 155 84 36 chr2 130032764 130032972 -51715115 - MTC LTR MaLR 0 419 174 6 1577 1707 161 83 46 chr2 130032972 130033323 -51714764 - ORR1B2 LTR MaLR -3 364 1 6 1577 1621 123 36 39 chr2 130033323 130033493 -51714594 - MTC LTR MaLR -248 173 1 6 1577 1378 180 116 59 chr2 130038069 130038423 -51709664 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 6 1577 553 288 91 45 chr2 130039092 130039401 -51708686 - ORR1E LTR MaLR -33 326 4 7 1577 563 213 75 25 chr2 130042000 130042148 -51705939 - MTC LTR MaLR -262 145 1 7 1577 4674 182 141 45 chr2 130042149 130042665 -51705422 - MTC-int LTR MaLR -1 1257 745 7 1577 4674 182 141 45 chr2 130042837 130043277 -51704810 - MTC-int LTR MaLR -514 744 185 7 1577 4674 182 141 45 chr2 130044434 130044623 -51703464 - MTC-int LTR MaLR -1074 184 1 7 1577 1922 196 79 10 chr2 130044623 130045014 -51703073 - MTC LTR MaLR 0 421 4 7 1577 842 283 84 12 chr2 130046298 130046631 -51701456 - ORR1E LTR MaLR -2 357 1 8 1577 516 293 46 63 chr2 130050244 130050481 -51697606 - RMER12 LTR ERVK 0 1322 1090 9 1577 3866 30 5 0 chr2 130052699 130053133 -51694954 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 1 1577 377 261 8 102 chr2 130053220 130053348 -51694739 + MT2B LTR ERVL 154 269 -332 1 1577 1672 203 30 16 chr2 130058329 130058694 -51689393 - MTE2b LTR MaLR -9 370 1 1 1577 774 217 151 11 chr2 130061912 130062098 -51685989 - RLTR18B LTR ERVK -12 500 289 1 1577 4892 161 86 61 chr2 130062200 130063369 -51684718 - RMER12 LTR ERVK -123 1199 1 1 1577 899 196 51 10 chr2 130063369 130063548 -51684539 - RLTR18B LTR ERVK -226 286 100 1 1577 3154 17 0 0 chr2 130063548 130063894 -51684193 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 1 1577 899 196 51 10 chr2 130063894 130063905 -51684182 - RLTR18B LTR ERVK -413 99 88 1 1577 1657 39 30 17 chr2 130063905 130064130 -51683957 - ORR1A0-int LTR MaLR 0 1792 1554 1 1577 1415 57 0 5 chr2 130064089 130064282 -51683805 + MTB LTR MaLR 209 400 0 1 1577 586 222 0 0 chr2 130064282 130064386 -51683701 - RLTR18B LTR ERVK -408 104 1 1 1577 2722 196 67 2 chr2 130069091 130069628 -51678459 - RMER15 LTR ERVL 0 575 4 1 1577 2642 140 101 32 chr2 130078480 130078974 -51669113 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 1 1 1577 328 237 25 66 chr2 130079316 130079438 -51668649 + MLT1D LTR MaLR 319 435 -70 1 1577 393 106 45 0 chr2 130082039 130082105 -51665982 - LTR16C LTR ERVL -2 487 419 1 1577 371 227 66 16 chr2 130082315 130082436 -51665651 + ORR1E LTR MaLR 8 134 -225 1 1577 781 226 148 0 chr2 130082522 130082739 -51665348 - RMER15 LTR ERVL -91 484 236 1 1577 383 297 19 24 chr2 130083614 130083821 -51664266 - RLTR15 LTR ERVK -21 338 133 1 1577 546 212 74 43 chr2 130083858 130084021 -51664066 - RLTR15 LTR ERVK -191 168 1 1 1577 563 232 129 25 chr2 130084030 130084251 -51663836 - MTD LTR MaLR -14 405 176 1 1577 2466 81 12 0 chr2 130091145 130091468 -51656619 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 1 1577 232 227 27 196 chr2 130092045 130092107 -51655980 - MLT1F1 LTR MaLR 0 548 497 1 1577 232 227 27 196 chr2 130092245 130092322 -51655765 - MLT1F1 LTR MaLR -52 496 434 1 1577 495 298 8 0 chr2 130092754 130092878 -51655209 - MLT1F1 LTR MaLR -195 374 250 1 1577 269 296 77 110 chr2 130094123 130094332 -51653755 - MLT1H LTR MaLR -192 357 156 1 1577 2148 97 0 21 chr2 130094813 130095139 -51652948 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 1 1577 272 303 154 7 chr2 130097951 130098094 -51649993 - MLT1H2 LTR MaLR 0 489 326 2 1577 1536 179 90 20 chr2 130108285 130108628 -51639459 + RMER4B LTR ERVK 17 383 -202 2 1577 516 274 11 58 chr2 130111430 130111575 -51636512 - MTEb LTR MaLR 0 379 236 2 1577 516 274 11 58 chr2 130111598 130111626 -51636461 - MTEb LTR MaLR -144 235 214 2 1577 2326 107 97 9 chr2 130113317 130113530 -51634557 + RLTR14 LTR ERV1 2 226 -156 2 1577 2326 107 97 9 chr2 130113670 130113805 -51634282 + RLTR14 LTR ERV1 227 381 -1 2 1577 3028 161 49 83 chr2 130114894 130115532 -51632555 + RLTR18 LTR ERVK 1 616 0 2 1577 242 284 31 102 chr2 130126892 130126990 -51621097 + LTR16E2 LTR ERVL 80 170 -319 2 1577 248 283 55 100 chr2 130127306 130127416 -51620671 + LTR16E2 LTR ERVL 464 568 0 2 1577 462 322 138 29 chr2 130129851 130130062 -51618025 - MLT1F LTR MaLR -309 239 3 2 1577 686 314 115 22 chr2 130132974 130133296 -51614791 - LTR16A1 LTR ERVL 0 456 105 2 1577 650 163 150 39 chr2 130154242 130154473 -51593614 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 3 197 4558 175 70 17 chr2 130154473 130154844 -51593243 - ORR1D1-int LTR MaLR 0 1370 989 3 1578 4558 175 70 17 chr2 130155024 130155532 -51592555 - ORR1D1-int LTR MaLR -382 988 444 3 1578 1257 173 33 29 chr2 130155569 130155813 -51592274 - ORR1D1 LTR MaLR -129 245 1 3 1578 1135 246 103 9 chr2 130158566 130158906 -51589181 - MTEa LTR MaLR 0 379 8 3 1578 453 309 149 24 chr2 130158993 130159248 -51588839 - RMER15 LTR ERVL 0 575 289 3 1578 450 261 28 42 chr2 130162343 130162487 -51585600 - MLT1D LTR MaLR -272 233 92 3 1578 225 227 104 26 chr2 130162932 130163009 -51585078 - MLT1J LTR MaLR -67 445 363 3 1578 362 338 36 7 chr2 130163094 130163231 -51584856 - MLT1J LTR MaLR -334 178 38 3 1578 992 210 259 19 chr2 130163949 130164265 -51583822 - MTD LTR MaLR -27 392 1 3 1578 2394 156 65 47 chr2 130165673 130166164 -51581923 - RLTR11A LTR ERVK -28 500 1 3 1578 2304 172 5 23 chr2 130168007 130168400 -51579687 + ORR1B1 LTR MaLR 1 386 -8 3 1578 475 32 48 0 chr2 130175796 130175859 -51572228 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 319 3 1578 1249 243 53 13 chr2 130176016 130176320 -51571767 - ORR1D1 LTR MaLR -58 316 1 3 1578 937 169 58 37 chr2 130198328 130198519 -51549568 - MTD LTR MaLR -28 391 197 4 1578 281 296 81 24 chr2 130198619 130198822 -51549265 - LTRIS2 LTR ERV1 -53 511 181 4 1578 644 206 61 8 chr2 130199427 130199559 -51548528 - MTD LTR MaLR -280 139 1 4 1578 406 364 119 11 chr2 130201363 130201624 -51546463 - LTR16A1 LTR ERVL -153 303 15 4 1578 1021 197 74 33 chr2 130201848 130202063 -51546024 - MTD LTR MaLR 0 419 196 4 1578 381 179 40 18 chr2 130202313 130202402 -51545685 - MTD LTR MaLR -188 233 131 4 1578 1906 133 98 12 chr2 130204219 130204545 -51543542 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 41 4 1578 296 286 0 125 chr2 130205269 130205397 -51542690 + MT2B LTR ERVL 143 254 -347 4 1578 374 239 97 9 chr2 130206174 130206288 -51541799 - MLT1B LTR MaLR -215 175 52 4 1578 671 297 78 135 chr2 130208679 130208744 -51539343 - RLTR40 LTR ERVK -252 565 499 4 1578 671 297 78 135 chr2 130208878 130209411 -51538676 - RLTR40 LTR ERVK -319 498 1 4 1578 1485 208 123 0 chr2 130211088 130211256 -51536831 - ORR1D1 LTR MaLR -1 373 182 4 1578 1485 208 123 0 chr2 130211328 130211491 -51536596 - ORR1D1 LTR MaLR -193 181 3 4 1578 507 180 22 11 chr2 130212025 130212115 -51535972 + ORR1E LTR MaLR 4 94 -265 4 1578 250 250 108 90 chr2 130212118 130212285 -51535802 + ORR1E LTR MaLR 204 373 -6 4 1578 268 283 31 124 chr2 130215388 130215517 -51532570 + MLT1N2 LTR MaLR 437 553 -9 4 1578 283 295 101 0 chr2 130217781 130217920 -51530167 - LTR87 LTR ERVL? -23 601 449 4 1578 265 333 73 0 chr2 130218611 130218707 -51529380 - LTR87 LTR ERVL? -479 145 43 4 1578 892 242 150 32 chr2 130224566 130224920 -51523167 - MTD LTR MaLR -14 405 8 4 1578 1858 183 43 3 chr2 130225641 130225986 -51522101 - ORR1B2 LTR MaLR -8 359 1 4 1578 1311 317 47 53 chr2 130227836 130228365 -51519722 - MER77 LTR ERVL -24 583 58 4 1578 483 355 90 58 chr2 130228633 130228998 -51519089 + LTR16A1 LTR ERVL 9 385 -71 4 1578 336 216 29 67 chr2 130239202 130239306 -51508781 + RLTR42-int LTR ERVK 1230 1329 -4193 5 1578 3361 38 8 0 chr2 130254662 130255055 -51493032 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 1578 1306 209 73 7 chr2 130257705 130257980 -51490107 - ORR1D1 LTR MaLR -79 295 3 5 1578 582 299 113 13 chr2 130258066 130258368 -51489719 - ERVL-E-int LTR ERVL -1154 4513 4182 5 1578 228 227 106 0 chr2 130258541 130258607 -51489480 + RMER20A LTR ERVK 164 236 -280 5 1578 293 325 73 84 chr2 130259091 130259269 -51488818 - LTR41B LTR ERVL -580 178 3 5 1578 235 292 31 124 chr2 130259389 130259518 -51488569 + RLTR25A LTR ERVK 521 637 -466 5 1578 291 125 0 0 chr2 130261729 130261793 -51486294 - MT2A LTR ERVL -4 529 466 5 1578 1649 217 198 5 chr2 130261954 130262343 -51485744 - MT2A LTR ERVL -69 464 1 5 1578 457 322 68 14 chr2 130271297 130271445 -51476642 - MLT1G3 LTR MaLR -80 515 360 5 1578 2283 160 88 3 chr2 130272841 130273229 -51474858 - MTC LTR MaLR 0 421 1 5 1578 1662 189 250 19 chr2 130280720 130280781 -51467306 - MT2A LTR ERVL 0 533 463 6 1578 1662 189 250 19 chr2 130280811 130281181 -51466906 - MT2A LTR ERVL -71 462 2 6 1579 2042 189 25 2 chr2 130288292 130288695 -51459392 - MTD LTR MaLR 0 419 8 6 1579 284 297 66 79 chr2 130289940 130290181 -51457906 - MTEa LTR MaLR -134 245 8 6 1579 1441 225 83 5 chr2 130293228 130293603 -51454484 - MTD LTR MaLR -15 404 1 6 1579 1164 222 131 96 chr2 130293633 130294127 -51453960 - RMER5 LTR ERV1 0 534 24 6 1579 753 173 101 0 chr2 130294127 130294295 -51453792 - MTD LTR MaLR 0 419 235 6 1579 1003 308 64 28 chr2 130296295 130296780 -51451307 + MLT1E3 LTR MaLR 82 592 -88 6 1579 405 271 115 48 chr2 130302561 130302813 -51445274 - RMER10A LTR ERVL -156 286 18 6 1579 3084 64 26 0 chr2 130306980 130307370 -51440717 + MTB LTR MaLR 1 400 0 6 1579 552 240 51 23 chr2 130312878 130313053 -51435034 - ERVL-B4-int LTR ERVL -3 5711 5532 7 1579 849 243 97 73 chr2 130318467 130318821 -51429266 - MTE2a LTR MaLR -30 389 20 7 1579 1857 158 123 3 chr2 130318821 130319195 -51428892 - MTD LTR MaLR 0 419 1 7 1579 2319 54 108 0 chr2 130320802 130321097 -51426990 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 7 1579 1206 273 42 42 chr2 130326095 130326474 -51421613 + MTE2b LTR MaLR 1 379 0 7 1579 1200 217 112 0 chr2 130332852 130333129 -51414958 + MTD LTR MaLR 102 409 -10 7 1579 262 284 161 0 chr2 130334802 130334883 -51413204 - MLT1J LTR MaLR -349 163 70 7 1579 861 234 96 96 chr2 130337179 130337316 -51410771 - ORR1E LTR MaLR -5 354 213 7 1579 861 234 96 96 chr2 130337504 130337711 -51410376 - ORR1E LTR MaLR -147 212 10 7 1579 1852 71 130 38 chr2 130338499 130338791 -51409296 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 7 1579 230 328 69 46 chr2 130346407 130346538 -51401549 + RMER15 LTR ERVL 276 409 -166 8 1579 337 298 11 0 chr2 130346572 130346666 -51401421 + RMER15 LTR ERVL 476 570 -5 8 1579 1097 205 85 41 chr2 130349988 130350329 -51397758 - RLTR15 LTR ERVK 0 359 4 8 1579 260 157 81 101 chr2 130350411 130350510 -51397577 - ERVL-E-int LTR ERVL -3478 2189 2093 8 1579 2096 109 150 22 chr2 130354573 130354939 -51393148 - MTC LTR MaLR -8 413 1 8 1579 1454 167 219 13 chr2 130356233 130356396 -51391691 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 191 8 1579 1454 167 219 13 chr2 130356418 130356569 -51391518 - ORR1C2 LTR MaLR -194 190 5 8 1579 1588 138 239 3 chr2 130364511 130364817 -51383270 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 8 1579 1195 193 107 16 chr2 130380147 130380430 -51367657 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 20 8 1579 2414 106 84 40 chr2 130384061 130384464 -51363623 - MTC LTR MaLR 0 421 1 8 1579 3090 42 10 8 chr2 130384644 130385030 -51363057 - MTA_Mm LTR MaLR -9 387 1 8 1579 1364 212 91 55 chr2 130394445 130394864 -51353223 + RLTR20C LTR ERVK 1 434 -100 9 1579 313 323 45 30 chr2 130396499 130396633 -51351454 + MLT1F2 LTR MaLR 1 136 -424 9 1579 232 325 28 91 chr2 130398612 130398647 -51349440 - MT2B2 LTR ERVL -304 280 217 9 1579 232 325 28 91 chr2 130398736 130398788 -51349299 - MT2B2 LTR ERVL -304 216 116 9 1579 362 297 60 66 chr2 130412381 130412547 -51335540 + RMER5 LTR ERV1 15 179 -355 9 1579 371 193 75 54 chr2 130414032 130414125 -51333962 - MT2B LTR ERVL -339 262 168 9 1580 805 82 16 5 chr2 130419534 130419641 -51328446 + ORR1A3 LTR MaLR 1 151 -227 9 1580 1466 88 78 0 chr2 130420217 130420421 -51327666 + ORR1A3 LTR MaLR 94 313 -13 9 1580 262 219 0 131 chr2 130427840 130427924 -51320163 - MT2B LTR ERVL -350 251 179 9 1580 1375 174 61 32 chr2 130430607 130430886 -51317201 + ORR1D1 LTR MaLR 3 289 -85 1 1580 1168 237 41 28 chr2 130430930 130431221 -51316866 - MTD LTR MaLR -57 362 68 1 1580 329 233 0 40 chr2 130431603 130431679 -51316408 - MTD LTR MaLR -348 73 1 1 1580 3291 53 2 2 chr2 130432322 130432718 -51315369 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1580 1078 30 0 0 chr2 130443495 130443629 -51304458 + MERVL-int LTR ERVL 5238 5371 -114 1 1580 360 125 26 53 chr2 130443629 130443705 -51304382 + ORR1A3-int LTR MaLR 567 640 -1323 1 1580 284 233 32 79 chr2 130443714 130443743 -51304344 + ORR1A3-int LTR MaLR 591 613 -1350 1 1580 1840 28 0 0 chr2 130443743 130443958 -51304129 + MT2_Mm LTR ERVL 1 215 -278 1 1580 315 304 8 111 chr2 130443957 130443968 -51304119 - MT2B LTR ERVL -336 265 222 1 1580 315 304 8 111 chr2 130444069 130444083 -51304004 - MT2B LTR ERVL -336 221 153 1 1580 1295 218 91 56 chr2 130452901 130453328 -51294759 - RMER10A LTR ERVL 0 442 1 1 1580 233 300 24 24 chr2 130458947 130459029 -51289058 + LTR81C LTR ERV1? 853 934 -219 1 1580 239 254 0 56 chr2 130472548 130472568 -51275519 + MT2B LTR ERVL 221 240 -361 1 1580 239 254 0 56 chr2 130472597 130472617 -51275470 + MT2B LTR ERVL 241 257 -344 1 1580 1813 94 12 0 chr2 130472696 130472941 -51275146 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 79 1 1580 294 345 94 29 chr2 130472953 130473123 -51274964 + LTR53 LTR ERVL 3 183 -336 1 1580 611 330 16 36 chr2 130473101 130473293 -51274794 + LTR53 LTR ERVL 332 519 0 1 1580 1222 196 178 50 chr2 130476123 130476461 -51271626 + ORR1C2 LTR MaLR 4 384 0 1 1580 396 264 8 91 chr2 130477744 130477865 -51270222 - MT2B LTR ERVL -316 285 175 1 1580 382 196 25 116 chr2 130503908 130504029 -51244058 - MT2B LTR ERVL -344 257 148 1 1580 659 300 116 20 chr2 130508938 130509282 -51238805 + RMER15-int LTR ERVL 4158 4534 -465 2 1580 326 291 0 8 chr2 130514806 130514893 -51233194 + ORR1E LTR MaLR 1 84 -286 3 1580 407 279 43 65 chr2 130528431 130528569 -51219518 - MT2B LTR ERVL -344 257 123 7 1580 332 271 102 71 chr2 130539929 130540155 -51207932 - MT2B LTR ERVL -323 278 46 1 1581 1375 144 219 16 chr2 130555239 130555550 -51192537 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 1 1581 1786 173 126 3 chr2 130563341 130563706 -51184381 + MTD LTR MaLR 10 419 0 1 1581 791 219 186 9 chr2 130565403 130565704 -51182383 + ORR1D2 LTR MaLR 1 421 0 1 1581 326 274 18 64 chr2 130566951 130567060 -51181027 - MT2B LTR ERVL -355 246 143 1 1581 279 280 64 91 chr2 130567369 130567479 -51180608 - MT2B LTR ERVL -361 240 134 1 1581 264 150 0 0 chr2 130568304 130568344 -51179743 - RMER6B LTR ERVK -421 40 1 1 1581 688 293 41 54 chr2 130568835 130569077 -51179010 + MTD LTR MaLR 1 239 -180 1 1581 545 231 107 93 chr2 130569360 130569384 -51178703 + MTE2a LTR MaLR 167 185 -194 1 1581 545 231 107 93 chr2 130569407 130569433 -51178654 + MTE2a LTR MaLR 186 205 -174 1 1581 545 231 107 93 chr2 130569631 130569784 -51178303 + MTE2a LTR MaLR 206 374 -5 1 1581 2103 181 127 35 chr2 130569921 130570409 -51177678 + RMER16 LTR ERVK 1 533 0 2 1581 1980 199 55 171 chr2 130571267 130571958 -51176129 + RMER19C LTR ERVK 1 611 0 2 1581 1004 253 38 45 chr2 130571958 130572474 -51175613 + RLTR11B LTR ERVK 2 498 -30 2 1581 278 259 174 62 chr2 130576385 130576673 -51171414 + RMER10A LTR ERVL 123 442 0 2 1581 1527 193 47 116 chr2 130577360 130577747 -51170340 - RLTR30 LTR ERV1 -8 371 12 2 1581 259 315 75 30 chr2 130582535 130582669 -51165418 + MLT1B LTR MaLR 228 367 -23 2 1581 1932 113 3 129 chr2 130582829 130582883 -51165204 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 289 2 1581 1932 113 3 129 chr2 130583034 130583344 -51164743 - ORR1A2 LTR MaLR -39 288 1 2 1581 448 313 26 91 chr2 130587395 130587627 -51160460 + MLT1F-int LTR MaLR 810 1026 -463 2 1581 249 280 53 0 chr2 130587860 130587935 -51160152 + MLT1F-int LTR MaLR 1037 1115 -374 2 1581 289 256 49 0 chr2 130587971 130588053 -51160034 + MLT1E2-int LTR MaLR 1004 1089 -400 2 1581 235 338 35 63 chr2 130588705 130588847 -51159240 + MLT1E2-int LTR MaLR 1153 1290 -199 2 1581 368 317 212 55 chr2 130589649 130589867 -51158220 + MLT1E2 LTR MaLR 234 536 -144 2 1581 1247 148 80 4 chr2 130593506 130593729 -51154358 + ORR1D2-int LTR MaLR 994 1234 -136 2 1581 731 181 41 7 chr2 130593914 130594059 -51154028 + ORR1D2-int LTR MaLR 1220 1369 -1 2 1581 838 193 335 18 chr2 130594064 130594167 -51153920 + ORR1D2 LTR MaLR 5 111 -259 2 1581 838 193 335 18 chr2 130594207 130594378 -51153709 + ORR1D2 LTR MaLR 112 366 -4 2 1581 1259 213 154 3 chr2 130598393 130598756 -51149331 - MTD LTR MaLR 0 419 2 2 1581 302 286 36 125 chr2 130601698 130601866 -51146221 - MT2B LTR ERVL -344 257 105 3 1581 442 237 110 0 chr2 130607669 130607787 -51140300 + MTE2b LTR MaLR 1 131 -248 3 1581 466 291 0 0 chr2 130607804 130607914 -51140173 + MTE2b LTR MaLR 189 298 -81 3 1581 529 258 91 183 chr2 130608334 130608409 -51139678 + RMER15 LTR ERVL 1 65 -510 3 1581 529 258 91 183 chr2 130608552 130608580 -51139507 + RMER15 LTR ERVL 66 87 -488 3 1581 529 258 91 183 chr2 130608724 130609034 -51139053 + RMER15 LTR ERVL 93 487 -88 3 1581 847 257 167 26 chr2 130611906 130612254 -51135833 + MTD LTR MaLR 2 398 -21 3 1581 2453 126 207 5 chr2 130612698 130613137 -51134950 + RLTR11A LTR ERVK 1 528 0 3 1581 793 313 63 40 chr2 130614725 130615121 -51132966 - MTD LTR MaLR -14 405 1 3 1581 1197 115 10 15 chr2 130616535 130616729 -51131358 + RMER4A LTR ERVK 33 225 -241 3 1581 2053 70 59 29 chr2 130616729 130616995 -51131092 + ORR1A2 LTR MaLR 1 284 -43 3 1581 2053 70 59 29 chr2 130617179 130617219 -51130868 + ORR1A2 LTR MaLR 285 316 -11 3 1581 1238 147 57 36 chr2 130617220 130617467 -51130620 + RMER4A LTR ERVK 215 466 0 3 1581 1125 188 311 0 chr2 130622476 130622761 -51125326 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 3 1581 3077 68 2 10 chr2 130625741 130626140 -51121947 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 1581 347 294 114 67 chr2 130634030 130634285 -51113802 + ORR1E LTR MaLR 73 339 -20 4 1581 372 220 41 107 chr2 130645526 130645648 -51102439 + MT2B LTR ERVL 150 263 -338 4 1581 3071 29 0 0 chr2 130649587 130649933 -51098154 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 4 1581 1928 179 71 18 chr2 130654458 130654850 -51093237 + MTC LTR MaLR 1 413 -8 4 1581 1682 162 16 81 chr2 130656044 130656413 -51091674 + ORR1B1 LTR MaLR 42 386 -8 4 1581 1187 180 187 12 chr2 130656612 130656949 -51091138 - RMER15 LTR ERVL -1 574 179 4 1581 291 108 99 86 chr2 130657572 130657653 -51090434 + ORR1C1 LTR MaLR 2 83 -295 4 1581 980 138 58 0 chr2 130657656 130657830 -51090257 + ORR1C1 LTR MaLR 185 368 -10 4 1581 288 310 103 111 chr2 130657957 130658218 -51089869 + MLT1J LTR MaLR 114 372 -140 4 1581 295 324 165 16 chr2 130660909 130661097 -51086990 - MLT1I LTR MaLR -135 276 61 4 1581 759 216 44 22 chr2 130668258 130668438 -51079649 + MERVL_2A-int LTR ERVL 3906 4089 -1672 5 1581 929 73 32 0 chr2 130668754 130668877 -51079210 + MERVL_2A-int LTR ERVL 4078 4204 -1557 5 1581 2818 178 18 12 chr2 130669453 130669954 -51078133 + MERVL_2A-int LTR ERVL 4232 4735 -1026 5 1581 774 218 19 6 chr2 130669958 130670115 -51077972 + MERVL_2A-int LTR ERVL 4643 4801 -956 5 1581 4365 179 38 55 chr2 130670197 130671115 -51076972 + MERVL_2A-int LTR ERVL 4859 5761 0 5 1581 615 180 23 23 chr2 130671117 130671248 -51076839 + MT2A LTR ERVL 3 133 -400 5 1581 1016 236 76 21 chr2 130671869 130672159 -51075928 - RMER19B LTR ERVK -596 306 1 5 1581 230 191 0 0 chr2 130672169 130672216 -51075871 + MT2A LTR ERVL 487 533 0 5 1581 685 333 8 4 chr2 130673391 130673626 -51074461 - MTE2a LTR MaLR -141 238 3 5 1581 804 221 197 73 chr2 130675013 130675308 -51072779 - MTC LTR MaLR -18 403 74 5 1581 804 219 209 73 chr2 130675445 130675521 -51072566 - MTC LTR MaLR -348 73 1 5 1581 314 233 54 32 chr2 130677721 130677814 -51070273 + ORR1D2 LTR MaLR 274 368 -2 5 1581 879 294 46 105 chr2 130677839 130678250 -51069837 + MTD LTR MaLR 33 419 0 5 1581 261 324 14 22 chr2 130678533 130678672 -51069415 + LTR16A1 LTR ERVL 317 454 -2 5 1582 2925 71 24 29 chr2 130680335 130680525 -51067562 + MTB_Mm LTR MaLR 1 195 -212 5 1582 2925 71 24 29 chr2 130680700 130680915 -51067172 + MTB_Mm LTR MaLR 196 407 0 5 1582 226 309 0 23 chr2 130685015 130685101 -51062986 + MT2A LTR ERVL 350 433 -100 5 1582 3435 35 0 2 chr2 130685159 130685556 -51062531 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 1582 1121 179 62 31 chr2 130690997 130691257 -51056830 + RLTR18-int LTR ERVK 4115 4382 -979 5 1582 1177 225 109 27 chr2 130693222 130693551 -51054536 + RLTR18-int LTR ERVK 4345 4700 -661 5 1582 1004 208 5 19 chr2 130693766 130693972 -51054115 + RLTR18-int LTR ERVK 4673 4875 -486 5 1582 2359 186 23 15 chr2 130694661 130695136 -51052951 + RLTR18-int LTR ERVK 4881 5359 -2 5 1582 341 220 88 0 chr2 130695151 130695242 -51052845 + RLTR18B LTR ERVK 25 123 -389 5 1582 506 273 33 33 chr2 130695259 130695441 -51052646 + RLTR18B LTR ERVK 326 507 -5 5 1582 2504 130 18 25 chr2 130705508 130705956 -51042131 - RLTR11B LTR ERVK -8 445 1 6 1582 269 211 119 76 chr2 130718376 130718397 -51029690 + MLT1F LTR MaLR 98 118 -451 6 1582 1256 216 131 29 chr2 130718397 130718741 -51029346 + MTEa LTR MaLR 1 379 0 6 1582 347 246 370 31 chr2 130718741 130718969 -51029118 + MLT1F LTR MaLR 119 420 -149 6 1582 284 377 45 13 chr2 130723519 130723675 -51024412 - MamGypLTR3 LTR Gypsy -41 798 638 6 1582 864 320 21 3 chr2 130723879 130724167 -51023920 + LTR16B LTR ERVL 158 450 -13 6 1582 1234 191 85 127 chr2 130724597 130724998 -51023089 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 6 1582 1708 201 30 19 chr2 130725907 130726277 -51021810 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 6 1582 285 231 231 33 chr2 130726522 130726643 -51021444 + RLTR18 LTR ERVK 1 145 -471 6 1582 227 73 0 128 chr2 130727228 130727254 -51020833 + ORR1B2 LTR MaLR 1 26 -341 6 1582 2159 153 41 16 chr2 130727254 130727619 -51020468 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 6 1582 227 73 0 128 chr2 130727619 130727639 -51020448 + ORR1B2 LTR MaLR 27 41 -326 6 1582 953 239 68 78 chr2 130727852 130728160 -51019927 + ORR1E LTR MaLR 2 306 -53 6 1582 245 344 54 54 chr2 130729334 130729500 -51018587 - MLT1H1 LTR MaLR -7 572 407 6 1582 321 336 26 58 chr2 130729485 130729640 -51018447 - MLT1H1 LTR MaLR -263 292 143 6 1582 420 212 40 63 chr2 130729684 130729810 -51018277 - MTE2b LTR MaLR -1 378 256 6 1582 350 221 0 55 chr2 130730564 130730655 -51017432 + MT2A LTR ERVL 3 88 -445 6 1582 1271 253 134 12 chr2 130730791 130731135 -51016952 + MT2A LTR ERVL 75 460 -73 6 1582 281 314 40 24 chr2 130731399 130731523 -51016564 - MLT1H1 LTR MaLR -410 150 25 6 1582 332 296 66 7 chr2 130740230 130740366 -51007721 - MLT1C LTR MaLR -67 400 257 6 1582 272 225 133 29 chr2 130740438 130740543 -51007544 - MLT1C LTR MaLR -343 124 9 6 1582 1825 165 92 39 chr2 130743157 130743236 -51004851 + MTD LTR MaLR 1 76 -343 7 1582 1515 208 109 32 chr2 130743236 130743583 -51004504 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 7 1582 1825 165 92 39 chr2 130743583 130743893 -51004194 + MTD LTR MaLR 77 411 -8 7 1582 1017 207 108 20 chr2 130745202 130745523 -51002564 + ORR1D2 LTR MaLR 1 366 -4 7 1582 2312 165 57 53 chr2 130752011 130752536 -50995551 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 527 0 7 1582 1661 213 67 3 chr2 130752895 130753267 -50994820 + MTD LTR MaLR 1 396 -23 7 1582 2651 198 208 61 chr2 130753269 130754208 -50993879 + MTD-int LTR MaLR 24 1100 -158 7 1582 298 306 38 68 chr2 130755628 130755761 -50992326 + MLT2B3 LTR ERVL 209 337 -217 7 1582 271 310 31 19 chr2 130758575 130758736 -50989351 - RLTR15 LTR ERVK -41 318 156 7 1582 320 266 60 54 chr2 130758792 130758959 -50989128 - RLTR15 LTR ERVK -191 168 1 7 1582 227 188 62 0 chr2 130765978 130766026 -50982061 + MLT2B3 LTR ERVL 1 51 -503 7 1582 1034 282 58 7 chr2 130766082 130766392 -50981695 - ORR1D2 LTR MaLR -40 330 5 7 1582 1592 172 53 56 chr2 130774231 130774449 -50973638 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 164 7 1582 1592 172 53 56 chr2 130774474 130774630 -50973457 - ORR1D1 LTR MaLR -211 163 1 7 1582 1172 142 44 9 chr2 130777376 130777603 -50970484 + ORR1C2 LTR MaLR 150 384 0 8 1582 410 306 72 7 chr2 130779820 130779958 -50968129 - MLT1F2 LTR MaLR -405 155 9 8 1582 941 183 55 20 chr2 130782100 130782301 -50965786 - ORR1D1 LTR MaLR -166 208 1 8 1582 417 241 133 9 chr2 130784066 130784179 -50963908 - RLTR25A LTR ERVK 0 1103 977 8 1582 4580 150 167 22 chr2 130784288 130785247 -50962840 + RLTR25A LTR ERVK 5 1102 -1 8 1582 1916 156 71 71 chr2 130799858 130800238 -50947849 - ORR1C2 LTR MaLR -4 380 1 8 1582 2584 208 30 26 chr2 130802789 130803055 -50945032 - RLTR20A LTR ERVK 0 541 271 8 1582 2584 208 30 26 chr2 130803350 130803622 -50944465 - RLTR20A LTR ERVK -271 270 1 8 1583 577 291 188 39 chr2 130812927 130813465 -50934622 - MER76 LTR ERVL -18 673 56 8 1583 1559 133 9 17 chr2 130817813 130818061 -50930026 - ORR1A2 LTR MaLR -32 327 75 8 1583 511 186 29 0 chr2 130820108 130820210 -50927877 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 270 8 1583 2071 132 16 87 chr2 130823863 130824244 -50923843 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 41 9 1583 1928 174 65 14 chr2 130827529 130827885 -50920202 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 9 1583 1635 180 142 9 chr2 130832859 130833189 -50914898 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 9 1583 234 292 0 30 chr2 130836134 130836201 -50911886 - RMER15 LTR ERVL -105 470 406 9 1583 1293 219 155 9 chr2 130836635 130836958 -50911129 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 9 1583 1369 198 158 0 chr2 130840453 130840776 -50907311 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 9 1583 1608 157 165 6 chr2 130841762 130842083 -50906004 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 3 9 1583 268 274 68 45 chr2 130842441 130842529 -50905558 - MTEa LTR MaLR -11 368 279 9 1583 242 298 77 119 chr2 130843712 130843906 -50904181 - MT2A LTR ERVL -293 240 55 9 1583 681 222 69 12 chr2 130843753 130843913 -50904174 - MTEa LTR MaLR -163 216 48 9 1583 421 223 203 33 chr2 130848021 130848169 -50899918 - MTD LTR MaLR -48 371 198 9 1583 251 267 110 37 chr2 130856519 130856628 -50891459 + MLT1J2 LTR MaLR 37 153 -295 1 1583 433 289 63 59 chr2 130856765 130856986 -50891101 - RMER15 LTR ERVL -7 568 347 1 1583 2511 147 71 7 chr2 130858553 130858991 -50889096 + RMER4A LTR ERVK 1 466 0 1 1583 11188 149 49 13 chr2 130859001 130859118 -50888969 + MurERV4-int LTR ERVK 46 188 -5072 1 1583 11188 149 49 13 chr2 130859149 130861046 -50887041 + MurERV4-int LTR ERVK 189 2131 -3129 1 1583 581 137 58 25 chr2 130861031 130861151 -50886936 + MurERV4-int LTR ERVK 5137 5260 0 1 1583 2375 147 28 99 chr2 130861152 130861649 -50886438 + RMER4A LTR ERVK 5 466 0 1 1583 695 288 67 51 chr2 130862236 130862569 -50885518 - RMER15 LTR ERVL -249 326 27 1 1583 301 134 42 69 chr2 130862618 130862690 -50885397 - RMER15 LTR ERVL -503 72 3 1 1583 435 304 149 69 chr2 130869222 130869483 -50878604 + RMER15 LTR ERVL 276 557 -18 1 1583 1119 234 79 122 chr2 130870280 130870762 -50877325 + RLTR12B LTR ERVK 44 504 -24 1 1583 319 125 0 0 chr2 130871871 130871919 -50876168 + RLTR40 LTR ERVK 118 165 -652 1 1583 932 221 52 31 chr2 130872253 130872482 -50875605 + ORR1D2 LTR MaLR 3 236 -134 1 1583 8057 156 61 133 chr2 130873166 130873825 -50874262 - RLTR22_Mur LTR ERVK 0 1848 1322 1 1583 8057 156 61 133 chr2 130873882 130874900 -50873187 - RLTR22_Mur LTR ERVK -527 1321 268 1 1583 8057 156 61 133 chr2 130875072 130875087 -50873000 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1581 267 267 1 1583 8057 156 61 133 chr2 130875235 130875533 -50872554 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1581 267 2 1 1583 259 111 0 0 chr2 130890017 130890053 -50858034 + MT2C_Mm LTR ERVL 200 235 -240 1 1583 1169 247 49 90 chr2 130891852 130892239 -50855848 + MTEb LTR MaLR 9 379 0 1 1583 1327 159 271 16 chr2 130894331 130894478 -50853609 + ORR1C2 LTR MaLR 1 166 -218 1 1583 1327 159 271 16 chr2 130894568 130894726 -50853361 + ORR1C2 LTR MaLR 167 384 0 1 1583 475 297 49 31 chr2 130894925 130895088 -50852999 + MLT1J LTR MaLR 91 256 -256 1 1583 406 249 279 52 chr2 130897581 130897777 -50850310 + MLT1H LTR MaLR 193 449 -100 1 1583 406 249 279 52 chr2 130897968 130898000 -50850087 + MLT1H LTR MaLR 450 473 -76 1 1583 954 192 47 0 chr2 130905595 130905767 -50842320 + MTEa LTR MaLR 3 182 -197 1 1583 236 172 14 86 chr2 130909047 130909117 -50838970 - LTR68 LTR ERV1 -281 459 395 1 1583 239 288 55 46 chr2 130918178 130918287 -50829800 - RLTR25B LTR ERVK -528 500 391 1 1583 289 315 80 112 chr2 130918293 130918579 -50829508 + MLT1H LTR MaLR 77 353 -196 1 1583 272 272 103 37 chr2 130920528 130920635 -50827452 - MLT1J LTR MaLR -128 384 271 1 1583 492 246 152 62 chr2 130920876 130920994 -50827093 - ORR1D1 LTR MaLR -147 227 87 1 1583 492 246 152 62 chr2 130921585 130921644 -50826443 - ORR1D1 LTR MaLR -288 86 34 1 1583 3255 114 21 2 chr2 130929406 130929872 -50818215 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 475 0 1 1583 311 288 163 83 chr2 130934559 130934732 -50813355 + MTD LTR MaLR 2 188 -191 1 1583 2238 170 79 20 chr2 130935524 130935979 -50812108 - RLTR16 LTR ERVK -4 501 20 1 1583 4626 114 131 34 chr2 130935979 130936843 -50811244 + RMER17B LTR ERVK 1 948 -10 1 1584 271 243 85 33 chr2 130945307 130945449 -50802638 + MTD LTR MaLR 196 390 -29 1 1584 3033 182 110 18 chr2 130946431 130946690 -50801397 - RLTR40 LTR ERVK -10 807 543 1 1584 3033 182 110 18 chr2 130946737 130947198 -50800889 - RLTR40 LTR ERVK -275 542 22 1 1584 3274 30 5 0 chr2 130947686 130948080 -50800007 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 1584 329 318 99 20 chr2 130965461 130965612 -50782475 - LTR16A1 LTR ERVL -23 433 271 1 1584 1762 117 47 7 chr2 130988726 130989027 -50759060 + ORR1A1 LTR MaLR 1 313 -33 1 1584 369 109 0 0 chr2 130989164 130989219 -50758868 + ORR1A1 LTR MaLR 272 326 0 1 1584 1078 324 127 6 chr2 130989471 130989959 -50758128 + MLT2F LTR ERVL 1 547 -116 1 1584 333 250 48 0 chr2 130990193 130990277 -50757810 + MLT2F LTR ERVL 527 614 -49 1 1584 2798 142 15 74 chr2 130990561 130991085 -50757002 + RMER19C LTR ERVK 117 609 -2 1 1584 1301 283 43 64 chr2 130991670 130992233 -50755854 - MLT2B4 LTR ERVL -2 554 4 1 1584 1371 207 27 73 chr2 130993042 130993371 -50754716 + ORR1D1 LTR MaLR 48 361 -13 1 1584 449 293 57 0 chr2 130993466 130993604 -50754483 + MLT1F2 LTR MaLR 28 173 -387 1 1584 351 327 57 98 chr2 130993604 130993848 -50754239 - RMER2 LTR ERV1 0 567 334 1 1584 2245 136 152 24 chr2 130994688 130995156 -50752931 + RLTR12B LTR ERVK 1 528 0 1 1584 2013 141 281 0 chr2 130995277 130995732 -50752355 - RMER4B LTR ERVK -2 583 1 1 1584 402 284 153 96 chr2 130995811 130996060 -50752027 + MLT1F2 LTR MaLR 298 560 0 1 1584 1403 170 185 36 chr2 131008950 131009279 -50738808 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 2 1584 1032 201 20 31 chr2 131009440 131009581 -50738506 - MTD LTR MaLR -224 195 55 2 1584 2785 142 40 85 chr2 131009581 131010135 -50737952 - RLTR24 LTR ERV1 0 529 1 2 1584 1032 201 20 31 chr2 131010135 131010177 -50737910 - MTD LTR MaLR -365 54 18 2 1584 1412 170 226 3 chr2 131025614 131025655 -50722432 - RMER15 LTR ERVL 0 575 535 5 1584 2336 122 132 5 chr2 131025655 131026025 -50722062 - MTC LTR MaLR 0 421 5 5 1584 1412 170 226 3 chr2 131026025 131026301 -50721786 - RMER15 LTR ERVL -41 534 188 5 1584 671 119 9 18 chr2 131026559 131026670 -50721417 - RMER15 LTR ERVL -439 136 27 6 1584 1019 271 23 0 chr2 131029204 131029425 -50718662 - MTE2a LTR MaLR -151 228 3 7 1584 258 294 80 27 chr2 131034040 131034152 -50713935 + RMER15 LTR ERVL 453 570 -5 8 1584 307 330 67 34 chr2 131041802 131041921 -50706166 + LTR84b LTR ERVL 311 433 -328 1 1584 391 236 25 124 chr2 131044829 131044929 -50703158 + MT2B LTR ERVL 176 262 -339 1 1584 391 267 60 102 chr2 131044958 131044982 -50703105 + MT2B LTR ERVL 170 228 -373 1 1584 391 267 60 102 chr2 131045056 131045077 -50703010 + MT2B LTR ERVL 229 285 -316 1 1584 361 329 78 13 chr2 131045119 131045273 -50702814 + MLT1H LTR MaLR 33 196 -353 1 1584 1454 196 241 48 chr2 131047370 131047810 -50700277 + RMER15 LTR ERVL 51 575 0 1 1584 230 241 102 57 chr2 131048302 131048390 -50699697 - MT2B2 LTR ERVL -327 257 166 1 1584 407 234 34 59 chr2 131048824 131048942 -50699145 - ORR1E LTR MaLR -194 165 51 1 1584 427 253 82 66 chr2 131051413 131051595 -50696492 + RMER15 LTR ERVL 336 520 -55 1 1584 2285 133 69 36 chr2 131051903 131052293 -50695794 - MTC LTR MaLR -18 403 1 1 1584 3755 50 42 0 chr2 131054449 131054905 -50693182 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 1 1 1584 305 302 56 19 chr2 131055671 131055833 -50692254 - MER52-int LTR ERV1 -5269 1822 1655 1 1584 2639 141 42 9 chr2 131057091 131057542 -50690545 - RMER4A LTR ERVK 0 466 1 1 1584 1736 153 109 35 chr2 131058370 131058708 -50689379 + ORR1B2 LTR MaLR 5 367 0 1 1584 3358 36 5 2 chr2 131067097 131067490 -50680597 - MTA_Mm LTR MaLR -2 394 1 1 1584 256 292 146 0 chr2 131069350 131069446 -50678641 - MLT1H LTR MaLR -305 244 135 1 1584 2002 159 64 28 chr2 131069697 131070058 -50678029 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 1 1585 570 179 21 0 chr2 131076202 131076297 -50671790 + MTE2b LTR MaLR 1 97 -282 1 1585 585 231 6 89 chr2 131076264 131076421 -50671666 + MTE2b LTR MaLR 229 372 -7 1 1585 245 284 13 26 chr2 131076520 131076596 -50671491 + MLT1A0 LTR MaLR 1 75 -290 1 1585 1402 235 110 45 chr2 131077030 131077457 -50670630 + RLTR42-int LTR ERVK 4284 4738 -784 1 1585 256 143 0 0 chr2 131078175 131078217 -50669870 + RLTR42-int LTR ERVK 4734 4775 -747 1 1585 1029 152 172 0 chr2 131078217 131078415 -50669672 + RLTR28 LTR ERVL 1 232 -292 1 1585 316 309 157 32 chr2 131078415 131078696 -50669391 + RLTR9A LTR ERVK 1 316 -52 1 1585 1691 140 30 7 chr2 131078727 131079028 -50669059 + RLTR28 LTR ERVL 217 524 0 1 1585 2361 194 48 36 chr2 131079029 131079591 -50668496 + RLTR42-int LTR ERVK 4772 5340 -182 1 1585 240 254 75 143 chr2 131080202 131080363 -50667724 + RMER15 LTR ERVL 10 159 -416 2 1585 893 229 147 26 chr2 131080369 131080634 -50667453 + RMER15 LTR ERVL 277 573 -2 2 1585 949 180 118 144 chr2 131081505 131081810 -50666277 - ORR1D1 LTR MaLR -59 315 19 2 1585 5290 179 66 47 chr2 131081865 131082007 -50666080 - MTB-int LTR MaLR -99 1159 1022 2 1585 5290 179 66 47 chr2 131082033 131082305 -50665782 - MTB-int LTR MaLR -237 1021 724 2 1585 5290 179 66 47 chr2 131082499 131083219 -50664868 - MTB-int LTR MaLR -535 723 3 2 1585 791 167 31 39 chr2 131083218 131083470 -50664617 - MTB LTR MaLR 0 400 1 2 1585 819 327 87 6 chr2 131083645 131083968 -50664119 + MLT1F LTR MaLR 14 362 -186 2 1585 272 229 28 28 chr2 131093451 131093523 -50654564 - RMER15 LTR ERVL -70 505 434 2 1585 272 330 85 0 chr2 131101531 131101637 -50646450 - RMER5 LTR ERV1 0 534 420 2 1585 374 259 153 35 chr2 131101718 131101862 -50646225 - RMER5 LTR ERV1 -248 286 126 2 1585 2391 117 285 11 chr2 131103244 131103703 -50644384 + RMER4B LTR ERVK 1 585 0 2 1585 229 256 75 32 chr2 131104653 131104746 -50643341 - MT2B2 LTR ERVL -346 238 142 2 1585 1775 159 75 40 chr2 131106586 131106933 -50641154 + ORR1D1 LTR MaLR 1 359 -15 2 1585 809 171 171 0 chr2 131106935 131107099 -50640988 + ORR1D1-int LTR MaLR 1 192 -1178 2 1585 1380 161 98 7 chr2 131107095 131107371 -50640716 + ORR1D1-int LTR MaLR 1070 1370 0 2 1585 2101 138 36 8 chr2 131107372 131107736 -50640351 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 2 1585 373 250 78 61 chr2 131109307 131109422 -50638665 - MT2B LTR ERVL -342 259 143 2 1585 760 239 128 89 chr2 131115169 131115527 -50632560 - MTEa LTR MaLR -7 372 1 3 1585 602 331 145 21 chr2 131116468 131116758 -50631329 - MTE-int LTR MaLR -167 1203 878 3 1585 1827 173 32 15 chr2 131116844 131117244 -50630843 - RMER17C LTR ERVK -3 407 1 3 1585 272 235 72 101 chr2 131118727 131118851 -50629236 - MTEb LTR MaLR -256 123 3 3 1585 1753 175 46 28 chr2 131120925 131121318 -50626769 - MTD LTR MaLR -7 412 13 3 1585 281 296 84 16 chr2 131131090 131131225 -50616862 + MTEb LTR MaLR 231 377 -2 3 1585 290 123 77 64 chr2 131132688 131132766 -50615321 - RLTR25B LTR ERVK -519 509 431 3 1585 1268 137 47 20 chr2 131145345 131145598 -50602489 + RMER6C LTR ERVK 431 690 0 3 1585 317 287 49 10 chr2 131148388 131148490 -50599597 + MLT1A0 LTR MaLR 1 106 -259 3 1585 1178 114 117 19 chr2 131149044 131149258 -50598829 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 140 3 1585 331 190 12 23 chr2 131149384 131149470 -50598617 - ORR1D1 LTR MaLR -249 125 41 3 1585 1765 163 56 155 chr2 131150063 131150275 -50597812 + MTD LTR MaLR 1 211 -208 3 1585 1765 163 56 155 chr2 131150413 131150463 -50597624 + MTD LTR MaLR 212 214 -205 3 1585 1765 163 56 155 chr2 131150668 131150868 -50597219 + MTD LTR MaLR 215 418 -1 3 1585 2112 165 26 36 chr2 131154533 131154948 -50593139 - MTD LTR MaLR -8 411 1 3 1585 328 143 68 54 chr2 131163030 131163104 -50584983 + RMER4A LTR ERVK 3 77 -389 4 1585 466 304 99 6 chr2 131174913 131175095 -50572992 + MTE2b LTR MaLR 177 375 -4 4 1585 567 244 8 0 chr2 131179876 131180007 -50568080 + MTD LTR MaLR 29 160 -259 4 1585 1738 207 48 16 chr2 131180074 131180480 -50567607 + MTD LTR MaLR 1 402 -17 4 1585 2648 153 49 4 chr2 131183603 131184096 -50563991 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 515 -12 4 1585 1036 115 82 0 chr2 131185109 131185291 -50562796 - ORR1A4-int LTR MaLR -8 1955 1759 4 1585 8938 134 71 15 chr2 131185454 131187225 -50560862 - ORR1A4-int LTR MaLR -191 1772 1 4 1585 1966 115 41 77 chr2 131187225 131187563 -50560524 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 4 4 1585 900 247 108 0 chr2 131187960 131188219 -50559868 + ORR1D2 LTR MaLR 84 370 0 4 1585 593 335 39 39 chr2 131189249 131189532 -50558555 - LTR16E1 LTR ERVL -1 537 255 4 1585 1505 213 50 25 chr2 131190519 131190880 -50557207 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 4 1585 999 225 89 67 chr2 131192129 131192519 -50555568 + MT2A LTR ERVL 1 528 -73 4 1585 2297 165 0 37 chr2 131192836 131193157 -50554930 - MTC LTR MaLR -8 413 109 4 1585 2297 165 0 37 chr2 131193300 131193407 -50554680 - MTC LTR MaLR -313 108 2 4 1585 971 251 25 107 chr2 131194640 131194841 -50553246 - MTEa-int LTR MaLR -1043 537 358 4 1585 971 251 25 107 chr2 131195023 131195223 -50552864 - MTEa-int LTR MaLR -1223 357 169 4 1585 828 190 38 0 chr2 131196041 131196199 -50551888 - ORR1D1 LTR MaLR -210 164 1 4 1585 237 289 26 0 chr2 131197936 131198012 -50550075 - MTEa-int LTR MaLR -1477 103 26 4 1585 850 291 145 24 chr2 131198031 131198362 -50549725 - MTEa LTR MaLR -3 376 6 4 1585 589 368 77 4 chr2 131198438 131198697 -50549390 - LTR16A1 LTR ERVL -118 338 61 4 1585 576 278 46 23 chr2 131202064 131202281 -50545806 + RMER15 LTR ERVL 336 557 -18 5 1585 683 222 124 14 chr2 131202789 131202911 -50545176 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 244 5 1585 683 222 124 14 chr2 131202944 131203031 -50545056 - ORR1D1 LTR MaLR -131 243 144 5 1586 3502 20 8 0 chr2 131203976 131204369 -50543718 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 1586 454 229 80 51 chr2 131204460 131204635 -50543452 - MLT1D LTR MaLR -314 191 12 5 1586 1589 174 45 34 chr2 131204802 131205159 -50542928 - ORR1D1 LTR MaLR -8 366 6 5 1586 231 365 66 33 chr2 131208997 131209119 -50538968 - LTR16A1 LTR ERVL -326 130 5 5 1586 770 143 167 0 chr2 131209750 131209918 -50538169 - MTD LTR MaLR 0 419 224 5 1586 4989 46 2 0 chr2 131210155 131210741 -50537346 + LTRIS_Mus LTR ERV1 1 587 0 5 1586 298 363 28 56 chr2 131212712 131212928 -50535159 - MLT1C LTR MaLR -45 422 213 5 1586 582 219 36 0 chr2 131217453 131217590 -50530497 - MLT2D LTR ERVL -266 148 7 5 1586 2144 81 105 0 chr2 131218269 131218565 -50529522 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 5 1586 480 315 58 94 chr2 131220007 131220315 -50527772 + MLT1H LTR MaLR 120 416 -133 5 1586 250 258 87 55 chr2 131222689 131222816 -50525271 - MT2B LTR ERVL -344 257 127 5 1586 1540 178 0 4 chr2 131222861 131223115 -50524972 - MTD LTR MaLR -153 266 14 5 1586 305 292 216 62 chr2 131224465 131224609 -50523478 + RLTR41 LTR ERV1 163 322 -210 5 1586 418 248 91 33 chr2 131224747 131224911 -50523176 + RLTR41 LTR ERV1 300 499 -33 5 1586 646 304 107 19 chr2 131225311 131225573 -50522514 - LTR16E2 LTR ERVL -59 509 225 5 1586 364 210 52 8 chr2 131225607 131225695 -50522392 + MTC LTR MaLR 1 87 -309 5 1586 341 304 219 86 chr2 131226398 131226851 -50521236 - MLT1H LTR MaLR -36 513 1 5 1586 405 295 173 5 chr2 131228870 131229061 -50519026 - LTR33A LTR ERVL -4 516 294 5 1586 240 306 33 76 chr2 131230409 131230501 -50517586 - LTR16C LTR ERVL -106 383 296 5 1586 433 374 87 15 chr2 131232059 131232139 -50515948 + MLT1H LTR MaLR 39 117 -432 5 1586 882 271 74 52 chr2 131232139 131232544 -50515543 - MLT2D LTR ERVL 0 414 1 5 1586 433 374 87 15 chr2 131232544 131232729 -50515358 + MLT1H LTR MaLR 118 323 -226 5 1586 286 274 70 86 chr2 131233523 131233651 -50514436 + MT2B LTR ERVL 134 259 -342 5 1586 541 317 178 11 chr2 131234481 131234762 -50513325 - LTR16A1 LTR ERVL -26 430 103 5 1586 280 345 61 39 chr2 131234951 131235132 -50512955 + LTR88a LTR Gypsy 622 806 -10 5 1586 2930 138 25 84 chr2 131235784 131236346 -50511741 + RLTR24 LTR ERV1 1 529 0 5 1586 2356 132 66 20 chr2 131237324 131237527 -50510560 - MTC LTR MaLR -8 413 212 5 1586 2296 101 28 0 chr2 131237527 131237845 -50510242 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 5 1586 2356 132 66 20 chr2 131237845 131238036 -50510051 - MTC LTR MaLR -210 211 1 5 1586 648 259 145 52 chr2 131239960 131240126 -50507961 - MTEa LTR MaLR 0 379 211 6 1586 648 259 145 52 chr2 131240184 131240266 -50507821 - MTEa LTR MaLR -169 210 110 6 1586 725 259 132 28 chr2 131244857 131245182 -50502905 - ORR1E LTR MaLR 0 359 1 6 1586 3020 94 61 6 chr2 131246183 131246299 -50501788 - RLTR19B LTR ERVK 0 715 587 6 1586 3287 56 5 0 chr2 131246299 131246693 -50501394 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 1586 3020 94 61 6 chr2 131246693 131247049 -50501038 - RLTR19B LTR ERVK -129 586 217 6 1586 251 286 82 164 chr2 131249382 131249675 -50498412 + ORR1E LTR MaLR 91 359 0 6 1586 348 327 56 142 chr2 131249915 131250289 -50497798 - MLT1J LTR MaLR -74 438 97 6 1586 811 250 157 11 chr2 131251291 131251558 -50496529 - MTD LTR MaLR 0 419 114 6 1586 322 284 34 76 chr2 131251766 131251884 -50496203 - MTD LTR MaLR -303 116 4 6 1586 357 280 68 45 chr2 131254870 131255046 -50493041 + MT2A LTR ERVL 338 517 -16 6 1586 3618 93 213 0 chr2 131260627 131261186 -50486901 - RLTR33 LTR ERVK 0 678 1 6 1586 1345 265 62 28 chr2 131261965 131262353 -50485734 - MTD LTR MaLR -14 405 5 6 1586 808 254 122 28 chr2 131262865 131263153 -50484934 + MLT1B LTR MaLR 31 345 -45 6 1586 1181 218 87 15 chr2 131263287 131263552 -50484535 + MTD LTR MaLR 29 312 -107 6 1586 264 192 184 40 chr2 131263580 131263656 -50484431 + MLT1B LTR MaLR 304 390 0 6 1586 600 300 145 45 chr2 131263876 131264208 -50483879 - HERVL74-int LTR ERVL -3888 1797 1433 6 1586 2201 53 29 147 chr2 131264240 131264424 -50483663 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 184 -291 6 1586 2201 53 29 147 chr2 131265126 131265280 -50482807 + MT2C_Mm LTR ERVL 185 284 -191 6 1586 2201 53 29 147 chr2 131265417 131265451 -50482636 + MT2C_Mm LTR ERVL 285 328 -147 6 1586 801 77 29 0 chr2 131265448 131265586 -50482501 + MTC LTR MaLR 190 400 0 6 1586 4851 72 14 3 chr2 131265585 131266331 -50481756 + MTC-int LTR MaLR 1 765 -493 6 1586 1339 122 68 0 chr2 131266370 131266575 -50481512 + MTC LTR MaLR 5 223 -198 6 1586 2135 130 14 46 chr2 131266569 131266908 -50481179 - ORR1B2 LTR MaLR -8 359 29 6 1586 2135 130 14 46 chr2 131266931 131266962 -50481125 - ORR1B2 LTR MaLR -339 28 1 6 1586 403 145 0 0 chr2 131266965 131267027 -50481060 + MTC LTR MaLR 224 285 -136 6 1586 751 226 49 38 chr2 131267028 131267212 -50480875 + RLTR28B LTR ERVL 1 186 -295 6 1586 870 189 14 0 chr2 131267693 131267841 -50480246 + MTC LTR MaLR 272 421 0 6 1586 2550 148 81 2 chr2 131268368 131268823 -50479264 + RLTR28 LTR ERVL 16 506 -18 6 1586 2808 198 72 2 chr2 131268820 131269347 -50478740 - RMER15 LTR ERVL -11 564 1 6 1586 395 278 73 9 chr2 131269693 131269802 -50478285 - LTR52-int LTR ERVL -3159 397 282 6 1586 895 162 133 0 chr2 131271261 131271434 -50476653 + ORR1C2 LTR MaLR 189 384 0 6 1586 2915 146 149 15 chr2 131271500 131272035 -50476052 + RMER19C LTR ERVK 1 607 -4 6 1586 373 310 223 7 chr2 131272394 131272699 -50475388 + MLT1K LTR MaLR 178 548 -47 6 1586 234 283 20 211 chr2 131274075 131274227 -50473860 - RMER15 LTR ERVL -116 459 337 6 1586 1261 163 65 181 chr2 131274313 131274777 -50473310 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 6 1586 347 246 126 5 chr2 131274946 131275116 -50472971 - ORR1D1 LTR MaLR -138 232 22 6 1586 4244 218 134 82 chr2 131275088 131275473 -50472614 - ORR1D1-int LTR MaLR -36 1334 981 6 1586 4244 211 139 90 chr2 131275522 131276036 -50472051 - ORR1D1-int LTR MaLR -390 980 433 6 1586 4244 211 139 90 chr2 131276180 131276287 -50471800 - ORR1D1-int LTR MaLR -938 432 341 6 1586 4244 211 139 90 chr2 131276328 131276628 -50471459 - ORR1D1-int LTR MaLR -1030 340 4 6 1586 398 226 48 0 chr2 131276880 131276974 -50471113 - ORR1D1 LTR MaLR -25 349 249 6 1586 2640 137 45 2 chr2 131280687 131281089 -50466998 + MTC LTR MaLR 3 421 0 6 1586 665 127 206 15 chr2 131281537 131281673 -50466414 + ORR1B1 LTR MaLR 1 162 -232 6 1586 828 257 48 27 chr2 131284306 131284642 -50463445 + RLTR15 LTR ERVK 1 343 -16 7 1586 1825 142 96 52 chr2 131284870 131285013 -50463074 + RLTR23 LTR ERV1 5 173 -257 7 1586 1825 142 96 52 chr2 131285061 131285325 -50462762 + RLTR23 LTR ERV1 174 429 -1 7 1586 403 260 102 45 chr2 131285629 131285786 -50462301 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 265 7 1586 401 276 106 92 chr2 131287491 131287774 -50460313 - MLT1J-int LTR MaLR -51 1336 1050 7 1586 317 151 0 19 chr2 131288521 131288575 -50459512 + MTEb LTR MaLR 1 53 -326 7 1586 384 214 29 0 chr2 131288650 131288720 -50459367 + MTEb LTR MaLR 44 115 -264 7 1586 228 235 103 23 chr2 131288658 131288745 -50459342 + MLT2B4 LTR ERVL 61 154 -402 7 1586 383 291 68 63 chr2 131288737 131288928 -50459159 - MLT1J-int LTR MaLR -179 1208 1017 7 1586 339 125 18 0 chr2 131288930 131288986 -50459101 + MTEb LTR MaLR 121 177 -202 7 1586 374 304 181 19 chr2 131289195 131289350 -50458737 + MTEb LTR MaLR 162 317 -42 7 1586 2287 110 19 3 chr2 131289915 131290234 -50457853 - ORR1A2 LTR MaLR -3 324 1 7 1586 498 252 89 19 chr2 131292021 131292176 -50455911 + RLTR20B3 LTR ERVK 3 202 -375 7 1586 825 154 26 24 chr2 131292425 131292592 -50455495 + ORR1C2 LTR MaLR 1 141 -243 7 1586 1100 170 35 26 chr2 131292802 131293034 -50455053 + ORR1C2 LTR MaLR 115 384 0 7 1586 2199 111 7 0 chr2 131294893 131295200 -50452887 - ORR1A2 LTR MaLR -16 311 3 7 1586 1309 218 61 143 chr2 131295628 131296238 -50451849 - RLTR19-int LTR ERVK -1763 4374 3815 7 1586 445 261 25 42 chr2 131297066 131297186 -50450901 + MTD LTR MaLR 9 126 -293 7 1586 428 292 0 28 chr2 131297744 131297851 -50450236 + MTD LTR MaLR 105 208 -211 7 1586 598 177 132 9 chr2 131298250 131298364 -50449723 + MTD LTR MaLR 278 405 -14 7 1586 1638 151 11 14 chr2 131298834 131299116 -50448971 + RMER10A LTR ERVL 6 286 -156 7 1586 1332 153 18 83 chr2 131299115 131299392 -50448695 - RLTR14 LTR ERV1 -123 259 1 7 1586 493 314 84 93 chr2 131299435 131299779 -50448308 + LTR16A1 LTR ERVL 1 341 -115 7 1586 3538 18 5 0 chr2 131301966 131302360 -50445727 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 7 1586 2148 150 102 0 chr2 131304865 131305238 -50442849 - MTC LTR MaLR -8 413 3 7 1586 290 233 62 143 chr2 131306065 131306137 -50441950 - MTEb LTR MaLR -13 366 294 7 1586 290 255 46 127 chr2 131306280 131306372 -50441715 - MTEb LTR MaLR -74 296 212 7 1586 1707 206 100 5 chr2 131308775 131309146 -50438941 + MTD LTR MaLR 1 406 -13 7 1586 247 287 81 0 chr2 131312299 131312386 -50435701 + MLT1C LTR MaLR 16 109 -281 7 1586 666 351 38 0 chr2 131312730 131312969 -50435118 + MLT1C LTR MaLR 213 460 -7 7 1586 394 332 95 29 chr2 131313027 131313246 -50434841 + MLT1H2 LTR MaLR 7 280 -269 7 1586 396 281 115 0 chr2 131313265 131313414 -50434673 + MLT1H2 LTR MaLR 356 544 -11 7 1586 365 371 62 58 chr2 131313439 131313714 -50434373 - MLT1N2 LTR MaLR -254 308 33 7 1586 269 253 0 36 chr2 131313869 131313956 -50434131 + MT2A LTR ERVL 1 77 -524 7 1586 2346 165 96 2 chr2 131313961 131314380 -50433707 + RLTR20D LTR ERVK 2 461 -107 7 1586 2346 165 96 2 chr2 131314436 131314453 -50433634 + RLTR20D LTR ERVK 462 478 -90 7 1586 635 246 57 42 chr2 131330048 131330263 -50417824 - MLT1F1 LTR MaLR -2 622 385 8 1586 512 272 73 0 chr2 131330266 131330402 -50417685 - MLT1F1 LTR MaLR -381 167 22 8 1586 1364 210 123 54 chr2 131330749 131331122 -50416965 - MTD LTR MaLR -3 416 18 8 1587 1783 177 82 13 chr2 131340591 131340969 -50407118 + MTD LTR MaLR 13 416 -3 8 1587 564 338 57 10 chr2 131340969 131341164 -50406923 - MLT1H LTR MaLR -342 207 3 8 1587 277 373 0 29 chr2 131349280 131349385 -50398702 - MLT1J LTR MaLR -346 166 65 8 1587 886 237 38 29 chr2 131352625 131352864 -50395223 - ORR1D2 LTR MaLR -1 369 129 8 1587 605 233 68 0 chr2 131353060 131353193 -50394894 - ORR1D2 LTR MaLR -228 142 1 8 1587 233 349 103 9 chr2 131353849 131353956 -50394131 - ORR1E LTR MaLR -221 138 22 8 1587 1145 186 124 25 chr2 131356298 131356612 -50391475 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 26 8 1587 1644 170 104 0 chr2 131356615 131356932 -50391155 + RLTR30 LTR ERV1 7 356 -23 8 1587 587 184 335 0 chr2 131357042 131357194 -50390893 - RLTR30 LTR ERV1 0 379 177 8 1587 249 312 26 13 chr2 131357213 131357291 -50390796 - MTE2b LTR MaLR -14 365 287 8 1587 399 159 0 0 chr2 131357929 131357998 -50390089 - MTE2a LTR MaLR 0 379 311 8 1587 352 306 55 55 chr2 131357997 131358125 -50389962 - MTE2a LTR MaLR -241 138 11 8 1587 896 262 138 35 chr2 131358293 131358633 -50389454 - MTE2a-int LTR MaLR -9 1571 1197 8 1587 309 255 170 18 chr2 131358908 131359020 -50389067 - MTE2b LTR MaLR -243 136 8 8 1587 1526 152 66 14 chr2 131359753 131360039 -50388048 - RMER5 LTR ERV1 0 534 234 8 1587 846 282 96 41 chr2 131363771 131364137 -50383950 + MLT1B LTR MaLR 2 387 -3 8 1587 313 200 89 65 chr2 131364988 131365111 -50382976 + MLT1I LTR MaLR 1 126 -285 8 1587 280 210 15 61 chr2 131374509 131374575 -50373512 - LTR16C LTR ERVL 0 489 427 8 1587 265 279 169 59 chr2 131374664 131374900 -50373187 - LTR16C LTR ERVL -227 262 1 8 1587 490 233 52 22 chr2 131375322 131375458 -50372629 + MLT1A1 LTR MaLR 268 407 -1 8 1587 366 297 182 6 chr2 131378900 131379076 -50369011 + MLT1D LTR MaLR 297 503 -2 8 1587 690 144 0 7 chr2 131392007 131392155 -50355932 - ORR1B1 LTR MaLR -105 289 98 8 1587 249 135 0 71 chr2 131392282 131392338 -50355749 - ORR1B1 LTR MaLR -184 145 94 8 1587 229 154 0 71 chr2 131392338 131392394 -50355693 - ORR1A4 LTR MaLR -184 145 94 8 1587 229 154 0 71 chr2 131392422 131392478 -50355609 - ORR1A4 LTR MaLR -184 145 94 8 1587 229 154 0 71 chr2 131392506 131392562 -50355525 - ORR1A4 LTR MaLR -184 145 94 8 1587 242 154 0 71 chr2 131392562 131392618 -50355469 - ORR1A4 LTR MaLR -184 145 94 8 1587 795 150 6 40 chr2 131392618 131392792 -50355295 - ORR1B1 LTR MaLR -186 208 41 8 1587 2027 158 12 3 chr2 131395694 131396018 -50352069 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 9 1587 241 282 52 22 chr2 131396668 131396802 -50351285 - RMER15 LTR ERVL -59 516 379 9 1587 2493 68 3 58 chr2 131397953 131398299 -50349788 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 9 1587 2565 159 10 5 chr2 131402164 131402575 -50345512 + MTD LTR MaLR 5 417 -2 9 1587 3368 40 10 0 chr2 131405385 131405781 -50342306 + MTB LTR MaLR 1 400 0 9 1587 552 309 103 38 chr2 131407744 131408192 -50339895 + RLTR12B LTR ERVK 8 484 -44 9 1587 844 147 6 77 chr2 131409058 131409227 -50338860 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 211 9 1587 2195 114 25 30 chr2 131409227 131409588 -50338499 - RLTR15 LTR ERVK 0 359 1 9 1587 4492 198 73 28 chr2 131409595 131410703 -50337384 - MYSERV-int LTR ERVK -8 6542 5385 9 1587 298 301 94 25 chr2 131410836 131410996 -50337091 - RMER4A LTR ERVK -30 436 266 9 1587 2348 246 96 53 chr2 131410996 131411143 -50336944 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -1444 882 742 9 1587 2348 257 94 53 chr2 131411561 131412382 -50335705 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -1585 741 2 9 1587 1298 236 30 54 chr2 131412829 131413246 -50334841 - RMER19C LTR ERVK 0 611 153 9 1587 1087 192 27 107 chr2 131413254 131413552 -50334535 - RMER19C LTR ERVK -332 279 6 9 1587 609 200 7 58 chr2 131413653 131413791 -50334296 - MYSERV-int LTR ERVK -511 4850 4720 9 1587 796 144 33 46 chr2 131413784 131413937 -50334150 - MYSERV6-int LTR ERVK -2232 6727 6577 9 1587 1707 136 17 87 chr2 131413975 131414330 -50333757 - RLTR15 LTR ERVK -29 330 1 9 1587 1233 127 48 10 chr2 131414331 131414538 -50333549 - ORR1B2 LTR MaLR -152 215 1 9 1587 523 144 22 0 chr2 131416631 131416721 -50331366 - MTC LTR MaLR -329 92 1 9 1587 991 158 9 94 chr2 131417649 131417873 -50330214 + MTC LTR MaLR 7 211 -210 9 1587 277 267 0 0 chr2 131419781 131419841 -50328246 - LTR16C LTR ERVL -6 483 424 9 1587 410 292 92 0 chr2 131419965 131420160 -50327927 - LTR16C LTR ERVL -127 362 150 9 1587 558 172 0 10 chr2 131421658 131421758 -50326329 + MTC LTR MaLR 1 99 -322 9 1587 964 98 0 14 chr2 131421768 131421913 -50326174 + MTC LTR MaLR 270 412 -9 9 1587 1107 217 127 30 chr2 131423353 131423706 -50324381 - MTD LTR MaLR -14 405 1 9 1587 1834 169 45 19 chr2 131424604 131424978 -50323109 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 9 1587 1972 155 33 11 chr2 131427070 131427435 -50320652 + ORR1C1 LTR MaLR 1 373 -5 9 1587 1884 135 106 56 chr2 131428957 131429317 -50318770 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 9 1587 257 275 21 21 chr2 131430136 131430229 -50317858 - MTEa LTR MaLR 0 379 287 9 1587 255 266 0 30 chr2 131431070 131431136 -50316951 + MLT1J LTR MaLR 110 173 -339 9 1587 1812 178 36 3 chr2 131431741 131431761 -50316326 - ORR1D1 LTR MaLR -1 373 354 9 1587 3447 28 5 0 chr2 131431761 131432155 -50315932 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 9 1587 1812 178 36 3 chr2 131432155 131432495 -50315592 - ORR1D1 LTR MaLR -21 353 2 9 1587 2416 155 2 17 chr2 131438253 131438540 -50309547 - MTC LTR MaLR -8 413 130 9 1587 3175 61 0 20 chr2 131438540 131438944 -50309143 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 9 1587 2416 155 2 17 chr2 131438944 131439075 -50309012 - MTC LTR MaLR -292 129 1 9 1587 1182 231 82 0 chr2 131442992 131443274 -50304813 + MTD LTR MaLR 107 411 -8 9 1587 461 228 63 24 chr2 131444667 131444793 -50303294 + RMER15 LTR ERVL 1 131 -444 9 1587 492 289 73 15 chr2 131444997 131445271 -50302816 + RMER15 LTR ERVL 286 575 0 9 1587 705 275 36 32 chr2 131451173 131451421 -50296666 + MLT1D LTR MaLR 252 500 -5 1 1587 328 312 114 67 chr2 131451762 131452061 -50296026 + ORR1E LTR MaLR 1 313 -46 1 1587 1032 290 27 7 chr2 131454112 131454404 -50293683 + ORR1D2 LTR MaLR 1 298 -72 1 1587 281 370 68 29 chr2 131454876 131455035 -50293052 + MamGypLTR3 LTR Gypsy 580 746 -93 1 1587 281 370 68 29 chr2 131455257 131455303 -50292784 + MamGypLTR3 LTR Gypsy 747 792 -47 1 1587 409 337 98 38 chr2 131460234 131460521 -50287566 + LTR16C LTR ERVL 178 481 -8 1 1587 739 228 195 121 chr2 131460744 131461123 -50286964 + MLT1A1 LTR MaLR 1 407 -1 1 1588 559 338 115 16 chr2 131465752 131466116 -50281971 - LTR16C LTR ERVL -4 485 86 1 1588 908 254 188 10 chr2 131466702 131467016 -50281071 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 1 1588 329 226 75 0 chr2 131469171 131469264 -50278823 - RMER15 LTR ERVL -105 470 371 1 1588 2464 98 58 13 chr2 131471223 131471616 -50276471 - IAPLTR2a LTR ERVK 0 411 1 1 1588 5812 65 12 9 chr2 131471616 131472360 -50275727 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 5736 1 1588 2220 75 0 0 chr2 131472359 131472637 -50275450 - IAPEz-int LTR ERVK -4845 1636 1359 1 1588 3502 84 25 39 chr2 131472637 131473287 -50274800 - IAPEz-int LTR ERVK -5819 662 168 1 1588 236 244 0 0 chr2 131473287 131473332 -50274755 - RLTR27 LTR ERVK -34 275 231 1 1588 1185 144 33 105 chr2 131473334 131473635 -50274452 - IAPEz-int LTR ERVK -7323 258 9 1 1588 2449 101 58 13 chr2 131473636 131474029 -50274058 - IAPLTR2a LTR ERVK 0 411 1 1 1588 1617 187 96 34 chr2 131474355 131474710 -50273377 + ORR1C1 LTR MaLR 1 377 -1 1 1588 420 315 109 24 chr2 131478320 131478567 -50269520 + LTR16E1 LTR ERVL 246 513 -25 1 1588 655 317 99 33 chr2 131478730 131479092 -50268995 + MLT1C LTR MaLR 35 420 -47 1 1588 509 249 148 90 chr2 131488170 131488426 -50259661 - MLT2D LTR ERVL -38 376 106 1 1588 295 212 11 34 chr2 131489500 131489588 -50258499 - MTEb LTR MaLR 0 379 294 1 1588 1743 110 34 61 chr2 131491397 131491681 -50256406 + ORR1A2 LTR MaLR 1 277 -50 1 1588 1743 110 34 61 chr2 131491740 131491783 -50256304 + ORR1A2 LTR MaLR 278 319 -8 1 1588 1924 168 82 6 chr2 131495091 131495457 -50252630 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 1 1588 910 253 43 103 chr2 131497636 131498033 -50250054 - MTE2a LTR MaLR -4 375 3 1 1588 310 261 88 92 chr2 131499456 131499705 -50248382 + RLTR18B LTR ERVK 25 272 -240 1 1588 3145 58 18 2 chr2 131502018 131502412 -50245675 + MTB LTR MaLR 1 400 0 4 1588 343 267 116 22 chr2 131502860 131502998 -50245089 - MLT1A0 LTR MaLR -10 355 205 5 1588 1808 142 46 102 chr2 131502999 131503390 -50244697 + ORR1C1 LTR MaLR 2 370 -8 6 1588 681 255 29 58 chr2 131504271 131504479 -50243608 + MER74C LTR ERVL 160 361 -99 1 1588 279 259 99 0 chr2 131504531 131504612 -50243475 + MER74C LTR ERVL 364 452 -8 1 1588 1093 249 110 62 chr2 131504676 131505129 -50242958 - RMER5 LTR ERV1 -11 523 49 1 1588 263 239 14 40 chr2 131508248 131508322 -50239765 + MER52-int LTR ERV1 5038 5109 -1982 1 1588 1338 275 73 13 chr2 131509361 131509811 -50238276 - RMER5 LTR ERV1 -19 515 39 1 1588 294 331 42 74 chr2 131510687 131510913 -50237174 - MLT1L LTR MaLR -225 385 100 2 1588 496 252 127 47 chr2 131518948 131519160 -50228927 - ORR1E LTR MaLR -130 229 1 4 1588 2891 148 34 2 chr2 131520097 131520597 -50227490 + RMER20A LTR ERVK 1 516 0 4 1588 233 314 28 28 chr2 131527770 131527878 -50220209 + MLT1B LTR MaLR 276 383 -7 5 1588 2041 114 7 0 chr2 131528313 131528620 -50219467 - ORR1A2 LTR MaLR -18 309 1 5 1588 486 319 36 70 chr2 131528655 131528901 -50219186 + MTD LTR MaLR 15 277 -142 5 1588 597 299 99 15 chr2 131530701 131530973 -50217114 - MLT1A1 LTR MaLR -81 327 33 5 1588 322 285 155 52 chr2 131531841 131532015 -50216072 + MLT1A1 LTR MaLR 16 207 -201 5 1588 315 287 112 9 chr2 131532028 131532144 -50215943 + MLT1A1 LTR MaLR 268 395 -13 5 1588 1984 151 70 51 chr2 131534134 131534505 -50213582 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 6 1588 1942 147 21 75 chr2 131535042 131535416 -50212671 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 41 6 1588 1049 182 67 15 chr2 131535423 131535691 -50212396 - ORR1B1-int LTR MaLR 0 1963 1682 6 1588 3415 162 57 93 chr2 131535678 131536244 -50211843 - ORR1B1-int LTR MaLR -1105 858 352 6 1588 3415 162 57 93 chr2 131536270 131536593 -50211494 - ORR1B1-int LTR MaLR -1612 351 2 6 1588 1933 110 68 3 chr2 131536593 131536902 -50211185 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 66 6 1588 556 226 43 14 chr2 131540589 131540728 -50207359 - MTD LTR MaLR -264 155 13 6 1588 2239 160 11 0 chr2 131543676 131544044 -50204043 - ORR1D1 LTR MaLR -2 372 1 7 1588 249 152 0 0 chr2 131544408 131544454 -50203633 + MTEa LTR MaLR 334 379 0 7 1588 2140 141 33 6 chr2 131544610 131544974 -50203113 - ORR1C1 LTR MaLR -4 374 1 7 1588 1270 190 96 3 chr2 131546653 131546965 -50201122 - ORR1D1 LTR MaLR -33 341 1 7 1588 255 363 74 0 chr2 131547675 131547865 -50200222 + LTR16C LTR ERVL 255 458 -31 7 1588 1171 265 15 34 chr2 131549611 131549939 -50198148 - MTE-int LTR MaLR -1147 433 112 7 1588 384 293 53 18 chr2 131550320 131550490 -50197597 + RMER15 LTR ERVL 400 575 0 8 1588 530 138 131 17 chr2 131550519 131550649 -50197438 - MTD LTR MaLR -14 405 240 8 1588 389 244 33 25 chr2 131550637 131550759 -50197328 - MTE2a-int LTR MaLR -1135 123 1 8 1588 373 297 26 134 chr2 131550759 131551065 -50197022 - MTE2a LTR MaLR 0 379 102 8 1588 259 125 0 0 chr2 131551234 131551274 -50196813 - MTE2a LTR MaLR -339 40 1 8 1588 1367 233 36 44 chr2 131551457 131551821 -50196266 + MTE2a LTR MaLR 19 379 0 8 1588 3949 123 82 1 chr2 131553191 131553872 -50194215 - RMER17B LTR ERVK -222 736 1 8 1588 1204 191 8 17 chr2 131553872 131554111 -50193976 + MTC LTR MaLR 185 421 0 9 1588 491 301 49 0 chr2 131554743 131554926 -50193161 + MLT1J1 LTR MaLR 6 197 -247 9 1588 731 247 185 14 chr2 131556541 131556833 -50191254 - MLT1A0 LTR MaLR -3 362 21 9 1588 349 231 13 0 chr2 131557798 131557876 -50190211 - LTR37B LTR ERV1 -382 86 8 9 1588 645 251 112 72 chr2 131563245 131563550 -50184537 + RMER13A LTR ERVK 95 411 -449 1 1588 268 363 67 56 chr2 131564119 131564297 -50183790 - MER21B LTR ERV1 -194 669 490 1 1588 333 211 238 24 chr2 131564568 131564694 -50183393 + RMER15 LTR ERVL 371 523 -52 1 1588 2505 83 9 0 chr2 131564956 131565280 -50182807 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 1 1588 678 312 80 51 chr2 131576715 131577127 -50170960 - MER77 LTR ERVL -9 598 175 1 1588 915 231 62 76 chr2 131578028 131578304 -50169783 + ORR1D2 LTR MaLR 3 274 -96 1 1588 339 311 114 5 chr2 131578427 131578611 -50169476 + LTR33C LTR ERVL 425 628 -1 1 1588 2266 153 15 0 chr2 131579735 131580126 -50167961 + MTC LTR MaLR 25 421 0 1 1588 1543 203 70 18 chr2 131580126 131580273 -50167814 + ORR1D1 LTR MaLR 20 176 -198 1 1588 1543 203 70 18 chr2 131580349 131580535 -50167552 + ORR1D1 LTR MaLR 177 371 -3 1 1588 289 337 86 37 chr2 131580563 131580831 -50167256 - MER21B LTR ERV1 -126 737 457 1 1588 268 316 48 41 chr2 131580892 131581037 -50167050 - MER21B LTR ERV1 -513 350 205 1 1588 484 322 96 57 chr2 131581042 131581241 -50166846 - ORR1E LTR MaLR -10 349 137 1 1588 2955 75 40 2 chr2 131581241 131581645 -50166442 + BGLII LTR ERVK 3 421 0 1 1588 484 322 96 57 chr2 131581645 131581778 -50166309 - ORR1E LTR MaLR -223 136 4 1 1588 368 293 47 20 chr2 131585877 131586027 -50162060 - BGLII_B LTR ERVK -27 414 261 1 1588 612 282 71 125 chr2 131585995 131586139 -50161948 - RLTR11B LTR ERVK -195 333 205 1 1588 612 290 37 57 chr2 131586205 131586412 -50161675 - RLTR11B LTR ERVK -249 204 1 1 1588 577 229 105 12 chr2 131591578 131591826 -50156261 + MTEb LTR MaLR 9 340 -39 1 1588 841 172 35 0 chr2 131594206 131594375 -50153712 + MTD LTR MaLR 245 419 0 1 1589 388 228 128 35 chr2 131598280 131598421 -50149666 - MTC LTR MaLR 0 421 268 1 1589 418 311 33 13 chr2 131602214 131602367 -50145720 - RMER15 LTR ERVL -14 561 406 1 1589 226 177 47 31 chr2 131602586 131602650 -50145437 - RMER15 LTR ERVL -500 75 11 1 1589 1577 123 12 0 chr2 131603574 131603825 -50144262 + MTC LTR MaLR 1 254 -167 1 1589 549 210 8 8 chr2 131604637 131604762 -50143325 + ORR1C1 LTR MaLR 6 130 -248 1 1589 719 178 1 76 chr2 131604741 131604952 -50143135 - ORR1B2 LTR MaLR -136 234 52 1 1589 512 188 0 50 chr2 131604968 131605021 -50143066 - MT2A LTR ERVL -412 121 73 1 1589 4283 42 0 16 chr2 131605021 131605532 -50142555 - RLTR1C LTR ERV1 0 503 1 1 1589 512 188 0 50 chr2 131605532 131605579 -50142508 - MT2A LTR ERVL -461 72 26 1 1589 1734 227 39 93 chr2 131605899 131606284 -50141803 + RMER19B LTR ERVK 347 703 -199 1 1589 1734 227 39 93 chr2 131606459 131606661 -50141426 + RMER19B LTR ERVK 704 902 0 1 1589 1910 173 57 32 chr2 131606812 131607219 -50140868 - RLTR41 LTR ERV1 -29 417 1 1 1589 286 286 59 22 chr2 131607236 131607372 -50140715 - MLT1H LTR MaLR -37 512 372 1 1589 2760 88 44 5 chr2 131612396 131612784 -50135303 + RLTR9D LTR ERVK 1 403 0 2 1589 2637 177 84 114 chr2 131621995 131622913 -50125174 - RLTR13D6 LTR ERVK -12 890 1 2 1589 1206 186 110 0 chr2 131624226 131624463 -50123624 - MTC LTR MaLR 0 421 159 2 1589 274 315 35 18 chr2 131626168 131626281 -50121806 + LTR78 LTR ERV1 243 357 -947 2 1589 1215 128 38 5 chr2 131626551 131626763 -50121324 - ORR1B2 LTR MaLR -2 365 147 2 1589 243 371 60 86 chr2 131629188 131629536 -50118551 - MLT1F2 LTR MaLR -212 348 10 2 1589 329 263 51 34 chr2 131630399 131630517 -50117570 + RMER13A LTR ERVK 1 120 -740 2 1589 233 205 112 25 chr2 131630546 131630626 -50117461 + RMER13A LTR ERVK 432 518 -390 2 1589 375 157 72 0 chr2 131631211 131631294 -50116793 - ORR1B2 LTR MaLR -278 89 1 2 1589 746 269 32 16 chr2 131637307 131637556 -50110531 + MLT1A0 LTR MaLR 106 358 -7 2 1589 757 286 98 32 chr2 131639041 131639388 -50108699 - MLT2B4 LTR ERVL -186 370 1 2 1589 289 232 14 0 chr2 131641865 131641934 -50106153 + MTD LTR MaLR 55 124 -295 2 1589 3079 29 0 0 chr2 131644563 131644909 -50103178 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 2 1589 4211 60 48 7 chr2 131656530 131657068 -50091019 - LTRIS2 LTR ERV1 0 564 5 2 1589 786 205 102 5 chr2 131658469 131658665 -50089422 - MTD LTR MaLR -8 411 197 2 1589 834 241 69 58 chr2 131659155 131659432 -50088655 - MTD LTR MaLR -138 281 2 2 1589 670 201 42 24 chr2 131659963 131660126 -50087961 - MTD LTR MaLR -31 388 220 2 1589 2266 158 83 39 chr2 131660126 131660620 -50087467 + RMER20A LTR ERVK 1 516 0 2 1589 886 241 93 20 chr2 131660620 131660741 -50087346 - MTD LTR MaLR -168 251 132 2 1589 886 241 93 20 chr2 131660784 131660888 -50087199 - MTD LTR MaLR -288 131 9 2 1589 1769 191 11 29 chr2 131663042 131663419 -50084668 + ORR1D1 LTR MaLR 5 374 0 2 1589 374 304 88 0 chr2 131664257 131664405 -50083682 - MER21B LTR ERV1 -47 816 656 2 1589 508 316 109 5 chr2 131666352 131666562 -50081525 - MER21B LTR ERV1 -204 659 428 2 1589 614 336 78 16 chr2 131666875 131667132 -50080955 - MER21B LTR ERV1 -493 370 98 2 1589 2164 130 24 99 chr2 131668168 131668594 -50079493 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 2 1589 1951 181 16 32 chr2 131668700 131669077 -50079010 + ORR1D1 LTR MaLR 1 371 -3 2 1589 931 266 34 13 chr2 131669494 131669730 -50078357 - RMER5 LTR ERV1 -10 524 284 2 1589 251 160 20 20 chr2 131671562 131671613 -50076474 + RLTR42-int LTR ERVK 1275 1325 -4197 2 1589 1234 157 120 133 chr2 131673772 131674147 -50073940 + ORR1D1 LTR MaLR 5 374 0 2 1589 312 320 57 34 chr2 131682179 131682354 -50065733 - RLTR19-int LTR ERVK -1581 4556 4378 3 1589 278 322 35 9 chr2 131682255 131682371 -50065716 - MuRRS4-int LTR ERV1 -1996 5610 5492 3 1589 368 281 41 8 chr2 131682489 131682611 -50065476 - MuRRS4-int LTR ERV1 -2402 5376 5251 3 1589 470 303 28 11 chr2 131682820 131682997 -50065090 - MuRRS4-int LTR ERV1 -2512 5266 5087 3 1589 533 284 78 107 chr2 131683027 131683449 -50064638 - MuRRS4-int LTR ERV1 -5257 2521 2112 3 1589 611 316 66 72 chr2 131683616 131684188 -50063899 - MuRRS4-int LTR ERV1 -3444 1619 1051 3 1589 688 258 46 41 chr2 131685986 131686204 -50061883 + MER92B LTR ERV1 6 224 -412 3 1589 2438 143 55 5 chr2 131689604 131690005 -50058082 + MTC LTR MaLR 1 421 0 3 1589 901 234 47 30 chr2 131691119 131691454 -50056633 - MTD LTR MaLR -15 404 1 3 1589 474 307 50 54 chr2 131694069 131694310 -50053777 - MER92B LTR ERV1 -365 271 32 3 1589 2054 193 74 16 chr2 131694328 131694817 -50053270 - RMER5 LTR ERV1 0 534 18 3 1589 5663 133 38 7 chr2 131697195 131698049 -50050038 - RMER19B LTR ERVK -19 883 1 3 1589 1143 233 78 66 chr2 131699664 131700109 -50047978 + RLTR26 LTR ERVK 1 480 -162 3 1589 1597 224 60 12 chr2 131701362 131701696 -50046391 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 21 3 1589 1568 244 42 92 chr2 131702361 131702902 -50045185 - RMER5 LTR ERV1 -12 522 9 3 1589 234 278 174 0 chr2 131704463 131704578 -50043509 - MTE2a LTR MaLR -243 136 2 3 1589 486 268 520 65 chr2 131705384 131705637 -50042450 - MLT1F2 LTR MaLR 0 680 232 3 1589 1067 208 261 90 chr2 131706222 131706677 -50041410 + MT2A LTR ERVL 1 533 0 3 1589 1917 191 64 2 chr2 131706752 131707145 -50040942 + MTD LTR MaLR 3 419 0 3 1589 1031 214 272 32 chr2 131716143 131716481 -50031606 + MTD LTR MaLR 1 419 0 3 1589 267 384 26 40 chr2 131716809 131716961 -50031126 - MLT1C LTR MaLR -19 448 299 3 1589 1955 136 44 12 chr2 131719536 131719879 -50028208 + RMER10B LTR ERVL 26 379 -19 3 1589 453 284 104 61 chr2 131720540 131720863 -50027224 + MTEa LTR MaLR 1 359 0 3 1589 390 236 79 0 chr2 131724080 131724169 -50023918 + MLT1A1 LTR MaLR 299 394 -14 3 1589 1829 189 67 16 chr2 131724348 131724734 -50023353 + MTD LTR MaLR 1 406 -13 3 1589 5311 183 75 72 chr2 131724741 131725995 -50022092 + MTD-int LTR MaLR 1 1258 0 3 1589 1479 149 262 21 chr2 131726517 131726853 -50021234 + MTD LTR MaLR 3 419 0 4 1590 1787 167 52 96 chr2 131729305 131729689 -50018398 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 4 1590 1479 261 90 7 chr2 131730773 131731197 -50016890 - MER67C LTR ERV1 -42 669 211 4 1590 1304 106 230 99 chr2 131731698 131732011 -50016076 + ORR1B1 LTR MaLR 41 394 0 4 1590 277 224 449 0 chr2 131733084 131733191 -50014896 - MLT1A1 LTR MaLR -253 155 1 4 1590 1531 196 38 41 chr2 131743299 131743666 -50004421 + ORR1D1 LTR MaLR 1 366 -8 4 1590 3142 16 0 39 chr2 131743767 131744149 -50003938 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 4 1590 15122 25 1 3 chr2 131744149 131745850 -50002237 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 4784 4 1590 3262 19 0 0 chr2 131745845 131746209 -50001878 - IAPEz-int LTR ERVK -2252 4229 3866 4 1590 4362 20 4 0 chr2 131746209 131746700 -50001387 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 4 1590 319 0 0 0 chr2 131746700 131746738 -50001349 - MERVL-int LTR ERVL 0 5485 5448 4 1590 412 123 13 40 chr2 131746738 131746814 -50001273 - ORR1A3-int LTR MaLR -1323 640 567 4 1590 41552 16 14 0 chr2 131746814 131752100 -49995987 - MERVL-int LTR ERVL -114 5371 1 4 1590 31239 27 51 26 chr2 131752100 131752112 -49995975 - IAPEz-int LTR ERVK -2600 3881 3871 4 1590 4362 20 4 0 chr2 131752112 131752603 -49995484 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 4 1590 31239 27 51 26 chr2 131752603 131754097 -49993990 - IAPEz-int LTR ERVK -2611 3870 2305 4 1590 31239 27 51 26 chr2 131754183 131756371 -49991716 - IAPEz-int LTR ERVK -2611 2304 8 4 1590 3142 16 0 39 chr2 131756371 131756753 -49991334 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 4 1590 410 352 35 10 chr2 131761705 131761903 -49986184 + LTR87 LTR ERVL? 211 413 -211 4 1590 656 273 104 42 chr2 131765458 131765718 -49982369 - MER88 LTR ERVL -153 311 36 4 1590 847 310 162 57 chr2 131770192 131770639 -49977448 + MLT2B1 LTR ERVL 6 514 -42 4 1590 579 310 162 57 chr2 131770682 131770727 -49977360 + MLT2B1 LTR ERVL 515 550 -6 4 1590 970 205 37 19 chr2 131771055 131771269 -49976818 - MLT1B LTR MaLR -166 224 7 4 1590 2300 278 75 10 chr2 131773694 131774462 -49973625 + RMER15-int LTR ERVL 664 1481 -3518 4 1590 1543 269 29 19 chr2 131787996 131788189 -49959898 - MTE2b LTR MaLR 0 379 182 4 1590 1314 162 252 3 chr2 131788189 131788341 -49959746 + ORR1D1 LTR MaLR 2 175 -199 4 1590 1314 162 252 3 chr2 131788475 131788620 -49959467 + ORR1D1 LTR MaLR 176 372 -2 4 1590 1543 269 29 19 chr2 131788620 131788801 -49959286 - MTE2b LTR MaLR -198 181 1 4 1590 4462 20 0 0 chr2 131790768 131791261 -49956826 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 4 1590 301 363 68 52 chr2 131798523 131798831 -49949256 + ORR1E LTR MaLR 42 354 -5 4 1590 511 277 44 83 chr2 131801145 131801397 -49946690 + RMER13A LTR ERVK 2 243 -617 5 1590 638 82 0 23 chr2 131801523 131801610 -49946477 + ORR1B2 LTR MaLR 275 359 -8 5 1590 340 135 40 52 chr2 131801615 131801708 -49946379 - MTC LTR MaLR -263 158 56 5 1590 624 176 0 98 chr2 131801982 131802019 -49946068 - MTC LTR MaLR -301 120 96 5 1590 624 176 0 98 chr2 131802127 131802221 -49945866 - MTC LTR MaLR -326 95 2 5 1590 3442 115 114 25 chr2 131803429 131804063 -49944024 - RMER6C LTR ERVK 0 690 1 5 1590 2226 112 133 33 chr2 131804301 131804669 -49943418 + RLTR44A LTR ERVK 1 405 0 5 1590 1478 153 29 18 chr2 131804732 131805004 -49943083 - ORR1B2 LTR MaLR -88 279 5 5 1590 2540 87 110 5 chr2 131812233 131812419 -49935668 + BGLII_Mus LTR ERVK 1 190 -232 5 1590 2540 87 110 5 chr2 131812465 131812660 -49935427 + BGLII_Mus LTR ERVK 191 422 0 5 1590 230 135 73 55 chr2 131815100 131815155 -49932932 - MTE2b LTR MaLR 0 379 324 5 1590 667 159 83 42 chr2 131817595 131817739 -49930348 - MLT2D LTR ERVL -245 169 20 5 1590 239 260 17 133 chr2 131817837 131817957 -49930130 + LTR90B LTR LTR 133 238 -558 5 1590 256 248 205 9 chr2 131818015 131818124 -49929963 + ORR1D1 LTR MaLR 3 132 -276 5 1590 344 222 64 106 chr2 131823523 131823664 -49924423 + MLT1A1 LTR MaLR 268 402 -6 5 1590 276 309 60 0 chr2 131834366 131834450 -49913637 + MTE2a LTR MaLR 85 173 -186 5 1590 307 270 97 29 chr2 131834517 131834620 -49913467 + MTE2a LTR MaLR 275 384 0 5 1590 343 329 59 57 chr2 131835977 131836260 -49911827 + RLTR18B LTR ERVK 75 364 -252 5 1590 304 268 354 4 chr2 131837783 131838028 -49910059 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 1 5 1590 435 320 34 0 chr2 131839905 131840052 -49908035 + MLT1D LTR MaLR 352 503 -2 5 1590 242 295 112 11 chr2 131843588 131843677 -49904410 - LTR16A1 LTR ERVL -292 164 67 5 1590 1204 269 98 22 chr2 131847379 131847747 -49900340 - MER21B LTR ERV1 -17 846 451 5 1590 375 312 53 60 chr2 131852077 131852227 -49895860 - LTR16C LTR ERVL -154 335 187 5 1591 349 359 64 41 chr2 131859261 131859479 -49888608 - LTR16E2 LTR ERVL -22 546 324 6 1591 231 211 16 66 chr2 131860790 131860851 -49887236 + LTR81B LTR ERV1? 1187 1244 -149 6 1591 324 357 76 18 chr2 131860921 131861092 -49886995 + LTR88b LTR Gypsy? 25 205 -632 6 1591 422 288 264 34 chr2 131861328 131861618 -49886469 + ORR1D1 LTR MaLR 3 359 0 6 1591 336 250 49 59 chr2 131861858 131861960 -49886127 + MLT1A1 LTR MaLR 308 408 0 6 1591 324 305 0 12 chr2 131862173 131862256 -49885831 + LTR88b LTR Gypsy? 751 832 -5 6 1591 307 288 116 61 chr2 131869990 131870171 -49877916 - LTR33C LTR ERVL -92 571 381 6 1591 316 352 16 91 chr2 131870224 131870421 -49877666 - LTR33C LTR ERVL -438 190 1 6 1591 3000 140 111 109 chr2 131872542 131872720 -49875367 + RLTR40 LTR ERVK 1 170 -647 6 1591 3000 140 111 109 chr2 131872865 131873030 -49875057 + RLTR40 LTR ERVK 171 283 -534 6 1591 3000 140 111 109 chr2 131873078 131873473 -49874614 + RLTR40 LTR ERVK 284 740 -77 6 1591 283 265 84 0 chr2 131873850 131873933 -49874154 + MTD LTR MaLR 317 406 -13 6 1591 614 253 128 85 chr2 131873919 131874200 -49873887 - RMER5 LTR ERV1 -208 326 34 6 1591 1388 216 102 47 chr2 131874467 131874979 -49873108 + RMER4B LTR ERVK 1 576 -9 6 1591 442 324 39 85 chr2 131877655 131877915 -49870172 + MT2A LTR ERVL 243 490 -43 6 1591 839 176 373 15 chr2 131917572 131917843 -49830244 + ORR1D2 LTR MaLR 3 370 0 7 1591 1165 318 91 36 chr2 131918263 131918768 -49829319 + MER77 LTR ERVL 6 538 -69 7 1591 238 300 61 54 chr2 131924678 131924807 -49823280 - MLT1A0 LTR MaLR -279 129 1 7 1591 4015 94 3 14 chr2 131926421 131927002 -49821085 + RLTR19-int LTR ERVK 1429 2003 -4134 7 1591 230 261 9 140 chr2 131929527 131929555 -49818532 + MT2B LTR ERVL 148 172 -429 7 1591 230 261 9 140 chr2 131929610 131929688 -49818399 + MT2B LTR ERVL 173 240 -361 7 1591 267 237 92 0 chr2 131932113 131932189 -49815898 + MLT1A1 LTR MaLR 307 389 -19 7 1591 2456 99 3 0 chr2 131934242 131934565 -49813522 + ORR1A2 LTR MaLR 1 324 -3 7 1591 1668 190 73 18 chr2 131934790 131935187 -49812900 - MTC LTR MaLR 0 421 3 7 1591 1038 196 220 10 chr2 131943891 131944200 -49803887 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 7 1591 2032 148 24 78 chr2 131945875 131946249 -49801838 + ORR1B1 LTR MaLR 41 394 0 7 1591 2610 125 84 16 chr2 131949034 131949521 -49798566 + RLTR28 LTR ERVL 1 520 -4 7 1591 912 255 189 13 chr2 131951162 131951468 -49796619 + ORR1D2 LTR MaLR 4 363 -7 7 1591 2074 101 61 7 chr2 131951933 131952243 -49795844 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 7 1591 1870 110 250 12 chr2 131956424 131956764 -49791323 - MTC LTR MaLR 0 421 1 8 1591 322 294 40 105 chr2 131965916 131966068 -49782019 + MLT1A0 LTR MaLR 3 144 -230 8 1591 564 237 20 36 chr2 131966171 131966355 -49781732 + MLT1A0 LTR MaLR 178 369 -5 8 1591 355 296 63 74 chr2 131974942 131975212 -49772875 + RMER17D LTR ERVK 215 481 -408 8 1591 1119 246 50 49 chr2 131978467 131978911 -49769176 - MLT2B1 LTR ERVL -23 539 6 8 1591 536 266 76 76 chr2 131981391 131981780 -49766307 - RMER2 LTR ERV1 -27 540 5 8 1591 2655 74 49 35 chr2 131986928 131987333 -49760754 - RLTR10A LTR ERVK 0 411 1 9 1592 257 268 181 0 chr2 131994560 131994698 -49753389 - MLT1F1 LTR MaLR -2 567 405 9 1592 677 220 124 6 chr2 131999831 132000000 -49748087 + MT2A LTR ERVL 1 189 -344 9 1592 1035 209 87 7 chr2 132000000 132000306 -49747781 + MT2A LTR ERVL 190 599 -2 1 1592 1377 218 98 18 chr2 132000416 132000804 -49747283 + MTD LTR MaLR 1 419 0 2 1592 1237 132 89 4 chr2 132001439 132001675 -49746412 + ORR1B1 LTR MaLR 131 386 -8 5 1592 2082 179 76 5 chr2 132001714 132002107 -49745980 + MTC LTR MaLR 1 421 0 6 1592 1813 103 124 0 chr2 132003301 132003591 -49744496 + ORR1A3 LTR MaLR 1 326 0 1 1592 2001 144 66 26 chr2 132003669 132003843 -49744244 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 230 1 1592 2074 143 5 48 chr2 132003843 132004218 -49743869 + RLTR15 LTR ERVK 1 359 0 1 1592 2001 144 66 26 chr2 132004218 132004422 -49743665 - ORR1B1 LTR MaLR -165 229 1 1 1592 328 236 10 92 chr2 132007049 132007147 -49740940 - MT2B LTR ERVL -357 244 155 2 1592 1633 233 58 33 chr2 132008902 132009385 -49738702 + RLTR20B2 LTR ERVK 51 545 -15 2 1592 600 249 143 48 chr2 132009545 132009900 -49738187 - MTE2a LTR MaLR -2 377 18 2 1592 1082 248 125 16 chr2 132010752 132011121 -49736966 - MTD LTR MaLR -4 415 7 3 1592 699 322 79 81 chr2 132013381 132013787 -49734300 + MERVL_2A-int LTR ERVL 590 994 -4767 4 1592 915 244 118 65 chr2 132014862 132015217 -49732870 + MTE-int LTR MaLR 28 401 -1179 4 1592 263 284 173 0 chr2 132015224 132015351 -49732736 + MTE-int LTR MaLR 542 690 -890 4 1592 284 250 0 50 chr2 132015764 132015844 -49732243 + MLT1C LTR MaLR 30 105 -285 4 1592 325 294 62 23 chr2 132016017 132016146 -49731941 + MLT1C LTR MaLR 334 467 0 4 1592 460 277 47 35 chr2 132016848 132017020 -49731067 - MLT1B LTR MaLR -35 355 182 5 1592 236 304 121 17 chr2 132017071 132017245 -49730842 - MLT1B LTR MaLR -195 195 4 5 1592 606 362 91 18 chr2 132017245 132017572 -49730515 + LTR16A1 LTR ERVL 49 399 -57 5 1592 268 116 0 0 chr2 132020160 132020203 -49727884 - MT2B LTR ERVL 0 584 542 6 1592 1011 236 54 90 chr2 132020351 132020808 -49727279 - MT2B LTR ERVL -60 541 29 6 1592 377 307 55 55 chr2 132021430 132021630 -49726457 - RLTR42-int LTR ERVK -4134 1388 1189 6 1592 1388 222 62 40 chr2 132022103 132022142 -49725945 + MTE2b LTR MaLR 1 42 -337 6 1592 1388 222 62 40 chr2 132022375 132022706 -49725381 + MTE2b LTR MaLR 43 379 0 6 1592 744 299 166 15 chr2 132023895 132024292 -49723795 - MLT1F LTR MaLR -44 504 48 7 1592 1251 128 36 91 chr2 132026353 132026628 -49721459 - RMER6B LTR ERVK 0 461 202 8 1592 1760 152 39 29 chr2 132026749 132027134 -49720953 - RMER10A LTR ERVL -13 429 41 8 1592 659 264 25 15 chr2 132027405 132027605 -49720482 + MTE-int LTR MaLR 1 202 -1378 8 1592 553 299 133 22 chr2 132028519 132028789 -49719298 + MTE-int LTR MaLR 179 478 -1102 8 1592 586 323 147 30 chr2 132028966 132029362 -49718725 + MTE-int LTR MaLR 464 905 -675 8 1592 584 323 31 13 chr2 132029675 132029904 -49718183 + MTE-int LTR MaLR 1145 1377 -203 8 1592 324 319 25 8 chr2 132030650 132030770 -49717317 + MTE-int LTR MaLR 1425 1546 -34 8 1592 330 310 35 9 chr2 132030949 132031063 -49717024 + ORR1E LTR MaLR 19 135 -224 9 1592 456 273 68 76 chr2 132031418 132031669 -49716418 - ORR1E LTR MaLR -118 252 1 1 1592 1780 102 4 4 chr2 132035733 132036010 -49712077 + ORR1A2 LTR MaLR 43 319 -8 1 1592 496 269 24 18 chr2 132039860 132040030 -49708057 - MTD LTR MaLR -160 259 89 1 1592 256 316 155 48 chr2 132042210 132042416 -49705671 + MLT1F LTR MaLR 210 437 -111 1 1592 498 187 0 0 chr2 132044427 132044518 -49703569 - MTD LTR MaLR -321 98 8 1 1592 3997 60 22 8 chr2 132053042 132053547 -49694540 + RLTR1B LTR ERV1 1 512 0 1 1592 579 164 0 9 chr2 132059578 132059683 -49688404 - RMER5 LTR ERV1 -42 492 389 1 1592 914 245 119 36 chr2 132059837 132060172 -49687915 - RMER5 LTR ERV1 -139 395 33 1 1592 971 189 216 68 chr2 132061310 132061634 -49686453 + ORR1D1 LTR MaLR 3 374 0 1 1592 614 212 335 18 chr2 132066770 132067054 -49681033 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 1 1592 589 175 96 2 chr2 132067037 132067179 -49680908 - ORR1D1-int LTR MaLR 0 1370 1234 1 1592 267 174 14 68 chr2 132067178 132067252 -49680835 + ORR1D1 LTR MaLR 261 330 -44 1 1592 312 244 63 13 chr2 132082886 132082965 -49665122 - RLTR30 LTR ERV1 -206 173 91 2 1592 511 213 37 9 chr2 132083118 132083227 -49664860 - RLTR30 LTR ERV1 -267 112 1 2 1592 788 229 46 103 chr2 132084079 132084294 -49663793 + RLTR11B LTR ERVK 2 216 -237 2 1592 788 281 39 118 chr2 132084357 132084586 -49663501 + RLTR11B LTR ERVK 217 424 -103 2 1592 291 319 121 0 chr2 132086624 132086781 -49661306 + LTR86C LTR ERVL 1 176 -445 2 1592 656 158 40 36 chr2 132087314 132087507 -49660580 + RMER4B LTR ERVK 363 585 0 2 1592 497 130 50 0 chr2 132093386 132093486 -49654601 - RMER4B LTR ERVK -4 581 477 2 1592 1240 212 191 20 chr2 132099941 132100297 -49647790 - MTD LTR MaLR 0 419 3 2 1592 296 138 0 0 chr2 132107871 132107926 -49640161 - ORR1D2 LTR MaLR 0 374 320 3 1592 1974 152 116 11 chr2 132109855 132110233 -49637854 + MTC LTR MaLR 3 420 -1 3 1592 3447 133 41 17 chr2 132111565 132112154 -49635933 + RLTR17 LTR ERVK 90 692 0 3 1592 1332 226 93 108 chr2 132112154 132113018 -49635069 + RMER3D-int LTR ERVK 1 851 -1991 3 1592 6609 192 78 58 chr2 132113029 132114672 -49633415 + RMER3D-int LTR ERVK 1005 2669 -173 3 1592 6609 192 78 58 chr2 132114851 132115008 -49633079 + RMER3D-int LTR ERVK 2670 2842 0 3 1592 3017 143 24 10 chr2 132115031 132115534 -49632553 + RLTR17 LTR ERVK 98 607 -85 3 1592 226 204 82 0 chr2 132118835 132118884 -49629203 - LTR81C LTR ERV1? -642 511 459 3 24 1754 214 62 18 chr2 132120533 132120933 -49627154 - MTD LTR MaLR 0 419 2 3 1593 1140 180 176 21 chr2 132125047 132125358 -49622729 - ORR1B1 LTR MaLR -7 387 1 3 1593 357 200 0 0 chr2 132125358 132125418 -49622669 - ORR1B1-int LTR MaLR 0 1370 1311 3 1593 723 209 41 2 chr2 132125403 132125569 -49622518 - ORR1B1 LTR MaLR -208 170 1 3 1593 256 267 25 8 chr2 132136223 132136344 -49611743 - ORR1B1-int LTR MaLR -755 754 632 3 1593 592 219 206 41 chr2 132138055 132138274 -49609813 - RMER20B LTR ERVK 0 627 373 3 1593 1389 204 109 15 chr2 132140636 132140974 -49607113 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 3 1593 1807 139 19 112 chr2 132142634 132142721 -49605366 + ORR1B1 LTR MaLR 1 82 -312 3 1593 1807 139 19 112 chr2 132143107 132143393 -49604694 + ORR1B1 LTR MaLR 83 339 -55 3 1593 378 47 7 0 chr2 132145577 132145629 -49602458 + ORR1B1 LTR MaLR 274 319 -10 3 1593 617 296 57 91 chr2 132145798 132146170 -49601917 - ORR1E LTR MaLR 0 359 1 3 1593 1029 243 116 22 chr2 132149159 132149470 -49598617 - MTE2a LTR MaLR -23 356 17 3 1593 1550 206 135 45 chr2 132151093 132151125 -49596962 - MT2A LTR ERVL -72 461 435 3 1593 1972 105 71 61 chr2 132151125 132151451 -49596636 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 3 1593 1550 206 135 45 chr2 132151451 132151776 -49596311 - MT2A LTR ERVL -99 434 61 3 1593 1550 206 135 45 chr2 132151925 132151987 -49596100 - MT2A LTR ERVL -473 60 3 3 1593 737 267 89 86 chr2 132157783 132157930 -49590157 - RLTR12B LTR ERVK -121 407 264 3 1593 737 268 89 84 chr2 132158026 132158265 -49589822 - RLTR12B LTR ERVK -265 263 2 3 1593 819 139 16 0 chr2 132162940 132163062 -49585025 + ORR1C2 LTR MaLR 261 384 0 4 1593 2188 84 58 48 chr2 132165174 132165572 -49582515 - RMER17C LTR ERVK -8 402 1 4 1593 247 226 67 56 chr2 132165755 132165825 -49582262 - MTD LTR MaLR 0 419 349 4 1593 938 177 27 51 chr2 132165825 132166054 -49582033 - ORR1D1 LTR MaLR 0 379 153 4 1593 5353 195 46 53 chr2 132172905 132174244 -49573843 - RLTR42-int LTR ERVK 0 5522 4194 4 1593 1045 148 29 39 chr2 132174443 132174647 -49573440 - RLTR42-int LTR ERVK -1319 4203 4002 4 1593 1556 139 43 4 chr2 132174712 132174965 -49573122 - RLTR42-int LTR ERVK -2548 2974 2712 4 1593 639 194 229 15 chr2 132175547 132175858 -49572229 + MTD LTR MaLR 3 408 -11 4 1593 455 277 102 65 chr2 132176961 132177317 -49570770 + RMER20A LTR ERVK 234 602 -25 4 1593 515 272 52 6 chr2 132178895 132179069 -49569018 - RMER5 LTR ERV1 0 534 353 4 1593 2315 81 62 0 chr2 132180893 132181201 -49566886 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 4 1593 2600 117 26 14 chr2 132183834 132184250 -49563837 + BGLII LTR ERVK 1 421 0 4 1593 6343 210 20 73 chr2 132184734 132185744 -49562343 + MYSERV6-int LTR ERVK 1820 2798 -6161 4 1593 3156 48 8 10 chr2 132185744 132186141 -49561946 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 1593 6343 210 20 73 chr2 132186141 132186508 -49561579 + MYSERV6-int LTR ERVK 2799 3140 -5819 4 1593 6343 210 20 73 chr2 132186645 132186804 -49561283 + MYSERV6-int LTR ERVK 3141 3275 -5684 4 1593 686 249 59 3 chr2 132186807 132187012 -49561075 + MYSERV6-int LTR ERVK 4245 4432 -2118 4 1593 2759 175 82 65 chr2 132187145 132187911 -49560176 + MYSERV6-int LTR ERVK 1015 2021 -821 4 1593 2329 119 6 6 chr2 132190348 132190694 -49557393 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 4 1593 299 348 7 22 chr2 132191340 132191475 -49556612 - RMER15 LTR ERVL -159 416 284 4 1593 264 344 44 59 chr2 132192297 132192433 -49555654 + LTR33 LTR ERVL 47 180 -335 4 1593 416 244 61 8 chr2 132193281 132193413 -49554674 + MLT1A1 LTR MaLR 268 406 -2 4 1593 2264 198 43 14 chr2 132193483 132193975 -49554112 - RMER20A LTR ERVK 0 516 11 4 1593 2577 138 24 52 chr2 132200109 132200575 -49547512 - RLTR11B LTR ERVK 0 453 1 4 1593 364 322 119 85 chr2 132201828 132202239 -49545848 - MLT1D LTR MaLR -75 430 6 4 1593 325 288 106 0 chr2 132204652 132204784 -49543303 + LTR16C LTR ERVL 185 330 -159 4 1593 1207 249 93 16 chr2 132212798 132213108 -49534979 - MTD LTR MaLR 0 419 86 4 1593 292 377 60 60 chr2 132222192 132222525 -49525562 - MLT1H LTR MaLR -15 534 202 5 1593 832 90 0 29 chr2 132225341 132225478 -49522609 - LTRIS4 LTR ERV1 0 507 375 5 1593 464 198 146 16 chr2 132225464 132225587 -49522500 - ORR1B1 LTR MaLR -132 262 124 5 1593 726 202 122 70 chr2 132225606 132225835 -49522252 + RLTR25B LTR ERVK 788 1028 0 5 1593 317 118 8 4 chr2 132226444 132226502 -49521585 - ORR1A4 LTR MaLR -2 377 301 5 1593 1969 94 3 118 chr2 132226506 132226869 -49521218 - ORR1A4 LTR MaLR -8 321 1 5 1593 488 153 23 12 chr2 132226869 132226955 -49521132 - MTD LTR MaLR -57 362 276 5 1593 520 325 47 47 chr2 132227013 132227268 -49520819 - MTD LTR MaLR -160 259 5 5 1593 1738 112 145 14 chr2 132229035 132229324 -49518763 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 5 1593 372 209 98 11 chr2 132233872 132233964 -49514123 + RLTR42-int LTR ERVK 4855 4954 -568 5 1593 3163 135 97 2 chr2 132236607 132237141 -49510946 + RMER4B LTR ERVK 1 585 0 5 1593 1211 195 100 98 chr2 132240019 132240388 -49507699 + ORR1D1 LTR MaLR 5 374 0 5 1593 465 321 70 90 chr2 132241384 132241771 -49506316 + MTEa LTR MaLR 1 379 0 5 1593 810 326 131 23 chr2 132241936 132242372 -49505715 + MLT1F LTR MaLR 66 548 0 5 1593 643 142 9 0 chr2 132243131 132243244 -49504843 + RMER15 LTR ERVL 1 114 -461 5 1593 2812 157 25 18 chr2 132244033 132244590 -49503497 + RMER15 LTR ERVL 1 561 -14 5 1593 3049 52 39 5 chr2 132245498 132245881 -49502206 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 1593 321 250 164 16 chr2 132246584 132246706 -49501381 + RMER15 LTR ERVL 336 475 -100 5 1594 1817 144 117 3 chr2 132256448 132256634 -49491453 - RMER17C LTR ERVK 0 410 197 5 1594 1817 144 117 3 chr2 132256717 132256898 -49491189 - RMER17C LTR ERVK -214 196 2 5 1594 1104 152 59 0 chr2 132257532 132257736 -49490351 - MTD LTR MaLR -8 411 196 5 1594 798 207 127 27 chr2 132258153 132258390 -49489697 - MTD LTR MaLR -144 235 1 5 1594 319 311 126 131 chr2 132265051 132265576 -49482511 + LTR55 LTR ERV 20 541 -7 5 1594 350 224 43 78 chr2 132272861 132272977 -49475110 + MLT2B4 LTR ERVL 1 112 -444 5 1594 436 289 35 40 chr2 132273130 132273313 -49474774 + MLT2B4 LTR ERVL 106 287 -269 5 1594 303 291 68 31 chr2 132273507 132273704 -49474383 + MLT2B4 LTR ERVL 285 554 0 5 1594 395 281 49 12 chr2 132276432 132276594 -49471493 - ORR1E LTR MaLR -165 194 27 5 1594 490 239 40 35 chr2 132278548 132278721 -49469366 - MTE-int LTR MaLR -219 1361 1188 6 1594 945 302 24 62 chr2 132279160 132279470 -49468617 - MTE-int LTR MaLR -435 1145 849 6 1594 421 226 225 7 chr2 132279470 132279608 -49468479 + MTC LTR MaLR 1 168 -253 6 1594 1021 147 18 58 chr2 132279683 132279957 -49468130 + RMER6A LTR ERVK 282 544 -212 6 1594 3227 51 5 8 chr2 132281539 132281936 -49466151 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 1594 2607 195 58 12 chr2 132283468 132283967 -49464120 - MERVL_2A-int LTR ERVL -585 5176 4655 6 1594 257 352 71 76 chr2 132284227 132284424 -49463663 + MLT1K LTR MaLR 4 199 -396 6 1594 445 250 38 8 chr2 132284960 132285093 -49462994 + MLT1D LTR MaLR 1 137 -368 6 1594 1693 209 74 18 chr2 132288972 132289362 -49458725 + MTD LTR MaLR 4 415 -4 6 1594 606 268 107 47 chr2 132293197 132293364 -49454723 - MLT2B1 LTR ERVL -136 384 203 6 1594 4293 101 23 137 chr2 132293364 132294217 -49453870 + RMER6A LTR ERVK 1 756 0 6 1594 606 268 107 47 chr2 132294217 132294264 -49453823 - MLT2B1 LTR ERVL -318 202 157 6 1594 297 289 97 0 chr2 132294436 132294550 -49453537 - MLT2B1 LTR ERVL -395 125 1 6 1594 517 237 131 40 chr2 132296294 132296492 -49451595 - RMER15 LTR ERVL 0 575 360 6 1594 406 275 36 57 chr2 132296503 132296696 -49451391 - RMER15 LTR ERVL -386 189 1 6 1594 432 141 26 0 chr2 132302540 132302618 -49445469 - RMER19C LTR ERVK 0 611 532 6 1594 273 267 0 106 chr2 132303440 132303553 -49444534 - RLTR25B LTR ERVK -474 554 454 6 1594 2509 117 71 8 chr2 132304322 132304718 -49443369 - MTC LTR MaLR 0 421 1 6 1594 2357 162 10 3 chr2 132309417 132309806 -49438281 - ORR1B1 LTR MaLR -2 392 1 6 1594 1644 226 19 16 chr2 132310258 132310626 -49437461 + ORR1D2 LTR MaLR 2 370 0 6 1594 602 281 70 36 chr2 132310898 132311201 -49436886 + ORR1E LTR MaLR 1 319 -51 6 1594 244 271 64 57 chr2 132311537 132311678 -49436409 - MER57C2 LTR ERV1 -48 386 245 6 1594 228 295 130 8 chr2 132312262 132312385 -49435702 - ORR1E LTR MaLR -221 138 1 6 1594 8408 159 38 36 chr2 132319729 132321220 -49426867 + MERVL_2A-int LTR ERVL 3688 5181 -580 6 1594 2367 146 90 17 chr2 132321443 132321854 -49426233 + MERVL_2A-int LTR ERVL 5188 5628 -133 6 1594 258 274 0 40 chr2 132321854 132321930 -49426157 + ORR1A3-int LTR MaLR 567 639 -1324 6 1594 1624 172 161 163 chr2 132321984 132322457 -49425630 + MT2A LTR ERVL 1 465 -68 6 1594 1624 172 161 163 chr2 132322567 132322625 -49425462 + MT2A LTR ERVL 466 531 -2 6 1594 1462 190 130 141 chr2 132322768 132322849 -49425238 + MT2A LTR ERVL 1 78 -455 6 1594 1462 190 130 141 chr2 132322874 132323331 -49424756 + MT2A LTR ERVL 79 533 0 6 1594 2418 153 31 24 chr2 132325042 132325456 -49422631 + MTC LTR MaLR 1 417 -4 6 1594 994 170 152 39 chr2 132326981 132327238 -49420849 + RMER19B LTR ERVK 309 594 -308 7 1594 2208 111 75 12 chr2 132327772 132328117 -49419970 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 7 1594 2275 107 3 58 chr2 132328209 132328555 -49419532 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 7 1594 228 140 192 39 chr2 132331323 132331375 -49416712 + MT2B LTR ERVL 176 235 -366 7 1594 2129 112 7 0 chr2 132341913 132342217 -49405870 + ORR1A2 LTR MaLR 7 312 -15 7 1594 1634 177 154 11 chr2 132342742 132343164 -49404923 - RMER16 LTR ERVK 0 533 1 7 1594 913 222 181 72 chr2 132345298 132345466 -49402621 - MTD LTR MaLR -14 405 220 7 1594 2012 136 43 86 chr2 132345466 132345861 -49402226 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 7 1594 913 222 181 72 chr2 132345861 132346051 -49402036 - MTD LTR MaLR -200 219 8 7 1594 462 67 147 0 chr2 132348249 132348324 -49399763 - RMER6B LTR ERVK -375 86 1 7 1594 465 152 55 45 chr2 132350105 132350215 -49397872 - MTD LTR MaLR -8 411 301 7 1594 582 132 0 0 chr2 132350651 132350742 -49397345 - MTD LTR MaLR -124 295 205 7 1594 968 132 291 20 chr2 132359280 132359383 -49388704 + ORR1D1 LTR MaLR 52 167 -207 7 1594 968 132 291 20 chr2 132359410 132359560 -49388527 + ORR1D1 LTR MaLR 168 373 -1 7 1594 1363 243 77 34 chr2 132374971 132375359 -49372728 - MTD LTR MaLR -14 405 1 8 1595 352 218 56 33 chr2 132388268 132388358 -49359729 + RMER15 LTR ERVL 371 462 -113 8 1595 1470 202 59 50 chr2 132394782 132394958 -49353129 + MYSERV-int LTR ERVK 6122 6311 -239 8 1595 1470 202 59 50 chr2 132395140 132395385 -49352702 + MYSERV-int LTR ERVK 6312 6547 -3 8 1595 1739 202 118 23 chr2 132395389 132395870 -49352217 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 527 0 8 1595 261 235 14 29 chr2 132406827 132406897 -49341190 + MTE2b LTR MaLR 259 327 -52 8 1595 694 298 74 48 chr2 132412571 132412963 -49335124 - MLT1C LTR MaLR -29 438 37 8 1595 244 311 27 0 chr2 132413198 132413272 -49334815 - ORR1E LTR MaLR -16 343 268 8 1595 2613 122 182 6 chr2 132413276 132413781 -49334306 - MT2B LTR ERVL 0 601 8 8 1595 427 264 234 39 chr2 132417189 132417486 -49330601 + MLT1A0 LTR MaLR 4 358 -7 9 1595 332 275 45 9 chr2 132419381 132419491 -49328596 - MLT1H2 LTR MaLR -2 487 374 9 1595 351 290 128 15 chr2 132420513 132420646 -49327441 - MLT1F1 LTR MaLR -124 445 298 9 1595 292 164 16 0 chr2 132420649 132420710 -49327377 + RLTR11A2 LTR ERVK 462 523 -4 9 1595 931 129 106 0 chr2 132420695 132420865 -49327222 - RLTR11B LTR ERVK -265 188 1 9 1595 322 274 26 94 chr2 132424547 132424664 -49323423 - MT2B LTR ERVL -341 260 152 9 1595 968 279 86 21 chr2 132428457 132428794 -49319293 - MTD LTR MaLR -56 363 5 9 1595 328 314 117 0 chr2 132430205 132430342 -49317745 - LTR16A LTR ERVL -17 434 282 9 1595 227 352 0 0 chr2 132430708 132430779 -49317308 - LTR16A LTR ERVL -361 90 20 9 1595 397 312 61 64 chr2 132434882 132435194 -49312893 - ORR1E LTR MaLR -6 353 43 9 1595 1980 184 160 20 chr2 132443159 132443597 -49304490 - RLTR19 LTR ERVK 0 499 1 9 1595 385 302 74 6 chr2 132446086 132446249 -49301838 - MLT1A0 LTR MaLR -3 362 189 1 1595 999 111 13 0 chr2 132448551 132448704 -49299383 - RMER19C LTR ERVK 0 611 457 1 1595 1797 147 68 14 chr2 132449140 132449493 -49298594 + RLTR14 LTR ERV1 3 374 -8 1 1595 4257 201 84 94 chr2 132449493 132449875 -49298212 + RLTR14-int LTR ERV1 27 394 -4923 1 1595 4257 201 84 94 chr2 132449921 132449984 -49298103 + RLTR14-int LTR ERV1 395 435 -4882 1 1595 4421 84 2 28 chr2 132449984 132450587 -49297500 - LTRIS_Mus LTR ERV1 0 587 1 1 1595 4257 201 84 94 chr2 132450587 132451415 -49296672 + RLTR14-int LTR ERV1 436 1288 -4029 1 1595 9074 174 36 55 chr2 132451535 132451970 -49296117 + RLTR14-int LTR ERV1 2224 2637 -2680 1 1595 4240 82 22 17 chr2 132451970 132452551 -49295536 - MT2B2 LTR ERVL 0 584 1 1 1595 9074 174 36 55 chr2 132452551 132453284 -49294803 + RLTR14-int LTR ERV1 2638 3363 -1954 1 1595 9074 174 36 55 chr2 132453429 132454024 -49294063 + RLTR14-int LTR ERV1 3364 3953 -1364 1 1595 2225 117 0 60 chr2 132454042 132454389 -49293698 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 1 1595 5793 160 27 48 chr2 132454953 132456041 -49292046 + RLTR14-int LTR ERV1 3946 5010 -307 1 1595 2118 103 0 50 chr2 132456052 132456390 -49291697 - ORR1A4 LTR MaLR -8 321 1 1 1595 1780 137 6 51 chr2 132456390 132456706 -49291381 + RLTR14-int LTR ERV1 5016 5317 0 1 1595 2349 110 3 0 chr2 132457466 132457792 -49290295 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 1 1595 226 299 42 25 chr2 132458568 132458688 -49289399 + MLT1H2 LTR MaLR 368 489 0 1 1595 306 273 0 43 chr2 132459038 132459130 -49288957 + MLT1E2 LTR MaLR 123 210 -417 1 1595 257 319 129 74 chr2 132459163 132459488 -49288599 + MLT1E2 LTR MaLR 279 621 -3 1 1595 348 319 75 0 chr2 132459644 132459804 -49288283 - LTR16C LTR ERVL -18 471 300 1 1595 2979 21 24 0 chr2 132460455 132460793 -49287294 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 1 1595 327 246 122 40 chr2 132463682 132463830 -49284257 - MLT1D LTR MaLR -333 172 13 1 1595 251 391 93 0 chr2 132464246 132464471 -49283616 + LTR16E1 LTR ERVL 161 406 -132 1 1595 1987 131 80 0 chr2 132464470 132464821 -49283266 - ORR1B1 LTR MaLR -14 380 2 1 1595 307 315 39 8 chr2 132464821 132464947 -49283140 + LTR16E1 LTR ERVL 394 523 -15 1 1595 2174 173 5 63 chr2 132465612 132465975 -49282112 - MTC LTR MaLR 0 421 79 1 1595 2174 173 5 63 chr2 132466104 132466185 -49281902 - MTC LTR MaLR -343 78 3 1 1595 1150 144 186 17 chr2 132469270 132469592 -49278495 - MTC LTR MaLR -8 411 2 1 1595 1172 172 528 16 chr2 132471198 132471378 -49276709 + ORR1B1 LTR MaLR 1 275 -119 1 1595 4564 10 0 0 chr2 132471378 132471871 -49276216 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 1 1595 1172 186 8 25 chr2 132471871 132471994 -49276093 + ORR1B1 LTR MaLR 276 394 0 1 1595 441 318 49 31 chr2 132472938 132473162 -49274925 - MLT1D LTR MaLR -188 317 90 1 1595 680 336 148 19 chr2 132473389 132473762 -49274325 + LTR16C LTR ERVL 69 489 0 1 1595 2232 112 79 0 chr2 132474287 132474643 -49273444 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 1 1595 2314 73 79 0 chr2 132479480 132479783 -49268304 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 1 1595 760 266 101 8 chr2 132484050 132484308 -49263779 - ORR1D2 LTR MaLR -1 369 88 1 1595 392 325 8 0 chr2 132484449 132484566 -49263521 + MT2A LTR ERVL 345 462 -71 1 1595 390 309 26 47 chr2 132486515 132486705 -49261382 - MLT1A LTR MaLR 0 374 189 1 1595 1336 205 62 46 chr2 132486820 132487193 -49260894 - RMER16 LTR ERVK 0 533 155 1 1595 582 283 51 23 chr2 132490357 132490574 -49257513 + MLT1G3 LTR MaLR 373 595 0 1 1595 304 346 63 0 chr2 132491205 132491364 -49256723 - LTR33 LTR ERVL -57 458 290 1 1595 264 367 8 8 chr2 132491472 132491593 -49256494 - LTR33 LTR ERVL -376 139 19 1 1595 1148 34 60 21 chr2 132491833 132492062 -49256025 - LTRIS_Mm LTR ERV1 -341 141 1 1 1595 412 311 178 31 chr2 132492671 132493116 -49254971 - MLT1G3 LTR MaLR -30 565 56 1 1595 3329 55 0 2 chr2 132493204 132493605 -49254482 - MTB LTR MaLR 0 400 1 1 1595 289 343 72 17 chr2 132495032 132495211 -49252876 + MLT1D LTR MaLR 4 192 -313 1 1595 299 305 40 48 chr2 132498229 132498353 -49249734 - MLT1D LTR MaLR -83 422 300 1 1595 506 260 278 0 chr2 132498517 132498783 -49249304 - MTEa LTR MaLR -15 364 25 1 1595 1692 212 44 27 chr2 132501638 132502050 -49246037 - MTD LTR MaLR 0 419 1 5 1595 948 165 78 8 chr2 132503668 132503880 -49244207 + ORR1C1 LTR MaLR 1 223 -151 1 1595 3021 35 0 0 chr2 132504104 132504450 -49243637 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 1 1595 302 305 125 60 chr2 132505907 132506155 -49241932 + ORR1E LTR MaLR 92 355 -4 2 1595 309 241 86 110 chr2 132507284 132507447 -49240640 + MT2B LTR ERVL 175 333 -268 2 1595 1728 124 126 10 chr2 132510903 132511196 -49236891 + ORR1A4 LTR MaLR 3 329 0 4 1595 266 281 21 43 chr2 132511874 132511967 -49236120 + MER57A-int LTR ERV1 5820 5910 -277 5 1596 300 217 51 173 chr2 132518887 132518900 -49229187 - MT2B LTR ERVL -308 293 211 6 1596 3640 10 0 5 chr2 132521781 132522179 -49225908 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 7 1596 277 167 174 43 chr2 132526232 132526301 -49221786 - MT2B LTR ERVL -361 240 163 8 1596 497 120 31 42 chr2 132526294 132526349 -49221738 + ORR1B2 LTR MaLR 265 317 -50 9 1596 497 120 31 42 chr2 132526549 132526584 -49221503 + ORR1B2 LTR MaLR 318 351 -16 9 1596 299 292 184 33 chr2 132529822 132530066 -49218021 + ORR1D2 LTR MaLR 8 288 -82 1 1596 423 200 12 0 chr2 132530069 132530149 -49217938 - RLTR25A LTR ERVK 0 1103 1023 1 1596 3393 30 8 0 chr2 132533482 132533875 -49214212 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 1596 1495 196 63 91 chr2 132536473 132536904 -49211183 - MTD LTR MaLR 0 419 1 1 1596 229 264 133 26 chr2 132537125 132537238 -49210849 - LTR50 LTR ERVL -279 516 392 1 1596 246 232 159 68 chr2 132537242 132537418 -49210669 - LTR50 LTR ERVL -251 544 353 1 1596 250 308 17 78 chr2 132541554 132541670 -49206417 - MLT1F2 LTR MaLR -23 537 429 1 1596 459 309 68 88 chr2 132543965 132544330 -49203757 - ORR1E LTR MaLR 0 359 2 1 1596 1180 189 201 19 chr2 132544890 132545203 -49202884 + ORR1D1 LTR MaLR 5 374 0 1 1596 1396 239 52 6 chr2 132555809 132556158 -49191929 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 1 1 1596 630 219 168 24 chr2 132559310 132559619 -49188468 - ORR1D2 LTR MaLR -9 361 6 1 1596 2098 145 80 0 chr2 132560514 132560852 -49187235 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 3 1 1596 1194 155 186 40 chr2 132561047 132561370 -49186717 - ORR1D1 LTR MaLR -4 370 1 1 1596 3684 181 74 52 chr2 132561370 132562066 -49186021 - ORR1D1-int LTR MaLR 0 1370 652 1 1596 3684 181 74 52 chr2 132562212 132562382 -49185705 - ORR1D1-int LTR MaLR -719 651 485 1 1596 1551 255 80 98 chr2 132562384 132564020 -49184067 - RLTR19-int LTR ERVK -2450 3687 1870 1 1596 679 188 97 138 chr2 132566700 132566947 -49181140 - RLTR19-int LTR ERVK -3727 1795 1559 1 1596 1555 166 89 112 chr2 132572641 132573034 -49175053 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 2 1596 553 179 118 9 chr2 132574346 132574508 -49173579 - ORR1D2 LTR MaLR -31 339 141 2 1596 286 163 0 0 chr2 132574915 132574964 -49173123 + RLTR18B LTR ERVK 27 75 -437 2 1596 1813 144 3 13 chr2 132575244 132575553 -49172534 + ORR1B1 LTR MaLR 89 394 0 2 1596 327 259 36 36 chr2 132576708 132576820 -49171267 + LTR16C LTR ERVL 365 476 -13 2 1596 579 299 18 23 chr2 132585224 132585406 -49162681 - MLT1H2 LTR MaLR -300 189 12 2 1596 324 217 14 14 chr2 132590141 132590211 -49157876 - MTE2a LTR MaLR -290 89 20 2 1596 2198 155 70 10 chr2 132590379 132590776 -49157311 - MTC LTR MaLR 0 421 1 2 1596 2119 90 80 3 chr2 132592038 132592340 -49155747 + ORR1A3 LTR MaLR 1 325 -1 2 1596 1182 248 92 27 chr2 132593416 132593889 -49154198 - RMER15 LTR ERVL -2 573 8 2 1596 1492 231 229 14 chr2 132593978 132594743 -49153344 + RMER12 LTR ERVK 1 1008 -396 2 1596 1136 33 7 7 chr2 132594789 132594942 -49153145 + RLTR1C LTR ERV1 1 153 -350 2 1596 2812 34 0 0 chr2 132595593 132595945 -49152142 + RLTR1C LTR ERV1 152 503 0 2 1596 657 187 42 168 chr2 132596007 132596245 -49151842 + RMER12 LTR ERVK 958 1165 -157 2 1596 1049 132 112 0 chr2 132598135 132598340 -49149747 + RMER6A LTR ERVK 529 756 0 2 1596 971 84 7 34 chr2 132598340 132598488 -49149599 - MTC LTR MaLR -265 156 13 2 1596 2477 96 3 0 chr2 132601191 132601515 -49146572 + ORR1A2 LTR MaLR 1 325 -2 2 1596 675 309 134 49 chr2 132602758 132603184 -49144903 + LTR33A LTR ERVL 8 469 -51 2 1596 2471 86 3 12 chr2 132603851 132604181 -49143906 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 2 1596 402 267 59 32 chr2 132615982 132616168 -49131919 - MLT1A0 LTR MaLR -164 201 11 3 1596 344 310 44 98 chr2 132622313 132622656 -49125431 - MLT1C LTR MaLR -93 374 54 3 1596 344 310 44 98 chr2 132622687 132622729 -49125358 - MLT1C LTR MaLR -414 53 11 3 1596 262 255 262 9 chr2 132622752 132622859 -49125228 + LTR16C LTR ERVL 237 370 -119 3 1596 1148 246 94 40 chr2 132623121 132623183 -49124904 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 312 3 1596 1900 145 45 181 chr2 132623183 132623367 -49124720 + MTC LTR MaLR 1 103 -318 3 1596 1900 145 45 181 chr2 132623553 132623855 -49124232 + MTC LTR MaLR 104 421 0 3 1596 1148 246 94 40 chr2 132623855 132624143 -49123944 - ORR1D2 LTR MaLR -59 311 1 3 1596 581 177 80 0 chr2 132624242 132624355 -49123732 - MTD LTR MaLR 0 419 298 3 1596 2708 179 94 89 chr2 132624339 132625113 -49122974 - MTC-int LTR MaLR -122 1136 359 3 1596 2606 273 101 66 chr2 132625110 132626297 -49121790 + MTE-int LTR MaLR 136 1364 -216 3 1596 466 273 58 71 chr2 132626431 132626507 -49121580 + MTE-int LTR MaLR 1356 1424 -156 3 1596 466 273 58 71 chr2 132626686 132626834 -49121253 + MTE-int LTR MaLR 1425 1577 -3 3 1596 506 239 144 14 chr2 132627351 132627559 -49120528 + MTEb LTR MaLR 84 318 -61 3 1596 1324 191 86 16 chr2 132627866 132628169 -49119918 + MTC LTR MaLR 90 413 -8 3 1596 614 242 196 35 chr2 132628593 132628910 -49119177 + RLTR9A LTR ERVK 1 368 0 3 1596 377 245 39 0 chr2 132638989 132639091 -49108996 + RMER15 LTR ERVL 454 559 -16 3 1597 1855 144 115 0 chr2 132649771 132650111 -49097976 - ORR1B1 LTR MaLR -15 379 1 3 1597 5597 86 11 65 chr2 132651450 132652299 -49095788 - RLTR13B4 LTR ERVK 0 803 1 3 1597 225 236 0 18 chr2 132661591 132661647 -49086440 + LTR90A LTR LTR 271 325 -651 3 1597 787 276 84 43 chr2 132692778 132693218 -49054869 - RLTR12B LTR ERVK -24 504 47 4 1597 908 194 277 7 chr2 132693365 132693650 -49054437 + ORR1D2 LTR MaLR 1 362 -8 4 1597 386 247 80 29 chr2 132697442 132697617 -49050470 + MLT1J1 LTR MaLR 43 226 -218 4 1597 2813 97 36 39 chr2 132698894 132699336 -49048751 - BGLII_B LTR ERVK 0 441 1 4 1597 293 346 79 12 chr2 132699426 132699590 -49048497 + MLT1H LTR MaLR 1 175 -374 4 1597 2303 124 73 16 chr2 132700713 132701098 -49046989 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 4 1597 365 293 72 81 chr2 132701320 132701640 -49046447 - RLTR26 LTR ERVK -74 568 252 4 1597 2117 171 79 14 chr2 132708312 132708816 -49039271 - RLTR31_Mur LTR ERVK -16 537 1 4 1597 267 275 43 0 chr2 132708980 132709049 -49039038 - LTR16C LTR ERVL -14 475 404 4 1597 4480 16 0 0 chr2 132711338 132711831 -49036256 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 4 1597 315 26 0 0 chr2 132711831 132711869 -49036218 - MERVL-int LTR ERVL 0 5485 5448 4 1597 298 214 46 35 chr2 132711869 132711956 -49036131 - ORR1A3-int LTR MaLR -1323 640 553 4 1597 48578 18 0 0 chr2 132711956 132717315 -49030772 - MERVL-int LTR ERVL -125 5360 1 4 1597 4480 16 0 0 chr2 132717315 132717808 -49030279 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 4 1597 250 200 50 91 chr2 132718109 132718208 -49029879 + MTEa LTR MaLR 278 372 -7 4 1597 461 270 0 93 chr2 132718777 132718830 -49029257 - MTD LTR MaLR -281 138 89 4 1597 461 270 0 93 chr2 132718998 132719094 -49028993 - MTD LTR MaLR -331 88 3 4 1597 250 222 16 7 chr2 132719327 132719404 -49028683 + MLT1D LTR MaLR 445 502 -3 4 1597 337 333 126 14 chr2 132720339 132720561 -49027526 - MLT1H1 LTR MaLR -1 554 308 4 1597 363 220 65 11 chr2 132721124 132721216 -49026871 + MTD LTR MaLR 1 97 -322 4 1597 252 296 63 27 chr2 132721248 132721266 -49026821 + MTD LTR MaLR 100 115 -292 4 1597 2925 188 79 57 chr2 132722078 132722898 -49025189 + RMER19B LTR ERVK 1 724 -178 5 1597 249 329 77 97 chr2 132723354 132723613 -49024474 - MLT1L LTR MaLR -207 403 150 5 1597 289 304 19 38 chr2 132724833 132724939 -49023148 + MLT1J LTR MaLR 1 104 -408 5 1597 1551 169 0 7 chr2 132726921 132727195 -49020892 - MTC LTR MaLR 0 421 150 5 1597 2110 104 6 0 chr2 132734809 132735126 -49012961 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 5 1597 267 139 0 0 chr2 132745181 132745224 -49002863 - RLTRETN_Mm LTR ERVK -279 43 1 5 1597 1492 139 84 105 chr2 132748891 132749309 -48998778 - RMER17C LTR ERVK 0 410 2 5 1597 3440 194 98 19 chr2 132751931 132752589 -48995498 + RMER12 LTR ERVK 96 767 -555 5 1597 3440 204 121 31 chr2 132752740 132753233 -48994854 + RMER12 LTR ERVK 768 1038 -284 5 1597 2027 152 91 0 chr2 132755084 132755458 -48992629 + MTC LTR MaLR 1 408 -13 5 1597 1758 145 53 100 chr2 132756263 132756693 -48991394 + RMER17C LTR ERVK 1 410 0 5 1597 243 323 0 0 chr2 132766226 132766291 -48981796 + MLT1A1 LTR MaLR 68 132 -242 5 1597 305 185 11 69 chr2 132766477 132766564 -48981523 + MLT1A1 LTR MaLR 323 404 -4 5 1597 1363 197 57 78 chr2 132772412 132772835 -48975252 + MTC LTR MaLR 8 421 0 5 1598 3533 20 2 0 chr2 132778256 132778651 -48969436 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 1598 9488 25 3 1 chr2 132778651 132779747 -48968340 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 6 1598 3533 20 2 0 chr2 132779747 132780142 -48967945 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 1598 1061 224 119 14 chr2 132782746 132783031 -48965056 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 56 6 1598 1076 244 134 63 chr2 132785712 132786062 -48962025 - MTE2a LTR MaLR -1 378 4 6 1598 1833 191 61 5 chr2 132787465 132787846 -48960241 + MTD LTR MaLR 13 405 -14 6 1598 295 356 67 67 chr2 132788310 132788617 -48959470 + LTR16C LTR ERVL 77 444 -94 6 1598 468 296 36 16 chr2 132788959 132789151 -48958936 - ORR1E LTR MaLR -163 196 1 6 1598 2686 149 38 16 chr2 132789262 132789761 -48958326 + RLTR28 LTR ERVL 1 510 -14 6 1598 231 318 11 11 chr2 132792829 132792918 -48955169 + MLT1A0 LTR MaLR 53 141 -224 6 1598 556 300 67 67 chr2 132793086 132793415 -48954672 - ORR1E LTR MaLR -4 355 27 6 1598 242 250 0 0 chr2 132793435 132793483 -48954604 - MTE-int LTR MaLR -76 1504 1457 6 1598 2147 275 85 37 chr2 132793665 132794417 -48953670 - MTE-int LTR MaLR -114 1466 679 6 1598 407 234 37 9 chr2 132794437 132794545 -48953542 - MTD LTR MaLR -308 111 1 6 1598 295 164 18 0 chr2 132794827 132794882 -48953205 - MTD LTR MaLR -4 415 360 6 1598 2267 190 79 28 chr2 132794884 132795392 -48952695 - RMER5 LTR ERV1 0 534 1 6 1598 1405 200 61 12 chr2 132795401 132795740 -48952347 - MTD LTR MaLR -72 347 10 6 1598 1434 196 145 0 chr2 132797205 132797262 -48950825 - MTE2a LTR MaLR 0 379 305 6 1598 1434 196 145 0 chr2 132797282 132797555 -48950532 - MTE2a LTR MaLR -75 304 2 6 1598 1006 276 34 28 chr2 132797902 132798223 -48949864 + MLT1D LTR MaLR 180 502 -3 6 1598 409 287 285 50 chr2 132798335 132798720 -48949367 - MLT1F LTR MaLR -22 526 47 6 1598 269 330 134 56 chr2 132798993 132799029 -48949058 - MLT1F LTR MaLR -523 46 12 6 1598 1730 199 51 6 chr2 132800586 132800939 -48947148 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 2 6 1598 277 200 15 44 chr2 132801742 132801810 -48946277 + MLT1J1 LTR MaLR 38 103 -341 6 1598 1273 201 194 21 chr2 132803815 132803846 -48944241 - MTD LTR MaLR -9 410 382 6 1598 3188 109 12 35 chr2 132803846 132804332 -48943755 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 475 0 6 1598 1273 201 194 21 chr2 132804332 132804635 -48943452 - MTD LTR MaLR -38 381 18 6 1598 1458 224 49 74 chr2 132804680 132805168 -48942919 - MTD-int LTR MaLR 0 1258 783 6 1598 2619 138 124 46 chr2 132806128 132806654 -48941433 - RLTR12A LTR ERVK 0 568 2 6 1598 2019 146 62 26 chr2 132813920 132814272 -48933815 + ORR1B2 LTR MaLR 3 367 0 6 1598 284 351 9 17 chr2 132815222 132815338 -48932749 - ORR1E LTR MaLR -244 115 1 6 1598 492 302 65 11 chr2 132820858 132821042 -48927045 + LTR16B1 LTR ERVL 282 475 -5 6 1598 229 230 0 119 chr2 132822266 132822350 -48925737 - ORR1D1 LTR MaLR -184 190 117 6 1598 520 290 84 21 chr2 132822339 132822529 -48925558 + MTEb LTR MaLR 12 213 -166 6 1598 392 250 46 0 chr2 132822530 132822638 -48925449 - MTE-int LTR MaLR -1396 184 72 6 1598 751 124 15 37 chr2 132822673 132822807 -48925280 + ORR1C1 LTR MaLR 1 131 -247 6 1598 794 266 127 29 chr2 132827219 132827533 -48920554 + MTE-int LTR MaLR 566 910 -670 6 1598 3574 40 28 5 chr2 132828416 132828842 -48919245 + RLTR10C LTR ERVK 1 436 0 6 1598 2219 245 90 11 chr2 132829554 132830177 -48917910 + MTE-int LTR MaLR 909 1580 0 6 1598 4784 150 29 65 chr2 132830459 132831395 -48916692 - RMER19B LTR ERVK 0 902 1 6 1598 2438 93 98 87 chr2 132834947 132835417 -48912670 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 6 1598 500 342 40 20 chr2 132847659 132847907 -48900180 + LTR16A1 LTR ERVL 134 386 -70 7 1598 374 293 80 29 chr2 132851614 132851751 -48896336 - RMER15 LTR ERVL -96 479 336 7 1598 228 310 50 66 chr2 132852079 132852200 -48895887 - LTR16E2 LTR ERVL -9 559 441 7 1598 1142 223 114 46 chr2 132853118 132853443 -48894644 - ORR1D2 LTR MaLR -23 347 1 7 1598 6924 62 11 14 chr2 132856885 132857806 -48890281 + RLTR13D5 LTR ERVK 106 1023 0 7 1598 1717 202 133 30 chr2 132862172 132862647 -48885440 + RMER19C LTR ERVK 88 611 0 7 1598 867 257 102 21 chr2 132864828 132865091 -48882996 - MTE2b LTR MaLR -17 402 132 7 1598 354 345 97 6 chr2 132867452 132867627 -48880460 - MT2A LTR ERVL -113 420 230 7 1598 3373 125 42 28 chr2 132867647 132868224 -48879863 - RMER4B LTR ERVK 0 585 1 7 1598 407 250 48 0 chr2 132868271 132868355 -48879732 - MTEa LTR MaLR -287 92 5 7 1598 262 357 141 13 chr2 132868657 132868813 -48879274 - MLT1F2 LTR MaLR 0 560 385 7 1598 832 202 89 16 chr2 132868880 132869071 -48879016 - MTE2a LTR MaLR -2 377 173 7 1598 575 257 39 39 chr2 132869321 132869499 -48878588 - MTE2a LTR MaLR -201 178 1 7 1598 338 320 148 30 chr2 132869685 132869888 -48878199 - MLT1F2 LTR MaLR -155 405 179 7 1598 276 224 159 53 chr2 132869922 132870054 -48878033 - MLT1F2 LTR MaLR -358 211 66 7 1598 1153 259 141 17 chr2 132874270 132874624 -48873463 + MLT1F LTR MaLR 91 488 -60 7 1598 1121 263 136 15 chr2 132875111 132875435 -48872652 + MTE2b LTR MaLR 6 368 -11 7 1598 778 281 45 0 chr2 132877811 132877875 -48870212 + MTE-int LTR MaLR 1213 1284 -296 7 1598 2645 143 59 18 chr2 132877875 132878381 -48869706 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 527 0 7 1598 778 281 45 0 chr2 132878381 132878537 -48869550 + MTE-int LTR MaLR 1285 1442 -138 7 1598 637 265 37 37 chr2 132878576 132878764 -48869323 + MTEa LTR MaLR 4 191 -188 7 1598 743 262 26 21 chr2 132880483 132880674 -48867413 + MTEa LTR MaLR 186 377 -2 7 1598 6691 26 40 5 chr2 132884077 132884871 -48863216 + RLTR13B2 LTR ERVK 1 822 0 7 1598 380 335 125 22 chr2 132892776 132893093 -48854994 + MLT1F1 LTR MaLR 6 356 -239 7 1598 4026 30 5 0 chr2 132893466 132893900 -48854187 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 7 1598 8192 36 1 0 chr2 132893900 132894835 -48853252 - MMERVK10C-int LTR ERVK 0 7581 6646 7 1598 42993 38 0 1 chr2 132894821 132899768 -48848319 - MMERVK10C-int LTR ERVK -1771 5810 870 7 1598 1423 94 36 3 chr2 132899766 132900068 -48848019 - MMERVK10C-int LTR ERVK -7182 399 1 7 1598 4039 28 5 0 chr2 132900068 132900502 -48847585 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 7 1598 339 327 71 17 chr2 132900517 132900665 -48847422 + MTEb LTR MaLR 223 379 0 7 1598 336 357 79 83 chr2 132901021 132901098 -48846989 + MLT1F1 LTR MaLR 333 413 -166 7 1598 336 357 79 83 chr2 132901734 132901885 -48846202 + MLT1F1 LTR MaLR 414 560 -19 7 1598 647 259 67 24 chr2 132905403 132905613 -48842474 + RMER15 LTR ERVL 357 575 0 8 1599 1170 238 114 31 chr2 132918975 132919300 -48828787 - ORR1E LTR MaLR -7 352 1 8 1599 438 310 79 118 chr2 132924018 132924373 -48823714 + ORR1E LTR MaLR 4 344 -15 8 1599 1084 328 43 48 chr2 132924639 132925081 -48823006 - MER74A LTR ERVL -71 487 48 8 1599 500 306 177 101 chr2 132925927 132926258 -48821829 + MLT-int LTR MaLR 284 670 -1065 8 1599 500 306 177 101 chr2 132926306 132926664 -48821423 + MLT-int LTR MaLR 671 1025 -710 8 1599 743 263 78 69 chr2 132929360 132929605 -48818482 - MTEa LTR MaLR -54 325 79 8 1599 238 125 25 0 chr2 132929626 132929666 -48818421 + ORR1B1 LTR MaLR 354 394 0 8 1599 5391 174 171 18 chr2 132929666 132930283 -48817804 + ORR1B1-int LTR MaLR 1 712 -797 8 1599 5391 174 171 18 chr2 132930402 132930998 -48817089 + ORR1B1-int LTR MaLR 713 1398 -111 8 1599 770 152 48 0 chr2 132930996 132931121 -48816966 + ORR1B1 LTR MaLR 134 264 -130 8 1599 1170 277 20 59 chr2 132932833 132933190 -48814897 + ORR1E LTR MaLR 15 357 -2 8 1599 261 100 161 32 chr2 132933814 132933876 -48814211 + RLTR19-int LTR ERVK 4798 4867 -1270 8 1599 1196 238 151 57 chr2 132942274 132942463 -48805624 - MTD LTR MaLR 0 419 196 8 1599 1196 238 151 57 chr2 132942496 132942689 -48805398 - MTD LTR MaLR -224 195 1 8 1599 2097 171 88 5 chr2 132942861 132943020 -48805067 + MTC LTR MaLR 1 189 -232 8 1599 2097 171 88 5 chr2 132943230 132943458 -48804629 + MTC LTR MaLR 190 419 -2 8 1599 1830 274 22 4 chr2 132946833 132947292 -48800795 - MLT1C LTR MaLR 0 467 1 8 1599 267 211 46 37 chr2 132949074 132949167 -48798920 - MTEa LTR MaLR -14 365 271 8 1599 420 309 231 38 chr2 132952947 132953262 -48794825 + MTEa LTR MaLR 4 379 0 8 1599 788 254 74 13 chr2 132953610 132953959 -48794128 + MTD LTR MaLR 19 419 0 8 1599 442 340 42 148 chr2 132959402 132959893 -48788194 - MLT1G3 LTR MaLR -6 573 112 8 1599 458 368 53 8 chr2 132960175 132960438 -48787649 - MLT1H1 LTR MaLR 0 555 281 8 1599 260 329 12 0 chr2 132968533 132968615 -48779472 - LTR33A LTR ERVL -87 433 351 9 1599 595 313 145 8 chr2 132973123 132973371 -48774716 - MLT1H LTR MaLR -245 304 23 9 1599 2174 106 0 59 chr2 132979556 132979897 -48768190 + ORR1A4 LTR MaLR 1 321 -8 9 1599 993 227 170 49 chr2 132986831 132987201 -48760886 + MTD LTR MaLR 5 419 0 9 1599 230 240 53 13 chr2 132988336 132988412 -48759675 + MTEb LTR MaLR 288 366 -13 9 1599 732 313 53 84 chr2 132988425 132988796 -48759291 + ORR1E LTR MaLR 9 379 0 9 1599 372 273 159 35 chr2 133000335 133000536 -48747551 + MER90a LTR ERV1 67 292 -322 1 1599 360 271 63 21 chr2 133000535 133000678 -48747409 + RMER15 LTR ERVL 423 571 -4 2 1599 429 320 61 22 chr2 133001898 133002128 -48745959 + RMER15 LTR ERVL 337 575 0 4 1599 728 306 79 9 chr2 133002153 133002483 -48745604 + MLT1F LTR MaLR 184 536 -12 5 1599 500 125 12 0 chr2 133003215 133003295 -48744792 + MTD LTR MaLR 1 81 -338 8 1599 711 291 21 113 chr2 133011518 133011809 -48736278 + MTEb-int LTR MaLR 2 265 -1315 2 1599 1311 265 98 19 chr2 133011781 133012200 -48735887 + MTEb-int LTR MaLR 1128 1579 -1 2 1599 956 325 22 0 chr2 133012205 133012476 -48735611 + MTEb LTR MaLR 6 282 -97 2 1599 1731 174 38 9 chr2 133015025 133015366 -48732721 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 24 2 1599 572 232 77 6 chr2 133018630 133018799 -48729288 + MLT1C LTR MaLR 49 229 -238 3 1599 318 159 0 16 chr2 133019509 133019573 -48728514 + MLT1C LTR MaLR 328 390 0 3 1599 271 271 96 15 chr2 133019928 133020063 -48728024 + LTR16A1 LTR ERVL 219 364 -92 3 1599 3464 208 51 72 chr2 133023785 133024706 -48723381 + RMER13B LTR ERVK 7 908 0 4 1599 400 206 0 0 chr2 133025242 133025315 -48722772 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 298 4 1599 296 203 0 17 chr2 133026037 133026097 -48721990 - ORR1D2 LTR MaLR -55 315 257 4 1599 615 269 35 79 chr2 133027072 133027141 -48720946 - ORR1D2 LTR MaLR -172 198 127 4 1599 1874 157 23 70 chr2 133027141 133027538 -48720549 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 4 1599 615 269 35 79 chr2 133027538 133027670 -48720417 - ORR1D2 LTR MaLR -244 126 6 4 1599 356 338 91 36 chr2 133028825 133029046 -48719041 + MLT2F LTR ERVL 260 492 -171 4 1599 731 317 75 26 chr2 133030362 133030709 -48717378 + MT2A LTR ERVL 102 465 -68 4 1599 1528 170 138 3 chr2 133030870 133031188 -48716899 + ORR1C2 LTR MaLR 24 384 0 5 1600 1089 255 88 3 chr2 133039929 133040212 -48707875 - MTD LTR MaLR -94 325 19 6 1600 259 250 17 0 chr2 133044358 133044418 -48703669 - LTR16C LTR ERVL -238 251 191 6 1600 290 319 118 7 chr2 133044441 133044577 -48703510 + MLT1D LTR MaLR 1 151 -354 6 1600 646 311 77 37 chr2 133044719 133045043 -48703044 + ORR1E LTR MaLR 3 339 -20 6 1600 242 241 57 82 chr2 133047114 133047236 -48700851 + RMER20B LTR ERVK 488 606 -21 7 1600 279 331 39 55 chr2 133047407 133047589 -48700498 - ORR1D2 LTR MaLR -190 180 2 7 1600 736 162 143 11 chr2 133050453 133050628 -48697459 - MTD LTR MaLR -14 405 208 7 1600 1055 202 10 5 chr2 133050885 133051094 -48696993 - MTD LTR MaLR -207 212 3 7 1600 3215 30 0 230 chr2 133054156 133054722 -48693365 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 8 1600 351 293 138 18 chr2 133057307 133057474 -48690613 - RMER15 LTR ERVL -90 485 299 8 1600 1306 254 44 69 chr2 133059264 133059417 -48688670 + MTE2b LTR MaLR 24 187 -192 8 1600 1306 254 44 69 chr2 133059840 133059857 -48688230 + MTE2b LTR MaLR 188 196 -183 8 1600 1306 254 44 69 chr2 133059888 133060072 -48688015 + MTE2b LTR MaLR 197 377 -2 8 1600 2749 302 79 60 chr2 133060490 133061495 -48686592 + MTE2b-int LTR MaLR 15 1148 -432 9 1600 2749 299 84 61 chr2 133061534 133061905 -48686182 + MTE2b-int LTR MaLR 1149 1577 -3 9 1600 1038 289 46 24 chr2 133061907 133062276 -48685811 + MTE2b LTR MaLR 1 377 -2 9 1600 920 284 67 82 chr2 133071076 133071467 -48676620 + MTC LTR MaLR 5 389 -32 1 1600 1484 231 57 11 chr2 133071467 133071821 -48676266 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 1 1600 1569 227 44 14 chr2 133077934 133078300 -48669787 + MTE2a LTR MaLR 3 379 0 1 1600 784 276 22 26 chr2 133078301 133078528 -48669559 + MTE2a-int LTR MaLR 3 228 -1352 1 1600 2107 281 101 73 chr2 133078562 133079394 -48668693 + MTE2a-int LTR MaLR 724 1578 -2 1 1600 1516 209 43 27 chr2 133079396 133079769 -48668318 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 1 1600 280 294 31 19 chr2 133079805 133079940 -48668147 + MLT1H2 LTR MaLR 62 185 -304 1 1600 247 253 81 40 chr2 133080657 133080756 -48667331 + MLT1H2 LTR MaLR 302 404 -4 1 1600 539 193 28 0 chr2 133093753 133093862 -48654225 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 263 1 1600 626 177 26 0 chr2 133093905 133094018 -48654069 - ORR1D1 LTR MaLR -164 210 95 1 1600 481 342 13 0 chr2 133096951 133097109 -48650978 - MLT1F1 LTR MaLR 0 569 410 1 1600 1468 250 100 8 chr2 133097148 133097527 -48650560 + MTD LTR MaLR 5 418 -1 1 1600 233 320 26 0 chr2 133097527 133097601 -48650486 - MLT1F1 LTR MaLR -212 336 261 1 1600 660 328 135 8 chr2 133101202 133101601 -48646486 - MLT1C LTR MaLR -7 460 11 1 1600 2300 171 10 2 chr2 133105132 133105546 -48642541 + RLTR20D LTR ERVK 1 568 0 1 1600 673 100 20 1 chr2 133107248 133107359 -48640728 + ORR1A4 LTR MaLR 1 170 -189 1 1600 325 183 122 0 chr2 133112197 133112279 -48635808 + ORR1A4 LTR MaLR 279 370 0 1 1600 436 286 33 8 chr2 133112488 133112608 -48635479 - RMER15 LTR ERVL -106 469 347 1 1600 618 254 30 108 chr2 133115505 133115708 -48632379 - MTE-int LTR MaLR -46 1534 1348 1 1600 2460 293 70 24 chr2 133118310 133119058 -48629029 - MTE-int LTR MaLR -232 1348 567 1 1600 462 295 142 37 chr2 133119183 133119401 -48628686 + RMER15 LTR ERVL 299 539 -36 1 1600 687 332 59 47 chr2 133121849 133122181 -48625906 - MER90 LTR ERV1 -144 431 91 1 1600 687 332 59 47 chr2 133122224 133122317 -48625770 - MER90 LTR ERV1 -485 90 1 1 1600 355 292 186 23 chr2 133136785 133136957 -48611130 - LTR16E1 LTR ERVL 0 538 339 1 1600 2388 164 77 3 chr2 133138505 133138897 -48609190 + MTC LTR MaLR 1 421 0 1 1600 361 262 229 17 chr2 133138906 133139081 -48609006 - LTR50 LTR ERVL -517 278 67 1 1600 230 208 90 77 chr2 133141354 133141432 -48606655 + MamGypLTR3 LTR Gypsy 394 472 -367 2 1600 1891 176 248 6 chr2 133146149 133146508 -48601579 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 1 2 1600 435 145 0 0 chr2 133150453 133150522 -48597565 - ORR1B1 LTR MaLR 0 367 299 2 1600 510 118 94 0 chr2 133150518 133150603 -48597484 - ORR1B1 LTR MaLR -301 93 1 2 1600 391 316 22 41 chr2 133150975 133151182 -48596905 + MER57C2 LTR ERV1 71 276 -135 2 1600 764 335 28 25 chr2 133152089 133152374 -48595713 + MLT1I LTR MaLR 77 362 -49 2 1600 1757 248 32 24 chr2 133154942 133155351 -48592736 - MTD LTR MaLR 0 419 8 2 1600 2223 152 57 0 chr2 133168225 133168594 -48579493 - MTC LTR MaLR -31 390 1 2 1601 227 344 66 44 chr2 133169619 133169756 -48578331 - MLT1J2 LTR MaLR -46 402 263 2 1601 2017 206 127 13 chr2 133181957 133182430 -48565657 - RLTR11A2 LTR ERVK 0 527 1 2 1601 227 380 19 0 chr2 133182813 133182921 -48565166 - LTR16A LTR ERVL -233 218 109 2 1601 404 361 78 10 chr2 133194261 133194454 -48553633 - MLT1A0 LTR MaLR -71 294 89 2 1601 767 286 59 8 chr2 133196486 133196740 -48551347 + MLT2B1 LTR ERVL 1 267 -253 2 1601 288 345 50 16 chr2 133202391 133202512 -48545575 + LTR16C LTR ERVL 258 382 -107 3 1601 285 300 113 102 chr2 133202508 133202783 -48545304 - ORR1E LTR MaLR -5 354 77 3 1601 1832 100 61 4 chr2 133208367 133208647 -48539440 + RMER19A LTR ERVK 1 296 -441 3 1601 2285 112 15 58 chr2 133208647 133208989 -48539098 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 3 1601 6638 152 178 68 chr2 133208989 133210603 -48537484 - ORR1A2-int LTR MaLR 0 1792 1 3 1601 2270 94 3 59 chr2 133210607 133210945 -48537142 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 3 1601 296 280 23 113 chr2 133211184 133211361 -48536726 + MLT1C LTR MaLR 297 457 -10 3 1601 2487 159 39 10 chr2 133211831 133212238 -48535849 - MTC LTR MaLR -2 419 1 3 1601 257 266 38 12 chr2 133216118 133216198 -48531889 + RMER15 LTR ERVL 429 510 -65 3 1601 1647 230 42 79 chr2 133216771 133217200 -48530887 + MTD LTR MaLR 5 417 -2 3 1601 661 333 81 58 chr2 133227741 133228171 -48519916 - LTR16A1 LTR ERVL 0 456 17 3 1601 1369 255 61 100 chr2 133228772 133229342 -48518745 + RMER15 LTR ERVL 27 574 -1 3 1601 466 240 0 85 chr2 133233443 133233584 -48514503 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 280 3 1601 377 283 58 72 chr2 133235014 133235265 -48512822 - MLT1H LTR MaLR 0 591 301 3 1601 377 308 82 91 chr2 133235301 133235380 -48512707 - MLT1H LTR MaLR -249 300 224 3 1601 1160 240 140 13 chr2 133236928 133237236 -48510851 + ORR1E LTR MaLR 4 350 -9 3 1601 465 321 73 87 chr2 133238447 133238899 -48509188 - MLT1H2 LTR MaLR -6 543 83 3 1601 479 340 81 27 chr2 133244654 133244875 -48503212 - MLT1K LTR MaLR -319 276 44 3 1601 814 350 69 61 chr2 133249465 133249943 -48498144 - LTR33A_ LTR ERVL -46 485 4 3 1601 329 295 0 67 chr2 133250465 133250614 -48497473 - MT2A LTR ERVL 0 533 395 3 1601 294 302 58 11 chr2 133250655 133250742 -48497345 - MT2A LTR ERVL -130 403 313 3 1601 1139 264 30 24 chr2 133250918 133251242 -48496845 - MT2A LTR ERVL -205 328 3 3 1601 307 243 14 0 chr2 133251322 133251396 -48496691 - LTR33A LTR ERVL 0 520 446 3 1601 926 255 49 49 chr2 133261694 133262044 -48486043 + ORR1E LTR MaLR 1 350 -9 4 1601 395 280 28 0 chr2 133265638 133265745 -48482342 + MLT2B3 LTR ERVL 1 110 -444 4 1601 228 352 32 16 chr2 133265800 133265924 -48482163 + ORR1E LTR MaLR 66 191 -168 4 1601 283 333 47 23 chr2 133266438 133266610 -48481477 + MLT1E3 LTR MaLR 71 246 -378 4 1601 247 277 149 0 chr2 133266682 133266776 -48481311 + MLT1E3 LTR MaLR 354 461 -166 4 1601 833 180 44 11 chr2 133277910 133278090 -48469997 - RLTR12B LTR ERVK -12 516 331 4 1601 289 158 406 73 chr2 133278103 133278226 -48469861 - RLTR12B LTR ERVK -364 164 1 4 1601 298 286 0 21 chr2 133278541 133278634 -48469453 + MLT1A1 LTR MaLR 306 396 -12 4 1601 265 344 104 36 chr2 133279123 133279316 -48468771 - MLT1H1 LTR MaLR -12 583 378 4 1601 1213 284 70 18 chr2 133279395 133279793 -48468294 - MTD LTR MaLR 0 419 1 4 1601 396 380 22 0 chr2 133279804 133279988 -48468099 - MLT1H1 LTR MaLR -333 222 35 4 1601 248 300 104 75 chr2 133283349 133283522 -48464565 + MLT1F LTR MaLR 233 410 -138 4 1601 695 328 59 81 chr2 133285368 133285946 -48462141 - MLT1F1 LTR MaLR 0 569 5 4 1601 2422 229 18 18 chr2 133289435 133289894 -48458193 - ORR1C2-int LTR MaLR -819 551 93 4 1601 2422 229 18 18 chr2 133289925 133290016 -48458071 - ORR1C2-int LTR MaLR -1278 92 1 4 1601 782 209 97 16 chr2 133290016 133290201 -48457886 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 185 4 1601 335 360 66 18 chr2 133290632 133290799 -48457288 - MLT1A0 LTR MaLR -3 576 402 4 1601 353 374 7 7 chr2 133292105 133292245 -48455842 - MLT1A0 LTR MaLR -225 140 1 4 1602 261 349 75 109 chr2 133304782 133305104 -48442983 - ORR1E LTR MaLR -14 345 35 4 1602 1726 213 98 3 chr2 133313053 133313429 -48434658 + MTC LTR MaLR 2 413 -8 4 1602 3090 32 15 0 chr2 133313953 133314294 -48433793 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 4 1602 289 320 19 0 chr2 133319670 133319773 -48428314 - RMER15 LTR ERVL -48 527 423 4 1602 225 280 100 167 chr2 133321519 133321699 -48426388 + RMER17A LTR ERVK 518 685 -66 4 1602 299 315 26 44 chr2 133327860 133327973 -48420114 + MLT1H LTR MaLR 82 192 -357 4 1602 415 290 44 113 chr2 133328197 133328546 -48419541 + MLT1H LTR MaLR 221 545 -4 4 1602 249 178 0 0 chr2 133341064 133341109 -48406978 + MER57C2 LTR ERV1 125 169 -265 5 1602 275 317 30 0 chr2 133342378 133342479 -48405608 + MTEb LTR MaLR 1 104 -275 5 1602 3275 282 74 31 chr2 133342477 133343655 -48404432 + MTEa-int LTR MaLR 211 1439 -141 5 1602 504 288 12 12 chr2 133343781 133343946 -48404141 + MTEa-int LTR MaLR 1416 1580 0 5 1602 994 281 96 3 chr2 133343948 133344280 -48403807 + MTEa LTR MaLR 3 365 -14 5 1602 1142 274 68 24 chr2 133344676 133345046 -48403041 + MTD LTR MaLR 18 403 -16 5 1602 977 319 90 16 chr2 133349476 133349967 -48398120 - MT2A LTR ERVL -4 529 3 5 1602 284 299 76 55 chr2 133353724 133353869 -48394218 - MTEa LTR MaLR 0 379 232 5 1602 247 287 102 47 chr2 133354085 133354213 -48393874 - MTEa LTR MaLR -203 156 22 5 1602 1871 208 42 14 chr2 133357525 133357954 -48390133 + BGLII_B LTR ERVK 1 441 0 5 1602 474 320 137 36 chr2 133360313 133360699 -48387388 - LTR33A LTR ERVL -2 518 94 5 1602 586 302 113 0 chr2 133361687 133361909 -48386178 - MLT1G LTR MaLR -333 258 12 5 1602 582 341 59 9 chr2 133372437 133372656 -48375431 + MLT1E1A LTR MaLR 29 258 -396 5 1602 810 279 50 17 chr2 133372720 133372961 -48375126 + MLT1E1A LTR MaLR 432 680 0 5 1602 247 167 0 0 chr2 133373681 133373723 -48374364 - ORR1E LTR MaLR -16 363 322 5 1602 433 241 90 67 chr2 133373763 133373941 -48374146 - ORR1E LTR MaLR -122 237 56 5 1602 1899 190 30 40 chr2 133398214 133398619 -48349468 - MTD LTR MaLR -18 401 1 5 1602 527 324 31 24 chr2 133398649 133398849 -48349238 - MLT1F1 LTR MaLR -12 642 408 5 1602 258 302 95 80 chr2 133398906 133399043 -48349044 - MLT1F1 LTR MaLR -375 194 56 5 1602 3554 38 2 0 chr2 133405767 133406161 -48341926 + MTA_Mm LTR MaLR 2 396 0 5 1602 2637 157 18 5 chr2 133408473 133408908 -48339179 + RMER10A LTR ERVL 1 441 -1 5 1602 306 243 27 13 chr2 133413762 133413837 -48334250 - MTEb LTR MaLR -11 368 293 6 1602 228 222 62 31 chr2 133414221 133414286 -48333801 + MTEa LTR MaLR 290 356 -23 6 1602 2368 180 50 104 chr2 133414986 133415544 -48332543 + RLTR11A LTR ERVK 1 528 0 6 1602 1111 234 27 82 chr2 133416486 133416931 -48331156 - MTD LTR MaLR -10 390 1 6 1602 2780 112 11 36 chr2 133423667 133424111 -48323976 + RLTR20A LTR ERVK 7 439 -102 6 1602 549 177 291 18 chr2 133424163 133424215 -48323872 + RLTR20A LTR ERVK 476 541 0 6 1602 2297 120 9 58 chr2 133426095 133426441 -48321646 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 6 1603 997 254 159 15 chr2 133431345 133431685 -48316402 - MTD LTR MaLR -19 400 12 6 1603 2232 214 85 26 chr2 133437798 133438233 -48309854 + RLTR20B1 LTR ERVK 1 468 -95 6 1603 2232 214 85 26 chr2 133438278 133438374 -48309713 + RLTR20B1 LTR ERVK 469 562 -1 6 1603 256 355 21 43 chr2 133459307 133459448 -48288639 + MLT1H2 LTR MaLR 348 485 -4 6 1603 501 332 52 45 chr2 133461259 133461546 -48286541 - LTR83 LTR ERVL -294 486 198 6 1603 252 321 110 37 chr2 133461714 133461905 -48286182 + LTR16E2 LTR ERVL 354 558 -10 6 1603 235 330 21 21 chr2 133462492 133462588 -48285499 - LTR33 LTR ERVL -156 359 264 6 1603 713 232 86 13 chr2 133464079 133464261 -48283826 + MTD LTR MaLR 228 403 -16 6 1603 305 227 69 40 chr2 133464731 133464832 -48283255 - RMER15 LTR ERVL -445 130 27 6 1603 702 314 40 20 chr2 133464901 133465151 -48282936 + MLT1E2 LTR MaLR 345 599 -28 6 1603 280 360 93 78 chr2 133465162 133465496 -48282591 - ORR1E LTR MaLR -15 344 6 6 1603 1811 191 123 59 chr2 133466603 133467025 -48281062 - RMER20B LTR ERVK -169 458 10 6 1603 429 336 65 22 chr2 133475159 133475394 -48272693 + MLT1H LTR MaLR 52 342 -207 6 1603 1105 229 163 21 chr2 133498273 133498446 -48249641 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 177 7 1603 1105 229 163 21 chr2 133498517 133498669 -48249418 - ORR1D1 LTR MaLR -198 176 5 7 1603 1790 204 32 16 chr2 133507486 133507860 -48240227 + MTD LTR MaLR 3 382 -37 7 1603 2171 151 96 3 chr2 133509806 133510191 -48237896 + MTC LTR MaLR 1 421 0 8 1603 325 227 82 60 chr2 133510385 133510458 -48237629 - RMER17A LTR ERVK -264 487 406 9 1603 325 227 82 60 chr2 133510495 133510604 -48237483 - RMER17A LTR ERVK -346 405 301 9 1603 823 205 329 7 chr2 133512313 133512593 -48235494 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 1 1603 1713 233 16 6 chr2 133514543 133514906 -48233181 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 8 1 1603 426 347 16 63 chr2 133515632 133515958 -48232129 + ORR1E LTR MaLR 54 379 0 2 1603 1245 296 71 36 chr2 133515958 133516453 -48231634 + ORR1E-int LTR MaLR 1 512 -1068 2 1603 411 291 77 109 chr2 133516487 133516734 -48231353 + RMER15 LTR ERVL 337 575 0 2 1603 344 159 227 0 chr2 133517179 133517267 -48230820 - RLTR11A LTR ERVK 0 527 420 2 1603 701 218 81 13 chr2 133517256 133517405 -48230682 - RLTR11A LTR ERVK -369 159 1 2 1603 362 243 9 37 chr2 133520120 133520227 -48227860 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 305 2 1603 532 327 49 81 chr2 133531333 133531702 -48216385 - ORR1E LTR MaLR 0 359 3 3 1603 539 317 60 78 chr2 133536128 133536460 -48211627 + ORR1E LTR MaLR 11 336 -23 4 1603 432 237 20 103 chr2 133538271 133538296 -48209791 + MT2B LTR ERVL 145 157 -444 4 1603 366 407 70 65 chr2 133539063 133539604 -48208483 + MLT1K LTR MaLR 48 591 -4 4 1603 348 316 65 17 chr2 133546081 133546224 -48201863 + LTR16C LTR ERVL 305 516 -52 5 1603 362 313 126 42 chr2 133547468 133547763 -48200324 + MLT1G3 LTR MaLR 161 433 -56 5 1603 244 301 155 54 chr2 133547793 133547838 -48200249 + MLT1G3 LTR MaLR 434 481 -8 5 1604 228 289 0 67 chr2 133568836 133568925 -48179162 + MLT1C LTR MaLR 381 463 -4 9 1604 1392 233 113 0 chr2 133569616 133569951 -48178136 + MTD LTR MaLR 46 418 -1 9 1604 325 289 82 0 chr2 133576733 133576830 -48171257 + MER57C2 LTR ERV1 11 115 -319 1 1604 262 125 0 0 chr2 133577977 133578017 -48170070 + MER57C2 LTR ERV1 176 215 -219 1 1604 561 245 80 6 chr2 133585626 133585788 -48162299 - ORR1D1 LTR MaLR -213 181 1 1 1604 240 326 20 20 chr2 133585838 133585938 -48162149 + MLT1C LTR MaLR 368 467 0 1 1604 1717 234 29 37 chr2 133623883 133623900 -48124187 - MTD LTR MaLR 0 419 403 1 1604 2805 58 0 0 chr2 133623900 133624246 -48123841 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 1 1604 1717 234 29 37 chr2 133624246 133624637 -48123450 - MTD LTR MaLR -17 402 14 1 1604 549 329 132 94 chr2 133631474 133631708 -48116379 + MLT1E2 LTR MaLR 242 448 -179 1 1604 549 329 132 94 chr2 133631782 133631919 -48116168 + MLT1E2 LTR MaLR 449 627 0 1 1604 400 216 58 47 chr2 133643456 133643646 -48104441 - RMER17C LTR ERVK -120 290 99 1 1604 1232 130 20 95 chr2 133647113 133647366 -48100721 + ORR1A2-int LTR MaLR 1740 1963 0 1 1604 1261 167 113 4 chr2 133647366 133647623 -48100464 + ORR1A2 LTR MaLR 38 316 -30 1 1604 455 37 0 0 chr2 133648641 133648695 -48099392 + ORR1A3 LTR MaLR 272 325 -1 1 1604 275 343 30 0 chr2 133651005 133651104 -48096983 + MLT1A1 LTR MaLR 54 155 -253 1 1604 1696 221 56 5 chr2 133653279 133653652 -48094435 + MTC LTR MaLR 21 412 -9 2 1604 277 289 105 38 chr2 133660641 133660774 -48087313 + MLT1A1 LTR MaLR 256 397 -11 2 1604 260 265 83 12 chr2 133661866 133661950 -48086137 + ORR1E LTR MaLR 259 348 -11 2 1604 394 404 12 4 chr2 133661969 133662210 -48085877 - MLT1D LTR MaLR 0 505 263 2 1604 280 315 130 57 chr2 133662222 133662414 -48085673 - MLT1D LTR MaLR -299 206 1 2 1604 266 279 69 11 chr2 133662818 133662905 -48085182 - MLT1A1 LTR MaLR -8 400 309 2 1604 384 300 92 33 chr2 133663561 133663833 -48084254 + ERVL-E-int LTR ERVL 3644 3931 -1736 2 1604 950 314 32 18 chr2 133665480 133665823 -48082264 + MLT1A0 LTR MaLR 18 365 0 2 1604 325 111 0 0 chr2 133668539 133668593 -48079494 - MT2A LTR ERVL 0 533 480 2 1604 1064 182 99 53 chr2 133668593 133668904 -48079183 + IAPEY3_LTR LTR ERVK 1 388 -2 2 1604 1468 105 12 10 chr2 133668908 133669249 -48078838 + MMERVK10C-int LTR ERVK 3 422 -7159 2 1604 792 102 8 0 chr2 133669310 133669437 -48078650 + MMERVK10C-int LTR ERVK 708 835 -6746 2 1604 777 182 97 0 chr2 133669451 133669616 -48078471 + IAPEz-int LTR ERVK 323 503 -4903 2 1604 520 229 238 17 chr2 133669584 133669819 -48078268 + RLTR19-int LTR ERVK 376 662 -5475 2 1604 262 255 50 20 chr2 133669929 133670029 -48078058 + RLTR19-int LTR ERVK 1462 1564 -6017 2 1604 355 140 0 0 chr2 133670048 133670105 -48077982 + IAPEz-int LTR ERVK 447 503 -6039 2 1604 703 118 303 0 chr2 133670105 133670296 -48077791 + IAPEz-int LTR ERVK 5007 5255 -1287 2 1604 1586 103 60 26 chr2 133670353 133670622 -48077465 + IAPEY3-int LTR ERVK 7060 7337 -343 2 1604 1221 204 55 15 chr2 133670640 133670983 -48077104 + IAPEz-int LTR ERVK 6125 6481 0 2 1604 996 194 102 56 chr2 133670983 133671294 -48076793 + IAPEY3_LTR LTR ERVK 1 388 -2 2 1604 907 216 126 96 chr2 133671534 133671957 -48076130 - MT2B LTR ERVL -40 561 1 2 1604 5577 63 13 24 chr2 133681068 133681847 -48066240 + RLTR13C2 LTR ERVK 18 787 -21 2 1604 1869 211 140 0 chr2 133692783 133693239 -48054848 - RMER15 LTR ERVL -54 521 2 2 1605 4074 182 76 54 chr2 133695256 133696139 -48051948 - RMER19B LTR ERVK 0 902 1 2 1605 3191 90 29 33 chr2 133700710 133701194 -48046893 + RLTR45 LTR ERVK 1 482 0 2 1605 3432 35 0 0 chr2 133711616 133712012 -48036075 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 1605 596 261 22 146 chr2 133726470 133726697 -48021390 + MTD LTR MaLR 4 202 -177 3 1605 594 224 88 47 chr2 133726774 133726939 -48021148 + MTD LTR MaLR 204 365 -14 3 1605 1741 188 39 25 chr2 133733423 133733855 -48014232 + RMER3D-int LTR ERVK 2343 2780 -62 3 1605 395 233 73 13 chr2 133733874 133733999 -48014088 + MTD LTR MaLR 212 358 -61 3 1605 789 170 35 0 chr2 133738782 133738923 -48009164 + ORR1D1 LTR MaLR 1 146 -228 3 1605 967 232 11 7 chr2 133740039 133740260 -48007827 + ORR1D1 LTR MaLR 100 364 -10 3 1605 602 357 31 18 chr2 133741887 133742115 -48005972 + MER68 LTR ERVL 324 554 -9 3 1605 1520 145 247 29 chr2 133742627 133743004 -48005083 + RMER6B LTR ERVK 3 461 0 3 1605 1129 245 17 145 chr2 133772735 133773150 -47974937 + MTE2a LTR MaLR 1 362 -17 3 1605 2753 63 0 0 chr2 133788761 133789093 -47958994 + IAPEY3_LTR LTR ERVK 1 332 0 3 1605 2690 179 57 10 chr2 133801772 133802268 -47945819 + RLTR17 LTR ERVK 161 678 -14 4 1605 2690 179 57 10 chr2 133802292 133802303 -47945784 + RLTR17 LTR ERVK 679 691 -1 4 1605 343 261 134 9 chr2 133802305 133802364 -47945723 + RMER3D-int LTR ERVK 3 61 -2781 4 1605 343 261 134 9 chr2 133802399 133802451 -47945636 + RMER3D-int LTR ERVK 62 128 -2714 4 1605 6382 190 48 74 chr2 133802463 133804587 -47943500 + RMER3D-int LTR ERVK 163 2695 -147 4 1605 6382 185 45 77 chr2 133804722 133804876 -47943211 + RMER3D-int LTR ERVK 2696 2842 0 4 1605 2128 178 25 3 chr2 133804876 133805236 -47942851 + RLTR17 LTR ERVK 1 368 -324 4 1605 309 319 96 84 chr2 133806773 133807059 -47941028 + MLT1G LTR MaLR 6 283 -296 4 1605 227 340 90 0 chr2 133807188 133807288 -47940799 + MLT1G LTR MaLR 449 557 -12 4 1605 857 226 158 51 chr2 133822272 133822608 -47925479 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 3 4 1606 1344 261 39 17 chr2 133825748 133826107 -47921980 + ORR1D2 LTR MaLR 4 370 0 4 1606 427 374 57 25 chr2 133838784 133839028 -47909059 - MLT1A1 LTR MaLR -155 253 2 4 1606 441 295 114 53 chr2 133852241 133852586 -47895501 + ORR1E LTR MaLR 1 379 0 4 1606 326 347 64 72 chr2 133860861 133861234 -47886853 + ORR1D1 LTR MaLR 3 372 -2 4 1606 496 333 62 77 chr2 133868496 133868834 -47879253 + MLT1B LTR MaLR 2 334 -56 5 1606 307 173 0 0 chr2 133869853 133869905 -47878182 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 275 5 1606 740 298 49 122 chr2 133873104 133873433 -47874654 + MTE2b LTR MaLR 1 305 -74 5 1606 350 261 11 0 chr2 133873522 133873614 -47874473 + MTE2b LTR MaLR 278 370 -9 5 1606 527 261 181 29 chr2 133880300 133880505 -47867582 + MLT1A1 LTR MaLR 130 368 -40 5 1606 579 309 24 62 chr2 133890770 133891042 -47857045 - ORR1E LTR MaLR -116 254 4 5 1606 3004 111 56 23 chr2 133896175 133896655 -47851432 - MT2B LTR ERVL 0 601 106 5 1606 440 270 34 132 chr2 133896523 133896788 -47851299 - ORR1E-int LTR MaLR -1157 806 568 5 1606 5600 169 33 6 chr2 133896792 133897801 -47850286 - MERVL_2A-int LTR ERVL -136 5625 4590 5 1606 1471 168 16 75 chr2 133905906 133906204 -47841883 + RLTR20A LTR ERVK 1 281 -260 5 1606 809 147 12 30 chr2 133906621 133906789 -47841298 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 1 165 -2161 5 1606 2400 298 125 12 chr2 133916557 133917847 -47830240 - ERVL-int LTR ERVL -83 5674 4239 5 1606 393 275 17 0 chr2 133919053 133919173 -47828914 - ERVL-int LTR ERVL -1656 4101 3980 5 1606 388 304 61 72 chr2 133919211 133919392 -47828695 + MLT1A1 LTR MaLR 193 371 -37 5 1606 360 311 29 41 chr2 133919400 133919571 -47828516 - ERVL-int LTR ERVL -1841 3873 3705 5 1606 266 268 69 54 chr2 133920122 133920252 -47827835 - MT2A LTR ERVL -54 479 348 5 1606 479 323 35 13 chr2 133920875 133921101 -47826986 + RMER15-int LTR ERVL 220 450 -4549 5 1606 898 282 21 26 chr2 133921378 133921717 -47826370 + RMER15-int LTR ERVL 1156 1492 -3507 5 1606 2807 288 32 49 chr2 133921744 133922184 -47825903 + RMER15-int LTR ERVL 1458 1876 -3123 5 1606 2807 288 32 49 chr2 133922241 133922922 -47825165 + RMER15-int LTR ERVL 1877 2559 -2440 5 1606 649 286 142 28 chr2 133922940 133923335 -47824752 + RMER15-int LTR ERVL 4158 4597 -402 5 1606 295 268 0 58 chr2 133923607 133923694 -47824393 + RMER15-int LTR ERVL 4895 4976 -23 5 1606 343 329 73 0 chr2 133924040 133924177 -47823910 + RMER15 LTR ERVL 406 552 -23 5 1606 333 360 96 0 chr2 133933369 133933547 -47814540 - LTR16C LTR ERVL -3 486 292 6 1606 7576 82 10 16 chr2 133939734 133940764 -47807323 + RLTR13D5 LTR ERVK 1 1023 0 6 1606 2300 179 70 18 chr2 133948692 133949193 -47798894 - RLTR11A2 LTR ERVK 0 527 1 6 1607 1080 246 92 66 chr2 133962925 133963434 -47784653 + RMER17B LTR ERVK 1 904 -4 6 1607 228 323 20 30 chr2 133970170 133970269 -47777818 - MTEb LTR MaLR -4 375 278 6 1607 335 227 50 20 chr2 133971360 133971459 -47776628 - MTD LTR MaLR 0 419 318 6 1607 363 290 7 103 chr2 133971690 133971836 -47776251 + MER34A1 LTR ERV1 71 202 -385 6 1607 1209 262 113 38 chr2 133972284 133972657 -47775430 + MTD LTR MaLR 5 405 -14 6 1607 1192 289 75 3 chr2 133983509 133983856 -47764231 + MTD LTR MaLR 4 375 -44 6 1607 285 358 32 32 chr2 133985602 133985726 -47762361 - MLT1G3 LTR MaLR -296 299 176 6 1607 225 224 0 20 chr2 133994651 133994701 -47753386 - LTR87 LTR ERVL? -301 323 275 7 1607 1642 246 58 25 chr2 133995064 133995464 -47752623 + MTD LTR MaLR 7 419 0 7 1607 237 216 20 0 chr2 133996341 133996392 -47751695 + RMER15 LTR ERVL 3 54 -521 7 1607 608 331 27 41 chr2 133997333 133997626 -47750461 + RMER15 LTR ERVL 273 561 -14 7 1607 505 235 14 57 chr2 133998083 133998223 -47749864 - ORR1E-int LTR MaLR -1078 502 369 7 1607 1997 164 125 0 chr2 133998236 133998603 -47749484 + MTC LTR MaLR 1 413 -8 7 1607 560 310 205 10 chr2 133998602 133998897 -47749190 - ORR1E-int LTR MaLR -1217 363 12 7 1607 299 339 64 45 chr2 133998909 133999257 -47748830 - ORR1E LTR MaLR 0 379 6 7 1607 281 175 0 0 chr2 133999257 133999314 -47748773 + MLT1D LTR MaLR 445 501 -4 7 1607 3240 163 98 19 chr2 134008578 134008873 -47739214 + RMER6A LTR ERVK 1 350 -406 1 1607 3240 163 98 19 chr2 134009019 134009388 -47738699 + RMER6A LTR ERVK 351 716 -40 1 1607 1509 321 110 26 chr2 134019871 134020781 -47727306 - MTE-int LTR MaLR -448 1132 147 3 1607 484 161 12 2 chr2 134024042 134024139 -47723948 + MTD LTR MaLR 10 106 -301 3 1607 1816 144 24 60 chr2 134027235 134027568 -47720519 - ORR1A4 LTR MaLR -8 321 1 4 1607 455 335 5 74 chr2 134028853 134029056 -47719031 - MTEb LTR MaLR -171 208 20 4 1607 1532 289 89 12 chr2 134029068 134029628 -47718459 + MTE-int LTR MaLR 36 638 -942 4 1607 1088 297 81 50 chr2 134030332 134030729 -47717358 + MT2A LTR ERVL 118 526 -7 4 1607 1293 304 159 23 chr2 134032416 134033025 -47715062 + MTE-int LTR MaLR 851 1580 0 4 1607 829 262 141 46 chr2 134033035 134033319 -47714768 + MTE2b LTR MaLR 35 345 -34 5 1607 1301 229 30 7 chr2 134034101 134034396 -47713691 + RMER15 LTR ERVL 9 310 -265 5 1607 1394 238 17 0 chr2 134034419 134034709 -47713378 + RMER15-int LTR ERVL 3 297 -4702 5 1607 2415 262 38 8 chr2 134034948 134035549 -47712538 + RMER15-int LTR ERVL 303 921 -4078 5 1607 3641 270 130 17 chr2 134036703 134037716 -47710371 + RMER15-int LTR ERVL 931 2058 -2941 5 1607 796 224 93 49 chr2 134037716 134037941 -47710146 + RMER15 LTR ERVL 341 575 0 5 1607 404 321 39 97 chr2 134042362 134042569 -47705518 + ORR1E LTR MaLR 43 237 -122 6 1607 346 178 19 24 chr2 134042660 134042740 -47705347 + ORR1E LTR MaLR 281 376 -3 6 1607 285 360 92 13 chr2 134051717 134051881 -47696206 + MTC LTR MaLR 8 183 -236 7 1607 417 53 0 18 chr2 134061971 134062021 -47686066 - MTB LTR MaLR 0 400 351 9 1607 6531 113 25 60 chr2 134062021 134063158 -47684929 + MT-int LTR MaLR 1 1098 0 9 1607 2833 92 2 2 chr2 134063159 134063552 -47684535 + MTB LTR MaLR 8 400 0 9 1607 230 232 43 118 chr2 134069426 134069519 -47678568 - RLTR9E LTR ERVK -266 143 58 1 1607 375 352 50 14 chr2 134076204 134076345 -47671742 + MLT1H1 LTR MaLR 214 359 -196 1 1607 785 323 20 43 chr2 134076582 134076883 -47671204 - ERVL-int LTR ERVL -946 4811 4518 1 1607 742 336 82 42 chr2 134077360 134077960 -47670127 - ERVL-int LTR ERVL -1662 4052 3429 1 1607 1280 284 56 28 chr2 134084152 134084543 -47663544 + MTD LTR MaLR 1 402 -17 1 1608 1111 294 58 50 chr2 134089324 134089686 -47658401 + ORR1D2 LTR MaLR 6 370 0 1 1608 3321 288 53 64 chr2 134089686 134090959 -47657128 + ORR1D2-int LTR MaLR 1 1259 -111 1 1608 3101 159 20 6 chr2 134092411 134092911 -47655176 + RLTR17 LTR ERVK 186 692 0 1 1608 320 189 0 98 chr2 134092911 134092993 -47655094 + RMER3D-int LTR ERVK 1 74 -2768 1 1608 1962 185 22 42 chr2 134093135 134093592 -47654495 + RMER3D-int LTR ERVK 2355 2802 -40 1 1608 1710 199 3 3 chr2 134093592 134093889 -47654198 + RLTR17 LTR ERVK 72 368 -324 1 1608 1308 223 172 88 chr2 134096481 134096950 -47651137 + MT2A LTR ERVL 1 601 0 1 1608 654 357 51 37 chr2 134097405 134097757 -47650330 - ORR1E LTR MaLR -2 357 1 1 1608 525 366 61 7 chr2 134100549 134100843 -47647244 + MER76 LTR ERVL 382 691 0 1 1608 317 251 77 167 chr2 134101114 134101348 -47646739 - MLT1A1 LTR MaLR -195 213 1 1 1608 938 155 73 24 chr2 134112323 134112488 -47635599 - RMER6D LTR ERVK -5 715 543 1 1608 374 254 170 12 chr2 134117283 134117454 -47630633 - MLT1D LTR MaLR -260 245 48 1 1608 686 333 112 21 chr2 134119564 134119904 -47628183 + MTE2a LTR MaLR 1 371 -8 1 1608 1495 211 92 40 chr2 134122924 134123324 -47624763 + MTC LTR MaLR 1 421 0 1 1608 1315 263 88 15 chr2 134129099 134129442 -47618645 + ORR1D2 LTR MaLR 3 370 0 1 1608 529 223 119 21 chr2 134129846 134130028 -47618059 - MTD LTR MaLR -2 417 204 1 1608 1572 228 135 80 chr2 134130169 134130731 -47617356 - MTC-int LTR MaLR -529 729 137 1 1608 926 335 25 7 chr2 134130728 134131005 -47617082 - MTD LTR MaLR -105 314 33 1 1608 319 306 157 25 chr2 134138644 134138848 -47609239 - RMER20B LTR ERVK -271 356 126 2 1608 2937 23 6 0 chr2 134160721 134161063 -47587024 + ORR1A0 LTR MaLR 1 344 -2 2 1608 351 369 78 96 chr2 134167552 134167885 -47580202 - MLT1H1 LTR MaLR -219 336 10 2 1608 1102 265 45 97 chr2 134170047 134170427 -47577660 - MTE2a LTR MaLR -19 360 1 2 1608 1818 246 35 2 chr2 134185172 134185568 -47562519 + MTD LTR MaLR 8 416 -3 2 1608 509 294 204 19 chr2 134212217 134212487 -47535600 - MLT1A1 LTR MaLR -56 352 33 2 1608 631 292 81 113 chr2 134213046 134213575 -47534512 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 512 -15 3 1608 2144 190 36 24 chr2 134214956 134215372 -47532715 - MTC LTR MaLR 0 421 1 3 1608 539 165 0 44 chr2 134216462 134216617 -47531470 + RMER6D LTR ERVK 1 191 -529 3 1609 1384 174 80 160 chr2 134221741 134222037 -47526050 + ORR1B1 LTR MaLR 41 337 -57 3 1609 1384 174 80 160 chr2 134222184 134222263 -47525824 + ORR1B1 LTR MaLR 338 386 -8 3 1609 9356 157 43 87 chr2 134222268 134224319 -47523768 + ORR1B1-int LTR MaLR 2 1963 0 3 1609 1740 208 30 6 chr2 134224325 134224664 -47523423 + ORR1B1 LTR MaLR 40 386 -8 3 1609 528 254 16 32 chr2 134233212 134233338 -47514749 + RMER20B LTR ERVK 1 124 -503 3 1609 313 289 56 0 chr2 134249422 134249512 -47498575 + MTE-int LTR MaLR 1246 1340 -240 3 1609 413 216 57 0 chr2 134249644 134249732 -47498355 + MTE2b LTR MaLR 6 98 -281 3 1609 840 367 3 17 chr2 134249714 134250016 -47498071 + MTE2b LTR MaLR 42 339 -40 3 1609 308 364 65 25 chr2 134250399 134250599 -47497488 + LTR16A1 LTR ERVL 249 456 0 3 1609 345 362 86 7 chr2 134257238 134257377 -47490710 - MLT1H LTR MaLR -353 196 47 3 1609 4361 167 41 80 chr2 134257726 134258654 -47489433 - RMER19B LTR ERVK -10 892 1 3 1609 408 383 21 25 chr2 134261096 134261332 -47486755 + MLT1A0 LTR MaLR 69 303 -62 3 1609 2332 174 96 6 chr2 134267281 134267762 -47480325 + RLTR28 LTR ERVL 1 524 0 3 1609 230 275 56 42 chr2 134269649 134269721 -47478366 + ORR1D-int LTR MaLR 570 642 -728 3 1609 2699 93 160 0 chr2 134270200 134270619 -47477468 - RLTR44D LTR ERVK 0 486 1 3 1609 315 330 196 28 chr2 134275883 134276210 -47471877 + MLT1G LTR MaLR 210 591 0 3 1609 2455 201 41 41 chr2 134302253 134302792 -47445295 - RLTR20A LTR ERVK -2 539 1 4 1609 301 351 92 74 chr2 134304143 134304306 -47443781 + MLT1J2 LTR MaLR 265 431 -17 4 1609 1831 238 67 11 chr2 134310194 134310657 -47437430 - ORR1D1-int LTR MaLR -849 521 33 4 1609 1185 197 202 35 chr2 134310677 134310993 -47437094 - ORR1D1 LTR MaLR -1 373 5 4 1609 538 252 96 87 chr2 134325116 134325493 -47422594 - RLTR9E LTR ERVK -1 408 1 4 1609 228 288 34 96 chr2 134326239 134326385 -47421702 + ORR1D1 LTR MaLR 8 144 -230 4 1609 297 341 45 110 chr2 134327610 134327900 -47420187 + MLT1H LTR MaLR 80 350 -199 4 1609 278 346 37 31 chr2 134329316 134329507 -47418580 + MLT1H LTR MaLR 358 549 0 4 1609 283 351 67 36 chr2 134339113 134339164 -47408923 + MLT1B LTR MaLR 1 51 -339 4 1609 1836 155 38 6 chr2 134339164 134339482 -47408605 + ORR1A4 LTR MaLR 2 329 0 4 1609 283 351 67 36 chr2 134339482 134339625 -47408462 + MLT1B LTR MaLR 52 200 -190 4 1609 1334 261 25 31 chr2 134340102 134340458 -47407629 + MTC LTR MaLR 1 354 -67 4 1610 225 360 38 25 chr2 134349725 134349882 -47398205 + LTR16C LTR ERVL 232 390 -99 4 1610 286 234 0 0 chr2 134352390 134352454 -47395633 - MLT1D LTR MaLR -4 501 438 4 1610 248 323 40 73 chr2 134352849 134352862 -47395225 - MLT1D LTR MaLR -60 445 436 4 1610 368 309 169 40 chr2 134352915 134353268 -47394819 - MLT1D LTR MaLR -70 435 34 4 1610 661 288 106 36 chr2 134356853 134357184 -47390903 + MLT2C1 LTR ERVL 1 354 -43 4 1610 1164 175 36 75 chr2 134357261 134357594 -47390493 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 2 321 -1 4 1610 2149 147 102 124 chr2 134361552 134362082 -47386005 + RMER19B LTR ERVK 1 518 -384 4 1610 2622 66 21 0 chr2 134381448 134381783 -47366304 + ORR1A1 LTR MaLR 1 342 -4 5 1610 2040 132 30 0 chr2 134388338 134388640 -47359447 + RLTR10E LTR ERVK 1 311 0 5 1610 778 68 0 0 chr2 134388640 134388743 -47359344 + MMERVK10C-int LTR ERVK 1 103 -7478 5 1610 226 267 0 0 chr2 134388743 134388788 -47359299 + RLTR27 LTR ERVK 231 275 -34 5 1610 1296 116 0 0 chr2 134388788 134388987 -47359100 + MMERVK10C-int LTR ERVK 225 423 -7158 5 1610 2201 167 0 21 chr2 134389087 134389515 -47358572 + MMERVK10C-int LTR ERVK 441 859 -6722 5 1610 1437 165 109 42 chr2 134389505 134389943 -47358144 + ETnERV2-int LTR ERVK 313 819 -4587 5 1610 484 204 88 0 chr2 134389948 134390061 -47358026 + ETnERV2-int LTR ERVK 938 1060 -5077 5 1610 462 204 1 0 chr2 134390085 134390180 -47357907 + ETnERV2-int LTR ERVK 2669 2753 -4653 5 1610 3540 140 98 2 chr2 134390206 134390849 -47357238 + ETnERV2-int LTR ERVK 3567 4271 -3135 5 1610 397 206 13 0 chr2 134390891 134390988 -47357099 + MMETn-int LTR ERVK 2378 2464 -2380 5 1610 810 43 17 17 chr2 134390999 134391117 -47356970 + MMERVK10C-int LTR ERVK 4530 4647 -2934 5 1610 20518 78 23 28 chr2 134391883 134394855 -47353232 + MMERVK10C-int LTR ERVK 4623 7581 0 5 1610 2077 138 0 0 chr2 134394855 134395166 -47352921 + RLTR10E LTR ERVK 1 311 0 5 1610 993 184 6 0 chr2 134397855 134398023 -47350064 - MTC LTR MaLR 0 421 253 5 1610 1890 178 28 63 chr2 134405377 134405804 -47342283 - MTC LTR MaLR -5 416 5 5 1610 1289 131 112 13 chr2 134415430 134415663 -47332424 + RLTR17 LTR ERVK 1 256 -436 5 1610 2800 160 138 11 chr2 134415665 134416202 -47331885 + RLTR1D LTR ERV1 1 605 0 5 1610 2378 167 22 37 chr2 134416202 134416285 -47331802 + RLTR17 LTR ERVK 255 338 -354 5 1610 3465 32 0 128 chr2 134416285 134416785 -47331302 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 5 1610 2378 167 22 37 chr2 134416785 134417129 -47330958 + RLTR17 LTR ERVK 339 677 -15 5 1610 2378 167 22 37 chr2 134417153 134417169 -47330918 + RLTR17 LTR ERVK 678 691 -1 5 1610 280 246 182 32 chr2 134422126 134422252 -47325835 + RLTR25A LTR ERVK 438 582 -521 5 1610 902 302 150 27 chr2 134427578 134428154 -47319933 + ORR1E-int LTR MaLR 714 1494 -86 5 1610 437 291 115 32 chr2 134428166 134428322 -47319765 + ORR1E LTR MaLR 8 176 -183 5 1610 1790 183 456 63 chr2 134428327 134428551 -47319536 + RMER6C LTR ERVK 1 357 -333 5 1610 1790 189 131 76 chr2 134429547 134429904 -47318183 + RMER6C LTR ERVK 358 690 0 5 1610 282 295 44 71 chr2 134431169 134431282 -47316805 + ORR1E LTR MaLR 226 335 -44 5 1610 3207 181 46 19 chr2 134447741 134448440 -47299647 + MYSERV6-int LTR ERVK 3377 4094 -4865 5 1610 1937 227 52 35 chr2 134450392 134451039 -47297048 + MYSERV6-int LTR ERVK 7 248 -2078 5 1610 1937 245 63 66 chr2 134451304 134451954 -47296133 + MYSERV6-int LTR ERVK 249 881 -1445 5 1610 258 262 53 67 chr2 134451965 134452092 -47295995 + RMER4A LTR ERVK 296 533 -52 5 1610 3110 9 0 3 chr2 134454145 134454492 -47293595 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 5 1610 2584 226 19 48 chr2 134455194 134456007 -47292080 + MYSERV6-int LTR ERVK 1093 1881 -445 5 1610 1547 192 57 146 chr2 134456007 134456664 -47291423 + RLTR31_Mm LTR ERVK 2 553 -4 5 1610 1434 204 99 15 chr2 134456665 134457077 -47291010 + MYSERV-int LTR ERVK 6103 6549 -1 5 1610 944 275 136 63 chr2 134457091 134457487 -47290600 + BGLII_B LTR ERVK 7 431 -10 5 1610 1145 295 87 82 chr2 134459432 134460214 -47287873 + RMER15-int LTR ERVL 4162 4947 -52 5 1610 1406 227 114 39 chr2 134460481 134460866 -47287221 + MTD LTR MaLR 1 414 -5 5 1610 805 328 80 43 chr2 134471943 134472319 -47275768 + MLT1F2 LTR MaLR 3 392 -168 6 1610 2331 228 58 20 chr2 134473105 134473660 -47274427 - RLTR20A2 LTR ERVK 0 578 3 6 1610 997 210 79 87 chr2 134473835 134474216 -47273871 + RMER17C LTR ERVK 1 378 -32 6 1610 510 333 90 74 chr2 134474354 134474720 -47273367 - MLT1H1 LTR MaLR -181 374 3 6 1610 1198 196 152 59 chr2 134475752 134476093 -47271994 + ORR1D1 LTR MaLR 1 373 -1 6 1610 2006 110 86 0 chr2 134476852 134477153 -47270934 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 6 1611 476 326 106 5 chr2 134480200 134480388 -47267699 + MLT1E LTR MaLR 1 207 -446 6 1611 4426 131 133 43 chr2 134482115 134482994 -47265093 - RMER17B LTR ERVK 0 958 1 6 1611 915 190 28 28 chr2 134483871 134484024 -47264063 + MTD LTR MaLR 1 153 -266 6 1611 3889 194 89 85 chr2 134484024 134485122 -47262965 + RLTR25A LTR ERVK 1 1103 0 6 1611 1406 161 40 29 chr2 134485122 134485393 -47262694 + MTD LTR MaLR 146 419 0 6 1611 729 262 60 52 chr2 134501281 134501644 -47246443 - ORR1E LTR MaLR 0 379 1 4 1611 1033 345 36 36 chr2 134501644 134502096 -47245991 - ORR1E-int LTR MaLR -53 1527 1076 4 1611 452 351 45 14 chr2 134502092 134502314 -47245773 - ORR1E-int LTR MaLR -1346 234 6 4 1611 311 367 65 23 chr2 134502531 134502746 -47245341 - MTEb LTR MaLR -155 224 1 5 1611 487 305 121 46 chr2 134502760 134503042 -47245045 + ORR1E LTR MaLR 9 311 -48 6 1611 1053 150 58 29 chr2 134503184 134503390 -47244697 - RLTR18B LTR ERVK -63 449 238 8 1611 645 260 48 19 chr2 134504354 134504454 -47243633 + RMER10A LTR ERVL 1 99 -343 1 1611 645 260 48 19 chr2 134504653 134504760 -47243327 + RMER10A LTR ERVL 100 214 -228 1 1611 297 215 119 60 chr2 134506291 134506375 -47241712 + MT2B LTR ERVL 176 264 -337 1 1611 3246 51 3 0 chr2 134510185 134510577 -47237510 - MTA_Mm LTR MaLR -3 393 1 2 1611 1453 251 30 25 chr2 134511862 134512229 -47235858 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 2 2 1611 2136 152 34 27 chr2 134514062 134514474 -47233613 + RMER10A LTR ERVL 26 440 -2 3 1611 1142 213 54 25 chr2 134516279 134516558 -47231529 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 98 3 1611 1622 232 37 56 chr2 134516563 134517025 -47231062 - RLTR11B LTR ERVK 0 453 1 3 1611 330 123 18 0 chr2 134517025 134517078 -47231009 - RLTR11B LTR ERVK -328 125 72 3 1611 1282 162 262 56 chr2 134521628 134521968 -47226119 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 4 1611 312 325 40 77 chr2 134522282 134522579 -47225508 - LTR78 LTR ERV1 -227 1077 792 5 1611 953 291 166 21 chr2 134526079 134526507 -47221580 - MLT1G LTR MaLR 0 591 102 6 1611 318 276 119 60 chr2 134539180 134539365 -47208722 - MLT1H2 LTR MaLR -2 547 352 7 1611 325 316 53 0 chr2 134539987 134540082 -47208005 - MLT1H2 LTR MaLR -306 183 84 7 1611 227 269 61 49 chr2 134540933 134541015 -47207072 + MLT1A1 LTR MaLR 4 86 -322 7 1611 261 244 38 25 chr2 134541290 134541370 -47206717 + ORR1D2 LTR MaLR 283 363 -7 8 1611 2033 182 61 3 chr2 134542562 134542954 -47205133 + MTC LTR MaLR 7 421 0 8 1611 1853 184 60 8 chr2 134545432 134545832 -47202255 + MTC LTR MaLR 1 421 0 8 1611 420 348 65 71 chr2 134547976 134548270 -47199817 - ORR1E LTR MaLR -12 347 56 9 1611 318 339 30 94 chr2 134549827 134550029 -47198058 + MLT1E1 LTR MaLR 466 654 0 9 1611 664 99 10 10 chr2 134550376 134550478 -47197609 - RLTR12A LTR ERVK -466 102 1 1 1611 573 350 115 40 chr2 134564029 134564537 -47183550 + MLT1F2 LTR MaLR 1 556 -4 1 1611 260 386 61 53 chr2 134565522 134565768 -47182319 + LTR16C LTR ERVL 210 457 -32 1 1611 2421 125 39 62 chr2 134572393 134572879 -47175208 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 1 1611 4645 58 4 33 chr2 134572881 134573568 -47174519 + IAPEz-int LTR ERVK 3 662 -5819 1 1611 424 38 0 0 chr2 134573568 134573621 -47174466 + IAPEz-int LTR ERVK 1359 1411 -5070 1 1611 1703 123 4 4 chr2 134573620 134573882 -47174205 + IAPEz-int LTR ERVK 2236 2497 -5183 1 1611 886 73 24 0 chr2 134573879 134574002 -47174085 + IAPEz-int LTR ERVK 4785 4910 -2770 1 1611 20152 13 2 0 chr2 134574004 134576358 -47171729 + IAPEz-int LTR ERVK 4123 6481 0 1 1611 2429 125 39 62 chr2 134576358 134576844 -47171243 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 1 1611 302 319 65 60 chr2 134576954 134577154 -47170933 - LTR85a LTR Gypsy? -30 754 549 1 1611 870 215 48 5 chr2 134585162 134585349 -47162738 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 190 1 1611 2870 214 79 14 chr2 134585346 134585731 -47162356 - ORR1C2-int LTR MaLR -678 692 294 1 1611 2042 168 7 76 chr2 134585731 134586150 -47161937 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 5 1 1611 2870 214 79 14 chr2 134586150 134586413 -47161674 - ORR1C2-int LTR MaLR -1077 293 2 1 1611 331 203 14 0 chr2 134586414 134586483 -47161604 - ORR1C2 LTR MaLR 0 374 305 1 1611 1546 234 60 10 chr2 134592270 134592668 -47155419 + MTD LTR MaLR 1 418 -1 1 1611 1414 246 67 39 chr2 134593429 134593590 -47154497 - MTD LTR MaLR -2 417 244 1 1611 1414 246 67 39 chr2 134593810 134594054 -47154033 - MTD LTR MaLR -176 243 1 1 1611 589 316 105 92 chr2 134595390 134595760 -47152327 - MTEa LTR MaLR 0 379 5 1 1611 2048 189 5 20 chr2 134596340 134596744 -47151343 - RMER10B LTR ERVL 0 398 1 1 1611 371 316 47 84 chr2 134598848 134599222 -47148865 - RLTR20D LTR ERVK -88 489 50 1 1611 1992 117 40 25 chr2 134602837 134603161 -47144926 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 1 1611 720 227 8 33 chr2 134603636 134603817 -47144270 + MTC LTR MaLR 213 421 0 1 1611 1289 226 137 3 chr2 134604462 134604769 -47143318 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 27 1 1611 358 358 87 34 chr2 134606400 134606608 -47141479 - MLT1J1 LTR MaLR -54 390 172 1 1611 4376 130 24 0 chr2 134607221 134607883 -47140204 + RLTR33 LTR ERVK 1 678 0 1 1611 737 330 99 26 chr2 134608353 134608477 -47139610 - MTD LTR MaLR -86 333 189 1 1611 737 321 111 26 chr2 134608528 134608738 -47139349 - MTD LTR MaLR -179 240 1 1 1611 1837 142 126 30 chr2 134610028 134610392 -47137695 + MTB_Mm LTR MaLR 1 399 -8 1 1612 1457 33 0 27 chr2 134615497 134615685 -47132402 + MTA_Mm LTR MaLR 1 183 -213 2 1612 2757 161 91 6 chr2 134616498 134617017 -47131070 - RMER15 LTR ERVL -12 563 1 2 1612 231 262 62 62 chr2 134621719 134621784 -47126303 - MamGypLTR2b LTR Gypsy -797 125 61 2 1612 696 307 49 85 chr2 134623764 134624130 -47123957 + ORR1E LTR MaLR 1 353 -6 2 1612 638 263 175 50 chr2 134624519 134624866 -47123221 - MLT1B LTR MaLR -9 381 2 2 1612 1404 266 57 8 chr2 134625503 134625808 -47122279 + MTD LTR MaLR 35 343 -76 2 1612 1404 266 57 8 chr2 134625829 134625890 -47122197 + MTD LTR MaLR 344 418 -1 2 1612 1003 289 118 18 chr2 134639840 134640221 -47107866 + MTD LTR MaLR 1 419 0 2 1612 977 251 26 38 chr2 134640666 134641013 -47107074 - RLTR15 LTR ERVK -16 343 1 2 1612 437 353 128 53 chr2 134656075 134656545 -47091542 - MLT1H LTR MaLR -8 541 37 2 1612 318 360 7 62 chr2 134668369 134668514 -47079573 - LTR16B2 LTR ERVL -7 456 320 2 1612 339 352 60 24 chr2 134668569 134668735 -47079352 - LTR16B2 LTR ERVL -252 210 39 2 1612 260 391 137 32 chr2 134672691 134672976 -47075111 + MLT1J LTR MaLR 72 386 -126 2 1612 644 303 67 35 chr2 134674132 134674477 -47073610 + MLT1A0 LTR MaLR 10 365 0 2 1612 553 312 152 51 chr2 134688230 134688585 -47059502 + MLT1C LTR MaLR 5 395 -72 2 1612 596 236 80 53 chr2 134694381 134694569 -47053518 - MTD LTR MaLR 0 419 227 3 1612 1366 222 66 47 chr2 134695150 134695514 -47052573 - MTD LTR MaLR -33 386 16 3 1612 3320 30 8 0 chr2 134700751 134701144 -47046943 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 1612 418 343 151 44 chr2 134709009 134709399 -47038688 - MLT1H LTR MaLR 0 549 118 3 1612 448 285 221 55 chr2 134713151 134713463 -47034624 - MLT1A0 LTR MaLR -1 364 1 3 1612 234 175 0 0 chr2 134718114 134718154 -47029933 - MLT1H LTR MaLR 0 549 510 3 1612 1830 176 53 9 chr2 134721407 134721746 -47026341 + MTC LTR MaLR 61 414 -7 3 1612 527 319 189 20 chr2 134733875 134734224 -47013863 - MLT1J LTR MaLR -104 408 1 3 1612 1343 192 136 13 chr2 134737284 134737600 -47010487 + RLTR20D LTR ERVK 214 568 0 3 1612 281 285 111 24 chr2 134737843 134737969 -47010118 - LTR16A1 LTR ERVL 0 456 320 3 1612 383 325 118 34 chr2 134739066 134739388 -47008699 - LTR16C LTR ERVL -8 481 133 3 1613 2035 140 82 8 chr2 134743761 134744128 -47003959 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 3 1613 234 305 19 130 chr2 134745749 134745840 -47002247 - RMER12 LTR ERVK -467 855 771 3 1613 234 305 19 130 chr2 134745893 134745963 -47002124 - RMER12 LTR ERVK -552 770 712 3 1613 252 246 101 0 chr2 134757174 134757243 -46990844 - MLT2F LTR ERVL -518 145 70 3 1613 236 316 96 64 chr2 134758251 134758376 -46989711 + LTR16A LTR ERVL 230 358 -93 3 1613 303 319 119 57 chr2 134761151 134761327 -46986760 - MLT1H LTR MaLR -266 283 97 3 1613 371 360 92 35 chr2 134763491 134763859 -46984228 + LTR16C LTR ERVL 66 454 -35 3 1613 245 364 77 55 chr2 134768581 134768764 -46979323 - MLT1J LTR MaLR -217 295 109 4 1613 481 253 223 48 chr2 134773253 134773535 -46974552 - ORR1D2 LTR MaLR 0 379 1 4 1613 338 290 114 8 chr2 134774052 134774184 -46973903 - MLT1A1 LTR MaLR -2 406 261 4 1613 308 312 43 26 chr2 134774523 134774638 -46973449 + MLT1J2 LTR MaLR 322 438 -10 4 1613 358 302 189 82 chr2 134788180 134788383 -46959704 - MLT2B3 LTR ERVL -13 502 246 4 1613 358 286 186 91 chr2 134788457 134788695 -46959392 - MLT2B3 LTR ERVL -304 250 2 4 1613 254 346 136 28 chr2 134792398 134792648 -46955439 + MLT1J LTR MaLR 193 469 -43 4 1613 251 274 191 14 chr2 134804764 134804993 -46943094 - MLT1E1 LTR MaLR 0 680 410 4 1613 299 325 51 70 chr2 134805081 134805296 -46942791 - MLT1E LTR MaLR -442 211 1 4 1613 1808 189 29 20 chr2 134806004 134806355 -46941732 + ORR1B1 LTR MaLR 41 394 0 4 1613 1044 245 98 30 chr2 134808408 134808745 -46939342 + ORR1D2 LTR MaLR 8 367 -3 4 1613 282 226 111 56 chr2 134816751 134816859 -46931228 + MT2B LTR ERVL 144 257 -344 4 1613 295 220 24 59 chr2 134823995 134824082 -46924005 - MLT1B LTR MaLR -283 91 8 4 1613 333 324 87 11 chr2 134825886 134826070 -46922017 + MLT1A0 LTR MaLR 167 364 -1 4 1613 2151 116 0 63 chr2 134827931 134828280 -46919807 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 4 1613 488 352 62 64 chr2 134839589 134839993 -46908094 - MLT1H LTR MaLR -140 409 7 5 1613 364 205 121 97 chr2 134840493 134840617 -46907470 + LTR48 LTR ERV1 9 135 -652 5 1613 278 267 53 3 chr2 134842430 134842514 -46905573 + MLT1D LTR MaLR 377 496 -9 5 1613 318 264 102 83 chr2 134846058 134846215 -46901872 - MLT1A LTR MaLR -179 195 36 5 1613 517 298 62 74 chr2 134849499 134849818 -46898269 + MTEa LTR MaLR 52 370 -9 5 1613 1383 203 191 0 chr2 134856085 134856430 -46891657 + MTD LTR MaLR 1 411 -8 5 1613 452 253 152 17 chr2 134861294 134861471 -46886616 - MLT1B LTR MaLR -185 205 5 5 1613 934 340 54 59 chr2 134864343 134864865 -46883222 + MLT1E1A LTR MaLR 160 678 -2 5 1613 278 361 50 0 chr2 134865571 134865690 -46882397 - MLT1K LTR MaLR -349 246 122 5 1613 265 273 117 85 chr2 134870831 134871019 -46877068 + MTEb LTR MaLR 121 314 -65 5 1613 295 348 123 32 chr2 134871657 134871844 -46876243 - ORR1E LTR MaLR -106 253 50 5 201 358 349 90 60 chr2 134872998 134873392 -46874695 + LTR33A LTR ERVL 17 420 -111 5 1614 747 300 89 53 chr2 134878608 134878964 -46869123 + MLT1B LTR MaLR 6 381 -9 5 1614 281 241 169 0 chr2 134880470 134880553 -46867534 - MLT1A0 LTR MaLR -2 363 267 5 1614 598 300 131 15 chr2 134881190 134881464 -46866623 - MER89 LTR ERV1 -1 558 253 5 1614 231 297 41 62 chr2 134881532 134881629 -46866458 - MER89 LTR ERV1 -464 95 1 5 1614 3478 25 2 0 chr2 134891721 134892116 -46855971 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 1614 3524 152 34 52 chr2 134892805 134893457 -46854630 - RLTR26 LTR ERVK 0 642 3 6 1614 236 358 84 0 chr2 134896694 134896789 -46851298 - MLT1J2 LTR MaLR -322 126 24 6 1614 327 206 25 143 chr2 134906836 134906955 -46841132 + MT2B LTR ERVL 153 257 -344 6 1614 1263 283 59 20 chr2 134907987 134908377 -46839710 - MTD LTR MaLR -14 405 1 6 1614 2290 278 47 63 chr2 134908377 134909494 -46838593 - MTD-int LTR MaLR 0 1098 6 6 1614 259 203 32 21 chr2 134909487 134909553 -46838534 - MTD LTR MaLR -19 400 302 6 1614 853 247 113 26 chr2 134909553 134909819 -46838268 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 240 6 1614 1439 216 48 61 chr2 134912794 134913169 -46834918 + MTEb LTR MaLR 1 370 -9 6 1614 273 222 0 53 chr2 134916700 134916757 -46831330 + RLTR9C LTR ERVK 340 393 0 6 1614 407 340 74 32 chr2 134919420 134919636 -46828451 - LTR31 LTR ERV1 -235 384 160 6 1614 664 348 40 0 chr2 134926384 134926657 -46821430 - MLT1I LTR MaLR -80 331 48 6 1614 584 318 104 45 chr2 134934141 134934477 -46813610 - ORR1E LTR MaLR -3 356 1 6 1614 310 289 87 0 chr2 134939682 134939786 -46808301 + MLT1J1 LTR MaLR 39 151 -293 6 1614 385 253 11 107 chr2 134950635 134950812 -46797275 + RMER10B LTR ERVL 239 398 0 6 1614 310 300 38 139 chr2 134962401 134962668 -46785419 - MTEa LTR MaLR -22 337 98 6 1614 381 276 46 54 chr2 134962723 134962853 -46785234 - MTEa LTR MaLR -250 129 1 6 1614 1487 231 78 70 chr2 134980233 134980786 -46767301 + RMER13A LTR ERVK 1 557 -303 7 1614 229 256 132 11 chr2 134982968 134983059 -46765028 + RMER15 LTR ERVL 58 159 -416 7 1614 3627 203 62 7 chr2 134984913 134985608 -46762479 + RMER13A LTR ERVK 128 860 0 7 1614 1612 175 162 23 chr2 134986233 134986578 -46761509 - MTD LTR MaLR -14 405 13 7 1614 294 266 177 14 chr2 134986799 134986940 -46761147 - MTEa LTR MaLR -12 367 204 7 1614 697 208 74 35 chr2 134990847 134991061 -46757026 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 102 7 1614 1218 257 107 0 chr2 134991809 134992147 -46755940 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 7 1614 506 319 69 109 chr2 134992518 134992866 -46755221 - MTEb LTR MaLR -7 372 39 7 1614 240 305 65 19 chr2 135002307 135002414 -46745673 + MTE2b LTR MaLR 22 133 -246 4 1614 566 332 80 27 chr2 135002416 135002716 -46745371 + MT2A LTR ERVL 107 422 -111 5 1614 426 343 42 46 chr2 135003732 135003949 -46744138 + ORR1E LTR MaLR 1 216 -143 1 1615 1860 188 34 60 chr2 135005190 135005644 -46742443 - MT2A LTR ERVL -16 585 1 1 1615 276 386 90 13 chr2 135008501 135008656 -46739431 - LTR16C LTR ERVL -289 200 34 2 1615 287 312 58 110 chr2 135012189 135012380 -46735707 + MLT1H2 LTR MaLR 1 181 -308 2 1615 437 337 52 0 chr2 135013010 135013203 -46734884 + LTR16A1 LTR ERVL 250 452 -4 2 1615 227 222 0 43 chr2 135015938 135015985 -46732102 + RLTR20B1 LTR ERVK 454 498 -65 3 1615 1063 229 186 4 chr2 135018645 135018925 -46729162 + MTD LTR MaLR 2 332 -87 4 1615 311 295 55 47 chr2 135021336 135021464 -46726623 + ORR1E LTR MaLR 6 134 -225 4 1615 711 229 164 41 chr2 135021692 135022013 -46726074 + MLT1D LTR MaLR 136 496 -9 4 1615 227 304 58 0 chr2 135022431 135022500 -46725587 + MLT1A0 LTR MaLR 118 190 -175 4 1615 282 152 102 0 chr2 135022514 135022573 -46725514 + MLT1A0 LTR MaLR 256 320 -45 4 1615 240 160 134 85 chr2 135023232 135023314 -46724773 + MT-int LTR MaLR 824 909 -189 4 1615 398 290 96 78 chr2 135026749 135027073 -46721014 - MLT1B LTR MaLR -41 349 1 5 1615 233 352 103 45 chr2 135033875 135034098 -46713989 - ORR1E LTR MaLR -122 237 2 6 1615 3430 35 0 0 chr2 135041890 135042286 -46705801 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 7 1615 553 210 93 31 chr2 135049339 135049501 -46698586 - RMER10A LTR ERVL -103 339 168 9 1615 638 146 10 10 chr2 135049518 135049622 -46698465 - RMER10A LTR ERVL -336 106 3 9 1615 352 225 67 0 chr2 135055596 135055685 -46692402 - RMER12 LTR ERVK -472 850 756 1 1615 666 49 0 0 chr2 135061931 135062013 -46686074 - RLTR1B LTR ERV1 -76 436 355 1 1615 2229 88 30 59 chr2 135066698 135067035 -46681052 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 1 1615 3461 20 5 0 chr2 135073197 135073591 -46674496 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1615 9574 20 0 0 chr2 135073591 135074689 -46673398 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 1 1615 3556 18 0 0 chr2 135074689 135075085 -46673002 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1615 564 184 132 0 chr2 135085237 135085351 -46662736 + MTD LTR MaLR 238 366 -53 1 1615 263 316 0 73 chr2 135092382 135092420 -46655667 + MT2B LTR ERVL 128 156 -445 1 1615 1602 219 49 66 chr2 135094518 135094988 -46653099 - RLTR31_Mm LTR ERVK 0 561 100 1 1615 1906 157 102 19 chr2 135095724 135096088 -46651999 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 1 1615 4375 18 2 0 chr2 135098002 135098494 -46649593 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 1 1615 302 318 79 26 chr2 135098797 135098949 -46649138 - MLT1K LTR MaLR -14 581 422 1 1615 1960 115 108 0 chr2 135101403 135101698 -46646389 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 1 1615 1452 226 10 51 chr2 135105699 135106091 -46641996 - MTEb LTR MaLR -3 376 1 1 1615 731 267 6 6 chr2 135106093 135106255 -46641832 - MTEb-int LTR MaLR -2 1578 1417 1 1615 4051 286 69 35 chr2 135106544 135107194 -46640893 - MTEb-int LTR MaLR -164 1416 741 1 1615 4051 286 69 35 chr2 135107220 135107870 -46640217 - MTEb-int LTR MaLR -840 740 72 1 1615 583 296 63 105 chr2 135107902 135108283 -46639804 - MTEa LTR MaLR 0 379 15 1 1615 665 351 135 29 chr2 135122000 135122510 -46625577 - MLT1G LTR MaLR -24 567 4 2 1615 374 329 80 53 chr2 135129941 135130355 -46617732 - RMER5 LTR ERV1 0 534 110 2 1615 360 258 92 53 chr2 135131058 135131189 -46616898 - MTE2b LTR MaLR -89 290 155 2 1615 731 267 111 57 chr2 135131350 135131803 -46616284 - MT2A LTR ERVL -68 465 1 2 1615 526 233 35 0 chr2 135131803 135131919 -46616168 - MTE2b LTR MaLR -242 137 18 2 1615 2097 132 32 52 chr2 135134351 135134751 -46613336 - RMER10B LTR ERVL -6 392 1 2 1616 326 280 40 48 chr2 135137152 135137276 -46610811 - MT2B LTR ERVL -337 264 142 2 1616 835 303 58 12 chr2 135148619 135148876 -46599211 - RMER15 LTR ERVL -36 539 271 2 1616 267 268 33 159 chr2 135148901 135149052 -46599035 - RMER15 LTR ERVL -419 156 25 2 1616 354 325 98 54 chr2 135151732 135151956 -46596131 - MLT1D LTR MaLR -146 359 126 2 1616 286 260 18 46 chr2 135171103 135171212 -46576875 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 303 2 1616 4919 78 29 51 chr2 135174196 135174962 -46573125 - RMER17A LTR ERVK -2 749 1 2 1616 6750 67 40 11 chr2 135177057 135177960 -46570127 + RLTR13B3 LTR ERVK 1 929 0 2 1616 1258 222 174 1 chr2 135191419 135191778 -46556309 + MTD LTR MaLR 3 408 -11 3 1616 1248 165 29 4 chr2 135192024 135192262 -46555825 + MTC LTR MaLR 3 246 -175 3 1616 1944 176 116 68 chr2 135194024 135194189 -46553898 - RLTR18B LTR ERVK -6 506 342 3 1616 1944 176 116 68 chr2 135194506 135194822 -46553265 - RLTR18B LTR ERVK -171 341 2 3 1616 2574 105 155 24 chr2 135206498 135206957 -46541130 - MURVY-LTR LTR ERV1 0 519 1 3 1616 1462 188 142 3 chr2 135212233 135212570 -46535517 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 3 1616 1185 254 48 39 chr2 135216318 135216674 -46531413 - ORR1E LTR MaLR 0 359 1 3 1616 514 364 75 58 chr2 135216728 135217232 -46530855 - MLT1L LTR MaLR -97 513 1 3 1616 227 277 0 15 chr2 135217743 135217809 -46530278 - MTEb LTR MaLR -14 365 301 3 1616 260 285 111 89 chr2 135230123 135230258 -46517829 - MLT1A1 LTR MaLR -270 138 1 3 1616 271 335 48 17 chr2 135231309 135231514 -46516573 - MLT1A1 LTR MaLR -12 396 151 3 1616 1934 114 18 51 chr2 135241301 135241633 -46506454 + ORR1A4 LTR MaLR 1 321 -8 3 1616 263 323 129 0 chr2 135249511 135249635 -46498452 - MLT1H LTR MaLR -339 210 71 3 1616 1928 181 36 75 chr2 135249679 135249855 -46498232 + MTC LTR MaLR 26 202 -219 3 1616 1928 181 36 75 chr2 135250276 135250511 -46497576 + MTC LTR MaLR 203 421 0 3 1616 1081 280 96 54 chr2 135250514 135250994 -46497093 + MLT2B4 LTR ERVL 2 501 -55 3 1616 3126 326 121 22 chr2 135251032 135252432 -46495655 + MTE-int LTR MaLR 14 1552 -28 3 1616 524 314 63 102 chr2 135259732 135260065 -46488022 - MLT1A1 LTR MaLR -13 395 76 4 1616 259 356 0 0 chr2 135260592 135260665 -46487422 - MER21B LTR ERV1 -768 95 23 4 1616 469 327 39 25 chr2 135262056 135262260 -46485827 + MLT1A0 LTR MaLR 129 335 -30 4 1616 451 256 44 22 chr2 135264955 135265091 -46482996 + RMER15 LTR ERVL 419 557 -18 4 1617 2455 148 23 3 chr2 135272348 135272734 -46475353 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 4 1617 247 367 53 33 chr2 135286735 135286887 -46461200 - MLT1H LTR MaLR -394 155 1 4 1617 2374 102 3 0 chr2 135291444 135291769 -46456318 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 2 4 1617 496 331 76 66 chr2 135301553 135301934 -46446153 - MLT1G3 LTR MaLR -206 389 5 4 1617 307 313 98 57 chr2 135313960 135314153 -46433934 + MLT1H LTR MaLR 347 547 -2 4 1617 250 280 10 70 chr2 135320589 135320689 -46427398 + MLT1A1 LTR MaLR 1 94 -314 5 1617 402 327 103 67 chr2 135320713 135321221 -46426866 + MT2A LTR ERVL 25 553 -1 5 1617 305 295 46 23 chr2 135321967 135322113 -46425974 + MLT1A1 LTR MaLR 212 367 -7 5 1617 2308 155 18 3 chr2 135324102 135324490 -46423597 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 5 1617 801 326 135 0 chr2 135325939 135326264 -46421823 + MLT1G3 LTR MaLR 58 426 -169 5 1617 1123 280 124 25 chr2 135326682 135327004 -46421083 - ORR1E LTR MaLR 0 359 6 5 1617 6461 128 55 10 chr2 135329930 135330983 -46417104 - RLTR25A LTR ERVK 0 1103 4 5 1617 551 375 78 4 chr2 135332934 135333202 -46414885 - MLT1H LTR MaLR -202 347 60 5 1617 390 234 74 105 chr2 135334324 135334522 -46413565 + MTE2a LTR MaLR 205 379 0 5 1617 584 301 67 139 chr2 135334524 135334569 -46413518 + MTE2a-int LTR MaLR 1 34 -1064 5 1617 1950 133 35 6 chr2 135334569 135334887 -46413200 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 3 5 1617 1294 273 120 77 chr2 135334887 135335712 -46412375 + MTE2a-int LTR MaLR 35 857 -401 5 1617 3979 117 2 33 chr2 135336477 135336843 -46411244 + MT2B2 LTR ERVL 5 351 -233 5 1617 3979 117 2 33 chr2 135336876 135337108 -46410979 + MT2B2 LTR ERVL 352 584 0 5 1617 1826 199 46 32 chr2 135345370 135345743 -46402344 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 5 1617 231 345 11 0 chr2 135349733 135349820 -46398267 - RMER13A LTR ERVK -88 772 685 5 1617 499 294 165 12 chr2 135349880 135350128 -46397959 - RMER13A LTR ERVK -175 685 400 5 1617 297 352 68 32 chr2 135352930 135353150 -46394937 + MLT1G3 LTR MaLR 84 311 -284 5 1617 276 262 141 16 chr2 135353235 135353363 -46394724 + MLT1G3 LTR MaLR 465 608 -16 5 1617 2910 35 3 3 chr2 135360185 135360531 -46387556 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 5 1617 2196 108 15 80 chr2 135364970 135365371 -46382716 + RLTR1B LTR ERV1 138 512 0 5 1617 371 359 75 5 chr2 135367732 135367945 -46380142 - MLT1H LTR MaLR -4 545 318 5 1617 1574 184 31 198 chr2 135368817 135368920 -46379167 + RLTR23 LTR ERV1 1 100 -330 5 1617 1574 184 31 198 chr2 135368951 135369363 -46378724 + RLTR23 LTR ERV1 101 430 0 5 1617 1872 221 75 20 chr2 135370150 135370766 -46377321 - MTC-int LTR MaLR -421 677 1 5 1617 610 219 169 27 chr2 135370776 135370959 -46377128 - MTD LTR MaLR -5 414 206 5 1617 539 243 47 20 chr2 135372803 135372980 -46375107 - MTD LTR MaLR -212 195 13 5 1617 584 289 60 15 chr2 135373764 135373964 -46374123 - MLT1A0 LTR MaLR -144 221 13 5 1617 234 229 14 41 chr2 135377372 135377445 -46370642 - MLT1C LTR MaLR -396 71 1 5 1617 3074 91 37 35 chr2 135383680 135384161 -46363926 + RLTR45 LTR ERVK 1 482 0 5 1617 732 278 44 87 chr2 135384301 135384691 -46363396 - RMER10A LTR ERVL -69 373 1 5 1617 239 338 92 9 chr2 135385119 135385337 -46362750 + MamGypLTR1b LTR Gypsy 222 457 -325 5 1617 558 194 61 103 chr2 135386722 135386935 -46361152 + RMER10A LTR ERVL 239 442 0 5 1617 311 365 106 34 chr2 135388336 135388543 -46359544 + LTR16A1 LTR ERVL 133 354 -102 5 1617 231 267 39 39 chr2 135388950 135389028 -46359059 - ORR1E LTR MaLR -15 364 287 5 1617 330 295 124 0 chr2 135389188 135389293 -46358794 - ORR1E LTR MaLR -223 136 19 5 1617 1629 164 94 77 chr2 135389421 135389824 -46358263 + RMER17C LTR ERVK 1 410 0 5 1617 735 274 33 19 chr2 135395326 135395626 -46352461 - MTD LTR MaLR 0 419 3 6 1617 243 183 13 78 chr2 135395894 135395971 -46352116 - MLT1I LTR MaLR -3 408 337 6 1618 391 283 153 33 chr2 135403337 135403611 -46344476 + MLT1A0 LTR MaLR 58 364 -1 6 1618 348 268 119 32 chr2 135414661 135414826 -46333261 + MLT1H2 LTR MaLR 73 299 -250 6 1618 227 183 46 77 chr2 135426260 135426325 -46321762 - RMER20A LTR ERVK -268 248 186 6 1618 446 311 77 11 chr2 135432087 135432269 -46315818 - MLT1A0 LTR MaLR -27 338 145 6 1618 246 261 206 15 chr2 135433663 135433799 -46314288 + MER90a LTR ERV1 270 431 -183 6 1618 627 255 168 13 chr2 135433833 135434071 -46314016 + MLT1A0 LTR MaLR 33 307 -58 6 1618 1349 206 111 55 chr2 135438419 135438763 -46309324 - RLTR14 LTR ERV1 -12 370 8 6 1618 247 315 172 47 chr2 135439620 135439853 -46308234 - ORR1E LTR MaLR 0 359 98 6 1618 734 269 37 99 chr2 135443586 135443908 -46304179 + ORR1E LTR MaLR 4 305 -54 6 1618 1459 212 10 97 chr2 135443910 135444302 -46303785 + ORR1D1 LTR MaLR 3 360 -14 6 1618 422 356 67 73 chr2 135445128 135445470 -46302617 - LTR16A1 LTR ERVL -95 361 22 6 1618 259 302 75 30 chr2 135447082 135447215 -46300872 + MLT1A1 LTR MaLR 268 406 -2 6 1618 246 233 52 72 chr2 135448930 135449027 -46299060 + MLT1A1 LTR MaLR 464 558 -4 6 1618 231 326 103 58 chr2 135451678 135451834 -46296253 - MER34A1 LTR ERV1 -302 285 123 6 1618 505 321 72 32 chr2 135453719 135453996 -46294091 - MLT1J-int LTR MaLR -324 1063 776 6 1618 278 173 60 96 chr2 135454057 135454140 -46293947 - RLTR25B LTR ERVK -519 509 430 6 1618 244 397 33 46 chr2 135457970 135458210 -46289877 + MLT1L LTR MaLR 3 239 -371 7 1618 473 298 150 59 chr2 135460453 135460827 -46287260 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 1 7 1618 258 242 67 48 chr2 135461169 135461273 -46286814 - ORR1D2 LTR MaLR -31 348 243 7 1618 386 355 47 0 chr2 135461287 135461456 -46286631 - ORR1D2 LTR MaLR -189 181 5 7 1618 889 312 126 34 chr2 135466216 135466723 -46281364 + MER21B LTR ERV1 273 826 -37 7 1618 474 306 118 76 chr2 135466871 135467253 -46280834 + MLT1E2 LTR MaLR 230 627 0 7 1618 344 314 45 7 chr2 135467939 135468093 -46279994 + ORR1E LTR MaLR 8 167 -192 7 1618 1798 212 51 165 chr2 135468247 135468918 -46279169 - RMER19C LTR ERVK -16 595 2 7 1618 240 204 20 0 chr2 135468918 135468967 -46279120 + ORR1E LTR MaLR 330 379 0 7 1618 3051 66 5 5 chr2 135469159 135469605 -46278482 + RMER16 LTR ERVK 1 533 0 7 1618 311 330 70 22 chr2 135470566 135470797 -46277290 + MLT2B1 LTR ERVL 303 567 0 7 1618 2445 169 44 57 chr2 135472158 135472698 -46275389 + RLTR17 LTR ERVK 103 635 -57 7 1618 531 349 56 16 chr2 135473680 135473983 -46274104 - MLT1D LTR MaLR -190 315 1 7 1618 3147 17 0 0 chr2 135476263 135476609 -46271478 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 7 1618 478 302 50 118 chr2 135476653 135477036 -46271051 - ORR1E LTR MaLR -2 357 1 7 1618 1560 142 71 29 chr2 135480556 135480867 -46267220 - ORR1A2 LTR MaLR -3 324 1 7 1618 811 290 44 83 chr2 135497469 135497830 -46250257 - ORR1E LTR MaLR -11 348 2 7 1618 366 252 30 52 chr2 135500941 135501075 -46247012 + MLT1B LTR MaLR 191 321 -69 4 1618 1667 176 191 6 chr2 135506887 135507242 -46240845 - MTC LTR MaLR 0 421 1 7 1618 639 257 67 73 chr2 135516766 135517091 -46230996 + MTD LTR MaLR 42 404 -17 2 1618 2450 169 19 2 chr2 135517678 135518092 -46229995 - MTC LTR MaLR 0 421 1 2 1618 300 250 19 39 chr2 135523081 135523185 -46224902 - MTEa LTR MaLR 0 379 278 3 1618 367 295 230 10 chr2 135525555 135525764 -46222323 - MER21B LTR ERV1 -108 755 501 3 1618 535 321 24 18 chr2 135525779 135525944 -46222143 - MER21B LTR ERV1 -426 437 272 3 1618 265 257 0 67 chr2 135526342 135526417 -46221670 - MER21-int LTR ERV1 -61 4130 4061 3 1619 4098 173 42 26 chr2 135528967 135529855 -46218232 - RMER13B LTR ERVK -4 904 3 4 1619 227 173 145 13 chr2 135530292 135530368 -46217719 + MTEa LTR MaLR 294 379 0 4 1619 311 293 125 45 chr2 135530749 135530949 -46217138 - MLT1G1 LTR MaLR -271 308 93 4 1619 1407 126 46 0 chr2 135540716 135540955 -46207132 - ORR1A4 LTR MaLR -8 321 72 6 1619 1257 234 43 87 chr2 135540953 135541300 -46206787 - RMER15 LTR ERVL -243 332 1 6 1619 906 257 223 9 chr2 135550887 135551232 -46196855 + MTD LTR MaLR 1 419 0 7 1619 338 320 72 11 chr2 135552716 135552896 -46195191 + LTR16C LTR ERVL 296 486 -3 7 1619 1550 190 115 27 chr2 135554815 135555188 -46192899 + MTD LTR MaLR 3 408 -11 8 1619 280 330 220 16 chr2 135560664 135560969 -46187118 + LTR33 LTR ERVL 142 508 -7 9 1619 3117 156 57 9 chr2 135561697 135562255 -46185832 - RMER4B LTR ERVK 0 585 1 9 1619 336 267 105 13 chr2 135563291 135563504 -46184583 - MLT1H2 LTR MaLR -12 537 302 9 1619 1644 131 93 9 chr2 135563710 135564034 -46184053 + RMER4B LTR ERVK 1 351 -234 9 1619 362 319 28 0 chr2 135574810 135574954 -46173133 - LTR16A LTR ERVL -2 449 302 1 1619 994 255 125 7 chr2 135589174 135589478 -46158609 + MTE2b LTR MaLR 3 342 -37 1 1619 892 285 6 66 chr2 135595956 135596275 -46151812 + MTE2a LTR MaLR 75 374 -5 1 1619 505 293 37 55 chr2 135596390 135596607 -46151480 - MLT1D LTR MaLR -257 248 36 1 1619 579 176 7 103 chr2 135596668 135596814 -46151273 + MTE2b LTR MaLR 173 304 -75 1 1619 836 231 126 31 chr2 135598786 135599112 -46148975 - ORR1E LTR MaLR -2 357 1 1 1619 833 217 142 14 chr2 135608371 135608640 -46139447 - MTD LTR MaLR 0 419 113 1 1619 484 306 112 16 chr2 135609503 135609752 -46138335 + MLT1A0 LTR MaLR 86 358 -7 1 1619 2274 181 135 53 chr2 135611259 135611784 -46136303 + RLTR25A LTR ERVK 9 576 -527 1 1619 1137 253 90 51 chr2 135612577 135612931 -46135156 + ORR1D2 LTR MaLR 1 368 -2 1 1619 902 309 82 58 chr2 135613159 135613624 -46134463 + MLT2B2 LTR ERVL 1 478 -37 1 1619 902 309 82 58 chr2 135613672 135613707 -46134380 + MLT2B2 LTR ERVL 479 513 -2 1 1619 465 174 149 21 chr2 135613948 135614089 -46133998 - RMER10B LTR ERVL -46 352 194 1 1619 1548 180 19 67 chr2 135627899 135628215 -46119872 + MTC LTR MaLR 121 421 0 1 1619 301 255 124 99 chr2 135628412 135628573 -46119514 + MLT1E3 LTR MaLR 331 614 -10 1 1619 1597 228 35 65 chr2 135630051 135630483 -46117604 - MTD LTR MaLR 0 419 1 1 1619 402 295 123 40 chr2 135647039 135647290 -46100797 - ORR1D1 LTR MaLR -18 356 85 2 1619 350 333 55 39 chr2 135652953 135653081 -46095006 - MLT1H LTR MaLR -230 319 190 2 1619 435 328 17 0 chr2 135656099 135656218 -46091869 - MLT1H LTR MaLR -350 199 79 2 1619 468 279 107 124 chr2 135656355 135656645 -46091442 + MLT1C LTR MaLR 175 459 -8 2 1619 244 348 134 7 chr2 135659269 135659411 -46088676 - MLT1D LTR MaLR -89 416 257 2 1620 309 328 59 7 chr2 135661865 135662000 -46086087 + MLT2B1 LTR ERVL 412 553 -14 2 1620 260 211 39 0 chr2 135665778 135665830 -46082257 + MTE2a LTR MaLR 8 61 -318 2 1620 263 284 45 0 chr2 135670356 135670444 -46077643 - LTR33B LTR ERVL -1 502 411 2 1620 1059 257 116 3 chr2 135678226 135678546 -46069541 + ORR1D2 LTR MaLR 1 356 -14 2 1620 403 113 0 31 chr2 135682807 135682871 -46065216 - RMER13A LTR ERVK -616 244 183 2 1620 253 157 59 0 chr2 135683622 135683673 -46064414 - MLT1H LTR MaLR -438 111 58 2 1620 264 306 73 98 chr2 135686697 135686943 -46061144 - RMER15 LTR ERVL 0 575 336 2 1620 950 201 9 38 chr2 135693915 135694127 -46053960 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 179 2 1620 752 230 119 77 chr2 135696192 135696503 -46051584 - MTEb LTR MaLR -55 324 1 2 1620 239 211 223 43 chr2 135698044 135698138 -46049949 + MER34 LTR ERV1 6 116 -426 2 1620 310 151 101 131 chr2 135706753 135706852 -46041235 + MT2B LTR ERVL 144 239 -362 2 1620 409 321 141 61 chr2 135718303 135718762 -46029325 - MLT2B1 LTR ERVL 0 520 25 3 1620 305 263 255 28 chr2 135722813 135723106 -46024981 - MLT1A LTR MaLR 0 374 1 3 1620 1298 149 9 237 chr2 135725622 135725906 -46022181 - ORR1B2 LTR MaLR -8 359 105 3 1620 3320 36 8 0 chr2 135725906 135726298 -46021789 + MTA_Mm LTR MaLR 2 396 0 3 1620 1298 149 9 237 chr2 135726334 135726509 -46021578 - ORR1B2 LTR MaLR -263 104 1 3 1620 990 235 72 158 chr2 135727653 135728058 -46020029 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 3 1620 1264 191 118 46 chr2 135746274 135746603 -46001484 + MTD LTR MaLR 1 353 -66 3 1620 560 322 21 21 chr2 135750121 135750308 -45997779 + MTE2b LTR MaLR 30 216 -163 3 1620 519 257 59 0 chr2 135750568 135750704 -45997383 + MTE2b LTR MaLR 234 377 -2 3 1620 273 277 96 72 chr2 135758728 135758895 -45989192 - MLT1A0 LTR MaLR -164 201 31 3 1620 485 302 179 20 chr2 135773570 135773867 -45974220 - ORR1E LTR MaLR -15 344 1 3 1620 263 255 52 21 chr2 135789766 135789862 -45958225 - MLT1A0 LTR MaLR -15 375 277 3 1620 265 295 59 59 chr2 135789898 135790017 -45958070 - MLT1A0 LTR MaLR -174 191 73 3 1621 3458 25 5 5 chr2 135814860 135815256 -45932831 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 1621 454 223 31 90 chr2 135815366 135815703 -45932384 - ORR1D1 LTR MaLR 0 384 77 4 1621 2427 87 28 120 chr2 135816329 135816786 -45931301 - RLTR9F LTR ERVK 0 415 1 4 1621 462 298 35 6 chr2 135825051 135825220 -45922867 - MLT1H LTR MaLR -1 548 375 4 1621 357 312 39 31 chr2 135825341 135825470 -45922617 - MLT1H LTR MaLR -381 168 39 4 1621 2254 123 116 20 chr2 135832277 135832734 -45915353 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 28 4 1621 4825 124 39 13 chr2 135843196 135843912 -45904175 - RMER19A LTR ERVK 0 737 3 4 1621 286 208 19 0 chr2 135851383 135851436 -45896651 + RMER15 LTR ERVL 7 60 -515 4 1621 1145 220 134 27 chr2 135852027 135852363 -45895724 - ORR1D1 LTR MaLR -2 372 1 4 1621 1780 247 30 5 chr2 135852365 135852764 -45895323 + MTD LTR MaLR 9 417 -2 4 1621 1988 229 44 20 chr2 135852790 135853240 -45894847 + RMER15 LTR ERVL 87 547 -28 4 1621 882 314 64 94 chr2 135853589 135853678 -45894409 - MLT1E1A LTR MaLR -1 679 606 4 1621 882 314 64 94 chr2 135853826 135854267 -45893820 - MLT1E1A LTR MaLR -75 605 165 4 1621 610 91 0 11 chr2 135864823 135864912 -45883175 + BGLII LTR ERVK 334 421 0 4 1621 284 228 37 25 chr2 135865858 135865939 -45882148 + MTC LTR MaLR 340 421 0 4 1621 640 333 39 109 chr2 135867234 135867675 -45880412 - MLT1H2 LTR MaLR 0 489 80 4 1621 2435 155 13 5 chr2 135871323 135871699 -45876388 - RLTR30 LTR ERV1 0 379 1 4 1621 650 216 43 7 chr2 135871699 135871839 -45876248 - MTC LTR MaLR -23 398 254 4 1621 261 192 0 0 chr2 135871832 135871884 -45876203 - MTC LTR MaLR -116 305 254 4 1621 254 178 0 0 chr2 135871877 135871922 -45876165 - MTC LTR MaLR -116 305 261 4 1621 1321 216 78 3 chr2 135871922 135872206 -45875881 - MTC LTR MaLR -116 305 1 4 1621 276 319 51 79 chr2 135872851 135873028 -45875059 + MLT1A LTR MaLR 43 214 -160 4 1621 289 271 88 45 chr2 135874031 135874176 -45873911 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 241 4 1621 1223 143 57 14 chr2 135874914 135875126 -45872961 + RLTR25A LTR ERVK 2 222 -881 5 1621 350 198 49 12 chr2 135875107 135875189 -45872898 + RLTR25A LTR ERVK 419 503 -600 5 1621 783 230 97 67 chr2 135890064 135890302 -45857785 - LTR55 LTR ERV -303 245 1 5 1621 1849 181 33 39 chr2 135895822 135896183 -45851904 - ORR1B2 LTR MaLR -8 359 1 5 1621 337 279 61 106 chr2 135896198 135896378 -45851709 - ORR1E LTR MaLR -42 317 146 5 1621 236 182 182 0 chr2 135902044 135902099 -45845988 - RMER15 LTR ERVL -94 481 417 5 1621 1623 312 85 35 chr2 135902100 135902820 -45845267 - RMER15-int LTR ERVL -3189 1810 1055 5 1621 1108 336 71 74 chr2 135902955 135903174 -45844913 - RMER15-int LTR ERVL -4191 808 598 5 1621 3657 30 2 0 chr2 135903174 135903569 -45844518 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 1621 1108 336 71 74 chr2 135903569 135904008 -45844079 - RMER15-int LTR ERVL -4402 597 152 5 1621 1615 223 78 26 chr2 135904054 135904478 -45843609 - RMER20A LTR ERVK -60 456 11 5 1621 263 275 36 36 chr2 135904637 135904720 -45843367 - RMER15 LTR ERVL -14 561 479 5 1621 1251 271 57 45 chr2 135915001 135915403 -45832684 + MTD LTR MaLR 13 419 0 5 1621 284 338 58 66 chr2 135921203 135921444 -45826643 + MLT1G1 LTR MaLR 90 328 -221 5 1622 289 286 69 57 chr2 135921711 135921856 -45826231 + MLT1G1 LTR MaLR 430 654 0 5 1622 250 339 125 0 chr2 135922547 135922659 -45825428 + LTR33 LTR ERVL 155 280 -235 5 1622 633 319 47 70 chr2 135927701 135928042 -45820045 + MLT1F LTR MaLR 216 548 0 5 1622 349 244 11 0 chr2 135928051 135928141 -45819946 + MLT1F LTR MaLR 450 540 -8 5 1622 248 235 182 50 chr2 135945845 135945966 -45802121 + RMER15 LTR ERVL 434 570 -5 5 1622 467 175 9 93 chr2 135948674 135948781 -45799306 - MT2B LTR ERVL -344 257 160 5 1622 476 141 0 0 chr2 135949306 135949384 -45798703 + ORR1C1 LTR MaLR 38 115 -263 5 1622 234 200 33 16 chr2 135949683 135949744 -45798343 + MTE2a LTR MaLR 315 376 -3 6 1622 2339 117 59 10 chr2 135951861 135952250 -45795837 + RMER16 LTR ERVK 1 408 -125 6 1622 1606 183 107 9 chr2 135952244 135952596 -45795491 + RLTR41 LTR ERV1 25 446 0 6 1622 477 358 147 10 chr2 135954936 135955235 -45792852 - MLT1H LTR MaLR -209 340 1 6 1622 2970 81 8 0 chr2 135955490 135955887 -45792200 + MTB LTR MaLR 1 400 0 6 1622 284 170 38 0 chr2 135958431 135958484 -45789603 + ORR1C1 LTR MaLR 324 378 0 6 1622 1468 224 62 11 chr2 135961195 135961551 -45786536 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 6 1622 605 245 27 10 chr2 135962587 135962804 -45785283 - MTD LTR MaLR -15 404 139 6 1622 393 317 16 16 chr2 135963086 135963208 -45784879 - MTD LTR MaLR -297 122 1 6 1622 274 344 0 0 chr2 135963304 135963400 -45784687 - MLT1A0 LTR MaLR -2 363 268 6 1622 303 229 128 20 chr2 135963491 135963602 -45784485 - MLT1A0 LTR MaLR -277 131 10 6 1622 373 220 16 121 chr2 135965885 135966009 -45782078 + MLT1A1 LTR MaLR 3 113 -295 6 1622 674 216 36 0 chr2 135966048 135966187 -45781900 + MLT1A1 LTR MaLR 262 405 -3 6 1622 2014 198 26 70 chr2 135968341 135968797 -45779290 + RLTR25A LTR ERVK 74 509 -594 6 1622 1917 147 99 72 chr2 135968728 135969184 -45778903 + ORR1A3-int LTR MaLR 494 961 -1002 6 1622 590 237 157 24 chr2 135969165 135969434 -45778653 + RLTR25A LTR ERVK 620 1028 0 6 1622 822 207 99 28 chr2 135969851 135970117 -45777970 - RLTR33 LTR ERVK -4 495 1 6 1622 324 375 130 42 chr2 135978813 135979097 -45768990 + LTR16A1 LTR ERVL 146 454 -2 6 1622 725 333 94 32 chr2 135984012 135984449 -45763638 + MLT1E1-int LTR MaLR 40 503 -986 6 1622 938 322 88 87 chr2 135984524 135985160 -45762927 + MLT1E1-int LTR MaLR 844 1480 -9 6 1622 579 289 12 42 chr2 135985438 135985604 -45762483 + MLT1E1 LTR MaLR 420 580 -74 6 1622 829 288 91 74 chr2 135985624 135985988 -45762099 + MTEa LTR MaLR 4 373 -6 6 1622 360 201 174 35 chr2 135990840 135990984 -45757103 - RLTR21 LTR ERVK -68 1504 1341 6 1622 952 224 150 130 chr2 135991021 135991214 -45756873 - RLTR22_Mus LTR ERVK -248 1560 1365 6 1622 952 219 161 130 chr2 135991284 135991540 -45756547 - RLTR22_Mus LTR ERVK -444 1364 1119 6 1622 1956 237 81 111 chr2 135991544 135992374 -45755713 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1043 805 1 6 1622 2079 159 5 54 chr2 135998228 135998552 -45749535 + ORR1B2 LTR MaLR 1 315 -52 6 1622 2079 159 5 54 chr2 135998997 135999058 -45749029 + ORR1B2 LTR MaLR 316 367 0 6 1622 245 371 61 55 chr2 136001745 136001940 -45746147 + MTEb LTR MaLR 23 222 -152 1 1622 4552 134 154 1 chr2 136001940 136002771 -45745316 + RMER17B LTR ERVK 1 958 0 2 1622 290 320 23 35 chr2 136002771 136002911 -45745176 + MTEb LTR MaLR 223 363 -16 1 1622 3383 35 2 0 chr2 136003238 136003633 -45744454 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 1622 340 324 90 0 chr2 136003765 136003876 -45744211 + MLT1H2 LTR MaLR 66 186 -303 5 1622 276 355 98 64 chr2 136003907 136004142 -45743945 + MLT1H2 LTR MaLR 299 541 -8 5 1622 1159 305 23 11 chr2 136005199 136005571 -45742516 - MTE2b LTR MaLR 0 370 3 7 1622 3130 42 45 0 chr2 136005578 136005957 -45742130 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 8 1622 298 301 140 0 chr2 136006138 136006231 -45741856 - MER68 LTR ERVL -12 551 446 9 1622 4025 62 0 14 chr2 136008838 136009396 -45738691 + ETnERV3-int LTR ERVK 5257 5806 -2 1 1622 6523 97 9 34 chr2 136009397 136010400 -45737687 + RLTR13A3 LTR ERVK 1 978 0 1 1622 759 324 76 40 chr2 136015393 136015747 -45732340 - MLT1D LTR MaLR 0 505 139 1 1622 924 309 76 22 chr2 136017011 136017381 -45730706 - MLT1B LTR MaLR 0 390 1 1 1622 3205 41 18 3 chr2 136018565 136018955 -45729132 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 1622 257 408 53 8 chr2 136028075 136028206 -45719881 + MLT1H1 LTR MaLR 369 505 -50 3 1622 1384 213 22 3 chr2 136038754 136039069 -45709018 + ORR1B2-int LTR MaLR 714 1034 -475 5 1622 846 155 6 6 chr2 136039041 136039197 -45708890 + ORR1B2-int LTR MaLR 1354 1509 0 5 1622 1759 155 75 12 chr2 136039197 136039542 -45708545 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 5 1622 243 338 95 14 chr2 136041020 136041167 -45706920 + MLT1J2 LTR MaLR 267 425 -23 5 1622 1220 253 80 37 chr2 136041372 136041721 -45706366 + ORR1D2 LTR MaLR 5 368 -2 5 1622 992 275 12 17 chr2 136042782 136043022 -45705065 + MTD LTR MaLR 181 419 0 6 1622 355 240 0 59 chr2 136043022 136043122 -45704965 + MLT1B LTR MaLR 294 387 -3 6 1622 906 260 180 7 chr2 136048405 136048699 -45699388 + MTD LTR MaLR 20 364 -55 7 1622 1067 271 78 52 chr2 136048699 136049046 -45699041 + ORR1E LTR MaLR 1 356 -3 7 1622 2055 179 14 6 chr2 136050048 136050402 -45697685 + ORR1B2 LTR MaLR 3 359 -8 7 1622 414 265 28 64 chr2 136052154 136052295 -45695792 + ORR1E LTR MaLR 2 137 -222 7 202 3224 315 111 41 chr2 136052501 136053925 -45694162 + ORR1E-int LTR MaLR 2 1527 -53 7 1623 565 313 109 95 chr2 136053925 136054274 -45693813 + ORR1E LTR MaLR 1 354 -5 7 1623 251 150 33 16 chr2 136058157 136058218 -45689869 + MYSERV6-int LTR ERVK 8898 8959 0 8 1623 596 174 111 43 chr2 136058222 136058391 -45689696 + RMER6B LTR ERVK 4 164 -592 8 1623 567 310 49 51 chr2 136058528 136058977 -45689110 + IAPEz-int LTR ERVK 2840 3287 -3194 8 1623 2585 200 72 0 chr2 136066967 136067493 -45680594 + RLTR12A LTR ERVK 1 564 -4 8 1623 442 120 67 0 chr2 136073623 136073698 -45674389 - ORR1D2 LTR MaLR -290 80 1 1 1623 2525 162 2 9 chr2 136076367 136076791 -45671296 + MTC LTR MaLR 1 421 0 1 1623 3181 186 66 56 chr2 136084058 136084844 -45663243 + RMER17D2 LTR ERVK 1 794 -15 1 1623 813 213 264 29 chr2 136090379 136090655 -45657432 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 34 1 1623 323 365 88 83 chr2 136092963 136093325 -45654762 + LTR16C LTR ERVL 35 398 -91 1 1623 1569 227 106 8 chr2 136096587 136096956 -45651131 + MTD LTR MaLR 1 405 -14 1 1623 352 270 216 19 chr2 136098340 136098502 -45649585 + RMER2 LTR ERV1 370 563 -4 1 1623 1375 156 54 14 chr2 136098752 136099031 -45649056 - MYSERV6-int LTR ERVK -3612 5347 5058 1 1623 2688 149 58 84 chr2 136099175 136099864 -45648223 - MYSERV6-int LTR ERVK -3942 5017 4347 1 1623 369 145 29 0 chr2 136100109 136100178 -45647909 + MTC LTR MaLR 26 96 -325 1 1623 2284 138 46 57 chr2 136100179 136100656 -45647431 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 472 -3 1 1623 4202 59 22 2 chr2 136100656 136101234 -45646853 + IAPEz-int LTR ERVK 2 591 -5890 1 1623 424 38 0 0 chr2 136101266 136101319 -45646768 + IAPEz-int LTR ERVK 1359 1411 -5070 1 1623 1763 107 4 4 chr2 136101318 136101580 -45646507 + IAPEz-int LTR ERVK 2236 2497 -5183 1 1623 886 73 24 0 chr2 136101577 136101700 -45646387 + IAPEz-int LTR ERVK 4785 4910 -2770 1 1623 25235 13 2 0 chr2 136101700 136104650 -45643437 + IAPEz-int LTR ERVK 3525 6481 0 1 1623 2294 139 46 56 chr2 136104650 136105130 -45642957 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 1 1623 1997 188 0 3 chr2 136105130 136105461 -45642626 + MTC LTR MaLR 92 421 0 1 1623 588 264 89 6 chr2 136112731 136112899 -45635188 + ORR1D1 LTR MaLR 1 182 -192 1 1623 576 280 156 14 chr2 136114107 136114354 -45633733 + ORR1D1 LTR MaLR 99 372 -2 1 1623 232 229 113 16 chr2 136116210 136116272 -45631815 - MLT1H2 LTR MaLR -362 127 60 1 1623 582 283 127 5 chr2 136116867 136117087 -45631000 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 128 1 1623 1376 234 20 3 chr2 136117079 136117371 -45630716 - ORR1D1-int LTR MaLR -1073 297 1 1 1623 1564 246 13 35 chr2 136117373 136117748 -45630339 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 8 1 1623 292 53 0 0 chr2 136119859 136119897 -45628190 + MT2B LTR ERVL 2 39 -562 1 1623 1636 127 24 0 chr2 136122201 136122454 -45625633 + ORR1A2 LTR MaLR 69 327 0 1 1623 971 254 53 94 chr2 136125476 136125871 -45622216 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 1 1623 1063 269 75 81 chr2 136125876 136126248 -45621839 + MTE2a-int LTR MaLR 32 401 -1179 1 1623 998 309 208 11 chr2 136126254 136126696 -45621391 + MTE2a-int LTR MaLR 540 1068 -512 1 1623 267 320 78 73 chr2 136128169 136128361 -45619726 + LTR80B LTR ERVL 113 305 -279 1 1623 313 330 78 0 chr2 136134787 136134902 -45613185 - MLT1N2 LTR MaLR -370 192 69 1 1623 743 333 73 25 chr2 136136146 136136463 -45611624 + MLT1H LTR MaLR 15 346 -203 1 1623 2358 208 49 73 chr2 136139513 136140351 -45607736 + ORR1B1-int LTR MaLR 425 1887 -76 1 1623 2096 178 37 16 chr2 136140351 136140728 -45607359 + ORR1B1 LTR MaLR 1 385 -9 1 1623 524 251 291 43 chr2 136145232 136145584 -45602503 + RMER4B LTR ERVK 138 576 -9 2 1623 2150 116 28 0 chr2 136152748 136153066 -45595021 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 2 1623 232 308 116 58 chr2 136156583 136156721 -45591366 + MT2B LTR ERVL 198 343 -258 2 1623 296 351 89 18 chr2 136157770 136157938 -45590149 + LTR16C LTR ERVL 96 275 -214 2 1623 249 256 48 86 chr2 136162890 136163073 -45585014 + RLTR20B3 LTR ERVK 112 270 -307 2 1623 1031 268 53 57 chr2 136167006 136167443 -45580644 + RMER20B LTR ERVK 136 589 -38 2 1623 2638 163 89 10 chr2 136170646 136171165 -45576922 - RLTR12A LTR ERVK -4 564 5 2 1623 466 406 84 25 chr2 136177227 136177717 -45570370 - LTR16E2 LTR ERVL -40 528 10 2 1623 231 162 0 0 chr2 136177922 136177959 -45570128 - MTD LTR MaLR -14 405 369 2 1623 312 232 29 0 chr2 136178016 136178085 -45570002 + MTC LTR MaLR 18 88 -333 2 1623 264 341 93 14 chr2 136180155 136180295 -45567792 - ORR1E LTR MaLR 0 370 220 2 1623 671 308 68 44 chr2 136180380 136181263 -45566824 - ORR1E-int LTR MaLR -108 1472 439 2 1623 301 243 27 0 chr2 136181469 136181543 -45566544 + MTD LTR MaLR 7 82 -339 2 1623 862 243 19 33 chr2 136181749 136181962 -45566125 + MTD LTR MaLR 196 405 -14 2 1623 468 346 9 18 chr2 136182270 136182488 -45565599 - MLT1D LTR MaLR -287 218 3 2 1623 1884 117 71 10 chr2 136183147 136183457 -45564630 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 2 1624 856 304 86 45 chr2 136189709 136190091 -45557996 + MLT2B1 LTR ERVL 67 464 -56 2 1624 662 323 96 53 chr2 136191487 136191902 -45556185 + MER31A LTR ERV1 6 438 -47 2 1624 288 374 43 17 chr2 136196035 136196152 -45551935 + LTR16C LTR ERVL 183 302 -187 2 1624 271 287 5 24 chr2 136196840 136196934 -45551153 + MLT1A0 LTR MaLR 271 408 0 2 1624 2047 178 15 62 chr2 136199495 136199896 -45548191 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 3 3 1624 455 336 55 99 chr2 136211066 136211469 -45536618 + MLT1C LTR MaLR 6 390 0 3 1624 650 333 99 10 chr2 136220951 136221254 -45526833 + LTR16A LTR ERVL 1 330 -121 3 1624 1249 211 105 43 chr2 136223799 136224150 -45523937 - MTEb LTR MaLR -6 373 1 3 1624 1273 335 17 45 chr2 136224241 136224770 -45523317 - MTE-int LTR MaLR -629 951 438 3 1624 2439 141 14 134 chr2 136233380 136233895 -45514192 - RMER6B LTR ERVK -8 453 1 3 1624 5545 115 65 72 chr2 136237919 136238881 -45509206 - RMER17B LTR ERVK 0 958 3 3 1624 374 329 57 34 chr2 136241089 136241265 -45506822 - MLT1J LTR MaLR -304 208 29 3 1624 3026 23 0 9 chr2 136245863 136246212 -45501875 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 3 1624 13778 51 18 1 chr2 136246212 136247973 -45500114 + ORR1A0-int LTR MaLR 1 1792 0 3 1624 3112 14 0 0 chr2 136247973 136248319 -45499768 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 3 1624 1511 262 73 22 chr2 136251376 136251826 -45496261 + RLTR20A2 LTR ERVK 5 485 -93 3 1624 1511 262 73 22 chr2 136251925 136252019 -45496068 + RLTR20A2 LTR ERVK 486 576 -2 3 1624 3426 148 15 22 chr2 136253411 136253999 -45494088 + RMER4B LTR ERVK 2 585 0 3 1624 1916 245 73 34 chr2 136257192 136257729 -45490358 + RLTR20B1 LTR ERVK 6 563 0 3 1624 233 347 51 45 chr2 136259317 136259474 -45488613 + MLT1G1 LTR MaLR 150 307 -272 3 1624 567 348 71 84 chr2 136262420 136262788 -45485299 - MTD LTR MaLR -15 404 37 3 1624 567 348 71 84 chr2 136263001 136263024 -45485063 - MTD LTR MaLR -383 36 18 3 1624 547 363 70 29 chr2 136263087 136263402 -45484685 - MLT1E1 LTR MaLR -325 329 2 3 1624 341 314 313 4 chr2 136263788 136264031 -45484056 + MTEa-int LTR MaLR 55 372 -1208 3 1624 2419 206 2 56 chr2 136264032 136264617 -45483470 - RLTR31_Mur LTR ERVK 0 553 1 3 1624 1114 335 187 48 chr2 136264648 136265567 -45482520 + MTEa-int LTR MaLR 420 1326 -44 3 1624 392 331 62 49 chr2 136266414 136266761 -45481326 + MTEa LTR MaLR 19 379 0 3 1624 2433 165 60 100 chr2 136276828 136277366 -45470721 - RMER16 LTR ERVK -17 516 1 4 1624 372 335 99 6 chr2 136279968 136280139 -45467948 + MLT1H LTR MaLR 17 203 -346 4 1624 837 298 121 26 chr2 136281433 136281781 -45466306 - MLT1B LTR MaLR -3 387 7 4 1624 312 268 59 77 chr2 136282351 136282521 -45465566 - LTR37B LTR ERV1 -157 311 145 4 1624 225 178 59 88 chr2 136287887 136287955 -45460132 - RMER20A LTR ERVK -265 251 186 4 1624 296 331 90 39 chr2 136306305 136306543 -45441544 - LTR33 LTR ERVL -284 236 1 4 1624 289 355 104 75 chr2 136308042 136308389 -45439698 - ORR1D2 LTR MaLR -13 357 1 4 1624 342 363 82 53 chr2 136313729 136314011 -45434076 - MLT1I LTR MaLR -16 395 106 4 1625 401 371 53 82 chr2 136332545 136332924 -45415163 + MTEa LTR MaLR 10 377 -2 4 1625 1563 194 63 44 chr2 136342731 136343098 -45404989 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 4 1625 3546 20 0 0 chr2 136344185 136344581 -45403506 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 1625 2242 151 27 0 chr2 136349513 136349883 -45398204 + RLTR14 LTR ERV1 3 382 0 5 1625 619 324 100 73 chr2 136350030 136350278 -45397809 + MT2A LTR ERVL 1 244 -289 5 1625 619 324 100 73 chr2 136350339 136350529 -45397558 + MT2A LTR ERVL 245 451 -82 5 1625 364 298 111 72 chr2 136350514 136350695 -45397392 + MT2A LTR ERVL 344 531 -2 5 1625 1229 171 252 3 chr2 136350735 136351029 -45397058 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 5 1625 406 284 136 55 chr2 136352862 136353082 -45395005 - MLT1F1 LTR MaLR -29 540 303 5 1625 1930 132 32 59 chr2 136353746 136354084 -45394003 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 5 1625 2169 219 41 105 chr2 136361817 136362464 -45385623 - RLTR18 LTR ERVK 0 616 1 5 1625 1022 149 23 86 chr2 136378548 136378876 -45369211 + RMER17B LTR ERVK 16 439 -519 5 1625 272 283 109 0 chr2 136384082 136384174 -45363913 + MER34A1 LTR ERV1 461 562 -25 5 1625 297 305 72 56 chr2 136386624 136386749 -45361338 - LTR16A1 LTR ERVL -329 127 1 5 1625 783 346 74 28 chr2 136388135 136388527 -45359560 + LTR33A_ LTR ERVL 35 444 -87 5 1625 1875 146 78 81 chr2 136388742 136389137 -45358950 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 5 1625 1666 184 131 6 chr2 136389604 136389964 -45358123 + MTB_Mm LTR MaLR 1 405 -2 5 1625 2535 57 41 38 chr2 136393547 136393891 -45354196 + IAPLTR4 LTR ERVK 1 345 0 5 1625 410 329 55 12 chr2 136396260 136396423 -45351664 + MLT1F LTR MaLR 206 375 -173 5 1625 460 272 49 131 chr2 136396759 136397026 -45351061 + MLT1F LTR MaLR 301 545 -3 5 1625 761 305 63 24 chr2 136407617 136407872 -45340215 + LTR16C LTR ERVL 225 489 0 5 1625 419 302 15 37 chr2 136409375 136409509 -45338578 + MLT1D LTR MaLR 1 131 -374 5 1625 655 302 48 56 chr2 136409484 136409736 -45338351 + MLT1D LTR MaLR 256 505 0 5 1625 230 345 104 108 chr2 136410094 136410325 -45337762 - LTR33A LTR ERVL -285 235 6 5 1625 329 365 41 29 chr2 136414242 136414414 -45333673 - MLT1K LTR MaLR -190 405 232 5 1625 226 269 86 37 chr2 136416272 136416353 -45331734 + MLT1G1 LTR MaLR 479 563 -16 5 1625 1747 166 46 6 chr2 136416717 136417062 -45331025 + RLTR15 LTR ERVK 1 359 0 5 1625 281 180 0 0 chr2 136417161 136417211 -45330876 + ORR1B1 LTR MaLR 345 394 0 6 1625 613 378 128 12 chr2 136419610 136420033 -45328054 - LTR16C LTR ERVL -17 472 1 6 1625 232 292 89 50 chr2 136425105 136425206 -45322881 - MLT1H LTR MaLR -318 231 127 6 1625 359 346 58 58 chr2 136426452 136426710 -45321377 - LTR16C LTR ERVL -79 410 153 6 1625 608 228 201 14 chr2 136428589 136428803 -45319284 + MTEa LTR MaLR 123 376 -3 6 1625 260 217 57 14 chr2 136429191 136429261 -45318826 - LTR45 LTR ERV1 -8 517 445 6 1625 671 254 162 41 chr2 136429494 136429814 -45318273 - ORR1E LTR MaLR 0 359 1 6 1625 1172 233 16 56 chr2 136431469 136431792 -45316295 + MTD LTR MaLR 102 411 -8 6 1625 424 318 58 137 chr2 136432049 136432428 -45315659 + ORR1E LTR MaLR 1 349 -10 6 1625 601 205 24 71 chr2 136434414 136434582 -45313505 - ORR1D2 LTR MaLR -3 367 208 6 1625 419 349 53 60 chr2 136434939 136435204 -45312883 - MLT1G3 LTR MaLR -262 333 71 6 1625 237 360 153 16 chr2 136438181 136438370 -45309717 + LTR33 LTR ERVL 1 215 -300 6 1625 3523 25 0 128 chr2 136438605 136439105 -45308982 + RLTR10C LTR ERVK 1 436 0 6 1625 2535 188 65 34 chr2 136441540 136442095 -45305992 + RMER15 LTR ERVL 1 572 -3 6 1625 526 347 31 55 chr2 136443383 136443673 -45304414 - LTR16A1 LTR ERVL -14 442 160 6 1625 346 267 78 0 chr2 136444906 136444996 -45303091 - MLT1J1 LTR MaLR -312 132 36 6 1626 1317 243 96 11 chr2 136451074 136451428 -45296659 - MTD LTR MaLR -1 418 35 6 1626 280 369 50 70 chr2 136451556 136451856 -45296231 + MLT1K LTR MaLR 206 499 -96 6 1626 684 326 60 46 chr2 136453025 136453372 -45294715 - ORR1E LTR MaLR 0 359 8 6 1626 1292 284 68 8 chr2 136457140 136457491 -45290596 + MTEa LTR MaLR 1 372 -7 6 1626 2094 173 25 0 chr2 136457826 136458190 -45289897 + ORR1C1 LTR MaLR 2 374 -4 6 1626 6294 162 131 26 chr2 136458195 136459558 -45288529 + ORR1C1-int LTR MaLR 3 1509 0 6 1626 1503 182 185 0 chr2 136459558 136459877 -45288210 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 6 1626 2337 110 160 10 chr2 136459912 136460325 -45287762 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 6 1626 782 161 14 7 chr2 136467276 136467414 -45280673 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 269 6 1626 2116 184 80 30 chr2 136467421 136467831 -45280256 + RLTR20C LTR ERVK 12 431 -103 6 1626 2116 184 80 30 chr2 136467889 136467976 -45280111 + RLTR20C LTR ERVK 432 533 -1 6 1626 1382 206 3 49 chr2 136467976 136468259 -45279828 - MTB_Mm LTR MaLR -134 273 4 6 1626 1843 138 102 12 chr2 136468636 136468959 -45279128 + ORR1B1 LTR MaLR 4 355 -39 6 1626 315 172 0 0 chr2 136469008 136469066 -45279021 + ORR1B1 LTR MaLR 337 394 0 6 1626 364 392 66 22 chr2 136469993 136470220 -45277867 + LTR16A1 LTR ERVL 1 237 -219 6 1626 719 293 57 20 chr2 136471255 136471499 -45276588 + MLT1H LTR MaLR 46 298 -251 6 1626 388 347 40 40 chr2 136472447 136472669 -45275418 + RMER15 LTR ERVL 347 568 -7 6 1626 311 226 20 51 chr2 136479193 136479291 -45268796 + MTEb LTR MaLR 278 372 -7 6 1626 290 348 93 7 chr2 136486981 136487120 -45260967 - MLT1K LTR MaLR -364 231 81 6 1626 332 309 95 61 chr2 136489196 136489458 -45258629 + MLT1A0 LTR MaLR 34 304 -61 6 1626 333 339 148 52 chr2 136497502 136497732 -45250355 + LTR16C LTR ERVL 184 435 -54 7 1626 972 267 52 46 chr2 136498169 136498591 -45249496 + RMER15 LTR ERVL 26 575 0 7 1626 242 190 34 17 chr2 136501144 136501203 -45246884 + MLT1H LTR MaLR 488 547 -2 2 1626 560 319 178 11 chr2 136507884 136508157 -45239930 - MLT1H LTR MaLR -175 374 56 1 1626 1974 134 185 11 chr2 136508356 136508903 -45239184 + RLTR26 LTR ERVK 1 642 0 1 1626 4403 65 24 45 chr2 136509082 136509658 -45238429 - LTRIS2 LTR ERV1 0 564 1 1 1626 278 280 131 63 chr2 136515298 136515504 -45232583 - MLT1L LTR MaLR -28 582 363 2 1626 286 341 132 40 chr2 136515859 136516131 -45231956 - LTR81A LTR ERV1? -883 467 171 2 1626 3014 49 0 39 chr2 136516483 136516843 -45231244 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 2 1626 868 296 87 16 chr2 136517981 136518417 -45229670 - MLT1C LTR MaLR 0 467 1 3 1626 527 369 77 28 chr2 136556326 136556688 -45191399 - LTR16A1 LTR ERVL -76 380 1 7 1626 867 245 50 160 chr2 136557842 136558241 -45189846 - ORR1E LTR MaLR -4 355 1 7 1626 1373 191 146 15 chr2 136559844 136559948 -45188139 + ORR1D1 LTR MaLR 1 109 -265 8 1626 1373 191 146 15 chr2 136559993 136560218 -45187869 + ORR1D1 LTR MaLR 110 372 -2 8 1626 346 254 25 83 chr2 136561654 136561774 -45186313 - MLT1H LTR MaLR 0 549 437 8 1626 1340 226 69 7 chr2 136562038 136562328 -45185759 - MTD LTR MaLR -92 327 20 8 1626 256 268 278 0 chr2 136566413 136566561 -45181526 - LTR37B LTR ERV1 -3 465 277 9 1626 298 343 117 56 chr2 136568395 136568674 -45179413 + LTR16A1 LTR ERVL 153 460 -29 9 1626 406 272 190 6 chr2 136572419 136572593 -45175494 + LTR37B LTR ERV1 244 449 -19 1 1626 341 268 28 56 chr2 136573857 136574033 -45174054 - MTEb LTR MaLR -2 377 205 1 1626 338 328 71 25 chr2 136574451 136574648 -45173439 - LTR16A1 LTR ERVL 0 456 251 1 1626 4519 123 32 49 chr2 136574851 136575674 -45172413 - RMER17D2 LTR ERVK 0 809 1 1 203 2240 146 10 120 chr2 136576933 136577415 -45170672 - RLTR24 LTR ERV1 0 529 101 1 1627 1740 256 53 10 chr2 136578073 136578559 -45169528 + RMER5 LTR ERV1 13 519 -15 1 1627 366 361 19 86 chr2 136591013 136591222 -45156865 - LTR16B LTR ERVL -174 289 95 1 1627 259 342 145 6 chr2 136599833 136599992 -45148095 - MLT1H LTR MaLR -138 411 231 1 1627 467 330 107 18 chr2 136600223 136600448 -45147639 - LTR33 LTR ERVL -256 259 15 1 1627 237 325 18 112 chr2 136610978 136611148 -45136939 + LTR16C LTR ERVL 263 416 -73 1 1627 308 306 12 0 chr2 136612193 136612278 -45135809 + LTR16C LTR ERVL 273 358 -131 1 1627 268 326 155 28 chr2 136613270 136613412 -45134675 - MLT1H LTR MaLR -8 541 382 1 1627 358 300 50 0 chr2 136613531 136613651 -45134436 - MLT1H LTR MaLR -376 173 48 1 1627 452 362 108 32 chr2 136619889 136620289 -45127798 - LTR33 LTR ERVL -50 465 36 1 1627 312 299 61 85 chr2 136620540 136620752 -45127335 - MLT1M LTR MaLR -326 346 140 1 1627 311 343 101 22 chr2 136620866 136621045 -45127042 - LTR16E1 LTR ERVL -1 537 345 1 1627 261 371 98 21 chr2 136621062 136621205 -45126882 - LTR16E1 LTR ERVL -260 308 155 1 1627 434 172 184 103 chr2 136622726 136622772 -45125315 - MTEa LTR MaLR -8 371 328 1 1627 622 237 424 63 chr2 136622923 136623160 -45124927 - MTEa LTR MaLR -52 327 1 1 1627 3302 285 58 10 chr2 136623162 136623245 -45124842 - MTEa-int LTR MaLR -2 1578 1486 1 1627 3302 285 58 10 chr2 136623266 136624068 -45124019 - MTEa-int LTR MaLR -95 1485 652 1 1627 305 318 81 16 chr2 136625422 136625547 -45122540 - MLT1B LTR MaLR 0 505 262 1 1627 283 276 50 104 chr2 136625665 136625853 -45122234 - MLT1B LTR MaLR -309 196 9 1 1627 454 299 188 65 chr2 136626471 136626764 -45121323 + LTR16A1 LTR ERVL 127 455 -1 1 1627 285 238 168 13 chr2 136628315 136628464 -45119623 - LTR84b LTR ERVL -3 758 587 1 1627 932 284 90 39 chr2 136628579 136628967 -45119120 - LTR84b LTR ERVL -352 409 2 1 1627 413 268 55 31 chr2 136635117 136635244 -45112843 - LTR16C LTR ERVL -8 481 352 1 1627 2130 92 3 3 chr2 136635374 136635651 -45112436 - MMERVK10C-int LTR ERVK -1543 6038 5761 1 1627 1309 97 0 33 chr2 136635645 136635827 -45112260 - MMERVK10C-int LTR ERVK -1942 5639 5464 1 1627 3051 72 10 5 chr2 136635825 136636227 -45111860 + IAPEy-int LTR ERVK 7110 7513 0 1 1627 2233 107 9 9 chr2 136636238 136636567 -45111520 + IAPEY2_LTR LTR ERVK 29 357 0 1 1627 299 280 103 0 chr2 136638444 136638551 -45109536 + MamGypLTR1b LTR Gypsy 653 770 -12 1 1627 412 314 241 13 chr2 136638554 136638793 -45109294 + MLT1A0 LTR MaLR 5 297 -68 1 1627 356 228 65 0 chr2 136640393 136640485 -45107602 + MLT1B LTR MaLR 11 108 -282 2 1627 3299 59 38 2 chr2 136640494 136640887 -45107200 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 2 1627 1731 163 58 9 chr2 136640887 136641209 -45106878 - MTB_Mm LTR MaLR -8 413 67 2 1627 1731 196 82 3 chr2 136641287 136641335 -45106752 - MTB_Mm LTR MaLR -341 66 2 2 1627 357 256 10 2 chr2 136641378 136641476 -45106611 + MLT1B LTR MaLR 126 230 -237 2 1627 241 352 0 42 chr2 136641496 136641591 -45106496 - LTR33B LTR ERVL -398 105 15 2 1627 3287 76 2 0 chr2 136641611 136642006 -45106081 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 1627 332 184 53 88 chr2 136643111 136643224 -45104863 + LTR37A LTR ERV1 19 127 -299 2 1627 1814 153 55 61 chr2 136645039 136645366 -45102721 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 5 2 1627 357 239 86 68 chr2 136649310 136649427 -45098660 - LTR16E2 LTR ERVL 0 568 450 2 1627 965 207 6 16 chr2 136649998 136650180 -45097907 - MTC LTR MaLR 0 421 242 2 1627 486 176 11 0 chr2 136650173 136650264 -45097823 - RLTR18B LTR ERVK -121 391 300 2 1627 279 309 68 54 chr2 136650298 136650445 -45097642 - RLTR18B LTR ERVK -205 307 159 2 1627 889 247 83 21 chr2 136650745 136650985 -45097102 - RLTR18B LTR ERVK -255 257 3 2 1627 502 263 151 32 chr2 136655223 136655400 -45092687 - ORR1D2 LTR MaLR -3 367 168 2 1627 530 283 48 7 chr2 136655580 136655726 -45092361 - ORR1D2 LTR MaLR -218 152 1 2 1627 403 198 0 81 chr2 136655726 136655782 -45092305 - ORR1D2-int LTR MaLR 0 1370 1316 2 1627 5647 96 15 14 chr2 136655782 136656518 -45091569 - RMER19A LTR ERVK 0 737 1 2 1627 403 198 0 81 chr2 136656518 136656560 -45091527 - ORR1D2-int LTR MaLR -55 1315 1280 2 1627 1608 263 84 70 chr2 136656789 136657345 -45090742 - ORR1D2-int LTR MaLR -245 1125 562 2 1627 611 224 8 8 chr2 136657360 136657486 -45090601 - ORR1D2-int LTR MaLR -1096 274 149 2 1627 369 306 39 65 chr2 136657688 136657842 -45090245 - ORR1D2 LTR MaLR -205 154 5 2 1627 589 267 58 41 chr2 136658347 136658519 -45089568 - ORR1E LTR MaLR 0 379 205 2 1627 798 289 19 30 chr2 136658918 136659160 -45088927 - ORR1E LTR MaLR -154 213 3 2 1627 555 302 164 43 chr2 136660596 136661012 -45087075 - MER92C LTR ERV1 -85 469 4 2 1627 604 270 229 7 chr2 136661190 136661496 -45086591 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 2 1627 376 152 30 0 chr2 136662699 136662765 -45085322 + ORR1B1 LTR MaLR 7 74 -320 2 1627 1353 136 54 0 chr2 136663524 136663745 -45084342 + ORR1B1 LTR MaLR 162 394 0 2 1627 958 231 155 96 chr2 136665999 136666334 -45081753 - ORR1E LTR MaLR -4 355 1 2 1627 2268 108 38 13 chr2 136670798 136671116 -45076971 + ORR1A3 LTR MaLR 1 326 0 2 1627 2527 138 36 70 chr2 136671200 136671669 -45076418 + RLTR11B LTR ERVK 1 453 0 2 1627 333 200 59 69 chr2 136671835 136671847 -45076240 + ORR1B1-int LTR MaLR 605 615 -1348 2 1627 1067 141 6 271 chr2 136671847 136672198 -45075889 + MT2B LTR ERVL 1 258 -343 2 1627 1007 216 7 0 chr2 136672071 136672340 -45075747 + ORR1B1-int LTR MaLR 624 894 -615 2 1627 2520 148 7 2 chr2 136672334 136672748 -45075339 + ORR1B1-int LTR MaLR 1094 1509 0 2 1627 2793 138 5 0 chr2 136672748 136673140 -45074947 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 2 1627 958 278 119 59 chr2 136673594 136673894 -45074193 - RMER15 LTR ERVL -3 572 245 2 1627 958 278 119 59 chr2 136673949 136674187 -45073900 - RMER15 LTR ERVL -331 244 2 2 1627 1996 207 21 43 chr2 136677493 136677916 -45070171 - MTD LTR MaLR -5 414 1 2 1627 639 317 126 21 chr2 136678817 136679143 -45068944 - MER21B LTR ERV1 -93 770 411 2 1627 458 320 33 71 chr2 136679278 136679490 -45068597 - MER21B LTR ERV1 -639 224 21 2 1627 281 216 0 0 chr2 136685086 136685137 -45062950 - MER57A-int LTR ERV1 -319 5868 5818 2 1627 1861 207 148 64 chr2 136685137 136685608 -45062479 - RMER19B LTR ERVK 0 902 362 2 1627 1861 207 148 64 chr2 136685656 136685732 -45062355 - RMER19B LTR ERVK -541 361 309 2 1627 965 259 94 4 chr2 136685830 136686074 -45062013 + ORR1D2 LTR MaLR 105 370 0 2 1627 353 286 79 113 chr2 136686472 136686747 -45061340 - ORR1E LTR MaLR -50 324 65 2 1627 947 151 389 14 chr2 136686826 136686967 -45061120 + RMER17C LTR ERVK 1 213 -197 2 1627 947 151 389 14 chr2 136687092 136687118 -45060969 + RMER17C LTR ERVK 214 259 -151 2 1627 947 151 389 14 chr2 136687179 136687306 -45060781 + RMER17C LTR ERVK 260 406 -4 2 1627 1245 204 14 78 chr2 136688615 136688897 -45059190 + RLTR25A LTR ERVK 1 264 -839 2 1627 3259 17 0 3 chr2 136688897 136689244 -45058843 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 2 1627 1592 30 0 0 chr2 136689244 136689443 -45058644 + ORR1A0-int LTR MaLR 1 199 -1593 2 1627 12090 55 6 6 chr2 136696128 136697734 -45050353 + ORR1A0-int LTR MaLR 187 1792 0 2 1627 3197 20 0 20 chr2 136697734 136698087 -45050000 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 2 1627 904 128 14 0 chr2 136698087 136698228 -45049859 + RLTR25A LTR ERVK 260 402 -701 2 1627 842 216 66 69 chr2 136698362 136698650 -45049437 + RLTR25B LTR ERVK 742 1028 0 2 1627 4227 134 86 6 chr2 136700487 136701154 -45046933 + RMER6D LTR ERVK 1 720 0 2 1627 785 265 104 27 chr2 136703906 136704166 -45043921 - MTE2a LTR MaLR 0 379 100 3 1628 297 213 52 44 chr2 136708320 136708434 -45039653 + MTE2a LTR MaLR 1 141 -238 3 1628 723 254 50 39 chr2 136708623 136708803 -45039284 + MTE2a LTR MaLR 198 379 0 3 1628 2259 185 30 30 chr2 136710481 136710943 -45037144 - RMER4A LTR ERVK -2 464 3 3 1628 3380 25 2 12 chr2 136724884 136725284 -45022803 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 1628 906 255 60 139 chr2 136731705 136732145 -45015942 + MTD LTR MaLR 14 405 -14 3 1628 352 339 44 50 chr2 136742850 136743030 -45005057 - MLT1H2 LTR MaLR -128 361 183 3 1628 1912 129 61 20 chr2 136743342 136743736 -45004351 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 3 1628 385 262 23 45 chr2 136758185 136758317 -44989770 + MLT1A1 LTR MaLR 268 396 -12 4 1628 4163 31 12 2 chr2 136760222 136760710 -44987377 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 4 1628 412 264 11 0 chr2 136762361 136762452 -44985635 + MLT1C LTR MaLR 281 372 -95 4 1628 1286 226 89 34 chr2 136764610 136764959 -44983128 - ORR1D2 LTR MaLR -2 368 1 4 1628 379 309 82 22 chr2 136771461 136771643 -44976444 + MLT2D LTR ERVL 214 406 -8 4 1628 1280 240 128 27 chr2 136777394 136777770 -44970317 + MTD LTR MaLR 6 419 0 4 1628 225 344 22 0 chr2 136778923 136779013 -44969074 + ORR1E LTR MaLR 268 359 0 4 1628 1108 184 53 0 chr2 136784214 136784421 -44963666 + ORR1C2 LTR MaLR 3 220 -164 4 1628 1132 226 93 93 chr2 136786646 136787002 -44961085 - MTEa LTR MaLR -21 358 3 4 1628 891 222 202 4 chr2 136787006 136787268 -44960819 - MTEa-int LTR MaLR -2 1578 1265 4 1628 3363 145 22 46 chr2 136797839 136797953 -44950134 - RLTR20A2 LTR ERVK 0 578 482 4 1628 3363 145 22 46 chr2 136797993 136798470 -44949617 - RLTR20A2 LTR ERVK -97 481 1 4 1628 406 317 96 35 chr2 136801707 136802036 -44946051 - MLT1C LTR MaLR -9 458 100 4 1628 968 197 63 39 chr2 136807355 136807561 -44940526 + ORR1C2 LTR MaLR 120 330 -54 4 1628 632 127 136 0 chr2 136807568 136807678 -44940409 + ORR1C2 LTR MaLR 260 384 0 4 1629 3377 40 2 0 chr2 136851097 136851492 -44896595 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 1629 632 306 74 41 chr2 136852113 136852382 -44895705 - MER57D LTR ERV1 0 411 134 5 1629 251 149 21 21 chr2 136865681 136865729 -44882358 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 337 5 1629 1050 186 0 87 chr2 136865708 136865949 -44882138 + ORR1C2 LTR MaLR 153 372 -12 5 1629 549 207 31 23 chr2 136865949 136866148 -44881939 + ORR1C2-int LTR MaLR 1 246 -1124 5 1629 234 293 122 57 chr2 136867539 136867662 -44880425 + ORR1C2-int LTR MaLR 832 962 -547 5 1629 1624 222 87 8 chr2 136884879 136885260 -44862827 + MTD LTR MaLR 1 411 -8 5 1629 684 319 128 125 chr2 136887746 136888043 -44860044 - MLT1A1 LTR MaLR -53 355 24 5 1629 332 339 133 51 chr2 136901449 136901645 -44846442 - MLT1E1 LTR MaLR -5 649 438 5 1629 229 298 38 136 chr2 136919378 136919510 -44828577 + RMER13A LTR ERVK 349 467 -393 5 1629 1988 78 74 3 chr2 136921566 136921850 -44826237 + ORR1A2 LTR MaLR 1 304 -23 6 1629 1318 237 68 55 chr2 136926784 136927168 -44820919 - LTR16A1 LTR ERVL -67 389 1 6 1629 1434 178 54 22 chr2 136946131 136946447 -44801640 - RMER10A LTR ERVL 0 442 117 6 1629 253 353 70 32 chr2 136950204 136950362 -44797725 + MLT1H LTR MaLR 373 536 -13 6 1629 2739 157 139 72 chr2 136952331 136952900 -44795187 + RMER19C LTR ERVK 1 607 -4 6 1629 449 289 157 60 chr2 136968440 136968872 -44779215 + LTR50 LTR ERVL 3 625 -170 6 1630 327 320 77 19 chr2 136973342 136973443 -44774644 + LTR16A1 LTR ERVL 290 400 -56 6 1630 327 320 77 19 chr2 136973506 136973560 -44774527 + LTR16A1 LTR ERVL 401 454 -2 6 1630 324 255 94 0 chr2 136974717 136974823 -44773264 + MLT1H LTR MaLR 243 358 -191 6 1630 2207 197 91 14 chr2 136983920 136984367 -44763720 + MT2A LTR ERVL 2 488 -45 6 1630 2207 197 91 14 chr2 136984468 136984513 -44763574 + MT2A LTR ERVL 489 532 -1 6 1630 1477 185 113 29 chr2 136985387 136985732 -44762355 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 6 1630 247 146 0 0 chr2 136986307 136986348 -44761739 - MT2A LTR ERVL 0 533 493 7 1630 2247 219 25 7 chr2 136986442 136986917 -44761170 - MT2A LTR ERVL -34 567 4 7 1630 261 294 130 67 chr2 137002068 137002338 -44745749 - MLT1I LTR MaLR -27 384 98 4 1630 457 338 45 103 chr2 137004859 137005149 -44742938 - MLT1H LTR MaLR -146 403 131 1 1630 983 208 89 9 chr2 137009764 137010075 -44738012 + ORR1D1 LTR MaLR 1 353 -6 1 1630 1020 282 124 17 chr2 137011256 137011602 -44736485 - MTD LTR MaLR -36 383 1 1 1630 2085 220 72 12 chr2 137012356 137012428 -44735659 - RLTR20B1 LTR ERVK -50 513 433 1 1630 2085 220 72 12 chr2 137012581 137012992 -44735095 - RLTR20B1 LTR ERVK -131 432 1 1 1630 6541 166 67 22 chr2 137012992 137014620 -44733467 - MYSERV16_I-int LTR ERVK 0 2842 457 1 1630 293 321 48 92 chr2 137022214 137022420 -44725667 - MLT1A1 LTR MaLR -210 198 2 3 1630 425 350 5 63 chr2 137028397 137028586 -44719501 - LTR33 LTR ERVL -337 178 1 4 1630 387 295 83 80 chr2 137032048 137032130 -44715957 + RMER17C LTR ERVK 1 86 -324 4 1630 387 295 83 80 chr2 137032191 137032458 -44715629 + RMER17C LTR ERVK 87 351 -59 4 1630 253 298 95 0 chr2 137034358 137034442 -44713645 + ORR1E LTR MaLR 20 111 -248 4 1630 2388 168 22 19 chr2 137038383 137038795 -44709292 + MTC LTR MaLR 1 413 -8 5 1630 427 325 39 4 chr2 137042071 137042276 -44705811 + LTR16E1 LTR ERVL 269 535 -3 5 1630 393 269 93 0 chr2 137042367 137042475 -44705612 - LTR16C LTR ERVL -4 485 368 5 1630 3354 162 8 38 chr2 137045114 137045717 -44702370 - RMER4B LTR ERVK 0 585 1 6 1630 392 374 67 26 chr2 137048320 137048589 -44699498 - MLT1H LTR MaLR -226 323 44 7 1630 440 332 106 39 chr2 137048638 137048845 -44699242 - MLT1J2 LTR MaLR -21 427 207 7 1630 319 267 250 35 chr2 137049958 137050342 -44697745 + RLTR12B LTR ERVK 11 476 -52 7 1630 839 292 50 31 chr2 137053055 137053189 -44694898 - MLT1A0 LTR MaLR -21 387 199 8 1630 839 291 52 39 chr2 137053225 137053424 -44694663 - MLT1A0 LTR MaLR -167 198 4 8 1630 247 205 14 57 chr2 137060987 137061065 -44687022 - MTE2a LTR MaLR -26 353 279 9 1630 358 264 89 18 chr2 137063561 137063673 -44684414 + MLT1A1 LTR MaLR 270 389 -19 9 1630 1146 294 51 25 chr2 137063845 137064201 -44683886 + MTEa LTR MaLR 6 370 -9 1 1630 259 275 91 86 chr2 137065032 137065219 -44682868 + MTEb LTR MaLR 174 361 -18 1 1630 422 340 108 9 chr2 137065367 137065581 -44682506 - MLT1C LTR MaLR -2 465 231 1 1630 1579 248 41 19 chr2 137065613 137066021 -44682066 + MTD LTR MaLR 1 405 -14 1 1630 259 291 35 11 chr2 137066018 137066105 -44681982 - MLT1C LTR MaLR -375 92 4 1 1630 366 309 127 87 chr2 137067260 137067661 -44680426 + MLT1D LTR MaLR 40 456 -49 1 1630 256 218 18 0 chr2 137067717 137067772 -44680315 + MLT1D LTR MaLR 439 494 -11 1 1630 305 327 81 64 chr2 137071445 137071618 -44676469 + LTR33 LTR ERVL 14 189 -342 1 1630 350 329 36 0 chr2 137071688 137071828 -44676259 + LTR33 LTR ERVL 338 482 -33 1 1630 326 336 72 100 chr2 137072988 137073319 -44674768 + LTR16A1 LTR ERVL 15 336 -120 1 1630 330 332 92 48 chr2 137077885 137078091 -44669996 - LTR16E1 LTR ERVL -11 527 313 1 1630 347 286 109 36 chr2 137078998 137079136 -44668951 + MLT1K LTR MaLR 425 572 -23 1 1630 355 365 102 53 chr2 137079648 137079952 -44668135 - MLT1H LTR MaLR -115 434 116 1 1630 960 96 13 65 chr2 137079846 137080073 -44668014 + MTB LTR MaLR 191 400 0 1 1630 430 298 68 52 chr2 137082623 137082830 -44665257 + MLT1J1 LTR MaLR 46 260 -188 1 1630 1981 116 3 0 chr2 137086367 137086651 -44661436 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 43 1 1630 398 88 0 0 chr2 137087363 137087420 -44660667 - ORR1A2 LTR MaLR -270 57 1 1 1630 239 323 70 31 chr2 137088135 137088263 -44659824 + MLT1H LTR MaLR 33 165 -384 1 1630 418 241 25 74 chr2 137088726 137088847 -44659240 + MLT1H LTR MaLR 226 340 -209 1 1630 1313 286 27 45 chr2 137091581 137091845 -44656242 - ORR1D2 LTR MaLR -2 368 113 1 1630 3620 28 6 123 chr2 137091845 137092383 -44655704 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 1 1630 1313 286 27 45 chr2 137092383 137092492 -44655595 - ORR1D2 LTR MaLR -258 112 2 1 1630 1236 279 70 8 chr2 137095016 137095399 -44652688 + MTD LTR MaLR 1 407 -12 1 1630 665 228 113 5 chr2 137099522 137099707 -44648380 + MTEb LTR MaLR 151 355 -24 1 1630 458 191 100 0 chr2 137100698 137100808 -44647279 + MTEb LTR MaLR 151 271 -108 1 203 3615 14 56 0 chr2 137100808 137101395 -44646692 + MERVL-int LTR ERVL 290 909 -4576 1 1631 683 12 0 0 chr2 137101395 137101477 -44646610 - MT-int LTR MaLR -390 708 627 1 1631 3330 10 0 0 chr2 137101480 137101875 -44646212 + MTA_Mm-int LTR MaLR 704 1098 0 1 1631 2023 21 0 0 chr2 137101875 137102116 -44645971 + MTA_Mm LTR MaLR 1 241 -155 1 1631 689 231 75 38 chr2 137109929 137110193 -44637894 + MT2A LTR ERVL 316 601 0 1 1631 1898 142 59 6 chr2 137115957 137116298 -44631789 - RLTR15 LTR ERVK 0 359 1 1 1631 1162 197 181 4 chr2 137117020 137117285 -44630802 - ORR1C1 LTR MaLR -66 312 1 1 1631 2551 177 122 8 chr2 137117701 137118219 -44629868 - RMER20B LTR ERVK -41 586 10 1 1631 2135 201 20 8 chr2 137128887 137129289 -44618798 - MTD LTR MaLR -7 412 6 2 1631 2083 252 81 130 chr2 137129294 137129737 -44618350 - MTD-int LTR MaLR 0 1098 732 2 1631 2122 244 71 50 chr2 137129790 137130475 -44617612 - MTD-int LTR MaLR -367 731 26 2 1631 1174 249 8 0 chr2 137130472 137130717 -44617370 - MTD LTR MaLR -170 249 3 2 1631 262 219 17 0 chr2 137132210 137132269 -44615818 + LTR16C LTR ERVL 393 478 -11 2 1631 426 347 122 62 chr2 137134778 137135050 -44613037 - LTR16C LTR ERVL -1 488 197 2 1631 426 347 122 62 chr2 137135379 137135407 -44612680 - LTR16C LTR ERVL -293 196 167 2 1631 386 324 68 14 chr2 137142094 137142241 -44605846 + MLT1H LTR MaLR 56 210 -339 2 1631 286 340 51 39 chr2 137142299 137142455 -44605632 + MLT1H LTR MaLR 293 450 -99 2 1631 986 314 53 64 chr2 137144622 137144982 -44603105 + LTR16A1 LTR ERVL 1 356 -100 2 1631 513 315 179 26 chr2 137154086 137154438 -44593649 + MLT1A1 LTR MaLR 3 408 0 2 1631 255 363 24 8 chr2 137158541 137158666 -44589421 + LTR16A1 LTR ERVL 330 456 0 2 1631 854 196 364 23 chr2 137160801 137161103 -44586984 - MTD LTR MaLR -14 405 1 2 1631 974 192 22 6 chr2 137166365 137166543 -44581544 + MTC LTR MaLR 241 421 0 2 1631 1158 225 103 75 chr2 137166982 137167419 -44580668 + RLTR12B LTR ERVK 47 495 -33 2 1631 515 307 101 48 chr2 137171139 137171448 -44576639 + MLT1J2 LTR MaLR 18 349 -99 2 1631 901 352 22 30 chr2 137179787 137180150 -44567937 - MLT1H LTR MaLR -177 372 13 2 1631 270 338 75 96 chr2 137184214 137184453 -44563634 - LTR16C LTR ERVL -43 446 213 2 1631 913 252 37 63 chr2 137184717 137184988 -44563099 - MTE2b LTR MaLR -110 269 6 2 1631 487 340 54 10 chr2 137185621 137185826 -44562261 + MLT1F LTR MaLR 173 386 -162 2 1631 301 355 70 12 chr2 137187140 137187311 -44560776 + MLT1A LTR MaLR 175 355 -19 2 1631 587 312 111 51 chr2 137197446 137197841 -44550246 + LTR52 LTR ERVL 1 419 -2 2 1631 344 404 44 64 chr2 137204544 137204744 -44543343 + LTR16E1 LTR ERVL 131 329 -209 3 1631 344 404 44 64 chr2 137204888 137205076 -44543011 + LTR16E1 LTR ERVL 330 511 -27 3 1631 504 250 164 56 chr2 137208514 137208764 -44539323 - LTR33A LTR ERVL -93 427 151 3 1631 286 323 136 25 chr2 137212122 137212284 -44535803 + LTR33 LTR ERVL 162 341 -174 3 1631 1655 238 16 29 chr2 137216005 137216381 -44531706 + ORR1D1 LTR MaLR 4 374 0 3 1631 508 333 25 38 chr2 137216765 137217002 -44531085 + MTD LTR MaLR 1 234 -185 3 1631 481 218 17 66 chr2 137217088 137217223 -44530864 + MTD LTR MaLR 220 375 -44 3 1631 2669 121 105 0 chr2 137220409 137220839 -44527248 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 3 1631 286 110 77 64 chr2 137220841 137220919 -44527168 + IAPEz-int LTR ERVK 3 81 -1906 3 1631 446 128 114 105 chr2 137220899 137221004 -44527083 + IAPEz-int LTR ERVK 18 123 -6358 3 1631 231 267 0 0 chr2 137221004 137221049 -44527038 + RLTR27 LTR ERVK 231 275 -34 3 1631 251 302 0 0 chr2 137221077 137221130 -44526957 + RLTR27 LTR ERVK 223 275 -34 3 1631 3684 56 1 16 chr2 137221130 137221708 -44526379 + IAPEz-int LTR ERVK 168 662 -5819 3 1631 2626 79 3 3 chr2 137221708 137222050 -44526037 + IAPEz-int LTR ERVK 1359 1700 -4781 3 1631 6708 48 4 18 chr2 137222043 137222884 -44525203 + IAPEz-int LTR ERVK 5651 6479 -2 3 1631 2272 112 71 33 chr2 137222886 137223282 -44524805 + IAPLTR2a LTR ERVK 1 411 0 3 1631 2203 129 69 100 chr2 137223338 137223828 -44524259 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 3 1631 984 307 11 132 chr2 137231632 137231981 -44516106 + MTE2b LTR MaLR 6 312 -67 3 1632 489 281 91 6 chr2 137236547 137236712 -44511375 - LTR16A1 LTR ERVL 0 456 278 3 1632 231 284 76 43 chr2 137238539 137238631 -44509456 + MLT1H2 LTR MaLR 71 165 -324 3 1632 392 346 19 45 chr2 137242270 137242493 -44505594 - MLT1J1 LTR MaLR -182 266 54 3 1632 622 386 53 14 chr2 137246642 137246999 -44501088 - LTR33A LTR ERVL -1 519 149 3 1632 243 188 35 59 chr2 137249506 137249591 -44498496 + ORR1D2 LTR MaLR 286 368 -2 3 1632 2071 267 178 58 chr2 137249593 137250541 -44497546 + ORR1D2-int LTR MaLR 1 1080 -178 3 1632 372 324 48 66 chr2 137252462 137252697 -44495390 - MLT1E2 LTR MaLR -113 541 327 3 1632 230 350 18 65 chr2 137252752 137252876 -44495211 - MLT1E2 LTR MaLR -522 132 14 3 1632 332 341 209 28 chr2 137254658 137255122 -44492965 + MER74A LTR ERVL 1 550 -8 3 1632 553 307 57 16 chr2 137255574 137255766 -44492321 - MLT1A0 LTR MaLR -62 303 104 3 1632 648 317 24 19 chr2 137278223 137278435 -44469652 + MLT1H LTR MaLR 337 549 0 3 1632 1725 182 13 16 chr2 137288175 137288487 -44459600 + ORR1A4 LTR MaLR 1 311 -18 4 1632 344 319 36 22 chr2 137289544 137289682 -44458405 - MLT1D LTR MaLR -348 157 18 4 1632 281 360 16 8 chr2 137289991 137290117 -44457970 + MLT1H LTR MaLR 114 240 -309 4 1632 476 239 137 0 chr2 137310410 137310527 -44437560 - MTD LTR MaLR -14 405 273 4 1632 429 332 150 47 chr2 137310786 137311193 -44436894 - MLT1H LTR MaLR -36 513 65 4 1632 2122 147 5 55 chr2 137312760 137313163 -44434924 - RMER6B LTR ERVK -65 396 14 4 1632 346 326 117 56 chr2 137322189 137322420 -44425667 + ORR1E LTR MaLR 15 259 -111 4 1632 229 135 27 0 chr2 137322949 137322986 -44425101 - RLTR11A2 LTR ERVK -471 56 19 4 1632 465 335 75 16 chr2 137323187 137323375 -44424712 + MLT1H LTR MaLR 108 306 -243 4 1632 242 262 89 80 chr2 137325554 137325666 -44422421 + MT-int LTR MaLR 742 854 -244 4 1632 549 255 110 58 chr2 137329378 137329565 -44418522 - RLTR15 LTR ERVK -53 306 104 4 1632 549 255 110 58 chr2 137329622 137329725 -44418362 - RLTR15 LTR ERVK -256 103 1 4 1632 539 379 85 36 chr2 137330622 137331011 -44417076 - LTR33 LTR ERVL -2 513 106 4 1632 1504 264 59 45 chr2 137332895 137333402 -44414685 + RLTR17 LTR ERVK 102 615 -77 4 1632 458 221 0 28 chr2 137334185 137334292 -44413795 + MLT1A1 LTR MaLR 302 405 -3 4 1632 314 314 124 0 chr2 137343781 137343886 -44404201 + MLT1A1 LTR MaLR 34 151 -257 4 1632 330 272 132 28 chr2 137343934 137344040 -44404047 + MLT1A1 LTR MaLR 288 404 -4 4 1632 418 295 126 87 chr2 137359292 137359648 -44388439 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 5 1633 245 359 53 46 chr2 137370839 137370991 -44377096 + RMER12 LTR ERVK 739 891 -431 5 1633 694 310 150 8 chr2 137374256 137374623 -44373464 + MER57C2 LTR ERV1 11 429 -5 5 1633 273 309 70 49 chr2 137380018 137380161 -44367926 - LTR33 LTR ERVL -1 514 369 5 1633 3190 62 7 5 chr2 137382246 137382666 -44365421 - BGLII LTR ERVK 0 421 1 5 1633 279 333 69 79 chr2 137387699 137387901 -44360186 - MLT1H LTR MaLR -2 547 348 5 1633 1780 224 50 19 chr2 137388773 137389197 -44358890 - RLTR20A LTR ERVK -100 441 5 5 1633 434 309 59 22 chr2 137401883 137402105 -44345982 - MLT1K LTR MaLR -28 567 338 5 1633 4917 193 66 59 chr2 137406261 137406282 -44341805 - RLTR21 LTR ERVK -370 1202 1182 5 1633 4917 193 66 59 chr2 137406337 137407504 -44340583 - RLTR21 LTR ERVK -391 1181 6 5 1633 459 357 86 46 chr2 137418317 137418643 -44329444 - LTR16A1 LTR ERVL -16 440 102 5 1633 737 320 84 70 chr2 137421258 137421641 -44326446 + MLT1B LTR MaLR 3 390 0 5 1633 244 212 75 15 chr2 137431623 137431690 -44316397 + MLT1H LTR MaLR 236 306 -243 6 1633 875 313 45 15 chr2 137434969 137435238 -44312849 + MTEa LTR MaLR 15 291 -88 6 1633 1554 241 39 24 chr2 137435238 137435651 -44312436 + MTD LTR MaLR 1 419 0 6 1633 368 256 11 11 chr2 137435651 137435725 -44312362 + MTEa LTR MaLR 304 377 -2 6 1633 1301 116 0 0 chr2 137443305 137443495 -44304592 - ORR1A2-int LTR MaLR -1772 191 2 6 1633 2164 83 6 60 chr2 137443500 137443832 -44304255 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 6 6 1633 469 337 85 98 chr2 137451470 137451718 -44296369 + LTR16C LTR ERVL 98 360 -129 6 1633 469 337 85 98 chr2 137451751 137451880 -44296207 + LTR16C LTR ERVL 361 470 -19 6 1633 281 305 28 19 chr2 137460243 137460350 -44287737 - MLT1A LTR MaLR -211 163 56 6 1633 1090 264 100 32 chr2 137475009 137475349 -44272738 - MTE2b LTR MaLR -14 365 3 6 1633 1313 246 33 77 chr2 137475506 137476227 -44271860 - RMER19C LTR ERVK 0 902 1 6 1633 549 315 83 25 chr2 137476227 137476530 -44271557 + ORR1E LTR MaLR 23 364 -15 6 1633 277 326 65 61 chr2 137492111 137492356 -44255731 - LTR37B LTR ERV1 -27 441 196 6 1634 2878 92 3 0 chr2 137499000 137499392 -44248695 - MTB LTR MaLR 0 400 8 7 1634 371 137 382 0 chr2 137504979 137505081 -44243006 - ORR1D1 LTR MaLR -233 141 1 1 1634 1545 214 28 143 chr2 137505218 137505507 -44242580 - MTD LTR MaLR -4 415 190 1 1634 1545 214 28 143 chr2 137506126 137506305 -44241782 - MTD LTR MaLR -230 189 1 1 1634 402 323 121 20 chr2 137506469 137506668 -44241419 + MLT1H LTR MaLR 86 304 -245 1 1634 1088 93 7 0 chr2 137506692 137506842 -44241245 + ORR1A2 LTR MaLR 1 151 -176 1 1634 6017 160 71 10 chr2 137506844 137508030 -44240057 + ORR1A2-int LTR MaLR 1 1258 -705 1 1634 3542 93 34 6 chr2 137508030 137508528 -44239559 - RLTR1B LTR ERV1 0 512 1 1 1634 2725 110 2 2 chr2 137508529 137508939 -44239148 + ORR1A1-int LTR MaLR 1086 1495 -297 1 1634 1061 100 6 24 chr2 137508930 137509094 -44238993 + ORR1A1 LTR MaLR 186 346 0 1 1634 473 373 134 24 chr2 137509669 137510161 -44237926 + MLT1H1 LTR MaLR 10 555 0 1 1634 463 344 126 29 chr2 137517394 137517744 -44230343 - MLT1H LTR MaLR -165 384 1 3 1634 453 319 75 41 chr2 137518751 137519059 -44229028 + ORR1E LTR MaLR 4 348 -31 3 1634 381 248 10 29 chr2 137523683 137523787 -44224300 - MTE2a LTR MaLR -2 377 276 3 1634 1695 227 66 3 chr2 137525796 137526176 -44221911 - MTD LTR MaLR -8 411 8 4 1634 239 368 124 57 chr2 137535294 137535680 -44212407 + MLT1H LTR MaLR 92 503 -9 5 1634 660 355 56 48 chr2 137537546 137537883 -44210204 + MLT1H-int LTR MaLR 656 995 -392 5 1634 333 333 86 13 chr2 137538998 137539150 -44208937 + MLT1H LTR MaLR 30 192 -357 5 1634 3382 134 4 68 chr2 137548456 137549016 -44199071 - RLTR28 LTR ERVL 0 524 1 7 1634 342 289 113 13 chr2 137549449 137549600 -44198487 + MLT1H LTR MaLR 58 223 -326 7 1634 446 346 53 5 chr2 137550031 137550240 -44197847 - MLT1B LTR MaLR -7 383 165 7 1634 473 306 6 44 chr2 137550581 137550762 -44197325 - MLT1B LTR MaLR -210 180 7 7 1634 2967 80 51 15 chr2 137552901 137553294 -44194793 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 7 1634 248 191 176 0 chr2 137567935 137568003 -44180084 - MTEb LTR MaLR -20 359 280 1 1634 328 342 114 97 chr2 137568356 137568822 -44179265 + LTR40b LTR ERVL 21 494 -25 1 1634 1011 309 66 73 chr2 137569721 137570736 -44177351 + MTD-int LTR MaLR 1 1056 -202 1 1634 229 244 156 0 chr2 137570761 137570851 -44177236 + MTD-int LTR MaLR 1147 1250 -8 1 1634 240 333 24 0 chr2 137570888 137570972 -44177115 + MTD LTR MaLR 58 143 -276 1 1634 610 265 7 0 chr2 137571050 137571186 -44176901 + MTD LTR MaLR 269 405 -14 1 1634 861 276 63 87 chr2 137580589 137580955 -44167132 - ORR1E LTR MaLR -2 357 1 1 1634 359 277 21 19 chr2 137584294 137584406 -44163681 + MLT1H2 LTR MaLR 59 211 -301 1 1634 241 371 20 20 chr2 137584749 137584895 -44163192 - LTR82A LTR ERVL -48 824 679 1 1634 244 346 47 94 chr2 137592750 137592983 -44155104 + ORR1D2 LTR MaLR 3 224 -146 1 1634 346 311 160 30 chr2 137593597 137593766 -44154321 - MLT1H2 LTR MaLR -296 193 3 1 1634 511 353 48 10 chr2 137594073 137594282 -44153805 - MLT1C LTR MaLR 0 467 251 1 1634 234 333 76 93 chr2 137594860 137595032 -44153055 - MLT1C LTR MaLR -291 176 8 1 1634 481 327 90 40 chr2 137608305 137608582 -44139505 + MLT1A0 LTR MaLR 54 344 -21 1 1634 258 307 44 22 chr2 137609084 137609174 -44138913 - MTEa LTR MaLR -240 139 48 1 1634 293 329 36 99 chr2 137616180 137616433 -44131654 - LTR37B LTR ERV1 -55 413 177 1 1634 328 323 152 18 chr2 137616886 137617110 -44130977 - ORR1E LTR MaLR -105 254 1 1 1634 327 325 173 25 chr2 137617933 137618211 -44129876 - LTR16A LTR ERVL -106 345 27 1 1634 960 307 58 4 chr2 137618361 137618527 -44129560 + ORR1D2 LTR MaLR 3 176 -194 1 1634 960 307 58 4 chr2 137618608 137618716 -44129371 + ORR1D2 LTR MaLR 177 292 -78 1 1634 973 349 37 35 chr2 137618739 137619274 -44128813 - MLT1F2 LTR MaLR -19 541 6 1 1634 427 346 114 54 chr2 137622180 137622495 -44125592 - LTR16C LTR ERVL -8 481 148 1 1634 2741 162 38 40 chr2 137622523 137623050 -44125037 - RLTR11A LTR ERVK -2 526 1 1 1634 3199 166 154 3 chr2 137623520 137624177 -44123910 + RMER6A LTR ERVK 1 756 0 1 1635 274 221 13 25 chr2 137627452 137627531 -44120556 + MTEb LTR MaLR 3 80 -299 1 1635 571 369 24 24 chr2 137639949 137640199 -44107888 + LTR16B2 LTR ERVL 119 368 -94 2 1635 750 344 40 37 chr2 137643632 137643958 -44104129 - MLT1H LTR MaLR -198 351 25 2 1635 4579 124 156 7 chr2 137644576 137645410 -44102677 + RMER17B LTR ERVK 1 958 0 2 1635 2517 178 12 55 chr2 137650588 137651098 -44096989 - RMER4B LTR ERVK 0 585 98 2 1635 323 379 124 44 chr2 137652380 137652653 -44095434 + MLT1H LTR MaLR 132 426 -123 2 1635 603 335 66 91 chr2 137655302 137655709 -44092378 + MLT1H LTR MaLR 32 428 -121 2 1635 2201 135 71 11 chr2 137657603 137657971 -44090116 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 5 2 1635 354 329 56 45 chr2 137658143 137658321 -44089766 - MLT1G LTR MaLR 0 591 412 2 1635 246 348 124 9 chr2 137661373 137661486 -44086601 - MLT1G LTR MaLR -378 213 88 2 1635 573 359 73 86 chr2 137665415 137665717 -44082370 + ORR1E LTR MaLR 3 300 -70 2 1635 394 312 64 17 chr2 137682523 137682696 -44065391 + MLT2B1 LTR ERVL 58 238 -282 2 1635 282 269 0 13 chr2 137683054 137683133 -44064954 - RMER15-int LTR ERVL -229 4770 4693 2 1635 269 322 58 58 chr2 137683453 137683608 -44064479 - RMER15-int LTR ERVL -678 4321 4167 2 1635 538 355 91 34 chr2 137683827 137684177 -44063910 - RMER15-int LTR ERVL -2852 2147 1778 2 1635 429 318 62 76 chr2 137684285 137684639 -44063448 - RMER15-int LTR ERVL -3370 1629 1281 2 1635 413 319 124 6 chr2 137685056 137685217 -44062870 - RMER15-int LTR ERVL -3800 1199 1020 2 1635 850 359 52 28 chr2 137685975 137686397 -44061690 - RMER15-int LTR ERVL -4559 440 9 2 1635 398 333 89 6 chr2 137686425 137686594 -44061493 - RMER15 LTR ERVL -21 554 372 2 1635 363 284 82 5 chr2 137695099 137695291 -44052796 + MLT1F2 LTR MaLR 361 565 -4 3 1635 1227 292 41 29 chr2 137697807 137698220 -44049867 - MTD LTR MaLR -1 418 1 3 1635 2116 174 46 27 chr2 137701339 137701752 -44046335 - MTC LTR MaLR 0 421 1 3 1635 395 346 71 45 chr2 137703238 137703462 -44044625 - MLT1H LTR MaLR -257 292 63 3 1635 352 334 104 40 chr2 137712562 137712797 -44035290 - MLT1F LTR MaLR -162 407 140 3 1635 253 390 65 20 chr2 137724365 137724564 -44023523 - MLT1H LTR MaLR -123 426 219 3 1635 551 366 25 0 chr2 137728972 137729197 -44018890 + MLT1A0 LTR MaLR 5 244 -130 3 1635 2977 79 20 2 chr2 137729274 137729667 -44018420 + MTB LTR MaLR 1 400 0 3 1635 6443 120 16 71 chr2 137729667 137730829 -44017258 + MTB-int LTR MaLR 1 1098 0 3 1635 2738 90 34 0 chr2 137730829 137731216 -44016871 + MTB LTR MaLR 1 400 0 3 1635 1940 174 71 0 chr2 137731437 137731805 -44016282 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 3 1635 347 305 0 63 chr2 137732477 137732603 -44015484 + MLT1A0 LTR MaLR 242 359 -6 3 1635 1529 212 206 34 chr2 137739976 137740475 -44007612 - RMER4B LTR ERVK 0 585 1 3 1635 4153 161 70 7 chr2 137741281 137742005 -44006082 + RMER13A LTR ERVK 1 770 -90 3 1635 522 284 177 5 chr2 137745756 137745954 -44002133 + ORR1D2 LTR MaLR 4 235 -135 3 1635 322 279 35 145 chr2 137746030 137746202 -44001885 + ORR1D2 LTR MaLR 225 377 -2 3 1635 283 308 11 11 chr2 137752082 137752174 -43995913 - MTEb LTR MaLR -12 367 276 3 1635 2083 216 132 15 chr2 137752629 137753152 -43994935 - RLTR31A_Mm LTR ERVK 0 584 1 3 1635 1426 222 31 56 chr2 137753152 137753643 -43994444 - RMER3D-int LTR ERVK -1 2841 2391 3 1636 327 343 209 0 chr2 137761593 137761794 -43986293 + MLT1E LTR MaLR 387 629 -24 3 1636 608 264 26 23 chr2 137766868 137767120 -43980967 + MTEa LTR MaLR 46 377 -2 4 1636 489 352 105 54 chr2 137772551 137772588 -43975499 - LTR16B LTR ERVL -11 452 414 4 1636 489 352 105 54 chr2 137772619 137773010 -43975077 - LTR16B LTR ERVL -50 413 2 4 1636 375 195 34 51 chr2 137773203 137773381 -43974706 - RMER17C LTR ERVK -135 275 101 4 1636 253 359 20 20 chr2 137773599 137773747 -43974340 - MER110 LTR ERV1 -36 455 308 4 1636 277 275 107 48 chr2 137776174 137776342 -43971745 - LTR16A1 LTR ERVL -61 395 218 4 1636 388 344 150 48 chr2 137776992 137777413 -43970674 - MLT1D LTR MaLR -5 500 37 4 1636 233 300 48 120 chr2 137777792 137777917 -43970170 + MTB_Mm LTR MaLR 164 279 -128 4 1636 406 317 82 7 chr2 137781488 137781634 -43966453 + MLT1F LTR MaLR 219 375 -173 4 1636 375 314 9 9 chr2 137785821 137785927 -43962160 - MT2A LTR ERVL -158 375 270 4 1636 2327 216 77 20 chr2 137785927 137786471 -43961616 - RMER15 LTR ERVL 0 575 1 4 1636 285 388 62 8 chr2 137786597 137786727 -43961360 - MTEa LTR MaLR -242 137 1 4 1636 399 331 164 24 chr2 137787500 137787877 -43960210 - MLT1H LTR MaLR 0 549 120 4 1636 1312 268 29 6 chr2 137788671 137788987 -43959100 + MTEa LTR MaLR 55 377 -2 4 1636 2971 38 0 0 chr2 137789483 137789829 -43958258 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 4 1636 275 362 54 16 chr2 137790033 137790162 -43957925 - LTR79 LTR ERVL -56 471 338 4 1636 259 358 137 0 chr2 137790788 137790883 -43957204 - MLT1D LTR MaLR -119 386 279 4 1636 227 238 43 87 chr2 137793287 137793356 -43954731 + MLT1H LTR MaLR 105 170 -379 4 1636 946 272 88 25 chr2 137797167 137797521 -43950566 - MTEa LTR MaLR -3 376 1 4 1636 1140 278 68 16 chr2 137801742 137802049 -43946038 + MTE2a LTR MaLR 31 353 -26 4 1636 993 330 109 20 chr2 137809984 137810481 -43937606 + MLT1E1A LTR MaLR 74 614 -66 4 1636 254 336 35 0 chr2 137812990 137813106 -43934981 - MLT1D LTR MaLR -4 501 382 4 1636 530 299 207 47 chr2 137814098 137814475 -43933612 - MLT1E2 LTR MaLR -175 452 7 4 1636 337 366 118 34 chr2 137814917 137815239 -43932848 + MLT1F1 LTR MaLR 221 569 0 4 1636 637 211 96 24 chr2 137830820 137831029 -43917058 - MTD LTR MaLR 0 419 196 5 1636 620 313 62 0 chr2 137833430 137833609 -43914478 - MTD LTR MaLR -209 210 21 5 1636 619 315 81 143 chr2 137833793 137834396 -43913691 - MER34A LTR ERV1 -2 569 4 5 1636 321 346 78 36 chr2 137834701 137834893 -43913194 + MLT1H LTR MaLR 104 303 -246 5 1636 303 303 116 19 chr2 137844126 137844281 -43903806 + MLT1E3 LTR MaLR 5 174 -450 5 1636 290 374 124 22 chr2 137844812 137844990 -43903097 + MLT1E1A LTR MaLR 406 601 -79 5 1636 493 234 26 46 chr2 137852406 137852558 -43895529 - LTR81A LTR ERV1? -1163 187 39 5 1636 820 274 68 64 chr2 137853097 137853650 -43894437 + ERVL-B4-int LTR ERVL 4649 5202 -465 5 1636 737 272 74 134 chr2 137856118 137856521 -43891566 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 5 1636 2934 30 5 14 chr2 137860821 137861191 -43886896 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 5 1636 6739 101 109 14 chr2 137861191 137862384 -43885703 + IAPEz-int LTR ERVK 8 1313 -5168 5 1636 27421 23 1 1 chr2 137862383 137865654 -43882433 + IAPEz-int LTR ERVK 3210 6481 0 5 1636 2934 30 5 14 chr2 137865654 137866024 -43882063 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 5 1636 392 271 32 24 chr2 137866024 137866149 -43881938 + LTR16A1 LTR ERVL 329 454 -2 5 1636 277 272 202 47 chr2 137866597 137866855 -43881232 + MER90 LTR ERV1 106 403 -172 5 1636 258 280 215 0 chr2 137867507 137867600 -43880487 + LTR16A1 LTR ERVL 1 113 -343 5 1636 307 275 161 23 chr2 137867881 137868066 -43880021 + LTR45C LTR ERV1 322 536 -3 5 1636 2116 146 29 6 chr2 137875584 137875935 -43872152 + ORR1B2 LTR MaLR 1 359 -8 5 1636 324 254 179 23 chr2 137878478 137878651 -43869436 + LTR16A1 LTR ERVL 257 456 0 5 1636 375 320 47 114 chr2 137878964 137879366 -43868721 - MLT1B LTR MaLR -1 389 15 5 1636 1053 253 27 109 chr2 137880380 137880792 -43867295 + MTEb LTR MaLR 2 379 0 5 1636 238 271 110 52 chr2 137884594 137884730 -43863357 + MLT1A1 LTR MaLR 1 144 -264 5 1636 360 348 36 114 chr2 137884729 137885063 -43863024 + ORR1E LTR MaLR 52 359 0 5 1636 909 278 134 10 chr2 137886554 137886845 -43861242 + MTEb LTR MaLR 16 342 -37 5 1637 979 224 192 13 chr2 137900707 137901024 -43847063 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 6 1637 696 280 118 5 chr2 137908616 137908907 -43839180 - ORR1D1 LTR MaLR -37 347 1 6 1637 1545 183 47 16 chr2 137908907 137909229 -43838858 - ORR1D1-int LTR MaLR 0 1370 1039 6 1637 3166 274 19 8 chr2 137909205 137910029 -43838058 - ORR1D1-int LTR MaLR -536 834 2 6 1637 379 176 0 14 chr2 137910035 137910104 -43837983 - ORR1D1 LTR MaLR -8 366 299 6 1637 644 250 51 34 chr2 137910195 137910373 -43837714 - ORR1D1 LTR MaLR -193 181 1 6 1637 548 340 82 66 chr2 137918231 137918549 -43829538 - MTEa LTR MaLR -7 372 50 6 1637 2581 184 43 29 chr2 137918568 137919096 -43828991 + RLTR31A_Mm LTR ERVK 6 584 0 6 1637 404 370 22 50 chr2 137919916 137920098 -43827989 - LTR16C LTR ERVL -280 209 33 6 1637 2047 267 71 60 chr2 137922067 137922840 -43825247 + RLTR40 LTR ERVK 31 812 -5 6 1637 1083 142 82 0 chr2 137937665 137937848 -43810239 + RMER19B LTR ERVK 693 890 -12 6 1637 258 50 0 91 chr2 137938401 137938445 -43809642 + MERVL-int LTR ERVL 4730 4769 -716 6 1637 1010 47 0 0 chr2 137938425 137938554 -43809533 + MERVL-int LTR ERVL 5243 5371 -114 6 1637 353 125 26 53 chr2 137938554 137938630 -43809457 + ORR1A3-int LTR MaLR 567 640 -1323 6 1637 229 216 95 95 chr2 137938612 137938668 -43809419 + ORR1A3-int LTR MaLR 558 613 -1350 6 1637 2367 25 0 0 chr2 137938668 137938952 -43809135 + MT2_Mm LTR ERVL 1 284 -209 6 1637 554 330 64 53 chr2 137940077 137940435 -43807652 + MER57D LTR ERV1 12 373 -38 6 1637 903 252 122 137 chr2 137940480 137940860 -43807227 - MTD LTR MaLR -5 374 1 6 1637 363 293 80 37 chr2 137947606 137947769 -43800318 - RMER20A LTR ERVK 0 516 347 6 1637 446 281 31 8 chr2 137948697 137948826 -43799261 - MLT1A0 LTR MaLR -224 141 10 6 1637 262 329 108 38 chr2 137949055 137949213 -43798874 - MLT1H LTR MaLR -233 316 148 6 1637 1427 204 26 108 chr2 137952794 137953212 -43794875 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 6 1637 1627 268 55 25 chr2 137954426 137954916 -43793171 - RMER20A LTR ERVK 0 516 12 6 1637 1666 271 90 27 chr2 137955369 137955882 -43792205 + RMER15 LTR ERVL 27 571 -4 6 1637 227 302 68 23 chr2 137965607 137965695 -43782392 + MLT1B LTR MaLR 282 373 -17 7 1637 521 299 40 50 chr2 137968321 137968543 -43779544 + MER21B LTR ERV1 640 859 -4 7 1637 415 314 159 13 chr2 137970950 137971189 -43776898 + MLT1H LTR MaLR 29 302 -247 7 1637 313 361 88 58 chr2 137972760 137973089 -43774998 - LTR16A1 LTR ERVL -21 435 97 7 1637 1799 191 88 0 chr2 137977163 137977525 -43770562 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 7 1637 1303 251 52 10 chr2 137977746 137978052 -43770035 + MTD LTR MaLR 87 405 -14 7 1637 397 214 11 35 chr2 137984454 137984541 -43763546 + RLTR18 LTR ERVK 1 85 -531 7 1637 1908 153 23 38 chr2 137985330 137985677 -43762410 + RLTR18 LTR ERVK 249 590 -26 7 1637 818 324 75 28 chr2 137986740 137987169 -43760918 - MER67A LTR ERV1 0 543 95 7 1637 277 326 101 18 chr2 137989492 137989658 -43758429 + MLT1A1 LTR MaLR 190 408 0 7 1637 2026 230 51 10 chr2 137993123 137993556 -43754531 + MT2A LTR ERVL 24 558 -43 7 1637 287 153 0 12 chr2 137993636 137993691 -43754396 + MT2A LTR ERVL 426 533 0 7 1637 276 307 74 69 chr2 138001056 138001231 -43746856 + ORR1E LTR MaLR 22 197 -162 3 1637 760 272 129 20 chr2 138007716 138008016 -43740071 + MT2A LTR ERVL 29 361 -172 1 1637 2511 127 14 9 chr2 138010689 138011109 -43736978 + BGLII_Mus LTR ERVK 1 422 0 1 1637 456 345 81 61 chr2 138011580 138011926 -43736161 - ORR1E LTR MaLR -6 353 1 1 1637 420 340 101 16 chr2 138011947 138012135 -43735952 + LTR16C LTR ERVL 286 489 0 2 1637 354 356 101 6 chr2 138015271 138015449 -43732638 - LTR16C LTR ERVL -5 484 290 3 1637 1377 238 43 16 chr2 138015783 138016154 -43731933 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 4 3 1637 1956 102 81 62 chr2 138017921 138018244 -43729843 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 3 1638 328 358 99 16 chr2 138023813 138023995 -43724092 - LTR16E2 LTR ERVL -1 567 371 4 1638 282 216 19 4 chr2 138025788 138025875 -43722212 + MamGypLTR1b LTR Gypsy 710 796 -7 4 1638 444 248 171 57 chr2 138031052 138031457 -43716630 - MER34A1 LTR ERV1 -75 512 9 5 1638 448 285 39 122 chr2 138031464 138031875 -43716212 + MTE2a LTR MaLR 1 377 -2 5 1638 344 260 65 76 chr2 138032076 138032256 -43715831 - MLT2B1 LTR ERVL -2 565 347 5 1638 228 265 20 0 chr2 138039246 138039295 -43708792 + MLT1J2 LTR MaLR 84 133 -315 6 1638 361 215 0 48 chr2 138039734 138039817 -43708270 - MTD LTR MaLR -135 284 206 6 1638 1097 141 38 0 chr2 138043047 138043232 -43704855 + RMER4A LTR ERVK 275 466 0 6 1638 519 296 81 38 chr2 138046928 138047275 -43700812 + MLT1A0 LTR MaLR 1 362 -3 7 1638 308 278 85 23 chr2 138048807 138048936 -43699151 + MLT1G1 LTR MaLR 110 246 -333 7 1638 392 315 76 33 chr2 138049236 138049420 -43698667 - MLT1J2 LTR MaLR -252 196 5 7 1638 7420 101 35 3 chr2 138050464 138051568 -43696519 + ORR1A2-int LTR MaLR 824 1963 0 7 1638 1996 89 7 0 chr2 138051568 138051838 -43696249 + ORR1A2 LTR MaLR 1 272 -55 7 1638 296 363 0 26 chr2 138052876 138052992 -43695095 + RMER15 LTR ERVL 422 534 -41 7 1638 660 326 86 30 chr2 138054154 138054388 -43693699 - MER21B LTR ERV1 -558 305 59 8 1638 229 358 54 70 chr2 138054364 138054493 -43693594 - MER21B LTR ERV1 -715 148 22 8 1638 414 386 50 16 chr2 138057831 138058089 -43689998 - MER68 LTR ERVL -80 483 217 9 1638 374 328 94 47 chr2 138062546 138062802 -43685285 + ORR1D2 LTR MaLR 101 368 -2 9 1638 574 318 67 28 chr2 138062806 138063091 -43684996 + ORR1D2-int LTR MaLR 3 298 -1282 9 1638 327 317 9 19 chr2 138064350 138064456 -43683631 + MTEa LTR MaLR 271 375 -4 1 1638 1105 273 62 20 chr2 138064775 138065179 -43682908 + MTC LTR MaLR 1 421 0 1 1638 427 325 148 69 chr2 138067017 138067496 -43680591 + MLT1H LTR MaLR 8 524 -25 1 1638 487 357 81 108 chr2 138071497 138071748 -43676339 + LTR16C LTR ERVL 54 273 -216 1 1638 487 357 81 108 chr2 138071776 138071970 -43676117 + LTR16C LTR ERVL 274 487 -2 1 1638 3238 66 2 10 chr2 138072729 138073128 -43674959 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1638 264 175 35 17 chr2 138074800 138074858 -43673229 + MER34A LTR ERV1 507 565 -6 1 1638 1840 163 128 9 chr2 138076599 138076927 -43671160 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 1 1638 249 196 0 0 chr2 138079162 138079208 -43668879 - MLT2D LTR ERVL 0 560 515 1 1638 327 294 77 19 chr2 138079784 138079973 -43668114 - MLT2D LTR ERVL -198 266 68 1 1638 234 320 41 10 chr2 138080661 138080754 -43667333 - RMER15 LTR ERVL -104 471 375 1 1638 439 229 34 135 chr2 138086580 138086787 -43661300 - RMER10A LTR ERVL -24 418 233 1 1638 521 335 101 12 chr2 138117938 138118195 -43629892 - MLT1H LTR MaLR -248 301 22 1 1638 659 286 66 33 chr2 138121792 138122125 -43625962 + RLTR15 LTR ERVK 1 344 -15 1 1638 1096 278 71 145 chr2 138123181 138123685 -43624402 + MLT2B2 LTR ERVL 1 467 -48 1 1638 2230 78 32 3 chr2 138124175 138124483 -43623604 - IAPLTR2b LTR ERVK -10 317 1 1 1638 244 326 103 52 chr2 138124483 138124612 -43623475 + MLT1G3 LTR MaLR 426 561 -34 1 1638 255 345 11 43 chr2 138127069 138127163 -43620924 + MLT1F LTR MaLR 204 294 -254 1 1638 547 286 102 40 chr2 138127828 138128054 -43620033 + MLT1F LTR MaLR 266 505 -43 1 1638 297 264 100 36 chr2 138128269 138128379 -43619708 - MLT1H2 LTR MaLR -321 168 52 1 1638 961 385 50 37 chr2 138129888 138129948 -43618139 - MLT1H LTR MaLR 0 549 488 1 1638 961 385 50 37 chr2 138130144 138130623 -43617464 - MLT1H LTR MaLR -62 487 3 1 1638 285 311 66 91 chr2 138130646 138130887 -43617200 + MLT1K LTR MaLR 286 520 -75 1 1638 1595 222 65 25 chr2 138132350 138132706 -43615381 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 1 1638 2338 154 25 6 chr2 138133297 138133657 -43614430 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 2 1638 573 334 46 83 chr2 138133898 138134247 -43613840 - ORR1E LTR MaLR -23 336 1 2 1638 955 282 93 13 chr2 138134741 138135043 -43613044 + MLT1A1 LTR MaLR 1 326 -82 2 1638 481 325 113 77 chr2 138135065 138135428 -43612659 + MLT1G3 LTR MaLR 209 584 -11 2 1638 253 265 29 14 chr2 138137911 138137980 -43610107 - MLT1J LTR MaLR -334 178 109 2 1638 456 332 73 26 chr2 138140348 138140833 -43607254 - MLT1H LTR MaLR -4 545 18 2 1638 225 366 126 45 chr2 138142569 138142792 -43605295 - LTR16A1 LTR ERVL -18 438 198 2 1638 490 324 118 42 chr2 138146232 138146538 -43601549 - MLT1H LTR MaLR -204 345 17 2 1639 235 361 106 46 chr2 138154478 138154760 -43593327 + MLT1N2 LTR MaLR 220 518 -44 2 1639 457 290 145 0 chr2 138154870 138155056 -43593031 - MLT1F1 LTR MaLR -16 532 320 2 1639 477 332 33 43 chr2 138155069 138155344 -43592743 - MLT1F1 LTR MaLR -287 273 3 2 1639 2044 163 8 31 chr2 138155753 138156108 -43591979 + ORR1B1 LTR MaLR 48 394 0 2 1639 237 266 48 48 chr2 138158535 138158618 -43589469 - MLT1F LTR MaLR -433 115 33 2 1639 529 294 152 75 chr2 138168336 138168685 -43579402 + LTR16C LTR ERVL 108 483 -6 2 1639 1000 238 65 141 chr2 138170260 138170720 -43577367 + RLTR23 LTR ERV1 6 430 0 2 1639 298 310 81 31 chr2 138178242 138178402 -43569685 - MLT1H2 LTR MaLR -282 207 40 2 1639 1315 223 108 28 chr2 138180670 138181058 -43567029 + MTD LTR MaLR 1 419 0 2 1639 560 284 125 44 chr2 138182857 138183152 -43564935 + RMER5 LTR ERV1 47 365 -169 2 1639 637 306 83 83 chr2 138184787 138185125 -43562962 + MER67C LTR ERV1 16 353 -358 2 1639 344 280 9 45 chr2 138186409 138186521 -43561566 + MER67C LTR ERV1 386 493 -218 2 1639 599 328 72 55 chr2 138197233 138197540 -43550547 + MER21B LTR ERV1 503 814 -49 2 1639 2565 141 155 6 chr2 138200113 138200598 -43547489 + RLTR31B_Mm LTR ERVK 1 557 0 2 1639 263 333 0 10 chr2 138201176 138201279 -43546808 - MLT1D LTR MaLR -8 497 396 2 1639 392 325 44 57 chr2 138201305 138201602 -43546485 - MLT1D LTR MaLR -212 293 1 2 1639 268 237 0 17 chr2 138202992 138203052 -43545035 + MLT1A1 LTR MaLR 350 408 0 2 1639 479 359 63 19 chr2 138204510 138204780 -43543307 - LTR16C LTR ERVL -89 400 119 3 1639 508 340 57 91 chr2 138209061 138209433 -43538654 - ORR1E LTR MaLR 0 359 1 3 1639 520 148 0 0 chr2 138212843 138212924 -43535163 + MTC LTR MaLR 1 81 -340 3 1639 1833 167 119 0 chr2 138213214 138213532 -43534555 + MTC LTR MaLR 66 421 0 3 1639 2003 164 53 18 chr2 138222913 138223293 -43524794 + ORR1B1 LTR MaLR 2 394 0 3 1639 327 349 101 65 chr2 138224674 138224922 -43523165 + MLT1K LTR MaLR 10 266 -329 3 1639 543 358 102 56 chr2 138225713 138226124 -43521963 - LTR86C LTR ERVL -102 519 90 3 1639 545 333 124 30 chr2 138232457 138232828 -43515259 - MLT1L LTR MaLR -8 602 197 3 1639 563 308 94 73 chr2 138244069 138244409 -43503678 - LTR16A1 LTR ERVL -92 364 18 3 1639 654 322 100 50 chr2 138245254 138245692 -43502395 - MLT1H LTR MaLR -34 515 22 3 1639 232 237 128 49 chr2 138248462 138248564 -43499523 - MLT1G3 LTR MaLR -31 458 349 3 1639 227 317 35 58 chr2 138248537 138248624 -43499463 - MLT1G3 LTR MaLR -121 458 374 3 1639 344 371 55 68 chr2 138248656 138248948 -43499139 - MLT1G3 LTR MaLR -302 293 6 3 1639 420 349 120 36 chr2 138252267 138252436 -43495651 - MLT1H LTR MaLR -24 525 327 3 1639 420 349 120 36 chr2 138252495 138252717 -43495370 - MLT1H LTR MaLR -223 326 101 3 1639 328 269 151 0 chr2 138254218 138254315 -43493772 - MLT1H LTR MaLR -391 158 44 3 1639 723 316 104 14 chr2 138255759 138256038 -43492049 + MLT2B4 LTR ERVL 67 370 -186 3 1639 298 323 102 12 chr2 138256636 138256802 -43491285 + MLT2B4 LTR ERVL 373 553 -3 3 1639 639 283 121 39 chr2 138256868 138257100 -43490987 - MLT1H2 LTR MaLR -198 291 41 3 1639 252 326 35 0 chr2 138258551 138258637 -43489450 + MER87 LTR ERV1 300 388 -153 3 1639 545 329 46 50 chr2 138259115 138259461 -43488626 + MLT1B LTR MaLR 1 345 -122 3 1639 265 288 0 15 chr2 138259864 138259931 -43488156 + MLT1B LTR MaLR 402 467 0 3 1639 643 332 49 23 chr2 138260770 138261078 -43487009 + MLT1B LTR MaLR 72 387 -3 3 1639 336 338 130 23 chr2 138266712 138266927 -43481160 + MLT1C LTR MaLR 228 465 -2 3 1639 2869 218 92 51 chr2 138267076 138267901 -43480186 - RMER13A LTR ERVK -1 859 1 3 1639 2266 177 174 17 chr2 138268160 138268688 -43479399 - RMER19C LTR ERVK 0 611 1 3 1639 238 293 58 37 chr2 138269680 138269844 -43478243 + MTEb LTR MaLR 206 377 -2 3 1639 240 238 0 16 chr2 138270572 138270636 -43477451 + RMER4A LTR ERVK 27 89 -377 3 1639 298 270 65 114 chr2 138273168 138273352 -43474735 + MTEa LTR MaLR 191 365 -14 3 1639 393 237 121 17 chr2 138273687 138273803 -43474284 - MLT1G LTR MaLR -453 138 11 3 1639 235 323 52 22 chr2 138277383 138277519 -43470568 - LTR16E2 LTR ERVL -8 560 421 4 1639 2367 63 119 11 chr2 138278491 138278843 -43469244 - RLTR10 LTR ERVK 0 390 1 4 1639 8414 14 0 4 chr2 138278845 138279844 -43468243 - RLTR10-int LTR ERVK -3 1984 990 4 1639 340 238 54 31 chr2 138279926 138280056 -43468031 - RLTR10-int LTR ERVK -5987 1594 1462 4 1639 5553 36 9 3 chr2 138280120 138280813 -43467274 - RLTR10-int LTR ERVK -989 998 302 4 204 644 95 250 12 chr2 138280813 138280973 -43467114 - RLTR10 LTR ERVK 0 390 193 4 1640 2537 54 0 0 chr2 138280987 138281320 -43466767 - IAPEz-int LTR ERVK -5905 576 244 4 1640 1010 120 32 0 chr2 138281320 138281478 -43466609 - IAPLTR2b LTR ERVK -164 163 1 4 1640 2432 148 29 19 chr2 138282083 138282495 -43465592 + MTC LTR MaLR 6 421 0 4 1640 303 399 41 20 chr2 138285739 138285936 -43462151 - LTR16A LTR ERVL -6 445 245 4 1640 546 307 62 19 chr2 138286612 138286821 -43461266 - MLT1D LTR MaLR 0 505 288 4 1640 486 273 92 85 chr2 138287044 138287304 -43460783 + RMER2 LTR ERV1 290 551 -16 4 1640 609 316 125 50 chr2 138293352 138293465 -43454622 - LTR48 LTR ERV1 -35 752 643 4 1640 609 316 125 50 chr2 138293607 138293893 -43454194 - LTR48 LTR ERV1 -145 642 323 4 1640 1638 214 25 28 chr2 138298046 138298406 -43449681 + ORR1D1 LTR MaLR 13 371 -3 4 1640 1213 261 123 0 chr2 138301921 138302254 -43445833 + MTD LTR MaLR 3 376 -43 4 1640 343 379 55 29 chr2 138304126 138304398 -43443689 - LTR16A1 LTR ERVL -25 431 153 4 1640 548 330 70 89 chr2 138309259 138309642 -43438445 - LTR16A1 LTR ERVL -20 436 61 4 1640 284 294 50 100 chr2 138311332 138311472 -43436615 - MLT1H LTR MaLR -134 415 283 4 1640 2246 103 25 3 chr2 138315989 138316309 -43431778 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 4 1640 367 273 76 41 chr2 138319481 138319653 -43428434 + ORR1E LTR MaLR 19 196 -163 4 1640 226 167 39 77 chr2 138320685 138320737 -43427350 - MT2B LTR ERVL 0 584 535 4 1640 1035 273 52 49 chr2 138320809 138321270 -43426817 - MT2B LTR ERVL -45 556 2 4 1640 4277 32 10 2 chr2 138322274 138322773 -43425314 + RLTR1C LTR ERV1 1 503 0 4 1640 706 265 71 13 chr2 138327966 138328192 -43419895 + ORR1E LTR MaLR 105 343 -16 4 1640 1243 276 57 43 chr2 138329535 138329887 -43418200 - ORR1E LTR MaLR -2 357 1 4 1640 297 331 61 92 chr2 138339449 138339645 -43408442 + MLT1K LTR MaLR 246 435 -160 4 1640 1565 181 140 6 chr2 138340413 138340764 -43407323 - RMER10B LTR ERVL 0 398 1 4 1640 800 228 36 64 chr2 138341069 138341204 -43406883 - RLTR12B LTR ERVK -3 525 391 4 1640 719 231 182 64 chr2 138341204 138341533 -43406554 - RLTR9A LTR ERVK 0 368 1 4 1640 800 228 36 64 chr2 138341533 138341678 -43406409 - RLTR12B LTR ERVK -138 390 253 4 1640 853 260 37 48 chr2 138341669 138341964 -43406123 - RLTR12B LTR ERVK -202 326 35 4 1640 3185 59 200 9 chr2 138342739 138343169 -43404918 + RLTR1B LTR ERV1 1 512 0 4 1640 43817 21 1 0 chr2 138343169 138348087 -43400000 + MMERGLN-int LTR ERV1 1 4919 -2637 4 1640 23933 23 0 0 chr2 138348109 138350765 -43397322 + MMERGLN-int LTR ERV1 4901 7556 0 4 1640 3185 59 200 9 chr2 138350765 138351195 -43396892 + RLTR1B LTR ERV1 1 512 0 4 1640 384 299 15 0 chr2 138351370 138351495 -43396592 - MLT1G3 LTR MaLR -63 532 396 4 1640 563 332 33 41 chr2 138352105 138352350 -43395737 - RMER15 LTR ERVL -38 537 295 4 1640 301 279 42 31 chr2 138352342 138352438 -43395649 - RMER15 LTR ERVL -415 160 64 4 1640 765 322 126 20 chr2 138355763 138356105 -43391982 - MER54A LTR ERVL -115 786 409 5 1640 413 229 9 29 chr2 138359371 138359472 -43388615 + MLT1I LTR MaLR 98 230 -319 5 1640 2184 175 20 91 chr2 138361336 138361523 -43386564 - RLTR9B2 LTR ERVK 0 420 242 5 1640 2184 175 20 91 chr2 138361666 138361930 -43386157 - RLTR9B2 LTR ERVK -179 241 1 5 1640 2110 158 28 8 chr2 138363035 138363393 -43384694 + ORR1B2 LTR MaLR 3 367 0 5 1640 306 269 83 9 chr2 138366455 138366564 -43381523 - LTR33C LTR ERVL -303 326 210 5 1640 1326 225 138 80 chr2 138367495 138368045 -43380042 + RMER4B LTR ERVK 4 585 0 5 1640 228 317 136 60 chr2 138368526 138368791 -43379296 - MLT1J1 LTR MaLR -148 296 12 5 1640 509 314 46 10 chr2 138369983 138370179 -43377908 - MER89 LTR ERV1 -2 557 355 5 1640 373 276 47 8 chr2 138370190 138370318 -43377769 - MER89 LTR ERV1 -245 314 182 5 1640 260 262 141 45 chr2 138372522 138372678 -43375409 + RMER15 LTR ERVL 337 507 -68 5 1640 703 232 88 14 chr2 138377371 138377673 -43370414 + MER57C2 LTR ERV1 13 434 0 5 1640 940 218 82 157 chr2 138381901 138382412 -43365675 - RLTR12B LTR ERVK -9 519 47 5 1640 1542 191 42 148 chr2 138384703 138384885 -43363202 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 202 5 1640 1542 191 42 148 chr2 138384928 138385170 -43362917 - ORR1C2 LTR MaLR -183 201 5 5 1640 1962 118 262 36 chr2 138388115 138388562 -43359525 - RLTR6_Mm LTR ERV1 -70 584 37 5 1640 246 145 222 16 chr2 138388607 138388670 -43359417 - RLTR6_Mm LTR ERV1 -578 76 1 5 1640 61980 35 12 19 chr2 138388670 138396400 -43351687 - RLTR6-int LTR ERV1 0 7778 1 5 1640 1853 112 278 49 chr2 138396400 138396850 -43351237 - RLTR6_Mm LTR ERV1 -65 589 37 5 1640 260 179 206 15 chr2 138396890 138396958 -43351129 - RLTR6_Mm LTR ERV1 -573 81 1 5 1640 3016 21 0 0 chr2 138399551 138399888 -43348199 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 0 337 1 5 1640 29712 11 2 0 chr2 138399888 138403121 -43344966 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 3244 5 1640 22312 30 41 14 chr2 138403113 138405786 -43342301 - IAPEz-int LTR ERVK -3730 2751 8 5 1640 3016 21 0 0 chr2 138405786 138406123 -43341964 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 0 337 1 5 1640 251 355 120 20 chr2 138407836 138408178 -43339909 - LTR16A1 LTR ERVL 0 456 81 5 1640 347 341 80 47 chr2 138409245 138409546 -43338541 - MLT1H LTR MaLR -1 548 238 5 1640 579 289 207 3 chr2 138410516 138410815 -43337272 - MTD LTR MaLR -25 394 35 5 1641 910 269 33 14 chr2 138412225 138412500 -43335587 + RMER15 LTR ERVL 296 575 0 5 1641 521 330 52 42 chr2 138414835 138415123 -43332964 + LTR16A1 LTR ERVL 149 439 -17 5 1641 1936 115 6 75 chr2 138419244 138419532 -43328555 + ORR1A2 LTR MaLR 1 270 -57 5 1641 1936 115 6 75 chr2 138420005 138420064 -43328023 + ORR1A2 LTR MaLR 271 324 -3 5 1641 4048 160 60 53 chr2 138421869 138422753 -43325334 + RMER19B LTR ERVK 1 890 -12 5 1641 2498 159 18 22 chr2 138428338 138428793 -43319294 + RLTR11B LTR ERVK 1 453 0 6 1641 540 302 129 25 chr2 138429886 138430212 -43317875 + MER34 LTR ERV1 73 432 -110 6 1641 4177 168 116 29 chr2 138430763 138431598 -43316489 - RMER13B LTR ERVK 0 908 1 6 1641 256 308 71 76 chr2 138434022 138434233 -43313854 + LTR16A1 LTR ERVL 147 356 -100 6 1641 4155 249 82 37 chr2 138439355 138440606 -43307481 - ORR1D2-int LTR MaLR 0 1370 62 6 1641 4155 249 82 37 chr2 138440630 138440689 -43307398 - ORR1D2-int LTR MaLR -1309 61 2 6 1641 1155 239 121 18 chr2 138440689 138440966 -43307121 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 60 6 1641 420 232 192 76 chr2 138440966 138441362 -43306725 + RMER10A LTR ERVL 1 442 0 6 1641 1155 239 121 18 chr2 138441362 138441416 -43306671 - ORR1D2 LTR MaLR -311 59 5 6 1641 233 308 23 62 chr2 138442534 138442662 -43305425 + MTEb LTR MaLR 239 361 -18 6 1641 433 238 52 113 chr2 138442852 138443046 -43305041 - MER67D LTR ERV1 -332 182 1 6 1641 453 328 26 21 chr2 138445085 138445275 -43302812 - LTR16E1 LTR ERVL -2 536 346 6 1641 3106 30 43 0 chr2 138447211 138447583 -43300504 - RLTR10 LTR ERVK -2 388 1 6 1641 8426 18 0 0 chr2 138447583 138448580 -43299507 - RLTR10-int LTR ERVK -1 1986 990 6 1641 7659 25 7 6 chr2 138448659 138449606 -43298481 - RLTR10-int LTR ERVK -999 988 41 6 1641 2389 96 65 35 chr2 138449616 138450015 -43298072 - IAPLTR2a LTR ERVK 0 411 1 6 1641 231 286 23 142 chr2 138450533 138450835 -43297252 - RMER12 LTR ERVK -330 992 727 6 1641 1933 148 17 12 chr2 138451423 138451809 -43296278 + ORR1A2 LTR MaLR 1 394 0 6 1641 8575 173 17 50 chr2 138451809 138452728 -43295359 + ORR1A2-int LTR MaLR 1 871 -921 6 1641 8575 173 17 50 chr2 138453382 138454315 -43293772 + ORR1A2-int LTR MaLR 872 1792 0 6 1641 1955 128 69 0 chr2 138454315 138454619 -43293468 + ORR1A2 LTR MaLR 1 325 -2 6 1641 1675 257 32 42 chr2 138455774 138456184 -43291903 + MTD LTR MaLR 14 419 0 6 1641 525 350 82 102 chr2 138459707 138460295 -43287792 + MLT1G1 LTR MaLR 4 579 0 6 1641 1606 234 19 19 chr2 138466414 138466780 -43281307 + ORR1B1 LTR MaLR 29 394 0 6 1641 848 379 36 14 chr2 138466948 138467449 -43280638 - LTR82A LTR ERVL -351 521 10 6 1641 228 324 90 80 chr2 138470519 138470707 -43277380 + RMER2 LTR ERV1 373 562 -5 6 1641 523 185 30 71 chr2 138471470 138471668 -43276419 - RMER17C LTR ERVK -133 277 88 6 1641 229 371 38 45 chr2 138474917 138475205 -43272882 + RMER12 LTR ERVK 709 994 -328 6 1641 438 332 62 66 chr2 138476109 138476351 -43271736 + MLT1B LTR MaLR 146 386 -4 6 1641 1123 207 4 23 chr2 138478317 138478574 -43269513 + RLTR28 LTR ERVL 252 503 -21 6 1641 619 337 112 13 chr2 138479415 138479863 -43268224 - RMER5 LTR ERV1 0 534 43 6 1641 737 294 177 42 chr2 138480767 138481130 -43266957 - MER92B LTR ERV1 0 636 235 6 1641 737 294 177 42 chr2 138481183 138481366 -43266721 - MER92B LTR ERV1 -402 234 16 6 1641 596 253 42 42 chr2 138482396 138482586 -43265501 + MTD LTR MaLR 229 418 -1 6 1641 280 273 64 13 chr2 138484783 138484861 -43263226 - MLT1E1A LTR MaLR -168 456 375 6 1641 535 318 86 10 chr2 138489997 138490194 -43257893 - MLT1E1A LTR MaLR -327 353 142 6 1641 736 250 56 45 chr2 138490670 138490938 -43257149 + LTR37B LTR ERV1 198 468 0 6 1641 1466 273 39 36 chr2 138497049 138497463 -43250624 + MTD LTR MaLR 5 419 0 6 1641 705 254 68 144 chr2 138502230 138502640 -43245447 - MTE2a LTR MaLR 0 379 1 5 1641 466 286 148 71 chr2 138506575 138506899 -43241188 - ORR1E LTR MaLR -8 351 3 1 1641 265 348 43 33 chr2 138507638 138507822 -43240265 + MLT2B1 LTR ERVL 1 186 -334 1 1641 634 316 147 41 chr2 138508145 138508465 -43239622 + ORR1E LTR MaLR 6 359 0 1 1641 1343 277 25 126 chr2 138510762 138511327 -43236760 - RLTR18B LTR ERVK -4 508 1 1 1641 245 219 176 42 chr2 138511750 138511869 -43236218 - RLTR15 LTR ERVK -192 167 33 2 1641 3852 181 74 13 chr2 138511939 138512854 -43235233 - MYSERV6-int LTR ERVK -70 8889 7919 2 1641 626 317 111 26 chr2 138513333 138513683 -43234404 - MLT1D LTR MaLR -120 385 6 2 1641 555 388 116 9 chr2 138515065 138515487 -43232600 - LTR16C LTR ERVL 0 489 23 2 1641 1579 193 79 73 chr2 138521783 138521839 -43226248 - ORR1C1 LTR MaLR -2 376 338 4 1641 1579 193 79 73 chr2 138522277 138522431 -43225656 - ORR1C1 LTR MaLR -41 337 165 4 1641 1579 193 79 73 chr2 138522512 138522643 -43225444 - ORR1C1 LTR MaLR -214 164 24 4 1641 2782 72 65 0 chr2 138522643 138523029 -43225058 - RLTR10A LTR ERVK 0 411 1 4 1641 1579 193 79 73 chr2 138523029 138523054 -43225033 - ORR1C1 LTR MaLR -355 23 7 4 1641 437 326 73 6 chr2 138527226 138527343 -43220744 + LTR16A1 LTR ERVL 235 360 -96 5 1641 1101 223 32 120 chr2 138527343 138527751 -43220336 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 3 5 1641 437 326 73 6 chr2 138527751 138527812 -43220275 + LTR16A1 LTR ERVL 361 424 -32 5 1641 1819 181 43 20 chr2 138538943 138539288 -43208799 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 15 6 1642 534 296 94 94 chr2 138549814 138550153 -43197934 + MLT1A0 LTR MaLR 27 365 0 8 1642 295 348 117 6 chr2 138560663 138560842 -43187245 + MLT1H LTR MaLR 350 548 -1 1 1642 296 266 126 37 chr2 138563872 138564087 -43184000 - RLTR42-int LTR ERVK -4135 1387 1154 1 1642 3139 184 99 26 chr2 138568441 138569128 -43178959 - RMER19A LTR ERVK 0 737 1 1 1642 744 231 43 196 chr2 138570694 138570976 -43177111 - RMER17C LTR ERVK 0 410 151 1 1642 744 231 43 196 chr2 138571008 138571119 -43176968 - RMER17C LTR ERVK -260 150 87 1 1642 744 231 43 196 chr2 138571185 138571274 -43176813 - RMER17C LTR ERVK -324 86 1 1 1642 2725 188 75 14 chr2 138573898 138574448 -43173639 - RLTR17 LTR ERVK -109 583 1 1 1642 1727 235 65 99 chr2 138587098 138587731 -43160356 - RMER19C LTR ERVK 0 611 1 1 1642 344 267 65 24 chr2 138589009 138589132 -43158955 - RMER15 LTR ERVL -42 533 406 1 1642 404 255 47 9 chr2 138593238 138593345 -43154742 - MTD LTR MaLR -308 111 1 1 1642 531 360 79 66 chr2 138596334 138596727 -43151360 - LTR16B2 LTR ERVL -8 454 57 1 1642 251 331 162 40 chr2 138596846 138597102 -43150985 - MLT1H2 LTR MaLR -41 370 83 1 1642 941 236 266 17 chr2 138599746 138600039 -43148048 - ORR1D2 LTR MaLR -2 368 3 1 1642 362 247 0 0 chr2 138604516 138604597 -43143490 + MTD LTR MaLR 332 412 -7 1 1642 263 431 54 37 chr2 138604605 138604846 -43143241 - LTR16A LTR ERVL -202 249 5 1 1642 1832 198 77 63 chr2 138606945 138607488 -43140599 - RMER13B LTR ERVK -1 859 276 1 1642 1703 182 16 61 chr2 138607819 138607900 -43140187 - RMER13B LTR ERVK -561 347 271 1 1642 3240 35 35 0 chr2 138607900 138608297 -43139790 + IAPLTR2a LTR ERVK 1 411 0 1 1642 1703 182 16 61 chr2 138608297 138608578 -43139509 - RMER13B LTR ERVK -638 270 1 1 1642 609 304 213 15 chr2 138610000 138610338 -43137749 + MTD LTR MaLR 1 405 -14 1 1642 234 289 103 0 chr2 138611101 138611198 -43136889 - LTR33 LTR ERVL -10 505 399 1 1642 2391 116 116 0 chr2 138612626 138612967 -43135120 + RLTR11B LTR ERVK 1 379 -74 1 1642 2391 116 116 0 chr2 138613012 138613076 -43135011 + RLTR11B LTR ERVK 380 452 -1 1 1642 663 252 130 147 chr2 138613365 138613848 -43134239 - RLTR12B LTR ERVK -43 485 11 1 1642 2900 81 15 5 chr2 138617189 138617585 -43130502 + MTB LTR MaLR 1 400 0 1 1642 324 194 128 78 chr2 138620648 138620707 -43127380 - RMER17C LTR ERVK -135 275 217 1 1642 324 194 128 78 chr2 138620760 138620879 -43127208 - RMER17C LTR ERVK -194 216 88 1 1642 1760 110 30 280 chr2 138623509 138624077 -43124010 - RLTR23 LTR ERV1 -4 426 1 2 1642 238 375 61 30 chr2 138626907 138627006 -43121081 - LTR16E2 LTR ERVL -229 339 238 2 1642 703 322 17 74 chr2 138627948 138628312 -43119775 + MTEa LTR MaLR 1 348 -31 2 1642 677 296 38 57 chr2 138628509 138628730 -43119357 + MLT1C LTR MaLR 3 218 -249 2 1642 1192 257 109 14 chr2 138628730 138629097 -43118990 - MTD LTR MaLR 0 419 18 2 1642 531 307 51 34 chr2 138629115 138629351 -43118736 + MLT1C LTR MaLR 228 467 0 2 1642 254 325 62 133 chr2 138630559 138630643 -43117444 + MLT1F2 LTR MaLR 96 161 -399 2 1642 254 325 62 133 chr2 138630844 138630954 -43117133 + MLT1F2 LTR MaLR 162 276 -284 2 1642 265 278 62 36 chr2 138632515 138632627 -43115460 - LTR16E1 LTR ERVL -35 503 389 2 1642 326 370 142 31 chr2 138633877 138634229 -43113858 - LTR40a LTR ERVL -1 518 128 2 1642 1079 316 113 24 chr2 138640207 138640674 -43107413 - MLT1H LTR MaLR 0 549 41 2 1642 293 224 86 67 chr2 138641680 138641785 -43106302 - MLT1A0 LTR MaLR -2 363 257 2 1642 3087 37 47 5 chr2 138642559 138642939 -43105148 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 1642 481 202 96 28 chr2 138644745 138644923 -43103164 + RMER17C LTR ERVK 86 275 -135 2 1642 754 275 28 81 chr2 138647661 138648068 -43100019 - RLTR20D LTR ERVK -49 485 1 2 1642 1363 209 142 68 chr2 138648135 138648550 -43099537 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 1 2 1642 329 319 60 50 chr2 138654322 138654540 -43093547 + MLT1E LTR MaLR 46 265 -388 2 1642 251 320 136 47 chr2 138655252 138655465 -43092622 + MLT1E LTR MaLR 280 511 -142 2 1642 2217 111 12 24 chr2 138659379 138659720 -43088367 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 337 0 2 1642 20416 40 21 16 chr2 138659722 138662387 -43085700 + IAPEz-int LTR ERVK 3 2670 -3811 2 1642 7992 53 23 5 chr2 138662368 138663426 -43084661 + IAPEz-int LTR ERVK 5403 6479 -2 2 1642 2217 111 12 24 chr2 138663428 138663769 -43084318 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 337 0 2 1642 1933 188 29 3 chr2 138666627 138667011 -43081076 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 2 1642 2233 97 3 59 chr2 138667978 138668317 -43079770 - ORR1A2 LTR MaLR -7 320 1 2 1642 9496 140 61 91 chr2 138668317 138669229 -43078858 - ORR1A2-int LTR MaLR 0 1963 1038 2 1642 9496 140 61 91 chr2 138669397 138670506 -43077581 - ORR1A2-int LTR MaLR -926 1037 2 2 1642 1738 106 8 0 chr2 138670507 138670753 -43077334 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 80 2 1643 3383 23 5 0 chr2 138675084 138675478 -43072609 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 1643 9115 34 4 1 chr2 138675478 138676573 -43071514 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 2 1643 3383 23 5 0 chr2 138676573 138676967 -43071120 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 1643 345 191 56 56 chr2 138678911 138679000 -43069087 - ORR1A2 LTR MaLR -238 89 1 2 1643 428 291 59 26 chr2 138686028 138686180 -43061907 + MLT1B LTR MaLR 232 388 -2 2 1643 1869 127 18 60 chr2 138687231 138687566 -43060521 + ORR1A4 LTR MaLR 1 321 -8 2 1643 1394 281 92 12 chr2 138687877 138688357 -43059730 + RMER5 LTR ERV1 17 534 0 2 1643 2505 50 120 0 chr2 138693004 138693345 -43054742 + MTA_Mm LTR MaLR 1 382 -14 2 1643 1989 189 42 15 chr2 138705544 138705947 -43042140 - MTC LTR MaLR -3 418 5 3 1643 2558 67 12 0 chr2 138721323 138721651 -43026436 - IAPEY_LTR LTR ERVK 0 385 54 3 1643 266 448 8 29 chr2 138724722 138724968 -43023119 + LTR16A LTR ERVL 113 353 -98 3 1643 3904 102 48 0 chr2 138725084 138725641 -43022446 - MT2B2 LTR ERVL 0 584 1 3 1643 1427 214 119 34 chr2 138727128 138727514 -43020573 + MTD LTR MaLR 1 419 0 3 1643 480 355 61 37 chr2 138739366 138739693 -43008394 + MER110 LTR ERV1 1 335 -156 3 1643 767 313 140 21 chr2 138747815 138748151 -42999936 + MLT1F1 LTR MaLR 191 566 -3 3 1643 266 333 94 0 chr2 138748154 138748250 -42999837 - MLT1J2 LTR MaLR -343 105 1 3 1643 3214 38 28 0 chr2 138758848 138759248 -42988839 - IAPLTR2a LTR ERVK 0 411 1 3 1643 5750 59 14 8 chr2 138759250 138759990 -42988097 - IAPEz-int LTR ERVK -2 6479 5736 3 1643 2160 79 0 0 chr2 138759989 138760267 -42987820 - IAPEz-int LTR ERVK -4845 1636 1359 3 1643 3484 68 1 19 chr2 138760267 138760900 -42987187 - IAPEz-int LTR ERVK -5819 662 116 3 1643 1232 141 45 58 chr2 138760885 138761179 -42986908 - IAPEz-int LTR ERVK -7312 269 9 3 1643 3188 42 28 0 chr2 138761180 138761580 -42986507 - IAPLTR2a LTR ERVK 0 411 1 3 1643 550 293 49 69 chr2 138764482 138764728 -42983359 + RMER15 LTR ERVL 298 538 -37 3 1643 332 354 65 35 chr2 138771997 138772196 -42975891 - LTR16A1 LTR ERVL -6 450 246 4 1643 367 362 69 20 chr2 138773975 138774178 -42973909 - MLT1H LTR MaLR -330 219 7 4 1643 681 322 32 35 chr2 138786776 138787059 -42961028 + MER31A LTR ERV1 129 410 -75 4 1643 1835 225 32 34 chr2 138790205 138790614 -42957473 + MTC LTR MaLR 1 408 -13 4 1643 1910 146 18 12 chr2 138794415 138794742 -42953345 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 4 1643 389 209 11 42 chr2 138794917 138795012 -42953075 + MT2B LTR ERVL 5 96 -437 4 1643 749 268 119 32 chr2 138795228 138795289 -42952798 + MT2B LTR ERVL 277 337 -264 4 1643 749 268 119 32 chr2 138795313 138795502 -42952585 + MT2B LTR ERVL 338 549 -52 4 1643 250 401 63 50 chr2 138799494 138799733 -42948354 + LTR16C LTR ERVL 1 242 -247 4 1643 304 316 51 56 chr2 138799745 138799923 -42948164 + LTR16C LTR ERVL 294 470 -19 4 1643 990 273 94 39 chr2 138804594 138804975 -42943112 - MTD LTR MaLR 0 419 18 4 1644 524 219 58 52 chr2 138805752 138805906 -42942181 - RMER15 LTR ERVL -399 176 22 4 1644 1429 267 21 26 chr2 138806359 138806736 -42941351 + MTEb LTR MaLR 1 375 -4 4 1644 452 313 67 49 chr2 138807555 138807719 -42940368 - ORR1E LTR MaLR -56 303 134 4 1644 452 313 67 49 chr2 138807938 138807998 -42940089 - ORR1E LTR MaLR -226 133 75 4 1644 841 273 39 107 chr2 138809740 138810125 -42937962 + ORR1E LTR MaLR 1 359 0 4 1644 1711 170 100 6 chr2 138812914 138813264 -42934823 + ORR1C2 LTR MaLR 2 384 0 4 1644 226 304 63 118 chr2 138813527 138813654 -42934433 + LTR16D2 LTR ERVL 169 288 -284 4 1644 1599 241 47 15 chr2 138818982 138819383 -42928704 - MTD LTR MaLR -5 414 1 4 1644 2775 47 12 0 chr2 138824559 138824901 -42923186 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 4 1644 514 343 62 73 chr2 138826218 138826398 -42921689 + ORR1D2 LTR MaLR 1 183 -187 4 1644 514 343 62 73 chr2 138826460 138826650 -42921437 + ORR1D2 LTR MaLR 184 367 -3 4 1644 552 276 31 19 chr2 138833011 138833170 -42914917 - MTE2b LTR MaLR -23 356 196 5 1644 863 267 89 74 chr2 138833178 138833595 -42914492 + RLTR23 LTR ERV1 8 430 0 5 1644 354 241 58 100 chr2 138833662 138833782 -42914305 - MTE2b LTR MaLR -264 115 1 5 1644 3713 325 88 19 chr2 138833785 138834657 -42913430 - MTE2b-int LTR MaLR -3 1577 636 5 1644 3713 325 88 19 chr2 138834709 138835311 -42912776 - MTE2b-int LTR MaLR -945 635 2 5 1644 374 267 526 12 chr2 138835316 138835562 -42912525 - MTE2b LTR MaLR -4 375 3 5 1644 656 254 90 60 chr2 138835631 138835789 -42912298 + ORR1D1 LTR MaLR 1 161 -213 5 1644 656 254 90 60 chr2 138835824 138835899 -42912188 + ORR1D1 LTR MaLR 162 240 -134 5 1644 512 268 104 14 chr2 138835977 138836166 -42911921 + ORR1D1 LTR MaLR 159 379 0 5 1644 564 251 60 22 chr2 138840568 138840742 -42907345 + MLT1D LTR MaLR 323 503 -2 5 1644 604 348 79 57 chr2 138843415 138843784 -42904303 + MTEa LTR MaLR 3 379 0 5 1644 741 326 139 22 chr2 138845850 138846343 -42901744 - MLT1F2 LTR MaLR -9 551 2 5 1644 551 298 30 42 chr2 138846425 138846593 -42901494 - MTEa LTR MaLR -213 166 1 5 1644 383 300 126 30 chr2 138852313 138852609 -42895478 - RMER20B LTR ERVK -68 448 131 5 1644 660 221 14 21 chr2 138852616 138852759 -42895328 + ORR1C1 LTR MaLR 237 378 0 5 1644 236 259 35 0 chr2 138855711 138855769 -42892318 + RMER15 LTR ERVL 1 60 -515 5 1644 461 196 33 0 chr2 138855787 138855879 -42892208 + RMER15 LTR ERVL 23 117 -458 5 1644 1052 224 25 21 chr2 138856847 138857089 -42890998 - RMER15 LTR ERVL 0 575 333 5 1644 255 299 26 0 chr2 138857615 138857692 -42890395 + LTR16C LTR ERVL 40 118 -371 5 1644 572 266 307 20 chr2 138861899 138862193 -42885894 - MTEa LTR MaLR -1 378 1 5 1644 306 338 60 33 chr2 138863176 138863326 -42884761 - RMER15 LTR ERVL 0 575 422 5 1644 580 352 101 32 chr2 138865599 138865977 -42882110 + MLT1A1 LTR MaLR 1 404 -4 5 1644 672 346 98 14 chr2 138867144 138867572 -42880515 - MLT1C LTR MaLR -3 464 1 5 1644 3057 189 78 16 chr2 138874121 138874799 -42873288 + RMER6D LTR ERVK 1 720 0 5 1644 1496 276 39 13 chr2 138875913 138876302 -42871785 - MTD LTR MaLR 0 419 21 5 1644 435 234 233 6 chr2 138880605 138880654 -42867433 + ORR1D1 LTR MaLR 180 228 -146 5 1644 435 234 233 6 chr2 138880681 138880790 -42867297 + ORR1D1 LTR MaLR 229 373 -1 5 1644 401 336 59 78 chr2 138882551 138882909 -42865178 - ORR1D2 LTR MaLR -2 368 18 5 1644 906 252 129 4 chr2 138901174 138901437 -42846650 + MTD LTR MaLR 2 297 -122 6 1644 513 304 127 104 chr2 138914299 138914710 -42833377 + MTE2a LTR MaLR 1 405 -14 6 1644 323 364 86 67 chr2 138914885 138915153 -42832934 - LTR16C LTR ERVL -30 459 187 6 1644 296 322 34 17 chr2 138915171 138915288 -42832799 - LTR16C LTR ERVL -353 136 18 6 1644 1159 217 198 54 chr2 138921429 138921925 -42826162 + RMER2 LTR ERV1 1 567 0 6 1644 1545 134 45 31 chr2 138921981 138922350 -42825737 + IAPLTR2a LTR ERVK 1 393 -82 6 1644 875 98 155 14 chr2 138922428 138922646 -42825441 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 220 475 0 6 1644 271 132 0 86 chr2 138922671 138922729 -42825358 + IAPEz-int LTR ERVK 3 55 -1932 6 1644 4078 90 17 35 chr2 138922724 138923545 -42824542 + IAPEz-int LTR ERVK 10 662 -5819 6 1644 2168 79 0 0 chr2 138923545 138923823 -42824264 + IAPEz-int LTR ERVK 1359 1636 -4845 6 1644 5884 48 4 19 chr2 138923822 138924579 -42823508 + IAPEz-int LTR ERVK 5736 6481 0 6 1644 1694 138 8 226 chr2 138924579 138925186 -42822901 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 6 1644 922 306 71 12 chr2 138925532 138925856 -42822231 - MTE2b LTR MaLR -36 343 1 6 1645 236 330 186 20 chr2 138944461 138944563 -42803524 - MLT1G LTR MaLR -404 187 69 6 1645 317 343 94 33 chr2 138944596 138944777 -42803310 + MLT2F LTR ERVL 14 205 -458 6 1645 446 369 96 45 chr2 138945772 138946104 -42801983 + MLT2F LTR ERVL 61 409 -254 6 1645 443 345 177 60 chr2 138955118 138955537 -42792550 - MLT1H LTR MaLR -31 518 51 6 1645 327 398 66 46 chr2 138957685 138958033 -42790054 - LTR16A1 LTR ERVL -101 355 1 6 1645 240 191 54 161 chr2 138958063 138958175 -42789912 + MLT1A1 LTR MaLR 3 102 -306 6 1645 555 274 6 76 chr2 138958877 138959035 -42789052 + RLTR33 LTR ERVK 447 593 -85 6 1645 472 309 143 33 chr2 138961776 138962118 -42785969 + MTE2a LTR MaLR 6 419 0 6 1645 312 218 38 13 chr2 138963092 138963171 -42784916 + RMER5 LTR ERV1 33 113 -421 6 1645 377 217 56 9 chr2 138972369 138972476 -42775611 + RLTR15 LTR ERVK 1 112 -247 7 1645 797 290 121 43 chr2 138972682 138973053 -42775034 + MTD LTR MaLR 6 405 -14 7 1645 765 271 75 30 chr2 138974186 138974521 -42773566 + MTD LTR MaLR 20 396 -23 7 1645 289 231 15 0 chr2 138975921 138975986 -42772101 + RLTR15 LTR ERVK 1 66 -293 7 1645 371 270 75 80 chr2 138978983 138979196 -42768891 + RLTR15 LTR ERVK 79 290 -69 7 1645 1924 220 39 12 chr2 138986361 138986771 -42761316 - MTC LTR MaLR 0 421 1 7 1645 1079 270 131 19 chr2 138989193 138989559 -42758528 - MTD LTR MaLR -12 407 1 7 1645 3781 212 27 32 chr2 138993512 138994329 -42753758 + RMER13A LTR ERVK 1 813 -47 7 1645 430 276 124 49 chr2 138994293 138994560 -42753527 + LTR16E1 LTR ERVL 220 506 -32 7 1645 289 328 74 51 chr2 138994636 138994851 -42753236 - MLT1B LTR MaLR -166 224 5 7 1645 239 325 50 99 chr2 138999232 138999413 -42748674 + MLT1B LTR MaLR 124 295 -95 7 1645 248 350 108 36 chr2 139005110 139005276 -42742811 - MLT1H LTR MaLR -196 353 176 7 1645 262 315 46 39 chr2 139011323 139011465 -42736622 - MLT1F1 LTR MaLR -100 460 315 1 1645 626 200 9 0 chr2 139012695 139012810 -42735277 - RLTR1C LTR ERV1 -109 394 279 1 1645 274 284 99 0 chr2 139013493 139013574 -42734513 + MTE2b LTR MaLR 51 139 -220 2 1645 284 299 10 67 chr2 139013609 139013713 -42734374 + MTE2b LTR MaLR 259 356 -23 2 1645 944 225 5 26 chr2 139013808 139014000 -42734087 - RLTR1D LTR ERV1 -3 602 415 2 1645 2552 56 0 48 chr2 139014331 139014686 -42733401 - RLTR1C LTR ERV1 -165 338 1 2 1645 567 320 75 61 chr2 139019041 139019387 -42728700 + MTEa LTR MaLR 1 351 -28 2 1645 2046 93 42 26 chr2 139022225 139022535 -42725552 + ORR1A2 LTR MaLR 1 315 -12 3 1645 1324 170 290 3 chr2 139022827 139023110 -42724977 + ORR1B2 LTR MaLR 4 367 0 3 1645 297 323 73 0 chr2 139026786 139026882 -42721205 + MLT1G1 LTR MaLR 89 191 -388 3 1645 1763 250 47 12 chr2 139028414 139028819 -42719268 + MTD LTR MaLR 1 419 0 3 1645 1209 163 72 0 chr2 139028906 139029115 -42718972 + MTC LTR MaLR 1 224 -197 4 1645 866 160 155 0 chr2 139030996 139031190 -42716897 + MTC LTR MaLR 196 419 0 4 1645 1567 262 73 16 chr2 139031482 139031927 -42716160 + MT2A LTR ERVL 1 460 -73 4 1645 1567 262 73 16 chr2 139031979 139032037 -42716050 + MT2A LTR ERVL 461 533 0 4 1645 2993 20 0 14 chr2 139035692 139036043 -42712044 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 4 1645 3214 62 0 5 chr2 139038463 139038865 -42709222 + MTB LTR MaLR 1 400 0 5 1645 3104 148 93 6 chr2 139056620 139057158 -42690929 - RMER4B LTR ERVK 0 585 1 7 1645 468 321 72 69 chr2 139059853 139060319 -42687768 - MLT1E2 LTR MaLR -3 502 36 7 1645 294 354 68 6 chr2 139062996 139063158 -42684929 + MLT1H LTR MaLR 11 182 -367 8 1646 896 215 247 27 chr2 139073314 139073606 -42674481 - ORR1D2 LTR MaLR -14 356 1 8 1646 2252 172 50 0 chr2 139075080 139075481 -42672606 + MTC LTR MaLR 1 421 0 9 1646 621 255 98 5 chr2 139080175 139080380 -42667707 - MERVL_2A-int LTR ERVL -5535 226 3 9 1646 1001 229 195 112 chr2 139080392 139080436 -42667651 - MT2A LTR ERVL 0 533 461 9 1646 1001 229 195 112 chr2 139080487 139080628 -42667459 - MT2A LTR ERVL -73 460 271 9 1646 1001 229 195 112 chr2 139080682 139080987 -42667100 - MT2A LTR ERVL -263 270 2 9 1646 351 352 70 35 chr2 139104471 139104698 -42643389 - MLT1K LTR MaLR -139 456 222 1 1646 454 315 101 55 chr2 139108900 139109226 -42638861 + MTEa LTR MaLR 16 356 -23 1 1646 885 200 217 7 chr2 139112307 139112603 -42635484 + ORR1D2 LTR MaLR 1 358 -12 1 1646 330 242 67 75 chr2 139113914 139114048 -42634039 - RLTR17 LTR ERVK -455 237 105 1 1646 2126 144 68 13 chr2 139115857 139116237 -42631850 + RLTR9D LTR ERVK 1 401 -2 1 1646 2224 126 3 12 chr2 139125223 139125553 -42622534 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 1 1646 1840 141 71 33 chr2 139132632 139133028 -42615059 - IAPLTR2a LTR ERVK 0 411 1 1 1646 321 276 0 54 chr2 139142934 139143067 -42605020 + MLT1A1 LTR MaLR 271 408 0 1 1646 236 304 10 61 chr2 139148840 139148938 -42599149 - MLT2F LTR ERVL -136 527 435 2 1646 298 369 18 36 chr2 139149161 139149327 -42598760 - MLT2F LTR ERVL -329 334 172 2 1646 262 351 106 47 chr2 139149941 139150177 -42597910 - LTR33 LTR ERVL -11 504 255 2 1646 2158 181 47 7 chr2 139153253 139153447 -42594640 + MTC LTR MaLR 1 195 -226 2 1646 2158 181 47 7 chr2 139153609 139153819 -42594268 + MTC LTR MaLR 196 420 -1 2 1646 1634 209 69 26 chr2 139156843 139157222 -42590865 + MTD LTR MaLR 3 397 -22 2 1646 769 300 47 61 chr2 139160924 139161283 -42586804 + ORR1E LTR MaLR 1 354 -5 2 1646 354 351 49 82 chr2 139162527 139162915 -42585172 - MLT1A1 LTR MaLR -7 401 27 2 1646 540 331 100 87 chr2 139165564 139166034 -42582053 - MLT1F2 LTR MaLR -61 499 24 2 1646 765 125 32 19 chr2 139172917 139173072 -42575015 + RMER17B LTR ERVK 312 468 -490 2 1646 2107 238 77 29 chr2 139173165 139173714 -42574373 + RMER15 LTR ERVL 1 575 0 2 1646 406 284 48 187 chr2 139178799 139179232 -42568855 + ORR1E LTR MaLR 3 375 -4 2 1646 672 322 47 75 chr2 139184385 139184744 -42563343 + MLT1D LTR MaLR 7 355 -150 2 1646 1048 237 72 0 chr2 139190661 139190897 -42557190 + MTC LTR MaLR 1 253 -168 2 1646 392 278 2 21 chr2 139191028 139191131 -42556956 + MLT2B1 LTR ERVL 403 496 -64 2 1646 435 351 49 66 chr2 139192348 139192531 -42555556 + MLT1N2 LTR MaLR 24 203 -359 2 1646 241 353 71 99 chr2 139192568 139192779 -42555308 + MLT1N2 LTR MaLR 277 481 -81 2 1646 393 331 147 53 chr2 139193538 139194013 -42554074 - LTR85a LTR Gypsy? -6 696 177 2 1646 268 197 79 0 chr2 139195067 139195143 -42552944 + LTR65 LTR ERV1 9 90 -579 2 1646 250 149 85 0 chr2 139195154 139195201 -42552886 + LTR65 LTR ERV1 132 182 -487 2 1646 639 341 88 12 chr2 139195699 139196040 -42552047 + LTR65 LTR ERV1 238 604 -65 2 1646 361 260 77 71 chr2 139196895 139197077 -42551010 - MLT1A1 LTR MaLR -224 184 2 2 1647 236 333 43 106 chr2 139200882 139201043 -42547044 + MER77 LTR ERVL 203 353 -254 2 1647 293 347 75 71 chr2 139200903 139201142 -42546945 + MER21B LTR ERV1 212 451 -412 2 1647 245 368 29 99 chr2 139201399 139201541 -42546546 + MER21B LTR ERV1 526 655 -208 2 1647 1759 175 258 2 chr2 139201541 139202006 -42546081 + RLTR31A_Mm LTR ERVK 1 584 0 2 1647 245 368 29 99 chr2 139202006 139202035 -42546052 + MER21B LTR ERV1 656 684 -179 2 1647 279 259 18 44 chr2 139202513 139202626 -42545461 - LTR81A LTR ERV1? 0 1350 1241 2 1647 1955 166 39 16 chr2 139203410 139203795 -42544292 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 2 1647 975 273 111 123 chr2 139203920 139204481 -42543606 + RLTR18 LTR ERVK 5 541 -75 2 1647 525 282 116 112 chr2 139204512 139204545 -42543542 + RLTR18 LTR ERVK 463 506 -6 2 1647 1352 234 27 32 chr2 139209065 139209441 -42538646 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 3 1647 2114 175 92 16 chr2 139217931 139218419 -42529668 - RLTR11A2 LTR ERVK -2 525 1 3 1647 490 237 77 31 chr2 139221758 139221938 -42526149 - MTD LTR MaLR -1 420 245 3 1647 356 290 65 0 chr2 139221924 139222048 -42526039 - MER90a LTR ERV1 -177 437 306 3 1647 998 343 81 44 chr2 139225120 139225642 -42522445 - MER21B LTR ERV1 -49 814 274 3 1647 348 320 65 7 chr2 139243402 139243556 -42504531 - LTR16C LTR ERVL 0 489 327 3 1647 671 305 0 14 chr2 139243971 139244114 -42503973 + MTEa LTR MaLR 14 154 -225 3 1647 657 296 18 121 chr2 139244304 139244577 -42503510 + MTEa LTR MaLR 126 370 -9 3 1647 279 263 62 21 chr2 139245965 139246062 -42502025 - LTR81B LTR ERV1? -17 1376 1276 3 1647 1862 109 28 19 chr2 139260180 139260499 -42487588 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 3 1647 1522 213 33 93 chr2 139265593 139265906 -42482181 + ORR1B1 LTR MaLR 1 287 -107 3 1647 1522 213 33 93 chr2 139266488 139266593 -42481494 + ORR1B1 LTR MaLR 288 394 0 3 1647 304 335 40 0 chr2 139268557 139268757 -42479330 - RMER15-int LTR ERVL -4072 927 720 3 1647 935 364 43 6 chr2 139268940 139269427 -42478660 - RMER15-int LTR ERVL -4492 507 3 3 1647 464 270 101 30 chr2 139273228 139273267 -42474820 - MTE-int LTR MaLR -16 1564 1528 3 1647 1098 227 75 142 chr2 139273267 139273668 -42474419 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 3 1647 582 188 141 0 chr2 139273668 139273786 -42474301 - ORR1D1-int LTR MaLR 0 1370 1235 3 1647 5159 232 48 15 chr2 139273930 139274856 -42473231 - ORR1D1-int LTR MaLR -149 1221 257 3 1647 5159 232 48 15 chr2 139274887 139275142 -42472945 - ORR1D1-int LTR MaLR -1114 256 1 3 1647 1809 176 30 11 chr2 139275142 139275509 -42472578 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 3 1647 1483 182 56 30 chr2 139276233 139276572 -42471515 + RLTR28 LTR ERVL 163 510 -14 3 1647 623 155 44 17 chr2 139291525 139291664 -42456423 - MT2C_Mm LTR ERVL -48 445 293 3 1647 1206 294 51 34 chr2 139305868 139306341 -42441746 + RLTR17 LTR ERVK 1 566 -126 4 1647 321 206 32 0 chr2 139306416 139306479 -42441608 + RLTR31_Mur LTR ERVK 489 553 0 4 1647 383 314 134 12 chr2 139311803 139311974 -42436113 - LTR16C LTR ERVL 0 489 298 4 1647 2292 122 10 37 chr2 139312506 139312917 -42435170 + RMER17A2 LTR ERVK 1 445 -461 4 1647 3105 49 15 5 chr2 139312917 139313309 -42434778 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 1647 5108 143 107 10 chr2 139313309 139314269 -42433818 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1258 206 4 1647 773 65 0 27 chr2 139314253 139314364 -42433723 - MTA_Mm LTR MaLR -288 108 1 4 1647 2587 135 65 12 chr2 139314370 139314849 -42433238 + RMER17A2 LTR ERVK 403 906 0 4 1647 424 335 191 28 chr2 139324835 139325191 -42422896 + MLT1G1 LTR MaLR 83 496 -83 4 1648 1671 155 39 42 chr2 139331413 139331743 -42416344 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 4 1648 368 204 74 21 chr2 139347226 139347321 -42400766 - RLTR16 LTR ERVK -311 194 95 4 1648 3330 31 13 0 chr2 139365189 139365580 -42382507 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 1648 9270 28 2 2 chr2 139365580 139366678 -42381409 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 4 1648 3419 33 2 0 chr2 139366678 139367073 -42381014 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 1648 1791 133 0 0 chr2 139369969 139370232 -42377855 + ORR1A4 LTR MaLR 18 280 -49 4 1648 1093 138 21 11 chr2 139370232 139370423 -42377664 + MERVL_2A-int LTR ERVL 5256 5448 -313 4 1648 3045 157 70 31 chr2 139370423 139370963 -42377124 + MT2B LTR ERVL 41 601 0 4 1648 525 335 116 59 chr2 139398111 139398568 -42349519 + MLT1D LTR MaLR 23 505 0 5 1648 3369 38 2 0 chr2 139403528 139403923 -42344164 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 1648 413 343 111 83 chr2 139409323 139409813 -42338274 - MLT1H2 LTR MaLR -4 485 6 5 1648 241 333 11 0 chr2 139424389 139424476 -42323611 - MLT1I LTR MaLR 0 411 324 5 1648 321 327 30 41 chr2 139432641 139432803 -42315284 - MLT1J2 LTR MaLR -252 192 30 5 1648 543 291 57 72 chr2 139435675 139436048 -42312039 - MLT1E3 LTR MaLR 0 654 191 5 1649 393 289 20 31 chr2 139461310 139461603 -42286484 - RMER17D2 LTR ERVK -327 482 193 5 1649 271 351 103 35 chr2 139475611 139475785 -42272302 + LTR16C LTR ERVL 6 191 -298 6 1649 353 293 37 44 chr2 139478785 139478941 -42269146 - MLT1B LTR MaLR -21 446 215 6 1649 286 250 54 132 chr2 139479080 139479209 -42268878 - MLT1B LTR MaLR -194 171 53 6 1649 225 208 110 14 chr2 139487190 139487262 -42260825 + MLT2B4 LTR ERVL 235 313 -243 6 1649 363 320 228 28 chr2 139487262 139487551 -42260536 + MLT1H LTR MaLR 3 349 -200 6 1649 1466 233 62 20 chr2 139487649 139488004 -42260083 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 6 1649 1464 176 107 41 chr2 139488717 139488871 -42259216 + ORR1C2 LTR MaLR 13 155 -229 6 1649 1464 182 102 48 chr2 139488905 139489104 -42258983 + ORR1C2 LTR MaLR 156 379 0 6 1649 3124 141 19 10 chr2 139492982 139493498 -42254589 - RLTR28 LTR ERVL -2 522 2 6 1649 408 152 15 0 chr2 139495064 139495130 -42252957 + RLTR9A LTR ERVK 207 273 -95 6 1649 283 262 254 0 chr2 139495664 139495790 -42252297 - MLT1J1 LTR MaLR -55 494 337 6 1649 612 309 79 35 chr2 139497962 139498321 -42249766 - MLT1J1 LTR MaLR -39 372 2 6 1649 278 253 38 12 chr2 139499748 139499828 -42248259 + MTD LTR MaLR 327 408 -11 6 1649 449 136 171 0 chr2 139499840 139499928 -42248159 - MT2A LTR ERVL -412 121 19 6 1649 857 239 21 54 chr2 139500003 139500333 -42247754 - MERVL_2A-int LTR ERVL -5173 588 211 1 1649 346 237 26 0 chr2 139500377 139500453 -42247634 + MTD-int LTR MaLR 1180 1257 -1 2 1649 1549 217 130 21 chr2 139500454 139500830 -42247257 + MTD LTR MaLR 1 417 -2 2 1649 483 284 36 32 chr2 139508645 139508862 -42239225 - MLT1H LTR MaLR 0 555 332 1 1649 624 164 0 26 chr2 139514102 139514215 -42233872 - MT2A LTR ERVL -423 110 1 2 1649 299 286 13 0 chr2 139522990 139523067 -42225020 + MLT2B3 LTR ERVL 1 78 -476 3 1649 444 202 24 0 chr2 139526365 139526449 -42221638 - ORR1E LTR MaLR -266 93 8 3 1649 784 339 71 45 chr2 139527679 139528177 -42219910 - MLT1F2 LTR MaLR -10 550 9 4 1649 2371 93 55 0 chr2 139536355 139536667 -42211420 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 5 1649 393 307 41 24 chr2 139536982 139537152 -42210935 - RMER15 LTR ERVL 0 575 403 5 1649 350 297 45 76 chr2 139542002 139542159 -42205928 + LTR33 LTR ERVL 5 156 -359 6 1649 248 343 127 63 chr2 139542195 139542416 -42205671 + LTR33 LTR ERVL 278 512 -3 6 1649 276 299 0 13 chr2 139542445 139542523 -42205564 + MTEb LTR MaLR 1 77 -302 6 1649 394 293 0 73 chr2 139542709 139542860 -42205227 + MTEb LTR MaLR 240 379 0 6 1649 2119 206 143 64 chr2 139543248 139543503 -42204584 - RMER20B LTR ERVK 0 627 336 6 1649 2119 206 143 64 chr2 139543534 139543859 -42204228 - RMER20B LTR ERVK -292 335 1 6 1649 281 262 129 102 chr2 139544329 139544593 -42203494 - LTR37B LTR ERV1 -192 276 6 7 1649 326 266 64 9 chr2 139546362 139546472 -42201615 - MLT1H LTR MaLR 0 549 434 7 1649 1445 266 53 11 chr2 139547259 139547639 -42200448 - MTD LTR MaLR 0 419 24 7 1649 2021 199 24 39 chr2 139552625 139553037 -42195050 + MTC LTR MaLR 16 421 0 8 1649 3322 150 11 17 chr2 139556142 139556672 -42191415 - RLTR11A2 LTR ERVK 0 527 1 9 1649 1538 172 76 73 chr2 139557102 139557485 -42190602 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 9 1649 1258 189 129 9 chr2 139566914 139567239 -42180848 + ORR1D1 LTR MaLR 1 364 -10 1 1649 1381 216 102 19 chr2 139568991 139569354 -42178733 + MTD LTR MaLR 12 404 -15 1 1649 260 380 134 0 chr2 139577336 139577523 -42170564 - LTR33 LTR ERVL -293 222 11 1 1649 524 284 125 102 chr2 139580039 139580134 -42167953 - MER92B LTR ERV1 -192 444 358 1 1649 524 284 125 102 chr2 139580738 139581067 -42167020 - MER92B LTR ERV1 -279 357 7 1 1649 236 65 0 0 chr2 139590163 139590194 -42157893 - MTE2a-int LTR MaLR -1546 34 4 1 1649 1104 263 72 24 chr2 139590196 139590531 -42157556 - MTE2a LTR MaLR -1 378 28 1 1650 3057 61 13 2 chr2 139593436 139593832 -42154255 + MTB LTR MaLR 1 400 0 1 1650 1149 165 177 10 chr2 139593863 139594151 -42153936 + ORR1D1 LTR MaLR 1 336 -38 1 1650 1385 268 22 8 chr2 139594160 139594521 -42153566 - ORR1D1 LTR MaLR -8 366 1 1 1650 317 340 62 39 chr2 139604209 139604515 -42143572 + LTR84b LTR ERVL 75 387 -374 1 1650 1038 284 66 25 chr2 139615143 139615507 -42132580 + MTEb LTR MaLR 1 379 0 1 1650 586 306 80 63 chr2 139617238 139617601 -42130486 - MLT1H LTR MaLR -113 436 68 1 1650 1141 239 63 44 chr2 139619320 139619687 -42128400 - MTEa LTR MaLR 0 379 6 1 1650 522 229 30 26 chr2 139620040 139620196 -42127891 + MTC LTR MaLR 221 420 -1 1 1650 269 318 0 53 chr2 139620236 139620349 -42127738 - RMER12 LTR ERVK -477 845 739 2 1650 1867 145 29 20 chr2 139625384 139625728 -42122359 + ORR1B2 LTR MaLR 13 359 -8 2 1650 240 259 24 12 chr2 139625954 139626036 -42122051 - ORR1E LTR MaLR -4 375 293 2 1650 371 205 12 35 chr2 139626188 139626300 -42121787 - ORR1E LTR MaLR -276 108 1 2 1650 2444 104 3 0 chr2 139628140 139628466 -42119621 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 2 1650 263 331 92 108 chr2 139633557 139633892 -42114195 + MER21B LTR ERV1 128 457 -406 2 1650 635 306 117 38 chr2 139633913 139633955 -42114132 + MER21B LTR ERV1 520 555 -308 2 1650 3331 48 4 130 chr2 139633955 139634454 -42113633 + RLTR10C LTR ERVK 1 436 0 2 1650 635 306 117 38 chr2 139634454 139634474 -42113613 + MER21B LTR ERV1 556 589 -274 2 1650 635 306 117 38 chr2 139634505 139634706 -42113381 + MER21B LTR ERV1 590 804 -59 2 1650 1303 206 135 0 chr2 139634770 139635081 -42113006 - ORR1D1 LTR MaLR -12 362 10 2 1650 249 254 0 0 chr2 139636106 139636161 -42111926 + ORR1E LTR MaLR 113 167 -192 2 1650 1067 267 75 11 chr2 139636161 139636532 -42111555 + MTEa-int LTR MaLR 81 475 -1105 2 1650 829 223 200 39 chr2 139637139 139637419 -42110668 + MTEa-int LTR MaLR 560 884 -696 2 1650 1056 268 79 106 chr2 139637388 139638009 -42110078 - RLTR18 LTR ERVK -4 612 9 2 1650 1393 264 116 5 chr2 139638027 139638446 -42109641 + MTEa-int LTR MaLR 863 1328 -252 2 1650 1483 242 69 15 chr2 139638446 139638837 -42109250 + MTD LTR MaLR 1 412 -7 2 1650 348 237 0 0 chr2 139638838 139638914 -42109173 + MTEa-int LTR MaLR 1324 1399 -181 2 1650 566 211 14 37 chr2 139639096 139639236 -42108851 + MTEa-int LTR MaLR 1243 1527 -53 2 1650 420 257 284 17 chr2 139639236 139639480 -42108607 + MTEa LTR MaLR 1 371 -8 2 1650 444 280 58 39 chr2 139639823 139640031 -42108056 + RMER15 LTR ERVL 364 575 0 2 1650 423 251 88 52 chr2 139640977 139641170 -42106917 + RMER20B LTR ERVK 236 435 -192 2 1650 315 321 30 30 chr2 139641370 139641505 -42106582 + RMER20B LTR ERVK 473 607 -20 2 1650 378 319 151 66 chr2 139654593 139654912 -42093175 + MLT1E2 LTR MaLR 61 406 -221 2 1650 866 252 111 114 chr2 139654966 139655316 -42092771 - MTE2b LTR MaLR -30 349 1 2 1650 275 172 62 0 chr2 139655316 139655379 -42092708 + MTEa LTR MaLR 313 379 0 2 1650 236 321 129 70 chr2 139655978 139656390 -42091697 + MLT1H2 LTR MaLR 26 461 -28 2 1650 1685 186 105 13 chr2 139661339 139661720 -42086367 + MTC LTR MaLR 5 420 -1 2 1650 557 280 29 18 chr2 139673459 139673630 -42074457 + RLTR42-int LTR ERVK 1154 1326 -4196 2 1650 1285 146 161 22 chr2 139684939 139685206 -42062881 - ORR1B2 LTR MaLR -63 304 1 3 1650 848 55 0 0 chr2 139690125 139690234 -42057853 + IAPEY_LTR LTR ERVK 1 109 -276 3 1650 2122 57 4 0 chr2 139690459 139690723 -42057364 + IAPEY_LTR LTR ERVK 121 385 0 3 1650 3862 55 19 0 chr2 139697080 139697567 -42050520 + LTRIS2 LTR ERV1 69 564 0 3 1650 579 258 66 125 chr2 139699466 139699654 -42048433 + RLTR18B LTR ERVK 2 189 -323 3 1650 2014 109 170 14 chr2 139699654 139700007 -42048080 + RLTR9E LTR ERVK 2 409 0 3 1650 579 258 66 125 chr2 139700007 139700106 -42047981 + RLTR18B LTR ERVK 190 272 -240 3 1650 467 299 102 74 chr2 139700144 139700461 -42047626 + RLTR18 LTR ERVK 186 612 -4 3 1650 2913 136 30 93 chr2 139701892 139702453 -42045634 - RLTR24 LTR ERV1 -3 526 1 3 1650 237 305 195 43 chr2 139703357 139703542 -42044545 + RMER13A LTR ERVK 434 646 -214 3 1650 309 206 14 29 chr2 139708322 139708392 -42039695 - RLTR25B LTR ERVK -530 498 430 3 1650 1708 188 124 54 chr2 139710557 139710880 -42037207 + MTD LTR MaLR 1 356 -63 3 1650 1708 188 124 54 chr2 139711067 139711131 -42036956 + MTD LTR MaLR 357 415 -4 3 1650 1900 173 168 0 chr2 139711413 139711771 -42036316 - MTC LTR MaLR -3 418 1 3 1650 250 250 47 12 chr2 139712021 139712106 -42035981 - ORR1D2 LTR MaLR -1 369 282 3 1650 3672 146 52 5 chr2 139718245 139718804 -42029283 + RMER4B LTR ERVK 1 585 0 3 1651 1807 158 69 9 chr2 139723722 139724055 -42024032 + ORR1C1 LTR MaLR 1 353 -25 3 1651 1029 320 40 12 chr2 139730872 139731201 -42016886 - MTE2b LTR MaLR -41 338 1 3 1651 1851 208 69 15 chr2 139735236 139735626 -42012461 - MTD LTR MaLR -8 411 1 3 1651 251 289 39 0 chr2 139735637 139735741 -42012346 + LTR41B LTR ERVL 643 750 -8 3 1651 2771 162 42 14 chr2 139744237 139744743 -42003344 + RLTR11A LTR ERVK 7 526 -2 3 1651 2772 61 67 0 chr2 139747260 139747635 -42000452 + MTB LTR MaLR 1 400 0 3 1651 273 294 83 45 chr2 139750914 139751142 -41996945 - ORR1E LTR MaLR -13 366 82 4 1651 1305 248 36 75 chr2 139755425 139755813 -41992274 + MTE2a LTR MaLR 6 378 -1 4 1651 2163 175 24 7 chr2 139762721 139763135 -41984952 + MTC LTR MaLR 1 421 0 4 1651 866 167 29 103 chr2 139765332 139765535 -41982552 + ORR1B1-int LTR MaLR 390 611 -898 4 1651 255 228 0 60 chr2 139765574 139765658 -41982429 + ORR1B1-int LTR MaLR 567 645 -1318 4 1651 269 217 0 46 chr2 139765632 139765719 -41982368 + ORR1B1-int LTR MaLR 558 640 -1323 4 1651 832 285 88 33 chr2 139765759 139766031 -41982056 + MT2B LTR ERVL 1 287 -314 4 1651 3804 179 196 73 chr2 139765904 139767065 -41981022 + ORR1B1-int LTR MaLR 661 1963 0 4 1651 1559 168 4 236 chr2 139767065 139767578 -41980509 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 4 1651 281 210 16 0 chr2 139793320 139793382 -41954705 + MERVL-int LTR ERVL 4454 4516 -969 4 1651 559 253 36 48 chr2 139793450 139793616 -41954471 - MTD LTR MaLR -250 169 6 4 1651 1159 234 50 8 chr2 139804699 139804957 -41943130 + MTEb LTR MaLR 3 271 -108 5 1651 1793 177 73 14 chr2 139805932 139806276 -41941811 + ORR1C1 LTR MaLR 1 364 -14 5 1651 1406 220 26 22 chr2 139809666 139809977 -41938110 - ORR1D1 LTR MaLR -54 320 9 5 1651 2693 131 10 7 chr2 139812715 139813130 -41934957 + MTC LTR MaLR 1 416 -5 5 1651 452 272 164 86 chr2 139816013 139816282 -41931805 + MLT1A0 LTR MaLR 6 295 -70 5 1651 697 271 57 20 chr2 139819414 139819692 -41928395 + MTD LTR MaLR 115 419 0 5 1651 7362 139 31 112 chr2 139822982 139823496 -41924591 - RLTR21 LTR ERVK 0 1572 1137 5 1651 7362 139 31 112 chr2 139823521 139824010 -41924077 - RLTR21 LTR ERVK -436 1136 713 5 1651 7362 139 31 112 chr2 139824184 139824772 -41923315 - RLTR21 LTR ERVK -860 712 109 5 1651 2615 164 26 34 chr2 139824841 139825370 -41922717 + RLTR31B_Mm LTR ERVK 1 525 -32 5 1651 571 210 39 68 chr2 139825525 139825850 -41922237 + RMER3D-int LTR ERVK 214 849 -1993 5 1651 538 187 49 0 chr2 139825883 139826006 -41922081 + RMER3D-int LTR ERVK 490 618 -2224 5 1651 5170 196 83 52 chr2 139825982 139827038 -41921049 + RMER3D-int LTR ERVK 1160 2277 -565 5 1651 5170 196 83 52 chr2 139827187 139827762 -41920325 + RMER3D-int LTR ERVK 2278 2842 0 5 1651 2668 90 55 7 chr2 139827762 139828165 -41919922 + BGLII_Mus LTR ERVK 1 422 0 5 1651 1822 166 65 78 chr2 139832042 139832441 -41915646 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 5 1651 3004 145 43 79 chr2 139835092 139835676 -41912411 - RLTR18 LTR ERVK -53 563 1 5 1651 3369 103 4 4 chr2 139838998 139839485 -41908602 - RLTR1C LTR ERV1 -16 487 1 5 1651 2195 156 64 8 chr2 139841496 139841871 -41906216 + MTC LTR MaLR 25 420 -1 5 1651 1851 157 21 57 chr2 139842378 139842750 -41905337 + RLTR15 LTR ERVK 1 359 0 5 1651 943 221 41 97 chr2 139847144 139847485 -41900602 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 6 1651 1411 171 112 18 chr2 139853347 139853632 -41894455 + MTD LTR MaLR 107 418 -1 6 206 3731 232 72 86 chr2 139853638 139854175 -41893912 + MTD-int LTR MaLR 6 549 -709 6 1652 3731 232 72 86 chr2 139854321 139855052 -41893035 + MTD-int LTR MaLR 550 1256 -2 6 1652 2218 171 34 27 chr2 139855054 139855464 -41892623 + MTD LTR MaLR 1 413 -6 6 1652 701 249 192 33 chr2 139862686 139862970 -41885117 - MTD LTR MaLR -85 334 1 6 1652 4074 115 53 2 chr2 139863347 139863965 -41884122 + RLTR21 LTR ERVK 1 650 -922 6 1652 2828 120 84 107 chr2 139863966 139864515 -41883572 + RLTR21 LTR ERVK 771 1304 -268 6 1652 2828 120 84 107 chr2 139864574 139864631 -41883456 + RLTR21 LTR ERVK 1305 1363 -209 6 1652 463 149 0 54 chr2 139865532 139865551 -41882536 + RLTR21 LTR ERVK 1336 1351 -221 6 1652 463 149 0 54 chr2 139866010 139866082 -41882005 + RLTR21 LTR ERVK 1352 1422 -150 6 1652 1310 153 5 5 chr2 139866136 139866346 -41881741 + RLTR21 LTR ERVK 1349 1558 -14 6 1652 1792 137 27 27 chr2 139868289 139868663 -41879424 + RLTR19 LTR ERVK 7 499 0 6 1652 599 208 52 26 chr2 139868663 139868816 -41879271 + RLTR19-int LTR ERVK 1 157 -5980 6 1652 2004 151 3 6 chr2 139869058 139869385 -41878702 + RLTR19-int LTR ERVK 289 614 -5523 6 1652 954 135 54 5 chr2 139869378 139869564 -41878523 + RLTR19-int LTR ERVK 921 1115 -5022 6 1652 6069 125 15 58 chr2 139869897 139871108 -41876979 + RLTR19-int LTR ERVK 1105 2263 -3874 6 1652 402 206 138 40 chr2 139880829 139881012 -41867075 + LTR48 LTR ERV1 386 735 -52 6 1652 266 284 0 29 chr2 139882074 139882143 -41865944 + RMER6B LTR ERVK 368 434 -27 6 1652 1682 177 205 14 chr2 139885115 139885346 -41862741 + MT2A LTR ERVL 8 276 -257 6 1652 1682 177 205 14 chr2 139885490 139885693 -41862394 + MT2A LTR ERVL 277 524 -9 6 1652 401 228 103 115 chr2 139885774 139886086 -41862001 - RLTR15 LTR ERVK -19 340 33 6 1652 1987 142 125 0 chr2 139893221 139893573 -41854514 - RMER10B LTR ERVL 0 398 3 7 1652 238 299 187 56 chr2 139900898 139901096 -41846991 + LTR16E1 LTR ERVL 127 350 -188 7 1652 1669 185 18 148 chr2 139902500 139902640 -41845447 - RMER10B LTR ERVL 0 398 319 7 1652 1669 185 18 148 chr2 139902792 139903109 -41844978 - RMER10B LTR ERVL -80 318 1 7 1652 1069 251 69 26 chr2 139904066 139904413 -41843674 - RMER5 LTR ERV1 0 534 173 7 1652 440 244 65 75 chr2 139904557 139904743 -41843344 + RMER17C LTR ERVK 154 337 -73 7 1652 5487 71 10 24 chr2 139904805 139905615 -41842472 + RLTR13D1 LTR ERVK 8 806 0 7 1652 291 256 0 25 chr2 139910539 139910619 -41837468 + MTB_Mm LTR MaLR 328 405 -2 7 1652 339 286 0 0 chr2 139911116 139911200 -41836887 - MTEa LTR MaLR -26 353 270 7 1652 1025 252 27 12 chr2 139911706 139911963 -41836124 - MTEa LTR MaLR -118 261 1 7 1652 352 260 28 19 chr2 139911986 139912092 -41835995 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 324 7 1652 615 242 106 53 chr2 139913559 139913839 -41834248 + ORR1E LTR MaLR 67 379 0 7 1652 3120 52 31 0 chr2 139914086 139914472 -41833615 + MTB LTR MaLR 1 398 -2 7 1652 630 200 0 32 chr2 139917269 139917393 -41830694 - MTC LTR MaLR -301 120 1 7 1652 2374 149 30 17 chr2 139920290 139920692 -41827395 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 7 1652 1006 284 111 11 chr2 139920745 139921115 -41826972 + MTD LTR MaLR 1 407 -12 7 1652 3936 156 77 56 chr2 139921173 139922028 -41826059 - RMER21A LTR ERV1 0 947 75 7 1652 518 109 172 70 chr2 139922436 139922564 -41825523 - RMER17C LTR ERVK -9 401 261 7 1652 874 173 31 97 chr2 139922751 139923039 -41825048 - RMER17C LTR ERVK -141 269 1 7 1652 410 215 24 47 chr2 139923101 139923258 -41824829 + RMER21B LTR ERV1 20 303 -644 7 1652 1489 167 70 0 chr2 139923244 139923557 -41824530 + RMER21B LTR ERV1 442 842 0 7 1652 1916 82 18 0 chr2 139923983 139924265 -41823822 + ORR1A2 LTR MaLR 1 287 -40 8 1652 325 146 0 0 chr2 139925141 139925196 -41822891 + ORR1A2 LTR MaLR 340 394 0 8 1652 266 299 33 87 chr2 139927690 139927840 -41820247 + MLT1K LTR MaLR 446 587 -8 8 1652 1126 273 81 3 chr2 139928278 139928623 -41819464 - MTE2b LTR MaLR -5 374 3 8 1652 1183 244 91 66 chr2 139932315 139932371 -41815716 - MTD LTR MaLR 0 419 365 8 1652 1183 244 91 66 chr2 139932583 139932935 -41815152 - MTD LTR MaLR -55 364 1 8 1652 1840 204 40 34 chr2 139934937 139935439 -41812648 + RLTR16 LTR ERVK 1 505 0 8 1652 2450 75 18 18 chr2 139938306 139938633 -41809454 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 8 1652 1481 201 142 47 chr2 139940401 139940678 -41807409 - RLTR19 LTR ERVK 0 499 199 8 1652 1481 201 142 47 chr2 139940920 139941084 -41807003 - RLTR19 LTR ERVK -301 198 16 8 1652 227 242 0 83 chr2 139941980 139942052 -41806035 + MTC LTR MaLR 15 80 -341 8 1652 227 242 0 83 chr2 139942078 139942150 -41805937 + MTC LTR MaLR 15 80 -341 8 1652 1428 218 46 20 chr2 139942170 139942474 -41805613 + MTD LTR MaLR 9 320 -99 8 1652 254 262 27 64 chr2 139942851 139942961 -41805126 - MT2B LTR ERVL -341 260 155 8 1652 375 58 0 19 chr2 139943294 139943347 -41804740 + ORR1A3 LTR MaLR 275 326 0 8 1652 1868 138 9 42 chr2 139956629 139956961 -41791126 + ORR1A4 LTR MaLR 1 321 -8 8 1652 261 115 0 133 chr2 139958601 139958661 -41789426 + ORR1A4 LTR MaLR 274 325 -4 8 1652 874 241 51 45 chr2 139959641 139959972 -41788115 + RLTR15 LTR ERVK 10 342 -17 8 1652 286 200 31 133 chr2 139980919 139981017 -41767070 + MT2B LTR ERVL 153 240 -361 9 1653 612 210 8 32 chr2 139998591 139998714 -41749373 + RMER20B LTR ERVK 1 120 -507 9 1653 3846 128 8 61 chr2 140001620 140002359 -41745728 + RMER6A LTR ERVK 57 756 0 5 1653 2260 141 47 0 chr2 140003720 140004081 -41744006 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 1 1653 4958 107 25 28 chr2 140008007 140008067 -41740020 - RMER12 LTR ERVK -494 828 771 1 1653 4958 107 25 28 chr2 140008106 140008306 -41739781 - RMER12 LTR ERVK -552 770 582 1 1653 4958 107 25 28 chr2 140008500 140009068 -41739019 - RMER12 LTR ERVK -741 581 1 1 1653 1749 158 19 63 chr2 140011045 140011298 -41736789 - MTC LTR MaLR -8 413 158 2 1653 4363 154 17 107 chr2 140011298 140012289 -41735798 - RLTR13D6 LTR ERVK 0 902 1 3 1653 1749 158 19 63 chr2 140012289 140012346 -41735741 - MTC LTR MaLR -264 157 119 2 1653 1749 158 19 63 chr2 140012668 140012721 -41735366 - MTC LTR MaLR -303 118 65 2 1653 463 128 26 0 chr2 140013077 140013155 -41734932 - MTC LTR MaLR -339 82 3 2 1653 347 272 115 42 chr2 140013978 140014143 -41733944 - MLT1H LTR MaLR -317 232 56 3 1653 480 248 181 53 chr2 140018422 140018665 -41729422 - MTD LTR MaLR -126 293 20 4 1653 433 267 214 22 chr2 140020071 140020347 -41727740 - ORR1E LTR MaLR -30 329 1 4 1653 1112 207 161 41 chr2 140023597 140023939 -41724148 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 2 5 1653 313 306 59 0 chr2 140030588 140030758 -41717329 + ORR1E LTR MaLR 16 195 -164 6 1653 250 268 179 0 chr2 140032842 140032954 -41715133 - RMER15 LTR ERVL -22 553 422 7 1653 402 271 99 40 chr2 140034718 140034941 -41713146 + ORR1E LTR MaLR 19 254 -105 7 1653 3295 45 2 8 chr2 140037117 140037515 -41710572 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 8 1653 244 228 18 0 chr2 140039745 140039802 -41708285 - RLTR14 LTR ERV1 -48 334 277 8 1653 2235 151 51 70 chr2 140039802 140040230 -41707857 + MTC LTR MaLR 1 420 -1 8 1653 262 250 112 49 chr2 140041280 140041423 -41706664 - MLT1J1 LTR MaLR -227 217 66 8 1653 473 262 129 34 chr2 140045253 140045486 -41702601 + MER21B LTR ERV1 557 811 -52 9 1653 485 330 94 31 chr2 140045820 140046170 -41701917 - LTR16E1 LTR ERVL -2 536 165 9 1653 290 239 101 11 chr2 140050633 140050722 -41697365 + LTR16C LTR ERVL 391 487 -2 1 1653 1484 55 0 0 chr2 140052211 140052411 -41695676 + RLTR10 LTR ERVK 1 200 -190 1 1653 3988 57 32 28 chr2 140052441 140053351 -41694736 + RLTR10-int LTR ERVK 1 991 -996 1 1653 483 309 39 32 chr2 140053515 140053799 -41694288 + RLTR10-int LTR ERVK 1309 1594 -5987 1 1653 8681 29 4 2 chr2 140053881 140054876 -41693211 + RLTR10-int LTR ERVK 990 1986 -1 1 1653 2988 57 10 33 chr2 140054876 140055275 -41692812 + RLTR10 LTR ERVK 1 390 0 1 1653 376 313 96 53 chr2 140056717 140056926 -41691161 + MLT1E2 LTR MaLR 52 269 -358 1 1653 557 306 134 32 chr2 140062865 140063209 -41684878 - MLT1J2 LTR MaLR -10 438 60 1 1653 369 336 19 13 chr2 140063773 140063927 -41684160 + RMER15 LTR ERVL 353 507 -68 1 1653 410 317 61 56 chr2 140076581 140076654 -41671433 + RMER15 LTR ERVL 337 402 -173 1 1653 410 317 61 56 chr2 140076860 140076983 -41671104 + RMER15 LTR ERVL 403 534 -41 1 1653 2423 181 32 7 chr2 140078806 140079217 -41668870 - MTC LTR MaLR 0 421 1 1 1653 514 318 64 94 chr2 140080473 140080897 -41667190 + RMER10A LTR ERVL 13 423 -19 1 1653 231 357 10 39 chr2 140086090 140086192 -41661895 + RLTR44B LTR ERVK 330 428 -21 1 1653 1740 109 42 15 chr2 140095992 140096252 -41651835 - ORR1A2 LTR MaLR -60 267 1 1 1653 971 90 0 0 chr2 140096252 140096385 -41651702 - ORR1A2-int LTR MaLR 0 1963 1831 1 1653 4051 105 7 7 chr2 140096383 140096979 -41651108 - ORR1A2-int LTR MaLR -566 1397 802 1 1653 527 319 172 28 chr2 140099570 140099854 -41648233 + LTR87 LTR ERVL? 20 344 -280 1 1653 818 251 24 19 chr2 140099872 140100079 -41648008 + LTR87 LTR ERVL? 416 623 -1 1 1653 1667 207 43 35 chr2 140103263 140103639 -41644448 + MTEb LTR MaLR 1 379 0 1 1653 1087 292 182 9 chr2 140103639 140104074 -41644013 + MTEb-int LTR MaLR 1 510 -1070 1 1653 356 292 125 0 chr2 140105450 140105570 -41642517 + MTEb-int LTR MaLR 561 695 -885 1 1653 3085 288 60 18 chr2 140105697 140106573 -41641514 + MTEb-int LTR MaLR 666 1578 -2 1 1653 851 261 122 11 chr2 140106604 140106891 -41641196 + MTEb LTR MaLR 53 371 -8 1 1653 4588 19 0 0 chr2 140113995 140114477 -41633610 - LTRIS_Mm LTR ERV1 0 482 1 2 1653 803 270 61 71 chr2 140114752 140114942 -41633145 - MTD LTR MaLR -15 404 212 2 1653 803 270 61 71 chr2 140115151 140115255 -41632832 - MTD LTR MaLR -208 211 113 2 1654 613 307 6 6 chr2 140116582 140116746 -41631341 + MLT1B LTR MaLR 223 386 -4 2 1654 2018 218 116 20 chr2 140122500 140123086 -41625001 - RLTR26 LTR ERVK 0 642 1 2 1654 448 235 0 30 chr2 140124650 140124751 -41623336 + MTD LTR MaLR 113 210 -209 2 1654 455 263 165 21 chr2 140125873 140126067 -41622020 + MLT2C1 LTR ERVL 3 224 -173 2 1654 306 275 13 138 chr2 140126505 140126657 -41621430 + MLT2C1 LTR ERVL 426 558 -5 2 1654 280 401 122 48 chr2 140127335 140127712 -41620375 + LTR33 LTR ERVL 98 502 -13 2 1654 1515 166 138 0 chr2 140128752 140129048 -41619039 - MTC LTR MaLR -82 339 3 2 1654 499 241 122 118 chr2 140129053 140129307 -41618780 + MT2A LTR ERVL 279 533 0 2 1654 2130 104 90 10 chr2 140132368 140132669 -41615418 - ORR1A2 LTR MaLR -2 325 1 2 1654 345 115 39 0 chr2 140132669 140132721 -41615366 - ORR1A2-int LTR MaLR 0 1963 1910 2 1654 1624 126 0 0 chr2 140132717 140132971 -41615116 - ORR1A2-int LTR MaLR -1709 254 1 2 1654 1789 178 56 0 chr2 140132975 140133295 -41614792 - ORR1A2 LTR MaLR -8 338 1 2 1654 884 223 80 72 chr2 140133645 140133896 -41614191 - MTEa LTR MaLR -10 369 117 2 1654 826 197 13 0 chr2 140133913 140134065 -41614022 - ORR1D2 LTR MaLR -2 368 215 2 1654 397 268 0 0 chr2 140134174 140134256 -41613831 - ORR1D2 LTR MaLR -297 82 1 2 1654 274 412 27 27 chr2 140134586 140134773 -41613314 - MLT1J1 LTR MaLR -86 358 172 2 1654 4106 34 2 33 chr2 140145645 140146135 -41601952 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 2 1654 1112 109 10 85 chr2 140146136 140146336 -41601751 + IAPEz-int LTR ERVK 9 193 -6288 2 1654 228 327 0 0 chr2 140146336 140146391 -41601696 + RLTR27 LTR ERVK 221 275 -34 2 1654 291 81 0 0 chr2 140146391 140146428 -41601659 + IAPEz-int LTR ERVK 145 181 -7400 2 1654 231 273 0 0 chr2 140146428 140146472 -41601615 + RLTR27 LTR ERVK 232 275 -34 2 1654 3542 89 20 39 chr2 140146472 140147125 -41600962 + IAPEz-int LTR ERVK 168 662 -5819 2 1654 955 59 0 0 chr2 140147125 140147244 -41600843 + IAPEz-int LTR ERVK 1359 1477 -5004 2 1654 1920 89 0 0 chr2 140147245 140147491 -41600596 + IAPEz-int LTR ERVK 2252 2497 -5183 2 1654 14229 65 14 9 chr2 140147490 140149305 -41598782 + IAPEz-int LTR ERVK 4656 6479 -2 2 1654 4109 34 2 33 chr2 140149307 140149797 -41598290 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 2 1654 3834 157 76 26 chr2 140155011 140155697 -41592390 - RMER6D LTR ERVK 0 720 1 2 1654 1152 235 114 7 chr2 140158133 140158441 -41589646 + ORR1D1 LTR MaLR 10 350 -24 2 1654 3401 48 5 5 chr2 140159323 140159719 -41588368 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 1654 282 388 80 49 chr2 140163974 140164364 -41583723 + LTR89 LTR ERVL? 309 710 -169 3 1654 228 242 15 61 chr2 140167028 140167094 -41580993 - RMER15 LTR ERVL -109 466 404 3 1654 813 202 118 132 chr2 140167250 140167672 -41580415 + MT2B LTR ERVL 1 528 -73 3 1654 343 231 30 7 chr2 140171013 140171039 -41577048 - ORR1A3-int LTR MaLR -859 650 622 3 1654 4501 10 0 0 chr2 140171615 140172108 -41575979 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 3 1654 302 0 0 0 chr2 140172108 140172146 -41575941 - MERVL-int LTR ERVL 0 5485 5448 3 1654 390 167 46 35 chr2 140172146 140172233 -41575854 - ORR1A3-int LTR MaLR -1323 640 553 3 1654 45542 18 0 0 chr2 140172233 140177592 -41570495 - MERVL-int LTR ERVL -125 5360 1 3 1654 4501 10 0 0 chr2 140177592 140178085 -41570002 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 3 1654 1686 121 25 143 chr2 140181504 140181860 -41566227 + ORR1B1 LTR MaLR 41 354 -40 3 1654 447 37 0 0 chr2 140182952 140183006 -41565081 + ORR1A4 LTR MaLR 276 329 0 3 1654 2292 184 22 0 chr2 140185636 140186048 -41562039 + MTC LTR MaLR 1 421 0 3 1654 3326 156 58 58 chr2 140188881 140189573 -41558514 - RLTR17 LTR ERVK 0 692 1 3 1654 542 236 33 33 chr2 140192925 140193078 -41555009 + RLTR42-int LTR ERVK 4253 4405 -1117 3 1654 821 268 34 175 chr2 140193459 140193934 -41554153 + RLTR11B LTR ERVK 1 408 -45 3 1654 649 268 162 14 chr2 140213093 140213309 -41534778 - MTE2b LTR MaLR -120 259 12 3 1654 419 303 15 22 chr2 140213355 140213490 -41534597 - MTE-int LTR MaLR -850 730 597 3 1654 555 285 98 11 chr2 140216774 140216948 -41531139 - MLT1D LTR MaLR -2 503 315 3 1654 572 306 118 78 chr2 140218392 140218753 -41529334 - MLT1B LTR MaLR 0 390 1 3 1654 235 349 102 83 chr2 140219451 140219776 -41528311 - ORR1E LTR MaLR -25 334 4 3 1654 414 174 627 0 chr2 140230097 140230176 -41517911 - ORR1D1 LTR MaLR -4 366 244 3 1654 414 231 145 0 chr2 140230217 140230293 -41517794 - ORR1D1 LTR MaLR -131 243 151 3 1654 674 275 21 21 chr2 140230373 140230559 -41517528 - ORR1D1 LTR MaLR -188 186 1 3 1655 614 274 326 32 chr2 140247957 140248242 -41499845 - ORR1E LTR MaLR -9 370 2 4 1655 1042 241 137 19 chr2 140275850 140276121 -41471966 + MTD LTR MaLR 65 367 -52 4 1655 345 339 35 25 chr2 140279226 140279426 -41468661 - MER92B LTR ERV1 0 636 435 4 1655 599 359 51 13 chr2 140279444 140279760 -41468327 - MER92B LTR ERV1 -307 329 2 4 1655 2535 107 24 34 chr2 140287933 140288348 -41459739 + IAPLTR2a LTR ERVK 1 411 0 4 1655 3636 63 8 10 chr2 140292132 140292614 -41455473 - LTRIS2 LTR ERV1 -79 485 5 4 1655 895 238 31 0 chr2 140292617 140292844 -41455243 - RLTR1B-int LTR ERV1 -42 5021 4788 4 1655 8070 159 66 58 chr2 140292835 140294842 -41453245 - RLTR1B-int LTR ERV1 -792 4271 1172 4 1655 8070 206 134 31 chr2 140294887 140295182 -41452905 - RLTR1B-int LTR ERV1 -3354 1709 1125 4 1655 1329 200 114 6 chr2 140295177 140295685 -41452402 - MuRRS4-int LTR ERV1 -3741 1322 760 4 1655 4282 141 53 18 chr2 140295676 140296393 -41451694 - RMER16-int LTR ERVK -3962 1444 703 4 1655 1016 88 68 19 chr2 140296432 140296594 -41451493 - RMER16-int LTR ERVK -5096 310 141 4 1655 252 288 35 64 chr2 140296641 140296782 -41451305 - MuRRS4-int LTR ERV1 -4747 316 180 4 1655 252 216 25 75 chr2 140297229 140297349 -41450738 - MuRRS4-int LTR ERV1 -3584 114 1 4 1655 1259 72 6 0 chr2 140297349 140297515 -41450572 - LTRIS2 LTR ERV1 0 564 398 4 1655 581 311 84 20 chr2 140297527 140297776 -41450311 - MT2A LTR ERVL 0 533 269 4 1655 6955 285 36 16 chr2 140297778 140299778 -41448309 - MERVL_2A-int LTR ERVL -1868 3893 1854 4 1655 298 298 0 0 chr2 140301481 140301565 -41446522 + MLT1A1 LTR MaLR 303 386 -22 5 1655 311 272 0 178 chr2 140304426 140304578 -41443509 - MT2B LTR ERVL -324 277 153 5 1655 253 263 165 71 chr2 140306880 140307007 -41441080 + MLT1E LTR MaLR 6 144 -509 5 1655 1553 191 114 8 chr2 140310525 140310884 -41437203 - MTC LTR MaLR -20 401 5 5 1655 665 280 86 84 chr2 140315756 140316213 -41431874 - MLT2B4 LTR ERVL 0 464 1 5 1655 2407 116 14 8 chr2 140317688 140318053 -41430034 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 5 1655 469 326 65 35 chr2 140319149 140319378 -41428709 + LTR16A LTR ERVL 204 439 -12 5 1655 2764 136 11 58 chr2 140321219 140321741 -41426346 + RLTR28 LTR ERVL 27 524 0 5 1655 1931 242 77 45 chr2 140322578 140323084 -41425003 + RMER15 LTR ERVL 27 548 -27 5 1655 1323 260 71 6 chr2 140323081 140323421 -41424666 + ORR1D2 LTR MaLR 9 370 0 5 1655 235 227 28 83 chr2 140324028 140324100 -41423987 + MTEa LTR MaLR 10 77 -302 5 1655 934 250 55 122 chr2 140332282 140332683 -41415404 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 5 1655 1371 228 25 70 chr2 140357836 140358194 -41389893 - ORR1E LTR MaLR -13 346 5 5 1655 405 231 287 80 chr2 140361110 140361448 -41386639 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 1 5 1655 234 255 83 0 chr2 140376165 140376254 -41371833 - MTE2a LTR MaLR -2 368 281 6 1656 262 341 12 0 chr2 140382536 140382618 -41365469 + ORR1E LTR MaLR 272 354 -5 6 1656 1293 309 148 27 chr2 140382681 140382872 -41365215 + MER21B LTR ERV1 13 222 -641 6 1656 1293 309 148 27 chr2 140383074 140383483 -41364604 + MER21B LTR ERV1 223 686 -177 6 1656 428 304 182 4 chr2 140383717 140383942 -41364145 - MLT1J1 LTR MaLR -142 302 38 6 1656 280 383 45 13 chr2 140385342 140385498 -41362589 + LTR33 LTR ERVL 3 163 -352 6 1656 490 308 178 49 chr2 140390234 140390599 -41357488 - MLT2D LTR ERVL -2 412 1 6 1656 1156 236 91 6 chr2 140399495 140399836 -41348251 + ORR1D1 LTR MaLR 3 372 -2 6 1656 1237 242 78 11 chr2 140407207 140407554 -41340533 + ORR1D1 LTR MaLR 5 374 0 6 1656 784 330 56 3 chr2 140425518 140425874 -41322213 - MTEa LTR MaLR -2 377 3 6 1656 225 192 69 103 chr2 140430263 140430350 -41317737 - MT2B LTR ERVL -366 235 152 6 1656 416 388 72 23 chr2 140441028 140441373 -41306714 - MLT1G3 LTR MaLR -178 377 17 7 1656 311 326 74 52 chr2 140445961 140446251 -41301836 - MLT1D LTR MaLR -32 648 342 7 1656 363 236 195 8 chr2 140446493 140446621 -41301466 + MLT1J LTR MaLR 1 152 -360 7 1656 910 214 69 28 chr2 140450157 140450373 -41297714 + MTD LTR MaLR 26 250 -169 7 1656 3649 147 53 48 chr2 140458691 140459440 -41288647 - RMER6A LTR ERVK 0 756 4 7 1656 428 204 0 115 chr2 140459904 140460026 -41288061 - MT2B LTR ERVL -337 264 157 7 1656 626 310 142 19 chr2 140460062 140460322 -41287765 - MLT1E2 LTR MaLR -110 517 226 7 1656 298 200 192 39 chr2 140460326 140460404 -41287683 - MLT1E2 LTR MaLR -564 90 1 7 1656 1331 220 61 20 chr2 140465773 140465965 -41282122 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 171 7 1656 1331 220 61 20 chr2 140466035 140466139 -41281948 - ORR1D1 LTR MaLR -204 170 66 7 1656 1133 303 33 0 chr2 140468593 140468930 -41279157 + MTE2b LTR MaLR 12 359 -20 7 1656 1913 141 57 79 chr2 140499334 140499741 -41248346 + RMER10B LTR ERVL 1 398 0 7 1657 307 371 16 8 chr2 140511517 140511642 -41236445 - MLT1G1 LTR MaLR -296 283 158 1 1657 4965 146 35 25 chr2 140512165 140513052 -41235035 + RMER17B LTR ERVK 1 896 -62 1 1657 1089 276 117 23 chr2 140514919 140515271 -41232816 + MTD LTR MaLR 20 404 -15 2 1657 880 242 157 38 chr2 140520222 140520565 -41227522 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 3 1657 239 233 44 55 chr2 140525879 140525970 -41222117 - MLT1E1A LTR MaLR -5 675 586 3 1657 354 357 41 20 chr2 140533452 140533598 -41214489 + LTR16A LTR ERVL 117 265 -186 4 1657 1244 189 21 4 chr2 140539465 140539704 -41208383 - MTC LTR MaLR 0 421 179 6 1657 2945 180 79 25 chr2 140539685 140540401 -41207686 - ORR1C2-int LTR MaLR -425 1538 477 6 1657 1369 177 238 3 chr2 140540401 140540712 -41207375 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 6 1657 551 299 206 29 chr2 140548548 140548858 -41199229 + MTD LTR MaLR 55 419 0 7 1657 406 311 148 32 chr2 140556097 140556313 -41191774 - ORR1E LTR MaLR -94 265 25 8 1657 704 222 95 30 chr2 140556575 140556775 -41191312 - MTE2a LTR MaLR 0 379 167 8 1657 251 314 99 98 chr2 140556851 140557037 -41191050 - MTE2a LTR MaLR -197 182 11 8 1657 284 302 0 16 chr2 140565963 140566084 -41182003 - RLTR6-int LTR ERV1 -318 7460 7342 9 1657 2540 44 78 0 chr2 140568917 140569238 -41178849 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 1 1657 228 183 46 77 chr2 140581172 140581237 -41166850 - RMER20A LTR ERVK -268 248 186 1 1657 275 261 210 12 chr2 140604316 140604483 -41143604 - MLT1C LTR MaLR -14 453 254 1 1657 402 110 39 52 chr2 140607764 140607841 -41140246 + MT2B LTR ERVL 189 264 -337 1 1657 702 305 29 82 chr2 140608728 140609037 -41139050 + MLT1H LTR MaLR 61 387 -204 1 1657 517 358 62 57 chr2 140622833 140623239 -41124848 - LTR16C LTR ERVL -3 486 79 1 1657 242 268 84 12 chr2 140629952 140630035 -41118052 + RMER15 LTR ERVL 422 510 -65 1 1657 350 340 74 25 chr2 140636223 140636386 -41111701 - LTR16A LTR ERVL -9 442 272 2 1658 273 273 79 83 chr2 140642909 140643125 -41104962 - LTR33 LTR ERVL -4 511 297 2 1658 1060 226 191 6 chr2 140646960 140647280 -41100807 + MTC LTR MaLR 1 379 -42 2 1658 396 175 91 8 chr2 140651489 140651610 -41096477 + RMER17C LTR ERVK 145 275 -135 2 1658 225 308 9 61 chr2 140653337 140653451 -41094636 - MLT1J LTR MaLR -404 108 1 2 1658 283 369 2 0 chr2 140673470 140673581 -41074506 - MTE2b LTR MaLR -226 153 42 2 1658 276 263 99 20 chr2 140673493 140673594 -41074493 - MT2A LTR ERVL -404 129 21 2 1658 1134 276 35 32 chr2 140675119 140675493 -41072594 + MTE2a LTR MaLR 3 377 -2 2 1658 2099 89 23 16 chr2 140682257 140682564 -41065523 - RLTR27 LTR ERVK 0 309 1 2 1658 524 320 109 82 chr2 140686693 140687142 -41060945 + MLT1C LTR MaLR 7 467 0 2 1658 2283 154 24 29 chr2 140697798 140698213 -41049874 - MTC LTR MaLR -8 413 1 2 1658 507 358 79 0 chr2 140710984 140711224 -41036863 - LTR16C LTR ERVL -169 320 62 3 1658 305 354 61 17 chr2 140713011 140713126 -41034961 - LTR16C LTR ERVL -307 182 63 3 1658 328 283 74 8 chr2 140714417 140714538 -41033549 - MLT1A1 LTR MaLR -5 403 275 3 1658 413 350 110 14 chr2 140730403 140730612 -41017475 + LTR16A LTR ERVL 31 259 -192 3 1658 293 250 20 40 chr2 140736493 140736593 -41011494 + MLT1A1 LTR MaLR 311 408 0 3 1658 318 423 30 15 chr2 140742112 140742309 -41005778 + LTR16E2 LTR ERVL 269 468 -100 3 1658 1941 185 58 84 chr2 140742495 140742615 -41005472 + MTD LTR MaLR 1 119 -300 3 1658 1941 185 58 84 chr2 140742704 140742729 -41005358 + MTD LTR MaLR 120 120 -299 3 1658 1941 185 58 84 chr2 140743273 140743555 -41004532 + MTD LTR MaLR 120 418 -1 3 1658 312 303 96 17 chr2 140744606 140744784 -41003303 + LTR16E1 LTR ERVL 244 435 -103 3 1658 5508 108 90 2 chr2 140745164 140745759 -41002328 - RMER17B LTR ERVK 0 958 319 3 1658 5508 108 90 2 chr2 140745840 140746122 -41001965 - RMER17B LTR ERVK -640 318 5 3 1658 2591 46 65 0 chr2 140755861 140756186 -40991901 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 3 1658 1462 185 74 27 chr2 140762757 140763124 -40984963 - RMER6C LTR ERVK -7 683 300 3 1658 268 361 79 56 chr2 140766554 140766806 -40981281 - MamGypLTR3 LTR Gypsy -37 802 545 3 1658 589 311 162 68 chr2 140767298 140767573 -40980514 - MLT1C LTR MaLR -2 465 178 3 1658 589 311 162 68 chr2 140767778 140767927 -40980160 - MLT1C LTR MaLR -290 177 1 3 1659 439 253 69 35 chr2 140776826 140777057 -40971030 - RLTR12B LTR ERVK -298 230 1 3 1659 717 332 70 67 chr2 140785138 140785480 -40962607 - LTR16A LTR ERVL -10 441 99 4 1659 462 345 93 44 chr2 140795508 140795778 -40952309 + LTR16A LTR ERVL 1 283 -168 4 1659 461 372 8 4 chr2 140795942 140796177 -40951910 + HERV16-int LTR ERVL 930 1165 -3831 4 1659 270 392 20 10 chr2 140797742 140797840 -40950247 + LTR16A1 LTR ERVL 11 109 -347 4 1659 336 352 60 101 chr2 140797883 140798249 -40949838 - ORR1D2 LTR MaLR -14 356 6 4 1659 346 341 87 28 chr2 140798273 140798526 -40949561 + LTR16A1 LTR ERVL 186 453 -3 4 1659 432 312 77 39 chr2 140802484 140802829 -40945258 + MLT1A1 LTR MaLR 1 386 -4 4 1659 255 302 0 11 chr2 140802873 140802960 -40945127 + MER57A-int LTR ERV1 5795 5880 -307 4 1659 328 360 70 47 chr2 140805582 140805871 -40942216 - MLT1D LTR MaLR 0 505 188 4 1659 279 341 65 32 chr2 140806765 140806950 -40941137 - ORR1E LTR MaLR -165 194 4 4 1659 5436 102 65 33 chr2 140806963 140807841 -40940246 - RMER17A2 LTR ERVK 0 906 1 4 1659 2189 152 20 55 chr2 140812421 140812555 -40935532 - RMER20B LTR ERVK -27 600 483 4 1659 2189 152 20 55 chr2 140812580 140812842 -40935245 - RMER20B LTR ERVK -145 482 218 4 1659 423 321 69 6 chr2 140820154 140820314 -40927773 + RMER15 LTR ERVL 406 575 0 4 1659 491 351 57 60 chr2 140823709 140823826 -40924261 - ORR1E LTR MaLR -9 350 228 4 1659 1772 249 70 10 chr2 140823826 140824328 -40923759 - MT2A LTR ERVL -1 532 1 4 1659 491 351 57 60 chr2 140824328 140824559 -40923528 - ORR1E LTR MaLR -132 227 3 4 1659 765 285 93 83 chr2 140835856 140836231 -40911856 + MTE2b LTR MaLR 1 379 0 4 1659 1274 275 134 37 chr2 140839591 140840047 -40908040 - MLT1H LTR MaLR -2 547 20 4 1659 284 377 129 11 chr2 140842687 140842966 -40905121 - MLT1J2 LTR MaLR -94 354 43 4 1659 1223 214 214 3 chr2 140846840 140847027 -40901060 + MTD LTR MaLR 4 202 -217 4 1659 1223 214 214 3 chr2 140847966 140848096 -40899991 + MTD LTR MaLR 203 387 -32 4 1659 1872 207 60 17 chr2 140851601 140852004 -40896083 + MTC LTR MaLR 2 421 0 4 1659 322 306 149 106 chr2 140859218 140859613 -40888474 - MLT1C LTR MaLR -12 455 44 5 1659 375 318 81 0 chr2 140859822 140859970 -40888117 + MLT1F LTR MaLR 306 465 -83 5 1659 1079 282 104 47 chr2 140863878 140864264 -40883823 + MTD LTR MaLR 1 399 -20 5 1659 1982 108 46 59 chr2 140865994 140866318 -40881769 - ORR1A4 LTR MaLR -8 321 2 5 1659 1062 217 16 55 chr2 140868042 140868243 -40879844 - RMER12B LTR ERVK -136 1436 1285 5 1659 7430 149 14 41 chr2 140868298 140869706 -40878381 - RMER12B LTR ERVK -279 1293 12 5 1659 851 252 32 32 chr2 140869943 140870164 -40877923 + ORR1D1 LTR MaLR 154 374 0 5 1659 327 362 94 22 chr2 140889957 140890138 -40857949 - LTR16C LTR ERVL -64 425 232 5 1659 406 169 0 0 chr2 140894713 140894778 -40853309 + ORR1A4 LTR MaLR 200 264 -65 5 1660 1625 150 77 126 chr2 140906289 140906693 -40841394 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 5 1660 3895 173 77 68 chr2 140915661 140916555 -40831532 + RMER19B LTR ERVK 1 902 0 5 1660 2406 130 346 2 chr2 140918535 140919043 -40829044 + RMER6C LTR ERVK 5 687 -3 5 1660 237 349 211 36 chr2 140919620 140919867 -40828220 + LTR33 LTR ERVL 13 302 -213 5 1660 1615 177 21 14 chr2 140923400 140923686 -40824401 - MERVL_2A-int LTR ERVL -1240 4521 4234 6 1660 1759 141 35 47 chr2 140923686 140924005 -40824082 - ORR1B1 LTR MaLR -33 361 47 6 1660 369 273 103 45 chr2 140925682 140925810 -40822277 + MLT2B2 LTR ERVL 351 505 -51 6 1660 1973 161 126 0 chr2 140926948 140927321 -40820766 - MTC LTR MaLR -1 420 1 6 1660 1472 226 58 44 chr2 140927748 140927959 -40820128 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 166 6 1660 1472 226 58 44 chr2 140928001 140928150 -40819937 - ORR1D1 LTR MaLR -209 165 10 6 1660 895 308 54 38 chr2 140945986 140946303 -40801784 - MTEb LTR MaLR 0 379 58 6 1660 1471 283 48 6 chr2 140946307 140946662 -40801425 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 6 1660 336 308 0 0 chr2 140946665 140946756 -40801331 - MTEb LTR MaLR -283 96 6 6 1660 306 394 49 45 chr2 140946917 140947090 -40800997 - LTR16C LTR ERVL -227 262 92 6 1660 306 394 49 45 chr2 140947253 140947326 -40800761 - LTR16C LTR ERVL -398 91 16 6 1660 1496 228 49 30 chr2 140951442 140951849 -40796238 + MTD LTR MaLR 5 419 0 6 1660 292 310 72 54 chr2 140960647 140960885 -40787202 - MTEa LTR MaLR -1 378 113 6 1660 885 203 155 9 chr2 140965044 140965302 -40782785 + ORR1B2 LTR MaLR 3 347 -31 6 1660 377 125 0 0 chr2 140965695 140965751 -40782336 + ORR1B2 LTR MaLR 312 367 0 6 1660 1332 355 117 17 chr2 140970649 140971373 -40776714 - MER21B LTR ERV1 -55 808 12 6 1660 421 294 141 58 chr2 140980745 140980986 -40767101 - MLT1J LTR MaLR -4 606 348 6 1660 355 340 67 65 chr2 140981745 140982218 -40765869 - MLT1F LTR MaLR -14 475 3 6 1660 258 368 79 39 chr2 140985727 140985905 -40762182 + ORR1E LTR MaLR 55 239 -120 6 1660 240 191 27 68 chr2 140991674 140991747 -40756340 + RLTR25B LTR ERVK 442 511 -517 6 1660 345 276 100 41 chr2 140992688 140992858 -40755229 - LTR16E1 LTR ERVL -34 504 325 6 1660 2657 190 103 21 chr2 140995283 140995848 -40752239 - RMER19C LTR ERVK 0 611 1 6 1660 2008 213 35 40 chr2 141010138 141010689 -40737398 - RLTR31A_Mm LTR ERVK 0 561 1 1 1660 357 180 0 0 chr2 141014909 141014970 -40733117 - MTD LTR MaLR -358 61 1 2 1660 693 336 148 30 chr2 141020232 141020704 -40727383 + LTR33A_ LTR ERVL 2 529 -2 3 1660 293 300 120 59 chr2 141024449 141024747 -40723340 - ORR1E LTR MaLR -36 323 5 3 1660 568 351 120 11 chr2 141025600 141025966 -40722121 - MLT1J1 LTR MaLR -2 442 37 4 1661 448 336 47 118 chr2 141041512 141041565 -40706522 + MTEb LTR MaLR 47 97 -282 5 1661 2695 102 0 43 chr2 141041565 141041983 -40706104 - MTB LTR MaLR 0 400 1 5 1661 448 336 47 118 chr2 141041983 141042267 -40705820 + MTEb LTR MaLR 98 359 -20 5 1661 270 228 151 42 chr2 141044286 141044405 -40703682 - MLT1N2 LTR MaLR -7 555 424 6 1661 355 377 47 10 chr2 141044407 141044600 -40703487 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 166 6 1661 323 238 12 0 chr2 141047200 141047280 -40700807 - RMER6C LTR ERVK -150 540 460 7 1661 1838 155 72 3 chr2 141047330 141047679 -40700408 + RMER6A LTR ERVK 3 375 -381 7 1661 844 292 29 101 chr2 141048847 141049255 -40698832 - MTE2a LTR MaLR 0 379 1 7 1661 264 306 22 53 chr2 141053904 141054061 -40694026 + LTR33A LTR ERVL 314 464 -67 7 1661 262 326 52 29 chr2 141067043 141067258 -40680829 - MLT1B LTR MaLR -57 333 85 9 1661 1010 298 54 24 chr2 141072354 141072650 -40675437 + ORR1D2 LTR MaLR 66 370 0 1 1661 1174 276 59 27 chr2 141104199 141104605 -40643482 + MTD LTR MaLR 1 419 0 1 1661 446 235 96 0 chr2 141127019 141127134 -40620953 - MLT1C LTR MaLR -306 161 36 1 1661 551 160 21 0 chr2 141128866 141128960 -40619127 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 299 1 1661 507 178 0 269 chr2 141128936 141129144 -40618943 - ORR1B1 LTR MaLR -215 152 1 1 1661 655 157 224 60 chr2 141129933 141130116 -40617971 - ORR1C1 LTR MaLR 0 384 172 1 1661 765 249 11 11 chr2 141130223 141130410 -40617677 - ORR1C1 LTR MaLR -191 187 1 1 1661 2970 25 8 0 chr2 141132823 141133183 -40614904 + MTA_Mm LTR MaLR 1 363 -33 1 1661 269 225 222 11 chr2 141138440 141138530 -40609557 + MLT1K LTR MaLR 163 271 -324 1 1661 470 376 57 67 chr2 141138784 141139066 -40609021 + LTR16A LTR ERVL 1 279 -172 1 1661 1254 212 178 24 chr2 141144884 141145261 -40602826 + RMER4B LTR ERVK 1 435 -150 1 1661 242 237 90 26 chr2 141145246 141145324 -40602763 + RMER4B LTR ERVK 351 433 -33 1 1661 1991 216 18 159 chr2 141146196 141146907 -40601180 - RMER19C LTR ERVK 0 611 1 2 1661 382 330 124 90 chr2 141162438 141162671 -40585416 + MER21B LTR ERV1 195 435 -428 2 1661 423 262 30 37 chr2 141162703 141162838 -40585249 + MER21B LTR ERV1 493 626 -237 2 1661 1375 254 64 20 chr2 141162860 141163205 -40584882 - ORR1D1 LTR MaLR -2 372 13 2 207 528 362 152 17 chr2 141164442 141164917 -40583170 - MER21B LTR ERV1 -222 641 103 2 1662 249 393 80 0 chr2 141165312 141165475 -40582612 + LTR33 LTR ERVL 319 494 -21 2 1662 2723 242 99 12 chr2 141166864 141167542 -40580545 - RMER19A LTR ERVK 0 737 1 2 1662 250 106 0 0 chr2 141167825 141167872 -40580215 - MER4B-int LTR ERV1 -5562 1196 1150 2 1662 573 311 107 57 chr2 141175964 141176244 -40571843 - MLT2C1 LTR ERVL -87 310 17 2 1662 249 331 47 71 chr2 141178769 141178938 -40569149 - LTR78 LTR ERV1 -14 1290 1126 2 1662 335 295 57 16 chr2 141182711 141182835 -40565252 + LTR33C LTR ERVL 50 178 -451 2 1662 226 386 75 20 chr2 141182856 141183057 -40565030 + LTR33C LTR ERVL 212 423 -206 2 1662 355 352 128 24 chr2 141183695 141184108 -40563979 + LTR16C LTR ERVL 4 459 -30 2 1662 876 268 25 46 chr2 141186277 141186516 -40561571 - MTEb LTR MaLR -145 234 1 2 1662 2449 170 72 6 chr2 141188992 141189466 -40558621 - RLTR16 LTR ERVK 0 505 1 2 1662 2081 138 65 20 chr2 141189471 141189915 -40558172 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -5 2321 1858 2 1662 383 229 28 9 chr2 141193547 141193653 -40554434 + MLT1A1 LTR MaLR 301 408 0 2 1662 661 342 75 11 chr2 141194538 141194880 -40553207 + MER21B LTR ERV1 1 402 -461 2 1662 502 344 81 24 chr2 141194857 141195104 -40552983 + MER21B LTR ERV1 589 849 -14 2 1662 1012 238 68 87 chr2 141202471 141202871 -40545216 - RMER16 LTR ERVK 0 533 10 2 1662 640 366 92 14 chr2 141211777 141212137 -40535950 - MLT1A1 LTR MaLR -1 407 20 3 1662 3205 108 2 41 chr2 141212779 141213272 -40534815 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 2 3 1662 259 250 16 0 chr2 141215609 141215673 -40532414 - MER57-int LTR ERV1 -315 7222 7158 3 1662 495 323 78 56 chr2 141221074 141221343 -40526744 + MLT1A LTR MaLR 8 282 -92 3 1662 1382 136 148 0 chr2 141225400 141225643 -40522444 - MTC LTR MaLR -140 281 3 3 1662 392 129 157 0 chr2 141228579 141228649 -40519438 - RLTR25B LTR ERVK -328 775 695 3 1662 3063 176 36 16 chr2 141228648 141229207 -40518880 - RLTR25B LTR ERVK -458 570 1 3 1662 1092 252 91 61 chr2 141234042 141234405 -40513682 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 3 1662 1986 90 138 6 chr2 141234459 141234784 -40513303 - RLTR9A LTR ERVK 0 368 1 3 1662 287 282 224 55 chr2 141235931 141236096 -40511991 - ORR1E LTR MaLR -166 193 1 3 1662 544 319 133 81 chr2 141236096 141236476 -40511611 - ORR1E-int LTR MaLR -53 1527 1127 3 1662 385 341 77 36 chr2 141236529 141236751 -40511336 - ORR1E-int LTR MaLR -576 1004 774 3 1662 759 297 174 48 chr2 141236900 141237342 -40510745 - ORR1E-int LTR MaLR -1082 498 1 3 1662 768 40 0 0 chr2 141237602 141237702 -40510385 + LTRIS3 LTR ERV1 413 512 0 3 1662 633 316 112 33 chr2 141238720 141239086 -40509001 + MLT1E1A LTR MaLR 286 680 0 3 1662 628 343 19 39 chr2 141243625 141243883 -40504204 - MTE2b LTR MaLR -124 255 3 3 1662 2780 62 144 132 chr2 141244511 141245017 -40503070 - RLTR1B LTR ERV1 0 512 1 3 1662 409 73 18 0 chr2 141247821 141247876 -40500211 - RMER13B LTR ERVK -518 390 335 3 1662 297 241 154 43 chr2 141249116 141249233 -40498854 - MLT1F LTR MaLR 0 548 419 3 1662 1208 266 122 6 chr2 141253793 141254145 -40493942 + MTD LTR MaLR 13 405 -14 3 1662 1396 204 46 30 chr2 141257628 141257996 -40490091 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 3 1662 1419 210 17 27 chr2 141262976 141263274 -40484813 + ORR1D1 LTR MaLR 1 295 -79 3 1662 345 194 0 0 chr2 141263333 141263395 -40484692 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 313 3 1662 464 332 115 24 chr2 141269291 141269544 -40478543 - MLT1A0 LTR MaLR -10 355 80 3 1662 489 298 51 28 chr2 141271880 141272056 -40476031 - MLT1B LTR MaLR -29 361 182 3 1662 277 278 63 7 chr2 141272200 141272308 -40475779 - MLT1B LTR MaLR -190 175 54 3 1662 487 329 84 21 chr2 141275623 141275862 -40472225 - MER21B LTR ERV1 -156 707 454 3 1662 228 157 18 89 chr2 141277606 141277662 -40470425 + MLT2C1 LTR ERVL 204 255 -142 3 1662 2628 118 69 24 chr2 141290794 141291255 -40456832 - RLTR45 LTR ERVK 0 482 1 4 1662 601 288 86 75 chr2 141292693 141293067 -40455020 - MLT1B LTR MaLR -24 366 1 4 1663 230 125 0 0 chr2 141297461 141297493 -40450594 + RLTR25B LTR ERVK 997 1028 0 4 1663 429 365 92 47 chr2 141301789 141302169 -40445918 + MLT1I LTR MaLR 10 406 -5 4 1663 471 306 69 19 chr2 141304430 141304590 -40443497 - MER74A LTR ERVL -2 556 389 4 1663 340 294 29 0 chr2 141317588 141317690 -40430397 - MLT1G1 LTR MaLR 0 591 487 4 1663 423 307 104 65 chr2 141317702 141318011 -40430076 - MLT1G1 LTR MaLR -205 350 42 4 1663 423 276 124 60 chr2 141318054 141318128 -40429959 - MLT1G1 LTR MaLR -494 85 2 4 1663 973 275 167 6 chr2 141323686 141324004 -40424083 + MTEa LTR MaLR 3 371 -8 4 1663 289 269 19 152 chr2 141327362 141327520 -40420567 - MTE2b LTR MaLR -241 138 2 4 1663 358 382 72 62 chr2 141334876 141335152 -40412935 + MLT1G LTR MaLR 5 283 -308 4 1663 234 392 16 31 chr2 141335270 141335399 -40412688 + MLT1G LTR MaLR 431 557 -12 4 1663 280 308 11 11 chr2 141337443 141337535 -40410552 + MTEb LTR MaLR 288 379 0 4 1663 810 314 122 22 chr2 141342043 141342411 -40405676 - MTD LTR MaLR -14 405 1 4 1663 297 355 18 94 chr2 141350923 141350967 -40397120 - MTE2b LTR MaLR -3 376 344 4 1663 729 299 7 58 chr2 141350994 141351280 -40396807 - MTE2b LTR MaLR -36 343 1 4 1663 395 357 48 27 chr2 141351670 141351857 -40396230 - LTR16C LTR ERVL 0 489 299 4 1663 866 287 174 3 chr2 141352001 141352323 -40395764 - MTD LTR MaLR -31 388 12 4 1663 271 189 0 0 chr2 141354306 141354359 -40393728 - MTD LTR MaLR -326 53 1 4 1663 504 381 39 6 chr2 141356183 141356365 -40391722 - LTR16A LTR ERVL -263 188 1 5 1663 235 345 25 83 chr2 141356385 141356505 -40391582 + RLTR9A LTR ERVK 121 233 -135 5 1663 363 271 90 35 chr2 141371315 141371460 -40376627 - MLT1D LTR MaLR -9 496 344 5 1663 316 326 71 61 chr2 141371479 141371675 -40376412 - MLT1D LTR MaLR -259 246 49 5 1663 377 352 104 22 chr2 141374106 141374376 -40373711 - MER110 LTR ERV1 -21 470 179 5 1663 643 273 21 14 chr2 141378542 141378687 -40369400 + ORR1D1 LTR MaLR 218 363 -11 5 1663 399 395 7 32 chr2 141385604 141385884 -40362203 - MLT1A0 LTR MaLR -16 349 77 5 1663 261 344 73 16 chr2 141392534 141392658 -40355429 + MLT1L LTR MaLR 314 444 -166 5 1663 1481 173 62 59 chr2 141397984 141398371 -40349716 - RMER17C LTR ERVK -3 407 20 5 1663 737 365 33 72 chr2 141398392 141398820 -40349267 + MLT2B2 LTR ERVL 96 506 -9 5 1663 1477 240 62 12 chr2 141401889 141402226 -40345861 - RMER20A LTR ERVK -162 354 1 5 1663 2187 230 120 36 chr2 141402522 141403165 -40344922 + RMER19A LTR ERVK 49 737 0 5 1663 276 376 0 35 chr2 141407083 141407196 -40340891 - RMER12 LTR ERVK -472 850 742 5 1663 2386 218 27 8 chr2 141411459 141411976 -40336111 - RMER5 LTR ERV1 -7 527 1 5 1663 546 287 67 63 chr2 141422542 141422795 -40325292 - MTD LTR MaLR -7 412 159 5 1664 330 269 67 60 chr2 141429393 141429543 -40318544 + MER34 LTR ERV1 68 218 -324 5 1664 342 306 123 74 chr2 141431320 141431633 -40316454 - MTEa LTR MaLR -5 374 6 6 1664 2258 328 81 26 chr2 141431620 141432862 -40315225 - MTEa-int LTR MaLR -35 1545 109 6 1664 343 333 25 8 chr2 141433055 141433173 -40314914 - MTEa-int LTR MaLR -1459 121 2 6 1664 568 330 24 95 chr2 141433192 141433530 -40314557 - ORR1E LTR MaLR -41 318 5 6 1664 1510 216 80 6 chr2 141434517 141434830 -40313257 - MTD LTR MaLR 0 419 84 6 1664 416 210 19 74 chr2 141437778 141437886 -40310201 - MTD LTR MaLR -319 102 1 6 1664 1325 281 23 8 chr2 141438851 141439203 -40308884 + ORR1E LTR MaLR 1 357 -2 6 1664 321 287 110 43 chr2 141442413 141442576 -40305511 - MER95 LTR ERV -215 216 43 6 1664 1654 204 25 48 chr2 141459832 141460188 -40287899 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 37 6 1664 476 287 49 0 chr2 141462937 141463101 -40284986 - RLTR42-int LTR ERVK -1092 4430 4259 6 1664 664 276 25 116 chr2 141463120 141463362 -40284725 - RLTR17 LTR ERVK -287 405 186 6 1664 269 237 30 15 chr2 141465708 141465841 -40282246 - ORR1B1-int LTR MaLR -756 753 619 6 1664 3001 126 134 156 chr2 141471629 141472522 -40275565 - RMER17D LTR ERVK -15 874 1 6 1664 1064 201 257 37 chr2 141486860 141487238 -40260849 - RMER6B LTR ERVK 0 461 1 6 1664 640 178 17 0 chr2 141496609 141496727 -40251360 + ORR1A0 LTR MaLR 1 120 -226 6 1664 1537 37 154 0 chr2 141496674 141496888 -40251199 - MT2C_Mm LTR ERVL -228 247 1 6 1664 352 197 16 0 chr2 141511132 141511193 -40236894 + MTD LTR MaLR 3 64 -357 1 1664 407 163 0 8 chr2 141511449 141511529 -40236558 + MTD LTR MaLR 346 421 0 1 1664 1563 191 86 23 chr2 141511562 141511932 -40236155 + ORR1C1 LTR MaLR 2 378 0 1 1664 440 209 93 36 chr2 141512561 141512700 -40235387 - RMER5 LTR ERV1 -10 524 378 1 1664 424 296 67 46 chr2 141512957 141513152 -40234935 - RMER5 LTR ERV1 -142 392 194 1 1664 1358 153 16 35 chr2 141513158 141513415 -40234672 + RLTR15 LTR ERVK 1 252 -107 2 1664 3339 175 87 42 chr2 141519953 141520047 -40228040 + RLTR25B LTR ERVK 1 88 -940 2 1664 3339 160 238 40 chr2 141520090 141520870 -40227217 + RLTR25B LTR ERVK 89 1103 0 2 1664 916 274 97 33 chr2 141521629 141522020 -40226067 - MLT2D LTR ERVL -11 386 3 3 1664 439 285 107 34 chr2 141527801 141527979 -40220108 + MTE2a LTR MaLR 139 329 -50 4 1664 252 378 39 0 chr2 141528909 141529065 -40219022 - LTR16C LTR ERVL 0 489 328 4 1664 244 338 47 20 chr2 141530945 141530981 -40217106 - LTR82A LTR ERVL -448 424 274 5 1664 3186 65 0 2 chr2 141541988 141542389 -40205698 - MTB LTR MaLR 0 400 1 7 1664 642 313 64 79 chr2 141544900 141545243 -40202844 - MLT1A0 LTR MaLR -21 344 7 7 1664 691 338 82 23 chr2 141548326 141548680 -40199407 - LTR16A LTR ERVL -5 446 72 8 1664 729 266 60 36 chr2 141549824 141550105 -40197982 + MER34 LTR ERV1 184 471 -71 8 1664 1487 282 25 3 chr2 141551735 141552101 -40195986 - MTEa LTR MaLR -4 375 2 8 1664 422 323 142 0 chr2 141557276 141557431 -40190656 + MTEa LTR MaLR 2 178 -201 8 1665 273 326 92 39 chr2 141574215 141574368 -40173719 + MLT1K LTR MaLR 411 571 -24 1 1665 1397 206 213 77 chr2 141574880 141575349 -40172738 - MT2A LTR ERVL 0 533 1 1 1665 1152 262 37 13 chr2 141576314 141576612 -40171475 - MTE2b LTR MaLR -14 365 61 1 1665 272 260 110 0 chr2 141576615 141576688 -40171399 - MTE2b LTR MaLR -281 98 18 1 1665 226 340 127 46 chr2 141578404 141578663 -40169424 + LTR50 LTR ERVL 403 682 -113 1 1665 1527 238 26 11 chr2 141583698 141584047 -40164040 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 21 1 1665 231 208 20 20 chr2 141585584 141585633 -40162454 + LTR16C LTR ERVL 436 484 -5 1 1665 2446 171 7 7 chr2 141586583 141586996 -40161091 + MTC LTR MaLR 1 413 -8 1 1665 2056 162 33 112 chr2 141587648 141587802 -40160285 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 344 1 1665 2056 162 33 112 chr2 141588475 141588836 -40159251 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK -132 343 1 1 1665 2395 161 33 66 chr2 141591713 141592321 -40155766 - RMER17A LTR ERVK -15 874 150 1 1665 1209 164 38 45 chr2 141592463 141592731 -40155356 - RMER17A LTR ERVK -585 304 1 1 1665 520 342 89 28 chr2 141598662 141599134 -40148953 + MLT1D LTR MaLR 5 505 0 1 1665 307 266 81 44 chr2 141603771 141603982 -40144105 + RMER17A LTR ERVK 169 389 -362 1 1665 307 266 81 44 chr2 141604162 141604198 -40143889 + RMER17A LTR ERVK 390 425 -326 1 1665 341 238 109 0 chr2 141614626 141614727 -40133360 - ORR1C2 LTR MaLR -84 300 189 1 1665 1808 235 88 99 chr2 141614732 141615347 -40132740 - RMER19C LTR ERVK -3 608 1 1 1665 1302 235 74 16 chr2 141616732 141617095 -40130992 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 1 1665 839 196 58 21 chr2 141617095 141617283 -40130804 + ORR1C2-int LTR MaLR 1 195 -1314 1 1665 3405 216 83 96 chr2 141617278 141618338 -40129749 + ORR1C2-int LTR MaLR 464 1509 0 1 1665 908 211 102 9 chr2 141618340 141618586 -40129501 + ORR1C2 LTR MaLR 3 224 -160 1 1665 302 85 30 0 chr2 141618561 141618616 -40129471 + ORR1C2 LTR MaLR 319 381 -13 1 1665 1749 229 49 12 chr2 141620912 141621318 -40126769 + MTC LTR MaLR 1 421 0 1 1665 235 309 172 51 chr2 141626534 141626691 -40121396 + MamGypLTR2c LTR Gypsy 436 611 -457 1 1665 1485 141 16 12 chr2 141627376 141627628 -40120459 + RLTR15 LTR ERVK 107 359 0 1 1665 363 342 87 0 chr2 141640051 141640200 -40107887 - MLT1I LTR MaLR -4 407 246 1 1665 953 272 8 32 chr2 141646127 141646378 -40101709 + MTC LTR MaLR 15 259 -162 2 1665 256 196 39 0 chr2 141653454 141653505 -40094582 - RMER15 LTR ERVL -87 488 436 2 1665 1547 304 73 20 chr2 141662243 141662844 -40085243 - ORR1E-int LTR MaLR -945 635 3 2 1665 774 314 86 37 chr2 141662860 141663184 -40084903 - ORR1E LTR MaLR -18 341 2 2 1665 308 268 46 11 chr2 141668965 141669052 -40079035 - ORR1E LTR MaLR 0 359 270 2 1665 512 232 52 156 chr2 141671245 141671515 -40076572 + RMER6C LTR ERVK 226 467 -223 2 1665 321 229 35 22 chr2 141685806 141685920 -40062167 - MLT1H2 LTR MaLR -318 171 62 2 1665 332 198 132 0 chr2 141685920 141686011 -40062076 - MLT2B2 LTR ERVL 0 562 460 2 1666 412 335 114 46 chr2 141690921 141691438 -40056649 + MLT1F1 LTR MaLR 11 652 -2 2 1666 1242 248 118 12 chr2 141695695 141696026 -40052061 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 5 2 1666 258 271 40 50 chr2 141709830 141709931 -40038156 - MLT1I LTR MaLR -3 408 309 2 1666 279 302 28 19 chr2 141711136 141711244 -40036843 - MLT1K LTR MaLR -22 573 465 2 1666 1340 252 102 59 chr2 141712572 141713045 -40035042 - RLTR26 LTR ERVK -148 494 2 2 1666 254 416 43 7 chr2 141747070 141747208 -40000879 + LTR78 LTR ERV1 208 350 -954 3 1666 429 404 41 48 chr2 141752095 141752389 -39995698 + LTR16A LTR ERVL 151 442 -9 3 1666 226 257 16 153 chr2 141759189 141759313 -39988774 - MLT1D LTR MaLR -141 364 258 3 1666 996 240 151 42 chr2 141759655 141759986 -39988101 - ORR1D1 LTR MaLR -3 371 5 3 1666 330 331 45 38 chr2 141773470 141773602 -39974485 - MLT1H1 LTR MaLR -187 368 236 3 1666 375 323 10 0 chr2 141783299 141783395 -39964692 + ORR1E LTR MaLR 15 111 -248 3 1666 375 287 74 25 chr2 141785135 141785342 -39962745 + ORR1E LTR MaLR 139 379 0 3 1666 921 171 57 57 chr2 141785661 141785853 -39962234 - ORR1C2 LTR MaLR -190 194 3 3 1666 379 222 0 77 chr2 141792289 141792367 -39955720 + RLTR20A LTR ERVK 464 535 -6 3 1666 986 312 2 96 chr2 141792424 141792818 -39955269 - ORR1E LTR MaLR -2 357 1 3 1666 256 329 62 62 chr2 141793169 141793331 -39954756 - MLT1K LTR MaLR -7 588 427 3 1666 1850 128 3 7 chr2 141793388 141793672 -39954415 - RLTR10E LTR ERVK -28 283 1 3 1666 239 384 20 0 chr2 141812289 141812388 -39935699 - MLT1H2 LTR MaLR -322 167 67 4 1666 566 294 88 81 chr2 141814775 141815070 -39933017 - ORR1E LTR MaLR -74 296 6 4 208 232 437 50 14 chr2 141819889 141820107 -39927980 + MLT1K LTR MaLR 142 367 -228 4 1667 1521 169 17 37 chr2 141821326 141821673 -39926414 + ORR1C2 LTR MaLR 38 384 0 4 1667 904 293 118 24 chr2 141833883 141834212 -39913875 - MTE2b LTR MaLR -13 366 7 4 1667 720 283 65 53 chr2 141836690 141837027 -39911060 + ORR1E LTR MaLR 6 372 -2 4 1667 227 229 0 20 chr2 141845337 141845386 -39902701 + MTEa LTR MaLR 288 335 -44 4 1667 234 388 27 54 chr2 141845916 141846063 -39902024 - MLT1F LTR MaLR -123 425 283 4 1667 254 354 81 47 chr2 141846106 141846278 -39901809 - MLT1F LTR MaLR -368 180 3 4 1667 805 241 64 84 chr2 141849425 141849833 -39898254 - RMER16 LTR ERVK 0 533 1 4 1667 354 320 81 11 chr2 141870751 141870925 -39877162 - MLT1J2 LTR MaLR -2 446 261 4 1667 373 295 9 28 chr2 141870957 141871065 -39877022 - MLT1J2 LTR MaLR -319 129 24 4 1667 1540 198 95 52 chr2 141878172 141878560 -39869527 + MTD LTR MaLR 1 405 -14 4 1667 651 329 59 64 chr2 141882389 141882454 -39865633 - MLT1A LTR MaLR 0 374 314 4 1667 651 329 59 64 chr2 141882643 141882934 -39865153 - MLT1A LTR MaLR -61 313 20 4 1667 711 105 9 9 chr2 141885574 141885680 -39862407 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 221 5 1667 1288 126 0 5 chr2 141885679 141885870 -39862217 - ORR1A3 LTR MaLR -19 307 118 5 1667 533 148 24 48 chr2 141886374 141886516 -39861571 - ORR1A3 LTR MaLR -237 157 1 5 1667 313 313 66 66 chr2 141887090 141887316 -39860771 + MLT1H LTR MaLR 66 291 -258 5 1667 832 291 97 42 chr2 141887491 141887800 -39860287 + MTD LTR MaLR 41 366 -53 5 1667 358 256 150 64 chr2 141889994 141890225 -39857862 - MLT1H2 LTR MaLR -226 323 72 5 1667 4598 193 50 34 chr2 141899447 141899815 -39848272 - RLTR25A LTR ERVK 0 1028 645 5 1667 4598 173 34 17 chr2 141899856 141900500 -39847587 - RLTR25A LTR ERVK -459 644 2 5 1667 244 346 79 0 chr2 141903325 141903452 -39844635 - RMER15 LTR ERVL -17 558 422 5 1667 602 326 59 31 chr2 141904164 141904386 -39843701 - MLT1A1 LTR MaLR -4 404 177 5 1667 964 293 94 35 chr2 141904445 141904785 -39843302 + MTE2a LTR MaLR 19 378 -1 5 1667 1315 205 90 37 chr2 141904836 141905191 -39842896 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 5 1667 277 381 19 45 chr2 141906117 141906271 -39841816 - MLT1A1 LTR MaLR -374 181 32 5 1667 787 226 115 119 chr2 141906314 141906682 -39841405 - MT2A LTR ERVL -3 598 101 5 1667 787 194 128 173 chr2 141907198 141907297 -39840790 - MT2A LTR ERVL -433 100 5 5 1667 5204 161 68 46 chr2 141908563 141908703 -39839384 + RLTR25A LTR ERVK 38 157 -946 5 1667 5204 161 68 46 chr2 141908994 141909759 -39838328 + RLTR25A LTR ERVK 158 956 -147 5 1667 5204 161 68 46 chr2 141909812 141909946 -39838141 + RLTR25A LTR ERVK 957 1100 -3 5 1667 584 389 33 4 chr2 141937222 141937467 -39810620 - MLT1G LTR MaLR -88 503 252 5 1667 642 302 85 36 chr2 141940370 141940674 -39807413 - ORR1E LTR MaLR -27 352 1 5 1668 908 138 90 62 chr2 141961458 141961636 -39786451 - ORR1A3-int LTR MaLR -925 1038 856 5 1668 640 238 35 98 chr2 141962833 141963135 -39784952 - MT2B LTR ERVL -255 329 53 6 1668 426 168 187 0 chr2 141963098 141963205 -39784882 - ORR1A2-int LTR MaLR -1187 605 479 6 1668 546 220 0 0 chr2 141963217 141963317 -39784770 - MT2B LTR ERVL -342 259 160 6 1668 2845 138 52 17 chr2 141963318 141963840 -39784247 - ORR1A2-int LTR MaLR -1423 540 1 6 1668 2037 124 38 3 chr2 141963840 141964156 -39783931 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 6 1668 963 136 97 0 chr2 141969559 141969735 -39778352 + MTC LTR MaLR 1 193 -228 6 1668 571 183 10 0 chr2 141969734 141969838 -39778249 + MTC LTR MaLR 315 419 0 6 1668 227 308 43 111 chr2 141970837 141970954 -39777133 + LTR16A LTR ERVL 8 116 -335 6 1668 1639 136 146 0 chr2 141971042 141971322 -39776765 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 7 6 1668 383 340 75 62 chr2 141971343 141971569 -39776518 - LTR33A LTR ERVL -281 239 11 6 1668 482 359 158 25 chr2 141973368 141973848 -39774239 + MLT1F LTR MaLR 3 546 -2 6 1668 1826 225 35 5 chr2 141985147 141985541 -39762546 - MTD LTR MaLR 0 419 13 6 1668 390 271 28 0 chr2 141985795 141985902 -39762185 + MLT1C LTR MaLR 63 172 -295 6 1668 246 306 45 79 chr2 141990431 141990633 -39757454 - LTR16A LTR ERVL 0 451 257 6 1668 306 330 97 57 chr2 141990766 141990994 -39757093 - MLT1B LTR MaLR -142 248 12 6 1668 399 387 64 32 chr2 141993373 141993717 -39754370 + MLT1E2 LTR MaLR 222 576 -51 6 1668 362 223 95 11 chr2 141994005 141994100 -39753987 + MLT1E1 LTR MaLR 151 253 -401 6 1668 340 358 75 46 chr2 141995242 141995478 -39752609 + MLT1E1 LTR MaLR 232 474 -180 6 1668 258 322 45 51 chr2 141997308 141997465 -39750622 - LTR33C LTR ERVL 0 629 474 6 1668 368 228 138 21 chr2 141998546 141998640 -39749447 - MLT1G3 LTR MaLR -71 508 404 6 1668 456 355 108 15 chr2 141998659 141998928 -39749159 - MLT1G3 LTR MaLR -263 332 39 6 1668 398 294 106 98 chr2 142000000 142000179 -39747908 - MER57E1 LTR ERV1 -120 252 74 1 1668 398 294 106 98 chr2 142000239 142000304 -39747783 - MER57E1 LTR ERV1 -299 73 6 1 1668 2100 121 88 0 chr2 142004236 142004533 -39743554 - ORR1A2 LTR MaLR -3 324 2 7 1668 1968 219 7 29 chr2 142006438 142006852 -39741235 - MTC LTR MaLR -8 413 9 1 1668 889 307 66 9 chr2 142006819 142007151 -39740936 - MER73 LTR ERVL -277 367 17 1 1668 951 279 34 53 chr2 142007576 142007954 -39740133 - MLT1B LTR MaLR -18 372 2 1 1668 4007 144 87 14 chr2 142009143 142009848 -39738239 + RMER6A LTR ERVK 1 756 0 1 1668 628 294 61 57 chr2 142012497 142012793 -39735294 + MLT1D LTR MaLR 153 449 -56 2 1668 434 330 54 17 chr2 142018787 142019027 -39729060 - MLT2B1 LTR ERVL -8 512 264 3 1668 592 302 65 73 chr2 142019174 142019439 -39728648 - MLT2B4 LTR ERVL -208 348 86 3 1668 398 320 48 42 chr2 142019567 142019756 -39728331 - LTR16C LTR ERVL -31 458 269 3 1668 370 337 50 109 chr2 142021338 142021741 -39726346 + MLT1A1 LTR MaLR 26 404 -4 4 1668 3257 25 0 42 chr2 142022879 142023262 -39724825 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 4 1668 56145 21 22 3 chr2 142023262 142029615 -39718472 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 8 4 1668 3257 25 0 42 chr2 142029615 142029998 -39718089 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 4 1668 553 249 220 37 chr2 142034715 142035015 -39713072 - MLT1A0 LTR MaLR -4 361 7 4 1668 467 349 37 49 chr2 142038092 142038336 -39709751 + LTR16C LTR ERVL 249 489 0 5 1668 356 294 180 50 chr2 142044137 142044420 -39703667 - LTR16B1 LTR ERVL -151 329 10 5 1668 1103 291 95 85 chr2 142054646 142055233 -39692854 + RLTR18 LTR ERVK 24 616 0 7 1668 279 335 89 19 chr2 142055349 142055507 -39692580 + LTR33 LTR ERVL 336 504 -11 7 1668 851 178 31 13 chr2 142055709 142055868 -39692219 + MTD LTR MaLR 1 162 -257 7 1668 1246 212 25 67 chr2 142056088 142056450 -39691637 - MT2B LTR ERVL -55 546 161 8 1668 254 274 50 158 chr2 142056447 142056560 -39691527 - MLT1G1 LTR MaLR -451 128 30 8 1668 254 274 50 158 chr2 142056645 142056670 -39691417 - MLT1G1 LTR MaLR -550 29 5 8 1668 463 357 88 78 chr2 142057694 142058013 -39690074 - MLT1K LTR MaLR -186 409 88 8 1668 783 326 78 118 chr2 142061923 142062271 -39685816 - MER21B LTR ERV1 -518 345 12 9 1668 543 307 77 83 chr2 142063126 142063439 -39684648 - MLT1F1 LTR MaLR -258 311 1 9 1668 243 333 158 21 chr2 142068974 142069164 -39678923 - LTR16C LTR ERVL -15 474 259 1 1668 1933 179 38 8 chr2 142074257 142074629 -39673458 - ORR1C2 LTR MaLR -1 383 1 1 1668 229 212 132 29 chr2 142075785 142075853 -39672234 - MLT1A1 LTR MaLR -15 393 319 1 1668 266 322 99 91 chr2 142081143 142081406 -39666681 - MLT1G LTR MaLR -234 357 93 1 1669 244 245 155 44 chr2 142083690 142083942 -39664145 - RLTR21 LTR ERVK -266 1306 1027 1 1669 385 332 109 81 chr2 142101585 142101870 -39646217 - MLT1J1 LTR MaLR -131 313 21 1 1669 2045 137 0 57 chr2 142106935 142107284 -39640803 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 1 1669 7284 146 188 75 chr2 142107284 142109049 -39639038 - ORR1A4-int LTR MaLR 0 1963 1 1 1669 1677 156 67 64 chr2 142109049 142109377 -39638710 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 1 1669 237 224 85 17 chr2 142110119 142110178 -39637909 - RMER5 LTR ERV1 -404 130 68 1 1669 1516 133 82 98 chr2 142110507 142110741 -39637346 + RMER17C LTR ERVK 1 211 -199 1 1669 1516 133 82 98 chr2 142110921 142111103 -39636984 + RMER17C LTR ERVK 212 409 -1 1 1669 497 373 22 30 chr2 142117227 142117495 -39630592 - MLT1A0 LTR MaLR -2 363 98 1 1669 3272 149 175 104 chr2 142118860 142119706 -39628381 - RMER17A2 LTR ERVK 0 906 1 1 1669 2107 81 41 61 chr2 142131771 142132113 -39615974 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK -2 335 1 1 1669 25023 17 3 0 chr2 142132113 142135060 -39613027 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 3525 1 1669 886 73 24 0 chr2 142135060 142135183 -39612904 - IAPEz-int LTR ERVK -2770 4910 4785 1 1669 1717 111 8 0 chr2 142135180 142135432 -39612655 - IAPEz-int LTR ERVK -5183 2497 2244 1 1669 10969 48 27 18 chr2 142135427 142136886 -39611201 - IAPEz-int LTR ERVK -5004 1477 6 1 1669 2072 88 41 62 chr2 142136886 142137225 -39610862 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK -5 332 1 1 1669 3581 159 8 23 chr2 142139073 142139677 -39608410 + RLTR17 LTR ERVK 98 692 0 1 1669 238 228 111 25 chr2 142146012 142146093 -39601994 - ORR1D2 LTR MaLR -14 356 269 2 1669 374 290 54 16 chr2 142150619 142150745 -39597342 - LTR37A LTR ERV1 -11 415 280 2 1669 374 290 54 16 chr2 142150796 142150855 -39597232 - LTR37A LTR ERV1 -147 279 224 2 1669 3888 151 29 129 chr2 142152590 142153104 -39594983 - RMER13B LTR ERVK -109 799 388 2 1669 3888 151 29 129 chr2 142153608 142153981 -39594106 - RMER13B LTR ERVK -521 387 1 2 1669 950 285 122 46 chr2 142156991 142157384 -39590703 + MLT1D LTR MaLR 7 429 -76 2 1669 236 287 69 10 chr2 142165909 142166011 -39582076 - LTR16B1 LTR ERVL -75 405 298 2 1669 233 262 191 0 chr2 142166074 142166158 -39581929 - LTR16B1 LTR ERVL -281 181 82 2 1669 1467 199 83 69 chr2 142169588 142170024 -39578063 - RMER10A LTR ERVL 0 442 1 2 1669 907 267 123 17 chr2 142171456 142171749 -39576338 + ORR1D2 LTR MaLR 1 324 -46 2 1669 401 224 0 45 chr2 142171745 142171834 -39576253 - MTEa LTR MaLR -74 305 221 2 1669 931 274 109 47 chr2 142174391 142174875 -39573212 - MT2B LTR ERVL 0 601 44 2 1669 2174 165 30 0 chr2 142174875 142175244 -39572843 - RLTR14 LTR ERV1 -2 380 1 2 1669 546 347 76 66 chr2 142175244 142175287 -39572800 - MT2B LTR ERVL -490 43 1 2 1669 1013 216 175 74 chr2 142178274 142178599 -39569488 + MTD LTR MaLR 54 411 -8 2 1669 1945 114 69 0 chr2 142201987 142202293 -39545794 - ORR1A4 LTR MaLR -2 327 1 2 1669 408 335 77 22 chr2 142212393 142212576 -39535511 - ORR1E LTR MaLR -166 193 1 2 1670 597 271 308 49 chr2 142213283 142213580 -39534507 + MTEa LTR MaLR 6 379 0 2 1670 3484 142 134 60 chr2 142219062 142219814 -39528273 + RLTR13C2 LTR ERVK 1 808 0 2 1670 292 316 32 49 chr2 142221932 142222055 -39526032 + MLT1K LTR MaLR 130 250 -345 3 1670 259 282 128 68 chr2 142231346 142231479 -39516608 + MLT1G3 LTR MaLR 11 151 -444 3 1670 322 304 88 0 chr2 142233484 142233609 -39514478 - LTR16E1 LTR ERVL -12 526 391 3 1670 1444 176 56 35 chr2 142237373 142237661 -39510426 - RMER19B LTR ERVK -252 650 357 3 1670 1596 165 148 30 chr2 142241705 142241868 -39506219 + ORR1C1 LTR MaLR 1 162 -216 3 1670 1596 165 148 30 chr2 142241895 142242069 -39506018 + ORR1C1 LTR MaLR 163 378 0 3 1670 4687 199 121 98 chr2 142242069 142243543 -39504544 + ORR1C1-int LTR MaLR 1 1507 -2 3 1670 1561 183 118 3 chr2 142243545 142243884 -39504203 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 3 1670 728 338 96 18 chr2 142244852 142245195 -39502892 + MLT1A LTR MaLR 1 370 -4 3 1670 1244 246 94 12 chr2 142246581 142246923 -39501164 - ORR1D1 LTR MaLR -2 372 3 3 1670 328 242 67 48 chr2 142249382 142249486 -39498601 - MLT1B LTR MaLR -2 388 283 3 1670 2171 168 75 5 chr2 142257669 142258082 -39490005 - RMER10A LTR ERVL 0 442 1 3 1670 1265 199 180 52 chr2 142262522 142262866 -39485221 - MTD LTR MaLR -14 405 18 3 1670 249 339 102 76 chr2 142265126 142265468 -39482619 + MLT1K LTR MaLR 242 592 -3 3 1670 566 328 135 18 chr2 142265888 142266154 -39481933 + MLT1F LTR MaLR 1 309 -251 3 1670 232 351 177 23 chr2 142273690 142273865 -39474222 + MLT1H LTR MaLR 332 533 -16 3 1670 511 301 72 10 chr2 142275294 142275489 -39472598 - MLT1D LTR MaLR -48 457 251 3 1670 267 260 123 131 chr2 142275520 142275871 -39472216 - ORR1E LTR MaLR -4 370 24 3 1670 282 254 15 15 chr2 142275901 142275969 -39472118 - MLT1D LTR MaLR -437 68 1 3 1670 551 326 29 6 chr2 142276668 142276841 -39471246 + ORR1E LTR MaLR 1 177 -182 3 1670 2854 132 123 66 chr2 142276963 142277581 -39470506 - RMER6A LTR ERVK -103 653 1 3 1670 306 286 71 89 chr2 142278239 142278408 -39469679 - MT2B LTR ERVL -269 332 167 3 1670 975 245 118 7 chr2 142281715 142281986 -39466101 + ORR1D1 LTR MaLR 74 374 0 4 1670 349 362 121 39 chr2 142287017 142287477 -39460610 - MLT1H LTR MaLR -6 543 1 4 1670 2448 170 5 12 chr2 142287569 142287985 -39460102 + MTC LTR MaLR 1 413 -8 4 1670 240 303 11 63 chr2 142288491 142288586 -39459501 + MTE2a LTR MaLR 290 379 0 4 1670 4358 14 2 12 chr2 142289988 142290486 -39457601 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 4 1670 38651 17 14 0 chr2 142290486 142295773 -39452314 + MERVL-int LTR ERVL 1 5360 -125 4 1670 372 167 46 35 chr2 142295773 142295860 -39452227 + ORR1A3-int LTR MaLR 553 640 -1323 4 1670 302 0 0 0 chr2 142295860 142295898 -39452189 + MERVL-int LTR ERVL 5448 5485 0 4 1670 4358 14 2 12 chr2 142295898 142296396 -39451691 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 4 1670 1006 209 34 59 chr2 142302075 142302314 -39445773 - RMER12 LTR ERVK -96 1226 994 4 1670 824 111 18 223 chr2 142302393 142302613 -39445474 - RMER12 LTR ERVK -434 888 714 4 1670 4372 12 2 12 chr2 142302614 142303112 -39444975 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 4 1670 302 0 0 0 chr2 142303112 142303150 -39444937 - MERVL-int LTR ERVL 0 5485 5448 4 1670 373 179 46 35 chr2 142303150 142303237 -39444850 - ORR1A3-int LTR MaLR -1323 640 553 4 1670 45033 17 6 0 chr2 142303237 142308563 -39439524 - MERVL-int LTR ERVL -125 5360 1 4 1670 4372 12 2 12 chr2 142308563 142309061 -39439026 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 4 1670 1327 99 65 5 chr2 142309065 142309279 -39438808 - RMER12 LTR ERVK -605 717 491 4 1670 3060 125 12 40 chr2 142309500 142310018 -39438069 - RMER12 LTR ERVK -819 503 1 4 1670 3044 178 68 32 chr2 142311782 142312575 -39435512 + RMER6C LTR ERVK 1 702 -18 4 1670 383 296 146 12 chr2 142313684 142313855 -39434232 - MT2A LTR ERVL 0 533 340 4 1670 837 297 108 69 chr2 142313862 142314270 -39433817 - MT2A LTR ERVL -109 424 1 4 1670 705 287 62 40 chr2 142314979 142315251 -39432836 - MTEb-int LTR MaLR -1277 303 26 4 1670 377 330 115 72 chr2 142315253 142315531 -39432556 - MTEb LTR MaLR -8 371 73 4 1670 271 276 50 20 chr2 142315795 142315895 -39432192 - MTEb LTR MaLR -256 103 1 4 1670 1183 314 26 37 chr2 142318633 142319016 -39429071 - MTEa LTR MaLR 0 379 1 4 1670 1497 197 177 110 chr2 142320290 142320549 -39427538 + RMER6D LTR ERVK 1 346 -374 4 1670 1497 197 177 110 chr2 142320592 142321006 -39427081 + RMER6D LTR ERVK 347 719 -1 4 1670 1817 228 55 0 chr2 142321068 142321450 -39426637 + MTD LTR MaLR 3 405 -14 4 1670 2108 169 35 11 chr2 142322655 142322890 -39425197 - ORR1B1 LTR MaLR -1 393 159 4 1670 2108 178 41 53 chr2 142322944 142323137 -39424950 - ORR1B1 LTR MaLR -236 158 16 4 1670 383 236 87 31 chr2 142325759 142325886 -39422201 + MTEa LTR MaLR 243 376 -3 4 1670 396 301 117 66 chr2 142327954 142328150 -39419937 + MLT1H2 LTR MaLR 284 489 0 4 1670 293 380 53 57 chr2 142332393 142332692 -39415395 + MLT1H LTR MaLR 202 499 -50 4 1670 1685 78 89 41 chr2 142337393 142337410 -39410677 - ORR1A2 LTR MaLR -44 283 273 4 1670 1685 78 89 41 chr2 142337924 142338175 -39409912 - ORR1A2 LTR MaLR -55 272 2 4 1670 1988 112 26 3 chr2 142342417 142342723 -39405364 + ORR1A4 LTR MaLR 1 313 -16 4 1671 428 314 58 14 chr2 142346541 142346680 -39401407 - MLT1H2 LTR MaLR -338 151 7 4 1671 2385 77 189 19 chr2 142346966 142347326 -39400761 + BGLII LTR ERVK 1 421 0 4 1671 1387 204 74 121 chr2 142350135 142350525 -39397562 - ORR1D1 LTR MaLR -2 372 1 4 1671 281 283 40 20 chr2 142353052 142353153 -39394934 - MLT1H LTR MaLR -15 534 432 4 1671 781 214 144 119 chr2 142353533 142353893 -39394194 + MTEa LTR MaLR 1 369 -10 4 1671 1151 188 31 3 chr2 142354973 142355216 -39392871 + RLTR20B3 LTR ERVK 1 241 -322 4 1671 1065 167 73 35 chr2 142357665 142358158 -39389929 + RMER17C LTR ERVK 2 409 -1 5 1671 3524 41 5 0 chr2 142362479 142362873 -39385214 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 1671 2252 161 59 20 chr2 142363457 142363862 -39384225 + MTC LTR MaLR 1 421 0 5 1671 704 262 164 45 chr2 142367361 142367696 -39380391 - MTEa LTR MaLR 0 379 5 5 1671 2995 44 9 0 chr2 142368308 142368651 -39379436 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 5 1671 659 259 71 59 chr2 142368920 142369257 -39378830 - RLTR15 LTR ERVK -18 341 1 5 1671 247 343 16 93 chr2 142372127 142372310 -39375777 - MLT1E2 LTR MaLR -11 494 326 5 1671 456 321 192 23 chr2 142372293 142372637 -39375450 - MLT1E2 LTR MaLR -187 440 39 5 1671 1099 223 108 0 chr2 142373850 142374110 -39373977 - MTE2a LTR MaLR -54 325 38 5 1671 343 324 105 41 chr2 142375575 142375794 -39372293 + MLT1E LTR MaLR 415 647 -6 5 1671 268 303 120 49 chr2 142381949 142382215 -39365872 - MLT1H2 LTR MaLR -4 485 228 5 1671 225 364 50 10 chr2 142384074 142384174 -39363913 + LTR16A LTR ERVL 38 141 -310 5 1671 457 263 15 59 chr2 142387506 142387682 -39360405 - MTEa LTR MaLR 0 379 202 5 1671 1232 230 85 22 chr2 142387682 142387998 -39360089 - MTD LTR MaLR 0 419 84 5 1671 346 247 0 11 chr2 142388358 142388452 -39359635 - MTD LTR MaLR -326 93 1 5 1671 455 206 19 0 chr2 142391134 142391241 -39356846 + RLTR42-int LTR ERVK 1107 1215 -4307 5 1671 358 174 41 13 chr2 142391424 142391511 -39356576 + RLTR42-int LTR ERVK 899 977 -5160 5 1671 1372 218 4 4 chr2 142391527 142391799 -39356288 + RLTR14 LTR ERV1 47 318 -64 5 1671 404 246 8 34 chr2 142392021 142392139 -39355948 + RLTR42-int LTR ERVK 1870 1984 -3538 5 1671 672 277 108 124 chr2 142392136 142393033 -39355054 + RLTR19-int LTR ERVK 7170 7499 -1460 5 1671 734 192 27 80 chr2 142393104 142393291 -39354796 + RLTR19-int LTR ERVK 3511 3687 -2450 5 1671 1280 230 149 87 chr2 142393391 142394033 -39354054 + RLTR19-int LTR ERVK 3700 4381 -1756 5 1671 3174 141 7 51 chr2 142394236 142394789 -39353298 + RLTR24 LTR ERV1 1 529 0 5 1671 772 226 86 5 chr2 142401036 142401245 -39346842 - RLTR18 LTR ERVK -9 607 382 5 1671 791 239 136 76 chr2 142407513 142407843 -39340244 + ORR1E LTR MaLR 7 356 -3 5 1671 681 281 69 69 chr2 142408790 142409080 -39339007 - LTR80B LTR ERVL -292 292 3 5 1671 695 278 189 40 chr2 142409201 142409523 -39338564 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 5 1671 751 287 59 12 chr2 142409668 142409968 -39338119 + LTR48 LTR ERV1 432 751 -36 5 1671 468 298 33 55 chr2 142416364 142416545 -39331542 - MLT1F2 LTR MaLR -6 554 378 5 1671 355 250 24 0 chr2 142417524 142417608 -39330479 + ORR1E LTR MaLR 1 86 -273 5 1671 316 308 70 52 chr2 142417643 142417882 -39330205 + ORR1E LTR MaLR 79 314 -60 5 1671 1386 251 66 10 chr2 142417882 142418276 -39329811 - MTD LTR MaLR -3 416 1 5 1671 288 360 48 58 chr2 142418276 142418331 -39329756 + ORR1E LTR MaLR 315 370 -4 5 1671 637 300 42 21 chr2 142418317 142418555 -39329532 - MLT1F2 LTR MaLR -306 254 12 5 1671 1562 170 48 94 chr2 142418827 142419198 -39328889 + ORR1B1 LTR MaLR 41 394 0 5 1671 247 218 18 0 chr2 142419803 142419858 -39328229 + MLT1H1 LTR MaLR 1 56 -499 5 1671 458 301 63 11 chr2 142426219 142426394 -39321693 - ORR1E LTR MaLR -2 357 174 6 1671 1341 156 310 7 chr2 142426415 142426705 -39321382 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 6 1671 632 299 76 17 chr2 142427487 142427725 -39320362 + MER34 LTR ERV1 12 263 -279 6 1671 242 217 107 12 chr2 142427778 142427862 -39320225 + MER34 LTR ERV1 375 466 -76 6 1671 300 235 35 0 chr2 142429374 142429459 -39318628 + MTEb LTR MaLR 278 365 -14 6 1671 439 272 58 123 chr2 142436879 142437172 -39310915 + LTR50 LTR ERVL 2 275 -520 6 1671 308 294 55 24 chr2 142437387 142437551 -39310536 - RMER15 LTR ERVL -2 573 405 6 1671 335 324 43 27 chr2 142437858 142438045 -39310042 + LTR50 LTR ERVL 502 691 -104 6 1671 1656 131 48 118 chr2 142438518 142438890 -39309197 + ORR1B1 LTR MaLR 41 386 -8 6 1671 1565 174 58 97 chr2 142441262 142441727 -39306360 + RLTR31A_Mm LTR ERVK 1 447 -137 6 1671 614 152 68 8 chr2 142449864 142449997 -39298090 - MTD LTR MaLR 0 419 279 6 1671 236 241 0 0 chr2 142450288 142450346 -39297741 + RMER15 LTR ERVL 410 467 -108 6 1671 2611 131 109 27 chr2 142455831 142456318 -39291769 + RLTR24 LTR ERV1 1 527 -2 6 1671 623 154 30 61 chr2 142456607 142456738 -39291349 + MT2A LTR ERVL 60 186 -347 6 1671 402 364 98 13 chr2 142466640 142466946 -39281141 - LTR16A LTR ERVL -68 383 52 6 1671 621 232 10 91 chr2 142468398 142468597 -39279490 + MER90a LTR ERV1 74 256 -358 6 1671 913 223 170 21 chr2 142470297 142470352 -39277735 - MTE2a LTR MaLR 0 379 326 6 1671 913 223 170 21 chr2 142470376 142470650 -39277437 - MTE2a LTR MaLR -54 325 1 6 1672 1118 247 196 11 chr2 142478302 142478654 -39269433 + MTD LTR MaLR 1 417 -2 6 1672 3693 145 72 17 chr2 142480547 142481293 -39266794 + RMER17D2 LTR ERVK 1 787 -22 6 1672 320 111 224 82 chr2 142481296 142481394 -39266693 + RMER17D2 LTR ERVK 563 674 -135 6 1672 1763 104 33 7 chr2 142481390 142481689 -39266398 + RMER17D2 LTR ERVK 503 809 0 6 1672 3477 28 5 0 chr2 142488615 142489008 -39259079 + MTA_Mm LTR MaLR 1 395 -1 6 1672 620 293 124 23 chr2 142491525 142491832 -39256255 - MLT1A0 LTR MaLR -18 347 10 7 1672 319 312 126 24 chr2 142493541 142493787 -39254300 - LTR87 LTR ERVL? -79 545 275 7 1672 2262 168 17 17 chr2 142522790 142523196 -39224891 + MTB_Mm LTR MaLR 2 407 0 2 1672 1187 221 53 123 chr2 142552078 142552297 -39195790 - ORR1C1 LTR MaLR -9 369 167 4 1672 1187 221 53 123 chr2 142552363 142552540 -39195547 - ORR1C1 LTR MaLR -212 166 1 4 1672 1770 168 115 22 chr2 142569372 142569738 -39178349 + RMER10A LTR ERVL 15 414 -28 6 1672 359 250 33 67 chr2 142570433 142570471 -39177616 - ORR1B2 LTR MaLR -205 179 144 6 1672 481 142 203 20 chr2 142570513 142570617 -39177470 - ORR1B2 LTR MaLR -241 143 1 6 1672 3794 31 28 9 chr2 142572602 142573030 -39175057 + RLTR10C LTR ERVK 1 436 0 6 1672 3193 150 48 34 chr2 142578978 142579647 -39168440 + RMER6A LTR ERVK 1 678 -78 7 1672 328 327 35 29 chr2 142583195 142583368 -39164719 + LTR86B1 LTR ERVL 293 466 -27 8 1672 1413 227 109 12 chr2 142585153 142585483 -39162604 + ORR1D2 LTR MaLR 4 365 -5 8 1672 1654 238 27 14 chr2 142588998 142589364 -39158723 + MTEb LTR MaLR 6 376 -3 8 1672 406 311 152 59 chr2 142596099 142596335 -39151752 - MLT1E LTR MaLR -81 572 315 9 1672 687 205 133 44 chr2 142604456 142604614 -39143473 - ORR1C2 LTR MaLR -10 374 193 1 1672 1101 200 21 71 chr2 142605195 142605461 -39142626 - ORR1C2 LTR MaLR -175 192 1 1 1673 1218 278 20 23 chr2 142612116 142612458 -39135629 - MTE2b LTR MaLR -11 368 28 1 1673 1801 162 80 169 chr2 142613334 142613824 -39134263 + RLTR41 LTR ERV1 1 446 0 1 1673 4453 12 2 12 chr2 142614885 142615383 -39132704 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 1 1673 48421 15 6 0 chr2 142615383 142620709 -39127378 + MERVL-int LTR ERVL 1 5360 -125 1 1673 362 167 46 35 chr2 142620709 142620796 -39127291 + ORR1A3-int LTR MaLR 553 640 -1323 1 1673 321 0 0 0 chr2 142620796 142620834 -39127253 + MERVL-int LTR ERVL 5448 5485 0 1 1673 4453 12 2 12 chr2 142620834 142621332 -39126755 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 1 1673 1216 194 45 30 chr2 142627453 142627527 -39120560 + ORR1C1 LTR MaLR 107 179 -199 1 1673 1216 194 45 30 chr2 142627706 142627897 -39120190 + ORR1C1 LTR MaLR 180 376 -2 1 1673 1126 260 82 47 chr2 142632796 142633199 -39114888 + MTD LTR MaLR 3 419 0 1 1673 365 266 113 87 chr2 142654772 142655072 -39093015 - LTR33A_ LTR ERVL -1 530 223 1 1673 247 324 98 22 chr2 142655151 142655334 -39092753 + MLT1B LTR MaLR 194 390 0 1 1673 3827 216 92 75 chr2 142664025 142665324 -39082763 - RMER12 LTR ERVK 0 1322 1 1 1673 331 224 143 0 chr2 142665599 142665697 -39082390 + LTR87 LTR ERVL? 17 128 -496 1 1673 508 331 48 27 chr2 142665779 142666074 -39082013 + LTR87 LTR ERVL? 245 545 -79 1 1673 992 276 76 53 chr2 142677885 142678226 -39069861 - MTEa LTR MaLR -30 349 1 1 1673 2769 119 14 19 chr2 142680836 142681255 -39066832 + MTC LTR MaLR 5 421 0 2 1673 284 319 54 64 chr2 142693435 142693639 -39054448 + MLT1F2 LTR MaLR 68 269 -291 2 1673 242 305 31 10 chr2 142711340 142711436 -39036651 + MLT1J1 LTR MaLR 72 169 -275 2 1673 2014 186 91 3 chr2 142717304 142717687 -39030400 - MTC LTR MaLR 0 421 5 2 1673 278 288 88 26 chr2 142718256 142718370 -39029717 - ORR1E LTR MaLR 0 379 259 2 1673 518 208 15 44 chr2 142718407 142718508 -39029579 - ORR1E LTR MaLR -227 132 36 2 1673 518 208 15 44 chr2 142718699 142718733 -39029354 - ORR1E LTR MaLR -324 35 1 2 1673 1131 205 123 10 chr2 142719499 142719799 -39028288 - MTD LTR MaLR 0 419 86 2 1673 3195 67 23 5 chr2 142722040 142722433 -39025654 - MTB LTR MaLR 0 400 1 2 1673 394 264 9 35 chr2 142722874 142722988 -39025099 + MLT1C LTR MaLR 353 463 -4 2 1673 627 194 113 0 chr2 142731056 142731180 -39016907 + MTD LTR MaLR 68 205 -214 2 1673 333 191 211 11 chr2 142731599 142731689 -39016398 + MTD LTR MaLR 299 406 -13 2 1673 449 376 68 63 chr2 142732776 142733202 -39014885 + MLT1H LTR MaLR 18 445 -104 2 1674 3055 88 19 109 chr2 142738430 142738952 -39009135 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 3 1674 3094 80 26 3 chr2 142738952 142739342 -39008745 + MTB LTR MaLR 2 400 0 3 1674 488 205 0 104 chr2 142739432 142739557 -39008530 + MT2B LTR ERVL 153 264 -337 3 1674 372 310 84 0 chr2 142742497 142742639 -39005448 + MLT1B LTR MaLR 84 237 -153 3 1674 355 331 58 0 chr2 142742723 142742862 -39005225 + MLT1B LTR MaLR 244 390 0 3 1674 255 347 40 46 chr2 142748223 142748398 -38999689 + RLTR42-int LTR ERVK 1148 1321 -4201 3 1674 2005 157 130 26 chr2 142748932 142749381 -38998706 - RMER16 LTR ERVK 0 533 1 3 1674 249 296 24 36 chr2 142751651 142751735 -38996352 + ORR1E LTR MaLR 66 148 -211 3 1674 262 219 15 143 chr2 142751722 142751738 -38996349 + ORR1E LTR MaLR 292 303 -104 3 1674 446 203 1 80 chr2 142751816 142751931 -38996156 + ORR1E LTR MaLR 259 406 -1 3 1674 858 207 205 42 chr2 142756808 142757030 -38991057 + ORR1A4 LTR MaLR 1 269 -60 3 1674 858 207 205 42 chr2 142757204 142757264 -38990823 + ORR1A4 LTR MaLR 270 329 0 3 1674 1092 265 86 38 chr2 142760566 142760962 -38987125 + MTD LTR MaLR 5 419 0 3 1674 329 270 28 57 chr2 142762435 142762541 -38985546 - MTC LTR MaLR 0 421 319 3 1674 681 333 77 40 chr2 142766149 142766524 -38981563 - MLT2B3 LTR ERVL -161 393 5 3 1674 225 183 46 77 chr2 142776785 142776850 -38971237 - RMER20A LTR ERVK -268 248 186 3 1674 1553 176 126 104 chr2 142780377 142780632 -38967455 - MTC LTR MaLR 0 421 122 3 1674 1553 176 126 104 chr2 142781103 142781259 -38966828 - MTC LTR MaLR -300 121 2 3 1674 1125 353 43 7 chr2 142782178 142782600 -38965487 - LTR16B1 LTR ERVL -2 478 42 3 1674 380 345 86 70 chr2 142783242 142783485 -38964602 - LTR16A1 LTR ERVL -121 335 89 3 1674 463 360 9 37 chr2 142784191 142784407 -38963680 - MLT1J LTR MaLR -6 506 297 3 1674 3592 35 2 0 chr2 142786544 142786939 -38961148 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 1674 355 317 218 41 chr2 142787939 142788255 -38959832 - MTEa LTR MaLR -2 377 6 3 1674 356 355 113 24 chr2 142789509 142789757 -38958330 - LTR16A1 LTR ERVL -84 372 103 3 1674 749 294 119 84 chr2 142790598 142790992 -38957095 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 1 4 1674 305 328 121 30 chr2 142791281 142791479 -38956608 + LTR50 LTR ERVL 459 674 -121 4 1674 593 344 96 19 chr2 142793707 142794083 -38954004 + MLT1C LTR MaLR 53 457 -10 4 1674 2287 142 50 0 chr2 142794310 142794670 -38953417 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 17 4 1674 280 207 0 128 chr2 142796298 142796392 -38951695 + MTEa LTR MaLR 1 82 -297 4 1674 266 325 95 38 chr2 142796472 142796683 -38951404 + MTEa LTR MaLR 67 289 -70 4 1674 1962 213 15 20 chr2 142797242 142797649 -38950438 + MTD LTR MaLR 7 411 -8 4 1674 386 332 117 60 chr2 142797702 142798006 -38950081 + LTR16B2 LTR ERVL 147 433 -29 4 1674 1509 256 64 45 chr2 142800306 142800866 -38947221 - MER34A LTR ERV1 0 571 1 4 1674 235 282 212 13 chr2 142803355 142803506 -38944581 + MLT1K LTR MaLR 375 555 -40 4 1674 835 267 46 104 chr2 142804419 142804820 -38943267 - MLT2D LTR ERVL -18 538 15 4 1674 245 239 127 0 chr2 142807988 142808059 -38940028 + MLT1H2 LTR MaLR 393 472 -17 4 1674 346 296 104 10 chr2 142815936 142816157 -38931930 - MER34 LTR ERV1 0 587 342 4 1674 278 348 80 15 chr2 142822027 142822164 -38925923 + MLT1G3 LTR MaLR 1 146 -409 4 1674 319 279 32 98 chr2 142822185 142822308 -38925779 + MLT1G3 LTR MaLR 235 349 -246 4 1674 272 321 70 18 chr2 142822417 142822531 -38925556 + MER74A LTR ERVL 401 520 -38 4 1674 488 203 50 101 chr2 142824481 142824640 -38923447 + RLTR20A2 LTR ERVK 51 201 -333 4 1674 582 275 5 100 chr2 142824645 142824737 -38923350 + RLTR20A2 LTR ERVK 392 476 -102 4 1674 582 275 5 100 chr2 142824803 142824898 -38923189 + RLTR20A2 LTR ERVK 477 563 -15 4 1674 547 213 84 14 chr2 142826079 142826222 -38921865 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 218 4 1674 684 312 71 46 chr2 142827431 142827653 -38920434 + MLT2B1 LTR ERVL 232 452 -68 4 1674 684 312 71 46 chr2 142827762 142827819 -38920268 + MLT2B1 LTR ERVL 453 520 0 4 1674 797 317 62 41 chr2 142831652 142831850 -38916237 - MTEa LTR MaLR -1 378 172 4 1674 797 317 62 41 chr2 142831881 142832050 -38916037 - MTEa LTR MaLR -208 171 3 4 1674 259 297 79 26 chr2 142832281 142832395 -38915692 - LTR16C LTR ERVL -10 479 360 4 1674 299 196 28 79 chr2 142832514 142832691 -38915396 + RMER17D LTR ERVK 230 397 -492 4 1674 375 411 72 36 chr2 142835177 142835538 -38912549 - MLT1I LTR MaLR -37 374 1 4 1674 297 331 39 8 chr2 142839254 142839382 -38908705 - MLT1A1 LTR MaLR -256 152 21 4 1674 463 309 66 12 chr2 142843165 142843332 -38904755 + MLT1B LTR MaLR 215 390 0 4 1674 1726 173 138 9 chr2 142848742 142849091 -38898996 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 5 1674 940 255 275 49 chr2 142849102 142849488 -38898599 + RLTR33 LTR ERVK 176 648 -30 5 1674 295 330 80 139 chr2 142850962 142851030 -38897057 + ORR1E LTR MaLR 1 63 -296 5 1674 295 330 80 139 chr2 142851215 142851470 -38896617 + ORR1E LTR MaLR 64 305 -54 5 1674 239 239 0 0 chr2 142851908 142851954 -38896133 + MT2A LTR ERVL 1 46 -487 5 1674 1497 162 162 0 chr2 142851962 142852240 -38895847 + ORR1B1 LTR MaLR 9 331 -63 5 1674 319 281 183 103 chr2 142852420 142852682 -38895405 - MLT1A1 LTR MaLR -37 371 89 5 1674 261 282 34 34 chr2 142852758 142852846 -38895241 - MLT1A1 LTR MaLR -271 103 16 5 1674 421 179 21 21 chr2 142856412 142856509 -38891578 - RLTR15 LTR ERVK -259 100 4 5 1674 1018 271 53 81 chr2 142858998 142859391 -38888696 + MLT1B LTR MaLR 1 382 -8 5 1674 477 250 97 41 chr2 142863458 142863499 -38884588 - MT2A LTR ERVL -1 532 494 5 1674 477 250 97 41 chr2 142863537 142863691 -38884396 - MT2A LTR ERVL -40 493 326 5 1674 285 311 0 43 chr2 142863795 142863889 -38884198 - MTEa LTR MaLR -280 99 10 5 1674 259 278 170 30 chr2 142864137 142864237 -38883850 + MLT1J LTR MaLR 240 353 -159 5 1674 406 329 105 60 chr2 142865465 142865779 -38882308 + MLT1G LTR MaLR 72 399 -192 5 1674 1248 278 42 91 chr2 142866079 142866268 -38881819 + MTD LTR MaLR 10 198 -221 5 1674 1248 278 42 91 chr2 142866362 142866602 -38881485 + MTD LTR MaLR 199 418 -1 5 1675 709 305 130 39 chr2 142875648 142875986 -38872101 + MLT1C LTR MaLR 67 435 -32 5 1675 2198 154 28 18 chr2 142879330 142879720 -38868367 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 5 1675 330 388 99 63 chr2 142879876 142880239 -38867848 + MLT1G3 LTR MaLR 63 438 -157 5 1675 429 291 23 97 chr2 142881935 142882069 -38866018 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 283 5 1675 429 291 23 97 chr2 142882171 142882211 -38865876 - MLT1A1 LTR MaLR -126 282 247 5 1675 238 337 129 0 chr2 142883036 142883137 -38864950 + MLT1A1 LTR MaLR 1 114 -294 5 1675 971 203 27 49 chr2 142883165 142883388 -38864699 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 157 5 1675 800 282 25 37 chr2 142883451 142883775 -38864312 - RLTR15 LTR ERVK -39 320 1 5 1675 673 265 0 0 chr2 142883783 142883930 -38864157 - ORR1D1 LTR MaLR -227 147 1 5 1675 523 202 36 42 chr2 142884502 142884667 -38863420 + RLTR43A LTR ERVK 201 364 0 5 1675 624 200 126 48 chr2 142886429 142886458 -38861629 - RMER6A LTR ERVK -226 530 503 5 1675 624 200 126 48 chr2 142886553 142886754 -38861333 - RMER6A LTR ERVK -254 502 283 5 1675 1937 176 43 17 chr2 142886775 142887197 -38860890 - RMER6A LTR ERVK -323 433 1 5 1675 242 244 8 82 chr2 142887284 142887308 -38860779 + ORR1B1-int LTR MaLR 631 644 -865 5 1675 664 185 74 0 chr2 142902618 142902753 -38845334 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 223 5 1675 618 157 0 112 chr2 142914333 142914488 -38833599 + ORR1B1 LTR MaLR 1 122 -272 5 1675 1338 159 65 18 chr2 142915698 142915974 -38832113 - RLTR13C1 LTR ERVK 0 983 695 6 1675 2700 111 7 18 chr2 142915968 142916409 -38831678 + RLTR13C1 LTR ERVK 283 718 -265 6 1675 1888 171 107 5 chr2 142917963 142918249 -38829838 + RMER4B LTR ERVK 18 319 -266 6 1675 1888 133 73 7 chr2 142918315 142918509 -38829578 + RMER4B LTR ERVK 320 576 -9 6 1675 420 294 63 94 chr2 142918717 142918972 -38829115 - LTR16A1 LTR ERVL 0 456 210 6 1675 370 337 81 60 chr2 142922332 142922616 -38825471 + LTR16C LTR ERVL 196 485 -4 6 1675 1265 214 91 12 chr2 142924492 142924832 -38823255 - ORR1D1 LTR MaLR -5 369 3 6 1675 252 268 57 23 chr2 142924916 142925004 -38823083 + MTEa LTR MaLR 272 362 -17 6 1675 2644 278 146 30 chr2 142925121 142926260 -38821827 + ORR1E-int LTR MaLR 25 1295 -285 6 1675 747 314 38 23 chr2 142926287 142926551 -38821536 - MTE-int LTR MaLR -1100 480 213 6 1675 443 307 66 62 chr2 142926558 142926801 -38821286 + ORR1E-int LTR MaLR 1308 1551 -29 6 1675 468 291 65 69 chr2 142926792 142927138 -38820949 + ORR1E LTR MaLR 16 379 0 6 1675 234 308 25 25 chr2 142929318 142929398 -38818689 + LTR16C LTR ERVL 386 465 -24 6 1675 1756 188 30 50 chr2 142929570 142929967 -38818120 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 6 6 1675 3417 80 2 4 chr2 142931410 142931898 -38816189 - RLTR1C LTR ERV1 -16 487 1 6 1675 412 172 140 10 chr2 142932598 142932698 -38815389 + MTE2b LTR MaLR 1 113 -266 6 1675 2365 154 40 8 chr2 142933291 142933671 -38814416 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 3 6 1675 4245 142 61 25 chr2 142935603 142936388 -38811699 + RMER13A LTR ERVK 17 829 -31 6 1675 396 281 16 162 chr2 142936746 142936937 -38811150 - MTEa LTR MaLR -208 171 9 6 1675 2093 185 36 19 chr2 142941830 142942243 -38805844 + MTC LTR MaLR 2 421 0 6 1675 2389 111 17 57 chr2 142943490 142943910 -38804177 + RLTR9E LTR ERVK 7 409 0 6 1675 237 272 66 99 chr2 142947218 142947369 -38800718 - ORR1D1 LTR MaLR -13 361 216 6 1675 1542 150 218 13 chr2 142947371 142947669 -38800418 + ORR1B2 LTR MaLR 1 359 -8 6 1675 225 250 11 56 chr2 142947751 142947840 -38800247 - MLT1A0 LTR MaLR -260 105 21 6 1675 1212 267 76 30 chr2 142952503 142952675 -38795412 + RMER5 LTR ERV1 50 224 -310 6 1675 2130 136 81 3 chr2 142952675 142953008 -38795079 + RLTR15 LTR ERVK 1 359 0 6 1675 1212 267 76 30 chr2 142953008 142953295 -38794792 + RMER5 LTR ERV1 225 529 -5 6 1675 891 310 97 9 chr2 142961077 142961414 -38786673 + MLT1A0 LTR MaLR 6 372 -2 6 1675 490 357 106 46 chr2 142964321 142964688 -38783399 - MLT1H1 LTR MaLR -8 547 159 6 1675 233 267 16 87 chr2 142972019 142972146 -38775941 + LTR16E1 LTR ERVL 341 458 -80 6 1675 2044 216 39 12 chr2 142972502 142972910 -38775177 + MTD LTR MaLR 1 419 0 6 1675 466 355 40 32 chr2 142991944 142992319 -38755768 + HERV16-int LTR ERVL 1 378 -4618 7 1675 626 309 59 28 chr2 142993665 142993951 -38754136 - RMER5 LTR ERV1 -17 517 223 7 1675 541 280 70 25 chr2 142993965 142994207 -38753880 - RMER5 LTR ERV1 -275 259 7 7 1675 297 302 179 39 chr2 142994669 142994794 -38753293 + ERVL-E-int LTR ERVL 4744 4897 -770 7 1675 297 302 179 39 chr2 142994830 142994883 -38753204 + ERVL-E-int LTR ERVL 4898 4947 -720 7 1675 253 321 114 21 chr2 142996043 142996183 -38751904 + LTR16A LTR ERVL 121 273 -178 7 1675 579 300 46 37 chr2 142996314 142996532 -38751555 + MLT1F2 LTR MaLR 72 291 -269 7 1675 409 313 101 10 chr2 142996547 142996724 -38751363 + MLT1F2 LTR MaLR 404 653 0 7 1675 2344 163 31 36 chr2 142997386 142997806 -38750281 - MTC LTR MaLR -3 418 1 7 1675 3762 186 95 15 chr2 142997806 142998045 -38750042 - MTC-int LTR MaLR 0 1258 996 7 1675 3762 186 95 15 chr2 142998071 142998622 -38749465 - MTC-int LTR MaLR -263 995 406 7 1676 1679 198 20 34 chr2 142999585 142999940 -38748147 - MTC-int LTR MaLR -815 443 94 7 1676 838 209 5 65 chr2 143000233 143000417 -38747670 - MTC LTR MaLR -26 395 223 2 1676 975 216 51 5 chr2 143000706 143000901 -38747186 - MTC LTR MaLR -187 234 31 2 1676 525 163 69 30 chr2 143001084 143001169 -38746918 - MTC LTR MaLR -332 89 1 7 1676 345 309 191 56 chr2 143003086 143003401 -38744686 - MLT2B5 LTR ERVL -7 548 191 9 1676 1742 205 157 17 chr2 143003711 143004177 -38743910 - MT2A LTR ERVL -2 531 1 1 1676 1377 268 34 0 chr2 143004830 143005188 -38742899 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 1 1676 2043 219 14 12 chr2 143005220 143005640 -38742447 + MTC LTR MaLR 1 421 0 1 1676 227 191 0 0 chr2 143008692 143008734 -38739353 - MT2A LTR ERVL -490 43 2 1 1676 677 253 34 3 chr2 143010170 143010346 -38737741 - MTE2b LTR MaLR -192 227 18 2 1676 430 305 151 42 chr2 143010693 143010977 -38737110 - ORR1D2 LTR MaLR -22 348 34 2 1676 316 310 48 21 chr2 143011417 143011562 -38736525 + MER92B LTR ERV1 483 631 -5 2 1676 2105 235 18 12 chr2 143014063 143014559 -38733528 - RLTR11A2 LTR ERVK -28 499 1 3 1676 918 146 4 86 chr2 143015405 143015638 -38732449 + RMER17C LTR ERVK 1 214 -196 3 1676 240 299 32 75 chr2 143015858 143015952 -38732135 + MLT1M LTR MaLR 95 184 -488 3 1676 528 316 186 40 chr2 143022501 143022775 -38725312 + MER70B LTR ERVL 21 334 -244 4 1676 256 388 98 52 chr2 143024983 143025157 -38722930 + MLT1G3 LTR MaLR 216 397 -198 5 1676 249 247 52 146 chr2 143031763 143031976 -38716111 + RMER15 LTR ERVL 1 193 -382 6 1676 738 283 69 22 chr2 143031994 143032225 -38715862 + RMER15 LTR ERVL 297 538 -37 6 1676 227 318 35 0 chr2 143033351 143033436 -38714651 - LTR16C LTR ERVL -78 411 324 6 1676 461 209 11 0 chr2 143033444 143033535 -38714552 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 279 6 1676 1057 293 33 16 chr2 143038402 143038707 -38709380 + MTEa LTR MaLR 15 324 -55 7 1676 578 333 53 69 chr2 143040285 143040646 -38707441 + MLT1A0 LTR MaLR 1 355 -19 7 1676 1037 271 77 33 chr2 143044286 143044649 -38703438 + MLT1B LTR MaLR 1 379 -11 8 1676 867 315 131 24 chr2 143047492 143047911 -38700176 + MLT1A-int LTR MaLR 1268 1731 -4 8 1676 515 286 69 121 chr2 143047931 143048315 -38699772 + MLT1A LTR MaLR 26 372 -2 8 1676 639 206 75 125 chr2 143051956 143052267 -38695820 - RLTR25B LTR ERVK -5 1098 628 9 1676 1083 177 0 71 chr2 143052247 143052514 -38695573 - ORR1A3-int LTR MaLR -998 965 718 9 1676 1393 149 66 62 chr2 143052468 143052725 -38695362 - MT2B LTR ERVL -309 292 35 9 1676 2081 205 22 131 chr2 143052723 143053474 -38694613 - RLTR25B LTR ERVK -460 643 1 9 1676 1859 206 16 0 chr2 143055768 143056136 -38691951 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 9 1676 350 327 71 26 chr2 143062735 143062798 -38685289 + ORR1E LTR MaLR 11 75 -284 1 1676 350 327 71 26 chr2 143062886 143062976 -38685111 + ORR1E LTR MaLR 76 170 -189 1 1676 841 288 45 100 chr2 143063003 143063451 -38684636 + RLTR23 LTR ERV1 8 430 0 1 1676 295 188 19 200 chr2 143063460 143063629 -38684458 + ORR1E LTR MaLR 236 379 0 1 1676 1632 300 107 58 chr2 143064660 143065332 -38682755 - MER21B LTR ERV1 -9 854 150 1 1676 458 393 61 18 chr2 143066125 143066402 -38681685 + LTR16C LTR ERVL 18 306 -183 1 1676 3462 23 2 0 chr2 143067451 143067846 -38680241 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1676 355 333 35 7 chr2 143069205 143069350 -38678737 + MLT1H LTR MaLR 388 536 -13 1 1676 335 326 55 7 chr2 143072824 143072969 -38675118 + LTR16A1 LTR ERVL 241 392 -64 1 1676 887 251 10 10 chr2 143091053 143091262 -38656825 - MTE-int LTR MaLR -1123 457 249 1 1676 381 311 113 54 chr2 143095097 143095318 -38652769 + MLT1J LTR MaLR 71 304 -208 1 1676 489 252 131 6 chr2 143107642 143107802 -38640285 - MLT1B LTR MaLR -23 367 188 1 1676 4222 105 132 65 chr2 143110156 143110989 -38637098 + RMER17D LTR ERVK 1 889 0 1 1676 1988 204 160 2 chr2 143112821 143113186 -38634901 + RMER4B LTR ERVK 17 435 -150 1 1676 1988 204 160 2 chr2 143113240 143113356 -38634731 + RMER4B LTR ERVK 436 573 -12 1 1676 2561 230 89 27 chr2 143113367 143113569 -38634518 + MurERV4-int LTR ERVK 2 219 -5041 1 1676 2561 216 97 22 chr2 143113608 143114130 -38633957 + MurERV4-int LTR ERVK 220 793 -4467 1 1676 237 167 46 77 chr2 143115927 143115992 -38632095 + RMER20A LTR ERVK 186 248 -268 1 1676 4716 190 24 3 chr2 143120757 143121674 -38626413 + MurERV4-int LTR ERVK 792 1727 -3533 1 1676 1171 206 106 0 chr2 143121673 143121965 -38626122 + MurERV4-int LTR ERVK 4938 5260 0 1 1676 2137 171 127 33 chr2 143121987 143122473 -38625614 + RMER4B LTR ERVK 34 564 -21 1 1677 1719 236 64 3 chr2 143133639 143134029 -38614058 - MTD LTR MaLR -5 414 1 1 1677 3239 61 2 0 chr2 143140218 143140613 -38607474 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 1677 3289 36 5 10 chr2 143142228 143142625 -38605462 + MTA_Mm LTR MaLR 1 395 -1 2 1677 2552 77 12 0 chr2 143147853 143148176 -38599911 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 2 1677 10540 138 66 7 chr2 143148176 143150029 -38598058 + ORR1A2-int LTR MaLR 1 1963 0 2 1677 2240 110 6 0 chr2 143150029 143150346 -38597741 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 2 1677 269 272 11 69 chr2 143151298 143151385 -38596702 + MLT1H LTR MaLR 116 197 -352 2 1677 2836 117 136 28 chr2 143160616 143161144 -38586943 - RLTR1D LTR ERV1 -16 589 1 2 1677 1775 191 22 27 chr2 143162555 143162959 -38585128 + RLTR9D LTR ERVK 1 402 -1 2 1677 1734 157 12 61 chr2 143162980 143163097 -38584990 + ORR1A4 LTR MaLR 1 101 -228 2 1677 1734 157 12 61 chr2 143163274 143163502 -38584585 + ORR1A4 LTR MaLR 102 329 0 2 1677 665 327 65 58 chr2 143169767 143170196 -38577891 - MLT1H1 LTR MaLR 0 555 124 2 1677 3890 115 38 65 chr2 143172735 143173099 -38574988 - RMER6A LTR ERVK -58 698 332 2 1677 3890 115 38 65 chr2 143173123 143173476 -38574611 - RMER6A LTR ERVK -425 331 2 2 1677 441 198 70 0 chr2 143177993 143178079 -38570008 + RMER5 LTR ERV1 423 514 -20 2 1677 265 322 156 50 chr2 143183318 143183498 -38564589 - MLT1H LTR MaLR 0 549 351 2 1677 674 251 122 57 chr2 143185663 143185955 -38562132 + MTEb LTR MaLR 1 308 -71 2 1677 674 251 122 57 chr2 143185986 143186047 -38562040 + MTEb LTR MaLR 309 376 -3 2 1677 525 317 122 30 chr2 143189882 143190152 -38557935 - LTR16C LTR ERVL -11 478 184 2 1677 277 381 82 57 chr2 143192196 143192527 -38555560 - LTR16C LTR ERVL -43 446 108 2 1677 3105 9 0 6 chr2 143193075 143193423 -38554664 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 2 1677 302 312 40 113 chr2 143195472 143195546 -38552541 - MLT2B1 LTR ERVL -5 562 498 3 1677 302 312 40 113 chr2 143195567 143195669 -38552418 - MLT2B1 LTR ERVL -70 497 399 3 1677 1024 300 58 36 chr2 143196813 143197036 -38551051 + MTEa LTR MaLR 9 234 -145 3 1677 1024 300 58 36 chr2 143197131 143197215 -38550872 + MTEa LTR MaLR 235 312 -67 3 1677 1024 300 58 36 chr2 143197271 143197324 -38550763 + MTEa LTR MaLR 313 377 -2 3 1677 2725 152 38 117 chr2 143227113 143227336 -38520751 - RLTR25A LTR ERVK 0 1103 900 3 1677 2725 152 38 117 chr2 143227423 143227630 -38520457 - RLTR25A LTR ERVK -204 899 709 3 1677 2725 152 38 117 chr2 143227714 143227769 -38520318 - RLTR25A LTR ERVK -395 708 673 3 1677 2725 152 38 117 chr2 143228420 143228565 -38519522 - RLTR25A LTR ERVK -431 672 522 3 1677 2502 134 99 0 chr2 143228650 143229076 -38519011 - RLTR25A LTR ERVK -577 526 59 3 1677 2511 152 159 2 chr2 143230254 143230750 -38517337 - RMER4B LTR ERVK -11 574 1 3 1677 620 273 28 22 chr2 143230816 143230996 -38517091 + MLT1A0 LTR MaLR 11 191 -174 3 1677 272 237 67 76 chr2 143231898 143231910 -38516177 + MLT1A0 LTR MaLR 262 274 -91 3 1677 272 237 67 76 chr2 143232153 143232244 -38515843 + MLT1A0 LTR MaLR 275 364 -1 3 1677 444 349 67 28 chr2 143232498 143232678 -38515409 + MLT1G1 LTR MaLR 3 189 -390 3 1677 1159 294 88 19 chr2 143233328 143233702 -38514385 - MTD LTR MaLR -15 404 5 3 1677 293 268 76 152 chr2 143233709 143233841 -38514246 + MLT1G1 LTR MaLR 192 313 -282 3 1677 304 331 65 91 chr2 143237332 143237463 -38510624 + MLT1D LTR MaLR 21 151 -354 3 1677 304 328 46 53 chr2 143238140 143238393 -38509694 + MLT1D LTR MaLR 152 427 -40 3 1677 504 341 53 5 chr2 143239734 143239940 -38508147 - ORR1E LTR MaLR -142 217 2 3 1677 2036 179 14 6 chr2 143243758 143244118 -38503969 - ORR1B2 LTR MaLR -4 363 1 3 1677 337 336 84 14 chr2 143244850 143245064 -38503023 - ORR1E LTR MaLR -123 236 8 3 1677 420 315 96 56 chr2 143246622 143246945 -38501142 + MLT1A0 LTR MaLR 13 348 -17 3 1677 907 266 56 45 chr2 143259691 143259979 -38488108 - RMER15 LTR ERVL -11 564 274 3 1677 256 241 33 44 chr2 143260013 143260104 -38487983 - RMER15 LTR ERVL -441 134 45 3 209 579 306 90 40 chr2 143261599 143261922 -38486165 - ORR1E LTR MaLR -2 357 19 3 1678 231 311 13 39 chr2 143263569 143263646 -38484441 + MT2B LTR ERVL 167 241 -360 3 1678 660 368 96 10 chr2 143268418 143268805 -38479282 - LTR16A1 LTR ERVL 0 456 37 3 1678 2478 165 32 0 chr2 143270000 143270406 -38477681 - MTC LTR MaLR -1 420 2 3 1678 403 341 160 43 chr2 143270482 143270850 -38477237 + MLT1G1 LTR MaLR 163 573 -6 3 1678 1064 264 9 28 chr2 143270928 143271193 -38476894 - MTEb LTR MaLR -66 293 57 3 1678 523 274 61 27 chr2 143274134 143274351 -38473736 - MLT2D LTR ERVL -326 230 6 4 1678 249 312 13 13 chr2 143274658 143274736 -38473351 + LTR16A1 LTR ERVL 372 449 -7 4 1678 276 279 116 0 chr2 143277765 143277894 -38470193 + MLT1H LTR MaLR 383 534 -15 4 1678 386 277 76 21 chr2 143284295 143284439 -38463648 + LTR16C LTR ERVL 178 329 -160 4 1678 276 330 184 0 chr2 143291120 143291299 -38456788 - MLT1E2 LTR MaLR 0 627 416 4 1678 256 280 30 111 chr2 143292243 143292422 -38455665 - MLT1E2 LTR MaLR -466 161 1 4 1678 597 261 53 76 chr2 143303500 143303922 -38444165 - RLTR12B LTR ERVK -29 499 125 4 1678 270 315 37 30 chr2 143305175 143305309 -38442778 - RLTR12B LTR ERVK -390 138 4 4 1678 459 238 126 72 chr2 143306553 143306829 -38441258 - ORR1D2 LTR MaLR -7 363 2 4 1678 457 296 92 103 chr2 143306953 143307322 -38440765 + ORR1D2 LTR MaLR 5 369 -1 4 1678 2952 174 55 6 chr2 143309602 143310145 -38437942 + RMER15 LTR ERVL 6 575 0 4 1678 2148 129 32 178 chr2 143317633 143318094 -38429993 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 4 1678 309 309 18 35 chr2 143318279 143318393 -38429694 + RMER15 LTR ERVL 368 479 -96 4 1678 492 303 105 81 chr2 143320277 143320306 -38427781 + ORR1E LTR MaLR 1 29 -330 4 1678 492 257 97 65 chr2 143320359 143320675 -38427412 + ORR1E LTR MaLR 30 379 0 4 1678 943 305 43 49 chr2 143326326 143326771 -38421316 + RLTR17 LTR ERVK 125 566 -126 4 1678 309 159 31 16 chr2 143326847 143326911 -38421176 + RLTR31_Mur LTR ERVK 489 553 0 4 1678 566 312 71 56 chr2 143329242 143329564 -38418523 - ORR1E LTR MaLR -22 337 11 4 1678 1480 237 52 23 chr2 143331063 143331409 -38416678 + MTE2a LTR MaLR 20 375 -4 5 1678 626 327 65 71 chr2 143333355 143333707 -38414380 + ORR1E LTR MaLR 1 350 -9 5 1678 565 308 74 31 chr2 143333958 143334283 -38413804 + LTR37A LTR ERV1 88 426 0 5 1678 484 261 215 8 chr2 143334284 143334531 -38413556 - RMER15 LTR ERVL -5 570 273 5 1678 1956 290 80 32 chr2 143334662 143335411 -38412676 - RMER15-int LTR ERVL -1 4998 4214 5 1678 2560 329 83 25 chr2 143335565 143336667 -38411420 - RMER15-int LTR ERVL -2776 2223 1057 5 1678 463 189 131 9 chr2 143336684 143336791 -38411296 + MTD LTR MaLR 286 405 -14 5 1678 409 373 68 4 chr2 143337065 143337302 -38410785 - RMER15-int LTR ERVL -4745 254 3 5 1678 607 296 111 26 chr2 143337872 143338145 -38409942 - ORR1E LTR MaLR -89 281 6 5 1678 352 334 114 33 chr2 143353040 143353395 -38394692 - MLT2E LTR ERVL -204 424 24 5 1678 3591 30 5 0 chr2 143356248 143356642 -38391445 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 1678 3398 63 5 0 chr2 143358676 143359070 -38389017 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 1678 310 408 77 16 chr2 143363113 143363307 -38384780 - LTR33 LTR ERVL -261 254 49 5 1678 387 306 133 75 chr2 143369416 143369762 -38378325 - MLT1A1 LTR MaLR -2 406 41 5 1678 1237 249 95 24 chr2 143376951 143377329 -38370758 + MTD LTR MaLR 1 405 -14 5 1678 742 297 143 78 chr2 143377384 143377935 -38370152 - MLT1E1A LTR MaLR -93 587 1 5 1678 334 360 155 50 chr2 143379289 143379659 -38368428 + MLT1J1 LTR MaLR 24 432 -12 5 1678 1155 257 59 45 chr2 143381949 143382303 -38365784 + ORR1E LTR MaLR 1 359 0 5 1678 771 156 36 22 chr2 143383379 143383517 -38364570 + ORR1D1 LTR MaLR 1 140 -234 5 1678 1259 239 83 31 chr2 143383716 143384066 -38364021 - ORR1D2 LTR MaLR -2 368 1 5 1678 657 272 126 129 chr2 143391615 143391995 -38356092 - MTE2a LTR MaLR 0 379 1 5 1679 320 255 71 10 chr2 143393672 143393771 -38354316 - MLT1G LTR MaLR -2 589 485 5 1679 3020 86 8 0 chr2 143401180 143401577 -38346510 - MTB LTR MaLR 0 400 1 6 1679 949 243 26 56 chr2 143402725 143402991 -38345096 + MTC LTR MaLR 156 413 -8 6 1679 990 204 247 16 chr2 143403438 143403742 -38344345 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 6 1679 320 365 146 50 chr2 143409172 143409495 -38338592 - LTR16A LTR ERVL -97 354 1 6 1679 1587 161 113 137 chr2 143416633 143417050 -38331037 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 6 1679 381 240 39 68 chr2 143421025 143421128 -38326959 - MTEa LTR MaLR 0 379 280 6 1679 849 277 117 27 chr2 143422031 143422287 -38325800 - MTEa LTR MaLR -88 291 13 6 1679 2017 149 6 63 chr2 143423554 143423931 -38324156 + ORR1A3 LTR MaLR 1 378 0 6 1679 806 167 13 7 chr2 143423931 143424078 -38324009 + ORR1A3-int LTR MaLR 20 167 -1796 6 1679 1885 91 7 7 chr2 143427268 143427544 -38320543 - RMER17C-int LTR ERVK -1217 2021 1746 6 1679 450 304 141 34 chr2 143436301 143436478 -38311609 - MLT2C1 LTR ERVL 0 397 202 6 1679 336 289 0 85 chr2 143436584 143436690 -38311397 + MTEa LTR MaLR 1 97 -282 6 1679 407 317 20 14 chr2 143437136 143437283 -38310804 - MLT2C1 LTR ERVL -248 166 19 6 1679 932 229 136 76 chr2 143438838 143438879 -38309208 + MLT1B LTR MaLR 1 41 -349 6 1679 932 229 136 76 chr2 143439058 143439384 -38308703 + MLT1B LTR MaLR 42 390 0 6 1679 377 296 96 93 chr2 143445388 143445712 -38302375 - ORR1E LTR MaLR -15 344 20 6 1679 1680 191 21 55 chr2 143446464 143446846 -38301241 - ORR1D1 LTR MaLR -5 369 1 6 1679 712 336 100 47 chr2 143462911 143463379 -38284708 - MLT1H LTR MaLR 0 549 57 6 1679 3166 51 38 3 chr2 143468823 143469214 -38278873 + MTB_Mm LTR MaLR 3 407 0 6 1679 385 209 53 32 chr2 143470456 143470550 -38277537 - RLTR21 LTR ERVK -1270 302 207 6 1679 257 246 87 0 chr2 143470546 143470615 -38277472 - RLTR21 LTR ERVK -1490 82 8 6 1679 335 338 53 26 chr2 143472667 143472895 -38275192 - MLT1H2 LTR MaLR -253 236 3 6 1679 264 217 58 0 chr2 143474562 143474631 -38273456 - MER110 LTR ERV1 -14 477 405 6 1679 357 257 19 19 chr2 143474814 143474916 -38273171 + MLT1B LTR MaLR 1 102 -288 6 1679 730 248 106 157 chr2 143474916 143475342 -38272745 + MTD LTR MaLR 1 404 -15 6 1679 282 197 49 0 chr2 143475355 143475416 -38272671 + MLT1B LTR MaLR 97 160 -230 6 1679 349 283 19 0 chr2 143475450 143475556 -38272531 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 301 7 1679 662 309 88 42 chr2 143475651 143475982 -38272105 - MLT1A1 LTR MaLR -62 346 1 7 1679 707 300 14 14 chr2 143476883 143477106 -38270981 + MLT1B LTR MaLR 165 387 -3 6 1679 1729 176 77 20 chr2 143481511 143481864 -38266223 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 2 7 1679 4259 81 14 2 chr2 143484897 143485457 -38262630 - RMER2 LTR ERV1 0 567 1 7 1679 928 276 90 57 chr2 143486350 143486861 -38261226 - MT2A LTR ERVL -4 529 2 7 1679 1271 251 44 27 chr2 143489377 143489742 -38258345 - MTE2b LTR MaLR -2 377 7 7 1679 1392 236 64 40 chr2 143491020 143491425 -38256662 - MTD LTR MaLR 0 419 5 7 1679 2209 112 22 12 chr2 143498745 143499069 -38249018 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 7 1679 495 230 157 45 chr2 143501947 143502014 -38246073 + MLT1D LTR MaLR 258 320 -185 5 1679 495 230 157 45 chr2 143502058 143502213 -38245874 + MLT1D LTR MaLR 321 504 -1 5 1679 307 273 124 75 chr2 143505200 143505311 -38242776 - MLT1B LTR MaLR -112 278 154 9 1679 3008 147 26 36 chr2 143505311 143505839 -38242248 - RLTR28 LTR ERVL 0 524 2 1 1679 307 273 124 75 chr2 143505839 143505992 -38242095 - MLT1B LTR MaLR -237 153 1 9 1679 246 193 88 0 chr2 143507134 143507191 -38240896 - MLT1B LTR MaLR -328 62 1 1 1679 806 156 8 184 chr2 143508309 143508576 -38239511 - RLTR28 LTR ERVL -5 519 300 1 1679 1502 105 82 11 chr2 143508987 143509257 -38238830 - RLTR28 LTR ERVL -235 289 1 1 1679 298 237 52 31 chr2 143514589 143514685 -38233402 - MLT1I LTR MaLR 0 411 314 2 1679 294 318 58 64 chr2 143514719 143514907 -38233180 - MLT1I LTR MaLR -204 207 21 2 1679 992 266 29 79 chr2 143518503 143518865 -38229222 - ORR1E LTR MaLR -26 358 3 2 1679 3122 263 108 66 chr2 143518869 143520178 -38227909 - ORR1E-int LTR MaLR -5 1365 2 2 1679 1049 278 32 38 chr2 143520186 143520533 -38227554 - ORR1E LTR MaLR -4 355 11 2 1680 598 265 101 64 chr2 143526030 143526328 -38221759 - LTR16C LTR ERVL -3 486 178 3 1680 800 296 95 81 chr2 143530535 143531031 -38217056 + MLT1E LTR MaLR 10 512 -141 4 1680 263 291 64 64 chr2 143533317 143533442 -38214645 + MLT1E2 LTR MaLR 10 134 -493 4 1680 411 282 100 118 chr2 143533459 143533808 -38214279 - ORR1E LTR MaLR -15 344 2 4 1680 1246 225 124 6 chr2 143538578 143538909 -38209178 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 5 1680 1398 220 35 18 chr2 143542363 143542705 -38205382 + ORR1D1 LTR MaLR 24 371 -3 6 1680 468 285 32 0 chr2 143559709 143559832 -38188255 - MTEa LTR MaLR -252 127 1 8 1680 425 312 279 3 chr2 143563829 143564127 -38183960 - MLT1A1 LTR MaLR -12 396 17 9 1680 1582 149 57 3 chr2 143567523 143567819 -38180268 - ORR1B1 LTR MaLR -81 313 2 9 1680 790 271 122 57 chr2 143572813 143572946 -38175141 - MTEa LTR MaLR -2 377 227 1 1680 790 271 122 57 chr2 143572975 143573193 -38174894 - MTEa LTR MaLR -153 226 4 1 1680 347 258 99 114 chr2 143578874 143579198 -38168889 - ORR1D1 LTR MaLR -55 319 1 1 1680 500 230 57 199 chr2 143592090 143592508 -38155579 - RLTR15 LTR ERVK 0 359 1 1 1680 540 156 125 0 chr2 143597841 143597969 -38150118 - ORR1D1 LTR MaLR -230 144 1 1 1680 2129 107 48 61 chr2 143604840 143605170 -38142917 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 1 1680 379 211 56 28 chr2 143608846 143608953 -38139134 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 299 1 1680 258 217 100 0 chr2 143610914 143610974 -38137113 - MLT1G3 LTR MaLR -82 513 448 1 1680 1053 342 36 40 chr2 143611924 143612393 -38135694 + MLT1C LTR MaLR 1 467 0 1 1680 482 264 88 44 chr2 143612393 143612619 -38135468 - LTR83 LTR ERVL -296 484 249 1 1680 1716 195 151 3 chr2 143614678 143615043 -38133044 + MTD LTR MaLR 1 419 0 1 1680 287 163 20 0 chr2 143615050 143615099 -38132988 - LTR16E1 LTR ERVL -7 531 482 1 1680 669 288 35 63 chr2 143615148 143615496 -38132591 - RLTR15 LTR ERVK -21 338 1 1 1680 857 298 59 74 chr2 143617612 143618003 -38130084 - MLT1H LTR MaLR -142 407 23 1 1680 226 239 14 69 chr2 143622952 143623024 -38125063 - LTR84a LTR ERVL -200 557 490 1 1680 230 402 10 0 chr2 143623254 143623351 -38124736 - MLT1J LTR MaLR -311 201 104 1 1680 409 267 30 22 chr2 143625460 143625594 -38122493 - MLT1A1 LTR MaLR -5 403 269 1 1680 692 245 53 65 chr2 143629780 143630025 -38118062 - RLTR40 LTR ERVK -10 807 566 1 1680 2343 222 60 29 chr2 143630535 143631152 -38116935 - RLTR40 LTR ERVK -129 688 53 2 1680 278 281 113 46 chr2 143634756 143634950 -38113137 - LTR16A1 LTR ERVL -23 433 227 2 1680 1148 301 67 61 chr2 143636468 143636843 -38111244 - MTE2b LTR MaLR -2 377 1 2 1680 258 318 63 96 chr2 143638598 143638869 -38109218 - LTR16C LTR ERVL -227 262 1 2 1680 273 289 123 19 chr2 143642628 143642734 -38105353 - MLT1I LTR MaLR -10 401 285 2 1680 508 311 89 28 chr2 143645975 143646223 -38101864 + LTR16C LTR ERVL 136 398 -91 2 1680 459 335 16 49 chr2 143647016 143647201 -38100886 - MLT1A0 LTR MaLR -4 361 183 2 1680 680 369 75 23 chr2 143648418 143648856 -38099231 - LTR16C LTR ERVL -2 487 27 2 1681 352 352 41 5 chr2 143663832 143663943 -38084144 + MLT1E2 LTR MaLR 361 475 -152 2 1681 352 352 41 5 chr2 143663965 143664047 -38084040 + MLT1E2 LTR MaLR 476 560 -67 2 1681 702 236 130 60 chr2 143667595 143667888 -38080199 + MLT1A0 LTR MaLR 17 353 -37 2 1681 5069 160 33 10 chr2 143668565 143669453 -38078634 + RMER13B LTR ERVK 1 908 0 2 1681 714 224 68 0 chr2 143669581 143669728 -38078359 - ORR1E LTR MaLR -195 164 8 2 1681 683 280 181 45 chr2 143670254 143670568 -38077519 + MLT1A1 LTR MaLR 52 408 0 2 1681 251 252 74 121 chr2 143671041 143671190 -38076897 + MLT1B LTR MaLR 97 238 -152 2 1681 233 246 13 80 chr2 143671408 143671483 -38076604 - MER57C2 LTR ERV1 -27 407 338 2 1681 238 361 321 23 chr2 143672785 143673136 -38074951 - LTR16E1 LTR ERVL -1 537 82 2 1681 445 337 71 113 chr2 143675997 143676378 -38071709 + LTR82A LTR ERVL 273 637 -235 3 1681 246 395 44 7 chr2 143679252 143679387 -38068700 - LTR16E1 LTR ERVL -193 345 206 3 1681 1966 198 75 3 chr2 143682382 143682771 -38065316 - MTD LTR MaLR 0 419 3 3 1681 229 265 14 42 chr2 143683532 143683603 -38064484 + MLT1J LTR MaLR 274 342 -23 3 1681 275 356 58 17 chr2 143684474 143684594 -38063493 - LTR16C LTR ERVL -51 438 314 3 1681 233 281 0 0 chr2 143684985 143685042 -38063045 + MLT1J LTR MaLR 455 511 -1 3 1681 673 196 86 63 chr2 143686301 143686531 -38061556 - RLTR11A2 LTR ERVK -256 197 1 3 1681 274 348 45 0 chr2 143691315 143691427 -38056660 - MLT1I LTR MaLR -14 397 281 3 1681 537 240 140 38 chr2 143692904 143693090 -38054997 + MLT1B LTR MaLR 1 205 -185 3 1681 893 10 0 0 chr2 143698133 143698235 -38049852 + IAPLTR2a LTR ERVK 310 411 0 3 1681 370 156 90 13 chr2 143698717 143698795 -38049292 + MLT1A1 LTR MaLR 323 406 -2 3 1681 486 313 123 5 chr2 143702973 143703185 -38044902 - LTR16C LTR ERVL -1 488 252 3 1681 1317 230 64 14 chr2 143705007 143705351 -38042736 + ORR1D2 LTR MaLR 10 370 0 3 1681 819 226 222 15 chr2 143706589 143706859 -38041228 + RLTR26 LTR ERVK 1 326 -316 3 1681 489 194 575 24 chr2 143707274 143707484 -38040603 + RLTR26 LTR ERVK 312 637 -5 3 1681 909 261 53 34 chr2 143708146 143708408 -38039679 - MLT2C1 LTR ERVL -58 339 73 3 1681 259 287 151 23 chr2 143708779 143708973 -38039114 - MLT1L LTR MaLR -19 591 285 3 1681 1308 144 56 0 chr2 143710644 143710859 -38037228 + RMER19B LTR ERVK 1 227 -675 3 1681 769 192 58 47 chr2 143710882 143711073 -38037014 + RMER19B LTR ERVK 353 545 -357 3 1681 1876 137 68 109 chr2 143712467 143712628 -38035459 + ORR1C1 LTR MaLR 1 154 -224 3 1681 1876 137 68 109 chr2 143712800 143713032 -38035055 + ORR1C1 LTR MaLR 155 378 0 3 1681 848 307 33 16 chr2 143716559 143716804 -38031283 - MTE2b LTR MaLR -11 368 120 3 1681 232 404 0 9 chr2 143716799 143716904 -38031183 - MT2A LTR ERVL -429 104 1 3 1681 1882 164 89 16 chr2 143717010 143717381 -38030706 + RMER10B LTR ERVL 1 398 0 3 1681 1744 144 21 85 chr2 143725679 143726057 -38022030 + ORR1B1 LTR MaLR 41 394 0 4 1681 1623 171 213 5 chr2 143731783 143732218 -38015869 - RMER4B LTR ERVK -57 528 1 4 1681 1095 257 31 112 chr2 143734261 143734808 -38013279 - RLTR12B LTR ERVK -5 523 21 4 1681 2201 88 124 119 chr2 143734834 143735262 -38012825 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 1 4 1681 228 167 0 0 chr2 143736003 143736045 -38012042 - RLTR11A2 LTR ERVK 0 527 486 4 1681 455 193 35 44 chr2 143738707 143738821 -38009266 - MLT1A0 LTR MaLR -36 329 217 4 1681 289 250 31 61 chr2 143738999 143739097 -38008990 - MLT1A0 LTR MaLR -235 130 36 4 1681 282 172 127 28 chr2 143744799 143744879 -38003208 - MER92B LTR ERV1 -467 87 1 4 1681 374 185 0 15 chr2 143745908 143745974 -38002113 + ORR1E LTR MaLR 5 69 -290 4 1681 2947 41 6 0 chr2 143753150 143753494 -37994593 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 4 1681 1511 166 205 23 chr2 143769114 143769465 -37978622 - MTD LTR MaLR 0 419 5 5 1681 2055 85 102 0 chr2 143769835 143770130 -37977957 + ORR1A2 LTR MaLR 1 325 -2 5 1681 1770 158 140 3 chr2 143774612 143774948 -37973139 + ORR1C2 LTR MaLR 3 384 0 5 1681 2232 145 14 17 chr2 143778176 143778534 -37969553 + ORR1B2 LTR MaLR 3 359 -8 5 1682 821 176 230 8 chr2 143797477 143797710 -37950377 + MTD LTR MaLR 136 421 0 5 1682 436 256 106 31 chr2 143813576 143813708 -37934379 + RMER15 LTR ERVL 361 497 -78 5 1682 436 256 106 31 chr2 143813770 143813798 -37934289 + RMER15 LTR ERVL 498 532 -43 5 1682 272 317 29 100 chr2 143821250 143821390 -37926697 + RMER12 LTR ERVK 711 840 -482 5 1682 363 256 14 136 chr2 143838139 143838279 -37909808 - MT2B LTR ERVL -348 253 131 5 1682 492 315 86 79 chr2 143839167 143839216 -37908871 - LTR16C LTR ERVL -8 481 433 5 1682 492 315 86 79 chr2 143839546 143839799 -37908288 - LTR16C LTR ERVL -57 432 177 5 1682 1847 124 46 0 chr2 143842352 143842635 -37905452 + ORR1A3 LTR MaLR 1 296 -30 5 1682 371 366 88 58 chr2 143843434 143843694 -37904393 - LTR16C LTR ERVL -23 466 200 5 1682 371 366 88 58 chr2 143843846 143844037 -37904050 - LTR16C LTR ERVL -290 199 1 5 1682 677 231 67 18 chr2 143844875 143845126 -37902961 - RMER4B LTR ERVK -14 571 272 5 1682 932 165 132 50 chr2 143845808 143846050 -37902037 - RMER4B LTR ERVK -323 262 1 5 1682 4359 163 57 81 chr2 143846050 143847147 -37900940 - MYSERV6-int LTR ERVK 0 8959 7922 5 1682 3967 225 67 46 chr2 143847291 143847401 -37900686 - MYSERV6-int LTR ERVK -1117 5433 5318 5 1682 878 253 63 35 chr2 143849749 143850003 -37898084 - MTEa LTR MaLR -118 261 1 5 1682 2132 155 87 18 chr2 143853295 143853676 -37894411 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 5 1682 226 299 177 43 chr2 143857270 143857434 -37890653 - LTR16C LTR ERVL 0 489 304 6 1682 389 258 45 38 chr2 143857526 143857659 -37890428 - LTR16C LTR ERVL -348 141 8 6 1682 326 309 148 24 chr2 143861996 143862225 -37885862 - MLT1H1 LTR MaLR -32 523 213 6 1682 524 265 68 0 chr2 143863042 143863189 -37884898 + RMER15 LTR ERVL 407 563 -12 6 1682 544 339 134 22 chr2 143864528 143864893 -37883194 - MLT1K LTR MaLR -101 494 89 6 1682 250 344 21 31 chr2 143872535 143872631 -37875456 - MamGypLTR2 LTR Gypsy -534 655 561 6 1682 225 311 83 55 chr2 143872548 143872657 -37875430 - LTR81C LTR ERV1? -519 634 523 6 1682 1185 241 131 12 chr2 143877314 143877650 -37870437 + MTEa LTR MaLR 4 379 0 6 1682 330 293 51 8 chr2 143879275 143879392 -37868695 - MLT1K LTR MaLR -72 523 402 6 1682 439 294 231 21 chr2 143879634 143879965 -37868122 + MTD LTR MaLR 18 404 -15 6 1682 225 329 86 75 chr2 143889055 143889229 -37858858 + MLT2B5 LTR ERVL 151 326 -391 6 1682 574 307 28 66 chr2 143889283 143889588 -37858499 - ORR1E LTR MaLR -78 292 1 6 1682 1047 262 103 37 chr2 143890148 143890528 -37857559 - MTD LTR MaLR -14 405 1 6 1682 943 205 135 46 chr2 143892846 143893127 -37854960 - MTEb LTR MaLR -3 376 71 7 1682 413 256 113 68 chr2 143898273 143898558 -37849529 - MLT2B2 LTR ERVL -2 661 370 7 1682 331 308 157 47 chr2 143900270 143900461 -37847626 - MLT1F1 LTR MaLR -266 303 92 7 1682 256 323 53 30 chr2 143901119 143901244 -37846843 + MLT1I LTR MaLR 239 366 -45 7 1682 363 290 29 137 chr2 143901244 143901448 -37846639 - RMER15 LTR ERVL -1 574 393 7 1682 281 302 174 64 chr2 143903717 143903936 -37844151 + LTR16C LTR ERVL 244 486 -3 7 1682 238 220 40 0 chr2 143905945 143905995 -37842092 + MLT1I LTR MaLR 76 127 -284 7 1682 390 327 59 0 chr2 143906061 143906214 -37841873 + MLT1I LTR MaLR 250 411 0 7 1682 832 240 44 14 chr2 143907019 143907207 -37840880 + MTE2a LTR MaLR 1 217 -162 7 1682 832 250 75 5 chr2 143907234 143907379 -37840708 + MTE2a LTR MaLR 218 372 -7 7 1682 257 314 141 63 chr2 143909178 143909508 -37838579 + ORR1E LTR MaLR 25 374 0 7 1682 282 277 9 105 chr2 143910363 143910468 -37837619 + MT2B2 LTR ERVL 161 255 -329 7 1683 3455 146 32 16 chr2 143917513 143918082 -37830005 + RLTR20A2 LTR ERVK 1 578 0 7 1683 355 185 47 58 chr2 143919269 143919355 -37828732 - MTEb LTR MaLR -293 86 2 7 1683 259 290 39 88 chr2 143920481 143920583 -37827504 - MLT1A LTR MaLR 0 408 312 7 1683 337 302 27 67 chr2 143920609 143920758 -37827329 - MLT1A LTR MaLR -191 183 41 7 1683 1661 145 24 0 chr2 143924502 143924757 -37823330 - ORR1B1 LTR MaLR -3 391 131 7 1683 2248 128 18 49 chr2 143926538 143926923 -37821164 + ORR1C1 LTR MaLR 5 377 -1 7 1683 1602 206 122 11 chr2 143928553 143928930 -37819157 + MTD LTR MaLR 1 419 0 7 1683 613 218 4 12 chr2 143929190 143929317 -37818770 - MTE2b LTR MaLR -252 127 1 7 1683 1027 255 146 18 chr2 143930978 143931313 -37816774 - MTE2b LTR MaLR -1 378 1 7 1683 2912 68 18 3 chr2 143932693 143933079 -37815008 - MTB LTR MaLR -8 392 1 7 1683 280 290 160 63 chr2 143933392 143933598 -37814489 + MLT1D LTR MaLR 261 486 -19 7 1683 1235 235 83 31 chr2 143933896 143934251 -37813836 + MTE2a LTR MaLR 39 405 -14 7 1683 246 327 89 18 chr2 143938359 143938471 -37809616 - LTR16E2 LTR ERVL -1 567 448 8 1683 679 256 73 0 chr2 143938533 143938697 -37809390 + MTEa LTR MaLR 143 318 -61 8 1683 947 254 125 54 chr2 143938697 143938823 -37809264 + MTE2a LTR MaLR 1 147 -232 8 1683 947 254 125 54 chr2 143939002 143939228 -37808859 + MTE2a LTR MaLR 148 378 -1 8 1683 320 154 0 0 chr2 143939228 143939280 -37808807 + MTEa LTR MaLR 318 369 -10 8 1683 235 383 21 11 chr2 143942495 143942590 -37805497 + LTR16B2 LTR ERVL 106 201 -261 8 1683 1903 92 144 0 chr2 143942607 143942912 -37805175 + ORR1B1 LTR MaLR 1 349 -45 8 1683 474 321 39 19 chr2 143943894 143944246 -37803841 + MLT1D LTR MaLR 1 422 -83 8 1683 2591 58 3 41 chr2 143944546 143944886 -37803201 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 8 1683 1800 201 39 11 chr2 143945132 143945494 -37802593 - ORR1D1 LTR MaLR -2 372 1 8 1683 240 208 73 36 chr2 143945627 143945682 -37802405 - LTR16A1 LTR ERVL -229 227 171 8 1683 326 356 113 66 chr2 143948186 143948700 -37799387 + MLT1K LTR MaLR 33 570 -25 8 1683 237 287 56 33 chr2 143949447 143949537 -37798550 - MLT1L LTR MaLR -185 425 334 8 1683 251 333 121 55 chr2 143949545 143949802 -37798285 + LTR16C LTR ERVL 5 278 -211 8 1683 686 307 132 23 chr2 143949910 143950220 -37797867 + MT2A LTR ERVL 189 532 -1 8 1683 249 341 134 23 chr2 143950239 143950410 -37797677 + LTR16C LTR ERVL 253 442 -47 8 1683 525 136 91 0 chr2 143951329 143951417 -37796670 - MTC LTR MaLR -325 96 1 8 1683 257 310 87 66 chr2 143951638 143951821 -37796266 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 140 8 1683 273 355 13 66 chr2 143952086 143952167 -37795920 - LTR33A_ LTR ERVL -13 518 445 8 1683 273 355 13 66 chr2 143952491 143952560 -37795527 - LTR33A_ LTR ERVL -87 444 376 8 1683 253 273 26 13 chr2 143955985 143956063 -37792024 - MLT1A1 LTR MaLR -12 396 318 8 1683 334 294 181 87 chr2 143956518 143956656 -37791431 + MLT1J LTR MaLR 268 418 -94 8 1683 2165 126 6 19 chr2 143956838 143957161 -37790926 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 8 1683 3215 39 39 3 chr2 143957367 143957749 -37790338 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 8 1683 1169 211 77 98 chr2 143963497 143963875 -37784212 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 8 1683 367 80 20 0 chr2 143965554 143965604 -37782483 + ORR1B2 LTR MaLR 317 367 0 8 1683 828 285 114 20 chr2 143965720 143966057 -37782030 - MLT2D LTR ERVL -20 539 37 8 1683 377 206 31 52 chr2 143966410 143966507 -37781580 - MLT2D LTR ERVL -318 96 2 8 1683 330 206 0 40 chr2 143971514 143971590 -37776497 - MER57A-int LTR ERV1 -301 5886 5814 8 1683 1915 106 31 22 chr2 143974716 143975035 -37773052 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 322 0 8 1683 17076 165 40 31 chr2 143975035 143978529 -37769558 + ETnERV2-int LTR ERVK 1 3751 -3655 8 1683 17076 165 40 31 chr2 143978572 143981874 -37766213 + ETnERV2-int LTR ERVK 3752 7299 -107 8 1683 1915 106 31 22 chr2 143981874 143982193 -37765894 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 322 0 8 1683 359 291 0 0 chr2 143987457 143987543 -37760544 + MTEa LTR MaLR 294 379 0 9 1683 389 317 106 0 chr2 143987676 143987818 -37760269 + LTR16A1 LTR ERVL 298 454 -2 9 1683 366 299 174 102 chr2 143993524 143993759 -37754328 - LTR33A LTR ERVL -267 253 2 9 1683 288 288 169 4 chr2 143996948 143997168 -37750919 - MLT1G1 LTR MaLR -194 355 82 9 1683 588 304 209 25 chr2 143998009 143998410 -37749677 - LTR33A LTR ERVL 0 520 58 9 1683 370 329 21 28 chr2 143999706 143999850 -37748237 - MTE-int LTR MaLR -940 640 498 9 1683 260 328 84 37 chr2 144000400 144000590 -37747497 - MLT1H1 LTR MaLR -280 275 77 2 1683 3027 69 2 44 chr2 144001863 144002274 -37745813 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 3 6 1683 421 294 137 100 chr2 144004755 144005149 -37742938 - MLT1F2 LTR MaLR -59 594 70 1 1683 1670 247 26 24 chr2 144010990 144011309 -37736778 - MTEa LTR MaLR 0 379 60 3 1683 2139 108 6 58 chr2 144011309 144011654 -37736433 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 3 1683 1670 247 26 24 chr2 144011654 144011712 -37736375 - MTEa LTR MaLR -320 59 1 3 1683 1060 310 55 25 chr2 144012943 144013376 -37734711 + MT2A LTR ERVL 3 448 -85 3 1683 2246 215 12 7 chr2 144013396 144013813 -37734274 + MTD LTR MaLR 1 419 0 3 1683 259 208 0 0 chr2 144013813 144013861 -37734226 + MT2A LTR ERVL 486 533 0 3 1683 803 263 136 40 chr2 144015859 144016211 -37731876 - MLT1A1 LTR MaLR -22 386 1 4 1683 379 241 149 46 chr2 144016573 144016758 -37731329 + RMER10A LTR ERVL 3 201 -197 4 1683 2112 150 174 82 chr2 144017129 144017173 -37730914 - MT2A LTR ERVL 0 533 490 4 1683 2112 150 174 82 chr2 144017219 144017662 -37730425 - MT2A LTR ERVL -44 489 2 4 1683 447 311 92 17 chr2 144019169 144019408 -37728679 - LTR37A LTR ERV1 -67 359 103 5 1683 588 171 8 49 chr2 144023670 144023793 -37724294 - RMER10B LTR ERVL -51 347 230 5 1683 900 247 56 35 chr2 144026603 144026888 -37721199 - RLTR15 LTR ERVK -68 291 1 6 1683 367 283 10 11 chr2 144030949 144031068 -37717019 - MLT1A0 LTR MaLR -2 406 263 8 1683 327 293 111 24 chr2 144032068 144032194 -37715893 - LTR33 LTR ERVL -21 494 358 8 1683 716 307 184 3 chr2 144034078 144034382 -37713705 + MLT1F LTR MaLR 8 366 -182 8 1683 347 280 167 78 chr2 144035499 144035826 -37712261 - MLT1C LTR MaLR -14 453 111 8 1683 349 327 90 24 chr2 144036913 144037079 -37711008 + MLT1H2 LTR MaLR 303 479 -10 9 1683 482 287 206 0 chr2 144037994 144038009 -37710078 + MLT1A1 LTR MaLR 73 87 -321 9 1683 482 287 206 0 chr2 144038159 144038390 -37709697 + MLT1A1 LTR MaLR 88 369 -39 9 1683 281 314 22 97 chr2 144038934 144039068 -37709019 - MT2B LTR ERVL -323 278 155 9 1683 312 207 30 139 chr2 144046576 144046677 -37701410 - MT2B LTR ERVL -330 271 182 1 1683 317 245 37 88 chr2 144046999 144047146 -37700941 + MT2B LTR ERVL 97 240 -344 1 1683 3580 33 38 2 chr2 144047649 144048070 -37700017 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 1 1684 536 308 70 43 chr2 144048449 144048707 -37699380 + MLT1H LTR MaLR 83 347 -202 1 1684 249 250 110 33 chr2 144051305 144051329 -37696758 + MT2B LTR ERVL 144 174 -427 1 1684 1926 234 125 33 chr2 144052387 144052965 -37695122 + RLTR26 LTR ERVK 1 631 -11 1 1684 1572 177 137 26 chr2 144053428 144053771 -37694316 + ORR1C2 LTR MaLR 1 381 -3 1 1684 879 228 84 0 chr2 144055583 144055798 -37692289 + RLTR42 LTR ERVK 1 233 -6 1 1684 374 298 87 87 chr2 144056930 144057136 -37690951 - MTEa LTR MaLR -162 217 12 1 1684 906 149 78 21 chr2 144060560 144060752 -37687335 + MTC-int LTR MaLR 1 203 -1055 1 1684 308 354 77 36 chr2 144061723 144061943 -37686144 + LTR16C LTR ERVL 247 475 -14 1 1684 255 337 12 0 chr2 144068638 144068721 -37679366 + MLT1H LTR MaLR 86 169 -380 2 1684 331 299 169 12 chr2 144069749 144070003 -37678084 + LTR31 LTR ERV1 144 437 -182 2 1684 412 266 74 40 chr2 144107457 144107633 -37640454 - MT2A LTR ERVL -73 460 279 2 1684 849 93 13 20 chr2 144112544 144112697 -37635390 - RMER17B LTR ERVK -495 463 312 3 1684 849 293 87 7 chr2 144116217 144116506 -37631581 - MLT2B2 LTR ERVL -3 512 201 3 1684 424 204 0 114 chr2 144118358 144118463 -37629624 + MT2B LTR ERVL 172 264 -337 3 1684 246 292 214 8 chr2 144119162 144119293 -37628794 - MLT1H2 LTR MaLR -16 473 316 3 1684 3023 71 38 13 chr2 144119841 144120238 -37627849 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 3 1684 276 219 62 35 chr2 144122191 144122281 -37625806 + MTC LTR MaLR 1 84 -323 3 1684 279 238 264 7 chr2 144124962 144125063 -37623024 + MLT1G3 LTR MaLR 337 469 -126 3 1684 279 238 264 7 chr2 144125088 144125130 -37622957 + MLT1G3 LTR MaLR 470 517 -78 3 1684 375 204 29 97 chr2 144132368 144132471 -37615616 + MT2B LTR ERVL 146 241 -360 3 1684 227 208 159 9 chr2 144141845 144141952 -37606135 + ORR1B1-int LTR MaLR 632 754 -755 4 1684 306 213 105 11 chr2 144143950 144144045 -37604042 + MLT1J LTR MaLR 274 377 -135 4 1684 274 213 63 51 chr2 144154660 144154679 -37593408 - RLTR25A LTR ERVK -495 608 529 4 1684 374 298 158 18 chr2 144162547 144162718 -37585369 + MLT1K LTR MaLR 67 261 -334 4 1684 468 269 67 148 chr2 144162901 144163256 -37584831 + MLT1D LTR MaLR 19 339 -51 4 1684 1990 122 17 86 chr2 144165011 144165291 -37582796 + ORR1A3 LTR MaLR 1 286 -40 4 1684 1990 122 17 86 chr2 144165437 144165506 -37582581 + ORR1A3 LTR MaLR 287 326 0 4 1684 225 297 30 90 chr2 144166311 144166342 -37581745 - RLTR25B LTR ERVK -493 535 508 4 1684 225 297 30 90 chr2 144166438 144166506 -37581581 - RLTR25B LTR ERVK -521 507 442 4 1684 467 257 162 22 chr2 144167943 144168122 -37579965 - RMER15 LTR ERVL -15 560 357 4 1684 1764 186 64 43 chr2 144168170 144168546 -37579541 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 4 1684 963 214 25 0 chr2 144172331 144172532 -37575555 - ORR1C2 LTR MaLR -4 380 175 5 1684 1465 225 48 48 chr2 144172545 144172999 -37575088 + RLTR28B LTR ERVL 28 481 0 5 1684 289 213 40 0 chr2 144173001 144173076 -37575011 - ORR1C2 LTR MaLR -203 181 104 5 1684 282 264 48 27 chr2 144174735 144174922 -37573165 - ORR1C2-int LTR MaLR -755 754 564 5 1684 275 324 50 14 chr2 144175005 144175146 -37572941 - MLT1D LTR MaLR -43 462 317 5 1684 226 169 82 33 chr2 144178691 144178752 -37569335 - LTR16C LTR ERVL -425 64 1 5 1685 620 271 149 29 chr2 144182750 144183099 -37564988 - MER74A LTR ERVL -148 410 20 5 1685 573 313 87 67 chr2 144185191 144185746 -37562341 + MLT1G3 LTR MaLR 1 571 -8 5 1685 252 244 45 34 chr2 144191670 144191759 -37556328 - RLTR14 LTR ERV1 -7 375 286 5 1685 3293 60 0 5 chr2 144191889 144192291 -37555796 + MTB LTR MaLR 1 400 0 5 1685 714 216 116 6 chr2 144196782 144196954 -37551133 - MTD LTR MaLR 0 419 229 5 1685 279 186 30 140 chr2 144214532 144214632 -37533455 - MT2B2 LTR ERVL -345 239 151 6 1685 1932 174 96 8 chr2 144216298 144216685 -37531402 - MTC LTR MaLR 0 421 1 6 1685 363 191 52 87 chr2 144218695 144218810 -37529277 - RMER19B LTR ERVK -106 796 686 6 1685 521 165 116 0 chr2 144218806 144218927 -37529160 - RMER19B LTR ERVK -765 137 3 6 1685 283 310 143 45 chr2 144222157 144222270 -37525817 - RMER15 LTR ERVL 0 575 444 6 1685 1021 252 223 0 chr2 144222270 144222580 -37525507 - MTE2a LTR MaLR 0 379 1 6 1685 373 310 143 45 chr2 144222580 144222689 -37525398 - RMER15 LTR ERVL -132 443 331 6 1685 297 371 21 48 chr2 144225044 144225231 -37522856 - MLT1H2 LTR MaLR -6 483 302 6 1685 793 126 0 59 chr2 144226761 144226878 -37521209 - BGLII_B LTR ERVK -50 391 280 6 1685 793 126 0 59 chr2 144227017 144227034 -37521053 - BGLII_B LTR ERVK -162 279 265 6 1685 1548 160 102 11 chr2 144230406 144230691 -37517396 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 68 6 1685 1411 196 125 12 chr2 144233760 144234096 -37513991 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 6 1685 952 218 80 136 chr2 144234444 144234601 -37513486 - MT2A LTR ERVL 0 533 406 6 1685 952 218 80 136 chr2 144234739 144234920 -37513167 - MT2A LTR ERVL -128 405 214 6 1685 642 248 74 42 chr2 144234979 144235194 -37512893 - MERVL_2A-int LTR ERVL -1 5760 5539 7 1685 268 193 35 0 chr2 144235197 144235254 -37512833 - MERVL_2A-int LTR ERVL -287 5427 5369 7 1685 654 270 239 26 chr2 144240924 144241304 -37506783 - MLT1H LTR MaLR -27 522 62 7 1685 427 205 105 44 chr2 144247127 144247291 -37500796 - MLT1D LTR MaLR -8 646 377 7 1685 337 271 65 41 chr2 144247397 144247520 -37500567 - MT2B2 LTR ERVL -306 278 153 7 1685 643 207 66 7 chr2 144249023 144249159 -37498928 - RMER15 LTR ERVL 0 575 432 7 1685 588 159 17 42 chr2 144249189 144249307 -37498780 - RMER15 LTR ERVL -452 123 9 7 1685 356 100 0 0 chr2 144249356 144249406 -37498681 - RMER15 LTR ERVL -513 62 13 7 1685 1058 169 173 25 chr2 144249833 144250103 -37497984 - RMER21B LTR ERV1 -258 689 298 7 1685 238 182 218 0 chr2 144250993 144251048 -37497039 - MLT1G LTR MaLR -515 76 10 7 1685 1651 128 54 20 chr2 144251498 144251794 -37496293 - RMER6A LTR ERVK 0 756 451 7 1685 461 310 48 140 chr2 144251981 144252121 -37495966 + ORR1E LTR MaLR 15 158 -201 7 1685 461 310 48 140 chr2 144252189 144252427 -37495660 + ORR1E LTR MaLR 159 357 -2 7 1685 3290 55 8 0 chr2 144252725 144253122 -37494965 + MTB LTR MaLR 1 400 0 7 1685 532 294 86 15 chr2 144256334 144256652 -37491435 - ORR1E LTR MaLR -9 370 3 7 1685 2095 120 70 39 chr2 144256923 144257279 -37490808 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 7 1685 2348 111 0 0 chr2 144259370 144259694 -37488393 + ORR1A2 LTR MaLR 4 327 0 7 1685 1177 262 139 0 chr2 144263584 144263688 -37484399 + MTE2b LTR MaLR 1 132 -247 8 1685 2147 157 62 3 chr2 144263688 144264058 -37484029 + ORR1B1 LTR MaLR 2 393 -1 8 1685 1177 262 139 0 chr2 144264058 144264285 -37483802 + MTE2b LTR MaLR 133 377 -2 8 1685 288 316 107 46 chr2 144264834 144265030 -37483057 + RMER15 LTR ERVL 352 559 -16 8 1685 320 192 74 37 chr2 144270038 144270119 -37477968 - RLTR25B LTR ERVK -519 509 426 8 1685 411 255 62 122 chr2 144271351 144271655 -37476432 + RMER17C LTR ERVK 70 355 -55 8 1685 665 316 67 28 chr2 144273675 144273929 -37474158 + MER21B LTR ERV1 52 315 -548 8 1685 851 303 131 39 chr2 144274277 144274658 -37473429 + MER21B LTR ERV1 377 792 -71 8 1685 274 252 26 112 chr2 144275544 144275660 -37472427 - MT2B LTR ERVL -344 257 152 8 1685 464 248 21 49 chr2 144283050 144283194 -37464893 + ORR1E LTR MaLR 215 354 -5 8 1685 2504 177 49 55 chr2 144283489 144284021 -37464066 + RLTR24 LTR ERV1 1 529 0 8 1685 405 206 17 101 chr2 144285665 144285784 -37462303 - MT2B LTR ERVL -344 257 149 8 1685 239 324 170 55 chr2 144287821 144288056 -37460031 - MLT1G LTR MaLR -229 362 101 8 1685 494 289 122 73 chr2 144289707 144290009 -37458078 - MTEa LTR MaLR -55 324 8 8 1685 580 214 171 43 chr2 144295547 144295882 -37452205 + MTE2a LTR MaLR 10 379 0 8 1685 300 284 19 19 chr2 144296955 144297059 -37451028 - MTEb LTR MaLR -1 378 275 8 1685 323 250 33 104 chr2 144301034 144301217 -37446870 + RLTR15 LTR ERVK 48 217 -142 8 1685 491 297 12 35 chr2 144304398 144304569 -37443518 + ORR1E LTR MaLR 191 357 -2 9 1685 1387 163 79 4 chr2 144306661 144306938 -37441149 + ORR1C2 LTR MaLR 52 349 -35 9 1685 2023 187 8 0 chr2 144308609 144308973 -37439114 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 9 1686 1884 133 71 6 chr2 144312302 144312629 -37435458 + ORR1B1 LTR MaLR 1 351 -43 9 1686 1884 133 71 6 chr2 144312806 144312817 -37435270 + ORR1B1 LTR MaLR 352 361 -33 9 1686 315 128 0 0 chr2 144312907 144312954 -37435133 + ORR1B1 LTR MaLR 340 386 -8 9 1686 700 98 9 9 chr2 144316521 144316634 -37431453 - RLTR13B1 LTR ERVK 0 893 781 9 1686 2019 127 18 24 chr2 144317898 144318229 -37429858 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 9 1686 2339 89 41 0 chr2 144320484 144320800 -37427287 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 9 1686 4092 198 61 58 chr2 144325865 144326953 -37421134 + RLTR21 LTR ERVK 7 1097 -475 9 1686 581 196 90 19 chr2 144326922 144326954 -37421133 + RMER12B LTR ERVK 1227 1259 -145 9 1686 581 196 90 19 chr2 144326976 144327099 -37420988 + RMER12B LTR ERVK 1260 1393 -11 9 1686 898 283 170 22 chr2 144327800 144328259 -37419828 + MTE-int LTR MaLR 518 1044 -536 9 1686 3060 73 10 5 chr2 144334507 144334905 -37413182 - MTB LTR MaLR 0 400 1 9 1686 292 255 135 9 chr2 144336918 144337029 -37411058 + LTR65 LTR ERV1 447 571 -98 9 1686 3507 71 24 6 chr2 144337806 144338273 -37409814 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 475 0 9 1686 1292 190 104 22 chr2 144340497 144340815 -37407272 - MTD LTR MaLR 0 419 76 9 1686 1332 178 194 27 chr2 144341256 144341585 -37406502 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 9 1686 1050 232 95 51 chr2 144341604 144341940 -37406147 + MTEa LTR MaLR 18 368 -11 9 1686 274 330 83 17 chr2 144342044 144342164 -37405923 - MLT1J LTR MaLR -275 237 110 9 1686 2619 173 46 31 chr2 144343718 144344238 -37403849 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 1 9 1686 292 328 8 74 chr2 144344991 144345013 -37403074 - MT2B LTR ERVL -325 276 166 9 1686 323 325 77 12 chr2 144345858 144346026 -37402061 + MTEb LTR MaLR 201 379 0 9 1686 1370 239 93 58 chr2 144346381 144346878 -37401209 + RMER15 LTR ERVL 26 539 -36 9 1686 464 327 153 38 chr2 144354626 144355043 -37393044 + MLT2B1 LTR ERVL 1 465 -55 1 1686 1076 307 53 186 chr2 144377145 144378350 -37369737 - MTEa-int LTR MaLR -527 1053 9 1 1686 831 267 64 122 chr2 144378367 144378677 -37369410 - MTEa LTR MaLR -10 369 75 1 1686 831 267 64 122 chr2 144378866 144378947 -37369140 - MTEa LTR MaLR -305 74 1 1 1686 1161 218 83 0 chr2 144384182 144384434 -37363653 + MTD LTR MaLR 13 285 -134 1 1686 393 179 77 0 chr2 144384634 144384712 -37363375 + MTD LTR MaLR 336 419 0 1 1686 1911 157 44 76 chr2 144388859 144389088 -37358999 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 160 1 1686 1911 157 44 76 chr2 144389144 144389321 -37358766 - ORR1B1 LTR MaLR -235 159 1 1 1686 2141 204 104 43 chr2 144401105 144401827 -37346260 - RLTR40 LTR ERVK -45 772 7 1 1686 822 269 33 41 chr2 144406577 144406848 -37341239 - MTE2a LTR MaLR -9 370 102 1 1686 252 209 0 91 chr2 144407304 144407391 -37340696 - MTE2a LTR MaLR -291 88 9 1 1686 374 90 30 0 chr2 144410940 144411007 -37337080 - RLTR12B LTR ERVK -457 71 3 1 1686 1572 174 166 15 chr2 144424294 144424626 -37323461 + RLTR14 LTR ERV1 1 382 0 1 1686 405 285 202 53 chr2 144430330 144430658 -37317429 + MTEa LTR MaLR 1 377 -2 1 1686 813 233 51 119 chr2 144431584 144431909 -37316178 - BGLII_B LTR ERVK -21 420 96 1 1686 599 219 53 144 chr2 144431938 144431965 -37316122 - BGLII_B LTR ERVK -358 95 67 1 1686 599 219 53 144 chr2 144431992 144432008 -37316079 - BGLII_B LTR ERVK -387 66 62 1 1686 599 219 53 144 chr2 144432087 144432152 -37315935 - BGLII_B LTR ERVK -392 61 5 1 1686 604 251 267 30 chr2 144439666 144439970 -37308117 - ORR1E LTR MaLR -3 376 1 1 1687 1303 148 9 0 chr2 144448534 144448753 -37299334 - RLTR28 LTR ERVL -30 494 274 1 1687 1413 173 35 18 chr2 144448948 144449024 -37299063 - RLTR28 LTR ERVL -236 288 209 1 1687 1413 173 35 18 chr2 144449048 144449254 -37298833 - RLTR28 LTR ERVL -316 208 2 1 1687 2780 30 32 20 chr2 144449700 144450042 -37298045 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 1 1687 2298 125 75 60 chr2 144453631 144454099 -37293988 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 1 1687 21581 14 2 0 chr2 144454099 144456458 -37291629 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 4117 1 1687 474 66 0 0 chr2 144456450 144456511 -37291576 - IAPEz-int LTR ERVK -2896 3585 3525 1 1687 934 88 24 0 chr2 144456511 144456636 -37291451 - IAPEz-int LTR ERVK -2770 4910 4783 1 1687 1846 115 4 4 chr2 144456631 144456893 -37291194 - IAPEz-int LTR ERVK -5183 2497 2236 1 1687 460 66 0 32 chr2 144456882 144456945 -37291142 - IAPEz-int LTR ERVK -5062 1419 1359 1 1687 4925 53 22 33 chr2 144456945 144457619 -37290468 - IAPEz-int LTR ERVK -5819 662 3 1 1687 2298 125 75 60 chr2 144457621 144458089 -37289998 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 1 1687 1758 140 57 10 chr2 144477382 144477678 -37270409 + MTC LTR MaLR 1 310 -111 1 1687 318 327 136 55 chr2 144477967 144478187 -37269900 + ORR1E LTR MaLR 11 248 -111 1 1687 1385 178 175 34 chr2 144478364 144478611 -37269476 - MTD LTR MaLR -14 405 128 1 1687 1385 178 175 34 chr2 144478647 144478754 -37269333 - MTD LTR MaLR -292 127 3 1 1687 248 244 134 0 chr2 144481687 144481769 -37266318 - LTR16E1 LTR ERVL -195 343 251 1 1687 475 277 152 6 chr2 144482542 144482720 -37265367 - ORR1E LTR MaLR -151 208 5 1 1687 271 342 134 20 chr2 144482699 144482848 -37265239 - ORR1E-int LTR MaLR -28 1552 1387 1 1687 2025 270 166 48 chr2 144483013 144483806 -37264281 - ORR1E-int LTR MaLR -216 1364 408 1 1687 784 243 28 122 chr2 144484026 144484128 -37263959 - ORR1E-int LTR MaLR -1141 439 355 1 1687 784 249 30 113 chr2 144484340 144484549 -37263538 - ORR1E-int LTR MaLR -1226 354 12 1 1687 809 270 147 13 chr2 144484550 144484850 -37263237 - ORR1E LTR MaLR -19 340 1 1 1687 291 203 38 63 chr2 144484862 144484941 -37263146 - ORR1E LTR MaLR -7 372 295 1 1687 434 323 57 31 chr2 144485006 144485198 -37262889 - ORR1E LTR MaLR -162 197 1 1 1687 316 253 26 13 chr2 144487922 144487998 -37260089 - MLT1J1 LTR MaLR -3 441 365 1 1687 582 222 59 51 chr2 144488016 144488253 -37259834 + RMER17C LTR ERVK 116 354 -56 1 1687 939 281 193 41 chr2 144491033 144491494 -37256593 - MLT1F LTR MaLR -13 535 5 1 1687 665 169 47 59 chr2 144492829 144492999 -37255088 + RMER15 LTR ERVL 1 168 -407 1 1687 1060 267 31 18 chr2 144492989 144493275 -37254812 + RMER15 LTR ERVL 281 570 -5 1 1687 2998 72 9 181 chr2 144494732 144495306 -37252781 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 1 1687 514 348 148 33 chr2 144496600 144496998 -37251089 - MLT1F LTR MaLR -96 452 9 1 1687 488 279 109 71 chr2 144497634 144497900 -37250187 - ORR1E LTR MaLR -4 355 80 1 1687 760 145 200 36 chr2 144499835 144500000 -37248087 + ORR1B2 LTR MaLR 1 192 -175 1 1687 1167 114 0 0 chr2 144500000 144500175 -37247912 + ORR1B2 LTR MaLR 193 367 0 1 1687 608 276 145 51 chr2 144507216 144507548 -37240539 - MTE2a LTR MaLR -14 365 3 1 1687 783 334 49 27 chr2 144510235 144510564 -37237523 - MLT1F LTR MaLR -14 534 199 1 1687 593 126 0 31 chr2 144516356 144516454 -37231633 + RLTR18B LTR ERVK 1 95 -417 2 1687 270 274 115 0 chr2 144516455 144516568 -37231519 - RMER12B LTR ERVK 0 1404 1279 2 1687 1816 212 26 97 chr2 144516600 144517068 -37231019 - RLTR21 LTR ERVK -445 1127 694 2 1687 1816 212 26 97 chr2 144517215 144517356 -37230731 - RLTR21 LTR ERVK -879 693 561 2 1687 1681 210 25 3 chr2 144517355 144517680 -37230407 - RLTR21 LTR ERVK -1240 332 1 2 1687 540 184 149 0 chr2 144517682 144517796 -37230291 + RLTR18B LTR ERVK 93 223 -289 2 1687 808 252 44 40 chr2 144527466 144527714 -37220373 + MTE2b LTR MaLR 7 255 -124 5 1687 307 219 0 0 chr2 144527836 144527900 -37220187 + MTE2b LTR MaLR 316 379 0 5 1687 934 180 10 149 chr2 144530502 144530790 -37217297 - RMER13A LTR ERVK -70 790 543 5 1687 2901 238 80 62 chr2 144540496 144540819 -37207268 - RMER13B LTR ERVK 0 908 590 6 1687 2901 238 80 62 chr2 144540848 144541412 -37206675 - RMER13B LTR ERVK -319 589 5 6 1687 623 232 102 5 chr2 144548581 144548727 -37199360 + BGLII_B LTR ERVK 238 399 -42 8 1687 623 232 102 5 chr2 144548747 144548786 -37199301 + BGLII_B LTR ERVK 400 440 -1 8 1687 238 303 0 0 chr2 144556928 144556994 -37191093 + MTEb LTR MaLR 314 379 0 9 1687 2201 139 71 3 chr2 144557043 144557424 -37190663 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 9 1688 300 159 59 129 chr2 144575498 144575599 -37172488 - RLTR25B LTR ERVK -519 509 416 1 1688 3278 32 14 22 chr2 144576625 144577039 -37171048 + IAPLTR2a LTR ERVK 1 411 0 1 1688 765 205 45 50 chr2 144581720 144581920 -37166167 - RMER6B LTR ERVK 0 461 263 1 1688 1173 159 210 33 chr2 144590968 144591243 -37156844 + MTC LTR MaLR 35 364 -57 1 1688 2013 136 13 3 chr2 144591243 144591560 -37156527 - RLTR46 LTR ERVK 0 320 1 1 1688 1173 165 62 42 chr2 144591560 144591621 -37156466 + MTC LTR MaLR 365 421 0 1 1688 296 238 45 45 chr2 144598771 144598903 -37149184 - LTR40b LTR ERVL -2 460 329 1 1688 410 250 175 0 chr2 144599306 144599426 -37148661 - ORR1E LTR MaLR -218 141 1 1 1688 282 192 0 0 chr2 144607607 144607659 -37140428 + MLT1F1 LTR MaLR 205 256 -313 1 1688 1079 199 228 7 chr2 144609309 144609612 -37138475 - ORR1D1 LTR MaLR -4 370 1 1 1688 449 301 58 7 chr2 144609988 144610142 -37137945 - MLT1G3 LTR MaLR -27 568 407 1 1688 228 273 18 0 chr2 144610198 144610253 -37137834 - MLT1G3 LTR MaLR -282 313 258 1 1688 4492 166 48 30 chr2 144612228 144612469 -37135618 + RMER19B LTR ERVK 1 244 -658 1 1688 4492 166 48 30 chr2 144612513 144612524 -37135563 + RMER19B LTR ERVK 245 245 -657 1 1688 4492 166 48 30 chr2 144612552 144613172 -37134915 + RMER19B LTR ERVK 245 890 -12 1 1688 3332 48 2 0 chr2 144614509 144614904 -37133183 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 1688 499 253 293 13 chr2 144617038 144617260 -37130827 - MTD LTR MaLR -2 417 133 1 1688 437 247 51 45 chr2 144621630 144621787 -37126300 + MLT1H LTR MaLR 390 547 -2 2 1688 1332 180 120 21 chr2 144622369 144622743 -37125344 - RMER10A LTR ERVL -31 411 1 2 1688 600 151 0 50 chr2 144624231 144624350 -37123737 + MTC LTR MaLR 8 120 -301 2 1688 1236 194 60 26 chr2 144624654 144624919 -37123168 + MTC LTR MaLR 146 419 -2 2 1688 3274 93 8 41 chr2 144626290 144626781 -37121306 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 475 0 2 1688 4663 106 29 14 chr2 144626846 144627641 -37120446 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1 807 -1041 2 1688 1126 165 40 24 chr2 144628548 144628797 -37119290 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1592 1844 -4 2 1688 263 299 0 0 chr2 144628806 144628873 -37119214 - RMER15 LTR ERVL -106 469 403 2 1688 811 252 56 9 chr2 144629136 144629352 -37118735 - RMER15 LTR ERVL -48 527 302 2 1688 514 250 25 127 chr2 144629373 144629570 -37118517 - RMER15 LTR ERVL -398 177 1 2 1688 254 204 19 0 chr2 144630077 144630131 -37117956 - MLT1F1 LTR MaLR -508 61 7 2 1688 1838 178 59 6 chr2 144634229 144634585 -37113502 - RMER13B LTR ERVK 0 908 534 2 1688 230 163 0 0 chr2 144634577 144634620 -37113467 - RMER13B LTR ERVK -865 43 1 2 1688 384 308 9 0 chr2 144647130 144647237 -37100850 - MLT1A LTR MaLR 0 374 267 2 1688 560 329 44 63 chr2 144650969 144651332 -37096755 - MLT1A LTR MaLR 0 374 19 2 1688 306 305 140 42 chr2 144655720 144656166 -37091921 - MLT1E3 LTR MaLR -8 619 65 2 1688 247 272 24 12 chr2 144656375 144656457 -37091630 + MLT1B LTR MaLR 300 382 -8 2 1688 1084 272 70 29 chr2 144658409 144658750 -37089337 - ORR1E LTR MaLR 0 359 5 2 1688 3996 119 147 52 chr2 144659551 144660224 -37087863 - RMER19A LTR ERVK 0 737 1 2 1688 503 118 0 0 chr2 144660227 144660303 -37087784 - MurERV4_19-int LTR ERVK -4 5776 5701 2 1688 4373 135 57 41 chr2 144660556 144661381 -37086706 - MurERV4_19-int LTR ERVK -96 5684 4695 2 1688 312 264 22 44 chr2 144664332 144664423 -37083664 + ORR1E LTR MaLR 3 91 -288 2 1688 353 283 47 105 chr2 144664497 144664754 -37083333 + ORR1E LTR MaLR 118 359 0 2 1688 3047 307 67 63 chr2 144667137 144668486 -37079601 + RMER15-int LTR ERVL 408 1761 -3238 2 1688 386 278 0 30 chr2 144668626 144668726 -37079361 + MLT1G3 LTR MaLR 97 193 -402 2 1688 1709 182 197 18 chr2 144668801 144669192 -37078895 - RMER6B LTR ERVK 0 461 1 2 1688 2568 163 27 2 chr2 144671270 144671681 -37076406 + MTC LTR MaLR 1 421 0 2 1688 404 322 62 40 chr2 144671724 144671950 -37076137 + MLT1H LTR MaLR 61 291 -258 2 1688 1149 264 34 110 chr2 144671952 144672361 -37075726 - MTE2a LTR MaLR -1 378 1 2 1688 374 295 101 118 chr2 144672534 144672899 -37075188 - ORR1E LTR MaLR 0 359 1 2 1688 1939 220 93 6 chr2 144679600 144680085 -37068002 - RLTR11A2 LTR ERVK 0 527 1 3 1688 287 309 121 132 chr2 144682165 144682430 -37065657 + ORR1E LTR MaLR 87 348 -11 3 1688 310 290 109 103 chr2 144682567 144682986 -37065101 - ORR1E LTR MaLR -4 404 5 3 1688 2088 176 41 95 chr2 144683219 144683683 -37064404 - RMER21A LTR ERV1 -506 441 3 3 1688 316 319 51 76 chr2 144686569 144686766 -37061321 + LTR16E2 LTR ERVL 324 515 -53 3 1688 355 211 86 9 chr2 144687419 144687524 -37060563 + MTC-int LTR MaLR 1096 1208 -50 3 1688 339 259 62 9 chr2 144689281 144689394 -37058693 + MTC-int LTR MaLR 1135 1253 -5 3 1688 1891 207 16 77 chr2 144689403 144689751 -37058336 + MTC LTR MaLR 1 341 -80 3 1688 1891 207 16 77 chr2 144689869 144689960 -37058127 + MTC LTR MaLR 342 413 -8 3 1688 663 308 44 89 chr2 144690245 144690634 -37057453 - MLT2C2 LTR ERVL -49 348 2 3 1688 1904 207 68 18 chr2 144692020 144692419 -37055668 + MTD LTR MaLR 1 419 0 3 1688 407 291 51 114 chr2 144700980 144701217 -37046870 - RMER12 LTR ERVK 0 1322 1101 3 1688 4654 105 65 10 chr2 144701390 144702007 -37046080 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1037 811 173 3 1688 4654 105 65 10 chr2 144702072 144702223 -37045864 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1676 172 3 3 1689 260 339 8 63 chr2 144704567 144704693 -37043394 + MLT1A1 LTR MaLR 20 138 -270 3 1689 564 312 115 12 chr2 144708556 144708887 -37039200 + MLT1A0 LTR MaLR 1 365 0 3 1689 266 346 9 88 chr2 144709767 144709881 -37038206 + LTR16C LTR ERVL 178 282 -207 3 1689 341 306 96 42 chr2 144710861 144711028 -37037059 - MLT1B LTR MaLR -214 176 1 3 1689 1840 216 5 48 chr2 144714117 144714516 -37033571 - RLTR14 LTR ERV1 0 382 1 3 1689 254 297 27 13 chr2 144714866 144714941 -37033146 + MLT1G1 LTR MaLR 13 88 -503 3 1689 278 359 45 7 chr2 144714952 144715106 -37032981 + MLT1G1 LTR MaLR 200 359 -220 3 1689 522 294 114 51 chr2 144720421 144720694 -37027393 + LTR16C LTR ERVL 200 489 0 3 1689 4414 158 63 101 chr2 144720715 144721630 -37026457 - RMER19B LTR ERVK -19 883 3 3 1689 1910 172 71 5 chr2 144721684 144722052 -37026035 + MTD LTR MaLR 28 419 0 3 1689 2869 227 48 54 chr2 144724932 144725023 -37023064 + RLTR40 LTR ERVK 1 92 -725 3 1689 2128 120 226 16 chr2 144725023 144725404 -37022683 - RMER6B LTR ERVK 0 461 1 3 1689 2869 227 48 54 chr2 144725404 144725543 -37022544 + RLTR40 LTR ERVK 93 225 -592 3 1689 2869 227 48 54 chr2 144725732 144726312 -37021775 + RLTR40 LTR ERVK 226 807 -10 3 1689 353 280 56 0 chr2 144727460 144727567 -37020520 - LTR81A LTR ERV1? -1095 255 143 3 1689 332 261 43 35 chr2 144727659 144727774 -37020313 - LTR37B LTR ERV1 -8 460 345 3 1689 397 286 56 49 chr2 144729971 144730133 -37017954 - MER31B LTR ERV1 -54 412 250 3 1689 267 291 115 11 chr2 144731233 144731320 -37016767 - MER34A LTR ERV1 -386 185 90 3 1689 588 338 144 16 chr2 144733460 144733773 -37014314 + MLT1G3 LTR MaLR 73 425 -170 3 1689 931 263 181 56 chr2 144733795 144734325 -37013762 + LTR48 LTR ERV1 2 519 -125 3 1689 476 364 19 33 chr2 144734581 144734919 -37013168 - MLT1J1 LTR MaLR -111 337 2 3 1689 612 298 51 68 chr2 144739385 144739619 -37008468 + MLT1A LTR MaLR 1 230 -144 3 1689 779 276 54 65 chr2 144740685 144740945 -37007142 - MTE2a LTR MaLR -1 378 122 3 1689 535 260 151 57 chr2 144746538 144746869 -37001218 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 4 4 1689 1992 129 3 67 chr2 144750399 144750740 -36997347 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 4 1689 225 203 91 30 chr2 144754636 144754700 -36993387 - ORR1C1 LTR MaLR 0 384 317 4 1689 3709 151 40 52 chr2 144754700 144755058 -36993029 + RLTR17 LTR ERVK 3 376 -316 4 1689 3709 151 40 52 chr2 144755839 144756168 -36991919 + RLTR17 LTR ERVK 377 692 0 4 1689 1436 176 59 69 chr2 144756168 144756278 -36991809 - ORR1C1 LTR MaLR -76 302 189 4 1689 1436 176 59 69 chr2 144756393 144756587 -36991500 - ORR1C1 LTR MaLR -190 188 1 4 1689 1299 232 165 86 chr2 144759692 144760249 -36987838 + MT2B LTR ERVL 1 601 0 4 1689 2314 133 26 18 chr2 144764376 144764759 -36983328 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 1 4 1689 289 322 22 88 chr2 144768842 144768886 -36979201 + MLT1A LTR MaLR 16 60 -305 4 1689 289 322 22 88 chr2 144769083 144769174 -36978913 + MLT1A LTR MaLR 61 142 -223 4 1689 301 333 17 42 chr2 144769304 144769423 -36978664 + MLT1A LTR MaLR 259 374 0 4 1689 627 287 60 44 chr2 144771564 144771746 -36976341 + MLT1D LTR MaLR 1 185 -320 4 1689 361 330 81 15 chr2 144771773 144771970 -36976117 + MLT1D LTR MaLR 296 505 0 4 1689 238 333 116 6 chr2 144773399 144773571 -36974516 - MLT1G1 LTR MaLR -3 545 355 4 1689 426 363 129 5 chr2 144773637 144773861 -36974226 - MLT1G1 LTR MaLR -262 317 66 4 1689 341 216 58 55 chr2 144774262 144774397 -36973690 - MLT1A1 LTR MaLR -17 450 306 4 1689 586 343 118 28 chr2 144775821 144776220 -36971867 - LTR16E1 LTR ERVL -77 461 27 4 1689 2738 58 61 0 chr2 144783832 144784158 -36963929 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 4 1689 2297 164 34 3 chr2 144787781 144788165 -36959922 + MTC LTR MaLR 26 421 0 4 1689 468 301 96 79 chr2 144793018 144793372 -36954715 - MLT1A0 LTR MaLR -4 361 2 4 1689 1929 182 49 41 chr2 144797591 144797980 -36950107 - ORR1B1 LTR MaLR -2 392 1 4 1689 7629 164 96 75 chr2 144798008 144799844 -36948243 - ORR1B1-int LTR MaLR -59 1904 29 4 1689 2384 174 23 0 chr2 144799956 144800341 -36947746 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 4 1689 1559 256 34 23 chr2 144801106 144801490 -36946597 + MTD LTR MaLR 18 405 -14 4 1689 273 339 36 0 chr2 144808597 144808709 -36939378 - MLT1H2 LTR MaLR -339 150 35 4 1689 384 291 49 79 chr2 144811803 144811967 -36936120 + LTR16C LTR ERVL 314 472 -17 4 1689 702 177 52 30 chr2 144812421 144812555 -36935532 + MTD LTR MaLR 3 139 -280 4 1689 627 187 16 47 chr2 144812559 144812688 -36935399 + MTD LTR MaLR 287 411 -8 4 1689 438 300 185 69 chr2 144812648 144813036 -36935051 - MLT1G LTR MaLR -72 507 130 5 1689 313 371 41 71 chr2 144813241 144813580 -36934507 + ORR1E LTR MaLR 31 359 0 5 1689 274 327 91 0 chr2 144818091 144818201 -36929886 + MLT1H2 LTR MaLR 65 184 -305 5 1689 495 278 72 110 chr2 144819508 144819799 -36928288 - RLTR31A_Mm LTR ERVK 0 584 305 5 1689 2794 192 82 3 chr2 144819799 144820370 -36927717 - RLTR17 LTR ERVK -23 669 54 5 1689 1046 274 62 25 chr2 144820367 144820689 -36927398 + ORR1E LTR MaLR 26 359 0 5 1689 324 307 118 20 chr2 144822387 144822540 -36925547 + LTR16E1 LTR ERVL 368 535 -3 5 1689 675 271 29 6 chr2 144824980 144825151 -36922936 + MTD LTR MaLR 1 175 -244 5 1689 518 208 60 23 chr2 144826822 144826948 -36921139 + MTD LTR MaLR 253 383 -36 5 1689 1820 226 29 46 chr2 144826948 144827361 -36920726 - MTD LTR MaLR 0 419 14 5 1689 2847 149 74 16 chr2 144829896 144830395 -36917692 + RLTR11A LTR ERVK 1 528 0 5 1689 985 318 117 17 chr2 144832241 144832711 -36915376 - MLT1H1 LTR MaLR -10 545 29 5 1689 646 252 183 70 chr2 144834015 144834288 -36913799 - ORR1E LTR MaLR -55 304 1 5 1690 365 343 77 0 chr2 144835348 144835491 -36912596 - MLT1G3 LTR MaLR -58 537 384 5 1690 1749 206 96 21 chr2 144842462 144842848 -36905239 + MTD LTR MaLR 5 419 0 5 1690 278 359 43 49 chr2 144848502 144848666 -36899421 + LTR16A LTR ERVL 219 381 -70 5 1690 1355 246 70 19 chr2 144866025 144866581 -36881506 - RMER19A LTR ERVK -15 722 87 5 1690 233 266 0 130 chr2 144868678 144868704 -36879383 + MT2B LTR ERVL 146 157 -444 5 1690 1309 241 7 94 chr2 144871118 144871521 -36876566 + ORR1D2 LTR MaLR 3 370 0 5 1690 396 300 59 103 chr2 144878288 144878559 -36869528 + ORR1E LTR MaLR 97 355 -4 5 1690 375 330 83 69 chr2 144883716 144883993 -36864094 + ORR1E LTR MaLR 22 302 -57 6 1690 723 222 19 17 chr2 144886240 144886415 -36861672 + MTEb LTR MaLR 13 183 -196 6 1690 276 143 69 35 chr2 144886523 144886581 -36861506 + MTEb LTR MaLR 163 222 -157 6 1690 309 211 27 27 chr2 144886610 144886683 -36861404 + MTEb LTR MaLR 307 379 0 6 1690 317 362 13 32 chr2 144886684 144886841 -36861246 - MER90 LTR ERV1 -177 398 245 6 1690 1408 226 57 25 chr2 144889040 144889407 -36858680 - MTE2b LTR MaLR 0 379 1 6 1690 620 245 92 152 chr2 144890002 144890391 -36857696 + ORR1C2 LTR MaLR 5 370 -14 6 1690 411 297 203 28 chr2 144894448 144894739 -36853348 - MLT1A0 LTR MaLR -12 353 12 6 1690 271 329 75 25 chr2 144895548 144895707 -36852380 + MLT1A0 LTR MaLR 199 365 0 6 1690 268 318 65 0 chr2 144895943 144896050 -36852037 - ERVL-B4-int LTR ERVL -828 4886 4773 6 1690 2981 166 131 13 chr2 144898827 144899329 -36848758 - RMER6C LTR ERVK 0 690 125 6 1690 2981 166 131 13 chr2 144899383 144899497 -36848590 - RMER6C LTR ERVK -566 124 2 6 1690 1067 304 23 47 chr2 144903054 144903144 -36844943 - MTEa LTR MaLR 0 379 288 6 1690 1530 237 56 43 chr2 144903144 144903558 -36844529 - MTD LTR MaLR 0 419 1 6 1690 1067 304 23 47 chr2 144903558 144903853 -36844234 - MTEa LTR MaLR -92 287 3 6 1690 441 176 11 21 chr2 144919462 144919555 -36828532 - MTD LTR MaLR 0 421 330 6 1690 1983 154 11 20 chr2 144919555 144919912 -36828175 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 41 6 1690 1702 208 7 0 chr2 144919922 144920230 -36827857 - MTD LTR MaLR -92 327 18 6 1690 3106 79 5 9 chr2 144921047 144921470 -36826617 + BGLII LTR ERVK 1 421 0 6 1690 4251 51 20 3 chr2 144921746 144922341 -36825746 + MTA_Mm-int LTR MaLR 494 1098 0 6 1690 2582 53 3 3 chr2 144922341 144922683 -36825404 + MTA_Mm LTR MaLR 1 342 -54 6 1690 673 340 81 53 chr2 144929509 144929978 -36818109 - MLT1E3 LTR MaLR 0 624 143 6 1690 225 286 22 77 chr2 144930913 144931004 -36817083 - MTEa LTR MaLR -287 92 7 6 1690 365 299 9 18 chr2 144933566 144933675 -36814412 + MTEa LTR MaLR 260 367 -12 6 1690 2421 113 0 0 chr2 144935536 144935863 -36812224 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 6 1690 453 373 37 45 chr2 144935907 144936151 -36811936 - LTR16C LTR ERVL -243 246 5 6 1690 2408 113 0 0 chr2 144941970 144942297 -36805790 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 6 1690 2289 95 28 19 chr2 144944139 144944503 -36803584 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 6 1690 29168 25 1 2 chr2 144944505 144947780 -36800307 - IAPEz-int LTR ERVK -2 6479 3209 6 1690 8393 83 53 57 chr2 144947778 144949090 -36798997 - IAPEz-int LTR ERVK -5168 1313 8 6 1690 2265 98 28 19 chr2 144949090 144949454 -36798633 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 6 1690 1687 228 29 3 chr2 144951379 144951758 -36796329 - RMER19C LTR ERVK 0 611 223 6 1690 301 306 220 54 chr2 144953684 144954089 -36793998 + LTR50 LTR ERVL 209 680 -115 6 1690 1226 298 30 11 chr2 144954654 144955024 -36793063 - MTE2b LTR MaLR -2 377 1 6 1690 242 282 137 0 chr2 144955650 144955767 -36792320 + MLT1C LTR MaLR 11 143 -324 6 1690 616 124 9 28 chr2 144961957 144962065 -36786022 + RMER4B LTR ERVK 19 124 -342 7 1690 811 132 65 14 chr2 144962069 144962322 -36785765 + RMER4B LTR ERVK 281 585 0 7 1690 376 193 0 35 chr2 144963621 144963707 -36784380 + ORR1B1 LTR MaLR 34 116 -278 7 1690 1170 204 34 116 chr2 144963943 144964270 -36783817 + ORR1B1 LTR MaLR 95 394 0 7 211 1410 193 76 18 chr2 144965426 144965769 -36782318 + RLTR20A LTR ERVK 1 363 -178 7 1691 411 161 12 47 chr2 144972168 144972253 -36775834 + RLTR20A LTR ERVK 351 432 -109 7 1691 1098 256 129 34 chr2 144973247 144973616 -36774471 + MTD LTR MaLR 5 383 -36 7 1691 3523 25 2 0 chr2 144973935 144974330 -36773757 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 7 1691 590 314 69 72 chr2 144975434 144975794 -36772293 + ORR1E LTR MaLR 1 359 0 7 1691 472 207 103 58 chr2 144980662 144980836 -36767251 + RMER20B LTR ERVK 236 417 -210 7 1691 884 260 90 66 chr2 144997261 144997747 -36750340 - MLT1G3 LTR MaLR -3 592 84 7 1691 877 253 153 86 chr2 145012776 145012824 -36735263 - MT2A LTR ERVL 0 533 490 2 1691 877 253 153 86 chr2 145012860 145013287 -36734800 - MT2A LTR ERVL -44 489 26 2 1691 844 301 103 43 chr2 145013559 145014025 -36734062 + MLT1D LTR MaLR 3 496 -9 3 1691 304 339 38 8 chr2 145016120 145016251 -36731836 + ORR1E LTR MaLR 3 137 -222 3 1691 1278 259 54 14 chr2 145018991 145019344 -36728743 + MTE2b LTR MaLR 2 368 -11 3 1691 1842 154 25 36 chr2 145022717 145023075 -36725012 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 41 4 1691 731 289 97 26 chr2 145027285 145027676 -36720411 - LTR37A LTR ERV1 -4 422 4 4 1691 279 272 207 17 chr2 145041278 145041394 -36706693 - LTR16E1 LTR ERVL -1 537 400 6 1691 229 343 64 43 chr2 145041901 145042041 -36706046 - LTR16E1 LTR ERVL -137 352 210 6 1691 988 291 43 9 chr2 145047881 145048203 -36699884 - MTEa LTR MaLR -8 371 39 7 1691 358 316 113 29 chr2 145053419 145053657 -36694430 + LTR16E1 LTR ERVL 221 478 -60 7 1691 394 356 56 28 chr2 145070310 145070523 -36677564 - LTR16C LTR ERVL -95 394 176 8 1691 437 301 106 36 chr2 145083133 145083414 -36664673 + MLT1G3 LTR MaLR 111 411 -184 1 1692 1522 187 70 112 chr2 145098042 145098133 -36649954 - MTD LTR MaLR -8 411 332 1 1692 1522 187 70 112 chr2 145098276 145098611 -36649476 - MTD LTR MaLR -88 331 3 1 1692 298 342 32 45 chr2 145102064 145102220 -36645867 + LTR16C LTR ERVL 2 155 -334 1 1692 267 349 57 0 chr2 145102286 145102392 -36645695 + LTR16C LTR ERVL 285 396 -93 1 1692 2188 115 40 18 chr2 145106945 145107155 -36640932 + RMER17C LTR ERVK 1 224 -186 1 1692 2188 115 40 18 chr2 145107202 145107390 -36640697 + RMER17C LTR ERVK 225 407 -3 1 1692 1157 239 95 37 chr2 145110848 145111196 -36636891 + ORR1D2 LTR MaLR 1 368 -2 1 1692 226 233 43 120 chr2 145113124 145113241 -36634846 + MER72B LTR ERV1 506 613 -155 1 1692 405 346 40 29 chr2 145117007 145117214 -36630873 - MLT1H LTR MaLR 0 549 282 1 1692 250 309 102 40 chr2 145117309 145117465 -36630622 - MLT1H LTR MaLR -397 198 26 1 1692 1485 202 18 30 chr2 145119596 145119932 -36628155 - MTC-int LTR MaLR -686 572 261 1 1692 697 318 40 24 chr2 145119934 145120182 -36627905 + MLT1C LTR MaLR 216 467 0 1 1692 284 299 45 123 chr2 145121973 145122331 -36625756 + RMER17C LTR ERVK 8 337 -73 1 1692 492 364 131 43 chr2 145126756 145127198 -36620889 + LTR16C LTR ERVL 1 481 -8 1 1692 2461 102 6 3 chr2 145127742 145128068 -36620019 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 1 1692 1919 209 38 8 chr2 145132595 145132990 -36615097 - MTD LTR MaLR 0 419 13 1 1692 249 359 71 54 chr2 145149522 145149561 -36598526 + LTR16C LTR ERVL 82 123 -366 1 1692 1461 208 91 61 chr2 145149561 145149924 -36598163 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 1 1692 249 359 71 54 chr2 145149924 145149996 -36598091 + LTR16C LTR ERVL 124 195 -294 1 1692 674 318 102 78 chr2 145163759 145164298 -36583789 - MLT2B3 LTR ERVL -2 552 1 1 1692 1026 274 13 146 chr2 145187155 145187628 -36560459 - MTD LTR MaLR -15 404 8 2 1692 250 330 43 0 chr2 145190352 145190446 -36557641 - LTR16C LTR ERVL -164 325 228 2 1692 2105 173 23 36 chr2 145195841 145196230 -36551857 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 2 1692 246 335 78 12 chr2 145196796 145196962 -36551125 - RMER5 LTR ERV1 -62 472 296 2 1692 309 298 131 48 chr2 145200224 145200453 -36547634 - LTR16B LTR ERVL -2 461 214 2 1692 1331 218 93 0 chr2 145202235 145202579 -36545508 + MTD LTR MaLR 44 419 0 2 1692 1224 287 79 36 chr2 145202636 145203132 -36544955 - MER74A LTR ERVL -30 528 12 2 1692 448 260 1 37 chr2 145208530 145208687 -36539400 - MLT1A0 LTR MaLR 0 390 241 2 1692 522 342 108 24 chr2 145214177 145214521 -36533566 + LTR16C LTR ERVL 138 484 -54 2 1692 411 327 129 78 chr2 145216181 145216513 -36531574 - ORR1E LTR MaLR -9 350 2 2 1692 345 313 116 67 chr2 145220275 145220559 -36527528 - MLT1A LTR MaLR 0 374 77 2 1692 755 116 413 107 chr2 145225779 145226031 -36522056 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 2 1693 440 191 21 0 chr2 145230332 145230426 -36517661 - RLTR20B3 LTR ERVK -4 573 478 2 1693 1824 140 12 16 chr2 145233929 145234248 -36513839 + ORR1A3 LTR MaLR 1 318 -8 2 1693 988 150 58 34 chr2 145249333 145249540 -36498547 + MTC LTR MaLR 1 212 -209 3 1693 1275 170 5 5 chr2 145250082 145250306 -36497781 + MTC LTR MaLR 196 419 -2 3 1693 2002 189 37 22 chr2 145250318 145250602 -36497485 + MTC LTR MaLR 10 308 -113 3 1693 3088 32 0 0 chr2 145250602 145250948 -36497139 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 3 1693 12622 52 87 2 chr2 145250948 145252601 -36495486 + ORR1A0-int LTR MaLR 1 1792 0 3 1693 3115 23 0 0 chr2 145252601 145252947 -36495140 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 3 1693 2002 189 37 22 chr2 145252947 145253066 -36495021 + MTC LTR MaLR 309 419 -2 3 1693 1297 112 19 5 chr2 145253324 145253540 -36494547 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 257 3 1693 3929 79 5 47 chr2 145253540 145254225 -36493862 - MERVL-int LTR ERVL -4396 1089 3 3 1693 227 396 78 29 chr2 145254844 145255086 -36493001 - LTR16A1 LTR ERVL -202 254 1 3 1693 568 340 51 29 chr2 145258188 145258539 -36489548 + ORR1E LTR MaLR 1 359 0 3 1693 295 288 174 43 chr2 145265140 145265347 -36482740 - RMER15 LTR ERVL -39 536 303 3 1693 388 279 41 48 chr2 145267199 145267346 -36480741 + MLT1A LTR MaLR 15 160 -214 3 1693 321 310 16 95 chr2 145267579 145267768 -36480319 + MLT1A LTR MaLR 192 365 -9 3 1693 1674 145 215 3 chr2 145268124 145268449 -36479638 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 3 1693 3303 138 50 15 chr2 145271544 145272262 -36475825 - RLTR13D3 LTR ERVK 0 1114 1 3 1693 269 344 87 58 chr2 145275505 145275746 -36472341 - MLT1H1 LTR MaLR -248 307 60 3 1693 1118 192 211 32 chr2 145276669 145276981 -36471106 + ORR1D2 LTR MaLR 1 368 -2 3 1693 483 274 66 19 chr2 145279821 145280060 -36468027 - ORR1E LTR MaLR -125 249 7 3 1693 241 390 80 24 chr2 145283348 145283721 -36464366 + LTR16C LTR ERVL 21 414 -75 3 1693 397 260 60 35 chr2 145306006 145306212 -36441875 - MLT1J1 LTR MaLR -296 216 1 3 1693 236 139 0 0 chr2 145309147 145309190 -36438897 + MTEa LTR MaLR 337 379 0 3 1693 427 314 62 11 chr2 145312696 145312873 -36435214 - MLT1A0 LTR MaLR -24 341 156 3 1693 350 300 0 10 chr2 145314169 145314270 -36433817 - MLT1A0 LTR MaLR -218 147 48 3 1693 1195 238 85 37 chr2 145314358 145314733 -36433354 - MTD LTR MaLR -14 405 13 3 1693 664 141 117 0 chr2 145316062 145316190 -36431897 - RMER19B LTR ERVK 0 902 760 3 1693 3827 168 57 10 chr2 145322930 145323644 -36424443 - RMER19B LTR ERVK -154 748 1 3 1693 253 366 73 43 chr2 145325087 145325484 -36422603 - LTR16C LTR ERVL -54 435 27 3 1693 262 329 101 25 chr2 145330272 145330431 -36417656 - LTR16C LTR ERVL 0 489 319 4 1693 256 337 61 0 chr2 145330465 145330563 -36417524 - LTR16C LTR ERVL -228 261 158 4 1693 866 320 106 21 chr2 145348044 145348468 -36399619 - LTR16C LTR ERVL 0 489 30 4 1693 358 289 33 88 chr2 145352082 145352264 -36395823 - ORR1E LTR MaLR -196 174 3 4 1693 633 265 116 5 chr2 145353154 145353344 -36394743 - MTEa LTR MaLR -30 349 139 4 1694 738 242 75 120 chr2 145358993 145359369 -36388718 + ORR1E LTR MaLR 1 359 0 4 1694 1843 160 14 41 chr2 145361660 145362024 -36386063 + ORR1B1 LTR MaLR 41 394 0 4 1694 1136 320 42 23 chr2 145363726 145364200 -36383887 + MLT1F LTR MaLR 9 491 -57 4 1694 329 177 0 135 chr2 145365875 145365986 -36382101 + IAPEz-int LTR ERVK 832 927 -5554 4 1694 273 268 0 129 chr2 145365967 145366158 -36381929 + IAPEz-int LTR ERVK 816 935 -5546 4 1694 1259 286 33 11 chr2 145367414 145367782 -36380305 + MTE2a LTR MaLR 1 376 -3 4 1694 469 299 138 12 chr2 145374226 145374562 -36373525 - MLT1B LTR MaLR -11 379 2 4 1694 375 314 18 73 chr2 145380711 145380876 -36367211 - MLT1H LTR MaLR -1 548 393 4 1694 357 335 75 65 chr2 145380880 145381081 -36367006 - MLT1H LTR MaLR -258 291 89 4 1694 364 250 241 7 chr2 145387918 145388055 -36360032 - MLT1D LTR MaLR -61 444 276 4 1694 583 326 96 45 chr2 145388870 145388920 -36359167 - MLT1B LTR MaLR -11 379 327 4 1694 583 326 96 45 chr2 145388943 145389245 -36358842 - MLT1B LTR MaLR -64 326 9 4 1694 449 330 168 46 chr2 145391351 145391761 -36356326 - MLT1G LTR MaLR -1 594 95 4 1694 2877 207 117 33 chr2 145396177 145396662 -36351425 + RMER13A LTR ERVK 1 530 -330 5 1694 2877 207 117 33 chr2 145396712 145396894 -36351193 + RMER13A LTR ERVK 531 719 -141 5 1694 2877 207 117 33 chr2 145396915 145397039 -36351048 + RMER13A LTR ERVK 720 859 -1 5 1694 291 330 172 22 chr2 145399843 145400023 -36348064 + LTR16C LTR ERVL 35 241 -248 5 1694 334 284 118 59 chr2 145406209 145406417 -36341670 + LTR16B1 LTR ERVL 171 400 -62 5 1694 236 185 179 36 chr2 145407341 145407425 -36340662 + MLT2B1 LTR ERVL 3 98 -417 5 1694 557 304 67 43 chr2 145407415 145407669 -36340418 - ORR1E LTR MaLR -5 354 95 5 1694 894 305 139 37 chr2 145407742 145408117 -36339970 + MLT2B1 LTR ERVL 108 520 0 5 1694 854 269 63 150 chr2 145412037 145412417 -36335670 - MTE2a LTR MaLR -30 349 3 5 1694 296 284 81 0 chr2 145414858 145414932 -36333155 - ORR1E LTR MaLR -275 84 5 5 1694 276 362 111 62 chr2 145417437 145417761 -36330326 - ORR1E LTR MaLR 0 359 20 5 1694 2256 125 56 8 chr2 145418873 145419228 -36328859 - ORR1C1 LTR MaLR -2 376 5 5 1694 1154 247 62 46 chr2 145420513 145420882 -36327205 - MTE2a LTR MaLR 0 379 5 5 1694 2298 111 183 8 chr2 145431321 145431692 -36316395 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 5 1694 1579 236 75 34 chr2 145431696 145432161 -36315926 - RLTR11A2 LTR ERVK -25 502 19 5 1694 1213 255 76 29 chr2 145437833 145438176 -36309911 - MTD LTR MaLR 0 419 61 5 1694 1622 191 113 22 chr2 145441497 145441867 -36306220 - MTD LTR MaLR -14 405 2 5 1694 456 316 67 25 chr2 145444442 145444746 -36303341 - MER77 LTR ERVL -3 604 237 5 1694 3036 14 5 52 chr2 145450974 145451359 -36296728 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 5 1694 29549 18 1 2 chr2 145451359 145454634 -36293453 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 3210 5 1694 7332 82 108 37 chr2 145454633 145455850 -36292237 - IAPEz-int LTR ERVK -5168 1313 67 5 1694 1054 85 152 0 chr2 145455821 145455985 -36292102 - IAPEz-int LTR ERVK -6285 196 8 5 1694 3036 14 5 52 chr2 145455985 145456370 -36291717 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 5 1694 472 233 29 52 chr2 145458737 145458873 -36289214 + MLT1A1 LTR MaLR 271 403 -5 5 1694 463 111 426 0 chr2 145460386 145460494 -36287593 + ORR1B2 LTR MaLR 214 367 0 5 1694 2022 157 16 11 chr2 145464256 145464623 -36283464 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 6 5 1694 2074 110 23 94 chr2 145464687 145465039 -36283048 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 5 1694 3676 103 128 46 chr2 145473493 145474187 -36273900 + RMER17A LTR ERVK 1 751 0 6 1694 582 265 20 99 chr2 145475149 145475466 -36272621 - MTD LTR MaLR -14 405 131 6 1694 1531 237 55 17 chr2 145475476 145475880 -36272207 - MTD LTR MaLR 0 419 1 6 1694 243 220 0 0 chr2 145476020 145476070 -36272017 + MTE2b LTR MaLR 1 50 -329 6 1694 2346 203 20 56 chr2 145476099 145476651 -36271436 - RMER15 LTR ERVL -43 532 1 6 1694 1191 241 64 27 chr2 145476702 145477000 -36271087 + MTE2b LTR MaLR 57 365 -14 6 1694 2036 172 11 8 chr2 145479157 145479521 -36268566 - RLTR17 LTR ERVK -98 594 230 6 1694 1297 116 40 4 chr2 145480130 145480355 -36267732 - RLTR17 LTR ERVK -442 250 18 6 1694 1034 252 99 19 chr2 145481681 145482005 -36266082 - ORR1E LTR MaLR -6 353 4 6 1694 963 258 53 90 chr2 145483867 145484252 -36263835 + MTE2a LTR MaLR 35 404 -15 6 1694 596 279 133 113 chr2 145486270 145486434 -36261653 - RMER5 LTR ERV1 -6 528 349 6 1694 2393 82 25 0 chr2 145486434 145486753 -36261334 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 6 1694 596 279 133 113 chr2 145486753 145486964 -36261123 - RMER5 LTR ERV1 -186 348 131 6 1694 596 279 133 113 chr2 145487236 145487264 -36260823 - RMER5 LTR ERV1 -404 130 114 6 1694 2693 22 0 47 chr2 145487264 145487602 -36260485 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 322 0 6 1694 596 279 133 113 chr2 145487602 145487656 -36260431 - RMER5 LTR ERV1 -421 113 60 6 1694 394 256 112 94 chr2 145489159 145489383 -36258704 + MLT1C LTR MaLR 58 285 -182 6 1695 403 263 97 19 chr2 145492457 145492612 -36255475 + MER89 LTR ERV1 391 557 -2 6 1695 267 267 26 10 chr2 145492612 145492708 -36255379 + MLT1C LTR MaLR 389 493 -161 6 1695 399 307 49 6 chr2 145494982 145495146 -36252941 - MLT1H2 LTR MaLR -29 460 290 6 1695 983 225 92 41 chr2 145495227 145495519 -36252568 - MTEb LTR MaLR -4 375 69 6 1695 229 308 67 0 chr2 145495656 145495760 -36252327 - MLT1H2 LTR MaLR -413 142 32 6 1695 3406 183 206 11 chr2 145496118 145496838 -36251249 + RMER13A LTR ERVK 1 860 0 6 1695 1869 174 32 48 chr2 145502942 145503321 -36244766 + ORR1D1 LTR MaLR 2 374 0 2 1695 822 259 78 22 chr2 145504679 145504958 -36243129 - ORR1D2 LTR MaLR -67 312 1 5 1695 301 296 22 22 chr2 145510246 145510336 -36237751 - MTE2a LTR MaLR -17 362 273 1 1695 651 316 105 46 chr2 145510513 145510798 -36237289 - MTEa LTR MaLR 0 379 78 1 1695 322 289 154 19 chr2 145511716 145511878 -36236209 + MLT1C LTR MaLR 270 453 -14 2 1695 321 329 43 68 chr2 145515253 145515416 -36232671 - MER34 LTR ERV1 -3 539 381 2 1695 1320 192 60 37 chr2 145516980 145517331 -36230756 - RLTR10D LTR ERVK 0 359 1 3 1695 310 274 201 65 chr2 145521911 145522232 -36225855 - RLTR12B LTR ERVK -117 411 47 4 1695 292 248 104 17 chr2 145523630 145523745 -36224342 - LTR16C LTR ERVL 0 489 365 4 1695 562 310 92 81 chr2 145526109 145526691 -36221396 + MLT1F1 LTR MaLR 1 577 -2 4 1695 554 310 192 35 chr2 145527550 145527978 -36220109 - MTE-int LTR MaLR -722 858 223 5 1695 765 254 45 20 chr2 145529793 145529994 -36218093 - RMER5 LTR ERV1 0 534 329 5 1695 252 254 0 130 chr2 145530230 145530242 -36217845 + MT2B LTR ERVL 156 157 -444 5 1695 414 236 89 41 chr2 145530335 145530481 -36217606 - RMER5 LTR ERV1 -188 346 194 5 1695 400 315 80 97 chr2 145534094 145534456 -36213631 - MLT1A0 LTR MaLR -4 361 6 6 1695 304 285 167 95 chr2 145538878 145539099 -36208988 + MLT1G1 LTR MaLR 54 290 -289 7 1695 278 233 76 22 chr2 145540032 145540124 -36207963 - MLT1H LTR MaLR -66 483 387 7 1695 303 275 39 70 chr2 145540259 145540388 -36207699 - MLT1H LTR MaLR -381 168 44 7 1695 581 250 182 48 chr2 145548852 145549104 -36198983 - MTE2a LTR MaLR -17 362 77 8 1695 307 277 133 60 chr2 145549488 145549638 -36198449 - MLT1H LTR MaLR -306 243 83 9 1695 1176 155 23 37 chr2 145550856 145551069 -36197018 + MTC LTR MaLR 1 210 -211 9 1695 1415 165 0 4 chr2 145551421 145551646 -36196441 + MTC LTR MaLR 196 419 -2 9 1695 397 283 51 61 chr2 145551976 145552247 -36195840 + MTEa LTR MaLR 94 367 -12 9 1695 548 328 35 85 chr2 145558146 145558406 -36189681 - MLT1A LTR MaLR 0 374 128 1 1695 3593 15 2 0 chr2 145558412 145558807 -36189280 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1695 9835 16 0 1 chr2 145558807 145559906 -36188181 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 1 1695 3600 13 2 0 chr2 145559906 145560301 -36187786 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1695 1445 292 36 7 chr2 145562249 145562663 -36185424 - MER54A LTR ERVL -475 426 1 1 1695 233 347 30 10 chr2 145567043 145567142 -36180945 + LTR33A LTR ERVL 83 183 -337 1 1695 313 331 52 22 chr2 145569012 145569148 -36178939 + LTR16B2 LTR ERVL 319 458 -4 1 1695 2301 116 0 0 chr2 145571036 145571365 -36176722 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 1 1695 1292 226 82 18 chr2 145572625 145572968 -36175119 + ORR1D2 LTR MaLR 2 366 -4 1 1695 335 308 141 12 chr2 145573374 145573558 -36174529 + MTE2b LTR MaLR 127 351 -28 1 1695 411 322 137 48 chr2 145573655 145574027 -36174060 + MLT1A1 LTR MaLR 4 408 0 1 1695 3475 30 5 0 chr2 145574070 145574464 -36173623 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1695 1237 277 78 20 chr2 145574639 145575019 -36173068 + MTD LTR MaLR 8 405 -14 1 1695 819 227 138 15 chr2 145576680 145576940 -36171147 - RLTR28B LTR ERVL -162 319 28 1 1695 928 194 160 26 chr2 145580627 145580900 -36167187 + MTD LTR MaLR 19 397 -22 1 1695 1570 150 154 47 chr2 145580916 145581085 -36167002 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 176 1 1695 1570 150 154 47 chr2 145581235 145581407 -36166680 - ORR1C2 LTR MaLR -209 175 6 1 1695 272 226 81 54 chr2 145582794 145582917 -36165170 - LTR16C LTR ERVL -39 499 372 1 1695 251 350 82 48 chr2 145582961 145583108 -36164979 - LTR16C LTR ERVL -269 220 69 1 1695 1410 241 82 22 chr2 145583959 145584413 -36163674 + MER31A LTR ERV1 1 481 -4 1 1695 657 292 123 15 chr2 145585044 145585305 -36162782 + LTR16C LTR ERVL 154 442 -47 1 1695 1214 221 86 58 chr2 145587283 145587651 -36160436 - MT2B LTR ERVL -1 600 99 1 1695 3421 38 2 0 chr2 145587925 145588320 -36159767 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 1695 525 252 14 82 chr2 145588584 145588731 -36159356 - MT2B LTR ERVL -462 139 3 1 1695 271 278 71 10 chr2 145590613 145590711 -36157376 - MTEb LTR MaLR -2 377 274 1 1695 259 319 31 70 chr2 145590945 145590977 -36157110 - MLT2B3 LTR ERVL -429 125 3 1 1695 260 273 21 83 chr2 145590977 145591073 -36157014 - MTEb LTR MaLR -287 92 3 1 1695 235 265 158 105 chr2 145596258 145596372 -36151715 + LTR16C LTR ERVL 362 481 -8 1 1695 282 336 20 79 chr2 145596549 145596727 -36151360 - MTE2a LTR MaLR -1 378 195 1 1695 273 241 0 227 chr2 145596872 145597022 -36151065 - MLT1A1 LTR MaLR -292 116 1 1 1695 1100 254 135 29 chr2 145597831 145598172 -36149915 - MTEb LTR MaLR 0 379 3 1 1695 923 259 33 71 chr2 145600066 145600429 -36147658 + MTE2a LTR MaLR 88 405 -14 2 1695 995 265 79 32 chr2 145605424 145605767 -36142320 - ORR1E LTR MaLR 0 359 1 2 1695 250 332 114 67 chr2 145613201 145613562 -36134525 - MER110 LTR ERV1 -61 430 53 2 1695 2615 152 40 32 chr2 145614825 145615348 -36132739 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 527 0 2 1695 2796 116 54 70 chr2 145616295 145616813 -36131274 - RLTR28 LTR ERVL -14 510 1 2 1696 695 279 75 94 chr2 145628480 145628864 -36119223 + MTEa LTR MaLR 3 379 0 2 1696 485 198 27 15 chr2 145634860 145634963 -36113124 + MLT1A1 LTR MaLR 303 489 -16 2 1696 1737 157 19 72 chr2 145657168 145657355 -36090732 - RMER17C LTR ERVK 0 410 232 3 1696 1737 157 19 72 chr2 145657385 145657630 -36090457 - RMER17C LTR ERVK -179 231 1 3 1696 675 185 21 80 chr2 145661509 145661697 -36086390 - RMER10A LTR ERVL 0 442 266 3 1696 315 302 0 2 chr2 145664710 145664817 -36083270 - MER57-int LTR ERV1 -302 7235 7155 3 1696 227 303 76 0 chr2 145682370 145682427 -36065660 + RMER12 LTR ERVK 754 815 -507 4 1696 248 281 76 33 chr2 145694782 145694874 -36053213 + LTR16E1 LTR ERVL 443 538 0 4 1696 562 252 32 66 chr2 145695436 145695680 -36052407 + MTEa LTR MaLR 128 379 0 4 1696 269 224 40 150 chr2 145696220 145696319 -36051768 + RMER17D LTR ERVK 366 458 -431 4 1696 269 224 40 150 chr2 145696511 145696611 -36051476 + RMER17D LTR ERVK 459 543 -346 4 1696 393 264 108 54 chr2 145697819 145697967 -36050120 - LTR31 LTR ERV1 -60 559 404 4 1696 2347 151 48 54 chr2 145700995 145701479 -36046608 + RLTR28B LTR ERVL 1 481 0 4 1696 231 308 89 61 chr2 145707065 145707279 -36040808 + RMER15 LTR ERVL 211 430 -145 4 1696 1747 173 52 48 chr2 145720363 145720772 -36027315 - RMER16 LTR ERVK 0 533 1 4 1696 741 141 0 8 chr2 145723054 145723176 -36024911 - RMER10B LTR ERVL 0 398 278 4 1696 820 122 8 0 chr2 145723178 145723309 -36024778 - RMER10B LTR ERVL -252 146 15 4 1696 2765 62 267 2 chr2 145726129 145726534 -36021553 - RLTR1B LTR ERV1 0 512 1 4 1696 1108 183 142 17 chr2 145732218 145732513 -36015574 - MTD LTR MaLR -87 332 1 5 1696 3200 199 88 5 chr2 145732561 145733307 -36014780 - RLTR40 LTR ERVK -9 808 1 5 1697 876 259 180 30 chr2 145759236 145759598 -35988489 - MTD LTR MaLR -1 418 3 5 1697 257 280 46 9 chr2 145771632 145771740 -35976347 + MTD LTR MaLR 55 166 -253 5 1697 822 160 89 52 chr2 145772083 145772274 -35975813 + MTD LTR MaLR 206 403 -16 5 1697 902 253 70 44 chr2 145777700 145778066 -35970021 - RLTR18 LTR ERVK -3 613 129 5 1697 530 253 55 15 chr2 145778228 145778403 -35969684 - RLTR18B LTR ERVK -431 185 1 5 1697 957 244 93 25 chr2 145780648 145781017 -35967070 - MTE2a LTR MaLR -22 397 7 5 1697 1755 153 78 46 chr2 145786017 145786387 -35961700 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 3 6 1697 2227 149 100 12 chr2 145789265 145789685 -35958402 - RMER6B LTR ERVK 0 461 5 6 1697 863 201 142 28 chr2 145791092 145791350 -35956737 + MTD LTR MaLR 1 271 -136 6 1697 3047 147 119 32 chr2 145795106 145795668 -35952419 - RMER19C LTR ERVK 0 611 1 6 1697 1446 251 54 13 chr2 145801749 145802140 -35945947 - MTD LTR MaLR 0 419 13 6 1697 227 288 237 35 chr2 145804596 145804769 -35943318 + LTR16C LTR ERVL 204 411 -78 6 1697 482 226 65 24 chr2 145806522 145806690 -35941397 - MLT1B LTR MaLR -50 340 166 6 1697 835 255 64 53 chr2 145809061 145809438 -35938649 - RMER5 LTR ERV1 0 534 154 6 1697 1326 184 82 48 chr2 145813532 145813886 -35934201 + ORR1D1 LTR MaLR 1 366 -8 6 1697 285 224 66 120 chr2 145816994 145817161 -35930926 + MTC LTR MaLR 204 361 -60 6 1697 445 89 0 12 chr2 145817786 145817866 -35930221 - RMER4A LTR ERVK -3 463 385 6 1697 394 259 176 11 chr2 145818810 145818997 -35929090 - MTE2a LTR MaLR 0 379 162 6 1697 523 263 85 11 chr2 145822320 145822497 -35925590 - MTE2a LTR MaLR -189 190 1 6 1697 737 221 118 75 chr2 145822890 145823237 -35924850 - RMER13A LTR ERVK -399 461 100 6 1697 286 322 122 38 chr2 145836997 145837210 -35910877 - MLT1D LTR MaLR -6 499 269 6 1697 378 296 16 0 chr2 145837260 145837385 -35910702 - MLT1D LTR MaLR -333 172 46 6 1697 731 243 220 13 chr2 145843248 145843548 -35904539 + ORR1D2 LTR MaLR 6 367 -3 7 1697 773 260 35 13 chr2 145843552 145843782 -35904305 - RMER15 LTR ERVL -42 533 299 7 1697 1341 266 65 65 chr2 145843945 145844500 -35903587 - RMER15-int LTR ERVL -20 4979 4425 7 1697 862 220 155 76 chr2 145844500 145844944 -35903143 - MT2A LTR ERVL 0 533 1 7 1697 2571 194 40 17 chr2 145844945 145845464 -35902623 - MERVL_2A-int LTR ERVL -1 5760 5230 7 1697 5839 182 30 30 chr2 145845457 145845639 -35902448 - MERVL_2A-int LTR ERVL -864 4897 4705 7 1697 11650 176 42 24 chr2 145845794 145846997 -35901090 - MERVL_2A-int LTR ERVL -1057 4704 3076 7 1697 2309 153 34 37 chr2 145846997 145847405 -35900682 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 7 1697 11650 163 67 10 chr2 145847405 145849092 -35898995 - MERVL_2A-int LTR ERVL -2686 3075 1285 7 1697 1277 260 34 6 chr2 145849556 145849908 -35898179 + MTEa LTR MaLR 18 379 0 7 1697 2042 185 82 5 chr2 145856263 145856654 -35891433 + MTC LTR MaLR 1 421 0 7 1697 313 289 30 30 chr2 145864301 145864433 -35883654 + LTR33 LTR ERVL 374 505 -10 7 1697 1494 141 168 10 chr2 145867114 145867423 -35880664 - ORR1C1 LTR MaLR -8 370 2 7 1697 1084 260 14 0 chr2 145877732 145877999 -35870088 - MTE2b LTR MaLR -66 313 42 7 1697 289 279 99 55 chr2 145879790 145879972 -35868115 - LTR78 LTR ERV1 -129 1175 986 7 1697 3029 113 133 8 chr2 145882022 145882541 -35865546 + RMER4B LTR ERVK 1 584 -1 7 1698 735 304 146 47 chr2 145889969 145890393 -35857694 + MER21B LTR ERV1 195 660 -203 7 1698 387 353 87 65 chr2 145893404 145893774 -35854313 + MLT1J LTR MaLR 135 512 0 7 1698 541 284 107 79 chr2 145893986 145894277 -35853810 + ORR1E LTR MaLR 1 299 -60 7 1698 492 210 39 77 chr2 145896706 145896791 -35851296 + RMER17C LTR ERVK 1 84 -326 7 1698 492 272 37 75 chr2 145896946 145897166 -35850921 + RMER17C LTR ERVK 85 375 -35 7 1698 2368 124 91 40 chr2 145899689 145900141 -35847946 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 8 1698 280 272 88 16 chr2 145900745 145900895 -35847192 + MLT1H LTR MaLR 310 533 -16 8 1698 7224 86 43 12 chr2 145907898 145908890 -35839197 - RLTR13D5 LTR ERVK 0 1023 1 8 1698 250 248 96 113 chr2 145911984 145912161 -35835926 - ORR1A4 LTR MaLR -32 297 124 8 1698 265 377 34 77 chr2 145916831 145917038 -35831049 + MLT1J LTR MaLR 13 210 -302 8 1698 1518 162 221 21 chr2 145921638 145921876 -35826211 - MTC LTR MaLR -8 413 105 8 1698 1518 162 221 21 chr2 145922066 145922167 -35825920 - MTC LTR MaLR -317 104 6 8 1698 713 327 47 113 chr2 145934936 145935450 -35812637 + MLT1G3 LTR MaLR 116 595 0 8 1698 1657 254 46 21 chr2 145947427 145947902 -35800185 + MTE-int LTR MaLR 770 1256 -324 8 1698 279 383 9 0 chr2 145947936 145948043 -35800044 + ORR1E LTR MaLR 4 111 -248 8 1698 245 262 49 12 chr2 145948217 145948298 -35799789 + ORR1E LTR MaLR 272 355 -24 8 1698 2092 159 67 0 chr2 145956688 145957046 -35791041 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 3 9 1698 394 266 212 46 chr2 145957304 145957673 -35790414 + MLT1C LTR MaLR 34 463 -4 9 1698 348 319 65 38 chr2 145957861 145958080 -35790007 - RMER20B LTR ERVK -192 435 206 9 1698 326 268 126 42 chr2 145961277 145961491 -35786596 - RMER20B LTR ERVK -216 411 180 9 1698 2219 91 3 6 chr2 145961506 145961839 -35786248 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 332 -5 9 1698 11231 60 38 74 chr2 145961839 145963632 -35784455 + IAPEz-int LTR ERVK 6 1648 -4833 9 1698 1950 97 4 0 chr2 145963619 145963876 -35784211 + IAPEz-int LTR ERVK 2240 2497 -5183 9 1698 15236 45 10 1 chr2 145963875 145965682 -35782405 + IAPEz-int LTR ERVK 4656 6479 -2 9 1698 2257 85 3 6 chr2 145965684 145966017 -35782070 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 332 -5 9 1698 1590 167 131 21 chr2 145968378 145968715 -35779372 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 9 1698 523 341 111 23 chr2 145971331 145971547 -35776540 + MLT1F LTR MaLR 15 249 -299 9 1698 230 292 115 0 chr2 145972574 145972687 -35775400 + MLT1F LTR MaLR 373 498 -50 9 1698 902 220 188 16 chr2 145973033 145973342 -35774745 - MTEb LTR MaLR 0 379 18 9 1698 259 283 43 11 chr2 145973875 145973968 -35774119 + MLT1J LTR MaLR 83 178 -334 9 1698 2893 53 3 0 chr2 145976481 145976861 -35771226 - MTB_Mm LTR MaLR -26 381 1 9 1698 2162 102 45 3 chr2 145976894 145977208 -35770879 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 9 1698 391 173 13 0 chr2 145978061 145978136 -35769951 - MTE2a LTR MaLR 0 379 304 9 1698 368 244 0 0 chr2 145978134 145978212 -35769875 - MTE2a LTR MaLR -244 135 58 9 1698 280 277 0 108 chr2 145978212 145978267 -35769820 - MTE2a LTR MaLR -281 98 53 9 1698 280 277 0 108 chr2 145978464 145978501 -35769586 - MTE2a LTR MaLR -327 52 16 9 1698 2932 161 10 2 chr2 145990399 145990911 -35757176 - RMER20A LTR ERVK 0 516 1 9 1698 311 289 199 10 chr2 145996096 145996292 -35751795 - RMER15 LTR ERVL -19 556 324 9 1698 558 203 158 26 chr2 146003072 146003224 -35744863 + MTD LTR MaLR 76 247 -172 5 1698 565 134 60 35 chr2 146003565 146003652 -35744435 + MTD LTR MaLR 245 334 -85 5 1698 565 134 60 35 chr2 146003847 146003875 -35744212 + MTD LTR MaLR 335 363 -56 5 1698 250 330 53 0 chr2 146009141 146009235 -35738852 + MLT1B LTR MaLR 204 302 -88 1 1698 362 282 239 14 chr2 146011292 146011631 -35736456 + LTR16D LTR ERVL 206 647 -28 1 1699 2652 10 0 0 chr2 146037684 146037984 -35710103 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 47 7 1699 2927 68 0 68 chr2 146039792 146040217 -35707870 + MTB LTR MaLR 5 400 0 7 1699 364 292 68 118 chr2 146056082 146056248 -35691839 + MLT1A0 LTR MaLR 1 171 -194 1 1699 296 212 0 88 chr2 146056498 146056602 -35691485 + MLT1A0 LTR MaLR 270 373 -17 1 1699 643 292 65 57 chr2 146057921 146058273 -35689814 - ORR1E LTR MaLR 0 359 5 1 1699 404 329 0 21 chr2 146058592 146058735 -35689352 + MLT1N2 LTR MaLR 2 141 -421 1 1699 382 298 112 25 chr2 146059361 146059557 -35688530 + MLT1G1 LTR MaLR 79 291 -288 1 1699 304 261 31 86 chr2 146060166 146060297 -35687790 - MLT1F LTR MaLR -24 567 428 1 1699 366 309 61 12 chr2 146060732 146060876 -35687211 - MLT1F LTR MaLR -266 313 122 1 1699 362 319 35 28 chr2 146061920 146062065 -35686022 - MLT1F LTR MaLR -228 146 1 1 1699 249 197 39 26 chr2 146091270 146091348 -35656739 - MLT1D LTR MaLR -329 176 98 1 1699 1325 208 169 6 chr2 146109396 146109745 -35638342 - MTD LTR MaLR 0 419 14 1 1699 2618 132 68 5 chr2 146128845 146129241 -35618846 + MTC LTR MaLR 1 421 0 1 1700 1954 177 21 32 chr2 146166274 146166648 -35581439 + ORR1C1 LTR MaLR 1 370 -8 2 1700 1659 224 36 22 chr2 146166704 146167069 -35581018 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 2 1700 229 227 135 126 chr2 146170295 146170406 -35577681 - MamGypLTR1a LTR Gypsy -600 184 73 2 1700 1821 177 55 31 chr2 146174867 146175252 -35572835 + ORR1D1-int LTR MaLR 977 1370 0 2 1700 1721 190 60 33 chr2 146175257 146175296 -35572791 + ORR1D1 LTR MaLR 1 38 -336 2 1700 1721 190 60 33 chr2 146175702 146176026 -35572061 + ORR1D1 LTR MaLR 39 374 0 2 1700 470 298 138 52 chr2 146195819 146196108 -35551979 + MTEa LTR MaLR 84 377 -2 2 1700 4086 97 146 9 chr2 146217538 146218203 -35529884 + RMER6A LTR ERVK 1 756 0 2 1700 315 44 133 0 chr2 146218600 146218645 -35529442 + RMER6A LTR ERVK 144 194 -562 2 1700 308 256 32 53 chr2 146220378 146220473 -35527614 + MTE2a LTR MaLR 1 93 -286 2 1700 621 315 48 34 chr2 146226571 146226840 -35521247 + MER74A LTR ERVL 15 287 -271 2 1700 4568 21 0 0 chr2 146229386 146229868 -35518219 + LTRIS_Mm LTR ERV1 1 482 0 2 1700 303 265 83 64 chr2 146249000 146249109 -35498978 + MLT1H LTR MaLR 13 123 -366 3 1700 471 330 131 29 chr2 146249144 146249419 -35498668 + MLT1H LTR MaLR 247 549 0 3 1700 250 299 45 77 chr2 146256102 146256258 -35491829 - RMER17D2 LTR ERVK -417 392 242 3 1700 2018 155 100 26 chr2 146267033 146267423 -35480664 - MTC LTR MaLR -2 419 1 3 1700 461 272 140 45 chr2 146270405 146270648 -35477439 + MLT1H1 LTR MaLR 282 547 -8 3 1700 251 209 94 52 chr2 146271435 146271531 -35476556 + MTEa LTR MaLR 278 377 -2 3 1701 1859 204 62 22 chr2 146280706 146281108 -35466979 + MTC LTR MaLR 1 418 -3 3 1701 2329 89 41 0 chr2 146293037 146293351 -35454736 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 4 1701 406 210 22 21 chr2 146298636 146298741 -35449346 + MER74A LTR ERVL 13 173 -449 4 1701 259 335 91 43 chr2 146298814 146299067 -35449020 + MER74A LTR ERVL 273 537 -21 4 1701 4055 146 36 32 chr2 146303931 146304644 -35443443 - RMER6D LTR ERVK -4 716 1 4 1701 269 259 59 51 chr2 146307215 146307333 -35440754 + MLT1H LTR MaLR 81 199 -350 4 1701 272 279 62 112 chr2 146307401 146307579 -35440508 + MLT1H LTR MaLR 381 549 0 4 1701 1046 286 60 103 chr2 146309358 146309939 -35438148 + MER21B LTR ERV1 193 748 -115 4 1701 3436 39 0 130 chr2 146314890 146315391 -35432696 + RLTR10C LTR ERVK 1 436 0 4 1701 301 342 46 5 chr2 146319212 146319406 -35428681 + MLT1L LTR MaLR 103 304 -306 4 1701 2166 136 179 27 chr2 146321162 146321648 -35426439 + RLTR20B2 LTR ERVK 1 560 0 4 1701 1027 166 230 13 chr2 146322855 146323155 -35424932 + ORR1D1 LTR MaLR 1 365 -9 4 1701 799 224 194 50 chr2 146323865 146324185 -35423902 + ORR1D2 LTR MaLR 1 366 -4 4 1701 293 250 195 35 chr2 146327515 146327689 -35420398 - LTR16B LTR ERVL 0 463 262 4 1701 259 374 59 30 chr2 146329352 146329589 -35418498 - MLT1K LTR MaLR -15 580 337 4 1701 3148 53 13 0 chr2 146341456 146341851 -35406236 - MTB LTR MaLR 0 400 1 4 1701 289 371 32 38 chr2 146342173 146342349 -35405738 + MLT1D LTR MaLR 18 192 -313 4 1701 2742 56 13 0 chr2 146344350 146344725 -35403362 + MTA_Mm LTR MaLR 4 383 -13 4 1701 884 234 171 24 chr2 146345387 146345713 -35402374 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 4 1701 1217 229 90 3 chr2 146346912 146347223 -35400864 + MTD LTR MaLR 11 348 -71 4 1701 591 206 73 27 chr2 146348955 146349105 -35398982 - RLTR28B LTR ERVL -316 165 9 5 1701 343 209 58 11 chr2 146350838 146350925 -35397162 + MTD LTR MaLR 57 147 -272 5 1701 573 188 193 30 chr2 146350973 146351170 -35396917 + MTD LTR MaLR 191 419 0 5 1701 640 177 23 15 chr2 146353865 146353997 -35394090 + ORR1B2 LTR MaLR 227 359 -8 5 1701 1359 235 73 3 chr2 146356789 146357131 -35390956 - ORR1D2 LTR MaLR -4 366 1 5 1701 243 360 34 26 chr2 146357131 146357240 -35390847 - ORR1E LTR MaLR -222 137 26 5 1701 1866 210 73 15 chr2 146357241 146357695 -35390392 + MT2A LTR ERVL 1 480 -53 5 1701 236 179 0 0 chr2 146357781 146357848 -35390239 + MT2A LTR ERVL 467 533 0 5 1701 3095 96 157 0 chr2 146360028 146360550 -35387537 + RLTR1D LTR ERV1 2 605 0 5 1701 2307 159 45 0 chr2 146367213 146367590 -35380497 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 5 1701 300 280 4 28 chr2 146371366 146371469 -35376618 + MLT1A1 LTR MaLR 279 396 -12 5 1701 252 331 72 26 chr2 146371843 146371995 -35376092 + LTR33 LTR ERVL 1 159 -356 5 1701 737 221 289 3 chr2 146376396 146376490 -35371597 + ORR1D1 LTR MaLR 1 124 -250 5 1701 737 221 289 3 chr2 146376552 146376748 -35371339 + ORR1D1 LTR MaLR 125 374 0 5 1701 236 325 30 37 chr2 146381348 146381482 -35366605 + MLT1H2 LTR MaLR 357 489 0 5 1701 895 241 132 39 chr2 146389631 146389963 -35358124 - MTD LTR MaLR -14 405 45 5 1701 973 242 32 141 chr2 146394404 146394808 -35353279 + MTE2a LTR MaLR 6 365 -14 6 1701 1015 279 34 7 chr2 146400455 146400751 -35347336 - MLT1B LTR MaLR -6 384 81 6 1701 362 217 21 32 chr2 146400991 146401086 -35347001 + MLT1A1 LTR MaLR 315 408 0 6 1701 297 298 24 0 chr2 146401086 146401169 -35346918 - MLT1B LTR MaLR -305 85 1 6 1701 2312 141 26 31 chr2 146403250 146403591 -35344496 - MTC LTR MaLR 0 421 82 6 1701 2312 141 26 31 chr2 146404196 146404277 -35343810 - MTC LTR MaLR -340 81 1 6 1701 1690 198 12 103 chr2 146404633 146404785 -35343302 + ORR1C1 LTR MaLR 1 128 -250 6 1701 1690 198 12 103 chr2 146404828 146405091 -35342996 + ORR1C1 LTR MaLR 129 378 0 6 1701 399 245 28 89 chr2 146406501 146406680 -35341407 + MTEb LTR MaLR 207 374 -5 6 1702 1328 277 93 8 chr2 146408506 146408998 -35339089 + RMER15 LTR ERVL 42 575 0 6 1702 1360 275 111 34 chr2 146409734 146410097 -35337990 - RMER15 LTR ERVL 0 575 196 6 1702 1360 275 111 34 chr2 146410200 146410370 -35337717 - RMER15 LTR ERVL -380 195 2 6 1702 333 100 20 0 chr2 146410419 146410469 -35337618 - RMER15 LTR ERVL -90 485 435 6 1702 387 162 0 86 chr2 146410888 146410969 -35337118 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 311 6 1702 846 152 74 9 chr2 146411232 146411410 -35336677 - ORR1C2 LTR MaLR -39 345 149 6 1702 402 288 104 0 chr2 146411932 146412057 -35336030 + ORR1E LTR MaLR 1 138 -221 6 1702 3181 58 12 24 chr2 146416358 146416784 -35331303 - BGLII LTR ERVK 0 421 1 6 1702 771 257 68 12 chr2 146417445 146417708 -35330379 + ORR1D2 LTR MaLR 1 277 -97 6 1702 660 313 34 52 chr2 146418048 146418375 -35329712 - MLT2B4 LTR ERVL -223 333 13 6 1702 5974 86 50 12 chr2 146425236 146426063 -35322024 - MMVL30-int LTR ERV1 -1177 2521 1664 6 1702 2410 100 0 6 chr2 146426065 146426396 -35321691 - MMVL30-int LTR ERV1 -2598 1100 772 6 1702 2231 184 88 18 chr2 146426888 146427386 -35320701 - MMVL30-int LTR ERV1 -7023 533 1 6 1702 4165 58 0 6 chr2 146427386 146427892 -35320195 - RLTR1C LTR ERV1 0 503 1 6 1702 284 264 92 139 chr2 146428313 146428370 -35319717 + MTD LTR MaLR 1 67 -312 6 1702 817 217 186 44 chr2 146428411 146428677 -35319410 + MTD LTR MaLR 68 403 -16 6 1702 2230 152 85 8 chr2 146428767 146429157 -35318930 - MTC LTR MaLR 0 421 2 6 1702 1862 186 67 42 chr2 146431039 146431565 -35316522 - RLTR20B3 LTR ERVK -15 562 24 6 1702 447 257 173 21 chr2 146431847 146432036 -35316051 + MLT2B1 LTR ERVL 18 235 -321 6 1702 406 156 187 8 chr2 146432036 146432159 -35315928 + ORR1B1 LTR MaLR 1 145 -249 6 1702 1123 158 44 0 chr2 146432260 146432463 -35315624 + ORR1B1 LTR MaLR 166 377 -1 6 1702 1316 239 101 40 chr2 146433044 146433520 -35314567 - RLTR16 LTR ERVK 0 505 1 6 1702 420 291 28 60 chr2 146434236 146434452 -35313635 - RLTR40 LTR ERVK -39 778 570 6 1702 743 223 137 45 chr2 146434509 146434823 -35313264 - RLTR40 LTR ERVK -456 361 19 6 1702 2123 118 43 19 chr2 146435679 146436049 -35312038 + ORR1B1-int LTR MaLR 1131 1509 0 6 1702 2123 137 82 8 chr2 146436049 146436416 -35311671 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 6 1702 1478 141 27 8 chr2 146436674 146436931 -35311156 - ORR1B2 LTR MaLR -105 262 1 6 1702 369 293 8 17 chr2 146437043 146437161 -35310926 - MTEa LTR MaLR -13 366 250 6 1702 1148 210 242 6 chr2 146437635 146437974 -35310113 - MTD LTR MaLR 0 419 1 6 1702 461 165 22 0 chr2 146440108 146440199 -35307888 + MTD LTR MaLR 2 94 -325 6 1702 1474 212 126 79 chr2 146440513 146441194 -35306893 + RLTR40 LTR ERVK 2 714 -103 6 1702 1886 179 8 56 chr2 146441194 146441572 -35306515 - ORR1C1 LTR MaLR -7 360 1 6 1702 6827 171 87 14 chr2 146441573 146442887 -35305200 - ORR1C1-int LTR MaLR -1 1508 103 6 1702 6827 171 87 14 chr2 146443049 146443139 -35304948 - ORR1C1-int LTR MaLR -1407 102 1 6 1702 1955 157 99 0 chr2 146443139 146443483 -35304604 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 6 1702 760 224 12 6 chr2 146443483 146443643 -35304444 + MTD LTR MaLR 221 381 -38 6 1702 2078 160 80 10 chr2 146443643 146444029 -35304058 + MTC LTR MaLR 1 413 -8 6 1702 238 257 27 13 chr2 146447817 146447892 -35300195 - MLT2D LTR ERVL 0 560 485 7 1702 619 311 30 17 chr2 146447931 146448163 -35299924 - MLT2D LTR ERVL -171 243 9 7 1702 613 356 111 18 chr2 146448619 146449071 -35299016 + MLT1H LTR MaLR 18 511 -38 7 1702 493 264 121 94 chr2 146465608 146465947 -35282140 - ORR1E LTR MaLR -11 348 1 7 1702 451 239 45 0 chr2 146471095 146471229 -35276858 - MTEa LTR MaLR -20 359 220 7 1702 1453 232 75 31 chr2 146473546 146473883 -35274204 - MTD LTR MaLR -11 408 55 7 1702 1453 232 75 31 chr2 146474747 146474796 -35273291 - MTD LTR MaLR -365 54 5 7 1702 292 297 29 80 chr2 146475440 146475566 -35272521 + MLT1J1 LTR MaLR 36 158 -290 7 1702 1399 193 29 11 chr2 146475804 146476081 -35272006 - MTC LTR MaLR -139 282 1 7 1702 1609 173 28 75 chr2 146478988 146479375 -35268712 + ORR1D1 LTR MaLR 1 369 -5 7 1702 228 262 35 23 chr2 146483937 146484023 -35264064 - ORR1E LTR MaLR -5 374 288 7 1702 260 318 18 27 chr2 146484137 146484247 -35263840 - ORR1E LTR MaLR -174 185 77 7 1702 246 257 29 0 chr2 146493468 146493538 -35254549 + MLT1A0 LTR MaLR 232 303 -62 7 1702 1130 307 91 17 chr2 146494382 146494846 -35253241 - MLT2B1 LTR ERVL -22 498 1 7 1702 1268 234 101 21 chr2 146495294 146495682 -35252405 + MTD LTR MaLR 1 419 0 7 1702 821 307 55 33 chr2 146497326 146497690 -35250397 + MER89 LTR ERV1 166 537 -22 7 1702 740 204 342 9 chr2 146497815 146498122 -35249965 + MTD LTR MaLR 1 409 -10 7 1702 317 291 68 45 chr2 146502325 146502458 -35245629 + MLT1G LTR MaLR 153 288 -303 3 1702 670 325 37 12 chr2 146504402 146504645 -35243442 - MTD LTR MaLR -115 304 56 9 1702 536 363 65 4 chr2 146505262 146505508 -35242579 - LTR16C LTR ERVL 0 489 229 1 1702 2069 166 106 12 chr2 146507925 146508341 -35239746 + RMER15 LTR ERVL 121 575 0 1 1702 1658 167 108 34 chr2 146508541 146509013 -35239074 - RMER17A LTR ERVK 0 751 245 1 1702 1409 78 5 5 chr2 146509914 146510121 -35237966 - RMER17A LTR ERVK -496 255 49 1 1702 400 169 11 0 chr2 146510135 146510224 -35237863 + RMER15 LTR ERVL 294 383 -192 2 1702 242 216 101 126 chr2 146510658 146510817 -35237270 - MTEb LTR MaLR -13 366 212 2 1702 1240 161 161 60 chr2 146511074 146511391 -35236696 - MTD LTR MaLR -7 412 64 2 1702 458 298 75 17 chr2 146511760 146511934 -35236153 + LTR88b LTR Gypsy? 654 837 0 2 1702 459 307 48 38 chr2 146513814 146514024 -35234063 - MLT1A1 LTR MaLR -196 212 1 3 1702 379 292 71 0 chr2 146517982 146518095 -35229992 + RLTR14 LTR ERV1 262 382 0 3 1702 379 343 50 98 chr2 146522051 146522410 -35225677 - ORR1E LTR MaLR -17 342 1 4 1702 247 259 8 129 chr2 146522829 146522953 -35225134 + RMER20B LTR ERVK 495 603 -24 4 1702 466 188 41 20 chr2 146526543 146526641 -35221446 - ETnERV2-int LTR ERVK -6254 1152 1053 5 1702 229 344 228 49 chr2 146528095 146528358 -35219729 + LTR78 LTR ERV1 417 726 -578 5 1702 1541 95 87 0 chr2 146532810 146533051 -35215036 + RMER17B LTR ERVK 1 262 -696 6 1702 2953 171 56 46 chr2 146533357 146533962 -35214125 + RMER19C LTR ERVK 1 611 0 6 1703 694 274 64 42 chr2 146542809 146543178 -35204909 - ORR1E LTR MaLR -10 360 1 6 1703 471 329 44 35 chr2 146552805 146553032 -35195055 - MLT1D LTR MaLR -1 504 276 7 1703 229 340 10 0 chr2 146553050 146553150 -35194937 - MLT1D LTR MaLR -332 173 73 7 1703 1171 218 75 47 chr2 146553315 146553633 -35194454 - MTD LTR MaLR -2 417 91 7 1703 2121 109 19 0 chr2 146555230 146555542 -35192545 + ORR1A2 LTR MaLR 1 318 -9 8 1703 251 200 67 39 chr2 146555579 146555683 -35192404 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 302 8 1703 230 312 83 60 chr2 146555808 146555941 -35192146 - MLT1A1 LTR MaLR -238 136 1 8 1703 2100 154 43 3 chr2 146557589 146557960 -35190127 + ORR1B1 LTR MaLR 1 386 -8 8 1703 1957 162 63 14 chr2 146562513 146562863 -35185224 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 9 1703 545 252 108 19 chr2 146563148 146563372 -35184715 - MTEb LTR MaLR 0 379 110 9 1703 482 271 14 27 chr2 146563368 146563516 -35184571 - MTEb LTR MaLR -272 147 2 9 1703 869 241 16 28 chr2 146565985 146566233 -35181854 + RMER15 LTR ERVL 9 253 -322 1 1703 1468 217 70 22 chr2 146566310 146566668 -35181419 + RMER15 LTR ERVL 201 575 0 1 1703 330 268 93 14 chr2 146568846 146568986 -35179101 - MLT1A0 LTR MaLR -6 359 209 1 1703 297 256 33 55 chr2 146569073 146569164 -35178923 - MLT1A0 LTR MaLR -276 98 10 1 1703 2409 149 8 0 chr2 146576809 146577184 -35170903 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 1 1703 384 222 131 0 chr2 146581696 146581795 -35166292 + MTEa LTR MaLR 9 120 -259 1 1703 384 251 14 16 chr2 146582127 146582252 -35165835 + MTEa LTR MaLR 132 257 -122 1 1703 1752 217 82 3 chr2 146583056 146583444 -35164643 + MTD LTR MaLR 1 419 0 1 1703 228 235 11 23 chr2 146585138 146585181 -35162906 - MLT1A1 LTR MaLR -21 387 345 1 1703 228 235 11 23 chr2 146585390 146585432 -35162655 - MLT1A1 LTR MaLR -64 344 304 1 1703 243 175 110 110 chr2 146592154 146592263 -35155824 + MLT1H2 LTR MaLR 57 165 -324 1 1703 228 330 27 36 chr2 146593160 146593270 -35154817 + LTR16C LTR ERVL 1 109 -380 1 1703 400 193 108 75 chr2 146595005 146595204 -35152883 - RMER20B LTR ERVK -204 423 219 1 1703 2177 136 20 64 chr2 146595690 146596082 -35152005 - ORR1C1 LTR MaLR -3 375 1 1 1703 1058 137 6 11 chr2 146601613 146601790 -35146297 - ORR1B2 LTR MaLR -189 178 3 1 1703 645 302 65 47 chr2 146601790 146602217 -35145870 - MLT2B4 LTR ERVL -21 696 230 1 1703 1662 172 30 60 chr2 146602219 146602589 -35145498 + ORR1B2 LTR MaLR 9 367 0 1 1703 636 271 12 6 chr2 146603495 146603655 -35144432 + MTE2b LTR MaLR 5 165 -214 1 1703 343 362 67 17 chr2 146605615 146605795 -35142292 + MLT1G LTR MaLR 35 223 -368 1 1703 258 283 19 57 chr2 146605940 146606045 -35142042 + MLT1G LTR MaLR 495 595 0 1 1703 389 249 85 104 chr2 146606351 146606585 -35141502 - MTEa LTR MaLR -4 375 122 1 1703 1164 275 45 13 chr2 146607395 146607708 -35140379 - MTEb LTR MaLR -56 323 1 1 1703 990 238 26 38 chr2 146607733 146608078 -35140009 + RLTR15 LTR ERVK 1 341 -18 1 1703 3113 69 2 5 chr2 146608670 146609065 -35139022 - MTA_Mm LTR MaLR -2 394 1 1 1703 436 313 50 81 chr2 146610449 146610769 -35137318 + LTR16A1 LTR ERVL 19 328 -128 1 1703 414 266 57 0 chr2 146610814 146610938 -35137149 - MLT1A0 LTR MaLR -232 133 3 1 1703 225 273 104 0 chr2 146611414 146611491 -35136596 + MLT1A1 LTR MaLR 308 392 -16 1 1703 284 293 69 42 chr2 146611722 146611911 -35136176 - RMER17C LTR ERVK -35 375 182 1 1703 4171 61 74 0 chr2 146614497 146615022 -35133065 + LTRIS2 LTR ERV1 1 564 0 1 1703 857 163 152 0 chr2 146616694 146616872 -35131215 - RLTR24 LTR ERV1 -6 523 319 2 1703 291 150 16 16 chr2 146616865 146616926 -35131161 - RLTR24 LTR ERV1 -353 176 116 2 1703 1586 110 84 7 chr2 146616921 146617206 -35130881 - MTC LTR MaLR -114 307 1 2 1703 506 314 211 14 chr2 146618688 146619053 -35129034 - MER70B LTR ERVL -141 437 1 2 1703 2226 86 42 60 chr2 146622154 146622487 -35125600 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 2 1703 3947 110 133 15 chr2 146632242 146632917 -35115170 + RMER6A LTR ERVK 2 756 0 2 1703 233 291 86 19 chr2 146633527 146633632 -35114455 - LTR16E1 LTR ERVL -21 517 406 2 1703 308 236 94 58 chr2 146633993 146634164 -35113923 + RLTR42-int LTR ERVK 1224 1400 -4122 2 1703 233 271 47 12 chr2 146636642 146636728 -35111359 - MLT1B LTR MaLR -300 90 2 2 1703 302 281 46 69 chr2 146640477 146640607 -35107480 - MLT1A1 LTR MaLR -262 146 20 2 1703 1031 226 98 44 chr2 146640651 146640947 -35107140 - ORR1E LTR MaLR -40 319 8 2 1703 633 225 160 0 chr2 146641257 146641426 -35106661 - MTD LTR MaLR 0 419 224 2 1703 247 109 21 21 chr2 146641421 146641468 -35106619 + MTE2b LTR MaLR 329 375 -4 2 1703 404 259 18 9 chr2 146641568 146641677 -35106410 - MTD LTR MaLR -201 218 109 2 1703 519 234 5 112 chr2 146641734 146641922 -35106165 - MTD-int LTR MaLR -677 581 414 2 1703 568 175 10 0 chr2 146642083 146642182 -35105905 - MTC LTR MaLR 0 419 320 2 1703 1706 163 101 9 chr2 146642182 146642528 -35105559 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 2 1703 1954 156 33 3 chr2 146642528 146642849 -35105238 - MTC LTR MaLR -90 331 1 2 1703 783 192 19 48 chr2 146643213 146643282 -35104805 - MTD-int LTR MaLR -670 428 363 2 1703 783 200 286 52 chr2 146643305 146643468 -35104619 - MTD-int LTR MaLR -893 365 162 2 1703 783 200 286 52 chr2 146643644 146643766 -35104321 - MTD-int LTR MaLR -1097 161 2 2 1703 749 214 121 0 chr2 146643770 146643943 -35104144 - MTD LTR MaLR -3 416 223 2 1703 510 299 116 52 chr2 146644028 146644374 -35103713 - LTR40a LTR ERVL -52 467 100 2 1703 2179 73 133 145 chr2 146644749 146645080 -35103007 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 105 2 1703 2179 73 133 145 chr2 146645106 146645209 -35102878 - RLTR23 LTR ERV1 -326 104 1 2 1703 332 288 190 28 chr2 146654827 146655201 -35092886 + MLT1H2 LTR MaLR 78 485 -4 2 1703 288 284 58 10 chr2 146656050 146656153 -35091934 - MLT1J LTR MaLR -322 190 83 2 1703 388 293 124 10 chr2 146667687 146667878 -35080209 + MLT2C1 LTR ERVL 142 354 -43 2 1704 1917 87 5 84 chr2 146670529 146670901 -35077186 + RLTR10A LTR ERVK 1 314 -45 3 1704 446 204 148 22 chr2 146672063 146672198 -35075889 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 257 3 1704 472 337 47 38 chr2 146672632 146672845 -35075242 + MTEb LTR MaLR 1 215 -164 3 1704 233 307 53 0 chr2 146673574 146673639 -35074448 - MLT1A0 LTR MaLR -295 70 2 3 1704 315 343 89 47 chr2 146673793 146674029 -35074058 + LTR16C LTR ERVL 231 538 0 3 1704 1891 143 36 60 chr2 146674075 146674410 -35073677 - ORR1A4 LTR MaLR -2 327 1 3 1704 291 328 22 14 chr2 146678203 146678342 -35069745 + MLT1A1 LTR MaLR 265 404 -4 3 1704 262 182 0 0 chr2 146678346 146678401 -35069686 - MLT2D LTR ERVL -270 144 90 3 1704 1507 233 27 15 chr2 146678403 146678734 -35069353 - RLTR19 LTR ERVK 0 499 165 3 1704 971 263 66 63 chr2 146678911 146679289 -35068798 - MTEa LTR MaLR 0 379 1 3 1704 3122 67 26 3 chr2 146685593 146685984 -35062103 - MTB LTR MaLR 0 400 1 3 1704 343 125 109 0 chr2 146685984 146686048 -35062039 - MTB-int LTR MaLR 0 1258 1188 3 1704 720 289 92 8 chr2 146700203 146700454 -35047633 - LTR16C LTR ERVL -5 484 213 3 1704 557 255 104 38 chr2 146707442 146707654 -35040433 + MLT1A0 LTR MaLR 4 229 -136 3 1704 285 302 33 11 chr2 146708881 146708990 -35039097 + MLT1A0 LTR MaLR 229 338 -70 3 1704 288 239 16 128 chr2 146711962 146712087 -35036000 - MT2B LTR ERVL -338 263 153 3 1704 3676 50 115 25 chr2 146715675 146716224 -35031863 + RLTR6_Mm LTR ERV1 1 598 -56 3 1704 260 263 123 105 chr2 146718755 146719031 -35029056 + RLTR12B LTR ERVK 55 335 -193 3 1704 297 220 34 0 chr2 146721208 146721267 -35026820 - MLT1H2 LTR MaLR -342 147 87 4 1704 972 237 120 3 chr2 146721743 146722027 -35026060 + MLT1E1 LTR MaLR 3 319 -335 4 1704 636 248 74 6 chr2 146722106 146722268 -35025819 + MLT1E1 LTR MaLR 468 640 -13 4 1704 602 275 164 22 chr2 146724748 146725023 -35023064 + MLT1A LTR MaLR 32 345 -29 4 1704 1129 329 77 18 chr2 146727377 146727855 -35020232 + MLT1H1 LTR MaLR 73 586 -5 4 1704 240 266 15 15 chr2 146728460 146728525 -35019562 - RLTR20B3 LTR ERVK 0 577 513 4 1704 1770 177 62 98 chr2 146728570 146728914 -35019173 - RLTR20B3 LTR ERVK -141 436 89 4 1704 1770 177 62 98 chr2 146728981 146729005 -35019082 - RLTR20B3 LTR ERVK -489 88 78 4 1704 1770 177 62 98 chr2 146729332 146729413 -35018674 - RLTR20B3 LTR ERVK -500 77 2 4 1704 463 224 47 95 chr2 146732473 146732621 -35015466 + MLT1G LTR MaLR 440 580 -11 4 1704 904 301 67 33 chr2 146733551 146733850 -35014237 + MLT1A LTR MaLR 44 352 -22 4 1704 485 250 8 77 chr2 146738188 146738318 -35009769 - MT2B LTR ERVL -325 276 156 4 1704 473 252 30 0 chr2 146741689 146741820 -35006267 - RMER15 LTR ERVL -19 556 422 4 1704 7792 13 4 0 chr2 146744297 146745116 -35002971 - RLTR13B2 LTR ERVK 0 822 1 4 1704 317 312 255 23 chr2 146748747 146749006 -34999081 - ORR1E LTR MaLR -40 319 1 4 1704 1637 182 73 30 chr2 146749320 146749488 -34998599 + ORR1C2 LTR MaLR 1 176 -208 4 1704 1637 182 73 30 chr2 146749660 146749675 -34998412 + ORR1C2 LTR MaLR 177 193 -191 4 1704 1637 182 73 30 chr2 146749725 146749908 -34998179 + ORR1C2 LTR MaLR 194 383 -1 4 1704 3704 31 62 47 chr2 146752112 146752580 -34995507 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 4 1704 1319 156 223 53 chr2 146752923 146753241 -34994846 - ORR1D1 LTR MaLR -2 372 1 4 1704 4074 78 89 4 chr2 146755914 146756452 -34991635 - MT2B2 LTR ERVL 0 584 1 4 1704 943 153 95 140 chr2 146758112 146758266 -34989821 - MTD LTR MaLR -8 411 266 4 1704 943 153 95 140 chr2 146758412 146758500 -34989587 - MTD LTR MaLR -154 265 180 4 1704 1746 115 169 0 chr2 146759552 146759831 -34988256 + ORR1A4 LTR MaLR 1 326 -3 4 1704 6989 94 21 21 chr2 146770458 146771412 -34976675 - RMER17B LTR ERVK -4 954 1 4 1704 303 303 94 67 chr2 146775443 146775666 -34972421 - MLT1C LTR MaLR -233 234 6 4 1704 680 57 0 0 chr2 146781644 146781732 -34966355 + LTRIS2 LTR ERV1 398 485 -79 4 1704 1292 145 78 82 chr2 146787644 146787937 -34960150 + MTD LTR MaLR 3 294 -125 5 1704 2146 142 85 0 chr2 146789285 146789638 -34958449 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 2 5 1704 3670 162 204 45 chr2 146789639 146790665 -34957422 - ORR1C2-int LTR MaLR 0 1509 321 5 1704 949 175 62 11 chr2 146790718 146790931 -34957156 - MTD LTR MaLR -20 399 194 5 1704 2244 105 12 79 chr2 146790948 146791353 -34956734 - RLTR1B LTR ERV1 0 512 135 5 1704 524 211 61 9 chr2 146791457 146791572 -34956515 - MTD LTR MaLR -209 210 90 5 1704 269 228 102 61 chr2 146791626 146791724 -34956363 - RLTR42 LTR ERVK 0 239 138 5 1704 1918 194 8 27 chr2 146796121 146796497 -34951590 + ORR1D1 LTR MaLR 3 371 -3 5 1704 2013 182 114 101 chr2 146796850 146797535 -34950552 + MTC-int LTR MaLR 454 1147 -111 5 1704 367 193 266 0 chr2 146797568 146797679 -34950408 + MTD LTR MaLR 206 341 -78 5 1704 457 216 8 57 chr2 146799579 146799702 -34948385 - RMER19B LTR ERVK -633 269 153 5 1704 1156 223 3 86 chr2 146799710 146800014 -34948073 - RMER19C LTR ERVK -332 279 1 5 1704 383 176 52 69 chr2 146800015 146800131 -34947956 + RMER15 LTR ERVL 50 163 -412 5 1704 883 241 95 19 chr2 146800145 146800407 -34947680 + RMER15 LTR ERVL 294 575 0 5 1705 1745 129 88 9 chr2 146802217 146802537 -34945550 + ORR1B1 LTR MaLR 41 385 -9 5 1705 348 308 84 51 chr2 146804062 146804240 -34943847 - MLT1G3 LTR MaLR 0 595 412 5 1705 349 242 22 11 chr2 146804269 146804361 -34943726 - MTEa LTR MaLR 0 379 287 5 1705 230 333 31 43 chr2 146804450 146804613 -34943474 - MTEa LTR MaLR -200 184 24 5 1705 271 247 0 83 chr2 146804636 146804720 -34943367 - MLT1G3 LTR MaLR -271 324 248 5 1705 699 95 0 0 chr2 146804937 146805042 -34943045 - RMER12B LTR ERVK -672 732 628 5 1705 2274 108 37 5 chr2 146805469 146805851 -34942236 - RMER12B LTR ERVK -750 654 261 5 1705 1803 145 65 18 chr2 146807998 146808336 -34939751 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 41 5 1705 908 160 101 83 chr2 146808521 146808784 -34939303 + RLTR31A_Mm LTR ERVK 276 584 0 5 1705 738 308 68 60 chr2 146812733 146812796 -34935291 + MTE2a LTR MaLR 6 71 -348 5 1705 2141 124 38 0 chr2 146812796 146813111 -34934976 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 5 1705 904 265 42 63 chr2 146813111 146813430 -34934657 + MTE2a LTR MaLR 58 391 -28 5 1705 1899 105 15 60 chr2 146816808 146817143 -34930944 - ORR1A4 LTR MaLR -8 321 2 5 1705 947 234 119 58 chr2 146817657 146817709 -34930378 + MTEa LTR MaLR 1 51 -328 5 1705 947 234 119 58 chr2 146817899 146818191 -34929896 + MTEa LTR MaLR 52 366 -13 5 1705 1980 263 60 2 chr2 146818215 146818749 -34929338 + MTE-int LTR MaLR 34 598 -982 5 1705 2203 173 48 27 chr2 146819728 146820250 -34927837 + RLTR20B3 LTR ERVK 19 577 0 5 1705 2102 82 73 0 chr2 146820585 146820900 -34927187 - ORR1A1 LTR MaLR -8 338 1 5 1705 2545 115 48 56 chr2 146821413 146821892 -34926195 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 5 1705 27164 11 1 2 chr2 146821892 146824852 -34923235 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 3525 5 1705 938 88 24 0 chr2 146824852 146824977 -34923110 - IAPEz-int LTR ERVK -2770 4910 4783 5 1705 1809 127 4 4 chr2 146824972 146825234 -34922853 - IAPEz-int LTR ERVK -5183 2497 2236 5 1705 454 66 0 32 chr2 146825223 146825286 -34922801 - IAPEz-int LTR ERVK -5062 1419 1359 5 1705 4539 60 66 20 chr2 146825286 146825924 -34922163 - IAPEz-int LTR ERVK -5819 662 3 5 1705 2510 119 48 56 chr2 146825926 146826405 -34921682 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 5 1705 27164 11 1 2 chr2 146826405 146829365 -34918722 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 3525 5 1705 938 88 24 0 chr2 146829365 146829490 -34918597 - IAPEz-int LTR ERVK -2770 4910 4783 5 1705 1809 127 4 4 chr2 146829485 146829747 -34918340 - IAPEz-int LTR ERVK -5183 2497 2236 5 1705 454 66 0 32 chr2 146829736 146829799 -34918288 - IAPEz-int LTR ERVK -5062 1419 1359 5 1705 4539 60 66 20 chr2 146829799 146830437 -34917650 - IAPEz-int LTR ERVK -5819 662 3 5 1705 2510 119 48 56 chr2 146830439 146830918 -34917169 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 5 1705 307 163 0 0 chr2 146831158 146831207 -34916880 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 326 5 1705 1073 156 30 5 chr2 146831220 146831420 -34916667 - ORR1D1 LTR MaLR -169 205 1 5 1705 402 268 89 0 chr2 146832526 146832649 -34915438 + MLT1B LTR MaLR 47 180 -210 5 1705 1827 188 36 22 chr2 146835842 146836201 -34911886 - ORR1D2 LTR MaLR -2 368 5 5 1705 437 218 36 101 chr2 146836278 146836416 -34911671 - RMER10B LTR ERVL 0 398 270 5 1705 325 200 26 130 chr2 146841666 146841781 -34906306 - MT2B LTR ERVL -344 257 155 5 1705 1650 140 17 100 chr2 146842220 146842587 -34905500 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 6 1705 3452 20 5 0 chr2 146847503 146847897 -34900190 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 1705 2128 165 61 8 chr2 146861799 146862190 -34885897 - MTC LTR MaLR 0 421 10 6 1705 378 219 8 123 chr2 146865177 146865307 -34882780 - MT2B LTR ERVL -345 256 142 6 1705 433 205 43 122 chr2 146868730 146868869 -34879218 - MT2B LTR ERVL -323 278 151 6 1705 1322 222 91 58 chr2 146870630 146871061 -34877026 - RLTR11A2 LTR ERVK -81 446 2 6 1705 586 290 143 23 chr2 146871088 146871388 -34876699 - MTEb LTR MaLR 0 379 44 6 1705 240 286 143 0 chr2 146871507 146871591 -34876496 - MTEa LTR MaLR -283 96 1 6 1705 642 285 99 105 chr2 146884073 146884426 -34863661 - ORR1E LTR MaLR -2 357 7 6 1705 2519 153 37 0 chr2 146886208 146886614 -34861473 - MTC LTR MaLR 0 421 1 6 1705 338 308 20 40 chr2 146923978 146924130 -34823957 + MLT1A1 LTR MaLR 210 401 -7 7 1705 1448 343 40 16 chr2 146924304 146924754 -34823333 + MTEa-int LTR MaLR 837 1297 -283 7 1705 774 272 73 11 chr2 146925169 146925429 -34822658 + MTEa-int LTR MaLR 1303 1578 -2 7 1705 767 298 96 74 chr2 146925431 146925794 -34822293 + MTEa LTR MaLR 1 371 -8 7 1705 405 307 459 19 chr2 146929898 146930160 -34817927 - LTR52 LTR ERVL -21 400 23 7 1706 414 321 82 72 chr2 146933173 146933381 -34814706 + LTR16A LTR ERVL 242 451 0 7 1706 1313 187 99 37 chr2 146933423 146933778 -34814309 + LTRIS5 LTR ERV1 71 447 0 7 1706 1790 182 56 0 chr2 146934159 146934500 -34813587 - RLTR11B LTR ERVK 0 453 94 7 1706 1641 168 82 22 chr2 146934517 146934882 -34813205 + RLTR11A2 LTR ERVK 141 527 0 7 1706 1298 200 244 3 chr2 146937878 146938214 -34809873 + MTD LTR MaLR 1 417 -2 7 1706 1537 239 74 11 chr2 146945367 146945747 -34802340 - MTD LTR MaLR -13 406 3 7 1706 229 268 72 12 chr2 146946677 146946760 -34801327 + MLT2C2 LTR ERVL 159 246 -218 7 1706 528 146 11 0 chr2 146949363 146949452 -34798635 - MTD LTR MaLR -319 100 11 7 1706 656 223 55 75 chr2 146949461 146949603 -34798484 + ORR1C1 LTR MaLR 8 147 -231 7 1706 656 223 55 75 chr2 146949767 146949822 -34798265 + ORR1C1 LTR MaLR 148 201 -177 7 1706 2028 138 27 54 chr2 146954957 146955325 -34792762 + RLTR15 LTR ERVK 2 359 0 7 1706 547 295 161 35 chr2 146956437 146956753 -34791334 + RMER13A LTR ERVK 95 450 -410 7 1706 231 378 35 43 chr2 146978485 146978626 -34769461 + MLT1J LTR MaLR 328 467 -45 8 1706 356 271 132 52 chr2 146978681 146978817 -34769270 - MLT2B1 LTR ERVL -215 305 159 8 1706 487 247 242 57 chr2 146978815 146979129 -34768958 + MLT1A1 LTR MaLR 30 401 -7 8 1706 1036 324 80 21 chr2 146983825 146984311 -34763776 - MLT2B2 LTR ERVL 0 515 1 8 1706 625 257 315 0 chr2 146986803 146987080 -34761007 - MTEb LTR MaLR -12 367 3 8 1706 694 259 43 0 chr2 146987087 146987272 -34760815 - MTEb-int LTR MaLR -5 1575 1383 8 1706 1735 258 20 54 chr2 146987473 146987978 -34760109 - MTEb-int LTR MaLR -152 1428 942 8 1706 483 256 8 24 chr2 146987978 146988102 -34759985 + MTD LTR MaLR 1 122 -297 8 1706 893 250 142 21 chr2 146988864 146989203 -34758884 - MLT1A1 LTR MaLR -21 387 8 8 1706 386 351 100 55 chr2 146989206 146989646 -34758441 + MLT1G LTR MaLR 51 510 -81 8 1706 1200 212 211 34 chr2 146992910 146993407 -34754680 - RMER4B LTR ERVK 0 585 1 8 1706 3499 25 4 132 chr2 146996465 146996965 -34751122 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 8 1706 1724 101 59 132 chr2 146999386 146999741 -34748346 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 8 1706 327 280 62 31 chr2 147002482 147002611 -34745476 - MLT1B LTR MaLR -38 352 220 6 1706 227 239 0 69 chr2 147026916 147026988 -34721099 - RLTR22_Mus LTR ERVK -28 1780 1714 3 1706 309 197 70 0 chr2 147028012 147028083 -34720004 - MLT1C LTR MaLR 0 467 392 3 1706 256 313 50 50 chr2 147028299 147028412 -34719675 - MLT1B LTR MaLR -218 172 60 4 1706 2329 106 0 68 chr2 147028595 147028948 -34719139 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 4 1706 2536 51 64 0 chr2 147032611 147032923 -34715164 - IAPEY3_LTR LTR ERVK 0 332 1 5 1706 265 337 98 32 chr2 147038715 147039027 -34709060 + MLT1E LTR MaLR 167 500 -154 6 1706 516 286 124 97 chr2 147042628 147043008 -34705079 - MLT1F-int LTR MaLR -1067 422 33 7 1706 1220 270 88 6 chr2 147055501 147055840 -34692247 + ORR1D2 LTR MaLR 4 370 0 1 1706 235 329 116 12 chr2 147060730 147060902 -34687185 + ORR1E LTR MaLR 1 190 -169 1 1706 235 275 17 52 chr2 147060995 147061110 -34686977 + ORR1E LTR MaLR 269 379 0 1 1707 233 373 84 22 chr2 147065097 147065322 -34682765 + LTR16E1 LTR ERVL 290 528 -10 1 1707 1005 134 43 11 chr2 147068908 147069096 -34678991 + RMER19B LTR ERVK 709 902 0 1 1707 348 268 8 97 chr2 147069587 147069711 -34678376 - MT2B LTR ERVL -336 265 153 1 1707 1942 196 47 17 chr2 147083510 147083914 -34664173 - MTD LTR MaLR 0 419 4 1 1707 257 259 67 11 chr2 147086941 147087031 -34661056 + MTEb LTR MaLR 283 377 -2 1 1707 561 232 93 28 chr2 147087575 147087757 -34660330 + MTEa LTR MaLR 186 379 0 1 1707 1872 201 39 17 chr2 147096290 147096700 -34651387 - MTD LTR MaLR 0 419 1 1 1707 932 277 80 16 chr2 147097407 147097719 -34650368 - MTE2b LTR MaLR -39 340 9 1 1707 1537 236 48 10 chr2 147098033 147098427 -34649660 - MTD LTR MaLR -10 409 1 1 1707 947 263 35 70 chr2 147098862 147099234 -34648853 - ORR1E LTR MaLR 0 359 1 1 1707 811 283 95 27 chr2 147108897 147109191 -34638896 - RMER15 LTR ERVL -29 546 233 2 1707 402 321 80 72 chr2 147109985 147110283 -34637804 + MLT1G LTR MaLR 4 303 -288 2 1707 276 348 75 79 chr2 147110885 147111190 -34636897 + MLT1J LTR MaLR 196 499 -13 2 1707 271 220 82 35 chr2 147112309 147112394 -34635693 + MLT1J LTR MaLR 491 579 0 2 1707 319 276 50 41 chr2 147114689 147114810 -34633277 + LTR16C LTR ERVL 367 488 -1 2 1707 4861 115 63 11 chr2 147118424 147119266 -34628821 - RLTR13D6 LTR ERVK -16 886 1 2 1707 3250 69 0 14 chr2 147120610 147121023 -34627064 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 2 1707 2016 124 34 25 chr2 147126170 147126493 -34621594 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 2 1707 396 335 34 45 chr2 147126783 147126961 -34621126 + MLT1G1 LTR MaLR 396 571 -8 2 1707 954 321 41 25 chr2 147132222 147132589 -34615498 + MTEa LTR MaLR 6 378 -1 2 1707 4182 183 69 74 chr2 147138084 147139032 -34609055 + RLTR21 LTR ERVK 29 976 -596 2 1707 4182 183 69 74 chr2 147139665 147139783 -34608304 + RLTR21 LTR ERVK 977 1093 -479 2 1707 299 317 90 59 chr2 147140483 147140738 -34607349 - LTR50 LTR ERVL -510 285 23 2 1707 477 302 49 0 chr2 147141714 147141876 -34606211 - MLT1D LTR MaLR 0 505 336 2 1707 1993 148 8 47 chr2 147143092 147143474 -34604613 - RMER6B LTR ERVK -1 460 94 2 1707 486 141 109 0 chr2 147143741 147143833 -34604254 - RMER6B LTR ERVK -359 102 1 2 1707 2056 160 94 25 chr2 147144150 147144542 -34603545 - MTD LTR MaLR 0 419 1 2 1707 295 305 156 11 chr2 147144750 147144929 -34603158 + MLT1C LTR MaLR 6 210 -257 2 1707 447 292 181 58 chr2 147144964 147145273 -34602814 - MT2A LTR ERVL -181 352 6 2 1707 237 302 29 59 chr2 147145724 147145826 -34602261 - MLT1H LTR MaLR -354 195 97 2 1707 426 276 23 169 chr2 147159521 147159812 -34588275 - MTEb LTR MaLR 0 379 85 3 1707 1102 248 108 34 chr2 147171579 147171740 -34576347 + MTEa LTR MaLR 1 183 -196 3 1707 1102 248 108 34 chr2 147171890 147172078 -34576009 + MTEa LTR MaLR 184 376 -3 3 1707 538 252 104 36 chr2 147175758 147176038 -34572049 + RMER15 LTR ERVL 277 575 0 3 1707 352 371 131 27 chr2 147180643 147180978 -34567109 - LTR16A LTR ERVL -74 377 8 3 1708 226 265 0 42 chr2 147210225 147210296 -34537791 - MTE2a LTR MaLR -37 342 275 3 1708 665 281 93 53 chr2 147211149 147211472 -34536615 - MT2A LTR ERVL -93 440 105 3 1708 281 297 109 0 chr2 147211435 147211563 -34536524 - MTE2a LTR MaLR -237 142 1 3 1708 278 267 110 11 chr2 147220771 147220862 -34527225 + MLT1F LTR MaLR 150 249 -299 3 1708 1231 246 95 23 chr2 147222144 147222493 -34525594 + MTEb LTR MaLR 4 377 -2 3 1708 439 309 85 42 chr2 147222493 147222675 -34525412 + MTEb-int LTR MaLR 12 201 -1379 3 1708 292 253 168 0 chr2 147223000 147223095 -34524992 + MTEb-int LTR MaLR 323 433 -1147 3 1708 2095 245 111 8 chr2 147223094 147223507 -34524580 + MTEb-int LTR MaLR 911 1349 -231 3 1708 2095 245 111 8 chr2 147223741 147223927 -34524160 + MTEb-int LTR MaLR 1355 1578 -2 3 1708 1283 268 14 30 chr2 147223939 147224301 -34523786 + MTEb LTR MaLR 24 379 0 3 1708 2088 129 3 13 chr2 147224667 147224981 -34523106 + RLTR10E LTR ERVK 1 311 0 3 1708 1749 134 13 23 chr2 147227933 147228239 -34519848 - ORR1B1 LTR MaLR -51 343 41 3 1708 737 285 82 44 chr2 147229555 147229874 -34518213 + MLT1F1 LTR MaLR 231 561 -8 4 1708 400 377 64 36 chr2 147230093 147230481 -34517606 + LTR16E1 LTR ERVL 140 538 0 4 1708 389 284 31 1 chr2 147233187 147233336 -34514751 + MERVL_2A-int LTR ERVL 1543 1786 -3975 4 1708 2823 203 106 40 chr2 147233485 147234177 -34513910 + RMER19A LTR ERVK 1 737 0 4 1708 645 299 114 39 chr2 147235847 147236181 -34511906 + ORR1E LTR MaLR 1 359 0 4 1708 1690 126 0 0 chr2 147241558 147241819 -34506268 + ORR1A2 LTR MaLR 59 319 -8 4 1708 258 229 0 108 chr2 147241839 147241897 -34506190 - MTEb LTR MaLR -5 374 322 4 1708 2150 259 27 2 chr2 147241897 147242416 -34505671 - MT2A LTR ERVL 0 533 2 4 1708 258 229 0 108 chr2 147242416 147242450 -34505637 - MTEb LTR MaLR -58 321 292 4 1708 267 379 111 0 chr2 147243326 147243516 -34504571 + MLT1J1 LTR MaLR 25 235 -209 4 1708 352 311 3 33 chr2 147250490 147250697 -34497390 - MLT1I LTR MaLR -259 290 64 4 1708 469 336 69 64 chr2 147253699 147254045 -34494042 - ORR1E LTR MaLR -11 348 1 4 1708 771 327 64 0 chr2 147254233 147254514 -34493573 - MTEa LTR MaLR -53 326 28 4 1708 461 276 90 52 chr2 147258633 147258866 -34489221 - ORR1E LTR MaLR -23 336 95 4 1708 1467 189 108 3 chr2 147260174 147260498 -34487589 - MTD LTR MaLR 0 419 62 4 1708 276 273 0 0 chr2 147263401 147263467 -34484620 - MLT2C2 LTR ERVL -372 92 27 4 1708 396 291 36 88 chr2 147264694 147264943 -34483144 + ORR1E LTR MaLR 35 270 -89 4 1708 229 336 47 16 chr2 147265984 147266111 -34481976 - LTR16C LTR ERVL -3 535 405 4 1708 274 382 23 0 chr2 147266194 147266325 -34481762 - LTR16C LTR ERVL -256 233 100 4 1708 1057 241 202 11 chr2 147266420 147266772 -34481315 + MTD LTR MaLR 1 419 0 4 1708 1108 192 169 25 chr2 147270948 147271268 -34476819 + ORR1D1 LTR MaLR 9 374 0 4 1708 270 352 11 0 chr2 147279032 147279120 -34468967 - MLT1J LTR MaLR -184 328 240 4 1708 282 307 162 26 chr2 147286195 147286269 -34461818 - LTR16C LTR ERVL 0 489 402 4 1708 1460 154 416 60 chr2 147286269 147286719 -34461368 - RMER19C LTR ERVK 0 611 2 4 1708 282 307 162 26 chr2 147286719 147286878 -34461209 - LTR16C LTR ERVL -88 401 225 4 1708 238 358 121 6 chr2 147286892 147287058 -34461029 - LTR16C LTR ERVL -301 188 4 4 1708 1306 124 209 80 chr2 147288812 147289162 -34458925 - RLTR6_Mm LTR ERV1 -223 431 37 4 1708 3314 39 0 0 chr2 147289275 147289658 -34458429 - RLTR6-int LTR ERV1 0 7778 7396 4 1708 436 244 40 24 chr2 147309745 147309871 -34438216 - MLT1C LTR MaLR -2 465 338 5 1708 328 237 58 17 chr2 147310306 147310426 -34437661 - MLT1C LTR MaLR -256 134 10 5 1708 744 284 99 15 chr2 147313015 147313358 -34434729 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 37 5 1708 377 260 114 16 chr2 147319465 147319649 -34428438 - RMER15 LTR ERVL -22 553 352 5 1708 403 257 138 28 chr2 147322525 147322810 -34425277 - MLT1B LTR MaLR -30 360 20 5 1709 251 250 139 26 chr2 147331236 147331351 -34416736 + ORR1E LTR MaLR 64 191 -168 5 1709 243 212 22 66 chr2 147332791 147332882 -34415205 - MLT1J LTR MaLR 0 408 322 5 1709 239 320 30 30 chr2 147333011 147333111 -34414976 - MLT1A0 LTR MaLR -265 100 1 5 1709 378 270 47 16 chr2 147333538 147333666 -34414421 - MLT1J LTR MaLR -338 174 43 5 1709 1333 255 121 18 chr2 147337490 147337870 -34410217 - MTD LTR MaLR 0 419 1 5 1709 410 349 79 50 chr2 147338600 147338878 -34409209 + LTR16C LTR ERVL 14 299 -190 5 1709 330 181 86 43 chr2 147340170 147340332 -34407755 + RMER17D LTR ERVK 354 522 -367 5 1709 298 327 137 91 chr2 147343799 147344149 -34403938 + LTR16E1 LTR ERVL 173 538 0 5 1709 297 341 5 69 chr2 147345869 147346058 -34402029 + MTEb LTR MaLR 203 379 0 5 1709 1096 269 81 36 chr2 147346169 147346478 -34401609 + ORR1E LTR MaLR 3 325 -34 5 1709 1888 187 24 16 chr2 147349635 147350010 -34398077 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 5 1709 325 323 117 25 chr2 147350102 147350264 -34397823 + LTR16A LTR ERVL 15 191 -260 5 1709 667 289 119 73 chr2 147354061 147354404 -34393683 - ORR1E LTR MaLR 0 359 1 5 1709 1960 161 43 19 chr2 147356866 147357239 -34390848 - ORR1C2 LTR MaLR -2 382 1 5 1709 884 276 51 64 chr2 147357289 147357602 -34390485 - ORR1E LTR MaLR -1 358 50 5 1709 4567 269 75 23 chr2 147357595 147357712 -34390375 - MTE-int LTR MaLR -33 1547 1444 5 1709 4567 269 75 23 chr2 147357744 147358860 -34389227 - MTE-int LTR MaLR -137 1443 250 5 1709 456 191 31 21 chr2 147358846 147358942 -34389145 - ORR1E LTR MaLR -297 97 1 5 1709 684 250 207 17 chr2 147358945 147359177 -34388910 - ORR1E LTR MaLR -58 301 26 5 1709 256 274 39 78 chr2 147361807 147361910 -34386177 - MLT1A LTR MaLR -257 117 19 5 1709 349 313 173 64 chr2 147362240 147362506 -34385581 + LTR16E1 LTR ERVL 240 534 -4 5 1709 1539 180 70 19 chr2 147363409 147363528 -34384559 + ORR1C1 LTR MaLR 41 173 -205 5 1709 1539 180 70 19 chr2 147363581 147363773 -34384314 + ORR1C1 LTR MaLR 174 368 -10 5 1709 1031 282 109 70 chr2 147379148 147379533 -34368554 + MTD LTR MaLR 1 400 0 6 1709 918 306 68 43 chr2 147379559 147379910 -34368177 + MLT1A1 LTR MaLR 3 362 -46 6 1709 2705 150 61 20 chr2 147388161 147388705 -34359382 + RLTR14-int LTR ERV1 4750 5315 -2 6 1709 1957 166 28 66 chr2 147388719 147388780 -34359307 + RLTR14 LTR ERV1 5 66 -316 6 1709 1957 166 28 66 chr2 147389018 147389299 -34358788 + RLTR14 LTR ERV1 67 333 -49 6 1709 1957 166 28 66 chr2 147390053 147390102 -34357985 + RLTR14 LTR ERV1 334 382 0 6 1709 2121 148 91 25 chr2 147390358 147390753 -34357334 + MTC LTR MaLR 1 421 0 6 1709 251 239 124 78 chr2 147398606 147398824 -34349263 - RLTR42-int LTR ERVK -4122 1400 1173 6 1709 2154 158 10 43 chr2 147401330 147401721 -34346366 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 6 1709 881 229 332 38 chr2 147425351 147425803 -34322284 + MT2B2 LTR ERVL 1 584 0 6 1709 1142 265 77 81 chr2 147428606 147429089 -34318998 + RMER15 LTR ERVL 1 570 -5 7 1710 1781 190 95 36 chr2 147456854 147457242 -34290845 - MTD LTR MaLR -8 411 1 7 1710 2523 148 26 0 chr2 147457333 147457717 -34290370 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 7 1710 609 263 160 70 chr2 147462056 147462387 -34285700 + MLT1B LTR MaLR 11 371 -19 7 1710 1244 239 136 18 chr2 147470535 147470867 -34277220 - MTD LTR MaLR -48 371 1 7 1710 278 327 19 9 chr2 147479481 147479589 -34268498 + MLT1A1 LTR MaLR 27 135 -273 7 1710 1585 102 0 68 chr2 147493114 147493338 -34254749 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 207 -268 8 1710 419 302 124 79 chr2 147495839 147496217 -34251870 + RLTR12B LTR ERVK 9 403 -165 8 1710 460 299 145 14 chr2 147496728 147497059 -34251028 - MLT2B2 LTR ERVL -6 556 81 8 1710 246 294 70 70 chr2 147507559 147507687 -34240400 - MamGypLTR1b LTR Gypsy 0 782 655 5 1710 309 250 12 12 chr2 147510305 147510390 -34237697 + MLT1A1 LTR MaLR 313 397 -11 9 1710 4579 138 51 8 chr2 147521877 147522602 -34225485 + RMER6A LTR ERVK 1 756 0 3 1710 998 308 55 9 chr2 147544267 147544595 -34203492 - MLT1A0 LTR MaLR -8 357 15 6 1710 634 265 7 13 chr2 147545714 147545867 -34202220 - MLT1B LTR MaLR -7 383 232 6 1710 334 250 9 63 chr2 147545895 147546006 -34202081 - MLT1B LTR MaLR -250 140 36 6 1710 460 318 100 57 chr2 147554214 147554514 -34193573 + ORR1E LTR MaLR 35 347 -12 7 1710 3343 76 0 12 chr2 147556332 147556744 -34191343 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 8 1710 4937 140 48 87 chr2 147556750 147557059 -34191028 + MTB_Mm-int LTR MaLR 15 343 -755 8 1710 4937 140 48 87 chr2 147557443 147557485 -34190602 + MTB_Mm-int LTR MaLR 344 382 -716 8 1710 4937 140 48 87 chr2 147557528 147558303 -34189784 + MTB_Mm-int LTR MaLR 383 1097 -1 8 1710 226 361 78 78 chr2 147558716 147558935 -34189152 - MamGypLTR1a LTR Gypsy -76 708 490 8 1710 1356 230 85 9 chr2 147567264 147567606 -34180481 - MTD LTR MaLR -49 370 3 1 1710 463 291 21 45 chr2 147568587 147568763 -34179324 + MTEa LTR MaLR 45 213 -166 1 1710 834 245 130 94 chr2 147568986 147569347 -34178740 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 1 1710 249 257 13 39 chr2 147569780 147569857 -34178230 - ORR1E LTR MaLR -6 373 299 1 1710 276 275 9 56 chr2 147569994 147570102 -34177985 - ORR1E LTR MaLR -169 190 88 1 1710 721 293 144 25 chr2 147570598 147570917 -34177170 - ORR1E LTR MaLR 0 359 3 1 1710 1893 186 89 45 chr2 147579501 147579815 -34168272 - RLTR16 LTR ERVK 0 505 209 1 1710 1893 186 89 45 chr2 147579997 147580166 -34167921 - RLTR16 LTR ERVK -297 208 1 1 1710 1013 275 104 16 chr2 147582848 147583214 -34164873 - MTD LTR MaLR -14 405 8 1 1710 332 263 20 89 chr2 147583360 147583506 -34164581 - MLT1A0 LTR MaLR -217 148 13 1 1710 570 318 15 110 chr2 147585770 147586106 -34161981 - MT2A LTR ERVL -162 371 68 1 1711 2215 172 42 12 chr2 147588142 147588547 -34159540 - MTD LTR MaLR -2 417 1 1 1711 871 261 130 38 chr2 147593195 147593534 -34154553 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 1 1711 705 273 80 112 chr2 147601456 147601831 -34146256 - ORR1E LTR MaLR -7 363 1 1 1711 226 215 0 30 chr2 147601831 147601879 -34146208 - MTE-int LTR MaLR -53 1527 1482 1 1711 1339 261 28 17 chr2 147601906 147602268 -34145819 - ORR1D2 LTR MaLR -2 368 3 1 1711 2970 229 151 130 chr2 147602270 147603611 -34144476 - ORR1D2-int LTR MaLR 0 1370 2 1 1711 774 179 104 22 chr2 147603612 147603795 -34144292 - ORR1D2 LTR MaLR -4 366 169 1 1711 1220 223 63 84 chr2 147604740 147604882 -34143205 + ORR1D1 LTR MaLR 1 138 -236 1 1711 1220 223 63 84 chr2 147605047 147605286 -34142801 + ORR1D1 LTR MaLR 139 374 0 1 1711 3145 68 2 12 chr2 147605592 147605996 -34142091 - MTB LTR MaLR 0 400 1 1 1711 536 250 6 38 chr2 147606864 147607022 -34141065 + LTR83 LTR ERVL 628 780 0 1 1711 3380 50 0 0 chr2 147610061 147610457 -34137630 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1711 270 26 0 49 chr2 147611082 147611123 -34136964 + MTA_Mm LTR MaLR 1 39 -357 1 1711 337 342 30 56 chr2 147611813 147612011 -34136076 + MLT1A0 LTR MaLR 27 219 -146 1 1711 297 324 52 58 chr2 147619376 147619530 -34128557 - MLT1A LTR MaLR -221 153 1 1 1711 280 285 36 58 chr2 147620399 147620537 -34127550 + ORR1E LTR MaLR 1 135 -224 1 1711 278 263 167 10 chr2 147620613 147620709 -34127378 - ORR1D2 LTR MaLR -69 301 191 1 1711 1998 117 50 3 chr2 147623978 147624127 -34123960 + BGLII LTR ERVK 45 208 -213 1 1711 1998 117 50 3 chr2 147624317 147624527 -34123560 + BGLII LTR ERVK 209 420 -1 1 1711 261 182 0 0 chr2 147635083 147635127 -34112960 - MT2A LTR ERVL -282 319 276 2 1711 550 191 8 50 chr2 147635173 147635294 -34112793 - MT2A LTR ERVL -417 116 1 2 1711 1160 274 50 28 chr2 147638031 147638392 -34109695 - MTE2a LTR MaLR 0 379 11 2 1711 1888 219 22 8 chr2 147640795 147641207 -34106880 + MTD LTR MaLR 1 407 -12 2 1711 744 297 53 79 chr2 147643483 147643838 -34104249 - MTD LTR MaLR 0 419 74 2 1711 352 315 91 57 chr2 147647942 147648117 -34099970 + MER21B LTR ERV1 385 565 -298 2 1711 361 264 27 9 chr2 147648297 147648408 -34099679 + RMER15 LTR ERVL 423 535 -40 2 1711 4459 158 54 30 chr2 147648625 147649461 -34098626 - RMER13A LTR ERVK -4 856 1 2 1711 1332 201 24 10 chr2 147650724 147651183 -34096904 - RLTR12A LTR ERVK -5 563 69 2 1711 373 329 20 20 chr2 147652016 147652165 -34095922 + MLT1A1 LTR MaLR 259 407 -1 2 1711 712 350 78 44 chr2 147668072 147668458 -34079629 - MLT1E1A LTR MaLR 0 680 282 2 1711 1652 198 102 87 chr2 147668826 147668945 -34079142 + MTC LTR MaLR 5 135 -286 2 1711 1652 198 102 87 chr2 147669091 147669374 -34078713 + MTC LTR MaLR 136 413 -8 2 1711 382 344 139 15 chr2 147669605 147669871 -34078216 - MLT1E1A LTR MaLR -242 307 9 2 1711 340 252 9 28 chr2 147674408 147674514 -34073573 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 305 2 1711 402 346 98 61 chr2 147674906 147675232 -34072855 - MTEa LTR MaLR -6 373 36 2 1711 227 176 98 0 chr2 147677526 147677577 -34070510 + RLTR28B LTR ERVL 328 383 -98 2 1711 528 284 174 103 chr2 147678913 147679263 -34068824 - MTE2b LTR MaLR -4 375 1 2 1711 257 220 0 17 chr2 147680658 147680718 -34067369 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 350 2 1711 2144 182 62 10 chr2 147709770 147710170 -34037917 - MTC LTR MaLR 0 421 1 3 1711 690 318 70 41 chr2 147712741 147713056 -34035031 - MER110 LTR ERV1 -8 483 160 3 1711 2458 92 6 41 chr2 147715003 147715342 -34032745 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 3 1711 2606 157 2 2 chr2 147716416 147716832 -34031255 + MTC LTR MaLR 1 416 -5 3 1712 458 292 27 20 chr2 147718789 147718936 -34029151 + MER110 LTR ERV1 40 187 -304 3 1712 472 246 79 14 chr2 147719310 147719450 -34028637 - RMER15 LTR ERVL 0 575 427 3 1712 2128 196 38 43 chr2 147720474 147720895 -34027192 - MTD LTR MaLR 0 419 1 3 1712 325 363 135 40 chr2 147721333 147721629 -34026458 + LTR33 LTR ERVL 1 324 -191 3 1712 418 322 58 58 chr2 147723045 147723358 -34024729 - MT2A LTR ERVL -219 314 2 3 1712 602 316 71 54 chr2 147728171 147728525 -34019562 + MLT1A LTR MaLR 4 363 -11 3 1712 288 236 42 0 chr2 147729385 147729457 -34018630 + MLT1A LTR MaLR 93 167 -207 3 1712 330 326 50 21 chr2 147736594 147736735 -34011352 + MTEa LTR MaLR 8 152 -207 3 1712 428 264 65 36 chr2 147736806 147736998 -34011089 + MTEa LTR MaLR 173 377 -2 3 1712 1082 263 102 18 chr2 147737486 147737869 -34010218 + MTD LTR MaLR 5 419 0 3 1712 2010 101 23 3 chr2 147741646 147741953 -34006134 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 14 3 1712 383 331 53 65 chr2 147742008 147742270 -34005817 + ORR1E LTR MaLR 101 359 0 3 1712 1484 231 45 40 chr2 147762461 147762835 -33985252 - MTE2a LTR MaLR 0 379 4 3 1712 3213 148 66 16 chr2 147763145 147763499 -33984588 - RMER6A LTR ERVK 0 756 388 3 1712 3213 148 66 16 chr2 147763576 147763861 -33984226 - RMER6A LTR ERVK -369 387 85 3 1712 249 300 44 26 chr2 147769233 147769346 -33978741 + LTR16C LTR ERVL 285 399 -90 3 1712 341 301 130 39 chr2 147775712 147775741 -33972346 - MLT1C LTR MaLR -23 444 419 3 1712 341 277 352 31 chr2 147775944 147776170 -33971917 - MLT1C LTR MaLR -49 418 114 3 1712 1265 239 16 33 chr2 147784605 147784823 -33963264 - RMER17C LTR ERVK 0 410 189 4 1712 1265 239 16 33 chr2 147785084 147785232 -33962855 - RMER17C LTR ERVK -222 188 50 4 1712 512 332 43 46 chr2 147785544 147785891 -33962196 + ORR1E LTR MaLR 1 346 -13 4 1712 390 301 96 60 chr2 147815438 147815777 -33932310 + MLT1A1 LTR MaLR 19 400 -8 4 1712 2176 124 15 9 chr2 147816170 147816495 -33931592 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 4 1712 352 295 45 35 chr2 147837030 147837178 -33910909 + MLT1H2 LTR MaLR 359 591 0 5 1712 297 291 12 12 chr2 147837515 147837595 -33910492 - MTEa LTR MaLR -13 366 287 5 1712 255 350 10 29 chr2 147837914 147838017 -33910070 - LTR33 LTR ERVL -370 145 45 5 1713 226 371 106 0 chr2 147884443 147884594 -33863493 + LTR16A LTR ERVL 71 237 -214 6 1713 331 380 89 26 chr2 147884859 147885129 -33862958 - LTR16C LTR ERVL -4 485 199 6 1713 3119 46 13 18 chr2 147889170 147889568 -33858519 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 1713 397 271 86 14 chr2 147890503 147890780 -33857307 + MTD LTR MaLR 30 383 -38 6 1713 294 292 55 14 chr2 147892854 147893000 -33855087 - MLT1B LTR MaLR -215 175 24 6 1713 266 268 103 0 chr2 147908298 147908395 -33839692 + MLT2B2 LTR ERVL 1 107 -408 6 1713 290 329 99 85 chr2 147916322 147916682 -33831405 - MLT1H1 LTR MaLR -200 355 14 6 1713 3978 70 79 6 chr2 147926326 147926870 -33821217 - MT2B2 LTR ERVL 0 584 1 6 1713 341 264 8 39 chr2 147930038 147930168 -33817919 + MLT1A1 LTR MaLR 283 408 0 6 1713 267 211 0 0 chr2 147930173 147930230 -33817857 - MTEa LTR MaLR -12 367 311 6 1713 385 332 149 31 chr2 147940490 147940872 -33807215 + LTR33A_ LTR ERVL 86 512 -19 6 1713 400 317 52 22 chr2 147943040 147943272 -33804815 - MER77 LTR ERVL -32 575 337 6 1713 806 244 104 0 chr2 147943288 147943509 -33804578 - MER77 LTR ERVL -314 293 50 6 1713 768 291 75 16 chr2 147945711 147945966 -33802121 + MLT1A1 LTR MaLR 57 326 -82 6 1713 1108 244 148 19 chr2 147954753 147955124 -33792963 - MTD LTR MaLR 0 419 1 7 1713 5507 79 18 85 chr2 147956046 147956996 -33791091 - RMER17D LTR ERVK -3 886 1 7 1713 1239 221 129 29 chr2 147959307 147959648 -33788439 - MTEa LTR MaLR 0 379 5 7 1713 231 313 134 45 chr2 147960661 147960818 -33787269 - MLT1F1 LTR MaLR 0 560 390 7 1713 3968 127 126 19 chr2 147960821 147961487 -33786600 + RMER19A LTR ERVK 1 737 0 7 1713 1221 213 51 4 chr2 147961507 147961761 -33786326 - MTD LTR MaLR -24 395 130 7 1713 463 229 9 0 chr2 147963764 147963869 -33784218 - MTD LTR MaLR -302 117 12 7 1713 266 271 29 0 chr2 147964039 147964109 -33783978 - MLT1F1 LTR MaLR -428 141 70 7 1713 2145 107 62 0 chr2 147967174 147967482 -33780605 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 7 1713 2816 151 100 57 chr2 147968706 147969234 -33778853 - RMER4B LTR ERVK 0 585 40 7 1713 2816 151 100 57 chr2 147969414 147969446 -33778641 - RMER4B LTR ERVK -546 39 1 7 1713 534 305 132 41 chr2 147974015 147974408 -33773679 + MER67A LTR ERV1 50 478 -65 7 1713 309 324 110 17 chr2 147976383 147976556 -33771531 - MLT1A0 LTR MaLR -176 189 1 7 1713 553 309 8 68 chr2 147979065 147979310 -33768777 - ORR1E LTR MaLR -144 226 1 7 1713 320 232 24 0 chr2 147979958 147980040 -33768047 - MTEa LTR MaLR 0 379 296 7 1714 391 320 123 6 chr2 147981555 147981734 -33766353 + MLT1F1 LTR MaLR 3 202 -367 7 1714 281 241 69 0 chr2 147981795 147981882 -33766205 + RMER5 LTR ERV1 43 135 -399 7 1714 693 228 51 20 chr2 147981880 147982077 -33766010 + RMER5 LTR ERV1 332 534 0 7 1714 254 288 12 0 chr2 147982080 147982160 -33765927 + MLT1F1 LTR MaLR 184 264 -284 7 1714 453 307 36 36 chr2 147982171 147982367 -33765720 + MLT1F1 LTR MaLR 374 569 0 7 1714 752 271 44 136 chr2 148004195 148004511 -33743576 - MTE2a LTR MaLR -92 287 1 3 1714 274 364 96 43 chr2 148004819 148005049 -33743038 - LTR16C LTR ERVL -170 319 78 4 1714 836 274 109 93 chr2 148009704 148010070 -33738017 - MTE2a LTR MaLR -2 377 6 1 1714 266 297 19 38 chr2 148021742 148021847 -33726240 - MLT1A1 LTR MaLR -2 406 304 2 1714 2138 181 32 7 chr2 148021852 148022258 -33725829 - MTC LTR MaLR -5 416 1 2 1714 2584 164 41 29 chr2 148022455 148022971 -33725116 - RLTR28 LTR ERVL -2 522 1 3 1714 539 324 91 36 chr2 148027468 148027798 -33720289 + ORR1E LTR MaLR 7 354 -5 3 1714 778 275 60 58 chr2 148033908 148034255 -33713832 + ORR1E LTR MaLR 8 355 -4 4 1714 1918 139 26 68 chr2 148038533 148038873 -33709214 + ORR1A3 LTR MaLR 1 326 0 5 1714 2363 82 3 9 chr2 148041834 148042178 -33705909 - MTA_Mm LTR MaLR -54 342 1 5 1714 4213 81 31 102 chr2 148042178 148042951 -33705136 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 381 5 1714 231 305 66 37 chr2 148045120 148045256 -33702831 - MLT1D LTR MaLR -257 248 109 5 1714 511 252 0 0 chr2 148045463 148045574 -33702513 + ORR1E LTR MaLR 1 111 -248 5 1714 929 131 268 25 chr2 148049538 148049757 -33698330 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 115 6 1714 2041 143 9 6 chr2 148050459 148050797 -33697290 - ORR1B1 LTR MaLR -55 339 1 6 1714 1960 166 23 28 chr2 148054169 148054566 -33693521 + MTB_Mm LTR MaLR 11 405 -2 7 1714 275 98 0 0 chr2 148055661 148055702 -33692385 - MT2B LTR ERVL 0 584 544 7 1714 454 246 19 96 chr2 148055791 148055948 -33692139 - MT2B LTR ERVL -183 418 274 7 1714 390 262 81 27 chr2 148055976 148056125 -33691962 - MT2B LTR ERVL -376 157 1 7 1714 272 229 59 50 chr2 148061648 148061749 -33686338 + MTEa LTR MaLR 278 379 0 8 1714 325 251 41 16 chr2 148061749 148061877 -33686210 - MLT1J1 LTR MaLR -269 243 73 8 1714 1061 262 116 21 chr2 148071673 148071795 -33676292 + MTE2b LTR MaLR 1 155 -224 9 1714 1061 262 116 21 chr2 148071912 148072116 -33675971 + MTE2b LTR MaLR 156 358 -21 9 1714 1794 163 81 14 chr2 148076255 148076615 -33671472 + ORR1B1 LTR MaLR 11 394 0 1 1714 1143 229 131 61 chr2 148077127 148077471 -33670616 - ORR1D2 LTR MaLR -2 368 1 1 1714 849 311 63 69 chr2 148078017 148078542 -33669545 - MT2A LTR ERVL -11 522 1 1 1714 375 267 166 24 chr2 148082651 148082904 -33665183 + RMER20B LTR ERVK 123 411 -216 1 1714 758 292 41 19 chr2 148088552 148088821 -33659266 + MLT1C LTR MaLR 28 302 -165 1 1714 400 347 20 5 chr2 148091855 148092055 -33656032 + RLTR6-int LTR ERV1 4356 4558 -3220 1 1714 1079 318 26 29 chr2 148092432 148092903 -33655184 + MuRRS4-int LTR ERV1 3165 3947 -1116 1 1714 707 168 131 31 chr2 148093346 148093506 -33654581 - ORR1B2 LTR MaLR -167 200 25 1 1714 402 152 0 15 chr2 148093700 148093785 -33654302 - ORR1B2-int LTR MaLR -42 1538 1437 1 1714 1809 150 332 0 chr2 148093908 148094375 -33653712 - ORR1B2-int LTR MaLR -887 622 1 1 1714 501 128 0 0 chr2 148094385 148094463 -33653624 - ORR1B2 LTR MaLR -289 78 1 1 1714 396 284 125 10 chr2 148094467 148094659 -33653428 + MLT1B LTR MaLR 154 367 -23 1 1714 477 299 94 113 chr2 148101424 148101786 -33646301 + ORR1E LTR MaLR 4 358 -1 1 1714 235 315 76 53 chr2 148106134 148106305 -33641782 + LTR16C LTR ERVL 295 469 -20 1 1714 484 394 30 30 chr2 148108708 148109043 -33639044 - LTR16C LTR ERVL -24 465 131 1 1715 422 361 18 12 chr2 148112031 148112202 -33635885 + LTR16C LTR ERVL 317 488 -1 1 1715 837 308 36 60 chr2 148112615 148112950 -33635137 - MTEa LTR MaLR -2 377 51 1 1715 232 372 138 0 chr2 148114546 148114691 -33633396 - LTR16C LTR ERVL -136 353 189 1 1715 1498 209 136 16 chr2 148117046 148117420 -33630667 - MTD LTR MaLR 0 419 1 1 1715 249 299 439 46 chr2 148118994 148119191 -33628896 - MLT1A LTR MaLR -47 361 87 1 1715 1656 196 79 28 chr2 148121916 148122272 -33625815 + MTD LTR MaLR 1 374 -45 1 1715 907 303 19 19 chr2 148124256 148124626 -33623461 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 1 1715 397 331 72 55 chr2 148126899 148127190 -33620897 - LTR16C LTR ERVL -2 487 192 1 1715 243 314 66 86 chr2 148127163 148127493 -33620594 + ORR1D2 LTR MaLR 46 362 -12 1 1715 305 311 126 71 chr2 148131318 148131557 -33616530 - MLT1F2 LTR MaLR -3 651 315 1 1715 386 379 14 14 chr2 148131745 148131892 -33616195 - MLT1F2 LTR MaLR -411 149 3 1 1715 1204 267 77 42 chr2 148134437 148134867 -33613220 - RMER5 LTR ERV1 -40 494 50 1 1715 1330 197 0 27 chr2 148139783 148140044 -33608043 - RMER19B LTR ERVK -7 895 642 2 1715 376 354 79 70 chr2 148140640 148140827 -33607260 - RMER5 LTR ERV1 0 534 271 2 1715 376 354 79 70 chr2 148140948 148141056 -33607031 - RMER5 LTR ERV1 0 270 115 2 1715 1065 229 137 18 chr2 148142516 148142854 -33605233 - MTD LTR MaLR -2 368 11 2 1715 517 316 73 66 chr2 148143341 148143615 -33604472 + RMER5 LTR ERV1 11 286 -248 2 1715 1983 142 89 6 chr2 148144008 148144333 -33603754 + ORR1B1 LTR MaLR 1 352 -42 2 1715 319 216 7 0 chr2 148144328 148144417 -33603670 + ORR1B1 LTR MaLR 286 386 -8 2 1715 1283 318 41 35 chr2 148148074 148148612 -33599475 + MLT2B3 LTR ERVL 3 548 -19 2 1715 1420 231 129 19 chr2 148149421 148149799 -33598288 - MTD LTR MaLR -14 405 1 2 1715 729 349 143 25 chr2 148149943 148150433 -33597654 + MLT2B3 LTR ERVL 1 548 -6 2 1715 673 287 69 69 chr2 148153855 148154244 -33593843 - LTR37A LTR ERV1 -20 406 18 2 1715 557 288 98 128 chr2 148157346 148157719 -33590368 + MLT2B2 LTR ERVL 73 448 -67 2 1715 1708 232 14 11 chr2 148157719 148158076 -33590011 - ORR1D1 LTR MaLR -16 358 1 2 1715 245 316 115 111 chr2 148160986 148161221 -33586866 - ORR1E LTR MaLR 0 359 124 2 1715 336 349 72 96 chr2 148162075 148162420 -33585667 + ORR1E LTR MaLR 20 356 -3 2 1715 803 285 40 73 chr2 148162420 148162791 -33585296 - ORR1E LTR MaLR 0 359 1 2 1715 659 333 88 27 chr2 148166364 148166694 -33581393 + MLT1A0 LTR MaLR 1 350 -15 2 1715 229 363 102 0 chr2 148167048 148167205 -33580882 + LTR33 LTR ERVL 5 177 -338 2 1715 614 275 55 62 chr2 148167576 148167851 -33580236 - MLT1B LTR MaLR -72 318 46 2 1715 238 348 0 70 chr2 148169674 148169816 -33578271 - MLT1A LTR MaLR -218 156 25 2 1715 423 335 46 41 chr2 148180494 148180712 -33567375 - ORR1E LTR MaLR -108 251 33 2 1715 248 361 35 7 chr2 148183031 148183176 -33564911 - MLT1L LTR MaLR -207 403 255 2 1715 2788 13 31 0 chr2 148185015 148185332 -33562755 - IAPLTR2b LTR ERVK 0 327 1 2 1715 772 303 90 9 chr2 148187227 148187560 -33560527 - MLT1A0 LTR MaLR -5 360 1 2 1715 226 194 149 27 chr2 148193110 148193184 -33554903 - ORR1E LTR MaLR -4 375 293 2 1715 330 282 53 70 chr2 148195624 148195811 -33552276 - ORR1E LTR MaLR -167 192 9 2 1715 420 298 8 8 chr2 148199780 148199905 -33548182 + MLT1H2 LTR MaLR 365 489 0 3 1715 2622 139 110 4 chr2 148206712 148207202 -33540885 - RMER19A LTR ERVK 0 737 196 3 1715 1752 193 6 9 chr2 148207200 148207529 -33540558 + RLTR20D LTR ERVK 241 568 0 3 1715 891 223 97 13 chr2 148207530 148207757 -33540330 + MTD LTR MaLR 174 419 0 3 1715 447 306 104 0 chr2 148207858 148208051 -33540036 + MLT1A1 LTR MaLR 147 359 -49 3 1715 251 271 14 26 chr2 148208478 148208587 -33539500 - MTE2a LTR MaLR 0 379 272 3 1715 1243 209 105 10 chr2 148209789 148210094 -33537993 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 41 3 1715 1352 239 52 62 chr2 148212733 148213156 -33534931 - MTD LTR MaLR 0 419 1 3 1715 382 300 109 37 chr2 148213569 148213891 -33534196 + LTR40b LTR ERVL 118 462 0 3 1715 249 293 179 8 chr2 148218949 148219066 -33529021 - ORR1E LTR MaLR -222 137 1 3 1715 279 186 0 125 chr2 148235352 148235432 -33512655 + MT2B2 LTR ERVL 195 264 -320 3 1715 1906 209 52 8 chr2 148235976 148236342 -33511745 - MTD LTR MaLR 0 419 37 3 1715 2807 12 95 6 chr2 148236342 148236679 -33511408 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 3 1715 1906 209 52 8 chr2 148236679 148236693 -33511394 - MTD LTR MaLR -383 36 23 3 1715 7669 81 113 17 chr2 148236693 148238001 -33510086 + IAPEz-int LTR ERVK 16 1313 -5168 3 1715 29378 22 1 1 chr2 148238000 148241271 -33506816 + IAPEz-int LTR ERVK 3210 6481 0 3 1715 2807 12 95 6 chr2 148241271 148241608 -33506479 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 3 1716 502 230 137 0 chr2 148250256 148250417 -33497670 - MLT1D LTR MaLR -6 499 317 3 1716 3721 192 55 40 chr2 148257095 148258071 -33490016 + RMER12 LTR ERVK 1 1194 -128 3 1716 314 243 40 0 chr2 148258177 148258251 -33489836 + RLTR21 LTR ERVK 1341 1417 -155 3 1716 276 323 53 120 chr2 148270679 148270978 -33477109 - MER54A LTR ERVL -334 567 289 4 1716 1258 154 114 94 chr2 148272515 148272917 -33475170 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 4 1716 2409 140 0 38 chr2 148274513 148274913 -33473174 - RMER10B LTR ERVL 0 398 14 4 1716 3217 53 5 5 chr2 148275789 148276185 -33471902 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 1716 504 297 87 108 chr2 148278293 148278708 -33469379 + MLT1A1 LTR MaLR 1 406 -2 4 1716 339 186 0 0 chr2 148283480 148283539 -33464548 + RLTR28 LTR ERVL 1 59 -465 4 1716 624 268 67 112 chr2 148283630 148283790 -33464297 + ORR1E LTR MaLR 1 164 -195 4 1716 624 268 67 112 chr2 148283940 148284152 -33463935 + ORR1E LTR MaLR 165 356 -3 4 1716 733 250 76 51 chr2 148285854 148286099 -33461988 + MTE2a LTR MaLR 62 299 -80 4 1716 344 248 39 10 chr2 148292791 148292893 -33455194 + MTE2a LTR MaLR 275 379 0 4 1716 1725 150 172 3 chr2 148300217 148300531 -33447556 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 4 1716 273 190 177 0 chr2 148312006 148312085 -33436002 + MTEb LTR MaLR 277 369 -10 4 1716 346 291 75 74 chr2 148313971 148314187 -33433900 - MLT1B LTR MaLR -23 444 152 4 1716 400 270 26 0 chr2 148314558 148314673 -33433414 - MLT1B LTR MaLR -252 138 21 4 1716 1246 253 107 20 chr2 148314683 148315030 -33433057 - MTEa LTR MaLR -2 377 1 4 1716 1958 180 78 18 chr2 148319417 148319801 -33428286 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 4 1716 1128 179 157 20 chr2 148327303 148327613 -33420474 + MTD LTR MaLR 68 405 -14 4 1716 2976 65 36 5 chr2 148336974 148337358 -33410729 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 1716 6586 84 11 102 chr2 148337358 148337426 -33410661 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1043 4 1716 6586 84 11 102 chr2 148337901 148339040 -33409047 - MTA_Mm-int LTR MaLR -56 1042 1 4 1716 2971 73 34 3 chr2 148339040 148339424 -33408663 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 1716 939 251 89 12 chr2 148339847 148340093 -33407994 + ORR1D1 LTR MaLR 1 265 -109 4 1716 1020 212 229 159 chr2 148352102 148352192 -33395895 - MT2A LTR ERVL 0 533 463 5 1716 1020 212 229 159 chr2 148352234 148352403 -33395684 - MT2A LTR ERVL -71 462 197 5 1716 1020 212 229 159 chr2 148352469 148352705 -33395382 - MT2A LTR ERVL -337 196 3 5 1716 412 310 136 23 chr2 148353390 148353654 -33394433 - MLT1B LTR MaLR -55 335 42 5 1716 3278 202 113 59 chr2 148366576 148367745 -33380342 - RLTR25B LTR ERVK 0 1103 1 5 1716 236 298 36 0 chr2 148367746 148367830 -33380257 - RLTR25A LTR ERVK -1016 87 1 5 1716 1112 184 20 63 chr2 148369223 148369478 -33378609 - ORR1B2 LTR MaLR -8 359 116 5 1716 4812 145 42 12 chr2 148369472 148370332 -33377755 + RMER13B LTR ERVK 23 908 0 5 1716 563 165 37 59 chr2 148370332 148370445 -33377642 - ORR1B2 LTR MaLR -257 110 1 5 1716 248 261 14 84 chr2 148370682 148370753 -33377334 - ORR1E LTR MaLR -262 97 32 5 1716 1835 119 93 137 chr2 148370753 148371161 -33376926 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 5 5 1716 236 219 14 111 chr2 148371161 148371180 -33376907 - ORR1E LTR MaLR -344 30 19 5 1716 390 340 77 71 chr2 148371579 148372073 -33376014 - RMER5 LTR ERV1 -37 497 1 5 1717 233 362 22 87 chr2 148380816 148381137 -33366950 + MER74A LTR ERVL 126 425 -133 5 1717 297 293 44 29 chr2 148386538 148386675 -33361412 - MLT1A1 LTR MaLR -266 142 4 5 1717 419 285 94 78 chr2 148388357 148388659 -33359428 + LTR37B LTR ERV1 23 318 -150 5 1717 419 285 94 78 chr2 148388816 148388931 -33359156 + LTR37B LTR ERV1 324 455 -13 5 1717 417 298 96 0 chr2 148388988 148389206 -33358881 + MER92B LTR ERV1 26 264 -372 5 1717 271 279 40 32 chr2 148389332 148389441 -33358646 + MER92B LTR ERV1 416 525 -111 5 1717 420 310 28 45 chr2 148389441 148389617 -33358470 + ORR1E LTR MaLR 1 173 -186 5 1717 642 275 35 39 chr2 148393149 148393406 -33354681 + MLT-int LTR MaLR 1 256 -1479 5 1717 1258 328 81 81 chr2 148393604 148394690 -33353397 + MLT1A0-int LTR MaLR 280 1365 -6 5 1717 523 315 142 4 chr2 148394732 148395006 -33353081 + MLT1A0 LTR MaLR 42 353 -12 5 1717 229 232 0 0 chr2 148399689 148399745 -33348342 + MLT1E2 LTR MaLR 570 625 -2 5 1717 376 193 11 46 chr2 148402918 148403005 -33345082 + MLT1A0 LTR MaLR 55 138 -227 5 1717 444 206 31 10 chr2 148408476 148408574 -33339513 - MTD LTR MaLR -319 100 1 5 1717 392 218 23 0 chr2 148408992 148409079 -33339008 - ORR1C2 LTR MaLR -40 344 256 5 1717 781 137 7 0 chr2 148409081 148409220 -33338867 + ORR1B1 LTR MaLR 1 140 -254 5 1717 814 291 42 0 chr2 148410223 148410464 -33337623 + MTD LTR MaLR 19 269 -150 5 1717 286 152 34 0 chr2 148412022 148412081 -33336006 + MTD LTR MaLR 345 405 -14 5 1717 1572 129 135 38 chr2 148413799 148414169 -33333918 - RMER17C LTR ERVK 0 410 5 5 1717 368 204 10 83 chr2 148422112 148422124 -33325963 + MT2B LTR ERVL 152 156 -445 6 1717 233 235 14 68 chr2 148422239 148422312 -33325775 - MLT1C LTR MaLR -297 170 102 6 1717 717 302 63 22 chr2 148425771 148426089 -33321998 - MLT1A0 LTR MaLR -2 363 33 6 1717 311 302 51 8 chr2 148428028 148428145 -33319942 - MLT1B LTR MaLR -90 300 179 6 1717 423 293 70 6 chr2 148428322 148428480 -33319607 - MLT1B LTR MaLR -222 168 1 6 1717 449 299 49 59 chr2 148430033 148430354 -33317733 - ORR1E LTR MaLR -3 376 42 6 1717 377 231 28 19 chr2 148430701 148430807 -33317280 + MLT1A1 LTR MaLR 302 408 0 6 1717 3261 74 25 20 chr2 148432489 148432998 -33315089 + RLTR13D1 LTR ERVK 295 806 0 6 1717 3025 50 10 33 chr2 148438396 148438793 -33309294 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK -2 388 1 6 1717 16071 36 9 52 chr2 148438795 148440866 -33307221 - RLTR10-int LTR ERVK -3 1984 3 6 1717 3300 82 2 67 chr2 148440868 148441376 -33306711 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 6 1717 2177 123 15 6 chr2 148442065 148442399 -33305688 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 337 0 6 1717 12274 110 49 29 chr2 148442399 148444312 -33303775 + IAPEz-int LTR ERVK 8 1958 -4523 6 1717 9224 40 9 6 chr2 148444306 148445397 -33302690 + IAPEz-int LTR ERVK 5385 6479 -2 6 1717 2177 123 15 6 chr2 148445399 148445733 -33302354 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 337 0 6 1717 346 296 9 9 chr2 148447219 148447328 -33300759 + MLT1A1 LTR MaLR 26 134 -274 6 1717 696 221 39 39 chr2 148447715 148447894 -33300193 - MTD LTR MaLR -240 179 1 6 1717 408 171 21 35 chr2 148449817 148449962 -33298125 - RMER17B LTR ERVK -511 447 305 6 1717 792 313 95 24 chr2 148454932 148455312 -33292775 - MER70A LTR ERVL -63 409 3 6 1717 1500 241 2 71 chr2 148461845 148462130 -33285957 - MTEb LTR MaLR 0 379 115 6 1717 1500 241 2 71 chr2 148462586 148462707 -33285380 - MTEb LTR MaLR -265 114 1 6 1717 489 193 0 0 chr2 148465165 148465253 -33282834 + ORR1C1 LTR MaLR 1 88 -290 6 1717 602 288 63 58 chr2 148468166 148468513 -33279574 - ORR1E LTR MaLR -10 349 1 6 1717 563 283 55 32 chr2 148472014 148472233 -33275854 + MLT2B1 LTR ERVL 12 235 -285 6 1717 1174 240 116 0 chr2 148473331 148473660 -33274427 - MTEa LTR MaLR -8 351 1 6 1717 1203 190 105 121 chr2 148477489 148477861 -33270226 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 5 6 1717 948 249 102 57 chr2 148478807 148478930 -33269157 + MTEa LTR MaLR 8 126 -253 7 1717 3514 40 30 9 chr2 148478930 148479357 -33268730 + RLTR10C LTR ERVK 1 436 0 7 1717 948 249 102 57 chr2 148479357 148479587 -33268500 + MTEa LTR MaLR 127 377 -2 7 1717 245 338 74 51 chr2 148479590 148479884 -33268203 + MTEa LTR MaLR 18 348 -31 7 1717 418 238 70 64 chr2 148482027 148482198 -33265889 + RMER21A LTR ERV1 393 564 -383 7 1717 13001 227 76 68 chr2 148486477 148487406 -33260681 + MERVK26-int LTR ERVK 2558 3488 -3431 7 1717 13001 227 76 68 chr2 148487929 148488524 -33259563 + MERVK26-int LTR ERVK 3489 4155 -2764 7 1717 3638 50 35 7 chr2 148488524 148488810 -33259277 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 285 -190 7 1717 3638 50 35 7 chr2 148488830 148489005 -33259082 + MT2C_Mm LTR ERVL 286 473 -2 7 1717 13001 227 76 68 chr2 148489005 148491458 -33256629 + MERVK26-int LTR ERVK 4156 6573 -346 7 1717 13001 227 76 68 chr2 148491683 148492026 -33256061 + MERVK26-int LTR ERVK 6574 6916 -3 7 1717 444 308 47 55 chr2 148492165 148492419 -33255668 + RLTR26 LTR ERVK 165 416 -226 7 1717 5590 135 105 26 chr2 148493680 148494827 -33253260 - RMER12 LTR ERVK -85 1237 1 7 1717 291 123 35 0 chr2 148495042 148495099 -33252988 - MTD LTR MaLR -1 418 360 7 1717 426 300 64 7 chr2 148495106 148495247 -33252840 - MTD LTR MaLR -185 234 86 7 1717 330 70 0 0 chr2 148496707 148496750 -33251337 + MERVL-int LTR ERVL 5443 5485 0 7 1717 1558 90 5 0 chr2 148496750 148496972 -33251115 + MT2B2 LTR ERVL 1 223 -361 7 1718 1071 206 101 14 chr2 148505191 148505477 -33242610 - RMER21A LTR ERV1 -385 562 252 5 1718 263 282 157 38 chr2 148506121 148506331 -33241756 - MER67C LTR ERV1 -438 273 39 7 1718 815 281 128 3 chr2 148524250 148524585 -33223502 + MTEb LTR MaLR 2 378 -1 3 1718 1192 256 36 27 chr2 148529458 148529823 -33218264 + ORR1D2 LTR MaLR 1 368 -2 4 1718 252 312 123 12 chr2 148530344 148530506 -33217581 + MLT1J-int LTR MaLR 261 440 -947 4 1718 439 333 43 64 chr2 148536246 148536463 -33211624 + MLT1A1 LTR MaLR 3 276 -132 5 1718 439 290 9 78 chr2 148536996 148537133 -33210954 + MLT1A1 LTR MaLR 277 404 -4 5 1718 2347 146 23 23 chr2 148538708 148539100 -33208987 + ORR1B1 LTR MaLR 1 392 -2 5 1718 258 337 162 5 chr2 148540527 148540718 -33207369 + MLT1A1 LTR MaLR 176 396 -12 6 1718 481 239 145 83 chr2 148545130 148545358 -33202729 + ORR1E LTR MaLR 118 359 0 7 1718 1594 255 86 76 chr2 148545366 148545864 -33202223 + ORR1E-int LTR MaLR 9 536 -1044 7 1718 1594 255 86 76 chr2 148546008 148546125 -33201962 + ORR1E-int LTR MaLR 537 630 -950 7 1718 1091 255 108 18 chr2 148546611 148546943 -33201144 + ORR1E-int LTR MaLR 681 1042 -538 7 1718 1385 190 149 28 chr2 148553574 148553937 -33194150 - MTD LTR MaLR -8 411 5 9 1718 728 225 31 0 chr2 148560216 148560345 -33187742 - ETnERV2-int LTR ERVK -204 7202 7070 9 1718 862 252 54 73 chr2 148560871 148561054 -33187033 - MTE2a LTR MaLR -3 376 184 1 1718 3761 28 14 97 chr2 148561054 148561572 -33186515 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 1 1718 862 252 54 73 chr2 148561572 148561701 -33186386 - MTE2a LTR MaLR -196 183 70 1 1718 440 251 33 8 chr2 148562698 148562850 -33185237 + MLT2B1 LTR ERVL 381 538 -17 1 1718 2282 180 47 150 chr2 148566000 148566681 -33181406 - RMER19C LTR ERVK 0 611 1 1 1718 890 244 65 90 chr2 148567929 148568411 -33179676 - MT2B LTR ERVL 0 601 1 1 1718 3113 23 2 116 chr2 148570597 148571037 -33177050 - RLTR10 LTR ERVK 0 390 1 1 1718 17278 25 4 0 chr2 148571039 148572976 -33175111 - RLTR10-int LTR ERVK -3 1984 41 1 1718 3082 21 2 121 chr2 148572989 148573429 -33174658 - RLTR10 LTR ERVK -2 388 1 1 1718 582 207 146 32 chr2 148579147 148579332 -33168755 - RMER15 LTR ERVL -15 560 355 1 1718 703 97 0 0 chr2 148581771 148581874 -33166213 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 265 1 1718 3331 46 2 0 chr2 148582221 148582614 -33165473 + MTA_Mm LTR MaLR 1 394 -2 1 1718 1352 122 84 4 chr2 148589367 148589605 -33158482 - ORR1B2 LTR MaLR -110 257 1 1 1718 422 315 133 12 chr2 148589605 148589845 -33158242 - MER68 LTR ERVL -134 429 161 1 1718 371 329 128 12 chr2 148598629 148598801 -33149286 + RMER15 LTR ERVL 285 476 -99 1 1718 323 290 99 58 chr2 148599165 148599337 -33148750 - ORR1E LTR MaLR -162 197 19 1 1718 232 269 216 15 chr2 148599702 148599906 -33148181 - MLT1D LTR MaLR -236 269 25 1 1718 3852 28 5 0 chr2 148601055 148601489 -33146598 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 1 1718 1104 247 148 3 chr2 148602346 148602671 -33145416 + MTEb LTR MaLR 8 379 0 1 1718 1646 123 84 61 chr2 148602748 148603059 -33145028 - ORR1A3 LTR MaLR -8 318 1 1 1718 627 325 100 3 chr2 148603153 148603452 -33144635 + MLT1D LTR MaLR 135 462 -43 1 1718 1989 214 37 0 chr2 148613611 148614013 -33134074 + MTD LTR MaLR 3 419 0 1 1718 1053 256 19 63 chr2 148621906 148621987 -33126100 + ORR1D1 LTR MaLR 72 151 -223 1 1718 1053 256 19 63 chr2 148622079 148622313 -33125774 + ORR1D1 LTR MaLR 152 373 -1 1 1718 400 318 124 22 chr2 148627203 148627476 -33120611 - LTR16C LTR ERVL -10 479 179 2 1719 2658 139 189 18 chr2 148639049 148639586 -33108501 + RMER6A LTR ERVK 1 629 -127 2 1719 2676 151 24 17 chr2 148644013 148644431 -33103656 + MTC LTR MaLR 1 421 0 2 1719 2101 157 11 11 chr2 148645128 148645482 -33102605 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 41 2 1719 771 243 53 5 chr2 148645519 148645709 -33102378 + RMER15 LTR ERVL 377 575 0 2 1719 311 337 199 33 chr2 148648249 148648645 -33099442 - MER21B LTR ERV1 -397 466 5 2 1719 2538 221 53 36 chr2 148651524 148652130 -33095957 - RLTR18 LTR ERVK 0 616 1 2 1719 231 258 60 70 chr2 148652206 148652306 -33095781 + MLT1A1 LTR MaLR 1 99 -309 2 1719 232 337 11 21 chr2 148654278 148654372 -33093715 - MLT1H2 LTR MaLR -47 442 350 2 1719 6193 59 0 0 chr2 148661255 148662066 -33086021 + RLTR22_Mus LTR ERVK 1 811 -997 2 1719 635 197 101 7 chr2 148663128 148663276 -33084811 - MTE2a LTR MaLR 0 379 218 2 1719 1250 226 54 15 chr2 148663281 148663614 -33084473 - RLTR15 LTR ERVK -13 346 1 2 1719 758 227 19 166 chr2 148663614 148663873 -33084214 - MTE2a LTR MaLR -153 226 6 2 1719 1730 163 24 107 chr2 148670935 148671354 -33076733 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 2 1719 491 221 81 37 chr2 148677488 148677624 -33070463 - RMER12 LTR ERVK -13 1309 1168 2 1719 3660 174 34 61 chr2 148678345 148679108 -33068979 - RMER12 LTR ERVK -178 1144 203 2 1719 2089 136 3 13 chr2 148679108 148679422 -33068665 - RLTR10E LTR ERVK 0 311 1 3 1719 3660 163 31 51 chr2 148679422 148679629 -33068458 - RMER12 LTR ERVK -1120 202 1 2 1719 2848 87 38 8 chr2 148679710 148680105 -33067982 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 3 1719 239 247 69 23 chr2 148684849 148684936 -33063151 + MLT1A1 LTR MaLR 1 91 -317 3 1719 1754 133 43 12 chr2 148689152 148689479 -33058608 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1 337 -1511 3 1719 274 277 10 0 chr2 148689925 148690026 -33058061 - LTR23-int LTR ERV1 -3268 1855 1754 3 1719 404 320 26 0 chr2 148691347 148691500 -33056587 + MLT2C1 LTR ERVL 69 225 -172 3 1719 1638 213 67 10 chr2 148692497 148692625 -33055462 + MTD LTR MaLR 4 130 -289 3 1719 1668 159 123 18 chr2 148692625 148692900 -33055187 + ORR1C1 LTR MaLR 1 312 -66 3 1719 1668 159 123 18 chr2 148692920 148692984 -33055103 + ORR1C1 LTR MaLR 313 375 -3 3 1719 1638 213 67 10 chr2 148692984 148693244 -33054843 + MTD LTR MaLR 131 414 -5 3 1719 269 259 118 0 chr2 148693668 148693753 -33054334 + MTE2a LTR MaLR 4 98 -281 3 1719 2901 52 0 0 chr2 148695200 148695545 -33052542 + ORR1A0 LTR MaLR 1 345 -1 3 1719 360 338 89 45 chr2 148705432 148705791 -33042296 + MER31B LTR ERV1 52 426 -40 3 1719 526 268 100 21 chr2 148711105 148711345 -33036742 + RMER5 LTR ERV1 33 291 -243 3 1719 442 267 16 8 chr2 148711377 148711498 -33036589 + RMER5 LTR ERV1 361 482 -52 3 1719 389 228 135 71 chr2 148722160 148722330 -33025757 + MLT1H2 LTR MaLR 308 488 -1 3 1719 1123 207 48 0 chr2 148722671 148722879 -33025208 - RLTR18B LTR ERVK -8 504 287 3 1719 4608 79 37 0 chr2 148722892 148723540 -33024547 - MERVL-int LTR ERVL -1253 4232 3561 3 1719 799 220 23 17 chr2 148723588 148723764 -33024323 - RLTR18B LTR ERVK -242 270 94 3 1719 232 247 65 93 chr2 148724124 148724231 -33023856 + RMER15 LTR ERVL 1 104 -471 3 1719 723 323 31 16 chr2 148724312 148724570 -33023517 + RMER15 LTR ERVL 300 561 -14 3 1719 1094 273 105 113 chr2 148725258 148725572 -33022515 + RLTR18 LTR ERVK 6 326 -290 3 1719 1094 273 105 113 chr2 148725693 148725989 -33022098 + RLTR18 LTR ERVK 327 611 -5 3 1719 2088 184 52 12 chr2 148733320 148733721 -33014366 + MTC LTR MaLR 5 421 0 3 1719 4021 42 38 8 chr2 148736625 148737129 -33010958 + MURVY-LTR LTR ERV1 1 519 0 3 1719 631 327 30 20 chr2 148739435 148739923 -33008164 - RLTR6-int LTR ERV1 -128 7650 6907 3 1719 2205 103 19 0 chr2 148740584 148740904 -33007183 + IAPEY2_LTR LTR ERVK 32 357 0 3 1719 7362 120 19 8 chr2 148740904 148742101 -33005986 + IAPEY3-int LTR ERVK 1 1211 -6469 3 1719 8515 114 4 17 chr2 148742082 148743442 -33004645 + IAPEy-int LTR ERVK 6171 7513 0 3 1719 691 110 92 0 chr2 148743442 148743551 -33004536 + IAPEY3_LTR LTR ERVK 1 119 -213 3 1719 336 280 14 20 chr2 148743556 148743702 -33004385 - RLTR4_MM-int LTR ERV1 -3214 4392 4248 3 1719 479 302 0 6 chr2 148743695 148743868 -33004219 - RLTR4_MM-int LTR ERV1 -3508 4093 3922 3 1719 1595 21 0 15 chr2 148747053 148747249 -33000838 - RLTR13B2 LTR ERVK -615 207 15 3 1719 4118 220 78 65 chr2 148751689 148752315 -32995772 + RMER12 LTR ERVK 1 622 -700 3 1719 4118 220 78 65 chr2 148752462 148753034 -32995053 + RMER12 LTR ERVK 623 1215 -107 3 1720 886 392 46 32 chr2 148768021 148768827 -32979260 - MTE-int LTR MaLR -745 835 19 4 1720 1252 294 17 12 chr2 148769373 148769776 -32978311 - MTC LTR MaLR -14 407 3 4 1720 571 337 124 4 chr2 148773751 148774001 -32974086 + MTD LTR MaLR 6 285 -134 4 1720 386 377 33 51 chr2 148774836 148775225 -32972862 - MTE-int LTR MaLR -717 863 482 4 1720 226 369 63 34 chr2 148776278 148776483 -32971604 - MTE-int LTR MaLR -1134 446 236 4 1720 271 293 20 20 chr2 148776702 148776803 -32971284 - MTE-int LTR MaLR -1351 229 129 4 1720 270 336 52 26 chr2 148777536 148777689 -32970398 - RLTR12B LTR ERVK -293 235 79 4 1720 673 188 107 0 chr2 148780044 148780193 -32967894 - RMER16-int LTR ERVK -4908 498 334 4 1720 755 108 8 0 chr2 148780208 148780328 -32967759 - MMERVK10C-int LTR ERVK -6753 828 708 4 1720 1488 131 24 12 chr2 148780426 148780763 -32967324 - MMERVK10C-int LTR ERVK -7155 426 1 4 1720 1017 192 130 49 chr2 148780763 148781070 -32967017 - IAPEY3_LTR LTR ERVK 0 332 1 4 1720 621 392 49 23 chr2 148796720 148797070 -32951017 - ORR1D2 LTR MaLR -2 368 10 4 1720 264 250 0 0 chr2 148797093 148797157 -32950930 - ORR1D2-int LTR MaLR -10 1360 1297 4 1720 360 223 18 0 chr2 148816409 148816521 -32931566 + MERVL_2A-int LTR ERVL 5643 5756 -5 4 1720 347 279 0 0 chr2 148816528 148816614 -32931473 + MT2A LTR ERVL 3 88 -445 4 1720 234 349 0 28 chr2 148820195 148820304 -32927783 + MT2A LTR ERVL 73 178 -355 4 1720 897 309 113 53 chr2 148820314 148820977 -32927110 + RMER12B LTR ERVK 1 808 -596 4 1720 3915 195 30 42 chr2 148823315 148824216 -32923871 + RMER12 LTR ERVK 1 890 -432 4 1720 428 302 83 65 chr2 148824310 148824526 -32923561 + RMER12 LTR ERVK 994 1213 -109 4 1720 260 219 84 12 chr2 148829976 148830059 -32918028 + MTEb LTR MaLR 281 369 -10 4 1720 437 391 75 40 chr2 148830565 148831044 -32917043 - MTE-int LTR MaLR -560 1020 525 4 1720 328 304 113 56 chr2 148832164 148832359 -32915728 - MTE-int LTR MaLR -1156 424 219 4 1720 594 326 9 13 chr2 148832563 148832787 -32915300 - MTE-int LTR MaLR -1351 229 7 4 1720 292 286 48 26 chr2 148832881 148833026 -32915061 - RLTR12B LTR ERVK -309 219 79 4 1720 2778 58 0 14 chr2 148833976 148834327 -32913760 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 4 1720 13471 61 9 4 chr2 148834327 148836110 -32911977 + ORR1A1-int LTR MaLR 1 1792 0 4 1720 2751 69 0 0 chr2 148836110 148836456 -32911631 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 4 1720 601 353 55 7 chr2 148837804 148838095 -32909992 - MTC-int LTR MaLR -278 980 676 4 1720 419 402 47 32 chr2 148838298 148838856 -32909231 - MTC-int LTR MaLR -1014 566 1 4 1720 772 372 30 27 chr2 148839320 148839708 -32908379 - MTC LTR MaLR -30 389 1 4 1720 1641 23 139 0 chr2 148842897 148843113 -32904974 + RLTR10B LTR ERVK 1 246 -46 4 1720 1044 390 51 29 chr2 148852706 148853505 -32894582 - MTE-int LTR MaLR -745 835 19 4 1720 1412 259 44 24 chr2 148854007 148854418 -32893669 - MTC LTR MaLR 0 421 3 4 1720 1727 228 109 30 chr2 148856080 148856574 -32891513 + RMER16 LTR ERVK 1 533 0 4 1720 9018 117 24 12 chr2 148856574 148857949 -32890138 + RMER16-int LTR ERVK 1 1391 -4015 4 1720 25709 97 39 28 chr2 148858026 148858521 -32889566 + RMER16-int LTR ERVK 1327 1801 -3605 4 1720 25709 97 39 28 chr2 148858668 148862090 -32885997 + RMER16-int LTR ERVK 1802 5287 -119 4 1720 273 98 0 0 chr2 148862233 148862274 -32885813 + RMER16-int LTR ERVK 5366 5406 0 4 1720 1847 218 116 12 chr2 148862274 148862757 -32885330 + RMER16 LTR ERVK 1 533 0 4 1720 4984 136 118 37 chr2 148865078 148865988 -32882099 + RLTR13C1 LTR ERVK 1 983 0 4 1720 271 380 104 38 chr2 148883103 148883634 -32864453 - MTE-int LTR MaLR -863 717 152 5 1720 448 265 51 0 chr2 148892325 148892423 -32855664 + ETnERV2-int LTR ERVK 7100 7202 -204 5 1721 2481 149 5 0 chr2 148902510 148902927 -32845160 + BGLII LTR ERVK 1 419 -2 5 1721 763 241 101 3 chr2 148907106 148907387 -32840700 + ORR1B1-int LTR MaLR 1205 1480 -29 5 1721 7597 203 24 77 chr2 148907386 148907479 -32840608 - ORR1A4-int LTR MaLR -211 1752 1670 5 1721 7597 203 24 77 chr2 148907746 148909498 -32838589 - ORR1A4-int LTR MaLR -294 1669 2 5 1721 1066 136 12 0 chr2 148909499 148909668 -32838419 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 159 5 1721 2572 122 14 7 chr2 148919290 148919703 -32828384 + BGLII LTR ERVK 1 416 -5 5 1721 1928 247 28 9 chr2 148922840 148923297 -32824790 + MERVK26-int LTR ERVK 5832 6297 -622 5 1721 731 379 41 26 chr2 148923729 148924236 -32823851 - MTEb-int LTR MaLR -1063 517 3 5 1721 254 297 0 13 chr2 148924241 148924316 -32823771 - MTEb LTR MaLR -4 375 302 5 1721 2787 123 35 35 chr2 148930390 148930872 -32817215 + RLTR45 LTR ERVK 1 482 0 5 1721 3864 96 32 19 chr2 148930872 148931436 -32816651 + RLTR45-int LTR ERVK 1 571 -6673 5 1721 1106 42 0 40 chr2 148932189 148932339 -32815748 + RLTR45-int LTR ERVK 549 692 -6552 5 1721 1128 51 0 0 chr2 148932683 148932821 -32815266 + RLTR45-int LTR ERVK 681 818 -6426 5 1721 473 258 56 31 chr2 148933031 148933191 -32814896 + RNERVK23-int LTR ERVK 6195 6358 -1859 5 1721 2310 65 51 16 chr2 148933549 148933861 -32814226 + RLTR45-int LTR ERVK 1323 1645 -5599 5 1721 7257 155 15 18 chr2 148933953 148935357 -32812730 + RLTR45-int LTR ERVK 6331 7761 -456 5 1721 2588 142 35 39 chr2 148935357 148935841 -32812246 + RLTR45 LTR ERVK 1 482 0 5 1721 284 309 135 0 chr2 148942623 148942749 -32805338 - RMER4B LTR ERVK -102 483 341 5 1721 346 396 10 0 chr2 148942796 148942998 -32805089 + MTE-int LTR MaLR 3 206 -1374 5 1721 243 352 11 0 chr2 148943160 148943248 -32804839 + MTE-int LTR MaLR 274 362 -1008 5 1721 228 222 14 100 chr2 148951875 148951945 -32796142 - RLTR43A LTR ERVK -280 84 21 5 1721 700 317 18 24 chr2 148963079 148963412 -32784675 + MYSERV6-int LTR ERVK 3836 4166 -2384 5 1721 815 283 90 19 chr2 148963489 148964149 -32783938 + MYSERV6-int LTR ERVK 4499 4984 -1566 5 1721 1003 226 18 33 chr2 148964144 148964418 -32783669 + MYSERV6-int LTR ERVK 8257 8526 -433 5 1721 1386 244 156 17 chr2 148967967 148968430 -32779657 - RLTR11A2 LTR ERVK 0 527 1 6 1721 1483 241 19 36 chr2 148977494 148977859 -32770228 - MTC LTR MaLR 0 421 63 6 1721 428 195 12 0 chr2 148978025 148978107 -32769980 - MTC LTR MaLR -338 83 1 6 1721 448 294 41 51 chr2 148984019 148984216 -32763871 - RLTR46 LTR ERVK 0 320 126 6 1721 225 291 35 69 chr2 148984260 148984404 -32763683 - RLTR46 LTR ERVK -180 140 2 6 1721 1353 330 92 24 chr2 148985712 148986494 -32761593 + MTE-int LTR MaLR 20 854 -726 6 1721 593 365 120 42 chr2 149000602 149001168 -32746919 + MTE-int LTR MaLR 248 857 -723 6 1721 599 230 183 55 chr2 149002070 149002305 -32745782 - RLTR10A LTR ERVK 0 411 147 8 1721 1677 232 13 26 chr2 149002350 149002837 -32745250 - RLTR45-int LTR ERVK -202 7042 6529 8 1721 1583 312 57 60 chr2 149003112 149004876 -32743211 - IAP-d-int LTR ERVK -2179 5402 3339 9 1721 1711 281 52 43 chr2 149004921 149005750 -32742337 - IAP-d-int LTR ERVK -3574 2968 2133 9 1721 479 200 49 56 chr2 149006527 149006670 -32741417 - RLTR45-int LTR ERVK -1554 433 292 8 1721 280 250 39 55 chr2 149009396 149009443 -32738644 - RMER17A LTR ERVK -282 469 418 1 1721 280 250 39 55 chr2 149009500 149009634 -32738453 - RMER17A LTR ERVK -334 417 291 1 1721 651 180 0 0 chr2 149017827 149017938 -32730149 - RLTR13D6 LTR ERVK -791 111 1 2 1721 1189 235 0 8 chr2 149017938 149018190 -32729897 - ORR1A4-int LTR MaLR -1320 643 394 2 1721 542 214 0 0 chr2 149018196 149018299 -32729788 - ORR1A4 LTR MaLR -68 261 159 2 1721 2699 113 20 2 chr2 149020204 149020613 -32727474 + BGLII LTR ERVK 3 418 -3 2 1721 836 251 187 10 chr2 149023737 149024133 -32723954 + MERVK26-int LTR ERVK 5832 6297 -622 2 1721 638 381 22 30 chr2 149024503 149025056 -32723031 - MTE-int LTR MaLR -844 526 3 3 1722 4255 176 48 20 chr2 149029418 149030277 -32717810 - RLTR13D6 LTR ERVK -19 883 1 3 1722 873 351 87 41 chr2 149032701 149033336 -32714751 + MTE-int LTR MaLR 212 875 -705 3 1722 815 129 0 8 chr2 149036639 149036764 -32711323 + MTB LTR MaLR 3 126 -270 4 1722 2483 104 38 10 chr2 149036765 149037164 -32710923 + RLTR22_Mus LTR ERVK 1 410 -1398 4 1722 3015 121 19 12 chr2 149039726 149040211 -32707876 + RLTR22_Mus LTR ERVK 330 817 -991 4 1722 1230 198 56 0 chr2 149040468 149040720 -32707367 + RLTR22_Mus LTR ERVK 1543 1808 0 4 1722 1793 132 4 0 chr2 149040721 149040993 -32707094 + MTB LTR MaLR 128 400 0 4 1722 414 295 0 9 chr2 149050713 149050826 -32697261 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 296 5 1722 453 190 0 23 chr2 149050822 149050908 -32697179 - MTB_Mm LTR MaLR -323 84 1 5 1722 2730 55 0 0 chr2 149052340 149052669 -32695418 + IAPEY3_LTR LTR ERVK 4 332 0 5 1722 36266 64 7 1 chr2 149052669 149058474 -32689613 + IAPEY3-int LTR ERVK 1 5847 -1833 5 1722 8356 56 47 16 chr2 149058473 149059566 -32688521 + IAPEY3-int LTR ERVK 6554 7680 0 5 1722 2670 72 0 0 chr2 149059566 149059898 -32688189 + IAPEY3_LTR LTR ERVK 1 332 0 5 1722 226 170 85 0 chr2 149064937 149064984 -32683103 - RLTR19B LTR ERVK -557 158 108 7 1722 637 263 182 0 chr2 149078315 149078513 -32669574 - RMER4B LTR ERVK -11 574 341 8 1722 287 386 28 6 chr2 149078558 149078735 -32669352 + MTE-int LTR MaLR 3 183 -1397 8 1722 239 321 90 22 chr2 149078834 149078968 -32669119 + MTE-int LTR MaLR 279 421 -949 8 1722 756 332 17 27 chr2 149104902 149105335 -32642752 + MYSERV-int LTR ERVK 3828 4414 -4545 1 1722 1432 270 86 24 chr2 149105389 149106054 -32642033 + MYSERV-int LTR ERVK 4279 4984 -1566 1 1722 1034 226 18 29 chr2 149106049 149106322 -32641765 + MYSERV6-int LTR ERVK 8257 8526 -433 1 1722 418 286 51 77 chr2 149109077 149109312 -32638775 + RLTR45 LTR ERVK 34 262 -220 1 1722 245 173 169 26 chr2 149109383 149109460 -32638627 + RLTR45 LTR ERVK 395 482 0 1 1722 1275 241 170 20 chr2 149110198 149110656 -32637431 - RLTR11A2 LTR ERVK 0 527 1 1 1722 230 183 46 77 chr2 149116742 149116807 -32631280 - RMER20A LTR ERVK -268 248 186 1 1722 2684 118 7 7 chr2 149122572 149122975 -32625112 - RLTR9D LTR ERVK 0 403 1 1 1722 625 268 32 43 chr2 149123164 149123445 -32624642 - IAP-d-int LTR ERVK -799 5743 5466 1 1722 2034 209 10 14 chr2 149123725 149124290 -32623797 - ETnERV3-int LTR ERVK -1076 5745 5098 1 1722 741 102 17 8 chr2 149124425 149124544 -32623543 - ETnERV3-int LTR ERVK -2932 4649 4530 1 1722 417 179 18 36 chr2 149124570 149124680 -32623407 - MMETn-int LTR ERVK -2380 2464 2357 1 1722 6085 112 43 25 chr2 149124719 149125671 -32622416 - ETnERV3-int LTR ERVK -3198 4208 3135 1 1722 6085 105 25 31 chr2 149125817 149126227 -32621860 - ETnERV3-int LTR ERVK -2674 3134 2735 1 1722 268 217 0 68 chr2 149126239 149126313 -32621774 - ETnERV3-int LTR ERVK -4867 2539 2471 1 1722 400 239 92 0 chr2 149126352 149126461 -32621626 - RMER16-int LTR ERVK -5081 1056 938 1 1722 1020 212 133 52 chr2 149126475 149126880 -32621207 - RMER16-int LTR ERVK -4783 623 317 1 1722 1020 205 140 39 chr2 149126925 149126981 -32621106 - RMER16-int LTR ERVK -5090 316 256 1 1722 386 129 0 121 chr2 149127104 149127236 -32620851 - MMERVK10C-int LTR ERVK -6629 952 837 1 1722 412 192 8 55 chr2 149127210 149127337 -32620750 - IAPLTR3-int LTR ERVK -5867 954 834 1 1722 471 193 25 34 chr2 149127337 149127455 -32620632 - IAPLTR3-int LTR ERVK -6704 117 1 1 1722 2743 50 18 3 chr2 149127455 149127795 -32620292 - IAPLTR4 LTR ERVK 0 345 1 1 1722 2199 196 20 4 chr2 149128992 149129443 -32618644 + RMER12 LTR ERVK 1 458 -864 1 1722 823 287 15 134 chr2 149129438 149129833 -32618254 - MTC-int LTR MaLR -496 762 415 1 1722 285 261 95 56 chr2 149129899 149130025 -32618062 - MTC-int LTR MaLR -1122 136 6 1 1722 262 320 31 39 chr2 149130060 149130187 -32617900 - MTC LTR MaLR -37 384 259 1 1722 630 361 81 52 chr2 149131358 149132027 -32616060 - MTE-int LTR MaLR -749 831 144 1 1722 929 334 77 10 chr2 149133806 149134196 -32613891 - MTC LTR MaLR -5 416 1 1 1722 1008 370 69 29 chr2 149136435 149137201 -32610886 - MTE-int LTR MaLR -671 909 113 1 1722 1789 201 66 5 chr2 149142182 149142577 -32605510 - MTC LTR MaLR -2 419 1 1 1722 934 104 32 13 chr2 149145209 149145365 -32602722 + RMER17A-int LTR ERVK 3 161 -1567 1 1722 343 161 57 11 chr2 149145540 149145628 -32602459 + RMER17A-int LTR ERVK 189 280 -1448 1 1722 1423 170 80 25 chr2 149145640 149146056 -32602031 + RMER17D LTR ERVK 316 887 -2 1 1722 240 311 48 10 chr2 149147440 149147544 -32600543 - MTEa LTR MaLR 0 379 272 1 1722 258 212 100 57 chr2 149150961 149151031 -32597056 - RLTR31_Mur LTR ERVK 0 553 481 1 1722 1744 262 22 45 chr2 149151009 149151516 -32596571 - RLTR17 LTR ERVK -93 599 105 1 1722 5168 132 14 34 chr2 149152839 149153744 -32594343 + RMER17D LTR ERVK 1 887 -2 1 1722 830 142 37 78 chr2 149153749 149153875 -32594212 + RMER17A-int LTR ERVK 3 127 -1601 1 1722 830 142 37 78 chr2 149153934 149153998 -32594089 + RMER17A-int LTR ERVK 128 185 -1543 1 1722 6363 115 28 36 chr2 149154292 149155441 -32592646 + RMER17A-int LTR ERVK 253 1726 -2 1 1722 4369 132 12 82 chr2 149155450 149156308 -32591779 + RMER17D LTR ERVK 92 889 0 1 1722 255 267 54 32 chr2 149158110 149158203 -32589884 + LTR33B LTR ERVL 29 123 -380 1 1723 458 233 378 29 chr2 149169009 149169181 -32578906 - MTEa LTR MaLR -100 279 48 1 1723 706 339 86 0 chr2 149169185 149169442 -32578645 + MER21B LTR ERV1 499 777 -86 1 1723 662 344 78 3 chr2 149177843 149178187 -32569900 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 1 1723 1243 263 40 3 chr2 149178187 149178485 -32569602 + ORR1D2-int LTR MaLR 1 309 -1061 1 1723 1161 228 49 68 chr2 149184091 149184458 -32563629 - RLTR9A LTR ERVK -8 360 1 2 1723 8710 145 70 24 chr2 149184743 149186513 -32561574 - RMER16-int LTR ERVK -4081 3325 1568 2 1723 233 354 0 12 chr2 149191887 149191970 -32556117 + MLT1L LTR MaLR 185 266 -344 2 1723 236 357 68 20 chr2 149210911 149211057 -32537030 + MLT1H LTR MaLR 135 287 -262 2 1723 1425 213 4 4 chr2 149212343 149212612 -32535475 - RLTR28 LTR ERVL -255 269 1 2 1723 4147 154 82 102 chr2 149212628 149213539 -32534548 + RLTR13B1 LTR ERVK 1 893 0 2 1723 737 136 192 13 chr2 149213541 149213576 -32534511 + ETnERV2-int LTR ERVK 3 37 -5771 2 1723 737 136 192 13 chr2 149213602 149213722 -32534365 + ETnERV2-int LTR ERVK 38 185 -5623 2 1723 21936 110 55 25 chr2 149213906 149217898 -32530189 + ETnERV2-int LTR ERVK 186 4023 -1785 2 1723 20385 133 41 57 chr2 149217930 149218215 -32529872 + ETnERV2-int LTR ERVK 4024 4305 -1503 2 1723 1575 191 148 27 chr2 149222084 149222456 -32525631 - MTC LTR MaLR 0 421 5 2 1723 4828 105 12 56 chr2 149223364 149224210 -32523877 - RMER17D2 LTR ERVK 0 809 1 2 1723 3417 35 0 0 chr2 149227403 149227799 -32520288 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 1723 1666 203 42 63 chr2 149259210 149259589 -32488498 - ORR1C1 LTR MaLR -2 376 6 2 1723 371 325 66 55 chr2 149263231 149263488 -32484599 - MLT1D LTR MaLR -212 293 34 2 1723 1816 122 47 185 chr2 149263887 149264438 -32483649 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 2 1723 3296 59 37 15 chr2 149264439 149265151 -32482936 + IAPEz-int LTR ERVK 9 662 -5819 2 1723 2080 75 0 0 chr2 149265151 149265429 -32482658 + IAPEz-int LTR ERVK 1359 1636 -4845 2 1723 5837 43 4 12 chr2 149265428 149266180 -32481907 + IAPEz-int LTR ERVK 5736 6481 0 2 1723 1727 147 21 198 chr2 149266180 149266757 -32481330 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 2 1723 699 300 93 76 chr2 149266769 149267060 -32481027 + ORR1E LTR MaLR 3 295 -64 2 1723 699 300 93 76 chr2 149267127 149267178 -32480909 + ORR1E LTR MaLR 296 350 -9 2 1723 815 304 184 66 chr2 149283463 149284085 -32464002 + RMER13A LTR ERVK 2 755 -153 3 1723 1921 135 39 66 chr2 149285286 149285619 -32462468 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 3 3 1724 2254 180 63 10 chr2 149295565 149295964 -32452123 + MTC LTR MaLR 1 420 -1 3 1724 369 358 75 54 chr2 149305953 149306325 -32441762 + MTD LTR MaLR 25 404 -15 3 1724 790 260 107 44 chr2 149306951 149307289 -32440798 - RLTR10D LTR ERVK 0 359 1 3 1724 323 343 124 62 chr2 149307289 149307643 -32440444 - MLT1H1 LTR MaLR -111 444 69 3 1724 1290 276 42 25 chr2 149308851 149309212 -32438875 + MTEa LTR MaLR 1 367 -12 3 1724 350 367 71 24 chr2 149315902 149316072 -32432015 - LTR16E2 LTR ERVL -164 404 227 3 1724 455 251 132 130 chr2 149316585 149317001 -32431086 + RMER10A LTR ERVL 7 423 -19 3 1724 262 317 63 58 chr2 149320726 149321084 -32427003 - ORR1D2 LTR MaLR 0 359 1 3 1724 898 268 40 8 chr2 149326518 149326766 -32421321 - MTD LTR MaLR -2 417 162 3 1724 495 189 31 0 chr2 149327262 149327371 -32420716 + MTD LTR MaLR 13 124 -297 3 1724 560 301 41 23 chr2 149330758 149330976 -32417111 - RMER15 LTR ERVL -14 561 340 3 1724 723 265 78 108 chr2 149331206 149331610 -32416477 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 3 1724 455 250 7 17 chr2 149331698 149331826 -32416261 + MLT1A1 LTR MaLR 234 405 -3 3 1724 1284 288 150 54 chr2 149332751 149333426 -32414661 + RMER13A LTR ERVK 1 739 -121 3 1724 585 340 84 33 chr2 149335520 149335854 -32412233 + MLT1A LTR MaLR 24 374 0 3 1724 253 345 72 88 chr2 149336407 149336588 -32411499 + LTR16A1 LTR ERVL 186 363 -93 3 1724 803 312 74 40 chr2 149348941 149349362 -32398725 + MER31A LTR ERV1 11 445 -40 3 1724 530 329 79 26 chr2 149349379 149349676 -32398411 + ORR1E LTR MaLR 37 379 0 3 1724 815 314 58 21 chr2 149350670 149350995 -32397092 + MLT1A LTR MaLR 1 337 -37 3 1724 992 226 4 4 chr2 149351750 149351934 -32396153 - MTC LTR MaLR -54 367 196 3 1724 466 368 48 63 chr2 149352944 149353295 -32394792 - MLT1D LTR MaLR -152 353 8 3 1724 508 33 0 0 chr2 149356226 149356286 -32391801 + MTA_Mm LTR MaLR 341 400 0 4 1724 8142 62 27 4 chr2 149356286 149357359 -32390728 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 4 1724 3339 35 2 2 chr2 149357359 149357755 -32390332 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 1724 1116 235 214 12 chr2 149360164 149360487 -32387600 + MTEa-int LTR MaLR 1030 1417 -163 4 1724 423 304 26 0 chr2 149361210 149361325 -32386762 + MTEa-int LTR MaLR 1441 1558 -22 4 1724 993 292 22 86 chr2 149361337 149361742 -32386345 + MTEa LTR MaLR 1 379 0 4 1724 640 299 87 29 chr2 149362641 149363082 -32385005 + MT2A LTR ERVL 2 492 -28 4 1724 1045 285 120 17 chr2 149363504 149363921 -32384166 + RMER5 LTR ERV1 41 500 -34 4 1724 1576 255 47 7 chr2 149365741 149366144 -32381943 - MTD LTR MaLR 0 419 1 4 1724 234 364 38 63 chr2 149369114 149369401 -32378686 - MLT1F LTR MaLR -4 544 265 4 1724 340 363 76 71 chr2 149371590 149371972 -32376115 + MLT1H1 LTR MaLR 13 396 -159 4 1724 245 161 71 0 chr2 149371986 149372042 -32376045 - MTEa LTR MaLR -4 375 316 4 1724 791 311 56 105 chr2 149376729 149377121 -32370966 + MTEa LTR MaLR 1 373 -6 4 1724 556 257 40 51 chr2 149378727 149378930 -32369157 - ORR1D2 LTR MaLR 0 379 201 4 1724 265 233 23 0 chr2 149378889 149378975 -32369112 - RMER17C LTR ERVK -143 267 180 4 1724 533 289 45 19 chr2 149378949 149379104 -32368983 - ORR1D2 LTR MaLR -168 191 33 4 1724 2340 273 80 63 chr2 149380111 149380949 -32367138 + RMER13A LTR ERVK 9 860 0 4 1724 1050 248 37 11 chr2 149382524 149382797 -32365290 + ERVL-int LTR ERVL 66 345 -5369 4 1724 335 269 11 0 chr2 149382794 149382887 -32365200 - ERVL-B4-int LTR ERVL -5162 552 459 4 1724 389 250 65 0 chr2 149382926 149383034 -32365053 - ERVL-B4-int LTR ERVL -5257 457 343 4 1724 343 342 0 0 chr2 149383034 149383145 -32364942 + ERVL-int LTR ERVL 2086 2196 -3518 4 1724 957 277 121 43 chr2 149383159 149383532 -32364555 - MTD LTR MaLR -15 404 3 4 1724 1012 294 89 15 chr2 149384241 149385120 -32362967 + ERVL-int LTR ERVL 2294 3237 -2477 4 1724 758 312 55 62 chr2 149385145 149385552 -32362535 + ORR1E LTR MaLR 1 370 0 4 1724 2291 309 97 27 chr2 149385552 149386868 -32361219 + ERVL-int LTR ERVL 3306 4712 -1045 4 1724 378 303 99 57 chr2 149387200 149387483 -32360604 + ERVL-int LTR ERVL 5094 5388 -326 4 1724 1215 191 137 175 chr2 149388078 149388124 -32359963 - MT2A LTR ERVL 0 533 491 4 1724 1215 191 137 175 chr2 149388241 149388427 -32359660 - MT2A LTR ERVL -43 490 272 4 1724 1215 191 137 175 chr2 149388607 149388885 -32359202 - MT2A LTR ERVL -262 271 42 4 1724 737 222 97 0 chr2 149394332 149394508 -32353579 - MTD LTR MaLR 0 419 227 4 1724 570 241 181 41 chr2 149397481 149397702 -32350385 - MTD LTR MaLR -3 416 165 4 1724 886 301 103 30 chr2 149402628 149402957 -32345130 + ORR1E LTR MaLR 1 353 -6 4 1724 311 364 8 8 chr2 149403035 149403168 -32344919 - ORR1E LTR MaLR -224 135 3 4 1724 1337 214 51 114 chr2 149403216 149403611 -32344476 - ORR1D1 LTR MaLR -4 370 1 4 1724 576 359 45 33 chr2 149403954 149404199 -32343888 - ORR1E LTR MaLR -107 252 5 4 1724 414 286 130 45 chr2 149410569 149410792 -32337295 - MTEb LTR MaLR -65 314 73 4 1724 288 301 28 38 chr2 149411129 149411279 -32336808 - ORR1E LTR MaLR -205 165 24 4 1725 1017 318 176 43 chr2 149423681 149424406 -32323681 - RMER13A LTR ERVK -37 823 2 5 1725 2813 67 3 14 chr2 149434672 149435035 -32313052 - RLTR10D LTR ERVK 0 359 1 5 1725 706 327 34 9 chr2 149436676 149436972 -32311115 + ORR1E LTR MaLR 7 367 -3 5 1725 2625 231 106 73 chr2 149437019 149437919 -32310168 + RMER17B LTR ERVK 1 929 -29 5 1725 1681 298 71 118 chr2 149437913 149439171 -32308916 + ORR1E-int LTR MaLR 35 1527 -53 5 1725 891 331 58 26 chr2 149439171 149439515 -32308572 + ORR1E LTR MaLR 1 355 -4 5 1725 1141 299 47 25 chr2 149443727 149444087 -32304000 + MTD LTR MaLR 4 371 -48 5 1725 1245 302 101 61 chr2 149453096 149453700 -32294387 - MTEb-int LTR MaLR -897 683 57 5 1725 1245 302 101 61 chr2 149453783 149453832 -32294255 - MTEb-int LTR MaLR -1524 56 4 5 1725 651 310 76 53 chr2 149453837 149454140 -32293947 - MTEb LTR MaLR -2 377 68 5 1725 786 311 62 71 chr2 149456211 149456633 -32291454 + MTD LTR MaLR 2 419 0 5 1725 1455 248 13 26 chr2 149457564 149457941 -32290146 - ORR1D1 LTR MaLR -2 372 1 5 1725 438 249 20 51 chr2 149459401 149459542 -32288545 + MTEa LTR MaLR 43 179 -200 5 1725 770 298 156 0 chr2 149463169 149463495 -32284592 + MTE2b LTR MaLR 3 379 0 5 1725 308 379 82 10 chr2 149463513 149463721 -32284366 + MTE2b-int LTR MaLR 29 251 -1329 5 1725 230 277 22 118 chr2 149464429 149464564 -32283523 + MTE2b-int LTR MaLR 238 359 -1221 5 1725 2406 331 76 35 chr2 149464812 149465808 -32282279 + MTE2b-int LTR MaLR 543 1579 -1 5 1725 463 279 41 0 chr2 149465812 149465934 -32282153 + MTE2b LTR MaLR 4 130 -249 5 1725 562 267 22 0 chr2 149465932 149466067 -32282020 + MTE2b LTR MaLR 238 375 -4 5 1725 1513 243 99 5 chr2 149470346 149470718 -32277369 - MTD LTR MaLR 0 419 13 5 1725 546 331 103 19 chr2 149470886 149471174 -32276913 - ORR1D2 LTR MaLR -40 319 3 5 1725 325 241 69 47 chr2 149471215 149471368 -32276719 - ORR1D-int LTR MaLR -1270 310 160 5 1725 694 218 91 11 chr2 149471298 149471474 -32276613 + MTEb LTR MaLR 190 379 0 5 1725 289 267 51 40 chr2 149473672 149473823 -32274264 + ORR1D2 LTR MaLR 223 372 -7 5 1725 1912 189 68 20 chr2 149479520 149479565 -32268522 - MTC LTR MaLR -8 413 369 5 1725 1912 189 68 20 chr2 149480138 149480486 -32267601 - MTC LTR MaLR -53 368 1 5 1725 2051 120 31 16 chr2 149482152 149482474 -32265613 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 5 1725 256 256 0 163 chr2 149482640 149482738 -32265349 - MT2B LTR ERVL -368 233 152 5 1725 1326 280 51 22 chr2 149500000 149500310 -32247777 + RMER5 LTR ERV1 32 349 -185 1 1725 603 298 199 6 chr2 149500310 149500661 -32247426 - MTD LTR MaLR 0 419 1 2 1725 1326 280 51 22 chr2 149500661 149500839 -32247248 + RMER5 LTR ERV1 350 534 0 1 1725 387 322 73 15 chr2 149501429 149501634 -32246453 - MLT1G1 LTR MaLR -362 217 1 4 1725 1961 128 9 66 chr2 149503358 149503784 -32244303 - RMER17C LTR ERVK -8 402 1 8 1725 401 350 170 29 chr2 149506392 149506698 -32241389 - MLT1H LTR MaLR -98 451 103 1 1725 292 314 0 0 chr2 149513890 149513976 -32234111 - ERVL-B4-int LTR ERVL -821 4893 4808 1 1725 265 323 61 8 chr2 149517291 149517422 -32230665 - ERVL-B4-int LTR ERVL -961 4800 4663 1 1725 365 337 29 6 chr2 149517428 149517598 -32230489 - ERVL-B4-int LTR ERVL -2149 3518 3345 1 1725 1007 335 65 6 chr2 149517651 149518002 -32230085 + MTEa LTR MaLR 8 379 0 2 1725 2265 315 42 20 chr2 149518099 149519089 -32228998 - ERVL-B4-int LTR ERVL -2495 3219 2206 1 1725 1616 201 16 30 chr2 149519089 149519453 -32228634 + RLTR15 LTR ERVK 1 359 0 2 1725 2265 315 42 20 chr2 149519453 149519569 -32228518 - ERVL-B4-int LTR ERVL -3509 2205 2089 1 1725 311 288 18 0 chr2 149519761 149519872 -32228215 - ERVL-B4-int LTR ERVL -4188 1526 1414 1 1725 1252 81 249 20 chr2 149523361 149523560 -32224527 + MT2C_Mm LTR ERVL 223 432 -43 2 1725 243 278 0 27 chr2 149524331 149524405 -32223682 - MLT1A1 LTR MaLR -19 389 318 3 1725 250 333 64 102 chr2 149531520 149531677 -32216410 - MLT1G3 LTR MaLR -287 308 158 3 1725 258 312 42 0 chr2 149533697 149533793 -32214294 + ORR1E LTR MaLR 5 104 -255 4 1725 252 114 92 34 chr2 149533906 149533981 -32214106 + ORR1E LTR MaLR 286 358 -21 4 1725 706 190 28 14 chr2 149533983 149534127 -32213960 + ORR1D1 LTR MaLR 1 146 -228 4 1725 1324 241 103 20 chr2 149534473 149534847 -32213240 - MTD LTR MaLR -20 399 1 4 1725 2134 128 12 0 chr2 149540886 149541207 -32206880 - ORR1A2 LTR MaLR -2 325 1 5 1725 243 185 0 100 chr2 149541225 149541285 -32206802 - MTE-int LTR MaLR -391 1189 1136 5 1725 1171 210 96 58 chr2 149541557 149541745 -32206342 + RMER17C LTR ERVK 1 179 -231 5 1725 1171 210 96 58 chr2 149541835 149542041 -32206046 + RMER17C LTR ERVK 180 409 -1 5 1725 847 171 9 161 chr2 149542935 149543165 -32204922 - ORR1C2 LTR MaLR -189 195 1 6 1725 1551 160 94 81 chr2 149545368 149545535 -32202552 - ORR1B2 LTR MaLR -2 365 212 6 1725 1551 160 94 81 chr2 149545677 149545869 -32202218 - ORR1B2 LTR MaLR -156 211 1 6 1725 2147 138 16 119 chr2 149549461 149549963 -32198124 + MurERV4_19-int LTR ERVK 4774 5223 -557 7 1725 2762 214 22 70 chr2 149550067 149550735 -32197352 - RLTR26 LTR ERVK 0 642 7 7 1725 267 160 20 0 chr2 149550735 149550785 -32197302 + MurERV4_19-int LTR ERVK 5228 5278 -502 7 1725 1954 196 56 45 chr2 149550776 149551369 -32196718 + MurERV4_19-int LTR ERVK 5171 5769 -11 7 1725 2636 244 93 54 chr2 149551376 149552227 -32195860 + RMER19B LTR ERVK 1 884 -18 7 1726 1103 330 139 42 chr2 149558355 149559079 -32189008 + ORR1E-int LTR MaLR 731 1527 -53 7 1726 457 337 40 97 chr2 149559079 149559408 -32188679 + ORR1E LTR MaLR 1 310 -49 7 1726 281 291 45 0 chr2 149561642 149561745 -32186342 - LTR31 LTR ERV1 -294 325 261 8 1726 1983 193 21 136 chr2 149561981 149562598 -32185489 - RLTR31_Mur LTR ERVK -7 546 1 8 1726 354 302 10 10 chr2 149564823 149564920 -32183167 + MLT1H1 LTR MaLR 110 206 -349 8 1726 302 316 134 76 chr2 149567277 149567606 -32180481 - ORR1E LTR MaLR -11 348 1 9 1726 265 271 29 0 chr2 149583949 149584019 -32164068 + MTEb LTR MaLR 281 352 -27 1 1726 356 230 19 29 chr2 149585431 149585534 -32162553 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 307 1 1726 271 289 22 152 chr2 149585676 149585860 -32162227 - MLT1A1 LTR MaLR -205 160 1 1 1726 459 279 135 38 chr2 149593789 149594102 -32153985 - LTR16E1 LTR ERVL -3 535 131 1 1726 548 299 101 73 chr2 149596802 149597177 -32150910 - MTD LTR MaLR -14 405 6 1 1726 993 301 49 49 chr2 149597674 149598044 -32150043 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 1 1726 467 351 43 107 chr2 149598271 149598599 -32149488 + ORR1E LTR MaLR 53 359 0 1 1726 241 214 248 30 chr2 149601135 149601183 -32146904 + MLT-int LTR MaLR 980 1049 -686 1 1726 3261 173 35 31 chr2 149601183 149601821 -32146266 + RLTR26 LTR ERVK 1 640 -2 1 1726 232 209 0 0 chr2 149609704 149609747 -32138340 + MER54B LTR ERVL 568 610 -183 1 1726 2290 69 88 0 chr2 149610906 149611224 -32136863 - MTB LTR MaLR -54 346 1 1 1726 350 353 16 26 chr2 149622150 149622342 -32125745 - RLTR42-int LTR ERVK -4122 1400 1211 1 1726 468 332 89 50 chr2 149623054 149623470 -32124617 + MLT1D LTR MaLR 72 503 -2 1 1726 2733 95 46 10 chr2 149626647 149627040 -32121047 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 1 1726 271 355 71 5 chr2 149632459 149632643 -32115444 - MLT1E3 LTR MaLR -422 202 7 1 1726 1455 271 18 32 chr2 149635269 149635669 -32112418 + MTD LTR MaLR 6 399 -20 1 1726 301 276 62 69 chr2 149640774 149640918 -32107169 - MER110 LTR ERV1 -301 190 48 1 1726 709 335 37 24 chr2 149642272 149642569 -32105518 + RMER15 LTR ERVL 275 575 0 1 1726 571 284 165 33 chr2 149646367 149646640 -32101447 + MLT1A LTR MaLR 4 312 -62 2 1726 270 245 19 67 chr2 149649787 149649892 -32098195 + MTD LTR MaLR 1 100 -319 2 1726 810 209 22 118 chr2 149649909 149649990 -32098097 + MTD LTR MaLR 214 269 -150 2 1726 810 209 22 118 chr2 149650137 149650283 -32097804 + MTD LTR MaLR 270 419 0 2 1726 1505 168 117 18 chr2 149660788 149661122 -32086965 - ORR1C1 LTR MaLR -11 367 1 2 1726 359 289 83 0 chr2 149666565 149666686 -32081401 - ORR1E LTR MaLR -228 131 1 2 1726 1571 237 30 22 chr2 149666824 149667191 -32080896 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 2 1726 229 97 0 0 chr2 149669201 149669232 -32078855 - MLT1G1 LTR MaLR -6 573 543 2 1726 252 316 63 0 chr2 149669490 149669585 -32078502 - MLT1F1 LTR MaLR -425 144 44 2 1726 323 351 35 74 chr2 149671067 149671220 -32076867 - MLT1G LTR MaLR -287 304 161 2 1726 3523 26 23 0 chr2 149671220 149671607 -32076480 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 1726 8435 65 37 3 chr2 149671607 149672669 -32075418 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 2 1726 3374 29 43 0 chr2 149672673 149673049 -32075038 - MTA_Mm LTR MaLR -4 392 1 2 1726 323 351 35 74 chr2 149673049 149673172 -32074915 - MLT1G LTR MaLR -431 160 38 2 1726 3307 150 65 4 chr2 149676829 149677379 -32070708 - RMER4B LTR ERVK 0 585 2 2 1726 356 313 128 71 chr2 149678953 149679235 -32068852 + RMER10A LTR ERVL 1 298 -144 2 1727 2788 203 143 22 chr2 149688740 149689421 -32058666 + RMER13A LTR ERVK 1 908 0 2 1727 1916 188 6 30 chr2 149690550 149690912 -32057175 - ORR1B2 LTR MaLR -14 353 1 2 1727 1244 224 129 12 chr2 149690917 149691242 -32056845 + ORR1D1 LTR MaLR 1 363 -11 2 1727 5098 224 57 31 chr2 149691248 149692433 -32055654 + ORR1D1-int LTR MaLR 1 1216 -154 2 1727 705 199 50 0 chr2 149692625 149692766 -32055321 + ORR1D1-int LTR MaLR 1217 1364 -6 2 1727 1649 223 48 8 chr2 149692766 149693123 -32054964 + ORR1D1 LTR MaLR 2 372 -2 2 1727 525 267 48 24 chr2 149693123 149693147 -32054940 + MTE-int LTR MaLR 1523 1546 -34 2 1727 1458 273 44 8 chr2 149700875 149701240 -32046847 - MTE2b LTR MaLR 0 379 2 2 1727 853 268 60 78 chr2 149712081 149712413 -32035674 - RLTR18 LTR ERVK 0 616 291 2 1727 558 323 51 31 chr2 149712440 149712635 -32035452 - RLTR18 LTR ERVK -311 201 3 2 1727 517 190 10 0 chr2 149715524 149715624 -32032463 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 265 2 1727 2025 189 63 2 chr2 149727343 149727740 -32020347 + MTC LTR MaLR 1 421 0 2 1727 284 262 93 9 chr2 149729683 149729791 -32018296 - MLT1H LTR MaLR 0 549 433 2 1727 1020 284 32 22 chr2 149732861 149733174 -32014913 + MTD LTR MaLR 76 391 -28 3 1727 765 192 38 60 chr2 149735517 149735700 -32012387 + MTD LTR MaLR 1 179 -240 3 1727 1170 202 35 83 chr2 149735692 149736067 -32012020 - MT2B LTR ERVL -5 596 82 3 1727 1204 240 27 111 chr2 149741308 149741715 -32006372 - MTE2a LTR MaLR -2 377 5 3 1727 428 315 115 12 chr2 149746372 149746616 -32001471 + RMER15 LTR ERVL 292 560 -15 3 1727 253 278 43 77 chr2 149747991 149748108 -31999979 + MTEb LTR MaLR 253 365 -14 3 1727 272 226 0 31 chr2 149748186 149748250 -31999837 - RMER10A LTR ERVL -25 417 356 3 1727 456 284 87 42 chr2 149748285 149748550 -31999537 - RMER10A LTR ERVL -154 288 12 3 1727 661 322 32 57 chr2 149749585 149749957 -31998130 + ORR1D2 LTR MaLR 8 370 0 3 1727 1057 256 104 16 chr2 149752046 149752228 -31995859 - MTD LTR MaLR -14 405 204 3 1727 1057 256 104 16 chr2 149752282 149752416 -31995671 - MTD LTR MaLR -216 203 62 3 1727 2915 63 236 2 chr2 149764906 149765321 -31982766 - RLTR1B LTR ERV1 0 512 1 3 1727 924 199 24 71 chr2 149775339 149775593 -31972494 + RMER15 LTR ERVL 27 268 -307 3 1727 741 319 33 63 chr2 149779137 149779471 -31968616 + ORR1E LTR MaLR 8 331 -28 3 1727 805 246 204 136 chr2 149784085 149784143 -31963944 - MT2A LTR ERVL 0 533 461 3 1727 805 246 204 136 chr2 149784183 149784623 -31963464 - MT2A LTR ERVL -73 460 1 3 1727 435 307 81 78 chr2 149786947 149787294 -31960793 + MLT1A LTR MaLR 1 337 -28 3 1727 226 231 95 71 chr2 149787517 149787601 -31960486 + MTEb LTR MaLR 6 91 -288 3 1727 280 281 88 42 chr2 149787689 149787939 -31960148 + MTEb LTR MaLR 97 379 0 3 1727 306 316 62 79 chr2 149788177 149788438 -31959649 - MLT1G3 LTR MaLR -193 402 100 3 1727 636 303 72 103 chr2 149792288 149792586 -31955501 - MTE2a LTR MaLR 0 379 88 3 1727 636 303 72 103 chr2 149792625 149792713 -31955374 - MTE2a LTR MaLR -292 87 5 3 1727 1707 211 46 10 chr2 149797772 149798165 -31949922 + MTC LTR MaLR 10 416 -5 3 1727 1621 218 90 70 chr2 149800284 149800826 -31947261 - RLTR31_Mur LTR ERVK 0 553 1 3 1727 5918 227 72 76 chr2 149800831 149802691 -31945396 - RMER3D-int LTR ERVK -5 2837 1002 3 1727 5918 227 56 41 chr2 149802717 149803369 -31944718 - RMER3D-int LTR ERVK -1841 1001 1 3 1727 582 206 14 7 chr2 149803418 149803565 -31944522 - RLTR31_Mur LTR ERVK -405 148 1 3 1727 231 248 283 25 chr2 149812699 149812819 -31935268 + MLT1G LTR MaLR 243 393 -198 3 1727 1660 182 129 16 chr2 149814730 149815103 -31932984 - MTD LTR MaLR 0 419 5 3 1727 361 327 0 0 chr2 149815113 149815214 -31932873 + ORR1E LTR MaLR 1 101 -258 3 1728 240 273 0 29 chr2 149819629 149819697 -31928390 + MLT1H1 LTR MaLR 60 125 -430 3 1728 754 171 0 7 chr2 149819692 149819839 -31928248 - ORR1A1 LTR MaLR -199 147 2 3 1728 351 229 50 50 chr2 149826769 149826930 -31921157 - RLTR15 LTR ERVK -13 346 186 4 1728 269 171 14 14 chr2 149827114 149827185 -31920902 - RLTR15 LTR ERVK -239 120 50 4 1728 479 293 41 32 chr2 149837087 149837304 -31910783 - MLT1B LTR MaLR -230 237 21 4 1728 230 341 85 23 chr2 149842654 149842831 -31905256 - LTR16C LTR ERVL -41 448 261 4 1728 285 217 0 0 chr2 149844060 149844120 -31903967 + MTC LTR MaLR 194 253 -168 4 1728 755 308 77 7 chr2 149845103 149845388 -31902699 - MTD LTR MaLR -97 322 18 4 1728 1030 279 142 14 chr2 149853626 149853979 -31894108 - MTD LTR MaLR -21 398 1 4 1728 1500 191 66 20 chr2 149869318 149869714 -31878373 + RLTR9F LTR ERVK 2 415 0 4 1728 1648 190 80 6 chr2 149870349 149870687 -31877400 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 5 4 1728 3866 222 57 63 chr2 149876319 149877483 -31870604 + RLTR21 LTR ERVK 8 1253 -151 4 1728 559 251 72 123 chr2 149877545 149877683 -31870404 + RLTR21 LTR ERVK 1254 1399 -5 4 1728 908 284 56 4 chr2 149879119 149879388 -31868699 + MTE2b LTR MaLR 47 329 -50 4 1728 255 172 109 0 chr2 149879410 149879446 -31868641 + MTE2b LTR MaLR 308 344 -35 4 1728 255 172 109 0 chr2 149879484 149879511 -31868576 + MTE2b LTR MaLR 345 376 -3 4 1728 268 272 184 0 chr2 149880437 149880540 -31867547 - MER89-int LTR ERV1 -4453 2348 2227 4 1728 1070 200 176 4 chr2 149883540 149883796 -31864291 - MTD LTR MaLR -102 317 18 4 1728 263 226 45 73 chr2 149886647 149886757 -31861330 + MLT1A1 LTR MaLR 302 408 0 4 1728 330 163 39 66 chr2 149888673 149888778 -31859309 - MTE2a LTR MaLR -2 406 278 4 1728 1607 227 110 6 chr2 149903285 149903648 -31844439 + MTD LTR MaLR 5 405 -14 4 1728 5892 97 74 64 chr2 149905314 149906310 -31841777 + RLTR13D4 LTR ERVK 1 1006 -27 5 1728 731 219 144 44 chr2 149907054 149907210 -31840877 + RLTR22_Mur LTR ERVK 2 153 -1695 5 1728 2156 175 101 32 chr2 149907247 149908015 -31840072 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1410 1848 0 5 1728 284 303 56 50 chr2 149908581 149908741 -31839346 - RMER12 LTR ERVK -61 1261 1101 5 1728 302 106 0 0 chr2 149912557 149912604 -31835483 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1043 805 759 5 1728 4229 199 48 22 chr2 149912604 149913454 -31834633 + RMER13B LTR ERVK 1 872 -36 5 1728 5167 88 19 23 chr2 149913465 149914252 -31833835 - RLTR22_Mus LTR ERVK -1024 784 1 5 1728 732 69 0 12 chr2 149918171 149918282 -31829805 + ORR1A1 LTR MaLR 253 384 0 5 1728 246 204 20 0 chr2 149919698 149919747 -31828340 - MTC LTR MaLR -371 50 1 5 1728 3513 228 53 104 chr2 149919749 149921041 -31827046 - MTC-int LTR MaLR -2 1256 31 5 1728 277 286 36 0 chr2 149921060 149921144 -31826943 + ORR1E LTR MaLR 52 138 -221 5 1728 1821 210 30 40 chr2 149921718 149922144 -31825943 - RMER10A LTR ERVL -20 422 1 5 1728 239 243 93 13 chr2 149922916 149922991 -31825096 - MTEb LTR MaLR 0 379 299 5 1728 349 257 79 0 chr2 149924816 149924917 -31823170 + ORR1A3-int LTR MaLR 626 734 -1229 5 1728 1243 214 246 47 chr2 149924832 149925219 -31822868 + MT2B2 LTR ERVL 34 497 -87 5 1728 244 266 52 31 chr2 149925586 149925683 -31822404 - RMER5 LTR ERV1 -10 524 426 5 1728 301 217 0 115 chr2 149926804 149926858 -31821229 + MTEa LTR MaLR 286 330 -49 5 1728 301 217 0 115 chr2 149927477 149927526 -31820561 + MTEa LTR MaLR 331 377 -2 5 1728 1100 69 5 14 chr2 149933304 149933468 -31814619 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 193 409 0 5 1728 4287 22 0 10 chr2 149933468 149933961 -31814126 + MMETn-int LTR ERVK 1 488 -4356 5 1728 468 273 26 59 chr2 149936180 149936332 -31811755 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1504 1650 -198 5 1728 2603 258 42 47 chr2 149938549 149939290 -31808797 + RMER15-int LTR ERVL 1639 2375 -2624 5 1728 1341 236 66 52 chr2 149939302 149939903 -31808184 + RMER12B LTR ERVK 73 731 -673 5 1728 442 226 6 193 chr2 149942204 149942385 -31805702 + RLTR33 LTR ERVK 447 593 -85 5 1729 276 366 107 5 chr2 149947076 149947282 -31800805 - ORR1E LTR MaLR -103 256 30 5 1729 1774 270 70 41 chr2 149947304 149947438 -31800649 - ORR1E-int LTR MaLR -19 1351 1256 5 1729 1774 292 68 69 chr2 149947582 149948233 -31799854 - ORR1E-int LTR MaLR -115 1255 585 5 1729 831 313 94 45 chr2 149950794 149951283 -31796804 - ORR1E-int LTR MaLR -852 518 6 5 1729 443 299 144 73 chr2 149951340 149951646 -31796441 - MTD LTR MaLR -86 333 5 5 1729 5427 123 40 24 chr2 149952072 149952965 -31795122 - RMER17B LTR ERVK -50 908 1 5 1729 960 217 221 45 chr2 149958424 149958800 -31789287 - RMER10A LTR ERVL 0 442 1 5 1729 733 95 121 0 chr2 149959896 149960012 -31788075 - MT2B LTR ERVL -471 130 1 5 1729 414 174 16 148 chr2 149960803 149960931 -31787156 + MT2B LTR ERVL 154 264 -337 5 1729 872 237 26 109 chr2 149963168 149963481 -31784606 - RLTR25B LTR ERVK 0 1028 742 5 1729 1022 187 79 105 chr2 149963736 149964041 -31784046 - RLTR25A LTR ERVK -200 903 607 5 1729 1948 147 36 12 chr2 149964063 149964400 -31783687 + ORR1A3-int LTR MaLR 92 436 -1527 5 1729 677 299 38 28 chr2 149965275 149965474 -31782613 - MTD LTR MaLR -220 201 8 5 1729 255 308 0 0 chr2 149966114 149966179 -31781908 + ORR1E-int LTR MaLR 1159 1223 -357 5 1729 1367 184 33 18 chr2 149969269 149969545 -31778542 + RMER6A LTR ERVK 477 756 0 5 1729 456 249 46 17 chr2 149969562 149969718 -31778369 + ORR1E-int LTR MaLR 1182 1476 -104 5 1729 355 339 117 62 chr2 149969728 149970002 -31778085 + ORR1E LTR MaLR 4 292 -67 5 1729 2011 111 6 107 chr2 149970409 149970471 -31777616 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 281 6 1729 2011 111 6 107 chr2 149971177 149971478 -31776609 - ORR1A2 LTR MaLR -47 280 1 6 1729 1667 218 80 0 chr2 149973344 149973707 -31774380 - ORR1B1 LTR MaLR -2 392 1 6 1729 228 196 0 0 chr2 149974811 149974857 -31773230 - MT2A LTR ERVL -141 392 347 6 1729 868 233 34 85 chr2 149974904 149975139 -31772948 - MT2A LTR ERVL -309 224 2 6 1729 454 36 0 0 chr2 149975727 149975782 -31772305 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 292 6 1729 2187 68 37 0 chr2 149977877 149978171 -31769916 - ORR1A1 LTR MaLR -41 305 1 6 1729 13159 51 44 1 chr2 149978171 149979888 -31768199 - ORR1A1-int LTR MaLR 0 1792 1 6 1729 1707 55 5 0 chr2 149979888 149980108 -31767979 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 126 6 1729 648 336 85 21 chr2 149981898 149982226 -31765861 - ORR1E LTR MaLR -2 357 9 6 1729 356 352 58 33 chr2 149982460 149982701 -31765386 - RMER5 LTR ERV1 -41 493 247 6 1729 315 321 53 29 chr2 149985379 149985549 -31762538 - MTD-int LTR MaLR -1180 190 17 6 1729 777 319 63 48 chr2 149985580 149985955 -31762132 - MTD LTR MaLR -14 405 19 6 1729 1492 263 71 4 chr2 149986326 149986803 -31761284 - RLTR19-int LTR ERVK -3313 2824 2316 6 1729 2977 271 115 49 chr2 149986842 149987811 -31760276 - RLTR22_Mur LTR ERVK -179 1669 797 6 1729 2977 264 119 46 chr2 149987990 149988390 -31759697 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1052 796 360 6 1729 495 289 63 88 chr2 149989418 149989703 -31758384 - MTC-int LTR MaLR -59 1199 922 6 1729 1022 262 32 35 chr2 149989710 149990168 -31757919 - RLTR19-int LTR ERVK -4903 1234 638 6 1729 499 322 5 92 chr2 149990707 149990902 -31757185 + MTD LTR MaLR 24 201 -218 6 1729 1800 171 23 112 chr2 149993199 149993249 -31754838 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 355 6 1729 1800 171 23 112 chr2 149993439 149993816 -31754271 - ORR1B1 LTR MaLR -40 354 5 6 1729 1084 186 14 51 chr2 149998174 149998468 -31749619 - RLTR19-int LTR ERVK -2130 4007 3725 6 1729 4271 230 114 34 chr2 149998588 149999547 -31748540 - RLTR22_Mur LTR ERVK -181 1667 587 6 1729 4271 230 114 34 chr2 149999614 149999999 -31748088 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1262 586 215 6 1729 611 291 33 28 chr2 150000001 150000213 -31747874 - RMER12 LTR ERVK -1108 214 2 1 1729 1521 259 21 97 chr2 150003363 150003897 -31744190 + RLTR20D LTR ERVK 1 493 -75 8 1729 499 248 130 0 chr2 150006463 150006624 -31741463 + MT2A LTR ERVL 350 531 -2 1 1729 226 197 134 15 chr2 150008208 150008275 -31739812 + MLT1A1 LTR MaLR 206 280 -128 1 1729 1175 254 77 49 chr2 150008899 150009326 -31738761 + RMER10A LTR ERVL 4 442 0 2 1729 253 296 14 0 chr2 150013637 150013708 -31734379 + ORR1D-int LTR MaLR 562 633 -947 2 1729 1582 321 96 41 chr2 150013692 150014452 -31733635 + ORR1D-int LTR MaLR 562 1363 -7 2 1729 273 291 58 0 chr2 150021932 150022035 -31726052 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 262 3 1729 4164 64 2 49 chr2 150022677 150023417 -31724670 - IAPEz-int LTR ERVK -5685 796 168 4 1729 248 302 0 0 chr2 150023417 150023470 -31724617 - RLTR27 LTR ERVK -34 275 223 4 1729 789 126 44 5 chr2 150023470 150023626 -31724461 - IAPEz-int LTR ERVK -6286 195 3 4 1729 3060 48 142 0 chr2 150023628 150024044 -31724043 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 4 1729 2022 146 74 11 chr2 150031675 150032042 -31716045 + RLTR9D LTR ERVK 1 390 -13 4 1729 599 182 8 27 chr2 150032106 150032245 -31715842 + ORR1B1-int LTR MaLR 1395 1547 -33 5 1729 778 258 74 108 chr2 150033605 150033954 -31714133 + MT2A LTR ERVL 1 473 -128 5 1729 496 383 55 11 chr2 150035021 150035293 -31712794 - ORR1E LTR MaLR -65 294 11 5 1729 485 283 49 1 chr2 150035314 150035470 -31712617 - ORR1E-int LTR MaLR -40 1330 1182 5 1729 2844 193 45 3 chr2 150035489 150036083 -31712004 - RMER6A LTR ERVK -2 754 136 5 1729 2955 89 5 22 chr2 150037538 150037952 -31710135 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 6 1729 2163 238 77 29 chr2 150038069 150038757 -31709330 - RLTR19-int LTR ERVK -2944 3193 2473 6 1729 1035 196 50 60 chr2 150040884 150041180 -31706907 + RLTR25A LTR ERVK 544 860 -243 6 1729 573 280 97 77 chr2 150041448 150041567 -31706520 + RLTR25A LTR ERVK 802 984 -119 6 1729 573 276 110 69 chr2 150042091 150042212 -31705875 + RLTR25A LTR ERVK 910 1025 -3 6 1729 804 259 187 102 chr2 150042669 150043160 -31704927 + MT2A LTR ERVL 1 533 0 7 1729 5912 64 16 1 chr2 150046060 150046855 -31701232 + RLTR22_Mus LTR ERVK 1 807 -1001 7 1729 1605 118 14 78 chr2 150047105 150047389 -31700698 + RLTR22_Mus LTR ERVK 1543 1808 0 7 1729 1012 218 207 37 chr2 150048233 150048609 -31699478 + RMER10A LTR ERVL 3 442 0 7 1729 4370 22 0 0 chr2 150049400 150049893 -31698194 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 7 1729 238 228 53 0 chr2 150052916 150052973 -31695114 + MTE-int LTR MaLR 851 910 -670 7 1729 554 336 69 66 chr2 150053204 150053523 -31694564 + MTD LTR MaLR 52 371 -48 7 1729 2281 326 65 64 chr2 150053567 150054853 -31693234 + ORR1D2-int LTR MaLR 29 1315 -55 7 1729 3128 56 5 8 chr2 150058426 150058823 -31689264 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 8 1729 1869 174 15 24 chr2 150060195 150060545 -31687542 - RLTR10E LTR ERVK -3 354 1 8 1729 242 339 63 68 chr2 150060782 150061019 -31687068 + ORR1D2 LTR MaLR 1 236 -134 7 1729 2114 105 3 9 chr2 150065530 150065846 -31682241 - IAPLTR2b LTR ERVK -11 316 3 9 1729 230 273 61 0 chr2 150066210 150066276 -31681811 - MTE2a LTR MaLR -11 368 299 9 1729 1808 253 87 0 chr2 150067309 150067915 -31680172 - ETnERV2-int LTR ERVK -2396 5010 4352 9 1729 932 268 76 15 chr2 150069214 150069600 -31678487 + MT2A LTR ERVL 1 577 -24 9 1729 391 318 26 77 chr2 150073640 150073794 -31674293 + MER68 LTR ERVL 163 309 -254 1 1729 391 318 26 77 chr2 150074159 150074198 -31673889 + MER68 LTR ERVL 310 346 -217 1 1730 435 262 127 6 chr2 150082223 150082388 -31665699 + MT2A LTR ERVL 347 531 -2 1 1730 1122 256 77 56 chr2 150084654 150085084 -31663003 + RMER10A LTR ERVL 4 442 0 1 1730 253 296 14 0 chr2 150089368 150089439 -31658648 + ORR1D-int LTR MaLR 562 633 -947 1 1730 1594 320 96 41 chr2 150089423 150090183 -31657904 + ORR1D-int LTR MaLR 562 1363 -7 1 1730 304 208 106 106 chr2 150095590 150095703 -31652384 - RLTR33 LTR ERVK -119 559 447 1 1730 249 216 92 34 chr2 150098553 150098648 -31649439 - ORR1D1 LTR MaLR 0 370 275 1 1730 4815 55 2 2 chr2 150106520 150107107 -31640980 - LTRIS_Mus LTR ERV1 0 587 1 1 1730 3748 55 2 12 chr2 150108762 150109242 -31638845 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 475 0 1 1730 640 216 139 22 chr2 150114414 150114630 -31633457 - RMER12B LTR ERVK -118 1454 1252 1 1730 329 234 11 11 chr2 150114631 150114726 -31633361 - RMER12B LTR ERVK -521 1051 957 1 1730 332 378 8 0 chr2 150114780 150114899 -31633188 - MTE-int LTR MaLR -302 1278 1159 1 1730 431 291 127 81 chr2 150116348 150116402 -31631685 + MuRRS4-int LTR ERV1 1159 1212 -3851 1 1730 431 291 127 81 chr2 150116473 150116983 -31631104 + MuRRS4-int LTR ERV1 1213 1749 -3314 1 1730 295 329 41 41 chr2 150117772 150117943 -31630144 + RLTR6-int LTR ERV1 3152 3322 -4279 1 1730 500 340 50 13 chr2 150117920 150118158 -31629929 + RLTR6-int LTR ERV1 3510 3794 -3762 1 1730 405 393 5 8 chr2 150118170 150118547 -31629540 + RLTR6-int LTR ERV1 3827 4201 -3405 1 1730 1199 289 48 39 chr2 150118910 150119403 -31628684 + RLTR6-int LTR ERV1 4923 5371 -2407 1 1730 1061 229 77 49 chr2 150119898 150120348 -31627739 + RMER2 LTR ERV1 1 563 -4 1 1730 756 338 77 25 chr2 150122248 150122640 -31625447 - MTD LTR MaLR -7 412 1 1 1730 1522 327 86 82 chr2 150122640 150122984 -31625103 - MTD-int LTR MaLR 0 1258 871 1 1730 1522 327 86 82 chr2 150123130 150124038 -31624049 - MTD-int LTR MaLR -388 870 1 1 1730 556 308 44 0 chr2 150124520 150124702 -31623385 - MTD LTR MaLR -217 202 13 1 1730 1311 230 20 64 chr2 150125814 150125875 -31622212 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 286 1 1730 1311 203 29 56 chr2 150126030 150126421 -31621666 - ORR1A4 LTR MaLR -43 341 1 1 1730 320 250 25 136 chr2 150126427 150126589 -31621498 + RLTR31B_Mm LTR ERVK 371 514 -43 1 1730 300 275 50 0 chr2 150126578 150126658 -31621429 + MTE-int LTR MaLR 1261 1344 -236 1 1730 898 294 100 12 chr2 150126725 150127056 -31621031 + ORR1D1 LTR MaLR 10 369 -5 1 1730 1408 164 118 67 chr2 150128861 150129174 -31618913 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 2 1730 7050 175 109 10 chr2 150129174 150130688 -31617399 - ORR1A4-int LTR MaLR 0 1963 299 2 1730 7050 244 164 76 chr2 150130722 150130869 -31617218 - ORR1A4-int LTR MaLR -1665 298 92 2 1730 1108 157 75 18 chr2 150130885 150131080 -31617007 + RLTR25A LTR ERVK 600 797 -306 2 1730 1108 157 75 18 chr2 150131122 150131153 -31616934 + RLTR25A LTR ERVK 798 838 -265 2 1730 669 223 150 104 chr2 150134241 150134348 -31613739 + RLTR25B LTR ERVK 757 897 -131 2 1730 669 223 150 104 chr2 150134419 150134571 -31613516 + RLTR25B LTR ERVK 898 1028 0 2 1730 1033 281 130 73 chr2 150135205 150135696 -31612391 + MT2A LTR ERVL 1 519 -14 2 1730 298 256 144 0 chr2 150135977 150136067 -31612020 + RLTR13D3 LTR ERVK 1 103 -1011 2 1730 263 193 92 85 chr2 150136616 150136746 -31611341 + RLTR13D3 LTR ERVK 942 1072 -42 2 1730 1153 170 14 9 chr2 150139478 150139692 -31608395 + MT2B LTR ERVL 386 600 -1 2 1730 1464 222 148 16 chr2 150140705 150141090 -31606997 + RMER10A LTR ERVL 1 436 -6 2 1730 597 307 122 50 chr2 150146339 150146658 -31601429 + MTD LTR MaLR 1 342 -77 2 1730 2109 306 87 63 chr2 150146814 150148019 -31600068 + ORR1D-int LTR MaLR 128 1361 -9 2 1730 328 320 25 92 chr2 150158008 150158046 -31590041 - MER68 LTR ERVL -218 345 310 2 1730 328 320 25 92 chr2 150158423 150158580 -31589507 - MER68 LTR ERVL -254 309 163 2 1730 2016 251 87 0 chr2 150160840 150161446 -31586641 + ETnERV2-int LTR ERVK 4352 5010 -2396 2 1730 258 237 13 13 chr2 150162281 150162358 -31585729 + RLTR6-int LTR ERV1 6723 6799 -979 2 1730 947 303 51 67 chr2 150162613 150163225 -31584862 + RLTR6-int LTR ERV1 7053 7654 -124 2 1730 1967 107 7 0 chr2 150163498 150163778 -31584309 - MTB LTR MaLR -118 282 1 2 1730 6736 128 16 72 chr2 150163780 150164940 -31583147 - MTB-int LTR MaLR -2 1096 3 2 1730 3088 83 10 5 chr2 150164943 150165341 -31582746 - MTB LTR MaLR 0 400 1 2 1730 236 214 267 19 chr2 150165370 150165475 -31582612 - RMER21B LTR ERV1 -275 567 437 2 1730 2055 115 6 9 chr2 150166938 150167255 -31580832 + IAPLTR2b LTR ERVK 1 316 -11 2 1730 3262 50 36 8 chr2 150173737 150174122 -31573965 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 1730 264 285 56 49 chr2 150177241 150177285 -31570802 - ORR1D-int LTR MaLR -40 1923 1882 2 1730 2283 316 67 63 chr2 150177721 150179008 -31569079 - ORR1D-int LTR MaLR -82 1881 29 2 1730 561 313 72 69 chr2 150179051 150179370 -31568717 - MTD LTR MaLR -48 371 52 2 1730 1194 251 114 27 chr2 150183369 150183774 -31564313 - RMER10A LTR ERVL 0 442 3 2 1730 1498 141 14 78 chr2 150184621 150184905 -31563182 - RLTR22_Mus LTR ERVK 0 1808 1543 2 1730 5911 63 16 1 chr2 150185139 150185934 -31562153 - RLTR22_Mus LTR ERVK -1001 807 1 2 1730 858 278 50 114 chr2 150190533 150190985 -31557102 - MT2A LTR ERVL -39 562 6 2 1730 509 243 9 18 chr2 150191443 150191556 -31556531 - RLTR25B LTR ERVK 0 1028 917 2 1730 914 236 96 24 chr2 150191936 150192227 -31555860 - RLTR25B LTR ERVK -175 853 542 2 1730 973 239 98 14 chr2 150206127 150206403 -31541684 + RMER21B LTR ERV1 277 575 -267 2 1730 236 271 58 23 chr2 150206514 150206601 -31541486 + MTE2b LTR MaLR 288 377 -2 2 1731 410 188 106 0 chr2 150210291 150210376 -31537711 - RLTR18B LTR ERVK -418 94 1 3 1731 479 297 55 40 chr2 150216370 150216570 -31531517 + MER68 LTR ERVL 159 361 -202 3 1731 366 340 33 52 chr2 150216605 150216816 -31531271 + RLTR25B LTR ERVK 1 207 -821 3 1731 403 274 7 52 chr2 150217381 150217535 -31530552 + RLTR9B LTR ERVK 291 437 0 3 1731 1990 254 88 0 chr2 150219829 150220433 -31527654 + ETnERV2-int LTR ERVK 4354 5010 -2396 3 1731 980 311 36 65 chr2 150221585 150221647 -31526440 + RLTR6-int LTR ERV1 7050 7111 -667 3 1731 980 311 36 65 chr2 150221831 150222401 -31525686 + RLTR6-int LTR ERV1 7112 7664 -114 3 1731 456 299 54 63 chr2 150225520 150225569 -31522518 + RLTR9B LTR ERVK 183 237 -166 3 1731 7622 84 36 14 chr2 150225569 150225973 -31522114 + RLTR13D5 LTR ERVK 1 404 -619 3 1731 7622 84 36 14 chr2 150226121 150226717 -31521370 + RLTR13D5 LTR ERVK 405 1023 0 3 1731 508 260 12 94 chr2 150226717 150226888 -31521199 + RLTR9B LTR ERVK 238 437 0 3 1731 1958 147 45 0 chr2 150228164 150228477 -31519610 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 3 1731 2914 96 5 68 chr2 150229739 150229852 -31518235 - MTB LTR MaLR 0 400 313 3 1731 2914 96 5 68 chr2 150229997 150230310 -31517777 - MTB LTR MaLR -88 312 1 3 1731 6885 123 15 72 chr2 150230312 150231473 -31516614 - MTB-int LTR MaLR -2 1096 3 3 1731 3114 81 10 5 chr2 150231476 150231874 -31516213 - MTB LTR MaLR 0 400 1 3 1731 269 193 297 18 chr2 150231903 150232014 -31516073 - RMER21B LTR ERV1 -275 567 426 3 1731 1846 187 19 15 chr2 150245889 150246235 -31501852 + RLTR10E LTR ERVK 1 354 -3 3 1731 3400 48 2 8 chr2 150247622 150248018 -31500069 + MTA_Mm LTR MaLR 3 396 0 3 1731 7713 71 39 79 chr2 150248018 150249161 -31498926 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 3 1731 3388 56 2 8 chr2 150249161 150249559 -31498528 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 1731 2250 322 69 58 chr2 150260248 150261567 -31486520 - ORR1D-int LTR MaLR -44 1919 29 3 1731 540 311 75 69 chr2 150261610 150261928 -31486159 - MTD LTR MaLR -48 371 52 3 1731 230 211 58 0 chr2 150262164 150262216 -31485871 - MTE-int LTR MaLR -675 905 851 3 1731 1221 214 202 35 chr2 150265558 150265935 -31482152 - RMER10A LTR ERVL 0 442 3 3 1731 1584 118 14 78 chr2 150273623 150273907 -31474180 - RLTR22_Mus LTR ERVK 0 1808 1543 3 1731 6066 65 0 2 chr2 150274169 150274978 -31473109 - RLTR22_Mus LTR ERVK -1001 807 1 3 1731 738 265 187 104 chr2 150277920 150278412 -31469675 - MT2A LTR ERVL 0 533 1 3 1731 602 226 65 102 chr2 150278869 150278991 -31469096 - RLTR25B LTR ERVK 0 1028 910 3 1731 602 226 65 102 chr2 150279181 150279303 -31468784 - RLTR25B LTR ERVK -119 909 793 3 1731 998 203 53 59 chr2 150279556 150279851 -31468236 - RLTR25A LTR ERVK -243 860 544 3 1731 1240 234 39 11 chr2 150281980 150282335 -31465752 + RLTR19-int LTR ERVK 2473 2837 -3300 3 1731 1071 233 18 52 chr2 150282438 150282792 -31465295 + RLTR19-int LTR ERVK 2903 3193 -2944 3 1731 2886 96 5 22 chr2 150282881 150283295 -31464792 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 3 1731 2925 189 43 3 chr2 150284745 150285344 -31462743 + RMER6A LTR ERVK 132 754 -2 3 1731 248 273 0 0 chr2 150285363 150285429 -31462658 + ORR1D2-int LTR MaLR 1182 1247 -123 3 1731 254 277 78 19 chr2 150293016 150293119 -31454968 + ORR1D2 LTR MaLR 262 370 0 3 1731 317 198 106 106 chr2 150297245 150297358 -31450729 + RLTR33 LTR ERVK 447 559 -119 3 1731 1644 311 99 44 chr2 150302290 150303047 -31445040 - ORR1D-int LTR MaLR -10 1360 562 3 1731 253 296 14 0 chr2 150303031 150303102 -31444985 - ORR1D-int LTR MaLR -947 633 562 3 1731 1137 247 90 52 chr2 150308999 150309422 -31438665 - RMER10A LTR ERVL 0 442 4 4 1731 226 197 134 15 chr2 150310046 150310113 -31437974 - MLT1A1 LTR MaLR -128 280 206 4 1731 733 299 97 64 chr2 150311692 150312140 -31435947 - MT2B LTR ERVL -2 599 10 4 1731 368 248 102 54 chr2 150312757 150312923 -31435164 - RLTR13D3 LTR ERVK -2 1112 939 4 1731 2096 216 54 83 chr2 150314059 150314251 -31433836 + RLTR12A LTR ERVK 4 168 -400 4 1731 2096 216 54 83 chr2 150314398 150314569 -31433518 + RLTR12A LTR ERVK 169 339 -229 4 1731 2096 216 54 83 chr2 150314719 150314930 -31433157 + RLTR12A LTR ERVK 340 562 -6 4 1731 2456 144 59 14 chr2 150314971 150315009 -31433078 - RMER16 LTR ERVK 0 533 500 4 1731 3681 50 119 16 chr2 150315009 150315520 -31432567 + LTRIS2 LTR ERV1 1 564 0 4 1731 2456 144 59 14 chr2 150315520 150315925 -31432162 - RMER16 LTR ERVK -34 499 70 4 1731 3537 137 16 28 chr2 150316541 150317111 -31430976 - RMER2 LTR ERV1 -4 563 1 4 1731 2133 213 71 74 chr2 150317274 150317892 -31430195 + RLTR18 LTR ERVK 1 616 0 4 1731 722 153 32 0 chr2 150318683 150318807 -31429280 - RLTR25A LTR ERVK -278 825 698 4 1731 326 203 16 0 chr2 150318815 150318879 -31429208 + RLTR9A LTR ERVK 1 65 -303 4 1731 1105 176 5 0 chr2 150319021 150319209 -31428878 - RLTR25A LTR ERVK -412 691 503 4 1731 2202 178 104 34 chr2 150319377 150319726 -31428361 - RLTR25A LTR ERVK -598 505 130 4 1731 2202 178 104 34 chr2 150319768 150319890 -31428197 - RLTR25A LTR ERVK -974 129 1 4 1731 624 177 150 0 chr2 150319936 150320083 -31428004 - RLTR47_MM LTR ERV1 0 532 364 4 1731 1234 260 17 3 chr2 150320080 150320373 -31427714 - ORR1B2-int LTR MaLR -1212 297 1 4 1731 322 188 14 0 chr2 150320477 150320546 -31427541 - ORR1B2 LTR MaLR -45 349 280 4 1731 322 188 14 0 chr2 150320594 150320663 -31427424 - ORR1B1 LTR MaLR -45 349 280 4 1731 1377 231 4 4 chr2 150335843 150336108 -31411979 - ORR1B2 LTR MaLR -102 265 1 4 1731 1500 215 61 23 chr2 150336253 150336701 -31411386 - BGLII_A LTR ERVK -5 440 1 4 216 3344 73 36 21 chr2 150339528 150340003 -31408084 - RLTR45 LTR ERVK 0 482 1 4 1732 767 284 88 23 chr2 150340679 150341021 -31407066 - RMER10A LTR ERVL 0 442 79 4 1732 435 216 79 85 chr2 150344547 150344568 -31403519 - RLTR10 LTR ERVK -7 404 384 4 1732 938 68 34 9 chr2 150344629 150344784 -31403303 - RLTR10 LTR ERVK -28 383 215 4 1732 1096 257 59 65 chr2 150348679 150349020 -31399067 - RLTR40 LTR ERVK -4 813 475 4 1732 497 258 5 158 chr2 150349182 150349251 -31398836 - RLTR40 LTR ERVK -660 157 110 4 1732 497 258 5 158 chr2 150349398 150349512 -31398575 - RLTR40 LTR ERVK -708 109 2 4 1732 2000 299 48 26 chr2 150352786 150353596 -31394491 + RMER15-int LTR ERVL 1572 2399 -2600 4 1732 1713 254 102 8 chr2 150353682 150354425 -31393662 + RMER15-int LTR ERVL 4156 4967 -32 4 1732 1383 200 21 85 chr2 150354432 150354760 -31393327 + RMER15 LTR ERVL 1 307 -268 4 1732 2547 152 21 15 chr2 150358746 150359219 -31388868 + RLTR19-int LTR ERVK 2578 3053 -3084 4 1732 284 222 0 0 chr2 150359274 150359328 -31388759 + RLTR19-int LTR ERVK 3044 3097 -3040 4 1732 3683 147 107 54 chr2 150362262 150362605 -31385482 + RLTR19-int LTR ERVK 3315 3643 -2494 4 1732 3683 147 107 54 chr2 150362752 150363314 -31384773 + RLTR19-int LTR ERVK 3644 4268 -1869 4 1732 1673 312 85 73 chr2 150363320 150364413 -31383674 + MTC-int LTR MaLR 8 1113 -145 4 1732 2079 124 42 113 chr2 150369636 150369754 -31378333 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1452 396 282 5 1732 2079 124 42 113 chr2 150369894 150370201 -31377886 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1567 281 1 5 1732 2723 47 0 17 chr2 150374832 150375177 -31372910 + MT2C_Mm LTR ERVL 133 471 -4 5 1732 3491 64 25 21 chr2 150375277 150375757 -31372330 + RLTR45 LTR ERVK 1 482 0 5 1732 4147 157 83 8 chr2 150375948 150376743 -31371344 - RLTR13A LTR ERVK 0 855 1 5 1732 43889 42 9 12 chr2 150376751 150378551 -31369536 - ETnERV3-int LTR ERVK -7 5801 4010 5 1732 43889 42 9 12 chr2 150378590 150382606 -31365481 - ETnERV3-int LTR ERVK -1799 4009 1 5 1732 4147 157 83 8 chr2 150382606 150383401 -31364686 - RLTR13A LTR ERVK 0 855 1 5 1732 314 258 91 8 chr2 150384649 150384770 -31363317 - RMER15 LTR ERVL 0 575 445 5 1732 932 253 78 69 chr2 150385081 150385544 -31362543 - MT2A LTR ERVL 0 601 3 5 1732 303 169 244 11 chr2 150389598 150389688 -31358399 - MTEa LTR MaLR -34 345 235 5 1732 254 338 35 42 chr2 150389732 150389874 -31358213 - MTEa LTR MaLR -218 141 1 5 1732 776 289 125 0 chr2 150394605 150394916 -31353171 - ERVL-B4-int LTR ERVL -5073 641 292 5 1732 1595 205 162 26 chr2 150407201 150407702 -31340385 - RMER4B LTR ERVK -16 569 1 5 1732 2043 170 71 19 chr2 150438359 150438779 -31309308 + RMER10A LTR ERVL 1 442 0 5 1732 856 249 51 120 chr2 150440420 150440813 -31307274 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 5 5 1732 519 293 97 22 chr2 150441179 150441406 -31306681 - MLT1A0 LTR MaLR -7 358 115 5 1732 488 289 90 71 chr2 150446548 150446898 -31301189 + ORR1E LTR MaLR 1 378 -1 6 1732 1302 194 21 158 chr2 150458030 150458131 -31289956 + ORR1C2 LTR MaLR 1 96 -288 6 1732 1302 194 21 158 chr2 150458322 150458435 -31289652 + ORR1C2 LTR MaLR 97 191 -193 6 1732 1302 194 21 158 chr2 150458578 150458615 -31289472 + ORR1C2 LTR MaLR 192 199 -185 6 1732 1302 194 21 158 chr2 150458889 150459008 -31289079 + ORR1C2 LTR MaLR 200 322 -62 6 1732 300 190 0 0 chr2 150459064 150459122 -31288965 + ORR1C2 LTR MaLR 327 384 0 6 1732 5927 199 65 23 chr2 150459122 150460436 -31287651 + ORR1C2-int LTR MaLR 1 1370 0 6 1732 1024 117 490 8 chr2 150460436 150460538 -31287549 + ORR1C2 LTR MaLR 1 170 -214 6 1732 1024 117 490 8 chr2 150460618 150460774 -31287313 + ORR1C2 LTR MaLR 171 383 -1 6 1732 1772 149 122 54 chr2 150461591 150461945 -31286142 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 6 1732 4078 129 93 10 chr2 150462491 150463189 -31284898 - RMER6A LTR ERVK 0 756 1 6 1732 697 299 109 78 chr2 150465114 150465251 -31282836 + ORR1E LTR MaLR 1 161 -198 6 1732 697 299 109 78 chr2 150465299 150465509 -31282578 + ORR1E LTR MaLR 162 359 0 6 1733 447 306 129 72 chr2 150471759 150472023 -31276064 + RMER15 LTR ERVL 284 562 -13 6 1733 237 306 0 27 chr2 150473014 150473088 -31274999 - MTEb LTR MaLR -14 365 294 6 1733 705 257 107 102 chr2 150476017 150476079 -31272008 - MTE2b LTR MaLR -4 375 314 6 1733 705 257 107 102 chr2 150476115 150476425 -31271662 - MTE2b LTR MaLR -66 313 2 6 1733 1758 178 41 3 chr2 150479242 150479580 -31268507 + RMER6C LTR ERVK 1 351 -339 6 1733 851 264 40 92 chr2 150481146 150481516 -31266571 + ORR1E LTR MaLR 3 379 0 6 1733 393 236 81 9 chr2 150488171 150488282 -31259805 + MER57-int LTR ERV1 7148 7266 -271 6 1733 3986 105 34 29 chr2 150489768 150490387 -31257700 - RMER6A LTR ERVK -134 622 1 6 1733 226 241 84 92 chr2 150491548 150491591 -31256496 + LTR82A LTR ERVL 510 551 -321 6 1733 290 241 8 138 chr2 150502155 150502285 -31245802 + MT2B LTR ERVL 151 263 -338 6 1733 813 223 23 59 chr2 150503816 150504035 -31244052 - MTEa LTR MaLR -2 377 167 1 1733 383 270 105 7 chr2 150520029 150520182 -31227905 + RMER15 LTR ERVL 337 504 -71 3 1733 2873 69 24 7 chr2 150527452 150527862 -31220225 - LTRIS2 LTR ERV1 -79 485 69 5 1733 1057 196 51 0 chr2 150527862 150528097 -31219990 - RLTR1B-int LTR ERV1 -26 5037 4791 5 1733 9884 134 128 49 chr2 150528185 150530861 -31217226 - RLTR1B-int LTR ERV1 -917 4146 760 5 1733 4497 145 39 19 chr2 150530852 150531599 -31216488 - RMER16-int LTR ERVK -3962 1444 683 5 1733 949 166 63 16 chr2 150531575 150531765 -31216322 - RMER16-int LTR ERVK -5066 340 142 5 1733 1116 147 72 14 chr2 150532110 150532331 -31215756 - RLTR1B-int LTR ERV1 -3006 293 60 5 1733 269 200 34 76 chr2 150532357 150532476 -31215611 - RLTR1B-int LTR ERV1 -3584 114 1 5 1733 1269 125 13 50 chr2 150532476 150532780 -31215307 - LTRIS3 LTR ERV1 0 564 269 5 1733 447 193 199 41 chr2 150540953 150541099 -31206988 - MTD LTR MaLR -13 406 238 7 1733 342 297 17 0 chr2 150541328 150541446 -31206641 - MTD LTR MaLR -299 120 1 7 1733 823 215 99 48 chr2 150542340 150542633 -31205454 - MLT1B LTR MaLR -63 327 20 8 1733 488 292 100 79 chr2 150542645 150542935 -31205152 - MTEa LTR MaLR 0 379 84 8 1733 395 282 16 0 chr2 150546076 150546200 -31201887 - MLT1A1 LTR MaLR -2 406 281 9 1733 378 299 113 24 chr2 150547454 150547498 -31200589 - MLT1A1 LTR MaLR -169 196 150 9 1733 1038 230 52 150 chr2 150547498 150547918 -31200169 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 9 1733 378 299 113 24 chr2 150547918 150548041 -31200046 - MLT1A1 LTR MaLR -216 149 15 9 1733 2420 164 98 2 chr2 150548363 150548833 -31199254 + RMER20A LTR ERVK 2 516 0 9 1733 894 190 22 16 chr2 150549244 150549426 -31198661 + ORR1D1 LTR MaLR 1 183 -191 9 1733 522 209 9 9 chr2 150552209 150552320 -31195767 + RLTR42-int LTR ERVK 1105 1215 -4307 1 1733 268 235 12 24 chr2 150552492 150552575 -31195512 + RLTR42-int LTR ERVK 896 977 -5160 1 1733 511 159 352 0 chr2 150552602 150552764 -31195323 + RLTR14 LTR ERV1 100 318 -64 1 1733 1234 195 9 70 chr2 150552963 150553278 -31194809 + RLTR42-int LTR ERVK 1870 2165 -3357 1 1733 481 256 52 100 chr2 150553294 150553563 -31194524 + MYSERV6-int LTR ERVK 7216 7471 -1488 1 1733 326 208 204 53 chr2 150553680 150553832 -31194255 + RLTR42-int LTR ERVK 2861 3035 -3102 1 1733 3825 9 121 0 chr2 150554229 150554669 -31193418 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 1 1733 321 0 0 0 chr2 150554669 150554707 -31193380 - MERVL-int LTR ERVL 0 5485 5448 1 1733 354 167 46 35 chr2 150554707 150554794 -31193293 - ORR1A3-int LTR MaLR -1323 640 553 1 1733 41654 13 6 0 chr2 150554794 150560121 -31187966 - MERVL-int LTR ERVL -125 5360 1 1 1733 3824 9 121 0 chr2 150560121 150560561 -31187526 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 1 1733 256 203 15 15 chr2 150560741 150560806 -31187281 + RMER17C-int LTR ERVK 2114 2178 -1060 1 1733 282 314 214 17 chr2 150572466 150572644 -31175443 - LTR16E1 LTR ERVL 0 538 326 1 1733 747 328 89 44 chr2 150572674 150573035 -31175052 - MER70A LTR ERVL 0 472 96 1 1733 3313 36 15 3 chr2 150580326 150580717 -31167370 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 1733 2041 167 98 13 chr2 150583541 150583929 -31164158 - MTC LTR MaLR 0 421 1 1 1733 341 297 87 105 chr2 150590454 150590740 -31157347 - ORR1E LTR MaLR -52 307 27 1 1733 487 249 74 62 chr2 150600394 150600578 -31147509 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 194 1 1734 1643 131 58 76 chr2 150602534 150602864 -31145223 + ORR1A4 LTR MaLR 2 325 -4 1 1734 3860 181 75 65 chr2 150604575 150605450 -31142637 + RMER19B LTR ERVK 1 884 -18 1 1734 402 250 271 0 chr2 150608235 150608379 -31139708 + RMER15 LTR ERVL 372 554 -21 2 1734 2275 147 10 82 chr2 150608452 150608868 -31139219 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 1 2 1734 352 306 73 64 chr2 150609228 150609462 -31138625 + LTR73 LTR ERV1 249 484 -88 2 1734 1076 250 53 0 chr2 150609802 150610046 -31138041 - MTD LTR MaLR -162 257 1 2 1734 227 304 155 9 chr2 150611779 150611895 -31136192 - LTR65 LTR ERV1 -532 137 5 2 1734 323 209 56 44 chr2 150617762 150617852 -31130235 + RLTR25B LTR ERVK 412 502 -526 2 1734 380 246 96 9 chr2 150618335 150618450 -31129637 + MLT2B4 LTR ERVL 3 127 -429 2 1734 2153 144 37 35 chr2 150618601 150618975 -31129112 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 4 2 1734 316 283 32 21 chr2 150626097 150626191 -31121896 - LTR48 LTR ERV1 -158 629 535 2 1734 239 304 186 37 chr2 150626384 150626572 -31121515 - LTR48 LTR ERV1 -413 231 1 2 1734 308 361 58 51 chr2 150628015 150628272 -31119815 - ORR1E LTR MaLR 0 359 101 2 1734 2367 88 25 9 chr2 150637170 150637492 -31110595 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 2 1734 1957 134 16 13 chr2 150651145 150651462 -31096625 - ORR1A3 LTR MaLR -8 318 1 2 1734 531 269 72 42 chr2 150667097 150667334 -31080753 + MLT1D LTR MaLR 262 505 0 3 1734 250 303 150 7 chr2 150676374 150676527 -31071560 + MLT1B LTR MaLR 1 175 -215 3 1734 233 214 161 0 chr2 150676728 150676784 -31071303 + MLT1B LTR MaLR 255 319 -71 3 1734 1416 219 73 70 chr2 150678142 150678511 -31069576 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 3 1734 301 148 346 0 chr2 150696420 150696501 -31051586 + MTE2b LTR MaLR 10 118 -261 3 1734 1285 211 137 30 chr2 150696501 150696873 -31051214 + MTD LTR MaLR 1 412 -7 3 1734 512 238 0 16 chr2 150696899 150697023 -31051064 + MTE2b LTR MaLR 247 368 -11 3 1734 1133 159 136 11 chr2 150701112 150701594 -31046493 + RLTR25B LTR ERVK 324 1025 -3 3 1734 595 291 143 31 chr2 150707312 150707642 -31040445 + MLT1A0 LTR MaLR 8 361 -4 3 1734 358 232 131 22 chr2 150711873 150712035 -31036052 + MTEa LTR MaLR 195 375 -4 3 1734 299 291 29 0 chr2 150712210 150712313 -31035774 + MLT1B LTR MaLR 65 170 -220 3 1734 234 225 237 43 chr2 150712322 150712415 -31035672 + MT2B LTR ERVL 154 264 -337 3 1734 430 256 194 6 chr2 150712735 150712900 -31035187 + MLT1B LTR MaLR 187 382 -8 3 1734 929 265 117 43 chr2 150714618 150714969 -31033118 + MTEa LTR MaLR 3 379 0 3 1734 963 254 25 0 chr2 150714969 150715205 -31032882 + MTEa-int LTR MaLR 1 242 -1338 3 1734 429 259 28 62 chr2 150715215 150715392 -31032695 - RLTR23 LTR ERV1 -16 414 244 3 1734 258 274 217 30 chr2 150715796 150715999 -31032088 + MTEa-int LTR MaLR 383 623 -957 3 1734 2277 268 52 75 chr2 150716008 150716811 -31031276 + MTEa-int LTR MaLR 790 1574 -6 3 1734 420 245 116 52 chr2 150716818 150716973 -31031114 + MTEa LTR MaLR 2 166 -213 3 1734 413 232 125 0 chr2 150717009 150717121 -31030966 + MTEa LTR MaLR 249 374 -5 3 1734 368 268 85 16 chr2 150720552 150720681 -31027406 + MLT1A0 LTR MaLR 226 363 -2 4 1734 410 284 69 32 chr2 150720914 150721103 -31026984 + MLT-int LTR MaLR 34 229 -1506 4 1734 730 244 20 16 chr2 150721118 150721184 -31026903 - MTD LTR MaLR -14 405 295 4 1734 730 296 113 15 chr2 150721345 150721622 -31026465 - MTD LTR MaLR -79 340 38 4 1734 404 250 51 51 chr2 150721740 150721896 -31026191 + MLT1A0-int LTR MaLR 258 418 -953 4 1734 1068 318 132 52 chr2 150721922 150722483 -31025604 + MLT1A0-int LTR MaLR 1092 1697 -38 4 1734 919 231 53 47 chr2 150724944 150725182 -31022905 - RLTR15 LTR ERVK -17 342 102 4 1734 919 231 53 47 chr2 150725226 150725327 -31022760 - RLTR15 LTR ERVK -258 101 1 4 1735 559 225 244 6 chr2 150733980 150734308 -31013779 + MTD LTR MaLR 11 404 -15 4 1735 2837 141 86 42 chr2 150742638 150743208 -31004879 - RLTR17 LTR ERVK 0 692 98 4 1735 1591 266 136 110 chr2 150749448 150749940 -30998147 - RLTR22_Mus LTR ERVK -215 1593 861 4 1735 1591 248 174 104 chr2 150750021 150750835 -30997252 - RLTR22_Mus LTR ERVK -517 1291 406 4 1735 1591 248 174 104 chr2 150750982 150751058 -30997029 - RLTR22_Mus LTR ERVK -1403 405 328 4 1735 494 222 69 7 chr2 150751057 150751202 -30996885 - RMER12 LTR ERVK -1168 154 1 4 1735 449 232 8 59 chr2 150751274 150751393 -30996694 + MTE2a LTR MaLR 19 131 -248 4 1735 366 189 0 133 chr2 150754417 150754545 -30993542 + MT2B LTR ERVL 155 265 -336 5 1735 442 175 71 24 chr2 150772654 150772824 -30975263 - RMER17C LTR ERVK -136 274 97 5 1735 6154 85 11 92 chr2 150773286 150774257 -30973830 + RLTR13B1 LTR ERVK 1 893 0 5 1735 2019 171 197 16 chr2 150777493 150777944 -30970143 + MT2A LTR ERVL 1 533 0 5 1735 301 327 87 46 chr2 150797601 150797830 -30950257 + MLT1G LTR MaLR 4 280 -315 5 1735 1521 154 138 32 chr2 150798607 150798977 -30949110 + RLTR9E LTR ERVK 1 409 0 5 1735 298 307 22 66 chr2 150803672 150803808 -30944279 + RMER15 LTR ERVL 1 130 -445 5 1735 230 307 44 22 chr2 150803871 150803961 -30944126 + RMER15 LTR ERVL 424 515 -60 5 1735 233 284 34 158 chr2 150808353 150808499 -30939588 - MT2B LTR ERVL -338 263 136 5 1735 693 327 65 4 chr2 150810198 150810474 -30937613 - RMER5 LTR ERV1 -9 525 233 5 1735 3170 31 39 10 chr2 150820086 150820471 -30927616 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 1735 1924 249 44 28 chr2 150822113 150822618 -30925469 - RMER5 LTR ERV1 -9 525 13 5 1735 498 194 40 128 chr2 150823589 150823737 -30924350 + RMER21A LTR ERV1 1 135 -812 6 1735 393 315 109 44 chr2 150823743 150823972 -30924115 - RMER13A LTR ERVK -32 828 585 6 1735 776 206 227 32 chr2 150824095 150824346 -30923741 - RMER13A LTR ERVK -466 394 95 6 1735 384 204 127 18 chr2 150824435 150824545 -30923542 + RMER21A LTR ERV1 89 210 -737 6 1735 3663 151 96 18 chr2 150824562 150824794 -30923293 + RMER21A LTR ERV1 143 385 -562 6 1735 3663 151 96 18 chr2 150824819 150825327 -30922760 + RMER21A LTR ERV1 386 940 -7 6 1735 2479 118 76 5 chr2 150828032 150828425 -30919662 - MTC LTR MaLR 0 421 1 6 1735 507 223 65 39 chr2 150846999 150847153 -30900934 - RMER13B LTR ERVK -9 899 742 6 1735 1768 243 53 65 chr2 150847153 150848030 -30900057 - RMER17B LTR ERVK -104 854 1 6 1735 3409 46 2 0 chr2 150848159 150848554 -30899533 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 1735 301 220 75 12 chr2 150852631 150852720 -30895367 + MTEa LTR MaLR 195 297 -82 6 1735 1541 190 110 34 chr2 150859908 150860262 -30887825 - ORR1C2 LTR MaLR -1 383 3 6 1735 1133 243 162 18 chr2 150862469 150862796 -30885291 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 6 1736 862 289 93 8 chr2 150867383 150867739 -30880348 + MTD LTR MaLR 6 419 0 6 1736 1704 155 156 9 chr2 150876463 150876796 -30871291 + ORR1C2 LTR MaLR 1 382 -2 6 1736 1005 184 65 0 chr2 150877057 150877258 -30870829 - RLTR19 LTR ERVK 0 499 286 7 1736 1084 88 55 5 chr2 150877249 150877441 -30870646 + RLTR19 LTR ERVK 83 278 -218 7 1736 557 156 10 0 chr2 150877775 150877871 -30870216 + MTC LTR MaLR 1 97 -324 7 1736 1153 188 45 8 chr2 150879026 150879268 -30868819 + MTC LTR MaLR 85 335 -86 7 1736 368 288 73 32 chr2 150887595 150887814 -30860273 + RLTR15 LTR ERVK 4 231 -128 7 1736 265 272 11 21 chr2 150888164 150888258 -30859829 + RMER17A-int LTR ERVK 994 1086 -642 7 1736 642 88 20 0 chr2 150899633 150899735 -30848352 + MT2C_Mm LTR ERVL 294 397 -78 7 1736 1652 175 6 6 chr2 150915989 150916305 -30831782 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 14 7 1736 317 213 211 47 chr2 150918212 150918340 -30829747 - ORR1E LTR MaLR 0 379 231 7 1736 409 264 16 62 chr2 150918385 150918514 -30829573 - ORR1E LTR MaLR -236 123 1 7 1736 801 190 0 61 chr2 150918609 150918805 -30829282 - RLTR17 LTR ERVK -1 691 508 7 1736 1426 148 30 8 chr2 150918800 150919065 -30829022 - RLTR17 LTR ERVK -421 271 1 7 1736 389 265 17 8 chr2 150919500 150919618 -30828469 - MLT1A1 LTR MaLR -21 387 269 7 1736 266 148 0 0 chr2 150922513 150922567 -30825520 + MLT1A1 LTR MaLR 334 387 -21 7 1736 1426 148 30 8 chr2 150923002 150923267 -30824820 + RLTR17 LTR ERVK 1 271 -421 7 1736 794 186 5 66 chr2 150923262 150923458 -30824629 + RLTR17 LTR ERVK 508 691 -1 7 1736 414 264 16 55 chr2 150923553 150923681 -30824406 + ORR1E LTR MaLR 1 123 -236 7 1736 317 213 211 47 chr2 150923726 150923854 -30824233 + ORR1E LTR MaLR 231 379 0 7 1736 1652 175 6 6 chr2 150925761 150926077 -30822010 + ORR1A4 LTR MaLR 14 329 0 7 1736 1952 98 3 66 chr2 150936199 150936547 -30811540 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 326 -11 7 1736 2975 70 5 1 chr2 150936548 150937243 -30810844 + IAPEz-int LTR ERVK 1 662 -5819 7 1736 430 82 0 32 chr2 150937243 150937306 -30810781 + IAPEz-int LTR ERVK 1359 1419 -5062 7 1736 1820 127 4 4 chr2 150937295 150937557 -30810530 + IAPEz-int LTR ERVK 2236 2497 -5183 7 1736 936 88 24 0 chr2 150937552 150937677 -30810410 + IAPEz-int LTR ERVK 4783 4910 -2770 7 1736 27354 8 1 0 chr2 150937677 150940632 -30807455 + IAPEz-int LTR ERVK 3525 6481 0 7 1736 1973 95 3 66 chr2 150940632 150940980 -30807107 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 326 -11 7 1736 642 88 20 0 chr2 150949379 150949481 -30798606 - MT2C_Mm LTR ERVL -78 397 294 7 1736 1472 273 17 82 chr2 150950042 150950634 -30797453 + RMER19C LTR ERVK 129 610 -1 7 1736 248 279 179 48 chr2 150953641 150953682 -30794405 - MLT1C LTR MaLR -6 461 421 7 1736 248 279 179 48 chr2 150953869 150954033 -30794054 - MLT1C LTR MaLR -47 420 229 7 1736 227 235 50 143 chr2 150954144 150954263 -30793824 + ORR1E LTR MaLR 10 117 -242 8 1736 1051 127 6 11 chr2 150954971 150955146 -30792941 - MTB_Mm LTR MaLR -52 355 182 8 1736 7036 198 43 59 chr2 150962272 150962473 -30785614 - RMER3D-int LTR ERVK -76 2766 2571 8 1736 7036 198 43 59 chr2 150962797 150964366 -30783721 - RMER3D-int LTR ERVK -272 2570 1014 8 1736 498 131 6 58 chr2 150964434 150964561 -30783526 - RMER3D-int LTR ERVK -1731 1111 1022 8 1736 639 122 60 17 chr2 150964563 150964680 -30783407 - RMER3D-int LTR ERVK -2232 610 489 8 1736 352 282 22 37 chr2 150978830 150978966 -30769121 - ORR1E LTR MaLR -225 134 1 8 1736 1193 320 72 29 chr2 150982684 150983309 -30764778 + RMER15-int LTR ERVL 2390 3041 -1958 8 1736 1458 257 12 47 chr2 150983399 150983827 -30764260 + RMER15-int LTR ERVL 4577 4989 -10 8 1736 664 308 68 14 chr2 150984149 150984429 -30763658 + RMER15 LTR ERVL 281 575 0 8 1736 244 366 0 0 chr2 150984438 150984539 -30763548 - ORR1E LTR MaLR -223 136 36 8 1736 501 229 9 18 chr2 150985252 150985363 -30762724 - MTC LTR MaLR -12 409 300 8 1737 3941 166 19 143 chr2 150997071 150998127 -30749960 - RMER21A LTR ERV1 -22 925 1 8 1737 3010 20 42 3 chr2 151004958 151005311 -30742776 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 4 1737 3493 74 36 13 chr2 151005311 151006025 -30742062 + IAPEz-int LTR ERVK 8 662 -5819 4 1737 454 66 0 32 chr2 151006025 151006088 -30741999 + IAPEz-int LTR ERVK 1359 1419 -5062 4 1737 1793 123 4 15 chr2 151006077 151006342 -30741745 + IAPEz-int LTR ERVK 2236 2497 -5183 4 1737 936 88 24 0 chr2 151006337 151006462 -30741625 + IAPEz-int LTR ERVK 4783 4910 -2770 4 1737 26835 16 1 0 chr2 151006462 151009416 -30738671 + IAPEz-int LTR ERVK 3525 6481 0 5 1737 3010 20 42 3 chr2 151009416 151009769 -30738318 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 5 1737 1031 165 36 10 chr2 151016324 151016520 -30731567 + RLTR41 LTR ERV1 246 446 0 7 1737 517 296 51 0 chr2 151016936 151017112 -30730975 + MER34A1 LTR ERV1 295 479 -108 8 1737 3089 17 40 0 chr2 151030703 151031056 -30717031 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 2 1737 57012 19 17 1 chr2 151031056 151037420 -30710667 + IAPEz-int LTR ERVK 8 6478 -3 2 1737 3118 14 40 0 chr2 151037424 151037777 -30710310 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 2 1737 266 229 43 0 chr2 151039080 151039150 -30708937 - MER68 LTR ERVL -26 537 465 2 1737 381 251 77 38 chr2 151039175 151039427 -30708660 - MER68 LTR ERVL -156 407 58 2 1737 3969 161 30 50 chr2 151066198 151066964 -30681123 + RMER21A LTR ERV1 175 925 -22 4 1737 667 311 14 28 chr2 151070974 151071192 -30676895 + MTD LTR MaLR 1 215 -204 4 1737 272 286 71 62 chr2 151072746 151072858 -30675229 + MLT1A1 LTR MaLR 56 168 -240 4 1737 563 211 9 18 chr2 151072931 151073042 -30675045 + MTD LTR MaLR 300 409 -12 4 1737 298 326 37 52 chr2 151073722 151073858 -30674229 + ORR1E LTR MaLR 3 136 -223 4 1737 731 321 64 11 chr2 151073867 151074147 -30673940 - RMER15 LTR ERVL 0 575 281 4 1737 590 246 25 119 chr2 151074601 151074836 -30673251 - RMER15-int LTR ERVL -267 4732 4520 4 1737 1225 319 72 28 chr2 151074844 151075459 -30672628 - RMER15-int LTR ERVL -1958 3041 2400 4 1737 394 282 22 37 chr2 151079180 151079316 -30668771 + ORR1E LTR MaLR 1 134 -225 5 1737 253 240 172 110 chr2 151079345 151079490 -30668597 + ORR1E LTR MaLR 226 379 0 5 1737 376 307 73 32 chr2 151094591 151094810 -30653277 + RLTR15 LTR ERVK 4 231 -128 6 1737 382 252 0 20 chr2 151095161 151095262 -30652825 + RMER17A-int LTR ERVK 988 1086 -642 6 1737 931 264 31 107 chr2 151095365 151095823 -30652264 + RMER17A-int LTR ERVK 1066 1488 -240 6 1737 622 156 42 56 chr2 151099981 151100124 -30647963 + RMER3D-int LTR ERVK 470 610 -2232 6 1737 526 127 6 58 chr2 151100126 151100253 -30647834 + RMER3D-int LTR ERVK 1022 1111 -1731 6 1737 7216 196 45 56 chr2 151100321 151101882 -30646205 + RMER3D-int LTR ERVK 1014 2564 -278 6 1737 7216 196 45 56 chr2 151102054 151102266 -30645821 + RMER3D-int LTR ERVK 2565 2766 -76 6 1737 1063 153 6 6 chr2 151102627 151102798 -30645289 + MTB_Mm LTR MaLR 182 352 -55 7 1737 293 293 126 88 chr2 151103296 151103637 -30644450 - ORR1E LTR MaLR 0 359 6 7 1737 1534 247 7 106 chr2 151107085 151107196 -30640891 - RMER19C LTR ERVK -1 610 508 8 1737 1534 268 42 99 chr2 151107898 151108392 -30639695 - RMER19C LTR ERVK -98 639 129 8 1737 651 108 20 0 chr2 151108953 151109055 -30639032 + MT2C_Mm LTR ERVL 294 397 -78 8 1737 1096 160 36 10 chr2 151123120 151123316 -30624771 + RLTR41 LTR ERV1 246 446 0 9 1737 281 210 73 12 chr2 151123516 151123598 -30624489 + MER34A1 LTR ERV1 34 120 -451 9 1737 527 336 84 4 chr2 151123639 151123914 -30624173 + MER34A1 LTR ERV1 183 479 -108 9 217 271 248 25 144 chr2 151126002 151126120 -30621967 - MT2B LTR ERVL -345 256 153 1 1738 372 255 31 0 chr2 151127163 151127261 -30620826 + RMER19C LTR ERVK 155 255 -356 1 1738 293 293 126 88 chr2 151128701 151129042 -30619045 + ORR1E LTR MaLR 6 359 0 1 1738 1057 149 6 6 chr2 151129541 151129710 -30618377 - MTB_Mm LTR MaLR -55 352 184 1 1738 7118 196 44 65 chr2 151130070 151130299 -30617788 - RMER3D-int LTR ERVK -76 2766 2565 1 1738 7118 196 44 65 chr2 151130444 151132005 -30616082 - RMER3D-int LTR ERVK -278 2564 1014 1 1738 526 127 6 58 chr2 151132073 151132200 -30615887 - RMER3D-int LTR ERVK -1731 1111 1022 1 1738 622 156 42 56 chr2 151132202 151132345 -30615742 - RMER3D-int LTR ERVK -2232 610 470 1 1738 909 262 33 107 chr2 151136501 151136958 -30611129 - RMER17A-int LTR ERVK -240 1488 1066 1 1738 382 252 0 20 chr2 151137061 151137162 -30610925 - RMER17A-int LTR ERVK -642 1086 988 1 1738 376 307 73 32 chr2 151137511 151137730 -30610357 - RLTR15 LTR ERVK -128 231 4 1 1738 253 240 172 110 chr2 151152830 151152975 -30595112 - ORR1E LTR MaLR 0 379 226 1 1738 394 282 22 37 chr2 151153004 151153140 -30594947 - ORR1E LTR MaLR -225 134 1 1 1738 1194 333 67 24 chr2 151156850 151157475 -30590612 + RMER15-int LTR ERVL 2390 3041 -1958 1 1738 764 261 29 5 chr2 151157483 151157691 -30590396 + RMER15-int LTR ERVL 4520 4732 -267 1 1738 743 321 64 11 chr2 151158135 151158415 -30589672 + RMER15 LTR ERVL 281 575 0 1 1738 322 318 37 52 chr2 151158424 151158560 -30589527 - ORR1E LTR MaLR -223 136 3 1 1738 563 211 9 18 chr2 151159238 151159349 -30588738 - MTD LTR MaLR -12 409 300 1 1738 272 286 71 62 chr2 151159422 151159534 -30588553 - MLT1A1 LTR MaLR -240 168 56 1 1738 2810 6 4 240 chr2 151159568 151160048 -30588039 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 1 1738 1032 86 159 0 chr2 151160048 151160211 -30587876 + IAPEz-int LTR ERVK 8 196 -6285 1 1738 47902 23 15 3 chr2 151160182 151165658 -30582429 + IAPEz-int LTR ERVK 67 5554 -927 1 1738 7058 31 4 0 chr2 151165651 151166459 -30581628 + IAPEz-int LTR ERVK 5671 6481 0 1 1738 2810 6 4 240 chr2 151166459 151166939 -30581148 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 1 1738 616 293 15 20 chr2 151175097 151175284 -30572803 - MTD LTR MaLR -232 187 2 1 1738 912 291 18 79 chr2 151197343 151197799 -30550288 - RMER19C LTR ERVK -123 488 129 1 1738 2065 115 13 10 chr2 151198788 151199096 -30548991 - RLTR27 LTR ERVK 0 309 1 1 1738 1564 229 35 27 chr2 151199096 151199660 -30548427 - MMERVK10C-int LTR ERVK 0 7581 6907 1 1738 3147 302 47 47 chr2 151201216 151203117 -30544970 - MMERVK10C-int LTR ERVK -2103 5478 3579 1 1738 582 253 62 41 chr2 151203484 151203678 -30544409 - RLTR10-int LTR ERVK -1135 852 655 1 1738 320 125 38 10 chr2 151203682 151203763 -30544324 - RLTR10-int LTR ERVK -7319 262 132 1 1738 1963 132 16 10 chr2 151203787 151204094 -30543993 - RLTR27 LTR ERVK 0 309 1 1 1738 266 238 25 144 chr2 151204796 151204914 -30543173 + MT2B LTR ERVL 153 256 -345 1 1738 521 290 51 0 chr2 151206945 151207121 -30540966 - MER34A1 LTR ERV1 -108 479 295 1 1738 1005 166 41 10 chr2 151207538 151207733 -30540354 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 246 1 1738 3893 172 18 142 chr2 151220847 151221903 -30526184 + RMER21A LTR ERV1 1 925 -22 1 1738 240 292 62 54 chr2 151226341 151226453 -30521634 + MLT1A1 LTR MaLR 56 168 -240 1 1738 556 211 9 18 chr2 151226526 151226637 -30521450 + MTC LTR MaLR 300 409 -12 1 1738 303 326 37 52 chr2 151227319 151227455 -30520632 + ORR1E LTR MaLR 3 136 -223 1 1738 745 331 61 7 chr2 151227464 151227744 -30520343 - RMER15 LTR ERVL 0 575 281 1 1738 603 237 26 7 chr2 151228172 151228325 -30519762 - RMER15-int LTR ERVL -267 4732 4577 1 1738 1204 321 72 28 chr2 151228415 151229030 -30519057 - RMER15-int LTR ERVL -1958 3041 2400 1 1738 394 282 22 37 chr2 151232748 151232884 -30515203 + ORR1E LTR MaLR 1 134 -225 1 1738 246 260 159 97 chr2 151232913 151233058 -30515029 + ORR1E LTR MaLR 226 379 0 1 1738 376 307 73 32 chr2 151248169 151248388 -30499699 + RLTR15 LTR ERVK 4 231 -128 2 1738 382 252 0 20 chr2 151248733 151248834 -30499253 + RMER17A-int LTR ERVK 988 1086 -642 2 1738 934 259 33 107 chr2 151248937 151249395 -30498692 + RMER17A-int LTR ERVK 1065 1488 -240 2 1738 619 147 51 8 chr2 151253575 151253692 -30494395 + RMER3D-int LTR ERVK 489 610 -2232 2 1738 526 127 6 58 chr2 151253694 151253821 -30494266 + RMER3D-int LTR ERVK 1022 1111 -1731 2 1738 2747 174 15 28 chr2 151253889 151254426 -30493661 + RMER3D-int LTR ERVK 1014 1543 -1299 2 1738 4087 197 63 53 chr2 151254590 151255452 -30492635 + RMER3D-int LTR ERVK 1680 2564 -278 2 1738 4087 197 63 53 chr2 151255626 151255819 -30492268 + RMER3D-int LTR ERVK 2565 2746 -96 2 1738 1119 125 12 0 chr2 151256207 151256375 -30491712 + MTB_Mm LTR MaLR 181 350 -57 2 217 379 281 128 96 chr2 151256879 151257222 -30490865 - ORR1E LTR MaLR 0 359 6 2 1739 364 257 162 54 chr2 151257320 151257494 -30490593 + MLT1C LTR MaLR 216 409 -58 2 1739 364 257 162 54 chr2 151257643 151257690 -30490397 + MLT1C LTR MaLR 410 461 -6 2 1739 1528 262 20 78 chr2 151260621 151261181 -30486906 - RMER19C LTR ERVK 0 902 224 2 1739 516 265 88 6 chr2 151265892 151266063 -30482024 - MER34A1 LTR ERV1 -108 479 295 2 1739 281 210 73 12 chr2 151266213 151266295 -30481792 - MER34A1 LTR ERV1 -451 120 34 2 1739 1094 160 36 10 chr2 151266495 151266691 -30481396 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 246 2 1739 1641 178 6 6 chr2 151299758 151300074 -30448013 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 14 2 1739 302 248 194 31 chr2 151302013 151302142 -30445945 - ORR1E LTR MaLR 0 379 230 2 1739 424 264 16 40 chr2 151302186 151302312 -30445775 - ORR1E LTR MaLR -236 123 1 2 1739 798 197 0 58 chr2 151302407 151302596 -30445491 - RLTR17 LTR ERVK -1 691 514 2 1739 1465 154 22 8 chr2 151302597 151302865 -30445222 - RLTR17 LTR ERVK -420 272 1 2 1739 389 265 17 8 chr2 151303300 151303418 -30444669 - MLT1A1 LTR MaLR -21 387 269 2 1739 753 235 126 61 chr2 151310798 151311124 -30436963 - ORR1E LTR MaLR -7 352 6 2 1739 274 306 150 17 chr2 151311996 151312169 -30435918 - MER68 LTR ERVL -176 387 192 2 1739 3247 243 186 43 chr2 151313077 151313546 -30434541 - RLTR22_Mur LTR ERVK 0 1848 1324 2 1739 3247 243 186 43 chr2 151313600 151314746 -30433341 - RLTR22_Mur LTR ERVK -525 1323 2 2 1739 611 325 33 29 chr2 151331660 151331936 -30416151 - MTD LTR MaLR -138 281 5 3 1739 3232 85 10 10 chr2 151332965 151333435 -30414652 - MTA_Mm-int LTR MaLR -664 434 1 3 1739 3362 25 10 2 chr2 151333435 151333828 -30414259 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 1739 2625 199 81 64 chr2 151342082 151342727 -30405360 - RMER19B LTR ERVK -246 656 1 3 1739 1213 217 19 142 chr2 151347012 151347059 -30401028 - MTE2a LTR MaLR 0 379 346 3 1739 1213 217 19 142 chr2 151347233 151347615 -30400472 - MTE2a LTR MaLR -34 345 3 3 1739 439 210 0 24 chr2 151352372 151352455 -30395632 + MLT1J LTR MaLR 100 180 -332 3 1739 1826 238 44 56 chr2 151352866 151353389 -30394698 - RMER19C LTR ERVK 0 611 1 3 1739 566 288 149 57 chr2 151356167 151356502 -30391585 - RMER15 LTR ERVL 0 575 210 3 1739 369 224 276 9 chr2 151362669 151362828 -30385259 + MLT1J2 LTR MaLR 7 203 -241 3 1739 1384 206 64 79 chr2 151364484 151364852 -30383235 + MTD LTR MaLR 1 419 0 3 1739 459 338 125 49 chr2 151365224 151365507 -30382580 + ORR1E LTR MaLR 10 317 -42 3 1739 459 338 125 49 chr2 151365641 151365662 -30382425 + ORR1E LTR MaLR 318 337 -22 3 1739 233 304 0 0 chr2 151365871 151365927 -30382160 - MLT1L LTR MaLR 0 610 555 3 1739 2451 156 36 74 chr2 151366090 151366562 -30381525 - RLTR24 LTR ERV1 -75 454 1 3 1739 758 220 79 87 chr2 151366766 151367020 -30381067 - RLTR19-int LTR ERVK -1756 4381 4130 3 1739 3112 212 188 13 chr2 151379559 151380288 -30367799 + RMER19B LTR ERVK 51 879 -23 4 1740 329 250 35 88 chr2 151395212 151395326 -30352761 - MT2B LTR ERVL -343 258 151 4 1740 243 260 9 115 chr2 151395766 151395879 -30352208 + MT2B LTR ERVL 157 257 -344 4 1740 2320 155 22 12 chr2 151404593 151404997 -30343090 + MTC LTR MaLR 6 413 -8 4 1740 3831 184 229 14 chr2 151405001 151406034 -30342053 + MTC-int LTR MaLR 1 1256 -2 4 1740 1694 133 3 28 chr2 151406036 151406322 -30341765 + MTC LTR MaLR 1 279 -142 4 1740 635 243 112 50 chr2 151407149 151407269 -30340818 + MTC-int LTR MaLR 963 1099 -159 4 1740 635 243 112 50 chr2 151407492 151407640 -30340447 + MTC-int LTR MaLR 1106 1256 -2 4 1740 1292 181 224 12 chr2 151407642 151407982 -30340105 + MTC LTR MaLR 1 412 -9 4 1740 430 233 41 8 chr2 151431880 151432001 -30316086 + MTEa LTR MaLR 55 179 -200 4 1740 2144 92 13 3 chr2 151439141 151439459 -30308628 + ORR1A4 LTR MaLR 1 321 -8 4 1740 3065 63 0 8 chr2 151440120 151440519 -30307568 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 1740 5708 130 68 18 chr2 151445346 151446393 -30301694 + RLTR25A LTR ERVK 1 1099 -4 4 1740 1074 272 92 33 chr2 151459237 151459572 -30288515 + MTEa LTR MaLR 17 371 -8 5 1740 1539 71 5 0 chr2 151462217 151462429 -30285658 + ORR1A2 LTR MaLR 115 327 0 5 1740 279 185 121 15 chr2 151462817 151462883 -30285204 - RMER13A LTR ERVK -776 84 12 5 1740 2218 76 8 39 chr2 151462884 151463170 -30284917 + RLTR31B_Mm LTR ERVK 1 286 -271 5 1740 2218 76 8 39 chr2 151463371 151463440 -30284647 + RLTR31B_Mm LTR ERVK 287 345 -212 5 1740 1065 163 68 10 chr2 151464093 151464298 -30283789 + RLTR31B_Mm LTR ERVK 341 557 0 5 1740 293 214 71 0 chr2 151472241 151472311 -30275776 + MTD LTR MaLR 46 120 -299 5 1740 253 176 20 0 chr2 151475057 151475108 -30272979 + RMER15 LTR ERVL 1 52 -523 5 1740 840 199 0 0 chr2 151475115 151475271 -30272816 + RMER15 LTR ERVL 420 575 0 5 1740 5451 103 26 17 chr2 151481695 151482320 -30265767 + RMER12 LTR ERVK 4 636 -686 5 1740 5451 103 26 17 chr2 151482516 151482770 -30265317 + RMER12 LTR ERVK 637 891 -431 5 1740 404 191 11 22 chr2 151482935 151483026 -30265061 + RMER12 LTR ERVK 1072 1161 -161 5 1740 543 322 126 16 chr2 151490417 151490663 -30257424 + MLT1A0 LTR MaLR 1 273 -92 5 1740 960 279 45 19 chr2 151490684 151490995 -30257092 - MLT1A0 LTR MaLR -40 325 7 5 1740 401 291 27 41 chr2 151497092 151497239 -30250848 - RLTR14 LTR ERV1 -4 378 234 6 1740 324 276 76 15 chr2 151500031 151500190 -30247897 - MTEa LTR MaLR 0 379 201 1 1740 309 315 22 21 chr2 151500137 151500255 -30247832 + MLT1C LTR MaLR 284 399 -106 2 1740 3284 155 23 16 chr2 151502997 151503566 -30244521 + RMER15 LTR ERVL 3 575 0 1 1740 2209 168 60 0 chr2 151503880 151504244 -30243843 + ORR1B1 LTR MaLR 1 386 -8 1 1740 231 375 28 7 chr2 151505082 151505227 -30242860 - RLTR33 LTR ERVK -30 648 501 1 1740 248 292 14 0 chr2 151505502 151505574 -30242513 - RLTR19C LTR ERVK -409 97 25 1 1740 309 211 187 45 chr2 151505611 151505745 -30242342 - LTR50 LTR ERVL -45 750 598 2 1740 273 309 112 69 chr2 151505887 151506075 -30242012 - LTR50 LTR ERVL -521 274 79 2 1740 1779 194 161 79 chr2 151507066 151507558 -30240529 - MT2A LTR ERVL -1 532 1 2 1740 1189 237 94 31 chr2 151508389 151508707 -30239380 + ORR1D2 LTR MaLR 2 339 -31 2 1740 1884 202 90 3 chr2 151508707 151509094 -30238993 - MTC LTR MaLR 0 421 1 2 1740 5075 147 71 23 chr2 151509094 151510162 -30237925 - MTC-int LTR MaLR 0 1258 170 2 1740 421 309 132 12 chr2 151510382 151510549 -30237538 - LTR16D2 LTR ERVL -333 239 53 2 1740 352 224 30 123 chr2 151512361 151512503 -30235584 + MLT1J LTR MaLR 203 407 -203 3 1740 235 341 23 12 chr2 151514912 151514998 -30233089 - MLT1H LTR MaLR -338 211 125 3 1740 254 255 34 41 chr2 151516917 151516960 -30231127 - ORR1B1-int LTR MaLR -859 650 609 4 1740 408 336 65 43 chr2 151518474 151518717 -30229370 + MLT1J LTR MaLR 28 319 -193 5 1741 891 247 33 37 chr2 151519311 151519555 -30228532 + ORR1D1 LTR MaLR 1 243 -131 5 1741 634 311 146 51 chr2 151520949 151521319 -30226768 - MLT1J LTR MaLR -28 484 80 5 1741 322 335 149 77 chr2 151521640 151521976 -30226111 + MLT1G1 LTR MaLR 110 469 -110 6 1741 329 324 20 0 chr2 151522298 151522400 -30225687 + LTR87 LTR ERVL? 8 111 -513 6 1741 353 314 56 21 chr2 151525818 151525961 -30222126 + LTR87 LTR ERVL? 474 621 -3 7 1741 2299 157 62 12 chr2 151544666 151545066 -30203021 + MTC LTR MaLR 2 421 0 9 1741 2533 81 16 0 chr2 151550387 151550709 -30197378 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 1 1741 1499 196 117 6 chr2 151556115 151556448 -30191639 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 1 1741 1507 216 92 45 chr2 151562907 151563286 -30184801 - MTD LTR MaLR 0 419 23 1 1741 2854 38 15 0 chr2 151563596 151563937 -30184150 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 1 1741 240 323 128 23 chr2 151569942 151570075 -30178012 - MTA_Mm LTR MaLR -78 318 172 1 1741 3534 25 2 0 chr2 151570710 151571105 -30176982 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1741 2108 183 46 0 chr2 151572820 151573187 -30174900 + MTD LTR MaLR 36 419 0 1 1741 367 278 121 82 chr2 151573620 151573935 -30174152 + ORR1E LTR MaLR 26 377 -2 1 1741 382 257 13 79 chr2 151574550 151574702 -30173385 - LTR37A LTR ERV1 -1 425 284 1 1741 2312 170 104 39 chr2 151576795 151577334 -30170753 - RMER15 LTR ERVL 0 575 2 1 1741 325 264 122 9 chr2 151582062 151582169 -30165918 + MTEb LTR MaLR 261 379 0 1 1741 3024 252 123 50 chr2 151582159 151582305 -30165782 + MTEb-int LTR MaLR 4 132 -1448 1 1741 3024 252 123 50 chr2 151582501 151583356 -30164731 + MTEb-int LTR MaLR 133 1078 -502 1 1741 1275 204 91 57 chr2 151583963 151584316 -30163771 + ORR1D1 LTR MaLR 1 365 -9 1 1741 491 310 77 105 chr2 151587794 151588147 -30159940 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 66 1 1741 1147 165 163 45 chr2 151594804 151595135 -30152952 - RMER10A LTR ERVL -72 370 1 2 1741 411 179 86 43 chr2 151595833 151595973 -30152114 + RMER17B LTR ERVK 318 463 -495 2 1741 1503 187 77 129 chr2 151596030 151596472 -30151615 + MTD LTR MaLR 1 419 0 2 1741 359 197 75 22 chr2 151597808 151597905 -30150182 - MLT1B LTR MaLR -32 358 249 2 1741 352 222 0 0 chr2 151598142 151598214 -30149873 - MLT1B LTR MaLR -171 194 123 2 1741 438 306 46 98 chr2 151598415 151598809 -30149278 - ORR1E LTR MaLR 0 370 3 2 1741 1704 251 108 12 chr2 151599127 151599634 -30148453 + MLT1G LTR MaLR 34 589 -2 2 1741 888 260 77 46 chr2 151603938 151604363 -30143724 + RMER15 LTR ERVL 41 575 0 2 1741 795 273 90 75 chr2 151605550 151605926 -30142161 - MLT1B LTR MaLR -8 382 1 2 1741 737 306 63 61 chr2 151605946 151606294 -30141793 - ORR1E LTR MaLR -13 366 1 2 1741 3198 74 97 25 chr2 151607302 151607786 -30140301 - MURVY-LTR LTR ERV1 0 519 1 2 1741 3996 68 16 8 chr2 151607805 151608320 -30139767 + MURVY-LTR LTR ERV1 1 519 0 2 1741 1352 239 145 3 chr2 151610738 151611090 -30136997 - MTD LTR MaLR -15 404 3 2 1741 345 267 2 83 chr2 151618956 151619094 -30128993 + MLT1L LTR MaLR 239 445 -165 2 1741 3109 97 0 5 chr2 151620307 151620733 -30127354 - RLTR10C LTR ERVK -12 424 1 2 1741 240 333 41 41 chr2 151622105 151622202 -30125885 + MLT1K LTR MaLR 199 295 -300 2 1741 1864 202 106 15 chr2 151624365 151624800 -30123287 + RMER4B LTR ERVK 1 467 -118 2 1741 265 233 137 53 chr2 151624910 151624961 -30123126 + RMER4B LTR ERVK 396 457 -9 2 1741 887 295 22 66 chr2 151624972 151625291 -30122796 - MT2A LTR ERVL -99 434 130 2 1741 2337 231 62 30 chr2 151625359 151625935 -30122152 - RLTR17 LTR ERVK -97 595 1 2 1741 556 250 29 7 chr2 151625935 151626072 -30122015 - MTEa LTR MaLR -239 140 1 2 1741 264 266 50 50 chr2 151629987 151630086 -30118001 + RMER15 LTR ERVL 61 159 -416 2 1741 496 332 70 10 chr2 151630155 151630356 -30117731 + RMER15 LTR ERVL 363 575 0 2 1741 271 310 120 26 chr2 151631425 151631630 -30116457 - MLT1J2 LTR MaLR -28 420 186 2 1741 291 273 22 11 chr2 151633108 151633197 -30114890 + MTEa LTR MaLR 290 379 0 2 1741 262 304 83 60 chr2 151633920 151634088 -30113999 + MLT1K LTR MaLR 317 488 -107 3 1741 325 307 52 115 chr2 151635843 151636219 -30111868 - ORR1E LTR MaLR -7 372 6 3 1741 228 322 201 17 chr2 151636211 151636385 -30111702 + LTR16A LTR ERVL 227 432 -19 3 1741 1624 217 52 38 chr2 151639093 151639462 -30108625 + MTD LTR MaLR 46 419 0 3 1741 259 243 40 13 chr2 151643108 151643183 -30104904 - MTEa LTR MaLR -13 366 290 3 1741 1295 256 69 25 chr2 151645497 151645874 -30102213 - MTD LTR MaLR -14 405 7 3 1741 225 342 40 40 chr2 151647290 151647366 -30100721 + RLTR47_MM LTR ERV1 52 127 -405 3 1742 547 316 62 9 chr2 151654469 151654680 -30093407 - RMER15 LTR ERVL -15 560 339 3 1742 1147 214 171 12 chr2 151657666 151657993 -30090094 + MTEb LTR MaLR 1 379 0 3 1742 1181 238 104 38 chr2 151659238 151659631 -30088456 + MTD LTR MaLR 1 419 0 3 1742 772 238 138 48 chr2 151664165 151664506 -30083581 + MTD LTR MaLR 26 419 0 3 1742 233 257 139 107 chr2 151665220 151665342 -30082745 + MLT1J2 LTR MaLR 12 137 -311 3 1742 1131 249 42 94 chr2 151666353 151666713 -30081374 - ORR1D2 LTR MaLR -8 362 22 3 1742 2586 100 104 5 chr2 151676952 151677335 -30070752 - MTC LTR MaLR 0 421 1 3 1742 2163 161 5 44 chr2 151678203 151678592 -30069495 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 3 1742 259 209 14 29 chr2 151680290 151680359 -30067728 - MTE2a LTR MaLR -32 347 280 3 1742 308 219 0 14 chr2 151687098 151687172 -30060915 - MLT1K LTR MaLR 0 595 523 3 1742 501 305 78 53 chr2 151690628 151690939 -30057148 + ORR1E LTR MaLR 12 356 -23 4 1742 258 289 136 32 chr2 151693301 151693426 -30054661 - MLT1J LTR MaLR -325 187 50 4 1742 234 200 0 0 chr2 151703016 151703061 -30045026 + MLT1G3 LTR MaLR 487 531 -64 4 1742 1099 254 49 3 chr2 151703280 151703568 -30044519 - RLTR16 LTR ERVK -204 301 1 4 1742 1258 239 96 22 chr2 151705666 151706054 -30042033 - MTD LTR MaLR -15 392 1 4 1742 313 286 23 125 chr2 151713057 151713127 -30034960 + MTEa LTR MaLR 265 335 -44 4 1742 1961 170 67 3 chr2 151713127 151713486 -30034601 - RLTR14 LTR ERV1 0 382 1 4 1742 313 286 23 125 chr2 151713486 151713543 -30034544 + MTEa LTR MaLR 336 379 0 4 1742 652 303 156 42 chr2 151713556 151713890 -30034197 + MTEa-int LTR MaLR 22 393 -1187 4 1742 1736 311 45 20 chr2 151713862 151714466 -30033621 + MTEa-int LTR MaLR 932 1550 -30 4 1742 441 325 74 74 chr2 151714475 151714771 -30033316 + ORR1E LTR MaLR 53 348 -11 4 1742 350 343 22 15 chr2 151718388 151718524 -30029563 + MTEa LTR MaLR 82 218 -161 4 1742 525 302 38 11 chr2 151718789 151718973 -30029114 + MTEa LTR MaLR 189 377 -2 4 1742 2077 158 0 43 chr2 151722001 151722377 -30025710 - MTC LTR MaLR -13 408 49 4 1742 4612 6 0 0 chr2 151722715 151723208 -30024879 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 4 1742 276 316 79 43 chr2 151727684 151727823 -30020264 - ORR1E LTR MaLR -215 144 1 4 1742 303 275 104 73 chr2 151729120 151729312 -30018775 - MLT1H2 LTR MaLR -224 265 68 4 1742 237 339 79 16 chr2 151732272 151732398 -30015689 + MLT1K LTR MaLR 369 502 -93 4 1742 285 312 112 58 chr2 151733279 151733609 -30014478 - MLT1A1 LTR MaLR -58 350 3 4 1742 1409 191 123 52 chr2 151734054 151734138 -30013949 + RMER17C LTR ERVK 1 83 -327 4 1742 1409 191 123 52 chr2 151734221 151734518 -30013569 + RMER17C LTR ERVK 84 409 -1 4 1742 1573 227 91 55 chr2 151752090 151752487 -29995600 - MTD LTR MaLR -4 415 5 4 1742 439 270 38 53 chr2 151758194 151758327 -29989760 - RMER12 LTR ERVK -2 1320 1190 5 1742 1261 236 39 6 chr2 151759567 151759879 -29988208 - RMER12 LTR ERVK -146 1176 855 5 1742 5288 152 35 34 chr2 151760834 151761739 -29986348 - RMER13B LTR ERVK -1 907 2 5 1742 346 204 17 127 chr2 151761933 151762051 -29986036 + MTEa LTR MaLR 244 348 -31 5 1742 251 314 149 0 chr2 151774119 151774240 -29973847 - MLT1K LTR MaLR -192 403 265 5 1742 308 367 121 15 chr2 151779691 151779890 -29968197 - MLT1J LTR MaLR -48 464 245 5 1742 296 291 117 22 chr2 151780326 151780463 -29967624 + MLT1G LTR MaLR 31 180 -411 5 1742 600 365 88 19 chr2 151780652 151781119 -29966968 + MER90a LTR ERV1 2 500 -114 5 1743 1525 237 42 74 chr2 151784774 151785207 -29962880 + MTD LTR MaLR 1 419 0 5 1743 269 240 8 148 chr2 151793839 151793961 -29954126 - MT2B LTR ERVL -344 257 153 5 1743 4266 108 115 15 chr2 151807870 151808316 -29939771 + RMER6A LTR ERVK 1 489 -267 5 1743 4266 108 115 15 chr2 151808390 151808630 -29939457 + RMER6A LTR ERVK 490 756 0 5 1743 1639 194 98 13 chr2 151811621 151811998 -29936089 - MTD LTR MaLR -14 405 12 6 1743 388 182 35 119 chr2 151819938 151819962 -29928125 + MT2B LTR ERVL 134 145 -456 6 1743 341 282 9 28 chr2 151822902 151823008 -29925079 + RMER12 LTR ERVK 748 851 -471 6 1743 732 253 127 0 chr2 151835728 151835965 -29912122 - MER67C LTR ERV1 -140 571 305 6 1743 796 239 123 20 chr2 151836081 151836325 -29911762 - MTD LTR MaLR -150 269 1 6 1743 284 338 85 6 chr2 151838302 151838466 -29909621 + MLT1E2 LTR MaLR 11 187 -440 6 1743 275 362 78 13 chr2 151838557 151838711 -29909376 + MLT1E2 LTR MaLR 339 502 -125 6 1743 2104 38 4 0 chr2 151842981 151843248 -29904839 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 129 6 1743 8637 42 3 23 chr2 151843252 151844373 -29903714 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 6 1743 3294 28 5 0 chr2 151844373 151844767 -29903320 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 1743 1053 134 0 159 chr2 151844767 151845024 -29903063 - RMER2 LTR ERV1 -8 559 344 6 1743 2091 73 98 0 chr2 151845713 151846028 -29902059 - RMER2 LTR ERV1 -221 346 1 6 1743 3327 112 72 24 chr2 151848660 151849281 -29898806 - RMER6A LTR ERVK 0 756 106 6 1743 649 125 0 104 chr2 151849424 151849549 -29898538 - RMER6A LTR ERVK -619 137 26 6 1743 515 307 181 10 chr2 151850037 151850340 -29897747 - MLT1D LTR MaLR -150 355 1 6 1743 241 362 38 75 chr2 151852275 151852514 -29895573 - MLT1C LTR MaLR -202 265 36 6 1743 342 250 0 86 chr2 151854232 151854337 -29893750 - MT2B LTR ERVL -344 257 162 6 1743 953 203 143 9 chr2 151856393 151856617 -29891470 + MTC LTR MaLR 168 421 0 6 1743 339 155 0 0 chr2 151856829 151856878 -29891209 + ORR1B2 LTR MaLR 29 77 -290 6 1743 1593 152 54 16 chr2 151856878 151857193 -29890894 + ORR1B2 LTR MaLR 41 367 0 6 1743 1987 132 101 27 chr2 151858822 151859189 -29888898 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 6 1743 261 260 51 13 chr2 151859681 151859759 -29888328 - MLT1F LTR MaLR -202 346 266 6 1743 357 199 4 17 chr2 151860845 151860932 -29887155 - MTEb LTR MaLR -3 376 287 6 1743 1237 281 11 52 chr2 151861281 151861645 -29886442 + ORR1E LTR MaLR 1 349 -10 6 1743 4434 258 89 63 chr2 151861659 151862969 -29885118 + ORR1E-int LTR MaLR 1 1351 -229 6 1743 4434 258 89 63 chr2 151863119 151863274 -29884813 + ORR1E-int LTR MaLR 1352 1503 -77 6 1743 1597 189 19 19 chr2 151865000 151865318 -29882769 - MTC LTR MaLR 0 421 104 7 1743 649 183 0 8 chr2 151865463 151865584 -29882503 - MTC LTR MaLR -301 120 1 7 1743 5619 156 122 5 chr2 151865587 151866703 -29881384 - MTC-int LTR MaLR 0 1258 13 7 1743 2357 163 7 28 chr2 151866716 151867146 -29880941 - MTC LTR MaLR 0 421 1 7 1743 436 336 44 92 chr2 151875057 151875417 -29872670 - MER92C LTR ERV1 -2 552 210 7 1743 269 227 30 8 chr2 151878724 151878799 -29869288 + ORR1E LTR MaLR 268 341 -38 7 1743 4227 172 81 8 chr2 151879565 151880396 -29867691 - RMER19B LTR ERVK -24 878 38 7 1743 234 297 76 80 chr2 151880431 151880633 -29867454 - MLT1G1 LTR MaLR -248 347 141 7 1743 398 327 52 79 chr2 151883208 151883637 -29864450 - RMER20B LTR ERVK -180 462 15 7 1743 247 367 10 10 chr2 151888083 151888182 -29859905 - LTR16D1 LTR ERVL -341 334 236 7 1743 5090 107 39 5 chr2 151898487 151899334 -29848753 - RMER12 LTR ERVK -92 1312 4 8 1743 909 241 87 115 chr2 151904215 151904562 -29843525 - MTE2a LTR MaLR -42 337 1 8 1744 1220 232 73 61 chr2 151915596 151915940 -29832147 - ORR1D2 LTR MaLR -22 348 1 8 1744 276 232 0 167 chr2 151918287 151918401 -29829686 + MT2B2 LTR ERVL 163 257 -327 8 1744 293 342 32 58 chr2 151922247 151922402 -29825685 - LTR33B LTR ERVL -329 174 24 8 1744 348 315 60 30 chr2 151923737 151923871 -29824216 - MLT1A0 LTR MaLR -76 289 152 8 1744 583 250 35 7 chr2 151923946 151924091 -29823996 - MLT1A0 LTR MaLR -202 163 15 8 1744 793 308 158 6 chr2 151924240 151924576 -29823511 - MLT1A0-int LTR MaLR -32 1703 1317 8 1744 531 322 33 11 chr2 151924970 151925152 -29822935 - MLT1A0 LTR MaLR -135 230 45 8 1744 703 340 54 57 chr2 151925862 151926181 -29821906 + MLT1J LTR MaLR 9 340 -172 8 1744 703 340 54 57 chr2 151926318 151926403 -29821684 + MLT1J LTR MaLR 341 412 -100 8 1744 464 173 72 9 chr2 151928473 151928584 -29819503 - RMER5 LTR ERV1 -83 451 334 8 1744 460 324 53 91 chr2 151928787 151929022 -29819065 - RMER5 LTR ERV1 -174 360 126 8 1744 460 324 53 91 chr2 151929168 151929306 -29818781 - RMER5 LTR ERV1 -409 125 2 8 1744 326 217 58 35 chr2 151929789 151929875 -29818212 - RLTR23 LTR ERV1 -32 398 311 8 1744 1261 269 58 20 chr2 151933062 151933117 -29814970 - MTE2a LTR MaLR -8 371 317 8 1744 1261 269 58 20 chr2 151933287 151933575 -29814512 - MTE2a LTR MaLR -63 316 15 8 1744 496 292 111 41 chr2 151933577 151933848 -29814239 - MLT1D LTR MaLR -214 291 2 8 1744 478 358 123 15 chr2 151935729 151936055 -29812032 - MLT1H LTR MaLR -2 547 187 8 1744 1038 232 160 16 chr2 151943165 151943472 -29804615 + MTD LTR MaLR 55 405 -14 8 1744 810 193 20 16 chr2 151950326 151950513 -29797574 - MTD LTR MaLR -8 413 230 9 1744 233 300 63 91 chr2 151950783 151950926 -29797161 - MLT1G1 LTR MaLR -255 324 186 9 1744 2518 60 31 0 chr2 151952000 151952317 -29795770 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 9 1744 1327 211 110 9 chr2 151953930 151954265 -29793822 + ORR1D2 LTR MaLR 1 369 -1 9 1744 250 228 0 66 chr2 151954269 151954405 -29793682 + ORR1D2-int LTR MaLR 613 739 -770 9 1744 423 184 0 127 chr2 151954290 151954312 -29793775 + MT2B LTR ERVL 148 154 -447 9 1744 261 312 143 23 chr2 151956773 151956951 -29791136 - MLT1H1 LTR MaLR -18 577 374 9 1744 269 270 76 48 chr2 151957071 151957176 -29790911 - MLT1H1 LTR MaLR -408 147 40 9 1744 2698 118 72 34 chr2 151959117 151959564 -29788523 - RMER16 LTR ERVK 0 533 70 9 1744 372 353 71 19 chr2 151959984 151960195 -29787892 - MLT1G LTR MaLR -289 302 81 9 1744 2795 146 64 20 chr2 151960303 151960805 -29787282 + RMER15 LTR ERVL 34 557 -18 9 1744 288 292 82 30 chr2 151961082 151961216 -29786871 - MLT1J LTR MaLR -114 398 258 9 1744 268 270 26 39 chr2 151961611 151961688 -29786399 - MTEb LTR MaLR -15 364 289 9 1744 251 315 18 102 chr2 151961776 151961942 -29786145 - MTEb LTR MaLR -163 196 45 9 1744 272 314 148 76 chr2 151963975 151964185 -29783902 + MLT1J LTR MaLR 124 348 -164 9 1744 1022 261 91 58 chr2 151966692 151967034 -29781053 - MTE2b LTR MaLR -26 353 1 9 1744 3544 18 5 0 chr2 151982761 151983154 -29764933 - MTA_Mm LTR MaLR -1 395 1 9 1744 9812 16 0 0 chr2 151983154 151984252 -29763835 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 9 1744 3553 18 5 0 chr2 151984252 151984646 -29763441 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 9 1744 690 177 55 47 chr2 151986860 151987090 -29760997 - ORR1D1 LTR MaLR -173 221 1 1 1744 235 316 75 119 chr2 151995264 151995355 -29752732 + MT2B2 LTR ERVL 79 160 -424 1 1744 1814 190 114 12 chr2 151995670 151996040 -29752047 - MTD LTR MaLR -14 405 18 1 1744 365 323 42 48 chr2 151996248 151996414 -29751673 + MLT1J LTR MaLR 29 193 -319 1 1744 4769 157 68 34 chr2 151997520 151997623 -29750464 - RMER19B LTR ERVK -37 865 766 1 1744 4769 157 68 34 chr2 151997869 151998597 -29749490 - RMER19B LTR ERVK -137 765 1 1 1744 688 208 259 19 chr2 151998916 151999183 -29748904 - MTEb LTR MaLR -12 367 37 1 1744 2035 149 22 94 chr2 152000309 152000386 -29747701 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 311 1 1744 2035 149 22 94 chr2 152000533 152000869 -29747218 - ORR1B1 LTR MaLR -84 310 3 1 1744 1922 158 92 3 chr2 152007622 152007959 -29740128 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 2 1744 1260 219 93 65 chr2 152012633 152013063 -29735024 + RMER10A LTR ERVL 1 442 0 4 1744 588 329 26 107 chr2 152025099 152025371 -29722716 - MLT1A0 LTR MaLR -115 250 1 1 1744 1715 121 180 6 chr2 152027168 152027312 -29720775 + ORR1C2 LTR MaLR 13 167 -217 1 1744 1715 121 180 6 chr2 152027336 152027508 -29720579 + ORR1C2 LTR MaLR 168 383 -1 1 1744 1394 220 66 99 chr2 152027679 152027858 -29720229 + RMER4A LTR ERVK 17 210 -256 1 1744 1394 220 66 99 chr2 152028041 152028315 -29719772 + RMER4A LTR ERVK 211 455 -11 1 1744 2389 166 7 38 chr2 152028604 152028775 -29719312 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 239 1 1744 2271 91 18 18 chr2 152028775 152029101 -29718986 + ORR1A3 LTR MaLR 1 326 0 1 1744 11697 114 67 12 chr2 152029101 152030961 -29717126 + ORR1A3-int LTR MaLR 1 1963 0 1 1744 2299 85 21 39 chr2 152030961 152031243 -29716844 + ORR1A3 LTR MaLR 1 283 -43 1 1744 2299 85 21 39 chr2 152031433 152031481 -29716606 + ORR1A3 LTR MaLR 284 325 -1 1 1744 2389 166 7 38 chr2 152031481 152031727 -29716360 - MTB_Mm LTR MaLR -169 238 3 1 1744 625 170 188 13 chr2 152031914 152032063 -29716024 - MTD LTR MaLR -45 374 200 1 1744 2541 106 36 48 chr2 152032131 152032547 -29715540 + IAPLTR2a LTR ERVK 1 411 0 1 1744 3481 69 16 30 chr2 152032548 152033288 -29714799 + IAPEz-int LTR ERVK 9 662 -5819 1 1744 460 66 0 32 chr2 152033288 152033351 -29714736 + IAPEz-int LTR ERVK 1359 1419 -5062 1 1744 1848 115 4 4 chr2 152033340 152033602 -29714485 + IAPEz-int LTR ERVK 2236 2497 -5183 1 1744 935 88 24 0 chr2 152033597 152033722 -29714365 + IAPEz-int LTR ERVK 4783 4910 -2770 1 1744 26938 13 3 0 chr2 152033722 152036669 -29711418 + IAPEz-int LTR ERVK 3525 6481 0 1 1744 2478 109 36 57 chr2 152036669 152037089 -29710998 + IAPLTR2a LTR ERVK 1 411 0 1 1744 755 238 104 6 chr2 152037245 152037427 -29710660 - MTD LTR MaLR -209 210 11 1 1744 1570 189 42 76 chr2 152039181 152039564 -29708523 + ORR1D1 LTR MaLR 5 374 0 1 1744 379 282 85 49 chr2 152039962 152040126 -29707961 - RMER15 LTR ERVL -11 564 395 1 1744 3232 110 21 2 chr2 152040841 152041307 -29706780 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 1 1 1745 2192 83 57 0 chr2 152046426 152046726 -29701361 + MTB LTR MaLR 79 395 -5 1 1745 292 247 123 0 chr2 152046940 152047021 -29701066 + MLT1H LTR MaLR 14 104 -445 1 1745 406 375 120 50 chr2 152047969 152048351 -29699736 + MLT1H LTR MaLR 139 547 -2 1 1745 583 285 77 49 chr2 152049178 152049425 -29698662 - LTR73 LTR ERV1 -281 291 38 1 1745 3333 98 4 35 chr2 152050625 152051113 -29696974 + MT2C_Mm LTR ERVL 3 475 0 1 1745 1388 273 111 28 chr2 152055428 152055895 -29692192 + MLT1E2 LTR MaLR 112 617 -10 1 1745 464 274 178 39 chr2 152055897 152056178 -29691909 + MLT1E2-int LTR MaLR 1 320 -1169 1 1745 254 313 25 42 chr2 152057528 152057633 -29690454 + MLT1E2-int LTR MaLR 1368 1470 -19 1 1745 289 240 140 0 chr2 152057633 152057716 -29690371 + MLT1E2 LTR MaLR 3 99 -528 1 1745 272 294 27 137 chr2 152058354 152058415 -29689672 + MT2B LTR ERVL 109 153 -448 2 1745 624 305 210 3 chr2 152058598 152058905 -29689182 + MLT1E2 LTR MaLR 252 621 -6 1 1745 252 262 17 120 chr2 152077765 152077863 -29670224 - MT2B LTR ERVL -339 262 177 2 1745 886 154 513 0 chr2 152087291 152087567 -29660520 - MTD LTR MaLR 0 419 2 3 1745 972 307 162 12 chr2 152087691 152088093 -29659994 - MER21B LTR ERV1 -101 762 301 3 1745 4718 12 2 0 chr2 152089097 152089589 -29658498 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 3 1745 48271 15 6 0 chr2 152089589 152094917 -29653170 + MERVL-int LTR ERVL 1 5360 -125 3 1745 401 155 46 35 chr2 152094917 152095004 -29653083 + ORR1A3-int LTR MaLR 553 640 -1323 3 1745 322 0 0 0 chr2 152095004 152095042 -29653045 + MERVL-int LTR ERVL 5448 5485 0 3 1745 4718 12 2 0 chr2 152095042 152095534 -29652553 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 3 1745 340 331 46 63 chr2 152096717 152096891 -29651196 + MT2B LTR ERVL 104 274 -327 3 1745 2969 150 53 10 chr2 152100470 152100976 -29647111 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 1 3 1745 2504 176 62 29 chr2 152108805 152109285 -29638802 - RLTR19A LTR ERVK 0 496 1 3 1745 854 236 39 94 chr2 152115267 152115314 -29632773 - RLTR15 LTR ERVK -17 342 304 3 1745 854 236 39 94 chr2 152115500 152115813 -29632274 - RLTR15 LTR ERVK -56 303 2 3 1745 369 312 92 43 chr2 152152174 152152358 -29595729 + ORR1E LTR MaLR 2 194 -165 4 1745 351 229 15 174 chr2 152152354 152152486 -29595601 + MT2B LTR ERVL 147 257 -344 4 1745 305 232 77 50 chr2 152152769 152152911 -29595176 + ORR1E LTR MaLR 236 366 -13 4 1745 1110 203 126 116 chr2 152153154 152153291 -29594796 + MTD LTR MaLR 3 141 -278 4 1745 1110 203 126 116 chr2 152153495 152153557 -29594530 + MTD LTR MaLR 142 195 -224 4 1745 1110 203 126 116 chr2 152153695 152153907 -29594180 + MTD LTR MaLR 196 419 0 4 1745 267 279 72 24 chr2 152159833 152159896 -29588191 - MLT1F1 LTR MaLR 0 569 505 4 1745 267 279 72 24 chr2 152160008 152160069 -29588018 - MLT1F1 LTR MaLR -65 504 439 4 1745 3842 127 100 114 chr2 152160343 152160750 -29587337 + RMER17A2 LTR ERVK 1 402 -504 4 1745 3842 127 100 114 chr2 152160780 152161278 -29586809 + RMER17A2 LTR ERVK 403 893 -13 4 1745 258 242 38 142 chr2 152168516 152168622 -29579465 - MT2B2 LTR ERVL -344 240 146 5 1746 1168 302 52 70 chr2 152180708 152181110 -29566977 - MT2A LTR ERVL -77 456 62 5 1746 274 258 152 30 chr2 152183685 152183849 -29564238 - RMER2 LTR ERV1 -28 539 356 5 1746 2356 155 181 42 chr2 152190564 152191062 -29557025 - RMER2 LTR ERV1 0 567 1 6 1746 392 179 0 0 chr2 152191300 152191367 -29556720 + RMER10A LTR ERVL 54 120 -322 6 1746 2238 101 18 68 chr2 152191361 152191744 -29556343 + RLTR23 LTR ERV1 67 430 0 6 1746 1035 268 37 95 chr2 152191744 152192067 -29556020 + RMER10B LTR ERVL 98 398 0 6 1746 1074 264 17 84 chr2 152198739 152199281 -29548806 + RLTR11B LTR ERVK 1 516 -12 6 1746 1631 159 94 120 chr2 152203556 152203766 -29544321 + ORR1C2 LTR MaLR 1 176 -208 6 1746 1631 159 94 120 chr2 152203813 152203994 -29544093 + ORR1C2 LTR MaLR 177 381 -3 6 1746 1208 289 16 72 chr2 152204399 152204775 -29543312 + MTE2b LTR MaLR 25 379 0 6 1746 308 292 39 77 chr2 152206462 152206592 -29541495 + MLT1H2 LTR MaLR 327 451 -38 6 1746 2205 113 6 58 chr2 152207560 152207907 -29540180 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 6 1746 8950 124 126 107 chr2 152207907 152209834 -29538253 - ORR1A4-int LTR MaLR 0 1963 1 6 1746 1738 127 83 80 chr2 152209834 152210160 -29537927 - ORR1A4 LTR MaLR -2 327 1 6 1746 2628 161 57 65 chr2 152210217 152210722 -29537365 + RMER15 LTR ERVL 75 575 0 6 1746 4283 115 40 16 chr2 152211041 152211706 -29536381 - RLTR33 LTR ERVK 0 678 10 6 1746 245 331 72 5 chr2 152217273 152217371 -29530716 - MLT1G LTR MaLR -93 502 401 6 1746 257 272 147 65 chr2 152219311 152219664 -29528423 - LTR16B1 LTR ERVL -14 466 18 6 1746 1976 108 9 43 chr2 152229324 152229372 -29518715 + ORR1A4 LTR MaLR 12 57 -272 7 1746 1976 108 9 43 chr2 152229557 152229837 -29518250 + ORR1A4 LTR MaLR 58 329 0 7 1746 1572 154 16 142 chr2 152230628 152231000 -29517087 + RMER19B LTR ERVK 1 325 -577 7 1746 237 333 188 7 chr2 152232582 152232736 -29515351 - MTE2a LTR MaLR -56 323 142 7 1746 3149 43 5 0 chr2 152234325 152234719 -29513368 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 7 1746 360 297 14 72 chr2 152240962 152241100 -29506987 - RMER10B LTR ERVL 0 398 269 7 1746 3232 245 36 95 chr2 152241612 152242251 -29505836 + RLTR25A LTR ERVK 15 632 -471 7 1746 3232 245 36 95 chr2 152242689 152243205 -29504882 + RLTR25A LTR ERVK 633 1102 -1 7 1746 1942 113 58 13 chr2 152243878 152244191 -29503896 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 7 1746 1857 242 60 29 chr2 152244489 152245190 -29502897 - MYSERV6-int LTR ERVK -276 8683 8077 7 1746 1030 226 54 51 chr2 152246203 152246717 -29501370 + RMER19C LTR ERVK 343 886 -16 7 1746 1030 187 30 43 chr2 152246744 152246756 -29501331 + RMER19C LTR ERVK 596 610 -1 7 1746 2377 155 34 2 chr2 152246756 152247170 -29500917 + MurERV4_19-int LTR ERVK 1 427 -5353 7 1746 1359 123 82 8 chr2 152247170 152247425 -29500662 - MT2B LTR ERVL -327 274 1 7 1746 1054 273 101 85 chr2 152247425 152247529 -29500558 - ORR1A4-int LTR MaLR -921 449 361 7 1746 1335 195 39 31 chr2 152247614 152247951 -29500136 - ORR1A4-int LTR MaLR -1592 371 1 7 1746 342 80 0 20 chr2 152247951 152248002 -29500085 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 280 7 1746 1462 78 78 0 chr2 152248018 152248237 -29499850 + MurERV4_19-int LTR ERVK 2471 2706 -3074 7 1746 1825 159 62 22 chr2 152248246 152248380 -29499707 + MurERV4_19-int LTR ERVK 5312 5451 -329 7 1746 1825 159 62 22 chr2 152248524 152248560 -29499527 + MurERV4_19-int LTR ERVK 5452 5505 -275 7 1746 1825 159 62 22 chr2 152248676 152248955 -29499132 + MurERV4_19-int LTR ERVK 5506 5779 -1 7 1746 738 279 41 37 chr2 152248955 152249285 -29498802 + RMER19C LTR ERVK 1 389 -348 7 1746 750 117 4 22 chr2 152249285 152249449 -29498638 + MT2B LTR ERVL 1 244 -357 7 1746 3170 110 16 12 chr2 152251468 152251972 -29496115 + RLTR19C LTR ERVK 1 506 0 7 1746 305 204 0 2 chr2 152252110 152252181 -29495906 + MT2B LTR ERVL 19 88 -445 7 1746 649 224 108 30 chr2 152252420 152252695 -29495392 + MT2B LTR ERVL 99 525 -76 7 1746 314 345 144 17 chr2 152254843 152255023 -29493064 - MLT1J1 LTR MaLR -8 440 238 7 1746 331 289 105 20 chr2 152255056 152255208 -29492879 - MLT1J1 LTR MaLR -279 165 1 7 1746 651 255 99 57 chr2 152255611 152255873 -29492214 + RMER15 LTR ERVL 299 571 -4 7 1746 1591 154 30 56 chr2 152256919 152257257 -29490830 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 8 1746 609 257 139 10 chr2 152257511 152257719 -29490368 + RMER15 LTR ERVL 337 571 -4 8 1746 250 292 70 76 chr2 152264069 152264254 -29483833 - MLT1B LTR MaLR -139 251 68 8 1746 1448 188 135 22 chr2 152267264 152267768 -29480319 + RLTR20D LTR ERVK 13 534 0 8 1746 369 310 28 14 chr2 152268809 152268953 -29479134 - RMER15 LTR ERVL -86 489 344 8 1746 444 314 76 40 chr2 152271518 152271767 -29476320 + MLT1A1 LTR MaLR 151 408 0 8 1746 370 269 132 47 chr2 152271767 152272011 -29476076 - MLT1-int LTR MaLR -790 581 209 8 1746 2519 105 43 5 chr2 152273526 152273918 -29474169 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 8 1746 1241 97 213 0 chr2 152274371 152274629 -29473458 - RLTR10A LTR ERVK 0 411 99 8 1746 621 236 20 0 chr2 152275084 152275232 -29472855 - MTE2b LTR MaLR -4 375 225 8 1746 266 273 184 14 chr2 152294676 152294817 -29453270 - MLT1G LTR MaLR -179 412 248 9 1746 5034 208 81 58 chr2 152295549 152295724 -29452363 - RLTR18-int LTR ERVK -486 4875 4711 9 1746 1596 182 52 104 chr2 152295724 152296129 -29451958 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 9 1746 5034 208 81 58 chr2 152296129 152297219 -29450868 - RLTR18-int LTR ERVK -651 4710 3580 9 1746 239 276 107 132 chr2 152299881 152300002 -29448085 - MLT1D LTR MaLR -5 500 383 9 1746 543 210 52 53 chr2 152300009 152300152 -29447935 - MT2A LTR ERVL -468 133 1 9 1747 1543 186 257 80 chr2 152308430 152308881 -29439206 + MT2A LTR ERVL 3 533 0 9 1747 1800 151 21 0 chr2 152317300 152317585 -29430502 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 104 9 1747 5189 168 143 21 chr2 152317556 152318690 -29429397 - ORR1B1-int LTR MaLR -184 1325 54 9 1747 809 224 40 30 chr2 152322623 152322825 -29425262 + MTE2a LTR MaLR 174 377 -2 9 1747 1027 249 111 139 chr2 152322825 152322886 -29425201 + MTD LTR MaLR 6 90 -329 9 1747 2169 117 15 59 chr2 152322886 152323223 -29424864 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 5 9 1747 1027 249 111 139 chr2 152323223 152323477 -29424610 + MTD LTR MaLR 91 348 -71 9 1747 1027 249 111 139 chr2 152323610 152323718 -29424369 + MTD LTR MaLR 349 418 -1 9 1747 330 154 0 0 chr2 152325978 152326030 -29422057 - ORR1D2-int LTR MaLR -1272 98 47 1 1747 754 266 153 11 chr2 152326077 152326358 -29421729 - ORR1D2 LTR MaLR -25 345 25 1 1747 256 200 50 0 chr2 152326575 152326635 -29421452 + MLT1D LTR MaLR 380 442 -63 1 1747 2300 123 3 19 chr2 152329071 152329436 -29418651 + RLTR15 LTR ERVK 1 359 0 1 1747 1424 140 222 75 chr2 152329490 152329551 -29418536 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 343 1 1747 1424 140 222 75 chr2 152329696 152329835 -29418252 - ORR1C2 LTR MaLR -42 342 192 1 1747 1424 140 222 75 chr2 152329881 152330012 -29418075 - ORR1C2 LTR MaLR -193 191 3 1 1747 3202 60 25 0 chr2 152330603 152331004 -29417083 - RLTR10A LTR ERVK 0 411 1 1 1747 456 158 29 95 chr2 152334707 152334812 -29413275 - MT2B LTR ERVL -344 257 160 1 1747 324 292 55 47 chr2 152340017 152340268 -29407819 + MTE2a LTR MaLR 26 355 -24 1 1747 697 275 141 26 chr2 152346482 152346822 -29401265 - MTE2b LTR MaLR 0 379 1 1 1747 900 218 84 75 chr2 152346887 152347234 -29400853 + MLT1B LTR MaLR 45 408 0 1 1747 424 243 124 7 chr2 152347537 152347682 -29400405 - MTD LTR MaLR -15 404 243 1 1747 347 177 152 0 chr2 152348063 152348142 -29399945 - RMER15 LTR ERVL -149 426 336 1 1747 227 247 57 34 chr2 152348767 152348855 -29399232 - RMER15 LTR ERVL -441 134 45 1 1747 1797 193 57 3 chr2 152349603 152349956 -29398131 + ORR1D1 LTR MaLR 1 372 -2 1 1747 404 216 75 33 chr2 152350287 152350407 -29397680 + RMER5 LTR ERV1 40 164 -370 1 1747 365 259 98 40 chr2 152350434 152350607 -29397480 + RMER5 LTR ERV1 219 401 -133 1 1747 1661 238 89 22 chr2 152351425 152351920 -29396167 - MT2A LTR ERVL -5 528 1 1 1747 2607 163 78 8 chr2 152353387 152353900 -29394187 + RLTR12A LTR ERVK 11 559 -9 1 1747 1690 137 28 41 chr2 152356808 152357128 -29390959 + ORR1B2 LTR MaLR 52 367 0 1 1747 340 44 0 0 chr2 152357186 152357231 -29390856 + ORR1B2 LTR MaLR 323 367 0 1 1747 1684 162 55 41 chr2 152358157 152358524 -29389563 + ORR1D1 LTR MaLR 1 372 -2 1 1747 1000 218 149 8 chr2 152358636 152358966 -29389121 + ORR1D1-int LTR MaLR 506 885 -485 1 1747 2878 130 18 7 chr2 152358966 152359422 -29388665 - RMER6B LTR ERVK 0 461 1 1 1747 1254 91 11 0 chr2 152359423 152359598 -29388489 - MYSERV6-int LTR ERVK -1191 7768 7592 1 1747 2018 183 58 26 chr2 152359598 152360131 -29387956 + RLTR31_Mm LTR ERVK 1 550 -11 1 1747 2733 156 23 8 chr2 152360133 152360605 -29387482 - MYSERV6-int LTR ERVK -1368 7591 7113 1 1747 8790 136 60 63 chr2 152360663 152361150 -29386937 - MYSERV6-int LTR ERVK -2127 6832 6331 1 1747 8790 136 60 63 chr2 152361208 152362325 -29385762 - MYSERV6-int LTR ERVK -2127 6330 5176 1 1747 848 146 64 0 chr2 152362329 152362500 -29385587 + ORR1D1-int LTR MaLR 1189 1370 0 1 1747 1871 169 21 54 chr2 152362500 152362887 -29385200 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 1 1747 1998 106 23 88 chr2 152362986 152363338 -29384749 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 1 1747 307 185 15 0 chr2 152368197 152368262 -29379825 - RLTR15 LTR ERVK -293 66 1 1 1747 561 227 147 13 chr2 152382000 152382156 -29365931 + MTEb LTR MaLR 12 188 -191 1 1747 643 226 113 26 chr2 152382417 152382612 -29365475 + MTEb LTR MaLR 161 372 -7 1 1747 289 221 13 13 chr2 152384465 152384543 -29363544 - MTEa LTR MaLR -29 350 273 1 1747 536 278 22 95 chr2 152384671 152384902 -29363185 - MTEa LTR MaLR -162 217 4 1 1747 485 329 22 18 chr2 152384951 152385216 -29362871 + MLT1F LTR MaLR 299 645 -8 1 1747 1368 199 108 26 chr2 152386965 152387306 -29360781 - ORR1D2 LTR MaLR -1 369 1 1 1747 1078 224 109 72 chr2 152387433 152387780 -29360307 + ORR1D2 LTR MaLR 11 370 0 1 1747 293 250 35 123 chr2 152392106 152392220 -29355867 - MT2B LTR ERVL -336 265 162 1 1747 1880 177 40 6 chr2 152394302 152394654 -29353433 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 11 1 1747 256 227 29 29 chr2 152407199 152407267 -29340820 + MLT1A1 LTR MaLR 319 386 -22 1 1747 337 322 89 38 chr2 152407502 152407521 -29340566 - MLT1J LTR MaLR -262 250 232 1 1747 337 322 89 38 chr2 152407570 152407763 -29340324 - MLT1J LTR MaLR -281 231 28 1 1747 3918 162 115 48 chr2 152407867 152408432 -29339655 - RMER19B LTR ERVK -11 891 244 1 1747 3918 162 115 48 chr2 152408456 152408725 -29339362 - RMER19B LTR ERVK -659 243 3 1 1747 846 300 47 32 chr2 152411100 152411379 -29336708 - MT2A LTR ERVL -188 345 63 1 1747 260 301 73 55 chr2 152411317 152411426 -29336661 - MTD LTR MaLR -256 163 53 1 1747 396 264 49 124 chr2 152412001 152412226 -29335861 - RLTR31_Mm LTR ERVK 0 561 354 1 1747 2089 139 16 27 chr2 152412538 152412906 -29335181 - RLTR31_Mm LTR ERVK -195 366 1 1 1747 1284 163 78 39 chr2 152414031 152414286 -29333801 - RLTR24 LTR ERV1 0 529 265 1 1747 265 355 96 8 chr2 152414331 152414456 -29333631 + MLT1I LTR MaLR 203 338 -73 1 1747 499 321 8 0 chr2 152414619 152414750 -29333337 + MTEb-int LTR MaLR 1443 1574 -6 1 1747 504 261 154 59 chr2 152414756 152415009 -29333078 + MTEb LTR MaLR 1 277 -102 1 1747 537 266 71 154 chr2 152417040 152417391 -29330696 + RMER20B LTR ERVK 236 557 -70 1 1747 500 315 63 0 chr2 152424654 152424781 -29323306 + MTD LTR MaLR 42 176 -243 1 1747 837 203 141 5 chr2 152424879 152425078 -29323009 + MTD LTR MaLR 180 419 0 1 1747 470 267 199 75 chr2 152427212 152427479 -29320608 - MTEb LTR MaLR -23 356 57 1 1747 324 311 66 89 chr2 152428414 152428672 -29319415 + MLT2E LTR ERVL 135 386 -242 1 1747 2370 89 209 11 chr2 152428889 152429253 -29318834 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 1 1747 253 327 91 24 chr2 152429462 152429672 -29318415 - LTR33A LTR ERVL 0 520 297 1 1747 389 307 58 29 chr2 152433408 152433613 -29314474 - LTR65 LTR ERV1 -294 375 165 1 1747 506 248 146 33 chr2 152434115 152434328 -29313759 - RMER15 LTR ERVL -3 572 336 1 1748 907 182 42 41 chr2 152439362 152439534 -29308553 - ORR1B1 LTR MaLR -230 164 1 1 1748 386 256 0 0 chr2 152442946 152443024 -29305063 - MTC LTR MaLR -340 81 4 1 1748 836 173 40 23 chr2 152443027 152443204 -29304883 - MTC-int LTR MaLR 0 1258 1079 1 1748 306 215 122 51 chr2 152444205 152444303 -29303784 - MTC-int LTR MaLR -179 1079 975 1 1748 3887 198 126 17 chr2 152444514 152445396 -29302691 - MTC-int LTR MaLR -279 979 2 1 1748 2198 171 67 5 chr2 152445497 152445886 -29302201 - MTC LTR MaLR -8 413 1 1 1748 321 238 67 38 chr2 152446164 152446269 -29301818 - MTD LTR MaLR -295 124 17 1 1748 1155 237 70 25 chr2 152449116 152449475 -29298612 + MTEa LTR MaLR 1 375 -4 1 1748 1448 218 25 21 chr2 152464314 152464666 -29283421 - RMER20A LTR ERVK -37 479 64 1 1748 493 240 25 8 chr2 152466837 152466946 -29281141 + MTD LTR MaLR 8 119 -300 1 1748 493 240 25 8 chr2 152466996 152467008 -29281079 + MTD LTR MaLR 120 131 -288 1 1748 328 361 69 24 chr2 152468028 152468275 -29279812 - MLT1L LTR MaLR -163 447 190 1 1748 357 339 43 0 chr2 152469746 152469861 -29278226 - MLT1D LTR MaLR -2 503 384 1 1748 2331 77 9 64 chr2 152471215 152471561 -29276526 + ORR1A4 LTR MaLR 1 327 -2 1 1748 592 319 100 48 chr2 152471680 152471990 -29276097 + ORR1E LTR MaLR 12 337 -22 1 1748 1545 209 98 3 chr2 152472348 152472684 -29275403 + ORR1D2 LTR MaLR 3 370 0 1 1748 251 288 61 0 chr2 152474041 152474107 -29273980 - MLT1J LTR MaLR -332 180 111 1 1748 1184 246 241 18 chr2 152481809 152482244 -29265843 - MT2A LTR ERVL 0 533 2 1 1748 315 248 108 47 chr2 152484866 152485014 -29263073 - LTR85a LTR Gypsy? -481 221 65 1 1748 1220 269 69 23 chr2 152486937 152487287 -29260800 + MTEb LTR MaLR 6 371 -8 1 1748 395 200 72 68 chr2 152491589 152491724 -29256363 - RLTR13D3 LTR ERVK -42 1072 839 1 1748 261 247 158 51 chr2 152491917 152491939 -29256148 - RLTR13D3 LTR ERVK -195 838 817 1 1748 235 184 0 0 chr2 152492674 152492712 -29255375 - RLTR13D3 LTR ERVK -1076 38 1 1 1748 318 379 43 0 chr2 152493080 152493220 -29254867 + LTR41 LTR ERVL 9 154 -614 1 1748 497 321 100 62 chr2 152516347 152516686 -29231401 - MLT1L LTR MaLR -53 557 206 3 1748 1614 135 179 12 chr2 152527409 152527738 -29220349 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 5 1748 237 275 33 99 chr2 152528238 152528359 -29219728 + MT2B LTR ERVL 143 255 -346 5 1748 2113 163 34 36 chr2 152536793 152537207 -29210880 - MTC LTR MaLR -8 413 1 7 1748 2296 152 48 3 chr2 152539139 152539516 -29208571 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 8 1748 542 264 184 27 chr2 152556069 152556394 -29191693 + MTEa LTR MaLR 4 379 0 1 1749 292 265 119 30 chr2 152569617 152569718 -29178369 - MT2B LTR ERVL -337 264 155 1 1749 242 309 36 24 chr2 152570544 152570627 -29177460 + ORR1E LTR MaLR 2 85 -274 1 1749 2727 171 53 22 chr2 152573415 152573966 -29174121 - RLTR12A LTR ERVK 0 568 1 1 1749 261 240 24 107 chr2 152576233 152576317 -29171770 - MT2B LTR ERVL -367 234 158 2 1749 252 272 70 129 chr2 152585503 152585689 -29162398 - MT2B2 LTR ERVL -321 263 89 2 1749 261 273 42 83 chr2 152587248 152587344 -29160743 - MLT1J LTR MaLR -329 183 92 2 1749 2000 145 77 3 chr2 152587571 152587923 -29160164 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 2 1749 232 315 100 27 chr2 152594868 152595018 -29153069 - MLT1B LTR MaLR 0 365 205 2 1749 302 268 35 11 chr2 152595643 152595730 -29152357 - MLT1B LTR MaLR -300 90 2 2 1749 2797 29 3 3 chr2 152598296 152598646 -29149441 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 47 2 1749 1416 172 93 27 chr2 152600902 152601215 -29146872 + ORR1C2 LTR MaLR 1 333 -61 2 1749 983 234 91 130 chr2 152601386 152601480 -29146607 + ORR1C2 LTR MaLR 334 392 -2 2 1749 3371 117 136 5 chr2 152609337 152609956 -29138131 - RMER6A LTR ERVK 0 756 57 3 1749 328 220 40 45 chr2 152612118 152612305 -29135782 + RMER17D2 LTR ERVK 255 441 -368 3 1749 328 220 40 45 chr2 152612447 152612459 -29135628 + RMER17D2 LTR ERVK 442 453 -356 3 1749 256 311 55 85 chr2 152629053 152629218 -29118869 + MER34A LTR ERV1 412 571 0 3 1749 239 301 26 88 chr2 152632950 152633063 -29115024 + RMER12 LTR ERVK 746 851 -471 3 1749 274 313 116 5 chr2 152633135 152633334 -29114753 + RMER10A LTR ERVL 121 341 -101 3 1749 554 269 28 47 chr2 152634499 152634710 -29113377 - RLTR15 LTR ERVK -34 325 119 3 1749 537 195 26 45 chr2 152634734 152634890 -29113197 - RLTR15 LTR ERVK -206 153 1 3 1749 236 264 113 43 chr2 152635810 152635925 -29112162 - RLTR25B LTR ERVK -529 499 377 3 1749 326 247 9 134 chr2 152638315 152638427 -29109660 + MT2B LTR ERVL 166 263 -338 3 1749 338 265 75 108 chr2 152640502 152640688 -29107399 + MT2B2 LTR ERVL 90 269 -315 3 1749 288 295 0 25 chr2 152644516 152644596 -29103491 + MLT1A1 LTR MaLR 26 103 -305 4 1749 230 301 77 49 chr2 152644808 152644951 -29103136 + MER70B LTR ERVL 337 483 -95 4 1749 252 240 133 44 chr2 152649470 152649605 -29098482 + MER34 LTR ERV1 396 542 0 4 1749 2927 38 6 0 chr2 152660269 152660613 -29087474 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 4 1749 284 265 104 83 chr2 152663919 152663981 -29084106 - MT2B LTR ERVL -443 158 94 4 1749 847 199 118 84 chr2 152665133 152665430 -29082657 - RMER10A LTR ERVL -135 307 1 4 1749 2416 58 58 50 chr2 152666924 152667267 -29080820 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 4 1749 5346 40 29 10 chr2 152667267 152667995 -29080092 - ORR1A1-int LTR MaLR 0 1792 1051 4 1749 2554 41 26 0 chr2 152667997 152668341 -29079746 + ORR1A1-int LTR MaLR 18 370 -1422 4 1749 1108 193 77 74 chr2 152668524 152668809 -29079278 - ORR1C1 LTR MaLR -77 301 16 4 1749 2602 118 31 71 chr2 152669032 152669242 -29078845 - RMER6B LTR ERVK -4 457 241 4 1749 2602 118 31 71 chr2 152669432 152669583 -29078504 - RMER6B LTR ERVK -221 240 115 4 1749 2602 118 31 71 chr2 152669774 152669887 -29078200 - RMER6B LTR ERVK -347 114 1 4 1749 990 148 76 3 chr2 152670346 152670565 -29077522 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 147 4 1749 284 319 26 34 chr2 152671219 152671336 -29076751 + RMER10B LTR ERVL 283 398 0 4 1749 2962 161 182 85 chr2 152671546 152672368 -29075719 + RMER19B LTR ERVK 1 902 0 5 1749 607 195 204 42 chr2 152676780 152677150 -29070937 - MT2A LTR ERVL -89 495 1 5 1749 1054 126 67 184 chr2 152677150 152677344 -29070743 - MERVL_2A-int LTR ERVL 0 5761 5598 5 1749 1054 126 67 184 chr2 152677491 152677579 -29070508 - MERVL_2A-int LTR ERVL -164 5597 5512 5 1749 502 191 57 0 chr2 152677725 152677830 -29070257 - MERVL_2A-int LTR ERVL -252 5509 5399 5 1749 5000 145 30 17 chr2 152678016 152678823 -29069264 - MERVL_2A-int LTR ERVL -354 5407 4591 5 1749 1302 133 16 0 chr2 152678828 152679016 -29069071 + MERVL_2A-int LTR ERVL 4169 4359 -1402 5 1749 6430 172 103 12 chr2 152679014 152679562 -29068525 - MERVL_2A-int LTR ERVL -1883 3878 3277 5 1749 6430 172 103 12 chr2 152679748 152680437 -29067650 - MERVL_2A-int LTR ERVL -2485 3276 2528 5 1749 295 239 54 11 chr2 152685013 152685106 -29062981 + RMER10B LTR ERVL 300 396 -2 5 1750 1843 236 8 172 chr2 152703370 152703690 -29044397 - RLTR22_Mus LTR ERVK -201 1647 1339 6 1750 1843 251 148 108 chr2 152703865 152704426 -29043661 - RLTR22_Mus LTR ERVK -470 1338 738 6 1750 1843 251 148 108 chr2 152704746 152705418 -29042669 - RLTR22_Mus LTR ERVK -1071 737 2 6 1750 273 160 138 0 chr2 152715791 152715867 -29032220 - MTE2a LTR MaLR 0 379 294 6 1750 302 312 78 23 chr2 152720108 152720236 -29027851 - ORR1E LTR MaLR -210 149 15 6 1750 1213 243 61 41 chr2 152720554 152720800 -29027287 + RMER20A LTR ERVK 1 256 -260 6 1750 2418 39 109 0 chr2 152720800 152721112 -29026975 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 6 1750 1213 243 61 41 chr2 152721112 152721256 -29026831 + RMER20A LTR ERVK 257 399 -117 6 1750 2259 162 72 62 chr2 152721763 152722315 -29025772 - RLTR20B2 LTR ERVK -2 558 1 6 1750 229 326 63 32 chr2 152722957 152723052 -29025035 - LTR85a LTR Gypsy? -547 155 58 6 1750 296 287 63 27 chr2 152723031 152723075 -29025012 + MT2B LTR ERVL 120 167 -434 6 1750 238 291 16 145 chr2 152724798 152724878 -29023209 - MT2B2 LTR ERVL -429 155 101 6 1750 2094 169 40 3 chr2 152734244 152734618 -29013469 - MTD LTR MaLR -14 405 18 6 1750 225 310 74 11 chr2 152745269 152745458 -29002629 + RMER17A LTR ERVK 188 388 -363 6 1750 251 294 60 130 chr2 152750904 152750971 -28997116 - MT2B2 LTR ERVL -302 281 112 7 1750 238 261 0 74 chr2 152763376 152763471 -28984616 + LTR45 LTR ERV1 136 223 -302 7 1750 293 302 23 85 chr2 152772375 152772404 -28975683 + MT2B2 LTR ERVL 134 154 -430 7 1750 291 289 0 26 chr2 152782923 152783001 -28965086 + MLT1D LTR MaLR 1 76 -551 7 1750 549 282 87 24 chr2 152783478 152783685 -28964402 + MLT1D LTR MaLR 280 499 -6 7 1750 529 316 83 0 chr2 152785613 152785781 -28962306 + MTE2b LTR MaLR 3 184 -195 7 1750 1724 139 10 173 chr2 152789473 152789953 -28958134 + RMER17C LTR ERVK 1 402 -8 7 1750 1471 162 302 18 chr2 152790367 152790701 -28957386 - RLTR23 LTR ERV1 -1 429 1 7 1750 2071 125 26 0 chr2 152790851 152791164 -28956923 + ORR1A2 LTR MaLR 1 321 -8 7 1750 11934 99 12 126 chr2 152791169 152791828 -28956259 + ORR1A2-int LTR MaLR 2 618 -1345 7 1750 11934 99 12 126 chr2 152792002 152793557 -28954530 + ORR1A2-int LTR MaLR 619 1963 0 7 1750 2197 107 16 0 chr2 152793561 152793871 -28954216 + ORR1A2 LTR MaLR 5 319 -8 7 1750 324 317 40 40 chr2 152794967 152795092 -28952995 - RMER10B LTR ERVL -2 396 272 8 1750 283 307 80 0 chr2 152795511 152795599 -28952488 - MLT1D LTR MaLR -12 493 399 8 1750 5352 161 94 82 chr2 152795608 152795993 -28952094 + RMER12 LTR ERVK 1 388 -934 8 1750 5352 161 94 82 chr2 152796180 152796207 -28951880 + RMER12 LTR ERVK 389 389 -933 8 1750 5352 161 94 82 chr2 152796400 152796606 -28951481 + RMER12 LTR ERVK 389 637 -685 8 1750 5352 161 94 82 chr2 152796754 152796833 -28951254 + RMER12 LTR ERVK 638 715 -607 8 1750 5352 161 94 82 chr2 152796973 152797474 -28950613 + RMER12 LTR ERVK 716 1215 -107 8 1750 471 280 48 0 chr2 152797680 152797805 -28950282 + MLT1E1A LTR MaLR 543 673 -7 8 1750 2343 130 8 11 chr2 152798399 152798765 -28949322 + RLTR14 LTR ERV1 18 382 0 8 1750 373 295 12 108 chr2 152799006 152799021 -28949066 - MT2B2 LTR ERVL -273 311 223 8 1750 1027 260 80 45 chr2 152802297 152802611 -28945476 + MTE2b LTR MaLR 1 325 -54 8 1750 291 143 35 18 chr2 152802679 152802736 -28945351 + MTE2b LTR MaLR 315 372 -7 8 1750 2300 94 25 6 chr2 152806314 152806634 -28941453 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 2 8 1750 295 226 43 106 chr2 152808092 152808186 -28939901 + MT2B LTR ERVL 154 241 -360 8 1750 250 338 0 0 chr2 152810143 152810211 -28937876 + MLT2C2 LTR ERVL 202 269 -195 8 1750 2509 257 33 12 chr2 152813092 152813698 -28934389 + MTEa-int LTR MaLR 808 1426 -154 8 1750 425 272 65 13 chr2 152814006 152814159 -28933928 + MTEa-int LTR MaLR 1410 1570 -10 8 1750 727 279 87 48 chr2 152814179 152814466 -28933621 + MTEa LTR MaLR 17 305 -74 8 1750 2402 131 99 5 chr2 152824379 152824764 -28923323 - MTC LTR MaLR 0 421 1 8 1750 258 260 80 71 chr2 152826472 152826584 -28921503 - RMER15 LTR ERVL -78 497 385 8 1750 480 150 45 107 chr2 152826771 152826883 -28921204 - MT2B LTR ERVL -337 264 160 8 1750 352 308 107 28 chr2 152827701 152827878 -28920209 - RMER15-int LTR ERVL -2441 2558 2368 8 1751 3346 125 82 16 chr2 152838390 152838937 -28909150 + RMER4B LTR ERVK 1 583 -2 9 1751 1107 267 77 68 chr2 152843883 152844043 -28904044 + RMER5 LTR ERV1 1 164 -370 9 1751 1107 267 77 68 chr2 152844079 152844302 -28903785 + RMER5 LTR ERV1 165 406 -128 9 1751 1107 267 77 68 chr2 152844427 152844560 -28903527 + RMER5 LTR ERV1 407 522 -12 9 1751 1892 184 19 16 chr2 152847065 152847364 -28900723 + ORR1C2 LTR MaLR 19 319 -65 9 1751 1892 184 19 16 chr2 152847397 152847462 -28900625 + ORR1C2 LTR MaLR 320 384 0 9 1751 2785 128 36 15 chr2 152864951 152865363 -28882724 + MTC LTR MaLR 1 421 0 9 1751 280 333 42 116 chr2 152886994 152887306 -28860781 - MTEb LTR MaLR -42 337 49 1 1751 348 277 208 0 chr2 152888045 152888175 -28859912 - MLT1B LTR MaLR 0 390 234 1 1751 256 293 279 0 chr2 152889191 152889331 -28858756 + MLT1L LTR MaLR 426 604 -6 1 1751 1467 199 320 7 chr2 152895894 152896300 -28851787 - MT2A LTR ERVL 0 533 1 1 1751 2523 58 3 0 chr2 152904645 152904958 -28843129 - ORR1A2 LTR MaLR -13 314 1 1 1751 583 291 454 11 chr2 152913334 152913706 -28834381 + MLT1F1 LTR MaLR 32 569 0 1 1751 698 254 221 0 chr2 152916833 152917077 -28831010 - MTEb LTR MaLR -78 301 4 1 1751 361 283 115 53 chr2 152927348 152927674 -28820413 - MLT1F1 LTR MaLR -2 567 156 1 1751 259 302 100 50 chr2 152932372 152932655 -28815432 + LTR16C LTR ERVL 148 449 -89 1 1751 323 203 0 0 chr2 152938349 152938408 -28809679 - MTEa LTR MaLR -69 310 252 1 1751 456 342 60 10 chr2 152938993 152939194 -28808893 - LTR16C LTR ERVL -275 214 4 1 1751 281 312 139 26 chr2 152942079 152942194 -28805893 - MLT1K LTR MaLR -10 585 458 1 1751 259 359 97 51 chr2 152942323 152942391 -28805696 - MLT1K LTR MaLR -411 184 112 1 1751 259 359 97 51 chr2 152942579 152942686 -28805401 - MLT1K LTR MaLR -484 111 1 1 1751 1822 243 61 17 chr2 152947036 152947496 -28800591 - RMER5 LTR ERV1 -46 488 9 1 1751 1435 232 50 29 chr2 152950621 152950963 -28797124 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 22 1 1751 1493 202 69 81 chr2 152954172 152954583 -28793504 - MTD LTR MaLR -22 397 2 1 1751 475 330 32 64 chr2 152958833 152959053 -28789034 - MLT1D LTR MaLR -26 479 267 1 1752 334 292 90 23 chr2 152962810 152962943 -28785144 + MLT1H2 LTR MaLR 165 306 -183 1 1752 746 265 227 34 chr2 152964864 152965185 -28782902 - MLT1H2 LTR MaLR -37 452 70 1 1752 879 225 79 14 chr2 152970360 152970576 -28777511 - MTEa LTR MaLR -149 230 1 1 1752 635 239 185 87 chr2 152977733 152978090 -28769997 - MLT1D LTR MaLR -113 392 1 1 1752 1400 298 133 15 chr2 152978640 152979158 -28768929 - MER21B LTR ERV1 -11 852 274 1 1752 366 223 74 13 chr2 152979772 152979894 -28768193 + MLT1H2 LTR MaLR 27 149 -340 1 1752 357 210 24 24 chr2 152980662 152980745 -28767342 - MLT1A1 LTR MaLR -7 401 319 1 1752 252 311 87 10 chr2 152981824 152981928 -28766159 + MLT1J LTR MaLR 70 181 -331 1 1752 269 168 112 56 chr2 152982967 152983074 -28765013 + RLTR25B LTR ERVK 397 509 -519 1 1752 282 284 15 0 chr2 152983997 152984064 -28764023 + LTR16C LTR ERVL 288 355 -134 1 1752 240 413 38 9 chr2 152985398 152985503 -28762584 - MLT1H LTR MaLR -87 402 295 1 1752 350 287 93 23 chr2 152985610 152985805 -28762282 - MLT1H LTR MaLR -346 233 29 1 1752 420 252 23 92 chr2 152986578 152986627 -28761460 + MT2B LTR ERVL 118 157 -444 1 1752 4575 8 0 0 chr2 153026708 153027201 -28720886 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 7 1752 382 281 89 68 chr2 153032463 153032654 -28715433 - MLT1K LTR MaLR -4 591 397 9 1752 1002 160 16 27 chr2 153033983 153034169 -28713918 - MTC LTR MaLR 0 421 238 9 1752 670 126 0 0 chr2 153034169 153034264 -28713823 - MTC LTR MaLR -325 96 2 9 1752 228 317 162 52 chr2 153036629 153036802 -28711285 - MLT1K LTR MaLR -123 472 281 9 1752 1204 236 96 29 chr2 153040807 153041121 -28706966 - MTE2b LTR MaLR -5 374 40 1 1752 286 247 68 0 chr2 153041121 153041194 -28706893 - MTE2b LTR MaLR -301 78 1 1 1752 551 295 36 8 chr2 153051568 153051742 -28696345 + MTD LTR MaLR 46 227 -194 1 1752 312 228 206 0 chr2 153052114 153052206 -28695881 + MTD LTR MaLR 309 419 0 1 1752 239 286 110 20 chr2 153053227 153053327 -28694760 + MLT1K LTR MaLR 468 576 -19 1 1752 236 328 8 60 chr2 153079798 153079931 -28668156 - MT2B LTR ERVL -333 268 143 1 1752 329 296 49 54 chr2 153080419 153080721 -28667366 - MTEb LTR MaLR -27 352 30 1 1752 1300 146 31 40 chr2 153089862 153090090 -28657997 - MTC LTR MaLR 0 421 196 2 1752 1149 152 4 87 chr2 153090175 153090282 -28657805 - MTC LTR MaLR -210 211 107 2 1752 1149 152 4 87 chr2 153090469 153090591 -28657496 - MTC LTR MaLR -315 106 1 2 1753 1140 263 72 63 chr2 153094828 153095242 -28652845 + MTD LTR MaLR 1 418 -1 2 1753 4093 143 85 7 chr2 153095317 153096001 -28652086 + RMER19A LTR ERVK 1 737 0 2 1753 371 169 24 61 chr2 153101630 153101712 -28646375 - MT2B LTR ERVL -337 264 186 2 1753 832 315 137 20 chr2 153101785 153102229 -28645858 - MLT1F LTR MaLR -52 496 1 2 1753 549 290 20 14 chr2 153104733 153104888 -28643199 - MLT1F1 LTR MaLR -135 434 280 2 1753 399 345 85 168 chr2 153105010 153105058 -28643029 - MLT1F1 LTR MaLR -274 286 274 2 1753 407 345 85 168 chr2 153105359 153105608 -28642479 - MLT1F1 LTR MaLR -271 277 9 2 1753 3267 26 42 0 chr2 153106482 153106862 -28641225 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 1753 634 257 216 41 chr2 153111818 153112138 -28635949 - MTEb LTR MaLR -3 376 1 3 1753 390 191 45 12 chr2 153115175 153115299 -28632788 + ORR1D2 LTR MaLR 246 378 0 3 1753 583 222 108 0 chr2 153120123 153120299 -28627788 + MT2A LTR ERVL 337 531 -2 3 1753 590 261 28 84 chr2 153152986 153153173 -28594914 + MTD LTR MaLR 18 192 -215 4 1753 512 243 8 156 chr2 153153350 153153540 -28594547 + MTD LTR MaLR 173 340 -79 4 1753 1070 227 106 52 chr2 153159664 153160013 -28588074 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 3 4 1753 236 252 93 75 chr2 153160492 153160599 -28587488 + MT2B LTR ERVL 155 263 -338 4 1753 401 254 66 98 chr2 153166197 153166380 -28581707 - MLT1F1 LTR MaLR -22 547 371 4 1753 276 315 108 0 chr2 153166388 153166499 -28581588 - MLT1F1 LTR MaLR -290 258 136 4 1753 533 288 182 41 chr2 153169085 153169426 -28578661 - MLT1E2 LTR MaLR 0 627 239 4 1753 258 149 165 63 chr2 153169453 153169532 -28578555 - MLT1E2 LTR MaLR -474 153 67 4 1753 299 278 20 40 chr2 153182449 153182550 -28565537 - MT2B LTR ERVL -354 247 149 5 1753 1252 222 135 12 chr2 153188093 153188426 -28559661 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 5 1753 2911 70 45 11 chr2 153190128 153190574 -28557513 - RLTR44C LTR ERVK -25 477 17 5 1753 457 254 31 118 chr2 153191227 153191388 -28556699 + MTE2b LTR MaLR 1 147 -232 5 1753 351 221 181 39 chr2 153191522 153191649 -28556438 + MTE2b LTR MaLR 167 311 -68 5 1753 383 313 96 69 chr2 153191807 153192080 -28556007 + MTE-int LTR MaLR 270 555 -1025 5 1753 383 313 96 69 chr2 153192230 153192333 -28555754 + MTE-int LTR MaLR 556 656 -924 5 1753 422 295 124 11 chr2 153192392 153192577 -28555510 + MTE-int LTR MaLR 801 1006 -574 5 1753 919 231 97 23 chr2 153194732 153195036 -28553051 + ORR1D1 LTR MaLR 19 367 0 5 1753 374 260 51 45 chr2 153195183 153195200 -28552887 + RMER5 LTR ERV1 179 193 -341 5 1753 374 260 51 45 chr2 153195383 153195522 -28552565 + RMER5 LTR ERV1 194 336 -198 5 1753 567 164 133 35 chr2 153196245 153196409 -28551678 - ORR1C2 LTR MaLR -14 370 140 5 1753 2034 148 139 44 chr2 153196621 153197123 -28550964 + RLTR25A LTR ERVK 554 1103 0 5 1753 234 235 73 0 chr2 153204162 153204230 -28543857 - MLT1H LTR MaLR -17 532 460 5 1753 470 289 192 37 chr2 153204434 153204815 -28543272 + MLT1E1A LTR MaLR 220 659 -21 5 1753 2826 158 41 20 chr2 153208603 153209192 -28538895 - RMER6A LTR ERVK -13 743 143 5 1753 2260 83 88 11 chr2 153212134 153212487 -28535600 + MTB LTR MaLR 16 395 -5 5 1753 474 316 58 0 chr2 153220643 153220814 -28527273 - MER68 LTR ERVL -89 474 294 6 1753 348 297 80 33 chr2 153221489 153221639 -28526448 - MER68 LTR ERVL -358 205 49 6 1754 3213 11 73 0 chr2 153247392 153247761 -28500326 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 1754 238 304 38 0 chr2 153250932 153251011 -28497076 + MLT1K LTR MaLR 464 545 -50 6 1754 367 195 91 11 chr2 153275482 153275570 -28472517 + MTC LTR MaLR 2 96 -325 6 1754 726 138 15 30 chr2 153275736 153275870 -28472217 + MTC LTR MaLR 80 211 -210 6 1754 968 186 13 65 chr2 153276021 153276251 -28471836 + MTC LTR MaLR 196 413 -8 6 1754 363 200 19 104 chr2 153277483 153277589 -28470498 - MT2B LTR ERVL -344 257 161 6 1754 425 187 48 163 chr2 153282701 153282848 -28465239 + MT2B LTR ERVL 167 296 -305 6 1754 297 330 0 52 chr2 153282756 153282871 -28465216 + RLTR25A LTR ERVK 522 630 -473 6 1754 1999 172 28 8 chr2 153287505 153287857 -28460230 + RLTR15 LTR ERVK 1 359 0 7 1754 248 325 15 120 chr2 153293557 153293592 -28454495 - MT2B LTR ERVL -347 230 136 7 1754 308 200 10 133 chr2 153297319 153297417 -28450670 - MT2B2 LTR ERVL -325 259 174 7 1754 577 211 116 0 chr2 153315223 153315370 -28432717 + RMER10B LTR ERVL 189 352 -46 7 1754 725 217 18 37 chr2 153327100 153327263 -28420824 + RMER15-int LTR ERVL 4588 4747 -252 7 1754 2332 152 124 31 chr2 153327365 153327874 -28420213 + RMER15 LTR ERVL 17 572 -3 7 1755 228 349 64 39 chr2 153362531 153362734 -28385353 + MT2B2 LTR ERVL 62 269 -315 8 1755 881 211 6 0 chr2 153384576 153384747 -28363340 - MTD LTR MaLR 0 419 248 9 1755 1015 188 136 44 chr2 153384857 153384894 -28363193 - MTD LTR MaLR -136 283 241 9 1755 1015 188 136 44 chr2 153384935 153385148 -28362939 - MTD LTR MaLR -179 240 10 9 1755 2018 193 72 5 chr2 153387948 153388339 -28359748 + MTD LTR MaLR 3 419 0 9 1755 747 330 35 67 chr2 153390582 153390994 -28357093 - MTE2b LTR MaLR -14 405 7 9 1755 287 216 55 110 chr2 153392519 153392535 -28355552 + MT2B LTR ERVL 153 162 -439 9 1755 258 200 92 37 chr2 153394773 153394882 -28353205 - RMER17D LTR ERVK -388 501 387 9 1755 245 291 0 0 chr2 153397509 153397564 -28350523 - RMER15 LTR ERVL -118 457 403 9 1755 621 279 79 5 chr2 153397831 153398033 -28350054 - MTE2a LTR MaLR -157 222 6 9 1755 248 275 0 80 chr2 153398434 153398509 -28349578 + MT2B LTR ERVL 194 262 -339 9 1755 247 222 50 100 chr2 153399507 153399627 -28348460 - RLTR25B LTR ERVK -526 502 389 9 1755 225 296 13 90 chr2 153403380 153403458 -28344629 + ORR1E LTR MaLR 1 72 -287 9 1755 2062 161 104 41 chr2 153403636 153404096 -28343991 + RMER19B LTR ERVK 1 489 -413 9 1755 754 166 16 115 chr2 153404091 153404282 -28343805 + RMER19B LTR ERVK 731 902 0 9 1755 268 282 42 0 chr2 153421306 153421377 -28326710 - MT2B2 LTR ERVL -344 240 167 1 1755 407 200 0 107 chr2 153439716 153439828 -28308259 + MT2B LTR ERVL 156 255 -346 1 1755 716 182 219 0 chr2 153440031 153440218 -28307869 + MTC LTR MaLR 194 421 0 1 1755 434 266 45 19 chr2 153441417 153441574 -28306513 + MLT2D LTR ERVL 39 199 -215 1 1755 273 192 19 0 chr2 153442252 153442304 -28305783 + MLT2B1 LTR ERVL 514 566 -1 1 1755 966 242 132 9 chr2 153446802 153447144 -28300943 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 1 1755 308 226 16 138 chr2 153448789 153448822 -28299265 + MT2B LTR ERVL 140 157 -444 1 1755 244 247 57 80 chr2 153453353 153453441 -28294646 + MT2B LTR ERVL 154 239 -362 1 1755 1050 161 38 176 chr2 153455754 153456124 -28291963 + RMER10B LTR ERVL 22 340 -58 1 1755 3495 31 0 0 chr2 153460958 153461350 -28286737 + MTA_Mm LTR MaLR 1 392 -4 1 1755 555 168 21 0 chr2 153465843 153465938 -28282149 + RLTR24 LTR ERV1 1 97 -432 1 1755 271 237 98 136 chr2 153481207 153481339 -28266748 + MT2B LTR ERVL 117 243 -358 1 1756 391 243 18 134 chr2 153485482 153485534 -28262553 - MT2B LTR ERVL -442 159 128 1 1756 227 231 36 152 chr2 153494080 153494192 -28253895 - MLT1-int LTR MaLR -53 1318 1220 1 1756 776 199 210 54 chr2 153507111 153507387 -28240700 - RMER6C LTR ERVK -64 626 308 8 1756 1589 157 158 26 chr2 153507387 153507728 -28240359 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 1 9 1756 997 145 210 62 chr2 153507729 153507865 -28240222 - RMER6C LTR ERVK -377 313 177 8 1756 997 145 210 62 chr2 153508057 153508177 -28239910 - RMER6C LTR ERVK -514 176 19 8 1756 1289 198 78 21 chr2 153514367 153514651 -28233436 - ORR1C2 LTR MaLR -76 308 9 2 1756 3457 167 188 22 chr2 153514811 153515565 -28232522 + RMER19B LTR ERVK 12 890 -12 2 1756 1763 204 66 20 chr2 153515637 153516101 -28231986 - RLTR33 LTR ERVK 0 678 18 2 1756 3519 15 8 0 chr2 153517020 153517413 -28230674 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 1756 9766 16 2 0 chr2 153517413 153518509 -28229578 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 2 1756 3589 10 5 0 chr2 153518509 153518903 -28229184 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 1756 1282 156 66 18 chr2 153519811 153520039 -28228048 - MTC LTR MaLR -1 420 182 3 1756 2212 115 12 15 chr2 153523630 153523957 -28224130 + ORR1A3 LTR MaLR 1 326 0 3 1756 4117 132 19 58 chr2 153523957 153524472 -28223615 + ORR1A3-int LTR MaLR 1 495 -1468 3 1756 4117 132 19 58 chr2 153524617 153524726 -28223361 + ORR1A3-int LTR MaLR 496 594 -1369 3 1756 4117 132 19 58 chr2 153524783 153524878 -28223209 + ORR1A3-int LTR MaLR 595 693 -1270 3 1756 3734 99 88 26 chr2 153524882 153525375 -28222712 + ORR1A3-int LTR MaLR 1345 1884 -79 3 1756 3734 99 88 26 chr2 153525560 153525647 -28222440 + ORR1A3-int LTR MaLR 1885 1961 -2 3 1756 2135 103 17 0 chr2 153525647 153525934 -28222153 + ORR1A3 LTR MaLR 36 327 0 3 1756 1778 166 87 9 chr2 153527008 153527343 -28220744 + ORR1D1 LTR MaLR 1 361 -13 4 1756 2267 59 45 13 chr2 153535003 153535314 -28212773 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 26 7 1756 619 37 12 0 chr2 153535288 153535370 -28212717 - ORR1A1-int LTR MaLR -311 1481 1399 7 1756 695 48 0 0 chr2 153535351 153535434 -28212653 - ORR1A1-int LTR MaLR -993 799 717 7 1756 498 239 114 50 chr2 153538318 153538538 -28209549 - RLTR42-int LTR ERVK -4122 1400 1167 8 1756 311 255 25 131 chr2 153543337 153543459 -28204628 + MT2B LTR ERVL 169 277 -324 8 1756 2497 117 16 21 chr2 153547166 153547550 -28200537 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 3 9 1756 5409 216 74 36 chr2 153547551 153547906 -28200181 - ORR1C2-int LTR MaLR 0 1370 1021 9 1756 5409 216 74 36 chr2 153548104 153549067 -28199020 - ORR1C2-int LTR MaLR -350 1020 1 9 1756 228 179 0 0 chr2 153549067 153549106 -28198981 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 346 9 1756 1593 214 54 11 chr2 153553087 153553441 -28194646 - ORR1D2 LTR MaLR -1 369 1 1 1756 1152 208 175 29 chr2 153556819 153557161 -28190926 - MTD LTR MaLR -33 386 1 1 1756 2016 77 115 0 chr2 153557770 153558056 -28190031 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 1 1756 5248 99 32 13 chr2 153558056 153559198 -28188889 - ORR1A2-int LTR MaLR 0 1963 1 1 1756 1938 94 115 0 chr2 153559202 153559488 -28188599 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 1 1756 701 257 35 171 chr2 153562666 153562976 -28185111 - MTEb LTR MaLR -106 273 6 1 1756 2163 166 58 32 chr2 153565359 153565551 -28182536 + MTC LTR MaLR 1 187 -234 1 1756 3172 68 2 0 chr2 153565551 153565946 -28182141 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1756 2163 166 58 32 chr2 153565946 153566163 -28181924 + MTC LTR MaLR 188 421 0 1 1756 1347 90 8 16 chr2 153570023 153570271 -28177816 + MTB LTR MaLR 1 400 0 1 1756 440 186 16 117 chr2 153577362 153577490 -28170597 - MT2B LTR ERVL -337 264 150 1 1756 329 229 27 27 chr2 153577367 153577515 -28170572 - ORR1B1-int LTR MaLR -755 754 607 1 1756 276 265 36 0 chr2 153578659 153578683 -28169404 - MT2B LTR ERVL -339 262 177 1 1756 1797 111 118 0 chr2 153579422 153579702 -28168385 - ORR1A2 LTR MaLR -14 313 1 1 1756 360 320 24 89 chr2 153590471 153590519 -28157568 - MT2B LTR ERVL -443 158 122 2 1756 2172 116 22 0 chr2 153601957 153602276 -28145811 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 2 1756 3096 14 0 87 chr2 153603635 153604037 -28144050 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 2 1756 744 328 83 68 chr2 153609792 153610295 -28137792 - MLT1E1A LTR MaLR -7 673 43 2 1756 237 297 0 13 chr2 153616193 153616268 -28131819 - MER34A1 LTR ERV1 -505 82 9 2 1757 2546 112 34 81 chr2 153621878 153622346 -28125741 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 1 2 1757 3812 41 61 4 chr2 153624689 153625180 -28122907 - MURVY-LTR LTR ERV1 0 519 1 2 1757 1719 178 109 13 chr2 153629692 153630068 -28118019 - MTD LTR MaLR -7 412 1 2 1757 1120 293 108 24 chr2 153639391 153639845 -28108242 - RMER5 LTR ERV1 0 534 43 3 1757 821 299 103 16 chr2 153642403 153642723 -28105364 - MLT1A0 LTR MaLR -14 351 4 3 1757 780 273 92 0 chr2 153642938 153643165 -28104922 - MLT-int LTR MaLR -91 1644 1397 3 1757 942 265 47 35 chr2 153644334 153644586 -28103501 - MLT-int LTR MaLR -1283 452 198 3 1757 384 286 34 18 chr2 153644877 153645014 -28103073 - MLT1A0-int LTR MaLR -1258 151 10 3 1757 345 232 105 94 chr2 153645331 153645502 -28102585 - MLT1A0 LTR MaLR -189 176 4 3 1757 1061 256 62 69 chr2 153646752 153647172 -28100915 - RLTR12B LTR ERVK -65 463 47 3 1757 507 286 86 37 chr2 153647370 153647688 -28100399 - MTEa LTR MaLR -7 372 18 3 1757 278 167 0 0 chr2 153649927 153649975 -28098112 + MTD LTR MaLR 365 412 -7 3 1757 236 114 0 0 chr2 153651753 153651788 -28096299 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 352 3 1757 1687 121 35 84 chr2 153652824 153653168 -28094919 - ORR1B1 LTR MaLR -27 367 41 3 1757 567 196 16 111 chr2 153654166 153654355 -28093732 - RLTR19-int LTR ERVK -2434 3703 3533 3 1757 503 194 47 128 chr2 153655380 153655528 -28092559 - MTD LTR MaLR -1 418 283 3 1757 312 262 51 86 chr2 153656010 153656127 -28091960 - MT2B LTR ERVL -337 264 152 3 1757 1821 151 31 52 chr2 153665744 153666163 -28081924 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 3 1757 1701 129 74 49 chr2 153667111 153667502 -28080585 - RMER17C LTR ERVK 0 410 10 3 1757 695 311 132 48 chr2 153672333 153672728 -28075359 - MT2A LTR ERVL -105 428 1 3 1757 1003 271 94 31 chr2 153672730 153672848 -28075239 - MTE-int LTR MaLR -3 1577 1458 3 1757 1003 271 94 31 chr2 153673031 153673304 -28074783 - MTE-int LTR MaLR -123 1457 1163 3 1757 1127 197 109 93 chr2 153673312 153673687 -28074400 - MERVL_2A-int LTR ERVL -158 5603 5223 3 1757 351 292 131 7 chr2 153673704 153673849 -28074238 - MERVL_2A-int LTR ERVL -679 5078 4916 3 1757 632 245 0 7 chr2 153673836 153673976 -28074111 - MERVL_2A-int LTR ERVL -1320 4347 4209 3 1757 1021 277 98 50 chr2 153673983 153674549 -28073538 + MERVL_2A-int LTR ERVL 315 913 -4801 3 1757 800 322 69 78 chr2 153674618 153674913 -28073174 - MT2A LTR ERVL -76 457 172 3 1757 1651 167 64 38 chr2 153674913 153675286 -28072801 + ORR1C2 LTR MaLR 2 384 0 3 1757 800 322 69 78 chr2 153675286 153675451 -28072636 - MT2A LTR ERVL -362 171 1 3 1757 416 306 51 51 chr2 153688230 153688504 -28059583 + ORR1E LTR MaLR 3 274 -96 4 1757 2054 313 107 42 chr2 153688641 153689630 -28058457 + MTE-int LTR MaLR 1 1054 -526 4 1757 2068 92 9 69 chr2 153696921 153697271 -28050816 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 4 1757 342 288 201 35 chr2 153697834 153698003 -28050084 + MLT1D LTR MaLR 234 430 -75 4 1757 457 288 102 114 chr2 153722056 153722417 -28025670 - ORR1E LTR MaLR 0 359 3 4 1757 575 305 98 34 chr2 153735624 153735999 -28012088 - MLT1K LTR MaLR -7 588 143 4 1758 261 264 156 28 chr2 153759270 153759379 -27988708 - MTEa LTR MaLR -152 227 105 4 1758 372 252 67 10 chr2 153759534 153759638 -27988449 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 299 4 1758 859 101 160 13 chr2 153790755 153790905 -27957182 - ORR1A4 LTR MaLR -37 292 121 5 1758 547 248 1 7 chr2 153792213 153792325 -27955762 + MTE-int LTR MaLR 876 972 -608 5 1758 1178 264 41 19 chr2 153792327 153792647 -27955440 - RLTR18B LTR ERVK 0 512 186 5 1758 881 275 41 76 chr2 153792685 153793000 -27955087 - RLTR18 LTR ERVK -298 318 15 5 1758 1200 284 157 0 chr2 153792994 153793332 -27954755 + MTE-int LTR MaLR 961 1351 -229 5 1758 267 182 119 83 chr2 153795158 153795242 -27952845 - MT2B2 LTR ERVL -343 241 155 5 1758 1146 229 36 130 chr2 153795446 153795862 -27952225 + MTE2a LTR MaLR 3 379 0 5 1758 488 310 92 0 chr2 153798483 153798667 -27949420 - MLT1B LTR MaLR -4 386 186 5 1758 2336 147 27 0 chr2 153799558 153799926 -27948161 + RLTR14 LTR ERV1 3 380 -2 5 1758 1094 270 50 45 chr2 153803468 153803920 -27944167 - RLTR16 LTR ERVK -33 495 1 5 1758 784 276 58 136 chr2 153804019 153804379 -27943708 + MTE2a LTR MaLR 3 334 -45 5 1758 1162 265 124 14 chr2 153806250 153806614 -27941473 - MTD LTR MaLR -15 404 1 5 1758 460 286 83 79 chr2 153807686 153807963 -27940124 - MLT1G3 LTR MaLR -302 293 16 5 1758 318 317 90 25 chr2 153812995 153813302 -27934785 + ORR1D2 LTR MaLR 1 373 -6 5 1758 915 269 130 7 chr2 153819583 153819875 -27928212 - MTEa LTR MaLR 0 379 52 5 1758 707 284 161 27 chr2 153820942 153821203 -27926884 - MTE2a LTR MaLR -74 305 10 5 1758 3133 214 52 87 chr2 153824630 153825485 -27922602 - RMER13A LTR ERVK -35 825 1 6 1758 299 357 82 27 chr2 153826564 153826711 -27921376 + MLT1K LTR MaLR 171 325 -270 6 1758 1371 327 57 62 chr2 153827489 153828099 -27919988 - RLTR18 LTR ERVK -3 613 7 6 1758 1438 241 31 14 chr2 153840745 153841098 -27906989 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 16 6 1758 252 363 0 0 chr2 153842894 153842985 -27905102 + MTEa LTR MaLR 3 93 -266 6 1758 414 270 12 92 chr2 153843041 153843204 -27904883 + MTEa LTR MaLR 230 379 0 6 1758 1276 299 39 26 chr2 153843204 153843698 -27904389 + MTEa-int LTR MaLR 1 500 -1080 6 1758 300 324 86 0 chr2 153843707 153843812 -27904275 + MTEa-int LTR MaLR 979 1092 -488 6 1758 970 288 29 17 chr2 153843822 153844158 -27903929 - ORR1E LTR MaLR -10 369 6 6 1758 734 270 137 100 chr2 153844335 153844854 -27903233 - RMER4B LTR ERVK -15 570 33 6 1758 710 277 32 43 chr2 153856257 153856604 -27891483 + RLTR15 LTR ERVK 1 343 -16 6 1758 2180 123 28 9 chr2 153866881 153867202 -27880885 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 6 1758 238 259 40 88 chr2 153869623 153869771 -27878316 + RLTR43B LTR ERVK 235 375 0 6 1758 368 321 28 32 chr2 153869905 153870156 -27877931 + SRV_MM-int LTR ERVK 180 429 -7788 6 1758 4852 331 58 50 chr2 153870895 153875115 -27872972 + SRV_MM-int LTR ERVK 943 5195 -972 6 1758 338 284 14 31 chr2 153875737 153875875 -27872212 + RLTR14-int LTR ERV1 4894 5010 -307 6 1759 1394 226 39 14 chr2 153884644 153885003 -27863084 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 7 6 1759 2290 184 33 13 chr2 153886062 153886493 -27861594 - RMER4A LTR ERVK 0 466 32 6 1759 2290 184 33 13 chr2 153886527 153886552 -27861535 - RMER4A LTR ERVK -435 31 1 6 1759 2387 83 3 60 chr2 153888086 153888433 -27859654 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 6 1759 1031 207 19 101 chr2 153893607 153893914 -27854173 - MurERV4_19-int LTR ERVK -312 5468 5187 6 1759 2610 143 32 13 chr2 153893928 153894394 -27853693 - MurERV4_19-int LTR ERVK -555 5225 4751 6 1759 367 134 0 15 chr2 153894678 153894746 -27853341 - MurERV4_19-int LTR ERVK -1008 4772 4706 6 1759 472 141 13 0 chr2 153894738 153894816 -27853271 - MurERV4_19-int LTR ERVK -3284 2496 2418 6 1759 2689 125 22 103 chr2 153896349 153896989 -27851098 - RMER17A LTR ERVK -17 734 147 6 1759 1771 146 57 108 chr2 153896989 153897519 -27850568 + MurERV4_19-int LTR ERVK 5278 5780 0 6 1759 2149 185 6 99 chr2 153897519 153898053 -27850034 + RMER19B LTR ERVK 1 484 -418 6 1759 1154 164 23 14 chr2 153898052 153898269 -27849818 + RMER19B LTR ERVK 684 902 0 6 1759 3813 32 5 0 chr2 153910713 153911147 -27836940 + RLTR10C LTR ERVK 1 436 0 6 1759 277 149 0 0 chr2 153920164 153920211 -27827876 + MTD LTR MaLR 196 242 -177 6 1759 7150 183 19 5 chr2 153926023 153927396 -27820691 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 934 2325 -1 7 1759 1604 239 77 41 chr2 153927397 153927907 -27820180 + RLTR11A LTR ERVK 1 528 0 7 1759 404 145 13 0 chr2 153927907 153927983 -27820104 - RMER19C LTR ERVK -534 77 1 7 1759 984 109 16 27 chr2 153927983 153928171 -27819916 - MurERV4_19-int LTR ERVK 0 5780 5595 7 1759 2045 131 43 42 chr2 153929277 153929762 -27818325 + RLTR13D6 LTR ERVK 1 902 0 7 1759 247 102 0 20 chr2 153936837 153936887 -27811200 - RMER4B LTR ERVK -520 65 17 7 1759 706 240 62 48 chr2 153936916 153937126 -27810961 + ORR1D2 LTR MaLR 158 370 0 7 1759 2001 187 80 5 chr2 153937875 153938263 -27809824 + MTC LTR MaLR 5 421 0 7 1759 307 384 18 9 chr2 153944490 153944603 -27803484 + MLT1A1 LTR MaLR 29 142 -266 7 1759 256 143 2 17 chr2 153944627 153944687 -27803400 + ORR1C2 LTR MaLR 1 54 -313 7 1759 2194 144 39 8 chr2 153952290 153952653 -27795434 + ORR1C1 LTR MaLR 5 378 0 7 1759 450 249 59 47 chr2 153953903 153954072 -27794015 - RLTR13D3 LTR ERVK 0 1114 944 7 1759 726 284 67 104 chr2 153957293 153957620 -27790467 - MLT1B LTR MaLR 0 390 77 7 1759 583 183 104 61 chr2 153958027 153958190 -27789897 - RMER10A LTR ERVL -45 397 228 7 1759 2305 124 58 63 chr2 153958855 153959251 -27788836 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 7 1759 322 295 109 103 chr2 153973947 153974314 -27773773 - MTEb LTR MaLR -1 378 5 7 1759 1925 290 60 11 chr2 153976380 153976928 -27771159 - MER70-int LTR ERVL -2716 2307 1733 7 1759 638 274 241 27 chr2 153977948 153978392 -27769695 - MER70-int LTR ERVL -3688 1335 798 7 1759 327 260 122 40 chr2 153979009 153979182 -27768905 + RLTR13D3 LTR ERVK 1 177 -846 7 1759 294 291 117 39 chr2 153979682 153979836 -27768251 + RLTR13D3 LTR ERVK 643 808 0 7 1759 440 266 143 113 chr2 153979970 153980271 -27767816 - MTEb LTR MaLR -44 335 26 7 1759 877 227 147 46 chr2 153982053 153982312 -27765775 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 90 7 1759 2544 135 186 32 chr2 153984270 153984797 -27763290 - RMER12 LTR ERVK -135 1187 580 7 1759 2012 92 223 0 chr2 153984794 153985122 -27762965 - RMER12 LTR ERVK -921 401 1 7 1759 1052 303 27 50 chr2 153985122 153985458 -27762629 - ORR1E LTR MaLR -31 328 1 7 1759 227 244 0 0 chr2 153994526 153994571 -27753516 - MTD LTR MaLR 0 419 375 7 1759 1214 227 96 80 chr2 153994835 153995209 -27752878 - MTD LTR MaLR -9 410 31 7 1759 4176 206 48 57 chr2 153995221 153996225 -27751862 - MTD-int LTR MaLR 0 1258 264 7 1759 260 235 0 0 chr2 153996232 153996283 -27751804 - RMER20B LTR ERVK -36 591 541 7 1759 999 231 77 29 chr2 153996306 153996578 -27751509 - RMER20B LTR ERVK -214 413 129 7 1759 922 221 72 42 chr2 153996729 153996993 -27751094 - MTD-int LTR MaLR -986 272 1 7 1759 558 167 333 0 chr2 153996993 153997137 -27750950 - MTD LTR MaLR 0 419 228 7 1759 451 310 125 62 chr2 153997281 153997618 -27750469 - ORR1E LTR MaLR 0 359 2 7 1759 255 350 179 5 chr2 153997618 153997825 -27750262 - MLT1F1 LTR MaLR -323 246 4 7 1759 1826 197 102 23 chr2 154006667 154007139 -27740948 + RMER19C LTR ERVK 103 611 0 4 1759 541 176 124 11 chr2 154007378 154007513 -27740574 - MTD LTR MaLR -12 407 240 5 1759 1275 176 143 29 chr2 154008231 154008548 -27739539 + RLTR24 LTR ERV1 166 505 -24 8 1760 1896 202 59 45 chr2 154009910 154010350 -27737737 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 1 1 1760 756 171 70 65 chr2 154012566 154012761 -27735326 + ORR1C2 LTR MaLR 97 346 -38 1 1760 398 91 0 0 chr2 154012887 154012942 -27735145 + ORR1C2 LTR MaLR 330 384 0 1 1760 2056 192 43 92 chr2 154025283 154025817 -27722270 + RLTR18B LTR ERVK 1 508 -4 4 1760 344 316 25 69 chr2 154029227 154029431 -27718656 - LTR41B LTR ERVL 0 758 564 5 1760 312 274 57 0 chr2 154029705 154029811 -27718276 - LTR41B LTR ERVL -608 160 49 5 1760 328 250 68 29 chr2 154038220 154038323 -27709764 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 302 6 1760 515 276 24 49 chr2 154051380 154051544 -27696543 - MLT1C LTR MaLR -268 199 40 9 1760 325 212 30 0 chr2 154067557 154067623 -27680464 + RMER5 LTR ERV1 33 100 -434 1 1760 684 296 68 13 chr2 154067968 154068204 -27679883 + RMER5 LTR ERV1 143 391 -143 1 1760 4380 45 44 7 chr2 154068301 154068841 -27679246 + LTRIS2 LTR ERV1 5 564 0 1 1760 336 174 182 23 chr2 154068855 154068943 -27679144 + RMER5 LTR ERV1 426 527 -7 1 1760 459 291 78 40 chr2 154069344 154069714 -27678373 - RLTR16 LTR ERVK -265 427 21 1 1760 2736 71 145 139 chr2 154070082 154070591 -27677496 - RLTR1B LTR ERV1 0 512 1 1 1760 2486 200 26 83 chr2 154071538 154072186 -27675901 + RMER19C LTR ERVK 1 611 0 1 1760 994 201 50 186 chr2 154072460 154072901 -27675186 + RMER17C LTR ERVK 1 381 -29 1 1760 1351 114 45 18 chr2 154076916 154077140 -27670947 - BGLII_B LTR ERVK 0 441 212 1 1760 363 253 43 134 chr2 154077997 154078184 -27669903 - RMER10A LTR ERVL -15 427 258 1 1760 2284 124 3 12 chr2 154098414 154098756 -27649331 + RMER19A LTR ERVK 1 339 -398 1 1760 385 226 39 10 chr2 154099811 154099914 -27648173 + MYSERV-int LTR ERVK 5679 5784 -766 1 1760 491 212 83 38 chr2 154102643 154102800 -27645287 - RLTR43A LTR ERVK 0 364 201 1 1760 1396 190 105 102 chr2 154107989 154108308 -27639779 + RLTR19-int LTR ERVK 2595 2912 -3225 1 1760 1396 190 105 102 chr2 154108452 154108543 -27639544 + RLTR19-int LTR ERVK 2913 3006 -3131 1 1760 296 379 53 10 chr2 154108609 154108817 -27639270 - RMER15 LTR ERVL -104 471 255 1 1760 411 159 0 0 chr2 154111095 154111164 -27636923 - RLTR9C LTR ERVK 0 393 325 1 1760 318 231 0 167 chr2 154111332 154111524 -27636563 + RLTR19-int LTR ERVK 3212 3371 -2766 1 1760 679 229 181 103 chr2 154111612 154112078 -27636009 + RMER17C-int LTR ERVK 2654 3155 -83 1 1760 841 98 8 8 chr2 154112122 154112255 -27635832 + RMER10B LTR ERVL 1 133 -265 1 1760 1153 96 250 0 chr2 154116083 154116303 -27631784 + RLTR10A LTR ERVK 137 411 0 1 1760 478 212 20 46 chr2 154117961 154118114 -27629973 + RLTR43A LTR ERVK 216 364 0 1 1760 263 272 56 66 chr2 154120400 154120597 -27627490 - RLTR46 LTR ERVK 0 320 126 1 1760 1889 225 115 38 chr2 154125136 154125659 -27622428 + RMER13A LTR ERVK 162 724 -136 1 1761 481 136 0 0 chr2 154147798 154147879 -27600208 - MTC LTR MaLR -335 86 6 2 1761 1789 176 89 38 chr2 154151470 154151865 -27596222 - MTC LTR MaLR 0 421 7 2 1761 1216 262 11 78 chr2 154155550 154155923 -27592164 + MT2A LTR ERVL 1 348 -185 2 1761 476 113 82 10 chr2 154155965 154156063 -27592024 + ORR1C2 LTR MaLR 266 370 0 2 1761 2786 270 42 61 chr2 154156081 154157088 -27590999 + ORR1C2-int LTR MaLR 24 1015 -355 2 1761 3317 43 5 0 chr2 154157088 154157482 -27590605 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 1761 2786 270 42 61 chr2 154157482 154157547 -27590540 + ORR1C2-int LTR MaLR 1016 1076 -294 2 1761 1592 132 171 11 chr2 154157550 154157895 -27590192 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 3 2 1761 1044 241 48 44 chr2 154157895 154157947 -27590140 + ORR1C2-int LTR MaLR 1110 1161 -209 2 1761 1044 241 48 44 chr2 154158132 154158338 -27589749 + ORR1C2-int LTR MaLR 1162 1369 -1 2 1761 371 190 51 0 chr2 154158338 154158417 -27589670 + ORR1C2 LTR MaLR 1 83 -287 2 1761 304 130 0 0 chr2 154158720 154158774 -27589313 + ORR1C2 LTR MaLR 42 95 -289 2 1761 1425 178 92 0 chr2 154159061 154159342 -27588745 + ORR1C2 LTR MaLR 78 384 0 2 1761 271 251 34 139 chr2 154166937 154167145 -27580942 + RMER10A LTR ERVL 238 423 -19 2 1761 297 260 125 0 chr2 154170125 154170229 -27577858 + MLT1B LTR MaLR 224 340 -50 2 1761 1206 245 93 95 chr2 154173741 154174214 -27573873 + RLTR19 LTR ERVK 21 492 -7 2 1761 2220 86 15 84 chr2 154179998 154180392 -27567695 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 3 1761 7602 76 98 71 chr2 154180392 154181664 -27566423 + IAPEz-int LTR ERVK 8 1313 -5168 3 1761 29493 20 1 1 chr2 154181662 154184930 -27563157 + IAPEz-int LTR ERVK 3209 6478 -3 3 1761 2220 86 15 84 chr2 154184934 154185328 -27562759 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 3 1761 5594 123 55 31 chr2 154187695 154188417 -27559670 + RMER12B LTR ERVK 1 733 -671 3 1761 5594 123 55 31 chr2 154188603 154188892 -27559195 + RMER12B LTR ERVK 734 1037 -367 3 1761 2328 153 95 24 chr2 154190658 154191327 -27556760 - RMER12 LTR ERVK -133 1189 447 3 1761 1378 202 61 3 chr2 154191354 154191647 -27556440 - RMER12 LTR ERVK -1012 310 1 3 1761 917 224 105 43 chr2 154192603 154192884 -27555203 + RLTR20D LTR ERVK 25 413 -92 3 1761 497 232 108 13 chr2 154192947 154193036 -27555051 + RLTR20D LTR ERVK 414 504 -1 3 1761 273 229 194 16 chr2 154200313 154200437 -27547650 + MLT1F LTR MaLR 8 153 -212 3 1761 333 189 13 26 chr2 154201795 154201871 -27546216 + MLT1F LTR MaLR 388 462 -86 3 1761 3465 35 5 0 chr2 154207707 154208105 -27539982 + MTB LTR MaLR 1 400 0 3 1761 273 323 15 25 chr2 154208353 154208482 -27539605 + MLT1J LTR MaLR 19 180 -332 3 1761 445 201 51 4 chr2 154209915 154210040 -27538047 + MLT1J LTR MaLR 63 176 -268 3 1761 386 288 45 45 chr2 154210292 154210470 -27537617 + MLT1J LTR MaLR 99 276 -236 3 1761 337 216 13 26 chr2 154222430 154222506 -27525581 + MT2A LTR ERVL 47 121 -412 4 1761 772 251 70 44 chr2 154222439 154222668 -27525419 + MTE2b LTR MaLR 54 288 -91 4 1761 266 192 0 0 chr2 154222961 154223013 -27525074 + MTE2b LTR MaLR 328 379 0 4 1761 353 288 117 100 chr2 154223013 154223143 -27524944 + MT2B LTR ERVL 25 158 -443 4 1761 488 257 98 98 chr2 154230247 154230471 -27517616 + MT2B LTR ERVL 53 276 -325 4 1761 256 221 65 212 chr2 154235425 154235452 -27512635 + MT2B LTR ERVL 131 184 -417 5 1761 256 221 65 212 chr2 154235561 154235609 -27512478 + MT2B LTR ERVL 185 287 -314 5 1761 1818 113 86 38 chr2 154270525 154270839 -27477248 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 6 1762 425 128 15 174 chr2 154273611 154273743 -27474344 - MT2B LTR ERVL -337 264 154 6 1762 343 254 71 71 chr2 154279340 154279480 -27468607 - MT2B LTR ERVL -323 278 139 7 1762 343 385 0 0 chr2 154283638 154283742 -27464345 - MLT1F1 LTR MaLR -271 298 195 7 1762 2032 120 158 17 chr2 154292820 154293169 -27454918 - RMER10B LTR ERVL 0 398 1 7 1762 1486 139 176 35 chr2 154294001 154294313 -27453774 - ORR1C1 LTR MaLR -4 374 19 7 1762 225 287 50 60 chr2 154308218 154308240 -27439847 - MT2B LTR ERVL -351 250 186 8 1762 2151 158 50 21 chr2 154308950 154309331 -27438756 - ORR1B1 LTR MaLR -2 392 1 8 1762 768 255 164 24 chr2 154309927 154310253 -27437834 + MTE2a LTR MaLR 30 369 -10 8 1762 486 144 32 112 chr2 154311421 154311435 -27436652 + MT2B LTR ERVL 150 153 -448 8 1762 259 250 143 48 chr2 154318512 154318596 -27429491 - MT2B LTR ERVL -350 251 160 8 1762 1204 114 24 31 chr2 154321569 154321793 -27426294 - ORR1A0 LTR MaLR 0 384 142 8 1762 765 149 12 61 chr2 154321686 154321900 -27426187 + ORR1A2 LTR MaLR 28 219 -127 8 1762 1114 243 70 27 chr2 154322522 154322980 -27425107 - RLTR33 LTR ERVK 0 678 149 8 1762 1816 155 87 9 chr2 154336788 154337133 -27410954 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 23 9 1762 422 356 102 74 chr2 154337848 154338212 -27409875 - MLT1J1 LTR MaLR -53 391 18 9 1762 899 302 131 123 chr2 154341960 154342171 -27405916 - MER21B LTR ERV1 -152 711 559 9 1762 899 302 131 123 chr2 154342303 154342763 -27405324 - MER21B LTR ERV1 -305 558 35 9 1762 687 217 96 0 chr2 154345381 154345538 -27402549 + MTD LTR MaLR 5 176 -243 9 1762 1919 163 80 6 chr2 154346136 154346487 -27401600 - ORR1C1 LTR MaLR -1 377 1 9 1762 288 298 332 0 chr2 154350201 154350406 -27397681 - MER21B LTR ERV1 -271 592 320 9 1762 1977 162 3 6 chr2 154355470 154355793 -27392294 - RMER4A LTR ERVK -135 331 10 9 1762 318 322 236 15 chr2 154390813 154391084 -27357003 + MLT1F LTR MaLR 177 507 -41 1 1762 245 232 93 83 chr2 154401899 154402007 -27346080 + MT2B LTR ERVL 127 235 -366 1 1763 286 232 107 78 chr2 154405077 154405180 -27342907 - MT2B LTR ERVL -344 257 152 1 1763 1361 207 114 62 chr2 154405377 154405576 -27342511 + MTD LTR MaLR 3 202 -217 1 1763 1361 207 114 62 chr2 154405766 154405952 -27342135 + MTD LTR MaLR 203 408 -11 1 1763 875 249 128 88 chr2 154408507 154409010 -27339077 + RMER13A LTR ERVK 25 560 -67 1 1763 264 254 0 35 chr2 154410245 154410302 -27337785 - LTR16C LTR ERVL -3 535 481 1 1763 299 331 107 42 chr2 154410348 154410657 -27337430 - LTR16C LTR ERVL -154 335 7 1 1763 415 171 107 92 chr2 154411975 154412149 -27335938 + MT2B LTR ERVL 82 264 -320 1 1763 2078 158 88 16 chr2 154423044 154423429 -27324658 + MTC LTR MaLR 1 413 -8 1 1763 500 272 57 37 chr2 154433545 154433721 -27314366 - MLT1B LTR MaLR -5 385 190 1 1763 1061 124 19 6 chr2 154436162 154436324 -27311763 + ORR1A3 LTR MaLR 112 275 -51 1 1763 2786 67 42 18 chr2 154442307 154442690 -27305397 - MTB LTR MaLR -8 392 1 1 1763 341 276 0 117 chr2 154447178 154447289 -27300798 - MT2B LTR ERVL -352 249 152 1 1763 435 320 14 103 chr2 154448930 154449029 -27299058 - MLT1J LTR MaLR -211 301 209 1 1763 435 320 14 103 chr2 154449155 154449259 -27298828 - MLT1J LTR MaLR -304 208 118 1 1763 435 320 14 103 chr2 154449396 154449414 -27298673 - MLT1J LTR MaLR -395 117 100 1 1763 434 208 0 145 chr2 154452324 154452448 -27295639 - MT2B LTR ERVL -344 257 152 1 1763 523 347 135 59 chr2 154454816 154455187 -27292900 - MLT1J LTR MaLR -7 505 107 1 1763 361 378 47 19 chr2 154461516 154461729 -27286358 - MLT1J LTR MaLR -68 444 226 1 1763 304 243 44 88 chr2 154470232 154470345 -27277742 + MT2B2 LTR ERVL 157 264 -320 1 1763 1113 191 31 36 chr2 154475052 154475275 -27272812 - MTC LTR MaLR -3 418 197 1 1763 845 193 102 23 chr2 154475604 154475778 -27272309 - MTC LTR MaLR -212 209 24 1 1763 1970 157 59 36 chr2 154475778 154476167 -27271920 - RMER10B LTR ERVL 0 398 1 1 1763 817 224 24 68 chr2 154476167 154476195 -27271892 - MTC LTR MaLR -379 28 1 1 1763 1297 179 92 48 chr2 154476556 154476949 -27271138 + RMER17C LTR ERVK 1 410 0 1 1763 278 262 87 0 chr2 154478540 154478643 -27269444 - MLT1D LTR MaLR -18 487 376 1 1763 240 301 61 49 chr2 154478649 154478715 -27269372 + ORR1B1-int LTR MaLR 547 614 -895 1 1763 240 301 61 49 chr2 154478861 154478958 -27269129 + ORR1B1-int LTR MaLR 615 712 -797 1 1763 345 231 41 71 chr2 154478966 154478982 -27269105 + MT2B LTR ERVL 177 250 -351 1 1763 231 274 32 0 chr2 154479790 154479852 -27268235 - MLT1D LTR MaLR -334 171 108 1 1763 333 205 0 98 chr2 154481190 154481282 -27266805 + MT2B LTR ERVL 182 264 -337 1 1763 516 168 74 0 chr2 154481478 154481573 -27266514 - MTC LTR MaLR -39 382 281 1 1763 330 307 20 105 chr2 154508219 154508372 -27239715 - MT2B LTR ERVL -337 264 125 3 1763 265 328 56 115 chr2 154511581 154511744 -27236343 + MT2B2 LTR ERVL 4 150 -434 4 1763 1012 188 101 23 chr2 154521199 154521417 -27226670 - ORR1C2 LTR MaLR -63 321 87 6 1763 272 200 120 74 chr2 154522572 154522680 -27225407 - MLT1J LTR MaLR -292 220 108 6 1763 1779 144 40 34 chr2 154522751 154523074 -27225013 + ORR1A2 LTR MaLR 3 327 0 6 1763 10427 113 128 14 chr2 154523075 154524835 -27223252 + ORR1A2-int LTR MaLR 2 1963 0 6 1763 2256 104 22 3 chr2 154524835 154525154 -27222933 + ORR1A2 LTR MaLR 1 325 -2 6 1763 1777 108 59 97 chr2 154530632 154530692 -27217395 - ORR1A2 LTR MaLR -1 326 288 8 1763 1777 108 59 97 chr2 154530881 154531159 -27216928 - ORR1A2 LTR MaLR -40 287 1 8 1764 1286 204 159 59 chr2 154534649 154534988 -27213099 + ORR1D1 LTR MaLR 2 374 0 9 1764 337 221 110 55 chr2 154535211 154535302 -27212785 - MT2B LTR ERVL -337 264 169 9 1764 4357 87 148 3 chr2 154541399 154542043 -27206044 - RMER19A LTR ERVK 0 737 1 1 1764 897 237 265 24 chr2 154544528 154544822 -27203265 - LTR69 LTR ERVL -202 386 22 1 1764 2543 249 58 50 chr2 154545380 154546224 -27201863 - RMER13A LTR ERVK -60 800 19 1 1764 743 219 204 119 chr2 154551516 154551683 -27196404 + RMER17C LTR ERVK 1 213 -197 1 1764 743 219 204 119 chr2 154551885 154552092 -27195995 + RMER17C LTR ERVK 214 407 -3 1 1764 335 355 27 43 chr2 154552119 154552307 -27195780 + RMER15 LTR ERVL 384 568 -7 1 1764 868 241 127 177 chr2 154554269 154554387 -27193700 + MT2B LTR ERVL 3 89 -444 1 1764 912 241 127 177 chr2 154554471 154554911 -27193176 + MT2B LTR ERVL 90 556 -45 1 1764 538 301 81 111 chr2 154556338 154556682 -27191405 - ORR1E LTR MaLR -20 339 6 1 1764 270 312 50 67 chr2 154557644 154557764 -27190323 + RLTR24 LTR ERV1 1 118 -411 1 1764 382 174 204 129 chr2 154557944 154558076 -27190011 + RLTR24 LTR ERV1 388 529 0 1 1764 231 328 108 31 chr2 154560120 154560249 -27187838 - MLT1K LTR MaLR -7 588 450 1 1764 703 229 189 74 chr2 154561332 154561561 -27186526 - MLT1B LTR MaLR 0 390 165 1 1764 703 229 189 74 chr2 154561605 154561672 -27186415 - MLT1B LTR MaLR -226 164 62 1 1764 696 267 157 0 chr2 154561896 154562158 -27185929 + LTR16C LTR ERVL 179 481 -8 1 1764 1212 205 131 43 chr2 154562748 154563099 -27184988 + RLTR14 LTR ERV1 1 382 0 1 1764 1887 161 73 12 chr2 154563483 154563810 -27184277 - ORR1B1 LTR MaLR -7 387 41 1 1764 968 224 213 9 chr2 154564067 154564382 -27183705 - MTEa LTR MaLR 0 379 1 1 1764 3580 205 49 63 chr2 154565313 154566269 -27181818 + RMER17B LTR ERVK 1 943 -15 1 1764 361 257 26 34 chr2 154566298 154566415 -27181672 + MTEb LTR MaLR 264 379 0 1 1764 416 309 121 8 chr2 154567477 154567619 -27180468 + MLT1G LTR MaLR 12 207 -388 1 1764 250 160 78 20 chr2 154568163 154568214 -27179873 + MLT1G LTR MaLR 244 297 -298 1 1764 263 314 84 8 chr2 154568241 154568360 -27179727 + MLT1G LTR MaLR 413 540 -39 1 1764 1006 248 83 34 chr2 154568496 154568937 -27179150 - RLTR28 LTR ERVL -38 443 2 1 1764 3065 80 5 2 chr2 154569957 154570356 -27177731 + MTB LTR MaLR 1 400 0 1 1764 286 304 79 16 chr2 154572054 154572181 -27175906 - MLT1E3 LTR MaLR -2 622 488 1 1764 872 262 70 26 chr2 154573679 154573949 -27174138 + RMER5 LTR ERV1 253 534 0 1 1764 995 256 211 9 chr2 154578111 154578438 -27169649 - MTD LTR MaLR -15 404 12 2 1764 417 171 0 139 chr2 154579070 154579199 -27168888 + MT2B LTR ERVL 154 264 -337 2 1764 501 230 24 183 chr2 154582563 154582776 -27165311 + MTE2b LTR MaLR 2 180 -199 2 1764 611 287 46 6 chr2 154584322 154584497 -27163590 - MLT1H LTR MaLR -257 292 111 2 1764 1127 267 78 58 chr2 154585827 154586225 -27161862 + MTD LTR MaLR 14 419 0 2 1764 416 265 92 0 chr2 154586861 154586959 -27161128 + MLT1N2 LTR MaLR 121 227 -335 2 1764 251 337 53 0 chr2 154588716 154588811 -27159276 - MLT1L LTR MaLR -343 267 168 2 1764 242 320 13 13 chr2 154588834 154588910 -27159177 - MLT1L LTR MaLR -529 81 6 2 1764 512 281 64 64 chr2 154590694 154590896 -27157191 + MLT1A1 LTR MaLR 147 348 -60 2 1764 1508 111 128 105 chr2 154592911 154593155 -27154932 + ORR1B1 LTR MaLR 75 354 -40 2 1764 1508 111 128 105 chr2 154593297 154593365 -27154722 + ORR1B1 LTR MaLR 355 394 0 2 1764 316 328 120 4 chr2 154598775 154599029 -27149058 - LTR40c LTR ERVL -30 489 156 2 1764 325 317 115 67 chr2 154600092 154600316 -27147771 - MLT1H2 LTR MaLR -226 323 58 2 1764 868 268 208 13 chr2 154601804 154602107 -27145980 - ORR1D2 LTR MaLR -8 362 1 2 1764 461 302 57 155 chr2 154607274 154607344 -27140743 - MLT1H2 LTR MaLR 0 489 438 3 1764 461 302 57 155 chr2 154607537 154607885 -27140202 - MLT1H2 LTR MaLR -52 437 112 3 1764 287 218 0 0 chr2 154608269 154608324 -27139763 - MLT1K LTR MaLR -387 208 154 3 1764 395 200 32 53 chr2 154610768 154610863 -27137224 + MLT1H2 LTR MaLR 397 489 0 3 1764 598 140 352 5 chr2 154628978 154629140 -27118947 - MTD LTR MaLR -5 414 196 3 1764 523 224 216 0 chr2 154629742 154629876 -27118211 - MTD LTR MaLR -211 208 46 3 1764 303 277 176 0 chr2 154631802 154631950 -27116137 - RMER20B LTR ERVK -321 306 133 3 1764 361 198 0 81 chr2 154636188 154636287 -27111800 - MT2B LTR ERVL -343 258 168 3 1764 1761 132 9 70 chr2 154638352 154638695 -27109392 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 3 1764 441 351 29 12 chr2 154639891 154640061 -27108026 + MTD LTR MaLR 56 228 -191 3 1764 356 265 48 10 chr2 154640073 154640176 -27107911 + MTD LTR MaLR 292 398 -21 3 1764 248 278 103 0 chr2 154640306 154640403 -27107684 - ORR1E LTR MaLR -197 162 56 3 1764 520 282 69 69 chr2 154640460 154640692 -27107395 - MTEa-int LTR MaLR -152 1428 1197 3 1764 962 287 233 9 chr2 154640721 154641247 -27106840 - MTEa-int LTR MaLR -693 887 244 3 1764 543 270 198 28 chr2 154641248 154641499 -27106588 + MTEb LTR MaLR 3 312 -67 3 1764 490 309 18 96 chr2 154641708 154641937 -27106150 - MTEa-int LTR MaLR -1368 212 2 3 1764 572 184 0 0 chr2 154642178 154642287 -27105800 - MTEa LTR MaLR -15 364 256 3 1764 639 257 93 9 chr2 154645107 154645323 -27102764 + ORR1E LTR MaLR 1 234 -125 3 1764 3240 43 18 18 chr2 154654422 154654822 -27093265 - MTB LTR MaLR 0 400 1 4 1764 259 308 162 35 chr2 154657879 154658108 -27089979 + ORR1E LTR MaLR 93 350 -9 4 1765 1849 163 108 0 chr2 154673304 154673648 -27074439 - ORR1B1 LTR MaLR -13 381 1 4 1765 1350 202 110 86 chr2 154677354 154677792 -27070295 - MT2B LTR ERVL -11 590 75 4 1765 401 143 141 13 chr2 154678001 154678079 -27070008 - MT2B LTR ERVL -445 88 1 4 1765 1282 177 205 4 chr2 154693184 154693462 -27054625 - MTD LTR MaLR -13 406 73 4 1765 641 263 166 15 chr2 154694354 154694613 -27053474 - MER57A-int LTR ERV1 -446 5741 5444 4 1765 5958 225 95 40 chr2 154704820 154706627 -27041460 + MYSERV6-int LTR ERVK 1200 3106 -5853 5 1765 3479 147 31 5 chr2 154706621 154707204 -27040883 + MYSERV6-int LTR ERVK 3249 3846 -5113 5 1765 3790 251 145 93 chr2 154707198 154708784 -27039303 + MYSERV6-int LTR ERVK 3734 5332 -1218 5 1765 4080 175 84 41 chr2 154708961 154709965 -27038122 + MYSERV6-int LTR ERVK 8133 8896 -63 5 1765 387 338 142 72 chr2 154710903 154711320 -27036767 - MER21B LTR ERV1 -111 752 307 5 1765 565 292 99 36 chr2 154719524 154719776 -27028311 - MER90 LTR ERV1 -199 376 109 5 1765 7671 23 1 2 chr2 154720130 154720953 -27027134 + RLTR13B2 LTR ERVK 1 822 0 5 1765 1739 142 26 68 chr2 154722570 154722761 -27025326 + MTC LTR MaLR 19 209 -212 5 1765 1739 142 26 68 chr2 154722951 154723098 -27024989 + MTC LTR MaLR 210 343 -78 5 1765 2746 239 95 60 chr2 154724167 154724583 -27023504 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 1147 1542 -784 5 1765 2746 239 95 60 chr2 154724728 154724770 -27023317 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 1543 1588 -738 5 1765 6903 43 7 2 chr2 154724770 154725588 -27022499 - RLTR13B2 LTR ERVK 0 822 1 5 1765 2746 239 95 60 chr2 154725588 154726089 -27021998 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 1589 2141 -185 5 1765 2746 239 95 60 chr2 154726234 154726413 -27021674 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 2142 2325 -1 5 1765 2203 126 28 8 chr2 154726414 154726766 -27021321 + RLTR15 LTR ERVK 1 359 0 5 1765 1965 161 86 10 chr2 154727477 154727861 -27020226 + MTC LTR MaLR 1 413 -8 5 1765 3500 61 12 16 chr2 154729540 154730038 -27018049 - LTRIS2 LTR ERV1 0 564 69 5 1765 968 236 65 187 chr2 154731047 154731120 -27016967 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 459 5 1765 968 236 65 187 chr2 154731161 154731483 -27016604 - RLTR11A LTR ERVK -70 458 214 5 1765 968 236 65 187 chr2 154731630 154731833 -27016254 - RLTR11A LTR ERVK -315 213 2 5 1765 1342 163 91 4 chr2 154732057 154732310 -27015777 - MTC LTR MaLR 0 421 147 5 1765 983 179 35 40 chr2 154732296 154732494 -27015593 + RLTR18B LTR ERVK 310 506 -6 5 1765 2112 165 88 16 chr2 154733083 154733471 -27014616 - MTC LTR MaLR -1 420 5 5 1765 381 205 8 118 chr2 154735016 154735042 -27013045 + MT2B LTR ERVL 145 156 -445 5 1765 305 293 50 0 chr2 154745816 154745915 -27002172 - MER21B LTR ERV1 -314 549 446 6 1765 330 308 108 0 chr2 154746286 154746406 -27001681 - MER21B LTR ERV1 -457 406 274 6 1765 1708 146 15 112 chr2 154754495 154754608 -26993479 + RMER6B LTR ERVK 1 98 -363 6 1765 1708 146 15 112 chr2 154754801 154755097 -26992990 + RMER6B LTR ERVK 99 370 -91 6 1765 396 157 29 0 chr2 154755539 154755609 -26992478 + MTD LTR MaLR 1 72 -347 6 1765 2386 74 48 3 chr2 154755850 154756163 -26991924 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 6 1765 835 259 71 39 chr2 154757110 154757419 -26990668 - ORR1E LTR MaLR -5 354 36 6 1765 1923 213 50 5 chr2 154763229 154763630 -26984457 - MTD LTR MaLR 0 419 1 6 1765 1138 230 34 154 chr2 154763809 154764251 -26983836 - ORR1B1 LTR MaLR -5 389 1 6 1765 341 243 9 64 chr2 154764278 154764388 -26983699 - MTE2b LTR MaLR -99 280 177 6 1765 284 297 82 18 chr2 154764467 154764596 -26983491 - MTE2b LTR MaLR -278 141 4 6 1765 919 243 109 125 chr2 154765081 154765584 -26982503 - RMER5 LTR ERV1 -39 495 1 6 1765 634 314 162 38 chr2 154786044 154786494 -26961593 - MLT1E3 LTR MaLR -13 611 106 6 1765 963 169 83 33 chr2 154788383 154788659 -26959428 - RMER17C LTR ERVK 0 410 121 6 1765 731 196 182 36 chr2 154789597 154789896 -26958191 - MTC LTR MaLR 0 421 1 6 1765 348 269 11 11 chr2 154792773 154792867 -26955220 - MTD LTR MaLR 0 419 326 7 220 377 285 106 0 chr2 154796007 154796130 -26951957 + MER21B LTR ERV1 274 409 -454 7 1766 281 250 66 0 chr2 154796489 154796565 -26951522 + MER21B LTR ERV1 446 526 -337 7 1766 1765 31 9 0 chr2 154802548 154802776 -26945311 - MTA_Mm LTR MaLR -63 333 104 7 1766 310 274 102 31 chr2 154802900 154803096 -26944991 + MER74B LTR ERVL 280 489 -133 7 1766 255 328 23 62 chr2 154805242 154805372 -26942715 - MLT1F2 LTR MaLR -7 553 429 7 1766 714 225 152 95 chr2 154805592 154805940 -26942147 + MTE2a LTR MaLR 12 379 0 7 1766 240 253 173 0 chr2 154807315 154807390 -26940697 - MTEa LTR MaLR 0 379 292 7 1766 1382 129 349 14 chr2 154815135 154815410 -26932677 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 7 1766 369 193 510 12 chr2 154816162 154816414 -26931673 + MTE2b LTR MaLR 1 376 -3 7 1766 874 150 37 58 chr2 154819446 154819637 -26928450 + ORR1D1 LTR MaLR 3 189 -185 7 1766 1098 178 5 33 chr2 154819724 154819939 -26928148 + ORR1D1 LTR MaLR 166 374 0 7 1766 1286 219 14 144 chr2 154821904 154822093 -26925994 + MTD LTR MaLR 25 198 -221 7 1766 1286 219 14 144 chr2 154822237 154822484 -26925603 + MTD LTR MaLR 199 404 -15 7 1766 520 290 78 46 chr2 154822651 154822868 -26925219 - LTR40b LTR ERVL -33 429 206 7 1766 420 261 18 26 chr2 154823028 154823142 -26924945 - HERVL40-int LTR ERVL -2 5528 5416 7 1766 2049 151 8 41 chr2 154824986 154825374 -26922713 - RLTR14 LTR ERV1 0 382 8 7 1766 908 312 42 42 chr2 154825539 154825787 -26922300 - LTR40c LTR ERVL 0 465 214 7 1766 2285 129 6 0 chr2 154825787 154826112 -26921975 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 7 1766 908 312 42 42 chr2 154826112 154826297 -26921790 - LTR40c LTR ERVL -252 213 32 7 1766 1888 131 65 3 chr2 154832073 154832365 -26915722 + RLTR10E LTR ERVK 2 311 0 7 1766 735 224 143 0 chr2 154832473 154832669 -26915418 - MTEa LTR MaLR -12 367 144 7 1766 1237 238 128 27 chr2 154837024 154837400 -26910687 - MTD LTR MaLR 0 419 6 8 1766 3695 106 41 66 chr2 154840686 154841321 -26906766 - RLTR6_Mm LTR ERV1 -35 619 1 8 1766 16299 45 81 7 chr2 154841321 154843605 -26904482 - MMVL30-int LTR ERV1 0 3698 1286 8 1766 557 268 46 23 chr2 154843600 154843730 -26904357 + ETnERV2-int LTR ERVK 7070 7202 -204 8 1766 302 303 11 11 chr2 154845886 154845976 -26902111 + RNERVK23-int LTR ERVK 1371 1460 -4707 8 1766 356 337 26 26 chr2 154845966 154846161 -26901926 + RLTR45-int LTR ERVK 692 886 -6358 8 1766 5820 325 73 51 chr2 154846404 154851820 -26896267 + RNERVK23-int LTR ERVK 2295 7828 -389 8 1766 3973 191 27 10 chr2 154851848 154852546 -26895541 + ETnERV2-int LTR ERVK 6493 7202 -204 8 1766 3902 100 24 22 chr2 154852937 154853520 -26894567 - MMVL30-int LTR ERV1 -2399 1299 716 8 1766 277 96 19 0 chr2 154853813 154853865 -26894222 - MMVL30-int LTR ERV1 -2922 377 325 8 1766 6755 19 47 17 chr2 154853891 154854696 -26893391 - RLTR6-int LTR ERV1 -6949 829 1 8 1766 4194 47 52 126 chr2 154854697 154855387 -26892700 - RLTR6_Mm LTR ERV1 -15 639 1 8 1766 921 299 185 9 chr2 154856235 154856822 -26891265 - MER21B LTR ERV1 -21 842 153 8 1766 485 306 178 54 chr2 154857912 154858022 -26890065 - MER31B LTR ERV1 -88 378 262 8 1766 485 306 178 54 chr2 154858238 154858459 -26889628 - MER31B LTR ERV1 -205 261 6 8 1766 390 324 75 63 chr2 154867714 154868033 -26880054 + MER34A LTR ERV1 249 571 0 8 1766 2314 176 37 12 chr2 154870074 154870483 -26877604 - MTD LTR MaLR 0 419 1 8 1766 231 306 34 34 chr2 154885567 154885655 -26862432 - LTR50 LTR ERVL -572 223 136 9 1766 335 314 83 25 chr2 154894241 154894362 -26853725 + MLT1K LTR MaLR 157 284 -311 9 1766 651 270 122 24 chr2 154894944 154895191 -26852896 + BGLII_B LTR ERVK 171 441 0 9 1766 253 306 23 99 chr2 154901156 154901377 -26846710 + RMER15 LTR ERVL 307 510 -65 9 1766 718 189 19 105 chr2 154901865 154902060 -26846027 + ORR1C2 LTR MaLR 116 328 -56 9 1766 404 162 15 0 chr2 154902184 154902252 -26845835 + ORR1C2 LTR MaLR 314 382 -2 9 1766 1487 197 96 26 chr2 154902406 154902791 -26845296 + MTD LTR MaLR 4 415 -4 9 1766 892 277 112 49 chr2 154905039 154905232 -26842855 + MTE2b LTR MaLR 1 193 -186 9 1766 892 277 112 49 chr2 154905260 154905415 -26842672 + MTE2b LTR MaLR 194 371 -8 9 1766 412 223 49 86 chr2 154911039 154911201 -26836886 - RLTR11B LTR ERVK -41 412 257 9 1766 802 242 44 73 chr2 154911215 154911529 -26836558 - RLTR11B LTR ERVK -224 304 1 9 1766 3165 200 138 32 chr2 154911992 154912797 -26835290 - RMER19B LTR ERVK -12 890 1 9 1766 794 311 71 71 chr2 154912890 154913243 -26834844 - ORR1E LTR MaLR -6 353 1 9 1766 594 218 35 14 chr2 154913243 154913373 -26834714 + MLT1C LTR MaLR 266 398 -69 9 1766 273 193 21 135 chr2 154913470 154913484 -26834603 + MLT1C LTR MaLR 379 389 -78 9 1766 273 193 21 135 chr2 154913592 154913673 -26834414 + MLT1C LTR MaLR 390 463 -4 9 1766 380 362 57 35 chr2 154917381 154917696 -26830391 - MLT1L LTR MaLR -22 588 267 1 1766 1276 144 0 0 chr2 154919111 154919298 -26828789 - RLTR14 LTR ERV1 0 382 196 1 1766 232 175 25 0 chr2 154919308 154919348 -26828739 - RLTR14 LTR ERV1 -341 41 1 1 1766 1246 128 5 35 chr2 154919808 154920010 -26828077 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 183 1 1766 2292 149 57 8 chr2 154922604 154922990 -26825097 - MTD LTR MaLR -14 405 1 1 1766 2683 109 44 19 chr2 154923436 154923846 -26824241 - RLTR9B2 LTR ERVK 0 420 1 1 1766 265 259 0 0 chr2 154926428 154926482 -26821605 + MLT1F LTR MaLR 14 67 -481 1 1766 543 299 124 32 chr2 154926536 154926754 -26821333 + MLT1F LTR MaLR 47 284 -264 1 1767 2527 146 38 2 chr2 154931998 154932397 -26815690 - MTC LTR MaLR -8 413 1 1 1767 3203 86 29 37 chr2 154932936 154933422 -26814665 - RLTR45 LTR ERVK 0 482 1 1 1767 1839 166 57 82 chr2 154934158 154934611 -26813476 + RMER10A LTR ERVL 1 442 0 1 1767 3097 123 142 4 chr2 154934984 154935498 -26812589 - RMER4B LTR ERVK 0 585 1 1 1767 531 307 29 0 chr2 154936421 154936558 -26811529 - MTEa LTR MaLR -236 143 3 1 1767 3676 28 10 91 chr2 154938175 154938692 -26809395 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 1 1767 3014 138 95 57 chr2 154939460 154940206 -26807881 + RMER6C LTR ERVK 1 718 -38 1 1767 823 226 113 118 chr2 154940353 154940422 -26807665 + RMER6C LTR ERVK 646 717 -3 1 1767 314 315 6 95 chr2 154942244 154942402 -26805685 - MT2B LTR ERVL -345 256 113 1 1767 2201 133 41 38 chr2 154946810 154947176 -26800911 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 1 1767 57843 20 6 3 chr2 154947176 154953630 -26794457 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 8 1 1767 2186 136 41 38 chr2 154953630 154953996 -26794091 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 1 1767 715 183 7 27 chr2 154954485 154954631 -26793456 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 180 1 1767 293 240 26 26 chr2 154972596 154972673 -26775414 - RMER5 LTR ERV1 -275 259 183 1 1767 892 290 101 9 chr2 154979050 154979377 -26768710 - ORR1E LTR MaLR -2 357 1 1 1767 819 276 66 54 chr2 154982007 154982417 -26765670 - BGLII_B LTR ERVK -26 415 1 1 1767 455 289 92 26 chr2 154983687 154983882 -26764205 - MLT1C LTR MaLR -60 407 200 1 1767 1418 215 108 15 chr2 154985392 154985821 -26762266 - RMER15 LTR ERVL 0 575 6 1 1767 486 291 119 34 chr2 154986180 154986666 -26761421 - MLT1F LTR MaLR -5 543 1 1 1767 2147 154 9 11 chr2 154993599 154993948 -26754139 - ORR1B2 LTR MaLR -2 365 18 1 1767 2154 113 17 70 chr2 154996796 154997140 -26750947 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 1 1767 537 244 55 38 chr2 155003915 155004098 -26743989 + RLTR23 LTR ERV1 245 430 0 1 1767 240 206 51 76 chr2 155006509 155006588 -26741499 - MT2B2 LTR ERVL -341 243 167 2 1767 383 244 222 22 chr2 155017407 155017587 -26730500 - RLTR15 LTR ERVK -68 291 76 6 1767 343 269 34 10 chr2 155018679 155018819 -26729268 - MLT1C LTR MaLR -66 401 180 6 1767 1280 204 140 131 chr2 155020215 155020773 -26727314 - RMER4B LTR ERVK -11 574 12 7 1767 2144 138 108 45 chr2 155048108 155048534 -26699553 + RLTR11B LTR ERVK 1 453 0 1 1767 445 274 113 35 chr2 155054552 155054836 -26693251 - MuLV-int LTR ERV1 -119 7487 7182 1 1767 352 295 96 22 chr2 155054632 155054861 -26693226 - RNERVK23-int LTR ERVK -554 7663 7418 1 1767 4428 14 0 0 chr2 155055672 155056165 -26691922 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 1 1767 383 274 4 45 chr2 155056843 155056966 -26691121 - MMERGLN-int LTR ERV1 -2082 5696 5491 1 1767 1703 277 29 34 chr2 155057109 155057670 -26690417 - MMERGLN-int LTR ERV1 -2324 5232 4675 1 220 307 329 46 54 chr2 155057986 155058273 -26689814 - RLTR6-int LTR ERV1 -5398 2380 1978 1 1768 346 348 19 34 chr2 155058431 155058639 -26689448 - RLTR6-int LTR ERV1 -5836 1720 1516 1 1768 537 276 65 41 chr2 155058666 155058919 -26689168 - RLTR6-int LTR ERV1 -6308 1470 1113 1 1768 1690 180 136 52 chr2 155063058 155063699 -26684388 - RMER21A LTR ERV1 0 842 1 1 1768 3130 117 108 43 chr2 155065203 155065849 -26682238 - RLTR19-int LTR ERVK -2161 3976 3289 1 1768 267 235 86 29 chr2 155066010 155066080 -26682007 - RMER16-int LTR ERVK -5143 263 190 1 1768 270 342 7 7 chr2 155066052 155066199 -26681888 - RNERVK23-int LTR ERVK -7785 432 286 1 1768 265 252 92 67 chr2 155067541 155067660 -26680427 + RLTR25B LTR ERVK 444 565 -463 1 1768 240 292 34 120 chr2 155069741 155069916 -26678171 - MT2B2 LTR ERVL -334 250 91 1 1768 388 39 78 0 chr2 155072500 155072551 -26675536 - ORR1A2 LTR MaLR 0 326 272 1 1768 1789 77 99 15 chr2 155072787 155073050 -26675037 - ORR1A2 LTR MaLR -41 286 2 1 1768 1147 233 59 34 chr2 155085908 155086123 -26661964 - MTD LTR MaLR -8 411 193 2 1768 1147 231 61 34 chr2 155086292 155086380 -26661707 - MTD LTR MaLR -227 192 109 2 1768 1306 182 171 0 chr2 155086421 155086701 -26661386 + MTD LTR MaLR 92 419 0 2 1768 1176 168 277 3 chr2 155088160 155088452 -26659635 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 3 2 1768 227 282 44 97 chr2 155089714 155089828 -26658259 + MT2B LTR ERVL 157 264 -337 2 1768 319 289 7 112 chr2 155092539 155092691 -26655396 + MT2B LTR ERVL 129 264 -337 2 1768 3790 127 66 82 chr2 155093792 155094220 -26653867 - RMER6A LTR ERVK -7 749 316 2 1768 3790 127 66 82 chr2 155094397 155094729 -26653358 - RMER6A LTR ERVK -441 315 1 2 1768 248 250 20 137 chr2 155131209 155131311 -26616776 - MT2B2 LTR ERVL -343 241 152 3 1768 1032 62 39 6 chr2 155164649 155164827 -26583260 - RMER17B LTR ERVK -498 460 277 4 1768 2078 112 45 0 chr2 155173081 155173394 -26574693 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 5 1768 1520 114 3 169 chr2 155175752 155176089 -26571998 + ORR1A4 LTR MaLR 1 281 -48 5 1768 1000 249 158 3 chr2 155178757 155179067 -26569020 + MTD LTR MaLR 48 405 -14 5 1768 949 187 107 57 chr2 155183570 155183870 -26564217 - MTD LTR MaLR -104 315 1 5 1768 444 293 145 10 chr2 155187591 155187791 -26560296 - RMER15 LTR ERVL -13 562 336 5 1769 302 314 44 38 chr2 155194170 155194329 -26553758 + MLT1K LTR MaLR 199 358 -237 5 1769 407 257 98 7 chr2 155195036 155195189 -26552898 - LTR75 LTR ERVL -313 249 83 5 1769 241 257 27 90 chr2 155200196 155200243 -26547844 + MT2B LTR ERVL 183 286 -315 6 1769 1553 176 114 0 chr2 155202404 155202728 -26545359 + ORR1D1 LTR MaLR 2 362 -12 6 1769 2345 227 111 20 chr2 155220134 155220876 -26527211 + RLTR40 LTR ERVK 2 810 -7 6 1769 1884 163 82 9 chr2 155248013 155248354 -26499733 + ORR1B2 LTR MaLR 1 366 -1 7 1769 3145 46 8 5 chr2 155256598 155256993 -26491094 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 7 1769 4847 100 81 82 chr2 155260881 155261793 -26486294 + RMER12 LTR ERVK 1 911 -411 7 1769 586 164 39 54 chr2 155261820 155261949 -26486138 + RMER12 LTR ERVK 1196 1322 0 7 1769 604 253 37 48 chr2 155269447 155269634 -26478453 + RLTR18 LTR ERVK 2 186 -430 7 1769 835 281 87 34 chr2 155269780 155270157 -26477930 + RLTR18 LTR ERVK 111 616 0 7 1769 1952 215 52 55 chr2 155271543 155272084 -26476003 + RLTR20B3 LTR ERVK 21 559 -18 7 1769 685 298 127 15 chr2 155278948 155279345 -26468742 + MTE-int LTR MaLR 61 544 -1191 8 1769 299 293 23 54 chr2 155289298 155289428 -26458659 + MLT1C LTR MaLR 340 465 -2 8 1769 867 216 202 62 chr2 155304610 155304657 -26443430 - MT2B LTR ERVL 0 533 488 8 1769 1275 182 101 39 chr2 155304729 155305128 -26442959 - MT2B LTR ERVL -71 530 1 8 1769 854 221 16 6 chr2 155306058 155306240 -26441847 - RMER20B LTR ERVK -433 194 11 8 1769 1075 189 208 3 chr2 155315030 155315333 -26432754 + ORR1D1 LTR MaLR 3 367 -7 9 1769 386 299 85 89 chr2 155315766 155316082 -26432005 + ORR1E LTR MaLR 41 355 -4 9 1770 1813 145 188 3 chr2 155333636 155333955 -26414132 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 9 1770 2024 127 44 42 chr2 155364186 155364547 -26383540 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 4 365 -2 1 1770 293 234 8 16 chr2 155364636 155364762 -26383325 - ORR1B1-int LTR MaLR -755 754 630 1 1770 856 115 0 0 chr2 155368258 155368380 -26379707 + ORR1A2 LTR MaLR 119 240 -87 1 1770 713 314 91 91 chr2 155385746 155386153 -26361934 - MLT1F1 LTR MaLR -8 561 155 1 1770 2115 82 32 86 chr2 155392947 155393295 -26354792 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 1 1770 358 200 33 174 chr2 155398060 155398181 -26349906 - MT2B LTR ERVL -337 264 161 1 1770 731 148 0 142 chr2 155408862 155409059 -26339028 + RMER10B LTR ERVL 197 365 -33 1 1770 255 265 108 39 chr2 155416192 155416294 -26331793 - ORR1E LTR MaLR -223 136 28 1 1770 3223 95 25 19 chr2 155418959 155419431 -26328656 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 1 1 1770 270 267 35 114 chr2 155424230 155424344 -26323743 - MT2B LTR ERVL -344 257 153 1 1770 656 281 135 25 chr2 155427246 155427490 -26320597 + MTD LTR MaLR 1 271 -148 1 1770 1874 177 101 3 chr2 155427521 155427889 -26320198 + MTC LTR MaLR 18 421 0 1 1771 230 337 103 29 chr2 155471598 155471772 -26276315 + ORR1E LTR MaLR 52 238 -121 1 1771 938 286 132 30 chr2 155471869 155472337 -26275750 + MTE-int LTR MaLR 14 529 -1051 1 1771 338 357 81 81 chr2 155472466 155472823 -26275264 + MTE-int LTR MaLR 491 847 -733 1 1771 329 300 255 74 chr2 155473153 155473447 -26274640 + MTE-int LTR MaLR 853 1199 -381 1 1771 329 361 34 54 chr2 155473629 155473711 -26274376 + MTE-int LTR MaLR 1200 1280 -300 1 1771 255 353 117 67 chr2 155474933 155475173 -26272914 + ORR1E LTR MaLR 106 357 -2 1 1771 1569 217 59 13 chr2 155480316 155480704 -26267383 - MTD LTR MaLR -8 411 6 1 1771 410 199 48 18 chr2 155523631 155523769 -26224318 + RMER21A LTR ERV1 322 512 -435 7 1771 321 286 177 31 chr2 155523963 155524093 -26223994 + RMER21B LTR ERV1 419 567 -275 8 1771 2952 55 0 32 chr2 155524311 155524688 -26223399 - RLTR10B2 LTR ERVK 0 365 1 8 1771 243 299 15 0 chr2 155525106 155525173 -26222914 - RMER15 LTR ERVL -105 470 403 8 1771 699 158 64 109 chr2 155537428 155537584 -26210503 + RMER4B LTR ERVK 17 165 -420 1 1771 469 197 112 58 chr2 155537667 155537889 -26210198 + RMER4B LTR ERVK 316 585 0 1 1771 317 196 0 0 chr2 155538124 155538180 -26209907 + RMER15 LTR ERVL 5 60 -515 1 1771 1217 126 108 0 chr2 155538330 155538544 -26209543 + RMER15 LTR ERVL 339 575 0 1 1771 408 277 81 46 chr2 155540044 155540218 -26207869 - LTR16C LTR ERVL -59 430 251 1 1771 1810 183 96 5 chr2 155541190 155541564 -26206523 + MTD LTR MaLR 1 408 -11 1 1771 2448 86 3 0 chr2 155547703 155548029 -26200058 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 1 1771 272 287 113 0 chr2 155548740 155548855 -26199232 + MLT1L LTR MaLR 353 480 -130 1 1771 665 304 148 45 chr2 155549672 155550092 -26197995 + MLT1K LTR MaLR 128 590 -5 1 1771 397 314 114 68 chr2 155551582 155551881 -26196206 + ORR1E LTR MaLR 1 314 -45 1 1771 945 289 117 63 chr2 155557144 155557316 -26190771 - MLT1D LTR MaLR 0 505 329 1 1771 2191 158 90 5 chr2 155557316 155557704 -26190383 - MTC LTR MaLR 0 421 1 1 1771 945 289 117 63 chr2 155557704 155558010 -26190077 - MLT1D LTR MaLR -177 328 2 1 1771 487 336 55 24 chr2 155562671 155562924 -26185163 + LTR37B LTR ERV1 203 463 -5 1 1771 1787 82 167 31 chr2 155565789 155566007 -26182080 + ORR1A2 LTR MaLR 1 264 -63 1 1771 1787 82 167 31 chr2 155566207 155566276 -26181811 + ORR1A2 LTR MaLR 265 327 0 1 1771 1034 175 110 74 chr2 155572773 155573094 -26174993 + MT2B LTR ERVL 84 529 -72 2 1771 1550 237 30 46 chr2 155573534 155573968 -26174119 - RLTR11A2 LTR ERVK -94 433 7 2 1771 343 182 14 5 chr2 155574037 155574129 -26173958 + MT2B LTR ERVL 440 601 0 2 1771 225 284 164 0 chr2 155582187 155582303 -26165784 - MLT1K LTR MaLR -155 440 306 2 1772 367 337 147 36 chr2 155582769 155583021 -26165066 + LTR16A LTR ERVL 70 349 -102 2 1772 288 158 112 56 chr2 155583858 155583965 -26164122 - RLTR25B LTR ERVK -519 509 397 2 1772 526 221 8 34 chr2 155584355 155584472 -26163615 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 295 2 1772 2260 103 78 9 chr2 155588899 155589243 -26158844 + RLTR9A LTR ERVK 1 368 0 2 1772 287 214 14 41 chr2 155593216 155593289 -26154798 - MTC LTR MaLR -350 71 1 2 1772 1702 129 4 8 chr2 155606546 155606803 -26141284 - MTC LTR MaLR -3 418 163 3 1772 359 174 5 3 chr2 155611205 155611280 -26136807 - MLT1D LTR MaLR 0 505 446 3 1772 278 261 160 21 chr2 155611284 155611378 -26136709 - MLT1D LTR MaLR -387 118 12 3 1772 1431 226 89 41 chr2 155612518 155612910 -26135177 - MTD LTR MaLR 0 419 9 3 1772 365 176 25 157 chr2 155634329 155634450 -26113637 + MT2B LTR ERVL 153 257 -344 3 1772 229 227 71 102 chr2 155657562 155657660 -26090427 - MT2B2 LTR ERVL -344 240 146 4 1772 360 257 8 120 chr2 155667965 155668137 -26079950 - MT2B LTR ERVL -327 257 105 4 1772 230 294 0 14 chr2 155670202 155670271 -26077816 - RMER15 LTR ERVL -105 470 403 4 1772 413 192 35 103 chr2 155676761 155676781 -26071306 - MT2B LTR ERVL -341 260 153 4 1772 869 273 48 74 chr2 155686355 155686667 -26061420 - ORR1E LTR MaLR -31 328 25 4 1772 644 241 134 92 chr2 155691342 155691603 -26056484 + MTEa LTR MaLR 3 274 -105 5 1772 824 241 86 34 chr2 155700662 155700988 -26047099 + RLTR15 LTR ERVK 1 343 -16 5 1772 583 256 169 35 chr2 155701002 155701344 -26046743 + MLT1C LTR MaLR 12 435 -32 5 1772 1106 197 108 36 chr2 155701743 155702022 -26046065 - ORR1D2 LTR MaLR -71 299 1 5 1773 314 169 152 25 chr2 155729946 155730025 -26018062 - RLTR25B LTR ERVK -519 509 421 5 1773 4417 125 89 4 chr2 155742686 155743363 -26004724 + RMER19A LTR ERVK 4 737 0 6 1773 3582 15 2 0 chr2 155746452 155746846 -26001241 + MTA_Mm LTR MaLR 2 396 0 6 1773 278 290 16 0 chr2 155747670 155747732 -26000355 + MER21B LTR ERV1 12 74 -789 6 1773 234 248 26 110 chr2 155749437 155749568 -25998519 - RMER12 LTR ERVK -487 835 711 6 1773 234 248 26 110 chr2 155749713 155749735 -25998352 - RMER12 LTR ERVK -612 710 695 6 1773 264 244 9 143 chr2 155761218 155761235 -25986852 + MT2B2 LTR ERVL 150 152 -432 7 1773 547 94 274 0 chr2 155779813 155779841 -25968246 - RMER17B LTR ERVK -498 460 432 7 1773 547 94 274 0 chr2 155780006 155780094 -25967993 - RMER17B LTR ERVK -527 431 313 7 1773 317 271 31 85 chr2 155780668 155780698 -25967389 - MT2B LTR ERVL -442 159 137 7 1773 613 287 218 19 chr2 155785799 155786140 -25961947 - MLT1F LTR MaLR -13 535 133 7 1773 550 350 43 51 chr2 155786333 155786365 -25961722 - MLT1F LTR MaLR -434 135 105 7 1773 550 350 43 51 chr2 155786568 155786630 -25961457 - MLT1F LTR MaLR -465 104 50 7 1773 226 262 124 53 chr2 155790905 155791018 -25957069 - LTR88b LTR Gypsy? -573 264 144 8 1773 985 248 54 76 chr2 155800715 155801030 -25947057 - MTEa LTR MaLR -71 308 1 8 1773 686 286 107 76 chr2 155823338 155823492 -25924595 - MTE2a LTR MaLR -12 367 205 8 1773 686 286 107 76 chr2 155823525 155823726 -25924361 - MTE2a LTR MaLR -175 204 2 8 1773 1295 82 11 27 chr2 155825350 155825537 -25922550 + RMER6A LTR ERVK 13 196 -560 8 1773 1121 198 293 20 chr2 155826349 155826694 -25921393 - RMER15 LTR ERVL -108 467 29 8 1773 271 267 0 0 chr2 155826718 155826778 -25921309 - RMER15 LTR ERVL -515 60 1 8 1773 2373 185 100 14 chr2 155828296 155828806 -25919281 - RLTR17 LTR ERVK 0 692 139 8 1774 374 274 24 131 chr2 155858524 155858692 -25889395 + MTE2a LTR MaLR 19 168 -211 9 1774 263 267 0 0 chr2 155858784 155858844 -25889243 + MTE2a LTR MaLR 213 272 -107 9 1774 699 284 76 106 chr2 155866571 155867204 -25880883 + RLTR18 LTR ERVK 1 614 -2 9 1774 704 302 79 9 chr2 155867946 155868173 -25879914 + MTE2b LTR MaLR 1 243 -136 9 1774 2183 142 41 15 chr2 155869125 155869517 -25878570 + MTB_Mm LTR MaLR 3 404 -3 9 1774 274 189 0 4 chr2 155879017 155879077 -25869010 - MTD LTR MaLR -14 405 317 9 1774 1343 198 179 22 chr2 155879082 155879439 -25868648 - MTC LTR MaLR -8 413 1 9 1774 4691 184 106 25 chr2 155879439 155879613 -25868474 - MTC-int LTR MaLR 0 1258 1084 9 1774 4691 184 106 25 chr2 155879755 155880744 -25867343 - MTC-int LTR MaLR -175 1083 1 9 1774 1290 190 64 39 chr2 155880744 155880950 -25867137 - MTC LTR MaLR 0 421 201 9 1774 1290 190 64 39 chr2 155880989 155881094 -25866993 - MTC LTR MaLR -221 200 102 9 1774 387 188 75 0 chr2 155883805 155883885 -25864202 - MTC LTR MaLR -335 86 1 9 1774 336 252 65 71 chr2 155883885 155884023 -25864064 - MTC LTR MaLR -60 361 225 9 1774 1120 260 4 29 chr2 155884131 155884404 -25863683 - MTD LTR MaLR -140 279 14 1 1774 1801 231 30 42 chr2 155885895 155886538 -25861549 - RLTR18B LTR ERVK -47 569 1 1 1774 1344 235 31 48 chr2 155887591 155887948 -25860139 + ORR1D2 LTR MaLR 17 367 -3 1 1774 241 306 0 14 chr2 155902150 155902223 -25845864 + MT2B2 LTR ERVL 167 238 -346 1 1774 310 196 20 61 chr2 155937999 155938097 -25809990 + RLTR25B LTR ERVK 428 521 -507 1 1774 578 177 133 0 chr2 155939183 155939296 -25808791 - MT2B LTR ERVL -380 221 94 1 1774 4413 130 38 14 chr2 155939216 155939949 -25808138 - ORR1A3-int LTR MaLR -1212 751 1 1 1774 495 114 0 0 chr2 155939949 155940019 -25808068 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 257 1 1774 2413 141 42 36 chr2 155940056 155940528 -25807559 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 1 1774 26870 15 3 0 chr2 155940528 155943477 -25804610 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 3525 1 1774 946 80 24 0 chr2 155943477 155943602 -25804485 - IAPEz-int LTR ERVK -2770 4910 4783 1 1774 1886 111 4 4 chr2 155943597 155943859 -25804228 - IAPEz-int LTR ERVK -5183 2497 2236 1 1774 446 66 0 32 chr2 155943848 155943911 -25804176 - IAPEz-int LTR ERVK -5062 1419 1359 1 1774 5111 58 5 31 chr2 155943911 155944584 -25803503 - IAPEz-int LTR ERVK -5819 662 8 1 1774 2399 137 47 36 chr2 155944584 155945054 -25803033 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 1 1774 1422 159 67 47 chr2 155945212 155945524 -25802563 - ORR1B1 LTR MaLR -58 336 24 1 1774 7240 111 4 6 chr2 155945524 155946509 -25801578 - MERVL_2A-int LTR ERVL -2538 3223 2158 1 1774 4112 121 6 4 chr2 155946632 155947156 -25800931 - MERVL_2A-int LTR ERVL -3493 2268 1735 1 1774 225 164 15 154 chr2 155947160 155947225 -25800862 - MT2C_Mm LTR ERVL -220 255 200 1 1774 3519 28 13 3 chr2 155947556 155947948 -25800139 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1774 1365 17 111 0 chr2 155962421 155962593 -25785494 + MTA_Mm LTR MaLR 206 396 0 1 1774 4708 17 1 0 chr2 155962593 155963172 -25784915 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 552 -546 1 1774 1089 223 54 21 chr2 155964737 155965017 -25783070 + MTD LTR MaLR 131 419 0 1 1774 533 256 358 50 chr2 155966443 155966745 -25781342 + RLTR20C LTR ERVK 1 440 -111 1 1774 360 261 23 131 chr2 155966938 155966953 -25781134 + RLTR20C LTR ERVK 441 454 -97 1 1774 360 261 23 131 chr2 155967341 155967436 -25780651 + RLTR20C LTR ERVK 455 539 -12 1 1775 238 286 39 13 chr2 155983766 155983844 -25764243 + MTE2a LTR MaLR 299 378 -1 1 1775 1033 181 52 35 chr2 156007335 156007564 -25740523 + RLTR42 LTR ERVK 1 233 -6 7 1775 354 227 25 98 chr2 156008034 156008059 -25740028 + MT2B LTR ERVL 144 159 -442 1 1775 7175 110 46 0 chr2 156010440 156011483 -25736604 - MERVL-int LTR ERVL -129 5356 4266 2 1775 687 151 32 70 chr2 156018331 156018488 -25729599 - MTB_Mm LTR MaLR -256 151 1 6 1775 361 341 56 19 chr2 156020636 156020851 -25727236 + RMER5 LTR ERV1 154 376 -158 7 1775 2271 148 44 54 chr2 156036718 156037196 -25710891 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 473 -2 1 1775 4404 68 37 2 chr2 156037196 156037796 -25710291 + IAPEz-int LTR ERVK 3 662 -5819 1 1775 454 66 0 32 chr2 156037796 156037859 -25710228 + IAPEz-int LTR ERVK 1359 1419 -5062 1 1775 1830 119 4 4 chr2 156037848 156038110 -25709977 + IAPEz-int LTR ERVK 2236 2497 -5183 1 1775 953 80 24 0 chr2 156038105 156038230 -25709857 + IAPEz-int LTR ERVK 4783 4910 -2770 1 1775 5817 14 2 0 chr2 156038232 156038870 -25709217 + IAPEz-int LTR ERVK 4123 4761 -1720 1 1775 6905 27 4 0 chr2 156038869 156039650 -25708437 + IAPEz-int LTR ERVK 5698 6481 0 1 1775 2271 148 44 54 chr2 156039650 156040128 -25707959 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 473 -2 1 1775 1735 199 73 18 chr2 156051141 156051525 -25696562 - MTD LTR MaLR -14 405 1 1 1775 1277 139 58 182 chr2 156054935 156055000 -25693087 - ORR1A4 LTR MaLR -8 386 323 2 1775 1277 139 58 182 chr2 156055185 156055232 -25692855 - ORR1A4 LTR MaLR -72 322 322 2 1775 1607 108 7 66 chr2 156055674 156055961 -25692126 - ORR1A4 LTR MaLR -59 270 1 2 1775 2964 57 44 13 chr2 156059785 156060173 -25687914 + MTB LTR MaLR 1 400 0 2 1775 319 301 21 50 chr2 156069459 156069599 -25678488 - MLT1F LTR MaLR -2 546 411 2 1775 1400 123 428 0 chr2 156074125 156074401 -25673686 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 2 1775 271 306 83 9 chr2 156075107 156075216 -25672871 - LTR33B LTR ERVL -37 466 350 2 1776 455 176 12 0 chr2 156109663 156109748 -25638339 + MTC LTR MaLR 1 86 -335 3 1776 2426 114 53 0 chr2 156109750 156110146 -25637941 + RLTR18 LTR ERVK 148 564 -52 3 1776 572 29 14 0 chr2 156112288 156112358 -25635729 + MTB LTR MaLR 330 400 0 4 1776 281 274 268 0 chr2 156116486 156116643 -25631444 - MLT1A0 LTR MaLR -65 300 102 4 1776 681 271 127 55 chr2 156120645 156120992 -25627095 - MTE2a LTR MaLR -2 377 6 4 1776 355 278 96 40 chr2 156125461 156125660 -25622427 - MT2B LTR ERVL -344 257 48 4 1776 292 316 94 16 chr2 156132633 156132771 -25615316 - ORR1E LTR MaLR -16 378 226 4 1776 307 296 37 12 chr2 156132811 156132893 -25615194 - ORR1E LTR MaLR -275 84 1 4 1776 2553 159 175 19 chr2 156139686 156139869 -25608218 - RMER6D LTR ERVK -25 695 479 4 1776 2553 159 175 19 chr2 156140136 156140546 -25607541 - RMER6D LTR ERVK -242 478 9 4 1776 1990 174 54 33 chr2 156140937 156141366 -25606721 - RMER10A LTR ERVL 0 442 5 4 1776 2503 121 25 20 chr2 156141510 156141908 -25606179 - MTB_Mm LTR MaLR -3 404 5 4 1776 460 61 45 0 chr2 156142453 156142519 -25605568 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 339 4 1776 4812 142 41 18 chr2 156142514 156143370 -25604717 - MTB_Mm-int LTR MaLR -378 880 5 4 1776 3025 47 70 13 chr2 156143376 156143761 -25604326 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 4 1776 3226 130 48 31 chr2 156144155 156144741 -25603346 - RMER6A LTR ERVK -11 745 150 4 1776 1882 164 108 9 chr2 156145321 156145665 -25602422 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 4 1776 1952 180 22 19 chr2 156146297 156146665 -25601422 + ORR1D1 LTR MaLR 1 369 -5 4 1776 1501 125 73 19 chr2 156150565 156150826 -25597261 + RMER21B LTR ERV1 2 276 -566 5 1776 1862 158 74 6 chr2 156154784 156155122 -25592965 - ORR1D1 LTR MaLR -13 361 1 5 1776 1611 216 61 96 chr2 156155204 156155777 -25592310 - RLTR31_Mur LTR ERVK 0 553 1 5 1776 681 261 50 31 chr2 156156969 156157191 -25590896 - RMER15 LTR ERVL -1 574 349 5 1776 1207 212 175 136 chr2 156179908 156180416 -25567671 - MT2A LTR ERVL 0 533 6 5 1776 2207 58 0 23 chr2 156182291 156182590 -25565497 - RLTR4_Mm LTR ERV1 0 742 451 6 1776 1280 80 222 12 chr2 156182567 156182793 -25565294 - RLTR4_Mm LTR ERV1 -468 274 1 6 1776 31502 42 1 1 chr2 156182795 156186633 -25561454 - MuLV-int LTR ERV1 0 7606 3769 6 1776 17188 58 1 5 chr2 156186619 156188839 -25559248 - RLTR4_MM-int LTR ERV1 -5389 2212 1 6 1776 2207 58 0 23 chr2 156188839 156189138 -25558949 - RLTR4_Mm LTR ERV1 0 742 451 6 1776 1280 80 222 12 chr2 156189115 156189341 -25558746 - RLTR4_Mm LTR ERV1 -468 274 1 6 1776 680 276 155 75 chr2 156202331 156202411 -25545676 + MTD LTR MaLR 9 100 -319 6 1776 680 276 155 75 chr2 156202473 156202500 -25545587 + MTD LTR MaLR 101 107 -312 6 1776 680 276 155 75 chr2 156202640 156202880 -25545207 + MTD LTR MaLR 108 385 -34 6 1776 1181 234 193 6 chr2 156206524 156206877 -25541210 - MTD LTR MaLR 0 419 1 6 1776 1379 137 247 30 chr2 156208159 156208459 -25539628 + ORR1B2 LTR MaLR 1 365 -2 6 1776 6931 150 101 57 chr2 156208459 156209133 -25538954 + ORR1B2-int LTR MaLR 1 793 -716 6 1776 6931 150 101 57 chr2 156209277 156210045 -25538042 + ORR1B2-int LTR MaLR 794 1507 -2 6 1776 1372 162 212 13 chr2 156210045 156210351 -25537736 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 6 1776 361 212 9 66 chr2 156211389 156211495 -25536592 - RLTR25B LTR ERVK -488 540 441 6 1776 279 248 0 16 chr2 156211535 156211550 -25536537 - ORR1B1-int LTR MaLR -755 754 634 6 1776 1069 26 0 85 chr2 156218188 156218353 -25529734 - RLTR45-int LTR ERVK -5918 1326 1176 6 1776 1181 30 0 0 chr2 156218531 156218696 -25529391 - RLTR45-int LTR ERVK -6067 1177 1013 6 1776 898 308 13 4 chr2 156222528 156222756 -25525331 - MLT1A0 LTR MaLR -55 310 81 6 1776 2105 165 56 10 chr2 156224494 156224885 -25523202 + MTC LTR MaLR 5 413 -8 7 1777 525 325 146 54 chr2 156238904 156239290 -25508797 + MLT2B4 LTR ERVL 1 431 -89 7 1777 731 294 50 19 chr2 156239885 156240145 -25507942 - MLT1C LTR MaLR 0 467 200 7 1777 273 352 72 0 chr2 156241316 156241441 -25506646 - MLT1I LTR MaLR 0 411 278 7 1777 472 293 133 33 chr2 156251848 156252209 -25495878 - MLT1C LTR MaLR -63 404 5 7 1777 2301 140 16 26 chr2 156260080 156260505 -25487582 - MTC LTR MaLR 0 421 1 7 1777 1286 199 203 6 chr2 156261685 156262031 -25486056 - MTC LTR MaLR -14 407 3 7 1777 2534 136 21 30 chr2 156271251 156271721 -25476366 - RMER6A LTR ERVK 0 756 291 8 1777 513 289 136 47 chr2 156272420 156272656 -25475431 + MLT1A0 LTR MaLR 91 347 -18 8 1777 2158 145 88 3 chr2 156275894 156276282 -25471805 - MTC LTR MaLR 0 421 1 8 1777 610 311 187 14 chr2 156282060 156282419 -25465668 - MLT1D LTR MaLR -60 445 25 8 1777 342 309 105 96 chr2 156333034 156333378 -25414709 - ORR1E LTR MaLR -12 347 1 9 1777 1175 126 87 5 chr2 156354204 156354411 -25393676 - MTD LTR MaLR 0 419 196 9 1777 1096 177 25 5 chr2 156354679 156354883 -25393204 - MTD LTR MaLR -209 210 3 9 1778 3155 87 4 42 chr2 156372169 156372663 -25375424 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 475 0 1 1778 807 275 149 27 chr2 156383178 156383514 -25364573 - MTE2b LTR MaLR 0 379 3 1 1778 274 215 82 41 chr2 156387516 156387613 -25360474 + MT2B2 LTR ERVL 155 255 -329 1 1778 427 123 0 14 chr2 156394749 156394823 -25353264 - MMETn-int LTR ERVK -1066 3778 3706 1 1778 4429 218 81 39 chr2 156397584 156399328 -25348759 + MYSERV6-int LTR ERVK 7814 8863 -96 1 1778 1716 147 97 184 chr2 156399375 156399808 -25348279 + RLTR12B LTR ERVK 23 419 -109 1 1778 1716 147 97 184 chr2 156399955 156400048 -25348039 + RLTR12B LTR ERVK 420 503 -25 1 1778 700 198 110 6 chr2 156400332 156400505 -25347582 - ORR1D1 LTR MaLR -182 192 2 1 1778 967 249 109 35 chr2 156411828 156411928 -25336159 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 303 1 1778 967 249 109 35 chr2 156411959 156412225 -25335862 - ORR1B1 LTR MaLR -92 302 1 1 1778 849 280 108 54 chr2 156414899 156415288 -25332799 - MLT1G3 LTR MaLR -28 567 158 1 1778 1035 149 248 11 chr2 156423551 156423869 -25324218 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 1 1778 1952 155 112 0 chr2 156427437 156427786 -25320301 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 7 1 1778 485 276 84 18 chr2 156432728 156432953 -25315134 - LTR16E2 LTR ERVL -4 564 325 1 1778 2163 98 120 5 chr2 156433305 156433673 -25314414 + BGLII_A LTR ERVK 1 410 -35 1 1778 274 297 68 31 chr2 156463469 156463632 -25284455 + RLTR21 LTR ERVK 1086 1254 -318 1 1778 1380 200 132 6 chr2 156467758 156468090 -25279997 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 1 1778 246 333 197 9 chr2 156496009 156496242 -25251845 - MLT1K LTR MaLR 0 595 319 1 1779 259 241 76 0 chr2 156516760 156516839 -25231248 - MLT1A0 LTR MaLR -280 85 1 3 1779 299 300 49 20 chr2 156517041 156517143 -25230944 - MLT1F LTR MaLR -59 489 385 3 1779 407 367 97 39 chr2 156523733 156524147 -25223940 - LTR16A LTR ERVL -9 442 5 4 1779 519 235 77 88 chr2 156533584 156533622 -25214465 - RLTR11B LTR ERVK 0 453 425 6 1779 2274 110 22 0 chr2 156533622 156533940 -25214147 - ORR1A2 LTR MaLR -2 325 1 6 1779 519 235 77 88 chr2 156533940 156534083 -25214004 - RLTR11B LTR ERVK -29 424 274 6 1779 421 307 79 5 chr2 156540197 156540387 -25207700 - MLT1H-int LTR MaLR -887 522 319 7 1779 878 168 9 148 chr2 156541633 156541694 -25206393 - ORR1C2 LTR MaLR -12 372 343 7 1779 878 168 9 148 chr2 156541836 156542004 -25206083 - ORR1C2 LTR MaLR -42 342 175 7 1779 969 188 10 10 chr2 156542045 156542239 -25205848 - ORR1C2 LTR MaLR -190 194 1 7 1779 2110 139 69 5 chr2 156544787 156545162 -25202925 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 9 8 1779 1533 207 101 16 chr2 156579444 156579812 -25168275 - MTD LTR MaLR 0 419 21 1 1779 360 254 47 74 chr2 156593770 156593919 -25154168 + MER21B LTR ERV1 500 644 -219 1 1779 3459 23 8 2 chr2 156595329 156595723 -25152364 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 1779 1510 104 63 148 chr2 156598874 156598953 -25149134 - ORR1A4 LTR MaLR -8 321 257 1 1779 1510 104 63 148 chr2 156599154 156599425 -25148662 - ORR1A4 LTR MaLR -73 256 1 1 1779 2135 97 19 39 chr2 156611577 156611752 -25136335 + ORR1A3 LTR MaLR 1 179 -147 2 1779 5849 109 16 49 chr2 156611752 156612685 -25135402 - RLTR13D6 LTR ERVK 0 902 1 2 1779 2135 97 18 39 chr2 156612685 156612842 -25135245 + ORR1A3 LTR MaLR 174 326 0 2 1779 496 251 26 6 chr2 156612842 156613001 -25135086 + MuLV-int LTR ERV1 1157 1267 -3796 2 1779 2488 172 110 0 chr2 156613092 156613557 -25134530 - RMER20A LTR ERVK 0 516 1 2 1779 268 232 87 0 chr2 156613607 156613676 -25134411 + MuLV-int LTR ERV1 1648 1722 -6056 2 1779 772 337 96 57 chr2 156614046 156614852 -25133235 + MuLV-int LTR ERV1 1987 2823 -4783 2 1779 4636 255 38 40 chr2 156616217 156616621 -25131466 + MYSERV-int LTR ERVK 1304 1710 -4840 2 1779 4636 255 38 40 chr2 156616768 156616790 -25131297 + MYSERV-int LTR ERVK 1711 1716 -4834 2 1779 4636 255 38 40 chr2 156616975 156617905 -25130182 + MYSERV-int LTR ERVK 1717 2657 -3893 2 1779 660 259 101 72 chr2 156617904 156618302 -25129785 + MYSERV-int LTR ERVK 4818 5159 -1391 2 1779 308 238 117 19 chr2 156618540 156618643 -25129444 + RMER4A LTR ERVK 309 421 -45 2 1779 4712 180 43 72 chr2 156618654 156619716 -25128371 + MYSERV6-int LTR ERVK 7769 8808 -151 2 1779 4712 180 43 72 chr2 156619900 156620009 -25128078 + MYSERV6-int LTR ERVK 8809 8905 -54 2 1779 1194 229 11 111 chr2 156620099 156620544 -25127543 + RLTR11B LTR ERVK 1 410 -118 2 1779 640 290 154 42 chr2 156621210 156621541 -25126546 + RLTR9A LTR ERVK 1 368 0 2 1779 281 302 98 69 chr2 156621543 156621849 -25126238 + RMER16-int LTR ERVK 4 318 -2996 2 1779 720 156 133 0 chr2 156622094 156622229 -25125858 + RMER16-int LTR ERVK 256 408 -4998 2 1779 4338 162 102 50 chr2 156622247 156622629 -25125458 + RMER16-int LTR ERVK 458 908 -4498 2 1779 4338 162 102 50 chr2 156622654 156623035 -25125052 + RMER16-int LTR ERVK 909 1291 -4115 2 1779 4338 162 102 50 chr2 156623228 156623435 -25124652 + RMER16-int LTR ERVK 1292 1478 -3928 2 1779 2401 67 78 6 chr2 156623435 156623779 -25124308 - MURVY-LTR LTR ERV1 0 519 151 2 1779 1141 156 34 59 chr2 156623821 156624059 -25124028 - RLTR20B3 LTR ERVK -345 232 1 2 1779 1050 97 101 10 chr2 156624060 156624259 -25123828 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -1 2325 2109 2 1779 776 203 43 9 chr2 156624279 156624480 -25123607 + RMER12 LTR ERVK 1125 1293 -29 2 1779 2752 302 41 51 chr2 156624502 156625798 -25122289 + MYSERV6-int LTR ERVK 952 2234 -6725 2 1779 4282 241 162 133 chr2 156625799 156626158 -25121929 + MYSERV-int LTR ERVK 4051 4432 -2118 2 1779 3338 43 2 2 chr2 156626158 156626551 -25121536 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 4 2 1779 4282 241 162 133 chr2 156626551 156627148 -25120939 + MYSERV-int LTR ERVK 4433 5057 -1493 2 1779 4282 229 130 109 chr2 156627324 156627836 -25120251 + MYSERV-int LTR ERVK 5058 5585 -965 2 1779 2100 103 9 51 chr2 156627836 156628172 -25119915 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 2 1779 4282 241 162 133 chr2 156628172 156629131 -25118956 + MYSERV-int LTR ERVK 5586 6550 0 2 1779 243 301 27 54 chr2 156629204 156629390 -25118697 + RLTR15 LTR ERVK 48 228 -131 2 1779 2353 169 51 59 chr2 156629473 156629964 -25118123 + RMER15 LTR ERVL 89 575 0 2 1780 565 252 347 54 chr2 156633952 156634272 -25113815 - MTD LTR MaLR 0 419 6 2 1780 2330 100 22 0 chr2 156634904 156635224 -25112863 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 2 1780 232 304 0 55 chr2 156635921 156635994 -25112093 + MTEb LTR MaLR 309 377 -2 2 1780 260 360 10 0 chr2 156636033 156636133 -25111954 + MTE-int LTR MaLR 38 138 -1442 2 1780 568 251 67 12 chr2 156636139 156636288 -25111799 + MTE-int LTR MaLR 300 457 -1123 2 1780 255 332 186 26 chr2 156637391 156637617 -25110470 + MTE-int LTR MaLR 999 1260 -320 2 1780 2546 150 122 25 chr2 156642194 156642678 -25105409 + RMER19B LTR ERVK 1 531 -371 2 1780 584 287 32 96 chr2 156643744 156643884 -25104203 - RLTR41 LTR ERV1 -1 445 313 2 1780 584 287 32 96 chr2 156644053 156644189 -25103898 - RLTR41 LTR ERV1 -134 312 183 2 1780 3772 294 63 53 chr2 156644566 156646689 -25101398 - MuLV-int LTR ERV1 -2418 5188 3045 2 1780 360 313 60 53 chr2 156646728 156647072 -25101015 - MuLV-int LTR ERV1 -4823 2733 2155 2 1780 617 118 10 19 chr2 156647077 156647181 -25100906 - ORR1A1 LTR MaLR -224 103 1 2 1780 13866 56 9 21 chr2 156647181 156647226 -25100861 - ORR1A1-int LTR MaLR 0 1792 1756 2 1780 13866 56 9 21 chr2 156647413 156648887 -25099200 - ORR1A1-int LTR MaLR -37 1755 280 2 1780 13866 56 9 21 chr2 156649031 156649325 -25098762 - ORR1A1-int LTR MaLR -1513 279 1 2 1780 2751 75 3 0 chr2 156649325 156649670 -25098417 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 2 1780 560 302 47 49 chr2 156649696 156650132 -25097955 - MuLV-int LTR ERV1 -6885 893 543 2 1780 394 200 59 34 chr2 156650473 156650592 -25097495 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 325 2 1780 809 255 51 32 chr2 156652434 156652708 -25095379 - LTRIS4 LTR ERV1 0 587 285 3 1780 3879 312 81 70 chr2 156652907 156656367 -25091720 - MMERGLN-int LTR ERV1 0 7556 4060 3 1780 1823 216 120 35 chr2 156656367 156656860 -25091227 - RLTR1 LTR ERV1 0 624 90 3 1780 6568 276 40 53 chr2 156656863 156659228 -25088859 - MMERGLN-int LTR ERV1 0 7556 5222 3 1780 6226 222 21 5 chr2 156659229 156660585 -25087502 - MMERGLN-int LTR ERV1 -2487 5069 2360 3 1780 4180 274 19 34 chr2 156660580 156662065 -25086022 - MuRRS-int LTR ERV1 -4431 3125 1647 3 1780 257 271 51 89 chr2 156675627 156675785 -25072302 + MLT1F-int LTR MaLR 1248 1399 -90 3 1780 269 318 35 0 chr2 156683120 156683205 -25064882 + MTEa LTR MaLR 292 379 0 3 1780 384 171 51 110 chr2 156701095 156701213 -25046874 - MT2B LTR ERVL -337 264 154 4 1780 1223 122 332 10 chr2 156713739 156713883 -25034204 - RLTR25A LTR ERVK -1 1102 906 4 1780 1223 122 332 10 chr2 156713924 156714086 -25034001 - RLTR25A LTR ERVK -198 905 697 4 1780 827 203 34 36 chr2 156716867 156717147 -25030940 + RMER17C LTR ERVK 1 481 -328 4 1780 1010 230 29 20 chr2 156719830 156720074 -25028013 + ORR1D1 LTR MaLR 1 246 -128 4 1780 1184 239 67 62 chr2 156731152 156731571 -25016516 + RMER16 LTR ERVK 113 533 0 4 1780 3151 47 201 2 chr2 156733523 156733950 -25014137 + RLTR1B LTR ERV1 1 512 0 4 1780 2038 135 5 84 chr2 156736689 156737068 -25011019 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 98 5 1780 2158 87 23 0 chr2 156737114 156737413 -25010674 + ORR1A2 LTR MaLR 22 327 0 5 1780 493 219 125 59 chr2 156746233 156746369 -25001718 - ORR1D2 LTR MaLR -225 145 1 5 1780 240 261 114 84 chr2 156746404 156746571 -25001516 + MLT2B4 LTR ERVL 383 554 -2 5 1780 3625 18 0 0 chr2 156749416 156749812 -24998275 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 1780 3276 57 10 12 chr2 156751026 156751434 -24996653 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 5 1780 247 322 25 42 chr2 156756438 156756558 -24991529 - MTD LTR MaLR -102 317 200 5 1780 238 305 28 9 chr2 156758216 156758322 -24989765 - RMER12 LTR ERVK -467 855 748 5 1780 290 287 0 87 chr2 156760048 156760151 -24987936 - MT2B LTR ERVL -354 247 154 5 1781 3511 138 163 8 chr2 156773281 156773919 -24974168 + RMER19A LTR ERVK 1 737 0 5 1781 472 263 65 43 chr2 156793341 156793480 -24954607 - MLT1A LTR MaLR -53 321 180 6 1781 642 191 17 100 chr2 156793547 156793727 -24954360 - MTE2a LTR MaLR 0 379 215 6 1781 734 184 22 152 chr2 156793920 156794144 -24953943 - MTE2a LTR MaLR -184 195 1 6 1781 244 240 133 0 chr2 156794152 156794227 -24953860 - MLT1A LTR MaLR -305 85 1 6 1781 419 294 133 79 chr2 156796004 156796524 -24951563 + MLT1F2 LTR MaLR 4 551 -9 6 1781 3256 60 2 2 chr2 156796673 156797073 -24951014 + MTB LTR MaLR 1 400 0 6 1781 724 319 142 23 chr2 156797152 156797637 -24950450 + MLT1F LTR MaLR 4 546 -2 6 1781 352 299 73 6 chr2 156799650 156799815 -24948272 + ERVL-E-int LTR ERVL 5065 5240 -427 6 1781 427 191 44 39 chr2 156804867 156805047 -24943040 + RMER17C LTR ERVK 91 271 -139 6 1781 1847 104 18 73 chr2 156807128 156807469 -24940618 + ORR1A4 LTR MaLR 8 329 0 6 1781 2120 159 42 0 chr2 156810018 156810376 -24937711 + ORR1D1 LTR MaLR 2 374 0 6 1781 864 183 164 5 chr2 156818489 156818708 -24929379 + MTD LTR MaLR 1 254 -165 7 1781 384 299 63 14 chr2 156820725 156820932 -24927155 - RLTR15 LTR ERVK -95 264 48 7 1781 517 206 15 7 chr2 156826904 156827041 -24921046 + ORR1D1 LTR MaLR 1 138 -236 7 1781 260 105 0 0 chr2 156827040 156827078 -24921009 + ORR1D1 LTR MaLR 328 365 -5 7 1781 409 211 16 95 chr2 156828949 156829075 -24919012 + MT2B LTR ERVL 142 257 -344 7 1781 260 254 56 7 chr2 156833635 156833671 -24914416 + ORR1B1-int LTR MaLR 605 647 -862 7 1781 244 198 89 0 chr2 156835297 156835398 -24912689 - ORR1B1-int LTR MaLR -776 733 624 7 1781 339 335 85 5 chr2 156847472 156847673 -24900414 + LTR16C LTR ERVL 179 395 -94 7 1781 250 222 0 0 chr2 156850318 156850372 -24897715 + LTR16C LTR ERVL 403 456 0 7 1781 1760 168 45 56 chr2 156850619 156850650 -24897437 + ORR1C1 LTR MaLR 1 31 -347 7 1781 1760 168 45 56 chr2 156850840 156851186 -24896901 + ORR1C1 LTR MaLR 32 374 -4 7 1781 4535 14 0 0 chr2 156860392 156860885 -24887202 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 7 1781 2718 174 98 13 chr2 156871595 156872125 -24875962 + RMER15 LTR ERVL 1 575 0 8 1781 518 294 20 0 chr2 156886244 156886390 -24861697 + MLT1D LTR MaLR 7 155 -350 8 1782 1194 263 30 8 chr2 156924585 156924946 -24823141 - ORR1C2 LTR MaLR -15 369 1 9 1782 2759 164 139 27 chr2 156928027 156928768 -24819319 + RMER17B LTR ERVK 1 818 -140 9 1782 2122 152 124 0 chr2 156934019 156934415 -24813672 - BGLII_A LTR ERVK 0 445 1 9 1782 545 314 118 44 chr2 156936904 156937270 -24810817 + MLT1A1 LTR MaLR 16 408 0 9 1782 2060 150 38 5 chr2 156951774 156952143 -24795944 + ORR1B1 LTR MaLR 5 385 -9 1 1782 349 235 133 0 chr2 156952283 156952381 -24795706 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 264 1 1782 238 297 48 19 chr2 156953880 156953978 -24794109 - LTR16E1 LTR ERVL -27 511 411 1 1782 1588 219 143 32 chr2 156962344 156962819 -24785268 - MT2A LTR ERVL -4 529 2 1 1782 3132 23 0 0 chr2 156962959 156963305 -24784782 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 1 1782 359 277 172 80 chr2 156965295 156965632 -24782455 + RLTR9E LTR ERVK 1 406 -3 1 1782 1044 254 86 28 chr2 156968993 156969390 -24778697 - RMER5 LTR ERV1 0 534 115 1 1782 883 157 23 6 chr2 156969883 156970056 -24778031 + MTC LTR MaLR 1 176 -245 1 1782 509 245 72 73 chr2 156970082 156970398 -24777689 + RLTR15 LTR ERVK 34 278 -81 1 1782 361 159 23 4 chr2 156970458 156970559 -24777528 + MTC LTR MaLR 133 233 -174 1 1782 279 196 290 0 chr2 156970722 156970829 -24777258 - ORR1D2 LTR MaLR -78 292 155 1 1782 1479 239 66 44 chr2 156970833 156971333 -24776754 - RMER20A LTR ERVK 0 516 6 1 1782 236 123 328 17 chr2 156971338 156971396 -24776691 - ORR1D2 LTR MaLR -222 162 87 1 1782 1785 158 53 48 chr2 156974129 156974522 -24773565 - MTB_Mm LTR MaLR -8 399 5 1 1782 2082 145 25 5 chr2 156977313 156977681 -24770406 + RLTR14 LTR ERV1 1 375 -7 1 1782 1782 207 150 60 chr2 156977729 156978330 -24769757 + RLTR14-int LTR ERV1 70 724 -4593 1 1782 3994 225 64 24 chr2 156979751 156979833 -24768254 + RMER12 LTR ERVK 1 73 -1249 1 1782 2451 80 6 3 chr2 156979833 156980159 -24767928 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 1 1782 3994 225 64 24 chr2 156980159 156980829 -24767258 + RMER12 LTR ERVK 74 767 -555 1 1782 3994 225 64 24 chr2 156980971 156981165 -24766922 + RMER12 LTR ERVK 768 983 -339 1 1782 3994 225 64 24 chr2 156981312 156981505 -24766582 + RMER12 LTR ERVK 984 1187 -135 1 1782 534 299 28 17 chr2 156981834 156982011 -24766076 + RMER12 LTR ERVK 1144 1322 0 1 1782 323 320 0 0 chr2 156982994 156983097 -24764990 + MLT1A1 LTR MaLR 294 396 -12 1 1782 326 292 52 0 chr2 156984010 156984106 -24763981 + ORR1E LTR MaLR 1 101 -258 1 1782 451 225 315 12 chr2 156984621 156984909 -24763178 - MTE2b LTR MaLR 0 379 6 1 1782 377 241 0 24 chr2 156991314 156991432 -24756655 - ERVL-int LTR ERVL -4984 773 680 1 1782 347 286 0 11 chr2 156991463 156991555 -24756532 - ERVL-int LTR ERVL -4987 770 680 1 1782 294 253 0 32 chr2 156991934 156992028 -24756059 - ERVL-int LTR ERVL -4987 770 680 1 1782 228 274 133 0 chr2 156996726 156996861 -24751226 - RMER5 LTR ERV1 -23 511 359 1 1782 288 261 104 35 chr2 156997634 156997749 -24750338 - RMER5 LTR ERV1 -267 267 145 1 1782 1485 217 116 11 chr2 156997764 156998127 -24749960 + MTD LTR MaLR 7 407 -12 1 1782 460 261 35 21 chr2 156998168 156998313 -24749774 - MTE-int LTR MaLR -96 1484 1338 1 1782 3005 95 5 2 chr2 157004277 157004676 -24743411 + MTB LTR MaLR 1 400 0 1 1782 731 212 112 129 chr2 157005320 157005429 -24742658 + MTD LTR MaLR 9 105 -314 1 1782 731 212 112 129 chr2 157005866 157006038 -24742049 + MTD LTR MaLR 106 290 -129 1 1782 1691 24 0 0 chr2 157006038 157006247 -24741840 + MTB LTR MaLR 192 400 0 2 1782 3999 28 37 0 chr2 157008321 157008779 -24739308 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 475 0 2 222 3487 32 0 130 chr2 157023904 157024405 -24723682 + RLTR10C LTR ERVK 1 436 0 6 1783 347 279 155 42 chr2 157031637 157031850 -24716237 - RMER15 LTR ERVL -22 553 317 8 1783 4161 169 72 61 chr2 157033236 157034241 -24713846 + RLTR25B LTR ERVK 1 1016 -12 8 1783 2681 168 8 18 chr2 157036672 157037180 -24710907 + RMER19C LTR ERVK 109 611 0 9 1783 360 173 13 39 chr2 157038375 157038453 -24709634 + MT2B LTR ERVL 189 264 -337 9 1783 253 227 15 15 chr2 157040363 157040430 -24707657 + RMER15 LTR ERVL 404 470 -105 1 1783 2042 67 156 0 chr2 157044360 157044643 -24703444 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 1 1783 252 250 0 81 chr2 157049346 157049433 -24698654 + MT2B LTR ERVL 161 240 -361 1 1783 233 282 25 25 chr2 157058077 157058157 -24689930 - MT2B2 LTR ERVL -332 252 173 1 1783 226 245 0 54 chr2 157061654 157061710 -24686377 + MT2A LTR ERVL 74 126 -407 1 1783 1216 176 227 113 chr2 157061710 157061997 -24686090 + MT2A LTR ERVL 92 461 -72 1 1783 1216 176 227 113 chr2 157062048 157062157 -24685930 + MT2A LTR ERVL 462 533 0 1 1783 230 264 59 108 chr2 157063177 157063279 -24684808 + MT2B LTR ERVL 161 257 -344 1 1783 3275 53 5 2 chr2 157065001 157065395 -24682692 + MTA_Mm LTR MaLR 2 396 0 1 1783 2461 147 50 0 chr2 157066327 157066728 -24681359 - MTC LTR MaLR 0 421 1 1 1783 2016 120 122 3 chr2 157066967 157067310 -24680777 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 1 1783 4520 14 0 0 chr2 157068444 157068937 -24679150 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 1 1783 753 194 179 93 chr2 157073225 157073600 -24674487 + RMER17C LTR ERVK 4 410 0 2 1783 445 234 87 67 chr2 157073747 157074071 -24674016 - RMER10A LTR ERVL -19 423 63 2 1783 2381 159 42 17 chr2 157074494 157074545 -24673542 + MTC LTR MaLR 2 52 -369 2 1783 2381 159 42 17 chr2 157075315 157075673 -24672414 + MTC LTR MaLR 53 421 0 2 1783 2480 186 74 14 chr2 157075698 157076183 -24671904 + RLTR20A LTR ERVK 1 514 -27 2 1783 379 178 19 115 chr2 157076738 157076888 -24671199 + RMER17C LTR ERVK 89 222 -188 2 1783 379 178 19 115 chr2 157077077 157077135 -24670952 + RMER17C LTR ERVK 223 277 -133 2 1783 290 328 8 101 chr2 157077510 157077639 -24670448 - MT2B LTR ERVL -332 269 153 2 1783 4517 138 19 21 chr2 157077681 157078439 -24669648 - RMER6A LTR ERVK 0 756 1 2 1783 2423 149 60 9 chr2 157079368 157079788 -24668299 + BGLII_B LTR ERVK 1 441 0 2 1783 258 233 169 77 chr2 157081748 157081878 -24666209 - RLTR25B LTR ERVK -509 519 378 2 1783 1040 205 184 86 chr2 157082614 157082873 -24665214 - MTD LTR MaLR 0 419 123 2 1783 1040 205 184 86 chr2 157083300 157083409 -24664678 - MTD LTR MaLR -297 122 13 2 1783 2976 75 31 3 chr2 157084053 157084442 -24663645 - MTB LTR MaLR 0 400 1 2 1783 1935 144 13 122 chr2 157084656 157085042 -24663045 + RMER19B LTR ERVK 1 344 -558 2 1783 322 232 101 25 chr2 157086379 157086578 -24661509 + RMER17C LTR ERVK 197 410 0 2 1783 994 236 261 68 chr2 157088313 157088650 -24659437 + MTD LTR MaLR 1 402 -5 2 1783 2728 162 72 54 chr2 157090172 157090727 -24657360 + RLTR20B3 LTR ERVK 1 565 -12 2 1783 662 208 155 0 chr2 157091768 157091936 -24656151 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 177 2 1783 1680 173 107 0 chr2 157093449 157093785 -24654302 + ORR1D1 LTR MaLR 3 374 0 2 1783 1565 70 0 0 chr2 157100777 157100977 -24647110 + MTB LTR MaLR 193 392 -8 2 1783 261 294 28 56 chr2 157101166 157101274 -24646813 - MT2B LTR ERVL -344 257 153 2 1783 1185 126 50 63 chr2 157101351 157101571 -24646516 + RMER6B LTR ERVK 1 217 -244 2 1783 625 223 129 54 chr2 157102301 157102618 -24645469 + RLTR15 LTR ERVK 2 342 -17 2 1783 469 234 114 82 chr2 157102649 157102741 -24645346 - RLTR20C LTR ERVK 0 578 493 2 1783 1009 203 115 55 chr2 157102786 157103137 -24644950 - RLTR20C LTR ERVK -86 492 1 2 1783 231 217 50 0 chr2 157110528 157110588 -24637499 - MLT1E3 LTR MaLR -6 618 556 3 1783 1765 197 50 47 chr2 157115722 157116126 -24631961 - MTC LTR MaLR -12 409 5 3 1783 587 218 0 31 chr2 157117541 157117669 -24630418 + MTC LTR MaLR 262 385 -36 3 1783 308 181 125 0 chr2 157152464 157152536 -24595551 - MLT1A0 LTR MaLR -284 81 1 3 1784 509 295 71 102 chr2 157172431 157172714 -24575373 + RMER20B LTR ERVK 90 363 -264 4 1784 228 279 25 25 chr2 157179223 157179304 -24568783 - MLT1A1 LTR MaLR -285 123 43 4 1784 1306 201 16 4 chr2 157180866 157181111 -24566976 + ORR1D1 LTR MaLR 3 250 -124 4 1784 2332 112 31 9 chr2 157181124 157181474 -24566613 + ORR1B2 LTR MaLR 2 359 -8 4 1784 2011 224 122 35 chr2 157181478 157182025 -24566062 + ORR1B2-int LTR MaLR 1 595 -914 4 1784 325 262 9 112 chr2 157182199 157182235 -24565852 + MT2B LTR ERVL 132 155 -446 4 1784 2282 108 3 55 chr2 157182701 157182938 -24565149 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 107 4 1784 2282 108 3 55 chr2 157183082 157183188 -24564899 - ORR1A3 LTR MaLR -220 106 1 4 1784 2204 84 26 0 chr2 157183724 157184035 -24564052 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 4 1784 9250 128 151 40 chr2 157184039 157184706 -24563381 + ORR1A2-int LTR MaLR 1 859 -1104 4 1784 9250 128 151 40 chr2 157184835 157185934 -24562153 + ORR1A2-int LTR MaLR 860 1962 -1 4 1784 2442 89 3 3 chr2 157185934 157186259 -24561828 + ORR1A2 LTR MaLR 1 325 -2 4 1784 1714 201 72 8 chr2 157186260 157186697 -24561390 - RLTR11A2 LTR ERVK -56 472 1 4 1784 1155 251 206 8 chr2 157188730 157189065 -24559022 - MTD LTR MaLR -18 401 1 4 1784 533 258 84 187 chr2 157190257 157190567 -24557520 - MLT1C LTR MaLR 0 390 112 4 1784 246 293 35 47 chr2 157191432 157191518 -24556569 - MLT1C LTR MaLR -295 95 11 4 1784 281 289 102 50 chr2 157192056 157192230 -24555857 - MTE2a LTR MaLR -5 374 197 5 1784 467 229 153 7 chr2 157192619 157192807 -24555280 - MLT1F LTR MaLR -207 372 89 5 1784 1419 199 93 39 chr2 157200331 157200390 -24547697 + ORR1D1 LTR MaLR 1 69 -305 5 1784 4391 43 2 10 chr2 157200390 157200906 -24547181 - LTRIS3 LTR ERV1 0 512 1 5 1784 1419 199 93 39 chr2 157200906 157201201 -24546886 + ORR1D1 LTR MaLR 70 374 0 5 1784 1379 181 99 18 chr2 157201662 157202056 -24546031 + RMER17C LTR ERVK 16 444 -514 5 1784 340 305 98 13 chr2 157206392 157206545 -24541542 - MER68 LTR ERVL -139 424 259 5 1784 641 297 72 34 chr2 157207062 157207271 -24540816 - MER68 LTR ERVL -294 269 53 5 1784 244 232 87 174 chr2 157209456 157209488 -24538599 - MT2B LTR ERVL -320 281 244 5 1784 244 232 87 174 chr2 157209641 157209723 -24538364 - MT2B LTR ERVL -358 243 177 5 1784 3380 48 39 28 chr2 157214512 157214943 -24533144 + RLTR10C LTR ERVK 1 436 0 5 1784 1857 100 114 52 chr2 157219079 157219148 -24528939 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 272 5 1784 1857 100 114 52 chr2 157219299 157219536 -24528551 - ORR1A3 LTR MaLR -55 271 1 5 1784 237 284 124 62 chr2 157221716 157221941 -24526146 + RMER21A LTR ERV1 700 938 -9 5 1784 501 257 171 53 chr2 157223958 157224221 -24523866 - MLT2B4 LTR ERVL -226 294 1 5 1784 300 185 75 132 chr2 157225442 157225548 -24522539 - MT2B LTR ERVL -344 257 158 5 1784 266 223 85 25 chr2 157226843 157226980 -24521107 + MLT1A LTR MaLR 272 460 -7 5 1784 291 327 71 54 chr2 157228656 157228908 -24519179 + MLT1D LTR MaLR 150 432 -73 6 1784 340 195 0 99 chr2 157234694 157234785 -24513302 + MT2B LTR ERVL 159 240 -361 6 1784 850 218 113 5 chr2 157235064 157235267 -24512820 + MTD LTR MaLR 14 238 -181 6 1784 259 233 12 96 chr2 157241015 157241128 -24506959 - RMER17C LTR ERVK -136 274 166 6 1784 259 233 12 96 chr2 157241170 157241222 -24506865 - RMER17C LTR ERVK -245 165 123 6 1784 461 201 25 98 chr2 157241281 157241430 -24506657 - MT2B LTR ERVL -320 264 123 6 1784 237 299 109 42 chr2 157243328 157243611 -24504476 - RMER17C LTR ERVK -63 347 46 6 1784 525 214 89 10 chr2 157243846 157243981 -24504106 + MTD LTR MaLR 3 137 -263 6 1784 1554 243 35 8 chr2 157269090 157269459 -24478628 - MTE2b LTR MaLR 0 379 1 7 1784 4161 79 59 11 chr2 157271882 157272455 -24475632 - MT2B LTR ERVL 0 601 1 7 1785 2996 21 18 3 chr2 157310846 157311187 -24436900 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 7 1785 234 426 30 0 chr2 157319481 157319582 -24428505 - RMER12 LTR ERVK -471 851 748 8 1785 273 319 8 87 chr2 157328625 157328642 -24419445 - MT2B2 LTR ERVL -312 272 208 8 1785 273 319 8 87 chr2 157328741 157328752 -24419335 - MT2B2 LTR ERVL -312 207 156 8 1785 935 323 106 0 chr2 157338628 157339080 -24409007 - MLT1F1-int LTR MaLR -988 501 2 8 1785 316 290 275 19 chr2 157339097 157339313 -24408774 - MLT1F1 LTR MaLR -277 271 1 8 1785 1610 203 67 47 chr2 157340820 157341023 -24407064 + MTC LTR MaLR 3 210 -211 8 1785 1610 203 67 47 chr2 157341149 157341348 -24406739 + MTC LTR MaLR 211 413 -8 8 1785 2615 17 0 0 chr2 157353373 157353673 -24394414 + MERVL-int LTR ERVL 4219 4518 -967 8 1785 379 167 46 35 chr2 157353690 157353777 -24394310 + ORR1A3-int LTR MaLR 553 640 -1323 8 1785 301 0 0 0 chr2 157353777 157353815 -24394272 + MERVL-int LTR ERVL 5448 5485 0 8 1785 1815 68 30 19 chr2 157353815 157354085 -24394002 + MT2_Mm LTR ERVL 1 273 -220 8 1785 229 277 63 108 chr2 157361342 157361500 -24386587 + MLT1L LTR MaLR 91 241 -369 9 1785 225 261 67 22 chr2 157361696 157361786 -24386301 + MLT1L LTR MaLR 489 582 -28 9 1785 252 317 0 12 chr2 157364146 157364229 -24383858 - MLT1H1 LTR MaLR -390 165 84 9 1785 2125 132 64 11 chr2 157394492 157394866 -24353221 - RMER10B LTR ERVL 0 398 5 9 1785 503 331 91 60 chr2 157395316 157395769 -24352318 + RLTR12B LTR ERVK 38 504 -24 9 1785 951 289 12 145 chr2 157396292 157396713 -24351374 + MTE2a LTR MaLR 1 365 -14 9 1785 2056 152 26 26 chr2 157396815 157397165 -24350922 - ORR1B2 LTR MaLR -15 352 3 9 1785 550 190 198 23 chr2 157397841 157398013 -24350074 + MTE2a LTR MaLR 147 348 -31 9 1785 552 272 77 42 chr2 157398826 157399122 -24348965 - RMER20B LTR ERVK -181 461 168 9 1785 4976 156 32 21 chr2 157399357 157400208 -24347879 - RMER13A LTR ERVK 0 860 1 9 1785 1509 210 34 131 chr2 157400536 157401008 -24347079 - RLTR23 LTR ERV1 -4 426 1 9 1785 663 314 34 28 chr2 157401058 157401518 -24346569 - RLTR6-int LTR ERV1 -162 7616 7092 9 1785 1865 230 78 44 chr2 157402716 157403257 -24344830 + RLTR17 LTR ERVK 105 619 -73 9 1785 2217 338 64 71 chr2 157403749 157403963 -24344124 - RLTR6-int LTR ERV1 -2384 5394 5176 9 1785 1122 252 54 114 chr2 157403963 157404401 -24343686 + RLTR16 LTR ERVK 1 407 -98 9 1785 1122 252 54 114 chr2 157404475 157404573 -24343514 + RLTR16 LTR ERVK 408 505 0 9 1785 2217 338 64 71 chr2 157404573 157405843 -24342244 - RLTR6-int LTR ERV1 -2603 5175 3940 9 1785 2217 338 64 71 chr2 157406054 157407859 -24340228 - RLTR6-int LTR ERV1 -3839 3939 2125 9 1785 2042 77 22 0 chr2 157408437 157408711 -24339376 + ORR1A2 LTR MaLR 6 285 -42 9 1785 398 60 0 0 chr2 157409320 157409370 -24338717 + ORR1A2 LTR MaLR 277 326 0 9 1785 398 325 26 5 chr2 157409370 157409551 -24338536 - RLTR6-int LTR ERV1 -6086 1692 1548 9 1785 2800 16 25 0 chr2 157411309 157411623 -24336464 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 322 0 9 1785 40458 22 1 3 chr2 157411623 157416477 -24331610 + MMETn-int LTR ERVK 1 4844 0 9 1785 1054 15 61 0 chr2 157416477 157416609 -24331478 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 140 -182 9 1786 3553 23 2 0 chr2 157418409 157418804 -24329283 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 9 1786 643 253 140 81 chr2 157419129 157419451 -24328636 + RMER13A LTR ERVK 1 341 -519 9 1786 3533 25 2 0 chr2 157419464 157419859 -24328228 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 9 1786 828 127 1 10 chr2 157419931 157420073 -24328014 + RLTR16 LTR ERVK 386 561 -7 9 1786 880 166 27 20 chr2 157421952 157422100 -24325987 + RLTR20A LTR ERVK 393 541 0 9 1786 1700 204 52 59 chr2 157422725 157423163 -24324924 - RLTR17 LTR ERVK -152 540 106 9 1786 290 269 98 32 chr2 157425675 157425798 -24322289 - MLT1A1 LTR MaLR -10 398 268 1 1786 1074 284 51 51 chr2 157425829 157425913 -24322174 - MTD LTR MaLR -15 404 326 1 1786 2018 156 56 77 chr2 157425913 157426128 -24321959 - MTC LTR MaLR 0 421 223 1 1786 2018 156 56 77 chr2 157426194 157426212 -24321875 - MTC LTR MaLR -199 222 211 1 1786 2018 156 56 77 chr2 157426357 157426445 -24321642 - MTC LTR MaLR -211 210 106 1 1786 2018 156 56 77 chr2 157426596 157426702 -24321385 - MTC LTR MaLR -316 105 1 1 1786 1074 284 51 51 chr2 157426702 157426948 -24321139 - MTD LTR MaLR -94 325 75 1 1786 250 245 0 0 chr2 157427089 157427138 -24320949 - MLT1A1 LTR MaLR -311 97 49 1 1786 401 282 75 15 chr2 157427356 157427489 -24320598 + MER70B LTR ERVL 4 144 -434 1 1786 313 264 44 62 chr2 157427513 157427626 -24320461 + MER70B LTR ERVL 217 327 -251 1 1786 1964 128 84 105 chr2 157429168 157429596 -24318491 + MTD LTR MaLR 1 419 0 1 1786 277 328 106 50 chr2 157429861 157430002 -24318085 - MLT1A1 LTR MaLR -241 167 19 1 1786 277 249 422 48 chr2 157444407 157444637 -24303450 - MER31B LTR ERV1 -116 350 35 1 1786 2307 88 164 6 chr2 157446226 157446579 -24301508 - IAPLTR2a LTR ERVK -2 409 1 1 1786 8454 49 9 6 chr2 157446581 157447657 -24300430 - IAPEz-int LTR ERVK -2 6479 5400 1 1786 17838 91 27 25 chr2 157447635 157450320 -24297767 - IAPEz-int LTR ERVK -3811 2670 3 1 1786 2307 88 164 6 chr2 157450327 157450680 -24297407 - IAPLTR2a LTR ERVK -2 409 1 1 1786 3060 50 44 3 chr2 157451565 157451949 -24296138 + MTB LTR MaLR 1 400 0 1 1786 294 307 145 66 chr2 157452438 157452679 -24295408 + MER21B LTR ERV1 296 555 -308 1 1786 1373 182 116 53 chr2 157453992 157454294 -24293793 + MTC LTR MaLR 3 323 -98 1 1786 384 159 21 19 chr2 157454929 157455010 -24293077 + MTC LTR MaLR 311 419 0 1 1786 496 194 0 41 chr2 157455709 157455806 -24292281 + MTEb LTR MaLR 279 371 -8 1 1786 1614 144 15 77 chr2 157457998 157458337 -24289750 + RMER17C LTR ERVK 1 318 -92 1 1786 422 345 44 75 chr2 157460734 157461028 -24287059 + RLTR26 LTR ERVK 169 453 -189 1 1786 890 271 54 40 chr2 157461273 157461550 -24286537 + MTEa LTR MaLR 1 281 -98 1 1786 233 276 54 62 chr2 157464398 157464451 -24283636 + ORR1E LTR MaLR 1 55 -304 1 1786 1310 243 101 126 chr2 157464451 157464508 -24283579 - MT2A LTR ERVL 0 533 477 1 1786 1310 243 101 126 chr2 157464538 157465027 -24283060 - MT2A LTR ERVL -57 476 2 1 1786 233 276 54 62 chr2 157465027 157465085 -24283002 + ORR1E LTR MaLR 56 111 -248 1 1786 242 258 91 0 chr2 157469939 157470005 -24278082 + LTR16C LTR ERVL 355 426 -63 1 1786 2665 59 16 0 chr2 157470130 157470452 -24277635 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 1 1786 3390 36 3 0 chr2 157477984 157478368 -24269719 - IAPEY_LTR LTR ERVK 0 385 1 1 1786 21392 43 3 6 chr2 157478370 157481088 -24266999 - IAPEy-int LTR ERVK -2 7511 4804 1 1786 2741 136 11 24 chr2 157481088 157481767 -24266320 - IAPEy-int LTR ERVK -6455 1058 1 1 1786 3390 36 3 0 chr2 157481767 157482151 -24265936 - IAPEY_LTR LTR ERVK 0 385 1 1 1786 619 214 51 103 chr2 157484336 157484419 -24263668 - MTE2b LTR MaLR -192 187 109 1 1786 1270 234 74 77 chr2 157484419 157484798 -24263289 + MTE2a LTR MaLR 1 378 -1 1 1786 619 214 51 103 chr2 157484798 157484870 -24263217 - MTE2b LTR MaLR -271 108 40 1 1786 266 294 153 0 chr2 157484850 157484935 -24263152 - MTE2b LTR MaLR -281 98 1 1 1786 645 313 45 14 chr2 157488401 157488621 -24259466 - LTR16A LTR ERVL -222 229 3 1 1786 1489 186 110 9 chr2 157491954 157492291 -24255796 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 4 1 1786 3371 181 196 57 chr2 157492932 157493724 -24254363 + RMER19B LTR ERVK 1 902 0 1 1786 225 298 52 82 chr2 157496026 157496061 -24252026 - MT2B LTR ERVL -441 160 130 1 1786 291 252 93 78 chr2 157498042 157498171 -24249916 + MLT1A LTR MaLR 239 369 -5 1 1786 1027 223 178 3 chr2 157498343 157498658 -24249429 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 1 1786 5123 147 65 13 chr2 157503606 157504461 -24243626 - RMER19B LTR ERVK 0 902 3 8 1786 1180 234 125 16 chr2 157506404 157506708 -24241379 - MTE2a LTR MaLR -40 339 3 1 1786 1465 267 189 20 chr2 157507010 157507503 -24240584 + MTE-int LTR MaLR 404 979 -601 1 1786 710 177 69 65 chr2 157507585 157507786 -24240301 + ORR1D1 LTR MaLR 208 392 -2 2 1786 1784 258 22 5 chr2 157507786 157508197 -24239890 + MTE-int LTR MaLR 977 1394 -186 1 1786 681 238 61 34 chr2 157508991 157509247 -24238840 + MTE-int LTR MaLR 1188 1558 -22 1 1786 2309 121 11 35 chr2 157509729 157510097 -24237990 - ORR1B2 LTR MaLR -8 359 1 2 1786 7673 154 78 5 chr2 157510097 157511504 -24236583 - ORR1B2-int LTR MaLR 0 1509 1 2 1786 2400 117 28 14 chr2 157511507 157511862 -24236225 - ORR1B2 LTR MaLR -7 360 1 2 1786 1862 224 21 11 chr2 157512029 157512403 -24235684 + MTEa LTR MaLR 2 379 0 2 1786 1811 149 67 27 chr2 157512505 157512836 -24235251 - ORR1D1 LTR MaLR -30 344 1 2 1786 412 241 355 22 chr2 157514358 157514617 -24233470 + RMER20B LTR ERVK 97 441 -75 3 1786 334 296 49 57 chr2 157516362 157516484 -24231603 + MT2B LTR ERVL 156 276 -325 4 1786 779 285 144 56 chr2 157525097 157525561 -24222526 - MLT1D LTR MaLR 0 505 1 7 1786 2213 92 69 0 chr2 157525945 157526251 -24221836 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 7 1786 264 298 99 74 chr2 157532148 157532391 -24215696 + LTR33A LTR ERVL 256 504 -16 9 1786 1340 198 62 4 chr2 157534561 157534820 -24213267 - ORR1D1 LTR MaLR -98 276 3 9 1786 1372 216 99 102 chr2 157536313 157536726 -24211361 + MTD LTR MaLR 8 419 0 1 1786 2032 134 52 127 chr2 157538101 157538527 -24209560 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 1 1786 287 274 31 31 chr2 157539952 157540050 -24208037 + MLT1D LTR MaLR 5 102 -403 1 1786 1966 122 228 7 chr2 157540175 157540587 -24207500 + RLTR28 LTR ERVL 6 508 -16 1 1786 269 284 231 45 chr2 157540712 157540959 -24207128 + MLT1D LTR MaLR 171 463 -4 1 1786 505 339 83 0 chr2 157544150 157544380 -24203707 + MLT1L LTR MaLR 151 399 -211 1 1786 1065 202 45 27 chr2 157544767 157544991 -24203096 - MTD LTR MaLR 0 419 192 1 1786 258 250 0 106 chr2 157545245 157545330 -24202757 - MTD LTR MaLR -250 171 96 1 1786 649 174 166 13 chr2 157545314 157545465 -24202622 + MTE2a LTR MaLR 206 379 0 1 1786 800 183 0 8 chr2 157545542 157545674 -24202413 + MTD LTR MaLR 3 133 -286 1 1786 332 307 123 0 chr2 157545682 157545796 -24202291 - MTE2a LTR MaLR -189 190 63 1 1786 738 191 15 8 chr2 157545832 157545964 -24202123 + RLTR18B LTR ERVK 5 137 -375 1 1786 1502 245 19 109 chr2 157546133 157546554 -24201533 + RLTR18B LTR ERVK 123 505 -7 1 1786 1206 210 143 55 chr2 157546828 157547156 -24200931 - ORR1E LTR MaLR 0 359 3 1 223 630 283 117 108 chr2 157548441 157548810 -24199277 - MTEa LTR MaLR 0 379 8 1 1787 2276 141 78 15 chr2 157549043 157549199 -24198888 + MTC LTR MaLR 1 153 -268 1 1787 2276 141 78 15 chr2 157549257 157549496 -24198591 + MTC LTR MaLR 154 420 -1 1 1787 485 273 29 7 chr2 157549496 157549630 -24198457 - MLT1A0 LTR MaLR -227 138 1 1 1787 276 384 48 0 chr2 157552397 157552522 -24195565 + MLT1J2 LTR MaLR 14 144 -304 1 1787 2298 108 9 36 chr2 157556998 157557334 -24190753 + ORR1A1 LTR MaLR 1 327 0 1 1787 9400 138 97 58 chr2 157557334 157558065 -24190022 + ORR1A1-int LTR MaLR 1 676 -1287 1 1787 2929 59 31 3 chr2 157558065 157558454 -24189633 + MTB LTR MaLR 1 400 0 1 1787 9400 138 97 58 chr2 157558454 157559611 -24188476 + ORR1A1-int LTR MaLR 677 1963 0 1 1787 2316 117 15 3 chr2 157559611 157559953 -24188134 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 1 1787 823 248 102 0 chr2 157560688 157560864 -24187223 - ORR1B2-int LTR MaLR -861 648 450 1 1787 1625 110 0 4 chr2 157560857 157561094 -24186993 - ORR1B2-int LTR MaLR -1270 239 4 1 1787 2303 119 28 14 chr2 157561094 157561451 -24186636 - ORR1B2 LTR MaLR -3 364 3 1 1787 1172 219 86 62 chr2 157570261 157570367 -24177720 - MTEb LTR MaLR 0 379 283 1 1787 1357 213 59 64 chr2 157570367 157570724 -24177363 - ORR1E LTR MaLR 0 359 5 1 1787 1172 219 86 62 chr2 157570724 157570953 -24177134 - MTEb LTR MaLR -97 282 36 1 1787 609 272 166 15 chr2 157590383 157590588 -24157499 + ORR1D2 LTR MaLR 135 370 0 2 1787 2667 148 83 14 chr2 157600904 157601398 -24146689 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 1 2 1787 792 269 114 25 chr2 157616090 157616414 -24131673 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 13 2 1787 508 163 108 8 chr2 157622314 157622444 -24125643 - RMER17B LTR ERVK -495 463 321 2 1787 413 200 23 46 chr2 157625782 157625913 -24122174 - RMER17C LTR ERVK -132 278 151 2 1787 3209 45 13 5 chr2 157629133 157629530 -24118557 - MTB LTR MaLR 0 400 1 2 1787 2328 153 39 12 chr2 157637992 157638401 -24109686 - MTC LTR MaLR -1 420 1 2 1787 309 267 17 152 chr2 157647274 157647451 -24100636 + LTR48 LTR ERV1 5 157 -630 2 1787 228 210 31 156 chr2 157647689 157647785 -24100302 - MT2B2 LTR ERVL -352 232 149 2 1787 1010 187 272 3 chr2 157655588 157655889 -24092198 - ORR1C2 LTR MaLR -2 382 1 3 1787 238 368 32 8 chr2 157657792 157657918 -24090169 + ORR1E LTR MaLR 9 137 -222 3 1787 448 316 125 42 chr2 157668457 157668744 -24079343 + ORR1E LTR MaLR 9 319 -40 3 1787 1230 144 7 44 chr2 157675984 157676259 -24071828 + RMER10B LTR ERVL 1 265 -133 3 1787 1000 143 39 39 chr2 157676268 157676472 -24071615 + RMER10B LTR ERVL 195 398 0 3 1787 2015 156 52 16 chr2 157678574 157678998 -24069089 - RLTR11B LTR ERVK -14 439 1 3 1788 304 340 0 31 chr2 157681801 157681898 -24066189 - MLT1J LTR MaLR -205 307 214 3 1788 963 251 212 14 chr2 157688555 157688918 -24059169 + MLT2B1 LTR ERVL 15 449 -71 3 1788 810 72 24 8 chr2 157691832 157691959 -24056128 + RMER10B LTR ERVL 3 131 -267 3 1788 658 153 82 22 chr2 157691937 157692071 -24056016 + RMER10B LTR ERVL 257 398 0 3 1788 646 267 162 85 chr2 157697083 157697435 -24050652 - MTEb LTR MaLR 0 379 1 3 1788 368 211 10 40 chr2 157716119 157716218 -24031869 - MLT1A1 LTR MaLR -14 394 299 3 1788 472 296 116 28 chr2 157734949 157735130 -24012957 + MLT1B LTR MaLR 190 386 -4 4 1788 688 79 59 0 chr2 157774557 157774658 -23973429 - MTC LTR MaLR -211 210 104 4 1788 896 161 45 35 chr2 157776051 157776251 -23971836 - ORR1D1 LTR MaLR 0 384 183 4 1788 382 147 67 0 chr2 157776226 157776301 -23971786 - ORR1D1 LTR MaLR -128 246 167 4 1788 909 222 0 6 chr2 157776445 157776626 -23971461 - ORR1D1 LTR MaLR -193 181 2 4 1788 229 258 61 0 chr2 157777852 157777918 -23970169 - RLTR22_Mur LTR ERVK -481 1367 1298 4 1788 1672 146 64 18 chr2 157778882 157779242 -23968845 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 12 5 1788 1331 241 16 98 chr2 157780762 157780890 -23967197 + ORR1E LTR MaLR 3 118 -241 5 1788 2671 144 9 14 chr2 157780890 157781313 -23966774 + MTC LTR MaLR 1 421 0 5 1788 1331 241 16 98 chr2 157781313 157781571 -23966516 + ORR1E LTR MaLR 119 357 -2 5 1788 304 350 85 12 chr2 157782213 157782378 -23965709 + MLT1L LTR MaLR 424 600 -10 5 1788 1666 210 228 11 chr2 157782567 157783005 -23965082 - MT2A LTR ERVL 0 533 1 5 1788 247 320 47 28 chr2 157790978 157791084 -23957003 - MLT1J LTR MaLR -210 302 195 5 1788 336 214 236 0 chr2 157791289 157791387 -23956700 - MLT1J LTR MaLR -303 209 49 5 1788 326 346 145 40 chr2 157791884 157792311 -23955776 - LTR16C LTR ERVL -1 488 17 5 1788 225 263 12 144 chr2 157795262 157795342 -23952745 - RLTR22_Mur LTR ERVK -409 1439 1371 5 1788 225 263 12 144 chr2 157795514 157795592 -23952495 - RLTR22_Mur LTR ERVK -478 1370 1302 5 1788 736 264 280 22 chr2 157799295 157799693 -23948394 - RMER5 LTR ERV1 -1 533 33 5 1789 264 286 76 38 chr2 157823063 157823105 -23924982 + MT2B2 LTR ERVL 117 163 -421 6 1789 930 222 118 126 chr2 157840535 157840900 -23907187 + MTE2a LTR MaLR 16 377 -2 6 1789 266 194 83 147 chr2 157849267 157849376 -23898711 - MT2B LTR ERVL -345 256 155 6 1789 323 209 99 50 chr2 157849941 157850062 -23898025 - RLTR13D3 LTR ERVK 0 1114 988 6 1789 657 56 0 0 chr2 157856896 157856985 -23891102 - RMER10B LTR ERVL -2 396 308 6 1789 2117 129 66 16 chr2 157856986 157857364 -23890723 + RMER10B LTR ERVL 2 398 0 6 1789 2191 122 25 0 chr2 157894014 157894335 -23853752 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 7 1789 1931 153 91 47 chr2 157897901 157898264 -23849823 - ORR1C2 LTR MaLR -5 379 1 7 1789 405 290 120 76 chr2 157906806 157907097 -23840990 - MLT2D LTR ERVL 0 562 230 7 1789 495 288 75 41 chr2 157907520 157907751 -23840336 - MLT2D LTR ERVL -143 254 18 7 1789 259 265 145 101 chr2 157910746 157910973 -23837114 + RMER21A LTR ERV1 453 689 -258 7 1789 8407 212 87 84 chr2 157911026 157913725 -23834362 + RodERV21-int LTR ERV1 7 2713 -2278 7 1789 280 218 11 65 chr2 157913919 157914012 -23834075 + RLTR42-int LTR ERVK 798 885 -5252 7 1789 777 222 45 23 chr2 157914119 157914340 -23833747 + RLTR42-int LTR ERVK 1105 1330 -4192 7 1789 1018 234 53 11 chr2 157914479 157914764 -23833323 + RLTR19-int LTR ERVK 3434 3730 -2407 7 1789 404 250 132 20 chr2 157915076 157915227 -23832860 + RLTR19-int LTR ERVK 4188 4355 -1782 7 1789 1088 210 9 27 chr2 157915456 157915676 -23832411 + RodERV21-int LTR ERV1 4440 4655 -336 7 1789 581 317 78 0 chr2 157915804 157916034 -23832053 + MLT1A LTR MaLR 127 374 0 7 1789 618 288 52 31 chr2 157924577 157924806 -23823281 + MLT1F2 LTR MaLR 316 549 -11 8 1789 1037 221 93 58 chr2 157926665 157926718 -23821369 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 334 8 1789 1037 221 93 58 chr2 157926935 157927027 -23821060 - ORR1D1 LTR MaLR -41 333 230 8 1789 1037 179 52 44 chr2 157927077 157927242 -23820845 - ORR1D1 LTR MaLR -145 229 26 8 1789 280 315 26 44 chr2 157929669 157929782 -23818305 + MTE2a LTR MaLR 247 357 -22 8 1789 476 283 94 137 chr2 157930307 157930635 -23817452 + ORR1E LTR MaLR 1 314 -45 8 1789 356 313 59 46 chr2 157935682 157935920 -23812167 + RLTR42-int LTR ERVK 1148 1388 -4134 8 1789 260 245 32 145 chr2 157936067 157936191 -23811896 - RLTR25A LTR ERVK -531 572 463 8 1789 236 330 57 48 chr2 157941040 157941145 -23806942 + LTR33A LTR ERVL 43 148 -372 8 1790 340 321 172 45 chr2 157963920 157964233 -23783854 + MLT1A0 LTR MaLR 13 365 0 9 1790 1263 242 65 81 chr2 157976117 157976335 -23771752 - MTE2a LTR MaLR 0 379 183 9 1790 1263 242 65 81 chr2 157976512 157976675 -23771412 - MTE2a LTR MaLR -197 182 4 9 1790 237 235 10 19 chr2 157981195 157981206 -23766881 + RMER17C LTR ERVK 169 179 -231 9 1790 237 235 10 19 chr2 157981301 157981393 -23766694 + RMER17C LTR ERVK 180 270 -140 9 1790 495 295 158 98 chr2 157984757 157985136 -23762951 + MTD LTR MaLR 18 419 0 9 1790 561 239 69 26 chr2 157985352 157985541 -23762546 + RMER15 LTR ERVL 346 542 -33 9 1790 257 397 13 38 chr2 157988258 157988415 -23759672 + LTR33B LTR ERVL 31 183 -320 9 1790 243 340 74 19 chr2 157988905 157989013 -23759074 + LTR33B LTR ERVL 388 501 -2 9 1790 327 281 22 22 chr2 157992206 157992297 -23755790 + MLT2D LTR ERVL 217 307 -107 9 1790 840 266 196 19 chr2 157994958 157995280 -23752807 + MTEa LTR MaLR 1 379 0 9 1790 3162 72 0 5 chr2 157997208 157997610 -23750477 + MTB LTR MaLR 1 400 0 9 1790 7212 86 35 70 chr2 157997610 157998748 -23749339 + MTB-int LTR MaLR 1 1098 0 9 1790 3245 68 2 2 chr2 157998748 157999148 -23748939 + MTB LTR MaLR 1 400 0 9 1790 775 107 14 58 chr2 158002232 158002371 -23745716 + MTB_Mm LTR MaLR 1 133 -274 3 1790 332 256 196 91 chr2 158003993 158004260 -23743827 - MLT1G1 LTR MaLR -277 318 14 8 1790 957 258 57 79 chr2 158014843 158015250 -23732837 + MTE2b LTR MaLR 3 405 -14 3 1790 351 282 149 64 chr2 158015248 158015577 -23732510 + ORR1D2 LTR MaLR 13 369 -1 4 1790 440 371 143 12 chr2 158016222 158016703 -23731384 - MER21B LTR ERV1 -104 759 217 4 1790 229 375 0 10 chr2 158016743 158016840 -23731247 - MER21B LTR ERV1 -756 107 12 4 1790 1583 200 65 83 chr2 158017528 158017959 -23730128 + RLTR11A2 LTR ERVK 17 439 -88 4 1790 418 247 10 30 chr2 158020268 158020368 -23727719 + MLT1A0 LTR MaLR 251 348 -17 5 1790 250 226 167 31 chr2 158021246 158021342 -23726745 + LTR16C LTR ERVL 379 487 -2 5 1790 1069 196 287 17 chr2 158028004 158028300 -23719787 + MTE2b LTR MaLR 1 376 -3 6 1790 291 359 44 19 chr2 158037634 158037793 -23710294 + MLT1L LTR MaLR 122 284 -326 8 1790 245 340 36 36 chr2 158040995 158041105 -23706982 + LTR16A1 LTR ERVL 92 201 -255 9 1790 418 323 0 31 chr2 158045407 158045535 -23702552 + MLT1K LTR MaLR 146 269 -326 9 1790 1574 188 30 101 chr2 158047512 158047909 -23700178 + ORR1D1 LTR MaLR 6 374 0 9 1790 3815 30 37 4 chr2 158059506 158059966 -23688121 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 1 1790 645 330 197 11 chr2 158061058 158061535 -23686552 + MLT1F1 LTR MaLR 1 566 -3 1 1790 1756 178 71 44 chr2 158062695 158063059 -23685028 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 1 1790 1058 284 40 48 chr2 158063879 158064252 -23683835 - MTEa LTR MaLR -9 370 1 1 1790 2660 77 3 0 chr2 158064784 158065110 -23682977 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 1 1790 410 242 16 24 chr2 158065339 158065462 -23682625 - MTEa LTR MaLR 0 379 258 1 1790 3486 162 33 247 chr2 158065688 158066836 -23681251 - RMER19B LTR ERVK 0 902 1 1 1790 800 298 135 8 chr2 158067941 158068303 -23679784 - MLT1F LTR MaLR -77 471 64 1 1790 2440 138 132 39 chr2 158071125 158071608 -23676479 - RLTR12B LTR ERVK 0 528 1 1 1791 867 219 77 64 chr2 158074610 158074960 -23673127 - MTE2a LTR MaLR -86 333 3 1 1791 2090 164 68 25 chr2 158075051 158075451 -23672636 + MTC LTR MaLR 5 421 0 1 1791 256 227 160 85 chr2 158087468 158087574 -23660513 - MLT1H1 LTR MaLR -4 551 376 1 1791 416 313 101 0 chr2 158091660 158091839 -23656248 - MTEa LTR MaLR -55 324 128 1 1791 430 316 62 68 chr2 158092835 158093204 -23654883 + MLT1A1 LTR MaLR 1 408 0 1 1791 227 320 84 42 chr2 158096242 158096457 -23651630 - RMER12 LTR ERVK -364 958 735 2 1791 243 295 39 0 chr2 158099731 158099809 -23648278 - MLT1B LTR MaLR -37 353 273 2 1791 319 304 8 67 chr2 158102301 158102421 -23645666 - MLT1K LTR MaLR -132 463 351 2 1791 717 203 12 295 chr2 158103829 158104092 -23643995 - RMER12B LTR ERVK -118 1454 1198 2 1791 4312 104 66 30 chr2 158104144 158105302 -23642785 - RMER12B LTR ERVK -151 1253 1 2 1791 1144 158 7 133 chr2 158108344 158108614 -23639473 - RLTR42 LTR ERVK -3 236 1 2 1791 4526 14 0 0 chr2 158112011 158112504 -23635583 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 2 1791 46071 16 6 0 chr2 158112504 158117830 -23630257 + MERVL-int LTR ERVL 1 5360 -125 2 1791 399 167 46 35 chr2 158117830 158117917 -23630170 + ORR1A3-int LTR MaLR 553 640 -1323 2 1791 305 0 0 0 chr2 158117917 158117955 -23630132 + MERVL-int LTR ERVL 5448 5485 0 2 1791 4526 14 0 0 chr2 158117955 158118448 -23629639 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 2 1791 637 241 113 70 chr2 158118933 158119261 -23628826 - RMER15 LTR ERVL -110 465 3 2 1791 430 284 26 8 chr2 158120878 158120995 -23627092 - RMER10B LTR ERVL -5 393 275 2 1791 357 326 43 0 chr2 158121560 158121701 -23626386 - MERVK26-int LTR ERVK -300 6619 6473 2 1791 3216 107 12 43 chr2 158123197 158123687 -23624400 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 1 2 1791 2539 88 5 136 chr2 158124495 158124944 -23623143 - RLTR10 LTR ERVK 0 390 1 2 1791 1562 125 133 84 chr2 158125686 158126009 -23622078 + ORR1A4 LTR MaLR 41 379 -15 2 1791 10046 145 47 87 chr2 158126035 158128077 -23620010 + ORR1A4-int LTR MaLR 5 1963 0 2 1791 2002 98 10 160 chr2 158128077 158128464 -23619623 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 2 1791 257 279 56 34 chr2 158128464 158128553 -23619534 - RMER10B LTR ERVL -37 361 271 2 1791 3290 48 2 5 chr2 158128857 158129256 -23618831 + MTB LTR MaLR 2 399 -1 2 1791 232 274 106 12 chr2 158130005 158130090 -23617997 - MLT1G1 LTR MaLR -394 185 93 2 1791 281 257 28 14 chr2 158133405 158133476 -23614611 - LTR16C LTR ERVL -225 264 193 2 1791 275 276 138 47 chr2 158136013 158136117 -23611970 - MLT1B LTR MaLR -132 258 152 2 1791 275 276 138 47 chr2 158136330 158136457 -23611630 - MLT1B LTR MaLR -239 151 7 2 1791 311 256 10 72 chr2 158142069 158142085 -23606002 + MT2B2 LTR ERVL 151 160 -424 2 1791 1416 212 122 3 chr2 158147381 158147716 -23600371 + MTE2b LTR MaLR 1 375 -4 2 1791 277 318 17 78 chr2 158150667 158150783 -23597304 + LTR33A_ LTR ERVL 42 150 -370 2 1791 290 272 48 19 chr2 158150860 158150965 -23597122 + LTR33A_ LTR ERVL 421 528 -3 2 1791 347 349 74 17 chr2 158152740 158152915 -23595172 - MLT1K LTR MaLR -92 503 319 2 1791 342 289 142 17 chr2 158160063 158160239 -23587848 - LTR16C LTR ERVL 0 489 292 3 1791 1544 229 90 39 chr2 158160434 158160654 -23587433 - MTD LTR MaLR -17 402 204 3 1791 1544 223 90 40 chr2 158160835 158161006 -23587081 - MTD LTR MaLR -216 203 6 3 1791 515 261 146 6 chr2 158161039 158161197 -23586890 - MTEa LTR MaLR -199 180 1 3 1791 764 271 48 146 chr2 158161369 158161624 -23586463 - MTD LTR MaLR -141 278 1 3 1791 835 286 53 50 chr2 158162299 158162601 -23585486 - MLT1A0 LTR MaLR -15 350 48 3 1791 426 318 97 17 chr2 158165639 158165876 -23582211 + MLT1B LTR MaLR 53 308 -82 3 1791 1667 244 27 11 chr2 158166731 158167104 -23580983 - MTE2b LTR MaLR 0 379 1 3 1791 2745 133 14 17 chr2 158170945 158171058 -23577029 + MTC LTR MaLR 1 113 -308 3 1791 2745 133 14 17 chr2 158171254 158171553 -23576534 + MTC LTR MaLR 114 412 -9 3 1791 267 248 82 113 chr2 158171956 158172115 -23575972 - MLT1J LTR MaLR -63 449 296 3 1791 282 231 82 115 chr2 158172392 158172514 -23575573 + LTR41 LTR ERVL 431 548 -220 3 1791 3498 23 2 2 chr2 158172774 158173170 -23574917 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 1791 2701 52 6 0 chr2 158176578 158176903 -23571184 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 3 1791 3939 78 84 16 chr2 158179360 158179910 -23568177 - LTRIS_Mus LTR ERV1 0 587 1 3 1791 966 198 112 37 chr2 158183339 158183607 -23564480 + ORR1D1 LTR MaLR 26 313 -61 3 1791 1229 264 58 120 chr2 158188772 158189172 -23558915 + MTE2b LTR MaLR 1 375 -4 3 1791 5809 165 154 8 chr2 158189531 158190571 -23557516 + RMER12B LTR ERVK 1 1159 -245 3 1791 5809 165 154 8 chr2 158190764 158190813 -23557274 + RMER12B LTR ERVK 1169 1249 -155 3 1791 5809 165 154 8 chr2 158190866 158190965 -23557122 + RMER12B LTR ERVK 1250 1369 -35 3 1791 5300 147 86 26 chr2 158190985 158192006 -23556081 + RLTR21 LTR ERVK 1 1082 -490 3 1791 325 148 82 0 chr2 158192210 158192271 -23555816 + RMER12B LTR ERVK 1339 1404 0 3 1791 458 214 85 52 chr2 158193368 158193521 -23554566 + MTE2a LTR MaLR 235 405 -14 3 1791 280 264 7 21 chr2 158193937 158193973 -23554114 + ORR1B1-int LTR MaLR 614 647 -862 3 1791 768 246 105 63 chr2 158195605 158195939 -23552148 + RLTR9A LTR ERVK 1 348 -20 4 1791 1013 260 133 83 chr2 158196793 158197154 -23550933 - MTEa LTR MaLR 0 379 1 4 1791 1647 171 28 105 chr2 158197322 158197675 -23550412 + ORR1B1 LTR MaLR 1 326 -68 3 1791 523 103 4 0 chr2 158197768 158197853 -23550234 + ORR1B1 LTR MaLR 298 394 0 3 1791 4460 163 48 89 chr2 158198502 158199410 -23548677 - RMER19B LTR ERVK -31 871 1 4 1791 230 224 35 0 chr2 158199529 158199587 -23548500 + MTEb LTR MaLR 302 361 -18 4 1791 300 286 43 87 chr2 158199714 158199829 -23548258 - MLT1A0 LTR MaLR -255 110 1 4 1791 2700 125 5 10 chr2 158203500 158203904 -23544183 - MTC LTR MaLR 0 421 20 4 1792 1200 247 62 102 chr2 158206877 158207178 -23540909 + RLTR18B LTR ERVK 8 322 -190 4 1792 1200 249 63 101 chr2 158207325 158207457 -23540630 + RLTR18B LTR ERVK 228 422 -90 4 1792 442 336 99 58 chr2 158207595 158207733 -23540354 + RLTR18B LTR ERVK 368 511 -1 4 1792 664 222 0 7 chr2 158207901 158208046 -23540041 + RLTR18-int LTR ERVK 139 282 -5079 4 1792 2839 198 41 92 chr2 158210415 158210652 -23537435 + RLTR18-int LTR ERVK 4115 4368 -993 4 1792 2839 198 41 92 chr2 158210813 158211376 -23536711 + RLTR18-int LTR ERVK 4369 4874 -487 4 1792 400 202 0 67 chr2 158211580 158211670 -23536417 + RLTR18B LTR ERVK 411 494 -18 4 1792 1102 225 44 30 chr2 158211659 158211929 -23536158 + ORR1D2 LTR MaLR 97 370 0 4 1792 232 336 73 44 chr2 158212811 158212948 -23535139 + MLT1M LTR MaLR 123 263 -409 4 1792 230 292 151 62 chr2 158215109 158215167 -23532920 + MT2B2 LTR ERVL 99 217 -367 4 1792 230 292 151 62 chr2 158215253 158215288 -23532799 + MT2B2 LTR ERVL 218 293 -291 4 1792 2342 79 3 25 chr2 158216394 158216720 -23531367 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 4 1792 1872 153 25 19 chr2 158216994 158217072 -23531015 + ORR1C1 LTR MaLR 1 80 -298 4 1792 2288 117 3 6 chr2 158217072 158217400 -23530687 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 4 1792 1872 153 25 19 chr2 158217400 158217640 -23530447 + ORR1C1 LTR MaLR 81 321 -57 4 1792 273 234 15 30 chr2 158217683 158217749 -23530338 + ORR1C1 LTR MaLR 320 384 0 4 1792 252 229 16 32 chr2 158217861 158217917 -23530170 - MTE2b LTR MaLR 0 379 325 4 1792 419 157 182 32 chr2 158218320 158218420 -23529667 - MTE2b LTR MaLR -48 322 216 4 1792 635 211 7 22 chr2 158218421 158218557 -23529530 + ORR1D1 LTR MaLR 1 134 -240 4 1792 2081 144 17 117 chr2 158218565 158218983 -23529104 - ORR1C2 LTR MaLR -8 376 1 4 1792 905 196 147 0 chr2 158219012 158219216 -23528871 + ORR1D1 LTR MaLR 141 374 0 4 1792 550 281 15 0 chr2 158219216 158219348 -23528739 - MTE2b LTR MaLR -160 219 86 4 1792 578 293 49 61 chr2 158220677 158220924 -23527163 + RMER5 LTR ERV1 1 244 -290 4 1792 342 230 56 74 chr2 158222820 158222847 -23525240 + MT2B LTR ERVL 133 157 -444 4 1792 1125 83 51 29 chr2 158222932 158223175 -23524912 + RLTR27 LTR ERVK 26 309 0 4 1792 801 286 52 81 chr2 158224333 158224743 -23523344 + MTE2a LTR MaLR 1 406 -13 4 1792 5118 198 80 68 chr2 158224829 158225687 -23522400 - RMER12 LTR ERVK -35 1813 487 4 1792 5118 161 78 40 chr2 158225826 158226292 -23521795 - RMER12 LTR ERVK -836 486 1 4 1792 698 198 174 15 chr2 158227469 158227663 -23520424 - MTEa LTR MaLR -37 342 118 5 1792 332 298 72 96 chr2 158227802 158227969 -23520118 - MTEa LTR MaLR -216 163 1 5 1792 949 225 124 23 chr2 158227969 158228228 -23519859 + MLT1A LTR MaLR 90 374 0 5 1792 375 286 69 69 chr2 158229184 158229357 -23518730 - MLT1G1 LTR MaLR -401 178 6 5 1792 1250 225 75 72 chr2 158232815 158233189 -23514898 + MTE2a LTR MaLR 1 375 -4 5 1792 1370 152 268 3 chr2 158247300 158247631 -23500456 - MTC LTR MaLR 0 421 3 5 1792 1365 43 31 0 chr2 158254332 158254494 -23493593 - RLTR1B-int LTR ERV1 -227 3072 2906 5 1792 800 187 136 54 chr2 158256688 158257004 -23491083 - RLTR15 LTR ERVK -17 342 1 5 1792 4257 145 40 28 chr2 158260143 158260886 -23487201 + RMER6A LTR ERVK 1 752 -4 5 1792 1628 161 3 7 chr2 158277762 158278044 -23470043 - MTE2b LTR MaLR 0 379 99 6 1792 232 327 166 25 chr2 158287374 158287609 -23460478 - LTR16A LTR ERVL -103 348 81 6 1792 433 173 0 113 chr2 158298243 158298367 -23449720 - MT2B LTR ERVL -337 264 155 6 1792 881 257 94 4 chr2 158300273 158300550 -23447537 - MTE2a LTR MaLR 0 379 78 6 1792 571 299 63 41 chr2 158303713 158303990 -23444097 - ORR1E LTR MaLR -79 291 15 6 1792 1098 296 121 42 chr2 158303995 158304548 -23443539 - MTD-int LTR MaLR -43 1537 941 6 1792 696 271 230 10 chr2 158304715 158305006 -23443081 - MTD-int LTR MaLR -1225 355 1 6 1792 1004 266 93 23 chr2 158305027 158305415 -23442672 - MTD LTR MaLR 0 419 5 6 1792 482 300 60 75 chr2 158305415 158305764 -23442323 - ORR1E LTR MaLR -15 344 1 6 1792 309 296 153 0 chr2 158310585 158310774 -23437313 + MLT1E LTR MaLR 70 287 -366 6 1792 3480 11 0 0 chr2 158314697 158315074 -23433013 + MERVL-int LTR ERVL 2609 2985 -2500 6 1792 3819 45 10 2 chr2 158315074 158315612 -23432475 - ORR1A1-int LTR MaLR -273 1519 976 6 1792 2640 126 42 13 chr2 158326195 158326653 -23421434 - RLTR31B_Mm LTR ERVK -86 471 1 7 1792 434 247 37 106 chr2 158326883 158327194 -23420893 - RMER20B LTR ERVK -184 443 95 7 1792 388 261 206 30 chr2 158330998 158331231 -23416856 - ORR1E LTR MaLR -40 319 46 7 1793 547 308 15 58 chr2 158335661 158335898 -23412189 - MLT1B LTR MaLR -202 265 22 7 1793 523 296 121 43 chr2 158339219 158339541 -23408546 - MLT1D LTR MaLR -155 350 4 7 1793 353 243 77 123 chr2 158342239 158342394 -23405693 + MTE2b LTR MaLR 1 148 -231 7 1793 447 281 121 6 chr2 158342623 158342788 -23405299 + MTE2b LTR MaLR 166 349 -30 7 1793 262 324 58 85 chr2 158346831 158346848 -23401239 + RMER12 LTR ERVK 640 661 -661 7 1793 279 273 15 0 chr2 158346848 158346914 -23401173 - MTEb LTR MaLR -24 355 289 7 1793 262 324 58 85 chr2 158346914 158347054 -23401033 + RMER12 LTR ERVK 662 856 -466 7 1793 292 261 66 83 chr2 158347924 158348045 -23400042 - MLT1H LTR MaLR 0 549 431 7 1793 318 250 0 0 chr2 158352543 158352607 -23395480 - MTE2b LTR MaLR -315 64 1 7 1793 303 283 133 106 chr2 158353410 158353658 -23394429 - MLT1G3 LTR MaLR -49 440 212 7 1793 252 319 20 92 chr2 158355227 158355411 -23392676 - RMER4B LTR ERVK -279 187 5 7 1793 1760 154 56 104 chr2 158369268 158369681 -23378406 - RLTR9C LTR ERVK 0 393 1 8 1793 1894 112 22 135 chr2 158370911 158371282 -23376805 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 8 1793 706 325 67 75 chr2 158377181 158377674 -23370413 - LTR16C LTR ERVL 0 489 1 8 1793 387 343 87 71 chr2 158379025 158379279 -23368808 + MLT1B LTR MaLR 3 260 -130 8 1793 4509 14 2 0 chr2 158380414 158380906 -23367181 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 8 1793 663 41 0 0 chr2 158385395 158385492 -23362595 + ORR1A3 LTR MaLR 1 97 -229 8 1793 542 264 21 53 chr2 158394461 158394649 -23353438 + RMER15 LTR ERVL 338 519 -56 8 1793 828 331 66 49 chr2 158398831 158399196 -23348891 - MTEa LTR MaLR -3 376 6 8 1793 2149 129 107 8 chr2 158399691 158400074 -23348013 - MTC LTR MaLR 0 421 1 8 1793 1391 134 37 29 chr2 158401302 158401548 -23346539 + ORR1B1 LTR MaLR 147 394 0 8 1793 993 222 47 47 chr2 158401548 158401791 -23346296 - MT2A LTR ERVL -290 243 1 8 1793 2291 89 13 55 chr2 158403357 158403738 -23344349 + RLTR8 LTR ERVK 1 365 0 8 1793 1833 115 80 50 chr2 158404276 158404614 -23343473 + ORR1B1 LTR MaLR 47 394 0 8 1793 2334 80 3 58 chr2 158406302 158406648 -23341439 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 9 1793 2344 101 0 0 chr2 158407312 158407639 -23340448 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 9 1793 1730 155 112 11 chr2 158408959 158409317 -23338770 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 9 1793 3439 180 42 67 chr2 158411669 158412478 -23335609 + RMER19B LTR ERVK 1 891 -11 9 1793 2145 206 38 106 chr2 158412562 158413215 -23334872 - RMER19C LTR ERVK 0 611 3 9 1793 1930 180 82 8 chr2 158413471 158413863 -23334224 + MTC LTR MaLR 1 421 0 9 1793 2375 127 5 5 chr2 158415101 158415473 -23332614 + RLTR14 LTR ERV1 11 382 0 9 1793 2237 92 16 0 chr2 158422878 158423192 -23324895 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 9 1793 1027 225 148 89 chr2 158427379 158427680 -23320407 + MT2B LTR ERVL 1 383 -201 9 1793 1027 222 30 82 chr2 158427878 158428053 -23320034 + MT2B LTR ERVL 384 561 -40 9 1793 331 328 8 25 chr2 158445672 158445794 -23302293 + LTR16E1 LTR ERVL 419 538 0 9 1793 225 259 0 0 chr2 158447565 158447623 -23300464 + LTR88c LTR Genie? 99 156 -706 9 1793 1798 84 112 0 chr2 158447859 158448146 -23299941 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 9 1793 3285 30 5 0 chr2 158459722 158460116 -23287971 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 1794 283 247 55 22 chr2 158470565 158470656 -23277431 - ORR1E LTR MaLR -210 149 56 1 1794 472 184 50 10 chr2 158471099 158471198 -23276889 + MTEb LTR MaLR 15 117 -262 1 1794 2385 197 15 91 chr2 158471201 158471310 -23276777 + RLTR12A LTR ERVK 23 130 -438 1 1794 2385 197 15 91 chr2 158471487 158471967 -23276120 + RLTR12A LTR ERVK 131 567 -1 1 1794 533 191 151 34 chr2 158472031 158472177 -23275910 + MTEb LTR MaLR 202 364 -15 1 1794 3341 30 2 0 chr2 158475439 158475834 -23272253 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 1794 254 320 57 8 chr2 158476923 158477046 -23271041 - MLT1H2 LTR MaLR -293 196 68 1 1794 666 316 69 43 chr2 158477766 158478070 -23270017 + MLT1B LTR MaLR 1 312 -78 1 1794 326 317 14 119 chr2 158478565 158478708 -23269379 + MLT1B LTR MaLR 390 539 -56 1 1794 266 288 0 0 chr2 158481283 158481349 -23266738 - MLT1B LTR MaLR -295 95 30 1 1794 2465 154 29 5 chr2 158482645 158483056 -23265031 + MTC LTR MaLR 1 421 0 1 1794 9294 70 13 4 chr2 158487028 158488237 -23259850 + MERVL-int LTR ERVL 3111 4330 -1155 1 1794 326 95 120 13 chr2 158488244 158488319 -23259768 + MERVL-int LTR ERVL 5547 5629 -132 1 1794 313 192 13 40 chr2 158488319 158488395 -23259692 + ORR1A3-int LTR MaLR 567 640 -1323 1 1794 301 0 0 0 chr2 158488395 158488433 -23259654 + MERVL-int LTR ERVL 5448 5485 0 1 1794 3109 110 2 37 chr2 158488433 158488925 -23259162 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 475 0 1 1794 380 233 41 41 chr2 158490377 158490498 -23257589 - MLT1B LTR MaLR -2 388 268 1 1794 241 256 10 100 chr2 158497596 158497696 -23250391 - MT2B2 LTR ERVL -346 238 148 1 1794 236 329 42 97 chr2 158504201 158504262 -23243825 + MT2B LTR ERVL 108 159 -442 1 1794 280 324 0 85 chr2 158506674 158506687 -23241400 + MT2B LTR ERVL 153 155 -446 2 1794 2032 175 37 10 chr2 158507186 158507596 -23240491 - MTC LTR MaLR 0 421 1 2 1794 2116 157 14 89 chr2 158511458 158511898 -23236189 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 3 1794 909 235 102 48 chr2 158529337 158529736 -23218351 + ORR1D1 LTR MaLR 3 384 0 6 1794 288 253 221 0 chr2 158533430 158533525 -23214562 - MTEb LTR MaLR 0 379 264 7 1794 320 198 94 47 chr2 158535163 158535269 -23212818 + MLT1A0 LTR MaLR 1 111 -254 8 1794 281 264 68 117 chr2 158535324 158535487 -23212600 + ORR1E LTR MaLR 100 254 -105 8 1794 542 331 0 14 chr2 158535891 158536032 -23212055 - MLT1H2 LTR MaLR -296 193 55 8 1794 1599 222 79 6 chr2 158560804 158561157 -23186930 - MTEb LTR MaLR 0 379 1 1 1794 2514 203 79 55 chr2 158561281 158562069 -23186018 + RMER19B LTR ERVK 1 885 -17 1 1794 843 278 42 120 chr2 158573861 158574267 -23173820 - MTE2a LTR MaLR -14 405 23 1 1794 4372 99 132 9 chr2 158577959 158578632 -23169455 - RMER6A LTR ERVK 0 756 1 1 1794 1531 212 68 49 chr2 158579703 158580173 -23167914 - RLTR20A LTR ERVK 0 541 63 1 1794 729 305 165 17 chr2 158580222 158580639 -23167448 - MLT1F LTR MaLR -78 470 3 1 1794 1482 164 118 47 chr2 158582056 158582439 -23165648 - MTD LTR MaLR 0 419 10 1 1794 376 305 123 60 chr2 158583565 158583816 -23164271 - MLT1C LTR MaLR -37 430 164 1 1794 309 296 166 68 chr2 158586550 158586713 -23161374 - MLT1K LTR MaLR -40 555 377 2 1794 266 362 123 39 chr2 158586792 158586947 -23161140 - MLT1K LTR MaLR -309 286 119 2 1795 227 308 74 42 chr2 158599192 158599287 -23148800 - RLTR25B LTR ERVK -521 507 410 2 1795 1415 204 197 23 chr2 158614673 158615105 -23132982 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 1 2 1795 2450 117 98 0 chr2 158617273 158617649 -23130438 - MTC LTR MaLR -8 413 1 2 1795 463 300 131 29 chr2 158617974 158618180 -23129907 + MLT1K LTR MaLR 1 227 -368 2 1795 336 250 11 74 chr2 158625642 158625737 -23122350 + MT2B LTR ERVL 169 257 -344 2 1795 308 102 119 0 chr2 158629006 158629065 -23119022 - MT2B2 LTR ERVL -344 240 175 2 1795 299 266 28 96 chr2 158634241 158634302 -23113785 + RMER17D LTR ERVK 292 341 -548 3 1795 299 266 28 96 chr2 158634483 158634593 -23113494 + RMER17D LTR ERVK 342 524 -365 3 1795 299 266 28 96 chr2 158634691 158634712 -23113375 + RMER17D LTR ERVK 525 562 -327 3 1795 1881 177 113 0 chr2 158641870 158642243 -23105844 - MTD LTR MaLR -4 415 1 3 1795 1985 164 86 25 chr2 158652687 158653082 -23095005 + MTC LTR MaLR 3 421 0 3 1795 2003 96 101 64 chr2 158662602 158662649 -23085438 - ORR1B2 LTR MaLR -8 359 330 3 1795 2003 96 101 64 chr2 158662836 158663134 -23084953 - ORR1B2 LTR MaLR -38 329 1 3 1795 2795 24 21 0 chr2 158679935 158680274 -23067813 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 3 1795 1396 209 179 94 chr2 158680401 158680484 -23067603 - MT2A LTR ERVL 0 533 465 3 1795 1396 209 179 94 chr2 158680601 158681008 -23067079 - MT2A LTR ERVL -69 464 1 3 1795 755 264 135 17 chr2 158688545 158688855 -23059232 + MTEb LTR MaLR 6 368 -11 3 1795 313 323 36 51 chr2 158690407 158690544 -23057543 + MLT1G LTR MaLR 8 142 -449 3 1795 278 255 178 51 chr2 158690684 158690841 -23057246 + MLT1G LTR MaLR 404 580 -11 3 1795 3013 51 35 2 chr2 158692777 158693171 -23054916 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 3 1795 1049 196 72 0 chr2 158693872 158694107 -23053980 + MTD LTR MaLR 167 418 -1 3 1795 225 241 59 71 chr2 158694945 158695030 -23053057 - MT2B LTR ERVL -364 237 154 4 1795 479 314 120 50 chr2 158699627 158700009 -23048078 + MLT1C LTR MaLR 55 463 -4 4 1795 1518 261 54 10 chr2 158702039 158702430 -23045657 + MTD LTR MaLR 12 419 0 4 1795 298 343 93 77 chr2 158702599 158702899 -23045188 - ORR1E LTR MaLR -6 353 49 4 1795 2042 174 2 69 chr2 158705493 158705900 -23042187 + MT2A LTR ERVL 1 380 -153 4 1795 228 79 53 0 chr2 158705896 158705934 -23042153 + MT2A LTR ERVL 488 527 -6 4 1795 1153 148 11 0 chr2 158706009 158706198 -23041889 - MTC LTR MaLR -219 202 12 4 1795 817 254 97 38 chr2 158710038 158710448 -23037639 + MLT2B4 LTR ERVL 1 496 -60 4 1795 561 240 82 58 chr2 158710979 158711187 -23036900 - MTEb LTR MaLR -116 263 51 4 1795 371 300 0 35 chr2 158714566 158714680 -23033407 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 299 4 1795 227 231 0 19 chr2 158714801 158714854 -23033233 - MLT1A1 LTR MaLR -286 122 71 4 1795 2730 80 43 10 chr2 158716369 158716763 -23031324 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 4 1795 307 260 94 0 chr2 158717050 158717146 -23030941 - MLT1D LTR MaLR -88 417 313 4 1795 1053 239 106 0 chr2 158717222 158717515 -23030572 + ORR1D2 LTR MaLR 1 324 -46 4 1795 298 130 0 4 chr2 158717777 158717835 -23030252 + ORR1D2 LTR MaLR 322 405 -14 4 1795 335 225 180 0 chr2 158721664 158721775 -23026312 + MLT1B LTR MaLR 43 173 -217 4 1795 402 266 25 50 chr2 158721963 158722129 -23025958 - ORR1E LTR MaLR -4 370 199 4 1795 1520 208 33 111 chr2 158722129 158722535 -23025552 - MTE2a LTR MaLR -2 377 6 4 1795 621 339 40 24 chr2 158726417 158726668 -23021419 - MLT1B LTR MaLR -135 255 1 4 1796 244 292 15 0 chr2 158733008 158733073 -23015014 - MLT1J2 LTR MaLR -128 320 255 4 1796 387 310 108 0 chr2 158733091 158733220 -23014867 - MLT1J2 LTR MaLR -243 205 63 4 1796 1235 216 201 27 chr2 158735173 158735511 -23012576 + MTD LTR MaLR 10 406 -13 4 1796 443 253 219 31 chr2 158737100 158737328 -23010759 + RMER15 LTR ERVL 305 575 0 4 1796 542 331 131 45 chr2 158742101 158742436 -23005651 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 7 4 1796 317 271 149 79 chr2 158743121 158743514 -23004573 - MLT1H1 LTR MaLR -15 540 90 5 1796 1419 239 94 19 chr2 158744500 158744862 -23003225 + MTD LTR MaLR 1 389 -30 5 1796 243 333 109 35 chr2 158749621 158749795 -22998292 - MLT1C LTR MaLR -57 410 224 5 1796 328 234 194 45 chr2 158750084 158750218 -22997869 - RMER15 LTR ERVL 0 575 422 5 1796 379 347 30 25 chr2 158750536 158750737 -22997350 + LTR16E1 LTR ERVL 325 526 -12 5 1796 461 136 57 0 chr2 158753292 158753370 -22994717 - MTD LTR MaLR 0 419 337 5 1796 799 306 40 106 chr2 158753370 158753871 -22994216 + RLTR11A LTR ERVK 1 468 -60 5 1796 1164 231 133 16 chr2 158753923 158754231 -22993856 - MTD LTR MaLR -75 344 1 5 1796 238 196 54 0 chr2 158755120 158755176 -22992911 + MTD LTR MaLR 282 340 -79 5 1796 277 218 132 44 chr2 158756770 158756861 -22991226 - ORR1E LTR MaLR -165 194 96 5 1796 281 158 0 34 chr2 158759477 158759536 -22988551 + MLT1A1 LTR MaLR 350 406 -2 5 1796 638 299 118 86 chr2 158761383 158761585 -22986502 + MLT1C LTR MaLR 1 201 -266 5 1796 638 299 118 86 chr2 158761687 158761813 -22986274 + MLT1C LTR MaLR 202 340 -127 5 1796 2168 167 63 37 chr2 158761813 158762223 -22985864 + MTC LTR MaLR 1 421 0 5 1796 4158 148 323 11 chr2 158762223 158763178 -22984909 + MTC-int LTR MaLR 2 1255 -3 5 1796 2692 126 42 5 chr2 158763181 158763587 -22984500 + MTC LTR MaLR 1 421 0 5 1796 638 299 118 86 chr2 158763587 158763666 -22984421 + MLT1C LTR MaLR 341 428 -39 5 1796 230 300 57 108 chr2 158765356 158765513 -22982574 - ORR1D1 LTR MaLR -30 349 201 5 1796 942 149 50 6 chr2 158765550 158765732 -22982355 - ORR1D1 LTR MaLR -184 190 1 5 1796 317 186 42 14 chr2 158766399 158766470 -22981617 - MTD LTR MaLR -5 414 342 5 1796 2409 142 32 3 chr2 158766466 158766841 -22981246 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 1 5 1796 816 249 160 35 chr2 158766840 158766857 -22981230 - MTD LTR MaLR -64 355 343 5 1796 4625 93 2 0 chr2 158766857 158767457 -22980630 - MT2B LTR ERVL 0 601 1 5 1796 816 249 160 35 chr2 158767457 158767751 -22980336 - MTD LTR MaLR -77 342 5 5 1796 598 324 111 27 chr2 158768118 158768416 -22979671 + LTR16C LTR ERVL 142 464 -25 5 1796 2303 90 51 0 chr2 158769854 158770165 -22977922 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 5 1796 448 338 44 94 chr2 158770982 158771272 -22976815 + MTEb LTR MaLR 1 277 -102 5 1796 984 184 31 0 chr2 158772283 158772446 -22975641 - MTE2b LTR MaLR 0 379 212 5 1796 568 259 90 45 chr2 158772535 158772558 -22975529 - MTE2b LTR MaLR -172 187 168 5 1796 743 255 67 39 chr2 158772911 158773119 -22974968 - MTE2b LTR MaLR -165 214 1 5 1796 533 290 62 0 chr2 158773121 158773266 -22974821 - MLT1J1 LTR MaLR -14 430 277 5 1796 1252 153 141 11 chr2 158773610 158773933 -22974154 + MTC LTR MaLR 2 415 -6 5 1796 1200 228 128 53 chr2 158778294 158778669 -22969418 - MTD LTR MaLR -16 403 1 5 1796 355 303 10 0 chr2 158779701 158779800 -22968287 - RMER15 LTR ERVL -105 470 371 5 1796 463 303 25 56 chr2 158780642 158780803 -22967284 + RMER13A LTR ERVK 705 860 0 5 1796 833 283 41 110 chr2 158783384 158783702 -22964385 + MTEa LTR MaLR 9 304 -75 5 1796 234 157 39 103 chr2 158783726 158783804 -22964283 + MTEa LTR MaLR 347 419 0 5 1796 322 274 54 6 chr2 158790305 158790410 -22957677 - MLT1I LTR MaLR -1 447 324 5 1796 336 366 15 92 chr2 158791705 158791976 -22956111 + ORR1E LTR MaLR 69 318 -41 5 1796 1342 246 130 19 chr2 158792385 158792762 -22955325 + MTD LTR MaLR 1 419 0 5 1796 244 296 30 122 chr2 158793577 158793708 -22954379 + MLT1A1 LTR MaLR 71 189 -406 5 1796 668 335 94 46 chr2 158793812 158794247 -22953840 + MT2A LTR ERVL 1 456 -77 6 1796 241 159 44 0 chr2 158794260 158794317 -22953770 - ORR1D1 LTR MaLR -301 66 4 6 1796 240 91 91 0 chr2 158794325 158794369 -22953718 + MT2A LTR ERVL 484 531 -2 6 1796 283 323 101 45 chr2 158794388 158794586 -22953501 + MLT1K LTR MaLR 374 582 -13 6 1796 392 275 0 11 chr2 158795959 158796051 -22952036 + MLT1A1 LTR MaLR 318 408 0 5 1796 552 350 75 62 chr2 158800754 158801226 -22946861 - LTR33A_ LTR ERVL -43 472 3 6 1796 378 189 177 64 chr2 158804558 158804699 -22943388 - RMER15 LTR ERVL -2 573 417 6 1796 306 294 29 73 chr2 158804757 158804893 -22943194 - RMER15 LTR ERVL -445 130 1 6 1796 269 243 122 37 chr2 158804952 158805059 -22943028 - RMER15 LTR ERVL -6 569 454 6 1796 336 303 88 39 chr2 158805060 158805242 -22942845 + MLT1D LTR MaLR 46 236 -269 6 1796 1418 224 129 3 chr2 158806409 158806781 -22941306 + MTD LTR MaLR 1 419 0 6 1796 516 217 26 0 chr2 158806781 158806896 -22941191 + MTD-int LTR MaLR 1 118 -1140 6 1796 597 276 94 6 chr2 158811813 158811984 -22936103 - MLT1F LTR MaLR -362 186 1 6 1796 659 314 115 31 chr2 158812570 158812976 -22935111 + MLT1G1 LTR MaLR 1 467 -112 6 1796 269 326 10 21 chr2 158817942 158818039 -22930048 - MLT1H LTR MaLR -361 188 93 6 1796 749 329 87 71 chr2 158819017 158819511 -22928576 - MLT1D LTR MaLR 0 505 4 6 1796 526 318 84 81 chr2 158821151 158821538 -22926549 + MLT2B1 LTR ERVL 15 542 -20 6 1796 3353 188 95 7 chr2 158821617 158822378 -22925709 - RMER19B LTR ERVK -236 666 1 6 1796 1685 183 136 21 chr2 158825000 158825374 -22922713 + MTD LTR MaLR 2 418 -1 6 1796 234 376 51 0 chr2 158827054 158827171 -22920916 - MLT1K LTR MaLR -18 577 455 6 1796 367 322 56 62 chr2 158827190 158827352 -22920735 + MLT2F LTR ERVL 1 161 -502 6 1796 443 276 142 11 chr2 158828171 158828354 -22919733 - MER92B LTR ERV1 -399 237 31 6 1796 583 240 141 10 chr2 158829130 158829336 -22918751 + MLT1B LTR MaLR 60 292 -98 6 1796 831 326 41 58 chr2 158835516 158835858 -22912229 - MLT1I LTR MaLR 0 411 76 6 1796 1044 252 93 74 chr2 158836474 158836838 -22911249 + MTE2a LTR MaLR 4 374 -5 6 1796 296 278 102 10 chr2 158837916 158838014 -22910073 + MLT1A1 LTR MaLR 23 129 -279 6 1796 508 301 36 73 chr2 158838696 158838915 -22909172 + RMER15 LTR ERVL 350 560 -15 6 1796 342 306 43 36 chr2 158844212 158844351 -22903736 - ORR1E LTR MaLR -167 192 53 6 1796 713 291 64 38 chr2 158847224 158847460 -22900627 + MLT1G3 LTR MaLR 28 269 -326 6 1796 1350 256 75 30 chr2 158847609 158848008 -22900079 + MTD LTR MaLR 3 419 0 6 1796 1400 216 71 46 chr2 158848086 158848454 -22899633 - MTE2b LTR MaLR -2 377 1 6 1796 258 241 0 0 chr2 158848894 158848948 -22899139 + MTEb LTR MaLR 1 54 -325 7 1796 240 395 0 0 chr2 158852742 158852828 -22895259 - MLT1I LTR MaLR -9 402 317 7 1797 658 276 69 19 chr2 158861824 158862174 -22885913 - MTD LTR MaLR -39 380 1 7 1797 1058 252 121 16 chr2 158863198 158863520 -22884567 - MLT1B LTR MaLR -34 356 1 7 1797 863 224 82 5 chr2 158864263 158864447 -22883640 + MTD LTR MaLR 134 331 -88 7 1797 511 367 11 72 chr2 158867784 158868027 -22880060 + MTE-int LTR MaLR 17 243 -1337 7 1797 1213 201 7 183 chr2 158868027 158868491 -22879596 - ORR1C2 LTR MaLR -2 382 1 7 1797 511 367 11 72 chr2 158868491 158868526 -22879561 + MTE-int LTR MaLR 244 278 -1302 7 1797 682 289 29 24 chr2 158868513 158868722 -22879365 + MTE-int LTR MaLR 1329 1538 -42 7 1797 318 276 194 58 chr2 158868734 158868976 -22879111 + ORR1E LTR MaLR 32 253 -106 7 1797 912 250 162 25 chr2 158870688 158871105 -22876982 - RMER15 LTR ERVL -6 569 2 7 1797 660 290 95 41 chr2 158872314 158872630 -22875457 + ORR1E LTR MaLR 27 359 0 7 1797 576 308 116 56 chr2 158872934 158873245 -22874842 - ORR1E LTR MaLR -2 357 27 7 1797 576 308 116 56 chr2 158873274 158873299 -22874788 - ORR1E LTR MaLR -333 26 2 7 1797 1019 289 42 36 chr2 158875313 158875486 -22872601 - MTEa LTR MaLR -4 375 204 7 1797 1019 289 42 36 chr2 158875539 158875674 -22872413 - MTEa LTR MaLR -176 203 66 7 1797 2213 176 0 34 chr2 158875949 158876336 -22871751 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 7 1797 3618 76 4 11 chr2 158877526 158878002 -22870085 - MT2C_Mm LTR ERVL -1 474 2 7 1797 811 314 92 27 chr2 158888520 158888949 -22859138 + MLT1E2 LTR MaLR 137 617 -7 7 1797 305 259 118 0 chr2 158896291 158896376 -22851711 + MTE2a LTR MaLR 3 97 -282 7 1797 289 213 0 0 chr2 158896376 158896437 -22851650 + MTE2a LTR MaLR 57 117 -262 7 1797 714 284 47 111 chr2 158896632 158896929 -22851158 + MTE2a LTR MaLR 102 379 0 7 1797 1196 244 80 16 chr2 158897100 158897450 -22850637 + MTD LTR MaLR 1 382 -37 7 1797 538 249 113 27 chr2 158898285 158898603 -22849484 + MTEa LTR MaLR 3 377 -2 7 1797 278 288 85 39 chr2 158899382 158899512 -22848575 + ORR1E LTR MaLR 1 136 -223 7 1797 236 275 0 36 chr2 158899643 158899726 -22848361 + ORR1E LTR MaLR 278 357 -22 7 1797 626 258 81 9 chr2 158899864 158900075 -22848012 - LTR16A1 LTR ERVL -22 434 209 7 1797 250 320 66 113 chr2 158901912 158902169 -22845918 - LTR16A1 LTR ERVL -244 245 1 7 1797 266 318 207 6 chr2 158903107 158903281 -22844806 + LTR33A_ LTR ERVL 319 527 -4 7 1797 3596 131 10 63 chr2 158905633 158906311 -22841776 - RLTR26 LTR ERVK 0 642 1 8 1797 1421 260 24 40 chr2 158907795 158908172 -22839915 - MTE2b LTR MaLR -6 373 3 8 1797 1182 183 297 3 chr2 158909083 158909373 -22838714 + ORR1C1 LTR MaLR 1 375 -3 8 1797 1765 221 57 0 chr2 158911197 158911581 -22836506 + MTD LTR MaLR 1 406 -13 8 1797 325 216 20 102 chr2 158915280 158915378 -22832709 - MLT1J1 LTR MaLR -248 196 107 8 1797 452 342 139 65 chr2 158916790 158917385 -22830702 + MLT1E1A LTR MaLR 8 646 -7 8 1797 481 278 133 20 chr2 158918911 158919106 -22828981 - MLT1F2 LTR MaLR -2 558 342 8 1797 1278 187 67 24 chr2 158919117 158919555 -22828532 - MT2A LTR ERVL 0 533 33 8 1797 1885 201 49 0 chr2 158919558 158919967 -22828120 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 1897 2325 -1 8 1797 2509 191 73 6 chr2 158919968 158920463 -22827624 + RLTR11A LTR ERVK 1 528 0 8 1797 461 294 83 54 chr2 158920503 158920744 -22827343 - MLT1F2 LTR MaLR -278 282 35 8 1797 1869 171 122 9 chr2 158924835 158925261 -22822826 - RMER19B LTR ERVK -12 890 417 8 1797 903 216 52 72 chr2 158925272 158925522 -22822565 - RMER19B LTR ERVK -657 245 1 8 1797 649 235 193 47 chr2 158926666 158926987 -22821100 + RLTR9A LTR ERVK 1 368 0 8 1797 1460 224 19 108 chr2 158934497 158934912 -22813175 + MTE2a LTR MaLR 2 379 0 8 1797 2718 85 8 37 chr2 158942192 158942594 -22805493 + RLTR10 LTR ERVK 1 390 0 8 1797 1658 156 82 12 chr2 158943952 158944283 -22803804 + ORR1B1 LTR MaLR 41 394 0 8 1797 1260 247 43 20 chr2 158946299 158946355 -22801732 - ORR1E LTR MaLR 0 359 303 8 1797 1260 247 43 20 chr2 158946396 158946690 -22801397 - ORR1E LTR MaLR -57 302 2 8 1797 646 338 86 11 chr2 158946700 158947050 -22801037 + LTR16C LTR ERVL 93 468 -21 8 1797 667 296 73 35 chr2 158951412 158951727 -22796360 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 104 8 1797 480 135 38 208 chr2 158951749 158951908 -22796179 - RLTR23 LTR ERV1 -291 139 8 8 1797 2440 188 12 33 chr2 158956863 158957127 -22790960 - RLTR19C LTR ERVK 0 506 254 8 1797 2467 164 26 72 chr2 158957127 158957707 -22790380 - RLTR31_Mur LTR ERVK 0 553 1 8 1797 2440 188 12 33 chr2 158957707 158957959 -22790128 - RLTR19C LTR ERVK -253 253 1 8 1797 228 296 163 0 chr2 158960435 158960533 -22787554 + LTR16C LTR ERVL 3 116 -373 8 1797 1056 246 98 67 chr2 158962448 158962806 -22785281 - MTEa LTR MaLR -9 370 2 8 1797 353 315 89 54 chr2 158962851 158963140 -22784947 + MLT1H2 LTR MaLR 1 345 -204 8 1797 250 303 80 53 chr2 158963573 158963723 -22784364 + MLT1H2 LTR MaLR 393 546 -3 8 1797 2947 159 8 15 chr2 158968451 158968982 -22779105 + RLTR11A LTR ERVK 1 527 -1 9 1797 1664 178 17 92 chr2 158969665 158970067 -22778020 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 3 9 1797 2159 106 42 0 chr2 158973183 158973495 -22774592 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 3 9 1797 1290 197 154 31 chr2 158976194 158976550 -22771537 - MTD LTR MaLR -2 417 18 9 1797 942 219 32 176 chr2 158982874 158983311 -22764776 - MTE2a LTR MaLR 0 379 6 9 1798 2204 105 18 12 chr2 158991786 158992113 -22755974 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 9 1798 2900 138 55 20 chr2 158996141 158996651 -22751436 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 1 9 1798 700 290 130 44 chr2 158997151 158997488 -22750599 + MLT2B3 LTR ERVL 3 464 -103 9 1798 304 286 35 2 chr2 158999430 158999549 -22748538 - MLT1D LTR MaLR -378 127 6 9 1798 1442 255 53 31 chr2 159001737 159002093 -22745994 + ORR1D2 LTR MaLR 1 364 -6 2 1798 861 259 98 95 chr2 159003343 159003659 -22744428 - MTEa LTR MaLR -59 320 4 4 1798 2770 102 32 5 chr2 159009637 159010041 -22738046 - MTC LTR MaLR -6 415 1 1 1798 4979 174 99 54 chr2 159010041 159011244 -22736843 - MTC-int LTR MaLR 0 1258 2 1 1798 1368 164 6 10 chr2 159011244 159011485 -22736602 - MTC LTR MaLR -1 420 186 1 1798 544 279 64 94 chr2 159013214 159013462 -22734625 + ORR1D2 LTR MaLR 122 370 0 1 1798 462 350 71 35 chr2 159015823 159016285 -22731802 - LTR16B1 LTR ERVL -1 479 1 2 1798 2398 153 37 2 chr2 159021852 159022258 -22725829 - RLTR9B2 LTR ERVK 0 420 1 3 1798 1797 176 38 93 chr2 159023692 159024088 -22723999 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 3 1798 682 243 0 7 chr2 159026641 159026782 -22721305 + ORR1E LTR MaLR 4 143 -216 3 1798 360 143 28 14 chr2 159027583 159027654 -22720433 - MTEb LTR MaLR -2 377 306 4 1798 251 311 7 129 chr2 159028182 159028322 -22719765 - MTEb LTR MaLR -55 324 202 4 1798 956 279 81 28 chr2 159028757 159029151 -22718936 + MTD LTR MaLR 5 419 0 4 1798 864 266 54 48 chr2 159030288 159030604 -22717483 + RMER19C LTR ERVK 1 318 -293 4 1798 428 306 50 50 chr2 159033645 159034010 -22714077 - MLT2B1 LTR ERVL -70 497 6 5 1798 602 340 99 19 chr2 159034173 159034485 -22713602 + MLT1G1 LTR MaLR 1 337 -242 5 1798 375 354 51 17 chr2 159038764 159038942 -22709145 - MLT1A1 LTR MaLR -168 240 57 6 1798 1351 196 105 25 chr2 159046716 159047039 -22701048 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 41 7 1798 1996 193 48 25 chr2 159053178 159053955 -22694132 + RMER17B LTR ERVK 1 893 -13 8 1798 2586 161 55 11 chr2 159055604 159056062 -22692025 + RLTR28B LTR ERVL 1 478 -3 8 1798 555 294 59 18 chr2 159056340 159056562 -22691525 - RMER15 LTR ERVL 0 575 345 8 1798 226 150 0 0 chr2 159061589 159061629 -22686458 + MTC LTR MaLR 262 301 -120 9 1798 1156 262 73 6 chr2 159064292 159064607 -22683480 - MTD LTR MaLR 0 419 84 1 1798 481 311 78 69 chr2 159070003 159070248 -22677839 - MLT1C LTR MaLR 0 467 221 1 1798 1401 205 210 41 chr2 159072043 159072495 -22675592 + RLTR12B LTR ERVK 1 528 0 1 1798 846 301 60 9 chr2 159077618 159077953 -22670134 - MLT1B LTR MaLR 0 390 39 1 1798 543 287 125 43 chr2 159080150 159080594 -22667493 - MT2A LTR ERVL -16 517 1 1 1798 566 312 12 6 chr2 159081917 159082088 -22665999 - ORR1E LTR MaLR -182 177 6 1 1798 414 393 54 0 chr2 159089337 159089561 -22658526 - MLT1A0 LTR MaLR -112 253 18 1 1798 332 293 102 18 chr2 159093561 159093728 -22654359 - MTEb LTR MaLR 0 379 199 1 1798 915 252 121 9 chr2 159094876 159095208 -22652879 + ORR1D2 LTR MaLR 1 369 -1 1 1798 428 314 40 90 chr2 159097383 159097761 -22650326 + ORR1E LTR MaLR 1 359 0 1 1798 1148 240 77 65 chr2 159097835 159098249 -22649838 - MTD LTR MaLR 0 419 1 1 1798 354 214 42 12 chr2 159100300 159100400 -22647687 - MTD LTR MaLR -15 404 224 1 1798 888 258 16 32 chr2 159100404 159100656 -22647431 - MTD LTR MaLR -160 259 12 1 1798 336 266 74 30 chr2 159100673 159100808 -22647279 - MTD-int LTR MaLR 0 1258 1148 1 1799 2107 134 3 67 chr2 159124162 159124506 -22623581 + ORR1A3 LTR MaLR 5 326 0 1 1799 1052 222 149 79 chr2 159125856 159126198 -22621889 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 5 2 1799 240 245 61 0 chr2 159126349 159126398 -22621689 + MLT1E1 LTR MaLR 1 52 -602 2 1799 985 310 61 57 chr2 159126430 159126957 -22621130 + MT2A LTR ERVL 3 531 -2 2 1799 547 302 46 102 chr2 159127433 159127720 -22620367 + MLT1E3 LTR MaLR 343 641 -13 2 1799 870 258 66 15 chr2 159128348 159128620 -22619467 - RMER15 LTR ERVL -17 558 273 2 1799 271 374 16 0 chr2 159130006 159130129 -22617958 + HERV16-int LTR ERVL 713 837 -4159 2 1799 1201 257 66 26 chr2 159133790 159134138 -22613949 + MTEb LTR MaLR 1 362 -17 2 1799 300 275 64 55 chr2 159149427 159149603 -22598484 + MLT1C LTR MaLR 251 418 -49 2 1799 260 425 39 6 chr2 159150379 159150561 -22597526 + LTR16A LTR ERVL 259 446 -5 2 1799 1920 154 89 17 chr2 159150661 159151104 -22596983 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 8 2 1799 793 259 53 91 chr2 159155532 159155906 -22592181 - MLT2D LTR ERVL -49 365 6 2 1799 353 305 81 58 chr2 159156254 159156428 -22591659 + LTR88b LTR Gypsy? 118 295 -542 2 1799 246 347 104 33 chr2 159156762 159156944 -22591143 - MLT1J2 LTR MaLR -210 238 44 2 1799 235 267 33 65 chr2 159161616 159161708 -22586379 + MLT1D LTR MaLR 3 91 -414 2 1799 394 314 123 61 chr2 159161758 159162019 -22586068 + MLT1D LTR MaLR 226 502 -3 2 1799 1690 229 75 28 chr2 159162969 159163369 -22584718 + MTD LTR MaLR 1 419 0 2 1799 3332 61 10 2 chr2 159167386 159167783 -22580304 + MTB LTR MaLR 1 400 0 2 1799 1463 244 53 69 chr2 159168230 159168650 -22579437 + RLTR16 LTR ERVK 3 407 -98 2 1799 1463 244 53 69 chr2 159168704 159168790 -22579297 + RLTR16 LTR ERVK 408 500 -5 2 1799 2117 135 8 74 chr2 159169254 159169606 -22578481 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 2 1799 951 176 13 0 chr2 159185761 159185943 -22562144 + MTC LTR MaLR 1 186 -233 3 1799 1218 189 20 136 chr2 159197035 159197432 -22550655 + RMER10A LTR ERVL 1 351 -91 3 1799 299 178 0 61 chr2 159198368 159198434 -22549653 + RLTR42-int LTR ERVK 906 967 -5170 3 1799 526 249 120 70 chr2 159198448 159198520 -22549567 + RLTR42-int LTR ERVK 1529 1603 -3919 3 1799 526 237 148 49 chr2 159198547 159198752 -22549335 + RLTR42-int LTR ERVK 1604 1782 -3740 3 1799 858 261 47 87 chr2 159199172 159199875 -22548212 + RLTR42-int LTR ERVK 1871 2875 -3262 3 1799 283 235 0 125 chr2 159199992 159200104 -22547983 + RLTR42-int LTR ERVK 2938 3035 -3102 3 1799 579 228 64 137 chr2 159200381 159200491 -22547596 + RMER17C-int LTR ERVK 2627 2730 -508 3 1799 579 228 64 137 chr2 159200742 159200880 -22547207 + RMER17C-int LTR ERVK 2731 2857 -381 3 1799 2664 166 12 28 chr2 159201427 159201939 -22546148 + RMER19C LTR ERVK 12 610 -1 3 1799 378 384 70 33 chr2 159204139 159204352 -22543735 - LTR16A LTR ERVL -146 305 85 3 1799 391 168 162 36 chr2 159204824 159204935 -22543152 - RLTR24 LTR ERV1 -18 511 387 3 1799 598 270 58 49 chr2 159206055 159206281 -22541806 - MLT1K LTR MaLR -12 583 356 3 1799 1878 129 12 81 chr2 159207279 159207624 -22540463 - ORR1A4 LTR MaLR -8 321 1 3 1799 538 115 32 19 chr2 159207624 159207730 -22540357 - ORR1B1 LTR MaLR -260 134 1 3 1799 1132 257 147 3 chr2 159212632 159212952 -22535135 - ORR1D2 LTR MaLR -4 366 1 3 1799 6687 55 24 9 chr2 159221819 159222615 -22525472 - RLTR13C2 LTR ERVK 0 808 1 3 1799 506 261 358 39 chr2 159226004 159226318 -22521769 - MLT1B LTR MaLR -5 462 1 3 1799 4635 126 8 8 chr2 159232192 159232920 -22515167 - RMER19A LTR ERVK 0 737 10 3 1799 268 309 71 7 chr2 159241105 159241245 -22506842 + MLT1C LTR MaLR 13 161 -306 3 1799 1438 156 58 18 chr2 159241247 159241522 -22506565 + RLTR11A LTR ERVK 1 286 -242 3 1799 532 186 10 0 chr2 159241510 159241612 -22506475 + RLTR11A LTR ERVK 426 528 0 3 1799 308 339 59 29 chr2 159241706 159241876 -22506211 + MLT1C LTR MaLR 256 430 -37 3 1799 346 358 83 36 chr2 159245421 159245699 -22502388 + MLT2B3 LTR ERVL 264 554 0 3 1800 1537 214 20 82 chr2 159259583 159259986 -22488101 + RLTR1B LTR ERV1 135 512 0 4 1800 1213 226 107 23 chr2 159265306 159265651 -22482436 + MTE2b LTR MaLR 6 379 0 4 1800 1176 355 75 20 chr2 159266926 159267484 -22480603 + MER21B LTR ERV1 20 608 -255 4 1800 284 319 60 93 chr2 159267644 159267827 -22480260 + MER21B LTR ERV1 612 788 -75 4 1800 453 239 9 26 chr2 159273554 159273670 -22474417 - RLTR26 LTR ERVK -5 637 524 4 1800 1131 238 121 20 chr2 159273692 159274040 -22474047 - RLTR26 LTR ERVK -231 411 29 4 1800 490 344 119 5 chr2 159274831 159275245 -22472842 - LTR16B1 LTR ERVL -3 477 17 4 1800 884 263 48 86 chr2 159279025 159279435 -22468652 + MTE2a LTR MaLR 3 405 -14 4 1800 3874 33 19 0 chr2 159281073 159281501 -22466586 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 4 1800 8241 37 0 0 chr2 159281501 159282437 -22465650 - MMERVK10C-int LTR ERVK 0 7581 6646 4 1800 42665 41 0 1 chr2 159282423 159287367 -22460720 - MMERVK10C-int LTR ERVK -1771 5810 870 4 1800 2703 92 53 3 chr2 159287365 159287745 -22460342 - MMERVK10C-int LTR ERVK -7182 399 1 4 1800 3868 35 19 0 chr2 159287745 159288173 -22459914 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 4 1800 483 385 48 32 chr2 159289353 159289664 -22458423 - LTR16A LTR ERVL -1 450 135 4 1800 906 113 18 36 chr2 159295529 159295694 -22452393 - RLTR10 LTR ERVK -2 388 227 4 1800 2435 42 16 0 chr2 159295762 159296073 -22452014 - RLTR10 LTR ERVK -74 316 1 4 1800 345 272 36 72 chr2 159299299 159299410 -22448677 - MLT1B LTR MaLR -176 214 108 4 1800 2864 148 2 7 chr2 159300855 159301276 -22446811 + MTC LTR MaLR 1 419 -2 4 1800 482 301 88 29 chr2 159311000 159311262 -22436825 - MT2A LTR ERVL -1 600 340 4 1800 436 275 34 28 chr2 159311326 159311502 -22436585 - MTD LTR MaLR -257 162 10 4 1800 409 291 122 41 chr2 159320557 159320754 -22427333 + MLT1J LTR MaLR 238 450 -62 4 1800 226 262 50 0 chr2 159321336 159321416 -22426671 + RLTR47_MM LTR ERV1 125 208 -324 4 1800 1143 232 251 48 chr2 159321504 159321976 -22426111 - RMER4B LTR ERVK -17 568 1 4 1800 242 204 0 0 chr2 159322991 159323035 -22425052 + ORR1D1 LTR MaLR 9 52 -332 4 1800 1027 201 58 129 chr2 159323132 159323474 -22424613 + ORR1D1 LTR MaLR 57 374 0 4 1800 292 345 113 59 chr2 159324381 159324812 -22423275 + LTR16D LTR ERVL 169 667 -8 4 1800 550 340 66 7 chr2 159327743 159328030 -22420057 + MLT1C LTR MaLR 14 317 -150 5 1800 640 349 32 138 chr2 159334756 159335258 -22412829 - MLT1-int LTR MaLR -56 1315 867 5 1800 635 323 101 34 chr2 159337156 159337573 -22410514 + MLT1C LTR MaLR 23 467 0 5 1800 681 261 118 25 chr2 159348239 159348553 -22399534 - RLTR15 LTR ERVK -16 343 1 5 1800 549 350 25 10 chr2 159350917 159351119 -22396968 + LTR33 LTR ERVL 309 513 -2 5 1800 249 303 97 35 chr2 159359140 159359253 -22388834 - LTR16C LTR ERVL -292 197 78 5 1800 1741 186 117 56 chr2 159362276 159362669 -22385418 - MTC LTR MaLR -2 419 3 5 1800 264 331 117 99 chr2 159362708 159363238 -22384849 + MLT1E LTR MaLR 7 644 -9 5 1800 606 312 160 11 chr2 159369636 159369905 -22378182 + MLT1D LTR MaLR 33 341 -164 5 1800 476 314 34 63 chr2 159371999 159372320 -22375767 - MLT1A1 LTR MaLR -4 404 60 5 1800 380 313 17 9 chr2 159383059 159383175 -22364912 + MTE2b LTR MaLR 1 117 -262 5 1801 561 256 25 19 chr2 159383863 159384022 -22364065 + MTD LTR MaLR 1 160 -259 5 1801 225 204 41 0 chr2 159384021 159384070 -22364017 + MTD LTR MaLR 297 347 -12 5 1801 843 258 47 79 chr2 159386958 159387408 -22360679 + MT2B LTR ERVL 1 542 -59 5 1801 1663 221 40 3 chr2 159388907 159389256 -22358831 - MTD LTR MaLR -57 362 1 5 1801 307 230 93 23 chr2 159389671 159389800 -22358287 + RMER15 LTR ERVL 404 541 -34 5 1801 278 222 79 79 chr2 159393932 159394059 -22354028 + RMER15 LTR ERVL 61 187 -388 5 1801 432 290 62 0 chr2 159394202 159394347 -22353740 + RMER15 LTR ERVL 422 575 0 5 1801 358 235 136 25 chr2 159394354 159394472 -22353615 + MLT1E2 LTR MaLR 111 241 -386 5 1801 642 317 64 18 chr2 159394696 159394975 -22353112 + MLT1E2 LTR MaLR 365 678 -2 5 1801 316 367 7 26 chr2 159399796 159399947 -22348140 + MLT1H LTR MaLR 126 273 -276 5 1801 235 256 125 55 chr2 159400077 159400205 -22347882 + LTR88c LTR Genie? 217 353 -509 6 1801 261 209 45 0 chr2 159400298 159400365 -22347722 + MLT1F1 LTR MaLR 3 72 -497 6 1801 1796 196 86 11 chr2 159402034 159402416 -22345671 + MTC LTR MaLR 2 412 -9 6 1801 238 244 46 58 chr2 159402666 159402753 -22345334 + RMER15 LTR ERVL 68 153 -422 6 1801 400 286 23 0 chr2 159402871 159403004 -22345083 + RMER15 LTR ERVL 426 561 -14 6 1801 2401 188 19 41 chr2 159403105 159403435 -22344652 - RMER19C LTR ERVK -1 610 279 6 1801 2401 171 32 52 chr2 159403762 159403988 -22344099 - RMER19C LTR ERVK -333 278 1 6 1801 346 282 45 8 chr2 159406827 159406959 -22341128 + RMER15 LTR ERVL 423 559 -16 6 1801 2900 158 62 41 chr2 159410741 159411301 -22336786 - RMER15 LTR ERVL 0 575 4 6 1801 270 299 11 0 chr2 159412042 159412129 -22335958 + MLT1C LTR MaLR 29 116 -351 6 1801 491 255 14 75 chr2 159415949 159416161 -22331926 + RLTR15 LTR ERVK 1 199 -160 6 1801 324 360 42 5 chr2 159417268 159417480 -22330607 + LTR33A LTR ERVL 301 520 0 6 1801 1925 133 19 0 chr2 159420347 159420656 -22327431 + ORR1A2 LTR MaLR 5 319 -8 6 1801 2077 166 9 0 chr2 159421475 159421818 -22326269 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 6 1801 617 98 80 9 chr2 159425803 159425916 -22322171 - RMER17C LTR ERVK -289 121 1 6 1801 254 253 11 33 chr2 159438087 159438177 -22309910 - MLT1A1 LTR MaLR -1 407 320 6 1801 583 188 36 0 chr2 159440230 159440342 -22307745 - MTC LTR MaLR -3 418 303 6 1801 992 128 0 0 chr2 159440954 159441110 -22306977 - MTC LTR MaLR -36 385 230 6 1801 307 389 64 0 chr2 159441961 159442164 -22305923 + MLT1C LTR MaLR 250 465 -2 6 1801 326 302 30 23 chr2 159449898 159450030 -22298057 - LTR16C LTR ERVL -4 485 353 6 1801 388 319 261 11 chr2 159452564 159452859 -22295228 - ORR1E LTR MaLR -8 371 4 6 1801 538 302 97 4 chr2 159454667 159454893 -22293194 + RMER15 LTR ERVL 327 573 -2 6 1801 2041 172 103 3 chr2 159456164 159456543 -22291544 - MTC LTR MaLR 0 421 5 6 1801 260 372 51 98 chr2 159459820 159460076 -22288011 + MLT1C LTR MaLR 208 451 -16 6 1801 249 359 70 30 chr2 159460449 159460650 -22287437 - MLT1J1 LTR MaLR -177 267 59 6 1801 504 261 53 8 chr2 159476387 159476518 -22271569 - MTE2a LTR MaLR -9 370 234 7 1801 466 288 45 0 chr2 159476561 159476693 -22271394 - MTE2a LTR MaLR -241 138 1 7 1801 864 306 113 21 chr2 159501258 159501595 -22246492 + MTE2b LTR MaLR 1 368 -11 3 1801 324 336 131 40 chr2 159505130 159505458 -22242629 + MLT1E3 LTR MaLR 107 464 -160 5 1801 425 342 166 19 chr2 159507853 159508166 -22239921 - ORR1E LTR MaLR 0 359 1 8 1802 3553 148 104 19 chr2 159525200 159525836 -22222251 + RMER6C LTR ERVK 1 690 0 3 1802 1788 190 87 0 chr2 159526104 159526451 -22221636 - ORR1B1 LTR MaLR -13 381 5 3 1802 2840 160 101 91 chr2 159530056 159530244 -22217843 + RMER19C LTR ERVK 1 219 -392 3 1802 2840 160 101 91 chr2 159530290 159530706 -22217381 + RMER19C LTR ERVK 220 611 0 3 1802 1600 235 95 11 chr2 159549697 159550076 -22198011 - MTD LTR MaLR -8 411 1 5 1802 1552 227 70 3 chr2 159552080 159552424 -22195663 + ORR1D2 LTR MaLR 4 370 0 5 1802 774 285 139 61 chr2 159554093 159554489 -22193598 + MLT1H LTR MaLR 7 433 -116 6 1802 341 374 29 0 chr2 159571097 159571236 -22176851 - ORR1E LTR MaLR -214 145 3 9 1802 3079 17 0 0 chr2 159575524 159575870 -22172217 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 9 1802 408 337 47 41 chr2 159577220 159577462 -22170625 + MLT1H2 LTR MaLR 273 555 0 1 1802 403 333 74 91 chr2 159580068 159580421 -22167666 + ORR1E LTR MaLR 12 358 -1 1 1802 798 253 158 36 chr2 159580745 159581081 -22167006 + MTE2b LTR MaLR 3 379 0 1 1802 1105 236 109 18 chr2 159582819 159583104 -22164983 + MTD LTR MaLR 1 311 -108 1 1802 4108 70 9 13 chr2 159583108 159583658 -22164429 + LTRIS2 LTR ERV1 17 564 0 1 1802 454 176 75 32 chr2 159583664 159583758 -22164329 + MTD LTR MaLR 315 412 -7 1 1802 443 52 17 0 chr2 159603123 159603181 -22144906 - ORR1A4 LTR MaLR -4 325 267 1 1802 1246 193 3 85 chr2 159604057 159604351 -22143736 - ORR1A4 LTR MaLR -59 270 1 1 1802 1975 138 32 132 chr2 159604765 159604826 -22143261 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 309 1 1802 1975 138 32 132 chr2 159605412 159605756 -22142331 - ORR1B2 LTR MaLR -59 308 1 1 1802 3758 165 87 8 chr2 159605756 159605918 -22142169 - ORR1B2-int LTR MaLR 0 1509 1335 1 1802 3758 165 87 8 chr2 159605968 159606588 -22141499 - ORR1B2-int LTR MaLR -175 1334 665 1 1802 1833 214 63 10 chr2 159608307 159608703 -22139384 + MTD LTR MaLR 3 419 0 1 1802 1537 259 49 23 chr2 159611604 159612075 -22136012 - RMER20A LTR ERVK 0 516 34 1 1802 3868 185 28 61 chr2 159632413 159632815 -22115272 - MTC-int LTR MaLR -460 798 384 1 1802 3868 185 28 61 chr2 159632921 159632944 -22115143 - MTC-int LTR MaLR -875 383 383 1 1802 3868 185 28 61 chr2 159633098 159633494 -22114593 - MTC-int LTR MaLR -875 383 3 1 1802 1991 209 42 8 chr2 159633505 159633906 -22114181 - MTC LTR MaLR -6 415 1 1 1802 342 294 75 18 chr2 159636406 159636551 -22111536 - MLT1A1 LTR MaLR -214 151 1 1 1802 226 242 32 0 chr2 159638349 159638411 -22109676 - LTR16E1 LTR ERVL -57 481 418 1 1803 1519 123 145 29 chr2 159655826 159656136 -22091951 + ORR1B1 LTR MaLR 41 386 -8 2 1803 447 375 76 5 chr2 159660181 159660366 -22087721 + MER21B LTR ERV1 27 224 -639 2 1803 421 403 23 6 chr2 159660615 159660792 -22087295 + MER21B LTR ERV1 514 693 -170 2 1803 1923 184 22 27 chr2 159665323 159665730 -22082357 + MTB_Mm LTR MaLR 3 407 0 2 1803 235 307 44 22 chr2 159665888 159665949 -22082138 + ORR1E LTR MaLR 100 163 -196 2 1803 235 307 44 22 chr2 159666131 159666159 -22081928 + ORR1E LTR MaLR 164 191 -168 2 1803 3493 18 39 0 chr2 159667975 159668356 -22079731 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 1803 234 299 0 69 chr2 159676584 159676656 -22071431 - RMER15 LTR ERVL -106 469 403 2 1803 584 277 76 15 chr2 159683543 159683741 -22064346 - MTEa LTR MaLR -4 375 166 2 1803 868 283 42 46 chr2 159690729 159691036 -22057051 + MTE2a LTR MaLR 61 366 -13 2 1803 273 302 25 33 chr2 159691035 159691155 -22056932 - MLT1B LTR MaLR -23 367 249 2 1803 1962 132 9 58 chr2 159692614 159692959 -22055128 - ORR1A4 LTR MaLR -1 328 1 2 1803 298 280 31 51 chr2 159699461 159699559 -22048528 + MLT1D LTR MaLR 12 107 -520 2 1803 511 316 129 63 chr2 159699684 159700037 -22048050 + MLT1D LTR MaLR 122 497 -8 2 1803 311 328 107 59 chr2 159713336 159713589 -22034498 + ORR1E LTR MaLR 51 315 -44 3 1803 745 249 172 9 chr2 159733483 159733698 -22014389 - MLT1D LTR MaLR -4 501 252 3 1803 485 312 127 39 chr2 159736580 159736887 -22011200 - MLT1B LTR MaLR -53 337 4 3 1803 2759 102 90 0 chr2 159739255 159739656 -22008431 + RLTR9B LTR ERVK 1 437 0 3 1803 1910 167 57 11 chr2 159740647 159740998 -22007089 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 3 1803 350 330 77 57 chr2 159746036 159746443 -22001644 - MLT1D LTR MaLR 0 505 7 3 1803 450 315 78 81 chr2 159749060 159749396 -21998691 - ORR1D2 LTR MaLR -14 370 37 3 1803 230 264 21 94 chr2 159757867 159757880 -21990207 + MT2B LTR ERVL 152 157 -444 3 1803 922 271 134 9 chr2 159765533 159765853 -21982234 + MTD LTR MaLR 1 360 -59 3 1803 1989 214 7 35 chr2 159765870 159766114 -21981973 + MTD LTR MaLR 10 248 -171 3 1803 1989 214 7 35 chr2 159766555 159766732 -21981355 + MTD LTR MaLR 249 419 0 3 1803 1423 165 49 55 chr2 159767162 159767470 -21980617 + ORR1D1 LTR MaLR 5 310 -64 4 1803 225 270 108 0 chr2 159772497 159772571 -21975516 - LTR55 LTR ERV 0 548 467 4 1803 1120 269 38 32 chr2 159772623 159772968 -21975119 - LTR55 LTR ERV -201 347 1 4 1804 278 339 25 8 chr2 159779457 159779579 -21968508 + MLT1I LTR MaLR 1 124 -287 4 1804 700 344 47 38 chr2 159779884 159780228 -21967859 + MLT1I-int LTR MaLR 70 416 -971 4 1804 374 352 69 37 chr2 159788001 159788219 -21959868 + MLT1G3 LTR MaLR 184 408 -187 4 1804 1056 258 63 62 chr2 159794864 159795263 -21952824 + MTE2a LTR MaLR 1 405 -14 4 1804 344 289 0 88 chr2 159807681 159807829 -21940258 + MLT1A1 LTR MaLR 241 408 0 4 1804 338 297 74 25 chr2 159826320 159826441 -21921646 - LTR41 LTR ERVL -564 204 78 4 1804 597 267 110 67 chr2 159832435 159832772 -21915315 + ORR1E LTR MaLR 4 370 0 5 1804 383 281 99 22 chr2 159834759 159834941 -21913146 - LTR73 LTR ERV1 -273 299 104 5 1804 356 328 81 50 chr2 159836152 159836473 -21911614 + MTEa LTR MaLR 43 373 -6 5 1804 263 333 123 22 chr2 159841792 159841930 -21906157 - LTR16A1 LTR ERVL -147 309 158 5 1804 2729 132 21 51 chr2 159846843 159847370 -21900717 - RLTR28 LTR ERVL -12 512 2 5 1804 1511 183 133 6 chr2 159850176 159850528 -21897559 + MTD LTR MaLR 21 417 -2 5 1804 250 234 73 21 chr2 159859429 159859525 -21888562 + RMER17C-int LTR ERVK 2870 2970 -268 5 1804 928 264 208 13 chr2 159864553 159864596 -21883491 - RMER15 LTR ERVL -1 574 531 5 1804 928 264 208 13 chr2 159864651 159865060 -21883027 - RMER15 LTR ERVL -45 530 35 5 1804 619 206 52 15 chr2 159865526 159865760 -21882327 - MTE2a LTR MaLR -4 375 1 5 1804 305 228 0 12 chr2 159868410 159868490 -21879597 + MTEb LTR MaLR 300 378 -1 5 1804 1115 176 283 3 chr2 159869116 159869406 -21878681 - ORR1D1 LTR MaLR -3 371 1 5 1804 442 320 182 8 chr2 159883983 159884241 -21863846 - MLT1C LTR MaLR -153 314 12 5 1804 674 295 112 6 chr2 159903525 159903839 -21844248 + MLT1D LTR MaLR 1 347 -158 6 1805 1233 249 134 40 chr2 159919744 159920275 -21827812 + MTD-int LTR MaLR 678 1258 0 6 1805 1638 195 58 5 chr2 159920276 159920652 -21827435 + MTD LTR MaLR 3 398 -21 6 1805 339 322 87 4 chr2 159922098 159922296 -21825791 + MLT2B3 LTR ERVL 1 215 -339 6 1805 293 341 45 70 chr2 159924384 159924627 -21823460 + MLT2B3 LTR ERVL 310 546 -8 6 1805 1296 285 50 38 chr2 159925705 159926128 -21821959 + MER54B LTR ERVL 353 780 -13 6 1805 317 297 84 28 chr2 159930145 159930287 -21817800 + MLT1H LTR MaLR 62 211 -338 6 1805 292 212 112 0 chr2 159930416 159930496 -21817591 + MLT1H LTR MaLR 385 473 -16 6 1805 1422 234 42 60 chr2 159938558 159938944 -21809143 + MTEa LTR MaLR 1 379 0 6 1805 767 278 65 90 chr2 159941295 159941746 -21806341 - MTD LTR MaLR -31 388 5 6 1805 274 292 54 54 chr2 159943128 159943227 -21804860 + MLT1J LTR MaLR 78 180 -332 6 1805 274 292 54 54 chr2 159943322 159943334 -21804753 + MLT1J LTR MaLR 181 189 -323 6 1805 751 228 16 5 chr2 159948173 159948358 -21799729 + ORR1C2 LTR MaLR 1 187 -187 6 1805 760 238 49 17 chr2 159948418 159948646 -21799441 + ORR1C2 LTR MaLR 149 384 0 6 1805 236 344 68 74 chr2 159948790 159948905 -21799182 - MLT1J-int LTR MaLR -120 1267 1142 6 1805 236 344 68 74 chr2 159949000 159949060 -21799027 - MLT1J-int LTR MaLR -246 1141 1093 6 1805 650 298 48 78 chr2 159950447 159950782 -21797305 + ORR1E LTR MaLR 1 325 -34 6 1805 1085 261 56 26 chr2 159950785 159951157 -21796930 - MTE2b LTR MaLR 0 370 2 6 1805 1469 191 74 12 chr2 159956754 159956940 -21791147 + ORR1D1 LTR MaLR 32 228 -146 6 1805 1469 191 74 12 chr2 159956969 159957105 -21790982 + ORR1D1 LTR MaLR 229 374 0 6 1805 316 239 59 42 chr2 159959448 159959566 -21788521 + RLTR25B LTR ERVK 390 509 -519 7 1805 476 389 69 30 chr2 159963912 159964402 -21783685 + MLT1G1 LTR MaLR 1 577 -2 7 1805 677 302 51 89 chr2 159967058 159967429 -21780658 - ORR1E LTR MaLR -2 357 1 7 1805 419 355 100 72 chr2 159969784 159970185 -21777902 - MLT1D LTR MaLR -93 412 1 7 1805 277 330 87 56 chr2 159975476 159975707 -21772380 + MLT1B LTR MaLR 8 245 -260 7 1805 309 274 32 28 chr2 159975772 159975898 -21772189 + MLT1B LTR MaLR 225 378 -12 7 1805 330 307 83 60 chr2 159992751 159992969 -21755118 + LTR33 LTR ERVL 140 362 -153 7 1805 237 291 23 0 chr2 159995990 159996076 -21752011 - ORR1E LTR MaLR -14 365 278 7 1805 366 269 106 69 chr2 159996163 159996351 -21751736 - ORR1E LTR MaLR -154 205 11 7 1805 231 297 21 42 chr2 160003885 160003980 -21744107 - LTR33 LTR ERVL -4 511 419 9 1805 372 290 223 123 chr2 160005092 160005429 -21742658 + MTEa LTR MaLR 7 377 -2 1 1805 2266 120 2 101 chr2 160006607 160007005 -21741082 - ORR1B2 LTR MaLR -8 359 1 1 1805 1406 235 86 21 chr2 160014142 160014524 -21733563 + MTD LTR MaLR 13 419 0 2 1805 425 273 16 32 chr2 160015593 160015718 -21732369 + MLT1A0 LTR MaLR 4 126 -239 2 1805 251 281 156 49 chr2 160015742 160015985 -21732102 + ORR1E LTR MaLR 80 348 -11 2 1805 411 373 58 41 chr2 160020934 160021225 -21726862 + ORR1E LTR MaLR 49 344 -15 3 1805 254 301 92 97 chr2 160025791 160026008 -21722079 + MLT1H LTR MaLR 333 548 -1 3 1805 322 276 307 18 chr2 160028202 160028368 -21719719 - RMER15 LTR ERVL -14 561 348 4 1805 279 257 40 13 chr2 160029774 160029849 -21718238 - MLT2F LTR ERVL -315 348 272 4 1805 418 299 56 0 chr2 160029916 160030060 -21718027 - LTR33C LTR ERVL -462 167 16 4 1805 429 268 108 59 chr2 160031220 160031442 -21716645 - ERVL-E-int LTR ERVL -350 5317 5085 4 1805 264 330 121 6 chr2 160031493 160031667 -21716420 - ERVL-E-int LTR ERVL -688 4979 4786 4 1805 379 277 12 0 chr2 160031667 160031750 -21716337 - MTE2b LTR MaLR -9 370 287 4 1805 550 262 155 16 chr2 160032102 160032296 -21715791 + MT2A LTR ERVL 288 508 -25 5 1805 311 305 46 7 chr2 160032439 160032567 -21715520 - MTE2b LTR MaLR -229 141 3 4 1805 847 308 107 16 chr2 160032659 160033032 -21715055 - ERVL-E-int LTR ERVL -1001 4666 4260 4 1805 2384 128 37 25 chr2 160033726 160034134 -21713953 - MTC LTR MaLR -8 413 1 5 225 427 364 100 28 chr2 160038862 160039132 -21708955 + MLT1G1 LTR MaLR 1 330 -249 5 1806 486 207 48 128 chr2 160043235 160043423 -21704664 - MLT1B LTR MaLR -217 173 1 6 1806 1803 205 58 39 chr2 160043904 160044315 -21703772 + MTD LTR MaLR 1 419 0 6 1806 352 337 105 20 chr2 160049229 160049429 -21698658 - RMER15 LTR ERVL -20 555 339 7 1806 2565 132 92 2 chr2 160053041 160053467 -21694620 + ORR1B1-int LTR MaLR 1045 1508 -1 8 1806 1060 163 78 15 chr2 160053469 160053674 -21694413 + ORR1B1 LTR MaLR 2 219 -175 8 1806 643 300 83 89 chr2 160061623 160061971 -21686116 - MTEa LTR MaLR -8 371 26 9 1806 233 156 0 62 chr2 160065190 160065238 -21682849 - MLT1A1 LTR MaLR -44 364 320 1 1806 391 345 32 84 chr2 160068836 160069086 -21679001 - MLT1A0 LTR MaLR -20 345 109 1 1806 345 212 222 0 chr2 160076578 160076677 -21671410 - MTEa LTR MaLR -8 371 251 1 1806 354 331 95 0 chr2 160085838 160085986 -21662101 + RMER15 LTR ERVL 403 564 -11 1 1806 477 225 47 7 chr2 160086135 160086285 -21661802 - MTD LTR MaLR -15 404 241 1 1806 694 286 11 6 chr2 160086297 160086473 -21661614 - MTD LTR MaLR -242 177 1 1 1806 351 234 128 18 chr2 160088471 160088580 -21659507 - LTR16E1 LTR ERVL -2 536 416 1 1806 466 309 34 71 chr2 160092314 160092597 -21655490 + ORR1E LTR MaLR 1 267 -107 1 1806 537 299 52 1 chr2 160092713 160092880 -21655207 + MTE2b LTR MaLR 201 368 -2 1 1806 310 313 57 43 chr2 160100273 160100413 -21647674 + MLT1H LTR MaLR 12 153 -396 1 1806 298 278 122 0 chr2 160107198 160107288 -21640799 - MLT1D LTR MaLR 0 505 405 2 1806 594 335 58 61 chr2 160107669 160108088 -21639999 - MLT1D LTR MaLR -108 516 1 2 1806 238 313 101 51 chr2 160108251 160108389 -21639698 - MLT1N2 LTR MaLR -384 178 34 2 1806 516 245 97 43 chr2 160110370 160110550 -21637537 + MLT2B1 LTR ERVL 317 502 -65 2 1806 248 373 80 40 chr2 160120391 160120592 -21627495 + MLT1N2 LTR MaLR 343 551 -11 2 1806 413 311 55 109 chr2 160124929 160125185 -21622902 - MLT1D LTR MaLR -263 242 1 2 1806 328 348 118 54 chr2 160125445 160125870 -21622217 - LTR85a LTR Gypsy? -239 463 12 2 1806 1504 255 29 29 chr2 160129790 160130169 -21617918 - MTEb LTR MaLR 0 379 1 2 1806 1865 174 52 27 chr2 160131741 160132142 -21615945 - MTD LTR MaLR -7 412 2 2 1806 356 331 82 67 chr2 160138530 160138799 -21609288 - MLT1K LTR MaLR -26 569 297 2 1806 258 307 13 13 chr2 160138993 160139069 -21609018 - MTEb LTR MaLR 0 379 304 2 1806 255 354 59 50 chr2 160139118 160139237 -21608850 - MTEb LTR MaLR -239 120 1 2 1806 1274 235 81 35 chr2 160140547 160140895 -21607192 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 7 2 1806 249 304 43 11 chr2 160141315 160141408 -21606679 + LTR33A LTR ERVL 425 520 0 2 1806 587 362 86 24 chr2 160146198 160146580 -21601507 + MLT2F LTR ERVL 207 612 -51 2 1806 2118 192 38 20 chr2 160162535 160162934 -21585153 + MTD LTR MaLR 6 411 -8 3 1806 665 319 197 11 chr2 160165019 160165476 -21582611 + MLT1G LTR MaLR 33 574 -17 3 1807 269 364 45 0 chr2 160172715 160172825 -21575262 - MLT1D LTR MaLR -177 328 214 3 1807 397 250 72 27 chr2 160172882 160172993 -21575094 - MLT1D LTR MaLR -378 127 12 3 1807 869 281 85 73 chr2 160174735 160175239 -21572848 + RLTR11A2 LTR ERVK 3 512 -15 3 1807 2493 158 32 17 chr2 160178433 160178844 -21569243 - MTC LTR MaLR 0 421 5 3 1807 397 281 57 150 chr2 160225712 160225992 -21522095 - ORR1E LTR MaLR -6 353 100 4 1807 696 233 25 22 chr2 160229123 160229307 -21518780 - MLT1A1 LTR MaLR -14 394 184 4 1807 258 292 0 117 chr2 160230629 160230647 -21517440 + MT2B LTR ERVL 152 155 -446 4 1807 413 343 70 91 chr2 160244742 160244877 -21503210 + MTEa LTR MaLR 6 153 -217 4 1807 427 269 62 109 chr2 160245058 160245294 -21502793 + MTEa LTR MaLR 154 378 -1 4 1807 2641 58 61 0 chr2 160250009 160250335 -21497752 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 4 1807 1971 190 63 18 chr2 160256392 160256788 -21491299 - MTD LTR MaLR 0 419 6 4 1807 399 302 146 32 chr2 160260114 160260339 -21487748 + MLT1J2 LTR MaLR 193 439 -5 4 1807 271 259 12 58 chr2 160261843 160261929 -21486158 - MLT1D LTR MaLR -7 562 481 4 1807 923 259 26 26 chr2 160262508 160262734 -21485353 - MLT1D LTR MaLR -7 498 273 4 1807 239 253 83 60 chr2 160262936 160263020 -21485067 + LTR86A2 LTR ERVL 329 414 -94 4 1807 351 301 87 0 chr2 160270730 160270833 -21477254 + MLT1H LTR MaLR 98 209 -340 5 1807 258 316 13 13 chr2 160270918 160270995 -21477092 + MLT1H LTR MaLR 334 410 -79 5 1807 1083 365 13 11 chr2 160282664 160283041 -21465046 - LTR16A LTR ERVL -52 399 22 5 1807 1189 244 77 57 chr2 160283659 160284011 -21464076 - MTE2a LTR MaLR -18 361 3 5 1807 255 208 86 49 chr2 160284020 160284101 -21463986 - ORR1E LTR MaLR -275 84 1 5 1807 1623 157 169 39 chr2 160285064 160285395 -21462692 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 5 1807 242 221 84 101 chr2 160293525 160293762 -21454325 + RMER17C LTR ERVK 82 314 -96 5 1807 884 315 18 56 chr2 160294327 160294613 -21453474 - MLT1A0 LTR MaLR -14 351 77 5 1808 412 297 78 65 chr2 160302199 160302538 -21445549 + MLT1A0 LTR MaLR 3 365 0 5 1808 351 322 50 75 chr2 160308650 160308811 -21439276 - LTR33A LTR ERVL -246 274 118 5 1808 1297 287 34 6 chr2 160311981 160312307 -21435780 - MLT1F LTR MaLR 0 548 214 5 1808 313 331 160 13 chr2 160319715 160319871 -21428216 + MLT1F1 LTR MaLR 127 305 -264 6 1808 292 301 39 31 chr2 160322341 160322468 -21425619 + MLT1H LTR MaLR 26 153 -396 6 1808 325 367 122 0 chr2 160322783 160322971 -21425116 + MLT1H LTR MaLR 333 543 -6 6 1808 296 335 120 0 chr2 160329011 160329178 -21418909 + LTR16C LTR ERVL 303 489 0 6 1808 1256 301 52 19 chr2 160330582 160330705 -21417382 - MLT1F LTR MaLR -18 530 399 6 1808 2821 58 0 11 chr2 160330705 160331054 -21417033 - ORR1A1 LTR MaLR -1 345 1 6 1808 1256 280 135 16 chr2 160331054 160331413 -21416674 - MLT1F LTR MaLR -150 398 1 6 1808 1055 216 198 24 chr2 160332526 160332824 -21415263 + ORR1E LTR MaLR 3 352 -7 6 1808 566 294 118 38 chr2 160334446 160334833 -21413254 + MLT1D LTR MaLR 1 462 -43 6 1808 1932 166 122 3 chr2 160335873 160336242 -21411845 - MTC LTR MaLR -8 413 1 6 1808 305 314 67 0 chr2 160344126 160344231 -21403856 + RMER15 LTR ERVL 422 533 -42 6 1808 2266 110 3 3 chr2 160346181 160346500 -21401587 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 6 1808 396 301 108 73 chr2 160347456 160347729 -21400358 + LTR16C LTR ERVL 238 512 -26 6 1808 235 235 191 73 chr2 160350004 160350114 -21397973 + MLT1F LTR MaLR 3 125 -444 6 1808 695 302 100 59 chr2 160350189 160350569 -21397518 + MLT1F LTR MaLR 167 541 -7 6 1808 1098 309 24 40 chr2 160350875 160351249 -21396838 + MTEa LTR MaLR 12 379 0 6 1808 553 286 192 25 chr2 160353149 160353467 -21394620 - MLT1C LTR MaLR -130 337 1 6 1808 921 274 74 48 chr2 160354951 160355262 -21392825 + MLT1D LTR MaLR 3 321 -184 6 1808 254 320 86 23 chr2 160358820 160358948 -21389139 + LTR85a LTR Gypsy? 9 144 -558 6 1808 288 279 116 9 chr2 160360299 160360411 -21387676 - MLT1C LTR MaLR -16 451 328 6 1808 323 330 71 94 chr2 160360598 160360865 -21387222 - MLT1C LTR MaLR -204 263 3 6 1808 245 257 9 114 chr2 160375362 160375476 -21372611 - RMER12 LTR ERVK -472 850 749 7 1808 269 246 29 0 chr2 160376212 160376281 -21371806 + MLT1H LTR MaLR 479 549 0 7 1808 316 253 98 36 chr2 160376713 160376949 -21371138 - ORR1E LTR MaLR -66 313 4 7 1808 311 333 119 0 chr2 160377059 160377185 -21370902 - MLT1H1 LTR MaLR -405 150 10 7 1808 288 233 0 100 chr2 160377251 160377351 -21370736 + MLT1F2 LTR MaLR 471 560 0 7 1808 1152 239 137 42 chr2 160380542 160380848 -21367239 + ORR1D2 LTR MaLR 33 367 -3 7 1808 1380 244 38 16 chr2 160382394 160382761 -21365326 - MTE2b LTR MaLR -4 375 1 7 1808 273 290 0 14 chr2 160388896 160388966 -21359121 - MLT1J2 LTR MaLR -7 358 290 7 1808 259 281 30 36 chr2 160392101 160392160 -21355927 + ORR1B1-int LTR MaLR 590 647 -862 7 1808 384 277 145 68 chr2 160393604 160393852 -21354235 - MLT1J2 LTR MaLR -181 267 1 7 1808 772 235 63 100 chr2 160401531 160401862 -21346225 + ORR1E LTR MaLR 41 359 0 7 1808 2050 93 61 20 chr2 160408935 160409232 -21338855 + RLTR27 LTR ERVK 1 309 0 8 1808 2424 121 64 51 chr2 160413872 160414307 -21333780 - BGLII_B LTR ERVK 0 441 1 8 1808 323 308 137 82 chr2 160417612 160417845 -21330242 + ORR1E LTR MaLR 114 359 0 8 1808 948 316 33 47 chr2 160421642 160422001 -21326086 - RMER5 LTR ERV1 -8 526 173 8 1808 269 314 83 19 chr2 160422829 160422985 -21325102 - RMER5 LTR ERV1 -354 180 15 8 1808 3341 38 2 8 chr2 160424159 160424557 -21323530 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 8 1808 335 276 102 127 chr2 160430250 160430581 -21317506 + MTEb LTR MaLR 18 379 0 8 1808 827 222 25 6 chr2 160430987 160431166 -21316921 + ORR1E LTR MaLR 15 189 -170 8 28 509 218 96 8 chr2 160432024 160432149 -21315938 + ORR1E LTR MaLR 242 377 -2 8 1809 2138 66 15 0 chr2 160434058 160434332 -21313755 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 50 8 1809 393 278 160 68 chr2 160435138 160435391 -21312696 + MTEa LTR MaLR 50 326 -53 8 1809 339 318 57 63 chr2 160445764 160445922 -21302165 - MLT1I LTR MaLR -252 159 3 9 1809 1161 242 42 61 chr2 160448290 160448668 -21299419 - MTE2a LTR MaLR -8 371 1 9 1809 513 167 94 0 chr2 160457446 160457542 -21290545 + MTC LTR MaLR 1 105 -316 9 1809 2885 36 0 3 chr2 160457543 160457881 -21290206 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 0 337 1 9 1809 29192 19 1 3 chr2 160457881 160461126 -21286961 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 3244 9 1809 22637 40 22 13 chr2 160461118 160463836 -21284251 - IAPEz-int LTR ERVK -3730 2751 8 9 1809 2885 36 0 3 chr2 160463836 160464174 -21283913 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 0 337 1 9 1809 250 200 0 136 chr2 160478252 160478333 -21269754 - MT2B2 LTR ERVL -352 232 163 1 1809 667 262 76 124 chr2 160481722 160482183 -21265904 - RLTR12B LTR ERVK -43 485 47 1 1809 456 306 217 9 chr2 160493093 160493314 -21254773 - MLT1F LTR MaLR -162 386 120 1 1809 1110 210 142 25 chr2 160494864 160495181 -21252906 - ORR1C2 LTR MaLR -30 354 1 1 1809 373 237 19 76 chr2 160499342 160499447 -21248640 + MTD LTR MaLR 1 99 -322 1 1809 618 166 249 29 chr2 160499603 160499866 -21248221 + MTD LTR MaLR 84 405 -14 1 1809 264 282 26 155 chr2 160503735 160503890 -21244197 + MT2B2 LTR ERVL 123 257 -327 8 1809 1564 173 108 13 chr2 160513002 160513307 -21234780 - MTC LTR MaLR -83 338 5 2 1809 285 276 47 66 chr2 160539409 160539524 -21208563 + RMER17A LTR ERVK 291 485 -266 8 1809 285 276 47 66 chr2 160539634 160539665 -21208422 + RMER17A LTR ERVK 486 541 -210 8 1809 367 172 0 94 chr2 160551188 160551200 -21196887 + MT2B LTR ERVL 154 240 -361 1 1810 2398 150 2 23 chr2 160574390 160574820 -21173267 - MTC LTR MaLR 0 421 1 1 1810 3267 38 2 0 chr2 160599531 160599926 -21148161 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1810 2379 63 0 0 chr2 160608754 160609073 -21139014 - LTRIS_Mus LTR ERV1 0 587 269 1 1810 1151 154 81 5 chr2 160609498 160609707 -21138380 - MTC LTR MaLR 0 421 197 1 1810 297 164 0 121 chr2 160609791 160609874 -21138213 + RLTR25A LTR ERVK 500 572 -531 1 1810 1059 174 35 0 chr2 160610107 160610307 -21137780 - MTC LTR MaLR -211 210 4 1 1810 233 359 209 9 chr2 160611287 160611498 -21136589 + MLT1I LTR MaLR 3 255 -156 1 1810 2053 167 33 59 chr2 160615087 160615508 -21132579 + RMER17C LTR ERVK 1 410 0 1 1810 441 326 34 7 chr2 160615915 160616063 -21132024 - MLT1A0 LTR MaLR -213 152 1 1 1810 363 245 61 0 chr2 160616180 160616278 -21131809 - MTEb LTR MaLR 0 379 276 1 1810 2137 178 62 27 chr2 160619612 160619829 -21128258 - MTD LTR MaLR 0 419 209 1 1810 2137 178 62 27 chr2 160620013 160620200 -21127887 - MTD LTR MaLR -211 208 1 1 1810 257 215 133 51 chr2 160623695 160623793 -21124294 - MLT1L LTR MaLR -13 597 492 1 1810 2305 173 70 45 chr2 160634189 160634598 -21113489 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 426 -101 2 1810 7329 42 29 1 chr2 160634598 160635430 -21112657 + RLTR13A LTR ERVK 1 855 0 2 1810 2305 173 70 45 chr2 160635430 160635534 -21112553 + RLTR11A2 LTR ERVK 427 527 0 2 1810 2510 177 53 161 chr2 160640939 160641528 -21106559 + RMER6C LTR ERVK 1 598 -92 2 1810 2510 177 53 161 chr2 160642340 160642428 -21105659 + RMER6C LTR ERVK 599 599 -91 2 1810 2510 177 53 161 chr2 160642594 160642688 -21105399 + RMER6C LTR ERVK 599 689 -1 2 1810 1559 144 145 15 chr2 160642706 160643030 -21105057 + ORR1D1 LTR MaLR 1 366 -8 2 1810 1362 227 90 36 chr2 160651339 160651695 -21096392 - MTEb LTR MaLR -1 378 4 2 1810 291 317 40 27 chr2 160658678 160658827 -21089260 - RMER12 LTR ERVK -471 851 701 2 1810 1882 89 58 71 chr2 160668221 160668546 -21079541 + ORR1A4 LTR MaLR 1 321 -8 2 1810 2179 176 31 19 chr2 160669087 160669503 -21078584 - MTC LTR MaLR 0 421 1 2 1810 233 224 0 0 chr2 160669504 160669553 -21078534 + MTE2b LTR MaLR 293 341 -38 2 1810 303 191 63 0 chr2 160669544 160669607 -21078480 + MT2A LTR ERVL 396 462 -71 2 1810 800 284 30 18 chr2 160676189 160676452 -21071635 + MLT1F2 LTR MaLR 1 252 -296 2 1810 1727 165 94 9 chr2 160676939 160677270 -21070817 + ORR1B2 LTR MaLR 1 359 -8 2 1810 249 341 20 86 chr2 160687209 160687360 -21060727 + MLT1J1 LTR MaLR 154 294 -150 3 1810 1029 181 13 67 chr2 160688771 160688996 -21059091 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 172 3 1810 760 132 148 12 chr2 160689090 160689259 -21058828 - ORR1C2 LTR MaLR -188 196 5 3 1810 1416 173 186 97 chr2 160690120 160690853 -21057234 - RMER6A LTR ERVK 0 720 1 3 1810 1014 254 92 56 chr2 160691496 160691855 -21056232 + MTEa LTR MaLR 6 377 -2 3 1811 2131 129 99 11 chr2 160703856 160704046 -21044041 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 191 3 1811 2131 129 99 11 chr2 160704085 160704247 -21043840 - ORR1C2 LTR MaLR -194 190 2 3 1811 863 248 101 78 chr2 160704649 160705035 -21043052 - MTE2a LTR MaLR 0 419 18 3 1811 1905 170 26 29 chr2 160705647 160706092 -21041995 - RMER19C LTR ERVK -97 514 3 3 1811 230 205 21 126 chr2 160711729 160711824 -21036263 + MT2B LTR ERVL 155 239 -362 3 1811 702 257 190 34 chr2 160740447 160740773 -21007314 - MLT1C LTR MaLR -37 430 54 4 1811 226 213 43 0 chr2 160743324 160743371 -21004716 + LTR16A1 LTR ERVL 184 232 -224 4 1811 421 361 71 51 chr2 160747855 160748205 -20999882 + MLT1A0 LTR MaLR 1 357 -8 4 1811 775 259 141 15 chr2 160748692 160748955 -20999132 + MTEa LTR MaLR 80 375 -4 4 1811 258 290 0 14 chr2 160748980 160749050 -20999037 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 340 4 1811 1066 299 19 74 chr2 160752690 160753125 -20994962 - MTE2b LTR MaLR 0 419 19 4 1811 935 231 149 31 chr2 160754494 160754815 -20993272 - MLT1B LTR MaLR -4 386 28 4 1811 3442 23 3 0 chr2 160763494 160763878 -20984209 - IAPEY_LTR LTR ERVK 0 385 1 4 1811 467 319 80 38 chr2 160768609 160768821 -20979266 + MLT1A LTR MaLR 154 374 0 4 1811 497 247 147 56 chr2 160780145 160780342 -20967745 + MLT1A0 LTR MaLR 104 318 -47 4 1811 992 226 208 0 chr2 160804719 160805007 -20943080 + ORR1E LTR MaLR 5 352 -7 5 1811 417 256 104 37 chr2 160806340 160806474 -20941613 + MTE2b LTR MaLR 236 378 -1 5 1811 732 190 84 66 chr2 160810552 160810769 -20937318 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 639 821 -1505 5 1811 3130 176 55 13 chr2 160810850 160811595 -20936492 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 1658 2842 0 5 1811 667 193 7 58 chr2 160811599 160811724 -20936363 + RLTR16 LTR ERVK 6 124 -381 5 1811 667 193 7 58 chr2 160811837 160811865 -20936222 + RLTR16 LTR ERVK 125 151 -354 5 1811 1197 249 25 46 chr2 160811998 160812029 -20936058 + RLTR16 LTR ERVK 119 148 -357 5 1811 1197 249 25 46 chr2 160812203 160812566 -20935521 + RLTR16 LTR ERVK 149 505 0 5 1811 978 214 203 3 chr2 160819894 160820184 -20927903 + MT2A LTR ERVL 1 348 -185 5 1811 238 105 0 0 chr2 160820243 160820281 -20927806 + MT2A LTR ERVL 494 531 -2 5 1812 391 188 48 77 chr2 160825973 160826077 -20922010 + MT2B LTR ERVL 157 257 -344 5 1812 2426 57 12 29 chr2 160835400 160835743 -20912344 + MTB LTR MaLR 1 337 -63 5 1812 2137 98 7 0 chr2 160860361 160860667 -20887420 - ORR1A4 LTR MaLR -19 310 3 5 1812 926 229 147 47 chr2 160861104 160861383 -20886704 + ORR1C2 LTR MaLR 1 307 -77 5 1812 2187 141 70 8 chr2 160863094 160863466 -20884621 - MTC LTR MaLR -22 399 5 6 1812 231 316 0 60 chr2 160864804 160864888 -20883199 + MTE-int LTR MaLR 963 1041 -539 6 1812 2164 55 132 0 chr2 160872100 160872389 -20875698 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 6 1812 2256 104 34 14 chr2 160872389 160872966 -20875121 + ORR1A2 LTR MaLR 15 394 0 6 1812 812 158 147 127 chr2 160889173 160889590 -20858497 + MT2A LTR ERVL 1 578 -6 6 1812 1035 209 49 36 chr2 160890179 160890487 -20857600 + MTE2b LTR MaLR 1 312 -67 6 1812 3721 134 122 77 chr2 160894035 160894885 -20853202 + RMER19B LTR ERVK 1 889 -13 6 1812 1956 274 132 47 chr2 160903183 160904164 -20843923 - ORR1E-int LTR MaLR -515 1065 1 6 1812 451 284 135 63 chr2 160904165 160904499 -20843588 - ORR1E LTR MaLR -1 358 1 6 1812 791 287 64 14 chr2 160905631 160905914 -20842173 + LTR41B LTR ERVL 1 297 -461 6 1812 451 279 93 0 chr2 160906271 160906400 -20841687 + LTR41B LTR ERVL 421 561 -197 6 1812 226 180 20 0 chr2 160911460 160911510 -20836577 + MT2A LTR ERVL 210 260 -273 6 1812 555 252 92 62 chr2 160914949 160915274 -20832813 + MLT1B LTR MaLR 23 358 -16 6 1812 234 186 82 33 chr2 160916198 160916259 -20831828 + MT2B LTR ERVL 179 242 -359 6 1812 262 193 17 17 chr2 160920171 160920229 -20827858 - MT2A LTR ERVL -391 142 85 6 1812 696 182 0 64 chr2 160920215 160920356 -20827731 - MT2A LTR ERVL -401 132 1 6 1812 544 244 151 37 chr2 160927998 160928270 -20819817 + ORR1E LTR MaLR 57 359 0 7 1812 2226 161 76 5 chr2 160936310 160936703 -20811384 + MTC LTR MaLR 1 421 0 7 1812 477 312 175 36 chr2 160938324 160938697 -20809390 + MLT1J2 LTR MaLR 23 448 0 7 1812 1374 195 145 6 chr2 160939114 160939439 -20808648 - MTC LTR MaLR -23 398 29 7 1812 2654 130 29 17 chr2 160940233 160940649 -20807438 + MTC LTR MaLR 1 421 0 7 1812 505 326 124 31 chr2 160940921 160941195 -20806892 - MLT1J LTR MaLR -77 435 141 7 1812 505 326 124 31 chr2 160941219 160941299 -20806788 - MLT1J LTR MaLR -372 140 49 7 1812 1295 247 35 97 chr2 160941758 160942162 -20805925 - MTE2a LTR MaLR 0 379 1 7 1812 324 282 219 30 chr2 160942682 160942883 -20805204 + RMER15 LTR ERVL 337 575 0 7 1812 523 90 26 0 chr2 160943634 160943712 -20804375 + RMER17B LTR ERVK 1 80 -878 7 1812 2054 128 60 5 chr2 160943708 160944077 -20804010 + RMER17B LTR ERVK 570 958 0 7 1812 1058 313 92 14 chr2 160946043 160946551 -20801536 + MLT1F LTR MaLR 1 548 0 7 1812 512 253 106 61 chr2 160948210 160948408 -20799679 + MLT2B2 LTR ERVL 61 267 -253 7 1812 476 227 175 7 chr2 160948435 160948670 -20799417 + MTD LTR MaLR 49 401 -18 7 1812 726 276 28 63 chr2 160948698 160948892 -20799195 + MLT2B2 LTR ERVL 317 496 -66 7 1812 726 276 28 63 chr2 160948953 160949013 -20799074 + MLT2B2 LTR ERVL 497 562 0 7 1812 2355 125 16 6 chr2 160951283 160951646 -20796441 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 7 1812 3251 135 130 11 chr2 160951937 160952552 -20795535 - RMER6C LTR ERVK -2 688 1 7 1812 2355 141 61 32 chr2 160955695 160956104 -20791983 - MTC LTR MaLR 0 421 1 7 1813 266 128 0 21 chr2 160957070 160957118 -20790969 + MLT1A1 LTR MaLR 362 408 0 7 1813 2223 120 11 3 chr2 160958374 160958724 -20789363 - ORR1B2 LTR MaLR -14 353 1 7 1813 335 223 53 11 chr2 160960420 160960515 -20787572 + RMER15 LTR ERVL 422 520 -55 7 1813 1680 157 102 35 chr2 160960845 160961189 -20786898 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 7 1813 665 266 138 20 chr2 160963499 160963752 -20784335 - LTR33A_ LTR ERVL 0 531 249 7 1813 228 264 164 61 chr2 160964213 160964378 -20783709 - LTR33A_ LTR ERVL -317 214 33 7 1813 599 211 16 24 chr2 160967006 160967132 -20780955 + RMER20B LTR ERVK 1 125 -502 7 1813 259 303 78 31 chr2 160967286 160967477 -20780610 + RMER20B LTR ERVK 317 516 0 7 1813 608 208 117 19 chr2 160969101 160969263 -20778824 - MTD LTR MaLR 0 419 242 7 1813 376 164 0 0 chr2 160969265 160969332 -20778755 - MTD LTR MaLR -328 91 25 7 1813 1648 158 27 191 chr2 160969379 160969818 -20778269 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 7 1813 237 228 136 25 chr2 160971074 160971155 -20776932 + MLT1A1 LTR MaLR 39 128 -280 7 1813 2319 113 12 89 chr2 160971532 160971961 -20776126 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 7 1813 255 300 58 58 chr2 160972069 160972207 -20775880 + RMER15 LTR ERVL 273 410 -165 7 1813 862 262 109 40 chr2 160972540 160972842 -20775245 + MTE2a LTR MaLR 57 379 0 7 1813 344 366 13 7 chr2 160979086 160979240 -20768847 + MLT1J2 LTR MaLR 30 184 -264 8 1813 279 281 45 0 chr2 160982992 160983081 -20765006 - MLT1J LTR MaLR -351 161 69 8 1813 1167 246 70 30 chr2 160988619 160988991 -20759096 + MTD LTR MaLR 18 404 -15 8 1813 311 264 97 38 chr2 160990863 160991048 -20757039 - LTR85a LTR Gypsy? -142 560 365 8 1813 955 183 77 122 chr2 160993369 160993390 -20754697 + MT2A LTR ERVL 1 21 -512 8 1813 3130 52 201 2 chr2 160993390 160993817 -20754270 + RLTR1B LTR ERV1 1 512 0 8 1813 955 205 68 103 chr2 160993817 160994217 -20753870 + MT2A LTR ERVL 22 544 -57 8 1813 2185 135 78 86 chr2 160996305 160996791 -20751296 + RLTR45 LTR ERVK 1 482 0 8 1813 2023 77 17 90 chr2 160998308 160998501 -20749586 + ORR1A4 LTR MaLR 1 172 -157 8 1813 3117 87 26 51 chr2 160998501 160998995 -20749092 + RLTR45 LTR ERVK 1 482 0 8 1813 2023 77 17 90 chr2 160998995 160999156 -20748931 + ORR1A4 LTR MaLR 173 329 0 8 1813 1340 177 197 9 chr2 161000977 161001302 -20746785 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 1 5 1813 1134 247 70 17 chr2 161004892 161005192 -20742895 + MTEa LTR MaLR 56 371 -8 9 1813 298 287 54 34 chr2 161008382 161008530 -20739557 + RMER15 LTR ERVL 414 564 -11 1 1813 355 174 80 23 chr2 161013790 161013878 -20734209 + RMER10A LTR ERVL 322 414 -28 2 1813 376 278 84 56 chr2 161014613 161014792 -20733295 + RMER17C-int LTR ERVK 82 265 -2973 3 1813 420 186 27 89 chr2 161015012 161015124 -20732963 + RMER17C-int LTR ERVK 420 524 -2714 3 1813 1240 298 29 42 chr2 161015058 161015514 -20732573 + RodERV21-int LTR ERV1 689 1138 -3853 3 1813 3517 262 39 23 chr2 161015557 161016457 -20731630 + RodERV21-int LTR ERV1 1128 2041 -2950 3 1813 419 273 14 7 chr2 161016506 161016650 -20731437 + RodERV21-int LTR ERV1 4645 4789 -202 3 1813 246 289 32 32 chr2 161016693 161016786 -20731301 + RMER4B LTR ERVK 349 441 -144 3 1813 479 299 79 76 chr2 161018595 161018950 -20729137 + ORR1E LTR MaLR 4 359 0 4 1813 463 280 0 51 chr2 161019193 161019351 -20728736 - MLT1A1 LTR MaLR -3 405 256 4 1813 389 266 32 64 chr2 161019767 161019934 -20728153 - MLT1A1 LTR MaLR -219 171 1 4 1813 2480 133 20 16 chr2 161023374 161023568 -20724519 - RMER20A LTR ERVK -70 446 257 4 1813 3515 30 0 0 chr2 161023568 161023964 -20724123 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 1813 2480 133 20 16 chr2 161023964 161024213 -20723874 - RMER20A LTR ERVK -260 256 1 4 1813 1746 183 85 6 chr2 161024921 161025284 -20722803 + MTD LTR MaLR 1 392 -27 5 1813 320 270 60 53 chr2 161025292 161025425 -20722662 + ORR1E LTR MaLR 57 190 -169 5 1813 1145 266 97 9 chr2 161026087 161026428 -20721659 + MTEb LTR MaLR 1 371 -8 5 1813 899 302 90 81 chr2 161026561 161026874 -20721213 - MER70A LTR ERVL -8 464 129 5 1813 2303 123 137 36 chr2 161026874 161027312 -20720775 + RLTR45 LTR ERVK 1 482 0 5 1813 899 302 90 81 chr2 161027312 161027380 -20720707 - MER70A LTR ERVL -344 128 74 5 1813 899 302 90 81 chr2 161027457 161027520 -20720567 - MER70A LTR ERVL -399 73 15 5 1813 2391 94 68 46 chr2 161027520 161027931 -20720156 - MT2B LTR ERVL -181 420 1 6 1813 527 279 87 54 chr2 161027988 161028230 -20719857 - MLT1D LTR MaLR -232 273 24 6 1813 540 282 146 12 chr2 161030676 161031020 -20717067 - MLT1B LTR MaLR 0 390 1 7 1813 602 295 129 36 chr2 161035894 161036259 -20711828 - MLT1F LTR MaLR 0 548 150 8 1813 369 284 68 47 chr2 161044212 161044360 -20703727 + MLT1A1 LTR MaLR 255 405 -3 9 1813 2665 208 41 74 chr2 161052766 161053748 -20694339 + RMER17B LTR ERVK 1 904 -4 1 1813 348 370 35 25 chr2 161057914 161058111 -20689976 + MLT1J2 LTR MaLR 242 440 -8 1 1813 343 366 27 43 chr2 161061421 161061721 -20686366 - LTR16C LTR ERVL 0 489 195 1 1813 260 343 82 85 chr2 161063760 161064088 -20683999 - MLT1I LTR MaLR -22 389 63 1 1813 253 314 169 34 chr2 161064304 161064482 -20683605 - LTR16C LTR ERVL 0 489 288 1 1813 560 133 20 30 chr2 161064580 161064681 -20683406 - ORR1B1 LTR MaLR 0 378 279 1 1813 357 182 0 0 chr2 161064707 161064773 -20683314 - ORR1B1 LTR MaLR -328 66 1 1 1813 2193 291 83 65 chr2 161064773 161064894 -20683193 - ORR1B1-int LTR MaLR 0 1370 1253 1 1813 5195 190 60 12 chr2 161065063 161066285 -20681802 - ORR1B1-int LTR MaLR -118 1252 1 1 1813 2278 153 56 3 chr2 161066285 161066659 -20681428 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 1 1813 812 307 61 80 chr2 161070662 161070849 -20677238 + MLT1B LTR MaLR 26 229 -161 1 1813 1168 266 159 33 chr2 161070849 161071307 -20676780 - MLT2B1 LTR ERVL 0 520 5 1 1813 812 307 61 80 chr2 161071307 161071435 -20676652 + MLT1B LTR MaLR 230 346 -44 1 1813 812 307 61 80 chr2 161071605 161071649 -20676438 + MLT1B LTR MaLR 347 379 -11 1 1813 305 235 9 81 chr2 161076612 161076723 -20671364 + MLT1A1 LTR MaLR 306 408 0 1 1813 252 314 0 0 chr2 161078842 161078928 -20669159 + MTE2b LTR MaLR 1 86 -293 1 1813 365 174 101 0 chr2 161079033 161079102 -20668985 + MTE2b LTR MaLR 268 343 -36 1 1813 1315 206 136 12 chr2 161082456 161082780 -20665307 - MTE2b LTR MaLR -15 364 1 1 1813 1307 215 103 29 chr2 161084887 161085236 -20662851 + MTE2a LTR MaLR 1 375 -4 1 1814 1029 228 75 101 chr2 161088967 161089174 -20658913 + MTE2a LTR MaLR 1 190 -189 2 1814 1029 228 75 101 chr2 161089224 161089391 -20658696 + MTE2a LTR MaLR 191 365 -14 2 1814 420 268 95 6 chr2 161093799 161093957 -20654130 - MT2A LTR ERVL -49 484 313 2 1814 243 274 157 19 chr2 161095168 161095276 -20652811 - MLT1A0 LTR MaLR -17 348 226 2 1814 325 314 95 50 chr2 161101238 161101479 -20646608 - MLT1J LTR MaLR -116 396 145 2 1814 736 327 64 26 chr2 161101497 161101918 -20646169 - RMER5 LTR ERV1 -47 487 51 2 1814 225 284 10 146 chr2 161105924 161106027 -20642060 - MT2B LTR ERVL -338 263 175 2 1814 386 279 43 122 chr2 161106300 161106488 -20641599 + LTR16C LTR ERVL 313 485 -4 2 1814 311 356 20 7 chr2 161107798 161107945 -20640142 - LTR16A LTR ERVL -1 450 302 2 1814 1345 271 112 17 chr2 161108757 161109005 -20639082 - MLT2B1 LTR ERVL -8 512 230 2 1814 2105 147 54 6 chr2 161109005 161109355 -20638732 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 2 1814 1345 271 112 17 chr2 161109355 161109572 -20638515 - MLT2B1 LTR ERVL -291 229 3 2 1814 239 397 73 34 chr2 161110193 161110399 -20637688 - LTR16A LTR ERVL -214 324 111 2 1814 953 294 71 3 chr2 161112612 161112895 -20635192 + MTEa LTR MaLR 68 369 -10 2 1814 2051 129 12 0 chr2 161114311 161114636 -20633451 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 2 1814 307 299 43 0 chr2 161115478 161115595 -20632492 - MTD LTR MaLR -296 123 2 2 1814 324 397 39 90 chr2 161118952 161119207 -20628880 + MLT1I LTR MaLR 130 371 -40 2 1814 637 372 86 15 chr2 161119918 161120382 -20627705 - MLT1J LTR MaLR -15 497 1 2 1814 451 335 32 48 chr2 161120414 161120568 -20627519 - MLT1J-int LTR MaLR -70 1317 1165 2 1814 2905 49 3 0 chr2 161120568 161120913 -20627174 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 2 1814 451 335 32 48 chr2 161120913 161120946 -20627141 - MLT1J-int LTR MaLR -223 1164 1133 2 1814 522 332 74 93 chr2 161123079 161123307 -20624780 - MER21B LTR ERV1 -149 714 489 2 1814 522 332 74 93 chr2 161123531 161123883 -20624204 - MER21B LTR ERV1 -375 488 145 2 1814 555 252 75 51 chr2 161124171 161124506 -20623581 + RLTR15 LTR ERVK 1 343 -16 2 1814 232 234 244 24 chr2 161127103 161127230 -20620857 + MLT1F LTR MaLR 2 156 -392 2 1814 654 303 96 21 chr2 161127464 161127721 -20620366 - ORR1E LTR MaLR 0 359 92 2 1814 654 303 96 21 chr2 161127915 161127991 -20620096 - ORR1E LTR MaLR -268 91 2 2 1814 448 321 73 77 chr2 161128111 161128371 -20619716 + MLT1F LTR MaLR 199 457 -91 2 1814 292 327 67 52 chr2 161129122 161129330 -20618757 - LTR16C LTR ERVL 0 489 279 2 1814 312 315 92 26 chr2 161129330 161129483 -20618604 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 203 2 1814 243 256 100 5 chr2 161130272 161130367 -20617720 - MTEa LTR MaLR -1 378 277 2 1814 251 329 39 28 chr2 161131935 161132107 -20615980 - MLT1J LTR MaLR -189 259 84 3 1814 626 299 93 37 chr2 161136297 161136602 -20611485 + ORR1E LTR MaLR 3 341 -38 3 1814 372 352 155 18 chr2 161138479 161138820 -20609267 - MLT1H LTR MaLR -6 543 156 3 1814 451 295 87 0 chr2 161139256 161139439 -20608648 - MLT1A0 LTR MaLR -15 350 152 3 1814 1930 169 30 8 chr2 161143537 161143902 -20604185 - ORR1C1 LTR MaLR -5 373 1 3 1814 981 227 83 74 chr2 161144907 161145095 -20602992 - ORR1D1 LTR MaLR -2 372 175 3 1814 981 227 83 74 chr2 161145120 161145255 -20602832 - ORR1D1 LTR MaLR -200 174 48 3 1814 249 157 39 0 chr2 161146255 161146306 -20601781 - ORR1D1 LTR MaLR -319 55 3 3 1814 1959 201 77 3 chr2 161148062 161148452 -20599635 - MTD LTR MaLR 0 419 1 3 1814 1441 221 37 45 chr2 161148869 161149243 -20598844 + MTE2a LTR MaLR 3 373 -6 3 1814 994 321 60 8 chr2 161149524 161149894 -20598193 + LTR16C LTR ERVL 99 487 -2 3 1814 229 250 167 67 chr2 161150818 161150938 -20597149 + LTR16E1 LTR ERVL 404 535 -3 3 1814 542 350 98 5 chr2 161152092 161152296 -20595791 + LTR16C LTR ERVL 21 243 -246 3 1814 372 299 16 16 chr2 161152363 161152492 -20595595 + LTR16C LTR ERVL 360 488 -1 3 1814 1205 260 73 9 chr2 161153768 161154109 -20593978 + MTEb LTR MaLR 13 375 -4 3 1814 261 336 0 26 chr2 161156033 161156149 -20591938 + MLT1K LTR MaLR 475 587 -8 3 1814 494 303 70 80 chr2 161156804 161157142 -20590945 + ORR1E LTR MaLR 6 355 -15 3 1814 447 291 108 60 chr2 161160094 161160343 -20587744 - MLT1F LTR MaLR -281 267 7 3 1814 250 274 0 87 chr2 161160879 161160971 -20587116 - MT2B LTR ERVL -344 257 174 3 1814 255 235 0 0 chr2 161161187 161161238 -20586849 - MLT1F2 LTR MaLR -4 551 501 3 1814 414 275 108 38 chr2 161161597 161161782 -20586305 - MLT1F2 LTR MaLR -49 511 314 3 1814 1275 219 118 9 chr2 161161779 161162138 -20585949 + MTD LTR MaLR 8 405 -14 3 1814 430 258 93 36 chr2 161162142 161162280 -20585807 - MLT1F2 LTR MaLR -236 324 168 3 1814 1162 250 79 42 chr2 161163650 161164005 -20584082 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 3 3 1814 1406 155 93 10 chr2 161164007 161164307 -20583780 - ORR1D2-int LTR MaLR 0 1370 1046 3 1814 486 325 61 9 chr2 161168171 161168385 -20579702 - MT2A LTR ERVL -8 525 301 3 1814 2944 94 25 82 chr2 161171725 161172236 -20575851 - RLTR45 LTR ERVK 0 482 1 3 1814 3241 51 15 0 chr2 161172607 161173001 -20575086 + MTB LTR MaLR 1 400 0 3 1814 5206 125 29 11 chr2 161173001 161173898 -20574189 + MTB-int LTR MaLR 3 915 -343 3 1814 297 0 0 0 chr2 161173892 161173928 -20574159 + MTB LTR MaLR 365 400 0 3 1814 370 261 570 0 chr2 161173998 161174161 -20573926 + ORR1E LTR MaLR 116 371 -8 3 1814 1103 268 71 36 chr2 161186644 161187008 -20561079 + MTE2b LTR MaLR 3 379 0 4 1814 256 266 12 25 chr2 161190048 161190129 -20557958 - MTEa LTR MaLR -14 365 286 4 1814 586 321 176 22 chr2 161191628 161191985 -20556102 - MLT1H LTR MaLR 0 549 138 4 1814 885 146 47 30 chr2 161193463 161193631 -20554456 + RLTR24 LTR ERV1 6 176 -353 4 1814 1464 258 62 47 chr2 161193631 161194082 -20554005 - RMER19C LTR ERVK 0 611 154 4 1814 3014 20 42 3 chr2 161194563 161194916 -20553171 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 4 1814 963 117 159 0 chr2 161194916 161195079 -20553008 + IAPEz-int LTR ERVK 8 196 -6285 4 1814 55939 28 13 1 chr2 161195050 161201446 -20546641 + IAPEz-int LTR ERVK 67 6481 0 4 1814 3014 20 42 3 chr2 161201446 161201799 -20546288 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 4 1814 286 125 35 18 chr2 161202550 161202607 -20545480 - RMER19B LTR ERVK -537 365 308 4 1814 1541 170 48 45 chr2 161202627 161202985 -20545102 + RLTR24 LTR ERV1 171 529 0 4 1814 2142 85 71 16 chr2 161214573 161214883 -20533204 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 4 1814 920 223 141 110 chr2 161217541 161217995 -20530092 + RMER4B LTR ERVK 1 468 -117 4 1815 3002 82 39 53 chr2 161219804 161220293 -20527794 - RLTR45 LTR ERVK 0 482 1 4 1815 490 277 54 86 chr2 161220349 161220570 -20527517 + LTR16C LTR ERVL 269 482 -7 4 1815 915 120 9 286 chr2 161224002 161224212 -20523875 + ORR1B1 LTR MaLR 1 207 -187 4 1815 1232 84 0 16 chr2 161224572 161224754 -20523333 + ORR1A4 LTR MaLR 148 326 -3 4 1815 529 274 41 31 chr2 161225285 161225481 -20522606 + RMER15 LTR ERVL 352 549 -26 4 1815 284 397 28 0 chr2 161226423 161226564 -20521523 - LTR33 LTR ERVL -292 223 79 4 1815 664 320 59 51 chr2 161227091 161227364 -20520723 - MLT1H1 LTR MaLR -265 290 16 4 1815 887 289 31 68 chr2 161227971 161228324 -20519763 - ORR1E LTR MaLR -12 347 8 4 1815 579 280 108 37 chr2 161231564 161231855 -20516232 - ORR1E LTR MaLR -42 337 1 4 1815 1021 226 43 91 chr2 161235696 161236090 -20511997 + MTE2a LTR MaLR 3 377 -2 4 1815 3413 72 17 9 chr2 161237932 161238433 -20509654 + RLTR1C LTR ERV1 1 507 0 4 1815 4710 138 102 11 chr2 161239900 161240777 -20507310 + RMER17B LTR ERVK 2 957 -1 4 1815 649 130 24 16 chr2 161241011 161241136 -20506951 + ORR1D2 LTR MaLR 1 126 -244 4 1815 2024 174 36 5 chr2 161250536 161250924 -20497163 + MTD LTR MaLR 12 411 -8 5 1815 1310 222 96 112 chr2 161252363 161252748 -20495339 - MTE2b LTR MaLR 0 379 1 5 1815 281 310 43 0 chr2 161252925 161253041 -20495046 - LTR33 LTR ERVL -1 514 394 5 1815 1935 176 70 10 chr2 161257253 161257650 -20490437 - MTC LTR MaLR 0 421 1 5 1815 6589 132 36 110 chr2 161260802 161262314 -20485773 + RMER12B LTR ERVK 1 1401 -3 5 1815 1818 152 39 53 chr2 161262555 161262759 -20485328 - RMER17C LTR ERVK 0 410 201 5 1815 1818 152 39 53 chr2 161262794 161263005 -20485082 - RMER17C LTR ERVK -210 200 1 5 1815 632 95 0 0 chr2 161263005 161263089 -20484998 - RMER17C-int LTR ERVK 0 3238 3155 5 1815 1296 183 20 16 chr2 161263089 161263358 -20484729 + RMER13B LTR ERVK 1 339 -569 5 1815 3041 171 59 7 chr2 161263381 161263987 -20484100 - RLTR26 LTR ERVK 0 642 5 5 1815 1784 193 68 41 chr2 161263987 161264446 -20483641 + RMER13B LTR ERVK 341 811 -97 5 1815 7604 95 52 81 chr2 161264485 161265812 -20482275 - RMER17C-int LTR ERVK -83 3155 1867 5 1815 500 307 72 29 chr2 161265817 161266025 -20482062 - MLT1A1 LTR MaLR -165 243 27 5 1815 2170 174 49 10 chr2 161268171 161268576 -20479511 + MTC LTR MaLR 1 421 0 5 1815 449 315 55 59 chr2 161268958 161269265 -20478822 + ORR1E LTR MaLR 11 316 -43 5 1815 250 250 0 0 chr2 161274694 161274754 -20473333 - LTR16A1 LTR ERVL -353 103 44 5 1815 1299 310 17 0 chr2 161274873 161275231 -20472856 + MTEa LTR MaLR 12 375 -4 5 1815 232 337 108 5 chr2 161283749 161283934 -20464153 - LTR16A1 LTR ERVL -2 454 251 5 1815 295 271 93 88 chr2 161285763 161285997 -20462090 - MTEa LTR MaLR -14 365 114 5 1815 938 286 11 42 chr2 161286003 161286288 -20461799 + MTE2a LTR MaLR 1 276 -103 5 1815 545 167 9 9 chr2 161286831 161286940 -20461147 + MTE2a LTR MaLR 269 377 -2 5 1815 2304 193 199 14 chr2 161287719 161288312 -20459775 + RMER19A LTR ERVK 1 703 -34 5 1815 420 258 85 30 chr2 161288767 161288931 -20459156 + MLT2B2 LTR ERVL 10 182 -333 5 1815 1002 176 148 36 chr2 161288960 161289281 -20458806 + RMER16 LTR ERVK 1 533 0 5 1815 237 182 0 0 chr2 161292125 161292169 -20455918 - MLT1H LTR MaLR -4 545 502 5 1815 644 297 37 108 chr2 161299378 161299706 -20448381 + ORR1E LTR MaLR 56 376 -3 6 1815 3719 282 72 76 chr2 161299715 161301267 -20446820 + ORR1E-int LTR MaLR 8 1552 -28 6 1815 561 308 113 98 chr2 161301250 161301596 -20446491 + ORR1E LTR MaLR 9 359 0 6 1815 316 362 149 15 chr2 161301835 161302231 -20445856 + LTR16B1 LTR ERVL 32 480 0 6 1815 380 308 88 6 chr2 161304041 161304211 -20443876 + MLT1F1 LTR MaLR 297 480 -89 6 1815 540 313 57 98 chr2 161304893 161305190 -20442897 - MLT1F2 LTR MaLR -275 285 1 6 1815 1414 219 101 13 chr2 161307063 161307438 -20440649 + MTD LTR MaLR 2 409 -10 6 1815 310 283 32 32 chr2 161311189 161311313 -20436774 + ORR1E LTR MaLR 6 129 -230 6 1815 540 337 74 14 chr2 161315324 161315607 -20432480 - RMER15 LTR ERVL 0 575 276 6 1815 352 263 31 62 chr2 161315609 161315771 -20432316 - RMER15 LTR ERVL -418 157 1 6 1815 354 357 79 76 chr2 161316631 161317025 -20431062 + MLT1J1 LTR MaLR 41 435 -9 6 1815 535 284 118 31 chr2 161318057 161318286 -20429801 - MLT1D LTR MaLR -2 503 255 6 1815 740 314 129 63 chr2 161321003 161321514 -20426573 + MLT1G3 LTR MaLR 9 595 0 6 1815 1899 156 41 6 chr2 161321744 161322086 -20426001 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 41 6 1815 412 330 84 0 chr2 161323089 161323316 -20424771 + MTEa LTR MaLR 1 245 -134 6 1815 351 329 73 27 chr2 161336130 161336385 -20411702 + MTEb LTR MaLR 64 358 -21 6 1815 2290 129 40 43 chr2 161337390 161337859 -20410228 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK -7 468 1 6 1816 237 196 20 0 chr2 161367841 161367892 -20380195 - ORR1E LTR MaLR 0 370 319 6 1816 653 268 68 34 chr2 161368376 161368581 -20379506 - ORR1E LTR MaLR -107 252 41 6 1816 447 328 21 37 chr2 161379252 161379439 -20368648 + MLT1A LTR MaLR 188 371 -3 7 1816 238 360 65 8 chr2 161380051 161380269 -20367818 + LTR16C LTR ERVL 280 511 -27 7 1816 260 200 0 0 chr2 161393459 161393509 -20354578 + MTEa LTR MaLR 5 54 -325 7 1816 466 231 117 45 chr2 161393694 161393848 -20354239 + MTEa LTR MaLR 202 366 -13 7 1816 1129 196 236 55 chr2 161397145 161397514 -20350573 + RLTR20A2 LTR ERVK 1 442 -99 7 1816 583 234 70 14 chr2 161397559 161397642 -20350445 + RLTR20A2 LTR ERVK 443 535 -6 7 1816 320 359 82 19 chr2 161399664 161399934 -20348153 - LTR33A LTR ERVL -2 518 232 7 1816 459 347 81 5 chr2 161408348 161408571 -20339516 - LTR16C LTR ERVL -244 245 6 7 1816 236 272 82 52 chr2 161409549 161409646 -20338441 + LTR33 LTR ERVL 111 210 -305 7 1816 744 295 25 39 chr2 161418595 161418874 -20329213 + MER90 LTR ERV1 1 275 -300 7 1816 789 301 35 35 chr2 161419103 161419483 -20328604 + RMER15 LTR ERVL 62 561 -14 7 1816 3474 28 2 0 chr2 161422100 161422495 -20325592 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 7 1816 541 357 42 15 chr2 161429086 161429348 -20318739 + MLT1G LTR MaLR 131 399 -192 7 1816 326 225 9 16 chr2 161439002 161439101 -20308986 + MLT1A1 LTR MaLR 270 389 -19 7 1816 1832 138 11 73 chr2 161441848 161442053 -20306034 + RMER17C LTR ERVK 1 193 -217 7 1816 1832 138 11 73 chr2 161442124 161442355 -20305732 + RMER17C LTR ERVK 194 410 0 7 1816 2752 40 55 0 chr2 161443332 161443660 -20304427 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 7 1816 1606 169 191 22 chr2 161448420 161448740 -20299347 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 8 1816 471 248 48 41 chr2 161451004 161451151 -20296936 - MLT1F2 LTR MaLR -412 148 1 8 1816 661 335 83 107 chr2 161459855 161460396 -20287691 + MLT1G LTR MaLR 35 562 -29 8 1817 332 344 43 96 chr2 161483954 161484141 -20263946 - LTR33A LTR ERVL -300 215 28 8 1817 402 315 30 124 chr2 161489242 161489332 -20258755 + MLT1C LTR MaLR 228 390 -77 8 1817 402 315 30 124 chr2 161489703 161489781 -20258306 + MLT1C LTR MaLR 391 467 0 8 1817 2874 161 52 20 chr2 161510979 161511438 -20236649 + RLTR20B3 LTR ERVK 1 471 -106 1 1817 2874 161 52 20 chr2 161511459 161511558 -20236529 + RLTR20B3 LTR ERVK 472 576 -1 1 1817 290 333 68 0 chr2 161513498 161513615 -20234472 + MLT1H1 LTR MaLR 159 283 -272 1 1817 269 363 116 22 chr2 161513681 161513819 -20234268 + MLT1H1 LTR MaLR 429 579 -16 1 1817 355 295 53 15 chr2 161515139 161515270 -20232817 + MLT1A1 LTR MaLR 269 404 -4 1 1817 381 246 68 26 chr2 161519811 161519928 -20228159 + MTD LTR MaLR 270 391 -28 2 1817 325 344 61 6 chr2 161531629 161531793 -20216294 - LTR33A_ LTR ERVL -344 187 15 3 1817 358 344 33 87 chr2 161535282 161535482 -20212605 - MLT1B LTR MaLR -43 347 171 3 1817 358 344 33 87 chr2 161535537 161535702 -20212385 - MLT1B LTR MaLR -220 170 3 3 1817 1948 91 40 61 chr2 161544979 161545308 -20202779 + ORR1A2 LTR MaLR 6 327 0 4 1817 805 266 132 65 chr2 161546155 161546541 -20201546 + MTD LTR MaLR 1 412 -7 5 1817 264 276 0 0 chr2 161548730 161548806 -20199281 + MLT1I LTR MaLR 332 407 -4 5 1817 377 298 168 22 chr2 161549790 161549975 -20198112 + RMER15 LTR ERVL 324 535 -40 5 1817 4059 58 8 0 chr2 161553895 161554394 -20193693 + RLTR1C LTR ERV1 1 503 0 6 1817 348 254 93 65 chr2 161555632 161555771 -20192316 + LTR16A1 LTR ERVL 299 441 -15 7 1817 402 251 94 47 chr2 161560001 161560150 -20187937 - MLT1I LTR MaLR -254 157 3 7 1817 1674 155 115 3 chr2 161565697 161566001 -20182086 - ORR1A1 LTR MaLR -8 338 1 8 1817 485 307 49 0 chr2 161570264 161570427 -20177660 + MTEa LTR MaLR 207 377 -2 9 1817 352 303 124 37 chr2 161584563 161584724 -20163363 + MLT1I LTR MaLR 33 207 -204 1 1817 2502 28 63 0 chr2 161590762 161591079 -20157008 + ORR1A0 LTR MaLR 2 338 -8 1 1817 647 257 57 179 chr2 161597801 161598211 -20149876 - RLTR11A2 LTR ERVK -135 393 11 1 1817 1549 124 132 44 chr2 161598746 161599041 -20149046 - ORR1A4 LTR MaLR -8 321 1 1 1817 320 221 116 39 chr2 161601296 161601451 -20146636 - MTEb LTR MaLR -17 362 196 1 1817 417 296 35 56 chr2 161602697 161602972 -20145115 + MTEb LTR MaLR 97 378 -1 1 1818 2633 187 84 28 chr2 161614706 161615388 -20132699 + MYSERV6-int LTR ERVK 8239 8958 -1 1 1818 1556 150 196 3 chr2 161615389 161615690 -20132397 + RLTR15 LTR ERVK 1 359 0 1 1818 970 249 78 18 chr2 161632961 161633243 -20114844 + MTEa LTR MaLR 68 366 -13 1 1818 382 192 19 0 chr2 161655035 161655122 -20092965 + ORR1D1 LTR MaLR 71 167 -192 2 1818 473 294 163 0 chr2 161655172 161655376 -20092711 + MLT1A0 LTR MaLR 132 408 0 2 1818 615 302 94 46 chr2 161658182 161658556 -20089531 + MLT1A1 LTR MaLR 1 408 0 2 1818 1632 119 91 158 chr2 161658959 161659377 -20088710 - RLTR23 LTR ERV1 -31 399 10 2 1818 541 353 14 5 chr2 161665372 161665594 -20082493 + MLT1I LTR MaLR 46 269 -142 2 1818 713 295 74 87 chr2 161665751 161666130 -20081957 - MTD LTR MaLR -39 380 7 2 1818 278 374 32 59 chr2 161670585 161670804 -20077283 + MLT1A1 LTR MaLR 1 213 -195 2 1818 335 311 114 14 chr2 161672712 161672950 -20075137 - MER34 LTR ERV1 -8 579 285 2 1818 299 196 105 52 chr2 161674190 161674313 -20073774 + MLT1L LTR MaLR 55 250 -360 2 1818 397 315 155 39 chr2 161682161 161682514 -20065573 - MLT1H1 LTR MaLR -32 457 65 2 1818 233 228 35 17 chr2 161685782 161685840 -20062247 + MLT1K LTR MaLR 516 574 -21 2 1818 328 314 190 60 chr2 161687371 161687639 -20060448 + MLT1J2 LTR MaLR 6 308 -140 2 1818 1083 238 14 5 chr2 161688189 161688404 -20059683 + ORR1E LTR MaLR 1 217 -142 2 1818 285 195 50 38 chr2 161689395 161689475 -20058612 + ORR1E LTR MaLR 224 304 -66 2 1818 309 247 14 0 chr2 161689530 161689603 -20058484 + ORR1E LTR MaLR 306 379 0 2 1818 277 380 46 51 chr2 161690784 161690981 -20057106 + MLT1K LTR MaLR 37 232 -363 2 1818 767 317 89 21 chr2 161692473 161692799 -20055288 - MLT1A0 LTR MaLR -17 348 1 2 1818 516 306 112 22 chr2 161698036 161698303 -20049784 - MLT1C LTR MaLR -50 417 127 2 1818 398 304 99 39 chr2 161700653 161700886 -20047201 + MLT1C LTR MaLR 67 313 -154 2 1818 551 308 17 6 chr2 161701361 161701534 -20046553 + MLT1C LTR MaLR 293 467 0 2 1818 247 316 117 31 chr2 161702378 161702541 -20045546 - MamGypLTR3 LTR Gypsy -513 326 150 2 1818 281 281 0 63 chr2 161702687 161702782 -20045305 + MLT1C LTR MaLR 65 153 -314 2 1818 846 325 36 47 chr2 161705984 161706349 -20041738 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 5 2 1818 860 296 67 0 chr2 161709718 161709988 -20038099 + MTE2b LTR MaLR 19 306 -73 2 1818 1766 146 62 45 chr2 161718747 161718957 -20029130 + RMER17C LTR ERVK 1 219 -191 3 1818 1766 146 62 45 chr2 161718982 161719174 -20028913 + RMER17C LTR ERVK 220 410 0 3 1818 585 296 66 21 chr2 161719215 161719501 -20028586 - MLT2D LTR ERVL -173 383 1 3 1818 2641 154 13 26 chr2 161722459 161722924 -20025163 + RMER4A LTR ERVK 6 464 -2 3 1818 561 167 143 0 chr2 161729748 161729818 -20018269 + RLTR28B LTR ERVL 1 80 -401 3 1818 561 167 143 0 chr2 161729841 161729857 -20018230 + RLTR28B LTR ERVL 81 104 -377 3 1818 561 167 143 0 chr2 161730486 161730523 -20017564 + RLTR28B LTR ERVL 105 141 -340 3 1818 292 185 37 0 chr2 161730524 161730578 -20017509 + RLTR28B LTR ERVL 464 519 -5 3 1818 655 266 82 39 chr2 161738878 161739085 -20009002 + MTE2b LTR MaLR 156 371 -8 3 1818 1286 275 81 20 chr2 161741500 161741845 -20006242 + MTE2a LTR MaLR 2 367 -12 3 1819 2012 170 55 89 chr2 161744616 161745074 -20003013 + RMER10A LTR ERVL 1 442 0 3 1819 1094 269 105 56 chr2 161759324 161759510 -19988577 + MTD LTR MaLR 9 197 -222 3 1819 1094 269 105 56 chr2 161760293 161760496 -19987591 + MTD LTR MaLR 198 417 -2 3 1819 1803 194 67 0 chr2 161763322 161763663 -19984424 + ORR1C1 LTR MaLR 1 364 -14 3 1819 1210 272 27 30 chr2 161764147 161764470 -19983617 - LTR82A LTR ERVL -6 866 545 3 1819 236 348 99 7 chr2 161766661 161766803 -19981284 + LTR50 LTR ERVL 28 182 -613 3 1819 2716 172 0 2 chr2 161767323 161767743 -19980344 - MTC LTR MaLR -2 419 1 3 1819 1573 200 53 29 chr2 161769661 161770001 -19978086 + ORR1C2 LTR MaLR 2 349 -35 3 1819 454 272 223 11 chr2 161770994 161771254 -19976833 + MLT1D LTR MaLR 54 368 -137 3 1819 1268 212 196 3 chr2 161772005 161772327 -19975760 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 3 1819 256 315 178 68 chr2 161774331 161774463 -19973624 + MLT1A1 LTR MaLR 68 222 -186 4 1819 256 315 178 68 chr2 161774654 161774712 -19973375 + MLT1A1 LTR MaLR 223 279 -129 4 1819 3197 79 12 12 chr2 161775165 161775586 -19972501 + BGLII LTR ERVK 1 421 0 4 1819 2078 163 32 8 chr2 161775976 161776353 -19971734 + ORR1B1 LTR MaLR 1 386 -8 4 1819 1704 176 71 61 chr2 161785914 161785964 -19962123 - RMER10B LTR ERVL 0 398 349 4 1819 1704 176 71 61 chr2 161786037 161786380 -19961707 - RMER10B LTR ERVL -50 348 2 4 1819 251 309 180 22 chr2 161786911 161787050 -19961037 - MLT1I LTR MaLR -9 402 242 4 1819 413 168 8 144 chr2 161791808 161791926 -19956161 + MT2B LTR ERVL 156 257 -344 4 1819 329 116 115 11 chr2 161792077 161792164 -19955923 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 220 315 -52 4 1819 1244 261 49 43 chr2 161793391 161793760 -19954327 + MTE2b LTR MaLR 5 375 -4 4 1819 262 339 22 59 chr2 161793709 161793844 -19954243 + RMER12 LTR ERVK 732 861 -461 4 1819 577 325 48 71 chr2 161795823 161796134 -19951953 - ORR1E LTR MaLR -40 319 16 4 1819 489 274 165 48 chr2 161803269 161803518 -19944569 + RMER15 LTR ERVL 190 467 -108 4 1819 229 355 17 68 chr2 161803620 161803738 -19944349 - MER74C LTR ERVL -136 324 213 4 1819 399 232 17 51 chr2 161803939 161804057 -19944030 + RMER15 LTR ERVL 462 575 0 4 1819 2062 176 12 27 chr2 161804105 161804514 -19943573 + MTB_Mm LTR MaLR 2 404 -3 4 1819 301 204 15 37 chr2 161828605 161828698 -19919389 + MTC LTR MaLR 1 93 -326 4 1819 1275 179 157 94 chr2 161828815 161829209 -19918878 + MTD LTR MaLR 1 419 0 4 1819 271 292 69 59 chr2 161836382 161836577 -19911510 + RMER15 LTR ERVL 2 189 -386 5 1819 823 292 35 9 chr2 161836623 161836851 -19911236 + RMER15 LTR ERVL 320 553 -22 5 1819 2494 126 3 11 chr2 161838924 161839286 -19908801 - RLTR15 LTR ERVK 0 359 1 5 1819 500 333 35 29 chr2 161842303 161842476 -19905611 + MTEa LTR MaLR 7 180 -199 5 1819 275 353 31 41 chr2 161842476 161842498 -19905589 + MT2A LTR ERVL 7 199 -334 5 1819 388 329 46 40 chr2 161856080 161856232 -19891855 + LTR33A_ LTR ERVL 72 224 -307 5 1819 1033 92 0 0 chr2 161859956 161860098 -19887989 + MT2B LTR ERVL 460 601 0 5 1819 512 358 62 32 chr2 161861758 161862099 -19885988 + ORR1E LTR MaLR 1 351 -8 5 1819 275 340 70 81 chr2 161867531 161867889 -19880198 + ORR1D1 LTR MaLR 21 374 0 5 1819 1071 278 78 42 chr2 161868952 161869309 -19878778 - ORR1D1 LTR MaLR -4 370 1 5 1819 318 254 117 161 chr2 161870448 161870790 -19877297 + MLT1D LTR MaLR 3 329 -176 5 1819 242 202 162 42 chr2 161870777 161870929 -19877158 + MLT1D LTR MaLR 178 356 -149 5 1820 721 220 154 89 chr2 161876400 161876659 -19871428 + MTEb LTR MaLR 95 370 -9 5 1820 227 288 153 59 chr2 161878722 161878837 -19869250 + MLT1H1 LTR MaLR 286 412 -143 5 1820 2254 165 11 8 chr2 161878837 161879203 -19868884 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 5 1820 227 288 153 59 chr2 161879203 161879257 -19868830 + MLT1H1 LTR MaLR 413 470 -85 5 1820 594 333 151 16 chr2 161881909 161882220 -19865867 - ORR1E LTR MaLR -6 353 1 5 1820 1005 274 91 13 chr2 161885897 161886215 -19861872 + MLT1G3 LTR MaLR 58 400 -195 5 1820 444 288 200 0 chr2 161892749 161892954 -19855133 - MLT1E1 LTR MaLR 0 654 409 6 1820 420 265 44 22 chr2 161892999 161893134 -19854953 - MLT1E1 LTR MaLR -381 273 136 6 1820 2629 147 23 55 chr2 161897077 161897602 -19850485 - RLTR28 LTR ERVL -16 508 1 6 1820 1195 229 79 87 chr2 161903225 161903603 -19844484 - MTEa LTR MaLR -4 375 1 6 1820 587 312 32 117 chr2 161905061 161905369 -19842718 - MLT1A LTR MaLR -16 358 77 6 1820 389 314 33 114 chr2 161905460 161905752 -19842335 - MLT1G LTR MaLR -103 492 224 6 1820 1064 266 115 30 chr2 161909877 161910304 -19837783 - MLT1C LTR MaLR -2 465 3 6 1820 456 177 14 1 chr2 161913350 161913446 -19834641 - MTC LTR MaLR -298 98 1 6 1820 450 342 55 72 chr2 161914110 161914472 -19833615 + ORR1E LTR MaLR 2 357 -2 6 1820 344 342 49 12 chr2 161917564 161917727 -19830360 + MLT1D LTR MaLR 22 190 -315 6 1820 257 270 180 116 chr2 161917774 161917946 -19830141 + MLT1D LTR MaLR 302 484 -21 6 1820 454 358 108 24 chr2 161919014 161919309 -19828778 - LTR16A LTR ERVL 0 451 132 6 1820 762 340 67 77 chr2 161919334 161919930 -19828157 + MER77 LTR ERVL 9 598 -9 6 1820 1210 214 23 78 chr2 161923185 161923529 -19824558 - MTEb LTR MaLR -2 377 53 6 1820 436 336 80 19 chr2 161927598 161927862 -19820225 + MLT1H LTR MaLR 67 346 -203 6 1820 402 230 100 0 chr2 161933625 161933725 -19814362 - MLT1J LTR MaLR -335 177 68 6 1820 942 251 125 5 chr2 161941885 161942261 -19805826 + LTR37A LTR ERV1 1 421 -5 6 1820 1099 258 57 13 chr2 161943341 161943640 -19804447 - MTEb LTR MaLR -67 312 1 6 1820 2052 223 32 69 chr2 161948084 161948637 -19799450 + MT2A LTR ERVL 1 533 0 6 1820 1047 302 66 17 chr2 161948967 161949438 -19798649 - RMER5 LTR ERV1 0 534 41 6 1820 710 301 112 22 chr2 161952117 161952431 -19795656 + MTE2a LTR MaLR 9 390 -29 6 1820 2046 121 54 3 chr2 161952966 161953297 -19794790 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 47 6 1820 310 290 264 10 chr2 161957838 161958126 -19789961 - MLT1A0 LTR MaLR -3 362 1 7 1820 2257 166 10 34 chr2 161961788 161961885 -19786202 + MTC LTR MaLR 1 86 -335 7 1820 2257 166 10 34 chr2 161962022 161962342 -19785745 + MTC LTR MaLR 87 408 -13 7 1820 345 355 87 24 chr2 161962783 161963037 -19785050 + LTR86A2 LTR ERVL 180 449 -59 7 1820 1344 231 27 59 chr2 161965974 161966347 -19781740 + MTEa LTR MaLR 5 365 -14 7 1820 1683 206 93 8 chr2 161967559 161967945 -19780142 - MTD LTR MaLR 0 419 1 7 1820 228 267 78 0 chr2 161970815 161970905 -19777182 - MTEa LTR MaLR -27 352 256 7 1820 340 317 17 85 chr2 161971049 161971225 -19776862 - MTEa LTR MaLR -196 183 20 7 1820 326 301 19 19 chr2 161982180 161982285 -19765802 - LTR16A1 LTR ERVL -102 354 250 7 1820 556 355 50 47 chr2 161982394 161982722 -19765365 - MLT1C LTR MaLR -2 465 144 7 1820 1012 228 299 12 chr2 161982722 161983046 -19765041 - MTD LTR MaLR -2 417 1 7 1820 556 355 50 47 chr2 161983046 161983181 -19764906 - MLT1C LTR MaLR -324 143 1 7 1820 432 299 87 109 chr2 161983571 161983928 -19764159 - ORR1E LTR MaLR -8 351 3 7 1820 2168 103 20 62 chr2 161984302 161984643 -19763444 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 3 7 1820 1574 194 163 0 chr2 161998316 161998671 -19749416 + MTD LTR MaLR 7 419 0 7 1820 264 339 35 9 chr2 161998691 161998807 -19749280 + RMER15-int LTR ERVL 4528 4646 -353 7 1820 347 318 82 31 chr2 162002178 162002373 -19745714 + MLT1F2 LTR MaLR 5 209 -351 3 1820 400 277 68 90 chr2 162003343 162003565 -19744522 + MTEa LTR MaLR 6 222 -157 7 1821 558 284 119 0 chr2 162005028 162005222 -19742865 - ORR1D2 LTR MaLR -18 352 136 1 1821 2366 64 126 11 chr2 162005260 162005610 -19742477 - RLTR10 LTR ERVK 0 390 1 1 1821 454 218 60 8 chr2 162005804 162005938 -19742149 - ORR1D2 LTR MaLR -229 141 1 1 1821 581 254 71 89 chr2 162011179 162011529 -19736558 + RLTR15 LTR ERVK 1 344 -15 1 1821 2213 132 6 0 chr2 162012363 162012688 -19735399 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 2 1821 3524 25 2 0 chr2 162013468 162013863 -19734224 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 1821 404 311 162 14 chr2 162014306 162014596 -19733491 + MLT1C LTR MaLR 1 333 -134 2 1821 1006 336 33 25 chr2 162014828 162015310 -19732777 + MLT1E3 LTR MaLR 139 624 0 2 1821 929 321 76 27 chr2 162030416 162030864 -19717223 - MLT1D LTR MaLR -20 485 16 4 1821 1030 269 76 59 chr2 162034750 162035105 -19712982 + ORR1D2 LTR MaLR 10 370 0 5 1821 295 335 50 29 chr2 162043624 162043864 -19704223 + MLT1B LTR MaLR 7 251 -139 6 1821 1982 190 25 2 chr2 162045675 162046076 -19702011 + MTD LTR MaLR 10 419 0 6 1821 407 276 101 73 chr2 162047157 162047446 -19700641 + MTEa LTR MaLR 85 377 -2 6 1821 251 205 0 3 chr2 162049881 162049939 -19698148 - MLT1J1 LTR MaLR 0 448 392 7 1821 4288 146 45 30 chr2 162053282 162053399 -19694688 + RLTR25B LTR ERVK 1 116 -912 7 1821 4288 157 41 34 chr2 162053458 162054262 -19693825 + RLTR25B LTR ERVK 117 1103 0 7 1821 2013 161 19 5 chr2 162056978 162057346 -19690741 + ORR1C1 LTR MaLR 6 378 0 8 1821 1869 214 16 3 chr2 162057853 162058224 -19689863 + ORR1C1 LTR MaLR 1 376 -2 8 1821 965 264 107 26 chr2 162061323 162061682 -19686405 - MTE2b LTR MaLR 0 370 2 8 1821 828 258 77 68 chr2 162063017 162063341 -19684746 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 44 8 1821 521 332 42 18 chr2 162066392 162066723 -19681364 + MLT1D LTR MaLR 12 350 -155 9 1821 318 303 53 66 chr2 162067161 162067313 -19680774 + MLT1D LTR MaLR 355 504 -1 9 1821 746 248 114 40 chr2 162068072 162068370 -19679717 - MTE2a LTR MaLR -2 377 58 9 1821 570 336 25 36 chr2 162073649 162073924 -19674163 + LTR40a LTR ERVL 222 493 -26 1 1821 2007 208 40 5 chr2 162080800 162081201 -19666886 - MTD LTR MaLR -1 418 4 1 1821 253 196 20 0 chr2 162081300 162081351 -19666736 + MTE2a LTR MaLR 1 52 -327 1 1821 693 254 75 88 chr2 162083231 162083538 -19664549 + MTE2a LTR MaLR 72 374 -5 1 1821 569 343 28 70 chr2 162086543 162086900 -19661187 + MLT1B LTR MaLR 47 388 -2 1 1821 1983 123 124 17 chr2 162088589 162088935 -19659152 + RLTR9A2 LTR ERVK 1 383 0 1 1821 328 226 159 33 chr2 162104789 162104940 -19643147 + MLT1H LTR MaLR 31 200 -349 1 1821 2227 174 23 18 chr2 162109233 162109672 -19638415 + BGLII_B LTR ERVK 1 441 0 1 1821 376 171 0 0 chr2 162109734 162109804 -19638283 + BGLII_A LTR ERVK 376 445 0 1 1821 582 222 98 38 chr2 162110412 162110595 -19637492 + MTD LTR MaLR 211 404 -15 1 1821 1807 221 44 46 chr2 162115868 162116300 -19631787 + RMER10A LTR ERVL 3 433 -9 1 1821 971 315 80 28 chr2 162119247 162119636 -19628451 - MLT1C LTR MaLR -56 411 3 1 1821 1239 258 97 17 chr2 162121336 162121687 -19626400 - MTEb LTR MaLR 0 379 1 1 1821 340 368 65 12 chr2 162122811 162122979 -19625108 + LTR16A LTR ERVL 32 208 -243 1 1821 455 310 126 59 chr2 162124859 162125281 -19622806 - MLT1C LTR MaLR -9 458 9 1 1821 1205 226 147 52 chr2 162127722 162127856 -19620231 + RMER6B LTR ERVK 1 150 -311 1 1821 2982 107 35 2 chr2 162127856 162128250 -19619837 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 1 1821 1205 226 147 52 chr2 162128250 162128536 -19619551 + RMER6B LTR ERVK 151 460 -1 1 1821 1062 258 55 29 chr2 162131433 162131815 -19616272 + MTD LTR MaLR 24 405 -14 1 1821 1355 238 97 13 chr2 162132426 162132817 -19615270 - BGLII_B LTR ERVK -17 424 1 1 1822 741 22 0 0 chr2 162136340 162136429 -19611658 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 238 2 1822 1896 149 125 33 chr2 162141855 162142216 -19605871 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 2 1822 1207 100 5 40 chr2 162144255 162144453 -19603634 - RMER17D2 LTR ERVK 0 809 619 2 1822 1116 259 94 44 chr2 162146031 162146371 -19601716 - ORR1E LTR MaLR -2 357 1 2 1822 629 315 38 75 chr2 162154578 162154949 -19593138 + ORR1E LTR MaLR 1 357 -2 2 1822 233 179 16 125 chr2 162157014 162157078 -19591009 + RMER17B LTR ERVK 83 139 -819 2 1822 595 289 114 6 chr2 162161997 162162164 -19585923 + MLT1A0 LTR MaLR 5 189 -176 2 1822 2422 161 2 44 chr2 162162177 162162260 -19585827 + MTC LTR MaLR 6 74 -347 2 1822 2422 161 2 44 chr2 162162419 162162768 -19585319 + MTC LTR MaLR 75 420 -1 2 1822 1602 225 20 92 chr2 162162914 162163315 -19584772 + MTE2a LTR MaLR 1 372 -7 2 1822 371 309 38 51 chr2 162163317 162163474 -19584613 - MER31B LTR ERV1 -311 155 1 2 1822 3415 48 8 0 chr2 162163486 162163879 -19584208 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 1822 451 323 85 73 chr2 162170451 162170624 -19577463 + MLT1A0 LTR MaLR 1 195 -170 2 1822 451 323 85 73 chr2 162170675 162170818 -19577269 + MLT1A0 LTR MaLR 196 321 -44 2 1822 639 298 30 72 chr2 162170950 162171325 -19576762 + ORR1E LTR MaLR 4 379 0 2 1822 1294 323 74 69 chr2 162171325 162172163 -19575924 + ORR1E-int LTR MaLR 1 842 -738 2 1822 302 299 31 0 chr2 162173776 162173873 -19574214 + LTR33B LTR ERVL 401 500 -3 2 1822 1930 169 77 13 chr2 162174736 162175132 -19572955 - MTC LTR MaLR -10 411 1 2 1822 626 348 20 8 chr2 162182504 162182749 -19565338 - MLT1C LTR MaLR -15 452 205 2 1822 1223 251 132 6 chr2 162182821 162183186 -19564901 + MTD LTR MaLR 1 411 -8 2 1822 331 318 25 37 chr2 162183194 162183357 -19564730 - MLT1C LTR MaLR -305 162 2 2 1822 244 279 0 48 chr2 162184810 162184893 -19563194 + MTEb LTR MaLR 284 362 -17 2 1822 385 318 38 0 chr2 162189865 162189997 -19558090 + MLT1A0 LTR MaLR 15 151 -257 2 1822 448 309 53 18 chr2 162190255 162190426 -19557661 + MLT1A0 LTR MaLR 189 365 0 2 1822 907 175 49 11 chr2 162197512 162197697 -19550390 - ORR1B1 LTR MaLR -202 192 1 3 1822 521 295 41 5 chr2 162198011 162198205 -19549882 - MLT1B LTR MaLR 0 390 190 3 1822 644 360 114 22 chr2 162198389 162198989 -19549098 - MLT1E3 LTR MaLR -3 650 1 3 1822 495 214 72 27 chr2 162205800 162205930 -19542157 + MTEa LTR MaLR 248 380 -14 3 1822 347 305 46 0 chr2 162215116 162215247 -19532840 - MLT1C LTR MaLR -1 466 330 3 1822 4097 154 31 13 chr2 162216355 162217033 -19531054 + RLTR17 LTR ERVK 1 690 -2 3 1822 445 302 99 0 chr2 162218920 162219092 -19528995 + MER92B LTR ERV1 10 198 -438 3 1822 383 323 49 98 chr2 162219265 162219632 -19528455 - ORR1E LTR MaLR -5 354 6 3 1822 2347 211 37 12 chr2 162226206 162226718 -19521369 + MT2A LTR ERVL 4 528 -5 3 1822 1036 274 105 16 chr2 162227690 162227994 -19520093 + MTE2b LTR MaLR 1 331 -48 3 1822 904 274 164 3 chr2 162227976 162228294 -19519793 - MTE2b LTR MaLR -10 369 1 3 1822 1371 166 24 203 chr2 162229942 162230410 -19517677 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 3 1822 329 204 37 37 chr2 162230482 162230589 -19517498 + MTE2a LTR MaLR 273 379 0 3 1822 773 300 51 89 chr2 162235458 162235908 -19512179 - MLT1F2 LTR MaLR 0 560 128 3 1822 308 296 80 11 chr2 162237803 162237991 -19510096 - LTR37A LTR ERV1 0 426 226 3 1822 238 312 20 40 chr2 162238595 162238695 -19509392 - MLT2B3 LTR ERVL -454 100 3 3 1822 645 280 240 0 chr2 162243075 162243381 -19504706 - MTEb LTR MaLR 0 379 1 3 1822 1662 141 235 3 chr2 162256797 162257095 -19490992 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 3 1822 766 240 24 74 chr2 162257154 162257476 -19490611 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 300 -153 3 1822 636 205 12 37 chr2 162257552 162257714 -19490373 + RLTR11A2 LTR ERVK 277 434 -19 3 1822 428 270 190 20 chr2 162257731 162257931 -19490156 - MLT1A1 LTR MaLR -65 343 110 3 1822 422 312 40 0 chr2 162259146 162259319 -19488768 + MLT1D LTR MaLR 1 180 -325 3 1822 298 286 6 22 chr2 162259376 162259547 -19488540 + MLT1D LTR MaLR 293 503 -2 3 1823 2091 99 0 16 chr2 162267581 162267900 -19480187 + ORR1A4 LTR MaLR 8 321 -8 4 1823 1058 232 204 13 chr2 162268529 162268847 -19479240 + MTE2b LTR MaLR 1 379 0 4 1823 232 326 66 15 chr2 162269666 162269803 -19478284 + MLT1C LTR MaLR 1 144 -361 4 1823 433 231 102 36 chr2 162269919 162270085 -19478002 + MLT1C LTR MaLR 287 463 -4 4 1823 658 210 94 34 chr2 162273169 162273389 -19474698 - ORR1D1 LTR MaLR -57 302 54 4 1823 2126 87 0 124 chr2 162277075 162277430 -19470657 + RLTR10E LTR ERVK 1 311 0 4 1823 966 299 54 25 chr2 162277458 162277848 -19470239 + MTE2a LTR MaLR 8 419 -2 4 1823 2280 95 6 63 chr2 162279557 162279904 -19468183 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 4 1823 406 284 32 91 chr2 162284776 162284933 -19463154 + MER67D LTR ERV1 4 157 -357 4 1823 2088 193 130 13 chr2 162284933 162285355 -19462732 + MT2A LTR ERVL 1 481 -52 4 1823 2088 193 130 13 chr2 162285441 162285495 -19462592 + MT2A LTR ERVL 482 532 -1 4 1823 406 284 32 91 chr2 162285495 162285558 -19462529 + MER67D LTR ERV1 158 211 -303 4 1823 345 286 33 8 chr2 162286016 162286136 -19461951 + MER67D LTR ERV1 278 400 -311 4 1823 786 229 164 0 chr2 162289976 162290190 -19457897 + MTEb LTR MaLR 129 377 -2 4 1823 2465 140 24 31 chr2 162290599 162291057 -19457030 + RMER6B LTR ERVK 7 461 0 4 1823 242 358 74 35 chr2 162293795 162293963 -19454124 - MLT1F1 LTR MaLR -294 275 95 4 1823 1930 100 39 3 chr2 162296686 162296996 -19451091 + ORR1A4 LTR MaLR 1 321 -8 4 1823 243 258 0 16 chr2 162302808 162302871 -19445216 + MLT1I LTR MaLR 348 409 -2 4 1823 631 245 14 7 chr2 162304855 162304999 -19443088 - MLT1F1 LTR MaLR 0 569 425 4 1823 1726 136 16 103 chr2 162306728 162307098 -19440989 + ORR1B1 LTR MaLR 41 378 -16 4 1823 386 310 228 47 chr2 162307175 162307662 -19440425 + MLT1G1 LTR MaLR 5 579 0 4 1823 489 294 96 25 chr2 162311028 162311227 -19436860 - MTEa LTR MaLR -166 213 1 5 1823 280 311 22 0 chr2 162318701 162318791 -19429296 + RMER15 LTR ERVL 461 552 -23 5 1823 229 264 33 54 chr2 162320818 162320910 -19427177 + MLT1C LTR MaLR 53 142 -325 5 1823 262 403 7 0 chr2 162320953 162321107 -19426980 + MLT1C LTR MaLR 223 377 -90 5 1823 670 272 42 0 chr2 162328462 162328675 -19419412 + MLT2B5 LTR ERVL 90 311 -406 5 1823 1896 170 67 3 chr2 162328896 162329239 -19418848 + ORR1B2 LTR MaLR 1 365 -2 5 1823 2216 143 26 11 chr2 162330031 162330413 -19417674 - MTC LTR MaLR -33 388 1 5 1823 541 302 25 5 chr2 162332661 162332857 -19415230 + MLT1A0 LTR MaLR 162 361 -4 5 1823 420 293 137 95 chr2 162332975 162332997 -19415090 + ORR1E LTR MaLR 4 26 -333 5 1823 420 293 137 95 chr2 162333068 162333381 -19414706 + ORR1E LTR MaLR 27 353 -6 5 1823 489 318 33 61 chr2 162343711 162344094 -19403993 + ORR1E LTR MaLR 4 369 -1 5 1823 297 313 7 37 chr2 162346067 162346203 -19401884 - ORR1E LTR MaLR -210 149 18 5 1823 257 228 72 48 chr2 162349977 162350060 -19398027 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 286 5 1823 422 296 33 52 chr2 162352906 162353116 -19394971 - RLTR42-int LTR ERVK -4142 1380 1175 5 1823 1221 277 51 10 chr2 162353567 162353961 -19394126 - MTD LTR MaLR 0 419 10 5 1823 3124 42 44 0 chr2 162358773 162359156 -19388931 - MTB LTR MaLR 0 400 1 5 1823 481 323 50 38 chr2 162359916 162360174 -19387913 - MLT1A-int LTR MaLR -1151 584 324 5 1823 554 321 96 7 chr2 162360304 162360574 -19387513 - MLT1A-int LTR MaLR -1427 308 15 5 1823 251 352 16 39 chr2 162360589 162360716 -19387371 - MLT1A LTR MaLR 0 374 251 5 1823 1425 165 164 6 chr2 162380327 162380644 -19367443 - MTD LTR MaLR -52 367 1 6 1823 2198 147 92 36 chr2 162382616 162383082 -19365005 + RMER5 LTR ERV1 17 508 -26 6 1823 371 175 102 10 chr2 162389704 162389802 -19358285 - RMER12 LTR ERVK -457 865 759 6 1823 311 333 38 30 chr2 162390879 162391012 -19357075 + MLT1I LTR MaLR 9 142 -269 6 1823 319 230 0 94 chr2 162391139 162391235 -19356852 + MLT1I LTR MaLR 325 411 0 6 1824 266 322 76 8 chr2 162398398 162398517 -19349570 - RMER15 LTR ERVL -4 571 445 6 1824 226 277 31 0 chr2 162403628 162403693 -19344394 + MLT1F LTR MaLR 20 86 -493 6 1824 244 320 94 47 chr2 162403894 162404022 -19344065 + MLT1F LTR MaLR 320 453 -95 6 1824 2133 183 3 3 chr2 162416221 162416599 -19331488 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 6 1824 449 364 41 22 chr2 162417739 162418006 -19330081 + MLT1J LTR MaLR 208 479 -33 6 1824 331 277 67 107 chr2 162428974 162429152 -19318935 + RLTR24 LTR ERV1 319 489 -40 6 1824 336 139 67 112 chr2 162429157 162429246 -19318841 + MTEa LTR MaLR 287 371 -8 6 1824 1017 217 212 11 chr2 162429411 162429696 -19318391 - MTD LTR MaLR -19 400 74 6 1824 2038 175 41 69 chr2 162429707 162430125 -19317962 - MTC LTR MaLR -6 415 10 6 1824 1489 190 162 26 chr2 162430797 162431148 -19316939 + MTD LTR MaLR 1 399 -20 6 1824 783 319 144 41 chr2 162443358 162443845 -19304242 - MLT1H LTR MaLR 0 549 13 7 1824 336 373 6 30 chr2 162446314 162446480 -19301607 - MER68 LTR ERVL -24 539 378 7 1824 239 243 125 28 chr2 162447062 162447134 -19300953 - ORR1E LTR MaLR -272 87 9 7 1824 238 221 86 29 chr2 162448235 162448305 -19299782 - MER72 LTR ERV1 -116 606 533 7 1824 2596 199 30 15 chr2 162450465 162450990 -19297097 - RMER15 LTR ERVL 0 575 43 7 1824 603 253 130 50 chr2 162451384 162451728 -19296359 - RMER21B LTR ERV1 -289 553 186 7 1824 265 351 21 0 chr2 162467890 162467984 -19280103 + MLT1E1 LTR MaLR 60 155 -414 7 1824 664 328 35 83 chr2 162468000 162468339 -19279748 + MLT1E1 LTR MaLR 332 654 0 7 1824 899 222 0 43 chr2 162472119 162472307 -19275780 + ORR1D1 LTR MaLR 1 180 -194 7 1824 935 194 38 52 chr2 162472688 162472900 -19275187 + ORR1D1 LTR MaLR 166 374 0 7 1824 377 263 20 31 chr2 162476668 162476766 -19271321 + LTR86A2 LTR ERVL 76 172 -336 7 1824 439 245 9 9 chr2 162478899 162479006 -19269081 + MLT2B2 LTR ERVL 416 522 -40 7 1824 450 286 112 15 chr2 162479242 162479568 -19268519 + MLT1F2 LTR MaLR 96 490 -70 7 1824 930 168 0 6 chr2 162480959 162481115 -19266972 + ORR1A1 LTR MaLR 6 160 -186 7 1824 478 322 92 37 chr2 162498449 162498688 -19249399 - LTR33A_ LTR ERVL -239 292 37 8 1824 478 322 92 37 chr2 162498775 162498806 -19249281 - LTR33A_ LTR ERVL -495 36 7 8 1824 816 288 197 14 chr2 162499229 162499574 -19248513 + MLT1I LTR MaLR 1 408 -3 8 1824 1919 173 86 8 chr2 162500609 162500993 -19247094 + MTD LTR MaLR 5 418 -1 2 1824 2264 103 100 6 chr2 162501460 162501810 -19246277 - ORR1C2 LTR MaLR -1 383 1 5 1824 566 336 77 27 chr2 162507147 162507407 -19240680 - MLT1I LTR MaLR -66 345 73 1 1824 2619 158 9 7 chr2 162509276 162509696 -19238391 + MTC LTR MaLR 1 421 0 2 1824 425 397 56 44 chr2 162510210 162510529 -19237558 - LTR16C LTR ERVL -4 485 163 2 1824 290 281 115 61 chr2 162513666 162513808 -19234279 - LTR16E1 LTR ERVL 0 538 389 2 1824 276 331 20 64 chr2 162514020 162514223 -19233864 - LTR16E1 LTR ERVL -135 354 161 2 1824 256 262 83 48 chr2 162515426 162515510 -19232577 + MLT1F1 LTR MaLR 7 93 -476 3 1824 228 330 73 78 chr2 162515695 162515886 -19232201 + MLT1F1 LTR MaLR 196 385 -26 3 1824 421 299 130 54 chr2 162516592 162516675 -19231412 - LTR16A1 LTR ERVL -16 440 344 3 1824 421 299 130 54 chr2 162516889 162517122 -19230965 - LTR16A1 LTR ERVL -113 343 94 3 1824 421 299 130 54 chr2 162517170 162517205 -19230882 - LTR16A1 LTR ERVL -363 93 61 3 1824 425 290 186 16 chr2 162519093 162519345 -19228742 - LTR16C LTR ERVL -2 487 193 4 1824 683 298 20 132 chr2 162521046 162521402 -19226685 + MLT1E2 LTR MaLR 312 627 0 4 1824 1332 303 96 30 chr2 162523562 162524062 -19224025 - MLT1F2 LTR MaLR -10 550 18 4 1824 310 339 53 58 chr2 162524380 162524568 -19223519 + LTR33 LTR ERVL 259 445 -70 4 1824 1696 209 36 17 chr2 162526607 162526967 -19221120 - ORR1D2 LTR MaLR -3 367 1 4 1825 238 250 111 12 chr2 162530856 162530937 -19217150 + RMER21A LTR ERV1 652 740 -207 5 1825 553 311 100 21 chr2 162531512 162531752 -19216335 + MLT1C LTR MaLR 37 295 -172 6 1825 1693 207 67 36 chr2 162531777 162532167 -19215920 - MTD LTR MaLR -15 404 3 6 1825 818 242 70 67 chr2 162533043 162533327 -19214760 + MLT1B LTR MaLR 1 285 -105 6 1825 1336 208 112 18 chr2 162539195 162539533 -19208554 - ORR1D1 LTR MaLR -4 370 1 7 1825 249 239 104 0 chr2 162539879 162539946 -19208141 + MLT1K LTR MaLR 10 83 -512 7 1825 553 368 113 61 chr2 162540193 162540618 -19207469 + LTR16A1 LTR ERVL 7 453 -3 8 1825 2125 144 20 17 chr2 162542153 162542506 -19205581 + ORR1B1 LTR MaLR 41 394 0 8 1825 908 263 73 50 chr2 162545193 162545493 -19202594 + MTE2b LTR MaLR 18 324 -55 9 1825 312 164 82 0 chr2 162545639 162545700 -19202387 + MTE2b LTR MaLR 314 379 0 9 1825 449 335 93 36 chr2 162547806 162548072 -19200015 - MLT1J2 LTR MaLR -120 328 47 9 1825 240 261 100 75 chr2 162549001 162549121 -19198966 - RMER13A LTR ERVK 0 860 738 9 1825 2040 226 126 46 chr2 162549136 162549683 -19198404 - RMER13A LTR ERVK -202 658 68 9 1825 600 292 30 6 chr2 162550168 162550337 -19197750 + LTR16C LTR ERVL 217 389 -100 9 1825 244 229 21 0 chr2 162556292 162556340 -19191747 - MLT2B4 LTR ERVL 0 563 515 1 1825 644 225 122 110 chr2 162556446 162556845 -19191242 - MLT2B4 LTR ERVL -40 374 2 1 1825 306 312 62 77 chr2 162558072 162558280 -19189807 + MLT1J LTR MaLR 224 428 -84 1 1825 811 240 60 118 chr2 162562667 162563064 -19185023 - MTE2a LTR MaLR 0 379 6 1 1825 348 293 26 26 chr2 162565617 162565768 -19182319 - LTR16B LTR ERVL -8 455 305 1 1825 1930 165 104 8 chr2 162566220 162566604 -19181483 - MTC LTR MaLR 0 421 1 1 1825 251 286 14 14 chr2 162566920 162566991 -19181096 - LTR16B LTR ERVL -192 288 218 1 1825 248 212 75 96 chr2 162570356 162570450 -19177637 + ORR1E LTR MaLR 260 351 -8 1 1825 294 307 50 21 chr2 162587148 162587338 -19160749 - MLT1C LTR MaLR -4 463 283 1 1825 772 339 86 0 chr2 162587964 162588256 -19159831 - MLT1J2 LTR MaLR -111 337 21 1 1825 420 291 192 8 chr2 162589871 162590131 -19157956 + LTR16C LTR ERVL 182 489 0 1 1825 524 292 107 34 chr2 162596543 162596834 -19151253 - LTR16A1 LTR ERVL -91 365 54 1 1825 594 324 95 46 chr2 162597829 162597975 -19150112 + MLT1B LTR MaLR 11 180 -210 1 1825 594 324 95 46 chr2 162598125 162598327 -19149760 + MLT1B LTR MaLR 181 375 -15 1 1825 293 277 68 19 chr2 162599436 162599609 -19148478 + MLT1J LTR MaLR 6 154 -358 1 1825 253 254 78 78 chr2 162599739 162599867 -19148220 + MLT1J LTR MaLR 326 453 -59 1 1825 231 262 0 87 chr2 162601944 162602036 -19146051 + MLT1B LTR MaLR 365 448 0 1 1825 4675 95 76 13 chr2 162603344 162604055 -19144032 + RMER6A LTR ERVK 1 756 0 1 1825 1381 205 109 63 chr2 162604319 162604715 -19143372 - MTD LTR MaLR -5 414 1 1 1825 252 200 143 24 chr2 162604764 162604849 -19143238 + MTEa LTR MaLR 272 356 -3 1 1825 1212 217 66 0 chr2 162605983 162606241 -19141846 + MTE2b LTR MaLR 1 275 -104 1 1825 1118 243 40 101 chr2 162606308 162606706 -19141381 + MTE2a LTR MaLR 1 374 -5 2 1825 251 299 0 54 chr2 162606963 162607055 -19141032 - MLT1A1 LTR MaLR -278 130 44 2 1825 415 276 125 50 chr2 162607575 162607861 -19140226 + ORR1E LTR MaLR 56 379 0 2 1825 234 259 34 34 chr2 162611907 162611995 -19136092 + MLT1A1 LTR MaLR 317 404 -4 2 1825 286 326 52 89 chr2 162612485 162612754 -19135333 + RLTR15 LTR ERVK 58 316 -43 2 1825 1535 221 181 49 chr2 162612925 162613396 -19134691 + MT2A LTR ERVL 1 533 0 2 1825 7091 163 32 11 chr2 162613396 162614608 -19133479 + MERVL_2A-int LTR ERVL 1 1238 -4523 2 1825 5755 150 50 18 chr2 162614730 162615720 -19132367 + MERVL_2A-int LTR ERVL 1224 2244 -3517 2 1825 358 311 20 13 chr2 162619046 162619196 -19128891 + MER77 LTR ERVL 446 596 -11 2 1825 2571 67 0 38 chr2 162627560 162627900 -19120187 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 2 1825 1502 209 77 20 chr2 162634528 162634880 -19113207 + ORR1D1 LTR MaLR 1 372 -2 2 1825 600 297 91 37 chr2 162635829 162636070 -19112017 - LTR53 LTR ERVL -265 254 1 2 1825 289 281 192 38 chr2 162637127 162637266 -19110821 - MLT1B LTR MaLR -34 356 215 2 1825 289 281 192 38 chr2 162637343 162637443 -19110644 - MLT1B LTR MaLR -176 214 80 2 1825 577 311 11 120 chr2 162639235 162639502 -19108585 + MLT1D LTR MaLR 268 505 0 2 1825 623 312 12 68 chr2 162641053 162641301 -19106786 - MLT1D LTR MaLR -4 501 268 2 1825 230 295 123 65 chr2 162641343 162641481 -19106606 - MLT1D LTR MaLR -325 180 35 2 1825 233 310 20 10 chr2 162644532 162644633 -19103454 - RMER15 LTR ERVL -71 504 403 2 1825 1628 163 64 41 chr2 162644643 162644988 -19103099 + ORR1B1 LTR MaLR 41 393 -1 2 1825 367 287 106 62 chr2 162646567 162646775 -19101312 - ORR1D2 LTR MaLR -128 242 26 2 1825 477 209 98 72 chr2 162648616 162648850 -19099237 + LTRIS_Mm LTR ERV1 284 628 0 2 1825 320 256 23 0 chr2 162649539 162649625 -19098462 - MLT1C LTR MaLR -248 219 132 2 1825 1885 80 262 13 chr2 162649639 162650021 -19098066 - RLTR44C LTR ERVK -25 477 1 2 1825 589 325 93 13 chr2 162651290 162651602 -19096485 + LTR16C LTR ERVL 142 478 -11 2 1825 1160 229 35 12 chr2 162652719 162652975 -19095112 + MTE2b LTR MaLR 1 262 -117 2 1825 793 257 5 5 chr2 162652977 162653161 -19094926 + ORR1E LTR MaLR 1 184 -175 2 1825 318 172 180 34 chr2 162653348 162653479 -19094608 + ORR1E LTR MaLR 176 325 -54 2 1825 275 280 10 29 chr2 162653663 162653766 -19094321 + MLT1A1 LTR MaLR 308 408 0 2 1825 1106 269 112 10 chr2 162658118 162658600 -19089487 + MER34A1 LTR ERV1 1 548 -39 2 1826 354 296 20 0 chr2 162662533 162662631 -19085456 - LTR16C LTR ERVL 0 489 390 3 1826 321 341 228 24 chr2 162674062 162674356 -19073731 + MLT1D LTR MaLR 31 384 -121 3 1826 2344 92 3 66 chr2 162674581 162674930 -19073157 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 3 1826 4545 149 65 70 chr2 162675660 162676555 -19071532 - RMER19B LTR ERVK -12 890 1 3 1826 349 302 110 88 chr2 162680641 162680913 -19067174 - ORR1E LTR MaLR 0 359 82 3 1826 429 295 86 16 chr2 162682191 162682377 -19065710 - RMER15 LTR ERVL -5 570 372 3 1826 469 275 133 118 chr2 162684775 162685097 -19062990 - ORR1D2 LTR MaLR 0 359 33 3 1826 651 286 24 19 chr2 162686301 162686511 -19061576 - RMER15 LTR ERVL -13 562 352 3 1826 925 221 152 29 chr2 162688165 162688481 -19059606 + ORR1E LTR MaLR 1 355 -4 3 1826 1711 168 80 89 chr2 162697076 162697501 -19050586 - MTC LTR MaLR 0 421 1 3 1826 344 333 54 0 chr2 162697584 162697713 -19050374 + ORR1E LTR MaLR 1 136 -223 3 1826 634 287 128 35 chr2 162698806 162699068 -19049019 + MLT1C LTR MaLR 11 299 -261 3 1826 1052 297 70 52 chr2 162699068 162699189 -19048898 + MLT1C LTR MaLR 1 116 -351 3 1826 3095 20 0 0 chr2 162699189 162699535 -19048552 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 3 1826 1052 297 70 52 chr2 162699535 162699871 -19048216 + MLT1C LTR MaLR 117 466 -1 3 1826 430 326 101 75 chr2 162700135 162700549 -19047538 - MLT1H2 LTR MaLR -4 485 78 3 1826 1501 155 60 49 chr2 162701189 162701403 -19046684 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 164 3 1826 2022 114 110 81 chr2 162701403 162701786 -19046301 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 3 1826 1501 155 60 49 chr2 162701786 162701856 -19046231 - ORR1D1 LTR MaLR -211 163 87 3 1826 286 306 32 86 chr2 162701873 162702059 -19046028 + RLTR25B LTR ERVK 1 176 -852 3 1826 482 135 0 0 chr2 162702474 162702548 -19045539 - ORR1D1 LTR MaLR -300 74 1 3 1826 3601 23 0 0 chr2 162707649 162708045 -19040042 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 1826 2247 210 222 18 chr2 162711107 162711719 -19036368 - RMER19A LTR ERVK 0 737 1 3 1826 353 321 54 105 chr2 162715101 162715473 -19032614 + MLT1H LTR MaLR 97 449 -100 3 1826 260 339 26 9 chr2 162718130 162718246 -19029841 + MLT1A LTR MaLR 45 162 -212 4 1826 3053 63 8 12 chr2 162718475 162718875 -19029212 + MTB LTR MaLR 2 399 -1 4 1826 1633 209 54 17 chr2 162719704 162720054 -19028033 - MT2A LTR ERVL -93 440 78 4 1826 297 71 0 0 chr2 162720397 162720439 -19027648 - MT2A LTR ERVL -491 42 1 4 1826 888 247 151 79 chr2 162721100 162721478 -19026609 - MTD LTR MaLR -14 405 1 4 1826 398 299 120 24 chr2 162725266 162725475 -19022612 + LTR31 LTR ERV1 326 554 -65 4 1826 568 280 57 16 chr2 162726161 162726353 -19021734 - MLT2F LTR ERVL -459 204 5 4 1826 581 316 72 97 chr2 162728892 162729253 -19018834 + ORR1E LTR MaLR 8 359 0 4 1826 276 250 128 26 chr2 162730087 162730165 -19017922 + MTEa LTR MaLR 24 109 -250 4 1826 365 214 39 40 chr2 162730312 162730421 -19017666 + MTEa LTR MaLR 269 407 -1 4 1826 711 32 21 21 chr2 162736306 162736401 -19011686 - MTA_Mm LTR MaLR -301 95 1 4 1826 247 330 18 36 chr2 162736445 162736555 -19011532 - RMER12 LTR ERVK -466 856 749 4 1826 445 167 55 11 chr2 162736579 162736670 -19011417 + ORR1D2 LTR MaLR 276 370 0 4 1826 814 227 74 116 chr2 162736921 162737205 -19010882 + MTE2b LTR MaLR 1 272 -107 4 1826 328 298 20 28 chr2 162737223 162737336 -19010751 + MTE2b LTR MaLR 236 349 -30 4 1826 570 255 53 58 chr2 162739412 162739620 -19008467 - RLTR42-int LTR ERVK -4122 1400 1194 4 1826 261 235 138 65 chr2 162741555 162741678 -19006409 + MamGypLTR2c LTR Gypsy 28 159 -909 4 1826 425 264 89 44 chr2 162742264 162742399 -19005688 + MLT1A1 LTR MaLR 268 408 0 4 1826 775 319 78 28 chr2 162742941 162743263 -19004824 + LTR16C LTR ERVL 152 489 0 4 1826 1372 231 31 55 chr2 162743820 162744234 -19003853 - MTE2a LTR MaLR 0 379 6 4 1826 622 302 137 47 chr2 162746348 162746626 -19001461 - RMER15 LTR ERVL 0 575 273 4 1826 753 253 90 34 chr2 162746729 162746962 -19001125 + MTD LTR MaLR 5 250 -169 4 1826 290 120 60 0 chr2 162746965 162747015 -19001072 - ERVL-B4-int LTR ERVL -1201 4513 4461 4 1826 459 196 56 56 chr2 162747221 162747329 -19000758 + MTD LTR MaLR 282 389 -30 4 1826 3776 108 37 77 chr2 162750110 162750735 -18997352 - MT2B LTR ERVL -1 600 1 5 1826 1356 249 76 84 chr2 162751354 162751841 -18996246 + MLT1D LTR MaLR 2 484 -21 5 1826 2233 112 25 0 chr2 162752484 162752804 -18995283 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 2 5 1826 2591 129 45 18 chr2 162753601 162753622 -18994465 + RLTR11B LTR ERVK 1 21 -432 5 1826 2318 101 20 85 chr2 162753622 162754012 -18994075 - RLTR8 LTR ERVK 0 365 1 5 1826 2591 129 45 18 chr2 162754012 162754431 -18993656 + RLTR11B LTR ERVK 22 453 0 5 1826 450 332 100 33 chr2 162770216 162770456 -18977631 - LTR16A LTR ERVL -110 341 86 5 1826 1744 149 51 166 chr2 162776297 162776731 -18971356 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 5 1827 302 290 49 3 chr2 162793941 162794071 -18954016 - MLT1A LTR MaLR -4 386 244 5 1827 1866 286 60 11 chr2 162803211 162803774 -18944313 + MTE-int LTR MaLR 645 1235 -345 6 1827 1042 195 142 12 chr2 162809399 162809726 -18938361 - MTD LTR MaLR -5 416 20 6 1827 2435 139 125 33 chr2 162813542 162814054 -18934033 + RMER4B LTR ERVK 17 575 -10 6 1827 1964 54 96 119 chr2 162822389 162822724 -18925363 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 6 1827 235 294 44 67 chr2 162824215 162824350 -18923737 - RMER12 LTR ERVK -467 855 724 6 1827 246 321 45 27 chr2 162833538 162833618 -18914469 + MT2C_Mm LTR ERVL 232 313 -162 6 1827 542 217 80 15 chr2 162833577 162833778 -18914309 + RMER17C LTR ERVK 63 276 -134 6 1827 1166 214 144 49 chr2 162836304 162836673 -18911414 - RMER5 LTR ERV1 -130 404 1 6 1827 235 270 62 73 chr2 162837481 162837577 -18910510 - MLT1H LTR MaLR -260 289 195 6 1827 231 276 116 90 chr2 162839051 162839320 -18908767 - MTEb LTR MaLR -13 366 88 7 1827 2084 118 139 80 chr2 162857280 162857704 -18890383 - RLTR11B LTR ERVK -4 449 1 7 1827 261 206 144 67 chr2 162858315 162858360 -18889727 - RMER4B LTR ERVK -9 576 537 7 1827 261 206 144 67 chr2 162858386 162858444 -18889643 - RMER4B LTR ERVK -49 536 465 7 1827 703 190 108 29 chr2 162858458 162858824 -18889263 - RMER4B LTR ERVK -171 414 2 7 1827 702 268 183 14 chr2 162865669 162865953 -18882134 - MTA_Mm LTR MaLR -12 384 53 7 1827 2131 160 13 16 chr2 162866647 162867022 -18881065 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 7 1827 617 258 44 68 chr2 162867122 162867372 -18880715 - RMER15 LTR ERVL -18 557 314 7 1827 252 316 70 99 chr2 162869754 162869926 -18878161 + MT2B LTR ERVL 194 360 -241 7 1827 2250 138 14 25 chr2 162874787 162875145 -18872942 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 41 8 1827 384 244 63 24 chr2 162876139 162876265 -18871822 - RMER15 LTR ERVL -13 562 432 8 1827 293 93 0 0 chr2 162878634 162878677 -18869410 + MER57A-int LTR ERV1 1102 1144 -5043 8 1827 281 260 61 30 chr2 162878723 162878822 -18869265 + LTR48 LTR ERV1 380 481 -306 8 1827 382 269 65 53 chr2 162878856 162879025 -18869062 + LTR48 LTR ERV1 614 784 -3 8 1827 229 288 9 103 chr2 162884550 162884612 -18863475 + RLTR25B LTR ERVK 390 469 -559 8 1827 248 264 27 14 chr2 162884614 162884687 -18863400 + MT2C_Mm LTR ERVL 162 235 -240 8 1827 2111 128 77 139 chr2 162887537 162888019 -18860068 - RLTR11B LTR ERVK 0 453 2 8 1827 428 222 104 12 chr2 162891069 162891240 -18856847 - MTD LTR MaLR -2 377 195 8 1827 2844 38 3 0 chr2 162895089 162895434 -18852653 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 8 1827 666 251 105 92 chr2 162895816 162896317 -18851770 - MT2B LTR ERVL 0 533 13 8 1827 1801 99 37 111 chr2 162896569 162896862 -18851225 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 48 8 1827 1801 99 37 111 chr2 162897010 162897069 -18851018 - ORR1A2 LTR MaLR -280 47 1 8 1827 354 330 22 59 chr2 162898972 162899194 -18848893 - RMER15 LTR ERVL -15 560 347 8 1827 926 288 61 35 chr2 162900798 162901108 -18846979 - MTE2b LTR MaLR -46 333 16 8 1827 1198 222 205 23 chr2 162904550 162904896 -18843191 - MTD LTR MaLR -10 409 1 8 1827 478 200 244 18 chr2 162910248 162910416 -18837671 - MTEa LTR MaLR -166 213 8 9 1827 2441 110 56 40 chr2 162915116 162915562 -18832525 - RLTR11B LTR ERVK 0 453 1 9 1827 260 214 54 0 chr2 162918975 162919028 -18829059 + MTEa LTR MaLR 26 81 -289 9 1827 2408 151 39 12 chr2 162919029 162919439 -18828648 + MTC LTR MaLR 1 421 0 9 1827 560 209 0 0 chr2 162919444 162919549 -18828538 + ORR1D2 LTR MaLR 1 105 -265 9 1828 597 195 202 71 chr2 162922873 162923028 -18825059 + MTEa LTR MaLR 109 287 -92 9 1828 597 195 202 71 chr2 162923213 162923295 -18824792 + MTEa LTR MaLR 288 377 -2 9 1828 1220 191 362 36 chr2 162924467 162924828 -18823259 + RMER20A LTR ERVK 39 516 0 9 1828 283 327 44 0 chr2 162925613 162925726 -18822361 + RMER15 LTR ERVL 380 497 -78 9 1828 738 286 149 7 chr2 162932270 162932566 -18815521 - MTE2b LTR MaLR -3 376 39 9 1828 740 245 202 77 chr2 162933144 162933480 -18814607 - MTE2b LTR MaLR -1 378 1 9 1828 1175 235 157 6 chr2 162942052 162942416 -18805671 + MTD LTR MaLR 1 419 0 9 1828 5079 139 51 38 chr2 162942789 162943729 -18804358 + RMER17B LTR ERVK 2 953 -5 1 1828 280 364 98 20 chr2 162948229 162948473 -18799614 - MLT1C LTR MaLR -204 263 1 1 1828 2935 128 11 28 chr2 162949176 162949643 -18798444 - RMER6B LTR ERVK -2 459 1 1 1828 488 283 93 38 chr2 162950898 162951253 -18796834 + RLTR12B LTR ERVK 10 259 -309 1 1828 1185 207 119 25 chr2 162963403 162963681 -18784406 - ORR1D2 LTR MaLR -3 367 64 1 1828 344 243 65 105 chr2 162963811 162963935 -18784152 - MT2B LTR ERVL -344 257 139 1 1828 2778 188 40 73 chr2 162965729 162966361 -18781726 - RMER19C LTR ERVK 0 611 1 1 1828 338 187 0 142 chr2 162967235 162967341 -18780746 + MT2B LTR ERVL 174 264 -337 1 1828 1967 164 88 33 chr2 162967954 162968276 -18779811 + MTC LTR MaLR 2 350 -71 1 1828 1967 164 88 33 chr2 162968304 162968379 -18779708 + MTC LTR MaLR 351 421 0 1 1828 1175 239 186 6 chr2 162971784 162972129 -18775958 + MTD LTR MaLR 1 407 -12 1 1828 2151 143 20 6 chr2 162980350 162980694 -18767393 - ORR1B1 LTR MaLR -39 355 7 1 1828 276 264 133 20 chr2 162984291 162984444 -18763643 - MTEb LTR MaLR -1 378 201 1 1828 1682 217 40 32 chr2 162986714 162987090 -18760997 - MTE2a LTR MaLR 0 379 1 1 1828 680 299 136 7 chr2 162988858 162989106 -18758981 - ORR1E LTR MaLR 0 359 78 1 1828 513 239 18 35 chr2 162989635 162989748 -18758339 - ORR1E LTR MaLR -247 112 2 1 1828 1397 264 40 22 chr2 162990012 162990429 -18757658 + MTE2b LTR MaLR 6 419 0 1 1828 1051 161 35 25 chr2 162990626 162990823 -18757264 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 176 1 1828 549 122 218 15 chr2 162990986 162991119 -18756968 - ORR1D1 LTR MaLR -211 163 4 1 1828 409 263 23 65 chr2 162993658 162993843 -18754244 - MTEb LTR MaLR 0 370 245 1 1828 587 209 113 11 chr2 163000724 163000892 -18747195 - MTD LTR MaLR -2 417 205 2 1828 466 306 94 21 chr2 163000927 163001121 -18746966 - MTD LTR MaLR -203 204 5 2 1828 2773 243 216 32 chr2 163001130 163001854 -18746233 - MTD-int LTR MaLR -5 1253 415 2 1828 2773 243 216 32 chr2 163002047 163002380 -18745707 - MTD-int LTR MaLR -844 414 1 2 1828 422 276 19 0 chr2 163002393 163002498 -18745589 - MTD LTR MaLR -14 405 299 2 1828 778 221 109 16 chr2 163002480 163002664 -18745423 + MTD LTR MaLR 205 405 -14 5 1828 277 341 99 0 chr2 163004705 163004796 -18743291 + ORR1E LTR MaLR 57 156 -203 7 1828 685 269 40 48 chr2 163005431 163005675 -18742412 + MTD LTR MaLR 1 200 -179 1 1828 641 222 60 88 chr2 163005846 163006063 -18742024 + MTD LTR MaLR 167 377 -2 1 1828 233 344 31 31 chr2 163008361 163008457 -18739630 + MT2B2 LTR ERVL 145 240 -344 1 1828 265 331 70 16 chr2 163010241 163010370 -18737717 - MLT1D LTR MaLR -52 453 318 2 1828 231 274 67 27 chr2 163010588 163010663 -18737424 - MLT1D LTR MaLR -549 78 1 2 1828 424 256 61 46 chr2 163014501 163014632 -18733455 - MTD LTR MaLR 0 419 287 3 1828 1620 179 98 10 chr2 163017766 163018071 -18730016 - MTD LTR MaLR 0 419 88 4 1828 747 304 140 15 chr2 163023666 163024060 -18724027 + LTR16C LTR ERVL 27 469 -20 5 1828 379 246 209 0 chr2 163024896 163025006 -18723081 - MLT1I LTR MaLR -237 174 42 5 1828 274 314 36 89 chr2 163025244 163025356 -18722731 + MER74A LTR ERVL 34 139 -419 6 1828 351 310 94 27 chr2 163025491 163025640 -18722447 + MER74A LTR ERVL 385 543 -15 6 1828 446 315 139 24 chr2 163026926 163027160 -18720927 - MLT1H1 LTR MaLR -306 263 7 6 1828 284 344 38 23 chr2 163027701 163027832 -18720255 + LTR85c LTR Gypsy? 356 488 -335 6 1828 1407 233 116 24 chr2 163033971 163034349 -18713738 + MTD LTR MaLR 7 419 0 8 1828 2267 82 30 60 chr2 163035264 163035599 -18712488 + ORR1A2 LTR MaLR 3 327 0 8 1828 2347 143 21 5 chr2 163035777 163036157 -18711930 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 1 8 1828 239 157 38 38 chr2 163036450 163036503 -18711584 - MTEb LTR MaLR 0 379 327 8 1828 228 292 164 58 chr2 163037742 163037913 -18710174 + LTR16A LTR ERVL 242 430 -21 9 1828 672 313 103 103 chr2 163040824 163041296 -18706791 + LTR87 LTR ERVL? 1 480 -144 9 1828 672 313 103 103 chr2 163041334 163041406 -18706681 + LTR87 LTR ERVL? 481 545 -79 9 1829 260 238 35 23 chr2 163056125 163056211 -18691876 - MLT1I LTR MaLR 0 411 325 1 1829 260 304 126 10 chr2 163056625 163056728 -18691359 + MLT1D LTR MaLR 5 119 -386 1 1829 574 270 92 46 chr2 163056794 163057054 -18691033 + MLT1D LTR MaLR 213 484 -21 1 1829 277 268 28 0 chr2 163062497 163062568 -18685519 + LTR16A LTR ERVL 214 286 -165 1 1829 592 305 8 74 chr2 163075714 163075972 -18672115 - MLT1H LTR MaLR -266 283 43 1 1829 232 257 141 77 chr2 163076825 163076981 -18671106 - MTC-int LTR MaLR -1052 206 41 1 1829 227 328 69 46 chr2 163077920 163078051 -18670036 + MT2B LTR ERVL 152 285 -316 1 1829 2651 61 3 3 chr2 163083166 163083493 -18664594 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 1 1829 323 310 87 39 chr2 163086742 163086947 -18661140 - MLT1F2 LTR MaLR -49 604 298 1 1829 1114 217 154 18 chr2 163090687 163090973 -18657114 + MTD LTR MaLR 81 405 -14 1 1829 1867 220 47 22 chr2 163093197 163093606 -18654481 - MTD LTR MaLR 0 419 1 1 1829 312 330 128 10 chr2 163104495 163104691 -18643396 - MLT1D LTR MaLR -9 496 278 2 1829 440 302 187 28 chr2 163108353 163108799 -18639288 - MLT1H2 LTR MaLR -5 544 12 2 1829 830 216 134 89 chr2 163108803 163109118 -18638969 + MTE2a LTR MaLR 5 375 -44 2 1829 1968 193 63 12 chr2 163109127 163109526 -18638561 + MTD LTR MaLR 1 419 0 2 1829 252 154 28 84 chr2 163109747 163109818 -18638269 + MTE2b LTR MaLR 313 379 0 2 1829 259 186 66 33 chr2 163116297 163116358 -18631729 - LTR16A1 LTR ERVL -147 309 247 2 1829 2327 168 73 93 chr2 163117437 163117586 -18630501 - RMER4B LTR ERVK -40 545 309 2 1829 2327 152 71 101 chr2 163117731 163118161 -18629926 - RMER4B LTR ERVK -134 451 1 2 1829 1624 175 86 138 chr2 163119418 163119823 -18628264 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 2 1829 255 290 82 34 chr2 163129771 163129978 -18618109 - RMER17C LTR ERVK -70 340 124 2 1829 6926 32 22 0 chr2 163131405 163132191 -18615896 - RLTR13B4 LTR ERVK 0 803 1 2 1829 537 286 65 28 chr2 163132809 163133057 -18615030 - LTR37A LTR ERV1 -2 466 209 2 1829 2687 67 140 3 chr2 163142260 163142618 -18605469 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 2 1829 2131 142 18 40 chr2 163142814 163143209 -18604878 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 1 2 1829 368 316 175 18 chr2 163144154 163144298 -18603789 - MLT1H2 LTR MaLR -93 396 230 2 1829 1524 153 51 231 chr2 163144298 163144766 -18603321 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 2 1829 368 316 175 18 chr2 163144766 163144947 -18603140 - MLT1H2 LTR MaLR -260 229 21 2 1829 615 249 103 10 chr2 163151932 163152127 -18595960 - MLT1A0 LTR MaLR -128 237 25 3 1829 373 309 16 16 chr2 163167476 163167604 -18580483 + MLT1J1 LTR MaLR 46 173 -271 3 1829 362 217 0 115 chr2 163168465 163168569 -18579518 - MT2B LTR ERVL -337 264 173 3 1829 248 279 35 11 chr2 163170781 163170868 -18577219 + MLT1J1 LTR MaLR 344 432 -16 3 1829 1718 253 11 3 chr2 163176781 163177157 -18570930 + MTE2b LTR MaLR 1 379 0 3 1829 520 284 181 29 chr2 163177538 163177948 -18570139 + MLT1D LTR MaLR 29 500 -5 3 1829 349 340 40 13 chr2 163179064 163179213 -18568874 + MLT1F2 LTR MaLR 40 192 -368 3 1829 663 277 116 13 chr2 163181921 163182199 -18565888 + MLT1J1 LTR MaLR 2 306 -142 3 1830 431 381 97 36 chr2 163188371 163188874 -18559213 + LTR16E1 LTR ERVL 1 534 -4 3 1830 238 341 160 38 chr2 163197633 163197831 -18550256 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 182 3 1830 366 279 19 28 chr2 163198801 163198955 -18549132 - MLT1A1 LTR MaLR -252 156 1 3 1830 309 244 202 8 chr2 163199439 163199563 -18548524 + ORR1E LTR MaLR 42 189 -170 4 1830 440 248 160 84 chr2 163199889 163200114 -18547973 + LTR16A LTR ERVL 205 446 -5 4 1830 572 310 80 71 chr2 163208213 163208564 -18539523 + ORR1E LTR MaLR 6 359 0 4 1830 237 259 17 0 chr2 163209515 163209573 -18538514 + ORR1E LTR MaLR 1 59 -300 4 1830 389 143 34 238 chr2 163210278 163210425 -18537662 + MTEb LTR MaLR 263 379 0 4 1830 2913 125 84 36 chr2 163213513 163214071 -18534016 - RMER4B LTR ERVK 0 585 1 4 1830 850 258 26 101 chr2 163216838 163217183 -18530904 + MTEa LTR MaLR 32 350 -29 4 1830 3340 28 15 3 chr2 163233444 163233835 -18514252 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 1830 1672 195 59 14 chr2 163236455 163236813 -18511274 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 4 1830 2432 122 85 46 chr2 163241592 163242029 -18506058 - MT2C_Mm LTR ERVL -2 473 20 5 1830 303 223 40 50 chr2 163241958 163242057 -18506030 - ORR1A3-int LTR MaLR -1258 705 608 5 1830 299 156 21 0 chr2 163247372 163247438 -18500649 - ORR1A1 LTR MaLR -2 382 291 5 1830 1248 194 191 11 chr2 163249755 163250105 -18497982 - MTD LTR MaLR -2 417 5 5 1830 342 296 92 0 chr2 163252525 163252623 -18495464 - MER57C2 LTR ERV1 -40 394 288 5 1830 880 134 83 30 chr2 163256701 163256870 -18491217 - RLTR30 LTR ERV1 0 379 202 5 1830 838 184 91 63 chr2 163256898 163256997 -18491090 - RLTR30 LTR ERV1 -152 227 128 5 1830 1634 227 50 3 chr2 163256997 163257359 -18490728 + RLTR30 LTR ERV1 1 379 0 5 1830 838 184 91 63 chr2 163257359 163257480 -18490607 - RLTR30 LTR ERV1 -252 127 1 5 1830 413 254 68 104 chr2 163258210 163258439 -18489648 + MTEb LTR MaLR 115 374 -5 5 1830 317 247 65 0 chr2 163260340 163260417 -18487670 + MTC LTR MaLR 1 82 -297 5 1830 361 257 58 71 chr2 163260880 163261035 -18487052 - RLTR11B LTR ERVK -6 447 295 5 1830 1449 202 72 64 chr2 163261763 163262032 -18486055 + MTC LTR MaLR 59 338 -83 5 1830 1449 202 72 64 chr2 163262182 163262272 -18485815 + MTC LTR MaLR 339 421 0 5 1830 711 336 54 72 chr2 163262275 163262663 -18485424 + MT2A LTR ERVL 78 458 -75 5 1830 2221 141 26 54 chr2 163270165 163270592 -18477495 - MTD LTR MaLR 0 419 5 5 1830 414 263 236 53 chr2 163276639 163276864 -18471223 - LTR16A1 LTR ERVL -108 348 83 6 1830 1777 216 102 29 chr2 163281971 163281986 -18466101 + RMER20B LTR ERVK 1 12 -615 6 1830 3015 76 5 8 chr2 163281986 163282383 -18465704 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 1830 1777 216 102 29 chr2 163282383 163282816 -18465271 + RMER20B LTR ERVK 13 482 -145 6 1830 611 207 16 24 chr2 163283332 163283456 -18464631 - MTEa LTR MaLR -256 123 1 6 1830 276 309 11 0 chr2 163283983 163284077 -18464010 - ERVL-E-int LTR ERVL -1600 4067 3973 6 1830 427 325 61 29 chr2 163284577 163284894 -18463193 - ERVL-E-int LTR ERVL -2346 3368 3020 6 1830 326 167 29 200 chr2 163285414 163285519 -18462568 + MTE2a LTR MaLR 2 88 -291 6 1830 2174 123 3 6 chr2 163287019 163287331 -18460756 - RLTR10E LTR ERVK 0 311 1 6 1830 378 102 0 0 chr2 163287337 163287386 -18460701 - RLTR10E LTR ERVK -262 49 1 6 1830 227 264 19 0 chr2 163288998 163289051 -18459036 + MTE2b LTR MaLR 1 54 -325 6 1830 427 225 71 126 chr2 163294473 163294537 -18453550 + MT2B LTR ERVL 106 159 -442 6 1830 1992 281 110 85 chr2 163301511 163301717 -18446370 - RMER12 LTR ERVK -104 1218 987 6 1830 1992 281 110 85 chr2 163301770 163301814 -18446273 - RMER12 LTR ERVK -336 986 946 6 1830 1992 281 110 85 chr2 163301970 163302253 -18445834 - RMER12 LTR ERVK -377 945 682 6 1830 1992 281 110 85 chr2 163302446 163303098 -18444989 - RMER12 LTR ERVK -641 681 1 6 1830 1010 58 25 13 chr2 163303634 163303792 -18444295 + MTA_Mm-int LTR MaLR 939 1098 0 6 1830 2760 36 15 0 chr2 163303792 163304129 -18443958 + MTA_Mm LTR MaLR 1 342 -54 6 1830 2816 114 22 10 chr2 163312366 163312782 -18435305 - MTC LTR MaLR 0 421 1 7 1830 3791 116 136 22 chr2 163314104 163314783 -18433304 + RMER6A LTR ERVK 1 756 0 7 1831 227 162 0 0 chr2 163323389 163323426 -18424661 + MT2B LTR ERVL 199 235 -366 7 1831 242 239 46 148 chr2 163324785 163324893 -18423194 + RLTR25B LTR ERVK 387 483 -545 7 1831 4503 12 2 0 chr2 163344860 163345352 -18402735 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 8 1831 305 0 0 0 chr2 163345352 163345390 -18402697 - MERVL-int LTR ERVL 0 5485 5448 8 1831 399 167 46 35 chr2 163345390 163345477 -18402610 - ORR1A3-int LTR MaLR -1323 640 553 8 1831 46168 14 6 0 chr2 163345477 163350803 -18397284 - MERVL-int LTR ERVL -125 5360 1 8 1831 4503 12 2 0 chr2 163350803 163351295 -18396792 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 8 1831 1299 251 79 44 chr2 163352036 163352441 -18395646 - MTD LTR MaLR 0 419 1 8 1831 230 135 0 0 chr2 163352560 163352597 -18395490 - MT2A LTR ERVL -2 531 495 8 1831 793 333 18 51 chr2 163352708 163353043 -18395044 - MT2A LTR ERVL -104 429 106 8 1831 236 330 9 57 chr2 163353624 163353730 -18394357 + MT2B2 LTR ERVL 178 278 -306 8 1831 2585 83 0 0 chr2 163354896 163355223 -18392864 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 8 1831 416 327 148 5 chr2 163404529 163404738 -18343349 + MLT1E2 LTR MaLR 336 574 -53 9 1831 2314 139 80 28 chr2 163407411 163407811 -18340276 - MTC LTR MaLR 0 421 1 9 1831 488 281 293 59 chr2 163410196 163410619 -18337468 + MLT1F1 LTR MaLR 1 522 -47 9 1831 242 266 0 72 chr2 163411688 163411826 -18336261 - ORR1B1-int LTR MaLR -762 747 620 9 1831 354 321 35 9 chr2 163412823 163412936 -18335151 - MLT1A1 LTR MaLR -2 406 291 9 1831 1002 253 120 37 chr2 163425595 163425894 -18322193 - MTE2b LTR MaLR -55 324 1 1 1831 645 291 54 32 chr2 163425969 163426152 -18321935 + MLT1D LTR MaLR 8 194 -311 1 1831 315 286 112 86 chr2 163426626 163426813 -18321274 + MLT1D LTR MaLR 494 626 -1 1 1831 338 228 85 47 chr2 163431081 163431187 -18316900 - LTR16B2 LTR ERVL -59 404 295 1 1831 238 371 103 41 chr2 163431269 163431415 -18316672 - LTR16B2 LTR ERVL -304 159 5 1 1831 249 307 30 96 chr2 163433536 163433702 -18314385 - MT2B2 LTR ERVL -324 260 106 1 1831 291 250 147 39 chr2 163436423 163436459 -18311628 + MT2B LTR ERVL 118 167 -434 1 1831 1183 233 114 9 chr2 163438660 163438985 -18309102 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 12 1 1831 927 194 167 67 chr2 163440418 163440744 -18307343 - MTD LTR MaLR -12 407 8 1 1832 3456 35 0 0 chr2 163459580 163459976 -18288111 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1832 2338 170 59 8 chr2 163464104 163464578 -18283509 + RLTR17 LTR ERVK 1 498 -194 1 1832 251 256 138 16 chr2 163466427 163466550 -18281537 + MLT1C LTR MaLR 248 385 -82 1 1832 747 208 0 0 chr2 163466610 163466754 -18281333 + ORR1A3 LTR MaLR 1 144 -182 1 1832 379 262 55 16 chr2 163466782 163466797 -18281290 + ORR1A3 LTR MaLR 163 177 -201 1 1832 664 134 27 0 chr2 163466939 163467051 -18281036 + ORR1A3 LTR MaLR 130 244 -82 1 1832 438 108 12 177 chr2 163467741 163467803 -18280284 + ORR1A3 LTR MaLR 243 353 -41 1 1832 438 108 10 162 chr2 163467948 163468002 -18280085 + ORR1A3 LTR MaLR 286 326 0 1 1832 1468 83 66 0 chr2 163468387 163468615 -18279472 + RLTR4_Mm LTR ERV1 1 243 -499 1 1832 243 75 0 0 chr2 163468637 163468677 -18279410 + RLTR4_Mm LTR ERV1 204 243 -499 1 1832 1767 89 21 28 chr2 163468687 163468976 -18279111 + RLTR4_Mm LTR ERV1 456 742 0 1 1832 357 216 46 121 chr2 163471385 163471559 -18276528 + RMER10A LTR ERVL 257 417 -25 1 1832 317 281 42 0 chr2 163472670 163472766 -18275321 - RMER16 LTR ERVK 0 533 434 1 1832 284 237 96 128 chr2 163473400 163473449 -18274638 - RMER16 LTR ERVK -125 408 358 1 1832 284 201 77 116 chr2 163473595 163473798 -18274289 - RMER16 LTR ERVK -176 357 1 1 1832 1003 207 112 35 chr2 163474737 163474997 -18273090 + MTD LTR MaLR 140 419 0 1 1832 818 223 84 66 chr2 163475002 163475276 -18272811 - RMER5 LTR ERV1 -223 311 33 1 1832 1159 213 122 30 chr2 163475773 163476102 -18271985 - ORR1D1 LTR MaLR -5 369 11 1 1832 377 237 30 20 chr2 163476526 163476625 -18271462 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 331 1 1832 1923 89 11 92 chr2 163476628 163476987 -18271100 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 330 -7 1 1832 3667 71 16 27 chr2 163476988 163477808 -18270279 + IAPEz-int LTR ERVK 2 662 -5819 1 1832 990 42 0 8 chr2 163477808 163477928 -18270159 + IAPEz-int LTR ERVK 1359 1477 -5004 1 1832 1939 77 0 4 chr2 163477929 163478176 -18269911 + IAPEz-int LTR ERVK 2252 2497 -5183 1 1832 938 88 24 0 chr2 163478171 163478296 -18269791 + IAPEz-int LTR ERVK 4783 4910 -2770 1 1832 26689 15 4 0 chr2 163478296 163481239 -18266848 + IAPEz-int LTR ERVK 3525 6479 -2 1 1832 1923 89 11 92 chr2 163481241 163481600 -18266487 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 330 -7 1 1832 3348 94 12 35 chr2 163489291 163489777 -18258310 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 475 0 1 1832 351 266 62 27 chr2 163498191 163498303 -18249784 - MTEa LTR MaLR -8 371 256 1 1832 364 190 12 12 chr2 163498591 163498671 -18249416 - RLTR42-int LTR ERVK -3916 1606 1527 1 1832 282 186 14 14 chr2 163498692 163498763 -18249324 - RLTR42-int LTR ERVK -5171 966 896 1 1832 980 207 71 118 chr2 163498743 163499083 -18249004 - RLTR42-int LTR ERVK -4000 1522 1199 1 1832 388 247 21 0 chr2 163499313 163499406 -18248681 - RLTR42-int LTR ERVK -4323 1199 1105 1 1832 1267 128 21 11 chr2 163504413 163504643 -18243444 + ORR1C1 LTR MaLR 165 384 0 1 1832 410 319 83 80 chr2 163507948 163508261 -18239826 - ORR1E LTR MaLR -4 355 42 3 1832 320 281 88 88 chr2 163526047 163526207 -18221880 - MT2B LTR ERVL -323 278 119 7 1832 228 311 70 141 chr2 163536064 163536277 -18211810 - MLT1F1 LTR MaLR -302 267 70 9 1832 376 239 48 71 chr2 163541404 163541530 -18206557 - MT2B LTR ERVL -325 276 154 1 1832 245 279 30 90 chr2 163566609 163566743 -18181344 + MLT1D LTR MaLR 123 248 -257 1 1833 390 293 198 4 chr2 163578673 163578920 -18169167 - LTR16C LTR ERVL 0 489 195 1 1833 235 253 53 13 chr2 163582718 163582794 -18165293 - MLT1J LTR MaLR -34 478 400 1 1833 321 250 56 11 chr2 163594756 163594845 -18153242 + MER66-int LTR ERV1 6584 6676 0 2 1833 3115 55 5 2 chr2 163595320 163595719 -18152368 + MTB LTR MaLR 1 400 0 2 1833 476 224 118 33 chr2 163598721 163598873 -18149214 - MLT1J1 LTR MaLR -249 195 31 2 1833 2226 131 24 11 chr2 163607797 163608176 -18139911 + ORR1B1 LTR MaLR 6 389 -5 2 1833 3436 20 0 0 chr2 163611010 163611406 -18136681 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 1833 287 238 35 35 chr2 163611550 163611637 -18136450 - MTEa LTR MaLR -218 161 75 2 1833 3349 23 2 0 chr2 163611767 163612162 -18135925 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 1833 2970 8 46 0 chr2 163614761 163615112 -18132975 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 2 1833 54538 18 16 1 chr2 163615112 163621491 -18126596 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 8 2 1833 2970 8 46 0 chr2 163621491 163621842 -18126245 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 2 1833 330 211 0 14 chr2 163624742 163624814 -18123273 + MLT1I LTR MaLR 341 411 0 2 1833 1559 199 44 57 chr2 163632826 163633192 -18114895 - MTD LTR MaLR 0 419 54 2 1833 1559 199 44 57 chr2 163633363 163633380 -18114707 - MTD LTR MaLR -366 53 41 2 1833 372 131 0 16 chr2 163633405 163633467 -18114620 - MTD LTR MaLR -360 61 1 2 1833 868 184 4 175 chr2 163633555 163633812 -18114275 + MT2A LTR ERVL 1 213 -320 2 1833 894 263 49 76 chr2 163633843 163634172 -18113915 - MTE-int LTR MaLR -86 1494 1175 2 1833 2202 122 118 28 chr2 163641861 163642203 -18105884 + RMER4A LTR ERVK 5 345 -121 2 1833 2202 122 118 28 chr2 163642247 163642326 -18105761 + RMER4A LTR ERVK 346 463 -3 2 1833 477 182 30 53 chr2 163645575 163645708 -18102379 - RLTR15 LTR ERVK -229 130 1 3 1833 2611 118 43 7 chr2 163656333 163656770 -18091317 - RLTR11B LTR ERVK 0 453 1 3 1833 1017 223 44 4 chr2 163657487 163657762 -18090325 + BGLII_B LTR ERVK 155 440 -1 3 1833 253 278 64 101 chr2 163659279 163659467 -18088620 + MT2B2 LTR ERVL 98 278 -306 3 1833 3280 18 3 5 chr2 163659556 163659947 -18088140 - RLTR10 LTR ERVK 0 390 1 3 1833 10779 120 38 35 chr2 163659949 163661886 -18086201 - RLTR10-int LTR ERVK -3 1984 41 3 1833 3255 23 3 5 chr2 163661896 163662287 -18085800 - RLTR10 LTR ERVK 0 390 1 3 1833 241 279 87 34 chr2 163665203 163665322 -18082765 - MLT1J1 LTR MaLR -291 221 58 3 1833 4566 12 0 0 chr2 163668532 163669025 -18079062 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 3 1833 297 0 0 0 chr2 163669025 163669063 -18079024 - MERVL-int LTR ERVL 0 5485 5448 3 1833 374 167 46 35 chr2 163669063 163669150 -18078937 - ORR1A3-int LTR MaLR -1323 640 553 3 1833 45841 15 6 0 chr2 163669150 163674476 -18073611 - MERVL-int LTR ERVL -125 5360 1 3 1833 4566 12 0 0 chr2 163674476 163674969 -18073118 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 3 1833 380 345 132 31 chr2 163676682 163677038 -18071049 - MLT1D LTR MaLR -113 392 1 3 1833 233 240 63 16 chr2 163686165 163686292 -18061795 + RMER17D LTR ERVK 376 508 -381 3 1833 563 313 69 9 chr2 163696665 163696897 -18051190 - LTR90B LTR LTR -409 387 142 3 1833 1081 230 114 130 chr2 163703976 163704138 -18043949 - MTE2b LTR MaLR 0 379 182 4 1833 1081 230 114 130 chr2 163704321 163704541 -18043546 - MTE2b LTR MaLR -198 181 1 4 1834 429 326 45 6 chr2 163717441 163717617 -18030470 - MLT1I LTR MaLR 0 411 229 4 1834 250 342 55 91 chr2 163731314 163731533 -18016554 + LTR16C LTR ERVL 279 489 0 4 1834 1860 19 0 121 chr2 163736698 163736995 -18011092 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 107 4 1834 678 300 144 11 chr2 163745934 163746295 -18001792 - MLT1E2 LTR MaLR -1 626 218 5 1834 2084 163 109 11 chr2 163752654 163753029 -17995058 + RLTR16 LTR ERVK 1 400 -105 5 1834 2084 163 109 11 chr2 163753073 163753157 -17994930 + RLTR16 LTR ERVK 401 504 -1 5 1834 2283 146 15 15 chr2 163760886 163761283 -17986804 - MTB_Mm LTR MaLR -6 401 5 5 1834 524 210 122 47 chr2 163766773 163766884 -17981203 + RMER17C LTR ERVK 103 229 -181 5 1834 524 210 122 47 chr2 163766956 163767099 -17980988 + RMER17C LTR ERVK 230 375 -35 5 1834 452 114 0 14 chr2 163767566 163767637 -17980450 + MTC LTR MaLR 1 70 -351 5 1834 1386 234 47 41 chr2 163770746 163771111 -17976976 - MTEa LTR MaLR -11 368 2 5 1834 4532 62 2 3 chr2 163771401 163771986 -17976101 - MT2B2 LTR ERVL 0 584 1 5 1834 319 313 17 63 chr2 163774151 163774325 -17973762 - MLT1J LTR MaLR -113 399 234 5 1834 386 206 8 93 chr2 163775104 163775116 -17972971 + MT2B LTR ERVL 156 157 -444 5 1834 2849 176 2 16 chr2 163775549 163776056 -17972031 - RLTR18B LTR ERVK -11 501 2 5 1834 393 333 40 0 chr2 163782168 163782294 -17965793 - MLT1A0 LTR MaLR 0 408 278 6 1834 411 262 26 58 chr2 163782630 163782784 -17965303 - MLT1A0 LTR MaLR -216 149 1 6 1834 336 279 0 0 chr2 163783215 163783283 -17964804 + MTEa LTR MaLR 5 72 -307 6 1834 352 322 151 23 chr2 163783295 163783514 -17964573 + MTEa LTR MaLR 133 379 0 6 1834 2038 258 18 2 chr2 163783514 163783949 -17964138 + MTEa-int LTR MaLR 1 442 -1138 6 1834 2939 30 0 3 chr2 163783949 163784287 -17963800 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 337 0 6 1834 25823 37 8 21 chr2 163784287 163787396 -17960691 + IAPEz-int LTR ERVK 8 3076 -3405 6 1834 7517 25 1 7 chr2 163787381 163788239 -17959848 + IAPEz-int LTR ERVK 5629 6481 0 6 1834 2939 30 0 3 chr2 163788239 163788577 -17959510 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 337 0 6 1834 1231 276 51 62 chr2 163788585 163788940 -17959147 + MTEa-int LTR MaLR 460 810 -770 6 1834 1571 279 118 27 chr2 163788943 163789098 -17958989 + MTEa-int LTR MaLR 1004 1161 -419 6 1834 1180 122 374 11 chr2 163789098 163789371 -17958716 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 3 6 1834 1571 279 118 27 chr2 163789371 163789742 -17958345 + MTEa-int LTR MaLR 1162 1578 -2 6 1834 397 328 55 115 chr2 163789743 163790108 -17957979 + MTEa LTR MaLR 1 343 -36 6 1834 399 241 0 107 chr2 163790087 163790102 -17957985 + MT2B LTR ERVL 150 151 -450 6 1834 2316 97 19 0 chr2 163795023 163795344 -17952743 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 6 1834 336 269 152 29 chr2 163797923 163798061 -17950026 + MLT1J-int LTR MaLR 884 1038 -349 6 1834 330 367 65 70 chr2 163798088 163798443 -17949644 + MLT1J LTR MaLR 64 416 -96 6 1834 2473 187 75 26 chr2 163798566 163798815 -17949272 - RLTR20B2 LTR ERVK 0 560 309 6 1834 2473 187 75 26 chr2 163798847 163799040 -17949047 - RLTR20B2 LTR ERVK -252 308 90 6 1834 3334 42 3 0 chr2 163799040 163799424 -17948663 - IAPEY_LTR LTR ERVK 0 385 1 6 1834 2473 187 75 26 chr2 163799424 163799513 -17948574 - RLTR20B2 LTR ERVK -471 89 3 6 1834 507 252 18 125 chr2 163799859 163800053 -17948034 - MLT1A LTR MaLR -28 439 173 6 1834 1304 275 28 83 chr2 163800150 163800547 -17947540 - MTE2b LTR MaLR -1 378 4 6 1834 339 324 72 0 chr2 163802311 163802422 -17945665 + LTR33 LTR ERVL 21 139 -376 6 1834 548 253 120 6 chr2 163803199 163803374 -17944713 + MLT1I LTR MaLR 93 287 -124 6 1834 231 271 50 17 chr2 163807737 163807797 -17940290 + MLT1E2 LTR MaLR 1 62 -565 6 1834 894 233 53 29 chr2 163807800 163807949 -17940138 - MTE2b LTR MaLR -120 259 108 6 1834 2506 136 8 13 chr2 163807949 163808345 -17939742 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 6 1834 894 214 54 27 chr2 163808345 163808450 -17939637 - MTE2b LTR MaLR -272 107 1 6 1834 2160 169 34 15 chr2 163811299 163811707 -17936380 - MTD LTR MaLR -3 416 1 6 1834 366 177 26 205 chr2 163812839 163812873 -17935214 + MT2B LTR ERVL 137 142 -459 6 1834 979 304 75 30 chr2 163816169 163816606 -17931481 - MLT1C LTR MaLR -3 464 8 7 1834 2809 112 168 12 chr2 163817342 163817848 -17930239 + RMER4B LTR ERVK 1 585 0 7 1834 1673 211 132 3 chr2 163818305 163818676 -17929411 + MTD LTR MaLR 1 419 0 7 1834 1164 101 216 0 chr2 163819528 163819727 -17928360 + MTC LTR MaLR 180 421 0 7 1834 633 312 157 18 chr2 163833374 163833717 -17914370 - RLTR26 LTR ERVK -251 391 1 7 1835 557 257 145 6 chr2 163844659 163844831 -17903256 + RMER15 LTR ERVL 376 571 -4 7 1835 411 332 54 45 chr2 163844950 163845171 -17902916 + RMER15-int LTR ERVL 331 553 -4446 7 1835 499 266 131 15 chr2 163845569 163845775 -17902312 + RMER15-int LTR ERVL 959 1188 -3811 7 1835 559 310 100 8 chr2 163848738 163848979 -17899108 + RMER15-int LTR ERVL 2269 2531 -2468 7 1835 683 336 83 30 chr2 163853607 163854034 -17894053 - MLT1H LTR MaLR -71 418 11 7 1835 546 218 130 34 chr2 163888937 163889101 -17858986 + MTE2b LTR MaLR 102 294 -85 8 1835 1763 154 21 12 chr2 163897637 163897805 -17850282 - RMER10B LTR ERVL 0 398 229 8 1835 1763 154 21 12 chr2 163897855 163898022 -17850065 - RMER10B LTR ERVL -170 228 60 8 1835 543 270 127 60 chr2 163901961 163902251 -17845836 - MLT1B LTR MaLR -3 387 10 9 1835 828 343 24 55 chr2 163928144 163928566 -17819521 - MT2A LTR ERVL -100 433 25 9 1835 439 273 119 18 chr2 163938105 163938339 -17809748 - MLT1H LTR MaLR -8 547 289 9 1835 3056 28 88 0 chr2 163944153 163944517 -17803570 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 1835 466 192 37 104 chr2 163947516 163947548 -17800539 + MT2B LTR ERVL 133 155 -446 1 1835 234 182 0 0 chr2 163950758 163950802 -17797285 - MT2A LTR ERVL 0 533 490 1 1835 1512 161 47 71 chr2 163954858 163955083 -17793004 - RMER6B LTR ERVK -30 431 214 1 1835 1512 161 47 71 chr2 163955316 163955430 -17792657 - RMER6B LTR ERVK -248 213 100 1 1835 251 303 28 83 chr2 163970259 163970367 -17777720 - MT2B2 LTR ERVL -326 258 157 1 1836 684 291 185 34 chr2 163983373 163983857 -17764230 - MER89 LTR ERV1 0 559 3 1 1836 281 312 62 48 chr2 163984642 163984851 -17763236 + ERVL-B4-int LTR ERVL 1057 1268 -4446 1 1836 578 298 72 24 chr2 163985524 163985829 -17762258 + ERVL-E-int LTR ERVL 4770 5140 -617 1 1836 429 343 32 48 chr2 163986864 163987051 -17761036 + MLT1C LTR MaLR 64 247 -258 1 1836 480 261 43 29 chr2 163987084 163987222 -17760865 + MLT1C LTR MaLR 319 458 -9 1 1836 1941 177 62 8 chr2 163989312 163989683 -17758404 - MTD LTR MaLR -6 413 23 1 1836 354 273 0 59 chr2 163998795 163998928 -17749159 - MLT1E2 LTR MaLR 0 680 523 1 1836 338 315 130 65 chr2 163999169 163999464 -17748623 + MLT1E2 LTR MaLR 316 616 -11 1 1836 1671 229 44 28 chr2 164001981 164002345 -17745742 - MTE2a LTR MaLR 0 379 10 3 1836 727 209 0 33 chr2 164009822 164009975 -17738112 - RMER13A LTR ERVK 0 860 713 1 1836 833 249 79 162 chr2 164012183 164012523 -17735564 - MTE2a LTR MaLR -67 312 1 1 1836 1042 245 83 4 chr2 164015182 164015424 -17732663 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 105 2 1836 4218 139 94 81 chr2 164016753 164017638 -17730449 - RMER19B LTR ERVK -6 896 1 3 1836 2186 141 9 0 chr2 164018364 164018690 -17729397 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 3 1836 566 258 133 83 chr2 164020124 164020424 -17727663 - MLT2C2 LTR ERVL -2 462 148 3 1836 332 259 4 30 chr2 164024500 164024592 -17723495 + MLT1A1 LTR MaLR 302 396 -12 3 1836 1656 258 103 82 chr2 164032148 164033461 -17714626 + MYSERV6-int LTR ERVK 8092 8685 -274 4 1836 308 149 30 121 chr2 164033462 164033561 -17714526 + RMER17C-int LTR ERVK 2777 2866 -372 4 1836 1147 305 108 64 chr2 164033639 164034407 -17713680 + RMER13A LTR ERVK 2 803 -57 4 1836 316 259 8 74 chr2 164034411 164034532 -17713555 + RMER17C-int LTR ERVK 2897 3009 -229 4 1836 313 264 63 94 chr2 164035078 164035237 -17712850 + RMER10B LTR ERVL 236 389 -9 4 1836 1557 224 96 35 chr2 164035474 164035933 -17712154 + RLTR11A2 LTR ERVK 33 519 -8 4 1836 382 259 145 28 chr2 164036247 164036401 -17711686 + RLTR12B LTR ERVK 369 524 -3 5 1836 1523 227 129 24 chr2 164036827 164037144 -17710943 + MTD LTR MaLR 1 357 -62 5 1836 1213 206 32 180 chr2 164037144 164037583 -17710504 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 5 1836 1523 227 129 24 chr2 164037583 164037644 -17710443 + MTD LTR MaLR 358 419 0 5 1836 2258 270 40 126 chr2 164037644 164038610 -17709477 + MTD-int LTR MaLR 1 883 -375 5 1836 295 320 45 41 chr2 164038818 164039062 -17709025 - RLTR15 LTR ERVK -18 341 97 5 1836 323 226 186 99 chr2 164039040 164039212 -17708875 - RLTR15 LTR ERVK -171 188 2 5 1836 2062 141 0 21 chr2 164049957 164050291 -17697796 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 3 7 1836 654 235 82 66 chr2 164050862 164051101 -17696986 - RMER12 LTR ERVK -116 1206 1017 7 1836 2491 73 26 0 chr2 164057556 164057900 -17690187 + RLTR13D5 LTR ERVK 1 353 -670 8 1836 2794 106 50 2 chr2 164057894 164058330 -17689757 + RLTR13D5 LTR ERVK 567 1023 0 8 1836 524 225 391 22 chr2 164058355 164058580 -17689507 + MT2A LTR ERVL 226 533 0 8 1836 272 347 90 26 chr2 164058774 164059047 -17689040 - MLT1-int LTR MaLR -176 1195 1048 9 1836 392 102 2 4 chr2 164059429 164059492 -17688595 - ORR1C2 LTR MaLR -1 420 329 9 1836 1281 156 121 52 chr2 164059727 164060032 -17688055 - ORR1C2 LTR MaLR -57 327 2 9 1836 771 260 29 143 chr2 164077014 164077328 -17670759 + MTE2a LTR MaLR 5 282 -97 1 1836 2843 127 2 4 chr2 164085450 164085909 -17662178 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1390 458 1 1 1836 8963 87 31 7 chr2 164086509 164087870 -17660217 + RLTR22_Mur LTR ERVK 455 1848 0 1 1836 1626 171 75 51 chr2 164091480 164091688 -17656399 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 178 1 1836 1626 171 75 51 chr2 164091789 164091955 -17656132 - ORR1C2 LTR MaLR -207 177 1 1 1836 2505 99 167 19 chr2 164094405 164094825 -17653262 + RLTR45 LTR ERVK 1 482 0 1 1837 2600 125 87 12 chr2 164103255 164103659 -17644428 - RLTR10C LTR ERVK -2 434 1 1 1837 1975 193 2 55 chr2 164109275 164109709 -17638378 + MTD LTR MaLR 1 411 -8 1 1837 3568 18 2 0 chr2 164118575 164118970 -17629117 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1837 747 270 25 43 chr2 164119839 164120118 -17627969 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 274 -253 1 1837 549 267 57 46 chr2 164120111 164120377 -17627710 + RLTR11A2 LTR ERVK 242 504 -24 1 1837 276 268 40 20 chr2 164122239 164122338 -17625749 - RMER12 LTR ERVK -25 1783 1683 1 1837 1538 231 49 73 chr2 164123447 164124126 -17623961 - RMER12 LTR ERVK -120 1688 567 1 1837 1184 184 26 45 chr2 164124145 164124546 -17623541 - RMER12 LTR ERVK -895 427 42 1 1837 783 141 76 13 chr2 164124541 164124699 -17623388 + RMER12 LTR ERVK 412 579 -743 1 1837 722 161 0 0 chr2 164149986 164150104 -17597983 - MTC LTR MaLR -303 118 1 2 1837 1621 135 32 11 chr2 164151769 164152046 -17596041 + ORR1A2 LTR MaLR 1 283 -44 2 1837 398 74 0 0 chr2 164152529 164152583 -17595504 + ORR1A2 LTR MaLR 273 326 0 2 1837 550 152 19 8 chr2 164154175 164154307 -17593780 + ORR1D-int LTR MaLR 1226 1320 -50 2 1837 539 234 78 0 chr2 164157265 164157419 -17590668 + MTD LTR MaLR 199 364 -55 2 1837 431 114 194 58 chr2 164161379 164161518 -17586569 - RMER12B LTR ERVK 0 1322 1165 2 1837 383 191 56 11 chr2 164161611 164161687 -17586400 - RMER12B LTR ERVK -157 1165 1085 2 1837 383 191 56 11 chr2 164161818 164161831 -17586256 - RMER12B LTR ERVK -238 1084 1072 2 1837 1680 185 17 0 chr2 164161859 164162161 -17585926 - RMER12B LTR ERVK -1097 307 1 2 1837 692 188 23 0 chr2 164162687 164162815 -17585272 - MTD LTR MaLR -92 327 197 2 1837 2162 187 10 179 chr2 164164353 164165083 -17583004 - RMER19C LTR ERVK -5 606 1 2 1837 1265 197 137 57 chr2 164166696 164166876 -17581211 + ORR1C1 LTR MaLR 1 163 -215 2 1837 1277 197 137 57 chr2 164167098 164167266 -17580821 + ORR1C1 LTR MaLR 164 376 -2 2 1837 557 187 64 16 chr2 164175081 164175206 -17572881 + MTD-int LTR MaLR 1125 1255 -3 2 1837 1697 214 47 9 chr2 164175208 164175547 -17572540 + MTD LTR MaLR 13 364 -55 2 1837 2502 173 89 9 chr2 164176351 164176876 -17571211 - RLTR12A LTR ERVK 0 568 2 2 1837 233 143 21 0 chr2 164185336 164185384 -17562703 + MLT2B3 LTR ERVL 506 563 0 2 1837 535 246 107 39 chr2 164190904 164191137 -17556950 + RLTR15 LTR ERVK 111 359 0 2 1837 1352 172 15 152 chr2 164191368 164191710 -17556377 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 80 2 1837 245 254 78 9 chr2 164191985 164192100 -17555987 - ORR1D1 LTR MaLR -246 128 6 2 1837 335 284 113 44 chr2 164192322 164192525 -17555562 - RMER17C LTR ERVK -49 361 145 2 1837 874 215 107 90 chr2 164192721 164193337 -17554750 - RMER17C-int LTR ERVK 0 3238 2607 2 1837 408 245 0 142 chr2 164194286 164194440 -17553647 - RMER17C-int LTR ERVK -857 2381 2261 2 1837 278 253 34 57 chr2 164194795 164194883 -17553204 - RMER17C-int LTR ERVK -2864 3273 3188 2 1837 720 181 0 97 chr2 164194975 164195140 -17552947 - RMER17C-int LTR ERVK -2947 3190 3042 2 1837 754 325 102 20 chr2 164195531 164195873 -17552214 + MTE-int LTR MaLR 612 981 -599 2 1837 800 270 194 4 chr2 164195890 164196169 -17551918 + MTE-int LTR MaLR 1241 1572 -8 2 1837 443 270 77 45 chr2 164196242 164196397 -17551690 + MTE2b LTR MaLR 57 216 -163 3 1837 675 259 42 0 chr2 164196582 164196748 -17551339 + MTE2b LTR MaLR 207 379 0 3 1837 535 254 234 22 chr2 164213438 164213799 -17534288 + MLT1D LTR MaLR 18 497 -8 3 1837 536 311 121 40 chr2 164220369 164220617 -17527470 + MLT1A LTR MaLR 43 310 -64 3 1837 226 289 50 50 chr2 164220629 164220709 -17527378 + MLT1A1 LTR MaLR 1 80 -328 3 1837 349 272 32 148 chr2 164220738 164220949 -17527138 - ORR1E LTR MaLR -39 340 151 3 1837 349 277 42 195 chr2 164221237 164221308 -17526779 - ORR1E LTR MaLR -215 144 74 3 1837 229 225 69 14 chr2 164221448 164221520 -17526567 + MLT1A1 LTR MaLR 82 157 -251 3 1838 2419 56 11 106 chr2 164240906 164241263 -17506824 - ORR1A2 LTR MaLR -4 323 1 4 1838 424 252 104 0 chr2 164245131 164245246 -17502841 - MLT1E1 LTR MaLR -16 638 512 4 1838 277 281 55 47 chr2 164245423 164245550 -17502537 - MLT1E1 LTR MaLR -461 193 66 4 1838 3344 23 20 13 chr2 164246511 164246908 -17501179 + MTB LTR MaLR 1 400 0 4 1838 259 319 16 28 chr2 164247214 164247328 -17500759 + ORR1E LTR MaLR 97 214 -170 4 1838 1230 320 70 20 chr2 164247473 164247971 -17500116 + MLT1F LTR MaLR 24 546 -2 4 1838 226 328 32 32 chr2 164258104 164258227 -17489860 - LTR81A LTR ERV1? -872 478 356 4 1838 1915 161 133 61 chr2 164275801 164276258 -17471829 + RMER15 LTR ERVL 30 519 -56 4 1838 3843 37 62 0 chr2 164285307 164285795 -17462292 - MURVY-LTR LTR ERV1 0 519 2 5 1838 3533 65 31 14 chr2 164302499 164302984 -17445103 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 5 1838 618 168 296 75 chr2 164305427 164305640 -17442447 + ORR1C2 LTR MaLR 119 378 -6 5 1838 249 298 116 110 chr2 164316944 164317299 -17430788 - MLT1J LTR MaLR -13 499 143 5 1838 2128 174 94 34 chr2 164317636 164318135 -17429952 - RLTR24 LTR ERV1 0 529 1 5 1838 451 222 29 15 chr2 164328600 164328737 -17419350 - MTC-int LTR MaLR -11 1247 1109 6 1838 4162 160 161 9 chr2 164329064 164329998 -17418089 - MTC-int LTR MaLR -182 1076 1 6 1838 614 182 9 9 chr2 164329998 164330109 -17417978 - MTC LTR MaLR 0 421 311 6 1838 1107 227 69 38 chr2 164341842 164342131 -17405956 + MTEa LTR MaLR 22 319 -60 6 1838 277 324 29 19 chr2 164342479 164342583 -17405504 + MLT1G LTR MaLR 198 302 -289 6 1838 1162 258 43 53 chr2 164344377 164344795 -17403292 + RMER5 LTR ERV1 1 414 -120 6 1838 824 242 130 97 chr2 164344796 164345125 -17402962 + RLTR14 LTR ERV1 1 346 -36 6 1838 824 242 130 97 chr2 164345271 164345311 -17402776 + RLTR14 LTR ERV1 347 382 0 6 1838 225 163 0 0 chr2 164345311 164345354 -17402733 + RMER5 LTR ERV1 412 454 -80 6 1838 816 342 117 26 chr2 164347323 164347888 -17400199 + MER21B LTR ERV1 13 628 -235 6 1838 1965 137 198 7 chr2 164348471 164348875 -17399212 + RMER4B LTR ERVK 99 579 -6 6 1838 2236 121 160 0 chr2 164348932 164349319 -17398768 + RLTR44B LTR ERVK 1 449 0 6 1838 677 138 97 48 chr2 164349319 164349464 -17398623 + RLTR44-int LTR ERVK 1 152 -2660 6 1838 397 164 0 0 chr2 164349462 164349529 -17398558 + RLTR44-int LTR ERVK 871 937 -1875 6 1838 350 100 0 0 chr2 164349578 164349628 -17398459 + RLTR44-int LTR ERVK 894 943 -1869 6 1838 373 113 113 0 chr2 164349613 164349684 -17398403 + RLTR44-int LTR ERVK 74 152 -2660 6 1838 6747 182 19 26 chr2 164349701 164352271 -17395816 + RLTR44-int LTR ERVK 659 2812 0 6 1838 2144 105 204 0 chr2 164352271 164352644 -17395443 + RLTR44B LTR ERVK 1 449 0 6 1838 1201 262 105 11 chr2 164353897 164354267 -17393820 + MTD LTR MaLR 1 405 -14 6 1838 417 346 0 8 chr2 164355416 164355547 -17392540 - MLT1C LTR MaLR 0 467 338 6 1838 880 222 75 163 chr2 164355558 164355957 -17392130 - MTE2a LTR MaLR -5 374 11 6 1838 382 309 67 62 chr2 164356053 164356232 -17391855 - MLT1C LTR MaLR -210 180 1 6 1838 1949 63 42 102 chr2 164357626 164357917 -17390170 + ORR1A2 LTR MaLR 5 286 -41 6 1838 1949 63 42 102 chr2 164358104 164358147 -17389940 + ORR1A2 LTR MaLR 287 319 -8 6 1839 942 296 59 84 chr2 164366790 164367266 -17380821 + MLT1C LTR MaLR 2 465 -2 6 1839 235 229 27 41 chr2 164367744 164367817 -17380270 - MLT1A1 LTR MaLR -35 373 302 6 1839 1056 138 5 77 chr2 164367995 164368191 -17379896 + RMER6A LTR ERVK 1 182 -574 6 1839 1113 67 0 35 chr2 164368191 164368361 -17379726 - RLTR44D LTR ERVK -322 164 1 6 1839 2245 134 39 16 chr2 164368361 164368793 -17379294 + RMER6A LTR ERVK 174 615 -141 6 1839 1819 152 91 11 chr2 164369051 164369424 -17378663 + RMER16 LTR ERVK 64 466 -67 6 1839 3386 23 2 0 chr2 164371267 164371662 -17376425 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 7 1839 684 225 24 237 chr2 164376298 164376636 -17371451 - ORR1E LTR MaLR -2 357 92 7 1839 424 198 0 102 chr2 164376886 164376901 -17371186 + MT2B LTR ERVL 152 154 -447 7 1839 4746 110 48 1 chr2 164377059 164377763 -17370324 + RMER19A LTR ERVK 1 737 0 7 1839 335 287 103 53 chr2 164378799 164379042 -17369045 - ORR1E LTR MaLR -12 347 93 7 1839 1186 274 39 3 chr2 164379883 164380245 -17367842 + MTEb LTR MaLR 3 377 -2 7 1839 395 123 0 0 chr2 164380828 164380885 -17367202 + RLTR15 LTR ERVK 1 57 -302 7 1839 1828 132 7 10 chr2 164381073 164381378 -17366709 + RLTR15 LTR ERVK 56 359 0 7 1839 2086 97 26 0 chr2 164387043 164387353 -17360734 + ORR1A3 LTR MaLR 1 318 -8 7 1839 2117 152 14 81 chr2 164398848 164399269 -17348818 + RLTR9C LTR ERVK 1 393 0 7 1839 284 226 65 0 chr2 164399597 164399659 -17348428 + ORR1E LTR MaLR 44 109 -250 7 1839 256 260 76 48 chr2 164400369 164400474 -17347613 + MLT1A1 LTR MaLR 289 396 -12 7 1839 3431 33 5 0 chr2 164402609 164403003 -17345084 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 7 1839 1649 206 42 180 chr2 164406242 164406881 -17341206 - RMER13B LTR ERVK -86 822 272 7 1839 1473 166 38 117 chr2 164406892 164407315 -17340772 - RMER17B LTR ERVK -519 439 71 7 1839 1134 216 197 15 chr2 164410918 164411256 -17336831 - MTD LTR MaLR -14 405 18 7 1839 229 338 0 0 chr2 164413617 164413688 -17334399 + LTR16C LTR ERVL 402 472 -17 8 1839 237 281 0 78 chr2 164416266 164416381 -17331706 + MLT1A LTR MaLR 3 104 -261 8 1839 227 221 81 11 chr2 164416514 164416601 -17331486 + MLT1A LTR MaLR 314 406 -2 8 1839 1937 275 107 90 chr2 164421268 164421692 -17326395 + RMER12 LTR ERVK 16 447 -875 8 1839 1937 275 107 90 chr2 164421862 164422618 -17325469 + RMER12 LTR ERVK 448 1216 -106 8 1839 711 356 45 30 chr2 164429802 164430135 -17317952 + MER90 LTR ERV1 158 495 -80 8 1839 627 298 96 68 chr2 164432281 164432605 -17315482 + MLT1E LTR MaLR 234 566 -87 8 1839 380 263 64 116 chr2 164444452 164444624 -17303463 - RLTR33 LTR ERVK -85 593 431 8 1839 231 269 90 0 chr2 164444770 164444837 -17303250 - RLTR19C LTR ERVK -409 97 25 8 1839 639 165 16 47 chr2 164445313 164445440 -17302647 + RMER19B LTR ERVK 353 475 -427 8 1839 4258 146 104 53 chr2 164445991 164446845 -17301242 + RMER19B LTR ERVK 1 898 -4 8 1839 7825 175 53 46 chr2 164453574 164455345 -17292742 - RMER3D-int LTR ERVK -62 2780 998 8 1839 384 187 16 66 chr2 164455419 164455547 -17292540 - RMER3D-int LTR ERVK -1731 1111 1022 8 1839 661 145 42 8 chr2 164455549 164455667 -17292420 - RMER3D-int LTR ERVK -2232 610 489 8 1839 257 295 10 59 chr2 164465510 164465611 -17282476 + MLT1A1 LTR MaLR 313 408 0 9 1839 872 265 56 32 chr2 164467452 164467736 -17280351 + ORR1D2 LTR MaLR 1 291 -79 9 1839 1742 206 93 10 chr2 164469626 164470013 -17278074 - MTD LTR MaLR 0 419 1 9 1839 509 176 29 19 chr2 164476807 164476911 -17271176 + RLTR25B LTR ERVK 1 105 -923 9 1839 316 277 83 8 chr2 164480383 164480503 -17267584 + ORR1E LTR MaLR 1 129 -230 9 1839 229 337 9 47 chr2 164484652 164484758 -17263329 - MLT2B3 LTR ERVL -450 104 3 9 1839 516 245 0 0 chr2 164485424 164485521 -17262566 + MTC LTR MaLR 1 97 -324 9 1839 1982 114 35 13 chr2 164485729 164486040 -17262047 + MTC LTR MaLR 104 421 0 9 1839 1601 139 57 99 chr2 164487538 164487897 -17260190 + ORR1B1 LTR MaLR 35 393 -1 9 1839 3162 90 57 30 chr2 164493337 164493842 -17254245 - MURVY-LTR LTR ERV1 0 519 1 9 1840 1327 244 39 75 chr2 164496969 164497355 -17250732 - MTEa LTR MaLR 0 379 8 9 1840 1107 239 39 99 chr2 164500087 164500450 -17247637 - ORR1D2 LTR MaLR -8 362 22 1 1840 473 179 0 12 chr2 164500452 164500537 -17247550 - RLTR21 LTR ERVK -1 1403 1320 2 1840 5831 161 37 50 chr2 164500539 164501660 -17246427 - RLTR21 LTR ERVK -201 1203 1 2 1840 857 271 33 68 chr2 164505462 164505830 -17242257 + ORR1E LTR MaLR 1 355 -4 1 1840 3378 163 102 3 chr2 164508330 164508947 -17239140 - RLTR33 LTR ERVK 0 678 1 2 1840 3056 79 18 0 chr2 164529164 164529557 -17218530 + MTB LTR MaLR 1 400 0 7 1840 2248 181 24 19 chr2 164532286 164532703 -17215384 - MTD LTR MaLR 0 419 1 9 1840 771 135 9 194 chr2 164533114 164533325 -17214762 + MTB_Mm LTR MaLR 236 407 0 9 1840 2592 50 9 0 chr2 164538125 164538447 -17209640 + MTB LTR MaLR 76 400 0 1 1840 237 311 43 50 chr2 164542416 164542555 -17205532 - RLTR22_Mur LTR ERVK -658 1190 1053 1 1840 1679 123 0 0 chr2 164545112 164545356 -17202731 - ORR1A2 LTR MaLR -83 244 1 1 1840 2245 138 22 19 chr2 164546773 164547142 -17200945 - ORR1D1 LTR MaLR -4 370 1 1 1840 3239 125 24 12 chr2 164547232 164547725 -17200362 - RLTR19 LTR ERVK 0 499 1 1 1840 1116 263 78 22 chr2 164548371 164548607 -17199480 - RLTR26 LTR ERVK -166 476 227 1 1840 1116 221 44 99 chr2 164548747 164548933 -17199154 - RLTR26 LTR ERVK -416 226 5 1 1840 1515 182 102 3 chr2 164548944 164549259 -17198828 + ORR1D1 LTR MaLR 28 373 -1 1 1840 3042 123 306 24 chr2 164550379 164550954 -17197133 + RMER19A LTR ERVK 1 737 0 1 1840 2269 111 88 49 chr2 164558193 164558391 -17189696 + MTC LTR MaLR 1 209 -212 1 1840 2269 111 88 49 chr2 164558544 164558733 -17189354 + MTC LTR MaLR 210 403 -18 1 1840 296 340 29 0 chr2 164560013 164560116 -17187971 + MLT1H2 LTR MaLR 1 106 -383 1 1840 440 296 108 30 chr2 164560439 164560606 -17187481 + MLT1H2 LTR MaLR 290 469 -20 1 1840 226 279 87 110 chr2 164575689 164575775 -17172312 + MT2B LTR ERVL 73 154 -447 2 1840 1277 220 55 194 chr2 164585967 164586406 -17161681 - MTD LTR MaLR 0 419 42 2 1840 285 277 125 54 chr2 164587474 164587642 -17160445 - MT2B LTR ERVL -350 251 72 2 1840 2455 84 63 14 chr2 164596374 164596722 -17151365 - RLTR8 LTR ERVK 0 365 1 2 1840 576 333 40 5 chr2 164625919 164626142 -17121945 - MER89 LTR ERV1 -82 477 247 3 1841 1829 159 30 6 chr2 164634906 164635235 -17112852 - ORR1B1 LTR MaLR -57 337 1 3 1841 1234 225 104 41 chr2 164639074 164639412 -17108675 - MTD LTR MaLR -13 406 48 3 1841 1176 175 55 16 chr2 164639774 164640181 -17107906 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 7 4 1841 226 292 29 86 chr2 164661367 164661379 -17086708 + MT2B LTR ERVL 155 160 -441 4 1841 3752 35 12 0 chr2 164689064 164689495 -17058592 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 5 1841 1279 163 228 89 chr2 164690560 164690801 -17057286 + RLTR31A_Mm LTR ERVK 4 322 -262 5 1841 1279 168 202 81 chr2 164690950 164691139 -17056948 + RLTR31A_Mm LTR ERVK 323 557 0 5 1841 1643 169 53 202 chr2 164694064 164694328 -17053759 - MTC LTR MaLR -4 417 210 5 1841 1643 169 53 202 chr2 164694470 164694593 -17053494 - MTC LTR MaLR -212 209 103 5 1841 1643 169 53 202 chr2 164694701 164694802 -17053285 - MTC LTR MaLR -319 102 1 5 1841 541 304 35 29 chr2 164695114 164695287 -17052800 + RLTR18B LTR ERVK 9 182 -330 5 1841 625 304 108 112 chr2 164695438 164695783 -17052304 + RLTR18B LTR ERVK 132 616 0 5 1841 503 195 15 15 chr2 164695897 164696009 -17052078 + MTD LTR MaLR 75 209 -210 5 1841 772 118 185 6 chr2 164696039 164696093 -17051994 - RMER6A LTR ERVK -431 325 252 5 1841 772 173 177 51 chr2 164696162 164696422 -17051665 - RMER6A LTR ERVK -463 257 1 5 1841 276 175 255 10 chr2 164696522 164696620 -17051467 - MTD LTR MaLR -98 321 200 5 1841 1663 149 135 65 chr2 164697110 164697188 -17050899 + RMER6A LTR ERVK 313 391 -365 5 1841 1663 149 135 65 chr2 164697373 164697709 -17050378 + RMER6A LTR ERVK 392 756 0 5 1841 314 181 60 95 chr2 164703627 164703743 -17044344 - RLTR25B LTR ERVK -519 509 398 5 1841 412 100 0 0 chr2 164723094 164723154 -17024933 + ORR1C2 LTR MaLR 1 60 -324 6 1841 661 146 0 0 chr2 164723212 164723322 -17024765 + ORR1C2 LTR MaLR 275 384 0 6 1841 2523 188 89 72 chr2 164730809 164731419 -17016668 - RMER6A LTR ERVK -3 753 149 6 1841 2523 188 89 72 chr2 164731441 164731534 -17016553 - RMER6A LTR ERVK -608 148 40 6 1841 1721 211 14 8 chr2 164739841 164740205 -17007882 + ORR1D1 LTR MaLR 9 374 0 6 1841 517 299 49 136 chr2 164740543 164740595 -17007492 - MTE2a LTR MaLR -6 373 323 6 1841 1679 168 102 3 chr2 164740741 164741094 -17006993 - MTC LTR MaLR -31 390 3 6 1841 1512 198 133 3 chr2 164741918 164742257 -17005830 + ORR1C2 LTR MaLR 1 383 -1 6 1841 1876 312 102 56 chr2 164742259 164742588 -17005499 + RMER15-int LTR ERVL 554 928 -4071 6 1841 1876 312 102 56 chr2 164742763 164743616 -17004471 + RMER15-int LTR ERVL 929 1791 -3208 6 1841 372 241 406 36 chr2 164744523 164744745 -17003342 + RMER15-int LTR ERVL 2084 2387 -2612 6 1841 1623 136 80 3 chr2 164744915 164745203 -17002884 + MTC LTR MaLR 1 310 -111 6 1841 499 225 26 43 chr2 164745390 164745505 -17002582 + MTC LTR MaLR 301 413 -8 6 1841 335 239 45 0 chr2 164745513 164745601 -17002486 + RMER15-int LTR ERVL 4277 4368 -631 6 1841 371 264 232 39 chr2 164745715 164745967 -17002120 + RMER15 LTR ERVL 275 575 0 6 1841 808 275 162 13 chr2 164748366 164748681 -16999406 + MTE2b LTR MaLR 18 379 0 6 1841 2232 136 62 13 chr2 164751509 164751896 -16996191 - MTC LTR MaLR -13 408 3 6 1841 1616 163 138 0 chr2 164753752 164754078 -16994009 + ORR1C1 LTR MaLR 8 378 0 6 1841 243 273 0 0 chr2 164754266 164754321 -16993766 - MLT1E2 LTR MaLR 0 627 573 6 1841 484 185 5 102 chr2 164754851 164755056 -16993031 - RMER17C LTR ERVK -135 275 91 6 1841 1227 226 42 54 chr2 164755944 164756280 -16991807 - MTE2a LTR MaLR -47 332 1 7 1842 1197 279 64 17 chr2 164760380 164760741 -16987346 + MLT1B LTR MaLR 1 378 -12 7 1842 247 300 145 100 chr2 164761342 164761375 -16986712 + MLT1H1 LTR MaLR 3 35 -520 7 1842 247 300 145 100 chr2 164761577 164761743 -16986344 + MLT1H1 LTR MaLR 36 211 -344 7 1842 373 351 106 25 chr2 164762609 164762892 -16985195 - MER74A LTR ERVL -244 314 9 7 1842 255 155 24 165 chr2 164762936 164763021 -16985066 + MLT1H1 LTR MaLR 433 505 -50 7 1842 315 132 89 38 chr2 164767108 164767187 -16980900 + RLTR25B LTR ERVK 427 509 -519 7 1842 242 297 21 117 chr2 164769120 164769265 -16978822 + MT2B LTR ERVL 157 287 -314 7 1842 449 183 23 115 chr2 164771520 164771650 -16976437 - MT2B LTR ERVL -337 264 147 7 1842 1704 131 65 0 chr2 164779899 164780189 -16967898 - ORR1B2 LTR MaLR -58 309 1 7 1842 3481 124 41 71 chr2 164781895 164782557 -16965530 - RLTR26 LTR ERVK 0 642 1 7 1842 1773 205 111 34 chr2 164784995 164785383 -16962704 - MTD LTR MaLR 0 419 2 7 1842 273 236 102 17 chr2 164789885 164790062 -16958025 + RMER17A2 LTR ERVK 241 432 -474 7 1842 235 188 112 56 chr2 164799589 164799696 -16948391 - RLTR25B LTR ERVK -519 509 397 8 1842 284 247 0 125 chr2 164831446 164831534 -16916553 - RLTR25A LTR ERVK -531 572 496 8 1842 2157 105 89 0 chr2 164832802 164833126 -16914961 + ORR1B1 LTR MaLR 42 394 0 8 1842 323 385 70 21 chr2 164833815 164834001 -16914086 + MLT1K LTR MaLR 95 289 -306 8 1842 244 397 41 7 chr2 164834481 164834628 -16913459 + MLT1K LTR MaLR 279 430 -165 8 1842 256 197 69 83 chr2 164837512 164837584 -16910503 - MT2B2 LTR ERVL -355 229 159 8 1842 1132 260 85 50 chr2 164839913 164840388 -16907699 - RLTR12B LTR ERVK -14 514 46 8 1842 697 187 199 13 chr2 164845957 164846240 -16901847 + ORR1C2 LTR MaLR 11 380 -14 8 1842 1730 127 50 8 chr2 164854570 164854831 -16893256 + ORR1A3 LTR MaLR 46 317 -9 9 1842 1669 190 119 2 chr2 164856692 164857087 -16891000 - BGLII_B LTR ERVK 0 441 1 9 1842 1258 162 341 11 chr2 164862360 164862636 -16885451 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 9 1842 672 278 113 5 chr2 164862915 164863128 -16884959 + MLT1D LTR MaLR 1 236 -269 9 1842 361 285 27 75 chr2 164863267 164863453 -16884634 + MTEa LTR MaLR 172 348 -31 9 1842 464 322 122 19 chr2 164865436 164865708 -16882379 - MLT1G3 LTR MaLR -305 286 16 9 1842 391 214 40 30 chr2 164865721 164865822 -16882265 + RMER12 LTR ERVK 755 856 -466 9 1842 2840 161 37 78 chr2 164870139 164870208 -16877879 + RMER15 LTR ERVL 2 67 -508 9 1842 2840 161 37 78 chr2 164870360 164870889 -16877198 + RMER15 LTR ERVL 68 575 0 9 1842 2498 121 5 75 chr2 164875678 164875800 -16872287 + MTC LTR MaLR 13 120 -301 9 1842 2498 121 5 75 chr2 164875947 164876261 -16871826 + MTC LTR MaLR 121 418 -3 9 1842 1577 197 45 68 chr2 164879478 164879860 -16868227 + ORR1C2 LTR MaLR 1 373 -11 9 1842 2974 59 8 8 chr2 164884180 164884571 -16863516 + MTA_Mm LTR MaLR 1 391 -5 9 1842 302 244 291 15 chr2 164886254 164886450 -16861637 - RMER21B LTR ERV1 -336 506 257 9 1843 2734 130 88 38 chr2 164897055 164897558 -16850529 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 1 1 1843 2656 55 6 3 chr2 164897661 164897987 -16850100 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 1 1843 227 344 24 101 chr2 164913848 164913906 -16834181 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1307 1367 -481 1 1843 227 344 24 101 chr2 164913942 164914051 -16834036 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1368 1461 -387 1 1843 239 247 129 0 chr2 164921482 164921567 -16826520 + MLT1F1 LTR MaLR 174 269 -300 1 1843 579 343 68 52 chr2 164929802 164930222 -16817865 - MLT1J LTR MaLR -20 492 61 1 1843 579 343 68 52 chr2 164930418 164930437 -16817650 - MLT1J LTR MaLR -452 60 46 1 1843 1296 178 42 113 chr2 164972396 164972731 -16775356 + ORR1D1 LTR MaLR 3 313 -61 1 1843 271 393 18 0 chr2 164974938 164975050 -16773037 + MLT1H2 LTR MaLR 11 124 -365 1 1843 259 175 172 16 chr2 164975733 164975797 -16772290 - MLT1H LTR MaLR -380 169 96 1 1843 942 248 106 32 chr2 164976661 164976944 -16771143 + MTE2a LTR MaLR 76 379 0 1 1843 608 229 357 60 chr2 164977070 164977342 -16770745 + ORR1D2 LTR MaLR 9 370 0 1 1843 292 264 0 157 chr2 165010377 165010430 -16737657 + MLT1A1 LTR MaLR 306 348 -60 1 1843 292 264 0 157 chr2 165010577 165010631 -16737456 + MLT1A1 LTR MaLR 349 396 -12 1 1843 522 342 141 6 chr2 165012670 165012982 -16735105 + MLT1L LTR MaLR 169 522 -88 2 1843 287 305 25 25 chr2 165015022 165015143 -16732944 + MLT1A1 LTR MaLR 2 122 -286 2 1843 353 233 23 114 chr2 165016242 165016266 -16731821 + MT2B LTR ERVL 146 157 -444 2 1844 501 215 9 18 chr2 165024474 165024583 -16723504 + MTEa LTR MaLR 263 370 -9 4 1844 350 304 46 92 chr2 165026952 165027104 -16720983 + ORR1E LTR MaLR 20 164 -195 4 1844 240 353 51 29 chr2 165057090 165057227 -16690860 - MLT2C2 LTR ERVL -178 286 147 1 1844 537 307 104 19 chr2 165089506 165089765 -16658322 + MLT1J LTR MaLR 2 282 -230 1 1844 645 158 7 57 chr2 165090401 165090542 -16657545 + MTC LTR MaLR 2 135 -284 1 1844 1560 180 36 7 chr2 165090608 165090888 -16657199 + MTC LTR MaLR 126 413 -8 1 1844 1097 257 101 42 chr2 165112541 165112898 -16635189 + MTE2a LTR MaLR 1 378 -1 2 1844 279 232 119 59 chr2 165119531 165119632 -16628455 - RLTR25B LTR ERVK -519 509 403 2 1844 2624 125 31 22 chr2 165131819 165132236 -16615851 + MTC LTR MaLR 1 421 0 2 1844 4519 160 216 31 chr2 165132236 165133298 -16614789 + MTC-int LTR MaLR 1 1258 0 2 1844 951 177 16 36 chr2 165133298 165133491 -16614596 + MTC LTR MaLR 1 189 -232 2 1845 1930 173 95 16 chr2 165153525 165153913 -16594174 - MTD LTR MaLR 0 419 1 2 1845 5078 160 87 74 chr2 165155743 165155997 -16592090 + RMER12 LTR ERVK 1 241 -1081 2 1845 5078 160 87 74 chr2 165156143 165156158 -16591929 + RMER12 LTR ERVK 242 248 -1074 2 1845 5078 160 87 74 chr2 165156357 165156788 -16591299 + RMER12 LTR ERVK 249 695 -627 2 1845 5078 160 87 74 chr2 165156985 165157491 -16590596 + RMER12 LTR ERVK 696 1224 -98 2 1845 1682 211 44 67 chr2 165158807 165159193 -16588894 - MTEa LTR MaLR 0 379 3 2 1845 1912 153 8 306 chr2 165160889 165160965 -16587122 - ORR1C1 LTR MaLR 0 384 342 2 1845 1912 133 17 122 chr2 165161113 165161451 -16586636 - ORR1C1 LTR MaLR -37 341 29 2 1845 1912 133 17 122 chr2 165161584 165161612 -16586475 - ORR1C1 LTR MaLR -350 28 2 2 1845 269 252 8 51 chr2 165161612 165161703 -16586384 + RMER12 LTR ERVK 773 858 -464 2 1845 1742 247 102 83 chr2 165163123 165163750 -16584337 + RLTR26 LTR ERVK 4 642 0 2 1845 479 271 50 84 chr2 165166309 165166547 -16581540 + RLTR14 LTR ERV1 153 382 0 2 1845 1742 194 82 71 chr2 165167140 165167439 -16580648 + RLTR11A LTR ERVK 1 313 -215 2 1845 1742 194 82 71 chr2 165167576 165167798 -16580289 + RLTR11A LTR ERVK 314 528 0 2 1845 285 333 71 0 chr2 165168455 165168581 -16579506 + LTR16A LTR ERVL 307 441 -10 2 1845 532 263 42 0 chr2 165172731 165172849 -16575238 + MTEb LTR MaLR 1 123 -256 3 1845 386 231 133 9 chr2 165172913 165173018 -16575069 + MTEb LTR MaLR 262 379 0 3 1845 778 180 147 5 chr2 165173411 165173595 -16574492 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 165 3 1845 859 321 63 22 chr2 165173708 165174074 -16574013 - MTE-int LTR MaLR -443 1137 781 3 1845 232 309 0 67 chr2 165176087 165176191 -16571896 + LTR78 LTR ERV1 1168 1264 -40 3 1845 624 206 88 7 chr2 165176512 165176649 -16571438 + MLT1A1 LTR MaLR 261 408 0 3 1845 4784 110 26 81 chr2 165187050 165187829 -16560258 + RMER19A LTR ERVK 2 737 0 3 1845 1139 212 270 88 chr2 165195759 165195793 -16552294 - MT2A LTR ERVL -8 525 492 3 1845 1139 212 270 88 chr2 165195838 165196247 -16551840 - MT2A LTR ERVL -42 491 3 3 1845 982 203 55 46 chr2 165196515 165196668 -16551419 - ORR1D2 LTR MaLR -151 219 63 3 1845 2179 176 124 22 chr2 165196668 165197126 -16550961 + RLTR16 LTR ERVK 1 505 0 3 1845 982 203 55 46 chr2 165197126 165197189 -16550898 - ORR1D2 LTR MaLR -308 62 1 3 1845 1222 267 60 75 chr2 165199373 165199758 -16548329 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 3 1845 1136 201 187 0 chr2 165199902 165200201 -16547886 + ORR1E LTR MaLR 3 357 -2 3 1845 953 214 215 39 chr2 165201637 165201948 -16546139 + MTD LTR MaLR 41 406 -13 3 1845 282 167 18 18 chr2 165201948 165202003 -16546084 + MTC LTR MaLR 354 408 -13 3 1845 1020 248 94 17 chr2 165202646 165202933 -16545154 + RMER15 LTR ERVL 267 575 0 3 1845 440 316 59 100 chr2 165202997 165203268 -16544819 + MLT1C LTR MaLR 47 306 -161 3 1845 369 283 83 121 chr2 165215123 165215388 -16532699 + MLT1H1 LTR MaLR 292 546 -9 4 1845 2682 124 7 18 chr2 165215746 165216163 -16531924 + ORR1B1 LTR MaLR 1 386 -8 4 1845 238 317 31 72 chr2 165216193 165216387 -16531700 - RLTR21 LTR ERVK -319 1253 1068 4 1845 1535 218 31 19 chr2 165219254 165219327 -16528760 - ORR1D1 LTR MaLR -29 345 277 4 1845 3338 60 0 0 chr2 165219327 165219727 -16528360 - MTB LTR MaLR 0 400 1 4 1845 1535 218 31 19 chr2 165219727 165219971 -16528116 - ORR1D1 LTR MaLR -98 276 24 4 1845 1192 200 178 48 chr2 165220267 165220666 -16527421 + RMER6B LTR ERVK 1 451 -10 4 1845 310 237 0 106 chr2 165222269 165222354 -16525733 + MTEa LTR MaLR 23 98 -281 4 1845 501 311 112 38 chr2 165229171 165229243 -16518844 + MLT2D LTR ERVL 16 101 -313 4 1845 501 311 112 38 chr2 165229271 165229512 -16518575 + MLT2D LTR ERVL 102 351 -63 4 1845 621 240 88 20 chr2 165232943 165233147 -16514940 + RMER5 LTR ERV1 309 526 -8 4 1845 3246 115 14 37 chr2 165236521 165237007 -16511080 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 475 0 4 1845 1017 266 23 142 chr2 165237857 165238287 -16509800 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 4 1845 2065 146 139 13 chr2 165241319 165241693 -16506394 + MTC LTR MaLR 1 421 0 4 1845 591 224 0 0 chr2 165242056 165242163 -16505924 + MTEb LTR MaLR 1 107 -272 4 1845 271 178 397 0 chr2 165242185 165242258 -16505829 + MTEb LTR MaLR 204 305 -74 4 1845 1089 219 99 31 chr2 165247571 165247863 -16500224 + MTEb LTR MaLR 1 312 -67 4 1845 680 294 34 91 chr2 165247863 165248275 -16499812 - MTE2a LTR MaLR -3 416 12 4 1845 933 250 138 7 chr2 165253379 165253661 -16494426 + MTE2b LTR MaLR 4 322 -57 4 1845 1317 265 101 0 chr2 165253676 165254034 -16494053 + MTE-int LTR MaLR 4 397 -1183 4 1845 1187 273 330 18 chr2 165254045 165254835 -16493252 + MTE-int LTR MaLR 542 1579 -1 4 1845 3205 132 54 6 chr2 165272941 165273444 -16474643 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 527 0 5 1845 251 309 134 21 chr2 165274527 165274669 -16473418 - LTR16C LTR ERVL -54 435 278 5 1845 251 297 118 42 chr2 165275772 165275916 -16472171 + MLT1A0 LTR MaLR 127 281 -84 5 1845 345 240 0 26 chr2 165275934 165276011 -16472076 + MLT1A0 LTR MaLR 270 344 -21 5 1845 1403 113 17 17 chr2 165277030 165277064 -16471023 + BGLII_Mus LTR ERVK 189 219 -203 5 1845 1403 113 17 17 chr2 165277131 165277330 -16470757 + BGLII_Mus LTR ERVK 220 421 -1 5 1846 768 144 0 8 chr2 165288585 165288711 -16459376 + RLTR11B LTR ERVK 1 125 -328 5 1846 2762 168 47 18 chr2 165288713 165289223 -16458864 + RLTR11A2 LTR ERVK 3 527 0 5 1846 265 286 172 38 chr2 165292838 165293100 -16454987 + MER74A LTR ERVL 201 497 -61 5 1846 3335 24 39 0 chr2 165302922 165303303 -16444784 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 1846 9385 32 3 2 chr2 165303305 165304400 -16443687 - MTA_Mm-int LTR MaLR -2 1096 1 6 1846 3335 24 39 0 chr2 165304400 165304781 -16443306 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 1846 956 258 76 37 chr2 165305437 165305803 -16442284 + MTD LTR MaLR 1 393 -14 6 1846 643 265 35 43 chr2 165309677 165309925 -16438162 - MTE2a LTR MaLR -37 342 115 6 1846 335 311 178 17 chr2 165311759 165312057 -16436030 + LTR16A LTR ERVL 12 357 -94 6 1846 2340 75 3 0 chr2 165313258 165313576 -16434511 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 6 1846 2303 116 14 3 chr2 165321067 165321422 -16426665 + ORR1B2 LTR MaLR 1 359 -8 6 1846 972 167 62 46 chr2 165322611 165322991 -16425096 + RLTR24 LTR ERV1 1 452 -77 6 1846 2355 124 64 3 chr2 165323704 165324092 -16423995 - MTC LTR MaLR -2 419 8 6 1846 307 325 97 100 chr2 165325935 165326274 -16421813 - MLT1F2 LTR MaLR -195 365 28 6 1846 433 257 152 107 chr2 165326616 165326952 -16421135 + ORR1E LTR MaLR 1 351 -8 6 1846 2575 71 0 58 chr2 165327830 165328173 -16419914 - ORR1A2 LTR MaLR -4 323 1 6 1846 713 315 71 7 chr2 165330687 165330968 -16417119 - MTA_Mm-int LTR MaLR -260 1320 1022 6 1846 732 327 124 44 chr2 165330967 165331402 -16416685 - MTA_Mm-int LTR MaLR -741 839 370 6 1846 1192 291 9 23 chr2 165331937 165332285 -16415802 - MTA_Mm-int LTR MaLR -1234 346 4 6 1846 3539 25 2 0 chr2 165332380 165332775 -16415312 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 1846 9287 36 4 1 chr2 165332775 165333870 -16414217 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 6 1846 3539 25 2 0 chr2 165333870 165334265 -16413822 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 1846 380 323 0 22 chr2 165334395 165334531 -16413556 - ORR1E LTR MaLR -226 133 1 6 1846 1536 140 111 103 chr2 165334589 165334809 -16413278 - RMER17C LTR ERVK 0 410 169 6 1846 1536 140 111 103 chr2 165334835 165335021 -16413066 - RMER17C LTR ERVK -242 168 1 6 1846 3035 133 54 33 chr2 165346661 165347176 -16400911 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 526 -1 6 1846 588 257 144 38 chr2 165347533 165347796 -16400291 - LTRIS4 LTR ERV1 0 507 217 6 1846 1898 193 60 3 chr2 165349011 165349396 -16398691 + MTD LTR MaLR 5 411 -8 6 1846 1988 109 16 16 chr2 165349788 165350106 -16397981 - ORR1A3 LTR MaLR -8 318 1 6 1846 1372 187 65 14 chr2 165353989 165354266 -16393821 - MTC LTR MaLR -8 413 123 6 1846 229 254 47 85 chr2 165355542 165355671 -16392416 + MamGypLTR2b LTR Gypsy 24 147 -775 7 1846 782 197 94 16 chr2 165358493 165358595 -16389492 + RLTR20A1 LTR ERVK 346 446 -105 7 1846 782 197 94 16 chr2 165358637 165358725 -16389362 + RLTR20A1 LTR ERVK 447 550 -1 7 1846 953 261 59 118 chr2 165362005 165362158 -16385929 + ORR1E LTR MaLR 8 145 -214 7 1846 953 261 59 118 chr2 165362333 165362553 -16385534 + ORR1E LTR MaLR 146 359 0 7 1846 995 271 60 11 chr2 165366528 165366793 -16381294 + ORR1E LTR MaLR 76 353 -6 7 1846 300 376 15 29 chr2 165370446 165370583 -16377504 + MamGypLTR1a LTR Gypsy 373 507 -277 7 1846 362 218 88 10 chr2 165372474 165372576 -16375511 + MLT1K LTR MaLR 478 587 -8 7 1846 958 266 91 58 chr2 165374180 165374543 -16373544 - MTEb LTR MaLR -4 375 1 7 1846 294 213 16 16 chr2 165375086 165375148 -16372939 - ORR1C2 LTR MaLR -320 64 3 7 1846 343 256 146 38 chr2 165375459 165375617 -16372470 - ORR1E LTR MaLR -108 251 77 7 1846 1960 78 36 67 chr2 165377661 165377990 -16370097 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 7 1846 321 305 38 8 chr2 165379948 165380080 -16368007 - MLT1K LTR MaLR -14 581 446 7 1846 1859 211 88 14 chr2 165383291 165383782 -16364305 - RLTR11A2 LTR ERVK 0 527 1 7 1846 436 297 122 57 chr2 165387062 165387341 -16360746 - ORR1E LTR MaLR -3 356 60 7 1846 341 312 56 25 chr2 165387401 165387562 -16360525 - MLT1C LTR MaLR -1 466 301 7 1846 377 204 9 64 chr2 165394107 165394217 -16353870 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 305 7 1846 239 310 32 81 chr2 165395420 165395543 -16352544 - MLT1G LTR MaLR -235 356 240 7 1846 510 222 103 0 chr2 165396286 165396412 -16351675 + MLT1A1 LTR MaLR 269 407 -1 7 1846 538 324 47 78 chr2 165399945 165400306 -16347781 - ORR1E LTR MaLR -9 350 1 8 1846 640 278 23 42 chr2 165401155 165401369 -16346718 + ORR1E LTR MaLR 5 214 -145 8 1846 1198 243 145 14 chr2 165403343 165403757 -16344330 - RLTR20A2 LTR ERVK -100 478 11 8 1846 1376 224 79 22 chr2 165404926 165405282 -16342805 - MTEb LTR MaLR -2 377 2 8 1846 1885 85 69 7 chr2 165406308 165406620 -16341467 - ORR1A2 LTR MaLR -3 343 10 8 1846 522 143 11 0 chr2 165406596 165406687 -16341400 - ORR1A2 LTR MaLR -235 92 1 8 1846 613 323 170 21 chr2 165411563 165411898 -16336189 + MLT1J LTR MaLR 110 494 -18 8 1846 1641 206 62 11 chr2 165412119 165412472 -16335615 + MTD LTR MaLR 46 416 -3 8 1847 370 330 96 56 chr2 165414491 165414741 -16333346 - ORR1E LTR MaLR -14 345 86 8 1847 942 207 143 0 chr2 165414848 165415065 -16333022 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 161 8 1847 406 260 113 8 chr2 165415300 165415424 -16332663 - MLT1A1 LTR MaLR -271 137 1 8 1847 3007 67 34 0 chr2 165433105 165433492 -16314595 - MTB LTR MaLR 0 400 1 8 1847 415 267 79 36 chr2 165434225 165434260 -16313827 + MT2B LTR ERVL 119 159 -442 8 1847 239 293 103 8 chr2 165435365 165435482 -16312605 - MLT1K LTR MaLR -64 531 404 8 1847 304 189 23 172 chr2 165440192 165440209 -16307878 - MT2B2 LTR ERVL -308 276 224 9 1847 304 189 23 172 chr2 165440305 165440320 -16307767 - MT2B2 LTR ERVL -308 223 168 9 1847 1719 177 48 64 chr2 165442453 165442637 -16305450 + ORR1D1 LTR MaLR 5 176 -198 9 1847 1719 177 48 64 chr2 165442673 165442862 -16305225 + ORR1D1 LTR MaLR 177 372 -2 9 1847 423 307 208 34 chr2 165445701 165446139 -16301948 - MLT2B2 LTR ERVL 0 515 2 9 1847 2325 63 0 6 chr2 165450139 165450460 -16297627 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 9 1847 2192 143 20 53 chr2 165451349 165451748 -16296339 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 1 9 1847 526 366 48 46 chr2 165454079 165454257 -16293830 + MLT1K LTR MaLR 218 400 -195 9 1847 526 366 48 46 chr2 165454323 165454516 -16293571 + MLT1K LTR MaLR 401 590 -5 9 1847 339 384 70 22 chr2 165463115 165463344 -16284743 - LTR16C LTR ERVL -16 473 234 9 1847 331 240 129 24 chr2 165463632 165463756 -16284331 - MLT1J1 LTR MaLR -294 150 14 9 1847 697 329 75 34 chr2 165464361 165464776 -16283311 + MLT1D LTR MaLR 68 499 -6 9 1847 287 263 49 29 chr2 165471223 165471325 -16276762 + MLT1L LTR MaLR 162 265 -345 9 1847 459 302 60 49 chr2 165482620 165482885 -16265202 - RLTR12B LTR ERVK -250 278 11 1 1847 238 235 14 42 chr2 165485218 165485289 -16262798 - ORR1E LTR MaLR -290 69 1 1 1847 277 213 46 66 chr2 165487851 165487938 -16260149 + RMER17D LTR ERVK 355 441 -448 1 1847 277 213 46 66 chr2 165487983 165488046 -16260041 + RMER17D LTR ERVK 442 502 -387 1 1847 702 229 78 27 chr2 165493776 165493988 -16254099 - MTD LTR MaLR -14 405 182 1 1847 517 233 101 30 chr2 165494170 165494338 -16253749 - MTD LTR MaLR -218 203 24 1 1847 1453 294 123 95 chr2 165497448 165497482 -16250605 - MTD-int LTR MaLR -100 1158 1121 1 1847 1453 294 123 95 chr2 165497517 165498347 -16249740 - MTD-int LTR MaLR -138 1120 257 1 1847 1453 294 123 95 chr2 165498519 165498779 -16249308 - MTD-int LTR MaLR -1002 256 1 1 1847 897 275 111 42 chr2 165498782 165499149 -16248938 - MTD LTR MaLR -23 396 10 1 1847 2503 146 33 56 chr2 165500687 165501173 -16246914 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 2 1847 20132 16 3 2 chr2 165501173 165503530 -16244557 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 4123 2 1847 900 80 24 0 chr2 165503532 165503657 -16244430 - IAPEz-int LTR ERVK -2770 4910 4783 3 1847 1785 107 4 4 chr2 165503652 165503914 -16244173 - IAPEz-int LTR ERVK -5183 2497 2236 3 1847 445 66 0 32 chr2 165503903 165503966 -16244121 - IAPEz-int LTR ERVK -5062 1419 1359 3 1847 4247 60 66 22 chr2 165503966 165504605 -16243482 - IAPEz-int LTR ERVK -5819 662 3 3 1847 2528 144 33 56 chr2 165504607 165505093 -16242994 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 3 1847 252 284 0 0 chr2 165511398 165511465 -16236622 - MLT1K LTR MaLR -97 498 432 1 1847 257 262 215 31 chr2 165511931 165512061 -16236026 - MLT1K LTR MaLR -110 485 332 1 1847 295 322 63 99 chr2 165520111 165520445 -16227642 + MLT1A LTR MaLR 1 322 -52 4 1847 349 351 0 8 chr2 165524563 165524692 -16223395 + MLT1I LTR MaLR 281 408 -3 4 1847 306 314 64 8 chr2 165525622 165525747 -16222340 - MLT1C LTR MaLR -329 138 7 5 1847 234 355 65 45 chr2 165527630 165527875 -16220212 - MLT1E2 LTR MaLR -332 295 46 5 1847 238 298 52 37 chr2 165528943 165529079 -16219008 - MLT1C LTR MaLR -285 182 45 5 1847 367 351 87 6 chr2 165531149 165531321 -16216766 - MLT1A0 LTR MaLR -125 240 55 6 1847 1026 118 67 86 chr2 165532943 165533184 -16214903 + ORR1B1 LTR MaLR 1 207 -187 6 1847 1310 183 4 28 chr2 165533180 165533433 -16214654 - ORR1C1 LTR MaLR -131 247 1 6 1847 554 163 10 0 chr2 165537765 165537863 -16210224 - RLTR28 LTR ERVL -4 520 422 7 1847 258 229 32 16 chr2 165537834 165537896 -16210191 - RLTR28 LTR ERVL -461 63 1 7 1847 306 333 97 28 chr2 165542636 165542852 -16205235 - MLT1K LTR MaLR -324 271 41 9 1848 296 325 67 0 chr2 165547647 165547767 -16200320 + MLT1A0 LTR MaLR 73 200 -165 1 1848 995 265 59 26 chr2 165554417 165554723 -16193364 - MTD LTR MaLR -103 316 1 1 1848 760 284 6 10 chr2 165560603 165560796 -16187291 - MLT1J LTR MaLR -305 305 41 1 1848 317 227 37 85 chr2 165573295 165573377 -16174710 + MT2B LTR ERVL 167 244 -357 1 1848 553 273 80 6 chr2 165575219 165575381 -16172706 - MTEa LTR MaLR -2 377 204 1 1848 399 187 44 61 chr2 165575403 165575500 -16172587 - MTEa LTR MaLR -247 112 18 1 1848 3269 23 18 0 chr2 165575500 165575889 -16172198 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 1848 399 187 44 61 chr2 165575889 165575905 -16172182 - MTEa LTR MaLR -342 17 1 1 1848 1191 266 104 10 chr2 165577479 165577862 -16170225 - MTD LTR MaLR 0 419 1 1 1848 539 294 40 146 chr2 165578128 165578526 -16169561 - ORR1E LTR MaLR -3 356 1 1 1848 1040 256 44 91 chr2 165579088 165579184 -16168903 - MTEb LTR MaLR 0 379 305 1 1848 1040 256 44 91 chr2 165579330 165579616 -16168471 - MTEb LTR MaLR -75 304 15 1 1848 666 271 41 6 chr2 165582401 165582572 -16165515 - MTE2a LTR MaLR -16 363 187 1 1848 1422 295 43 35 chr2 165597346 165597837 -16150250 - RMER5 LTR ERV1 -3 531 37 2 1848 1016 276 127 16 chr2 165598458 165598827 -16149260 + MTD LTR MaLR 10 419 0 2 1848 827 289 68 23 chr2 165599434 165599700 -16148387 - MTEa LTR MaLR -5 374 97 2 1848 1671 153 26 26 chr2 165599938 165600246 -16147841 - MTD LTR MaLR -107 312 5 2 1848 430 235 0 48 chr2 165600249 165600352 -16147735 - MTEa LTR MaLR -265 114 17 2 1848 577 188 72 29 chr2 165605884 165606060 -16142027 + MTEa LTR MaLR 158 359 -20 2 1848 3494 44 5 2 chr2 165606435 165606870 -16141217 + RLTR10C LTR ERVK 1 436 0 2 1848 1535 125 66 33 chr2 165624855 165625160 -16122927 + ORR1A4 LTR MaLR 15 329 0 3 1848 1653 113 41 42 chr2 165625435 165625652 -16122435 - MTC LTR MaLR -8 413 201 3 1848 1653 107 36 39 chr2 165625800 165625876 -16122211 - MTC LTR MaLR -212 209 134 3 1848 419 273 62 140 chr2 165625879 165625992 -16122095 + RLTR11B LTR ERVK 1 133 -394 3 1848 439 242 6 90 chr2 165626177 165626367 -16121720 + RLTR11B LTR ERVK 120 298 -230 3 1848 619 210 12 87 chr2 165626382 165626554 -16121533 + RLTR11B LTR ERVK 263 421 -32 3 1848 620 179 0 57 chr2 165626606 165626730 -16121357 - MTC LTR MaLR -304 117 1 3 1848 662 266 240 36 chr2 165631004 165631417 -16116670 + MER67A LTR ERV1 11 507 -36 3 1848 249 260 69 50 chr2 165649456 165649557 -16098530 + MT2B LTR ERVL 136 238 -363 3 1848 1148 239 174 19 chr2 165659029 165659392 -16088695 + MTD LTR MaLR 1 419 0 3 1848 228 256 122 49 chr2 165667564 165667646 -16080441 - MT2B LTR ERVL -362 239 152 4 1849 1003 249 40 94 chr2 165678046 165678419 -16069668 + ORR1E LTR MaLR 7 359 0 4 1849 244 312 52 31 chr2 165688445 165688541 -16059546 - MT2B2 LTR ERVL -334 250 153 4 1849 254 244 89 73 chr2 165715167 165715186 -16032901 + MT2B LTR ERVL 139 159 -442 5 1849 1889 172 98 14 chr2 165726473 165726832 -16021255 - MTB_Mm LTR MaLR -1 406 18 5 1849 1161 206 93 131 chr2 165727136 165727533 -16020554 - RMER15 LTR ERVL 0 575 194 5 1849 1033 134 52 43 chr2 165727818 165728029 -16020058 + ORR1B1 LTR MaLR 7 219 -175 5 1849 2481 42 45 60 chr2 165728305 165728637 -16019450 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 5 1849 370 233 56 0 chr2 165731051 165731141 -16016946 - MLT1B LTR MaLR -251 139 45 5 1849 406 322 8 25 chr2 165735265 165735386 -16012701 + MER110 LTR ERV1 215 333 -158 5 1849 246 245 0 0 chr2 165735455 165735508 -16012579 + MER110 LTR ERV1 437 489 -2 5 1849 3405 116 217 21 chr2 165736454 165737086 -16011001 - RMER6A LTR ERVK 0 756 1 5 1849 365 265 113 8 chr2 165742920 165743053 -16005034 - RMER20B LTR ERVK -219 408 262 6 1849 831 267 31 78 chr2 165744854 165745195 -16002892 + RLTR18B LTR ERVK 202 511 -1 6 1849 1366 113 56 19 chr2 165748580 165748796 -15999291 + RLTR28B LTR ERVL 1 224 -257 6 1849 1473 172 122 27 chr2 165751848 165752183 -15995904 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 6 1849 1071 224 28 28 chr2 165753111 165753423 -15994664 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 3 6 1849 923 183 273 29 chr2 165753448 165753769 -15994318 + MTC LTR MaLR 18 397 -24 6 1849 2885 22 5 85 chr2 165753941 165754340 -15993747 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 6 1849 6498 114 108 38 chr2 165754340 165755560 -15992527 + IAPEz-int LTR ERVK 8 1313 -5168 6 1849 26932 19 18 1 chr2 165755558 165758776 -15989311 + IAPEz-int LTR ERVK 3209 6481 0 6 1849 2885 22 5 85 chr2 165758776 165759175 -15988912 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 6 1849 245 286 35 35 chr2 165762781 165762868 -15985219 - MLT1K LTR MaLR -445 150 64 6 1849 242 167 160 12 chr2 165763610 165763695 -15984392 + MLT1A LTR MaLR 245 331 -43 6 1849 368 212 19 8 chr2 165764152 165764248 -15983839 - MLT1H2 LTR MaLR -338 151 60 6 1849 1910 145 71 21 chr2 165769824 165770161 -15977926 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 41 7 1849 2364 104 3 0 chr2 165771445 165771763 -15976324 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 7 1849 336 139 112 56 chr2 165772639 165772746 -15975341 + RLTR25B LTR ERVK 397 509 -519 7 1849 529 314 59 52 chr2 165781698 165781987 -15966100 + MLT1C LTR MaLR 174 464 -3 7 1849 264 335 52 103 chr2 165784627 165784840 -15963247 - MT2B LTR ERVL -361 240 39 8 1849 316 292 17 34 chr2 165787684 165787801 -15960286 - RLTR25A LTR ERVK -467 636 522 8 1849 300 225 15 146 chr2 165797612 165797634 -15950453 + MT2B LTR ERVL 148 152 -449 8 1849 3782 90 33 123 chr2 165800257 165800436 -15947651 + MT2B LTR ERVL 3 158 -443 8 1849 3782 90 33 123 chr2 165800518 165800996 -15947091 + MT2B LTR ERVL 159 601 0 8 1850 436 332 46 42 chr2 165808580 165808797 -15939290 - MLT1M LTR MaLR -425 247 30 9 1850 852 238 178 10 chr2 165809659 165809952 -15938135 + ORR1D1 LTR MaLR 3 344 -30 9 1850 1220 215 80 36 chr2 165811121 165811483 -15936604 - MTE2b LTR MaLR -1 378 1 9 1850 792 249 77 8 chr2 165815082 165815317 -15932770 - MTD LTR MaLR -137 284 12 9 1850 679 265 37 65 chr2 165830789 165831035 -15917052 - RMER19B LTR ERVK -663 239 1 9 1850 496 186 10 19 chr2 165844275 165844379 -15903708 + MERVL_2A-int LTR ERVL 1185 1287 -4474 1 1850 2431 96 80 5 chr2 165844855 165845254 -15902833 + MT2C_Mm LTR ERVL 47 475 0 1 1850 278 182 60 83 chr2 165846064 165846148 -15901939 - RLTR25B LTR ERVK -519 509 428 1 1850 427 254 383 40 chr2 165851472 165851723 -15896364 + MTE2a LTR MaLR 43 379 0 1 1850 259 259 24 139 chr2 165861403 165861593 -15886494 - MTEb LTR MaLR -208 171 1 1 1850 226 282 67 82 chr2 165866346 165866361 -15881726 + MT2B LTR ERVL 150 162 -439 1 1850 812 226 103 37 chr2 165875177 165875420 -15872667 - MLT1B LTR MaLR -8 382 124 1 1850 251 274 56 105 chr2 165887498 165887641 -15860446 - RLTR24 LTR ERV1 -73 456 321 1 1850 421 130 0 0 chr2 165889059 165889128 -15858959 - RMER17B LTR ERVK 0 958 890 1 1850 1813 86 123 0 chr2 165889138 165889439 -15858648 - RMER17B LTR ERVK -620 338 1 1 1850 281 319 41 49 chr2 165918022 165918144 -15829943 + MLT1F2 LTR MaLR 458 654 0 1 1850 925 236 215 0 chr2 165918205 165918498 -15829589 + MTEa LTR MaLR 1 356 -23 1 1850 721 259 31 26 chr2 165919300 165919494 -15828593 + MTE2b LTR MaLR 3 197 -182 1 1850 332 237 0 139 chr2 165920391 165920415 -15827672 + MT2B LTR ERVL 147 151 -450 1 1850 2080 172 43 19 chr2 165920691 165921065 -15827022 + ORR1C2 LTR MaLR 2 384 0 1 1850 437 286 18 104 chr2 165923061 165923225 -15824862 + ORR1E LTR MaLR 1 151 -219 1 1851 225 306 25 83 chr2 165939879 165940000 -15808087 - MT2B2 LTR ERVL -346 238 125 1 1851 341 312 0 51 chr2 165940118 165940236 -15807851 + MLT1J LTR MaLR 70 181 -331 1 1851 2247 124 90 41 chr2 165947702 165948090 -15799997 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 1 1851 1818 193 99 16 chr2 165950376 165950760 -15797327 + MTD LTR MaLR 4 419 0 1 1851 294 305 46 37 chr2 165951342 165951451 -15796636 + LTR33 LTR ERVL 127 236 -279 1 1851 255 369 7 60 chr2 165953929 165954079 -15794008 + MLT1K LTR MaLR 453 594 -1 1 1851 346 290 23 61 chr2 165963072 165963204 -15784883 + MLT1K LTR MaLR 141 267 -328 1 1851 268 265 191 45 chr2 165965304 165965482 -15782605 + MLT1K LTR MaLR 351 554 -41 1 1851 310 200 93 74 chr2 165965662 165965770 -15782317 - MT2B LTR ERVL -323 278 169 1 1851 279 293 32 72 chr2 165970389 165970514 -15777573 - MT2B2 LTR ERVL -321 263 144 1 1851 257 272 14 150 chr2 165986465 165986477 -15761610 - MT2B LTR ERVL -328 273 237 1 1851 257 272 14 150 chr2 165986587 165986612 -15761475 - MT2B LTR ERVL -328 236 147 1 1851 262 254 215 42 chr2 165988790 165988934 -15759153 + MTEb LTR MaLR 77 245 -134 1 1851 294 338 85 24 chr2 165989142 165989306 -15758781 + MLT1K LTR MaLR 136 309 -286 1 1851 506 251 217 13 chr2 165989368 165989598 -15758489 + MLT1E1 LTR MaLR 7 283 -371 1 1851 228 292 14 27 chr2 165990370 165990444 -15757643 + MLT1K LTR MaLR 450 522 -73 1 1851 267 322 94 82 chr2 166007180 166007413 -15740674 - MLT1F2 LTR MaLR 0 560 325 1 1851 2449 70 31 3 chr2 166009037 166009354 -15738733 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 2 1 1851 1049 245 81 27 chr2 166011301 166011599 -15736488 + MTE2b LTR MaLR 66 379 0 1 1851 286 312 63 16 chr2 166011657 166011784 -15736303 + MLT1D LTR MaLR 236 368 -137 2 1851 684 284 67 8 chr2 166017311 166017549 -15730538 - MLT1E1 LTR MaLR -337 317 66 3 1851 939 142 349 0 chr2 166028762 166029066 -15719021 + MTC LTR MaLR 8 418 -3 4 1851 869 289 83 77 chr2 166034670 166035033 -15713054 - MLT2D LTR ERVL -49 365 1 5 1851 365 228 12 15 chr2 166035195 166035303 -15712784 + MLT1K LTR MaLR 84 252 -343 6 1851 2690 118 78 14 chr2 166036464 166036902 -15711185 + RMER4A LTR ERVK 1 466 0 6 1851 2452 121 16 13 chr2 166036977 166037363 -15710724 + MTC LTR MaLR 1 387 -34 6 1851 942 288 92 123 chr2 166039622 166040143 -15707944 + MT2A LTR ERVL 5 508 -25 7 1851 942 288 92 123 chr2 166040369 166040393 -15707694 + MT2A LTR ERVL 509 532 -1 7 1851 986 244 43 128 chr2 166043652 166044066 -15704021 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 7 1851 5468 98 52 34 chr2 166045897 166046040 -15702047 - RMER17A2 LTR ERVK -4 902 738 7 1851 5468 98 52 34 chr2 166046062 166046804 -15701283 - RMER17A2 LTR ERVK -169 737 2 7 1851 235 250 22 77 chr2 166050461 166050552 -15697535 + MTEa LTR MaLR 290 375 -4 9 1851 362 252 93 47 chr2 166051482 166051611 -15696476 - MLT1A1 LTR MaLR -4 404 270 9 1851 340 276 19 19 chr2 166052020 166052127 -15695960 - MER31B LTR ERV1 -348 118 12 9 1851 367 271 9 0 chr2 166053381 166053488 -15694599 + LTR37A LTR ERV1 298 405 -21 1 1851 3489 33 2 0 chr2 166057071 166057466 -15690621 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1851 391 237 78 17 chr2 166059795 166059952 -15688135 - ORR1E LTR MaLR -194 176 8 1 1851 247 330 54 18 chr2 166062415 166062526 -15685561 - MTEb LTR MaLR -18 361 247 1 1851 623 318 127 36 chr2 166063800 166064240 -15683847 - MER74A LTR ERVL -73 485 6 1 1851 1173 254 84 29 chr2 166064898 166065243 -15682844 + MTD LTR MaLR 50 413 -6 1 1852 3028 23 12 0 chr2 166078009 166078351 -15669736 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 1 1852 4357 45 22 8 chr2 166078351 166078951 -15669136 - ORR1A0-int LTR MaLR 0 1792 1020 1 1852 1454 228 82 0 chr2 166079410 166079752 -15668335 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 1 1852 2243 110 60 11 chr2 166080007 166080374 -15667713 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 2 1 1852 541 313 104 53 chr2 166080890 166081228 -15666859 + ORR1E LTR MaLR 3 357 -2 1 1852 251 258 30 0 chr2 166085522 166085588 -15662499 - MTE2b LTR MaLR -31 348 281 1 1852 1202 272 71 3 chr2 166088959 166089298 -15658789 + ORR1D2 LTR MaLR 1 362 -8 1 1852 560 287 132 10 chr2 166089613 166089810 -15658277 - MLT1K LTR MaLR -2 593 373 1 1852 366 286 72 99 chr2 166089853 166090118 -15657969 - MT2B LTR ERVL 0 601 339 1 1852 366 286 72 99 chr2 166090156 166090224 -15657863 - MT2B LTR ERVL -263 338 278 1 1852 391 312 10 83 chr2 166090158 166090350 -15657737 - MTEa LTR MaLR -200 179 2 1 1852 557 331 101 24 chr2 166090388 166090716 -15657371 + MLT1G LTR MaLR 32 384 -207 1 1852 2153 168 48 2 chr2 166091038 166091433 -15656654 - MTC LTR MaLR -8 413 1 1 1852 402 274 103 0 chr2 166093789 166093935 -15654152 - MLT1K LTR MaLR 0 390 230 1 1852 603 257 140 130 chr2 166094787 166094874 -15653213 + MTD LTR MaLR 5 65 -354 1 1852 603 257 140 130 chr2 166095109 166095428 -15652659 + MTD LTR MaLR 66 415 -4 1 1852 455 169 259 8 chr2 166095638 166095769 -15652318 + RLTR28B LTR ERVL 1 164 -317 1 1852 365 294 98 63 chr2 166096097 166096271 -15651816 - MLT1K LTR MaLR -168 222 43 1 1852 444 405 48 64 chr2 166099896 166100226 -15647861 + MLT1G LTR MaLR 134 458 -133 1 1852 4700 151 42 71 chr2 166110001 166110379 -15637708 + RMER13B LTR ERVK 1 401 -507 1 1852 4700 151 42 71 chr2 166110526 166111074 -15637013 + RMER13B LTR ERVK 402 900 -8 1 1852 414 293 89 11 chr2 166115230 166115420 -15632667 - MLT1D LTR MaLR -269 236 32 2 1852 2202 138 41 185 chr2 166117870 166118410 -15629677 - RLTR28 LTR ERVL 0 524 96 2 1852 2202 138 41 185 chr2 166118474 166118545 -15629542 - RLTR28 LTR ERVL -429 95 3 2 1852 933 186 238 11 chr2 166123119 166123271 -15624816 - ORR1D1 LTR MaLR -2 372 177 2 1852 933 186 238 11 chr2 166123302 166123426 -15624661 - ORR1D1 LTR MaLR -198 176 35 2 1852 979 312 65 0 chr2 166124673 166125029 -15623058 - MTEa LTR MaLR 0 379 1 2 1852 3943 147 29 29 chr2 166125258 166126014 -15622073 + RMER6A LTR ERVK 1 756 0 2 1852 244 284 14 0 chr2 166128553 166128627 -15619460 + MLT1L LTR MaLR 364 438 -172 2 1852 3003 43 12 55 chr2 166134403 166134821 -15613266 + MTB LTR MaLR 1 400 0 2 1852 1104 255 147 12 chr2 166136399 166136732 -15611355 + MTEa LTR MaLR 1 378 -1 2 1852 561 348 38 57 chr2 166139022 166139388 -15608699 + ORR1E LTR MaLR 1 359 0 2 1852 955 249 57 62 chr2 166140688 166141060 -15607027 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 2 1852 265 289 32 88 chr2 166143019 166143144 -15604943 + MER68 LTR ERVL 193 310 -253 2 1852 275 345 72 39 chr2 166143167 166143348 -15604739 + MER68 LTR ERVL 377 563 0 2 1852 237 169 123 0 chr2 166144292 166144357 -15603730 + MTC-int LTR MaLR 66 138 -1120 2 1852 3064 48 8 2 chr2 166145464 166145858 -15602229 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 1852 562 252 286 0 chr2 166152585 166152924 -15595163 + MT2A LTR ERVL 23 458 -75 2 1852 339 311 179 62 chr2 166154050 166154307 -15593780 - MLT1K LTR MaLR -165 430 144 2 1852 847 190 17 113 chr2 166157200 166157431 -15590656 - MTEb LTR MaLR 0 379 171 2 1852 485 257 103 41 chr2 166157724 166157870 -15590217 - MTEb LTR MaLR -224 155 1 2 1852 686 292 80 46 chr2 166159707 166160034 -15588053 + MLT1A0 LTR MaLR 19 356 -9 2 1852 374 268 109 76 chr2 166161461 166161863 -15586224 + MTEb LTR MaLR 1 378 -1 3 1852 242 363 87 69 chr2 166162143 166162489 -15585598 - ORR1E LTR MaLR 0 359 8 3 1852 360 340 18 77 chr2 166173420 166173640 -15574447 - RMER15 LTR ERVL -154 421 215 3 1852 400 317 207 31 chr2 166174887 166175278 -15572809 + MLT1K LTR MaLR 128 587 -8 3 1852 1124 247 71 60 chr2 166180858 166181211 -15566876 + ORR1E LTR MaLR 1 357 -2 3 1852 1236 240 101 26 chr2 166188719 166188895 -15559192 + MTEb LTR MaLR 4 196 -183 3 1852 1236 240 101 26 chr2 166188925 166189095 -15558992 + MTEb LTR MaLR 197 376 -3 3 1852 1900 240 15 0 chr2 166189365 166189774 -15558313 + MTD LTR MaLR 3 417 -2 3 1852 859 282 53 64 chr2 166191219 166191557 -15556530 - MTE2a LTR MaLR -13 406 58 3 1852 566 302 52 111 chr2 166191661 166191751 -15556336 - MTE2a LTR MaLR -320 99 8 3 1852 2093 176 94 8 chr2 166194241 166194625 -15553462 + MTD LTR MaLR 3 419 0 3 1852 1349 231 22 115 chr2 166195013 166195429 -15552658 + MTE2b LTR MaLR 1 377 -2 3 1852 335 352 131 48 chr2 166195567 166195904 -15552183 + ORR1D2 LTR MaLR 1 365 -5 3 1852 368 195 103 0 chr2 166196986 166197073 -15551014 + ORR1C2 LTR MaLR 3 98 -286 3 1852 866 148 118 0 chr2 166197105 166197274 -15550813 + ORR1C2 LTR MaLR 191 379 -5 3 1852 226 337 74 0 chr2 166198079 166198174 -15549913 + MLT1J LTR MaLR 24 125 -387 3 1852 245 338 58 83 chr2 166198239 166198481 -15549606 + MLT1J LTR MaLR 242 477 -35 3 1852 2397 147 72 0 chr2 166198481 166198896 -15549191 - BGLII_A LTR ERVK 0 445 1 3 231 4284 114 144 76 chr2 166199206 166200051 -15548036 + RMER17A2 LTR ERVK 4 906 0 3 1853 1114 216 256 48 chr2 166200921 166201363 -15546724 + RLTR20C LTR ERVK 1 534 0 3 1853 1677 231 126 98 chr2 166205410 166205618 -15542469 + RMER20B LTR ERVK 1 270 -357 3 1853 3318 43 8 2 chr2 166205618 166206012 -15542075 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 1853 1677 231 126 98 chr2 166206012 166206413 -15541674 + RMER20B LTR ERVK 271 627 0 3 1853 991 264 94 9 chr2 166211236 166211565 -15536522 - ORR1E LTR MaLR -2 357 1 3 1853 2751 195 160 83 chr2 166217364 166218162 -15529925 - RMER13A LTR ERVK 0 860 1 3 1853 2367 99 16 0 chr2 166220870 166221192 -15526895 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 4 1853 267 339 64 0 chr2 166223979 166224088 -15523999 + MLT1A0 LTR MaLR 219 334 -31 4 1853 3562 20 5 0 chr2 166229913 166230307 -15517780 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 1853 1752 238 50 0 chr2 166234039 166234400 -15513687 - MTE2b LTR MaLR 0 379 1 4 1853 432 200 128 17 chr2 166234712 166234829 -15513258 - MTD LTR MaLR -14 405 276 4 1853 304 148 0 18 chr2 166234831 166234886 -15513201 + MERVL_2A-int LTR ERVL 4556 4609 -1152 4 1853 820 227 86 30 chr2 166234910 166235142 -15512945 - MTD LTR MaLR -173 246 2 4 1853 872 229 65 11 chr2 166235221 166235498 -15512589 + ORR1D2 LTR MaLR 57 370 0 4 1853 743 292 80 80 chr2 166235566 166235930 -15512157 - MTEa LTR MaLR 0 379 16 4 1853 805 278 89 56 chr2 166236469 166236793 -15511294 - ORR1E LTR MaLR 0 359 25 4 1853 243 151 189 0 chr2 166238724 166238777 -15509310 - MTEb LTR MaLR 0 379 317 4 1853 238 316 71 0 chr2 166239982 166240080 -15508007 - RMER15 LTR ERVL -105 470 366 4 1853 1422 238 73 17 chr2 166240369 166240724 -15507363 + MTD LTR MaLR 10 384 -35 4 1853 243 274 175 25 chr2 166242466 166242586 -15505501 - ORR1E LTR MaLR -167 192 55 4 1853 312 212 150 0 chr2 166246408 166246488 -15501599 - MTE2a LTR MaLR -284 95 4 4 1853 1728 159 55 77 chr2 166246631 166246993 -15501094 + ORR1B1 LTR MaLR 41 394 0 4 1853 1061 221 26 66 chr2 166247707 166247978 -15500109 + MTEa LTR MaLR 1 260 -119 4 1853 412 316 115 30 chr2 166249644 166249813 -15498274 + ORR1E LTR MaLR 1 176 -183 4 1853 412 316 115 30 chr2 166249906 166250066 -15498021 + ORR1E LTR MaLR 177 357 -2 4 1853 232 304 118 0 chr2 166253487 166253589 -15494498 - MLT1F2 LTR MaLR -274 321 208 4 1853 555 235 183 0 chr2 166255891 166256044 -15492043 - MTE2a LTR MaLR -5 374 194 4 1853 2439 136 77 5 chr2 166256074 166256517 -15491570 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 4 1853 1526 334 78 78 chr2 166256530 166257571 -15490516 - MTE-int LTR MaLR -1 1579 539 4 1853 446 238 9 0 chr2 166257579 166257684 -15490403 - MTE-int LTR MaLR -1181 399 294 4 1853 256 346 14 83 chr2 166258374 166258519 -15489568 - MLT1F2 LTR MaLR -424 136 2 4 1853 1160 226 234 18 chr2 166261067 166261409 -15486678 + MTD LTR MaLR 4 419 0 4 1853 1870 102 81 40 chr2 166263084 166263381 -15484706 - RLTR27 LTR ERVK 0 309 1 4 1853 321 311 40 24 chr2 166267187 166267312 -15480775 + MLT1A1 LTR MaLR 4 130 -278 4 1853 1471 275 36 85 chr2 166267939 166268467 -15479620 + RMER5 LTR ERV1 33 534 0 4 1853 366 304 74 45 chr2 166272114 166272290 -15475797 + ORR1E LTR MaLR 13 193 -166 4 1853 750 295 83 17 chr2 166276503 166276744 -15471343 + MTE2b LTR MaLR 69 325 -54 5 1853 253 229 16 0 chr2 166276902 166276966 -15471121 + MTE2b LTR MaLR 314 378 -1 5 1853 2182 129 11 16 chr2 166277931 166278300 -15469787 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 5 1853 356 179 0 29 chr2 166282745 166282814 -15465273 - MTEa LTR MaLR 0 379 313 5 1853 230 276 149 0 chr2 166282954 166283041 -15465046 - MTEa LTR MaLR -59 320 221 5 1853 256 309 17 60 chr2 166284315 166284432 -15463655 - MLT1K LTR MaLR -112 483 372 5 1853 773 218 91 14 chr2 166286245 166286454 -15461633 + MTEa LTR MaLR 153 377 -2 5 1853 371 296 0 0 chr2 166288341 166288439 -15459648 - ORR1E LTR MaLR -229 130 33 5 1853 1050 333 174 50 chr2 166291517 166292471 -15455616 + MTE-int LTR MaLR 482 1553 -27 5 1853 1000 251 184 38 chr2 166293090 166293157 -15454930 - MT2B LTR ERVL 0 601 525 5 1853 1000 251 184 38 chr2 166293320 166293774 -15454313 - MT2B LTR ERVL -77 524 5 5 1853 387 268 201 13 chr2 166294695 166294854 -15453233 - MER57D LTR ERV1 -169 242 54 5 1853 600 238 41 20 chr2 166295506 166295652 -15452435 + MT2B LTR ERVL 1 149 -384 5 1853 685 260 88 5 chr2 166295636 166295914 -15452173 + MT2B LTR ERVL 94 554 -47 5 1853 667 237 42 42 chr2 166295959 166296027 -15452060 + MT2A LTR ERVL 465 533 0 5 1853 341 322 39 34 chr2 166297706 166297912 -15450175 - MLT2B3 LTR ERVL -275 279 73 5 1853 2437 58 0 47 chr2 166301399 166301742 -15446345 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 5 1853 261 233 103 11 chr2 166302647 166302734 -15445353 + MLT1K LTR MaLR 121 215 -380 5 1853 985 193 162 55 chr2 166309624 166309804 -15438283 + RMER17C LTR ERVK 1 221 -189 5 1853 985 193 162 55 chr2 166309862 166310027 -15438060 + RMER17C LTR ERVK 222 383 -27 5 1853 2533 197 19 15 chr2 166310112 166310632 -15437455 + RMER5 LTR ERV1 13 534 0 5 1853 254 329 58 45 chr2 166310813 166310969 -15437118 - RMER5 LTR ERV1 -244 290 133 5 1853 255 254 57 66 chr2 166311287 166311409 -15436678 - RMER5 LTR ERV1 -382 152 32 5 1853 427 235 8 42 chr2 166315514 166315634 -15432453 + MTEb LTR MaLR 255 370 -9 5 1853 785 289 152 13 chr2 166315936 166316251 -15431836 + MTE-int LTR MaLR 97 455 -1125 5 1853 769 248 127 20 chr2 166317058 166317350 -15430737 - MLT1D LTR MaLR -178 327 5 5 1853 894 259 179 0 chr2 166317407 166317708 -15430379 - ORR1E LTR MaLR -4 355 1 5 1853 234 216 20 0 chr2 166318977 166319028 -15429059 - RMER15 LTR ERVL -113 462 411 5 1853 2045 99 16 7 chr2 166321539 166321845 -15426242 + RLTR27 LTR ERVK 1 309 0 5 1853 352 87 0 0 chr2 166321869 166321915 -15426172 + RLTR10-int LTR ERVK 222 267 -7314 5 1853 668 232 48 32 chr2 166321947 166322134 -15425953 + RLTR10-int LTR ERVK 655 844 -1143 5 1853 3469 309 36 37 chr2 166322496 166324402 -15423685 + MMERVK10C-int LTR ERVK 3579 5482 -2099 5 1853 1498 223 48 35 chr2 166324648 166325212 -15422875 + MMERVK10C-int LTR ERVK 6907 7581 0 5 1853 2013 99 16 10 chr2 166325212 166325519 -15422568 + RLTR27 LTR ERVK 1 309 0 5 1853 1955 139 43 3 chr2 166327272 166327617 -15420470 + RLTR15 LTR ERVK 1 359 0 5 1853 2185 164 50 2 chr2 166328471 166328888 -15419199 + RMER20A LTR ERVK 1 437 -79 5 1854 2861 181 150 49 chr2 166332168 166332987 -15415100 - RMER19B LTR ERVK 0 902 1 5 1854 699 327 125 16 chr2 166333512 166333817 -15414270 + ORR1E LTR MaLR 20 357 -2 5 1854 426 306 95 7 chr2 166334033 166334179 -15413908 + ORR1E LTR MaLR 1 159 -200 5 1854 1045 241 60 72 chr2 166334179 166334527 -15413560 + ORR1D1 LTR MaLR 1 344 -30 5 1854 538 210 129 0 chr2 166334647 166334771 -15413316 - ORR1E LTR MaLR -166 193 54 5 1854 306 292 8 98 chr2 166334810 166334943 -15413144 + ORR1E LTR MaLR 201 321 -58 5 1854 344 64 0 0 chr2 166337392 166337439 -15410648 + MT2A LTR ERVL 487 533 0 6 1854 1985 107 5 130 chr2 166341659 166342035 -15406052 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 6 1854 442 289 12 80 chr2 166342582 166342744 -15405343 - MTEa LTR MaLR -164 215 65 6 1854 285 276 37 66 chr2 166344436 166344572 -15403515 + LTR33 LTR ERVL 19 150 -365 6 1854 1095 296 85 20 chr2 166345091 166345377 -15402710 + MTEb LTR MaLR 5 309 -70 6 1854 3613 15 2 0 chr2 166345377 166345772 -15402315 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 1854 1095 296 85 20 chr2 166345772 166345837 -15402250 + MTEb LTR MaLR 310 379 0 6 1854 1512 209 104 20 chr2 166349419 166349776 -15398311 + MTD LTR MaLR 18 404 -15 6 1854 453 289 149 34 chr2 166352068 166352276 -15395811 - MTE-int LTR MaLR -1260 320 89 6 1854 2004 103 57 69 chr2 166352746 166353079 -15395008 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 6 1854 851 212 0 77 chr2 166353516 166353710 -15394377 - MTEa LTR MaLR -200 179 1 6 1854 2205 304 141 96 chr2 166353712 166354885 -15393202 - MTEa-int LTR MaLR -2 1578 363 6 1854 2205 304 141 96 chr2 166354908 166355234 -15392853 - MTEa-int LTR MaLR -1218 362 12 6 1854 2479 157 36 40 chr2 166356152 166356629 -15391458 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 6 1854 4615 70 5 35 chr2 166356652 166357318 -15390769 + IAPEz-int LTR ERVK 17 662 -5819 6 1854 435 82 0 32 chr2 166357318 166357381 -15390706 + IAPEz-int LTR ERVK 1359 1419 -5062 6 1854 1773 107 4 4 chr2 166357370 166357632 -15390455 + IAPEz-int LTR ERVK 2236 2497 -5183 6 1854 900 80 24 0 chr2 166357627 166357752 -15390335 + IAPEz-int LTR ERVK 4783 4910 -2770 6 1854 20178 18 2 2 chr2 166357754 166360113 -15387974 + IAPEz-int LTR ERVK 4123 6481 0 6 1854 2529 151 36 40 chr2 166360113 166360590 -15387497 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 6 1854 1087 242 40 109 chr2 166361889 166361925 -15386162 - MTE2a LTR MaLR 0 379 344 6 1854 1087 242 40 109 chr2 166361981 166362348 -15385739 - MTE2a LTR MaLR -36 343 6 6 1854 472 220 177 15 chr2 166364687 166364868 -15383219 + MTC LTR MaLR 190 407 -14 6 1854 290 328 51 34 chr2 166366127 166366245 -15381842 + MTEa LTR MaLR 243 362 -17 6 1854 1262 210 107 25 chr2 166368006 166368233 -15379854 + ORR1D1 LTR MaLR 1 228 -146 6 1854 1262 210 107 25 chr2 166368256 166368346 -15379741 + ORR1D1 LTR MaLR 229 343 -31 6 1854 1916 260 53 55 chr2 166368712 166369311 -15378776 - RLTR18 LTR ERVK -4 612 15 6 1854 969 141 251 68 chr2 166369933 166370184 -15377903 - ORR1B2 LTR MaLR -2 365 69 6 1854 412 260 157 22 chr2 166372000 166372185 -15375902 + RMER15 LTR ERVL 353 562 -13 6 1854 2128 111 60 3 chr2 166372985 166373336 -15374751 + RMER20A LTR ERVK 146 516 0 6 1854 1686 135 64 176 chr2 166374006 166374427 -15373660 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 6 1854 239 339 69 30 chr2 166379017 166379148 -15368939 - RMER4A LTR ERVK -88 378 243 6 1854 448 283 77 18 chr2 166379704 166379873 -15368214 - ERVL-E-int LTR ERVL -3206 2461 2283 6 1854 2234 132 25 0 chr2 166381466 166381821 -15366266 + ORR1C1 LTR MaLR 1 364 -14 6 1854 606 239 12 81 chr2 166385228 166385401 -15362686 - MTE2a LTR MaLR 0 379 219 6 1854 882 295 88 81 chr2 166387955 166388285 -15359802 - MT2A LTR ERVL -8 525 182 6 1854 2581 145 17 20 chr2 166388285 166388693 -15359394 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 6 1854 957 295 88 81 chr2 166388693 166388882 -15359205 - MT2A LTR ERVL -352 181 2 6 1854 283 331 49 44 chr2 166402460 166402721 -15345366 + RLTR20A LTR ERVK 29 234 -125 7 1854 466 301 32 85 chr2 166410986 166411175 -15336912 + MLT1J LTR MaLR 241 419 -93 7 1854 262 329 177 7 chr2 166422147 166422294 -15325793 + MLT1L LTR MaLR 306 477 -133 7 1854 313 416 54 51 chr2 166424583 166424915 -15323172 + MLT1L LTR MaLR 121 453 -157 7 1854 228 266 49 37 chr2 166437238 166437320 -15310767 - LTR50 LTR ERVL -512 283 201 7 1854 449 280 103 47 chr2 166439595 166439914 -15308173 + MLT1A0 LTR MaLR 2 374 0 7 1854 1317 233 34 115 chr2 166443513 166443921 -15304166 - MTE2b LTR MaLR -2 377 3 7 1854 1018 250 166 6 chr2 166446019 166446333 -15301754 + MTE2b LTR MaLR 15 378 -1 7 1854 1123 278 101 0 chr2 166446967 166447305 -15300782 + MTEa LTR MaLR 8 379 0 7 1854 1562 158 82 77 chr2 166452403 166452779 -15295308 + ORR1C2 LTR MaLR 7 384 0 7 1854 241 321 27 36 chr2 166458278 166458388 -15289699 + MLT1K LTR MaLR 144 252 -343 7 1854 251 344 109 30 chr2 166458565 166458730 -15289357 + MLT1K LTR MaLR 250 427 -168 7 1855 687 183 30 73 chr2 166462012 166462177 -15285910 + MTE2a LTR MaLR 13 170 -209 7 1855 353 210 86 0 chr2 166465306 166465387 -15282700 + ORR1E LTR MaLR 7 94 -265 8 1855 2310 148 13 24 chr2 166465886 166466268 -15281819 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 8 1855 614 241 5 70 chr2 166474473 166474660 -15273427 + MTEb LTR MaLR 126 300 -79 8 1855 421 274 19 0 chr2 166474757 166474863 -15273224 + MTEb LTR MaLR 271 378 -1 8 1855 1507 228 31 26 chr2 166480652 166481012 -15267075 + MTE2b LTR MaLR 18 370 0 8 1855 699 224 60 49 chr2 166484071 166484283 -15263804 + MLT1D LTR MaLR 281 484 -21 8 1855 272 217 199 31 chr2 166484289 166484406 -15263681 + MT2B LTR ERVL 125 257 -327 8 1855 486 245 155 10 chr2 166491142 166491336 -15256751 - RMER15 LTR ERVL -19 556 335 8 1855 1591 160 129 6 chr2 166513696 166514030 -15234057 - MTC LTR MaLR 0 421 47 3 1855 266 235 0 0 chr2 166514125 166514176 -15233911 - MTC LTR MaLR -366 55 5 3 1855 2214 162 10 65 chr2 166520200 166520617 -15227470 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 4 1855 293 240 9 123 chr2 166520869 166520983 -15227104 + MT2B LTR ERVL 157 257 -344 4 1855 406 254 50 50 chr2 166522165 166522306 -15225781 - MTD LTR MaLR -29 350 210 5 1855 698 263 74 22 chr2 166522745 166522974 -15225113 - MTD LTR MaLR -178 241 1 5 1855 241 186 33 17 chr2 166525181 166525241 -15222846 + MLT1E3 LTR MaLR 353 413 -211 5 1855 2605 143 127 2 chr2 166530378 166530882 -15217205 + RMER15 LTR ERVL 9 575 0 7 1855 1587 228 99 30 chr2 166530884 166531278 -15216809 + RMER15-int LTR ERVL 3 423 -4576 7 1855 6041 244 63 28 chr2 166531453 166531546 -15216541 + RMER15-int LTR ERVL 761 852 -4147 7 1855 3400 28 8 5 chr2 166531546 166531941 -15216146 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 7 1855 6041 244 63 28 chr2 166531941 166532389 -15215698 + RMER15-int LTR ERVL 853 1293 -3706 7 1855 6041 244 63 28 chr2 166532422 166533441 -15214646 + RMER15-int LTR ERVL 1294 2377 -2622 7 1855 2435 232 134 47 chr2 166533490 166534192 -15213895 + RMER15-int LTR ERVL 4176 4938 -61 7 1855 2323 139 249 13 chr2 166534228 166534693 -15213394 + RMER15 LTR ERVL 1 575 0 7 1855 273 298 104 62 chr2 166541565 166541851 -15206236 - MLT1L LTR MaLR 0 512 211 9 1855 3025 164 25 19 chr2 166542455 166543021 -15205066 + RMER15 LTR ERVL 2 570 -5 9 1855 2961 151 69 81 chr2 166543980 166544562 -15203525 + RMER15 LTR ERVL 1 575 0 9 1855 413 299 77 67 chr2 166544879 166545177 -15202910 + MLT1L LTR MaLR 307 607 -3 9 1855 959 296 16 55 chr2 166548458 166548840 -15199247 - MTEa LTR MaLR -6 373 7 1 1855 388 295 8 32 chr2 166549134 166549260 -15198827 - MTEa-int LTR MaLR -30 1550 1428 1 1855 871 247 17 128 chr2 166549476 166549751 -15198336 - MTEa-int LTR MaLR -186 1394 1152 1 1855 333 310 15 23 chr2 166550068 166550200 -15197887 - MTEa-int LTR MaLR -1105 475 345 1 1855 345 289 112 7 chr2 166550615 166550758 -15197329 - MTEa-int LTR MaLR -1422 158 1 1 1855 775 305 46 88 chr2 166550770 166551158 -15196929 - MTEa LTR MaLR -7 372 1 1 1855 978 308 29 12 chr2 166551458 166551800 -15196287 + MTE2b LTR MaLR 27 374 -5 1 1855 354 300 161 66 chr2 166553794 166554080 -15194007 + MLT1J1 LTR MaLR 26 338 -110 1 1855 2208 110 3 9 chr2 166556917 166557246 -15190841 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 1 1855 1856 107 12 59 chr2 166572128 166572466 -15175621 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 322 0 1 1855 345 206 19 93 chr2 166575696 166575803 -15172284 - MT2B LTR ERVL -351 250 152 1 1855 440 333 98 67 chr2 166579816 166580144 -15167943 - ORR1E LTR MaLR -21 338 1 2 1855 506 219 231 54 chr2 166585535 166585738 -15162349 - RMER4B LTR ERVK -4 581 343 2 1855 2343 49 10 0 chr2 166585751 166586241 -15161846 + RLTR10C LTR ERVK 1 426 -10 2 1855 424 165 143 10 chr2 166586338 166586436 -15161651 - RMER4B LTR ERVK -374 211 101 2 1855 382 272 25 139 chr2 166588177 166588293 -15159794 + MLT1K LTR MaLR 409 514 -81 2 1855 382 272 25 139 chr2 166588443 166588527 -15159560 + MLT1K LTR MaLR 515 586 -9 2 1855 367 196 27 73 chr2 166592166 166592276 -15155811 + MT2B LTR ERVL 153 257 -344 2 1856 449 256 120 0 chr2 166593051 166593184 -15154903 + ORR1E LTR MaLR 27 175 -184 2 1856 229 236 54 27 chr2 166593775 166593849 -15154238 + MamGypLTR3 LTR Gypsy 81 156 -683 2 1856 238 214 97 140 chr2 166593918 166594032 -15154055 - MT2B LTR ERVL -341 260 152 2 1856 2549 148 138 16 chr2 166600979 166601486 -15146601 + RMER4B LTR ERVK 17 585 0 2 1856 1363 243 143 77 chr2 166603345 166603933 -15144154 - RMER20B LTR ERVK 0 627 1 2 1856 4650 43 12 0 chr2 166609130 166609710 -15138377 + LTRIS_Mus LTR ERV1 1 587 0 2 1856 665 247 140 69 chr2 166609825 166610160 -15137927 - ORR1E LTR MaLR 0 359 1 3 1856 227 222 111 0 chr2 166610928 166610991 -15137096 - MTE2b LTR MaLR -132 247 178 3 1856 2764 177 53 22 chr2 166614065 166614167 -15133920 - RLTR20B2 LTR ERVK 0 560 453 3 1856 2764 177 53 22 chr2 166614243 166614682 -15133405 - RLTR20B2 LTR ERVK -108 452 2 3 1856 939 185 132 30 chr2 166615546 166615780 -15132307 - RLTR22_Mur LTR ERVK 0 1848 1591 3 1856 3983 144 57 68 chr2 166615883 166616232 -15131855 - RLTR22_Mur LTR ERVK -963 885 557 3 1856 3983 144 57 68 chr2 166616378 166616905 -15131182 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1292 556 20 3 1856 1034 173 168 53 chr2 166618370 166618632 -15129455 - RMER21B LTR ERV1 -275 567 276 3 1856 667 271 111 19 chr2 166624577 166624784 -15123303 - MTEb LTR MaLR -151 228 3 3 1856 1863 146 137 8 chr2 166625551 166625923 -15122164 + MTC LTR MaLR 2 421 0 3 1856 240 240 20 0 chr2 166626084 166626134 -15121953 - MLT1J LTR MaLR -221 291 241 3 1856 1096 161 19 63 chr2 166629568 166629732 -15118355 - RMER10B LTR ERVL 0 398 197 3 1856 1096 130 64 85 chr2 166629781 166629965 -15118122 - RMER10B LTR ERVL -202 196 19 3 1856 2913 14 55 6 chr2 166637698 166638045 -15110042 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK -3 364 1 3 1856 27944 21 1 2 chr2 166638050 166641322 -15106765 - IAPEz-int LTR ERVK -4 6477 3210 3 1856 6581 92 96 90 chr2 166641321 166642619 -15105468 - IAPEz-int LTR ERVK -5168 1313 8 3 1856 2945 14 54 6 chr2 166642619 166642969 -15105118 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 3 1856 229 298 86 31 chr2 166644994 166645122 -15102965 - MLT1A0 LTR MaLR -230 135 1 3 1856 1181 246 131 3 chr2 166646296 166646578 -15101509 - MTE2a LTR MaLR -44 335 18 3 1856 751 297 91 16 chr2 166655333 166655651 -15092436 - MLT1A LTR MaLR -32 342 1 4 1856 236 198 165 47 chr2 166664947 166665032 -15083055 - MLT1A1 LTR MaLR -54 354 260 4 1856 4199 142 27 28 chr2 166668873 166669618 -15078469 - RMER6A LTR ERVK -12 744 1 4 1856 318 218 137 32 chr2 166673420 166673540 -15074547 - ORR1E LTR MaLR -208 151 1 4 1856 854 320 49 12 chr2 166675633 166675977 -15072110 - MTE2b LTR MaLR -20 359 1 4 1856 385 186 104 96 chr2 166678208 166678333 -15069754 + MT2B LTR ERVL 154 279 -322 4 1856 283 203 17 0 chr2 166680600 166680659 -15067428 - MTE2a LTR MaLR -6 373 314 4 1856 434 161 42 94 chr2 166681602 166681698 -15066389 - MT2B LTR ERVL -344 257 167 4 1856 859 131 21 21 chr2 166706051 166706192 -15041895 - ORR1A3 LTR MaLR -51 275 135 5 1856 271 274 35 121 chr2 166714342 166714458 -15033629 + MT2B LTR ERVL 159 264 -337 5 1857 526 124 0 0 chr2 166727908 166727997 -15020090 + RLTR14 LTR ERV1 99 187 -195 6 1857 795 143 91 167 chr2 166734721 166734829 -15013258 + MTD LTR MaLR 173 264 -155 6 1857 795 143 91 167 chr2 166735021 166735164 -15012923 + MTD LTR MaLR 265 405 -14 6 1857 1596 109 123 0 chr2 166746698 166746982 -15001105 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 9 6 1857 1088 209 46 51 chr2 166749429 166749882 -14998205 - RLTR11A2 LTR ERVK -15 512 3 6 1857 241 289 35 46 chr2 166763711 166763724 -14984363 - MT2B LTR ERVL -362 239 154 7 1857 256 263 104 66 chr2 166763770 166763876 -14984211 + MT2B LTR ERVL 134 243 -358 7 1857 2056 139 69 51 chr2 166766017 166766450 -14981637 - BGLII_B LTR ERVK 0 441 1 7 1857 553 310 186 8 chr2 166782154 166782417 -14965670 + ORR1D2 LTR MaLR 53 362 -8 7 1857 381 233 26 88 chr2 166784330 166784443 -14963644 + MT2B LTR ERVL 152 257 -344 7 1857 252 300 127 101 chr2 166784940 166785248 -14962839 + ORR1E LTR MaLR 44 359 0 7 1857 367 313 83 24 chr2 166788075 166788295 -14959792 + MLT1G1 LTR MaLR 51 304 -275 7 1857 237 259 19 0 chr2 166788360 166788414 -14959673 + MLT1G1 LTR MaLR 459 513 -66 7 1857 239 246 14 55 chr2 166809499 166809572 -14938515 + RLTR25B LTR ERVK 429 498 -530 8 1857 311 227 47 85 chr2 166815208 166815314 -14932773 - MT2B LTR ERVL -338 263 162 8 1857 312 224 33 108 chr2 166819247 166819367 -14928720 + MT2B LTR ERVL 168 278 -323 8 1857 3455 111 45 56 chr2 166824399 166824972 -14923115 - RMER2 LTR ERV1 0 567 1 9 1857 603 265 45 73 chr2 166826480 166826827 -14921260 + RMER2 LTR ERV1 1 480 -87 9 1857 2818 134 39 26 chr2 166827178 166827670 -14920417 + RLTR19 LTR ERVK 2 499 0 9 1857 268 140 39 39 chr2 166828749 166828801 -14919286 - MT2B2 LTR ERVL 0 584 533 9 1857 2118 168 82 5 chr2 166830459 166830847 -14917240 - MTC LTR MaLR -3 418 1 9 1857 1548 167 241 69 chr2 166834757 166835318 -14912769 - RMER19B LTR ERVK -12 890 156 9 1857 1171 206 230 120 chr2 166835464 166835672 -14912415 - RMER19B LTR ERVK -747 155 1 9 1857 2203 146 35 15 chr2 166835672 166836069 -14912018 - RMER15 LTR ERVL -166 409 5 9 1857 2186 102 15 6 chr2 166837552 166837878 -14910209 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 9 1857 363 202 190 16 chr2 166839199 166839320 -14908767 - ORR1B2 LTR MaLR -3 364 223 9 1857 509 154 0 11 chr2 166839888 166839975 -14908112 - RMER19B LTR ERVK -13 889 804 9 1858 276 307 25 66 chr2 166871996 166872118 -14875969 - MT2B LTR ERVL -318 283 167 1 1858 248 292 187 9 chr2 166889451 166889558 -14858529 + MTD LTR MaLR 36 161 -258 1 1858 920 241 141 23 chr2 166896822 166897128 -14850959 + MTE2b LTR MaLR 4 345 -34 1 1858 429 277 47 59 chr2 166897312 166897481 -14850606 - MLT1K LTR MaLR -305 290 124 1 1858 883 226 90 45 chr2 166901083 166901328 -14846759 - MTE2b LTR MaLR -123 256 1 1 1858 1756 189 44 78 chr2 166902117 166902501 -14845586 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 4 1 1858 751 356 88 29 chr2 166903848 166904374 -14843713 - MLT1K LTR MaLR -14 581 25 1 1858 439 326 142 25 chr2 166914025 166914343 -14833744 + MLT1F LTR MaLR 185 539 -9 1 1858 3452 32 4 120 chr2 166917531 166918024 -14830063 + RLTR10C LTR ERVK 1 436 0 1 1858 246 259 113 49 chr2 166919731 166919804 -14828283 + RMER17D LTR ERVK 388 475 -414 1 1858 246 259 113 49 chr2 166919953 166920021 -14828066 + RMER17D LTR ERVK 476 537 -352 1 1858 2154 133 3 3 chr2 166933329 166933639 -14814448 - RLTR10E LTR ERVK -1 310 1 1 1858 382 325 16 8 chr2 166938988 166939112 -14808975 + MLT1J LTR MaLR 62 186 -326 1 1858 651 276 187 72 chr2 166940820 166941238 -14806849 - RMER13A LTR ERVK -393 467 2 1 1858 778 336 85 16 chr2 166942935 166943313 -14804774 + MLT1J LTR MaLR 44 447 -65 1 1858 2658 80 0 0 chr2 166959180 166959507 -14788580 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 1 1858 243 353 108 26 chr2 166961334 166961529 -14786558 + LTR40a LTR ERVL 65 275 -244 1 1858 329 359 100 10 chr2 166964736 166964936 -14783151 + MLT1K LTR MaLR 301 518 -77 1 1858 356 183 56 0 chr2 166974893 166974964 -14773123 + MTD LTR MaLR 345 419 0 1 1858 276 266 43 105 chr2 166976554 166976700 -14771387 + MLT1J LTR MaLR 44 180 -332 1 1859 1557 239 38 16 chr2 166986641 166987011 -14761076 + MTE2b LTR MaLR 2 379 0 1 1859 2304 32 3 71 chr2 166987550 166987886 -14760201 + ORR1A2 LTR MaLR 8 320 -7 1 1859 2108 152 30 40 chr2 166991168 166991572 -14756515 + MT2A LTR ERVL 1 400 -133 1 1859 283 292 0 117 chr2 166996065 166996091 -14751996 - MT2B LTR ERVL -446 155 145 1 1859 4087 126 15 77 chr2 166998117 166998923 -14749164 + RMER6A LTR ERVK 1 756 0 1 1859 581 270 276 3 chr2 166999243 166999544 -14748543 + MLT1K LTR MaLR 206 588 -7 1 1859 1426 176 115 25 chr2 167008592 167008906 -14739181 + ORR1D1 LTR MaLR 31 372 -2 2 1859 228 317 0 0 chr2 167009031 167009091 -14738996 + MLT1N2 LTR MaLR 98 157 -405 2 1859 650 341 61 55 chr2 167017234 167017761 -14730326 + MT2A LTR ERVL 4 533 0 3 1859 353 306 125 0 chr2 167022868 167023012 -14725075 + MLT1K LTR MaLR 419 580 -15 5 1859 2658 52 3 58 chr2 167030315 167030661 -14717426 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 7 1859 429 341 100 3 chr2 167033227 167033566 -14714521 + MLT1K LTR MaLR 171 578 -17 7 1859 925 280 147 3 chr2 167039443 167039769 -14708318 + MTE2b LTR MaLR 7 379 0 9 1859 339 177 49 37 chr2 167045570 167045652 -14702435 + MTD LTR MaLR 1 83 -287 1 1859 234 284 30 0 chr2 167045936 167046003 -14702084 + MTEb LTR MaLR 287 355 -24 1 1859 1609 185 261 30 chr2 167046244 167046673 -14701414 + RLTR12B LTR ERVK 1 528 0 1 1859 612 237 45 19 chr2 167046912 167047067 -14701020 + MTD LTR MaLR 246 404 -15 1 1859 3229 44 28 15 chr2 167048896 167049291 -14698796 + MTB LTR MaLR 1 400 0 1 1859 2471 153 5 7 chr2 167050280 167050702 -14697385 + MTC LTR MaLR 1 421 0 1 1859 268 309 73 0 chr2 167054133 167054243 -14693844 + MLT1E3 LTR MaLR 181 298 -326 1 1859 321 247 46 3 chr2 167063277 167063386 -14684701 + RLTR42-int LTR ERVK 1639 1774 -3748 1 1859 227 67 0 0 chr2 167067980 167068010 -14680077 - ORR1B2 LTR MaLR -332 35 6 1 1859 805 276 132 29 chr2 167069189 167069529 -14678558 - MTE2b LTR MaLR 0 379 5 1 1859 560 293 38 116 chr2 167073256 167073629 -14674458 - MTE2a LTR MaLR -30 389 3 1 1859 1318 166 26 118 chr2 167082816 167083237 -14664850 + ORR1B1 LTR MaLR 5 394 0 1 1859 2362 117 48 15 chr2 167083805 167084205 -14663882 + MTC LTR MaLR 1 413 -8 2 1859 1965 191 65 50 chr2 167084477 167084867 -14663220 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 1761 2167 -159 2 1859 1965 191 65 50 chr2 167085190 167085356 -14662731 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 2168 2325 -1 2 1859 2040 76 230 0 chr2 167085356 167085699 -14662388 + BGLII_Mus LTR ERVK 1 422 0 2 1859 3767 147 35 36 chr2 167091899 167092192 -14655895 + RLTR17 LTR ERVK 1 299 -393 2 1859 3767 147 35 36 chr2 167092380 167092776 -14655311 + RLTR17 LTR ERVK 300 689 -3 2 1859 626 170 13 39 chr2 167093021 167093174 -14654913 + ORR1B1 LTR MaLR 1 149 -245 2 1859 1870 144 98 6 chr2 167094480 167094837 -14653250 - ORR1B1 LTR MaLR -2 392 3 2 1859 1579 110 109 11 chr2 167095362 167095637 -14652450 + ORR1B1 LTR MaLR 29 330 -64 2 1859 1952 159 77 0 chr2 167097359 167097712 -14650375 - RLTR14 LTR ERV1 0 382 3 2 1859 1143 124 22 83 chr2 167098231 167098459 -14649628 - ORR1B2 LTR MaLR -151 216 3 2 1859 326 296 19 0 chr2 167098493 167098601 -14649486 - MLT1D LTR MaLR -52 453 344 2 1859 299 317 0 0 chr2 167100947 167101029 -14647058 + ORR1E LTR MaLR 1 82 -277 2 1859 2132 118 55 17 chr2 167101036 167101397 -14646690 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 33 2 1859 2870 21 3 0 chr2 167108243 167108579 -14639508 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 337 0 2 1859 34992 30 10 4 chr2 167108579 167114982 -14633105 + IAPEz-int LTR ERVK 8 6481 0 2 1859 3032 21 3 0 chr2 167114982 167115318 -14632769 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 337 0 2 1860 755 231 117 48 chr2 167118359 167118632 -14629455 - MTD LTR MaLR -16 403 112 2 1860 492 201 16 16 chr2 167118816 167118922 -14629165 - MTD LTR MaLR -290 106 1 2 1860 760 235 66 33 chr2 167121389 167121600 -14626487 - RMER10A LTR ERVL -207 235 18 2 1860 1634 202 76 3 chr2 167128114 167128457 -14619630 + ORR1D2 LTR MaLR 1 368 -2 2 1860 564 290 27 25 chr2 167131881 167132086 -14616001 + MTD LTR MaLR 18 191 -188 3 1860 2182 127 118 18 chr2 167135740 167136140 -14611947 + RMER10A LTR ERVL 3 442 0 3 1860 355 307 7 99 chr2 167141652 167141793 -14606294 - MTE2a LTR MaLR -9 370 243 3 1860 1725 179 100 9 chr2 167150678 167151118 -14596969 + RMER4B LTR ERVK 59 574 -11 3 1860 329 208 86 129 chr2 167153711 167153827 -14594260 - MT2B LTR ERVL -361 240 130 3 1860 1027 166 60 5 chr2 167180642 167180842 -14567245 + ORR1C1 LTR MaLR 168 378 0 4 1860 2053 111 9 12 chr2 167181039 167181359 -14566728 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 4 1860 718 325 58 71 chr2 167183784 167184235 -14563852 - RMER5 LTR ERV1 -66 468 24 4 1860 2414 259 87 60 chr2 167184777 167185647 -14562440 - RMER19B LTR ERVK -8 894 1 4 1860 745 263 43 30 chr2 167188137 167188368 -14559719 - MLT1A0 LTR MaLR -20 345 112 4 1860 684 299 180 32 chr2 167188721 167189160 -14558927 - MLT-int LTR MaLR -48 1687 1184 4 1860 468 365 75 48 chr2 167189805 167190328 -14557759 - MLT-int LTR MaLR -1153 582 46 4 1860 225 305 110 0 chr2 167191987 167192105 -14555982 - RMER15 LTR ERVL -23 552 422 4 1860 456 259 60 13 chr2 167195854 167196003 -14552084 - RMER5 LTR ERV1 -22 512 357 4 1860 330 217 85 70 chr2 167201887 167202016 -14546071 - MLT1K LTR MaLR -266 329 199 5 1860 270 349 9 0 chr2 167212041 167212147 -14535940 - MLT1K LTR MaLR -295 300 194 5 1860 2721 112 2 41 chr2 167214942 167215380 -14532707 - MTC LTR MaLR 0 421 1 5 1860 3334 56 0 43 chr2 167215893 167216362 -14531725 + RLTR1D LTR ERV1 157 605 0 5 1860 4393 151 80 19 chr2 167217822 167218661 -14529426 + RMER19B LTR ERVK 1 890 -12 5 1860 228 254 18 0 chr2 167221037 167221092 -14526995 + MLT1J LTR MaLR 112 167 -345 5 1860 1304 153 156 36 chr2 167221390 167221564 -14526523 + RMER17C LTR ERVK 2 177 -233 5 1860 1304 153 156 36 chr2 167221629 167221819 -14526268 + RMER17C LTR ERVK 178 409 -1 5 1860 2742 33 0 121 chr2 167221828 167222243 -14525844 + RLTR10B2 LTR ERVK 1 365 0 5 1860 1799 152 161 3 chr2 167224537 167224892 -14523195 + MTC LTR MaLR 1 411 -10 6 1860 285 326 116 22 chr2 167225106 167225338 -14522749 + MLT1K LTR MaLR 15 268 -327 6 1860 425 279 126 84 chr2 167226006 167226292 -14521795 + LTR16E1 LTR ERVL 213 510 -28 6 1860 243 171 89 39 chr2 167229549 167229616 -14518471 - RLTR13D6 LTR ERVK -2 900 839 6 1860 234 242 50 99 chr2 167230792 167230893 -14517194 + RMER5 LTR ERV1 1 96 -438 6 1860 465 297 161 86 chr2 167230961 167231252 -14516835 + RMER5 LTR ERV1 211 523 -11 6 1860 2335 81 54 17 chr2 167233543 167233897 -14514190 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 6 1860 1001 85 152 0 chr2 167233897 167234061 -14514026 + IAPEz-int LTR ERVK 8 196 -6285 6 1860 6598 89 126 34 chr2 167234032 167235224 -14512863 + IAPEz-int LTR ERVK 67 1313 -5168 6 1860 28296 16 1 0 chr2 167235223 167238492 -14509595 + IAPEz-int LTR ERVK 3210 6481 0 6 1860 2335 81 54 17 chr2 167238492 167238846 -14509241 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 6 1860 230 309 22 67 chr2 167238866 167238956 -14509131 + MLT1D LTR MaLR 306 391 -114 6 1860 1631 106 75 29 chr2 167239871 167240163 -14507924 - ORR1C2 LTR MaLR -22 362 41 6 1860 605 143 60 53 chr2 167240152 167240285 -14507802 - ORR1C2 LTR MaLR -244 134 1 6 1860 453 273 13 65 chr2 167240387 167240540 -14507547 - RMER5 LTR ERV1 -12 522 378 6 1860 304 284 12 109 chr2 167241113 167241267 -14506820 - MT2B LTR ERVL -260 324 176 6 1860 2262 126 81 5 chr2 167245208 167245590 -14502497 - MTC LTR MaLR -8 413 3 6 1861 333 250 33 0 chr2 167252395 167252487 -14495600 - RLTR42-int LTR ERVK -2278 3859 3765 6 1861 516 228 9 17 chr2 167252618 167252734 -14495353 - RLTR42-int LTR ERVK -2423 3714 3600 6 1861 1029 251 55 101 chr2 167253291 167254166 -14493921 - RLTR42-int LTR ERVK -3117 3020 1870 6 1861 2091 172 85 21 chr2 167254557 167254944 -14493143 - MTC LTR MaLR -8 413 2 6 1861 790 249 117 117 chr2 167255176 167255386 -14492701 - RLTR42-int LTR ERVK -3654 1868 1620 6 1861 790 249 117 117 chr2 167255750 167256213 -14491874 - RLTR42-int LTR ERVK -3903 1619 1195 6 1861 235 252 207 43 chr2 167262603 167262719 -14485368 + MLT1L LTR MaLR 225 359 -251 7 1861 340 237 49 133 chr2 167263592 167263886 -14484201 - RLTR13D3 LTR ERVK 0 1114 746 7 1861 2249 101 0 21 chr2 167264521 167264846 -14483241 - ORR1A3 LTR MaLR -8 318 1 7 1861 471 223 71 0 chr2 167265364 167265476 -14482611 - RMER15 LTR ERVL -164 411 292 7 1861 757 275 107 68 chr2 167269858 167270271 -14477816 - RMER10A LTR ERVL -13 429 1 7 1861 4429 22 0 0 chr2 167277037 167277530 -14470557 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 7 1861 1491 153 186 3 chr2 167278849 167279171 -14468916 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 14 7 1861 2532 58 64 3 chr2 167286409 167286735 -14461352 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 7 1861 578 193 53 0 chr2 167304733 167304847 -14443240 + MTD LTR MaLR 1 120 -299 8 1861 409 221 177 16 chr2 167304958 167305082 -14443005 + MTD LTR MaLR 102 245 -174 8 1861 3552 92 134 2 chr2 167314598 167315113 -14432974 + MT2B2 LTR ERVL 2 584 0 8 1861 253 292 54 81 chr2 167320986 167321135 -14426952 - MT2B2 LTR ERVL -327 257 113 8 1861 263 250 79 0 chr2 167328705 167328781 -14419306 - MLT1E1A LTR MaLR -53 627 546 8 1861 4536 16 0 0 chr2 167346022 167346515 -14401572 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 9 1861 9421 16 6 0 chr2 167346515 167347624 -14400463 + MERVL-int LTR ERVL 1 1116 -4369 9 1861 18441 27 4 9 chr2 167347594 167348345 -14399742 + MERVL-int LTR ERVL 3155 3911 -1574 9 1861 18441 27 4 9 chr2 167348805 167350276 -14397811 + MERVL-int LTR ERVL 3912 5365 -120 9 1861 356 177 12 37 chr2 167350276 167350358 -14397729 + ORR1A3-int LTR MaLR 561 640 -1323 9 1861 297 0 0 0 chr2 167350358 167350396 -14397691 + MERVL-int LTR ERVL 5448 5485 0 9 1861 3765 7 136 0 chr2 167350396 167350830 -14397257 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 9 1861 3212 49 156 0 chr2 167351370 167351781 -14396306 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 475 0 9 1861 230 330 0 104 chr2 167371660 167371678 -14376409 + MT2B LTR ERVL 151 253 -348 1 1861 1738 177 27 24 chr2 167371775 167372105 -14375982 + MTD LTR MaLR 1 331 -88 1 1861 533 265 105 7 chr2 167374983 167375135 -14372952 + MTD LTR MaLR 99 265 -154 1 1862 340 274 0 121 chr2 167379795 167379832 -14368255 + MT2B LTR ERVL 134 153 -448 1 1862 231 326 58 0 chr2 167385610 167385696 -14362391 - MLT1A1 LTR MaLR -2 406 316 1 1862 230 320 150 0 chr2 167390895 167390995 -14357092 + MLT1K LTR MaLR 88 202 -393 1 1862 410 181 39 87 chr2 167393469 167393572 -14354515 + MTD LTR MaLR 1 98 -321 1 1862 1137 211 18 40 chr2 167393705 167393982 -14354105 + MTD LTR MaLR 149 419 0 1 1862 226 322 11 33 chr2 167413316 167413406 -14334681 + MT2B LTR ERVL 154 241 -360 1 1862 226 216 70 120 chr2 167414410 167414510 -14333577 - RLTR13B2 LTR ERVK -283 539 445 1 1862 262 313 191 34 chr2 167425003 167425238 -14322849 + MLT1C LTR MaLR 10 281 -186 1 1862 494 196 266 12 chr2 167426808 167426979 -14321108 - MTD LTR MaLR -15 406 208 1 1862 970 218 0 5 chr2 167427629 167427823 -14320264 - MTD LTR MaLR -209 210 18 1 1862 1283 209 175 3 chr2 167461419 167461816 -14286271 - RMER4B LTR ERVK -64 521 25 1 1862 436 168 93 107 chr2 167462122 167462262 -14285825 + MT2B LTR ERVL 152 289 -312 1 1862 286 45 0 0 chr2 167462292 167462336 -14285751 + RLTR17 LTR ERVK 1 44 -648 1 1862 2462 164 199 11 chr2 167462550 167462673 -14285414 + RLTR17 LTR ERVK 41 166 -526 1 1862 2462 164 199 11 chr2 167462798 167463221 -14284866 + RLTR17 LTR ERVK 167 689 -3 1 1862 274 273 111 58 chr2 167464644 167464815 -14283272 - MTEa LTR MaLR -199 180 1 1 1862 1237 258 63 63 chr2 167488677 167489166 -14258921 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 390 878 -1448 1 1862 242 350 25 8 chr2 167489166 167489284 -14258803 + RMER4A LTR ERVK 261 380 -86 1 1862 1063 156 80 26 chr2 167489284 167489552 -14258535 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 1000 1266 -1060 1 1862 3739 237 54 12 chr2 167490084 167491068 -14257019 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 1301 2325 -1 1 1862 1509 148 53 7 chr2 167491071 167491371 -14256716 + RLTR15 LTR ERVK 3 316 -43 1 1862 524 163 354 0 chr2 167491873 167492020 -14256067 - MTD LTR MaLR 0 419 221 1 1862 356 229 138 0 chr2 167492074 167492183 -14255904 - MTD-int LTR MaLR -4 1254 1131 1 1862 259 272 42 32 chr2 167492261 167492356 -14255731 + RLTR25B LTR ERVK 412 507 -521 1 1862 2178 256 127 75 chr2 167492446 167492488 -14255599 - MTD-int LTR MaLR -171 1087 1045 1 1862 2178 256 127 75 chr2 167492671 167493228 -14254859 - MTD-int LTR MaLR -214 1044 482 1 1862 2178 260 129 72 chr2 167493401 167493829 -14254258 - MTD-int LTR MaLR -777 481 2 1 1862 498 224 32 8 chr2 167493833 167493959 -14254128 - MTD LTR MaLR -16 403 275 1 1862 1529 207 121 16 chr2 167495926 167496299 -14251788 + MTD LTR MaLR 8 419 0 1 1862 719 57 0 0 chr2 167499886 167499992 -14248095 + ORR1A4 LTR MaLR 1 106 -223 1 1862 1160 97 102 0 chr2 167500000 167500186 -14247901 + ORR1A2 LTR MaLR 115 319 -8 1 1862 1294 215 71 10 chr2 167501593 167501903 -14246184 + MTE2a LTR MaLR 19 347 -32 4 1862 813 291 138 23 chr2 167506485 167506869 -14241218 - RLTR12B LTR ERVK -25 503 76 2 1862 2597 77 0 12 chr2 167508552 167508880 -14239207 + ORR1A2 LTR MaLR 1 324 -3 3 1863 542 358 128 76 chr2 167520853 167521298 -14226789 + MLT1J LTR MaLR 38 505 -7 5 1863 247 226 98 161 chr2 167537030 167537174 -14210913 + ORR1A3 LTR MaLR 136 273 -53 1 1863 247 226 98 161 chr2 167537342 167537371 -14210716 + ORR1A3 LTR MaLR 274 298 -28 1 1863 1341 246 101 16 chr2 167616261 167616629 -14131458 + MTD LTR MaLR 5 403 -16 2 1863 703 252 50 138 chr2 167619336 167619699 -14128388 + MTEa LTR MaLR 1 331 -48 2 1863 305 233 18 97 chr2 167620040 167620154 -14127933 + MT2B2 LTR ERVL 167 271 -313 2 1863 229 359 83 30 chr2 167622287 167622419 -14125668 + MLT2C2 LTR ERVL 150 288 -176 2 1863 441 263 121 25 chr2 167625586 167625785 -14122302 - MLT1J1 LTR MaLR -163 281 64 2 1863 1921 91 144 20 chr2 167634957 167635304 -14112783 - RMER15 LTR ERVL -182 393 4 2 1863 436 211 10 69 chr2 167636367 167636469 -14111618 - MT2B LTR ERVL -362 239 144 3 1864 377 333 34 34 chr2 167642885 167643034 -14105053 - MLT1K LTR MaLR 0 595 447 3 1864 433 294 32 50 chr2 167647572 167647919 -14100168 - MTD LTR MaLR -30 389 1 3 1864 309 344 149 37 chr2 167649638 167650075 -14098012 - MLT1L LTR MaLR -113 497 12 3 1864 233 278 122 10 chr2 167651088 167651186 -14096901 - MLT1J LTR MaLR -158 354 246 3 1864 738 122 20 28 chr2 167660819 167660966 -14087121 + ORR1D1 LTR MaLR 3 141 -253 3 1864 468 201 204 30 chr2 167660964 167661184 -14086903 + ORR1D1 LTR MaLR 41 290 -84 3 1864 824 202 81 0 chr2 167661221 167661394 -14086693 + ORR1D1-int LTR MaLR 1 187 -1183 3 1864 259 95 119 0 chr2 167661406 167661448 -14086639 + ORR1D1-int LTR MaLR 263 309 -1061 3 1864 286 173 58 0 chr2 167661494 167661546 -14086541 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 324 3 1864 266 77 0 0 chr2 167661574 167661613 -14086474 - ORR1B1 LTR MaLR -355 39 1 3 1864 629 269 121 0 chr2 167680210 167680392 -14067695 + MLT1J LTR MaLR 101 304 -208 3 1864 2406 163 184 26 chr2 167680964 167681469 -14066618 - RMER4B LTR ERVK 0 585 1 3 1864 302 279 67 9 chr2 167682423 167682528 -14065559 - MLT1N2 LTR MaLR -372 190 80 3 1864 2286 91 0 0 chr2 167683197 167683516 -14064571 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 4 1864 1836 142 67 23 chr2 167690075 167690420 -14057667 + MTD LTR MaLR 60 419 0 4 1864 474 206 78 78 chr2 167703932 167704111 -14043976 - MLT1L LTR MaLR -224 386 208 4 1864 1154 280 55 103 chr2 167706456 167706930 -14041157 - MTC-int LTR MaLR -88 1170 720 4 1864 2768 132 109 19 chr2 167706923 167707446 -14040641 + RMER15 LTR ERVL 6 575 0 4 1864 2495 228 80 35 chr2 167707450 167708142 -14039945 - MTC-int LTR MaLR -530 728 6 4 1864 1627 214 82 8 chr2 167708144 167708534 -14039553 - MTC LTR MaLR 0 421 3 4 1864 289 309 0 37 chr2 167715685 167715798 -14032289 + MLT1A0 LTR MaLR 259 400 -8 4 1864 229 295 14 0 chr2 167723051 167723138 -14024949 + MLT1J LTR MaLR 52 178 -334 5 1864 381 299 98 34 chr2 167724104 167724264 -14023823 - MTD LTR MaLR -8 371 179 5 1864 432 293 20 73 chr2 167724309 167724461 -14023626 - MTD LTR MaLR -201 178 18 5 1864 300 380 8 15 chr2 167730261 167730392 -14017695 - MLT1K LTR MaLR -329 266 137 5 1864 3329 46 5 0 chr2 167732482 167732876 -14015211 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 1864 834 291 68 28 chr2 167733763 167734104 -14013983 + MTE2a LTR MaLR 6 360 -59 5 1864 1293 213 96 24 chr2 167736043 167736189 -14011898 + MTD LTR MaLR 59 203 -216 5 1864 1293 213 96 24 chr2 167736412 167736597 -14011490 + MTD LTR MaLR 204 414 -5 5 1864 4838 104 32 38 chr2 167737736 167738494 -14009593 + RMER6A LTR ERVK 4 756 0 5 1864 910 256 161 8 chr2 167738739 167739100 -14008987 - MTD LTR MaLR 0 421 2 5 1864 3347 38 10 0 chr2 167739300 167739692 -14008395 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 1864 9225 45 4 1 chr2 167739692 167740787 -14007300 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 5 1864 3149 35 53 0 chr2 167740787 167741163 -14006924 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 1864 242 362 59 51 chr2 167744226 167744462 -14003625 - LTR16C LTR ERVL -165 324 87 5 1864 283 243 112 25 chr2 167747755 167747876 -14000211 - MLT1J LTR MaLR -282 162 54 5 1864 1502 72 10 5 chr2 167749177 167749385 -13998702 + MTB LTR MaLR 192 400 0 5 1864 440 291 62 71 chr2 167749553 167749850 -13998237 + ORR1E LTR MaLR 3 296 -74 5 1864 259 227 13 39 chr2 167750056 167750134 -13997953 + ORR1E LTR MaLR 304 379 0 5 1864 610 298 47 47 chr2 167751548 167751784 -13996303 + MLT1K LTR MaLR 324 559 -36 5 1864 286 259 89 89 chr2 167754583 167754829 -13993258 + MLT1C LTR MaLR 66 311 -156 5 1864 308 278 51 77 chr2 167760256 167760373 -13987714 - MT2B2 LTR ERVL -328 256 143 6 1865 926 287 159 12 chr2 167820739 167821060 -13927027 + MTEa LTR MaLR 1 368 -11 6 1865 397 209 8 103 chr2 167824543 167824660 -13923427 - MT2B LTR ERVL -337 264 159 7 1865 674 257 54 85 chr2 167826228 167826581 -13921506 + RLTR15 LTR ERVK 1 342 -17 7 1865 275 295 0 13 chr2 167827028 167827107 -13920980 + MTD LTR MaLR 86 163 -216 7 1865 425 245 20 0 chr2 167827089 167827187 -13920900 + MTD LTR MaLR 320 419 0 7 1865 3288 67 27 0 chr2 167846448 167846897 -13901190 - MT2B2 LTR ERVL -2 582 122 7 1865 709 296 67 96 chr2 167853172 167853590 -13894497 - MTD LTR MaLR -13 406 1 7 1865 741 294 57 83 chr2 167859686 167859897 -13888190 + MTE2b LTR MaLR 1 210 -169 8 1865 741 280 203 34 chr2 167860226 167860374 -13887713 + MTE2b LTR MaLR 186 358 -1 8 1865 386 297 83 13 chr2 167860411 167860568 -13887519 + MLT1F2 LTR MaLR 384 551 -9 8 1865 1356 232 28 12 chr2 167861766 167862093 -13885994 - ORR1D1 LTR MaLR -39 335 4 8 1865 234 377 27 20 chr2 167865005 167865154 -13882933 + MLT1D LTR MaLR 356 505 0 8 1865 311 238 14 137 chr2 167890258 167890404 -13857683 + MT2B LTR ERVL 138 265 -336 9 1865 244 186 0 0 chr2 167894851 167894894 -13853193 - MTD LTR MaLR -3 416 374 9 1865 255 253 20 69 chr2 167894887 167894989 -13853098 + MT2B LTR ERVL 168 264 -337 9 1865 1532 208 54 14 chr2 167895049 167895400 -13852687 - MTD LTR MaLR -34 385 21 9 1865 527 332 84 26 chr2 167895905 167896214 -13851873 + MLT1C LTR MaLR 110 436 -31 9 1865 362 218 8 83 chr2 167897728 167897848 -13850239 + MT2B LTR ERVL 147 257 -344 9 1865 1952 143 93 36 chr2 167900014 167900399 -13847688 + MTC LTR MaLR 14 420 -1 9 1866 352 265 39 58 chr2 167909646 167909750 -13838337 - MT2B LTR ERVL -343 258 157 1 1866 1768 148 59 0 chr2 167934481 167934785 -13813302 - ORR1C1 LTR MaLR -42 336 15 1 1866 359 57 19 0 chr2 167935629 167935682 -13812405 + ORR1B2 LTR MaLR 314 367 0 1 1866 288 326 67 74 chr2 167937260 167937558 -13810529 - MLT1E1 LTR MaLR -177 477 182 1 1866 259 311 88 24 chr2 167938923 167939048 -13809039 - RMER15 LTR ERVL -1 574 442 1 1866 982 221 121 23 chr2 167939111 167939417 -13808670 - ORR1E LTR MaLR 0 359 24 1 1866 1868 164 8 69 chr2 167946502 167946881 -13801206 + ORR1B2 LTR MaLR 4 359 -8 1 1866 1407 193 76 10 chr2 167947656 167947970 -13800117 - ORR1C2 LTR MaLR -49 335 1 1 1866 2825 66 141 141 chr2 167948345 167948857 -13799230 + RLTR1B LTR ERV1 1 512 0 1 1866 2086 218 31 48 chr2 167960453 167960994 -13787093 + RMER19C LTR ERVK 80 611 0 1 1866 474 277 20 33 chr2 167963220 167963373 -13784714 + RLTR11A2 LTR ERVK 5 155 -372 1 1866 243 317 98 16 chr2 167964025 167964147 -13783940 - MLT1F2 LTR MaLR -174 386 255 1 1866 2303 73 0 168 chr2 167965102 167965437 -13782650 + ORR1A2 LTR MaLR 1 284 -43 1 1866 2303 73 0 168 chr2 167965629 167965686 -13782401 + ORR1A2 LTR MaLR 285 327 0 1 1866 1494 232 129 5 chr2 167967831 167968204 -13779883 + MTD LTR MaLR 1 419 0 1 1866 378 226 55 94 chr2 167971551 167971678 -13776409 - MT2B LTR ERVL -337 264 143 1 1866 417 163 0 148 chr2 167971787 167971902 -13776185 + MT2B LTR ERVL 167 264 -337 1 1866 1745 235 19 27 chr2 167976533 167976944 -13771143 - MTD LTR MaLR -10 409 2 1 1866 1962 132 16 93 chr2 167990870 167991255 -13756832 - RLTR41 LTR ERV1 -91 355 1 1 1866 2270 140 70 18 chr2 167991510 167991909 -13756178 - MTC LTR MaLR 0 421 2 1 1866 1785 152 39 35 chr2 167999365 167999759 -13748328 - MTC LTR MaLR 0 421 18 1 1866 1488 209 130 8 chr2 168000690 168001075 -13747012 - RMER15 LTR ERVL 0 575 144 7 1866 262 197 149 40 chr2 168001906 168001980 -13746107 - MT2B LTR ERVL -357 244 163 1 1866 1801 175 136 5 chr2 168021115 168021505 -13726582 - BGLII_A LTR ERVK 0 445 5 4 1866 336 288 85 59 chr2 168023311 168023429 -13724658 - MT2B LTR ERVL -326 275 155 5 1867 627 273 50 40 chr2 168039931 168040148 -13707939 + ORR1D1 LTR MaLR 155 384 0 7 1867 541 285 157 49 chr2 168040363 168040766 -13707321 + RLTR12B LTR ERVK 3 485 -43 7 1867 241 311 51 38 chr2 168048333 168048490 -13699597 + LTR33A LTR ERVL 362 520 0 1 1867 2867 119 132 10 chr2 168049772 168050452 -13697635 + ORR1B1-int LTR MaLR 788 1771 -192 1 1867 1828 143 41 9 chr2 168050436 168050753 -13697334 + ORR1B1 LTR MaLR 60 386 -8 1 1867 2056 126 98 0 chr2 168061416 168061764 -13686323 + RMER19A LTR ERVK 1 382 -355 1 1867 640 106 129 26 chr2 168061751 168061867 -13686220 + RMER19A LTR ERVK 592 719 -18 1 1867 4524 26 2 25 chr2 168063214 168063812 -13684275 + RLTR6_Mm LTR ERV1 1 584 -70 1 1867 915 212 72 31 chr2 168066096 168066353 -13681734 - RMER12B LTR ERVK -136 1436 1254 1 1867 4452 179 20 28 chr2 168066452 168067473 -13680614 - RMER12B LTR ERVK -319 1253 411 1 1867 1824 128 54 6 chr2 168067939 168068254 -13679833 - RMER12B LTR ERVK -937 467 138 1 1867 362 237 126 8 chr2 168068366 168068485 -13679602 - ORR1E LTR MaLR -60 319 187 1 1867 445 230 38 44 chr2 168068867 168069026 -13679061 - ORR1E LTR MaLR -201 158 1 1 1867 553 316 17 0 chr2 168071662 168071839 -13676248 + MTE2b LTR MaLR 194 373 -6 1 1867 277 262 217 58 chr2 168071935 168072073 -13676014 - MER74A LTR ERVL -153 405 246 1 1867 348 280 160 26 chr2 168072179 168072410 -13675677 - MER74A LTR ERVL -277 281 20 1 1867 2437 137 71 8 chr2 168072584 168072980 -13675107 + MTC LTR MaLR 1 421 0 1 1867 230 302 32 65 chr2 168073428 168073552 -13674535 - RMER16 LTR ERVK -28 505 386 1 1867 2041 137 23 20 chr2 168076089 168076439 -13671648 - MTC LTR MaLR -1 420 70 1 1867 414 130 14 0 chr2 168076604 168076673 -13671414 - MTC LTR MaLR -351 70 1 1 1867 263 361 43 100 chr2 168077584 168077975 -13670112 - MLT1A1 LTR MaLR -12 396 28 1 1867 283 339 149 4 chr2 168082640 168082921 -13665166 - MER74A LTR ERVL -103 455 134 1 1867 390 350 24 107 chr2 168085572 168085863 -13662224 - ORR1E LTR MaLR -4 355 89 1 1867 368 261 60 30 chr2 168097972 168098106 -13649981 + RMER5 LTR ERV1 52 189 -345 2 1867 446 272 119 27 chr2 168098141 168098326 -13649761 + RMER5 LTR ERV1 328 529 -5 2 1867 235 254 0 43 chr2 168103075 168103145 -13644942 + MLT1D LTR MaLR 276 342 -163 2 1867 5603 140 25 52 chr2 168110565 168111492 -13636595 - RMER19B LTR ERVK 0 902 1 2 1867 1921 35 39 0 chr2 168115600 168115856 -13632231 + MTA_Mm LTR MaLR 131 396 0 2 1867 2029 117 6 61 chr2 168115936 168116281 -13631806 + ORR1A3 LTR MaLR 1 326 0 2 1867 1116 230 142 6 chr2 168116862 168117173 -13630914 - ORR1E LTR MaLR -2 357 5 2 1867 350 310 50 86 chr2 168120791 168121013 -13627074 + RMER2 LTR ERV1 327 540 -27 2 1867 228 228 46 0 chr2 168122893 168122967 -13625120 - MTEa LTR MaLR -15 364 288 2 1867 787 174 86 6 chr2 168123466 168123628 -13624459 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 210 2 1867 371 210 0 0 chr2 168123654 168123739 -13624348 - ORR1C2 LTR MaLR -309 85 1 2 1867 1290 234 77 59 chr2 168123778 168124206 -13623881 + MTD LTR MaLR 1 419 0 2 1867 775 260 147 0 chr2 168126629 168126879 -13621208 - MTEa LTR MaLR -83 296 10 2 1867 731 308 69 64 chr2 168127104 168127524 -13620563 + MT2A LTR ERVL 1 422 -111 3 1867 459 314 8 16 chr2 168128842 168128968 -13619119 + MTEb LTR MaLR 255 379 0 3 1867 271 247 0 82 chr2 168136508 168136605 -13611482 - RLTR25B LTR ERVK -489 539 451 3 1867 241 241 323 44 chr2 168141757 168141983 -13606104 + RMER15 LTR ERVL 275 563 -12 3 1867 266 211 126 63 chr2 168150168 168150279 -13597808 - MLT1K LTR MaLR -22 573 456 3 1867 985 279 43 32 chr2 168150417 168150791 -13597296 + MTE2a LTR MaLR 2 379 0 3 1867 476 309 121 25 chr2 168150827 168151109 -13596978 - ORR1E LTR MaLR -40 319 11 3 1867 503 257 80 71 chr2 168159692 168159918 -13588169 + RMER5 LTR ERV1 1 228 -306 3 1867 892 275 66 23 chr2 168160207 168160512 -13587575 + RMER5 LTR ERV1 217 534 0 3 1868 293 328 127 5 chr2 168167300 168167439 -13580648 - RMER15 LTR ERVL -34 541 387 4 1868 2987 70 5 2 chr2 168167439 168167838 -13580249 - MTB LTR MaLR 0 400 1 4 1868 293 328 127 5 chr2 168167838 168167903 -13580184 - RMER15 LTR ERVL -189 386 313 4 1868 2054 170 65 0 chr2 168172967 168173337 -13574750 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 4 1868 2031 71 78 0 chr2 168174088 168174382 -13573705 - ORR1A2 LTR MaLR -10 317 1 4 1868 1652 171 112 25 chr2 168174731 168175133 -13572954 - RMER20A LTR ERVK -7 509 73 4 1868 2255 145 52 2 chr2 168176361 168176762 -13571325 + MTC LTR MaLR 1 421 0 4 1868 271 252 6 128 chr2 168177449 168177605 -13570482 + RMER10A LTR ERVL 110 263 -179 4 1868 808 308 76 32 chr2 168181401 168181743 -13566344 + ORR1E LTR MaLR 3 359 0 4 1868 2372 63 0 0 chr2 168182966 168183281 -13564806 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 5 4 1868 787 271 91 18 chr2 168184681 168184966 -13563121 + ORR1E LTR MaLR 14 319 -40 4 1868 491 253 32 26 chr2 168185480 168185634 -13562453 + MTEa LTR MaLR 224 378 -1 4 1868 2635 80 152 5 chr2 168188594 168189022 -13559065 - MT2B2 LTR ERVL 0 584 94 4 1868 306 293 52 47 chr2 168193960 168194132 -13553955 + ORR1E LTR MaLR 1 173 -186 4 1868 1805 151 74 22 chr2 168195534 168195899 -13552188 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 4 1868 3227 82 44 65 chr2 168199305 168199828 -13548259 + RLTR1B LTR ERV1 1 512 0 4 1868 3075 46 2 12 chr2 168201071 168201471 -13546616 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 1868 1311 162 71 60 chr2 168203289 168203571 -13544516 - MT2B LTR ERVL -314 287 3 5 1868 3784 163 35 58 chr2 168203571 168204173 -13543914 - ORR1A4-int LTR MaLR -1379 584 1 5 1868 1850 122 24 27 chr2 168204173 168204503 -13543584 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 5 1868 324 319 104 57 chr2 168206563 168206746 -13541341 - MLT1J LTR MaLR -30 482 291 5 1868 2158 168 12 40 chr2 168206746 168207169 -13540918 - MTD LTR MaLR 0 419 9 5 1868 438 301 61 14 chr2 168207249 168207397 -13540690 - MLT1J LTR MaLR -313 199 45 5 1868 232 302 82 47 chr2 168207861 168208094 -13539993 + RLTR21 LTR ERVK 1066 1306 -266 5 1868 821 193 45 149 chr2 168213277 168213545 -13534542 - ORR1D2 LTR MaLR -4 366 127 5 1868 1712 157 62 39 chr2 168213552 168213890 -13534197 + ORR1B1 LTR MaLR 41 386 -8 5 1868 655 196 22 7 chr2 168213883 168214022 -13534065 - ORR1D2 LTR MaLR -229 141 1 5 1868 2663 58 3 11 chr2 168216768 168217117 -13530970 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 5 1868 596 82 24 0 chr2 168217591 168217676 -13530411 + RLTR23 LTR ERV1 1 87 -343 5 1868 1947 138 3 78 chr2 168217836 168218221 -13529866 + RLTR23 LTR ERV1 75 430 0 5 1868 1497 214 64 38 chr2 168222082 168222587 -13525500 - RMER20A LTR ERVK -122 505 1 5 1868 2206 168 27 10 chr2 168223589 168223993 -13524094 - MT2A LTR ERVL -122 411 1 5 1868 677 220 51 23 chr2 168225653 168225830 -13522257 + MTE2b LTR MaLR 6 187 -192 5 1868 1735 187 107 31 chr2 168227000 168227391 -13520696 + MTC LTR MaLR 1 421 0 5 1868 5498 136 18 19 chr2 168230511 168231366 -13516721 - RMER13A LTR ERVK -4 856 3 5 1868 3583 135 32 39 chr2 168231769 168232415 -13515672 - RLTR26 LTR ERVK 0 642 1 5 1868 1325 66 6 0 chr2 168233103 168233284 -13514803 + ORR1A2 LTR MaLR 123 304 -23 5 1868 235 276 80 11 chr2 168234236 168234324 -13513763 - MTEa LTR MaLR 0 379 286 5 1868 3017 62 54 0 chr2 168234478 168234868 -13513219 + RLTR10A LTR ERVK 1 411 0 5 1868 288 304 118 0 chr2 168235155 168235290 -13512797 - MTEa LTR MaLR -191 188 38 5 1868 260 294 108 81 chr2 168235334 168235519 -13512568 - LTR37B LTR ERV1 -82 386 197 5 1868 991 197 151 55 chr2 168239354 168239666 -13508421 + MTEa LTR MaLR 31 372 -7 5 1868 1982 161 115 8 chr2 168242374 168242730 -13505357 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 5 1868 1467 165 6 95 chr2 168245129 168245478 -13502609 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 2 5 1868 537 204 32 7 chr2 168245490 168245623 -13502464 + ORR1A2 LTR MaLR 131 289 -105 5 1868 1295 159 40 16 chr2 168245563 168245812 -13502275 - ORR1C2 LTR MaLR -129 255 1 5 1868 2751 123 58 22 chr2 168246756 168246921 -13501166 + RMER20A LTR ERVK 1 165 -351 6 1868 3287 55 5 8 chr2 168246921 168247322 -13500765 - MTB LTR MaLR 0 400 1 6 1868 2751 123 58 22 chr2 168247322 168247654 -13500433 + RMER20A LTR ERVK 166 516 0 6 1868 1623 175 85 32 chr2 168251080 168251469 -13496618 + RMER16 LTR ERVK 1 533 0 6 1868 413 200 3 96 chr2 168252870 168253067 -13495020 - ORR1D1 LTR MaLR -149 245 41 6 1868 547 122 23 43 chr2 168253045 168253162 -13494925 - ORR1D1 LTR MaLR -245 129 1 6 1868 470 289 55 64 chr2 168254439 168254657 -13493430 - ORR1E LTR MaLR -143 216 1 6 1868 1160 269 54 40 chr2 168255075 168255427 -13492660 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 14 6 1868 434 191 31 21 chr2 168255447 168255543 -13492544 + MTEb LTR MaLR 279 375 -4 6 1868 3260 114 110 2 chr2 168257252 168257789 -13490298 - MT2B LTR ERVL -6 595 1 6 1868 264 303 13 0 chr2 168258280 168258356 -13489731 - MLT1J LTR MaLR -182 330 254 6 1868 2743 55 3 0 chr2 168260580 168260905 -13487182 + ORR1A2 LTR MaLR 2 327 0 6 1868 616 311 60 51 chr2 168263497 168263829 -13484258 - MTEa LTR MaLR -36 343 9 6 1868 1767 187 110 0 chr2 168265734 168266071 -13482016 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 6 1868 1802 129 59 92 chr2 168267704 168268062 -13480025 + ORR1B1 LTR MaLR 41 386 -8 6 1868 312 251 27 42 chr2 168268824 168268934 -13479153 + ORR1C2 LTR MaLR 91 202 -172 6 1868 2605 83 3 0 chr2 168275420 168275746 -13472341 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 6 1868 248 289 61 10 chr2 168278251 168278349 -13469738 - MLT2F LTR ERVL -554 109 7 6 1868 497 340 59 4 chr2 168279715 168279951 -13468136 + MLT1F LTR MaLR 300 548 0 6 1868 294 323 31 24 chr2 168281910 168282037 -13466050 - RMER15 LTR ERVL -101 474 347 6 1868 321 303 145 45 chr2 168282419 168282661 -13465426 + MLT1J LTR MaLR 45 310 -202 6 1868 229 368 131 30 chr2 168282949 168283277 -13464810 + MLT1J LTR MaLR 294 654 0 6 1869 2556 66 6 0 chr2 168297223 168297572 -13450515 - MTB LTR MaLR 0 400 50 6 1869 285 309 269 17 chr2 168297694 168298043 -13450044 + MLT1D LTR MaLR 21 457 -48 7 1869 277 318 12 0 chr2 168317536 168317621 -13430466 + MER34-int LTR ERV1 5666 5751 -2456 7 1869 1038 251 74 56 chr2 168330957 168331295 -13416792 + MTEa LTR MaLR 31 374 -5 7 1869 826 265 68 116 chr2 168346048 168346402 -13401685 - MTE2a LTR MaLR -42 337 1 7 1869 603 231 33 0 chr2 168347175 168347296 -13400791 + MTE2b LTR MaLR 2 126 -253 7 1869 443 313 30 7 chr2 168347296 168347310 -13400777 + MT2A LTR ERVL 2 139 -394 7 1869 439 279 185 6 chr2 168347312 168347485 -13400602 + MTE2b LTR MaLR 174 377 -2 7 1869 662 300 43 58 chr2 168364439 168364602 -13383485 + MTD LTR MaLR 49 220 -199 7 1869 662 300 43 58 chr2 168364625 168364737 -13383350 + MTD LTR MaLR 221 320 -99 7 1869 987 265 38 132 chr2 168373061 168373508 -13374579 - MTD LTR MaLR -14 405 1 8 1869 363 332 65 83 chr2 168376698 168376928 -13371159 + MLT1J LTR MaLR 86 311 -201 8 1869 1258 202 109 49 chr2 168384176 168384561 -13363526 + MTD LTR MaLR 12 419 0 8 1869 1093 249 217 0 chr2 168394846 168395155 -13352932 + MTE2b LTR MaLR 4 379 0 8 1869 520 231 24 13 chr2 168407335 168407475 -13340612 + MTD LTR MaLR 271 407 -14 8 1869 238 358 61 44 chr2 168417723 168417790 -13330297 + MLT1K LTR MaLR 12 75 -520 8 1869 238 358 61 44 chr2 168417857 168417970 -13330117 + MLT1K LTR MaLR 76 194 -401 8 1870 585 304 125 0 chr2 168435210 168435450 -13312637 + MLT1J LTR MaLR 206 475 -37 9 1870 245 255 61 10 chr2 168438039 168438138 -13309949 - MLT1F1 LTR MaLR -129 440 337 9 1870 368 331 105 39 chr2 168442757 168443015 -13305072 + MLT1K LTR MaLR 23 297 -298 9 1870 789 235 142 9 chr2 168445884 168446103 -13301984 - MTD LTR MaLR -166 253 6 9 1870 2011 111 11 26 chr2 168448428 168448806 -13299281 - RLTR10A LTR ERVK 0 359 1 9 1870 1945 180 60 19 chr2 168449500 168449869 -13298218 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 9 1870 1211 308 41 29 chr2 168449941 168450355 -13297732 - MTD LTR MaLR 0 419 1 9 1870 381 278 288 10 chr2 168484533 168484919 -13263168 + MLT1F2 LTR MaLR 68 560 0 1 1870 1142 191 199 147 chr2 168488485 168488555 -13259532 + MT2A LTR ERVL 5 81 -452 1 1870 1142 191 199 147 chr2 168488727 168489150 -13258937 + MT2A LTR ERVL 82 527 -6 1 1870 481 281 58 19 chr2 168490989 168491145 -13256942 + MLT1A0 LTR MaLR 172 333 -32 1 1870 339 336 31 8 chr2 168499818 168499947 -13248140 + MTD LTR MaLR 48 179 -240 1 1870 489 203 127 8 chr2 168500001 168500135 -13247952 + MTE2a LTR MaLR 216 365 -14 1 1870 1215 199 110 77 chr2 168511956 168512321 -13235766 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 2 3 1870 1578 154 186 21 chr2 168521452 168521790 -13226297 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 6 1870 2128 205 84 34 chr2 168524349 168524788 -13223299 + RLTR20B1 LTR ERVK 1 456 -107 7 1870 2128 205 84 34 chr2 168524830 168524926 -13223161 + RLTR20B1 LTR ERVK 457 562 -1 7 1870 536 287 88 61 chr2 168524998 168525327 -13222760 + ORR1E LTR MaLR 5 366 -4 7 1870 1374 207 119 29 chr2 168526090 168526433 -13221654 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 7 1870 270 323 0 86 chr2 168527264 168527403 -13220684 + RMER15 LTR ERVL 336 462 -113 8 1870 2228 56 16 173 chr2 168530797 168531130 -13216957 + ORR1A2 LTR MaLR 1 286 -41 9 1870 2228 56 16 173 chr2 168531323 168531377 -13216710 + ORR1A2 LTR MaLR 287 327 0 9 1870 226 254 14 69 chr2 168532684 168532756 -13215331 - MT2B2 LTR ERVL -320 264 197 1 1870 1754 187 185 136 chr2 168534257 168535095 -13212992 + RMER19B LTR ERVK 1 883 -19 1 1870 1754 148 34 72 chr2 168535293 168535309 -13212778 + RMER19B LTR ERVK 884 895 -7 1 1870 940 269 89 37 chr2 168536883 168537207 -13210880 + MTEb LTR MaLR 39 379 0 1 1870 299 279 14 119 chr2 168539741 168539896 -13208191 + MTEa LTR MaLR 194 326 -53 1 1870 4055 23 0 4 chr2 168541395 168541882 -13206205 + MERVL-int LTR ERVL 1398 1882 -3603 1 1870 296 295 49 0 chr2 168542248 168542370 -13205717 - RMER15 LTR ERVL -43 532 405 1 1870 2216 184 95 34 chr2 168542968 168543261 -13204826 + RLTR20B1 LTR ERVK 4 333 -230 1 1870 3167 63 2 10 chr2 168543261 168543660 -13204427 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 1870 2216 184 95 34 chr2 168543660 168543785 -13204302 + RLTR20B1 LTR ERVK 334 458 -105 1 1870 2216 184 95 34 chr2 168543806 168543914 -13204173 + RLTR20B1 LTR ERVK 459 563 0 1 1870 2087 141 30 80 chr2 168547701 168547785 -13200302 - ORR1A2 LTR MaLR 0 346 289 1 1870 2087 141 30 80 chr2 168547904 168548182 -13199905 - ORR1A2 LTR MaLR -58 288 2 1 1870 12104 114 31 55 chr2 168548183 168550194 -13197893 - ORR1A2-int LTR MaLR 0 1963 1 1 1870 2413 86 32 3 chr2 168550194 168550510 -13197577 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 3 1 1870 2921 102 72 9 chr2 168550807 168551254 -13196833 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 1 1870 225 330 21 31 chr2 168555202 168555299 -13192788 + RLTR25A LTR ERVK 522 617 -486 1 1871 237 160 19 57 chr2 168560985 168561038 -13187049 - ORR1D2 LTR MaLR -17 353 303 1 1871 1292 146 272 15 chr2 168561167 168561502 -13186585 - MTC LTR MaLR 0 421 1 2 1871 2859 72 14 31 chr2 168562138 168562334 -13185753 + MTB_Mm LTR MaLR 1 195 -212 2 1871 2859 72 14 31 chr2 168562519 168562736 -13185351 + MTB_Mm LTR MaLR 196 407 0 2 1871 460 286 211 0 chr2 168603718 168603917 -13144170 + MTE2b LTR MaLR 51 291 -88 3 1871 242 245 67 67 chr2 168607360 168607465 -13140622 - MT2B LTR ERVL -346 255 151 3 1871 435 248 20 107 chr2 168611610 168611759 -13136328 - MT2B LTR ERVL -337 264 129 3 1871 256 231 76 13 chr2 168617918 168617997 -13130090 - MTE2a LTR MaLR 0 379 296 4 1871 336 235 8 136 chr2 168620323 168620441 -13127646 - MT2B LTR ERVL -345 256 154 4 1871 237 327 48 89 chr2 168625139 168625307 -13122780 + MT2B LTR ERVL 98 258 -343 4 1871 353 304 91 35 chr2 168641045 168641188 -13106899 + ORR1E LTR MaLR 40 190 -169 5 1871 555 295 45 11 chr2 168646063 168646241 -13101846 - MLT1F1 LTR MaLR -2 567 384 5 1871 252 200 0 140 chr2 168646552 168646645 -13101442 - RLTR25A LTR ERVK -502 601 522 5 1871 336 252 76 35 chr2 168652849 168652993 -13095094 - RMER15 LTR ERVL -90 485 336 5 1871 3267 62 2 5 chr2 168653032 168653440 -13094647 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 5 1871 284 235 42 136 chr2 168655982 168656100 -13091987 + MLT1E2 LTR MaLR 36 142 -485 5 1871 239 236 136 111 chr2 168668246 168668292 -13079795 - MTEa LTR MaLR -6 373 328 6 1871 239 236 136 111 chr2 168668365 168668480 -13079607 - MTEa LTR MaLR -52 327 208 6 1871 360 295 85 0 chr2 168677620 168677749 -13070338 + ORR1D2 LTR MaLR 144 283 -87 6 1871 574 163 54 110 chr2 168678107 168678279 -13069808 + ORR1D2 LTR MaLR 206 379 0 6 1871 479 269 69 152 chr2 168682022 168682385 -13065702 - RMER17C LTR ERVK -77 333 1 6 1871 1105 120 17 48 chr2 168682581 168682853 -13065234 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 6 1872 1224 187 240 18 chr2 168691024 168691362 -13056725 - MTD LTR MaLR -5 414 2 7 1872 945 167 42 99 chr2 168691977 168692239 -13055848 - ORR1A2 LTR MaLR -132 262 1 7 1872 2801 134 0 41 chr2 168693329 168693795 -13054292 + RMER6B LTR ERVK 15 461 0 7 1872 1113 198 142 39 chr2 168695975 168696285 -13051802 - MTD LTR MaLR -76 343 2 7 1872 351 174 15 181 chr2 168703955 168704088 -13043999 - MT2B LTR ERVL -344 257 147 7 1872 413 254 88 58 chr2 168704590 168704733 -13043354 - MT2A LTR ERVL -30 524 344 7 1872 308 272 11 11 chr2 168704762 168704855 -13043232 - MT2A LTR ERVL -338 195 103 7 1872 316 152 70 81 chr2 168704923 168705009 -13043078 - RLTR25B LTR ERVK -519 509 425 7 1872 398 245 54 9 chr2 168704996 168705107 -13042980 - MT2A LTR ERVL -417 116 1 7 1872 1221 110 176 125 chr2 168715488 168715557 -13032530 - ORR1A4 LTR MaLR -1 328 283 8 1872 1221 110 176 125 chr2 168715702 168715944 -13032143 - ORR1A4 LTR MaLR -47 282 1 8 1872 230 265 43 152 chr2 168720850 168720988 -13027099 - RLTR25B LTR ERVK -508 520 398 8 1872 1218 212 69 7 chr2 168725605 168725881 -13022206 - MTE2a LTR MaLR -71 308 16 8 1872 3113 136 150 30 chr2 168726859 168727527 -13020560 - RMER6A LTR ERVK -8 748 1 8 1872 964 232 122 17 chr2 168728531 168728825 -13019262 + ORR1D2 LTR MaLR 46 370 0 8 1872 321 211 118 24 chr2 168730593 168730741 -13017346 + RLTR18 LTR ERVK 72 248 -264 8 1872 231 308 21 42 chr2 168735976 168736071 -13012016 + RLTR33 LTR ERVK 501 593 -85 8 1872 253 226 56 67 chr2 168740392 168740482 -13007605 + MT2B LTR ERVL 157 245 -356 8 1872 385 330 17 0 chr2 168746951 168747069 -13001018 + MLT1A0 LTR MaLR 245 364 -1 9 1872 997 231 161 18 chr2 168754526 168754861 -12993226 + MTD LTR MaLR 5 387 -32 9 1872 236 283 78 29 chr2 168761763 168761865 -12986222 + MLT1J LTR MaLR 392 498 -14 9 1872 3260 40 2 0 chr2 168762981 168763376 -12984711 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 9 1872 1864 129 29 20 chr2 168768703 168769052 -12979035 + RLTR15 LTR ERVK 1 352 -7 9 1872 707 231 95 82 chr2 168769689 168769920 -12978167 + MTC LTR MaLR 180 413 -8 9 1872 4849 174 107 53 chr2 168769923 168770834 -12977253 + MTC-int LTR MaLR 2 994 -264 9 1872 4849 174 107 53 chr2 168770981 168771180 -12976907 + MTC-int LTR MaLR 995 1162 -96 9 1872 4849 174 107 53 chr2 168771220 168771301 -12976786 + MTC-int LTR MaLR 1163 1257 -1 9 1872 1778 167 149 5 chr2 168771301 168771466 -12976621 + MTC LTR MaLR 1 189 -232 9 1872 1778 167 149 5 chr2 168771685 168771887 -12976200 + MTC LTR MaLR 190 421 0 9 1872 240 273 112 16 chr2 168777937 168778037 -12970050 + MTEa LTR MaLR 174 262 -117 1 1872 455 301 29 44 chr2 168781869 168782074 -12966013 - RodERV21-int LTR ERV1 -102 4889 4688 1 1872 1123 345 84 40 chr2 168782074 168783102 -12964985 - RodERV21-int LTR ERV1 -715 4276 3204 1 1872 400 302 75 85 chr2 168783158 168783481 -12964606 + MTEb LTR MaLR 29 377 -2 1 1872 266 382 108 70 chr2 168783926 168784185 -12963902 + LTR33A_ LTR ERVL 168 436 -95 1 1872 1135 126 104 10 chr2 168786377 168786578 -12961509 + ORR1B1 LTR MaLR 1 220 -174 1 1872 860 194 43 47 chr2 168786595 168786806 -12961281 + ORR1B1 LTR MaLR 172 381 -13 1 1872 1411 219 23 48 chr2 168787452 168787806 -12960281 + RMER10B LTR ERVL 4 348 -50 1 1872 269 306 27 9 chr2 168787919 168788031 -12960056 + RMER17C-int LTR ERVK 1133 1246 -1992 1 1872 655 140 60 0 chr2 168788273 168788373 -12959714 - RMER10B LTR ERVL -292 106 1 1 1872 533 268 92 18 chr2 168788397 168788625 -12959462 - RMER17C-int LTR ERVK -59 3179 2935 1 1872 279 178 66 123 chr2 168788732 168788744 -12959343 - RMER17C-int LTR ERVK -405 2833 2819 1 1872 279 178 66 123 chr2 168788892 168789001 -12959086 - RMER17C-int LTR ERVK -420 2818 2720 1 1872 342 206 0 0 chr2 168789099 168789172 -12958915 - MYSERV6-int LTR ERVK -177 8782 8710 1 1872 254 267 23 114 chr2 168789142 168789273 -12958814 - RLTR19-int LTR ERVK -2830 3307 3189 1 1872 4120 177 37 30 chr2 168789408 168790174 -12957913 - RLTR19-int LTR ERVK -2947 3190 2418 1 1872 4120 177 37 30 chr2 168790371 168790459 -12957628 - RLTR19-int LTR ERVK -3720 2417 2330 1 1872 565 182 45 65 chr2 168790447 168790666 -12957421 - RLTR19-int LTR ERVK -3810 2327 1895 1 1872 242 297 0 26 chr2 168791699 168791775 -12956312 - MLT1K LTR MaLR 0 595 522 1 1872 1439 132 109 147 chr2 168792747 168793094 -12954993 + RMER4B LTR ERVK 252 585 0 1 1872 255 200 0 0 chr2 168793431 168793476 -12954611 + MLT1D LTR MaLR 51 95 -410 1 1872 351 306 82 92 chr2 168793552 168793858 -12954229 + MLT1D LTR MaLR 95 397 -108 1 1872 404 306 26 77 chr2 168793986 168794142 -12953945 + MLT1D LTR MaLR 354 501 -4 1 1872 413 278 159 14 chr2 168798232 168798440 -12949647 - ORR1E LTR MaLR -120 239 2 1 1872 492 308 88 133 chr2 168798567 168798704 -12949383 - MTE2b LTR MaLR 0 379 226 1 1872 492 308 88 133 chr2 168798922 168799181 -12948906 - MTE2b LTR MaLR -154 225 1 1 1872 869 322 48 45 chr2 168799181 168799578 -12948509 + MLT1C LTR MaLR 69 466 -1 1 1872 284 319 33 16 chr2 168800274 168800395 -12947692 + MTD LTR MaLR 1 123 -296 1 1872 234 257 31 117 chr2 168800368 168800496 -12947591 - RLTR25B LTR ERVK -470 558 442 1 1872 1051 221 36 57 chr2 168800536 168800804 -12947283 + MTE2a LTR MaLR 78 339 -40 1 1872 4927 103 28 21 chr2 168802793 168803539 -12944548 + RMER17A LTR ERVK 1 751 0 1 1872 499 252 35 43 chr2 168806326 168806467 -12941620 + ORR1E LTR MaLR 1 140 -219 1 1872 342 369 77 27 chr2 168809474 168809694 -12938393 + ORR1E LTR MaLR 9 239 -120 1 1872 1829 121 68 12 chr2 168809977 168810320 -12937767 + ORR1A4 LTR MaLR 1 361 -13 1 1872 895 152 69 91 chr2 168811155 168811386 -12936701 - RMER15 LTR ERVL -323 252 27 1 1872 261 289 168 80 chr2 168811389 168811615 -12936472 - ORR1E LTR MaLR -3 356 111 1 1872 1673 199 63 16 chr2 168812837 168813204 -12934883 - MTD LTR MaLR -15 404 21 1 1872 1050 262 90 33 chr2 168813559 168813891 -12934196 + ORR1E LTR MaLR 9 359 0 1 1872 257 219 75 45 chr2 168813950 168814017 -12934070 + ORR1D2 LTR MaLR 1 69 -301 1 1872 2205 150 107 5 chr2 168819871 168820253 -12927834 + MTC LTR MaLR 1 421 0 1 1873 288 260 49 49 chr2 168821351 168821432 -12926655 + MLT1N2 LTR MaLR 71 151 -411 1 1873 959 248 10 0 chr2 168821776 168821978 -12926109 + RLTR16 LTR ERVK 1 204 -301 1 1873 2624 50 19 3 chr2 168822709 168823031 -12925056 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 1 1873 3028 211 78 96 chr2 168830292 168831240 -12916847 + RMER13A LTR ERVK 1 860 0 1 1873 1706 207 121 56 chr2 168831344 168831841 -12916246 + RLTR20B3 LTR ERVK 21 549 -28 1 1873 1024 235 179 40 chr2 168832304 168832601 -12915486 + ORR1D2 LTR MaLR 26 363 -11 1 1873 304 54 0 0 chr2 168840322 168840359 -12907728 + ORR1D1 LTR MaLR 1 37 -337 1 1873 1156 178 112 131 chr2 168840905 168841234 -12906853 + ORR1D1 LTR MaLR 52 374 0 1 1873 910 303 47 56 chr2 168841290 168841718 -12906369 + MTD LTR MaLR 1 396 -23 1 1873 832 240 0 11 chr2 168841952 168842132 -12905955 + ORR1E LTR MaLR 2 179 -180 1 1873 1119 219 19 72 chr2 168842132 168842492 -12905595 + RLTR15 LTR ERVK 1 341 -18 1 1873 499 179 102 5 chr2 168842501 168842672 -12905415 + ORR1E LTR MaLR 159 374 0 1 1873 337 217 0 0 chr2 168842720 168842780 -12905307 + RMER17C-int LTR ERVK 1171 1230 -2008 1 1873 1551 144 14 119 chr2 168842801 168843163 -12904924 + RMER17C-int LTR ERVK 1169 1492 -1746 1 1873 8296 132 63 85 chr2 168843172 168843929 -12904158 + RMER17C-int LTR ERVK 1355 2074 -1164 1 1873 8296 132 63 85 chr2 168844078 168844574 -12903513 + RMER17C-int LTR ERVK 2075 2599 -639 1 1873 8296 132 63 85 chr2 168844624 168844969 -12903118 + RMER17C-int LTR ERVK 2600 2967 -271 1 1873 760 215 71 59 chr2 168844970 168845398 -12902689 + RMER17C LTR ERVK 43 389 -21 1 1873 760 205 93 62 chr2 168845558 168845586 -12902501 + RMER17C LTR ERVK 390 409 -1 1 1873 574 276 137 6 chr2 168847988 168848170 -12899917 - LTR40b LTR ERVL 0 462 257 1 1873 1088 271 40 58 chr2 168848173 168848664 -12899423 - RMER15 LTR ERVL 0 575 6 1 1873 757 238 29 19 chr2 168848782 168848988 -12899099 + RMER21B LTR ERV1 254 461 -381 1 1873 3594 33 36 0 chr2 168849111 168849532 -12898555 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 1 1873 3684 42 7 2 chr2 168852437 168852871 -12895216 + RLTR10C LTR ERVK 1 436 0 1 1873 399 316 87 46 chr2 168853648 168853844 -12894243 - MLT1H LTR MaLR -211 338 135 1 1873 966 208 150 23 chr2 168855314 168855461 -12892626 + ORR1D1 LTR MaLR 4 175 -199 1 1873 966 208 150 23 chr2 168855484 168855602 -12892485 + ORR1D1 LTR MaLR 176 302 -72 1 1873 493 227 0 0 chr2 168855784 168855872 -12892215 + ORR1D1 LTR MaLR 282 369 -5 1 1873 2476 80 0 58 chr2 168856713 168857060 -12891027 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 1 1873 2127 80 71 26 chr2 168857425 168857733 -12890354 - ORR1A2 LTR MaLR -4 323 2 1 1873 391 274 90 90 chr2 168861240 168861473 -12886614 - RLTR23 LTR ERV1 -1 429 197 1 1873 3527 23 2 0 chr2 168868207 168868602 -12879485 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1873 9342 33 2 2 chr2 168868602 168869700 -12878387 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 1 1873 3457 30 2 2 chr2 168869700 168870096 -12877991 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1873 348 273 20 0 chr2 168873612 168873711 -12874376 + MLT1J1 LTR MaLR 71 171 -273 1 1873 502 334 96 61 chr2 168874215 168874559 -12873528 + MT2A LTR ERVL 2 357 -176 1 1873 367 288 52 38 chr2 168874568 168874753 -12873334 + MT2A LTR ERVL 332 589 -12 1 1873 1292 120 73 9 chr2 168878143 168878361 -12869726 + RMER5 LTR ERV1 277 508 -26 1 1873 648 232 7 60 chr2 168878752 168878838 -12869249 + MTD LTR MaLR 262 345 -74 1 1873 2396 70 33 40 chr2 168878838 168879113 -12868974 + ORR1A2 LTR MaLR 1 286 -41 1 1873 2396 70 33 40 chr2 168879305 168879358 -12868729 + ORR1A2 LTR MaLR 287 327 0 1 1873 648 232 7 60 chr2 168879358 168879422 -12868665 + MTD LTR MaLR 346 404 -15 1 1873 2077 192 50 2 chr2 168879651 168880052 -12868035 + MTC LTR MaLR 1 420 -1 1 1873 1155 247 73 54 chr2 168880964 168881336 -12866751 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 1 1873 2857 66 45 11 chr2 168882399 168882780 -12865307 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 3 1 1873 1076 207 121 6 chr2 168883869 168884184 -12863903 + ORR1D1 LTR MaLR 1 367 -3 1 1873 2363 98 3 0 chr2 168890195 168890513 -12857574 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 1 1873 725 212 46 0 chr2 168892590 168892741 -12855346 - MTD LTR MaLR -2 417 260 1 1873 730 271 90 31 chr2 168892808 168893063 -12855024 - MTD LTR MaLR -149 270 1 1 1873 892 240 81 154 chr2 168895245 168895280 -12852807 - MTE2a LTR MaLR 0 379 339 1 1873 892 240 81 154 chr2 168895327 168895700 -12852387 - MTE2a LTR MaLR -41 338 3 1 1873 2161 155 7 88 chr2 168896663 168897086 -12851001 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 6 1 1873 276 322 70 45 chr2 168898619 168898775 -12849312 - MLT1K LTR MaLR -92 503 344 1 1873 2904 75 52 3 chr2 168899088 168899476 -12848611 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 1 1873 395 341 60 33 chr2 168902581 168902796 -12845291 - LTR16E1 LTR ERVL -11 527 307 1 1873 259 312 45 45 chr2 168904405 168904606 -12843481 - RLTR15 LTR ERVK -17 342 142 1 1873 468 186 79 79 chr2 168904720 168904872 -12843215 - RLTR15 LTR ERVK -207 152 1 1 1873 2501 102 3 0 chr2 168908802 168909124 -12838963 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 5 1 1873 886 311 93 39 chr2 168909833 168910241 -12837846 - MLT1F LTR MaLR 0 548 119 1 1873 815 253 105 9 chr2 168910707 168910926 -12837161 + RMER15 LTR ERVL 336 575 0 1 1873 322 318 11 0 chr2 168914008 168914096 -12833991 + MLT1K LTR MaLR 195 283 -312 1 1873 330 262 83 83 chr2 168914700 168914904 -12833183 + ORR1E LTR MaLR 113 316 -43 1 1873 2279 87 58 3 chr2 168916612 168916922 -12831165 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 1 1873 1341 213 74 24 chr2 168919202 168919538 -12828549 - MT2A LTR ERVL -13 520 168 1 1873 1903 210 12 51 chr2 168920411 168920843 -12827244 - MTD LTR MaLR 0 419 5 1 1873 288 262 33 133 chr2 168923290 168923440 -12824647 - MLT1K LTR MaLR -329 266 132 1 1873 314 311 127 63 chr2 168925836 168926073 -12822014 + MLT1J LTR MaLR 164 415 -97 1 1873 583 289 16 27 chr2 168928449 168928634 -12819453 + MT2A LTR ERVL 239 421 -112 1 1873 1209 230 60 48 chr2 168929570 168929903 -12818184 + ORR1D2 LTR MaLR 1 337 -33 1 1873 276 310 115 91 chr2 168936033 168936320 -12811767 + MLT1F2 LTR MaLR 191 552 -8 1 1873 383 214 11 43 chr2 168938685 168938778 -12809309 - MT2B LTR ERVL -344 257 168 1 1873 2127 159 64 20 chr2 168939167 168939558 -12808529 + MTC LTR MaLR 1 408 -13 1 1873 291 275 82 16 chr2 168940892 168941014 -12807073 - MLT1F LTR MaLR -180 368 239 1 1873 1104 258 69 16 chr2 168950276 168950595 -12797492 + ORR1E LTR MaLR 18 353 -6 1 1874 437 260 0 20 chr2 168952052 168952150 -12795937 - MTE2a LTR MaLR -56 323 228 1 1874 464 258 16 24 chr2 168954551 168954678 -12793409 + MTEa LTR MaLR 254 379 0 1 1874 497 84 0 14 chr2 168955673 168955745 -12792342 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 314 1 1874 267 218 0 37 chr2 168955751 168955832 -12792255 + ORR1B2 LTR MaLR 53 130 -248 1 1874 1059 176 76 11 chr2 168955809 168956030 -12792057 + ORR1B2 LTR MaLR 40 301 -93 1 1874 2002 138 16 3 chr2 168958246 168958551 -12789536 - RLTR27 LTR ERVK 0 309 1 1 1874 1455 180 136 22 chr2 168958581 168958950 -12789137 + MTD LTR MaLR 1 411 -8 1 1874 1413 199 132 30 chr2 168962715 168963072 -12785015 - MTD LTR MaLR -14 405 1 1 1874 658 276 41 0 chr2 168963087 168963232 -12784855 - ORR1D2 LTR MaLR -219 151 1 1 1874 517 310 62 12 chr2 168963232 168963388 -12784699 + MLT1A0 LTR MaLR 194 357 -8 1 1874 285 197 33 0 chr2 168963580 168963641 -12784446 + MLT1J LTR MaLR 71 133 -379 1 1874 834 254 128 26 chr2 168964762 168965083 -12783004 + ORR1E LTR MaLR 1 379 0 1 1874 861 228 184 18 chr2 168969941 168970164 -12777923 + ORR1D1 LTR MaLR 3 262 -112 1 1874 327 294 47 90 chr2 168970395 168970625 -12777462 + ORR1D1 LTR MaLR 157 373 -5 1 1874 442 229 52 30 chr2 168971602 168971737 -12776350 - RMER15 LTR ERVL -16 559 422 1 1874 793 28 8 77 chr2 168972077 168972194 -12775893 - RLTR10B2 LTR ERVK 0 411 303 1 1874 1170 34 0 39 chr2 168972178 168972333 -12775754 - RLTR10B2 LTR ERVK -216 149 1 1 1874 965 297 31 24 chr2 168982428 168982721 -12765366 + MTE2b LTR MaLR 16 310 -69 1 1874 943 250 68 34 chr2 168987316 168987581 -12760506 - MTEb LTR MaLR -105 274 1 1 1874 1556 244 60 11 chr2 168992539 168992887 -12755200 + MTE2b LTR MaLR 3 367 -12 1 1874 324 336 122 49 chr2 168995115 168995443 -12752644 - LTR16A LTR ERVL -40 411 60 1 1874 1495 215 10 34 chr2 168998093 168998391 -12749696 + MTD LTR MaLR 122 412 -7 1 1874 388 375 88 13 chr2 169005888 169006196 -12741891 + MLT2F LTR ERVL 231 561 -102 9 1874 460 276 136 27 chr2 169006300 169006557 -12741530 - MLT1A LTR MaLR 0 374 90 1 1874 934 230 111 123 chr2 169007598 169008014 -12740073 - MTD LTR MaLR -4 415 5 1 1874 626 301 89 30 chr2 169008492 169008705 -12739382 - MER54B LTR ERVL -231 562 337 1 1874 1374 274 27 3 chr2 169008705 169009075 -12739012 + MTEa LTR MaLR 1 379 0 1 1874 626 301 89 30 chr2 169009075 169009131 -12738956 - MER54B LTR ERVL -457 336 277 1 1874 906 271 93 8 chr2 169011495 169011763 -12736324 - MTEb LTR MaLR -79 300 10 1 1874 1075 268 129 6 chr2 169012481 169012815 -12735272 + MTD LTR MaLR 31 405 -14 1 1874 592 264 101 45 chr2 169012938 169013136 -12734951 - MLT1A1 LTR MaLR -13 395 187 2 1874 346 241 56 72 chr2 169015227 169015352 -12732735 - MLT1A1 LTR MaLR -284 124 2 2 1874 603 286 40 22 chr2 169017486 169017708 -12730379 - RMER15 LTR ERVL -14 561 336 3 1874 329 259 146 50 chr2 169018003 169018298 -12729789 + MLT1A1 LTR MaLR 33 408 0 3 1874 1145 210 204 13 chr2 169024748 169025057 -12723030 + ORR1D1 LTR MaLR 3 370 -4 5 1874 2640 59 3 0 chr2 169026938 169027260 -12720827 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 5 5 1874 452 263 138 62 chr2 169031625 169031926 -12716161 + ORR1D2 LTR MaLR 17 353 -6 5 1874 2260 135 62 23 chr2 169034000 169034386 -12713701 - RLTR44A LTR ERVK -4 401 1 6 1874 5271 35 2 0 chr2 169034386 169034984 -12713103 - RLTR44-int LTR ERVK 0 2812 2214 6 1874 859 119 12 95 chr2 169035295 169035539 -12712548 - RLTR44-int LTR ERVK -1831 981 816 6 1874 341 100 0 0 chr2 169035558 169035608 -12712479 - RLTR44-int LTR ERVK -2617 195 146 6 1874 1355 157 111 65 chr2 169035623 169035957 -12712130 - RLTR44A LTR ERVK 0 449 1 6 1874 903 194 73 5 chr2 169036937 169037129 -12710958 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 166 6 1874 586 291 51 17 chr2 169037201 169037376 -12710711 - ORR1D2 LTR MaLR -173 186 6 6 1874 1192 244 156 27 chr2 169043233 169043604 -12704483 + MTD LTR MaLR 1 419 0 8 1874 230 360 106 59 chr2 169045861 169046183 -12701904 + LTR16C LTR ERVL 100 436 -53 9 1874 403 301 149 23 chr2 169046345 169046492 -12701595 + LTR52 LTR ERVL 20 179 -242 9 1874 403 301 149 23 chr2 169046534 169046600 -12701487 + LTR52 LTR ERVL 180 259 -162 9 1874 519 330 87 0 chr2 169046736 169046942 -12701145 + MTEa LTR MaLR 52 275 -104 9 1874 374 363 102 51 chr2 169047159 169047452 -12700635 - ORR1E LTR MaLR -48 311 4 9 1874 319 294 182 64 chr2 169049252 169049629 -12698458 + RMER15 LTR ERVL 1 548 -27 9 1874 2036 171 25 8 chr2 169050894 169051253 -12696834 + ORR1C1 LTR MaLR 14 378 0 9 1874 5269 109 47 1 chr2 169058360 169059162 -12688925 - RMER21B LTR ERV1 0 842 4 1 1874 310 189 0 0 chr2 169059326 169059379 -12688708 - RMER21A LTR ERV1 -303 644 592 1 1874 231 149 43 0 chr2 169059370 169059417 -12688670 + RMER21A LTR ERV1 526 574 -373 1 1874 1592 167 28 10 chr2 169059438 169059729 -12688358 + ORR1B1 LTR MaLR 99 394 0 1 1874 2131 49 13 45 chr2 169063636 169064083 -12684004 - RLTR10C LTR ERVK -119 317 1 1 1874 537 193 78 29 chr2 169066075 169066205 -12681882 - RMER12B LTR ERVK -33 1539 1288 1 1874 1115 152 91 31 chr2 169068893 169069145 -12678942 - ORR1A4 LTR MaLR 0 394 93 1 1874 2374 139 31 10 chr2 169070907 169071293 -12676794 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 1 1874 730 317 79 104 chr2 169072459 169072825 -12675262 + ORR1E LTR MaLR 3 359 0 1 1874 444 217 28 6 chr2 169079409 169079488 -12668599 - MTEa LTR MaLR -1 369 283 1 1874 444 261 21 118 chr2 169079531 169079635 -12668452 - MTEa LTR MaLR -79 300 199 1 1874 239 224 46 126 chr2 169079726 169079813 -12668274 - MTEa LTR MaLR -198 186 107 1 1874 552 328 114 9 chr2 169081180 169081403 -12666684 - MLT1A0 LTR MaLR -12 353 107 1 1874 1128 253 108 21 chr2 169081403 169081738 -12666349 + MTEa LTR MaLR 1 364 -15 1 1874 231 295 0 0 chr2 169081747 169081808 -12666279 - MLT1A0 LTR MaLR -257 108 48 1 234 2719 194 178 23 chr2 169082176 169082919 -12665168 - RMER13A LTR ERVK 0 860 1 1 1875 409 287 105 53 chr2 169083525 169083768 -12664319 - ORR1E LTR MaLR -106 264 9 1 1875 257 349 59 40 chr2 169086253 169086405 -12661682 + MLT1G3 LTR MaLR 178 332 -263 1 1875 2225 152 11 8 chr2 169086459 169086817 -12661270 - ORR1B2 LTR MaLR -8 359 1 1 1875 246 374 158 35 chr2 169086917 169087092 -12660995 - MLT1G1 LTR MaLR -196 383 178 1 1875 246 374 158 35 chr2 169087138 169087303 -12660784 - MLT1G1 LTR MaLR -402 177 2 1 1875 1541 186 99 48 chr2 169088123 169088519 -12659568 - MTD LTR MaLR -21 398 2 1 1875 228 335 88 12 chr2 169095003 169095163 -12652924 + MLT1L LTR MaLR 129 300 -310 1 1875 983 256 99 22 chr2 169103241 169103576 -12644511 - MTD LTR MaLR 0 419 6 2 1875 1035 218 231 73 chr2 169104645 169105139 -12642948 + RMER15 LTR ERVL 4 575 0 2 1875 618 317 118 39 chr2 169105945 169106283 -12641804 + MLT1A LTR MaLR 1 365 -9 2 1875 304 330 103 52 chr2 169106288 169106683 -12641404 + MLT1D LTR MaLR 18 458 -9 2 1875 2190 125 6 0 chr2 169114249 169114569 -12633518 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 6 2 1875 796 304 81 11 chr2 169118288 169118571 -12629516 + MLT1F2 LTR MaLR 25 327 -233 2 1875 329 318 28 25 chr2 169118590 169118714 -12629373 + MLT1F2 LTR MaLR 435 561 -8 2 1875 581 230 54 42 chr2 169120722 169120890 -12627197 + ORR1E LTR MaLR 1 170 -189 2 1875 557 328 94 11 chr2 169126892 169127253 -12620834 - MLT1C LTR MaLR -1 466 76 2 1875 952 323 115 76 chr2 169129095 169129710 -12618377 + MLT1E3 LTR MaLR 7 624 0 2 1875 293 247 54 33 chr2 169130173 169130265 -12617822 + MTEa LTR MaLR 272 365 -14 2 1875 1118 267 46 109 chr2 169131592 169132004 -12616083 + MTD LTR MaLR 6 391 -28 2 1875 338 364 8 0 chr2 169133717 169133849 -12614238 + MLT1D LTR MaLR 370 502 -3 2 1875 597 299 71 34 chr2 169134140 169134407 -12613680 + MER74B LTR ERVL 222 498 -124 2 1875 936 254 37 144 chr2 169154350 169154759 -12593328 - MTE2a LTR MaLR -9 370 6 2 1875 1285 202 227 6 chr2 169154940 169155283 -12592804 - MTD LTR MaLR 0 419 1 2 1875 1534 176 41 51 chr2 169155500 169155914 -12592173 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 2 1875 581 309 30 59 chr2 169156654 169156857 -12591230 - ORR1E LTR MaLR -2 357 161 2 1875 522 318 81 107 chr2 169157734 169158202 -12589885 - MLT1C LTR MaLR -8 459 4 2 1875 1771 201 96 19 chr2 169162660 169163036 -12585051 + MTD LTR MaLR 4 408 -11 3 1875 516 266 34 34 chr2 169163760 169163908 -12584179 + MTE2a LTR MaLR 17 164 -215 3 1875 524 208 9 19 chr2 169164832 169164940 -12583147 - MLT1A0 LTR MaLR -177 188 82 3 1875 249 255 35 97 chr2 169169221 169169334 -12578753 - LTR16A1 LTR ERVL -2 454 349 3 1875 755 224 13 6 chr2 169169424 169169581 -12578506 + ORR1E LTR MaLR 1 158 -201 3 1875 267 276 0 0 chr2 169170898 169170956 -12577131 + RMER15 LTR ERVL 409 466 -109 3 1875 238 228 101 109 chr2 169172870 169173008 -12575079 - MLT2B1 LTR ERVL -8 559 423 3 1875 833 328 43 51 chr2 169173141 169173491 -12574596 - MT2A LTR ERVL -102 431 85 3 1875 1294 252 21 17 chr2 169175424 169175715 -12572372 + MTE2b LTR MaLR 52 343 -36 3 1875 288 324 99 102 chr2 169180119 169180483 -12567604 + ORR1C2 LTR MaLR 22 384 0 3 1875 621 283 83 94 chr2 169184114 169184453 -12563634 - MLT1A0 LTR MaLR -27 338 4 3 1875 716 285 88 52 chr2 169189412 169189820 -12558267 - RMER15 LTR ERVL -18 557 15 3 1875 1067 213 206 16 chr2 169194695 169195001 -12553086 + ORR1D2 LTR MaLR 1 364 -6 3 1875 2517 92 3 0 chr2 169199213 169199539 -12548548 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 3 1875 1298 177 254 6 chr2 169199679 169200014 -12548073 + MTD LTR MaLR 2 419 0 3 1875 1108 274 113 14 chr2 169200373 169200728 -12547359 - MTD LTR MaLR -17 402 13 3 1875 1648 194 34 57 chr2 169200989 169201372 -12546715 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 3 1875 366 242 127 0 chr2 169201639 169201769 -12546318 + ORR1D2 LTR MaLR 3 158 -236 3 1875 733 277 130 7 chr2 169201969 169202238 -12545849 + ORR1D2 LTR MaLR 64 365 -5 3 1875 225 203 11 169 chr2 169203804 169203893 -12544194 - MT2B2 LTR ERVL -344 240 166 3 1875 756 251 226 31 chr2 169204125 169204417 -12543670 + MTE2b LTR MaLR 29 377 -2 3 1875 2194 142 22 25 chr2 169206556 169206923 -12541164 + RLTR14 LTR ERV1 16 381 -1 3 1875 238 342 139 42 chr2 169211144 169211309 -12536778 - MLT1E2 LTR MaLR -174 453 273 4 1875 492 304 74 6 chr2 169211718 169211880 -12536207 - ORR1D2 LTR MaLR -11 348 176 4 1875 513 247 97 18 chr2 169212031 169212196 -12535891 - ORR1D2 LTR MaLR -183 187 10 4 1876 340 272 123 14 chr2 169220740 169220878 -12527209 + RMER15 LTR ERVL 422 574 -1 4 1876 324 301 11 21 chr2 169220910 169221005 -12527082 - MLT2B1 LTR ERVL -69 498 405 4 1876 702 167 5 114 chr2 169224695 169224905 -12523182 - RMER17C LTR ERVK -223 187 1 4 1876 462 252 51 51 chr2 169224977 169225115 -12522972 + ORR1D2 LTR MaLR 233 370 0 4 1876 351 294 24 48 chr2 169226915 169227040 -12521047 + RMER12 LTR ERVK 770 891 -431 4 1876 1394 267 13 36 chr2 169228192 169228580 -12519507 + MTE2b LTR MaLR 1 379 0 4 1876 3404 23 15 0 chr2 169228844 169229234 -12518853 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 1876 247 218 0 0 chr2 169232738 169232793 -12515294 + MTEa LTR MaLR 143 197 -162 4 1876 329 330 5 68 chr2 169232889 169233081 -12515006 + MTEa LTR MaLR 196 375 -4 4 1876 289 266 60 34 chr2 169234980 169235097 -12512990 - RMER15 LTR ERVL -193 382 263 4 1876 1826 139 129 6 chr2 169240134 169240265 -12507822 + ORR1D1 LTR MaLR 1 159 -215 4 1876 1826 139 129 6 chr2 169240417 169240618 -12507469 + ORR1D1 LTR MaLR 160 373 -1 4 1876 2236 228 55 4 chr2 169242221 169242710 -12505377 - MT2A LTR ERVL -19 514 1 4 1876 278 338 64 50 chr2 169245783 169245923 -12502164 + ORR1E LTR MaLR 2 143 -216 4 1876 250 281 89 84 chr2 169246343 169246522 -12501565 + MLT1H2 LTR MaLR 62 241 -248 4 1876 281 325 23 62 chr2 169249576 169249704 -12498383 - MLT1J LTR MaLR -291 221 99 4 1876 249 283 110 10 chr2 169259817 169259917 -12488170 - MLT1A1 LTR MaLR -5 403 294 4 1876 4493 158 84 14 chr2 169259989 169260860 -12487227 - RMER19B LTR ERVK -7 895 28 4 1876 274 125 0 0 chr2 169267018 169267058 -12481029 - RMER19B LTR ERVK -862 40 1 4 1876 535 223 31 60 chr2 169269521 169269686 -12478401 - ORR1D2 LTR MaLR 0 374 195 4 1876 366 258 106 81 chr2 169269736 169269768 -12478319 - ORR1D2 LTR MaLR -180 194 172 4 1876 230 374 40 24 chr2 169272163 169272289 -12475798 - MLT1J LTR MaLR -115 397 270 5 1876 582 270 122 62 chr2 169272419 169272707 -12475380 - MLT1E1A LTR MaLR -2 678 374 5 1876 333 308 89 6 chr2 169275720 169275877 -12472210 + RMER15 LTR ERVL 406 575 0 5 1876 232 254 0 101 chr2 169277491 169277570 -12470517 - MT2B2 LTR ERVL -344 240 170 5 1876 1109 266 32 117 chr2 169280229 169280638 -12467449 - MTE2a LTR MaLR -5 374 1 5 1876 1081 213 296 10 chr2 169283093 169283380 -12464707 - ORR1D2 LTR MaLR -1 369 1 5 1876 1260 210 55 135 chr2 169284667 169285005 -12463082 - MTE2a LTR MaLR 0 379 56 5 1876 3248 136 226 2 chr2 169285005 169285607 -12462480 + RMER19A LTR ERVK 1 737 0 5 1876 1260 210 55 135 chr2 169285607 169285669 -12462418 - MTE2a LTR MaLR -324 55 11 5 1876 502 238 118 32 chr2 169287086 169287358 -12460729 - MTEa LTR MaLR -31 348 1 5 1876 263 276 0 0 chr2 169292465 169292523 -12455564 + MTEa LTR MaLR 1 58 -321 5 1876 364 271 66 25 chr2 169292800 169292921 -12455166 + MTEa LTR MaLR 250 375 -4 5 1876 1010 76 8 0 chr2 169304150 169304282 -12443805 + ORR1A3 LTR MaLR 193 325 -1 5 1876 274 259 172 26 chr2 169320086 169320237 -12427850 - MLT1K LTR MaLR -35 560 388 5 1876 237 259 167 0 chr2 169321214 169321322 -12426765 - RLTR22_Mus LTR ERVK -503 1305 1180 5 1876 505 323 120 45 chr2 169322190 169322524 -12425563 - ORR1E LTR MaLR 0 359 1 5 1876 1221 248 11 110 chr2 169324762 169325134 -12422953 - ORR1E LTR MaLR -24 335 1 5 1876 253 386 40 20 chr2 169325572 169325720 -12422367 - MLT1B LTR MaLR -35 355 205 5 1876 520 171 98 3 chr2 169326540 169326665 -12421422 - MTD LTR MaLR -14 405 271 5 1876 1987 158 28 54 chr2 169336341 169336728 -12411359 + ORR1C1 LTR MaLR 2 378 0 6 1876 353 333 66 30 chr2 169339094 169339261 -12408826 - ORR1E LTR MaLR -166 193 21 6 1876 648 250 292 13 chr2 169339404 169339716 -12408371 - MTD LTR MaLR -8 411 13 6 1876 884 251 110 34 chr2 169340765 169341091 -12406996 - ORR1E LTR MaLR -5 354 4 6 1876 1135 244 78 47 chr2 169341299 169341648 -12406439 + ORR1E LTR MaLR 3 421 0 6 1876 1058 236 90 27 chr2 169343491 169343791 -12404296 - MTD LTR MaLR -14 405 87 6 1877 2356 90 48 0 chr2 169347104 169347416 -12400671 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 6 1877 626 290 228 24 chr2 169352739 169353029 -12395058 + MTE2b LTR MaLR 1 349 -30 6 1877 479 238 60 34 chr2 169356657 169356834 -12391253 - ORR1E LTR MaLR 0 370 164 6 1877 611 234 8 0 chr2 169356963 169357087 -12391000 - ORR1E LTR MaLR -230 129 5 6 1877 907 171 77 0 chr2 169357104 169357274 -12390813 - ORR1C1 LTR MaLR -195 183 1 6 1877 1484 229 45 81 chr2 169357717 169358136 -12389951 - MTD LTR MaLR -15 404 1 6 1877 288 265 38 29 chr2 169371309 169371414 -12376673 - MLT2C1 LTR ERVL -280 117 12 6 1877 452 277 158 76 chr2 169377691 169378019 -12370068 + ORR1D1 LTR MaLR 16 370 -4 6 1877 226 255 0 38 chr2 169379055 169379107 -12368980 - MLT1B LTR MaLR 0 390 341 6 1877 1767 145 100 6 chr2 169379107 169379426 -12368661 + ORR1B1 LTR MaLR 1 349 -45 6 1877 505 326 55 25 chr2 169380432 169380750 -12367337 - MLT1B LTR MaLR -99 368 41 6 1877 518 313 115 32 chr2 169384254 169384472 -12363615 + RMER15 LTR ERVL 337 572 -3 6 1877 1418 264 16 46 chr2 169385891 169386261 -12361826 - ORR1E LTR MaLR 0 359 1 6 1877 3063 94 11 28 chr2 169387460 169387921 -12360166 - RLTR11B LTR ERVK 0 453 1 7 1877 229 259 22 90 chr2 169388827 169388916 -12359171 + LTR86C LTR ERVL 108 190 -431 7 1877 563 303 116 8 chr2 169388974 169389240 -12358847 + MLT1C LTR MaLR 177 504 -1 7 1877 507 241 65 9 chr2 169390013 169390151 -12357936 - MTD LTR MaLR 0 419 213 7 1877 725 264 91 12 chr2 169390179 169390453 -12357634 - MTD LTR MaLR -127 294 1 7 1877 250 348 44 18 chr2 169394387 169394501 -12353586 - MLT1G LTR MaLR -73 518 402 7 1877 412 362 94 16 chr2 169407668 169407912 -12340175 + LTR16A LTR ERVL 173 435 -16 7 1877 3930 142 43 24 chr2 169412257 169412936 -12335151 - RLTR17 LTR ERVK 0 692 1 7 1877 243 336 14 54 chr2 169413011 169413105 -12334982 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1307 1393 -455 7 1877 243 336 14 54 chr2 169413132 169413185 -12334902 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1394 1448 -400 7 1877 906 283 43 48 chr2 169418794 169419169 -12328918 + MTE2b LTR MaLR 3 375 -4 7 1877 1735 202 120 6 chr2 169427680 169428038 -12320049 + MTD LTR MaLR 18 416 -3 7 1877 522 294 39 0 chr2 169430083 169430236 -12317851 + MLT1I LTR MaLR 241 399 -12 8 1877 276 362 16 54 chr2 169430958 169431142 -12316945 - RMER15 LTR ERVL -57 518 342 8 1877 310 312 37 96 chr2 169440653 169440841 -12307246 - MLT1K LTR MaLR -41 554 378 8 1877 1229 238 97 17 chr2 169441262 169441612 -12306475 - MTE2a LTR MaLR -1 378 1 8 1877 347 296 56 30 chr2 169453367 169453515 -12294572 - ORR1E LTR MaLR -39 380 219 8 1877 425 241 32 57 chr2 169453533 169453656 -12294431 - ORR1E LTR MaLR -239 120 1 8 1877 1431 258 88 5 chr2 169454771 169455156 -12292931 - MTD LTR MaLR -2 417 1 8 1877 1113 264 28 130 chr2 169473358 169473780 -12274307 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 8 1878 234 326 21 52 chr2 169502655 169502752 -12245335 + LTR16B2 LTR ERVL 307 400 -62 5 1878 832 245 119 43 chr2 169507081 169507358 -12240729 + ORR1D2 LTR MaLR 5 302 -68 1 1878 474 290 150 64 chr2 169507398 169507711 -12240376 + ORR1E LTR MaLR 18 357 -2 1 1878 3634 5 5 0 chr2 169519096 169519490 -12228597 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 1878 240 387 57 17 chr2 169520947 169521123 -12226964 - MLT1K LTR MaLR -3 592 410 3 1878 1362 251 45 96 chr2 169526196 169526592 -12221495 + MTEb LTR MaLR 1 376 -3 4 1878 299 339 129 78 chr2 169527177 169527250 -12220837 - MLT1J LTR MaLR -195 317 251 4 1878 299 339 129 78 chr2 169527335 169527516 -12220571 - MLT1J LTR MaLR -262 250 50 4 1878 1368 238 60 8 chr2 169529316 169529668 -12218419 - ORR1D1 LTR MaLR -3 371 2 5 1878 2450 83 0 60 chr2 169530347 169530694 -12217393 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 5 1878 878 286 89 30 chr2 169532590 169532994 -12215093 - BGLII_B LTR ERVK -4 437 10 6 1878 259 319 21 21 chr2 169545854 169545947 -12202140 - MLT1B LTR MaLR 0 467 375 9 1878 540 329 79 12 chr2 169546128 169546380 -12201707 - MLT1B LTR MaLR -120 270 2 9 1878 1123 294 28 59 chr2 169556655 169556734 -12191353 + MTEa LTR MaLR 5 75 -304 1 1878 1123 294 28 59 chr2 169556781 169557088 -12190999 + MTEa LTR MaLR 76 379 0 1 1878 819 219 180 81 chr2 169559102 169559425 -12188662 + ORR1E LTR MaLR 1 355 -4 1 1878 386 320 123 5 chr2 169570795 169571015 -12177072 - MLT1K LTR MaLR 0 595 350 1 1878 974 262 11 53 chr2 169573315 169573471 -12174616 + ORR1E LTR MaLR 1 145 -214 1 1878 3183 41 20 10 chr2 169573471 169573861 -12174226 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 3 1 1878 974 272 39 85 chr2 169573861 169574066 -12174021 + ORR1E LTR MaLR 136 344 -26 1 1878 795 257 97 144 chr2 169578837 169579260 -12168827 - MTD LTR MaLR -12 407 5 1 1878 277 299 12 49 chr2 169587213 169587294 -12160793 - MLT1I LTR MaLR -3 408 331 1 1878 1656 216 60 23 chr2 169587323 169587751 -12160336 + RLTR16 LTR ERVK 1 411 -94 1 1878 1109 262 93 27 chr2 169593541 169593874 -12154213 - MTD LTR MaLR -64 355 1 1 1878 388 338 28 61 chr2 169596876 169597090 -12150997 - MLT1H LTR MaLR 0 549 343 1 1879 239 271 56 98 chr2 169610369 169610438 -12137649 + MT2B2 LTR ERVL 98 234 -367 2 1879 232 250 27 107 chr2 169612272 169612384 -12135703 - MLT1K LTR MaLR -61 534 432 2 1879 433 288 80 27 chr2 169621531 169621756 -12126331 - MLT1H LTR MaLR -194 355 119 2 1879 364 184 10 112 chr2 169624406 169624504 -12123583 - MT2B LTR ERVL -361 240 153 2 1879 410 316 44 55 chr2 169639687 169639868 -12108219 - MTEa LTR MaLR 0 379 201 2 1879 805 263 92 25 chr2 169647046 169647327 -12100760 - ORR1E LTR MaLR -59 300 1 2 1879 315 349 109 11 chr2 169661411 169661585 -12086502 - MLT1D LTR MaLR -263 242 52 2 1879 327 329 75 59 chr2 169670492 169670845 -12077242 - LTR48 LTR ERV1 -28 759 211 3 1879 409 304 0 0 chr2 169671488 169671580 -12076507 + MTEa LTR MaLR 3 94 -265 3 1879 428 237 20 92 chr2 169671577 169671706 -12076381 + MTEa LTR MaLR 200 317 -62 3 1879 1648 246 67 10 chr2 169671706 169672097 -12075990 - MTD LTR MaLR -1 418 6 3 1879 349 255 54 45 chr2 169672243 169672354 -12075733 + MTEa LTR MaLR 260 371 -8 3 1879 319 311 54 157 chr2 169673630 169673962 -12074125 - ORR1E LTR MaLR 0 359 62 3 1879 2137 101 6 3 chr2 169682388 169682766 -12065321 - ORR1A2 LTR MaLR 0 394 1 3 1879 322 160 0 51 chr2 169682766 169682845 -12065242 - ORR1B2 LTR MaLR -249 118 44 3 1879 326 154 0 49 chr2 169682846 169682928 -12065159 - ORR1A1 LTR MaLR -249 118 41 3 1879 290 169 0 0 chr2 169682907 169682966 -12065121 - ORR1A1 LTR MaLR -254 140 82 3 1879 480 188 17 0 chr2 169682957 169683074 -12065013 - ORR1A1 LTR MaLR -227 119 1 3 1879 320 314 18 54 chr2 169683090 169683201 -12064886 - ORR1E LTR MaLR -252 107 1 3 1879 827 270 195 6 chr2 169690679 169690992 -12057095 + MTEa LTR MaLR 4 375 -4 3 1879 252 246 17 17 chr2 169691645 169691703 -12056384 - MTEb LTR MaLR -290 89 32 3 1879 1225 268 56 48 chr2 169694682 169695039 -12053048 - MTE2b LTR MaLR -7 372 13 3 1879 778 268 28 28 chr2 169696157 169696372 -12051715 - MTEb LTR MaLR -5 374 160 3 1879 550 243 101 14 chr2 169696858 169696996 -12051091 - MTEb LTR MaLR -229 150 1 3 1879 521 279 54 13 chr2 169725136 169725285 -12022802 - MTD LTR MaLR 0 419 265 4 1879 1786 189 28 11 chr2 169725867 169726220 -12021867 - ORR1B2 LTR MaLR -8 359 1 4 1879 277 267 132 37 chr2 169726220 169726347 -12021740 - MTD LTR MaLR -244 177 38 4 1880 341 216 110 20 chr2 169740375 169740494 -12007593 + ORR1E LTR MaLR 39 177 -197 4 1880 1537 137 80 28 chr2 169740521 169740807 -12007280 + ORR1A3 LTR MaLR 26 326 0 4 1880 400 262 11 14 chr2 169740809 169740956 -12007131 + ORR1E LTR MaLR 224 369 -10 4 1880 1609 218 26 53 chr2 169741646 169742062 -12006025 - RLTR20C LTR ERVK 0 534 130 4 1880 705 266 120 74 chr2 169743658 169744073 -12004014 - RMER20B LTR ERVK -38 589 97 4 1880 2849 125 20 9 chr2 169744725 169745178 -12002909 + RLTR28B LTR ERVL 1 458 -23 4 1880 1779 192 102 5 chr2 169745729 169746111 -12001976 + MTD LTR MaLR 1 419 0 4 1880 284 274 0 107 chr2 169750203 169750334 -11997753 - RMER12 LTR ERVK -486 836 720 4 1880 2275 132 135 0 chr2 169750414 169750785 -11997302 - MTC LTR MaLR 0 421 1 4 1880 260 292 70 80 chr2 169752746 169752947 -11995140 + RMER12 LTR ERVK 743 941 -381 4 1880 593 254 54 17 chr2 169762571 169762864 -11985223 + MTEa LTR MaLR 4 373 -6 5 1880 242 306 133 88 chr2 169763205 169763445 -11984642 - MLT1E LTR MaLR -11 642 392 5 1880 369 270 172 33 chr2 169767945 169768125 -11979962 - MLT1F1 LTR MaLR -4 565 361 5 1880 399 288 60 8 chr2 169778230 169778363 -11969724 + RMER15 LTR ERVL 422 561 -14 5 1880 1294 262 21 44 chr2 169779910 169780294 -11967793 - MTE2b LTR MaLR -4 375 1 5 1880 497 280 27 19 chr2 169781864 169782043 -11966044 - MLT2C2 LTR ERVL -86 328 135 5 1880 234 182 17 52 chr2 169782227 169782285 -11965802 - MLT1J LTR MaLR -364 148 93 5 1880 909 276 64 35 chr2 169784276 169784621 -11963466 - ORR1E LTR MaLR 0 359 5 5 1880 249 320 164 19 chr2 169791194 169791401 -11956686 - MLT1D LTR MaLR -266 239 3 5 1880 320 296 6 134 chr2 169795147 169795174 -11952913 + MT2B LTR ERVL 143 148 -453 5 1880 1182 230 114 31 chr2 169795354 169795619 -11952468 - MTE2b LTR MaLR 0 379 84 5 1880 4022 133 79 6 chr2 169795619 169796264 -11951823 - RLTR17 LTR ERVK 0 692 1 5 1880 1182 230 114 31 chr2 169796264 169796348 -11951739 - MTE2b LTR MaLR -296 83 1 5 1880 2088 133 135 39 chr2 169797063 169797447 -11950640 - MTC LTR MaLR 0 421 1 5 1880 403 288 77 7 chr2 169798141 169798367 -11949720 - RMER12 LTR ERVK -359 963 755 5 1880 240 214 26 79 chr2 169804956 169804970 -11943117 - RLTR22_Mur LTR ERVK -481 1367 1357 6 1880 240 214 26 79 chr2 169805050 169805111 -11942976 - RLTR22_Mur LTR ERVK -492 1356 1296 6 1880 275 207 94 35 chr2 169807027 169807112 -11940975 - MTE2a LTR MaLR -11 368 279 6 1880 1560 209 74 9 chr2 169807310 169807648 -11940439 - ORR1D2 LTR MaLR -10 360 1 6 1880 843 274 75 88 chr2 169809235 169809624 -11938463 + MTE2a LTR MaLR 1 405 -14 6 1880 731 269 26 158 chr2 169817067 169817345 -11930742 - MTD LTR MaLR -136 243 3 6 1880 2288 168 58 5 chr2 169825645 169826045 -11922042 + MTC LTR MaLR 1 421 0 6 1880 1141 222 131 16 chr2 169833929 169834249 -11913838 - ORR1E LTR MaLR -2 357 1 6 1880 293 268 88 18 chr2 169834595 169834709 -11913378 - MTE2b LTR MaLR 0 379 258 6 1880 291 319 0 11 chr2 169837072 169837084 -11911003 - MT2A LTR ERVL -439 94 1 6 1880 468 217 0 0 chr2 169837084 169837167 -11910920 - MTE2b LTR MaLR -296 83 1 6 1880 415 150 58 17 chr2 169841061 169841155 -11906932 - MTC LTR MaLR -2 419 263 7 1880 728 200 155 31 chr2 169841233 169841512 -11906575 - MTC LTR MaLR -65 356 1 7 1880 264 355 56 60 chr2 169841649 169841898 -11906189 + MER21B LTR ERV1 163 410 -453 7 1880 758 288 42 94 chr2 169845161 169845563 -11902524 + MTE2a LTR MaLR 10 404 -15 7 1880 1014 205 12 54 chr2 169850534 169850776 -11897311 - ORR1D2 LTR MaLR -136 234 3 7 1880 333 271 196 0 chr2 169851244 169851351 -11896736 - MTEa LTR MaLR -251 128 1 7 1880 1106 252 14 158 chr2 169856395 169856819 -11891268 - MTE2a LTR MaLR -15 364 2 7 1880 241 328 90 39 chr2 169857270 169857427 -11890660 - MLT1K LTR MaLR -224 386 221 7 1880 1157 256 52 18 chr2 169857427 169857757 -11890330 - ORR1D2 LTR MaLR -1 369 29 7 1880 620 345 73 42 chr2 169858252 169858636 -11889451 - MT2A LTR ERVL -118 415 20 7 1880 267 336 66 15 chr2 169858515 169858651 -11889436 - MTEa LTR MaLR -233 146 4 7 1880 599 332 31 0 chr2 169860416 169860609 -11887478 - MLT1K LTR MaLR -350 245 47 7 1880 284 301 86 0 chr2 169868451 169868544 -11879543 + MLT1H2 LTR MaLR 36 136 -353 7 1880 903 228 166 17 chr2 169868735 169869032 -11879055 - ORR1D2 LTR MaLR -1 378 17 7 1881 1680 178 124 37 chr2 169871922 169872301 -11875786 - MTC LTR MaLR 0 421 10 7 1881 1036 264 85 35 chr2 169873024 169873419 -11874668 + MTD LTR MaLR 6 405 -14 7 1881 514 243 36 22 chr2 169873854 169873999 -11874088 + MTE2a LTR MaLR 15 191 -228 7 1881 976 241 142 55 chr2 169874529 169874840 -11873247 - MTD LTR MaLR 0 419 82 7 1881 4232 194 31 143 chr2 169874957 169875219 -11872868 - RLTR21 LTR ERVK -487 1085 895 7 1881 4232 194 31 143 chr2 169875398 169875677 -11872410 - RLTR21 LTR ERVK -678 894 677 7 1881 4232 194 31 143 chr2 169875719 169876318 -11871769 - RLTR21 LTR ERVK -896 676 73 7 1881 1986 146 103 6 chr2 169879569 169879928 -11868159 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 8 1881 2478 98 0 0 chr2 169887480 169887807 -11860280 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 8 1881 296 326 53 15 chr2 169887867 169887998 -11860089 + MTEb LTR MaLR 243 378 -1 8 1881 2714 110 77 3 chr2 169890470 169890861 -11857226 - MTC LTR MaLR -1 420 1 8 1881 1151 160 51 61 chr2 169891299 169891627 -11856460 - RMER6B LTR ERVK -2 459 100 8 1881 1151 138 57 68 chr2 169891793 169891890 -11856197 - RMER6B LTR ERVK -362 99 1 8 1881 544 327 107 48 chr2 169892310 169892647 -11855440 - ORR1E LTR MaLR -2 357 1 8 1881 1423 162 23 43 chr2 169895421 169895679 -11852408 + MTD LTR MaLR 150 402 -17 8 1881 719 248 98 63 chr2 169905529 169905866 -11842221 - RLTR9A LTR ERVK 0 437 1 8 1881 281 276 83 68 chr2 169906169 169906388 -11841699 + MTE2a LTR MaLR 151 374 0 8 1881 285 61 0 222 chr2 169910988 169911051 -11837036 + RMER19A LTR ERVK 689 737 0 8 1881 226 258 48 0 chr2 169915025 169915087 -11833000 + MT2B2 LTR ERVL 171 235 -349 9 1881 1398 239 49 32 chr2 169915677 169915821 -11832266 + ORR1D2 LTR MaLR 12 156 -214 9 1881 1398 239 49 32 chr2 169915849 169916049 -11832038 + ORR1D2 LTR MaLR 157 362 -8 9 1881 2159 163 66 15 chr2 169918223 169918616 -11829471 + MTC LTR MaLR 1 413 -8 9 1881 483 289 106 95 chr2 169919582 169919846 -11828241 - MLT1F1 LTR MaLR 0 569 303 9 1881 594 292 116 33 chr2 169920092 169920393 -11827694 + ORR1E LTR MaLR 25 350 -9 9 1881 739 258 45 15 chr2 169920502 169920703 -11827384 + MTE2a LTR MaLR 173 379 0 9 1881 387 348 70 26 chr2 169925223 169925450 -11822637 + MLT1K LTR MaLR 40 276 -319 9 1881 342 191 24 160 chr2 169932844 169932969 -11815118 + MT2B LTR ERVL 157 264 -337 9 1881 286 231 15 0 chr2 169966635 169966700 -11781387 + MT2B LTR ERVL 169 234 -367 1 1881 264 213 33 115 chr2 169969109 169969147 -11778940 - MT2B LTR ERVL -330 271 185 1 1881 331 255 42 68 chr2 169972184 169972198 -11775889 + MT2B LTR ERVL 155 165 -436 1 1881 250 273 49 128 chr2 169973636 169973800 -11774287 + MT2B2 LTR ERVL 128 278 -306 1 1881 402 247 89 112 chr2 169976206 169976268 -11771819 - MT2B LTR ERVL -285 316 184 1 1881 402 247 89 112 chr2 169976362 169976375 -11771712 - MT2B LTR ERVL -285 183 152 1 1881 225 289 40 0 chr2 169984468 169984544 -11763543 - MamGypLTR2b LTR Gypsy -814 108 30 1 1881 381 202 0 161 chr2 169986599 169986613 -11761474 + MT2B LTR ERVL 153 164 -437 1 1881 270 258 56 102 chr2 169989119 169989227 -11758860 - MT2B LTR ERVL -344 257 155 1 1881 250 296 12 36 chr2 169989713 169989797 -11758290 + MLT2B3 LTR ERVL 7 88 -466 1 1881 289 296 53 20 chr2 169989894 169990062 -11758025 + MTE2b LTR MaLR 211 379 0 1 1881 1187 233 73 94 chr2 169990865 169991249 -11756838 - MTE2b LTR MaLR 0 379 4 1 1881 862 257 140 13 chr2 169991319 169991619 -11756468 + MTEa LTR MaLR 29 366 -13 1 1881 225 218 0 114 chr2 169993601 169993689 -11754398 - RLTR40 LTR ERVK -219 598 521 1 1881 1508 203 81 7 chr2 169995022 169995329 -11752758 - MTC LTR MaLR 0 421 92 1 1881 263 321 145 13 chr2 169996312 169996539 -11751548 + RMER12 LTR ERVK 729 985 -337 1 1882 300 247 51 45 chr2 170011677 170011815 -11736272 - ORR1B1-int LTR MaLR -755 754 610 4 1882 300 247 51 45 chr2 170011958 170011976 -11736111 - ORR1B1-int LTR MaLR -900 609 597 4 1882 450 226 94 17 chr2 170015625 170015742 -11732345 + MLT1A0 LTR MaLR 27 152 -213 6 1882 382 259 46 150 chr2 170035670 170035843 -11712244 - MTEb LTR MaLR -27 352 181 1 1882 383 255 19 19 chr2 170040684 170040788 -11707299 - MTEb LTR MaLR -38 341 238 1 1882 264 335 141 18 chr2 170042883 170043053 -11705034 + MLT1C LTR MaLR 225 415 -52 1 1882 2480 179 2 5 chr2 170043193 170043615 -11704472 + MTC LTR MaLR 1 421 0 1 1882 268 208 19 0 chr2 170043615 170043668 -11704419 + MTE2b LTR MaLR 319 372 -7 1 1882 463 288 89 27 chr2 170054153 170054378 -11693709 - LTR82A LTR ERVL -177 695 457 2 1882 1996 130 27 52 chr2 170059892 170060298 -11687789 + RMER17C LTR ERVK 2 397 -13 2 1882 702 260 169 35 chr2 170060896 170061215 -11686872 - MTD LTR MaLR -40 379 18 2 1882 847 154 40 0 chr2 170067058 170067207 -11680880 - ORR1D1 LTR MaLR -218 156 2 2 1882 1043 226 88 4 chr2 170067550 170067790 -11680297 - MTEa LTR MaLR 0 379 120 2 1882 263 264 22 54 chr2 170072055 170072147 -11675940 - MTD LTR MaLR -1 418 330 2 1882 306 269 8 100 chr2 170072548 170072668 -11675419 - MT2B LTR ERVL -325 276 168 2 1882 2938 159 119 40 chr2 170075169 170075724 -11672363 - RMER19C LTR ERVK -12 599 1 2 1882 4750 176 70 59 chr2 170076204 170076250 -11671837 - MurERV4_19-int LTR ERVK -8 5772 5728 2 1882 4750 176 70 59 chr2 170076435 170077571 -11670516 - MurERV4_19-int LTR ERVK -53 5727 4577 2 1882 304 202 158 68 chr2 170078827 170078960 -11669127 - MLT1A1 LTR MaLR -7 401 257 2 1882 581 159 3 5 chr2 170080175 170080281 -11667806 + MTC LTR MaLR 315 421 0 3 1882 685 227 43 56 chr2 170082691 170082837 -11665250 + RMER4B LTR ERVK 33 248 -337 3 1882 685 269 40 143 chr2 170082861 170083151 -11664936 + RMER4B LTR ERVK 249 600 -11 3 1882 589 174 258 13 chr2 170083175 170083417 -11664670 - ORR1D1 LTR MaLR -24 350 40 3 1882 278 160 12 52 chr2 170083435 170083556 -11664531 - ORR1B1 LTR MaLR -253 141 21 3 1882 484 168 78 70 chr2 170083547 170083675 -11664412 - ORR1D1 LTR MaLR -239 135 7 3 1882 1112 174 14 82 chr2 170086032 170086251 -11661836 + MTD LTR MaLR 13 216 -203 3 1882 2427 124 59 5 chr2 170086626 170087000 -11661087 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 3 1882 2136 130 52 67 chr2 170087247 170087651 -11660436 - RMER10B LTR ERVL 0 398 1 3 1882 2261 125 57 14 chr2 170097281 170097647 -11650440 + ORR1C2 LTR MaLR 1 382 -2 3 1882 2637 162 40 42 chr2 170098554 170099107 -11648980 - RLTR31_Mur LTR ERVK 0 553 2 3 1882 1285 120 11 63 chr2 170099514 170099867 -11648220 + RMER17C LTR ERVK 9 410 0 3 1882 1272 160 156 30 chr2 170100266 170100594 -11647493 + ORR1C1 LTR MaLR 1 369 -9 3 1882 2369 160 58 83 chr2 170107969 170108500 -11639587 + RMER20B LTR ERVK 12 529 -98 3 1882 1239 208 149 3 chr2 170118902 170119197 -11628890 + ORR1D1 LTR MaLR 1 338 -36 4 1882 2266 94 21 33 chr2 170121393 170121724 -11626363 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 4 1882 228 333 35 79 chr2 170122529 170122541 -11625546 + MT2B LTR ERVL 160 201 -400 4 1882 228 333 35 79 chr2 170122627 170122643 -11625444 + MT2B LTR ERVL 202 268 -333 4 1882 3670 23 9 0 chr2 170123736 170124168 -11623919 + RLTR10C LTR ERVK 1 436 0 4 1882 2675 60 0 25 chr2 170125260 170125617 -11622470 + RLTR10B2 LTR ERVK 18 365 0 4 1882 327 257 17 103 chr2 170127856 170127973 -11620114 - MT2B LTR ERVL -343 258 152 4 1882 810 226 131 104 chr2 170128425 170128761 -11619326 + ORR1E LTR MaLR 6 350 -9 4 1882 987 256 5 0 chr2 170130147 170130358 -11617729 - MTD LTR MaLR -202 217 6 4 1883 1232 103 8 23 chr2 170141387 170141591 -11606496 + ORR1A0 LTR MaLR 185 366 -4 4 1883 2407 57 53 15 chr2 170141591 170141932 -11606155 + ORR1A0-int LTR MaLR 1 354 -1438 4 1883 2163 141 59 8 chr2 170142809 170143166 -11604921 - ORR1B1 LTR MaLR -15 379 5 4 1883 350 322 91 48 chr2 170148775 170148984 -11599103 - MLT1J LTR MaLR -293 219 2 4 1883 1235 198 208 33 chr2 170152034 170152399 -11595688 - RLTR23 LTR ERV1 -1 429 1 5 1883 681 315 27 98 chr2 170154715 170155123 -11592964 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 5 1883 783 194 118 5 chr2 170157691 170157878 -11590209 - MTD LTR MaLR -14 405 198 5 1883 1864 216 40 79 chr2 170159776 170160295 -11587792 - RLTR20B3 LTR ERVK -58 519 21 5 1883 2816 169 73 39 chr2 170162618 170162717 -11585370 - RMER4B LTR ERVK -1 584 466 5 1883 2342 140 216 25 chr2 170162717 170163207 -11584880 - RLTR31A_Mm LTR ERVK 0 584 1 5 1883 2816 169 73 39 chr2 170163207 170163669 -11584418 - RMER4B LTR ERVK -120 465 4 5 1883 1230 197 82 48 chr2 170163705 170164071 -11584016 - MT2B LTR ERVL -59 542 1 5 1883 301 341 97 67 chr2 170164071 170164350 -11583737 - LTR16C LTR ERVL -151 338 96 5 1883 2027 97 121 0 chr2 170164740 170165030 -11583057 - ORR1A2 LTR MaLR -2 325 1 5 1883 1310 150 43 63 chr2 170165216 170165515 -11582572 - RLTR11B LTR ERVK 0 453 161 5 1883 1412 153 26 32 chr2 170165516 170165797 -11582290 - RLTR11B LTR ERVK -162 283 6 5 1883 368 116 18 3 chr2 170174198 170174265 -11573822 + MTD LTR MaLR 308 405 -14 5 1883 385 299 151 54 chr2 170175469 170175727 -11572360 + MLT1K LTR MaLR 201 483 -112 5 1883 238 340 60 60 chr2 170179293 170179372 -11568715 + RLTR21 LTR ERVK 1087 1165 -407 5 1883 238 340 60 60 chr2 170179392 170179478 -11568609 + RLTR21 LTR ERVK 1166 1252 -320 5 1883 408 317 97 31 chr2 170180483 170180738 -11567349 + MLT1B LTR MaLR 104 374 -16 5 1883 1267 216 31 37 chr2 170183203 170183291 -11564796 + ORR1C1 LTR MaLR 77 166 -212 5 1883 1267 216 31 37 chr2 170183326 170183531 -11564556 + ORR1C1 LTR MaLR 167 368 -10 5 1883 1321 208 93 45 chr2 170183797 170183992 -11564095 + ORR1D2 LTR MaLR 1 206 -164 5 1883 1321 208 93 45 chr2 170184178 170184335 -11563752 + ORR1D2 LTR MaLR 207 370 0 5 1883 1463 184 182 125 chr2 170185426 170185930 -11562157 - MT2A LTR ERVL 0 533 1 5 1883 1757 187 71 11 chr2 170192410 170192761 -11555326 + ORR1D1 LTR MaLR 1 372 -2 6 1883 2992 121 38 47 chr2 170193285 170193815 -11554272 + RLTR31_Mm LTR ERVK 1 525 -36 6 1883 1675 201 64 37 chr2 170197629 170198037 -11550050 + MTD LTR MaLR 1 419 0 6 1883 882 271 115 0 chr2 170199061 170199330 -11548757 + RMER5 LTR ERV1 220 519 -15 6 1883 244 261 25 67 chr2 170215793 170215912 -11532175 + RMER12 LTR ERVK 745 858 -464 6 1883 3102 66 8 2 chr2 170216492 170216886 -11531201 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 1883 945 277 19 133 chr2 170219033 170219454 -11528633 + MTE2a LTR MaLR 7 379 0 6 1883 947 274 16 77 chr2 170220772 170221172 -11526915 - MTEa LTR MaLR -4 375 16 6 1883 1926 138 47 109 chr2 170221172 170221577 -11526510 - ORR1C2 LTR MaLR -2 382 3 6 1883 707 224 27 20 chr2 170221577 170221590 -11526497 - MTEa LTR MaLR -364 15 1 6 1883 717 264 141 124 chr2 170225407 170225761 -11522326 + MTE2a LTR MaLR 5 364 -15 6 1883 225 294 29 98 chr2 170229318 170229420 -11518667 - RMER17A LTR ERVK -22 729 635 6 1883 1896 113 18 3 chr2 170238343 170238626 -11509461 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 40 7 1883 574 275 229 80 chr2 170241795 170241985 -11506102 - MLT1D LTR MaLR -27 478 239 7 1883 574 275 229 80 chr2 170242028 170242213 -11505874 - MLT1D LTR MaLR -267 238 47 7 1883 698 283 118 47 chr2 170243638 170244001 -11504086 + MLT1B LTR MaLR 1 389 -1 7 1883 236 262 56 67 chr2 170249145 170249235 -11498852 + MLT1A LTR MaLR 282 370 -4 7 1883 255 345 0 22 chr2 170255372 170255464 -11492623 - MTEa LTR MaLR -15 364 275 7 1883 866 218 108 70 chr2 170260174 170260643 -11487444 + RLTR20C LTR ERVK 1 568 0 7 1883 299 346 95 89 chr2 170260716 170261052 -11487035 + ORR1E LTR MaLR 18 355 -4 7 1884 1540 229 100 8 chr2 170262878 170263239 -11484848 + MTD LTR MaLR 26 419 0 7 1884 1203 288 18 44 chr2 170266333 170266722 -11481365 - MTEa LTR MaLR 0 379 1 7 1884 311 318 18 98 chr2 170266722 170266860 -11481227 + MTEa LTR MaLR 108 232 -147 7 1884 2959 197 25 24 chr2 170267142 170267739 -11480348 + RLTR18 LTR ERVK 15 612 -4 7 1884 255 234 11 135 chr2 170286205 170286294 -11461793 - MT2B LTR ERVL -369 232 155 8 1884 235 407 34 34 chr2 170286655 170286861 -11461226 + MLT2F LTR ERVL 185 390 -273 8 1884 517 239 12 59 chr2 170288032 170288201 -11459886 - RLTR14 LTR ERV1 -1 381 221 8 1884 1065 186 135 72 chr2 170297211 170297529 -11450558 - RLTR18 LTR ERVK -278 338 1 8 1884 860 264 82 9 chr2 170301695 170301928 -11446159 - MTEb LTR MaLR 0 379 130 8 1884 887 238 43 5 chr2 170302483 170302690 -11445397 - MTE2a LTR MaLR -164 215 1 8 1884 2198 88 42 10 chr2 170305784 170306093 -11441994 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 8 1884 593 211 26 0 chr2 170307644 170307758 -11440329 + ORR1E LTR MaLR 6 122 -237 8 1884 262 281 93 34 chr2 170307882 170308000 -11440087 + ORR1E LTR MaLR 212 336 -23 8 1884 348 257 82 103 chr2 170316087 170316282 -11431805 - MT2B LTR ERVL -338 263 73 8 1884 700 177 152 81 chr2 170331626 170331823 -11416264 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 174 9 1884 468 274 0 82 chr2 170333782 170333941 -11414146 - MLT1A1 LTR MaLR -12 396 251 9 1884 540 253 31 115 chr2 170334042 170334234 -11413853 + RMER15 LTR ERVL 386 561 -14 9 1884 674 297 37 51 chr2 170342912 170343257 -11404830 + RLTR17 LTR ERVK 32 426 -266 9 1884 692 216 226 124 chr2 170345704 170345979 -11402108 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 68 9 1884 296 247 0 90 chr2 170346490 170346579 -11401508 - MT2B2 LTR ERVL -345 239 159 9 1884 2237 121 107 0 chr2 170347821 170348177 -11399910 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 9 1884 2726 134 9 7 chr2 170349767 170350187 -11397900 + MTC LTR MaLR 1 421 0 9 1884 1560 264 92 24 chr2 170350686 170351186 -11396901 - RMER5 LTR ERV1 0 534 1 9 1884 2852 121 26 7 chr2 170351504 170351929 -11396158 + RMER19B LTR ERVK 466 898 -4 9 1884 1288 252 78 14 chr2 170351930 170352288 -11395799 + RLTR17 LTR ERVK 233 613 -79 9 1884 1087 276 59 22 chr2 170353540 170353896 -11394191 - MTE2b LTR MaLR -10 369 1 9 1884 1249 254 41 91 chr2 170355192 170355233 -11392854 - RLTR11B LTR ERVK -22 431 391 9 1884 1249 254 41 91 chr2 170355258 170355654 -11392433 - RLTR11B LTR ERVK -63 390 18 9 1884 294 292 81 30 chr2 170356986 170357085 -11391002 - MLT1K LTR MaLR -344 251 148 9 1884 261 309 77 41 chr2 170357435 170357604 -11390483 - MLT1F2 LTR MaLR -8 552 378 9 1884 323 325 52 92 chr2 170357783 170357956 -11390131 - MLT1F2 LTR MaLR -338 222 57 9 1884 1142 251 134 3 chr2 170360905 170361240 -11386847 - MTEa LTR MaLR 0 379 1 9 1884 1678 121 111 97 chr2 170361775 170362179 -11385908 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 9 1884 1611 230 69 14 chr2 170363729 170364189 -11383898 - RMER20A LTR ERVK 0 516 11 9 1884 394 274 131 19 chr2 170368569 170368729 -11379358 - RMER5 LTR ERV1 0 534 357 1 1884 2137 122 9 18 chr2 170368746 170369072 -11379015 + MTB_Mm LTR MaLR 5 327 -80 1 1884 836 252 101 52 chr2 170369099 170369182 -11378905 + RMER2 LTR ERV1 261 346 -221 1 1884 836 252 101 52 chr2 170369205 170369389 -11378698 + RMER2 LTR ERV1 347 541 -26 1 1884 463 165 55 34 chr2 170369389 170369501 -11378586 + MTB_Mm LTR MaLR 269 407 0 1 1884 1456 174 92 3 chr2 170369504 170369799 -11378288 - RMER5 LTR ERV1 -211 323 3 1 1884 6114 170 68 89 chr2 170369833 170371267 -11376820 + RMER12B LTR ERVK 1 1404 0 1 1884 2603 142 37 15 chr2 170372193 170372601 -11375486 - MTC LTR MaLR -4 417 1 1 1884 1735 148 97 46 chr2 170376703 170376860 -11371227 + RMER17C LTR ERVK 1 179 -231 1 1884 1735 148 97 46 chr2 170376963 170377195 -11370892 + RMER17C LTR ERVK 180 410 0 1 1884 2612 52 0 66 chr2 170378487 170378837 -11369250 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 1 1884 1101 194 146 17 chr2 170379064 170379352 -11368735 - RMER16 LTR ERVK -96 437 113 1 1884 321 276 16 72 chr2 170379413 170379538 -11368549 + MT2B LTR ERVL 147 264 -337 1 1884 1186 279 65 10 chr2 170379668 170379976 -11368111 - MTEb LTR MaLR -49 330 6 1 1884 414 346 41 14 chr2 170381487 170381707 -11366380 - LTR40b LTR ERVL 0 462 237 1 1884 413 308 64 44 chr2 170381897 170382101 -11365986 - LTR40b LTR ERVL -242 277 70 1 1884 1066 263 67 19 chr2 170383508 170383822 -11364265 - RMER5 LTR ERV1 0 534 206 1 1884 1502 98 161 4 chr2 170392009 170392264 -11355823 - RLTR10A LTR ERVK 0 411 117 1 1884 3278 48 8 2 chr2 170392808 170393206 -11354881 + MTB LTR MaLR 1 400 0 1 235 2304 172 50 0 chr2 170393393 170393793 -11354294 + MTC LTR MaLR 2 421 0 1 1885 6710 158 32 39 chr2 170393793 170394344 -11353743 + MTC-int LTR MaLR 1 552 -706 1 1885 3954 150 74 66 chr2 170394344 170394944 -11353143 - RMER19A LTR ERVK 0 737 131 1 1885 3954 150 74 66 chr2 170395089 170395217 -11352870 - RMER19A LTR ERVK -607 130 3 1 1885 6710 158 32 39 chr2 170395217 170395929 -11352158 + MTC-int LTR MaLR 553 1256 -2 1 1885 2359 123 112 5 chr2 170395931 170396307 -11351780 + MTC LTR MaLR 1 416 -5 1 1885 950 136 7 0 chr2 170398937 170399077 -11349010 - ORR1A2 LTR MaLR -176 151 11 1 1885 2700 61 3 0 chr2 170400112 170400438 -11347649 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 1 1885 268 331 128 8 chr2 170402529 170402654 -11345433 + MLT1K LTR MaLR 365 504 -91 1 1885 968 272 27 128 chr2 170402968 170403376 -11344711 + ORR1D2 LTR MaLR 1 367 -3 1 1885 552 327 5 5 chr2 170404886 170405083 -11343004 - LTR37A LTR ERV1 -21 405 209 1 1885 1611 202 58 0 chr2 170408298 170408460 -11339627 + ORR1C2 LTR MaLR 3 182 -202 1 1885 1611 202 58 0 chr2 170408484 170408682 -11339405 + ORR1C2 LTR MaLR 183 383 -1 1 1885 346 329 114 20 chr2 170408991 170409290 -11338797 - MLT1F LTR MaLR -72 497 126 1 1885 412 231 55 82 chr2 170414536 170414682 -11333405 + MTE2a LTR MaLR 6 147 -232 1 1885 333 70 0 0 chr2 170417061 170417104 -11330983 - MERVL-int LTR ERVL -1017 4468 4426 1 1885 734 199 23 0 chr2 170417172 170417303 -11330784 - MLT1B LTR MaLR -17 373 240 1 1885 489 351 72 47 chr2 170418526 170418885 -11329202 + MLT1C LTR MaLR 68 435 -32 1 1885 2539 122 40 15 chr2 170420705 170421104 -11326983 - MTC LTR MaLR -8 413 5 1 1885 903 317 140 22 chr2 170421114 170421521 -11326566 + MER21B LTR ERV1 297 751 -112 1 1885 879 206 101 13 chr2 170421533 170421824 -11326263 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 9 1 1885 399 352 80 42 chr2 170423158 170423422 -11324665 - MLT1N2 LTR MaLR -20 542 269 1 1885 232 311 22 22 chr2 170424292 170424384 -11323703 + RMER15 LTR ERVL 389 480 -95 1 1885 3053 134 100 15 chr2 170425760 170426299 -11321788 - RMER4B LTR ERVK 0 585 1 1 1885 1348 199 43 64 chr2 170426819 170427147 -11320940 + ORR1E LTR MaLR 35 355 -4 1 1885 314 349 53 24 chr2 170427245 170427492 -11320595 + MLT1L LTR MaLR 349 602 -8 1 1885 825 271 106 19 chr2 170427556 170427868 -11320219 - ORR1D2 LTR MaLR -19 351 13 1 1885 1087 283 48 35 chr2 170428455 170428850 -11319237 - MTD LTR MaLR -14 405 6 1 1885 1246 272 55 15 chr2 170429521 170429581 -11318506 + ORR1E LTR MaLR 1 62 -297 1 1885 1246 272 55 15 chr2 170429607 170429889 -11318198 + ORR1E LTR MaLR 63 357 -2 1 1885 280 200 0 32 chr2 170430324 170430386 -11317701 + MTE2b LTR MaLR 307 366 -13 1 1885 385 327 125 35 chr2 170431675 170431877 -11316210 - MLT1B LTR MaLR -26 479 265 1 1885 1259 241 94 18 chr2 170431877 170432206 -11315881 - ORR1E LTR MaLR -2 357 4 1 1885 279 222 191 6 chr2 170432241 170432402 -11315685 - MLT1B LTR MaLR -165 225 29 1 1885 710 240 39 0 chr2 170432434 170432588 -11315499 - MTE2b LTR MaLR -210 169 10 1 1885 625 266 117 0 chr2 170432653 170432841 -11315246 + MTEb LTR MaLR 170 379 0 1 1885 2974 134 0 5 chr2 170435054 170435489 -11312598 - RLTR10C LTR ERVK -3 433 1 1 1885 288 0 0 0 chr2 170437742 170437778 -11310309 + RLTR10B LTR ERVK 1 36 -256 1 1885 2243 19 114 0 chr2 170437824 170438086 -11310001 - RLTR10B LTR ERVK 0 292 1 1 1885 2328 128 50 8 chr2 170441837 170442215 -11305872 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 1 1885 803 257 79 35 chr2 170443117 170443230 -11304857 + MTEb LTR MaLR 81 196 -183 1 1885 803 257 79 35 chr2 170443295 170443435 -11304652 + MTEb LTR MaLR 197 344 -35 1 1885 833 90 0 0 chr2 170448116 170448238 -11299849 + ORR1A4 LTR MaLR 1 122 -207 1 1885 387 338 15 0 chr2 170448357 170448490 -11299597 + MTEa LTR MaLR 1 135 -244 1 1885 363 305 91 6 chr2 170449227 170449392 -11298695 - MER34A LTR ERV1 -144 427 249 1 1885 2619 56 0 50 chr2 170449507 170449866 -11298221 - ORR1A1 LTR MaLR -5 341 1 1 1885 13551 70 6 12 chr2 170449866 170451669 -11296418 - ORR1A1-int LTR MaLR 0 1792 2 1 1885 2621 37 65 36 chr2 170451670 170452006 -11296081 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 1 1885 801 248 43 47 chr2 170452310 170452564 -11295523 + MTE2a LTR MaLR 73 325 -54 1 1885 449 268 0 51 chr2 170452984 170453102 -11294985 - MER34A LTR ERV1 -457 114 3 1 1885 3138 91 39 59 chr2 170453342 170453854 -11294233 - RLTR44C LTR ERVK 0 502 1 1 1885 627 260 38 33 chr2 170459484 170459667 -11288420 - RMER5 LTR ERV1 -32 502 319 1 1885 347 285 128 11 chr2 170459693 170459881 -11288206 - RMER5 LTR ERV1 -292 242 33 1 1885 909 263 68 99 chr2 170463443 170463970 -11284117 + RLTR11A2 LTR ERVK 2 512 -15 1 1885 1041 228 152 64 chr2 170471723 170472089 -11275998 + MER57D LTR ERV1 15 433 -3 1 1885 1157 282 19 26 chr2 170473151 170473464 -11274623 - MTE2b LTR MaLR -7 372 62 1 1885 711 240 139 50 chr2 170473696 170473955 -11274132 - RMER13A LTR ERVK -578 282 1 1 1885 1274 227 169 6 chr2 170474664 170475019 -11273068 - MTD LTR MaLR -2 417 5 1 1885 1262 262 98 15 chr2 170475020 170475357 -11272730 - MTD LTR MaLR -54 365 1 1 1885 928 224 199 25 chr2 170477297 170477618 -11270469 - MTEa LTR MaLR 0 379 3 1 1885 600 239 118 10 chr2 170478675 170478878 -11269209 - MT2A LTR ERVL -8 525 301 1 1885 251 152 0 21 chr2 170486709 170486756 -11261331 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 362 1 1885 1858 135 159 3 chr2 170488540 170488874 -11259213 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 1 1 1885 360 239 32 21 chr2 170489388 170489482 -11258605 - ORR1E LTR MaLR -261 98 4 1 1885 2775 99 19 2 chr2 170494938 170495353 -11252734 - BGLII_Mus LTR ERVK 0 422 1 1 1885 2272 107 3 58 chr2 170496400 170496746 -11251341 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 1 1885 427 321 76 88 chr2 170497291 170497619 -11250468 + ORR1E LTR MaLR 36 359 0 1 1885 701 284 144 11 chr2 170498072 170498389 -11249698 - ORR1D2 LTR MaLR -5 379 1 1 1885 228 154 159 58 chr2 170498923 170498992 -11249095 - RLTR16 LTR ERVK 0 505 430 1 1885 1492 184 190 14 chr2 170499088 170499457 -11248630 - RLTR16 LTR ERVK -71 434 1 1 1885 1504 243 25 28 chr2 170500271 170500631 -11247456 - MTEb LTR MaLR -19 360 2 1 1885 278 261 111 51 chr2 170501948 170502065 -11246022 - MLT1K LTR MaLR -72 523 400 3 1885 1800 58 68 23 chr2 170509587 170509850 -11238237 + RLTR27 LTR ERVK 1 275 -34 3 1885 1312 231 71 54 chr2 170510438 170510791 -11237296 + MTE2b LTR MaLR 21 379 0 3 1885 226 314 53 79 chr2 170511083 170511235 -11236852 - LTR80B LTR ERVL -16 568 421 4 1885 1077 245 112 89 chr2 170512648 170513042 -11235045 + MTD LTR MaLR 3 405 -14 4 1885 4525 98 65 22 chr2 170514333 170515055 -11233032 + RMER6A LTR ERVK 1 753 -3 4 1885 1997 83 16 203 chr2 170515314 170515537 -11232550 + RLTR9A LTR ERVK 1 195 -173 5 1885 1997 83 16 203 chr2 170515685 170515914 -11232173 + RLTR9A LTR ERVK 196 368 0 5 1885 308 323 52 0 chr2 170517558 170517654 -11230433 + ORR1E LTR MaLR 8 108 -251 5 1885 226 217 68 107 chr2 170517890 170518096 -11229991 + RMER17A LTR ERVK 313 510 -241 5 1885 3003 94 65 0 chr2 170519170 170519616 -11228471 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 6 1886 543 325 81 57 chr2 170526396 170526765 -11221322 - LTR40c LTR ERVL -52 413 36 8 1886 3476 28 2 0 chr2 170526819 170527214 -11220873 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 8 1886 8934 57 4 0 chr2 170527214 170528308 -11219779 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 8 1886 3385 40 2 0 chr2 170528308 170528703 -11219384 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 8 1886 710 336 66 61 chr2 170529237 170529586 -11218501 - MLT1A0 LTR MaLR -13 377 3 8 1886 1061 266 85 40 chr2 170534435 170534813 -11213274 + MTD LTR MaLR 10 368 -11 9 1886 1679 204 66 26 chr2 170535419 170535767 -11212320 + ORR1B2 LTR MaLR 6 367 0 1 1886 597 302 129 33 chr2 170538719 170539051 -11209036 + MTE2a LTR MaLR 6 369 -10 1 1886 1877 171 57 19 chr2 170539223 170539696 -11208391 - RLTR31A_Mm LTR ERVK -41 520 1 1 1886 266 339 76 0 chr2 170540318 170540436 -11207651 - MLT1C LTR MaLR -156 311 185 1 1886 333 247 0 56 chr2 170541660 170541750 -11206337 - LTR37A LTR ERV1 0 426 342 1 1886 558 295 36 0 chr2 170543828 170543967 -11204120 + MTE2b LTR MaLR 1 144 -235 1 1886 1072 235 32 32 chr2 170544006 170544252 -11203835 + MTE2b LTR MaLR 105 350 -29 1 1886 376 248 78 19 chr2 170544535 170544637 -11203450 - MTEa LTR MaLR -287 92 1 1 1886 291 281 108 91 chr2 170545545 170545721 -11202366 - MLT2B4 LTR ERVL -4 552 374 1 1886 299 266 62 52 chr2 170546543 170546799 -11201288 + RMER17A2 LTR ERVK 181 437 -469 1 1886 299 266 62 52 chr2 170546978 170547027 -11201060 + RMER17A2 LTR ERVK 438 488 -418 1 1886 234 214 0 23 chr2 170553593 170553636 -11194451 + MER34A1 LTR ERV1 438 479 -108 1 1886 2673 65 3 0 chr2 170554042 170554367 -11193720 + ORR1A2 LTR MaLR 1 326 -1 1 1886 525 294 172 29 chr2 170562882 170563190 -11184897 - ORR1E LTR MaLR -7 352 1 1 1886 531 292 68 60 chr2 170565121 170565185 -11182902 - MT2A LTR ERVL -2 531 464 1 1886 531 292 68 60 chr2 170565227 170565428 -11182659 - MT2A LTR ERVL -70 463 264 1 1886 279 363 142 43 chr2 170577307 170577701 -11170386 - MLT2F LTR ERVL -230 433 1 1 1886 1031 280 104 8 chr2 170578743 170579100 -11168987 + MTD LTR MaLR 1 391 -28 1 1886 865 299 115 54 chr2 170591079 170591471 -11156616 + MTD LTR MaLR 2 417 -2 2 1886 547 273 96 43 chr2 170591856 170592086 -11156001 - RMER5 LTR ERV1 -260 274 33 2 1886 229 333 11 11 chr2 170594236 170594330 -11153757 + MLT1A LTR MaLR 2 95 -279 2 1886 624 370 120 43 chr2 170596401 170597028 -11151059 - MER21B LTR ERV1 -187 676 2 2 1886 854 215 84 13 chr2 170603348 170603574 -11144513 - MTE2a LTR MaLR -133 246 5 2 1886 984 262 113 61 chr2 170608891 170609464 -11138623 - RMER20B LTR ERVK -24 603 1 2 1886 1050 241 157 41 chr2 170612825 170613188 -11134899 + MTD LTR MaLR 1 405 -14 2 1886 520 298 139 65 chr2 170613562 170613885 -11134202 - ORR1E LTR MaLR -6 353 7 2 1886 1838 122 66 0 chr2 170614419 170614723 -11133364 + ORR1A4 LTR MaLR 6 329 0 2 1886 2213 99 9 58 chr2 170619001 170619344 -11128743 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 2 1886 649 76 0 0 chr2 170623033 170623125 -11124962 - ORR1B1 LTR MaLR -1 393 302 2 1886 2202 120 0 27 chr2 170632004 170632339 -11115748 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 2 1886 2788 150 28 59 chr2 170637416 170637995 -11110092 - RLTR31_Mm LTR ERVK 0 561 1 3 1886 235 224 10 124 chr2 170640273 170640370 -11107717 - MT2B2 LTR ERVL -344 240 155 3 1886 2783 124 33 37 chr2 170643600 170644084 -11104003 - RLTR45 LTR ERVK 0 482 1 3 1886 1974 203 16 51 chr2 170645012 170645501 -11102586 - RMER19C LTR ERVK 0 611 140 3 1886 1365 215 12 37 chr2 170649427 170649852 -11098235 - MTD LTR MaLR -25 396 7 3 1886 975 241 34 22 chr2 170651497 170651765 -11096322 + ORR1E LTR MaLR 84 354 -5 3 1887 232 188 28 99 chr2 170668863 170668934 -11079153 + MLT2B4 LTR ERVL 49 114 -442 3 1887 291 337 123 24 chr2 170669113 170669283 -11078804 + MLT2B4 LTR ERVL 106 292 -264 3 1887 468 360 96 46 chr2 170672163 170672620 -11075467 - MLT1F2 LTR MaLR -79 481 2 3 1887 257 296 20 120 chr2 170672620 170672664 -11075423 - MamGypLTR2 LTR Gypsy -950 239 206 3 1887 456 250 22 36 chr2 170675007 170675152 -11072935 + MTD LTR MaLR 223 405 -14 3 1887 978 217 152 4 chr2 170686885 170687149 -11060938 - MTD LTR MaLR -16 403 101 3 1887 1128 237 114 15 chr2 170691199 170691542 -11056545 + MTE2b LTR MaLR 1 377 -2 4 1887 710 304 53 114 chr2 170697283 170697695 -11050392 - MTD LTR MaLR -32 387 1 4 1887 2458 63 38 0 chr2 170701304 170701619 -11046468 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 4 1887 793 280 179 3 chr2 170716946 170717247 -11030840 - MTE2b LTR MaLR -11 368 15 4 1887 3438 38 2 0 chr2 170717436 170717831 -11030256 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 1887 389 263 67 17 chr2 170718395 170718515 -11029572 - ORR1E LTR MaLR -1 378 253 4 1887 5219 123 44 9 chr2 170718578 170718943 -11029144 + RMER21B LTR ERV1 1 386 -456 4 1887 3358 50 0 2 chr2 170718943 170719344 -11028743 - MTB LTR MaLR 0 400 1 4 1887 5219 123 44 9 chr2 170719344 170719791 -11028296 + RMER21B LTR ERV1 387 842 0 4 1887 631 279 67 34 chr2 170719793 170719971 -11028116 - ORR1E LTR MaLR -168 191 8 4 1887 271 333 110 61 chr2 170722123 170722369 -11025718 + MLT1J LTR MaLR 132 389 -123 4 1887 1620 140 110 18 chr2 170726487 170726667 -11021420 - ORR1B2 LTR MaLR -7 360 178 4 1887 1620 140 110 18 chr2 170726718 170726756 -11021331 - ORR1B2 LTR MaLR -190 177 121 4 1887 1620 140 110 18 chr2 170726793 170726901 -11021186 - ORR1B2 LTR MaLR -247 120 3 4 1887 2713 142 98 0 chr2 170731649 170731756 -11016331 - RLTR22_Mur LTR ERVK -4 1844 1731 4 1887 2713 142 98 0 chr2 170731805 170732164 -11015923 - RLTR22_Mur LTR ERVK -118 1730 1351 4 1887 2713 142 98 0 chr2 170732214 170732259 -11015828 - RLTR22_Mur LTR ERVK -498 1350 1285 4 1887 3281 172 44 25 chr2 170732277 170732958 -11015129 - RMER19A LTR ERVK -43 694 1 4 1887 498 84 0 0 chr2 170734207 170734278 -11013809 + ORR1A4 LTR MaLR 259 329 0 4 1887 3435 35 2 0 chr2 170741796 170742190 -11005897 + MTA_Mm LTR MaLR 2 396 0 4 1887 682 235 88 119 chr2 170744353 170744766 -11003321 - MTE2a LTR MaLR -21 398 1 4 1887 354 268 98 35 chr2 170746395 170746538 -11001549 + ORR1E LTR MaLR 1 152 -207 4 1887 613 351 47 44 chr2 170747676 170748060 -11000027 - MLT1E1A LTR MaLR -2 678 294 4 1887 306 326 12 0 chr2 170748212 170748298 -10999789 - MLT1E1A LTR MaLR -422 138 52 4 1887 419 265 45 15 chr2 170754401 170754535 -10993552 - MLT1D LTR MaLR -118 387 250 5 1887 2672 65 3 0 chr2 170755247 170755615 -10992472 - MTB LTR MaLR 0 400 32 5 1887 2136 121 15 15 chr2 170758057 170758385 -10989702 - ORR1A4 LTR MaLR -1 328 1 5 1887 1422 263 36 19 chr2 170759097 170759508 -10988579 + MTD LTR MaLR 1 418 -1 5 1887 366 290 174 16 chr2 170762220 170762462 -10985625 + RMER15 LTR ERVL 275 554 -21 5 1887 1903 85 39 30 chr2 170767524 170767899 -10980188 - ORR1A2 LTR MaLR 0 346 1 5 1887 1536 203 39 75 chr2 170777846 170778234 -10969853 + ORR1C1 LTR MaLR 1 374 -4 5 1887 409 291 19 164 chr2 170778437 170778700 -10969387 - MTE2a LTR MaLR -154 225 1 5 1887 304 314 79 34 chr2 170780663 170780841 -10967246 + RMER15 LTR ERVL 336 521 -54 5 1887 811 258 9 45 chr2 170784049 170784160 -10963927 + RLTR20D LTR ERVK 354 464 -104 5 1887 811 258 9 45 chr2 170784199 170784310 -10963777 + RLTR20D LTR ERVK 465 568 0 5 1887 686 309 108 9 chr2 170784704 170785028 -10963059 + MLT1A0 LTR MaLR 10 365 0 5 1887 1791 174 27 57 chr2 170785057 170785394 -10962693 + ORR1C2 LTR MaLR 1 339 -45 5 1887 1791 174 27 57 chr2 170785571 170785603 -10962484 + ORR1C2 LTR MaLR 340 361 -23 5 235 694 273 79 58 chr2 170786611 170786855 -10961232 - ORR1E LTR MaLR -136 248 1 5 1888 1401 229 170 62 chr2 170789186 170789698 -10958389 + RMER2 LTR ERV1 1 567 0 5 1888 304 234 61 50 chr2 170791805 170791985 -10956102 + RMER17C LTR ERVK 92 273 -137 5 1888 1316 212 86 3 chr2 170796351 170796664 -10951423 - ORR1D2 LTR MaLR -30 340 2 5 1888 840 239 158 29 chr2 170801903 170802213 -10945874 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 21 5 1888 575 250 172 89 chr2 170803399 170803737 -10944350 + MTE2a LTR MaLR 1 366 -13 6 1888 4083 56 12 2 chr2 170805636 170806134 -10941953 - RLTR1C LTR ERV1 0 503 1 6 1888 462 222 9 44 chr2 170806541 170806654 -10941433 + MTE2a LTR MaLR 13 121 -258 6 1888 239 323 41 71 chr2 170806654 170806711 -10941376 + MT2A LTR ERVL 13 177 -356 6 1888 1985 112 6 3 chr2 170807743 170808056 -10940031 + ORR1A3 LTR MaLR 13 326 0 6 1888 345 363 139 34 chr2 170810458 170810752 -10937335 - MLT1E1A LTR MaLR -65 615 291 6 1888 992 223 65 121 chr2 170812803 170813201 -10934886 + MTE2a LTR MaLR 1 376 -3 6 1888 246 323 63 24 chr2 170813572 170813699 -10934388 - MLT1E1A LTR MaLR -217 148 17 6 1888 3786 80 108 24 chr2 170814235 170814774 -10933313 - MT2B2 LTR ERVL 0 584 1 6 1888 271 350 37 24 chr2 170815002 170815166 -10932921 - MER34A1 LTR ERV1 -128 459 294 6 1888 225 229 0 20 chr2 170815315 170815364 -10932723 - MLT1E1 LTR MaLR -388 266 219 6 1888 920 265 177 74 chr2 170816990 170817409 -10930678 + MT2A LTR ERVL 1 462 -71 6 1888 2163 106 51 0 chr2 170818542 170818853 -10929234 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 6 1888 414 284 9 0 chr2 170819511 170819620 -10928467 - RMER4A LTR ERVK -134 451 342 6 1888 669 164 182 16 chr2 170819671 170819852 -10928235 - RMER4A LTR ERVK -235 231 18 6 1888 789 261 177 58 chr2 170824248 170824610 -10923477 + MTD LTR MaLR 1 405 -14 6 1888 606 312 110 31 chr2 170828830 170829121 -10918966 - MLT1A0 LTR MaLR -3 362 49 6 1888 899 214 324 0 chr2 170829213 170829494 -10918593 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 3 6 1888 2512 83 6 0 chr2 170830042 170830367 -10917720 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 6 1888 1815 145 12 6 chr2 170834027 170834347 -10913740 + ORR1A1 LTR MaLR 1 322 -24 6 1888 1489 153 54 14 chr2 170835790 170836068 -10912019 + MTC LTR MaLR 1 289 -132 6 1888 2569 216 53 113 chr2 170836106 170837153 -10910934 + MTC-int LTR MaLR 109 1093 -5 6 1888 2137 142 90 10 chr2 170837159 170837549 -10910538 + MTC LTR MaLR 1 421 0 6 1888 890 275 59 37 chr2 170841314 170841635 -10906452 + MTE2b LTR MaLR 33 360 -19 6 1888 2095 109 35 19 chr2 170842513 170842831 -10905256 + ORR1A2 LTR MaLR 5 327 0 6 1888 610 290 80 104 chr2 170845289 170845663 -10902424 - MTE2a LTR MaLR -12 367 3 6 1888 420 275 146 24 chr2 170850397 170850602 -10897485 + MTD LTR MaLR 2 231 -188 6 1888 883 226 113 80 chr2 170853156 170853580 -10894507 - RMER13A LTR ERVK -422 438 1 6 1888 228 304 14 0 chr2 170858597 170858666 -10889421 - LTR48B LTR ERV1 -5 639 570 6 1888 648 313 57 40 chr2 170859011 170859364 -10888723 + ORR1E LTR MaLR 1 359 0 6 1888 273 270 101 44 chr2 170859395 170859554 -10888533 - LTR48B LTR ERV1 -476 168 1 6 1888 437 224 61 34 chr2 170859764 170859912 -10888175 - MTEb LTR MaLR 0 379 228 6 1888 458 224 131 7 chr2 170863231 170863384 -10884703 - MTEb LTR MaLR -6 373 202 7 1888 476 294 51 56 chr2 170869291 170869525 -10878562 - ORR1E LTR MaLR -119 240 8 7 1888 321 261 142 8 chr2 170870194 170870314 -10877773 - MTE2a LTR MaLR -36 343 208 7 1888 717 258 56 68 chr2 170870429 170870679 -10877408 - MTE2a LTR MaLR -129 250 4 7 1888 472 348 170 45 chr2 170870689 170871219 -10876868 - MER21B LTR ERV1 -127 736 141 7 1888 250 347 137 18 chr2 170874940 170875166 -10872921 + MER74A LTR ERVL 68 320 -238 7 1888 738 278 119 36 chr2 170875349 170875737 -10872350 + LTR37A LTR ERV1 5 424 -2 7 1888 250 252 209 35 chr2 170883414 170883564 -10864523 - MLT1A1 LTR MaLR -10 398 180 7 1888 241 333 38 8 chr2 170883604 170883737 -10864350 - MLT1A1 LTR MaLR -270 138 2 7 1888 454 282 37 31 chr2 170884601 170884762 -10863325 + MTEa LTR MaLR 33 194 -185 7 1888 306 196 83 9 chr2 170884910 170885018 -10863069 + MTEa LTR MaLR 264 379 0 7 1888 2987 68 31 8 chr2 170888894 170889281 -10858806 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 7 1888 2092 70 3 0 chr2 170897109 170897393 -10850694 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 43 7 1888 243 154 0 0 chr2 170897480 170897519 -10850568 - ORR1A2 LTR MaLR -288 39 1 7 1888 383 267 104 147 chr2 170906991 170907240 -10840847 - MTE2a LTR MaLR 0 379 142 7 1888 322 280 50 10 chr2 170907485 170907572 -10840515 - MTE2a LTR MaLR -232 147 57 7 1888 255 232 101 0 chr2 170907921 170907990 -10840097 - MTE2a LTR MaLR -303 76 1 7 1888 2812 169 60 4 chr2 170917055 170917554 -10830533 + RMER19A LTR ERVK 1 527 -210 7 1889 648 262 141 101 chr2 170924802 170925278 -10822809 - MLT1E LTR MaLR -16 637 143 8 1889 360 353 62 15 chr2 170927089 170927348 -10820739 - LTR52 LTR ERVL -150 271 1 8 1889 1567 221 47 10 chr2 170928052 170928436 -10819651 + MTC LTR MaLR 2 399 -22 8 1889 774 342 30 28 chr2 170928850 170929250 -10818837 + MTD LTR MaLR 5 405 -14 8 1889 381 189 128 40 chr2 170934483 170934632 -10813455 + MTD LTR MaLR 251 412 -7 8 1889 253 314 67 17 chr2 170935115 170935235 -10812852 + MLT2D LTR ERVL 2 127 -287 8 1889 345 306 69 19 chr2 170935781 170935941 -10812146 + MLT1A LTR MaLR 66 233 -141 8 1889 229 317 82 64 chr2 170940160 170940254 -10807833 + RMER15 LTR ERVL 339 435 -140 8 1889 2173 103 51 0 chr2 170940254 170940565 -10807522 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 8 1889 229 317 82 64 chr2 170940565 170940689 -10807398 + RMER15 LTR ERVL 436 561 -14 8 1889 855 309 26 4 chr2 170942640 170942913 -10805174 - MTE2b LTR MaLR 0 379 101 8 1889 712 240 39 6 chr2 170943708 170943888 -10804199 + MTE2b LTR MaLR 1 186 -193 8 1889 286 227 48 58 chr2 170944190 170944293 -10803794 - MTEb LTR MaLR -3 376 275 8 1889 2183 120 88 31 chr2 170946182 170946569 -10801518 + RLTR9E LTR ERVK 1 409 0 8 1889 819 270 100 89 chr2 170948880 170949250 -10798837 - MTE2a LTR MaLR -5 374 1 8 1889 478 319 39 49 chr2 170949587 170949891 -10798196 - MLT1E2 LTR MaLR -104 523 226 8 1889 391 293 78 30 chr2 170952720 170953001 -10795086 + ORR1D2 LTR MaLR 1 351 -19 8 1889 1263 284 41 41 chr2 170953270 170953682 -10794405 - MTD LTR MaLR 0 419 8 8 1889 648 198 0 0 chr2 170957397 170957513 -10790574 - RLTR1C LTR ERV1 0 605 490 8 1889 1633 61 0 4 chr2 170957500 170957729 -10790358 - RLTR1C LTR ERV1 -275 228 1 8 1889 2361 110 3 0 chr2 170964003 170964329 -10783758 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 8 1889 429 206 135 36 chr2 170965385 170965496 -10782591 + RMER20B LTR ERVK 1 122 -505 8 1889 1412 218 169 8 chr2 170975763 170976124 -10771963 + MTD LTR MaLR 1 419 0 9 1889 2509 86 6 0 chr2 170977247 170977572 -10770515 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 9 1889 1051 248 66 4 chr2 170978242 170978501 -10769586 + ORR1D2 LTR MaLR 1 275 -95 9 1889 746 252 68 114 chr2 170988062 170988429 -10759658 + ORR1E LTR MaLR 10 359 0 9 1889 1446 249 52 11 chr2 170989965 170990331 -10757756 + MTD LTR MaLR 9 389 -30 9 1889 549 295 44 92 chr2 170991839 170992244 -10755843 + MTE2a LTR MaLR 18 405 -14 9 1889 842 259 144 25 chr2 170998071 170998416 -10749671 + MTD LTR MaLR 20 419 0 9 1889 2631 168 52 65 chr2 171008859 171009459 -10738628 - RMER19B LTR ERVK 0 902 311 1 1889 1084 126 15 31 chr2 171009446 171009642 -10738445 - RMER19B LTR ERVK -709 193 1 1 1889 3441 139 67 28 chr2 171011948 171012634 -10735453 - RMER6A LTR ERVK 0 756 44 1 1889 1205 198 172 30 chr2 171014828 171015166 -10732921 + RLTR20D LTR ERVK 176 561 -7 2 1889 284 315 87 23 chr2 171016310 171016482 -10731605 + MER74C LTR ERVL 102 284 -176 2 1889 226 351 62 14 chr2 171019882 171020090 -10727997 - LTR88b LTR Gypsy? -509 328 111 3 1889 1373 244 51 28 chr2 171021601 171021955 -10726132 + ORR1D2 LTR MaLR 7 368 -2 3 1889 360 322 114 37 chr2 171023004 171023275 -10724812 - MLT1E2 LTR MaLR -13 614 323 3 1889 257 364 0 0 chr2 171023631 171023719 -10724368 - MLT1E2 LTR MaLR -539 88 1 3 1889 575 195 127 19 chr2 171036607 171036764 -10711323 - ORR1D1 LTR MaLR -10 364 191 5 1889 694 217 92 31 chr2 171036764 171036959 -10711128 + ORR1D1 LTR MaLR 157 363 -11 5 1889 270 331 188 6 chr2 171046078 171046248 -10701839 + MLT1E3 LTR MaLR 334 534 -90 6 1889 506 306 74 143 chr2 171046401 171046737 -10701350 + MTE2a LTR MaLR 5 317 -62 6 1890 458 330 105 37 chr2 171051228 171051609 -10696478 - MLT1F LTR MaLR -77 471 65 7 1890 293 294 101 68 chr2 171057580 171057817 -10690270 - MLT1G1 LTR MaLR -235 344 100 7 1890 1977 128 40 60 chr2 171059353 171059702 -10688385 + ORR1A1 LTR MaLR 4 345 -1 8 1890 535 195 128 9 chr2 171067984 171068157 -10679930 - ORR1D1 LTR MaLR -191 176 1 1 1890 444 319 116 60 chr2 171086507 171086904 -10661183 - MLT1A0-int LTR MaLR -880 609 191 1 1890 587 315 100 15 chr2 171087662 171087933 -10660154 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 72 1 1890 610 250 5 74 chr2 171091548 171091738 -10656349 - ORR1E LTR MaLR -179 180 4 1 1890 296 270 123 62 chr2 171094320 171094482 -10653605 + ORR1E LTR MaLR 6 177 -182 1 1890 834 232 116 63 chr2 171095229 171095610 -10652477 - MTD LTR MaLR -18 401 1 1 1890 1043 257 97 50 chr2 171097158 171097539 -10650548 + MTD LTR MaLR 10 408 -11 1 1890 693 321 55 67 chr2 171101983 171102404 -10645683 - MER77 LTR ERVL -12 595 180 1 1890 903 263 109 7 chr2 171102826 171103128 -10644959 - ORR1D2 LTR MaLR -37 333 1 1 1890 751 310 119 17 chr2 171105041 171105520 -10642567 - MT2A LTR ERVL 0 533 6 1 1890 1288 173 92 4 chr2 171105767 171106039 -10642048 + MTD LTR MaLR 1 296 -123 1 1890 356 190 12 12 chr2 171107960 171108026 -10640061 + ORR1B1 LTR MaLR 1 66 -328 1 1890 1530 176 68 68 chr2 171108026 171108380 -10639707 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 41 1 1890 1985 123 9 6 chr2 171108386 171108704 -10639383 + ORR1B1 LTR MaLR 76 394 0 1 1890 383 234 91 42 chr2 171112533 171112676 -10635411 + RLTR15 LTR ERVK 2 151 -208 1 1890 1392 147 95 11 chr2 171112706 171112989 -10635098 - RLTR20B2 LTR ERVK -244 316 10 1 1890 703 302 65 27 chr2 171115889 171116151 -10631936 - MTEa LTR MaLR 0 379 108 1 1890 916 285 28 7 chr2 171120530 171120813 -10627274 - RMER15 LTR ERVL -14 561 273 1 1890 253 207 80 68 chr2 171120833 171120921 -10627166 - RMER15 LTR ERVL -436 139 51 1 1890 2071 205 17 19 chr2 171131961 171132379 -10615708 + MTD LTR MaLR 1 417 -2 2 1890 881 258 43 136 chr2 171133460 171133922 -10614165 + MTD LTR MaLR 1 419 0 2 1890 881 252 68 129 chr2 171135906 171136302 -10611785 - MTE2a LTR MaLR -7 372 1 2 1890 642 303 37 8 chr2 171138559 171138805 -10609282 - ORR1D1 LTR MaLR -15 359 107 2 1890 323 192 26 0 chr2 171138815 171138893 -10609194 + RMER4B LTR ERVK 30 109 -476 2 1890 306 281 125 28 chr2 171140851 171141002 -10607085 + MTC LTR MaLR 6 164 -255 2 1890 567 255 0 39 chr2 171148363 171148518 -10599569 - MTD LTR MaLR -229 190 42 2 1890 867 245 157 27 chr2 171152486 171152817 -10595270 + MTEb LTR MaLR 3 376 -3 2 1890 3818 106 11 101 chr2 171155568 171156367 -10591720 - RMER17A LTR ERVK -8 743 17 2 1890 368 75 157 0 chr2 171156365 171156435 -10591652 - RMER17A LTR ERVK -807 82 4 2 1890 398 272 135 40 chr2 171159150 171159402 -10588685 + ORR1E LTR MaLR 1 262 -112 2 1890 4429 165 63 21 chr2 171161075 171161900 -10586187 + RMER13A LTR ERVK 1 860 0 2 1890 250 315 23 102 chr2 171164378 171164538 -10583549 + MLT1J2 LTR MaLR 56 202 -242 2 1890 277 241 0 78 chr2 171174548 171174638 -10573449 - RLTR25B LTR ERVK -507 521 439 2 1890 273 275 10 71 chr2 171177317 171177415 -10570672 - RMER12 LTR ERVK 0 1322 1231 2 1890 3116 39 0 0 chr2 171177917 171178274 -10569813 + IAPEY2_LTR LTR ERVK 1 357 0 2 1891 1152 253 38 46 chr2 171180345 171180454 -10567633 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 272 2 1891 1798 168 122 3 chr2 171180454 171180782 -10567305 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 2 1891 1152 253 38 46 chr2 171180782 171181045 -10567042 - ORR1D1 LTR MaLR -103 271 5 2 1891 785 245 68 12 chr2 171181053 171181379 -10566708 + MTEa LTR MaLR 22 378 -1 2 1891 946 289 56 8 chr2 171187313 171187672 -10560415 - MTE2b LTR MaLR -3 376 1 3 1891 275 318 43 62 chr2 171192244 171192455 -10555632 + RMER15 LTR ERVL 325 531 -44 3 1891 291 319 145 62 chr2 171204404 171204762 -10543325 - LTR16A1 LTR ERVL -55 401 14 3 1891 1581 111 110 142 chr2 171205462 171205799 -10542288 - ORR1A2 LTR MaLR -1 326 1 3 1891 600 274 62 12 chr2 171206947 171207191 -10540896 + RMER15 LTR ERVL 286 541 -34 3 1891 279 310 16 66 chr2 171209151 171209215 -10538872 - ORR1E LTR MaLR -227 132 69 3 1891 2333 209 29 52 chr2 171209215 171209796 -10538291 - RLTR12A LTR ERVK 0 568 1 3 1891 279 310 16 66 chr2 171209796 171209852 -10538235 - ORR1E LTR MaLR -291 68 18 3 1891 305 360 89 17 chr2 171211708 171212010 -10536077 + MLT1E2 LTR MaLR 302 625 -2 3 1891 3023 38 0 0 chr2 171213149 171213495 -10534592 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 3 1891 939 269 85 3 chr2 171233670 171233953 -10514134 + RMER20B LTR ERVK 131 436 -191 3 1891 543 326 29 42 chr2 171234309 171234549 -10513538 - ORR1E LTR MaLR -15 344 108 3 1891 673 184 136 13 chr2 171236974 171237128 -10510959 - ORR1C2 LTR MaLR -15 369 197 3 1891 1891 139 85 11 chr2 171245921 171246285 -10501802 + RLTR9D LTR ERVK 1 391 -12 3 1891 979 245 142 24 chr2 171247380 171247719 -10500368 - MTEa LTR MaLR 0 379 1 3 1891 288 333 10 10 chr2 171257755 171257880 -10490207 + MLT1B LTR MaLR 238 387 -3 4 1891 786 260 126 14 chr2 171260915 171261192 -10486895 + MTD LTR MaLR 22 329 -90 4 1891 425 318 35 6 chr2 171261962 171262133 -10485954 - MER34 LTR ERV1 -247 295 120 4 1891 1781 179 85 8 chr2 171265199 171265553 -10482534 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 4 4 1891 974 266 124 19 chr2 171265850 171265984 -10482103 - MTEb LTR MaLR -16 363 215 4 1891 974 266 124 19 chr2 171266181 171266363 -10481724 - MTEb LTR MaLR -165 214 17 4 1891 284 260 203 78 chr2 171267006 171267198 -10480889 - MTD LTR MaLR -203 216 1 4 1891 1864 116 112 3 chr2 171268900 171269195 -10478892 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 4 1891 697 343 52 83 chr2 171270453 171271009 -10477078 - MTE-int LTR MaLR -39 1541 1003 4 1891 766 329 60 25 chr2 171272351 171272784 -10475303 - MTE-int LTR MaLR -1074 506 59 4 1891 767 298 17 126 chr2 171273426 171273842 -10474245 + MTE2b LTR MaLR 19 407 -14 4 1891 1167 242 23 99 chr2 171276858 171277152 -10470935 + MTE2a LTR MaLR 1 270 -109 4 1891 2463 151 128 4 chr2 171277152 171277619 -10470468 + RLTR11A LTR ERVK 1 525 -3 4 1891 1167 242 23 99 chr2 171277619 171277718 -10470369 + MTE2a LTR MaLR 271 364 -15 4 1891 394 326 68 52 chr2 171283074 171283265 -10464822 + MTE2b LTR MaLR 1 194 -185 4 1891 446 310 88 52 chr2 171283494 171283858 -10464229 - MTEa LTR MaLR 0 379 3 4 1891 410 340 111 51 chr2 171286634 171286707 -10461380 + MLT1C LTR MaLR 20 102 -365 4 1891 410 340 111 51 chr2 171286907 171287248 -10460839 + MLT1C LTR MaLR 103 459 -8 4 1891 2936 53 45 18 chr2 171288278 171288678 -10459409 - RLTR10A LTR ERVK 0 411 1 4 1891 767 318 43 71 chr2 171290488 171290840 -10457247 - ORR1E LTR MaLR -11 348 7 4 1891 3969 161 73 70 chr2 171293366 171294259 -10453828 - RMER19B LTR ERVK -7 895 1 4 1891 1734 206 29 24 chr2 171294300 171294559 -10453528 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 123 4 1891 2124 108 69 0 chr2 171294559 171294864 -10453223 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 4 1891 1734 206 29 24 chr2 171294864 171294986 -10453101 - ORR1C2 LTR MaLR -262 122 1 4 1891 4634 205 189 13 chr2 171294986 171296267 -10451820 - ORR1C2-int LTR MaLR 0 1509 4 4 1891 1087 188 246 3 chr2 171296267 171296556 -10451531 - ORR1C2 LTR MaLR -10 374 16 4 236 3371 33 8 0 chr2 171310741 171311134 -10436953 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 1892 439 332 79 28 chr2 171312073 171312580 -10435507 - MER57A-int LTR ERV1 -595 5592 5060 4 1892 340 267 29 0 chr2 171313257 171313362 -10434725 - MER57A-int LTR ERV1 -1476 4711 4604 4 1892 529 301 17 17 chr2 171313565 171313795 -10434292 - MER57A-int LTR ERV1 -1830 4357 4128 4 1892 1103 259 91 0 chr2 171313822 171314131 -10433956 - MTE2a LTR MaLR -38 341 5 4 1892 421 281 114 25 chr2 171314334 171314535 -10433552 - MER57A-int LTR ERV1 -1957 5580 5414 4 1892 1366 238 56 15 chr2 171315795 171316136 -10431951 + ORR1D2 LTR MaLR 13 367 -3 4 1892 2431 170 99 27 chr2 171324450 171324976 -10423111 - RLTR12A LTR ERVK -4 564 1 5 1892 1758 207 61 25 chr2 171325675 171326120 -10421967 + RLTR20A LTR ERVK 13 473 -68 5 1892 5030 159 46 11 chr2 171326793 171326923 -10421164 - RMER19B LTR ERVK 0 902 766 5 1892 5030 159 46 11 chr2 171326949 171327690 -10420397 - RMER19B LTR ERVK -137 765 2 5 1892 252 300 0 0 chr2 171328438 171328522 -10419565 + ORR1D2 LTR MaLR 1 84 -310 5 1892 1365 300 98 107 chr2 171328554 171329858 -10418229 + RMER12 LTR ERVK 1 1292 -30 5 1892 485 257 54 14 chr2 171329891 171330087 -10418000 + ORR1D2 LTR MaLR 154 369 -1 5 1892 1110 211 166 21 chr2 171330484 171330822 -10417265 - MTD LTR MaLR -20 399 13 5 1892 2545 117 12 24 chr2 171334688 171335109 -10412978 - MTC LTR MaLR -5 416 1 5 1892 3303 48 20 0 chr2 171345261 171345660 -10402427 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 5 1892 532 254 183 5 chr2 171348463 171348665 -10399422 - MTD LTR MaLR -181 238 1 5 1892 432 350 38 21 chr2 171355812 171356051 -10392036 - LTR16A LTR ERVL -95 356 114 5 1892 1047 241 35 14 chr2 171360495 171360785 -10387302 - MTC LTR MaLR -1 420 125 5 1892 1864 118 9 16 chr2 171363262 171363607 -10384480 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 5 1892 934 277 59 4 chr2 171367054 171367326 -10380761 + MTE2b LTR MaLR 1 287 -92 5 1892 949 264 80 0 chr2 171375865 171376141 -10371946 - MTD LTR MaLR -2 417 120 5 1892 1754 200 265 59 chr2 171383683 171383782 -10364305 - RMER19A LTR ERVK 0 737 648 5 1892 1754 200 265 59 chr2 171383919 171383940 -10364147 - RMER19A LTR ERVK -90 647 647 6 1892 1754 200 265 59 chr2 171384178 171384665 -10363422 - RMER19A LTR ERVK -90 647 1 5 1892 303 313 47 51 chr2 171386638 171386894 -10361193 + RLTR15 LTR ERVK 91 345 -14 6 1892 365 332 48 40 chr2 171387360 171387608 -10360479 - MER57C2 LTR ERV1 -137 297 48 6 1892 465 248 142 107 chr2 171390469 171390807 -10357280 - ORR1E LTR MaLR 0 359 10 6 1892 1227 236 92 56 chr2 171399239 171399630 -10348457 - MTD LTR MaLR -2 417 13 6 1892 2093 105 13 0 chr2 171401135 171401450 -10346637 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 6 1892 1796 206 26 11 chr2 171401784 171402166 -10345921 + MTC LTR MaLR 1 388 -33 6 1892 237 197 0 29 chr2 171410821 171410889 -10337198 - LTR48 LTR ERV1 -50 737 672 6 1892 630 184 47 7 chr2 171411127 171411275 -10336812 - MTEa LTR MaLR -18 361 208 6 1892 228 186 0 63 chr2 171411265 171411328 -10336759 - MTEa LTR MaLR -124 255 197 6 1892 701 303 10 10 chr2 171411305 171411505 -10336582 - MTEa LTR MaLR -124 255 56 6 1892 1178 243 45 39 chr2 171412786 171413120 -10334967 + MTE2b LTR MaLR 1 336 -43 6 1892 273 173 0 0 chr2 171413317 171413369 -10334718 + MTE2b LTR MaLR 326 377 -2 6 1892 734 310 8 49 chr2 171433721 171434071 -10314016 + MTEa LTR MaLR 40 379 0 6 1892 1418 200 191 109 chr2 171435900 171436393 -10311694 + MT2A LTR ERVL 1 533 0 6 236 449 268 32 64 chr2 171442088 171442339 -10305748 - RLTR15 LTR ERVK -84 275 33 6 1893 365 279 66 56 chr2 171444387 171444530 -10303557 - MTE2b LTR MaLR -211 168 34 6 1893 2186 139 81 51 chr2 171444530 171444939 -10303148 - MTC LTR MaLR 0 421 1 6 1893 365 277 68 41 chr2 171444939 171444972 -10303115 - MTE2b LTR MaLR -346 33 2 6 1893 395 250 137 31 chr2 171465181 171465342 -10282745 + MLT1G3 LTR MaLR 177 354 -241 7 1893 2152 143 82 14 chr2 171468236 171468604 -10279483 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 2 7 1893 320 256 25 25 chr2 171468839 171468959 -10279128 + MTE2a LTR MaLR 1 120 -299 7 1893 451 296 37 6 chr2 171468973 171469136 -10278951 + MTE2a LTR MaLR 206 373 -6 7 1893 711 259 50 120 chr2 171469680 171470128 -10277959 - MTD LTR MaLR -14 407 11 7 1893 3540 47 28 9 chr2 171474402 171474830 -10273257 + RLTR10C LTR ERVK 1 436 0 7 1893 235 292 95 26 chr2 171481320 171481436 -10266651 - ORR1E LTR MaLR -226 133 10 7 1893 288 291 125 26 chr2 171483634 171483764 -10264323 - MTE2b LTR MaLR -15 364 217 7 1893 288 291 125 26 chr2 171484106 171484127 -10263960 - MTE2b LTR MaLR -163 216 198 7 1893 460 256 81 23 chr2 171488101 171488273 -10259814 - MTE2b LTR MaLR -7 372 191 7 1893 695 291 38 6 chr2 171488782 171488965 -10259122 - MTE2b LTR MaLR -187 192 4 7 1893 980 282 119 8 chr2 171491946 171492307 -10255780 - MTD LTR MaLR -14 405 5 7 1893 534 350 111 4 chr2 171493184 171493419 -10254668 + MER21B LTR ERV1 1 260 -603 7 1893 840 280 127 21 chr2 171496680 171497059 -10251028 - MTD LTR MaLR 0 419 1 7 1893 1233 144 248 75 chr2 171500962 171501284 -10246803 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 4 1893 779 279 61 61 chr2 171502591 171502954 -10245133 + MTEa LTR MaLR 2 364 -15 7 1893 1191 213 113 35 chr2 171503777 171504122 -10243965 - ORR1D1 LTR MaLR -2 372 1 9 1893 256 229 0 0 chr2 171509888 171509936 -10238151 + ORR1E LTR MaLR 18 65 -294 2 1893 1002 263 106 29 chr2 171509955 171510303 -10237784 + MTEa LTR MaLR 1 375 -4 2 1893 241 327 54 45 chr2 171510471 171510583 -10237504 + MTEb LTR MaLR 255 367 -12 2 1893 1637 139 64 57 chr2 171514671 171515076 -10233011 - RMER17C LTR ERVK -2 408 1 2 1893 591 207 80 0 chr2 171517398 171517548 -10230539 + RMER10B LTR ERVL 189 350 -48 3 1893 1287 234 25 0 chr2 171519506 171519784 -10228303 + MTE2b LTR MaLR 90 374 -5 3 1893 291 325 46 31 chr2 171524775 171524905 -10223182 + MLT1J2 LTR MaLR 35 166 -282 4 1893 243 394 42 58 chr2 171525817 171526008 -10222079 - MLT1E2 LTR MaLR -81 572 385 5 1893 264 259 181 0 chr2 171526085 171526201 -10221886 - MLT1E2 LTR MaLR -371 256 120 5 1893 438 314 7 0 chr2 171532224 171532364 -10215723 - ORR1E LTR MaLR -218 141 1 5 1893 4265 158 71 22 chr2 171532530 171533379 -10214708 - RMER19B LTR ERVK -12 890 1 5 1893 1664 179 43 40 chr2 171534974 171535173 -10212914 - ORR1C1 LTR MaLR -4 374 171 5 1893 1664 179 43 40 chr2 171535193 171535366 -10212721 - ORR1C1 LTR MaLR -208 170 3 5 1893 282 351 53 31 chr2 171535483 171535801 -10212286 + LTR37A LTR ERV1 61 385 -41 6 1893 413 237 105 0 chr2 171536017 171536131 -10211956 + ORR1D2 LTR MaLR 241 366 -4 6 1893 2343 103 0 3 chr2 171540039 171540351 -10207736 + RLTR10E LTR ERVK 1 311 0 6 1893 1376 144 30 147 chr2 171540860 171541324 -10206763 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 6 1893 861 251 15 0 chr2 171542416 171542615 -10205472 - MTE2b LTR MaLR -175 204 3 7 1893 498 312 115 93 chr2 171546507 171547005 -10201082 + MLT1E1A LTR MaLR 41 680 0 8 1893 1309 161 49 12 chr2 171547069 171547314 -10200773 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 141 8 1893 931 113 7 0 chr2 171547750 171547901 -10200186 - ORR1B1 LTR MaLR -242 152 1 8 1893 293 305 0 12 chr2 171549255 171549338 -10198749 + MTEb LTR MaLR 1 82 -297 8 1893 476 273 19 88 chr2 171549822 171550027 -10198060 + MTEb LTR MaLR 177 367 -12 8 1893 1320 267 113 25 chr2 171556171 171556658 -10191429 + MT2A LTR ERVL 4 533 0 1 1893 4115 126 196 17 chr2 171556722 171557535 -10190552 + RMER17B LTR ERVK 1 958 0 1 1893 810 299 85 23 chr2 171558899 171559252 -10188835 - MTE2b LTR MaLR -4 375 1 1 1893 1055 236 64 15 chr2 171562274 171562541 -10185546 + MTD LTR MaLR 140 419 0 1 1893 234 266 147 11 chr2 171566133 171566228 -10181859 - MTEb LTR MaLR -218 161 54 1 1893 2595 68 3 12 chr2 171567882 171568212 -10179875 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 1 1893 4231 148 31 11 chr2 171569105 171569845 -10178242 + RMER6A LTR ERVK 1 755 -1 1 1893 1056 271 115 24 chr2 171569866 171569920 -10178167 - MTD LTR MaLR 0 419 362 1 1893 2263 105 3 61 chr2 171569920 171570265 -10177822 + ORR1A2 LTR MaLR 1 325 -2 1 1893 1056 271 115 24 chr2 171570265 171570592 -10177495 - MTD LTR MaLR -58 361 3 1 1893 2102 210 62 13 chr2 171572120 171572588 -10175499 + RLTR16 LTR ERVK 7 497 -8 1 1894 350 330 43 32 chr2 171575108 171575296 -10172791 + ORR1E LTR MaLR 3 192 -167 1 1894 507 256 96 52 chr2 171576152 171576403 -10171684 + RLTR12B LTR ERVK 17 278 -250 1 1894 1064 253 27 109 chr2 171578273 171578685 -10169402 - MTE2a LTR MaLR 0 379 2 1 1894 338 331 96 84 chr2 171579693 171580016 -10168071 + ORR1E LTR MaLR 32 358 -1 1 1894 1253 284 17 81 chr2 171584626 171585146 -10162941 - MT2A LTR ERVL -46 487 1 1 1894 1482 180 84 36 chr2 171585841 171586198 -10161889 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 1 1894 2203 116 3 58 chr2 171595130 171595478 -10152609 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 1 1894 571 288 105 31 chr2 171595973 171596318 -10151769 - MTD LTR MaLR -9 370 1 1 1894 550 306 16 124 chr2 171598902 171599276 -10148811 + MTEa LTR MaLR 34 367 -12 1 1894 1982 178 14 29 chr2 171599985 171600403 -10147684 - MTD LTR MaLR -14 405 3 1 1894 1158 206 177 16 chr2 171604338 171604497 -10143590 - RMER4B LTR ERVK -138 447 281 1 1894 1158 206 177 16 chr2 171604542 171604767 -10143320 - RMER4B LTR ERVK -305 280 2 1 1894 884 332 32 30 chr2 171608288 171608694 -10139393 - MTE-int LTR MaLR -458 1122 716 1 1894 1233 282 30 17 chr2 171608699 171609060 -10139027 + ORR1D2 LTR MaLR 1 366 -4 1 1894 376 311 57 53 chr2 171610693 171610992 -10137095 + LTR37A LTR ERV1 89 388 -38 1 1894 424 244 152 0 chr2 171612701 171612852 -10135235 + ORR1E LTR MaLR 2 165 -205 1 1894 678 200 24 102 chr2 171615765 171615971 -10132116 + MER67D LTR ERV1 22 211 -303 1 1894 766 288 16 124 chr2 171620170 171620550 -10127537 - MTE2a LTR MaLR -36 343 5 2 1894 501 206 110 8 chr2 171622890 171623017 -10125070 + ORR1D1 LTR MaLR 124 263 -111 2 1894 2051 166 13 16 chr2 171623300 171623617 -10124470 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 54 2 1894 2513 173 58 4 chr2 171623617 171624117 -10123970 - RLTR11A2 LTR ERVK 0 527 1 2 1894 2051 166 13 16 chr2 171624117 171624172 -10123915 - ORR1D1 LTR MaLR -321 53 3 2 1894 299 274 108 0 chr2 171631095 171631197 -10116890 + MLT1E1 LTR MaLR 141 253 -401 2 1894 358 254 110 27 chr2 171634867 171635013 -10113074 + MTEb LTR MaLR 196 353 -26 2 1894 896 261 23 23 chr2 171636538 171636797 -10111290 - MTEa LTR MaLR -120 259 1 2 1894 326 369 12 97 chr2 171637868 171638126 -10109961 + MLT1D LTR MaLR 261 496 -9 2 1894 4563 4 2 0 chr2 171643536 171644028 -10104059 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 2 1894 667 300 69 11 chr2 171650873 171651204 -10096883 - MTEb LTR MaLR -8 371 24 2 1894 299 365 16 37 chr2 171657376 171657564 -10090523 - MLT1K LTR MaLR -14 581 398 2 1894 325 243 0 0 chr2 171657822 171657892 -10090195 - ORR1E LTR MaLR 0 379 310 2 1894 812 254 18 35 chr2 171658655 171658883 -10089204 - ORR1E LTR MaLR -134 225 2 2 1894 664 252 138 66 chr2 171659072 171659421 -10088666 - MTEa LTR MaLR 0 379 6 2 1894 2138 153 237 25 chr2 171660013 171660570 -10087517 + RMER19A LTR ERVK 4 737 0 2 1894 557 291 90 53 chr2 171661131 171661454 -10086633 - MTEa LTR MaLR -5 374 40 2 1894 3454 70 45 7 chr2 171664477 171664941 -10083146 + RLTR45 LTR ERVK 1 482 0 2 1894 2227 129 0 18 chr2 171668150 171668482 -10079605 + ORR1A3 LTR MaLR 1 326 0 2 1894 2261 153 24 3 chr2 171669992 171670365 -10077722 + MTC LTR MaLR 1 381 -40 2 1894 560 266 14 41 chr2 171670438 171670583 -10077504 - RLTR18 LTR ERVK -4 612 472 2 1894 1204 171 271 6 chr2 171671192 171671509 -10076578 + MTD LTR MaLR 7 407 -12 2 1894 1364 239 101 6 chr2 171673455 171673800 -10074287 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 3 1894 590 265 104 144 chr2 171674330 171674713 -10073374 + ORR1D1 LTR MaLR 5 372 -2 3 1894 641 240 37 48 chr2 171688241 171688429 -10059658 - MTEb LTR MaLR -13 366 181 3 1894 695 260 0 86 chr2 171689842 171690052 -10058035 - MTEb LTR MaLR -187 192 1 3 1894 769 163 15 15 chr2 171691969 171692106 -10055981 + RMER20A LTR ERVK 7 143 -373 3 1894 1952 178 10 41 chr2 171692172 171692564 -10055523 + RMER20A LTR ERVK 137 516 0 3 1894 1818 177 77 6 chr2 171694139 171694491 -10053596 - ORR1C2 LTR MaLR -6 378 2 3 1894 281 390 105 56 chr2 171694865 171695273 -10052814 - MLT1K LTR MaLR -167 428 1 3 1894 2447 171 28 180 chr2 171700697 171701403 -10046684 - RMER19C LTR ERVK -12 599 1 3 1894 306 229 0 0 chr2 171701897 171701993 -10046094 - IAPEz-int LTR ERVK -5552 929 834 3 1895 4851 106 138 19 chr2 171704479 171705285 -10042802 - RLTR13D6 LTR ERVK 0 902 1 3 1895 253 152 75 262 chr2 171709216 171709323 -10038764 + MTE2a LTR MaLR 1 87 -292 3 1895 279 226 21 97 chr2 171709329 171709422 -10038665 + MTE2a LTR MaLR 282 367 -12 3 1895 2118 179 27 143 chr2 171712291 171712844 -10035243 + RMER19C LTR ERVK 1 489 -122 3 1895 809 296 108 112 chr2 171713029 171713188 -10034899 - RMER13A LTR ERVK -41 586 393 3 1895 809 279 134 64 chr2 171713215 171713413 -10034674 - RMER13A LTR ERVK -468 392 184 3 1895 3522 34 0 128 chr2 171713413 171713913 -10034174 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 3 1895 809 279 134 64 chr2 171713913 171714089 -10033998 - RMER13A LTR ERVK -677 183 15 3 1895 554 181 103 0 chr2 171714111 171714227 -10033860 + RMER19C LTR ERVK 484 611 0 3 1895 556 277 44 22 chr2 171716640 171716821 -10031266 - ORR1E LTR MaLR -174 185 1 3 1895 1263 133 5 0 chr2 171717725 171717920 -10030167 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 191 3 1895 2649 133 46 38 chr2 171718269 171718747 -10029340 - RLTR45 LTR ERVK 0 482 1 3 1895 1464 223 87 8 chr2 171722411 171722791 -10025296 - MTD LTR MaLR 0 419 10 3 1895 1638 169 15 121 chr2 171726195 171726591 -10021496 + ORR1B1 LTR MaLR 41 394 0 3 1895 334 309 11 0 chr2 171726809 171726903 -10021184 - MLT1D LTR MaLR -162 343 249 3 1895 411 240 50 0 chr2 171727443 171727543 -10020544 - MTEa LTR MaLR -274 105 1 3 1895 818 292 96 17 chr2 171727717 171727997 -10020090 - MTD LTR MaLR 0 419 118 3 1895 818 292 96 17 chr2 171728056 171728068 -10020019 - MTD LTR MaLR -302 117 105 3 1895 1251 210 149 12 chr2 171740044 171740367 -10007720 + ORR1D2 LTR MaLR 4 370 0 4 1895 1371 164 34 135 chr2 171742265 171742628 -10005459 + ORR1B1 LTR MaLR 17 394 0 4 1895 741 215 24 38 chr2 171742836 171743049 -10005038 - ORR1D1 LTR MaLR 0 384 175 4 1895 1036 160 6 0 chr2 171743172 171743353 -10004734 - ORR1D1 LTR MaLR -192 182 1 4 1895 4972 152 85 27 chr2 171745418 171746460 -10001627 - RLTR25A LTR ERVK 0 1103 1 4 1895 336 314 82 43 chr2 171748850 171749083 -9999004 + MLT1D LTR MaLR 83 324 -181 4 1895 806 131 7 0 chr2 171749636 171749773 -9998314 - BGLII LTR ERVK 0 421 284 4 1895 2537 191 101 9 chr2 171749773 171750419 -9997668 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -325 2001 1297 4 1895 740 147 38 57 chr2 171750409 171750568 -9997519 - RMER3D-int LTR ERVK -1146 1696 1541 4 1895 1948 179 101 16 chr2 171750615 171751115 -9996972 - RMER3D-int LTR ERVK -1309 1533 1015 4 1895 4428 14 2 12 chr2 171751251 171751749 -9996338 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 4 1895 321 0 0 0 chr2 171751749 171751787 -9996300 - MERVL-int LTR ERVL 0 5485 5448 4 1895 369 155 46 35 chr2 171751787 171751874 -9996213 - ORR1A3-int LTR MaLR -1323 640 553 4 1895 41375 17 8 1 chr2 171751874 171757161 -9990926 - MERVL-int LTR ERVL -125 5360 1 4 1895 4428 14 2 12 chr2 171757161 171757659 -9990428 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 4 1895 570 134 31 3 chr2 171757694 171757810 -9990277 - RMER3D-int LTR ERVK -2250 592 489 4 1895 759 169 0 52 chr2 171757943 171758136 -9989951 - RMER3D-int LTR ERVK -1991 851 669 4 1895 2494 85 46 8 chr2 171758175 171758568 -9989519 - BGLII LTR ERVK -13 408 1 4 1895 1184 250 45 42 chr2 171767138 171767497 -9980590 - ORR1D2 LTR MaLR -3 367 8 4 1895 2675 123 35 29 chr2 171769812 171770298 -9977789 + RMER20A LTR ERVK 22 510 -6 4 1895 515 136 0 197 chr2 171772785 171772932 -9975155 + ORR1C1 LTR MaLR 1 118 -260 4 1895 660 223 42 12 chr2 171773294 171773462 -9974625 - ORR1E LTR MaLR -185 174 2 4 1895 302 312 26 52 chr2 171775033 171775148 -9972939 + MLT1J1 LTR MaLR 40 151 -293 4 1895 1088 237 46 75 chr2 171776083 171776471 -9971616 + MTE2a LTR MaLR 1 377 -2 4 1895 468 315 52 78 chr2 171778130 171778549 -9969538 - MLT1E3 LTR MaLR -3 624 216 4 1895 875 211 6 0 chr2 171778626 171778792 -9969295 + MTEb LTR MaLR 149 315 -64 4 1895 1199 255 35 3 chr2 171779828 171780111 -9967976 + MTE2b LTR MaLR 1 292 -87 4 1895 3406 146 42 7 chr2 171780284 171780849 -9967238 + RMER4B LTR ERVK 1 585 0 4 1895 429 193 80 0 chr2 171780879 171780967 -9967120 + RMER12 LTR ERVK 754 848 -474 4 1895 1296 237 62 23 chr2 171781813 171782272 -9965815 + RMER15 LTR ERVL 5 539 -36 4 1895 5386 157 116 38 chr2 171783732 171784617 -9963470 + RMER12 LTR ERVK 4 891 -431 4 1895 5386 157 116 38 chr2 171784694 171784824 -9963263 + RMER12 LTR ERVK 892 1095 -227 4 1895 5386 157 116 38 chr2 171784903 171785012 -9963075 + RMER12 LTR ERVK 1096 1216 -106 4 1895 777 294 54 17 chr2 171785904 171786143 -9961944 - ORR1E LTR MaLR -14 345 98 5 1895 423 220 88 20 chr2 171786193 171786295 -9961792 - ORR1E LTR MaLR -248 111 3 5 1895 410 252 191 0 chr2 171788758 171788873 -9959214 + ORR1E LTR MaLR 1 137 -222 5 1895 342 348 57 21 chr2 171788903 171788999 -9959088 + ORR1E LTR MaLR 230 330 -49 5 1895 1831 234 23 13 chr2 171788999 171789397 -9958690 - MTD LTR MaLR 0 419 18 5 1895 1253 190 23 0 chr2 171789425 171789646 -9958441 + ORR1C1 LTR MaLR 153 378 0 5 1895 285 291 96 43 chr2 171790941 171791056 -9957031 - MLT1K LTR MaLR -275 320 200 5 1895 504 101 12 48 chr2 171791636 171791719 -9956368 - RLTR26 LTR ERVK -333 309 230 5 1895 730 298 89 18 chr2 171796041 171796186 -9951901 - RMER15 LTR ERVL -2 573 408 5 1895 1387 182 174 9 chr2 171796186 171796507 -9951580 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 5 1895 730 298 89 18 chr2 171796507 171796641 -9951446 - RMER15 LTR ERVL -168 407 275 5 1895 497 265 368 22 chr2 171797731 171797999 -9950088 - MTEb LTR MaLR -18 361 1 5 1895 463 360 60 81 chr2 171799436 171799866 -9948221 + MLT1K LTR MaLR 65 485 -110 5 1895 2398 58 32 0 chr2 171802421 171802730 -9945357 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 5 1895 1075 238 69 83 chr2 171805992 171806354 -9941733 + ORR1E LTR MaLR 2 358 -1 5 1895 3441 30 2 2 chr2 171809484 171809880 -9938207 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 1895 1665 225 84 5 chr2 171814956 171815336 -9932751 - MTD LTR MaLR -2 417 8 5 1895 404 85 0 0 chr2 171823039 171823098 -9924989 - RLTR16 LTR ERVK -446 59 1 5 1895 669 242 100 79 chr2 171825675 171825946 -9922141 - MTD LTR MaLR -39 380 144 5 1895 484 257 157 0 chr2 171826100 171826240 -9921847 + ORR1E LTR MaLR 13 174 -185 5 1895 6333 58 20 31 chr2 171826800 171827631 -9920456 + RLTR13B2 LTR ERVK 1 822 0 5 1895 3752 154 25 32 chr2 171827992 171828638 -9919449 - RLTR26 LTR ERVK -1 641 1 5 1895 454 158 26 0 chr2 171832470 171832546 -9915541 + RLTR41 LTR ERV1 1 78 -368 5 1896 1652 169 57 42 chr2 171839853 171840186 -9907901 + RLTR41 LTR ERV1 109 446 0 5 1896 400 365 118 41 chr2 171841007 171841253 -9906834 + MLT1F2 LTR MaLR 25 300 -260 5 1896 3253 63 2 0 chr2 171841253 171841648 -9906439 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 1896 400 365 118 41 chr2 171841648 171841790 -9906297 + MLT1F2 LTR MaLR 301 443 -117 5 1896 239 250 15 15 chr2 171842524 171842589 -9905498 - MLT1I LTR MaLR -346 65 1 5 1896 447 298 72 161 chr2 171842747 171843227 -9904860 + MLT2B1 LTR ERVL 18 440 -80 5 1896 447 298 72 161 chr2 171843427 171843498 -9904589 + MLT2B1 LTR ERVL 441 520 0 5 1896 3198 55 17 34 chr2 171845052 171845466 -9902621 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 5 1896 2848 136 40 7 chr2 171845697 171846148 -9901939 + RMER4A LTR ERVK 1 466 0 5 1896 950 128 19 37 chr2 171846150 171846312 -9901775 + RMER4A LTR ERVK 308 466 0 5 1896 236 275 74 42 chr2 171850802 171850897 -9897190 + MamGypLTR1d LTR Gypsy 710 807 -6 5 1896 2119 168 50 11 chr2 171852276 171852655 -9895432 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 6 1896 6867 179 60 9 chr2 171852655 171854091 -9893996 - ORR1B1-int LTR MaLR 0 1509 1 6 1896 2591 124 15 32 chr2 171854091 171854492 -9893595 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 6 1896 366 242 96 8 chr2 171870164 171870289 -9877798 + RLTR21 LTR ERVK 1171 1306 -266 6 1896 441 305 143 22 chr2 171873735 171873814 -9874273 - ORR1D2 LTR MaLR -4 366 284 6 1896 441 305 143 22 chr2 171873879 171874030 -9874057 - ORR1D2 LTR MaLR -87 283 110 6 1896 2324 144 45 56 chr2 171874136 171874562 -9873525 + MTC LTR MaLR 1 421 0 6 1896 2231 126 5 143 chr2 171877047 171877129 -9870958 - ORR1C1 LTR MaLR -4 374 340 6 1896 2231 126 5 143 chr2 171877274 171877625 -9870462 - ORR1C1 LTR MaLR -39 339 1 6 1896 341 373 6 48 chr2 171880177 171880343 -9867744 + MLT1N2 LTR MaLR 48 206 -356 6 1896 2302 177 34 7 chr2 171881277 171881687 -9866400 + MTC LTR MaLR 1 421 0 6 1896 235 380 71 48 chr2 171882404 171882614 -9865473 + MLT1K LTR MaLR 146 360 -235 6 1896 805 301 71 21 chr2 171886647 171886929 -9861158 + MTEa LTR MaLR 83 378 -1 6 1896 267 325 142 68 chr2 171889704 171889909 -9858178 - LTR16A LTR ERVL -227 224 5 6 1896 233 190 155 0 chr2 171890606 171890664 -9857423 - MLT1H LTR MaLR 0 549 483 6 1896 481 380 82 46 chr2 171890688 171891104 -9856983 - MLT1H LTR MaLR -118 431 1 6 1896 236 175 64 149 chr2 171894493 171894587 -9853500 + RLTR25B LTR ERVK 454 539 -489 6 1896 410 385 60 0 chr2 171897231 171897413 -9850674 - MLT1D LTR MaLR -292 213 21 6 1896 810 214 201 88 chr2 171899242 171899550 -9848537 - MTD LTR MaLR -7 412 60 6 1896 478 209 9 26 chr2 171900658 171900771 -9847316 - MTD LTR MaLR -308 111 1 6 1896 1978 114 9 72 chr2 171905172 171905520 -9842567 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 6 1896 859 291 62 63 chr2 171907273 171907641 -9840446 - MTEa LTR MaLR -6 373 20 7 1896 730 297 19 14 chr2 171909577 171909792 -9838295 - MLT1K LTR MaLR 0 595 380 7 1896 525 237 48 75 chr2 171910180 171910373 -9837714 + MTEa LTR MaLR 189 421 0 7 1896 292 275 50 0 chr2 171912383 171912463 -9835624 - MLT1K LTR MaLR -103 492 409 7 1896 239 286 24 89 chr2 171912561 171912684 -9835403 + ORR1E LTR MaLR 3 117 -242 7 1896 232 261 29 14 chr2 171912765 171912835 -9835252 + ORR1E LTR MaLR 309 379 0 7 1896 409 244 0 0 chr2 171915448 171915530 -9832557 + ORR1E LTR MaLR 1 82 -277 7 1896 232 224 179 0 chr2 171915656 171915723 -9832364 + MTEa LTR MaLR 301 379 0 7 1896 609 330 59 67 chr2 171918374 171918747 -9829340 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 7 1896 419 298 126 23 chr2 171927998 171928173 -9819914 + MLT1J LTR MaLR 246 438 -74 7 1896 923 345 48 23 chr2 171928179 171928657 -9819430 - LTR40a LTR ERVL 0 519 30 7 1896 1078 244 99 3 chr2 171929086 171929370 -9818717 + MTD LTR MaLR 48 358 -61 7 1896 404 297 70 62 chr2 171931417 171931661 -9816426 + ORR1E LTR MaLR 3 248 -111 7 1896 307 253 12 25 chr2 171931898 171931979 -9816108 + ORR1E LTR MaLR 282 361 -18 7 1896 413 75 0 0 chr2 171932638 171932691 -9815396 + MTC LTR MaLR 1 53 -368 7 1896 1925 114 83 20 chr2 171933565 171933896 -9814191 - MTC LTR MaLR 0 421 58 7 1896 1039 294 19 38 chr2 171934905 171935223 -9812864 - MTE2a LTR MaLR 0 379 68 7 1896 266 250 14 56 chr2 171935385 171935457 -9812630 - MTE2a LTR MaLR -310 69 1 7 1896 1782 168 6 39 chr2 171943034 171943369 -9804718 - RMER4A LTR ERVK 0 466 143 7 1896 4781 130 105 20 chr2 171948100 171948932 -9799155 + RMER19B LTR ERVK 1 902 0 7 1896 2338 152 40 17 chr2 171951323 171951726 -9796361 + MTC LTR MaLR 2 413 -8 7 1896 3119 78 2 2 chr2 171953853 171954253 -9793834 + MTB LTR MaLR 1 400 0 7 1896 1287 237 39 69 chr2 171954704 171955121 -9792966 - MTE2a LTR MaLR -11 408 1 7 1896 303 305 75 45 chr2 171956282 171956416 -9791671 - MLT1J1 LTR MaLR -277 167 30 7 1896 3652 8 2 0 chr2 171959468 171959862 -9788225 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 2 8 1897 1373 297 61 80 chr2 171966695 171966871 -9781216 - MLT2B3 LTR ERVL -20 697 514 8 1897 2516 130 177 87 chr2 171966871 171967504 -9780583 - RMER6C LTR ERVK 0 690 1 8 1897 1373 284 39 59 chr2 171967504 171967895 -9780192 - MLT2B3 LTR ERVL -157 513 140 8 1897 1810 164 13 97 chr2 171970267 171970663 -9777424 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 8 1897 249 325 81 102 chr2 171971163 171971458 -9776629 - MLT1C LTR MaLR -19 448 160 8 1897 239 326 110 49 chr2 171973646 171973891 -9774196 + MLT1F2 LTR MaLR 290 549 -11 8 1897 477 349 43 53 chr2 171973934 171974234 -9773853 + LTR33 LTR ERVL 20 316 -199 8 1897 434 286 30 19 chr2 171978099 171978273 -9769814 + MLT1A1 LTR MaLR 137 350 -58 8 1897 2400 152 66 0 chr2 171982177 171982572 -9765515 + MTC LTR MaLR 1 421 0 8 1897 1142 265 32 29 chr2 171982574 171982885 -9765202 - MTD LTR MaLR -90 329 18 8 1897 1403 235 62 15 chr2 171985667 171986004 -9762083 - ORR1E LTR MaLR -5 354 2 8 1897 840 236 73 10 chr2 171987069 171987274 -9760813 + MTD LTR MaLR 149 366 -53 8 1897 320 342 38 6 chr2 171989389 171989548 -9758539 - RMER15 LTR ERVL -65 510 347 8 1897 285 244 14 162 chr2 171991134 171991276 -9756811 - MLT1A0 LTR MaLR -229 136 16 8 1897 1806 190 236 26 chr2 171991467 171991959 -9756128 + RMER19B LTR ERVK 308 902 0 8 1897 238 257 51 120 chr2 171993483 171993717 -9754370 - RLTR21 LTR ERVK -318 1254 1077 8 1897 505 333 22 54 chr2 171994566 171994579 -9753508 - MTEa LTR MaLR -163 216 205 8 1897 505 333 22 54 chr2 171994727 171994935 -9753152 - MTEa LTR MaLR -175 204 2 8 1897 381 340 87 84 chr2 171996858 171997214 -9750873 + ORR1E LTR MaLR 3 359 0 8 1897 1299 236 115 61 chr2 172002045 172002249 -9745838 - RMER4A LTR ERVK -2 464 259 7 1897 1299 236 115 61 chr2 172002457 172002676 -9745411 - RMER4A LTR ERVK -208 258 18 7 1897 443 299 101 21 chr2 172003060 172003591 -9744496 + MER73 LTR ERVL 84 680 -221 1 1897 645 236 39 3 chr2 172003655 172003823 -9744264 + MTE2b LTR MaLR 13 185 -194 1 1897 272 342 30 70 chr2 172007764 172007965 -9740122 + ORR1C2 LTR MaLR 1 193 -191 1 1897 4480 4 2 0 chr2 172012452 172012933 -9735154 - LTRIS_Mm LTR ERV1 0 482 1 2 1897 6403 155 107 5 chr2 172017780 172018980 -9729107 + RMER12 LTR ERVK 1 1322 0 2 1897 263 292 70 83 chr2 172020956 172021113 -9726974 - MTD LTR MaLR 0 419 265 3 1897 242 273 64 13 chr2 172022487 172022565 -9725522 - MLT1K LTR MaLR -404 191 110 3 1897 1486 187 114 53 chr2 172028451 172028846 -9719241 + MTD LTR MaLR 1 419 0 5 1897 2033 134 7 7 chr2 172034790 172035098 -9712989 - RLTR10E LTR ERVK -3 308 1 6 1897 916 260 105 99 chr2 172039252 172039615 -9708472 - MTE2a LTR MaLR -14 365 1 6 1897 574 203 232 5 chr2 172042308 172042497 -9705590 - MTD LTR MaLR 0 419 148 7 1897 716 255 108 93 chr2 172042767 172043100 -9704987 - MTE2a LTR MaLR -39 340 3 7 1897 4130 40 8 48 chr2 172045282 172045806 -9702281 - RLTR1C LTR ERV1 0 503 1 8 1897 3207 56 18 0 chr2 172046846 172047239 -9700848 + MTB LTR MaLR 1 400 0 8 1897 877 345 23 48 chr2 172048530 172048923 -9699164 - MT2A LTR ERVL -78 455 73 8 1897 235 330 126 58 chr2 172048826 172049016 -9699071 - MTD LTR MaLR -214 205 3 8 1897 254 311 67 0 chr2 172050889 172050979 -9697108 - RMER15 LTR ERVL -109 466 371 9 1897 504 331 123 49 chr2 172051092 172051400 -9696687 + MLT1E2 LTR MaLR 1 331 -296 9 1897 819 291 67 87 chr2 172054393 172054637 -9693450 + ORR1E LTR MaLR 8 235 -124 9 1897 819 291 67 87 chr2 172054671 172054772 -9693315 + ORR1E LTR MaLR 236 346 -13 9 1897 404 307 36 0 chr2 172055042 172055182 -9692905 - LTR37A LTR ERV1 0 426 282 1 1897 250 253 86 25 chr2 172055247 172055328 -9692759 - LTR37A LTR ERV1 -257 169 84 1 1897 2906 70 15 23 chr2 172056810 172057206 -9690881 - MTB LTR MaLR 0 400 8 1 1897 460 306 78 62 chr2 172057418 172057676 -9690411 - MLT1J LTR MaLR -11 501 240 1 1897 617 213 47 31 chr2 172058035 172058294 -9689793 - MTEb LTR MaLR 0 379 77 1 1897 614 240 68 50 chr2 172058334 172058410 -9689677 - MTEb LTR MaLR -303 76 2 1 1897 510 287 155 63 chr2 172062510 172062781 -9685306 - RMER15 LTR ERVL -5 570 275 1 1897 370 250 143 77 chr2 172062948 172063213 -9684874 - MLT1J1 LTR MaLR -174 270 20 1 1897 1370 205 129 76 chr2 172066001 172066381 -9681706 - MTD LTR MaLR -1 418 19 1 1897 249 352 126 7 chr2 172071007 172071150 -9676937 + MamGypLTR1d LTR Gypsy 642 801 -12 1 1897 1052 300 66 58 chr2 172072533 172072937 -9675150 - RMER5 LTR ERV1 -9 525 114 1 1897 1052 300 66 58 chr2 172073156 172073233 -9674854 - RMER5 LTR ERV1 -421 113 40 1 1897 625 275 96 39 chr2 172077886 172078178 -9669909 + MTE2b LTR MaLR 33 370 -9 1 1897 471 274 44 0 chr2 172083372 172083507 -9664580 + MTEa LTR MaLR 236 376 -3 1 1897 1840 137 75 12 chr2 172088009 172088355 -9659732 - RLTR9A LTR ERVK 0 368 1 1 1897 1281 291 35 14 chr2 172089612 172089982 -9658105 + MTE2b LTR MaLR 1 421 0 1 1897 1037 310 55 60 chr2 172090443 172090810 -9657277 + MTEa LTR MaLR 6 370 -9 1 1897 397 309 45 41 chr2 172092471 172092714 -9655373 + RMER17C LTR ERVK 118 361 -49 1 1897 1313 147 83 191 chr2 172095442 172095887 -9652200 + RMER10B LTR ERVL 2 398 0 2 1897 249 286 25 59 chr2 172096419 172096538 -9651549 - LTR33 LTR ERVL -6 509 395 2 1898 3394 41 5 2 chr2 172097654 172098049 -9650038 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 1898 1192 229 162 0 chr2 172100189 172100504 -9647583 - ORR1D2 LTR MaLR -4 366 1 2 1898 6203 97 19 25 chr2 172102951 172103863 -9644224 - RMER17A2 LTR ERVK 0 906 1 2 1898 1851 177 76 14 chr2 172104214 172104375 -9643712 + ORR1C1 LTR MaLR 1 163 -215 2 1898 1851 177 76 14 chr2 172104414 172104608 -9643479 + ORR1C1 LTR MaLR 164 376 -2 2 1898 3009 195 102 20 chr2 172104609 172105364 -9642723 + ORR1C1-int LTR MaLR 2 818 -691 2 1898 1576 195 111 26 chr2 172105403 172105624 -9642463 - MTC LTR MaLR 0 421 176 2 1898 5251 115 28 66 chr2 172105624 172106562 -9641525 - RLTR13D6 LTR ERVK 0 902 1 2 1898 1576 195 111 26 chr2 172106562 172106680 -9641407 - MTC LTR MaLR -246 175 53 2 1898 1896 193 84 26 chr2 172106680 172107063 -9641024 - MTC LTR MaLR -2 419 15 2 1898 290 320 10 54 chr2 172107280 172107393 -9640694 - MLT2D LTR ERVL -40 520 412 2 1898 1802 234 25 63 chr2 172107769 172108279 -9639808 - RLTR16 LTR ERVK -14 491 1 2 1898 2522 121 95 0 chr2 172110326 172110706 -9637381 - MTC LTR MaLR -3 418 3 2 1898 488 269 152 42 chr2 172112420 172112703 -9635384 + ORR1E LTR MaLR 28 341 -18 2 1898 2348 114 89 6 chr2 172113502 172113862 -9634225 + ORR1B1 LTR MaLR 5 394 0 2 1898 259 261 69 87 chr2 172114437 172114714 -9633373 + RMER17C LTR ERVK 87 358 -52 2 1898 2082 131 11 106 chr2 172115170 172115623 -9632464 + RMER17C LTR ERVK 1 410 0 2 1898 2819 89 150 0 chr2 172117510 172117971 -9630116 + RLTR47_MM LTR ERV1 3 532 0 2 1898 376 312 103 72 chr2 172119392 172119713 -9628374 + MLT1A0 LTR MaLR 1 331 -34 2 1898 2208 221 92 16 chr2 172120923 172121433 -9626654 + RMER15 LTR ERVL 27 575 0 2 1898 4813 71 19 0 chr2 172127359 172127953 -9620134 + RLTR1D LTR ERV1 1 605 0 2 1898 261 320 26 0 chr2 172128054 172128132 -9619955 + MLT1J LTR MaLR 105 184 -328 2 1898 2518 179 12 10 chr2 172128400 172128812 -9619275 + MTC LTR MaLR 1 413 -8 2 1898 2735 92 90 0 chr2 172131184 172131584 -9616503 + BGLII_B LTR ERVK 4 439 -2 2 1898 3231 41 48 0 chr2 172131584 172131976 -9616111 - IAPLTR2a LTR ERVK 0 411 1 2 1898 1682 142 153 31 chr2 172132337 172132663 -9615424 + MTC LTR MaLR 5 370 -51 2 1898 1545 232 85 19 chr2 172134068 172134445 -9613642 - MTD LTR MaLR -17 402 1 2 1898 246 317 38 47 chr2 172136678 172136784 -9611303 + MT2B LTR ERVL 155 259 -342 2 1898 683 241 27 140 chr2 172139233 172139455 -9608632 + MTE2a LTR MaLR 1 197 -182 2 1898 2341 73 28 28 chr2 172139937 172140262 -9607825 + ORR1A2 LTR MaLR 1 325 -2 2 1898 1403 216 86 47 chr2 172140265 172140354 -9607733 - MTEa LTR MaLR -4 375 292 3 1898 2067 149 47 28 chr2 172140354 172140741 -9607346 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 3 1898 1403 216 86 47 chr2 172140741 172141010 -9607077 - MTEa LTR MaLR -88 291 3 3 1898 2666 52 9 6 chr2 172142600 172142926 -9605161 - IAPLTR2b LTR ERVK 0 327 1 3 1898 706 244 101 81 chr2 172143304 172143612 -9604475 - ORR1E LTR MaLR -7 352 39 3 1898 1178 245 48 103 chr2 172143958 172144354 -9603733 + MTE2a LTR MaLR 5 378 -1 3 1898 275 229 0 81 chr2 172146353 172146446 -9601641 - ORR1E LTR MaLR -341 78 2 3 1898 616 261 75 94 chr2 172146632 172146886 -9601201 + MTE2a LTR MaLR 115 363 -16 3 1898 484 342 62 26 chr2 172148470 172148665 -9599422 + MLT1F LTR MaLR 1 202 -346 3 1898 505 258 17 62 chr2 172149072 172149250 -9598837 - RLTR42-int LTR ERVK -4122 1400 1231 3 1898 1230 296 33 38 chr2 172149694 172150060 -9598027 - MTEa LTR MaLR -15 364 1 3 1898 245 354 89 24 chr2 172151769 172151937 -9596150 - MamGypLTR2c LTR Gypsy -279 789 611 3 1898 454 348 32 32 chr2 172153610 172153827 -9594260 - MLT1H LTR MaLR -263 286 70 3 1898 363 284 122 83 chr2 172155475 172155598 -9592489 - LTR48 LTR ERV1 -26 761 642 3 1898 363 284 122 83 chr2 172155680 172155809 -9592278 - LTR48 LTR ERV1 -146 641 499 3 1898 234 267 114 38 chr2 172155790 172155895 -9592192 - LTR48 LTR ERV1 -334 310 198 3 1898 1734 203 52 22 chr2 172156705 172156874 -9591213 + ORR1A2 LTR MaLR 1 168 -206 3 1898 1734 203 52 22 chr2 172156922 172157115 -9590972 + ORR1A2 LTR MaLR 169 373 -1 3 1898 1183 174 53 117 chr2 172157117 172157185 -9590902 + ORR1A2-int LTR MaLR 3 72 -1298 3 1898 1183 174 53 117 chr2 172157333 172157564 -9590523 + ORR1A2-int LTR MaLR 73 283 -1087 3 1898 3594 221 57 23 chr2 172158391 172159220 -9588867 + ORR1A2-int LTR MaLR 290 1146 -224 3 1898 1750 88 16 5 chr2 172161264 172161558 -9586529 + ORR1A2 LTR MaLR 34 338 -8 3 1898 1656 177 18 52 chr2 172162217 172162336 -9585751 + ORR1C1 LTR MaLR 5 124 -254 3 1898 2332 92 38 3 chr2 172162336 172162651 -9585436 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 2 3 1898 1656 182 19 63 chr2 172162651 172162882 -9585205 + ORR1C1 LTR MaLR 125 320 -58 3 1898 1283 223 21 155 chr2 172163063 172163134 -9584953 + ORR1C1 LTR MaLR 305 372 -2 3 1898 226 314 92 87 chr2 172163368 172163574 -9584513 + MTC LTR MaLR 211 417 -4 3 1898 2462 104 0 18 chr2 172165021 172165354 -9582733 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 3 1898 1059 277 62 74 chr2 172165541 172165931 -9582156 - MTD LTR MaLR -15 404 20 3 1898 1034 188 183 6 chr2 172175404 172175715 -9572372 + ORR1D2 LTR MaLR 5 370 0 3 1898 1049 230 121 12 chr2 172176043 172176388 -9571699 - MTEa LTR MaLR -3 376 27 3 1898 540 282 66 51 chr2 172176402 172176735 -9571352 - MLT1D LTR MaLR -56 449 112 3 1898 453 188 340 5 chr2 172179391 172179585 -9568502 - MTC LTR MaLR 0 421 163 3 1898 373 338 41 33 chr2 172186001 172186317 -9561770 + RLTR12B LTR ERVK 43 300 -228 3 1898 1372 166 41 19 chr2 172190026 172190297 -9557790 + RMER6A LTR ERVK 480 756 0 4 1898 965 181 287 26 chr2 172199093 172199475 -9548612 - RLTR20B3 LTR ERVK -95 482 1 4 1898 381 222 60 77 chr2 172199515 172199632 -9548455 - RLTR40 LTR ERVK -419 398 284 4 1898 2567 127 123 75 chr2 172202158 172202769 -9545318 - RMER6A LTR ERVK -95 661 22 4 1898 3097 27 24 34 chr2 172209463 172209878 -9538209 + IAPLTR2a LTR ERVK 1 411 0 4 1898 1811 147 0 27 chr2 172213668 172213969 -9534118 - MTC LTR MaLR -21 400 108 4 1898 259 170 109 42 chr2 172214699 172214782 -9533305 - MTC LTR MaLR -323 98 1 4 1899 2146 189 82 32 chr2 172234000 172234502 -9513585 - RLTR11A LTR ERVK -1 527 1 5 1899 254 282 123 35 chr2 172247895 172248009 -9500078 - LTR65 LTR ERV1 -502 167 44 5 1899 347 328 73 39 chr2 172250430 172250608 -9497479 - ORR1E LTR MaLR -168 191 8 5 1899 988 225 168 3 chr2 172251589 172251905 -9496182 - ORR1D1 LTR MaLR -4 370 3 5 1899 2312 137 42 7 chr2 172254081 172254487 -9493600 - MTC LTR MaLR 0 421 2 5 1899 2756 28 30 14 chr2 172260096 172260464 -9487623 - MTB LTR MaLR 0 400 27 5 1899 514 276 59 12 chr2 172261768 172261937 -9486150 - MER68 LTR ERVL -360 203 27 5 1899 250 339 26 43 chr2 172262077 172262194 -9485893 - LTR40b LTR ERVL -227 292 178 5 1899 283 320 90 19 chr2 172262450 172262606 -9485481 - LTR40b LTR ERVL -276 186 20 5 1899 303 269 105 100 chr2 172268152 172268267 -9479820 + MER21B LTR ERV1 6 123 -740 6 1899 303 269 105 100 chr2 172268412 172268486 -9479601 + MER21B LTR ERV1 124 196 -667 6 1899 439 220 99 7 chr2 172269908 172270089 -9477998 - ORR1E LTR MaLR -146 238 33 6 1899 1880 108 51 72 chr2 172270982 172271313 -9476774 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 4 6 1899 294 208 51 13 chr2 172273832 172273910 -9474177 - MLT1A1 LTR MaLR -35 373 293 6 1899 239 271 8 93 chr2 172277273 172277287 -9470800 + MT2B2 LTR ERVL 148 198 -386 6 1899 239 271 8 93 chr2 172277378 172277391 -9470696 + MT2B2 LTR ERVL 199 255 -329 6 1899 942 239 191 15 chr2 172286682 172287022 -9461065 + MTD LTR MaLR 1 400 -19 6 1899 310 187 107 0 chr2 172288411 172288486 -9459601 - MER68 LTR ERVL -349 214 132 6 1899 828 250 194 3 chr2 172291436 172291745 -9456342 - ORR1D2 LTR MaLR -2 368 1 6 1899 416 277 141 80 chr2 172301285 172301611 -9446476 + MLT1E1A LTR MaLR 308 680 0 6 1899 246 312 84 71 chr2 172308362 172308517 -9439570 + ORR1D2 LTR MaLR 6 162 -208 6 1899 332 236 8 120 chr2 172315711 172315836 -9432251 + MT2B LTR ERVL 154 264 -337 7 1899 233 281 0 0 chr2 172315995 172316052 -9432035 - MLT1G3 LTR MaLR -538 57 1 7 1899 674 293 15 20 chr2 172317685 172317880 -9430207 + ORR1D2 LTR MaLR 177 370 0 7 1899 230 209 0 0 chr2 172317885 172317928 -9430159 + ORR1D2-int LTR MaLR 5 47 -1745 7 1899 2444 86 6 50 chr2 172318180 172318522 -9429565 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 7 1899 3592 259 98 44 chr2 172318630 172320082 -9428005 + ORR1D2-int LTR MaLR 81 1527 -53 7 1899 1099 257 80 23 chr2 172320082 172320432 -9427655 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 7 1899 244 234 0 15 chr2 172320870 172320935 -9427152 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 307 7 1899 265 302 40 65 chr2 172321743 172321867 -9426220 - MLT1A LTR MaLR -235 139 19 7 1899 594 280 62 131 chr2 172323087 172323247 -9424840 + MTE2a LTR MaLR 1 137 -282 7 1899 998 194 46 47 chr2 172323391 172323673 -9424414 + MTE2a LTR MaLR 123 405 -14 7 1899 1465 165 21 175 chr2 172324908 172325242 -9422845 - RMER17C LTR ERVK 0 410 110 7 1899 1465 165 21 175 chr2 172325387 172325537 -9422550 - RMER17C LTR ERVK -301 109 1 7 1899 876 275 84 75 chr2 172329458 172329886 -9418201 - BGLII_B LTR ERVK -3 438 7 7 1899 265 349 35 35 chr2 172332767 172332880 -9415207 + MLT1F LTR MaLR 1 113 -435 7 1899 3038 74 18 3 chr2 172333228 172333619 -9414468 + MTB LTR MaLR 1 397 -3 7 1899 264 282 11 76 chr2 172336181 172336273 -9411814 + MT2B LTR ERVL 159 244 -357 7 1899 1037 263 57 92 chr2 172338303 172338739 -9409348 + MTC LTR MaLR 1 421 0 7 1899 460 271 80 40 chr2 172338986 172339186 -9408901 - MER110 LTR ERV1 -22 469 262 7 1899 1648 206 81 3 chr2 172346242 172346588 -9401499 + RLTR14 LTR ERV1 8 380 -2 8 1900 2303 197 182 55 chr2 172361578 172362232 -9385855 - RMER19A LTR ERVK 0 737 1 8 1900 1028 225 30 17 chr2 172362883 172363114 -9384973 - MTEa LTR MaLR -142 237 4 8 1900 1790 196 85 8 chr2 172363127 172363503 -9384584 - MTD LTR MaLR -14 405 1 8 1900 272 281 30 30 chr2 172364587 172364789 -9383298 - RMER17D2 LTR ERVK -357 452 251 8 1900 539 235 155 21 chr2 172364855 172365042 -9383045 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 159 8 1900 595 247 179 0 chr2 172365330 172365520 -9382567 + ORR1D2 LTR MaLR 147 370 0 8 1900 1424 205 12 34 chr2 172365520 172365843 -9382244 + ORR1D2-int LTR MaLR 1 316 -1054 8 1900 2230 276 41 54 chr2 172365833 172366569 -9381518 + ORR1D2-int LTR MaLR 454 1179 -191 8 1900 254 274 29 114 chr2 172381996 172382136 -9365951 + MT2B LTR ERVL 167 294 -307 9 1900 390 150 280 0 chr2 172388855 172388955 -9359132 + MLT1C LTR MaLR 34 161 -306 9 1900 1466 177 127 47 chr2 172394086 172394495 -9353592 + RMER10A LTR ERVL 1 442 0 9 1900 494 217 127 48 chr2 172396847 172397012 -9351075 + MTE2a LTR MaLR 39 216 -163 9 1900 557 230 135 26 chr2 172397352 172397508 -9350579 + MTE2a LTR MaLR 207 379 0 9 1900 629 272 102 78 chr2 172408941 172409236 -9338851 - MTEa LTR MaLR -1 378 77 9 1900 382 311 40 35 chr2 172409233 172409433 -9338654 - RMER15 LTR ERVL -15 560 360 9 1900 275 347 167 0 chr2 172415303 172415542 -9332545 - MLT1C LTR MaLR -125 342 64 1 1900 318 359 133 30 chr2 172425087 172425417 -9322670 - MLT1H1 LTR MaLR -174 381 18 1 1900 2172 113 19 0 chr2 172426354 172426673 -9321414 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 3 1 1900 561 269 152 25 chr2 172427521 172427719 -9320368 - MTD LTR MaLR -22 397 175 1 1900 637 303 23 28 chr2 172428175 172428389 -9319698 - MTD LTR MaLR -206 213 1 1 1900 299 181 43 98 chr2 172429775 172429867 -9318220 - MT2B LTR ERVL -362 239 153 1 1900 577 192 19 0 chr2 172431053 172431157 -9316930 + MTE2a LTR MaLR 16 121 -258 1 1900 857 245 98 12 chr2 172431293 172431549 -9316538 + MTE2a LTR MaLR 99 376 -3 1 1900 614 256 91 0 chr2 172440172 172440348 -9307739 - MLT1D LTR MaLR -55 450 259 1 1900 5631 43 0 0 chr2 172441926 172442654 -9305433 - MT-int LTR MaLR -69 1029 302 1 1900 333 313 57 69 chr2 172444228 172444475 -9303612 - RLTR12B LTR ERVK -14 514 271 1 1900 423 306 74 7 chr2 172448195 172448330 -9299757 + MTEa LTR MaLR 39 182 -197 1 1900 496 285 53 24 chr2 172448485 172448654 -9299433 + MTEa LTR MaLR 204 377 -2 1 1900 319 253 34 11 chr2 172450040 172450128 -9297959 - MLT1K LTR MaLR -30 565 476 1 1900 254 325 37 37 chr2 172459354 172459488 -9288599 - MLT1B LTR MaLR -29 361 228 1 1900 297 192 173 27 chr2 172463212 172463287 -9284800 + MTD LTR MaLR 13 98 -321 1 1900 1542 157 80 3 chr2 172463490 172463777 -9284310 + MTD LTR MaLR 109 417 -2 1 1900 265 232 0 168 chr2 172464785 172464904 -9283183 - MT2B LTR ERVL -337 264 166 1 1900 3599 18 2 0 chr2 172465189 172465584 -9282503 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1900 256 284 11 74 chr2 172471200 172471295 -9276792 + MT2B LTR ERVL 194 282 -319 1 1900 345 379 49 37 chr2 172473124 172473524 -9274563 - LTR16B1 LTR ERVL -17 446 28 1 1900 2224 180 71 15 chr2 172476771 172477235 -9270852 - RMER19C LTR ERVK 0 611 56 1 1900 680 310 53 43 chr2 172477642 172477692 -9270395 - RMER19C LTR ERVK -852 50 1 1 1900 241 264 56 22 chr2 172480363 172480452 -9267635 + MTEb LTR MaLR 286 377 -2 1 1900 847 328 42 39 chr2 172482880 172483213 -9264874 - ORR1E LTR MaLR -23 336 3 1 1900 518 262 151 113 chr2 172484300 172484384 -9263703 + ORR1E LTR MaLR 1 113 -246 1 1900 518 262 151 113 chr2 172484414 172484673 -9263414 + ORR1E LTR MaLR 114 357 -2 1 1901 297 218 153 35 chr2 172492150 172492264 -9255823 - MTD LTR MaLR -14 405 291 1 1901 4589 105 106 103 chr2 172493817 172494720 -9253367 + RMER17A2 LTR ERVK 1 906 0 1 1901 789 287 119 55 chr2 172494993 172495321 -9252766 - MTE-int LTR MaLR -1227 353 5 1 1901 232 323 98 18 chr2 172495707 172495871 -9252216 + MLT1L LTR MaLR 160 336 -274 1 1901 419 279 48 18 chr2 172498908 172499076 -9249011 + RMER15 LTR ERVL 403 575 0 1 1901 360 123 0 0 chr2 172502587 172502644 -9245443 + MTD LTR MaLR 1 57 -270 6 1901 731 157 506 16 chr2 172503036 172503289 -9244798 - ORR1C1 LTR MaLR -1 377 1 7 1901 1151 237 15 15 chr2 172504817 172505087 -9243000 + MTD LTR MaLR 18 287 -132 6 1901 2057 173 74 18 chr2 172512111 172512505 -9235582 + MTD LTR MaLR 4 419 0 2 1901 1592 171 201 89 chr2 172515026 172515488 -9232599 + RMER19C LTR ERVK 1 514 -97 3 1901 4021 112 57 9 chr2 172519549 172520213 -9227874 - RLTR19B LTR ERVK 0 715 20 4 1901 954 232 160 51 chr2 172521163 172521494 -9226593 - MTE2b LTR MaLR -2 377 11 5 1901 1422 188 48 95 chr2 172523767 172523963 -9224124 + MTD LTR MaLR 2 210 -209 6 1901 1422 188 48 95 chr2 172524110 172524271 -9223816 + MTD LTR MaLR 211 342 -77 6 1901 235 136 91 0 chr2 172524409 172524453 -9223634 + MTD LTR MaLR 364 411 -8 6 1901 346 270 75 81 chr2 172527354 172527515 -9220572 + MT2B LTR ERVL 98 257 -344 6 1901 351 296 115 64 chr2 172529368 172529703 -9218384 + MTEa LTR MaLR 1 373 -6 7 1901 2027 123 14 80 chr2 172530995 172531347 -9216740 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 8 1901 389 292 105 3 chr2 172531530 172531683 -9216404 + MTEb LTR MaLR 4 170 -209 8 1901 566 336 63 27 chr2 172531683 172531947 -9216140 + MT2A LTR ERVL 211 510 -44 8 1901 275 340 127 52 chr2 172532010 172532052 -9216035 + MT2A LTR ERVL 511 552 -2 8 1901 1263 239 41 94 chr2 172532443 172532836 -9215251 + MTE2a LTR MaLR 1 372 -7 8 1901 969 320 96 53 chr2 172535113 172535760 -9212327 - RMER13A LTR ERVK -184 676 2 9 1901 277 256 60 12 chr2 172536974 172537057 -9211030 - MLT1A1 LTR MaLR -2 406 320 9 1901 1984 140 19 80 chr2 172540300 172540711 -9207376 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 1 1 1901 891 265 135 49 chr2 172545195 172545544 -9202543 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 1 1901 847 271 142 24 chr2 172545843 172546173 -9201914 - MTEa LTR MaLR 0 379 11 1 1901 1672 110 139 3 chr2 172547969 172548279 -9199808 + ORR1B1 LTR MaLR 2 353 -41 1 1901 457 258 24 8 chr2 172548882 172549007 -9199080 + MTE2b LTR MaLR 20 146 -233 1 1901 438 271 125 0 chr2 172549038 172549182 -9198905 + MTE2b LTR MaLR 116 277 -102 1 1901 435 368 64 8 chr2 172549282 172549518 -9198569 - MER34A LTR ERV1 -159 412 164 1 1901 607 267 85 30 chr2 172549719 172549920 -9198167 - MTD LTR MaLR -14 405 194 1 1901 879 214 71 10 chr2 172550292 172550490 -9197597 - MTD LTR MaLR -209 210 1 1 1901 804 294 167 6 chr2 172562818 172563136 -9184951 - MTEa LTR MaLR -9 370 2 1 1901 459 255 80 80 chr2 172563860 172564060 -9184027 - MT2B LTR ERVL -337 264 65 1 1901 283 278 97 60 chr2 172566981 172567115 -9180972 + MLT1D LTR MaLR 320 458 -47 1 1901 2594 86 0 0 chr2 172567133 172567457 -9180630 - ORR1A2 LTR MaLR -3 324 1 1 1901 3075 14 5 92 chr2 172569242 172569644 -9178443 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 1 1901 53240 26 13 1 chr2 172569696 172576098 -9171989 + IAPEz-int LTR ERVK 84 6481 0 1 1901 3075 14 5 92 chr2 172576098 172576500 -9171587 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 1 1901 520 199 107 52 chr2 172577592 172577825 -9170262 + RMER17C LTR ERVK 1 246 -164 1 1901 289 310 61 9 chr2 172587352 172587466 -9160621 + MT2A LTR ERVL 343 462 -71 1 1901 265 306 14 0 chr2 172587663 172587735 -9160352 + MTEa LTR MaLR 8 80 -299 1 1901 235 259 66 127 chr2 172589085 172589266 -9158821 + ORR1E LTR MaLR 24 193 -166 1 1901 2591 137 166 28 chr2 172589959 172590424 -9157663 - RLTR24 LTR ERV1 0 529 1 1 1901 316 333 86 7 chr2 172590953 172591104 -9156983 + LTR37A LTR ERV1 122 284 -142 1 1901 573 255 140 47 chr2 172592689 172592882 -9155205 + ORR1E LTR MaLR 2 212 -147 2 1901 522 311 100 68 chr2 172593516 172593974 -9154113 + RLTR12B LTR ERVK 42 514 -14 2 1901 250 293 0 109 chr2 172607360 172607498 -9140589 + RMER12 LTR ERVK 732 854 -468 2 1901 666 212 63 26 chr2 172608989 172609178 -9138909 + ORR1E LTR MaLR 10 205 -154 2 1901 2106 66 3 3 chr2 172609865 172610154 -9137933 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 31 2 1901 3238 58 0 12 chr2 172616400 172616801 -9131286 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 1901 617 243 37 7 chr2 172620110 172620285 -9127802 - MTEb LTR MaLR -7 372 171 2 1901 329 340 99 0 chr2 172620388 172620529 -9127558 + MLT1K LTR MaLR 112 266 -329 2 1901 595 222 111 0 chr2 172620857 172621010 -9127077 + ORR1E LTR MaLR 1 170 -189 2 1901 341 255 74 19 chr2 172621025 172621133 -9126954 + ORR1E LTR MaLR 266 379 0 2 1902 1109 193 99 153 chr2 172627924 172628050 -9120037 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 256 2 1902 1109 193 99 153 chr2 172628228 172628241 -9119846 - ORR1C2 LTR MaLR -129 255 255 2 1902 1109 193 99 153 chr2 172628419 172628682 -9119405 - ORR1C2 LTR MaLR -129 255 3 2 1902 978 235 120 7 chr2 172628866 172629149 -9118938 + ORR1E LTR MaLR 26 340 -19 2 1902 2222 128 71 6 chr2 172629663 172629823 -9118264 + ORR1C1 LTR MaLR 4 165 -213 2 1902 2222 128 71 6 chr2 172629888 172630078 -9118009 + ORR1C1 LTR MaLR 166 377 -1 2 1902 1099 194 19 0 chr2 172630613 172630819 -9117268 + MTC LTR MaLR 1 210 -211 2 1902 976 157 107 24 chr2 172631063 172631269 -9116818 + MTC LTR MaLR 197 405 -14 2 1902 741 220 43 34 chr2 172634431 172634674 -9113413 - LTRIS4 LTR ERV1 0 519 286 2 1902 501 307 151 14 chr2 172651377 172651655 -9096432 + MLT1L LTR MaLR 125 440 -170 3 1902 347 164 15 154 chr2 172653136 172653266 -9094821 + ORR1E LTR MaLR 1 112 -247 3 1902 314 271 80 58 chr2 172653301 172653438 -9094649 + ORR1E LTR MaLR 240 379 0 3 1902 673 244 68 22 chr2 172654947 172655228 -9092859 + MTE2a LTR MaLR 35 379 0 3 1902 272 328 90 39 chr2 172657089 172657267 -9090820 + MLT1D LTR MaLR 20 206 -299 3 1902 697 298 99 25 chr2 172661024 172661347 -9086740 - MTEa LTR MaLR 0 379 33 3 1902 236 271 158 30 chr2 172662991 172663124 -9084963 + MLT1E2 LTR MaLR 2 151 -503 3 1902 269 305 62 28 chr2 172663298 172663477 -9084610 + MLT1E2 LTR MaLR 281 469 -155 3 1902 537 335 88 28 chr2 172668949 172669268 -9078819 + ORR1E LTR MaLR 14 351 -8 3 1902 2340 110 6 42 chr2 172672491 172672850 -9075237 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 3 1902 1137 239 59 83 chr2 172673027 172673414 -9074673 - MTE2b LTR MaLR 0 379 2 3 1902 1264 224 100 17 chr2 172675590 172675890 -9072197 + MTEa LTR MaLR 1 325 -54 3 1902 785 168 20 61 chr2 172682566 172682651 -9065436 - ORR1D1 LTR MaLR -183 191 114 3 1902 4364 139 13 13 chr2 172682651 172683342 -9064745 + RLTR17 LTR ERVK 2 692 0 3 1902 785 168 20 61 chr2 172683342 172683453 -9064634 - ORR1D1 LTR MaLR -261 113 3 3 1902 1091 286 72 10 chr2 172684084 172684365 -9063722 + MTD LTR MaLR 8 306 -113 3 1902 713 229 91 34 chr2 172684365 172684573 -9063514 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 155 3 1902 790 176 85 28 chr2 172684700 172684876 -9063211 - ORR1D1 LTR MaLR -188 186 1 3 1902 367 305 29 0 chr2 172684876 172684981 -9063106 + MTD LTR MaLR 300 407 -12 3 1902 668 267 170 7 chr2 172685484 172685767 -9062320 - ORR1D2 LTR MaLR -41 329 1 3 1902 1052 216 109 38 chr2 172699492 172699843 -9048244 + RLTR20D LTR ERVK 5 381 -187 4 1902 1141 218 109 10 chr2 172707102 172707413 -9040674 + MTEa LTR MaLR 37 378 -1 4 1902 1048 213 177 10 chr2 172708969 172709268 -9038819 + MTEa LTR MaLR 31 379 0 4 1902 1258 216 131 3 chr2 172717141 172717462 -9030625 + ORR1D2 LTR MaLR 1 362 -8 4 1902 2109 89 3 158 chr2 172717765 172718085 -9030002 + ORR1A2 LTR MaLR 1 270 -57 4 1902 2109 89 3 158 chr2 172718232 172718297 -9029790 + ORR1A2 LTR MaLR 271 326 -1 4 1902 744 293 81 63 chr2 172721050 172721385 -9026702 + MLT1A0 LTR MaLR 23 363 -2 4 1902 2532 143 5 5 chr2 172723314 172723735 -9024352 + MTC LTR MaLR 1 421 0 4 1902 276 341 8 31 chr2 172723811 172723941 -9024146 - ORR1E LTR MaLR -45 325 199 4 1902 1727 158 92 121 chr2 172723990 172724435 -9023652 + RMER19B LTR ERVK 1 432 -470 4 1902 1916 124 34 16 chr2 172724433 172724753 -9023334 + RMER19B LTR ERVK 576 901 -1 4 1902 404 276 21 0 chr2 172724818 172724938 -9023149 - ORR1E LTR MaLR -239 131 1 4 1902 230 220 68 0 chr2 172725009 172725068 -9023019 + MLT1A0 LTR MaLR 399 461 -94 4 1902 907 227 166 30 chr2 172743207 172743538 -9004549 - MTE2a LTR MaLR -3 376 1 4 1902 2193 128 49 91 chr2 172744448 172744550 -9003537 + MTC LTR MaLR 1 67 -354 4 1902 2193 128 49 91 chr2 172744578 172744906 -9003181 + MTC LTR MaLR 68 413 -8 4 1903 406 211 11 0 chr2 172756828 172756918 -8991169 - ORR1E LTR MaLR -259 100 10 5 1903 247 254 62 27 chr2 172772113 172772158 -8975929 - ORR1B1-int LTR MaLR -856 653 604 5 1903 266 229 376 17 chr2 172778625 172778798 -8969289 + MLT1F2 LTR MaLR 82 316 -244 5 1903 876 210 58 44 chr2 172780096 172780355 -8967732 - MTC LTR MaLR -2 419 113 5 1903 1608 213 28 52 chr2 172780410 172780956 -8967131 - RMER17A LTR ERVK 0 751 257 5 1903 2499 139 16 15 chr2 172780962 172781438 -8966649 - RMER17A LTR ERVK -417 472 1 5 1903 257 330 123 84 chr2 172781655 172782046 -8966041 - MLT1J LTR MaLR -73 439 34 5 1903 317 264 132 58 chr2 172790559 172790764 -8957323 + RLTR40 LTR ERVK 573 792 -25 5 1903 1071 251 109 27 chr2 172792049 172792380 -8955707 + ORR1E LTR MaLR 2 359 0 5 1903 1187 243 173 6 chr2 172795061 172795384 -8952703 - MTE2b LTR MaLR 0 379 3 6 1903 4408 100 22 156 chr2 172795612 172796463 -8951624 - RMER19A LTR ERVK 0 737 1 6 1903 237 275 106 24 chr2 172796604 172796727 -8951360 + MLT1K LTR MaLR 441 573 -22 6 1903 553 226 67 8 chr2 172801286 172801420 -8946667 + MTEa LTR MaLR 5 146 -233 6 1903 276 308 89 77 chr2 172801420 172801455 -8946632 + MT2A LTR ERVL 5 175 -358 6 1903 610 178 141 31 chr2 172801776 172801967 -8946120 + RMER17C LTR ERVK 45 256 -154 6 1903 888 179 148 53 chr2 172801947 172802048 -8946039 - RMER17C LTR ERVK -100 310 180 6 1903 888 179 148 53 chr2 172802112 172802293 -8945794 - RMER17C LTR ERVK -231 179 1 6 1903 387 208 14 0 chr2 172802306 172802378 -8945709 + MTE2a LTR MaLR 16 88 -291 6 1903 929 224 203 23 chr2 172802536 172802797 -8945290 + MTE2a LTR MaLR 71 378 -1 6 1903 1390 142 66 109 chr2 172803968 172804316 -8943771 + RMER17C LTR ERVK 1 333 -77 6 1903 378 301 95 14 chr2 172813210 172813358 -8934729 - MLT1A0 LTR MaLR -185 180 21 6 1903 2404 139 85 0 chr2 172823621 172824009 -8924078 - MTC LTR MaLR 0 421 1 6 1903 341 215 43 161 chr2 172827845 172827900 -8920187 - RLTR25B LTR ERVK -440 588 447 6 1903 620 189 196 0 chr2 172830812 172830960 -8917127 - ORR1D2 LTR MaLR -17 353 177 6 1903 253 136 45 0 chr2 172830972 172831016 -8917071 - ORR1D2 LTR MaLR -328 46 1 6 1903 1853 143 139 27 chr2 172832792 172833122 -8914965 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 6 1903 1844 116 56 16 chr2 172836865 172837171 -8910916 - ORR1A3 LTR MaLR -8 318 1 6 1903 2718 123 21 46 chr2 172839098 172839576 -8908511 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 10 6 1903 225 111 20 82 chr2 172843154 172843203 -8904884 - MLT1L LTR MaLR -217 393 348 6 1903 301 315 94 47 chr2 172868082 172868252 -8879835 - MLT1E2 LTR MaLR -11 616 439 7 1903 279 313 77 17 chr2 172871812 172871929 -8876158 - MT2B LTR ERVL -344 257 134 7 1904 228 227 14 43 chr2 172886132 172886201 -8861886 - LTR85a LTR Gypsy? -514 188 122 7 1904 4804 64 5 0 chr2 172889066 172889647 -8858440 - MT2B2 LTR ERVL 0 584 1 7 1904 1424 216 100 0 chr2 172889827 172890137 -8857950 + MTE2b LTR MaLR 1 341 -38 7 1904 2314 145 22 8 chr2 172890731 172891133 -8856954 - MTC LTR MaLR -8 413 6 7 1904 2032 66 251 0 chr2 172891229 172891516 -8856571 + RLTR10D LTR ERVK 1 359 0 7 1904 50547 55 13 14 chr2 172891516 172892087 -8856000 + IAP-d-int LTR ERVK 1 595 -5947 7 1904 50547 55 13 14 chr2 172892234 172898210 -8849877 + IAP-d-int LTR ERVK 596 6542 0 7 1904 2878 70 0 22 chr2 172898210 172898577 -8849510 + RLTR10D LTR ERVK 1 359 0 7 1904 3029 156 17 2 chr2 172899222 172899742 -8848345 + RLTR25A LTR ERVK 1 528 -575 7 1904 657 72 10 0 chr2 172899740 172899837 -8848250 + RLTR25A LTR ERVK 1006 1103 0 7 1904 2593 97 8 55 chr2 172902392 172902775 -8845312 + RLTR8 LTR ERVK 1 365 0 7 1904 1254 137 0 24 chr2 172907593 172907803 -8840284 + MTC LTR MaLR 1 205 -202 7 1904 1429 127 18 9 chr2 172907912 172908135 -8839952 + MTC LTR MaLR 196 420 -1 7 1904 635 152 85 156 chr2 172909339 172909520 -8838567 + ORR1D1 LTR MaLR 11 176 -198 7 1904 635 152 85 156 chr2 172909577 172909606 -8838481 + ORR1D1 LTR MaLR 177 206 -168 7 1904 504 213 67 54 chr2 172909772 172909921 -8838166 + ORR1D1 LTR MaLR 195 345 -29 7 1904 302 118 20 0 chr2 172923306 172923357 -8824730 - MTD LTR MaLR -8 411 360 8 1904 395 283 71 21 chr2 172926392 172926573 -8821514 + MLT1F1 LTR MaLR 439 654 0 8 1904 342 339 116 24 chr2 172950443 172950736 -8797351 + MLT1D LTR MaLR 64 383 -122 9 1904 235 326 22 43 chr2 172953259 172953397 -8794690 + RMER12 LTR ERVK 701 835 -487 9 1904 532 300 17 17 chr2 172959406 172959579 -8788508 - RMER15 LTR ERVL -17 558 386 9 1904 450 228 38 63 chr2 172959631 172959790 -8788297 - RMER15 LTR ERVL -420 155 1 9 1904 1423 268 15 128 chr2 172974903 172975515 -8772572 + MT2B LTR ERVL 3 545 -56 9 1904 263 130 0 0 chr2 172976133 172976179 -8771908 + MT2B LTR ERVL 539 584 0 9 1904 265 269 39 106 chr2 172983152 172983256 -8764831 + MT2B2 LTR ERVL 161 257 -327 9 1904 497 338 33 5 chr2 173000642 173000856 -8747231 + MLT1J LTR MaLR 241 460 -52 1 1904 1236 252 38 88 chr2 173000859 173001255 -8746832 + MTE2a LTR MaLR 4 379 0 2 1904 609 247 86 105 chr2 173001255 173001318 -8746769 + MTE2a-int LTR MaLR 1 44 -1326 2 1904 609 257 72 111 chr2 173001520 173001826 -8746261 + MTE2a-int LTR MaLR 45 340 -918 2 1905 481 276 155 61 chr2 173017440 173017762 -8730325 - RLTR18B LTR ERVK 0 616 148 2 1905 3681 141 68 47 chr2 173017772 173018494 -8729593 - RMER19A LTR ERVK 0 737 1 2 1905 342 227 214 10 chr2 173018599 173018697 -8729390 - RLTR18B LTR ERVK -387 125 8 2 1905 1853 84 30 0 chr2 173020137 173020400 -8727687 + ORR1A2 LTR MaLR 57 327 0 2 1905 1899 102 114 9 chr2 173025531 173025856 -8722231 + ORR1B2 LTR MaLR 1 359 -8 3 1905 2283 27 120 18 chr2 173027575 173027909 -8720178 + MTB_Mm LTR MaLR 1 368 -39 3 1905 3415 15 2 0 chr2 173029658 173030053 -8718034 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 1905 2262 92 38 0 chr2 173031686 173032001 -8716086 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 3 1905 2524 148 129 69 chr2 173039917 173040568 -8707519 - RMER6C LTR ERVK 0 690 1 5 1905 732 244 73 12 chr2 173046355 173046596 -8701491 + MTD LTR MaLR 10 270 -151 6 1905 492 192 20 33 chr2 173055667 173055804 -8692283 + MTD LTR MaLR 212 403 -16 7 1905 270 366 70 39 chr2 173071249 173071479 -8676608 + MLT1A LTR MaLR 93 329 -45 9 1905 1346 180 102 55 chr2 173104280 173104686 -8643401 + RMER10A LTR ERVL 1 442 0 1 1905 3726 149 72 34 chr2 173113654 173114216 -8633871 - RMER19A LTR ERVK -1 736 132 1 1905 3726 149 72 34 chr2 173114367 173114513 -8633574 - RMER19A LTR ERVK -606 131 1 1 1905 932 156 176 9 chr2 173116610 173116837 -8631250 + ORR1B1 LTR MaLR 1 265 -129 1 1905 643 263 189 15 chr2 173117397 173117656 -8630431 - MTEa LTR MaLR -25 354 51 1 1905 643 118 9 52 chr2 173117661 173117777 -8630310 + MTD LTR MaLR 1 111 -308 1 1905 1573 162 69 105 chr2 173120119 173120151 -8627936 + ORR1C1 LTR MaLR 1 26 -352 1 1905 1573 162 69 105 chr2 173120337 173120696 -8627391 + ORR1C1 LTR MaLR 27 378 0 1 1905 269 244 71 24 chr2 173121443 173121527 -8626560 + MT2B LTR ERVL 154 241 -360 1 1905 357 333 15 82 chr2 173121719 173121925 -8626162 + MLT1K LTR MaLR 70 261 -334 1 1905 256 340 157 0 chr2 173121926 173122123 -8625964 + MER70B LTR ERVL 204 431 -147 1 1905 350 343 60 56 chr2 173123386 173123636 -8624451 - MLT1E2 LTR MaLR 0 627 377 1 1905 936 237 58 132 chr2 173124130 173124524 -8623563 + MTEa LTR MaLR 15 379 0 1 1905 3830 290 60 65 chr2 173124524 173124736 -8623351 + MTEa-int LTR MaLR 1 232 -1348 1 1905 3830 290 60 65 chr2 173124770 173125980 -8622107 + MTEa-int LTR MaLR 233 1416 -164 1 1905 1540 229 50 8 chr2 173127852 173128209 -8619878 - MTE2a LTR MaLR 0 379 8 1 1905 1684 231 56 12 chr2 173131617 173132029 -8616058 - MT2A LTR ERVL -103 430 1 2 1905 315 320 60 13 chr2 173134110 173134259 -8613828 + MLT1G LTR MaLR 239 394 -197 2 1905 236 269 15 15 chr2 173134363 173134431 -8613656 - ORR1E LTR MaLR -18 361 294 2 1905 646 275 120 37 chr2 173136591 173136916 -8611171 + ORR1E LTR MaLR 6 357 -2 2 1905 248 335 38 97 chr2 173136938 173137176 -8610911 - ORR1E LTR MaLR -32 327 104 2 1905 235 302 177 14 chr2 173138895 173139036 -8609051 - MLT1F1 LTR MaLR -318 251 88 2 1905 684 283 100 67 chr2 173139668 173139857 -8608230 - ORR1E LTR MaLR -7 352 155 2 1905 684 283 100 67 chr2 173139901 173140052 -8608035 - ORR1E LTR MaLR -205 154 1 2 1905 1866 143 47 9 chr2 173140476 173140815 -8607272 - RLTR11B LTR ERVK -101 352 1 2 1905 304 242 0 0 chr2 173143630 173143696 -8604391 - ORR1E LTR MaLR -293 66 1 2 1905 2391 137 33 42 chr2 173145169 173145626 -8602461 - RLTR11B LTR ERVK 0 453 1 2 1906 1460 114 84 133 chr2 173148495 173148616 -8599471 + ORR1A4 LTR MaLR 2 82 -247 2 1906 1744 139 12 164 chr2 173148616 173149099 -8598988 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 2 1906 1460 114 84 133 chr2 173149099 173149322 -8598765 + ORR1A4 LTR MaLR 83 329 0 2 1906 696 242 135 23 chr2 173152689 173152964 -8595123 + MTEb LTR MaLR 70 347 -32 2 1906 268 365 43 92 chr2 173155724 173155887 -8592200 - MLT1K LTR MaLR -297 298 144 2 1906 1396 178 90 7 chr2 173158283 173158572 -8589515 - MTD LTR MaLR 0 419 107 2 1906 476 219 17 42 chr2 173159337 173159456 -8588631 - MTD LTR MaLR -305 116 1 2 1906 233 250 19 0 chr2 173163039 173163091 -8584996 - ORR1D1 LTR MaLR 0 370 318 2 1906 583 282 150 38 chr2 173163494 173163679 -8584408 - ORR1D1 LTR MaLR -18 356 163 2 1906 583 282 150 38 chr2 173163741 173163875 -8584212 - ORR1D1 LTR MaLR -212 162 1 2 1906 1478 162 152 30 chr2 173166341 173166709 -8581378 - MTC LTR MaLR -8 413 1 2 1906 2003 174 68 53 chr2 173170233 173170646 -8577441 + MTC LTR MaLR 3 421 0 2 1906 773 291 110 36 chr2 173180630 173180837 -8567250 - RLTR40 LTR ERVK -38 779 571 3 1906 773 291 110 36 chr2 173180935 173181005 -8567082 - RLTR40 LTR ERVK -247 570 487 3 1906 773 291 110 36 chr2 173181033 173181199 -8566888 - RLTR40 LTR ERVK -331 486 303 3 1906 339 258 9 82 chr2 173183511 173183621 -8564466 - MT2B2 LTR ERVL -334 250 149 3 1906 389 269 200 18 chr2 173188647 173188817 -8559270 - MLT1A0 LTR MaLR -164 201 1 3 1906 249 329 40 52 chr2 173189977 173190150 -8557937 - RLTR21 LTR ERVK -321 1251 1081 3 1906 1939 143 178 46 chr2 173197394 173197833 -8550254 - RMER19C LTR ERVK -114 497 1 3 1906 3076 81 25 82 chr2 173198288 173198799 -8549288 + RLTR45 LTR ERVK 1 482 0 3 1906 1184 303 29 29 chr2 173198906 173199283 -8548804 + MTE2a LTR MaLR 1 377 -2 3 1906 434 308 58 6 chr2 173201749 173201922 -8546165 - MLT1K LTR MaLR -7 588 407 3 1906 650 270 222 3 chr2 173202300 173202611 -8545476 + MTEa LTR MaLR 1 379 0 3 1906 704 225 13 7 chr2 173204529 173204681 -8543406 - RMER5 LTR ERV1 -27 507 355 3 1906 2460 81 16 0 chr2 173204932 173205254 -8542833 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 3 1906 504 337 118 26 chr2 173208435 173208880 -8539207 - MER77 LTR ERVL -6 601 77 3 1906 1663 60 0 0 chr2 173209870 173210087 -8538000 - MTB LTR MaLR -183 217 1 3 1906 2063 152 46 19 chr2 173211909 173212116 -8535971 - ORR1C2 LTR MaLR -4 380 169 3 1906 2063 152 46 19 chr2 173212158 173212320 -8535767 - ORR1C2 LTR MaLR -216 168 1 3 1906 1858 174 55 58 chr2 173213373 173213752 -8534335 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 3 1906 1851 183 8 19 chr2 173214177 173214540 -8533547 - ORR1D1 LTR MaLR -15 359 1 3 1906 1056 209 160 14 chr2 173216589 173216870 -8531217 + MTD LTR MaLR 1 322 -97 3 1906 870 303 36 122 chr2 173217807 173218390 -8529697 + MT2A LTR ERVL 1 533 0 3 1906 230 279 16 0 chr2 173218969 173219030 -8529057 - RMER15 LTR ERVL -72 503 442 3 1906 358 266 13 0 chr2 173219106 173219185 -8528902 - MTEa LTR MaLR -281 98 19 3 1906 231 345 18 9 chr2 173220670 173220781 -8527306 + LTR16C LTR ERVL 370 481 -8 3 1906 2201 127 49 0 chr2 173223193 173223539 -8524548 - ORR1B2 LTR MaLR -4 363 1 3 1906 2329 80 6 50 chr2 173224751 173225094 -8522993 - ORR1A4 LTR MaLR -1 328 1 4 1906 2520 147 83 10 chr2 173225111 173225592 -8522495 - RMER20A LTR ERVK 0 516 1 4 1906 1013 308 118 41 chr2 173226664 173226943 -8521144 - MTE-int LTR MaLR -512 1068 745 4 1906 2590 83 0 0 chr2 173226943 173227268 -8520819 + ORR1A2 LTR MaLR 1 325 -2 4 1906 1013 308 118 41 chr2 173227268 173227496 -8520591 - MTE-int LTR MaLR -836 744 522 4 1906 806 235 68 18 chr2 173227496 173227717 -8520370 - MTE-int LTR MaLR -1170 410 179 4 1906 1015 253 70 19 chr2 173227711 173227896 -8520191 - MTE2b LTR MaLR -93 286 106 4 1906 1842 129 64 124 chr2 173227896 173227983 -8520104 - ORR1B2 LTR MaLR -2 365 310 4 1906 1842 129 64 124 chr2 173228130 173228430 -8519657 - ORR1B2 LTR MaLR -58 309 1 4 1906 1015 253 70 19 chr2 173228430 173228502 -8519585 - MTE2b LTR MaLR -274 105 18 4 1906 1322 230 75 14 chr2 173237487 173237836 -8510251 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 4 1906 416 304 43 69 chr2 173240739 173240972 -8507115 - MTEa LTR MaLR -1 378 152 4 1906 2661 183 120 14 chr2 173244556 173245154 -8502933 - RMER19B LTR ERVK -282 620 1 4 1906 661 300 86 22 chr2 173246782 173247124 -8500963 + MLT2B1 LTR ERVL 19 481 -86 4 1906 3506 23 5 0 chr2 173247238 173247632 -8500455 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 1906 9372 31 6 1 chr2 173247632 173248725 -8499362 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 4 1906 3506 23 5 0 chr2 173248725 173249119 -8498968 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 1906 1433 208 270 25 chr2 173256165 173256555 -8491532 - RMER15 LTR ERVL -40 535 50 4 1906 736 233 34 64 chr2 173260060 173260296 -8487791 - MTEb LTR MaLR -19 400 153 4 1906 1591 197 111 23 chr2 173266371 173266714 -8481373 + ORR1D1 LTR MaLR 2 374 0 4 1906 244 316 90 116 chr2 173269334 173269688 -8478399 + MLT1B LTR MaLR 6 350 -40 4 1906 1578 181 83 20 chr2 173269828 173270178 -8477909 - MTD LTR MaLR -2 417 46 4 1906 2120 116 6 138 chr2 173270879 173271351 -8476736 + RMER17C LTR ERVK 1 410 0 4 1906 383 363 35 0 chr2 173272076 173272247 -8475840 + ORR1E LTR MaLR 4 180 -179 4 1906 275 271 23 23 chr2 173272326 173272413 -8475674 + ORR1E LTR MaLR 293 379 0 4 1906 2220 120 0 66 chr2 173272493 173272841 -8475246 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 2 4 1906 703 274 59 17 chr2 173273236 173273441 -8474646 + ORR1E LTR MaLR 76 290 -69 4 1906 902 218 258 39 chr2 173273441 173273747 -8474340 - ORR1D1 LTR MaLR -1 373 1 4 1906 3259 221 87 30 chr2 173273747 173274802 -8473285 - ORR1D1-int LTR MaLR 0 1370 189 4 1906 729 217 163 5 chr2 173275087 173275277 -8472810 - ORR1D1-int LTR MaLR -1102 268 49 4 1906 752 241 73 29 chr2 173275275 173275523 -8472564 - ORR1D1 LTR MaLR -6 368 67 4 1906 906 222 5 21 chr2 173275527 173275720 -8472367 - ORR1D1 LTR MaLR -184 190 1 4 1906 255 237 0 62 chr2 173275721 173275802 -8472285 + ORR1E LTR MaLR 304 379 0 4 1907 309 184 0 0 chr2 173278761 173278810 -8469277 - MT2B LTR ERVL -361 240 192 4 1907 241 299 65 0 chr2 173279510 173279587 -8468500 - ORR1E LTR MaLR 0 379 298 4 1907 668 297 11 5 chr2 173279633 173279819 -8468268 - ORR1E LTR MaLR -169 190 4 4 1907 1370 262 60 6 chr2 173281954 173282303 -8465784 - MTEa LTR MaLR -9 370 3 4 1907 1081 199 97 63 chr2 173283126 173283449 -8464638 - MTD LTR MaLR -52 327 1 4 1907 235 333 15 45 chr2 173284267 173284399 -8463688 + MLT1L LTR MaLR 348 475 -135 5 1907 1029 239 55 98 chr2 173287351 173287764 -8460323 + MTE2a LTR MaLR 7 406 -13 5 1907 2086 138 112 11 chr2 173289133 173289491 -8458596 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 5 1907 2062 95 7 7 chr2 173289491 173289778 -8458309 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 33 5 1907 1029 238 90 18 chr2 173291448 173291726 -8456361 - MTE2b LTR MaLR -30 349 52 5 1907 983 262 119 12 chr2 173295327 173295655 -8452432 + ORR1D2 LTR MaLR 5 367 -3 5 1907 549 268 18 93 chr2 173295658 173295862 -8452225 + ORR1D2-int LTR MaLR 1 189 -1320 5 1907 1310 174 95 0 chr2 173299403 173299644 -8448443 - MTC LTR MaLR -54 367 104 5 1907 695 203 44 33 chr2 173305895 173306076 -8442011 + RMER19B LTR ERVK 1 158 -579 5 1907 3096 64 18 0 chr2 173306077 173306470 -8441617 + MTB LTR MaLR 1 400 0 5 1907 5668 125 90 127 chr2 173306470 173306763 -8441324 + MTB-int LTR MaLR 3 297 -961 5 1907 5668 125 90 127 chr2 173307287 173308297 -8439790 + MTB-int LTR MaLR 298 1258 0 5 1907 2707 47 111 0 chr2 173308297 173308657 -8439430 + MTB LTR MaLR 1 400 0 5 1907 2967 168 210 0 chr2 173308657 173309293 -8438794 + RMER19B LTR ERVK 124 894 -8 5 1907 601 210 170 69 chr2 173310060 173310340 -8437747 + MTE2b LTR MaLR 63 420 -1 5 1907 1828 237 91 21 chr2 173311722 173312196 -8435891 + RLTR18B LTR ERVK 1 507 -5 5 1907 711 87 0 37 chr2 173312604 173312711 -8435376 + ORR1A2-int LTR MaLR 1861 1963 0 5 1907 2286 124 3 0 chr2 173312711 173313034 -8435053 + ORR1A2 LTR MaLR 1 324 -3 5 1907 915 209 0 157 chr2 173317121 173317370 -8430717 - RMER19C LTR ERVK -401 210 1 5 1907 534 234 0 74 chr2 173317370 173317518 -8430569 - ORR1A4 LTR MaLR -192 137 1 5 1907 2269 147 39 36 chr2 173319270 173319657 -8428430 + MTC LTR MaLR 26 413 -8 5 1907 260 292 157 21 chr2 173319555 173319695 -8428392 - MTB LTR MaLR -127 273 115 5 1907 1650 152 64 29 chr2 173320963 173321275 -8426812 - ORR1A4 LTR MaLR -6 323 1 5 1907 2293 166 38 0 chr2 173322372 173322764 -8425323 + MTC LTR MaLR 1 407 -14 5 1907 1260 209 46 56 chr2 173322997 173323438 -8424649 + MT2A LTR ERVL 14 543 -58 5 1907 260 239 163 99 chr2 173323946 173324179 -8423908 + RLTR47_MM LTR ERV1 269 452 -80 5 1907 322 236 99 22 chr2 173324897 173324988 -8423099 - RMER10A LTR ERVL -27 415 318 5 1907 3288 53 5 10 chr2 173325897 173326299 -8421788 + MTB LTR MaLR 1 400 0 5 1907 676 131 0 36 chr2 173330181 173330289 -8417798 + ORR1C2 LTR MaLR 5 108 -276 5 1907 4340 168 78 75 chr2 173330289 173331188 -8416899 - RMER19B LTR ERVK 0 902 1 5 1907 234 197 0 129 chr2 173331188 173331218 -8416869 + ORR1C2 LTR MaLR 103 123 -261 5 1907 1895 197 69 42 chr2 173331218 173331509 -8416578 - MTC LTR MaLR 0 421 108 5 1907 1895 197 69 42 chr2 173331828 173331842 -8416245 - MTC LTR MaLR -314 107 103 5 1907 1895 197 69 42 chr2 173332094 173332193 -8415894 - MTC LTR MaLR -319 102 3 5 1907 1025 176 83 66 chr2 173332193 173332446 -8415641 + ORR1C2 LTR MaLR 123 386 -8 5 1907 2724 167 16 86 chr2 173333115 173333684 -8414403 - RLTR24 LTR ERV1 0 529 1 5 1907 713 157 0 135 chr2 173336470 173336640 -8411447 + ORR1A4 LTR MaLR 1 147 -182 5 1907 1979 179 6 8 chr2 173336760 173337120 -8410967 - RMER19C LTR ERVK 0 611 253 5 1907 2438 125 68 0 chr2 173337945 173338312 -8409775 + ORR1B1 LTR MaLR 1 392 -2 5 1907 459 199 22 18 chr2 173343097 173343215 -8404872 + MTEb LTR MaLR 49 179 -200 6 1907 624 321 27 27 chr2 173343516 173343737 -8404350 + MTEb LTR MaLR 159 379 0 6 1907 685 276 83 128 chr2 173345216 173345590 -8402497 - MTD LTR MaLR -14 405 49 6 1907 409 267 124 106 chr2 173345809 173346035 -8402052 + MTEb LTR MaLR 100 329 -50 6 1907 2331 166 24 12 chr2 173350357 173350773 -8397314 + MTC LTR MaLR 1 421 0 6 1907 297 374 104 35 chr2 173356427 173356801 -8391286 + MLT1C LTR MaLR 6 405 -62 6 1907 1982 179 35 20 chr2 173358209 173358614 -8389473 - MTC LTR MaLR -8 413 3 6 1907 328 334 82 62 chr2 173360818 173361159 -8386928 + MLT1F2 LTR MaLR 1 348 -212 6 1907 276 283 131 0 chr2 173361446 173361545 -8386542 - MTD LTR MaLR -51 368 257 6 1907 234 231 85 49 chr2 173361557 173361639 -8386448 - MTD LTR MaLR -241 178 94 6 1907 287 330 148 51 chr2 173361721 173361957 -8386130 - MTD-int LTR MaLR -1111 259 1 6 1907 1069 274 120 5 chr2 173361961 173362335 -8385752 - MTD LTR MaLR -2 417 1 6 1907 1644 190 87 24 chr2 173365891 173366269 -8381818 - MTD LTR MaLR -12 407 6 6 1907 264 373 47 52 chr2 173372748 173372960 -8375127 - RMER15 LTR ERVL -18 557 347 6 1907 2026 145 103 71 chr2 173373557 173373935 -8374152 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 5 6 1907 236 248 185 17 chr2 173376761 173376880 -8371207 + MLT1E3 LTR MaLR 444 582 -42 6 1907 1060 157 31 1 chr2 173381500 173381759 -8366328 + ORR1A4 LTR MaLR 27 305 -24 6 1907 4684 178 51 50 chr2 173381766 173383535 -8364552 + ORR1A4-int LTR MaLR 1 1792 0 6 1907 2183 118 15 6 chr2 173383536 173383860 -8364227 + ORR1A4 LTR MaLR 2 328 -1 6 1908 359 256 30 23 chr2 173423293 173423425 -8324662 + LTR37A LTR ERV1 292 424 -2 7 1908 1619 194 58 58 chr2 173445111 173445493 -8302594 - ORR1C2 LTR MaLR -2 382 1 7 1908 1049 289 140 12 chr2 173446518 173446854 -8301233 - MTEa LTR MaLR 0 379 1 7 1908 282 345 70 80 chr2 173449583 173449882 -8298205 + ORR1C2 LTR MaLR 7 302 -82 7 1908 721 146 245 0 chr2 173453956 173454191 -8293896 - RMER4A LTR ERVK 0 466 174 7 1908 1340 142 267 14 chr2 173476683 173476975 -8271112 + ORR1D1 LTR MaLR 1 366 -8 8 1908 2895 47 9 0 chr2 173488787 173489130 -8258957 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 8 1908 821 267 215 16 chr2 173496238 173496256 -8251831 - MTE2a LTR MaLR 0 379 358 8 1908 821 267 215 16 chr2 173496441 173496738 -8251349 - MTE2a LTR MaLR -22 357 1 8 1908 2838 267 55 11 chr2 173496740 173497463 -8250624 - MTE2a-int LTR MaLR -2 1578 824 8 1908 856 254 256 6 chr2 173497465 173497782 -8250305 - MTE2a-int LTR MaLR -1177 403 8 8 1908 252 167 0 0 chr2 173497809 173497851 -8250236 - MTE2a LTR MaLR -23 356 315 8 1908 257 259 62 10 chr2 173497907 173497984 -8250103 - MTE2b LTR MaLR -302 77 1 8 1908 1026 163 97 5 chr2 173498511 173498696 -8249391 + MTC LTR MaLR 1 202 -219 8 1908 855 186 98 17 chr2 173499462 173499665 -8248422 + MTC LTR MaLR 177 413 -8 8 1908 1491 228 64 8 chr2 173500232 173500590 -8247497 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 2 1908 2185 113 3 16 chr2 173501247 173501570 -8246517 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 7 1908 454 210 92 9 chr2 173504769 173504891 -8243196 - MTD LTR MaLR -16 403 250 1 1908 233 279 12 60 chr2 173505452 173505536 -8242551 - MLT1A1 LTR MaLR -12 396 317 2 1908 1681 173 71 28 chr2 173505965 173506358 -8241729 + RMER17C LTR ERVK 1 410 0 2 1908 400 306 217 18 chr2 173508671 173508897 -8239190 - MLT1D LTR MaLR -27 478 208 2 1908 250 185 253 24 chr2 173508897 173508980 -8239107 + MT2B LTR ERVL 156 257 -344 2 1909 572 308 164 12 chr2 173543043 173543372 -8204715 - MTEa LTR MaLR 0 379 1 7 1909 1715 157 223 6 chr2 173543725 173544070 -8204017 - RLTR9B2 LTR ERVK 0 420 1 7 1909 2302 62 82 53 chr2 173544598 173544953 -8203134 - RLTR10B2 LTR ERVK 0 365 1 7 1909 340 299 137 14 chr2 173545288 173545427 -8202660 + MLT1D LTR MaLR 1 156 -349 7 1909 2355 123 26 6 chr2 173545505 173545857 -8202230 + ORR1B2 LTR MaLR 1 359 -8 8 1909 526 248 73 13 chr2 173554351 173554370 -8193717 - MTE-int LTR MaLR -29 1551 1529 1 1909 1174 190 89 164 chr2 173554370 173554773 -8193314 - ORR1D1 LTR MaLR -1 373 1 1 1909 696 153 61 0 chr2 173554773 173554904 -8193183 - ORR1D1-int LTR MaLR 0 1370 1232 1 1909 765 240 37 65 chr2 173554898 173555162 -8192925 - ORR1D1-int LTR MaLR -774 596 369 1 1909 611 281 44 0 chr2 173555459 173555619 -8192468 + MTE2b LTR MaLR 18 184 -195 1 1909 438 275 0 90 chr2 173555620 173555764 -8192323 - RMER5 LTR ERV1 -23 511 381 1 1909 2100 211 5 8 chr2 173555784 173556176 -8191911 - RMER5 LTR ERV1 -143 391 1 1 1909 279 222 69 0 chr2 173556176 173556248 -8191839 + MTE2b LTR MaLR 180 256 -123 1 1909 276 373 84 37 chr2 173556956 173557229 -8190858 + RMER15 LTR ERVL 276 561 -14 1 1909 1182 282 113 17 chr2 173560321 173560780 -8187307 + RMER5 LTR ERV1 1 503 -31 1 1909 227 246 45 113 chr2 173575318 173575363 -8172724 - RLTR25B LTR ERVK -449 579 456 1 1909 271 225 24 59 chr2 173583338 173583423 -8164664 - MT2B2 LTR ERVL -340 244 163 1 1909 247 214 21 134 chr2 173614974 173615071 -8133016 - LTR41B LTR ERVL -110 648 563 1 1909 1351 250 76 16 chr2 173645592 173645965 -8102122 + MTE2b LTR MaLR 18 371 -8 2 1909 3087 44 44 3 chr2 173654520 173654904 -8093183 - MTB LTR MaLR 0 400 1 2 1909 7282 93 10 68 chr2 173654904 173656069 -8092018 - MTB-int LTR MaLR 0 1098 1 2 1909 3104 78 5 2 chr2 173656069 173656468 -8091619 - MTB LTR MaLR 0 400 1 2 1909 574 311 116 27 chr2 173657409 173657703 -8090384 - MLT1B LTR MaLR -53 337 18 2 1909 1231 246 22 18 chr2 173664955 173665232 -8082855 + MTE2b LTR MaLR 1 278 -101 2 1909 2526 93 54 3 chr2 173665226 173665580 -8082507 - MTB_Mm LTR MaLR -35 372 1 2 1909 421 121 15 0 chr2 173665877 173665943 -8082144 + MTE2b LTR MaLR 311 377 -2 2 1909 657 240 16 48 chr2 173667783 173667971 -8080116 + MTE2b LTR MaLR 2 183 -196 2 1910 235 234 16 0 chr2 173675633 173675697 -8072390 - RMER15 LTR ERVL -70 505 441 2 1910 654 295 28 110 chr2 173682474 173682904 -8065183 - MTE2a LTR MaLR -30 389 1 3 1910 1686 208 16 16 chr2 173699991 173700368 -8047719 + ORR1C1 LTR MaLR 2 378 0 3 1910 3186 21 61 11 chr2 173705054 173705431 -8042656 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 1910 1666 210 16 16 chr2 173724868 173725245 -8022842 + ORR1C1 LTR MaLR 2 378 0 3 1910 1499 53 10 10 chr2 173732641 173732850 -8015237 + MTA_Mm LTR MaLR 188 396 0 3 1910 8351 67 7 4 chr2 173732850 173733944 -8014143 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 3 1910 1622 59 5 0 chr2 173733944 173734165 -8013922 + MTA_Mm LTR MaLR 1 222 -174 3 1910 1686 208 16 16 chr2 173738185 173738562 -8009525 + ORR1C1 LTR MaLR 2 378 0 3 1910 3415 59 28 5 chr2 173740294 173740720 -8007367 + RLTR10C LTR ERVK 1 436 0 3 1910 2296 200 175 22 chr2 173743113 173743752 -8004335 + RMER19A LTR ERVK 1 737 0 3 1910 1384 232 65 6 chr2 173743906 173744262 -8003825 + ORR1C1 LTR MaLR 2 378 0 3 1910 2440 84 12 3 chr2 173748497 173748821 -7999266 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 3 1910 11063 142 46 14 chr2 173748821 173750722 -7997365 + ORR1A2-int LTR MaLR 2 1963 0 3 1910 2535 71 6 6 chr2 173750722 173751049 -7997038 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 3 1910 540 256 128 70 chr2 173758200 173758545 -7989542 + ORR1D2 LTR MaLR 5 369 -1 3 1910 642 221 63 113 chr2 173758606 173758986 -7989101 - ORR1E LTR MaLR -27 343 5 3 1910 3894 161 80 71 chr2 173769160 173770036 -7978051 + RMER19B LTR ERVK 1 884 -18 4 1910 1219 231 78 59 chr2 173792653 173793025 -7955062 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 4 1910 273 348 8 51 chr2 173797463 173797581 -7950506 + MT2A LTR ERVL 356 468 -65 4 1911 1966 79 157 0 chr2 173807006 173807286 -7940801 + ORR1A2 LTR MaLR 4 327 0 4 1911 1173 230 67 93 chr2 173814588 173814976 -7933111 + MTEb LTR MaLR 1 378 -1 4 1911 1303 250 31 67 chr2 173815517 173815907 -7932180 - MTE2a LTR MaLR 0 379 4 4 1911 545 201 147 28 chr2 173823365 173823508 -7924579 + MTD LTR MaLR 216 375 -44 5 1911 311 261 0 0 chr2 173823531 173823600 -7924487 + MTC-int LTR MaLR 1 69 -1189 5 1911 413 182 303 7 chr2 173823599 173823754 -7924333 + MTC-int LTR MaLR 974 1174 -84 5 1911 731 230 21 21 chr2 173823842 173824033 -7924054 + MTD LTR MaLR 20 210 -209 5 1911 1892 113 28 22 chr2 173824107 173824424 -7923663 - ORR1B2 LTR MaLR -8 359 41 5 1911 245 0 0 0 chr2 173824426 173824462 -7923625 - ORR1B1 LTR MaLR -271 96 61 5 1911 296 182 0 25 chr2 173824442 173824521 -7923566 - ORR1B1 LTR MaLR -253 141 65 5 1911 546 169 14 28 chr2 173824522 173824662 -7923425 - ORR1B2 LTR MaLR -253 141 1 5 1911 3871 211 94 49 chr2 173825240 173826116 -7921971 + ORR1D1-int LTR MaLR 232 1155 -215 5 1911 3871 211 94 49 chr2 173826159 173826372 -7921715 + ORR1D1-int LTR MaLR 1156 1369 -1 5 1911 1238 244 57 17 chr2 173826374 173826724 -7921363 + ORR1D1 LTR MaLR 3 366 -8 5 1911 296 221 26 13 chr2 173827152 173827230 -7920857 + MTD LTR MaLR 196 274 -145 5 1911 302 237 89 134 chr2 173833139 173833251 -7914836 + MLT1J LTR MaLR 77 183 -329 5 1911 949 253 240 0 chr2 173838629 173838929 -7909158 + MTEa LTR MaLR 6 377 -2 5 1911 709 296 160 44 chr2 173839391 173839709 -7908378 - MLT1F1 LTR MaLR -1 568 214 5 1911 373 298 97 38 chr2 173841979 173842229 -7905858 - RMER15 LTR ERVL 0 575 272 5 1911 267 265 36 172 chr2 173848992 173849289 -7898798 - ORR1E LTR MaLR -15 364 83 5 1911 265 229 128 35 chr2 173849732 173849818 -7898269 - MTEa LTR MaLR -12 367 274 5 1911 248 340 87 76 chr2 173852509 173852681 -7895406 + MLT2B5 LTR ERVL 111 284 -433 5 1911 565 265 37 91 chr2 173852567 173852754 -7895333 + MTEa LTR MaLR 31 207 -172 5 1911 424 362 60 0 chr2 173852972 173853157 -7894930 + RMER15 LTR ERVL 380 575 0 5 1911 290 284 27 13 chr2 173853160 173853203 -7894884 + MTEa LTR MaLR 186 229 -150 5 1911 2256 79 8 112 chr2 173853203 173853602 -7894485 + ORR1A2 LTR MaLR 1 384 0 5 1911 401 239 48 39 chr2 173853606 173853744 -7894343 + MTEb LTR MaLR 244 379 0 5 1911 1675 298 54 54 chr2 173853761 173854314 -7893773 + MTEb-int LTR MaLR 1026 1578 -2 5 1911 768 272 214 10 chr2 173854316 173854624 -7893463 + MTEb LTR MaLR 1 371 -8 5 1911 1076 209 78 123 chr2 173855345 173855764 -7892323 - MT2A LTR ERVL -71 530 1 5 1911 960 286 53 23 chr2 173855816 173856143 -7891944 - MTE2a LTR MaLR -76 343 3 5 1911 1618 232 62 19 chr2 173856638 173857007 -7891080 - MTD LTR MaLR -17 402 18 5 1911 2358 159 45 0 chr2 173857991 173858393 -7889694 - MTC LTR MaLR -1 420 1 5 1911 1299 296 192 34 chr2 173858506 173859353 -7888734 - MTE2a-int LTR MaLR -2 1578 224 5 1911 3575 25 0 0 chr2 173864866 173865262 -7882825 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 1911 497 327 89 5 chr2 173866348 173866572 -7881515 - MTE2a-int LTR MaLR -1336 244 2 5 1911 1171 255 20 137 chr2 173866587 173866996 -7881091 - MTE2a LTR MaLR -18 361 1 5 1911 1316 258 28 4 chr2 173867039 173867329 -7880758 + MTE2a LTR MaLR 74 365 -14 5 1911 1810 184 43 30 chr2 173867329 173867698 -7880389 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 5 1911 369 288 38 46 chr2 173867698 173867710 -7880377 + MTE2a LTR MaLR 360 370 0 5 1911 1178 274 97 29 chr2 173870171 173870522 -7877565 + MTD LTR MaLR 11 389 -30 5 1911 1178 274 97 29 chr2 173870568 173870599 -7877488 + MTD LTR MaLR 390 419 0 5 1911 1217 269 158 96 chr2 173870621 173871497 -7876590 + MTD-int LTR MaLR 22 1323 -257 5 1911 344 165 20 99 chr2 173872937 173873038 -7875049 + MTD-int LTR MaLR 1066 1158 -100 5 1911 268 245 112 9 chr2 173873204 173873311 -7874776 + MTD-int LTR MaLR 1121 1238 -20 5 1911 686 282 273 15 chr2 173873385 173873718 -7874369 + MTD LTR MaLR 1 419 0 5 1911 1181 269 72 4 chr2 173873798 173874074 -7874013 - MTEa LTR MaLR -25 354 60 5 1911 712 266 128 9 chr2 173878882 173879211 -7868876 + MTEb LTR MaLR 12 379 0 5 1911 550 290 88 44 chr2 173879212 173879439 -7868648 + MLT1C LTR MaLR 70 306 -161 5 1911 1272 209 131 9 chr2 173880877 173881206 -7866881 - ORR1D1 LTR MaLR -5 369 1 5 1911 869 259 64 132 chr2 173881594 173881936 -7866151 - MTE2a LTR MaLR -55 324 6 6 1911 313 321 132 52 chr2 173881941 173882027 -7866060 - MTE2a-int LTR MaLR -1 1579 1498 6 1911 313 321 132 52 chr2 173882077 173882240 -7865847 - MTE2a-int LTR MaLR -83 1497 1311 6 1911 1993 147 61 3 chr2 173882221 173882548 -7865539 + ORR1C1 LTR MaLR 33 378 0 6 1911 1474 290 81 68 chr2 173882548 173883522 -7864565 - MTE2a-int LTR MaLR -342 1238 2 6 1911 1212 227 35 125 chr2 173883522 173883880 -7864207 - MTE2a LTR MaLR -54 325 1 6 1911 428 146 2 2 chr2 173887782 173887858 -7860229 - MTEb LTR MaLR 0 379 295 6 1911 415 329 2 17 chr2 173887860 173888000 -7860087 - MTEb LTR MaLR -230 149 15 6 1911 287 313 94 31 chr2 173889081 173889305 -7858782 - MLT2F LTR ERVL 0 663 426 6 1911 392 272 58 14 chr2 173889444 173889582 -7858505 - MLT2F LTR ERVL -519 144 1 6 1911 1778 82 9 0 chr2 173890236 173890468 -7857619 + ORR1A2 LTR MaLR 86 319 -8 6 1911 10773 139 58 20 chr2 173890472 173891035 -7857052 + ORR1A2-int LTR MaLR 1 563 -1400 6 1911 10773 139 58 20 chr2 173891231 173892452 -7855635 + ORR1A2-int LTR MaLR 564 1858 -105 6 1911 10773 139 58 20 chr2 173892565 173892669 -7855418 + ORR1A2-int LTR MaLR 1859 1963 0 6 1911 2216 79 29 81 chr2 173892669 173892943 -7855144 + ORR1A2 LTR MaLR 1 261 -66 6 1911 2216 79 29 81 chr2 173893112 173893182 -7854905 + ORR1A2 LTR MaLR 262 327 0 6 1911 622 212 38 56 chr2 173893183 173893343 -7854744 - RMER15 LTR ERVL -391 184 28 6 1911 3560 161 23 0 chr2 173894007 173894485 -7853602 + RLTR20A2 LTR ERVK 1 481 -97 6 1911 3560 161 23 0 chr2 173894539 173894624 -7853463 + RLTR20A2 LTR ERVK 482 576 -2 6 1911 581 317 15 25 chr2 173896475 173896679 -7851408 + MLT1K LTR MaLR 203 404 -191 6 1911 373 172 20 139 chr2 173916548 173916649 -7831438 - MT2B LTR ERVL -351 250 162 6 1912 564 263 45 39 chr2 173949754 173949932 -7798155 + MTD LTR MaLR 13 191 -228 6 1912 289 304 373 46 chr2 173950787 173951047 -7797040 - MTD LTR MaLR -15 404 60 6 1912 348 281 199 11 chr2 173957734 173957968 -7790119 + MTEb LTR MaLR 43 339 -40 6 1912 1394 222 198 40 chr2 173964002 173964456 -7783631 - MT2A LTR ERVL -2 531 6 7 1912 433 208 84 65 chr2 173974757 173974911 -7773176 + RLTR40 LTR ERVK 1 157 -660 7 1912 356 222 0 14 chr2 173976008 173976081 -7772006 - MERVL-int LTR ERVL -962 4523 4452 7 1912 440 215 15 97 chr2 173976081 173976215 -7771872 + RLTR40 LTR ERVK 169 291 -526 7 1912 574 288 100 84 chr2 173976256 173976707 -7771380 + RLTR40 LTR ERVK 349 806 -11 7 1912 3351 50 0 0 chr2 173977718 173978114 -7769973 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 7 1912 1538 224 97 3 chr2 173978613 173978985 -7769102 + MTD LTR MaLR 1 407 -12 7 1912 870 240 114 76 chr2 173988383 173988726 -7759361 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 15 7 1912 1375 240 93 11 chr2 173991858 173992233 -7755854 - MTD LTR MaLR 0 419 14 7 1912 233 268 11 44 chr2 174016858 174016948 -7731139 + MLT1A1 LTR MaLR 322 408 0 3 1912 435 191 0 96 chr2 174024996 174025100 -7722987 + MT2B LTR ERVL 163 256 -345 3 1912 1505 248 121 18 chr2 174033753 174034208 -7713879 + RMER5 LTR ERV1 33 534 0 5 1912 2094 102 12 62 chr2 174041418 174041754 -7706333 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 7 1912 9394 140 116 25 chr2 174041758 174043557 -7704530 + ORR1A2-int LTR MaLR 1 1963 0 7 1912 1906 85 68 98 chr2 174043560 174043886 -7704201 + ORR1A2 LTR MaLR 4 319 -8 7 1912 2204 117 26 0 chr2 174046667 174047017 -7701070 - RLTR15 LTR ERVK 0 359 1 8 1912 1876 171 32 17 chr2 174049047 174049392 -7698695 + ORR1B1 LTR MaLR 41 390 -4 9 1913 453 181 0 6 chr2 174067084 174067178 -7680909 + MTE2a LTR MaLR 288 378 -1 1 1913 1974 165 30 0 chr2 174068977 174069311 -7678776 - ORR1A1 LTR MaLR -2 344 1 1 1913 1189 270 104 21 chr2 174069497 174069832 -7678255 + MTEa LTR MaLR 10 372 -7 1 1913 349 274 127 16 chr2 174069832 174069958 -7678129 + MTE2a LTR MaLR 1 140 -239 1 1913 710 347 35 83 chr2 174069917 174070322 -7677765 + MT2A LTR ERVL 100 487 -46 1 1913 710 347 35 83 chr2 174070366 174070416 -7677671 + MT2A LTR ERVL 488 533 0 1 1913 3041 291 98 59 chr2 174070428 174071678 -7676409 + MTEa-int LTR MaLR 1 1299 -281 1 1913 518 243 173 15 chr2 174071832 174072035 -7676052 + MTEa-int LTR MaLR 1311 1578 -2 1 1913 809 296 47 99 chr2 174072037 174072401 -7675686 + MTEa LTR MaLR 1 345 -34 1 1913 675 291 188 53 chr2 174072701 174072900 -7675187 + MT2B LTR ERVL 1 239 -362 1 1913 675 291 188 53 chr2 174073049 174073343 -7674744 + MT2B LTR ERVL 240 560 -41 1 1913 280 87 0 115 chr2 174073468 174073546 -7674541 + MT2A LTR ERVL 465 533 0 1 1913 2065 103 56 13 chr2 174073898 174074204 -7673883 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 1 1913 9961 157 60 42 chr2 174074204 174076016 -7672071 - ORR1A2-int LTR MaLR 0 1963 89 1 1913 9961 157 60 42 chr2 174076158 174076274 -7671813 - ORR1A2-int LTR MaLR -1875 88 1 1 1913 2086 119 0 43 chr2 174076274 174076599 -7671488 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 17 1 1913 1554 163 123 16 chr2 174077160 174077478 -7670609 - ORR1B2 LTR MaLR -15 352 1 1 1913 620 220 150 10 chr2 174078132 174078333 -7669754 - MTD LTR MaLR 0 419 181 1 1913 610 289 9 28 chr2 174078409 174078599 -7669488 - MTD LTR MaLR -185 215 46 1 1913 348 305 22 30 chr2 174116706 174116841 -7631246 + LTR90B LTR LTR 624 757 -39 1 1913 252 252 23 164 chr2 174179443 174179571 -7568516 + MT2B2 LTR ERVL 156 265 -319 2 1913 794 220 78 144 chr2 174184962 174185308 -7562779 - MTE2b LTR MaLR -56 323 1 2 1913 271 280 197 16 chr2 174188352 174188580 -7559507 + MLT1A0 LTR MaLR 40 339 -35 2 1914 1875 131 25 9 chr2 174196207 174196523 -7551564 + ORR1A4 LTR MaLR 1 321 -8 2 1914 1972 113 15 18 chr2 174201792 174201810 -7546277 - ORR1A2-int LTR MaLR -1621 342 330 2 1914 3406 38 2 5 chr2 174201810 174202207 -7545880 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 1914 1972 113 15 18 chr2 174202207 174202531 -7545556 - ORR1A2-int LTR MaLR -1634 329 1 2 1914 2209 106 48 0 chr2 174202531 174202843 -7545244 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 2 1914 673 241 0 89 chr2 174212775 174212966 -7535121 + MTD LTR MaLR 19 192 -227 2 1914 878 206 42 14 chr2 174212953 174213165 -7534922 + MTD LTR MaLR 146 363 -56 2 1914 3901 107 159 11 chr2 174227053 174227634 -7520453 - RMER19A LTR ERVK 0 737 65 3 1914 3291 53 8 2 chr2 174227634 174228032 -7520055 - MTB LTR MaLR 0 400 1 3 1914 3901 107 159 11 chr2 174228032 174228092 -7519995 - RMER19A LTR ERVK -673 64 1 3 1914 230 205 131 71 chr2 174233060 174233115 -7514972 - MT2A LTR ERVL -326 258 199 3 1914 641 193 0 111 chr2 174234479 174234660 -7513427 - MT2A LTR ERVL -8 525 365 3 1914 321 221 104 0 chr2 174234707 174234784 -7513303 - MT2A LTR ERVL -355 178 94 3 1914 642 178 16 41 chr2 174235009 174235132 -7512955 - MT2A LTR ERVL -412 121 2 3 1914 607 251 55 96 chr2 174235406 174235626 -7512461 - MLT1F1 LTR MaLR -6 563 353 3 1914 277 312 158 47 chr2 174235646 174235788 -7512299 - MLT1F1 LTR MaLR -328 241 89 3 1914 277 312 158 47 chr2 174235895 174235967 -7512120 - MLT1F1 LTR MaLR -481 88 3 3 1914 362 322 0 17 chr2 174240192 174240309 -7507778 + MT2A LTR ERVL 16 130 -403 3 1914 283 194 12 100 chr2 174255335 174255415 -7492672 + RLTR25B LTR ERVK 426 498 -530 3 1914 1624 166 144 6 chr2 174260726 174261053 -7487034 + ORR1D1 LTR MaLR 2 373 -1 4 1914 1115 267 96 22 chr2 174269132 174269471 -7478616 + MTD LTR MaLR 46 407 -12 4 1914 1960 133 27 93 chr2 174274977 174275416 -7472671 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 4 1914 453 208 50 96 chr2 174281599 174281817 -7466270 + RMER17C LTR ERVK 67 274 -136 4 1914 238 237 243 64 chr2 174286176 174286316 -7461771 + RLTR22_Mus LTR ERVK 1 165 -1643 4 1914 447 141 126 26 chr2 174286199 174286327 -7461760 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1648 160 1 4 1914 1448 105 226 25 chr2 174292753 174293027 -7455060 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 4 1914 235 289 165 0 chr2 174301148 174301245 -7446842 + MER21B LTR ERV1 136 248 -615 4 1914 550 279 119 63 chr2 174301295 174301597 -7446490 + MER21B LTR ERV1 384 702 -161 4 1914 2339 113 3 3 chr2 174302229 174302556 -7445531 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 4 1914 236 267 160 0 chr2 174303661 174303736 -7444351 - MTE2b LTR MaLR -73 306 220 4 1914 1001 196 78 5 chr2 174304164 174304369 -7443718 - MTE2b LTR MaLR -143 236 17 4 1914 1513 201 166 100 chr2 174305385 174305867 -7442220 - MT2A LTR ERVL -16 517 4 4 1914 1818 171 58 32 chr2 174305922 174306349 -7441738 + MT2A LTR ERVL 1 582 -19 4 1914 2495 145 37 7 chr2 174307379 174307788 -7440299 + MTC LTR MaLR 1 421 0 4 1914 448 259 69 64 chr2 174312641 174312814 -7435273 - MTEa LTR MaLR -15 364 191 4 1914 317 272 204 25 chr2 174312871 174313033 -7435054 - MLT2B5 LTR ERVL -336 265 75 4 1914 693 304 54 0 chr2 174312891 174313075 -7435012 - MTEa LTR MaLR -163 216 23 4 1914 1970 126 117 0 chr2 174313233 174313430 -7434657 - ORR1C2 LTR MaLR -3 381 148 4 1914 1970 126 117 0 chr2 174313599 174313742 -7434345 - ORR1C2 LTR MaLR -237 147 2 4 1914 1351 274 41 25 chr2 174315789 174316156 -7431931 + MTE2b LTR MaLR 2 374 -5 5 1914 226 225 267 29 chr2 174316871 174316913 -7431174 + MLT1F LTR MaLR 331 397 -151 5 1914 1735 131 191 24 chr2 174322814 174323150 -7424937 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 3 5 1915 1051 181 61 69 chr2 174326069 174326330 -7421757 + MTEb LTR MaLR 67 325 -54 5 1915 243 293 119 17 chr2 174334517 174334635 -7413452 + MLT1C LTR MaLR 3 132 -335 5 1915 349 337 49 0 chr2 174334929 174335092 -7412995 + MLT1C LTR MaLR 280 450 -17 5 1915 230 319 62 0 chr2 174343122 174343235 -7404852 + RLTR22_Mus LTR ERVK 1584 1703 -105 5 1915 293 266 25 0 chr2 174343595 174343674 -7404413 - MTEb LTR MaLR 0 379 299 5 1915 1309 189 212 3 chr2 174344938 174345235 -7402852 - ORR1B2 LTR MaLR -8 359 1 5 1915 3273 36 5 2 chr2 174345802 174346195 -7401892 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 3 5 1915 390 252 0 126 chr2 174355441 174355568 -7392519 - MT2B LTR ERVL -341 260 150 5 1915 253 337 0 33 chr2 174359284 174359376 -7388711 - MLT1A1 LTR MaLR -13 395 307 6 1915 1492 191 149 0 chr2 174369145 174369501 -7378586 + MTD LTR MaLR 10 418 -1 6 1915 1715 129 9 81 chr2 174369739 174370086 -7378001 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 6 1915 246 292 100 50 chr2 174375713 174375893 -7372194 - MLT1C LTR MaLR -133 334 146 6 1915 813 133 0 0 chr2 174377210 174377330 -7370757 + MTB_Mm LTR MaLR 1 120 -287 6 1915 3476 30 2 5 chr2 174377330 174377727 -7370360 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 1915 3336 63 12 53 chr2 174377727 174378120 -7369967 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 390 -708 6 1915 3336 63 12 53 chr2 174378874 174378968 -7369119 + MTA_Mm-int LTR MaLR 391 468 -630 6 1915 850 207 261 30 chr2 174383120 174383419 -7364668 - ORR1D2 LTR MaLR -2 368 1 6 1915 326 302 53 129 chr2 174390036 174390207 -7357880 + MLT1H LTR MaLR 392 549 0 6 1915 1073 273 87 21 chr2 174397013 174397346 -7350741 - MTE2a LTR MaLR -6 373 19 6 1915 274 152 86 57 chr2 174398462 174398532 -7349555 + RLTR18B LTR ERVK 20 91 -421 6 1915 1289 248 95 45 chr2 174399309 174399689 -7348398 + RLTR18B LTR ERVK 114 512 0 6 1915 597 323 113 36 chr2 174402690 174402992 -7345095 - ORR1E LTR MaLR -7 352 28 6 1915 2750 58 0 0 chr2 174403536 174403862 -7344225 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 2 6 1915 241 281 92 20 chr2 174405020 174405118 -7342969 + ORR1E LTR MaLR 32 136 -223 7 1915 312 277 79 0 chr2 174405745 174405846 -7342241 - MLT1E2 LTR MaLR -440 187 79 7 1915 295 301 87 17 chr2 174406169 174406284 -7341803 + MLT1J LTR MaLR 9 131 -381 7 1915 4780 66 2 0 chr2 174407221 174407800 -7340287 + MT2B2 LTR ERVL 5 584 0 7 1915 704 170 13 54 chr2 174408029 174408178 -7339909 + ORR1D1 LTR MaLR 1 143 -231 7 1915 2340 92 9 0 chr2 174408167 174408483 -7339604 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 7 1915 1155 202 56 17 chr2 174408483 174408715 -7339372 + ORR1D1 LTR MaLR 129 369 -5 7 1915 474 367 73 19 chr2 174409825 174410086 -7338001 + MLT1I LTR MaLR 1 275 -136 7 1915 295 231 37 37 chr2 174410105 174410186 -7337901 + MLT1I LTR MaLR 327 407 -4 7 1915 3077 74 8 2 chr2 174413738 174414132 -7333955 - MTB LTR MaLR 0 400 5 7 1915 1905 163 117 3 chr2 174414380 174414731 -7333356 + MTC LTR MaLR 6 396 -25 7 1915 4807 144 127 50 chr2 174414734 174415729 -7332358 + MTC-int LTR MaLR 188 1258 0 7 1915 2374 173 14 9 chr2 174415729 174416148 -7331939 + MTC LTR MaLR 1 421 0 7 1915 2096 151 0 12 chr2 174418227 174418550 -7329537 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 7 1915 10237 147 69 16 chr2 174418554 174420417 -7327670 + ORR1A2-int LTR MaLR 1 1963 0 7 1915 297 122 0 0 chr2 174420422 174420463 -7327624 + ORR1A2 LTR MaLR 278 318 -8 7 1915 720 239 125 0 chr2 174422800 174423021 -7325066 + MTD LTR MaLR 166 417 -4 7 1915 1374 236 77 14 chr2 174433922 174434271 -7313816 + MTE2b LTR MaLR 5 375 -4 7 1915 283 260 84 72 chr2 174446623 174446706 -7301381 - LTR41B LTR ERVL -591 167 84 7 1915 271 351 37 15 chr2 174447469 174447605 -7300482 - ERVL-E-int LTR ERVL -4089 1668 1530 7 1915 369 298 32 58 chr2 174448244 174448433 -7299654 + ERVL-E-int LTR ERVL 260 443 -5224 7 1915 392 267 124 62 chr2 174448905 174449205 -7298882 - ERVL-E-int LTR ERVL -5119 595 260 7 1915 519 301 0 67 chr2 174453389 174453553 -7294534 + MTEa LTR MaLR 8 160 -219 7 1915 651 228 80 52 chr2 174454381 174454667 -7293420 - MTEa LTR MaLR -36 343 4 7 1915 228 233 0 0 chr2 174454874 174454917 -7293170 - MLT2B3 LTR ERVL -511 43 1 7 1916 1143 244 67 94 chr2 174458629 174459000 -7289087 - MTEa LTR MaLR 0 379 19 8 1916 383 114 17 22 chr2 174474701 174474773 -7273314 - ORR1D1 LTR MaLR 0 384 316 8 1916 725 307 41 122 chr2 174476526 174476967 -7271120 - MTD LTR MaLR -14 405 1 8 1916 393 341 120 36 chr2 174481046 174481320 -7266767 - LTR16A1 LTR ERVL -40 416 120 8 1916 269 289 126 42 chr2 174495916 174496035 -7252052 - MLT1K LTR MaLR -301 294 166 8 1916 532 373 102 19 chr2 174507387 174507857 -7240230 - MLT1J LTR MaLR -3 509 1 1 1916 1465 249 34 12 chr2 174509640 174509961 -7238126 + MTEa LTR MaLR 32 359 -20 2 1916 743 219 75 35 chr2 174538492 174538691 -7209396 + ORR1C2 LTR MaLR 172 378 -6 6 1916 680 149 8 50 chr2 174538700 174538820 -7209267 - MTC LTR MaLR -5 416 302 6 1916 955 141 13 7 chr2 174538816 174538966 -7209121 - MTC LTR MaLR -270 151 1 6 1916 1463 286 20 0 chr2 174548864 174549217 -7198870 - MTE2b LTR MaLR -17 362 3 7 1916 2969 36 100 0 chr2 174553239 174553599 -7194488 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 7 1916 791 245 69 0 chr2 174557656 174557872 -7190215 + MTEa LTR MaLR 143 373 -6 8 1916 238 267 87 55 chr2 174560608 174560735 -7187352 - MTE2a LTR MaLR 0 379 249 9 1916 1098 285 64 38 chr2 174562703 174563046 -7185041 + MTEb LTR MaLR 24 375 -4 9 1916 1441 191 136 15 chr2 174568232 174568544 -7179543 + ORR1D1 LTR MaLR 16 358 -20 1 1916 974 237 127 67 chr2 174568594 174568617 -7179470 + ORR1D1 LTR MaLR 359 376 -2 1 1916 632 312 79 99 chr2 174570975 174571458 -7176629 + MLT1D-int LTR MaLR 969 1489 0 1 1916 259 235 136 73 chr2 174571460 174571570 -7176517 + MLT1D LTR MaLR 3 119 -508 1 1916 1900 186 74 6 chr2 174572251 174572602 -7175485 + MTC LTR MaLR 3 377 -44 1 1916 786 246 65 6 chr2 174576201 174576369 -7171718 - MTEb LTR MaLR 0 379 202 1 1916 285 206 10 0 chr2 174576410 174576463 -7171624 + ORR1E LTR MaLR 116 170 -204 1 1916 386 288 175 16 chr2 174581032 174581226 -7166861 - MLT1D LTR MaLR -15 490 266 1 1916 274 333 22 22 chr2 174581322 174581411 -7166676 - MLT1D LTR MaLR -416 89 1 1 1916 342 330 136 55 chr2 174583287 174583560 -7164527 - MLT1K LTR MaLR -112 483 189 1 1916 299 290 21 41 chr2 174585184 174585281 -7162806 + MLT1A LTR MaLR 274 368 -6 1 1917 863 300 115 40 chr2 174590785 174591132 -7156955 - MLT2D LTR ERVL 0 414 42 1 1917 1220 258 44 16 chr2 174597003 174597370 -7150717 + MTEa LTR MaLR 1 377 -2 1 1917 295 277 122 31 chr2 174597370 174597539 -7150548 - MTEb LTR MaLR -52 327 116 1 1917 231 292 91 30 chr2 174600810 174600909 -7147178 + LTR16A1 LTR ERVL 241 345 -111 1 1917 1055 297 32 65 chr2 174611584 174611955 -7136132 + ORR1E LTR MaLR 1 359 0 1 1917 366 311 172 20 chr2 174613534 174613737 -7134350 + RMER15 LTR ERVL 338 571 -4 1 1917 424 323 75 37 chr2 174613842 174614003 -7134084 - MER21B LTR ERV1 -109 754 588 1 1917 398 273 167 13 chr2 174614322 174614478 -7133609 - MER21B LTR ERV1 -665 198 19 1 1917 2114 196 45 8 chr2 174615930 174616327 -7131760 - MTD LTR MaLR 0 419 8 1 1917 321 266 16 117 chr2 174621689 174621817 -7126270 - RMER15 LTR ERVL -90 485 371 1 1917 237 298 76 64 chr2 174622309 174622481 -7125606 - MER66C LTR ERV1 -227 328 155 1 1917 1236 212 139 18 chr2 174630229 174630560 -7117527 - ORR1D1 LTR MaLR -2 372 2 2 1917 768 271 27 22 chr2 174631417 174631640 -7116447 - RMER15 LTR ERVL -16 559 336 2 1917 1789 196 34 49 chr2 174632697 174633083 -7115004 + ORR1C2 LTR MaLR 5 384 0 2 1917 1967 240 52 9 chr2 174633092 174633537 -7114550 - MT2A LTR ERVL -69 464 1 2 1917 314 289 78 58 chr2 174633593 174633784 -7114303 + MLT1E2 LTR MaLR 208 402 -225 2 1917 912 290 23 70 chr2 174636526 174636871 -7111216 - MTEa LTR MaLR 0 379 51 2 1917 391 316 178 23 chr2 174640331 174640590 -7107497 - RMER15 LTR ERVL -1 574 276 2 1917 332 236 51 114 chr2 174640589 174640747 -7107340 - RMER15 LTR ERVL -414 161 14 2 1917 323 288 118 8 chr2 174647155 174647274 -7100813 - ORR1E LTR MaLR 0 379 248 2 1917 478 271 16 25 chr2 174647508 174647629 -7100458 + MT2A LTR ERVL 268 387 -146 2 1917 359 326 159 26 chr2 174647760 174647949 -7100138 - ORR1E LTR MaLR -143 216 3 2 1917 368 309 96 41 chr2 174652378 174652588 -7095499 - LTR16A LTR ERVL -14 437 218 2 1917 272 188 21 0 chr2 174666024 174666072 -7082015 - RMER15 LTR ERVL -92 483 435 2 1917 239 344 65 0 chr2 174667715 174667808 -7080279 - MLT1K LTR MaLR -469 126 28 2 1917 3090 51 5 15 chr2 174668766 174669162 -7078925 - MTB LTR MaLR 0 400 9 2 1917 3268 148 85 6 chr2 174669504 174670046 -7078041 - RMER4B LTR ERVK 0 585 1 2 1917 249 245 0 19 chr2 174671654 174671708 -7076379 - MLT1L LTR MaLR -224 386 334 2 1917 2214 103 0 108 chr2 174671939 174672308 -7075779 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 2 1917 759 254 43 11 chr2 174672308 174672495 -7075592 + MTE2a LTR MaLR 8 200 -179 2 1917 232 312 54 81 chr2 174678259 174678444 -7069643 - ORR1E LTR MaLR -111 248 69 2 1917 319 292 94 84 chr2 174685230 174685432 -7062655 - MLT1D LTR MaLR -47 458 255 3 1917 472 242 99 91 chr2 174686427 174686659 -7061428 + ORR1E LTR MaLR 33 266 -93 3 1917 619 358 77 50 chr2 174687809 174688173 -7059914 - MTEa LTR MaLR -5 374 1 3 1917 292 339 38 61 chr2 174703130 174703262 -7044825 - LTR16C LTR ERVL 0 489 361 3 1917 1192 244 140 9 chr2 174703383 174703705 -7044382 + ORR1D2 LTR MaLR 3 366 -4 3 1917 367 253 67 67 chr2 174708694 174708872 -7039215 - LTR16C LTR ERVL -18 471 294 3 1917 576 274 48 142 chr2 174711089 174711378 -7036709 + MTE2a LTR MaLR 1 262 -117 3 1918 579 304 151 25 chr2 174722158 174722482 -7025605 - ORR1D2 LTR MaLR -3 367 3 3 1918 1981 145 73 12 chr2 174724247 174724589 -7023498 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 5 3 1918 269 296 185 34 chr2 174730233 174730471 -7017616 - MLT1E2 LTR MaLR -138 489 216 3 1918 767 271 119 12 chr2 174732725 174732968 -7015119 - MTEa LTR MaLR -67 312 44 3 1918 379 240 173 0 chr2 174734454 174734558 -7013529 + MTEb LTR MaLR 57 178 -201 3 1918 3284 29 37 3 chr2 174735862 174736245 -7011842 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 1918 5042 77 7 1 chr2 174736245 174736926 -7011161 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 685 -413 3 1918 1689 252 55 28 chr2 174737839 174738312 -7009775 + RMER5 LTR ERV1 35 520 -14 3 1918 476 273 23 8 chr2 174738684 174738813 -7009274 + RMER15 LTR ERVL 373 503 -72 3 1918 509 253 86 31 chr2 174739276 174739439 -7008648 + RMER15 LTR ERVL 402 573 -2 3 1918 342 317 49 21 chr2 174740120 174740262 -7007825 - RMER15 LTR ERVL -158 417 272 3 1918 1905 131 164 158 chr2 174741739 174741844 -7006243 + RLTR24 LTR ERV1 1 108 -421 3 1918 1905 131 164 158 chr2 174742027 174742447 -7005640 + RLTR24 LTR ERV1 109 529 0 3 1918 319 266 52 26 chr2 174743778 174743894 -7004193 + MLT1C LTR MaLR 52 170 -297 3 1918 248 336 24 24 chr2 174746161 174746286 -7001801 + RMER15 LTR ERVL 448 572 -3 4 1918 2687 110 38 15 chr2 174747796 174748194 -6999893 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 4 1918 618 256 22 44 chr2 174748520 174748700 -6999387 - MLT1C LTR MaLR -253 214 39 4 1918 252 206 15 31 chr2 174749243 174749308 -6998779 + RMER15 LTR ERVL 336 399 -176 4 1918 287 251 115 42 chr2 174749378 174749569 -6998518 + RLTR15 LTR ERVK 45 249 -110 4 1918 412 310 21 0 chr2 174749657 174749799 -6998288 + RMER15 LTR ERVL 422 566 -9 4 1918 288 251 456 39 chr2 174752927 174753134 -6994953 - MLT1A0 LTR MaLR -81 293 1 4 1918 273 304 60 35 chr2 174759431 174759547 -6988540 - RLTR25A LTR ERVK -513 590 472 4 1918 1303 114 5 45 chr2 174762936 174763170 -6984917 - ORR1C1 LTR MaLR -7 377 155 4 1918 956 339 76 74 chr2 174763179 174764244 -6983843 - RMER12B LTR ERVK -193 1211 10 4 1918 992 144 113 7 chr2 174764218 174764425 -6983662 - ORR1C1 LTR MaLR -153 231 1 4 1918 3206 193 12 13 chr2 174764425 174765023 -6983064 - ORR1C1-int LTR MaLR 0 1509 913 4 1918 245 293 98 85 chr2 174766672 174766836 -6981251 + MLT1G3 LTR MaLR 419 584 -11 4 1918 608 212 95 24 chr2 174769797 174769966 -6978121 + MERVL_2A-int LTR ERVL 5576 5756 -5 4 1918 433 188 65 57 chr2 174769981 174770105 -6977982 + RMER15 LTR ERVL 34 158 -417 4 1918 748 183 19 44 chr2 174770772 174770932 -6977155 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 167 4 1918 17417 124 8 30 chr2 174770933 174773783 -6974304 - MMETn-int LTR ERVK -2047 2797 10 4 1918 1543 167 12 78 chr2 174773791 174774136 -6973951 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 4 1918 1082 143 212 28 chr2 174774272 174774641 -6973446 + RMER10A LTR ERVL 6 442 0 4 1918 250 213 143 26 chr2 174774641 174774718 -6973369 + MTE-int LTR MaLR 329 414 -1166 4 1918 2223 102 13 0 chr2 174775034 174775348 -6972739 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 2 4 1918 820 249 142 21 chr2 174780184 174780587 -6967500 + RMER12 LTR ERVK 755 1236 -86 4 1918 2241 102 6 6 chr2 174780905 174781232 -6966855 - IAPEY3_LTR LTR ERVK -5 327 1 4 1918 2842 48 48 0 chr2 174781588 174781918 -6966169 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 4 1918 288 245 234 9 chr2 174781921 174782032 -6966055 + RMER16-int LTR ERVK 208 343 -5063 4 1918 1359 143 0 14 chr2 174782769 174782982 -6965105 + RLTR19-int LTR ERVK 3491 3700 -2437 4 1918 3354 176 25 5 chr2 174783010 174783603 -6964484 + RLTR19-int LTR ERVK 3799 4403 -1734 4 1918 1217 300 63 41 chr2 174783983 174784052 -6964035 - RLTR20A LTR ERVK -4 530 447 4 1918 1217 248 60 28 chr2 174784093 174784474 -6963613 - RLTR20A LTR ERVK -89 452 58 4 1918 901 113 7 14 chr2 174787759 174787903 -6960184 + MTA_Mm LTR MaLR 258 400 0 4 1918 7363 119 17 4 chr2 174787904 174788987 -6959100 + MTA_Mm-int LTR MaLR 2 1098 0 4 1918 3186 51 5 30 chr2 174788987 174789393 -6958694 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 1918 250 130 0 169 chr2 174789479 174789544 -6958543 - RLTR33 LTR ERVK -172 506 453 4 1918 233 265 15 0 chr2 174789743 174789811 -6958276 - RLTR19C LTR ERVK -413 93 25 4 1918 1833 254 89 8 chr2 174789855 174790374 -6957713 + RLTR20B1 LTR ERVK 3 563 0 4 1918 728 314 27 54 chr2 174793190 174793336 -6954751 + MuRRS4-int LTR ERV1 3850 3995 -1068 4 1918 4200 104 22 48 chr2 174793336 174793939 -6954148 - LTRIS_Mus LTR ERV1 0 587 1 4 1918 728 315 35 58 chr2 174793939 174794217 -6953870 + MuRRS4-int LTR ERV1 3996 4393 -297 4 1918 804 219 85 5 chr2 174794208 174794419 -6953668 + MuRRS4-int LTR ERV1 4803 5030 -33 4 1918 347 233 82 111 chr2 174796829 174796964 -6951123 - MTEb LTR MaLR -13 366 236 5 1918 232 278 81 27 chr2 174797138 174797212 -6950875 - MTEb LTR MaLR -253 126 49 5 1918 281 338 51 36 chr2 174797243 174797381 -6950706 - RMER15 LTR ERVL -161 414 275 5 1918 866 335 43 40 chr2 174797720 174798118 -6949969 - MTE2a LTR MaLR -17 402 1 5 1918 292 162 133 11 chr2 174798491 174798591 -6949496 - ORR1D1 LTR MaLR -14 380 246 5 1918 906 204 208 33 chr2 174798594 174798977 -6949110 + RMER6B LTR ERVK 1 450 -11 5 1918 894 265 18 81 chr2 174799010 174799293 -6948794 - ORR1D1 LTR MaLR -106 268 4 5 1918 354 305 49 7 chr2 174799488 174799630 -6948457 - MT2A LTR ERVL -385 148 1 5 1918 605 275 53 29 chr2 174799961 174800167 -6947920 - ORR1D1 LTR MaLR -161 213 3 5 1918 664 331 62 8 chr2 174800235 174800491 -6947596 - MTE-int LTR MaLR -236 1344 1075 5 1918 421 186 20 10 chr2 174800781 174800879 -6947208 - RLTR25A LTR ERVK 0 1103 1005 5 1918 3251 133 6 84 chr2 174804442 174804981 -6943106 + RLTR22_Mus LTR ERVK 241 732 -1076 5 1918 3251 133 6 84 chr2 174805078 174805172 -6942915 + RLTR22_Mus LTR ERVK 733 825 -983 5 1918 296 269 25 13 chr2 174805367 174805446 -6942641 + RMER12 LTR ERVK 1102 1181 -141 5 1918 877 277 111 21 chr2 174808890 174809222 -6938865 - ORR1D1 LTR MaLR -12 362 1 5 1918 559 350 32 0 chr2 174809290 174809510 -6938577 - MTE-int LTR MaLR -236 1344 1118 5 1918 3503 11 0 0 chr2 174809510 174809877 -6938210 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 5 1918 56530 23 17 1 chr2 174809877 174816252 -6931835 + IAPEz-int LTR ERVK 8 6481 0 5 1918 3503 11 0 0 chr2 174816252 174816619 -6931468 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 5 1918 3936 192 63 38 chr2 174816983 174817910 -6930177 - RLTR25A LTR ERVK 0 1103 154 5 1918 2627 81 6 36 chr2 174817916 174818273 -6929814 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 5 1918 499 270 46 56 chr2 174824579 174824748 -6923339 - MTEb LTR MaLR -1 378 205 5 1918 242 344 20 40 chr2 174825088 174825188 -6922899 - RMER15 LTR ERVL -185 390 293 5 1918 690 309 50 106 chr2 174825534 174825666 -6922421 - MTE2a LTR MaLR -17 362 238 5 1918 690 309 50 106 chr2 174825850 174826057 -6922030 - MTE2a LTR MaLR -142 237 42 5 1918 11221 165 27 12 chr2 174826108 174826139 -6921948 - RMER16-int LTR ERVK -1823 3583 3558 5 1918 8288 40 2 2 chr2 174826139 174827068 -6921019 - RLTR13B3 LTR ERVK 0 929 1 5 1918 11221 165 27 12 chr2 174827068 174829023 -6919064 - RMER16-int LTR ERVK -1849 3557 1566 5 1918 311 352 47 41 chr2 174829354 174829523 -6918564 - SRV_MM-int LTR ERVK -4043 2124 1955 5 1918 274 295 25 13 chr2 174831488 174831567 -6916520 - RMER12 LTR ERVK -141 1181 1102 5 1918 4918 130 5 30 chr2 174831765 174832536 -6915551 - RLTR22_Mus LTR ERVK -983 825 64 5 1918 4918 130 5 30 chr2 174832714 174832788 -6915299 - RLTR22_Mus LTR ERVK -1745 63 1 5 1918 652 354 75 14 chr2 174832823 174833104 -6914983 + MTE-int LTR MaLR 1038 1335 -245 5 1918 264 204 20 0 chr2 174833182 174833231 -6914856 + ORR1D1 LTR MaLR 1 50 -334 5 1918 402 281 166 18 chr2 174833446 174833676 -6914411 + ORR1D1 LTR MaLR 112 370 0 5 1918 233 185 0 143 chr2 174846602 174846665 -6901422 - RLTR33 LTR ERVK -172 506 453 5 1918 262 209 30 0 chr2 174847068 174847135 -6900952 - RLTR19C LTR ERVK -413 93 25 5 1918 2263 231 64 4 chr2 174847170 174847701 -6900386 + RLTR20B1 LTR ERVK 1 563 0 5 1918 623 234 63 17 chr2 174847944 174848118 -6899969 - RLTR20B1 LTR ERVK -376 184 3 5 1918 259 250 15 0 chr2 174848162 174848230 -6899857 + RLTR19C LTR ERVK 25 93 -413 5 1918 253 130 0 169 chr2 174848635 174848700 -6899387 + RLTR33 LTR ERVK 453 506 -172 5 1918 492 48 0 0 chr2 174848789 174848852 -6899235 - MTB LTR MaLR 0 400 338 5 1919 399 237 89 77 chr2 174850264 174850433 -6897654 - RLTR13D3 LTR ERVK 0 1114 944 5 1919 1656 183 9 75 chr2 174854934 174855282 -6892805 - ORR1A2 LTR MaLR -2 325 1 5 1919 1512 234 42 26 chr2 174855335 174855713 -6892374 + RLTR25B LTR ERVK 645 1028 0 5 1919 387 313 43 38 chr2 174855999 174856185 -6891902 - RMER12 LTR ERVK -35 1287 1101 6 1919 4806 110 72 3 chr2 174856375 174857150 -6890937 - RLTR22_Mus LTR ERVK -977 831 3 6 1919 726 345 45 4 chr2 174857202 174857467 -6890620 + MTE-int LTR MaLR 1060 1335 -245 6 1919 290 210 27 3 chr2 174857544 174857600 -6890487 + ORR1D2 LTR MaLR 1 58 -309 6 1919 405 331 127 34 chr2 174857762 174858028 -6890059 + ORR1D2 LTR MaLR 59 365 -5 6 1919 2074 175 45 19 chr2 174859518 174859949 -6888138 + RLTR1 LTR ERV1 135 596 -28 6 1919 2074 168 46 13 chr2 174859976 174859997 -6888090 + RLTR1 LTR ERV1 597 624 0 6 1919 1031 256 96 9 chr2 174861257 174861580 -6886507 + RMER10A LTR ERVL 86 436 -6 6 1919 2059 95 3 71 chr2 174867451 174867801 -6880286 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK -11 326 1 6 1919 6154 52 10 6 chr2 174867801 174868602 -6879485 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 5678 6 1919 10356 17 3 46 chr2 174868600 174869963 -6878124 - IAPEz-int LTR ERVK -5177 1304 1 6 1919 1923 120 3 87 chr2 174869964 174870320 -6877767 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK -11 326 1 6 1919 233 185 0 143 chr2 174881985 174882048 -6866039 - RLTR33 LTR ERVK -172 506 453 6 1919 229 227 30 0 chr2 174882542 174882608 -6865479 - RLTR19C LTR ERVK -413 93 26 6 1919 2289 230 62 4 chr2 174882644 174883176 -6864911 + RLTR20B1 LTR ERVK 1 563 0 6 1919 518 255 90 25 chr2 174883419 174883619 -6864468 - RLTR20B1 LTR ERVK -376 184 1 6 1919 256 141 52 188 chr2 174883869 174883965 -6864122 + RLTR33 LTR ERVK 424 506 -172 6 1919 2916 66 8 20 chr2 174884266 174884667 -6863420 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 1919 6710 125 16 5 chr2 174884667 174885753 -6862334 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 6 1919 907 113 7 14 chr2 174885753 174885897 -6862190 - MTA_Mm LTR MaLR 0 400 258 6 1919 441 249 174 16 chr2 174895170 174895354 -6852733 - ORR1D1 LTR MaLR -8 366 154 6 1919 311 157 20 0 chr2 174895606 174895657 -6852430 - ORR1D1 LTR MaLR -322 52 1 6 1919 688 335 72 4 chr2 174895734 174896013 -6852074 - MTE-int LTR MaLR -245 1335 1038 6 1919 7145 160 35 17 chr2 174896054 174897493 -6850594 + RMER16-int LTR ERVK 1858 3323 -2083 6 1919 5330 76 2 54 chr2 174897493 174897690 -6850397 + RLTR13C2 LTR ERVK 1 189 -619 6 1919 5330 85 6 52 chr2 174897871 174898521 -6849566 + RLTR13C2 LTR ERVK 190 983 0 6 1919 1146 147 62 13 chr2 174898523 174898750 -6849337 + RMER16-int LTR ERVK 3320 3557 -1849 6 1919 1676 268 53 61 chr2 174900503 174900848 -6847239 + RLTR20A LTR ERVK 1 357 -184 6 1919 1676 268 53 61 chr2 174900993 174901005 -6847082 + RLTR20A LTR ERVK 358 358 -183 6 1919 1676 268 53 61 chr2 174901184 174901369 -6846718 + RLTR20A LTR ERVK 358 540 -1 6 1919 278 306 23 12 chr2 174908405 174908491 -6839596 - RMER12 LTR ERVK -134 1188 1102 6 1919 754 158 33 0 chr2 174908677 174908829 -6839258 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1016 832 676 6 1919 704 217 6 24 chr2 174909866 174910036 -6838051 + RMER10A LTR ERVL 271 437 -5 6 1919 884 99 14 14 chr2 174915492 174915635 -6832452 + MTA_Mm LTR MaLR 258 400 0 6 1919 6826 107 29 10 chr2 174915635 174916613 -6831474 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1003 -95 6 1919 2860 29 18 0 chr2 174916613 174916953 -6831134 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 6 1919 6826 107 29 10 chr2 174916953 174917052 -6831035 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1004 1098 0 6 1919 2726 71 5 115 chr2 174917052 174917176 -6830911 + MTA_Mm LTR MaLR 1 107 -289 6 1919 2726 71 5 115 chr2 174917322 174917642 -6830445 + MTA_Mm LTR MaLR 108 396 0 6 1919 2832 104 68 3 chr2 174917761 174918237 -6829850 - RLTR1C LTR ERV1 0 605 1 6 1919 238 265 15 0 chr2 174918480 174918548 -6829539 - RLTR19C LTR ERVK -413 93 25 6 1919 1903 240 86 10 chr2 174918592 174919113 -6828974 + RLTR20B1 LTR ERVK 3 563 0 6 1919 1025 250 94 12 chr2 174933717 174934037 -6814050 - RMER10A LTR ERVL -6 436 91 6 1919 909 272 115 21 chr2 174937766 174938096 -6809991 - ORR1D1 LTR MaLR -13 361 1 6 1919 782 347 35 10 chr2 174938165 174938453 -6809634 - MTE-int LTR MaLR -239 1341 1047 6 1919 631 207 80 0 chr2 174938661 174938811 -6809276 + RLTR25A LTR ERVK 286 447 -656 7 1919 3967 201 61 40 chr2 174938893 174939823 -6808264 - RLTR25A LTR ERVK 0 1103 154 7 1919 2356 106 18 0 chr2 174939829 174940109 -6807978 + ORR1A1 LTR MaLR 1 280 -66 7 1919 2356 106 18 0 chr2 174940143 174940202 -6807885 + ORR1A1 LTR MaLR 281 344 -2 7 1919 362 247 0 76 chr2 174946483 174946575 -6801512 - MTEb LTR MaLR -1 378 294 7 1919 272 312 20 40 chr2 174946764 174946864 -6801223 - RMER15 LTR ERVL -185 390 293 7 1919 840 341 42 37 chr2 174947211 174947581 -6800506 - MTE2a LTR MaLR -17 404 20 7 1919 2538 160 6 4 chr2 174947583 174948067 -6800020 - RMER16-int LTR ERVK -1823 3583 3099 7 1919 491 163 0 11 chr2 174948667 174948760 -6799327 - RMER16-int LTR ERVK -2297 3109 3018 7 1919 1651 75 0 26 chr2 174948766 174948999 -6799088 - RLTR13C2 LTR ERVK -398 410 184 7 1919 1413 86 5 0 chr2 174949199 174949396 -6798691 - RLTR13C2 LTR ERVK -610 198 1 7 1919 1772 140 6 52 chr2 174949396 174949743 -6798344 - RMER16-int LTR ERVK -2083 3323 2993 7 1919 1004 186 20 10 chr2 174949766 174949961 -6798126 + RLTR41 LTR ERV1 250 446 0 7 1919 1730 266 87 6 chr2 174951604 174952123 -6795964 - RLTR20B1 LTR ERVK 0 563 3 7 1919 253 130 0 169 chr2 174952405 174952470 -6795617 + RLTR33 LTR ERVK 453 506 -172 7 1919 2953 64 8 20 chr2 174952561 174952962 -6795125 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 7 1919 6789 120 13 11 chr2 174952962 174954058 -6794029 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 7 1919 933 106 7 14 chr2 174954058 174954202 -6793885 - MTA_Mm LTR MaLR 0 400 258 7 1919 608 212 43 24 chr2 174960778 174960942 -6787145 - RMER10A LTR ERVL -5 437 271 7 1919 809 199 0 126 chr2 174966193 174966383 -6781704 + RLTR26 LTR ERVK 477 642 0 7 1919 1658 177 95 0 chr2 174967023 174967412 -6780675 + RMER17B LTR ERVK 533 958 0 7 1919 461 351 79 70 chr2 174968172 174968690 -6779397 - MT2A LTR ERVL -10 523 1 7 1919 452 250 70 88 chr2 174969021 174969236 -6778851 - ORR1D1 LTR MaLR -161 213 3 7 1919 753 329 59 4 chr2 174969306 174969562 -6778525 - MTE-int LTR MaLR -236 1344 1075 7 1919 4790 188 53 31 chr2 174969852 174970913 -6777174 - RLTR25A LTR ERVK 0 1103 20 7 1919 900 215 50 118 chr2 174970877 174971157 -6776930 - RLTR41 LTR ERV1 -123 323 63 7 1919 1439 211 33 209 chr2 174971212 174971752 -6776335 - RLTR41 LTR ERV1 -1 445 1 7 1919 1021 265 110 12 chr2 174972978 174973314 -6774773 - ORR1D1 LTR MaLR -5 369 1 7 1919 748 341 26 0 chr2 174973380 174973609 -6774478 - MTE-int LTR MaLR -236 1344 1110 7 1919 671 189 263 70 chr2 174974988 174975216 -6772871 - RLTR25B LTR ERVK 0 1028 757 7 1919 668 177 38 0 chr2 174975263 174975421 -6772666 - RMER16-int LTR ERVK -75 2251 2088 7 1919 2051 109 0 122 chr2 174976102 174976456 -6771631 - RLTR10E LTR ERVK 0 311 1 7 1919 19520 84 2 4 chr2 174976456 174979497 -6768590 - MMERVK10C-int LTR ERVK 0 7680 4623 7 1919 2365 121 21 1 chr2 174980110 174980750 -6767337 - MMERVK10C-int LTR ERVK -3137 4269 3567 7 1919 1108 227 72 23 chr2 174980758 174981064 -6767023 - MMERVK10C-int LTR ERVK -4632 2774 2454 7 239 573 168 88 0 chr2 174981077 174981190 -6766897 - RMER16-int LTR ERVK -5077 1060 938 7 1920 1648 176 192 47 chr2 174981204 174981694 -6766393 - RMER16-int LTR ERVK -4595 811 251 7 1920 1407 121 0 0 chr2 174981830 174982070 -6766017 - MMERVK10C-int LTR ERVK -6629 952 713 7 1920 824 167 0 0 chr2 174982081 174982225 -6765862 - MMERVK10C-int LTR ERVK -7212 369 226 7 1920 254 245 0 19 chr2 174982227 174982281 -6765806 - RLTR27 LTR ERVK -35 274 222 7 1920 593 99 11 0 chr2 174982281 174982372 -6765715 - MMERVK10C-int LTR ERVK -7489 92 1 7 1920 2155 119 0 28 chr2 174982372 174982692 -6765395 - RLTR10E LTR ERVK 0 311 1 7 1920 615 257 6 28 chr2 174982929 174983109 -6764978 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -1586 740 565 7 1920 540 203 47 7 chr2 174983114 174983263 -6764824 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -2171 155 1 7 1920 30137 63 8 11 chr2 174984369 174988405 -6759682 - MMERVK10C-int LTR ERVK -1778 5803 1778 7 1920 4222 20 12 2 chr2 174988405 174988893 -6759194 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 7 1920 5749 15 0 0 chr2 174988893 174989568 -6758519 + MERVL-int LTR ERVL 1 675 -4810 7 1920 6913 60 4 0 chr2 174989569 174990471 -6757616 - MMERVK10C-int LTR ERVK -5806 1775 870 7 1920 1409 119 10 12 chr2 174990469 174990789 -6757298 - MMERVK10C-int LTR ERVK -7182 399 1 7 1920 2947 47 0 29 chr2 174990789 174991165 -6756922 - RLTR10B2 LTR ERVK 0 365 1 7 1920 244 206 135 14 chr2 174991165 174991239 -6756848 - RLTR20B1 LTR ERVK -478 85 3 7 1920 251 250 15 0 chr2 174991278 174991346 -6756741 + RLTR19C LTR ERVK 25 93 -413 7 1920 228 35 0 0 chr2 174991552 174991581 -6756506 + RLTR33 LTR ERVK 453 481 -197 7 1920 3017 54 18 10 chr2 174991703 174992096 -6755991 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 7 1920 7074 109 12 16 chr2 174992096 174993199 -6754888 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 7 1920 982 78 7 14 chr2 174993199 174993343 -6754744 - MTA_Mm LTR MaLR 0 400 258 7 1920 679 255 7 0 chr2 174999469 174999622 -6748465 - RMER10A LTR ERVL -6 436 283 7 1920 239 204 0 0 chr2 174999729 174999778 -6748309 - RMER10A LTR ERVL -305 137 89 7 1920 931 273 107 12 chr2 175003652 175003989 -6744098 - ORR1D1 LTR MaLR -5 369 1 8 1920 2490 184 49 39 chr2 175004031 175004568 -6743519 - RLTR25A LTR ERVK -433 670 154 9 1920 2569 72 0 67 chr2 175004575 175004946 -6743141 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 1 1920 462 252 57 64 chr2 175011202 175011342 -6736745 - MTEb LTR MaLR -1 378 240 1 1920 287 302 20 40 chr2 175011713 175011813 -6736274 - RMER15 LTR ERVL -185 390 293 1 1920 810 344 31 37 chr2 175012160 175012483 -6735604 - MTE2b LTR MaLR -17 362 42 1 1920 2564 158 6 6 chr2 175012534 175013019 -6735068 - RMER16-int LTR ERVK -1823 3583 3099 1 1920 491 163 0 11 chr2 175013622 175013715 -6734372 - RMER16-int LTR ERVK -2297 3109 3018 1 1920 1580 128 21 10 chr2 175013721 175014004 -6734083 - RLTR13C2 LTR ERVK -394 499 203 2 1920 1464 71 5 0 chr2 175014185 175014382 -6733705 - RLTR13C2 LTR ERVK -610 198 1 2 1920 1776 137 6 52 chr2 175014382 175014729 -6733358 - RMER16-int LTR ERVK -2083 3323 2993 2 1920 1013 181 20 10 chr2 175014752 175014947 -6733140 + RLTR41 LTR ERV1 250 446 0 2 1920 1733 269 85 6 chr2 175016590 175017110 -6730977 - RLTR20B1 LTR ERVK 0 563 3 3 1920 253 130 0 169 chr2 175017419 175017484 -6730603 + RLTR33 LTR ERVK 453 506 -172 3 1920 2984 61 8 20 chr2 175017575 175017976 -6730111 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 1920 6416 128 30 11 chr2 175017976 175019054 -6729033 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 3 1920 857 101 36 7 chr2 175019054 175019193 -6728894 - MTA_Mm LTR MaLR 0 400 258 3 1920 680 229 6 24 chr2 175025387 175025557 -6722530 - RMER10A LTR ERVL -5 437 271 4 1920 802 211 0 126 chr2 175031033 175031223 -6716864 + RLTR26 LTR ERVK 477 642 0 4 1920 1535 191 96 23 chr2 175031864 175032261 -6715826 + RMER17B LTR ERVK 533 958 0 4 1920 503 313 35 140 chr2 175033022 175033263 -6714824 - MT2A LTR ERVL -10 591 378 4 1920 588 296 23 56 chr2 175033288 175033545 -6714542 - MT2A LTR ERVL -224 377 1 4 1920 501 248 60 79 chr2 175033876 175034091 -6713996 - ORR1D1 LTR MaLR -161 213 3 4 1920 736 327 62 8 chr2 175034161 175034417 -6713670 - MTE-int LTR MaLR -236 1344 1075 4 1920 4779 187 54 29 chr2 175034708 175035767 -6712320 - RLTR25A LTR ERVK 0 1103 19 5 1920 909 224 52 112 chr2 175035719 175036006 -6712081 - RLTR41 LTR ERV1 -112 334 65 5 1920 1495 217 32 199 chr2 175036063 175036597 -6711490 - RLTR41 LTR ERV1 -1 445 1 5 1920 264 197 14 57 chr2 175037811 175037881 -6710206 - MTE-int LTR MaLR -255 1115 1049 4 1920 553 276 75 6 chr2 175050551 175050755 -6697332 - RLTR20B1 LTR ERVK -358 219 3 6 1920 271 250 15 0 chr2 175050799 175050867 -6697220 + RLTR19C LTR ERVK 25 93 -413 6 1920 242 148 0 169 chr2 175051070 175051135 -6696952 + RLTR33 LTR ERVK 453 506 -172 6 1920 2879 69 18 10 chr2 175051528 175051921 -6696166 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 1920 7090 110 10 14 chr2 175051921 175053023 -6695064 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 6 1920 232 244 82 122 chr2 175053023 175053037 -6695050 - MTA_Mm LTR MaLR 0 394 381 6 1920 873 109 7 14 chr2 175053222 175053361 -6694726 - MTB LTR MaLR -5 395 258 6 1920 953 84 7 14 chr2 175059439 175059583 -6688504 + MTA_Mm LTR MaLR 258 400 0 7 1920 7046 112 18 3 chr2 175059586 175060665 -6687422 + MTA_Mm-int LTR MaLR 4 1098 0 7 1920 2742 99 2 10 chr2 175060665 175061064 -6687023 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 7 1920 1843 244 90 12 chr2 175061516 175062026 -6686061 + RLTR20B1 LTR ERVK 3 552 -11 7 1920 2510 70 68 29 chr2 175062856 175063207 -6684880 + RLTR10B2 LTR ERVK 1 365 0 7 1920 4121 121 17 76 chr2 175067509 175068288 -6679799 - RMER17A LTR ERVK -18 733 1 8 1920 2843 205 86 28 chr2 175070660 175072116 -6675971 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 6 1545 -3861 8 1920 237 310 0 0 chr2 175072118 175072176 -6675911 + ORR1B1 LTR MaLR 151 208 -186 8 1920 1580 184 7 0 chr2 175074214 175074491 -6673596 - MT2B LTR ERVL -320 281 3 9 1920 1175 171 35 17 chr2 175075029 175075261 -6672826 - ORR1A4 LTR MaLR -1 328 93 9 1920 696 210 14 14 chr2 175075261 175075401 -6672686 + RLTR46 LTR ERVK 1 140 -180 9 1920 300 316 40 56 chr2 175075445 175075643 -6672444 + RLTR46 LTR ERVK 126 320 0 9 1920 553 201 51 45 chr2 175075643 175075775 -6672312 - ORR1A4 LTR MaLR -245 149 1 9 1920 3092 102 125 21 chr2 175076096 175076607 -6671480 + LTRIS2 LTR ERV1 1 564 0 9 1920 3040 77 12 5 chr2 175077118 175077536 -6670551 + BGLII LTR ERVK 1 421 0 1 1920 2948 40 0 0 chr2 175079474 175079820 -6668267 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 1 1920 2227 188 77 42 chr2 175081919 175082441 -6665646 - RLTR25A LTR ERVK -420 683 144 1 1920 282 204 0 0 chr2 175082567 175082616 -6665471 + RLTR25A LTR ERVK 512 560 -543 1 1920 766 265 108 48 chr2 175082672 175082922 -6665165 - RLTR41 LTR ERV1 -181 265 1 1 1920 817 322 26 0 chr2 175086303 175086533 -6661554 + MTE-int LTR MaLR 1109 1344 -236 1 1920 885 272 110 24 chr2 175086599 175086934 -6661153 + ORR1D1 LTR MaLR 1 364 -10 1 1920 735 98 223 0 chr2 175087932 175088107 -6659980 + RLTR45 LTR ERVK 1 214 -268 1 1920 1956 60 7 31 chr2 175090052 175090342 -6657745 + RLTR45 LTR ERVK 200 482 0 1 1920 25237 35 15 5 chr2 175090342 175093514 -6654573 + RLTR45-int LTR ERVK 1 3205 -4039 1 1920 19423 33 19 1 chr2 175093503 175094860 -6653227 + RLTR45-int LTR ERVK 3385 4745 -2499 1 1920 19423 33 19 1 chr2 175094901 175096031 -6652056 + RLTR45-int LTR ERVK 4746 5914 -1330 1 1920 10186 39 41 0 chr2 175096742 175098034 -6650053 + RLTR45-int LTR ERVK 5900 7244 0 1 1920 3242 68 61 4 chr2 175098034 175098490 -6649597 + RLTR45 LTR ERVK 1 482 0 1 1920 2507 186 36 30 chr2 175098491 175099068 -6649019 + RLTR25A LTR ERVK 523 1103 0 1 1920 717 339 63 4 chr2 175099359 175099614 -6648473 + MTE-int LTR MaLR 1075 1344 -236 1 1920 627 277 39 24 chr2 175099682 175099889 -6648198 + ORR1D1 LTR MaLR 4 213 -161 1 1920 1567 193 112 0 chr2 175100724 175101107 -6646980 - RMER17B LTR ERVK 0 958 533 1 1920 834 241 23 110 chr2 175101755 175101974 -6646113 - RLTR26 LTR ERVK 0 642 443 1 1920 335 284 22 11 chr2 175105204 175105293 -6642794 - RMER12 LTR ERVK -131 1191 1102 1 1920 740 128 8 0 chr2 175105503 175105628 -6642459 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1047 801 676 1 1920 693 223 6 24 chr2 175106665 175106835 -6641252 + RMER10A LTR ERVL 271 437 -5 1 1921 911 99 14 7 chr2 175112619 175112761 -6635326 + MTA_Mm LTR MaLR 258 400 0 1 1921 7118 101 19 9 chr2 175112761 175113749 -6634338 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1004 -94 1 1921 2850 32 18 0 chr2 175113749 175114089 -6633998 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 1 1921 13871 58 4 1 chr2 175114089 175115875 -6632212 + ORR1A0-int LTR MaLR 1 1792 0 1 1921 2932 29 9 0 chr2 175115875 175116218 -6631869 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 1 1921 7118 101 19 9 chr2 175116218 175116314 -6631773 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1005 1096 -2 1 1921 2875 61 2 102 chr2 175116314 175116434 -6631653 + MTA_Mm LTR MaLR 1 107 -289 1 1921 2875 61 2 102 chr2 175116580 175116899 -6631188 + MTA_Mm LTR MaLR 108 396 0 1 1921 2732 115 68 6 chr2 175117054 175117531 -6630556 - RLTR1C LTR ERV1 0 605 1 1 1921 238 265 15 0 chr2 175117771 175117839 -6630248 - RLTR19C LTR ERVK -413 93 25 1 1921 1812 252 86 10 chr2 175117883 175118404 -6629683 + RLTR20B1 LTR ERVK 3 563 0 1 1921 909 272 115 21 chr2 175132578 175132908 -6615179 - ORR1D1 LTR MaLR -13 361 1 1 1921 806 344 35 10 chr2 175132977 175133265 -6614822 - MTE-int LTR MaLR -239 1341 1047 1 1921 631 207 80 0 chr2 175133488 175133638 -6614449 + RLTR25A LTR ERVK 286 447 -656 1 1921 3981 201 60 40 chr2 175133720 175134651 -6613436 - RLTR25A LTR ERVK 0 1103 154 1 1921 2329 107 27 0 chr2 175134657 175134937 -6613150 + ORR1A1 LTR MaLR 1 280 -66 1 1921 2329 107 27 0 chr2 175134971 175135027 -6613060 + ORR1A1 LTR MaLR 281 344 -2 1 1921 352 247 0 76 chr2 175141307 175141399 -6606688 - MTEb LTR MaLR -1 378 294 1 1921 283 312 20 40 chr2 175141568 175141668 -6606419 - RMER15 LTR ERVL -185 390 293 1 1921 823 330 37 40 chr2 175142015 175142337 -6605750 - MTE2a LTR MaLR -17 362 42 1 1921 2576 156 6 4 chr2 175142388 175142872 -6605215 - RMER16-int LTR ERVK -1823 3583 3099 1 1921 520 158 0 10 chr2 175143470 175143566 -6604521 - RMER16-int LTR ERVK -2294 3112 3018 1 1921 1681 66 0 30 chr2 175143572 175143806 -6604281 - RLTR13C2 LTR ERVK -398 410 184 1 1921 1464 71 5 0 chr2 175144003 175144200 -6603887 - RLTR13C2 LTR ERVK -610 198 1 1 1921 1750 140 6 52 chr2 175144200 175144547 -6603540 - RMER16-int LTR ERVK -2083 3323 2993 1 1921 983 176 21 11 chr2 175144587 175144777 -6603310 + RLTR41 LTR ERV1 255 446 0 1 1921 1704 273 85 6 chr2 175146418 175146938 -6601149 - RLTR20B1 LTR ERVK 0 563 3 1 1921 253 130 0 169 chr2 175147247 175147312 -6600775 + RLTR33 LTR ERVK 453 506 -172 1 1921 2966 64 8 20 chr2 175147403 175147804 -6600283 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 1921 6409 129 30 11 chr2 175147804 175148882 -6599205 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 1 1921 852 109 36 7 chr2 175148882 175149021 -6599066 - MTA_Mm LTR MaLR 0 400 258 1 1921 694 223 6 24 chr2 175155058 175155228 -6592859 - RMER10A LTR ERVL -5 437 271 1 1921 3545 18 0 0 chr2 175155512 175155908 -6592179 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1921 9546 20 1 0 chr2 175155908 175157005 -6591082 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 1 1921 3518 20 0 0 chr2 175157005 175157401 -6590686 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1921 837 231 23 110 chr2 175162370 175162589 -6585498 + RLTR26 LTR ERVK 443 642 0 1 1921 1541 191 115 3 chr2 175163230 175163613 -6584474 + RMER17B LTR ERVK 533 958 0 1 1921 917 282 150 78 chr2 175164373 175164585 -6583502 - MT2A LTR ERVL -10 523 248 1 1921 917 282 150 78 chr2 175164620 175164895 -6583192 - MT2A LTR ERVL -286 247 2 1 1921 504 256 55 83 chr2 175165225 175165442 -6582645 - ORR1D1 LTR MaLR -161 213 3 2 1921 686 332 66 12 chr2 175165512 175165768 -6582319 - MTE-int LTR MaLR -236 1344 1075 2 1921 4541 188 62 31 chr2 175166059 175167112 -6580975 - RLTR25A LTR ERVK 0 1103 19 2 1921 945 223 48 117 chr2 175167064 175167354 -6580733 - RLTR41 LTR ERV1 -112 334 65 2 1921 1331 227 31 218 chr2 175167411 175167958 -6580129 - RLTR41 LTR ERV1 -1 445 1 2 1921 962 265 122 24 chr2 175169212 175169548 -6578539 - ORR1D1 LTR MaLR -5 369 1 2 1921 793 328 26 4 chr2 175169614 175169844 -6578243 - MTE-int LTR MaLR -236 1344 1110 2 1921 2839 206 87 29 chr2 175170648 175172104 -6575983 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 6 1545 -3861 2 1921 237 310 0 0 chr2 175172106 175172164 -6575923 + ORR1B1 LTR MaLR 151 208 -186 2 1921 1564 188 7 0 chr2 175174218 175174495 -6573592 - MT2B LTR ERVL -320 281 3 2 1921 1173 167 35 17 chr2 175175033 175175265 -6572822 - ORR1A4 LTR MaLR -1 328 93 2 1921 707 196 14 14 chr2 175175265 175175405 -6572682 + RLTR46 LTR ERVK 1 140 -180 2 1921 254 325 46 46 chr2 175175449 175175623 -6572464 + RLTR46 LTR ERVK 126 299 -21 2 1921 543 204 17 26 chr2 175175628 175175744 -6572343 - ORR1A4 LTR MaLR -214 115 1 2 1921 3091 102 125 21 chr2 175176099 175176610 -6571477 + LTRIS2 LTR ERV1 1 564 0 2 1921 2999 82 12 5 chr2 175177121 175177539 -6570548 + BGLII LTR ERVK 1 421 0 2 1921 2897 46 0 0 chr2 175179478 175179824 -6568263 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 2 1921 2234 184 76 49 chr2 175181923 175182449 -6565638 - RLTR25A LTR ERVK -420 683 144 2 1921 282 204 0 0 chr2 175182545 175182594 -6565493 + RLTR25A LTR ERVK 512 560 -543 2 1921 743 269 108 48 chr2 175182652 175182902 -6565185 - RLTR41 LTR ERV1 -181 265 1 2 1921 848 306 32 76 chr2 175186017 175186089 -6561998 + MTE-int LTR MaLR 1044 1108 -472 2 1921 848 306 32 76 chr2 175186267 175186509 -6561578 + MTE-int LTR MaLR 1109 1344 -236 2 1921 903 282 102 15 chr2 175186575 175186910 -6561177 + ORR1D1 LTR MaLR 1 364 -10 2 1921 468 191 0 110 chr2 175187378 175187496 -6560591 - MT2B LTR ERVL -339 262 158 2 1921 3169 52 94 16 chr2 175187894 175188341 -6559746 + RLTR45 LTR ERVK 1 482 0 2 1921 24852 42 12 8 chr2 175188341 175191533 -6556554 + RLTR45-int LTR ERVK 1 3205 -4039 2 1921 28791 38 28 24 chr2 175191511 175192857 -6555230 + RLTR45-int LTR ERVK 3380 4761 -2483 2 1921 28791 38 28 24 chr2 175192899 175195404 -6552683 + RLTR45-int LTR ERVK 4762 7243 -1 2 1921 3269 70 59 4 chr2 175195404 175195861 -6552226 + RLTR45 LTR ERVK 1 482 0 2 1921 2531 184 36 30 chr2 175195862 175196439 -6551648 + RLTR25A LTR ERVK 523 1103 0 2 1921 766 323 63 4 chr2 175196730 175196985 -6551102 + MTE-int LTR MaLR 1075 1344 -236 2 1921 659 262 44 15 chr2 175197055 175197260 -6550827 + ORR1D1 LTR MaLR 3 213 -161 2 1921 1660 184 103 3 chr2 175198094 175198481 -6549606 - RMER17B LTR ERVK 0 958 533 2 1921 833 232 13 0 chr2 175199129 175199280 -6548807 - RLTR26 LTR ERVK 0 642 490 2 1921 301 296 34 0 chr2 175202364 175202452 -6545635 - RMER12 LTR ERVK -131 1191 1101 2 1921 740 128 8 0 chr2 175202661 175202786 -6545301 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1047 801 676 2 1921 704 217 6 24 chr2 175203823 175203993 -6544094 + RMER10A LTR ERVL 271 437 -5 2 1921 911 99 14 7 chr2 175210189 175210331 -6537756 + MTA_Mm LTR MaLR 258 400 0 2 1921 7090 101 20 10 chr2 175210331 175211319 -6536768 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1004 -94 2 1921 2823 38 18 0 chr2 175211319 175211659 -6536428 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 2 1921 13774 61 4 1 chr2 175211659 175213445 -6534642 + ORR1A0-int LTR MaLR 1 1792 0 2 1921 2932 29 9 0 chr2 175213445 175213788 -6534299 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 2 1921 7090 101 20 10 chr2 175213788 175213884 -6534203 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1005 1096 -2 2 1921 2865 61 2 106 chr2 175213884 175214006 -6534081 + MTA_Mm LTR MaLR 1 107 -289 2 1921 2865 61 2 106 chr2 175214152 175214471 -6533616 + MTA_Mm LTR MaLR 108 396 0 2 1921 2732 115 68 6 chr2 175214626 175215103 -6532984 - RLTR1C LTR ERV1 0 605 1 2 1921 238 265 15 0 chr2 175215343 175215411 -6532676 - RLTR19C LTR ERVK -413 93 25 2 1921 1812 252 86 10 chr2 175215455 175215976 -6532111 + RLTR20B1 LTR ERVK 3 563 0 2 1921 909 272 115 21 chr2 175230148 175230478 -6517609 - ORR1D1 LTR MaLR -13 361 1 2 1921 806 344 35 10 chr2 175230547 175230835 -6517252 - MTE-int LTR MaLR -239 1341 1047 2 1921 631 207 80 0 chr2 175231043 175231193 -6516894 + RLTR25A LTR ERVK 286 447 -656 2 1921 3981 201 60 40 chr2 175231275 175232206 -6515881 - RLTR25A LTR ERVK 0 1103 154 2 1921 2329 107 27 0 chr2 175232212 175232492 -6515595 + ORR1A1 LTR MaLR 1 280 -66 2 1921 2329 107 27 0 chr2 175232526 175232582 -6515505 + ORR1A1 LTR MaLR 281 344 -2 2 1921 352 247 0 76 chr2 175238864 175238956 -6509131 - MTEb LTR MaLR -1 378 294 2 1921 283 312 20 40 chr2 175239125 175239225 -6508862 - RMER15 LTR ERVL -185 390 293 2 1921 823 330 37 40 chr2 175239572 175239894 -6508193 - MTE2a LTR MaLR -17 362 42 2 1921 2576 156 6 4 chr2 175239945 175240429 -6507658 - RMER16-int LTR ERVK -1823 3583 3099 3 1921 551 153 0 10 chr2 175241024 175241123 -6506964 - RMER16-int LTR ERVK -2291 3115 3018 3 1921 1681 66 0 30 chr2 175241129 175241363 -6506724 - RLTR13C2 LTR ERVK -398 410 184 3 1921 1464 71 5 0 chr2 175241560 175241757 -6506330 - RLTR13C2 LTR ERVK -610 198 1 3 1921 1750 140 6 52 chr2 175241757 175242104 -6505983 - RMER16-int LTR ERVK -2083 3323 2993 3 1921 983 176 21 11 chr2 175242144 175242334 -6505753 + RLTR41 LTR ERV1 255 446 0 3 1922 1704 273 85 6 chr2 175243975 175244495 -6503592 - RLTR20B1 LTR ERVK 0 563 3 3 1922 253 130 0 169 chr2 175244804 175244869 -6503218 + RLTR33 LTR ERVK 453 506 -172 3 1922 2966 64 8 20 chr2 175244960 175245361 -6502726 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 1922 6409 129 30 11 chr2 175245361 175246439 -6501648 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 3 1922 852 109 36 7 chr2 175246439 175246578 -6501509 - MTA_Mm LTR MaLR 0 400 258 3 1922 694 223 6 24 chr2 175252615 175252785 -6495302 - RMER10A LTR ERVL -5 437 271 3 1922 3518 20 0 0 chr2 175253069 175253465 -6494622 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 1922 9614 17 1 0 chr2 175253465 175254562 -6493525 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 3 1922 3518 20 0 0 chr2 175254562 175254958 -6493129 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 1922 837 231 23 110 chr2 175259929 175260148 -6487939 + RLTR26 LTR ERVK 443 642 0 3 1922 1646 178 98 3 chr2 175260789 175261178 -6486909 + RMER17B LTR ERVK 533 958 0 3 1922 917 282 150 78 chr2 175261938 175262150 -6485937 - MT2A LTR ERVL -10 523 248 3 1922 917 282 150 78 chr2 175262185 175262460 -6485627 - MT2A LTR ERVL -286 247 2 3 1922 504 256 55 83 chr2 175262790 175263007 -6485080 - ORR1D1 LTR MaLR -161 213 3 3 1922 686 332 66 12 chr2 175263077 175263333 -6484754 - MTE-int LTR MaLR -236 1344 1075 3 1922 4541 188 62 31 chr2 175263624 175264677 -6483410 - RLTR25A LTR ERVK 0 1103 19 3 1922 945 223 48 117 chr2 175264629 175264919 -6483168 - RLTR41 LTR ERV1 -112 334 65 3 1922 1331 227 31 218 chr2 175264976 175265523 -6482564 - RLTR41 LTR ERV1 -1 445 1 3 1922 962 265 122 24 chr2 175266771 175267107 -6480980 - ORR1D1 LTR MaLR -5 369 1 3 1922 793 328 26 4 chr2 175267173 175267403 -6480684 - MTE-int LTR MaLR -236 1344 1110 3 1922 2839 206 87 29 chr2 175268207 175269663 -6478424 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 6 1545 -3861 3 1922 237 310 0 0 chr2 175269665 175269723 -6478364 + ORR1B1 LTR MaLR 151 208 -186 3 1922 1564 188 7 0 chr2 175271782 175272059 -6476028 - MT2B LTR ERVL -320 281 3 3 1922 1173 167 35 17 chr2 175272597 175272829 -6475258 - ORR1A4 LTR MaLR -1 328 93 3 1922 707 196 14 14 chr2 175272829 175272969 -6475118 + RLTR46 LTR ERVK 1 140 -180 3 1922 254 325 46 46 chr2 175273013 175273187 -6474900 + RLTR46 LTR ERVK 126 299 -21 3 1922 543 204 17 26 chr2 175273192 175273308 -6474779 - ORR1A4 LTR MaLR -214 115 1 3 1922 3091 102 125 21 chr2 175273663 175274174 -6473913 + LTRIS2 LTR ERV1 1 564 0 3 1922 2999 82 12 5 chr2 175274685 175275103 -6472984 + BGLII LTR ERVK 1 421 0 3 1922 2897 46 0 0 chr2 175277042 175277388 -6470699 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 3 1922 2234 184 76 49 chr2 175279487 175280013 -6468074 - RLTR25A LTR ERVK -420 683 144 3 1922 282 204 0 0 chr2 175280109 175280158 -6467929 + RLTR25A LTR ERVK 512 560 -543 3 1922 743 269 108 48 chr2 175280217 175280467 -6467620 - RLTR41 LTR ERV1 -181 265 1 3 1922 817 310 31 0 chr2 175283851 175284080 -6464007 + MTE-int LTR MaLR 1109 1344 -236 3 1922 883 285 102 15 chr2 175284146 175284481 -6463606 + ORR1D1 LTR MaLR 1 364 -10 3 1922 3121 59 93 20 chr2 175285473 175285922 -6462165 + RLTR45 LTR ERVK 1 482 0 3 1922 24914 41 14 5 chr2 175285922 175289100 -6458987 + RLTR45-int LTR ERVK 1 3205 -4039 3 1922 28819 37 29 24 chr2 175289078 175290421 -6457666 + RLTR45-int LTR ERVK 3380 4761 -2483 3 1922 28819 37 29 24 chr2 175290446 175292951 -6455136 + RLTR45-int LTR ERVK 4762 7243 -1 3 1922 3216 73 59 7 chr2 175292951 175293409 -6454678 + RLTR45 LTR ERVK 1 482 0 3 1922 2522 186 36 30 chr2 175293410 175293987 -6454100 + RLTR25A LTR ERVK 523 1103 0 3 1922 720 335 62 8 chr2 175294278 175294534 -6453553 + MTE-int LTR MaLR 1075 1344 -236 3 1922 633 267 44 15 chr2 175294604 175294809 -6453278 + ORR1D1 LTR MaLR 3 213 -161 3 1922 1648 186 98 3 chr2 175295643 175296032 -6452055 - RMER17B LTR ERVK 0 958 533 3 1922 822 241 23 110 chr2 175296680 175296899 -6451188 - RLTR26 LTR ERVK 0 642 443 3 1922 315 287 35 0 chr2 175299917 175300004 -6448083 - RMER12 LTR ERVK -131 1191 1102 3 1922 754 158 33 0 chr2 175300190 175300342 -6447745 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1016 832 676 3 1922 709 217 6 24 chr2 175301379 175301549 -6446538 + RMER10A LTR ERVL 271 437 -5 3 1922 911 99 14 7 chr2 175307822 175307964 -6440123 + MTA_Mm LTR MaLR 258 400 0 3 1922 7115 98 20 10 chr2 175307964 175308952 -6439135 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1004 -94 3 1922 2833 35 18 0 chr2 175308952 175309292 -6438795 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 3 1922 13733 62 4 1 chr2 175309292 175311078 -6437009 + ORR1A0-int LTR MaLR 1 1792 0 3 1922 2916 29 9 0 chr2 175311078 175311421 -6436666 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 3 1922 7115 98 20 10 chr2 175311421 175311517 -6436570 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1005 1096 -2 3 1922 2787 71 2 104 chr2 175311517 175311638 -6436449 + MTA_Mm LTR MaLR 1 107 -289 3 1922 2787 71 2 104 chr2 175311784 175312103 -6435984 + MTA_Mm LTR MaLR 108 396 0 3 1922 2740 116 68 6 chr2 175312210 175312687 -6435400 - RLTR1C LTR ERV1 0 605 1 3 1922 271 235 15 0 chr2 175312927 175312995 -6435092 - RLTR19C LTR ERVK -413 93 25 4 1922 1801 252 86 10 chr2 175313039 175313560 -6434527 + RLTR20B1 LTR ERVK 3 563 0 4 1923 1900 242 86 10 chr2 175388288 175388809 -6359278 - RLTR20B1 LTR ERVK 0 563 3 4 1923 235 265 15 0 chr2 175388853 175388921 -6359166 + RLTR19C LTR ERVK 25 93 -413 4 1923 2806 108 68 3 chr2 175389164 175389640 -6358447 + RLTR1C LTR ERV1 1 605 0 4 1923 3039 63 2 112 chr2 175389759 175390079 -6358008 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 108 4 1923 3039 63 2 112 chr2 175390225 175390349 -6357738 - MTA_Mm LTR MaLR -289 107 1 4 1923 6853 107 29 9 chr2 175390349 175390448 -6357639 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1005 4 1923 3043 29 18 0 chr2 175390448 175390788 -6357299 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 4 1923 6853 107 29 9 chr2 175390788 175391765 -6356322 - MTA_Mm-int LTR MaLR -94 1004 1 4 1923 905 99 14 7 chr2 175391765 175391907 -6356180 - MTA_Mm LTR MaLR 0 400 258 4 1923 2711 59 225 0 chr2 175396571 175396927 -6351160 + RLTR10C LTR ERVK 1 436 0 4 1923 675 229 6 24 chr2 175398225 175398395 -6349692 - RMER10A LTR ERVL -5 437 271 4 1923 725 170 26 0 chr2 175399432 175399585 -6348502 + RLTR22_Mur LTR ERVK 676 832 -1016 4 1923 314 269 25 13 chr2 175399771 175399850 -6348237 + RMER12 LTR ERVK 1102 1181 -141 4 1923 1625 265 57 68 chr2 175406887 175407072 -6341015 - RLTR20A LTR ERVK 0 541 358 4 1923 1625 265 57 68 chr2 175407270 175407284 -6340803 - RLTR20A LTR ERVK -184 357 357 4 1923 1625 265 57 68 chr2 175407429 175407774 -6340313 - RLTR20A LTR ERVK -184 357 2 4 1923 1206 160 48 0 chr2 175409557 175409763 -6338324 - RMER16-int LTR ERVK -1876 3530 3315 4 1923 4995 86 35 62 chr2 175409779 175410390 -6337697 - RLTR13C2 LTR ERVK -21 787 190 4 1923 4995 86 35 62 chr2 175410572 175410769 -6337318 - RLTR13C2 LTR ERVK -619 189 1 4 1923 3869 150 7 31 chr2 175410769 175411445 -6336642 - RMER16-int LTR ERVK -2083 3323 2664 4 1923 4840 132 1 31 chr2 175413929 175414690 -6333397 - RLTR22_Mus LTR ERVK -997 811 65 4 1923 4840 132 1 31 chr2 175414868 175414942 -6333145 - RLTR22_Mus LTR ERVK -1744 64 1 4 1923 620 354 66 7 chr2 175414977 175415264 -6332823 + MTE-int LTR MaLR 1038 1341 -239 4 1923 295 163 20 0 chr2 175415334 175415383 -6332704 + ORR1D1 LTR MaLR 1 50 -324 4 1923 389 263 169 21 chr2 175415605 175415826 -6332261 + ORR1D1 LTR MaLR 126 370 0 4 1923 2233 213 65 4 chr2 175419011 175419502 -6328585 + RLTR20B1 LTR ERVK 1 521 -42 4 1923 979 187 19 34 chr2 175420772 175420977 -6327110 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 6 207 -2119 4 1923 1998 196 78 117 chr2 175420977 175421151 -6326936 - RMER16 LTR ERVK 0 533 400 4 1923 1998 196 78 117 chr2 175421692 175422072 -6326015 - RMER16 LTR ERVK -134 399 2 4 1923 2789 223 43 37 chr2 175422074 175422800 -6325287 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 204 933 -1393 4 1923 4514 211 70 8 chr2 175422795 175423986 -6324101 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 1058 2322 -4 4 1923 468 277 71 0 chr2 175423992 175424104 -6323983 + RLTR20B1 LTR ERVK 1 120 -443 4 1923 1371 203 45 109 chr2 175424234 175424654 -6323433 + RLTR9C LTR ERVK 1 393 0 4 1923 6494 132 23 74 chr2 175424657 175425888 -6322199 + ETnERV2-int LTR ERVK 2 1169 -3675 4 1923 2681 136 34 55 chr2 175425886 175426549 -6321538 + ETnERV2-int LTR ERVK 1721 2190 -2654 4 1923 7050 154 14 25 chr2 175427033 175429798 -6318289 + ETnERV2-int LTR ERVK 2354 7203 -203 4 1923 333 230 158 8 chr2 175429800 175429927 -6318160 + RLTR13B1 LTR ERVK 155 300 -593 4 1923 267 156 138 15 chr2 175429951 175430016 -6318071 + RLTR13B1 LTR ERVK 459 531 -371 4 1923 486 114 0 12 chr2 175430020 175430100 -6317987 + ETnERV2-int LTR ERVK 7327 7405 -1 4 1923 1257 200 96 106 chr2 175430100 175430497 -6317590 + RLTR9C LTR ERVK 1 393 0 4 1923 374 243 58 0 chr2 175430969 175431072 -6317015 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 262 4 1923 1688 192 3 59 chr2 175433098 175433436 -6314651 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 4 1923 876 255 21 75 chr2 175433911 175434191 -6313896 + ORR1D1 LTR MaLR 3 267 -107 4 1923 622 258 35 35 chr2 175434225 175434422 -6313665 - RMER6B LTR ERVK -11 450 254 4 1923 3352 87 48 4 chr2 175434434 175434896 -6313191 - RLTR45 LTR ERVK 0 482 1 4 1923 6013 59 106 0 chr2 175434896 175435659 -6312428 - RLTR45-int LTR ERVK 0 7244 6401 4 1923 239 278 35 119 chr2 175435659 175435802 -6312285 + LTR50 LTR ERVL 136 266 -529 4 1923 607 345 31 31 chr2 175435802 175436218 -6311869 - RNERVK23-int LTR ERVK -673 7544 7129 4 1923 2659 69 0 18 chr2 175436308 175436645 -6311442 - RLTR45-int LTR ERVK -5596 1648 1318 4 1923 525 250 50 25 chr2 175437000 175437160 -6310927 - RNERVK23-int LTR ERVK -1859 6358 6195 4 1923 3119 319 59 47 chr2 175437496 175440517 -6307570 - RNERVK23-int LTR ERVK -2469 5748 2339 4 1923 821 122 0 0 chr2 175440877 175441000 -6307087 - RLTR45-int LTR ERVK -6212 1032 910 4 1923 1774 64 0 0 chr2 175441116 175441335 -6306752 - RLTR45-int LTR ERVK -6334 910 692 4 1923 261 289 0 0 chr2 175441397 175441480 -6306607 - RLTR45-int LTR ERVK -4987 1494 1412 4 1923 1117 49 0 40 chr2 175441691 175441841 -6306246 - RLTR45-int LTR ERVK -6552 692 549 4 1923 4162 93 3 22 chr2 175442587 175443169 -6304918 - RLTR45-int LTR ERVK -6673 571 1 4 1923 3423 83 50 4 chr2 175443169 175443630 -6304457 - RLTR45 LTR ERVK 0 482 1 4 1923 883 153 97 29 chr2 175443631 175443806 -6304281 - RMER6B LTR ERVK -273 188 2 4 1923 322 216 53 95 chr2 175443806 175443926 -6304161 + ORR1D2 LTR MaLR 262 377 -2 4 1923 922 303 29 101 chr2 175444292 175444670 -6303417 + MTE2a LTR MaLR 1 351 -28 4 1923 282 349 58 36 chr2 175445027 175445164 -6302923 + RMER15 LTR ERVL 275 414 -161 4 1923 233 347 71 0 chr2 175445296 175445394 -6302693 + MTEb LTR MaLR 170 274 -105 4 1923 339 260 97 52 chr2 175445458 175445592 -6302495 + MTEb LTR MaLR 240 379 0 4 1923 825 201 84 4 chr2 175447950 175448175 -6299912 - MuRRS4-int LTR ERV1 -33 5030 4788 4 1923 412 321 5 42 chr2 175448406 175448433 -6299654 - MuRRS4-int LTR ERV1 -2265 5187 5163 5 1923 3834 112 22 48 chr2 175448433 175449036 -6299051 + LTRIS_Mus LTR ERV1 1 587 0 5 1923 664 262 0 0 chr2 175449036 175449200 -6298887 - MuRRS4-int LTR ERV1 -1068 3995 3832 5 1923 5767 119 10 3 chr2 175450151 175451044 -6297043 - MTB-int LTR MaLR -198 900 2 5 1923 899 120 7 14 chr2 175451045 175451189 -6296898 - MTB LTR MaLR 0 400 258 5 1923 1766 264 88 8 chr2 175453503 175454014 -6294073 - RLTR20B1 LTR ERVK -9 554 3 5 1923 242 148 0 169 chr2 175454326 175454391 -6293696 + RLTR33 LTR ERVK 453 506 -172 5 1923 2944 63 5 20 chr2 175454479 175454881 -6293206 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 1923 6897 115 15 4 chr2 175454881 175455967 -6292120 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 5 1923 876 101 28 14 chr2 175455967 175456108 -6291979 - MTA_Mm LTR MaLR 0 400 258 5 1923 507 269 75 40 chr2 175461387 175461702 -6286385 - RMER10A LTR ERVL -5 437 89 5 1923 828 199 0 126 chr2 175466812 175467002 -6281085 + RLTR26 LTR ERVK 477 642 0 5 1923 1660 183 98 3 chr2 175467643 175468032 -6280055 + RMER17B LTR ERVK 533 958 0 5 1923 528 306 40 142 chr2 175468792 175469032 -6279055 - MT2A LTR ERVL -10 591 383 5 1923 600 290 24 57 chr2 175469060 175469317 -6278770 - MT2A LTR ERVL -219 382 1 5 1923 638 272 44 5 chr2 175469648 175469851 -6278236 - ORR1D1 LTR MaLR -161 213 3 5 1923 733 305 73 26 chr2 175469885 175470176 -6277911 - ORR1D1-int LTR MaLR -236 1344 1049 5 1923 4757 189 56 31 chr2 175470467 175471526 -6276561 - RLTR25A LTR ERVK 0 1103 19 5 1923 878 236 52 110 chr2 175471478 175471768 -6276319 - RLTR41 LTR ERV1 -112 334 62 5 1923 1510 213 31 209 chr2 175471822 175472363 -6275724 - RLTR41 LTR ERV1 -1 445 1 5 1923 996 261 129 24 chr2 175473605 175473939 -6274148 - ORR1D1 LTR MaLR -5 369 1 5 1923 791 319 26 4 chr2 175474006 175474236 -6273851 - MTE-int LTR MaLR -236 1344 1110 5 1923 536 274 73 31 chr2 175487071 175487316 -6260771 - RLTR20B1 LTR ERVK -318 223 3 5 1923 271 250 15 0 chr2 175487360 175487428 -6260659 + RLTR19C LTR ERVK 25 93 -413 5 1923 242 148 0 169 chr2 175487631 175487696 -6260391 + RLTR33 LTR ERVK 453 506 -172 5 1923 2785 82 18 10 chr2 175488089 175488482 -6259605 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 1923 7197 106 10 14 chr2 175488482 175489584 -6258503 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 5 1923 873 109 7 14 chr2 175489810 175489949 -6258138 - MTB LTR MaLR -5 395 258 5 1923 2182 81 21 45 chr2 175490555 175490890 -6257197 + IAPLTR2b LTR ERVK 1 327 0 5 1923 953 84 7 14 chr2 175496329 175496473 -6251614 + MTA_Mm LTR MaLR 258 400 0 5 1923 7154 107 17 4 chr2 175496476 175497557 -6250530 + MTA_Mm-int LTR MaLR 4 1098 0 5 1923 2761 96 2 10 chr2 175497557 175497956 -6250131 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 1923 251 250 15 0 chr2 175498296 175498364 -6249723 - RLTR19C LTR ERVK -413 93 25 5 1923 1839 246 90 12 chr2 175498413 175498923 -6249164 + RLTR20B1 LTR ERVK 3 552 -11 5 1923 1623 60 94 41 chr2 175499755 175500000 -6248087 + RLTR10B2 LTR ERVK 1 258 -107 5 1923 751 113 9 0 chr2 175500000 175500106 -6247981 + RLTR10B2 LTR ERVK 259 365 0 1 1923 4118 115 14 77 chr2 175504410 175505192 -6242895 - RMER17A LTR ERVK -18 733 1 4 1924 2851 206 87 28 chr2 175507585 175509041 -6239046 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 6 1545 -3861 7 1924 237 310 0 0 chr2 175509043 175509101 -6238986 + ORR1B1 LTR MaLR 151 208 -186 8 1924 1591 181 7 0 chr2 175511131 175511408 -6236679 - MT2B LTR ERVL -320 281 3 1 1924 1170 167 35 17 chr2 175511946 175512178 -6235909 - ORR1A4 LTR MaLR -1 328 93 1 1924 702 203 14 14 chr2 175512178 175512318 -6235769 + RLTR46 LTR ERVK 1 140 -180 1 1924 553 203 55 48 chr2 175512538 175512692 -6235395 - ORR1A4 LTR MaLR -182 177 1 1 1924 3069 104 125 21 chr2 175513013 175513524 -6234563 + LTRIS2 LTR ERV1 1 564 0 2 1924 3015 82 12 5 chr2 175514035 175514453 -6233634 + BGLII LTR ERVK 1 421 0 2 1924 2923 43 0 0 chr2 175516391 175516737 -6231350 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 2 1924 2243 182 76 51 chr2 175518835 175519362 -6228725 - RLTR25A LTR ERVK -420 683 144 2 1924 282 204 0 0 chr2 175519454 175519503 -6228584 + RLTR25A LTR ERVK 512 560 -543 3 1924 743 269 108 48 chr2 175519563 175519813 -6228274 - RLTR41 LTR ERV1 -181 265 1 3 1924 759 296 35 144 chr2 175529621 175529850 -6218237 + ORR1D1-int LTR MaLR 1109 1317 -192 4 1924 903 282 102 15 chr2 175529916 175530251 -6217836 + ORR1D1 LTR MaLR 1 364 -10 4 1924 3181 54 92 16 chr2 175531232 175531680 -6216407 + RLTR45 LTR ERVK 1 482 0 4 1924 24969 40 13 7 chr2 175531680 175534867 -6213220 + RLTR45-int LTR ERVK 1 3205 -4039 4 1924 28665 39 29 24 chr2 175534845 175536186 -6211901 + RLTR45-int LTR ERVK 3380 4761 -2483 4 1924 28665 39 29 24 chr2 175536232 175538736 -6209351 + RLTR45-int LTR ERVK 4762 7243 -1 4 1924 3256 72 59 4 chr2 175538736 175539193 -6208894 + RLTR45 LTR ERVK 1 482 0 4 1924 2545 182 36 29 chr2 175539193 175539771 -6208316 + RLTR25A LTR ERVK 522 1103 0 4 1924 695 309 73 26 chr2 175540062 175540353 -6207734 + ORR1D1-int LTR MaLR 1049 1344 -236 4 1924 659 262 44 15 chr2 175540387 175540592 -6207495 + ORR1D1 LTR MaLR 3 213 -161 4 1924 1623 189 103 3 chr2 175541427 175541814 -6206273 - RMER17B LTR ERVK 0 958 533 5 1924 759 246 23 110 chr2 175542455 175542674 -6205413 - RLTR26 LTR ERVK 0 642 443 5 1924 689 223 6 24 chr2 175547916 175548086 -6200001 + RMER10A LTR ERVL 271 437 -5 5 1924 852 109 36 7 chr2 175554369 175554508 -6193579 + MTA_Mm LTR MaLR 258 400 0 6 1924 6455 128 30 11 chr2 175554508 175555586 -6192501 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 6 1924 2933 69 8 20 chr2 175555586 175555987 -6192100 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 1924 253 130 0 169 chr2 175556079 175556144 -6191943 - RLTR33 LTR ERVK -172 506 453 6 1924 1701 272 85 6 chr2 175556453 175556970 -6191117 + RLTR20B1 LTR ERVK 3 560 -3 6 1924 1006 186 20 10 chr2 175558618 175558813 -6189274 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 250 6 1924 1769 137 6 52 chr2 175558836 175559183 -6188904 + RMER16-int LTR ERVK 2993 3323 -2083 6 1924 1399 91 5 0 chr2 175559183 175559380 -6188707 + RLTR13C2 LTR ERVK 1 198 -610 7 1924 1643 75 0 34 chr2 175559581 175559816 -6188271 + RLTR13C2 LTR ERVK 184 410 -398 7 1924 551 153 0 10 chr2 175559822 175559921 -6188166 + RMER16-int LTR ERVK 3018 3115 -2291 7 1924 2580 158 6 4 chr2 175560518 175561002 -6187085 + RMER16-int LTR ERVK 3099 3583 -1823 7 1924 826 330 37 40 chr2 175561053 175561375 -6186712 + MTE2a LTR MaLR 42 362 -17 7 1924 272 312 20 40 chr2 175561722 175561822 -6186265 + RMER15 LTR ERVL 293 390 -185 7 1924 362 247 0 76 chr2 175562014 175562106 -6185981 + MTEb LTR MaLR 294 378 -1 7 1924 2291 99 3 99 chr2 175568391 175568774 -6179313 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 8 1924 4021 199 60 40 chr2 175568780 175569711 -6178376 + RLTR25A LTR ERVK 154 1103 0 8 1924 631 207 80 0 chr2 175569793 175569943 -6178144 - RLTR25A LTR ERVK -656 447 286 8 1924 806 344 35 10 chr2 175570146 175570434 -6177653 + MTE-int LTR MaLR 1047 1341 -239 8 1924 918 272 115 21 chr2 175570503 175570833 -6177254 + ORR1D1 LTR MaLR 1 361 -13 8 1924 1055 247 94 12 chr2 175574611 175574931 -6173156 + RMER10A LTR ERVL 91 436 -6 9 1924 1896 242 86 10 chr2 175589927 175590448 -6157639 - RLTR20B1 LTR ERVK 0 563 3 1 1924 238 265 15 0 chr2 175590492 175590560 -6157527 + RLTR19C LTR ERVK 25 93 -413 1 1924 2786 113 68 3 chr2 175590803 175591279 -6156808 + RLTR1C LTR ERV1 1 605 0 1 1924 2805 66 2 112 chr2 175591398 175591718 -6156369 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 108 1 1924 2805 66 2 112 chr2 175591864 175591988 -6156099 - MTA_Mm LTR MaLR -289 107 1 1 1924 6872 108 29 8 chr2 175591988 175592087 -6156000 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1005 1 1924 2936 21 18 0 chr2 175592087 175592427 -6155660 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 1 1924 6872 108 29 8 chr2 175592427 175593403 -6154684 - MTA_Mm-int LTR MaLR -94 1004 1 1 1924 911 99 14 7 chr2 175593403 175593545 -6154542 - MTA_Mm LTR MaLR 0 400 258 1 1924 709 217 6 24 chr2 175599245 175599415 -6148672 - RMER10A LTR ERVL -5 437 271 1 1924 754 158 33 0 chr2 175600452 175600604 -6147483 + RLTR22_Mur LTR ERVK 676 832 -1016 1 1924 315 287 35 0 chr2 175600790 175600877 -6147210 + RMER12 LTR ERVK 1102 1191 -131 1 1924 822 241 23 110 chr2 175603895 175604114 -6143973 + RLTR26 LTR ERVK 443 642 0 1 1924 1648 186 98 3 chr2 175604762 175605151 -6142936 + RMER17B LTR ERVK 533 958 0 1 1924 633 267 44 15 chr2 175605985 175606190 -6141897 - ORR1D1 LTR MaLR -161 213 3 1 1924 720 335 62 8 chr2 175606260 175606516 -6141571 - MTE-int LTR MaLR -236 1344 1075 1 1924 2522 186 36 30 chr2 175606807 175607384 -6140703 - RLTR25A LTR ERVK 0 1103 523 1 1924 3216 73 59 7 chr2 175607385 175607843 -6140244 - RLTR45 LTR ERVK 0 482 1 1 1924 28819 37 29 24 chr2 175607843 175610348 -6137739 - RLTR45-int LTR ERVK 0 7244 4763 1 1924 28819 30 27 6 chr2 175610373 175611716 -6136371 - RLTR45-int LTR ERVK -2482 4762 3381 1 1924 24914 41 14 5 chr2 175611694 175614872 -6133215 - RLTR45-int LTR ERVK -4039 3205 1 1 1924 3121 59 93 20 chr2 175614872 175615321 -6132766 - RLTR45 LTR ERVK 0 482 1 1 1924 883 285 102 15 chr2 175616313 175616648 -6131439 - ORR1D1 LTR MaLR -10 364 1 1 1924 817 310 31 0 chr2 175616714 175616943 -6131144 - MTE-int LTR MaLR -236 1344 1109 1 1924 743 269 108 48 chr2 175620327 175620577 -6127510 + RLTR41 LTR ERV1 1 265 -181 1 1924 282 204 0 0 chr2 175620636 175620685 -6127402 - RLTR25A LTR ERVK -543 560 512 1 1924 2234 184 76 49 chr2 175620781 175621307 -6126780 + RLTR25A LTR ERVK 144 683 -420 1 1924 2897 46 0 0 chr2 175623406 175623752 -6124335 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 1 1924 2999 82 12 5 chr2 175625691 175626109 -6121978 - BGLII LTR ERVK 0 421 1 1 1924 3091 102 125 21 chr2 175626620 175627131 -6120956 - LTRIS2 LTR ERV1 0 564 1 1 1924 543 204 17 26 chr2 175627486 175627602 -6120485 + ORR1A4 LTR MaLR 1 115 -214 1 1924 254 325 46 46 chr2 175627607 175627781 -6120306 - RLTR46 LTR ERVK -21 299 126 1 1924 707 196 14 14 chr2 175627825 175627965 -6120122 - RLTR46 LTR ERVK -180 140 1 1 1924 1173 167 35 17 chr2 175627965 175628197 -6119890 + ORR1A4 LTR MaLR 93 328 -1 1 1924 1564 188 7 0 chr2 175628735 175629012 -6119075 + MT2B LTR ERVL 3 281 -320 1 1924 237 310 0 0 chr2 175631071 175631129 -6116958 - ORR1B1 LTR MaLR -186 208 151 1 1924 2839 206 87 29 chr2 175631131 175632587 -6115500 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -3861 1545 6 1 1924 793 328 26 4 chr2 175633391 175633621 -6114466 + MTE-int LTR MaLR 1110 1344 -236 1 1924 962 265 122 24 chr2 175633687 175634023 -6114064 + ORR1D1 LTR MaLR 1 369 -5 1 1924 1331 227 31 218 chr2 175635277 175635824 -6112263 + RLTR41 LTR ERV1 1 445 -1 1 1924 945 223 48 117 chr2 175635881 175636171 -6111916 + RLTR41 LTR ERV1 65 334 -112 1 240 4541 188 62 31 chr2 175636123 175637176 -6110911 + RLTR25A LTR ERVK 19 1103 0 1 1925 686 332 66 12 chr2 175637467 175637723 -6110364 + MTE-int LTR MaLR 1075 1344 -236 1 1925 504 256 55 83 chr2 175637793 175638010 -6110077 + ORR1D1 LTR MaLR 3 213 -161 1 1925 917 282 150 78 chr2 175638340 175638615 -6109472 + MT2A LTR ERVL 1 246 -287 1 1925 917 282 150 78 chr2 175638650 175638862 -6109225 + MT2A LTR ERVL 247 522 -11 1 1925 1541 191 115 3 chr2 175639622 175640005 -6108082 - RMER17B LTR ERVK 0 958 533 1 1925 837 231 23 110 chr2 175640646 175640865 -6107222 - RLTR26 LTR ERVK 0 642 443 1 1925 3518 20 0 0 chr2 175645834 175646230 -6101857 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 1925 9546 20 1 0 chr2 175646230 175647327 -6100760 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 1 1925 3545 18 0 0 chr2 175647327 175647723 -6100364 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 1925 694 223 6 24 chr2 175648007 175648177 -6099910 + RMER10A LTR ERVL 271 437 -5 1 1925 852 109 36 7 chr2 175654214 175654353 -6093734 + MTA_Mm LTR MaLR 258 400 0 1 1925 6409 129 30 11 chr2 175654353 175655431 -6092656 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 1 1925 2966 64 8 20 chr2 175655431 175655832 -6092255 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1925 253 130 0 169 chr2 175655923 175655988 -6092099 - RLTR33 LTR ERVK -172 506 453 1 1925 1704 273 85 6 chr2 175656297 175656817 -6091270 + RLTR20B1 LTR ERVK 3 563 0 1 1925 983 176 21 11 chr2 175658458 175658648 -6089439 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 255 1 1925 1750 140 6 52 chr2 175658688 175659035 -6089052 + RMER16-int LTR ERVK 2993 3323 -2083 1 1925 1464 71 5 0 chr2 175659035 175659232 -6088855 + RLTR13C2 LTR ERVK 1 198 -610 1 1925 1681 66 0 30 chr2 175659429 175659663 -6088424 + RLTR13C2 LTR ERVK 184 410 -398 1 1925 551 153 0 10 chr2 175659669 175659768 -6088319 + RMER16-int LTR ERVK 3018 3115 -2291 2 1925 2576 156 6 4 chr2 175660363 175660847 -6087240 + RMER16-int LTR ERVK 3099 3583 -1823 2 1925 823 330 37 40 chr2 175660898 175661220 -6086867 + MTE2a LTR MaLR 42 362 -17 2 1925 283 312 20 40 chr2 175661567 175661667 -6086420 + RMER15 LTR ERVL 293 390 -185 2 1925 352 247 0 76 chr2 175661836 175661928 -6086159 + MTEb LTR MaLR 294 378 -1 2 1925 2329 107 27 0 chr2 175668210 175668266 -6079821 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 290 2 1925 2329 107 27 0 chr2 175668300 175668580 -6079507 - ORR1A1 LTR MaLR -57 289 2 2 1925 3981 201 60 40 chr2 175668586 175669517 -6078570 + RLTR25A LTR ERVK 154 1103 0 2 1925 631 207 80 0 chr2 175669599 175669749 -6078338 - RLTR25A LTR ERVK -656 447 286 2 1925 806 344 35 10 chr2 175669957 175670245 -6077842 + MTE-int LTR MaLR 1047 1341 -239 2 1925 909 272 115 21 chr2 175670314 175670644 -6077443 + ORR1D1 LTR MaLR 1 361 -13 2 1925 1812 252 86 10 chr2 175684816 175685337 -6062750 - RLTR20B1 LTR ERVK 0 563 3 2 1925 238 265 15 0 chr2 175685381 175685449 -6062638 + RLTR19C LTR ERVK 25 93 -413 2 1925 2732 115 68 6 chr2 175685689 175686166 -6061921 + RLTR1C LTR ERV1 1 605 0 2 1925 2865 61 2 106 chr2 175686321 175686640 -6061447 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 108 2 1925 2865 61 2 106 chr2 175686786 175686908 -6061179 - MTA_Mm LTR MaLR -289 107 1 2 1925 7090 101 20 10 chr2 175686908 175687004 -6061083 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1005 2 1925 2932 29 9 0 chr2 175687004 175687347 -6060740 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 2 1925 13774 61 4 1 chr2 175687347 175689133 -6058954 - ORR1A0-int LTR MaLR 0 1792 1 2 1925 2823 38 18 0 chr2 175689133 175689473 -6058614 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 2 1925 7090 101 20 10 chr2 175689473 175690461 -6057626 - MTA_Mm-int LTR MaLR -94 1004 3 2 1925 911 99 14 7 chr2 175690461 175690603 -6057484 - MTA_Mm LTR MaLR 0 400 258 2 1925 704 217 6 24 chr2 175696799 175696969 -6051118 - RMER10A LTR ERVL -5 437 271 2 1925 740 128 8 0 chr2 175698006 175698131 -6049956 + RLTR22_Mur LTR ERVK 676 801 -1047 2 1925 301 296 34 0 chr2 175698340 175698428 -6049659 + RMER12 LTR ERVK 1101 1191 -131 2 1925 833 232 13 0 chr2 175701512 175701663 -6046424 + RLTR26 LTR ERVK 490 642 0 2 1925 1660 184 103 3 chr2 175702311 175702698 -6045389 + RMER17B LTR ERVK 533 958 0 2 1925 659 262 44 15 chr2 175703532 175703737 -6044350 - ORR1D1 LTR MaLR -161 213 3 2 1925 766 323 63 4 chr2 175703807 175704062 -6044025 - MTE-int LTR MaLR -236 1344 1075 2 1925 2531 184 36 30 chr2 175704353 175704930 -6043157 - RLTR25A LTR ERVK 0 1103 523 2 1925 3269 70 59 4 chr2 175704931 175705388 -6042699 - RLTR45 LTR ERVK 0 482 1 2 1925 28791 38 28 24 chr2 175705388 175707893 -6040194 - RLTR45-int LTR ERVK 0 7244 4763 2 1925 28791 38 28 24 chr2 175707935 175709281 -6038806 - RLTR45-int LTR ERVK -2482 4762 3381 2 1925 24852 42 12 8 chr2 175709259 175712451 -6035636 - RLTR45-int LTR ERVK -4039 3205 1 2 1925 3169 52 94 16 chr2 175712451 175712898 -6035189 - RLTR45 LTR ERVK 0 482 1 2 1925 468 191 0 110 chr2 175713296 175713414 -6034673 + MT2B LTR ERVL 158 262 -339 2 1925 903 282 102 15 chr2 175713882 175714217 -6033870 - ORR1D1 LTR MaLR -10 364 1 2 1925 848 306 32 76 chr2 175714283 175714525 -6033562 - MTE-int LTR MaLR -236 1344 1109 2 1925 848 306 32 76 chr2 175714703 175714775 -6033312 - MTE-int LTR MaLR -472 1108 1044 2 1925 743 269 108 48 chr2 175717890 175718140 -6029947 + RLTR41 LTR ERV1 1 265 -181 2 1925 282 204 0 0 chr2 175718198 175718247 -6029840 - RLTR25A LTR ERVK -543 560 512 2 1925 2234 184 76 49 chr2 175718343 175718869 -6029218 + RLTR25A LTR ERVK 144 683 -420 2 1925 2897 46 0 0 chr2 175720968 175721314 -6026773 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 2 1925 2999 82 12 5 chr2 175723253 175723671 -6024416 - BGLII LTR ERVK 0 421 1 2 1925 3091 102 125 21 chr2 175724182 175724693 -6023394 - LTRIS2 LTR ERV1 0 564 1 2 1925 543 204 17 26 chr2 175725048 175725164 -6022923 + ORR1A4 LTR MaLR 1 115 -214 2 1925 254 325 46 46 chr2 175725169 175725343 -6022744 - RLTR46 LTR ERVK -21 299 126 2 1925 707 196 14 14 chr2 175725387 175725527 -6022560 - RLTR46 LTR ERVK -180 140 1 2 1925 1173 167 35 17 chr2 175725527 175725759 -6022328 + ORR1A4 LTR MaLR 93 328 -1 2 1925 1564 188 7 0 chr2 175726297 175726574 -6021513 + MT2B LTR ERVL 3 281 -320 2 1925 237 310 0 0 chr2 175728627 175728685 -6019402 - ORR1B1 LTR MaLR -186 208 151 2 1925 2839 206 87 29 chr2 175728687 175730143 -6017944 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -3861 1545 6 2 1925 793 328 26 4 chr2 175730948 175731178 -6016909 + MTE-int LTR MaLR 1110 1344 -236 2 1925 962 265 122 24 chr2 175731244 175731580 -6016507 + ORR1D1 LTR MaLR 1 369 -5 2 1925 1331 227 31 218 chr2 175732828 175733375 -6014712 + RLTR41 LTR ERV1 1 445 -1 2 1925 945 223 48 117 chr2 175733432 175733722 -6014365 + RLTR41 LTR ERV1 65 334 -112 3 1925 4541 188 62 31 chr2 175733674 175734727 -6013360 + RLTR25A LTR ERVK 19 1103 0 3 1925 686 332 66 12 chr2 175735018 175735274 -6012813 + MTE-int LTR MaLR 1075 1344 -236 3 1925 504 256 55 83 chr2 175735344 175735561 -6012526 + ORR1D1 LTR MaLR 3 213 -161 3 1925 917 282 150 78 chr2 175735891 175736166 -6011921 + MT2A LTR ERVL 1 246 -287 3 1925 917 282 150 78 chr2 175736201 175736413 -6011674 + MT2A LTR ERVL 247 522 -11 3 1925 1646 178 98 3 chr2 175737173 175737562 -6010525 - RMER17B LTR ERVK 0 958 533 3 1925 837 231 23 110 chr2 175738203 175738422 -6009665 - RLTR26 LTR ERVK 0 642 443 3 1925 3518 20 0 0 chr2 175743393 175743789 -6004298 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 1925 9614 17 1 0 chr2 175743789 175744886 -6003201 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 3 1925 3518 20 0 0 chr2 175744886 175745282 -6002805 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 1925 694 223 6 24 chr2 175745566 175745736 -6002351 + RMER10A LTR ERVL 271 437 -5 3 1925 852 109 36 7 chr2 175751773 175751912 -5996175 + MTA_Mm LTR MaLR 258 400 0 3 1925 6409 129 30 11 chr2 175751912 175752990 -5995097 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 3 1925 2966 64 8 20 chr2 175752990 175753391 -5994696 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 1925 253 130 0 169 chr2 175753482 175753547 -5994540 - RLTR33 LTR ERVK -172 506 453 3 1925 1704 273 85 6 chr2 175753856 175754376 -5993711 + RLTR20B1 LTR ERVK 3 563 0 3 1925 983 176 21 11 chr2 175756017 175756207 -5991880 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 255 3 1925 1750 140 6 52 chr2 175756247 175756594 -5991493 + RMER16-int LTR ERVK 2993 3323 -2083 3 1925 1464 71 5 0 chr2 175756594 175756791 -5991296 + RLTR13C2 LTR ERVK 1 198 -610 3 1925 1681 66 0 30 chr2 175756988 175757222 -5990865 + RLTR13C2 LTR ERVK 184 410 -398 3 1925 520 158 0 10 chr2 175757228 175757324 -5990763 + RMER16-int LTR ERVK 3018 3112 -2294 3 1925 2576 156 6 4 chr2 175757922 175758406 -5989681 + RMER16-int LTR ERVK 3099 3583 -1823 3 1925 823 330 37 40 chr2 175758457 175758779 -5989308 + MTE2a LTR MaLR 42 362 -17 3 1925 283 312 20 40 chr2 175759126 175759226 -5988861 + RMER15 LTR ERVL 293 390 -185 3 1925 352 247 0 76 chr2 175759395 175759487 -5988600 + MTEb LTR MaLR 294 378 -1 3 1925 2329 107 27 0 chr2 175765767 175765823 -5982264 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 290 3 1925 2329 107 27 0 chr2 175765857 175766137 -5981950 - ORR1A1 LTR MaLR -57 289 2 3 1925 3981 201 60 40 chr2 175766143 175767074 -5981013 + RLTR25A LTR ERVK 154 1103 0 3 1925 631 207 80 0 chr2 175767156 175767306 -5980781 - RLTR25A LTR ERVK -656 447 286 3 240 806 344 35 10 chr2 175767529 175767817 -5980270 + MTE-int LTR MaLR 1047 1341 -239 3 1926 909 272 115 21 chr2 175767886 175768216 -5979871 + ORR1D1 LTR MaLR 1 361 -13 3 1926 1812 252 86 10 chr2 175782390 175782911 -5965176 - RLTR20B1 LTR ERVK 0 563 3 3 1926 238 265 15 0 chr2 175782955 175783023 -5965064 + RLTR19C LTR ERVK 25 93 -413 3 1926 2732 115 68 6 chr2 175783263 175783740 -5964347 + RLTR1C LTR ERV1 1 605 0 3 1926 2875 61 2 102 chr2 175783895 175784214 -5963873 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 108 3 1926 2875 61 2 102 chr2 175784360 175784480 -5963607 - MTA_Mm LTR MaLR -289 107 1 3 1926 7118 101 19 9 chr2 175784480 175784576 -5963511 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1005 3 1926 2932 29 9 0 chr2 175784576 175784919 -5963168 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 3 1926 13871 58 4 1 chr2 175784919 175786705 -5961382 - ORR1A0-int LTR MaLR 0 1792 1 3 1926 2850 32 18 0 chr2 175786705 175787045 -5961042 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 3 1926 7118 101 19 9 chr2 175787045 175788033 -5960054 - MTA_Mm-int LTR MaLR -94 1004 3 3 1926 911 99 14 7 chr2 175788033 175788175 -5959912 - MTA_Mm LTR MaLR 0 400 258 3 1926 693 223 6 24 chr2 175793959 175794129 -5953958 - RMER10A LTR ERVL -5 437 271 3 1926 740 128 8 0 chr2 175795166 175795291 -5952796 + RLTR22_Mur LTR ERVK 676 801 -1047 3 1926 335 284 22 11 chr2 175795501 175795590 -5952497 + RMER12 LTR ERVK 1102 1191 -131 3 1926 834 241 23 110 chr2 175798820 175799039 -5949048 + RLTR26 LTR ERVK 443 642 0 3 1926 1567 193 112 0 chr2 175799687 175800070 -5948017 + RMER17B LTR ERVK 533 958 0 3 1926 627 277 39 24 chr2 175800905 175801112 -5946975 - ORR1D1 LTR MaLR -161 213 4 3 1926 717 339 63 4 chr2 175801180 175801435 -5946652 - MTE-int LTR MaLR -236 1344 1075 3 1926 2507 186 36 30 chr2 175801726 175802303 -5945784 - RLTR25A LTR ERVK 0 1103 523 3 1926 3242 68 61 4 chr2 175802304 175802760 -5945327 - RLTR45 LTR ERVK 0 482 1 3 1926 10186 39 41 0 chr2 175802760 175804052 -5944035 - RLTR45-int LTR ERVK 0 7244 5900 3 1926 19423 33 19 1 chr2 175804763 175805893 -5942194 - RLTR45-int LTR ERVK -1328 5916 4763 3 1926 19423 33 19 1 chr2 175805934 175807291 -5940796 - RLTR45-int LTR ERVK -2482 4762 3386 3 1926 25237 35 15 5 chr2 175807280 175810452 -5937635 - RLTR45-int LTR ERVK -4039 3205 1 3 1926 1956 60 7 31 chr2 175810452 175810742 -5937345 - RLTR45 LTR ERVK 0 482 200 3 1926 735 98 223 0 chr2 175812686 175812861 -5935226 - RLTR45 LTR ERVK -268 214 1 3 1926 885 272 110 24 chr2 175813859 175814194 -5933893 - ORR1D1 LTR MaLR -10 364 1 3 1926 817 322 26 0 chr2 175814260 175814490 -5933597 - MTE-int LTR MaLR -236 1344 1109 3 1926 766 265 108 48 chr2 175817871 175818121 -5929966 + RLTR41 LTR ERV1 1 265 -181 3 1926 282 204 0 0 chr2 175818177 175818226 -5929861 - RLTR25A LTR ERVK -543 560 512 3 1926 2227 188 77 42 chr2 175818352 175818874 -5929213 + RLTR25A LTR ERVK 144 683 -420 3 1926 2948 40 0 0 chr2 175820973 175821319 -5926768 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 4 1926 3040 77 12 5 chr2 175823257 175823675 -5924412 - BGLII LTR ERVK 0 421 1 4 1926 3092 102 125 21 chr2 175824186 175824697 -5923390 - LTRIS2 LTR ERV1 0 564 1 4 1926 553 201 51 45 chr2 175825018 175825150 -5922937 + ORR1A4 LTR MaLR 1 149 -245 4 1926 300 316 40 56 chr2 175825150 175825348 -5922739 - RLTR46 LTR ERVK 0 320 126 4 1926 696 210 14 14 chr2 175825392 175825532 -5922555 - RLTR46 LTR ERVK -180 140 1 4 1926 1175 171 35 17 chr2 175825532 175825764 -5922323 + ORR1A4 LTR MaLR 93 328 -1 4 1926 1580 184 7 0 chr2 175826302 175826579 -5921508 + MT2B LTR ERVL 3 281 -320 4 1926 237 310 0 0 chr2 175828618 175828676 -5919411 - ORR1B1 LTR MaLR -186 208 151 4 1926 2843 205 86 28 chr2 175828678 175830134 -5917953 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -3861 1545 6 4 1926 4121 121 17 76 chr2 175832506 175833285 -5914802 + RMER17A LTR ERVK 1 733 -18 4 1926 2510 70 68 29 chr2 175837587 175837938 -5910149 - RLTR10B2 LTR ERVK 0 365 1 4 1926 1843 244 90 12 chr2 175838768 175839278 -5908809 - RLTR20B1 LTR ERVK -11 552 3 4 1926 2742 99 2 10 chr2 175839730 175840129 -5907958 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 1926 7046 112 18 3 chr2 175840129 175841208 -5906879 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 4 4 1926 953 84 7 14 chr2 175841211 175841355 -5906732 - MTA_Mm LTR MaLR 0 400 258 4 1926 873 109 7 14 chr2 175847433 175847572 -5900515 + MTB LTR MaLR 258 395 -5 4 1926 232 244 82 122 chr2 175847757 175847771 -5900316 + MTA_Mm LTR MaLR 381 393 -1 4 1926 7090 110 10 14 chr2 175847771 175848873 -5899214 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 4 1926 2879 69 18 10 chr2 175848873 175849266 -5898821 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 1926 242 148 0 169 chr2 175849659 175849724 -5898363 - RLTR33 LTR ERVK -172 506 453 4 1926 271 250 15 0 chr2 175849927 175849995 -5898092 - RLTR19C LTR ERVK -413 93 25 4 1926 553 276 75 6 chr2 175850039 175850243 -5897844 + RLTR20B1 LTR ERVK 3 219 -358 4 1926 264 197 14 57 chr2 175862913 175862983 -5885104 + MTE-int LTR MaLR 1049 1115 -255 4 1926 1495 217 32 199 chr2 175864197 175864731 -5883356 + RLTR41 LTR ERV1 1 445 -1 4 1926 909 224 52 112 chr2 175864788 175865075 -5883012 + RLTR41 LTR ERV1 65 334 -112 4 1926 4779 187 54 29 chr2 175865027 175866086 -5882001 + RLTR25A LTR ERVK 19 1103 0 4 1926 736 327 62 8 chr2 175866377 175866633 -5881454 + MTE-int LTR MaLR 1075 1344 -236 4 1926 501 248 60 79 chr2 175866703 175866918 -5881169 + ORR1D1 LTR MaLR 3 213 -161 4 1926 588 296 23 56 chr2 175867249 175867506 -5880581 + MT2A LTR ERVL 1 377 -224 4 1926 503 313 35 140 chr2 175867531 175867772 -5880315 + MT2A LTR ERVL 378 591 -10 4 1926 1535 191 96 23 chr2 175868533 175868930 -5879157 - RMER17B LTR ERVK 0 958 533 4 1926 802 211 0 126 chr2 175869571 175869761 -5878326 - RLTR26 LTR ERVK 0 642 477 4 1926 680 229 6 24 chr2 175875237 175875407 -5872680 + RMER10A LTR ERVL 271 437 -5 4 1926 857 101 36 7 chr2 175881601 175881740 -5866347 + MTA_Mm LTR MaLR 258 400 0 4 1926 6416 128 30 11 chr2 175881740 175882818 -5865269 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 4 1926 2966 64 8 20 chr2 175882818 175883219 -5864868 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 1926 253 130 0 169 chr2 175883310 175883375 -5864712 - RLTR33 LTR ERVK -172 506 453 4 1926 1704 273 85 6 chr2 175883684 175884204 -5863883 + RLTR20B1 LTR ERVK 3 563 0 4 1926 983 176 21 11 chr2 175885845 175886035 -5862052 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 255 4 1926 1750 140 6 52 chr2 175886075 175886422 -5861665 + RMER16-int LTR ERVK 2993 3323 -2083 4 1926 1464 71 5 0 chr2 175886422 175886619 -5861468 + RLTR13C2 LTR ERVK 1 198 -610 4 1926 1681 66 0 30 chr2 175886816 175887050 -5861037 + RLTR13C2 LTR ERVK 184 410 -398 4 1926 520 158 0 10 chr2 175887056 175887152 -5860935 + RMER16-int LTR ERVK 3018 3112 -2294 4 1926 2576 156 6 4 chr2 175887750 175888234 -5859853 + RMER16-int LTR ERVK 3099 3583 -1823 4 1926 823 330 37 40 chr2 175888285 175888607 -5859480 + MTE2a LTR MaLR 42 362 -17 4 1926 283 312 20 40 chr2 175888954 175889054 -5859033 + RMER15 LTR ERVL 293 390 -185 4 1926 352 247 0 76 chr2 175889223 175889315 -5858772 + MTEb LTR MaLR 294 378 -1 4 1926 2329 107 27 0 chr2 175895595 175895651 -5852436 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 290 4 1926 2329 107 27 0 chr2 175895685 175895965 -5852122 - ORR1A1 LTR MaLR -57 289 2 4 1926 3981 201 60 40 chr2 175895971 175896902 -5851185 + RLTR25A LTR ERVK 154 1103 0 4 1926 631 207 80 0 chr2 175896984 175897134 -5850953 - RLTR25A LTR ERVK -656 447 286 4 1926 806 344 35 10 chr2 175897357 175897645 -5850442 + MTE-int LTR MaLR 1047 1341 -239 4 1926 909 272 115 21 chr2 175897714 175898044 -5850043 + ORR1D1 LTR MaLR 1 361 -13 5 1927 1812 252 86 10 chr2 175912218 175912739 -5835348 - RLTR20B1 LTR ERVK 0 563 3 5 1927 238 265 15 0 chr2 175912783 175912851 -5835236 + RLTR19C LTR ERVK 25 93 -413 5 1927 2732 115 68 6 chr2 175913091 175913568 -5834519 + RLTR1C LTR ERV1 1 605 0 5 1927 2865 61 2 106 chr2 175913723 175914042 -5834045 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 108 5 1927 2865 61 2 106 chr2 175914188 175914310 -5833777 - MTA_Mm LTR MaLR -289 107 1 5 1927 7090 101 20 10 chr2 175914310 175914406 -5833681 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1005 5 1927 2932 29 9 0 chr2 175914406 175914749 -5833338 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 5 1927 13774 61 4 1 chr2 175914749 175916535 -5831552 - ORR1A0-int LTR MaLR 0 1792 1 5 1927 2823 38 18 0 chr2 175916535 175916875 -5831212 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 5 1927 7090 101 20 10 chr2 175916875 175917863 -5830224 - MTA_Mm-int LTR MaLR -94 1004 3 5 1927 911 99 14 7 chr2 175917863 175918005 -5830082 - MTA_Mm LTR MaLR 0 400 258 5 1927 704 217 6 24 chr2 175924201 175924371 -5823716 - RMER10A LTR ERVL -5 437 271 5 1927 740 128 8 0 chr2 175925408 175925533 -5822554 + RLTR22_Mur LTR ERVK 676 801 -1047 5 1927 301 296 34 0 chr2 175925742 175925830 -5822257 + RMER12 LTR ERVK 1101 1191 -131 5 1927 833 232 13 0 chr2 175928914 175929065 -5819022 + RLTR26 LTR ERVK 490 642 0 5 1927 1660 184 103 3 chr2 175929713 175930100 -5817987 + RMER17B LTR ERVK 533 958 0 5 1927 659 262 44 15 chr2 175930934 175931139 -5816948 - ORR1D1 LTR MaLR -161 213 3 5 1927 766 323 63 4 chr2 175931209 175931464 -5816623 - MTE-int LTR MaLR -236 1344 1075 5 1927 2531 184 36 30 chr2 175931755 175932332 -5815755 - RLTR25A LTR ERVK 0 1103 523 5 1927 3269 70 59 4 chr2 175932333 175932790 -5815297 - RLTR45 LTR ERVK 0 482 1 5 1927 28791 38 28 24 chr2 175932790 175935295 -5812792 - RLTR45-int LTR ERVK 0 7244 4763 5 1927 28791 38 28 24 chr2 175935337 175936683 -5811404 - RLTR45-int LTR ERVK -2482 4762 3381 5 1927 24852 42 12 8 chr2 175936661 175939853 -5808234 - RLTR45-int LTR ERVK -4039 3205 1 5 1927 3169 52 94 16 chr2 175939853 175940300 -5807787 - RLTR45 LTR ERVK 0 482 1 5 1927 468 191 0 110 chr2 175940698 175940816 -5807271 + MT2B LTR ERVL 158 262 -339 5 1927 903 282 102 15 chr2 175941284 175941619 -5806468 - ORR1D1 LTR MaLR -10 364 1 5 1927 848 306 32 76 chr2 175941685 175941927 -5806160 - MTE-int LTR MaLR -236 1344 1109 5 1927 848 306 32 76 chr2 175942105 175942177 -5805910 - MTE-int LTR MaLR -472 1108 1044 5 1927 738 269 108 48 chr2 175945292 175945542 -5802545 + RLTR41 LTR ERV1 1 265 -181 5 1927 284 204 0 0 chr2 175945600 175945649 -5802438 - RLTR25A LTR ERVK -543 560 512 5 1927 2210 184 76 49 chr2 175945745 175946271 -5801816 + RLTR25A LTR ERVK 144 683 -420 5 1927 3080 46 0 0 chr2 175948370 175948716 -5799371 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 5 1927 3208 82 12 5 chr2 175950655 175951073 -5797014 - BGLII LTR ERVK 0 421 1 5 1927 3341 102 125 21 chr2 175951584 175952095 -5795992 - LTRIS2 LTR ERV1 0 564 1 5 1927 534 213 15 12 chr2 175952450 175952569 -5795518 + ORR1A4 LTR MaLR 1 177 -182 5 1927 249 319 46 46 chr2 175952571 175952745 -5795342 - RLTR46 LTR ERVK -21 299 126 5 1927 714 196 14 14 chr2 175952789 175952929 -5795158 - RLTR46 LTR ERVK -180 140 1 5 1927 1171 167 35 17 chr2 175952929 175953161 -5794926 + ORR1A4 LTR MaLR 93 328 -1 5 1927 1555 188 7 0 chr2 175953699 175953976 -5794111 + MT2B LTR ERVL 3 281 -320 5 1927 238 310 0 0 chr2 175956035 175956093 -5791994 - ORR1B1 LTR MaLR -186 208 151 5 1927 3220 207 86 29 chr2 175956095 175957568 -5790519 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -3861 1545 6 5 1927 777 328 26 4 chr2 175958355 175958585 -5789502 + MTE-int LTR MaLR 1110 1344 -236 5 1927 938 265 122 24 chr2 175958651 175958987 -5789100 + ORR1D1 LTR MaLR 1 369 -5 5 1927 1509 227 31 218 chr2 175960241 175960788 -5787299 + RLTR41 LTR ERV1 1 445 -1 5 1927 951 219 49 119 chr2 175960845 175961130 -5786957 + RLTR41 LTR ERV1 65 329 -117 5 1927 4498 188 62 31 chr2 175961087 175962140 -5785947 + RLTR25A LTR ERVK 19 1103 0 5 1927 667 336 66 12 chr2 175962431 175962687 -5785400 + MTE-int LTR MaLR 1075 1344 -236 5 1927 494 256 55 83 chr2 175962757 175962974 -5785113 + ORR1D1 LTR MaLR 3 213 -161 5 1927 868 282 150 78 chr2 175963304 175963579 -5784508 + MT2A LTR ERVL 1 246 -287 5 1927 868 282 150 78 chr2 175963614 175963826 -5784261 + MT2A LTR ERVL 247 522 -11 5 1927 1588 191 115 3 chr2 175964586 175964969 -5783118 - RMER17B LTR ERVK 0 958 533 5 1927 849 231 23 110 chr2 175965610 175965829 -5782258 - RLTR26 LTR ERVK 0 642 443 5 1927 3735 20 0 0 chr2 175970798 175971194 -5776893 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 1927 10155 20 1 0 chr2 175971194 175972291 -5775796 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 5 1927 3763 18 0 0 chr2 175972291 175972687 -5775400 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 1927 686 223 6 24 chr2 175972971 175973141 -5774946 + RMER10A LTR ERVL 271 437 -5 5 1927 850 109 36 7 chr2 175979178 175979317 -5768770 + MTA_Mm LTR MaLR 258 400 0 6 1927 6933 129 30 11 chr2 175979317 175980395 -5767692 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 6 1927 3193 61 8 20 chr2 175980395 175980796 -5767291 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 1927 250 130 0 169 chr2 175980887 175980952 -5767135 - RLTR33 LTR ERVK -172 506 453 6 1927 1704 269 85 6 chr2 175981261 175981781 -5766306 + RLTR20B1 LTR ERVK 3 563 0 6 1927 1019 181 20 10 chr2 175983424 175983619 -5764468 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 250 6 1927 1947 137 6 52 chr2 175983642 175983989 -5764098 + RMER16-int LTR ERVK 2993 3323 -2083 6 1927 1466 71 5 0 chr2 175983989 175984186 -5763901 + RLTR13C2 LTR ERVK 1 198 -610 6 1927 1579 127 22 12 chr2 175984367 175984650 -5763437 + RLTR13C2 LTR ERVK 203 499 -394 6 1927 534 163 0 11 chr2 175984656 175984749 -5763338 + RMER16-int LTR ERVK 3018 3109 -2297 6 1927 2808 158 6 6 chr2 175985352 175985837 -5762250 + RMER16-int LTR ERVK 3099 3583 -1823 6 1927 796 344 31 37 chr2 175985888 175986211 -5761876 + MTE2b LTR MaLR 42 362 -17 6 1927 291 302 20 40 chr2 175986558 175986658 -5761429 + RMER15 LTR ERVL 293 390 -185 6 1927 459 252 57 64 chr2 175987029 175987169 -5760918 + MTEb LTR MaLR 240 378 -1 6 1928 1835 253 86 8 chr2 176042845 176043355 -5704732 - RLTR20B1 LTR ERVK -11 552 3 3 1928 251 250 15 0 chr2 176043404 176043472 -5704615 + RLTR19C LTR ERVK 25 93 -413 4 1928 2731 101 2 10 chr2 176043809 176044208 -5703879 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 1928 7069 111 17 4 chr2 176044208 176045289 -5702798 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 4 5 1928 929 92 7 14 chr2 176045292 176045436 -5702651 - MTA_Mm LTR MaLR 0 400 258 5 1928 851 117 7 14 chr2 176051396 176051535 -5696552 + MTB LTR MaLR 258 395 -5 1 1928 7142 110 10 14 chr2 176051737 176052839 -5695248 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 1 1928 2816 72 18 13 chr2 176052839 176053233 -5694854 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1928 611 253 75 12 chr2 176054009 176054214 -5693873 + RLTR20B1 LTR ERVK 3 219 -358 1 1928 909 272 115 21 chr2 176066020 176066350 -5681737 - ORR1D1 LTR MaLR -13 361 1 2 1928 802 341 38 14 chr2 176066419 176066707 -5681380 - MTE-int LTR MaLR -239 1341 1047 2 1928 631 207 80 0 chr2 176066935 176067085 -5681002 + RLTR25A LTR ERVK 286 447 -656 2 1928 3993 199 61 40 chr2 176067167 176068097 -5679990 - RLTR25A LTR ERVK 0 1103 154 2 1928 2271 110 30 0 chr2 176068103 176068382 -5679705 + ORR1A1 LTR MaLR 1 280 -66 2 1928 2271 110 30 0 chr2 176068424 176068480 -5679607 + ORR1A1 LTR MaLR 281 344 -2 2 1928 362 247 0 76 chr2 176074760 176074852 -5673235 - MTEb LTR MaLR -1 378 294 3 1928 272 312 20 40 chr2 176075021 176075121 -5672966 - RMER15 LTR ERVL -185 390 293 3 1928 793 335 54 40 chr2 176075468 176075835 -5672252 - MTE2a LTR MaLR -17 402 20 3 1928 2600 153 6 4 chr2 176075837 176076321 -5671766 - RMER16-int LTR ERVK -1823 3583 3099 3 1928 503 169 0 10 chr2 176076920 176077016 -5671071 - RMER16-int LTR ERVK -2294 3112 3018 3 1928 1617 70 0 66 chr2 176077022 176077265 -5670822 - RLTR13C2 LTR ERVK -398 410 184 4 1928 1471 71 5 0 chr2 176077465 176077662 -5670425 - RLTR13C2 LTR ERVK -610 198 1 4 1928 1776 137 6 52 chr2 176077662 176078009 -5670078 - RMER16-int LTR ERVK -2083 3323 2993 4 1928 983 176 21 11 chr2 176078049 176078239 -5669848 + RLTR41 LTR ERV1 255 446 0 4 1928 1665 274 89 6 chr2 176079880 176080398 -5667689 - RLTR20B1 LTR ERVK 0 563 3 4 1928 253 130 0 169 chr2 176080707 176080772 -5667315 + RLTR33 LTR ERVK 453 506 -172 5 1928 2952 66 8 20 chr2 176080864 176081265 -5666822 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 1928 6445 128 30 11 chr2 176081265 176082343 -5665744 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 5 1928 852 109 36 7 chr2 176082343 176082482 -5665605 - MTA_Mm LTR MaLR 0 400 258 5 1928 705 217 6 24 chr2 176088516 176088686 -5659401 - RMER10A LTR ERVL -5 437 271 5 1928 3545 18 0 0 chr2 176088970 176089366 -5658721 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 1928 9614 17 1 0 chr2 176089366 176090463 -5657624 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 5 1928 3518 20 0 0 chr2 176090463 176090859 -5657228 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 1928 837 231 23 110 chr2 176095830 176096049 -5652038 + RLTR26 LTR ERVK 443 642 0 6 1928 1646 178 98 3 chr2 176096690 176097079 -5651008 + RMER17B LTR ERVK 533 958 0 6 1928 917 282 150 78 chr2 176097839 176098051 -5650036 - MT2A LTR ERVL -10 523 248 6 1928 917 282 150 78 chr2 176098086 176098361 -5649726 - MT2A LTR ERVL -286 247 2 6 1928 504 256 55 83 chr2 176098691 176098908 -5649179 - ORR1D1 LTR MaLR -161 213 3 6 1928 686 332 66 12 chr2 176098978 176099234 -5648853 - MTE-int LTR MaLR -236 1344 1075 6 1928 4541 188 62 31 chr2 176099525 176100578 -5647509 - RLTR25A LTR ERVK 0 1103 19 6 1928 945 223 48 117 chr2 176100530 176100820 -5647267 - RLTR41 LTR ERV1 -112 334 65 6 1928 1331 227 31 218 chr2 176100877 176101424 -5646663 - RLTR41 LTR ERV1 -1 445 1 6 1928 962 265 122 24 chr2 176102672 176103008 -5645079 - ORR1D1 LTR MaLR -5 369 1 7 1928 793 328 26 4 chr2 176103074 176103304 -5644783 - MTE-int LTR MaLR -236 1344 1110 7 1928 2839 206 87 29 chr2 176104109 176105565 -5642522 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 6 1545 -3861 7 1928 237 310 0 0 chr2 176105567 176105625 -5642462 + ORR1B1 LTR MaLR 151 208 -186 7 1928 1564 188 7 0 chr2 176107678 176107955 -5640132 - MT2B LTR ERVL -320 281 3 8 1928 1173 167 35 17 chr2 176108493 176108725 -5639362 - ORR1A4 LTR MaLR -1 328 93 8 1928 707 196 14 14 chr2 176108725 176108865 -5639222 + RLTR46 LTR ERVK 1 140 -180 8 1928 254 325 46 46 chr2 176108909 176109083 -5639004 + RLTR46 LTR ERVK 126 299 -21 8 1928 543 204 17 26 chr2 176109088 176109204 -5638883 - ORR1A4 LTR MaLR -214 115 1 8 1928 3091 102 125 21 chr2 176109559 176110070 -5638017 + LTRIS2 LTR ERV1 1 564 0 9 1928 2999 82 12 5 chr2 176110581 176110999 -5637088 + BGLII LTR ERVK 1 421 0 9 1928 2897 46 0 0 chr2 176112938 176113284 -5634803 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 9 1928 2234 184 76 49 chr2 176115383 176115909 -5632178 - RLTR25A LTR ERVK -420 683 144 1 1928 282 204 0 0 chr2 176116005 176116054 -5632033 + RLTR25A LTR ERVK 512 560 -543 1 1928 743 269 108 48 chr2 176116113 176116363 -5631724 - RLTR41 LTR ERV1 -181 265 1 1 1928 817 310 31 0 chr2 176119747 176119976 -5628111 + MTE-int LTR MaLR 1109 1344 -236 1 1928 883 285 102 15 chr2 176120042 176120377 -5627710 + ORR1D1 LTR MaLR 1 364 -10 1 1928 3121 59 93 20 chr2 176121369 176121818 -5626269 + RLTR45 LTR ERVK 1 482 0 1 1928 24914 41 14 5 chr2 176121818 176124996 -5623091 + RLTR45-int LTR ERVK 1 3205 -4039 1 1928 28819 37 29 24 chr2 176124974 176126317 -5621770 + RLTR45-int LTR ERVK 3380 4761 -2483 1 1928 28819 37 29 24 chr2 176126342 176128847 -5619240 + RLTR45-int LTR ERVK 4762 7243 -1 1 1928 3216 73 59 7 chr2 176128847 176129305 -5618782 + RLTR45 LTR ERVK 1 482 0 1 1928 2522 186 36 30 chr2 176129306 176129883 -5618204 + RLTR25A LTR ERVK 523 1103 0 1 1928 720 335 62 8 chr2 176130174 176130430 -5617657 + MTE-int LTR MaLR 1075 1344 -236 1 1928 633 267 44 15 chr2 176130500 176130705 -5617382 + ORR1D1 LTR MaLR 3 213 -161 1 1928 1648 186 98 3 chr2 176131539 176131928 -5616159 - RMER17B LTR ERVK 0 958 533 1 1928 822 241 23 110 chr2 176132576 176132795 -5615292 - RLTR26 LTR ERVK 0 642 443 1 1928 315 287 35 0 chr2 176135813 176135900 -5612187 - RMER12 LTR ERVK -131 1191 1102 1 1928 754 158 33 0 chr2 176136086 176136238 -5611849 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1016 832 676 1 1928 709 217 6 24 chr2 176137275 176137445 -5610642 + RMER10A LTR ERVL 271 437 -5 1 1928 911 99 14 7 chr2 176143718 176143860 -5604227 + MTA_Mm LTR MaLR 258 400 0 1 1928 7115 98 20 10 chr2 176143860 176144848 -5603239 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1004 -94 1 1928 2833 35 18 0 chr2 176144848 176145188 -5602899 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 1 1928 13733 62 4 1 chr2 176145188 176146974 -5601113 + ORR1A0-int LTR MaLR 1 1792 0 1 1928 2916 29 9 0 chr2 176146974 176147317 -5600770 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 1 1928 7115 98 20 10 chr2 176147317 176147413 -5600674 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1005 1096 -2 1 1928 2787 71 2 104 chr2 176147413 176147534 -5600553 + MTA_Mm LTR MaLR 1 107 -289 1 1928 2787 71 2 104 chr2 176147680 176147999 -5600088 + MTA_Mm LTR MaLR 108 396 0 1 1928 2740 116 68 6 chr2 176148106 176148583 -5599504 - RLTR1C LTR ERV1 0 605 1 1 1928 271 235 15 0 chr2 176148823 176148891 -5599196 - RLTR19C LTR ERVK -413 93 25 1 1928 1801 252 86 10 chr2 176148935 176149456 -5598631 + RLTR20B1 LTR ERVK 3 563 0 1 1929 909 272 115 21 chr2 176163624 176163954 -5584133 - ORR1D1 LTR MaLR -13 361 1 1 1929 806 344 35 10 chr2 176164023 176164311 -5583776 - MTE-int LTR MaLR -239 1341 1047 1 1929 631 207 80 0 chr2 176164519 176164669 -5583418 + RLTR25A LTR ERVK 286 447 -656 1 1929 3981 201 60 40 chr2 176164751 176165682 -5582405 - RLTR25A LTR ERVK 0 1103 154 1 1929 2329 107 27 0 chr2 176165688 176165968 -5582119 + ORR1A1 LTR MaLR 1 280 -66 1 1929 2329 107 27 0 chr2 176166002 176166058 -5582029 + ORR1A1 LTR MaLR 281 344 -2 1 1929 347 247 0 76 chr2 176172340 176172432 -5575655 - MTEb LTR MaLR -1 378 294 1 1929 285 312 20 40 chr2 176172601 176172701 -5575386 - RMER15 LTR ERVL -185 390 293 1 1929 808 330 37 40 chr2 176173048 176173370 -5574717 - MTE2a LTR MaLR -17 362 42 1 1929 2820 156 6 4 chr2 176173421 176173905 -5574182 - RMER16-int LTR ERVK -1823 3583 3099 1 1929 599 153 0 10 chr2 176174500 176174599 -5573488 - RMER16-int LTR ERVK -2291 3115 3018 1 1929 1678 66 0 30 chr2 176174605 176174839 -5573248 - RLTR13C2 LTR ERVK -398 410 184 1 1929 1466 71 5 0 chr2 176175036 176175233 -5572854 - RLTR13C2 LTR ERVK -610 198 1 1 1929 1921 140 6 52 chr2 176175233 176175580 -5572507 - RMER16-int LTR ERVK -2083 3323 2993 1 1929 990 176 21 11 chr2 176175620 176175810 -5572277 + RLTR41 LTR ERV1 255 446 0 1 1929 1674 273 85 6 chr2 176177451 176177971 -5570116 - RLTR20B1 LTR ERVK 0 563 3 1 1929 250 130 0 169 chr2 176178280 176178345 -5569742 + RLTR33 LTR ERVK 453 506 -172 1 1929 3174 64 8 20 chr2 176178436 176178837 -5569250 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 1929 6933 129 30 11 chr2 176178837 176179915 -5568172 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 1 1929 850 109 36 7 chr2 176179915 176180054 -5568033 - MTA_Mm LTR MaLR 0 400 258 1 1929 686 223 6 24 chr2 176186091 176186261 -5561826 - RMER10A LTR ERVL -5 437 271 1 1929 3736 20 0 0 chr2 176186545 176186941 -5561146 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1929 10176 18 1 0 chr2 176186941 176188038 -5560049 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 1 1929 3735 20 0 0 chr2 176188038 176188434 -5559653 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1929 849 231 23 110 chr2 176193399 176193618 -5554469 + RLTR26 LTR ERVK 443 642 0 1 1929 1669 188 98 3 chr2 176194259 176194648 -5553439 + RMER17B LTR ERVK 533 958 0 1 1929 849 307 91 79 chr2 176195408 176195925 -5552162 - MT2A LTR ERVL -10 523 1 1 1929 492 249 65 88 chr2 176196255 176196471 -5551616 - ORR1D1 LTR MaLR -161 213 3 1 1929 677 339 62 8 chr2 176196541 176196797 -5551290 - MTE-int LTR MaLR -236 1344 1075 1 1929 4503 188 62 31 chr2 176197088 176198141 -5549946 - RLTR25A LTR ERVK 0 1103 19 1 1929 909 232 49 118 chr2 176198098 176198386 -5549701 - RLTR41 LTR ERV1 -117 329 62 2 1929 1309 232 42 11 chr2 176198440 176198723 -5549364 - RLTR41 LTR ERV1 -1 445 154 2 1929 713 228 32 76 chr2 176198802 176198987 -5549100 - RLTR41 LTR ERV1 -269 177 1 2 1929 977 259 122 24 chr2 176200214 176200550 -5547537 - ORR1D1 LTR MaLR -5 369 1 2 1929 775 319 26 4 chr2 176200616 176200846 -5547241 - MTE-int LTR MaLR -236 1344 1110 2 1929 1780 252 86 10 chr2 176214500 176215021 -5533066 - RLTR20B1 LTR ERVK 0 563 3 2 1929 235 265 15 0 chr2 176215065 176215133 -5532954 + RLTR19C LTR ERVK 25 93 -413 2 1929 2734 115 68 6 chr2 176215373 176215850 -5532237 + RLTR1C LTR ERV1 1 605 0 2 1929 3071 61 2 106 chr2 176216005 176216324 -5531763 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 108 2 1929 3071 61 2 106 chr2 176216470 176216592 -5531495 - MTA_Mm LTR MaLR -289 107 1 2 1929 7094 101 20 10 chr2 176216592 176216688 -5531399 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1005 2 1929 3119 29 9 0 chr2 176216688 176217031 -5531056 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 2 1929 14724 61 4 1 chr2 176217031 176218817 -5529270 - ORR1A0-int LTR MaLR 0 1792 1 2 1929 3006 38 18 0 chr2 176218817 176219157 -5528930 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 2 1929 7094 101 20 10 chr2 176219157 176220145 -5527942 - MTA_Mm-int LTR MaLR -94 1004 3 2 1929 905 99 14 7 chr2 176220145 176220287 -5527800 - MTA_Mm LTR MaLR 0 400 258 2 1929 704 217 6 24 chr2 176226483 176226653 -5521434 - RMER10A LTR ERVL -5 437 271 2 1929 740 128 8 0 chr2 176227690 176227815 -5520272 + RLTR22_Mur LTR ERVK 676 801 -1047 2 1929 301 296 34 0 chr2 176228024 176228112 -5519975 + RMER12 LTR ERVK 1101 1191 -131 2 1929 833 232 13 0 chr2 176231196 176231347 -5516740 + RLTR26 LTR ERVK 490 642 0 2 1929 1660 184 103 3 chr2 176231995 176232382 -5515705 + RMER17B LTR ERVK 533 958 0 2 1929 659 262 44 15 chr2 176233216 176233421 -5514666 - ORR1D1 LTR MaLR -161 213 3 2 1929 766 323 63 4 chr2 176233491 176233746 -5514341 - MTE-int LTR MaLR -236 1344 1075 2 1929 2531 184 36 30 chr2 176234037 176234614 -5513473 - RLTR25A LTR ERVK 0 1103 523 2 1929 3269 70 59 4 chr2 176234615 176235072 -5513015 - RLTR45 LTR ERVK 0 482 1 2 1929 28791 38 28 24 chr2 176235072 176237577 -5510510 - RLTR45-int LTR ERVK 0 7244 4763 2 1929 28791 38 28 24 chr2 176237619 176238965 -5509122 - RLTR45-int LTR ERVK -2482 4762 3381 2 1929 24852 42 12 8 chr2 176238943 176242135 -5505952 - RLTR45-int LTR ERVK -4039 3205 1 2 1929 3169 52 94 16 chr2 176242135 176242582 -5505505 - RLTR45 LTR ERVK 0 482 1 2 1929 468 191 0 110 chr2 176242980 176243098 -5504989 + MT2B LTR ERVL 158 262 -339 2 1929 903 282 102 15 chr2 176243566 176243901 -5504186 - ORR1D1 LTR MaLR -10 364 1 2 1929 848 306 32 76 chr2 176243967 176244209 -5503878 - MTE-int LTR MaLR -236 1344 1109 2 1929 848 306 32 76 chr2 176244387 176244459 -5503628 - MTE-int LTR MaLR -472 1108 1044 2 1929 743 269 108 48 chr2 176247574 176247824 -5500263 + RLTR41 LTR ERV1 1 265 -181 2 1929 282 204 0 0 chr2 176247882 176247931 -5500156 - RLTR25A LTR ERVK -543 560 512 2 1929 2234 184 76 49 chr2 176248027 176248553 -5499534 + RLTR25A LTR ERVK 144 683 -420 2 1929 2897 46 0 0 chr2 176250652 176250998 -5497089 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 2 1929 2999 82 12 5 chr2 176252937 176253355 -5494732 - BGLII LTR ERVK 0 421 1 2 1929 3091 102 125 21 chr2 176253866 176254377 -5493710 - LTRIS2 LTR ERV1 0 564 1 2 1929 543 204 17 26 chr2 176254732 176254848 -5493239 + ORR1A4 LTR MaLR 1 115 -214 2 1929 254 325 46 46 chr2 176254853 176255027 -5493060 - RLTR46 LTR ERVK -21 299 126 2 1929 707 196 14 14 chr2 176255071 176255211 -5492876 - RLTR46 LTR ERVK -180 140 1 2 1929 1173 167 35 17 chr2 176255211 176255443 -5492644 + ORR1A4 LTR MaLR 93 328 -1 2 1929 1564 188 7 0 chr2 176255981 176256258 -5491829 + MT2B LTR ERVL 3 281 -320 2 1929 237 310 0 0 chr2 176258317 176258375 -5489712 - ORR1B1 LTR MaLR -186 208 151 2 1929 2839 206 87 29 chr2 176258377 176259833 -5488254 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -3861 1545 6 2 1929 793 328 26 4 chr2 176260637 176260867 -5487220 + MTE-int LTR MaLR 1110 1344 -236 2 1929 962 265 122 24 chr2 176260933 176261269 -5486818 + ORR1D1 LTR MaLR 1 369 -5 2 1929 1331 227 31 218 chr2 176262523 176263070 -5485017 + RLTR41 LTR ERV1 1 445 -1 2 1929 945 223 48 117 chr2 176263127 176263417 -5484670 + RLTR41 LTR ERV1 65 334 -112 2 1929 4541 188 62 31 chr2 176263369 176264422 -5483665 + RLTR25A LTR ERVK 19 1103 0 2 1929 686 332 66 12 chr2 176264713 176264969 -5483118 + MTE-int LTR MaLR 1075 1344 -236 2 1929 504 256 55 83 chr2 176265039 176265256 -5482831 + ORR1D1 LTR MaLR 3 213 -161 2 1929 917 282 150 78 chr2 176265586 176265861 -5482226 + MT2A LTR ERVL 1 246 -287 2 1929 917 282 150 78 chr2 176265896 176266108 -5481979 + MT2A LTR ERVL 247 522 -11 2 1929 1541 191 115 3 chr2 176266868 176267251 -5480836 - RMER17B LTR ERVK 0 958 533 2 1929 837 231 23 110 chr2 176267892 176268111 -5479976 - RLTR26 LTR ERVK 0 642 443 2 1929 3518 20 0 0 chr2 176273082 176273478 -5474609 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 1929 9546 20 1 0 chr2 176273478 176274575 -5473512 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 2 1929 3545 18 0 0 chr2 176274575 176274971 -5473116 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 1929 694 223 6 24 chr2 176275255 176275425 -5472662 + RMER10A LTR ERVL 271 437 -5 2 1929 852 109 36 7 chr2 176281462 176281601 -5466486 + MTA_Mm LTR MaLR 258 400 0 3 1929 6409 129 30 11 chr2 176281601 176282679 -5465408 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 3 1929 2966 64 8 20 chr2 176282679 176283080 -5465007 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 1929 253 130 0 169 chr2 176283171 176283236 -5464851 - RLTR33 LTR ERVK -172 506 453 3 1929 1704 273 85 6 chr2 176283545 176284065 -5464022 + RLTR20B1 LTR ERVK 3 563 0 3 1929 983 176 21 11 chr2 176285706 176285896 -5462191 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 255 3 1929 1750 140 6 52 chr2 176285936 176286283 -5461804 + RMER16-int LTR ERVK 2993 3323 -2083 3 1929 1464 71 5 0 chr2 176286283 176286480 -5461607 + RLTR13C2 LTR ERVK 1 198 -610 3 1929 1681 66 0 30 chr2 176286677 176286911 -5461176 + RLTR13C2 LTR ERVK 184 410 -398 3 1929 520 158 0 10 chr2 176286917 176287013 -5461074 + RMER16-int LTR ERVK 3018 3112 -2294 3 1929 2576 156 6 4 chr2 176287611 176288095 -5459992 + RMER16-int LTR ERVK 3099 3583 -1823 3 1929 823 330 37 40 chr2 176288146 176288468 -5459619 + MTE2a LTR MaLR 42 362 -17 3 1929 283 312 20 40 chr2 176288815 176288915 -5459172 + RMER15 LTR ERVL 293 390 -185 3 1929 352 247 0 76 chr2 176289084 176289176 -5458911 + MTEb LTR MaLR 294 378 -1 3 1930 2329 107 27 0 chr2 176295456 176295512 -5452575 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 290 3 1930 2329 107 27 0 chr2 176295546 176295826 -5452261 - ORR1A1 LTR MaLR -57 289 2 3 1930 3981 201 60 40 chr2 176295832 176296763 -5451324 + RLTR25A LTR ERVK 154 1103 0 3 1930 631 207 80 0 chr2 176296845 176296995 -5451092 - RLTR25A LTR ERVK -656 447 286 3 1930 806 344 35 10 chr2 176297218 176297506 -5450581 + MTE-int LTR MaLR 1047 1341 -239 3 1930 909 272 115 21 chr2 176297575 176297905 -5450182 + ORR1D1 LTR MaLR 1 361 -13 3 1930 1812 252 86 10 chr2 176312083 176312604 -5435483 - RLTR20B1 LTR ERVK 0 563 3 3 1930 238 265 15 0 chr2 176312648 176312716 -5435371 + RLTR19C LTR ERVK 25 93 -413 3 1930 2732 115 68 6 chr2 176312956 176313433 -5434654 + RLTR1C LTR ERV1 1 605 0 3 1930 2875 61 2 102 chr2 176313588 176313907 -5434180 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 108 3 1930 2875 61 2 102 chr2 176314053 176314173 -5433914 - MTA_Mm LTR MaLR -289 107 1 3 1930 7118 101 19 9 chr2 176314173 176314269 -5433818 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1005 3 1930 2932 29 9 0 chr2 176314269 176314612 -5433475 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 3 1930 13871 58 4 1 chr2 176314612 176316398 -5431689 - ORR1A0-int LTR MaLR 0 1792 1 3 1930 2850 32 18 0 chr2 176316398 176316738 -5431349 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 3 1930 7118 101 19 9 chr2 176316738 176317726 -5430361 - MTA_Mm-int LTR MaLR -94 1004 3 3 1930 911 99 14 7 chr2 176317726 176317868 -5430219 - MTA_Mm LTR MaLR 0 400 258 3 1930 693 223 6 24 chr2 176323652 176323822 -5424265 - RMER10A LTR ERVL -5 437 271 3 1930 740 128 8 0 chr2 176324859 176324984 -5423103 + RLTR22_Mur LTR ERVK 676 801 -1047 3 1930 335 284 22 11 chr2 176325194 176325283 -5422804 + RMER12 LTR ERVK 1102 1191 -131 3 1930 834 241 23 110 chr2 176328513 176328732 -5419355 + RLTR26 LTR ERVK 443 642 0 3 1930 1567 193 112 0 chr2 176329380 176329763 -5418324 + RMER17B LTR ERVK 533 958 0 3 1930 627 277 39 24 chr2 176330598 176330805 -5417282 - ORR1D1 LTR MaLR -161 213 4 3 1930 717 339 63 4 chr2 176330873 176331128 -5416959 - MTE-int LTR MaLR -236 1344 1075 3 1930 2507 186 36 30 chr2 176331419 176331996 -5416091 - RLTR25A LTR ERVK 0 1103 523 3 1930 3242 68 61 4 chr2 176331997 176332453 -5415634 - RLTR45 LTR ERVK 0 482 1 3 1930 9062 41 11 0 chr2 176332453 176333581 -5414506 - RLTR45-int LTR ERVK 0 7244 6105 3 1930 909 272 115 21 chr2 176389898 176390228 -5357859 - ORR1D1 LTR MaLR -13 361 1 3 1930 806 344 35 10 chr2 176390297 176390585 -5357502 - MTE-int LTR MaLR -239 1341 1047 3 1930 631 207 80 0 chr2 176390793 176390943 -5357144 + RLTR25A LTR ERVK 286 447 -656 3 1930 3981 201 60 40 chr2 176391025 176391956 -5356131 - RLTR25A LTR ERVK 0 1103 154 3 1930 2329 107 27 0 chr2 176391962 176392242 -5355845 + ORR1A1 LTR MaLR 1 280 -66 3 1930 2329 107 27 0 chr2 176392276 176392332 -5355755 + ORR1A1 LTR MaLR 281 344 -2 3 1930 352 247 0 76 chr2 176398614 176398706 -5349381 - MTEb LTR MaLR -1 378 294 3 1930 283 312 20 40 chr2 176398875 176398975 -5349112 - RMER15 LTR ERVL -185 390 293 3 1930 823 330 37 40 chr2 176399322 176399644 -5348443 - MTE2a LTR MaLR -17 362 42 3 1930 2576 156 6 4 chr2 176399695 176400179 -5347908 - RMER16-int LTR ERVK -1823 3583 3099 3 1930 551 153 0 10 chr2 176400774 176400873 -5347214 - RMER16-int LTR ERVK -2291 3115 3018 3 1930 1681 66 0 30 chr2 176400879 176401113 -5346974 - RLTR13C2 LTR ERVK -398 410 184 3 1930 1464 71 5 0 chr2 176401310 176401507 -5346580 - RLTR13C2 LTR ERVK -610 198 1 3 1930 1750 140 6 52 chr2 176401507 176401854 -5346233 - RMER16-int LTR ERVK -2083 3323 2993 3 1930 983 176 21 11 chr2 176401894 176402084 -5346003 + RLTR41 LTR ERV1 255 446 0 3 1930 1704 273 85 6 chr2 176403725 176404245 -5343842 - RLTR20B1 LTR ERVK 0 563 3 3 1930 253 130 0 169 chr2 176404554 176404619 -5343468 + RLTR33 LTR ERVK 453 506 -172 3 1930 2966 64 8 20 chr2 176404710 176405111 -5342976 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 1930 6409 129 30 11 chr2 176405111 176406189 -5341898 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 4 1930 852 109 36 7 chr2 176406189 176406328 -5341759 - MTA_Mm LTR MaLR 0 400 258 4 1930 694 223 6 24 chr2 176412365 176412535 -5335552 - RMER10A LTR ERVL -5 437 271 4 1930 3518 20 0 0 chr2 176412819 176413215 -5334872 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 1930 9614 17 1 0 chr2 176413215 176414312 -5333775 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 4 1930 3518 20 0 0 chr2 176414312 176414708 -5333379 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 1930 837 231 23 110 chr2 176419679 176419898 -5328189 + RLTR26 LTR ERVK 443 642 0 4 1930 1646 178 98 3 chr2 176420539 176420928 -5327159 + RMER17B LTR ERVK 533 958 0 4 1930 917 282 150 78 chr2 176421688 176421900 -5326187 - MT2A LTR ERVL -10 523 248 4 1930 917 282 150 78 chr2 176421935 176422210 -5325877 - MT2A LTR ERVL -286 247 2 4 1930 504 256 55 83 chr2 176422540 176422757 -5325330 - ORR1D1 LTR MaLR -161 213 3 4 241 686 332 66 12 chr2 176422827 176423083 -5325004 - MTE-int LTR MaLR -236 1344 1075 4 1931 4541 188 62 31 chr2 176423374 176424427 -5323660 - RLTR25A LTR ERVK 0 1103 19 4 1931 945 223 48 117 chr2 176424379 176424669 -5323418 - RLTR41 LTR ERV1 -112 334 65 4 1931 1331 227 31 218 chr2 176424726 176425273 -5322814 - RLTR41 LTR ERV1 -1 445 1 4 1931 962 265 122 24 chr2 176426521 176426857 -5321230 - ORR1D1 LTR MaLR -5 369 1 4 1931 793 328 26 4 chr2 176426923 176427153 -5320934 - MTE-int LTR MaLR -236 1344 1110 4 1931 2839 206 87 29 chr2 176427958 176429414 -5318673 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 6 1545 -3861 4 1931 237 310 0 0 chr2 176429416 176429474 -5318613 + ORR1B1 LTR MaLR 151 208 -186 4 1931 1564 188 7 0 chr2 176431527 176431804 -5316283 - MT2B LTR ERVL -320 281 3 4 1931 1173 167 35 17 chr2 176432342 176432574 -5315513 - ORR1A4 LTR MaLR -1 328 93 4 1931 707 196 14 14 chr2 176432574 176432714 -5315373 + RLTR46 LTR ERVK 1 140 -180 4 1931 254 325 46 46 chr2 176432758 176432932 -5315155 + RLTR46 LTR ERVK 126 299 -21 4 1931 543 204 17 26 chr2 176432937 176433053 -5315034 - ORR1A4 LTR MaLR -214 115 1 4 1931 3091 102 125 21 chr2 176433408 176433919 -5314168 + LTRIS2 LTR ERV1 1 564 0 4 1931 2999 82 12 5 chr2 176434430 176434848 -5313239 + BGLII LTR ERVK 1 421 0 4 1931 2897 46 0 0 chr2 176436787 176437133 -5310954 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 4 1931 2234 184 76 49 chr2 176439232 176439758 -5308329 - RLTR25A LTR ERVK -420 683 144 4 1931 282 204 0 0 chr2 176439854 176439903 -5308184 + RLTR25A LTR ERVK 512 560 -543 4 1931 743 269 108 48 chr2 176439962 176440212 -5307875 - RLTR41 LTR ERV1 -181 265 1 4 1931 817 310 31 0 chr2 176443596 176443825 -5304262 + MTE-int LTR MaLR 1109 1344 -236 4 1931 859 285 102 15 chr2 176443891 176444226 -5303861 + ORR1D1 LTR MaLR 1 364 -10 4 1931 3341 59 93 20 chr2 176445218 176445667 -5302420 + RLTR45 LTR ERVK 1 482 0 4 1931 26696 41 14 5 chr2 176445667 176448845 -5299242 + RLTR45-int LTR ERVK 1 3205 -4039 4 1931 31008 37 29 24 chr2 176448823 176450166 -5297921 + RLTR45-int LTR ERVK 3380 4761 -2483 4 1931 31008 37 29 24 chr2 176450191 176452696 -5295391 + RLTR45-int LTR ERVK 4762 7243 -1 4 1931 3442 73 59 7 chr2 176452696 176453154 -5294933 + RLTR45 LTR ERVK 1 482 0 4 1931 2503 186 36 30 chr2 176453155 176453732 -5294355 + RLTR25A LTR ERVK 523 1103 0 4 1931 697 335 62 8 chr2 176454023 176454279 -5293808 + MTE-int LTR MaLR 1075 1344 -236 4 1931 626 267 44 15 chr2 176454349 176454554 -5293533 + ORR1D1 LTR MaLR 3 213 -161 4 1931 1694 186 98 3 chr2 176455388 176455777 -5292310 - RMER17B LTR ERVK 0 958 533 4 1931 834 241 23 110 chr2 176456425 176456644 -5291443 - RLTR26 LTR ERVK 0 642 443 4 1931 315 287 35 0 chr2 176459662 176459749 -5288338 - RMER12 LTR ERVK -131 1191 1102 4 1931 743 158 33 0 chr2 176459935 176460087 -5288000 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1016 832 676 4 1931 701 217 6 24 chr2 176461124 176461294 -5286793 + RMER10A LTR ERVL 271 437 -5 4 1931 905 99 14 7 chr2 176467567 176467709 -5280378 + MTA_Mm LTR MaLR 258 400 0 4 1931 7121 98 20 10 chr2 176467709 176468697 -5279390 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1004 -94 4 1931 3015 35 18 0 chr2 176468697 176469037 -5279050 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 4 1931 14682 62 4 1 chr2 176469037 176470823 -5277264 + ORR1A0-int LTR MaLR 1 1792 0 4 1931 3102 29 9 0 chr2 176470823 176471166 -5276921 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 4 1931 7121 98 20 10 chr2 176471166 176471262 -5276825 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1005 1096 -2 4 1931 2991 71 2 104 chr2 176471262 176471383 -5276704 + MTA_Mm LTR MaLR 1 107 -289 4 1931 2991 71 2 104 chr2 176471529 176471848 -5276239 + MTA_Mm LTR MaLR 108 396 0 4 1931 2744 116 68 6 chr2 176471955 176472432 -5275655 - RLTR1C LTR ERV1 0 605 1 4 1931 267 235 15 0 chr2 176472672 176472740 -5275347 - RLTR19C LTR ERVK -413 93 25 4 1931 1771 252 86 10 chr2 176472784 176473305 -5274782 + RLTR20B1 LTR ERVK 3 563 0 4 1931 775 319 26 4 chr2 176486955 176487185 -5260902 + MTE-int LTR MaLR 1110 1344 -236 4 1931 977 259 122 24 chr2 176487251 176487587 -5260500 + ORR1D1 LTR MaLR 1 369 -5 4 1931 713 228 32 76 chr2 176488814 176488999 -5259088 + RLTR41 LTR ERV1 1 177 -269 5 1931 1309 232 42 11 chr2 176489078 176489361 -5258726 + RLTR41 LTR ERV1 154 445 -1 5 1931 909 232 49 118 chr2 176489415 176489703 -5258384 + RLTR41 LTR ERV1 62 329 -117 5 1931 4503 188 62 31 chr2 176489660 176490713 -5257374 + RLTR25A LTR ERVK 19 1103 0 5 1931 677 339 62 8 chr2 176491004 176491260 -5256827 + MTE-int LTR MaLR 1075 1344 -236 5 1931 492 249 65 88 chr2 176491330 176491546 -5256541 + ORR1D1 LTR MaLR 3 213 -161 5 1931 849 307 91 79 chr2 176491876 176492393 -5255694 + MT2A LTR ERVL 1 523 -10 5 1931 1669 188 98 3 chr2 176493153 176493542 -5254545 - RMER17B LTR ERVK 0 958 533 5 1931 849 231 23 110 chr2 176494183 176494402 -5253685 - RLTR26 LTR ERVK 0 642 443 5 1931 3735 20 0 0 chr2 176499367 176499763 -5248324 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 1931 1820 25 0 0 chr2 176499763 176500000 -5248087 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 862 5 1931 7205 16 1 0 chr2 176500000 176500860 -5247227 - MTA_Mm-int LTR MaLR -237 861 1 1 1931 3545 18 0 0 chr2 176500860 176501256 -5246831 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 1931 705 217 6 24 chr2 176501540 176501710 -5246377 + RMER10A LTR ERVL 271 437 -5 2 1931 852 109 36 7 chr2 176507744 176507883 -5240204 + MTA_Mm LTR MaLR 258 400 0 5 1931 6445 128 30 11 chr2 176507883 176508961 -5239126 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 5 1931 2952 66 8 20 chr2 176508961 176509362 -5238725 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 1931 253 130 0 169 chr2 176509454 176509519 -5238568 - RLTR33 LTR ERVK -172 506 453 7 1931 1665 274 89 6 chr2 176509828 176510346 -5237741 + RLTR20B1 LTR ERVK 3 563 0 8 1931 983 176 21 11 chr2 176511987 176512177 -5235910 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 255 1 1931 1776 137 6 52 chr2 176512217 176512564 -5235523 + RMER16-int LTR ERVK 2993 3323 -2083 1 1931 1471 71 5 0 chr2 176512564 176512761 -5235326 + RLTR13C2 LTR ERVK 1 198 -610 1 1931 1617 70 0 66 chr2 176512961 176513204 -5234883 + RLTR13C2 LTR ERVK 184 410 -398 1 1931 503 169 0 10 chr2 176513210 176513306 -5234781 + RMER16-int LTR ERVK 3018 3112 -2294 1 1931 2600 153 6 4 chr2 176513905 176514389 -5233698 + RMER16-int LTR ERVK 3099 3583 -1823 1 1931 793 335 54 40 chr2 176514391 176514758 -5233329 + MTE2a LTR MaLR 20 402 -17 2 1931 272 312 20 40 chr2 176515105 176515205 -5232882 + RMER15 LTR ERVL 293 390 -185 2 1931 362 247 0 76 chr2 176515374 176515466 -5232621 + MTEb LTR MaLR 294 378 -1 2 1931 2271 110 30 0 chr2 176521746 176521802 -5226285 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 290 2 1931 2271 110 30 0 chr2 176521844 176522123 -5225964 - ORR1A1 LTR MaLR -57 289 2 2 1931 3993 199 61 40 chr2 176522129 176523059 -5225028 + RLTR25A LTR ERVK 154 1103 0 2 1931 631 207 80 0 chr2 176523141 176523291 -5224796 - RLTR25A LTR ERVK -656 447 286 3 1931 802 341 38 14 chr2 176523519 176523807 -5224280 + MTE-int LTR MaLR 1047 1341 -239 3 1931 909 272 115 21 chr2 176523876 176524206 -5223881 + ORR1D1 LTR MaLR 1 361 -13 3 1931 611 253 75 12 chr2 176536012 176536217 -5211870 - RLTR20B1 LTR ERVK -358 219 3 4 1931 2816 72 18 13 chr2 176536993 176537387 -5210700 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 1931 7142 110 10 14 chr2 176537387 176538489 -5209598 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 4 1931 851 117 7 14 chr2 176538691 176538830 -5209257 - MTB LTR MaLR -5 395 258 4 1931 929 92 7 14 chr2 176544790 176544934 -5203153 + MTA_Mm LTR MaLR 258 400 0 5 1931 7069 111 17 4 chr2 176544937 176546018 -5202069 + MTA_Mm-int LTR MaLR 4 1098 0 5 1931 2731 101 2 10 chr2 176546018 176546417 -5201670 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 1931 251 250 15 0 chr2 176546754 176546822 -5201265 - RLTR19C LTR ERVK -413 93 25 5 1931 1835 253 86 8 chr2 176546871 176547381 -5200706 + RLTR20B1 LTR ERVK 3 552 -11 5 1931 2549 62 68 29 chr2 176548199 176548550 -5199537 + RLTR10B2 LTR ERVK 1 365 0 5 1931 4099 114 14 93 chr2 176552848 176553644 -5194443 - RMER17A LTR ERVK -18 733 1 6 1932 2839 206 87 29 chr2 176556045 176557501 -5190586 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 6 1545 -3861 6 1932 231 316 0 0 chr2 176557504 176557561 -5190526 + ORR1B1 LTR MaLR 152 208 -186 6 1932 1591 181 7 0 chr2 176559621 176559898 -5188189 - MT2B LTR ERVL -320 281 3 7 1932 1170 167 35 17 chr2 176560436 176560668 -5187419 - ORR1A4 LTR MaLR -1 328 93 7 1932 702 203 14 14 chr2 176560668 176560808 -5187279 + RLTR46 LTR ERVK 1 140 -180 7 1932 553 203 55 48 chr2 176561028 176561182 -5186905 - ORR1A4 LTR MaLR -182 177 1 7 1932 3083 102 125 21 chr2 176561503 176562014 -5186073 + LTRIS2 LTR ERV1 1 564 0 7 1932 3028 79 12 5 chr2 176562525 176562943 -5185144 + BGLII LTR ERVK 1 421 0 8 1932 2923 43 0 0 chr2 176564881 176565227 -5182860 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 8 1932 2223 184 74 48 chr2 176567326 176567852 -5180235 - RLTR25A LTR ERVK -420 683 144 8 1932 282 204 0 0 chr2 176567977 176568026 -5180061 + RLTR25A LTR ERVK 512 560 -543 9 1932 743 269 108 48 chr2 176568084 176568334 -5179753 - RLTR41 LTR ERV1 -181 265 1 9 1932 817 310 31 0 chr2 176571715 176571944 -5176143 + MTE-int LTR MaLR 1109 1344 -236 1 1932 868 288 102 15 chr2 176572010 176572345 -5175742 + ORR1D1 LTR MaLR 1 364 -10 1 1932 3121 59 93 20 chr2 176573337 176573786 -5174301 + RLTR45 LTR ERVK 1 482 0 1 1932 24900 41 14 5 chr2 176573786 176576964 -5171123 + RLTR45-int LTR ERVK 1 3205 -4039 1 1932 19850 38 25 0 chr2 176576953 176578285 -5169802 + RLTR45-int LTR ERVK 3385 4761 -2483 1 1932 19850 42 33 0 chr2 176578337 176580753 -5167334 + RLTR45-int LTR ERVK 4762 7244 0 1 1932 3223 77 59 4 chr2 176580753 176581210 -5166877 + RLTR45 LTR ERVK 1 482 0 1 1932 2550 184 36 29 chr2 176581210 176581788 -5166299 + RLTR25A LTR ERVK 522 1103 0 9 1932 715 339 63 4 chr2 176582079 176582334 -5165753 + MTE-int LTR MaLR 1075 1344 -236 1 1932 659 262 44 15 chr2 176582404 176582609 -5165478 + ORR1D1 LTR MaLR 3 213 -161 1 1932 1592 190 106 5 chr2 176583443 176583830 -5164257 - RMER17B LTR ERVK 0 958 533 1 1932 759 246 23 110 chr2 176584471 176584690 -5163397 - RLTR26 LTR ERVK 0 642 443 1 1932 705 217 6 24 chr2 176589942 176590112 -5157975 + RMER10A LTR ERVL 271 437 -5 1 1932 852 109 36 7 chr2 176597149 176597288 -5150799 + MTA_Mm LTR MaLR 258 400 0 1 1932 6420 128 30 11 chr2 176597288 176598366 -5149721 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 1 1932 2951 66 8 20 chr2 176598366 176598767 -5149320 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1932 253 130 0 169 chr2 176598859 176598924 -5149163 - RLTR33 LTR ERVK -172 506 453 1 1932 1664 279 85 6 chr2 176599233 176599753 -5148334 + RLTR20B1 LTR ERVK 3 563 0 1 1932 1013 181 20 10 chr2 176601396 176601591 -5146496 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 250 1 1932 1720 135 12 59 chr2 176601614 176601974 -5146113 + RMER16-int LTR ERVK 2993 3299 -2107 1 1932 1418 86 5 0 chr2 176601974 176602171 -5145916 + RLTR13C2 LTR ERVK 1 198 -610 1 1932 1661 66 0 46 chr2 176602371 176602609 -5145478 + RLTR13C2 LTR ERVK 184 410 -398 1 1932 491 163 0 11 chr2 176602615 176602708 -5145379 + RMER16-int LTR ERVK 3018 3109 -2297 1 1932 2580 158 6 4 chr2 176603293 176603777 -5144310 + RMER16-int LTR ERVK 3099 3583 -1823 1 1932 889 324 37 40 chr2 176603828 176604150 -5143937 + MTE2a LTR MaLR 42 362 -17 1 1932 272 312 20 40 chr2 176604497 176604597 -5143490 + RMER15 LTR ERVL 293 390 -185 1 1932 362 247 0 76 chr2 176604786 176604878 -5143209 + MTEb LTR MaLR 294 378 -1 1 1932 2361 98 3 65 chr2 176611163 176611532 -5136555 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 1 1932 4017 197 61 40 chr2 176611538 176612468 -5135619 + RLTR25A LTR ERVK 154 1103 0 1 1932 631 207 80 0 chr2 176612550 176612700 -5135387 - RLTR25A LTR ERVK -656 447 286 1 1932 806 344 35 10 chr2 176612903 176613191 -5134896 + MTE-int LTR MaLR 1047 1341 -239 1 1932 918 272 115 21 chr2 176613260 176613590 -5134497 + ORR1D1 LTR MaLR 1 361 -13 1 1932 1055 247 94 12 chr2 176617325 176617645 -5130442 + RMER10A LTR ERVL 91 436 -6 1 1932 1900 242 86 10 chr2 176632634 176633155 -5114932 - RLTR20B1 LTR ERVK 0 563 3 1 1932 238 265 15 0 chr2 176633199 176633267 -5114820 + RLTR19C LTR ERVK 25 93 -413 1 1932 2802 108 68 3 chr2 176633510 176633986 -5114101 + RLTR1C LTR ERV1 1 605 0 1 1932 2833 63 2 112 chr2 176634105 176634425 -5113662 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 108 1 1932 2833 63 2 112 chr2 176634571 176634695 -5113392 - MTA_Mm LTR MaLR -289 107 1 1 1932 6854 107 29 9 chr2 176634695 176634794 -5113293 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1005 1 1932 2859 29 18 0 chr2 176634794 176635134 -5112953 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 1 1932 6854 107 29 9 chr2 176635134 176636111 -5111976 - MTA_Mm-int LTR MaLR -94 1004 1 1 1932 911 99 14 7 chr2 176636111 176636253 -5111834 - MTA_Mm LTR MaLR 0 400 258 1 1932 2529 59 225 0 chr2 176640917 176641273 -5106814 + RLTR10C LTR ERVK 1 436 0 1 1932 679 229 6 24 chr2 176642571 176642741 -5105346 - RMER10A LTR ERVL -5 437 271 1 1932 737 170 26 0 chr2 176643778 176643931 -5104156 + RLTR22_Mur LTR ERVK 676 832 -1016 1 1932 317 282 23 12 chr2 176644117 176644203 -5103884 + RMER12 LTR ERVK 1102 1188 -134 1 1932 1660 270 53 64 chr2 176651233 176651418 -5096669 - RLTR20A LTR ERVK 0 541 358 1 1932 1660 270 53 64 chr2 176651616 176651630 -5096457 - RLTR20A LTR ERVK -184 357 357 1 1932 1660 270 53 64 chr2 176651775 176652120 -5095967 - RLTR20A LTR ERVK -184 357 2 1 1932 1099 160 48 0 chr2 176653903 176654109 -5093978 - RMER16-int LTR ERVK -1876 3530 3315 2 1932 5003 86 35 62 chr2 176654125 176654736 -5093351 - RLTR13C2 LTR ERVK -21 787 190 2 1932 5003 86 35 62 chr2 176654918 176655115 -5092972 - RLTR13C2 LTR ERVK -619 189 1 2 1932 3527 151 7 31 chr2 176655115 176655791 -5092296 - RMER16-int LTR ERVK -2083 3323 2664 2 1932 4898 132 1 31 chr2 176658275 176659036 -5089051 - RLTR22_Mus LTR ERVK -997 811 65 2 1932 4898 132 1 31 chr2 176659214 176659288 -5088799 - RLTR22_Mus LTR ERVK -1744 64 1 2 1932 643 354 66 7 chr2 176659323 176659610 -5088477 + MTE-int LTR MaLR 1038 1341 -239 2 1932 299 163 20 0 chr2 176659680 176659729 -5088358 + ORR1D2 LTR MaLR 1 50 -324 2 1932 404 301 145 36 chr2 176659951 176660172 -5087915 + ORR1D2 LTR MaLR 126 370 0 2 1932 2252 231 61 4 chr2 176663357 176663882 -5084205 + RLTR20B1 LTR ERVK 1 555 -8 2 1932 885 187 19 34 chr2 176665118 176665323 -5082764 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 6 207 -2119 2 1932 2013 196 78 117 chr2 176665323 176665497 -5082590 - RMER16 LTR ERVK 0 533 400 2 1932 2013 196 78 117 chr2 176666038 176666418 -5081669 - RMER16 LTR ERVK -134 399 2 2 1932 2789 223 43 37 chr2 176666420 176667146 -5080941 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 204 933 -1393 2 1932 4514 211 70 8 chr2 176667141 176668332 -5079755 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 1058 2322 -4 2 1932 468 277 71 0 chr2 176668338 176668450 -5079637 + RLTR20B1 LTR ERVK 1 120 -443 2 1932 1371 203 45 109 chr2 176668580 176669000 -5079087 + RLTR9C LTR ERVK 1 393 0 2 1932 6494 132 23 74 chr2 176669003 176670234 -5077853 + ETnERV2-int LTR ERVK 2 1169 -3675 2 1932 2681 136 34 55 chr2 176670232 176670895 -5077192 + ETnERV2-int LTR ERVK 1721 2190 -2654 2 1932 7050 154 14 25 chr2 176671379 176674144 -5073943 + ETnERV2-int LTR ERVK 2354 7203 -203 2 1932 333 230 158 8 chr2 176674146 176674273 -5073814 + RLTR13B1 LTR ERVK 155 300 -593 2 1932 267 156 138 15 chr2 176674297 176674362 -5073725 + RLTR13B1 LTR ERVK 459 531 -371 2 1932 486 114 0 12 chr2 176674366 176674446 -5073641 + ETnERV2-int LTR ERVK 7327 7405 -1 2 1932 1257 200 96 106 chr2 176674446 176674843 -5073244 + RLTR9C LTR ERVK 1 393 0 2 1932 374 243 58 0 chr2 176675315 176675418 -5072669 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 262 2 1932 1688 192 3 59 chr2 176677444 176677782 -5070305 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 2 1932 876 255 21 75 chr2 176678257 176678537 -5069550 + ORR1D1 LTR MaLR 3 267 -107 2 1932 622 258 35 35 chr2 176678571 176678768 -5069319 - RMER6B LTR ERVK -11 450 254 2 1932 3352 87 48 4 chr2 176678780 176679242 -5068845 - RLTR45 LTR ERVK 0 482 1 2 1932 6013 59 106 0 chr2 176679242 176680005 -5068082 - RLTR45-int LTR ERVK 0 7244 6401 2 1932 239 278 35 119 chr2 176680005 176680148 -5067939 + LTR50 LTR ERVL 136 266 -529 2 1932 607 345 31 31 chr2 176680148 176680564 -5067523 - RNERVK23-int LTR ERVK -673 7544 7129 2 1932 2659 69 0 18 chr2 176680654 176680991 -5067096 - RLTR45-int LTR ERVK -5596 1648 1318 2 1932 525 250 50 25 chr2 176681346 176681506 -5066581 - RNERVK23-int LTR ERVK -1859 6358 6195 2 1932 3119 319 59 47 chr2 176681842 176684863 -5063224 - RNERVK23-int LTR ERVK -2469 5748 2339 2 1933 821 122 0 0 chr2 176685223 176685346 -5062741 - RLTR45-int LTR ERVK -6212 1032 910 2 1933 1774 64 0 0 chr2 176685462 176685681 -5062406 - RLTR45-int LTR ERVK -6334 910 692 2 1933 261 289 0 0 chr2 176685743 176685826 -5062261 - RLTR45-int LTR ERVK -4987 1494 1412 2 1933 1117 49 0 40 chr2 176686037 176686187 -5061900 - RLTR45-int LTR ERVK -6552 692 549 2 1933 4162 93 3 22 chr2 176686933 176687515 -5060572 - RLTR45-int LTR ERVK -6673 571 1 2 1933 3423 83 50 4 chr2 176687515 176687976 -5060111 - RLTR45 LTR ERVK 0 482 1 2 1933 877 153 97 29 chr2 176687977 176688152 -5059935 - RMER6B LTR ERVK -273 188 2 2 1933 313 216 53 95 chr2 176688152 176688272 -5059815 + ORR1D2 LTR MaLR 262 377 -2 2 1933 906 303 29 101 chr2 176688638 176689016 -5059071 + MTE2a LTR MaLR 1 351 -28 2 1933 282 349 58 36 chr2 176689373 176689510 -5058577 + RMER15 LTR ERVL 275 414 -161 2 1933 229 347 71 0 chr2 176689642 176689740 -5058347 + MTEb LTR MaLR 170 274 -105 2 1933 330 260 97 52 chr2 176689804 176689938 -5058149 + MTEb LTR MaLR 240 379 0 2 1933 933 201 84 4 chr2 176692294 176692519 -5055568 - MuRRS4-int LTR ERV1 -33 5030 4788 2 1933 686 333 63 43 chr2 176692510 176692777 -5055310 - MuRRS4-int LTR ERV1 -792 4271 3996 2 1933 4115 112 22 48 chr2 176692777 176693380 -5054707 + LTRIS_Mus LTR ERV1 1 587 0 2 1933 686 333 63 43 chr2 176693380 176693526 -5054561 - MuRRS4-int LTR ERV1 -1068 3995 3850 2 1933 5758 119 10 3 chr2 176694495 176695388 -5052699 - MTB-int LTR MaLR -198 900 2 2 1933 896 120 7 14 chr2 176695389 176695533 -5052554 - MTB LTR MaLR 0 400 258 2 1933 1751 264 88 8 chr2 176697847 176698358 -5049729 - RLTR20B1 LTR ERVK -9 554 3 2 1933 239 148 0 169 chr2 176698670 176698735 -5049352 + RLTR33 LTR ERVK 453 506 -172 2 1933 3152 63 5 20 chr2 176698823 176699225 -5048862 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 1933 7443 115 15 4 chr2 176699225 176700311 -5047776 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 2 1933 875 101 28 14 chr2 176700311 176700452 -5047635 - MTA_Mm LTR MaLR 0 400 258 2 1933 498 274 45 50 chr2 176705731 176706046 -5042041 - RMER10A LTR ERVL -5 437 89 2 1933 839 199 0 126 chr2 176711156 176711346 -5036741 + RLTR26 LTR ERVK 477 642 0 2 1933 1706 183 98 3 chr2 176711987 176712376 -5035711 + RMER17B LTR ERVK 533 958 0 2 1933 501 306 40 142 chr2 176713136 176713376 -5034711 - MT2A LTR ERVL -10 591 383 2 1933 590 290 24 57 chr2 176713404 176713661 -5034426 - MT2A LTR ERVL -219 382 1 2 1933 629 272 44 5 chr2 176713992 176714195 -5033892 - ORR1D1 LTR MaLR -161 213 3 2 1933 707 305 73 26 chr2 176714229 176714520 -5033567 - ORR1D1-int LTR MaLR -236 1344 1049 2 1933 4713 189 56 31 chr2 176714811 176715870 -5032217 - RLTR25A LTR ERVK 0 1103 19 2 1933 882 233 53 112 chr2 176715827 176716112 -5031975 - RLTR41 LTR ERV1 -117 329 62 2 1933 1691 213 31 209 chr2 176716166 176716707 -5031380 - RLTR41 LTR ERV1 -1 445 1 2 1933 975 261 129 24 chr2 176717949 176718283 -5029804 - ORR1D1 LTR MaLR -5 369 1 2 1933 775 319 26 4 chr2 176718350 176718580 -5029507 - MTE-int LTR MaLR -236 1344 1110 2 1933 536 274 73 31 chr2 176731415 176731660 -5016427 - RLTR20B1 LTR ERVK -318 223 3 2 1933 271 250 15 0 chr2 176731704 176731772 -5016315 + RLTR19C LTR ERVK 25 93 -413 2 1933 242 148 0 169 chr2 176731975 176732040 -5016047 + RLTR33 LTR ERVK 453 506 -172 2 1933 2785 82 18 10 chr2 176732433 176732826 -5015261 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 1933 7197 106 10 14 chr2 176732826 176733928 -5014159 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 2 1933 873 109 7 14 chr2 176734154 176734293 -5013794 - MTB LTR MaLR -5 395 258 2 1933 2182 81 21 45 chr2 176734899 176735234 -5012853 + IAPLTR2b LTR ERVK 1 327 0 2 1933 953 84 7 14 chr2 176740673 176740817 -5007270 + MTA_Mm LTR MaLR 258 400 0 3 1933 7154 107 17 4 chr2 176740820 176741901 -5006186 + MTA_Mm-int LTR MaLR 4 1098 0 3 1933 2761 96 2 10 chr2 176741901 176742300 -5005787 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 1933 251 250 15 0 chr2 176742640 176742708 -5005379 - RLTR19C LTR ERVK -413 93 25 3 1933 1839 246 90 12 chr2 176742757 176743267 -5004820 + RLTR20B1 LTR ERVK 3 552 -11 3 1933 2464 76 68 29 chr2 176744099 176744450 -5003637 + RLTR10B2 LTR ERVK 1 365 0 3 1933 4118 115 14 77 chr2 176748754 176749536 -4998551 - RMER17A LTR ERVK -18 733 1 3 1933 2851 206 87 28 chr2 176751929 176753385 -4994702 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 6 1545 -3861 3 1933 237 310 0 0 chr2 176753387 176753445 -4994642 + ORR1B1 LTR MaLR 151 208 -186 3 1933 1591 181 7 0 chr2 176755475 176755752 -4992335 - MT2B LTR ERVL -320 281 3 3 1933 1170 167 35 17 chr2 176756290 176756522 -4991565 - ORR1A4 LTR MaLR -1 328 93 3 1933 702 203 14 14 chr2 176756522 176756662 -4991425 + RLTR46 LTR ERVK 1 140 -180 3 1933 553 203 55 48 chr2 176756882 176757036 -4991051 - ORR1A4 LTR MaLR -182 177 1 3 1933 3069 104 125 21 chr2 176757357 176757868 -4990219 + LTRIS2 LTR ERV1 1 564 0 3 1933 3015 82 12 5 chr2 176758379 176758797 -4989290 + BGLII LTR ERVK 1 421 0 3 1933 2923 43 0 0 chr2 176760735 176761081 -4987006 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 3 1933 2243 182 76 51 chr2 176763179 176763706 -4984381 - RLTR25A LTR ERVK -420 683 144 3 1933 282 204 0 0 chr2 176763798 176763847 -4984240 + RLTR25A LTR ERVK 512 560 -543 3 1933 743 269 108 48 chr2 176763907 176764157 -4983930 - RLTR41 LTR ERV1 -181 265 1 3 1933 759 296 35 144 chr2 176773965 176774194 -4973893 + ORR1D1-int LTR MaLR 1109 1317 -192 3 1933 903 282 102 15 chr2 176774260 176774595 -4973492 + ORR1D1 LTR MaLR 1 364 -10 3 1933 3181 54 92 16 chr2 176775576 176776024 -4972063 + RLTR45 LTR ERVK 1 482 0 3 1933 20502 38 6 4 chr2 176776024 176779211 -4968876 + RLTR45-int LTR ERVK 1 3205 -4039 3 1933 28665 39 29 24 chr2 176779189 176780530 -4967557 + RLTR45-int LTR ERVK 3380 4761 -2483 3 1933 28665 39 29 24 chr2 176780576 176783080 -4965007 + RLTR45-int LTR ERVK 4762 7243 -1 3 1933 3256 72 59 4 chr2 176783080 176783537 -4964550 + RLTR45 LTR ERVK 1 482 0 3 1933 2545 182 36 29 chr2 176783537 176784115 -4963972 + RLTR25A LTR ERVK 522 1103 0 3 1933 695 309 73 26 chr2 176784406 176784697 -4963390 + ORR1D1-int LTR MaLR 1049 1344 -236 3 1933 659 262 44 15 chr2 176784731 176784936 -4963151 + ORR1D1 LTR MaLR 3 213 -161 3 1933 1623 189 103 3 chr2 176785771 176786158 -4961929 - RMER17B LTR ERVK 0 958 533 3 1933 759 246 23 110 chr2 176786799 176787018 -4961069 - RLTR26 LTR ERVK 0 642 443 3 1933 689 223 6 24 chr2 176792260 176792430 -4955657 + RMER10A LTR ERVL 271 437 -5 3 1933 852 109 36 7 chr2 176798713 176798852 -4949235 + MTA_Mm LTR MaLR 258 400 0 3 1933 6455 128 30 11 chr2 176798852 176799930 -4948157 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 3 1933 2933 69 8 20 chr2 176799930 176800331 -4947756 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 1933 253 130 0 169 chr2 176800423 176800488 -4947599 - RLTR33 LTR ERVK -172 506 453 3 1933 1701 272 85 6 chr2 176800797 176801314 -4946773 + RLTR20B1 LTR ERVK 3 560 -3 3 1933 1006 186 20 10 chr2 176802962 176803157 -4944930 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 250 3 1933 1769 137 6 52 chr2 176803180 176803527 -4944560 + RMER16-int LTR ERVK 2993 3323 -2083 3 1933 1399 91 5 0 chr2 176803527 176803724 -4944363 + RLTR13C2 LTR ERVK 1 198 -610 3 1933 1643 75 0 34 chr2 176803925 176804160 -4943927 + RLTR13C2 LTR ERVK 184 410 -398 3 1933 551 153 0 10 chr2 176804166 176804265 -4943822 + RMER16-int LTR ERVK 3018 3115 -2291 3 1933 2580 158 6 4 chr2 176804862 176805346 -4942741 + RMER16-int LTR ERVK 3099 3583 -1823 3 1933 826 330 37 40 chr2 176805397 176805719 -4942368 + MTE2a LTR MaLR 42 362 -17 3 1933 272 312 20 40 chr2 176806066 176806166 -4941921 + RMER15 LTR ERVL 293 390 -185 3 1933 362 247 0 76 chr2 176806358 176806450 -4941637 + MTEb LTR MaLR 294 378 -1 3 1933 2291 99 3 99 chr2 176812735 176813118 -4934969 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 3 1933 4021 199 60 40 chr2 176813124 176814055 -4934032 + RLTR25A LTR ERVK 154 1103 0 3 1933 631 207 80 0 chr2 176814137 176814287 -4933800 - RLTR25A LTR ERVK -656 447 286 3 1933 806 344 35 10 chr2 176814490 176814778 -4933309 + MTE-int LTR MaLR 1047 1341 -239 3 1933 918 272 115 21 chr2 176814847 176815177 -4932910 + ORR1D1 LTR MaLR 1 361 -13 3 1934 1055 247 94 12 chr2 176818955 176819275 -4928812 + RMER10A LTR ERVL 91 436 -6 4 1934 1872 246 86 10 chr2 176834276 176834797 -4913290 - RLTR20B1 LTR ERVK 0 563 3 4 1934 225 279 15 0 chr2 176834841 176834909 -4913178 + RLTR19C LTR ERVK 25 93 -413 4 1934 2790 111 68 3 chr2 176835152 176835628 -4912459 + RLTR1C LTR ERV1 1 605 0 4 1934 2747 68 2 126 chr2 176835745 176836065 -4912022 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 108 4 1934 2747 68 2 126 chr2 176836207 176836338 -4911749 - MTA_Mm LTR MaLR -289 107 1 4 1934 6859 108 29 9 chr2 176836338 176836437 -4911650 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1005 4 1934 2875 29 18 0 chr2 176836437 176836777 -4911310 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 4 1934 6859 108 29 9 chr2 176836777 176837754 -4910333 - MTA_Mm-int LTR MaLR -94 1004 1 4 1934 911 99 14 7 chr2 176837754 176837896 -4910191 - MTA_Mm LTR MaLR 0 400 258 4 1934 704 217 6 24 chr2 176843520 176843690 -4904397 - RMER10A LTR ERVL -5 437 271 4 1934 765 163 26 0 chr2 176844727 176844880 -4903207 + RLTR22_Mur LTR ERVK 676 832 -1016 4 1934 281 291 23 11 chr2 176845065 176845152 -4902935 + RMER12 LTR ERVK 1101 1188 -134 4 1934 1423 283 25 119 chr2 176852055 176852306 -4895781 - RLTR20A LTR ERVK 0 541 313 4 1934 1423 283 25 119 chr2 176852453 176852798 -4895289 - RLTR20A LTR ERVK -229 312 1 4 1934 1146 147 62 13 chr2 176854551 176854778 -4893309 - RMER16-int LTR ERVK -1849 3557 3320 4 1934 5319 85 6 53 chr2 176854780 176855431 -4892656 - RLTR13C2 LTR ERVK 0 983 190 4 1934 5319 76 2 55 chr2 176855612 176855809 -4892278 - RLTR13C2 LTR ERVK -619 189 1 4 1934 5225 157 11 7 chr2 176855809 176856784 -4891303 - RMER16-int LTR ERVK -2083 3323 2345 4 1934 3111 190 26 21 chr2 176856855 176857533 -4890554 - RMER16-int LTR ERVK -3121 2285 1604 4 1934 340 325 35 29 chr2 176858063 176858234 -4889853 - SRV_MM-int LTR ERVK -4043 2124 1953 4 1934 273 291 25 12 chr2 176860204 176860284 -4887803 - RMER12 LTR ERVK -141 1181 1101 4 1934 4780 126 27 28 chr2 176860481 176861243 -4886844 - RLTR22_Mus LTR ERVK -983 825 62 4 1934 4780 126 27 28 chr2 176861434 176861497 -4886590 - RLTR22_Mus LTR ERVK -1747 61 1 4 1934 657 342 72 4 chr2 176861532 176861811 -4886276 + MTE-int LTR MaLR 1038 1335 -245 4 1934 311 157 20 0 chr2 176861889 176861940 -4886147 + ORR1D1 LTR MaLR 1 52 -322 4 1934 429 254 174 16 chr2 176862191 176862375 -4885712 + ORR1D1 LTR MaLR 154 366 -8 4 1934 1275 32 0 0 chr2 176862638 176862796 -4885291 + MERVL-int LTR ERVL 2147 2304 -3181 4 1934 2412 24 3 0 chr2 176862796 176863085 -4885002 - MT2_Mm LTR ERVL -203 290 1 4 1934 302 0 0 0 chr2 176863085 176863123 -4884964 - MERVL-int LTR ERVL 0 5485 5448 4 1934 399 123 13 40 chr2 176863123 176863199 -4884888 - ORR1A3-int LTR MaLR -1323 640 567 4 1934 889 34 8 0 chr2 176863199 176863318 -4884769 - MERVL-int LTR ERVL -114 5371 5252 4 1934 907 113 7 14 chr2 176872711 176872855 -4875232 + MTA_Mm LTR MaLR 258 400 0 4 1934 6557 125 24 5 chr2 176872855 176873932 -4874155 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 4 1934 2939 64 8 20 chr2 176873932 176874333 -4873754 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 1934 518 253 95 12 chr2 176875011 176875179 -4872908 + RLTR20B1 LTR ERVK 3 184 -376 4 1934 2268 227 71 13 chr2 176875422 176875954 -4872133 - RLTR20B1 LTR ERVK 0 563 1 4 1934 229 227 30 0 chr2 176875990 176876056 -4872031 + RLTR19C LTR ERVK 26 93 -413 4 1934 256 209 37 44 chr2 176876245 176876319 -4871768 + RMER17A LTR ERVK 339 413 -338 4 1934 256 209 37 44 chr2 176876466 176876526 -4871561 + RMER17A LTR ERVK 414 472 -279 4 1934 1033 256 96 9 chr2 176893234 176893557 -4854530 - RMER10A LTR ERVL -6 436 86 4 1934 2077 166 46 13 chr2 176894818 176894839 -4853248 - RLTR1 LTR ERV1 0 624 597 4 1934 2077 171 45 19 chr2 176894886 176895317 -4852770 - RLTR1 LTR ERV1 -28 596 135 4 1934 405 325 133 33 chr2 176896810 176897020 -4851067 - ORR1D2 LTR MaLR -5 365 135 4 1934 290 196 20 0 chr2 176897239 176897290 -4850797 - ORR1D2 LTR MaLR -322 52 1 4 1934 704 349 45 4 chr2 176897370 176897635 -4850452 - MTE-int LTR MaLR -245 1335 1060 4 1934 4758 114 72 3 chr2 176897687 176898462 -4849625 + RLTR22_Mus LTR ERVK 3 831 -977 4 1934 387 313 43 38 chr2 176898652 176898838 -4849249 + RMER12 LTR ERVK 1101 1287 -35 4 1934 1512 234 42 26 chr2 176899124 176899502 -4848585 - RLTR25B LTR ERVK 0 1028 645 4 1934 1635 186 9 77 chr2 176899555 176899904 -4848183 + ORR1A2 LTR MaLR 1 325 -2 5 1934 389 241 77 65 chr2 176904398 176904567 -4843520 + RLTR13D3 LTR ERVK 944 1114 0 5 1934 481 63 0 0 chr2 176905977 176906040 -4842047 + MTB LTR MaLR 338 400 0 5 1934 236 118 0 177 chr2 176906129 176906191 -4841896 - RLTR33 LTR ERVK -172 506 456 5 1934 234 242 45 0 chr2 176906588 176906654 -4841433 - RLTR19C LTR ERVK -413 93 25 5 1934 614 254 52 6 chr2 176906698 176906872 -4841215 + RLTR20B1 LTR ERVK 3 184 -376 5 1934 2293 230 62 4 chr2 176907115 176907647 -4840440 - RLTR20B1 LTR ERVK 0 563 1 5 1934 235 209 29 15 chr2 176907682 176907750 -4840337 + RLTR19C LTR ERVK 25 93 -413 5 1934 233 185 0 143 chr2 176908169 176908232 -4839855 + RLTR33 LTR ERVK 453 506 -172 5 1934 929 280 60 9 chr2 176915764 176916111 -4831976 + RLTR20A LTR ERVK 1 388 -175 5 1934 287 302 23 11 chr2 176919776 176919863 -4828224 - RMER12 LTR ERVK -134 1188 1101 5 1934 765 163 26 0 chr2 176920048 176920201 -4827886 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1016 832 676 5 1934 704 217 6 24 chr2 176921238 176921408 -4826679 + RMER10A LTR ERVL 271 437 -5 5 1934 911 99 14 7 chr2 176927108 176927250 -4820837 + MTA_Mm LTR MaLR 258 400 0 5 1934 6872 108 29 8 chr2 176927250 176928226 -4819861 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1004 -94 5 1934 2936 21 18 0 chr2 176928226 176928566 -4819521 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 5 1934 6872 108 29 8 chr2 176928566 176928665 -4819422 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1005 1098 0 5 1934 2805 66 2 112 chr2 176928665 176928789 -4819298 + MTA_Mm LTR MaLR 1 107 -289 5 1934 2805 66 2 112 chr2 176928935 176929255 -4818832 + MTA_Mm LTR MaLR 108 396 0 5 1934 2786 113 68 3 chr2 176929374 176929850 -4818237 - RLTR1C LTR ERV1 0 605 1 5 1934 238 265 15 0 chr2 176930093 176930161 -4817926 - RLTR19C LTR ERVK -413 93 25 5 1934 1896 242 86 10 chr2 176930205 176930726 -4817361 + RLTR20B1 LTR ERVK 3 563 0 5 1934 2136 93 65 20 chr2 176941299 176941650 -4806437 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 5 241 48948 25 2 2 chr2 176941650 176948097 -4799990 + IAPEz-int LTR ERVK 8 6478 -3 5 1935 2304 93 65 20 chr2 176948101 176948452 -4799635 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 5 1935 1031 250 94 12 chr2 176955768 176956088 -4791999 - RMER10A LTR ERVL -6 436 91 5 1935 883 272 115 21 chr2 176959832 176960162 -4787925 - ORR1D1 LTR MaLR -13 361 1 5 1935 758 347 35 10 chr2 176960231 176960519 -4787568 - MTE-int LTR MaLR -239 1341 1047 5 1935 610 213 80 0 chr2 176960717 176960867 -4787220 + RLTR25A LTR ERVK 286 447 -656 5 1935 3949 199 61 40 chr2 176960949 176961879 -4786208 - RLTR25A LTR ERVK 0 1103 154 5 1935 2466 113 27 0 chr2 176961885 176962165 -4785922 + ORR1A1 LTR MaLR 1 280 -66 5 1935 2466 113 27 0 chr2 176962202 176962258 -4785829 + ORR1A1 LTR MaLR 281 344 -2 5 1935 358 247 0 76 chr2 176968699 176968791 -4779296 - MTEb LTR MaLR -1 378 294 5 1935 277 312 20 40 chr2 176968979 176969079 -4779008 - RMER15 LTR ERVL -185 390 293 5 1935 818 330 37 40 chr2 176969426 176969748 -4778339 - MTE2a LTR MaLR -17 362 42 5 1935 2796 160 6 4 chr2 176969799 176970283 -4777804 - RMER16-int LTR ERVK -1823 3583 3099 5 1935 599 153 0 10 chr2 176970880 176970979 -4777108 - RMER16-int LTR ERVK -2291 3115 3018 5 1935 2618 81 2 146 chr2 176970985 176971266 -4776821 - RLTR13C2 LTR ERVK -398 410 190 5 1935 2618 81 2 146 chr2 176971447 176971644 -4776443 - RLTR13C2 LTR ERVK -619 189 1 5 1935 1898 146 6 52 chr2 176971644 176971991 -4776096 - RMER16-int LTR ERVK -2083 3323 2993 5 1935 1009 186 20 10 chr2 176972014 176972209 -4775878 + RLTR41 LTR ERV1 250 446 0 5 1935 1672 273 85 6 chr2 176973853 176974373 -4773714 - RLTR20B1 LTR ERVK 0 563 3 6 1935 250 130 0 169 chr2 176974682 176974747 -4773340 + RLTR33 LTR ERVK 453 506 -172 6 1935 3189 61 8 20 chr2 176974838 176975239 -4772848 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 1935 6948 128 30 11 chr2 176975239 176976317 -4771770 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 6 1935 850 109 36 7 chr2 176976317 176976456 -4771631 - MTA_Mm LTR MaLR 0 400 258 6 1935 698 217 6 24 chr2 176982488 176982658 -4765429 - RMER10A LTR ERVL -5 437 271 6 1935 3751 20 0 0 chr2 176982942 176983338 -4764749 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 1935 10201 17 1 0 chr2 176983338 176984435 -4763652 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 6 1935 3713 23 0 0 chr2 176984435 176984831 -4763256 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 1935 815 236 23 110 chr2 176989775 176989994 -4758093 + RLTR26 LTR ERVK 443 642 0 6 1935 1647 191 98 3 chr2 176990635 176991024 -4757063 + RMER17B LTR ERVK 533 958 0 6 1935 887 296 90 85 chr2 176991784 176992304 -4755783 - MT2A LTR ERVL -10 523 1 6 1935 502 235 70 88 chr2 176992635 176992850 -4755237 - ORR1D1 LTR MaLR -161 213 3 6 1935 710 333 59 4 chr2 176992920 176993176 -4754911 - MTE-int LTR MaLR -236 1344 1075 6 1935 4681 181 63 30 chr2 176993463 176994514 -4753573 - RLTR25A LTR ERVK 0 1103 19 6 1935 895 229 53 112 chr2 176994471 176994756 -4753331 - RLTR41 LTR ERV1 -117 329 62 6 1935 1676 210 31 213 chr2 176994810 176995354 -4752733 - RLTR41 LTR ERV1 -1 445 1 6 1935 935 282 102 9 chr2 176996709 176997042 -4751045 - ORR1D1 LTR MaLR -10 364 1 6 1935 779 328 26 0 chr2 176997108 176997337 -4750750 - MTE-int LTR MaLR -236 1344 1110 6 1935 1835 247 88 10 chr2 177006636 177007156 -4740931 - RLTR20B1 LTR ERVK 0 563 3 4 1935 246 233 17 0 chr2 177007208 177007268 -4740819 + RLTR19C LTR ERVK 33 93 -413 5 1935 2740 132 68 5 chr2 177007507 177007981 -4740106 + RLTR1C LTR ERV1 1 507 0 6 1935 2895 71 4 128 chr2 177008104 177008426 -4739661 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 108 8 1935 2895 71 4 128 chr2 177008572 177008701 -4739386 - MTA_Mm LTR MaLR -289 107 1 8 1935 8021 92 16 4 chr2 177008701 177009786 -4738301 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 8 1935 884 106 14 7 chr2 177009786 177009928 -4738159 - MTA_Mm LTR MaLR 0 400 258 8 1935 574 231 42 36 chr2 177015628 177015794 -4732293 - RMER10A LTR ERVL -5 437 271 1 1935 256 184 0 0 chr2 177015891 177015940 -4732147 - RMER10A LTR ERVL -305 137 89 1 1935 754 120 8 0 chr2 177016827 177016952 -4731135 + RLTR22_Mur LTR ERVK 676 801 -1047 1 1935 295 282 25 13 chr2 177017162 177017241 -4730846 + RMER12 LTR ERVK 1102 1181 -141 2 1935 742 204 21 129 chr2 177020303 177020489 -4727598 + RLTR26 LTR ERVK 477 642 0 2 1935 1044 199 138 15 chr2 177021141 177021401 -4726686 + RMER17B LTR ERVK 533 824 -134 2 1935 49018 56 17 12 chr2 177021401 177026072 -4722015 + IAPEz-int LTR ERVK 355 5054 -1427 2 1935 49018 56 17 12 chr2 177026264 177027689 -4720398 + IAPEz-int LTR ERVK 5055 6481 0 2 1935 2721 44 25 6 chr2 177027689 177028008 -4720079 + IAPLTR2b LTR ERVK 1 325 -2 2 1935 234 191 0 0 chr2 177028010 177028052 -4720035 - RLTR25A LTR ERVK -1043 60 19 2 1935 856 184 27 0 chr2 177028048 177028195 -4719892 - RLTR41 LTR ERV1 -155 291 141 2 1935 625 229 82 22 chr2 177028441 177028624 -4719463 - RMER10A LTR ERVL -5 437 244 2 1935 3582 25 82 179 chr2 177035624 177036293 -4711794 + RLTR6_Mm LTR ERV1 1 604 -50 3 1935 4363 57 12 13 chr2 177036294 177037086 -4711001 + RLTR6-int LTR ERV1 1 829 -6949 3 1935 390 179 118 40 chr2 177037080 177037232 -4710855 + MMVL30-int LTR ERV1 280 533 -7023 3 1935 24022 30 30 17 chr2 177037580 177040469 -4707618 + MMVL30-int LTR ERV1 772 3698 0 3 1935 3450 23 85 185 chr2 177040469 177041119 -4706968 + RLTR6_Mm LTR ERV1 1 585 -69 3 1935 1352 276 40 101 chr2 177041589 177041732 -4706355 - RLTR20A LTR ERVK 0 541 404 3 1935 1352 276 40 101 chr2 177041920 177041986 -4706101 - RLTR20A LTR ERVK -138 403 345 3 1935 1352 276 40 101 chr2 177042133 177042152 -4705935 - RLTR20A LTR ERVK -197 344 324 3 1935 1352 276 40 101 chr2 177042307 177042652 -4705435 - RLTR20A LTR ERVK -218 323 2 3 1935 1168 127 70 15 chr2 177044435 177044635 -4703452 - RMER16-int LTR ERVK -1876 3530 3320 4 1935 4175 84 6 17 chr2 177044637 177045269 -4702818 - RLTR13C2 LTR ERVK 0 983 184 4 1935 340 82 0 0 chr2 177045485 177045534 -4702553 - RLTR13C2 LTR ERVK -759 49 1 4 1935 2150 142 5 49 chr2 177045534 177045920 -4702167 - RMER16-int LTR ERVK -2083 3323 2955 5 1935 6392 121 14 5 chr2 177045920 177046938 -4701149 + MTA_Mm-int LTR MaLR 72 1098 0 5 1935 3169 59 8 20 chr2 177046938 177047339 -4700748 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 1935 578 241 88 12 chr2 177048026 177048186 -4699901 + RLTR20B1 LTR ERVK 3 174 -389 5 1935 1405 227 81 22 chr2 177048442 177048802 -4699285 - RLTR20B1 LTR ERVK -4 559 179 5 1935 402 281 166 18 chr2 177059104 177059334 -4688753 - ORR1D1 LTR MaLR 0 370 112 7 1935 264 204 20 0 chr2 177059550 177059599 -4688488 - ORR1D1 LTR MaLR -334 50 1 7 1935 643 354 75 14 chr2 177059676 177059957 -4688130 - MTE-int LTR MaLR -245 1335 1038 7 1935 4906 134 5 30 chr2 177059992 177060066 -4688021 + RLTR22_Mus LTR ERVK 1 63 -1745 7 1935 4906 134 5 30 chr2 177060244 177061015 -4687072 + RLTR22_Mus LTR ERVK 64 825 -983 7 1935 281 282 25 13 chr2 177061213 177061292 -4686795 + RMER12 LTR ERVK 1102 1181 -141 7 1935 254 352 47 41 chr2 177063253 177063422 -4684665 + SRV_MM-int LTR ERVK 1955 2124 -4043 7 1935 10232 165 27 12 chr2 177063753 177065708 -4682379 + RMER16-int LTR ERVK 1566 3557 -1849 8 1935 7793 39 2 2 chr2 177065708 177066637 -4681450 + RLTR13B3 LTR ERVK 1 929 0 8 1935 10232 165 27 12 chr2 177066637 177066668 -4681419 + RMER16-int LTR ERVK 3558 3583 -1823 8 1935 735 309 51 90 chr2 177066719 177066920 -4681167 + MTE2a LTR MaLR 42 237 -142 8 1935 735 309 51 90 chr2 177067104 177067236 -4680851 + MTE2a LTR MaLR 238 362 -17 8 1935 237 344 20 40 chr2 177067582 177067682 -4680405 + RMER15 LTR ERVL 293 390 -185 8 1935 500 270 46 56 chr2 177068022 177068191 -4679896 + MTEb LTR MaLR 205 378 -1 8 1935 2446 81 6 39 chr2 177074509 177074867 -4673220 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 9 1935 3992 194 63 38 chr2 177074873 177075800 -4672287 + RLTR25A LTR ERVK 154 1103 0 9 1935 742 363 53 14 chr2 177076085 177076440 -4671647 + MTE-int LTR MaLR 1040 1408 -172 9 1935 900 276 113 21 chr2 177076440 177076777 -4671310 + ORR1D1 LTR MaLR 2 369 -5 9 1936 280 282 25 13 chr2 177080199 177080278 -4667809 - RMER12 LTR ERVK -141 1181 1102 1 1936 3289 132 6 82 chr2 177080473 177080567 -4667520 - RLTR22_Mus LTR ERVK -983 825 733 1 1936 3289 132 6 82 chr2 177080662 177081200 -4666887 - RLTR22_Mus LTR ERVK -1076 732 241 1 1936 419 186 20 10 chr2 177084774 177084872 -4663215 + RLTR25A LTR ERVK 1005 1103 0 1 1936 669 333 59 4 chr2 177085162 177085418 -4662669 + MTE-int LTR MaLR 1075 1344 -236 1 1936 624 287 44 19 chr2 177085486 177085692 -4662395 + ORR1D1 LTR MaLR 3 213 -161 1 1936 398 298 49 7 chr2 177086023 177086165 -4661922 + MT2A LTR ERVL 1 148 -385 1 1936 911 265 18 81 chr2 177086360 177086643 -4661444 + ORR1D1 LTR MaLR 4 268 -106 1 1936 918 217 58 43 chr2 177086673 177087056 -4661031 - RMER6B LTR ERVK -11 450 1 1 1936 299 162 133 11 chr2 177087059 177087159 -4660928 + ORR1D1 LTR MaLR 246 380 -14 1 1936 868 338 43 40 chr2 177087532 177087930 -4660157 + MTE2a LTR MaLR 1 402 -17 1 1936 270 346 51 36 chr2 177088269 177088407 -4659680 + RMER15 LTR ERVL 275 414 -161 1 1936 347 250 82 111 chr2 177088686 177088821 -4659266 + MTEb LTR MaLR 236 366 -13 1 1936 691 224 85 5 chr2 177091278 177091489 -4656598 - MuRRS4-int LTR ERV1 -33 5030 4803 1 1936 672 313 26 51 chr2 177091532 177091758 -4656329 - MuRRS4-int LTR ERV1 -851 4212 3996 1 1936 3913 106 22 48 chr2 177091758 177092361 -4655726 + LTRIS_Mus LTR ERV1 1 587 0 1 1936 672 313 26 51 chr2 177092361 177092525 -4655562 - MuRRS4-int LTR ERV1 -1068 3995 3832 1 1936 1818 260 89 6 chr2 177095324 177095842 -4652245 - RLTR20B1 LTR ERVK 0 563 3 1 1936 235 265 15 0 chr2 177095886 177095954 -4652133 + RLTR19C LTR ERVK 25 93 -413 1 1936 253 130 0 169 chr2 177096154 177096219 -4651868 + RLTR33 LTR ERVK 453 506 -172 1 1936 2855 57 12 30 chr2 177096307 177096708 -4651379 - MTA_Mm LTR MaLR -2 394 1 1 1936 6620 126 18 4 chr2 177096708 177097790 -4650297 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 2 1 1936 906 113 7 14 chr2 177097791 177097935 -4650152 - MTA_Mm LTR MaLR 0 400 258 1 1936 652 235 6 24 chr2 177104187 177104357 -4643730 - RMER10A LTR ERVL -5 437 271 1 1936 413 291 149 40 chr2 177110938 177111160 -4636927 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 125 1 1936 726 340 68 0 chr2 177111487 177111766 -4636321 - MTE-int LTR MaLR -245 1335 1038 1 1936 4859 134 6 30 chr2 177111801 177111875 -4636212 + RLTR22_Mus LTR ERVK 1 63 -1745 1 1936 4859 134 6 30 chr2 177112053 177112823 -4635264 + RLTR22_Mus LTR ERVK 64 825 -983 1 1936 258 287 199 27 chr2 177112914 177113100 -4634987 + RMER12 LTR ERVK 964 1181 -141 1 1936 321 327 47 41 chr2 177115270 177115439 -4632648 + SRV_MM-int LTR ERVK 1955 2124 -4043 1 1936 7667 162 34 13 chr2 177115703 177117215 -4630872 + RMER16-int LTR ERVK 1566 3109 -2297 1 1936 2630 155 2 4 chr2 177117836 177118322 -4629765 + RMER16-int LTR ERVK 3099 3583 -1823 1 1936 898 343 28 34 chr2 177118373 177118696 -4629391 + MTE2b LTR MaLR 42 362 -17 1 1936 246 333 20 40 chr2 177119043 177119143 -4628944 + RMER15 LTR ERVL 293 390 -185 1 1936 447 272 45 55 chr2 177119515 177119655 -4628432 + MTEb LTR MaLR 212 362 -17 1 1936 2344 102 6 28 chr2 177125926 177126280 -4621807 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 1 1936 3952 196 63 38 chr2 177126488 177127410 -4620677 + RLTR25A LTR ERVK 159 1103 0 1 1936 766 363 53 14 chr2 177127705 177128060 -4620027 + MTE-int LTR MaLR 1040 1408 -172 1 1936 902 282 107 15 chr2 177128061 177128399 -4619688 + ORR1D1 LTR MaLR 1 369 -5 1 1936 273 291 25 12 chr2 177130382 177130462 -4617625 - RMER12 LTR ERVK -141 1181 1101 1 1936 3302 124 2 86 chr2 177130676 177130753 -4617334 - RLTR22_Mus LTR ERVK -1002 806 732 1 1936 3302 124 2 86 chr2 177130844 177131384 -4616703 - RLTR22_Mus LTR ERVK -1077 731 241 1 1936 878 281 92 18 chr2 177141868 177142194 -4605893 + RMER10A LTR ERVL 91 440 -2 1 1936 832 199 34 28 chr2 177150853 177151029 -4597058 + RLTR41 LTR ERV1 1 177 -269 2 1936 1373 225 42 11 chr2 177151111 177151394 -4596693 + RLTR41 LTR ERV1 154 445 -1 2 1936 920 232 48 116 chr2 177151448 177151741 -4596346 + RLTR41 LTR ERV1 62 334 -112 2 1936 4581 197 58 31 chr2 177151693 177152750 -4595337 + RLTR25A LTR ERVK 19 1103 0 2 1936 711 349 50 19 chr2 177153040 177153361 -4594726 + MTE-int LTR MaLR 1075 1405 -175 2 1936 625 279 48 29 chr2 177153365 177153572 -4594515 + ORR1D1 LTR MaLR 3 213 -161 2 1936 332 322 47 20 chr2 177153903 177154052 -4594035 + MT2A LTR ERVL 2 154 -379 2 1936 841 265 18 84 chr2 177154240 177154524 -4593563 + ORR1D1 LTR MaLR 4 268 -106 2 1936 857 226 60 43 chr2 177154567 177154953 -4593134 - RMER6B LTR ERVK -10 451 1 2 1936 300 216 50 50 chr2 177154953 177155056 -4593031 + ORR1D1 LTR MaLR 262 367 -12 2 1936 928 321 86 58 chr2 177155436 177155834 -4592253 + MTE2a LTR MaLR 1 402 -17 2 1936 359 296 58 50 chr2 177156174 177156313 -4591774 + RMER15 LTR ERVL 275 414 -161 2 1936 288 256 73 119 chr2 177156581 177156732 -4591355 + MTEb LTR MaLR 236 379 0 2 1936 1729 277 45 21 chr2 177159785 177160313 -4587774 + RLTR20A LTR ERVK 1 541 0 2 1936 624 283 48 28 chr2 177161111 177161355 -4586732 - LTRIS4 LTR ERV1 0 519 285 2 1936 298 76 3 0 chr2 177161574 177161625 -4586462 - MuRRS4-int LTR ERV1 0 7778 7737 2 1936 898 297 0 0 chr2 177161838 177162107 -4585980 - MuRRS4-int LTR ERV1 -158 4905 4637 2 1936 1650 111 43 35 chr2 177162108 177162472 -4585615 - LTRIS3 LTR ERV1 -165 347 3 2 1936 722 217 78 5 chr2 177162475 177162693 -4585394 - MuRRS4-int LTR ERV1 -42 5021 4788 2 1936 2154 243 22 31 chr2 177162706 177162946 -4585141 - MuRRS4-int LTR ERV1 -836 4227 3992 2 1936 2592 117 218 55 chr2 177162946 177163451 -4584636 + LTRIS_Mus LTR ERV1 1 587 0 2 1936 2154 243 22 31 chr2 177163451 177163856 -4584231 - MuRRS4-int LTR ERV1 -1072 3991 3588 2 1936 1752 277 81 2 chr2 177168001 177168521 -4579566 - RLTR20B1 LTR ERVK 0 563 3 2 1936 253 130 0 169 chr2 177168830 177168895 -4579192 + RLTR33 LTR ERVK 453 506 -172 2 1936 3029 51 8 20 chr2 177168974 177169375 -4578712 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 1936 6838 118 15 5 chr2 177169375 177170462 -4577625 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 2 1936 958 90 7 34 chr2 177170462 177170611 -4577476 - MTA_Mm LTR MaLR 0 400 256 2 1936 496 267 75 45 chr2 177176225 177176542 -4571545 - RMER10A LTR ERVL -5 437 89 2 1936 783 211 0 126 chr2 177181688 177181878 -4566209 + RLTR26 LTR ERVK 477 642 0 2 1936 1595 189 101 3 chr2 177182519 177182896 -4565191 + RMER17B LTR ERVK 533 946 -12 2 1936 546 343 96 46 chr2 177183667 177183907 -4564180 - MT2A LTR ERVL -10 523 254 2 1936 589 299 38 34 chr2 177183932 177184189 -4563898 - MT2A LTR ERVL -280 253 1 2 1936 515 248 60 79 chr2 177184563 177184778 -4563309 - ORR1D1 LTR MaLR -161 213 3 2 1936 758 323 62 8 chr2 177184848 177185104 -4562983 - MTE-int LTR MaLR -236 1344 1075 2 1936 4756 185 58 31 chr2 177185394 177186451 -4561636 - RLTR25A LTR ERVK 0 1103 19 2 1936 878 235 52 112 chr2 177186403 177186690 -4561397 - RLTR41 LTR ERV1 -112 334 65 2 1936 1455 220 32 203 chr2 177186747 177187284 -4560803 - RLTR41 LTR ERV1 -1 445 1 2 1936 1004 266 126 21 chr2 177188510 177188844 -4559243 - ORR1D1 LTR MaLR -5 369 1 2 1936 776 323 26 4 chr2 177188911 177189141 -4558946 - MTE-int LTR MaLR -236 1344 1110 2 1936 506 282 74 24 chr2 177201713 177201920 -4546167 - RLTR20B1 LTR ERVK -358 219 3 2 1936 271 250 15 0 chr2 177201964 177202032 -4546055 + RLTR19C LTR ERVK 25 93 -413 2 1936 242 148 0 169 chr2 177202235 177202300 -4545787 + RLTR33 LTR ERVK 453 506 -172 2 1936 2891 69 18 10 chr2 177202694 177203087 -4545000 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 1936 7174 108 10 14 chr2 177203087 177204189 -4543898 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 2 1936 873 109 7 14 chr2 177204410 177204549 -4543538 - MTB LTR MaLR -5 395 258 2 1937 953 84 7 14 chr2 177210286 177210430 -4537657 + MTA_Mm LTR MaLR 258 400 0 2 1937 7051 111 18 3 chr2 177210433 177211512 -4536575 + MTA_Mm-int LTR MaLR 4 1098 0 2 1937 2784 94 2 10 chr2 177211512 177211911 -4536176 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 1937 251 250 15 0 chr2 177212253 177212321 -4535766 - RLTR19C LTR ERVK -413 93 25 2 1937 1881 240 90 12 chr2 177212370 177212880 -4535207 + RLTR20B1 LTR ERVK 3 552 -11 2 1937 2498 70 68 29 chr2 177213710 177214061 -4534026 + RLTR10B2 LTR ERVK 1 365 0 2 1937 4142 115 18 75 chr2 177218364 177219141 -4528946 - RMER17A LTR ERVK -18 733 1 2 1937 2881 205 87 29 chr2 177221539 177222995 -4525092 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 6 1545 -3861 2 1937 237 310 0 0 chr2 177222997 177223055 -4525032 + ORR1B1 LTR MaLR 151 208 -186 2 1937 1595 181 7 0 chr2 177225073 177225350 -4522737 - MT2B LTR ERVL -320 281 3 2 1937 1186 167 35 17 chr2 177225885 177226117 -4521970 - ORR1A4 LTR MaLR -1 328 93 3 1937 702 203 14 14 chr2 177226117 177226257 -4521830 + RLTR46 LTR ERVK 1 140 -180 3 1937 300 316 40 56 chr2 177226301 177226499 -4521588 + RLTR46 LTR ERVK 126 320 0 3 1937 534 213 51 45 chr2 177226499 177226631 -4521456 - ORR1A4 LTR MaLR -245 149 1 3 1937 3091 102 125 21 chr2 177226952 177227463 -4520624 + LTRIS2 LTR ERV1 1 564 0 3 1937 3040 77 12 5 chr2 177227974 177228392 -4519695 + BGLII LTR ERVK 1 421 0 3 1937 2886 43 3 0 chr2 177230330 177230675 -4517412 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 3 1937 2232 184 76 48 chr2 177232775 177233300 -4514787 - RLTR25A LTR ERVK -420 683 144 3 1937 282 204 0 0 chr2 177233394 177233443 -4514644 + RLTR25A LTR ERVK 512 560 -543 3 1937 743 269 108 48 chr2 177233499 177233749 -4514338 - RLTR41 LTR ERV1 -181 265 1 3 1937 849 312 22 0 chr2 177237134 177237365 -4510722 + MTE-int LTR MaLR 1109 1344 -236 3 1937 912 254 122 36 chr2 177237431 177237766 -4510321 + ORR1D1 LTR MaLR 1 364 -10 3 1937 3101 68 91 22 chr2 177238754 177239205 -4508882 + RLTR45 LTR ERVK 1 482 0 3 1937 24955 38 16 8 chr2 177239205 177242385 -4505702 + RLTR45-int LTR ERVK 1 3205 -4039 3 1937 19337 34 19 1 chr2 177242374 177243730 -4504357 + RLTR45-int LTR ERVK 3385 4745 -2499 3 1937 19337 34 19 1 chr2 177243771 177244902 -4503185 + RLTR45-int LTR ERVK 4746 5914 -1330 3 1937 10285 36 41 0 chr2 177245594 177246886 -4501201 + RLTR45-int LTR ERVK 5900 7244 0 3 1937 3188 71 64 4 chr2 177246886 177247341 -4500746 + RLTR45 LTR ERVK 1 482 0 3 1937 2479 186 40 33 chr2 177247342 177247919 -4500168 + RLTR25A LTR ERVK 523 1103 0 3 1937 682 346 63 4 chr2 177248208 177248463 -4499624 + MTE-int LTR MaLR 1075 1344 -236 3 1937 636 272 39 24 chr2 177248531 177248738 -4499349 + ORR1D1 LTR MaLR 4 213 -161 3 1937 1641 189 104 0 chr2 177249573 177249959 -4498128 - RMER17B LTR ERVK 0 958 533 3 1937 839 199 0 126 chr2 177250606 177250796 -4497291 - RLTR26 LTR ERVK 0 642 477 3 1937 309 282 23 12 chr2 177253847 177253933 -4494154 - RMER12 LTR ERVK -134 1188 1102 3 1937 731 164 33 0 chr2 177254119 177254271 -4493816 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1016 832 676 3 1937 720 211 6 24 chr2 177255309 177255479 -4492608 + RMER10A LTR ERVL 271 437 -5 3 1937 1917 127 258 29 chr2 177256939 177257392 -4490695 + RLTR6_Mm LTR ERV1 37 593 -61 3 1937 895 106 14 7 chr2 177262478 177262620 -4485467 + MTA_Mm LTR MaLR 258 400 0 3 1937 7191 99 16 8 chr2 177262620 177263609 -4484478 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1004 -94 3 1937 2955 26 9 0 chr2 177263609 177263952 -4484135 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 3 1937 7191 99 16 8 chr2 177263952 177264051 -4484036 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1005 1098 0 3 1937 2781 61 5 122 chr2 177264051 177264182 -4483905 + MTA_Mm LTR MaLR 1 107 -289 3 1937 2781 61 5 122 chr2 177264329 177264646 -4483441 + MTA_Mm LTR MaLR 108 396 0 3 1937 2785 111 68 3 chr2 177264765 177265241 -4482846 - RLTR1C LTR ERV1 0 605 1 3 1937 268 217 17 0 chr2 177265492 177265552 -4482535 - RLTR19C LTR ERVK -413 93 33 3 1937 1840 248 86 10 chr2 177265604 177266125 -4481962 + RLTR20B1 LTR ERVK 3 563 0 3 1937 802 317 27 0 chr2 177276839 177277063 -4471024 + MTE-int LTR MaLR 1115 1344 -236 3 1937 1001 256 122 24 chr2 177277129 177277465 -4470622 + ORR1D1 LTR MaLR 1 369 -5 3 1937 1686 215 32 203 chr2 177278710 177279247 -4468840 + RLTR41 LTR ERV1 1 445 -1 3 1937 922 232 49 112 chr2 177279301 177279587 -4468500 + RLTR41 LTR ERV1 62 329 -117 3 1937 4814 178 56 31 chr2 177279544 177280603 -4467484 + RLTR25A LTR ERVK 19 1103 0 3 1937 699 331 63 4 chr2 177280894 177281149 -4466938 + MTE-int LTR MaLR 1075 1344 -236 3 1937 474 237 67 91 chr2 177281225 177281434 -4466653 + ORR1D1 LTR MaLR 10 213 -161 3 1937 874 297 95 83 chr2 177281765 177282282 -4465805 + MT2A LTR ERVL 1 523 -10 3 1937 1620 189 103 3 chr2 177283042 177283429 -4464658 - RMER17B LTR ERVK 0 958 533 3 1937 792 205 0 126 chr2 177284070 177284260 -4463827 - RLTR26 LTR ERVK 0 642 477 3 1937 600 212 43 24 chr2 177289494 177289658 -4458429 + RMER10A LTR ERVL 271 437 -5 3 1937 932 99 7 14 chr2 177295444 177295588 -4452499 + MTA_Mm LTR MaLR 258 400 0 3 1937 7261 122 26 9 chr2 177295588 177296668 -4451419 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 3 1937 3101 69 8 18 chr2 177296668 177297068 -4451019 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 1937 250 130 0 169 chr2 177297155 177297220 -4450867 - RLTR33 LTR ERVK -172 506 453 3 1937 1770 269 85 2 chr2 177297529 177298047 -4450040 + RLTR20B1 LTR ERVK 3 563 0 3 1937 2139 263 40 28 chr2 177302219 177302608 -4445479 + MuRRS4-int LTR ERV1 3588 3995 -1068 3 1937 4205 105 27 29 chr2 177302608 177303196 -4444891 - LTRIS_Mus LTR ERV1 0 587 1 3 1937 2139 263 40 28 chr2 177303196 177303439 -4444648 + MuRRS4-int LTR ERV1 3996 4227 -836 3 1937 904 207 78 5 chr2 177303452 177303670 -4444417 + MuRRS4-int LTR ERV1 4788 5021 -42 3 1937 1617 113 43 35 chr2 177303673 177304037 -4444050 + LTRIS3 LTR ERV1 3 347 -165 3 1937 1022 278 11 11 chr2 177304038 177304311 -4443776 + MuRRS4-int LTR ERV1 4637 4909 -154 3 1937 320 76 3 0 chr2 177304558 177304609 -4443478 + MuRRS4-int LTR ERV1 7737 7778 0 3 1937 544 285 25 12 chr2 177304859 177305019 -4443068 + LTRIS4 LTR ERV1 285 446 -61 3 1937 14316 118 58 47 chr2 177305019 177309099 -4438988 - RLTR45-int LTR ERVK -3126 4118 1 3 1937 3825 60 32 2 chr2 177309099 177309567 -4438520 - RLTR45 LTR ERVK 0 482 1 3 1937 355 284 97 52 chr2 177309646 177309780 -4438307 - MTEb LTR MaLR 0 379 240 3 1937 235 326 71 10 chr2 177309844 177309943 -4438144 - MTEb LTR MaLR -105 274 170 3 1937 275 336 66 37 chr2 177310075 177310211 -4437876 - RMER15 LTR ERVL -161 414 275 3 1937 515 326 30 40 chr2 177310556 177310757 -4437330 - MTE2b LTR MaLR -14 365 167 3 1937 1900 249 84 8 chr2 177322867 177323388 -4424699 - RLTR20B1 LTR ERVK 0 563 3 4 1937 266 217 17 0 chr2 177323440 177323500 -4424587 + RLTR19C LTR ERVK 33 93 -413 4 1937 2753 132 68 5 chr2 177323743 177324217 -4423870 + RLTR1C LTR ERV1 1 507 0 4 1937 2957 66 4 124 chr2 177324351 177324671 -4423416 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 108 4 1937 2957 66 4 124 chr2 177324817 177324946 -4423141 - MTA_Mm LTR MaLR -289 107 1 4 1937 7918 94 16 5 chr2 177324946 177326032 -4422055 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 4 1937 881 106 14 7 chr2 177326032 177326174 -4421913 - MTA_Mm LTR MaLR 0 400 258 4 1937 296 282 25 13 chr2 177327357 177327436 -4420651 + RMER12 LTR ERVK 1102 1181 -141 4 1937 775 212 5 127 chr2 177330497 177330686 -4417401 + RLTR26 LTR ERVK 477 642 0 4 1937 1024 203 138 15 chr2 177331338 177331598 -4416489 + RMER17B LTR ERVK 533 824 -134 4 1937 44037 52 17 7 chr2 177331598 177336267 -4411820 + IAPEz-int LTR ERVK 355 5054 -1427 4 1937 44037 50 15 6 chr2 177336458 177337882 -4410205 + IAPEz-int LTR ERVK 5055 6481 0 4 1937 2546 44 25 6 chr2 177337882 177338201 -4409886 + IAPLTR2b LTR ERVK 1 325 -2 4 1937 233 191 0 0 chr2 177338203 177338245 -4409842 - RLTR25A LTR ERVK -1043 60 19 4 1937 852 227 28 11 chr2 177338210 177338388 -4409699 - RLTR41 LTR ERV1 -125 321 141 4 1937 630 229 82 27 chr2 177338634 177338818 -4409269 - RMER10A LTR ERVL -5 437 244 4 1938 1565 267 56 83 chr2 177346273 177346416 -4401671 - RLTR20A LTR ERVK 0 541 404 4 1938 1565 267 56 83 chr2 177346604 177346670 -4401417 - RLTR20A LTR ERVK -138 403 358 4 1938 1565 267 56 83 chr2 177346825 177347170 -4400917 - RLTR20A LTR ERVK -184 357 1 4 1938 1054 132 70 15 chr2 177348954 177349154 -4398933 - RMER16-int LTR ERVK -1876 3530 3320 4 1938 4193 83 6 17 chr2 177349156 177349788 -4398299 - RLTR13C2 LTR ERVK 0 983 184 4 1938 315 122 0 0 chr2 177350004 177350053 -4398034 - RLTR13C2 LTR ERVK -759 49 1 4 1938 1948 144 5 49 chr2 177350053 177350439 -4397648 - RMER16-int LTR ERVK -2083 3323 2955 4 1938 6434 120 14 5 chr2 177350439 177351457 -4396630 + MTA_Mm-int LTR MaLR 72 1098 0 4 1938 2948 61 8 20 chr2 177351457 177351858 -4396229 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 1938 228 148 0 169 chr2 177352163 177352228 -4395859 - RLTR33 LTR ERVK -172 506 453 4 1938 580 241 88 12 chr2 177352542 177352702 -4395385 + RLTR20B1 LTR ERVK 3 174 -389 4 1938 1414 227 78 19 chr2 177352958 177353318 -4394769 - RLTR20B1 LTR ERVK -4 559 179 4 1938 402 281 166 18 chr2 177364980 177365210 -4382877 - ORR1D1 LTR MaLR 0 370 112 4 1938 264 204 20 0 chr2 177365425 177365474 -4382613 - ORR1D1 LTR MaLR -334 50 1 4 1938 642 369 68 7 chr2 177365552 177365833 -4382254 - MTE-int LTR MaLR -245 1335 1038 4 1938 4976 130 5 30 chr2 177365868 177365942 -4382145 + RLTR22_Mus LTR ERVK 1 63 -1745 4 1938 4976 130 5 30 chr2 177366120 177366891 -4381196 + RLTR22_Mus LTR ERVK 64 825 -983 4 1938 281 282 25 13 chr2 177367089 177367168 -4380919 + RMER12 LTR ERVK 1102 1181 -141 4 1938 253 207 0 49 chr2 177369139 177369200 -4378887 + RNERVK23-int LTR ERVK 2373 2430 -5787 4 1938 10247 164 27 12 chr2 177369632 177371587 -4376500 + RMER16-int LTR ERVK 1566 3557 -1849 4 1938 7779 40 2 2 chr2 177371587 177372516 -4375571 + RLTR13B3 LTR ERVK 1 929 0 4 1938 10247 164 27 12 chr2 177372516 177372547 -4375540 + RMER16-int LTR ERVK 3558 3583 -1823 4 1938 725 309 51 95 chr2 177372598 177372801 -4375286 + MTE2a LTR MaLR 42 237 -142 4 1938 725 309 51 95 chr2 177372985 177373117 -4374970 + MTE2a LTR MaLR 238 362 -17 4 1938 248 340 20 40 chr2 177373463 177373564 -4374523 + RMER15 LTR ERVL 292 390 -185 4 1938 500 270 46 56 chr2 177373908 177374077 -4374010 + MTEb LTR MaLR 205 378 -1 4 1938 2445 84 6 31 chr2 177380382 177380737 -4367350 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 4 1938 4021 193 63 38 chr2 177380743 177381670 -4366417 + RLTR25A LTR ERVK 154 1103 0 4 1938 719 366 53 14 chr2 177381965 177382320 -4365767 + MTE-int LTR MaLR 1040 1408 -172 4 1938 880 281 112 21 chr2 177382321 177382659 -4365428 + ORR1D1 LTR MaLR 1 369 -5 4 1938 280 282 25 13 chr2 177386098 177386177 -4361910 - RMER12 LTR ERVK -141 1181 1102 4 1938 3267 136 17 84 chr2 177386363 177386467 -4361620 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1016 832 722 4 1938 3267 136 17 84 chr2 177386572 177387111 -4360976 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1127 721 232 4 1938 2894 23 54 3 chr2 177389180 177389529 -4358558 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 4 1938 29287 21 1 2 chr2 177389543 177392806 -4355281 - IAPEz-int LTR ERVK -13 6468 3210 4 1938 7737 76 107 12 chr2 177392805 177393994 -4354093 - IAPEz-int LTR ERVK -5168 1313 67 4 1938 973 124 77 0 chr2 177393965 177394134 -4353953 - IAPEz-int LTR ERVK -6285 196 15 4 1938 2894 23 54 3 chr2 177394141 177394490 -4353597 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 4 1938 387 186 20 10 chr2 177395991 177396089 -4351998 + RLTR25A LTR ERVK 1005 1103 0 5 1938 580 331 62 8 chr2 177396379 177396635 -4351452 + MTE-int LTR MaLR 1075 1344 -236 5 1938 540 275 53 29 chr2 177396703 177396909 -4351178 + ORR1D1 LTR MaLR 3 213 -161 5 1938 315 305 49 7 chr2 177397240 177397382 -4350705 + MT2A LTR ERVL 1 148 -385 5 1938 805 265 18 81 chr2 177397577 177397860 -4350227 + ORR1D1 LTR MaLR 4 268 -106 5 1938 842 204 208 33 chr2 177397890 177398273 -4349814 - RMER6B LTR ERVK -11 450 1 5 1938 268 135 162 0 chr2 177398298 177398372 -4349715 + ORR1D1 LTR MaLR 295 380 -14 5 1938 246 122 0 0 chr2 177398749 177398790 -4349297 + MTE2a LTR MaLR 1 41 -338 5 1938 3091 102 125 21 chr2 177449146 177449657 -4298430 - LTRIS2 LTR ERV1 0 564 1 5 1938 553 201 51 45 chr2 177449978 177450110 -4297977 + ORR1A4 LTR MaLR 1 149 -245 5 1938 300 316 40 56 chr2 177450110 177450308 -4297779 - RLTR46 LTR ERVK 0 320 126 5 1938 696 210 14 14 chr2 177450352 177450492 -4297595 - RLTR46 LTR ERVK -180 140 1 5 1938 1186 167 35 17 chr2 177450492 177450724 -4297363 + ORR1A4 LTR MaLR 93 328 -1 5 1938 1595 181 7 0 chr2 177451262 177451539 -4296548 + MT2B LTR ERVL 3 281 -320 5 1938 237 310 0 0 chr2 177453590 177453648 -4294439 - ORR1B1 LTR MaLR -186 208 151 5 1938 2843 205 86 28 chr2 177453650 177455106 -4292981 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -3861 1545 6 5 1938 4107 112 15 82 chr2 177457499 177458284 -4289803 + RMER17A LTR ERVK 1 733 -18 5 1938 2536 65 68 29 chr2 177462585 177462936 -4285151 - RLTR10B2 LTR ERVK 0 365 1 5 1938 1862 231 92 8 chr2 177463797 177464276 -4283811 - RLTR20B1 LTR ERVK -42 521 3 5 1938 251 250 15 0 chr2 177464325 177464393 -4283694 + RLTR19C LTR ERVK 25 93 -413 5 1938 2784 94 2 10 chr2 177464734 177465133 -4282954 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 1938 7040 112 18 3 chr2 177465133 177466212 -4281875 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 4 5 1938 953 84 7 14 chr2 177466215 177466359 -4281728 - MTA_Mm LTR MaLR 0 400 258 5 1939 873 109 7 14 chr2 177472463 177472602 -4275485 + MTB LTR MaLR 258 395 -5 5 1939 7216 106 10 14 chr2 177472798 177473900 -4274187 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 5 1939 2879 69 18 10 chr2 177473900 177474293 -4273794 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 1939 242 148 0 169 chr2 177474686 177474751 -4273336 - RLTR33 LTR ERVK -172 506 453 5 1939 271 250 15 0 chr2 177474954 177475022 -4273065 - RLTR19C LTR ERVK -413 93 25 5 1939 526 276 75 12 chr2 177475066 177475271 -4272816 + RLTR20B1 LTR ERVK 3 219 -358 5 1939 776 323 26 4 chr2 177487842 177488072 -4260015 + MTE-int LTR MaLR 1110 1344 -236 5 1939 992 269 126 21 chr2 177488139 177488473 -4259614 + ORR1D1 LTR MaLR 1 369 -5 5 1939 860 199 34 28 chr2 177489723 177489899 -4258188 + RLTR41 LTR ERV1 1 177 -269 5 1939 1321 232 42 11 chr2 177489977 177490260 -4257827 + RLTR41 LTR ERV1 154 445 -1 5 1939 907 228 52 112 chr2 177490317 177490604 -4257483 + RLTR41 LTR ERV1 65 334 -112 5 1939 4770 186 56 29 chr2 177490556 177491613 -4256474 + RLTR25A LTR ERVK 19 1103 0 5 1939 758 323 62 8 chr2 177491904 177492160 -4255927 + MTE-int LTR MaLR 1075 1344 -236 5 1939 524 242 60 79 chr2 177492230 177492445 -4255642 + ORR1D1 LTR MaLR 3 213 -161 5 1939 589 299 38 34 chr2 177492819 177493076 -4255011 + MT2A LTR ERVL 1 253 -280 5 1939 552 343 96 46 chr2 177493101 177493341 -4254746 + MT2A LTR ERVL 254 523 -10 5 1939 1618 193 98 3 chr2 177494100 177494489 -4253598 - RMER17B LTR ERVK 0 958 533 5 1939 813 193 0 126 chr2 177495130 177495320 -4252767 - RLTR26 LTR ERVK 0 642 477 5 1939 486 291 82 47 chr2 177500464 177500781 -4247306 + RMER10A LTR ERVL 89 437 -5 1 1939 968 83 7 34 chr2 177506395 177506544 -4241543 + MTA_Mm LTR MaLR 256 400 0 6 1939 6858 117 15 5 chr2 177506544 177507631 -4240456 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 6 1939 3029 51 8 20 chr2 177507631 177508032 -4240055 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 1939 253 130 0 169 chr2 177508111 177508176 -4239911 - RLTR33 LTR ERVK -172 506 453 7 1939 1762 276 81 2 chr2 177508485 177509005 -4239082 + RLTR20B1 LTR ERVK 3 563 0 8 1939 2181 241 22 31 chr2 177513136 177513541 -4234546 + MuRRS4-int LTR ERV1 3588 3991 -1072 1 1939 2553 119 218 55 chr2 177513541 177514046 -4234041 - LTRIS_Mus LTR ERV1 0 587 1 1 1939 2181 241 22 31 chr2 177514046 177514286 -4233801 + MuRRS4-int LTR ERV1 3992 4227 -836 1 1939 722 217 78 5 chr2 177514299 177514517 -4233570 + MuRRS4-int LTR ERV1 4788 5021 -42 1 1939 1667 107 43 35 chr2 177514520 177514884 -4233203 + LTRIS3 LTR ERV1 3 347 -165 1 1939 909 297 0 0 chr2 177514885 177515158 -4232929 + MuRRS4-int LTR ERV1 4637 4909 -154 1 1939 298 76 3 0 chr2 177515357 177515408 -4232679 + MuRRS4-int LTR ERV1 7737 7778 0 1 1939 624 283 48 28 chr2 177515632 177515876 -4232211 + LTRIS4 LTR ERV1 285 519 0 1 1939 1737 283 48 19 chr2 177516674 177517200 -4230887 - RLTR20A LTR ERVK 0 541 1 1 1939 288 256 73 119 chr2 177520239 177520390 -4227697 - MTEb LTR MaLR 0 379 236 2 1939 359 296 58 50 chr2 177520658 177520797 -4227290 - RMER15 LTR ERVL -161 414 275 2 1939 900 334 43 40 chr2 177521137 177521535 -4226552 - MTE2a LTR MaLR -17 402 1 3 1939 301 245 62 62 chr2 177521915 177522018 -4226069 - ORR1D1 LTR MaLR -10 364 262 3 1939 866 216 63 40 chr2 177522018 177522401 -4225686 + RMER6B LTR ERVK 1 451 -10 3 1939 842 273 18 81 chr2 177522448 177522731 -4225356 - ORR1D1 LTR MaLR -106 268 4 3 1939 364 313 47 20 chr2 177522919 177523069 -4225018 - MT2A LTR ERVL -379 154 1 3 1939 647 274 48 29 chr2 177523399 177523606 -4224481 - ORR1D1 LTR MaLR -161 213 3 3 1939 732 346 49 16 chr2 177523624 177523932 -4224155 - MTE-int LTR MaLR -188 1392 1075 3 1939 4568 194 59 32 chr2 177524222 177525279 -4222808 - RLTR25A LTR ERVK 0 1103 19 4 1939 931 232 48 116 chr2 177525231 177525524 -4222563 - RLTR41 LTR ERV1 -112 334 62 4 1939 1514 210 31 209 chr2 177525578 177526119 -4221968 - RLTR41 LTR ERV1 -1 445 1 4 1939 871 280 97 10 chr2 177534768 177535078 -4213009 - RMER10A LTR ERVL -15 427 91 4 1939 3260 138 8 73 chr2 177545548 177546080 -4202007 + RLTR22_Mus LTR ERVK 241 732 -1076 6 1939 3260 138 8 73 chr2 177546172 177546265 -4201822 + RLTR22_Mus LTR ERVK 733 825 -983 6 1939 273 291 25 12 chr2 177546463 177546543 -4201544 + RMER12 LTR ERVK 1101 1181 -141 6 1939 902 282 107 15 chr2 177548540 177548878 -4199209 - ORR1D1 LTR MaLR -5 369 1 6 1939 786 345 59 0 chr2 177548947 177549234 -4198853 - MTE-int LTR MaLR -237 1343 1040 6 1939 3945 197 63 38 chr2 177549535 177550457 -4197630 - RLTR25A LTR ERVK 0 1103 159 7 1939 2367 99 6 28 chr2 177550653 177551007 -4197080 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 7 1939 435 281 45 55 chr2 177557281 177557421 -4190666 - MTEb LTR MaLR -17 362 212 8 1939 242 344 20 40 chr2 177557798 177557898 -4190189 - RMER15 LTR ERVL -185 390 293 8 1939 826 346 28 37 chr2 177558245 177558569 -4189518 - MTE2b LTR MaLR -17 362 42 8 1939 2885 153 2 4 chr2 177558620 177559106 -4188981 - RMER16-int LTR ERVK -1823 3583 3099 8 1939 541 139 0 11 chr2 177559706 177559793 -4188294 - RMER16-int LTR ERVK -2297 3109 3024 8 1939 1635 57 0 73 chr2 177559806 177560051 -4188036 - RLTR13C2 LTR ERVK -398 410 184 8 1939 1402 82 10 0 chr2 177560252 177560448 -4187639 - RLTR13C2 LTR ERVK -610 198 1 8 1939 1941 137 6 52 chr2 177560448 177560795 -4187292 - RMER16-int LTR ERVK -2083 3323 2993 9 1939 966 202 20 10 chr2 177560818 177561013 -4187074 + RLTR41 LTR ERV1 250 446 0 9 1939 1710 266 87 6 chr2 177562658 177563177 -4184910 - RLTR20B1 LTR ERVK 0 563 3 9 1939 250 130 0 169 chr2 177563486 177563551 -4184536 + RLTR33 LTR ERVK 453 506 -172 9 1939 3175 64 8 20 chr2 177563643 177564044 -4184043 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 9 1939 7325 117 19 11 chr2 177564044 177565133 -4182954 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 9 1939 919 92 14 14 chr2 177565133 177565276 -4182811 - MTA_Mm LTR MaLR 0 400 258 9 1939 608 238 12 47 chr2 177571305 177571477 -4176610 - RMER10A LTR ERVL -6 436 271 1 1939 832 193 0 126 chr2 177573700 177573890 -4174197 + RLTR26 LTR ERVK 477 642 0 1 1939 1687 183 95 3 chr2 177574531 177574921 -4173166 + RMER17B LTR ERVK 533 958 0 1 1939 835 306 82 82 chr2 177575681 177576204 -4171883 - MT2A LTR ERVL -10 523 1 1 1939 470 268 67 67 chr2 177576535 177576743 -4171344 - ORR1D1 LTR MaLR -161 213 6 1 1939 701 333 59 4 chr2 177576847 177577103 -4170984 - MTE-int LTR MaLR -236 1344 1075 1 1939 4613 190 56 29 chr2 177577394 177578451 -4169636 - RLTR25A LTR ERVK 0 1103 19 1 1939 966 224 49 118 chr2 177578408 177578696 -4169391 - RLTR41 LTR ERV1 -117 329 62 1 1939 1696 211 34 203 chr2 177578750 177579286 -4168801 - RLTR41 LTR ERV1 -1 445 1 1 1939 641 258 75 6 chr2 177584025 177584229 -4163858 - RLTR20B1 LTR ERVK -358 219 3 1 1939 267 250 15 0 chr2 177584273 177584341 -4163746 + RLTR19C LTR ERVK 25 93 -413 1 1939 251 132 0 172 chr2 177584544 177584608 -4163479 + RLTR33 LTR ERVK 453 505 -173 1 1939 3076 72 18 10 chr2 177584999 177585392 -4162695 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 1939 7642 110 12 14 chr2 177585392 177586492 -4161595 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 1 1939 851 117 7 14 chr2 177586686 177586825 -4161262 - MTB LTR MaLR -5 395 258 1 1939 941 85 7 14 chr2 177592861 177593004 -4155083 + MTA_Mm LTR MaLR 259 400 0 1 1939 7836 101 17 5 chr2 177593004 177594089 -4153998 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 1 1939 3069 86 2 10 chr2 177594089 177594488 -4153599 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1939 245 250 15 0 chr2 177594829 177594897 -4153190 - RLTR19C LTR ERVK -413 93 25 1 1939 1847 246 90 12 chr2 177594951 177595461 -4152626 + RLTR20B1 LTR ERVK 3 552 -11 1 1939 2656 70 68 29 chr2 177596293 177596644 -4151443 + RLTR10B2 LTR ERVK 1 365 0 1 1939 4154 112 14 96 chr2 177600958 177601757 -4146330 - RMER17A LTR ERVK -18 733 1 1 1940 3190 210 96 31 chr2 177604255 177605113 -4142974 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 6 1358 -1484 1 1940 2708 205 15 26 chr2 177605122 177605732 -4142355 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 943 1545 -3861 1 1940 229 328 0 0 chr2 177605734 177605792 -4142295 + ORR1B1 LTR MaLR 151 208 -186 1 1940 1629 173 7 0 chr2 177607283 177607560 -4140527 - MT2B LTR ERVL -320 281 3 1 1940 1153 183 30 13 chr2 177608098 177608330 -4139757 - ORR1A4 LTR MaLR -1 328 93 1 1940 720 196 14 14 chr2 177608330 177608470 -4139617 + RLTR46 LTR ERVK 1 140 -180 1 1940 287 286 50 66 chr2 177608514 177608712 -4139375 + RLTR46 LTR ERVK 126 320 0 1 1940 547 213 52 18 chr2 177608712 177608838 -4139249 - ORR1A4 LTR MaLR -245 149 1 1 1940 3397 96 125 21 chr2 177609164 177609675 -4138412 + LTRIS2 LTR ERV1 1 564 0 1 1940 3140 82 19 5 chr2 177610186 177610601 -4137486 + BGLII LTR ERVK 1 421 0 1 1940 2908 46 0 0 chr2 177612747 177613093 -4134994 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 1 1940 2180 188 76 53 chr2 177615193 177615721 -4132366 - RLTR25A LTR ERVK -420 683 144 1 1940 743 269 108 48 chr2 177615938 177616188 -4131899 - RLTR41 LTR ERV1 -181 265 1 1 1940 846 309 26 0 chr2 177619572 177619802 -4128285 + MTE-int LTR MaLR 1109 1344 -236 1 1940 864 291 102 15 chr2 177619868 177620203 -4127884 + ORR1D1 LTR MaLR 1 364 -10 1 1940 3146 63 91 20 chr2 177621183 177621633 -4126454 + RLTR45 LTR ERVK 1 482 0 1 1940 24941 40 16 4 chr2 177621633 177624799 -4123288 + RLTR45-int LTR ERVK 1 3205 -4039 1 1940 19368 33 19 1 chr2 177624788 177626145 -4121942 + RLTR45-int LTR ERVK 3385 4745 -2499 1 1940 19368 33 19 1 chr2 177626190 177627320 -4120767 + RLTR45-int LTR ERVK 4746 5914 -1330 1 1940 9546 39 24 2 chr2 177628014 177629288 -4118799 + RLTR45-int LTR ERVK 5900 7244 0 1 1940 3197 75 61 4 chr2 177629288 177629744 -4118343 + RLTR45 LTR ERVK 1 482 0 1 1940 2463 189 36 30 chr2 177629745 177630322 -4117765 + RLTR25A LTR ERVK 523 1103 0 1 1940 716 343 86 4 chr2 177630590 177630868 -4117219 + MTE-int LTR MaLR 1044 1344 -236 1 1940 625 272 39 24 chr2 177630936 177631143 -4116944 + ORR1D1 LTR MaLR 4 213 -161 1 1940 1647 189 104 0 chr2 177631978 177632364 -4115723 - RMER17B LTR ERVK 0 958 533 1 1940 838 231 23 110 chr2 177633012 177633231 -4114856 - RLTR26 LTR ERVK 0 642 443 1 1940 720 211 6 24 chr2 177636308 177636478 -4111609 + RMER10A LTR ERVL 271 437 -5 1 1940 1961 123 258 29 chr2 177637938 177638391 -4109696 + RLTR6_Mm LTR ERV1 37 593 -61 1 1940 911 99 14 7 chr2 177642811 177642953 -4105134 + MTB LTR MaLR 258 400 0 2 1940 6826 111 29 9 chr2 177642953 177643930 -4104157 + MTB-int LTR MaLR 1 1004 -94 2 1940 2953 26 9 0 chr2 177643930 177644273 -4103814 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 2 1940 6826 111 29 9 chr2 177644273 177644372 -4103715 + MTB-int LTR MaLR 1005 1098 0 2 1940 795 65 0 9 chr2 177644372 177644480 -4103607 + MTB LTR MaLR 1 107 -289 2 1940 1048 253 94 12 chr2 177658465 177658785 -4089302 - RMER10A LTR ERVL -6 436 91 2 1940 888 276 115 21 chr2 177662530 177662860 -4085227 - ORR1D1 LTR MaLR -13 361 1 2 1940 806 344 35 10 chr2 177662929 177663217 -4084870 - MTE-int LTR MaLR -239 1341 1047 2 1940 631 207 80 0 chr2 177663410 177663560 -4084527 + RLTR25A LTR ERVK 286 447 -656 2 1940 4006 198 60 41 chr2 177663642 177664574 -4083513 - RLTR25A LTR ERVK 0 1103 154 2 1940 2293 110 27 0 chr2 177664580 177664860 -4083227 + ORR1A1 LTR MaLR 1 280 -66 2 1940 2293 110 27 0 chr2 177664894 177664950 -4083137 + ORR1A1 LTR MaLR 281 344 -2 2 1940 362 247 0 76 chr2 177671239 177671331 -4076756 - MTEb LTR MaLR -1 378 294 2 1940 283 312 20 40 chr2 177671527 177671627 -4076460 - RMER15 LTR ERVL -185 390 293 2 1940 846 335 43 41 chr2 177671969 177672340 -4075747 - MTE2a LTR MaLR -17 404 20 2 1940 2540 158 6 6 chr2 177672342 177672827 -4075260 - RMER16-int LTR ERVK -1823 3583 3099 2 1940 551 153 0 10 chr2 177673420 177673519 -4074568 - RMER16-int LTR ERVK -2291 3115 3018 2 1940 1605 54 0 0 chr2 177673525 177673729 -4074358 - RLTR13C2 LTR ERVK -398 410 207 2 1940 1461 71 5 0 chr2 177673995 177674192 -4073895 - RLTR13C2 LTR ERVK -610 198 1 2 1940 1757 131 6 53 chr2 177674192 177674530 -4073557 - RMER16-int LTR ERVK -2083 3323 3002 2 1940 1040 173 62 9 chr2 177674530 177674757 -4073330 + RLTR41 LTR ERV1 208 446 0 2 1940 1749 267 85 6 chr2 177676401 177676921 -4071166 - RLTR20B1 LTR ERVK 0 563 3 2 1940 253 130 0 169 chr2 177677229 177677294 -4070793 + RLTR33 LTR ERVK 453 506 -172 2 1940 2979 61 8 20 chr2 177677383 177677784 -4070303 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 1940 6756 123 13 11 chr2 177677784 177678880 -4069207 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 2 1940 926 104 7 34 chr2 177678880 177679029 -4069058 - MTA_Mm LTR MaLR 0 400 256 2 1940 612 212 43 24 chr2 177685218 177685382 -4062705 - RMER10A LTR ERVL -5 437 271 2 1940 802 211 0 126 chr2 177690664 177690854 -4057233 + RLTR26 LTR ERVK 477 642 0 2 1940 1604 178 96 23 chr2 177691495 177691892 -4056195 + RMER17B LTR ERVK 533 958 0 2 1940 960 296 91 78 chr2 177692652 177693168 -4054919 - MT2A LTR ERVL -10 523 1 2 1940 492 263 67 67 chr2 177693499 177693707 -4054380 - ORR1D1 LTR MaLR -161 213 6 2 1940 744 333 59 4 chr2 177693811 177694067 -4054020 - MTE-int LTR MaLR -236 1344 1075 2 1940 4605 189 58 31 chr2 177694358 177695415 -4052672 - RLTR25A LTR ERVK 0 1103 19 2 1940 928 236 48 110 chr2 177695367 177695658 -4052429 - RLTR41 LTR ERV1 -112 334 62 2 1940 1377 224 37 206 chr2 177695712 177696247 -4051840 - RLTR41 LTR ERV1 -1 445 1 2 1940 1031 253 122 24 chr2 177697473 177697809 -4050278 - ORR1D1 LTR MaLR -5 369 1 2 1940 753 316 49 25 chr2 177697809 177698105 -4049982 - ORR1D1-int LTR MaLR -237 1343 1049 2 1940 637 252 75 6 chr2 177710670 177710874 -4037213 - RLTR20B1 LTR ERVK -358 219 3 2 1940 256 265 15 0 chr2 177710918 177710986 -4037101 + RLTR19C LTR ERVK 25 93 -413 2 1940 242 148 0 169 chr2 177711189 177711254 -4036833 + RLTR33 LTR ERVK 453 506 -172 2 1940 2879 69 18 10 chr2 177711630 177712023 -4036064 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 1940 7128 109 11 14 chr2 177712023 177713124 -4034963 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 2 1940 931 80 7 14 chr2 177714116 177714255 -4033832 - MTB LTR MaLR -5 395 258 2 1940 946 84 7 14 chr2 177720059 177720203 -4027884 + MTA_Mm LTR MaLR 258 400 0 2 1940 6994 108 23 4 chr2 177720203 177721280 -4026807 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 2 1940 1940 85 0 15 chr2 177721282 177721556 -4026531 + MTA_Mm LTR MaLR 3 272 -124 2 1940 859 221 79 33 chr2 177721556 177721771 -4026316 + RLTR20B1 LTR ERVK 316 540 -23 2 1940 2712 65 68 29 chr2 177722600 177722951 -4025136 + RLTR10B2 LTR ERVK 1 365 0 3 1940 4287 107 14 73 chr2 177727273 177728052 -4020035 - RMER17A LTR ERVK -18 733 1 3 1940 3222 211 95 31 chr2 177730554 177731413 -4016674 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 6 1358 -1484 3 1940 2677 206 14 29 chr2 177731405 177732030 -4016057 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 930 1545 -3861 3 1940 236 310 0 0 chr2 177732032 177732090 -4015997 + ORR1B1 LTR MaLR 151 208 -186 3 1941 1603 177 7 0 chr2 177734081 177734358 -4013729 - MT2B LTR ERVL -320 281 3 3 1941 1153 183 30 13 chr2 177734896 177735128 -4012959 - ORR1A4 LTR MaLR -1 328 93 3 1941 714 196 14 14 chr2 177735128 177735268 -4012819 + RLTR46 LTR ERVK 1 140 -180 3 1941 302 305 40 56 chr2 177735312 177735510 -4012577 + RLTR46 LTR ERVK 126 320 0 3 1941 547 213 52 18 chr2 177735510 177735636 -4012451 - ORR1A4 LTR MaLR -245 149 1 3 1941 3433 94 125 21 chr2 177735963 177736474 -4011613 + LTRIS2 LTR ERV1 1 564 0 3 1941 3161 80 19 5 chr2 177736985 177737400 -4010687 + BGLII LTR ERVK 1 421 0 3 1941 2972 52 9 0 chr2 177739550 177739893 -4008194 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 3 1941 2161 188 77 44 chr2 177741995 177742518 -4005569 - RLTR25A LTR ERVK -420 683 144 3 1941 720 269 108 48 chr2 177742776 177743026 -4005061 - RLTR41 LTR ERV1 -181 265 1 3 1941 803 317 26 0 chr2 177746412 177746642 -4001445 + MTE-int LTR MaLR 1109 1344 -236 3 1941 812 275 110 24 chr2 177746708 177747043 -4001044 + ORR1D1 LTR MaLR 1 364 -10 3 1941 3276 66 93 20 chr2 177748037 177748486 -3999601 + RLTR45 LTR ERVK 1 482 0 3 1941 26954 38 13 7 chr2 177748486 177751670 -3996417 + RLTR45-int LTR ERVK 1 3205 -4039 3 1941 21399 38 24 4 chr2 177751648 177752992 -3995095 + RLTR45-int LTR ERVK 3380 4745 -2499 3 1941 21399 40 17 2 chr2 177753025 177755442 -3992645 + RLTR45-int LTR ERVK 4746 7244 0 3 1941 3127 77 120 5 chr2 177755442 177755874 -3992213 + RLTR45 LTR ERVK 1 482 0 3 1941 2453 184 38 30 chr2 177755875 177756451 -3991636 + RLTR25A LTR ERVK 523 1103 0 3 1941 585 358 32 5 chr2 177756742 177756958 -3991129 + MTE-int LTR MaLR 1075 1296 -284 3 1941 693 252 39 24 chr2 177757065 177757272 -3990815 + ORR1D1 LTR MaLR 4 213 -161 3 1941 1671 181 101 3 chr2 177758106 177758494 -3989593 - RMER17B LTR ERVK 0 958 533 3 1941 838 199 0 126 chr2 177759142 177759332 -3988755 - RLTR26 LTR ERVK 0 642 477 3 1941 322 269 25 13 chr2 177762390 177762469 -3985618 - RMER12 LTR ERVK -141 1181 1102 3 1941 705 171 33 0 chr2 177762655 177762807 -3985280 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1016 832 676 3 1941 713 211 6 24 chr2 177763838 177764008 -3984079 + RMER10A LTR ERVL 271 437 -5 3 1941 885 106 14 7 chr2 177769936 177770078 -3978009 + MTA_Mm LTR MaLR 258 400 0 3 1941 7172 98 17 10 chr2 177770078 177771066 -3977021 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1004 -94 3 1941 2980 21 36 0 chr2 177771066 177771400 -3976687 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 3 1941 15149 51 2 1 chr2 177771400 177773190 -3974897 + ORR1A0-int LTR MaLR 1 1792 0 3 1941 3196 20 9 0 chr2 177773190 177773533 -3974554 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 3 1941 7172 98 17 10 chr2 177773533 177773632 -3974455 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1005 1096 -2 3 1941 2979 68 2 112 chr2 177773632 177773758 -3974329 + MTA_Mm LTR MaLR 1 107 -289 3 1941 2979 68 2 112 chr2 177773904 177774222 -3973865 + MTA_Mm LTR MaLR 108 396 0 3 1941 2757 116 68 6 chr2 177774333 177774810 -3973277 - RLTR1C LTR ERV1 0 605 1 3 1941 235 279 15 0 chr2 177775053 177775121 -3972966 - RLTR19C LTR ERVK -413 93 25 3 1941 1851 242 86 10 chr2 177775165 177775686 -3972401 + RLTR20B1 LTR ERVK 3 563 0 3 1941 765 341 26 0 chr2 177784947 177785176 -3962911 + MTE-int LTR MaLR 1110 1344 -236 3 1941 1031 253 122 24 chr2 177785242 177785578 -3962509 + ORR1D1 LTR MaLR 1 369 -5 3 1941 1431 218 35 208 chr2 177786828 177787367 -3960720 + RLTR41 LTR ERV1 1 446 0 3 1941 878 251 121 51 chr2 177787395 177787710 -3960377 + RLTR41 LTR ERV1 1 337 -109 3 1941 4645 187 61 26 chr2 177787665 177788116 -3959971 + RLTR25A LTR ERVK 19 502 -601 3 1941 4645 187 61 26 chr2 177788136 177788732 -3959355 + RLTR25A LTR ERVK 503 1102 -1 3 1941 769 323 62 8 chr2 177789006 177789262 -3958825 + MTE-int LTR MaLR 1075 1344 -236 3 1941 634 261 58 29 chr2 177789332 177789537 -3958550 + ORR1D1 LTR MaLR 3 213 -161 3 1941 407 299 47 20 chr2 177789868 177790018 -3958069 + MT2A LTR ERVL 1 154 -379 3 1941 842 276 18 84 chr2 177790204 177790489 -3957598 + ORR1D1 LTR MaLR 3 268 -106 3 1941 937 208 62 49 chr2 177790526 177790909 -3957178 - RMER6B LTR ERVK -10 451 1 3 1941 314 142 150 3 chr2 177790925 177791010 -3957077 + ORR1D1 LTR MaLR 261 380 -14 3 1941 930 301 57 104 chr2 177791393 177791779 -3956308 + MTE2a LTR MaLR 1 368 -11 3 1941 268 311 66 28 chr2 177792119 177792225 -3955862 + RMER15 LTR ERVL 275 384 -191 3 1941 249 326 71 0 chr2 177792384 177792482 -3955605 + MTEb LTR MaLR 170 274 -105 3 1941 338 268 97 52 chr2 177792546 177792680 -3955407 + MTEb LTR MaLR 240 379 0 3 1941 655 225 95 9 chr2 177794956 177795167 -3952920 - MuRRS4-int LTR ERV1 -33 5030 4802 4 1941 405 335 0 31 chr2 177795407 177795433 -3952654 - MuRRS4-int LTR ERV1 -2265 5187 5167 4 1941 3742 125 22 48 chr2 177795433 177796036 -3952051 + LTRIS_Mus LTR ERV1 1 587 0 4 1941 639 281 0 0 chr2 177796036 177796200 -3951887 - MuRRS4-int LTR ERV1 -1068 3995 3832 4 1941 1787 260 88 17 chr2 177798623 177799147 -3948940 - RLTR20B1 LTR ERVK 0 563 3 4 1941 259 250 15 0 chr2 177799191 177799259 -3948828 + RLTR19C LTR ERVK 25 93 -413 4 1941 249 118 0 177 chr2 177799461 177799523 -3948564 + RLTR33 LTR ERVK 456 506 -172 4 1941 2971 63 5 20 chr2 177799612 177800014 -3948073 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 1941 6857 114 16 4 chr2 177800014 177801099 -3946988 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 4 1941 839 108 28 14 chr2 177801099 177801240 -3946847 - MTA_Mm LTR MaLR 0 400 258 4 1941 629 260 12 12 chr2 177806634 177806805 -3941282 - RMER10A LTR ERVL -1 441 271 4 1941 851 181 0 126 chr2 177811823 177812013 -3936074 + RLTR26 LTR ERVK 477 642 0 4 1941 1677 182 95 0 chr2 177812653 177813042 -3935045 + RMER17B LTR ERVK 533 958 0 4 1941 483 340 78 82 chr2 177813802 177814327 -3933760 - MT2A LTR ERVL -10 523 1 4 1941 474 245 70 88 chr2 177814658 177814873 -3933214 - ORR1D1 LTR MaLR -161 213 3 4 1941 761 337 54 4 chr2 177814941 177815200 -3932887 - MTE-int LTR MaLR -234 1346 1075 4 1941 4836 185 53 31 chr2 177815491 177816553 -3931534 - RLTR25A LTR ERVK 0 1103 19 4 1941 867 244 48 116 chr2 177816505 177816797 -3931290 - RLTR41 LTR ERV1 -112 334 63 4 1941 1414 216 33 209 chr2 177816852 177817392 -3930695 - RLTR41 LTR ERV1 -1 445 1 4 1941 1022 257 113 15 chr2 177818624 177818960 -3929127 - ORR1D1 LTR MaLR -5 369 1 4 1941 735 345 26 0 chr2 177819026 177819255 -3928832 - MTE-int LTR MaLR -236 1344 1110 4 1941 467 283 148 19 chr2 177826552 177826761 -3921326 - ORR1D1 LTR MaLR -5 369 134 4 1941 290 196 20 0 chr2 177826969 177827020 -3921067 - ORR1D1 LTR MaLR -322 52 1 4 1941 584 171 32 36 chr2 177827998 177828150 -3919937 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -1406 920 812 4 1941 259 170 0 0 chr2 177828206 177828259 -3919828 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -1540 786 734 4 1941 738 207 90 0 chr2 177828748 177828936 -3919151 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -1592 734 530 4 1941 557 232 33 71 chr2 177828951 177829251 -3918836 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -2179 147 23 4 1941 1916 246 45 34 chr2 177829941 177830476 -3917611 - RLTR20A LTR ERVK 0 541 1 4 1941 236 346 63 19 chr2 177833248 177833339 -3914748 - RMER15 LTR ERVL -14 561 464 4 1941 465 256 35 55 chr2 177833339 177833500 -3914587 - MTEa LTR MaLR 0 379 211 4 1941 734 277 120 4 chr2 177833544 177833769 -3914318 - MTEa LTR MaLR -105 274 24 4 1941 299 238 291 30 chr2 177833741 177833906 -3914181 - RMER15 LTR ERVL -93 482 275 4 1941 1010 256 6 202 chr2 177834383 177834681 -3913406 - RLTR11B LTR ERVK -15 438 224 4 1941 1010 256 6 202 chr2 177834779 177835024 -3913063 - RLTR11B LTR ERVK -230 223 2 4 1941 234 278 0 65 chr2 177835625 177835702 -3912385 + MTE2b LTR MaLR 278 349 -30 4 1941 1179 184 60 26 chr2 177837011 177837245 -3910842 - RLTR17 LTR ERVK 0 692 451 4 1941 2175 136 72 6 chr2 177837297 177837659 -3910428 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 1 4 1941 2585 97 128 3 chr2 177838563 177838955 -3909132 + BGLII_B LTR ERVK 1 441 0 4 1941 1639 289 88 64 chr2 177839558 177840639 -3907448 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 5 909 -1417 4 1941 228 262 75 113 chr2 177840649 177840808 -3907279 + RMER4A LTR ERVK 308 460 -6 4 1941 5738 150 72 4 chr2 177840810 177841978 -3906109 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 1080 2326 0 4 1941 2706 113 83 2 chr2 177841978 177842386 -3905701 + BGLII_B LTR ERVK 1 441 0 4 1941 2096 47 0 51 chr2 177843479 177843772 -3904315 - RLTR10B LTR ERVK -6 286 9 4 1941 255 86 0 0 chr2 177843779 177843814 -3904273 - RLTR10B LTR ERVK -249 43 9 4 1941 286 71 0 0 chr2 177843822 177843864 -3904223 - RLTR10B LTR ERVK -250 42 1 4 1941 2895 97 21 19 chr2 177847457 177847877 -3900210 - BGLII LTR ERVK 0 421 1 4 1941 1606 225 24 14 chr2 177851534 177851904 -3896183 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 4 1941 769 263 100 23 chr2 177852082 177852371 -3895716 - ORR1E LTR MaLR -41 338 7 4 1941 280 268 110 84 chr2 177861369 177861524 -3886563 - MLT1B LTR MaLR -138 252 94 5 1941 235 299 28 145 chr2 177861992 177862274 -3885813 - RLTR21 LTR ERVK -242 1330 1082 5 1941 304 243 14 0 chr2 177862792 177862862 -3885225 - MLT1B LTR MaLR -285 105 35 5 1941 301 292 24 24 chr2 177862911 177863034 -3885053 - MLT1G1 LTR MaLR -299 280 158 5 1942 418 295 219 75 chr2 177865712 177866177 -3881910 - MLT1E2 LTR MaLR -5 622 91 5 1942 553 240 156 38 chr2 177868387 177868625 -3879462 - ORR1E LTR MaLR -87 272 7 5 1942 1601 182 151 11 chr2 177868711 177869061 -3879026 - MTD LTR MaLR -19 400 2 5 1942 917 276 81 24 chr2 177869067 177869364 -3878723 + MTEa LTR MaLR 1 314 -65 5 1942 600 327 18 27 chr2 177879970 177880190 -3867897 - RMER15 LTR ERVL -11 564 347 5 1942 302 290 6 50 chr2 177884131 177884274 -3863813 - MLT1J LTR MaLR -257 187 65 5 1942 253 299 0 13 chr2 177890542 177890620 -3857467 + MLT1E3 LTR MaLR 139 215 -409 5 1942 237 307 120 35 chr2 177890779 177890921 -3857166 + MLT1E3 LTR MaLR 439 592 -32 5 1942 1210 193 150 17 chr2 177895156 177895456 -3852631 + MTE2a LTR MaLR 3 342 -37 5 1942 677 289 129 34 chr2 177897346 177897672 -3850415 - ORR1E LTR MaLR -2 357 1 5 1942 1608 123 220 0 chr2 177900336 177900604 -3847483 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 5 1942 1139 242 60 117 chr2 177902175 177902577 -3845510 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 5 1942 290 306 114 36 chr2 177902772 177902938 -3845149 - MLT2B4 LTR ERVL -375 181 3 5 1942 2095 176 70 10 chr2 177905829 177906226 -3841861 + MTC LTR MaLR 1 421 0 5 1942 1652 196 139 6 chr2 177915957 177916316 -3831771 - MTD LTR MaLR -12 407 1 6 1942 227 114 87 43 chr2 177916491 177916537 -3831550 - MT2C_Mm LTR ERVL -240 235 188 6 1942 587 305 92 21 chr2 177918588 177918826 -3829261 + ORR1D2 LTR MaLR 116 370 0 6 1942 609 314 107 47 chr2 177920105 177920231 -3827856 - MLT1C LTR MaLR 0 467 340 6 1942 609 314 107 47 chr2 177920284 177920521 -3827566 - MLT1C LTR MaLR -128 339 82 6 1942 268 274 60 34 chr2 177921178 177921295 -3826792 - ORR1E LTR MaLR -168 191 72 6 1942 2359 108 6 0 chr2 177924217 177924541 -3823546 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 6 1942 227 280 77 86 chr2 177929591 177929708 -3818379 + IAPLTR3 LTR ERVK 23 138 -188 6 1942 590 291 87 22 chr2 177934369 177934684 -3813403 - ORR1E LTR MaLR -8 371 4 6 1942 2631 168 5 2 chr2 177935033 177935452 -3812635 + MTC LTR MaLR 1 420 -1 6 1942 1518 183 114 26 chr2 177944050 177944392 -3803695 + ORR1D1 LTR MaLR 3 374 0 6 1942 339 302 107 51 chr2 177944922 177945231 -3802856 + MTEa LTR MaLR 43 377 -2 6 1942 1612 310 226 20 chr2 177945231 177946179 -3801908 + MTEa-int LTR MaLR 1 1143 -437 6 1942 937 282 111 69 chr2 177946408 177946941 -3801146 + MTE-int LTR MaLR 992 1546 -34 6 1942 735 280 107 52 chr2 177946929 177947257 -3800830 + ORR1E LTR MaLR 8 353 -6 6 1942 2322 169 38 36 chr2 177950316 177950788 -3797299 + RMER20A LTR ERVK 1 473 -43 6 1942 1961 222 15 12 chr2 177965844 177966250 -3781837 + MTD LTR MaLR 13 419 0 6 1942 539 220 111 85 chr2 177968657 177968749 -3779338 + MTEa LTR MaLR 170 273 -106 6 1942 3359 45 2 0 chr2 177968749 177969148 -3778939 + MTB LTR MaLR 1 400 0 6 1942 539 220 111 85 chr2 177969148 177969244 -3778843 + MTEa LTR MaLR 274 363 -16 6 1942 393 149 189 0 chr2 177987894 177987968 -3760119 + RMER12B LTR ERVK 1317 1404 0 7 1943 278 225 14 40 chr2 177997019 177997093 -3750994 - MLT1A1 LTR MaLR -19 389 318 7 1943 263 256 35 35 chr2 177997222 177997307 -3750780 + ORR1E LTR MaLR 112 196 -163 7 1943 635 94 45 18 chr2 178005150 178005298 -3742789 + ORR1A3 LTR MaLR 238 411 -8 1 1943 3534 13 8 0 chr2 178006292 178006685 -3741402 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 1943 231 312 54 0 chr2 178008138 178008231 -3739856 - ORR1E LTR MaLR -12 367 270 6 1943 541 301 15 41 chr2 178008376 178008573 -3739514 - ORR1E LTR MaLR -157 202 11 6 1943 905 210 148 36 chr2 178014593 178014870 -3733217 - RMER4B LTR ERVK -9 576 269 1 1943 908 239 253 22 chr2 178014931 178015243 -3732844 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 1 1943 308 355 32 24 chr2 178016197 178016321 -3731766 - MLT1A0 LTR MaLR -32 333 209 1 1943 810 296 91 47 chr2 178021457 178021818 -3726269 + MTEa LTR MaLR 3 379 0 1 1943 260 335 49 107 chr2 178022907 178023151 -3724936 + MLT2C1 LTR ERVL 79 308 -89 2 1943 795 337 35 32 chr2 178025894 178026234 -3721853 + MTEa LTR MaLR 1 341 -38 2 1943 1615 198 97 19 chr2 178029342 178029703 -3718384 - MTD LTR MaLR -18 401 13 3 1943 2741 114 39 19 chr2 178034676 178035089 -3712998 - MTC LTR MaLR 0 421 1 4 1943 3403 41 10 0 chr2 178046633 178047026 -3701061 - MTB LTR MaLR 0 400 4 5 1943 294 232 122 0 chr2 178052591 178052673 -3695414 + MLT1A0 LTR MaLR 9 100 -265 6 1943 1905 191 11 3 chr2 178052702 178053058 -3695029 - MTEa LTR MaLR -20 359 1 6 1943 284 330 52 0 chr2 178053133 178053248 -3694839 + MLT1A0 LTR MaLR 245 365 0 6 1943 1270 225 147 5 chr2 178066350 178066717 -3681370 - MTD LTR MaLR 0 419 1 7 1943 296 284 26 52 chr2 178075736 178075851 -3672236 - RMER20B LTR ERVK -39 588 477 8 1943 5377 83 41 11 chr2 178076538 178077339 -3670748 + RLTR22_Mus LTR ERVK 1 825 -983 8 1943 495 211 28 31 chr2 178077440 178077626 -3670461 - ORR1B2-int LTR MaLR -1185 185 3 8 1943 1244 184 171 11 chr2 178077889 178078169 -3669918 - ORR1B2 LTR MaLR -42 325 1 8 1943 2391 217 129 33 chr2 178098410 178099147 -3648940 + RLTR40 LTR ERVK 1 808 -9 1 1943 4382 142 115 13 chr2 178106638 178107537 -3640550 + RLTR22_Mur LTR ERVK 2 991 -857 1 1943 400 191 157 0 chr2 178107720 178107809 -3640278 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1565 1667 -181 1 1943 226 311 108 90 chr2 178108070 178108236 -3639851 - ORR1E LTR MaLR -106 253 85 1 1943 249 200 20 0 chr2 178108250 178108300 -3639787 - MLT1A0 LTR MaLR -231 134 84 1 1943 630 218 440 7 chr2 178108520 178108812 -3639275 + MTD LTR MaLR 1 419 0 1 1943 289 296 8 50 chr2 178121501 178121622 -3626465 + MLT1A1 LTR MaLR 293 408 0 1 1943 750 257 88 129 chr2 178124597 178124859 -3623228 - MTE2a LTR MaLR -5 365 98 1 1943 750 256 90 135 chr2 178125042 178125169 -3622918 - MTE2a LTR MaLR -282 97 1 1 1944 294 294 188 22 chr2 178142918 178143099 -3604988 - RMER15 LTR ERVL -13 562 352 1 1944 1375 218 111 36 chr2 178144110 178144471 -3603616 + MTD LTR MaLR 18 405 -14 1 1944 229 328 110 45 chr2 178145535 178145781 -3602306 + RMER15 LTR ERVL 311 572 -3 1 1944 406 240 92 46 chr2 178151604 178151757 -3596330 - RMER15 LTR ERVL -53 522 363 1 1944 292 310 93 39 chr2 178159697 178159902 -3588185 + RMER15 LTR ERVL 356 571 -4 1 1944 237 203 96 53 chr2 178164820 178165007 -3583080 + RMER17A2 LTR ERVK 234 428 -478 1 1944 1392 273 70 95 chr2 178168657 178169289 -3578798 + RLTR18 LTR ERVK 1 616 0 2 1944 662 254 83 50 chr2 178172462 178172702 -3575385 - RMER15 LTR ERVL -48 527 280 2 1944 638 249 43 29 chr2 178175106 178175313 -3572774 - RLTR15 LTR ERVK -17 342 133 2 1944 602 224 122 33 chr2 178175309 178175489 -3572598 - RLTR15 LTR ERVK -131 228 33 2 1944 1981 196 16 0 chr2 178186216 178186589 -3561498 - RLTR14 LTR ERV1 -3 379 1 2 1944 1794 144 3 24 chr2 178186640 178186932 -3561155 + ORR1A3 LTR MaLR 1 286 -40 2 1944 225 140 98 20 chr2 178187849 178187900 -3560187 + MLT1C LTR MaLR 94 148 -319 2 1944 3440 54 0 2 chr2 178188624 178189032 -3559055 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 2 1944 289 207 18 70 chr2 178191325 178191413 -3556674 - MTE2a LTR MaLR 0 419 309 2 1944 580 219 8 16 chr2 178198707 178198832 -3549255 + RMER12 LTR ERVK 1 124 -1198 2 1944 3977 171 179 36 chr2 178199810 178200801 -3547286 + RMER12 LTR ERVK 117 1248 -74 2 1944 1870 172 84 4 chr2 178202295 178202646 -3545441 - ORR1C1 LTR MaLR -5 374 1 2 1944 294 316 153 33 chr2 178204978 178205161 -3542926 + MER77 LTR ERVL 166 370 -237 2 1944 377 270 127 0 chr2 178205329 178205455 -3542632 - RMER15 LTR ERVL -13 562 421 2 1944 365 359 48 48 chr2 178208359 178208608 -3539479 - ORR1E LTR MaLR -65 294 46 2 1944 1046 252 76 12 chr2 178210034 178210363 -3537724 - ORR1E LTR MaLR 0 359 10 2 1944 1715 128 122 93 chr2 178210691 178211044 -3537043 - ORR1B2 LTR MaLR -4 363 1 2 1944 225 333 12 0 chr2 178216495 178216576 -3531511 - MLT1B LTR MaLR 0 390 309 2 1944 243 245 73 106 chr2 178217398 178217521 -3530566 - ORR1E LTR MaLR -162 197 79 2 1944 1603 198 55 60 chr2 178221738 178222119 -3525968 + MTE2b LTR MaLR 1 379 0 2 1944 307 352 179 31 chr2 178224800 178225152 -3522935 + MLT1J LTR MaLR 107 510 -2 2 1944 371 383 75 20 chr2 178225170 178225476 -3522611 + MLT1J-int LTR MaLR 15 337 -1050 2 1944 498 281 32 25 chr2 178228025 178228182 -3519905 - RMER15 LTR ERVL -13 562 405 2 1944 1388 234 54 42 chr2 178230001 178230292 -3517795 + ORR1D1 LTR MaLR 1 304 -70 3 1944 2750 135 123 30 chr2 178230292 178230827 -3517260 - RMER4B LTR ERVK 0 585 1 3 1944 1388 234 54 42 chr2 178230827 178230866 -3517221 + ORR1D1 LTR MaLR 305 335 -39 3 1944 860 256 14 63 chr2 178233857 178233971 -3514116 - RMER17C LTR ERVK -12 398 289 3 1944 3157 17 0 0 chr2 178233971 178234317 -3513770 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 3 1944 860 256 14 63 chr2 178234317 178234373 -3513714 - RMER17C LTR ERVK -122 288 235 3 1944 860 170 21 83 chr2 178234441 178234633 -3513454 - RMER17C LTR ERVK -176 234 1 3 1944 876 184 87 180 chr2 178235316 178235627 -3512460 - MT2A LTR ERVL -251 282 1 3 1944 294 314 8 83 chr2 178236687 178236819 -3511268 + MLT1K LTR MaLR 111 232 -363 3 1944 1487 153 180 11 chr2 178237917 178237973 -3510114 + RMER6A LTR ERVK 1 56 -700 3 1944 1487 171 127 12 chr2 178238015 178238537 -3509550 + RMER6A LTR ERVK 57 756 0 3 1944 359 202 9 132 chr2 178239194 178239308 -3508779 - ORR1E LTR MaLR -258 101 2 3 1944 1143 208 78 112 chr2 178242360 178242707 -3505380 + MTE2a LTR MaLR 1 335 -44 3 1944 448 293 225 21 chr2 178245104 178245442 -3502645 + MLT1A1 LTR MaLR 2 408 0 3 1944 247 318 52 45 chr2 178245654 178245809 -3502278 - RLTR22_Mur LTR ERVK -387 1461 1306 3 1944 1871 167 88 0 chr2 178245838 178246168 -3501919 - ORR1B2 LTR MaLR -8 359 1 3 1944 242 234 31 0 chr2 178246398 178246462 -3501625 - LTR16C LTR ERVL -18 471 406 3 1944 787 256 35 44 chr2 178249573 178249802 -3498285 + MTE2b LTR MaLR 60 293 -86 3 1944 348 236 142 104 chr2 178250099 178250359 -3497728 + ORR1E LTR MaLR 1 270 -89 3 1944 924 289 133 35 chr2 178250888 178251318 -3496769 + RMER5 LTR ERV1 53 524 -10 3 1944 768 200 90 27 chr2 178251636 178251846 -3496241 - RMER19B LTR ERVK -394 508 97 3 1944 1332 252 46 6 chr2 178254101 178254448 -3493639 - MTEb LTR MaLR -4 375 15 3 1945 305 257 40 13 chr2 178258775 178258850 -3489237 + RMER15 LTR ERVL 453 529 -46 3 1945 893 274 98 29 chr2 178259053 178259374 -3488713 + MTD LTR MaLR 5 337 -42 3 1945 1291 216 74 59 chr2 178259921 178260237 -3487850 + ORR1D1 LTR MaLR 28 349 -25 3 1945 1291 216 74 59 chr2 178260364 178260386 -3487701 + ORR1D1 LTR MaLR 350 371 -3 3 1945 254 178 0 93 chr2 178271953 178272028 -3476059 + MLT1J LTR MaLR 44 150 -362 3 1945 697 212 151 78 chr2 178274984 178275229 -3472858 - MTEb LTR MaLR -62 317 55 3 1945 230 293 43 115 chr2 178283789 178283928 -3464159 - RMER12 LTR ERVK -470 852 724 3 1945 2478 95 3 0 chr2 178284539 178284865 -3463222 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 3 1945 227 302 99 50 chr2 178285640 178285741 -3462346 - LTR16A LTR ERVL -184 267 162 3 1945 1430 238 48 8 chr2 178297952 178298308 -3449779 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 4 1945 1126 286 70 38 chr2 178298413 178298758 -3449329 + ORR1E LTR MaLR 4 359 0 4 1945 805 265 42 21 chr2 178301181 178301438 -3446649 + MTEb LTR MaLR 14 262 -117 4 1945 1170 207 70 126 chr2 178305177 178305575 -3442512 + MTE2a LTR MaLR 3 378 -1 4 1945 848 262 25 59 chr2 178306460 178306699 -3441388 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 140 4 1945 257 274 144 8 chr2 178307711 178307836 -3440251 + MLT2B1 LTR ERVL 330 471 -96 4 1945 2826 28 0 47 chr2 178311732 178312075 -3436012 + IAPLTR2b LTR ERVK 1 327 0 4 1945 825 259 66 106 chr2 178313342 178313662 -3434425 - MTE2a LTR MaLR -72 307 1 4 1945 884 230 208 26 chr2 178313670 178313801 -3434286 + MT2A LTR ERVL 1 178 -355 4 1945 884 230 208 26 chr2 178313850 178313982 -3434105 + MT2A LTR ERVL 179 312 -221 4 1945 589 303 70 21 chr2 178316961 178317277 -3430810 + MTD LTR MaLR 39 396 -23 4 1945 385 269 134 45 chr2 178317348 178317516 -3430571 + MLT1B LTR MaLR 190 390 -18 4 1945 1698 217 66 5 chr2 178320440 178320452 -3427635 + MTD LTR MaLR 3 14 -405 4 1945 1698 217 66 5 chr2 178320475 178320855 -3427232 + MTD LTR MaLR 15 419 0 4 1945 2343 116 0 0 chr2 178320948 178321275 -3426812 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 4 1945 671 278 150 40 chr2 178324233 178324507 -3423580 - MTD LTR MaLR -115 304 1 4 1945 1915 152 76 22 chr2 178333468 178333837 -3414250 - RLTR9D LTR ERVK -13 390 2 4 1945 4148 50 28 2 chr2 178334137 178334636 -3413451 - RLTR1B LTR ERV1 0 512 1 4 1945 1838 123 58 119 chr2 178335244 178335604 -3412483 + ORR1A1 LTR MaLR 1 338 -8 4 1945 518 269 214 23 chr2 178337165 178337445 -3410642 - MT2A LTR ERVL -1 600 251 4 1945 3341 154 20 33 chr2 178337472 178337746 -3410341 + RLTR25A LTR ERVK 53 335 -768 4 1945 3341 154 20 33 chr2 178337943 178338266 -3409821 + RLTR25A LTR ERVK 336 642 -461 4 1945 252 310 46 0 chr2 178338618 178338705 -3409382 - MLT1K LTR MaLR -138 457 367 4 1945 4413 104 5 25 chr2 178338725 178339366 -3408721 + RLTR5_Mm LTR ERV1 1 628 0 4 1945 322 272 21 85 chr2 178342177 178342347 -3405740 - RMER17C LTR ERVK -107 303 141 4 1945 322 272 21 85 chr2 178342423 178342441 -3405646 - RMER17C LTR ERVK -270 140 127 4 1945 2389 95 38 0 chr2 178348585 178348900 -3399187 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 4 1945 372 305 22 45 chr2 178353090 178353224 -3394863 - MTEa LTR MaLR -47 332 202 4 1945 804 284 5 23 chr2 178353364 178353580 -3394507 - MTEa LTR MaLR -162 217 6 4 1945 245 276 7 153 chr2 178354674 178354824 -3393263 - MTEa LTR MaLR -12 367 240 4 1945 2120 97 53 28 chr2 178355020 178355339 -3392748 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 5 1945 2255 151 174 9 chr2 178360468 178360917 -3387170 + RLTR11A2 LTR ERVK 3 525 -2 5 1945 1459 162 144 31 chr2 178370180 178370661 -3377426 - RMER17C LTR ERVK -118 633 16 5 1945 1178 246 88 17 chr2 178372079 178372430 -3375657 - MTE2b LTR MaLR -1 378 3 5 1945 994 174 89 194 chr2 178372634 178373026 -3375061 - ORR1E LTR MaLR -6 353 3 5 1945 948 145 28 9 chr2 178374932 178375215 -3372872 + RLTR41 LTR ERV1 132 446 0 5 1945 830 299 45 60 chr2 178379493 178379845 -3368242 - ORR1E LTR MaLR -2 357 11 5 1945 1446 227 35 41 chr2 178384121 178384436 -3363651 + MTD LTR MaLR 106 418 -1 5 1945 273 282 0 71 chr2 178386526 178386610 -3361477 - MLT1C LTR MaLR -335 132 55 5 1946 1385 241 106 24 chr2 178391935 178392313 -3355774 - MTD LTR MaLR 0 419 11 5 1946 254 299 101 22 chr2 178393425 178393514 -3354573 + MLT1C LTR MaLR 363 458 -9 5 1946 279 296 108 47 chr2 178395321 178395598 -3352489 - RMER12 LTR ERVK -334 988 695 5 1946 586 301 129 43 chr2 178396617 178397037 -3351050 + MLT1E2 LTR MaLR 3 458 -169 5 1946 414 249 186 62 chr2 178399226 178399436 -3348651 + RMER15 LTR ERVL 324 559 -16 5 1946 791 263 5 26 chr2 178399763 178399958 -3348129 - ORR1E LTR MaLR -165 194 4 5 1946 881 273 96 100 chr2 178406854 178407342 -3340745 + RMER5 LTR ERV1 49 534 0 5 1946 258 318 47 0 chr2 178407975 178408060 -3340027 - ORR1E LTR MaLR -248 111 23 5 1946 313 272 23 43 chr2 178408223 178408321 -3339766 + MTE2a LTR MaLR 279 366 -4 5 1946 2342 113 3 3 chr2 178418622 178418949 -3329138 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 5 1946 403 287 9 36 chr2 178419930 178420042 -3328045 + MTE2a LTR MaLR 258 366 -13 5 1946 368 308 98 31 chr2 178422937 178423239 -3324848 + ORR1D2 LTR MaLR 2 333 -26 5 1946 366 291 285 0 chr2 178425164 178425343 -3322744 - MTE2a LTR MaLR -87 292 63 5 1946 5217 110 12 9 chr2 178425930 178426665 -3321422 + RMER19A LTR ERVK 1 737 0 5 1946 330 307 119 61 chr2 178428339 178428568 -3319519 - MTEb LTR MaLR -38 341 81 5 1946 227 177 62 46 chr2 178430852 178430917 -3317170 - ORR1E LTR MaLR -25 354 289 5 1946 552 321 10 49 chr2 178431015 178431218 -3316869 - ORR1E LTR MaLR -164 195 1 5 1946 602 291 45 104 chr2 178431247 178431570 -3316517 + MTD LTR MaLR 3 404 -15 5 1946 1854 55 8 0 chr2 178431967 178432204 -3315883 + MTB LTR MaLR 1 239 -161 6 1946 3533 28 2 0 chr2 178432204 178432599 -3315488 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 1946 1211 229 124 21 chr2 178434324 178434539 -3313548 + ORR1D1 LTR MaLR 1 228 -146 6 1946 1211 229 124 21 chr2 178434606 178434729 -3313358 + ORR1D1 LTR MaLR 229 374 0 6 1946 823 220 195 85 chr2 178435536 178435864 -3312223 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 7 6 1946 225 320 55 110 chr2 178436118 178436318 -3311769 + ORR1E LTR MaLR 169 357 -2 6 1946 848 255 132 9 chr2 178438828 178439160 -3308927 + MTEb LTR MaLR 3 378 -1 6 1946 578 289 75 57 chr2 178439622 178439997 -3308090 - ORR1E LTR MaLR -6 364 11 6 1946 226 262 99 12 chr2 178445706 178445787 -3302300 - RMER5 LTR ERV1 -7 527 440 6 1946 279 322 107 13 chr2 178445897 178446034 -3302053 - MTE2b LTR MaLR -238 141 1 6 1946 1621 250 44 24 chr2 178446058 178446468 -3301619 - MTD LTR MaLR 0 419 2 6 1946 293 297 111 102 chr2 178451413 178451657 -3296430 - MLT1G3 LTR MaLR -143 452 207 6 1946 757 224 141 11 chr2 178452879 178453158 -3294929 + ORR1E LTR MaLR 27 377 -2 6 1946 591 365 81 25 chr2 178453397 178453804 -3294283 + MT2A LTR ERVL 5 434 -99 6 1946 4161 176 75 76 chr2 178454085 178454129 -3293958 - RMER19B LTR ERVK 0 902 860 6 1946 3417 101 133 10 chr2 178454129 178454649 -3293438 - MT2B2 LTR ERVL 0 584 1 6 1946 4161 176 75 76 chr2 178454649 178455507 -3292580 - RMER19B LTR ERVK -43 859 1 6 1946 372 286 31 87 chr2 178459771 178459932 -3288155 - RMER15 LTR ERVL -5 570 419 6 1946 2105 106 10 13 chr2 178461784 178462091 -3285996 - ORR1A3 LTR MaLR -20 306 1 6 1946 591 120 11 0 chr2 178462325 178462417 -3285670 - RMER6A LTR ERVK -663 93 1 6 1946 295 359 91 25 chr2 178464745 178464942 -3283145 - ORR1E LTR MaLR -142 217 8 6 1946 254 285 24 48 chr2 178465028 178465194 -3282893 + RMER17D LTR ERVK 349 510 -379 6 1946 781 248 54 26 chr2 178467887 178468196 -3279891 - MTEb LTR MaLR 0 379 19 6 1946 2324 99 6 6 chr2 178468481 178468805 -3279282 - ORR1A3 LTR MaLR -2 324 1 6 1946 237 220 50 17 chr2 178471928 178471988 -3276099 + MLT1K LTR MaLR 334 395 -200 6 1946 556 303 136 9 chr2 178482979 178483199 -3264888 - ORR1E LTR MaLR -106 253 6 6 1946 705 275 128 36 chr2 178484779 178485028 -3263059 - MTE2a LTR MaLR 0 379 108 6 1946 362 356 132 45 chr2 178486353 178486779 -3261308 - RMER5 LTR ERV1 0 534 72 6 1946 240 248 78 129 chr2 178489342 178489458 -3258629 + MLT1F2 LTR MaLR 280 389 -171 6 1946 3231 60 5 12 chr2 178490215 178490618 -3257469 + MTB LTR MaLR 1 400 0 6 1946 326 320 226 39 chr2 178491462 178491775 -3256312 + RMER13A LTR ERVK 356 726 -134 6 1946 1431 234 138 3 chr2 178492058 178492413 -3255674 + MTD LTR MaLR 9 411 -8 6 1946 1146 218 112 10 chr2 178493867 178494160 -3253927 - ORR1D1 LTR MaLR -2 372 50 7 1946 394 159 0 0 chr2 178494160 178494223 -3253864 + ORR1D1 LTR MaLR 1 63 -311 7 1946 1463 214 147 8 chr2 178499468 178499836 -3248251 - MTD LTR MaLR 0 419 1 7 1946 572 250 22 0 chr2 178499841 178499977 -3248110 - MTD LTR MaLR -269 150 12 7 1946 3952 217 136 21 chr2 178500013 178501139 -3246948 - MTC-int LTR MaLR -2 1256 2 1 1946 2210 161 66 5 chr2 178501140 178501533 -3246554 - MTC LTR MaLR -2 419 3 1 1946 772 327 49 77 chr2 178504179 178504619 -3243468 - MLT1D LTR MaLR -7 498 78 7 1946 772 327 49 77 chr2 178504649 178504715 -3243372 - MLT1D LTR MaLR -428 77 6 7 1946 6955 126 19 9 chr2 178507857 178508919 -3239168 + RLTR21 LTR ERVK 1 1072 -500 1 1946 275 164 0 82 chr2 178515380 178515453 -3232634 + RMER12B LTR ERVK 1187 1253 -151 1 1946 652 113 66 0 chr2 178515427 178515533 -3232554 + RLTR21 LTR ERVK 1064 1176 -396 1 1946 226 184 0 0 chr2 178515969 178516007 -3232080 + RLTR21 LTR ERVK 1482 1519 -53 1 1946 317 200 0 0 chr2 178516043 178516108 -3231979 + RLTR21 LTR ERVK 1482 1546 -26 1 1946 1405 193 163 22 chr2 178517213 178517568 -3230519 + MTD LTR MaLR 1 405 -14 2 1947 1453 219 105 56 chr2 178520973 178521365 -3226722 + MTD LTR MaLR 9 419 0 2 1947 264 238 0 16 chr2 178522358 178522422 -3225665 - MLT1A1 LTR MaLR -3 405 343 2 1947 293 286 99 105 chr2 178524946 178525137 -3222950 + MTE2a LTR MaLR 67 256 -103 3 1947 2560 78 3 0 chr2 178527352 178527674 -3220413 + ORR1A2 LTR MaLR 1 323 -4 3 1947 426 228 16 83 chr2 178529658 178529832 -3218255 + MTE2a LTR MaLR 252 417 -2 3 1947 1820 211 29 75 chr2 178531906 178532109 -3215978 - RMER19C LTR ERVK 0 611 427 3 1947 1820 211 29 75 chr2 178532287 178532535 -3215552 - RMER19C LTR ERVK -185 426 181 3 1947 1174 184 178 19 chr2 178533566 178533887 -3214200 + MTD LTR MaLR 35 406 -13 4 1947 286 369 142 40 chr2 178540279 178540849 -3207238 + MLT1F-int LTR MaLR 223 850 -639 5 1947 342 291 37 79 chr2 178543057 178543221 -3204866 + MER67D LTR ERV1 1 157 -357 5 1947 518 329 63 85 chr2 178544620 178544985 -3203102 - ORR1E LTR MaLR 0 359 3 5 1947 290 305 53 72 chr2 178549258 178549523 -3198564 + RMER12 LTR ERVK 729 988 -334 6 1947 804 283 87 52 chr2 178553029 178553376 -3194711 - MTEa LTR MaLR -20 359 1 6 1947 3057 83 5 7 chr2 178556624 178557046 -3191041 - BGLII LTR ERVK 0 421 1 7 1947 3017 201 105 11 chr2 178557046 178557987 -3190100 - MYSERV16_I-int LTR ERVK 0 2326 1297 7 1947 651 187 38 51 chr2 178557977 178558135 -3189952 - RMER3D-int LTR ERVK -1146 1696 1541 7 1947 1757 197 85 36 chr2 178558175 178558977 -3189110 - RMER3D-int LTR ERVK -1309 1533 358 7 1947 2995 58 67 18 chr2 178559289 178559690 -3188397 - BGLII LTR ERVK 0 421 1 7 1947 533 291 63 0 chr2 178566371 178566546 -3181541 - RMER15-int LTR ERVL -4622 377 192 8 1947 306 295 116 0 chr2 178566557 178566669 -3181418 - RMER15-int LTR ERVL -4866 133 9 8 1947 741 242 44 34 chr2 178566685 178566890 -3181197 - RMER15 LTR ERVL -17 558 352 8 1947 406 223 136 54 chr2 178567982 178568129 -3179958 - MTD LTR MaLR -8 411 253 9 1947 1383 254 7 0 chr2 178568317 178568612 -3179475 - MTD LTR MaLR -110 309 13 9 1947 1087 216 24 35 chr2 178569652 178569906 -3178181 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 124 9 1947 292 276 28 84 chr2 178579719 178579730 -3168357 + MT2B LTR ERVL 152 156 -445 1 1947 3505 134 68 49 chr2 178580406 178581036 -3167051 + RLTR26 LTR ERVK 1 642 0 1 1947 534 180 410 55 chr2 178584333 178584609 -3163478 - ORR1D1 LTR MaLR 0 394 1 1 1947 1475 220 65 17 chr2 178588794 178589145 -3158942 + ORR1D2 LTR MaLR 3 370 0 1 1947 2750 74 63 8 chr2 178591502 178591898 -3156189 + BGLII LTR ERVK 1 418 -3 1 1947 225 239 144 42 chr2 178600020 178600138 -3147949 - RMER15 LTR ERVL -445 130 1 1 1947 389 292 85 97 chr2 178601079 178601337 -3146750 + ORR1D2 LTR MaLR 1 255 -115 1 1947 344 253 81 110 chr2 178601316 178601525 -3146562 + ORR1D2 LTR MaLR 168 370 0 1 1947 913 250 87 34 chr2 178603793 178604058 -3144029 - MTD LTR MaLR 0 419 141 1 1947 477 312 45 13 chr2 178604529 178604685 -3143402 - MTD LTR MaLR -246 173 13 1 1947 654 298 32 101 chr2 178604741 178605088 -3142999 - MTD LTR MaLR -16 403 81 1 1947 262 284 84 90 chr2 178606025 178606180 -3141907 + LTR33 LTR ERVL 40 193 -322 1 1947 1374 289 133 23 chr2 178614980 178615498 -3132589 + RMER15 LTR ERVL 1 575 0 1 1947 278 206 45 189 chr2 178615579 178615711 -3132376 + MT2B LTR ERVL 152 264 -337 1 1947 232 316 88 76 chr2 178616296 178616467 -3131620 + MLT1D LTR MaLR 44 216 -289 1 1947 243 325 95 88 chr2 178616912 178617175 -3130912 - LTR33A LTR ERVL -11 509 245 1 1947 506 291 120 11 chr2 178617777 178617933 -3130154 + MLT1A0 LTR MaLR 150 325 -40 1 1947 1612 218 158 19 chr2 178617933 178618305 -3129782 + RLTR20C LTR ERVK 1 433 -101 1 1947 1612 218 158 19 chr2 178618397 178618486 -3129601 + RLTR20C LTR ERVK 434 528 -6 1 1947 1297 229 39 0 chr2 178620885 178621143 -3126944 - ORR1D1 LTR MaLR -106 268 1 1 1947 1138 293 84 12 chr2 178630977 178631322 -3116765 - MTD LTR MaLR -14 405 50 1 1947 406 313 104 56 chr2 178631936 178632306 -3115781 + ORR1E LTR MaLR 2 374 0 1 1947 409 296 152 18 chr2 178637811 178638064 -3110023 + MLT2B4 LTR ERVL 20 314 -100 2 1947 402 226 12 12 chr2 178639774 178639859 -3108228 + MTE2b LTR MaLR 291 375 -4 2 1947 463 204 103 62 chr2 178642047 178642193 -3105894 + RMER15 LTR ERVL 8 159 -416 2 1947 630 298 146 8 chr2 178642202 178642456 -3105631 + RMER15 LTR ERVL 287 575 0 2 1947 315 317 141 24 chr2 178645343 178645556 -3102531 + MLT1B LTR MaLR 27 264 -126 2 1947 279 287 29 11 chr2 178645939 178646047 -3102040 + MLT1B LTR MaLR 270 391 -17 2 1947 4805 199 120 18 chr2 178647031 178647785 -3100302 + RMER12 LTR ERVK 2 761 -561 2 1947 4805 199 120 18 chr2 178647965 178648324 -3099763 + RMER12 LTR ERVK 762 1229 -93 2 1948 1602 161 164 0 chr2 178656792 178657096 -3090991 + ORR1C1 LTR MaLR 1 354 -13 2 1948 4763 215 88 35 chr2 178657107 178658407 -3089680 + ORR1C1-int LTR MaLR 1 1370 0 2 1948 1943 180 21 72 chr2 178658407 178658796 -3089291 + ORR1C1 LTR MaLR 1 369 -9 2 1948 442 294 55 18 chr2 178659442 178659605 -3088482 - MTEa LTR MaLR -6 373 205 2 1948 627 282 179 22 chr2 178664538 178664732 -3083355 + MT2A LTR ERVL 1 226 -307 2 1948 627 282 179 22 chr2 178664770 178664938 -3083149 + MT2A LTR ERVL 227 420 -113 2 1948 722 318 94 14 chr2 178669748 178670042 -3078045 - MTE-int LTR MaLR -217 1363 936 2 1948 2080 277 112 46 chr2 178670474 178670796 -3077291 - MTE-int LTR MaLR -516 1064 717 2 1948 2080 277 112 46 chr2 178671002 178671436 -3076651 - MTE-int LTR MaLR -864 716 258 2 1948 663 233 60 24 chr2 178671812 178672015 -3076072 - MTE-int LTR MaLR -1347 388 130 2 1948 242 309 10 30 chr2 178675496 178675596 -3072491 + MTEb LTR MaLR 264 361 -18 2 1948 2350 129 56 5 chr2 178677987 178678360 -3069727 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 3 2 1948 364 287 64 75 chr2 178684438 178684626 -3063461 - ORR1E LTR MaLR -168 191 6 2 1948 689 325 134 10 chr2 178687344 178687649 -3060438 - MER77 LTR ERVL -69 538 196 2 1948 2361 137 62 18 chr2 178688086 178688486 -3059601 + MTC LTR MaLR 4 421 0 2 1948 998 271 134 34 chr2 178689146 178689495 -3058592 + MTD LTR MaLR 1 374 -45 2 1948 800 285 133 21 chr2 178692132 178692469 -3055618 + MTEb LTR MaLR 5 379 0 2 1948 354 281 74 0 chr2 178695137 178695258 -3052829 + RMER15 LTR ERVL 433 562 -13 2 1948 345 301 180 37 chr2 178696583 178696828 -3051259 - MLT1D LTR MaLR 0 505 226 2 1948 705 242 169 113 chr2 178699147 178699473 -3048614 - MTE2b LTR MaLR 0 379 36 2 1948 1535 241 17 137 chr2 178705708 178706175 -3041912 + MTD LTR MaLR 1 411 -8 2 1948 251 359 53 37 chr2 178706956 178707144 -3040943 + MLT1E1A LTR MaLR 424 614 -66 2 1948 737 287 114 45 chr2 178709677 178710082 -3038005 + RMER15 LTR ERVL 49 575 0 2 1948 1747 112 155 0 chr2 178710424 178710701 -3037386 + ORR1A2 LTR MaLR 8 327 0 2 1948 1314 284 11 7 chr2 178731937 178732224 -3015863 - MTE2b LTR MaLR -82 297 10 3 1948 270 347 15 45 chr2 178732727 178732969 -3015118 + MLT1C LTR MaLR 150 457 -10 3 1948 374 316 126 32 chr2 178734292 178734550 -3013537 + MLT2B3 LTR ERVL 227 503 -51 3 1948 249 211 96 96 chr2 178740188 178740366 -3007721 + RMER12 LTR ERVK 679 856 -466 3 1948 810 302 97 10 chr2 178740766 178741054 -3007033 - MTD LTR MaLR -89 330 18 3 1948 426 293 29 46 chr2 178741670 178741929 -3006158 + MTD LTR MaLR 126 419 0 3 1948 909 308 69 47 chr2 178744539 178744903 -3003184 + MTEa LTR MaLR 8 379 0 3 1948 3623 33 28 5 chr2 178750492 178750917 -2997170 + RLTR10C LTR ERVK 1 435 -1 3 1948 880 231 296 3 chr2 178751153 178751444 -2996643 - MTEb LTR MaLR -3 376 1 3 1948 878 289 150 0 chr2 178756534 178756828 -2991259 - MTEa LTR MaLR 0 379 42 3 1948 234 244 70 100 chr2 178758412 178758463 -2989624 + MT2A LTR ERVL 2 52 -481 3 1948 234 244 70 100 chr2 178758685 178758733 -2989354 + MT2A LTR ERVL 53 98 -435 3 1948 714 344 30 45 chr2 178758755 178759020 -2989067 + MT2A LTR ERVL 187 447 -86 3 1948 567 315 38 11 chr2 178764283 178764469 -2983618 - ORR1E LTR MaLR -168 191 1 3 1948 659 294 29 40 chr2 178765090 178765363 -2982724 - RLTR15 LTR ERVK -76 283 14 3 1948 728 186 11 94 chr2 178765494 178765761 -2982326 - RMER17C LTR ERVK -164 246 2 3 1948 717 311 57 43 chr2 178765806 178766088 -2981999 + MTE2a LTR MaLR 87 372 -7 3 1948 736 271 53 110 chr2 178766149 178766468 -2981619 + ORR1E LTR MaLR 20 320 -39 3 1948 227 310 122 47 chr2 178769400 178769613 -2978474 + RLTR21 LTR ERVK 1074 1302 -270 3 1948 1151 235 173 0 chr2 178770961 178771284 -2976803 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 3 1948 1318 242 134 40 chr2 178772632 178773006 -2975081 + MTD LTR MaLR 11 419 0 3 1948 1090 286 119 23 chr2 178776798 178777285 -2970802 + RMER5 LTR ERV1 1 534 0 3 1948 772 232 153 17 chr2 178780613 178780854 -2967233 + RMER5 LTR ERV1 2 275 -259 4 1949 230 286 107 56 chr2 178790773 178790969 -2957118 - BGLII_A LTR ERVK -160 285 80 4 1949 658 269 23 46 chr2 178791201 178791419 -2956668 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 158 4 1949 458 226 65 9 chr2 178791468 178791575 -2956512 - ORR1D2 LTR MaLR -168 191 79 4 1949 860 241 68 60 chr2 178791626 178791860 -2956227 - ORR1D2-int LTR MaLR -11 1359 1124 4 1949 347 326 119 56 chr2 178794212 178794589 -2953498 + MLT1D LTR MaLR 85 485 -20 4 1949 321 290 137 0 chr2 178796408 178796539 -2951548 - RMER15 LTR ERVL -3 572 424 4 1949 308 212 20 133 chr2 178797003 178797101 -2950986 - RMER15 LTR ERVL -482 93 7 4 1949 234 162 0 0 chr2 178803942 178803979 -2944108 - ORR1E LTR MaLR -322 37 1 4 1949 3102 310 112 38 chr2 178803979 178805399 -2942688 - MTEa-int LTR MaLR -53 1527 1 4 1949 366 252 61 26 chr2 178805400 178805514 -2942573 - MTEa LTR MaLR -4 375 258 4 1949 656 176 71 8 chr2 178805609 178805735 -2942352 + MTE2b LTR MaLR 185 318 -61 4 1949 551 304 49 22 chr2 178810134 178810319 -2937768 + ORR1E LTR MaLR 1 190 -169 4 1949 254 360 0 0 chr2 178816048 178816137 -2931950 - MLT1D LTR MaLR -126 469 381 4 1949 267 274 223 36 chr2 178818446 178818666 -2929421 - MLT1D LTR MaLR -76 429 169 4 1949 706 313 110 74 chr2 178818703 178819066 -2929021 + MTE2a LTR MaLR 1 376 -3 4 1949 310 370 8 16 chr2 178822519 178822648 -2925439 + MLT1C LTR MaLR 16 143 -324 4 1949 549 216 14 144 chr2 178822649 178822840 -2925247 + MTE2a LTR MaLR 2 195 -224 4 1949 229 407 44 0 chr2 178822864 178822977 -2925110 + MLT1C LTR MaLR 349 466 -1 4 1949 269 325 65 116 chr2 178826991 178827301 -2920786 - ORR1D2 LTR MaLR -66 304 11 4 1949 545 287 24 24 chr2 178829484 178829652 -2918435 + RMER15 LTR ERVL 403 570 -5 4 1949 1887 200 30 22 chr2 178833318 178833681 -2914406 - ORR1D1 LTR MaLR -6 368 3 4 1949 2143 124 9 12 chr2 178833907 178834233 -2913854 - ORR1A4 LTR MaLR -4 325 1 4 1949 1032 101 0 0 chr2 178834233 178834381 -2913706 - ORR1A4-int LTR MaLR 0 1963 1816 4 1949 1166 326 47 3 chr2 178834453 178834816 -2913271 + MTEa LTR MaLR 1 379 0 4 1949 2571 77 0 0 chr2 178835204 178835531 -2912556 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 4 1949 3352 57 2 2 chr2 178838767 178839174 -2908913 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 4 1949 2081 150 76 5 chr2 178842914 178843282 -2904805 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 4 1949 233 269 132 53 chr2 178843820 178843934 -2904153 + MTC LTR MaLR 1 123 -298 4 1949 296 326 122 102 chr2 178845514 178845866 -2902221 - ORR1E LTR MaLR 0 359 1 4 1949 1844 226 30 28 chr2 178849767 178850271 -2897816 + RLTR16 LTR ERVK 1 505 0 5 1949 2515 156 12 2 chr2 178850951 178851350 -2896737 + MERVL_2A-int LTR ERVL 5211 5613 -148 5 1949 311 202 46 35 chr2 178851354 178851441 -2896646 + ORR1A3-int LTR MaLR 552 639 -1324 5 1949 299 60 120 0 chr2 178851441 178851491 -2896596 + MERVL_2A-int LTR ERVL 5706 5761 0 5 1949 1180 237 213 91 chr2 178851493 178851902 -2896185 + MT2A LTR ERVL 3 461 -72 5 1949 322 90 0 0 chr2 178852055 178852122 -2895965 + MT2A LTR ERVL 467 533 0 5 1949 1101 271 9 142 chr2 178853450 178853871 -2894216 - MTE2a LTR MaLR -14 365 1 5 1949 1174 197 21 52 chr2 178854175 178854443 -2893644 + MTD LTR MaLR 111 417 -2 5 1949 367 297 96 6 chr2 178856026 178856182 -2891905 + MLT2B1 LTR ERVL 3 172 -348 5 1949 532 271 65 48 chr2 178856181 178856367 -2891720 - MTEb LTR MaLR -93 286 98 5 1949 231 150 0 0 chr2 178856385 178856425 -2891662 - MTEb LTR MaLR -337 42 3 5 1949 1494 194 143 14 chr2 178858782 178859152 -2888935 + MTD LTR MaLR 1 418 -1 5 1949 537 318 113 19 chr2 178866226 178866492 -2881595 - MTD LTR MaLR -128 291 1 5 1949 298 317 85 28 chr2 178874054 178874215 -2873872 - RMER15 LTR ERVL -2 573 402 5 1949 2311 127 61 19 chr2 178874215 178874593 -2873494 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 5 1949 298 317 85 28 chr2 178874593 178874642 -2873445 - RMER15 LTR ERVL -174 401 351 5 1949 1182 254 122 19 chr2 178880216 178880585 -2867502 + MTD LTR MaLR 1 407 -12 5 1949 247 200 0 0 chr2 178880603 178880643 -2867444 - MLT1D LTR MaLR -82 423 384 5 1949 832 272 65 81 chr2 178882329 178882713 -2865374 + MTE2a LTR MaLR 2 379 0 5 1949 307 341 5 109 chr2 178883731 178883915 -2864172 + MamGypLTR2b LTR Gypsy 685 849 -73 5 1949 3197 67 2 17 chr2 178898396 178898809 -2849278 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 5 1949 4836 137 81 26 chr2 178899580 178900422 -2847665 - RMER19B LTR ERVK -14 888 1 5 1949 232 262 49 0 chr2 178901758 178901819 -2846268 + MLT1D LTR MaLR 22 85 -420 5 1949 374 294 220 42 chr2 178903827 178904068 -2844019 + MER21B LTR ERV1 474 757 -106 5 1949 1987 177 27 47 chr2 178905280 178905730 -2842357 + RMER10A LTR ERVL 2 442 0 5 1949 1262 265 51 40 chr2 178906235 178906608 -2841479 - MTE2b LTR MaLR -2 377 1 5 1950 548 236 178 30 chr2 178920767 178920964 -2827123 + ORR1E LTR MaLR 132 357 -2 5 1950 487 279 42 12 chr2 178921262 178921429 -2826658 - MLT1C LTR MaLR -41 426 255 5 1950 260 326 43 0 chr2 178921448 178921540 -2826547 - MLT1C LTR MaLR -273 194 99 5 1950 364 310 103 96 chr2 178924873 178925155 -2822932 + MLT1A LTR MaLR 91 374 0 5 1950 627 338 52 11 chr2 178932479 178932751 -2815336 + MER70A LTR ERVL 121 403 -69 6 1950 3899 145 61 18 chr2 178936129 178936482 -2811605 + RMER6A LTR ERVK 1 383 -373 6 1950 3899 145 61 18 chr2 178936539 178936910 -2811177 + RMER6A LTR ERVK 384 756 0 6 1950 371 315 73 43 chr2 178938536 178938768 -2809319 - RLTR42-int LTR ERVK -4136 1386 1148 6 1950 1450 246 41 20 chr2 178940004 178940345 -2807742 + ORR1E LTR MaLR 5 352 -7 6 1950 996 293 120 23 chr2 178946705 178947190 -2800897 - MT2A LTR ERVL -1 532 1 6 1950 351 340 241 4 chr2 178961632 178961898 -2786189 + MLT1E LTR MaLR 321 649 -4 6 1950 1560 113 2 9 chr2 178966152 178966401 -2781686 + ORR1A4 LTR MaLR 111 394 0 6 1950 701 233 37 0 chr2 178966407 178966596 -2781491 - MLT2B4 LTR ERVL -356 200 5 6 1950 239 282 78 52 chr2 178968027 178968143 -2779944 + MT2A LTR ERVL 4 122 -411 6 1950 1148 248 111 21 chr2 178968052 178968386 -2779701 + MTD LTR MaLR 56 419 0 6 1950 952 247 53 118 chr2 178969002 178969323 -2778764 + MTD LTR MaLR 14 313 -106 6 1950 3124 138 4 16 chr2 178970259 178970773 -2777314 - RLTR28 LTR ERVL -16 508 1 6 1950 238 268 54 126 chr2 178971765 178971811 -2776276 - MTEa LTR MaLR -18 361 320 6 1950 440 264 62 27 chr2 178972007 178972138 -2775949 - MTEa LTR MaLR -60 319 147 6 1950 585 277 111 52 chr2 178974860 178975130 -2772957 - ORR1E LTR MaLR -71 288 3 6 1950 236 356 22 164 chr2 178976087 178976319 -2771768 + MLT1A1 LTR MaLR 6 204 -204 6 1950 445 277 82 17 chr2 178985194 178985469 -2762618 - ORR1E LTR MaLR -26 353 31 6 1950 841 207 212 95 chr2 178986350 178986676 -2761411 - ORR1D2 LTR MaLR -6 364 1 6 1950 2029 202 50 8 chr2 178988187 178988585 -2759502 - MTD LTR MaLR -1 418 4 6 1950 1962 172 36 17 chr2 178988697 178989057 -2759030 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 6 1950 2124 75 81 0 chr2 178994778 178995073 -2753014 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 7 1950 1880 143 63 38 chr2 178996361 178996680 -2751407 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 7 1950 1267 248 91 11 chr2 178998246 178998597 -2749490 + MTEa LTR MaLR 1 379 0 7 1950 259 297 69 48 chr2 179002744 179002807 -2745280 - MER90a LTR ERV1 -87 527 462 4 1950 860 287 310 36 chr2 179002807 179003230 -2744857 - RMER15 LTR ERVL 0 575 38 5 1950 234 186 95 54 chr2 179003868 179003942 -2744145 + RLTR13D4 LTR ERVK 275 351 -682 8 1950 1808 111 7 31 chr2 179006422 179006710 -2741377 - MT2B LTR ERVL -3 598 318 1 1950 4226 115 23 62 chr2 179006820 179007601 -2740486 - RMER17A LTR ERVK 0 751 1 1 1950 2267 124 4 82 chr2 179007865 179008267 -2739820 - MT2B LTR ERVL -248 353 1 1 1950 1243 239 148 6 chr2 179010188 179010533 -2737554 + MTD LTR MaLR 13 406 -13 1 1950 648 244 219 98 chr2 179012243 179012569 -2735518 - MTE2a LTR MaLR -14 365 1 1 1950 330 301 108 96 chr2 179012760 179013010 -2735077 + ORR1E LTR MaLR 102 354 -5 1 1950 3017 85 22 0 chr2 179020540 179020953 -2727134 + BGLII_Mus LTR ERVK 1 422 0 2 1950 1590 247 83 8 chr2 179022113 179022497 -2725590 + MTD LTR MaLR 7 419 0 3 1950 366 292 57 75 chr2 179023397 179023556 -2724531 + RMER15 LTR ERVL 417 572 -3 3 1950 2873 39 2 126 chr2 179033219 179033664 -2714423 + RLTR10 LTR ERVK 1 390 0 4 1950 16207 21 8 13 chr2 179033673 179035628 -2712459 + RLTR10-int LTR ERVK 39 1984 -3 4 1950 2910 34 2 126 chr2 179035630 179036073 -2712014 + RLTR10 LTR ERVK 1 388 -2 4 1951 2202 182 133 7 chr2 179047106 179047571 -2700516 + RLTR28 LTR ERVL 1 524 0 5 1951 2503 71 35 0 chr2 179048268 179048606 -2699481 + MTB LTR MaLR 9 358 -42 5 1951 1180 228 77 141 chr2 179048814 179049175 -2698912 + MTE2b LTR MaLR 2 342 -37 5 1951 3128 34 44 15 chr2 179049175 179049564 -2698523 - MTB LTR MaLR 0 400 1 5 1951 1180 228 77 141 chr2 179049564 179049606 -2698481 + MTE2b LTR MaLR 343 379 0 5 1951 979 266 145 18 chr2 179050676 179051041 -2697046 - MT2A LTR ERVL 0 533 120 5 1951 2956 163 25 8 chr2 179051041 179051555 -2696532 - RLTR28 LTR ERVL -1 523 1 5 1951 414 293 16 41 chr2 179051555 179051676 -2696411 - MTEa LTR MaLR -250 129 12 6 1951 3360 38 10 2 chr2 179052050 179052443 -2695644 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 1951 1053 235 67 90 chr2 179053711 179054099 -2693988 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 6 1951 282 366 7 58 chr2 179054156 179054295 -2693792 - LTR16C LTR ERVL -12 477 346 6 1951 5705 164 44 34 chr2 179055218 179056289 -2691798 - MTC-int LTR MaLR -21 1237 156 6 1951 1659 134 24 0 chr2 179056284 179056537 -2691550 + MTC LTR MaLR 20 278 -143 6 1951 1847 171 0 89 chr2 179060728 179061133 -2686954 + MERVL_2A-int LTR ERVL 5240 5608 -153 7 1951 277 260 50 38 chr2 179061133 179061213 -2686874 + ORR1A3-int LTR MaLR 544 624 -1339 7 1951 280 300 44 11 chr2 179061204 179061295 -2686792 + ORR1A3-int LTR MaLR 546 639 -1324 7 1951 301 196 0 0 chr2 179061295 179061351 -2686736 + MERVL_2A-int LTR ERVL 5706 5761 0 7 1951 402 179 46 35 chr2 179061351 179061438 -2686649 + MT2B2 LTR ERVL 1 88 -496 7 1951 1116 168 115 21 chr2 179061461 179061704 -2686383 - MTC-int LTR MaLR -988 270 5 7 1951 1247 207 41 78 chr2 179061708 179062069 -2686018 - MT2B LTR ERVL 0 601 94 7 1951 894 187 0 45 chr2 179062075 179062254 -2685833 + MTC-int LTR MaLR 234 404 -854 7 1951 1372 190 37 80 chr2 179062231 179062608 -2685479 + MTC-int LTR MaLR 898 1258 0 7 1951 2272 150 91 0 chr2 179062608 179062994 -2685093 + MTC LTR MaLR 1 421 0 7 1951 515 267 294 43 chr2 179063240 179063541 -2684546 - MTE2a LTR MaLR 0 379 3 7 1951 1131 290 59 3 chr2 179063680 179063982 -2684105 + MTEa LTR MaLR 1 313 -66 7 1951 1131 290 59 3 chr2 179064158 179064211 -2683876 + MTEa LTR MaLR 314 375 -4 7 1951 228 254 36 126 chr2 179070339 179070506 -2677581 - MLT1D LTR MaLR -142 363 212 8 1951 1094 180 48 5 chr2 179073099 179073306 -2674781 - MTD LTR MaLR -5 414 199 8 1951 255 229 92 79 chr2 179073275 179073351 -2674736 - MTD LTR MaLR -342 77 1 8 1951 1282 213 48 152 chr2 179073502 179073939 -2674148 + MTD LTR MaLR 13 379 0 8 1951 296 280 102 85 chr2 179076915 179077161 -2670926 - ORR1D2 LTR MaLR -49 321 72 9 1951 851 248 124 119 chr2 179081021 179081391 -2666696 + MTE2a LTR MaLR 6 377 -2 9 1951 1120 176 128 44 chr2 179081626 179081900 -2666187 - MTD LTR MaLR -120 299 3 9 1951 1749 233 28 11 chr2 179086286 179086484 -2661603 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 174 9 1951 1749 233 28 11 chr2 179086538 179086703 -2661384 - ORR1D1 LTR MaLR -201 173 5 9 1951 510 229 142 78 chr2 179090880 179091098 -2656989 - RMER4B LTR ERVK 0 585 354 1 1951 245 311 156 63 chr2 179097479 179097716 -2650371 - MLT1D LTR MaLR -168 337 79 1 1951 236 266 145 34 chr2 179101303 179101420 -2646667 - MLT1A1 LTR MaLR -18 390 261 1 1951 2387 168 64 0 chr2 179101606 179101999 -2646088 - MTC LTR MaLR -2 419 2 1 1951 453 278 7 67 chr2 179102616 179102692 -2645395 + MLT1D LTR MaLR 1 70 -435 1 1951 453 278 7 67 chr2 179102876 179102934 -2645153 + MLT1D LTR MaLR 71 127 -378 1 1951 557 227 205 106 chr2 179103837 179104157 -2643930 + ORR1E LTR MaLR 2 356 -3 1 1951 300 328 77 15 chr2 179107839 179107969 -2640118 + RMER15 LTR ERVL 424 561 -14 1 1951 794 214 187 4 chr2 179108623 179108848 -2639239 + MTEb LTR MaLR 100 365 -14 1 1951 257 207 138 0 chr2 179112250 179112308 -2635779 - MLT2B4 LTR ERVL -109 447 382 1 1951 792 208 67 114 chr2 179112920 179113278 -2634809 + RLTR15 LTR ERVK 2 342 -17 1 1951 1528 205 54 83 chr2 179115677 179116050 -2632037 + MTE2b LTR MaLR 16 377 -2 1 1951 1455 209 103 3 chr2 179121579 179121891 -2626196 + MTEa LTR MaLR 7 349 -30 1 1951 336 339 110 0 chr2 179124204 179124322 -2623765 - MT2A LTR ERVL -135 398 268 1 1951 326 346 38 11 chr2 179124353 179124372 -2623715 - MT2A LTR ERVL -343 190 2 1 1951 582 276 36 12 chr2 179124372 179124537 -2623550 - MTEa LTR MaLR -209 170 2 1 1951 557 253 41 94 chr2 179126417 179126587 -2621500 - MTEa LTR MaLR 0 379 219 1 1951 1005 233 72 14 chr2 179126908 179127130 -2620957 - MTEa LTR MaLR -137 242 8 1 1951 273 359 75 17 chr2 179127840 179128013 -2620074 + RMER15 LTR ERVL 377 559 -16 1 1951 2324 124 65 72 chr2 179131295 179131728 -2616359 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 1 1 1951 425 223 158 63 chr2 179134422 179134580 -2613507 - MTE2a LTR MaLR -1 378 206 1 1951 453 339 78 46 chr2 179139183 179139467 -2608620 - MT2A LTR ERVL -68 465 173 1 1951 298 297 122 7 chr2 179139470 179139609 -2608478 - MTEb LTR MaLR -224 155 1 1 1951 231 361 75 25 chr2 179140235 179140394 -2607693 + MLT1H LTR MaLR 31 197 -352 1 1951 546 257 194 32 chr2 179145954 179146207 -2601880 + MTE2a LTR MaLR 84 377 -2 2 1951 1508 243 70 13 chr2 179146316 179146699 -2601388 - MTD LTR MaLR -14 405 1 2 1951 484 276 144 38 chr2 179152164 179152475 -2595612 - ORR1E LTR MaLR -8 362 1 2 1951 1542 307 97 41 chr2 179152475 179153108 -2594979 - ORR1E-int LTR MaLR -55 1525 856 2 1951 288 342 56 56 chr2 179153130 179153328 -2594759 - ORR1E-int LTR MaLR -861 719 522 2 1951 2046 119 9 51 chr2 179153834 179154170 -2593917 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 322 0 2 1951 447 235 36 135 chr2 179155681 179155722 -2592365 - MTC LTR MaLR -232 164 123 2 1951 447 213 44 119 chr2 179155924 179156066 -2592021 - MTC LTR MaLR -289 132 2 2 1951 321 194 75 0 chr2 179157074 179157141 -2590946 + MLT1D LTR MaLR 59 130 -375 2 1951 377 181 9 62 chr2 179157362 179157474 -2590613 + ORR1B1 LTR MaLR 40 145 -249 2 1951 259 172 10 103 chr2 179157481 179157562 -2590525 + ORR1A2 LTR MaLR 41 112 -255 2 1951 1287 150 62 42 chr2 179157562 179157939 -2590148 + ORR1A2 LTR MaLR 1 357 -2 2 1951 435 246 63 84 chr2 179162039 179162230 -2585857 + RLTR23 LTR ERV1 244 430 0 2 1951 278 312 73 80 chr2 179162536 179162825 -2585262 + MLT1K LTR MaLR 248 534 -61 2 1951 1092 255 123 19 chr2 179168376 179168700 -2579387 - MTD LTR MaLR -31 388 31 2 1951 2085 153 72 10 chr2 179169060 179169449 -2578638 + MTC LTR MaLR 1 413 -8 2 1951 1973 115 76 0 chr2 179170980 179171284 -2576803 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 2 1952 234 302 134 0 chr2 179175776 179175895 -2572192 + RMER15 LTR ERVL 426 560 -15 2 1952 1520 191 110 0 chr2 179188354 179188700 -2559387 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 2 1952 271 301 183 24 chr2 179189197 179189405 -2558682 - MLT1D LTR MaLR -63 442 202 2 1952 811 286 134 32 chr2 179190310 179190653 -2557434 - MTEa LTR MaLR 0 379 2 2 1952 2208 262 58 55 chr2 179190656 179191380 -2556707 - MTEa-int LTR MaLR -2 1578 853 2 1952 392 286 134 33 chr2 179201019 179201348 -2546739 + MLT1A0 LTR MaLR 1 362 -3 2 1952 1791 194 42 8 chr2 179201959 179202360 -2545727 + MTD LTR MaLR 5 419 0 2 1952 542 313 111 64 chr2 179204398 179204695 -2543392 + ORR1E LTR MaLR 44 354 -5 2 1952 285 287 169 22 chr2 179217066 179217244 -2530843 + MLT1D LTR MaLR 1 204 -301 3 1952 1173 290 21 0 chr2 179219793 179220076 -2528011 - MTEa LTR MaLR -87 292 4 3 1952 564 268 25 25 chr2 179230828 179230985 -2517102 + MTEa LTR MaLR 211 367 -12 3 1952 960 253 54 127 chr2 179231060 179231232 -2516855 - MTD LTR MaLR -15 404 236 3 1952 960 253 54 127 chr2 179231308 179231560 -2516527 - MTD LTR MaLR -184 235 11 3 1952 735 229 13 6 chr2 179231964 179232122 -2515965 - ORR1E LTR MaLR -200 159 1 3 1952 414 286 72 30 chr2 179238736 179238902 -2509185 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 236 3 1952 1022 264 88 17 chr2 179245920 179246231 -2501856 + MTE2b LTR MaLR 1 337 -42 3 1952 1022 264 88 17 chr2 179246410 179246452 -2501635 + MTE2b LTR MaLR 338 379 0 3 1952 523 276 7 22 chr2 179249922 179250059 -2498028 + RMER15 LTR ERVL 422 556 -19 3 1952 1184 248 62 85 chr2 179250329 179250717 -2497370 - MTE2a LTR MaLR 0 379 1 3 1952 260 294 82 100 chr2 179259056 179259226 -2488861 + LTR48 LTR ERV1 3 169 -618 3 1952 235 357 99 23 chr2 179261372 179261544 -2486543 - MTC LTR MaLR -101 320 136 3 1952 593 316 45 74 chr2 179265105 179265457 -2482630 + MTEa LTR MaLR 37 378 -1 3 1952 4674 47 9 2 chr2 179276283 179276839 -2471248 - LTRIS2 LTR ERV1 0 564 5 4 1952 1007 271 57 73 chr2 179280272 179280655 -2467432 - MTEa LTR MaLR -2 377 1 4 1952 271 312 30 30 chr2 179280901 179281000 -2467087 - MLT1D LTR MaLR -111 394 296 4 1952 1213 244 26 101 chr2 179281187 179281574 -2466513 + MTE2a LTR MaLR 15 372 -7 4 1952 317 338 78 63 chr2 179284063 179284382 -2463705 + ORR1E LTR MaLR 4 327 -32 4 1952 1425 279 27 38 chr2 179286981 179287354 -2460733 + MTE2b LTR MaLR 7 375 -4 4 1952 281 277 170 70 chr2 179289914 179290155 -2457932 - MLT2D LTR ERVL -3 411 147 4 1952 354 314 28 28 chr2 179291079 179291223 -2456864 + MLT1J LTR MaLR 37 180 -332 4 1952 271 297 21 76 chr2 179291363 179291651 -2456436 - RMER17D LTR ERVK -416 473 202 4 1952 254 318 173 0 chr2 179293553 179293663 -2454424 - MLT1D LTR MaLR -354 151 23 4 1952 1240 228 90 47 chr2 179301146 179301468 -2446619 - ORR1D2 LTR MaLR -7 363 28 4 1952 1691 130 180 3 chr2 179301469 179301786 -2446301 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 6 4 1952 1332 216 24 132 chr2 179303203 179303620 -2444467 + MTE2a LTR MaLR 8 379 0 4 1952 245 361 52 15 chr2 179305705 179305840 -2442247 - MER21B LTR ERV1 -225 638 499 4 1952 525 286 34 13 chr2 179306078 179306227 -2441860 - MER21B LTR ERV1 -691 172 21 4 1953 303 301 178 66 chr2 179309134 179309347 -2438740 - ORR1D2 LTR MaLR -66 304 68 4 1953 232 267 48 79 chr2 179314158 179314284 -2433803 + RMER12 LTR ERVK 733 854 -468 4 1953 868 223 73 15 chr2 179324649 179324995 -2423092 + BGLII_B LTR ERVK 1 424 -17 4 1953 1890 157 127 14 chr2 179325062 179325431 -2422656 - MTC LTR MaLR -2 419 9 4 1953 251 266 82 31 chr2 179329124 179329221 -2418866 + LTR68 LTR ERV1 289 390 -350 4 1953 1837 60 8 0 chr2 179342114 179342349 -2405738 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 91 4 1953 417 300 99 93 chr2 179345037 179345390 -2402697 + ORR1E LTR MaLR 1 355 -4 4 1953 1591 36 0 5 chr2 179347156 179347353 -2400734 - RLTR45-int LTR ERVK -5720 1524 1329 4 1953 1086 58 0 0 chr2 179348149 179348287 -2399800 - RLTR45-int LTR ERVK -6426 818 681 4 1953 4033 66 136 15 chr2 179348585 179349202 -2398885 - RLTR45-int LTR ERVK -6552 692 1 4 1953 3157 77 24 118 chr2 179349202 179349734 -2398353 - RLTR45 LTR ERVK 0 482 1 4 1953 324 304 47 16 chr2 179350258 179350385 -2397702 - RMER12 LTR ERVK -468 854 724 4 1953 1622 161 58 126 chr2 179351014 179351426 -2396661 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 4 1953 4673 228 151 12 chr2 179351426 179352629 -2395458 + ORR1C2-int LTR MaLR 1 1370 0 4 1953 1806 130 188 6 chr2 179352629 179352954 -2395133 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 4 1953 1747 189 57 11 chr2 179353243 179353597 -2394490 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 5 4 1953 412 291 124 14 chr2 179359568 179359777 -2388310 - ORR1E LTR MaLR -127 232 1 5 1953 1123 285 124 118 chr2 179359777 179360418 -2387669 - MTE-int LTR MaLR -53 1527 883 5 1953 252 321 54 118 chr2 179360528 179360671 -2387416 - MTE-int LTR MaLR -937 643 510 5 1953 1088 310 46 73 chr2 179360777 179361155 -2386932 - MTE-int LTR MaLR -856 515 63 5 1953 819 259 156 95 chr2 179362091 179362449 -2385638 + MTD LTR MaLR 10 389 -11 5 1953 2199 97 51 0 chr2 179367595 179367906 -2380181 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 5 1953 1132 252 106 49 chr2 179371900 179372250 -2375837 - MTEa LTR MaLR -4 375 6 5 1953 426 235 11 50 chr2 179379262 179379431 -2368656 - MTEa LTR MaLR -5 365 202 5 1953 428 252 65 29 chr2 179393729 179393868 -2354219 - MLT1B LTR MaLR -129 261 118 5 1953 279 325 25 33 chr2 179396484 179396605 -2351482 + MLT1I LTR MaLR 31 150 -261 5 1953 3168 144 40 24 chr2 179413659 179414235 -2333852 - RMER4B LTR ERVK 0 585 1 5 1953 2092 160 51 2 chr2 179418773 179419168 -2328919 - MTC LTR MaLR -5 416 3 5 1953 340 282 29 0 chr2 179419202 179419305 -2328782 - MLT1D LTR MaLR -64 441 336 5 1953 255 328 148 0 chr2 179426330 179426458 -2321629 + MLT1D LTR MaLR 41 187 -318 5 1953 234 253 30 59 chr2 179426510 179426611 -2321476 + MLT1D LTR MaLR 277 374 -131 5 1953 267 356 24 108 chr2 179436583 179436750 -2311337 + MER21B LTR ERV1 19 171 -692 6 1954 1928 153 78 0 chr2 179449631 179449964 -2298123 - ORR1B2 LTR MaLR -8 359 1 6 1954 1848 219 24 5 chr2 179450485 179450862 -2297225 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 6 1954 860 175 256 26 chr2 179462595 179462865 -2285222 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 39 6 1954 1393 203 258 18 chr2 179465394 179465851 -2282236 - RMER15 LTR ERVL 0 575 9 6 1954 606 296 90 35 chr2 179465905 179466161 -2281926 + ORR1E LTR MaLR 41 310 -49 6 1954 246 317 86 82 chr2 179474283 179474503 -2273584 + MLT1D LTR MaLR 22 242 -263 6 1954 503 295 140 26 chr2 179475992 179476263 -2271824 - RMER15 LTR ERVL -1 574 273 6 1954 490 332 41 32 chr2 179478342 179478563 -2269524 - MLT1C LTR MaLR -19 448 226 6 1954 248 345 57 14 chr2 179483565 179483706 -2264381 + RLTR22_Mus LTR ERVK 1243 1389 -419 6 1954 241 316 136 7 chr2 179499730 179499870 -2248217 - MTD LTR MaLR -227 192 35 6 1954 227 306 53 18 chr2 179499887 179500000 -2248087 - RLTR15 LTR ERVK -21 338 222 6 1954 275 319 32 11 chr2 179501710 179501805 -2246282 + LTR65 LTR ERV1 573 669 0 4 1954 3397 13 5 0 chr2 179512431 179512825 -2235262 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 1954 282 279 125 0 chr2 179522571 179522675 -2225412 + MLT1C LTR MaLR 183 299 -168 4 1954 930 240 108 40 chr2 179537857 179538208 -2209879 + MTEa LTR MaLR 1 375 -4 6 1954 1343 222 176 16 chr2 179540786 179541211 -2206876 - MT2A LTR ERVL -40 493 1 6 1954 1241 250 46 24 chr2 179541459 179541787 -2206300 - MTEa LTR MaLR -13 366 32 6 1954 440 304 131 52 chr2 179544007 179544336 -2203751 + ORR1E LTR MaLR 2 356 -3 7 1954 468 356 103 30 chr2 179544564 179544961 -2203126 - MLT1D LTR MaLR -46 459 34 7 1954 282 287 36 112 chr2 179551017 179551268 -2196819 + RMER12B LTR ERVK 890 1078 -326 8 1954 2117 116 79 49 chr2 179555542 179555949 -2192138 + MTC LTR MaLR 3 421 0 9 1954 270 369 72 43 chr2 179563196 179563403 -2184684 - MLT2B4 LTR ERVL -322 234 22 1 1955 480 254 8 0 chr2 179570369 179570487 -2177600 - RMER15-int LTR ERVL -11 4988 4870 1 1955 272 236 39 147 chr2 179574425 179574554 -2173533 + MT2B LTR ERVL 143 257 -344 1 1955 2017 137 67 20 chr2 179574931 179575289 -2172798 - ORR1B1 LTR MaLR -19 375 1 1 1955 268 275 15 13 chr2 179575289 179575376 -2172711 - ORR1B1-int LTR MaLR -1030 933 791 1 1955 1557 186 23 25 chr2 179575452 179575806 -2172281 - ORR1B1-int LTR MaLR -869 640 288 1 1955 700 245 109 47 chr2 179582312 179582650 -2165437 - RLTR15 LTR ERVK 0 359 1 1 1955 446 322 17 96 chr2 179586373 179586665 -2161422 + ORR1E LTR MaLR 85 353 -6 1 1955 311 321 75 47 chr2 179587052 179587330 -2160757 - ORR1E LTR MaLR -20 339 54 1 1955 4103 127 102 6 chr2 179592263 179593030 -2155057 - RMER17B LTR ERVK -148 810 1 1 1955 2127 98 3 7 chr2 179600657 179600964 -2147123 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 22 1 1955 1357 208 159 19 chr2 179610620 179610977 -2137110 - MTD LTR MaLR 0 419 13 1 1955 1136 204 142 7 chr2 179614864 179615145 -2132942 + MTEb LTR MaLR 61 379 0 1 1955 355 350 40 0 chr2 179618730 179618899 -2129188 + MLT1D LTR MaLR 18 203 -302 1 1955 895 231 153 123 chr2 179618901 179618946 -2129141 - MTD LTR MaLR 0 419 390 1 1955 895 231 153 123 chr2 179619090 179619129 -2128958 - MTD LTR MaLR -30 389 350 1 1955 895 231 153 123 chr2 179619312 179619631 -2128456 - MTD LTR MaLR -70 349 4 1 1955 230 261 193 0 chr2 179619752 179619840 -2128247 + MLT1D LTR MaLR 354 458 -47 1 1955 2316 83 6 0 chr2 179638421 179638745 -2109342 - ORR1A2 LTR MaLR -1 326 1 2 1955 411 198 104 47 chr2 179640850 179640956 -2107131 + MTE2b LTR MaLR 205 316 -63 2 1955 3650 172 91 32 chr2 179640957 179641089 -2106998 + RMER19B LTR ERVK 1 129 -773 2 1955 3650 172 91 32 chr2 179641282 179641995 -2106092 + RMER19B LTR ERVK 130 895 -7 2 1955 1424 240 97 86 chr2 179643866 179644151 -2103936 - RMER4B LTR ERVK 0 585 305 2 1955 4213 106 92 0 chr2 179644151 179644772 -2103315 + RLTR33 LTR ERVK 1 678 0 2 1955 1424 240 97 86 chr2 179644772 179645065 -2103022 - RMER4B LTR ERVK -281 304 1 2 1955 1274 196 124 7 chr2 179645198 179645496 -2102591 + MTE2b LTR MaLR 34 366 -13 2 1955 452 289 110 47 chr2 179646262 179646516 -2101571 + MLT1B LTR MaLR 35 304 -86 2 1955 230 343 29 10 chr2 179649546 179649649 -2098438 + MamGypLTR1b LTR Gypsy 253 357 -425 2 1955 242 278 35 61 chr2 179652699 179652814 -2095273 + MT2B2 LTR ERVL 152 263 -321 2 1955 2344 144 200 16 chr2 179652972 179653466 -2094621 + RMER4B LTR ERVK 1 585 0 2 1955 744 279 106 100 chr2 179665279 179665655 -2082432 - MTE2a LTR MaLR -6 373 7 2 1955 1361 201 132 12 chr2 179684119 179684452 -2063635 - MTD LTR MaLR -8 411 39 2 1955 308 83 104 0 chr2 179688603 179688651 -2059436 + MT2A LTR ERVL 1 53 -480 2 1955 1659 140 18 14 chr2 179688646 179688929 -2059158 + MT2A LTR ERVL 172 455 -78 2 1955 1339 240 33 36 chr2 179690419 179690838 -2057249 - MTD LTR MaLR 0 419 2 2 1955 2080 102 11 69 chr2 179698788 179699137 -2048950 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 2 1956 276 310 163 25 chr2 179715368 179715570 -2032517 - ORR1D2 LTR MaLR -105 265 36 3 1956 325 83 104 0 chr2 179723087 179723135 -2024952 + MT2A LTR ERVL 1 53 -480 3 1956 1636 185 25 50 chr2 179723130 179723494 -2024593 + MT2A LTR ERVL 172 526 -7 3 1956 1226 262 43 41 chr2 179723651 179724088 -2023999 - RLTR12B LTR ERVK -43 485 48 3 1956 954 61 2 0 chr2 179733158 179733292 -2014795 - MTB LTR MaLR 0 407 272 3 1956 695 58 0 0 chr2 179733282 179733369 -2014718 - MTB LTR MaLR -320 87 1 3 1956 364 264 110 0 chr2 179736258 179736349 -2011738 + MLT1C LTR MaLR 311 411 -56 3 1956 708 235 203 8 chr2 179737038 179737274 -2010813 - MT2A LTR ERVL 0 533 252 3 1956 709 249 180 67 chr2 179737357 179737673 -2010414 - MTD LTR MaLR -2 377 39 3 1956 272 305 88 38 chr2 179738863 179739023 -2009064 - MLT2B1 LTR ERVL -71 496 329 3 1956 2143 105 68 7 chr2 179739546 179739854 -2008233 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 4 1956 1086 229 115 21 chr2 179741864 179742150 -2005937 + MTEb LTR MaLR 23 335 -44 4 1956 2263 133 88 3 chr2 179743209 179743572 -2004515 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 4 1956 2121 124 156 22 chr2 179744679 179745050 -2003037 - MTC LTR MaLR 0 421 1 4 1956 317 207 0 0 chr2 179746559 179746617 -2001470 - MTE2b LTR MaLR -1 378 321 4 1956 821 306 60 16 chr2 179747747 179747999 -2000088 - MTE2b LTR MaLR -43 336 74 4 1956 366 208 14 14 chr2 179748330 179748403 -1999684 - MTE2b LTR MaLR -306 73 1 4 1956 449 276 40 24 chr2 179751599 179751725 -1996362 - RMER15 LTR ERVL -15 560 433 4 1956 3065 144 28 38 chr2 179752317 179752895 -1995192 + RMER15 LTR ERVL 4 575 0 4 1956 319 134 0 69 chr2 179753552 179753624 -1994463 - RMER15 LTR ERVL -116 459 393 4 1956 2038 161 83 47 chr2 179774712 179775155 -1972932 + RMER6B LTR ERVK 3 461 0 4 1956 280 281 113 80 chr2 179779596 179779809 -1968278 - MLT1C LTR MaLR -102 365 146 4 1956 3269 166 91 65 chr2 179781554 179781800 -1966287 + RMER6D LTR ERVK 1 299 -421 4 1956 3269 166 91 65 chr2 179781833 179781876 -1966211 + RMER6D LTR ERVK 300 343 -377 4 1956 3269 166 91 65 chr2 179782051 179782089 -1965998 + RMER6D LTR ERVK 344 369 -351 4 1956 3269 166 91 65 chr2 179782118 179782138 -1965949 + RMER6D LTR ERVK 370 385 -335 4 1956 3269 166 91 65 chr2 179782180 179782531 -1965556 + RMER6D LTR ERVK 386 719 -1 4 1956 791 261 81 83 chr2 179783217 179783589 -1964498 - RMER15 LTR ERVL -171 404 34 4 1956 320 277 48 12 chr2 179783625 179783709 -1964378 - MTE2b LTR MaLR -218 161 75 4 1956 239 310 17 50 chr2 179789227 179789346 -1958741 - MT2B LTR ERVL -320 281 167 4 1956 450 291 117 5 chr2 179795598 179795795 -1952292 - MLT1C LTR MaLR -72 395 177 5 1956 1132 173 254 10 chr2 179795893 179796196 -1951891 - MTEb LTR MaLR 0 379 3 5 1956 1173 173 41 58 chr2 179809092 179809422 -1938665 + ORR1A3 LTR MaLR 14 318 -8 5 1956 1827 97 168 66 chr2 179811415 179811484 -1936603 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 299 5 1956 1827 97 168 66 chr2 179811867 179812125 -1935962 - ORR1B2 LTR MaLR -69 298 1 5 1956 275 321 82 110 chr2 179812529 179812774 -1935313 - MER21B LTR ERV1 -621 242 5 5 1956 284 208 39 0 chr2 179825996 179826073 -1922014 + MTE-int LTR MaLR 66 145 -1435 5 1956 3479 35 2 0 chr2 179826130 179826525 -1921562 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 1956 9514 29 2 2 chr2 179826525 179827623 -1920464 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 5 1956 3562 23 2 0 chr2 179827623 179828018 -1920069 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 1956 273 269 156 9 chr2 179828412 179828521 -1919566 + MTE-int LTR MaLR 323 447 -1133 5 1956 803 304 27 53 chr2 179828660 179828959 -1919128 + MTE-int LTR MaLR 983 1273 -307 5 1957 260 287 92 0 chr2 179853056 179853143 -1894944 - MLT1K LTR MaLR -44 551 457 5 1957 639 64 18 9 chr2 179859807 179859917 -1888170 + MT-int LTR MaLR 917 1027 -71 6 1957 769 303 67 74 chr2 179864611 179864852 -1883235 - RMER5 LTR ERV1 -91 443 215 6 1957 769 303 67 74 chr2 179864999 179865202 -1882885 - RMER5 LTR ERV1 -320 214 2 6 1957 236 139 23 0 chr2 179865550 179865593 -1882494 - MT2C_Mm LTR ERVL -240 235 192 6 1957 322 295 59 52 chr2 179868312 179868448 -1879639 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 272 6 1957 261 284 9 113 chr2 179869115 179869230 -1878857 - MT2B LTR ERVL -312 289 187 6 1957 569 195 192 66 chr2 179874330 179874528 -1873559 - MTD LTR MaLR -1 418 196 6 1957 886 193 34 53 chr2 179874601 179874809 -1873278 - MTD LTR MaLR -208 211 8 6 1957 227 260 127 24 chr2 179876819 179876945 -1871142 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 227 6 1957 3151 57 18 3 chr2 179877492 179877882 -1870205 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 1957 4148 13 46 0 chr2 179888765 179889226 -1858861 + LTRIS_Mm LTR ERV1 1 482 0 6 1957 509 228 168 0 chr2 179891603 179891850 -1856237 - MTD LTR MaLR -13 406 1 6 1957 321 282 47 0 chr2 179903080 179903165 -1844922 + MLT1A1 LTR MaLR 61 149 -259 7 1957 379 287 246 21 chr2 179942512 179942797 -1805290 + MLT1K LTR MaLR 136 484 -111 7 1957 549 162 13 150 chr2 179943191 179943344 -1804743 + ORR1E LTR MaLR 7 138 -221 7 1957 338 229 134 111 chr2 179943340 179943512 -1804575 + MT2B LTR ERVL 89 264 -337 7 1957 412 312 35 99 chr2 179943617 179943699 -1804388 + MTE-int LTR MaLR 45 122 -1458 7 1957 402 312 35 99 chr2 179943886 179943974 -1804113 + MTE-int LTR MaLR 123 204 -1376 7 1957 1287 321 213 26 chr2 179944328 179945210 -1802877 + MTE-int LTR MaLR 215 1261 -319 7 1957 352 227 182 0 chr2 179945736 179945868 -1802219 + ORR1D-int LTR MaLR 1137 1292 -78 7 1957 998 229 35 60 chr2 179946750 179947034 -1801053 - MTD LTR MaLR -141 278 2 7 1957 230 184 20 0 chr2 179947010 179947059 -1801028 - MTD-int LTR MaLR -12 1246 1197 7 1957 1402 250 140 97 chr2 179947254 179947410 -1800677 - MTD-int LTR MaLR -491 767 600 7 1957 1402 250 140 97 chr2 179947603 179947652 -1800435 - MTD-int LTR MaLR -659 599 523 7 1957 1402 250 140 97 chr2 179947833 179948095 -1799992 - MTD-int LTR MaLR -736 522 258 7 1957 1402 250 140 97 chr2 179948249 179948514 -1799573 - MTD-int LTR MaLR -1001 257 2 7 1957 677 247 368 0 chr2 179948516 179948785 -1799302 - MTD LTR MaLR -2 417 51 7 1958 1021 184 68 19 chr2 179976412 179976712 -1771375 + ORR1C2 LTR MaLR 8 383 -1 7 1958 3233 47 26 0 chr2 179976807 179977193 -1770894 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 7 1958 371 241 0 100 chr2 179978663 179978783 -1769304 - MT2B LTR ERVL -344 257 150 7 1958 2555 55 6 77 chr2 179978897 179978966 -1769121 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 285 7 1958 2555 55 6 77 chr2 179979107 179979389 -1768698 - ORR1A2 LTR MaLR -43 284 1 7 1958 523 84 0 0 chr2 179979389 179979460 -1768627 - ORR1A2-int LTR MaLR 0 1963 1893 7 1958 8239 140 42 128 chr2 179980218 179981167 -1766920 - ORR1A3-int LTR MaLR -75 1888 998 8 1958 2769 77 139 139 chr2 179981167 179981679 -1766408 - RLTR1B LTR ERV1 0 512 1 8 1958 8239 140 42 128 chr2 179981679 179982707 -1765380 - ORR1A3-int LTR MaLR -966 997 82 8 1958 263 351 19 81 chr2 179987226 179987299 -1760788 - MT2B LTR ERVL -341 152 90 8 1958 427 242 1 3 chr2 179987445 179987532 -1760555 - MT2B LTR ERVL -404 89 2 8 1958 247 235 25 183 chr2 179988694 179988814 -1759273 - MT2B LTR ERVL -351 250 150 8 1958 1480 142 136 94 chr2 179990497 179990871 -1757216 + RLTR28B LTR ERVL 48 437 -44 8 1958 916 195 188 36 chr2 180002125 180002395 -1745692 + MLT1B LTR MaLR 16 335 -55 6 1958 916 195 188 36 chr2 180002600 180002637 -1745450 + MLT1B LTR MaLR 336 370 -20 6 1958 747 276 85 101 chr2 180014775 180015199 -1732888 + MTD LTR MaLR 1 417 -2 1 1958 384 268 121 16 chr2 180025859 180026041 -1722046 + MLT1A0 LTR MaLR 2 202 -163 2 1958 531 201 121 34 chr2 180027260 180027409 -1720678 - RMER20B LTR ERVK -5 622 461 2 1958 701 242 244 54 chr2 180027513 180027924 -1720163 - RMER20B LTR ERVK -138 489 1 2 1958 2253 129 34 157 chr2 180029891 180030008 -1718079 - MTC LTR MaLR 0 421 360 3 1958 2253 129 34 157 chr2 180030520 180030871 -1717216 - MTC LTR MaLR -62 359 5 3 1958 512 256 179 86 chr2 180031573 180031864 -1716223 + MTE2a LTR MaLR 10 327 -52 4 1958 2123 105 22 0 chr2 180031895 180032208 -1715879 - ORR1A2 LTR MaLR -1 326 7 4 1958 2674 169 39 14 chr2 180033706 180034199 -1713888 - RLTR16 LTR ERVK 0 505 1 5 1958 476 234 83 13 chr2 180043607 180043779 -1704308 + MLT1C LTR MaLR 12 189 -316 7 1958 468 301 91 25 chr2 180046987 180047185 -1700902 - MLT1C LTR MaLR -245 222 12 7 1958 291 242 30 0 chr2 180047231 180047297 -1700790 + ORR1E LTR MaLR 46 113 -246 7 1958 3408 35 22 0 chr2 180051237 180051639 -1696448 + IAPLTR2a LTR ERVK 1 411 0 8 1958 266 319 102 0 chr2 180059607 180059764 -1688323 - RLTR21 LTR ERVK -326 1246 1074 9 1959 480 282 61 103 chr2 180094763 180095024 -1653063 + MTEb LTR MaLR 4 253 -126 1 1959 1879 204 32 25 chr2 180096108 180096510 -1651577 - MTD LTR MaLR -14 405 1 1 1959 3492 105 45 16 chr2 180110032 180110545 -1637542 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 1 1 1959 377 299 84 37 chr2 180112570 180112761 -1635326 - MLT1E1A LTR MaLR -62 618 419 1 1959 292 277 130 43 chr2 180117051 180117213 -1630874 - MLT1D LTR MaLR -107 398 223 1 1959 1298 294 47 6 chr2 180117302 180117661 -1630426 - MTEa LTR MaLR -5 374 1 1 1959 2342 96 9 61 chr2 180135901 180136245 -1611842 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 1 1959 233 332 82 48 chr2 180137283 180137514 -1610573 - RMER12 LTR ERVK -334 988 750 1 1959 302 299 58 29 chr2 180141660 180141798 -1606289 - MLT1K LTR MaLR -125 470 329 1 1959 633 303 97 16 chr2 180148590 180148838 -1599249 - RMER15 LTR ERVL -9 566 299 1 1959 243 277 0 0 chr2 180149939 180150004 -1598083 - MLT2D LTR ERVL 0 560 496 1 1959 269 270 108 23 chr2 180150212 180150341 -1597746 - MLT2D LTR ERVL -274 140 1 1 1959 455 127 0 60 chr2 180150885 180150969 -1597118 - MTB_Mm LTR MaLR -328 79 1 1 1959 1192 270 62 23 chr2 180152204 180152556 -1595531 + MTEa LTR MaLR 6 371 -8 1 1959 3620 86 294 19 chr2 180154213 180154791 -1593296 + RMER19A LTR ERVK 1 737 0 1 1959 410 236 142 0 chr2 180157517 180157623 -1590464 - MER74A LTR ERVL -437 121 1 1 1959 772 267 190 22 chr2 180165196 180165464 -1582623 + MTE2b LTR MaLR 67 379 0 2 1959 5405 98 33 23 chr2 180170814 180171692 -1576395 + RMER17B LTR ERVK 1 887 -71 2 1959 1545 163 4 14 chr2 180181225 180181505 -1566582 - MTD LTR MaLR 0 419 143 2 1959 310 284 30 28 chr2 180196385 180196501 -1551586 - MLT2B4 LTR ERVL -16 551 417 2 1959 2286 88 0 0 chr2 180210844 180211163 -1536924 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 2 1959 2317 78 14 72 chr2 180211597 180211943 -1536144 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 2 1959 233 250 60 103 chr2 180212734 180212850 -1535237 + MLT1F-int LTR MaLR 1250 1360 -129 2 1959 368 327 52 67 chr2 180220686 180220808 -1527279 - RMER15 LTR ERVL -2 573 453 2 1959 368 327 52 67 chr2 180221105 180221187 -1526900 - RMER15 LTR ERVL -123 452 367 2 1959 762 270 141 50 chr2 180221492 180221812 -1526275 + ORR1E LTR MaLR 11 359 0 2 1960 297 341 11 21 chr2 180224851 180224944 -1523143 - MER21B LTR ERV1 -771 92 1 2 1960 485 244 26 0 chr2 180225102 180225217 -1522870 - ORR1E LTR MaLR -241 118 1 2 1960 470 299 240 29 chr2 180226459 180226809 -1521278 + MER77 LTR ERVL 41 463 -144 2 1960 283 136 73 29 chr2 180240468 180240536 -1507551 + MTD LTR MaLR 349 419 0 3 1960 2367 78 22 0 chr2 180240554 180240874 -1507213 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 3 1960 316 336 155 17 chr2 180247127 180247424 -1500663 - MLT1C LTR MaLR -63 404 67 3 1960 876 262 95 92 chr2 180252197 180252554 -1495533 - MTEa LTR MaLR 0 379 22 3 1960 1862 181 78 23 chr2 180254677 180255000 -1493087 - MTC LTR MaLR 0 421 76 3 1960 1862 181 78 23 chr2 180255221 180255291 -1492796 - MTC LTR MaLR -346 75 6 3 1960 276 357 84 62 chr2 180255297 180255443 -1492644 - MLT1A1 LTR MaLR -17 391 255 3 1960 276 357 84 62 chr2 180255589 180255812 -1492275 - MLT1A1 LTR MaLR -154 254 15 3 1960 2393 72 60 0 chr2 180272461 180272809 -1475278 + MTA_Mm LTR MaLR 28 396 0 3 1960 469 279 131 10 chr2 180276503 180276702 -1471385 - MER68 LTR ERVL -202 361 139 3 1960 2215 178 22 2 chr2 180280946 180281357 -1466730 - MTC LTR MaLR -1 420 2 3 1960 4017 46 2 8 chr2 180283750 180284256 -1463831 + RLTR1C LTR ERV1 1 503 0 3 1960 282 252 115 49 chr2 180291485 180291738 -1456349 + MLT1C LTR MaLR 17 279 -226 3 1960 869 262 164 37 chr2 180298455 180299035 -1449052 + MER67C LTR ERV1 41 694 -17 4 1960 404 195 1 92 chr2 180299470 180299590 -1448497 + RLTR20A LTR ERVK 302 412 -139 4 1960 232 305 89 38 chr2 180299648 180299805 -1448282 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1308 1472 -376 4 1960 227 262 24 24 chr2 180299900 180299982 -1448105 + RMER10A LTR ERVL 318 399 -43 4 1960 1233 154 116 0 chr2 180300632 180300865 -1447222 - RMER19B LTR ERVK 0 902 643 4 1960 1308 130 16 179 chr2 180300868 180301176 -1446911 - RMER19B LTR ERVK -644 258 1 4 1960 2627 38 0 9 chr2 180305860 180306201 -1441886 + ORR1A1 LTR MaLR 1 338 -8 4 1960 1519 164 162 12 chr2 180307561 180307894 -1440193 - RMER20A LTR ERVK -133 383 1 4 1960 8038 144 80 100 chr2 180307940 180309159 -1438928 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1 1327 -521 4 1960 8038 144 80 100 chr2 180309204 180309871 -1438216 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1328 1847 -1 4 1960 490 189 0 40 chr2 180310714 180310813 -1437274 + RMER10A LTR ERVL 28 122 -320 4 1960 3418 26 18 0 chr2 180335779 180336168 -1411919 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 1960 233 308 56 125 chr2 180347874 180348140 -1399947 - RLTR15 LTR ERVK 0 359 104 4 1960 233 308 56 125 chr2 180348217 180348253 -1399834 - RLTR15 LTR ERVK -256 103 78 4 1960 467 186 81 52 chr2 180348227 180348363 -1399724 - RLTR15 LTR ERVK -218 141 2 4 1961 593 191 24 117 chr2 180361468 180361681 -1386406 + RLTR19-int LTR ERVK 3484 3676 -2461 4 1961 249 229 53 126 chr2 180363322 180363417 -1384670 + RMER10B LTR ERVL 311 398 0 4 1961 1008 195 84 65 chr2 180365835 180366269 -1381818 + MT2B LTR ERVL 1 601 0 4 1961 778 93 0 0 chr2 180366269 180366376 -1381711 + MERVL_2A-int LTR ERVL 1 107 -5654 4 1961 630 117 0 11 chr2 180366378 180366473 -1381614 + MERVL_2A-int LTR ERVL 1412 1505 -4256 4 1961 6372 132 25 10 chr2 180366468 180367504 -1380583 + MERVL_2A-int LTR ERVL 113 1164 -4597 4 1961 2920 199 158 7 chr2 180367498 180368213 -1379874 + MERVL_2A-int LTR ERVL 1097 1919 -3566 4 1961 1664 133 47 0 chr2 180368204 180368526 -1379561 + MERVL_2A-int LTR ERVL 5354 5690 -71 4 1961 340 111 13 53 chr2 180368534 180368610 -1379477 + ORR1A3-int LTR MaLR 567 639 -1324 4 1961 298 96 39 0 chr2 180368610 180368662 -1379425 + MERVL_2A-int LTR ERVL 5706 5759 -2 4 1961 1050 174 333 125 chr2 180368664 180369105 -1378982 + MT2A LTR ERVL 1 533 0 4 1961 337 241 69 0 chr2 180372673 180372760 -1375327 + MER68 LTR ERVL 13 105 -458 4 1961 1357 188 75 82 chr2 180378013 180378230 -1369857 - MTC LTR MaLR 0 421 210 4 1961 1357 188 75 82 chr2 180378376 180378489 -1369598 - MTC LTR MaLR -212 209 93 4 1961 360 284 18 44 chr2 180379577 180379691 -1368396 - RMER15 LTR ERVL -42 533 423 5 1961 3133 12 0 23 chr2 180379864 180380218 -1367869 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 5 1961 242 349 14 85 chr2 180381207 180381268 -1366819 + MT2B LTR ERVL 109 159 -442 5 1961 830 121 19 102 chr2 180383279 180383436 -1364651 - RLTR11B LTR ERVK 0 453 310 5 1961 342 35 69 17 chr2 180383422 180383480 -1364607 - RLTR11B LTR ERVK -392 61 1 5 1961 1595 198 66 121 chr2 180383570 180383907 -1364180 - MYSERV6-int LTR ERVK -446 8513 8222 5 1961 1595 198 66 121 chr2 180384052 180384277 -1363810 - MYSERV6-int LTR ERVK -738 8221 7982 5 1961 3803 234 78 62 chr2 180384455 180385900 -1362187 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -998 1328 8 5 1961 1233 312 58 80 chr2 180386047 180386271 -1361816 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -2390 4160 3939 5 1961 1233 312 58 80 chr2 180386457 180386618 -1361469 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -2612 3938 3774 5 1961 2679 125 26 50 chr2 180387710 180388174 -1359913 - RLTR11B LTR ERVK 0 453 1 5 1961 431 292 46 0 chr2 180390569 180390699 -1357388 - RMER15 LTR ERVL -18 557 422 5 1961 328 298 104 139 chr2 180390965 180391171 -1356916 + ORR1E LTR MaLR 1 197 -162 5 1961 328 298 104 139 chr2 180391407 180391566 -1356521 + ORR1E LTR MaLR 198 353 -6 5 1961 294 246 22 149 chr2 180407529 180407551 -1340536 + MT2B LTR ERVL 148 152 -449 5 1961 260 222 0 122 chr2 180439058 180439140 -1308947 + MT2B LTR ERVL 169 240 -361 6 1961 500 276 96 68 chr2 180461884 180462269 -1285818 + RMER10A LTR ERVL 31 426 -16 6 1961 373 208 8 165 chr2 180467771 180467898 -1280189 - MT2B LTR ERVL -337 264 158 6 1961 237 215 77 0 chr2 180468666 180468731 -1279356 - MTEb LTR MaLR 0 379 310 6 1961 898 209 16 28 chr2 180469228 180469410 -1278677 - MTEb LTR MaLR -196 183 4 6 1961 367 269 38 19 chr2 180470753 180470859 -1277228 - RMER15 LTR ERVL -2 573 466 6 1961 1880 194 8 54 chr2 180473179 180473550 -1274537 - ORR1D1 LTR MaLR -8 366 13 6 1961 230 236 36 0 chr2 180477273 180477328 -1270759 - RMER15 LTR ERVL -77 498 442 6 1961 280 140 140 0 chr2 180477501 180477551 -1270536 - RMER15 LTR ERVL -112 463 407 6 1961 1697 181 148 11 chr2 180478918 180479276 -1268811 + MTD LTR MaLR 5 411 -8 6 1961 750 77 41 27 chr2 180482718 180482865 -1265222 - RMER17B LTR ERVK -498 460 312 6 1962 1114 250 69 32 chr2 180494927 180495129 -1252958 - MTD LTR MaLR -14 405 220 6 1962 1114 281 48 53 chr2 180495325 180495530 -1252557 - MTD LTR MaLR -200 219 10 6 1962 2072 114 65 68 chr2 180501735 180502041 -1246046 + ORR1B2 LTR MaLR 1 311 -56 5 1962 2072 114 65 68 chr2 180502219 180502279 -1245808 + ORR1B2 LTR MaLR 312 366 -1 5 1962 1725 192 25 17 chr2 180504984 180505345 -1242742 + ORR1C1 LTR MaLR 1 364 -14 1 1962 1019 258 127 15 chr2 180513697 180514035 -1234052 + MTE2b LTR MaLR 4 379 0 2 1962 1740 126 149 66 chr2 180514936 180515285 -1232802 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 2 1962 1312 237 59 6 chr2 180520592 180520932 -1227155 + ORR1D2 LTR MaLR 3 360 -10 3 1962 1065 178 205 26 chr2 180524266 180524612 -1223475 + RMER17C LTR ERVK 1 408 -2 4 1962 2704 161 48 48 chr2 180532977 180533540 -1214547 + RLTR20B1 LTR ERVK 1 563 0 5 1962 1053 204 24 0 chr2 180552828 180553034 -1195053 + MTC LTR MaLR 1 211 -210 8 1962 2177 82 13 3 chr2 180553200 180553506 -1194581 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 11 8 1962 1154 150 29 5 chr2 180553560 180553768 -1194319 + MTC LTR MaLR 201 413 -8 8 1962 1315 106 14 10 chr2 180553965 180554174 -1193913 + MTC LTR MaLR 1 210 -211 8 1962 1200 128 108 0 chr2 180555427 180555631 -1192456 + MTC LTR MaLR 196 421 0 9 1962 227 303 40 0 chr2 180563853 180563929 -1184158 + MTEb LTR MaLR 272 350 -29 1 1962 2226 81 53 25 chr2 180565657 180565975 -1182112 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 1 1962 3668 142 32 47 chr2 180574969 180575589 -1172498 - RMER19C LTR ERVK 0 611 1 1 1962 1405 179 141 9 chr2 180575649 180575976 -1172111 + ORR1D1 LTR MaLR 5 374 0 1 1962 2425 133 166 13 chr2 180576372 180576830 -1171257 + RLTR11A LTR ERVK 1 528 0 1 1962 381 307 132 49 chr2 180580984 180581307 -1166780 - MLT1C LTR MaLR -33 472 61 1 1962 1134 175 42 5 chr2 180584274 180584464 -1163623 + ORR1D1 LTR MaLR 1 197 -177 1 1962 3547 66 28 8 chr2 180586289 180586762 -1161325 + RLTR45 LTR ERVK 1 482 0 1 1962 346 264 44 0 chr2 180587224 180587315 -1160772 - ORR1E LTR MaLR -264 95 1 1 1962 271 326 114 57 chr2 180587315 180587452 -1160635 - RMER15 LTR ERVL -37 538 394 1 1962 1078 226 137 76 chr2 180588349 180588746 -1159341 - MT2B LTR ERVL -47 554 88 1 1962 234 195 0 0 chr2 180591330 180591371 -1156716 - RLTR22_Mur LTR ERVK -499 1349 1309 1 1962 239 266 30 45 chr2 180592653 180592720 -1155367 + MURVY-LTR LTR ERV1 155 220 -299 1 1962 264 174 0 0 chr2 180592696 180592742 -1155345 - MLT1A1 LTR MaLR -54 354 309 1 1962 2431 70 38 12 chr2 180594166 180594485 -1153602 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 1 1962 1360 282 31 22 chr2 180597236 180597595 -1150492 - MTEa LTR MaLR 0 379 18 1 1962 3585 13 5 0 chr2 180599744 180600138 -1147949 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1962 9124 43 4 1 chr2 180600138 180601233 -1146854 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 1 1962 3627 13 2 0 chr2 180601233 180601628 -1146459 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1962 1489 192 38 14 chr2 180602600 180602902 -1145185 - MTC LTR MaLR 0 421 39 1 1962 1160 140 6 11 chr2 180604143 180604324 -1143763 + ORR1C1 LTR MaLR 1 180 -198 1 1962 688 174 150 24 chr2 180604480 180604660 -1143427 + ORR1C1 LTR MaLR 148 351 -33 1 1962 1337 232 42 3 chr2 180605224 180605534 -1142553 - MTEb LTR MaLR -4 375 45 1 1962 348 206 41 0 chr2 180605534 180605607 -1142480 + MTD LTR MaLR 4 79 -342 1 1962 1984 173 38 19 chr2 180605949 180606315 -1141772 + MTD LTR MaLR 47 419 0 1 1962 284 303 0 0 chr2 180606583 180606649 -1141438 - MTEb LTR MaLR -309 70 5 1 1962 329 316 0 0 chr2 180608418 180608513 -1139574 + RLTR24 LTR ERV1 2 96 -433 1 1962 380 246 67 42 chr2 180608989 180609108 -1138979 + MT2B2 LTR ERVL 4 125 -408 1 1962 805 232 15 22 chr2 180609118 180609385 -1138702 + MT2B2 LTR ERVL 100 524 -60 1 1962 421 301 16 0 chr2 180610027 180610150 -1137937 - MLT1D LTR MaLR -56 449 325 1 1962 276 369 36 67 chr2 180610848 180611072 -1137015 - ORR1D2 LTR MaLR -118 252 36 1 1962 265 287 122 39 chr2 180612813 180612969 -1135118 - RLTR21 LTR ERVK -320 1252 1084 1 1963 2952 105 34 34 chr2 180617306 180617781 -1130306 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 1 1 1963 340 223 39 41 chr2 180634429 180634539 -1113548 + MTEa LTR MaLR 247 363 -16 2 1963 306 161 65 65 chr2 180658613 180658706 -1089381 + RLTR25B LTR ERVK 417 509 -519 2 1963 306 161 65 65 chr2 180659403 180659496 -1088591 + RLTR25B LTR ERVK 417 509 -519 2 1963 2390 141 5 25 chr2 180677194 180677586 -1070501 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 2 1963 1676 174 130 18 chr2 180679320 180679712 -1068375 + RMER10A LTR ERVL 1 436 -6 2 1963 2029 173 24 41 chr2 180680709 180681087 -1067000 + MTD LTR MaLR 3 376 -43 2 1963 2029 173 24 41 chr2 180681274 180681311 -1066776 + MTD LTR MaLR 377 411 -8 2 1963 450 321 70 105 chr2 180683015 180683387 -1064700 + ORR1D2 LTR MaLR 11 369 -1 2 1963 2076 99 76 0 chr2 180683656 180683960 -1064127 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 2 1963 237 196 140 18 chr2 180686148 180686274 -1061813 - RMER17A LTR ERVK -355 396 258 2 1963 237 196 140 18 chr2 180686353 180686397 -1061690 - RMER17A LTR ERVK -494 257 205 2 1963 514 132 76 11 chr2 180692100 180692192 -1055895 + MERVL_2A-int LTR ERVL 5584 5681 -80 2 1963 269 216 55 33 chr2 180692192 180692283 -1055804 + ORR1A3-int LTR MaLR 546 638 -1325 2 1963 332 93 37 0 chr2 180692284 180692338 -1055749 + MERVL_2A-int LTR ERVL 5706 5761 0 2 1963 581 144 0 37 chr2 180692340 180692448 -1055639 + MT2A LTR ERVL 3 106 -427 2 1963 366 331 7 78 chr2 180692631 180692772 -1055315 + MT2A LTR ERVL 84 214 -319 2 1963 709 290 76 70 chr2 180692752 180693197 -1054890 + RLTR12B LTR ERVK 33 480 -48 2 1963 577 214 41 27 chr2 180693220 180693424 -1054663 + MT2A LTR ERVL 319 561 -40 2 1963 625 321 94 15 chr2 180694474 180694740 -1053347 + RMER15 LTR ERVL 273 559 -16 2 1963 470 286 64 19 chr2 180695567 180695765 -1052322 - MLT1A1 LTR MaLR -26 382 134 2 1963 817 180 122 68 chr2 180699056 180699277 -1048810 - MTC LTR MaLR -136 285 53 2 1963 261 240 48 68 chr2 180700825 180700928 -1047159 - MT2B LTR ERVL -344 257 157 2 1963 265 324 0 89 chr2 180710326 180710438 -1037649 - MT2B LTR ERVL -348 253 152 3 1963 1183 272 96 25 chr2 180722798 180723152 -1024935 - MTE2a LTR MaLR 0 379 1 3 1963 314 255 116 18 chr2 180739971 180740083 -1008004 - RMER15 LTR ERVL -110 465 343 3 1964 315 261 79 36 chr2 180756821 180756960 -991127 - MER74B LTR ERVL -463 159 15 3 1964 244 313 79 64 chr2 180789466 180789606 -958481 + MLT1A0 LTR MaLR 1 142 -223 3 1964 351 318 28 0 chr2 180789667 180789774 -958313 + MLT1A0 LTR MaLR 255 364 -1 3 1964 2988 66 5 5 chr2 180793686 180794084 -954003 + MTB LTR MaLR 3 400 0 3 1964 272 213 103 122 chr2 180798963 180799070 -949017 - MT2B LTR ERVL -344 257 153 3 1964 1378 203 64 76 chr2 180799449 180799979 -948108 + RMER20B LTR ERVK 33 602 -25 3 1964 408 279 9 26 chr2 180802079 180802219 -945868 + MTD LTR MaLR 46 172 -247 3 1964 710 70 0 10 chr2 180802608 180802709 -945378 - MT2A LTR ERVL -433 100 1 3 1964 3450 63 5 0 chr2 180802765 180803210 -944877 + LTRIS5 LTR ERV1 1 447 0 3 1964 499 175 260 0 chr2 180803357 180803511 -944576 + MTD LTR MaLR 226 419 0 3 1964 2660 112 92 14 chr2 180807802 180808277 -939810 + MT2B LTR ERVL 1 475 0 3 1964 389 360 75 9 chr2 180832791 180833018 -915069 - MLT1C-int LTR MaLR -40 1331 1090 4 1964 781 309 102 62 chr2 180833412 180833864 -914223 - MLT1C-int LTR MaLR -602 769 300 4 1964 601 283 21 10 chr2 180834209 180834402 -913685 - MLT1C-int LTR MaLR -1173 198 4 4 1964 260 362 63 48 chr2 180834406 180834612 -913475 - MLT1C LTR MaLR -6 461 253 4 1964 236 287 0 0 chr2 180841596 180841718 -906369 - ORR1B1-int LTR MaLR -755 754 633 4 1964 319 225 29 96 chr2 180849915 180850195 -897892 + RMER17D LTR ERVK 290 550 -339 4 1964 241 306 122 0 chr2 180851900 180851998 -896089 - MLT2C2 LTR ERVL -352 112 3 4 1964 225 197 24 95 chr2 180862613 180862697 -885390 - ORR1A3-int LTR MaLR -826 1137 1060 4 1964 285 279 75 34 chr2 180875168 180875351 -872736 + MLT1A0 LTR MaLR 6 194 -171 4 1964 3256 72 7 12 chr2 180876412 180876821 -871266 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 4 1965 242 324 25 92 chr2 180881363 180881526 -866561 + MLT1D LTR MaLR 93 244 -261 4 1965 328 257 135 88 chr2 180895722 180896058 -852029 - ORR1D1 LTR MaLR -9 369 1 4 1965 2015 234 73 12 chr2 180897503 180898010 -850077 - RMER19C LTR ERVK -1 610 73 4 1965 705 125 16 8 chr2 180898932 180899053 -849034 + RLTR42-int LTR ERVK 1603 1724 -3798 4 1965 2469 142 44 75 chr2 180899077 180899558 -848529 + RMER4A LTR ERVK 1 466 0 4 1965 1090 101 10 53 chr2 180899558 180899578 -848509 + RLTR42-int LTR ERVK 2137 2156 -3366 4 1965 1090 101 10 53 chr2 180899805 180899993 -848094 + RLTR42-int LTR ERVK 2157 2336 -3186 4 1965 299 107 125 0 chr2 180899996 180900052 -848035 + RLTR42-int LTR ERVK 3749 3811 -1711 4 1965 2127 132 66 42 chr2 180900709 180901119 -846968 - RMER10A LTR ERVL -22 420 1 4 1965 5312 171 66 29 chr2 180901119 180902278 -845809 + RLTR42-int LTR ERVK 3808 5009 -513 4 1965 1999 128 80 6 chr2 180902336 180902650 -845437 + ORR1B2 LTR MaLR 1 337 -30 4 1965 7441 157 52 32 chr2 180902651 180904064 -844023 + ORR1B2-int LTR MaLR 1 1441 -68 4 1965 2060 143 34 34 chr2 180904291 180904646 -843441 - ORR1B1 LTR MaLR -39 355 1 4 1965 2212 123 15 6 chr2 180904656 180904990 -843097 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 337 0 4 1965 12469 71 118 25 chr2 180904990 180907128 -840959 + IAPEz-int LTR ERVK 8 2345 -4136 4 1965 379 89 0 0 chr2 180907127 180907183 -840904 + IAPEz-int LTR ERVK 2719 2774 -3707 4 1965 3009 20 0 0 chr2 180907181 180907538 -840549 + IAPEz-int LTR ERVK 4001 4357 -2124 4 1965 5652 63 13 19 chr2 180907529 180908305 -839782 + IAPEz-int LTR ERVK 5709 6479 -2 4 1965 2212 123 15 6 chr2 180908307 180908641 -839446 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 337 0 4 1965 503 175 0 0 chr2 180908849 180908929 -839158 + ORR1B2-int LTR MaLR 1291 1370 0 4 1965 1765 175 104 6 chr2 180908929 180909256 -838831 + ORR1B2 LTR MaLR 1 359 -8 4 1965 1334 161 128 38 chr2 180909333 180909784 -838303 + RLTR42-int LTR ERVK 5031 5522 0 4 1965 1378 174 13 8 chr2 180909784 180910022 -838065 + RLTR42 LTR ERVK 1 239 0 4 1965 4555 136 9 16 chr2 180912787 180913482 -834605 + RLTR17 LTR ERVK 3 692 0 5 1965 2164 147 45 87 chr2 180913800 180914226 -833861 - RMER19B LTR ERVK 0 902 495 5 1965 1577 269 82 16 chr2 180914225 180914728 -833359 + RLTR20A2 LTR ERVK 8 543 -35 5 1965 2363 139 93 44 chr2 180914755 180914963 -833124 - RMER19B LTR ERVK -430 472 245 5 1965 2363 139 93 44 chr2 180914983 180915224 -832863 - RMER19B LTR ERVK -658 244 1 5 1965 2375 207 12 99 chr2 180915256 180915862 -832225 - RMER19C LTR ERVK -40 571 19 5 1965 229 382 22 22 chr2 180916199 180916338 -831749 + RMER12 LTR ERVK 718 856 -466 5 1965 3707 16 81 14 chr2 180917306 180917751 -830336 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 5 1965 521 266 65 0 chr2 180919657 180919796 -828291 - RMER15 LTR ERVL -4 571 424 5 1965 1049 247 65 29 chr2 180919799 180920074 -828013 + MTEb LTR MaLR 3 287 -92 5 1965 225 306 124 52 chr2 180923793 180923986 -824101 - LTR50 LTR ERVL -495 300 94 5 1965 342 200 88 0 chr2 180925191 180925271 -822816 + RMER10B LTR ERVL 224 310 -88 5 1965 593 222 137 116 chr2 180926302 180926590 -821497 + RLTR15 LTR ERVK 1 303 -56 5 1965 593 222 137 116 chr2 180926783 180926830 -821257 + RLTR15 LTR ERVK 304 343 -16 5 1965 363 227 119 15 chr2 180928261 180928395 -819692 - MER31-int LTR ERV1 -3586 1350 1203 5 1965 1126 140 59 36 chr2 180950167 180950281 -797806 + ORR1D1-int LTR MaLR 1144 1249 -121 5 1965 1126 140 59 36 chr2 180950457 180950564 -797523 + ORR1D1-int LTR MaLR 1250 1369 -1 5 1965 1498 189 91 9 chr2 180950565 180950906 -797181 + ORR1D1 LTR MaLR 2 370 -4 5 1965 3899 84 5 24 chr2 180952298 180952892 -795195 + RLTR19-int LTR ERVK 1430 2012 -4125 5 1965 1905 125 9 40 chr2 180958624 180958950 -789137 + ORR1A3 LTR MaLR 1 316 -10 5 1965 4062 149 40 23 chr2 180958952 180959356 -788731 + ORR1A3-int LTR MaLR 22 438 -1525 5 1965 4062 149 40 23 chr2 180959386 180959772 -788315 + ORR1A3-int LTR MaLR 439 826 -1137 5 1965 6919 116 20 96 chr2 180959776 180961124 -786963 + ORR1A3-int LTR MaLR 718 1963 0 5 1965 2101 113 0 50 chr2 180961124 180961467 -786620 + ORR1A3 LTR MaLR 1 326 0 5 1965 3943 177 55 22 chr2 180977215 180978041 -770046 + RLTR25B LTR ERVK 1 853 -175 5 1965 609 168 118 26 chr2 180978445 180978598 -769489 + RLTR25B LTR ERVK 937 1103 0 5 1965 310 292 88 40 chr2 180979014 180979050 -769037 + MT2B LTR ERVL 126 167 -434 5 1965 722 159 324 24 chr2 180981738 180981978 -766109 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 63 5 1965 1480 215 116 3 chr2 180982036 180982240 -765847 + ORR1D1 LTR MaLR 1 228 -146 5 1965 1480 215 116 3 chr2 180982267 180982398 -765689 + ORR1D1 LTR MaLR 229 373 -1 5 1965 254 184 0 0 chr2 180996292 180996341 -751746 + ORR1C2 LTR MaLR 336 384 0 6 1965 278 367 106 24 chr2 181003610 181003733 -744354 + ORR1E LTR MaLR 64 196 -163 1 1965 3526 25 2 0 chr2 181008251 181008646 -739441 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 1965 2015 204 38 10 chr2 181008738 181009138 -738949 + MTD LTR MaLR 1 411 -8 3 1965 338 276 10 48 chr2 181009586 181009689 -738398 + MTEb LTR MaLR 272 370 -9 3 1966 1152 260 100 35 chr2 181013253 181013572 -734515 + MTE2a LTR MaLR 32 371 -8 4 1966 1166 201 178 1 chr2 181017104 181017411 -730676 - MTE2b LTR MaLR -17 362 3 5 1966 2412 80 0 89 chr2 181018083 181018388 -729699 + ORR1A2 LTR MaLR 1 275 -52 6 1966 2412 80 0 89 chr2 181018580 181018633 -729454 + ORR1A2 LTR MaLR 276 327 0 6 1966 510 226 6 140 chr2 181020753 181020861 -727226 - MT2B LTR ERVL -398 186 152 7 1966 432 287 74 28 chr2 181024358 181024531 -723556 + MLT1A0 LTR MaLR 201 404 -4 8 1966 966 214 165 34 chr2 181025324 181025596 -722491 + MTD LTR MaLR 6 318 -101 9 1966 2695 133 2 15 chr2 181025596 181026008 -722079 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 9 1966 966 214 165 34 chr2 181026008 181026026 -722061 + MTD LTR MaLR 319 334 -85 9 1966 616 205 29 40 chr2 181026012 181026185 -721902 + RLTR15 LTR ERVK 19 189 -170 9 1966 410 200 42 25 chr2 181026335 181026453 -721634 - RLTR15 LTR ERVK -239 120 1 9 1966 323 258 10 110 chr2 181028976 181029076 -719011 - MTEa LTR MaLR -287 92 3 9 1966 246 266 10 60 chr2 181031469 181031569 -716518 - RLTR15 LTR ERVK -22 337 243 1 1966 338 164 0 15 chr2 181033649 181033717 -714370 - RLTR15 LTR ERVK -238 121 55 1 1966 671 221 71 132 chr2 181034381 181034745 -713342 + RLTR15 LTR ERVK 1 342 -17 1 1966 275 250 12 36 chr2 181035312 181035395 -712692 + MT2A LTR ERVL 2 82 -451 1 1966 263 295 30 50 chr2 181035395 181035412 -712675 + MTE2b LTR MaLR 2 99 -280 1 1966 734 155 17 21 chr2 181035503 181035675 -712412 - RMER21B LTR ERV1 -8 834 686 1 1966 946 286 6 82 chr2 181035897 181036251 -711836 + MT2A LTR ERVL 181 507 -26 1 1966 837 231 262 41 chr2 181036408 181036827 -711260 + RMER21B LTR ERV1 2 513 -329 1 1966 1006 141 119 5 chr2 181036850 181037043 -711044 - RMER21A LTR ERV1 -611 336 122 1 1966 400 253 0 25 chr2 181037338 181037419 -710668 - RMER21A LTR ERV1 -868 79 1 1 1966 766 202 145 44 chr2 181037456 181037684 -710403 - RMER21B LTR ERV1 -275 567 317 1 1966 229 297 180 0 chr2 181038069 181038180 -709907 + MLT1F2 LTR MaLR 428 558 -2 1 1966 526 321 87 100 chr2 181044319 181044689 -703398 + MLT1A0 LTR MaLR 1 365 0 1 1966 392 205 98 11 chr2 181049912 181050012 -698075 - MTD LTR MaLR -45 374 244 1 1966 385 341 64 49 chr2 181050068 181050156 -697931 - MTD LTR MaLR -150 269 184 1 1966 385 341 64 49 chr2 181050304 181050480 -697607 - MTD LTR MaLR -236 183 1 1 1966 1160 282 154 56 chr2 181059491 181060269 -687818 - RMER13A LTR ERVK -21 887 1 1 1966 1667 210 28 36 chr2 181061746 181062102 -685985 - MTD LTR MaLR -66 353 1 1 1966 576 284 52 23 chr2 181072564 181072737 -675350 - MTEb LTR MaLR -5 374 197 2 1966 383 323 111 41 chr2 181072916 181073087 -675000 - MTEb LTR MaLR -196 183 1 2 1966 298 226 92 51 chr2 181082867 181082965 -665122 - MT2B LTR ERVL -323 278 177 2 1966 1906 152 93 6 chr2 181106169 181106512 -641575 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 14 2 1966 1042 209 124 105 chr2 181108781 181109144 -638943 + ORR1D1 LTR MaLR 5 374 0 2 1966 401 250 18 80 chr2 181110287 181110317 -637770 - MT2B LTR ERVL -444 157 135 2 1966 230 239 12 155 chr2 181132536 181132611 -615476 + MT2B LTR ERVL 182 248 -353 3 1966 302 261 120 0 chr2 181133611 181133703 -614384 + MER74A LTR ERVL 3 105 -453 3 1966 987 253 126 53 chr2 181133717 181134059 -614028 + MTEa LTR MaLR 5 371 -8 3 1967 455 278 150 23 chr2 181151193 181151366 -596721 + RMER15 LTR ERVL 345 539 -36 3 1967 812 229 48 36 chr2 181160056 181160333 -587754 - MLT1C LTR MaLR -118 272 3 3 1967 1642 199 77 106 chr2 181162779 181162840 -585247 + RMER4B LTR ERVK 56 118 -467 4 1967 1642 199 77 106 chr2 181163130 181163607 -584480 + RMER4B LTR ERVK 124 583 -2 4 1967 264 276 21 146 chr2 181166082 181166226 -581861 + MT2B2 LTR ERVL 122 247 -337 4 1967 290 267 18 98 chr2 181169909 181170021 -578066 - MT2B LTR ERVL -337 264 162 4 1967 480 224 169 35 chr2 181170083 181170269 -577818 + MLT1C LTR MaLR 1 192 -182 4 1967 236 279 26 80 chr2 181171328 181171441 -576646 - LTR88c LTR Genie? -524 338 232 4 1967 247 354 10 30 chr2 181173003 181173102 -574985 + MLT1B LTR MaLR 124 220 -170 4 1967 3957 160 93 80 chr2 181176355 181177243 -570844 + RMER19B LTR ERVK 3 902 0 4 1967 536 153 42 74 chr2 181177244 181177434 -570653 + RMER17C LTR ERVK 90 273 -137 4 1967 702 307 168 16 chr2 181181880 181182261 -565826 + MLT1C LTR MaLR 25 463 -4 4 1967 299 192 147 27 chr2 181183078 181183153 -564934 + RLTR25B LTR ERVK 426 509 -519 4 1967 1975 175 76 47 chr2 181187276 181188024 -560063 + RMER6A LTR ERVK 2 661 -95 4 1967 2535 142 148 24 chr2 181201284 181201776 -546311 + RMER4B LTR ERVK 33 585 0 4 1967 655 161 150 29 chr2 181209870 181210028 -538059 - MTD LTR MaLR -49 370 178 5 1967 1053 201 11 11 chr2 181210167 181210358 -537729 - MTD LTR MaLR -217 202 12 5 1967 3283 48 2 10 chr2 181210394 181210793 -537294 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 1967 7912 71 9 69 chr2 181210793 181211960 -536127 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 5 1967 3052 49 5 10 chr2 181212176 181212569 -535518 - MTA_Mm LTR MaLR -5 391 1 5 1967 761 109 38 6 chr2 181223184 181223341 -524746 + RMER17B LTR ERVK 299 460 -498 5 1967 328 256 80 75 chr2 181223690 181223842 -524245 + MT2B LTR ERVL 113 258 -326 5 1967 1650 154 70 20 chr2 181225867 181225887 -522200 - ORR1B1 LTR MaLR -16 378 360 5 1967 3066 58 14 79 chr2 181225887 181226257 -521830 + MTB LTR MaLR 1 344 -56 5 1967 3066 58 14 79 chr2 181226394 181226451 -521636 + MTB LTR MaLR 345 400 0 5 1967 1650 154 70 20 chr2 181226451 181226787 -521300 - ORR1B1 LTR MaLR -35 359 4 5 1967 2936 158 13 67 chr2 181233058 181233654 -514433 - RMER15 LTR ERVL -11 564 1 5 1967 774 174 130 130 chr2 181233827 181233896 -514191 + MTD LTR MaLR 2 51 -368 5 1967 774 174 130 130 chr2 181234040 181234254 -513833 + MTD LTR MaLR 52 285 -134 5 1967 472 251 67 42 chr2 181248726 181249009 -499078 - RLTR15 LTR ERVK -22 337 48 5 1967 2231 128 101 0 chr2 181259063 181259421 -488666 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 6 1967 572 291 26 43 chr2 181261045 181261278 -486809 - MER57A-int LTR ERV1 -2013 4174 3946 6 1967 259 325 158 12 chr2 181262340 181262511 -485576 - MLT1K LTR MaLR -120 475 280 6 1967 368 242 141 47 chr2 181264450 181264641 -483446 - MER57A-int LTR ERV1 -5977 210 2 6 1967 372 206 207 50 chr2 181264655 181264834 -483253 - MER57C2 LTR ERV1 -11 423 217 6 1967 1879 122 49 3 chr2 181265345 181265650 -482437 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 6 1967 10612 115 128 5 chr2 181265654 181267401 -480686 + ORR1A2-int LTR MaLR 1 1962 -1 6 1967 2069 109 6 0 chr2 181267405 181267718 -480369 + ORR1A2 LTR MaLR 5 319 -8 6 1967 970 197 50 42 chr2 181267903 181268141 -479946 - MTE2a LTR MaLR 0 379 140 6 1967 1122 246 33 115 chr2 181268556 181268946 -479141 + MTEa LTR MaLR 15 372 -7 6 1967 621 259 28 80 chr2 181269686 181269981 -478106 - RLTR15 LTR ERVK -18 341 56 6 1967 621 259 28 80 chr2 181270171 181270227 -477860 - RLTR15 LTR ERVK -304 55 8 6 1967 614 88 38 150 chr2 181270230 181270363 -477724 - MYSERV6-int LTR ERVK 0 8959 8842 6 1967 544 256 92 71 chr2 181270371 181270665 -477422 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 327 626 -1700 6 1967 2849 258 52 55 chr2 181270672 181270684 -477403 - MYSERV6-int LTR ERVK -7626 1333 1318 6 1967 2849 258 52 55 chr2 181270712 181270957 -477130 - MYSERV6-int LTR ERVK -7642 1317 1097 6 1967 2849 258 52 55 chr2 181271103 181271850 -476237 - MYSERV6-int LTR ERVK -7863 1096 332 6 1967 426 264 51 71 chr2 181271851 181272104 -475983 - MYSERV6-int LTR ERVK -8538 421 174 6 1968 598 279 83 34 chr2 181272955 181273281 -474806 - RLTR15 LTR ERVK -17 342 1 6 1968 791 291 43 16 chr2 181275525 181275783 -472304 + MTE2b LTR MaLR 58 322 -57 6 1968 1055 214 140 15 chr2 181277700 181277965 -470122 + MTEb LTR MaLR 31 328 -51 6 1968 795 134 23 16 chr2 181290958 181291087 -457000 + RMER4A LTR ERVK 32 161 -305 6 1968 1434 101 117 8 chr2 181291086 181291326 -456761 - RMER4B LTR ERVK -319 266 1 6 1968 7204 152 49 54 chr2 181291326 181291555 -456532 - MurERV4-int LTR ERVK 0 5260 5034 6 1968 7204 152 49 54 chr2 181291702 181291893 -456194 - MurERV4-int LTR ERVK -227 5033 4873 6 1968 7204 152 49 54 chr2 181292034 181292047 -456040 - MurERV4-int LTR ERVK -388 4872 4860 6 1968 7204 152 49 54 chr2 181292239 181292335 -455752 - MurERV4-int LTR ERVK -401 4859 4771 6 1968 7204 152 49 54 chr2 181292510 181293519 -454568 - MurERV4-int LTR ERVK -490 4770 3723 6 1968 10445 120 55 42 chr2 181293749 181294086 -454001 - MurERV4-int LTR ERVK -1562 3698 3345 6 1968 10445 120 55 42 chr2 181294274 181295388 -452699 - MurERV4-int LTR ERVK -1916 3344 2214 6 1968 10445 120 55 42 chr2 181295634 181295743 -452344 - MurERV4-int LTR ERVK -3047 2213 2115 6 1968 10445 120 55 42 chr2 181295932 181296222 -451865 - MurERV4-int LTR ERVK -3146 2114 1822 6 1968 997 236 29 74 chr2 181296223 181296535 -451552 + RLTR11B LTR ERVK 1 321 -124 7 1968 921 234 24 40 chr2 181296692 181296990 -451097 - RLTR11B LTR ERVK -160 293 1 7 1968 5963 146 39 19 chr2 181296993 181298061 -450026 - MurERV4-int LTR ERVK -3438 1822 733 7 1968 3264 156 80 87 chr2 181298751 181298869 -449218 - MurERV4-int LTR ERVK -4515 745 631 7 1968 3264 156 80 87 chr2 181298908 181299175 -448912 - MurERV4-int LTR ERVK -4630 630 332 7 1968 3264 156 80 87 chr2 181299322 181299339 -448748 - MurERV4-int LTR ERVK -4929 331 331 7 1968 3264 156 80 87 chr2 181299369 181299598 -448489 - MurERV4-int LTR ERVK -4929 331 109 7 1968 3264 156 80 87 chr2 181299887 181299991 -448096 - MurERV4-int LTR ERVK -5152 108 3 7 1968 3172 146 69 13 chr2 181299991 181300545 -447542 - RMER4B LTR ERVK 0 585 1 7 1968 276 232 41 31 chr2 181306373 181306471 -441616 - MTA_Mm LTR MaLR -109 287 189 7 1968 350 244 0 82 chr2 181328515 181328600 -419487 - MT2B LTR ERVL -361 240 163 7 1968 2655 120 21 57 chr2 181337781 181338259 -409828 - RMER6B LTR ERVK 0 461 1 7 1968 3912 107 66 36 chr2 181338264 181338902 -409185 - MYSERV6-int LTR ERVK -1197 7762 7106 7 1968 1021 228 23 69 chr2 181339020 181339082 -409005 - MYSERV6-int LTR ERVK -1842 7117 7057 7 1968 1021 228 23 69 chr2 181339268 181339511 -408576 - MYSERV6-int LTR ERVK -1903 7056 6826 7 1968 250 232 110 55 chr2 181339520 181339666 -408421 - RLTR15 LTR ERVK -16 343 190 7 1968 482 215 79 37 chr2 181339745 181339909 -408178 - RLTR15 LTR ERVK -188 171 1 7 1968 3488 196 77 81 chr2 181339910 181340173 -407914 - MYSERV6-int LTR ERVK 0 8959 8754 7 1968 3488 196 77 81 chr2 181340309 181340761 -407326 - MYSERV6-int LTR ERVK -206 8753 8291 7 1968 3488 196 77 81 chr2 181340950 181341313 -406774 - MYSERV6-int LTR ERVK -669 8290 7885 7 1968 375 282 105 28 chr2 181341328 181341576 -406511 - RLTR15 LTR ERVK -17 342 76 7 1968 309 241 71 54 chr2 181341609 181341793 -406294 - RLTR15 LTR ERVK -170 189 3 7 1968 469 271 64 0 chr2 181341809 181341949 -406138 - RMER4A LTR ERVK -27 439 291 7 1968 233 180 46 62 chr2 181342005 181342060 -406027 - RLTR25A LTR ERVK -531 572 518 7 1968 1294 154 295 21 chr2 181345286 181345571 -402516 - ORR1B2 LTR MaLR -2 365 3 7 1968 258 237 28 69 chr2 181346139 181346284 -401803 - MTD-int LTR MaLR -128 1130 992 7 1968 1136 240 123 63 chr2 181346640 181347474 -400613 - MTD-int LTR MaLR -275 983 1 7 1968 911 194 218 16 chr2 181347477 181347734 -400353 - MTD LTR MaLR -3 416 108 7 1968 382 258 156 67 chr2 181347848 181347933 -400154 - MTD LTR MaLR -303 97 3 7 1968 734 242 87 174 chr2 181350133 181350523 -397564 + MTE2a LTR MaLR 9 364 -15 7 1968 2385 172 94 12 chr2 181351052 181351540 -396547 - RLTR12B LTR ERVK 0 528 1 7 1968 723 132 110 0 chr2 181352315 181352366 -395721 - RMER10B LTR ERVL 0 398 338 7 1968 723 132 110 0 chr2 181352407 181352491 -395596 - RMER10B LTR ERVL -61 337 249 7 1968 225 324 14 0 chr2 181352559 181352633 -395454 + RLTR24 LTR ERV1 1 75 -454 7 1968 735 251 26 79 chr2 181353386 181353689 -394398 + RLTR11B LTR ERVK 3 289 -164 7 1968 262 320 0 0 chr2 181354438 181354513 -393574 - RLTR24 LTR ERV1 -454 75 1 7 1968 1361 135 151 47 chr2 181363827 181364146 -383941 + ORR1B1 LTR MaLR 41 392 -2 8 1968 773 201 19 12 chr2 181365659 181365820 -382267 - ORR1D1 LTR MaLR -198 176 15 8 1968 1962 115 78 89 chr2 181369081 181369148 -378939 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 318 8 1968 1962 115 78 89 chr2 181369267 181369570 -378517 - ORR1B2 LTR MaLR -50 317 1 8 1968 261 328 42 25 chr2 181370251 181370370 -377717 - ERVL-E-int LTR ERVL -2819 2848 2728 8 1968 1221 122 25 0 chr2 181372455 181372652 -375435 - MTC LTR MaLR -7 414 213 8 1968 1773 122 77 3 chr2 181374033 181374330 -373757 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 8 1968 1349 173 43 18 chr2 181378940 181379216 -368871 - ORR1B2 LTR MaLR -82 285 3 8 1969 230 324 0 26 chr2 181430229 181430305 -317782 + MLT1F1 LTR MaLR 198 271 -298 9 1969 1695 111 172 0 chr2 181436752 181437031 -311056 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 9 1969 548 226 13 46 chr2 181438817 181438970 -309117 - RLTR15 LTR ERVK -179 180 33 9 1969 1601 228 108 35 chr2 181440734 181441188 -306899 + RMER5 LTR ERV1 43 529 -5 9 1969 1388 242 50 25 chr2 181444170 181444534 -303553 - ORR1D1 LTR MaLR -1 373 1 9 1969 329 273 56 11 chr2 181446360 181446449 -301638 + RLTR18B LTR ERVK 104 196 -316 9 1969 800 279 99 4 chr2 181446527 181446800 -301287 + RLTR18B LTR ERVK 120 418 -94 9 1969 530 250 66 149 chr2 181446826 181447127 -300960 - RMER12 LTR ERVK -5 1317 1042 9 1969 318 228 0 37 chr2 181447116 181447198 -300889 - RMER12 LTR ERVK -1243 79 1 9 1969 250 228 0 17 chr2 181447260 181447318 -300769 + MTC-int LTR MaLR 951 1007 -251 9 1969 318 226 35 12 chr2 181456407 181456492 -291595 - MLT1A0 LTR MaLR -246 119 33 1 1969 322 357 141 14 chr2 181458024 181458237 -289850 + MLT1F LTR MaLR 301 540 -8 1 1969 2123 176 20 47 chr2 181463261 181463713 -284374 - RMER10A LTR ERVL -2 440 1 1 1969 917 213 116 36 chr2 181466432 181466656 -281431 - MERVL_2A-int LTR ERVL -2000 3761 3520 1 1969 3439 113 107 6 chr2 181466659 181467303 -280784 - MERVL_2A-int LTR ERVL -2792 2969 2261 1 1969 2887 128 40 83 chr2 181467452 181467689 -280398 - MERVL_2A-int LTR ERVL -3493 2268 2019 1 1969 2887 128 40 83 chr2 181467818 181468110 -279977 - MERVL_2A-int LTR ERVL -3743 2018 1762 1 1969 1367 124 188 7 chr2 181468114 181468406 -279681 - IAPLTR4 LTR ERVK 0 345 1 1 1969 3307 124 112 4 chr2 181468406 181468934 -279153 - MERVL_2A-int LTR ERVL -3995 1766 1182 1 1969 268 250 61 0 chr2 181468982 181469010 -279077 + ORR1B1-int LTR MaLR 615 650 -859 1 1969 7234 127 63 9 chr2 181469180 181470295 -277792 - MERVL_2A-int LTR ERVL -4586 1175 1 1 1969 890 229 96 97 chr2 181470295 181470657 -277430 - MT2B LTR ERVL 0 601 93 1 1969 780 217 125 112 chr2 181471577 181471667 -276420 - MT2B LTR ERVL -441 92 3 1 1969 1673 147 17 75 chr2 181471919 181472264 -275823 + RMER15 LTR ERVL 1 325 -250 1 1969 2509 157 92 4 chr2 181473685 181473930 -274157 + RLTR28 LTR ERVL 1 265 -259 1 1969 2262 99 21 12 chr2 181473930 181474256 -273831 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 1 1969 2509 157 92 4 chr2 181474256 181474490 -273597 + RLTR28 LTR ERVL 266 522 -2 1 1969 1315 241 16 42 chr2 181481672 181481980 -266107 + ORR1D2 LTR MaLR 63 362 -8 1 1969 3323 140 12 12 chr2 181482094 181482672 -265415 - RMER4B LTR ERVK 0 585 8 1 1969 2353 122 16 16 chr2 181482987 181483354 -264733 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 1 1969 1874 87 72 17 chr2 181485076 181485367 -262720 - ORR1A2 LTR MaLR -20 307 1 1 1969 603 67 156 0 chr2 181485668 181485758 -262329 - ORR1A2 LTR MaLR -159 168 65 1 1969 946 95 135 0 chr2 181485782 181485930 -262157 - ORR1A2 LTR MaLR -159 168 1 1 1969 1760 117 84 0 chr2 181486217 181486515 -261572 + ORR1B1 LTR MaLR 1 323 -71 1 1969 679 148 51 22 chr2 181486528 181486666 -261421 - ORR1B1 LTR MaLR -226 168 27 1 1969 2158 128 96 19 chr2 181487060 181487426 -260661 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 1 1969 1024 204 13 22 chr2 181488169 181488395 -259692 - MTC LTR MaLR -2 419 196 1 1969 231 184 0 0 chr2 181489233 181489282 -258805 - MTC LTR MaLR -211 210 162 1 1969 1831 134 13 3 chr2 181489282 181489581 -258506 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 145 1 1969 524 231 30 7 chr2 181492541 181492676 -255411 + RMER15 LTR ERVL 422 559 -16 1 1969 311 115 19 0 chr2 181493503 181493555 -254532 + ORR1C2 LTR MaLR 17 69 -315 1 1969 540 177 41 7 chr2 181511533 181511659 -236428 - ORR1C2 LTR MaLR -253 121 2 1 1969 1822 158 16 10 chr2 181512381 181512694 -235393 - MTD LTR MaLR -8 411 97 1 1969 566 140 11 0 chr2 181512924 181513017 -235070 - MTD LTR MaLR -323 98 5 1 1969 352 201 16 0 chr2 181533660 181533743 -214344 + ORR1C2 LTR MaLR 6 90 -304 4 1970 340 296 48 34 chr2 181562866 181563013 -185074 + MLT1K LTR MaLR 394 542 -53 6 1970 1995 144 169 30 chr2 181570045 181570452 -177635 + RMER4A LTR ERVK 3 466 0 7 1970 430 287 61 65 chr2 181574684 181574915 -173172 - RLTR42-int LTR ERVK -4136 1386 1157 8 1970 1741 247 154 80 chr2 181581710 181582819 -165268 - RMER12 LTR ERVK -131 1191 1 9 1970 405 241 73 42 chr2 181587334 181587499 -160588 + RLTR15 LTR ERVK 2 171 -188 1 1970 345 317 46 46 chr2 181587521 181587762 -160325 + RLTR15 LTR ERVK 119 359 0 1 1970 3568 104 119 11 chr2 181594269 181594918 -153169 + RMER6A LTR ERVK 38 756 0 1 1970 226 83 28 0 chr2 181595920 181595956 -152131 - MTD LTR MaLR 0 419 383 1 1970 3471 20 5 0 chr2 181595960 181596350 -151737 - MTA_Mm LTR MaLR -4 392 1 1 1970 8867 50 8 2 chr2 181596350 181597441 -150646 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 1 1970 3050 33 5 0 chr2 181597441 181597830 -150257 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 6 1 1970 411 248 157 0 chr2 181597836 181597957 -150130 - MTD LTR MaLR -73 346 207 1 1970 792 231 27 11 chr2 181598223 181598411 -149676 - MTD LTR MaLR -209 210 20 1 1970 2366 150 153 8 chr2 181604564 181605054 -143033 + RLTR31_Mm LTR ERVK 1 561 0 1 1970 3063 61 8 10 chr2 181606650 181607047 -141040 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1970 250 320 70 23 chr2 181609756 181609884 -138203 - MLT1A0 LTR MaLR -22 343 210 1 1970 1987 152 69 20 chr2 181614823 181615173 -132914 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 1 1970 520 296 43 55 chr2 181617526 181617780 -130307 + MLT1A0 LTR MaLR 1 251 -114 1 1970 1803 191 33 8 chr2 181619251 181619646 -128441 + BGLII_B LTR ERVK 1 405 -36 1 1970 458 343 48 60 chr2 181624541 181624857 -123230 - RLTR25B LTR ERVK -716 312 1 1 1970 1652 272 34 24 chr2 181624954 181625421 -122666 + RMER19C LTR ERVK 138 609 -2 1 1970 1743 195 200 17 chr2 181625425 181625904 -122183 + RMER2 LTR ERV1 1 567 0 1 1970 302 220 0 0 chr2 181626257 181626316 -121771 + RLTR23 LTR ERV1 1 59 -371 1 1970 1132 183 30 25 chr2 181626350 181626585 -121502 + RLTR23 LTR ERV1 195 430 0 1 1970 677 304 39 38 chr2 181627708 181628146 -119941 + MuRRS4-int LTR ERV1 1159 1842 -5936 1 1970 471 252 41 15 chr2 181628172 181628326 -119761 + MMERGLN-int LTR ERV1 2902 3092 -4464 1 1970 3632 31 31 2 chr2 181636652 181637076 -111011 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 1 1970 44196 29 5 13 chr2 181637076 181642270 -105817 - MMERVK10C-int LTR ERVK 0 7581 1729 1 1970 348 236 153 28 chr2 181642267 181642411 -105676 - MMERVK10C-int LTR ERVK -5452 685 524 1 1970 825 167 280 25 chr2 181642407 181642646 -105441 - MMERVK10C-int LTR ERVK -4795 611 312 1 1970 489 122 0 43 chr2 181642738 181642832 -105255 - MMERVK10C-int LTR ERVK -6629 952 863 1 1970 822 189 5 10 chr2 181642837 181643029 -105058 - MMERVK10C-int LTR ERVK -6662 919 729 1 1970 826 126 0 0 chr2 181643027 181643146 -104941 - MMERVK10C-int LTR ERVK -7238 343 225 1 1970 241 222 0 0 chr2 181643146 181643191 -104896 - RLTR27 LTR ERVK -34 275 231 1 1970 1536 22 6 0 chr2 181643191 181643370 -104717 - MMERVK10C-int LTR ERVK -7401 180 1 1 1970 3637 28 31 2 chr2 181643370 181643794 -104293 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 1 1970 11479 231 11 3 chr2 181643894 181648215 -99872 - MMERGLN-int LTR ERV1 -2049 5507 1110 1 1970 257 148 112 56 chr2 181651357 181651464 -96623 + RLTR25B LTR ERVK 397 509 -519 2 1970 2306 78 275 35 chr2 181654105 181654563 -93524 + RLTR6_Mm LTR ERV1 37 604 -50 2 1970 67826 21 14 2 chr2 181654564 181662253 -85834 + RLTR6-int LTR ERV1 1 7778 0 2 1970 2175 75 288 36 chr2 181662363 181662801 -85286 + RLTR6_Mm LTR ERV1 37 584 -70 2 1970 539 102 0 39 chr2 181662856 181662958 -85129 + RMER17B LTR ERVK 366 463 -495 2 1970 2747 147 85 56 chr2 181665064 181665654 -82433 + RLTR33 LTR ERVK 1 607 -71 2 1971 347 172 113 41 chr2 181666931 181667028 -81059 - RLTR11A2 LTR ERVK -53 474 371 2 1971 931 206 16 0 chr2 181668143 181668332 -79755 - RLTR33 LTR ERVK -68 610 419 2 1971 1394 134 58 55 chr2 181668323 181668615 -79472 - RLTR33 LTR ERVK -385 293 1 2 1971 932 241 37 12 chr2 181668809 181669067 -79020 + MERVL_2A-int LTR ERVL 4265 4545 -1216 2 1971 2929 72 15 5 chr2 181669067 181669459 -78628 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 1971 730 308 12 66 chr2 181669459 181669520 -78567 + MERVL_2A-int LTR ERVL 4508 4567 -1190 2 1971 1848 230 42 8 chr2 181669521 181669998 -78089 + MERVL_2A-int LTR ERVL 5148 5640 -121 2 1971 3934 129 57 55 chr2 181670607 181670947 -77140 - RMER17A2 LTR ERVK -11 895 566 2 1971 3934 129 57 55 chr2 181671689 181672161 -75926 - RMER17A2 LTR ERVK -341 565 82 2 1971 2679 81 0 50 chr2 181672919 181673297 -74790 + RLTR10D LTR ERVK 1 359 0 2 1971 676 214 290 12 chr2 181674498 181674753 -73334 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 2 1971 343 207 22 148 chr2 181685226 181685418 -62669 + RMER16 LTR ERVK 1 329 -204 2 1971 327 181 117 16 chr2 181685986 181686097 -61990 + RMER4A LTR ERVK 322 414 -52 2 1971 11719 78 27 25 chr2 181688503 181690302 -57785 - RLTR22_Mus LTR ERVK -6 1802 1 2 1971 13538 144 45 33 chr2 181694068 181696345 -51742 - ETnERV2-int LTR ERVK -485 6921 4619 2 1971 5787 49 0 4 chr2 181696336 181697028 -51059 - ETnERV-int LTR ERVK -2625 689 1 2 1971 1302 177 33 72 chr2 181697028 181697363 -50724 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 2 1971 2324 174 37 15 chr2 181698057 181698466 -49621 + RLTR9B2 LTR ERVK 1 418 -2 2 1971 1579 152 18 76 chr2 181703229 181703571 -44516 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 322 0 3 1971 2879 75 10 5 chr2 181704710 181705098 -42989 + MTA_Mm LTR MaLR 1 390 -6 3 1971 2867 71 3 0 chr2 181705098 181705495 -42592 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 388 -710 3 1971 4615 88 45 7 chr2 181712218 181712914 -35173 + MTA_Mm-int LTR MaLR 377 1098 0 3 1971 3018 76 2 5 chr2 181712914 181713311 -34776 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 1971 1752 142 167 9 chr2 181716779 181717127 -30960 + RLTR9D LTR ERVK 1 403 0 3 1971 2580 34 3 48 chr2 181721154 181721491 -26596 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 322 0 3 1971 748 336 90 6 chr2 181736187 181736519 -11568 + MTD LTR MaLR 45 404 -15 3 1971 4461 8 2 0 chr2 181738475 181738967 -9120 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 3 1971 2352 25 0 0 chr2 181738967 181739252 -8835 + MERVL-int LTR ERVL 1 285 -5200 3 1971 25712 19 0 0 chr2 181739247 181742279 -5808 + MERVL-int LTR ERVL 2328 5360 -125 3 1971 390 167 46 35 chr2 181742279 181742366 -5721 + ORR1A3-int LTR MaLR 553 640 -1323 3 1971 302 0 0 0 chr2 181742366 181742404 -5683 + MERVL-int LTR ERVL 5448 5485 0 3 1971 4428 8 2 2 chr2 181742404 181742897 -5190 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 3 1971 2464 294 68 43 chr2 181744189 181744440 -3647 + MYSERV-int LTR ERVK 3828 4013 -2537 3 1971 4873 115 140 10 chr2 181744440 181744891 -3196 - RMER17A2 LTR ERVK 0 906 405 3 1971 4873 115 140 10 chr2 181744980 181745330 -2757 - RMER17A2 LTR ERVK -502 404 2 3 1971 2464 282 89 43 chr2 181745330 181746348 -1739 + MYSERV-int LTR ERVK 4014 5088 -1462 3 1971 501 277 73 36 chr2 181746348 181746537 -1550 + RMER4A LTR ERVK 239 544 -41 3 1971 326 245 51 41 chr2 181746830 181746843 -1244 + RMER4A LTR ERVK 545 557 -28 3 1971 744 217 20 40 chr2 181746843 181747093 -994 + MYSERV-int LTR ERVK 5302 5546 -1004 3