587 7436 44 42 0 chr2LHet 287817 288786 -80086 - ROOA_I LTR Pao -468 6381 5372 1 587 234 147 0 0 chr2LHet 288805 288839 -80033 - ROOA_I LTR Pao -1467 5382 5349 1 587 229 118 0 0 chr2LHet 289018 289052 -79820 - ROOA_I LTR Pao -1246 5603 5570 1 587 20325 42 45 1 chr2LHet 344320 346365 -22507 - ROOA_I LTR Pao -1503 5346 3195 1 587 20325 42 45 1 chr2LHet 346392 347020 -21852 - ROOA_I LTR Pao -3655 3194 2558 1 587 4577 45 104 0 chr2LHet 347017 347657 -21215 - ROOA_I LTR Pao -4423 2426 1720 1 587 12563 44 10 34 chr2LHet 359608 361373 -7499 - ROOA_I LTR Pao -5127 1722 1 1 643 227 169 82 82 chr2L 7677541 7677638 -15333906 + ROOA_I LTR Pao 792 888 -5961 3 760 3124 41 13 0 chr2L 22978158 22978552 -32992 + ROOA_I LTR Pao 255 653 -6196 1 760 6879 47 119 32 chr2L 22978550 22980081 -31463 + ROOA_I LTR Pao 964 2627 -4222 1 760 6033 53 32 1 chr2L 22980079 22980853 -30691 + ROOA_I LTR Pao 2982 3779 -3070 1 760 19225 91 32 31 chr2L 22980853 22983924 -27620 + ROOA_I LTR Pao 3673 6747 -102 1 588 581 27 14 0 chr2RHet 485551 485624 -2803137 + ROOA_I LTR Pao 74 147 -6702 2 588 1179 58 135 26 chr2RHet 485631 485824 -2802937 + ROOA_I LTR Pao 6 219 -6630 2 588 5163 35 41 52 chr2RHet 485823 486551 -2802210 + ROOA_I LTR Pao 468 1187 -5662 2 588 6843 48 15 17 chr2RHet 486540 487433 -2801328 + ROOA_I LTR Pao 1533 2423 -4426 2 588 4144 38 0 0 chr2RHet 487419 487916 -2800845 + ROOA_I LTR Pao 4069 4565 -2284 2 588 4764 87 54 4 chr2RHet 487912 488615 -2800146 + ROOA_I LTR Pao 4704 6090 -2166 2 588 327 45 0 43 chr2RHet 488652 488698 -2800063 + ROOA_I LTR Pao 6799 6842 -7 2 596 7082 45 96 28 chr2RHet 1460040 1461027 -1827734 + ROOA_I LTR Pao 1 1054 -5795 2 596 10997 44 60 5 chr2RHet 1461026 1463323 -1825438 + ROOA_I LTR Pao 2925 5346 -1503 2 596 254 65 0 0 chr2RHet 1463465 1463496 -1825265 + ROOA_I LTR Pao 6805 6835 -14 2 599 1481 57 0 0 chr2RHet 1916513 1916705 -1372056 + ROOA_I LTR Pao 4441 4632 -2217 2 599 242 108 0 0 chr2RHet 1916719 1916756 -1372005 + ROOA_I LTR Pao 5567 5603 -1246 2 599 226 118 0 0 chr2RHet 1916935 1916969 -1371792 + ROOA_I LTR Pao 5349 5382 -1467 2 599 7576 50 102 0 chr2RHet 1916988 1918088 -1370673 + ROOA_I LTR Pao 5372 6583 -266 2 599 3281 22 51 0 chr2RHet 1935827 1936237 -1352524 + ROOA_I LTR Pao 3148 3578 -3271 2 599 2265 42 62 0 chr2RHet 1936238 1936546 -1352215 + ROOA_I LTR Pao 4078 4404 -2445 2 604 1667 30 0 0 chr2RHet 2588399 2588601 -700160 + ROOA_I LTR Pao 354 555 -6294 2 606 334 45 0 43 chr2RHet 2852291 2852337 -436424 - ROOA_I LTR Pao -7 6842 6799 2 606 6382 80 41 2 chr2RHet 2852364 2853281 -435480 - ROOA_I LTR Pao -2148 6108 4505 2 606 6638 33 30 33 chr2RHet 2862096 2862976 -425785 - ROOA_I LTR Pao -5972 877 1 2 606 6612 34 30 33 chr2RHet 2870105 2870985 -417776 + ROOA_I LTR Pao 1 877 -5972 2 606 6612 34 30 33 chr2RHet 2874822 2875702 -413059 + ROOA_I LTR Pao 1 877 -5972 2 609 4394 31 38 0 chr2RHet 3217192 3217766 -70995 - ROOA_I LTR Pao -882 5967 5372 2 609 237 135 0 0 chr2RHet 3217999 3218036 -70725 - ROOA_I LTR Pao -1246 5603 5567 2 609 7176 42 5 1 chr2RHet 3218264 3219187 -69574 - ROOA_I LTR Pao -1503 5346 4420 2 609 4705 40 27 11 chr2RHet 3219177 3219803 -68958 - ROOA_I LTR Pao -2581 4268 3633 2 609 22720 44 89 56 chr2RHet 3224510 3228037 -60724 - ROOA_I LTR Pao -3206 3643 1 2 609 841 11 0 0 chr2RHet 3244743 3244837 -43924 - ROOA_I LTR Pao -7 6842 6749 2 609 9510 191 103 113 chr2RHet 3244836 3249105 -39656 - ROOA_I LTR Pao -309 6540 2316 2 609 27969 134 88 80 chr2RHet 3253224 3260017 -28744 - ROOA_I LTR Pao -7 6842 1 2 587 329 23 0 43 chr2R 300394 300440 -20846268 - ROOA_I LTR Pao -7 6842 6799 1 587 2931 103 13 11 chr2R 300477 300947 -20845761 - ROOA_I LTR Pao -1503 5346 4966 1 587 4616 31 9 0 chr2R 300949 301526 -20845182 - ROOA_I LTR Pao -2239 4610 4029 1 587 23708 139 81 79 chr2R 337408 343749 -20802959 - ROOA_I LTR Pao -482 6367 14 1 587 704 52 10 0 chr2R 343751 343847 -20802861 - ROOA_I LTR Pao -6752 97 1 1 589 23340 38 56 13 chr2R 546906 550623 -20596085 - ROOA_I LTR Pao -3058 3791 1 1 590 10458 44 40 36 chr2R 743320 744723 -20401985 + ROOA_I LTR Pao 445 1853 -4996 1 590 5109 45 55 2 chr2R 744727 745369 -20401339 + ROOA_I LTR Pao 2062 2737 -4112 1 590 9905 33 15 3 chr2R 745361 746538 -20400170 + ROOA_I LTR Pao 3078 4268 -2581 1 590 7727 35 14 0 chr2R 746535 747442 -20399266 + ROOA_I LTR Pao 4427 5346 -1503 1 590 419 89 0 0 chr2R 747693 747749 -20398959 + ROOA_I LTR Pao 5372 5427 -1422 1 590 5792 27 37 2 chr2R 749794 751047 -20395661 + ROOA_I LTR Pao 5417 6747 -102 1 590 984 19 0 0 chr2R 756430 756538 -20390170 + ROOA_I LTR Pao 6735 6842 -7 1 593 5462 47 28 27 chr2R 1114388 1115266 -20031442 + ROOA_I LTR Pao 1 794 -6055 1 593 361 59 39 0 chr2R 1120362 1120409 -20026299 + ROOA_I LTR Pao 801 849 -6000 1 593 12632 23 47 9 chr2R 1120408 1122038 -20024670 + ROOA_I LTR Pao 1026 2717 -4132 1 593 7470 39 48 3 chr2R 1122050 1123189 -20023519 + ROOA_I LTR Pao 3078 4268 -2581 1 593 7439 30 0 8 chr2R 1123186 1124113 -20022595 + ROOA_I LTR Pao 4427 5346 -1503 1 593 255 28 0 53 chr2R 1124207 1124245 -20022463 + ROOA_I LTR Pao 6799 6834 -15 1 601 5856 32 61 0 chr2R 2214587 2215307 -18931401 - ROOA_I LTR Pao -7 6842 6079 1 601 956 208 127 55 chr2R 2215336 2215769 -18930939 - ROOA_I LTR Pao -1164 5685 5222 1 601 14717 26 19 1 chr2R 2215765 2217468 -18929240 - ROOA_I LTR Pao -2247 4602 2869 1 601 2670 26 161 0 chr2R 2217480 2217829 -18928879 - ROOA_I LTR Pao -4052 2797 2393 1 601 5921 29 61 1 chr2R 2225197 2225947 -18920761 - ROOA_I LTR Pao -4457 2392 1598 1 601 9913 30 29 16 chr2R 2225941 2227189 -18919519 - ROOA_I LTR Pao -5585 1264 1 1 601 16383 40 72 7 chr3LHet 2148180 2150814 -404677 - ROOA_I LTR Pao -2548 4301 1495 4 601 4569 44 2 2 chr3LHet 2150810 2151380 -404111 - ROOA_I LTR Pao -6183 666 11 4 763 273 306 36 29 chr3L 23375213 23375351 -1168206 - ROOA_I LTR Pao -2155 4694 4556 3 765 236 61 0 0 chr3L 23630724 23630757 -912800 - ROOA_I LTR Pao -3882 2967 2935 3 765 2704 38 0 3 chr3L 23632476 23632820 -910737 - ROOA_I LTR Pao -3908 2941 2599 3 765 6019 46 7 18 chr3L 23635359 23636176 -907381 - ROOA_I LTR Pao -4532 2317 1510 3 765 9450 35 33 21 chr3L 23636187 23637485 -906072 - ROOA_I LTR Pao -5535 1314 1 3 591 1845 56 261 0 chr3RHet 786649 786936 -1730571 - ROOA_I LTR Pao -1844 5005 4644 5 591 4400 51 84 3 chr3RHet 792026 792620 -1724887 - ROOA_I LTR Pao -2215 4634 3993 5 591 1632 23 116 0 chr3RHet 792614 792830 -1724677 - ROOA_I LTR Pao -4390 2459 2219 5 592 1716 67 3 3 chr3RHet 921665 921952 -1595555 - ROOA_I LTR Pao -1844 5005 4644 5 595 231 276 0 0 chr3RHet 1313410 1313468 -1204039 - ROOA_I LTR Pao -3316 3533 3476 5 595 6687 50 64 5 chr3RHet 1390067 1390959 -1126548 - ROOA_I LTR Pao -7 6842 5898 5 599 9587 49 97 24 chr3RHet 1903439 1904832 -612675 - ROOA_I LTR Pao -7 6842 5349 5 599 225 252 151 28 chr3RHet 1904942 1905048 -612459 - ROOA_I LTR Pao -1164 5685 5567 5 599 40079 42 30 19 chr3RHet 1905276 1910485 -607022 - ROOA_I LTR Pao -1503 5346 78 5 587 34524 25 94 2 chr4 303790 308159 -1043698 - ROOA_I LTR Pao 0 6849 2076 5 587 9623 21 18 6 chr4 308160 309317 -1042540 - ROOA_I LTR Pao -4880 1969 799 5 587 3795 24 24 0 chr4 309312 309769 -1042088 - ROOA_I LTR Pao -6381 468 1 5 587 3911 19 13 0 chr4 365045 365507 -986350 + ROOA_I LTR Pao 1 468 -6381 5 587 9623 21 18 6 chr4 365502 366659 -985198 + ROOA_I LTR Pao 799 1969 -4880 5 587 2439 23 56 0 chr4 366660 366963 -984894 + ROOA_I LTR Pao 2076 2395 -4454 5 587 1769 38 0 0 chr4 366966 367178 -984679 + ROOA_I LTR Pao 2761 2972 -3877 5 585 16935 56 76 19 chrUextra 66422 68868 -28935788 - ROOA_I LTR Pao -3533 3316 730 7 585 458 43 532 0 chrUextra 74690 74782 -28929874 + ROOA_I LTR Pao 6702 6842 -7 7 585 5025 45 23 2 chrUextra 75320 75939 -28928717 + ROOA_I LTR Pao 3146 3777 -3072 7 585 4958 81 8 4 chrUextra 75955 76639 -28928017 + ROOA_I LTR Pao 4740 6075 -2181 7 585 13094 51 16 34 chrUextra 85508 87277 -28917379 + ROOA_I LTR Pao 1 1737 -5112 7 585 4237 60 147 28 chrUextra 87275 87909 -28916747 + ROOA_I LTR Pao 2007 2715 -4134 7 585 949 63 102 0 chrUextra 87928 88055 -28916601 + ROOA_I LTR Pao 3104 3243 -3606 7 585 1648 137 3 10 chrUextra 88054 88334 -28916322 + ROOA_I LTR Pao 5147 5345 -1504 7 585 10205 45 99 1 chrUextra 88745 90085 -28914571 + ROOA_I LTR Pao 5372 6842 -7 7 586 9561 44 67 0 chrUextra 194079 195295 -28809361 - ROOA_I LTR Pao -9 6840 5544 7 586 871 54 0 9 chrUextra 225747 225859 -28778797 + ROOA_I LTR Pao 6730 6840 -9 7 586 16124 37 37 0 chrUextra 242044 243980 -28760676 + ROOA_I LTR Pao 3304 5310 -1539 7 586 4525 77 53 20 chrUextra 244419 245082 -28759574 + ROOA_I LTR Pao 5349 6033 -816 7 590 871 54 0 9 chrUextra 662113 662225 -28342431 + ROOA_I LTR Pao 6730 6840 -9 7 593 1309 68 288 18 chrUextra 1063827 1064053 -27940603 + ROOA_I LTR Pao 1489 1775 -5074 7 593 931 59 8 0 chrUextra 1064048 1064166 -27940490 + ROOA_I LTR Pao 1962 2080 -4769 7 602 3650 35 113 4 chrUextra 2326457 2326980 -26677676 + ROOA_I LTR Pao 5961 6540 -309 7 602 805 11 0 0 chrUextra 2326979 2327073 -26677583 + ROOA_I LTR Pao 6749 6842 -7 7 618 1587 67 3 3 chrUextra 4426170 4426457 -24578199 + ROOA_I LTR Pao 4644 5005 -1844 7 619 4116 26 40 2 chrUextra 4505368 4505868 -24498788 - ROOA_I LTR Pao -4457 2392 1874 7 634 2181 53 0 0 chrUextra 6480788 6481070 -22523586 + ROOA_I LTR Pao 1615 1896 -4953 8 634 1876 63 4 4 chrUextra 6552801 6553054 -22451602 + ROOA_I LTR Pao 3064 3316 -3533 8 636 6126 29 71 2 chrUextra 6770354 6771180 -22233476 + ROOA_I LTR Pao 5658 6540 -309 8 667 5057 33 80 3 chrUextra 10787404 10788095 -18216561 - ROOA_I LTR Pao -734 6115 5372 8 670 1326 71 0 0 chrUextra 11165597 11165779 -17838877 - ROOA_I LTR Pao -2248 4601 4420 8 670 4303 42 29 12 chrUextra 11165769 11166348 -17838308 - ROOA_I LTR Pao -2581 4268 3680 8 673 589 39 0 0 chrUextra 11595312 11595389 -17409267 + ROOA_I LTR Pao 2393 2469 -4380 8 673 2063 16 0 0 chrUextra 11595414 11595661 -17408995 + ROOA_I LTR Pao 2551 2797 -4052 8 673 2580 26 0 0 chrUextra 11595673 11595983 -17408673 + ROOA_I LTR Pao 2869 3178 -3671 8 693 5477 58 44 0 chrUextra 14232116 14232824 -14771832 + ROOA_I LTR Pao 5438 6176 -673 9 698 1965 71 120 0 chrUextra 14818765 14819089 -14185567 + ROOA_I LTR Pao 5898 6260 -589 9 698 4181 28 96 3 chrUextra 14887017 14887733 -14116923 - ROOA_I LTR Pao -595 6254 5472 9 756 3193 44 39 16 chrUextra 22482751 22483189 -6521467 + ROOA_I LTR Pao 3821 4268 -2581 1 756 1725 61 0 0 chrUextra 22483179 22483410 -6521246 + ROOA_I LTR Pao 4420 4650 -2199 1 773 4390 59 64 47 chrUextra 24644937 24645575 -4359081 + ROOA_I LTR Pao 2116 2764 -4085 1 585 6702 41 117 25 chrU 11123 12049 -10036988 - ROOA_I LTR Pao -3877 2972 1962 6 585 12401 44 68 32 chrU 12044 13720 -10035317 - ROOA_I LTR Pao -5074 1775 39 6 588 709 21 52 21 chrU 492762 492858 -9556179 + ROOA_I LTR Pao 5162 5260 -1589 6 591 778 53 0 0 chrU 826890 826985 -9222052 - ROOA_I LTR Pao -5232 1617 1523 6 591 2718 39 6 3 chrU 830619 830953 -9218084 - ROOA_I LTR Pao -6433 416 82 6 597 6477 58 73 1 chrU 1692192 1693078 -8355959 - ROOA_I LTR Pao -1503 5346 4397 6 597 6982 54 140 1 chrU 1693089 1694225 -8354812 - ROOA_I LTR Pao -2764 4085 2791 6 603 1314 68 288 18 chrU 2438816 2439042 -7609995 + ROOA_I LTR Pao 1489 1775 -5074 6 603 1738 52 0 0 chrU 2439037 2439247 -7609790 + ROOA_I LTR Pao 1962 2171 -4678 6 603 4166 45 75 31 chrU 2439247 2439818 -7609219 + ROOA_I LTR Pao 2377 2972 -3877 6 604 2124 35 0 4 chrU 2560988 2561242 -7487795 + ROOA_I LTR Pao 3150 3402 -3447 6 604 11235 56 72 2 chrU 2561367 2563421 -7485616 + ROOA_I LTR Pao 3150 5346 -1503 6 605 12035 44 68 32 chrU 2635063 2636739 -7412298 + ROOA_I LTR Pao 39 1775 -5074 6 605 4908 42 125 25 chrU 2636734 2637443 -7411594 + ROOA_I LTR Pao 1962 2741 -4108 6 605 238 91 0 0 chrU 2645448 2645481 -7403556 + ROOA_I LTR Pao 2946 2978 -3871 6 624 8356 44 120 39 chrU 5157429 5158955 -4890082 - ROOA_I LTR Pao -5199 1650 1 6 630 14571 45 49 28 chrU 5981828 5983882 -4065155 - ROOA_I LTR Pao -4751 2098 1 6 639 2654 26 10 0 chrU 7207162 7207471 -2841566 - ROOA_I LTR Pao -6537 312 1 6 644 2814 41 34 42 chrU 7802189 7802599 -2246438 - ROOA_I LTR Pao -5863 986 580 6 644 959 45 75 0 chrU 7802598 7802731 -2246306 - ROOA_I LTR Pao -6567 282 140 6 645 1986 48 128 84 chrU 7977037 7977381 -2071656 - ROOA_I LTR Pao -1142 5707 5349 6 645 236 139 0 0 chrU 7977569 7977605 -2071432 - ROOA_I LTR Pao -1246 5603 5568 6 645 2288 132 12 15 chrU 7977737 7978122 -2070915 - ROOA_I LTR Pao -1503 5346 5076 6 648 8011 45 51 1 chrU 8283062 8284084 -1764953 + ROOA_I LTR Pao 2546 3618 -3231 6 648 2198 52 14 7 chrU 8284079 8284367 -1764670 + ROOA_I LTR Pao 3724 4013 -2836 6 648 2776 72 110 2 chrU 8284359 8284778 -1764259 + ROOA_I LTR Pao 4536 4999 -1850 6 650 1891 57 327 0 chrU 8607481 8607829 -1441208 + ROOA_I LTR Pao 2791 3252 -3597 6 651 7728 69 110 0 chrU 8700908 8702053 -1346984 - ROOA_I LTR Pao -177 6672 5402 6 657 2620 44 101 66 chrU 9485205 9485643 -563394 + ROOA_I LTR Pao 5349 5801 -1048 7 748 2262 40 30 3 chrX 21393233 21393530 -1029297 - ROOA_I LTR Pao -6 6843 6539 1 748 5117 50 25 4 chrX 21393515 21394203 -1028624 - ROOA_I LTR Pao -1590 5259 4558 1 585 1300 82 39 0 chrYHet 118002 118182 -228856 - ROOA_I LTR Pao -1786 5063 4877 1 585 6553 62 135 4 chrYHet 118184 119149 -227889 - ROOA_I LTR Pao -2147 4702 3612 1 585 14913 47 67 42 chrYHet 119149 121302 -225736 - ROOA_I LTR Pao -4121 2728 522 1 585 1685 39 0 0 chrYHet 121303 121506 -225532 - ROOA_I LTR Pao -6603 246 44 1