94 15107 268 20 31 chr2L 22540111 22545932 -465612 + Gypsy2_I LTR Gypsy 862 7011 -1 1 757 9546 183 72 33 chr2L 22613719 22615830 -395714 + Gypsy2_I LTR Gypsy 2609 4803 -1332 1 757 332 152 0 0 chr2L 22615820 22615879 -395665 + Gypsy2_I LTR Gypsy 5097 5155 -980 1 757 1754 279 44 60 chr2L 22615883 22616563 -394981 + Gypsy2_I LTR Gypsy 5456 6124 -11 1 758 721 269 50 0 chr2L 22701162 22701363 -310181 - Gypsy2_I LTR Gypsy -4075 2060 1850 1 758 2400 299 77 36 chr2L 22701378 22702908 -308636 - Gypsy2_I LTR Gypsy -3991 2186 788 1 758 726 159 141 59 chr2L 22703013 22703233 -308311 - Gypsy2_I LTR Gypsy -5566 569 332 1 585 259 294 11 0 chr2RHet 214 306 -3288455 - Gypsy2_I LTR Gypsy -5352 783 691 2 585 2188 133 78 15 chr2RHet 7407 7818 -3280943 - Gypsy2_I LTR Gypsy -240 5895 5459 2 585 449 35 0 0 chr2RHet 7828 7886 -3280875 - Gypsy2_I LTR Gypsy -2151 3984 3927 2 585 253 139 0 0 chr2RHet 7882 7918 -3280843 - Gypsy2_I LTR Gypsy -2803 3332 3297 2 585 1745 209 60 2 chr2RHet 7943 8449 -3280312 - Gypsy2_I LTR Gypsy -2971 3164 2797 2 585 327 200 13 26 chr2RHet 8518 8595 -3280166 - Gypsy2_I LTR Gypsy -3714 2421 2346 2 585 1257 249 46 18 chr2RHet 8579 9007 -3279754 - Gypsy2_I LTR Gypsy -3983 2152 1814 2 585 13574 101 23 15 chr2RHet 19392 23456 -3265305 + Gypsy2_I LTR Gypsy 1 4106 -2906 2 585 15930 62 11 21 chr2RHet 23483 25880 -3262881 + Gypsy2_I LTR Gypsy 4097 6889 -123 2 585 1235 213 130 78 chr2RHet 90206 90691 -3198070 + Gypsy2_I LTR Gypsy 203 712 -5423 2 585 2815 179 33 0 chr2RHet 100837 101356 -3187405 + Gypsy2_I LTR Gypsy 725 1260 -4875 2 585 3990 98 85 2 chr2RHet 101364 101964 -3186797 + Gypsy2_I LTR Gypsy 3464 4113 -2022 2 585 1713 118 64 4 chr2RHet 101983 102263 -3186498 + Gypsy2_I LTR Gypsy 5603 5899 -236 2 585 310 157 0 0 chr2RHet 121421 121472 -3167289 - Gypsy2_I LTR Gypsy -119 6016 5966 2 585 5070 129 43 8 chr2RHet 121503 122301 -3166460 - Gypsy2_I LTR Gypsy -240 5895 5070 2 585 1127 110 200 0 chr2RHet 122295 122592 -3166169 - Gypsy2_I LTR Gypsy -1375 4760 4404 2 585 8120 168 96 32 chr2RHet 122593 124196 -3164565 - Gypsy2_I LTR Gypsy -1836 4299 2595 2 585 2044 216 17 15 chr2RHet 124246 124753 -3164008 - Gypsy2_I LTR Gypsy -3714 2421 1839 2 585 329 291 51 29 chr2RHet 124929 125067 -3163694 - Gypsy2_I LTR Gypsy -4913 1222 1082 2 585 386 267 9 0 chr2RHet 125216 125321 -3163440 - Gypsy2_I LTR Gypsy -5327 808 703 2 588 4797 295 38 29 chr2RHet 517228 519436 -2769325 + Gypsy2_I LTR Gypsy 3950 7012 0 2 590 401 283 8 0 chr2RHet 699201 699321 -2589440 - Gypsy2_I LTR Gypsy -9 6126 6006 2 590 856 192 0 12 chr2RHet 700201 700370 -2588391 - Gypsy2_I LTR Gypsy -743 5392 5226 2 590 2124 269 38 17 chr2RHet 706403 707106 -2581655 - Gypsy2_I LTR Gypsy -922 5213 4496 2 590 553 237 111 0 chr2RHet 707119 707254 -2581507 - Gypsy2_I LTR Gypsy -1732 4403 4254 2 590 968 186 6 0 chr2RHet 707425 707597 -2581164 - Gypsy2_I LTR Gypsy -2689 3446 3274 2 590 1199 210 174 2 chr2RHet 707599 708025 -2580736 - Gypsy2_I LTR Gypsy -2982 3153 2815 2 590 545 175 254 24 chr2RHet 708027 708208 -2580553 - Gypsy2_I LTR Gypsy -3807 2328 2106 2 591 342 340 19 19 chr2RHet 851087 851294 -2437467 - Gypsy2_I LTR Gypsy -2137 3998 3847 2 593 594 158 9 144 chr2RHet 1130207 1130422 -2158339 + Gypsy2_I LTR Gypsy 493 678 -5457 2 593 2451 152 32 11 chr2RHet 1130891 1131562 -2157199 + Gypsy2_I LTR Gypsy 712 1452 -4683 2 593 1516 230 81 30 chr2RHet 1131572 1132296 -2156465 + Gypsy2_I LTR Gypsy 1511 2335 -4677 2 593 322 91 0 0 chr2RHet 1132301 1132345 -2156416 + Gypsy2_I LTR Gypsy 1431 1474 -4661 2 594 4752 139 84 64 chr2RHet 1302200 1303124 -1985637 - Gypsy2_I LTR Gypsy -10 6125 5183 2 594 1813 164 148 3 chr2RHet 1303122 1303627 -1985134 - Gypsy2_I LTR Gypsy -1453 4682 4090 2 594 2140 108 32 24 chr2RHet 1303632 1303973 -1984788 - Gypsy2_I LTR Gypsy -2297 3838 3495 2 594 1055 222 34 0 chr2RHet 1303961 1304200 -1984561 - Gypsy2_I LTR Gypsy -3751 2384 2138 2 594 770 267 0 0 chr2RHet 1306423 1306603 -1982158 - Gypsy2_I LTR Gypsy -925 5210 5031 2 594 1274 244 59 17 chr2RHet 1306686 1307041 -1981720 - Gypsy2_I LTR Gypsy -1289 4846 4477 2 594 685 232 92 0 chr2RHet 1307041 1307205 -1981556 - Gypsy2_I LTR Gypsy -1829 4306 4128 2 594 2390 255 45 11 chr2RHet 1307371 1308138 -1980623 - Gypsy2_I LTR Gypsy -2616 4396 3246 2 594 5686 189 84 22 chr2RHet 1308133 1310632 -1978129 - Gypsy2_I LTR Gypsy -2961 3216 764 2 74 891 149 254 101 chr2RHet 1310651 1310927 -1977834 - Gypsy2_I LTR Gypsy -5817 318 1 2 601 17790 161 62 67 chr2RHet 2139835 2143844 -1144917 - Gypsy2_I LTR Gypsy -1973 4162 171 2 602 405 225 0 24 chr2RHet 2261934 2262016 -1026745 - Gypsy2_I LTR Gypsy -4257 1878 1799 2 603 16068 101 10 9 chr2RHet 2362751 2366928 -921833 + Gypsy2_I LTR Gypsy 1 4218 -2794 2 603 26153 38 26 29 chr2RHet 2366922 2370202 -918559 + Gypsy2_I LTR Gypsy 2858 6126 -9 2 606 37268 62 19 20 chr2RHet 2832171 2838300 -450461 - Gypsy2_I LTR Gypsy -4 6131 686 2 606 5006 22 66 21 chr2RHet 2839156 2839819 -448942 - Gypsy2_I LTR Gypsy -5442 693 1 2 607 371 268 26 26 chr2RHet 2897984 2898099 -390662 + Gypsy2_I LTR Gypsy 1775 1889 -4246 2 608 419 170 90 0 chr2RHet 3128370 3128470 -160291 - Gypsy2_I LTR Gypsy -3407 2728 2620 2 608 2773 213 72 8 chr2RHet 3128469 3129108 -159653 - Gypsy2_I LTR Gypsy -3642 2493 1814 2 608 2030 263 65 23 chr2RHet 3129106 3130032 -158729 - Gypsy2_I LTR Gypsy -4213 1964 992 2 608 419 170 90 0 chr2RHet 3131817 3131917 -156844 - Gypsy2_I LTR Gypsy -3407 2728 2620 2 608 2773 213 72 8 chr2RHet 3131916 3132555 -156206 - Gypsy2_I LTR Gypsy -3642 2493 1814 2 608 3114 279 87 31 chr2RHet 3132553 3134275 -154486 - Gypsy2_I LTR Gypsy -4213 1964 336 2 609 311 266 2 0 chr2RHet 3239712 3239807 -48954 + Gypsy2_I LTR Gypsy 2758 2834 -3301 2 585 679 24 0 0 chr2R 12508 12591 -21134117 - Gypsy2_I LTR Gypsy -1504 4631 4549 1 585 20630 96 20 17 chr2R 12588 16234 -21130474 - Gypsy2_I LTR Gypsy -1912 5100 1399 1 585 8545 34 36 5 chr2R 16231 17341 -21129367 - Gypsy2_I LTR Gypsy -4991 1144 1 1 587 31814 18 15 16 chr2R 302004 305953 -20840755 + Gypsy2_I LTR Gypsy 1864 5807 -328 1 588 469 300 74 43 chr2R 422376 422606 -20724102 + Gypsy2_I LTR Gypsy 1714 1950 -4185 1 589 971 91 78 0 chr2R 647041 647290 -20499418 + Gypsy2_I LTR Gypsy 3485 3839 -2296 1 589 3824 134 42 1 chr2R 647287 647952 -20498756 + Gypsy2_I LTR Gypsy 4097 5317 -1695 1 589 2359 108 21 8 chr2R 647959 648334 -20498374 + Gypsy2_I LTR Gypsy 5115 5494 -641 1 589 508 79 0 13 chr2R 648336 648413 -20498295 + Gypsy2_I LTR Gypsy 5692 5767 -368 1 681 237 185 18 36 chr2R 12686920 12686976 -8459732 + Gypsy2_I LTR Gypsy 361 415 -5720 1 588 939 123 97 0 chr3LHet 411526 411681 -2143810 - Gypsy2_I LTR Gypsy -175 5960 5791 4 588 2651 88 22 6 chr3LHet 412755 413120 -2142371 - Gypsy2_I LTR Gypsy -338 5797 5427 4 588 1035 97 13 13 chr3LHet 413119 413276 -2142215 - Gypsy2_I LTR Gypsy -864 5271 5115 4 588 3955 107 278 62 chr3LHet 413265 414077 -2141414 - Gypsy2_I LTR Gypsy -1390 4745 3758 4 588 12821 175 83 61 chr3LHet 414076 417236 -2138255 - Gypsy2_I LTR Gypsy -2587 3548 319 4 588 865 123 97 0 chr3LHet 460581 460736 -2094755 - Gypsy2_I LTR Gypsy -175 5960 5791 4 588 805 122 20 13 chr3LHet 461692 461842 -2093649 - Gypsy2_I LTR Gypsy -870 5265 5115 4 588 332 125 31 15 chr3LHet 461831 461896 -2093595 - Gypsy2_I LTR Gypsy -1390 4745 4680 4 588 1497 107 134 0 chr3LHet 478676 478929 -2076562 - Gypsy2_I LTR Gypsy -4442 1693 1407 4 592 3941 233 7 40 chr3LHet 1032823 1033814 -1521677 - Gypsy2_I LTR Gypsy -91 6044 5087 4 594 9902 222 43 36 chr3LHet 1193140 1195618 -1359873 - Gypsy2_I LTR Gypsy -250 5885 3434 4 594 729 301 31 31 chr3LHet 1207400 1207654 -1347837 - Gypsy2_I LTR Gypsy -4838 1297 1044 4 594 711 187 118 89 chr3LHet 1207691 1207961 -1347530 - Gypsy2_I LTR Gypsy -5566 569 292 4 595 3154 100 23 19 chr3LHet 1335931 1336408 -1219083 - Gypsy2_I LTR Gypsy -523 5612 5134 4 595 440 139 12 25 chr3LHet 1336399 1336480 -1219011 - Gypsy2_I LTR Gypsy -1419 4716 4637 4 595 361 82 0 0 chr3LHet 1336496 1336545 -1218946 - Gypsy2_I LTR Gypsy -1797 4338 4290 4 595 961 81 0 0 chr3LHet 1336556 1336680 -1218811 - Gypsy2_I LTR Gypsy -2072 4063 3940 4 595 11822 146 29 2 chr3LHet 1338704 1340931 -1214560 - Gypsy2_I LTR Gypsy -2785 4737 1713 4 595 501 189 0 0 chr3LHet 1342826 1342916 -1212575 - Gypsy2_I LTR Gypsy -5815 320 231 4 595 337 107 107 0 chr3LHet 1342952 1343008 -1212483 - Gypsy2_I LTR Gypsy -6073 62 1 4 598 3941 233 7 40 chr3LHet 1739899 1740890 -814601 - Gypsy2_I LTR Gypsy -91 6044 5087 4 598 233 286 0 0 chr3LHet 1750634 1750704 -804787 - Gypsy2_I LTR Gypsy -91 6044 5975 4 598 1923 273 8 4 chr3LHet 1750755 1751259 -804232 - Gypsy2_I LTR Gypsy -174 5961 5456 4 599 233 286 0 0 chr3LHet 1921771 1921841 -633650 + Gypsy2_I LTR Gypsy 5975 6044 -91 4 600 4726 169 6 2 chr3LHet 1997787 1998628 -556863 + Gypsy2_I LTR Gypsy 2791 3634 -2501 4 600 2786 226 159 21 chr3LHet 1998633 1999533 -555958 + Gypsy2_I LTR Gypsy 4439 5462 -673 4 602 3385 218 48 45 chr3LHet 2267875 2269124 -286367 - Gypsy2_I LTR Gypsy -3917 2260 1002 4 603 453 301 9 9 chr3LHet 2400794 2401034 -154457 - Gypsy2_I LTR Gypsy -17 6160 5919 4 603 8112 215 70 37 chr3LHet 2401034 2402971 -152520 - Gypsy2_I LTR Gypsy -455 5680 3679 4 603 953 191 6 6 chr3LHet 2402960 2403134 -152357 - Gypsy2_I LTR Gypsy -3267 2868 2695 4 603 875 260 82 0 chr3LHet 2404078 2404297 -151194 - Gypsy2_I LTR Gypsy -4595 1540 1304 4 603 1228 248 120 44 chr3LHet 2404307 2404847 -150644 - Gypsy2_I LTR Gypsy -5263 872 292 4 725 432 55 18 0 chr3L 18462924 18462979 -6080578 + Gypsy2_I LTR Gypsy 1199 1254 -4881 3 725 1884 146 134 15 chr3L 18462977 18463389 -6080168 + Gypsy2_I LTR Gypsy 1369 1873 -5139 3 725 5635 129 45 23 chr3L 18463424 18464391 -6079166 + Gypsy2_I LTR Gypsy 3550 4538 -1597 3 763 30168 98 38 34 chr3L 23351881 23358681 -1184876 + Gypsy2_I LTR Gypsy 1 6126 -9 3 763 1517 241 128 0 chr3L 23373459 23373858 -1169699 - Gypsy2_I LTR Gypsy -2491 4521 4072 3 763 3301 264 37 5 chr3L 23374067 23375161 -1168396 - Gypsy2_I LTR Gypsy -4148 2864 1715 3 765 3101 176 180 73 chr3L 23650443 23651447 -892110 + Gypsy2_I LTR Gypsy 2 1113 -5022 3 765 1858 113 88 30 chr3L 23651436 23651764 -891793 + Gypsy2_I LTR Gypsy 1368 1714 -4421 3 765 4725 143 46 47 chr3L 23652042 23652953 -890604 + Gypsy2_I LTR Gypsy 2166 3075 -3060 3 765 6090 104 15 61 chr3L 23653892 23654952 -888605 + Gypsy2_I LTR Gypsy 5115 6125 -10 3 765 2518 250 115 80 chr3L 23698045 23699527 -844030 + Gypsy2_I LTR Gypsy 182 1714 -4421 4 765 5023 144 46 47 chr3L 23699805 23700716 -842841 + Gypsy2_I LTR Gypsy 2166 3075 -3060 4 765 1265 112 6 0 chr3L 23700702 23700880 -842677 + Gypsy2_I LTR Gypsy 3394 3572 -2563 4 765 6296 114 76 48 chr3L 23700896 23701989 -841568 + Gypsy2_I LTR Gypsy 3623 4745 -1390 4 765 5778 135 20 21 chr3L 23701978 23703036 -840521 + Gypsy2_I LTR Gypsy 5115 7010 -2 4 765 818 220 26 0 chr3L 23703648 23703839 -839718 + Gypsy2_I LTR Gypsy 758 953 -5182 4 765 1410 95 16 0 chr3L 23703832 23704022 -839535 + Gypsy2_I LTR Gypsy 1062 1254 -4881 4 765 2155 211 82 21 chr3L 23704020 23704724 -838833 + Gypsy2_I LTR Gypsy 1369 2152 -4860 4 765 4702 106 33 22 chr3L 23704877 23705599 -837958 + Gypsy2_I LTR Gypsy 2467 3196 -2939 4 765 6778 121 84 42 chr3L 23705603 23706768 -836789 + Gypsy2_I LTR Gypsy 3673 4886 -1249 4 765 1540 135 0 171 chr3L 23706778 23707135 -836422 + Gypsy2_I LTR Gypsy 5813 6108 -27 4 766 7256 241 72 50 chr3L 23835742 23838584 -704973 + Gypsy2_I LTR Gypsy 1951 4920 -1257 4 766 777 195 0 7 chr3L 23838582 23838737 -704820 + Gypsy2_I LTR Gypsy 5272 5425 -752 4 766 799 210 0 6 chr3L 23838729 23838897 -704660 + Gypsy2_I LTR Gypsy 5540 5706 -471 4 769 234 303 44 22 chr3L 24242213 24242304 -301253 + Gypsy2_I LTR Gypsy 3843 3935 -2200 4 770 370 43 0 0 chr3L 24306415 24306461 -237096 + Gypsy2_I LTR Gypsy 11 56 -6079 4 770 9866 157 79 50 chr3L 24306490 24308828 -234729 + Gypsy2_I LTR Gypsy 1085 3490 -2645 4 770 2043 168 16 62 chr3L 24308841 24309278 -234279 + Gypsy2_I LTR Gypsy 4678 5094 -1041 4 588 8061 10 0 2 chr3RHet 520792 521685 -1995822 + Gypsy2_I LTR Gypsy 5070 5960 -175 5 588 1392 24 0 0 chr3RHet 521728 521894 -1995613 + Gypsy2_I LTR Gypsy 5966 6131 -4 5 589 11942 14 29 6 chr3RHet 525632 527352 -1990155 + Gypsy2_I LTR Gypsy 4201 5960 -175 5 590 607 247 191 17 chr3RHet 686133 686364 -1831143 - Gypsy2_I LTR Gypsy -613 5522 5252 5 590 1114 306 0 0 chr3RHet 690363 690749 -1826758 - Gypsy2_I LTR Gypsy -3066 3069 2684 5 590 1165 261 9 13 chr3RHet 704431 704749 -1812758 - Gypsy2_I LTR Gypsy -3998 2137 1821 5 590 361 149 0 119 chr3RHet 751144 751228 -1766279 - Gypsy2_I LTR Gypsy -11 6124 6051 5 590 26235 116 39 20 chr3RHet 751239 755727 -1761780 - Gypsy2_I LTR Gypsy -194 5941 1713 5 590 2655 148 43 2 chr3RHet 755747 756208 -1761299 - Gypsy2_I LTR Gypsy -4568 1567 1088 5 590 459 143 0 0 chr3RHet 759130 759207 -1758300 - Gypsy2_I LTR Gypsy -4971 1164 1088 5 594 7174 99 156 2 chr3RHet 1262356 1263684 -1253823 - Gypsy2_I LTR Gypsy -2086 4049 2515 5 594 2995 114 113 4 chr3RHet 1263684 1264196 -1253311 - Gypsy2_I LTR Gypsy -3850 2285 1718 5 599 1377 335 52 29 chr3RHet 1839892 1840883 -676624 + Gypsy2_I LTR Gypsy 3073 4085 -2050 5 600 277 288 153 109 chr3RHet 2023840 2024160 -493347 - Gypsy2_I LTR Gypsy -4800 1335 1002 5 601 371 302 116 65 chr3RHet 2197439 2197733 -319774 - Gypsy2_I LTR Gypsy -4840 1295 987 5 586 3953 280 61 52 chrUextra 209623 211580 -28793076 + Gypsy2_I LTR Gypsy 3256 5280 -855 7 586 430 355 0 0 chrUextra 211598 211753 -28792903 + Gypsy2_I LTR Gypsy 6023 6177 0 7 589 6452 13 3 10 chrUextra 652679 653400 -28351256 - Gypsy2_I LTR Gypsy -1085 5050 4335 7 590 4365 182 26 22 chrUextra 708334 709688 -28294968 + Gypsy2_I LTR Gypsy 1549 2916 -4096 7 590 294 119 0 243 chrUextra 721433 721544 -28283112 + Gypsy2_I LTR Gypsy 595 678 -5457 7 590 397 21 21 0 chrUextra 757419 757466 -28247190 - Gypsy2_I LTR Gypsy -6087 48 1 7 591 2279 0 0 0 chrUextra 899254 899501 -28105155 + Gypsy2_I LTR Gypsy 5889 6135 0 7 592 6167 25 27 7 chrUextra 977981 978717 -28025939 + Gypsy2_I LTR Gypsy 1 751 -5384 7 594 312 266 2 0 chrUextra 1195509 1195604 -27809052 - Gypsy2_I LTR Gypsy -3301 2834 2758 7 594 9796 14 16 1 chrUextra 1259851 1261023 -27743633 - Gypsy2_I LTR Gypsy -2774 3361 2172 7 594 960 192 0 5 chrUextra 1296648 1296836 -27707820 - Gypsy2_I LTR Gypsy -862 5273 5087 7 594 2201 270 2 4 chrUextra 1306758 1307312 -27697344 - Gypsy2_I LTR Gypsy -509 5626 5074 7 595 663 215 0 0 chrUextra 1433382 1433517 -27571139 - Gypsy2_I LTR Gypsy -914 5221 5087 7 596 5387 118 28 3 chrUextra 1461936 1463073 -27541583 + Gypsy2_I LTR Gypsy 2034 3939 -3073 7 596 1020 249 12 12 chrUextra 1488220 1488464 -27516192 + Gypsy2_I LTR Gypsy 1847 2090 -4045 7 597 258 286 0 0 chrUextra 1664697 1664767 -27339889 - Gypsy2_I LTR Gypsy -91 6044 5975 7 598 8943 13 9 45 chrUextra 1805912 1806996 -27197660 + Gypsy2_I LTR Gypsy 3284 4328 -1807 7 600 9497 13 0 6 chrUextra 2027439 2028497 -26976159 - Gypsy2_I LTR Gypsy -4848 1287 236 7 601 708 221 0 7 chrUextra 2166568 2166718 -26837938 - Gypsy2_I LTR Gypsy -900 5235 5087 7 602 3425 24 86 2 chrUextra 2258703 2259287 -26745369 - Gypsy2_I LTR Gypsy -1302 4833 4201 7 602 8303 23 0 13 chrUextra 2348947 2349971 -26654685 - Gypsy2_I LTR Gypsy -4841 1294 284 7 603 9476 0 0 0 chrUextra 2388199 2389218 -26615438 + Gypsy2_I LTR Gypsy 3576 4594 -1541 7 605 4015 9 0 7 chrUextra 2732087 2732548 -26272108 - Gypsy2_I LTR Gypsy -175 5960 5503 7 611 8896 2 1 0 chrUextra 3523460 3524416 -25480240 - Gypsy2_I LTR Gypsy -497 5638 4682 7 613 459 143 0 0 chrUextra 3677728 3677805 -25326851 + Gypsy2_I LTR Gypsy 1088 1164 -4971 7 616 4577 18 0 4 chrUextra 4087628 4088183 -24916473 + Gypsy2_I LTR Gypsy 5335 5887 -248 7 618 1384 107 25 14 chrUextra 4366475 4366764 -24637892 + Gypsy2_I LTR Gypsy 5877 6126 -9 7 622 2271 269 41 55 chrUextra 4864653 4865552 -24139104 + Gypsy2_I LTR Gypsy 4183 5069 -1066 7 622 254 286 0 0 chrUextra 4923928 4923998 -24080658 + Gypsy2_I LTR Gypsy 5975 6044 -91 7 623 5101 14 0 0 chrUextra 4999439 5000000 -24004656 + Gypsy2_I LTR Gypsy 3073 3633 -2502 7 623 2880 24 0 0 chrUextra 5000000 5000335 -24004321 + Gypsy2_I LTR Gypsy 3634 3968 -2167 7 623 1623 5 0 177 chrUextra 5050807 5051078 -23953578 - Gypsy2_I LTR Gypsy -9 6126 5904 7 623 1396 319 52 33 chrUextra 5096863 5097749 -23906907 - Gypsy2_I LTR Gypsy -2127 4008 3106 7 625 2169 274 7 48 chrUextra 5335119 5335722 -23668934 - Gypsy2_I LTR Gypsy -91 6044 5467 7 626 229 339 31 31 chrUextra 5385936 5386064 -23618592 - Gypsy2_I LTR Gypsy -4664 1471 1344 7 626 3093 167 46 74 chrUextra 5391067 5391713 -23612943 + Gypsy2_I LTR Gypsy 3878 4505 -1630 7 627 3846 251 6 9 chrUextra 5528906 5529782 -23474874 - Gypsy2_I LTR Gypsy -3548 2587 1715 7 629 2559 93 28 5 chrUextra 5819482 5819871 -23184785 - Gypsy2_I LTR Gypsy -338 5797 5400 8 632 7240 16 0 0 chrUextra 6226159 6227011 -22777645 + Gypsy2_I LTR Gypsy 828 1679 -4456 8 634 492 269 0 125 chrUextra 6543081 6543289 -22461367 - Gypsy2_I LTR Gypsy -91 6044 5863 8 637 6483 0 0 0 chrUextra 6869326 6870068 -22134588 - Gypsy2_I LTR Gypsy 0 6135 5394 8 638 6741 13 40 5 chrUextra 7054942 7055768 -21948888 - Gypsy2_I LTR Gypsy -3493 2642 1788 8 639 6702 22 13 1 chrUextra 7149242 7150065 -21854591 + Gypsy2_I LTR Gypsy 2169 3001 -3134 8 645 310 312 14 14 chrUextra 7933649 7933807 -21070849 - Gypsy2_I LTR Gypsy -4643 1492 1218 8 645 233 286 0 0 chrUextra 7981261 7981331 -21023325 - Gypsy2_I LTR Gypsy -91 6044 5975 8 645 1598 276 10 2 chrUextra 7981382 7981799 -21022857 - Gypsy2_I LTR Gypsy -174 5961 5542 8 647 3389 22 3 21 chrUextra 8186281 8187002 -20817654 - Gypsy2_I LTR Gypsy -5312 823 1 8 649 2689 173 13 15 chrUextra 8515571 8516334 -20488322 + Gypsy2_I LTR Gypsy 1713 2747 -4265 8 650 254 286 0 0 chrUextra 8611758 8611828 -20392828 - Gypsy2_I LTR Gypsy -91 6044 5975 8 650 2931 242 7 3 chrUextra 8611879 8612497 -20392159 - Gypsy2_I LTR Gypsy -174 5961 5342 8 652 6929 0 0 0 chrUextra 8824721 8825507 -20179149 - Gypsy2_I LTR Gypsy -2507 3628 2843 8 81 1489 254 109 22 chrUextra 8912640 8913082 -20091574 + Gypsy2_I LTR Gypsy 2722 3202 -2933 8 653 3799 220 9 2 chrUextra 8955586 8956359 -20048297 - Gypsy2_I LTR Gypsy -203 5974 5195 8 653 501 87 12 12 chrUextra 8959109 8959191 -20045465 - Gypsy2_I LTR Gypsy -939 5196 5115 8 653 3634 109 181 70 chrUextra 8959180 8959892 -20044764 - Gypsy2_I LTR Gypsy -1390 4745 3955 8 659 2471 88 22 6 chrUextra 9728233 9728598 -19276058 - Gypsy2_I LTR Gypsy -338 5797 5427 8 664 3739 128 1 1 chrUextra 10457111 10457870 -18546786 + Gypsy2_I LTR Gypsy 4097 5281 -1731 8 671 4197 111 6 1 chrUextra 11278745 11279488 -17725168 + Gypsy2_I LTR Gypsy 3647 5111 -1901 8 671 7007 0 1 0 chrUextra 11290645 11291395 -17713261 - Gypsy2_I LTR Gypsy -1265 4870 4120 8 673 594 158 9 144 chrUextra 11663415 11663630 -17341026 - Gypsy2_I LTR Gypsy -5457 678 493 8 678 6452 19 11 5 chrUextra 12215074 12215813 -16788843 - Gypsy2_I LTR Gypsy -3381 2754 2012 9 678 405 180 17 35 chrUextra 12295174 12295289 -16709367 - Gypsy2_I LTR Gypsy -5530 605 493 9 679 6043 6 0 65 chrUextra 12434862 12435600 -16569056 - Gypsy2_I LTR Gypsy -1855 4280 3591 9 682 5206 53 2 5 chrUextra 12764298 12765033 -16239623 + Gypsy2_I LTR Gypsy 1713 3043 -3969 9 683 1140 328 43 24 chrUextra 12896102 12896820 -16107836 + Gypsy2_I LTR Gypsy 3360 4091 -2044 9 694 3273 227 8 3 chrUextra 14298685 14299406 -14705250 + Gypsy2_I LTR Gypsy 5144 5868 -267 9 696 6392 14 0 4 chrUextra 14560511 14561231 -14443425 + Gypsy2_I LTR Gypsy 5237 5953 -182 9 696 6445 13 0 4 chrUextra 14583458 14584175 -14420481 + Gypsy2_I LTR Gypsy 1749 2462 -3673 9 702 5986 13 0 10 chrUextra 15385904 15386617 -13618039 + Gypsy2_I LTR Gypsy 4746 5451 -684 9 708 3794 116 11 9 chrUextra 16175313 16176020 -12828636 - Gypsy2_I LTR Gypsy -4982 2030 1269 9 709 5883 31 2 1 chrUextra 16343998 16344704 -12659952 + Gypsy2_I LTR Gypsy 3459 4094 -2041 9 714 829 87 0 17 chrUextra 16949443 16949560 -12055096 - Gypsy2_I LTR Gypsy -338 5797 5683 9 717 310 324 27 27 chrUextra 17411348 17411497 -11593159 + Gypsy2_I LTR Gypsy 1344 1492 -4643 9 724 5408 14 0 0 chrUextra 18231688 18232322 -10772334 + Gypsy2_I LTR Gypsy 1081 1714 -4421 1 730 3719 117 4 1 chrUextra 19053664 19054338 -9950318 + Gypsy2_I LTR Gypsy 1713 2839 -4173 1 731 5609 18 0 9 chrUextra 19203929 19204615 -9800041 + Gypsy2_I LTR Gypsy 1928 2607 -3528 1 731 1537 172 10 3 chrUextra 19216888 19217191 -9787465 + Gypsy2_I LTR Gypsy 5087 5391 -744 1 732 4220 44 1 3 chrUextra 19306895 19307581 -9697075 + Gypsy2_I LTR Gypsy 5459 6104 -31 1 738 4258 77 4 6 chrUextra 20181323 20182002 -8822654 - Gypsy2_I LTR Gypsy -4074 2938 1713 1 740 6121 10 1 0 chrUextra 20380458 20381132 -8623524 - Gypsy2_I LTR Gypsy -4445 1690 1016 1 741 2277 61 3 23 chrUextra 20509557 20510055 -8494601 - Gypsy2_I LTR Gypsy -1 6176 5679 1 744 280 119 0 243 chrUextra 20865150 20865261 -8139395 + Gypsy2_I LTR Gypsy 595 678 -5457 1 744 3039 137 14 12 chrUextra 20878154 20878770 -8125886 + Gypsy2_I LTR Gypsy 1375 2044 -4968 1 745 4448 80 7 6 chrUextra 21029588 21030250 -7974406 + Gypsy2_I LTR Gypsy 1211 1931 -5081 1 745 6021 7 0 1 chrUextra 21051976 21052648 -7952008 + Gypsy2_I LTR Gypsy 5024 5694 -441 1 746 1003 298 72 36 chrUextra 21109113 21109720 -7894936 - Gypsy2_I LTR Gypsy -910 5225 4597 1 750 5709 21 16 0 chrUextra 21709040 21709706 -7294950 - Gypsy2_I LTR Gypsy -2882 3253 2577 1 751 1364 180 8 0 chrUextra 21780323 21780590 -7224066 - Gypsy2_I LTR Gypsy -780 5355 5087 1 753 5391 23 15 1 chrUextra 22112305 22112969 -6891687 + Gypsy2_I LTR Gypsy 2472 3144 -2991 1 756 5430 20 1 6 chrUextra 22445460 22446121 -6558535 - Gypsy2_I LTR Gypsy -3477 2658 2001 1 757 254 286 0 0 chrUextra 22581905 22581975 -6422681 + Gypsy2_I LTR Gypsy 5975 6044 -91 1 765 5059 32 5 0 chrUextra 23620942 23621592 -5383064 - Gypsy2_I LTR Gypsy -1694 5318 4097 1 766 3081 202 9 5 chrUextra 23844791 23845428 -5159228 + Gypsy2_I LTR Gypsy 5135 5774 -361 1 769 741 265 62 0 chrUextra 24161424 24161635 -4843021 + Gypsy2_I LTR Gypsy 1311 1534 -4601 1 785 4954 38 0 2 chrUextra 26230490 26231103 -2773553 - Gypsy2_I LTR Gypsy -1694 5318 4097 1 788 1547 255 77 50 chrUextra 26627387 26627986 -2376670 - Gypsy2_I LTR Gypsy -1178 4957 4343 1 788 2387 145 10 1 chrUextra 26670376 26670916 -2333740 + Gypsy2_I LTR Gypsy 1713 2709 -4303 1 586 2344 293 55 18 chrU 210707 211716 -9837321 + Gypsy2_I LTR Gypsy 1038 2118 -4894 6 587 784 50 303 7 chrU 285031 285173 -9763864 + Gypsy2_I LTR Gypsy 1 184 -5951 6 587 13396 136 54 70 chrU 285158 288087 -9760950 + Gypsy2_I LTR Gypsy 56 2937 -3198 6 587 13445 21 11 30 chrU 291826 293428 -9755609 + Gypsy2_I LTR Gypsy 2928 4499 -1636 6 587 18846 16 11 25 chrU 302374 304567 -9744470 + Gypsy2_I LTR Gypsy 2928 5090 -1045 6 587 4425 141 41 27 chrU 304546 305485 -9743552 + Gypsy2_I LTR Gypsy 5416 7011 -1 6 589 649 259 9 6 chrU 635685 635972 -9413065 - Gypsy2_I LTR Gypsy -1544 4744 4403 6 589 379 244 100 15 chrU 636031 636175 -9412862 - Gypsy2_I LTR Gypsy -3299 2836 2695 6 592 7691 258 47 45 chrU 1036694 1039007 -9010030 + Gypsy2_I LTR Gypsy 3056 5371 -764 6 597 37795 82 9 14 chrU 1600599 1607384 -8441653 + Gypsy2_I LTR Gypsy 1 7011 -1 6 597 23545 52 9 19 chrU 1607741 1613396 -8435641 + Gypsy2_I LTR Gypsy 1 5089 -1923 6 597 2789 338 63 22 chrU 1667413 1669126 -8379911 - Gypsy2_I LTR Gypsy -2052 4083 2300 6 598 56509 0 0 0 chrU 1810216 1816351 -8232686 + Gypsy2_I LTR Gypsy 1 6135 0 6 603 456 225 47 12 chrU 2360565 2360731 -7688306 + Gypsy2_I LTR Gypsy 2684 2789 -3346 6 608 1916 106 61 10 chrU 3070816 3071112 -6977925 + Gypsy2_I LTR Gypsy 5477 5787 -348 6 608 2682 121 16 90 chrU 3071112 3071621 -6977416 + Gypsy2_I LTR Gypsy 5653 6123 -12 6 617 231 329 0 0 chrU 4276281 4276357 -5772680 - Gypsy2_I LTR Gypsy -5058 1077 1002 6 624 640 296 62 53 chrU 5187082 5187625 -4861412 + Gypsy2_I LTR Gypsy 1392 1925 -4252 6 624 1251 241 186 0 chrU 5187611 5188106 -4860931 + Gypsy2_I LTR Gypsy 1715 2596 -4416 6 627 1715 293 96 51 chrU 5561291 5562661 -4486376 + Gypsy2_I LTR Gypsy 1398 2765 -3412 6 628 3043 309 64 35 chrU 5638392 5639727 -4409310 + Gypsy2_I LTR Gypsy 4754 6126 -9 6 629 38238 14 18 23 chrU 5805088 5809535 -4239502 + Gypsy2_I LTR Gypsy 1704 6131 -4 6 630 1687 108 10 23 chrU 5914590 5914998 -4134039 - Gypsy2_I LTR Gypsy -8 6127 5768 6 630 1394 198 116 51 chrU 5944569 5945290 -4103747 + Gypsy2_I LTR Gypsy 231 1089 -5046 6 631 1586 240 97 11 chrU 6135523 6135978 -3913059 + Gypsy2_I LTR Gypsy 3094 3587 -2548 6 638 1768 270 104 7 chrU 7014670 7015208 -3033829 + Gypsy2_I LTR Gypsy 1940 2529 -3606 6 639 5586 280 41 32 chrU 7171452 7173489 -2875548 - Gypsy2_I LTR Gypsy -1 7011 4120 6 641 12273 127 48 9 chrU 7371988 7374517 -2674520 + Gypsy2_I LTR Gypsy 145 2835 -4177 6 641 1850 272 2 4 chrU 7383918 7384445 -2664592 - Gypsy2_I LTR Gypsy -516 5619 5094 6 641 1530 237 48 63 chrU 7384488 7385010 -2664027 - Gypsy2_I LTR Gypsy -1449 4686 4173 6 642 581 219 0 16 chrU 7570445 7570570 -2478467 + Gypsy2_I LTR Gypsy 5249 5371 -764 6 645 3903 11 0 16 chrU 7927797 7928243 -2120794 - Gypsy2_I LTR Gypsy -797 5338 4900 6 645 2173 4 0 0 chrU 7928312 7928551 -2120486 - Gypsy2_I LTR Gypsy -1243 4892 4654 6 654 254 286 0 0 chrU 9057924 9057994 -991043 - Gypsy2_I LTR Gypsy -91 6044 5975 6 656 3649 25 0 49 chrU 9331489 9331957 -717080 + Gypsy2_I LTR Gypsy 1 445 -5690 6 659 1670 251 2 10 chrU 9747585 9747979 -301058 - Gypsy2_I LTR Gypsy -3931 2204 1814 7 749 21748 113 52 55 chrX 21529160 21530191 -892636 - Gypsy2_I LTR Gypsy -1358 4777 3795 1 749 21748 113 52 55 chrX 21530211 21533241 -889586 - Gypsy2_I LTR Gypsy -2341 3794 727 1 749 228 27 0 0 chrX 21533232 21533269 -889558 - Gypsy2_I LTR Gypsy -5525 610 574 1 749 3857 38 39 14 chrX 21537974 21538488 -884339 - Gypsy2_I LTR Gypsy -5553 582 56 1 749 646 86 312 7 chrX 21538473 21538614 -884213 - Gypsy2_I LTR Gypsy -5951 184 1 1 585 1798 245 2 7 chrYHet 114784 115219 -231819 + Gypsy2_I LTR Gypsy 5074 5506 -629 1