/oak/stanford/groups/akundaje/marinovg/programs/MACS-2.1.0/bin/macs2 callpeak -t ChCUC1_halo_REP1.SE.a.bam -c halo_REP1.SE.a.bam -n ChCUC1_halo_REP1.SE.a.MACS-2.1.0 -g 201353655 -f BAM
/oak/stanford/groups/akundaje/marinovg/programs/MACS-2.1.0/bin/macs2 callpeak -t ChCUC1_halo_REP2.SE.a.bam -c halo_REP2.SE.a.bam -n ChCUC1_halo_REP2.SE.a.MACS-2.1.0 -g 201353655 -f BAM
/oak/stanford/groups/akundaje/marinovg/programs/MACS-2.1.0/bin/macs2 callpeak -t ChCUC1_halo_REP3.SE.a.bam -c halo_REP3.SE.a.bam -n ChCUC1_halo_REP3.SE.a.MACS-2.1.0 -g 201353655 -f BAM
 