zcat ChCUC1_halo_REP1.fastq.gz | wc -l > ChCUC1_halo_REP1.fastq.lines
zcat ChCUC1_halo_REP2.fastq.gz | wc -l > ChCUC1_halo_REP2.fastq.lines
zcat ChCUC1_halo_REP3.fastq.gz | wc -l > ChCUC1_halo_REP3.fastq.lines
zcat halo_REP1.fastq.gz | wc -l > halo_REP1.fastq.lines
zcat halo_REP2.fastq.gz | wc -l > halo_REP2.fastq.lines
zcat halo_REP3.fastq.gz | wc -l > halo_REP3.fastq.lines
