#seq1	Length	seq2	Length	Similarity_AB	Similarity_BA	Similarity_max
Ymf63|P.biaurelia-Sample_379	561	Ymf63|P.caudatum-Sample_C083	647	0.297682709447	0.258114374034	0.297682709447
Ymf63|P.biaurelia-Sample_379	561	Ymf63|P.multimicronucleatum-Sample_M04	450	0.224598930481	0.28	0.28
Ymf63|P.biaurelia-Sample_379	561	Ymf63|P.octaurelia-Sample_1038	561	0.786096256684	0.786096256684	0.786096256684
Ymf63|P.biaurelia-Sample_379	561	Ymf63|P.sexaurelia-Sample_130	561	0.718360071301	0.718360071301	0.718360071301
Ymf63|P.biaurelia-Sample_379	561	Ymf63|P.tetraurelia-Sample_291	563	0.736185383244	0.733570159858	0.736185383244
Ymf63|P.biaurelia-Sample_379	561	Ymf63|Sample_C026	642	0.285204991087	0.249221183801	0.285204991087
Ymf63|P.biaurelia-Sample_379	561	Ymf63|Sample_M13	538	0.237076648841	0.247211895911	0.247211895911
Ymf63|P.biaurelia-Sample_379	561	Ymf63|Sample_Peniche3I	540	0.237076648841	0.246296296296	0.246296296296
Ymf63|P.caudatum-Sample_C083	647	Ymf63|P.multimicronucleatum-Sample_M04	450	0.204018547141	0.293333333333	0.293333333333
Ymf63|P.caudatum-Sample_C083	647	Ymf63|P.octaurelia-Sample_1038	561	0.258114374034	0.297682709447	0.297682709447
Ymf63|P.caudatum-Sample_C083	647	Ymf63|P.sexaurelia-Sample_130	561	0.26429675425	0.304812834225	0.304812834225
Ymf63|P.caudatum-Sample_C083	647	Ymf63|P.tetraurelia-Sample_291	563	0.248840803709	0.285968028419	0.285968028419
Ymf63|P.caudatum-Sample_C083	647	Ymf63|Sample_C026	642	0.537867078825	0.542056074766	0.542056074766
Ymf63|P.caudatum-Sample_C083	647	Ymf63|Sample_M13	538	0.213292117465	0.256505576208	0.256505576208
Ymf63|P.caudatum-Sample_C083	647	Ymf63|Sample_Peniche3I	540	0.219474497682	0.262962962963	0.262962962963
Ymf63|P.multimicronucleatum-Sample_M04	450	Ymf63|P.octaurelia-Sample_1038	561	0.271111111111	0.217468805704	0.271111111111
Ymf63|P.multimicronucleatum-Sample_M04	450	Ymf63|P.sexaurelia-Sample_130	561	0.286666666667	0.229946524064	0.286666666667
Ymf63|P.multimicronucleatum-Sample_M04	450	Ymf63|P.tetraurelia-Sample_291	563	0.26	0.207815275311	0.26
Ymf63|P.multimicronucleatum-Sample_M04	450	Ymf63|Sample_C026	642	0.291111111111	0.204049844237	0.291111111111
Ymf63|P.multimicronucleatum-Sample_M04	450	Ymf63|Sample_M13	538	0.493333333333	0.412639405204	0.493333333333
Ymf63|P.multimicronucleatum-Sample_M04	450	Ymf63|Sample_Peniche3I	540	0.528888888889	0.440740740741	0.528888888889
Ymf63|P.octaurelia-Sample_1038	561	Ymf63|P.sexaurelia-Sample_130	561	0.755793226381	0.755793226381	0.755793226381
Ymf63|P.octaurelia-Sample_1038	561	Ymf63|P.tetraurelia-Sample_291	563	0.848484848485	0.845470692718	0.848484848485
Ymf63|P.octaurelia-Sample_1038	561	Ymf63|Sample_C026	642	0.285204991087	0.249221183801	0.285204991087
Ymf63|P.octaurelia-Sample_1038	561	Ymf63|Sample_M13	538	0.235294117647	0.245353159851	0.245353159851
Ymf63|P.octaurelia-Sample_1038	561	Ymf63|Sample_Peniche3I	540	0.229946524064	0.238888888889	0.238888888889
Ymf63|P.sexaurelia-Sample_130	561	Ymf63|P.tetraurelia-Sample_291	563	0.716577540107	0.714031971581	0.716577540107
Ymf63|P.sexaurelia-Sample_130	561	Ymf63|Sample_C026	642	0.294117647059	0.257009345794	0.294117647059
Ymf63|P.sexaurelia-Sample_130	561	Ymf63|Sample_M13	538	0.242424242424	0.252788104089	0.252788104089
Ymf63|P.sexaurelia-Sample_130	561	Ymf63|Sample_Peniche3I	540	0.242424242424	0.251851851852	0.251851851852
Ymf63|P.tetraurelia-Sample_291	563	Ymf63|Sample_C026	642	0.277087033748	0.242990654206	0.277087033748
Ymf63|P.tetraurelia-Sample_291	563	Ymf63|Sample_M13	538	0.229129662522	0.239776951673	0.239776951673
Ymf63|P.tetraurelia-Sample_291	563	Ymf63|Sample_Peniche3I	540	0.223801065719	0.233333333333	0.233333333333
Ymf63|Sample_C026	642	Ymf63|Sample_M13	538	0.221183800623	0.263940520446	0.263940520446
Ymf63|Sample_C026	642	Ymf63|Sample_Peniche3I	540	0.232087227414	0.275925925926	0.275925925926
Ymf63|Sample_M13	538	Ymf63|Sample_Peniche3I	540	0.734200743494	0.731481481481	0.734200743494