#seq1	seq2	Ka	Ks	Ka/Ks	Length	S-Sites	N-Sites	Substitutions	S-Substitutions	N-Substitutions
rpS3|P.sexaurelia-Sample_137	rpS3|P.sexaurelia-Sample_126	0.0230284	0.290967	0.0791443	432	123.337	308.663	35	28	7
rpS3|P.sexaurelia-Sample_137	rpS3|P.sexaurelia-Sample_127	NA	0.039078	-0	432	105.049	326.951	4	4	NA
rpS3|P.sexaurelia-Sample_137	rpS3|P.sexaurelia-Sample_133	0.0676877	1.11584	0.0606607	423	95.5913	327.409	68	46.8268	21.1732
rpS3|P.sexaurelia-Sample_137	rpS3|P.sexaurelia-Sample_132	0.0676877	1.11584	0.0606607	423	95.5913	327.409	68	46.8268	21.1732
rpS3|P.sexaurelia-Sample_137	rpS3|P.sexaurelia-Sample_131	NA	0.039078	-0	432	105.049	326.951	4	4	NA
rpS3|P.sexaurelia-Sample_137	rpS3|P.sexaurelia-Sample_130	NA	0.0293008	-0	432	104.399	327.601	3	3	NA
rpS3|P.sexaurelia-Sample_137	rpS3|P.sexaurelia-Sample_128	0.0344184	0.205996	0.167083	432	162.294	269.706	37	28	9
rpS3|P.sexaurelia-Sample_137	rpS3|P.sexaurelia-Sample_Moz13BIII	0.0201527	0.249446	0.0807901	432	125.045	306.955	31	24.8964	6.10361
rpS3|P.sexaurelia-Sample_137	rpS3|P.sexaurelia-Sample_134	NA	0.0293008	-0	432	104.399	327.601	3	3	NA
rpS3|P.sexaurelia-Sample_137	rpS3|P.sexaurelia-Sample_Indo1-7I	0.0230284	0.290967	0.0791443	432	123.337	308.663	35	28	7
rpS3|P.sexaurelia-Sample_126	rpS3|P.sexaurelia-Sample_127	0.0225411	0.312821	0.0720575	432	116.766	315.234	35	28	7
rpS3|P.sexaurelia-Sample_126	rpS3|P.sexaurelia-Sample_133	0.0592302	0.91717	0.0645793	423	89.0937	333.906	60	41	19
rpS3|P.sexaurelia-Sample_126	rpS3|P.sexaurelia-Sample_132	0.0592302	0.91717	0.0645793	423	89.0937	333.906	60	41	19
rpS3|P.sexaurelia-Sample_126	rpS3|P.sexaurelia-Sample_131	0.0225411	0.312821	0.0720575	432	116.766	315.234	35	28	7
rpS3|P.sexaurelia-Sample_126	rpS3|P.sexaurelia-Sample_130	0.0230271	0.305238	0.0754397	432	123.319	308.681	36	29	7
rpS3|P.sexaurelia-Sample_126	rpS3|P.sexaurelia-Sample_128	0.0141447	0.0138268	1.02299	432	145.984	286.016	6	2	4
rpS3|P.sexaurelia-Sample_126	rpS3|P.sexaurelia-Sample_Moz13BIII	0.0247628	0.178837	0.138466	432	144.625	287.375	29	22	7
rpS3|P.sexaurelia-Sample_126	rpS3|P.sexaurelia-Sample_134	0.0230271	0.305238	0.0754397	432	123.319	308.681	36	29	7
rpS3|P.sexaurelia-Sample_126	rpS3|P.sexaurelia-Sample_Indo1-7I	NA	NA	NA	432	109.438	322.562	0	NA	NA
rpS3|P.sexaurelia-Sample_127	rpS3|P.sexaurelia-Sample_133	0.0676284	1.0458	0.0646665	423	95.2061	327.794	67	45.8194	21.1806
rpS3|P.sexaurelia-Sample_127	rpS3|P.sexaurelia-Sample_132	0.0676284	1.0458	0.0646665	423	95.2061	327.794	67	45.8194	21.1806
rpS3|P.sexaurelia-Sample_127	rpS3|P.sexaurelia-Sample_131	NA	NA	NA	432	105.764	326.236	0	NA	NA
rpS3|P.sexaurelia-Sample_127	rpS3|P.sexaurelia-Sample_130	NA	0.0290888	-0	432	105.145	326.855	3	3	NA
rpS3|P.sexaurelia-Sample_127	rpS3|P.sexaurelia-Sample_128	0.0345318	0.204622	0.16876	432	163.15	268.85	37	28	9
rpS3|P.sexaurelia-Sample_127	rpS3|P.sexaurelia-Sample_Moz13BIII	0.0195142	0.24765	0.0787973	432	115.501	316.499	29	22.9034	6.09655
rpS3|P.sexaurelia-Sample_127	rpS3|P.sexaurelia-Sample_134	NA	0.0290888	-0	432	105.145	326.855	3	3	NA
rpS3|P.sexaurelia-Sample_127	rpS3|P.sexaurelia-Sample_Indo1-7I	0.0225411	0.312821	0.0720575	432	116.766	315.234	35	28	7
rpS3|P.sexaurelia-Sample_133	rpS3|P.sexaurelia-Sample_132	NA	NA	NA	423	99.7512	323.249	0	NA	NA
rpS3|P.sexaurelia-Sample_133	rpS3|P.sexaurelia-Sample_131	0.0676284	1.0458	0.0646665	423	95.2061	327.794	67	45.8194	21.1806
rpS3|P.sexaurelia-Sample_133	rpS3|P.sexaurelia-Sample_130	0.0677085	1.03406	0.0654784	423	95.6003	327.4	67	45.8211	21.1789
rpS3|P.sexaurelia-Sample_133	rpS3|P.sexaurelia-Sample_128	0.0674337	0.842332	0.080056	423	97.0836	325.916	64	43	21
rpS3|P.sexaurelia-Sample_133	rpS3|P.sexaurelia-Sample_Moz13BIII	0.0691527	0.835985	0.0827201	420	101.864	318.136	65	44	21
rpS3|P.sexaurelia-Sample_133	rpS3|P.sexaurelia-Sample_134	0.0677085	1.03406	0.0654784	423	95.6003	327.4	67	45.8211	21.1789
rpS3|P.sexaurelia-Sample_133	rpS3|P.sexaurelia-Sample_Indo1-7I	0.0592302	0.91717	0.0645793	423	89.0937	333.906	60	41	19
rpS3|P.sexaurelia-Sample_132	rpS3|P.sexaurelia-Sample_131	0.0676284	1.0458	0.0646665	423	95.2061	327.794	67	45.8194	21.1806
rpS3|P.sexaurelia-Sample_132	rpS3|P.sexaurelia-Sample_130	0.0677085	1.03406	0.0654784	423	95.6003	327.4	67	45.8211	21.1789
rpS3|P.sexaurelia-Sample_132	rpS3|P.sexaurelia-Sample_128	0.0674337	0.842332	0.080056	423	97.0836	325.916	64	43	21
rpS3|P.sexaurelia-Sample_132	rpS3|P.sexaurelia-Sample_Moz13BIII	0.0691527	0.835985	0.0827201	420	101.864	318.136	65	44	21
rpS3|P.sexaurelia-Sample_132	rpS3|P.sexaurelia-Sample_134	0.0677085	1.03406	0.0654784	423	95.6003	327.4	67	45.8211	21.1789
rpS3|P.sexaurelia-Sample_132	rpS3|P.sexaurelia-Sample_Indo1-7I	0.0592302	0.91717	0.0645793	423	89.0937	333.906	60	41	19
rpS3|P.sexaurelia-Sample_131	rpS3|P.sexaurelia-Sample_130	NA	0.0290888	-0	432	105.145	326.855	3	3	NA
rpS3|P.sexaurelia-Sample_131	rpS3|P.sexaurelia-Sample_128	0.0345318	0.204622	0.16876	432	163.15	268.85	37	28	9
rpS3|P.sexaurelia-Sample_131	rpS3|P.sexaurelia-Sample_Moz13BIII	0.0195142	0.24765	0.0787973	432	115.501	316.499	29	22.9034	6.09655
rpS3|P.sexaurelia-Sample_131	rpS3|P.sexaurelia-Sample_134	NA	0.0290888	-0	432	105.145	326.855	3	3	NA
rpS3|P.sexaurelia-Sample_131	rpS3|P.sexaurelia-Sample_Indo1-7I	0.0225411	0.312821	0.0720575	432	116.766	315.234	35	28	7
rpS3|P.sexaurelia-Sample_130	rpS3|P.sexaurelia-Sample_128	0.0344236	0.215073	0.160056	432	162.333	269.667	38	29	9
rpS3|P.sexaurelia-Sample_130	rpS3|P.sexaurelia-Sample_Moz13BIII	0.0201747	0.23615	0.0854317	432	125.206	306.794	30	23.893	6.10697
rpS3|P.sexaurelia-Sample_130	rpS3|P.sexaurelia-Sample_134	NA	NA	NA	432	104.493	327.507	0	NA	NA
rpS3|P.sexaurelia-Sample_130	rpS3|P.sexaurelia-Sample_Indo1-7I	0.0230271	0.305238	0.0754397	432	123.319	308.681	36	29	7
rpS3|P.sexaurelia-Sample_128	rpS3|P.sexaurelia-Sample_Moz13BIII	0.0261586	0.143921	0.181756	432	158.201	273.799	27	20	7
rpS3|P.sexaurelia-Sample_128	rpS3|P.sexaurelia-Sample_134	0.0344236	0.215073	0.160056	432	162.333	269.667	38	29	9
rpS3|P.sexaurelia-Sample_128	rpS3|P.sexaurelia-Sample_Indo1-7I	0.0141447	0.0138268	1.02299	432	145.984	286.016	6	2	4
rpS3|P.sexaurelia-Sample_Moz13BIII	rpS3|P.sexaurelia-Sample_134	0.0201747	0.23615	0.0854317	432	125.206	306.794	30	23.893	6.10697
rpS3|P.sexaurelia-Sample_Moz13BIII	rpS3|P.sexaurelia-Sample_Indo1-7I	0.0247628	0.178837	0.138466	432	144.625	287.375	29	22	7
rpS3|P.sexaurelia-Sample_134	rpS3|P.sexaurelia-Sample_Indo1-7I	0.0230271	0.305238	0.0754397	432	123.319	308.681	36	29	7
#Average Ka: 0.0416506860465
#Average Ks: 0.544704293023
#Average KaKs: 0.132852997674