#seq1	seq2	Ka	Ks	Ka/Ks	Length	S-Sites	N-Sites	Substitutions	S-Substitutions	N-Substitutions
rpS3|P.sexaurelia-Sample_137	rpS3|P.sexaurelia-Sample_126	0.0205834	0.41893	0.0491333	432	87.2324	344.768	35	28	7
rpS3|P.sexaurelia-Sample_137	rpS3|P.sexaurelia-Sample_127	NA	0.0481865	-0	432	85.706	346.294	4	4	NA
rpS3|P.sexaurelia-Sample_137	rpS3|P.sexaurelia-Sample_133	0.0663023	1.00024	0.0662865	423	84.1834	338.817	68	46.5	21.5
rpS3|P.sexaurelia-Sample_137	rpS3|P.sexaurelia-Sample_132	0.0663023	1.00024	0.0662865	423	84.1834	338.817	68	46.5	21.5
rpS3|P.sexaurelia-Sample_137	rpS3|P.sexaurelia-Sample_131	NA	0.0481865	-0	432	85.706	346.294	4	4	NA
rpS3|P.sexaurelia-Sample_137	rpS3|P.sexaurelia-Sample_130	NA	0.0358465	-0	432	85.706	346.294	3	3	NA
rpS3|P.sexaurelia-Sample_137	rpS3|P.sexaurelia-Sample_128	0.0265289	0.422304	0.0628194	432	86.7122	345.288	37	28	9
rpS3|P.sexaurelia-Sample_137	rpS3|P.sexaurelia-Sample_Moz13BIII	0.0185419	0.360438	0.0514428	432	86.1919	345.808	31	24.6667	6.33333
rpS3|P.sexaurelia-Sample_137	rpS3|P.sexaurelia-Sample_134	NA	0.0358465	-0	432	85.706	346.294	3	3	NA
rpS3|P.sexaurelia-Sample_137	rpS3|P.sexaurelia-Sample_Indo1-7I	0.0205834	0.41893	0.0491333	432	87.2324	344.768	35	28	7
rpS3|P.sexaurelia-Sample_126	rpS3|P.sexaurelia-Sample_127	0.0205834	0.41893	0.0491333	432	87.2324	344.768	35	28	7
rpS3|P.sexaurelia-Sample_126	rpS3|P.sexaurelia-Sample_133	0.0584966	0.767071	0.0762597	423	85.3634	337.637	60	41	19
rpS3|P.sexaurelia-Sample_126	rpS3|P.sexaurelia-Sample_132	0.0584966	0.767071	0.0762597	423	85.3634	337.637	60	41	19
rpS3|P.sexaurelia-Sample_126	rpS3|P.sexaurelia-Sample_131	0.0205834	0.41893	0.0491333	432	87.2324	344.768	35	28	7
rpS3|P.sexaurelia-Sample_126	rpS3|P.sexaurelia-Sample_130	0.0205834	0.439243	0.0468611	432	87.2324	344.768	36	29	7
rpS3|P.sexaurelia-Sample_126	rpS3|P.sexaurelia-Sample_128	0.0117272	0.0230156	0.509529	432	88.2376	343.762	6	2	4
rpS3|P.sexaurelia-Sample_126	rpS3|P.sexaurelia-Sample_Moz13BIII	0.0206128	0.305308	0.0675149	432	87.7175	344.283	29	22	7
rpS3|P.sexaurelia-Sample_126	rpS3|P.sexaurelia-Sample_134	0.0205834	0.439243	0.0468611	432	87.2324	344.768	36	29	7
rpS3|P.sexaurelia-Sample_126	rpS3|P.sexaurelia-Sample_Indo1-7I	NA	NA	NA	432	88.7576	343.242	0	NA	NA
rpS3|P.sexaurelia-Sample_127	rpS3|P.sexaurelia-Sample_133	0.0663023	0.956464	0.0693203	423	84.1834	338.817	67	45.5	21.5
rpS3|P.sexaurelia-Sample_127	rpS3|P.sexaurelia-Sample_132	0.0663023	0.956464	0.0693203	423	84.1834	338.817	67	45.5	21.5
rpS3|P.sexaurelia-Sample_127	rpS3|P.sexaurelia-Sample_131	NA	NA	NA	432	85.706	346.294	0	NA	NA
rpS3|P.sexaurelia-Sample_127	rpS3|P.sexaurelia-Sample_130	NA	0.0358465	-0	432	85.706	346.294	3	3	NA
rpS3|P.sexaurelia-Sample_127	rpS3|P.sexaurelia-Sample_128	0.0265289	0.422304	0.0628194	432	86.7122	345.288	37	28	9
rpS3|P.sexaurelia-Sample_127	rpS3|P.sexaurelia-Sample_Moz13BIII	0.0185419	0.323825	0.0572591	432	86.1919	345.808	29	22.6667	6.33333
rpS3|P.sexaurelia-Sample_127	rpS3|P.sexaurelia-Sample_134	NA	0.0358465	-0	432	85.706	346.294	3	3	NA
rpS3|P.sexaurelia-Sample_127	rpS3|P.sexaurelia-Sample_Indo1-7I	0.0205834	0.41893	0.0491333	432	87.2324	344.768	35	28	7
rpS3|P.sexaurelia-Sample_133	rpS3|P.sexaurelia-Sample_132	NA	NA	NA	423	85.0164	337.984	0	NA	NA
rpS3|P.sexaurelia-Sample_133	rpS3|P.sexaurelia-Sample_131	0.0663023	0.956464	0.0693203	423	84.1834	338.817	67	45.5	21.5
rpS3|P.sexaurelia-Sample_133	rpS3|P.sexaurelia-Sample_130	0.0663023	0.956464	0.0693203	423	84.1834	338.817	67	45.5	21.5
rpS3|P.sexaurelia-Sample_133	rpS3|P.sexaurelia-Sample_128	0.0648933	0.83836	0.077405	423	85.1899	337.81	64	43	21
rpS3|P.sexaurelia-Sample_133	rpS3|P.sexaurelia-Sample_Moz13BIII	0.0654419	0.880813	0.0742971	420	84.901	335.099	65	44	21
rpS3|P.sexaurelia-Sample_133	rpS3|P.sexaurelia-Sample_134	0.0663023	0.956464	0.0693203	423	84.1834	338.817	67	45.5	21.5
rpS3|P.sexaurelia-Sample_133	rpS3|P.sexaurelia-Sample_Indo1-7I	0.0584966	0.767071	0.0762597	423	85.3634	337.637	60	41	19
rpS3|P.sexaurelia-Sample_132	rpS3|P.sexaurelia-Sample_131	0.0663023	0.956464	0.0693203	423	84.1834	338.817	67	45.5	21.5
rpS3|P.sexaurelia-Sample_132	rpS3|P.sexaurelia-Sample_130	0.0663023	0.956464	0.0693203	423	84.1834	338.817	67	45.5	21.5
rpS3|P.sexaurelia-Sample_132	rpS3|P.sexaurelia-Sample_128	0.0648933	0.83836	0.077405	423	85.1899	337.81	64	43	21
rpS3|P.sexaurelia-Sample_132	rpS3|P.sexaurelia-Sample_Moz13BIII	0.0654419	0.880813	0.0742971	420	84.901	335.099	65	44	21
rpS3|P.sexaurelia-Sample_132	rpS3|P.sexaurelia-Sample_134	0.0663023	0.956464	0.0693203	423	84.1834	338.817	67	45.5	21.5
rpS3|P.sexaurelia-Sample_132	rpS3|P.sexaurelia-Sample_Indo1-7I	0.0584966	0.767071	0.0762597	423	85.3634	337.637	60	41	19
rpS3|P.sexaurelia-Sample_131	rpS3|P.sexaurelia-Sample_130	NA	0.0358465	-0	432	85.706	346.294	3	3	NA
rpS3|P.sexaurelia-Sample_131	rpS3|P.sexaurelia-Sample_128	0.0265289	0.422304	0.0628194	432	86.7122	345.288	37	28	9
rpS3|P.sexaurelia-Sample_131	rpS3|P.sexaurelia-Sample_Moz13BIII	0.0185419	0.323825	0.0572591	432	86.1919	345.808	29	22.6667	6.33333
rpS3|P.sexaurelia-Sample_131	rpS3|P.sexaurelia-Sample_134	NA	0.0358465	-0	432	85.706	346.294	3	3	NA
rpS3|P.sexaurelia-Sample_131	rpS3|P.sexaurelia-Sample_Indo1-7I	0.0205834	0.41893	0.0491333	432	87.2324	344.768	35	28	7
rpS3|P.sexaurelia-Sample_130	rpS3|P.sexaurelia-Sample_128	0.0265289	0.442834	0.0599071	432	86.7122	345.288	38	29	9
rpS3|P.sexaurelia-Sample_130	rpS3|P.sexaurelia-Sample_Moz13BIII	0.0185419	0.341908	0.0542308	432	86.1919	345.808	30	23.6667	6.33333
rpS3|P.sexaurelia-Sample_130	rpS3|P.sexaurelia-Sample_134	NA	NA	NA	432	85.706	346.294	0	NA	NA
rpS3|P.sexaurelia-Sample_130	rpS3|P.sexaurelia-Sample_Indo1-7I	0.0205834	0.439243	0.0468611	432	87.2324	344.768	36	29	7
rpS3|P.sexaurelia-Sample_128	rpS3|P.sexaurelia-Sample_Moz13BIII	0.0205813	0.273767	0.0751781	432	87.1974	344.803	27	20	7
rpS3|P.sexaurelia-Sample_128	rpS3|P.sexaurelia-Sample_134	0.0265289	0.442834	0.0599071	432	86.7122	345.288	38	29	9
rpS3|P.sexaurelia-Sample_128	rpS3|P.sexaurelia-Sample_Indo1-7I	0.0117272	0.0230156	0.509529	432	88.2376	343.762	6	2	4
rpS3|P.sexaurelia-Sample_Moz13BIII	rpS3|P.sexaurelia-Sample_134	0.0185419	0.341908	0.0542308	432	86.1919	345.808	30	23.6667	6.33333
rpS3|P.sexaurelia-Sample_Moz13BIII	rpS3|P.sexaurelia-Sample_Indo1-7I	0.0206128	0.305308	0.0675149	432	87.7175	344.283	29	22	7
rpS3|P.sexaurelia-Sample_134	rpS3|P.sexaurelia-Sample_Indo1-7I	0.0205834	0.439243	0.0468611	432	87.2324	344.768	36	29	7
#Average Ka: 0.0389332348837
#Average Ks: 0.586145865116
#Average KaKs: 0.0834833372093