#NaNs Total_Count Fraction Read1/2 Base 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 0 10902200 0.803054467927 R1 A 0.000869274091468 0.00406009796188 0.00391875034397 0.000531177193594 0.00257599383611 0.00152748986443 0.0154495422942 0.997355120985 0.997250921832 0.978910586854 0.00441268734751 0.0215861018877 0.97210590523 0.00611904019372 0.026223055897 0.99511869164 0.996430720405 0.974364073306 0.0285588229899 0.967252114252 0.00572636715525 0.00287428225496 0.00557254499092 0.0997142778522 0.0985183724386 0.00620113371613 0.0136736621966 0.240244629524 0.384346003559 0.0151727174332 0.214146410816 0.329519729963 0.24915484948 0.42596264974 0.292983251087 0.118565427161 0.3343480215 0.260402212397 0.217125717745 0.522438498652 0.238421052632 0.177140393682 0.0109216488415 0.010658674396 0.00960044761608 0.00987213589918 0.0140893581112 0.0416585643265 0.93340289116 0 10902200 0.803054467927 R1 C 0.994074223551 0.000467612041606 0.000285813872429 0.000758379042762 0.000238850874135 0.000473390691787 0.0010974849113 8.01673056814e-05 0.000115939902038 0.000196015483114 0.000752508667975 0.00240153363541 0.0224059364165 0.970517785401 0.00386371558034 0.000841298086625 0.00250820935224 0.0248956173983 0.970633633579 0.0313832987837 0.99110940911 0.970043385739 0.0119790501 0.140952376585 0.462690466144 0.111816330649 0.362805305351 0.571413201005 0.400085487333 0.510452936105 0.285291409073 0.0823982315496 0.177125075673 0.233520206931 0.357345489901 0.140875236191 0.250210966594 0.138369503403 0.258242006201 0.0187705233806 0.376108400139 0.0166461815047 0.296245528425 0.0071630496597 0.00403349782613 0.00876410265818 0.0365844508448 0.927181119407 0.0238095980628 0 10902200 0.803054467927 R1 G 0.00155087963897 0.000685457980958 0.00725440736732 0.988360422667 0.0135277283484 0.996578488745 0.982989121462 0.00220056502357 0.00201307992882 0.0204890755994 0.994540092825 0.975629139073 0.00510667571683 0.0229496798811 0.969446900626 0.00365348278329 0.000462292014456 0.0005145750399 0.000351488690356 0.000920548146246 0.00270624277669 0.0257460879456 0.97449716571 0.575279760048 0.297140393682 0.460524664747 0.213764010934 0.178420043661 0.111445029444 0.338868210086 0.296978774926 0.338464896993 0.420124103392 0.258795747647 0.176258278146 0.731471813029 0.277255966686 0.463104419292 0.393772174424 0.452287061327 0.368453981765 0.396187650199 0.584438645411 0.938124323531 0.0126723046725 0.00526811102346 0.00460659316468 0.00877694410303 0.0366464566785 0 10902200 0.803054467927 R1 T 0.0032483351984 0.994783346481 0.988539560823 0.0103499293721 0.983656142797 0.00138605052191 0.000463667883546 0.000362312193869 0.000619966612243 0.000404322063437 0.000294711159216 0.000383041954835 0.000381115738108 0.000413494524041 0.000466327897122 0.000386435765258 0.000598778228248 0.000225642530865 0.000455412669003 0.000442112601126 0.000457155436517 0.0013311992075 0.0079493129827 0.184023958467 0.141585643265 0.421403753371 0.409754544954 0.00991974096971 0.104123204491 0.135503476363 0.203576250665 0.249614206307 0.153593494891 0.0817186439434 0.17341105465 0.00908642292381 0.13818266038 0.138123131111 0.130859826457 0.00650290767001 0.0170151895948 0.410025315991 0.108393351801 0.0440507420521 0.973688429858 0.976091706261 0.944700060538 0.0223775935132 0.00614004512851 0 10902200 0.803054467927 R1 N 0.00025728751995 3.48553502963e-06 1.46759369669e-06 9.17246060428e-08 1.2841444846e-06 3.45801764781e-05 1.83449212086e-07 1.83449212086e-06 9.17246060428e-08 0.0 0.0 1.83449212086e-07 3.66898424171e-07 0.0 0.0 9.17246060428e-08 0.0 9.17246060428e-08 6.420722423e-07 1.9262167269e-06 8.25521454385e-07 5.04485333235e-06 1.9262167269e-06 2.96270477518e-05 6.51244702904e-05 5.41175175653e-05 2.47656436316e-06 2.38483975711e-06 2.75173818128e-07 2.66001357524e-06 7.15451927134e-06 2.93518739337e-06 2.47656436316e-06 2.75173818128e-06 1.9262167269e-06 1.10069527251e-06 2.38483975711e-06 7.33796848343e-07 2.75173818128e-07 1.00897066647e-06 1.37586909064e-06 4.58623030214e-07 8.25521454385e-07 3.2103612115e-06 5.32002715048e-06 3.94415805984e-06 1.95373410871e-05 5.7786501807e-06 1.00897066647e-06 0 10902200 0.803054467927 R2 A 0.266750105483 0.284817101136 0.269004329401 0.277187998753 0.274578433711 0.241947129937 0.276864210893 0.266115646383 0.2641735613 0.262583606978 0 10902200 0.803054467927 R2 C 0.15976601053 0.167797050137 0.161117847774 0.165672616536 0.167986828347 0.166647373925 0.146911907688 0.158459118343 0.16084973675 0.173864816276 0 10902200 0.803054467927 R2 G 0.287134431583 0.296287079672 0.293815193264 0.278496817156 0.282766230669 0.303616884665 0.304339032489 0.312665333602 0.308211737081 0.238477096366 0 10902200 0.803054467927 R2 T 0.285762598375 0.250716644347 0.275905505311 0.278622112968 0.274651538222 0.287777696245 0.271877327512 0.262750270588 0.266754324815 0.325062372732 0 10902200 0.803054467927 R2 N 0.000586854029462 0.000382124708774 0.000157124250151 2.04545871475e-05 1.69690521179e-05 1.09152281191e-05 7.52141769551e-06 9.6310836345e-06 1.0640054301e-05 1.21076479977e-05 1 1265981 0.0932519765149 R1 A 0.00315960508096 0.0142119036542 0.0106660368521 0.000714070748297 0.00824577936004 0.00189813275239 0.0158967630636 0.996804059461 0.995791406032 0.977985451598 0.00464066996266 0.0214940034645 0.970678074947 0.00800880897897 0.0261362532297 0.993646034182 0.994169738724 0.972164669138 0.0295928611883 0.964893627945 0.00735635052975 0.00889112869782 0.00758463199685 0.102458093763 0.102237711308 0.0123619548793 0.0260011801125 0.248895520549 0.39113857159 0.0247152208445 0.225216650171 0.333237228679 0.259116053085 0.426481124124 0.296522617638 0.124896819147 0.344958573628 0.264402072385 0.222104439166 0.515199675193 0.246691696005 0.177475017398 0.0239047821413 0.0241512313376 0.0250027449069 0.0250375005628 0.0274111538799 0.0539676345854 0.9253156248 1 1265981 0.0932519765149 R1 C 0.984902617022 0.000516595430737 0.000330968632231 0.00250714663174 0.000322279718258 0.00158217224429 0.0027472766179 0.000215643046776 0.000215643046776 0.00042812648847 0.00203162606706 0.00390132237372 0.0233881867105 0.968750715848 0.00483103616879 0.0020118785353 0.0032275365902 0.0262713263469 0.96926178197 0.0329325637589 0.988869501201 0.963952065631 0.0155365680844 0.147942188706 0.451904886408 0.113451149741 0.358529077451 0.564762030394 0.39178550073 0.498791056106 0.285112493789 0.0810817855876 0.175425223601 0.239510703557 0.359622300809 0.147298419171 0.246349668755 0.143818904075 0.250332350959 0.0250690966136 0.37577894139 0.0208731410661 0.293586554617 0.0117363530732 0.00567307092287 0.0103255894046 0.0371293092076 0.912121113982 0.0269332636114 1 1265981 0.0932519765149 R1 G 0.00709963261692 0.00264537935403 0.00809253851361 0.985139587403 0.015541307492 0.994134983068 0.980120554732 0.00245659295045 0.00230177230148 0.0206930435765 0.99220209466 0.97355884488 0.00543452073925 0.0227886516464 0.967876295142 0.00383892017337 0.00075593551562 0.000914705670938 0.000631131114922 0.00121881765998 0.00323464570163 0.0256030698723 0.967024781573 0.565264407602 0.299045562295 0.455870190785 0.214175410215 0.172473362554 0.115978043904 0.33461244679 0.289570696559 0.337644877767 0.414280309104 0.254302394744 0.175692210231 0.715265079018 0.266936865561 0.448941966744 0.390033499713 0.449550190722 0.356858436264 0.383428345291 0.576659523326 0.918279974186 0.0144638821594 0.00904752914933 0.00764071498703 0.0103603450605 0.0375993004634 1 1265981 0.0932519765149 R1 T 0.00343528062427 0.982597685115 0.980897817582 0.011639195217 0.975888263726 0.00213510313346 0.00123224598157 0.000508696418035 0.00168485940942 0.000889428830291 0.00111929009993 0.0010458292818 0.000496057997711 0.000451033625307 0.00115562555836 0.000500797405332 0.00184678916982 0.000649298844137 0.000503167109143 0.00095341083318 0.000533183357412 0.00153082866173 0.00982795160433 0.184146523526 0.146194137195 0.417390940306 0.401130822658 0.0138406500571 0.101080505948 0.141843360998 0.200033017873 0.248006091719 0.151117591812 0.0795928216932 0.168121006555 0.0124978178977 0.141688540349 0.142810990054 0.137520231346 0.0101707687556 0.0206503889079 0.418206908319 0.105823863075 0.045721065324 0.954719699585 0.955079894564 0.927364628695 0.0233976655258 0.0101447020137 1 1265981 0.0932519765149 R1 N 0.00140286465595 2.84364457286e-05 1.26384203238e-05 0.0 2.36970381072e-06 0.000249608801396 3.15960508096e-06 1.50081241346e-05 6.31921016192e-06 3.9495063512e-06 6.31921016192e-06 0.0 3.15960508096e-06 7.8990127024e-07 7.8990127024e-07 2.36970381072e-06 0.0 0.0 1.10586177834e-05 1.57980254048e-06 6.31921016192e-06 2.2907136837e-05 2.60667419179e-05 0.000188786403587 0.000617702793328 0.000925764288722 0.00016350956294 2.84364457286e-05 1.73778279453e-05 3.79152609715e-05 6.71416079704e-05 3.00162482691e-05 6.08223978085e-05 0.000112955881644 4.18647673227e-05 4.18647673227e-05 6.63517067002e-05 2.60667419179e-05 9.47881524288e-06 1.02687165131e-05 2.05374330262e-05 1.6587926675e-05 2.52768406477e-05 0.000111376079104 0.000140602426103 0.000509486319305 0.000454193230388 0.000153240846427 7.10911143216e-06 1 1265981 0.0932519765149 R2 A 0.26585391092 0.281792538751 0.272272648642 0.277898325488 0.275557848025 0.239806126632 0.269875298286 0.266364977042 0.261629518926 0.265363382231 1 1265981 0.0932519765149 R2 C 0.162251250216 0.172985218578 0.160026098338 0.165538819303 0.171007305797 0.168790052931 0.153365650827 0.160158801751 0.163237047001 0.167169965426 1 1265981 0.0932519765149 R2 G 0.287392148855 0.296994978598 0.292257150779 0.281887326903 0.279988404249 0.310883022731 0.308191829103 0.31011128919 0.312484942507 0.239836932782 1 1265981 0.0932519765149 R2 T 0.282057155676 0.246308593889 0.274010431436 0.274033338573 0.273312948615 0.280463134913 0.268508769089 0.263322277349 0.262568711537 0.327567317361 1 1265981 0.0932519765149 R2 N 0.00244553433266 0.00191867018541 0.00143367080549 0.000642189732705 0.000133493314671 5.76627927275e-05 5.84526939978e-05 4.2654668593e-05 7.97800282943e-05 6.2402200349e-05 2 496570 0.0365772740491 R1 A 0.00423102483034 0.0184384880279 0.0133274261433 0.000745111464647 0.0116901947359 0.00215075417363 0.0147914694806 0.99651207282 0.995462875325 0.9791791691 0.00425720442234 0.0198018406267 0.972430875808 0.00882252250438 0.0239261332743 0.993344342187 0.993835712991 0.973429727934 0.0283927744326 0.966741849085 0.00855267132529 0.0110034838996 0.00698189580522 0.0960448677931 0.0966671365568 0.0151499285096 0.0419840103107 0.248524880681 0.416466963369 0.0287230400548 0.230140765652 0.335332380128 0.255498721228 0.419548099966 0.296677205631 0.124697424331 0.336965583906 0.275044807379 0.218867430574 0.51462230904 0.239362023481 0.179406730169 0.0265944378436 0.0220895342046 0.0271401816461 0.0264715951427 0.0309805264112 0.0553275469722 0.92916003786 2 496570 0.0365772740491 R1 C 0.983758583885 0.000519564210484 0.000338320881245 0.00388062106047 0.000287975512012 0.00280323015889 0.00397325653986 0.000304086030167 0.000388666250478 0.00065046217049 0.00354028636446 0.00504863362668 0.021894194172 0.969871317236 0.00546549328393 0.00240046720503 0.00309926092998 0.0246188855549 0.970326439374 0.0308274764887 0.987983567271 0.963864107779 0.0146384195582 0.144855710172 0.452429667519 0.104380047123 0.356837908049 0.570936625249 0.380437803331 0.50628310208 0.300811567352 0.0844231427593 0.172809472985 0.232929899108 0.34683931772 0.143935396822 0.258257647462 0.138566566647 0.251356304247 0.0332178746199 0.394129729947 0.0246108302958 0.29663894315 0.0138208107618 0.00606359627042 0.0094709708601 0.0335340435387 0.911059870713 0.0277463398917 2 496570 0.0365772740491 R1 G 0.00824657148036 0.00390075920817 0.00814185311235 0.983710252331 0.0151801357311 0.992174315806 0.979217431581 0.00238838431641 0.00213464365548 0.0189036792396 0.990067865558 0.973355216787 0.00501842640514 0.0208349276034 0.968725456632 0.00369937773124 0.000813581166804 0.00105523893912 0.00073907002034 0.00127877237852 0.00287975512012 0.0237610004632 0.96830658316 0.572289908774 0.313073685482 0.474315806432 0.218728477355 0.168566365266 0.107177235838 0.331048996113 0.277779567835 0.327067684314 0.410107336327 0.265859798216 0.186980687516 0.716489115331 0.261848279195 0.438616912016 0.398151318042 0.436162071813 0.344166985521 0.364532694283 0.575512012405 0.919056729162 0.013347564291 0.00858690617637 0.00799887226373 0.00889703365084 0.0333266206174 2 496570 0.0365772740491 R1 T 0.00318786877983 0.977121050406 0.97817427553 0.0116640151439 0.972841694021 0.00272469138289 0.00199770425116 0.000791429204342 0.00197756610347 0.00125460660128 0.00212860221117 0.001772156997 0.000654489800028 0.000469218841251 0.00188291680931 0.000553799061562 0.0022514449121 0.000896147572346 0.000533660913869 0.0011418329742 0.000579978653563 0.00135529733975 0.0100489356989 0.186684656745 0.137394526451 0.4055903498 0.382338844473 0.0119358801377 0.095879734982 0.133906599271 0.191135187385 0.253108323096 0.161340797873 0.0814769317518 0.169390015506 0.0147652898886 0.142753287553 0.147725396218 0.131574601768 0.0159051090481 0.0222828604225 0.431421551846 0.101184123084 0.0448637654309 0.953279497352 0.955244980567 0.927176430312 0.024522222446 0.00973679440965 2 496570 0.0365772740491 R1 N 0.000575951024025 2.01381476932e-05 1.81243329239e-05 0.0 0.0 0.00014700847816 2.01381476932e-05 4.02762953864e-06 3.62486658477e-05 1.20828886159e-05 6.04144430795e-06 2.21519624625e-05 2.01381476932e-06 2.01381476932e-06 0.0 2.01381476932e-06 0.0 0.0 8.05525907727e-06 1.00690738466e-05 4.02762953864e-06 1.61105181545e-05 2.41657772318e-05 0.000124856515698 0.000434983990173 0.000563868135409 0.000110759812312 3.62486658477e-05 3.8262480617e-05 3.8262480617e-05 0.000132911774775 6.84697021568e-05 0.000243671587087 0.000185270958777 0.000112773627082 0.000112773627082 0.000175201884931 4.63177396943e-05 5.03453692329e-05 9.26354793886e-05 5.84006283102e-05 2.81934067704e-05 7.04835169261e-05 0.000169160440623 0.000169160440623 0.000225547254164 0.000310127474475 0.000193326217854 3.02072215398e-05 2 496570 0.0365772740491 R2 A 0.286223493163 0.273087379423 0.284878264897 0.285270958777 0.270972873915 0.24915319089 0.282459673359 0.27825885575 0.276283303462 0.282465714804 2 496570 0.0365772740491 R2 C 0.151984614455 0.175866443804 0.14613448255 0.158140846205 0.165100590048 0.150047324647 0.145633042673 0.164452141692 0.156201542582 0.163934591296 2 496570 0.0365772740491 R2 G 0.27948728276 0.290015506374 0.317733652859 0.289580522384 0.298064724007 0.326568258252 0.308337193145 0.299182391204 0.304474696417 0.219856213625 2 496570 0.0365772740491 R2 T 0.28040356848 0.259639124393 0.250288982419 0.266641158346 0.265718831182 0.274160742695 0.263523773083 0.258046196911 0.262959904948 0.333681052017 2 496570 0.0365772740491 R2 N 0.00190104114224 0.0013915460056 0.000964617274503 0.000366514288016 0.000142980848622 7.04835169261e-05 4.63177396943e-05 6.04144430795e-05 8.05525907727e-05 6.24282578488e-05 3 911165 0.0671162815091 R1 A 0.00257362826711 0.0103054880291 0.00815220075398 0.000908726739943 0.00670899343149 0.00234864157425 0.0145352378548 0.996356313072 0.995645135623 0.979485603595 0.004408641684 0.0197022493182 0.97309268903 0.00739492847069 0.0237794471912 0.993781587309 0.994674949104 0.974758688053 0.0273221644817 0.968386625913 0.00707445962038 0.00665741111654 0.00589465135294 0.0998447043071 0.0997349547009 0.0142981787053 0.0575000137187 0.23326839815 0.366412230496 0.0323179665593 0.242192138636 0.327166868789 0.264556913402 0.426033704104 0.315793517091 0.120770661735 0.362536971899 0.254461047121 0.216154044547 0.493683361411 0.244384935769 0.173603024699 0.0229453501836 0.0286962295523 0.0189768044207 0.0189537570034 0.0229146202938 0.0492051384766 0.912494443926 3 911165 0.0671162815091 R1 C 0.989613297262 0.000594842866001 0.000531188094363 0.00288531714892 0.000381928629831 0.00194476302316 0.0031070113536 0.000442290913281 0.000621182771507 0.000870314377747 0.00239473640888 0.00424182228246 0.0209051050029 0.971263163093 0.00514286654997 0.00178343110194 0.00291165705443 0.0234238584669 0.971198410826 0.0292987548907 0.988803345168 0.968211026543 0.0134234743433 0.152528905303 0.489222039916 0.12308857342 0.325584279466 0.573755576652 0.397528438867 0.487662498011 0.258053151734 0.0877722476171 0.17861748421 0.251030274429 0.350225261067 0.156117717428 0.240248473109 0.149359336673 0.273359929321 0.0356653295506 0.377674735092 0.0246190316792 0.305143415298 0.011318476895 0.00697129499048 0.0103878002338 0.0489066195475 0.916140325847 0.0261324787497 3 911165 0.0671162815091 R1 G 0.00438998425093 0.00235522655062 0.00733127369906 0.985635971531 0.0136846784062 0.993498433324 0.980880521091 0.00255936081829 0.00227510933805 0.0186365806413 0.991728172175 0.974646743455 0.00519005888066 0.0208227927982 0.969552166732 0.00382477377862 0.000825317039175 0.00106347368479 0.000916409212382 0.00132906773197 0.0031157913221 0.0237542047818 0.97204458029 0.561688607442 0.264801655024 0.425816399884 0.203698561731 0.18163340339 0.119020155515 0.333520273496 0.303140484984 0.354934616672 0.419571647287 0.237355473487 0.16068000856 0.700609659063 0.27005427118 0.448975761799 0.370451016007 0.441512788573 0.358470748986 0.405207618818 0.543269331021 0.913103554241 0.0156294414294 0.021168504058 0.0099509968008 0.0113634742335 0.0517941316886 3 911165 0.0671162815091 R1 T 0.00302579664495 0.986741150066 0.983975459988 0.0105699845802 0.979224399532 0.00211706990501 0.00146296225162 0.00063435272426 0.00145418228312 0.00099981891315 0.00146735223587 0.0013960149918 0.000809952094297 0.000516920645547 0.00152332453507 0.000608012818754 0.00158807680277 0.000753979795097 0.000557527999868 0.000984453968271 0.00100201390528 0.00136967508629 0.00863509902158 0.185864250712 0.146065750989 0.436555398858 0.41319300017 0.0113261593674 0.117029297657 0.146476214517 0.1965714223 0.230092244544 0.137181520361 0.0855081132396 0.173260605928 0.0224657444041 0.127095531545 0.147186294469 0.140018547683 0.0291198630325 0.0194531177119 0.396558252347 0.128627636048 0.0468389369653 0.958371974341 0.949401041524 0.918123501232 0.0232416741205 0.00957126316309 3 911165 0.0671162815091 R1 N 0.000397293574709 3.2924881882e-06 9.8774645646e-06 0.0 0.0 9.10921732068e-05 1.42674488155e-05 7.68247243913e-06 4.38998425093e-06 7.68247243913e-06 1.09749606273e-06 1.31699527528e-05 2.19499212547e-06 2.19499212547e-06 2.19499212547e-06 2.19499212547e-06 0.0 0.0 5.48748031366e-06 1.09749606273e-06 4.38998425093e-06 7.68247243913e-06 2.19499212547e-06 7.35322362031e-05 0.000175599370037 0.000241449133801 2.41449133801e-05 1.6462440941e-05 9.8774645646e-06 2.30474173174e-05 4.28023464466e-05 3.40223779447e-05 7.24347401404e-05 7.24347401404e-05 4.06073543211e-05 3.62173700702e-05 6.47522677012e-05 1.75599370037e-05 1.6462440941e-05 1.86574330665e-05 1.6462440941e-05 1.20724566901e-05 1.42674488155e-05 4.28023464466e-05 5.04848188857e-05 8.88971810814e-05 0.00010426212596 4.9387322823e-05 7.68247243913e-06 3 911165 0.0671162815091 R2 A 0.238381632306 0.254931872932 0.241662048037 0.231617764071 0.247038681249 0.217458967366 0.25101600698 0.228399905615 0.233123528669 0.246061909753 3 911165 0.0671162815091 R2 C 0.125661104191 0.136904951353 0.129946826316 0.135675755763 0.135624173448 0.150138558878 0.124912611876 0.13701470096 0.145175681682 0.14972260787 3 911165 0.0671162815091 R2 G 0.374805880384 0.396629589591 0.385579999232 0.383836077988 0.385147585783 0.382635417295 0.392788353372 0.38858823594 0.386587500617 0.307193537943 3 911165 0.0671162815091 R2 T 0.260099981891 0.210808141226 0.242387492935 0.248704680272 0.232140172197 0.249752789012 0.231265467835 0.245986182525 0.23509133911 0.296999994513 3 911165 0.0671162815091 R2 N 0.0010514012281 0.000725444897466 0.000423633480215 0.000165721905473 4.9387322823e-05 1.42674488155e-05 1.75599370037e-05 1.09749606273e-05 2.19499212547e-05 2.19499212547e-05