CpG context =========== position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 519 572937 0.09 573456 2 563 568729 0.10 569292 3 521 578566 0.09 579087 4 522 568534 0.09 569056 5 542 567795 0.10 568337 6 553 578788 0.10 579341 7 506 576029 0.09 576535 8 541 576510 0.09 577051 9 495 579923 0.09 580418 10 563 580331 0.10 580894 11 547 577976 0.09 578523 12 587 585738 0.10 586325 13 588 582433 0.10 583021 14 684 580823 0.12 581507 15 678 582708 0.12 583386 16 575 581424 0.10 581999 17 523 578640 0.09 579163 18 581 583779 0.10 584360 19 608 583496 0.10 584104 20 610 582964 0.10 583574 21 585 582017 0.10 582602 22 627 579603 0.11 580230 23 575 574685 0.10 575260 24 608 574047 0.11 574655 25 611 571431 0.11 572042 26 583 565726 0.10 566309 27 613 567340 0.11 567953 28 583 560155 0.10 560738 29 561 554986 0.10 555547 30 548 553844 0.10 554392 31 560 550691 0.10 551251 32 550 543321 0.10 543871 33 552 541403 0.10 541955 34 560 536951 0.10 537511 35 568 528052 0.11 528620 36 486 523082 0.09 523568 37 536 518165 0.10 518701 38 483 512743 0.09 513226 39 550 508268 0.11 508818 40 472 502717 0.09 503189 41 491 494033 0.10 494524 42 514 490367 0.10 490881 43 480 487389 0.10 487869 44 501 478128 0.10 478629 45 494 473683 0.10 474177 46 452 467809 0.10 468261 47 477 461115 0.10 461592 48 492 455947 0.11 456439 49 448 449349 0.10 449797 50 449 441754 0.10 442203 51 466 438332 0.11 438798 52 456 429873 0.11 430329 53 416 424460 0.10 424876 54 435 417915 0.10 418350 55 383 408520 0.09 408903 56 402 398174 0.10 398576 57 404 389364 0.10 389768 58 391 373559 0.10 373950 59 361 349812 0.10 350173 60 343 304919 0.11 305262 61 235 221638 0.11 221873 CHG context =========== position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 483 533035 0.09 533518 2 495 534084 0.09 534579 3 710 545495 0.13 546205 4 503 536281 0.09 536784 5 463 534837 0.09 535300 6 618 540143 0.11 540761 7 464 538515 0.09 538979 8 475 537574 0.09 538049 9 498 542480 0.09 542978 10 500 539864 0.09 540364 11 507 538090 0.09 538597 12 476 543651 0.09 544127 13 560 543225 0.10 543785 14 550 539160 0.10 539710 15 510 544702 0.09 545212 16 475 542435 0.09 542910 17 519 539355 0.10 539874 18 526 543974 0.10 544500 19 556 543342 0.10 543898 20 554 540170 0.10 540724 21 522 543529 0.10 544051 22 518 539823 0.10 540341 23 536 535025 0.10 535561 24 495 536374 0.09 536869 25 516 532634 0.10 533150 26 491 527714 0.09 528205 27 504 527961 0.10 528465 28 473 521040 0.09 521513 29 467 515918 0.09 516385 30 452 517761 0.09 518213 31 473 511621 0.09 512094 32 538 504136 0.11 504674 33 465 503962 0.09 504427 34 502 499151 0.10 499653 35 463 491497 0.09 491960 36 459 489666 0.09 490125 37 486 484522 0.10 485008 38 439 476562 0.09 477001 39 461 474559 0.10 475020 40 455 467543 0.10 467998 41 421 460062 0.09 460483 42 472 457674 0.10 458146 43 410 450834 0.09 451244 44 434 444171 0.10 444605 45 452 441394 0.10 441846 46 401 437350 0.09 437751 47 397 428788 0.09 429185 48 390 423904 0.09 424294 49 415 419531 0.10 419946 50 398 410936 0.10 411334 51 435 407866 0.11 408301 52 397 401654 0.10 402051 53 416 393123 0.11 393539 54 387 388497 0.10 388884 55 356 381292 0.09 381648 56 325 371555 0.09 371880 57 376 365278 0.10 365654 58 348 350347 0.10 350695 59 338 327893 0.10 328231 60 311 285146 0.11 285457 61 214 207014 0.10 207228 CHH context =========== position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 1301 1430330 0.09 1431631 2 1250 1430423 0.09 1431673 3 1406 1441198 0.10 1442604 4 1219 1412494 0.09 1413713 5 1355 1400857 0.10 1402212 6 1245 1409329 0.09 1410574 7 1241 1401887 0.09 1403128 8 1242 1399624 0.09 1400866 9 1344 1410069 0.10 1411413 10 1230 1404771 0.09 1406001 11 1302 1401478 0.09 1402780 12 1298 1409002 0.09 1410300 13 1343 1403133 0.10 1404476 14 1351 1401494 0.10 1402845 15 1264 1406019 0.09 1407283 16 1237 1396623 0.09 1397860 17 1346 1392172 0.10 1393518 18 1366 1396646 0.10 1398012 19 1332 1392770 0.10 1394102 20 1340 1389511 0.10 1390851 21 1488 1393973 0.11 1395461 22 1361 1383684 0.10 1385045 23 1254 1376189 0.09 1377443 24 1281 1378474 0.09 1379755 25 1369 1367370 0.10 1368739 26 1345 1356243 0.10 1357588 27 1354 1351919 0.10 1353273 28 1317 1341630 0.10 1342947 29 1225 1332644 0.09 1333869 30 1328 1329412 0.10 1330740 31 1265 1318788 0.10 1320053 32 1332 1303977 0.10 1305309 33 1255 1298056 0.10 1299311 34 1257 1285667 0.10 1286924 35 1240 1270815 0.10 1272055 36 1207 1263054 0.10 1264261 37 1229 1249242 0.10 1250471 38 1284 1233352 0.10 1234636 39 1278 1226697 0.10 1227975 40 1164 1210149 0.10 1211313 41 1204 1195472 0.10 1196676 42 1153 1185072 0.10 1186225 43 1103 1169073 0.09 1170176 44 1153 1155164 0.10 1156317 45 1131 1144561 0.10 1145692 46 1106 1125925 0.10 1127031 47 1129 1108967 0.10 1110096 48 1117 1096037 0.10 1097154 49 1101 1079286 0.10 1080387 50 1032 1065228 0.10 1066260 51 1080 1053755 0.10 1054835 52 1032 1035731 0.10 1036763 53 1086 1015081 0.11 1016167 54 1037 1002040 0.10 1003077 55 981 984733 0.10 985714 56 1016 964158 0.11 965174 57 981 946887 0.10 947868 58 921 912314 0.10 913235 59 939 856939 0.11 857878 60 764 752016 0.10 752780 61 627 540734 0.12 541361