pos ref reads_all matches mismatches deletions insertions A C T G low_conf homopolymer predicted_methylation_site 1 T 3634 3634 0 0 0 0 0 3634 0 False 2 C 7023 7023 0 0 0 0 7023 0 0 False 3 A 7382 7382 0 0 0 7382 0 0 0 False 4 A 7693 7693 0 0 2 7693 0 0 0 False 5 G 7824 7801 1 22 1 1 0 0 7801 False 6 C 7932 7856 9 67 10 1 7856 3 5 False 7 A 8000 7941 5 54 8 7941 0 1 4 False 8 G 8001 7949 12 40 17 9 3 0 7949 False 9 A 8002 7951 13 38 5 7951 4 6 3 False 10 A 8003 7983 14 6 5 7983 3 1 10 False 11 G 8004 7949 42 13 19 24 11 7 7949 False 12 A 8005 7976 6 23 25 7976 3 2 1 False 13 C 8006 7944 27 35 35 4 7944 19 4 False 14 G 8007 7928 68 11 8 40 8 20 7928 False 15 G 8008 7983 17 8 3 11 6 0 7983 False 16 C 8009 7926 21 62 12 2 7926 9 10 False 17 A 8010 7953 45 12 17 7953 4 0 41 False 18 T 8011 7970 24 17 26 4 5 7970 15 False 19 A 8012 7924 32 56 15 7924 12 6 14 False 20 C 8013 7916 43 54 23 6 7916 22 15 False 21 G 8014 7897 74 43 11 29 34 11 7897 False 22 A 8015 7864 70 81 11 7864 12 5 53 False 23 G 8016 7940 36 40 14 11 19 6 7940 False 24 A 8017 7963 15 39 8 7963 7 3 5 False 25 T 8018 7931 50 37 81 3 25 7931 22 False 26 A 8019 7847 75 97 12 7847 58 3 14 False 27 G 8020 7898 47 75 10 30 13 4 7898 False 28 G 8021 7929 60 32 21 13 31 16 7929 False 29 A 8022 7976 25 21 10 7976 5 8 12 False 30 G 8023 7962 23 38 18 11 2 10 7962 False 31 T 8024 7971 35 18 73 13 21 7971 1 False 32 C 8025 7880 73 72 15 14 7880 31 28 False 33 C 8026 7949 57 20 35 17 7949 26 14 False 34 G 8027 7941 62 24 11 53 3 6 7941 False 35 T 8028 7986 21 21 32 3 18 7986 0 False 36 G 8029 7922 74 33 28 34 23 17 7922 False 37 A 8030 7963 36 31 23 7963 11 14 11 False 38 C 8031 7903 69 59 19 13 7903 43 13 False 39 T 8032 7838 113 81 41 6 57 7838 50 False 40 G 8033 7875 66 92 15 10 38 18 7875 False 41 G 8034 7914 95 25 16 35 43 17 7914 False 42 A 8035 7972 30 33 7 7972 6 8 16 False 43 G 8035 7918 49 68 16 34 3 12 7918 False 44 T 8036 7943 26 67 31 12 11 7943 3 False 45 C 8037 7884 40 113 30 12 7884 19 9 False 46 C 8037 7750 34 253 19 9 7750 16 9 False 47 T 8037 7760 19 258 28 7 6 7760 6 False 48 C 8037 7952 27 58 26 2 7952 11 14 False 49 T 8038 7940 37 61 13 16 9 7940 12 False 50 C 8038 7919 57 62 15 21 7919 26 10 False 51 T 8039 7757 158 124 16 4 7 7757 147 False 52 A 8040 7996 15 29 10 7996 10 1 4 False 53 T 8040 7941 56 43 40 3 50 7941 3 False 54 G 8041 7912 47 82 5 5 36 6 7912 False 55 G 8041 8019 8 14 3 4 2 2 8019 False 56 G 8041 8014 14 13 4 7 5 2 8014 False 57 C 8042 7983 38 21 9 11 7983 17 10 False 58 A 8043 8009 26 8 3 8009 8 2 16 False 59 G 8043 7999 25 19 15 17 2 6 7999 False 60 T 8043 8016 15 12 5 7 5 8016 3 False 61 C 8043 7949 71 23 23 25 7949 33 13 False 62 G 8044 7967 45 32 8 35 2 8 7967 False 63 G 8044 8006 27 11 7 17 5 5 8006 False 64 T 8044 8011 21 12 15 0 16 8011 5 False 65 G 8044 7961 61 22 19 21 30 10 7961 False 66 A 8044 8002 28 14 13 8002 2 6 20 False 67 T 8044 7993 23 28 8 8 7 7993 8 False 68 T 8044 7949 33 62 9 9 16 7949 8 False 69 T 8044 7935 49 60 16 4 38 7935 7 False 70 G 8044 7912 43 89 11 16 20 7 7912 False 71 A 8044 7940 41 63 6 7940 32 3 6 False 72 G 8044 7950 21 73 14 9 9 3 7950 False 73 T 8045 7938 32 75 11 13 17 7938 2 False 74 T 8045 7944 39 62 6 10 26 7944 3 False 75 G 8045 7967 22 56 4 7 11 4 7967 False 76 T 8044 7966 13 65 7 3 9 7966 1 False 77 C 8044 7947 34 63 15 3 7947 6 25 False 78 A 8043 7966 11 66 16 7966 0 2 9 False 79 T 8043 7941 31 71 4 0 2 7941 29 False 80 A 8042 7972 9 61 18 7972 6 0 3 False 81 T 8041 7951 22 68 2 3 16 7951 3 False 82 G 8040 7950 19 71 40 7 4 8 7950 False 83 T 8041 7250 23 768 1596 7 16 7250 0 False 84 T 8041 7911 64 66 1430 9 36 7911 19 False 85 G 7891 7398 118 375 81 61 28 29 7398 False 86 G 7908 7499 312 97 114 227 59 26 7499 False 87 A 7922 7780 43 99 115 7780 9 2 32 False 6mA 88 T 7928 7726 32 170 56 16 11 7726 5 False 6mA 89 C 7937 7388 175 374 20 120 7388 49 6 False 90 T 7948 7564 67 317 34 9 20 7564 38 False 91 C 7954 7351 161 442 69 21 7351 87 53 False 92 G 7961 7214 516 231 30 263 86 167 7214 False 93 A 7975 7849 28 98 41 7849 10 8 10 False 94 C 7979 7513 354 112 13 43 7513 302 9 False 95 G 7986 7840 36 110 22 25 7 4 7840 False 96 C 7993 7590 289 114 18 12 7590 92 185 False 97 T 7997 7816 24 157 7 7 12 7816 5 False 98 C 7998 7616 255 127 16 191 7616 24 40 False 99 T 8000 7877 21 102 26 5 8 7877 8 False 100 C 8000 7637 202 161 5 178 7637 15 9 False 101 C 8000 7678 224 98 10 6 7678 3 215 False 102 C 7999 7634 269 96 10 45 7634 27 197 False 103 T 7999 7572 265 162 13 8 15 7572 242 False 104 A 7974 7868 8 98 9 7868 4 0 4 False 105 T 7974 7683 199 92 5 7 6 7683 186 False 106 A 7976 7828 13 135 10 7828 4 2 7 False 107 C 7980 7680 201 99 4 8 7680 20 173 False 108 C 7981 7857 32 92 8 7 7857 18 7 False 109 G 7981 7842 20 119 3 15 4 1 7842 False 110 T 7979 7849 12 118 172 6 4 7849 2 False 111 T 7980 7739 151 90 44 3 3 7739 145 False 112 A 7980 7883 9 88 5 7883 1 1 7 False 113 T 7983 7889 7 87 119 1 6 7889 0 False 114 T 7981 7738 157 86 10 7 148 7738 2 False 115 A 7978 7843 41 94 1 7843 27 2 12 False 116 A 7996 7940 16 40 0 7940 4 1 11 False 117 C 7992 7942 12 38 6 2 7942 7 3 False 118 A 7979 7909 21 49 3 7909 3 3 15 False 119 T 7934 7864 18 52 1 5 5 7864 8 False 120 A 7920 7851 21 48 10 7851 13 2 6 False 121 T 7750 7677 18 55 7 4 7 7677 7 False 122 G 7732 7640 27 65 15 8 6 13 7640 False 123 A 6674 6553 19 102 4 6553 4 4 11 False 124 C 6654 6514 32 108 15 12 6514 8 12 False 125 A 6589 6423 39 127 14 6423 7 0 32 False 126 A 6575 6395 48 132 15 6395 7 15 26 False 127 C 6342 6141 52 149 17 11 6141 24 17 False 128 T 6334 6164 37 133 24 12 11 6164 14 False 129 C 6332 6096 93 143 31 20 6096 10 63 False 130 A 6324 6103 111 110 16 6103 2 2 107 False 131 A 6321 6188 32 101 12 6188 4 8 20 False 132 T 5882 5688 47 147 17 18 6 5688 23 False 133 T 5880 5700 53 127 207 16 24 5700 13 False 134 A 5880 5549 94 237 51 5549 25 10 59 False 135 A 5877 5638 54 185 64 5638 12 11 31 False 136 A 5876 5659 52 165 21 5659 11 27 14 False 137 C 5871 5510 183 178 65 34 5510 83 66 False 138 A 5868 5679 87 102 34 5679 36 5 46 False 139 G 5853 5598 109 146 41 48 9 52 5598 False 140 A 5853 5740 18 95 86 5740 5 8 5 False 6mA 141 T 5853 5747 11 95 38 4 3 5747 4 False 6mA 142 C 5853 5618 98 137 19 44 5618 35 19 False 143 G 5852 5690 54 108 9 29 5 20 5690 False 144 G 5851 5718 35 98 18 15 6 14 5718 False 145 A 5850 5690 22 138 5 5690 5 5 12 False 146 A 5851 5732 21 98 7 5732 4 9 8 False 147 G 5848 5713 38 97 17 14 8 16 5713 False 148 A 5847 5760 13 74 8 5760 5 4 4 False 149 G 5844 5706 31 107 1 11 8 12 5706 False 150 C 5840 5420 316 104 5 237 5420 58 21 False 151 G 5839 5701 42 96 14 31 4 7 5701 False 152 T 5837 5734 20 83 11 9 6 5734 5 False 153 C 5832 5575 189 68 14 101 5575 25 63 False 154 G 5830 5731 35 64 6 21 7 7 5731 False 155 T 5827 5758 12 57 7 4 4 5758 4 False 156 G 5826 5751 27 48 10 11 6 10 5751 False 157 T 5824 5746 20 58 29 9 5 5746 6 False 158 A 5816 5712 46 58 46 5712 29 12 5 False 159 G 5810 5688 28 94 12 16 10 2 5688 False 160 G 5804 5728 18 58 9 6 6 6 5728 False 161 G 5802 5703 38 61 56 25 5 8 5703 False 162 A 5798 5574 76 148 12 5574 5 5 66 False 163 A 5789 5712 24 53 9 5712 2 12 10 False 164 A 5780 5714 32 34 5 5714 7 11 14 False 165 G 5773 5685 47 41 35 23 10 14 5685 False 166 A 5766 5702 21 43 31 5702 9 4 8 False 167 G 5755 5677 30 48 20 10 4 16 5677 False 168 T 5753 5683 21 49 23 0 19 5683 2 False 169 G 5750 5669 36 45 263 12 13 11 5669 False 170 T 5746 5675 25 46 545 2 16 5675 7 False 171 A 5652 1769 2546 1337 266 1769 871 941 734 True 172 A 5631 2023 2685 923 92 2023 813 1133 739 True 173 A 5624 2813 2359 452 79 2813 454 1475 430 True 174 A 5618 2417 2883 318 35 2417 941 1028 914 True 175 T 5612 3660 1744 208 184 242 824 3660 678 False 176 A 5611 2676 1912 1023 115 2676 336 1254 322 True 177 A 5611 2228 2910 473 156 2228 1045 1046 819 True 178 A 5611 2349 2952 310 95 2349 1004 1169 779 True 179 A 5609 3530 1852 227 37 3530 1292 311 249 True 180 T 5608 4068 1352 188 214 28 533 4068 791 False 181 A 5608 3983 1290 335 37 3983 708 96 486 False 182 G 5608 3137 2176 295 522 406 1758 12 3137 True 183 T 5608 3313 1845 450 461 1398 383 3313 64 True 184 G 5608 2936 1788 884 244 16 443 1329 2936 True 185 A 5608 3884 1300 424 886 3884 459 834 7 False 186 G 5608 2458 3009 141 305 811 1208 990 2458 True 187 G 5607 5544 43 20 9 11 15 17 5544 False 188 T 5607 5557 29 21 9 7 21 5557 1 False 189 G 5607 5575 22 10 10 4 12 6 5575 False 190 T 5606 5568 20 18 19 6 10 5568 4 False 191 A 5603 5559 19 25 1 5559 5 7 7 False 192 G 5601 5532 45 24 17 21 18 6 5532 False 193 A 5600 5551 22 27 5 5551 5 3 14 False 6mA 194 T 5598 5551 19 28 2 4 7 5551 8 False 6mA 195 C 5594 5531 39 24 12 9 5531 21 9 False 196 T 5588 5562 16 10 4 8 6 5562 2 False 197 C 5583 5494 50 39 20 15 5494 27 8 False 198 G 5565 5502 28 35 3 16 8 4 5502 False 199 G 5560 5545 8 7 2 7 0 1 5545 False 200 T 5552 5510 35 7 2 4 29 5510 2 False 201 G 5544 5534 7 3 2 4 3 0 5534 False 202 G 5526 5520 5 1 2 5 0 0 5520 False 203 T 5514 5504 8 2 2 3 4 5504 1 False 204 C 5473 5416 54 3 0 16 5416 33 5 False 205 G 5452 5429 18 5 4 14 1 3 5429 False 206 C 5417 5405 7 5 1 3 5405 4 0 False 207 C 5408 5380 26 2 13 2 5380 22 2 False 208 G 5385 5364 14 7 3 11 1 2 5364 False 209 T 5349 5327 15 7 2 5 5 5327 5 False 210 A 5327 5323 3 1 4 5323 2 0 1 False 211 T 5280 5279 0 1 0 0 0 5279 0 False 212 C 5220 5210 10 0 0 2 5210 4 4 False 213 A 5187 5187 0 0 0 5187 0 0 0 False 214 T 5138 5138 0 0 0 0 0 5138 0 False 215 T 5071 5071 0 0 0 0 0 5071 0 False