#	MS119-HDF_NT1	MS120-HDF_NT2	MS121-HDF_NT3	MS122-HDF_TASOR2_1	MS123-HDF_TASOR2_2	MS124-HDF_TASOR2_3	MS125-HDF_TASOR_1	MS126-HDF_TASOR_2	MS127-K562_NT1	MS128-K562_NT2	MS129-K562_NT3	MS130-K562_TASOR2_1	MS131-K562_TASOR2_2	MS132-K562_TASOR2_3	MS133-K562_TASOR_1	MS134-K562_TASOR_2
DNA/TcMar-Pogo	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
DNA/TcMar-Tigger	71609.7286392	56831.1676731	50348.3505453	46218.1534816	55259.487644	54263.9428232	99294.1316132	84944.2247698	77256.0440632	68753.3219354	74269.5636359	70947.2182466	76708.2332351	74514.9992	71988.8267941	79042.8093526
SINE/tRNA-RTE	4456.55384615	3941.66666667	3342.91666667	2893.38571429	3538.3	3065.30952381	5402.33333333	4990.32051282	3357.48717949	2855.41904762	3045.09090909	2920.13461538	3259.22626263	3146.35757576	2926.16153846	3385.17708333
Satellite	1152.54296537	757.352921884	774.927833473	671.879585327	792.517857143	816.594677871	1573.00238095	1311.55532694	3357.54247565	2933.4032795	3561.17318573	3338.3173248	3849.34130592	3404.98276025	3143.31156791	3458.56592315
SINE/5S-Deu-L2	3498.17987013	3055.05735931	2523.75100733	2334.81410256	2768.93690476	2595.69545455	4096.30595238	3820.60833333	1594.18333333	1398.57344322	1462.91518759	1313.58672161	1557.89642857	1605.64047619	1424.75934066	1513.37380952
SINE/tRNA	4515.31428571	3166.0	3219.66025641	2952.11111111	3437.33333333	3179.04924242	5465.66666667	5263.15	5106.6523199	4398.32539683	4389.22142857	4355.33333333	4676.30606061	4573.66666667	4314.43596492	4511.84358974
LTR/ERVK	15186.6015433	11261.1765626	10022.2431862	9469.57838858	11275.6613934	10677.8021436	19679.1090633	16397.9030345	22184.5493041	19942.8086496	21278.7778632	21104.0468079	23491.2374462	22073.0333928	20202.2257704	22326.1786735
DNA/PiggyBac	898.0	619.0	596.0	561.0	620.0	622.0	1185.0	1090.02564103	1225.0	1155.5	1268.0	1161.0	1274.5	1191.0	1103.0	1232.0
DNA/PiggyBac?	139.0	117.5	118.0	117.0	108.0	138.5	171.0	155.5	127.5	88.0	126.0	130.0	131.0	129.0	108.0	126.0
Simple_repeat	690009.961651	591535.607659	510168.100516	478886.42923	584368.040324	530325.453197	953983.064289	853232.858944	546590.113201	496748.224459	517605.421736	470811.730787	539566.772395	512073.516295	505928.824317	533705.4728
DNA/hAT?	412.0	386.0	311.0	286.0	362.0	398.0	603.0	491.0	280.0	251.0	266.0	235.0	315.0	277.0	289.0	357.0
DNA/hAT-Tip100?	317.0	230.0	184.0	193.0	231.0	267.0	385.0	334.0	299.0	283.0	306.0	263.0	282.0	279.0	247.0	298.0
SINE?/tRNA	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
RC?/Helitron?	647.999999999	751.0	450.0	400.0	521.0	405.0	852.0	682.0	1272.0	1139.0	1120.0	1052.0	1258.0	1195.0	1261.66666667	1260.0
LINE/L1	336506.525256	252903.550769	224884.745199	212528.367332	248983.004039	242446.407152	457116.210474	376097.284253	440307.155448	390851.184488	430922.099288	411911.715682	441855.774832	426081.472563	410762.959974	465019.632885
scRNA	1184.72521521	1238.54237999	775.034999727	644.148379106	966.959133583	823.172947783	1360.30321192	1374.01152999	892.032634033	818.227039627	775.606993007	801.17948718	875.445797194	792.849155442	847.169017764	888.94032634
Satellite/acro	1.0	2.0	4.0	5.0	0.0	9.0	5.0	6.0	673.779680814	566.352129674	560.156150794	565.695388513	634.766917293	627.801461447	516.112673533	607.055357143
rRNA	431451.157143	414164.169048	283354.123016	305307.785715	452273.322619	250472.27381	415511.066667	452765.354762	409056.866667	311484.638095	291990.704762	332493.261905	383891.382897	370027.111905	337376.264286	423360.530953
DNA	791.666666667	710.75	657.416666667	552.416666667	786.516666667	573.983333333	968.133333333	816.05	437.0	350.0	423.166666667	355.5	458.25	370.0	373.583333333	435.166666667
DNA/MULE-MuDR	267.0	205.0	169.0	134.0	179.0	174.5	306.0	324.142857143	504.8	451.666666667	553.25990099	516.0	553.5	475.0	479.0	468.5
RNA	225.0	238.0	165.0	156.0	216.0	195.0	287.0	273.0	258.0	163.0	182.0	219.0	230.0	258.0	217.0	266.0
Satellite/centr	806.043478261	607.180092414	635.02173913	541.0	621.023529412	737.059737045	1383.572182	1048.03637566	4345.61912571	3945.99509633	4225.00920822	4089.53094266	4677.78033139	4296.89800134	4389.94789313	5632.70483799
SINE/Alu	915861.703395	728815.074101	635012.514699	591463.889296	708948.787928	673969.706702	1228122.5713	1036855.18586	1021779.46008	943534.503109	998394.980864	927973.821968	1012928.07893	976166.500388	945755.307012	1042816.61772
LINE/RTE-BovB	13914.6964311	12234.6142669	10644.7326194	9861.31063977	12195.5428559	10759.5747417	18316.2691642	16398.5740727	13108.5299448	11503.3207185	11967.2041168	11556.8923549	12223.7566147	12188.965075	11459.2627725	12317.6418852
LTR/ERV1?	73.5	27.3333333333	65.5714285714	51.1666666667	63.0	48.0	109.117647059	105.277777778	114.0	102.5	103.18907563	129.0	123.0	94.7857142857	108.454545455	107.222222222
DNA/hAT-Blackjack	4057.04761905	3184.58333333	2848.33333333	2619.33333333	3223.5	2857.21428571	5330.10416667	4610.39230769	6299.71428571	5530.18333333	5944.85	5668.96666667	6159.11960784	6215.22380952	5783.96666667	6462.23809524
DNA/TcMar-Mariner	11835.0138889	9877.0	8600.22222222	7559.5	9554.83333333	9021.06666667	15183.09375	13860.25	10466.75	9452.56666667	10253.0126582	9650.86781609	10781.3333333	9846.76162791	9716.76960784	10659.5
DNA/TcMar?	88.0	62.2	92.0	89.0	80.5714285714	103.666666667	165.0	155.0	71.8333333333	83.9523809523	75.1666666667	91.1666666666	80.5666666667	87.9833333334	77.3333333334	65.5714285714
DNA/hAT-Charlie	125792.315787	98129.7918652	86655.8585857	80211.3277867	96242.7752238	91596.0149539	167415.439553	139918.807551	121611.985315	110836.177606	120077.428004	111799.280724	122063.281835	117348.934691	113705.487282	124622.002461
srpRNA	2681.1	2185.3042082	2164.7	1967.81428571	2713.15	2071.33333333	4282.84761905	3696.48333333	2560.77619048	2360.6	2801.3	2557.65	2726.33333333	2083.36666667	2914.94285714	2692.48333333
RC/Helitron	334.142857143	211.0	178.0	129.0	230.333333333	159.0	421.0	291.0	305.0	282.0	284.0	257.166666667	310.0	337.0	354.0	391.0
LTR?	1746.0	1273.0	1186.0	1058.0	1288.0	1192.0	2167.30769231	1798.0	1712.5	1707.0	1694.0	1625.33333333	1613.0	1680.0	1686.33333333	1857.0
LTR/Gypsy?	636.333333333	459.666666667	375.0	397.666666667	498.166666667	473.666666667	877.666666667	724.833333333	423.5	420.333333333	529.688762779	429.666666667	492.353333333	558.666666667	454.333333333	506.012658228
Low_complexity	145763.470721	130153.950044	106267.637556	97422.3103877	118713.357063	109436.882042	199974.209169	179972.730341	130566.466517	117297.361339	121730.37202	112613.49503	126931.938119	121034.560691	119553.078227	125899.786986
LINE/Dong-R4	684.0	700.5	496.5	461.5	583.0	485.0	803.0	709.5	245.0	180.02173913	223.5	202.0	222.0	196.5	210.0	206.5
DNA/PIF-Harbinger	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	6.0	0.0	0.0	3.0	0.0	3.0	0.0	1.0	2.0
Unknown	4838.0	3820.56666667	3662.26666667	3213.93333333	4047.1	3739.5	6534.4	5950.61694915	2578.83333333	2417.86666667	2548.66666667	2416.0	2523.13333333	2625.85	2402.8	2635.85
LINE/L2	184635.751503	133308.875416	121523.882502	114201.82227	131404.307587	129155.86112	242189.414014	195890.166016	201469.919357	180231.811984	195550.026339	180777.317169	199712.780511	191015.158574	184994.31417	203727.070166
SINE?	0.0	0.0	0.0	0.0	2.0	1.0	0.0	3.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Satellite/telo	79.518070818	38.3333333333	38.0	40.4047619048	36.85	51.7857142857	122.861904762	109.980952381	527.252070707	457.075143378	510.75	501.45	588.485536033	525.678746743	426.014492754	477.114285714
DNA/Merlin	13.0	22.0	7.0	12.0	18.0	16.0	11.0	29.0	21.0	60.0	49.0	35.0	37.0	36.0	23.0	46.0
LTR/ERVL?	1430.33333333	1331.0	1024.33333333	1033.50990099	1209.5	1061.16666667	1765.33333333	1708.0	1738.0	1593.45	1614.68333333	1600.06666667	1620.54444444	1640.12857143	1494.5	1638.06190476
LTR/ERV1	76277.4604723	58900.5848792	52951.0281243	49430.1335535	59727.6922902	55265.0430609	99340.749416	83642.4515896	243713.705062	221580.504189	243710.741567	231663.798229	266885.040468	259284.886244	241862.014737	270361.063531
LTR/ERVL	48204.3651573	37172.6455723	32818.9532119	30852.3024062	36818.1517137	34571.1303198	62436.8848076	52666.2805374	57939.7116478	52671.4188114	57742.8336157	54798.362027	60431.6241237	57548.9573078	55948.0901432	61873.4794774
SINE/MIR	241345.782101	176957.474631	162083.611049	151180.848284	176181.336995	171956.081695	314821.241458	259801.801887	225337.18371	205269.661861	221289.282466	202661.034614	222912.354245	215330.38945	210763.865295	230076.881935
LTR	542.0	412.0	397.0	360.0	395.0	413.666666667	718.011363636	649.0	295.0	302.0	333.0	306.0	341.015384615	375.512345679	309.0	364.0
LINE/Penelope	838.5	833.0	576.166666667	527.333333333	655.365079365	604.0	1100.66666667	1060.16666667	1339.7952381	1207.00952381	1253.0	1130.92857143	1317.59523809	1188.42023809	1243.66666667	1418.625
DNA/TcMar-Tc2	3591.22244224	2958.10066007	2431.11291843	2231.32508251	2669.76968411	2594.45214521	4756.31035104	4158.96090378	3870.60468333	3576.17845356	3894.22494107	3585.02835713	4050.16075593	3915.81617162	3852.63540228	4117.75464404
SINE/tRNA-Deu	456.5	462.0	350.5	324.0	415.5	347.5	605.5	520.0	515.666666667	462.0	510.0	448.0	488.666666667	457.666666667	413.0	513.833333333
tRNA	8612.33333334	7735.33333334	4392.66666666	4017.01298701	5253.33333334	4986.66666666	9954.16666666	6486.58333333	17634.0	15342.3333333	14927.0833333	15016.5	16583.4333333	15419.5555555	13971.9583333	16148.9444445
DNA/hAT	2087.32656766	1462.34323432	1466.13030303	1298.58767877	1586.06666667	1446.94285714	2702.4	2389.70707071	1931.59323432	1739.63333333	1897.3	1806.95833333	1967.39946237	1820.62333333	1843.93333333	1972.0
snRNA	1079.0	816.728571429	657.0	633.7	698.681818182	748.166666667	1450.83333333	1148.66666667	1641.0	1501.66666667	1619.5	1471.35416667	1544.66666667	1419.365722	1451.5	1627.51
DNA/hAT-Tip100	11244.6344534	8890.46428571	8028.57777778	7297.99315363	8645.93855472	8163.66681971	14812.3807043	12341.6305628	10444.4913718	9593.85749808	10449.5298003	9459.05790242	10741.6440177	10316.7385876	9960.6141728	11343.0346681
LINE/CR1	29994.259414	22379.9425701	20825.1533911	18990.107684	22798.1559524	21782.7079455	39094.6378649	32871.9587571	29103.4417494	26459.0680537	28868.4016336	26529.2521373	28594.7562827	27932.5882168	27857.4131707	30229.5452846
Retroposon/SVA	11423.0488584	8510.58116089	7519.7162753	7004.00448008	8230.68557831	8143.53710552	15464.7087899	12726.7384335	22460.6637271	20766.8280884	22291.8541266	19627.7451819	23892.2977464	22503.5949652	22841.5947518	25098.6042311
LTR/ERVL-MaLR	109655.560721	80223.3541944	77332.5964041	70911.8280288	84267.6202302	79259.132962	142464.557475	120364.094327	120392.552929	109016.487066	118306.259511	111122.415912	122583.401813	118458.761246	114352.914959	127926.928176
LTR/Gypsy	7603.78333333	6860.0	5522.0	4993.0	6037.5	6250.00990099	10866.509901	9620.16666667	3601.36219512	3227.33333333	3482.5	3131.67901235	3559.5	3710.18666667	3537.83333333	3838.01923077
DNA/hAT-Ac	5983.81515152	5421.0	4604.65	4198.75	5070.09444444	4863.48333333	8296.09206349	7370.41269841	6039.07380952	5517.02222222	5728.96309524	5589.28452381	6271.95753968	5920.83333333	5969.9718254	5904.76547619
DNA/hAT-Tag1	148.0	110.666666667	105.0	74.0	107.333333333	102.0	157.0	172.0	163.0	122.0	158.0	135.0	191.0	146.0	155.0	140.0
DNA?	3584.05	3139.5	2883.33333333	2374.83333333	3033.0	2650.93333333	4649.29166667	4243.0	2330.73333333	2105.66666667	2355.85833333	1963.0	2260.53333333	2236.01785714	2105.16666667	2480.46666667
LINE/RTE-X	3461.37777778	2264.32029915	2152.58333333	2027.66666667	2282.67307692	2422.66666667	4467.49166667	3919.67948718	4405.43333333	4121.40507246	4374.17550505	4051.54978355	4500.58608059	4218.63333333	4302.71304945	4506.50912698
DNA/TcMar	13.0	5.33333333333	3.0	13.0	16.0	8.0	20.3333333333	18.0	19.0	18.0	15.0	13.0	12.0	21.0	10.0	13.0
