/oak/stanford/groups/akundaje/marinovg/programs/MACS-2.1.0/bin/macs2 callpeak -t Yki_S2_ChIP_rep1-GSM1128467.36mers.unique.bam -c Yki_S2_ChIP_input-GSM1128469.36mers.unique.bam -n Yki_S2_ChIP_rep1-GSM1128467.36mers.unique.MACS-2.1.0 -g dm -f BAM
/oak/stanford/groups/akundaje/marinovg/programs/MACS-2.1.0/bin/macs2 callpeak -t Yki_S2_ChIP_rep2-GSM1128468.36mers.unique.bam -c Yki_S2_ChIP_input-GSM1128469.36mers.unique.bam -n Yki_S2_ChIP_rep2-GSM1128468.36mers.unique.MACS-2.1.0 -g dm -f BAM