#4471/4471 #3.01 # k-mer/r.c. Cluster Offset PosCt wPosCt NegCt HGP_10 AAAAGAATAA/TTATTCTTTT 0 -7 34 36 8 -5.6 43 213 214 311 387 670 682 734 735 744 798 870 1064 1087 1110 1471 1596 2112 2184 2303 2304 2381 2455 2490 2527 2573 3330 3331 3352 3378 3810 4015 4075 4226 908 1115 1615 1784 1968 2529 3598 4182 AAAAGAATAT/ATATTCTTTT 0 -7 35 36 8 -5.6 186 213 214 375 377 378 391 397 414 899 1267 1419 1458 1606 1653 1699 1735 1776 1777 1859 1860 1877 1924 2010 2503 2689 3233 3324 3546 3547 3552 3772 4257 4326 4372 847 902 2570 3639 4062 4186 4256 4271 AAAGAATAAA/TTTATTCTTT 0 -6 33 36 6 -6.7 43 151 155 230 257 311 387 652 682 734 735 744 775 798 1087 1213 1319 1471 1696 1697 2112 2184 2309 2387 2492 2991 3300 3378 3742 3954 4015 4017 4169 908 1609 1615 1784 3239 3297 AAGAATAAAA/TTTTATTCTT 0 -5 32 34 7 -5.6 110 257 279 311 405 652 682 728 729 734 735 775 875 1265 1319 1471 1525 1687 1696 1697 2297 2382 2502 2628 2809 2991 3300 3346 3378 3608 3954 4366 156 267 908 1609 2283 3297 3361 AAAGAACAAA/TTTGTTCTTT 0 -6 28 29 9 -3.6 76 179 307 493 560 653 755 784 785 1074 1199 1518 1957 1974 2018 2247 2466 2722 2736 2737 3371 3400 3551 3577 3745 3828 3944 4032 258 1520 1913 1926 2529 2844 2863 3557 3677 AAGAAGAATA/TATTCTTCTT 0 -8 27 29 5 -5.5 110 126 279 315 405 444 589 759 875 1022 1034 1159 1191 1456 1512 1765 1915 1916 1993 2238 2497 2675 2676 4179 4359 4360 4366 533 907 1090 3098 3906 AAGAACAAAA/TTTTGTTCTT 0 -5 27 27 9 -3.2 60 493 784 785 981 982 1199 1374 1385 1505 1506 1518 1542 1957 2247 2545 2722 2736 2737 3038 3371 3400 3683 3684 3745 3944 3990 135 220 258 1520 2529 2844 2863 3557 3677 AGAAGAATAA/TTATTCTTCT 0 -7 24 27 3 -6.4 110 126 257 279 405 444 589 666 875 1022 1159 1176 1191 1512 1525 1915 1916 2457 2497 2675 2676 2961 3992 4366 267 533 1090 AGAATAAAAA/TTTTTATTCT 0 -4 24 27 8 -3.6 8 236 245 279 697 728 729 775 875 1054 1265 1296 1471 1696 1697 1734 1921 2167 2368 2502 2651 2809 3480 4165 908 2030 2279 2283 3113 3249 3361 3986 AGAATAAAAT/ATTTTATTCT 0 -4 24 27 3 -6.4 34 154 168 194 405 734 735 968 1182 1319 1376 1525 1687 1706 1877 2333 2334 2539 2840 2892 2893 3346 3448 4366 156 2961 3092 CAAAAGAATA/TATTCTTTTG 0 -8 24 26 3 -6.1 43 186 375 377 378 397 414 1064 1087 1653 1735 1776 1777 1877 2303 2304 2381 2481 2490 2527 2689 3378 3772 4094 902 3598 3732 ATAAGAATAT/ATATTCTTAT 0 -7 26 23 6 -3.6 290 885 1080 1368 1519 1520 1833 1845 1848 2321 2592 2634 2649 2738 2739 2864 2865 3167 3168 3180 3204 3757 3758 4078 4104 4445 740 786 2561 3185 3711 4035 TTGTCTTTTT/AAAAAGACAA 1 -4 23 23 5 -4.1 130 326 684 685 1049 1235 1513 1560 1746 2068 2069 2524 2525 2542 2694 3115 3116 3432 3535 3741 3786 3846 3907 104 1554 2981 4281 4330 AAAGAATATA/TATATTCTTT 0 -6 20 22 4 -4.4 35 104 375 382 383 622 680 899 1486 1860 1877 2315 3019 3020 3233 3289 3324 3772 4207 4257 902 3975 4062 4186 AAAGAATATT/AATATTCTTT 0 -6 25 22 5 -3.8 397 414 802 1267 1442 1458 1692 1735 1776 1777 2010 2123 2151 2503 2565 2577 2689 2838 3356 3368 3528 3548 3552 4014 4326 217 2910 3479 3639 4292 GAATAAAATA/TATTTTATTC 0 -3 20 22 5 -3.8 168 194 218 256 405 968 1142 1488 1525 1549 1662 1706 1877 2333 2334 2476 2539 2728 3448 4366 156 309 1462 1916 2421 TGGAATATTC/GAATATTCCA 0 -5 24 22 3 -5.0 156 306 791 1014 1516 1584 1735 1784 1901 2096 2151 2369 2566 2826 3036 3039 3130 3280 3578 3579 3606 3747 4097 4326 2305 3554 4362 TTCGAATATT/AATATTCGAA 0 -6 19 22 4 -4.4 53 69 70 174 501 694 695 1017 1256 2295 3130 3585 3606 3801 3965 3974 4292 4386 4387 107 341 1046 4238 AGAATAATAT/ATATTATTCT 0 -4 22 21 3 -4.8 35 640 773 1227 1323 1508 1906 1942 1971 1972 2264 2355 2356 2513 2573 3004 3282 3396 3661 4316 4343 4351 2480 2953 3385 GAATAATAAT/ATTATTATTC 0 -3 23 21 4 -4.1 284 447 897 1280 1596 1610 1728 1836 1880 2024 2080 2178 2229 2284 2360 2475 2680 2681 2742 3082 3114 3526 4189 1200 2020 3270 3649 GAGAATAAAA/TTTTATTCTC 0 -5 20 21 2 -5.6 8 154 168 194 697 1182 1296 1734 2167 2343 2368 2651 2840 2892 2893 3041 3256 3480 3900 4165 3092 3986 GGAATATTCG/CGAATATTCC 0 -4 20 21 1 -6.6 67 69 70 472 1014 1256 1492 1493 1516 1584 2826 3024 3130 3254 3280 3606 3747 3923 3965 4097 4362 TCAAAAGAAT/ATTCTTTTGA 0 -9 20 21 4 -4.1 43 186 282 375 991 1064 1099 1595 1653 1665 1666 1776 1777 2126 2280 2335 2689 2879 4094 4299 151 334 1773 3558 AAAGAATAAT/ATTATTCTTT 0 -6 20 20 4 -3.9 441 670 740 773 1047 1064 1110 1188 1334 1335 1596 2018 2303 2304 2491 2573 3330 3331 4075 4226 2474 2529 3649 4424 GAATATTCGA/TCGAATATTC 0 -3 19 20 1 -6.3 69 70 406 414 1017 1256 1584 1796 1809 2295 2455 2826 3070 3130 3280 3601 3606 3747 3965 4362 AAAGAATATG/CATATTCTTT 0 -6 20 19 4 -3.6 377 378 391 515 516 1606 1688 1689 1699 1836 1859 1860 1956 2271 2360 3546 3547 4260 4372 4438 1956 2570 4256 4271 AACGAATATT/AATATTCGTT 0 -6 17 19 1 -6.0 33 266 304 731 732 760 1049 1106 1492 1493 1516 2352 2528 3254 3948 4097 4293 2935 AAGAATAAAG/CTTTATTCTT 0 -5 16 19 1 -6.0 43 151 155 230 368 594 666 1005 1010 1213 2309 2492 2675 2676 3300 4017 940 AAGAATATAT/ATATATTCTT 0 -5 16 19 2 -5.0 35 104 133 256 495 1486 1533 1877 2315 2321 2738 2739 3019 3020 3657 4373 3906 4030 AAGAATATTA/TAATATTCTT 0 -5 21 19 4 -3.6 251 397 802 1148 1442 1519 1520 1776 1777 2123 2253 2503 2565 2592 2689 3548 3552 3757 3758 4014 4432 217 2256 3639 4292 AAGGAATAAT/ATTATTCCTT 0 -6 15 19 3 -4.2 404 698 769 1367 1856 1857 1858 2137 2462 2515 2603 2606 2780 4400 4421 1919 2457 2908 GAAGAATAAA/TTTATTCTTC 0 -6 19 19 2 -5.0 110 257 279 405 666 875 1010 1525 2297 2502 2628 2675 2676 2809 3474 3608 3721 4017 4366 267 940 GGAATAATTT/AAATTATTCC 0 -4 14 19 2 -5.0 635 653 672 673 769 1186 1734 1792 2137 3209 3286 3287 3334 3768 1910 2136 AAAAGGAATA/TATTCCTTTT 0 -8 18 18 3 -4.0 569 698 769 1415 1852 2029 2083 2200 2201 2378 2447 2677 2714 2780 3337 4233 4391 4392 1919 3532 3979 AAAGAAGAAT/ATTCTTCTTT 0 -9 19 18 3 -4.0 126 279 315 543 775 875 1034 1512 1915 1916 2188 2433 2703 2727 3471 4034 4405 4406 4465 533 1770 3906 AAGAATAAGA/TCTTATTCTT 0 -5 18 18 3 -4.0 266 381 444 587 1159 1176 1191 1718 1833 1915 1916 2457 3326 3352 3487 3745 3992 4052 1968 2921 3409 AGGAATATTC/GAATATTCCT 0 -5 17 18 0 -6.3 67 438 561 661 791 1492 1493 1522 1652 2447 2877 2878 3254 3447 3923 3965 4121 -1 ATAAAAGAAT/ATTCTTTTAT 0 -9 17 18 1 -5.7 110 213 214 344 586 870 1686 1919 2468 2503 2628 3045 3046 3350 3767 4304 4372 1784 GAATAAAGAA/TTCTTTATTC 0 -3 19 18 3 -4.0 138 230 368 441 1010 1013 1213 1386 2180 2648 2675 2676 3300 3356 3828 3845 4165 4336 4337 2394 4007 4289 AAAAAGGAAT/ATTCCTTTTT 0 -9 17 17 4 -3.1 569 697 769 1382 1415 1531 2029 2065 2200 2201 2307 2350 2378 2447 2677 3181 4233 1978 2397 2948 3532 AAGAATATTC/GAATATTCTT 0 -5 16 17 1 -5.4 58 95 306 414 1458 1541 1692 1735 1848 1964 2151 2649 3528 4054 4121 4326 380 AAGAATGAAA/TTTCATTCTT 0 -5 19 17 1 -5.4 472 613 740 1089 1199 1575 1846 1869 2266 2590 2685 2873 2909 3525 3927 4019 4020 4124 4261 4207 AGAATATTCC/GGAATATTCT 0 -4 16 17 0 -6.0 202 306 438 455 458 459 1652 1735 2127 2151 2566 2877 2878 4054 4121 4326 -1 GAAGAAGAAT/ATTCTTCTTC 0 -9 19 17 4 -3.1 110 405 444 1022 1765 2014 2497 2658 2675 2676 3457 3541 3542 3543 3658 3838 4013 4124 4179 303 2012 2096 3315 GAATAATATA/TATATTATTC 0 -3 19 17 2 -4.4 228 662 1155 1227 1906 1971 1972 2222 2573 2606 3004 3151 3282 3381 3405 3728 3729 3863 4343 3951 4222 GAATAATTTA/TAAATTATTC 0 -3 13 17 1 -5.4 497 653 769 1188 1734 2137 2514 3209 3286 3287 3334 3957 3958 2021 TAAAAGAATA/TATTCTTTTA 0 -8 17 17 3 -3.7 213 214 387 391 670 870 1110 1606 1859 2309 2503 3233 3330 3331 3546 3547 4372 1784 4186 4256 TAAGAATATT/AATATTCTTA 0 -6 19 17 4 -3.1 306 1080 1450 1519 1520 1541 1848 2055 2592 2649 3110 3131 3167 3168 3757 3758 3945 4054 4121 380 422 3711 4035 AAAGAATGAA/TTCATTCTTT 0 -6 16 16 1 -5.1 373 472 615 740 1199 1336 1337 1632 2266 2590 2604 2873 2909 3525 3927 4261 1765 AATGGAATAA/TTATTCCATT 0 -7 18 16 3 -3.4 89 726 745 1617 1618 2281 2434 2636 2706 2804 2805 2966 3036 3702 3893 4175 4176 4245 2110 2136 2786 ACAAGAATAA/TTATTCTTGT 0 -7 15 16 2 -4.1 266 338 368 811 1005 1161 1265 1971 1972 2313 2363 3326 3346 3526 4194 1596 2340 AGGAATAATT/AATTATTCCT 0 -5 12 16 3 -3.4 404 653 769 1367 1705 1734 1792 2137 2462 2780 3286 3287 1919 2457 2908 GAATATATTT/AAATATATTC 0 -3 16 16 3 -3.4 495 498 499 646 1320 1692 2029 2333 2334 2608 2638 2639 2738 2739 2937 3165 1939 2142 4030 TTGGAATATT/AATATTCCAA 0 -6 18 16 3 -3.4 791 828 1244 1258 1436 1722 1901 1908 2096 2486 2566 3578 3579 3747 4097 4190 4361 4368 1012 1603 4362 TGTCTTTTTC/GAAAAAGACA 1 -3 17 16 3 -3.4 1049 1175 1235 1513 1746 1801 2019 2161 2162 2474 2694 3099 3115 3116 3432 3462 3535 2218 4281 4330 AAGAATAAAT/ATTTATTCTT 0 -5 16 15 2 -3.9 257 387 682 1087 1778 1905 1948 2184 2363 2387 3474 3721 4015 4169 4247 4248 1160 1596 AAGGAATATA/TATATTCCTT 0 -6 14 15 2 -3.9 275 408 460 520 577 674 1268 2029 2677 2925 2926 3403 3404 4269 3339 3833 AGAACAAAAG/CTTTTGTTCT 0 -4 15 15 3 -3.2 60 784 785 981 982 1182 1199 1582 1830 2623 2624 3481 3683 3684 3745 2797 2863 3677 AGAATAAGAT/ATCTTATTCT 0 -4 16 15 3 -3.2 266 587 1016 1343 1638 1639 1915 1916 2821 3007 3134 3352 3487 3638 4052 4118 240 2921 4413 ATGAGAATAT/ATATTCTCAT 0 -7 15 15 1 -4.8 172 458 459 733 1124 1125 1371 1850 1851 2246 2540 2649 3527 4262 4263 4054 CAAGAATAAA/TTTATTCTTG 0 -6 14 15 2 -3.9 368 682 728 729 1005 1161 1265 1687 1778 1948 2363 3300 3346 4152 1596 2283 GAAAAGAATA/TATTCTTTTC 0 -8 15 15 3 -3.2 213 214 734 735 798 1460 1860 1924 2010 2386 2455 2573 3552 4075 4257 1115 1615 3639 GAATATTATT/AATAATATTC 0 -3 17 15 0 -5.4 79 1244 1323 1331 1588 1589 1900 2006 2322 2396 2560 2973 3223 3430 4245 4292 4349 -1 GAATATTCGG/CCGAATATTC 0 -3 12 15 1 -4.8 18 26 59 946 947 1014 1458 1753 2295 2371 2632 3024 3443 GAGAATAATA/TATTATTCTC 0 -5 17 15 0 -5.4 944 1227 1449 1610 1728 1836 2264 2355 2356 2473 2771 2836 3396 3661 3838 4316 4343 -1 GAGAGAATAA/TTATTCTCTC 0 -7 17 15 0 -5.4 153 299 480 1110 1440 1836 2167 2343 2355 2356 2892 2893 3361 3396 4118 4140 4141 -1 TAGAATATTC/GAATATTCTA 0 -5 16 15 0 -5.4 406 438 736 799 1541 1652 2007 2008 2111 2371 2632 3070 3528 3873 4054 4459 -1 GTCTTTTTCT/AGAAAAAGAC 1 -2 15 15 0 -5.4 163 738 1049 1513 1746 1801 1966 1967 2019 2161 2162 2694 3462 3479 3535 -1 AAGAATGAGA/TCTCATTCTT 0 -5 13 14 0 -5.1 153 293 294 551 690 1099 1191 2208 2220 3658 3666 3714 3838 -1 AAGAGAATAA/TTATTCTCTT 0 -7 14 14 0 -5.1 944 1036 1227 1343 2269 2473 2651 2836 2889 2930 3256 3480 3695 4267 -1 AGAATATTAT/ATAATATTCT 0 -4 15 14 1 -4.5 251 998 1148 1331 1442 1776 1777 1805 2253 2396 2565 2973 3355 3689 4245 217 AGAGAATAAA/TTTATTCTCT 0 -6 17 14 1 -4.5 153 2167 2269 2343 2651 2794 2892 2893 3039 3256 3480 3695 3900 3995 4140 4141 4267 3092 AGGAATAATA/TATTATTCCT 0 -5 12 14 0 -5.1 24 1856 1857 1858 2515 2603 2606 2680 2681 3863 4400 4421 -1 ATGGAATAAA/TTTATTCCAT 0 -6 14 14 2 -3.6 89 511 745 890 1615 1617 1618 1861 2281 2804 2805 2966 3036 4245 1272 2027 GAATATAGAA/TTCTATATTC 0 -3 9 14 1 -4.5 3 4 15 375 481 1362 2296 3597 4329 933 GAATATTCAA/TTGAATATTC 0 -3 15 14 1 -4.5 59 736 846 1522 1692 1848 2007 2008 2435 2447 2876 3036 3617 3618 4459 2305 GAGGAATATT/AATATTCCTC 0 -6 12 14 1 -4.5 67 334 427 655 661 1522 1592 2877 2878 3114 3254 3964 3340 AAAGGAATAT/ATATTCCTTT 0 -7 14 13 2 -3.3 408 520 997 1187 1925 2029 2200 2201 2306 2447 2677 2714 3183 4269 3532 3986 AAGAATAATG/CATTATTCTT 0 -5 15 13 1 -4.2 670 811 1334 1335 2303 2304 2927 3095 3109 3305 3330 3331 4044 4045 4226 2529 AAGAATATGA/TCATATTCTT 0 -5 13 13 2 -3.3 31 290 759 1456 1606 1688 1689 1699 3713 4260 4372 4438 4445 740 2570 AAGGAATATT/AATATTCCTT 0 -6 14 13 2 -3.3 66 438 791 1149 1652 2200 2201 2447 2714 3528 3965 4018 4192 4426 3173 3532 ACGAATATTT/AAATATTCGT 0 -5 12 13 1 -4.2 33 266 719 731 732 1049 2337 2528 3607 3883 3937 3948 2134 AGAATAATGA/TCATTATTCT 0 -4 12 13 1 -4.2 233 395 670 965 1490 2303 2304 2764 2927 3330 3331 3463 2529 AGAATATTCA/TGAATATTCT 0 -4 12 13 1 -4.2 58 95 736 1067 1692 1848 1964 2007 2008 2876 4096 4459 380 AGAGAATAAT/ATTATTCTCT 0 -6 14 13 0 -4.8 212 944 1110 1227 1407 1449 1836 2005 2355 2356 2473 2836 3396 4316 -1 ATTTGGAATA/TATTCCAAAT 0 -8 13 13 0 -4.8 176 177 513 1062 1722 2096 2156 2157 2219 3290 3489 4097 4190 -1 CGAATATTTT/AAAATATTCG 0 -4 14 13 1 -4.2 33 266 719 1752 2212 2337 3585 3801 3883 3937 3974 4324 4386 4387 3365 GAACAAAAGA/TCTTTTGTTC 0 -3 12 13 1 -4.2 60 709 784 785 1182 1199 1487 1830 2490 2931 3481 3745 77 GAATATAAAG/CTTTATATTC 0 -3 12 13 0 -4.8 19 20 555 586 1225 1860 2540 2925 2926 3233 3685 3686 -1 GAATATGCTT/AAGCATATTC 0 -3 12 13 0 -4.8 37 183 531 901 1811 1907 2097 2772 3963 3975 4467 4468 -1 GGAATATTCA/TGAATATTCC 0 -4 12 13 2 -3.3 156 225 561 806 846 1522 2096 2447 3036 3039 3578 3579 2305 3554 AAGAGAATAT/ATATTCTCTT 0 -7 14 12 1 -3.9 52 1062 1451 2379 2484 2699 2723 2729 3471 3963 4096 4109 4110 4325 2640 AGAACAAAAC/GTTTTGTTCT 0 -4 13 12 2 -3.0 152 939 1374 1518 1542 1664 1957 2446 2598 2765 3090 3091 3400 1768 3557 AGAATAAAGA/TCTTTATTCT 0 -4 12 12 0 -4.5 151 230 368 1010 1213 1386 2648 2675 2676 3039 3300 4165 -1 AGAATATACT/AGTATATTCT 0 -4 12 12 1 -3.9 2 216 828 1845 2729 3180 3324 3836 3837 3984 3985 4191 902 AGAATATTCG/CGAATATTCT 0 -4 10 12 1 -3.9 18 26 406 414 1017 1458 2371 2632 3070 3873 3443 AGAGAATATA/TATATTCTCT 0 -6 12 12 0 -4.5 2 1411 1720 2160 2290 2608 2729 4109 4110 4191 4310 4329 -1 AGGAATATAT/ATATATTCCT 0 -5 10 12 2 -3.0 374 408 460 599 674 1170 1687 2009 2029 2342 1372 2541 ATAATTGAGA/TCTCAATTAT 0 -11 14 12 0 -4.5 1008 1037 1304 1321 1322 1610 1711 1986 1987 1988 2843 3586 4153 4154 -1 ATAGGAATAT/ATATTCCTAT 0 -7 12 12 0 -4.5 561 649 1351 1687 1849 2192 2310 2342 2754 2963 3923 4121 -1 GAATAAGATA/TATCTTATTC 0 -3 13 12 0 -4.5 563 1016 1024 1343 1637 1638 1639 2464 3134 3352 3487 3638 4052 -1 GAATAATAGA/TCTATTATTC 0 -3 10 12 1 -3.9 645 1449 1620 2385 2771 2836 3743 3838 4400 4421 1648 GAATATTCCC/GGGAATATTC 0 -3 11 12 0 -4.5 202 225 455 458 459 846 1256 2127 3024 3447 4054 -1 GATAAGAATA/TATTCTTATC 0 -8 13 12 2 -3.0 290 1368 1519 1520 1597 1833 1845 1848 2229 3204 3757 3758 4078 3348 4035 TTTGGAATAA/TTATTCCAAA 0 -7 13 12 1 -3.9 176 177 495 513 1062 1823 2219 2868 2922 3231 3446 3489 3741 4141 TTGTCTCTTT/AAAGAGACAA 1 -4 11 12 0 -4.5 231 349 388 727 909 1140 1193 1990 2147 2400 3514 -1 TTTGTCTCTT/AAGAGACAAA 1 -5 12 12 1 -3.9 349 388 727 773 909 1193 1221 2147 2400 2566 3514 3631 1387 AATATTCGGA/TCCGAATATT 0 -2 10 11 1 -3.6 59 135 946 947 1014 1458 2295 2632 3024 3562 2606 ATGGAACAAA/TTTGTTCCAT 0 -6 12 11 1 -3.6 436 669 985 1760 1842 1843 2541 3148 3264 3446 3554 4409 3769 CGAATATTAT/ATAATATTCG 0 -4 11 11 1 -3.6 79 351 501 1234 1900 2322 2352 2560 3567 3802 4292 2606 GAAAGAATAT/ATATTCTTTC 0 -7 11 11 1 -3.6 371 382 383 1836 1860 2315 2577 2801 3019 3020 3528 2910 GAAGAATAAG/CTTATTCTTC 0 -6 12 11 1 -3.6 444 1033 1159 1176 1191 1718 1915 1916 2457 3767 3992 4052 3137 GAAGGAATAT/ATATTCCTTC 0 -7 11 11 1 -3.6 66 275 438 674 1268 1652 3403 3404 3539 3688 4426 3173 TGAGAATAAA/TTTATTCTCA 0 -6 9 11 0 -4.2 8 168 194 986 1182 1483 1734 2840 4165 -1 TTGGAATAAT/ATTATTCCAA 0 -6 11 11 1 -3.6 176 177 672 673 1062 1931 2219 2222 2415 2470 3489 2712 TTTGGAATAT/ATATTCCAAA 0 -7 13 11 1 -3.6 1436 1722 1901 2096 2486 2845 2846 3290 3489 3747 4097 4190 4361 4362 TTTGTCTTTA/TAAAGACAAA 1 -5 12 11 1 -3.6 525 780 1119 1120 1240 1331 2940 3058 3133 3896 3951 4419 648 AAGGAACAAA/TTTGTTCCTT 0 -6 10 10 1 -3.3 433 594 836 837 2176 2379 3473 3666 3895 3947 613 AATGGGAATA/TATTCCCATT 0 -8 11 10 1 -3.3 762 906 1329 1354 1527 1528 2296 3144 3728 3729 3924 2785 ACAGAATAAA/TTTATTCTGT 0 -6 10 10 1 -3.3 245 1054 1080 2220 2230 2333 2334 2395 2600 2648 3658 AGAATGAGAA/TTCTCATTCT 0 -4 10 10 1 -3.3 293 294 564 1099 2245 3658 3743 3838 4169 4441 4183 AGGGAATAAA/TTTATTCCCT 0 -6 10 10 1 -3.3 138 434 1392 1979 2287 2643 2728 3490 3609 4135 4007 ATTGAGAATA/TATTCTCAAT 0 -8 10 10 0 -3.9 474 475 1304 1549 1986 1987 1988 2460 2461 2771 -1 CAAAGAACAA/TTGTTCTTTG 0 -7 10 10 1 -3.3 56 784 785 1957 2466 2736 2737 4032 4038 4107 3161 GAATATTCAT/ATGAATATTC 0 -3 10 10 0 -3.9 58 225 561 919 1809 1964 2002 3617 3618 4096 -1 GAATATTTCA/TGAAATATTC 0 -3 11 10 1 -3.3 208 287 2171 2360 2384 3167 3168 3607 3683 3684 4192 3933 GAATGAATAT/ATATTCATTC 0 -3 8 10 0 -3.9 19 20 498 499 1708 2526 2799 3925 -1 GGAATAATAA/TTATTATTCC 0 -4 12 10 0 -3.9 1276 1529 1856 1857 1858 2178 2603 2680 2681 2742 3114 4189 -1 GGAATATAAA/TTTATATTCC 0 -4 12 10 1 -3.3 797 1225 1231 1268 1837 2636 2677 2925 2926 3306 3685 3686 3833 GGGAATAAAA/TTTTATTCCC 0 -5 12 10 0 -3.9 1029 1392 1406 1979 2110 2287 2728 2972 3609 3860 3861 3960 -1 GTGGAATGAA/TTCATTCCAC 0 -6 6 10 1 -3.3 19 20 209 210 1359 2526 2725 TAATAGAATA/TATTCTATTA 0 -8 10 10 1 -3.3 362 799 914 1133 1342 2107 3445 3743 3864 4180 2030 TACAAGAATA/TATTCTTGTA 0 -8 10 10 1 -3.3 266 338 811 1414 1971 1972 2313 3346 3526 4188 2340 TACGAATATT/AATATTCGTA 0 -6 9 10 0 -3.9 45 69 70 919 1234 3607 3873 3883 4293 -1 TCAGAATATT/AATATTCTGA 0 -6 10 10 1 -3.3 26 202 917 2100 2396 2973 3622 3949 3950 4245 1402 TGAGAATATC/GATATTCTCA 0 -6 8 10 0 -3.9 7 474 475 958 1439 1986 1987 1988 -1 TGGAATAAAT/ATTTATTCCA 0 -5 13 10 1 -3.3 513 1615 1617 1618 1823 1922 2315 3036 3881 3882 3920 3921 4245 4141 TGGAATATAA/TTATATTCCA 0 -5 11 10 1 -3.3 599 797 1225 1231 1494 2845 2846 3228 3498 3685 3686 1668 TGGGAATAAT/ATTATTCCCA 0 -6 10 10 1 -3.3 62 679 739 803 1186 2742 3328 3728 3729 4189 3520 TGTCGTTTTC/GAAAACGACA 1 -3 10 10 0 -3.9 233 243 244 1274 1818 1819 2616 2679 3486 4015 -1 TTCTTGTCTT/AAGACAAGAA 1 -7 11 10 0 -3.9 90 838 1235 1870 2517 2524 2525 2545 3326 3880 4224 -1 TTTTGTCCTT/AAGGACAAAA 1 -6 11 10 0 -3.9 439 524 823 1491 1727 1731 1876 2505 2779 2963 4031 -1 AATAGAATAT/ATATTCTATT 0 -7 8 9 0 -3.6 96 438 665 799 1320 1342 2094 2309 -1 AATAGAGAAT/ATTCTCTATT 0 -9 9 9 1 -3.0 54 645 1249 1479 2319 2608 3581 3687 4094 4200 ACAAAGAACA/TGTTCTTTGT 0 -8 9 9 1 -3.0 56 241 1828 1957 2466 2736 2737 3410 4107 1025 AGAACAAAGA/TCTTTGTTCT 0 -4 9 9 1 -3.0 76 653 755 1827 1911 2018 2607 3000 4032 1913 AGAATAATGT/ACATTATTCT 0 -4 9 9 1 -3.0 102 811 1334 1335 3095 3305 4044 4045 4226 3656 AGAATATATC/GATATATTCT 0 -4 7 9 1 -3.0 35 216 256 1211 1720 1877 2687 1272 AGAATATCAA/TTGATATTCT 0 -4 7 9 0 -3.6 213 214 367 535 536 1439 1924 -1 AGAATATGCT/AGCATATTCT 0 -4 9 9 0 -3.6 515 516 901 1860 1907 2772 3021 3963 3975 -1 AGAATATGTT/AACATATTCT 0 -4 8 9 0 -3.6 80 96 491 1215 1477 1956 3546 3547 -1 AGAGAATATT/AATATTCTCT 0 -6 11 9 1 -3.0 551 1017 1451 2379 2566 2723 3471 3972 4054 4096 4325 3566 AGTGGGAATA/TATTCCCACT 0 -8 6 9 1 -3.0 62 77 78 557 1029 4470 3520 ATAAAGGAAT/ATTCCTTTAT 0 -9 11 9 1 -3.0 1187 1280 1856 1857 1858 1925 2462 2650 2793 3691 3805 3986 ATAGAGAATA/TATTCTCTAT 0 -8 9 9 0 -3.6 54 645 1017 2566 2608 3039 3581 3995 4310 -1 CAAGAGAATA/TATTCTCTTG 0 -8 9 9 0 -3.6 1227 1310 2484 2699 2723 2889 3372 3963 4267 -1 GAAGAACAAA/TTTGTTCTTC 0 -6 11 9 1 -3.0 761 981 982 1385 1542 3683 3684 3796 3942 3943 4458 2000 GAAGAATATA/TATATTCTTC 0 -6 9 9 1 -3.0 133 256 555 1032 3094 3657 3755 3858 4373 3906 GAATATACTT/AAGTATATTC 0 -3 8 9 1 -3.0 2 216 873 2729 3180 3836 3837 4191 902 GAATATTACA/TGTAATATTC 0 -3 9 9 1 -3.0 23 413 1436 2851 3949 3950 4159 4319 4426 3639 GAATATTCAC/GTGAATATTC 0 -3 9 9 1 -3.0 95 806 946 947 1067 2435 3039 3578 3579 3554 GAATATTCGT/ACGAATATTC 0 -3 10 9 0 -3.6 472 919 1492 1493 1516 1796 3254 3873 4097 4293 -1 GAATGGAATA/TATTCCATTC 0 -8 11 9 0 -3.6 89 726 1617 1618 2703 3036 3672 3673 4175 4176 4245 -1 GAGAATATTT/AAATATTCTC 0 -5 8 9 1 -3.0 6 208 494 1549 2723 3527 3956 4325 3933 GAGGAATAAT/ATTATTCCTC 0 -6 7 9 0 -3.6 24 90 133 653 1792 2680 2681 -1 GGAATAATAT/ATATTATTCC 0 -4 10 9 1 -3.0 24 739 2222 2606 2706 3437 3728 3729 3863 3893 1425 GGAATATTAA/TTAATATTCC 0 -4 9 9 1 -3.0 311 334 655 1258 2200 2201 2588 4122 4123 1295 TATGAGAATA/TATTCTCATA 0 -8 9 9 0 -3.6 194 458 459 733 1610 1850 1851 4262 4263 -1 TGAGAGAATG/CATTCTCTCA 0 -8 8 9 0 -3.6 83 84 1346 1599 2113 2114 3218 3458 -1 TGGAATAATG/CATTATTCCA 0 -5 7 9 1 -3.0 176 177 223 726 1062 1130 1931 2786 TGGAATGAAT/ATTCATTCCA 0 -5 7 9 0 -3.6 19 20 370 2526 2802 3338 3339 -1 TGGAGGAATA/TATTCCTCCA 0 -8 8 9 1 -3.0 334 427 655 661 1013 2579 2877 2878 3292 TTGGAATATA/TATATTCCAA 0 -6 10 9 0 -3.6 599 797 934 1231 2312 2730 2845 2846 2957 3290 -1 GTTTTGTCTT/AAGACAAAAC 1 -7 9 9 1 -3.0 102 231 553 665 2257 3388 3389 3741 4419 820 TCTTGTCTTT/AAAGACAAGA 1 -6 11 9 1 -3.0 1235 1513 2361 2524 2525 2545 2825 2896 3662 3663 4224 435 AAATCGAATA/TATTCGATTT 0 -8 8 8 0 -3.3 336 657 804 2248 2249 3280 3303 3802 -1 AACAGAATAA/TTATTCTGTT 0 -7 10 8 0 -3.3 1250 1638 1639 2220 2230 2333 2334 2600 3000 4351 -1 AAGAATATGC/GCATATTCTT 0 -5 8 8 0 -3.3 515 516 901 1325 1860 2271 3021 3975 -1 AATATTCCCT/AGGGAATATT 0 -2 8 8 0 -3.3 225 458 459 1527 1528 2127 3447 4241 -1 AGAATAAAGT/ACTTTATTCT 0 -4 8 8 0 -3.3 155 594 1862 2220 2309 2492 2794 3246 -1 AGAATAAGAC/GTCTTATTCT 0 -4 7 8 0 -3.3 63 381 1175 1176 1179 2173 3992 -1 AGAATATACG/CGTATATTCT 0 -4 8 8 0 -3.3 382 383 1234 1368 2290 2864 2865 3153 -1 AGAATGAAAG/CTTTCATTCT 0 -4 7 8 0 -3.3 568 613 740 1230 1346 1869 4124 -1 AGGAATAAAT/ATTTATTCCT 0 -5 8 8 0 -3.3 257 319 321 1174 1586 2579 3207 3713 -1 AGTGGAATAA/TTATTCCACT 0 -7 7 8 0 -3.3 6 449 1130 2476 3170 3920 3921 -1 ATACGAATAT/ATATTCGTAT 0 -7 10 8 0 -3.3 873 919 2086 2218 3450 3458 3550 3607 3698 4293 -1 ATAGAATATT/AATATTCTAT 0 -6 9 8 0 -3.3 438 799 852 1805 2111 2309 3689 3873 3922 -1 ATGAGAATAA/TTATTCTCAT 0 -7 8 8 0 -3.3 168 194 1610 1734 2349 3838 4293 4343 -1 CAGAGAATAT/ATATTCTCTG 0 -7 7 8 0 -3.3 2 1411 1907 1941 2290 3972 4191 -1 CATTTGGAAT/ATTCCAAATG 0 -9 7 8 0 -3.3 176 177 657 1722 3173 3489 3768 -1 GAGAATATCA/TGATATTCTC 0 -5 5 8 0 -3.3 7 367 474 475 1439 -1 GAGAATATGC/GCATATTCTC 0 -5 9 8 0 -3.3 618 1667 1750 1751 1907 2271 2278 2917 3963 -1 GGAATGAATA/TATTCATTCC 0 -4 6 8 0 -3.3 19 20 1294 1295 2526 4350 -1 TGGAGAATAT/ATATTCTCCA 0 -7 8 8 0 -3.3 413 494 618 1331 2012 2876 3001 4304 -1 AAAGGGAATA/TATTCCCTTT 0 -8 7 7 0 -3.0 149 463 879 1235 2127 3447 4135 -1 AAGAACATTC/GAATGTTCTT 0 -5 5 7 0 -3.0 22 545 546 2237 2948 -1 AAGAATACAA/TTGTATTCTT 0 -5 6 7 0 -3.0 76 573 1127 1251 2526 2951 -1 AAGAATATCC/GGATATTCTT 0 -5 7 7 0 -3.0 95 1228 1297 1298 1433 2936 3463 -1 AAGTGGGAAT/ATTCCCACTT 0 -9 4 7 0 -3.0 62 77 78 557 -1 AGAATATGCA/TGCATATTCT 0 -4 7 7 0 -3.0 503 618 1325 1667 2170 2278 2917 -1 AGAATGAAAA/TTTTCATTCT 0 -4 9 7 0 -3.0 1139 1199 1575 1636 3525 3927 4429 4430 4431 -1 AGCAAGAATA/TATTCTTGCT 0 -8 6 7 0 -3.0 682 929 1127 1297 1298 1942 -1 AGGGAATGAA/TTCATTCCCT 0 -6 8 7 0 -3.0 730 756 1258 2445 3466 3704 3995 4083 -1 ATATAGAATA/TATTCTATAT 0 -8 7 7 0 -3.0 61 1016 1343 1862 3689 3909 3910 -1 ATGAATTTAA/TTAAATTCAT 0 -1 8 7 0 -3.0 115 181 3188 3189 3275 3276 3791 3792 -1 ATGAGAGAAT/ATTCTCTCAT 0 -9 4 7 0 -3.0 83 84 153 299 -1 CAAGGAATAA/TTATTCCTTG 0 -7 7 7 0 -3.0 554 1367 2515 2606 2880 3163 4421 -1 CGAATATTCA/TGAATATTCG 0 -4 6 7 0 -3.0 59 919 946 947 1753 1809 -1 GAAGGAACAA/TTGTTCCTTC 0 -7 7 7 0 -3.0 836 837 853 1779 2884 3262 3285 -1 GAAGGGAATA/TATTCCCTTC 0 -8 7 7 0 -3.0 138 225 1527 1528 2027 3423 3975 -1 GCGAATATTA/TAATATTCGC 0 -5 6 7 0 -3.0 79 1290 1291 2322 3567 4319 -1 GGAATAAAAG/CTTTTATTCC 0 -4 8 7 0 -3.0 511 890 2281 2880 2989 3082 3446 3731 -1 GGAATAAATA/TATTTATTCC 0 -4 8 7 0 -3.0 434 513 1586 1823 2315 2579 3713 4245 -1 GGAGAATATG/CATATTCTCC 0 -6 7 7 0 -3.0 618 1163 2130 2131 2278 2977 4304 -1 TAGAGGAATA/TATTCCTCTA 0 -8 7 7 0 -3.0 133 653 1592 2680 2681 3254 3643 -1 TGGGTGGAAT/ATTCCACCCA 0 -9 5 7 0 -3.0 19 20 995 996 3072 -1 GTCTCTCTCT/AGAGAGAGAC 1 -2 8 7 0 -3.0 186 800 1557 2451 2862 2863 3294 4397 -1 TCCATTGTCT/AGACAATGGA 1 -8 8 7 0 -3.0 477 2589 2862 2863 3338 3339 4003 4004 -1 TGTCCCTTTC/GAAAGGGACA 1 -3 6 7 0 -3.0 140 141 730 1195 1196 4166 -1