#1637/285 #3.32 # k-mer/r.c. Cluster Offset PosCt wPosCt NegCt HGP_10 GAAGAAGG/CCTTCTTC 0 -6 470 456 15 -20.4 2 4 11 20 23 25 30 39 40 50 53 56 57 62 83 90 92 93 96 100 104 108 114 115 119 125 126 127 129 139 146 149 152 158 165 171 172 174 177 178 179 182 184 185 189 208 212 214 217 218 221 223 224 230 231 237 238 243 245 253 259 261 265 267 272 274 282 287 290 291 297 298 300 301 302 307 308 312 313 323 324 325 327 330 331 332 336 338 340 342 346 355 360 365 366 375 381 387 391 392 401 404 407 409 413 415 418 420 421 422 424 425 429 431 439 440 446 450 453 460 466 474 479 482 488 490 491 492 493 497 503 507 508 512 514 515 517 518 519 523 526 532 535 538 541 543 548 554 555 558 562 575 580 582 583 587 591 597 598 600 603 609 610 616 618 619 623 624 629 632 636 638 639 641 644 652 653 658 666 671 673 688 691 697 698 700 705 707 708 710 712 719 720 722 723 731 737 739 742 745 746 748 749 756 772 775 777 780 783 784 796 798 799 801 803 807 810 812 815 827 829 832 836 839 844 854 857 858 859 863 864 865 867 869 871 872 876 878 882 883 884 888 890 893 894 896 901 908 909 910 911 914 916 922 927 929 932 937 944 948 950 952 953 954 956 957 958 971 974 977 978 982 985 990 993 1006 1008 1009 1013 1016 1031 1032 1033 1034 1041 1044 1046 1048 1054 1060 1065 1067 1069 1071 1073 1075 1076 1077 1081 1083 1088 1090 1096 1097 1108 1115 1116 1117 1118 1123 1127 1128 1129 1134 1135 1140 1141 1144 1147 1150 1154 1157 1164 1166 1173 1174 1177 1182 1185 1187 1189 1200 1210 1211 1213 1218 1221 1224 1233 1235 1240 1241 1242 1243 1246 1247 1248 1249 1250 1253 1254 1255 1256 1257 1259 1263 1264 1265 1267 1270 1275 1278 1279 1284 1285 1288 1294 1295 1298 1309 1311 1312 1315 1316 1322 1324 1325 1326 1330 1334 1337 1341 1343 1345 1349 1350 1353 1365 1368 1369 1382 1387 1390 1391 1398 1399 1403 1404 1406 1407 1412 1417 1420 1422 1423 1426 1429 1431 1432 1434 1435 1437 1440 1445 1447 1461 1463 1470 1473 1475 1477 1478 1481 1491 1493 1494 1495 1501 1502 1504 1508 1511 1515 1526 1529 1530 1532 1536 1539 1542 1545 1548 1551 1556 1557 1560 1564 1566 1567 1568 1577 1578 1583 1585 1586 1589 1594 1595 1596 1598 1600 1605 1607 1614 1615 1619 1620 1630 1634 1636 23 32 38 39 41 48 108 111 114 159 194 197 204 209 247 AAGAAGGT/ACCTTCTT 0 -5 335 347 15 -12.6 2 4 11 20 23 25 30 39 40 50 53 56 57 62 83 90 92 93 96 100 104 108 114 115 119 122 124 125 129 146 147 150 152 158 170 171 172 182 191 193 201 204 212 213 214 215 218 221 224 244 256 257 260 261 274 287 292 294 298 310 311 321 322 327 338 344 346 355 360 370 379 384 389 406 407 409 413 414 418 422 426 428 429 435 438 453 461 465 478 482 489 491 497 500 504 517 523 531 537 541 548 550 552 554 561 564 566 576 577 579 587 601 603 607 610 615 616 617 619 630 631 633 634 646 656 663 665 670 671 678 686 689 692 696 699 700 705 707 710 713 722 725 728 731 733 734 741 745 747 749 761 764 766 768 775 778 780 783 785 792 799 803 808 813 815 829 836 849 856 857 858 865 869 875 876 879 882 884 885 886 890 893 894 895 896 899 901 904 909 913 914 916 919 922 927 929 941 944 947 948 956 957 963 966 974 980 990 997 1000 1004 1008 1020 1025 1039 1043 1044 1048 1055 1071 1072 1075 1076 1101 1111 1116 1117 1118 1131 1132 1133 1135 1145 1151 1153 1158 1159 1161 1171 1172 1180 1181 1202 1206 1211 1215 1224 1225 1227 1233 1241 1243 1244 1250 1252 1259 1263 1267 1269 1274 1275 1276 1279 1290 1295 1312 1314 1335 1343 1344 1356 1360 1363 1367 1371 1375 1376 1380 1381 1388 1391 1392 1397 1404 1406 1408 1410 1411 1412 1413 1423 1427 1429 1432 1435 1439 1440 1449 1456 1458 1460 1462 1469 1473 1482 1491 1492 1494 1495 1503 1504 1510 1514 1516 1519 1522 1526 1529 1548 1560 1564 1567 1568 1574 1575 1578 1585 1586 1596 1610 1612 1622 1625 1630 1634 1636 23 32 38 39 41 48 103 108 111 114 159 194 197 204 247 AGAAGGTT/AACCTTCT 0 -4 267 293 15 -9.2 2 4 11 20 23 25 30 36 39 40 50 53 56 57 62 83 90 92 93 96 104 108 114 115 119 122 125 129 137 146 150 155 158 166 176 182 191 192 212 214 220 221 236 239 242 251 257 258 269 274 281 287 294 306 311 316 320 321 327 335 339 344 351 358 361 367 370 372 380 384 398 406 409 419 428 429 449 455 461 464 484 489 491 497 499 500 504 505 517 522 523 541 547 548 552 556 564 576 579 590 596 601 603 605 606 611 619 622 630 631 633 634 646 650 655 656 670 678 684 692 695 699 700 705 707 709 710 711 722 728 733 735 750 764 765 766 769 771 788 789 791 793 794 799 804 813 815 818 822 831 836 838 842 849 856 862 875 879 881 882 884 890 896 897 899 909 956 957 963 968 980 981 1001 1004 1007 1023 1024 1026 1030 1040 1043 1048 1055 1071 1074 1086 1101 1109 1117 1126 1132 1146 1147 1148 1161 1170 1175 1176 1179 1188 1194 1199 1206 1207 1214 1223 1225 1230 1233 1251 1259 1267 1275 1295 1302 1306 1340 1346 1347 1356 1376 1380 1381 1391 1393 1396 1401 1404 1408 1410 1411 1427 1435 1439 1442 1449 1450 1458 1473 1492 1495 1505 1510 1517 1522 1525 1529 1553 1562 1564 1575 1578 1579 1587 1596 1599 1601 1602 1608 1609 1610 1622 1625 1627 1631 1634 1636 23 32 38 39 41 48 103 108 111 114 159 194 197 204 247 AACCTTCT/AGAAGGTT 2 -3 267 293 15 -9.2 2 4 11 20 23 25 30 36 39 40 50 53 56 57 62 83 90 92 93 96 104 108 114 115 119 122 125 129 137 146 150 155 158 166 176 182 191 192 212 214 220 221 236 239 242 251 257 258 269 274 281 287 294 306 311 316 320 321 327 335 339 344 351 358 361 367 370 372 380 384 398 406 409 419 428 429 449 455 461 464 484 489 491 497 499 500 504 505 517 522 523 541 547 548 552 556 564 576 579 590 596 601 603 605 606 611 619 622 630 631 633 634 646 650 655 656 670 678 684 692 695 699 700 705 707 709 710 711 722 728 733 735 750 764 765 766 769 771 788 789 791 793 794 799 804 813 815 818 822 831 836 838 842 849 856 862 875 879 881 882 884 890 896 897 899 909 956 957 963 968 980 981 1001 1004 1007 1023 1024 1026 1030 1040 1043 1048 1055 1071 1074 1086 1101 1109 1117 1126 1132 1146 1147 1148 1161 1170 1175 1176 1179 1188 1194 1199 1206 1207 1214 1223 1225 1230 1233 1251 1259 1267 1275 1295 1302 1306 1340 1346 1347 1356 1376 1380 1381 1391 1393 1396 1401 1404 1408 1410 1411 1427 1435 1439 1442 1449 1450 1458 1473 1492 1495 1505 1510 1517 1522 1525 1529 1553 1562 1564 1575 1578 1579 1587 1596 1599 1601 1602 1608 1609 1610 1622 1625 1627 1631 1634 1636 23 32 38 39 41 48 103 108 111 114 159 194 197 204 247 CAACCTTC/GAAGGTTG 2 -4 199 235 12 -7.5 2 4 11 23 25 30 36 40 45 50 53 56 57 62 83 90 93 96 104 108 109 114 115 119 122 125 191 211 212 214 219 220 221 226 234 239 242 250 254 264 273 274 275 309 311 321 327 339 352 359 367 370 380 383 384 386 395 406 409 423 427 436 455 458 487 516 520 523 534 539 545 547 552 560 569 602 603 619 620 627 633 643 646 650 651 661 670 672 678 693 695 732 743 752 754 758 765 769 770 776 786 787 793 799 804 811 815 817 820 824 825 830 833 837 842 851 861 862 873 875 882 887 891 896 897 909 912 924 939 957 960 963 964 968 975 981 986 992 1010 1017 1018 1024 1036 1048 1052 1053 1063 1070 1089 1093 1094 1101 1109 1117 1125 1126 1132 1167 1168 1197 1199 1203 1223 1225 1233 1260 1262 1268 1277 1281 1283 1295 1296 1317 1318 1320 1342 1347 1361 1381 1396 1408 1439 1443 1449 1452 1471 1492 1506 1522 1525 1529 1546 1564 1578 1601 1602 1634 1636 23 32 39 41 48 103 108 114 194 197 204 247 AAGAAGGA/TCCTTCTT 0 -5 197 159 3 -9.1 126 149 174 178 185 189 237 243 253 259 265 267 272 282 290 297 300 301 307 313 323 324 330 340 366 375 381 387 391 401 404 415 420 421 424 431 439 440 479 488 492 497 508 512 514 515 518 555 558 562 582 583 591 597 598 600 609 618 623 629 636 638 639 640 641 644 653 666 673 683 688 691 698 708 712 720 739 742 746 772 777 778 798 807 812 832 839 844 854 859 863 867 872 883 908 932 950 953 954 971 978 1009 1013 1016 1031 1033 1041 1054 1060 1067 1073 1077 1081 1083 1088 1090 1096 1097 1108 1123 1127 1128 1129 1140 1141 1144 1147 1157 1164 1166 1173 1174 1182 1185 1187 1200 1213 1218 1221 1235 1240 1248 1249 1256 1264 1265 1285 1294 1309 1311 1315 1316 1322 1324 1325 1334 1337 1341 1345 1349 1350 1353 1365 1368 1387 1390 1398 1399 1403 1407 1420 1422 1434 1437 1447 1461 1463 1477 1478 1481 1486 1493 1501 1515 1530 1539 1545 1556 1577 1589 1594 1595 1600 1605 1607 1613 1620 154 161 209 TGAAGAAG/CTTCTTCA 0 -7 170 144 2 -9.2 127 129 139 152 165 172 178 184 185 189 191 208 214 217 218 224 231 238 253 265 267 287 290 298 300 307 308 323 325 327 336 338 341 342 355 360 413 415 420 421 422 439 466 508 512 513 514 538 541 548 555 570 587 596 616 618 619 624 633 635 639 652 658 691 707 712 719 722 731 737 746 748 780 784 801 803 807 810 827 832 844 853 854 857 858 871 872 882 883 884 888 893 901 908 927 934 952 953 956 958 971 985 990 1001 1006 1008 1013 1032 1044 1060 1067 1071 1076 1090 1118 1127 1141 1147 1157 1177 1185 1187 1211 1224 1235 1242 1246 1247 1250 1254 1257 1264 1267 1270 1275 1278 1284 1295 1309 1312 1316 1324 1325 1337 1341 1343 1345 1350 1382 1390 1391 1403 1420 1422 1426 1434 1437 1461 1473 1481 1491 1530 1539 1557 1566 1577 1595 1600 1607 1614 194 209 GTTTTTTA/TAAAAAAC 1 -11 130 99 0 -7.3 42 59 82 89 268 271 299 363 369 371 382 441 457 527 540 546 559 568 571 572 573 594 599 635 637 645 647 669 674 682 690 694 702 717 721 724 726 781 826 841 843 866 898 902 903 906 915 917 928 942 943 972 976 989 995 1002 1005 1021 1028 1049 1051 1062 1068 1087 1112 1113 1137 1149 1160 1184 1190 1191 1192 1195 1198 1201 1219 1222 1231 1258 1261 1266 1282 1308 1321 1323 1329 1338 1339 1348 1355 1373 1379 1384 1389 1394 1400 1402 1418 1428 1441 1444 1451 1483 1498 1521 1524 1528 1531 1534 1537 1544 1547 1559 1561 1569 1571 1576 1582 1592 1597 1606 1613 1616 1617 1618 1621 1626 1633 1635 -1 GGAAGAAG/CTTCTTCC 0 -7 104 83 0 -6.1 174 212 237 302 308 325 330 331 332 340 346 360 365 375 391 392 401 450 482 488 490 491 492 493 497 507 554 558 564 583 598 603 610 636 638 666 673 698 739 742 756 761 772 775 815 836 853 878 896 929 932 937 978 993 1013 1031 1041 1054 1081 1088 1108 1116 1123 1128 1144 1150 1154 1166 1221 1240 1241 1243 1248 1253 1263 1265 1294 1311 1313 1315 1349 1353 1368 1369 1398 1407 1423 1445 1477 1478 1493 1494 1495 1511 1515 1551 1556 1568 1586 1594 1596 1605 1615 1619 -1 GAAGGTTT/AAACCTTC 0 -3 67 63 2 -3.5 42 59 82 89 92 146 150 192 251 287 294 306 316 320 344 361 372 419 429 500 504 541 579 596 601 611 631 656 705 707 733 750 766 771 789 791 831 849 856 890 899 1001 1030 1147 1161 1176 1179 1184 1214 1230 1259 1302 1306 1391 1404 1411 1427 1442 1505 1510 1553 1575 1579 1609 1610 1627 1631 38 159 AAACCTTC/GAAGGTTT 2 -4 67 63 2 -3.5 42 59 82 89 92 146 150 192 251 287 294 306 316 320 344 361 372 419 429 500 504 541 579 596 601 611 631 656 705 707 733 750 766 771 789 791 831 849 856 890 899 1001 1030 1147 1161 1176 1179 1184 1214 1230 1259 1302 1306 1391 1404 1411 1427 1442 1505 1510 1553 1575 1579 1609 1610 1627 1631 38 159 GAAGAAGA/TCTTCTTC 0 -9 74 62 1 -4.5 85 191 208 214 217 245 281 287 308 316 325 338 341 346 360 381 391 424 431 452 491 507 508 518 564 570 583 596 603 638 639 641 644 666 698 731 780 836 853 882 950 982 1001 1009 1013 1033 1071 1126 1127 1141 1150 1154 1164 1166 1173 1206 1221 1235 1253 1264 1265 1295 1313 1322 1387 1403 1470 1493 1515 1526 1557 1571 1583 1595 30 AAAGAAGG/CCTTCTTT 0 -6 76 61 1 -4.4 124 213 256 294 310 321 344 379 384 389 414 426 438 461 465 478 537 564 577 601 634 640 646 665 671 686 689 699 713 741 764 768 778 785 879 895 899 941 1000 1004 1020 1025 1039 1043 1072 1111 1133 1145 1151 1159 1171 1172 1215 1225 1244 1252 1269 1360 1365 1367 1371 1381 1407 1408 1410 1411 1458 1462 1469 1486 1510 1516 1574 1610 1612 1613 154 AGAAGGAA/TTCCTTCT 0 -4 74 61 2 -3.4 126 149 174 185 189 213 237 265 267 324 327 330 366 403 404 415 417 420 431 439 462 479 518 558 583 618 638 644 666 691 697 708 772 812 844 867 950 971 978 1013 1016 1035 1041 1077 1083 1088 1090 1097 1123 1144 1147 1166 1174 1213 1221 1256 1294 1315 1341 1349 1353 1376 1387 1399 1407 1493 1495 1515 1530 1539 1545 1556 1594 1620 154 209 AGAAGGTA/TACCTTCT 0 -4 71 58 0 -4.3 152 201 204 215 224 260 261 298 310 346 407 413 414 418 422 426 435 554 566 587 610 615 616 665 741 761 768 778 780 783 803 829 876 893 894 914 922 947 1020 1025 1039 1075 1111 1135 1145 1159 1172 1202 1211 1227 1243 1276 1290 1306 1343 1363 1371 1375 1392 1412 1423 1432 1460 1462 1494 1503 1516 1519 1548 1568 1574 -1 AGAAGGTG/CACCTTCT 0 -4 73 58 0 -4.3 147 172 213 292 322 338 360 379 453 465 478 531 537 550 561 577 617 663 689 696 725 734 749 775 792 808 849 857 858 869 885 886 895 901 916 941 948 966 974 997 1000 1044 1076 1116 1118 1133 1158 1171 1172 1180 1181 1215 1250 1252 1263 1269 1279 1312 1314 1335 1344 1367 1388 1406 1429 1430 1440 1491 1504 1514 1560 1567 1586 -1 GAAGGTTC/GAACCTTC 0 -3 68 58 0 -4.3 129 155 236 257 269 288 327 358 428 449 461 464 465 489 491 499 505 517 522 548 564 576 590 605 622 630 655 684 692 699 710 711 722 728 735 736 764 788 818 838 881 884 896 1004 1007 1011 1026 1055 1071 1074 1086 1148 1170 1188 1207 1267 1275 1376 1380 1397 1401 1435 1473 1495 1517 1562 1596 1599 -1 GAACCTTC/GAAGGTTC 2 -4 68 58 0 -4.3 129 155 236 257 269 288 327 358 428 449 461 464 465 489 491 499 505 517 522 548 564 576 590 605 622 630 655 684 692 699 710 711 722 728 735 736 764 788 818 838 881 884 896 1004 1007 1011 1026 1055 1071 1074 1086 1148 1170 1188 1207 1267 1275 1376 1380 1397 1401 1435 1473 1495 1517 1562 1596 1599 -1 ATGAAGAA/TTCTTCAT 0 -8 68 57 1 -4.1 165 172 185 218 238 253 265 300 307 308 323 341 342 355 390 420 421 439 570 596 618 624 631 635 719 724 748 749 784 812 844 853 871 872 882 901 908 927 952 953 971 982 990 1013 1030 1032 1044 1071 1075 1090 1141 1147 1157 1185 1224 1250 1254 1264 1278 1341 1345 1382 1434 1437 1481 1491 1557 1603 209 AGAAGGAG/CTCCTTCT 0 -4 69 55 1 -4.0 180 259 272 282 290 300 312 375 391 431 492 508 512 515 555 582 591 598 608 623 641 683 688 698 712 739 742 745 751 778 832 863 872 883 932 946 953 954 1009 1108 1123 1127 1128 1140 1173 1182 1185 1200 1235 1249 1264 1285 1311 1324 1337 1345 1365 1398 1403 1420 1422 1437 1477 1481 1501 1589 1595 1607 1613 161 AAGAAGGC/GCCTTCTT 0 -5 62 52 0 -3.9 147 165 223 230 231 245 291 302 308 312 331 342 365 446 450 460 466 474 493 503 507 535 538 622 671 697 719 737 748 784 796 801 827 888 911 933 937 952 958 977 982 985 993 1032 1046 1150 1177 1246 1255 1278 1288 1326 1365 1426 1446 1475 1508 1532 1551 1557 1614 1619 -1 AAGAAGGG/CCCTTCTT 0 -5 64 52 0 -3.9 127 139 177 179 184 208 217 238 325 332 336 392 425 490 519 526 532 543 575 580 624 632 652 658 723 756 810 864 871 878 910 1006 1034 1065 1069 1115 1134 1154 1189 1210 1242 1247 1253 1254 1257 1270 1284 1298 1330 1369 1382 1417 1431 1445 1470 1502 1511 1536 1542 1566 1577 1583 1598 1615 -1 CGAAGAAG/CTTCTTCG 0 -7 59 52 0 -3.9 158 177 179 182 223 259 297 301 324 366 407 424 433 453 479 497 526 532 543 562 575 591 597 600 609 623 629 644 697 698 708 710 745 783 865 867 876 944 950 954 977 1046 1048 1073 1129 1173 1206 1213 1235 1253 1298 1326 1330 1399 1417 1440 1504 1542 1560 -1 AGGAAGAA/TTCTTCCT 0 -8 63 50 0 -3.7 174 308 325 331 340 346 391 392 482 490 491 492 493 497 507 564 583 636 638 644 652 666 673 698 724 736 739 742 775 929 937 978 993 1013 1031 1036 1081 1116 1128 1144 1150 1221 1240 1243 1248 1253 1263 1265 1294 1311 1368 1432 1445 1477 1493 1515 1568 1586 1594 1596 1605 1615 1620 -1 TTGAAGAA/TTCTTCAA 0 -8 62 50 0 -3.7 129 178 219 290 294 298 310 360 422 429 455 465 508 538 548 555 587 616 619 629 633 658 712 716 722 731 801 803 810 842 854 884 888 893 1001 1008 1013 1077 1118 1121 1127 1132 1157 1211 1235 1270 1295 1337 1343 1348 1392 1403 1420 1461 1473 1480 1539 1577 1595 1607 1614 1615 -1 ACAACCTT/AAGGTTGT 2 -5 53 50 0 -3.7 2 191 220 226 254 273 309 352 380 406 427 436 455 520 539 569 643 672 693 695 732 752 754 758 765 769 770 776 792 837 842 862 887 896 912 924 975 981 992 1010 1089 1101 1125 1132 1154 1199 1203 1262 1268 1320 1347 1452 1525 -1 GAGAAGAA/TTCTTCTC 0 -8 57 49 0 -3.7 100 171 221 230 261 281 282 291 384 387 425 429 431 440 460 474 490 515 519 531 535 580 582 619 638 641 671 705 733 795 859 863 869 890 916 922 982 1033 1065 1070 1083 1097 1166 1210 1233 1279 1403 1412 1429 1431 1435 1459 1466 1470 1475 1585 1630 -1 AACCTTCA/TGAAGGTT 2 -3 58 49 0 -3.7 109 226 250 273 275 352 427 436 458 520 539 545 560 569 627 651 672 743 754 770 786 817 825 830 833 837 851 861 873 887 891 896 924 964 1010 1018 1036 1052 1053 1070 1089 1094 1167 1168 1184 1260 1262 1268 1277 1281 1283 1296 1317 1320 1342 1443 1471 1546 -1 GATGAAGA/TCTTCATC 0 -9 53 45 0 -3.4 165 182 185 218 238 286 300 308 323 333 341 342 355 385 392 545 570 618 624 635 719 749 757 789 812 818 844 853 872 882 908 952 953 968 982 1009 1030 1032 1044 1075 1090 1141 1157 1185 1218 1239 1264 1268 1341 1481 1557 1559 1603 -1 AGAAGGAT/ATCCTTCT 0 -4 53 44 0 -3.3 106 178 243 253 297 301 307 313 323 340 381 387 421 440 514 600 609 623 636 640 653 673 720 746 777 798 807 839 854 908 1054 1067 1073 1081 1096 1157 1164 1240 1265 1309 1316 1322 1325 1334 1350 1368 1434 1461 1463 1478 1486 1577 1600 -1 TGTTTTTT/AAAAAACA 1 -12 61 43 1 -3.1 144 371 401 420 441 559 572 573 637 677 682 717 726 826 898 902 903 915 917 995 1002 1012 1021 1022 1051 1068 1087 1107 1149 1190 1191 1192 1198 1222 1231 1258 1266 1308 1338 1355 1379 1384 1389 1400 1420 1428 1444 1451 1498 1524 1534 1544 1559 1561 1571 1576 1597 1606 1613 1616 1617 214 TCAACCTT/AAGGTTGA 2 -5 47 42 0 -3.2 119 219 234 239 275 308 321 327 339 370 383 386 458 545 552 588 619 620 627 651 670 786 787 793 811 817 824 825 830 833 875 891 939 960 1036 1053 1063 1070 1093 1223 1225 1260 1281 1295 1318 1342 1383 -1 AACCTTCC/GGAAGGTT 2 -3 36 41 0 -3.1 42 45 59 82 89 211 234 254 264 288 359 383 386 395 423 465 516 602 693 732 752 776 811 824 939 960 975 986 1011 1017 1088 1203 1318 1361 1397 1505 -1