#5000/5000 #3.37 # k-mer/r.c. Cluster Offset PosCt wPosCt NegCt HGP_10 TCGGAGA/TCTCCGA 0 -4 131 141 43 -13.7 32 38 39 59 71 83 112 113 176 204 252 257 267 268 269 331 339 343 440 451 465 466 536 540 560 566 594 632 671 729 732 778 822 848 891 892 894 895 914 930 934 955 1036 1061 1073 1156 1186 1190 1207 1292 1293 1318 1330 1331 1333 1337 1340 1344 1388 1392 1410 1604 1675 1735 1744 1745 1754 1774 1840 1859 1891 2040 2041 2183 2296 2314 2343 2351 2419 2425 2492 2511 2512 2528 2568 2639 2659 2814 2844 2914 2920 2927 3069 3140 3311 3372 3400 3610 3646 3711 3715 3776 3815 3816 3818 3855 3865 3879 3934 3938 3974 3978 3988 4084 4086 4100 4124 4179 4258 4284 4345 4365 4444 4496 4595 4640 4780 4964 4965 4966 4978 162 227 348 417 795 856 862 979 1008 1302 1430 1680 1916 2104 2160 2176 2254 2333 2375 2424 2505 2581 2677 2731 2787 2881 2949 2965 2967 3170 3578 3637 3924 3973 4047 4066 4160 4289 4393 4423 4441 4444 4976 TCGATTC/GAATCGA 2 -4 131 136 44 -12.4 22 33 40 50 138 155 203 211 214 237 256 302 354 365 377 417 428 508 563 564 685 757 784 791 821 846 864 869 919 938 939 998 1012 1073 1180 1187 1203 1209 1265 1281 1282 1294 1324 1338 1430 1449 1450 1463 1492 1493 1680 1681 1683 1684 1703 1719 1733 1803 1831 1935 2069 2087 2090 2109 2112 2153 2172 2185 2219 2226 2267 2324 2396 2410 2433 2462 2505 2525 2534 2575 2600 2683 2881 2927 2942 2969 3039 3097 3102 3103 3104 3128 3426 3427 3557 3591 3593 3604 3627 3639 3714 3727 3742 3768 3793 3859 3870 3882 3899 3941 4030 4095 4177 4184 4295 4311 4331 4332 4403 4482 4495 4657 4679 4698 4731 4755 4820 4843 4856 4871 4959 15 24 180 311 343 359 434 443 462 573 586 594 697 1174 1189 1414 1489 1494 1583 1966 2215 2267 2272 2737 2860 2912 3075 3220 3490 3540 3683 3948 4044 4071 4183 4317 4393 4677 4703 4727 4856 4913 4926 4978 ATCGGAG/CTCCGAT 0 -5 122 129 33 -15.0 24 32 58 79 108 160 176 240 252 257 267 268 331 387 389 551 560 566 600 632 653 671 680 681 709 777 828 848 873 891 892 927 930 934 955 1013 1042 1156 1172 1186 1190 1207 1293 1300 1318 1330 1331 1333 1344 1394 1403 1503 1675 1698 1706 1735 1744 1767 1825 1840 1849 1891 1905 1924 1940 1951 2040 2045 2101 2129 2130 2175 2351 2419 2548 2654 2659 2885 2914 2935 3009 3018 3140 3235 3311 3333 3353 3534 3610 3705 3711 3729 3741 3749 3795 3798 3815 3816 3818 3865 3934 3967 3978 4065 4066 4084 4086 4100 4124 4179 4345 4424 4444 4447 4595 4640 4847 4930 4964 4965 4966 4978 162 317 348 564 856 979 1008 1286 1430 1680 1866 1916 2104 2154 2227 2444 2921 2949 2965 3053 3125 3183 3307 3441 3695 3743 4066 4140 4234 4336 4573 4668 4995 CCGGAGA/TCTCCGG 0 -4 120 129 41 -12.1 4 48 49 75 94 118 142 147 168 169 179 186 206 207 213 229 245 313 328 344 448 502 525 610 702 728 741 775 777 784 807 859 872 913 969 1008 1098 1182 1183 1333 1352 1354 1391 1395 1397 1474 1587 1594 1623 1624 1787 1788 1792 1844 1880 1887 1888 1930 1942 1946 1989 2036 2103 2104 2131 2284 2285 2327 2392 2479 2515 2529 2613 2619 2695 2697 2749 2799 2836 2857 2886 2938 3045 3069 3070 3112 3147 3266 3275 3334 3335 3352 3479 3578 3638 3772 3773 3784 3831 3837 3867 3932 3935 4068 4069 4100 4127 4287 4394 4452 4494 4507 4566 4590 4610 4612 4623 4753 4767 4810 228 422 427 445 688 806 1068 1180 1249 1501 1722 1778 1811 2009 2256 2311 2369 2370 2371 2374 2376 2377 2888 2893 2972 3037 3038 3092 3125 3170 3513 3637 3733 3922 4177 4305 4394 4478 4720 4787 4933 ACGGAGA/TCTCCGT 0 -4 108 114 35 -11.2 48 49 114 145 168 169 200 224 247 249 292 315 328 339 348 349 361 371 439 509 523 562 590 647 758 800 826 867 1039 1043 1101 1129 1251 1269 1309 1335 1354 1451 1459 1477 1491 1504 1588 1627 1664 1705 1744 1774 1785 1820 1910 2047 2096 2162 2171 2238 2285 2315 2377 2384 2463 2515 2518 2527 2528 2544 2545 2590 2598 2623 2723 2724 2768 2866 2987 3098 3259 3266 3346 3444 3475 3487 3542 3621 3685 3691 3701 3702 3725 3726 3748 3841 3856 3889 3914 3932 3954 4050 4408 4653 4717 4718 4741 4742 4806 4843 4882 4923 99 187 344 601 693 905 914 1025 1053 1206 1523 1547 1710 1747 1752 1866 2009 2010 2019 2179 2274 2286 2336 2446 2768 2838 3041 3127 3448 3504 3698 3704 3903 4710 4861 GATCGGA/TCCGATC 4 -3 100 110 33 -11.1 24 27 28 32 87 88 108 184 257 264 300 331 418 457 551 560 573 632 680 681 698 739 777 800 843 858 896 930 955 995 1042 1065 1186 1190 1207 1293 1315 1330 1331 1344 1375 1394 1403 1406 1407 1431 1528 1529 1534 1584 1687 1744 1849 1864 1891 1901 1905 1924 2040 2081 2133 2288 2331 2337 2458 2480 2620 2641 2835 2855 2875 2914 2935 2958 3017 3117 3119 3251 3266 3294 3534 3685 3705 3795 3798 3815 3816 3818 3831 3879 3972 3973 4053 4100 4105 4345 4424 4558 4595 4841 82 348 356 564 952 967 1489 1501 1691 1692 1866 1962 2104 2227 2273 2670 2802 2921 2949 3004 3125 3142 3231 3695 3743 3828 3847 4140 4555 4668 4675 4741 4902 TTCATCG/CGATGAA 1 -3 105 107 35 -9.9 31 35 112 113 183 192 215 216 225 240 277 312 323 443 542 685 695 748 829 926 937 1107 1113 1117 1179 1195 1252 1253 1266 1280 1292 1391 1432 1503 1518 1549 1558 1606 1607 1646 1792 1851 1936 1951 2011 2023 2030 2085 2142 2182 2214 2237 2351 2366 2367 2425 2458 2577 2649 2776 2888 2975 3085 3094 3110 3116 3148 3258 3311 3353 3434 3482 3549 3631 3659 3671 3792 3855 3865 3915 3967 3969 4006 4022 4041 4070 4086 4090 4182 4203 4246 4252 4258 4336 4455 4499 4585 4680 4685 4686 4693 4703 4745 4810 4856 461 534 599 610 612 1028 1168 1354 1473 1475 1571 1593 1709 2056 2459 2669 2672 2891 3282 3315 3334 3627 3635 3960 4177 4262 4336 4394 4638 4687 4808 4856 4945 4953 4969 GACGGAG/CTCCGTC 0 -5 100 105 27 -12.4 33 48 49 102 123 141 145 224 257 292 315 328 349 433 504 590 647 659 789 800 826 891 892 955 969 1101 1129 1165 1166 1257 1269 1335 1362 1451 1491 1503 1504 1541 1588 1627 1662 1794 1820 1910 2047 2162 2238 2285 2320 2377 2384 2454 2465 2492 2509 2510 2515 2571 2590 2598 2623 2645 2723 2724 2786 2987 3142 3259 3266 3291 3346 3475 3487 3595 3681 3685 3691 3701 3702 3725 3726 3748 3780 3784 3857 3860 3889 3924 3932 4105 4111 4261 4408 4418 4488 4494 4521 4582 4742 4843 234 303 307 344 601 693 905 1053 1068 1206 1307 1523 1547 1710 1866 2010 2274 2286 2446 3041 3127 3128 3211 3504 3698 4546 4819 CGATTCC/GGAATCG 2 -3 96 103 30 -10.8 40 50 57 112 113 117 145 161 203 237 242 285 377 417 448 453 508 595 634 730 757 784 821 907 910 938 939 949 998 1004 1047 1053 1203 1265 1299 1374 1430 1449 1450 1463 1474 1492 1493 1511 1545 1680 1681 1778 1803 1824 1827 1845 1946 2112 2192 2217 2219 2447 2462 2505 2534 2694 2715 2799 2841 2881 2885 2942 3022 3097 3256 3277 3278 3382 3427 3593 3703 3718 3899 4024 4054 4059 4095 4295 4311 4482 4518 4531 4590 4605 4698 4727 4843 4856 4871 4959 24 64 102 187 443 586 605 816 870 1084 1162 1414 1734 2209 2215 2235 2272 2449 2737 2965 3490 3491 3683 3748 4044 4183 4393 4727 4926 4978 TCCGGCG/CGCCGGA 0 -5 94 96 31 -9.1 4 48 49 80 118 186 191 250 323 344 346 365 417 445 451 504 777 787 841 882 883 894 937 1034 1156 1199 1277 1290 1352 1356 1424 1471 1672 1680 1681 1724 1792 1887 1888 1930 1989 2045 2076 2221 2284 2302 2529 2561 2571 2613 2691 2697 2814 2836 2857 2889 2954 2955 2986 3107 3108 3153 3192 3193 3277 3278 3316 3370 3399 3476 3519 3638 3655 3748 3814 3818 3947 4022 4061 4069 4127 4319 4371 4372 4394 4452 4456 4531 4574 4612 4758 4759 4830 4834 231 233 444 465 806 838 978 1069 1071 1328 1607 2009 2185 2419 2589 2799 2881 3170 3401 3503 3513 3657 3709 3733 3767 3954 3970 4166 4249 4478 4920 CATCGTC/GACGATG 1 -1 83 92 25 -10.5 3 22 29 46 68 81 191 215 222 225 227 254 329 350 368 429 487 510 511 596 615 676 695 778 851 905 914 928 931 937 1160 1189 1195 1386 1444 1470 1491 1575 1646 1726 1792 1815 1936 1939 1968 2000 2060 2111 2180 2425 2469 2478 2634 2699 2796 2797 2879 2921 2933 2993 3009 3020 3021 3124 3354 3785 3839 3926 4007 4014 4031 4098 4138 4139 4510 4575 4690 4721 4837 4857 4948 4968 4969 154 246 461 946 1028 1084 1158 1196 1626 1680 2539 2570 2704 2759 3167 3314 3347 3423 3522 3770 3913 4283 4286 4690 4926 GATCTCG/CGAGATC 3 -3 89 91 24 -10.6 198 204 227 232 322 325 331 349 370 435 451 457 527 586 637 691 695 705 724 767 788 808 822 832 1001 1077 1079 1227 1236 1257 1274 1329 1374 1460 1487 1506 1534 1761 1824 1914 2037 2193 2210 2275 2279 2362 2490 2494 2584 2606 2648 2665 2691 2693 2709 2862 2867 2877 2878 2984 3110 3155 3196 3448 3488 3514 3545 3591 3653 3685 3773 3863 3918 4069 4137 4159 4181 4188 4200 4246 4264 4295 4312 4351 4405 4476 4662 4843 4985 81 168 214 580 842 848 949 1181 1501 2257 2552 2810 3115 3124 3135 3142 3206 3207 3455 3507 3836 3971 4005 4066 CCGATTC/GAATCGG 2 -4 82 85 25 -9.0 79 161 184 200 203 210 234 255 326 387 400 453 583 634 718 848 907 910 944 949 1004 1053 1090 1272 1374 1492 1493 1511 1538 1719 1734 1735 1740 1778 1781 1782 1825 1826 1833 1934 1946 1955 1995 2094 2129 2395 2423 2522 2523 2598 2623 2694 2715 2799 2841 2885 3333 3342 3414 3591 3603 3614 3718 3741 3757 3812 3853 3854 3899 3974 4024 4054 4059 4179 4264 4590 4605 4657 4727 4779 4857 4978 166 333 348 598 816 1220 1237 1430 1591 2272 2437 2729 2965 3062 3491 3727 3905 4119 4195 4234 4515 4573 4811 4887 4995 CGATTCA/TGAATCG 2 -3 81 83 26 -8.3 79 138 203 302 315 320 321 354 365 563 564 583 617 619 685 791 846 848 864 865 866 949 1012 1090 1209 1293 1294 1338 1538 1576 1684 1734 1762 1825 1831 1995 2025 2094 2116 2117 2129 2153 2196 2226 2324 2410 2448 2522 2523 2615 2623 3027 3039 3234 3342 3426 3557 3564 3569 3591 3627 3639 3742 3793 3811 3853 3854 3859 3882 3926 3951 4068 4179 4184 4264 4328 4329 4495 4527 4647 4657 180 293 598 602 697 848 889 1024 1153 1220 1262 1371 1489 1581 2272 2437 2902 2912 3194 3727 3749 3948 4106 4573 4791 4995 AGATCCG/CGGATCT 4 -4 77 82 18 -11.3 0 5 13 122 147 216 217 325 435 453 527 583 764 765 785 843 847 941 957 1034 1065 1121 1186 1301 1315 1348 1374 1378 1460 1526 1640 1720 1761 1787 1788 1806 2065 2081 2230 2301 2464 2607 2620 2626 2817 2867 2912 2913 2936 2943 2951 2969 2970 2986 2987 3082 3187 3249 3317 3329 3381 3486 3610 3631 3685 3833 3834 4099 4140 4193 4239 4264 4456 4631 4678 4935 4950 63 305 717 863 1475 1877 1904 2368 2373 2376 2559 2837 2845 3162 3307 4206 4328 4329 CGGAGAC/GTCTCCG 0 -3 68 78 18 -10.4 38 39 48 49 83 114 145 168 169 257 267 268 439 448 560 590 610 728 732 733 741 778 914 1101 1269 1333 1400 1432 1474 1504 1518 1587 1623 1624 1627 1638 1705 1735 1744 1754 1759 1774 1792 1851 2296 2314 2384 2451 2518 2527 2590 2613 2623 2836 2857 2866 2987 3064 3147 3266 3475 3685 3691 3784 3934 3978 4050 4610 228 862 905 1243 2009 2010 2243 2256 2286 2333 2916 3125 3733 3973 4155 4177 4861 4933 GATCCGA/TCGGATC 4 -3 72 77 18 -10.2 0 217 274 275 312 527 583 689 693 739 785 796 843 1034 1065 1098 1113 1133 1181 1199 1260 1301 1312 1315 1341 1374 1375 1471 1487 1526 1709 1720 1761 1787 1788 1806 1855 2065 2081 2288 2301 2362 2377 2582 2583 2587 2588 2598 2620 2835 2867 2868 2879 2970 2987 3187 3249 3294 3345 3381 3610 3685 3697 3739 3833 3834 4140 4170 4239 4264 4678 4803 305 327 625 717 736 863 1475 1692 1796 1853 2311 2376 2802 3004 3307 3417 4743 4775 CATCGGA/TCCGATG 1 -1 68 73 24 -7.1 52 53 73 183 240 253 312 323 345 369 389 411 432 507 542 653 748 751 828 830 891 892 993 1010 1050 1181 1236 1292 1318 1322 1333 1503 1532 1698 1720 1744 1951 2351 2582 2583 2634 2645 2654 2900 3018 3235 3242 3247 3294 3311 3345 3508 3552 3741 3802 3865 3869 3934 3967 3978 3997 4024 4203 4337 4507 4835 4847 4930 212 856 976 1068 1236 1680 1902 2043 2204 2214 2307 2444 3183 3315 3334 3477 3490 3683 4192 4336 4459 4560 4782 4893 CGGCGAA/TTCGCCG 0 -3 65 71 18 -8.9 4 48 49 62 75 114 234 238 239 309 346 417 489 545 595 638 647 775 777 881 976 1119 1223 1247 1315 1343 1361 1400 1403 1424 1460 1592 1779 1792 1910 1917 1943 2055 2265 2301 2470 2613 2626 2697 2782 2836 2911 3316 3361 3370 3632 3633 3638 3748 3814 3941 4006 4045 4336 4402 4645 4830 4834 4839 4948 190 325 599 834 1042 1656 1696 2226 2856 2920 3069 3142 3513 3552 3709 3767 3918 4407 CGACGGA/TCCGTCG 0 -6 68 67 16 -8.9 123 145 147 153 257 328 433 445 800 826 891 892 969 1050 1065 1107 1121 1266 1503 1504 1627 1662 1794 1910 2156 2157 2162 2226 2238 2285 2320 2332 2447 2464 2492 2509 2645 2723 2724 2969 3113 3142 3247 3259 3266 3346 3475 3487 3539 3600 3691 3701 3702 3748 3794 3889 3932 4081 4092 4098 4105 4301 4365 4402 4418 4531 4742 4822 234 267 599 693 820 905 1206 1245 1307 1923 2088 2446 3041 4096 4290 4677 CATCGAT/ATCGATG 1 -1 68 67 19 -7.6 72 96 151 249 255 277 325 328 570 622 711 820 997 1042 1085 1124 1126 1301 1309 1418 1543 1572 1680 1681 1684 1692 1792 1948 2090 2112 2139 2303 2324 2337 2439 2454 2577 2665 2792 2920 2987 3046 3075 3103 3104 3148 3251 3514 3631 3728 3734 3738 3859 4006 4059 4070 4125 4453 4499 4585 4827 4828 4838 4856 4864 4865 4903 4932 19 25 302 443 586 639 964 1283 1966 2032 2128 2215 2459 2891 3124 3333 3960 4576 4703 AGATCGG/CCGATCT 4 -4 61 67 20 -7.3 24 27 28 32 210 288 331 340 373 457 573 632 707 843 858 995 1015 1143 1186 1207 1293 1304 1305 1330 1331 1394 1406 1407 1419 1528 1529 1534 1622 1682 1687 1860 2040 2102 2150 2288 2661 2813 2855 2875 2914 3009 3061 3266 3294 3644 3795 3863 3879 3969 4171 4424 4576 4577 4780 4841 4854 81 82 356 702 770 952 2273 2606 2802 2921 2949 3111 3125 3142 4129 4572 4607 4675 4792 4902 TCATCGG/CCGATGA 1 -2 65 66 20 -7.1 3 183 240 312 323 345 411 443 542 595 748 753 925 954 993 1010 1050 1199 1292 1400 1491 1503 1532 1606 1607 1720 1744 1784 1951 2085 2099 2224 2283 2351 2479 2634 2645 2654 2768 2776 3012 3062 3242 3247 3311 3353 3508 3549 3683 3802 3864 3865 3967 4203 4273 4274 4336 4337 4455 4680 4703 4745 4835 4934 4949 599 842 857 976 1068 1168 1292 1680 1688 1751 2307 3314 3315 3334 3490 3962 4336 4782 4858 4893 TGATCGG/CCGATCA 4 -4 63 65 20 -6.9 108 257 264 274 275 278 331 343 489 551 697 698 739 800 930 1042 1065 1149 1190 1215 1344 1688 1726 1744 1773 1864 1901 1996 2103 2104 2179 2331 2483 2620 2880 2911 2951 2991 3017 3117 3119 3355 3480 3534 3580 3581 3705 3798 3815 3816 3818 3831 3972 3973 4016 4053 4100 4105 4135 4369 4370 4595 4972 120 135 564 931 982 1501 1633 1691 1692 1866 1962 2104 2129 2174 2670 3004 3165 3223 3231 4741 TCCATCG/CGATGGA 1 -3 62 62 11 -10.2 25 41 191 254 269 328 338 379 429 542 659 725 814 891 892 1058 1093 1423 1570 1571 1698 1721 1854 1948 2012 2019 2024 2121 2155 2249 2322 2469 2494 2511 2512 2561 2577 2634 2786 2792 2794 3075 3256 3345 3384 3385 3571 3578 3689 3887 3997 4098 4346 4453 4478 4507 4750 4838 4856 4881 4911 4948 665 1660 2027 2074 2651 2849 3710 4042 4286 4459 4994 TCGGCGA/TCGCCGA 0 -4 57 61 20 -6.1 33 75 114 151 222 234 238 239 309 370 489 595 638 757 907 911 922 972 1010 1119 1149 1272 1274 1375 1391 1403 1509 1592 1688 1854 1984 1985 2021 2160 2175 2179 2265 2279 2301 2393 2470 2859 2911 2961 3095 3276 3293 3792 4045 4062 4082 4217 4336 4396 4397 4645 4690 166 599 1061 1403 1606 1656 1696 1919 2083 2444 2513 2856 2920 3260 3375 3609 3918 4823 4865 4995 ACCATCG/CGATGGT 1 -3 52 58 17 -6.6 3 16 20 37 52 53 60 162 255 389 467 570 622 727 905 914 992 1042 1322 1444 1470 1732 1747 1749 1774 1830 1842 2165 2179 2478 2503 2504 2582 2583 2981 3038 3372 3734 3785 3811 3869 3934 4031 4086 4138 4139 4217 4552 4864 4865 4888 4930 586 923 982 1071 1606 1680 1961 2504 3183 3351 3522 3676 4189 4195 4260 4525 4576 GTCGGAG/CTCCGAC 0 -5 55 56 18 -5.8 43 59 112 113 231 339 343 732 822 914 1061 1126 1189 1292 1337 1339 1513 1604 1787 1788 1921 1978 2126 2130 2355 2402 2425 2492 2511 2512 2568 2740 2826 2844 2927 3132 3277 3278 3452 3480 3530 3610 3715 3776 3855 3879 3974 4236 4246 4258 4284 4327 4365 4525 4553 81 466 605 1902 2009 2160 2254 2424 2446 2677 2849 2881 3170 3578 3590 3973 4289 4423 CCATCGA/TCGATGG 1 -2 56 56 12 -8.2 20 25 60 255 328 533 542 570 622 725 761 1042 1124 1363 1414 1543 1570 1571 1774 1792 1948 2006 2187 2191 2249 2322 2324 2494 2511 2512 2577 2739 2792 2920 3005 3038 3075 3256 3384 3385 3514 3656 3728 3734 3738 3859 3887 4040 4125 4453 4838 4856 4864 4865 4888 4911 586 1180 1186 1517 1710 2651 3649 3676 4195 4308 4576 4703 CGGAGTC/GACTCCG 0 -3 44 50 12 -6.9 33 142 176 180 181 195 245 279 285 389 504 680 681 709 841 873 969 1036 1132 1172 1204 1337 1489 1919 1920 2100 2129 2202 2265 2458 2492 2535 2536 2767 2991 3012 3018 3235 3588 3774 4447 4463 4494 4582 93 1719 2450 2507 2599 2608 3183 3336 3441 3668 4520 4995 GAGCTCG/CGAGCTC 3 -3 49 50 14 -6.1 139 231 377 405 461 528 569 746 747 807 972 1086 1288 1352 1683 1717 1718 1819 1915 1916 1921 2071 2160 2236 2339 2340 2391 2452 2500 2604 2622 2723 2724 2836 2905 2920 3080 3251 3295 3456 3595 3682 3782 3926 4258 4330 4644 4880 4893 209 509 539 829 1344 2020 2043 2443 3512 3664 4355 4399 4618 4926 TGACGGA/TCCGTCA 0 -6 49 49 15 -5.5 292 315 349 497 504 590 647 694 789 836 847 852 915 1101 1129 1165 1166 1335 1464 1491 1628 1746 1839 1929 2384 2454 2465 2561 2786 3326 3576 3579 3614 3672 3681 3685 3725 3726 3798 3829 3924 4184 4408 4419 4494 4566 4819 4843 4931 303 307 716 807 1053 1126 1496 1850 2368 2373 2754 3033 3211 3602 4995 CCATCGG/CCGATGG 1 -2 47 49 13 -6.2 37 41 52 53 73 254 338 345 369 389 529 891 892 992 1058 1147 1333 1391 1698 1747 1830 2012 2019 2121 2582 2583 2784 2785 2794 3295 3345 3578 3791 3869 3934 3997 4016 4086 4217 4253 4408 4478 4507 4552 4847 4930 4984 212 812 1236 2027 2204 2214 2504 2890 3183 4189 4192 4459 4865 GAACTCG/CGAGTTC 3 -3 49 49 13 -6.2 114 203 231 295 300 379 416 430 618 633 647 763 954 1010 1087 1161 1174 1414 1533 1800 1841 1918 2079 2219 2291 2355 2547 2549 2550 2672 3244 3245 3251 3394 3443 3558 3626 3716 3750 3869 3944 4065 4066 4541 4600 4675 4676 4729 4764 418 544 1216 1453 1696 1942 2191 2509 2738 3241 3683 4022 4855 TCGGAGC/GCTCCGA 0 -4 43 46 13 -5.6 43 108 160 252 551 600 816 828 927 1013 1042 1087 1126 1182 1183 1403 1767 1785 1844 1849 1921 1924 1951 2101 2126 2130 2283 2355 2383 2548 2690 2935 3011 3353 3530 3729 3741 3798 4065 4066 4151 4236 4424 81 466 776 1723 1902 2444 2446 3004 3307 3695 3796 4140 4234 CATCGGC/GCCGATG 1 -1 44 46 9 -7.4 114 129 177 178 238 239 345 529 595 743 829 925 932 933 992 1147 1391 1606 1607 1689 1784 1854 2121 2530 2531 2630 2631 2768 2776 3211 3353 3471 3472 3549 3791 3802 4016 4132 4217 4336 4455 4478 4552 4745 599 932 2504 2581 3557 4189 4723 4858 4865 GCATCGT/ACGATGC 1 -2 41 46 11 -6.5 22 46 81 184 368 370 510 511 615 632 690 771 851 1246 1307 1308 1386 1575 1750 1872 1873 1886 1937 1968 2060 2246 2247 2289 2491 2581 2644 2933 3124 3598 3744 3926 3946 4083 4228 4303 4690 930 946 989 2143 2222 2365 2570 2692 2737 3370 3423 ATCGGCG/CGCCGAT 0 -5 43 45 11 -6.2 114 234 238 239 343 345 489 552 595 659 732 859 907 925 1004 1147 1149 1272 1277 1391 1403 1443 1688 1854 2179 2385 2393 2799 2911 3095 3276 3549 3577 3650 3792 4045 4080 4217 4336 4665 4767 4834 4869 86 166 599 1061 1656 1919 2198 2444 3702 4865 4995 CTCGGCG/CGCCGAG 0 -5 42 45 5 -9.7 75 98 242 334 376 416 569 593 620 638 749 757 922 972 1119 1202 1274 1375 1509 1761 1824 1921 2021 2092 2175 2207 2210 2279 2301 2613 3060 3183 3293 3353 3449 4062 4065 4066 4082 4133 4565 4645 67 1606 1721 3141 4191 AGCGGCG/CGCCGCT 0 -5 43 42 7 -7.6 145 452 568 801 876 1262 1380 1381 1387 1454 1639 1712 1753 1977 2041 2119 2266 2296 2334 2336 2468 2491 2713 2752 2782 2822 2867 2989 3210 3271 3670 3787 3930 4100 4131 4234 4335 4354 4363 4373 4574 4864 4865 231 275 794 3069 4574 4835 4902 CATCGAG/CTCGATG 1 -1 43 42 14 -4.5 20 224 293 410 898 925 1177 1221 1252 1253 1378 1389 1684 1686 1750 1797 1980 1993 2011 2494 2615 2695 2754 2856 2940 2941 2975 3110 3116 3159 3404 3569 3621 4068 4078 4082 4264 4312 4454 4481 4642 4764 4911 239 842 1180 1186 1202 2546 2724 2987 3124 3257 3649 3840 3983 4262 GCGGAGG/CCTCCGC 0 -4 44 41 13 -4.6 51 130 477 552 659 719 722 847 1234 1300 1361 1522 1541 1758 2055 2076 2479 2528 2591 2598 2645 2682 2691 2917 3062 3136 3291 3347 3434 3591 3686 3826 3857 3934 3974 4129 4130 4276 4496 4559 4663 4819 4841 4935 354 1111 1302 1426 1493 2193 2891 3037 3202 3228 3908 4360 4407 TCCGGAG/CTCCGGA 0 -5 38 41 9 -6.3 94 120 142 168 169 206 207 213 300 610 702 1021 1132 1202 1567 1587 1662 1844 2036 2103 2104 2171 2378 2720 2737 2749 2887 3042 3069 3071 3130 3465 3761 3867 4283 4287 4507 4610 260 390 688 1068 1722 1795 2311 2599 3138 CATCGAC/GTCGATG 1 -1 41 40 10 -5.6 375 402 403 645 761 770 807 1179 1262 1363 1414 1420 1521 1721 1736 1774 2021 2062 2121 2191 2237 2514 2645 2672 2739 2821 3005 3098 3256 3384 3385 3457 3656 3813 3887 3979 4040 4086 4241 4835 4888 424 1142 1236 2272 2363 2450 3217 3282 3676 4948 GATGTCG/CGACATC 3 -3 40 40 10 -5.6 177 178 290 313 347 544 632 653 907 989 1488 1577 1601 1614 1615 1680 1681 1741 1930 2005 2099 2200 2564 2565 2795 2865 3091 3235 3444 3899 4034 4082 4150 4168 4169 4643 4727 4778 4825 4981 848 989 1133 1152 1716 2405 2539 3281 4304 4536 GACATCG/CGATGTC 1 -3 34 37 8 -5.8 129 177 178 378 419 544 632 653 828 1021 1217 1418 1471 1680 1681 1741 1755 1930 2100 2454 2516 2564 2565 2630 2631 3046 3099 3159 3230 3235 3971 4053 4082 4454 6 100 848 1065 2539 3281 4480 4815 GGAGGCG/CGCCTCC 0 -2 35 35 6 -6.4 48 49 740 1165 1166 1300 1323 1541 1600 1638 1652 1680 1681 1706 1777 2076 2381 2382 2435 2509 2585 2634 2740 2760 3062 3147 3192 3193 3258 3343 3478 3673 4160 4226 4716 1018 1071 1427 1844 2316 4710 TGCATCG/CGATGCA 1 -3 35 35 11 -4.1 81 184 370 751 771 796 851 932 933 1036 1301 1389 1575 1743 1797 1854 1886 2644 2883 2899 3060 3098 3103 3104 3124 3211 3457 3621 3802 3926 4024 4078 4764 4827 4828 80 150 930 964 2365 2444 2968 3260 3477 3542 4405 ACGGAGT/ACTCCGT 0 -4 30 31 8 -4.5 33 102 123 141 257 433 969 994 1036 1337 1725 1780 1919 1920 2068 2458 2492 2510 2571 2767 3332 3340 4017 4111 4374 4494 4582 4613 4719 4793 303 456 1816 2447 2983 3142 3682 4819 CCGGCGT/ACGCCGG 0 -4 32 31 9 -4.1 199 250 344 445 787 894 1356 1502 1574 1840 1887 1888 1930 1997 2045 2161 2221 2284 2305 2492 2881 3153 3200 3476 3519 3655 4127 4371 4372 4394 4521 4612 679 865 1398 1904 2009 2589 2881 4166 4920 CGGAGCC/GGCTCCG 0 -3 31 30 7 -4.7 94 487 610 637 659 1204 1216 1325 1428 1429 1487 1510 1600 1767 1951 2749 2840 2954 2955 3011 3266 3595 3798 3902 4065 4066 4103 4151 4317 4320 4507 390 421 1019 2799 2899 3004 3796 CACATCG/CGATGTG 1 -3 28 29 9 -3.6 114 236 238 239 249 257 622 1010 1322 1692 1877 2228 2232 2303 2463 2661 2818 2940 2941 3259 3336 3404 3551 3839 3978 4125 4373 4660 19 420 1061 1069 2567 3314 3333 3715 4008 CGGAGGC/GCCTCCG 0 -3 27 27 9 -3.2 135 454 593 1165 1166 1300 1361 1373 1522 1541 1600 1638 1662 1706 1905 2435 2479 2509 2528 2645 2740 3347 3370 3534 4160 4841 4930 307 944 1545 2163 3982 4166 4490 4710 4932 CGGCGTC/GACGCCG 0 -3 25 27 9 -3.2 140 250 345 452 477 479 894 1004 1044 1186 1202 1356 1387 1454 1997 2130 2834 2881 3157 3346 3353 4394 4612 4781 4833 453 522 679 714 1294 2009 3982 4073 4724 TCGGCGG/CCGCCGA 0 -4 25 26 5 -4.8 50 334 353 355 552 659 749 925 1147 1150 1387 1761 1824 1921 2005 2613 2799 3577 3637 3650 3782 4428 4565 4636 4767 86 586 1155 1721 3702 GATCGGG/CCCGATC 4 -3 24 26 6 -4.3 33 172 210 278 719 1110 1143 1215 1388 1419 1726 1875 2102 2103 2104 2150 2483 2880 2951 3863 3969 3991 4015 4809 305 1633 2063 2253 2606 4691 CGGCGTA/TACGCCG 0 -3 26 24 7 -3.4 199 376 416 787 1287 1502 1840 1977 2161 2385 2392 2422 2521 2855 2867 3594 3655 3930 4054 4131 4148 4371 4372 4521 4574 4815 883 1300 1501 2589 3141 4332 4712 TCGGCGT/ACGCCGA 0 -4 22 24 4 -4.9 98 122 343 345 376 416 593 859 1004 1202 1277 2092 2207 2385 2392 3353 3449 3460 4065 4066 4815 4834 883 1300 3141 4250 CGGCGTG/CACGCCG 0 -3 21 23 3 -5.3 98 122 152 343 801 846 1639 1735 1887 1888 2221 2305 2334 2492 2799 2859 3028 3057 3670 4127 4176 1210 1398 1904 GATCGGC/GCCGATC 4 -3 23 22 5 -3.8 288 343 489 659 707 859 1149 1403 1443 1688 1845 2179 2911 3115 3355 3650 4016 4045 4135 4563 4593 4854 4972 51 931 1484 2174 3165 GCGGCGT/ACGCCGC 0 -4 21 21 4 -4.1 452 479 712 801 1177 1387 1454 1639 1977 2130 2334 2799 2867 3347 3670 3930 4054 4131 4148 4574 4781 127 522 2798 4902 GAGGTCG/CGACCTC 3 -3 20 21 6 -3.1 62 421 636 794 927 960 1051 1058 1060 1414 1864 2048 2049 2424 2571 2776 3386 3501 3860 4797 818 1043 1236 3543 3932 3986 GCGGAGC/GCTCCGC 0 -4 20 19 4 -3.6 445 637 946 958 1428 1429 1550 1640 1665 2381 2382 2840 3147 3195 3383 3776 4045 4103 4320 4734 2899 3932 4036 4927