#5000/5000 #29.44 # k-mer/r.c. Cluster Offset PosCt wPosCt NegCt HGP_10 TCGGAGA/TCTCCGA 0 -4 580 576 43 -127.4 21 25 29 45 49 77 81 83 93 118 122 133 151 158 180 182 189 217 233 252 255 259 267 278 285 302 331 338 358 361 375 377 379 389 390 394 402 426 432 454 471 472 477 482 483 485 520 539 543 551 558 562 570 590 593 609 625 630 636 644 645 646 660 666 681 684 685 694 704 707 714 716 721 723 724 742 746 762 771 773 778 798 814 824 827 830 832 834 837 838 840 868 869 874 885 892 900 904 936 938 944 945 948 950 954 957 966 980 984 985 989 998 1003 1011 1013 1023 1030 1043 1045 1064 1069 1071 1073 1079 1081 1092 1101 1108 1114 1127 1129 1135 1138 1144 1146 1147 1153 1156 1170 1176 1180 1196 1203 1205 1253 1256 1268 1275 1288 1297 1323 1324 1327 1330 1342 1343 1354 1358 1370 1374 1376 1384 1386 1388 1399 1420 1430 1444 1445 1446 1448 1463 1473 1490 1496 1497 1498 1501 1503 1508 1517 1518 1520 1524 1537 1559 1572 1584 1585 1586 1600 1620 1621 1640 1664 1676 1677 1678 1679 1681 1687 1704 1719 1721 1725 1727 1728 1748 1758 1774 1775 1817 1839 1849 1868 1889 1890 1893 1898 1910 1959 1961 1990 1996 2026 2030 2042 2052 2061 2108 2124 2127 2140 2142 2147 2154 2157 2158 2161 2163 2164 2168 2170 2173 2178 2180 2183 2187 2192 2196 2201 2207 2209 2216 2231 2233 2234 2248 2250 2262 2263 2266 2281 2282 2324 2328 2339 2340 2344 2355 2362 2367 2368 2384 2387 2398 2400 2408 2410 2418 2421 2424 2429 2444 2454 2457 2471 2478 2495 2500 2506 2510 2525 2545 2566 2589 2597 2602 2611 2616 2618 2619 2620 2640 2644 2645 2646 2651 2656 2659 2667 2677 2682 2699 2705 2728 2733 2738 2742 2753 2762 2766 2773 2787 2803 2804 2809 2813 2814 2816 2818 2821 2831 2852 2873 2876 2925 2926 2933 2943 2960 2964 2966 2967 2980 2990 2992 2996 3017 3022 3035 3038 3041 3057 3060 3061 3065 3072 3075 3089 3094 3103 3105 3108 3119 3124 3126 3131 3133 3139 3141 3150 3154 3158 3167 3178 3208 3218 3221 3236 3251 3264 3265 3269 3273 3277 3278 3291 3296 3304 3317 3320 3331 3335 3353 3365 3371 3372 3381 3394 3398 3421 3426 3430 3437 3438 3461 3462 3463 3465 3475 3479 3483 3487 3488 3499 3501 3542 3548 3550 3551 3558 3559 3577 3593 3609 3625 3635 3655 3658 3674 3675 3683 3694 3696 3714 3727 3738 3743 3751 3752 3756 3757 3759 3766 3767 3768 3781 3788 3794 3796 3801 3805 3815 3817 3822 3828 3830 3864 3867 3874 3875 3884 3894 3910 3925 3931 3936 3956 3960 3964 3968 3971 3974 3978 3993 3998 4021 4043 4046 4050 4060 4067 4072 4078 4080 4102 4122 4124 4150 4155 4159 4164 4177 4180 4184 4186 4210 4216 4246 4259 4267 4279 4280 4293 4305 4329 4335 4338 4340 4343 4361 4370 4373 4376 4378 4379 4398 4410 4416 4423 4430 4439 4458 4465 4481 4491 4492 4511 4514 4515 4517 4531 4559 4569 4590 4606 4608 4619 4629 4638 4639 4643 4650 4656 4705 4708 4711 4713 4720 4731 4733 4741 4760 4771 4773 4775 4791 4795 4799 4800 4807 4818 4822 4830 4835 4845 4848 4850 4869 4892 4919 4924 4930 4932 4945 4973 4986 4990 4991 162 227 348 417 795 856 862 979 1008 1302 1430 1680 1916 2104 2160 2176 2254 2333 2375 2424 2505 2581 2677 2731 2787 2881 2949 2965 2967 3170 3578 3637 3924 3973 4047 4066 4160 4289 4393 4423 4441 4444 4976 CGGAGAA/TTCTCCG 0 -3 581 565 55 -114.3 14 18 21 25 41 78 92 103 112 116 133 143 151 153 180 189 213 226 233 234 247 252 281 285 296 302 304 331 338 342 346 356 361 367 368 377 379 385 389 400 402 412 417 418 441 444 473 477 522 525 558 566 571 609 610 644 655 672 684 694 695 707 714 721 723 724 729 749 773 778 785 799 804 806 808 826 827 830 834 840 864 866 874 885 896 897 904 910 936 945 950 970 980 985 992 994 998 1011 1013 1020 1023 1042 1048 1064 1069 1071 1077 1081 1091 1094 1101 1107 1119 1128 1130 1135 1138 1162 1163 1175 1176 1182 1186 1192 1203 1210 1249 1253 1256 1260 1295 1297 1335 1338 1343 1348 1354 1356 1370 1373 1384 1404 1405 1408 1428 1430 1431 1446 1448 1463 1464 1472 1473 1486 1490 1497 1499 1503 1506 1507 1508 1517 1524 1529 1534 1537 1559 1570 1572 1574 1587 1609 1611 1616 1620 1626 1640 1659 1664 1669 1672 1677 1681 1684 1686 1687 1710 1711 1719 1727 1728 1741 1744 1775 1829 1831 1843 1849 1854 1858 1868 1885 1910 1924 1927 1937 1939 1946 1970 2000 2026 2038 2042 2055 2078 2102 2108 2120 2127 2128 2134 2136 2138 2140 2147 2151 2154 2164 2180 2185 2196 2198 2200 2211 2212 2216 2223 2229 2231 2236 2248 2250 2251 2262 2263 2294 2295 2296 2304 2315 2339 2340 2344 2349 2355 2361 2362 2365 2367 2368 2380 2387 2388 2398 2403 2416 2418 2421 2426 2429 2438 2444 2448 2469 2478 2484 2487 2488 2490 2498 2500 2506 2509 2510 2513 2516 2525 2533 2537 2545 2582 2588 2589 2595 2597 2616 2626 2630 2632 2640 2645 2646 2652 2657 2667 2677 2680 2682 2688 2699 2703 2705 2706 2723 2730 2733 2738 2758 2766 2783 2801 2803 2809 2810 2813 2814 2815 2821 2824 2831 2833 2849 2863 2866 2876 2900 2909 2923 2925 2940 2943 2964 2967 2982 2986 2992 2993 2996 3002 3007 3017 3030 3033 3041 3055 3063 3072 3094 3101 3103 3133 3141 3147 3150 3154 3155 3158 3167 3195 3208 3215 3218 3221 3236 3248 3249 3255 3262 3269 3277 3278 3285 3293 3315 3318 3320 3321 3328 3331 3335 3353 3371 3372 3374 3381 3384 3389 3423 3430 3437 3442 3457 3465 3479 3483 3484 3485 3487 3501 3504 3529 3551 3554 3559 3575 3577 3590 3609 3625 3635 3642 3646 3656 3663 3674 3683 3690 3708 3714 3727 3738 3756 3757 3766 3784 3788 3815 3822 3824 3828 3830 3841 3847 3849 3855 3856 3862 3866 3869 3880 3881 3894 3905 3921 3936 3957 3960 3967 3968 3971 3974 3978 3985 3993 3998 4010 4019 4020 4023 4042 4043 4046 4064 4067 4072 4080 4098 4102 4111 4114 4118 4125 4128 4144 4147 4155 4164 4184 4192 4200 4205 4216 4226 4259 4279 4280 4283 4293 4294 4305 4328 4330 4340 4341 4361 4370 4376 4378 4379 4387 4390 4398 4406 4410 4415 4435 4449 4465 4466 4468 4481 4490 4491 4492 4510 4514 4520 4531 4551 4553 4563 4597 4602 4605 4606 4608 4619 4622 4629 4643 4650 4663 4702 4705 4708 4711 4728 4732 4741 4765 4775 4783 4791 4799 4803 4822 4831 4835 4843 4849 4850 4851 4855 4857 4858 4863 4869 4873 4892 4919 4924 4932 4939 4940 4942 4946 4959 4966 4985 4994 4998 227 348 422 448 740 856 914 1008 1068 1501 1523 1606 1710 1722 1778 1811 1866 2010 2019 2108 2254 2274 2368 2369 2370 2371 2373 2374 2375 2376 2377 2596 2663 2677 2768 2838 2965 2967 3134 3228 3513 3578 3637 3704 3733 3903 3924 4047 4160 4289 4423 4441 4444 4720 4787 ATCGGAG/CTCCGAT 0 -5 493 498 33 -113.4 10 21 25 37 52 83 91 93 94 118 122 139 141 161 176 182 189 190 195 217 252 259 264 267 268 292 302 303 306 314 331 361 363 368 377 385 390 402 426 432 458 463 466 477 482 484 508 530 539 547 553 563 578 588 590 625 630 634 645 660 665 666 678 685 704 707 714 723 724 727 748 759 762 771 775 782 812 820 821 825 827 830 832 834 838 840 869 881 887 936 938 944 945 948 954 957 958 966 983 985 988 989 1003 1013 1025 1035 1038 1039 1045 1047 1064 1069 1075 1081 1101 1108 1114 1138 1144 1147 1170 1176 1197 1217 1230 1253 1256 1261 1268 1288 1290 1318 1323 1330 1342 1343 1349 1351 1354 1357 1362 1370 1374 1386 1396 1426 1439 1444 1446 1463 1490 1492 1496 1498 1500 1501 1503 1508 1512 1516 1518 1520 1524 1526 1528 1534 1551 1559 1584 1589 1620 1621 1640 1650 1666 1676 1677 1681 1707 1725 1727 1728 1733 1736 1762 1774 1775 1777 1783 1786 1798 1816 1818 1832 1838 1847 1849 1868 1889 1891 1898 1931 1934 1961 1979 1996 2019 2030 2031 2032 2061 2070 2106 2107 2108 2111 2124 2147 2149 2154 2157 2161 2187 2196 2199 2201 2203 2206 2216 2221 2226 2234 2238 2248 2249 2250 2263 2266 2281 2282 2288 2310 2320 2324 2326 2328 2339 2348 2351 2361 2382 2384 2387 2398 2410 2421 2424 2444 2471 2485 2495 2525 2556 2611 2616 2620 2624 2634 2644 2645 2646 2651 2653 2654 2667 2677 2699 2705 2708 2712 2720 2733 2745 2747 2751 2752 2753 2762 2766 2773 2787 2803 2804 2807 2839 2873 2876 2887 2896 2933 2943 2961 2962 2964 2967 2969 2974 2984 2992 3017 3046 3056 3057 3060 3061 3065 3071 3073 3089 3091 3094 3098 3104 3105 3107 3108 3133 3139 3178 3190 3191 3199 3207 3208 3209 3214 3217 3218 3221 3223 3244 3246 3248 3251 3264 3266 3269 3273 3355 3365 3378 3395 3402 3405 3413 3425 3438 3444 3470 3479 3480 3487 3488 3490 3493 3499 3507 3538 3563 3576 3577 3588 3593 3595 3614 3634 3635 3641 3683 3691 3705 3707 3711 3714 3727 3756 3759 3760 3767 3781 3794 3795 3797 3807 3810 3820 3826 3842 3852 3874 3884 3889 3920 3925 3950 3969 3971 3990 3993 3998 4031 4049 4051 4067 4072 4078 4086 4102 4119 4155 4159 4164 4167 4184 4186 4222 4224 4246 4272 4275 4279 4281 4293 4302 4310 4329 4338 4340 4361 4370 4373 4379 4423 4430 4445 4465 4478 4481 4487 4514 4515 4555 4559 4569 4570 4581 4606 4608 4615 4619 4623 4625 4632 4650 4653 4656 4674 4677 4693 4711 4713 4731 4733 4756 4771 4773 4775 4782 4795 4800 4809 4818 4819 4822 4848 4850 4869 4884 4918 4924 4930 4945 4995 162 317 348 564 856 979 1008 1286 1430 1680 1866 1916 2104 2154 2227 2444 2921 2949 2965 3053 3125 3183 3307 3441 3695 3743 4066 4140 4234 4336 4573 4668 4995 CCGGAGA/TCTCCGG 0 -4 486 466 41 -97.1 6 41 103 115 125 132 135 153 163 164 171 175 178 181 192 226 235 276 281 288 295 296 303 304 327 342 346 356 365 367 385 388 403 418 422 441 444 473 503 514 525 531 559 566 571 576 597 610 629 642 650 672 675 680 705 722 754 760 761 791 804 806 815 847 853 886 896 900 901 910 914 980 994 1007 1020 1029 1031 1034 1037 1055 1074 1094 1107 1130 1162 1179 1182 1186 1189 1192 1251 1260 1265 1277 1280 1287 1297 1307 1319 1322 1329 1332 1333 1334 1335 1338 1347 1356 1377 1391 1393 1405 1409 1428 1429 1431 1447 1464 1472 1513 1534 1536 1562 1570 1571 1572 1574 1578 1593 1607 1616 1617 1626 1659 1669 1672 1680 1684 1686 1689 1700 1718 1722 1724 1740 1741 1745 1779 1797 1829 1831 1843 1854 1867 1872 1873 1880 1918 1924 1932 1939 1947 1954 1955 1965 1967 1980 1997 2000 2002 2003 2038 2055 2060 2063 2078 2082 2086 2092 2098 2102 2105 2119 2125 2128 2134 2149 2189 2194 2198 2210 2212 2223 2229 2230 2236 2237 2264 2294 2295 2300 2319 2334 2338 2349 2361 2365 2403 2416 2426 2432 2438 2448 2484 2487 2498 2502 2519 2521 2523 2527 2533 2538 2552 2582 2605 2610 2613 2616 2621 2630 2641 2643 2652 2654 2683 2688 2689 2690 2703 2705 2706 2715 2730 2731 2735 2744 2748 2758 2770 2779 2780 2783 2804 2810 2815 2823 2838 2863 2866 2868 2876 2883 2893 2906 2909 2913 2922 2923 2931 2934 2935 2940 2946 2965 2967 2987 3002 3030 3032 3033 3055 3063 3085 3094 3115 3122 3123 3142 3147 3149 3155 3175 3201 3206 3215 3255 3285 3288 3315 3318 3328 3330 3334 3348 3350 3351 3353 3358 3366 3374 3376 3384 3409 3422 3423 3442 3457 3466 3472 3484 3485 3495 3504 3539 3545 3549 3553 3554 3575 3585 3592 3596 3617 3618 3621 3630 3642 3644 3646 3656 3663 3690 3708 3720 3724 3759 3774 3777 3779 3800 3820 3823 3824 3837 3847 3849 3856 3860 3862 3866 3873 3880 3882 3905 3921 3949 3953 3957 3967 3974 3976 3981 3985 4010 4017 4019 4020 4023 4045 4047 4065 4069 4070 4073 4084 4088 4104 4105 4111 4114 4125 4129 4142 4144 4160 4181 4184 4192 4204 4209 4226 4250 4258 4283 4284 4294 4299 4330 4333 4339 4347 4353 4365 4374 4380 4387 4390 4401 4406 4432 4435 4447 4449 4451 4466 4468 4487 4497 4510 4520 4523 4540 4547 4553 4556 4557 4563 4594 4597 4598 4602 4624 4628 4640 4641 4655 4660 4663 4696 4707 4716 4719 4732 4735 4742 4755 4765 4772 4777 4780 4798 4803 4814 4831 4842 4843 4855 4858 4862 4863 4865 4874 4877 4885 4895 4905 4911 4926 4929 4939 4940 4946 4959 4966 4984 228 422 427 445 688 806 1068 1180 1249 1501 1722 1778 1811 2009 2256 2311 2369 2370 2371 2374 2376 2377 2888 2893 2972 3037 3038 3092 3125 3170 3513 3637 3733 3922 4177 4305 4394 4478 4720 4787 4933 CGGAGAT/ATCTCCG 0 -3 450 454 47 -89.1 0 6 41 49 83 87 93 108 109 115 118 122 125 135 158 159 164 167 171 175 178 192 206 214 218 235 245 253 255 303 333 342 358 365 375 386 388 391 403 426 432 454 471 477 483 514 515 539 550 555 559 562 576 590 593 597 607 625 630 636 639 642 645 650 660 666 675 683 685 687 695 696 742 746 754 757 766 771 788 791 806 815 816 838 851 886 892 901 903 914 948 954 957 973 1007 1027 1029 1040 1043 1054 1055 1059 1074 1090 1127 1153 1170 1179 1211 1214 1265 1268 1272 1273 1277 1293 1303 1307 1319 1321 1327 1330 1331 1333 1337 1347 1374 1381 1386 1391 1399 1409 1429 1444 1445 1447 1456 1467 1496 1501 1513 1536 1571 1583 1586 1588 1593 1598 1607 1617 1653 1676 1678 1686 1689 1704 1717 1721 1725 1728 1745 1779 1796 1797 1817 1821 1839 1852 1860 1867 1872 1873 1876 1880 1897 1898 1913 1918 1943 1954 1955 1961 1965 1972 1990 1996 2003 2013 2030 2040 2042 2052 2056 2061 2082 2086 2092 2105 2119 2124 2131 2142 2149 2157 2170 2178 2189 2192 2194 2207 2210 2233 2234 2235 2236 2267 2319 2324 2331 2372 2400 2402 2410 2424 2431 2454 2471 2487 2500 2502 2523 2527 2538 2573 2578 2610 2611 2616 2618 2619 2621 2631 2651 2659 2683 2690 2705 2715 2731 2735 2738 2742 2769 2780 2786 2787 2804 2816 2818 2838 2842 2868 2884 2893 2894 2898 2913 2922 2926 2931 2933 2935 2946 2960 2964 2980 2987 2990 3043 3051 3057 3060 3063 3065 3089 3094 3106 3122 3124 3126 3131 3132 3142 3144 3152 3177 3178 3180 3201 3206 3211 3213 3249 3251 3273 3291 3296 3304 3314 3317 3334 3351 3364 3366 3367 3376 3382 3394 3421 3422 3463 3466 3475 3488 3539 3541 3542 3545 3548 3550 3558 3570 3578 3580 3593 3631 3638 3655 3658 3663 3694 3710 3720 3759 3777 3779 3800 3801 3820 3837 3855 3864 3867 3882 3895 3905 3925 3931 3953 3958 3964 3992 4008 4017 4045 4060 4065 4069 4070 4073 4078 4084 4094 4104 4105 4111 4122 4124 4129 4131 4134 4142 4184 4186 4209 4210 4227 4250 4267 4284 4305 4323 4328 4329 4339 4346 4365 4367 4379 4416 4421 4423 4439 4451 4475 4509 4511 4515 4517 4520 4540 4550 4556 4557 4559 4569 4592 4598 4628 4631 4637 4638 4639 4640 4655 4658 4675 4714 4719 4720 4735 4760 4771 4795 4800 4807 4814 4818 4822 4845 4865 4877 4885 4895 4905 4926 4930 4945 4973 4993 162 344 427 445 601 688 693 806 979 1025 1053 1180 1206 1249 1302 1752 2176 2179 2257 2311 2336 2406 2446 2581 2731 2787 2842 2881 2888 2893 2949 3037 3038 3127 3157 3170 3504 3698 3709 3713 4066 4166 4393 4394 4478 4710 4976 ACGGAGA/TCTCCGT 0 -4 416 421 35 -89.3 0 14 18 41 68 78 87 92 108 109 112 116 123 143 156 159 167 206 211 213 214 218 230 234 239 245 247 253 266 271 285 333 368 377 386 391 400 412 417 455 470 515 522 528 539 541 555 584 587 607 617 619 625 633 639 655 658 683 687 690 695 696 714 729 749 753 757 790 799 802 805 808 816 826 851 864 866 874 878 897 903 917 919 924 968 970 973 1027 1040 1042 1052 1054 1059 1077 1087 1090 1091 1094 1119 1128 1143 1163 1164 1175 1210 1211 1212 1214 1224 1249 1259 1273 1293 1295 1303 1306 1320 1331 1337 1338 1342 1348 1373 1404 1408 1456 1467 1468 1470 1478 1479 1486 1499 1506 1507 1525 1529 1561 1583 1588 1598 1606 1609 1611 1613 1669 1671 1686 1710 1711 1713 1717 1728 1744 1796 1852 1856 1858 1860 1876 1879 1885 1887 1888 1913 1927 1937 1943 1945 1946 1965 1970 1972 1978 1996 2000 2010 2013 2016 2018 2040 2056 2062 2075 2084 2087 2119 2120 2131 2132 2136 2138 2140 2144 2151 2169 2175 2185 2193 2195 2211 2235 2236 2251 2259 2267 2304 2315 2319 2331 2353 2357 2372 2380 2388 2402 2430 2431 2442 2469 2488 2509 2513 2516 2531 2537 2573 2578 2588 2595 2623 2626 2631 2632 2657 2663 2680 2694 2699 2723 2730 2738 2741 2759 2769 2774 2786 2795 2801 2824 2827 2842 2853 2884 2894 2900 2935 2936 2947 2982 2985 2986 2993 3007 3012 3043 3081 3101 3106 3117 3127 3132 3138 3151 3152 3177 3180 3181 3211 3213 3233 3235 3249 3250 3262 3275 3293 3299 3314 3315 3321 3324 3364 3367 3377 3385 3390 3410 3424 3451 3496 3505 3516 3529 3538 3541 3569 3578 3580 3590 3615 3620 3631 3638 3640 3700 3710 3718 3742 3744 3784 3788 3834 3841 3847 3855 3869 3881 3905 3933 3958 3970 3977 3978 3992 4006 4008 4042 4064 4066 4089 4091 4093 4094 4098 4118 4127 4128 4134 4147 4157 4163 4188 4191 4200 4202 4205 4214 4215 4217 4227 4296 4305 4323 4328 4338 4341 4346 4367 4374 4388 4415 4421 4446 4449 4464 4475 4488 4490 4500 4509 4551 4582 4591 4605 4622 4631 4642 4658 4670 4675 4681 4683 4702 4721 4725 4728 4764 4783 4821 4833 4836 4837 4849 4851 4855 4873 4883 4898 4905 4942 4985 4993 4994 4998 4999 99 187 344 601 693 905 914 1025 1053 1206 1523 1547 1710 1747 1752 1866 2009 2010 2019 2179 2274 2286 2336 2446 2768 2838 3041 3127 3448 3504 3698 3704 3903 4710 4861 ACGGAGA/TCTCCGT 1 -2 416 421 35 -89.3 0 14 18 41 68 78 87 92 108 109 112 116 123 143 156 159 167 206 211 213 214 218 230 234 239 245 247 253 266 271 285 333 368 377 386 391 400 412 417 455 470 515 522 528 539 541 555 584 587 607 617 619 625 633 639 655 658 683 687 690 695 696 714 729 749 753 757 790 799 802 805 808 816 826 851 864 866 874 878 897 903 917 919 924 968 970 973 1027 1040 1042 1052 1054 1059 1077 1087 1090 1091 1094 1119 1128 1143 1163 1164 1175 1210 1211 1212 1214 1224 1249 1259 1273 1293 1295 1303 1306 1320 1331 1337 1338 1342 1348 1373 1404 1408 1456 1467 1468 1470 1478 1479 1486 1499 1506 1507 1525 1529 1561 1583 1588 1598 1606 1609 1611 1613 1669 1671 1686 1710 1711 1713 1717 1728 1744 1796 1852 1856 1858 1860 1876 1879 1885 1887 1888 1913 1927 1937 1943 1945 1946 1965 1970 1972 1978 1996 2000 2010 2013 2016 2018 2040 2056 2062 2075 2084 2087 2119 2120 2131 2132 2136 2138 2140 2144 2151 2169 2175 2185 2193 2195 2211 2235 2236 2251 2259 2267 2304 2315 2319 2331 2353 2357 2372 2380 2388 2402 2430 2431 2442 2469 2488 2509 2513 2516 2531 2537 2573 2578 2588 2595 2623 2626 2631 2632 2657 2663 2680 2694 2699 2723 2730 2738 2741 2759 2769 2774 2786 2795 2801 2824 2827 2842 2853 2884 2894 2900 2935 2936 2947 2982 2985 2986 2993 3007 3012 3043 3081 3101 3106 3117 3127 3132 3138 3151 3152 3177 3180 3181 3211 3213 3233 3235 3249 3250 3262 3275 3293 3299 3314 3315 3321 3324 3364 3367 3377 3385 3390 3410 3424 3451 3496 3505 3516 3529 3538 3541 3569 3578 3580 3590 3615 3620 3631 3638 3640 3700 3710 3718 3742 3744 3784 3788 3834 3841 3847 3855 3869 3881 3905 3933 3958 3970 3977 3978 3992 4006 4008 4042 4064 4066 4089 4091 4093 4094 4098 4118 4127 4128 4134 4147 4157 4163 4188 4191 4200 4202 4205 4214 4215 4217 4227 4296 4305 4323 4328 4338 4341 4346 4367 4374 4388 4415 4421 4446 4449 4464 4475 4488 4490 4500 4509 4551 4582 4591 4605 4622 4631 4642 4658 4670 4675 4681 4683 4702 4721 4725 4728 4764 4783 4821 4833 4836 4837 4849 4851 4855 4873 4883 4898 4905 4942 4985 4993 4994 4998 4999 99 187 344 601 693 905 914 1025 1053 1206 1523 1547 1710 1747 1752 1866 2009 2010 2019 2179 2274 2286 2336 2446 2768 2838 3041 3127 3448 3504 3698 3704 3903 4710 4861 GACGGAG/CTCCGTC 0 -5 385 383 27 -85.3 0 33 41 43 53 68 78 87 107 123 131 143 159 167 206 214 245 250 253 259 271 319 333 341 349 361 368 400 412 413 417 470 493 510 515 522 528 541 555 563 603 618 619 622 625 634 635 638 652 655 658 665 669 675 690 696 718 729 749 753 764 777 796 802 805 851 864 872 874 878 880 889 902 911 919 926 968 970 973 977 979 1002 1027 1040 1042 1077 1094 1097 1118 1128 1139 1164 1174 1190 1211 1214 1224 1242 1249 1259 1271 1320 1373 1388 1401 1408 1415 1419 1479 1486 1491 1499 1505 1506 1526 1540 1561 1569 1606 1609 1634 1656 1669 1671 1710 1713 1717 1744 1796 1804 1806 1819 1826 1832 1837 1842 1876 1879 1888 1905 1907 1908 1913 1941 1943 1944 1960 1970 1972 1978 1991 1996 2000 2015 2016 2073 2075 2084 2118 2120 2136 2140 2144 2185 2193 2195 2196 2200 2211 2236 2251 2254 2259 2304 2315 2331 2334 2341 2357 2372 2376 2380 2385 2388 2403 2406 2423 2431 2436 2442 2488 2489 2497 2502 2509 2526 2531 2561 2573 2586 2589 2595 2623 2631 2632 2689 2699 2709 2730 2741 2759 2769 2774 2801 2817 2855 2862 2871 2884 2885 2900 2934 2935 2963 2977 2993 3006 3007 3008 3043 3051 3052 3064 3070 3081 3101 3106 3117 3123 3132 3138 3144 3159 3180 3205 3211 3213 3225 3228 3229 3233 3245 3250 3254 3259 3262 3263 3267 3284 3314 3315 3324 3364 3367 3377 3385 3390 3412 3424 3451 3495 3505 3510 3538 3544 3545 3546 3568 3590 3615 3616 3622 3626 3631 3657 3661 3662 3686 3698 3710 3732 3744 3754 3761 3784 3806 3813 3819 3827 3835 3855 3870 3873 3881 3885 3895 3905 3908 3938 3941 3966 3970 3978 4008 4018 4042 4066 4089 4098 4128 4132 4157 4168 4173 4200 4217 4227 4240 4262 4290 4311 4323 4325 4328 4338 4345 4346 4362 4374 4413 4420 4426 4449 4473 4488 4490 4497 4500 4509 4536 4550 4575 4591 4605 4622 4631 4638 4642 4670 4671 4675 4676 4681 4683 4696 4701 4702 4724 4729 4738 4768 4821 4833 4838 4849 4855 4873 4875 4883 4898 4905 4931 4933 4969 4994 234 303 307 344 601 693 905 1053 1068 1206 1307 1523 1547 1710 1866 2010 2274 2286 2446 3041 3127 3128 3211 3504 3698 4546 4819 GACGGAG/CTCCGTC 1 -3 385 383 27 -85.3 0 33 41 43 53 68 78 87 107 123 131 143 159 167 206 214 245 250 253 259 271 319 333 341 349 361 368 400 412 413 417 470 493 510 515 522 528 541 555 563 603 618 619 622 625 634 635 638 652 655 658 665 669 675 690 696 718 729 749 753 764 777 796 802 805 851 864 872 874 878 880 889 902 911 919 926 968 970 973 977 979 1002 1027 1040 1042 1077 1094 1097 1118 1128 1139 1164 1174 1190 1211 1214 1224 1242 1249 1259 1271 1320 1373 1388 1401 1408 1415 1419 1479 1486 1491 1499 1505 1506 1526 1540 1561 1569 1606 1609 1634 1656 1669 1671 1710 1713 1717 1744 1796 1804 1806 1819 1826 1832 1837 1842 1876 1879 1888 1905 1907 1908 1913 1941 1943 1944 1960 1970 1972 1978 1991 1996 2000 2015 2016 2073 2075 2084 2118 2120 2136 2140 2144 2185 2193 2195 2196 2200 2211 2236 2251 2254 2259 2304 2315 2331 2334 2341 2357 2372 2376 2380 2385 2388 2403 2406 2423 2431 2436 2442 2488 2489 2497 2502 2509 2526 2531 2561 2573 2586 2589 2595 2623 2631 2632 2689 2699 2709 2730 2741 2759 2769 2774 2801 2817 2855 2862 2871 2884 2885 2900 2934 2935 2963 2977 2993 3006 3007 3008 3043 3051 3052 3064 3070 3081 3101 3106 3117 3123 3132 3138 3144 3159 3180 3205 3211 3213 3225 3228 3229 3233 3245 3250 3254 3259 3262 3263 3267 3284 3314 3315 3324 3364 3367 3377 3385 3390 3412 3424 3451 3495 3505 3510 3538 3544 3545 3546 3568 3590 3615 3616 3622 3626 3631 3657 3661 3662 3686 3698 3710 3732 3744 3754 3761 3784 3806 3813 3819 3827 3835 3855 3870 3873 3881 3885 3895 3905 3908 3938 3941 3966 3970 3978 4008 4018 4042 4066 4089 4098 4128 4132 4157 4168 4173 4200 4217 4227 4240 4262 4290 4311 4323 4325 4328 4338 4345 4346 4362 4374 4413 4420 4426 4449 4473 4488 4490 4497 4500 4509 4536 4550 4575 4591 4605 4622 4631 4638 4642 4670 4671 4675 4676 4681 4683 4696 4701 4702 4724 4729 4738 4768 4821 4833 4838 4849 4855 4873 4875 4883 4898 4905 4931 4933 4969 4994 234 303 307 344 601 693 905 1053 1068 1206 1307 1523 1547 1710 1866 2010 2274 2286 2446 3041 3127 3128 3211 3504 3698 4546 4819 GGAGAAG/CTTCTCC 0 -2 388 379 89 -45.8 14 21 25 41 80 83 92 151 153 157 168 179 180 183 213 226 247 277 285 296 302 338 340 356 361 367 368 379 385 389 400 427 441 445 469 473 517 520 522 538 571 588 598 610 644 714 724 752 773 796 804 808 822 830 841 864 895 904 910 938 970 980 998 1011 1020 1023 1046 1048 1067 1069 1077 1082 1086 1101 1104 1107 1118 1119 1128 1135 1143 1162 1163 1175 1186 1192 1203 1210 1223 1244 1282 1326 1335 1338 1348 1350 1367 1408 1431 1446 1464 1473 1490 1497 1498 1503 1505 1506 1508 1524 1529 1532 1537 1570 1574 1600 1643 1668 1677 1682 1687 1710 1712 1719 1727 1775 1829 1858 1861 1891 1910 1935 1946 1948 1970 2000 2038 2039 2042 2055 2102 2108 2118 2129 2134 2140 2147 2151 2180 2198 2216 2248 2250 2253 2262 2304 2310 2323 2327 2338 2340 2349 2365 2367 2368 2380 2383 2387 2388 2398 2409 2413 2418 2421 2429 2431 2447 2448 2478 2484 2488 2498 2506 2509 2510 2513 2516 2533 2537 2557 2561 2588 2589 2597 2621 2624 2630 2632 2645 2646 2653 2657 2658 2667 2677 2680 2682 2699 2703 2723 2730 2737 2738 2783 2809 2810 2815 2821 2824 2833 2876 2940 2957 2967 2972 2980 2982 2986 2993 2996 3002 3007 3030 3069 3072 3075 3103 3132 3133 3141 3148 3150 3154 3155 3158 3167 3182 3195 3202 3208 3221 3245 3248 3249 3255 3259 3262 3269 3281 3289 3293 3296 3312 3320 3335 3374 3381 3384 3389 3423 3485 3486 3529 3542 3551 3577 3642 3656 3714 3732 3738 3757 3758 3788 3815 3822 3830 3847 3850 3856 3866 3872 3881 3930 3931 3936 3953 3967 3968 3971 3974 3978 3998 4019 4043 4046 4050 4059 4065 4067 4075 4080 4098 4110 4111 4128 4132 4144 4147 4148 4153 4184 4200 4224 4226 4237 4240 4259 4280 4294 4318 4330 4340 4372 4378 4387 4390 4408 4410 4415 4420 4435 4449 4473 4490 4491 4510 4514 4551 4563 4574 4582 4602 4619 4622 4629 4643 4663 4664 4697 4702 4708 4719 4728 4755 4765 4767 4822 4831 4833 4834 4850 4863 4873 4875 4890 4895 4919 4932 4934 4941 4942 4946 4950 4965 4966 4978 4998 99 111 115 190 236 457 708 794 898 916 943 1001 1008 1025 1166 1262 1461 1520 1523 1578 1581 1588 1710 1722 1812 1847 1866 2010 2168 2254 2280 2376 2456 2572 2596 2677 2761 2767 2819 2838 2847 2849 2873 2965 2984 3025 3041 3113 3273 3578 3667 3719 3733 3789 3800 3801 3810 3819 3826 3834 3903 3908 3924 3933 3949 4047 4054 4068 4216 4233 4270 4275 4286 4297 4305 4344 4396 4423 4441 4560 4700 4720 4757 4775 4805 4858 4911 4930 4942 CGCCGGA/TCCGGCG 0 -6 355 338 31 -69.1 6 15 17 41 103 192 200 212 265 272 296 308 316 318 321 329 335 342 350 359 364 385 395 445 501 503 576 597 665 689 703 710 754 788 804 813 832 839 846 875 890 892 893 900 927 933 971 1007 1034 1058 1063 1086 1094 1106 1125 1126 1140 1164 1189 1199 1213 1225 1228 1248 1265 1276 1278 1283 1287 1325 1332 1341 1344 1363 1381 1386 1431 1464 1521 1528 1534 1562 1612 1654 1672 1673 1675 1685 1699 1700 1724 1750 1754 1763 1789 1795 1797 1800 1808 1830 1835 1855 1856 1861 1863 1865 1866 1872 1892 1893 1897 1906 1938 1939 1954 1956 1958 1980 1985 1986 1987 2000 2044 2064 2080 2100 2116 2121 2131 2134 2162 2184 2194 2205 2212 2216 2230 2231 2246 2268 2294 2298 2329 2338 2340 2342 2349 2360 2387 2396 2411 2415 2417 2421 2422 2434 2435 2460 2464 2475 2480 2514 2520 2528 2564 2585 2612 2628 2641 2677 2678 2695 2703 2715 2732 2735 2740 2744 2748 2778 2784 2792 2804 2815 2822 2824 2835 2863 2874 2883 2896 2908 2913 2934 2951 2957 2967 3002 3014 3027 3032 3063 3085 3098 3122 3155 3156 3164 3206 3215 3232 3268 3274 3280 3286 3288 3315 3318 3319 3325 3329 3360 3366 3384 3414 3422 3429 3454 3472 3484 3497 3500 3502 3504 3508 3509 3522 3527 3531 3545 3565 3566 3574 3586 3637 3660 3668 3723 3728 3735 3749 3753 3754 3764 3777 3779 3783 3811 3816 3820 3824 3826 3839 3856 3866 3882 3905 3906 3915 3952 3967 3975 3976 4010 4019 4023 4024 4040 4048 4055 4065 4075 4077 4087 4104 4105 4111 4129 4142 4151 4169 4177 4181 4189 4192 4204 4213 4221 4273 4277 4281 4290 4306 4314 4330 4332 4341 4352 4371 4387 4390 4433 4447 4449 4450 4451 4456 4466 4482 4487 4504 4520 4542 4553 4554 4557 4562 4571 4594 4597 4628 4639 4640 4657 4694 4696 4707 4751 4757 4772 4777 4804 4806 4821 4850 4858 4868 4870 4887 4895 4909 4944 4953 4954 4986 231 233 444 465 806 838 978 1069 1071 1328 1607 2009 2185 2419 2589 2799 2881 3170 3401 3503 3513 3657 3709 3733 3767 3954 3970 4166 4249 4478 4920 CGCCGGA/TCCGGCG 1 -4 355 338 31 -69.1 6 15 17 41 103 192 200 212 265 272 296 308 316 318 321 329 335 342 350 359 364 385 395 445 501 503 576 597 665 689 703 710 754 788 804 813 832 839 846 875 890 892 893 900 927 933 971 1007 1034 1058 1063 1086 1094 1106 1125 1126 1140 1164 1189 1199 1213 1225 1228 1248 1265 1276 1278 1283 1287 1325 1332 1341 1344 1363 1381 1386 1431 1464 1521 1528 1534 1562 1612 1654 1672 1673 1675 1685 1699 1700 1724 1750 1754 1763 1789 1795 1797 1800 1808 1830 1835 1855 1856 1861 1863 1865 1866 1872 1892 1893 1897 1906 1938 1939 1954 1956 1958 1980 1985 1986 1987 2000 2044 2064 2080 2100 2116 2121 2131 2134 2162 2184 2194 2205 2212 2216 2230 2231 2246 2268 2294 2298 2329 2338 2340 2342 2349 2360 2387 2396 2411 2415 2417 2421 2422 2434 2435 2460 2464 2475 2480 2514 2520 2528 2564 2585 2612 2628 2641 2677 2678 2695 2703 2715 2732 2735 2740 2744 2748 2778 2784 2792 2804 2815 2822 2824 2835 2863 2874 2883 2896 2908 2913 2934 2951 2957 2967 3002 3014 3027 3032 3063 3085 3098 3122 3155 3156 3164 3206 3215 3232 3268 3274 3280 3286 3288 3315 3318 3319 3325 3329 3360 3366 3384 3414 3422 3429 3454 3472 3484 3497 3500 3502 3504 3508 3509 3522 3527 3531 3545 3565 3566 3574 3586 3637 3660 3668 3723 3728 3735 3749 3753 3754 3764 3777 3779 3783 3811 3816 3820 3824 3826 3839 3856 3866 3882 3905 3906 3915 3952 3967 3975 3976 4010 4019 4023 4024 4040 4048 4055 4065 4075 4077 4087 4104 4105 4111 4129 4142 4151 4169 4177 4181 4189 4192 4204 4213 4221 4273 4277 4281 4290 4306 4314 4330 4332 4341 4352 4371 4387 4390 4433 4447 4449 4450 4451 4456 4466 4482 4487 4504 4520 4542 4553 4554 4557 4562 4571 4594 4597 4628 4639 4640 4657 4694 4696 4707 4751 4757 4772 4777 4804 4806 4821 4850 4858 4868 4870 4887 4895 4909 4944 4953 4954 4986 231 233 444 465 806 838 978 1069 1071 1328 1607 2009 2185 2419 2589 2799 2881 3170 3401 3503 3513 3657 3709 3733 3767 3954 3970 4166 4249 4478 4920 CGGAGAC/GTCTCCG 0 -3 286 279 18 -63.6 22 29 41 45 68 77 116 123 189 217 259 271 286 295 296 327 337 390 392 394 407 412 417 422 455 470 482 503 531 543 551 619 629 658 690 716 753 760 762 790 802 805 853 900 917 968 989 1034 1037 1045 1052 1087 1108 1131 1144 1146 1164 1189 1196 1206 1259 1288 1306 1320 1323 1324 1342 1350 1375 1403 1420 1468 1478 1479 1498 1520 1525 1530 1544 1584 1585 1606 1613 1621 1671 1679 1700 1718 1724 1740 1758 1770 1774 1879 1887 1889 1893 1947 1959 1965 1978 1980 1997 2002 2010 2016 2018 2063 2084 2087 2098 2119 2140 2144 2158 2164 2175 2183 2193 2201 2209 2227 2230 2266 2281 2282 2300 2315 2319 2334 2338 2353 2384 2389 2430 2432 2457 2476 2521 2552 2623 2641 2643 2689 2694 2721 2725 2730 2741 2748 2759 2779 2795 2804 2827 2873 2919 2934 2935 2936 3012 3032 3061 3081 3085 3105 3115 3119 3122 3123 3127 3149 3221 3250 3264 3299 3324 3330 3353 3358 3360 3365 3377 3385 3396 3409 3410 3451 3486 3495 3496 3499 3553 3569 3585 3592 3602 3615 3617 3618 3640 3644 3648 3687 3700 3724 3743 3751 3768 3794 3796 3805 3817 3873 3874 3884 3917 3949 3956 3970 3974 3976 3981 4066 4074 4088 4093 4159 4160 4163 4177 4180 4181 4187 4204 4214 4215 4217 4232 4246 4258 4299 4333 4338 4343 4374 4388 4430 4432 4444 4447 4458 4464 4497 4523 4527 4590 4591 4592 4594 4610 4624 4641 4649 4670 4683 4713 4721 4733 4742 4764 4772 4773 4780 4798 4821 4836 4842 4855 4874 4883 4905 4984 4986 4990 4991 228 862 905 1243 2009 2010 2243 2256 2286 2333 2916 3125 3733 3973 4155 4177 4861 4933 CGGAGAG/CTCTCCG 0 -3 279 275 31 -51.9 81 132 156 163 178 181 182 211 230 239 266 267 276 278 288 335 361 369 377 472 485 520 528 539 541 570 584 587 617 625 626 633 646 680 681 704 705 722 761 798 814 824 832 837 847 868 869 878 900 919 924 938 944 966 984 1003 1030 1031 1073 1079 1092 1094 1114 1129 1143 1147 1156 1180 1205 1212 1224 1251 1268 1275 1280 1287 1297 1322 1329 1332 1334 1338 1358 1376 1377 1388 1393 1431 1470 1518 1561 1562 1572 1578 1600 1680 1713 1722 1748 1792 1811 1856 1887 1888 1890 1932 1938 1945 1967 1996 2060 2062 2075 2125 2132 2161 2163 2168 2169 2173 2187 2189 2195 2237 2259 2264 2328 2357 2380 2408 2442 2495 2519 2531 2566 2573 2602 2605 2613 2620 2623 2644 2654 2656 2663 2728 2744 2753 2762 2770 2773 2774 2816 2823 2832 2852 2853 2883 2906 2947 2965 2966 2985 2991 3022 3035 3038 3065 3075 3108 3117 3138 3139 3151 3175 3181 3233 3235 3265 3275 3288 3315 3318 3348 3350 3390 3398 3424 3426 3438 3461 3462 3472 3505 3516 3538 3549 3596 3620 3621 3630 3663 3675 3696 3718 3742 3744 3752 3759 3767 3774 3781 3788 3805 3823 3828 3834 3860 3875 3905 3910 3933 3977 4006 4021 4047 4050 4078 4089 4091 4096 4127 4150 4157 4188 4191 4202 4215 4226 4258 4296 4335 4338 4347 4353 4373 4380 4401 4446 4449 4487 4488 4500 4547 4582 4597 4642 4656 4660 4681 4694 4696 4707 4716 4725 4731 4755 4756 4777 4830 4833 4837 4848 4862 4898 4911 4929 4946 4999 81 99 137 187 334 417 795 930 1068 1250 1430 1441 1547 1680 1747 1916 2009 2104 2154 2160 2336 2377 2505 2972 3041 3092 3170 3448 3637 3922 4305 GCCGGAG/CTCCGGC 0 -5 293 272 31 -51.1 6 41 85 103 132 164 171 192 226 276 288 296 327 342 346 367 373 385 473 514 525 576 629 665 705 748 804 846 853 886 893 900 927 1007 1034 1058 1086 1094 1106 1107 1140 1162 1189 1190 1199 1228 1258 1265 1278 1287 1322 1332 1335 1353 1381 1405 1407 1409 1428 1431 1447 1464 1521 1528 1534 1562 1607 1616 1675 1700 1724 1740 1763 1797 1830 1843 1865 1872 1873 1892 1893 1906 1932 1939 1954 1967 2000 2044 2060 2063 2089 2092 2134 2147 2184 2194 2212 2216 2230 2236 2237 2264 2268 2294 2329 2338 2340 2342 2349 2360 2361 2396 2403 2411 2415 2417 2422 2434 2448 2460 2466 2480 2520 2528 2538 2609 2628 2641 2689 2715 2732 2735 2778 2790 2804 2813 2815 2823 2835 2863 2874 2883 2896 2909 2913 2934 2940 2951 2957 2967 3002 3014 3027 3032 3063 3085 3122 3155 3206 3215 3232 3288 3315 3318 3330 3334 3348 3353 3360 3366 3384 3422 3423 3454 3472 3484 3490 3495 3502 3504 3509 3522 3545 3554 3566 3574 3642 3660 3736 3753 3764 3777 3779 3806 3820 3824 3839 3856 3866 3882 3885 3888 3905 3906 3912 3941 3963 3967 3974 3976 4010 4019 4023 4048 4055 4065 4069 4087 4088 4104 4105 4111 4122 4125 4129 4132 4142 4144 4151 4181 4192 4204 4221 4281 4314 4330 4332 4352 4365 4368 4374 4382 4387 4390 4432 4433 4447 4449 4451 4466 4469 4481 4487 4504 4520 4540 4553 4556 4557 4594 4597 4598 4628 4640 4663 4696 4707 4716 4719 4731 4742 4751 4777 4790 4798 4804 4806 4821 4831 4855 4858 4861 4862 4865 4868 4870 4874 4895 4939 4954 4959 4966 4986 228 231 233 250 389 806 978 1069 1161 1249 1328 1778 2009 2185 2372 2376 2799 3125 3170 3259 3401 3637 3733 3954 4166 4394 4460 4478 4720 4920 4933 GCCGGAG/CTCCGGC 1 -3 293 272 31 -51.1 6 41 85 103 132 164 171 192 226 276 288 296 327 342 346 367 373 385 473 514 525 576 629 665 705 748 804 846 853 886 893 900 927 1007 1034 1058 1086 1094 1106 1107 1140 1162 1189 1190 1199 1228 1258 1265 1278 1287 1322 1332 1335 1353 1381 1405 1407 1409 1428 1431 1447 1464 1521 1528 1534 1562 1607 1616 1675 1700 1724 1740 1763 1797 1830 1843 1865 1872 1873 1892 1893 1906 1932 1939 1954 1967 2000 2044 2060 2063 2089 2092 2134 2147 2184 2194 2212 2216 2230 2236 2237 2264 2268 2294 2329 2338 2340 2342 2349 2360 2361 2396 2403 2411 2415 2417 2422 2434 2448 2460 2466 2480 2520 2528 2538 2609 2628 2641 2689 2715 2732 2735 2778 2790 2804 2813 2815 2823 2835 2863 2874 2883 2896 2909 2913 2934 2940 2951 2957 2967 3002 3014 3027 3032 3063 3085 3122 3155 3206 3215 3232 3288 3315 3318 3330 3334 3348 3353 3360 3366 3384 3422 3423 3454 3472 3484 3490 3495 3502 3504 3509 3522 3545 3554 3566 3574 3642 3660 3736 3753 3764 3777 3779 3806 3820 3824 3839 3856 3866 3882 3885 3888 3905 3906 3912 3941 3963 3967 3974 3976 4010 4019 4023 4048 4055 4065 4069 4087 4088 4104 4105 4111 4122 4125 4129 4132 4142 4144 4151 4181 4192 4204 4221 4281 4314 4330 4332 4352 4365 4368 4374 4382 4387 4390 4432 4433 4447 4449 4451 4466 4469 4481 4487 4504 4520 4540 4553 4556 4557 4594 4597 4598 4628 4640 4663 4696 4707 4716 4719 4731 4742 4751 4777 4790 4798 4804 4806 4821 4831 4855 4858 4861 4862 4865 4868 4870 4874 4895 4939 4954 4959 4966 4986 228 231 233 250 389 806 978 1069 1161 1249 1328 1778 2009 2185 2372 2376 2799 3125 3170 3259 3401 3637 3733 3954 4166 4394 4460 4478 4720 4920 4933 CGGAGGA/TCCTCCG 0 -3 260 252 38 -41.3 78 131 164 216 243 269 286 292 303 310 341 349 361 363 368 385 466 467 493 510 530 545 549 553 563 598 603 618 638 657 663 679 687 753 777 779 780 788 789 792 796 805 850 864 872 880 889 911 927 1025 1029 1038 1086 1097 1134 1154 1182 1190 1199 1230 1242 1253 1259 1261 1271 1325 1328 1362 1419 1439 1480 1522 1526 1546 1550 1619 1632 1656 1663 1696 1754 1756 1777 1832 1847 1871 1905 1907 1926 1943 1960 1976 2014 2020 2030 2051 2094 2128 2135 2144 2147 2149 2162 2199 2200 2203 2206 2217 2235 2238 2249 2254 2270 2286 2297 2298 2329 2363 2403 2406 2417 2422 2450 2454 2460 2462 2485 2498 2528 2532 2551 2597 2634 2654 2685 2709 2714 2779 2783 2807 2813 2833 2835 2855 2864 2874 2876 2914 2928 2957 2958 3006 3008 3044 3051 3052 3054 3066 3073 3091 3115 3134 3217 3218 3229 3244 3248 3258 3259 3267 3362 3365 3378 3405 3408 3440 3447 3457 3527 3591 3610 3629 3657 3660 3661 3720 3754 3806 3813 3814 3818 3822 3827 3833 3839 3863 3885 3886 3892 3895 3906 3929 3938 3941 3962 3963 3966 3994 4009 4024 4048 4059 4075 4087 4092 4101 4106 4123 4131 4132 4166 4224 4267 4269 4278 4284 4290 4339 4350 4352 4413 4420 4445 4474 4489 4504 4515 4529 4546 4555 4575 4602 4604 4609 4612 4623 4625 4676 4687 4711 4733 4738 4790 4833 4865 4875 4884 4891 4931 4954 58 234 354 503 959 1068 1069 1111 1302 1493 1866 2009 2154 2242 2266 2312 2316 2352 2841 2849 2891 3053 3061 3125 3127 3154 3170 3211 3228 3449 3590 3908 4140 4194 4407 4546 4573 4668 ACCGGAG/CTCCGGT 0 -5 254 250 40 -39.7 4 115 135 153 164 175 178 181 282 286 295 296 304 356 365 373 388 403 418 444 463 531 566 571 603 642 680 736 744 753 754 760 761 791 815 847 864 896 901 914 980 1020 1029 1031 1037 1055 1130 1179 1182 1192 1260 1261 1269 1277 1280 1297 1307 1319 1329 1334 1338 1347 1356 1377 1391 1393 1431 1450 1453 1472 1499 1513 1514 1536 1571 1578 1593 1620 1626 1628 1650 1669 1672 1680 1686 1689 1718 1720 1741 1779 1831 1851 1867 1918 1950 1955 1965 1980 1997 2003 2055 2078 2082 2086 2092 2102 2105 2198 2210 2212 2223 2229 2295 2319 2334 2365 2416 2426 2432 2438 2484 2487 2502 2519 2523 2527 2532 2533 2576 2593 2605 2610 2616 2621 2630 2643 2652 2683 2689 2690 2703 2705 2731 2740 2744 2748 2752 2758 2773 2780 2810 2838 2855 2868 2869 2893 2906 2929 2930 2946 2959 2965 2987 3030 3033 3055 3115 3122 3135 3147 3161 3175 3201 3244 3258 3285 3317 3374 3376 3442 3457 3485 3499 3553 3575 3585 3617 3618 3621 3630 3631 3644 3646 3662 3663 3708 3759 3774 3800 3836 3837 3849 3862 3874 3880 3908 3921 3948 3949 3957 3985 3990 4017 4047 4070 4073 4090 4105 4114 4160 4209 4283 4353 4401 4406 4412 4435 4488 4510 4523 4540 4553 4556 4602 4607 4631 4641 4655 4660 4732 4733 4755 4762 4765 4772 4790 4807 4863 4877 4905 4927 4929 4944 4984 422 427 445 750 944 995 1010 1019 1180 1501 1584 1778 1811 2256 2312 2369 2370 2371 2374 2377 2406 2415 2507 2888 2893 3010 3038 3056 3092 3170 3668 3733 3789 3922 4097 4177 4305 4787 4835 4933 TCGCCGG/CCGGCGA 0 -7 252 244 28 -45.8 6 15 17 41 192 197 200 212 222 272 296 305 308 321 329 350 359 364 385 432 461 503 576 597 689 703 710 785 804 813 832 846 890 900 915 927 933 971 1007 1058 1063 1094 1106 1125 1126 1140 1199 1213 1228 1248 1265 1278 1283 1332 1386 1464 1521 1559 1562 1645 1672 1695 1700 1715 1750 1754 1763 1776 1789 1797 1808 1851 1855 1861 1863 1866 1876 1892 1897 1906 1954 1958 1967 1980 2000 2044 2062 2080 2121 2162 2205 2212 2216 2220 2230 2231 2246 2291 2294 2298 2329 2338 2340 2360 2367 2380 2396 2411 2421 2434 2435 2437 2460 2464 2480 2481 2520 2528 2562 2564 2580 2585 2612 2616 2618 2628 2632 2677 2678 2695 2708 2732 2735 2740 2744 2748 2792 2808 2824 2835 2858 2863 2888 2890 2896 2908 2913 2951 3002 3027 3037 3063 3085 3098 3122 3198 3206 3265 3268 3280 3286 3315 3324 3325 3354 3359 3366 3384 3392 3412 3472 3476 3484 3498 3500 3508 3509 3531 3533 3545 3571 3573 3621 3637 3650 3652 3657 3660 3668 3735 3736 3749 3753 3764 3777 3779 3820 3826 3839 3856 3882 3888 3905 3909 3915 3923 3967 3996 4019 4065 4077 4087 4104 4151 4169 4189 4192 4204 4221 4273 4290 4305 4306 4314 4332 4334 4371 4430 4433 4447 4451 4456 4466 4520 4542 4553 4554 4557 4571 4594 4597 4605 4628 4639 4640 4707 4772 4806 4868 4870 4909 4986 190 233 325 410 785 806 857 1069 1071 1084 1292 1328 2121 2419 2630 2663 2799 3005 3114 3401 3609 3709 3733 3767 3970 4177 4249 4623 TCGCCGG/CCGGCGA 1 -5 252 244 28 -45.8 6 15 17 41 192 197 200 212 222 272 296 305 308 321 329 350 359 364 385 432 461 503 576 597 689 703 710 785 804 813 832 846 890 900 915 927 933 971 1007 1058 1063 1094 1106 1125 1126 1140 1199 1213 1228 1248 1265 1278 1283 1332 1386 1464 1521 1559 1562 1645 1672 1695 1700 1715 1750 1754 1763 1776 1789 1797 1808 1851 1855 1861 1863 1866 1876 1892 1897 1906 1954 1958 1967 1980 2000 2044 2062 2080 2121 2162 2205 2212 2216 2220 2230 2231 2246 2291 2294 2298 2329 2338 2340 2360 2367 2380 2396 2411 2421 2434 2435 2437 2460 2464 2480 2481 2520 2528 2562 2564 2580 2585 2612 2616 2618 2628 2632 2677 2678 2695 2708 2732 2735 2740 2744 2748 2792 2808 2824 2835 2858 2863 2888 2890 2896 2908 2913 2951 3002 3027 3037 3063 3085 3098 3122 3198 3206 3265 3268 3280 3286 3315 3324 3325 3354 3359 3366 3384 3392 3412 3472 3476 3484 3498 3500 3508 3509 3531 3533 3545 3571 3573 3621 3637 3650 3652 3657 3660 3668 3735 3736 3749 3753 3764 3777 3779 3820 3826 3839 3856 3882 3888 3905 3909 3915 3923 3967 3996 4019 4065 4077 4087 4104 4151 4169 4189 4192 4204 4221 4273 4290 4305 4306 4314 4332 4334 4371 4430 4433 4447 4451 4456 4466 4520 4542 4553 4554 4557 4571 4594 4597 4605 4628 4639 4640 4707 4772 4806 4868 4870 4909 4986 190 233 325 410 785 806 857 1069 1071 1084 1292 1328 2121 2419 2630 2663 2799 3005 3114 3401 3609 3709 3733 3767 3970 4177 4249 4623 CGACGGA/TCCGTCG 0 -6 246 242 16 -54.9 47 53 54 78 123 135 196 206 209 236 249 250 259 271 280 341 355 392 412 510 541 555 564 603 618 625 638 655 658 681 709 718 732 783 796 802 805 823 856 858 864 872 902 918 970 973 977 979 1050 1118 1128 1145 1151 1171 1214 1223 1224 1271 1298 1308 1373 1479 1486 1505 1526 1532 1536 1540 1561 1565 1573 1587 1606 1634 1656 1670 1671 1687 1694 1713 1766 1767 1774 1804 1824 1876 1888 1889 1898 1905 1944 1960 2000 2022 2098 2116 2118 2120 2136 2165 2171 2185 2186 2193 2195 2196 2200 2211 2236 2239 2315 2321 2331 2341 2372 2376 2380 2388 2390 2406 2423 2436 2442 2476 2502 2510 2520 2526 2531 2535 2581 2584 2589 2632 2637 2658 2709 2741 2765 2769 2774 2801 2819 2849 2862 2871 2875 2880 2884 2900 2934 2942 2993 3020 3038 3043 3052 3064 3138 3144 3211 3219 3228 3229 3245 3314 3364 3370 3377 3390 3394 3418 3451 3538 3544 3545 3610 3615 3616 3631 3657 3661 3662 3686 3688 3698 3702 3737 3744 3755 3783 3811 3819 3827 3869 3870 3878 3885 3903 3905 3908 3941 3963 3966 3970 4011 4018 4022 4033 4157 4168 4198 4200 4217 4227 4240 4311 4328 4368 4372 4374 4449 4473 4505 4537 4550 4638 4642 4661 4670 4671 4676 4696 4724 4729 4738 4745 4760 4768 4836 4855 4898 4923 4933 4952 4994 234 267 599 693 820 905 1206 1245 1307 1923 2088 2446 3041 4096 4290 4677 CGACGGA/TCCGTCG 1 -4 246 242 16 -54.9 47 53 54 78 123 135 196 206 209 236 249 250 259 271 280 341 355 392 412 510 541 555 564 603 618 625 638 655 658 681 709 718 732 783 796 802 805 823 856 858 864 872 902 918 970 973 977 979 1050 1118 1128 1145 1151 1171 1214 1223 1224 1271 1298 1308 1373 1479 1486 1505 1526 1532 1536 1540 1561 1565 1573 1587 1606 1634 1656 1670 1671 1687 1694 1713 1766 1767 1774 1804 1824 1876 1888 1889 1898 1905 1944 1960 2000 2022 2098 2116 2118 2120 2136 2165 2171 2185 2186 2193 2195 2196 2200 2211 2236 2239 2315 2321 2331 2341 2372 2376 2380 2388 2390 2406 2423 2436 2442 2476 2502 2510 2520 2526 2531 2535 2581 2584 2589 2632 2637 2658 2709 2741 2765 2769 2774 2801 2819 2849 2862 2871 2875 2880 2884 2900 2934 2942 2993 3020 3038 3043 3052 3064 3138 3144 3211 3219 3228 3229 3245 3314 3364 3370 3377 3390 3394 3418 3451 3538 3544 3545 3610 3615 3616 3631 3657 3661 3662 3686 3688 3698 3702 3737 3744 3755 3783 3811 3819 3827 3869 3870 3878 3885 3903 3905 3908 3941 3963 3966 3970 4011 4018 4022 4033 4157 4168 4198 4200 4217 4227 4240 4311 4328 4368 4372 4374 4449 4473 4505 4537 4550 4638 4642 4661 4670 4671 4676 4696 4724 4729 4738 4745 4760 4768 4836 4855 4898 4923 4933 4952 4994 234 267 599 693 820 905 1206 1245 1307 1923 2088 2446 3041 4096 4290 4677 CGGCGAA/TTCGCCG 0 -3 223 221 18 -47.2 6 15 30 41 72 114 116 167 185 197 200 220 222 228 236 305 308 322 350 357 385 395 461 503 551 576 597 670 689 698 706 735 769 785 804 811 832 859 877 915 921 956 971 1028 1033 1109 1121 1126 1150 1180 1181 1213 1222 1241 1248 1304 1305 1311 1328 1332 1440 1464 1504 1520 1534 1569 1645 1672 1695 1715 1724 1726 1750 1776 1789 1797 1817 1846 1851 1856 1874 1892 1961 1967 2007 2048 2151 2162 2167 2204 2220 2261 2291 2294 2298 2319 2338 2366 2367 2397 2437 2464 2480 2481 2485 2555 2562 2580 2609 2641 2669 2678 2695 2698 2715 2721 2808 2840 2846 2858 2890 2896 2921 2951 2972 3006 3022 3025 3026 3028 3037 3046 3054 3098 3163 3172 3176 3182 3198 3206 3227 3281 3286 3343 3349 3366 3392 3449 3476 3498 3509 3522 3531 3533 3561 3573 3583 3633 3637 3650 3652 3657 3679 3719 3735 3736 3764 3772 3779 3791 3826 3839 3842 3844 3846 3858 3888 3892 3909 3917 3932 3947 3965 3973 3996 4003 4026 4065 4104 4120 4169 4176 4198 4204 4212 4236 4264 4363 4375 4414 4447 4451 4454 4457 4494 4520 4535 4571 4594 4605 4635 4639 4641 4651 4668 4679 4713 4739 4752 4802 4867 4870 4906 190 325 599 834 1042 1656 1696 2226 2856 2920 3069 3142 3513 3552 3709 3767 3918 4407 AATCGGA/TCCGATT 0 -6 216 218 51 -26.6 10 25 26 37 52 83 139 147 153 176 217 224 302 368 377 402 426 455 458 482 483 516 530 547 556 558 563 578 634 666 692 704 714 748 771 782 825 834 840 869 887 896 938 948 954 957 966 983 988 1008 1018 1025 1035 1038 1039 1075 1114 1232 1253 1268 1303 1318 1329 1330 1343 1354 1443 1446 1475 1490 1503 1512 1518 1524 1549 1554 1598 1632 1676 1677 1728 1762 1777 1838 1868 1889 1891 1898 1931 1934 2022 2032 2077 2107 2154 2191 2203 2248 2250 2263 2266 2320 2351 2356 2382 2385 2387 2390 2398 2402 2408 2437 2495 2525 2611 2624 2644 2645 2651 2653 2657 2682 2683 2698 2752 2753 2762 2828 2835 2839 2887 2896 2934 2964 2992 3017 3025 3056 3057 3098 3108 3114 3139 3141 3183 3189 3190 3191 3207 3209 3214 3218 3221 3244 3266 3378 3402 3418 3425 3542 3563 3593 3595 3614 3635 3637 3683 3705 3727 3778 3781 3794 3842 3852 3911 3969 3993 3998 4029 4049 4055 4086 4155 4167 4246 4275 4279 4290 4310 4329 4340 4361 4379 4423 4465 4478 4481 4571 4606 4619 4623 4632 4653 4656 4658 4693 4773 4775 4800 4809 4818 4848 4850 4869 4884 4918 26 152 155 162 246 348 598 706 717 816 879 904 906 979 1107 1137 1286 1430 1721 1732 1916 2032 2253 2264 2272 2307 2689 2819 2965 3053 3143 3307 3441 3586 3632 3658 3727 3770 3905 4044 4066 4119 4195 4234 4515 4573 4623 4699 4728 4767 4887 GATCGGA/TCCGATC 0 -6 209 217 33 -35.5 6 17 21 27 148 161 189 195 213 259 268 292 303 306 343 361 363 366 385 390 432 458 466 468 477 484 508 534 539 588 590 618 685 707 762 775 820 821 830 840 936 944 945 985 1013 1045 1047 1068 1069 1081 1114 1120 1126 1138 1141 1144 1146 1170 1217 1230 1253 1288 1290 1323 1342 1357 1362 1386 1440 1444 1449 1466 1496 1498 1520 1536 1589 1621 1640 1650 1725 1727 1736 1775 1798 1876 1915 1932 1935 1961 1996 2063 2108 2147 2149 2157 2161 2187 2194 2199 2201 2216 2227 2281 2282 2326 2339 2361 2421 2424 2444 2455 2471 2485 2605 2616 2619 2677 2683 2699 2705 2712 2715 2720 2737 2739 2745 2747 2751 2766 2787 2873 2961 2962 2967 2992 3060 3065 3071 3073 3089 3091 3094 3104 3107 3109 3125 3133 3171 3217 3246 3248 3269 3273 3275 3296 3342 3355 3374 3395 3470 3479 3487 3490 3493 3499 3576 3577 3686 3711 3714 3719 3767 3826 3874 3884 3920 3925 3971 4010 4031 4067 4072 4078 4102 4159 4164 4184 4253 4293 4302 4373 4379 4445 4487 4488 4555 4570 4601 4608 4615 4623 4677 4711 4728 4733 4924 4945 4953 82 348 356 564 952 967 1489 1501 1691 1692 1866 1962 2104 2227 2273 2670 2802 2921 2949 3004 3125 3142 3231 3695 3743 3828 3847 4140 4555 4668 4675 4741 4902 GTCGGAG/CTCCGAC 0 -5 231 217 18 -46.1 34 37 46 81 130 216 255 278 285 394 423 483 504 542 558 564 593 598 679 716 721 752 773 779 780 824 868 874 900 980 984 1016 1073 1127 1135 1142 1156 1275 1291 1297 1318 1324 1347 1353 1356 1362 1364 1388 1410 1420 1430 1448 1484 1497 1509 1510 1532 1537 1538 1546 1619 1678 1687 1704 1719 1734 1756 1773 1917 1985 2042 2051 2058 2070 2142 2157 2163 2170 2178 2180 2190 2209 2256 2262 2324 2336 2337 2338 2340 2344 2362 2363 2390 2400 2408 2418 2450 2462 2468 2510 2545 2547 2566 2589 2618 2619 2659 2661 2682 2713 2726 2813 2815 2816 2826 2886 2888 2895 2914 2925 2926 3035 3041 3051 3067 3075 3076 3092 3135 3158 3167 3221 3234 3254 3265 3296 3317 3320 3340 3371 3394 3465 3484 3509 3542 3551 3591 3651 3674 3675 3688 3689 3694 3729 3738 3739 3746 3752 3768 3788 3801 3805 3815 3818 3822 3830 3843 3864 3876 3894 3931 3936 3968 3978 3979 3994 4009 4021 4043 4050 4058 4060 4061 4069 4078 4080 4114 4166 4174 4177 4210 4223 4259 4278 4282 4335 4352 4362 4363 4376 4378 4398 4439 4473 4492 4511 4515 4521 4530 4531 4537 4573 4577 4590 4608 4629 4638 4639 4708 4727 4760 4791 4797 4799 4807 4826 4827 4830 4865 4955 4991 81 466 605 1902 2009 2160 2254 2424 2446 2677 2849 2881 3170 3578 3590 3973 4289 4423 GTCGGAG/CTCCGAC 1 -3 231 217 18 -46.1 34 37 46 81 130 216 255 278 285 394 423 483 504 542 558 564 593 598 679 716 721 752 773 779 780 824 868 874 900 980 984 1016 1073 1127 1135 1142 1156 1275 1291 1297 1318 1324 1347 1353 1356 1362 1364 1388 1410 1420 1430 1448 1484 1497 1509 1510 1532 1537 1538 1546 1619 1678 1687 1704 1719 1734 1756 1773 1917 1985 2042 2051 2058 2070 2142 2157 2163 2170 2178 2180 2190 2209 2256 2262 2324 2336 2337 2338 2340 2344 2362 2363 2390 2400 2408 2418 2450 2462 2468 2510 2545 2547 2566 2589 2618 2619 2659 2661 2682 2713 2726 2813 2815 2816 2826 2886 2888 2895 2914 2925 2926 3035 3041 3051 3067 3075 3076 3092 3135 3158 3167 3221 3234 3254 3265 3296 3317 3320 3340 3371 3394 3465 3484 3509 3542 3551 3591 3651 3674 3675 3688 3689 3694 3729 3738 3739 3746 3752 3768 3788 3801 3805 3815 3818 3822 3830 3843 3864 3876 3894 3931 3936 3968 3978 3979 3994 4009 4021 4043 4050 4058 4060 4061 4069 4078 4080 4114 4166 4174 4177 4210 4223 4259 4278 4282 4335 4352 4362 4363 4376 4378 4398 4439 4473 4492 4511 4515 4521 4530 4531 4537 4573 4577 4590 4608 4629 4638 4639 4708 4727 4760 4791 4797 4799 4807 4826 4827 4830 4865 4955 4991 81 466 605 1902 2009 2160 2254 2424 2446 2677 2849 2881 3170 3578 3590 3973 4289 4423 GGAGGAG/CTCCTCC 0 -2 209 198 60 -18.9 83 141 266 271 292 295 362 368 427 467 479 493 549 553 556 563 618 627 638 657 687 777 780 788 801 805 872 880 911 912 970 1044 1076 1086 1097 1109 1154 1180 1190 1199 1220 1223 1237 1246 1257 1259 1293 1328 1419 1439 1472 1522 1526 1552 1590 1605 1632 1663 1668 1712 1746 1777 1799 1847 1855 1905 1907 1943 1989 1999 2020 2021 2051 2073 2092 2125 2135 2144 2162 2199 2200 2217 2219 2235 2237 2238 2249 2252 2270 2271 2286 2298 2325 2363 2403 2417 2422 2431 2462 2463 2464 2542 2551 2595 2654 2685 2704 2732 2779 2783 2807 2833 2835 2855 2914 2958 3006 3044 3054 3056 3182 3199 3206 3217 3218 3229 3244 3248 3258 3259 3289 3346 3347 3408 3440 3449 3457 3488 3580 3583 3591 3610 3657 3660 3661 3693 3720 3723 3754 3806 3822 3827 3839 3863 3885 3892 3899 3903 3929 3938 3941 3958 4024 4059 4075 4087 4106 4123 4132 4148 4185 4224 4237 4260 4278 4284 4339 4366 4413 4443 4489 4504 4506 4535 4555 4602 4604 4609 4612 4613 4623 4676 4687 4697 4719 4722 4733 4758 4790 4827 4833 4860 4865 4875 4880 4931 4945 4954 4989 35 111 234 284 461 503 787 917 1021 1111 1286 1493 1502 1543 1578 1694 1790 1826 1919 2266 2316 2456 2549 2646 2653 2715 2841 2849 2891 3014 3041 3125 3127 3156 3167 3195 3211 3228 3273 3367 3590 3710 3794 3895 3908 3949 4054 4099 4122 4140 4483 4493 4546 4560 4561 4573 4679 4872 4877 4884 TCGGCGA/TCGCCGA 0 -4 199 193 20 -38.0 33 50 114 116 157 168 185 199 200 228 248 357 360 362 369 393 447 448 496 503 509 551 670 672 681 739 757 787 859 921 940 959 1000 1025 1036 1111 1150 1181 1188 1189 1222 1241 1244 1262 1279 1304 1305 1311 1331 1354 1431 1435 1459 1534 1545 1560 1569 1587 1605 1652 1674 1708 1784 1788 1792 1828 1830 1850 1905 1933 1973 2007 2044 2105 2127 2143 2184 2201 2232 2319 2359 2364 2366 2439 2441 2442 2467 2505 2522 2574 2599 2681 2715 2721 2722 2739 2745 2755 2764 2766 2832 2845 2868 2882 2891 2892 2898 2919 2921 2929 2953 2958 2999 3006 3018 3022 3028 3045 3054 3059 3080 3089 3112 3143 3163 3173 3176 3185 3224 3281 3282 3287 3289 3316 3320 3322 3342 3349 3400 3403 3416 3428 3451 3467 3513 3515 3542 3565 3575 3581 3587 3590 3598 3627 3719 3721 3725 3755 3858 3872 3892 3918 3961 3984 4044 4063 4104 4112 4139 4166 4208 4239 4243 4251 4287 4363 4375 4414 4428 4450 4494 4525 4533 4543 4596 4605 4668 4670 4730 4739 4763 4779 4785 4793 4854 4857 4878 4901 4941 166 599 1061 1403 1606 1656 1696 1919 2083 2444 2513 2856 2920 3260 3375 3609 3918 4823 4865 4995 GGAGAAT/ATTCTCC 0 -2 176 174 45 -19.6 103 180 189 233 234 279 285 287 304 331 346 356 368 402 412 444 453 479 554 627 668 672 694 721 729 749 788 794 806 827 834 885 896 899 908 921 945 992 1064 1081 1093 1120 1157 1176 1248 1260 1325 1354 1356 1370 1371 1472 1486 1559 1607 1608 1616 1640 1657 1659 1664 1669 1681 1684 1710 1711 1728 1775 1849 1861 1927 1939 1984 2001 2128 2154 2185 2196 2212 2223 2229 2231 2263 2294 2295 2340 2344 2355 2361 2426 2578 2626 2640 2652 2688 2723 2758 2803 2813 2815 2866 2876 2882 2909 2923 2925 2967 2983 2992 3033 3054 3055 3094 3215 3278 3315 3328 3371 3376 3430 3435 3437 3463 3465 3483 3498 3504 3554 3559 3575 3620 3624 3663 3674 3828 3862 3869 3905 3957 3960 3967 3978 3993 4020 4023 4076 4102 4118 4135 4185 4210 4293 4303 4305 4341 4361 4376 4390 4398 4421 4450 4466 4481 4553 4597 4608 4720 4732 4795 4799 4803 4851 4857 4869 4877 4985 71 227 234 247 277 348 418 462 470 1293 1363 1398 1501 1542 1562 1607 1658 1778 1805 1807 1874 2019 2076 2375 2377 2393 2545 2688 2718 2768 2919 3327 3440 3548 3778 3781 3838 3962 4333 4466 4540 4684 4685 4862 4930 AACGGAG/CTCCGTT 0 -5 173 172 28 -27.3 14 18 85 92 110 116 156 177 188 211 218 230 239 285 297 359 396 412 422 550 566 576 584 589 602 687 714 778 808 826 868 903 950 1054 1059 1087 1175 1185 1210 1234 1273 1293 1295 1303 1306 1331 1337 1342 1348 1364 1372 1404 1456 1470 1567 1588 1661 1686 1687 1827 1836 1852 1856 1885 1927 1937 1946 2056 2062 2065 2087 2131 2132 2137 2151 2175 2235 2283 2315 2319 2363 2402 2408 2454 2469 2513 2516 2537 2578 2597 2657 2680 2723 2738 2824 2827 2853 2982 2985 3082 3127 3152 3177 3181 3235 3249 3267 3270 3275 3293 3299 3321 3397 3410 3420 3422 3516 3569 3578 3620 3640 3723 3780 3788 3841 3855 3892 3934 3992 4006 4036 4059 4094 4124 4127 4130 4134 4135 4147 4163 4188 4191 4202 4205 4214 4215 4296 4312 4341 4367 4377 4388 4415 4421 4437 4464 4470 4475 4493 4582 4588 4591 4658 4665 4725 4728 4764 4836 4837 4859 4921 4942 4999 187 307 456 846 1018 1025 1401 1500 1545 1787 2179 2242 2316 2336 2352 2838 2841 2983 3142 3448 3449 3682 3903 3971 4490 4677 4710 4932 AACGGAG/CTCCGTT 1 -3 173 172 28 -27.3 14 18 85 92 110 116 156 177 188 211 218 230 239 285 297 359 396 412 422 550 566 576 584 589 602 687 714 778 808 826 868 903 950 1054 1059 1087 1175 1185 1210 1234 1273 1293 1295 1303 1306 1331 1337 1342 1348 1364 1372 1404 1456 1470 1567 1588 1661 1686 1687 1827 1836 1852 1856 1885 1927 1937 1946 2056 2062 2065 2087 2131 2132 2137 2151 2175 2235 2283 2315 2319 2363 2402 2408 2454 2469 2513 2516 2537 2578 2597 2657 2680 2723 2738 2824 2827 2853 2982 2985 3082 3127 3152 3177 3181 3235 3249 3267 3270 3275 3293 3299 3321 3397 3410 3420 3422 3516 3569 3578 3620 3640 3723 3780 3788 3841 3855 3892 3934 3992 4006 4036 4059 4094 4124 4127 4130 4134 4135 4147 4163 4188 4191 4202 4205 4214 4215 4296 4312 4341 4367 4377 4388 4415 4421 4437 4464 4470 4475 4493 4582 4588 4591 4658 4665 4725 4728 4764 4836 4837 4859 4921 4942 4999 187 307 456 846 1018 1025 1401 1500 1545 1787 2179 2242 2316 2336 2352 2838 2841 2983 3142 3448 3449 3682 3903 3971 4490 4677 4710 4932 TCGGAGC/GCTCCGA 0 -4 174 169 13 -37.0 10 37 58 84 91 94 130 139 141 176 182 195 264 268 306 421 542 560 578 634 678 727 748 812 821 834 874 886 974 1016 1035 1039 1047 1217 1291 1318 1346 1353 1357 1364 1371 1410 1437 1509 1512 1551 1589 1628 1630 1650 1666 1690 1707 1734 1757 1762 1786 1798 1838 1917 1919 1934 1999 2019 2031 2070 2106 2107 2238 2256 2336 2338 2375 2382 2391 2433 2450 2617 2708 2712 2713 2764 2815 2886 2895 2984 3019 3046 3056 3093 3098 3141 3191 3207 3214 3234 3244 3245 3254 3295 3326 3402 3444 3470 3480 3484 3490 3507 3509 3549 3563 3588 3595 3596 3614 3641 3651 3652 3659 3667 3705 3739 3760 3795 3797 3810 3820 3826 3852 3887 3889 3920 3922 3979 4049 4051 4059 4061 4069 4077 4083 4114 4119 4152 4174 4206 4225 4275 4282 4302 4310 4438 4473 4518 4530 4541 4608 4677 4756 4797 4809 4819 4820 4824 4826 4827 4852 4886 4888 4913 4947 4955 4958 4965 81 466 776 1723 1902 2444 2446 3004 3307 3695 3796 4140 4234 CGGCGGA/TCCGCCG 0 -6 172 166 27 -26.4 32 82 154 243 258 280 282 283 290 335 395 419 445 493 503 513 545 549 550 593 663 721 785 788 884 959 1007 1071 1076 1106 1110 1131 1140 1150 1266 1269 1272 1276 1287 1375 1381 1443 1498 1546 1569 1632 1677 1777 1785 1795 1800 1811 1829 1830 1863 1872 1880 1893 1897 1911 1930 1938 1939 1956 2020 2062 2100 2116 2137 2151 2183 2205 2246 2255 2270 2276 2296 2380 2389 2425 2431 2500 2514 2528 2632 2663 2716 2725 2749 2750 2782 2784 2832 2839 2862 2879 2898 2919 2937 3103 3134 3144 3161 3188 3198 3258 3259 3267 3360 3389 3395 3429 3454 3478 3497 3504 3527 3629 3648 3663 3678 3736 3754 3804 3805 3827 3854 3866 3889 3909 3917 3954 3979 3987 4008 4024 4055 4069 4075 4081 4096 4131 4132 4139 4181 4210 4213 4215 4217 4240 4339 4350 4362 4444 4447 4450 4456 4487 4550 4609 4663 4694 4703 4721 4751 4757 4857 4880 4887 4923 4946 4954 86 96 200 751 1155 1302 1607 2107 2185 2257 2317 2663 2842 3025 3228 3394 3503 3709 3713 4166 4360 4407 4478 4520 4574 4784 4927 CGGAGCT/AGCTCCG 0 -3 177 165 20 -30.5 82 84 85 94 130 182 268 306 373 495 678 708 821 902 1007 1016 1039 1047 1118 1140 1205 1217 1286 1334 1346 1353 1357 1360 1364 1381 1410 1437 1498 1505 1509 1521 1589 1628 1630 1650 1661 1666 1675 1690 1734 1786 1830 1832 1838 1863 1903 1917 1964 1999 2019 2031 2070 2085 2106 2118 2119 2132 2184 2216 2325 2338 2375 2382 2385 2408 2415 2434 2435 2450 2489 2497 2577 2589 2597 2614 2617 2712 2716 2764 2790 2815 2880 2886 2895 2963 2984 2997 3014 3046 3056 3082 3093 3141 3158 3159 3191 3244 3245 3270 3307 3360 3412 3444 3467 3480 3484 3507 3509 3545 3546 3549 3566 3568 3588 3595 3596 3614 3651 3652 3662 3686 3732 3739 3820 3826 3835 3874 3908 3912 3916 3922 3954 4018 4049 4051 4055 4083 4096 4119 4151 4211 4221 4314 4332 4348 4362 4382 4412 4473 4518 4541 4550 4607 4631 4640 4666 4731 4751 4756 4762 4780 4820 4824 4826 4827 4868 4903 4933 4944 4951 4986 4995 187 307 466 750 1010 1023 1248 1307 1401 1723 1787 1902 3307 3667 3695 3932 3954 4036 4140 4927 TGACGGA/TCCGTCA 1 -4 170 165 15 -34.2 31 68 214 231 245 253 344 384 413 459 470 619 627 634 652 656 661 665 669 692 702 729 749 753 767 852 880 889 919 920 1027 1044 1077 1084 1097 1100 1190 1211 1215 1219 1367 1382 1401 1415 1499 1506 1552 1562 1610 1618 1682 1717 1744 1747 1806 1826 1832 1837 1879 1884 1904 1907 1941 1943 1969 1996 2015 2016 2021 2034 2152 2284 2304 2341 2385 2403 2410 2431 2489 2497 2507 2569 2580 2595 2649 2680 2690 2698 2699 2798 2805 2855 2867 2878 2881 2885 2935 2939 2944 2963 3006 3007 3016 3023 3045 3051 3101 3106 3117 3132 3149 3170 3180 3267 3284 3324 3367 3382 3385 3424 3431 3510 3568 3668 3717 3732 3733 3739 3754 3761 3787 3879 3920 3923 3938 3955 4008 4039 4066 4089 4141 4170 4323 4325 4326 4334 4349 4351 4362 4381 4413 4425 4500 4519 4575 4626 4654 4681 4701 4789 4825 4849 4868 4873 4908 4927 4931 4950 4969 4996 303 307 716 807 1053 1126 1496 1850 2368 2373 2754 3033 3211 3602 4995 GGCGGAG/CTCCGCC 0 -5 165 164 25 -27.1 32 78 79 82 189 243 258 269 282 335 369 407 417 419 493 495 503 545 549 550 593 657 663 708 785 788 880 884 911 959 1005 1007 1038 1048 1056 1071 1106 1123 1131 1150 1191 1266 1269 1272 1301 1328 1350 1375 1381 1403 1410 1443 1480 1498 1522 1546 1587 1632 1653 1677 1754 1777 1799 1811 1863 1872 1880 1897 1938 2020 2076 2100 2116 2146 2156 2200 2270 2296 2325 2380 2389 2425 2431 2487 2490 2500 2528 2542 2565 2632 2663 2714 2716 2725 2832 2833 2898 2919 2984 3051 3065 3103 3134 3144 3186 3248 3258 3259 3360 3389 3396 3433 3440 3447 3455 3457 3478 3527 3541 3547 3553 3610 3629 3648 3663 3752 3804 3805 3854 3886 3895 3909 3917 3954 3987 4024 4074 4075 4096 4101 4123 4131 4199 4210 4211 4215 4217 4269 4328 4339 4350 4376 4444 4456 4550 4592 4604 4609 4649 4694 4751 4757 4857 4927 4995 228 334 484 600 1155 1243 1302 2108 2154 2193 2243 2257 2663 2842 3037 3228 3709 3713 3908 3932 4360 4407 4520 4784 4927 GGAGACG/CGTCTCC 0 -2 161 163 18 -31.4 26 41 68 116 123 254 271 296 337 390 392 394 412 417 455 470 475 543 622 629 642 690 716 748 753 777 805 807 878 900 1037 1045 1087 1108 1128 1162 1164 1196 1211 1249 1288 1323 1324 1342 1375 1478 1494 1498 1520 1525 1544 1656 1671 1698 1700 1734 1740 1751 1758 1879 1887 1917 1947 1980 2073 2084 2087 2098 2140 2144 2175 2227 2232 2250 2251 2259 2282 2286 2296 2300 2315 2319 2334 2338 2382 2389 2412 2430 2432 2521 2577 2621 2623 2670 2689 2721 2730 2741 2759 2779 2827 2860 2873 2919 2934 2936 3032 3070 3081 3085 3121 3122 3196 3250 3274 3297 3299 3353 3420 3483 3495 3511 3531 3615 3661 3700 3702 3743 3768 3805 3806 3855 3873 3956 4037 4066 4093 4180 4204 4232 4338 4348 4350 4374 4388 4430 4497 4523 4591 4592 4594 4624 4638 4675 4683 4721 4733 4764 4773 4798 4833 522 524 649 693 910 1019 1283 1403 1493 2010 2286 3167 3347 3733 4371 4856 4861 4923 CATCGGA/TCCGATG 0 -6 158 162 24 -27.2 60 93 94 118 141 162 190 213 252 264 299 306 314 331 369 463 479 484 553 579 625 630 645 660 678 712 723 724 787 838 958 980 989 1064 1101 1108 1147 1176 1195 1230 1256 1261 1323 1342 1351 1370 1374 1386 1396 1406 1426 1439 1500 1508 1516 1526 1551 1554 1620 1666 1669 1686 1707 1722 1733 1774 1783 1786 1798 1818 1819 1847 1849 2019 2221 2226 2234 2238 2310 2319 2324 2328 2348 2384 2391 2410 2476 2556 2571 2620 2634 2646 2654 2658 2670 2708 2733 2773 2803 2876 2925 2933 2943 2981 3046 3061 3105 3117 3191 3199 3208 3223 3251 3261 3264 3278 3365 3413 3480 3544 3588 3634 3760 3795 3807 3810 3820 3827 3889 3947 3990 4017 4119 4165 4171 4186 4222 4227 4272 4275 4293 4294 4368 4430 4482 4559 4569 4581 4625 4650 4661 4676 4713 4756 4782 4819 4930 4987 212 856 976 1068 1236 1680 1902 2043 2204 2214 2307 2444 3183 3315 3334 3477 3490 3683 4192 4336 4459 4560 4782 4893 CTCGGAG/CTCCGAG 0 -5 164 162 15 -33.4 29 45 49 58 84 180 303 309 389 471 472 477 520 551 562 606 636 646 681 694 796 812 885 886 904 933 1023 1043 1071 1092 1129 1146 1153 1182 1196 1203 1205 1218 1327 1346 1371 1384 1399 1403 1437 1445 1473 1530 1572 1586 1600 1605 1628 1630 1647 1664 1667 1757 1890 1893 1959 1999 2052 2127 2128 2158 2164 2168 2173 2207 2367 2368 2375 2412 2429 2433 2454 2469 2506 2597 2602 2640 2728 2738 2742 2816 2821 2831 2852 2964 2966 2996 3038 3054 3072 3103 3119 3124 3126 3150 3154 3236 3245 3277 3278 3295 3326 3353 3372 3398 3426 3437 3463 3475 3483 3503 3527 3550 3558 3559 3604 3645 3696 3716 3751 3757 3766 3822 3875 3887 3929 3960 3964 4046 4122 4124 4148 4150 4206 4216 4225 4242 4267 4305 4343 4410 4416 4438 4491 4512 4517 4518 4541 4593 4705 4720 4822 4824 4845 4852 4947 4958 4973 4986 227 430 576 795 1342 1723 2163 2457 2580 2787 2834 3004 4047 4444 4976 TCCGATG/CATCGGA 2 -3 158 162 24 -27.2 60 93 94 118 141 162 190 213 252 264 299 306 314 331 369 463 479 484 553 579 625 630 645 660 678 712 723 724 787 838 958 980 989 1064 1101 1108 1147 1176 1195 1230 1256 1261 1323 1342 1351 1370 1374 1386 1396 1406 1426 1439 1500 1508 1516 1526 1551 1554 1620 1666 1669 1686 1707 1722 1733 1774 1783 1786 1798 1818 1819 1847 1849 2019 2221 2226 2234 2238 2310 2319 2324 2328 2348 2384 2391 2410 2476 2556 2571 2620 2634 2646 2654 2658 2670 2708 2733 2773 2803 2876 2925 2933 2943 2981 3046 3061 3105 3117 3191 3199 3208 3223 3251 3261 3264 3278 3365 3413 3480 3544 3588 3634 3760 3795 3807 3810 3820 3827 3889 3947 3990 4017 4119 4165 4171 4186 4222 4227 4272 4275 4293 4294 4368 4430 4482 4559 4569 4581 4625 4650 4661 4676 4713 4756 4782 4819 4930 4987 212 856 976 1068 1236 1680 1902 2043 2204 2214 2307 2444 3183 3315 3334 3477 3490 3683 4192 4336 4459 4560 4782 4893 CGGCGAT/ATCGCCG 0 -3 162 158 29 -23.4 17 68 157 181 192 212 329 360 364 393 432 448 461 496 506 509 639 703 757 787 791 868 959 1036 1063 1094 1111 1188 1192 1262 1265 1283 1330 1331 1354 1386 1412 1545 1560 1587 1641 1642 1674 1700 1708 1712 1740 1776 1788 1792 1808 1811 1850 1863 1866 1876 1893 1933 1958 1980 2000 2013 2044 2064 2080 2112 2127 2184 2201 2212 2230 2232 2329 2359 2360 2364 2367 2441 2467 2505 2522 2574 2580 2592 2618 2681 2722 2739 2741 2745 2749 2824 2828 2832 2858 2863 2888 2892 2898 2908 2913 2919 2958 3047 3122 3139 3143 3260 3280 3289 3314 3329 3342 3359 3395 3400 3412 3428 3451 3467 3484 3500 3515 3554 3565 3573 3581 3586 3621 3632 3721 3725 3753 3915 3961 3994 4028 4063 4077 4096 4112 4130 4189 4239 4269 4290 4305 4306 4371 4433 4456 4466 4525 4533 4554 4596 4597 4605 4628 4763 4901 4909 166 344 410 423 785 806 857 919 1069 1071 1084 1292 1403 1606 2056 2245 2419 2513 2630 3050 3260 3609 3710 3733 4177 4407 4458 4756 4995 CGGCGAG/CTCGCCG 0 -3 161 153 23 -25.5 50 132 168 200 241 248 252 296 321 359 365 369 447 503 511 555 710 739 752 813 846 890 927 933 982 1058 1106 1140 1171 1199 1228 1244 1261 1294 1431 1459 1527 1559 1562 1565 1605 1652 1754 1763 1784 1828 1855 1862 1897 1905 1954 1973 2044 2062 2103 2105 2143 2171 2184 2209 2216 2231 2246 2340 2387 2411 2421 2434 2435 2442 2448 2460 2466 2520 2528 2585 2612 2628 2732 2735 2740 2744 2764 2766 2827 2882 2891 2913 2923 2991 2999 3002 3018 3063 3073 3080 3089 3114 3173 3224 3237 3282 3287 3320 3322 3324 3325 3349 3354 3403 3416 3456 3472 3509 3513 3519 3542 3571 3668 3755 3777 3794 3806 3820 3836 3882 3923 4019 4044 4087 4104 4139 4149 4151 4192 4208 4247 4251 4334 4341 4428 4450 4524 4542 4543 4605 4607 4640 4692 4730 4747 4772 4779 4785 4790 4806 4854 4878 4892 4919 4986 486 993 1174 1328 1453 1547 2083 2106 2121 2257 2291 2444 2796 2799 2948 3375 3609 3970 4073 4350 4623 4730 4823 CACCGGA/TCCGGTG 0 -6 153 150 33 -19.6 85 135 159 164 252 258 286 288 304 344 356 444 457 485 492 603 639 642 648 736 753 847 877 886 890 914 939 980 1020 1130 1148 1179 1182 1192 1266 1319 1334 1384 1409 1499 1514 1555 1561 1571 1578 1620 1628 1650 1651 1669 1686 1720 1741 1749 1851 1867 1873 1943 1965 1990 2003 2064 2078 2082 2086 2210 2223 2324 2331 2334 2338 2415 2416 2438 2487 2523 2532 2533 2585 2593 2630 2673 2683 2703 2740 2752 2771 2773 2835 2869 2882 2890 2900 2922 2930 3021 3030 3059 3067 3086 3122 3139 3148 3161 3258 3317 3442 3499 3553 3585 3621 3631 3644 3662 3717 3728 3739 3781 3797 3800 3836 3841 3849 3874 3880 3905 3908 3948 3961 3985 3990 3996 4017 4070 4072 4105 4114 4160 4165 4401 4435 4523 4557 4602 4615 4660 4732 4790 4853 4875 4927 4932 4994 194 303 385 427 503 636 750 804 858 995 1543 1715 1778 2137 2215 2415 2507 2513 2796 3038 3069 3125 3219 3260 3395 4097 4177 4585 4679 4733 4835 4901 4933 ATCGGCG/CGCCGAT 0 -5 149 149 11 -33.2 32 55 114 116 185 200 204 255 299 334 357 369 405 419 441 448 493 513 541 621 672 680 681 739 761 769 842 844 939 940 955 959 1073 1110 1181 1188 1222 1235 1241 1269 1304 1390 1421 1431 1435 1459 1545 1546 1569 1768 1784 1792 1802 1826 1873 1902 1930 1933 2092 2120 2127 2141 2201 2221 2268 2276 2296 2311 2315 2366 2412 2467 2505 2548 2558 2583 2727 2739 2758 2766 2771 2836 2845 2868 2879 2891 2892 2898 2919 2921 2951 3022 3043 3089 3159 3173 3176 3185 3219 3224 3240 3306 3318 3355 3393 3489 3513 3515 3542 3551 3565 3579 3594 3699 3704 3782 3798 3804 3857 3889 3892 3961 3972 3984 4012 4044 4097 4104 4136 4190 4208 4251 4344 4362 4428 4528 4627 4640 4687 4691 4739 4793 4810 4857 4901 4906 4941 4946 4976 86 166 599 1061 1656 1919 2198 2444 3702 4865 4995 ACGACGG/CCGTCGT 1 -5 147 148 18 -27.5 32 45 47 78 132 162 181 209 230 236 249 259 271 341 412 469 486 510 531 626 655 663 683 709 718 732 802 813 856 864 918 973 979 1128 1131 1135 1214 1324 1373 1375 1479 1486 1561 1606 1634 1670 1677 1682 1694 1713 1766 1840 1859 1879 1888 1905 1944 1960 2000 2011 2022 2098 2116 2120 2165 2167 2193 2195 2200 2205 2236 2372 2376 2394 2406 2423 2442 2502 2526 2538 2595 2632 2769 2801 2844 2846 2900 2937 3038 3064 3082 3105 3138 3144 3164 3228 3234 3245 3281 3314 3329 3358 3364 3370 3390 3451 3544 3587 3592 3615 3616 3631 3661 3688 3737 3802 3827 3878 3888 3941 3963 4011 4018 4022 4037 4157 4168 4200 4312 4328 4368 4434 4449 4473 4505 4511 4530 4531 4551 4661 4671 4729 4768 4836 4898 4923 4994 234 267 423 774 834 978 1174 1206 1226 1905 2310 2351 2436 2446 2841 3760 3943 4729 AGACGGA/TCCGTCT 0 -6 141 147 27 -21.8 0 26 33 41 43 46 55 107 131 143 167 319 323 361 368 400 417 470 493 520 522 563 622 635 642 690 693 764 777 805 851 874 911 920 968 1042 1094 1128 1139 1164 1174 1210 1249 1259 1320 1329 1342 1354 1408 1419 1491 1573 1609 1710 1769 1794 1796 1842 1908 1913 1933 1970 1972 1991 2073 2075 2113 2140 2144 2251 2254 2334 2430 2488 2509 2561 2573 2623 2631 2681 2689 2730 2817 2934 3064 3070 3081 3116 3173 3213 3233 3250 3254 3262 3263 3315 3412 3495 3505 3511 3590 3622 3626 3762 3784 3806 3835 3855 3873 3881 3895 3978 4042 4098 4128 4158 4173 4290 4338 4345 4346 4370 4420 4426 4488 4497 4509 4536 4591 4605 4614 4675 4683 4702 4712 4821 4833 4838 4875 4905 4946 303 326 537 601 606 649 693 1043 1068 1347 1430 1512 1523 1547 2010 2274 2286 3128 3285 3311 3504 3935 4014 4133 4546 4756 4794 AGACGGA/TCCGTCT 1 -4 141 147 27 -21.8 0 26 33 41 43 46 55 107 131 143 167 319 323 361 368 400 417 470 493 520 522 563 622 635 642 690 693 764 777 805 851 874 911 920 968 1042 1094 1128 1139 1164 1174 1210 1249 1259 1320 1329 1342 1354 1408 1419 1491 1573 1609 1710 1769 1794 1796 1842 1908 1913 1933 1970 1972 1991 2073 2075 2113 2140 2144 2251 2254 2334 2430 2488 2509 2561 2573 2623 2631 2681 2689 2730 2817 2934 3064 3070 3081 3116 3173 3213 3233 3250 3254 3262 3263 3315 3412 3495 3505 3511 3590 3622 3626 3762 3784 3806 3835 3855 3873 3881 3895 3978 4042 4098 4128 4158 4173 4290 4338 4345 4346 4370 4420 4426 4488 4497 4509 4536 4591 4605 4614 4675 4683 4702 4712 4821 4833 4838 4875 4905 4946 303 326 537 601 606 649 693 1043 1068 1347 1430 1512 1523 1547 2010 2274 2286 3128 3285 3311 3504 3935 4014 4133 4546 4756 4794 TTCCGGC/GCCGGAA 0 -6 147 146 19 -26.3 17 161 187 212 308 316 318 329 335 350 364 417 445 503 560 577 597 642 680 686 689 703 710 754 813 832 839 890 892 971 1003 1063 1125 1126 1164 1213 1225 1263 1276 1283 1332 1341 1363 1386 1439 1479 1504 1612 1654 1672 1673 1754 1789 1835 1855 1863 1866 1897 1928 1938 1958 1985 2062 2064 2080 2116 2131 2162 2173 2231 2246 2298 2351 2421 2435 2464 2475 2514 2564 2585 2612 2678 2695 2740 2744 2792 2844 2908 2913 3014 3098 3198 3280 3319 3325 3329 3429 3500 3508 3531 3564 3565 3586 3637 3668 3723 3728 3735 3754 3811 3816 3824 3826 3915 3967 3975 4023 4040 4074 4075 4169 4177 4189 4236 4273 4290 4314 4329 4450 4456 4482 4520 4553 4554 4555 4562 4594 4639 4707 4757 4772 4809 4850 4862 4909 4944 4953 3 296 444 492 806 1161 1607 2108 2185 2257 2406 2419 2589 2881 3062 3441 3503 3657 4249 GCCGGAA/TTCCGGC 1 -3 147 146 19 -26.3 17 161 187 212 308 316 318 329 335 350 364 417 445 503 560 577 597 642 680 686 689 703 710 754 813 832 839 890 892 971 1003 1063 1125 1126 1164 1213 1225 1263 1276 1283 1332 1341 1363 1386 1439 1479 1504 1612 1654 1672 1673 1754 1789 1835 1855 1863 1866 1897 1928 1938 1958 1985 2062 2064 2080 2116 2131 2162 2173 2231 2246 2298 2351 2421 2435 2464 2475 2514 2564 2585 2612 2678 2695 2740 2744 2792 2844 2908 2913 3014 3098 3198 3280 3319 3325 3329 3429 3500 3508 3531 3564 3565 3586 3637 3668 3723 3728 3735 3754 3811 3816 3824 3826 3915 3967 3975 4023 4040 4074 4075 4169 4177 4189 4236 4273 4290 4314 4329 4450 4456 4482 4520 4553 4554 4555 4562 4594 4639 4707 4757 4772 4809 4850 4862 4909 4944 4953 3 296 444 492 806 1161 1607 2108 2185 2257 2406 2419 2589 2881 3062 3441 3503 3657 4249 TTCGGAG/CTCCGAA 0 -5 142 139 21 -23.3 77 122 133 151 158 182 233 338 358 375 379 421 454 485 543 560 570 606 609 644 684 742 746 767 778 798 814 837 892 950 974 998 1011 1014 1030 1079 1115 1180 1270 1358 1376 1517 1585 1661 1679 1690 1721 1748 1758 1817 1839 1910 1919 1990 1991 2024 2026 2030 2140 2183 2192 2231 2233 2355 2391 2450 2457 2478 2500 2617 2656 2764 2809 2814 2818 2960 2980 2990 3019 3022 3093 3115 3131 3141 3169 3291 3304 3331 3335 3371 3381 3421 3430 3461 3462 3501 3548 3549 3581 3596 3609 3625 3652 3655 3658 3659 3667 3728 3743 3796 3817 3828 3867 3910 3922 3956 3974 4059 4077 4083 4152 4180 4277 4280 4442 4458 4482 4643 4741 4820 4835 4886 4888 4892 4904 4913 4919 4932 4965 4973 4990 4996 58 93 417 776 837 862 1302 2176 2333 2375 2505 2581 2608 2731 2967 3154 3336 3637 3796 4160 4441 TCGGAGG/CCTCCGA 0 -4 142 138 17 -25.6 161 216 292 303 363 368 385 458 466 504 530 553 588 598 679 752 779 780 796 988 1025 1038 1142 1182 1197 1218 1230 1261 1351 1362 1403 1439 1492 1526 1528 1532 1534 1546 1605 1619 1647 1756 1773 1777 1783 1816 1832 1847 1891 1917 1931 1943 1979 1991 2030 2051 2058 2128 2149 2199 2203 2206 2221 2249 2288 2320 2326 2337 2351 2361 2450 2462 2468 2485 2504 2547 2556 2624 2634 2654 2720 2747 2752 2807 2826 2839 2888 2914 2962 2974 3051 3054 3073 3091 3104 3107 3115 3209 3217 3248 3266 3378 3405 3425 3493 3527 3538 3576 3591 3634 3688 3807 3818 3822 3876 3929 3950 3990 3994 4009 4058 4166 4222 4224 4272 4277 4278 4281 4352 4445 4482 4515 4555 4570 4573 4623 4625 4782 4865 4884 4973 4995 58 348 564 1866 2009 2154 2163 2227 2457 2849 3053 3125 3154 3590 3743 4573 4668 CGTCGGA/TCCGACG 0 -6 139 136 23 -21.4 34 45 46 54 103 199 216 277 394 433 470 509 558 593 598 663 721 729 752 779 900 926 951 980 1127 1142 1292 1318 1324 1347 1354 1356 1362 1364 1388 1410 1420 1495 1532 1538 1565 1619 1687 1704 1756 1817 1917 1985 1990 2042 2051 2070 2163 2178 2233 2245 2297 2324 2336 2338 2390 2408 2418 2450 2462 2510 2564 2566 2619 2659 2705 2726 2815 2826 2886 2925 2926 2930 2933 3001 3051 3075 3076 3098 3106 3158 3177 3221 3234 3254 3265 3317 3320 3371 3394 3443 3480 3542 3651 3689 3815 3818 3822 3844 3864 3876 3936 3968 3979 3994 4028 4043 4060 4061 4166 4177 4223 4278 4362 4363 4398 4473 4488 4511 4537 4590 4638 4639 4658 4708 4728 4760 4799 4826 4830 4865 4944 4955 4991 303 461 502 693 1612 1901 1902 1965 2008 2205 2244 2335 2424 2737 2849 2881 2888 3578 3580 4042 4052 4289 4901 GGAGATC/GATCTCC 0 -2 133 136 23 -21.4 14 17 60 80 167 173 227 235 254 303 388 432 478 559 582 587 596 639 675 685 687 742 771 850 872 886 903 914 918 1007 1027 1040 1043 1054 1060 1120 1134 1143 1179 1211 1327 1337 1374 1381 1409 1464 1467 1525 1526 1536 1686 1689 1717 1721 1807 1876 1924 1943 1949 1990 2003 2013 2052 2056 2124 2131 2132 2169 2195 2236 2249 2331 2410 2578 2611 2619 2681 2715 2746 2787 2964 3006 3057 3089 3142 3178 3189 3201 3246 3366 3475 3485 3533 3542 3548 3580 3631 3720 3777 3800 3855 3867 3925 3964 3992 4078 4105 4129 4179 4186 4329 4339 4346 4379 4382 4421 4476 4505 4544 4569 4628 4631 4637 4658 4690 4697 4742 4818 4821 4895 4905 4918 4984 237 427 594 1180 1187 1751 1752 2136 2570 2729 2968 3368 3423 3488 3948 4066 4220 4291 4297 4329 4565 4710 4903 CGTCGGA/TCCGACG 1 -4 139 136 23 -21.4 34 45 46 54 103 199 216 277 394 433 470 509 558 593 598 663 721 729 752 779 900 926 951 980 1127 1142 1292 1318 1324 1347 1354 1356 1362 1364 1388 1410 1420 1495 1532 1538 1565 1619 1687 1704 1756 1817 1917 1985 1990 2042 2051 2070 2163 2178 2233 2245 2297 2324 2336 2338 2390 2408 2418 2450 2462 2510 2564 2566 2619 2659 2705 2726 2815 2826 2886 2925 2926 2930 2933 3001 3051 3075 3076 3098 3106 3158 3177 3221 3234 3254 3265 3317 3320 3371 3394 3443 3480 3542 3651 3689 3815 3818 3822 3844 3864 3876 3936 3968 3979 3994 4028 4043 4060 4061 4166 4177 4223 4278 4362 4363 4398 4473 4488 4511 4537 4590 4638 4639 4658 4708 4728 4760 4799 4826 4830 4865 4944 4955 4991 303 461 502 693 1612 1901 1902 1965 2008 2205 2244 2335 2424 2737 2849 2881 2888 3578 3580 4042 4052 4289 4901 ACGGAGG/CCTCCGT 0 -4 133 133 24 -20.1 53 107 110 131 207 250 297 310 341 349 361 413 510 563 576 602 603 618 634 638 652 687 777 796 805 872 880 889 911 1097 1128 1137 1139 1154 1190 1242 1259 1271 1372 1401 1415 1491 1634 1656 1804 1806 1819 1826 1836 1837 1888 1905 1907 1944 1960 1991 2014 2073 2097 2144 2200 2254 2298 2334 2363 2376 2403 2406 2454 2526 2551 2561 2597 2689 2709 2855 2871 2885 2934 2977 3006 3008 3052 3064 3070 3123 3129 3218 3228 3229 3237 3254 3259 3263 3267 3321 3345 3510 3544 3610 3622 3657 3661 3754 3813 3819 3827 3885 3892 3895 3938 3966 4059 4124 4168 4173 4267 4290 4345 4404 4413 4420 4575 4591 4676 4724 4729 4738 4833 4838 4875 4921 4931 234 307 503 1018 1068 1545 2242 2266 2316 2352 2841 3061 3127 3128 3211 3449 3578 4140 4194 4490 4546 4710 4932 4942 ACGGAGG/CCTCCGT 1 -2 133 133 24 -20.1 53 107 110 131 207 250 297 310 341 349 361 413 510 563 576 602 603 618 634 638 652 687 777 796 805 872 880 889 911 1097 1128 1137 1139 1154 1190 1242 1259 1271 1372 1401 1415 1491 1634 1656 1804 1806 1819 1826 1836 1837 1888 1905 1907 1944 1960 1991 2014 2073 2097 2144 2200 2254 2298 2334 2363 2376 2403 2406 2454 2526 2551 2561 2597 2689 2709 2855 2871 2885 2934 2977 3006 3008 3052 3064 3070 3123 3129 3218 3228 3229 3237 3254 3259 3263 3267 3321 3345 3510 3544 3610 3622 3657 3661 3754 3813 3819 3827 3885 3892 3895 3938 3966 4059 4124 4168 4173 4267 4290 4345 4404 4413 4420 4575 4591 4676 4724 4729 4738 4833 4838 4875 4921 4931 234 307 503 1018 1068 1545 2242 2266 2316 2352 2841 3061 3127 3128 3211 3449 3578 4140 4194 4490 4546 4710 4932 4942 TCGGAGT/ACTCCGA 0 -4 133 132 18 -23.4 34 37 46 52 122 190 309 314 423 463 484 508 547 563 564 606 665 759 767 775 782 812 820 825 881 887 933 958 983 1014 1075 1115 1270 1290 1318 1342 1349 1356 1371 1396 1426 1484 1500 1510 1516 1530 1538 1661 1667 1733 1736 1818 1891 1985 2024 2032 2111 2157 2190 2226 2310 2348 2363 2390 2412 2469 2653 2661 2726 2745 2751 2816 2887 2896 2961 2969 3067 3071 3076 3092 3135 3169 3190 3199 3223 3246 3248 3340 3355 3395 3413 3503 3581 3604 3645 3689 3691 3707 3709 3711 3716 3728 3729 3746 3842 3843 3969 4031 4086 4148 4167 4223 4242 4362 4363 4442 4478 4487 4512 4521 4537 4577 4581 4593 4615 4632 4653 4674 4693 4727 4904 4918 4996 93 317 430 576 605 837 1286 1342 2450 2580 2608 2834 2921 3183 3336 3441 4336 4995 GAGACGG/CCGTCTC 0 -7 123 131 26 -18.6 0 13 26 33 46 51 68 123 131 167 239 271 319 328 361 417 470 475 520 551 622 630 635 642 680 748 764 777 805 874 900 968 982 1128 1141 1162 1174 1205 1249 1272 1342 1354 1408 1491 1520 1542 1740 1751 1769 1842 1857 1911 1913 1972 1991 2073 2113 2140 2144 2173 2251 2254 2259 2286 2300 2319 2334 2382 2389 2408 2412 2430 2479 2552 2621 2623 2670 2689 2730 2741 2744 2759 2779 2891 2919 2934 3070 3081 3173 3229 3250 3263 3353 3458 3495 3497 3511 3615 3767 3781 3806 3855 3873 3978 4042 4066 4098 4290 4345 4351 4374 4497 4591 4594 4605 4675 4712 4713 4821 4833 4855 4887 4905 38 537 649 696 1019 1347 1382 1430 1493 1512 1523 1547 1770 1852 1957 2010 2274 2465 2664 2675 3038 3366 3426 3504 3933 4546 GAGACGG/CCGTCTC 1 -5 123 131 26 -18.6 0 13 26 33 46 51 68 123 131 167 239 271 319 328 361 417 470 475 520 551 622 630 635 642 680 748 764 777 805 874 900 968 982 1128 1141 1162 1174 1205 1249 1272 1342 1354 1408 1491 1520 1542 1740 1751 1769 1842 1857 1911 1913 1972 1991 2073 2113 2140 2144 2173 2251 2254 2259 2286 2300 2319 2334 2382 2389 2408 2412 2430 2479 2552 2621 2623 2670 2689 2730 2741 2744 2759 2779 2891 2919 2934 3070 3081 3173 3229 3250 3263 3353 3458 3495 3497 3511 3615 3767 3781 3806 3855 3873 3978 4042 4066 4098 4290 4345 4351 4374 4497 4591 4594 4605 4675 4712 4713 4821 4833 4855 4887 4905 38 537 649 696 1019 1347 1382 1430 1493 1512 1523 1547 1770 1852 1957 2010 2274 2465 2664 2675 3038 3366 3426 3504 3933 4546 TCATCGG/CCGATGA 0 -7 127 128 20 -21.1 47 55 94 107 118 141 162 190 220 294 299 306 331 463 484 513 573 607 655 678 712 749 767 787 958 980 998 1108 1230 1256 1261 1307 1323 1342 1351 1370 1395 1406 1423 1500 1516 1526 1551 1620 1691 1722 1733 1774 1783 1798 1818 1819 1847 1849 1852 1933 2019 2221 2226 2234 2237 2238 2268 2319 2324 2381 2391 2485 2505 2571 2620 2634 2658 2733 2803 2868 2876 2892 2903 2925 2933 3046 3105 3176 3208 3223 3306 3413 3469 3489 3588 3634 3651 3693 3704 3820 3827 3857 3947 3984 3990 4115 4141 4165 4171 4186 4222 4227 4272 4275 4294 4368 4430 4435 4528 4559 4650 4661 4676 4687 4713 4764 4793 4879 4930 4941 4987 599 842 857 976 1068 1168 1292 1680 1688 1751 2307 3314 3315 3334 3490 3962 4336 4782 4858 4893 CCGATGA/TCATCGG 2 -2 127 128 20 -21.1 47 55 94 107 118 141 162 190 220 294 299 306 331 463 484 513 573 607 655 678 712 749 767 787 958 980 998 1108 1230 1256 1261 1307 1323 1342 1351 1370 1395 1406 1423 1500 1516 1526 1551 1620 1691 1722 1733 1774 1783 1798 1818 1819 1847 1849 1852 1933 2019 2221 2226 2234 2237 2238 2268 2319 2324 2381 2391 2485 2505 2571 2620 2634 2658 2733 2803 2868 2876 2892 2903 2925 2933 3046 3105 3176 3208 3223 3306 3413 3469 3489 3588 3634 3651 3693 3704 3820 3827 3857 3947 3984 3990 4115 4141 4165 4171 4186 4222 4227 4272 4275 4294 4368 4430 4435 4528 4559 4650 4661 4676 4687 4713 4764 4793 4879 4930 4941 4987 599 842 857 976 1068 1168 1292 1680 1688 1751 2307 3314 3315 3334 3490 3962 4336 4782 4858 4893 CGATGAA/TTCATCG 2 -1 124 126 35 -13.6 111 118 190 218 220 233 242 287 294 345 409 463 536 607 655 678 703 767 783 836 856 899 943 950 958 971 980 1003 1050 1063 1094 1163 1204 1236 1256 1261 1265 1267 1316 1423 1516 1526 1551 1593 1620 1712 1738 1774 1807 1818 1819 1826 1849 1852 1928 1972 1980 2025 2037 2226 2234 2292 2311 2319 2369 2372 2378 2391 2551 2634 2638 2670 2685 2730 2803 2835 2849 2903 2911 2967 3029 3046 3080 3105 3156 3176 3178 3208 3306 3413 3469 3489 3498 3526 3578 3586 3645 3693 3801 3820 3822 3880 3944 3947 3984 4062 4115 4117 4165 4219 4286 4314 4361 4368 4534 4559 4683 4764 4827 4843 4850 4901 4930 4941 461 534 599 610 612 1028 1168 1354 1473 1475 1571 1593 1709 2056 2459 2669 2672 2891 3282 3315 3334 3627 3635 3960 4177 4262 4336 4394 4638 4687 4808 4856 4945 4953 4969 TCCGGAG/CTCCGGA 0 -5 128 122 9 -27.5 94 125 157 163 178 422 456 559 610 628 667 722 789 806 850 889 910 972 994 1016 1029 1039 1173 1251 1282 1313 1333 1373 1374 1429 1507 1570 1572 1574 1617 1647 1663 1695 1745 1755 1829 1854 1871 1903 1924 1926 1947 1976 2038 2085 2094 2113 2119 2128 2149 2162 2189 2297 2300 2331 2495 2498 2552 2577 2613 2654 2672 2706 2770 2779 2844 2876 2922 2923 2928 2935 2997 3001 3123 3140 3149 3155 3318 3408 3409 3466 3467 3549 3596 3690 3720 3724 3860 3916 3962 3981 4017 4020 4045 4184 4196 4226 4258 4284 4294 4297 4301 4333 4350 4380 4382 4397 4468 4497 4512 4547 4624 4735 4762 4780 4803 4814 4872 4885 4891 4946 4951 4975 260 390 688 1068 1722 1795 2311 2599 3138 GACGGAA/TTCCGTC 1 -3 119 119 14 -22.7 26 31 46 54 55 135 196 209 280 355 384 484 520 642 656 693 783 856 858 918 1044 1145 1151 1210 1219 1248 1308 1342 1354 1367 1530 1536 1552 1562 1565 1573 1587 1610 1670 1694 1747 1767 1769 1884 1898 1904 1933 2022 2034 2098 2116 2152 2186 2239 2390 2476 2507 2510 2535 2580 2637 2649 2658 2680 2681 2765 2798 2805 2819 2875 2880 2939 2942 3023 3064 3116 3138 3173 3219 3370 3389 3431 3511 3610 3668 3688 3717 3737 3755 3783 3787 3878 3903 3916 3920 3923 3955 3963 4022 4033 4039 4170 4198 4326 4368 4370 4372 4381 4473 4505 4537 4614 4626 4654 4702 4712 4868 4946 4952 267 303 649 693 820 1126 1347 1430 1512 1850 2088 3285 4677 4794 GCGGAGG/CCTCCGC 0 -4 123 118 13 -23.1 32 78 137 166 243 269 282 419 467 493 545 549 657 663 788 792 884 911 920 959 1038 1106 1134 1151 1175 1253 1257 1272 1301 1325 1328 1405 1480 1522 1546 1550 1559 1632 1696 1697 1754 1777 1895 2020 2076 2135 2146 2156 2217 2235 2238 2246 2270 2286 2425 2431 2528 2542 2673 2685 2714 2783 2833 2859 2861 2864 3066 3103 3134 3202 3258 3259 3362 3365 3389 3433 3440 3447 3457 3478 3570 3610 3629 3661 3676 3695 3773 3814 3833 3863 3886 3892 3895 3987 4024 4041 4075 4092 4101 4106 4108 4123 4131 4149 4154 4269 4320 4339 4350 4419 4474 4489 4503 4529 4546 4602 4604 4609 4612 4649 4711 4751 4931 354 1111 1302 1426 1493 2193 2891 3037 3202 3228 3908 4360 4407 AGCGGCG/CGCCGCT 0 -5 119 115 7 -27.4 236 241 283 461 480 511 721 868 879 893 908 910 913 959 978 1071 1076 1117 1140 1150 1185 1208 1257 1258 1264 1385 1395 1412 1421 1434 1451 1482 1527 1601 1641 1642 1677 1712 1726 1751 1756 1777 1811 1815 1829 1856 1862 1909 1911 2092 2112 2113 2115 2145 2164 2202 2365 2394 2425 2485 2609 2634 2749 2750 2782 2825 2832 2898 2937 3046 3097 3114 3137 3161 3188 3195 3220 3237 3267 3349 3360 3363 3456 3500 3519 3522 3609 3678 3680 3836 3844 3855 3865 3928 3938 3951 3966 3975 4023 4081 4100 4120 4136 4215 4230 4335 4440 4524 4539 4552 4607 4651 4662 4669 4724 4740 4767 4790 4921 231 275 794 3069 4574 4835 4902 CGGCGGC/GCCGCCG 0 -3 125 115 26 -15.0 72 82 103 167 172 222 256 310 748 754 769 868 908 978 1028 1169 1246 1264 1269 1353 1412 1451 1523 1527 1641 1651 1685 1724 1726 1740 1776 1777 1811 1835 1865 1882 1905 1952 2033 2048 2064 2103 2120 2209 2219 2221 2246 2270 2302 2382 2387 2431 2485 2548 2595 2616 2634 2678 2723 2749 2750 2758 2828 2909 2951 2991 2998 3014 3043 3172 3232 3253 3260 3268 3363 3369 3449 3586 3615 3633 3704 3753 3774 3781 3855 3857 3877 3906 3972 3973 3979 3994 3996 4003 4010 4023 4061 4075 4097 4130 4139 4157 4190 4210 4219 4277 4341 4351 4352 4398 4444 4454 4482 4504 4524 4551 4573 4661 4663 4692 4752 4802 4906 4915 4919 12 231 233 275 325 437 459 751 1302 1398 1721 1790 1795 1840 2184 2549 2663 2842 3513 3657 3789 3970 4350 4600 4835 4931 TGATCGG/CCGATCA 0 -7 113 115 20 -18.0 114 161 195 255 259 268 292 303 306 343 458 468 477 484 539 590 617 618 672 707 840 945 985 1045 1061 1069 1110 1114 1141 1146 1170 1183 1241 1329 1341 1342 1421 1444 1589 1621 1727 1752 1775 1915 1961 1996 2063 2147 2161 2194 2199 2281 2329 2339 2366 2421 2424 2455 2470 2471 2485 2599 2605 2621 2720 2745 2826 2873 2961 2962 3060 3065 3078 3091 3094 3111 3133 3217 3269 3275 3374 3479 3487 3499 3512 3542 3577 3628 3686 3711 3767 3826 3884 3920 3938 3945 3961 4010 4046 4062 4078 4102 4159 4184 4251 4293 4302 4373 4456 4487 4677 4924 4943 120 135 564 931 982 1501 1633 1691 1692 1866 1962 2104 2129 2174 2670 3004 3165 3223 3231 4741 GGAGACA/TGTCTCC 0 -2 113 112 30 -12.6 45 73 77 104 155 295 327 344 401 422 447 464 482 503 551 658 687 762 786 802 853 902 917 968 975 989 1022 1095 1131 1136 1189 1206 1259 1350 1375 1420 1468 1479 1537 1584 1585 1587 1718 1770 1893 1978 2016 2018 2108 2281 2300 2321 2330 2353 2384 2643 2694 2725 2831 3012 3105 3119 3123 3127 3146 3147 3213 3221 3264 3358 3385 3496 3569 3580 3585 3602 3618 3644 3648 3687 3706 3767 3843 3884 3970 3974 3976 4088 4092 4093 4160 4177 4181 4187 4214 4215 4216 4246 4447 4493 4527 4616 4646 4662 4670 4713 4724 4725 4816 4821 4871 4935 4984 228 658 829 862 905 917 1413 1433 1514 1668 1817 1903 2190 2510 2541 2893 2916 2985 3068 3149 3162 3851 3973 4165 4230 4266 4523 4554 4928 4933 GGCGGCG/CGCCGCC 0 -2 119 111 25 -14.5 72 82 167 206 222 252 256 439 754 769 868 908 927 1028 1095 1192 1246 1261 1264 1269 1294 1328 1353 1412 1451 1523 1527 1632 1641 1651 1724 1726 1740 1776 1777 1811 1846 1865 1876 1879 1886 1952 2033 2048 2103 2117 2209 2219 2221 2246 2270 2387 2428 2431 2485 2595 2634 2658 2678 2698 2749 2750 2828 2885 2909 2991 3014 3026 3036 3080 3182 3227 3253 3260 3301 3369 3433 3449 3583 3586 3615 3632 3633 3753 3855 3857 3973 3979 3987 3994 4003 4061 4096 4097 4130 4139 4149 4190 4210 4212 4219 4247 4311 4339 4341 4350 4444 4482 4486 4535 4663 4692 4752 4802 4880 4906 4919 4944 4989 12 96 231 325 437 751 926 993 1302 1398 1790 1795 2184 2443 2549 2663 2842 3142 3513 3657 3675 4350 4600 4784 4835 CGGAGTT/AACTCCG 0 -3 117 110 24 -14.8 1 4 37 164 190 259 396 456 550 622 628 675 775 812 979 983 1106 1193 1345 1353 1356 1373 1377 1426 1450 1499 1500 1530 1538 1567 1569 1647 1661 1733 1827 1906 1908 1950 2032 2100 2111 2190 2341 2342 2363 2396 2412 2528 2586 2653 2661 2689 2712 2745 2760 2862 2887 2896 2930 2961 2969 3027 3067 3135 3169 3223 3318 3397 3420 3422 3454 3471 3574 3581 3647 3648 3691 3707 3709 3716 3723 3736 3780 3842 3843 3934 3969 4115 4130 4148 4167 4240 4262 4310 4352 4362 4363 4377 4382 4397 4481 4521 4536 4537 4556 4577 4588 4674 4693 4696 4701 4757 4804 4806 4870 4902 4969 208 303 317 430 456 576 600 605 837 1286 1342 2307 2406 2447 2580 2599 2921 3010 3142 4460 4761 4819 4920 4933 CGGAGTT/AACTCCG 1 -1 117 110 24 -14.8 1 4 37 164 190 259 396 456 550 622 628 675 775 812 979 983 1106 1193 1345 1353 1356 1373 1377 1426 1450 1499 1500 1530 1538 1567 1569 1647 1661 1733 1827 1906 1908 1950 2032 2100 2111 2190 2341 2342 2363 2396 2412 2528 2586 2653 2661 2689 2712 2745 2760 2862 2887 2896 2930 2961 2969 3027 3067 3135 3169 3223 3318 3397 3420 3422 3454 3471 3574 3581 3647 3648 3691 3707 3709 3716 3723 3736 3780 3842 3843 3934 3969 4115 4130 4148 4167 4240 4262 4310 4352 4362 4363 4377 4382 4397 4481 4521 4536 4537 4556 4577 4588 4674 4693 4696 4701 4757 4804 4806 4870 4902 4969 208 303 317 430 456 576 600 605 837 1286 1342 2307 2406 2447 2580 2599 2921 3010 3142 4460 4761 4819 4920 4933 CGGAGGT/ACCTCCG 0 -3 109 108 13 -20.5 53 72 107 137 161 166 303 419 458 602 634 752 846 884 889 920 988 1028 1058 1139 1142 1151 1228 1282 1301 1351 1415 1491 1514 1528 1534 1546 1572 1605 1634 1647 1763 1773 1804 1806 1917 1947 2058 2089 2113 2156 2221 2268 2300 2326 2334 2337 2340 2351 2361 2376 2425 2480 2526 2542 2547 2556 2747 2752 2826 2839 2844 2871 2934 2974 2977 3070 3103 3123 3202 3209 3237 3254 3258 3263 3321 3345 3348 3425 3433 3570 3622 3688 3773 3819 3863 3941 3990 4045 4108 4168 4196 4222 4281 4297 4350 4419 4573 4724 4729 4751 4782 4838 4921 250 260 348 978 995 1161 1426 2193 2457 3578 3743 4360 4942 GAATCGG/CCGATTC 0 -7 109 107 25 -13.7 37 148 313 357 393 397 426 448 455 458 516 558 605 704 714 739 834 887 896 938 954 957 983 1018 1075 1110 1114 1166 1253 1303 1330 1422 1443 1480 1524 1676 1838 1851 1891 1902 2032 2083 2084 2141 2221 2241 2351 2382 2385 2394 2398 2437 2495 2518 2611 2639 2644 2645 2653 2657 2752 2753 2835 2839 2879 2896 2964 2992 3098 3108 3139 3141 3173 3183 3191 3218 3244 3371 3402 3444 3563 3683 3804 3806 3911 4012 4055 4167 4279 4290 4310 4329 4340 4361 4403 4465 4481 4606 4619 4623 4632 4658 4800 4809 4820 4826 4850 4869 4884 166 333 348 598 816 1220 1237 1430 1591 2272 2437 2729 2965 3062 3491 3727 3905 4119 4195 4234 4515 4573 4811 4887 4995 GACGGCG/CGCCGTC 0 -5 107 107 25 -13.7 68 132 162 181 241 310 461 486 497 545 551 663 698 735 738 752 811 877 945 956 982 1007 1121 1131 1180 1189 1253 1266 1272 1324 1375 1520 1641 1726 1740 1751 1756 1811 1817 1859 1872 1911 1961 2011 2020 2077 2103 2105 2151 2167 2204 2205 2232 2261 2389 2394 2466 2528 2621 2669 2770 2827 2844 2846 2875 3097 3103 3139 3144 3229 3254 3262 3329 3353 3369 3395 3451 3458 3509 3539 3668 3767 3811 3836 3846 3917 3939 3947 3954 3994 4026 4028 4037 4069 4214 4253 4277 4312 4351 4551 4554 4579 4583 4621 4713 4747 4847 12 109 200 233 423 521 978 1106 1174 1236 2056 2106 2257 2273 2291 2310 2351 2549 2796 2948 3789 4407 4525 4724 4729 GACGGCG/CGCCGTC 1 -3 107 107 25 -13.7 68 132 162 181 241 310 461 486 497 545 551 663 698 735 738 752 811 877 945 956 982 1007 1121 1131 1180 1189 1253 1266 1272 1324 1375 1520 1641 1726 1740 1751 1756 1811 1817 1859 1872 1911 1961 2011 2020 2077 2103 2105 2151 2167 2204 2205 2232 2261 2389 2394 2466 2528 2621 2669 2770 2827 2844 2846 2875 3097 3103 3139 3144 3229 3254 3262 3329 3353 3369 3395 3451 3458 3509 3539 3668 3767 3811 3836 3846 3917 3939 3947 3954 3994 4026 4028 4037 4069 4214 4253 4277 4312 4351 4551 4554 4579 4583 4621 4713 4747 4847 12 109 200 233 423 521 978 1106 1174 1236 2056 2106 2257 2273 2291 2310 2351 2549 2796 2948 3789 4407 4525 4724 4729 TCGTCGG/CCGACGA 1 -5 112 107 21 -15.5 45 77 157 199 214 352 353 394 514 574 721 729 779 805 926 951 980 1142 1162 1280 1292 1324 1353 1354 1356 1410 1538 1673 1718 1789 1817 1859 1892 1990 2042 2051 2061 2178 2206 2233 2297 2324 2336 2408 2442 2448 2450 2462 2473 2522 2564 2566 2593 2619 2659 2715 2740 2826 2886 2891 2908 2925 3001 3045 3076 3080 3097 3106 3107 3177 3221 3234 3261 3320 3371 3394 3480 3542 3651 3689 3719 3818 3822 3844 3864 3876 3888 3918 3979 4043 4060 4082 4139 4166 4223 4278 4332 4362 4363 4412 4414 4431 4444 4543 4639 4728 4749 4799 4805 4826 4874 4991 67 167 303 461 522 711 1746 1902 2244 2265 2424 2737 2849 3578 3580 3652 4042 4250 4289 4729 4857 CGGAGTC/GACTCCG 0 -3 103 105 12 -20.4 33 46 122 171 258 309 314 319 373 456 508 547 563 606 635 647 665 667 718 736 759 778 782 825 868 881 887 898 926 933 958 1014 1075 1115 1234 1270 1349 1371 1407 1460 1510 1667 1736 1818 1829 1891 1941 1985 1992 2024 2137 2226 2271 2469 2520 2663 2726 2751 2816 2929 3051 3135 3140 3186 3190 3225 3355 3375 3395 3499 3509 3604 3616 3645 3709 3728 3729 3765 3775 3900 3912 3948 4090 4122 4126 4210 4242 4376 4442 4478 4512 4593 4615 4638 4676 4697 4727 4768 4859 4885 4904 4918 4996 93 1719 2450 2507 2599 2608 3183 3336 3441 3668 4520 4995 GCGAAGA/TCTTCGC 5 -3 108 105 28 -12.0 27 104 143 214 236 262 295 305 368 439 531 540 551 698 771 775 804 809 848 974 1080 1121 1213 1220 1248 1304 1315 1326 1328 1433 1440 1603 1724 1818 1856 2018 2156 2204 2225 2226 2261 2291 2298 2363 2537 2561 2614 2646 2669 2698 2801 2846 2858 2863 2906 2921 2953 3013 3015 3046 3072 3098 3163 3199 3213 3276 3279 3366 3416 3426 3428 3467 3506 3533 3561 3622 3648 3719 3779 3826 3831 3870 3909 3917 3943 3947 3954 3965 4128 4169 4212 4255 4294 4311 4375 4447 4494 4668 4679 4713 4767 4801 4846 4867 4884 4905 4906 4938 66 137 160 279 348 599 986 1710 1919 2026 2219 2242 2307 2340 2446 2551 2576 2948 3050 3162 3229 3444 3709 3914 4346 4407 4418 4495 GGCGAAG/CTTCGCC 0 -2 108 104 20 -15.3 15 30 41 143 197 220 236 305 503 551 645 670 698 771 804 1028 1106 1121 1126 1180 1213 1248 1304 1311 1328 1344 1440 1504 1641 1694 1724 1783 1856 2007 2017 2018 2162 2204 2230 2261 2291 2298 2342 2358 2561 2562 2641 2669 2698 2846 2858 2906 2921 2972 3006 3015 3026 3046 3072 3098 3163 3195 3198 3279 3366 3523 3533 3561 3583 3622 3637 3652 3719 3764 3779 3826 3839 3844 3846 3892 3909 3917 3932 3947 3965 3971 4026 4055 4104 4140 4169 4212 4264 4311 4375 4417 4447 4451 4494 4535 4668 4679 4713 4739 4801 4867 4870 4906 66 190 599 980 1031 1076 1375 1412 2295 3050 3069 3094 3229 3525 3709 4016 4346 4407 4418 4972 CCGCCGG/CCGGCGG 1 -5 116 104 19 -15.9 68 103 395 445 455 754 788 853 1086 1189 1265 1276 1287 1325 1344 1375 1381 1640 1685 1724 1795 1797 1830 1835 1865 1872 1893 1897 1930 1938 1939 1956 1987 1996 2048 2062 2064 2100 2116 2131 2134 2270 2296 2380 2382 2387 2415 2475 2485 2514 2616 2632 2641 2678 2749 2778 2784 2804 2839 3198 3232 3268 3340 3422 3429 3454 3478 3497 3504 3527 3586 3633 3736 3753 3754 3774 3866 3906 3967 3979 3996 4008 4010 4024 4055 4075 4111 4181 4213 4240 4277 4341 4352 4387 4449 4450 4456 4482 4487 4493 4504 4550 4584 4657 4692 4694 4751 4757 4802 4821 4857 4858 4887 4923 4953 4954 12 233 523 838 1383 1398 1607 1901 2185 2663 2842 3025 3503 3513 3657 4160 4341 4350 4478 GGCGAAG/CTTCGCC 5 -4 108 104 20 -15.3 15 30 41 143 197 220 236 305 503 551 645 670 698 771 804 1028 1106 1121 1126 1180 1213 1248 1304 1311 1328 1344 1440 1504 1641 1694 1724 1783 1856 2007 2017 2018 2162 2204 2230 2261 2291 2298 2342 2358 2561 2562 2641 2669 2698 2846 2858 2906 2921 2972 3006 3015 3026 3046 3072 3098 3163 3195 3198 3279 3366 3523 3533 3561 3583 3622 3637 3652 3719 3764 3779 3826 3839 3844 3846 3892 3909 3917 3932 3947 3965 3971 4026 4055 4104 4140 4169 4212 4264 4311 4375 4417 4447 4451 4494 4535 4668 4679 4713 4739 4801 4867 4870 4906 66 190 599 980 1031 1076 1375 1412 2295 3050 3069 3094 3229 3525 3709 4016 4346 4407 4418 4972 CGGCGAC/GTCGCCG 0 -3 111 103 17 -16.7 33 199 272 280 362 551 672 681 879 900 910 940 1000 1007 1025 1125 1189 1241 1253 1278 1279 1313 1323 1434 1435 1521 1651 1805 1830 1861 1872 1876 1886 1906 2103 2105 2121 2205 2212 2315 2380 2396 2439 2564 2599 2616 2632 2658 2677 2708 2755 2792 2835 2845 2868 2875 2888 2929 2953 3027 3045 3059 3085 3112 3185 3262 3268 3315 3316 3369 3384 3451 3508 3545 3575 3587 3590 3598 3627 3660 3749 3811 3856 3872 3905 3918 3967 3984 4100 4120 4166 4214 4221 4243 4273 4287 4314 4332 4430 4513 4553 4557 4670 4707 4724 4740 4793 4857 4868 4921 4941 233 325 521 926 1061 1236 1746 1919 2663 3005 3401 3609 4249 4296 4600 4729 4865 CCGGCGT/ACGCCGG 0 -4 106 100 9 -21.4 250 260 265 316 318 335 501 616 665 839 858 875 892 893 1034 1057 1135 1164 1225 1363 1431 1522 1528 1559 1596 1612 1631 1654 1655 1673 1675 1800 1835 1985 1986 2014 2184 2194 2301 2331 2342 2417 2422 2444 2604 2611 2612 2615 2715 2822 2863 2874 2883 2930 2934 2957 2967 3014 3032 3063 3155 3156 3164 3215 3216 3265 3274 3288 3319 3329 3354 3359 3414 3502 3565 3566 3574 3657 3728 3779 3783 3824 3856 3975 3976 3995 4023 4040 4105 4117 4142 4177 4232 4281 4330 4390 4562 4594 4692 4751 4791 4850 4867 4887 4979 4992 679 865 1398 1904 2009 2589 2881 4166 4920 CTCGGCG/CGCCGAG 0 -5 99 100 5 -25.1 51 82 125 154 187 222 228 290 341 360 393 427 447 503 551 622 850 859 964 1000 1021 1025 1068 1173 1189 1245 1251 1279 1311 1317 1331 1531 1548 1555 1651 1652 1674 1707 1714 1735 1786 1853 1905 2044 2103 2105 2143 2184 2255 2442 2574 2595 2750 2806 2832 2862 2882 2934 2953 2991 3012 3018 3028 3059 3112 3143 3210 3287 3289 3316 3320 3369 3557 3587 3590 3627 3725 3854 3864 3896 3924 3972 4082 4114 4194 4356 4375 4441 4546 4548 4703 4710 4730 4779 4784 4785 4878 4915 4936 67 1606 1721 3141 4191 GCGGCGA/TCGCCGC 0 -4 106 100 16 -16.6 72 167 236 241 252 395 511 706 769 868 879 910 1028 1033 1171 1192 1261 1294 1313 1328 1330 1412 1434 1527 1565 1641 1642 1651 1712 1724 1726 1740 1776 1811 1846 1856 1862 1874 1876 1886 2048 2103 2112 2164 2209 2387 2485 2555 2609 2658 2749 2786 2828 2840 2858 2972 2991 3026 3046 3047 3073 3114 3182 3227 3237 3260 3349 3369 3449 3456 3519 3522 3583 3586 3632 3633 3772 3794 3844 3932 3965 3973 3994 4003 4096 4100 4120 4130 4149 4198 4212 4247 4341 4524 4535 4607 4651 4692 4724 4740 4752 4790 4802 4906 4919 4921 325 344 926 993 1398 1453 2226 3069 3142 3513 4073 4350 4407 4458 4600 4756 ACGCCGG/CCGGCGT 1 -5 106 100 9 -21.4 250 260 265 316 318 335 501 616 665 839 858 875 892 893 1034 1057 1135 1164 1225 1363 1431 1522 1528 1559 1596 1612 1631 1654 1655 1673 1675 1800 1835 1985 1986 2014 2184 2194 2301 2331 2342 2417 2422 2444 2604 2611 2612 2615 2715 2822 2863 2874 2883 2930 2934 2957 2967 3014 3032 3063 3155 3156 3164 3215 3216 3265 3274 3288 3319 3329 3354 3359 3414 3502 3565 3566 3574 3657 3728 3779 3783 3824 3856 3975 3976 3995 4023 4040 4105 4117 4142 4177 4232 4281 4330 4390 4562 4594 4692 4751 4791 4850 4867 4887 4979 4992 679 865 1398 1904 2009 2589 2881 4166 4920 TATCGGA/TCCGATA 0 -6 99 99 21 -13.7 91 122 139 155 182 195 217 267 317 513 665 727 738 759 812 827 832 834 881 1003 1047 1089 1197 1349 1444 1463 1492 1501 1528 1534 1559 1584 1681 1759 1816 1832 1867 1891 1979 2030 2031 2061 2070 2106 2111 2124 2149 2166 2196 2206 2249 2288 2667 2671 2780 2804 2807 2892 2963 2969 2974 2984 3178 3239 3405 3418 3438 3444 3488 3507 3538 3579 3580 3641 3691 3707 3756 3759 3797 3820 3874 3950 4012 4051 4067 4224 4281 4338 4370 4514 4515 4545 4674 4731 4744 4771 4795 4822 4995 95 305 317 327 444 526 536 1008 1276 1411 2372 2374 2809 3050 3184 3353 3466 3556 3631 4783 4981 ACGGAGT/ACTCCGT 0 -4 99 97 8 -21.4 1 33 164 177 188 259 319 396 470 550 579 589 622 635 665 675 718 778 868 926 935 950 979 1193 1234 1274 1345 1388 1419 1460 1567 1569 1827 1842 1908 1941 2015 2065 2129 2137 2196 2197 2271 2283 2341 2423 2586 2760 2862 2934 2981 3051 3092 3225 3243 3284 3375 3397 3420 3422 3471 3495 3616 3626 3647 3709 3723 3775 3780 3806 3812 3873 3934 4036 4126 4130 4135 4240 4262 4270 4310 4312 4325 4354 4377 4424 4426 4536 4584 4586 4588 4638 4665 4696 4701 4768 4859 4902 4969 303 456 1816 2447 2983 3142 3682 4819 ACGGCGA/TCGCCGT 0 -4 99 97 24 -11.9 30 68 132 181 220 280 322 365 461 506 551 555 639 698 735 752 791 811 877 956 982 1109 1121 1180 1241 1253 1323 1440 1504 1520 1805 1817 1872 1961 2011 2013 2064 2103 2105 2151 2167 2171 2204 2261 2315 2397 2410 2448 2466 2592 2641 2669 2698 2827 2846 2868 2875 2923 3025 3139 3172 3262 3314 3329 3343 3395 3451 3509 3554 3561 3679 3791 3806 3811 3836 3842 3846 3917 3947 3965 4026 4028 4120 4176 4214 4236 4264 4269 4454 4457 4513 4554 4635 4641 4679 4713 4747 4867 4892 423 486 521 834 919 1042 1174 1236 1547 1746 2056 2106 2245 2257 2291 2796 2799 2948 3050 3710 4296 4407 4729 4730 GGAGAGG/CCTCTCC 0 -2 99 97 25 -11.5 132 266 278 377 378 440 479 494 528 541 584 587 626 704 738 781 803 824 878 900 902 915 919 1031 1077 1094 1143 1190 1212 1268 1329 1414 1449 1506 1589 1713 1722 1780 1792 1816 2055 2142 2189 2205 2264 2336 2357 2477 2613 2663 2695 2762 2784 2852 2853 2906 3075 3175 3202 3263 3275 3315 3318 3390 3426 3457 3505 3513 3516 3562 3576 3632 3663 3723 3805 3844 3875 3952 4021 4041 4050 4096 4279 4446 4449 4483 4487 4488 4555 4627 4656 4676 4697 4707 4798 4830 4898 4911 4946 55 137 677 1075 1441 1499 1674 1680 2242 2359 2432 2516 2663 2976 3166 3175 3245 3669 3922 3953 4305 4327 4478 4487 4994 ACGGAGT/ACTCCGT 1 -2 99 97 8 -21.4 1 33 164 177 188 259 319 396 470 550 579 589 622 635 665 675 718 778 868 926 935 950 979 1193 1234 1274 1345 1388 1419 1460 1567 1569 1827 1842 1908 1941 2015 2065 2129 2137 2196 2197 2271 2283 2341 2423 2586 2760 2862 2934 2981 3051 3092 3225 3243 3284 3375 3397 3420 3422 3471 3495 3616 3626 3647 3709 3723 3775 3780 3806 3812 3873 3934 4036 4126 4130 4135 4240 4262 4270 4310 4312 4325 4354 4377 4424 4426 4536 4584 4586 4588 4638 4665 4696 4701 4768 4859 4902 4969 303 456 1816 2447 2983 3142 3682 4819 TCTCGGA/TCCGAGA 0 -6 95 96 19 -14.0 29 46 49 84 228 477 520 581 636 653 676 681 683 705 740 877 933 958 988 1023 1051 1092 1129 1196 1203 1205 1371 1378 1384 1530 1628 1630 1647 1651 1664 1751 1927 2127 2173 2202 2311 2367 2368 2375 2385 2397 2469 2606 2635 2640 2819 2821 2831 2844 2915 2964 3072 3117 3124 3150 3191 3236 3277 3278 3353 3426 3437 3475 3483 3500 3550 3558 3559 3604 3716 3757 3804 3875 3929 3960 3964 4046 4180 4242 4343 4361 4491 4512 4518 4612 4705 4739 4822 4852 4958 227 294 795 1475 1609 1723 2054 2311 2376 2552 2582 3115 3189 4047 4312 4509 4743 4787 4974 CCGGAGC/GCTCCGG 0 -4 103 95 18 -14.3 85 94 125 282 373 665 744 748 972 1016 1039 1140 1205 1269 1334 1374 1381 1453 1507 1521 1628 1650 1675 1720 1830 1865 1892 1903 2085 2092 2119 2184 2216 2296 2331 2334 2360 2415 2434 2435 2466 2495 2577 2609 2672 2732 2740 2773 2778 2790 2869 2935 2997 3001 3014 3158 3232 3317 3360 3467 3490 3502 3522 3566 3646 3662 3753 3764 3836 3860 3874 3908 3912 3916 3981 4017 4055 4151 4221 4314 4332 4353 4382 4412 4469 4488 4512 4607 4631 4640 4698 4731 4751 4762 4780 4790 4794 4821 4868 4944 4951 4975 4986 233 390 750 880 1010 1019 1328 1722 1795 2415 2799 3056 3138 3259 3667 3954 4097 4835 GCGGAGA/TCTCCGC 0 -4 98 95 23 -11.9 22 189 286 335 337 361 369 392 407 417 550 626 766 785 788 992 1048 1131 1206 1272 1321 1350 1375 1381 1403 1530 1544 1587 1653 1677 1770 1792 1811 1821 1829 1880 1887 1897 1938 1939 2164 2200 2227 2296 2380 2389 2476 2487 2490 2500 2632 2721 2725 2832 2833 2849 2898 2919 2991 3051 3065 3144 3195 3248 3360 3382 3389 3396 3486 3570 3602 3648 3663 3687 3694 3805 3895 3917 4074 4096 4131 4187 4215 4232 4328 4444 4446 4527 4550 4592 4597 4610 4637 4649 4694 4714 4756 4857 81 137 334 930 1243 1250 1441 1606 2108 2154 2243 2257 2336 2406 2663 2842 2916 3134 3157 3228 3709 3713 4166 CGGAGCC/GGCTCCG 0 -3 101 93 7 -21.2 10 58 85 125 176 421 422 490 493 542 558 634 748 834 1071 1123 1266 1269 1371 1453 1551 1628 1720 1798 1872 1892 1934 2070 2123 2256 2336 2360 2433 2466 2565 2609 2672 2692 2708 2773 2869 2920 2984 3001 3019 3098 3144 3205 3207 3232 3234 3276 3279 3298 3326 3490 3563 3641 3646 3659 3698 3705 3760 3764 3795 3804 3852 3889 3909 3920 3941 3979 3981 3984 4008 4017 4059 4061 4069 4077 4120 4127 4132 4206 4225 4302 4437 4464 4470 4488 4493 4671 4698 4794 4809 4852 4882 4886 4927 4947 4975 390 421 1019 2799 2899 3004 3796 GGAGAAC/GTTCTCC 0 -2 96 92 21 -12.1 116 252 377 389 418 441 525 556 717 728 768 799 826 866 875 1042 1109 1130 1154 1170 1178 1253 1295 1397 1405 1428 1472 1497 1499 1612 1677 1723 1924 1950 2120 2127 2164 2243 2304 2315 2339 2357 2361 2380 2403 2444 2446 2449 2487 2567 2595 2640 2705 2706 2783 2807 2813 2814 3063 3147 3185 3186 3218 3236 3277 3285 3318 3321 3331 3501 3660 3727 3750 3816 3848 3855 4216 4312 4328 4370 4398 4520 4531 4579 4593 4597 4650 4688 4699 4775 4791 4855 4858 4870 4892 4959 338 796 801 864 1068 1246 1350 1398 1785 1906 2100 2263 3043 3134 3228 3513 3761 3794 4410 4589 4676 TCGACGG/CCGTCGA 1 -5 92 92 21 -12.1 54 308 310 392 541 555 625 658 660 710 738 783 858 877 908 913 958 988 1066 1118 1145 1180 1267 1298 1351 1385 1440 1464 1478 1505 1506 1526 1536 1573 1671 1767 1774 1824 1892 1898 1972 2118 2196 2204 2211 2236 2341 2388 2436 2476 2574 2581 2584 2741 2770 2819 2827 2849 2862 2880 2934 3020 3043 3219 3228 3229 3262 3418 3539 3545 3610 3686 3698 3702 3709 3744 3819 3869 3885 3903 3908 3917 3963 3966 4026 4227 4374 4550 4554 4676 4855 4952 188 881 905 1097 1236 1721 1738 1885 1966 2088 2184 2243 2257 2513 2858 3789 3790 4096 4290 4671 4707 TCGGCGG/CCGCCGA 0 -4 93 91 5 -22.5 32 82 125 154 222 290 355 419 493 503 513 550 761 769 820 850 955 1068 1110 1169 1269 1353 1421 1527 1546 1651 1785 1905 1930 1952 1989 2103 2120 2126 2137 2209 2221 2255 2276 2296 2302 2347 2494 2548 2583 2595 2727 2737 2750 2758 2828 2862 2879 2951 2991 2998 3043 3051 3210 3219 3253 3258 3260 3369 3478 3579 3589 3699 3704 3798 3804 3854 3857 3889 3924 3972 4012 4028 4045 4097 4190 4217 4362 4441 4443 4548 4627 4703 4710 4906 4915 4919 4946 86 586 1155 1721 3702 GCGACGG/CCGTCGC 1 -5 91 91 15 -14.9 41 53 206 250 267 271 280 305 541 564 603 618 681 746 796 805 902 970 977 1007 1050 1151 1171 1173 1189 1224 1253 1271 1308 1656 1720 1792 1804 1872 1876 1886 2020 2086 2171 2185 2205 2239 2264 2315 2321 2331 2380 2439 2520 2531 2637 2658 2765 2774 2845 2871 2875 2893 2942 2993 3052 3369 3377 3394 3451 3538 3657 3662 3767 3783 3811 3870 3905 3908 4166 4198 4214 4273 4311 4332 4372 4419 4642 4670 4696 4724 4738 4745 4847 4857 4933 233 483 521 599 820 992 1079 1106 1307 1923 3041 3174 4393 4668 4677 CGGCGTC/GACGCCG 0 -3 94 90 9 -18.7 250 254 265 299 316 318 496 497 685 892 1029 1044 1095 1117 1164 1170 1173 1225 1246 1251 1253 1318 1390 1395 1527 1548 1555 1596 1603 1612 1726 1780 1826 1835 1985 2184 2301 2315 2331 2342 2428 2444 2448 2514 2564 2588 2604 2715 2736 2854 2930 2967 3032 3040 3080 3155 3156 3159 3215 3223 3229 3288 3301 3319 3502 3565 3566 3620 3709 3728 3824 3976 3995 4023 4105 4108 4117 4142 4194 4219 4281 4390 4406 4412 4431 4562 4594 4687 4751 4810 4829 4867 4976 4992 453 522 679 714 1294 2009 3982 4073 4724 GGCGAAA/TTTCGCC 0 -2 91 90 18 -13.1 105 114 185 222 308 479 576 597 638 656 689 735 769 811 832 859 877 881 921 956 1109 1150 1241 1386 1520 1621 1672 1697 1715 1726 1750 1776 1797 1817 1961 1967 2048 2151 2167 2220 2268 2294 2305 2308 2366 2367 2397 2464 2480 2580 2593 2609 2642 2678 2715 2808 2896 3022 3028 3054 3206 3227 3286 3343 3349 3352 3449 3531 3633 3679 3735 3772 3791 3842 3858 3868 3916 3919 3996 4062 4065 4204 4249 4406 4435 4536 4594 4635 4641 4651 4752 33 34 604 694 796 801 834 1042 1493 2079 2819 3142 3459 3758 3767 3918 4207 4713 TACGGAG/CTCCGTA 0 -5 87 90 11 -17.2 1 109 112 164 213 234 247 266 377 391 579 607 633 683 695 757 799 816 866 897 924 935 1052 1091 1119 1137 1163 1212 1274 1460 1468 1507 1525 1583 1613 1711 1728 1860 1888 1945 1965 2010 2014 2018 2123 2169 2267 2298 2430 2551 2597 2663 2786 2936 2981 2986 3151 3243 3276 3279 3375 3471 3529 3580 3647 3700 3718 3847 3869 3905 3933 3977 3984 4064 4093 4126 4305 4310 4404 4446 4464 4551 4586 4783 4851 4985 4993 99 421 1023 1816 2009 2019 2266 2447 2768 3061 4871 TACGGAG/CTCCGTA 1 -3 87 90 11 -17.2 1 109 112 164 213 234 247 266 377 391 579 607 633 683 695 757 799 816 866 897 924 935 1052 1091 1119 1137 1163 1212 1274 1460 1468 1507 1525 1583 1613 1711 1728 1860 1888 1945 1965 2010 2014 2018 2123 2169 2267 2298 2430 2551 2597 2663 2786 2936 2981 2986 3151 3243 3276 3279 3375 3471 3529 3580 3647 3700 3718 3847 3869 3905 3933 3977 3984 4064 4093 4126 4305 4310 4404 4446 4464 4551 4586 4783 4851 4985 4993 99 421 1023 1816 2009 2019 2266 2447 2768 3061 4871 ACGGCGG/CCGCCGT 0 -7 90 88 24 -10.0 72 167 172 256 258 280 310 335 545 549 593 663 748 785 818 982 1007 1028 1106 1131 1189 1246 1266 1272 1278 1304 1375 1479 1523 1569 1740 1751 1776 1800 1811 1863 1893 1911 2020 2183 2205 2311 2389 2500 2528 2583 2716 2725 2909 3103 3134 3144 3245 3259 3353 3369 3389 3615 3629 3648 3663 3689 3767 3781 3805 3855 3877 3917 3954 3973 3994 4003 4069 4075 4130 4131 4132 4219 4341 4351 4473 4524 4551 4573 4583 4621 4661 4687 4721 4880 157 200 233 459 1607 1790 1795 1840 2107 2184 2257 2273 2549 3114 3228 3394 3789 4090 4360 4407 4520 4781 4927 4931 TACCGGA/TCCGGTA 0 -6 86 88 19 -12.2 4 115 153 178 217 296 311 361 365 373 463 528 744 754 820 864 924 1029 1031 1037 1106 1134 1176 1181 1261 1277 1307 1347 1356 1360 1431 1567 1593 1680 1689 1779 1891 1980 2204 2220 2303 2365 2426 2502 2527 2576 2605 2610 2621 2703 2705 2731 2827 2838 2929 2946 2987 3033 3201 3244 3285 3376 3400 3559 3633 3646 3708 3774 3843 3921 4209 4344 4406 4412 4450 4454 4488 4512 4580 4581 4631 4760 4807 4851 4863 4929 81 554 677 979 1019 1107 1180 1964 2312 2377 2465 2893 3010 3061 3668 3944 4421 4592 4926 GACGGTG/CACCGTC 1 -3 87 88 27 -8.9 328 384 423 433 469 494 509 521 525 541 563 598 660 710 748 757 777 802 820 883 913 914 1031 1066 1141 1154 1205 1385 1420 1464 1506 1526 1695 1720 1733 1886 2157 2196 2216 2259 2264 2286 2334 2344 2382 2425 2538 2574 2584 2604 2699 2727 2741 2744 2749 2845 2937 3006 3119 3237 3358 3456 3533 3610 3666 3704 3709 3721 3742 3777 3781 3889 3948 4155 4200 4258 4330 4332 4357 4408 4418 4542 4594 4616 4694 4887 4955 234 598 780 872 881 1019 1084 1162 1225 1327 1382 1493 1691 2009 2184 2205 2243 2264 2513 3038 3174 3426 3744 3908 4458 4668 4671 CGGCGTT/AACGCCG 0 -3 90 87 16 -13.4 256 334 335 341 427 439 441 485 486 616 621 622 663 665 738 844 858 875 883 964 970 1057 1324 1406 1431 1522 1523 1528 1596 1655 1689 1735 1741 1768 1986 2014 2117 2141 2194 2311 2417 2444 2585 2612 2615 2797 2806 2822 2844 2863 2874 2934 2957 3012 3014 3036 3063 3216 3254 3265 3306 3329 3393 3414 3433 3551 3557 3588 3609 3657 3676 3763 3779 3818 3856 3864 4136 4142 4155 4177 4232 4308 4312 4330 4546 4784 4871 4887 4979 4989 109 127 421 865 1343 2351 2798 2881 4166 4250 4324 4525 4729 4889 4902 4920 CGGCGGT/ACCGCCG 0 -3 92 86 20 -11.3 68 125 355 359 455 466 754 761 820 955 1068 1086 1189 1208 1257 1265 1278 1325 1353 1375 1405 1421 1479 1640 1751 1797 1865 1879 1893 1911 1930 1987 1989 1996 2126 2134 2296 2311 2347 2365 2389 2415 2475 2485 2494 2583 2609 2618 2641 2727 2737 2778 3051 3195 3210 3340 3369 3422 3478 3579 3589 3680 3689 3699 3767 3798 3857 3895 3924 3967 4012 4028 4045 4111 4190 4311 4441 4443 4449 4493 4539 4548 4552 4583 4621 4627 4657 4687 4710 4821 4880 4953 157 231 233 523 586 838 1383 1901 2205 2273 2549 3114 3394 3702 4090 4308 4341 4520 4742 4835 CGGAGCA/TGCTCCG 0 -3 86 85 13 -14.6 37 43 139 195 256 264 282 359 560 578 665 669 727 744 764 812 886 891 974 977 1150 1174 1191 1269 1291 1364 1374 1410 1443 1507 1512 1707 1799 1919 1950 2092 2107 2206 2238 2334 2391 2395 2436 2502 2550 2570 2732 2778 2817 2935 3214 3254 3295 3317 3402 3470 3522 3527 3547 3753 3761 3797 3810 3854 3860 3870 4109 4152 4174 4199 4282 4311 4438 4469 4512 4530 4608 4677 4790 4797 4819 4821 4888 4913 4955 4958 233 776 880 1328 2444 2446 2930 3056 3138 3259 3971 4097 4835 GACGATG/CATCGTC 2 -3 80 85 25 -9.0 13 15 26 47 98 187 199 272 273 280 294 305 387 409 428 574 645 703 716 880 884 899 942 1063 1183 1203 1252 1328 1358 1455 1487 1497 1616 1673 1881 1990 2093 2115 2173 2227 2303 2345 2372 2522 2614 2638 2670 2730 2800 2869 2899 2984 2993 3045 3155 3178 3288 3412 3505 3506 3598 3651 3721 3880 3979 4060 4117 4139 4180 4341 4348 4361 4412 4430 4552 4589 4683 4785 4850 4937 154 246 461 946 1028 1084 1158 1196 1626 1680 2539 2570 2704 2759 3167 3314 3347 3423 3522 3770 3913 4283 4286 4690 4926 CCGGAGG/CCTCCGG 0 -4 90 84 13 -14.4 157 164 286 603 753 789 846 850 864 889 927 1029 1058 1086 1190 1199 1228 1261 1282 1514 1572 1663 1763 1871 1926 1947 1976 2089 2094 2113 2147 2162 2268 2297 2300 2329 2340 2417 2422 2460 2480 2498 2532 2576 2593 2752 2779 2813 2835 2844 2855 2874 2876 2928 2951 2957 2959 3044 3244 3258 3348 3408 3660 3720 3806 3839 3863 3885 3888 3906 3941 3962 3963 4045 4048 4087 4132 4196 4284 4297 4301 4350 4504 4687 4733 4790 4803 4891 4927 4954 250 260 389 944 978 995 1069 1161 1778 2312 3170 3789 4166 CAACGGA/TCCGTTG 1 -4 78 83 23 -9.4 33 85 92 107 116 197 211 217 230 237 285 292 396 488 493 550 602 633 636 683 687 821 1059 1175 1190 1234 1273 1331 1337 1342 1456 1567 1610 1845 1927 2056 2348 2363 2380 2513 2578 2597 2627 2657 2676 2792 2828 2961 3127 3249 3268 3275 3299 3397 3420 3422 3493 3620 3640 3752 3782 3876 3891 3992 4147 4188 4202 4214 4298 4367 4437 4464 4491 4591 4621 4859 4942 4999 187 227 307 456 500 616 816 925 1106 1243 1500 1747 1787 1897 1924 2047 2336 2478 2721 3836 3971 4192 4626 TCAATCG/CGATTGA 3 -5 78 83 25 -8.6 9 49 80 108 177 264 302 382 412 530 537 713 745 768 840 869 972 983 998 1008 1119 1222 1299 1318 1343 1446 1464 1475 1487 1542 1674 1808 1809 1815 1826 1834 1901 1934 1956 2104 2132 2273 2282 2315 2387 2402 2525 2534 2558 2613 2650 2714 2848 2870 2936 2982 3017 3025 3056 3057 3214 3260 3359 3527 3572 3637 3796 3906 3920 3921 3945 3969 4031 4063 4086 4139 4349 4889 14 63 123 155 871 1042 1124 1378 1694 1738 2235 2307 2444 2672 2675 2837 3026 3485 3598 3704 4109 4197 4635 4690 4699 TCGGCGT/ACGCCGA 0 -4 79 80 4 -20.4 51 55 101 254 255 299 334 341 427 430 441 485 497 621 622 680 844 939 964 1073 1173 1184 1251 1280 1390 1531 1548 1603 1714 1735 1768 1786 1802 1826 2092 2141 2169 2311 2315 2328 2412 2448 2558 2585 2588 2736 2797 2806 2836 2934 3012 3100 3159 3240 3306 3357 3393 3551 3557 3588 3763 3864 3972 4082 4108 4136 4194 4308 4412 4431 4546 4687 4691 4717 4776 4784 4810 4871 4976 883 1300 3141 4250 TGTCGGA/TCCGACA 0 -6 86 80 13 -13.4 64 247 278 406 504 568 679 739 773 984 1056 1116 1135 1275 1291 1297 1443 1497 1503 1509 1537 1610 1708 1719 1773 1842 1917 2042 2058 2180 2181 2190 2215 2247 2256 2289 2340 2400 2468 2545 2661 2713 2813 2815 2931 3035 3041 3167 3262 3465 3484 3551 3664 3675 3688 3708 3738 3739 3752 3768 3801 3805 3830 3843 3894 4080 4114 4198 4223 4282 4304 4378 4439 4492 4521 4531 4532 4608 4628 4629 4727 4789 4797 4827 4882 4939 227 466 625 1162 1210 2446 2964 3871 3933 3973 4133 4169 4951 TGTCGGA/TCCGACA 1 -4 86 80 13 -13.4 64 247 278 406 504 568 679 739 773 984 1056 1116 1135 1275 1291 1297 1443 1497 1503 1509 1537 1610 1708 1719 1773 1842 1917 2042 2058 2180 2181 2190 2215 2247 2256 2289 2340 2400 2468 2545 2661 2713 2813 2815 2931 3035 3041 3167 3262 3465 3484 3551 3664 3675 3688 3708 3738 3739 3752 3768 3801 3805 3830 3843 3894 4080 4114 4198 4223 4282 4304 4378 4439 4492 4521 4531 4532 4608 4628 4629 4727 4789 4797 4827 4882 4939 227 466 625 1162 1210 2446 2964 3871 3933 3973 4133 4169 4951 CAATCGG/CCGATTG 0 -7 79 79 17 -11.1 25 139 302 530 563 592 634 681 692 771 782 840 869 904 971 983 990 1008 1038 1039 1222 1343 1446 1475 1487 1512 1549 1554 1677 1728 1809 1826 1934 2104 2250 2315 2387 2390 2402 2525 2534 2558 2613 2707 3017 3022 3025 3056 3057 3141 3207 3209 3214 3240 3393 3418 3511 3542 3572 3635 3637 3727 3778 3782 3794 3796 3841 3889 3945 3969 4041 4086 4139 4155 4247 4423 4428 4691 4848 123 152 155 323 354 411 1042 1281 1879 2307 2444 2819 3598 3770 3857 4293 4699 TGAATCG/CGATTCA 3 -5 81 79 26 -7.5 37 118 120 257 306 458 569 605 704 714 896 997 1061 1075 1085 1126 1166 1254 1338 1344 1422 1542 1623 1627 1632 1728 1838 1901 2032 2064 2083 2084 2141 2178 2242 2382 2398 2437 2638 2645 2649 2800 2820 2829 2835 2936 2958 2970 2995 3029 3067 3121 3141 3183 3201 3218 3248 3337 3342 3360 3402 3444 3622 3642 3705 3948 4165 4255 4329 4340 4361 4465 4482 4619 4658 4784 4787 4850 4890 4908 4970 180 293 598 602 697 848 889 1024 1153 1220 1262 1371 1489 1581 2272 2437 2902 2912 3194 3727 3749 3948 4106 4573 4791 4995 CGAAGAG/CTCTTCG 5 -2 79 78 25 -7.7 27 192 239 252 279 295 542 648 809 843 857 873 916 974 995 998 1062 1121 1213 1220 1266 1387 1406 1478 1484 1514 1515 1818 1837 1893 1924 1947 2042 2204 2225 2226 2261 2263 2355 2460 2575 2617 2698 2712 2890 2942 3013 3040 3056 3072 3098 3190 3238 3276 3279 3322 3366 3482 3506 3533 3561 3622 3648 3719 3749 3947 4015 4018 4108 4129 4180 4207 4233 4311 4570 4679 4867 4906 4952 300 611 658 992 1069 2074 2208 2226 2340 2361 2446 2651 2775 2905 3001 3003 3200 3229 3339 3503 3596 3877 4366 4495 4668 GACGGAT/ATCCGTC 1 -3 79 77 17 -10.6 47 231 236 344 392 627 661 681 692 702 709 732 767 802 823 920 1015 1050 1084 1187 1215 1223 1298 1329 1382 1532 1573 1618 1687 1766 1794 1824 1889 1969 2021 2113 2171 2321 2430 2520 2569 2581 2690 2698 2849 2878 2881 2944 3016 3020 3045 3105 3149 3170 3228 3382 3394 3418 3702 3733 3739 3811 3869 3879 4141 4158 4294 4349 4351 4425 4519 4661 4745 4789 4825 4836 4908 4923 4996 537 599 606 939 1043 1245 1923 2368 2373 3033 3311 3602 3917 4014 4133 4756 4995 GTCGGCG/CGCCGAC 0 -5 78 76 5 -18.3 50 157 168 199 355 362 430 509 550 757 820 1150 1244 1262 1280 1353 1354 1534 1560 1587 1603 1788 1828 1850 1859 1973 2126 2137 2184 2209 2232 2319 2347 2359 2441 2448 2522 2588 2599 2681 2715 2745 2771 2797 2929 3006 3045 3051 3080 3097 3100 3260 3281 3342 3349 3357 3451 3478 3551 3575 3581 3719 3721 3755 3918 4045 4108 4112 4139 4243 4332 4363 4412 4414 4431 4543 4670 4919 813 1300 2083 4250 4857 CGACGGC/GCCGTCG 1 -4 75 76 16 -10.9 132 162 181 308 310 486 509 593 663 738 746 752 813 877 1007 1127 1131 1180 1189 1253 1324 1351 1375 1440 1478 1495 1641 1682 1756 1792 1859 1872 1879 2011 2020 2086 2120 2163 2167 2204 2205 2232 2319 2394 2770 2827 2844 2846 3020 3098 3144 3262 3281 3329 3369 3417 3443 3451 3539 3802 3917 3994 4026 4028 4037 4214 4312 4434 4488 4511 4531 4551 4554 4847 4857 233 521 978 1106 1174 1226 1236 1738 2257 2310 2351 2419 3760 3789 4091 4729 CACGGAG/CTCCGTG 0 -5 77 75 13 -12.2 108 207 310 386 455 539 587 617 639 790 917 1090 1143 1154 1193 1259 1338 1345 1467 1478 1529 1598 1611 1758 1858 1887 2013 2040 2097 2119 2129 2132 2138 2197 2206 2271 2353 2573 2588 2623 2626 2692 2694 2760 2795 2842 2880 2894 2947 3012 3092 3129 3218 3237 3249 3321 3345 3496 3541 3610 3638 3709 3742 3775 3812 3834 3958 4091 4118 4267 4270 4354 4424 4584 4721 4902 4998 503 914 1747 1752 2930 3127 3578 3704 4140 4194 4350 4861 4942 CCGGAGT/ACTCCGG 0 -4 78 75 16 -10.6 4 94 167 373 456 628 667 736 893 1039 1106 1258 1278 1313 1353 1373 1377 1407 1450 1499 1528 1620 1647 1695 1755 1797 1829 1851 1893 1906 1950 2044 2212 2331 2342 2396 2411 2520 2528 2628 2689 2770 2896 2929 2930 2931 3027 3135 3140 3318 3454 3499 3509 3574 3631 3736 3912 3948 3990 4090 4122 4281 4352 4368 4382 4397 4433 4481 4556 4697 4762 4804 4806 4807 4861 4870 4872 4885 231 233 390 1584 2185 2307 2372 2406 2507 2599 3010 3401 3668 4460 4920 4933 CACGGAG/CTCCGTG 1 -3 77 75 13 -12.2 108 207 310 386 455 539 587 617 639 790 917 1090 1143 1154 1193 1259 1338 1345 1467 1478 1529 1598 1611 1758 1858 1887 2013 2040 2097 2119 2129 2132 2138 2197 2206 2271 2353 2573 2588 2623 2626 2692 2694 2760 2795 2842 2880 2894 2947 3012 3092 3129 3218 3237 3249 3321 3345 3496 3541 3610 3638 3709 3742 3775 3812 3834 3958 4091 4118 4267 4270 4354 4424 4584 4721 4902 4998 503 914 1747 1752 2930 3127 3578 3704 4140 4194 4350 4861 4942 TTGACGG/CCGTCAA 1 -5 78 75 18 -9.7 31 68 231 383 384 413 598 661 669 752 767 982 1084 1154 1190 1211 1280 1420 1506 1552 1562 1610 1682 1832 1941 2011 2015 2016 2021 2105 2317 2341 2385 2489 2497 2533 2569 2604 2649 2690 2798 2855 2875 2878 2885 2939 2963 3045 3101 3103 3117 3170 3180 3284 3382 3424 3466 3658 3700 3761 3848 3879 3954 4069 4277 4323 4325 4575 4615 4616 4747 4825 4849 4908 4927 4931 4976 4996 68 109 255 1370 1850 2264 2412 2445 2809 2948 3033 3244 3398 3602 3908 4286 4458 4525 GGCGATG/CATCGCC 2 -3 75 75 21 -8.5 68 192 360 448 461 509 652 662 783 787 791 868 919 959 1094 1188 1206 1236 1265 1353 1354 1372 1412 1447 1587 1621 1700 1712 1776 1780 1812 1826 1850 1866 1876 1958 1980 2032 2127 2184 2232 2359 2364 2580 2681 2741 2745 2832 3066 3122 3143 3156 3314 3350 3400 3427 3515 3554 3586 3632 3661 3725 3753 4084 4269 4284 4337 4371 4433 4525 4554 4611 4622 4780 4901 80 87 100 410 462 1069 1071 1582 1593 1606 2056 2419 2513 2968 3260 3710 3832 4177 4407 4659 4756 CGGAGGC/GCCTCCG 0 -3 74 74 9 -14.4 32 110 157 413 504 576 588 603 652 959 1038 1106 1128 1137 1175 1197 1218 1257 1261 1271 1272 1362 1372 1403 1405 1532 1559 1816 1826 1837 1888 1944 2073 2076 2146 2288 2431 2468 2561 2576 2593 2624 2673 2859 2861 2951 2959 2962 3064 3104 3107 3228 3389 3478 3538 3634 3661 3676 3695 3876 3888 3892 3987 4058 4149 4154 4277 4320 4345 4404 4591 4649 4927 4995 307 944 1545 2163 3982 4166 4490 4710 4932 TTCGGCG/CGCCGAA 0 -5 80 74 15 -10.9 33 101 248 254 485 496 497 670 787 921 1036 1111 1169 1184 1225 1305 1527 1605 1708 1785 1830 1905 1952 1989 2007 2169 2302 2328 2364 2439 2494 2585 2721 2722 2736 2737 2755 2764 2828 2958 2998 2999 3054 3163 3253 3258 3282 3322 3400 3403 3416 3428 3457 3467 3588 3589 3598 3763 3858 3872 4028 4063 4166 4217 4239 4287 4308 4443 4450 4494 4525 4533 4596 4605 4668 4717 4763 4776 4854 4871 586 686 883 1155 1403 1696 2513 2856 2920 3030 3260 3375 3609 3918 4823 GTGACGG/CCGTCAC 1 -5 75 74 17 -10.0 51 54 214 245 253 344 494 627 634 639 665 692 729 753 820 880 889 914 1077 1200 1499 1526 1663 1726 1879 1904 1907 1943 1996 2077 2156 2230 2431 2466 2507 2580 2669 2680 2698 2699 2749 2935 2944 3006 3016 3051 3132 3199 3210 3267 3324 3440 3451 3456 3510 3668 3717 3742 3754 3811 3889 3920 3923 3947 4008 4063 4089 4170 4253 4326 4349 4362 4418 4694 4701 303 307 716 850 1042 1084 1126 1494 1593 1961 2273 3211 3399 4142 4452 4643 4724 CCGTCGG/CCGACGG 0 -7 72 72 10 -13.3 123 135 196 355 433 469 509 593 598 638 663 752 757 823 872 1127 1223 1495 1532 1540 1565 1587 1641 1687 1756 1800 1889 1973 2070 2120 2136 2163 2186 2232 2319 2390 2510 2535 2589 2709 2884 2929 2933 3058 3098 3138 3144 3211 3254 3281 3317 3417 3443 3575 3721 3755 3815 3968 3970 3994 4028 4033 4217 4240 4387 4473 4488 4537 4638 4658 4760 4955 305 693 1245 1612 1901 2083 2205 2419 2912 4091 CCGACGG/CCGTCGG 1 -5 72 72 10 -13.3 123 135 196 355 433 469 509 593 598 638 663 752 757 823 872 1127 1223 1495 1532 1540 1565 1587 1641 1687 1756 1800 1889 1973 2070 2120 2136 2163 2186 2232 2319 2390 2510 2535 2589 2709 2884 2929 2933 3058 3098 3138 3144 3211 3254 3281 3317 3417 3443 3575 3721 3755 3815 3968 3970 3994 4028 4033 4217 4240 4387 4473 4488 4537 4638 4658 4760 4955 305 693 1245 1612 1901 2083 2205 2419 2912 4091 AGCGGAG/CTCCGCT 0 -5 75 71 11 -12.4 137 166 256 286 335 337 467 647 766 792 891 920 1151 1206 1253 1321 1325 1388 1405 1530 1544 1559 1770 1792 1829 1887 1895 1939 1992 2135 2164 2217 2227 2235 2246 2434 2685 2833 2849 2861 2920 2991 3195 3202 3382 3486 3648 3661 3687 3695 3765 3814 3892 3900 4092 4106 4108 4120 4149 4320 4403 4419 4446 4503 4597 4602 4610 4649 4666 4676 4711 4714 4756 4832 4882 81 1426 1441 1493 1606 2336 2406 2695 3134 3228 4036 CGGAGTA/TACTCCG 0 -3 70 70 13 -11.0 34 94 167 177 423 463 579 589 606 665 767 893 935 983 1039 1258 1274 1278 1290 1313 1318 1419 1484 1516 1620 1797 1842 1893 2116 2129 2157 2212 2283 2331 2390 2411 2423 2628 2770 2896 2931 2934 2981 3071 3092 3243 3246 3284 3340 3495 3503 3626 3631 3689 3746 3806 3812 4036 4135 4217 4270 4325 4368 4426 4433 4456 4581 4762 4807 4861 228 231 233 390 1155 1584 1816 2372 2695 2834 2983 3682 4336 CGGAGTA/TACTCCG 1 -1 70 70 13 -11.0 34 94 167 177 423 463 579 589 606 665 767 893 935 983 1039 1258 1274 1278 1290 1313 1318 1419 1484 1516 1620 1797 1842 1893 2116 2129 2157 2212 2283 2331 2390 2411 2423 2628 2770 2896 2931 2934 2981 3071 3092 3243 3246 3284 3340 3495 3503 3626 3631 3689 3746 3806 3812 4036 4135 4217 4270 4325 4368 4426 4433 4456 4581 4762 4807 4861 228 231 233 390 1155 1584 1816 2372 2695 2834 2983 3682 4336 GGAGCTA/TAGCTCC 0 -2 71 68 22 -6.8 86 306 316 615 678 772 1016 1109 1140 1143 1149 1190 1205 1218 1261 1279 1290 1292 1303 1346 1353 1661 1675 1838 1863 1898 1979 1999 2031 2085 2119 2184 2271 2435 2467 2790 2815 2833 2880 2902 2963 2973 3042 3217 3358 3360 3412 3415 3444 3456 3509 3654 3662 3686 3742 3866 3954 4049 4083 4211 4314 4412 4640 4731 4826 4827 4864 4903 4933 4951 4954 112 147 187 492 513 640 907 1212 1699 2302 2398 2906 3166 3557 3695 3709 3825 4044 4062 4483 4711 4791 GGCGAAT/ATTCGCC 0 -2 68 68 14 -10.0 3 6 72 228 322 350 357 395 461 706 785 915 1033 1181 1213 1276 1305 1332 1464 1569 1645 1695 1696 1760 1789 1851 1874 1892 2199 2319 2325 2338 2437 2481 2555 2682 2721 2840 2890 2951 3148 3172 3176 3281 3357 3421 3650 3657 3736 3800 3873 3888 3931 3973 4176 4198 4236 4361 4414 4454 4457 4520 4528 4571 4605 4613 4639 4802 325 737 858 1140 1584 1656 2226 2466 2856 2920 3552 3556 4804 4977 AAGACGG/CCGTCTT 1 -5 68 68 22 -6.8 39 159 183 323 368 384 400 497 521 531 658 690 693 811 849 920 956 1031 1042 1139 1329 1525 1609 1710 1794 1811 1872 1970 2075 2144 2151 2261 2466 2561 2573 2631 2814 2817 2913 2981 3006 3064 3097 3262 3505 3622 3626 3668 3762 3826 3835 3842 3881 3940 4128 4173 4214 4234 4370 4488 4509 4536 4579 4614 4683 4875 4934 4946 12 197 234 601 1068 1085 1327 1646 2056 2176 2220 2284 2291 2549 3128 3399 3935 4014 4182 4756 4794 4853 CGATGGA/TCCATCG 2 -1 68 68 11 -11.6 15 272 273 432 445 493 581 625 646 660 670 838 844 856 989 1035 1188 1439 1447 1539 1553 1554 1707 1709 1789 1807 1826 1866 1881 1953 2093 2182 2232 2243 2348 2460 2580 2581 2654 2717 2771 2891 2984 3020 3028 3071 3117 3154 3166 3201 3383 3427 3480 3515 3632 4017 4050 4278 4284 4341 4433 4436 4667 4739 4758 4782 4864 4930 665 1660 2027 2074 2651 2849 3710 4042 4286 4459 4994 GGAGCCA/TGGCTCC 0 -2 68 67 13 -10.3 10 58 85 176 207 337 352 421 422 435 467 542 654 834 911 939 1071 1072 1260 1266 1269 1293 1371 1522 1555 1934 2092 2336 2412 2433 2565 2681 2920 2984 3063 3205 3234 3258 3274 3310 3326 3411 3659 3705 3740 3760 3889 3941 3984 4069 4127 4206 4302 4366 4388 4405 4470 4493 4586 4636 4794 4809 4882 4886 4927 4947 4989 4994 167 211 461 1019 1286 1507 1647 1768 2799 2878 2899 3736 4565 ACGGAGC/GCTCCGT 0 -4 71 66 11 -11.1 43 85 359 422 493 669 764 902 977 1002 1118 1174 1185 1364 1505 1526 1540 1661 1687 1832 2118 2123 2132 2206 2385 2408 2436 2489 2497 2502 2589 2597 2692 2817 2880 2963 3082 3144 3159 3205 3245 3270 3276 3279 3412 3545 3546 3568 3662 3686 3698 3732 3761 3835 3870 3908 3941 3984 4018 4132 4311 4362 4437 4464 4470 4473 4493 4497 4550 4671 4933 187 307 421 1023 1307 1401 1787 2930 3971 4350 4677 ACGGAGC/GCTCCGT 1 -2 71 66 11 -11.1 43 85 359 422 493 669 764 902 977 1002 1118 1174 1185 1364 1505 1526 1540 1661 1687 1832 2118 2123 2132 2206 2385 2408 2436 2489 2497 2502 2589 2597 2692 2817 2880 2963 3082 3144 3159 3205 3245 3270 3276 3279 3412 3545 3546 3568 3662 3686 3698 3732 3761 3835 3870 3908 3941 3984 4018 4132 4311 4362 4437 4464 4470 4473 4493 4497 4550 4671 4933 187 307 421 1023 1307 1401 1787 2930 3971 4350 4677 CGATGAG/CTCATCG 2 -1 66 66 22 -6.4 26 55 257 299 305 306 389 573 620 787 788 791 850 868 1033 1073 1108 1230 1323 1328 1395 1481 1500 1595 1616 1673 1704 1830 1897 1958 2016 2203 2227 2381 2491 2561 2868 2925 2993 3212 3314 3342 3400 3438 3505 3588 3642 3651 3725 3844 3870 4072 4227 4294 4412 4430 4441 4525 4644 4661 4676 4687 4711 4713 4793 4879 207 424 539 858 1050 1068 1116 1203 1226 1283 1471 1644 1680 1903 2307 3167 3490 3650 3760 3962 4727 4876 CCATCGG/CCGATGG 0 -7 65 64 13 -9.6 60 234 252 299 314 625 645 660 723 838 844 856 955 989 1035 1064 1147 1364 1386 1396 1426 1439 1508 1554 1666 1707 2092 2125 2310 2342 2348 2476 2556 2557 2646 2654 2771 2891 2898 3061 3117 3201 3242 3365 3383 3480 3512 3795 3889 4017 4050 4097 4278 4344 4581 4625 4644 4739 4756 4782 4819 4863 4906 4930 4955 212 812 1236 2027 2204 2214 2504 2890 3183 4189 4192 4459 4865 CTTCGGA/TCCGAAG 0 -6 65 64 20 -6.7 82 158 182 278 354 375 379 823 916 940 998 1014 1030 1115 1203 1266 1376 1407 1661 1675 1817 1839 1900 1991 2019 2135 2192 2219 2326 2355 2391 2450 2478 2500 2617 2764 2769 2780 2809 2821 2879 2960 2990 3106 3215 3224 3273 3291 3304 3331 3381 3609 3659 3796 3974 4059 4273 4307 4442 4458 4629 4775 4892 4943 4965 232 260 295 736 862 1082 1302 1796 1839 1853 2176 2278 2546 2647 3154 3697 4355 4372 4441 4672 CCGATGG/CCATCGG 2 -2 65 64 13 -9.6 60 234 252 299 314 625 645 660 723 838 844 856 955 989 1035 1064 1147 1364 1386 1396 1426 1439 1508 1554 1666 1707 2092 2125 2310 2342 2348 2476 2556 2557 2646 2654 2771 2891 2898 3061 3117 3201 3242 3365 3383 3480 3512 3795 3889 4017 4050 4097 4278 4344 4581 4625 4644 4739 4756 4782 4819 4863 4906 4930 4955 212 812 1236 2027 2204 2214 2504 2890 3183 4189 4192 4459 4865 GACCGGA/TCCGGTC 0 -6 62 62 18 -7.0 8 282 295 327 414 418 531 545 673 680 815 985 1038 1260 1269 1329 1334 1377 1626 1725 1932 1973 1997 2055 2105 2150 2198 2266 2519 2613 2616 2643 2648 2652 2689 2690 2695 2725 2758 2810 2868 2906 2950 2965 2987 3343 3374 3457 3516 3575 3663 3957 4073 4090 4283 4353 4556 4635 4655 4696 4755 4905 194 488 500 545 838 1388 1535 1848 2165 2215 2888 3056 3170 3449 3544 3733 3778 3922 AGTCGGA/TCCGACT 0 -6 64 61 16 -7.6 81 309 472 483 542 563 674 716 759 858 868 874 1073 1156 1353 1430 1484 1570 1678 1891 1985 2010 2142 2157 2209 2337 2362 2516 2547 2589 2682 2816 2895 2914 2966 3067 3121 3135 3167 3296 3334 3550 3591 3659 3674 3694 3729 3746 3908 3931 3978 4021 4058 4069 4078 4174 4210 4352 4376 4573 4577 4608 4791 4807 81 605 1514 1664 2196 2274 2347 2362 2494 2677 2807 2924 2949 3696 4128 4423 CATCGGC/GCCGATG 0 -6 58 61 9 -11.1 55 107 116 124 132 185 200 204 220 299 405 513 672 680 780 844 955 998 1035 1188 1235 1255 1269 1364 1545 1714 1933 2092 2125 2268 2381 2505 2771 2868 2891 2892 2898 2919 3176 3306 3355 3383 3489 3512 3579 3704 3857 3972 3984 4097 4115 4344 4528 4687 4739 4793 4906 4941 599 932 2504 2581 3557 4189 4723 4858 4865 CCCGGAG/CTCCGGG 0 -5 66 61 5 -14.1 235 281 303 342 441 503 597 650 672 675 1074 1186 1205 1381 1659 1684 1722 1880 2002 2098 2125 2296 2300 2334 2435 2521 2582 2688 2730 2783 2866 2931 3044 3094 3142 3158 3255 3328 3348 3350 3351 3358 3539 3592 3656 3823 3847 3863 3873 3912 3953 4084 4250 4299 4339 4347 4563 4687 4697 4698 4794 4842 4843 4911 4926 4940 880 2307 3037 3513 3667 GCGGAGC/GCTCCGC 0 -4 62 61 4 -15.0 82 256 335 490 495 503 558 708 891 1005 1007 1071 1123 1150 1191 1266 1269 1286 1360 1410 1443 1498 1637 1799 1863 1872 1950 1964 2325 2395 2434 2550 2565 2570 2614 2716 2920 2984 3298 3307 3455 3527 3547 3553 3804 3854 3909 3954 4096 4109 4120 4127 4199 4211 4348 4403 4666 4832 4882 4903 4927 4995 2899 3932 4036 4927 GGCGTCG/CGACGCC 0 -2 67 61 11 -9.9 265 299 316 318 803 892 1044 1089 1117 1173 1253 1318 1404 1596 1619 1754 1906 1985 2009 2184 2331 2342 2444 2514 2564 2588 2604 2715 2736 2771 2815 2854 2930 2986 3032 3040 3076 3215 3229 3288 3301 3319 3413 3522 3566 3728 3930 3936 3995 4023 4036 4068 4117 4177 4219 4282 4406 4412 4454 4465 4562 4708 4810 4829 4941 4973 4976 453 522 714 905 932 1696 2242 3982 4073 4329 4724 AGTCGGA/TCCGACT 1 -4 64 61 16 -7.6 81 309 472 483 542 563 674 716 759 858 868 874 1073 1156 1353 1430 1484 1570 1678 1891 1985 2010 2142 2157 2209 2337 2362 2516 2547 2589 2682 2816 2895 2914 2966 3067 3121 3135 3167 3296 3334 3550 3591 3659 3674 3694 3729 3746 3908 3931 3978 4021 4058 4069 4078 4174 4210 4352 4376 4573 4577 4608 4791 4807 81 605 1514 1664 2196 2274 2347 2362 2494 2677 2807 2924 2949 3696 4128 4423 GCCGATG/CATCGGC 2 -3 58 61 9 -11.1 55 107 116 124 132 185 200 204 220 299 405 513 672 680 780 844 955 998 1035 1188 1235 1255 1269 1364 1545 1714 1933 2092 2125 2268 2381 2505 2771 2868 2891 2892 2898 2919 3176 3306 3355 3383 3489 3512 3579 3704 3857 3972 3984 4097 4115 4344 4528 4687 4739 4793 4906 4941 599 932 2504 2581 3557 4189 4723 4858 4865 GGAGCAG/CTGCTCC 0 -2 62 60 17 -7.0 264 272 282 344 578 620 713 727 744 764 812 895 955 974 1121 1191 1199 1246 1269 1308 1374 1443 1459 1507 1512 1707 1799 1919 2092 2107 2111 2138 2238 2436 2550 2570 2626 2752 2968 3011 3480 3760 3854 3860 3870 4104 4109 4152 4174 4199 4279 4311 4419 4469 4512 4677 4773 4790 4819 4842 4931 4958 208 769 938 1360 1462 1574 1790 1889 2444 2522 2741 3838 3971 4090 4360 4566 4977 AGCAACG/CGTTGCT 4 -4 54 60 17 -7.0 30 45 118 120 143 152 184 195 235 259 362 518 553 616 621 837 872 1059 1092 1135 1175 1214 1286 1440 1499 1655 1802 1909 2000 2334 2348 2378 2548 2657 3179 3257 3271 3521 3557 3604 3620 3688 3788 3907 4044 4087 4188 4247 4287 4491 4661 4687 4952 4966 537 862 1079 1106 1531 1965 1977 2336 2407 2449 2924 3417 3657 3668 3672 4276 4312 CGGCGTG/CACGCCG 0 -3 58 59 3 -15.4 51 101 109 117 206 255 430 480 496 680 839 1023 1135 1531 1601 1638 1654 1673 1675 1698 1714 1715 1786 1800 1801 1815 1928 2009 2033 2077 2221 2232 2381 2412 2611 2836 2883 2909 3100 3113 3144 3319 3359 3458 3539 3574 3632 3753 3972 4230 4255 4261 4486 4662 4767 4776 4812 4970 1210 1398 1904 ACGGATT/AATCCGT 1 -2 54 59 19 -6.0 47 154 195 237 271 292 301 324 344 353 415 585 681 692 709 747 767 802 821 823 992 994 1015 1050 1084 1187 1298 1573 1761 1794 1934 2138 2321 2354 2569 2828 2849 2944 3020 3142 3170 3542 3633 3702 3869 4018 4158 4294 4349 4361 4806 4908 4926 4996 131 537 1023 1162 1509 2226 2413 2816 3033 3110 3214 3282 3629 3917 4014 4133 4168 4723 4995 AGCGACG/CGTCGCT 1 -6 58 59 11 -9.5 47 205 206 209 229 250 305 432 541 603 618 803 1099 1151 1224 1252 1253 1271 1455 1651 1656 1792 1885 2020 2115 2163 2185 2200 2264 2328 2331 2439 2588 2628 2637 2765 2869 2871 2893 2899 2918 2942 3175 3301 3538 3566 3657 4137 4214 4289 4311 4372 4412 4419 4481 4642 4739 4745 155 465 521 599 992 1106 3323 4251 4393 4643 4677 CGATGAC/GTCATCG 2 -1 58 59 17 -6.8 47 59 68 183 331 562 678 685 749 791 913 919 998 1235 1254 1307 1351 1372 1641 1700 1733 1812 1847 2019 2082 2234 2237 2238 2301 2324 2422 2522 2571 2590 2658 2705 2721 2899 3045 3122 3156 3223 3288 3395 3554 3645 3704 3721 3827 3966 3972 4165 4205 4274 4275 4290 4435 4770 66 857 1382 1411 2001 2128 2419 2546 2759 3257 3282 3334 3775 4407 4534 4782 4893 ACCGGCG/CGCCGGT 0 -5 60 58 18 -6.2 68 222 250 256 455 616 785 853 915 1057 1066 1265 1375 1522 1631 1640 1645 1695 1715 1835 1897 1930 1996 2048 2270 2291 2301 2331 2382 2481 2485 2604 2680 2749 2771 2888 2890 3063 3319 3324 3360 3457 3476 3498 3571 3621 3652 3689 3995 4008 4012 4117 4305 4334 4550 4692 4802 4857 4923 4979 12 325 410 523 857 865 1084 1292 1901 1904 2185 2630 2663 2842 3025 3114 4160 4309 CGGCGTA/TACGCCG 0 -3 63 58 7 -11.7 55 162 260 501 663 893 939 1034 1073 1154 1184 1280 1363 1482 1559 1631 1802 1894 2039 2092 2169 2202 2219 2328 2361 2422 2558 2678 2770 2790 2833 3099 3164 3240 3274 3354 3357 3362 3381 3417 3500 3551 3678 3783 3939 3951 3975 4023 4040 4082 4136 4253 4277 4579 4686 4691 4692 4717 4747 4791 4847 4850 4860 883 1300 1501 2589 3141 4332 4712 GGATCGG/CCGATCC 0 -7 58 58 16 -6.9 146 148 361 491 493 508 513 588 650 762 775 939 1047 1072 1177 1181 1253 1288 1362 1449 1520 1762 1876 2107 2141 2149 2187 2188 2219 2291 2465 2715 2727 2992 3071 3073 3089 3107 3109 3224 3273 3274 3329 3493 3519 3554 3576 3971 4072 4081 4253 4352 4373 4555 4570 4615 4623 4708 47 51 305 315 2063 2227 2253 2557 2855 3695 3828 3847 4555 4631 4668 4691 GTCGGAA/TTCCGAC 1 -3 56 58 15 -7.3 45 64 161 406 509 563 568 663 674 729 739 759 858 937 1056 1116 1127 1292 1325 1495 1503 1565 1570 1610 1660 1842 1891 1985 2010 2150 2245 2297 2516 2790 2896 2930 2966 3001 3167 3177 3262 3296 3436 3445 3480 3484 3550 3659 3708 3815 4198 4304 4532 4728 4939 4944 693 835 1162 1210 1901 1965 2244 2737 2807 2849 2949 2964 3871 4207 4951 GCAACGA/TCGTTGC 4 -3 51 58 11 -9.2 70 118 120 143 184 195 203 235 259 366 532 553 616 621 746 864 916 983 1019 1092 1135 1214 1440 1499 1802 1909 2000 2001 2133 2182 2205 2283 2327 2548 2554 2710 2805 3050 3079 3212 3257 3688 3872 3921 3953 4087 4247 4287 4661 4809 4952 370 537 1000 1354 1531 1625 1946 1977 2924 2952 3242 GAACGGA/TCCGTTC 0 -6 57 57 15 -7.1 116 177 188 297 301 324 412 521 626 687 744 826 950 951 1083 1210 1293 1295 1348 1470 1500 1533 1539 1661 1687 1836 2132 2137 2235 2276 2408 2454 2516 3086 3321 3422 3551 3788 3855 4036 4111 4127 4130 4163 4205 4215 4312 4388 4493 4582 4588 4658 4725 4751 4764 4806 4836 131 187 302 1018 2242 2255 2383 3033 3124 3214 3358 3448 3903 4817 4930 GGAGCTC/GAGCTCC 0 -2 61 57 17 -6.4 94 264 299 801 821 1016 1039 1134 1334 1360 1364 1381 1589 1626 1650 1724 1734 1747 1786 1830 1881 2070 2172 2382 2422 2434 2597 2614 2704 2895 3014 3062 3082 3141 3245 3307 3480 3549 3595 3596 3651 3739 3820 3908 3929 3944 4018 4051 4096 4337 4473 4518 4541 4550 4569 4631 4751 4820 4929 4986 4995 157 466 602 750 1031 1262 1560 1719 2043 2146 3367 3667 4036 4079 4091 4399 4927 TGCCGGA/TCCGGCA 0 -6 62 57 13 -8.0 85 132 171 288 373 473 642 853 1322 1335 1409 1428 1439 1504 1607 1654 1740 1873 1932 2060 2062 2092 2219 2264 2403 2483 2538 2609 2689 2790 2823 3198 3353 3423 3495 3554 3564 3806 3824 3912 3941 3952 4074 4088 4144 4236 4264 4329 4540 4598 4663 4707 4742 4798 4804 4809 4831 4862 4874 4939 4959 4966 3 250 296 806 2185 2215 2376 2406 4394 4460 4478 4720 4933 ACGGATC/GATCCGT 1 -2 54 57 18 -6.0 5 111 147 155 197 231 236 243 301 392 521 661 685 702 920 1083 1386 1618 1687 1766 1889 1892 1969 2108 2113 2171 2187 2422 2520 2578 2676 2716 2881 2963 3105 3107 3149 3228 3382 3443 3613 3733 3752 3811 3947 4219 4296 4298 4351 4519 4745 4825 4905 4923 89 581 599 799 838 1043 1904 1923 2311 2368 2373 2658 2845 3828 3946 4206 4626 4746 GAACGGA/TCCGTTC 1 -4 57 57 15 -7.1 116 177 188 297 301 324 412 521 626 687 744 826 950 951 1083 1210 1293 1295 1348 1470 1500 1533 1539 1661 1687 1836 2132 2137 2235 2276 2408 2454 2516 3086 3321 3422 3551 3788 3855 4036 4111 4127 4130 4163 4205 4215 4312 4388 4493 4582 4588 4658 4725 4751 4764 4806 4836 131 187 302 1018 2242 2255 2383 3033 3124 3214 3358 3448 3903 4817 4930 TGCCGGA/TCCGGCA 1 -4 62 57 13 -8.0 85 132 171 288 373 473 642 853 1322 1335 1409 1428 1439 1504 1607 1654 1740 1873 1932 2060 2062 2092 2219 2264 2403 2483 2538 2609 2689 2790 2823 3198 3353 3423 3495 3554 3564 3806 3824 3912 3941 3952 4074 4088 4144 4236 4264 4329 4540 4598 4663 4707 4742 4798 4804 4809 4831 4862 4874 4939 4959 4966 3 250 296 806 2185 2215 2376 2406 4394 4460 4478 4720 4933 TCCCGGA/TCCGGGA 0 -6 57 56 16 -6.5 117 196 235 281 303 477 503 628 672 891 908 956 1074 1186 1205 1361 1410 1659 1686 1880 2002 2048 2098 2125 2291 2296 2300 2435 2521 2582 2783 2931 3061 3094 3255 3350 3358 3394 3515 3621 3714 3823 3847 3863 3912 3953 4084 4339 4563 4687 4697 4794 4842 4843 4911 4926 4940 298 859 880 1317 1412 1428 1529 1942 2307 2491 3037 3314 3667 3957 4309 4348 ATGACGG/CCGTCAT 1 -5 55 55 14 -7.1 459 470 619 652 698 728 749 852 880 919 1027 1044 1100 1215 1252 1367 1401 1415 1618 1717 1733 1744 1747 1806 1817 1826 1837 1874 2021 2152 2284 2304 2403 2410 2522 2595 2805 3007 3106 3149 3367 3431 3445 3610 3733 3939 4039 4381 4445 4654 4681 4719 4868 4950 4969 480 780 1067 1298 1691 1807 1842 2368 2373 2754 3744 4146 4407 4995 GAGCAGC/GCTGCTC 4 -5 54 55 18 -5.6 136 264 272 299 423 578 643 819 895 931 955 1033 1081 1121 1172 1175 1206 1246 1258 1305 1308 1387 1525 1799 1848 1958 1970 1984 2052 2092 2247 2261 2550 2611 2626 2668 2861 3096 3480 3554 3632 3830 4039 4061 4104 4108 4279 4419 4598 4691 4736 4810 4819 4885 268 483 515 560 1374 1574 1790 1889 2416 2444 2617 3896 4090 4203 4695 4972 4977 4985 CGATGGT/ACCATCG 2 -1 54 54 17 -5.8 234 314 448 461 499 509 565 574 661 694 699 716 723 880 884 966 1145 1189 1396 1499 1990 2032 2125 2344 2476 2557 2563 2566 2602 2614 2646 2832 2862 2898 3061 3303 3365 3466 3493 3639 3696 3795 3889 3973 4084 4097 4369 4581 4625 4785 4843 4863 4865 4955 586 923 982 1071 1606 1680 1961 2504 3183 3351 3522 3676 4189 4195 4260 4525 4576 CGATCGG/CCGATCG 0 -7 53 53 9 -9.1 187 189 369 385 390 432 441 534 549 621 936 1013 1068 1126 1230 1357 1440 1496 1650 1736 2033 2120 2201 2216 2227 2281 2619 2739 2751 2766 2787 3104 3125 3134 3171 3181 3342 3355 3371 3404 3490 3571 3714 3892 4031 4044 4064 4445 4488 4711 4728 4945 4953 348 427 502 1146 1489 3281 3291 3743 4707 GCGGCGT/ACGCCGC 0 -4 56 53 4 -12.7 206 256 439 480 496 883 927 1029 1095 1117 1246 1318 1395 1482 1523 1527 1601 1715 1741 1780 1815 2033 2039 2117 2202 2219 2221 2381 2428 2678 2909 3036 3040 3080 3223 3301 3362 3381 3433 3500 3609 3632 3676 3678 3753 3818 3951 4136 4219 4230 4486 4662 4767 4812 4860 4989 127 522 2798 4902 TCACGGA/TCCGTGA 0 -6 52 53 7 -10.4 111 194 243 253 353 455 539 587 617 639 662 790 917 943 1138 1345 1467 1526 1529 1570 1598 1691 1858 2013 2097 2129 2138 2197 2398 2573 2626 2692 2694 2760 2795 2842 2880 3218 3321 3345 3516 3541 3638 3683 3742 3812 3907 4118 4260 4267 4500 4721 867 1162 2930 4142 4155 4861 4982 TCACGGA/TCCGTGA 1 -4 52 53 7 -10.4 111 194 243 253 353 455 539 587 617 639 662 790 917 943 1138 1345 1467 1526 1529 1570 1598 1691 1858 2013 2097 2129 2138 2197 2398 2573 2626 2692 2694 2760 2795 2842 2880 3218 3321 3345 3516 3541 3638 3683 3742 3812 3907 4118 4260 4267 4500 4721 867 1162 2930 4142 4155 4861 4982 ATCCGGC/GCCGGAT 0 -6 51 52 12 -7.3 15 200 265 272 359 395 501 689 788 875 933 1248 1325 1344 1685 1699 1750 1795 1800 1808 1856 1861 1956 1987 2100 2121 2219 2483 2677 2748 2822 2824 3164 3268 3274 3286 3527 3779 3952 4024 4031 4081 4213 4264 4306 4341 4371 4571 4599 4831 4900 465 838 1069 2215 2278 2434 3709 3767 3944 3957 3970 4478 GGAGAGC/GCTCTCC 0 -2 55 52 14 -6.5 120 182 472 646 761 787 817 832 966 1085 1092 1147 1393 1561 1633 1756 1811 1890 2062 2136 2161 2195 2406 2428 2602 2644 2704 2774 2779 2966 3022 3075 3288 3398 3437 3549 3596 3759 3905 3963 3978 4016 4191 4314 4338 4373 4481 4547 4576 4675 4711 4731 4756 4844 4929 68 104 163 299 443 566 1078 1250 1747 2382 2646 2715 4140 4762 TAATCGG/CCGATTA 0 -7 51 52 17 -5.4 10 26 217 244 368 483 541 825 846 948 966 988 1023 1268 1318 1390 1569 1598 1777 1898 1930 2077 2107 2154 2248 2263 2356 2682 2753 2762 2786 2790 2961 3221 3294 3318 3378 3551 3565 3705 3771 3781 3798 3998 4205 4275 4365 4478 4693 4895 4918 879 1074 1286 1501 1566 2038 2264 3143 3236 3586 3750 4048 4066 4494 4728 4767 4975 AGACGGT/ACCGTCT 1 -4 48 52 17 -5.4 13 39 51 159 239 271 328 384 423 521 531 680 748 777 802 924 1031 1205 1695 1857 1923 2259 2286 2319 2334 2382 2408 2552 2670 2741 2744 2759 2779 2981 3006 3237 3533 3615 3781 3842 4066 4163 4234 4374 4408 4594 4855 4887 234 569 1019 1210 1327 1382 1493 1770 2160 2284 2465 2675 2759 2848 3038 3399 3426 GCCGGAT/ATCCGGC 1 -3 51 52 12 -7.3 15 200 265 272 359 395 501 689 788 875 933 1248 1325 1344 1685 1699 1750 1795 1800 1808 1856 1861 1956 1987 2100 2121 2219 2483 2677 2748 2822 2824 3164 3268 3274 3286 3527 3779 3952 4024 4031 4081 4213 4264 4306 4341 4371 4571 4599 4831 4900 465 838 1069 2215 2278 2434 3709 3767 3944 3957 3970 4478 ATCTCGG/CCGAGAT 0 -7 49 51 13 -6.7 29 228 288 362 426 444 636 681 850 988 1000 1021 1068 1245 1331 1371 1378 1384 1517 1530 1651 1664 1674 1717 1964 2127 2202 2208 2293 2311 2368 2397 2640 2648 2806 3072 3236 3277 3426 3526 3757 3854 3878 3924 4361 4612 4705 4777 4803 390 718 1181 1450 1818 2055 2530 2552 3115 3512 3545 3971 4105 CCTCGGA/TCCGAGG 0 -6 49 51 10 -8.1 45 180 389 400 471 562 596 606 646 885 904 957 1043 1071 1146 1327 1371 1403 1437 1445 1572 1667 1946 1999 2052 2189 2412 2433 2640 2696 2742 2924 3103 3119 3245 3302 3398 3503 3527 3546 3645 3687 3751 4122 4206 4438 4720 4824 4986 777 1042 1134 2163 2457 2580 2787 4365 4775 4976 GCCGGCG/CGCCGGC 0 -5 57 51 7 -9.8 54 197 432 461 979 1135 1559 1596 1655 1876 1967 2014 2062 2220 2367 2380 2437 2444 2562 2580 2611 2612 2615 2616 2632 2698 2815 2863 3037 3198 3216 3265 3354 3359 3412 3478 3573 3650 3657 3736 3753 3774 3856 3888 3909 3923 3979 3996 4232 4240 4430 4456 4493 4584 4605 4867 4923 190 785 1248 1398 2121 3609 4350 GCTCGGA/TCCGAGC 0 -6 51 51 10 -8.1 58 310 591 636 694 754 796 886 910 957 1153 1218 1399 1473 1586 1593 1605 1628 1757 1890 1893 1959 2000 2096 2128 2138 2164 2168 2208 2352 2429 2454 2506 2597 2602 2694 2726 2852 3054 3463 3819 3822 3887 4124 4150 4216 4305 4410 4845 4876 4947 430 576 764 1751 2892 3956 4029 4203 4444 4618 TTCCGGA/TCCGGAA 0 -6 56 51 11 -7.6 163 422 590 667 789 889 1173 1282 1333 1507 1570 1617 1663 1695 1745 1755 1838 1903 1926 1976 2149 2162 2297 2495 2552 2577 2613 2631 2672 2844 2922 3001 3037 3408 3452 3467 3759 4017 4144 4196 4275 4297 4333 4350 4380 4382 4397 4442 4542 4547 4624 4762 4814 4872 4941 4975 6 260 305 688 871 1113 1328 1795 3529 4378 4593 TTGTCGG/CCGACAA 0 -7 55 51 15 -5.9 64 199 247 406 693 773 1150 1159 1165 1167 1443 1537 1610 1678 1708 1719 1744 1773 1798 2058 2137 2180 2181 2256 2468 2632 2661 2713 2813 2815 3189 3262 3364 3551 3576 3675 3688 3708 3738 3739 3768 3805 3843 4375 4439 4492 4496 4521 4531 4532 4639 4797 4827 4882 4939 227 466 478 704 856 2631 2964 3038 3186 3838 3871 3933 3973 4497 4951 ACGGAAT/ATTCCGT 1 -2 54 51 12 -7.1 165 194 253 280 400 493 642 858 1114 1138 1210 1367 1643 1708 1742 1767 1771 1891 1933 2022 2112 2116 2152 2184 2239 2637 2649 2765 2798 3173 3219 3379 3431 3511 3516 3631 3688 3737 3750 3755 3783 3903 3916 3955 4033 4137 4244 4260 4326 4654 4712 4751 4803 4952 227 730 1430 2088 2691 2721 2791 3093 3124 3285 4256 4982 TTGTCGG/CCGACAA 1 -5 55 51 15 -5.9 64 199 247 406 693 773 1150 1159 1165 1167 1443 1537 1610 1678 1708 1719 1744 1773 1798 2058 2137 2180 2181 2256 2468 2632 2661 2713 2813 2815 3189 3262 3364 3551 3576 3675 3688 3708 3738 3739 3768 3805 3843 4375 4439 4492 4496 4521 4531 4532 4639 4797 4827 4882 4939 227 466 478 704 856 2631 2964 3038 3186 3838 3871 3933 3973 4497 4951 GTCGATG/CATCGAC 2 -3 53 51 10 -8.1 389 461 685 835 913 958 1033 1121 1145 1180 1262 1267 1298 1322 1385 1560 1770 1788 1830 1972 2167 2182 2342 2422 2436 2441 2566 2574 2581 2614 2717 2757 2862 2884 2986 3082 3154 3156 3237 3306 3395 3465 3588 3629 3639 3729 3738 3966 4184 4219 4575 4625 4927 424 1142 1236 2272 2363 2450 3217 3282 3676 4948 GGACGGA/TCCGTCC 0 -6 50 50 7 -9.6 87 159 333 349 484 515 528 675 696 878 926 1002 1015 1040 1187 1242 1248 1530 1569 1669 1671 1691 1819 1978 2084 2259 2357 2586 2759 2977 3008 3114 3123 3159 3205 3225 3259 3389 3546 3710 3813 3916 4132 4262 4294 4490 4622 4631 4702 4883 939 1710 1866 3127 3698 3917 4819 GGACGGA/TCCGTCC 1 -4 50 50 7 -9.6 87 159 333 349 484 515 528 675 696 878 926 1002 1015 1040 1187 1242 1248 1530 1569 1669 1671 1691 1819 1978 2084 2259 2357 2586 2759 2977 3008 3114 3123 3159 3205 3225 3259 3389 3546 3710 3813 3916 4132 4262 4294 4490 4622 4631 4702 4883 939 1710 1866 3127 3698 3917 4819 AGCCGGA/TCCGGCT 0 -6 51 49 11 -7.1 161 164 187 276 417 514 525 680 686 705 748 886 1162 1263 1332 1407 1616 1928 2063 2147 2173 2237 2448 2466 2619 2844 2909 2914 2940 3330 3334 3490 3642 3885 3963 3974 4069 4081 4132 4314 4365 4382 4432 4469 4481 4555 4719 4731 4831 4865 4900 228 389 902 1249 2257 2291 2372 3062 3259 3441 3637 CTCTCGG/CCGAGAG 0 -7 49 49 11 -7.1 84 96 187 290 360 477 581 607 653 722 877 1196 1279 1283 1313 1411 1630 1759 1786 1911 2143 2173 2255 2375 2385 2606 2862 2934 2955 3018 3234 3316 3414 3437 3475 3558 3559 3693 3804 3875 3960 4180 4361 4441 4507 4822 4878 4915 4958 506 1149 1187 2316 2475 2825 3115 3595 3771 4312 4509 AGCCGGA/TCCGGCT 1 -4 51 49 11 -7.1 161 164 187 276 417 514 525 680 686 705 748 886 1162 1263 1332 1407 1616 1928 2063 2147 2173 2237 2448 2466 2619 2844 2909 2914 2940 3330 3334 3490 3642 3885 3963 3974 4069 4081 4132 4314 4365 4382 4432 4469 4481 4555 4719 4731 4831 4865 4900 228 389 902 1249 2257 2291 2372 3062 3259 3441 3637 CGGAGTG/CACTCCG 0 -3 48 48 4 -11.3 52 79 188 327 470 484 564 593 820 950 1056 1342 1388 1396 1528 1695 1755 1851 2015 2044 2065 2196 2197 2310 2341 2348 3076 3199 3248 3413 3711 3752 3873 3990 4031 4086 4223 4281 4312 4354 4424 4487 4584 4586 4632 4653 4665 4872 484 2185 3401 4784 GAGTCGG/CCGACTC 0 -7 47 47 7 -8.8 46 168 309 472 483 542 563 674 759 814 858 868 1038 1073 1156 1251 1430 1891 1953 1985 1992 2334 2516 2547 2682 2816 2966 3051 3067 3130 3135 3296 3351 3550 3591 3604 3729 3746 3931 3978 4021 4069 4109 4210 4363 4577 4855 813 2494 2924 3643 4128 4423 4990 GGTCGGA/TCCGACC 0 -6 46 47 11 -6.7 130 161 255 285 414 423 564 729 780 824 874 937 1016 1325 1448 1510 1546 1660 1734 1796 2150 2170 2262 2344 2363 2618 2790 2809 2888 2896 3092 3261 3340 3436 3437 3445 3484 3509 3775 3788 4009 4050 4259 4335 4515 4530 296 466 835 856 2160 2254 2579 3170 3590 3932 4207 AGACGGC/GCCGTCT 1 -4 47 47 13 -5.8 68 123 241 475 497 551 811 956 982 1116 1141 1272 1520 1525 1740 1751 1811 1872 1911 1961 2151 2184 2261 2300 2389 2466 2479 2621 2891 3097 3139 3229 3254 3353 3458 3497 3548 3668 3767 3826 3917 4214 4351 4579 4621 4713 4934 12 1085 1646 1852 2056 2176 2220 2291 2549 2664 2796 3385 4853 GAGTCGG/CCGACTC 1 -5 47 47 7 -8.8 46 168 309 472 483 542 563 674 759 814 858 868 1038 1073 1156 1251 1430 1891 1953 1985 1992 2334 2516 2547 2682 2816 2966 3051 3067 3130 3135 3296 3351 3550 3591 3604 3729 3746 3931 3978 4021 4069 4109 4210 4363 4577 4855 813 2494 2924 3643 4128 4423 4990 GGTCGGA/TCCGACC 1 -4 46 47 11 -6.7 130 161 255 285 414 423 564 729 780 824 874 937 1016 1325 1448 1510 1546 1660 1734 1796 2150 2170 2262 2344 2363 2618 2790 2809 2888 2896 3092 3261 3340 3436 3437 3445 3484 3509 3775 3788 4009 4050 4259 4335 4515 4530 296 466 835 856 2160 2254 2579 3170 3590 3932 4207 GGAGTCG/CGACTCC 0 -2 46 46 8 -8.0 122 171 309 456 508 563 667 759 782 868 1014 1075 1115 1234 1276 1407 1891 1985 1992 2271 2334 2547 2751 2816 2929 3051 3076 3135 3154 3296 3315 3384 3395 3509 3604 3728 3729 3978 4021 4210 4395 4517 4594 4726 4768 4855 693 1719 2605 2608 2706 2924 3820 4352 AAGCGGA/TCCGCTT 0 -6 47 45 15 -4.7 166 181 256 286 330 467 508 647 766 1325 1343 1530 1770 1829 1887 1908 2135 2164 2217 2227 2246 2282 2392 2434 2558 2831 2957 3195 3202 3382 3486 3661 3662 3687 3695 3765 3960 4092 4149 4265 4320 4403 4597 4610 4666 4676 4882 411 599 1460 1493 1606 1705 1795 1945 2269 2382 2406 2761 4033 4329 4927 TCGATGG/CCATCGA 2 -2 47 45 12 -5.8 431 432 461 499 565 661 670 694 1121 1145 1189 1504 1553 1653 1709 1807 1826 1866 1924 2182 2563 2566 2581 2594 2614 2714 2717 2862 3028 3071 3136 3154 3303 3306 3493 3619 3639 3693 3696 3973 4059 4074 4239 4369 4758 4864 4927 586 1180 1186 1517 1710 2651 3649 3676 4195 4308 4576 4703 AGCAGCG/CGCTGCT 4 -4 43 45 10 -6.7 29 224 423 511 578 603 638 852 955 1121 1206 1246 1258 1299 1387 1712 1799 1811 1895 1911 1984 2052 2092 2187 2394 2644 2658 2710 2859 2861 2912 3097 3274 3554 3704 3723 3975 4108 4419 4535 4743 4807 4949 268 483 652 902 1528 1644 1796 3569 3714 4394 CGGCGCT/AGCGCCG 0 -3 44 44 6 -8.7 54 204 222 342 541 593 979 1021 1225 1235 1258 1299 1534 1699 1756 1856 1859 1865 1873 1902 2092 2115 2349 2595 2771 2940 3651 3723 3782 3865 4012 4048 4114 4129 4240 4244 4356 4482 4528 4640 4696 4777 4804 4895 231 813 1248 2184 4331 4407 GCGGCGC/GCGCCGC 0 -4 46 44 9 -7.0 222 461 593 893 913 1185 1258 1264 1299 1385 1451 1707 1756 1865 1952 2033 2092 2113 2115 2145 2394 2595 2680 2698 2750 2825 2832 2885 3097 3137 3220 3522 3615 3743 3855 3865 3928 3938 3966 3975 4091 4335 4440 4482 4539 4944 12 983 1790 2184 2443 2967 3657 4331 4901 GGAGCCG/CGGCTCC 0 -2 51 44 11 -6.0 634 748 904 1628 1720 1784 1798 1872 1892 1905 2070 2098 2125 2237 2322 2360 2466 2672 2708 2869 3001 3098 3144 3167 3232 3276 3490 3563 3646 3698 3795 3804 3815 3817 3852 3892 3909 3920 3979 4008 4017 4077 4120 4132 4344 4488 4493 4580 4671 4865 4975 96 275 389 421 843 1187 1711 1795 2569 3796 4238 ACGGAAC/GTTCCGT 1 -2 41 44 12 -5.6 86 138 217 361 384 405 443 484 488 518 693 766 783 1115 1144 1260 1529 1539 1565 1694 1769 2034 2186 2380 2408 2476 2627 2680 2681 2798 3325 3370 3750 3891 3907 4111 4381 4505 4537 4614 4702 480 500 864 1091 1347 1833 2255 2646 2670 4210 4249 4794 CTGACGG/CCGTCAG 1 -5 48 44 7 -8.1 525 656 664 702 903 920 945 1086 1097 1219 1266 1382 1544 1884 1969 2034 2157 2699 2774 2797 2798 2867 2881 3023 3385 3509 3568 3704 3732 3739 3787 3836 3938 3955 4066 4141 4330 4333 4334 4351 4413 4425 4500 4519 4583 4626 4789 4873 20 118 200 807 1053 1496 2426 GCAACGG/CCGTTGC 4 -3 40 44 10 -6.5 30 40 85 92 107 217 292 362 549 583 593 821 837 1059 1175 1307 1331 1337 1456 1707 2348 2657 3271 3491 3584 3604 3608 3620 3891 3992 4044 4109 4188 4214 4264 4269 4384 4491 4635 4942 1079 1106 1924 2336 2817 3657 3668 4073 4276 4984 GGAGACC/GGTCTCC 0 -2 44 43 6 -8.5 210 217 407 530 790 880 989 1028 1116 1144 1306 1320 1403 1444 1613 1953 1959 1997 2002 2063 2183 2201 2209 2230 2298 2457 2748 2795 2954 3163 3360 3365 3410 3617 3645 3949 4108 4163 4194 4269 4444 4500 4649 4780 255 389 1243 2121 2333 2715 GTATCGG/CCGATAC 0 -7 42 42 10 -6.0 122 139 178 182 217 267 463 665 759 1492 1501 1546 1768 1832 1970 2031 2061 2111 2124 2149 2276 2652 2807 2921 3239 3405 3431 3438 3515 3579 3594 3691 3707 3847 3950 4051 4101 4136 4338 4515 4744 4995 305 396 444 526 1411 2559 2809 3050 3556 4283 CGATGGC/GCCATCG 2 -1 44 42 11 -5.6 252 641 645 831 955 1064 1147 1364 1386 1426 1504 1587 1621 1653 1666 1780 1783 1924 2092 2173 2342 2381 2432 2556 2594 2608 2714 3136 3143 3242 3306 3619 3693 4074 4079 4269 4470 4552 4644 4651 4714 4780 4819 4927 1186 1582 1710 1966 2890 3347 3748 3770 4192 4308 4774 GGCCGGA/TCCGGCC 0 -6 41 41 10 -5.8 226 327 346 367 560 577 629 689 1003 1056 1107 1190 1258 1353 1405 1447 1479 1843 1967 2089 2351 2813 3014 3063 3348 3736 3747 3888 4031 4041 4111 4122 4125 4368 4374 4556 4599 4716 4790 4855 4861 492 1161 1778 1885 2108 2278 2434 3125 3944 3957 GGCCGGA/TCCGGCC 1 -4 41 41 10 -5.8 226 327 346 367 560 577 629 689 1003 1056 1107 1190 1258 1353 1405 1447 1479 1843 1967 2089 2351 2813 3014 3063 3348 3736 3747 3888 4031 4041 4111 4122 4125 4368 4374 4556 4599 4716 4790 4855 4861 492 1161 1778 1885 2108 2278 2434 3125 3944 3957 AGGCGGA/TCCGCCT 0 -6 43 40 12 -4.8 78 407 417 1038 1123 1188 1191 1197 1203 1272 1328 1403 1410 1705 1754 1799 2156 2200 2219 2490 2551 2833 2841 2856 3149 3240 3248 3389 3433 3447 3553 3610 3877 3886 4074 4096 4123 4567 4592 4604 4920 4927 4995 228 334 484 881 953 2243 2663 2668 3037 3182 3678 4754 GCGCCGG/CCGGCGC 1 -5 43 40 6 -7.7 54 197 256 342 432 842 979 1066 1341 1534 1699 1856 2268 2349 2680 2698 2771 2815 2863 3037 3216 3318 3360 3457 3522 3689 3723 3811 3816 3952 3957 4012 4048 4129 4240 4520 4623 4640 4696 4777 4804 4895 4944 231 444 978 1248 3954 4309 TGAGTCG/CGACTCA 3 -5 38 40 9 -6.0 33 46 80 168 300 397 573 674 814 840 1073 1107 1156 1430 1521 1622 1799 1953 1969 2516 2984 3027 3067 3130 3135 3311 3522 3550 3578 3639 3690 3763 3903 4020 4109 4212 4661 4953 220 1070 1860 2232 2273 2728 2839 4128 4990 CGGAGGG/CCCTCCG 0 -3 41 39 8 -6.3 207 250 282 297 796 911 1401 1492 1697 1783 1819 1836 1891 1895 1931 1979 1991 2097 2246 2320 2504 2689 2720 2885 2888 3266 3493 3510 3544 3576 3807 3950 4041 4173 4272 4301 4482 4503 4570 4803 4973 389 564 1018 1778 2227 3037 3128 3789 GCGTCGG/CCGACGC 0 -7 40 39 6 -7.4 46 50 216 277 470 558 900 1318 1388 1420 1619 1754 1917 1985 2184 2245 2450 2705 2715 2726 2771 2779 2815 2930 3051 3075 3158 3563 3815 3930 3936 4061 4177 4511 4515 4590 4670 4708 4740 4829 502 1650 2849 3174 3982 4677 GCGTCGG/CCGACGC 1 -5 40 39 6 -7.4 46 50 216 277 470 558 900 1318 1388 1420 1619 1754 1917 1985 2184 2245 2450 2705 2715 2726 2771 2779 2815 2930 3051 3075 3158 3563 3815 3930 3936 4061 4177 4511 4515 4590 4670 4708 4740 4829 502 1650 2849 3174 3982 4677 CGCGGCG/CGCCGCG 0 -5 39 38 8 -6.1 359 395 496 593 706 883 1029 1033 1171 1299 1498 1565 1715 1741 1780 1874 1880 1882 2033 2389 2786 2858 2884 2919 3172 3223 3362 3381 3395 3449 3632 3676 3743 3954 4061 4131 4198 4444 4454 2226 2967 3709 3713 3970 4166 4331 4901 CGGAGCG/CGCTCCG 0 -3 38 38 5 -7.8 91 141 335 503 874 972 1002 1005 1035 1185 1318 1526 1540 1637 1650 1687 1757 1762 1865 2296 2331 2495 2713 2740 3455 3490 3502 3553 3667 3836 3887 4114 4275 4310 4403 4497 4832 4965 81 1795 2415 4350 4677 CTTCGGC/GCCGAAG 0 -6 40 38 10 -5.1 33 254 670 787 921 1036 1389 1476 1538 1796 1830 1998 2328 2364 2431 2494 2737 2755 2764 3070 3132 3163 3232 3240 3258 3322 3403 3416 3428 3457 3588 4008 4109 4118 4166 4217 4308 4443 4494 4871 46 373 586 764 776 1696 2013 2775 2838 3375 CAGCGGC/GCCGCTG 0 -6 39 36 6 -6.7 511 893 908 913 1258 1385 1421 1712 1751 1756 1777 1811 1829 1856 1911 2092 2202 2288 2394 2609 2754 3097 3220 3360 3363 3440 3444 3522 3844 3928 3951 3975 4023 4163 4215 4230 4493 4524 4669 231 275 387 820 1668 4892 GGCGAGC/GCTCGCC 0 -2 37 36 6 -6.7 158 276 296 447 927 1137 1140 1171 1223 1294 1462 1855 2044 2143 2216 2397 2411 2434 2442 2520 2766 3018 3196 3320 3354 3416 3456 3509 3542 4019 4208 4341 4543 4779 4878 4919 4986 509 919 1328 2948 3666 4823 GGCGAGT/ACTCGCC 0 -2 37 36 8 -5.6 241 248 321 359 729 813 887 890 1058 1261 1527 1559 2094 2231 2421 2448 2460 2528 2571 2585 2891 2923 3003 3073 3114 3158 3173 3282 3426 3472 3668 3836 3923 4042 4139 4334 4819 1453 1547 1942 2901 3125 3609 3970 4623 TGCGGAG/CTCCGCA 0 -5 39 36 6 -6.7 327 361 490 558 626 898 1134 1360 1550 1696 1950 1964 2238 2286 2395 2476 2550 2570 2673 2783 2859 2864 3066 3298 3365 3602 3773 3833 3863 4041 4109 4154 4232 4474 4527 4529 4612 4903 4931 137 930 1111 1250 2916 3202 TGGACGG/CCGTCCA 0 -7 36 36 4 -8.0 87 349 461 484 545 675 696 809 1002 1015 1040 1187 1530 1569 1978 2259 2357 2425 2528 2574 2586 2977 3090 3123 3225 3666 3710 3777 3948 4356 4542 4622 4631 4702 4715 4915 367 992 2262 4752 TGGACGG/CCGTCCA 1 -5 36 36 4 -8.0 87 349 461 484 545 675 696 809 1002 1015 1040 1187 1530 1569 1978 2259 2357 2425 2528 2574 2586 2977 3090 3123 3225 3666 3710 3777 3948 4356 4542 4622 4631 4702 4715 4915 367 992 2262 4752 TACGGCG/CGCCGTA 0 -5 36 34 9 -4.7 72 109 320 322 663 748 1028 1109 1776 1800 1863 1928 2009 2583 2592 2620 2716 2833 2868 2923 3025 3259 3314 3389 3554 3663 3805 3811 3842 4003 4131 4132 4316 4513 4687 4970 167 459 714 1294 1501 1607 1795 3710 4407 TCGGCGC/GCGCCGA 0 -4 33 34 6 -6.2 187 204 405 541 842 1021 1225 1235 1245 1317 1555 1707 1741 1853 1859 1873 1902 2268 2771 3097 3318 3355 3457 3489 3594 3782 3896 4114 4332 4344 4356 4528 4936 67 686 813 3030 4191 4857 CTACGGA/TCCGTAG 0 -6 33 33 5 -6.5 1 164 287 306 579 897 1064 1274 1460 1507 1525 1635 1643 1678 2018 2123 2302 2899 2981 2986 3243 3647 3905 3977 3984 4093 4126 4153 4361 4586 4738 4851 4905 838 2658 2768 2791 4210 CTACGGA/TCCGTAG 1 -4 33 33 5 -6.5 1 164 287 306 579 897 1064 1274 1460 1507 1525 1635 1643 1678 2018 2123 2302 2899 2981 2986 3243 3647 3905 3977 3984 4093 4126 4153 4361 4586 4738 4851 4905 838 2658 2768 2791 4210 GCAGCGA/TCGCTGC 4 -3 33 32 10 -3.9 224 402 423 578 603 898 1315 1394 1501 1525 1559 1712 1799 1984 2052 2071 2187 2621 2644 2710 2893 2912 3274 3339 3429 3452 3554 3590 3952 4097 4157 4535 4867 268 456 459 483 652 999 1352 1644 3455 4994 GCAGCGG/CCGCTGC 0 -7 32 31 7 -4.9 29 84 511 893 913 1206 1246 1258 1700 1712 1777 1811 1895 1911 2092 2327 2394 2754 2861 3097 3648 3704 3975 4108 4120 4230 4419 4493 4669 4743 4949 4951 197 275 820 1065 2562 3569 4394 GCAGCGG/CCGCTGC 4 -3 32 31 7 -4.9 29 84 511 893 913 1206 1246 1258 1700 1712 1777 1811 1895 1911 2092 2327 2394 2754 2861 3097 3648 3704 3975 4108 4120 4230 4419 4493 4669 4743 4949 4951 197 275 820 1065 2562 3569 4394 TGCAACG/CGTTGCA 4 -4 29 31 8 -4.5 40 70 217 366 387 532 864 1019 1192 1237 1331 1590 2182 2327 2395 2554 2700 2879 3050 3055 3491 3584 3608 3921 3953 3992 4155 4384 4942 1000 1251 1354 2525 2817 3242 4381 4801 CGGCGCA/TGCGCCG 0 -3 30 30 9 -3.8 197 320 405 461 497 1185 1317 1555 1756 1853 1859 2033 2621 2750 2825 2863 3037 3220 3254 3489 3594 3615 3743 3842 3896 3966 4173 4332 4344 4539 647 978 983 2271 2967 3030 4191 4893 4901 GGAGCCT/AGGCTCC 0 -2 33 30 6 -5.2 125 490 493 558 717 801 1123 1453 2123 2125 2162 2256 2773 3019 3107 3207 3279 3298 3351 3438 3555 3641 3764 3787 3876 4059 4061 4225 4437 4464 4685 4698 4852 1768 2211 2694 3004 4303 4823 GCATCGG/CCGATGC 0 -7 29 29 9 -3.6 93 95 204 602 780 806 1188 1255 1374 1669 1786 2300 2328 2384 2773 2836 2943 3191 3199 3251 3264 3355 3544 3807 3810 3972 3975 4482 4604 373 834 932 1415 1902 2444 3174 3477 3945 GGAGGTC/GACCTCC 0 -2 30 29 8 -4.0 72 161 229 1028 1415 1534 1917 2051 2070 2250 2298 2351 2425 2483 2526 2752 2839 2914 2974 3237 3263 3277 3330 3396 3550 3570 3581 4222 4297 4921 1057 1236 3494 3932 3986 4160 4480 4782 CGACGGG/CCCGTCG 1 -4 27 28 5 -5.3 32 45 271 305 531 626 683 958 1135 1800 1840 1892 1973 2070 2439 2933 3082 3105 3164 3254 3281 3767 3963 3968 4273 4419 4530 305 423 483 1901 2083 ATGCCGG/CCGGCAT 0 -7 29 27 7 -4.0 54 171 373 461 473 1020 1322 1740 2014 2060 2403 2612 2763 3061 3495 3554 3774 3806 4039 4088 4139 4181 4358 4580 4584 4663 4707 4742 4874 747 2121 2215 2879 3398 4460 4478 GGCGACT/AGTCGCC 0 -2 29 27 9 -3.2 33 362 667 940 1000 1147 1435 1521 1943 2471 2599 2677 2835 2929 3027 3045 3059 3315 3384 3984 4132 4164 4214 4243 4295 4430 4645 4740 4768 220 975 2097 2848 3005 3401 3609 3902 4865 TTGCGGA/TCCGCAA 0 -6 28 27 9 -3.2 59 101 135 308 327 783 846 901 2238 2306 2476 2550 2673 2975 3048 3323 3602 3773 3833 3863 4109 4154 4232 4401 4474 4527 4529 4903 137 930 1250 1453 1802 1870 3151 3202 3248 CTTGCCG/CGGCAAG 1 -6 31 27 6 -4.5 240 433 510 1373 1654 1682 1889 2001 2086 2609 2712 2823 2998 3090 3138 3365 3484 3499 3548 3559 3824 4144 4264 4277 4329 4398 4662 4685 4798 4862 4959 2376 2406 4497 4528 4720 4835 GGCAACG/CGTTGCC 4 -4 25 27 7 -4.0 85 107 292 463 549 583 593 746 916 983 1307 1337 1456 1741 1801 2001 2205 2710 3079 3212 4214 4269 4456 4635 4809 370 1442 1946 2363 2952 4073 4183 CTATCGG/CCGATAG 0 -7 27 26 8 -3.4 513 727 827 881 1091 1349 1444 1534 1584 1792 1867 1979 2070 2196 2836 2963 2969 2984 3057 3178 3488 3820 3874 4731 4795 4822 4976 1271 2372 2910 3184 3197 3353 3631 4423 GAGCGGC/GCCGCTC 0 -6 30 26 5 -4.8 910 1071 1076 1140 1185 1677 1726 1815 1862 1909 2609 2873 2937 3114 3137 3267 3276 3456 3490 3559 3836 4233 4539 4552 4607 4724 4767 4833 4965 4975 794 1226 1507 4027 4574 GGCGTGG/CCACGCC 0 -2 26 26 6 -4.3 109 166 206 369 480 1313 1601 1698 1800 1801 1815 1928 2221 2242 2381 2437 3753 3767 3899 4230 4293 4333 4486 4662 4767 4970 1210 1398 2088 2631 2906 3374 CAGACGG/CCGTCTG 1 -5 25 26 7 -3.8 43 143 423 563 802 851 1116 1320 1419 1695 1923 1933 1961 2488 2509 2681 3254 3784 3917 4158 4338 4420 4426 4702 4838 606 2010 2160 2286 2291 2848 4117 GGCAGCT/AGCTGCC 4 -4 28 26 8 -3.4 84 227 516 877 894 925 1075 1259 1439 2165 2321 2434 2455 2843 2891 2959 3355 3787 3814 4010 4079 4119 4486 4551 4881 4900 4955 4966 275 1284 1851 2617 3154 3387 3794 4353 GGCGCTT/AAGCGCC 0 -2 23 25 6 -4.0 122 204 222 342 593 614 1235 1375 1390 1534 1699 1859 1902 2349 2771 2940 3651 3782 3865 4012 4356 4647 4804 813 2184 4087 4331 4407 4756 CGGAACG/CGTTCCG 1 -1 25 25 5 -4.5 138 202 224 703 769 783 1016 1539 2132 2186 2204 2408 2418 2627 2680 2683 2844 2966 3014 3261 3524 4505 4728 4850 4887 480 554 822 2670 3286 TATCGGC/GCCGATA 0 -6 28 24 7 -3.4 433 842 1304 1546 1768 1784 1792 1802 2276 2296 2412 2836 2921 2951 3159 3219 3431 3515 3594 3699 3847 4136 4614 4627 4695 4857 4946 4976 86 190 396 868 1364 3702 3845 GACGGCA/TGCCGTC 1 -3 26 24 4 -4.9 509 746 1127 1252 1478 1525 1650 1682 1792 2086 2120 2190 2300 2319 2567 2891 3090 3160 3281 3417 3548 4214 4356 4531 4615 4857 480 1646 2291 2419 CGGCAGC/GCTGCCG 4 -5 28 24 3 -5.6 877 925 1075 1259 1322 1428 1439 1780 2040 2092 2297 2394 2754 2891 3429 3787 3806 4010 4026 4097 4486 4551 4580 4867 4934 4955 4965 4966 307 459 1360 GACGGAC/GTCCGTC 1 -3 23 23 7 -3.2 249 323 459 564 852 1100 1171 1671 1682 1691 2165 2284 2410 2584 2867 3038 3114 3762 4011 4334 4760 4927 4950 326 716 807 2754 3935 4096 4290 CCCGGCG/CGCCGGG 0 -5 24 22 4 -4.4 260 305 842 858 1341 1776 1851 2296 2678 2708 2808 2839 2858 2930 3315 3340 3392 3533 3633 3957 4623 4791 4887 4992 679 2663 4341 4623 CGGACGG/CCGTCCG 1 -5 21 21 4 -4.1 159 515 563 633 964 1141 1671 1691 1817 1819 1915 2077 2216 2584 2605 3059 3114 3395 3546 4055 4676 598 2106 3231 4901 CGTACGG/CCGTACG 1 -5 22 21 5 -3.6 695 708 816 818 1121 1742 1858 1892 1908 1928 2169 2260 2422 2597 2684 2794 3896 4064 4091 4446 4550 4783 930 1017 1023 1855 2885 CGCGGAG/CTCCGCG 0 -5 21 20 5 -3.3 22 992 1257 1286 1405 1637 1697 2614 2712 2721 3307 3362 3570 3676 3694 4127 4187 4348 4489 4546 4637 354 1719 2891 3157 4166 CTTACGG/CCGTAAG 0 -7 22 20 3 -4.5 301 683 757 924 1586 1711 1776 2683 2868 2905 2998 3025 3279 3375 3487 3631 3718 3747 3842 4687 4947 4970 1445 3369 3794 GGACGGC/GCCGTCC 1 -4 21 20 3 -4.5 461 545 735 809 1121 1817 2077 2103 2190 2528 2567 3090 3160 3395 3846 3896 4055 4356 4715 4915 4979 423 2106 3725 CGCAACG/CGTTGCG 4 -4 19 20 4 -3.9 92 138 203 665 821 1596 1704 1707 1734 2133 2283 2805 3694 3872 3891 4109 4238 4264 4553 1625 4073 4931 4984 CGCTCGC/GCGAGCG 0 -10 18 18 2 -4.7 39 927 936 1140 1462 1756 1909 2143 2144 2185 2411 2434 2766 3354 3509 4297 4341 4543 1328 2948 GGCGACC/GGTCGCC 0 -2 21 18 3 -4.0 900 1278 1830 2033 2103 2105 2439 2616 2755 2868 3268 3627 3660 3676 3801 3872 3918 4221 4314 4317 4553 187 1236 1288 GTCCGGC/GCCGGAC 0 -6 22 18 4 -3.4 321 1056 1986 2205 2703 2784 2914 3156 3414 3497 3747 3749 3783 3952 4041 4077 4277 4542 4657 4694 4804 4887 902 1885 2291 3513 GCCGGAC/GTCCGGC 1 -3 22 18 4 -3.4 321 1056 1986 2205 2703 2784 2914 3156 3414 3497 3747 3749 3783 3952 4041 4077 4277 4542 4657 4694 4804 4887 902 1885 2291 3513 CCCTCGG/CCGAGGG 0 -7 17 15 3 -3.2 82 222 503 1297 2412 2574 2617 2750 3245 3587 4122 4194 4206 4438 4710 4824 4936 1134 2082 4775