#5000/5000 #9.91 # k-mer/r.c. Cluster Offset PosCt wPosCt NegCt HGP_10 TTGGTC/GACCAA 1 -5 508 541 171 -48.9 0 4 12 16 20 40 44 48 57 60 77 83 96 97 100 109 114 116 117 118 124 125 134 161 167 184 195 196 216 217 242 251 252 266 273 307 308 319 320 321 322 355 362 372 384 415 417 420 424 425 431 440 442 446 453 463 480 497 498 499 505 506 507 509 515 523 539 540 543 544 546 562 589 590 592 607 620 625 627 632 637 638 639 647 678 683 690 695 714 715 729 736 739 777 786 793 816 825 837 850 853 861 868 886 890 891 898 967 968 970 992 994 995 996 1006 1027 1036 1037 1048 1060 1065 1071 1093 1094 1096 1097 1098 1100 1112 1114 1126 1142 1145 1160 1169 1177 1178 1179 1186 1206 1207 1212 1239 1245 1248 1249 1250 1269 1270 1286 1302 1307 1310 1318 1321 1322 1327 1328 1329 1347 1354 1365 1366 1368 1369 1373 1384 1401 1440 1487 1496 1524 1533 1539 1550 1556 1557 1558 1581 1595 1608 1612 1630 1636 1637 1638 1644 1645 1665 1678 1685 1704 1705 1709 1712 1715 1717 1718 1735 1736 1754 1764 1765 1769 1783 1802 1804 1831 1857 1876 1895 1896 1897 1918 1923 1928 1937 1953 1963 1965 1966 1975 1985 1987 1991 1998 2014 2015 2038 2042 2043 2056 2064 2065 2069 2081 2111 2116 2117 2142 2157 2179 2182 2183 2190 2214 2215 2216 2244 2245 2247 2251 2253 2256 2259 2266 2276 2284 2285 2297 2299 2327 2330 2331 2337 2357 2364 2367 2368 2373 2375 2376 2388 2392 2393 2396 2407 2416 2425 2445 2452 2462 2476 2477 2479 2493 2494 2495 2515 2536 2543 2567 2568 2578 2586 2587 2589 2595 2611 2612 2628 2642 2687 2688 2689 2690 2701 2728 2751 2758 2776 2783 2788 2804 2842 2843 2850 2853 2854 2855 2859 2880 2890 2891 2898 2904 2910 2911 2927 2931 2942 2963 2968 2969 3031 3061 3063 3151 3153 3177 3198 3199 3203 3206 3216 3222 3223 3229 3233 3243 3247 3255 3269 3270 3271 3277 3288 3308 3315 3320 3337 3351 3360 3394 3397 3400 3422 3445 3464 3468 3469 3470 3491 3492 3535 3564 3586 3593 3594 3597 3619 3637 3646 3650 3651 3652 3664 3665 3673 3674 3682 3692 3721 3733 3734 3740 3746 3752 3759 3771 3776 3785 3797 3807 3856 3860 3861 3862 3878 3892 3912 3913 3923 3934 3951 3956 3963 3971 3981 3991 3992 4006 4015 4016 4049 4053 4077 4083 4091 4096 4097 4099 4105 4119 4126 4155 4179 4196 4198 4199 4200 4208 4215 4227 4229 4230 4243 4262 4277 4287 4288 4304 4310 4316 4325 4332 4361 4371 4384 4398 4399 4410 4418 4428 4446 4450 4459 4460 4487 4495 4501 4509 4536 4546 4559 4574 4576 4581 4584 4587 4599 4617 4623 4628 4629 4631 4644 4645 4663 4683 4705 4729 4732 4758 4759 4831 4835 4859 4883 4912 4922 4946 4954 4957 4958 4993 4996 4997 8 87 133 173 175 258 261 269 282 302 437 440 451 473 486 512 542 567 574 577 588 710 715 716 751 794 800 831 849 860 903 907 958 969 983 1014 1021 1026 1030 1032 1048 1126 1143 1159 1180 1205 1245 1250 1304 1306 1307 1324 1354 1375 1380 1423 1454 1464 1483 1561 1568 1590 1608 1610 1660 1698 1719 1757 1762 1782 1817 1836 1954 1970 1989 2019 2077 2078 2096 2141 2223 2225 2309 2329 2358 2359 2369 2383 2432 2446 2480 2493 2633 2660 2664 2668 2787 2789 2794 2799 2802 2856 2880 2882 2903 3013 3018 3044 3062 3073 3086 3088 3130 3133 3180 3190 3208 3222 3223 3269 3282 3349 3356 3369 3373 3447 3457 3462 3487 3523 3598 3620 3625 3663 3683 3700 3729 3776 3836 3874 3979 4003 4038 4101 4192 4229 4248 4291 4346 4397 4401 4429 4449 4455 4555 4556 4563 4573 4631 4699 4728 4742 4745 4765 4806 4809 4819 4820 4830 4894 4971 TGGACC/GGTCCA 0 -3 495 540 95 -81.4 0 10 12 22 35 40 41 45 59 75 78 83 115 116 124 125 134 139 140 152 160 163 171 204 211 212 227 243 246 247 256 257 258 259 260 274 287 298 304 305 306 307 308 314 316 322 327 328 361 374 381 384 397 404 414 435 438 446 452 453 457 458 463 477 480 485 496 498 506 507 519 540 544 555 560 562 577 590 593 594 598 609 610 648 662 670 678 680 681 690 696 697 717 718 720 737 738 741 742 751 775 777 792 807 820 821 827 833 877 881 883 884 885 891 903 909 917 925 926 932 933 962 968 989 994 995 1004 1027 1044 1045 1049 1064 1083 1097 1098 1100 1138 1186 1200 1203 1204 1206 1213 1214 1222 1245 1248 1249 1250 1253 1257 1258 1263 1264 1269 1270 1283 1286 1304 1306 1309 1314 1331 1340 1355 1384 1389 1398 1401 1402 1413 1415 1423 1440 1467 1488 1493 1496 1500 1528 1563 1565 1575 1593 1599 1608 1615 1629 1646 1649 1656 1670 1677 1683 1688 1708 1711 1721 1734 1747 1753 1754 1756 1766 1769 1771 1773 1797 1813 1814 1841 1864 1882 1889 1906 1908 1910 1923 1932 1933 1972 1994 2007 2021 2023 2033 2034 2038 2039 2041 2042 2043 2044 2045 2053 2054 2061 2065 2069 2080 2081 2101 2106 2108 2110 2126 2149 2199 2200 2203 2211 2239 2244 2245 2253 2264 2266 2274 2280 2281 2287 2295 2296 2298 2310 2323 2332 2336 2342 2359 2384 2387 2389 2402 2407 2421 2429 2432 2436 2455 2462 2478 2480 2483 2493 2494 2512 2534 2535 2536 2540 2586 2587 2593 2609 2635 2638 2673 2680 2694 2707 2716 2739 2740 2761 2771 2774 2777 2784 2798 2809 2818 2838 2849 2859 2860 2866 2867 2880 2888 2889 2900 2912 2913 2922 2923 2958 2965 2971 2985 3000 3004 3006 3015 3017 3018 3049 3060 3070 3086 3108 3109 3111 3159 3172 3193 3204 3205 3206 3216 3221 3239 3240 3255 3259 3260 3272 3283 3303 3304 3308 3314 3341 3345 3348 3389 3391 3409 3410 3420 3432 3436 3451 3454 3469 3474 3475 3489 3501 3507 3524 3531 3532 3564 3568 3571 3585 3627 3633 3637 3639 3641 3649 3652 3654 3660 3665 3674 3698 3699 3701 3714 3720 3724 3735 3737 3738 3752 3759 3771 3796 3812 3813 3835 3861 3862 3873 3881 3900 3922 3934 3937 3951 3953 3954 3955 3965 4006 4035 4072 4073 4078 4096 4122 4125 4131 4132 4154 4164 4198 4201 4209 4210 4230 4248 4251 4266 4289 4293 4335 4391 4415 4419 4430 4431 4454 4476 4494 4509 4525 4527 4536 4545 4547 4579 4591 4603 4614 4632 4634 4664 4683 4689 4698 4705 4719 4722 4747 4754 4760 4773 4777 4794 4850 4880 4886 4905 4919 4929 4947 4948 4957 4968 4996 4998 38 58 61 189 275 388 409 431 437 460 512 558 562 684 696 716 720 751 769 822 898 935 1035 1083 1163 1200 1358 1377 1396 1400 1438 1470 1507 1545 1649 1682 1684 1702 1703 1718 1757 1791 1865 1906 1955 2093 2099 2154 2202 2383 2399 2431 2446 2552 2691 2719 2746 2789 2799 2865 2876 2903 3086 3094 3146 3263 3282 3397 3406 3413 3487 3608 3618 3620 3623 3663 3702 3738 3757 3789 4018 4029 4038 4080 4172 4208 4248 4367 4456 4531 4577 4648 4843 4870 4964 GGTCCA/TGGACC 1 -3 495 540 95 -81.4 0 10 12 22 35 40 41 45 59 75 78 83 115 116 124 125 134 139 140 152 160 163 171 204 211 212 227 243 246 247 256 257 258 259 260 274 287 298 304 305 306 307 308 314 316 322 327 328 361 374 381 384 397 404 414 435 438 446 452 453 457 458 463 477 480 485 496 498 506 507 519 540 544 555 560 562 577 590 593 594 598 609 610 648 662 670 678 680 681 690 696 697 717 718 720 737 738 741 742 751 775 777 792 807 820 821 827 833 877 881 883 884 885 891 903 909 917 925 926 932 933 962 968 989 994 995 1004 1027 1044 1045 1049 1064 1083 1097 1098 1100 1138 1186 1200 1203 1204 1206 1213 1214 1222 1245 1248 1249 1250 1253 1257 1258 1263 1264 1269 1270 1283 1286 1304 1306 1309 1314 1331 1340 1355 1384 1389 1398 1401 1402 1413 1415 1423 1440 1467 1488 1493 1496 1500 1528 1563 1565 1575 1593 1599 1608 1615 1629 1646 1649 1656 1670 1677 1683 1688 1708 1711 1721 1734 1747 1753 1754 1756 1766 1769 1771 1773 1797 1813 1814 1841 1864 1882 1889 1906 1908 1910 1923 1932 1933 1972 1994 2007 2021 2023 2033 2034 2038 2039 2041 2042 2043 2044 2045 2053 2054 2061 2065 2069 2080 2081 2101 2106 2108 2110 2126 2149 2199 2200 2203 2211 2239 2244 2245 2253 2264 2266 2274 2280 2281 2287 2295 2296 2298 2310 2323 2332 2336 2342 2359 2384 2387 2389 2402 2407 2421 2429 2432 2436 2455 2462 2478 2480 2483 2493 2494 2512 2534 2535 2536 2540 2586 2587 2593 2609 2635 2638 2673 2680 2694 2707 2716 2739 2740 2761 2771 2774 2777 2784 2798 2809 2818 2838 2849 2859 2860 2866 2867 2880 2888 2889 2900 2912 2913 2922 2923 2958 2965 2971 2985 3000 3004 3006 3015 3017 3018 3049 3060 3070 3086 3108 3109 3111 3159 3172 3193 3204 3205 3206 3216 3221 3239 3240 3255 3259 3260 3272 3283 3303 3304 3308 3314 3341 3345 3348 3389 3391 3409 3410 3420 3432 3436 3451 3454 3469 3474 3475 3489 3501 3507 3524 3531 3532 3564 3568 3571 3585 3627 3633 3637 3639 3641 3649 3652 3654 3660 3665 3674 3698 3699 3701 3714 3720 3724 3735 3737 3738 3752 3759 3771 3796 3812 3813 3835 3861 3862 3873 3881 3900 3922 3934 3937 3951 3953 3954 3955 3965 4006 4035 4072 4073 4078 4096 4122 4125 4131 4132 4154 4164 4198 4201 4209 4210 4230 4248 4251 4266 4289 4293 4335 4391 4415 4419 4430 4431 4454 4476 4494 4509 4525 4527 4536 4545 4547 4579 4591 4603 4614 4632 4634 4664 4683 4689 4698 4705 4719 4722 4747 4754 4760 4773 4777 4794 4850 4880 4886 4905 4919 4929 4947 4948 4957 4968 4996 4998 38 58 61 189 275 388 409 431 437 460 512 558 562 684 696 716 720 751 769 822 898 935 1035 1083 1163 1200 1358 1377 1396 1400 1438 1470 1507 1545 1649 1682 1684 1702 1703 1718 1757 1791 1865 1906 1955 2093 2099 2154 2202 2383 2399 2431 2446 2552 2691 2719 2746 2789 2799 2865 2876 2903 3086 3094 3146 3263 3282 3397 3406 3413 3487 3608 3618 3620 3623 3663 3702 3738 3757 3789 4018 4029 4038 4080 4172 4208 4248 4367 4456 4531 4577 4648 4843 4870 4964 TGGTCC/GGACCA 0 -3 463 505 96 -72.2 0 4 6 20 40 45 56 59 75 77 78 83 113 116 118 128 134 135 149 150 152 161 204 216 217 221 235 236 243 246 251 257 258 259 260 287 292 304 305 308 322 330 361 362 375 404 418 431 435 440 444 445 446 452 453 463 480 485 491 492 498 499 506 507 509 516 517 519 540 543 561 562 590 592 593 594 600 620 638 639 647 656 670 690 714 715 725 737 745 770 777 794 807 816 827 833 845 856 857 870 877 885 891 903 909 929 932 933 968 971 989 994 995 1027 1031 1044 1045 1048 1071 1083 1093 1094 1095 1096 1097 1098 1100 1138 1148 1169 1178 1179 1186 1188 1203 1205 1206 1222 1238 1245 1248 1249 1250 1253 1262 1269 1270 1283 1286 1302 1304 1321 1322 1325 1340 1348 1355 1365 1366 1373 1381 1384 1398 1401 1402 1406 1423 1435 1440 1496 1518 1534 1535 1544 1546 1563 1583 1587 1598 1608 1610 1638 1649 1656 1663 1664 1670 1674 1675 1683 1691 1715 1747 1753 1754 1759 1765 1769 1771 1773 1774 1797 1804 1806 1807 1851 1876 1886 1910 1921 1923 1928 1937 1963 1972 1975 1985 1994 1997 1998 2014 2038 2040 2042 2043 2053 2054 2069 2080 2081 2086 2087 2099 2100 2126 2166 2182 2190 2199 2203 2215 2232 2242 2244 2247 2251 2266 2275 2295 2296 2322 2327 2330 2342 2359 2364 2376 2381 2393 2407 2416 2424 2429 2436 2462 2479 2516 2529 2536 2586 2587 2589 2607 2638 2673 2689 2708 2716 2718 2729 2776 2777 2783 2794 2804 2818 2830 2849 2853 2859 2860 2866 2880 2884 2900 2939 2949 3006 3008 3027 3042 3045 3049 3086 3096 3098 3111 3120 3122 3177 3206 3207 3209 3213 3216 3228 3240 3243 3255 3260 3270 3272 3292 3308 3315 3320 3336 3337 3338 3339 3341 3345 3352 3354 3362 3393 3398 3413 3436 3445 3451 3454 3468 3469 3489 3492 3501 3536 3537 3563 3564 3571 3573 3607 3611 3627 3634 3637 3639 3641 3646 3649 3650 3651 3652 3664 3665 3669 3674 3698 3699 3701 3723 3752 3771 3799 3807 3812 3813 3817 3839 3861 3862 3878 3892 3914 3923 3930 3951 3963 3978 4006 4035 4096 4097 4122 4150 4155 4157 4164 4198 4209 4210 4229 4230 4240 4247 4293 4305 4306 4310 4318 4325 4333 4344 4347 4369 4389 4399 4415 4416 4430 4431 4438 4450 4454 4487 4495 4509 4527 4528 4536 4547 4554 4559 4579 4584 4591 4603 4644 4663 4664 4683 4703 4705 4720 4754 4760 4767 4777 4785 4801 4802 4850 4862 4886 4912 4922 4929 4947 4951 4954 4957 38 58 189 318 358 409 437 460 504 512 541 562 567 684 716 720 751 769 817 822 910 938 1035 1286 1365 1376 1400 1438 1462 1507 1545 1561 1636 1660 1682 1684 1703 1745 1757 1762 1955 2075 2096 2106 2202 2328 2358 2383 2399 2446 2493 2640 2668 2707 2719 2789 2799 2802 2876 2903 2967 3005 3062 3086 3094 3111 3133 3222 3260 3282 3367 3387 3400 3457 3487 3513 3618 3620 3625 3637 3663 3702 3738 4038 4052 4080 4248 4315 4367 4456 4590 4614 4631 4754 4836 4983 TGGTCC/GGACCA 1 -4 463 505 96 -72.2 0 4 6 20 40 45 56 59 75 77 78 83 113 116 118 128 134 135 149 150 152 161 204 216 217 221 235 236 243 246 251 257 258 259 260 287 292 304 305 308 322 330 361 362 375 404 418 431 435 440 444 445 446 452 453 463 480 485 491 492 498 499 506 507 509 516 517 519 540 543 561 562 590 592 593 594 600 620 638 639 647 656 670 690 714 715 725 737 745 770 777 794 807 816 827 833 845 856 857 870 877 885 891 903 909 929 932 933 968 971 989 994 995 1027 1031 1044 1045 1048 1071 1083 1093 1094 1095 1096 1097 1098 1100 1138 1148 1169 1178 1179 1186 1188 1203 1205 1206 1222 1238 1245 1248 1249 1250 1253 1262 1269 1270 1283 1286 1302 1304 1321 1322 1325 1340 1348 1355 1365 1366 1373 1381 1384 1398 1401 1402 1406 1423 1435 1440 1496 1518 1534 1535 1544 1546 1563 1583 1587 1598 1608 1610 1638 1649 1656 1663 1664 1670 1674 1675 1683 1691 1715 1747 1753 1754 1759 1765 1769 1771 1773 1774 1797 1804 1806 1807 1851 1876 1886 1910 1921 1923 1928 1937 1963 1972 1975 1985 1994 1997 1998 2014 2038 2040 2042 2043 2053 2054 2069 2080 2081 2086 2087 2099 2100 2126 2166 2182 2190 2199 2203 2215 2232 2242 2244 2247 2251 2266 2275 2295 2296 2322 2327 2330 2342 2359 2364 2376 2381 2393 2407 2416 2424 2429 2436 2462 2479 2516 2529 2536 2586 2587 2589 2607 2638 2673 2689 2708 2716 2718 2729 2776 2777 2783 2794 2804 2818 2830 2849 2853 2859 2860 2866 2880 2884 2900 2939 2949 3006 3008 3027 3042 3045 3049 3086 3096 3098 3111 3120 3122 3177 3206 3207 3209 3213 3216 3228 3240 3243 3255 3260 3270 3272 3292 3308 3315 3320 3336 3337 3338 3339 3341 3345 3352 3354 3362 3393 3398 3413 3436 3445 3451 3454 3468 3469 3489 3492 3501 3536 3537 3563 3564 3571 3573 3607 3611 3627 3634 3637 3639 3641 3646 3649 3650 3651 3652 3664 3665 3669 3674 3698 3699 3701 3723 3752 3771 3799 3807 3812 3813 3817 3839 3861 3862 3878 3892 3914 3923 3930 3951 3963 3978 4006 4035 4096 4097 4122 4150 4155 4157 4164 4198 4209 4210 4229 4230 4240 4247 4293 4305 4306 4310 4318 4325 4333 4344 4347 4369 4389 4399 4415 4416 4430 4431 4438 4450 4454 4487 4495 4509 4527 4528 4536 4547 4554 4559 4579 4584 4591 4603 4644 4663 4664 4683 4703 4705 4720 4754 4760 4767 4777 4785 4801 4802 4850 4862 4886 4912 4922 4929 4947 4951 4954 4957 38 58 189 318 358 409 437 460 504 512 541 562 567 684 716 720 751 769 817 822 910 938 1035 1286 1365 1376 1400 1438 1462 1507 1545 1561 1636 1660 1682 1684 1703 1745 1757 1762 1955 2075 2096 2106 2202 2328 2358 2383 2399 2446 2493 2640 2668 2707 2719 2789 2799 2802 2876 2903 2967 3005 3062 3086 3094 3111 3133 3222 3260 3282 3367 3387 3400 3457 3487 3513 3618 3620 3625 3637 3663 3702 3738 4038 4052 4080 4248 4315 4367 4456 4590 4614 4631 4754 4836 4983 CCAATG/CATTGG 3 -3 408 456 114 -52.3 10 12 28 29 30 31 36 48 80 87 97 99 116 118 134 141 143 144 156 157 159 163 166 200 205 211 212 218 219 226 234 276 281 283 298 301 306 312 313 316 327 328 338 340 341 344 354 383 390 414 433 459 467 478 480 499 506 507 515 518 523 531 532 540 543 547 551 564 567 590 597 607 616 627 628 638 639 647 650 677 689 737 738 739 746 747 760 786 793 803 812 813 816 827 842 874 883 887 890 931 935 970 971 983 986 992 1006 1009 1010 1018 1025 1026 1038 1061 1065 1075 1076 1097 1098 1120 1125 1131 1136 1147 1160 1164 1169 1172 1195 1208 1221 1246 1252 1269 1270 1281 1284 1286 1288 1315 1316 1325 1328 1331 1352 1393 1398 1401 1418 1432 1445 1461 1476 1478 1481 1499 1508 1517 1545 1550 1562 1563 1590 1592 1630 1658 1665 1688 1689 1697 1705 1717 1722 1734 1754 1756 1766 1776 1783 1787 1831 1841 1848 1857 1859 1860 1895 1897 1919 1940 1942 1943 1950 1951 1952 1962 1965 1966 1980 1990 1997 2014 2017 2023 2053 2054 2064 2066 2069 2073 2074 2085 2103 2109 2140 2166 2214 2217 2218 2228 2229 2259 2269 2270 2274 2299 2306 2353 2383 2385 2429 2430 2432 2450 2457 2465 2487 2488 2489 2499 2517 2518 2532 2533 2540 2547 2563 2567 2568 2586 2587 2599 2675 2694 2745 2787 2842 2843 2851 2857 2858 2866 2869 2875 2885 2886 2891 2894 2908 2931 2933 2944 2958 2970 2975 2979 3012 3024 3025 3027 3094 3095 3145 3150 3155 3176 3183 3194 3202 3211 3236 3260 3275 3276 3310 3350 3352 3367 3397 3398 3401 3406 3411 3423 3437 3438 3448 3466 3494 3495 3532 3534 3573 3575 3576 3584 3595 3602 3603 3618 3627 3660 3676 3702 3711 3731 3762 3781 3785 3794 3837 3839 3850 3861 3862 3865 3866 3893 3899 3930 3940 3970 3979 3987 3988 4003 4037 4043 4049 4071 4096 4101 4102 4146 4158 4164 4181 4192 4193 4220 4225 4227 4236 4265 4276 4310 4316 4328 4332 4336 4365 4369 4388 4414 4419 4460 4465 4466 4476 4482 4493 4502 4520 4574 4649 4652 4653 4656 4664 4669 4688 4716 4724 4741 4766 4782 4840 4846 4861 4874 4896 4907 4911 4918 4963 4968 4984 4993 44 65 107 277 321 362 437 441 454 489 557 567 585 588 630 703 748 751 840 841 871 932 958 995 1112 1176 1201 1220 1259 1263 1286 1306 1362 1385 1389 1439 1470 1485 1493 1598 1649 1665 1673 1691 1698 1745 1747 1751 1765 1878 1893 1911 1942 2005 2018 2041 2062 2088 2089 2133 2182 2221 2251 2320 2374 2411 2513 2582 2586 2612 2628 2676 2684 2710 2717 2720 2750 2758 2882 2927 2996 3013 3039 3047 3072 3144 3180 3265 3310 3545 3548 3581 3637 3690 3755 3863 3903 3993 4157 4192 4349 4405 4455 4532 4596 4604 4610 4631 4644 4679 4726 4736 4815 4830 CAATGG/CCATTG 3 -2 412 451 119 -49.2 10 12 17 28 29 31 36 45 94 99 116 118 134 135 143 144 149 150 156 157 163 166 200 205 207 208 211 212 218 219 226 234 281 298 301 316 330 338 354 383 433 459 467 478 479 485 499 506 507 515 516 517 518 526 527 529 540 543 547 551 567 590 597 601 607 616 628 638 639 647 650 666 677 689 690 703 704 722 723 738 743 757 758 764 765 786 793 812 813 827 835 846 870 878 882 890 920 935 971 986 999 1009 1010 1018 1024 1025 1026 1029 1036 1037 1038 1048 1061 1065 1087 1090 1131 1135 1150 1160 1164 1169 1172 1184 1195 1199 1208 1221 1222 1252 1267 1281 1288 1289 1303 1318 1325 1328 1331 1334 1348 1349 1352 1365 1366 1370 1384 1393 1396 1398 1402 1411 1418 1439 1461 1470 1517 1525 1526 1536 1545 1563 1592 1618 1648 1649 1663 1664 1665 1668 1688 1689 1697 1722 1756 1764 1776 1787 1792 1793 1806 1807 1841 1853 1857 1859 1860 1867 1893 1895 1927 1930 1950 1951 1952 1966 1968 1980 1990 1997 2017 2053 2054 2055 2064 2065 2075 2085 2103 2109 2140 2214 2217 2218 2228 2229 2259 2274 2306 2329 2330 2336 2341 2348 2349 2350 2363 2373 2383 2420 2424 2429 2449 2450 2457 2499 2502 2505 2517 2518 2532 2533 2540 2547 2563 2567 2568 2586 2587 2653 2663 2694 2715 2728 2813 2819 2842 2843 2857 2858 2866 2875 2885 2891 2894 2908 2933 2944 2970 2971 2975 2977 2979 3017 3018 3025 3026 3027 3040 3050 3098 3106 3107 3110 3117 3145 3150 3154 3155 3173 3176 3178 3180 3183 3211 3236 3244 3250 3260 3265 3266 3275 3276 3284 3311 3350 3351 3352 3362 3397 3398 3406 3423 3437 3438 3443 3448 3454 3494 3532 3534 3571 3575 3576 3584 3595 3644 3674 3676 3699 3702 3711 3785 3837 3850 3861 3862 3866 3876 3899 3930 3940 3943 3979 3987 3988 4003 4004 4026 4049 4071 4099 4101 4121 4138 4146 4181 4192 4193 4236 4239 4265 4276 4281 4293 4295 4297 4310 4316 4328 4365 4369 4419 4455 4456 4465 4466 4467 4471 4482 4493 4500 4502 4515 4520 4573 4574 4653 4654 4656 4663 4687 4688 4716 4724 4760 4766 4777 4782 4840 4846 4847 4860 4873 4874 4918 4949 4963 4968 4977 4984 4985 44 110 111 118 163 220 244 260 295 296 349 372 387 441 454 504 541 567 572 579 680 715 722 744 841 884 919 958 972 995 1055 1195 1201 1220 1241 1263 1286 1310 1330 1637 1674 1691 1730 1848 1861 1899 1917 1942 1964 1999 2031 2088 2161 2179 2277 2339 2364 2571 2575 2618 2870 2904 2916 2927 2967 2992 3030 3031 3092 3106 3236 3264 3269 3283 3312 3330 3342 3414 3449 3456 3547 3568 3604 3606 3621 3668 3679 3699 3735 3771 3815 3863 4000 4039 4050 4093 4172 4266 4281 4315 4349 4431 4462 4476 4532 4580 4604 4611 4631 4650 4693 4734 4760 4830 4892 4908 4921 4977 4986 GGACAA/TTGTCC 1 -3 367 413 102 -47.8 17 20 27 38 40 55 71 74 79 81 91 102 112 154 177 178 179 194 195 197 198 210 213 218 219 221 224 246 252 266 296 297 316 317 325 329 330 335 336 339 340 341 346 347 348 373 375 392 432 441 453 506 507 534 537 550 551 566 568 582 602 603 625 626 646 652 653 659 660 667 673 676 699 700 703 712 713 721 723 725 732 740 743 745 800 812 813 818 833 836 858 863 864 865 873 879 882 887 934 935 942 943 951 961 964 974 975 977 985 986 994 995 1009 1010 1017 1028 1059 1073 1074 1075 1076 1079 1095 1106 1117 1118 1124 1131 1136 1140 1156 1157 1173 1180 1233 1269 1270 1320 1340 1350 1354 1359 1360 1380 1402 1412 1421 1438 1439 1441 1474 1510 1527 1554 1571 1612 1621 1622 1652 1655 1674 1675 1676 1679 1680 1705 1711 1791 1800 1830 1845 1884 1893 1920 1942 1943 1960 1978 1993 1995 2008 2011 2012 2015 2032 2049 2088 2099 2100 2118 2127 2161 2162 2171 2191 2204 2214 2221 2260 2280 2281 2295 2296 2325 2339 2343 2344 2351 2355 2373 2379 2428 2454 2465 2471 2472 2474 2503 2526 2551 2553 2554 2578 2592 2606 2613 2622 2655 2700 2704 2718 2742 2743 2770 2825 2826 2846 2852 2866 2869 2870 2871 2888 2889 2914 2915 2948 2960 2972 2973 2980 2994 2996 3017 3018 3027 3033 3038 3041 3056 3057 3076 3112 3140 3162 3170 3180 3195 3196 3208 3215 3250 3293 3343 3344 3352 3353 3364 3382 3388 3403 3418 3419 3443 3466 3478 3482 3516 3520 3528 3533 3548 3549 3581 3626 3636 3644 3656 3692 3719 3751 3752 3795 3809 3819 3838 3844 3871 3926 3976 4017 4018 4021 4085 4086 4108 4128 4166 4186 4204 4211 4219 4221 4223 4254 4259 4260 4267 4291 4295 4380 4382 4391 4393 4400 4433 4450 4453 4475 4533 4543 4559 4626 4634 4635 4667 4671 4686 4694 4696 4744 4777 4779 4795 4809 4826 4828 4835 4845 4860 4864 4912 4930 4961 4978 4991 4992 24 30 58 63 84 113 126 286 372 396 419 443 450 506 553 584 643 662 748 751 759 765 825 849 881 951 1028 1077 1107 1113 1162 1184 1195 1207 1212 1233 1257 1276 1389 1393 1456 1464 1471 1553 1568 1627 1658 1787 1796 1961 1999 2026 2106 2181 2182 2445 2559 2729 2757 2817 2880 2910 2911 2914 3181 3200 3258 3343 3347 3456 3476 3477 3507 3620 3657 3787 3850 3869 3876 3925 3976 3985 4139 4154 4176 4252 4306 4430 4431 4487 4557 4662 4712 4764 4813 4829 4954 4957 4969 4987 4989 4994 TTGGAC/GTCCAA 0 -4 372 392 113 -39.0 8 9 10 12 16 22 29 40 41 58 75 85 111 116 152 160 161 204 218 219 227 247 253 287 298 306 308 315 322 327 328 342 347 348 374 386 390 395 435 438 441 463 480 485 496 506 507 519 544 575 576 593 594 598 606 609 610 655 697 712 713 717 718 720 741 742 744 751 820 821 832 833 874 877 884 887 901 917 953 974 975 986 1038 1049 1051 1052 1062 1075 1076 1083 1105 1113 1156 1157 1180 1204 1212 1213 1214 1244 1252 1269 1270 1287 1304 1378 1389 1398 1402 1412 1413 1415 1421 1423 1445 1488 1496 1500 1510 1512 1554 1563 1608 1617 1625 1628 1629 1646 1649 1663 1664 1679 1680 1681 1682 1683 1705 1718 1754 1769 1771 1797 1841 1864 1887 1888 1908 1923 1942 1943 1952 1978 1993 1995 2007 2008 2021 2044 2045 2053 2054 2071 2077 2096 2099 2100 2101 2106 2110 2140 2149 2158 2228 2229 2251 2278 2307 2310 2342 2359 2367 2387 2393 2407 2429 2432 2481 2484 2487 2488 2492 2493 2494 2538 2540 2544 2545 2556 2594 2605 2607 2609 2625 2626 2694 2701 2704 2737 2739 2740 2768 2770 2771 2784 2839 2840 2852 2859 2866 2888 2889 2900 2912 2920 2922 2963 2975 3000 3002 3013 3016 3027 3049 3056 3057 3070 3103 3108 3109 3112 3136 3137 3158 3159 3172 3197 3206 3208 3213 3216 3219 3220 3221 3231 3239 3259 3269 3272 3288 3308 3312 3315 3352 3382 3401 3404 3409 3410 3420 3423 3432 3437 3474 3501 3521 3532 3533 3543 3564 3568 3627 3637 3639 3641 3654 3660 3665 3667 3698 3701 3719 3735 3737 3759 3771 3775 3787 3796 3812 3902 3930 3953 3954 3955 3963 3968 3994 4023 4024 4028 4035 4039 4043 4054 4057 4079 4096 4108 4114 4122 4153 4166 4201 4202 4248 4251 4254 4266 4297 4304 4350 4385 4391 4425 4434 4454 4476 4477 4494 4505 4527 4552 4603 4611 4632 4634 4664 4677 4694 4696 4705 4710 4737 4747 4748 4760 4777 4779 4835 4848 4850 4860 4880 4893 4899 4914 4944 4947 4957 4968 4995 4998 4 9 25 38 45 58 84 275 312 315 371 395 413 431 506 512 720 748 751 759 841 861 915 968 1205 1222 1257 1278 1377 1389 1393 1394 1470 1473 1601 1635 1665 1682 1702 1703 1718 1745 1747 1757 1796 1871 1877 1955 2062 2106 2181 2182 2310 2399 2411 2431 2445 2446 2560 2672 2706 2719 2740 2789 2808 2865 2873 2876 2895 2897 2900 3035 3086 3094 3164 3263 3282 3347 3476 3553 3596 3618 3620 3623 3663 3685 3709 3787 3827 3850 3888 3923 4172 4276 4329 4367 4400 4401 4407 4430 4569 4587 4600 4639 4643 4644 4771 4794 4843 4870 4964 4980 4982 ATGGAC/GTCCAT 0 -4 327 366 93 -41.2 9 17 29 45 59 80 83 98 130 134 139 140 143 144 194 202 211 212 243 246 256 257 258 281 302 304 305 314 316 327 328 333 340 341 343 379 381 404 446 453 456 457 458 463 469 470 477 494 505 534 540 560 568 574 578 590 597 617 629 659 660 662 670 673 680 681 690 702 703 716 723 760 777 782 792 820 821 827 829 834 846 861 863 875 881 882 885 891 903 904 909 925 926 935 962 989 994 995 1004 1064 1088 1097 1098 1141 1161 1162 1173 1200 1206 1243 1250 1258 1269 1270 1306 1309 1331 1340 1349 1355 1359 1360 1384 1401 1412 1413 1439 1440 1453 1461 1493 1528 1571 1599 1617 1642 1655 1656 1670 1677 1688 1708 1753 1756 1766 1773 1813 1841 1882 1889 1892 1895 1927 1955 1958 1959 1994 1995 1996 2023 2039 2041 2049 2061 2065 2069 2080 2081 2095 2108 2118 2126 2200 2211 2214 2227 2239 2244 2266 2274 2295 2296 2323 2336 2347 2354 2355 2362 2373 2389 2394 2402 2409 2421 2436 2452 2462 2480 2526 2579 2586 2587 2593 2635 2661 2673 2677 2707 2711 2712 2716 2750 2751 2761 2777 2807 2808 2832 2838 2860 2867 2880 2901 2903 2913 2965 2971 2998 3004 3015 3022 3039 3076 3104 3108 3109 3180 3193 3206 3226 3227 3240 3244 3260 3282 3283 3299 3300 3314 3340 3341 3345 3352 3356 3364 3367 3383 3389 3391 3394 3397 3431 3437 3443 3454 3469 3489 3524 3571 3584 3633 3644 3699 3723 3724 3752 3795 3813 3838 3840 3874 3881 3900 3930 3962 3965 4028 4072 4073 4078 4097 4119 4154 4175 4209 4210 4215 4227 4259 4260 4289 4290 4295 4331 4379 4391 4419 4467 4525 4536 4545 4585 4671 4683 4687 4698 4754 4773 4777 4820 4826 4843 4863 4874 4919 4955 4996 34 61 70 251 295 332 352 362 388 407 409 444 460 558 638 645 716 751 756 765 935 1044 1052 1070 1135 1163 1200 1266 1441 1487 1545 1553 1615 1619 1666 1839 1865 1888 1955 2026 2042 2093 2097 2099 2129 2172 2309 2357 2366 2460 2495 2557 2559 2619 2746 2750 2854 2871 2924 2969 2979 3022 3135 3359 3397 3402 3406 3426 3487 3517 3563 3608 3727 3757 4018 4029 4080 4100 4117 4281 4322 4343 4415 4431 4557 4624 4662 4713 4772 4796 4894 4897 4905 GTCCAT/ATGGAC 1 -2 327 366 93 -41.2 9 17 29 45 59 80 83 98 130 134 139 140 143 144 194 202 211 212 243 246 256 257 258 281 302 304 305 314 316 327 328 333 340 341 343 379 381 404 446 453 456 457 458 463 469 470 477 494 505 534 540 560 568 574 578 590 597 617 629 659 660 662 670 673 680 681 690 702 703 716 723 760 777 782 792 820 821 827 829 834 846 861 863 875 881 882 885 891 903 904 909 925 926 935 962 989 994 995 1004 1064 1088 1097 1098 1141 1161 1162 1173 1200 1206 1243 1250 1258 1269 1270 1306 1309 1331 1340 1349 1355 1359 1360 1384 1401 1412 1413 1439 1440 1453 1461 1493 1528 1571 1599 1617 1642 1655 1656 1670 1677 1688 1708 1753 1756 1766 1773 1813 1841 1882 1889 1892 1895 1927 1955 1958 1959 1994 1995 1996 2023 2039 2041 2049 2061 2065 2069 2080 2081 2095 2108 2118 2126 2200 2211 2214 2227 2239 2244 2266 2274 2295 2296 2323 2336 2347 2354 2355 2362 2373 2389 2394 2402 2409 2421 2436 2452 2462 2480 2526 2579 2586 2587 2593 2635 2661 2673 2677 2707 2711 2712 2716 2750 2751 2761 2777 2807 2808 2832 2838 2860 2867 2880 2901 2903 2913 2965 2971 2998 3004 3015 3022 3039 3076 3104 3108 3109 3180 3193 3206 3226 3227 3240 3244 3260 3282 3283 3299 3300 3314 3340 3341 3345 3352 3356 3364 3367 3383 3389 3391 3394 3397 3431 3437 3443 3454 3469 3489 3524 3571 3584 3633 3644 3699 3723 3724 3752 3795 3813 3838 3840 3874 3881 3900 3930 3962 3965 4028 4072 4073 4078 4097 4119 4154 4175 4209 4210 4215 4227 4259 4260 4289 4290 4295 4331 4379 4391 4419 4467 4525 4536 4545 4585 4671 4683 4687 4698 4754 4773 4777 4820 4826 4843 4863 4874 4919 4955 4996 34 61 70 251 295 332 352 362 388 407 409 444 460 558 638 645 716 751 756 765 935 1044 1052 1070 1135 1163 1200 1266 1441 1487 1545 1553 1615 1619 1666 1839 1865 1888 1955 2026 2042 2093 2097 2099 2129 2172 2309 2357 2366 2460 2495 2557 2559 2619 2746 2750 2854 2871 2924 2969 2979 3022 3135 3359 3397 3402 3406 3426 3487 3517 3563 3608 3727 3757 4018 4029 4080 4100 4117 4281 4322 4343 4415 4431 4557 4624 4662 4713 4772 4796 4894 4897 4905 CAACGG/CCGTTG 3 -2 285 338 84 -38.8 18 20 21 23 24 40 42 43 46 47 61 106 107 121 124 125 131 141 147 166 178 179 184 191 203 252 273 281 296 297 318 335 336 337 355 364 380 382 385 399 416 418 440 446 449 451 477 496 505 520 521 522 546 550 558 560 567 580 600 615 654 674 707 725 727 751 755 792 796 820 821 835 838 854 886 888 893 894 912 930 937 968 975 1016 1017 1054 1075 1076 1087 1105 1107 1109 1123 1133 1144 1171 1192 1205 1206 1227 1230 1238 1244 1264 1275 1309 1326 1327 1394 1399 1403 1406 1417 1424 1425 1435 1457 1521 1532 1536 1537 1546 1549 1589 1594 1611 1617 1624 1642 1673 1676 1698 1701 1709 1723 1751 1767 1770 1784 1816 1861 1864 1928 1946 1992 2009 2022 2031 2044 2045 2070 2099 2100 2122 2123 2145 2147 2148 2160 2166 2215 2225 2236 2246 2268 2272 2273 2310 2349 2350 2363 2377 2401 2416 2434 2439 2446 2482 2516 2539 2560 2569 2585 2593 2600 2648 2655 2664 2667 2696 2718 2719 2730 2775 2792 2830 2832 2835 2853 2859 2865 2888 2889 2972 2973 3014 3041 3052 3082 3100 3119 3159 3163 3164 3165 3218 3231 3242 3277 3287 3309 3337 3389 3422 3430 3443 3454 3456 3499 3511 3527 3546 3591 3647 3655 3670 3675 3702 3703 3745 3754 3755 3762 3781 3791 3810 3851 3860 3865 3906 3929 3931 3932 3952 3965 3989 4005 4054 4076 4085 4086 4127 4160 4191 4211 4228 4272 4310 4319 4388 4393 4397 4398 4510 4533 4596 4743 4816 4817 4856 4877 4893 4913 4953 4961 2 12 45 92 104 147 224 295 299 341 350 401 466 552 558 564 570 626 712 866 947 971 1002 1029 1098 1144 1223 1329 1417 1521 1649 1791 1841 2072 2079 2108 2177 2191 2248 2456 2479 2568 2772 2829 2873 2907 2918 2935 2980 2988 3003 3016 3028 3106 3124 3186 3187 3222 3318 3389 3554 3604 3669 3717 3748 3808 3864 3895 3904 4067 4082 4190 4350 4390 4429 4431 4457 4547 4558 4647 4661 4867 4926 4983 CCAACG/CGTTGG 3 -3 282 335 70 -44.4 18 20 21 23 24 29 35 40 46 47 48 61 90 95 107 111 121 141 166 184 191 194 252 273 287 296 297 315 321 335 336 337 345 362 364 380 382 385 399 407 408 418 440 446 449 451 460 461 477 496 518 520 525 546 558 560 567 575 592 600 612 618 619 654 674 683 693 725 727 792 816 820 821 835 854 883 888 893 894 912 930 968 975 1054 1075 1076 1093 1094 1100 1102 1105 1123 1133 1144 1171 1192 1206 1220 1238 1244 1275 1302 1305 1309 1318 1352 1378 1394 1399 1417 1444 1449 1457 1481 1491 1492 1512 1521 1532 1533 1536 1537 1546 1547 1549 1611 1617 1624 1673 1676 1698 1706 1709 1721 1738 1739 1767 1783 1784 1797 1842 1850 1864 1928 1992 2009 2020 2022 2044 2045 2070 2099 2100 2137 2138 2160 2166 2215 2225 2234 2236 2268 2272 2273 2310 2328 2349 2350 2377 2439 2482 2539 2585 2594 2600 2637 2648 2662 2664 2667 2696 2719 2734 2735 2767 2813 2819 2830 2832 2835 2853 2859 2865 2881 2888 2889 2939 2972 2973 3014 3020 3041 3052 3070 3082 3136 3137 3159 3165 3186 3187 3217 3231 3242 3287 3299 3300 3337 3359 3383 3389 3409 3410 3422 3430 3443 3454 3456 3470 3591 3647 3654 3666 3668 3670 3675 3682 3685 3702 3703 3704 3731 3752 3754 3755 3810 3851 3860 3906 3931 3932 3952 3961 3981 4005 4054 4076 4085 4088 4099 4175 4211 4247 4254 4310 4319 4388 4393 4397 4459 4491 4504 4510 4533 4603 4619 4620 4648 4831 4877 4893 4947 12 45 92 147 179 201 254 288 295 358 465 466 496 558 570 654 882 918 966 1029 1082 1144 1160 1181 1323 1500 1521 1608 1758 1759 1842 1877 1987 2052 2163 2171 2184 2363 2409 2455 2568 2646 2740 2793 2829 2873 2980 3016 3025 3222 3321 3341 3368 3462 3466 3604 3685 3748 3889 3989 4263 4274 4388 4494 4540 4542 4645 4765 4888 4943 TGGACA/TGTCCA 0 -3 293 331 87 -36.1 9 17 27 29 38 41 55 74 80 102 111 127 135 154 184 194 210 215 218 219 228 229 237 266 267 331 333 340 341 342 343 347 348 375 379 386 390 398 411 422 423 426 441 453 456 506 507 534 540 566 568 575 576 578 617 626 646 659 660 673 712 713 723 732 744 745 760 791 829 834 846 861 863 879 887 895 901 904 924 935 951 961 974 975 985 986 994 995 1028 1073 1075 1076 1113 1117 1118 1141 1156 1157 1173 1180 1233 1244 1252 1269 1270 1320 1340 1349 1364 1402 1412 1413 1421 1439 1441 1453 1461 1482 1495 1510 1531 1554 1571 1589 1617 1628 1652 1655 1679 1680 1705 1711 1718 1773 1800 1830 1841 1845 1882 1892 1920 1942 1943 1952 1960 1978 1993 1995 1996 2008 2015 2049 2077 2099 2100 2118 2134 2214 2278 2295 2296 2300 2347 2355 2362 2373 2393 2394 2428 2452 2454 2481 2487 2488 2492 2526 2579 2592 2594 2605 2625 2626 2704 2714 2742 2750 2770 2807 2808 2832 2839 2840 2852 2854 2855 2866 2880 2935 2960 2975 3013 3022 3027 3039 3056 3057 3076 3140 3169 3180 3188 3195 3196 3208 3219 3220 3244 3287 3293 3352 3353 3364 3382 3397 3404 3431 3437 3443 3520 3521 3533 3543 3552 3557 3604 3605 3644 3719 3723 3752 3761 3795 3838 3856 3874 3879 4028 4043 4079 4085 4088 4108 4114 4166 4168 4169 4186 4202 4211 4226 4254 4259 4260 4291 4295 4350 4380 4391 4400 4425 4433 4552 4559 4611 4626 4664 4671 4677 4686 4694 4696 4701 4733 4737 4748 4777 4779 4826 4835 4914 4930 4991 4992 63 84 113 251 395 506 645 748 751 759 765 825 951 1052 1077 1084 1107 1135 1148 1162 1166 1195 1212 1222 1246 1257 1389 1393 1441 1471 1473 1553 1590 1615 1796 1871 2026 2042 2058 2106 2129 2181 2182 2270 2310 2317 2445 2463 2559 2619 2706 2740 2817 2856 2873 2914 2979 3144 3164 3243 3347 3402 3410 3476 3477 3622 3685 3787 3850 3923 4100 4252 4285 4329 4430 4431 4557 4662 4771 4796 4813 4829 4894 4927 4957 4969 4994 TGGACA/TGTCCA 1 -4 293 331 87 -36.1 9 17 27 29 38 41 55 74 80 102 111 127 135 154 184 194 210 215 218 219 228 229 237 266 267 331 333 340 341 342 343 347 348 375 379 386 390 398 411 422 423 426 441 453 456 506 507 534 540 566 568 575 576 578 617 626 646 659 660 673 712 713 723 732 744 745 760 791 829 834 846 861 863 879 887 895 901 904 924 935 951 961 974 975 985 986 994 995 1028 1073 1075 1076 1113 1117 1118 1141 1156 1157 1173 1180 1233 1244 1252 1269 1270 1320 1340 1349 1364 1402 1412 1413 1421 1439 1441 1453 1461 1482 1495 1510 1531 1554 1571 1589 1617 1628 1652 1655 1679 1680 1705 1711 1718 1773 1800 1830 1841 1845 1882 1892 1920 1942 1943 1952 1960 1978 1993 1995 1996 2008 2015 2049 2077 2099 2100 2118 2134 2214 2278 2295 2296 2300 2347 2355 2362 2373 2393 2394 2428 2452 2454 2481 2487 2488 2492 2526 2579 2592 2594 2605 2625 2626 2704 2714 2742 2750 2770 2807 2808 2832 2839 2840 2852 2854 2855 2866 2880 2935 2960 2975 3013 3022 3027 3039 3056 3057 3076 3140 3169 3180 3188 3195 3196 3208 3219 3220 3244 3287 3293 3352 3353 3364 3382 3397 3404 3431 3437 3443 3520 3521 3533 3543 3552 3557 3604 3605 3644 3719 3723 3752 3761 3795 3838 3856 3874 3879 4028 4043 4079 4085 4088 4108 4114 4166 4168 4169 4186 4202 4211 4226 4254 4259 4260 4291 4295 4350 4380 4391 4400 4425 4433 4552 4559 4611 4626 4664 4671 4677 4686 4694 4696 4701 4733 4737 4748 4777 4779 4826 4835 4914 4930 4991 4992 63 84 113 251 395 506 645 748 751 759 765 825 951 1052 1077 1084 1107 1135 1148 1162 1166 1195 1212 1222 1246 1257 1389 1393 1441 1471 1473 1553 1590 1615 1796 1871 2026 2042 2058 2106 2129 2181 2182 2270 2310 2317 2445 2463 2559 2619 2706 2740 2817 2856 2873 2914 2979 3144 3164 3243 3347 3402 3410 3476 3477 3622 3685 3787 3850 3923 4100 4252 4285 4329 4430 4431 4557 4662 4771 4796 4813 4829 4894 4927 4957 4969 4994 TGGGCC/GGCCCA 0 -3 347 323 59 -47.1 29 32 36 61 99 149 150 173 174 175 192 193 207 208 239 240 325 351 357 383 392 398 409 410 419 433 439 466 478 493 499 538 545 549 563 564 567 569 597 601 618 619 665 671 688 697 711 746 747 757 758 884 895 899 905 943 1018 1038 1046 1061 1088 1135 1188 1190 1191 1210 1219 1281 1294 1295 1300 1303 1315 1316 1317 1319 1320 1337 1352 1385 1398 1432 1436 1454 1458 1473 1493 1517 1520 1531 1541 1588 1592 1627 1628 1640 1649 1657 1659 1688 1722 1733 1768 1787 1798 1806 1807 1827 1828 1859 1860 1894 1903 1914 1915 1950 1951 2003 2023 2024 2028 2055 2119 2215 2246 2261 2272 2273 2274 2289 2291 2292 2298 2302 2321 2327 2342 2353 2356 2363 2374 2427 2440 2495 2520 2539 2590 2591 2597 2608 2685 2696 2720 2745 2746 2819 2837 2869 2879 2897 2907 2929 2930 2936 2939 2974 2979 3016 3052 3067 3072 3089 3130 3145 3154 3166 3210 3226 3227 3235 3238 3242 3260 3302 3335 3347 3348 3358 3404 3405 3407 3409 3410 3431 3438 3440 3448 3481 3492 3493 3494 3500 3517 3534 3557 3560 3579 3587 3590 3595 3625 3639 3663 3693 3704 3712 3724 3781 3788 3800 3801 3802 3826 3829 3837 3838 3840 3842 3843 3850 3858 3904 3908 3918 3919 3940 3943 3945 3950 3974 3977 3979 4003 4007 4014 4026 4031 4038 4057 4064 4065 4071 4088 4095 4101 4111 4115 4116 4158 4164 4175 4181 4184 4192 4193 4220 4234 4235 4248 4265 4276 4280 4310 4328 4357 4364 4365 4366 4377 4379 4386 4390 4391 4393 4398 4401 4419 4421 4427 4435 4461 4464 4465 4479 4510 4531 4544 4552 4556 4561 4563 4580 4598 4612 4615 4637 4641 4642 4651 4652 4653 4671 4674 4680 4698 4712 4719 4729 4731 4745 4750 4762 4766 4773 4775 4782 4783 4790 4815 4826 4833 4866 4880 4883 4884 4918 4921 4929 4930 4936 4943 4950 4952 4953 4958 4985 4998 25 75 85 86 102 118 119 320 347 412 502 513 618 731 791 823 869 884 918 942 981 1080 1301 1467 1691 1716 1865 1901 2010 2062 2089 2139 2229 2358 2567 2612 2627 2669 2701 2704 2729 2868 3186 3274 3297 3330 3459 3500 3548 3560 3578 3828 3918 4155 4253 4563 4736 4817 4865 GGACCG/CGGTCC 0 -2 294 317 45 -53.6 0 10 11 19 22 41 59 76 82 107 120 124 125 152 160 227 247 274 304 305 306 307 314 319 327 328 370 371 374 384 391 428 440 468 472 477 535 551 555 577 605 651 662 665 680 681 697 717 718 729 741 742 743 751 777 792 820 821 833 881 885 906 909 925 926 944 981 1002 1003 1031 1049 1064 1129 1130 1159 1163 1173 1192 1200 1201 1204 1207 1213 1214 1230 1241 1259 1260 1261 1263 1306 1309 1314 1319 1327 1413 1415 1458 1488 1493 1500 1501 1528 1536 1555 1565 1575 1593 1599 1606 1629 1646 1677 1718 1766 1772 1773 1808 1813 1868 1882 1906 1930 2009 2032 2033 2034 2039 2042 2043 2044 2045 2065 2098 2101 2106 2110 2113 2149 2227 2247 2254 2264 2274 2310 2322 2329 2336 2377 2387 2390 2391 2399 2402 2421 2438 2467 2493 2494 2512 2513 2557 2577 2580 2593 2604 2607 2608 2609 2620 2634 2683 2686 2705 2725 2726 2736 2748 2749 2755 2774 2778 2779 2809 2868 2922 2958 2965 2990 3000 3004 3011 3070 3091 3120 3172 3191 3204 3205 3246 3252 3259 3314 3345 3346 3368 3389 3391 3399 3409 3410 3420 3432 3451 3461 3464 3465 3474 3475 3511 3524 3539 3585 3589 3630 3633 3660 3677 3699 3701 3720 3735 3737 3738 3747 3764 3782 3783 3812 3835 3847 3869 3873 3895 3906 3922 3934 3937 3997 3999 4052 4058 4074 4076 4078 4090 4092 4130 4154 4159 4162 4165 4197 4225 4251 4262 4267 4311 4323 4328 4407 4408 4445 4476 4494 4515 4521 4525 4626 4672 4674 4675 4689 4740 4747 4773 4816 4817 4820 4824 4843 4919 4932 4998 33 61 261 388 508 558 567 931 1083 1095 1143 1163 1200 1359 1377 1396 1702 1718 1779 1791 1865 1906 1955 2011 2099 2154 2552 2633 2691 2802 2865 2980 3124 3129 3202 3222 3406 3569 3705 3789 4018 4125 4155 4172 4983 CGGTCC/GGACCG 1 -4 294 317 45 -53.6 0 10 11 19 22 41 59 76 82 107 120 124 125 152 160 227 247 274 304 305 306 307 314 319 327 328 370 371 374 384 391 428 440 468 472 477 535 551 555 577 605 651 662 665 680 681 697 717 718 729 741 742 743 751 777 792 820 821 833 881 885 906 909 925 926 944 981 1002 1003 1031 1049 1064 1129 1130 1159 1163 1173 1192 1200 1201 1204 1207 1213 1214 1230 1241 1259 1260 1261 1263 1306 1309 1314 1319 1327 1413 1415 1458 1488 1493 1500 1501 1528 1536 1555 1565 1575 1593 1599 1606 1629 1646 1677 1718 1766 1772 1773 1808 1813 1868 1882 1906 1930 2009 2032 2033 2034 2039 2042 2043 2044 2045 2065 2098 2101 2106 2110 2113 2149 2227 2247 2254 2264 2274 2310 2322 2329 2336 2377 2387 2390 2391 2399 2402 2421 2438 2467 2493 2494 2512 2513 2557 2577 2580 2593 2604 2607 2608 2609 2620 2634 2683 2686 2705 2725 2726 2736 2748 2749 2755 2774 2778 2779 2809 2868 2922 2958 2965 2990 3000 3004 3011 3070 3091 3120 3172 3191 3204 3205 3246 3252 3259 3314 3345 3346 3368 3389 3391 3399 3409 3410 3420 3432 3451 3461 3464 3465 3474 3475 3511 3524 3539 3585 3589 3630 3633 3660 3677 3699 3701 3720 3735 3737 3738 3747 3764 3782 3783 3812 3835 3847 3869 3873 3895 3906 3922 3934 3937 3997 3999 4052 4058 4074 4076 4078 4090 4092 4130 4154 4159 4162 4165 4197 4225 4251 4262 4267 4311 4323 4328 4407 4408 4445 4476 4494 4515 4521 4525 4626 4672 4674 4675 4689 4740 4747 4773 4816 4817 4820 4824 4843 4919 4932 4998 33 61 261 388 508 558 567 931 1083 1095 1143 1163 1200 1359 1377 1396 1702 1718 1779 1791 1865 1906 1955 2011 2099 2154 2552 2633 2691 2802 2865 2980 3124 3129 3202 3222 3406 3569 3705 3789 4018 4125 4155 4172 4983 TTGGGC/GCCCAA 0 -4 309 291 66 -36.2 29 35 36 61 110 175 205 234 251 252 276 345 351 357 362 383 392 398 416 419 433 436 455 466 478 508 528 538 549 556 557 563 564 567 586 618 619 623 628 665 671 729 734 746 747 775 783 884 895 905 906 924 927 1018 1025 1026 1038 1046 1049 1055 1061 1080 1100 1135 1180 1190 1210 1220 1279 1280 1281 1300 1315 1316 1319 1352 1385 1431 1432 1436 1438 1454 1473 1493 1517 1520 1541 1592 1627 1657 1688 1706 1722 1734 1768 1787 1798 1828 1859 1860 1914 1915 1950 1951 2003 2008 2028 2051 2053 2054 2055 2072 2109 2124 2166 2207 2215 2228 2229 2233 2261 2270 2274 2289 2305 2316 2321 2327 2353 2356 2357 2370 2371 2374 2416 2419 2420 2427 2440 2453 2457 2476 2477 2491 2499 2527 2532 2533 2539 2547 2597 2656 2657 2696 2720 2729 2741 2745 2758 2821 2866 2879 2907 2936 2974 2979 2991 2992 3000 3008 3026 3052 3072 3076 3135 3145 3166 3226 3227 3235 3242 3260 3317 3340 3348 3358 3405 3411 3448 3481 3492 3494 3516 3534 3559 3579 3587 3595 3685 3687 3700 3731 3757 3765 3777 3781 3792 3794 3801 3802 3826 3837 3840 3842 3843 3850 3858 3899 3902 3904 3908 3945 3974 3977 3979 4003 4007 4026 4031 4071 4078 4088 4101 4111 4115 4116 4142 4143 4181 4184 4192 4193 4227 4246 4248 4265 4276 4280 4292 4310 4312 4328 4338 4365 4386 4393 4401 4434 4435 4465 4466 4471 4493 4501 4510 4549 4572 4587 4598 4615 4652 4674 4680 4698 4719 4730 4731 4743 4745 4750 4755 4762 4766 4773 4782 4790 4815 4831 4833 4835 4836 4866 4870 4880 4883 4884 4895 4896 4918 4921 4929 4937 4939 4950 4953 4963 4979 4987 4998 25 118 119 132 189 301 312 320 412 667 731 748 791 823 869 1007 1015 1080 1248 1286 1658 1691 1738 1745 1836 1865 1942 2056 2089 2113 2139 2146 2229 2453 2475 2612 2627 2669 2717 2729 2730 2779 2781 2862 2952 3061 3098 3190 3232 3274 3277 3548 3560 3748 3749 4024 4124 4155 4173 4253 4596 4649 4815 4817 4849 4909 AGGACC/GGTCCT 0 -3 263 281 42 -46.3 0 4 6 10 19 58 82 107 128 152 196 214 216 217 221 235 236 272 300 319 330 373 391 405 472 491 492 495 561 590 605 630 638 639 647 656 665 698 714 715 730 770 771 777 795 800 816 837 870 887 897 918 919 929 940 981 982 1002 1003 1031 1034 1044 1045 1084 1093 1094 1129 1130 1148 1169 1178 1179 1192 1204 1205 1207 1241 1250 1262 1269 1270 1284 1325 1350 1365 1366 1373 1381 1386 1387 1388 1401 1518 1534 1535 1549 1583 1587 1598 1606 1610 1631 1632 1633 1638 1657 1691 1715 1732 1765 1804 1806 1807 1808 1818 1824 1867 1868 1876 1893 1934 2032 2037 2042 2043 2086 2087 2099 2100 2139 2152 2153 2166 2182 2227 2240 2251 2275 2286 2317 2318 2322 2364 2390 2395 2424 2513 2529 2557 2570 2577 2580 2604 2607 2705 2729 2748 2749 2755 2756 2768 2783 2884 2949 2982 3008 3011 3045 3120 3147 3194 3195 3196 3207 3209 3245 3246 3252 3270 3320 3336 3338 3346 3352 3355 3362 3368 3393 3413 3445 3465 3471 3479 3498 3511 3536 3537 3563 3608 3611 3621 3623 3699 3747 3764 3799 3817 3869 3872 3877 3892 3920 3923 3930 3963 3978 3999 4076 4092 4145 4150 4159 4221 4229 4240 4294 4305 4306 4311 4318 4323 4325 4326 4333 4344 4347 4411 4416 4450 4521 4554 4559 4582 4584 4585 4607 4644 4646 4703 4737 4756 4767 4785 4798 4816 4817 4844 4886 4912 4928 4932 4935 4951 76 261 364 541 567 687 910 939 1359 1462 1636 1762 2011 2106 2150 2275 2383 2432 2493 2633 2640 2997 3133 3202 3211 3222 3367 3387 3400 3457 3513 3625 3637 3689 3804 4406 4614 4620 4631 4754 4836 4983 GGTCCT/AGGACC 1 -3 263 281 42 -46.3 0 4 6 10 19 58 82 107 128 152 196 214 216 217 221 235 236 272 300 319 330 373 391 405 472 491 492 495 561 590 605 630 638 639 647 656 665 698 714 715 730 770 771 777 795 800 816 837 870 887 897 918 919 929 940 981 982 1002 1003 1031 1034 1044 1045 1084 1093 1094 1129 1130 1148 1169 1178 1179 1192 1204 1205 1207 1241 1250 1262 1269 1270 1284 1325 1350 1365 1366 1373 1381 1386 1387 1388 1401 1518 1534 1535 1549 1583 1587 1598 1606 1610 1631 1632 1633 1638 1657 1691 1715 1732 1765 1804 1806 1807 1808 1818 1824 1867 1868 1876 1893 1934 2032 2037 2042 2043 2086 2087 2099 2100 2139 2152 2153 2166 2182 2227 2240 2251 2275 2286 2317 2318 2322 2364 2390 2395 2424 2513 2529 2557 2570 2577 2580 2604 2607 2705 2729 2748 2749 2755 2756 2768 2783 2884 2949 2982 3008 3011 3045 3120 3147 3194 3195 3196 3207 3209 3245 3246 3252 3270 3320 3336 3338 3346 3352 3355 3362 3368 3393 3413 3445 3465 3471 3479 3498 3511 3536 3537 3563 3608 3611 3621 3623 3699 3747 3764 3799 3817 3869 3872 3877 3892 3920 3923 3930 3963 3978 3999 4076 4092 4145 4150 4159 4221 4229 4240 4294 4305 4306 4311 4318 4323 4325 4326 4333 4344 4347 4411 4416 4450 4521 4554 4559 4582 4584 4585 4607 4644 4646 4703 4737 4756 4767 4785 4798 4816 4817 4844 4886 4912 4928 4932 4935 4951 76 261 364 541 567 687 910 939 1359 1462 1636 1762 2011 2106 2150 2275 2383 2432 2493 2633 2640 2997 3133 3202 3211 3222 3367 3387 3400 3457 3513 3625 3637 3689 3804 4406 4614 4620 4631 4754 4836 4983 ATGGGC/GCCCAT 0 -4 285 278 64 -34.2 29 32 41 84 99 118 122 123 137 149 150 173 174 192 193 200 205 207 208 239 240 312 313 316 325 338 352 353 374 409 410 439 478 499 538 564 569 601 624 688 697 743 757 758 858 899 943 972 973 986 1013 1049 1061 1065 1066 1082 1097 1098 1128 1164 1188 1191 1219 1281 1293 1317 1352 1390 1398 1436 1458 1469 1473 1502 1517 1531 1572 1573 1587 1628 1645 1659 1661 1665 1768 1787 1798 1850 1859 1860 1894 1903 1906 1954 2023 2025 2050 2055 2075 2085 2107 2109 2119 2177 2246 2274 2289 2291 2292 2298 2327 2336 2340 2342 2353 2363 2364 2440 2478 2495 2520 2527 2547 2563 2586 2587 2590 2591 2598 2608 2623 2624 2653 2669 2694 2789 2819 2823 2837 2841 2869 2870 2871 2885 2905 2906 2907 2936 2974 2979 3025 3067 3089 3130 3134 3145 3154 3173 3210 3235 3243 3254 3301 3302 3335 3347 3358 3398 3407 3409 3410 3411 3431 3438 3493 3500 3514 3517 3532 3539 3557 3560 3579 3590 3595 3625 3650 3663 3687 3700 3704 3712 3724 3788 3819 3820 3838 3848 3850 3899 3904 3918 3919 3940 3977 3979 4003 4035 4064 4065 4071 4095 4111 4123 4128 4145 4152 4158 4164 4175 4181 4192 4193 4220 4245 4265 4310 4345 4355 4357 4364 4365 4366 4377 4379 4390 4391 4398 4420 4421 4427 4457 4461 4464 4465 4471 4479 4492 4510 4529 4531 4544 4556 4561 4580 4585 4598 4605 4633 4637 4641 4651 4653 4671 4680 4685 4694 4715 4746 4750 4762 4766 4775 4782 4833 4918 4930 4939 4941 4943 4950 4952 4953 4985 4998 75 86 102 119 137 312 373 402 458 513 564 618 884 919 981 1003 1051 1106 1171 1301 1320 1467 1681 1691 1716 1748 1791 1814 1886 1964 1986 2010 2175 2358 2502 2515 2552 2557 2561 2567 2625 2663 2701 2728 2746 2860 3297 3330 3459 3500 3662 3694 3828 3918 4135 4172 4224 4245 4268 4434 4632 4712 4736 4896 GACCGG/CCGGTC 0 -1 243 267 38 -45.2 0 11 19 31 76 136 152 227 244 245 271 274 284 285 292 314 324 333 347 370 371 391 401 402 412 428 440 472 479 506 507 543 551 554 555 577 604 605 608 614 631 637 645 651 680 681 697 726 743 756 775 777 780 781 807 809 814 876 881 900 909 936 944 1002 1003 1049 1063 1101 1163 1207 1213 1214 1217 1241 1247 1261 1263 1271 1314 1319 1335 1336 1342 1355 1415 1453 1454 1474 1478 1481 1493 1528 1565 1567 1593 1606 1628 1696 1714 1718 1725 1730 1743 1772 1785 1808 1818 1877 1878 1906 1925 1926 1930 1932 1933 1980 1997 2009 2032 2042 2043 2044 2045 2105 2106 2110 2149 2155 2156 2159 2213 2254 2264 2282 2326 2329 2336 2369 2390 2391 2402 2410 2438 2441 2442 2496 2511 2513 2557 2580 2608 2668 2681 2686 2699 2706 2744 2755 2778 2779 2856 2868 2909 2937 2974 3004 3011 3066 3070 3072 3091 3120 3191 3246 3252 3261 3346 3361 3369 3372 3391 3409 3410 3420 3432 3444 3450 3451 3474 3524 3539 3585 3591 3608 3633 3660 3694 3720 3777 3812 3868 3869 3895 3937 3946 4027 4045 4051 4058 4074 4078 4090 4140 4251 4262 4266 4267 4302 4309 4370 4372 4377 4453 4476 4500 4515 4569 4598 4643 4675 4689 4711 4720 4740 4747 4775 4816 4817 4824 4872 4971 4976 4978 29 33 331 388 400 430 749 922 1056 1114 1173 1200 1396 1473 1779 1787 1865 1955 2004 2139 2160 2246 2267 2344 2633 2802 2829 2980 3569 3709 3786 3864 3979 4005 4273 4719 4829 4921 CCGGTC/GACCGG 1 -5 243 267 38 -45.2 0 11 19 31 76 136 152 227 244 245 271 274 284 285 292 314 324 333 347 370 371 391 401 402 412 428 440 472 479 506 507 543 551 554 555 577 604 605 608 614 631 637 645 651 680 681 697 726 743 756 775 777 780 781 807 809 814 876 881 900 909 936 944 1002 1003 1049 1063 1101 1163 1207 1213 1214 1217 1241 1247 1261 1263 1271 1314 1319 1335 1336 1342 1355 1415 1453 1454 1474 1478 1481 1493 1528 1565 1567 1593 1606 1628 1696 1714 1718 1725 1730 1743 1772 1785 1808 1818 1877 1878 1906 1925 1926 1930 1932 1933 1980 1997 2009 2032 2042 2043 2044 2045 2105 2106 2110 2149 2155 2156 2159 2213 2254 2264 2282 2326 2329 2336 2369 2390 2391 2402 2410 2438 2441 2442 2496 2511 2513 2557 2580 2608 2668 2681 2686 2699 2706 2744 2755 2778 2779 2856 2868 2909 2937 2974 3004 3011 3066 3070 3072 3091 3120 3191 3246 3252 3261 3346 3361 3369 3372 3391 3409 3410 3420 3432 3444 3450 3451 3474 3524 3539 3585 3591 3608 3633 3660 3694 3720 3777 3812 3868 3869 3895 3937 3946 4027 4045 4051 4058 4074 4078 4090 4140 4251 4262 4266 4267 4302 4309 4370 4372 4377 4453 4476 4500 4515 4569 4598 4643 4675 4689 4711 4720 4740 4747 4775 4816 4817 4824 4872 4971 4976 4978 29 33 331 388 400 430 749 922 1056 1114 1173 1200 1396 1473 1779 1787 1865 1955 2004 2139 2160 2246 2267 2344 2633 2802 2829 2980 3569 3709 3786 3864 3979 4005 4273 4719 4829 4921 TGGGCT/AGCCCA 0 -3 278 261 55 -34.5 11 29 35 41 58 94 110 122 123 136 137 164 165 205 251 252 276 345 352 353 374 416 419 436 478 538 548 564 586 624 669 688 734 743 899 986 1033 1046 1049 1055 1065 1082 1097 1098 1100 1122 1128 1142 1190 1256 1261 1281 1293 1300 1305 1315 1316 1351 1390 1454 1469 1473 1514 1517 1572 1573 1592 1640 1645 1661 1688 1706 1733 1768 1787 1798 1859 1860 1906 1954 1973 2003 2008 2050 2055 2085 2096 2109 2124 2125 2166 2177 2207 2233 2270 2289 2315 2316 2336 2340 2353 2356 2357 2370 2371 2374 2406 2419 2420 2440 2453 2457 2476 2477 2478 2499 2527 2532 2533 2547 2563 2565 2586 2587 2598 2623 2624 2653 2656 2657 2669 2694 2758 2789 2797 2821 2823 2841 2866 2885 2905 2906 2991 2992 3008 3025 3031 3044 3062 3145 3158 3224 3225 3250 3284 3302 3318 3376 3407 3411 3440 3481 3492 3500 3514 3532 3539 3559 3560 3579 3612 3650 3687 3700 3757 3765 3777 3792 3794 3819 3820 3840 3842 3843 3858 3869 3899 3904 3935 3945 4003 4007 4011 4035 4057 4064 4065 4071 4078 4095 4101 4123 4128 4136 4140 4145 4152 4159 4179 4181 4191 4192 4193 4227 4246 4265 4280 4292 4312 4338 4345 4357 4365 4366 4375 4377 4381 4386 4391 4398 4420 4434 4465 4471 4479 4483 4492 4510 4523 4529 4549 4561 4572 4585 4587 4588 4598 4605 4615 4633 4651 4652 4684 4685 4710 4730 4745 4755 4761 4762 4790 4815 4835 4836 4870 4885 4895 4918 4919 4929 4930 4937 4939 4950 4963 4979 4985 4998 132 301 312 402 412 458 667 1051 1106 1286 1301 1320 1658 1691 1716 1748 1791 1836 2010 2056 2146 2175 2453 2502 2669 2717 2730 2746 2779 2781 2862 2952 3041 3190 3277 3330 3410 3560 3576 3662 3748 3749 4024 4124 4173 4224 4225 4245 4341 4434 4632 4649 4712 4896 4954 TGGGTC/GACCCA 1 -5 252 257 78 -24.3 10 23 35 36 55 62 76 98 156 158 163 166 207 208 262 263 272 301 318 347 383 397 414 416 459 495 499 510 515 530 537 558 598 620 630 650 663 673 698 730 757 758 764 765 786 801 802 809 837 850 895 916 929 936 938 974 983 1004 1007 1029 1034 1044 1045 1051 1052 1139 1153 1255 1258 1259 1325 1331 1352 1373 1388 1485 1514 1527 1547 1549 1617 1662 1708 1722 1732 1754 1808 1818 1824 1856 1867 1917 1932 1933 1969 2011 2023 2066 2078 2082 2152 2153 2163 2164 2182 2195 2200 2222 2230 2233 2252 2280 2281 2286 2308 2323 2333 2382 2389 2433 2457 2478 2480 2498 2499 2536 2540 2544 2545 2552 2570 2597 2635 2659 2714 2723 2724 2732 2760 2867 2870 2871 2885 2888 2889 2923 2928 2971 2982 2984 2994 3009 3051 3099 3134 3138 3155 3184 3221 3224 3225 3236 3245 3267 3330 3367 3373 3396 3399 3403 3435 3448 3498 3521 3534 3575 3576 3607 3623 3626 3641 3654 3680 3718 3765 3790 3796 3801 3812 3837 3877 3902 3906 3964 3974 3985 4003 4014 4102 4121 4139 4144 4145 4155 4170 4173 4184 4201 4220 4251 4266 4294 4298 4316 4358 4411 4414 4421 4436 4482 4506 4507 4517 4546 4585 4593 4605 4614 4615 4629 4646 4673 4698 4707 4794 4796 4797 4801 4802 4861 4882 4895 4928 4929 4935 4941 4945 4957 4968 4987 4988 4994 35 42 45 60 193 268 322 399 406 470 488 499 541 665 696 701 732 787 889 1137 1350 1378 1481 1492 1561 1649 1717 1777 1890 1914 1976 2052 2053 2086 2150 2180 2181 2263 2267 2275 2339 2405 2494 2497 2612 2684 2711 2718 2746 2786 2803 2811 3111 3128 3211 3236 3261 3297 3391 3397 3413 3551 3571 3604 3721 3745 3804 3924 3961 3969 4104 4258 4299 4604 4625 4791 4870 4887 GTGGAC/GTCCAC 0 -4 234 255 74 -25.3 0 1 27 35 78 79 83 96 102 115 124 125 127 160 171 173 174 184 215 266 267 274 277 301 307 331 361 398 411 414 426 506 507 555 562 566 577 626 646 678 680 681 694 737 738 750 791 871 872 873 897 924 985 994 995 1027 1073 1100 1138 1173 1203 1222 1233 1249 1253 1263 1264 1283 1286 1314 1326 1343 1344 1364 1398 1426 1441 1470 1519 1575 1589 1593 1615 1655 1668 1711 1721 1722 1734 1745 1746 1747 1814 1821 1881 1882 1906 1910 1920 1932 1933 1944 1999 2000 2008 2015 2033 2034 2038 2042 2043 2134 2159 2199 2245 2264 2279 2280 2281 2287 2295 2296 2359 2455 2483 2512 2604 2620 2631 2680 2714 2742 2743 2774 2798 2809 2818 2849 2854 2855 2916 2923 2958 2960 3006 3060 3104 3111 3143 3144 3151 3169 3188 3195 3196 3204 3205 3238 3255 3303 3304 3345 3348 3369 3436 3482 3507 3543 3639 3641 3652 3674 3714 3715 3716 3720 3738 3752 3761 3771 3810 3824 3828 3856 3873 3879 3915 3934 3937 3954 3955 4013 4038 4085 4086 4125 4131 4132 4168 4169 4171 4184 4198 4211 4226 4230 4371 4380 4415 4426 4430 4431 4433 4559 4591 4596 4618 4626 4637 4686 4689 4701 4719 4733 4787 4794 4886 4905 4929 4930 4948 4956 4991 4992 55 113 141 419 437 569 696 769 822 884 946 1037 1077 1083 1084 1107 1148 1246 1257 1304 1358 1389 1396 1457 1471 1507 1590 1692 1739 1779 1841 1901 2058 2202 2261 2317 2383 2415 2603 2689 2691 2789 2799 2802 2856 2903 2914 2956 3144 3146 3243 3477 3579 3622 3702 3738 3789 4038 4151 4259 4285 4456 4494 4504 4514 4575 4577 4601 4648 4813 4882 4957 4993 4994 GTGGTC/GACCAC 1 -5 239 255 57 -32.2 6 56 64 75 78 149 150 153 155 171 206 235 236 250 259 260 265 276 288 293 301 304 305 326 343 361 377 378 393 418 488 489 561 565 575 578 593 594 597 611 635 670 678 702 745 807 825 833 871 872 885 903 909 917 982 1043 1083 1101 1109 1110 1113 1142 1188 1201 1213 1214 1224 1225 1238 1304 1334 1348 1355 1356 1376 1381 1417 1433 1534 1570 1583 1586 1598 1636 1637 1653 1654 1656 1670 1674 1675 1683 1685 1760 1771 1774 1776 1797 1798 1814 1817 1849 1879 1910 1918 1971 1979 1986 2003 2012 2013 2040 2053 2054 2080 2086 2087 2122 2123 2149 2150 2177 2178 2222 2232 2286 2287 2295 2296 2312 2313 2381 2410 2414 2450 2506 2523 2524 2556 2617 2632 2645 2669 2677 2729 2731 2741 2750 2754 2768 2777 2791 2811 2818 2827 2849 2919 2931 2949 2959 2985 3006 3049 3050 3086 3096 3111 3112 3122 3123 3191 3209 3210 3213 3228 3240 3272 3336 3337 3354 3368 3393 3436 3454 3487 3488 3546 3548 3549 3552 3563 3594 3634 3698 3817 3834 3839 3873 3914 3959 3978 3990 4016 4122 4150 4157 4170 4178 4182 4223 4237 4247 4330 4347 4350 4406 4415 4421 4446 4485 4488 4535 4554 4610 4635 4649 4663 4683 4721 4734 4754 4839 4846 4847 4862 4877 4898 4948 4970 77 245 358 494 594 703 838 910 922 976 1000 1075 1111 1212 1327 1462 1507 1524 1594 1636 1673 1684 1728 1817 2058 2140 2195 2229 2290 2294 2434 2496 2655 2764 2883 2967 3070 3233 3275 3419 3621 3676 3704 3784 3800 4058 4080 4129 4343 4391 4590 4662 4706 4750 4768 4803 4946 GTCCTT/AAGGAC 1 -2 241 248 73 -24.3 3 4 6 7 19 82 107 112 130 152 187 188 216 217 224 235 236 300 319 329 339 381 391 405 417 471 473 495 605 676 703 714 715 721 751 770 771 830 836 870 940 962 981 1002 1003 1014 1015 1070 1079 1084 1129 1130 1143 1169 1178 1192 1262 1269 1270 1325 1338 1350 1400 1493 1518 1534 1540 1601 1610 1633 1638 1642 1677 1691 1702 1713 1714 1715 1732 1741 1765 1804 1818 1825 1846 1868 1876 1884 1904 1934 1948 1989 2012 2030 2037 2042 2043 2099 2100 2135 2136 2166 2169 2180 2182 2227 2240 2251 2275 2286 2322 2343 2344 2361 2364 2379 2390 2424 2465 2471 2472 2513 2570 2578 2580 2581 2582 2586 2587 2604 2619 2622 2638 2700 2705 2729 2748 2749 2755 2768 2783 2860 2863 2864 2884 2888 2889 2982 2996 2999 3008 3011 3038 3045 3120 3149 3170 3194 3254 3268 3270 3298 3320 3343 3344 3347 3376 3394 3471 3608 3621 3636 3642 3648 3697 3799 3817 3819 3871 3872 3885 3892 3948 3963 3976 3978 3999 4022 4035 4121 4145 4159 4221 4225 4229 4294 4305 4306 4323 4325 4326 4333 4344 4347 4380 4383 4388 4416 4448 4450 4500 4502 4518 4521 4533 4538 4554 4582 4585 4607 4644 4646 4667 4694 4700 4709 4751 4755 4767 4780 4794 4816 4817 4844 4860 4884 4886 4904 4928 4932 4993 120 157 261 283 372 450 539 567 592 684 687 717 764 849 936 963 974 1269 1283 1408 1658 1787 1796 1999 2011 2149 2150 2195 2275 2383 2462 2520 2532 2586 2633 2640 2997 3001 3065 3070 3113 3181 3200 3258 3340 3344 3387 3400 3450 3456 3513 3555 3570 3620 3633 3637 3807 3865 3971 4104 4306 4379 4396 4416 4572 4631 4682 4712 4717 4773 4819 4987 4990 CGGTCA/TGACCG 1 -4 199 246 45 -35.9 9 15 18 19 21 23 32 37 105 114 131 133 153 158 159 184 191 215 244 245 284 285 292 296 297 302 324 333 337 347 382 384 395 400 401 402 418 427 479 496 505 554 616 627 645 654 680 681 726 756 775 780 781 809 812 813 814 824 859 876 936 963 1039 1040 1101 1103 1110 1116 1123 1163 1196 1199 1209 1217 1247 1259 1275 1289 1314 1417 1437 1453 1473 1478 1479 1487 1489 1490 1512 1544 1567 1591 1628 1714 1730 1743 1749 1770 1777 1778 1784 1785 1878 1922 1930 1980 1997 2009 2022 2049 2079 2110 2155 2156 2159 2179 2192 2210 2265 2282 2315 2326 2336 2378 2434 2490 2511 2580 2585 2612 2681 2706 2744 2778 2779 2783 2788 2807 2808 2872 2896 2897 2898 3006 3034 3042 3057 3066 3069 3072 3082 3085 3100 3105 3159 3248 3249 3277 3361 3372 3380 3381 3432 3450 3499 3506 3591 3670 3679 3758 3821 3868 3875 3896 3920 3944 4027 4127 4140 4191 4221 4266 4302 4309 4372 4388 4401 4425 4453 4500 4569 4607 4702 4711 4792 4794 4809 4824 4956 7 135 304 331 430 623 703 721 749 1056 1065 1124 1331 1473 1522 1523 1682 1778 1779 2139 2145 2160 2185 2246 2258 2270 2650 2829 3626 3709 3862 3904 4005 4041 4047 4153 4190 4273 4303 4383 4434 4719 4829 4875 4921 AACCGG/CCGGTT 4 -4 239 240 79 -20.7 8 12 18 19 22 46 56 92 119 159 172 222 225 242 284 315 324 374 376 397 428 469 470 474 502 506 507 652 653 709 733 755 790 807 808 849 881 885 906 983 1002 1003 1033 1050 1088 1101 1131 1140 1150 1231 1240 1247 1248 1261 1310 1335 1336 1454 1468 1474 1500 1537 1539 1545 1567 1585 1660 1670 1681 1682 1696 1714 1730 1732 1742 1754 1810 1815 1818 1835 1858 1861 1870 1877 1886 1914 1915 1927 1930 1949 1958 1959 1980 2028 2048 2050 2090 2102 2106 2143 2144 2155 2156 2258 2261 2322 2366 2369 2401 2402 2419 2441 2442 2445 2471 2472 2516 2615 2637 2643 2672 2721 2722 2744 2776 2803 2848 2879 2882 2928 2936 2948 2965 2974 3004 3043 3053 3103 3135 3215 3237 3242 3252 3310 3320 3338 3346 3349 3351 3353 3380 3381 3385 3407 3432 3434 3451 3539 3589 3591 3609 3620 3628 3656 3681 3689 3710 3711 3719 3777 3778 3868 3903 3943 3958 4001 4006 4009 4053 4058 4081 4090 4105 4140 4166 4170 4172 4198 4211 4262 4267 4272 4305 4306 4309 4329 4344 4424 4450 4500 4504 4512 4517 4548 4552 4553 4565 4567 4568 4589 4597 4607 4662 4671 4675 4711 4717 4720 4727 4740 4761 4771 4796 4797 4824 4837 4843 4887 4888 4894 4925 4953 4971 4974 4976 4980 4983 4989 4997 8 36 77 143 190 227 230 267 289 333 505 517 559 623 827 849 879 885 916 941 1139 1220 1247 1282 1396 1631 1726 1754 1764 1769 1787 1790 1797 1798 1876 1921 2019 2107 2384 2415 2443 2447 2479 2487 2558 2604 2654 2829 2835 2886 3051 3124 3274 3336 3380 3560 3565 3566 3623 3629 3630 3736 3905 3941 3960 4005 4016 4058 4125 4138 4144 4237 4349 4373 4434 4457 4463 4707 4921 CCACGT/ACGTGG 2 -2 241 233 60 -26.1 33 50 58 69 70 88 104 111 115 143 144 151 161 175 189 215 288 316 343 360 387 411 439 442 513 566 696 701 755 757 758 759 844 905 923 961 1001 1009 1010 1067 1069 1073 1088 1180 1238 1284 1307 1326 1347 1350 1351 1354 1378 1388 1432 1449 1509 1527 1533 1545 1558 1578 1588 1608 1630 1633 1643 1684 1687 1703 1711 1722 1779 1780 1825 1826 1827 1843 1848 1852 1945 1947 1960 2008 2029 2039 2086 2087 2110 2134 2159 2170 2185 2188 2199 2213 2215 2232 2252 2279 2361 2375 2385 2397 2398 2402 2409 2452 2460 2461 2462 2503 2544 2545 2553 2554 2586 2587 2594 2645 2669 2685 2734 2735 2774 2785 2787 2797 2804 2824 2848 2959 2980 2981 3051 3064 3065 3071 3143 3144 3169 3195 3196 3237 3257 3305 3354 3360 3365 3366 3369 3388 3403 3422 3462 3473 3493 3504 3575 3576 3578 3598 3602 3603 3611 3657 3674 3679 3682 3728 3752 3787 3789 3818 3841 3865 3873 3885 3922 3929 3943 3965 3977 4009 4024 4066 4067 4068 4069 4098 4113 4137 4173 4190 4196 4204 4224 4226 4244 4278 4279 4290 4294 4297 4299 4355 4383 4396 4409 4429 4446 4458 4485 4513 4520 4526 4539 4550 4551 4600 4608 4635 4637 4670 4676 4681 4682 4712 4738 4788 4789 4794 4823 4857 4883 4918 4934 4938 4947 4991 4992 45 278 399 437 453 468 536 613 857 909 921 1085 1126 1207 1209 1286 1335 1398 1457 1532 1561 1593 1673 1738 1865 2037 2122 2217 2247 2261 2291 2485 2550 2612 2737 2740 2764 2956 3008 3153 3229 3250 3254 3289 3331 3458 3602 3741 3751 3771 3855 3896 4129 4158 4172 4537 4719 4882 4954 4966 ACGGTC/GACCGT 1 -5 194 232 50 -30.2 15 18 21 23 24 59 107 114 120 131 133 153 191 203 225 267 273 282 296 297 307 319 327 328 337 364 374 382 384 399 418 427 468 477 496 505 520 531 535 568 580 588 616 654 662 708 717 718 725 733 751 792 824 833 842 854 859 861 925 926 1016 1039 1040 1087 1103 1123 1144 1173 1189 1192 1204 1207 1209 1230 1259 1275 1306 1309 1327 1367 1417 1424 1425 1449 1468 1512 1536 1555 1575 1628 1677 1767 1770 1778 1784 1785 1813 1868 1882 1996 2022 2036 2049 2065 2066 2179 2192 2227 2274 2310 2315 2349 2350 2363 2377 2378 2385 2421 2434 2490 2585 2593 2594 2609 2612 2634 2644 2683 2696 2697 2706 2719 2748 2749 2755 2775 2788 2809 2965 3034 3057 3082 3091 3100 3159 3163 3172 3204 3205 3248 3249 3259 3277 3361 3380 3381 3389 3399 3475 3499 3511 3514 3591 3670 3679 3738 3758 3764 3821 3835 3851 3906 3929 4052 4076 4127 4159 4191 4225 4228 4311 4319 4388 4445 4674 4792 4809 4843 4899 4930 4932 4946 4956 4998 2 12 261 288 304 508 558 567 705 890 1026 1095 1143 1320 1331 1359 1455 1522 1523 1778 1791 1921 2145 2154 2185 2258 2270 2302 2650 2829 2971 2980 2994 3051 3124 3202 3340 3406 3678 3695 3705 3789 3904 4018 4346 4434 4812 4875 4983 4989 GGTCAC/GTGACC 1 -3 203 232 52 -29.3 18 22 27 39 44 60 62 64 117 133 153 166 186 191 231 259 260 265 292 326 347 377 378 400 415 418 433 442 475 498 518 544 565 605 620 627 649 678 683 704 722 729 739 756 768 769 812 813 814 828 849 853 859 871 872 876 936 945 1060 1069 1101 1103 1110 1123 1132 1142 1196 1247 1259 1310 1314 1318 1325 1376 1380 1403 1487 1512 1544 1571 1581 1586 1628 1643 1648 1653 1654 1704 1708 1714 1722 1724 1749 1755 1764 1770 1786 1856 1952 1960 1991 2001 2002 2009 2022 2048 2049 2081 2122 2123 2159 2178 2179 2222 2282 2299 2317 2318 2321 2326 2333 2396 2450 2490 2498 2544 2545 2556 2586 2587 2603 2637 2706 2761 2783 2788 2872 2890 2898 2941 2987 3042 3051 3105 3118 3148 3176 3178 3203 3224 3225 3229 3230 3258 3288 3319 3331 3372 3397 3399 3591 3594 3640 3654 3670 3675 3759 3767 3834 3837 3956 4053 4083 4119 4126 4153 4221 4266 4287 4288 4309 4330 4372 4389 4390 4446 4485 4503 4510 4535 4574 4631 4701 4711 4738 4801 4802 4846 4879 4929 4956 4959 4997 229 304 433 499 504 647 721 755 794 921 933 976 1063 1065 1111 1205 1246 1248 1327 1454 1465 1610 1626 1746 1794 2012 2058 2207 2258 2320 2375 2432 2434 2577 2650 2916 3073 3312 3401 3626 3802 4135 4229 4417 4556 4557 4582 4604 4750 4765 4808 4829 CTGGTC/GACCAG 1 -5 184 217 52 -26.0 0 6 15 30 38 45 83 124 125 137 186 189 204 232 233 248 257 258 265 268 269 294 299 360 375 404 422 423 424 425 432 435 444 445 452 535 561 562 581 623 635 705 706 725 737 761 762 768 769 830 856 857 932 933 942 981 1001 1072 1078 1081 1138 1148 1203 1205 1227 1253 1262 1312 1313 1398 1403 1404 1408 1435 1544 1583 1634 1635 1643 1671 1747 1749 1752 1762 1763 1769 1779 1780 1879 1897 1979 1994 2001 2002 2053 2054 2146 2172 2188 2275 2288 2334 2342 2359 2416 2430 2436 2496 2516 2610 2637 2638 2664 2673 2718 2777 2785 2830 2849 2884 2939 3006 3058 3158 3161 3279 3316 3320 3339 3439 3451 3489 3514 3611 3639 3662 3669 3701 3723 3816 3828 3864 3895 3950 3974 3978 4008 4011 4122 4161 4225 4240 4297 4305 4306 4309 4318 4333 4348 4349 4389 4407 4408 4416 4422 4438 4468 4493 4540 4559 4594 4603 4646 4649 4664 4690 4720 4722 4772 4777 4815 4850 4913 4926 266 401 606 624 684 686 701 709 720 817 891 933 957 1035 1089 1216 1246 1248 1398 1548 1703 1930 2008 2181 2242 2328 2329 2719 2789 2802 2876 2921 3033 3094 3205 3387 3401 3425 3513 3637 3649 3738 4008 4202 4220 4309 4382 4417 4781 4808 4821 4983 ACCGGT/ACCGGT 4 -3 188 207 35 -31.9 0 8 11 19 31 56 136 152 159 222 242 274 284 324 347 370 371 397 401 402 412 428 474 479 506 507 577 604 614 637 645 651 680 681 697 709 755 807 809 849 876 881 936 983 1033 1050 1101 1163 1240 1241 1247 1261 1271 1314 1319 1335 1336 1342 1355 1453 1454 1474 1478 1493 1500 1537 1545 1567 1585 1593 1660 1670 1696 1714 1718 1730 1732 1742 1818 1858 1877 1878 1906 1927 1980 2032 2048 2090 2102 2110 2149 2159 2264 2282 2326 2329 2390 2402 2410 2441 2475 2516 2580 2637 2643 2672 2681 2721 2722 2744 2755 2778 2779 2803 2868 2879 2936 2965 2974 3004 3011 3066 3070 3237 3246 3252 3338 3346 3349 3353 3361 3407 3432 3450 3451 3474 3524 3585 3589 3591 3620 3654 3660 3675 3710 3777 3778 3812 3868 3943 3958 4045 4053 4058 4140 4172 4198 4211 4262 4302 4309 4370 4377 4417 4500 4504 4512 4517 4553 4565 4569 4589 4643 4649 4662 4675 4689 4711 4727 4740 4771 4816 4817 4824 4894 4971 4976 4989 8 143 230 289 849 916 922 1139 1173 1200 1220 1396 1409 1473 1631 1764 1769 1787 1798 1948 2480 2518 2604 2835 3274 3565 3566 3709 3905 4016 4237 4349 4759 4829 4921 CACGTG/CACGTG 2 -1 198 199 40 -27.4 33 88 97 104 111 122 123 131 143 144 148 151 189 215 241 278 279 288 343 348 360 431 439 442 468 566 577 606 668 701 759 871 872 950 961 964 1001 1067 1069 1180 1211 1237 1239 1284 1303 1347 1351 1370 1409 1410 1432 1455 1456 1457 1509 1545 1558 1570 1608 1643 1673 1687 1703 1722 1750 1785 1800 1802 1825 1843 1852 1989 1992 2008 2023 2027 2098 2104 2154 2232 2276 2324 2347 2361 2375 2397 2398 2402 2409 2425 2452 2503 2536 2544 2545 2548 2586 2587 2623 2624 2669 2685 2692 2693 2774 2787 2790 2793 2797 2804 2824 2921 2959 2981 3050 3065 3080 3195 3196 3299 3300 3325 3351 3388 3436 3458 3462 3473 3493 3501 3504 3508 3525 3526 3553 3577 3598 3618 3620 3682 3705 3728 3752 3782 3783 3789 3798 3841 3849 3856 3865 3885 3887 3888 3922 3933 3943 3965 3977 4009 4024 4066 4068 4069 4098 4117 4118 4137 4226 4257 4297 4299 4393 4400 4409 4446 4485 4539 4550 4551 4586 4600 4608 4676 4681 4682 4712 4738 4749 4788 4789 4794 4823 4857 4883 4947 4991 4992 23 45 272 278 296 358 437 449 468 475 476 536 921 1126 1207 1209 1603 1634 1673 2202 2247 2261 2543 2638 2737 3125 3153 3229 3250 3324 3458 3550 3675 3751 4172 4380 4567 4600 4850 4944 CGGACC/GGTCCG 0 -3 178 198 26 -35.1 0 6 11 23 55 56 59 113 120 135 149 150 161 271 292 362 370 371 428 431 440 468 509 519 543 551 555 558 583 592 600 651 743 745 833 856 857 896 906 909 947 1007 1029 1031 1048 1083 1095 1138 1163 1188 1201 1238 1260 1286 1319 1321 1322 1327 1348 1406 1435 1501 1546 1565 1718 1759 1769 1772 1808 1886 1900 1928 1930 1963 1975 1985 1994 2009 2014 2017 2032 2190 2200 2215 2242 2254 2322 2379 2381 2387 2416 2438 2479 2513 2516 2570 2607 2608 2634 2689 2695 2708 2725 2726 2736 2744 2804 2830 2853 2865 2868 2918 2939 2950 3027 3091 3096 3105 3122 3191 3213 3228 3337 3339 3354 3398 3451 3464 3492 3523 3539 3589 3630 3641 3643 3646 3647 3651 3664 3669 3701 3745 3760 3790 3839 3895 3914 3937 3997 4052 4054 4058 4090 4097 4130 4157 4197 4247 4262 4267 4310 4369 4407 4408 4436 4445 4485 4487 4495 4651 4674 4675 4720 4747 4820 4824 4843 4862 33 488 504 508 561 1095 1660 1745 1779 1907 1946 2075 2328 2358 2461 2802 2980 3111 3124 3569 4125 4155 4267 4405 4590 4711 GGTCCG/CGGACC 1 -3 178 198 26 -35.1 0 6 11 23 55 56 59 113 120 135 149 150 161 271 292 362 370 371 428 431 440 468 509 519 543 551 555 558 583 592 600 651 743 745 833 856 857 896 906 909 947 1007 1029 1031 1048 1083 1095 1138 1163 1188 1201 1238 1260 1286 1319 1321 1322 1327 1348 1406 1435 1501 1546 1565 1718 1759 1769 1772 1808 1886 1900 1928 1930 1963 1975 1985 1994 2009 2014 2017 2032 2190 2200 2215 2242 2254 2322 2379 2381 2387 2416 2438 2479 2513 2516 2570 2607 2608 2634 2689 2695 2708 2725 2726 2736 2744 2804 2830 2853 2865 2868 2918 2939 2950 3027 3091 3096 3105 3122 3191 3213 3228 3337 3339 3354 3398 3451 3464 3492 3523 3539 3589 3630 3641 3643 3646 3647 3651 3664 3669 3701 3745 3760 3790 3839 3895 3914 3937 3997 4052 4054 4058 4090 4097 4130 4157 4197 4247 4262 4267 4310 4369 4407 4408 4436 4445 4485 4487 4495 4651 4674 4675 4720 4747 4820 4824 4843 4862 33 488 504 508 561 1095 1660 1745 1779 1907 1946 2075 2328 2358 2461 2802 2980 3111 3124 3569 4125 4155 4267 4405 4590 4711 TCGGTC/GACCGA 1 -5 172 194 54 -20.3 11 32 36 37 41 65 66 82 88 105 124 125 133 159 184 247 270 284 286 302 304 305 308 384 395 535 608 627 665 676 729 737 759 800 812 813 842 864 865 906 923 1031 1064 1121 1159 1188 1196 1197 1199 1200 1201 1259 1260 1289 1331 1413 1420 1434 1458 1473 1478 1479 1487 1488 1501 1579 1580 1582 1599 1646 1681 1682 1749 1773 1922 2033 2034 2039 2079 2099 2100 2101 2110 2224 2247 2265 2304 2322 2336 2346 2387 2399 2459 2493 2494 2512 2513 2546 2577 2620 2642 2660 2672 2705 2736 2774 2783 2809 2816 2827 2872 2883 2897 2898 2922 2958 2978 2986 3000 3006 3042 3069 3155 3182 3309 3314 3334 3356 3368 3461 3470 3539 3589 3630 3655 3677 3699 3701 3735 3737 3782 3783 3873 3875 3896 3918 3919 3922 3925 3934 3937 3944 3997 3999 4092 4154 4165 4197 4221 4299 4315 4521 4525 4548 4607 4626 4637 4672 4773 4794 4820 4824 7 13 61 68 103 135 150 154 192 233 623 703 721 761 792 908 931 1065 1083 1124 1320 1368 1377 1625 1682 1702 1718 1779 1817 1877 2011 2061 2516 2517 2546 2552 2691 2865 2929 3129 3222 3265 3626 3712 3862 4047 4125 4155 4190 4273 4383 4435 4920 4929 CGGACA/TGTCCG 1 -4 153 190 32 -29.5 2 20 51 52 56 71 76 79 81 88 91 112 142 170 190 195 213 221 252 330 335 336 346 373 429 432 537 550 553 555 558 566 582 602 603 608 652 653 667 676 759 818 833 858 864 865 899 942 964 977 987 1009 1010 1017 1074 1124 1131 1136 1140 1207 1235 1288 1310 1354 1380 1438 1474 1592 1612 1621 1622 1630 1674 1675 1676 1684 1740 1754 1791 1823 1893 2011 2061 2069 2127 2161 2180 2307 2325 2369 2427 2445 2496 2524 2560 2606 2615 2643 2655 2669 2743 2796 2825 2826 2846 2861 2862 2948 3033 3041 3098 3112 3128 3149 3162 3181 3215 3250 3274 3387 3388 3418 3419 3478 3516 3529 3581 3656 3686 3692 3707 3809 3926 4021 4090 4167 4207 4219 4267 4363 4376 4475 4543 4643 4655 4757 4845 4864 4904 4931 4961 4971 4978 31 77 189 396 553 932 1130 1154 1184 1233 1456 1568 1606 1657 1745 1902 1906 2062 2161 2302 2368 3038 3289 3570 3787 3876 3898 4139 4368 4590 4673 4780 CGGTCT/AGACCG 1 -4 159 182 43 -22.2 24 31 50 65 66 88 136 172 197 198 203 225 270 282 286 307 412 418 479 506 507 532 543 568 577 580 604 608 614 631 637 651 676 722 733 737 759 800 807 809 814 842 854 900 923 1063 1087 1096 1144 1188 1189 1197 1207 1247 1271 1335 1336 1342 1355 1367 1420 1424 1425 1434 1449 1454 1468 1478 1493 1579 1580 1582 1628 1693 1718 1725 1730 1777 1785 1818 1932 1933 1941 1967 1996 2036 2099 2100 2105 2113 2208 2209 2224 2264 2282 2304 2346 2349 2350 2369 2410 2441 2442 2496 2546 2642 2644 2660 2668 2696 2755 2775 2809 2816 2827 2856 2868 2883 2937 2938 2974 2978 2986 3155 3182 3246 3309 3334 3369 3451 3470 3514 3591 3608 3655 3694 3777 3851 3868 3937 3946 3997 4051 4228 4267 4315 4319 4370 4377 4598 4637 4643 4672 4720 4775 4899 4930 4971 4976 2 13 29 68 103 138 150 154 192 233 304 400 460 515 761 890 1114 1173 1320 1368 1455 1787 1921 2004 2061 2267 2344 2516 2517 2546 2802 2980 2994 3051 3265 3678 3786 3979 4346 4435 4812 4929 4989 CCAGTG/CACTGG 3 -3 156 180 50 -18.9 0 6 80 83 119 126 153 177 235 236 237 248 254 255 259 260 286 290 291 331 361 369 397 426 433 462 510 518 545 565 581 582 597 633 694 725 732 744 768 769 876 942 951 961 987 1078 1104 1122 1133 1155 1233 1236 1248 1253 1255 1256 1267 1276 1281 1310 1311 1349 1531 1562 1643 1652 1653 1654 1706 1821 1827 1845 1856 1867 1879 1960 1972 2001 2002 2172 2195 2303 2315 2332 2406 2440 2454 2467 2539 2561 2567 2568 2592 2617 2682 2723 2770 2867 2929 2930 2983 2985 3015 3016 3058 3086 3140 3224 3225 3289 3326 3335 3541 3556 3604 3605 3693 3714 3759 3811 3812 3816 3844 3864 3951 3995 3996 4008 4038 4126 4139 4178 4186 4198 4218 4316 4325 4329 4366 4375 4401 4416 4443 4458 4537 4611 4617 4643 4664 4666 4730 4815 4845 4850 4855 4908 1 4 401 522 606 621 657 720 954 988 999 1080 1081 1098 1162 1216 1248 1400 1427 1508 1548 1708 1920 1959 2056 2275 2305 2307 2671 2706 2745 2842 2867 2934 2969 3004 3344 3401 3402 3522 3566 3628 3918 4139 4282 4285 4569 4646 4688 4829 GGGCCT/AGGCCC 0 -2 200 178 26 -30.0 18 29 61 173 174 392 398 419 433 436 466 499 563 564 567 618 619 621 665 697 746 747 787 884 963 1018 1038 1088 1135 1190 1210 1219 1281 1294 1295 1300 1315 1316 1317 1319 1337 1362 1363 1378 1385 1398 1432 1541 1588 1620 1640 1657 1659 1688 1733 1768 1787 1806 1807 1827 1903 1954 1962 1999 2003 2019 2023 2028 2039 2119 2246 2291 2298 2302 2327 2354 2356 2363 2427 2495 2539 2555 2590 2591 2597 2607 2622 2669 2745 2791 2837 2907 2936 2963 2979 3052 3072 3089 3125 3145 3166 3210 3226 3227 3242 3258 3260 3302 3348 3358 3404 3409 3410 3431 3440 3448 3493 3494 3506 3534 3557 3560 3579 3625 3693 3704 3724 3763 3788 3801 3838 3840 3842 3843 3850 3858 3904 3908 3918 3919 3940 3943 3945 3950 3998 4003 4007 4014 4031 4084 4095 4111 4181 4184 4219 4248 4292 4310 4357 4364 4365 4377 4379 4391 4421 4427 4435 4465 4510 4531 4549 4561 4580 4584 4587 4615 4637 4641 4642 4651 4653 4658 4661 4680 4698 4750 4766 4782 4815 4861 4884 4918 4919 4921 4936 4943 4950 4952 4953 4988 412 449 731 791 823 884 981 1691 1716 1901 2010 2062 2229 2567 2612 2627 3110 3186 3274 3459 3500 3578 3689 4736 4865 4876 GGACCC/GGGTCC 0 -2 169 174 25 -29.6 10 12 23 26 35 55 115 156 163 171 214 272 373 397 414 495 558 560 570 598 630 635 678 698 730 771 775 800 837 917 918 919 929 982 1004 1007 1029 1034 1250 1258 1259 1331 1350 1386 1387 1388 1389 1527 1549 1615 1631 1632 1674 1675 1708 1721 1732 1756 1808 1814 1818 1824 1864 1867 1900 1908 1932 1933 2007 2017 2023 2037 2152 2153 2200 2240 2280 2281 2286 2323 2332 2379 2389 2478 2480 2534 2535 2540 2570 2610 2635 2680 2756 2768 2867 2888 2889 2904 2912 2931 2971 2982 3017 3018 3099 3108 3109 3193 3195 3196 3221 3245 3283 3303 3304 3373 3498 3521 3568 3623 3641 3647 3714 3790 3796 3812 3817 3877 3892 3920 3953 3954 3955 4054 4137 4145 4201 4266 4294 4326 4411 4485 4546 4550 4551 4585 4607 4609 4614 4629 4632 4646 4673 4686 4698 4719 4794 4798 4801 4802 4880 4882 4914 4928 4935 4945 4948 4957 4968 76 193 429 488 889 935 1358 1470 1649 2086 2150 2275 2431 2432 2746 2803 3211 3397 3413 3617 3757 3804 4208 4620 4870 GGGTCC/GGACCC 1 -4 169 174 25 -29.6 10 12 23 26 35 55 115 156 163 171 214 272 373 397 414 495 558 560 570 598 630 635 678 698 730 771 775 800 837 917 918 919 929 982 1004 1007 1029 1034 1250 1258 1259 1331 1350 1386 1387 1388 1389 1527 1549 1615 1631 1632 1674 1675 1708 1721 1732 1756 1808 1814 1818 1824 1864 1867 1900 1908 1932 1933 2007 2017 2023 2037 2152 2153 2200 2240 2280 2281 2286 2323 2332 2379 2389 2478 2480 2534 2535 2540 2570 2610 2635 2680 2756 2768 2867 2888 2889 2904 2912 2931 2971 2982 3017 3018 3099 3108 3109 3193 3195 3196 3221 3245 3283 3303 3304 3373 3498 3521 3568 3623 3641 3647 3714 3790 3796 3812 3817 3877 3892 3920 3953 3954 3955 4054 4137 4145 4201 4266 4294 4326 4411 4485 4546 4550 4551 4585 4607 4609 4614 4629 4632 4646 4673 4686 4698 4719 4794 4798 4801 4802 4880 4882 4914 4928 4935 4945 4948 4957 4968 76 193 429 488 889 935 1358 1470 1649 2086 2150 2275 2431 2432 2746 2803 3211 3397 3413 3617 3757 3804 4208 4620 4870 CTGGAC/GTCCAG 0 -4 142 171 44 -19.4 10 38 41 55 59 74 101 130 153 154 163 210 218 219 228 229 237 259 260 340 341 375 397 422 423 452 453 498 565 593 594 648 725 732 743 744 745 775 807 879 883 885 895 932 933 951 961 968 1028 1033 1044 1045 1082 1117 1118 1133 1186 1245 1248 1257 1311 1320 1381 1467 1482 1495 1531 1565 1652 1778 1800 1830 1845 1953 1960 1972 2203 2253 2298 2300 2332 2342 2428 2454 2534 2535 2536 2592 2638 2737 2935 2965 2985 3017 3018 3086 3140 3178 3287 3293 3352 3353 3418 3419 3427 3451 3475 3520 3527 3531 3552 3557 3585 3604 3605 3649 3665 3724 3812 3835 3838 3922 3951 4006 4088 4126 4164 4186 4198 4291 4400 4462 4463 4547 4579 4614 4664 4722 4835 4897 4927 4957 63 189 312 431 456 562 570 684 825 898 1035 1162 1166 1195 1400 1438 1791 1796 1906 2154 2189 2270 2373 2383 2463 2552 2642 2814 2817 2983 3399 3410 3413 3583 4208 4248 4252 4254 4301 4304 4316 4531 4927 4969 GGACCT/AGGTCC 0 -2 168 162 41 -18.7 58 90 196 211 212 256 271 298 316 381 407 408 438 457 458 519 544 583 593 594 609 610 648 696 720 738 795 883 884 887 896 897 940 947 962 988 1084 1138 1204 1257 1264 1269 1270 1284 1286 1467 1478 1633 1634 1635 1643 1657 1688 1711 1734 1772 1841 1873 1889 1893 1934 1979 1990 2021 2041 2061 2082 2101 2108 2126 2139 2211 2239 2245 2253 2280 2281 2287 2298 2317 2318 2384 2387 2389 2395 2432 2483 2694 2695 2707 2739 2740 2744 2761 2771 2784 2796 2838 2865 2867 2884 2913 2918 2923 2950 2985 2997 3015 3040 3053 3059 3060 3105 3147 3159 3182 3194 3239 3254 3348 3355 3384 3403 3471 3479 3507 3523 3531 3532 3608 3621 3628 3637 3643 3654 3724 3759 3760 3872 3881 3900 3929 3965 3969 4072 4073 4125 4131 4132 4221 4248 4289 4335 4391 4419 4436 4502 4545 4582 4634 4651 4722 4747 4756 4770 4844 4905 4996 275 364 431 561 687 696 898 939 1025 1035 1121 1460 1718 1907 1933 1946 1977 2011 2093 2383 2461 2832 2997 3146 3263 3489 3608 3623 3689 4029 4267 4362 4405 4406 4531 4547 4577 4648 4711 4843 4964 AGGTCC/GGACCT 1 -4 168 162 41 -18.7 58 90 196 211 212 256 271 298 316 381 407 408 438 457 458 519 544 583 593 594 609 610 648 696 720 738 795 883 884 887 896 897 940 947 962 988 1084 1138 1204 1257 1264 1269 1270 1284 1286 1467 1478 1633 1634 1635 1643 1657 1688 1711 1734 1772 1841 1873 1889 1893 1934 1979 1990 2021 2041 2061 2082 2101 2108 2126 2139 2211 2239 2245 2253 2280 2281 2287 2298 2317 2318 2384 2387 2389 2395 2432 2483 2694 2695 2707 2739 2740 2744 2761 2771 2784 2796 2838 2865 2867 2884 2913 2918 2923 2950 2985 2997 3015 3040 3053 3059 3060 3105 3147 3159 3182 3194 3239 3254 3348 3355 3384 3403 3471 3479 3507 3523 3531 3532 3608 3621 3628 3637 3643 3654 3724 3759 3760 3872 3881 3900 3929 3965 3969 4072 4073 4125 4131 4132 4221 4248 4289 4335 4391 4419 4436 4502 4545 4582 4634 4651 4722 4747 4756 4770 4844 4905 4996 275 364 431 561 687 696 898 939 1025 1035 1121 1460 1718 1907 1933 1946 1977 2011 2093 2383 2461 2832 2997 3146 3263 3489 3608 3623 3689 4029 4267 4362 4405 4406 4531 4547 4577 4648 4711 4843 4964 GGGACC/GGTCCC 0 -3 161 158 36 -20.0 20 26 77 90 116 118 156 251 370 371 375 407 408 418 444 445 499 516 517 535 570 620 635 725 729 794 845 944 971 988 1048 1071 1096 1159 1173 1230 1259 1261 1302 1458 1527 1536 1555 1634 1635 1643 1663 1664 1674 1675 1773 1774 1851 1873 1921 1937 1979 1990 1997 1998 2040 2082 2098 2101 2113 2126 2149 2232 2247 2327 2329 2330 2376 2377 2389 2393 2399 2467 2589 2620 2683 2686 2718 2776 2778 2779 2794 2796 2867 2884 2931 2990 2997 3040 3042 3053 3059 3098 3099 3120 3147 3177 3182 3243 3254 3292 3373 3384 3399 3403 3468 3521 3573 3607 3628 3634 3637 3650 3677 3723 3782 3783 3807 3812 3817 3847 3878 3929 3969 4074 4137 4155 4162 4165 4225 4328 4389 4399 4438 4502 4528 4546 4550 4551 4553 4609 4626 4629 4663 4672 4673 4686 4740 4770 4801 4802 4882 4914 4922 4945 4954 193 318 358 429 817 889 931 938 1025 1121 1143 1286 1365 1376 1460 1718 1933 1977 2011 2086 2668 2707 2803 2832 3005 3062 3129 3260 3489 3617 3705 4052 4315 4362 4547 4983 GGGCCA/TGGCCC 0 -2 161 158 35 -20.4 36 63 99 149 150 166 175 192 193 207 208 239 240 351 357 363 383 439 446 478 493 549 567 569 597 631 671 688 711 895 943 1046 1047 1188 1191 1212 1352 1443 1454 1458 1473 1480 1525 1526 1569 1627 1657 1659 1688 1722 1772 1798 1827 1859 1860 1894 1903 1950 1951 2023 2024 2026 2107 2119 2215 2217 2218 2261 2274 2302 2321 2342 2374 2440 2608 2636 2706 2720 2746 2819 2869 2903 2939 2974 2979 3016 3028 3067 3089 3130 3154 3235 3269 3370 3378 3430 3435 3440 3455 3590 3595 3625 3639 3663 3788 3800 3802 3859 4007 4026 4038 4101 4115 4116 4122 4149 4158 4164 4180 4189 4192 4193 4220 4225 4234 4235 4265 4276 4280 4366 4401 4461 4479 4502 4544 4552 4563 4616 4652 4671 4674 4712 4729 4739 4745 4750 4762 4766 4782 4790 4807 4818 4826 4827 4832 4874 4883 4921 4929 4930 4985 102 347 413 502 869 882 918 1080 1277 1301 1440 1467 1702 1865 2089 2195 2669 2704 2736 2868 2888 2980 3118 3558 3776 3804 3828 3918 4208 4253 4563 4614 4812 4817 4865 GGTCCC/GGGACC 1 -3 161 158 36 -20.0 20 26 77 90 116 118 156 251 370 371 375 407 408 418 444 445 499 516 517 535 570 620 635 725 729 794 845 944 971 988 1048 1071 1096 1159 1173 1230 1259 1261 1302 1458 1527 1536 1555 1634 1635 1643 1663 1664 1674 1675 1773 1774 1851 1873 1921 1937 1979 1990 1997 1998 2040 2082 2098 2101 2113 2126 2149 2232 2247 2327 2329 2330 2376 2377 2389 2393 2399 2467 2589 2620 2683 2686 2718 2776 2778 2779 2794 2796 2867 2884 2931 2990 2997 3040 3042 3053 3059 3098 3099 3120 3147 3177 3182 3243 3254 3292 3373 3384 3399 3403 3468 3521 3573 3607 3628 3634 3637 3650 3677 3723 3782 3783 3807 3812 3817 3847 3878 3929 3969 4074 4137 4155 4162 4165 4225 4328 4389 4399 4438 4502 4528 4546 4550 4551 4553 4609 4626 4629 4663 4672 4673 4686 4740 4770 4801 4802 4882 4914 4922 4945 4954 193 318 358 429 817 889 931 938 1025 1121 1143 1286 1365 1376 1460 1718 1933 1977 2011 2086 2668 2707 2803 2832 3005 3062 3129 3260 3489 3617 3705 4052 4315 4362 4547 4983 GGGTCA/TGACCC 1 -4 144 155 47 -15.0 28 39 62 76 82 85 92 102 113 119 158 166 192 193 231 301 347 361 384 446 470 481 537 573 574 620 738 786 809 811 893 894 895 916 936 974 1139 1264 1273 1323 1324 1325 1389 1433 1466 1514 1547 1595 1624 1708 1721 1722 1735 1755 1847 1856 1917 1969 2011 2066 2078 2159 2164 2178 2252 2333 2351 2355 2498 2536 2544 2545 2552 2621 2659 2714 2732 2747 2760 2768 2772 2928 2943 2982 2987 3051 3118 3126 3134 3185 3224 3225 3236 3242 3267 3268 3330 3396 3399 3403 3441 3444 3534 3551 3613 3654 3658 3675 3718 3719 3767 3830 3837 3974 4003 4014 4090 4139 4144 4155 4184 4220 4355 4369 4414 4501 4522 4548 4568 4593 4695 4724 4764 4783 4796 4797 4801 4802 4861 4895 4906 4929 4988 4989 35 42 106 229 406 504 541 560 732 755 787 1376 1465 1492 1914 1919 2180 2181 2202 2339 2375 2405 2451 2494 2557 2673 2684 2708 2711 2786 2811 3128 3139 3220 3261 3271 3297 3604 3762 3781 4029 4086 4258 4610 4726 4791 4992 GGCCTT/AAGGCC 0 -1 163 152 38 -17.8 18 29 61 126 173 174 216 217 296 297 392 419 433 466 469 563 564 567 598 618 619 700 787 858 880 884 963 1018 1143 1190 1210 1219 1251 1311 1315 1316 1398 1432 1480 1541 1588 1640 1659 1688 1733 1787 1814 1886 1954 1963 2023 2096 2119 2196 2233 2239 2291 2312 2313 2403 2427 2444 2466 2514 2529 2571 2597 2637 2669 2733 2745 2762 2790 2791 2793 2837 2873 2874 2913 2936 2956 2963 2979 3030 3041 3059 3072 3168 3202 3210 3237 3242 3258 3260 3348 3358 3440 3501 3506 3534 3560 3579 3693 3750 3801 3840 3850 3857 3858 3904 3918 3919 3940 3945 3950 3962 3975 3978 3998 4007 4039 4063 4084 4088 4111 4178 4181 4184 4188 4292 4308 4352 4377 4379 4415 4427 4442 4460 4510 4549 4556 4561 4587 4640 4653 4658 4698 4713 4716 4739 4750 4861 4918 4921 4926 4936 4938 4952 4953 4973 4984 4987 4988 8 307 388 686 694 741 884 887 1085 1105 1263 1661 2086 2229 2538 2563 2656 2673 2934 2996 3110 3143 3145 3201 3376 3459 3592 3829 3938 4073 4080 4192 4212 4267 4404 4839 4876 4961 GACACG/CGTGTC 2 -3 163 147 37 -17.2 62 111 148 151 232 233 278 279 348 351 487 541 542 566 625 761 762 815 880 895 901 950 1053 1069 1138 1204 1216 1242 1255 1330 1348 1351 1370 1411 1455 1456 1482 1486 1509 1529 1611 1619 1628 1649 1655 1703 1757 1758 1829 1925 1926 1960 1962 1992 2008 2027 2104 2133 2232 2324 2361 2363 2397 2398 2452 2503 2522 2579 2583 2594 2623 2624 2633 2647 2685 2692 2786 2788 2804 2810 2818 2824 2845 2920 2924 2981 3036 3050 3051 3062 3312 3395 3424 3425 3436 3437 3451 3482 3515 3525 3526 3536 3537 3553 3565 3568 3577 3598 3604 3605 3659 3725 3729 3782 3783 3841 3885 3887 3888 3901 3933 3935 3997 4009 4024 4068 4069 4079 4088 4117 4118 4166 4168 4169 4174 4213 4225 4297 4409 4413 4490 4494 4548 4550 4551 4582 4586 4608 4661 4681 4682 4690 4736 4738 4751 4753 4822 4827 4945 4958 4978 4991 4992 98 101 272 296 322 354 475 710 717 1062 1118 1207 1418 1745 1780 1890 1942 1945 2302 2317 2369 2384 2510 2630 2836 3324 3462 3655 3675 4027 4249 4596 4615 4766 4781 4826 4912 CACGTC/GACGTG 2 -1 145 144 40 -15.4 27 89 115 143 144 161 175 181 204 232 233 316 387 487 621 625 652 653 687 696 754 844 905 923 990 991 996 1073 1088 1197 1238 1242 1255 1271 1317 1378 1411 1476 1529 1578 1633 1655 1667 1684 1711 1744 1757 1758 1826 1827 1863 1925 1926 1945 1947 1960 1978 2008 2039 2042 2043 2110 2134 2159 2167 2168 2170 2184 2188 2213 2215 2228 2229 2252 2279 2542 2636 2645 2647 2711 2712 2734 2735 2745 2771 2810 2818 2860 2949 3051 3078 3114 3143 3144 3180 3240 3241 3257 3301 3305 3369 3375 3383 3395 3403 3422 3424 3425 3458 3575 3576 3602 3603 3611 3657 3674 3679 3787 3801 3846 3938 3978 4067 4113 4174 4190 4208 4287 4288 4383 4396 4401 4513 4540 4638 4661 4670 4676 4736 4753 4822 4932 4934 4945 4978 6 127 229 354 453 674 794 888 909 922 1192 1398 1739 1996 2361 2368 2510 2612 2657 2663 2740 2956 3331 3380 3521 3735 3776 3994 4046 4129 4530 4537 4560 4587 4616 4617 4719 4872 4882 4966 GTGGGC/GCCCAC 0 -4 136 137 23 -21.6 32 47 53 58 126 136 164 165 167 190 202 419 545 548 586 597 669 711 716 731 839 840 896 899 905 921 1033 1088 1173 1260 1261 1281 1294 1295 1303 1320 1337 1469 1562 1588 1640 1649 1690 1706 1733 1800 1806 1807 1827 1898 1973 2024 2096 2272 2273 2315 2406 2451 2507 2520 2555 2565 2572 2573 2685 2694 2729 2748 2749 2793 2797 2879 2929 2930 2939 3014 3016 3031 3038 3044 3062 3072 3202 3224 3225 3238 3250 3284 3318 3376 3404 3440 3481 3492 3493 3500 3504 3707 3710 3829 3869 3924 3935 3943 3945 4011 4014 4095 4101 4136 4140 4159 4191 4246 4265 4381 4417 4419 4479 4523 4539 4552 4563 4588 4612 4651 4710 4712 4730 4761 4815 4826 4845 4939 4947 4958 85 119 551 562 918 942 1355 1645 1716 1831 1865 2701 3041 3410 3576 3578 3869 4224 4225 4267 4832 4865 4954 GGTCGG/CCGACC 1 -3 129 136 38 -14.5 11 12 36 41 59 119 153 184 234 252 273 285 304 305 308 499 520 535 562 695 807 856 857 864 865 1064 1081 1150 1201 1242 1307 1355 1368 1369 1418 1474 1514 1602 1696 1718 1735 1749 1754 1759 1897 1925 1926 2171 2195 2213 2219 2224 2233 2254 2307 2357 2385 2438 2459 2496 2524 2597 2610 2642 2672 2697 2716 2719 2750 2760 2772 2811 2898 2908 2965 3006 3010 3112 3157 3161 3163 3191 3261 3269 3314 3354 3360 3361 3365 3366 3422 3444 3464 3498 3519 3554 3873 3895 3906 3918 3919 3974 3998 4045 4046 4047 4058 4081 4105 4170 4196 4299 4349 4407 4408 4418 4419 4436 4446 4482 4496 4548 4625 4713 4820 4824 4872 4958 4997 61 370 449 504 765 766 908 1119 1126 1137 1166 1320 1561 1787 1836 1877 1926 1930 1937 2317 2392 2525 2552 2752 3241 3340 3359 3391 3424 3571 3745 3864 3874 4013 4309 4351 4435 4920 TGGGCA/TGCCCA 0 -3 120 135 33 -16.3 32 53 84 118 126 167 190 200 202 205 234 312 313 316 338 448 455 508 528 545 556 557 623 628 716 729 731 756 775 783 839 840 858 896 921 927 998 1013 1061 1066 1080 1180 1220 1279 1280 1431 1469 1502 1562 1587 1665 1690 1711 1734 1799 1800 1850 1898 2023 2025 2051 2072 2075 2107 2109 2228 2229 2305 2364 2416 2451 2507 2547 2555 2561 2682 2707 2741 2748 2749 2793 2812 3000 3014 3026 3038 3072 3076 3135 3202 3254 3340 3358 3398 3411 3516 3685 3707 3731 3745 3848 3902 3924 4095 4245 4417 4457 4466 4501 4539 4694 4715 4730 4743 4746 4831 4929 4939 4947 4987 137 189 373 551 562 748 919 1007 1248 1645 1681 1738 1814 1831 1886 1964 2113 2464 2475 2552 2557 2561 2625 2728 2860 3098 3437 3869 4135 4267 4596 4815 4909 GGTCAG/CTGACC 1 -3 123 134 44 -12.0 0 15 28 48 76 82 92 101 168 214 215 347 372 417 481 486 488 489 537 543 633 654 677 768 769 916 1036 1037 1224 1225 1273 1275 1453 1478 1532 1567 1667 1668 1777 1779 1780 1784 1878 1879 1946 1976 1997 2027 2149 2157 2179 2192 2214 2222 2252 2276 2287 2299 2308 2425 2536 2567 2568 2581 2582 2585 2659 2681 2714 2718 2744 2772 2854 2855 2904 3057 3134 3143 3144 3198 3199 3219 3220 3228 3236 3268 3277 3361 3380 3381 3451 3464 3468 3473 3552 3572 3613 3679 3718 3734 3758 3868 3890 3944 3974 3990 4127 4204 4225 4287 4288 4302 4316 4369 4388 4425 4587 4593 4607 4702 4794 4796 4797 106 135 340 430 578 715 749 1003 1014 1638 1715 1719 1758 1778 2145 2202 2242 2425 2458 2480 2557 2774 2794 2885 2921 3018 3074 3275 3482 3709 3906 3978 4047 4101 4303 4382 4434 4483 4509 4688 4728 4809 4857 4946 GGTCTG/CAGACC 1 -3 123 132 40 -13.0 13 14 24 167 181 250 282 286 301 383 412 424 425 454 499 532 543 546 553 608 635 650 663 688 705 706 733 807 916 1036 1037 1065 1138 1227 1247 1255 1323 1324 1354 1373 1467 1487 1639 1685 1752 1783 1844 1857 1866 1895 1932 1933 1967 2015 2036 2065 2177 2203 2208 2209 2216 2297 2307 2369 2396 2416 2425 2433 2445 2449 2476 2477 2490 2523 2696 2724 2755 2777 2815 2842 2843 2870 2871 2928 2974 3006 3031 3046 3047 3247 3284 3448 3451 3470 3514 3535 3592 3718 3777 3851 3856 3868 3937 3976 4034 4051 4121 4170 4182 4185 4363 4377 4488 4540 4554 4594 4610 4672 4720 4853 4895 4971 4976 2 282 447 577 588 695 710 787 1034 1216 1250 1380 1455 1464 1483 1631 1775 1796 2052 2141 2270 2294 2632 2660 2718 2752 2787 2802 2900 2994 3130 3261 3321 3356 3410 3725 3786 4019 4781 4830 GCCACG/CGTGGC 2 -3 136 129 33 -15.0 32 50 88 111 175 189 215 288 316 360 387 411 418 440 509 573 696 748 1001 1011 1054 1067 1069 1133 1200 1251 1350 1354 1388 1423 1432 1545 1558 1604 1608 1630 1643 1659 1693 1736 1779 1780 1843 1852 1945 1960 2008 2029 2134 2147 2170 2213 2215 2252 2330 2385 2397 2398 2399 2452 2544 2545 2558 2586 2587 2594 2611 2667 2734 2735 2785 2804 2848 2925 2926 2983 3065 3111 3305 3360 3388 3435 3462 3500 3512 3578 3598 3602 3603 3611 3657 3679 3682 3752 3787 3789 3798 3818 3841 3965 4009 4024 4050 4066 4098 4137 4190 4226 4276 4278 4279 4294 4297 4299 4383 4396 4429 4461 4513 4550 4551 4633 4670 4676 4681 4682 4690 4712 4792 4823 4857 4862 4882 4883 4918 4934 39 45 58 60 468 536 909 921 1119 1126 1309 1398 1467 1514 1619 1742 1777 1881 2037 2413 2550 2577 2585 2737 2880 3153 3229 3519 3741 3896 4537 4643 4982 CGGGTC/GACCCG 1 -5 114 123 25 -17.2 28 36 39 85 92 102 113 119 214 332 373 384 446 470 481 570 573 616 663 678 705 706 775 811 893 894 915 978 979 1150 1167 1242 1264 1273 1323 1324 1350 1389 1415 1466 1514 1595 1624 1735 1783 1814 1857 1908 2097 2157 2178 2200 2254 2307 2351 2355 2485 2486 2503 2522 2676 2760 2768 2772 2782 2928 2943 2965 3108 3109 3118 3157 3185 3218 3231 3242 3268 3318 3354 3444 3465 3551 3561 3647 3658 3718 3920 3942 3953 4046 4047 4054 4081 4090 4098 4194 4437 4485 4496 4522 4548 4550 4551 4607 4625 4695 4719 4783 4820 4880 4895 4974 4989 4997 37 76 229 458 504 560 787 814 1118 1119 1777 1988 2432 2557 2708 2752 2946 3032 3041 3271 3745 4029 4086 4781 4790 AACGGG/CCCGTT 4 -4 100 115 36 -11.1 21 39 42 43 46 47 121 166 281 296 297 355 373 428 436 446 449 481 521 522 616 741 742 743 986 1079 1205 1264 1268 1290 1291 1323 1324 1348 1390 1403 1561 1589 1617 1624 1698 1701 1772 1783 1857 2070 2086 2087 2145 2246 2340 2351 2357 2449 2539 2656 2657 2664 2772 2792 2859 2882 2888 2889 2902 3218 3363 3443 3590 3592 3670 3715 3716 3781 3860 3869 3931 3932 3950 3975 3999 4054 4091 4098 4107 4111 4191 4272 4298 4302 4335 4406 4506 4507 4525 4596 4645 4807 4877 4989 30 191 229 350 483 504 814 882 947 1098 1171 1320 2160 2410 2479 2557 2585 2621 2669 2828 2907 2935 3041 3055 3225 3705 3738 3804 3983 4073 4114 4418 4492 4661 4733 4736 ACCCGG/CCGGGT 4 -4 103 112 9 -24.7 8 46 92 102 119 128 199 284 285 295 373 470 481 551 570 576 592 597 652 653 669 775 893 894 915 921 1080 1100 1150 1207 1231 1242 1348 1389 1415 1468 1488 1569 1696 1735 1857 1961 2048 2097 2105 2143 2144 2155 2156 2200 2254 2306 2307 2419 2635 2698 2760 2768 2859 2879 2897 2928 2965 3103 3157 3231 3242 3369 3380 3381 3420 3432 3444 3464 3548 3549 3609 3647 3658 3773 3774 3836 4058 4081 4090 4092 4194 4295 4485 4500 4522 4607 4625 4675 4676 4719 4756 4783 4796 4797 4810 4838 4997 504 932 975 2042 2139 2888 3090 3271 4571 GCGGTC/GACCGC 1 -5 84 102 15 -17.7 9 10 18 22 50 158 160 172 197 198 215 306 400 418 532 722 741 742 814 820 821 885 963 981 1087 1096 1110 1116 1129 1130 1437 1489 1490 1500 1544 1591 1693 1730 1766 1777 1829 1941 1967 2098 2113 2208 2209 2210 2467 2604 2607 2693 2725 2726 2807 2808 2896 2938 2990 2997 3085 3105 3345 3464 3465 3484 3485 3506 3747 3847 3920 3997 4130 4162 4323 4328 4401 4407 4408 4425 4446 4494 4702 4919 230 304 332 460 515 536 713 844 1163 2099 2267 4041 4153 4172 4303 AGGGTC/GACCCT 1 -5 88 97 27 -10.7 15 26 59 76 82 92 115 120 171 231 251 361 574 635 738 771 904 918 919 1250 1325 1433 1615 1631 1632 1705 1708 1717 1721 1755 1756 1785 1847 1864 1866 2007 2017 2037 2173 2332 2403 2407 2524 2620 2621 2720 2756 2768 2772 2806 2931 2938 2982 2987 3003 3195 3196 3283 3303 3304 3377 3396 3441 3449 3464 3517 3519 3613 3622 3709 3719 3776 3816 3917 3921 3949 3954 3955 3998 4137 4326 4369 4568 4632 4686 4798 4914 4948 429 541 1288 1315 1358 1465 1746 1919 2018 2059 2392 2431 2445 2451 2453 2519 2673 2900 2910 3139 3244 3424 3757 4208 4406 4610 4620 CCAGCG/CGCTGG 3 -3 70 96 18 -14.5 10 13 14 45 55 74 104 160 180 190 213 268 269 359 437 525 531 564 579 705 706 728 768 769 873 885 895 956 1004 1066 1117 1118 1205 1254 1437 1693 1752 1825 1996 2001 2002 2046 2047 2119 2141 2172 2203 2214 2257 2403 2743 2950 3465 3516 3580 3585 3611 3646 3800 3803 4097 4231 4309 4348 4493 4547 4772 4826 4849 4975 328 470 544 624 626 895 1920 2350 2701 2817 3205 3521 3943 4061 4097 4624 4631 4647 GGCCTA/TAGGCC 0 -1 114 93 27 -9.9 344 407 408 499 621 697 746 747 880 884 1066 1135 1143 1223 1261 1281 1300 1311 1317 1337 1357 1358 1362 1363 1475 1506 1768 1778 1806 1807 1827 1962 1963 1999 2003 2039 2111 2140 2271 2327 2359 2363 2382 2403 2415 2463 2464 2539 2555 2591 2637 2746 2807 2808 2814 2907 3052 3063 3166 3302 3348 3367 3404 3409 3410 3421 3431 3448 3493 3494 3557 3597 3602 3603 3616 3704 3724 3763 3850 3857 3885 3896 3908 3943 3974 3975 4003 4014 4039 4095 4122 4178 4281 4338 4357 4364 4426 4442 4465 4556 4580 4584 4615 4651 4661 4680 4713 4815 4884 4918 4919 4926 4943 4950 106 329 412 458 527 791 981 1046 1691 1716 1791 2062 2086 2155 2485 2567 2633 3092 3186 3274 3564 3578 3689 4482 4629 4736 4865 GGGCCG/CGGCCC 0 -2 102 92 20 -12.6 32 87 149 150 325 383 409 410 440 545 598 899 905 927 1002 1003 1303 1432 1436 1517 1531 1592 1628 1768 1857 1914 1915 2055 2272 2273 2292 2340 2354 2357 2369 2520 2575 2600 2608 2685 2745 2807 2808 2879 2907 2929 2930 2936 2974 3016 3130 3226 3227 3235 3243 3335 3347 3407 3438 3492 3517 3545 3557 3587 3781 3826 3829 3831 3869 3891 3974 4013 4021 4039 4057 4064 4065 4070 4071 4088 4093 4175 4309 4328 4386 4393 4398 4419 4464 4556 4563 4598 4680 4719 4731 4769 4775 4783 4866 4953 4958 4998 25 75 85 118 513 551 618 942 1561 1865 2139 2358 2701 2729 3297 3330 3406 3548 4155 4272 GGACAG/CTGTCC 1 -3 80 90 25 -10.0 1 2 4 9 88 267 333 386 429 473 553 617 656 701 708 791 825 861 1113 1288 1495 1589 1702 1719 1730 1773 1866 1882 1892 2030 2090 2152 2153 2271 2307 2369 2421 2445 2480 2496 2553 2554 2558 2560 2586 2587 2619 2854 2855 2935 3098 3149 3155 3172 3253 3274 3509 3521 3543 3604 3605 3650 3723 3761 3856 3874 3928 3987 3988 4043 4066 4121 4226 4271 4470 4655 4757 4902 4914 4942 2 31 94 189 592 974 1148 1222 1246 1508 1902 2048 2106 2463 2619 2620 2979 3038 3144 3164 3410 3685 4100 4158 4682 GGACTG/CAGTCC 1 -3 87 90 30 -8.3 3 58 79 80 85 130 160 239 240 394 556 557 568 703 829 845 871 872 953 962 1038 1082 1088 1185 1212 1426 1522 1523 1587 1625 1627 1668 1999 2000 2021 2049 2114 2279 2288 2321 2466 2484 2556 2566 2620 2768 2793 2805 2903 2916 3278 3347 3401 3496 3589 3669 3791 3828 3840 3867 4022 4054 4057 4147 4184 4212 4215 4273 4315 4417 4467 4515 4556 4565 4579 4681 4682 4694 4746 4805 4812 4897 4901 4919 4965 4993 4999 312 315 419 784 963 1070 1176 1248 1389 1457 1839 1932 2137 2357 2435 2560 2789 2802 2809 2969 3094 3113 3566 3807 3964 4023 4325 4390 4401 4517 CGCGTG/CACGCG 2 -1 90 88 18 -12.6 29 32 203 261 277 326 364 369 418 509 511 644 669 766 767 844 1020 1067 1200 1373 1448 1470 1509 1552 1619 1629 1693 1803 1829 1891 1901 1902 1942 1943 2098 2109 2231 2310 2330 2447 2452 2611 2636 2667 2763 2764 2775 2780 2879 2892 2931 2949 2950 3005 3036 3037 3188 3399 3459 3504 3568 3579 3598 3705 3766 3790 3872 3958 3961 4099 4162 4168 4169 4171 4276 4316 4323 4330 4413 4437 4491 4534 4543 4717 4829 4848 4857 4879 4945 4960 132 295 551 712 757 1262 1814 1893 1947 2012 2214 2317 2971 3290 3843 3888 3952 4944 CCTACG/CGTAGG 3 -3 75 85 18 -12.0 15 84 93 106 120 143 144 203 237 253 285 380 490 775 800 809 826 847 1053 1061 1140 1250 1261 1294 1295 1443 1448 1679 1680 1785 1849 1893 1904 1994 2214 2356 2575 2634 2650 2668 2704 2707 2709 2710 2759 2771 2775 2851 2879 3119 3223 3318 3336 3387 3641 3816 3939 3980 4061 4074 4075 4097 4204 4278 4279 4418 4539 4582 4644 4692 4740 4845 4851 4896 4949 603 1227 1228 1267 1554 1593 1711 1941 2015 2356 2389 2871 3258 3449 4096 4431 4597 4963 GCACGT/ACGTGC 2 -2 80 79 24 -8.2 97 104 131 181 360 431 439 468 561 577 657 658 668 701 814 961 1007 1187 1300 1302 1370 1476 1570 1608 1687 1738 1739 1744 1785 1800 1844 1887 1888 2023 2184 2228 2229 2239 2375 2391 2410 2481 2536 2548 2662 2682 2687 3080 3180 3195 3196 3241 3301 3308 3325 3334 3383 3458 3462 3473 3501 3504 3508 3553 3642 3654 3705 3798 3856 4117 4118 4360 4539 4558 4681 4682 4738 4831 4857 4968 45 290 296 449 450 509 857 888 976 1163 1634 1727 2109 2202 2354 2543 2657 2954 3552 4046 4234 4337 4567 4944 GGGGAC/GTCCCC 1 -5 77 77 16 -11.1 68 226 317 407 408 418 444 445 519 556 557 635 708 725 729 743 794 873 879 944 1071 1359 1360 1440 1471 1494 1516 1659 1767 1851 1998 2098 2101 2162 2175 2176 2187 2224 2232 2271 2351 2421 2480 2551 2656 2657 2785 2972 2973 2997 3042 3053 3103 3159 3243 3274 3292 3341 3373 3403 3509 3650 3694 3817 3878 4100 4137 4162 4344 4393 4453 4553 4609 4686 4749 4828 4860 111 138 318 358 370 489 656 675 1286 1499 2443 2832 3343 3566 3652 4989 GCGCGT/ACGCGC 2 -2 77 75 18 -9.7 21 29 203 256 285 326 364 369 511 766 767 886 1020 1066 1067 1093 1094 1373 1448 1509 1619 1891 1901 1902 1942 1943 2078 2109 2231 2346 2409 2447 2452 2611 2775 2879 2892 2950 2976 3005 3036 3188 3395 3399 3504 3568 3611 3679 3707 3710 3766 3784 3945 3951 3961 4168 4169 4171 4194 4299 4316 4323 4330 4389 4413 4534 4596 4645 4650 4691 4829 4848 4857 4879 4889 4903 4960 177 295 309 1010 1549 1893 1947 2317 2337 2711 2971 3290 3370 3462 3836 3843 4107 4473 CTGGGC/GCCCAG 0 -4 77 72 8 -14.6 11 94 190 383 448 538 545 564 688 746 747 756 998 1122 1142 1256 1305 1351 1432 1575 1706 1768 1799 1827 1903 2023 2119 2270 2302 2315 2316 2561 2682 2885 2897 3016 3052 3136 3137 3158 3226 3227 3333 3440 3500 3612 3625 3639 3693 3745 3781 3800 3842 3843 3950 4031 4038 4057 4064 4065 4234 4235 4316 4366 4375 4483 4563 4642 4684 4730 4745 4783 4885 4895 4919 4929 4936 347 412 502 2062 2464 2868 3437 4341