#5000/5000 #14.39 # k-mer/r.c. Cluster Offset PosCt wPosCt NegCt HGP_10 TGGACC/GGTCCA 0 -3 764 742 95 -135.5 0 23 29 30 31 35 40 51 79 87 98 101 104 115 116 125 128 152 154 169 175 180 181 192 194 195 198 203 204 214 217 223 224 232 236 254 259 262 268 272 273 275 276 287 312 315 321 341 346 348 351 371 374 384 396 401 402 403 404 407 419 424 443 448 453 455 470 482 487 507 509 521 535 546 549 550 555 573 575 579 582 591 597 601 622 626 628 642 653 655 663 667 673 682 683 684 697 725 742 747 750 761 775 777 778 795 804 819 821 832 838 845 850 852 860 866 867 871 873 884 887 912 913 918 927 929 951 952 953 956 959 961 962 963 965 969 975 976 983 996 1002 1009 1010 1045 1063 1064 1079 1084 1086 1087 1091 1095 1098 1112 1121 1128 1136 1139 1140 1141 1149 1164 1168 1186 1192 1194 1196 1204 1218 1223 1225 1232 1235 1257 1258 1262 1276 1279 1283 1285 1299 1305 1312 1319 1321 1325 1332 1347 1355 1364 1370 1376 1377 1380 1382 1384 1398 1406 1409 1417 1420 1430 1439 1441 1450 1453 1461 1484 1493 1499 1505 1513 1516 1526 1529 1544 1557 1570 1574 1579 1581 1583 1585 1587 1594 1595 1598 1604 1607 1610 1632 1639 1648 1649 1652 1668 1680 1681 1684 1710 1711 1712 1713 1715 1719 1721 1727 1738 1745 1746 1760 1764 1771 1784 1789 1790 1795 1799 1801 1807 1812 1813 1815 1821 1823 1829 1832 1834 1836 1838 1848 1856 1857 1859 1868 1872 1873 1894 1909 1912 1914 1916 1922 1931 1932 1937 1940 1945 1946 1948 1949 1956 1966 1972 1975 1994 1998 2001 2005 2010 2035 2036 2042 2051 2052 2055 2056 2062 2063 2079 2085 2086 2091 2095 2109 2110 2113 2121 2131 2137 2144 2149 2150 2155 2157 2160 2163 2180 2182 2186 2188 2191 2192 2198 2207 2212 2221 2224 2232 2251 2254 2262 2269 2270 2279 2301 2304 2319 2321 2322 2334 2335 2339 2347 2351 2358 2365 2366 2377 2379 2388 2392 2394 2397 2406 2418 2429 2430 2437 2442 2448 2453 2455 2466 2478 2479 2486 2497 2527 2543 2550 2553 2559 2561 2563 2571 2576 2582 2585 2591 2595 2599 2601 2602 2603 2612 2617 2619 2627 2636 2637 2642 2646 2647 2653 2665 2678 2683 2699 2703 2706 2708 2714 2716 2719 2725 2748 2757 2769 2770 2773 2787 2793 2795 2797 2802 2803 2807 2819 2824 2825 2826 2833 2851 2863 2866 2868 2882 2884 2898 2899 2902 2904 2908 2917 2923 2949 2952 2955 2958 2964 2969 2987 2990 2995 3015 3017 3023 3027 3036 3050 3054 3062 3084 3089 3092 3096 3097 3100 3104 3106 3115 3131 3135 3136 3137 3142 3144 3161 3171 3179 3181 3189 3190 3191 3192 3195 3199 3201 3205 3209 3211 3214 3223 3228 3248 3258 3262 3264 3266 3274 3277 3286 3292 3309 3318 3324 3326 3335 3336 3339 3343 3345 3346 3349 3356 3370 3378 3382 3383 3386 3387 3388 3390 3397 3409 3412 3413 3419 3434 3462 3480 3481 3484 3489 3491 3497 3507 3513 3515 3520 3523 3539 3551 3553 3563 3567 3569 3581 3588 3589 3613 3627 3634 3649 3654 3656 3657 3666 3686 3710 3721 3724 3725 3730 3743 3745 3755 3770 3772 3774 3775 3776 3791 3792 3793 3802 3803 3825 3832 3837 3849 3856 3858 3860 3861 3871 3873 3874 3887 3888 3893 3907 3908 3913 3949 3950 3973 3975 3977 3981 3982 3984 3988 3993 3995 3998 3999 4004 4006 4007 4015 4027 4028 4029 4044 4045 4055 4058 4063 4067 4068 4069 4076 4080 4084 4088 4105 4116 4125 4128 4130 4139 4141 4147 4148 4157 4158 4176 4183 4184 4231 4243 4248 4254 4263 4264 4273 4274 4275 4282 4285 4294 4308 4310 4317 4323 4341 4347 4349 4358 4360 4362 4371 4376 4397 4403 4409 4410 4416 4419 4431 4432 4437 4439 4448 4458 4461 4464 4469 4480 4483 4497 4499 4502 4506 4519 4528 4551 4553 4556 4570 4576 4577 4586 4591 4596 4597 4599 4600 4606 4608 4612 4619 4629 4639 4646 4649 4656 4659 4663 4670 4683 4703 4705 4733 4734 4739 4742 4749 4750 4752 4757 4763 4768 4770 4781 4786 4792 4799 4800 4805 4811 4812 4822 4823 4829 4839 4841 4843 4846 4851 4871 4874 4893 4903 4906 4914 4917 4918 4921 4932 4947 4950 4951 4954 4961 4968 4979 4981 4984 4989 4991 4999 38 58 61 189 275 388 409 431 437 460 512 558 562 684 696 716 720 751 769 822 898 935 1035 1083 1163 1200 1358 1377 1396 1400 1438 1470 1507 1545 1649 1682 1684 1702 1703 1718 1757 1791 1865 1906 1955 2093 2099 2154 2202 2383 2399 2431 2446 2552 2691 2719 2746 2789 2799 2865 2876 2903 3086 3094 3146 3263 3282 3397 3406 3413 3487 3608 3618 3620 3623 3663 3702 3738 3757 3789 4018 4029 4038 4080 4172 4208 4248 4367 4456 4531 4577 4648 4843 4870 4964 TGGTCC/GGACCA 0 -3 770 732 96 -132.1 0 6 31 35 40 41 43 63 79 87 91 92 98 99 101 104 108 109 115 125 152 160 169 172 175 180 181 195 198 202 203 208 217 234 253 259 262 267 275 280 287 301 307 320 321 331 341 351 352 363 371 374 377 381 384 402 407 420 424 440 443 448 470 479 485 491 507 527 546 548 554 573 582 588 595 596 597 601 605 626 632 642 643 644 653 654 656 667 673 701 725 729 742 750 761 769 777 778 781 792 793 795 804 818 819 821 830 832 838 852 860 864 867 871 884 887 891 897 914 917 927 929 930 950 951 952 953 961 962 974 975 976 987 993 996 999 1023 1026 1027 1045 1055 1062 1063 1064 1079 1091 1098 1119 1149 1155 1158 1164 1166 1167 1169 1173 1186 1194 1207 1210 1212 1235 1240 1242 1253 1262 1263 1279 1280 1283 1294 1297 1305 1307 1312 1319 1331 1341 1348 1351 1369 1370 1376 1377 1384 1387 1402 1417 1432 1453 1461 1466 1485 1486 1487 1492 1493 1499 1514 1516 1523 1525 1544 1546 1550 1553 1569 1570 1574 1576 1594 1607 1613 1634 1648 1652 1654 1656 1688 1692 1709 1710 1721 1725 1733 1738 1744 1745 1764 1765 1782 1790 1793 1798 1799 1812 1813 1820 1828 1836 1838 1856 1859 1867 1868 1872 1890 1905 1931 1932 1934 1937 1940 1946 1947 1948 1949 1955 1956 1957 1973 1989 2000 2001 2016 2036 2037 2042 2051 2056 2057 2060 2062 2078 2090 2091 2095 2100 2109 2110 2113 2120 2124 2137 2144 2147 2149 2150 2163 2172 2185 2186 2188 2191 2195 2197 2198 2204 2206 2209 2212 2221 2223 2231 2232 2242 2251 2262 2289 2291 2305 2318 2322 2328 2331 2334 2335 2340 2342 2358 2361 2365 2377 2392 2395 2406 2411 2437 2450 2452 2453 2455 2459 2464 2475 2479 2481 2483 2487 2491 2497 2509 2519 2524 2527 2550 2554 2560 2569 2571 2576 2582 2585 2587 2595 2601 2602 2603 2610 2611 2612 2619 2620 2621 2626 2628 2629 2636 2637 2639 2653 2678 2683 2684 2686 2688 2689 2703 2705 2706 2708 2711 2725 2732 2735 2747 2748 2750 2764 2780 2793 2795 2802 2803 2807 2818 2819 2822 2839 2842 2851 2859 2866 2868 2884 2899 2908 2916 2917 2921 2930 2931 2940 2947 2955 2957 2958 2963 2964 2969 2972 2987 3003 3007 3008 3010 3013 3015 3016 3017 3018 3022 3033 3034 3036 3038 3048 3050 3051 3054 3090 3092 3094 3098 3100 3103 3106 3125 3132 3133 3135 3137 3142 3169 3171 3181 3185 3189 3192 3206 3207 3221 3223 3226 3228 3230 3235 3252 3253 3266 3267 3282 3292 3304 3311 3316 3326 3332 3343 3344 3346 3349 3357 3363 3369 3374 3378 3379 3382 3383 3390 3397 3399 3400 3403 3412 3413 3417 3419 3428 3436 3437 3442 3444 3450 3478 3481 3482 3484 3501 3507 3511 3523 3533 3552 3554 3557 3560 3564 3569 3577 3581 3582 3585 3596 3598 3602 3609 3615 3627 3628 3640 3649 3656 3662 3666 3683 3685 3686 3689 3699 3706 3707 3717 3721 3730 3743 3745 3762 3772 3774 3775 3776 3792 3793 3798 3811 3814 3825 3826 3835 3837 3842 3847 3856 3858 3860 3867 3873 3881 3886 3887 3888 3889 3893 3897 3902 3906 3915 3927 3931 3940 3943 3949 3953 3958 3962 3972 3973 3975 3979 3981 3982 3988 3991 3993 3995 3999 4001 4004 4006 4011 4015 4024 4027 4040 4044 4046 4055 4061 4064 4067 4069 4074 4086 4087 4088 4090 4101 4104 4105 4108 4115 4122 4125 4132 4140 4143 4150 4157 4176 4178 4184 4189 4195 4221 4223 4243 4244 4248 4254 4258 4263 4264 4272 4273 4274 4282 4286 4294 4299 4325 4331 4334 4337 4341 4347 4362 4371 4376 4377 4385 4389 4403 4409 4416 4417 4421 4429 4431 4434 4435 4437 4441 4445 4448 4452 4462 4468 4469 4480 4483 4490 4493 4497 4500 4501 4514 4515 4521 4528 4552 4570 4575 4576 4577 4615 4625 4629 4630 4646 4649 4650 4656 4657 4659 4665 4670 4677 4685 4691 4693 4695 4716 4719 4726 4739 4741 4742 4746 4750 4752 4762 4763 4768 4770 4783 4786 4788 4795 4800 4805 4807 4810 4816 4822 4823 4827 4829 4846 4851 4862 4871 4872 4874 4885 4887 4890 4893 4902 4910 4918 4923 4926 4928 4932 4934 4937 4938 4947 4948 4951 4954 4955 4959 4961 4968 4979 4981 4985 38 58 189 318 358 409 437 460 504 512 541 562 567 684 716 720 751 769 817 822 910 938 1035 1286 1365 1376 1400 1438 1462 1507 1545 1561 1636 1660 1682 1684 1703 1745 1757 1762 1955 2075 2096 2106 2202 2328 2358 2383 2399 2446 2493 2640 2668 2707 2719 2789 2799 2802 2876 2903 2967 3005 3062 3086 3094 3111 3133 3222 3260 3282 3367 3387 3400 3457 3487 3513 3618 3620 3625 3637 3663 3702 3738 4038 4052 4080 4248 4315 4367 4456 4590 4614 4631 4754 4836 4983 TTGGAC/GTCCAA 0 -4 591 556 113 -76.0 9 19 30 35 40 42 65 84 87 98 104 115 116 117 188 192 194 195 198 203 214 220 224 226 230 232 236 245 248 259 269 275 276 283 288 310 315 317 351 371 374 384 401 422 427 443 453 455 490 521 526 527 535 550 555 557 563 571 573 578 622 626 634 642 653 661 663 667 671 683 708 720 735 737 748 752 760 778 785 796 810 811 821 822 838 843 850 866 869 875 894 906 910 913 918 921 926 954 960 962 983 990 1051 1064 1069 1072 1077 1079 1092 1094 1095 1098 1102 1136 1140 1141 1144 1149 1159 1185 1194 1221 1229 1235 1248 1257 1259 1262 1264 1276 1277 1278 1281 1283 1294 1295 1296 1313 1323 1336 1377 1380 1406 1440 1441 1455 1462 1484 1508 1516 1527 1534 1549 1557 1564 1585 1602 1604 1610 1616 1632 1635 1639 1648 1649 1657 1668 1695 1711 1715 1719 1751 1755 1764 1765 1774 1781 1787 1792 1812 1815 1818 1829 1832 1838 1847 1848 1856 1857 1859 1864 1871 1909 1945 1976 1986 1994 1995 2001 2002 2009 2010 2021 2042 2054 2055 2057 2066 2074 2079 2085 2095 2121 2123 2144 2149 2152 2155 2160 2179 2180 2192 2198 2207 2239 2269 2274 2301 2310 2311 2322 2327 2335 2347 2358 2365 2379 2391 2397 2399 2406 2409 2413 2415 2419 2422 2423 2430 2434 2442 2448 2449 2453 2460 2462 2466 2479 2498 2499 2512 2521 2532 2543 2553 2559 2561 2566 2571 2575 2576 2578 2582 2589 2591 2599 2602 2607 2622 2626 2627 2637 2642 2646 2650 2664 2674 2682 2683 2695 2703 2706 2708 2717 2718 2720 2748 2773 2776 2787 2797 2804 2805 2821 2824 2825 2827 2868 2877 2890 2895 2902 2908 2917 2933 2948 2955 2965 2969 2983 2985 2987 2990 2992 3004 3023 3027 3036 3054 3062 3063 3088 3100 3132 3136 3155 3177 3179 3181 3186 3190 3195 3199 3209 3212 3215 3220 3224 3225 3227 3228 3233 3255 3266 3274 3279 3309 3313 3315 3317 3336 3338 3339 3345 3349 3382 3383 3386 3397 3412 3427 3428 3435 3442 3448 3451 3462 3469 3481 3485 3497 3507 3510 3515 3525 3556 3581 3591 3592 3600 3609 3610 3626 3627 3657 3667 3676 3679 3710 3712 3715 3721 3724 3725 3745 3753 3754 3771 3774 3777 3781 3789 3790 3791 3792 3793 3795 3822 3825 3829 3833 3834 3840 3845 3849 3851 3852 3854 3855 3857 3864 3865 3871 3873 3875 3883 3887 3888 3893 3894 3936 3943 3974 3975 3983 3989 3995 3998 3999 4004 4006 4007 4013 4015 4025 4044 4051 4055 4058 4067 4073 4075 4078 4081 4084 4085 4106 4112 4114 4125 4130 4148 4157 4158 4168 4179 4188 4203 4205 4225 4239 4245 4250 4261 4263 4264 4277 4282 4285 4288 4292 4293 4300 4311 4323 4327 4333 4335 4341 4351 4353 4376 4381 4382 4406 4413 4415 4416 4419 4423 4426 4436 4437 4444 4461 4464 4471 4480 4487 4488 4499 4501 4506 4510 4515 4529 4534 4547 4553 4557 4566 4573 4584 4597 4599 4609 4612 4619 4620 4629 4639 4647 4649 4659 4663 4667 4674 4683 4690 4698 4702 4705 4706 4723 4744 4749 4750 4751 4752 4757 4763 4768 4776 4780 4799 4804 4811 4818 4823 4829 4840 4841 4855 4866 4874 4880 4888 4889 4901 4917 4921 4947 4952 4953 4956 4970 4976 4981 4984 4988 4989 4991 4 9 25 38 45 58 84 275 312 315 371 395 413 431 506 512 720 748 751 759 841 861 915 968 1205 1222 1257 1278 1377 1389 1393 1394 1470 1473 1601 1635 1665 1682 1702 1703 1718 1745 1747 1757 1796 1871 1877 1955 2062 2106 2181 2182 2310 2399 2411 2431 2445 2446 2560 2672 2706 2719 2740 2789 2808 2865 2873 2876 2895 2897 2900 3035 3086 3094 3164 3263 3282 3347 3476 3553 3596 3618 3620 3623 3663 3685 3709 3787 3827 3850 3888 3923 4172 4276 4329 4367 4400 4401 4407 4430 4569 4587 4600 4639 4643 4644 4771 4794 4843 4870 4964 4980 4982 TTGGTC/GACCAA 0 -4 527 552 171 -51.1 0 15 28 32 38 39 40 47 63 70 71 79 87 88 101 104 109 115 124 176 184 197 198 202 219 225 249 253 259 261 266 271 275 280 286 294 300 307 318 321 332 340 363 365 367 373 374 377 401 402 407 417 424 440 462 463 466 470 472 479 484 485 506 508 511 513 532 540 571 572 573 579 594 619 627 641 642 650 654 656 670 673 674 687 695 713 716 725 731 747 750 753 769 777 780 793 804 818 830 831 832 838 844 864 867 872 887 891 927 929 946 950 951 952 961 962 970 975 986 993 994 996 1001 1005 1014 1026 1034 1053 1056 1062 1063 1079 1086 1091 1098 1119 1130 1174 1188 1230 1232 1237 1240 1246 1248 1250 1252 1262 1263 1271 1292 1295 1300 1307 1319 1322 1326 1331 1334 1341 1350 1351 1369 1370 1432 1453 1464 1466 1485 1490 1492 1499 1525 1526 1531 1538 1550 1554 1569 1570 1574 1575 1594 1597 1598 1607 1616 1625 1638 1641 1654 1664 1676 1710 1725 1733 1738 1739 1744 1765 1772 1776 1777 1798 1806 1813 1817 1820 1828 1830 1836 1838 1844 1856 1866 1868 1871 1872 1877 1885 1888 1892 1904 1906 1931 1932 1933 1946 1948 1955 1956 1973 2035 2036 2037 2042 2045 2051 2056 2078 2088 2090 2091 2095 2112 2142 2159 2184 2185 2188 2191 2195 2200 2204 2206 2209 2221 2232 2240 2272 2274 2280 2286 2288 2300 2314 2328 2337 2340 2354 2365 2392 2408 2411 2442 2449 2455 2479 2487 2513 2519 2524 2554 2560 2565 2576 2580 2594 2602 2610 2611 2612 2621 2627 2628 2629 2637 2639 2667 2683 2688 2706 2708 2732 2733 2747 2748 2749 2764 2795 2798 2803 2814 2817 2818 2819 2823 2839 2842 2845 2859 2861 2868 2889 2894 2896 2944 2957 2958 2999 3007 3008 3010 3016 3017 3018 3034 3036 3042 3078 3086 3121 3123 3125 3129 3135 3161 3173 3181 3185 3192 3195 3221 3223 3233 3242 3252 3266 3282 3304 3307 3311 3321 3343 3357 3363 3364 3378 3379 3381 3383 3390 3394 3403 3409 3417 3419 3422 3442 3474 3482 3501 3511 3528 3532 3533 3536 3541 3557 3581 3587 3604 3628 3638 3640 3656 3662 3670 3672 3675 3676 3684 3685 3686 3707 3711 3718 3731 3746 3763 3767 3775 3776 3789 3793 3798 3811 3839 3847 3858 3860 3889 3891 3902 3910 3927 3935 3940 3943 3953 3962 3975 3982 3988 3993 4001 4011 4027 4028 4038 4044 4055 4061 4069 4086 4087 4088 4090 4113 4122 4144 4186 4195 4223 4237 4247 4258 4276 4299 4300 4331 4337 4341 4347 4362 4377 4389 4417 4421 4434 4437 4445 4480 4484 4490 4497 4501 4521 4546 4570 4577 4587 4615 4624 4625 4634 4643 4649 4656 4657 4667 4670 4678 4685 4693 4716 4723 4742 4746 4752 4770 4783 4791 4795 4796 4800 4801 4810 4813 4822 4823 4827 4846 4851 4863 4871 4872 4874 4890 4893 4902 4923 4929 4937 4955 4979 4981 8 87 133 173 175 258 261 269 282 302 437 440 451 473 486 512 542 567 574 577 588 710 715 716 751 794 800 831 849 860 903 907 958 969 983 1014 1021 1026 1030 1032 1048 1126 1143 1159 1180 1205 1245 1250 1304 1306 1307 1324 1354 1375 1380 1423 1454 1464 1483 1561 1568 1590 1608 1610 1660 1698 1719 1757 1762 1782 1817 1836 1954 1970 1989 2019 2077 2078 2096 2141 2223 2225 2309 2329 2358 2359 2369 2383 2432 2446 2480 2493 2633 2660 2664 2668 2787 2789 2794 2799 2802 2856 2880 2882 2903 3013 3018 3044 3062 3073 3086 3088 3130 3133 3180 3190 3208 3222 3223 3269 3282 3349 3356 3369 3373 3447 3457 3462 3487 3523 3598 3620 3625 3663 3683 3700 3729 3776 3836 3874 3979 4003 4038 4101 4192 4229 4248 4291 4346 4397 4401 4429 4449 4455 4555 4556 4563 4573 4631 4699 4728 4742 4745 4765 4806 4809 4819 4820 4830 4894 4971 ATGGAC/GTCCAT 0 -4 530 513 93 -75.7 19 31 36 60 73 79 96 101 104 136 154 169 175 180 189 204 215 217 223 224 232 238 244 269 272 275 287 311 319 321 332 343 346 361 371 389 407 408 415 419 421 424 434 436 441 448 459 464 482 494 507 519 522 536 542 552 560 569 579 591 597 599 609 621 622 625 628 633 655 660 665 671 673 682 691 693 697 726 730 740 742 750 761 775 794 819 832 840 849 867 881 884 906 912 929 945 952 956 962 963 982 983 995 996 1002 1020 1030 1045 1063 1069 1084 1086 1087 1091 1099 1100 1104 1106 1128 1164 1168 1192 1206 1223 1245 1277 1279 1285 1299 1305 1312 1317 1319 1325 1326 1347 1355 1376 1382 1383 1384 1396 1406 1409 1417 1430 1450 1461 1483 1486 1493 1499 1501 1511 1529 1544 1545 1549 1570 1579 1581 1583 1587 1595 1598 1607 1617 1652 1680 1682 1713 1721 1726 1727 1738 1745 1752 1760 1789 1790 1821 1834 1836 1840 1842 1851 1865 1869 1872 1873 1912 1915 1916 1922 1932 1933 1935 1946 1949 1956 1963 1972 1975 1991 1998 2004 2031 2036 2056 2061 2063 2068 2073 2077 2086 2091 2092 2101 2104 2105 2108 2113 2119 2123 2134 2137 2142 2159 2163 2186 2188 2191 2214 2221 2226 2233 2235 2254 2279 2290 2304 2311 2338 2366 2380 2386 2392 2394 2430 2448 2484 2487 2517 2520 2527 2540 2544 2550 2552 2563 2571 2586 2595 2596 2602 2603 2618 2633 2636 2648 2667 2690 2699 2708 2714 2719 2723 2725 2734 2738 2742 2749 2757 2770 2778 2790 2795 2807 2808 2819 2827 2833 2862 2863 2864 2866 2875 2881 2882 2891 2899 2918 2928 2936 2949 2958 2959 2964 2970 2995 2999 3021 3043 3069 3080 3084 3097 3104 3106 3114 3130 3132 3135 3137 3138 3142 3144 3171 3178 3183 3186 3189 3200 3208 3211 3219 3240 3249 3262 3276 3277 3286 3288 3292 3293 3309 3324 3326 3335 3340 3350 3355 3359 3370 3373 3385 3387 3388 3390 3407 3418 3432 3434 3441 3461 3462 3478 3484 3489 3491 3513 3520 3523 3525 3528 3540 3548 3550 3563 3566 3567 3580 3581 3588 3604 3619 3621 3648 3665 3666 3672 3695 3729 3731 3734 3740 3742 3743 3748 3749 3755 3756 3761 3770 3776 3800 3802 3803 3806 3832 3837 3848 3860 3911 3949 3969 3975 3981 3982 3986 3993 4008 4010 4016 4026 4027 4028 4063 4068 4069 4072 4073 4076 4078 4080 4082 4105 4116 4120 4121 4139 4141 4147 4148 4179 4181 4183 4191 4196 4197 4202 4206 4208 4252 4253 4254 4260 4261 4273 4276 4298 4306 4317 4318 4320 4347 4350 4358 4364 4371 4387 4393 4397 4403 4410 4469 4478 4483 4486 4502 4511 4519 4540 4550 4551 4561 4577 4586 4600 4604 4608 4610 4618 4629 4630 4667 4668 4670 4712 4724 4734 4739 4756 4757 4768 4770 4773 4778 4781 4792 4800 4812 4819 4829 4851 4852 4854 4861 4883 4886 4898 4903 4906 4912 4918 4932 4943 4950 4951 4979 34 61 70 251 295 332 352 362 388 407 409 444 460 558 638 645 716 751 756 765 935 1044 1052 1070 1135 1163 1200 1266 1441 1487 1545 1553 1615 1619 1666 1839 1865 1888 1955 2026 2042 2093 2097 2099 2129 2172 2309 2357 2366 2460 2495 2557 2559 2619 2746 2750 2854 2871 2924 2969 2979 3022 3135 3359 3397 3402 3406 3426 3487 3517 3563 3608 3727 3757 4018 4029 4080 4100 4117 4281 4322 4343 4415 4431 4557 4624 4662 4713 4772 4796 4894 4897 4905 TGGGCC/GGCCCA 0 -3 570 476 59 -86.5 19 22 24 75 98 108 133 135 138 210 302 316 360 363 383 387 390 391 392 398 405 418 423 425 426 441 449 493 499 513 555 621 625 669 677 686 698 709 739 770 771 785 803 806 840 866 897 901 902 944 964 966 971 978 1004 1018 1022 1029 1033 1037 1038 1048 1066 1080 1093 1114 1119 1132 1154 1160 1177 1179 1198 1202 1203 1208 1213 1221 1239 1249 1255 1256 1282 1285 1303 1310 1337 1357 1358 1365 1367 1379 1385 1388 1389 1390 1391 1394 1408 1421 1442 1444 1460 1481 1504 1507 1521 1526 1540 1546 1587 1637 1647 1663 1699 1707 1731 1744 1754 1757 1773 1777 1778 1783 1789 1797 1805 1811 1838 1843 1870 1875 1896 1908 1911 1920 1968 1985 2006 2017 2022 2041 2044 2047 2048 2083 2087 2109 2127 2128 2132 2143 2158 2159 2166 2170 2178 2181 2189 2199 2202 2222 2228 2232 2237 2245 2250 2276 2296 2298 2311 2318 2331 2332 2352 2362 2365 2371 2372 2382 2393 2409 2420 2432 2440 2441 2461 2501 2507 2514 2515 2532 2534 2535 2542 2543 2558 2562 2570 2573 2586 2593 2617 2622 2625 2636 2643 2649 2658 2662 2667 2675 2676 2680 2692 2698 2704 2709 2721 2722 2729 2730 2743 2767 2775 2781 2783 2784 2797 2806 2813 2818 2820 2828 2834 2841 2856 2857 2867 2876 2902 2903 2905 2913 2914 2925 2938 2943 2949 2953 2957 2961 2985 2991 3029 3037 3047 3053 3065 3068 3072 3077 3085 3086 3108 3110 3113 3119 3138 3139 3148 3150 3152 3165 3166 3167 3170 3177 3182 3197 3211 3219 3229 3241 3285 3294 3295 3300 3318 3319 3323 3337 3351 3352 3360 3365 3372 3375 3376 3377 3380 3384 3408 3420 3421 3425 3429 3449 3457 3458 3460 3463 3472 3477 3479 3482 3483 3488 3493 3494 3502 3512 3514 3516 3517 3519 3526 3543 3547 3548 3569 3576 3580 3587 3593 3594 3595 3597 3619 3630 3638 3645 3646 3662 3664 3669 3678 3681 3688 3692 3696 3703 3714 3718 3722 3723 3725 3726 3728 3738 3746 3749 3750 3755 3758 3773 3786 3791 3795 3797 3801 3802 3809 3813 3818 3831 3832 3839 3843 3856 3869 3872 3876 3880 3896 3901 3914 3923 3924 3929 3942 3944 3952 3964 3971 3976 3982 3983 3987 3996 3997 4020 4031 4032 4036 4037 4039 4057 4071 4077 4078 4080 4088 4096 4103 4107 4123 4129 4131 4136 4139 4148 4152 4156 4164 4171 4180 4182 4204 4211 4212 4222 4224 4227 4236 4238 4245 4246 4251 4266 4283 4285 4289 4302 4303 4304 4305 4306 4307 4322 4324 4340 4354 4356 4357 4366 4373 4379 4383 4384 4386 4390 4391 4393 4395 4427 4428 4440 4442 4447 4449 4452 4466 4467 4475 4481 4482 4483 4489 4492 4496 4505 4514 4519 4520 4523 4527 4530 4532 4538 4545 4549 4555 4559 4561 4563 4580 4586 4593 4594 4595 4597 4600 4602 4603 4612 4613 4614 4616 4617 4618 4621 4623 4626 4628 4634 4641 4644 4651 4664 4675 4678 4682 4686 4699 4703 4708 4710 4713 4717 4720 4727 4730 4737 4739 4771 4775 4779 4787 4802 4811 4814 4824 4825 4828 4843 4847 4864 4867 4879 4891 4892 4900 4913 4915 4916 4920 4924 4934 4940 4966 4967 4973 4975 4977 4978 4980 4993 4997 4998 25 75 85 86 102 118 119 320 347 412 502 513 618 731 791 823 869 884 918 942 981 1080 1301 1467 1691 1716 1865 1901 2010 2062 2089 2139 2229 2358 2567 2612 2627 2669 2701 2704 2729 2868 3186 3274 3297 3330 3459 3500 3548 3560 3578 3828 3918 4155 4253 4563 4736 4817 4865 GGCCCA/TGGGCC 3 -1 570 476 59 -86.5 19 22 24 75 98 108 133 135 138 210 302 316 360 363 383 387 390 391 392 398 405 418 423 425 426 441 449 493 499 513 555 621 625 669 677 686 698 709 739 770 771 785 803 806 840 866 897 901 902 944 964 966 971 978 1004 1018 1022 1029 1033 1037 1038 1048 1066 1080 1093 1114 1119 1132 1154 1160 1177 1179 1198 1202 1203 1208 1213 1221 1239 1249 1255 1256 1282 1285 1303 1310 1337 1357 1358 1365 1367 1379 1385 1388 1389 1390 1391 1394 1408 1421 1442 1444 1460 1481 1504 1507 1521 1526 1540 1546 1587 1637 1647 1663 1699 1707 1731 1744 1754 1757 1773 1777 1778 1783 1789 1797 1805 1811 1838 1843 1870 1875 1896 1908 1911 1920 1968 1985 2006 2017 2022 2041 2044 2047 2048 2083 2087 2109 2127 2128 2132 2143 2158 2159 2166 2170 2178 2181 2189 2199 2202 2222 2228 2232 2237 2245 2250 2276 2296 2298 2311 2318 2331 2332 2352 2362 2365 2371 2372 2382 2393 2409 2420 2432 2440 2441 2461 2501 2507 2514 2515 2532 2534 2535 2542 2543 2558 2562 2570 2573 2586 2593 2617 2622 2625 2636 2643 2649 2658 2662 2667 2675 2676 2680 2692 2698 2704 2709 2721 2722 2729 2730 2743 2767 2775 2781 2783 2784 2797 2806 2813 2818 2820 2828 2834 2841 2856 2857 2867 2876 2902 2903 2905 2913 2914 2925 2938 2943 2949 2953 2957 2961 2985 2991 3029 3037 3047 3053 3065 3068 3072 3077 3085 3086 3108 3110 3113 3119 3138 3139 3148 3150 3152 3165 3166 3167 3170 3177 3182 3197 3211 3219 3229 3241 3285 3294 3295 3300 3318 3319 3323 3337 3351 3352 3360 3365 3372 3375 3376 3377 3380 3384 3408 3420 3421 3425 3429 3449 3457 3458 3460 3463 3472 3477 3479 3482 3483 3488 3493 3494 3502 3512 3514 3516 3517 3519 3526 3543 3547 3548 3569 3576 3580 3587 3593 3594 3595 3597 3619 3630 3638 3645 3646 3662 3664 3669 3678 3681 3688 3692 3696 3703 3714 3718 3722 3723 3725 3726 3728 3738 3746 3749 3750 3755 3758 3773 3786 3791 3795 3797 3801 3802 3809 3813 3818 3831 3832 3839 3843 3856 3869 3872 3876 3880 3896 3901 3914 3923 3924 3929 3942 3944 3952 3964 3971 3976 3982 3983 3987 3996 3997 4020 4031 4032 4036 4037 4039 4057 4071 4077 4078 4080 4088 4096 4103 4107 4123 4129 4131 4136 4139 4148 4152 4156 4164 4171 4180 4182 4204 4211 4212 4222 4224 4227 4236 4238 4245 4246 4251 4266 4283 4285 4289 4302 4303 4304 4305 4306 4307 4322 4324 4340 4354 4356 4357 4366 4373 4379 4383 4384 4386 4390 4391 4393 4395 4427 4428 4440 4442 4447 4449 4452 4466 4467 4475 4481 4482 4483 4489 4492 4496 4505 4514 4519 4520 4523 4527 4530 4532 4538 4545 4549 4555 4559 4561 4563 4580 4586 4593 4594 4595 4597 4600 4602 4603 4612 4613 4614 4616 4617 4618 4621 4623 4626 4628 4634 4641 4644 4651 4664 4675 4678 4682 4686 4699 4703 4708 4710 4713 4717 4720 4727 4730 4737 4739 4771 4775 4779 4787 4802 4811 4814 4824 4825 4828 4843 4847 4864 4867 4879 4891 4892 4900 4913 4915 4916 4920 4924 4934 4940 4966 4967 4973 4975 4977 4978 4980 4993 4997 4998 25 75 85 86 102 118 119 320 347 412 502 513 618 731 791 823 869 884 918 942 981 1080 1301 1467 1691 1716 1865 1901 2010 2062 2089 2139 2229 2358 2567 2612 2627 2669 2701 2704 2729 2868 3186 3274 3297 3330 3459 3500 3548 3560 3578 3828 3918 4155 4253 4563 4736 4817 4865 CATTGG/CCAATG 4 -3 404 458 114 -52.7 18 19 20 21 24 38 47 51 56 60 70 74 75 87 98 101 109 114 123 128 138 139 146 147 154 156 173 201 202 214 222 223 232 236 237 239 243 270 275 283 289 324 360 363 367 372 373 374 382 383 390 391 406 407 415 418 423 441 448 451 456 472 474 479 480 485 488 518 546 572 573 589 594 597 599 609 623 661 703 727 729 731 746 748 751 766 771 785 806 817 831 832 849 851 855 857 864 877 888 933 944 947 954 956 962 971 974 978 989 998 1006 1014 1029 1031 1037 1042 1047 1063 1082 1093 1094 1102 1127 1149 1154 1161 1189 1194 1208 1271 1285 1286 1295 1301 1310 1319 1332 1347 1354 1365 1389 1390 1406 1413 1421 1446 1464 1497 1498 1507 1508 1511 1516 1526 1535 1550 1552 1553 1566 1597 1611 1620 1657 1703 1707 1738 1750 1751 1776 1789 1812 1815 1824 1832 1868 1872 1876 1883 1884 1894 1933 1945 1964 1970 1987 2012 2016 2029 2035 2036 2088 2107 2116 2121 2132 2158 2162 2170 2171 2172 2177 2196 2203 2212 2221 2259 2265 2269 2272 2278 2297 2322 2323 2327 2352 2358 2392 2413 2419 2457 2507 2515 2524 2531 2549 2553 2561 2572 2573 2589 2598 2604 2618 2625 2626 2636 2639 2641 2644 2645 2672 2682 2692 2706 2709 2716 2738 2749 2750 2753 2770 2774 2776 2791 2805 2816 2818 2820 2827 2828 2844 2845 2881 2917 2931 2946 2953 2955 2987 3027 3037 3062 3066 3073 3076 3078 3094 3120 3132 3153 3166 3170 3174 3181 3185 3198 3216 3227 3246 3250 3262 3294 3310 3329 3337 3344 3346 3351 3370 3379 3380 3427 3466 3469 3500 3502 3509 3515 3591 3593 3597 3623 3626 3646 3670 3681 3683 3703 3718 3741 3765 3774 3812 3834 3900 3902 3915 3927 3942 3943 3995 3999 4032 4033 4036 4039 4051 4067 4074 4084 4090 4116 4117 4124 4138 4140 4145 4146 4179 4221 4223 4233 4235 4237 4250 4263 4266 4300 4305 4324 4334 4362 4373 4379 4387 4426 4436 4446 4463 4492 4509 4511 4515 4526 4528 4576 4594 4596 4598 4649 4668 4683 4714 4716 4721 4726 4738 4757 4768 4812 4816 4828 4834 4842 4872 4881 4898 4913 4918 4946 4948 4950 4956 4981 44 65 107 277 321 362 437 441 454 489 557 567 585 588 630 703 748 751 840 841 871 932 958 995 1112 1176 1201 1220 1259 1263 1286 1306 1362 1385 1389 1439 1470 1485 1493 1598 1649 1665 1673 1691 1698 1745 1747 1751 1765 1878 1893 1911 1942 2005 2018 2041 2062 2088 2089 2133 2182 2221 2251 2320 2374 2411 2513 2582 2586 2612 2628 2676 2684 2710 2717 2720 2750 2758 2882 2927 2996 3013 3039 3047 3072 3144 3180 3265 3310 3545 3548 3581 3637 3690 3755 3863 3903 3993 4157 4192 4349 4405 4455 4532 4596 4604 4610 4631 4644 4679 4726 4736 4815 4830 TTGGGC/GCCCAA 0 -4 503 430 66 -69.9 19 23 24 98 133 138 146 173 210 253 264 295 302 328 360 383 390 391 392 394 398 409 416 417 418 423 448 457 467 474 493 499 538 540 541 575 580 613 669 677 686 698 751 771 785 803 804 806 850 894 895 901 924 940 944 964 971 978 1007 1029 1037 1038 1048 1057 1071 1080 1093 1107 1132 1149 1154 1160 1161 1169 1177 1179 1198 1208 1223 1255 1285 1293 1298 1303 1308 1310 1332 1337 1358 1365 1367 1385 1389 1390 1394 1421 1437 1442 1444 1481 1491 1507 1521 1529 1535 1540 1564 1590 1616 1647 1663 1707 1737 1744 1751 1757 1767 1773 1783 1789 1797 1804 1811 1830 1835 1843 1844 1860 1868 1880 1899 1901 1911 1923 1965 1985 1987 1993 1997 2004 2006 2012 2016 2030 2048 2094 2107 2109 2128 2132 2156 2157 2158 2159 2162 2165 2166 2170 2178 2181 2202 2227 2232 2245 2276 2285 2291 2311 2318 2322 2347 2349 2362 2382 2393 2400 2420 2440 2454 2461 2462 2495 2507 2522 2534 2535 2536 2541 2542 2573 2586 2588 2593 2617 2625 2636 2643 2661 2666 2667 2675 2686 2687 2692 2704 2709 2743 2767 2775 2777 2783 2791 2806 2815 2818 2820 2843 2876 2903 2905 2914 2925 2927 2949 2953 2961 2970 3001 3005 3006 3037 3041 3055 3068 3102 3108 3113 3119 3120 3139 3148 3164 3166 3170 3174 3176 3177 3197 3211 3216 3229 3241 3245 3249 3269 3285 3294 3295 3318 3329 3337 3352 3360 3375 3376 3377 3380 3384 3397 3408 3420 3421 3425 3451 3457 3458 3460 3472 3476 3477 3493 3502 3506 3512 3513 3514 3517 3519 3526 3536 3544 3547 3548 3550 3576 3593 3594 3595 3611 3630 3638 3642 3645 3646 3647 3662 3664 3688 3691 3698 3703 3705 3718 3725 3726 3746 3750 3757 3773 3785 3796 3797 3801 3802 3809 3810 3813 3818 3830 3832 3856 3869 3872 3896 3905 3908 3914 3919 3923 3929 3942 3944 3953 3954 3971 3976 3982 3983 3987 3996 4027 4032 4033 4034 4036 4037 4039 4041 4043 4053 4057 4077 4080 4082 4084 4088 4095 4099 4123 4130 4131 4132 4134 4136 4139 4148 4152 4156 4161 4163 4172 4185 4186 4192 4204 4210 4218 4222 4236 4245 4251 4266 4267 4283 4289 4291 4305 4306 4322 4324 4338 4340 4343 4352 4356 4366 4373 4379 4383 4384 4395 4422 4427 4440 4442 4447 4452 4466 4467 4475 4479 4481 4482 4483 4489 4492 4506 4519 4520 4527 4532 4538 4545 4555 4559 4561 4563 4586 4593 4594 4600 4601 4603 4612 4613 4614 4616 4617 4621 4623 4634 4641 4644 4675 4686 4700 4707 4710 4713 4717 4727 4731 4748 4759 4771 4772 4775 4779 4787 4790 4811 4824 4828 4848 4864 4870 4875 4876 4879 4881 4891 4892 4897 4899 4900 4913 4915 4920 4922 4924 4925 4934 4939 4940 4942 4946 4961 4966 4977 4992 4993 4995 4997 25 118 119 132 189 301 312 320 412 667 731 748 791 823 869 1007 1015 1080 1248 1286 1658 1691 1738 1745 1836 1865 1942 2056 2089 2113 2139 2146 2229 2453 2475 2612 2627 2669 2717 2729 2730 2779 2781 2862 2952 3061 3098 3190 3232 3274 3277 3548 3560 3748 3749 4024 4124 4155 4173 4253 4596 4649 4815 4817 4849 4909 TGGACA/TGTCCA 0 -3 413 423 87 -56.9 14 19 27 29 36 58 60 69 72 78 84 94 99 134 136 151 156 178 184 185 189 226 230 238 244 245 246 248 250 257 267 269 283 288 293 305 311 317 322 358 371 374 389 408 421 422 427 436 459 464 471 483 494 527 554 557 563 569 571 578 584 599 609 621 633 660 677 680 691 693 695 720 723 726 730 735 737 745 748 750 760 779 805 822 843 894 906 910 954 962 982 990 995 1032 1066 1069 1076 1077 1099 1104 1108 1134 1138 1141 1149 1159 1185 1206 1214 1221 1231 1245 1248 1264 1272 1277 1295 1296 1313 1323 1336 1383 1406 1419 1428 1440 1450 1461 1462 1508 1511 1517 1534 1545 1549 1564 1596 1602 1606 1617 1723 1746 1781 1792 1814 1840 1847 1851 1864 1865 1913 1915 1933 1976 1986 1991 2004 2021 2031 2039 2054 2061 2066 2077 2092 2101 2104 2118 2119 2123 2140 2179 2191 2214 2233 2239 2286 2302 2315 2322 2327 2336 2338 2363 2365 2380 2412 2413 2415 2422 2423 2462 2488 2500 2505 2520 2532 2533 2556 2564 2566 2575 2578 2579 2583 2607 2624 2626 2650 2655 2690 2691 2696 2749 2776 2778 2790 2804 2805 2827 2855 2862 2875 2877 2888 2889 2918 2934 2936 2937 2948 2965 2978 2979 2983 2992 3004 3012 3043 3062 3079 3130 3135 3151 3156 3170 3178 3183 3186 3200 3212 3215 3219 3220 3225 3270 3279 3288 3293 3325 3327 3334 3338 3340 3385 3407 3418 3430 3432 3441 3448 3461 3469 3478 3490 3510 3525 3526 3540 3556 3581 3591 3592 3604 3610 3612 3625 3631 3636 3665 3667 3679 3695 3720 3729 3731 3734 3736 3740 3742 3749 3752 3761 3769 3815 3822 3833 3834 3840 3845 3855 3864 3865 3875 3885 3936 3943 3969 3974 3985 3986 3989 3990 4007 4010 4016 4017 4025 4051 4062 4072 4075 4078 4081 4109 4112 4114 4148 4159 4179 4183 4188 4190 4196 4203 4205 4208 4220 4240 4250 4256 4263 4296 4306 4327 4330 4335 4351 4364 4381 4393 4405 4406 4407 4416 4423 4426 4430 4434 4444 4459 4471 4473 4478 4485 4494 4501 4510 4513 4515 4529 4540 4557 4618 4625 4629 4667 4698 4702 4706 4712 4718 4723 4747 4751 4756 4776 4778 4789 4804 4818 4840 4854 4863 4869 4880 4886 4896 4909 4943 4952 4987 4990 63 84 113 251 395 506 645 748 751 759 765 825 951 1052 1077 1084 1107 1135 1148 1162 1166 1195 1212 1222 1246 1257 1389 1393 1441 1471 1473 1553 1590 1615 1796 1871 2026 2042 2058 2106 2129 2181 2182 2270 2310 2317 2445 2463 2559 2619 2706 2740 2817 2856 2873 2914 2979 3144 3164 3243 3347 3402 3410 3476 3477 3622 3685 3787 3850 3923 4100 4252 4285 4329 4430 4431 4557 4662 4771 4796 4813 4829 4894 4927 4957 4969 4994 ATGGGC/GCCCAT 0 -4 430 374 64 -56.9 19 22 62 75 90 98 108 109 135 146 202 222 223 237 262 316 363 375 383 387 398 418 425 426 449 468 513 551 555 621 700 709 715 748 770 791 806 814 817 832 861 866 897 902 936 966 978 989 1004 1029 1042 1066 1080 1088 1114 1122 1154 1160 1163 1170 1179 1202 1217 1221 1237 1239 1253 1271 1282 1288 1344 1357 1365 1388 1390 1414 1421 1444 1460 1481 1504 1526 1535 1537 1555 1582 1587 1603 1611 1612 1637 1663 1666 1674 1677 1699 1708 1717 1724 1731 1754 1757 1773 1777 1789 1797 1805 1811 1831 1834 1837 1838 1870 1908 1918 1920 1968 1997 2012 2022 2036 2041 2044 2059 2064 2070 2083 2088 2112 2121 2131 2178 2189 2203 2222 2223 2228 2236 2237 2245 2250 2255 2273 2278 2282 2295 2296 2303 2311 2332 2352 2365 2371 2372 2393 2432 2456 2461 2494 2507 2514 2515 2529 2532 2542 2558 2562 2570 2573 2593 2601 2658 2674 2675 2680 2692 2698 2709 2710 2721 2722 2729 2730 2750 2777 2781 2791 2796 2797 2799 2815 2828 2841 2843 2856 2867 2890 2902 2909 2913 2919 2921 2930 2943 2953 2957 2985 3029 3035 3037 3047 3053 3068 3072 3077 3086 3117 3138 3148 3150 3152 3164 3167 3176 3197 3219 3284 3287 3294 3298 3300 3302 3323 3329 3333 3351 3365 3371 3372 3377 3380 3394 3397 3411 3420 3463 3476 3477 3482 3488 3492 3494 3502 3516 3517 3543 3548 3569 3579 3580 3594 3597 3599 3607 3619 3646 3669 3681 3688 3690 3696 3701 3702 3703 3705 3714 3722 3728 3738 3749 3755 3758 3786 3791 3809 3823 3831 3841 3843 3869 3872 3876 3880 3901 3909 3914 3919 3924 3929 3939 3942 3960 3966 3997 4020 4032 4034 4037 4039 4041 4057 4059 4077 4078 4080 4096 4103 4107 4129 4131 4136 4148 4154 4156 4164 4171 4180 4181 4182 4189 4192 4211 4212 4222 4224 4226 4245 4246 4251 4260 4269 4284 4285 4289 4301 4303 4304 4319 4322 4340 4354 4366 4373 4379 4388 4390 4391 4393 4398 4404 4432 4447 4449 4467 4470 4482 4492 4498 4505 4514 4515 4523 4527 4529 4530 4544 4545 4549 4561 4567 4579 4594 4595 4602 4603 4608 4611 4612 4618 4619 4621 4626 4641 4648 4664 4666 4682 4694 4697 4699 4708 4710 4730 4737 4739 4745 4766 4775 4801 4808 4814 4824 4843 4847 4849 4856 4867 4879 4891 4900 4904 4913 4915 4916 4939 4964 4973 4989 4995 4998 75 86 102 119 137 312 373 402 458 513 564 618 884 919 981 1003 1051 1106 1171 1301 1320 1467 1681 1691 1716 1748 1791 1814 1886 1964 1986 2010 2175 2358 2502 2515 2552 2557 2561 2567 2625 2663 2701 2728 2746 2860 3297 3330 3459 3500 3662 3694 3828 3918 4135 4172 4224 4245 4268 4434 4632 4712 4736 4896 GGACCG/CGGTCC 0 -2 361 369 45 -67.3 0 8 12 29 30 51 61 82 115 116 149 192 194 212 214 217 219 224 232 260 276 307 309 346 348 381 388 396 403 404 414 439 442 482 489 499 509 540 550 551 555 579 591 622 626 655 663 682 697 707 718 736 765 781 797 850 853 873 883 908 911 912 913 918 930 948 958 959 965 969 980 983 1002 1009 1052 1068 1084 1095 1114 1128 1136 1139 1140 1141 1148 1167 1184 1192 1196 1201 1211 1223 1224 1248 1257 1260 1276 1279 1325 1355 1380 1409 1441 1450 1461 1478 1513 1561 1573 1574 1579 1585 1589 1595 1598 1610 1615 1632 1649 1650 1658 1668 1673 1680 1684 1687 1709 1711 1712 1715 1771 1779 1789 1797 1798 1806 1826 1833 1834 1848 1857 1862 1894 1909 1910 1912 1916 1922 1930 1936 1942 1950 1960 1962 1971 1994 1995 2019 2020 2027 2035 2055 2057 2063 2084 2108 2111 2130 2136 2160 2182 2187 2207 2219 2224 2225 2250 2267 2270 2271 2279 2289 2306 2339 2347 2351 2360 2394 2397 2418 2442 2463 2466 2477 2502 2561 2563 2581 2597 2604 2606 2627 2642 2646 2663 2681 2683 2699 2724 2725 2744 2748 2752 2757 2760 2773 2787 2797 2809 2817 2824 2825 2826 2853 2865 2882 2893 2902 2909 2910 2911 2920 2923 2941 2964 2995 3000 3027 3087 3091 3096 3109 3111 3115 3131 3143 3144 3161 3191 3234 3248 3258 3264 3281 3291 3336 3345 3382 3387 3406 3409 3445 3459 3462 3488 3489 3503 3505 3513 3524 3567 3574 3584 3588 3613 3627 3654 3680 3684 3693 3710 3735 3760 3799 3818 3861 3871 3907 3911 3917 3918 3961 3968 3984 3991 3994 3998 4056 4063 4080 4128 4130 4139 4141 4174 4193 4207 4216 4231 4285 4293 4310 4317 4337 4365 4394 4397 4407 4439 4451 4453 4461 4464 4469 4472 4499 4504 4525 4551 4553 4585 4586 4596 4599 4600 4606 4619 4624 4660 4663 4683 4687 4696 4733 4734 4757 4781 4792 4799 4819 4834 4861 4894 4895 4917 4921 4945 4965 4984 4986 4991 33 61 261 388 508 558 567 931 1083 1095 1143 1163 1200 1359 1377 1396 1702 1718 1779 1791 1865 1906 1955 2011 2099 2154 2552 2633 2691 2802 2865 2980 3124 3129 3202 3222 3406 3569 3705 3789 4018 4125 4155 4172 4983 GGACCG/CGGTCC 1 -3 361 369 45 -67.3 0 8 12 29 30 51 61 82 115 116 149 192 194 212 214 217 219 224 232 260 276 307 309 346 348 381 388 396 403 404 414 439 442 482 489 499 509 540 550 551 555 579 591 622 626 655 663 682 697 707 718 736 765 781 797 850 853 873 883 908 911 912 913 918 930 948 958 959 965 969 980 983 1002 1009 1052 1068 1084 1095 1114 1128 1136 1139 1140 1141 1148 1167 1184 1192 1196 1201 1211 1223 1224 1248 1257 1260 1276 1279 1325 1355 1380 1409 1441 1450 1461 1478 1513 1561 1573 1574 1579 1585 1589 1595 1598 1610 1615 1632 1649 1650 1658 1668 1673 1680 1684 1687 1709 1711 1712 1715 1771 1779 1789 1797 1798 1806 1826 1833 1834 1848 1857 1862 1894 1909 1910 1912 1916 1922 1930 1936 1942 1950 1960 1962 1971 1994 1995 2019 2020 2027 2035 2055 2057 2063 2084 2108 2111 2130 2136 2160 2182 2187 2207 2219 2224 2225 2250 2267 2270 2271 2279 2289 2306 2339 2347 2351 2360 2394 2397 2418 2442 2463 2466 2477 2502 2561 2563 2581 2597 2604 2606 2627 2642 2646 2663 2681 2683 2699 2724 2725 2744 2748 2752 2757 2760 2773 2787 2797 2809 2817 2824 2825 2826 2853 2865 2882 2893 2902 2909 2910 2911 2920 2923 2941 2964 2995 3000 3027 3087 3091 3096 3109 3111 3115 3131 3143 3144 3161 3191 3234 3248 3258 3264 3281 3291 3336 3345 3382 3387 3406 3409 3445 3459 3462 3488 3489 3503 3505 3513 3524 3567 3574 3584 3588 3613 3627 3654 3680 3684 3693 3710 3735 3760 3799 3818 3861 3871 3907 3911 3917 3918 3961 3968 3984 3991 3994 3998 4056 4063 4080 4128 4130 4139 4141 4174 4193 4207 4216 4231 4285 4293 4310 4317 4337 4365 4394 4397 4407 4439 4451 4453 4461 4464 4469 4472 4499 4504 4525 4551 4553 4585 4586 4596 4599 4600 4606 4619 4624 4660 4663 4683 4687 4696 4733 4734 4757 4781 4792 4799 4819 4834 4861 4894 4895 4917 4921 4945 4965 4984 4986 4991 33 61 261 388 508 558 567 931 1083 1095 1143 1163 1200 1359 1377 1396 1702 1718 1779 1791 1865 1906 1955 2011 2099 2154 2552 2633 2691 2802 2865 2980 3124 3129 3202 3222 3406 3569 3705 3789 4018 4125 4155 4172 4983 GTGGAC/GTCCAC 0 -4 379 359 74 -48.1 0 14 23 29 47 51 58 78 79 94 116 125 134 152 184 185 246 250 254 268 270 293 305 312 322 358 374 390 396 402 403 404 471 483 509 517 546 549 558 584 695 745 747 750 777 779 804 808 838 852 860 871 873 923 951 953 959 965 969 975 976 1006 1010 1019 1032 1061 1076 1116 1121 1138 1139 1170 1186 1204 1214 1218 1220 1225 1279 1310 1332 1342 1364 1370 1398 1405 1420 1428 1439 1450 1453 1474 1477 1501 1505 1513 1519 1527 1545 1574 1594 1606 1616 1631 1664 1666 1679 1681 1684 1712 1738 1746 1770 1771 1784 1795 1807 1814 1823 1868 1894 1914 1937 1948 1962 1966 1967 2005 2051 2062 2109 2110 2112 2131 2157 2182 2224 2251 2260 2262 2270 2286 2302 2315 2319 2334 2336 2337 2351 2363 2364 2377 2388 2418 2429 2455 2488 2497 2500 2501 2533 2551 2556 2564 2579 2583 2585 2594 2607 2612 2617 2647 2652 2655 2665 2691 2706 2707 2708 2725 2751 2769 2772 2778 2789 2793 2794 2801 2802 2803 2853 2868 2873 2884 2889 2898 2908 2923 2952 2959 2962 2978 2979 3014 3017 3024 3050 3052 3062 3079 3089 3092 3096 3108 3115 3116 3126 3131 3135 3145 3156 3168 3201 3205 3214 3237 3248 3258 3264 3270 3295 3325 3327 3334 3343 3346 3353 3356 3378 3395 3409 3413 3480 3490 3499 3504 3522 3539 3551 3553 3564 3589 3625 3630 3634 3649 3654 3655 3656 3686 3696 3720 3723 3730 3734 3736 3752 3764 3772 3778 3792 3815 3821 3858 3874 3885 3889 3908 3913 3921 3948 3973 3977 3984 3985 3988 3990 4002 4005 4027 4029 4045 4062 4079 4109 4128 4135 4159 4176 4183 4190 4220 4231 4235 4240 4247 4248 4256 4263 4274 4275 4294 4330 4349 4359 4360 4361 4362 4375 4407 4409 4424 4426 4430 4431 4434 4458 4459 4477 4485 4491 4494 4497 4513 4548 4556 4560 4570 4578 4591 4606 4625 4627 4635 4646 4656 4662 4676 4680 4700 4703 4718 4720 4733 4740 4774 4786 4789 4799 4805 4822 4839 4840 4841 4843 4846 4851 4869 4871 4884 4893 4914 4927 4954 4961 4968 4983 4987 4999 55 113 141 419 437 569 696 769 822 884 946 1037 1077 1083 1084 1107 1148 1246 1257 1304 1358 1389 1396 1457 1471 1507 1590 1692 1739 1779 1841 1901 2058 2202 2261 2317 2383 2415 2603 2689 2691 2789 2799 2802 2856 2903 2914 2956 3144 3146 3243 3477 3579 3622 3702 3738 3789 4038 4151 4259 4285 4456 4494 4504 4514 4575 4577 4601 4648 4813 4882 4957 4993 4994 GGTCCT/AGGACC 0 -2 367 358 42 -66.4 0 6 12 42 61 82 92 115 125 137 153 160 165 169 172 212 219 234 261 290 333 342 380 388 407 420 439 442 473 479 485 486 491 499 527 548 603 606 627 629 644 653 654 681 688 701 715 718 736 765 769 776 781 795 830 853 864 879 891 911 913 914 916 952 962 974 1023 1028 1046 1053 1062 1063 1082 1155 1166 1169 1173 1174 1207 1211 1212 1224 1240 1242 1243 1244 1253 1260 1280 1297 1307 1351 1369 1416 1432 1435 1457 1486 1495 1503 1523 1536 1570 1574 1576 1589 1593 1599 1609 1613 1654 1671 1692 1739 1765 1782 1812 1813 1820 1828 1852 1867 1887 1890 1895 1903 1905 1910 1930 1942 1956 1957 1959 1960 1971 1989 2019 2020 2027 2028 2051 2057 2060 2070 2078 2124 2130 2136 2146 2147 2164 2172 2173 2176 2206 2209 2215 2219 2242 2318 2342 2350 2396 2442 2444 2450 2452 2463 2477 2481 2483 2487 2491 2502 2554 2564 2569 2581 2604 2606 2621 2626 2639 2681 2683 2684 2688 2689 2705 2711 2724 2735 2747 2748 2754 2760 2795 2809 2832 2846 2847 2853 2859 2884 2893 2897 2899 2912 2916 2940 2942 2963 2972 2984 3022 3033 3034 3051 3078 3103 3105 3109 3111 3118 3132 3207 3226 3234 3248 3251 3252 3253 3257 3271 3282 3291 3303 3304 3332 3383 3399 3400 3442 3444 3445 3459 3467 3488 3552 3560 3573 3582 3602 3680 3683 3685 3699 3762 3783 3799 3811 3816 3818 3826 3835 3842 3850 3853 3863 3867 3881 3886 3897 3902 3906 3926 3927 3931 3941 3943 3953 3958 3972 4040 4087 4097 4101 4104 4108 4115 4118 4119 4140 4173 4174 4207 4217 4223 4242 4249 4258 4260 4268 4286 4299 4325 4331 4334 4337 4367 4434 4435 4445 4451 4452 4455 4493 4501 4515 4521 4539 4552 4554 4581 4583 4585 4615 4625 4630 4632 4646 4648 4659 4660 4672 4677 4688 4695 4713 4715 4719 4722 4733 4773 4783 4786 4795 4807 4810 4827 4834 4845 4862 4868 4885 4887 4902 4910 4926 4928 4945 4948 4954 4965 4974 4985 4986 76 261 364 541 567 687 910 939 1359 1462 1636 1762 2011 2106 2150 2275 2383 2432 2493 2633 2640 2997 3133 3202 3211 3222 3367 3387 3400 3457 3513 3625 3637 3689 3804 4406 4614 4620 4631 4754 4836 4983 AATGGG/CCCATT 0 -5 378 357 98 -37.3 16 24 41 75 87 98 109 118 138 146 150 156 163 182 189 202 223 237 258 262 298 363 383 387 418 423 449 456 468 486 539 546 549 555 567 572 588 589 590 593 616 715 728 748 793 806 809 817 830 861 866 889 902 914 921 977 978 986 989 1004 1029 1042 1046 1075 1081 1122 1149 1154 1160 1170 1179 1188 1202 1217 1237 1239 1253 1271 1282 1284 1286 1288 1302 1319 1365 1408 1421 1444 1504 1535 1555 1580 1582 1603 1611 1612 1620 1624 1644 1657 1667 1677 1699 1701 1704 1714 1730 1731 1733 1738 1751 1754 1783 1789 1797 1805 1811 1831 1832 1834 1836 1838 1841 1847 1870 1899 1912 1918 1942 1944 1945 1959 1966 1968 1987 1997 2012 2017 2020 2036 2037 2041 2064 2070 2088 2090 2104 2121 2132 2141 2171 2178 2203 2208 2213 2222 2223 2228 2236 2237 2265 2269 2270 2278 2279 2282 2322 2332 2348 2369 2372 2393 2461 2507 2515 2529 2532 2562 2570 2573 2574 2598 2601 2604 2625 2641 2662 2675 2692 2709 2730 2740 2770 2781 2791 2799 2800 2820 2827 2828 2850 2856 2890 2902 2909 2913 2943 2953 2960 2986 2990 3016 3023 3035 3037 3047 3068 3086 3101 3106 3138 3148 3150 3152 3164 3166 3176 3197 3261 3267 3284 3287 3300 3323 3329 3333 3337 3351 3372 3380 3397 3403 3420 3427 3446 3461 3488 3492 3501 3502 3516 3536 3539 3540 3543 3548 3557 3564 3579 3593 3599 3646 3681 3688 3690 3696 3701 3703 3714 3722 3724 3728 3749 3754 3786 3791 3817 3827 3831 3843 3874 3876 3884 3914 3919 3924 3929 3938 3942 3946 3960 4032 4037 4039 4041 4044 4059 4077 4080 4087 4094 4096 4097 4103 4107 4129 4131 4136 4138 4154 4164 4171 4212 4222 4224 4245 4251 4260 4263 4275 4289 4301 4303 4322 4324 4347 4379 4385 4390 4391 4393 4398 4432 4449 4454 4461 4492 4523 4525 4527 4530 4553 4561 4594 4602 4608 4610 4612 4618 4626 4648 4691 4697 4699 4708 4710 4725 4730 4737 4745 4796 4801 4814 4818 4821 4849 4850 4876 4879 4890 4891 4913 4916 4920 4941 4961 4995 4998 94 102 112 116 137 349 459 564 572 731 763 787 820 822 855 884 919 981 1102 1181 1194 1219 1289 1301 1330 1383 1671 1674 1691 1791 1814 1834 1850 1861 1964 1985 2010 2086 2144 2150 2181 2193 2224 2252 2288 2405 2449 2483 2573 2693 2701 2728 2757 2767 2805 2884 2944 2950 3051 3069 3131 3179 3283 3330 3336 3564 3604 3646 3649 3668 3732 3753 3909 3918 3978 4024 4044 4056 4101 4135 4172 4268 4299 4315 4331 4362 4413 4431 4434 4587 4682 4712 4736 4761 4818 4824 4830 4908 TGGGCT/AGCCCA 0 -3 407 354 55 -57.0 8 19 23 42 90 93 98 122 146 262 264 266 295 302 383 398 402 409 411 418 468 500 513 538 541 551 580 715 748 759 783 791 803 804 832 850 861 862 878 901 924 934 936 944 948 967 978 989 1007 1033 1037 1042 1088 1107 1132 1149 1154 1161 1170 1176 1179 1202 1208 1217 1223 1227 1232 1237 1293 1298 1314 1344 1365 1421 1444 1481 1504 1520 1535 1555 1564 1590 1611 1666 1674 1677 1708 1724 1737 1767 1787 1796 1797 1804 1805 1818 1830 1834 1835 1837 1843 1844 1850 1860 1868 1901 1923 1979 1985 1987 1997 2004 2012 2026 2036 2041 2059 2064 2070 2112 2121 2131 2157 2165 2203 2220 2223 2227 2228 2236 2245 2273 2278 2282 2285 2295 2303 2311 2322 2349 2355 2372 2382 2407 2431 2447 2454 2456 2462 2506 2507 2521 2530 2535 2536 2541 2542 2562 2588 2601 2614 2661 2666 2668 2674 2686 2697 2777 2791 2796 2799 2802 2815 2818 2843 2856 2890 2892 2905 2909 2913 2919 2927 2930 2953 2976 2988 3005 3006 3031 3035 3037 3055 3057 3064 3102 3111 3120 3147 3148 3164 3167 3176 3197 3249 3285 3287 3298 3302 3322 3329 3333 3352 3377 3394 3397 3408 3411 3420 3421 3451 3455 3457 3458 3476 3494 3502 3504 3513 3517 3519 3536 3548 3550 3570 3579 3593 3595 3599 3607 3611 3642 3646 3647 3678 3688 3690 3691 3703 3705 3714 3722 3744 3746 3753 3757 3785 3796 3797 3801 3830 3831 3832 3838 3841 3876 3905 3908 3909 3919 3923 3929 3957 3960 3983 3997 4009 4031 4032 4034 4037 4039 4041 4049 4057 4059 4077 4080 4082 4093 4095 4096 4099 4112 4123 4129 4130 4136 4137 4148 4154 4161 4163 4169 4171 4172 4181 4185 4189 4192 4197 4212 4218 4222 4226 4251 4260 4266 4267 4269 4273 4289 4291 4301 4305 4312 4319 4322 4352 4357 4373 4383 4390 4391 4404 4432 4447 4467 4470 4479 4482 4489 4496 4505 4506 4515 4520 4523 4527 4532 4542 4545 4555 4563 4567 4601 4603 4608 4611 4613 4616 4617 4621 4622 4626 4641 4664 4666 4682 4697 4700 4708 4710 4727 4730 4745 4748 4752 4759 4764 4772 4779 4790 4801 4808 4814 4824 4849 4856 4858 4870 4876 4879 4897 4900 4913 4916 4924 4939 4942 4952 4959 4961 4964 4989 4992 4995 132 301 312 402 412 458 667 1051 1106 1286 1301 1320 1658 1691 1716 1748 1791 1836 2010 2056 2146 2175 2453 2502 2669 2717 2730 2746 2779 2781 2862 2952 3041 3190 3277 3330 3410 3560 3576 3662 3748 3749 4024 4124 4173 4224 4225 4245 4341 4434 4632 4649 4712 4896 4954 ATTGGG/CCCAAT 0 -5 351 339 105 -31.2 19 24 47 56 112 114 123 138 146 154 173 222 243 248 253 270 273 288 296 302 324 360 363 380 383 386 389 390 391 417 418 423 431 448 456 465 467 470 474 488 518 535 572 580 609 617 669 686 698 715 729 740 746 771 785 803 850 855 895 944 956 971 974 978 1029 1031 1037 1038 1042 1047 1052 1080 1093 1148 1149 1150 1154 1161 1179 1208 1269 1285 1294 1301 1310 1332 1361 1365 1367 1380 1387 1389 1390 1413 1421 1454 1469 1481 1498 1502 1507 1511 1535 1537 1553 1611 1647 1691 1701 1707 1763 1789 1797 1798 1817 1830 1832 1878 1911 1947 1960 1987 1992 1997 2004 2012 2016 2028 2034 2060 2094 2128 2151 2158 2159 2162 2169 2170 2193 2196 2199 2232 2278 2289 2316 2322 2323 2382 2419 2440 2454 2462 2482 2497 2507 2515 2524 2535 2573 2586 2593 2598 2625 2636 2645 2675 2687 2692 2753 2764 2767 2791 2792 2818 2820 2836 2844 2905 2907 2911 2914 2920 2927 2953 3006 3024 3037 3055 3068 3087 3091 3094 3125 3127 3139 3148 3164 3166 3170 3177 3214 3216 3227 3229 3249 3255 3262 3272 3279 3285 3294 3309 3329 3330 3337 3344 3352 3375 3377 3380 3408 3420 3427 3435 3451 3477 3487 3502 3512 3513 3519 3530 3536 3545 3548 3550 3576 3593 3630 3638 3642 3645 3646 3662 3681 3691 3703 3715 3718 3719 3750 3757 3758 3796 3813 3830 3846 3872 3897 3942 3949 3982 3983 4014 4032 4033 4036 4037 4039 4041 4057 4061 4074 4084 4095 4096 4099 4117 4123 4130 4146 4161 4171 4192 4221 4222 4229 4251 4266 4289 4291 4305 4322 4324 4338 4349 4356 4373 4379 4383 4404 4424 4436 4446 4447 4467 4482 4483 4489 4492 4505 4506 4509 4527 4542 4559 4560 4563 4586 4594 4600 4601 4603 4612 4613 4614 4616 4617 4634 4639 4643 4675 4682 4693 4713 4727 4775 4779 4875 4879 4881 4899 4900 4913 4915 4934 4946 4966 4977 4988 4997 25 65 107 166 277 321 331 368 540 558 621 745 748 791 889 1060 1112 1165 1201 1248 1286 1347 1376 1439 1460 1545 1594 1649 1667 1677 1691 1715 1737 1745 1771 1836 1844 1855 1890 1942 2020 2026 2056 2065 2073 2087 2089 2113 2138 2153 2229 2297 2361 2374 2376 2475 2520 2612 2643 2668 2684 2779 2862 2889 2911 2952 3058 3128 3220 3245 3270 3274 3310 3327 3330 3345 3548 3560 3581 3587 3724 3755 3863 3871 3873 3886 3902 3969 3985 4024 4027 4148 4155 4173 4214 4314 4349 4435 4549 4649 4664 4791 4815 4886 4909 TGGACT/AGTCCA 0 -3 344 320 100 -29.1 9 42 60 65 73 77 96 104 116 117 214 215 232 239 275 310 319 332 343 361 415 434 441 490 504 517 519 522 526 536 542 551 552 558 560 571 573 588 622 625 634 640 661 665 671 683 752 785 794 810 811 840 849 861 869 875 881 921 923 926 945 1006 1019 1020 1025 1030 1051 1061 1092 1094 1098 1100 1170 1221 1229 1239 1259 1278 1294 1310 1396 1474 1477 1483 1501 1502 1509 1527 1557 1616 1631 1635 1649 1657 1664 1666 1682 1695 1726 1751 1754 1755 1764 1770 1774 1780 1818 1871 1935 1962 1963 1995 2002 2020 2073 2108 2112 2123 2142 2152 2159 2226 2260 2274 2290 2311 2321 2337 2357 2364 2391 2399 2409 2419 2430 2448 2449 2484 2487 2498 2501 2517 2521 2527 2545 2551 2552 2571 2586 2589 2590 2596 2633 2652 2664 2667 2674 2682 2695 2707 2717 2718 2720 2738 2742 2821 2864 2868 2881 2885 2890 2891 2895 2908 2928 2959 2962 2987 3014 3021 3024 3063 3088 3108 3116 3132 3138 3142 3145 3155 3177 3199 3208 3224 3227 3237 3255 3276 3307 3312 3315 3317 3353 3359 3368 3373 3395 3442 3451 3484 3485 3487 3491 3499 3538 3548 3550 3564 3566 3580 3585 3600 3601 3609 3630 3655 3656 3672 3676 3696 3712 3715 3723 3734 3753 3756 3764 3771 3777 3778 3781 3789 3790 3792 3795 3800 3806 3821 3829 3842 3848 3851 3854 3857 3883 3893 3894 3921 3975 3983 4002 4008 4013 4015 4026 4073 4082 4085 4120 4179 4197 4206 4225 4235 4239 4245 4247 4252 4253 4261 4277 4288 4290 4292 4298 4300 4303 4318 4320 4350 4353 4359 4364 4375 4382 4387 4413 4415 4426 4436 4477 4486 4487 4488 4491 4511 4527 4534 4548 4550 4553 4566 4573 4605 4610 4620 4647 4662 4668 4674 4680 4690 4700 4720 4724 4740 4744 4768 4812 4829 4852 4874 4884 4888 4889 4898 4901 4912 4927 4953 4956 4970 4972 4988 9 25 34 45 70 141 312 315 371 413 419 444 456 570 756 861 884 968 1037 1044 1070 1205 1266 1389 1457 1487 1601 1635 1665 1666 1747 1779 1839 1841 1877 1888 2172 2189 2309 2357 2366 2373 2415 2460 2495 2560 2603 2642 2672 2689 2750 2789 2802 2808 2814 2854 2871 2895 2897 2900 2924 2969 3135 3359 3426 3517 3563 3579 3583 3709 3727 3827 3888 4038 4117 4151 4254 4276 4281 4301 4316 4343 4400 4401 4407 4415 4504 4569 4587 4601 4639 4644 4713 4772 4794 4897 4905 4980 4982 4993 GTGGTC/GACCAC 0 -4 313 317 57 -46.7 0 6 35 41 49 75 108 110 113 125 152 162 169 172 181 183 187 191 204 205 209 217 270 301 352 355 371 381 420 427 436 441 443 448 504 507 519 528 554 598 601 626 642 653 778 782 804 819 821 839 843 862 884 897 908 918 999 1017 1023 1026 1027 1045 1064 1075 1111 1164 1167 1169 1173 1186 1207 1218 1239 1242 1246 1266 1283 1292 1305 1312 1331 1354 1376 1377 1403 1444 1490 1493 1500 1546 1613 1616 1618 1634 1645 1648 1652 1661 1668 1688 1705 1709 1726 1764 1782 1795 1799 1816 1828 1867 1891 1947 1949 1954 1957 1980 1985 2000 2001 2054 2068 2080 2097 2100 2110 2119 2124 2144 2147 2149 2161 2163 2186 2197 2198 2212 2224 2242 2251 2262 2289 2313 2321 2334 2342 2377 2406 2437 2452 2453 2459 2474 2475 2491 2509 2527 2529 2537 2542 2550 2569 2570 2571 2582 2585 2587 2597 2601 2603 2611 2619 2678 2702 2703 2705 2706 2765 2770 2793 2807 2855 2872 2884 2916 2947 3003 3015 3033 3048 3074 3075 3090 3094 3098 3103 3123 3133 3142 3171 3193 3207 3226 3230 3258 3267 3292 3316 3344 3349 3374 3450 3481 3501 3552 3560 3564 3582 3596 3602 3609 3615 3629 3649 3673 3699 3708 3717 3730 3736 3759 3771 3779 3792 3806 3824 3825 3834 3835 3837 3867 3922 3931 3952 3971 3972 3991 3999 4004 4015 4039 4054 4105 4108 4115 4170 4176 4178 4189 4190 4196 4203 4217 4244 4255 4261 4263 4264 4273 4281 4325 4350 4376 4377 4385 4403 4409 4416 4431 4434 4445 4448 4462 4465 4468 4469 4495 4500 4514 4517 4552 4564 4575 4587 4630 4688 4695 4698 4721 4762 4786 4788 4829 4842 4862 4885 4905 4928 4932 4938 4951 4954 4981 4982 77 245 358 494 594 703 838 910 922 976 1000 1075 1111 1212 1327 1462 1507 1524 1594 1636 1673 1684 1728 1817 2058 2140 2195 2229 2290 2294 2434 2496 2655 2764 2883 2967 3070 3233 3275 3419 3621 3676 3704 3784 3800 4058 4080 4129 4343 4391 4590 4662 4706 4750 4768 4803 4946 GACCGG/CCGGTC 1 -2 292 306 38 -55.3 0 8 12 21 115 177 187 194 208 211 219 224 238 248 260 292 307 309 316 329 374 381 388 396 399 404 414 439 442 445 458 476 484 489 509 529 530 539 551 553 555 575 579 614 617 630 655 682 685 707 718 756 765 780 807 850 873 883 911 918 935 948 950 959 969 977 987 1011 1054 1059 1099 1107 1127 1135 1196 1211 1221 1223 1224 1248 1265 1284 1325 1333 1346 1362 1371 1380 1399 1416 1436 1438 1443 1478 1479 1505 1524 1547 1553 1561 1573 1574 1585 1589 1619 1659 1668 1687 1689 1709 1715 1748 1771 1779 1785 1826 1834 1858 1862 1867 1888 1891 1910 1922 1923 1930 1936 1939 1942 1961 1971 2020 2027 2035 2071 2108 2111 2168 2184 2187 2192 2247 2250 2256 2263 2289 2292 2329 2370 2436 2440 2442 2445 2463 2477 2485 2490 2502 2563 2568 2597 2606 2609 2615 2653 2669 2674 2699 2728 2757 2797 2824 2825 2865 2882 2906 2909 2911 2942 2951 2995 3000 3011 3020 3027 3028 3034 3059 3071 3096 3111 3112 3118 3144 3161 3264 3281 3330 3336 3348 3387 3391 3433 3446 3452 3475 3488 3503 3505 3511 3513 3518 3524 3531 3537 3546 3574 3584 3590 3611 3652 3654 3657 3684 3710 3739 3760 3763 3787 3788 3794 3871 3878 3898 3911 3916 3918 3956 3968 3980 3984 3991 4000 4030 4063 4070 4092 4141 4168 4174 4198 4228 4230 4280 4281 4289 4310 4337 4339 4397 4438 4461 4462 4464 4465 4472 4504 4508 4553 4585 4590 4602 4606 4624 4630 4656 4660 4673 4684 4696 4734 4741 4757 4794 4803 4834 4895 4929 4942 4953 4958 4959 29 33 331 388 400 430 749 922 1056 1114 1173 1200 1396 1473 1779 1787 1865 1955 2004 2139 2160 2246 2267 2344 2633 2802 2829 2980 3569 3709 3786 3864 3979 4005 4273 4719 4829 4921 GACCCA/TGGGTC 1 -2 292 292 78 -31.4 16 17 23 24 45 47 57 73 114 121 123 128 138 165 182 248 270 273 280 295 333 342 363 378 395 397 455 473 486 488 497 524 530 535 567 572 580 584 617 627 641 655 677 701 715 761 796 809 830 874 880 951 956 960 963 974 981 997 1026 1029 1046 1137 1174 1201 1222 1270 1299 1306 1310 1321 1405 1416 1435 1505 1523 1536 1548 1567 1570 1587 1599 1609 1624 1636 1671 1682 1705 1713 1714 1721 1727 1730 1738 1766 1767 1784 1791 1812 1821 1827 1829 1832 1873 1899 1911 1915 1931 1956 1966 1972 1987 1998 1999 2001 2026 2028 2034 2052 2060 2086 2128 2131 2146 2174 2198 2199 2255 2269 2278 2279 2298 2303 2319 2329 2362 2366 2460 2473 2494 2497 2515 2559 2564 2574 2591 2598 2625 2631 2705 2716 2748 2752 2763 2770 2805 2820 2846 2858 2877 2904 2912 2948 2953 2960 2970 2986 2992 3023 3052 3081 3101 3118 3179 3209 3214 3251 3255 3275 3305 3309 3337 3339 3355 3370 3375 3386 3387 3398 3400 3405 3442 3467 3472 3497 3515 3519 3533 3555 3568 3576 3583 3623 3630 3641 3657 3679 3681 3700 3704 3724 3731 3741 3758 3782 3802 3804 3824 3832 3843 3847 3850 3856 3863 3913 3935 3946 3963 4007 4021 4022 4059 4084 4097 4099 4117 4118 4119 4121 4144 4158 4171 4217 4218 4229 4240 4260 4265 4275 4301 4305 4308 4316 4349 4376 4416 4424 4466 4506 4519 4523 4542 4554 4569 4573 4583 4588 4597 4648 4664 4691 4713 4714 4733 4735 4753 4756 4757 4796 4817 4833 4839 4845 4850 4857 4870 4897 4914 4941 4950 4961 4974 4997 35 42 45 60 193 268 322 399 406 470 488 499 541 665 696 701 732 787 889 1137 1350 1378 1481 1492 1561 1649 1717 1777 1890 1914 1976 2052 2053 2086 2150 2180 2181 2263 2267 2275 2339 2405 2494 2497 2612 2684 2711 2718 2746 2786 2803 2811 3111 3128 3211 3236 3261 3297 3391 3397 3413 3551 3571 3604 3721 3745 3804 3924 3961 3969 4104 4258 4299 4604 4625 4791 4870 4887 GTCCTT/AAGGAC 0 -1 265 273 73 -29.4 2 6 7 12 61 82 85 96 115 125 134 142 172 212 219 233 241 261 272 286 290 333 338 368 388 442 505 527 542 548 603 620 629 644 653 654 663 704 715 725 736 765 769 783 853 864 878 879 891 916 919 962 974 1023 1028 1054 1070 1128 1142 1155 1173 1174 1212 1240 1244 1259 1260 1280 1297 1307 1351 1369 1416 1432 1449 1468 1480 1484 1495 1536 1574 1593 1617 1627 1653 1654 1706 1756 1765 1782 1812 1820 1839 1867 1890 1894 1905 1914 1919 1930 1935 1953 1956 1960 1971 1977 2026 2027 2028 2036 2051 2054 2060 2078 2124 2130 2136 2147 2169 2206 2209 2219 2249 2284 2310 2318 2384 2396 2404 2444 2450 2477 2481 2487 2491 2502 2534 2554 2581 2591 2604 2621 2639 2681 2688 2689 2705 2772 2840 2847 2855 2893 2897 2915 2942 2984 2996 3022 3034 3051 3103 3209 3226 3257 3271 3282 3293 3326 3328 3332 3367 3383 3405 3442 3444 3461 3467 3481 3552 3573 3579 3582 3602 3683 3685 3699 3818 3826 3835 3842 3850 3853 3862 3867 3881 3885 3927 3931 3953 3958 4024 4092 4101 4104 4108 4127 4135 4145 4158 4166 4173 4207 4217 4223 4249 4260 4285 4310 4325 4331 4408 4445 4452 4455 4515 4521 4529 4539 4568 4583 4585 4601 4605 4632 4642 4646 4659 4661 4667 4672 4675 4677 4690 4713 4719 4722 4733 4771 4776 4786 4789 4795 4805 4807 4810 4827 4862 4868 4887 4907 4928 4944 4965 4985 4994 120 157 261 283 372 450 539 567 592 684 687 717 764 849 936 963 974 1269 1283 1408 1658 1787 1796 1999 2011 2149 2150 2195 2275 2383 2462 2520 2532 2586 2633 2640 2997 3001 3065 3070 3113 3181 3200 3258 3340 3344 3387 3400 3450 3456 3513 3555 3570 3620 3633 3637 3807 3865 3971 4104 4306 4379 4396 4416 4572 4631 4682 4712 4717 4773 4819 4987 4990 GGGCCT/AGGCCC 0 -2 325 263 26 -52.4 19 264 302 363 390 391 392 393 418 423 426 461 493 499 520 555 669 757 770 771 785 840 847 866 901 944 964 978 1004 1018 1022 1033 1037 1044 1048 1093 1119 1160 1176 1177 1203 1213 1236 1255 1256 1282 1285 1303 1357 1365 1379 1388 1408 1442 1481 1498 1504 1526 1540 1577 1579 1587 1637 1663 1699 1722 1731 1757 1773 1811 1842 1843 1875 1892 1911 1921 1968 1985 2006 2044 2048 2058 2065 2083 2098 2109 2128 2143 2158 2159 2178 2189 2213 2232 2237 2296 2311 2318 2372 2388 2393 2420 2436 2440 2444 2449 2461 2474 2486 2507 2515 2526 2534 2562 2570 2573 2586 2617 2625 2636 2658 2665 2675 2680 2698 2704 2743 2784 2797 2820 2841 2876 2905 2913 2938 2950 2953 2957 2961 2985 2991 3037 3047 3057 3065 3068 3077 3086 3152 3197 3219 3229 3241 3272 3300 3318 3319 3322 3337 3351 3352 3372 3376 3377 3380 3421 3424 3425 3429 3449 3458 3460 3463 3477 3479 3488 3512 3516 3517 3525 3542 3543 3548 3549 3574 3576 3580 3587 3594 3630 3638 3645 3658 3664 3678 3688 3691 3696 3703 3722 3725 3732 3738 3747 3767 3786 3801 3802 3813 3831 3832 3839 3856 3857 3866 3869 3872 3896 3929 3942 3952 3971 3976 3997 4031 4032 4039 4057 4080 4088 4091 4096 4107 4123 4131 4136 4139 4148 4156 4180 4185 4204 4212 4224 4236 4245 4246 4266 4267 4285 4302 4303 4304 4306 4337 4340 4354 4356 4357 4366 4379 4383 4390 4391 4398 4427 4442 4446 4449 4475 4482 4483 4489 4492 4496 4505 4514 4519 4520 4523 4530 4532 4549 4561 4594 4595 4597 4603 4613 4621 4623 4626 4628 4641 4644 4651 4664 4666 4678 4699 4713 4720 4730 4784 4802 4814 4844 4847 4864 4867 4879 4900 4913 4915 4917 4920 4924 4957 4966 4973 4975 4977 4978 4993 4997 412 449 731 791 823 884 981 1691 1716 1901 2010 2062 2229 2567 2612 2627 3110 3186 3274 3459 3500 3578 3689 4736 4865 4876 AGGCCC/GGGCCT 3 -2 325 263 26 -52.4 19 264 302 363 390 391 392 393 418 423 426 461 493 499 520 555 669 757 770 771 785 840 847 866 901 944 964 978 1004 1018 1022 1033 1037 1044 1048 1093 1119 1160 1176 1177 1203 1213 1236 1255 1256 1282 1285 1303 1357 1365 1379 1388 1408 1442 1481 1498 1504 1526 1540 1577 1579 1587 1637 1663 1699 1722 1731 1757 1773 1811 1842 1843 1875 1892 1911 1921 1968 1985 2006 2044 2048 2058 2065 2083 2098 2109 2128 2143 2158 2159 2178 2189 2213 2232 2237 2296 2311 2318 2372 2388 2393 2420 2436 2440 2444 2449 2461 2474 2486 2507 2515 2526 2534 2562 2570 2573 2586 2617 2625 2636 2658 2665 2675 2680 2698 2704 2743 2784 2797 2820 2841 2876 2905 2913 2938 2950 2953 2957 2961 2985 2991 3037 3047 3057 3065 3068 3077 3086 3152 3197 3219 3229 3241 3272 3300 3318 3319 3322 3337 3351 3352 3372 3376 3377 3380 3421 3424 3425 3429 3449 3458 3460 3463 3477 3479 3488 3512 3516 3517 3525 3542 3543 3548 3549 3574 3576 3580 3587 3594 3630 3638 3645 3658 3664 3678 3688 3691 3696 3703 3722 3725 3732 3738 3747 3767 3786 3801 3802 3813 3831 3832 3839 3856 3857 3866 3869 3872 3896 3929 3942 3952 3971 3976 3997 4031 4032 4039 4057 4080 4088 4091 4096 4107 4123 4131 4136 4139 4148 4156 4180 4185 4204 4212 4224 4236 4245 4246 4266 4267 4285 4302 4303 4304 4306 4337 4340 4354 4356 4357 4366 4379 4383 4390 4391 4398 4427 4442 4446 4449 4475 4482 4483 4489 4492 4496 4505 4514 4519 4520 4523 4530 4532 4549 4561 4594 4595 4597 4603 4613 4621 4623 4626 4628 4641 4644 4651 4664 4666 4678 4699 4713 4720 4730 4784 4802 4814 4844 4847 4864 4867 4879 4900 4913 4915 4917 4920 4924 4957 4966 4973 4975 4977 4978 4993 4997 412 449 731 791 823 884 981 1691 1716 1901 2010 2062 2229 2567 2612 2627 3110 3186 3274 3459 3500 3578 3689 4736 4865 4876 GGTCCG/CGGACC 0 -2 253 257 26 -50.7 0 6 8 17 41 43 91 99 108 187 208 253 260 307 309 377 381 384 396 414 440 475 489 524 551 554 596 626 643 655 656 661 678 711 738 761 781 793 809 821 860 883 893 897 908 917 958 975 980 987 999 1026 1027 1055 1068 1119 1148 1167 1184 1196 1210 1234 1248 1317 1348 1387 1402 1446 1469 1478 1492 1525 1540 1544 1550 1561 1569 1587 1589 1658 1682 1687 1709 1725 1727 1744 1779 1791 1856 1862 1934 1955 1971 1973 2003 2016 2028 2057 2084 2108 2184 2197 2204 2216 2223 2231 2250 2267 2268 2289 2291 2306 2316 2320 2326 2328 2331 2356 2392 2459 2460 2509 2524 2560 2587 2597 2611 2628 2629 2663 2686 2687 2705 2744 2750 2785 2812 2817 2818 2865 2880 2909 2910 2941 2947 2948 2957 3000 3008 3016 3038 3067 3070 3090 3091 3093 3133 3149 3235 3264 3281 3316 3332 3344 3363 3374 3382 3406 3408 3428 3450 3451 3505 3511 3519 3524 3574 3584 3585 3596 3609 3615 3662 3684 3693 3717 3760 3798 3816 3847 3871 3889 3911 3912 3915 3918 3968 3991 3992 3994 4024 4050 4056 4061 4064 4086 4090 4122 4132 4193 4195 4216 4221 4272 4380 4385 4391 4421 4441 4453 4462 4469 4472 4490 4500 4552 4553 4569 4624 4645 4650 4657 4665 4685 4687 4696 4714 4716 4735 4741 4746 4762 4788 4792 4816 4819 4838 4895 4934 4937 4945 4955 4959 33 488 504 508 561 1095 1660 1745 1779 1907 1946 2075 2328 2358 2461 2802 2980 3111 3124 3569 4125 4155 4267 4405 4590 4711 GGTCCG/CGGACC 1 -3 253 257 26 -50.7 0 6 8 17 41 43 91 99 108 187 208 253 260 307 309 377 381 384 396 414 440 475 489 524 551 554 596 626 643 655 656 661 678 711 738 761 781 793 809 821 860 883 893 897 908 917 958 975 980 987 999 1026 1027 1055 1068 1119 1148 1167 1184 1196 1210 1234 1248 1317 1348 1387 1402 1446 1469 1478 1492 1525 1540 1544 1550 1561 1569 1587 1589 1658 1682 1687 1709 1725 1727 1744 1779 1791 1856 1862 1934 1955 1971 1973 2003 2016 2028 2057 2084 2108 2184 2197 2204 2216 2223 2231 2250 2267 2268 2289 2291 2306 2316 2320 2326 2328 2331 2356 2392 2459 2460 2509 2524 2560 2587 2597 2611 2628 2629 2663 2686 2687 2705 2744 2750 2785 2812 2817 2818 2865 2880 2909 2910 2941 2947 2948 2957 3000 3008 3016 3038 3067 3070 3090 3091 3093 3133 3149 3235 3264 3281 3316 3332 3344 3363 3374 3382 3406 3408 3428 3450 3451 3505 3511 3519 3524 3574 3584 3585 3596 3609 3615 3662 3684 3693 3717 3760 3798 3816 3847 3871 3889 3911 3912 3915 3918 3968 3991 3992 3994 4024 4050 4056 4061 4064 4086 4090 4122 4132 4193 4195 4216 4221 4272 4380 4385 4391 4421 4441 4453 4462 4469 4472 4490 4500 4552 4553 4569 4624 4645 4650 4657 4665 4685 4687 4696 4714 4716 4735 4741 4746 4762 4788 4792 4816 4819 4838 4895 4934 4937 4945 4955 4959 33 488 504 508 561 1095 1660 1745 1779 1907 1946 2075 2328 2358 2461 2802 2980 3111 3124 3569 4125 4155 4267 4405 4590 4711 GGACCC/GGGTCC 0 -2 271 252 25 -50.1 17 23 44 114 125 128 153 165 261 273 278 312 333 342 380 419 455 473 486 524 528 575 603 606 627 629 655 683 688 701 715 738 747 761 775 809 838 866 874 956 963 981 997 1010 1028 1046 1053 1086 1121 1168 1174 1201 1215 1218 1219 1225 1243 1258 1299 1321 1347 1364 1398 1416 1435 1446 1469 1484 1503 1505 1536 1570 1587 1593 1599 1609 1639 1671 1682 1710 1713 1719 1727 1738 1739 1784 1791 1812 1821 1829 1832 1849 1852 1873 1887 1903 1944 1956 1959 1966 1972 1998 1999 2010 2028 2052 2060 2079 2086 2131 2146 2164 2176 2208 2215 2266 2269 2279 2301 2366 2367 2396 2430 2448 2460 2473 2478 2496 2497 2523 2537 2559 2564 2574 2591 2599 2631 2647 2705 2708 2714 2716 2763 2769 2833 2846 2858 2863 2877 2899 2904 2912 2948 2960 3062 3067 3081 3084 3089 3097 3101 3118 3179 3209 3211 3214 3251 3271 3303 3305 3309 3339 3356 3370 3386 3398 3451 3497 3515 3519 3539 3545 3555 3559 3641 3657 3700 3704 3724 3755 3802 3803 3816 3824 3832 3850 3853 3863 3871 3874 3882 3913 3935 3941 3946 3950 3963 4007 4022 4050 4056 4058 4084 4094 4097 4118 4144 4158 4173 4217 4229 4240 4260 4265 4268 4275 4308 4316 4349 4358 4380 4410 4458 4502 4506 4513 4519 4539 4552 4554 4581 4583 4597 4639 4648 4672 4688 4691 4703 4713 4714 4733 4735 4757 4773 4811 4817 4833 4839 4841 4845 4850 4853 4914 4941 4945 4950 4962 4969 4974 4989 76 193 429 488 889 935 1358 1470 1649 2086 2150 2275 2431 2432 2746 2803 3211 3397 3413 3617 3757 3804 4208 4620 4870 GGACCC/GGGTCC 1 -3 271 252 25 -50.1 17 23 44 114 125 128 153 165 261 273 278 312 333 342 380 419 455 473 486 524 528 575 603 606 627 629 655 683 688 701 715 738 747 761 775 809 838 866 874 956 963 981 997 1010 1028 1046 1053 1086 1121 1168 1174 1201 1215 1218 1219 1225 1243 1258 1299 1321 1347 1364 1398 1416 1435 1446 1469 1484 1503 1505 1536 1570 1587 1593 1599 1609 1639 1671 1682 1710 1713 1719 1727 1738 1739 1784 1791 1812 1821 1829 1832 1849 1852 1873 1887 1903 1944 1956 1959 1966 1972 1998 1999 2010 2028 2052 2060 2079 2086 2131 2146 2164 2176 2208 2215 2266 2269 2279 2301 2366 2367 2396 2430 2448 2460 2473 2478 2496 2497 2523 2537 2559 2564 2574 2591 2599 2631 2647 2705 2708 2714 2716 2763 2769 2833 2846 2858 2863 2877 2899 2904 2912 2948 2960 3062 3067 3081 3084 3089 3097 3101 3118 3179 3209 3211 3214 3251 3271 3303 3305 3309 3339 3356 3370 3386 3398 3451 3497 3515 3519 3539 3545 3555 3559 3641 3657 3700 3704 3724 3755 3802 3803 3816 3824 3832 3850 3853 3863 3871 3874 3882 3913 3935 3941 3946 3950 3963 4007 4022 4050 4056 4058 4084 4094 4097 4118 4144 4158 4173 4217 4229 4240 4260 4265 4268 4275 4308 4316 4349 4358 4380 4410 4458 4502 4506 4513 4519 4539 4552 4554 4581 4583 4597 4639 4648 4672 4688 4691 4703 4713 4714 4733 4735 4757 4773 4811 4817 4833 4839 4841 4845 4850 4853 4914 4941 4945 4950 4962 4969 4974 4989 76 193 429 488 889 935 1358 1470 1649 2086 2150 2275 2431 2432 2746 2803 3211 3397 3413 3617 3757 3804 4208 4620 4870 GGTCCC/GGGACC 0 -2 281 248 36 -41.5 44 63 109 118 149 202 260 267 278 280 301 320 331 352 363 381 454 528 540 588 595 605 632 707 729 733 792 793 797 818 874 930 948 950 981 993 997 1052 1062 1098 1114 1158 1167 1201 1215 1219 1263 1267 1294 1331 1341 1461 1466 1485 1487 1499 1514 1546 1553 1615 1620 1624 1632 1634 1650 1656 1668 1673 1688 1710 1733 1793 1797 1798 1806 1809 1826 1833 1849 1873 1936 1944 1947 1950 1962 1995 1999 2000 2016 2037 2060 2090 2100 2111 2120 2185 2187 2195 2197 2208 2225 2266 2271 2279 2305 2340 2348 2360 2361 2367 2385 2395 2411 2426 2428 2464 2473 2475 2496 2497 2518 2519 2523 2526 2537 2574 2608 2610 2620 2631 2676 2707 2732 2741 2752 2763 2764 2780 2822 2839 2842 2858 2877 2909 2911 2920 2921 2923 2930 2931 2954 2960 2975 3003 3007 3010 3013 3018 3046 3048 3062 3081 3087 3094 3098 3100 3101 3125 3143 3169 3184 3185 3206 3221 3230 3267 3305 3311 3353 3357 3369 3379 3398 3403 3417 3436 3437 3478 3482 3501 3503 3509 3533 3545 3554 3555 3557 3559 3564 3577 3598 3628 3640 3641 3689 3700 3704 3706 3707 3733 3735 3814 3818 3824 3836 3882 3917 3933 3935 3938 3940 3946 3961 3962 3963 3979 4001 4011 4022 4046 4074 4094 4133 4143 4144 4145 4150 4178 4189 4229 4240 4244 4265 4292 4293 4316 4337 4365 4377 4389 4394 4407 4417 4429 4468 4504 4513 4514 4517 4525 4575 4598 4661 4691 4693 4726 4746 4817 4833 4836 4850 4853 4861 4872 4890 4894 4923 4938 4941 4962 4969 193 318 358 429 817 889 931 938 1025 1121 1143 1286 1365 1376 1460 1718 1933 1977 2011 2086 2668 2707 2803 2832 3005 3062 3129 3260 3489 3617 3705 4052 4315 4362 4547 4983 GGTCCC/GGGACC 1 -3 281 248 36 -41.5 44 63 109 118 149 202 260 267 278 280 301 320 331 352 363 381 454 528 540 588 595 605 632 707 729 733 792 793 797 818 874 930 948 950 981 993 997 1052 1062 1098 1114 1158 1167 1201 1215 1219 1263 1267 1294 1331 1341 1461 1466 1485 1487 1499 1514 1546 1553 1615 1620 1624 1632 1634 1650 1656 1668 1673 1688 1710 1733 1793 1797 1798 1806 1809 1826 1833 1849 1873 1936 1944 1947 1950 1962 1995 1999 2000 2016 2037 2060 2090 2100 2111 2120 2185 2187 2195 2197 2208 2225 2266 2271 2279 2305 2340 2348 2360 2361 2367 2385 2395 2411 2426 2428 2464 2473 2475 2496 2497 2518 2519 2523 2526 2537 2574 2608 2610 2620 2631 2676 2707 2732 2741 2752 2763 2764 2780 2822 2839 2842 2858 2877 2909 2911 2920 2921 2923 2930 2931 2954 2960 2975 3003 3007 3010 3013 3018 3046 3048 3062 3081 3087 3094 3098 3100 3101 3125 3143 3169 3184 3185 3206 3221 3230 3267 3305 3311 3353 3357 3369 3379 3398 3403 3417 3436 3437 3478 3482 3501 3503 3509 3533 3545 3554 3555 3557 3559 3564 3577 3598 3628 3640 3641 3689 3700 3704 3706 3707 3733 3735 3814 3818 3824 3836 3882 3917 3933 3935 3938 3940 3946 3961 3962 3963 3979 4001 4011 4022 4046 4074 4094 4133 4143 4144 4145 4150 4178 4189 4229 4240 4244 4265 4292 4293 4316 4337 4365 4377 4389 4394 4407 4417 4429 4468 4504 4513 4514 4517 4525 4575 4598 4661 4691 4693 4726 4746 4817 4833 4836 4850 4853 4861 4872 4890 4894 4923 4938 4941 4962 4969 193 318 358 429 817 889 931 938 1025 1121 1143 1286 1365 1376 1460 1718 1933 1977 2011 2086 2668 2707 2803 2832 3005 3062 3129 3260 3489 3617 3705 4052 4315 4362 4547 4983 CCACGT/ACGTGG 2 -1 261 243 60 -28.2 42 55 67 80 84 111 117 133 142 164 205 218 219 223 250 312 318 340 379 522 564 644 651 686 706 723 762 766 808 839 840 843 965 997 1001 1010 1019 1026 1046 1056 1072 1093 1097 1170 1174 1188 1204 1213 1227 1244 1267 1294 1310 1385 1388 1393 1413 1415 1424 1449 1467 1486 1505 1517 1551 1564 1579 1609 1610 1613 1617 1636 1679 1680 1682 1686 1693 1725 1743 1746 1754 1766 1806 1866 1868 1869 1894 1896 1946 1958 1983 1987 1999 2009 2056 2062 2095 2100 2109 2113 2127 2131 2182 2197 2220 2426 2433 2435 2455 2466 2467 2530 2540 2558 2560 2571 2574 2685 2705 2706 2707 2730 2733 2778 2789 2790 2810 2813 2836 2841 2846 2848 2853 2873 2890 2894 2912 2946 2960 2963 2970 2975 2978 2983 2989 3010 3030 3035 3046 3052 3077 3081 3090 3116 3126 3135 3156 3172 3190 3203 3233 3246 3258 3292 3312 3325 3340 3346 3349 3354 3365 3378 3385 3423 3432 3434 3437 3441 3471 3496 3522 3537 3544 3573 3622 3625 3662 3682 3688 3690 3696 3720 3737 3743 3756 3890 3937 3946 3954 3961 3972 4035 4047 4071 4073 4079 4083 4084 4094 4102 4109 4135 4140 4152 4175 4199 4217 4240 4256 4297 4319 4325 4349 4370 4375 4380 4386 4392 4401 4426 4436 4459 4461 4477 4504 4507 4514 4536 4560 4589 4628 4634 4676 4691 4692 4703 4720 4735 4760 4796 4802 4812 4839 4841 4871 4882 4893 4913 4941 4960 4990 45 278 399 437 453 468 536 613 857 909 921 1085 1126 1207 1209 1286 1335 1398 1457 1532 1561 1593 1673 1738 1865 2037 2122 2217 2247 2261 2291 2485 2550 2612 2737 2740 2764 2956 3008 3153 3229 3250 3254 3289 3331 3458 3602 3741 3751 3771 3855 3896 4129 4158 4172 4537 4719 4882 4954 4966 GGACCT/AGGTCC 0 -2 260 235 41 -35.4 42 118 137 154 187 204 223 236 254 268 272 290 315 384 401 443 453 454 475 487 521 535 549 628 661 678 681 684 711 733 776 845 860 879 893 913 916 962 975 1082 1087 1112 1204 1232 1234 1244 1267 1285 1332 1382 1406 1420 1430 1439 1457 1495 1499 1526 1529 1557 1581 1583 1587 1604 1620 1624 1632 1681 1687 1746 1760 1795 1801 1807 1809 1813 1815 1823 1873 1895 1914 1945 1975 2003 2005 2051 2060 2070 2085 2121 2155 2157 2173 2180 2184 2192 2216 2254 2268 2279 2304 2316 2318 2319 2320 2321 2326 2348 2350 2356 2379 2385 2388 2392 2426 2428 2429 2444 2486 2518 2526 2543 2553 2608 2617 2665 2676 2687 2707 2719 2741 2754 2770 2785 2812 2832 2847 2880 2884 2897 2898 2923 2942 2949 2952 2954 2975 2984 2990 3013 3023 3046 3062 3070 3078 3093 3100 3104 3105 3136 3142 3149 3184 3190 3195 3199 3201 3205 3248 3257 3262 3274 3277 3286 3318 3324 3332 3335 3353 3388 3408 3434 3467 3480 3491 3509 3520 3524 3551 3553 3563 3573 3589 3634 3725 3733 3770 3783 3791 3816 3836 3849 3908 3912 3926 3933 3938 3977 3992 4028 4029 4045 4068 4069 4076 4116 4119 4133 4145 4147 4148 4183 4242 4249 4292 4323 4360 4367 4391 4419 4432 4455 4517 4553 4556 4569 4591 4598 4608 4612 4632 4645 4659 4661 4705 4715 4722 4746 4749 4812 4836 4838 4843 4868 4895 4903 4906 4954 4984 4999 275 364 431 561 687 696 898 939 1025 1035 1121 1460 1718 1907 1933 1946 1977 2011 2093 2383 2461 2832 2997 3146 3263 3489 3608 3623 3689 4029 4267 4362 4405 4406 4531 4547 4577 4648 4711 4843 4964 GACCGT/ACGGTC 1 -2 196 227 50 -29.1 5 11 15 17 29 30 82 95 110 145 148 149 197 200 219 232 240 256 276 301 310 346 348 364 385 403 421 429 451 456 482 534 591 604 626 663 697 749 768 784 800 828 836 865 896 903 907 911 913 930 941 965 1002 1021 1052 1068 1075 1084 1097 1102 1123 1128 1139 1141 1144 1167 1180 1184 1201 1221 1260 1279 1316 1349 1355 1362 1441 1450 1494 1534 1595 1598 1640 1649 1680 1709 1711 1712 1714 1789 1796 1806 1848 1858 1912 1917 1941 1959 1960 1995 2008 2055 2084 2122 2136 2160 2168 2200 2202 2240 2267 2339 2397 2404 2417 2418 2450 2465 2466 2561 2585 2604 2627 2646 2663 2681 2744 2748 2752 2759 2760 2794 2809 2826 2853 2894 2919 3009 3039 3071 3077 3084 3115 3131 3191 3202 3204 3234 3239 3291 3366 3459 3489 3510 3537 3550 3588 3680 3799 3836 3848 3861 3892 3907 3911 3944 3961 4128 4226 4285 4439 4455 4469 4551 4578 4584 4586 4619 4663 4665 4683 4708 4781 4792 4819 4841 4861 4893 4894 4921 4927 4945 4965 4984 4986 4991 2 12 261 288 304 508 558 567 705 890 1026 1095 1143 1320 1331 1359 1455 1522 1523 1778 1791 1921 2145 2154 2185 2258 2270 2302 2650 2829 2971 2980 2994 3051 3124 3202 3340 3406 3678 3695 3705 3789 3904 4018 4346 4434 4812 4875 4983 4989 GGGCCA/TGGCCC 0 -2 255 222 35 -35.6 24 75 108 123 133 135 138 210 258 316 340 360 383 423 425 426 441 476 513 621 625 677 698 709 794 803 897 902 926 971 1029 1038 1105 1114 1119 1132 1146 1160 1179 1198 1199 1202 1239 1282 1310 1332 1337 1389 1408 1421 1444 1460 1507 1528 1572 1637 1646 1647 1702 1707 1745 1750 1757 1773 1783 1789 1799 1838 1918 1920 1925 1969 2017 2022 2034 2047 2083 2087 2109 2132 2166 2168 2181 2199 2222 2228 2237 2245 2250 2318 2331 2332 2349 2352 2362 2382 2409 2432 2441 2514 2532 2535 2543 2558 2573 2593 2622 2662 2676 2692 2721 2722 2729 2781 2782 2806 2816 2837 2925 2935 2943 2949 2961 2982 2985 3029 3053 3068 3073 3083 3108 3118 3119 3127 3138 3139 3167 3177 3182 3243 3310 3360 3365 3389 3408 3420 3421 3481 3483 3484 3514 3547 3569 3593 3595 3597 3627 3638 3643 3646 3669 3681 3692 3718 3723 3728 3738 3773 3797 3809 3876 3922 3923 3924 3928 3971 3982 4019 4036 4071 4077 4107 4145 4152 4164 4181 4182 4213 4222 4227 4238 4294 4303 4305 4309 4322 4366 4379 4384 4386 4393 4395 4427 4440 4447 4449 4492 4503 4527 4530 4535 4537 4538 4543 4545 4550 4555 4561 4572 4580 4586 4592 4594 4614 4616 4618 4627 4634 4641 4651 4682 4686 4703 4708 4709 4725 4727 4743 4769 4771 4779 4782 4820 4824 4825 4828 4898 4920 4934 4936 4940 4967 4977 4978 4998 102 347 413 502 869 882 918 1080 1277 1301 1440 1467 1702 1865 2089 2195 2669 2704 2736 2868 2888 2980 3118 3558 3776 3804 3828 3918 4208 4253 4563 4614 4812 4817 4865 TGACCG/CGGTCA 1 -3 193 221 45 -30.1 11 12 15 17 22 81 95 110 121 177 208 211 215 238 240 248 250 276 301 303 310 316 329 364 399 411 456 472 509 529 530 539 575 611 614 617 630 712 749 784 836 883 899 907 950 969 977 987 1015 1054 1075 1099 1116 1126 1130 1131 1144 1158 1179 1180 1197 1221 1234 1309 1316 1346 1349 1362 1371 1386 1436 1438 1478 1489 1524 1534 1553 1561 1573 1623 1640 1662 1689 1715 1728 1785 1786 1796 1834 1858 1867 1917 1923 1928 1939 1941 1961 2008 2027 2168 2172 2184 2187 2192 2200 2209 2240 2256 2288 2303 2377 2395 2417 2436 2440 2445 2446 2465 2477 2485 2490 2568 2669 2674 2728 2766 2784 2794 2894 2906 2951 3034 3039 3040 3077 3084 3112 3118 3202 3204 3221 3256 3259 3288 3303 3366 3433 3446 3452 3483 3510 3518 3537 3550 3611 3657 3739 3763 3787 3788 3794 3836 3848 3878 3892 3900 3911 3923 3944 3980 4000 4030 4092 4168 4228 4230 4339 4433 4455 4465 4508 4578 4590 4630 4673 4694 4696 4839 4893 4927 4942 4953 4963 7 135 304 331 430 623 703 721 749 1056 1065 1124 1331 1473 1522 1523 1682 1778 1779 2139 2145 2160 2185 2246 2258 2270 2650 2829 3626 3709 3862 3904 4005 4041 4047 4153 4190 4273 4303 4383 4434 4719 4829 4875 4921 GACCGA/TCGGTC 1 -2 191 211 54 -23.8 8 22 24 30 50 51 61 81 149 192 212 215 217 224 228 267 276 310 316 329 411 472 499 505 540 546 553 564 606 611 637 647 706 736 781 797 835 907 908 912 956 958 963 977 980 983 1009 1015 1095 1114 1126 1130 1140 1147 1148 1179 1192 1197 1239 1257 1276 1281 1409 1415 1461 1489 1513 1573 1579 1610 1623 1632 1654 1662 1684 1730 1770 1786 1797 1798 1800 1804 1834 1855 1857 1894 1909 1962 1971 1994 2019 2038 2063 2076 2130 2172 2182 2207 2209 2219 2224 2225 2238 2257 2270 2288 2303 2306 2347 2351 2374 2377 2394 2395 2410 2489 2568 2597 2608 2642 2683 2724 2734 2757 2766 2773 2784 2787 2834 2902 2909 2910 2923 2941 2964 2985 3040 3073 3091 3129 3143 3161 3221 3248 3256 3258 3259 3264 3288 3300 3308 3382 3406 3409 3445 3459 3483 3567 3613 3693 3818 3917 3994 4056 4080 4130 4139 4193 4207 4216 4293 4317 4365 4394 4407 4421 4451 4453 4499 4525 4596 4600 4687 4694 4696 4733 4799 4839 4844 4893 4963 7 13 61 68 103 135 150 154 192 233 623 703 721 761 792 908 931 1065 1083 1124 1320 1368 1377 1625 1682 1702 1718 1779 1817 1877 2011 2061 2516 2517 2546 2552 2691 2865 2929 3129 3222 3265 3626 3712 3862 4047 4125 4155 4190 4273 4383 4435 4920 4929 GGCCTT/AAGGCC 0 -1 250 208 38 -30.5 19 282 302 343 383 390 392 418 423 426 455 493 643 662 669 700 757 771 785 847 850 878 901 964 981 1025 1033 1037 1068 1093 1105 1176 1177 1203 1213 1218 1254 1256 1282 1285 1303 1357 1365 1388 1402 1504 1587 1608 1625 1626 1629 1637 1663 1696 1722 1757 1760 1767 1773 1811 1816 1892 1898 1911 1924 1988 1989 2023 2048 2109 2128 2143 2147 2158 2167 2178 2206 2216 2237 2304 2311 2349 2365 2372 2387 2390 2393 2403 2428 2436 2440 2449 2461 2467 2474 2515 2525 2526 2531 2539 2541 2557 2570 2573 2605 2617 2636 2642 2658 2659 2675 2704 2743 2802 2820 2905 2913 2950 2957 2968 2991 3044 3047 3065 3073 3100 3137 3153 3180 3229 3238 3241 3276 3300 3319 3351 3352 3372 3376 3380 3421 3424 3449 3458 3477 3516 3517 3526 3545 3548 3549 3567 3576 3580 3587 3594 3608 3624 3627 3630 3645 3678 3688 3691 3696 3703 3722 3732 3737 3767 3786 3795 3801 3802 3813 3820 3832 3856 3869 3870 3880 3886 3896 3942 3952 3964 3997 4031 4057 4066 4096 4122 4131 4185 4204 4212 4224 4236 4241 4267 4270 4295 4302 4304 4306 4340 4345 4368 4379 4398 4405 4427 4443 4483 4503 4505 4509 4519 4520 4523 4530 4549 4561 4574 4595 4607 4613 4628 4637 4654 4666 4673 4689 4699 4736 4755 4784 4790 4802 4864 4879 4884 4900 4913 4915 4920 4924 4957 4960 4975 8 307 388 686 694 741 884 887 1085 1105 1263 1661 2086 2229 2538 2563 2656 2673 2934 2996 3110 3143 3145 3201 3376 3459 3592 3829 3938 4073 4080 4192 4212 4267 4404 4839 4876 4961 AAGGCC/GGCCTT 3 -3 250 208 38 -30.5 19 282 302 343 383 390 392 418 423 426 455 493 643 662 669 700 757 771 785 847 850 878 901 964 981 1025 1033 1037 1068 1093 1105 1176 1177 1203 1213 1218 1254 1256 1282 1285 1303 1357 1365 1388 1402 1504 1587 1608 1625 1626 1629 1637 1663 1696 1722 1757 1760 1767 1773 1811 1816 1892 1898 1911 1924 1988 1989 2023 2048 2109 2128 2143 2147 2158 2167 2178 2206 2216 2237 2304 2311 2349 2365 2372 2387 2390 2393 2403 2428 2436 2440 2449 2461 2467 2474 2515 2525 2526 2531 2539 2541 2557 2570 2573 2605 2617 2636 2642 2658 2659 2675 2704 2743 2802 2820 2905 2913 2950 2957 2968 2991 3044 3047 3065 3073 3100 3137 3153 3180 3229 3238 3241 3276 3300 3319 3351 3352 3372 3376 3380 3421 3424 3449 3458 3477 3516 3517 3526 3545 3548 3549 3567 3576 3580 3587 3594 3608 3624 3627 3630 3645 3678 3688 3691 3696 3703 3722 3732 3737 3767 3786 3795 3801 3802 3813 3820 3832 3856 3869 3870 3880 3886 3896 3942 3952 3964 3997 4031 4057 4066 4096 4122 4131 4185 4204 4212 4224 4236 4241 4267 4270 4295 4302 4304 4306 4340 4345 4368 4379 4398 4405 4427 4443 4483 4503 4505 4509 4519 4520 4523 4530 4549 4561 4574 4595 4607 4613 4628 4637 4654 4666 4673 4689 4699 4736 4755 4784 4790 4802 4864 4879 4884 4900 4913 4915 4920 4924 4957 4960 4975 8 307 388 686 694 741 884 887 1085 1105 1263 1661 2086 2229 2538 2563 2656 2673 2934 2996 3110 3143 3145 3201 3376 3459 3592 3829 3938 4073 4080 4192 4212 4267 4404 4839 4876 4961 CTGGTC/GACCAG 0 -4 191 207 52 -23.8 6 11 20 27 31 79 98 120 149 170 180 183 186 195 212 252 257 262 267 271 287 320 341 360 402 432 467 531 546 548 565 582 588 620 643 736 762 812 815 820 860 871 914 930 953 993 1118 1145 1158 1190 1207 1267 1279 1291 1294 1297 1336 1352 1447 1464 1523 1542 1544 1576 1662 1707 1790 1793 1838 1856 1859 1884 1940 1959 2060 2113 2150 2154 2172 2186 2223 2231 2251 2291 2305 2309 2318 2331 2359 2377 2406 2438 2483 2486 2605 2651 2653 2686 2688 2689 2712 2802 2851 2899 2919 2962 2963 2969 3000 3038 3082 3103 3106 3137 3227 3228 3235 3319 3332 3382 3397 3399 3412 3428 3433 3444 3478 3482 3487 3554 3585 3602 3627 3665 3674 3762 3774 3794 3814 3826 3842 3852 3856 3873 3886 3888 3906 3931 3934 3958 3979 4024 4036 4040 4050 4064 4115 4132 4140 4149 4209 4219 4221 4282 4284 4322 4346 4398 4411 4429 4441 4452 4470 4585 4629 4650 4665 4706 4736 4739 4741 4750 4763 4795 4805 4807 4816 4865 4952 4959 4993 266 401 606 624 684 686 701 709 720 817 891 933 957 1035 1089 1216 1246 1248 1398 1548 1703 1930 2008 2181 2242 2328 2329 2719 2789 2802 2876 2921 3033 3094 3205 3387 3401 3425 3513 3637 3649 3738 4008 4202 4220 4309 4382 4417 4781 4808 4821 4983 ACCGGT/ACCGGT 1 -1 189 206 35 -31.7 0 8 12 21 41 56 115 158 176 248 260 273 292 309 329 374 381 404 445 458 484 489 509 525 530 555 617 630 651 655 682 756 759 873 883 935 942 948 950 969 977 1011 1054 1059 1099 1107 1135 1136 1164 1193 1209 1211 1248 1284 1371 1399 1416 1427 1429 1438 1443 1478 1483 1519 1524 1536 1573 1589 1656 1668 1715 1771 1785 1826 1858 1874 1888 1891 1908 1922 1923 1930 1939 2027 2035 2087 2108 2139 2178 2184 2187 2256 2262 2263 2276 2339 2343 2370 2436 2442 2445 2450 2463 2477 2490 2502 2563 2568 2590 2606 2609 2635 2653 2674 2715 2825 2865 2882 2906 2937 2940 2941 2951 3011 3020 3023 3027 3034 3058 3074 3144 3177 3330 3336 3391 3471 3518 3531 3537 3546 3574 3584 3611 3617 3656 3684 3752 3765 3787 3788 3791 3794 3851 3871 3916 3951 3968 3984 4030 4063 4092 4141 4168 4174 4228 4230 4281 4310 4339 4438 4462 4464 4465 4472 4504 4585 4606 4624 4656 4673 4696 4800 4803 4827 4837 4842 4929 4942 4976 8 143 230 289 849 916 922 1139 1173 1200 1220 1396 1409 1473 1631 1764 1769 1787 1798 1948 2480 2518 2604 2835 3274 3565 3566 3709 3905 4016 4237 4349 4759 4829 4921 TGGGAC/GTCCCA 0 -4 210 200 64 -18.0 44 96 118 157 165 169 189 203 238 278 331 334 335 341 381 389 392 400 421 451 466 518 588 605 629 640 641 671 793 797 867 950 971 993 997 1052 1114 1115 1139 1165 1201 1219 1233 1243 1258 1263 1267 1302 1304 1323 1359 1461 1472 1499 1514 1558 1571 1609 1614 1624 1656 1671 1673 1697 1731 1733 1751 1784 1797 1798 1809 1820 1849 1916 1944 1962 1992 1995 1999 2000 2037 2111 2132 2151 2193 2195 2208 2225 2279 2316 2340 2348 2360 2361 2367 2368 2426 2428 2473 2497 2519 2523 2526 2537 2574 2608 2620 2631 2676 2707 2732 2776 2858 2877 2880 2909 2921 2923 2930 2931 2960 2975 3007 3010 3013 3046 3070 3081 3087 3094 3098 3101 3134 3143 3216 3234 3267 3311 3330 3343 3379 3398 3417 3437 3482 3509 3510 3533 3540 3554 3564 3603 3606 3640 3659 3706 3733 3735 3749 3818 3895 3932 3935 3938 3940 3946 3957 3962 3963 4002 4011 4022 4068 4090 4094 4133 4144 4146 4229 4265 4282 4291 4316 4394 4407 4429 4461 4468 4500 4525 4537 4598 4661 4681 4691 4725 4751 4767 4817 4825 4833 4836 4838 4848 4872 4894 4902 4923 4941 4969 193 429 542 817 889 938 1143 1207 1365 1376 1427 1460 1508 1575 1580 1933 1950 1977 2048 2086 2311 2342 2346 2368 2405 2430 2505 2642 2665 2668 2734 2803 2910 3005 3062 3086 3129 3260 3310 3327 3450 3489 3496 3574 3585 3617 3668 3755 3787 3964 3978 4072 4124 4154 4300 4315 4333 4362 4413 4431 4547 4587 4764 4954 GTCCCA/TGGGAC 1 -2 210 200 64 -18.0 44 96 118 157 165 169 189 203 238 278 331 334 335 341 381 389 392 400 421 451 466 518 588 605 629 640 641 671 793 797 867 950 971 993 997 1052 1114 1115 1139 1165 1201 1219 1233 1243 1258 1263 1267 1302 1304 1323 1359 1461 1472 1499 1514 1558 1571 1609 1614 1624 1656 1671 1673 1697 1731 1733 1751 1784 1797 1798 1809 1820 1849 1916 1944 1962 1992 1995 1999 2000 2037 2111 2132 2151 2193 2195 2208 2225 2279 2316 2340 2348 2360 2361 2367 2368 2426 2428 2473 2497 2519 2523 2526 2537 2574 2608 2620 2631 2676 2707 2732 2776 2858 2877 2880 2909 2921 2923 2930 2931 2960 2975 3007 3010 3013 3046 3070 3081 3087 3094 3098 3101 3134 3143 3216 3234 3267 3311 3330 3343 3379 3398 3417 3437 3482 3509 3510 3533 3540 3554 3564 3603 3606 3640 3659 3706 3733 3735 3749 3818 3895 3932 3935 3938 3940 3946 3957 3962 3963 4002 4011 4022 4068 4090 4094 4133 4144 4146 4229 4265 4282 4291 4316 4394 4407 4429 4461 4468 4500 4525 4537 4598 4661 4681 4691 4725 4751 4767 4817 4825 4833 4836 4838 4848 4872 4894 4902 4923 4941 4969 193 429 542 817 889 938 1143 1207 1365 1376 1427 1460 1508 1575 1580 1933 1950 1977 2048 2086 2311 2342 2346 2368 2405 2430 2505 2642 2665 2668 2734 2803 2910 3005 3062 3086 3129 3260 3310 3327 3450 3489 3496 3574 3585 3617 3668 3755 3787 3964 3978 4072 4124 4154 4300 4315 4333 4362 4413 4431 4547 4587 4764 4954 CTGGAC/GTCCAG 0 -4 185 199 44 -25.5 27 43 69 72 77 96 110 128 151 156 166 178 181 239 257 262 267 273 283 341 348 443 470 487 504 551 554 571 575 582 588 601 640 677 680 684 723 725 779 795 805 841 845 861 887 927 961 1009 1025 1066 1108 1112 1134 1141 1196 1231 1232 1239 1258 1272 1321 1419 1502 1509 1517 1526 1596 1649 1710 1723 1754 1780 1799 1801 1813 1913 1931 1940 2016 2020 2035 2039 2052 2118 2140 2150 2152 2212 2232 2321 2339 2357 2398 2412 2437 2478 2486 2505 2545 2590 2601 2619 2624 2653 2678 2696 2716 2736 2759 2826 2851 2855 2885 2888 2904 2934 2937 3012 3015 3036 3116 3142 3151 3161 3170 3191 3192 3219 3223 3307 3312 3318 3368 3419 3430 3487 3526 3538 3569 3585 3601 3602 3612 3613 3631 3636 3656 3769 3775 3842 3856 3861 3901 3907 3950 4017 4069 4088 4184 4243 4290 4296 4303 4308 4310 4364 4405 4432 4439 4448 4473 4528 4576 4596 4605 4723 4742 4747 4863 4874 4896 4909 4972 4980 4990 63 189 312 431 456 562 570 684 825 898 1035 1162 1166 1195 1400 1438 1791 1796 1906 2154 2189 2270 2373 2383 2463 2552 2642 2814 2817 2983 3399 3410 3413 3583 4208 4248 4252 4254 4301 4304 4316 4531 4927 4969 CACGTG/CACGTG 2 0 194 196 40 -26.7 42 51 67 70 80 84 90 95 111 121 130 171 196 205 218 245 250 316 318 390 404 526 560 564 714 723 762 913 965 970 977 994 1010 1083 1093 1170 1174 1188 1204 1227 1267 1294 1310 1340 1343 1353 1362 1371 1411 1415 1424 1449 1467 1496 1546 1564 1587 1679 1684 1686 1754 1806 1833 1840 1864 1866 1869 1906 1954 1983 1999 2009 2013 2040 2056 2077 2100 2113 2127 2182 2189 2216 2220 2264 2279 2426 2435 2458 2466 2484 2530 2540 2560 2574 2619 2659 2685 2707 2730 2779 2793 2810 2811 2813 2841 2846 2884 2885 2912 2960 2965 2978 2983 2989 3010 3015 3035 3052 3077 3081 3090 3100 3114 3116 3135 3156 3172 3236 3246 3280 3292 3325 3340 3365 3423 3432 3434 3441 3471 3496 3537 3720 3737 3743 3746 3778 3782 3840 3914 3916 3937 3954 3961 4017 4035 4047 4049 4073 4084 4094 4098 4104 4109 4140 4175 4195 4238 4255 4370 4375 4386 4398 4401 4436 4459 4477 4514 4536 4598 4628 4634 4692 4703 4760 4787 4802 4812 4839 4841 4871 4943 4950 4985 4997 23 45 272 278 296 358 437 449 468 475 476 536 921 1126 1207 1209 1603 1634 1673 2202 2247 2261 2543 2638 2737 3125 3153 3229 3250 3324 3458 3550 3675 3751 4172 4380 4567 4600 4850 4944 GTGGGC/GCCCAC 0 -4 214 192 23 -35.5 22 42 48 122 124 147 302 402 405 411 441 500 536 544 586 625 635 678 686 696 698 711 739 759 791 840 948 958 982 1018 1022 1033 1152 1203 1213 1227 1232 1249 1256 1287 1298 1314 1378 1379 1391 1408 1465 1520 1546 1614 1731 1732 1741 1746 1778 1787 1796 1850 1881 1897 1919 1979 1981 1996 2017 2026 2047 2081 2087 2121 2127 2136 2143 2147 2199 2213 2216 2220 2276 2331 2349 2409 2431 2440 2441 2447 2501 2506 2530 2531 2538 2614 2622 2668 2685 2697 2698 2784 2802 2813 2818 2834 2836 2841 2856 2892 2971 2976 3031 3064 3065 3072 3074 3085 3110 3111 3116 3147 3165 3177 3180 3285 3297 3342 3352 3362 3380 3408 3429 3449 3455 3479 3483 3504 3570 3593 3632 3678 3714 3744 3753 3796 3809 3831 3838 3880 3892 3922 3934 3952 3957 3959 3967 3997 4031 4035 4047 4049 4071 4093 4112 4129 4137 4160 4164 4169 4171 4175 4197 4227 4238 4307 4357 4379 4383 4386 4391 4428 4479 4496 4509 4520 4523 4532 4536 4542 4555 4563 4580 4597 4622 4628 4641 4651 4675 4678 4682 4703 4720 4728 4752 4764 4771 4802 4825 4897 4930 4959 4962 4967 4978 4980 4993 4995 85 119 551 562 918 942 1355 1645 1716 1831 1865 2701 3041 3410 3576 3578 3869 4224 4225 4267 4832 4865 4954 GTCCGA/TCGGAC 1 -2 161 191 32 -29.7 0 1 8 13 37 41 53 85 91 99 113 126 160 253 265 274 302 322 377 381 384 396 413 414 431 447 448 489 557 564 596 615 626 643 647 656 681 809 816 821 897 911 917 958 975 1022 1031 1041 1046 1068 1119 1135 1148 1184 1219 1228 1248 1348 1445 1525 1605 1658 1682 1706 1725 1856 1860 1862 1872 1973 2053 2057 2174 2184 2216 2246 2253 2316 2320 2339 2343 2459 2509 2524 2580 2629 2663 2686 2687 2705 2750 2768 2865 2909 2910 2932 2948 2957 3000 3008 3038 3091 3093 3099 3310 3332 3344 3363 3382 3406 3408 3450 3524 3584 3585 3644 3662 3684 3816 3847 3871 3918 3946 3994 4024 4035 4061 4064 4086 4087 4091 4098 4122 4132 4193 4209 4329 4391 4399 4438 4457 4463 4500 4528 4544 4569 4624 4633 4645 4658 4665 4687 4696 4762 4787 4792 4838 4861 4934 4937 4943 31 120 189 322 488 504 553 784 878 951 1168 1184 1627 1629 1675 1902 1907 2302 2368 2827 3222 3508 3787 3813 3876 3916 4139 4267 4405 4590 4758 4888 TGGGCA/TGCCCA 0 -3 177 186 33 -27.9 22 48 62 109 124 146 147 173 202 222 223 237 325 328 375 394 405 416 417 457 467 474 529 536 540 544 575 586 613 635 678 696 698 700 711 791 806 814 894 895 931 940 958 1071 1122 1132 1152 1156 1163 1169 1237 1253 1271 1287 1288 1290 1308 1332 1414 1437 1465 1529 1535 1582 1587 1603 1612 1614 1616 1732 1746 1751 1831 1854 1880 1881 1899 1918 1919 1981 1993 1996 2012 2030 2081 2088 2094 2103 2107 2136 2156 2162 2213 2216 2224 2291 2346 2347 2400 2440 2495 2531 2538 2675 2685 2687 2710 2750 2777 2791 2836 2970 2971 3001 3041 3065 3072 3174 3180 3216 3245 3269 3284 3297 3362 3371 3374 3380 3460 3485 3492 3495 3506 3632 3698 3701 3702 3810 3846 3922 3934 3939 3954 3959 4027 4033 4035 4053 4084 4134 4160 4175 4186 4338 4343 4388 4479 4498 4509 4529 4544 4579 4619 4648 4694 4707 4731 4766 4875 4891 4899 4922 4946 4961 4962 4993 4995 137 189 373 551 562 748 919 1007 1248 1645 1681 1738 1814 1831 1886 1964 2113 2464 2475 2552 2557 2561 2625 2728 2860 3098 3437 3869 4135 4267 4596 4815 4909 AGACCG/CGGTCT 1 -3 147 174 43 -20.5 5 21 25 50 127 145 148 200 219 228 280 292 301 374 403 404 421 439 445 458 476 484 489 505 537 546 553 564 606 614 617 637 655 685 706 756 800 807 828 865 896 903 911 935 941 963 977 1011 1021 1059 1097 1102 1107 1123 1147 1221 1239 1248 1265 1333 1362 1415 1478 1505 1522 1547 1568 1619 1650 1654 1659 1661 1730 1748 1770 1771 1779 1785 1855 1858 1888 1891 1959 1962 2038 2071 2076 2149 2202 2238 2257 2263 2292 2329 2330 2374 2410 2489 2585 2606 2608 2609 2653 2757 2759 2834 2919 2942 2985 3011 3020 3028 3059 3073 3129 3161 3239 3330 3348 3406 3475 3505 3511 3518 3537 3546 3652 3696 3762 3785 3916 3984 4198 4281 4289 4339 4438 4602 4656 4665 4684 4708 4741 4893 4929 4958 4959 2 13 29 68 103 138 150 154 192 233 304 400 460 515 761 890 1114 1173 1320 1368 1455 1787 1921 2004 2061 2267 2344 2516 2517 2546 2802 2980 2994 3051 3265 3678 3786 3979 4346 4435 4812 4929 4989 GTCCGT/ACGGAC 1 -2 147 157 33 -21.2 6 17 43 67 68 242 260 306 307 309 373 475 510 524 538 554 615 626 635 655 678 711 738 761 781 790 793 796 812 824 833 860 863 883 908 928 929 999 1026 1054 1055 1115 1157 1210 1229 1275 1387 1395 1440 1446 1457 1469 1475 1491 1492 1540 1544 1548 1561 1569 1587 1744 1779 1822 1878 1911 1955 2003 2016 2028 2084 2108 2183 2197 2231 2243 2266 2267 2268 2291 2306 2333 2361 2392 2416 2460 2587 2597 2662 2726 2756 2785 2809 2812 2818 2831 2854 2880 2895 2981 3070 3133 3140 3149 3217 3254 3313 3316 3342 3350 3374 3428 3451 3519 3528 3539 3574 3584 3596 3615 3747 3760 3798 3991 4129 4221 4226 4272 4312 4342 4380 4385 4395 4397 4421 4431 4462 4485 4593 4650 4685 4714 4728 4788 4855 4935 4955 33 508 561 670 711 991 1095 1154 1568 1606 1657 1745 1779 1906 1932 2194 2248 2648 2657 2809 2980 3038 3111 3187 3289 3497 4014 4325 4368 4429 4590 4711 4780 TGTCCG/CGGACA 1 -3 120 155 32 -21.2 1 37 41 53 54 67 68 85 102 126 155 160 234 242 306 322 380 396 413 431 447 505 538 553 557 564 615 626 647 648 665 734 766 774 812 816 824 833 857 863 911 928 929 937 1010 1031 1041 1056 1057 1135 1199 1208 1219 1230 1275 1392 1395 1423 1440 1457 1475 1491 1529 1548 1605 1706 1822 1872 1878 1911 1980 2016 2053 2183 2243 2246 2281 2343 2361 2416 2467 2726 2831 2854 2895 2915 2932 2989 3025 3033 3062 3161 3269 3310 3342 3433 3524 3528 3558 3652 3747 3771 3785 3865 3971 4042 4063 4087 4098 4195 4226 4272 4431 4438 4588 4652 4728 4787 4855 4943 31 77 189 396 553 932 1130 1154 1184 1233 1456 1568 1606 1657 1745 1902 1906 2062 2161 2302 2368 3038 3289 3570 3787 3876 3898 4139 4368 4590 4673 4780 TGACCC/GGGTCA 1 -3 127 148 47 -13.7 16 18 45 57 65 78 89 91 112 121 123 135 168 174 248 270 280 321 357 397 434 469 530 549 572 580 584 617 668 676 677 974 1026 1103 1222 1228 1247 1299 1306 1310 1338 1405 1422 1523 1548 1567 1612 1714 1719 1745 1766 1800 1827 1915 1931 1937 1991 2010 2033 2174 2298 2303 2316 2424 2494 2598 2748 2752 2755 2770 2805 2820 2953 2957 2967 2989 2992 3023 3026 3058 3116 3131 3157 3219 3275 3337 3355 3359 3375 3441 3467 3473 3524 3533 3568 3583 3590 3623 3626 3630 3679 3681 3731 3788 3823 3843 4021 4059 4072 4087 4103 4117 4119 4376 4424 4542 4573 4579 4588 4735 4753 4756 4809 4816 4892 4961 4997 35 42 106 229 406 504 541 560 732 755 787 1376 1465 1492 1914 1919 2180 2181 2202 2339 2375 2405 2451 2494 2557 2673 2684 2708 2711 2786 2811 3128 3139 3220 3261 3271 3297 3604 3762 3781 4029 4086 4258 4610 4726 4791 4992 GACACG/CGTGTC 2 -2 148 147 37 -17.2 13 45 51 84 111 130 170 196 204 245 253 400 447 466 503 565 612 677 714 720 802 859 860 913 943 955 963 977 1008 1027 1108 1129 1162 1221 1277 1294 1341 1359 1386 1409 1423 1496 1498 1501 1545 1554 1564 1602 1691 1731 1954 1983 2016 2032 2100 2110 2113 2114 2127 2173 2177 2200 2201 2264 2282 2363 2426 2431 2458 2499 2560 2655 2707 2715 2765 2793 2810 2827 2884 2983 3010 3012 3015 3033 3052 3075 3077 3099 3171 3274 3280 3292 3293 3305 3314 3320 3340 3342 3354 3396 3406 3423 3432 3483 3490 3507 3522 3526 3577 3610 3661 3737 3778 3782 3810 3815 3840 3879 3892 3922 3954 3998 4049 4075 4077 4094 4140 4164 4195 4226 4235 4249 4344 4370 4375 4409 4411 4469 4485 4536 4568 4665 4676 4787 4866 4943 4950 4955 98 101 272 296 322 354 475 710 717 1062 1118 1207 1418 1745 1780 1890 1942 1945 2302 2317 2369 2384 2510 2630 2836 3324 3462 3655 3675 4027 4249 4596 4615 4766 4781 4826 4912 TGGACG/CGTCCA 0 -3 165 141 41 -14.4 19 43 47 110 188 220 270 390 671 708 740 779 796 808 841 860 960 1072 1102 1106 1116 1144 1220 1277 1281 1317 1326 1342 1405 1453 1455 1486 1501 1519 1616 1679 1752 1765 1787 1842 1869 1967 2009 2016 2057 2068 2074 2105 2134 2152 2162 2235 2310 2311 2386 2398 2434 2460 2499 2512 2540 2544 2594 2602 2618 2622 2648 2706 2708 2723 2734 2736 2742 2751 2759 2772 2778 2789 2794 2801 2808 2853 2873 2933 2959 2970 2999 3052 3069 3080 3114 3126 3168 3186 3233 3240 3249 3295 3313 3350 3355 3427 3428 3435 3462 3504 3522 3525 3528 3602 3619 3621 3626 3648 3748 3754 3852 3901 3911 3948 4005 4078 4079 4087 4106 4121 4135 4168 4181 4191 4202 4260 4276 4280 4293 4311 4333 4361 4424 4547 4560 4578 4584 4604 4609 4627 4630 4635 4667 4676 4773 4774 4780 4799 4819 4840 4841 4851 4855 4861 4866 4883 4976 4980 4983 4 55 295 332 352 362 407 431 569 638 841 946 1278 1304 1394 1619 1692 1739 1745 1901 2062 2097 2261 2411 2956 2983 3022 3399 3426 3553 3596 3987 4259 4304 4322 4494 4575 4600 4624 4643 4882 GCCACG/CGTGGC 2 -2 139 140 33 -17.4 22 55 67 84 117 133 142 164 205 219 223 250 307 340 377 469 522 556 644 762 823 839 841 1019 1046 1056 1093 1170 1188 1227 1233 1235 1267 1282 1334 1424 1467 1479 1505 1515 1517 1551 1564 1594 1665 1682 1686 1725 1766 1959 1983 2009 2095 2096 2109 2113 2317 2334 2426 2466 2540 2558 2560 2571 2694 2730 2733 2782 2790 2810 2812 2846 2848 2856 2890 2912 2946 2955 2960 2963 2968 2970 2978 2989 3010 3030 3117 3135 3203 3233 3292 3340 3365 3398 3423 3432 3434 3496 3544 3662 3673 3718 3720 3737 3861 3890 3946 3961 3967 4022 4071 4073 4083 4094 4102 4107 4269 4297 4319 4370 4386 4392 4401 4411 4461 4477 4507 4514 4543 4634 4651 4692 4699 4760 4788 4817 4882 4913 4990 39 45 58 60 468 536 909 921 1119 1126 1309 1398 1467 1514 1619 1742 1777 1881 2037 2413 2550 2577 2585 2737 2880 3153 3229 3519 3741 3896 4537 4643 4982 CACGTC/GACGTG 2 0 143 137 40 -14.0 117 131 133 142 170 218 223 257 312 415 447 461 466 487 522 562 686 706 753 788 840 843 859 935 943 985 1026 1072 1120 1162 1204 1244 1273 1294 1359 1393 1431 1486 1517 1545 1554 1574 1579 1614 1617 1636 1672 1686 1693 1725 1730 1746 1751 1766 1868 1958 2104 2109 2110 2134 2158 2173 2180 2207 2282 2342 2426 2432 2530 2564 2603 2655 2676 2706 2723 2731 2789 2790 2811 2836 2848 2873 2894 2933 2946 2959 2963 2970 2975 3030 3032 3092 3099 3103 3126 3165 3232 3233 3240 3274 3289 3293 3305 3326 3378 3450 3483 3522 3573 3602 3622 3625 3661 3890 3967 4071 4079 4083 4102 4109 4146 4153 4240 4256 4297 4328 4333 4380 4392 4401 4459 4461 4471 4485 4504 4638 4774 4851 4883 4893 4941 4965 4990 6 127 229 354 453 674 794 888 909 922 1192 1398 1739 1996 2361 2368 2510 2612 2657 2663 2740 2956 3331 3380 3521 3735 3776 3994 4046 4129 4530 4537 4560 4587 4616 4617 4719 4872 4882 4966 TAGGCC/GGCCTA 3 -3 167 137 27 -19.5 243 291 361 363 391 461 520 555 662 669 814 866 878 944 946 948 978 1004 1018 1025 1039 1044 1078 1170 1227 1254 1255 1336 1379 1404 1408 1426 1481 1498 1563 1579 1638 1657 1663 1691 1696 1731 1788 1859 1985 2006 2058 2098 2159 2166 2189 2208 2213 2232 2275 2296 2328 2349 2388 2393 2411 2420 2426 2444 2479 2501 2534 2605 2617 2625 2665 2673 2680 2738 2797 2841 2876 2926 2946 2953 2977 3009 3020 3040 3068 3075 3152 3166 3180 3197 3219 3272 3349 3375 3376 3429 3456 3457 3460 3463 3479 3481 3498 3512 3517 3525 3558 3606 3624 3658 3664 3678 3684 3839 3872 3895 3905 3971 4032 4044 4080 4088 4091 4123 4131 4139 4153 4167 4180 4245 4246 4266 4329 4356 4390 4391 4438 4442 4449 4454 4475 4549 4556 4574 4589 4603 4621 4623 4641 4651 4659 4678 4713 4730 4736 4806 4808 4832 4847 4858 4873 4877 4913 4917 4966 4977 4978 106 329 412 458 527 791 981 1046 1691 1716 1791 2062 2086 2155 2485 2567 2633 3092 3186 3274 3564 3578 3689 4482 4629 4736 4865 GTCCCT/AGGGAC 0 -1 136 133 38 -13.9 40 62 63 109 136 149 202 223 267 280 413 454 559 611 632 729 733 773 792 874 930 948 981 987 990 997 1061 1062 1098 1158 1167 1201 1215 1331 1341 1466 1513 1546 1615 1620 1634 1643 1650 1673 1798 1826 1907 1921 1936 1947 1950 1966 1972 2016 2060 2090 2120 2185 2255 2266 2271 2279 2305 2363 2394 2397 2475 2518 2610 2615 2741 2747 2763 2764 2778 2780 2797 2822 2842 2954 3003 3013 3062 3100 3163 3184 3206 3369 3410 3427 3467 3478 3503 3557 3559 3577 3598 3616 3643 3658 3689 3704 3813 3814 3824 4001 4041 4046 4074 4109 4145 4150 4178 4240 4243 4256 4261 4365 4377 4389 4417 4486 4504 4575 4622 4626 4693 4699 4726 4761 4802 4850 4853 4938 4962 4985 47 94 112 247 339 362 714 867 881 931 993 1113 1121 1464 1516 1627 1718 1961 2034 2039 2284 2456 2475 2657 2707 2709 2757 3093 3657 3869 3981 4052 4115 4154 4176 4633 4973 4983 GTCCCT/AGGGAC 1 -2 136 133 38 -13.9 40 62 63 109 136 149 202 223 267 280 413 454 559 611 632 729 733 773 792 874 930 948 981 987 990 997 1061 1062 1098 1158 1167 1201 1215 1331 1341 1466 1513 1546 1615 1620 1634 1643 1650 1673 1798 1826 1907 1921 1936 1947 1950 1966 1972 2016 2060 2090 2120 2185 2255 2266 2271 2279 2305 2363 2394 2397 2475 2518 2610 2615 2741 2747 2763 2764 2778 2780 2797 2822 2842 2954 3003 3013 3062 3100 3163 3184 3206 3369 3410 3427 3467 3478 3503 3557 3559 3577 3598 3616 3643 3658 3689 3704 3813 3814 3824 4001 4041 4046 4074 4109 4145 4150 4178 4240 4243 4256 4261 4365 4377 4389 4417 4486 4504 4575 4622 4626 4693 4699 4726 4761 4802 4850 4853 4938 4962 4985 47 94 112 247 339 362 714 867 881 931 993 1113 1121 1464 1516 1627 1718 1961 2034 2039 2284 2456 2475 2657 2707 2709 2757 3093 3657 3869 3981 4052 4115 4154 4176 4633 4973 4983 GACCTA/TAGGTC 0 -1 133 132 42 -12.3 14 73 136 137 141 223 297 313 375 376 378 384 443 475 487 488 513 535 549 595 610 681 853 860 893 902 916 979 1146 1180 1181 1205 1332 1348 1373 1439 1529 1544 1581 1583 1592 1604 1607 1624 1632 1647 1680 1760 1857 1901 1914 1962 2005 2007 2180 2184 2248 2279 2288 2316 2321 2326 2348 2392 2394 2428 2444 2526 2613 2617 2642 2665 2676 2719 2754 2824 2832 2847 2880 2897 2923 2949 2952 3012 3023 3028 3142 3196 3201 3215 3248 3257 3274 3332 3347 3353 3447 3473 3509 3563 3619 3634 3733 3794 3822 3836 3856 3946 3992 4007 4029 4068 4076 4081 4133 4183 4249 4367 4453 4572 4608 4612 4645 4659 4713 4715 4718 4786 4836 4895 4949 4954 4984 163 361 447 535 603 653 754 771 866 876 898 968 1063 1121 1295 1300 1718 1792 1933 1967 1977 2011 2022 2153 2559 2577 2774 2794 3077 3159 3202 3410 3431 3608 3707 4007 4056 4237 4362 4483 4531 4879 GTCCGG/CCGGAC 1 -2 129 127 26 -17.7 25 54 102 174 187 208 229 234 307 380 396 440 505 529 553 616 648 665 734 766 774 850 857 893 918 937 980 987 992 1094 1196 1208 1234 1306 1307 1317 1328 1399 1423 1478 1529 1687 1697 1709 1727 1761 1934 1971 1980 2042 2250 2289 2328 2331 2467 2597 2611 2628 2742 2817 2853 2899 2909 2941 2945 2947 2989 3016 3025 3033 3067 3112 3161 3235 3264 3281 3387 3428 3433 3505 3511 3512 3524 3558 3652 3654 3693 3717 3771 3785 3865 3889 3898 3911 3912 3915 3968 3971 3991 3992 4042 4050 4056 4063 4070 4090 4195 4216 4235 4266 4454 4461 4472 4552 4553 4567 4588 4590 4638 4652 4735 4741 4746 4816 4819 4832 4895 4945 4959 74 77 305 932 975 988 1130 1233 1726 1823 2062 2075 2161 2328 2802 3094 3124 3271 3569 3570 4125 4155 4518 4673 4874 4887 GGGCCG/CGGCCC 0 -2 153 124 20 -20.1 22 108 138 307 387 405 455 686 698 739 765 1066 1080 1093 1154 1208 1221 1358 1394 1425 1481 1546 1731 1777 1778 1837 1842 1844 1878 1908 2121 2127 2158 2170 2178 2181 2214 2222 2250 2276 2365 2371 2409 2411 2445 2515 2542 2562 2586 2593 2606 2643 2649 2667 2675 2698 2707 2709 2730 2818 2828 2834 2839 2857 2867 2903 2914 3085 3086 3111 3150 3158 3165 3170 3211 3237 3323 3375 3380 3384 3394 3457 3472 3482 3494 3502 3519 3526 3530 3558 3587 3619 3638 3644 3662 3714 3726 3746 3749 3750 3755 3773 3794 3795 3818 3869 3872 3913 3942 3964 3983 3987 3996 4014 4020 4037 4078 4126 4129 4164 4171 4180 4200 4211 4227 4251 4289 4306 4324 4342 4373 4428 4452 4466 4481 4559 4593 4602 4612 4617 4643 4717 4739 4828 4834 4843 4879 4892 4915 4924 4936 4967 4980 25 75 85 118 513 551 618 942 1561 1865 2139 2358 2701 2729 3297 3330 3406 3548 4155 4272 GGACTG/CAGTCC 0 -2 120 119 30 -14.1 2 42 60 65 96 113 116 169 265 416 421 542 552 560 632 634 640 785 790 810 861 875 926 959 987 1006 1020 1061 1092 1165 1253 1259 1294 1400 1527 1617 1643 1666 1755 1770 1780 1898 1962 2073 2260 2419 2552 2590 2591 2662 2664 2717 2768 2821 2891 2941 2962 3038 3108 3227 3254 3440 3451 3481 3485 3487 3491 3538 3548 3586 3600 3603 3605 3630 3654 3658 3672 3712 3715 3777 3795 3829 3898 3921 3988 4002 4013 4082 4120 4129 4243 4245 4253 4261 4285 4298 4300 4350 4375 4397 4436 4457 4463 4469 4488 4500 4527 4528 4529 4544 4605 4658 4738 4768 4783 4785 4818 4874 4972 4988 312 315 419 784 963 1070 1176 1248 1389 1457 1839 1932 2137 2357 2435 2560 2789 2802 2809 2969 3094 3113 3566 3807 3964 4023 4325 4390 4401 4517 GACCCG/CGGGTC 1 -2 103 118 25 -16.1 18 24 65 78 89 91 153 235 278 321 357 380 456 469 497 531 575 580 668 676 688 715 738 747 838 869 882 889 893 943 1028 1042 1103 1218 1228 1247 1380 1425 1484 1601 1612 1676 1719 1727 1804 1849 1903 1978 1983 1991 2010 2033 2174 2190 2298 2316 2339 2430 2448 2523 2577 2729 2771 2863 2892 2899 2910 2957 2989 3026 3067 3109 3303 3363 3394 3451 3473 3524 3590 3693 3755 3788 3823 3853 3871 3941 4050 4056 4094 4313 4380 4393 4539 4552 4572 4677 4687 4697 4809 4811 4816 4892 4969 37 76 229 458 504 560 787 814 1118 1119 1777 1988 2432 2557 2708 2752 2946 3032 3041 3271 3745 4029 4086 4781 4790 AGGCCA/TGGCCT 3 -2 130 113 30 -12.8 81 92 135 267 291 361 362 643 700 850 946 1068 1105 1124 1167 1170 1192 1216 1227 1254 1303 1336 1363 1402 1404 1426 1563 1608 1625 1626 1629 1638 1657 1760 1788 1793 1816 1859 1898 1901 1988 1989 2147 2153 2208 2216 2266 2275 2328 2365 2403 2426 2428 2467 2501 2525 2531 2541 2543 2557 2636 2673 2698 2738 2743 2778 2820 2838 2848 2856 2923 2926 2946 2960 2968 2977 3020 3044 3073 3075 3153 3180 3238 3276 3349 3456 3481 3498 3512 3545 3616 3627 3684 3737 3824 3870 3886 3964 4066 4116 4122 4153 4167 4204 4241 4269 4295 4345 4368 4443 4503 4549 4556 4595 4596 4607 4637 4651 4654 4659 4689 4781 4785 4806 4834 4884 4905 4913 4928 4960 106 329 388 527 694 801 887 1046 1267 1593 1661 2155 2485 2538 2563 2642 2870 3143 3145 3219 3286 3312 3376 3564 3592 3657 4080 4212 4267 4961 CTGGGC/GCCCAG 0 -4 123 112 8 -25.6 8 93 138 266 325 391 398 405 418 513 529 783 862 878 931 934 967 1093 1119 1139 1156 1176 1290 1298 1408 1481 1587 1637 1754 1773 1796 1835 1854 1875 1896 2083 2103 2181 2224 2228 2298 2346 2355 2372 2407 2409 2420 2521 2562 2586 2588 2616 2649 2662 2676 2680 2784 2791 2856 2857 2905 2938 2985 2988 2991 3057 3086 3170 3182 3197 3319 3322 3374 3425 3438 3451 3458 3485 3494 3495 3516 3587 3595 3638 3678 3692 3723 3738 3746 3795 3804 3839 3846 3876 3944 3964 4009 4031 4123 4146 4227 4236 4266 4273 4302 4306 4312 4357 4479 4481 4489 4530 4563 4603 4651 4737 4779 4787 4858 4870 4952 4964 4975 347 412 502 2062 2464 2868 3437 4341 GACCCT/AGGGTC 1 -2 99 107 27 -12.8 11 43 44 57 112 125 168 174 277 312 314 434 528 549 603 629 688 691 950 974 1121 1168 1219 1225 1243 1295 1299 1338 1347 1362 1364 1398 1422 1433 1446 1593 1639 1696 1700 1710 1745 1800 1887 1937 1959 1980 2079 2164 2166 2208 2215 2330 2364 2367 2396 2424 2537 2647 2708 2714 2769 2833 2835 2867 2869 2901 2907 2967 3084 3211 3271 3275 3356 3449 3514 3626 3663 3737 3816 3840 3882 4058 4072 4103 4110 4268 4358 4410 4513 4581 4639 4672 4688 4703 4733 4841 4908 4945 4962 429 541 1288 1315 1358 1465 1746 1919 2018 2059 2392 2431 2445 2451 2453 2519 2673 2900 2910 3139 3244 3424 3757 4208 4406 4610 4620 CCCACG/CGTGGG 2 -2 115 103 32 -10.1 22 42 63 80 500 554 651 686 791 801 840 855 997 1010 1055 1072 1139 1174 1213 1227 1294 1359 1449 1499 1547 1548 1598 1610 1690 1693 1754 1866 1896 1921 1931 1946 1981 1987 1999 2047 2127 2220 2276 2299 2356 2426 2433 2519 2530 2531 2579 2601 2685 2707 2771 2813 2818 2836 2841 2856 2904 2976 3046 3064 3072 3152 3190 3216 3292 3305 3312 3437 3471 3537 3539 3593 3622 3714 3733 3809 3943 3957 3962 3976 3997 4035 4047 4061 4118 4132 4152 4175 4199 4233 4238 4240 4357 4380 4400 4462 4469 4477 4532 4615 4628 4675 4676 4691 4735 4782 4802 4810 4930 4960 4980 119 453 551 613 867 918 947 1112 1166 1207 1335 1337 1561 1865 1947 2122 2214 2247 2267 2291 2447 2612 3026 3071 3086 3153 3250 3587 3652 3895 4451 4954 ACTGGG/CCCAGT 0 -5 107 102 26 -12.1 1 138 165 266 378 391 398 405 416 431 529 878 880 934 941 967 971 984 997 1093 1119 1266 1298 1418 1527 1587 1636 1644 1671 1697 1706 1773 1796 1835 1854 1875 1890 1896 2018 2036 2083 2103 2126 2224 2279 2319 2359 2372 2409 2562 2588 2591 2662 2680 2709 2732 2739 2856 2905 2988 3073 3081 3086 3087 3089 3098 3155 3192 3297 3375 3411 3451 3458 3485 3516 3638 3658 3678 3723 3738 3795 3804 3876 3935 3944 3963 4009 4022 4142 4227 4302 4306 4466 4479 4481 4530 4558 4603 4651 4698 4733 4745 4779 4833 4858 4964 4975 37 111 176 412 488 523 732 733 969 1129 1365 1427 1820 2018 2275 2547 2745 2938 3004 3571 3797 4139 4287 4306 4341 4539 GTCCCC/GGGGAC 0 -1 98 91 16 -14.4 86 105 281 301 320 352 368 416 528 534 540 551 595 657 707 818 913 1091 1110 1133 1160 1282 1294 1373 1485 1554 1632 1667 1691 1704 1710 1716 1793 1833 1912 2100 2106 2160 2177 2197 2385 2395 2405 2464 2496 2506 2512 2543 2679 2707 2732 2804 2839 2911 2920 2975 3059 3125 3169 3221 3230 3353 3357 3403 3436 3440 3501 3545 3555 3628 3700 3707 3712 3818 3838 3881 3917 3933 4074 4103 4143 4189 4240 4293 4332 4337 4448 4507 4508 4513 4514 4516 4517 4701 4738 4818 4890 4944 111 138 318 358 370 489 656 675 1286 1499 2443 2832 3343 3566 3652 4989 GTCCCC/GGGGAC 1 -2 98 91 16 -14.4 86 105 281 301 320 352 368 416 528 534 540 551 595 657 707 818 913 1091 1110 1133 1160 1282 1294 1373 1485 1554 1632 1667 1691 1704 1710 1716 1793 1833 1912 2100 2106 2160 2177 2197 2385 2395 2405 2464 2496 2506 2512 2543 2679 2707 2732 2804 2839 2911 2920 2975 3059 3125 3169 3221 3230 3353 3357 3403 3436 3440 3501 3545 3555 3628 3700 3707 3712 3818 3838 3881 3917 3933 4074 4103 4143 4189 4240 4293 4332 4337 4448 4507 4508 4513 4514 4516 4517 4701 4738 4818 4890 4944 111 138 318 358 370 489 656 675 1286 1499 2443 2832 3343 3566 3652 4989 GGCCTC/GAGGCC 0 -1 108 90 22 -11.3 92 97 135 243 393 499 608 754 840 948 981 1022 1078 1160 1192 1236 1303 1363 1442 1663 1843 1875 1924 1968 2023 2040 2044 2065 2083 2153 2166 2318 2336 2461 2507 2636 2743 2771 2778 2838 2848 2923 2925 2950 3009 3037 3057 3077 3086 3197 3318 3323 3337 3377 3457 3488 3516 3526 3542 3558 3594 3616 3678 3696 3718 3732 3747 3765 3777 3826 3831 3832 3857 3866 3976 4037 4039 4136 4156 4204 4212 4236 4245 4269 4303 4329 4340 4354 4383 4405 4446 4482 4496 4509 4514 4532 4626 4644 4651 4720 4781 4834 4844 4867 4905 4928 4973 4997 638 731 741 801 1408 1574 1901 2110 2642 2656 2888 2996 3136 3274 3452 3500 3513 3629 3785 4072 4629 4678 GAGGCC/GGCCTC 3 -3 108 90 22 -11.3 92 97 135 243 393 499 608 754 840 948 981 1022 1078 1160 1192 1236 1303 1363 1442 1663 1843 1875 1924 1968 2023 2040 2044 2065 2083 2153 2166 2318 2336 2461 2507 2636 2743 2771 2778 2838 2848 2923 2925 2950 3009 3037 3057 3077 3086 3197 3318 3323 3337 3377 3457 3488 3516 3526 3542 3558 3594 3616 3678 3696 3718 3732 3747 3765 3777 3826 3831 3832 3857 3866 3976 4037 4039 4136 4156 4204 4212 4236 4245 4269 4303 4329 4340 4354 4383 4405 4446 4482 4496 4509 4514 4532 4626 4644 4651 4720 4781 4834 4844 4867 4905 4928 4973 4997 638 731 741 801 1408 1574 1901 2110 2642 2656 2888 2996 3136 3274 3452 3500 3513 3629 3785 4072 4629 4678 CGCGTG/CACGCG 2 0 85 84 18 -11.7 19 22 129 145 256 337 377 481 500 510 784 912 979 1063 1116 1181 1229 1366 1386 1474 1475 1503 1510 1535 1564 1594 1733 1754 1807 1833 1848 1892 1967 1999 2025 2109 2149 2276 2283 2342 2356 2429 2537 2556 2606 2765 2810 2949 2952 3216 3257 3305 3357 3384 3490 3532 3539 3578 3622 3718 3804 3834 3864 3879 3892 3930 3948 3966 3978 3997 4047 4065 4128 4231 4291 4364 4374 4541 4609 4634 4760 4845 4876 4878 4993 132 295 551 712 757 1262 1814 1893 1947 2012 2214 2317 2971 3290 3843 3888 3952 4944 AGGGCC/GGCCCT 0 -3 92 79 16 -11.6 258 340 393 449 461 520 686 698 794 806 966 971 1080 1105 1198 1199 1236 1249 1367 1521 1528 1555 1646 1702 1805 1870 1925 2034 2041 2058 2065 2098 2222 2298 2318 2349 2411 2444 2449 2486 2501 2593 2649 2783 2813 2816 2828 2837 2935 2950 2961 2999 3053 3072 3110 3111 3113 3148 3158 3237 3243 3285 3310 3421 3424 3481 3493 3530 3558 3627 3643 3644 3767 3791 3866 3913 4020 4091 4103 4145 4185 4215 4307 4309 4466 4503 4699 4725 4743 4811 4820 4978 86 413 449 551 1277 1440 2736 2888 3118 3558 3578 3689 3776 4614 4865 4876 GCACGT/ACGTGC 2 -1 71 72 24 -6.9 70 80 95 131 316 372 404 420 492 560 723 898 993 1120 1255 1264 1362 1371 1415 1455 1587 1730 1751 1760 1764 1806 1866 1891 1910 2013 2040 2103 2104 2189 2207 2211 2279 2299 2458 2479 2564 2574 2643 2723 2811 2813 2992 3015 3023 3035 3052 3100 3116 3537 3914 3916 3953 4047 4098 4146 4175 4195 4333 4509 4533 4609 4760 4806 4976 4994 4997 45 290 296 449 450 509 857 888 976 1163 1634 1727 2109 2202 2354 2543 2657 2954 3552 4046 4234 4337 4567 4944 GGCCGA/TCGGCC 0 -1 81 71 23 -7.0 26 138 163 282 387 650 849 1066 1080 1154 1263 1269 1304 1358 1481 1748 1767 1777 1837 1844 1877 1878 2040 2120 2139 2167 2178 2208 2214 2542 2544 2547 2562 2658 2659 2698 2857 2867 2903 2914 3077 3085 3158 3165 3194 3323 3375 3380 3384 3457 3472 3482 3502 3530 3558 3567 3608 3619 3726 3749 3795 3869 3913 3964 3975 3983 4037 4251 4270 4339 4373 4466 4481 4612 4617 4717 4790 4904 4936 4967 4975 25 36 85 307 513 551 686 715 1676 2358 2628 2673 3297 3330 3355 3387 3406 3443 3466 3513 3930 4482 4678 GGGCCC/GGGCCC 0 -2 80 68 4 -17.0 98 391 398 418 449 686 806 966 1080 1198 1249 1367 1385 1390 1391 1521 1555 1687 1754 1797 1805 1870 1896 2041 2202 2298 2420 2501 2680 2709 2767 2775 2783 2784 2813 2828 2841 2856 2902 2999 3053 3072 3110 3113 3148 3166 3170 3285 3294 3295 3425 3477 3493 3645 3758 3791 3809 3843 3880 3901 3944 3960 4020 4103 4215 4283 4307 4467 4563 4600 4612 4675 4710 4737 4771 4775 4787 4811 4891 4916 86 119 320 3560 GGCCTG/CAGGCC 0 -1 75 66 14 -9.6 81 95 264 267 362 388 770 785 978 1039 1048 1124 1167 1216 1321 1526 1540 1577 1699 1793 1842 1921 2266 2332 2387 2486 2543 2562 2586 2698 2784 2856 2938 2960 2961 2985 3077 3322 3351 3375 3425 3512 3543 3574 3638 3718 3725 3738 3820 3895 3918 3929 4107 4116 4148 4156 4246 4285 4337 4357 4366 4489 4492 4589 4594 4596 4597 4664 4699 4785 4790 4814 4858 4973 4993 449 638 715 823 1520 1593 1661 2010 2627 2870 3219 3286 3312 3657 CAGGCC/GGCCTG 3 -3 75 66 14 -9.6 81 95 264 267 362 388 770 785 978 1039 1048 1124 1167 1216 1321 1526 1540 1577 1699 1793 1842 1921 2266 2332 2387 2486 2543 2562 2586 2698 2784 2856 2938 2960 2961 2985 3077 3322 3351 3375 3425 3512 3543 3574 3638 3718 3725 3738 3820 3895 3918 3929 4107 4116 4148 4156 4246 4285 4337 4357 4366 4489 4492 4589 4594 4596 4597 4664 4699 4785 4790 4814 4858 4973 4993 449 638 715 823 1520 1593 1661 2010 2627 2870 3219 3286 3312 3657 CGGGCC/GGCCCG 0 -3 79 65 9 -12.1 123 264 307 476 757 765 847 1044 1146 1198 1332 1385 1425 1555 1577 1687 1722 1745 1799 1837 1842 1844 2109 2121 2168 2202 2214 2250 2388 2436 2445 2665 2680 2784 2943 2999 3057 3083 3170 3295 3322 3394 3477 3514 3517 3525 3549 3587 3638 3658 3691 3747 3773 3794 3857 3901 3928 3960 4126 4200 4213 4246 4267 4337 4398 4537 4550 4572 4592 4628 4675 4709 4769 4782 4834 4844 4879 4917 4936 882 2195 2980 3110 3560 3804 4272 4736 4812 GTAGGC/GCCTAC 3 -4 68 58 16 -6.9 145 243 444 520 651 662 684 948 978 1009 1039 1040 1055 1254 1403 1498 1532 1535 1615 1619 1691 1843 2113 2164 2213 2243 2264 2388 2426 2841 2926 3020 3172 3279 3312 3375 3376 3481 3498 3658 3664 3756 3880 3895 4047 4091 4153 4180 4190 4204 4286 4296 4304 4417 4442 4445 4449 4454 4514 4549 4589 4641 4644 4657 4659 4728 4891 4966 278 884 990 1370 1806 1842 2062 2214 2323 2871 3155 3449 3564 3724 4417 4482