#2413/2413 #15.17 # k-mer/r.c. Cluster Offset PosCt wPosCt NegCt HGP_10 GACCAA/TTGGTC 0 -2 306 342 98 -35.8 0 1 11 18 27 32 38 41 43 44 46 55 59 60 62 66 68 73 74 85 86 88 90 93 98 99 108 114 118 120 122 126 130 133 134 144 150 169 183 199 209 228 234 239 265 282 283 292 293 296 299 315 328 370 382 384 385 398 399 405 417 423 425 438 443 449 450 452 453 474 475 484 489 492 498 499 503 521 522 525 528 530 541 542 544 549 550 552 556 561 582 588 617 620 623 624 625 631 632 634 636 642 647 654 656 657 658 661 679 696 698 707 716 725 730 736 746 757 772 787 798 818 823 848 863 871 880 890 895 919 935 936 951 954 957 958 975 976 978 979 981 983 985 1024 1027 1044 1073 1077 1078 1080 1084 1111 1145 1148 1149 1150 1151 1159 1160 1161 1165 1168 1169 1170 1174 1188 1189 1206 1214 1216 1217 1219 1262 1263 1274 1282 1291 1292 1297 1306 1311 1314 1316 1317 1341 1358 1360 1384 1387 1388 1399 1428 1429 1439 1443 1452 1463 1484 1486 1487 1511 1538 1541 1544 1562 1568 1569 1570 1572 1582 1604 1607 1608 1614 1623 1632 1647 1648 1649 1653 1658 1662 1665 1667 1671 1680 1681 1692 1693 1712 1722 1747 1748 1797 1799 1800 1820 1824 1825 1833 1837 1838 1846 1851 1879 1882 1888 1893 1906 1907 1927 1934 1940 1959 1960 1976 1983 1984 1985 2057 2081 2085 2086 2089 2092 2094 2115 2126 2132 2135 2137 2138 2142 2159 2162 2163 2169 2174 2176 2179 2181 2186 2205 2206 2223 2242 2254 2255 2271 2279 2280 2285 2297 2298 2308 2331 2334 2363 2364 2369 2373 2381 2382 2384 2390 2400 60 70 73 74 103 122 152 161 184 205 212 230 272 276 296 308 321 339 354 359 383 425 439 446 454 466 515 552 588 632 635 637 675 679 683 703 712 736 742 785 787 792 803 836 837 859 866 884 889 917 965 970 1061 1106 1154 1178 1179 1181 1216 1227 1244 1255 1278 1299 1320 1346 1375 1472 1503 1535 1594 1603 1621 1661 1686 1700 1705 1737 1759 1790 1808 1828 1877 1907 1916 1924 2010 2137 2155 2163 2165 2170 2186 2190 2273 2309 2364 2412 GGACCA/TGGTCC 0 -3 303 332 51 -55.9 5 12 18 26 27 30 40 41 43 44 46 59 60 66 68 73 85 88 98 105 111 114 120 122 128 130 133 134 150 155 167 170 174 184 199 202 217 228 234 265 280 283 300 301 303 314 319 328 357 360 361 365 374 382 384 385 405 411 416 422 425 450 452 460 468 469 471 472 474 476 481 482 489 492 493 494 498 499 516 519 521 532 540 542 549 554 555 558 561 562 568 569 571 579 580 582 586 587 600 611 615 617 620 622 630 631 632 636 640 645 647 654 662 679 688 689 698 702 707 727 730 734 746 757 767 768 769 774 778 798 818 844 847 848 863 870 871 880 890 892 896 916 936 940 942 943 944 957 958 975 976 979 981 983 985 1012 1027 1030 1063 1072 1077 1078 1097 1101 1119 1144 1145 1148 1149 1159 1165 1168 1169 1193 1202 1204 1206 1214 1218 1239 1249 1260 1261 1274 1283 1289 1290 1297 1300 1309 1310 1311 1313 1314 1327 1330 1335 1338 1339 1341 1358 1360 1369 1384 1412 1415 1425 1439 1443 1460 1468 1473 1481 1508 1511 1517 1529 1547 1568 1572 1584 1600 1603 1612 1613 1614 1618 1620 1634 1635 1642 1648 1649 1653 1654 1662 1665 1698 1703 1735 1772 1781 1798 1821 1824 1825 1837 1846 1849 1850 1865 1877 1878 1905 1911 1915 1947 1952 1955 1984 1995 2016 2037 2043 2044 2062 2072 2082 2085 2092 2094 2100 2111 2137 2138 2142 2153 2154 2156 2161 2163 2183 2205 2206 2208 2242 2255 2256 2268 2271 2285 2299 2308 2310 2318 2346 2363 2373 2376 2380 2381 2382 2384 74 91 119 146 184 188 205 283 286 348 446 459 501 565 637 683 736 764 787 793 803 836 859 981 1179 1214 1260 1299 1305 1326 1361 1413 1487 1503 1705 1809 1910 1924 1938 1988 2007 2013 2068 2096 2137 2138 2142 2201 2217 2273 2372 TGGACC/GGTCCA 0 -4 284 307 41 -55.4 7 12 14 23 32 43 44 46 54 59 73 82 85 98 109 111 120 121 123 126 128 130 132 133 134 145 150 155 167 169 172 184 202 219 228 234 235 246 251 260 264 265 306 319 324 325 328 334 349 356 357 360 361 374 376 382 384 385 411 415 416 422 425 436 452 454 455 461 470 476 477 479 492 493 494 510 516 519 527 531 558 561 564 568 579 580 587 589 607 620 630 638 642 647 656 679 687 688 689 697 698 707 715 724 727 729 730 734 748 757 767 768 769 775 794 807 813 818 844 847 862 863 870 871 877 890 896 913 916 925 936 940 943 944 958 973 974 975 976 981 985 999 1012 1013 1030 1063 1072 1078 1095 1119 1127 1131 1142 1144 1145 1153 1154 1155 1157 1159 1164 1166 1183 1204 1207 1221 1274 1283 1289 1290 1300 1301 1304 1320 1322 1323 1333 1336 1338 1403 1407 1415 1421 1439 1441 1447 1448 1468 1473 1478 1479 1481 1508 1510 1517 1521 1529 1536 1547 1565 1566 1568 1572 1584 1612 1613 1614 1618 1621 1642 1648 1649 1653 1655 1662 1665 1673 1685 1689 1714 1715 1726 1735 1760 1772 1781 1790 1819 1821 1824 1825 1839 1846 1856 1870 1871 1872 1898 1912 1913 1921 1929 1947 1951 1967 2017 2040 2072 2079 2082 2085 2092 2107 2111 2156 2166 2177 2183 2184 2205 2206 2208 2210 2216 2224 2226 2239 2242 2246 2247 2253 2254 2283 2286 2299 2318 2328 2358 2363 2365 2373 2376 2384 2399 119 146 181 184 187 188 205 283 286 354 370 404 423 469 501 565 727 736 836 859 899 985 1079 1085 1214 1326 1361 1613 1705 1820 1924 1937 1938 2013 2035 2068 2138 2217 2223 2242 2273 TGGACC/GGTCCA 2 -3 284 307 41 -55.4 7 12 14 23 32 43 44 46 54 59 73 82 85 98 109 111 120 121 123 126 128 130 132 133 134 145 150 155 167 169 172 184 202 219 228 234 235 246 251 260 264 265 306 319 324 325 328 334 349 356 357 360 361 374 376 382 384 385 411 415 416 422 425 436 452 454 455 461 470 476 477 479 492 493 494 510 516 519 527 531 558 561 564 568 579 580 587 589 607 620 630 638 642 647 656 679 687 688 689 697 698 707 715 724 727 729 730 734 748 757 767 768 769 775 794 807 813 818 844 847 862 863 870 871 877 890 896 913 916 925 936 940 943 944 958 973 974 975 976 981 985 999 1012 1013 1030 1063 1072 1078 1095 1119 1127 1131 1142 1144 1145 1153 1154 1155 1157 1159 1164 1166 1183 1204 1207 1221 1274 1283 1289 1290 1300 1301 1304 1320 1322 1323 1333 1336 1338 1403 1407 1415 1421 1439 1441 1447 1448 1468 1473 1478 1479 1481 1508 1510 1517 1521 1529 1536 1547 1565 1566 1568 1572 1584 1612 1613 1614 1618 1621 1642 1648 1649 1653 1655 1662 1665 1673 1685 1689 1714 1715 1726 1735 1760 1772 1781 1790 1819 1821 1824 1825 1839 1846 1856 1870 1871 1872 1898 1912 1913 1921 1929 1947 1951 1967 2017 2040 2072 2079 2082 2085 2092 2107 2111 2156 2166 2177 2183 2184 2205 2206 2208 2210 2216 2224 2226 2239 2242 2246 2247 2253 2254 2283 2286 2299 2318 2328 2358 2363 2365 2373 2376 2384 2399 119 146 181 184 187 188 205 283 286 354 370 404 423 469 501 565 727 736 836 859 899 985 1079 1085 1214 1326 1361 1613 1705 1820 1924 1937 1938 2013 2035 2068 2138 2217 2223 2242 2273 CAATGG/CCATTG 1 -3 269 283 61 -38.0 0 8 27 29 39 42 45 46 56 65 73 78 79 85 98 105 119 126 129 139 146 160 169 184 202 207 209 217 218 228 234 249 250 254 256 266 267 275 281 283 291 294 295 303 328 348 349 363 377 384 385 391 397 398 411 416 417 420 429 436 456 459 474 493 521 522 530 532 551 552 554 558 568 569 575 584 587 608 630 650 651 679 726 746 757 776 783 800 803 804 806 807 823 832 835 836 843 844 856 859 860 863 870 871 880 883 896 898 908 925 928 933 938 942 958 1001 1013 1027 1030 1038 1049 1073 1077 1084 1090 1093 1094 1139 1146 1148 1149 1150 1153 1154 1165 1175 1176 1177 1185 1186 1189 1197 1204 1214 1215 1220 1224 1246 1269 1281 1282 1286 1292 1310 1316 1335 1338 1377 1385 1399 1402 1412 1417 1430 1445 1448 1463 1468 1485 1491 1500 1508 1517 1529 1544 1547 1555 1560 1562 1565 1566 1598 1604 1609 1612 1613 1633 1638 1652 1659 1666 1684 1697 1698 1712 1716 1725 1734 1737 1742 1743 1744 1745 1761 1762 1781 1784 1787 1801 1813 1818 1820 1835 1861 1876 1879 1889 1891 1894 1920 1931 1940 1943 1944 1946 1947 1957 1958 1965 1977 1978 1985 1995 2007 2009 2016 2035 2052 2059 2082 2094 2107 2128 2129 2134 2183 2209 2210 2216 2225 2242 2243 2245 2252 2253 2259 2271 2284 2293 2296 2301 2308 2342 2343 2365 2400 2403 2405 2406 88 105 112 115 121 150 193 197 283 291 312 325 326 348 373 440 470 501 545 737 779 860 879 971 981 1012 1036 1079 1085 1134 1148 1187 1225 1257 1413 1486 1670 1673 1760 1784 1814 1849 1860 1894 1941 1962 1974 1992 1996 2033 2050 2163 2258 2340 2342 2345 2349 2364 2386 2387 2402 CCAATG/CATTGG 1 -4 242 254 47 -37.9 0 8 27 42 52 53 56 73 74 85 98 106 107 119 125 126 128 139 146 160 169 202 207 209 228 234 249 250 254 256 267 270 272 275 281 283 294 295 314 326 328 348 349 353 370 382 385 397 398 416 417 420 436 456 459 474 484 493 508 521 522 526 530 532 541 543 551 552 554 558 568 569 575 583 585 587 626 630 665 666 670 679 725 726 746 772 783 793 800 807 823 835 836 843 844 856 863 870 890 919 925 928 932 958 961 965 981 1001 1016 1017 1027 1073 1077 1084 1094 1112 1136 1139 1148 1149 1150 1159 1165 1175 1185 1186 1189 1204 1214 1215 1254 1282 1291 1311 1316 1335 1338 1359 1377 1399 1404 1412 1417 1430 1445 1448 1463 1485 1486 1491 1494 1502 1503 1517 1528 1538 1544 1547 1551 1552 1562 1565 1566 1604 1605 1606 1633 1662 1684 1698 1712 1725 1728 1734 1740 1742 1743 1744 1755 1758 1761 1762 1778 1784 1801 1818 1820 1821 1835 1838 1844 1879 1889 1891 1894 1898 1912 1920 1923 1924 1928 1936 1940 1943 1944 1962 1974 1976 1977 1985 1988 2007 2009 2030 2035 2062 2081 2082 2094 2107 2128 2129 2140 2200 2205 2209 2210 2225 2237 2240 2242 2243 2252 2253 2271 2275 2284 2296 2308 2344 2365 2400 115 126 150 295 341 348 404 443 454 542 545 664 701 737 855 872 958 1067 1072 1107 1134 1136 1187 1235 1413 1446 1496 1600 1638 1738 1744 1784 1790 1797 1824 1908 2041 2050 2094 2163 2271 2321 2345 2364 2402 2404 2412 CAACGG/CCGTTG 1 -3 195 246 28 -47.5 2 20 23 29 37 39 41 50 51 54 55 58 59 60 63 72 78 79 82 88 89 90 91 95 100 103 110 112 115 131 133 134 150 176 187 188 196 210 211 213 223 238 256 268 282 293 299 306 313 320 326 342 344 359 371 384 410 422 423 432 434 445 451 452 453 458 464 470 478 482 485 495 504 553 585 637 641 645 652 654 656 657 658 686 687 717 718 726 748 788 794 813 815 816 817 831 837 857 866 892 900 912 936 949 977 982 983 987 1014 1028 1040 1085 1086 1097 1111 1136 1145 1153 1154 1166 1172 1174 1183 1188 1195 1196 1241 1244 1251 1257 1271 1280 1284 1287 1321 1345 1371 1373 1384 1391 1425 1427 1471 1484 1488 1494 1498 1501 1504 1511 1536 1553 1556 1561 1567 1573 1587 1601 1617 1623 1657 1673 1678 1687 1688 1689 1710 1719 1757 1761 1762 1792 1892 1913 1918 1933 1943 1973 1975 2006 2009 2065 2120 2165 2170 2174 2241 2270 2274 2286 2345 2348 2350 2362 2369 2 43 63 89 150 176 461 469 488 578 631 817 818 836 876 927 933 1086 1129 1194 1247 1272 1558 1650 1924 2021 2339 2386 TTGGAC/GTCCAA 0 -5 227 243 39 -39.6 6 11 14 32 46 54 69 83 94 98 109 111 113 121 123 128 130 132 145 146 168 169 175 195 202 222 234 248 251 253 261 265 284 306 311 314 319 334 349 356 368 376 381 384 411 415 416 422 425 436 442 443 452 454 477 492 493 494 510 516 519 525 526 527 558 561 577 584 587 589 608 615 620 630 638 642 656 669 679 681 684 687 688 697 698 700 701 715 717 718 734 749 768 769 781 783 789 793 797 844 849 862 870 877 890 896 906 909 914 930 951 958 961 973 977 999 1016 1017 1026 1034 1055 1056 1070 1100 1111 1131 1136 1137 1141 1159 1173 1191 1215 1221 1274 1278 1282 1289 1290 1300 1304 1310 1320 1323 1338 1392 1421 1430 1438 1441 1447 1448 1468 1469 1478 1479 1481 1486 1499 1502 1508 1517 1521 1525 1547 1561 1579 1584 1618 1621 1625 1642 1655 1673 1689 1714 1715 1726 1738 1744 1746 1758 1769 1785 1790 1802 1819 1837 1846 1870 1871 1872 1874 1913 1921 1928 1929 1991 1994 2017 2076 2079 2082 2093 2094 2101 2118 2155 2162 2183 2184 2206 2208 2226 2236 2253 2254 2283 2286 2313 2314 2350 2358 2375 2376 2397 2407 44 91 116 187 188 334 354 387 404 501 692 697 727 779 859 902 926 1079 1289 1298 1326 1353 1361 1520 1542 1615 1701 1705 1714 1820 1838 1938 1944 2062 2087 2138 2223 2233 2315 TTGGAC/GTCCAA 2 -4 227 243 39 -39.6 6 11 14 32 46 54 69 83 94 98 109 111 113 121 123 128 130 132 145 146 168 169 175 195 202 222 234 248 251 253 261 265 284 306 311 314 319 334 349 356 368 376 381 384 411 415 416 422 425 436 442 443 452 454 477 492 493 494 510 516 519 525 526 527 558 561 577 584 587 589 608 615 620 630 638 642 656 669 679 681 684 687 688 697 698 700 701 715 717 718 734 749 768 769 781 783 789 793 797 844 849 862 870 877 890 896 906 909 914 930 951 958 961 973 977 999 1016 1017 1026 1034 1055 1056 1070 1100 1111 1131 1136 1137 1141 1159 1173 1191 1215 1221 1274 1278 1282 1289 1290 1300 1304 1310 1320 1323 1338 1392 1421 1430 1438 1441 1447 1448 1468 1469 1478 1479 1481 1486 1499 1502 1508 1517 1521 1525 1547 1561 1579 1584 1618 1621 1625 1642 1655 1673 1689 1714 1715 1726 1738 1744 1746 1758 1769 1785 1790 1802 1819 1837 1846 1870 1871 1872 1874 1913 1921 1928 1929 1991 1994 2017 2076 2079 2082 2093 2094 2101 2118 2155 2162 2183 2184 2206 2208 2226 2236 2253 2254 2283 2286 2313 2314 2350 2358 2375 2376 2397 2407 44 91 116 187 188 334 354 387 404 501 692 697 727 779 859 902 926 1079 1289 1298 1326 1353 1361 1520 1542 1615 1701 1705 1714 1820 1838 1938 1944 2062 2087 2138 2223 2233 2315 AGACCA/TGGTCT 0 -3 227 239 64 -26.6 1 11 16 26 33 38 40 55 56 62 66 68 75 76 86 93 98 117 133 134 138 152 153 175 189 201 249 254 262 264 282 293 296 298 312 318 330 341 364 396 398 399 405 427 449 503 507 522 531 541 544 550 552 556 579 580 588 590 591 605 608 634 657 658 693 696 716 725 740 741 755 763 771 784 791 803 804 823 840 853 935 951 967 972 978 996 997 1001 1011 1049 1055 1056 1064 1073 1075 1080 1084 1099 1105 1150 1151 1156 1165 1170 1187 1189 1213 1214 1216 1217 1234 1237 1246 1262 1263 1278 1282 1292 1306 1308 1310 1322 1328 1348 1364 1368 1369 1375 1387 1412 1413 1414 1437 1442 1447 1452 1459 1499 1500 1502 1504 1513 1514 1526 1527 1562 1569 1570 1595 1604 1608 1615 1632 1636 1644 1647 1650 1651 1658 1667 1669 1670 1680 1681 1690 1692 1693 1703 1707 1725 1726 1735 1744 1747 1748 1769 1771 1772 1797 1799 1800 1820 1833 1838 1851 1882 1888 1892 1893 1896 1906 1907 1934 1940 1960 1968 1976 1978 2016 2028 2057 2077 2089 2091 2115 2126 2132 2135 2157 2162 2174 2176 2186 2204 2255 2262 2271 2298 2311 2326 2331 2340 2345 2349 2364 2381 2382 60 103 115 200 202 209 212 272 276 296 299 311 339 363 425 454 552 616 675 679 703 748 755 785 792 843 866 884 896 906 965 970 977 1061 1107 1117 1175 1195 1227 1241 1346 1375 1481 1535 1594 1659 1662 1700 1737 1916 1933 1999 2008 2010 2032 2034 2155 2163 2170 2186 2190 2256 2358 2412 CCAACG/CGTTGG 1 -4 185 227 32 -39.7 1 7 20 23 29 39 41 55 58 59 60 63 69 78 79 82 88 89 90 91 95 100 103 110 112 133 134 137 146 150 176 210 211 223 244 256 268 282 299 306 313 319 320 326 331 335 342 359 368 371 384 410 422 423 432 434 452 458 470 478 485 495 542 553 585 588 593 624 625 637 641 652 654 656 657 658 677 691 696 748 759 788 798 813 817 837 866 892 902 930 960 975 976 977 987 990 1014 1019 1028 1040 1076 1085 1086 1145 1148 1149 1166 1172 1174 1179 1195 1201 1206 1231 1241 1257 1271 1280 1287 1308 1330 1371 1373 1391 1393 1425 1427 1446 1447 1455 1471 1484 1494 1498 1499 1511 1556 1561 1567 1587 1593 1603 1623 1647 1657 1673 1687 1688 1689 1690 1719 1725 1757 1761 1762 1792 1802 1819 1842 1874 1913 1918 1933 1943 1954 1973 1975 1994 2006 2009 2017 2045 2065 2099 2120 2126 2138 2140 2170 2283 2306 2345 2350 2362 2369 43 91 113 137 150 248 276 300 431 456 571 673 697 711 836 878 888 992 1143 1227 1305 1329 1492 1602 1650 1653 1768 1800 1862 1964 2233 2261 GACCAT/ATGGTC 0 -2 205 223 59 -25.1 12 16 21 30 40 56 73 77 84 98 105 111 133 134 139 155 170 175 195 202 205 217 222 249 254 264 275 280 294 295 300 301 303 307 318 319 334 336 349 350 357 360 361 363 369 386 387 397 405 411 416 420 442 450 474 482 486 493 516 519 530 532 554 558 562 568 569 571 579 580 586 587 590 591 608 640 645 688 704 708 727 734 740 741 764 768 769 778 783 784 842 847 863 880 896 902 908 916 929 940 942 967 972 1001 1011 1018 1030 1048 1049 1055 1056 1068 1072 1077 1078 1094 1110 1119 1144 1165 1193 1213 1214 1218 1220 1239 1246 1281 1292 1309 1310 1313 1322 1330 1335 1357 1364 1369 1412 1413 1414 1437 1445 1447 1460 1491 1500 1502 1508 1513 1514 1517 1529 1547 1560 1562 1568 1575 1584 1593 1612 1613 1618 1638 1654 1684 1686 1698 1707 1724 1725 1744 1771 1798 1821 1905 1915 1947 1952 1955 1968 1978 1995 2002 2003 2016 2059 2062 2082 2100 2127 2131 2153 2169 2183 2208 2243 2245 2268 2298 2308 2310 2326 2346 2376 21 78 119 120 128 146 200 299 322 348 363 441 459 473 487 501 522 565 748 755 764 771 772 793 906 950 977 981 1001 1003 1107 1155 1187 1305 1326 1413 1458 1494 1507 1612 1620 1628 1765 1781 1910 1933 1992 2007 2008 2032 2068 2123 2128 2177 2226 2287 2305 2358 2372 TTGACC/GGTCAA 0 -4 194 222 62 -23.7 8 10 16 17 21 28 34 62 63 77 84 93 100 103 113 118 126 132 133 134 135 141 154 156 173 194 200 205 212 222 225 239 240 278 293 299 317 323 336 344 349 350 369 371 375 381 410 417 426 432 439 452 460 461 476 485 511 513 518 530 548 566 578 623 629 630 644 664 671 672 697 704 708 713 719 721 732 736 764 772 780 783 787 799 818 851 876 883 929 931 941 960 984 1001 1016 1017 1018 1029 1035 1043 1044 1048 1110 1146 1147 1152 1183 1184 1188 1195 1232 1241 1251 1257 1271 1281 1287 1288 1292 1303 1307 1316 1324 1345 1347 1349 1350 1372 1376 1386 1388 1399 1425 1439 1451 1458 1484 1486 1489 1491 1533 1562 1568 1575 1589 1590 1591 1594 1596 1623 1624 1647 1666 1684 1686 1689 1719 1722 1752 1766 1793 1794 1805 1842 1853 1862 1914 1927 1967 1973 2015 2068 2075 2084 2086 2089 2093 2096 2146 2161 2169 2174 2179 2181 2223 2245 2260 2263 2329 2340 2345 2364 2384 2400 54 58 73 106 155 161 229 265 359 416 473 488 515 588 635 712 805 889 950 986 1003 1012 1027 1064 1155 1244 1255 1338 1377 1443 1454 1465 1489 1542 1558 1578 1583 1595 1600 1620 1627 1653 1693 1696 1759 1823 1862 1864 1877 1884 1907 2103 2158 2165 2199 2212 2233 2248 2265 2333 2335 2386 ATGGAC/GTCCAT 0 -5 211 221 40 -33.4 6 8 12 23 45 52 85 87 92 116 120 133 134 146 150 155 167 172 184 198 202 204 224 228 233 246 250 251 257 260 264 267 324 328 333 334 343 357 376 382 385 393 404 423 424 426 429 436 455 461 470 479 492 496 507 579 580 596 600 647 681 700 701 711 712 724 726 727 729 754 757 770 779 790 801 807 813 818 823 844 847 859 863 871 874 876 890 916 925 936 940 943 944 958 974 975 976 1012 1013 1016 1017 1030 1060 1067 1072 1093 1095 1109 1119 1127 1128 1144 1145 1153 1154 1155 1157 1164 1166 1175 1191 1194 1204 1207 1209 1272 1284 1300 1311 1333 1335 1336 1349 1350 1439 1476 1477 1506 1507 1515 1518 1521 1529 1542 1559 1565 1566 1568 1609 1633 1653 1662 1677 1685 1724 1738 1772 1781 1786 1787 1801 1805 1808 1817 1824 1825 1856 1889 1891 1905 1912 1913 1940 1943 1951 1957 1958 1985 2005 2035 2068 2072 2092 2094 2107 2137 2153 2166 2174 2177 2182 2184 2202 2205 2216 2224 2281 2282 2299 2301 2318 2328 2344 2362 2365 2369 2373 2375 2399 2405 2406 12 119 184 205 266 289 341 423 896 899 941 985 1085 1148 1189 1214 1231 1250 1296 1451 1613 1664 1746 1781 1809 1873 1888 1940 1981 2013 2015 2033 2035 2046 2121 2163 2217 2273 2314 2371 ATGGAC/GTCCAT 2 -4 211 221 40 -33.4 6 8 12 23 45 52 85 87 92 116 120 133 134 146 150 155 167 172 184 198 202 204 224 228 233 246 250 251 257 260 264 267 324 328 333 334 343 357 376 382 385 393 404 423 424 426 429 436 455 461 470 479 492 496 507 579 580 596 600 647 681 700 701 711 712 724 726 727 729 754 757 770 779 790 801 807 813 818 823 844 847 859 863 871 874 876 890 916 925 936 940 943 944 958 974 975 976 1012 1013 1016 1017 1030 1060 1067 1072 1093 1095 1109 1119 1127 1128 1144 1145 1153 1154 1155 1157 1164 1166 1175 1191 1194 1204 1207 1209 1272 1284 1300 1311 1333 1335 1336 1349 1350 1439 1476 1477 1506 1507 1515 1518 1521 1529 1542 1559 1565 1566 1568 1609 1633 1653 1662 1677 1685 1724 1738 1772 1781 1786 1787 1801 1805 1808 1817 1824 1825 1856 1889 1891 1905 1912 1913 1940 1943 1951 1957 1958 1985 2005 2035 2068 2072 2092 2094 2107 2137 2153 2166 2174 2177 2182 2184 2202 2205 2216 2224 2281 2282 2299 2301 2318 2328 2344 2362 2365 2369 2373 2375 2399 2405 2406 12 119 184 205 266 289 341 423 896 899 941 985 1085 1148 1189 1214 1231 1250 1296 1451 1613 1664 1746 1781 1809 1873 1888 1940 1981 2013 2015 2033 2035 2046 2121 2163 2217 2273 2314 2371 AACGGT/ACCGTT 1 -2 170 211 39 -31.5 0 10 20 23 29 30 38 54 55 58 59 60 63 72 82 90 91 95 100 103 110 112 133 134 176 187 188 210 211 213 223 238 268 299 306 317 321 323 326 352 359 369 371 410 411 423 432 434 439 445 452 454 458 464 470 478 485 495 504 511 536 553 557 637 641 652 654 656 674 680 687 696 697 704 729 748 754 782 794 813 815 816 823 829 831 837 892 905 911 912 949 957 977 982 987 994 1014 1039 1040 1057 1077 1085 1086 1114 1124 1125 1132 1133 1136 1153 1154 1195 1196 1228 1241 1280 1287 1307 1332 1345 1373 1425 1427 1448 1471 1484 1494 1498 1510 1536 1550 1561 1567 1623 1647 1673 1687 1688 1689 1710 1757 1761 1762 1764 1792 1918 1921 1933 1943 1953 1973 1975 1989 2022 2023 2078 2120 2170 2173 2174 2241 2244 2286 2299 2348 2350 2362 2369 2388 2389 2 63 74 428 461 469 552 626 645 654 742 753 785 799 834 836 895 898 1086 1102 1208 1247 1249 1329 1372 1421 1539 1550 1564 1726 1778 1844 1854 1906 2067 2212 2305 2339 2386 GACCGT/ACGGTC 0 -2 147 193 15 -42.8 8 10 20 23 28 29 34 54 55 58 60 63 82 90 91 95 100 103 110 112 132 133 134 152 153 175 187 188 210 211 223 231 236 238 268 288 299 303 306 308 317 323 325 352 371 410 417 428 432 436 443 445 452 454 458 464 470 478 485 504 511 536 557 609 633 637 641 656 666 680 687 697 704 715 729 748 754 775 794 813 823 825 829 831 892 905 911 912 954 957 965 982 987 994 1002 1014 1039 1040 1072 1127 1153 1154 1241 1250 1267 1275 1277 1285 1287 1307 1327 1369 1425 1426 1448 1463 1471 1494 1536 1558 1584 1591 1623 1647 1663 1673 1689 1761 1762 1819 1866 1918 1933 1943 1951 1973 1975 2120 2166 2170 2174 2177 2244 2258 2286 2329 2369 2 86 298 376 469 753 897 899 1455 1479 1550 1854 2015 2212 2386 GGACAA/TTGTCC 0 -3 174 193 42 -25.7 2 9 19 39 41 45 61 64 78 79 92 116 129 148 156 193 196 197 198 229 239 250 253 257 262 267 279 286 293 298 311 316 322 351 376 378 379 391 392 426 429 440 446 449 453 486 507 525 536 579 580 584 586 596 603 604 633 655 696 699 700 701 703 715 727 730 754 755 756 779 781 788 789 795 796 797 807 815 816 825 828 845 855 871 873 878 890 906 909 914 942 946 956 981 994 1006 1007 1021 1080 1082 1109 1118 1122 1136 1170 1255 1305 1310 1312 1391 1418 1425 1428 1459 1469 1478 1479 1486 1492 1521 1525 1526 1527 1531 1542 1595 1609 1614 1633 1640 1653 1679 1747 1764 1786 1787 1801 1807 1826 1835 1840 1841 1847 1889 1890 1900 1909 1922 1978 1981 1982 1985 2039 2061 2073 2074 2094 2095 2124 2142 2152 2157 2158 2160 2162 2200 2202 2214 2285 2309 2311 2313 2314 2317 31 89 116 268 297 325 436 696 700 758 779 823 852 1007 1040 1148 1284 1296 1353 1376 1574 1595 1597 1615 1735 1809 1833 1838 1981 2046 2051 2062 2096 2139 2145 2229 2274 2278 2282 2304 2378 2382 GGACCG/CGGTCC 0 -3 164 191 13 -44.0 2 14 17 23 43 44 54 55 57 59 82 90 91 109 121 123 128 132 152 153 172 186 192 210 215 216 232 236 246 264 268 277 303 306 313 324 325 334 340 415 425 433 436 454 458 461 470 477 479 504 562 589 633 654 656 678 687 695 697 715 719 724 729 734 738 742 747 748 775 785 786 794 809 813 825 829 838 913 925 940 973 987 1029 1072 1106 1107 1122 1127 1134 1135 1142 1153 1154 1157 1198 1229 1230 1250 1309 1317 1320 1322 1323 1327 1421 1428 1444 1447 1448 1478 1479 1481 1494 1508 1521 1522 1523 1536 1555 1583 1584 1655 1660 1664 1673 1714 1715 1767 1774 1819 1839 1854 1872 1874 1913 1929 1934 1943 1951 1967 1987 2029 2040 2050 2051 2071 2084 2107 2120 2166 2177 2184 2216 2224 2226 2253 2254 2258 2286 2312 2373 2381 2382 2399 298 373 398 469 727 836 899 1079 1560 1820 2015 2223 2242 GACCAC/GTGGTC 0 -2 158 167 34 -23.4 5 26 36 40 43 44 48 66 117 128 138 152 153 155 158 160 189 201 312 341 346 360 361 365 374 386 387 395 411 422 460 468 469 471 472 476 494 503 506 531 548 555 561 567 574 579 580 600 605 611 615 622 630 662 688 689 693 702 711 712 763 771 844 870 892 905 943 944 950 951 962 996 997 1006 1012 1051 1052 1063 1079 1083 1101 1119 1202 1204 1207 1248 1249 1288 1289 1290 1300 1308 1315 1323 1324 1327 1328 1338 1339 1347 1349 1350 1355 1364 1372 1375 1387 1415 1439 1468 1482 1499 1502 1526 1527 1595 1600 1615 1618 1634 1642 1669 1670 1690 1703 1725 1726 1769 1772 1781 1833 1864 1892 1896 1905 1967 1974 2016 2028 2037 2043 2044 2072 2077 2089 2100 2126 2141 2154 2157 2161 2182 2204 2255 2256 2340 2349 2368 115 202 209 285 301 310 311 370 444 616 843 868 967 1117 1195 1241 1260 1286 1428 1487 1510 1558 1659 1787 1862 2013 2123 2138 2141 2142 2217 2265 2304 2305 TGGACA/TGTCCA 2 -3 158 160 32 -22.7 6 45 52 67 92 95 116 146 148 156 193 196 198 233 253 257 267 284 286 298 311 322 343 368 376 378 379 381 385 392 426 429 436 454 507 517 525 526 536 544 584 586 596 599 609 655 669 696 697 699 700 701 711 712 730 754 770 779 781 783 789 790 793 797 823 828 849 857 862 890 906 907 909 914 930 940 981 1021 1055 1056 1069 1093 1109 1111 1128 1136 1141 1173 1191 1208 1215 1247 1255 1300 1305 1310 1317 1388 1392 1424 1430 1462 1469 1476 1477 1486 1499 1507 1518 1521 1525 1526 1527 1542 1609 1633 1738 1746 1756 1758 1764 1769 1786 1787 1801 1808 1817 1819 1859 1860 1863 1877 1878 1889 1891 1909 1943 1985 1991 1994 2026 2073 2094 2152 2162 2182 2202 2285 2309 2313 2314 2362 2368 2369 2397 2405 2406 2407 31 116 289 325 334 387 423 692 697 729 779 896 1148 1296 1353 1501 1701 1714 1746 1781 1809 1838 1873 1981 1985 2015 2046 2062 2087 2121 2315 2382 TGACCG/CGGTCA 0 -3 126 158 15 -32.9 6 8 10 16 17 20 28 34 55 58 60 63 93 100 103 110 113 132 133 134 141 175 206 225 226 240 278 317 323 352 371 375 410 417 431 432 443 452 456 464 476 478 485 511 566 619 630 641 663 671 672 680 694 719 855 881 905 911 931 941 957 960 994 1036 1037 1039 1040 1116 1147 1194 1241 1247 1258 1267 1277 1287 1303 1307 1326 1330 1369 1425 1451 1458 1462 1489 1521 1588 1591 1596 1622 1624 1663 1689 1691 1700 1765 1766 1805 1814 1819 1845 1877 1878 1933 1939 1966 1973 1988 1989 2068 2096 2100 2146 2149 2150 2170 2174 2179 2244 2246 2247 2278 2303 2329 2394 86 111 189 376 1020 1086 1211 1443 1595 1600 2103 2212 2244 2290 2386 CGGACC/GGTCCG 0 -4 132 154 11 -35.1 5 18 30 40 43 44 55 57 66 73 103 105 114 122 128 152 153 170 210 215 216 236 237 280 303 313 314 322 433 468 469 481 482 490 498 499 516 519 549 562 582 608 615 617 622 631 632 633 645 654 688 695 702 719 738 747 749 773 774 811 825 829 848 880 983 987 1029 1072 1077 1097 1106 1107 1122 1134 1135 1137 1168 1169 1193 1198 1202 1206 1229 1230 1239 1250 1309 1311 1317 1322 1327 1330 1351 1360 1369 1374 1428 1433 1443 1460 1481 1508 1511 1555 1583 1603 1659 1698 1767 1798 1837 1905 1915 2016 2037 2043 2044 2084 2094 2109 2138 2142 2161 2205 2242 2268 2271 2274 2346 2373 2381 2382 142 298 446 637 793 1179 1305 1910 2079 2142 2201 AGGACC/GGTCCT 0 -4 130 148 22 -25.3 2 5 17 26 43 44 57 59 73 91 128 155 174 186 192 201 222 228 232 277 300 301 303 340 402 411 425 450 460 471 472 474 489 493 504 521 555 557 558 562 569 571 577 586 611 636 653 662 678 683 729 746 785 786 809 838 863 890 911 929 942 957 1008 1027 1043 1101 1102 1127 1129 1130 1148 1149 1218 1229 1230 1249 1262 1263 1297 1299 1309 1310 1339 1382 1384 1429 1437 1444 1508 1522 1523 1564 1572 1600 1618 1620 1634 1657 1660 1703 1789 1832 1849 1850 1865 1874 1877 1878 1911 1952 1953 1955 1984 1995 2040 2050 2051 2071 2098 2100 2120 2137 2153 2154 2177 2256 2285 2308 2312 2376 177 373 398 459 644 803 836 967 998 1171 1260 1299 1378 1560 1689 1727 1756 1809 2007 2015 2083 2137 GTGACC/GGTCAC 0 -4 121 138 35 -16.4 20 36 48 50 51 63 96 99 110 124 139 144 156 158 159 160 175 189 195 199 205 209 226 256 266 280 286 292 294 295 360 361 363 370 380 386 387 402 412 431 443 456 464 475 506 574 619 642 842 855 881 908 911 994 1008 1009 1036 1037 1040 1078 1116 1178 1248 1267 1277 1315 1326 1330 1357 1369 1413 1414 1439 1462 1463 1472 1487 1493 1525 1538 1544 1553 1579 1582 1586 1588 1602 1607 1615 1663 1684 1689 1700 1712 1725 1797 1805 1856 1933 1939 1971 1972 1988 2002 2003 2141 2143 2149 2150 2236 2239 2243 2244 2280 2283 2297 2298 2303 2308 2324 2400 147 189 202 257 312 321 354 398 444 477 522 635 742 924 942 1071 1187 1227 1293 1309 1320 1378 1428 1472 1489 1603 1654 1686 1893 1967 1977 2123 2223 2305 2401 TGGACT/AGTCCA 2 -3 138 135 30 -17.9 11 52 69 83 87 113 123 138 168 175 194 202 204 222 224 235 269 333 348 393 404 416 424 442 443 492 496 537 549 574 577 608 615 617 620 659 669 681 684 717 718 726 749 760 766 792 797 801 859 874 876 951 958 961 1016 1017 1026 1034 1047 1060 1063 1067 1070 1100 1137 1159 1173 1178 1191 1194 1202 1220 1272 1274 1276 1278 1308 1311 1335 1342 1349 1350 1425 1438 1448 1502 1506 1515 1559 1561 1580 1581 1608 1625 1724 1726 1738 1744 1785 1799 1800 1805 1817 1824 1825 1837 1846 1885 1905 1923 1924 1957 1958 1960 2005 2035 2068 2076 2093 2094 2101 2103 2137 2155 2174 2184 2236 2238 2282 2290 2301 2333 2344 2350 2358 2375 2381 2382 11 12 44 52 108 150 266 561 602 830 902 1231 1250 1289 1392 1451 1520 1542 1615 1664 1888 1940 1944 2033 2144 2163 2233 2235 2366 2371 GACCGA/TCGGTC 0 -2 121 133 18 -23.9 2 9 14 16 30 59 113 119 121 132 141 148 172 175 192 216 227 232 240 241 246 264 271 277 334 375 443 454 461 476 483 503 527 561 562 566 619 630 663 671 672 678 724 729 742 761 790 824 940 945 973 1029 1089 1092 1095 1106 1107 1116 1176 1177 1194 1212 1248 1264 1267 1309 1373 1421 1428 1451 1462 1478 1479 1481 1521 1540 1588 1596 1622 1655 1664 1691 1714 1715 1765 1767 1838 1854 1872 1877 1878 1892 1913 1929 1964 1966 1967 1968 1989 2029 2040 2050 2051 2067 2084 2100 2136 2149 2150 2161 2179 2216 2226 2254 2278 2299 2312 2335 2352 2373 2394 189 398 636 641 727 836 855 1086 1426 1443 1560 1600 1785 1820 2035 2201 2290 2364 GACCAG/CTGGTC 0 -2 118 132 34 -15.5 0 5 33 34 71 75 76 120 135 154 161 165 167 174 180 184 189 200 262 286 293 298 314 330 364 380 396 425 427 460 481 491 503 507 519 540 548 600 615 644 677 707 751 755 756 774 791 803 804 840 853 883 972 1064 1075 1097 1099 1105 1152 1156 1234 1237 1260 1261 1278 1283 1348 1357 1368 1369 1405 1425 1434 1435 1436 1442 1459 1473 1481 1500 1504 1525 1533 1553 1590 1603 1620 1636 1644 1650 1651 1722 1735 1753 1853 1865 1877 1878 1911 1964 1983 2091 2111 2142 2156 2171 2233 2260 2262 2299 2302 2311 2318 2324 2345 2380 2381 2382 188 257 283 286 312 416 566 896 986 1012 1044 1175 1214 1338 1361 1653 1662 1700 1809 1864 1884 1936 1938 1977 1988 1999 2034 2096 2158 2167 2201 2256 2306 2333 AAGGAC/GTCCTT 0 -5 118 129 40 -12.6 2 5 17 29 47 87 91 136 142 174 192 222 229 260 277 340 388 390 391 401 411 425 446 449 450 471 472 489 504 517 521 555 558 562 569 575 588 596 611 652 662 678 683 687 729 745 751 795 796 809 857 886 890 896 963 980 1008 1027 1030 1046 1115 1129 1130 1157 1160 1161 1170 1221 1229 1230 1262 1263 1297 1310 1341 1382 1404 1428 1429 1437 1444 1478 1479 1522 1523 1531 1578 1637 1640 1671 1728 1741 1832 1847 1849 1850 1874 1911 1952 1953 1982 1984 1995 2050 2051 2061 2097 2098 2100 2137 2138 2158 2256 2308 2312 2317 2368 2399 156 174 177 185 283 335 754 762 797 802 823 852 902 1063 1106 1171 1179 1282 1489 1559 1570 1579 1594 1615 1664 1677 1689 1697 1698 1727 1799 1833 1865 1935 2007 2051 2096 2137 2278 2307 AGACCG/CGGTCT 0 -3 106 126 18 -22.1 9 15 28 29 30 32 49 95 104 112 148 166 172 187 188 199 211 223 231 238 245 271 288 308 313 363 393 415 445 477 480 483 527 557 561 579 580 631 632 643 666 704 734 747 754 761 790 823 892 912 946 954 965 982 1002 1012 1053 1077 1089 1092 1095 1157 1176 1177 1198 1212 1222 1239 1248 1253 1275 1285 1317 1378 1426 1462 1463 1464 1471 1474 1540 1548 1558 1583 1623 1647 1686 1705 1761 1762 1798 1838 1866 1867 1968 2067 2075 2083 2136 2161 2224 2299 2335 2351 2352 2399 2 131 302 636 641 855 897 1209 1426 1455 1479 1550 1623 1715 1739 1785 2091 2364 GACCGG/CCGGTC 0 -2 114 125 11 -26.9 17 28 32 43 44 55 57 93 104 109 166 186 206 215 216 245 278 313 324 334 340 393 415 425 433 446 456 477 479 569 579 580 631 632 654 694 695 715 719 734 738 747 749 785 786 790 838 855 881 931 960 1012 1053 1077 1092 1122 1127 1134 1135 1142 1157 1198 1216 1217 1222 1239 1258 1303 1317 1320 1322 1323 1326 1330 1378 1447 1458 1462 1464 1489 1508 1521 1522 1523 1555 1583 1660 1689 1700 1705 1774 1798 1805 1814 1839 1845 1867 1874 1939 2068 2071 2075 2083 2096 2107 2175 2224 2246 2247 2253 2329 2381 2382 2399 111 302 373 632 1020 1211 1595 2091 2103 2201 2242 GTGGAC/GTCCAC 0 -5 110 115 26 -15.2 7 8 43 44 59 73 95 120 123 126 156 193 194 235 286 320 348 353 374 378 379 476 531 537 544 564 568 574 607 609 659 689 696 699 707 730 760 766 767 775 792 857 907 913 951 981 1047 1127 1142 1183 1202 1208 1220 1247 1276 1305 1308 1369 1388 1403 1407 1415 1421 1424 1462 1473 1536 1580 1581 1612 1613 1614 1624 1648 1649 1665 1735 1756 1760 1764 1799 1800 1821 1839 1846 1863 1877 1878 1885 1898 1923 1924 1947 1960 2026 2073 2085 2103 2152 2210 2239 2242 2285 2333 2358 2363 2381 2382 2390 2401 11 31 52 108 149 181 354 370 423 565 602 736 830 836 1364 1392 1452 1885 1937 2041 2056 2068 2099 2144 2242 2366 GTGGAC/GTCCAC 2 -4 110 115 26 -15.2 7 8 43 44 59 73 95 120 123 126 156 193 194 235 286 320 348 353 374 378 379 476 531 537 544 564 568 574 607 609 659 689 696 699 707 730 760 766 767 775 792 857 907 913 951 981 1047 1127 1142 1183 1202 1208 1220 1247 1276 1305 1308 1369 1388 1403 1407 1415 1421 1424 1462 1473 1536 1580 1581 1612 1613 1614 1624 1648 1649 1665 1735 1756 1760 1764 1799 1800 1821 1839 1846 1863 1877 1878 1885 1898 1923 1924 1947 1960 2026 2073 2085 2103 2152 2210 2239 2242 2285 2333 2358 2363 2381 2382 2390 2401 11 31 52 108 149 181 354 370 423 565 602 736 830 836 1364 1392 1452 1885 1937 2041 2056 2068 2099 2144 2242 2366 ACGGAC/GTCCGT 0 -5 83 106 25 -13.6 2 5 40 41 66 73 74 78 79 89 103 156 168 210 239 250 279 303 313 314 325 422 433 449 467 481 484 490 519 549 633 645 654 657 658 702 719 738 756 773 774 788 811 829 857 880 936 945 983 987 1028 1072 1097 1137 1193 1202 1212 1234 1250 1309 1351 1369 1374 1391 1418 1433 1474 1492 1511 1555 1556 1639 1785 1798 1809 1905 1915 2037 2109 2152 2160 2317 2330 142 183 298 429 445 469 504 578 782 793 818 853 1111 1121 1179 1225 1497 1595 1726 1782 1937 1970 2076 2079 2171 CGATGG/CCATCG 1 -3 93 106 33 -10.5 8 16 30 41 67 84 115 125 131 141 147 170 177 178 189 198 217 246 264 382 386 387 397 432 450 514 565 581 586 643 669 688 726 739 740 741 756 761 764 802 852 861 881 940 1007 1011 1018 1071 1078 1116 1118 1155 1162 1218 1239 1245 1297 1309 1314 1383 1421 1491 1584 1588 1607 1691 1698 1699 1707 1719 1730 1750 1751 1760 1802 1824 1825 1905 1968 1978 1989 2002 2003 2057 2088 2100 2127 2131 2137 2171 2268 2362 2373 179 184 232 249 341 442 489 696 716 765 771 880 905 911 1147 1245 1277 1490 1491 1559 1633 1657 1696 1713 1863 1866 1913 1940 2031 2218 2287 2366 2371 CACTGG/CCAGTG 1 -3 83 99 20 -14.3 0 5 36 50 51 117 120 138 165 167 174 200 203 286 314 320 327 345 360 361 364 374 435 471 472 481 488 493 513 548 567 599 635 644 650 651 655 664 690 791 828 910 1028 1063 1152 1241 1255 1283 1357 1368 1379 1418 1423 1425 1526 1527 1591 1603 1620 1650 1651 1697 1760 1763 1857 1858 1865 1877 1878 1967 2032 2033 2034 2118 2126 2145 2167 2228 2238 2255 2309 2320 2340 1 188 537 545 619 692 746 790 883 916 1199 1409 1514 1662 1716 1856 1924 2121 2170 2217 ACCGGT/ACCGGT 1 -2 76 95 16 -15.5 17 26 38 43 44 55 57 69 84 104 118 164 176 186 206 216 245 280 324 340 393 415 425 456 468 469 477 623 691 693 715 719 734 747 785 786 790 792 855 881 922 1008 1012 1038 1119 1157 1198 1216 1217 1222 1258 1301 1315 1317 1320 1458 1465 1489 1583 1700 1705 1805 1814 1839 1867 1939 2068 2096 2107 2116 2178 2224 2283 2301 2325 2399 40 53 246 499 511 632 641 642 1363 1773 1859 2077 2091 2103 2201 2242 CAGACC/GGTCTG 0 -4 87 92 23 -11.4 30 32 55 86 93 112 133 134 138 152 153 231 282 288 313 347 364 445 449 483 522 556 578 588 608 643 696 763 823 853 887 927 935 978 996 997 1001 1049 1075 1077 1092 1105 1150 1151 1213 1214 1222 1239 1248 1278 1285 1292 1310 1364 1369 1464 1504 1569 1570 1583 1604 1647 1658 1669 1670 1692 1693 1735 1747 1748 1761 1762 1834 1851 1862 1906 1940 1970 2077 2089 2135 2204 2262 2287 2298 2381 2382 2 121 180 282 679 757 878 897 977 1061 1111 1346 1361 1535 1594 1615 1626 1737 1785 1933 2015 2358 2378 CCGATG/CATCGG 1 -4 78 89 27 -9.2 16 18 20 30 84 101 102 115 128 141 170 177 178 189 198 240 246 264 382 450 538 582 586 643 669 688 726 730 740 741 802 939 940 1007 1018 1078 1116 1118 1155 1163 1260 1261 1282 1293 1297 1309 1421 1576 1588 1607 1622 1691 1703 1704 1719 1730 1735 1747 1750 1751 1765 1767 1877 1878 1968 1978 2055 2088 2100 2127 2131 2268 2299 2362 2373 2374 2393 2394 2 191 223 232 249 490 710 711 804 856 941 1075 1277 1479 1523 1530 1587 1633 1713 1785 1794 1860 1866 2031 2142 2218 2354 GGGCAA/TTGCCC 3 -1 82 85 11 -16.1 50 51 103 116 147 151 177 178 197 250 263 289 327 420 459 467 473 475 515 529 532 546 547 569 573 584 597 598 639 726 739 761 777 807 832 841 917 919 928 930 951 956 969 970 971 1000 1031 1079 1112 1166 1202 1203 1242 1257 1313 1343 1403 1462 1481 1519 1534 1611 1753 1834 1901 1930 1966 2021 2057 2064 2084 2088 2134 2164 2202 2268 2301 2337 2388 2389 2409 2410 9 232 434 752 779 936 1264 1528 1673 1802 2350 TGACCC/GGGTCA 0 -3 79 80 26 -7.8 56 96 124 159 170 193 194 199 225 256 277 280 292 337 344 359 381 402 442 456 461 500 518 563 578 595 612 613 683 691 713 787 818 834 874 876 908 984 1009 1183 1223 1257 1271 1316 1376 1386 1423 1448 1493 1579 1586 1594 1602 1654 1677 1684 1700 1708 1719 1793 1794 1797 1805 1834 1842 1913 1914 1942 1961 1980 1981 2075 2084 2137 2283 2338 2345 2372 2400 6 13 106 183 202 398 565 635 828 1202 1293 1377 1378 1416 1489 1627 1654 1823 1893 1967 1993 2034 2199 2223 2234 2335 GGACCT/AGGTCC 0 -3 79 76 17 -10.5 32 73 130 145 192 222 235 237 251 260 349 356 455 490 494 516 527 564 577 587 638 642 749 773 781 807 862 890 911 926 974 999 1102 1129 1130 1155 1164 1183 1207 1299 1304 1333 1336 1351 1382 1429 1433 1481 1510 1536 1564 1572 1621 1689 1717 1760 1789 1790 1822 1823 1829 1832 1842 1856 1898 2040 2079 2098 2100 2107 2109 2128 2129 2177 2242 2283 2328 2358 2376 177 181 250 283 354 404 505 644 1132 1171 1689 1727 1756 1808 1937 2079 2317 GGGACC/GGTCCC 0 -4 75 76 24 -7.7 27 41 60 68 90 192 199 217 283 365 405 458 498 499 532 542 554 600 640 690 715 734 742 778 781 798 880 892 903 926 940 950 974 979 996 997 1024 1165 1214 1260 1261 1313 1335 1341 1358 1412 1425 1482 1536 1568 1635 1654 1717 1774 1799 1800 1822 1823 1829 1842 1854 1934 1943 1987 2029 2062 2107 2128 2129 2163 2258 2262 2310 2325 2380 74 91 110 250 291 348 505 683 764 787 841 981 1132 1413 1487 1503 1808 1937 1988 2023 2096 2311 2317 2372 GGACCC/GGGTCC 0 -3 74 73 16 -10.3 7 103 126 128 169 201 219 251 322 402 493 498 499 510 531 557 558 607 608 641 653 683 690 844 877 903 929 974 996 997 1008 1013 1024 1043 1095 1127 1131 1137 1166 1221 1229 1230 1262 1263 1301 1341 1374 1421 1437 1441 1482 1508 1565 1566 1642 1657 1659 1685 1726 1799 1800 1870 1871 1913 1921 1953 2017 2210 2246 2247 2262 2274 2325 2365 110 142 187 291 370 841 985 998 1085 1378 1613 1937 2023 2035 2083 2311 TGGGCA/TGCCCA 3 -2 70 71 10 -13.1 27 61 141 151 176 250 270 272 289 327 420 459 467 473 475 490 515 546 547 556 569 584 593 598 606 690 739 761 773 807 832 835 836 841 851 917 928 951 1041 1042 1112 1139 1257 1341 1359 1399 1456 1519 1534 1562 1621 1723 1736 1753 1760 1810 1898 1917 1930 1966 2021 2082 2109 2185 2228 2246 2247 2268 2409 2410 146 274 779 912 936 959 1079 1535 1621 2100 CTGGAC/GTCCAG 0 -5 60 62 15 -8.3 67 87 128 138 148 196 219 269 298 322 325 360 361 392 417 454 494 517 536 599 655 697 748 794 828 862 985 1021 1063 1072 1078 1173 1178 1249 1255 1283 1301 1322 1425 1448 1510 1526 1527 1572 1608 1697 1819 1909 1967 2040 2111 2156 2238 2246 2247 2290 2309 2340 2368 2384 146 150 283 325 469 561 746 1501 1538 1728 1924 1985 2235 2269 2382 CTGGAC/GTCCAG 2 -4 60 62 15 -8.3 67 87 128 138 148 196 219 269 298 322 325 360 361 392 417 454 494 517 536 599 655 697 748 794 828 862 985 1021 1063 1072 1078 1173 1178 1249 1255 1283 1301 1322 1425 1448 1510 1526 1527 1572 1608 1697 1819 1909 1967 2040 2111 2156 2238 2246 2247 2290 2309 2340 2368 2384 146 150 283 325 469 561 746 1501 1538 1728 1924 1985 2235 2269 2382 GGACAC/GTGTCC 2 -2 67 62 15 -8.3 31 74 95 279 302 368 390 454 468 469 503 517 526 588 599 628 637 669 700 701 711 712 790 793 850 862 907 936 988 1055 1056 1068 1069 1191 1213 1255 1317 1412 1423 1424 1499 1507 1518 1545 1620 1626 1637 1639 1671 1677 1709 1758 1849 1850 1859 1860 1891 1994 2021 2088 2097 2142 2152 2182 2397 2405 2406 234 429 469 575 607 692 729 853 1117 1146 1344 1428 1501 1677 2034 CCGGAC/GTCCGG 0 -5 57 60 8 -11.6 19 32 57 152 153 166 197 302 322 325 389 579 580 602 608 617 631 632 654 689 715 749 755 876 942 994 1029 1077 1092 1106 1122 1206 1239 1312 1322 1323 1327 1330 1464 1492 1508 1573 1583 1603 1698 1709 2157 2253 2261 2274 2311 2343 2346 2349 2373 2381 2382 22 76 637 1249 1496 1629 2155 2156 GGACTG/CAGTCC 2 -2 59 60 15 -7.8 52 87 89 123 138 155 273 274 325 401 424 442 463 476 496 583 602 615 620 640 692 754 760 859 1032 1033 1034 1047 1067 1137 1142 1178 1202 1234 1272 1278 1438 1578 1580 1581 1676 1699 1708 1768 1824 1825 1837 1880 1885 1957 1958 2066 2103 2137 2172 2311 2333 2381 2382 11 108 335 504 797 902 1033 1121 1163 1402 1711 2076 2212 2234 2235 GACCGC/GCGGTC 0 -2 38 50 6 -10.3 6 15 49 63 123 128 172 199 225 226 363 415 431 480 546 547 589 809 913 941 946 1229 1230 1247 1253 1444 1474 1548 1624 1686 1766 1987 1988 2146 2184 2303 2351 2361 131 897 1079 1623 1739 2223 CGCTGG/CCAGCG 1 -3 37 43 8 -7.3 31 53 83 123 135 184 263 322 392 421 427 480 546 547 677 697 774 991 992 993 995 1075 1218 1220 1357 1360 1474 1490 1500 1708 1914 1987 2033 2034 2178 2215 2324 11 120 1055 1170 1189 1338 1476 1829 CGACCG/CGGTCG 0 -3 33 36 5 -7.3 119 175 216 227 241 299 417 428 443 446 503 536 546 547 569 609 637 749 790 824 831 1012 1014 1264 1267 1373 1623 1918 1964 1975 2175 2361 2369 632 753 2035 2201 2242