#3035/3035 #21.80 # k-mer/r.c. Cluster Offset PosCt wPosCt NegCt HGP_10 TTGGTC/GACCAA 0 -4 565 556 123 -74.5 0 1 11 14 32 35 40 45 46 51 52 54 56 57 60 65 66 73 74 76 78 87 88 105 113 115 122 125 133 137 138 140 147 148 174 187 190 195 212 219 231 239 267 281 282 289 291 292 298 304 312 319 348 350 355 357 358 359 361 369 373 376 383 391 418 420 422 424 425 438 439 440 445 446 451 457 461 463 468 469 474 487 489 492 496 503 507 509 512 515 516 517 518 520 525 527 538 546 548 576 578 586 588 595 601 602 603 606 609 613 614 616 620 631 632 634 654 673 675 676 680 681 682 683 688 694 696 697 699 703 718 726 740 750 768 769 785 786 794 799 813 815 818 825 839 840 849 850 859 865 872 886 899 900 901 906 911 914 916 919 923 944 949 951 953 955 958 962 963 969 970 978 981 1008 1015 1017 1021 1024 1034 1050 1060 1071 1074 1077 1078 1087 1088 1095 1098 1102 1105 1106 1107 1117 1118 1132 1135 1139 1140 1142 1147 1154 1164 1169 1177 1188 1194 1196 1197 1211 1218 1223 1225 1245 1247 1250 1256 1263 1272 1276 1284 1288 1291 1293 1295 1301 1309 1310 1319 1338 1341 1343 1346 1349 1350 1351 1353 1355 1359 1361 1362 1367 1368 1376 1383 1398 1399 1407 1417 1430 1439 1445 1465 1477 1479 1482 1486 1491 1502 1505 1516 1536 1545 1548 1552 1555 1581 1584 1612 1621 1623 1635 1636 1640 1643 1652 1654 1656 1665 1668 1671 1672 1686 1689 1692 1693 1705 1706 1709 1713 1716 1719 1725 1730 1731 1733 1735 1737 1740 1745 1748 1759 1764 1766 1769 1771 1777 1782 1783 1797 1829 1832 1836 1842 1846 1848 1849 1873 1875 1883 1898 1902 1903 1907 1927 1929 1932 1940 1942 1945 1947 1973 1975 1978 1982 1988 1990 2000 2006 2009 2013 2020 2025 2029 2030 2033 2034 2039 2041 2054 2063 2068 2069 2077 2078 2080 2089 2091 2093 2094 2109 2114 2115 2118 2119 2134 2143 2144 2145 2147 2149 2160 2163 2164 2171 2172 2175 2177 2180 2182 2184 2185 2190 2191 2192 2193 2194 2198 2208 2219 2224 2230 2236 2239 2246 2247 2250 2262 2264 2267 2272 2280 2281 2287 2291 2292 2315 2321 2322 2323 2324 2328 2331 2333 2337 2338 2352 2357 2361 2369 2379 2385 2402 2403 2405 2407 2417 2418 2422 2429 2430 2433 2438 2447 2453 2456 2469 2476 2491 2493 2496 2501 2502 2503 2506 2508 2511 2515 2516 2520 2527 2530 2532 2536 2546 2551 2560 2561 2562 2587 2591 2592 2594 2600 2608 2610 2616 2619 2621 2626 2628 2629 2631 2634 2637 2641 2649 2651 2656 2660 2661 2662 2674 2681 2688 2691 2697 2698 2706 2708 2717 2718 2720 2730 2742 2747 2748 2756 2759 2760 2764 2767 2768 2780 2785 2793 2796 2798 2801 2806 2819 2822 2825 2834 2837 2842 2843 2846 2851 2854 2855 2859 2860 2863 2867 2868 2875 2879 2880 2881 2883 2890 2892 2904 2915 2916 2919 2922 2928 2931 2936 2939 2940 2941 2945 2949 2950 2956 2958 2961 2968 2969 2972 2979 2980 2988 3004 3010 3011 3019 3020 3023 3026 3032 3034 60 70 73 74 103 122 152 161 184 205 212 230 272 276 296 308 321 339 354 359 383 425 439 446 454 466 515 552 588 632 635 637 675 679 683 703 712 736 742 785 787 792 803 836 837 859 866 884 889 917 965 970 1061 1106 1154 1178 1179 1181 1216 1227 1244 1255 1278 1299 1320 1346 1375 1472 1503 1535 1594 1603 1621 1661 1686 1700 1705 1737 1759 1790 1808 1828 1877 1907 1916 1924 2010 2137 2155 2163 2165 2170 2186 2190 2273 2309 2364 2412 2433 2465 2495 2543 2582 2588 2617 2629 2640 2647 2713 2721 2752 2765 2791 2811 2829 2835 2887 2890 2926 2932 2951 3014 3022 TGGTCC/GGACCA 0 -3 517 522 61 -101.3 5 12 14 23 24 34 35 40 51 52 56 57 60 65 73 74 76 86 87 89 93 103 105 113 122 138 140 143 148 160 162 165 170 182 187 190 193 195 213 219 231 256 262 267 286 287 297 305 307 312 337 344 348 352 354 355 358 359 361 373 383 385 389 397 413 416 420 424 425 433 438 439 442 448 451 454 460 461 463 464 468 470 473 482 495 496 498 499 500 509 512 516 523 527 528 534 538 543 546 551 574 576 578 585 587 591 592 595 596 601 609 618 620 631 636 639 642 648 652 665 672 673 675 676 681 685 688 693 697 698 699 702 703 704 720 724 726 733 750 768 769 772 787 792 794 801 810 813 815 818 825 830 832 833 839 845 847 851 858 872 879 887 899 901 903 906 914 916 919 923 933 945 951 952 953 962 963 968 978 988 997 1005 1008 1017 1030 1032 1034 1046 1049 1053 1074 1088 1089 1098 1102 1104 1105 1109 1130 1132 1139 1141 1147 1148 1149 1154 1164 1180 1193 1217 1219 1220 1221 1222 1223 1227 1231 1245 1246 1247 1249 1250 1253 1266 1267 1269 1273 1278 1279 1280 1288 1302 1309 1310 1322 1338 1342 1343 1344 1351 1353 1359 1361 1362 1366 1375 1407 1416 1417 1438 1442 1447 1449 1453 1461 1472 1476 1486 1491 1500 1511 1516 1522 1528 1529 1533 1536 1549 1553 1558 1572 1591 1603 1612 1617 1621 1626 1643 1646 1648 1661 1667 1668 1669 1672 1673 1677 1679 1682 1685 1692 1694 1698 1703 1708 1721 1731 1733 1740 1747 1749 1764 1766 1776 1779 1780 1781 1783 1787 1790 1792 1829 1832 1842 1849 1850 1857 1861 1863 1869 1873 1875 1897 1910 1915 1922 1923 1924 1929 1944 1946 1961 1970 1973 1977 1979 1982 1985 1990 1997 2000 2006 2009 2013 2020 2030 2035 2036 2039 2042 2053 2054 2062 2078 2083 2087 2091 2117 2123 2124 2130 2133 2143 2147 2155 2163 2168 2169 2171 2180 2182 2185 2191 2192 2195 2196 2198 2208 2216 2230 2234 2243 2251 2265 2272 2281 2287 2290 2292 2294 2302 2306 2307 2308 2322 2324 2325 2330 2331 2337 2353 2359 2360 2365 2373 2385 2392 2393 2405 2409 2453 2458 2459 2460 2477 2487 2490 2491 2494 2499 2501 2506 2508 2515 2519 2520 2525 2526 2530 2534 2540 2587 2589 2590 2591 2597 2600 2609 2610 2615 2632 2633 2637 2641 2646 2652 2656 2660 2662 2668 2679 2688 2694 2696 2724 2728 2739 2740 2744 2748 2758 2767 2772 2780 2787 2790 2795 2798 2799 2808 2826 2829 2831 2832 2837 2839 2842 2851 2855 2858 2860 2863 2867 2868 2870 2879 2880 2892 2900 2904 2909 2915 2916 2917 2922 2923 2925 2928 2940 2941 2950 2963 2964 2968 2971 2979 2980 3000 3001 3003 3004 3010 3011 3014 3020 3023 3031 74 91 119 146 184 188 205 283 286 348 446 459 501 565 637 683 736 764 787 793 803 836 859 981 1179 1214 1260 1299 1305 1326 1361 1413 1487 1503 1705 1809 1910 1924 1938 1988 2007 2013 2068 2096 2137 2138 2142 2201 2217 2273 2372 2418 2432 2506 2588 2640 2682 2765 2798 2856 3022 TGGACC/GGTCCA 0 -3 531 515 47 -109.9 7 9 12 20 26 40 45 65 73 74 86 87 96 97 103 114 115 121 122 132 137 140 143 144 148 160 161 170 173 182 187 193 210 219 231 238 246 247 255 258 262 267 295 305 306 307 308 309 312 318 328 344 349 352 354 355 358 359 361 373 385 388 389 394 397 411 416 425 428 430 434 439 446 448 450 451 460 463 464 466 473 478 482 495 497 498 500 504 512 526 527 538 543 544 551 552 569 580 591 592 595 601 602 609 613 620 631 637 646 648 652 661 670 676 681 685 687 688 693 698 699 706 738 744 754 762 768 769 772 774 787 809 813 815 818 819 830 833 834 839 851 854 858 872 875 876 878 899 903 906 914 919 923 932 935 945 947 953 965 968 978 988 997 1017 1022 1027 1034 1040 1046 1049 1053 1055 1061 1068 1072 1074 1080 1082 1088 1089 1100 1101 1105 1109 1114 1119 1126 1149 1153 1158 1164 1165 1178 1217 1222 1227 1230 1231 1235 1238 1239 1243 1245 1250 1260 1261 1271 1274 1278 1280 1282 1284 1288 1300 1302 1306 1311 1316 1328 1342 1344 1345 1348 1353 1357 1359 1362 1364 1372 1385 1396 1409 1412 1415 1423 1432 1440 1442 1449 1453 1455 1457 1458 1461 1468 1475 1476 1478 1486 1489 1490 1491 1511 1513 1518 1522 1524 1528 1529 1530 1533 1540 1558 1563 1572 1579 1585 1591 1592 1600 1608 1612 1616 1617 1622 1626 1627 1632 1643 1661 1667 1677 1679 1682 1685 1692 1695 1699 1703 1721 1728 1731 1733 1740 1752 1766 1767 1774 1776 1779 1781 1784 1787 1799 1800 1808 1813 1820 1829 1837 1842 1853 1855 1857 1860 1861 1863 1865 1866 1868 1869 1894 1901 1910 1922 1936 1961 1963 1969 1970 1971 1973 1977 1990 2000 2003 2006 2009 2013 2016 2017 2020 2021 2028 2035 2036 2039 2046 2047 2051 2053 2054 2058 2078 2091 2101 2116 2123 2127 2128 2131 2133 2136 2137 2143 2147 2157 2158 2161 2163 2168 2169 2171 2179 2183 2184 2189 2192 2196 2203 2207 2212 2215 2216 2225 2231 2234 2238 2240 2251 2257 2258 2259 2265 2273 2281 2294 2302 2307 2314 2322 2324 2331 2334 2335 2357 2359 2366 2371 2384 2387 2392 2398 2415 2428 2445 2453 2458 2459 2465 2472 2479 2490 2499 2506 2515 2523 2531 2540 2543 2554 2557 2568 2581 2585 2587 2589 2590 2593 2597 2606 2610 2615 2622 2632 2633 2642 2646 2647 2652 2653 2654 2659 2668 2673 2679 2683 2685 2688 2690 2696 2700 2707 2726 2727 2731 2737 2744 2758 2767 2769 2772 2780 2787 2792 2795 2798 2799 2800 2808 2810 2821 2822 2829 2831 2833 2837 2838 2839 2842 2849 2851 2855 2857 2858 2870 2872 2874 2879 2880 2889 2891 2892 2900 2901 2904 2906 2909 2915 2916 2919 2923 2925 2937 2950 2955 2960 2961 2971 2982 2987 3001 3002 3003 3004 3011 3014 3020 3023 3032 3033 119 146 181 184 187 188 205 283 286 354 370 404 423 469 501 565 727 736 836 859 899 985 1079 1085 1214 1326 1361 1613 1705 1820 1924 1937 1938 2013 2035 2068 2138 2217 2223 2242 2273 2418 2682 2856 2901 3022 3031 GGTCCA/TGGACC 1 -1 531 515 47 -109.9 7 9 12 20 26 40 45 65 73 74 86 87 96 97 103 114 115 121 122 132 137 140 143 144 148 160 161 170 173 182 187 193 210 219 231 238 246 247 255 258 262 267 295 305 306 307 308 309 312 318 328 344 349 352 354 355 358 359 361 373 385 388 389 394 397 411 416 425 428 430 434 439 446 448 450 451 460 463 464 466 473 478 482 495 497 498 500 504 512 526 527 538 543 544 551 552 569 580 591 592 595 601 602 609 613 620 631 637 646 648 652 661 670 676 681 685 687 688 693 698 699 706 738 744 754 762 768 769 772 774 787 809 813 815 818 819 830 833 834 839 851 854 858 872 875 876 878 899 903 906 914 919 923 932 935 945 947 953 965 968 978 988 997 1017 1022 1027 1034 1040 1046 1049 1053 1055 1061 1068 1072 1074 1080 1082 1088 1089 1100 1101 1105 1109 1114 1119 1126 1149 1153 1158 1164 1165 1178 1217 1222 1227 1230 1231 1235 1238 1239 1243 1245 1250 1260 1261 1271 1274 1278 1280 1282 1284 1288 1300 1302 1306 1311 1316 1328 1342 1344 1345 1348 1353 1357 1359 1362 1364 1372 1385 1396 1409 1412 1415 1423 1432 1440 1442 1449 1453 1455 1457 1458 1461 1468 1475 1476 1478 1486 1489 1490 1491 1511 1513 1518 1522 1524 1528 1529 1530 1533 1540 1558 1563 1572 1579 1585 1591 1592 1600 1608 1612 1616 1617 1622 1626 1627 1632 1643 1661 1667 1677 1679 1682 1685 1692 1695 1699 1703 1721 1728 1731 1733 1740 1752 1766 1767 1774 1776 1779 1781 1784 1787 1799 1800 1808 1813 1820 1829 1837 1842 1853 1855 1857 1860 1861 1863 1865 1866 1868 1869 1894 1901 1910 1922 1936 1961 1963 1969 1970 1971 1973 1977 1990 2000 2003 2006 2009 2013 2016 2017 2020 2021 2028 2035 2036 2039 2046 2047 2051 2053 2054 2058 2078 2091 2101 2116 2123 2127 2128 2131 2133 2136 2137 2143 2147 2157 2158 2161 2163 2168 2169 2171 2179 2183 2184 2189 2192 2196 2203 2207 2212 2215 2216 2225 2231 2234 2238 2240 2251 2257 2258 2259 2265 2273 2281 2294 2302 2307 2314 2322 2324 2331 2334 2335 2357 2359 2366 2371 2384 2387 2392 2398 2415 2428 2445 2453 2458 2459 2465 2472 2479 2490 2499 2506 2515 2523 2531 2540 2543 2554 2557 2568 2581 2585 2587 2589 2590 2593 2597 2606 2610 2615 2622 2632 2633 2642 2646 2647 2652 2653 2654 2659 2668 2673 2679 2683 2685 2688 2690 2696 2700 2707 2726 2727 2731 2737 2744 2758 2767 2769 2772 2780 2787 2792 2795 2798 2799 2800 2808 2810 2821 2822 2829 2831 2833 2837 2838 2839 2842 2849 2851 2855 2857 2858 2870 2872 2874 2879 2880 2889 2891 2892 2900 2901 2904 2906 2909 2915 2916 2919 2923 2925 2937 2950 2955 2960 2961 2971 2982 2987 3001 3002 3003 3004 3011 3014 3020 3023 3032 3033 119 146 181 184 187 188 205 283 286 354 370 404 423 469 501 565 727 736 836 859 899 985 1079 1085 1214 1326 1361 1613 1705 1820 1924 1937 1938 2013 2035 2068 2138 2217 2223 2242 2273 2418 2682 2856 2901 3022 3031 GTCCAA/TTGGAC 0 -1 423 412 55 -74.1 6 11 26 40 45 71 81 87 96 97 103 104 114 121 132 135 137 144 159 161 168 170 173 186 187 193 225 231 233 243 246 251 270 295 297 301 305 306 318 328 331 349 359 368 371 373 377 380 385 388 389 397 411 417 425 428 439 446 449 450 464 473 478 482 489 490 498 500 504 512 526 527 538 540 541 551 552 554 566 570 573 578 579 580 591 592 595 602 604 607 609 613 620 623 626 627 628 631 646 652 657 661 664 670 681 693 698 699 707 735 736 743 744 754 775 777 787 789 798 815 823 833 838 843 856 863 899 917 920 923 935 947 953 961 965 971 994 995 997 1009 1014 1031 1033 1046 1067 1068 1088 1105 1107 1119 1122 1126 1146 1153 1158 1161 1164 1178 1208 1217 1227 1230 1231 1232 1234 1235 1237 1256 1261 1278 1282 1284 1287 1306 1311 1328 1336 1342 1344 1345 1353 1357 1362 1372 1375 1385 1391 1392 1396 1402 1405 1412 1415 1423 1424 1426 1434 1449 1455 1457 1458 1466 1468 1473 1475 1476 1478 1482 1489 1498 1511 1518 1522 1524 1526 1528 1529 1539 1552 1558 1559 1564 1569 1577 1579 1591 1596 1617 1618 1627 1630 1637 1653 1660 1667 1674 1675 1677 1692 1695 1714 1718 1745 1752 1760 1766 1774 1789 1799 1829 1831 1837 1839 1842 1848 1850 1855 1857 1866 1870 1876 1877 1880 1881 1901 1905 1926 1929 1931 1936 1963 1969 2003 2006 2008 2010 2014 2017 2020 2021 2035 2036 2039 2047 2050 2051 2058 2078 2084 2085 2091 2116 2120 2128 2131 2133 2136 2138 2151 2153 2158 2161 2171 2183 2189 2196 2197 2201 2203 2212 2220 2226 2227 2235 2238 2251 2253 2255 2258 2259 2265 2273 2274 2278 2281 2294 2296 2313 2314 2322 2334 2348 2351 2374 2378 2384 2398 2415 2435 2436 2453 2457 2465 2475 2481 2483 2485 2486 2490 2507 2508 2510 2523 2540 2541 2543 2547 2554 2569 2575 2582 2585 2589 2597 2606 2615 2632 2636 2648 2654 2655 2659 2683 2688 2702 2709 2719 2726 2729 2738 2744 2754 2758 2759 2767 2772 2780 2781 2783 2799 2800 2801 2807 2811 2821 2822 2823 2831 2855 2857 2858 2861 2870 2889 2894 2913 2915 2919 2930 2932 2934 2943 2960 2961 2982 2987 2995 2998 3001 3013 3014 3022 3033 44 91 116 187 188 334 354 387 404 501 692 697 727 779 859 902 926 1079 1289 1298 1326 1353 1361 1520 1542 1615 1701 1705 1714 1820 1838 1938 1944 2062 2087 2138 2223 2233 2315 2418 2446 2458 2605 2682 2696 2701 2722 2755 2767 2774 2793 2825 2853 2870 3031 GGTCAA/TTGACC 1 -1 360 372 77 -51.1 9 10 15 18 29 38 55 67 72 76 80 91 101 104 115 118 121 122 129 138 145 147 156 164 166 192 198 200 211 212 214 218 232 235 239 266 268 273 277 282 291 315 316 319 320 328 331 333 347 349 351 353 355 375 380 384 391 401 403 409 416 425 434 437 446 448 456 479 480 483 514 515 530 542 586 591 593 598 599 605 634 641 647 656 661 666 671 676 678 689 694 696 716 721 728 736 740 748 751 770 773 785 824 841 849 850 866 871 897 902 908 910 912 918 920 923 933 949 957 964 972 980 981 983 1007 1018 1024 1042 1050 1075 1079 1085 1093 1097 1108 1115 1117 1123 1128 1131 1143 1151 1155 1177 1180 1182 1188 1198 1204 1212 1216 1233 1241 1244 1253 1254 1263 1264 1272 1275 1283 1290 1320 1321 1324 1331 1334 1346 1347 1350 1355 1376 1380 1382 1383 1403 1404 1413 1428 1431 1436 1459 1460 1465 1479 1482 1484 1491 1505 1506 1542 1554 1568 1575 1580 1581 1593 1594 1606 1613 1624 1625 1633 1634 1639 1641 1644 1650 1663 1671 1690 1691 1697 1701 1707 1711 1730 1744 1758 1763 1768 1773 1774 1788 1802 1804 1805 1814 1824 1830 1836 1841 1847 1853 1861 1885 1886 1900 1906 1928 1939 1941 1951 1952 1957 1981 2007 2012 2015 2022 2043 2049 2057 2069 2076 2080 2109 2114 2129 2142 2146 2149 2155 2160 2162 2164 2168 2173 2175 2233 2244 2248 2257 2284 2341 2361 2366 2367 2383 2389 2394 2402 2408 2417 2419 2420 2424 2429 2431 2433 2437 2438 2449 2450 2456 2464 2471 2474 2479 2498 2499 2502 2503 2507 2512 2514 2519 2532 2544 2546 2563 2564 2576 2577 2580 2598 2599 2601 2618 2651 2661 2664 2672 2677 2682 2689 2691 2713 2714 2720 2745 2751 2760 2765 2768 2791 2796 2799 2806 2815 2828 2836 2871 2877 2878 2890 2897 2917 2922 2925 2931 2935 2938 2945 2947 2954 2981 2984 2999 3017 54 58 73 106 155 161 229 265 359 416 473 488 515 588 635 712 805 889 950 986 1003 1012 1027 1064 1155 1244 1255 1338 1377 1443 1454 1465 1489 1542 1558 1578 1583 1595 1600 1620 1627 1653 1693 1696 1759 1823 1862 1864 1877 1884 1907 2103 2158 2165 2199 2212 2233 2248 2265 2333 2335 2386 2460 2461 2478 2551 2614 2629 2656 2730 2790 2809 2810 2829 2890 2897 3028 ATGGTC/GACCAT 0 -4 364 363 74 -50.4 12 18 24 34 38 47 65 67 72 86 87 89 93 99 101 103 122 143 151 162 168 186 193 198 213 214 218 258 264 273 279 286 287 293 302 305 309 316 318 328 333 337 344 346 347 352 356 362 366 373 383 385 389 395 413 417 424 438 453 454 464 473 482 495 499 500 512 515 523 528 534 535 540 543 551 570 596 599 642 652 666 671 672 685 693 698 701 702 716 719 733 736 737 747 772 793 801 810 818 825 833 836 845 851 858 871 879 887 912 925 930 943 944 952 957 978 990 997 1005 1008 1029 1039 1041 1042 1049 1053 1059 1104 1105 1109 1129 1130 1131 1138 1139 1141 1149 1154 1156 1170 1175 1188 1198 1207 1210 1212 1219 1227 1236 1242 1246 1249 1253 1254 1263 1269 1273 1302 1305 1308 1322 1332 1334 1340 1348 1366 1367 1376 1404 1413 1419 1438 1442 1491 1499 1511 1517 1522 1528 1529 1533 1541 1553 1554 1560 1574 1590 1593 1613 1617 1621 1626 1630 1661 1663 1667 1673 1677 1699 1703 1704 1711 1743 1747 1756 1763 1764 1768 1769 1772 1780 1784 1787 1788 1790 1795 1815 1817 1822 1834 1840 1850 1854 1875 1876 1879 1897 1904 1909 1915 1924 1946 1951 1957 1961 1963 1970 1977 1979 1985 1994 1997 1998 2003 2024 2031 2035 2044 2055 2057 2074 2080 2082 2083 2109 2117 2123 2126 2130 2147 2152 2169 2173 2194 2195 2196 2202 2222 2229 2234 2243 2251 2262 2266 2276 2288 2290 2299 2302 2325 2330 2342 2358 2360 2361 2365 2366 2392 2431 2435 2442 2443 2450 2459 2477 2487 2490 2494 2497 2499 2512 2515 2525 2528 2539 2540 2544 2570 2572 2589 2590 2602 2609 2611 2612 2614 2615 2625 2630 2643 2646 2649 2652 2675 2679 2694 2696 2698 2728 2739 2750 2758 2795 2799 2806 2826 2829 2832 2839 2853 2857 2858 2864 2870 2873 2878 2896 2909 2912 2915 2922 2923 2929 2952 2954 2981 2993 2994 2997 3000 3006 3011 3016 3018 21 78 119 120 128 146 200 299 322 348 363 441 459 473 487 501 522 565 748 755 764 771 772 793 906 950 977 981 1001 1003 1107 1155 1187 1305 1326 1413 1458 1494 1507 1612 1620 1628 1765 1781 1910 1933 1992 2007 2008 2032 2068 2123 2128 2177 2226 2287 2305 2358 2372 2418 2461 2506 2514 2612 2631 2695 2709 2726 2805 2838 2856 2859 2869 3028 GTCCAT/ATGGAC 0 -1 376 360 52 -61.9 6 9 12 20 39 43 74 86 94 106 107 122 135 140 143 148 160 177 182 193 196 216 219 238 242 246 247 254 255 258 259 267 271 300 308 312 318 323 330 344 354 355 358 361 376 379 394 398 399 403 407 430 434 435 451 463 466 483 484 543 562 567 581 601 633 635 637 664 668 684 685 687 688 697 709 721 734 738 746 753 754 760 762 769 772 774 786 787 792 809 813 818 821 830 834 835 839 849 851 858 860 872 876 878 899 903 906 945 947 954 987 999 1003 1017 1026 1027 1034 1040 1049 1053 1055 1058 1061 1063 1074 1080 1082 1083 1089 1100 1101 1109 1110 1120 1149 1165 1205 1214 1233 1238 1243 1245 1247 1271 1273 1274 1285 1288 1302 1316 1321 1342 1348 1397 1412 1420 1429 1432 1453 1468 1474 1486 1490 1491 1507 1508 1519 1523 1524 1533 1546 1550 1563 1572 1573 1585 1586 1588 1592 1608 1631 1632 1641 1651 1662 1679 1688 1696 1699 1703 1721 1728 1733 1740 1756 1772 1776 1781 1784 1787 1800 1803 1806 1808 1813 1853 1857 1861 1868 1872 1902 1910 1916 1922 1930 1933 1949 1952 1961 1971 1973 1977 1989 1990 2000 2004 2013 2017 2024 2046 2052 2053 2074 2078 2086 2095 2096 2098 2111 2113 2115 2117 2123 2127 2128 2137 2143 2148 2157 2159 2163 2169 2174 2179 2184 2187 2192 2196 2207 2216 2224 2225 2228 2232 2235 2240 2245 2271 2283 2292 2293 2298 2300 2302 2307 2310 2314 2331 2335 2336 2359 2366 2369 2372 2390 2392 2397 2412 2416 2428 2430 2464 2472 2487 2506 2508 2517 2531 2542 2553 2556 2568 2571 2579 2583 2587 2588 2593 2603 2610 2615 2622 2637 2647 2652 2653 2667 2668 2679 2684 2685 2688 2690 2691 2700 2725 2727 2728 2737 2741 2743 2755 2763 2769 2772 2778 2783 2792 2795 2797 2800 2829 2833 2842 2847 2849 2851 2856 2857 2868 2874 2891 2898 2900 2901 2904 2905 2906 2911 2915 2916 2919 2925 2945 2948 2971 2985 2989 3002 3004 3008 3011 3018 3020 3023 3032 12 119 184 205 266 289 341 423 896 899 941 985 1085 1148 1189 1214 1231 1250 1296 1451 1613 1664 1746 1781 1809 1873 1888 1940 1981 2013 2015 2033 2035 2046 2121 2163 2217 2273 2314 2371 2413 2574 2623 2653 2666 2676 2752 2856 2911 2925 2934 3022 TGGTCA/TGACCA 0 -3 346 354 102 -36.2 0 18 29 31 41 45 62 66 67 72 78 80 88 112 115 118 125 133 145 147 149 151 152 157 180 186 192 198 212 214 218 239 273 276 279 281 282 291 298 304 316 319 326 328 333 346 347 352 355 357 362 364 366 381 383 391 418 439 440 445 446 457 469 485 489 492 508 511 514 515 525 582 586 588 593 598 599 602 614 623 629 634 653 660 666 671 694 696 708 714 716 717 736 740 773 807 824 849 850 859 866 871 908 912 920 923 925 930 933 934 949 955 957 969 978 981 984 1008 1024 1029 1039 1041 1042 1050 1060 1079 1085 1095 1107 1117 1131 1140 1169 1179 1180 1188 1198 1212 1218 1233 1261 1263 1264 1291 1301 1308 1319 1321 1327 1340 1346 1350 1355 1367 1373 1376 1380 1383 1403 1404 1410 1411 1413 1439 1445 1460 1465 1479 1482 1491 1499 1502 1505 1512 1545 1548 1554 1574 1581 1582 1590 1593 1594 1606 1613 1621 1623 1630 1633 1638 1654 1663 1671 1687 1704 1705 1711 1719 1730 1741 1743 1756 1763 1764 1768 1769 1772 1773 1788 1797 1815 1817 1836 1842 1850 1854 1887 1898 1902 1904 1951 1957 1976 1988 1994 2024 2032 2034 2043 2044 2057 2069 2073 2080 2094 2105 2109 2114 2134 2146 2149 2160 2164 2172 2175 2194 2202 2208 2244 2248 2257 2262 2263 2288 2299 2323 2338 2352 2353 2361 2366 2380 2383 2394 2417 2418 2420 2429 2431 2433 2435 2438 2442 2443 2447 2449 2456 2462 2484 2502 2503 2512 2515 2532 2536 2537 2539 2544 2546 2563 2570 2572 2602 2608 2616 2619 2651 2657 2658 2661 2664 2672 2691 2693 2697 2701 2713 2714 2720 2730 2747 2750 2751 2756 2760 2764 2768 2796 2801 2806 2807 2812 2817 2822 2836 2853 2854 2878 2881 2883 2890 2915 2922 2925 2929 2931 2936 2952 2954 2958 2972 2981 2994 3018 3026 3028 21 70 73 78 122 128 147 161 225 257 285 310 312 321 354 359 416 439 441 444 466 473 487 515 522 566 588 635 712 742 771 868 889 917 950 986 1003 1012 1155 1178 1187 1216 1227 1244 1255 1278 1286 1320 1338 1428 1458 1472 1494 1507 1510 1558 1603 1620 1621 1628 1653 1686 1759 1765 1787 1862 1864 1877 1884 1907 1977 1992 2123 2128 2158 2165 2167 2177 2265 2304 2305 2309 2333 2461 2465 2514 2612 2614 2617 2629 2653 2695 2709 2721 2810 2829 2859 2869 2890 2932 2951 3028 TGGTCT/AGACCA 0 -3 354 346 77 -44.8 1 11 23 27 32 34 38 46 47 54 56 60 76 87 99 101 108 122 127 142 180 191 252 258 282 285 289 292 296 300 302 310 326 335 343 348 350 356 365 369 373 404 422 424 457 474 487 497 503 507 515 517 518 520 540 543 570 603 606 614 654 655 658 680 683 701 710 715 718 719 722 737 741 747 750 783 786 793 799 802 840 865 877 886 911 943 957 958 970 1006 1010 1015 1021 1028 1036 1077 1078 1086 1087 1091 1106 1118 1129 1135 1138 1139 1158 1166 1168 1175 1187 1188 1194 1196 1207 1208 1210 1211 1225 1236 1242 1245 1254 1263 1268 1272 1284 1286 1293 1295 1305 1318 1325 1332 1334 1340 1341 1348 1349 1366 1367 1368 1376 1381 1387 1403 1406 1408 1420 1422 1427 1430 1437 1498 1499 1517 1531 1541 1552 1555 1556 1562 1565 1578 1580 1584 1606 1616 1626 1630 1635 1636 1640 1642 1652 1656 1664 1665 1686 1689 1693 1699 1709 1713 1716 1725 1727 1732 1735 1737 1745 1746 1748 1755 1759 1769 1771 1775 1777 1782 1784 1786 1792 1795 1822 1826 1840 1843 1846 1848 1850 1867 1869 1876 1897 1905 1906 1907 1909 1910 1927 1940 1945 1947 1963 1975 1978 1998 2003 2025 2027 2029 2031 2032 2033 2041 2055 2068 2074 2077 2082 2088 2089 2093 2099 2118 2119 2126 2144 2145 2147 2152 2170 2177 2190 2193 2194 2222 2224 2236 2239 2247 2250 2260 2262 2264 2266 2276 2280 2315 2321 2328 2330 2333 2342 2349 2356 2357 2358 2370 2402 2403 2407 2430 2437 2451 2469 2476 2493 2496 2503 2511 2516 2527 2528 2542 2551 2560 2562 2592 2600 2611 2619 2621 2625 2626 2628 2630 2634 2643 2649 2653 2674 2675 2681 2683 2698 2699 2708 2716 2717 2746 2757 2759 2761 2766 2785 2793 2806 2819 2825 2834 2841 2843 2846 2850 2864 2873 2907 2912 2939 2945 2949 2956 2968 2970 2979 2983 2993 2997 3006 3010 3011 3019 60 103 115 200 202 209 212 272 276 296 299 311 339 363 425 454 552 616 675 679 703 748 755 785 792 843 866 884 896 906 965 970 977 1061 1107 1117 1175 1195 1227 1241 1346 1375 1481 1535 1594 1659 1662 1700 1737 1916 1933 1999 2008 2010 2032 2034 2155 2163 2170 2186 2190 2256 2358 2412 2543 2582 2588 2631 2647 2681 2713 2726 2805 2818 2838 2887 2932 CAATGG/CCATTG 3 -1 324 343 84 -41.0 0 9 33 36 39 40 47 57 65 68 74 87 92 93 96 98 99 110 115 135 137 151 152 182 193 195 209 213 219 231 232 242 248 259 264 271 278 279 287 312 328 331 346 355 359 361 366 369 378 385 389 391 395 407 432 438 464 487 490 492 495 496 499 521 523 534 536 551 554 559 570 581 585 591 602 611 655 684 698 703 725 729 731 736 752 769 774 781 786 787 802 804 813 817 818 824 825 833 834 835 840 845 849 860 873 879 887 954 962 976 997 1008 1021 1023 1026 1033 1041 1046 1049 1055 1070 1080 1087 1089 1095 1105 1110 1111 1116 1118 1127 1128 1129 1132 1135 1139 1145 1149 1155 1161 1170 1175 1177 1188 1203 1212 1225 1226 1238 1253 1254 1263 1273 1278 1310 1334 1339 1349 1355 1358 1366 1370 1376 1402 1404 1419 1442 1445 1481 1493 1499 1511 1520 1522 1529 1533 1548 1553 1573 1574 1576 1583 1590 1594 1608 1614 1643 1652 1661 1662 1673 1688 1702 1706 1738 1744 1755 1763 1769 1797 1804 1812 1815 1817 1820 1850 1851 1854 1875 1876 1879 1881 1898 1902 1904 1916 1922 1933 1949 1951 1957 1964 1971 1978 1979 1980 1992 2008 2052 2057 2061 2063 2066 2078 2082 2092 2094 2135 2137 2140 2152 2169 2170 2182 2184 2194 2196 2204 2223 2224 2228 2234 2236 2245 2249 2251 2254 2266 2279 2280 2281 2290 2291 2300 2319 2330 2331 2359 2369 2374 2390 2411 2428 2430 2434 2442 2443 2483 2490 2492 2496 2497 2508 2517 2531 2540 2561 2564 2575 2598 2604 2612 2615 2627 2647 2658 2690 2694 2698 2750 2772 2799 2823 2828 2853 2857 2872 2873 2898 2908 2913 2928 2929 2936 2946 2952 2954 2959 2976 2981 3000 3010 3020 3023 88 105 112 115 121 150 193 197 283 291 312 325 326 348 373 440 470 501 545 737 779 860 879 971 981 1012 1036 1079 1085 1134 1148 1187 1225 1257 1413 1486 1670 1673 1760 1784 1814 1849 1860 1894 1941 1962 1974 1992 1996 2033 2050 2163 2258 2340 2342 2345 2349 2364 2386 2387 2402 2501 2554 2558 2573 2631 2669 2678 2696 2705 2708 2709 2713 2725 2733 2752 2798 2828 2849 2857 2956 2966 2995 3032 CCAATG/CATTGG 3 -2 316 336 65 -48.3 0 9 36 43 47 57 65 66 70 72 74 85 87 92 96 98 99 110 115 116 135 137 151 152 193 195 197 209 219 231 242 248 259 264 279 284 293 297 312 328 331 355 357 358 361 366 369 378 389 391 395 432 438 464 469 487 490 492 495 496 499 507 518 521 523 534 536 549 551 584 586 591 620 621 622 627 683 684 694 698 699 703 725 736 743 745 752 774 775 781 786 787 804 817 818 834 840 859 860 887 890 899 914 917 923 947 954 962 965 982 997 1008 1018 1021 1024 1041 1046 1048 1067 1070 1087 1088 1089 1095 1105 1110 1116 1118 1127 1132 1135 1139 1161 1164 1177 1185 1188 1197 1211 1218 1225 1226 1227 1238 1247 1253 1254 1263 1273 1278 1282 1310 1349 1355 1359 1361 1362 1366 1370 1396 1402 1404 1407 1419 1434 1442 1445 1481 1482 1489 1493 1503 1505 1522 1529 1532 1548 1553 1571 1574 1576 1585 1605 1608 1610 1621 1630 1640 1643 1652 1673 1678 1688 1692 1706 1711 1719 1740 1743 1755 1763 1769 1780 1797 1815 1823 1828 1850 1851 1854 1859 1864 1875 1876 1879 1881 1902 1904 1917 1945 1949 1970 1971 1978 1979 1980 1981 1992 2025 2034 2052 2063 2066 2078 2086 2092 2101 2127 2135 2137 2151 2161 2182 2190 2196 2198 2204 2213 2223 2224 2228 2236 2249 2251 2254 2255 2263 2269 2276 2279 2281 2288 2296 2319 2331 2346 2361 2369 2428 2434 2481 2490 2496 2497 2508 2527 2531 2540 2560 2575 2576 2598 2604 2615 2690 2698 2717 2718 2740 2756 2783 2809 2830 2851 2857 2872 2873 2884 2892 2898 2908 2913 2916 2931 2942 2950 2952 2959 2960 2992 3000 3010 3012 3022 3023 3024 115 126 150 295 341 348 404 443 454 542 545 664 701 737 855 872 958 1067 1072 1107 1134 1136 1187 1235 1413 1446 1496 1600 1638 1738 1744 1784 1790 1797 1824 1908 2041 2050 2094 2163 2271 2321 2345 2364 2402 2404 2412 2425 2439 2466 2475 2562 2578 2581 2696 2708 2808 2853 2876 2936 2937 2946 2951 2978 3002 TTGTCC/GGACAA 0 -3 305 297 59 -41.8 2 8 17 22 33 35 39 53 68 94 107 136 156 185 188 221 242 243 252 254 259 271 276 282 285 299 300 301 317 322 334 363 402 403 407 422 435 453 462 489 505 517 533 540 554 555 559 573 581 582 592 612 650 662 663 664 665 670 680 685 688 709 710 711 714 734 735 764 767 774 775 777 782 788 789 810 813 817 827 837 838 843 855 856 860 865 870 879 880 884 888 889 896 899 924 930 941 950 961 998 999 1000 1001 1009 1012 1014 1015 1016 1017 1056 1062 1067 1083 1094 1106 1110 1136 1161 1186 1226 1228 1232 1248 1270 1287 1289 1294 1295 1314 1321 1336 1337 1371 1377 1386 1398 1401 1421 1434 1437 1444 1466 1468 1475 1482 1487 1496 1510 1514 1524 1531 1532 1537 1546 1563 1564 1573 1584 1601 1606 1607 1635 1645 1653 1658 1659 1662 1683 1688 1713 1733 1734 1743 1748 1751 1758 1803 1811 1820 1821 1826 1827 1832 1833 1839 1851 1857 1872 1902 1915 1916 1921 1926 1930 1931 1933 1949 1954 1974 1998 2023 2040 2072 2073 2096 2097 2104 2115 2120 2121 2139 2141 2154 2174 2175 2187 2197 2200 2204 2214 2220 2226 2228 2266 2271 2292 2293 2305 2320 2329 2344 2345 2351 2354 2374 2377 2383 2386 2397 2411 2415 2425 2426 2430 2434 2444 2454 2457 2470 2482 2483 2500 2517 2522 2548 2551 2556 2567 2575 2584 2599 2601 2608 2613 2617 2624 2638 2639 2660 2670 2677 2684 2692 2697 2719 2722 2723 2725 2727 2733 2741 2754 2761 2771 2783 2790 2823 2830 2847 2848 2852 2861 2866 2886 2893 2926 2932 2941 2962 2965 2977 2996 3008 3018 3029 31 89 116 268 297 325 436 696 700 758 779 823 852 1007 1040 1148 1284 1296 1353 1376 1574 1595 1597 1615 1735 1809 1833 1838 1981 2046 2051 2062 2096 2139 2145 2229 2274 2278 2282 2304 2378 2382 2438 2445 2458 2676 2693 2722 2725 2726 2732 2752 2762 2775 2776 2793 2927 2933 3007 CCAACG/CGTTGG 3 -2 242 297 41 -52.0 1 7 14 16 20 24 28 33 35 46 48 51 52 55 62 68 77 78 79 91 100 122 124 126 135 144 148 161 166 167 187 202 203 215 220 229 236 247 248 256 267 289 291 304 305 306 307 314 319 342 351 359 360 377 384 397 405 409 425 447 456 457 466 467 493 509 549 588 590 594 597 603 613 614 623 629 630 632 633 638 673 676 680 706 750 762 784 798 809 811 815 827 888 894 896 902 905 906 922 927 929 940 946 948 957 958 975 983 1009 1019 1051 1054 1071 1074 1098 1101 1112 1119 1123 1132 1137 1155 1192 1204 1216 1221 1234 1269 1290 1299 1311 1322 1328 1336 1351 1360 1377 1391 1396 1400 1415 1452 1477 1479 1489 1516 1539 1596 1602 1609 1611 1640 1648 1653 1671 1692 1709 1710 1712 1714 1730 1752 1770 1774 1802 1813 1828 1844 1854 1866 1895 1898 1927 1969 1981 2003 2004 2010 2019 2021 2023 2050 2065 2069 2084 2085 2093 2116 2128 2131 2140 2142 2163 2167 2213 2228 2235 2242 2258 2269 2278 2281 2285 2301 2304 2311 2319 2334 2339 2425 2436 2463 2541 2574 2582 2600 2641 2643 2644 2650 2651 2656 2678 2700 2729 2737 2753 2763 2774 2791 2800 2827 2840 2850 2881 2947 2949 2951 2986 2989 3009 3026 43 91 113 137 150 248 276 300 431 456 571 673 697 711 836 878 888 992 1143 1227 1305 1329 1492 1602 1650 1653 1768 1800 1862 1964 2233 2261 2513 2555 2565 2568 2597 2736 2755 2764 2835 GGACCG/CGGTCC 0 -2 282 291 15 -71.3 2 15 20 26 46 58 73 78 79 96 97 114 121 142 144 161 170 177 183 202 207 227 238 247 258 261 262 265 287 302 306 308 309 318 325 340 349 360 382 388 405 410 411 428 430 434 439 446 451 466 475 504 552 563 592 613 628 630 637 646 659 661 670 673 676 682 687 693 700 704 705 706 738 739 744 749 757 758 761 762 766 776 819 820 834 851 854 875 876 927 932 947 953 960 965 973 1022 1035 1040 1056 1061 1066 1068 1072 1073 1080 1119 1125 1126 1150 1158 1159 1165 1178 1181 1230 1246 1251 1256 1260 1261 1267 1276 1300 1306 1311 1313 1316 1348 1359 1362 1364 1372 1385 1396 1398 1409 1412 1415 1418 1423 1432 1443 1455 1458 1462 1470 1475 1476 1489 1509 1524 1525 1557 1570 1579 1583 1585 1611 1616 1622 1632 1657 1678 1699 1728 1739 1742 1752 1765 1767 1784 1799 1800 1813 1837 1860 1865 1866 1884 1892 1908 1912 1916 1958 1963 1965 1969 1984 1986 1996 2003 2009 2017 2021 2028 2047 2051 2058 2112 2127 2128 2131 2137 2140 2158 2165 2172 2179 2183 2184 2189 2202 2207 2211 2212 2225 2231 2238 2240 2257 2258 2273 2275 2350 2363 2366 2387 2396 2398 2400 2445 2448 2464 2467 2472 2478 2480 2489 2498 2509 2523 2531 2538 2568 2574 2588 2622 2645 2653 2654 2673 2683 2685 2695 2700 2726 2731 2769 2779 2784 2788 2792 2800 2821 2827 2836 2901 2906 2919 2960 2961 2967 2974 2979 2982 2986 2987 2992 3027 3032 3034 298 373 398 469 727 836 899 1079 1560 1820 2015 2223 2242 2901 3031 CGGTCC/GGACCG 1 -2 282 291 15 -71.3 2 15 20 26 46 58 73 78 79 96 97 114 121 142 144 161 170 177 183 202 207 227 238 247 258 261 262 265 287 302 306 308 309 318 325 340 349 360 382 388 405 410 411 428 430 434 439 446 451 466 475 504 552 563 592 613 628 630 637 646 659 661 670 673 676 682 687 693 700 704 705 706 738 739 744 749 757 758 761 762 766 776 819 820 834 851 854 875 876 927 932 947 953 960 965 973 1022 1035 1040 1056 1061 1066 1068 1072 1073 1080 1119 1125 1126 1150 1158 1159 1165 1178 1181 1230 1246 1251 1256 1260 1261 1267 1276 1300 1306 1311 1313 1316 1348 1359 1362 1364 1372 1385 1396 1398 1409 1412 1415 1418 1423 1432 1443 1455 1458 1462 1470 1475 1476 1489 1509 1524 1525 1557 1570 1579 1583 1585 1611 1616 1622 1632 1657 1678 1699 1728 1739 1742 1752 1765 1767 1784 1799 1800 1813 1837 1860 1865 1866 1884 1892 1908 1912 1916 1958 1963 1965 1969 1984 1986 1996 2003 2009 2017 2021 2028 2047 2051 2058 2112 2127 2128 2131 2137 2140 2158 2165 2172 2179 2183 2184 2189 2202 2207 2211 2212 2225 2231 2238 2240 2257 2258 2273 2275 2350 2363 2366 2387 2396 2398 2400 2445 2448 2464 2467 2472 2478 2480 2489 2498 2509 2523 2531 2538 2568 2574 2588 2622 2645 2653 2654 2673 2683 2685 2695 2700 2726 2731 2769 2779 2784 2788 2792 2800 2821 2827 2836 2901 2906 2919 2960 2961 2967 2974 2979 2982 2986 2987 2992 3027 3032 3034 298 373 398 469 727 836 899 1079 1560 1820 2015 2223 2242 2901 3031 CAACGG/CCGTTG 3 -1 229 286 34 -53.7 2 16 20 24 28 33 35 44 46 48 51 52 55 62 63 68 77 78 79 91 100 102 109 122 144 148 155 161 166 167 179 187 202 203 205 215 220 229 230 247 248 267 282 289 291 306 307 331 342 351 359 360 364 384 397 405 409 419 420 423 425 428 436 447 454 456 466 475 549 590 594 597 603 604 613 614 623 630 638 646 672 673 706 744 759 762 784 793 798 809 811 812 827 853 872 888 894 896 902 905 915 916 927 940 946 957 973 975 983 1000 1019 1030 1054 1067 1071 1074 1080 1101 1122 1123 1137 1155 1173 1182 1192 1204 1214 1216 1221 1234 1273 1290 1322 1328 1360 1364 1377 1400 1409 1415 1421 1466 1479 1483 1489 1501 1515 1516 1539 1565 1582 1596 1602 1609 1611 1632 1650 1653 1666 1671 1710 1712 1714 1749 1752 1770 1774 1783 1802 1813 1816 1844 1847 1860 1866 1880 1895 1953 2004 2019 2021 2050 2065 2084 2088 2093 2128 2131 2140 2163 2167 2173 2213 2235 2301 2304 2311 2312 2319 2376 2402 2425 2440 2463 2468 2574 2582 2643 2644 2646 2650 2661 2678 2729 2763 2774 2777 2791 2800 2827 2840 2892 2945 2947 2951 2986 2988 2996 3009 2 43 63 89 150 176 461 469 488 578 631 817 818 836 876 927 933 1086 1129 1194 1247 1272 1558 1650 1924 2021 2339 2386 2478 2491 2660 2722 2775 2949 ACGGTC/GACCGT 1 -3 234 275 17 -64.5 9 10 16 20 24 28 29 37 46 48 51 55 78 79 91 100 121 122 142 144 161 166 168 179 202 203 215 223 224 227 229 230 235 247 274 287 291 294 306 309 320 335 351 384 391 405 406 409 411 419 425 428 436 440 447 456 466 475 479 491 524 582 592 594 597 613 621 627 628 646 651 661 666 670 678 682 687 706 709 744 759 762 766 776 784 786 791 812 820 853 875 890 915 927 932 938 940 946 947 960 973 975 977 1054 1061 1080 1094 1122 1124 1133 1155 1162 1174 1181 1199 1206 1215 1216 1218 1221 1230 1244 1267 1290 1304 1316 1348 1362 1364 1372 1390 1394 1409 1412 1415 1423 1439 1445 1470 1473 1489 1501 1504 1542 1557 1585 1589 1611 1616 1622 1624 1628 1629 1632 1634 1650 1657 1671 1676 1699 1700 1710 1712 1724 1730 1752 1774 1800 1810 1813 1844 1860 1866 1884 1892 1895 1953 1969 2021 2022 2056 2065 2131 2167 2173 2197 2207 2213 2225 2231 2240 2258 2292 2301 2326 2366 2376 2407 2408 2419 2440 2448 2449 2468 2471 2509 2533 2538 2574 2588 2635 2644 2645 2650 2678 2686 2760 2769 2774 2784 2791 2792 2827 2865 2868 2869 2887 2945 2951 2953 2967 2986 3009 3027 2 86 298 376 469 753 897 899 1455 1479 1550 1854 2015 2212 2386 2655 2847 AACGGT/ACCGTT 1 -4 211 259 46 -39.2 0 10 16 20 24 28 32 46 48 51 52 55 63 64 78 79 91 100 122 144 161 166 167 179 202 203 205 215 220 223 229 230 235 247 267 291 306 320 335 342 351 384 385 401 405 409 419 425 428 436 447 456 466 475 479 491 524 571 582 590 594 597 603 613 619 628 636 638 646 651 661 666 673 680 687 706 709 744 759 762 776 784 786 798 809 812 820 853 905 915 927 940 946 960 973 975 977 986 1019 1054 1065 1067 1080 1122 1123 1124 1133 1155 1162 1192 1216 1221 1234 1244 1290 1304 1322 1328 1348 1362 1364 1380 1400 1409 1415 1423 1466 1479 1489 1501 1513 1557 1580 1596 1609 1611 1616 1632 1650 1671 1710 1712 1724 1726 1730 1752 1770 1774 1783 1810 1813 1844 1860 1866 1880 1881 1895 1953 1990 2019 2021 2022 2050 2054 2065 2084 2093 2110 2131 2167 2173 2207 2213 2231 2241 2252 2277 2301 2304 2419 2440 2448 2471 2473 2538 2550 2561 2574 2616 2644 2650 2678 2729 2731 2760 2763 2767 2774 2776 2784 2791 2827 2858 2887 2896 2944 2945 2951 2953 2986 3009 2 63 74 428 461 469 552 626 645 654 742 753 785 799 834 836 895 898 1086 1102 1208 1247 1249 1329 1372 1421 1539 1550 1564 1726 1778 1844 1854 1906 2067 2212 2305 2339 2386 2479 2638 2660 2722 2949 2994 3001 TGGACA/TGTCCA 2 -3 257 246 48 -35.0 6 39 43 59 94 107 135 136 156 185 223 229 235 243 254 259 270 271 276 285 300 301 317 330 361 371 377 379 380 403 407 435 449 481 489 490 517 540 554 567 573 581 582 612 623 633 639 644 661 663 664 665 668 680 688 697 709 721 734 735 736 743 746 754 759 764 775 777 786 789 805 835 838 842 843 851 856 860 863 870 889 899 909 950 961 999 1009 1014 1017 1026 1059 1063 1067 1083 1094 1107 1110 1122 1134 1161 1186 1228 1232 1256 1285 1287 1294 1314 1321 1336 1342 1346 1397 1402 1420 1424 1427 1429 1434 1441 1466 1468 1474 1482 1498 1508 1523 1524 1531 1546 1547 1559 1564 1569 1573 1577 1578 1586 1618 1637 1641 1651 1653 1662 1688 1696 1718 1722 1734 1743 1772 1803 1826 1827 1839 1847 1850 1857 1872 1877 1881 1882 1889 1894 1902 1905 1916 1921 1926 1930 1931 1933 1949 1969 2011 2048 2052 2062 2085 2086 2096 2115 2120 2121 2139 2151 2159 2174 2187 2220 2226 2228 2235 2253 2255 2271 2283 2292 2300 2312 2313 2320 2329 2346 2351 2374 2377 2397 2415 2426 2430 2434 2444 2446 2457 2470 2473 2481 2482 2486 2508 2517 2532 2551 2556 2575 2623 2638 2644 2684 2719 2725 2729 2741 2754 2763 2781 2783 2797 2823 2828 2847 2848 2861 2886 2894 2913 2915 2932 2934 2943 2965 2977 2985 3008 3018 3032 31 116 289 325 334 387 423 692 697 729 779 896 1148 1296 1353 1501 1701 1714 1746 1781 1809 1838 1873 1981 1985 2015 2046 2062 2087 2121 2315 2382 2574 2605 2676 2696 2701 2722 2725 2726 2752 2755 2767 2776 2793 2853 2911 2933 GTGGTC/GACCAC 0 -4 246 243 41 -38.0 5 23 31 34 41 56 73 76 80 108 127 142 143 149 152 180 191 256 262 273 296 326 336 352 362 364 385 397 416 433 442 448 460 485 497 498 508 514 527 543 574 582 585 587 592 618 620 623 636 648 652 653 658 660 665 704 714 715 717 720 722 773 787 792 807 830 832 847 877 881 903 908 923 926 933 934 945 984 988 1010 1013 1032 1046 1053 1057 1085 1089 1148 1166 1168 1179 1180 1187 1217 1220 1221 1231 1233 1245 1261 1264 1267 1268 1278 1279 1303 1321 1323 1325 1327 1340 1342 1375 1380 1403 1406 1408 1416 1420 1449 1460 1498 1512 1531 1549 1552 1556 1558 1566 1572 1591 1606 1630 1642 1646 1664 1667 1679 1682 1685 1694 1698 1741 1775 1776 1779 1786 1792 1842 1861 1863 1897 1905 1910 1922 1923 2032 2035 2036 2042 2053 2088 2099 2105 2117 2133 2168 2170 2177 2185 2193 2208 2244 2257 2260 2263 2288 2294 2306 2307 2330 2332 2349 2353 2359 2370 2373 2383 2392 2393 2405 2409 2418 2451 2460 2462 2484 2503 2512 2519 2525 2535 2542 2563 2597 2600 2625 2633 2653 2657 2658 2668 2669 2672 2693 2724 2740 2746 2751 2761 2766 2772 2779 2787 2790 2797 2807 2831 2839 2850 2877 2882 2899 2900 2907 2917 2925 2963 2964 2968 2970 2983 2997 3003 3014 3030 115 202 209 285 301 310 311 370 444 616 843 868 967 1117 1195 1241 1260 1286 1428 1487 1510 1558 1659 1787 1862 2013 2123 2138 2141 2142 2217 2265 2304 2305 2487 2614 2653 2681 2798 2813 2818 CGGTCA/TGACCG 1 -2 204 234 19 -50.7 6 9 10 15 16 29 37 38 46 48 51 55 76 91 100 101 104 121 122 129 138 166 168 211 218 232 235 266 268 315 320 335 349 351 353 384 391 409 425 429 436 437 447 448 456 479 483 530 583 591 597 605 639 647 676 678 690 721 735 770 803 822 866 897 909 940 974 975 977 1007 1018 1054 1069 1075 1076 1093 1094 1122 1124 1133 1155 1162 1174 1190 1197 1199 1206 1216 1221 1241 1244 1251 1265 1269 1290 1320 1334 1347 1390 1424 1426 1428 1436 1441 1484 1506 1524 1542 1567 1580 1599 1602 1624 1625 1628 1629 1634 1639 1644 1649 1650 1655 1670 1691 1710 1724 1750 1774 1785 1824 1830 1844 1885 1899 1928 1952 1958 1965 1969 1981 1997 2005 2009 2012 2015 2022 2038 2049 2088 2167 2173 2213 2217 2233 2256 2260 2276 2277 2284 2317 2341 2368 2376 2395 2419 2432 2450 2452 2464 2471 2504 2509 2519 2525 2533 2559 2579 2586 2599 2601 2650 2677 2686 2690 2705 2760 2773 2774 2791 2796 2814 2828 2863 2877 2887 2935 2938 2945 2953 2955 2972 2991 3009 3013 86 111 189 376 1020 1086 1211 1443 1595 1600 2103 2212 2244 2290 2386 2460 2656 2809 3024 GGTCCT/AGGACC 0 -2 208 222 26 -41.9 2 5 15 23 24 52 58 65 73 76 79 96 143 165 170 177 183 191 212 214 219 261 265 286 287 302 325 372 382 383 385 433 438 439 461 464 475 496 524 528 534 541 574 608 620 624 630 642 682 687 698 702 703 720 726 733 739 749 758 792 794 801 810 818 820 839 846 871 879 887 899 951 952 953 962 980 1032 1044 1061 1064 1132 1137 1141 1148 1150 1160 1166 1180 1194 1219 1220 1246 1253 1266 1279 1338 1361 1375 1399 1407 1416 1418 1480 1500 1525 1549 1557 1570 1587 1603 1612 1646 1667 1669 1678 1694 1698 1708 1717 1739 1740 1742 1747 1749 1765 1783 1792 1832 1847 1849 1850 1875 1897 1924 1935 1948 1957 1965 1982 1997 2030 2042 2062 2079 2087 2124 2150 2155 2168 2185 2191 2195 2198 2202 2206 2208 2214 2241 2243 2290 2303 2306 2325 2387 2392 2396 2400 2405 2409 2448 2460 2467 2477 2491 2494 2499 2501 2511 2519 2525 2566 2574 2600 2609 2633 2637 2645 2662 2695 2724 2728 2740 2784 2790 2792 2820 2860 2861 2876 2903 2922 2941 2963 2964 2974 2975 2992 3034 177 373 398 459 644 803 836 967 998 1171 1260 1299 1378 1560 1689 1727 1756 1809 2007 2015 2083 2137 2506 2588 2640 2696 CCTTTG/CAAAGG 5 -4 207 213 71 -18.5 27 31 43 45 49 55 60 66 69 80 102 132 134 154 163 172 176 190 231 240 253 255 265 273 277 304 311 328 362 364 401 418 424 425 444 475 476 494 496 511 535 552 598 626 661 669 676 713 724 729 732 756 799 806 863 881 899 901 943 962 963 999 1027 1033 1062 1085 1090 1106 1136 1138 1160 1172 1181 1182 1183 1194 1209 1213 1235 1243 1262 1270 1277 1288 1289 1309 1317 1320 1369 1399 1403 1457 1476 1480 1482 1487 1495 1508 1510 1514 1518 1519 1520 1528 1531 1533 1536 1545 1555 1575 1590 1595 1599 1607 1623 1646 1664 1667 1680 1681 1690 1695 1726 1729 1732 1754 1764 1798 1856 1858 1861 1870 1873 1880 1885 1891 1900 1901 1936 1947 1975 1976 1982 2000 2019 2020 2031 2054 2064 2077 2119 2133 2138 2154 2176 2185 2188 2206 2216 2227 2267 2274 2277 2322 2365 2374 2378 2381 2408 2410 2411 2438 2457 2477 2486 2487 2492 2493 2507 2524 2531 2544 2562 2604 2608 2619 2665 2674 2681 2682 2694 2696 2697 2708 2722 2730 2760 2861 2885 2890 2907 2926 2936 2950 2958 2964 3025 34 44 66 79 106 143 177 193 233 243 337 374 446 542 597 647 681 697 700 804 830 833 877 914 916 922 929 979 1057 1130 1151 1171 1199 1232 1251 1379 1465 1479 1579 1604 1675 1775 1790 1803 1821 1830 1861 1890 1905 1915 1942 2007 2084 2103 2127 2164 2216 2295 2303 2311 2347 2446 2478 2659 2671 2693 2726 2806 2854 2963 3000 GGTCCG/CGGACC 0 -2 196 212 12 -50.8 5 14 34 46 56 58 65 73 89 91 93 105 113 138 142 162 202 207 217 227 228 262 287 297 303 337 340 348 360 410 413 442 454 459 468 470 500 516 546 570 576 578 585 587 592 607 618 636 652 659 665 672 673 675 676 700 704 705 723 724 730 761 766 776 825 847 916 927 933 956 959 973 1005 1008 1030 1035 1040 1056 1066 1068 1073 1096 1098 1102 1103 1125 1130 1150 1154 1159 1181 1223 1246 1247 1251 1256 1260 1267 1269 1280 1310 1313 1322 1343 1351 1360 1365 1398 1417 1438 1443 1470 1476 1493 1516 1536 1563 1583 1611 1621 1626 1648 1657 1738 1767 1892 1908 1915 1916 1923 1929 1946 1949 1958 1979 1984 1996 2009 2015 2017 2018 2083 2102 2112 2117 2130 2140 2165 2180 2182 2199 2211 2272 2287 2304 2308 2330 2337 2353 2363 2373 2393 2410 2478 2480 2498 2508 2509 2515 2520 2524 2530 2538 2552 2555 2588 2591 2641 2654 2660 2779 2795 2836 2851 2863 2867 2868 2917 2950 2968 2979 2980 3000 3005 3010 3031 142 298 446 637 793 1179 1305 1910 2079 2142 2201 2762 TCGGTC/GACCGA 1 -3 192 202 22 -39.4 2 8 26 38 64 89 101 104 110 121 129 138 168 170 183 207 222 232 234 238 250 258 261 265 268 294 302 318 327 353 408 428 434 448 450 474 483 504 512 527 530 583 591 621 630 637 639 647 687 738 746 757 765 770 816 848 851 876 953 961 965 974 1018 1020 1022 1025 1027 1035 1055 1069 1093 1111 1119 1126 1159 1165 1178 1179 1195 1197 1199 1241 1246 1286 1306 1311 1313 1398 1428 1432 1441 1443 1455 1458 1467 1471 1475 1476 1509 1524 1527 1602 1633 1639 1644 1670 1720 1728 1742 1750 1753 1765 1784 1799 1837 1884 1885 1893 1899 1927 1938 1963 1991 1996 2012 2025 2047 2051 2058 2088 2106 2112 2128 2137 2140 2158 2165 2172 2176 2179 2184 2211 2227 2233 2238 2256 2257 2277 2317 2341 2350 2368 2387 2391 2395 2400 2427 2437 2498 2504 2509 2523 2525 2559 2579 2654 2671 2677 2685 2686 2690 2700 2727 2773 2779 2788 2796 2805 2863 2877 2894 2897 2901 2908 2919 2935 2961 2974 2986 3013 3021 3032 189 398 636 641 727 836 855 1086 1426 1443 1560 1600 1785 1820 2035 2201 2290 2364 2460 2583 2901 2929 TGGACT/AGTCCA 2 -3 219 199 41 -27.3 11 43 71 104 106 114 127 159 168 193 196 216 226 233 260 323 375 376 378 389 399 417 483 484 541 562 566 570 578 579 604 607 615 626 628 632 635 657 660 684 707 742 744 753 760 789 797 798 821 823 849 917 920 925 947 954 971 982 987 988 994 995 1003 1031 1033 1058 1088 1107 1120 1152 1170 1200 1205 1208 1224 1233 1237 1245 1247 1252 1266 1273 1280 1302 1353 1375 1384 1392 1405 1423 1426 1443 1472 1473 1495 1507 1519 1539 1550 1552 1569 1588 1596 1602 1630 1631 1660 1674 1675 1714 1741 1745 1756 1760 1799 1838 1848 1855 1861 1870 1876 1901 1916 1929 1952 1989 2004 2008 2010 2014 2024 2035 2039 2050 2074 2078 2084 2095 2098 2107 2111 2117 2137 2138 2148 2153 2156 2159 2196 2197 2201 2232 2245 2247 2268 2278 2281 2293 2296 2298 2310 2314 2336 2348 2369 2372 2378 2390 2400 2412 2414 2416 2464 2475 2483 2485 2487 2507 2508 2510 2542 2571 2579 2595 2603 2615 2636 2637 2647 2648 2655 2667 2688 2702 2738 2740 2755 2759 2778 2783 2800 2801 2807 2811 2833 2856 2894 2898 2905 2911 2930 2933 2945 2948 2979 2980 2995 2998 3013 11 12 44 52 108 150 266 561 602 830 902 1231 1250 1289 1392 1451 1520 1542 1615 1664 1888 1940 1944 2033 2144 2163 2233 2235 2366 2371 2413 2458 2599 2623 2666 2703 2714 2720 2774 2825 2870 CTGGTC/GACCAG 0 -4 184 194 38 -27.6 0 5 27 29 62 112 118 138 140 145 157 160 165 170 172 180 182 192 252 276 282 285 297 300 302 310 343 354 365 381 404 439 470 474 511 514 587 593 598 614 629 639 655 708 710 711 724 741 750 768 783 792 802 824 833 845 859 866 920 968 1006 1028 1030 1036 1079 1085 1086 1091 1158 1193 1208 1222 1266 1280 1286 1308 1318 1344 1373 1381 1387 1410 1411 1422 1427 1437 1447 1453 1461 1463 1472 1476 1499 1500 1562 1565 1578 1580 1582 1594 1603 1606 1616 1626 1633 1638 1648 1669 1687 1704 1708 1721 1727 1732 1746 1749 1755 1773 1781 1826 1843 1857 1867 1869 1884 1887 1897 1906 1944 1976 2027 2043 2062 2073 2087 2124 2146 2155 2216 2248 2265 2267 2279 2308 2339 2353 2356 2380 2394 2420 2437 2449 2458 2526 2534 2537 2546 2597 2632 2660 2664 2683 2699 2701 2713 2714 2715 2716 2744 2752 2757 2808 2812 2817 2836 2841 2924 2925 2971 2978 2979 3001 3028 3031 188 257 283 286 312 416 566 896 986 1012 1044 1175 1214 1338 1361 1653 1662 1700 1809 1864 1884 1936 1938 1977 1988 1999 2034 2096 2158 2167 2201 2256 2306 2333 2432 2682 2810 2932 CCGGTC/GACCGG 1 -3 193 190 14 -42.5 15 37 46 58 73 76 92 97 158 177 184 207 266 268 280 308 315 318 325 340 349 360 382 388 410 429 437 439 446 451 484 534 543 576 605 617 640 659 670 673 676 690 693 700 704 705 721 735 739 746 749 761 770 803 819 822 834 866 897 1007 1008 1025 1040 1056 1061 1066 1068 1072 1075 1076 1093 1125 1154 1160 1190 1196 1202 1241 1251 1256 1260 1261 1265 1267 1269 1276 1334 1359 1385 1396 1426 1436 1441 1446 1462 1464 1484 1506 1515 1524 1525 1557 1570 1579 1580 1583 1599 1614 1624 1649 1655 1678 1702 1739 1767 1771 1785 1828 1830 1834 1865 1893 1908 1912 1916 1920 1946 1952 1958 1965 1984 1987 1997 2003 2009 2015 2017 2028 2038 2049 2071 2090 2110 2112 2125 2182 2194 2217 2260 2273 2289 2363 2396 2398 2404 2432 2445 2452 2464 2467 2474 2478 2480 2489 2495 2519 2531 2568 2591 2599 2622 2654 2673 2683 2695 2705 2726 2731 2789 2814 2821 2828 2836 2863 2906 2938 2955 2960 2972 2979 2982 2987 2992 111 302 373 632 1020 1211 1595 2091 2103 2201 2242 2809 3024 3031 GTCCTT/AAGGAC 0 -1 172 184 54 -18.5 2 5 15 24 42 58 79 106 123 130 165 170 183 212 214 221 255 265 295 302 319 325 363 383 385 422 439 457 461 462 475 477 481 496 528 534 536 574 608 620 630 638 646 650 679 682 687 698 708 720 758 792 794 801 805 820 833 837 846 855 863 899 913 930 962 969 1016 1049 1064 1106 1136 1150 1160 1194 1235 1253 1270 1288 1289 1305 1361 1375 1399 1418 1466 1475 1480 1496 1510 1525 1537 1599 1601 1603 1607 1615 1632 1678 1698 1747 1821 1833 1849 1850 1859 1874 1893 1924 1948 1965 1982 1997 2004 2010 2040 2047 2072 2097 2124 2150 2168 2195 2202 2206 2213 2214 2220 2241 2277 2290 2303 2306 2335 2345 2400 2405 2411 2425 2455 2477 2483 2491 2501 2511 2519 2525 2584 2587 2600 2627 2637 2641 2648 2679 2682 2695 2717 2722 2790 2803 2820 2860 2861 2868 2876 2893 2903 2907 2964 2992 3029 3034 156 174 177 185 283 335 754 762 797 802 823 852 902 1063 1106 1171 1179 1282 1489 1559 1570 1579 1594 1615 1664 1677 1689 1697 1698 1727 1799 1833 1865 1935 2007 2051 2096 2137 2278 2307 2458 2459 2543 2634 2640 2693 2707 2722 2762 2867 2927 2939 3007 3016 CGGTCT/AGACCG 1 -2 160 178 22 -32.9 8 16 24 28 37 50 64 89 92 95 158 179 184 190 203 215 223 224 229 230 250 274 280 294 327 346 349 360 382 388 408 419 446 450 452 484 524 527 543 576 617 621 627 640 651 666 693 705 709 746 786 812 816 848 853 880 890 915 938 961 1008 1020 1025 1027 1040 1055 1076 1093 1111 1122 1125 1154 1160 1179 1184 1196 1202 1215 1221 1256 1323 1334 1394 1441 1445 1446 1464 1467 1471 1473 1504 1509 1515 1557 1589 1614 1622 1624 1671 1676 1700 1702 1712 1720 1730 1753 1768 1771 1810 1811 1834 1893 1895 1908 1920 1927 1938 1943 1946 1953 1987 1991 2025 2056 2071 2106 2110 2176 2197 2286 2292 2301 2391 2407 2408 2427 2437 2440 2449 2474 2480 2495 2591 2599 2644 2671 2715 2805 2809 2836 2865 2869 2894 2897 2906 2908 2951 2979 2986 3021 2 131 302 636 641 855 897 1209 1426 1455 1479 1550 1623 1715 1739 1785 2091 2364 2583 2655 2847 2929 GTCCAC/GTGGAC 0 -1 178 167 35 -22.7 7 9 65 73 114 115 140 141 156 185 223 226 235 276 307 375 378 416 448 460 495 497 517 518 544 569 615 632 644 648 663 680 688 742 768 797 805 819 842 854 875 889 909 914 925 932 982 1043 1059 1061 1072 1094 1101 1114 1134 1170 1200 1224 1245 1252 1266 1280 1294 1300 1306 1314 1346 1359 1362 1384 1427 1440 1441 1442 1443 1448 1461 1530 1540 1547 1552 1598 1600 1602 1616 1622 1626 1643 1661 1685 1691 1722 1731 1741 1743 1757 1767 1827 1860 1861 1863 1869 1882 1889 1894 1921 1970 2009 2011 2016 2028 2039 2048 2054 2062 2096 2101 2107 2137 2139 2215 2234 2247 2268 2273 2312 2324 2329 2331 2346 2357 2371 2377 2414 2434 2444 2445 2446 2459 2470 2473 2479 2482 2515 2532 2551 2557 2581 2590 2595 2623 2633 2638 2642 2644 2646 2673 2707 2740 2787 2798 2810 2837 2838 2839 2848 2872 2879 2880 2886 2892 2923 2937 2950 2965 2979 2980 3003 11 31 52 108 149 181 354 370 423 565 602 736 830 836 1364 1392 1452 1885 1937 2041 2056 2068 2099 2144 2242 2366 2505 2599 2688 2703 2720 2725 2726 2776 2901 AAGGTC/GACCTT 1 -3 159 160 44 -17.3 21 44 45 55 72 73 138 156 163 181 186 217 228 234 246 249 255 277 316 328 373 394 428 444 453 459 480 494 526 535 551 565 580 602 677 688 690 695 710 723 728 730 756 794 826 836 878 899 911 935 959 980 986 1044 1082 1096 1097 1123 1128 1138 1153 1160 1179 1182 1202 1232 1238 1243 1277 1282 1283 1309 1345 1360 1369 1399 1403 1431 1440 1451 1468 1474 1476 1480 1518 1521 1555 1590 1644 1664 1690 1695 1717 1744 1774 1781 1788 1804 1809 1853 1861 1868 1871 1901 1936 1947 2007 2018 2035 2046 2064 2102 2139 2150 2168 2203 2206 2253 2294 2335 2371 2379 2384 2394 2402 2408 2410 2456 2465 2479 2497 2507 2511 2521 2531 2576 2606 2608 2613 2665 2681 2682 2689 2745 2810 2815 2822 2847 2849 2861 2903 2907 2937 2947 2950 2957 3005 3033 3034 54 155 177 180 194 255 398 477 514 565 700 749 756 870 878 924 1060 1064 1111 1171 1430 1484 1591 1610 1626 1633 1727 1786 2026 2308 2317 2351 2457 2470 2492 2642 2651 2681 2694 2709 2724 2918 2932 2987 ACTGGT/ACCAGT 0 -5 137 154 41 -17.2 0 5 27 29 114 138 140 157 160 165 170 172 180 192 194 218 224 276 282 297 302 312 332 343 354 374 431 439 464 470 473 477 514 587 593 598 615 623 649 653 655 700 708 712 718 741 749 824 845 894 968 991 1022 1028 1032 1079 1085 1193 1196 1200 1208 1222 1266 1280 1308 1318 1373 1381 1387 1388 1406 1410 1472 1476 1484 1500 1576 1578 1580 1594 1616 1633 1648 1669 1695 1704 1708 1722 1732 1741 1746 1760 1769 1773 1781 1826 1838 1869 1887 1894 1902 1955 1964 2049 2061 2062 2073 2088 2098 2185 2201 2300 2308 2349 2362 2364 2366 2462 2530 2537 2546 2594 2624 2664 2668 2679 2701 2713 2716 2754 2812 2839 2841 2853 2856 2920 2963 55 159 188 234 286 312 416 554 744 854 901 1027 1090 1109 1164 1175 1199 1271 1409 1456 1562 1662 1700 1716 1842 1847 1881 1922 1938 1947 1977 1988 1996 2057 2170 2395 2554 2763 2800 2831 2834 TGGGTC/GACCCA 1 -3 151 154 43 -16.5 7 82 91 96 110 111 159 190 211 225 234 237 248 262 281 295 296 303 331 337 369 375 380 423 429 441 453 464 468 478 518 524 531 557 570 611 624 641 649 656 698 735 787 812 828 839 862 870 878 902 918 939 941 952 955 983 1027 1040 1055 1078 1092 1139 1157 1174 1177 1194 1239 1253 1254 1275 1294 1306 1324 1352 1360 1382 1388 1412 1459 1462 1478 1481 1490 1500 1526 1531 1608 1617 1620 1678 1681 1692 1738 1761 1763 1785 1791 1796 1808 1814 1820 1853 1856 1864 1900 1935 1950 1952 2015 2036 2076 2113 2128 2129 2136 2142 2157 2223 2249 2265 2303 2304 2305 2341 2410 2437 2451 2471 2478 2498 2505 2535 2554 2566 2585 2673 2690 2772 2786 2795 2815 2857 2872 2874 2886 2889 2891 2906 2981 2989 3017 6 13 106 249 291 495 581 640 768 793 807 828 998 1041 1063 1067 1085 1117 1187 1190 1293 1328 1336 1416 1489 1602 1792 1804 1967 2035 2083 2223 2306 2335 2498 2597 2632 2698 2702 2790 2830 2847 2912 CCATCG/CGATGG 4 -1 124 148 38 -17.2 9 30 35 38 59 64 66 72 89 101 102 116 129 134 147 162 169 172 180 213 238 254 258 262 358 362 366 383 409 483 529 545 626 642 652 684 694 697 701 711 716 727 755 801 808 816 851 865 874 904 912 941 943 952 954 978 1004 1012 1017 1042 1059 1069 1082 1093 1099 1109 1119 1141 1154 1242 1246 1306 1335 1348 1404 1443 1535 1563 1566 1617 1654 1687 1711 1787 1795 1802 1894 1962 1973 1999 2117 2133 2147 2190 2225 2266 2277 2293 2299 2321 2427 2436 2451 2504 2512 2525 2572 2585 2602 2614 2637 2669 2763 2773 2847 2857 2868 2899 2935 2968 2994 2997 3000 3006 179 184 232 249 341 442 489 696 716 765 771 880 905 911 1147 1245 1277 1490 1491 1559 1633 1657 1696 1713 1863 1866 1913 1940 2031 2218 2287 2366 2371 2425 2453 2813 2871 2974 GTCCGT/ACGGAC 0 -1 120 145 29 -20.5 2 5 34 35 56 65 66 68 77 91 156 159 202 217 242 287 295 297 309 360 397 410 422 459 469 470 516 555 592 607 614 618 665 672 673 676 700 711 723 724 730 761 776 825 827 847 848 872 876 888 894 896 916 927 933 959 967 973 1000 1005 1030 1040 1068 1096 1103 1130 1181 1223 1246 1280 1322 1360 1365 1371 1377 1443 1470 1487 1493 1516 1525 1526 1583 1599 1611 1626 1657 1685 1714 1746 1832 1908 1929 1946 1998 2009 2018 2073 2083 2102 2117 2130 2154 2165 2278 2332 2337 2373 2425 2480 2489 2509 2555 2677 2779 2795 2836 2980 2996 3005 142 183 298 429 445 469 504 578 782 793 818 853 1111 1121 1179 1225 1497 1595 1726 1782 1937 1970 2076 2079 2171 2511 2775 2825 2919 GTCCGA/TCGGAC 0 -1 127 144 30 -19.8 3 14 46 58 73 89 90 93 105 113 128 138 153 162 172 207 221 227 262 263 282 334 337 340 413 442 454 468 500 533 546 577 587 592 618 636 652 704 705 714 745 747 763 766 810 847 865 941 956 1001 1073 1102 1125 1138 1150 1247 1251 1256 1288 1295 1314 1329 1333 1334 1343 1351 1398 1401 1417 1438 1454 1476 1532 1536 1557 1563 1564 1687 1701 1713 1738 1758 1767 1815 1892 1899 1915 1923 1949 1973 1978 1984 1996 2017 2023 2112 2117 2140 2141 2182 2200 2211 2259 2266 2272 2308 2353 2363 2393 2410 2498 2515 2530 2538 2552 2558 2617 2641 2660 2841 2851 2917 2926 2941 2950 3000 3010 52 89 263 341 436 438 534 836 958 1003 1047 1223 1305 1610 1633 1788 1910 2094 2179 2191 2201 2218 2274 2346 2379 2402 2554 2687 2800 2929 ACCGGT/ACCGGT 1 -4 117 137 22 -22.4 15 23 32 46 58 72 73 92 124 154 155 167 177 184 207 239 268 280 308 315 325 337 349 388 429 439 442 446 484 576 582 605 617 658 670 676 693 704 705 735 739 742 746 761 770 803 819 822 834 908 942 976 1040 1043 1053 1068 1076 1093 1125 1190 1196 1202 1239 1251 1256 1327 1334 1385 1436 1447 1484 1489 1506 1553 1567 1579 1599 1616 1655 1678 1702 1726 1785 1865 1893 1940 1952 1958 1965 2009 2015 2017 2028 2049 2071 2182 2189 2217 2260 2273 2363 2396 2398 2445 2464 2480 2531 2622 2654 2695 2726 2828 2863 2906 2938 2972 2992 40 53 246 499 511 632 641 642 1363 1773 1859 2077 2091 2103 2201 2242 2534 2809 2824 2932 2959 3024 GGACCT/AGGTCC 0 -2 143 130 20 -21.8 45 65 132 173 183 214 217 228 246 255 328 373 394 450 459 467 498 500 526 541 544 551 564 580 602 607 723 730 735 743 754 774 846 864 878 899 935 956 959 1044 1064 1082 1096 1100 1114 1133 1153 1160 1238 1243 1271 1274 1282 1284 1328 1345 1365 1399 1409 1440 1457 1468 1476 1480 1513 1518 1530 1540 1563 1592 1600 1603 1612 1626 1695 1717 1774 1781 1809 1819 1847 1853 1868 1894 1901 1935 1936 1957 1972 1984 2016 2018 2046 2064 2079 2101 2102 2116 2139 2150 2199 2203 2206 2218 2335 2371 2384 2387 2410 2428 2465 2479 2511 2515 2525 2531 2543 2552 2554 2555 2557 2581 2604 2606 2633 2642 2647 2737 2792 2810 2820 2822 2833 2838 2849 2861 2876 2903 2937 2950 2976 3005 3033 177 181 250 283 354 404 505 644 1132 1171 1689 1727 1756 1808 1937 2079 2317 2696 2765 2932 GGTCCC/GGGACC 0 -2 132 130 29 -17.1 35 51 57 60 78 84 183 190 195 213 256 373 405 420 424 467 468 499 509 512 523 563 564 596 628 639 649 670 693 697 704 733 735 743 750 757 761 792 825 832 845 851 864 878 901 955 960 963 1104 1139 1147 1193 1221 1249 1273 1276 1309 1329 1353 1366 1406 1409 1447 1462 1472 1509 1553 1668 1672 1673 1761 1764 1780 1781 1790 1791 1809 1819 1864 1873 1875 1884 1912 1944 1950 1972 1985 1986 2000 2035 2064 2112 2139 2172 2218 2230 2275 2292 2350 2360 2365 2385 2471 2478 2487 2489 2526 2531 2534 2535 2549 2604 2617 2656 2694 2710 2721 2739 2748 2788 2826 2827 2832 2835 2838 2928 2940 2964 2967 2976 2986 3027 74 91 110 250 291 348 505 683 764 787 841 981 1132 1413 1487 1503 1808 1937 1988 2023 2096 2311 2317 2372 2432 2698 2765 2798 2932 AGGTCC/GGACCT 1 -2 143 130 20 -21.8 45 65 132 173 183 214 217 228 246 255 328 373 394 450 459 467 498 500 526 541 544 551 564 580 602 607 723 730 735 743 754 774 846 864 878 899 935 956 959 1044 1064 1082 1096 1100 1114 1133 1153 1160 1238 1243 1271 1274 1282 1284 1328 1345 1365 1399 1409 1440 1457 1468 1476 1480 1513 1518 1530 1540 1563 1592 1600 1603 1612 1626 1695 1717 1774 1781 1809 1819 1847 1853 1868 1894 1901 1935 1936 1957 1972 1984 2016 2018 2046 2064 2079 2101 2102 2116 2139 2150 2199 2203 2206 2218 2335 2371 2384 2387 2410 2428 2465 2479 2511 2515 2525 2531 2543 2552 2554 2555 2557 2581 2604 2606 2633 2642 2647 2737 2792 2810 2820 2822 2833 2838 2849 2861 2876 2903 2937 2950 2976 3005 3033 177 181 250 283 354 404 505 644 1132 1171 1689 1727 1756 1808 1937 2079 2317 2696 2765 2932 GGTCTG/CAGACC 0 -2 113 115 26 -15.1 28 46 64 76 89 122 127 142 184 224 274 289 343 360 408 419 422 457 487 550 570 617 654 680 715 747 750 786 802 828 870 911 957 958 1006 1008 1025 1036 1078 1087 1092 1093 1129 1138 1139 1154 1174 1179 1202 1207 1208 1215 1254 1295 1340 1376 1403 1406 1408 1446 1447 1565 1626 1636 1640 1665 1676 1702 1709 1735 1737 1748 1769 1771 1777 1811 1869 1893 1895 1943 2027 2029 2033 2041 2118 2194 2224 2239 2286 2301 2315 2370 2437 2449 2451 2503 2560 2591 2599 2634 2649 2715 2716 2781 2836 2841 2850 2894 2908 2949 2970 2979 2993 2 121 180 282 679 757 878 897 977 1061 1111 1346 1361 1535 1594 1615 1626 1737 1785 1933 2015 2358 2378 2582 2726 2838 GGACCC/GGGTCC 0 -2 110 110 18 -18.0 7 58 84 91 96 115 137 191 210 212 246 262 295 303 372 464 468 478 497 524 569 570 608 624 649 698 787 809 839 871 878 952 955 980 1027 1040 1055 1061 1101 1103 1137 1150 1166 1194 1235 1239 1306 1329 1357 1360 1406 1412 1478 1490 1493 1587 1608 1627 1738 1761 1791 1808 1820 1855 1864 1948 1950 1971 2015 2128 2136 2157 2161 2168 2214 2215 2241 2259 2303 2304 2314 2334 2415 2471 2478 2524 2535 2549 2566 2585 2593 2617 2659 2690 2707 2710 2721 2727 2772 2795 2835 2857 2872 2874 2889 2891 2919 2955 2975 3002 110 142 187 291 370 841 985 998 1085 1378 1613 1937 2023 2035 2083 2311 2698 2762 GGGTCC/GGACCC 1 -2 110 110 18 -18.0 7 58 84 91 96 115 137 191 210 212 246 262 295 303 372 464 468 478 497 524 569 570 608 624 649 698 787 809 839 871 878 952 955 980 1027 1040 1055 1061 1101 1103 1137 1150 1166 1194 1235 1239 1306 1329 1357 1360 1406 1412 1478 1490 1493 1587 1608 1627 1738 1761 1791 1808 1820 1855 1864 1948 1950 1971 2015 2128 2136 2157 2161 2168 2214 2215 2241 2259 2303 2304 2314 2334 2415 2471 2478 2524 2535 2549 2566 2585 2593 2617 2659 2690 2707 2710 2721 2727 2772 2795 2835 2857 2872 2874 2889 2891 2919 2955 2975 3002 110 142 187 291 370 841 985 998 1085 1378 1613 1937 2023 2035 2083 2311 2698 2762 GGGTCA/TGACCC 1 -2 111 106 32 -10.8 47 82 111 150 162 185 211 248 281 331 337 342 372 375 380 416 417 429 440 441 453 531 542 557 656 689 735 740 755 785 841 902 908 918 939 964 983 1058 1078 1143 1144 1177 1191 1204 1207 1253 1275 1287 1324 1369 1382 1388 1459 1462 1488 1500 1568 1595 1620 1641 1647 1655 1681 1697 1701 1763 1785 1802 1806 1814 1841 1847 1853 1900 1939 1941 1952 1984 2075 2076 2113 2128 2129 2142 2162 2249 2265 2302 2305 2375 2389 2395 2403 2437 2474 2498 2514 2580 2637 2673 2677 2680 2711 2832 2871 2886 2912 2981 2999 3017 3025 6 13 106 183 202 398 565 635 828 1202 1293 1377 1378 1416 1489 1627 1654 1823 1893 1967 1993 2034 2199 2223 2234 2335 2478 2597 2709 2732 2790 2942 GTCGGT/ACCGAC 1 -4 112 106 30 -11.5 67 121 168 183 194 222 234 261 268 302 315 318 327 424 428 434 448 474 512 527 530 548 569 613 690 705 738 746 764 765 770 783 785 810 816 831 876 937 950 961 1053 1114 1119 1125 1126 1136 1156 1195 1199 1273 1311 1368 1393 1428 1432 1441 1450 1458 1471 1475 1481 1524 1535 1558 1602 1633 1644 1692 1717 1720 1877 1879 1884 1963 1996 2012 2051 2063 2088 2090 2095 2128 2158 2165 2184 2185 2238 2257 2289 2317 2341 2391 2395 2525 2559 2653 2654 2700 2779 2789 2796 2863 2877 2896 2901 2919 2945 2961 3013 3016 3017 3032 110 111 115 120 178 292 364 445 557 636 799 967 1297 1642 1692 1734 1915 2201 2364 2416 2479 2490 2655 2660 2676 2728 2871 2926 2948 3023 TAGTCC/GGACTA 0 -3 97 97 31 -9.4 36 50 99 106 130 158 193 196 216 255 295 305 323 376 380 397 469 562 566 567 577 615 626 632 708 759 798 863 913 917 947 968 987 988 994 995 1058 1200 1245 1247 1252 1266 1302 1325 1329 1361 1446 1507 1539 1569 1588 1596 1674 1675 1697 1714 1745 1876 1919 2002 2003 2050 2117 2156 2293 2298 2336 2348 2369 2378 2414 2425 2470 2481 2483 2487 2508 2510 2565 2636 2647 2667 2740 2755 2780 2783 2797 2811 2836 2850 2868 2905 2933 2948 2980 2996 2998 52 174 183 288 602 958 1111 1212 1231 1361 1392 1496 1579 1637 1698 1833 1876 1888 1940 1965 2156 2163 2166 2278 2307 2707 2714 2774 2825 2867 2870 GGACTA/TAGTCC 2 -2 97 97 31 -9.4 36 50 99 106 130 158 193 196 216 255 295 305 323 376 380 397 469 562 566 567 577 615 626 632 708 759 798 863 913 917 947 968 987 988 994 995 1058 1200 1245 1247 1252 1266 1302 1325 1329 1361 1446 1507 1539 1569 1588 1596 1674 1675 1697 1714 1745 1876 1919 2002 2003 2050 2117 2156 2293 2298 2336 2348 2369 2378 2414 2425 2470 2481 2483 2487 2508 2510 2565 2636 2647 2667 2740 2755 2780 2783 2797 2811 2836 2850 2868 2905 2933 2948 2980 2996 2998 52 174 183 288 602 958 1111 1212 1231 1361 1392 1496 1579 1637 1698 1833 1876 1888 1940 1965 2156 2163 2166 2278 2307 2707 2714 2774 2825 2867 2870 GTCCAG/CTGGAC 0 -1 96 95 18 -14.4 59 96 106 127 136 210 260 262 285 307 309 317 352 481 498 561 582 612 639 660 661 665 706 734 744 759 764 775 870 919 950 968 978 988 1005 1017 1022 1107 1152 1180 1186 1222 1228 1239 1250 1260 1280 1302 1364 1409 1423 1427 1472 1495 1513 1531 1578 1612 1682 1734 1779 1799 1820 1826 1838 1847 1865 1916 1969 2009 2121 2147 2156 2231 2257 2289 2320 2387 2426 2444 2458 2489 2499 2647 2696 2731 2778 2808 2828 2839 2894 2909 2933 2955 2965 2977 146 150 283 325 469 561 746 1501 1538 1728 1924 1985 2235 2269 2382 2714 2752 2933 CTGGAC/GTCCAG 2 -4 96 95 18 -14.4 59 96 106 127 136 210 260 262 285 307 309 317 352 481 498 561 582 612 639 660 661 665 706 734 744 759 764 775 870 919 950 968 978 988 1005 1017 1022 1107 1152 1180 1186 1222 1228 1239 1250 1260 1280 1302 1364 1409 1423 1427 1472 1495 1513 1531 1578 1612 1682 1734 1779 1799 1820 1826 1838 1847 1865 1916 1969 2009 2121 2147 2156 2231 2257 2289 2320 2387 2426 2444 2458 2489 2499 2647 2696 2731 2778 2808 2828 2839 2894 2909 2933 2955 2965 2977 146 150 283 325 469 561 746 1501 1538 1728 1924 1985 2235 2269 2382 2714 2752 2933 GGTCGG/CCGACC 1 -1 99 93 16 -15.0 90 110 137 138 207 291 302 309 315 318 395 417 428 440 453 474 512 527 548 577 613 648 690 746 768 770 785 881 900 922 945 946 961 990 1005 1053 1137 1139 1156 1243 1256 1276 1277 1303 1335 1369 1398 1399 1441 1481 1527 1568 1692 1706 1796 1879 1884 1893 1949 2063 2064 2090 2178 2182 2184 2185 2186 2194 2267 2289 2317 2332 2363 2395 2410 2422 2514 2515 2525 2526 2546 2614 2654 2660 2721 2752 2779 2789 2797 2863 2877 2896 2919 2924 2961 2978 2999 3016 3032 120 171 230 307 308 322 495 1001 1292 2035 2201 2351 2364 2791 2835 2926 GTCCGG/CCGGAC 0 -1 82 81 8 -17.1 17 50 58 142 158 184 188 288 303 309 322 367 393 566 570 576 578 670 673 710 821 879 924 998 1008 1012 1025 1035 1056 1098 1143 1154 1159 1248 1260 1261 1267 1269 1313 1446 1462 1580 1648 1751 1767 1796 1979 1984 2002 2112 2139 2180 2187 2199 2287 2305 2365 2432 2478 2520 2522 2560 2588 2591 2608 2654 2683 2695 2727 2761 2771 2821 2836 2852 2863 2867 2960 2962 2968 2979 2982 3031 22 76 637 1249 1496 1629 2155 2156 GCGGTC/GACCGC 1 -3 67 72 7 -15.5 6 50 55 95 96 114 190 211 218 262 346 388 430 452 513 552 563 758 854 880 909 1073 1150 1158 1184 1221 1251 1300 1320 1323 1347 1418 1567 1625 1691 1768 1811 1824 1928 1943 1958 1981 1986 2005 2090 2112 2127 2183 2189 2202 2212 2275 2276 2284 2286 2450 2472 2586 2601 2605 2653 2715 2721 2800 2809 2991 3034 131 897 1079 1623 1739 2223 2656 GGACTG/CAGTCC 2 -2 65 69 23 -6.7 43 77 106 114 127 143 263 295 309 399 417 448 477 541 566 579 595 596 674 675 709 747 760 797 823 849 855 971 982 1003 1072 1205 1208 1405 1540 1615 1741 1746 1751 1838 1848 1857 1989 2010 2098 2107 2129 2196 2201 2209 2245 2268 2335 2372 2390 2579 2615 2637 2775 2807 2833 2856 2973 2979 3013 11 108 335 504 797 902 1033 1121 1163 1402 1711 2076 2212 2234 2235 2413 2425 2467 2511 2599 2623 2666 2825 CGGGTC/GACCCG 1 -3 65 67 19 -7.7 47 58 90 110 150 161 162 185 342 417 440 577 659 700 722 740 755 785 828 829 841 875 902 980 983 1061 1103 1137 1150 1204 1207 1235 1287 1329 1369 1441 1568 1572 1629 1640 1655 1701 1802 1939 1971 1984 2075 2128 2178 2186 2199 2214 2314 2353 2375 2439 2474 2514 2526 2593 2599 2721 2871 2955 2999 117 142 183 306 307 495 514 635 963 1202 1292 1627 1727 1993 2199 2234 2478 2790 2830 GGTCGA/TCGACC 1 -1 71 61 18 -6.8 110 138 157 234 391 474 491 534 582 594 616 641 667 688 711 765 794 833 836 862 901 926 944 1195 1286 1360 1439 1451 1477 1481 1501 1572 1604 1678 1759 1856 1893 1897 1997 2111 2117 2152 2199 2219 2246 2253 2267 2279 2291 2369 2405 2418 2450 2497 2594 2599 2629 2631 2635 2669 2706 2727 2815 2857 2868 2875 2882 2899 2981 3030 3034 301 370 383 400 507 642 967 1106 1156 1344 1612 1786 2141 2752 2813 2911 3008 3014 CAGCGG/CCGCTG 4 0 44 58 16 -7.0 6 25 50 70 71 77 114 182 283 317 330 404 452 513 563 661 724 923 990 1006 1153 1158 1300 1310 1337 1378 1477 1485 1499 1560 1563 1749 1794 1811 1824 1924 2008 2129 2183 2449 2555 2586 2630 2809 210 530 626 629 694 1601 1603 1829 1952 2034 2127 2193 2355 2734 2817 2959 CCAGCG/CGCTGG 4 -1 47 57 10 -9.6 25 50 70 71 114 118 182 257 317 325 396 404 452 513 563 629 661 724 923 990 1006 1153 1158 1170 1308 1310 1337 1477 1485 1499 1563 1734 1749 1755 1811 2008 2080 2087 2129 2183 2287 2449 2555 2632 2816 2882 2900 11 120 1055 1170 1189 1338 1476 1829 2464 2734 CGGTCG/CGACCG 1 -2 58 55 5 -12.4 110 168 207 222 234 291 406 440 474 491 512 513 534 582 594 746 759 765 770 784 791 945 946 1195 1199 1218 1241 1286 1304 1439 1501 1527 1633 1671 1828 1884 1893 2065 2090 2125 2182 2194 2227 2289 2326 2363 2395 2404 2468 2605 2635 2654 2678 2721 2727 2789 2863 2868 632 753 2035 2201 2242 GGGTCG/CGACCC 1 -2 53 51 14 -6.3 90 110 225 227 339 353 369 424 518 577 611 641 785 862 901 922 941 961 1005 1137 1139 1441 1481 1518 1531 1568 1572 1604 1624 1629 1640 1678 1692 1759 1796 1856 1949 2020 2178 2186 2199 2317 2353 2410 2423 2451 2514 2526 2554 2599 2786 2815 2999 307 495 502 640 973 1117 1187 1190 1292 1313 1328 2830 2847 2911