#1681/1681 #4.11 # k-mer/r.c. Cluster Offset PosCt wPosCt NegCt HGP_10 CCACCA/TGGTGG 0 -4 205 206 62 -20.8 18 19 25 29 48 49 55 56 59 60 61 68 78 88 90 95 100 108 123 147 163 183 188 203 206 209 226 240 241 244 246 247 248 258 268 291 293 301 315 316 329 340 344 349 354 359 360 361 378 387 388 400 415 422 426 427 433 441 458 470 477 478 479 483 492 495 510 512 521 534 536 548 555 557 566 568 583 597 604 621 622 631 636 644 661 678 682 684 687 688 698 701 707 714 715 732 745 747 758 770 771 777 795 796 799 803 804 805 812 816 821 826 832 849 850 852 853 854 861 862 863 864 870 881 886 901 902 909 914 928 930 943 949 950 953 959 963 990 991 994 995 997 1001 1005 1006 1010 1012 1024 1062 1066 1077 1078 1082 1101 1103 1113 1126 1143 1144 1145 1151 1163 1175 1206 1222 1225 1260 1261 1266 1275 1277 1285 1287 1291 1331 1333 1334 1349 1372 1373 1377 1378 1379 1438 1441 1455 1459 1468 1469 1473 1486 1488 1511 1556 1570 1578 1584 1589 1599 1608 1622 1628 1629 1670 1677 7 47 73 209 223 229 251 272 300 301 306 321 329 341 370 403 422 444 508 509 562 563 574 643 701 712 717 775 777 805 806 812 849 914 949 997 1000 1017 1026 1040 1041 1075 1102 1105 1127 1164 1209 1273 1294 1304 1305 1368 1388 1407 1420 1423 1433 1454 1464 1520 1554 1557 ACCACC/GGTGGT 0 -5 175 174 57 -16.0 0 11 19 25 29 35 40 48 49 55 56 59 60 61 72 73 90 119 123 147 150 163 183 206 217 220 244 246 248 261 262 268 291 311 314 316 329 340 344 354 360 361 387 400 422 427 441 470 479 480 484 485 491 495 534 536 548 566 568 604 612 631 640 644 675 678 684 686 688 698 701 707 732 739 747 748 758 770 771 795 796 799 812 816 821 826 832 849 850 852 853 861 862 863 864 881 889 901 902 909 914 927 928 930 943 950 959 963 966 973 974 990 991 1001 1005 1006 1010 1012 1018 1024 1026 1030 1058 1062 1066 1077 1078 1113 1117 1145 1151 1155 1162 1163 1168 1170 1175 1206 1225 1260 1261 1272 1275 1277 1285 1291 1296 1302 1331 1334 1349 1365 1374 1377 1378 1379 1430 1441 1455 1459 1473 1486 1488 1511 1525 1529 1556 1570 1578 1590 1608 1617 1628 1629 1677 11 73 162 229 301 313 318 347 376 382 403 422 425 444 505 588 643 701 712 714 717 737 749 772 776 777 797 805 883 914 997 1000 1041 1042 1075 1102 1127 1164 1171 1209 1233 1273 1304 1324 1327 1354 1388 1407 1419 1420 1451 1516 1520 1541 1548 1557 1563 CACCAC/GTGGTG 0 -3 174 172 47 -19.2 0 11 19 25 29 35 39 48 49 50 56 61 78 100 118 119 121 123 134 147 183 206 220 227 241 244 246 248 249 258 261 262 268 291 301 314 316 335 340 341 344 359 360 361 371 387 388 400 422 441 470 479 480 486 490 491 495 512 537 548 566 568 601 604 618 631 636 640 644 678 687 688 698 701 714 715 718 719 721 747 758 770 771 795 796 799 805 812 821 826 832 849 850 852 853 863 864 881 901 902 909 914 928 930 943 949 950 990 991 994 995 1005 1006 1010 1012 1018 1024 1026 1058 1062 1077 1078 1083 1113 1136 1151 1152 1158 1163 1168 1175 1201 1206 1260 1261 1266 1285 1287 1288 1289 1291 1302 1331 1333 1334 1365 1374 1377 1378 1379 1402 1430 1436 1441 1455 1468 1473 1486 1488 1511 1517 1518 1526 1538 1556 1568 1583 1590 1603 1608 1628 1629 1655 1677 7 11 47 73 127 229 301 308 318 394 444 469 503 508 580 588 635 683 714 717 777 797 805 806 883 914 951 966 991 1000 1102 1105 1127 1233 1250 1264 1284 1304 1305 1316 1332 1343 1392 1407 1464 1520 1613 GCACCA/TGGTGC 0 -4 115 123 37 -12.6 0 4 11 19 35 42 68 91 95 99 108 118 119 120 121 134 142 147 148 149 165 193 194 206 221 227 268 274 285 294 301 302 309 315 323 324 337 356 357 358 370 371 388 393 397 399 423 427 466 470 480 481 490 491 502 503 548 551 552 582 586 601 641 659 660 670 701 704 754 776 805 821 826 834 864 871 953 990 991 1005 1006 1010 1019 1053 1062 1078 1106 1113 1129 1142 1156 1158 1167 1206 1210 1219 1232 1234 1237 1287 1302 1308 1309 1331 1350 1374 1430 1442 1446 1500 1538 1555 1597 1598 1676 53 85 251 301 305 365 456 469 588 662 691 739 777 797 879 883 906 991 1027 1045 1122 1180 1273 1305 1327 1363 1388 1392 1415 1433 1449 1464 1495 1534 1558 1620 1642 CAGCCA/TGGCTG 1 -3 115 117 39 -10.7 3 18 41 51 83 85 97 121 132 159 178 179 180 190 205 212 224 235 242 243 249 256 295 351 364 375 381 388 402 403 426 427 454 480 494 508 534 548 573 577 599 602 603 621 622 636 638 639 650 653 654 722 728 745 763 778 779 791 793 802 803 805 810 832 858 881 886 896 898 925 935 938 943 945 961 962 1002 1013 1058 1065 1069 1070 1095 1099 1112 1121 1126 1143 1144 1170 1213 1214 1243 1251 1263 1266 1282 1326 1338 1379 1425 1456 1465 1495 1504 1522 1556 1566 1571 1586 1590 1606 1623 1624 1650 2 9 79 118 271 284 451 459 471 489 524 563 659 662 677 684 709 738 770 811 819 823 973 1010 1134 1141 1179 1256 1304 1305 1345 1348 1376 1482 1516 1526 1594 1605 1660 GCCACC/GGTGGC 0 -5 109 106 27 -12.9 19 29 33 35 83 88 108 123 150 152 166 183 241 257 258 264 291 301 380 381 388 395 400 426 427 448 458 483 492 512 513 525 526 550 604 617 636 650 663 687 688 692 709 770 803 804 805 811 816 832 852 853 854 861 862 868 869 881 882 889 909 920 928 930 935 943 959 961 963 966 968 990 991 1010 1030 1103 1105 1111 1126 1175 1182 1192 1225 1237 1250 1255 1260 1261 1266 1287 1291 1372 1373 1377 1378 1414 1441 1452 1455 1468 1486 1556 1581 1618 1620 1623 1624 1670 1679 47 56 72 223 251 301 345 370 439 459 543 563 662 754 806 846 1000 1009 1189 1220 1274 1298 1391 1453 1464 1485 1599 CCACCG/CGGTGG 0 -4 112 104 33 -10.2 26 33 59 60 72 73 83 150 153 166 189 287 294 311 340 341 344 379 381 395 416 422 443 448 480 525 526 601 612 640 650 663 686 692 709 710 724 739 770 771 811 816 821 832 845 854 868 869 882 889 912 920 928 935 959 961 963 966 968 973 974 996 997 998 999 1021 1022 1030 1058 1105 1118 1162 1168 1170 1174 1176 1206 1225 1231 1237 1244 1245 1260 1261 1273 1285 1296 1302 1327 1331 1350 1365 1377 1378 1384 1391 1418 1430 1431 1441 1445 1448 1452 1486 1556 1557 1569 1571 1589 1620 1677 1679 53 56 72 73 162 200 229 305 345 382 550 581 588 662 772 825 1000 1029 1032 1060 1127 1195 1274 1304 1391 1419 1485 1502 1516 1541 1563 1587 1648 CCGCCA/TGGCGG 0 -4 101 98 25 -12.0 29 35 59 60 70 71 76 113 150 166 177 206 220 256 257 265 282 289 300 311 313 327 362 405 441 448 450 476 512 532 570 618 629 659 660 662 667 676 686 688 698 707 740 752 770 816 861 862 868 869 932 947 954 959 966 968 1007 1014 1015 1030 1035 1062 1123 1124 1125 1142 1155 1162 1172 1173 1206 1218 1258 1259 1280 1281 1305 1331 1365 1374 1375 1377 1378 1386 1438 1441 1458 1473 1476 1477 1486 1487 1556 1557 1571 1581 1582 1596 1618 1649 1664 29 52 72 162 232 331 353 768 777 850 913 968 1000 1018 1047 1127 1139 1189 1201 1347 1391 1420 1485 1646 1676 TGCACC/GGTGCA 0 -5 91 98 24 -12.4 0 4 19 35 38 42 44 68 74 95 108 118 119 120 134 145 162 193 194 206 227 268 274 277 285 293 298 302 312 356 357 358 370 397 414 452 466 480 494 496 502 503 515 521 537 546 547 563 564 573 582 612 619 625 646 647 655 659 660 670 684 752 805 819 844 952 1029 1137 1142 1155 1201 1226 1227 1231 1232 1237 1277 1287 1308 1309 1315 1322 1326 1331 1350 1416 1417 1454 1547 1618 1666 85 272 393 445 609 691 739 797 865 883 1026 1027 1045 1078 1122 1128 1134 1166 1219 1305 1534 1535 1553 1650 CACCGC/GCGGTG 0 -3 99 94 24 -11.5 16 26 33 59 60 66 72 73 74 127 150 166 189 254 255 275 303 327 340 341 344 371 395 448 452 475 515 522 547 640 650 684 686 707 724 739 752 770 811 816 832 844 854 882 889 908 920 944 966 968 997 998 999 1017 1019 1030 1031 1061 1103 1113 1155 1158 1162 1206 1212 1215 1226 1227 1231 1244 1245 1258 1259 1260 1261 1273 1302 1369 1377 1378 1384 1431 1433 1434 1441 1445 1454 1473 1486 1543 1544 1556 1569 1571 1589 1596 1600 1611 1647 72 73 162 200 229 251 353 431 543 635 1000 1058 1060 1126 1127 1139 1300 1391 1420 1485 1502 1587 1589 1648 GCAGCC/GGCTGC 1 -4 88 89 20 -12.1 3 7 10 18 30 32 85 159 178 205 235 241 243 256 273 275 295 298 312 328 383 386 427 452 469 473 480 512 523 534 573 591 599 621 622 630 638 653 654 741 745 747 764 765 767 778 779 781 791 803 804 832 858 896 898 938 972 1002 1027 1033 1038 1115 1139 1143 1144 1176 1202 1203 1213 1214 1255 1266 1296 1326 1338 1379 1450 1456 1462 1504 1571 1586 1587 1588 1604 1606 1612 1637 228 284 471 684 709 744 783 818 937 973 983 996 1008 1010 1134 1179 1256 1378 1526 1660 CGCAGC/GCTGCG 1 -5 74 76 15 -11.5 1 8 10 18 25 31 32 46 47 86 143 171 178 241 254 255 275 295 302 303 304 312 349 430 445 482 519 573 576 580 609 643 672 680 697 729 730 741 747 767 776 804 832 896 898 972 1027 1033 1042 1069 1070 1113 1151 1176 1202 1203 1240 1279 1287 1296 1344 1350 1399 1409 1427 1429 1450 1476 1477 1543 1544 1604 1612 1637 49 148 284 309 554 640 684 739 776 957 967 983 1184 1526 1530 GACGGT/ACCGTC 2 -3 74 72 19 -8.8 27 41 42 104 105 134 152 264 271 272 277 282 299 302 310 320 323 324 344 348 362 373 381 410 454 522 570 581 613 614 662 713 736 842 845 871 873 883 889 907 912 928 932 963 985 986 1002 1024 1030 1048 1105 1149 1150 1169 1170 1172 1173 1258 1259 1327 1339 1340 1365 1396 1397 1412 1413 1416 1417 1431 1438 1499 1559 1672 21 280 315 341 431 450 452 514 662 728 739 820 995 1189 1244 1337 1451 1586 1622 GCTGCC/GGCAGC 1 -4 66 70 22 -7.3 3 7 10 30 33 87 94 101 119 159 160 174 190 205 216 241 252 253 256 272 301 308 333 348 360 361 386 389 390 416 469 546 637 672 747 762 791 803 804 811 814 821 835 858 867 895 938 955 1019 1063 1084 1253 1306 1310 1315 1338 1371 1391 1414 1435 1534 1577 1586 1652 1663 1679 56 114 159 251 380 415 438 471 575 738 776 830 842 996 1010 1049 1134 1385 1463 1464 1614 1660 CCCACC/GGTGGG 0 -5 67 68 18 -8.3 18 55 59 60 98 102 127 153 209 240 244 246 247 248 287 315 316 329 341 443 456 457 495 510 521 545 601 661 710 777 811 812 847 870 875 891 899 900 928 949 994 995 1018 1030 1076 1105 1118 1156 1174 1176 1184 1206 1225 1250 1266 1282 1285 1291 1304 1336 1384 1418 1442 1452 1571 1622 1635 7 300 337 341 520 673 691 914 1026 1032 1087 1105 1274 1294 1365 1420 1423 1454 CCGCCG/CGGCGG 0 -4 74 68 14 -10.2 26 48 111 112 126 156 272 282 296 340 344 362 395 410 430 448 469 471 484 485 491 522 598 615 688 739 767 815 908 911 944 945 964 968 1030 1053 1080 1140 1150 1172 1173 1200 1202 1203 1206 1212 1215 1222 1241 1244 1245 1260 1261 1271 1273 1291 1307 1327 1334 1377 1378 1380 1381 1386 1441 1445 1458 1486 1515 1516 1543 1544 1653 1661 18 72 73 229 248 267 334 489 499 509 603 709 937 1502 CAGCGG/CCGCTG 1 -3 68 68 18 -8.3 3 28 33 44 77 93 139 157 167 172 189 195 240 305 349 353 358 416 504 505 522 538 546 549 553 580 617 724 747 751 770 776 844 861 862 947 964 981 997 998 999 1009 1110 1178 1200 1263 1273 1278 1335 1344 1362 1374 1391 1396 1397 1398 1406 1446 1474 1483 1509 1560 1569 1575 1616 1645 1652 1654 18 53 208 493 505 842 861 863 935 1000 1073 1095 1110 1220 1370 1429 1587 1648 GCCGCC/GGCGGC 0 -5 69 66 12 -10.7 26 94 156 163 166 177 256 272 282 300 340 362 378 410 441 484 485 522 532 570 615 629 651 688 698 747 767 770 803 868 869 890 911 920 944 945 964 968 1035 1053 1080 1115 1123 1124 1126 1162 1182 1200 1202 1203 1271 1282 1291 1305 1333 1365 1380 1381 1386 1410 1441 1458 1486 1543 1544 1571 1581 1649 1661 18 72 73 229 248 521 709 775 861 913 968 1000 CCACGG/CCGTGG 2 -4 65 66 13 -10.2 19 27 37 39 53 61 82 100 118 150 201 216 239 241 268 295 316 347 380 387 400 468 488 512 568 592 656 667 701 709 757 774 775 780 783 802 826 842 866 888 908 924 926 934 939 975 998 999 1032 1033 1079 1114 1176 1233 1241 1287 1291 1296 1455 1483 1517 1518 1538 1627 1637 36 61 273 431 448 556 983 1145 1260 1393 1433 1619 1654 CACGGT/ACCGTG 2 -3 62 65 18 -7.7 39 61 62 83 90 96 107 110 118 130 145 196 197 212 294 315 316 321 347 374 380 387 398 409 441 468 480 525 526 568 617 657 658 663 667 674 709 810 818 845 888 908 919 939 959 972 998 999 1024 1048 1114 1143 1144 1192 1209 1215 1241 1296 1514 1543 1544 1676 8 19 42 244 353 490 689 812 830 980 1186 1223 1282 1390 1393 1400 1442 1553 GCAGCG/CGCTGC 1 -4 66 64 21 -6.4 25 33 58 146 213 214 260 302 348 349 356 357 358 360 361 378 395 443 504 519 546 549 553 567 609 617 680 700 724 729 730 747 748 776 844 950 970 997 1110 1147 1178 1210 1218 1273 1279 1286 1344 1352 1382 1391 1396 1397 1446 1463 1464 1474 1475 1476 1477 1534 1575 1643 1654 1660 1677 1679 53 56 84 114 127 159 505 686 739 825 863 882 906 973 1021 1038 1073 1094 1220 1370 1429 GCACCG/CGGTGC 0 -4 60 61 20 -6.2 16 23 24 36 74 118 119 127 145 153 178 186 246 275 277 292 299 334 448 452 460 480 493 496 515 525 526 547 556 563 564 619 684 692 752 842 844 944 1137 1153 1155 1201 1204 1205 1226 1227 1250 1315 1334 1363 1416 1417 1454 1543 1544 1547 1600 1605 1611 1620 21 353 393 431 432 445 668 865 914 1041 1078 1126 1128 1194 1282 1400 1535 1553 1557 1627 CCAGCC/GGCTGG 1 -4 61 61 17 -7.3 35 92 114 135 168 172 191 235 247 275 349 364 366 375 381 388 393 402 403 426 436 454 468 494 545 548 602 603 636 650 766 802 803 805 886 894 943 958 961 962 966 1013 1112 1129 1189 1223 1224 1253 1277 1282 1393 1394 1425 1495 1500 1556 1560 1623 1624 1631 1632 2 106 162 329 403 451 684 719 775 811 823 829 879 1117 1126 1447 1516 GACCTC/GAGGTC 7 -3 60 61 19 -6.5 32 58 96 148 149 153 192 224 238 247 294 376 379 438 439 446 470 490 500 504 542 591 615 624 635 640 657 658 676 679 684 724 902 941 1052 1066 1106 1168 1192 1213 1214 1229 1230 1231 1323 1325 1339 1340 1346 1347 1372 1373 1422 1459 1470 1471 1504 1606 1647 1650 271 276 452 464 601 760 950 954 1137 1146 1181 1229 1288 1300 1333 1388 1415 1505 1672 TCACGG/CCGTGA 2 -4 60 60 17 -7.1 20 23 24 74 77 90 96 110 130 252 253 276 294 304 312 315 317 387 398 409 473 480 541 544 552 657 658 663 674 677 702 772 774 775 786 836 848 865 890 998 999 1024 1082 1105 1201 1202 1203 1216 1273 1312 1345 1458 1500 1514 1546 1570 1578 1604 1676 1678 8 19 94 184 403 427 525 689 812 857 980 1034 1062 1316 1385 1442 1483 CCGGGA/TCCCGG 8 1 59 59 12 -9.0 65 95 110 118 122 136 175 216 229 241 245 261 262 286 354 369 383 394 418 419 462 496 539 548 556 568 570 702 753 758 819 888 982 983 996 1046 1047 1075 1148 1172 1173 1265 1271 1286 1291 1296 1300 1321 1338 1368 1370 1382 1392 1430 1452 1495 1527 1560 1608 2 242 382 412 432 484 625 753 1061 1227 1338 1547 ACGGTC/GACCGT 2 -2 54 56 15 -7.0 30 61 96 97 110 137 176 177 196 197 299 310 316 323 324 347 353 362 398 409 468 568 589 632 633 634 674 810 818 845 871 873 888 919 932 963 1024 1048 1129 1149 1161 1170 1171 1209 1215 1241 1284 1339 1340 1416 1417 1525 1531 1672 11 244 452 565 676 695 852 878 879 988 1027 1181 1393 1484 1586 CGACGG/CCGTCG 2 -4 57 56 8 -10.6 6 27 36 110 111 112 130 272 301 310 320 344 348 373 389 390 407 410 483 501 522 532 597 613 614 642 659 660 787 790 815 842 843 845 866 873 907 932 958 1002 1030 1105 1150 1172 1173 1215 1338 1412 1413 1416 1417 1431 1505 1506 1552 1579 1648 23 384 389 431 450 1014 1451 1464 GGCGAG/CTCGCC 6 1 54 55 16 -6.4 46 47 90 91 92 103 206 239 246 250 251 261 262 276 316 387 392 446 492 512 554 570 581 593 594 689 704 723 864 882 909 923 933 948 1066 1079 1080 1088 1101 1107 1116 1134 1142 1254 1295 1333 1370 1395 1410 1428 1575 1589 1643 1646 30 228 334 341 443 446 452 521 526 637 647 824 914 967 1550 1599 TCGTCC/GGACGA 9 -3 58 55 13 -7.6 56 184 190 297 316 338 417 443 449 582 587 604 642 677 709 713 720 787 828 829 842 846 852 853 855 856 860 865 946 970 998 999 1009 1018 1054 1056 1156 1207 1225 1226 1227 1344 1346 1347 1352 1402 1412 1413 1414 1422 1472 1489 1490 1501 1521 1549 1639 1648 242 339 431 505 719 825 845 983 1056 1204 1392 1547 1549 GGCCTG/CAGGCC 3 -4 52 54 12 -7.9 25 80 135 148 149 157 196 197 205 230 233 234 268 280 289 351 355 442 449 450 468 488 493 501 505 699 722 797 833 872 896 994 995 1012 1020 1023 1101 1104 1128 1131 1132 1133 1145 1151 1399 1432 1469 1545 1546 1575 1576 1648 23 133 148 556 573 577 871 888 976 1263 1446 1533 CTGCGG/CCGCAG 1 -3 50 53 10 -8.6 2 10 81 86 93 109 150 177 235 254 255 258 275 295 302 303 304 313 320 430 450 451 465 519 557 573 598 672 697 741 747 766 767 772 782 819 892 893 894 896 917 920 1014 1015 1086 1113 1231 1344 1409 1447 431 451 649 679 739 967 983 1055 1373 1478 CGACCA/TGGTCG 0 -4 56 51 16 -5.6 121 144 205 222 239 295 344 387 391 399 400 401 408 428 540 554 558 561 566 640 700 710 833 861 862 868 869 929 954 971 1170 1202 1203 1208 1225 1248 1249 1285 1303 1377 1378 1391 1409 1416 1417 1455 1488 1502 1525 1528 1529 1556 1558 1585 1608 1655 48 98 99 241 284 347 505 581 618 721 724 741 829 1224 1300 1516 CACGGC/GCCGTG 2 -3 52 51 12 -7.2 10 20 27 100 150 239 241 252 253 267 268 276 295 312 377 512 515 541 592 630 643 701 757 826 865 866 890 908 909 967 973 974 984 993 1033 1105 1176 1201 1202 1203 1216 1273 1287 1291 1333 1345 1435 1439 1455 1458 1509 1546 61 403 427 525 589 941 983 1122 1385 1511 1619 1644 CTGCCG/CGGCAG 1 -3 50 49 10 -7.7 26 79 166 249 272 282 360 361 383 389 390 427 447 469 501 617 676 698 747 756 787 821 835 917 938 945 968 987 988 1026 1046 1047 1053 1080 1271 1332 1333 1338 1386 1393 1394 1435 1460 1503 1581 1597 1598 1616 1649 1652 318 380 776 842 862 882 1174 1220 1625 1627 GGCCTC/GAGGCC 3 -4 49 49 14 -5.9 5 26 92 136 155 171 246 280 284 342 351 358 393 396 400 484 485 501 541 555 583 624 731 745 816 821 841 846 873 882 909 911 920 1050 1068 1135 1139 1193 1253 1307 1331 1355 1439 1496 1545 1625 1633 1653 1677 255 378 557 561 832 888 914 935 1018 1235 1368 1397 1613 1625 GCCGGA/TCCGGC 5 -1 49 49 6 -10.1 9 13 78 123 198 205 261 262 272 291 296 305 344 407 410 449 471 484 485 490 522 547 568 585 642 676 727 764 765 787 845 886 928 935 957 964 987 988 1010 1026 1030 1058 1153 1200 1333 1338 1376 1492 1661 18 119 318 808 822 1638 CACCCG/CGGGTG 0 -3 46 48 14 -5.7 0 49 52 78 122 143 162 231 246 248 257 264 298 311 346 369 394 494 513 649 675 693 772 819 849 850 863 891 910 927 967 1009 1029 1039 1040 1091 1111 1125 1250 1392 1460 1541 1548 1615 1618 1666 232 276 304 347 485 505 609 664 737 833 854 914 1189 1495 CCAGCG/CGCTGG 1 -4 48 47 15 -5.1 3 18 77 97 167 187 191 241 285 346 347 522 540 637 732 751 778 779 800 801 868 869 873 884 889 931 993 1009 1097 1100 1106 1147 1154 1163 1200 1235 1236 1362 1372 1373 1374 1398 1406 1425 1469 1483 1560 1654 18 87 210 314 393 493 754 861 905 935 1019 1110 1136 1415 1567 GGCTAG/CTAGCC 6 1 46 46 15 -4.9 49 70 71 85 200 367 409 413 466 504 525 526 621 622 633 634 687 692 733 767 771 789 818 833 855 856 882 951 957 973 974 996 1007 1021 1022 1023 1031 1101 1191 1363 1450 1538 1560 1610 1660 1678 55 120 375 602 634 694 698 781 824 901 992 1111 1171 1578 1619 GAGCGG/CCGCTC 4 0 45 45 7 -8.4 12 18 72 73 232 300 318 335 379 433 486 543 563 564 582 588 592 637 639 664 678 717 789 798 877 886 908 922 924 953 1008 1046 1047 1061 1140 1151 1182 1292 1293 1307 1319 1320 1399 1526 1604 148 321 406 986 996 1485 1614 CAGCCG/CGGCTG 1 -3 44 44 10 -6.5 10 30 35 128 129 135 177 241 273 298 349 393 416 512 536 573 642 705 741 747 764 765 766 767 843 890 925 957 966 972 1027 1033 1108 1109 1115 1176 1212 1226 1227 1321 1334 1380 1500 1531 106 162 228 329 403 642 775 937 983 1216 GGACGG/CCGTCC 2 -4 42 42 13 -4.8 41 146 155 216 264 282 342 348 352 362 364 368 433 447 488 504 571 656 789 911 912 963 1024 1048 1049 1088 1149 1170 1258 1259 1280 1281 1323 1339 1340 1380 1382 1392 1438 1595 1672 1678 132 321 341 452 588 603 791 995 1025 1258 1483 1534 1586 AGGCGT/ACGCCT 3 -5 41 42 4 -9.7 103 107 134 181 259 290 300 328 343 349 382 444 511 562 571 575 612 615 625 668 669 671 681 751 846 855 856 864 969 1066 1074 1108 1109 1185 1186 1187 1216 1478 1585 1608 1665 31 723 1156 1454 ACGGCG/CGCCGT 2 -2 42 41 7 -7.4 10 100 155 239 252 253 265 267 272 282 296 340 395 512 522 568 643 723 767 832 865 908 909 911 942 944 1080 1140 1169 1176 1202 1203 1215 1244 1245 1258 1259 1273 1333 1334 1380 1458 54 236 334 603 1334 1511 1632 GGCGTG/CACGCC 3 -4 41 41 5 -8.7 43 56 97 107 134 235 290 306 349 382 444 538 562 566 575 608 629 668 669 680 718 719 751 769 923 1066 1121 1129 1185 1186 1187 1207 1291 1409 1459 1468 1568 1585 1608 1645 1664 7 178 787 879 1602 GTGGGC/GCCCAC 10 -4 40 40 13 -4.4 16 18 46 47 59 60 153 246 287 292 316 349 355 374 479 510 521 562 811 892 893 908 939 949 985 986 1018 1076 1166 1225 1291 1299 1410 1442 1455 1463 1464 1529 1571 1637 117 337 505 520 575 595 741 744 821 914 1310 1454 1645 CGGCCT/AGGCCG 3 -5 40 39 7 -6.9 26 92 135 136 205 230 400 449 450 488 501 502 503 541 555 583 585 721 795 796 841 866 882 911 920 1023 1027 1050 1131 1132 1133 1193 1280 1281 1432 1439 1495 1546 1622 1633 2 133 556 561 861 911 976 GTCGGA/TCCGAC 5 -1 40 38 10 -5.2 1 77 170 261 262 272 319 391 401 411 447 475 496 549 635 667 733 771 1048 1051 1067 1091 1126 1191 1285 1303 1338 1362 1377 1378 1401 1409 1435 1487 1519 1521 1535 1545 1556 1642 406 485 629 992 1105 1219 1224 1325 1491 1656 ACCGGT/ACCGGT 0 -2 40 37 12 -4.2 44 153 287 294 379 408 415 469 475 507 601 613 614 619 780 877 929 945 954 982 983 1016 1029 1063 1174 1183 1228 1250 1296 1349 1350 1372 1373 1418 1492 1547 1569 1586 1605 1620 581 670 814 935 1003 1078 1137 1229 1249 1274 1305 1648 GCACCC/GGGTGC 0 -4 37 37 9 -5.4 52 162 231 298 313 346 414 428 430 494 521 523 538 593 594 646 647 649 808 819 882 952 967 1023 1029 1115 1206 1208 1232 1277 1322 1326 1369 1480 1511 1618 1666 543 609 845 1026 1042 1134 1299 1628 1650 GACGGC/GCCGTC 2 -3 38 37 5 -7.6 4 114 155 272 340 344 364 389 390 447 488 501 504 522 642 656 733 767 866 897 911 925 944 1088 1215 1229 1230 1258 1259 1280 1281 1339 1340 1597 1598 1627 1667 1676 54 603 791 851 992 TGACGG/CCGTCA 2 -4 39 37 11 -4.6 42 99 288 340 344 381 469 501 581 597 631 633 634 691 705 713 767 812 871 897 911 925 928 1017 1032 1059 1060 1169 1258 1259 1327 1365 1370 1380 1499 1597 1598 1627 1667 20 105 228 280 339 437 603 662 731 1244 1566 GGCGTT/AACGCC 3 -4 39 37 10 -5.0 100 222 265 328 343 374 511 533 568 574 586 612 615 625 706 755 764 765 832 854 864 956 969 1004 1034 1074 1108 1109 1153 1169 1304 1380 1476 1477 1532 1533 1559 1668 1669 193 236 509 618 831 1156 1228 1384 1632 1650 TGGCGT/ACGCCA 3 -5 37 37 12 -4.2 12 43 52 235 242 374 483 537 562 586 608 680 706 718 719 755 764 765 798 837 854 902 956 1075 1078 1111 1121 1126 1129 1153 1169 1380 1459 1504 1592 1636 1645 7 22 442 509 581 787 831 879 1123 1228 1602 1650 GGCACC/GGTGCC 0 -5 37 36 11 -4.4 36 52 99 148 149 292 323 324 360 361 415 470 523 539 552 649 701 776 808 826 842 882 967 1004 1053 1062 1113 1206 1208 1250 1363 1430 1443 1444 1597 1598 1676 21 53 431 668 777 845 847 1041 1282 1400 1449 ACGGCC/GGCCGT 2 -2 37 35 7 -5.9 27 100 150 183 268 276 295 344 377 488 541 630 795 796 824 866 897 911 954 973 974 1032 1033 1105 1131 1132 1133 1280 1281 1287 1291 1337 1345 1432 1439 1455 1546 61 133 561 814 819 821 1270 GCACGG/CCGTGC 2 -4 33 35 11 -4.2 10 107 145 147 160 219 274 285 321 374 377 381 441 473 511 515 529 565 617 643 648 720 909 972 984 1024 1048 1143 1144 1168 1192 1215 1639 589 698 922 1022 1122 1223 1282 1388 1400 1534 1553 CACGGG/CCCGTG 2 -3 33 34 11 -3.9 19 37 43 53 160 216 285 304 317 381 387 488 511 529 544 648 656 677 772 802 842 848 907 926 927 934 1032 1079 1168 1312 1570 1604 1627 94 273 431 556 698 922 1022 1145 1260 1419 1534 GCGCCA/TGGCGC 0 -4 32 33 10 -4.1 21 107 115 145 187 191 237 285 349 421 449 505 606 687 729 730 800 801 897 898 924 926 1055 1141 1240 1271 1275 1284 1469 1475 1590 1626 84 289 406 642 695 949 1416 1557 1577 1654 CAGCGT/ACGCTG 1 -3 34 33 11 -3.7 18 58 97 151 187 213 214 260 268 293 347 509 748 820 846 884 889 911 993 994 995 1003 1054 1235 1236 1286 1345 1372 1373 1425 1534 1643 1654 1678 159 272 724 825 882 905 1019 1047 1185 1218 1603 GGCCTA/TAGGCC 3 -4 33 33 11 -3.7 148 149 210 230 267 268 289 432 460 486 600 602 603 624 636 721 745 795 796 833 847 896 996 1013 1023 1027 1077 1104 1135 1169 1193 1440 1568 133 634 693 817 821 970 1358 1368 1446 1625 1645 CAGCGC/GCGCTG 1 -3 29 30 9 -3.9 5 25 174 187 191 241 285 302 333 519 609 700 729 730 732 800 801 970 1076 1147 1154 1210 1279 1287 1304 1463 1464 1475 1679 56 84 127 289 393 520 739 789 906 AGGCCT/AGGCCT 3 -5 30 30 9 -3.9 5 80 148 149 171 210 268 280 289 351 442 624 745 833 846 896 909 996 1077 1104 1135 1139 1145 1399 1545 1561 1576 1653 1663 1677 23 32 148 888 976 1209 1368 1446 1625 GCGTGG/CCACGC 3 -3 31 30 8 -4.3 43 56 142 223 349 382 566 610 611 668 669 748 773 902 923 972 1066 1121 1146 1163 1182 1291 1403 1409 1436 1468 1568 1570 1585 1645 1664 7 180 490 580 724 1281 1602 1632 GGGCGG/CCGCCC 4 0 29 29 4 -6.2 16 26 120 199 256 304 336 465 477 478 515 558 570 596 684 729 730 752 890 928 1018 1191 1212 1242 1410 1422 1539 1635 1650 72 271 521 797 GGGCGG/CCGCCC 10 -2 29 29 4 -6.2 16 26 120 199 256 304 336 465 477 478 515 558 570 596 684 729 730 752 890 928 1018 1191 1212 1242 1410 1422 1539 1635 1650 72 271 521 797 GGCGTA/TACGCC 3 -4 27 27 3 -6.4 12 103 136 181 184 242 259 300 483 537 571 642 681 798 837 855 856 1111 1126 1157 1216 1241 1258 1259 1478 1592 1636 22 31 303 CGACCT/AGGTCG 7 -4 28 27 9 -3.2 74 238 294 398 516 615 624 635 640 713 714 715 928 1009 1092 1231 1319 1320 1325 1346 1347 1450 1459 1469 1504 1606 1641 1650 271 275 304 495 626 1478 1547 1594 1664 CGGCGT/ACGCCG 3 -5 27 26 5 -4.8 97 100 265 300 306 538 568 574 588 629 642 643 832 865 923 1004 1035 1207 1231 1258 1259 1304 1380 1409 1476 1477 1559 193 236 303 618 1632 AGGGCC/GGCCCT 10 -3 26 26 8 -3.4 25 100 244 264 358 448 454 474 501 544 587 636 781 897 919 921 976 977 1101 1136 1154 1359 1410 1609 1635 1671 31 319 378 635 864 1358 1650 1679 AGCGCA/TGCGCT 1 -2 25 24 6 -3.8 25 202 320 519 531 532 617 681 820 906 1074 1092 1210 1231 1240 1279 1287 1304 1315 1450 1466 1475 1502 1543 1544 127 434 550 563 898 906 GCGGGC/GCCCGC 10 -4 25 23 1 -7.3 26 120 220 336 432 489 557 566 682 815 818 833 886 890 910 947 1131 1132 1133 1260 1261 1307 1364 1445 1496 986 CGGGCC/GGCCCG 10 -3 23 22 6 -3.4 20 62 126 144 342 636 682 711 783 792 798 864 884 913 975 1086 1131 1132 1133 1151 1260 1261 1570 31 56 724 1267 1592 1673