#4128/2515 #17.68 # k-mer/r.c. Cluster Offset PosCt wPosCt NegCt HGP_10 TGGTGG/CCACCA 0 -2 1232 1244 95 -179.4 0 2 3 5 7 9 10 13 16 17 19 24 26 27 29 31 34 36 37 38 39 42 45 46 49 54 55 57 58 59 62 63 64 67 68 72 77 80 82 84 89 90 91 95 96 97 99 100 104 108 110 112 113 116 121 122 128 129 130 134 137 143 144 145 152 154 156 157 158 159 163 168 169 170 171 177 180 184 186 187 189 192 196 197 200 201 203 204 208 210 211 216 217 219 220 223 228 229 232 237 238 239 243 244 245 246 255 257 263 265 272 273 274 277 279 281 284 285 286 290 292 294 297 298 300 301 303 304 306 308 311 312 313 317 319 323 326 332 335 338 340 341 344 349 350 354 355 357 360 365 368 376 377 380 388 399 400 401 402 406 407 413 415 417 419 420 428 436 437 440 443 445 446 447 449 450 454 459 465 468 472 475 476 479 483 486 487 492 497 502 504 506 508 509 510 517 520 521 528 535 539 541 547 550 553 557 562 565 567 569 587 593 603 607 608 610 612 613 615 616 620 624 625 626 629 632 635 638 640 649 653 658 666 667 668 681 682 684 685 686 690 692 693 695 696 697 702 708 709 712 714 720 723 725 726 730 733 735 737 738 741 747 749 750 754 755 756 758 760 762 763 765 766 769 771 773 775 777 781 782 787 790 792 793 794 795 801 802 812 813 817 818 820 822 823 824 826 828 830 832 841 846 851 853 855 856 858 862 864 871 874 878 881 883 884 893 894 900 905 908 910 911 913 914 921 922 924 925 927 930 933 934 935 940 941 943 945 947 948 951 952 953 957 958 965 972 976 977 978 981 983 984 987 988 990 991 995 1002 1005 1008 1015 1019 1020 1021 1025 1031 1033 1035 1037 1041 1042 1052 1055 1056 1057 1058 1059 1062 1063 1070 1078 1081 1085 1093 1100 1101 1105 1107 1110 1112 1113 1119 1122 1129 1133 1134 1142 1147 1149 1150 1152 1153 1164 1165 1167 1168 1170 1174 1176 1184 1188 1191 1192 1194 1201 1203 1206 1208 1211 1214 1215 1219 1220 1222 1223 1226 1234 1235 1244 1249 1251 1268 1271 1276 1277 1278 1286 1288 1292 1299 1302 1304 1306 1308 1310 1311 1312 1313 1321 1325 1330 1338 1341 1348 1349 1350 1360 1363 1364 1365 1366 1367 1369 1370 1373 1374 1377 1388 1389 1392 1393 1400 1402 1405 1406 1408 1409 1410 1411 1417 1422 1423 1428 1430 1431 1433 1435 1437 1438 1449 1451 1454 1465 1467 1474 1482 1490 1498 1501 1503 1504 1507 1515 1518 1520 1522 1533 1536 1542 1543 1545 1552 1555 1556 1557 1565 1572 1573 1574 1577 1582 1586 1589 1595 1596 1597 1598 1602 1606 1608 1610 1613 1618 1623 1627 1634 1635 1636 1638 1640 1641 1642 1647 1649 1650 1652 1656 1662 1668 1678 1682 1684 1688 1689 1690 1693 1695 1697 1698 1701 1706 1708 1713 1715 1723 1727 1730 1732 1736 1743 1750 1752 1754 1755 1757 1759 1765 1768 1773 1777 1778 1780 1781 1783 1784 1786 1787 1789 1798 1799 1807 1815 1817 1818 1825 1827 1828 1830 1837 1843 1847 1851 1854 1855 1856 1858 1862 1865 1868 1869 1873 1880 1883 1889 1891 1892 1895 1905 1906 1908 1911 1912 1915 1924 1925 1927 1932 1933 1935 1940 1941 1954 1959 1960 1961 1962 1963 1965 1966 1968 1972 1973 1979 1981 1983 1988 1990 1991 1992 1999 2000 2002 2003 2010 2015 2021 2022 2032 2038 2040 2045 2046 2051 2061 2064 2068 2069 2072 2074 2078 2079 2080 2081 2084 2085 2093 2099 2101 2102 2105 2108 2115 2119 2123 2124 2129 2130 2133 2136 2139 2145 2147 2151 2157 2158 2162 2164 2170 2172 2173 2176 2187 2194 2198 2202 2205 2213 2219 2229 2230 2231 2234 2237 2238 2247 2249 2253 2256 2259 2265 2270 2284 2289 2292 2297 2299 2301 2302 2303 2305 2316 2327 2331 2333 2335 2343 2346 2348 2352 2353 2355 2356 2360 2361 2366 2367 2369 2370 2378 2379 2381 2390 2392 2393 2396 2400 2401 2403 2418 2421 2422 2423 2424 2425 2430 2433 2434 2444 2446 2452 2454 2458 2459 2461 2466 2467 2468 2472 2482 2485 2486 2487 2491 2493 2501 2502 2505 2508 2510 2512 2517 2519 2535 2543 2546 2550 2558 2560 2561 2564 2566 2573 2576 2584 2586 2590 2591 2594 2595 2600 2601 2604 2606 2608 2611 2615 2619 2623 2635 2636 2638 2647 2648 2650 2651 2652 2653 2655 2658 2660 2668 2669 2670 2672 2674 2675 2676 2679 2682 2685 2693 2694 2698 2700 2707 2708 2709 2710 2711 2713 2714 2715 2716 2721 2725 2729 2739 2741 2742 2748 2753 2762 2764 2767 2768 2779 2782 2795 2798 2807 2809 2813 2817 2825 2830 2831 2835 2836 2839 2840 2846 2847 2852 2860 2866 2871 2874 2875 2878 2887 2893 2894 2903 2904 2905 2908 2909 2919 2920 2929 2935 2938 2939 2945 2946 2947 2948 2949 2952 2958 2968 2977 2978 2981 2989 2992 2993 2995 3001 3004 3007 3011 3014 3018 3019 3022 3041 3042 3047 3048 3049 3051 3065 3074 3079 3081 3086 3094 3098 3103 3109 3118 3120 3121 3122 3125 3128 3132 3134 3136 3138 3140 3142 3145 3151 3157 3162 3163 3165 3167 3168 3170 3183 3188 3191 3193 3194 3199 3200 3202 3205 3208 3212 3214 3215 3217 3224 3227 3230 3236 3240 3257 3258 3260 3264 3265 3267 3272 3278 3285 3296 3297 3301 3302 3303 3304 3307 3309 3311 3313 3316 3320 3325 3337 3346 3351 3356 3357 3359 3360 3367 3373 3377 3379 3386 3387 3389 3391 3392 3395 3396 3397 3406 3411 3412 3414 3419 3424 3425 3435 3436 3443 3450 3453 3460 3462 3463 3464 3465 3467 3469 3471 3475 3476 3480 3481 3487 3488 3493 3499 3501 3504 3505 3507 3509 3516 3519 3527 3528 3529 3532 3533 3535 3540 3543 3547 3549 3560 3572 3574 3579 3581 3583 3584 3586 3594 3604 3612 3622 3627 3634 3637 3644 3648 3652 3653 3656 3659 3661 3662 3664 3665 3668 3669 3673 3675 3677 3682 3685 3688 3700 3703 3704 3705 3708 3712 3715 3725 3727 3728 3730 3741 3746 3748 3751 3754 3766 3769 3772 3773 3775 3776 3777 3782 3783 3785 3788 3789 3792 3796 3801 3805 3818 3820 3821 3826 3827 3833 3835 3837 3839 3843 3844 3845 3850 3858 3860 3861 3865 3873 3875 3876 3878 3880 3881 3882 3887 3892 3894 3896 3897 3898 3900 3905 3911 3914 3915 3918 3924 3927 3928 3930 3933 3937 3938 3943 3953 3955 3957 3960 3965 3971 3972 3975 3977 3978 3979 3982 3985 3988 3993 3994 3996 4000 4001 4005 4007 4012 4016 4017 4021 4022 4025 4034 4035 4036 4040 4041 4043 4046 4050 4053 4054 4056 4057 4059 4061 4063 4065 4066 4070 4076 4077 4085 4086 4099 4102 4111 4114 4115 4117 4121 7 47 73 209 223 229 251 272 300 301 306 321 329 341 370 403 422 444 508 509 562 563 574 643 701 712 717 775 777 805 806 812 849 914 949 997 1000 1017 1026 1040 1041 1075 1102 1105 1127 1164 1209 1273 1294 1304 1305 1368 1388 1407 1420 1423 1433 1454 1464 1520 1554 1557 1708 1709 1729 1756 1776 1815 1842 1924 1999 2049 2067 2069 2100 2110 2114 2115 2123 2135 2152 2166 2167 2220 2249 2256 2375 2406 2411 2432 2441 2472 2488 2492 2494 GTGGTG/CACCAC 0 -3 907 913 75 -121.6 3 7 13 18 19 23 26 28 29 34 35 36 37 39 42 45 52 55 57 62 67 72 74 77 78 80 82 84 86 91 95 96 100 104 112 116 121 122 123 127 130 134 142 155 157 161 162 163 170 175 178 183 187 189 192 193 197 199 200 211 214 216 217 219 228 234 243 244 246 257 261 263 265 273 274 277 278 279 281 283 285 290 292 294 296 298 300 301 303 312 314 315 323 327 345 350 351 354 356 357 360 368 373 375 399 400 402 403 413 414 415 419 420 427 431 436 438 445 446 449 454 458 465 467 472 474 482 483 484 488 489 492 494 497 502 503 504 505 507 519 521 525 530 531 543 550 552 553 557 559 562 567 586 590 592 593 601 604 606 607 610 612 613 616 620 624 631 635 638 639 640 649 653 667 668 669 673 681 686 690 695 705 709 714 718 723 726 735 738 740 741 748 750 755 756 758 762 763 773 778 780 782 787 792 794 797 801 804 805 811 812 816 817 818 824 828 832 834 838 841 846 853 854 856 859 862 869 870 874 881 883 884 897 901 914 918 922 925 930 931 934 939 940 941 945 947 948 951 952 953 957 959 965 971 975 976 990 1001 1005 1008 1010 1019 1021 1024 1027 1029 1031 1037 1041 1042 1045 1052 1054 1056 1057 1058 1059 1061 1062 1063 1078 1081 1085 1095 1099 1110 1112 1119 1126 1129 1132 1152 1156 1158 1165 1167 1170 1171 1174 1179 1184 1188 1189 1192 1197 1203 1211 1212 1214 1218 1221 1234 1236 1248 1251 1255 1260 1276 1303 1304 1310 1311 1313 1316 1322 1330 1338 1340 1344 1350 1360 1365 1372 1374 1375 1388 1392 1393 1394 1399 1406 1417 1424 1425 1428 1430 1435 1437 1438 1439 1443 1444 1454 1455 1458 1462 1465 1470 1474 1482 1483 1500 1501 1503 1504 1507 1510 1520 1536 1545 1546 1552 1557 1562 1563 1565 1572 1573 1582 1583 1586 1589 1595 1597 1600 1602 1613 1614 1627 1635 1638 1640 1643 1649 1652 1656 1660 1662 1665 1668 1670 1677 1689 1690 1691 1693 1695 1697 1699 1701 1716 1723 1727 1730 1732 1743 1746 1749 1750 1752 1755 1764 1765 1766 1767 1768 1773 1783 1784 1785 1795 1798 1799 1803 1816 1817 1820 1827 1845 1849 1850 1851 1854 1858 1862 1865 1868 1870 1873 1880 1883 1887 1889 1892 1901 1903 1906 1910 1911 1912 1915 1924 1935 1947 1954 1959 1965 1966 1968 1972 1974 1976 1990 2005 2009 2010 2016 2022 2034 2045 2063 2072 2074 2079 2080 2083 2085 2093 2094 2095 2102 2108 2113 2114 2115 2119 2124 2128 2132 2138 2139 2143 2145 2147 2151 2154 2162 2164 2165 2173 2177 2181 2185 2194 2195 2198 2200 2202 2213 2219 2230 2234 2237 2238 2239 2240 2258 2263 2270 2274 2292 2297 2299 2301 2302 2303 2316 2333 2334 2335 2340 2345 2348 2355 2356 2361 2366 2367 2369 2370 2378 2396 2400 2409 2413 2422 2424 2431 2433 2434 2438 2444 2446 2456 2458 2461 2465 2466 2467 2468 2469 2472 2474 2484 2485 2491 2501 2508 2511 2512 2514 2517 2528 2531 2535 2536 2543 2548 2550 2552 2573 2581 2584 2586 2593 2594 2598 2601 2604 2607 2615 2620 2623 2626 2642 2646 2648 2656 2661 2663 2669 2675 2676 2683 2694 2696 2698 2703 2710 2714 2716 2721 2722 2729 2732 2733 2738 2739 2742 2748 2751 2753 2759 2761 2764 2767 2768 2782 2798 2799 2800 2807 2809 2813 2814 2816 2817 2824 2825 2826 2827 2830 2833 2845 2847 2850 2860 2875 2878 2891 2893 2897 2917 2920 2922 2927 2945 2947 2952 2962 2963 2977 2981 2986 2991 2999 3004 3005 3006 3010 3011 3018 3023 3032 3033 3040 3044 3049 3051 3052 3079 3086 3093 3098 3101 3103 3112 3120 3128 3131 3135 3138 3139 3140 3151 3160 3163 3166 3167 3184 3194 3197 3198 3199 3201 3205 3212 3222 3227 3228 3230 3233 3236 3246 3248 3254 3255 3257 3258 3264 3267 3272 3297 3302 3304 3305 3311 3313 3316 3322 3336 3340 3341 3346 3351 3354 3356 3359 3368 3369 3376 3381 3384 3390 3391 3392 3395 3396 3397 3401 3406 3414 3419 3424 3425 3443 3446 3450 3452 3457 3460 3462 3478 3488 3489 3493 3514 3521 3529 3533 3541 3550 3557 3560 3569 3572 3573 3574 3578 3582 3583 3584 3586 3590 3610 3612 3622 3624 3626 3633 3637 3639 3640 3648 3656 3661 3662 3664 3667 3668 3682 3685 3687 3688 3698 3700 3705 3712 3715 3718 3721 3727 3736 3737 3741 3746 3747 3752 3756 3762 3773 3775 3779 3784 3789 3791 3792 3796 3805 3810 3818 3821 3826 3835 3844 3845 3858 3860 3861 3869 3871 3876 3882 3886 3892 3896 3900 3908 3909 3911 3918 3923 3924 3927 3930 3938 3950 3951 3953 3960 3967 3971 3972 3979 3982 3984 3985 3988 3993 3994 3995 4000 4005 4007 4008 4018 4021 4034 4038 4046 4053 4056 4060 4067 4071 4076 4082 4085 4091 4092 4096 4098 4110 4115 4120 4121 4126 7 11 47 73 127 229 301 308 318 394 444 469 503 508 580 588 635 683 714 717 777 797 805 806 883 914 951 966 991 1000 1102 1105 1127 1233 1250 1264 1284 1304 1305 1316 1332 1343 1392 1407 1464 1520 1613 1709 1735 1776 1842 1843 1901 1920 1924 1945 1952 2021 2049 2056 2067 2069 2110 2114 2115 2166 2167 2249 2292 2327 2335 2384 2411 2415 2463 GGTGGT/ACCACC 0 -1 825 829 85 -97.3 3 7 18 19 24 25 26 27 29 31 34 36 37 39 42 45 49 52 55 57 64 71 72 76 80 84 90 91 95 96 97 100 104 114 120 128 130 134 142 151 152 162 163 170 184 187 189 192 197 208 211 214 216 217 228 239 249 252 255 262 263 265 273 274 278 279 281 283 285 290 292 294 297 300 301 314 317 319 323 324 329 335 341 349 353 354 357 361 368 377 399 400 401 402 407 411 413 415 420 424 426 427 436 445 446 449 450 454 456 465 466 469 472 474 475 479 483 489 497 503 505 506 507 521 528 542 543 546 548 550 559 562 567 575 579 585 595 604 607 608 613 620 623 624 627 635 638 640 649 667 673 681 682 685 686 690 694 696 705 709 712 714 720 723 729 738 740 747 748 755 758 762 765 770 773 784 787 788 790 792 794 797 801 811 812 817 823 824 828 832 833 839 841 846 853 855 862 864 874 880 881 883 884 894 897 901 905 914 924 930 931 933 934 939 940 941 945 947 948 951 953 957 976 981 988 991 992 995 1005 1006 1008 1010 1014 1015 1019 1021 1030 1035 1037 1041 1042 1054 1055 1056 1057 1058 1059 1061 1063 1079 1081 1099 1110 1111 1112 1115 1117 1119 1120 1147 1152 1153 1156 1160 1161 1166 1167 1174 1184 1191 1203 1206 1211 1213 1214 1218 1228 1235 1251 1262 1266 1271 1275 1276 1304 1307 1310 1311 1313 1316 1325 1337 1340 1356 1360 1363 1366 1374 1387 1388 1389 1392 1393 1399 1400 1409 1417 1429 1431 1434 1435 1437 1438 1442 1458 1462 1465 1467 1469 1470 1474 1491 1498 1505 1507 1510 1518 1520 1536 1552 1555 1557 1563 1565 1572 1582 1586 1595 1597 1604 1608 1609 1615 1627 1631 1632 1634 1636 1638 1639 1649 1656 1662 1665 1673 1678 1679 1680 1689 1690 1695 1697 1701 1708 1723 1727 1732 1736 1739 1743 1746 1749 1751 1752 1754 1765 1767 1768 1773 1775 1783 1784 1789 1795 1798 1799 1807 1817 1827 1828 1832 1837 1838 1849 1851 1852 1858 1862 1865 1868 1870 1873 1878 1880 1883 1889 1891 1903 1910 1911 1912 1915 1924 1925 1927 1933 1935 1940 1950 1954 1959 1960 1961 1963 1965 1968 1973 1979 1984 1988 2010 2014 2016 2022 2035 2036 2041 2045 2046 2068 2069 2074 2079 2080 2086 2087 2093 2097 2099 2102 2105 2108 2109 2119 2120 2125 2139 2145 2147 2152 2155 2162 2166 2176 2194 2197 2198 2201 2202 2213 2219 2223 2224 2230 2237 2238 2240 2251 2270 2280 2289 2294 2299 2301 2302 2307 2318 2328 2331 2333 2336 2337 2340 2342 2346 2352 2355 2361 2366 2367 2369 2370 2381 2390 2391 2394 2400 2401 2403 2424 2430 2431 2434 2444 2445 2446 2456 2458 2463 2464 2466 2467 2468 2469 2472 2474 2484 2485 2490 2491 2495 2496 2501 2509 2512 2520 2523 2531 2535 2550 2563 2566 2573 2576 2584 2586 2593 2594 2597 2601 2604 2607 2615 2620 2623 2632 2633 2648 2650 2660 2661 2663 2664 2667 2669 2674 2675 2676 2679 2698 2700 2704 2705 2707 2708 2710 2711 2714 2716 2721 2723 2751 2753 2760 2764 2767 2773 2779 2783 2790 2795 2798 2809 2810 2813 2814 2817 2822 2824 2825 2835 2838 2840 2842 2844 2845 2847 2852 2860 2867 2878 2889 2897 2902 2914 2920 2923 2931 2932 2940 2942 2943 2947 2949 2977 2978 2980 2981 3003 3004 3011 3012 3013 3018 3033 3040 3050 3051 3061 3069 3075 3079 3086 3120 3125 3128 3132 3136 3138 3146 3157 3163 3167 3168 3176 3180 3183 3194 3199 3201 3205 3208 3212 3215 3216 3217 3226 3227 3228 3233 3236 3246 3257 3258 3262 3264 3266 3276 3281 3284 3285 3290 3293 3294 3297 3304 3307 3311 3313 3315 3336 3346 3351 3356 3359 3362 3382 3384 3385 3395 3399 3401 3405 3414 3425 3428 3450 3460 3462 3464 3491 3493 3498 3499 3507 3511 3515 3526 3529 3533 3540 3541 3543 3546 3552 3560 3571 3574 3584 3586 3590 3612 3622 3634 3639 3640 3651 3656 3659 3664 3668 3678 3682 3685 3688 3694 3696 3697 3700 3712 3713 3715 3716 3736 3744 3756 3757 3758 3770 3773 3775 3782 3800 3801 3818 3821 3826 3835 3839 3845 3846 3850 3858 3860 3861 3870 3874 3876 3882 3885 3892 3895 3896 3900 3911 3919 3930 3943 3951 3953 3954 3960 3965 3970 3971 3972 3977 3982 3984 3985 3988 3993 3994 4000 4007 4012 4016 4019 4033 4034 4035 4054 4056 4057 4061 4066 4076 4085 4105 4110 4115 4121 4123 4125 4126 11 73 162 229 301 313 318 347 376 382 403 422 425 444 505 588 643 701 712 714 717 737 749 772 776 777 797 805 883 914 997 1000 1041 1042 1075 1102 1127 1164 1171 1209 1233 1273 1304 1324 1327 1354 1388 1407 1419 1420 1451 1516 1520 1541 1548 1557 1563 1709 1712 1741 1753 1756 1805 1815 1843 1875 1954 2049 2056 2067 2069 2110 2114 2115 2135 2167 2209 2213 2232 2249 2381 2406 2411 2415 2432 TGGTGC/GCACCA 0 -2 610 625 57 -76.3 1 4 7 12 18 19 23 28 30 34 37 41 48 56 61 70 74 93 101 109 117 122 128 135 150 153 155 161 162 164 165 167 174 175 183 186 190 193 202 213 222 224 236 242 250 251 269 278 279 280 295 296 309 314 320 327 331 339 343 345 347 356 365 366 374 375 378 384 393 395 416 420 422 425 427 438 442 448 452 463 472 474 475 486 488 489 491 500 502 505 507 510 516 526 531 534 555 558 559 570 571 572 574 586 588 589 590 591 592 604 609 618 623 631 641 642 650 651 655 669 680 686 700 707 710 717 739 751 756 761 763 766 767 778 786 792 797 801 806 811 812 827 829 834 838 845 856 863 866 869 870 876 900 918 928 944 946 950 962 964 969 971 982 994 996 1004 1008 1018 1039 1040 1045 1054 1056 1061 1078 1082 1090 1095 1099 1102 1113 1121 1125 1126 1130 1138 1144 1148 1151 1158 1162 1171 1174 1177 1179 1185 1189 1190 1198 1207 1221 1236 1239 1243 1245 1251 1254 1255 1260 1263 1267 1274 1280 1283 1289 1290 1291 1296 1301 1303 1315 1316 1319 1326 1327 1334 1344 1345 1361 1375 1385 1417 1419 1431 1435 1440 1441 1445 1447 1453 1455 1456 1457 1458 1461 1476 1479 1481 1486 1488 1492 1502 1507 1517 1519 1520 1527 1529 1535 1539 1540 1555 1561 1565 1567 1581 1582 1583 1584 1585 1614 1634 1653 1654 1655 1656 1676 1686 1695 1697 1699 1701 1704 1706 1709 1716 1746 1766 1768 1780 1784 1785 1795 1809 1821 1823 1831 1832 1836 1839 1844 1850 1859 1864 1879 1887 1888 1899 1903 1915 1916 1926 1929 1934 1945 1971 1987 2010 2013 2018 2020 2029 2043 2062 2070 2071 2092 2093 2094 2104 2107 2112 2114 2118 2126 2132 2135 2144 2148 2149 2151 2165 2175 2177 2182 2183 2185 2192 2198 2218 2219 2227 2239 2240 2242 2243 2245 2258 2263 2270 2271 2294 2305 2309 2325 2334 2337 2340 2343 2345 2349 2361 2363 2375 2377 2394 2396 2414 2419 2426 2437 2444 2450 2462 2472 2480 2484 2488 2492 2497 2499 2511 2513 2522 2526 2528 2532 2535 2536 2544 2547 2565 2569 2603 2604 2605 2607 2609 2612 2620 2623 2624 2626 2642 2645 2646 2650 2661 2668 2697 2699 2733 2736 2747 2762 2767 2772 2776 2784 2787 2790 2803 2804 2814 2816 2826 2833 2845 2853 2857 2860 2880 2882 2891 2900 2907 2909 2912 2934 2937 2941 2953 2960 2963 2978 2989 3005 3028 3035 3038 3039 3044 3045 3053 3057 3077 3080 3086 3090 3093 3101 3117 3128 3149 3178 3179 3182 3197 3206 3212 3219 3223 3225 3227 3228 3233 3235 3239 3244 3245 3249 3250 3254 3257 3259 3260 3270 3296 3297 3304 3308 3316 3318 3319 3322 3332 3336 3339 3341 3347 3354 3356 3365 3378 3382 3384 3390 3401 3407 3410 3418 3420 3422 3430 3431 3446 3452 3457 3472 3478 3485 3494 3500 3518 3535 3537 3564 3567 3597 3609 3625 3633 3640 3645 3647 3698 3715 3731 3733 3736 3737 3740 3745 3753 3756 3759 3779 3787 3791 3795 3797 3810 3812 3815 3840 3841 3842 3853 3868 3872 3879 3888 3903 3908 3911 3912 3916 3921 3932 3936 3939 3945 3949 3950 3951 3962 3968 3982 3988 4003 4008 4010 4020 4024 4031 4038 4048 4060 4062 4071 4073 4077 4078 4079 4081 4091 4093 4116 4119 4126 53 85 251 301 305 365 456 469 588 662 691 739 777 797 879 883 906 991 1027 1045 1122 1180 1273 1305 1327 1363 1388 1392 1415 1433 1449 1464 1495 1534 1558 1620 1642 1696 1729 1801 1836 1843 1901 1920 1952 2059 2086 2110 2114 2115 2167 2185 2213 2292 2384 2415 2492 GGTGGA/TCCACC 0 -1 607 609 81 -58.5 3 5 6 7 14 16 24 34 36 37 38 54 55 59 67 72 77 82 104 108 110 111 112 113 120 121 129 152 153 163 169 171 174 180 187 192 196 197 211 216 220 228 229 233 237 238 241 244 245 246 249 254 263 265 272 276 279 284 285 298 303 308 311 313 324 340 343 344 360 365 388 398 399 400 406 418 419 440 450 459 460 465 472 476 487 489 505 510 517 535 546 551 567 580 583 593 596 601 603 612 620 626 649 666 668 681 683 690 692 697 706 709 722 723 729 732 750 753 760 762 763 771 782 791 802 816 818 820 832 841 846 847 850 851 862 864 865 866 874 891 893 900 903 911 913 924 926 927 930 935 941 957 958 964 972 973 976 977 981 985 987 1021 1025 1031 1052 1058 1059 1062 1063 1093 1100 1109 1110 1112 1133 1142 1150 1165 1176 1182 1184 1188 1192 1194 1203 1208 1219 1223 1226 1234 1244 1249 1265 1277 1279 1285 1288 1292 1300 1302 1306 1308 1311 1312 1316 1330 1332 1348 1370 1373 1383 1388 1389 1393 1405 1410 1413 1415 1423 1428 1433 1437 1438 1441 1454 1465 1466 1482 1487 1490 1495 1501 1504 1507 1522 1534 1538 1545 1557 1560 1573 1582 1589 1597 1598 1608 1610 1618 1623 1637 1638 1640 1641 1642 1645 1647 1650 1652 1663 1682 1684 1688 1698 1713 1714 1730 1732 1738 1745 1752 1757 1758 1765 1767 1770 1780 1783 1786 1791 1799 1807 1818 1830 1843 1847 1855 1856 1868 1869 1873 1906 1912 1920 1935 1946 1948 1954 1962 1966 1969 1972 1983 2000 2004 2015 2019 2021 2040 2052 2056 2072 2078 2079 2081 2084 2101 2110 2115 2123 2124 2127 2129 2135 2136 2137 2157 2170 2173 2176 2219 2238 2252 2253 2256 2267 2274 2281 2284 2292 2297 2299 2302 2305 2313 2316 2334 2335 2338 2353 2360 2388 2393 2405 2407 2408 2418 2423 2425 2434 2439 2441 2444 2454 2459 2467 2471 2485 2491 2493 2501 2506 2508 2515 2517 2519 2522 2535 2543 2546 2550 2558 2560 2585 2591 2600 2608 2615 2635 2638 2640 2651 2652 2655 2669 2670 2690 2694 2696 2700 2709 2713 2715 2725 2735 2737 2741 2742 2748 2752 2762 2766 2768 2782 2797 2801 2806 2813 2817 2830 2831 2839 2840 2868 2869 2874 2875 2890 2893 2894 2916 2919 2929 2933 2935 2937 2938 2939 2941 2942 2946 2947 2948 2952 2955 2965 2968 2969 2975 2977 2981 2989 2993 2995 3007 3014 3022 3026 3042 3048 3079 3080 3081 3094 3103 3104 3108 3109 3111 3140 3145 3165 3172 3188 3191 3193 3194 3200 3205 3212 3216 3220 3224 3233 3249 3272 3279 3281 3302 3317 3325 3339 3342 3360 3389 3391 3392 3395 3407 3412 3419 3424 3432 3450 3455 3465 3475 3480 3487 3488 3501 3519 3528 3534 3535 3547 3549 3554 3560 3566 3581 3583 3584 3593 3602 3603 3606 3612 3627 3637 3644 3648 3650 3652 3653 3659 3668 3669 3673 3703 3704 3705 3725 3727 3728 3732 3741 3751 3754 3766 3769 3772 3773 3776 3778 3783 3796 3805 3820 3823 3827 3829 3837 3838 3843 3844 3845 3861 3865 3878 3884 3894 3905 3911 3912 3918 3924 3927 3928 3930 3931 3933 3937 3938 3971 3972 3978 3993 3996 4005 4017 4021 4036 4043 4046 4050 4056 4065 4070 4085 4093 4099 4100 4101 4103 4111 4114 4115 53 72 73 98 138 163 200 209 229 272 300 301 305 321 329 337 391 425 451 508 509 550 562 581 590 669 775 812 825 849 850 948 949 1000 1017 1029 1040 1060 1072 1102 1172 1195 1196 1305 1368 1377 1388 1423 1433 1495 1502 1554 1587 1648 1704 1705 1708 1709 1831 1842 1980 1999 2005 2110 2114 2134 2152 2166 2167 2180 2247 2263 2280 2356 2375 2428 2432 2446 2487 2492 2494 TTGGTG/CACCAA 0 -3 569 576 107 -40.7 3 4 8 10 24 38 41 48 55 59 84 91 95 100 108 109 113 114 117 122 134 135 137 144 145 150 152 159 177 180 184 186 187 190 196 201 202 203 213 217 219 229 232 238 242 254 269 279 281 284 290 308 309 315 317 326 335 340 341 344 354 365 368 374 377 384 393 401 407 413 415 417 419 425 442 443 450 452 463 475 479 483 487 491 500 502 510 512 516 526 530 534 535 541 558 565 567 569 570 571 587 588 603 609 618 623 631 632 650 655 666 670 681 684 692 697 702 707 708 730 733 739 749 751 754 755 756 761 766 773 775 777 781 784 794 795 801 813 830 846 866 867 871 876 884 900 908 914 935 941 944 969 983 987 990 1004 1016 1018 1021 1025 1033 1040 1055 1078 1081 1100 1105 1107 1121 1125 1130 1144 1149 1152 1153 1158 1164 1168 1176 1177 1180 1185 1198 1215 1219 1221 1223 1240 1243 1246 1249 1267 1268 1269 1271 1277 1283 1290 1291 1292 1302 1304 1306 1319 1321 1325 1363 1369 1373 1392 1408 1431 1440 1441 1467 1478 1479 1490 1498 1507 1515 1517 1539 1540 1542 1545 1547 1555 1556 1581 1582 1592 1595 1596 1608 1610 1623 1634 1636 1638 1641 1653 1656 1676 1688 1690 1695 1701 1704 1706 1708 1709 1727 1732 1749 1754 1778 1780 1783 1789 1799 1807 1815 1819 1832 1839 1843 1859 1869 1888 1890 1891 1895 1908 1909 1921 1925 1927 1932 1934 1941 1966 1968 1985 1991 1999 2000 2013 2015 2018 2020 2029 2032 2038 2040 2061 2064 2068 2075 2080 2092 2101 2104 2125 2130 2133 2145 2157 2158 2175 2185 2191 2194 2202 2209 2218 2231 2245 2247 2259 2284 2294 2299 2301 2302 2305 2309 2325 2326 2331 2334 2337 2340 2342 2343 2355 2363 2377 2383 2390 2392 2396 2401 2403 2411 2423 2425 2430 2437 2452 2462 2472 2482 2485 2487 2493 2510 2511 2513 2566 2586 2590 2600 2606 2608 2609 2615 2619 2627 2638 2647 2650 2651 2658 2668 2670 2675 2690 2693 2697 2709 2713 2715 2741 2776 2779 2787 2790 2804 2811 2831 2835 2840 2866 2874 2887 2894 2905 2908 2919 2931 2939 2948 2961 2978 2981 2984 2989 2992 2993 3001 3004 3014 3019 3028 3039 3041 3042 3068 3074 3093 3094 3102 3109 3117 3121 3122 3132 3134 3136 3149 3157 3170 3178 3182 3183 3187 3191 3193 3208 3214 3215 3218 3225 3235 3244 3245 3252 3257 3264 3265 3270 3278 3296 3297 3300 3304 3313 3332 3334 3339 3347 3351 3357 3365 3367 3372 3374 3376 3377 3378 3389 3407 3410 3414 3418 3425 3430 3450 3452 3460 3462 3463 3465 3467 3494 3499 3504 3518 3527 3535 3540 3549 3567 3579 3594 3597 3604 3609 3615 3634 3644 3662 3664 3673 3677 3704 3712 3715 3733 3765 3776 3777 3782 3785 3787 3788 3797 3801 3811 3815 3827 3830 3841 3842 3850 3865 3872 3873 3875 3880 3892 3898 3903 3912 3915 3916 3921 3924 3930 3932 3937 3943 3951 3955 3962 3971 3977 3988 3994 4007 4010 4012 4020 4022 4025 4031 4036 4040 4057 4065 4076 4077 4078 4102 4111 4114 4115 4117 55 63 167 186 187 189 191 200 209 218 223 251 305 321 329 373 401 405 415 438 455 463 514 563 574 638 646 691 707 712 751 779 846 887 893 928 938 997 1001 1018 1026 1040 1041 1045 1083 1098 1122 1209 1229 1237 1282 1294 1363 1368 1388 1415 1420 1423 1451 1454 1464 1495 1554 1557 1558 1692 1722 1729 1756 1801 1815 1836 1843 1885 1898 1917 1939 1943 1958 1999 2016 2038 2059 2077 2081 2086 2100 2123 2135 2167 2185 2213 2227 2285 2298 2371 2372 2375 2387 2408 2415 2421 2441 2464 2471 2481 2492 CTGGTG/CACCAG 0 -3 559 574 65 -61.5 1 2 7 26 31 36 37 39 46 49 54 56 58 59 61 63 68 70 72 80 90 93 95 96 97 100 101 121 128 129 130 152 153 156 158 163 164 165 167 168 169 171 204 216 220 222 223 224 236 237 238 245 250 251 269 278 286 295 297 298 300 306 311 314 320 338 343 347 348 349 355 365 366 370 373 378 388 393 395 406 414 415 422 423 428 436 437 440 447 448 450 486 491 502 506 510 517 520 528 547 555 574 591 608 613 614 615 625 626 636 642 645 649 658 666 673 682 686 696 700 705 712 720 723 725 727 738 745 747 755 758 760 767 768 769 771 792 806 812 820 822 827 832 845 851 855 856 858 859 863 894 900 904 905 906 910 921 924 928 933 943 946 950 958 972 977 979 984 991 994 1008 1020 1021 1039 1059 1063 1064 1078 1087 1090 1093 1101 1102 1113 1133 1142 1147 1151 1155 1162 1184 1190 1191 1201 1206 1207 1208 1220 1222 1226 1245 1254 1255 1274 1278 1280 1286 1289 1296 1299 1308 1310 1311 1312 1327 1334 1348 1349 1361 1366 1388 1400 1410 1411 1419 1422 1430 1433 1435 1445 1447 1449 1451 1456 1457 1476 1481 1486 1502 1507 1520 1529 1535 1543 1561 1565 1567 1574 1582 1584 1606 1614 1618 1642 1650 1652 1654 1655 1686 1695 1698 1708 1713 1715 1736 1757 1763 1777 1781 1784 1787 1797 1809 1821 1823 1830 1831 1834 1836 1837 1845 1872 1879 1899 1903 1926 1929 1932 1933 1940 1945 1953 1957 1960 1962 1963 1971 1973 1988 2002 2003 2021 2045 2046 2062 2069 2070 2071 2079 2080 2095 2101 2105 2118 2123 2129 2135 2136 2137 2144 2151 2172 2182 2187 2192 2194 2197 2205 2229 2232 2242 2247 2253 2259 2265 2270 2271 2294 2305 2352 2353 2360 2381 2393 2394 2414 2418 2421 2426 2429 2434 2444 2460 2466 2472 2473 2480 2486 2487 2502 2503 2505 2519 2522 2525 2535 2541 2547 2554 2558 2561 2564 2565 2569 2576 2590 2591 2603 2605 2611 2612 2624 2635 2636 2650 2652 2669 2672 2674 2676 2686 2699 2700 2707 2708 2716 2721 2725 2729 2736 2742 2746 2747 2753 2759 2762 2767 2772 2780 2784 2803 2836 2847 2852 2853 2857 2871 2882 2891 2900 2903 2907 2909 2912 2935 2937 2938 2941 2946 2947 2949 2953 2954 2960 2989 2995 3022 3035 3038 3045 3047 3053 3065 3067 3070 3077 3079 3121 3128 3142 3145 3162 3165 3179 3200 3206 3212 3217 3219 3223 3224 3239 3254 3285 3301 3304 3309 3316 3318 3320 3325 3338 3356 3373 3382 3387 3395 3400 3405 3411 3422 3426 3431 3435 3462 3469 3472 3475 3476 3480 3481 3487 3490 3499 3507 3509 3516 3528 3529 3532 3533 3535 3536 3547 3564 3581 3625 3645 3647 3652 3653 3665 3669 3703 3708 3716 3727 3736 3740 3745 3753 3754 3759 3795 3801 3812 3833 3837 3840 3843 3869 3875 3879 3881 3888 3897 3900 3914 3928 3937 3939 3945 3975 3982 3994 4003 4016 4017 4035 4041 4043 4048 4054 4062 4063 4070 4079 4082 4099 0 53 69 70 85 203 261 272 306 329 403 422 444 456 571 643 739 759 777 812 879 899 992 1048 1161 1164 1191 1202 1273 1305 1327 1388 1449 1454 1464 1478 1534 1557 1583 1620 1653 1666 1696 1776 1799 1834 1838 1841 1884 2114 2152 2156 2165 2222 2249 2256 2298 2343 2349 2415 2432 2472 2488 2492 2506 GGTGGC/GCCACC 0 -1 498 501 41 -63.8 9 13 17 19 26 34 58 62 63 72 89 99 105 106 116 118 130 132 141 145 154 157 159 168 172 177 179 186 197 200 201 203 210 238 243 257 260 265 281 288 304 306 307 318 326 332 350 355 358 376 380 400 405 414 428 433 435 443 468 471 473 486 497 504 507 508 509 518 539 550 557 561 565 569 582 587 593 625 626 648 658 667 672 681 702 708 713 723 725 726 730 735 737 740 741 753 756 781 791 796 817 822 824 832 833 835 841 846 853 856 858 873 874 878 879 891 894 900 912 925 934 937 940 943 947 948 953 956 966 968 974 979 984 990 996 998 1014 1044 1060 1063 1070 1076 1078 1081 1082 1088 1094 1099 1105 1116 1119 1122 1123 1129 1134 1149 1154 1164 1167 1168 1178 1192 1201 1205 1211 1215 1220 1246 1255 1257 1268 1281 1286 1288 1289 1297 1314 1321 1324 1336 1338 1339 1350 1355 1364 1365 1367 1371 1400 1403 1406 1408 1421 1430 1435 1437 1448 1449 1468 1473 1497 1512 1520 1556 1566 1572 1586 1596 1605 1606 1611 1613 1624 1642 1649 1658 1668 1669 1674 1678 1684 1688 1692 1693 1701 1704 1715 1745 1750 1755 1759 1769 1770 1771 1777 1778 1781 1783 1784 1793 1796 1797 1802 1825 1826 1846 1851 1854 1858 1861 1862 1885 1892 1895 1902 1905 1908 1917 1932 1941 1990 1991 1992 2003 2017 2031 2048 2061 2063 2066 2069 2074 2085 2100 2131 2133 2146 2151 2158 2160 2161 2164 2172 2186 2187 2194 2202 2206 2213 2220 2231 2234 2247 2265 2279 2286 2299 2303 2327 2344 2348 2354 2359 2367 2370 2373 2396 2397 2416 2421 2433 2434 2452 2458 2460 2467 2486 2518 2525 2561 2564 2567 2570 2573 2586 2589 2590 2597 2604 2619 2621 2628 2634 2647 2648 2650 2651 2658 2665 2668 2672 2682 2693 2712 2719 2739 2745 2746 2779 2780 2795 2807 2812 2836 2846 2856 2866 2871 2874 2876 2877 2878 2903 2905 2910 2911 2917 2945 2950 2964 2977 3037 3047 3049 3051 3052 3054 3074 3084 3096 3098 3122 3134 3148 3151 3157 3158 3159 3162 3168 3186 3215 3230 3240 3251 3257 3258 3265 3267 3269 3272 3278 3296 3302 3303 3313 3316 3320 3334 3337 3346 3357 3367 3373 3377 3379 3383 3386 3411 3426 3440 3443 3444 3463 3467 3469 3470 3471 3476 3481 3483 3485 3509 3523 3529 3532 3539 3540 3549 3572 3586 3592 3594 3612 3614 3622 3628 3630 3635 3648 3649 3655 3661 3662 3668 3675 3682 3688 3693 3708 3746 3748 3773 3781 3789 3818 3852 3863 3873 3876 3881 3892 3898 3904 3915 3929 3935 3947 3950 3957 3972 3975 3978 3999 4000 4001 4030 4034 4036 4041 4053 4077 4085 4086 4088 4102 4112 4117 47 56 72 223 251 301 345 370 439 459 543 563 662 754 806 846 1000 1009 1189 1220 1274 1298 1391 1453 1464 1485 1599 1685 1729 1738 1821 1924 1943 2100 2144 2167 2220 2415 2438 2472 2488 GGTGCA/TGCACC 0 -1 472 478 37 -62.4 1 4 8 23 44 75 87 93 94 101 128 135 136 139 140 153 155 162 164 183 209 233 236 264 268 269 279 299 302 305 314 327 337 343 345 360 362 363 365 366 374 375 379 386 397 404 425 427 432 452 455 486 488 489 502 516 526 531 534 549 551 559 574 581 589 592 617 618 631 632 642 643 659 661 662 663 674 680 698 707 716 739 755 760 767 778 797 800 801 806 811 812 825 829 838 842 862 865 866 877 886 900 915 916 919 944 946 948 950 962 963 964 978 994 996 1009 1018 1045 1054 1061 1080 1090 1096 1103 1113 1126 1130 1131 1136 1144 1145 1151 1154 1158 1162 1171 1173 1185 1187 1189 1190 1198 1221 1227 1232 1238 1239 1263 1267 1269 1283 1290 1295 1303 1304 1309 1315 1316 1323 1335 1345 1353 1361 1375 1382 1385 1420 1432 1435 1439 1440 1445 1446 1455 1458 1463 1464 1478 1479 1489 1502 1507 1509 1516 1519 1521 1523 1527 1529 1530 1535 1540 1544 1549 1565 1567 1568 1575 1581 1583 1584 1631 1633 1634 1653 1655 1656 1667 1686 1704 1706 1709 1731 1742 1746 1753 1776 1780 1794 1797 1814 1822 1824 1829 1831 1832 1833 1850 1859 1874 1888 1903 1913 1935 1948 1971 1978 1993 2010 2018 2020 2025 2027 2029 2062 2073 2076 2077 2092 2093 2094 2114 2118 2126 2135 2139 2144 2148 2151 2159 2183 2184 2185 2192 2198 2211 2216 2246 2257 2263 2275 2276 2285 2294 2311 2321 2322 2340 2356 2363 2377 2396 2411 2417 2426 2429 2444 2450 2457 2476 2480 2488 2498 2500 2503 2511 2513 2524 2526 2532 2535 2551 2553 2554 2565 2569 2572 2603 2623 2624 2625 2646 2661 2662 2676 2677 2704 2717 2720 2733 2740 2743 2747 2767 2770 2772 2787 2789 2816 2820 2821 2826 2831 2833 2862 2864 2869 2880 2881 2896 2907 2921 2934 2941 2950 2960 2972 3008 3015 3016 3020 3027 3039 3044 3045 3055 3057 3059 3063 3071 3076 3086 3087 3089 3101 3115 3117 3127 3128 3156 3172 3173 3177 3178 3182 3189 3204 3209 3212 3213 3225 3227 3228 3231 3235 3237 3239 3250 3254 3259 3260 3268 3289 3295 3304 3316 3327 3336 3343 3353 3363 3390 3394 3418 3429 3433 3447 3452 3455 3468 3472 3485 3490 3494 3536 3542 3544 3545 3555 3563 3565 3589 3597 3609 3645 3663 3668 3702 3717 3726 3733 3736 3740 3745 3750 3763 3773 3787 3790 3794 3795 3807 3813 3814 3824 3840 3842 3859 3862 3877 3888 3900 3908 3944 3964 3990 4011 4015 4020 4024 4028 4032 4041 4042 4047 4052 4060 4071 4091 4093 4116 4122 85 272 393 445 609 691 739 797 865 883 1026 1027 1045 1078 1122 1128 1134 1166 1219 1305 1534 1535 1553 1650 1766 1779 1816 1843 1901 1934 2003 2115 2142 2203 2415 2423 2492 ATGGTG/CACCAT 0 -3 467 470 79 -36.5 0 2 5 9 12 16 17 27 29 30 32 37 52 64 66 89 99 110 114 143 154 162 174 177 186 197 208 210 216 228 239 243 255 263 266 272 280 281 285 301 304 313 319 323 331 332 339 348 357 376 380 399 414 416 420 428 459 467 468 476 486 507 508 509 511 539 558 559 562 572 589 607 620 629 635 640 641 647 651 653 655 664 680 681 682 685 688 690 693 710 714 717 737 763 765 786 790 793 802 823 826 829 841 862 864 869 875 878 893 900 911 913 916 927 928 935 947 950 951 962 964 972 976 978 981 982 983 988 994 995 996 1002 1011 1015 1024 1035 1041 1070 1078 1082 1122 1134 1138 1148 1150 1185 1194 1203 1211 1221 1222 1235 1236 1239 1244 1263 1276 1288 1296 1301 1315 1326 1341 1345 1360 1363 1364 1367 1370 1376 1377 1385 1389 1392 1398 1402 1405 1409 1411 1417 1423 1435 1449 1453 1461 1465 1488 1492 1504 1518 1519 1522 1527 1533 1534 1564 1565 1573 1577 1585 1598 1627 1634 1647 1656 1678 1682 1684 1688 1716 1723 1732 1743 1752 1759 1765 1780 1786 1803 1813 1815 1818 1825 1828 1844 1847 1855 1856 1864 1905 1911 1916 1924 1961 1964 1979 1981 1983 1987 1992 2010 2039 2043 2051 2074 2078 2081 2084 2099 2107 2112 2119 2125 2126 2139 2148 2149 2170 2173 2176 2183 2219 2227 2243 2245 2249 2256 2261 2289 2299 2327 2343 2346 2347 2349 2355 2360 2361 2369 2370 2375 2379 2419 2430 2434 2437 2446 2449 2450 2454 2459 2468 2488 2491 2492 2497 2499 2511 2513 2518 2526 2532 2544 2546 2560 2573 2595 2601 2604 2623 2636 2645 2653 2655 2660 2668 2679 2682 2685 2697 2711 2762 2789 2795 2839 2846 2878 2880 2904 2909 2911 2919 2923 2929 2934 2957 2958 2968 2970 2973 2977 2978 2993 2997 3007 3048 3052 3057 3074 3078 3080 3081 3090 3092 3101 3102 3118 3121 3125 3138 3167 3168 3188 3202 3211 3212 3217 3224 3240 3249 3250 3259 3260 3265 3302 3303 3307 3308 3311 3316 3319 3322 3337 3360 3373 3374 3377 3379 3386 3406 3412 3420 3436 3453 3464 3471 3485 3493 3500 3501 3505 3507 3510 3519 3537 3543 3627 3659 3668 3671 3675 3700 3725 3728 3730 3731 3748 3751 3766 3769 3772 3775 3783 3804 3820 3821 3830 3839 3853 3860 3868 3878 3882 3887 3894 3905 3931 3933 3936 3949 3953 3957 3965 3968 3978 3993 3996 4000 4001 4008 4018 4024 4042 4043 4050 4059 4061 4066 4073 4077 4081 4086 4093 4112 4116 4119 4121 102 163 243 251 262 300 301 337 341 365 370 389 456 466 509 548 562 636 662 665 700 701 774 775 777 779 816 849 877 906 949 1017 1027 1075 1102 1170 1180 1215 1225 1231 1253 1273 1281 1329 1354 1401 1433 1464 1475 1539 1551 1642 1708 1709 1766 1776 1791 1798 1800 1841 1855 1919 1921 1924 2049 2091 2098 2110 2114 2153 2180 2220 2235 2249 2364 2406 2413 2494 2499 AGGTGG/CCACCT 0 -2 427 431 67 -35.9 3 7 18 19 25 34 37 55 72 84 104 108 130 151 153 159 162 179 192 208 225 240 249 252 265 266 278 283 292 314 324 330 332 336 342 343 351 353 361 371 400 405 411 418 427 444 445 448 449 450 456 459 473 499 503 505 507 546 548 551 567 575 585 597 623 624 627 648 665 667 672 673 681 705 709 723 729 753 770 788 791 796 797 801 811 812 816 824 828 832 833 835 846 866 879 891 894 897 900 903 924 931 934 939 941 953 957 961 968 974 979 981 983 986 992 997 998 1006 1010 1012 1036 1048 1054 1058 1063 1070 1072 1086 1100 1104 1106 1110 1111 1115 1117 1119 1160 1168 1182 1184 1192 1205 1211 1218 1228 1255 1257 1262 1266 1275 1276 1279 1281 1285 1288 1289 1306 1311 1316 1324 1336 1355 1356 1383 1387 1388 1389 1393 1400 1426 1429 1434 1437 1438 1441 1453 1458 1460 1466 1468 1469 1470 1487 1491 1495 1534 1553 1557 1566 1586 1597 1604 1605 1608 1609 1611 1631 1644 1658 1662 1663 1669 1673 1674 1679 1689 1692 1700 1704 1746 1751 1769 1770 1795 1832 1846 1862 1869 1870 1873 1878 1902 1903 1910 1914 1948 1950 1954 1984 2004 2016 2017 2036 2048 2050 2052 2056 2069 2077 2086 2107 2110 2117 2122 2125 2131 2135 2152 2153 2161 2194 2223 2230 2237 2256 2264 2281 2294 2297 2299 2307 2320 2330 2334 2338 2340 2344 2359 2365 2366 2394 2398 2405 2434 2444 2495 2515 2518 2520 2525 2527 2531 2543 2550 2567 2619 2634 2650 2663 2667 2672 2674 2686 2700 2705 2708 2745 2751 2798 2809 2815 2817 2822 2824 2829 2842 2856 2869 2874 2876 2886 2889 2897 2902 2911 2931 2933 2937 2941 2943 2947 2959 2965 2981 2984 3013 3037 3061 3069 3104 3130 3148 3157 3158 3165 3168 3176 3186 3190 3192 3194 3212 3215 3221 3227 3246 3251 3258 3266 3269 3279 3314 3317 3336 3339 3346 3382 3383 3388 3399 3402 3404 3405 3417 3428 3440 3444 3454 3470 3485 3491 3515 3523 3526 3533 3540 3546 3549 3552 3560 3586 3603 3612 3622 3630 3635 3659 3668 3688 3689 3693 3694 3720 3756 3770 3780 3800 3845 3855 3858 3863 3865 3911 3912 3930 3941 3942 3947 3951 3954 3956 3977 3984 3985 4000 4009 4033 4034 4036 4041 4083 4085 4088 4105 4110 4123 4126 11 229 300 301 318 337 376 391 425 459 520 543 590 673 691 777 797 846 850 948 1000 1009 1072 1087 1102 1171 1172 1196 1220 1233 1274 1324 1327 1365 1377 1388 1420 1451 1453 1599 1704 1705 1738 1741 1805 1843 1932 1943 2005 2049 2114 2115 2134 2144 2167 2180 2209 2232 2280 2284 2381 2415 2432 2438 2446 2487 2509 GGTGCT/AGCACC 0 -1 381 387 50 -37.4 3 4 18 19 22 28 30 34 37 65 70 103 109 117 121 122 150 161 165 167 174 186 190 198 206 213 224 231 235 245 250 253 278 282 284 294 296 311 320 330 331 347 348 362 367 378 393 416 420 422 438 442 448 457 472 474 475 500 502 505 510 529 538 541 558 570 571 572 577 588 609 623 631 633 640 641 655 669 670 687 700 710 723 751 756 761 768 792 799 801 804 807 829 834 835 837 847 863 864 881 909 943 955 969 971 982 1008 1039 1040 1056 1065 1073 1082 1083 1099 1115 1121 1124 1148 1152 1158 1181 1200 1202 1204 1207 1210 1229 1243 1245 1251 1254 1255 1273 1274 1279 1280 1291 1296 1308 1319 1327 1348 1349 1361 1407 1411 1416 1417 1419 1431 1441 1456 1461 1466 1481 1486 1520 1539 1555 1568 1569 1582 1594 1625 1630 1654 1671 1685 1689 1701 1708 1716 1741 1744 1754 1768 1787 1793 1795 1801 1832 1836 1839 1844 1866 1879 1887 1888 1900 1903 1915 1926 1928 1930 1953 1964 1987 1991 2011 2013 2019 2026 2037 2043 2062 2070 2104 2106 2112 2132 2134 2150 2175 2177 2182 2218 2219 2227 2239 2240 2242 2246 2271 2293 2294 2301 2304 2305 2309 2314 2334 2337 2342 2343 2361 2374 2375 2376 2397 2414 2435 2437 2462 2472 2473 2492 2504 2528 2536 2544 2547 2556 2557 2568 2583 2609 2626 2631 2649 2699 2709 2720 2736 2737 2762 2765 2784 2791 2803 2804 2811 2845 2853 2882 2937 2953 2966 2978 2979 2988 2989 3017 3028 3038 3053 3058 3066 3070 3077 3080 3090 3093 3121 3127 3143 3194 3233 3244 3249 3259 3270 3296 3298 3316 3319 3322 3332 3339 3341 3347 3365 3378 3382 3400 3410 3420 3422 3430 3431 3440 3457 3462 3478 3483 3499 3510 3562 3564 3575 3615 3616 3625 3633 3640 3646 3647 3689 3714 3715 3731 3753 3756 3759 3765 3771 3779 3811 3812 3816 3840 3843 3853 3868 3875 3879 3889 3903 3911 3912 3914 3936 3938 3939 3945 3946 3962 3968 3985 4003 4008 4031 4059 4062 4071 4077 4078 4079 4094 4119 4126 80 301 305 432 456 469 520 543 588 662 807 866 879 906 991 1042 1126 1180 1194 1198 1273 1299 1327 1368 1388 1392 1415 1418 1495 1557 1558 1585 1620 1627 1642 1693 1696 1801 2086 2110 2114 2115 2144 2167 2292 2317 2347 2376 2383 2403 CGGTGG/CCACCG 0 -2 380 372 43 -38.8 6 19 24 36 71 72 76 106 110 111 114 120 126 141 170 172 174 197 203 233 241 249 254 257 260 262 276 318 358 398 414 445 460 474 495 507 508 518 546 550 561 580 583 595 596 601 604 681 683 694 722 729 732 740 748 758 762 783 784 791 817 839 847 850 853 865 873 874 880 881 901 912 913 926 936 938 947 948 973 981 985 987 1014 1057 1060 1061 1076 1081 1082 1086 1089 1094 1099 1100 1109 1116 1120 1123 1137 1154 1156 1161 1166 1167 1178 1184 1209 1217 1246 1265 1297 1300 1307 1316 1332 1337 1340 1342 1403 1415 1448 1462 1507 1510 1512 1538 1560 1578 1597 1637 1639 1642 1645 1649 1665 1678 1680 1684 1701 1714 1738 1739 1745 1758 1767 1770 1771 1775 1779 1784 1788 1791 1793 1796 1797 1798 1802 1807 1826 1838 1849 1851 1858 1861 1880 1917 1943 1969 2004 2019 2031 2066 2097 2100 2109 2120 2127 2137 2146 2155 2160 2166 2174 2176 2180 2186 2196 2206 2213 2219 2220 2238 2240 2252 2274 2279 2281 2286 2302 2313 2318 2337 2354 2367 2373 2388 2391 2397 2407 2408 2416 2424 2431 2439 2441 2458 2460 2464 2467 2471 2484 2496 2501 2506 2509 2522 2535 2550 2570 2585 2589 2593 2620 2621 2628 2632 2633 2639 2640 2648 2655 2665 2666 2690 2701 2712 2719 2723 2735 2745 2746 2760 2766 2773 2779 2783 2797 2801 2806 2810 2813 2838 2840 2844 2845 2867 2868 2878 2879 2890 2910 2916 2917 2920 2926 2942 2950 2955 2964 2980 3012 3017 3033 3040 3050 3052 3054 3067 3075 3084 3085 3107 3108 3110 3111 3159 3163 3172 3205 3216 3220 3233 3257 3272 3281 3290 3312 3331 3342 3346 3359 3380 3384 3395 3401 3407 3425 3426 3432 3455 3470 3483 3498 3511 3534 3539 3541 3554 3566 3571 3577 3590 3593 3602 3606 3612 3614 3622 3640 3648 3649 3650 3651 3655 3656 3696 3700 3713 3732 3736 3744 3758 3773 3778 3781 3789 3818 3823 3829 3835 3838 3852 3870 3876 3884 3885 3896 3904 3929 3931 3935 3950 3970 3972 3999 4030 4085 4100 4103 4112 53 56 72 73 162 200 229 305 345 382 550 581 588 662 772 825 1000 1029 1032 1060 1127 1195 1274 1304 1391 1419 1485 1502 1516 1541 1563 1587 1648 1685 1767 1831 1875 2110 2114 2134 2263 2356 2428 GGTGGG/CCCACC 0 -1 369 372 30 -47.3 0 2 10 14 37 46 57 68 80 91 105 122 126 137 143 144 156 158 203 204 219 223 225 232 240 247 259 266 277 281 286 312 330 332 336 338 342 351 352 368 371 385 388 417 437 441 444 445 447 448 449 459 466 481 492 495 499 502 520 541 547 553 562 597 599 610 615 616 629 632 639 648 653 665 682 684 693 695 733 749 754 755 766 769 773 775 777 783 793 795 813 826 830 832 862 871 908 910 921 922 935 936 938 941 952 961 965 978 983 986 997 1002 1012 1020 1033 1036 1048 1063 1072 1084 1085 1086 1089 1101 1104 1106 1107 1113 1137 1168 1170 1209 1214 1217 1222 1268 1278 1299 1304 1339 1341 1342 1349 1369 1371 1373 1377 1402 1411 1422 1426 1430 1438 1451 1453 1460 1474 1503 1515 1533 1542 1543 1553 1574 1577 1578 1602 1627 1635 1644 1662 1668 1675 1700 1706 1779 1783 1787 1788 1815 1869 1914 1942 1943 1981 1999 2002 2005 2032 2038 2050 2051 2064 2077 2107 2117 2122 2130 2153 2174 2180 2196 2205 2229 2248 2249 2259 2264 2281 2297 2301 2320 2330 2343 2355 2356 2365 2378 2379 2392 2398 2405 2422 2461 2482 2487 2502 2505 2510 2512 2527 2543 2580 2595 2606 2611 2619 2636 2639 2653 2666 2676 2685 2686 2701 2729 2741 2742 2756 2815 2829 2878 2879 2886 2887 2904 2908 2909 2920 2926 2937 2958 2959 2981 2984 2992 3001 3017 3019 3041 3065 3067 3074 3085 3107 3110 3118 3121 3123 3130 3138 3142 3165 3170 3183 3190 3192 3202 3214 3221 3243 3256 3260 3292 3301 3309 3312 3314 3331 3359 3380 3387 3388 3396 3397 3402 3404 3406 3417 3425 3435 3436 3453 3454 3462 3470 3504 3505 3516 3527 3577 3579 3586 3604 3665 3677 3689 3720 3730 3775 3777 3780 3785 3788 3789 3792 3833 3855 3857 3865 3875 3880 3887 3896 3897 3900 3906 3914 3920 3924 3941 3942 3955 3956 3960 3972 3977 3979 3985 3989 4009 4022 4025 4040 4059 4063 4072 4076 4083 7 300 337 341 520 673 691 914 1026 1032 1087 1105 1274 1294 1365 1420 1423 1454 1709 1767 1776 1816 1932 2110 2123 2134 2150 2284 2441 2474 GTGGAG/CTCCAC 0 0 349 354 69 -23.4 5 6 16 22 37 49 55 60 72 82 95 108 109 110 112 113 121 125 127 152 163 164 200 215 216 219 220 223 233 241 249 250 265 272 278 279 284 303 308 310 311 313 322 332 343 344 346 365 388 406 411 419 440 460 476 487 489 495 510 519 535 536 546 580 598 603 620 625 626 642 649 659 668 689 704 722 723 726 729 750 758 762 771 773 786 791 801 802 808 820 841 847 848 854 862 864 874 888 900 903 911 913 930 935 941 952 957 968 976 977 979 987 1021 1052 1059 1068 1070 1093 1100 1115 1122 1133 1184 1219 1226 1247 1265 1267 1276 1294 1302 1308 1311 1312 1322 1330 1339 1373 1375 1388 1393 1423 1437 1482 1487 1494 1496 1504 1507 1522 1545 1557 1597 1608 1623 1629 1638 1641 1670 1698 1713 1733 1752 1765 1767 1783 1791 1799 1816 1818 1830 1847 1855 1860 1868 1905 1911 1912 1917 1920 1962 1966 1969 1972 1983 2004 2079 2081 2114 2123 2133 2136 2145 2157 2176 2184 2185 2188 2207 2219 2256 2274 2284 2302 2312 2321 2388 2398 2407 2408 2444 2459 2463 2471 2501 2512 2515 2519 2550 2554 2591 2596 2600 2608 2615 2638 2652 2653 2655 2659 2669 2670 2690 2696 2700 2701 2737 2741 2762 2782 2805 2813 2822 2823 2828 2831 2847 2856 2874 2879 2890 2893 2899 2916 2919 2937 2939 2946 2968 2969 2975 2981 2993 3004 3007 3009 3042 3060 3080 3085 3103 3191 3194 3210 3212 3218 3220 3233 3272 3281 3298 3318 3325 3339 3342 3345 3348 3350 3360 3377 3396 3432 3455 3475 3480 3488 3501 3517 3534 3547 3554 3560 3566 3581 3584 3602 3612 3637 3648 3650 3652 3664 3670 3694 3704 3705 3711 3726 3732 3741 3754 3773 3787 3788 3820 3823 3827 3829 3830 3838 3845 3855 3894 3909 3912 3928 3930 3931 3963 3983 3996 4017 4036 4050 4056 4070 4085 4093 4111 72 73 77 195 200 262 301 451 508 556 557 658 695 732 849 878 888 925 941 1000 1020 1060 1070 1168 1172 1200 1233 1274 1294 1303 1316 1391 1393 1423 1471 1491 1512 1527 1534 1587 1604 1625 1673 1708 1726 1802 1814 1924 2016 2035 2057 2065 2114 2134 2163 2166 2180 2224 2247 2257 2267 2309 2336 2353 2356 2375 2423 2439 2455 GCTGGT/ACCAGC 0 -4 323 330 47 -29.5 1 2 15 26 31 37 46 93 95 98 119 121 128 151 153 156 163 164 165 177 184 188 204 206 222 224 238 245 250 297 311 320 330 347 348 349 350 355 365 366 373 393 395 414 423 430 448 486 502 514 517 520 529 540 548 586 591 613 614 626 649 670 685 696 708 720 723 725 730 732 745 755 758 771 792 812 816 820 827 834 842 845 858 859 921 938 979 988 1039 1063 1064 1065 1083 1087 1093 1097 1102 1126 1132 1134 1142 1147 1152 1155 1164 1190 1207 1210 1215 1222 1226 1238 1245 1269 1273 1286 1289 1296 1310 1324 1342 1348 1354 1361 1366 1393 1410 1411 1430 1443 1449 1463 1470 1476 1480 1485 1486 1491 1507 1529 1535 1543 1567 1570 1582 1607 1612 1618 1632 1638 1642 1643 1644 1657 1658 1686 1696 1698 1708 1713 1715 1736 1768 1777 1809 1825 1831 1832 1836 1845 1862 1899 1929 1932 1933 1940 1962 1971 1973 1988 1995 2003 2026 2046 2079 2095 2101 2105 2123 2132 2135 2137 2151 2177 2182 2197 2205 2222 2231 2232 2242 2264 2265 2275 2288 2303 2304 2341 2353 2360 2410 2426 2433 2445 2475 2480 2486 2488 2502 2547 2553 2554 2561 2565 2569 2590 2603 2605 2618 2635 2650 2652 2669 2676 2699 2708 2725 2729 2736 2747 2772 2782 2807 2826 2832 2852 2876 2882 2891 2909 2937 2938 2941 2947 2954 2955 2960 2965 2967 2968 3035 3045 3077 3079 3121 3128 3142 3179 3212 3217 3223 3239 3279 3304 3316 3320 3335 3338 3340 3373 3399 3400 3422 3426 3440 3462 3472 3487 3490 3507 3529 3532 3537 3564 3573 3575 3598 3617 3645 3661 3669 3703 3716 3727 3744 3801 3837 3840 3842 3879 3881 3900 3914 3937 3957 4000 4017 4043 4048 4054 4070 4107 4123 9 14 69 329 337 393 396 451 456 472 527 543 581 823 849 879 958 976 1202 1273 1449 1463 1477 1529 1557 1719 1781 1800 1872 1993 2009 2085 2152 2165 2222 2313 2328 2342 2343 2432 2436 2459 2484 2488 2492 2504 2506 GTGGCT/AGCCAC 0 0 298 299 58 -19.9 13 17 19 58 84 105 116 118 130 157 177 179 186 201 207 210 238 257 266 281 288 295 306 318 326 358 375 382 433 443 471 501 502 504 507 508 537 555 559 561 585 592 614 625 626 652 672 708 723 726 730 735 748 753 763 790 791 799 812 817 824 832 834 835 873 878 879 891 900 912 940 947 962 965 979 984 990 996 998 1010 1041 1060 1063 1077 1081 1082 1094 1102 1105 1113 1119 1122 1143 1148 1149 1154 1164 1168 1174 1177 1192 1202 1215 1220 1222 1231 1297 1316 1339 1355 1364 1365 1421 1437 1448 1461 1471 1484 1488 1512 1571 1572 1596 1606 1611 1613 1643 1653 1658 1674 1677 1678 1688 1699 1702 1704 1715 1725 1735 1749 1782 1792 1796 1802 1826 1846 1851 1854 1869 1902 1941 1978 2003 2023 2031 2048 2056 2061 2066 2100 2105 2109 2137 2146 2149 2151 2160 2164 2172 2175 2205 2207 2213 2231 2242 2307 2330 2335 2348 2354 2370 2373 2397 2410 2416 2421 2432 2433 2434 2480 2486 2488 2518 2525 2533 2553 2561 2564 2573 2597 2646 2647 2648 2658 2665 2672 2690 2693 2712 2721 2723 2739 2749 2758 2764 2807 2846 2856 2864 2866 2872 2876 2910 2913 2916 2964 2978 3012 3019 3047 3051 3052 3054 3074 3111 3118 3122 3133 3145 3148 3157 3230 3233 3240 3258 3265 3267 3278 3296 3316 3320 3337 3346 3357 3373 3377 3379 3426 3429 3443 3444 3467 3471 3475 3483 3511 3529 3532 3592 3614 3628 3630 3642 3668 3746 3748 3778 3802 3822 3852 3853 3863 3881 3904 3921 3929 3935 3947 3950 3978 3988 4001 4034 4036 4053 4079 4088 4102 1 88 271 273 293 301 311 345 397 459 519 563 602 616 662 684 709 718 738 811 819 901 938 973 978 1009 1060 1145 1274 1276 1400 1408 1433 1437 1482 1516 1578 1619 1620 1642 1706 1729 1836 1854 2000 2085 2117 2158 2194 2220 2242 2254 2310 2399 2424 2438 2445 2498 TGGCGG/CCGCCA 0 -2 296 297 41 -27.3 11 36 66 72 79 89 92 111 120 131 141 148 170 172 173 201 221 251 260 271 279 303 310 321 333 346 356 359 364 369 382 391 410 418 429 434 445 486 490 502 507 508 509 545 550 553 554 560 578 605 614 652 673 677 681 702 706 721 723 725 733 736 738 742 764 798 808 831 846 855 860 868 874 881 894 906 909 947 948 970 989 999 1003 1016 1022 1045 1074 1076 1119 1123 1130 1134 1146 1156 1163 1180 1216 1257 1268 1270 1272 1288 1293 1314 1336 1350 1363 1370 1384 1395 1400 1401 1404 1436 1487 1494 1507 1551 1558 1592 1593 1606 1628 1649 1651 1664 1678 1683 1688 1694 1701 1705 1718 1722 1724 1725 1734 1738 1745 1762 1793 1795 1798 1848 1851 1858 1862 1866 1867 1873 1875 1890 1897 1903 1909 1918 1919 1921 1937 1953 1972 1975 1990 1998 1999 2004 2028 2030 2042 2057 2060 2085 2160 2207 2214 2230 2232 2235 2238 2306 2324 2367 2368 2371 2399 2404 2408 2412 2451 2494 2533 2545 2549 2585 2599 2613 2619 2621 2628 2653 2681 2695 2706 2715 2730 2735 2745 2754 2779 2786 2795 2818 2834 2881 2916 2928 2930 2942 2950 2973 3046 3062 3078 3098 3102 3114 3129 3151 3159 3169 3201 3212 3232 3242 3257 3272 3291 3298 3300 3331 3344 3352 3355 3366 3375 3395 3398 3400 3413 3417 3426 3427 3442 3445 3479 3497 3508 3515 3540 3585 3587 3599 3608 3612 3620 3622 3627 3648 3661 3668 3676 3682 3693 3701 3711 3714 3747 3749 3773 3817 3851 3854 3864 3891 3899 3901 3920 3931 3953 3972 3975 4013 4044 4045 4109 4118 29 52 72 162 232 331 353 768 777 850 913 968 1000 1018 1047 1127 1139 1189 1201 1347 1391 1420 1485 1646 1676 1685 1690 1817 1821 1868 2066 2110 2118 2144 2166 2167 2249 2356 2415 2424 2425 GCGGTG/CACCGC 0 -3 294 292 34 -30.3 6 72 76 120 121 126 131 141 170 197 203 249 254 260 299 305 316 321 330 348 382 434 445 458 462 470 474 490 496 507 508 513 546 550 564 584 596 598 601 622 634 645 646 657 662 663 681 688 694 722 740 748 754 762 768 783 817 834 837 839 865 872 874 880 881 887 896 898 909 912 926 932 947 948 955 963 1002 1003 1014 1047 1076 1089 1099 1100 1109 1123 1136 1140 1156 1167 1184 1186 1202 1204 1208 1225 1230 1232 1263 1265 1270 1279 1294 1297 1300 1346 1383 1403 1404 1415 1420 1426 1446 1510 1538 1547 1550 1590 1622 1625 1628 1645 1649 1657 1678 1680 1684 1685 1701 1728 1758 1767 1771 1791 1793 1798 1802 1842 1858 1861 1953 1967 1969 1977 1988 1995 2004 2006 2008 2019 2027 2073 2109 2120 2155 2187 2196 2198 2213 2230 2238 2257 2266 2275 2320 2322 2337 2342 2349 2374 2399 2424 2439 2458 2475 2498 2514 2516 2550 2570 2621 2622 2628 2648 2671 2684 2690 2712 2735 2737 2744 2745 2746 2763 2777 2808 2813 2821 2844 2855 2868 2878 2916 2917 2930 2942 2955 2959 2974 2976 2988 2994 3017 3025 3052 3075 3084 3111 3117 3127 3135 3163 3205 3212 3242 3257 3272 3281 3295 3308 3312 3331 3380 3395 3398 3400 3401 3403 3408 3426 3439 3441 3455 3492 3495 3496 3502 3525 3539 3545 3549 3589 3590 3594 3602 3603 3606 3612 3613 3614 3622 3627 3632 3650 3651 3655 3656 3668 3676 3683 3700 3773 3799 3818 3821 3823 3829 3838 3843 3885 3904 3929 3931 3932 3935 3953 3972 3977 3990 4026 4034 4041 4094 4112 72 73 162 200 229 251 353 431 543 635 1000 1058 1060 1126 1127 1139 1300 1391 1420 1485 1502 1587 1589 1648 1864 1932 2071 2110 2114 2210 2249 2356 2383 2472 GTGCAG/CTGCAC 0 0 250 251 34 -23.5 23 75 87 94 136 140 162 168 185 191 209 219 269 279 299 305 327 359 365 375 397 427 429 452 456 470 486 488 502 516 526 574 589 592 597 609 617 642 644 659 662 680 724 739 748 758 766 811 812 829 838 862 877 919 948 962 964 967 971 996 1005 1054 1103 1108 1113 1131 1151 1160 1162 1171 1185 1198 1238 1269 1272 1309 1335 1345 1361 1374 1375 1382 1385 1420 1439 1441 1446 1450 1458 1463 1467 1479 1496 1507 1509 1519 1527 1529 1540 1567 1568 1581 1583 1617 1631 1633 1653 1669 1709 1742 1753 1776 1784 1833 1850 1859 1867 1874 1888 1903 1979 1993 2010 2027 2042 2062 2076 2077 2119 2139 2144 2151 2184 2185 2192 2211 2216 2246 2253 2308 2311 2322 2331 2357 2363 2396 2417 2426 2429 2441 2444 2457 2477 2483 2488 2498 2526 2569 2603 2646 2649 2661 2662 2669 2676 2716 2740 2767 2772 2789 2821 2826 2833 2858 2862 2880 2881 2903 2921 2936 2972 3015 3020 3027 3030 3039 3055 3063 3101 3103 3117 3128 3178 3182 3204 3212 3227 3235 3248 3259 3260 3289 3294 3295 3304 3316 3343 3386 3390 3411 3470 3476 3491 3494 3524 3542 3544 3555 3558 3565 3589 3630 3680 3698 3707 3726 3763 3773 3787 3794 3803 3814 3840 3859 3888 3899 3900 3908 3990 4011 4020 4028 4034 4039 4047 4079 4091 4116 4122 4124 23 137 149 190 209 370 393 445 533 683 691 739 843 865 880 1083 1168 1220 1256 1262 1263 1443 1539 1591 1816 1853 1938 1977 2107 2142 2148 2150 2481 2492 TGGTCG/CGACCA 0 -2 239 238 40 -18.5 22 45 64 78 84 95 100 177 188 205 228 243 252 296 394 408 412 430 451 464 477 497 500 515 552 554 556 567 585 593 611 617 636 637 653 678 686 703 714 715 733 757 767 810 815 848 853 867 882 884 892 895 899 903 907 917 923 934 947 953 969 1035 1042 1045 1066 1071 1097 1123 1145 1147 1177 1182 1193 1229 1233 1235 1253 1258 1264 1266 1354 1358 1376 1383 1391 1405 1427 1484 1485 1495 1528 1548 1579 1586 1602 1607 1621 1644 1646 1648 1657 1673 1703 1704 1711 1717 1767 1787 1806 1857 1884 1886 1915 1953 1961 1996 1997 2017 2026 2034 2055 2080 2089 2090 2091 2141 2156 2179 2191 2207 2212 2217 2221 2257 2273 2282 2285 2288 2290 2298 2323 2326 2339 2341 2384 2389 2406 2410 2415 2428 2435 2448 2455 2470 2483 2519 2541 2578 2592 2615 2641 2667 2686 2728 2773 2795 2854 2863 2867 2870 2923 2925 2955 2977 2982 2990 2996 3000 3009 3056 3113 3114 3149 3155 3175 3191 3218 3241 3277 3282 3288 3315 3329 3330 3331 3333 3335 3359 3370 3416 3438 3449 3490 3512 3531 3534 3584 3605 3617 3618 3631 3636 3671 3686 3700 3716 3755 3770 3776 3804 3830 3861 3919 3921 3925 3926 3963 3974 3980 3987 3991 4027 4039 4058 4075 4104 4108 4113 4125 48 98 99 241 284 347 505 581 618 721 724 741 829 1224 1300 1516 1761 1805 1814 1836 1840 1929 1941 1952 1977 2006 2009 2012 2059 2067 2160 2239 2313 2316 2326 2371 2412 2432 2476 2508 CCGGTG/CACCGG 0 -3 222 221 44 -14.5 8 21 47 69 71 94 107 108 111 114 140 174 178 233 247 257 258 262 264 268 315 318 327 366 367 398 432 454 460 495 502 518 529 538 577 604 640 659 729 732 739 762 784 799 839 850 853 873 913 938 940 942 947 985 1034 1043 1053 1065 1086 1120 1121 1131 1152 1154 1157 1161 1166 1175 1178 1181 1209 1217 1227 1238 1295 1307 1311 1323 1353 1361 1448 1464 1466 1512 1533 1549 1568 1569 1600 1612 1619 1642 1645 1649 1665 1681 1708 1710 1738 1745 1766 1775 1779 1784 1788 1826 1838 1874 1906 1913 1923 1943 1964 2019 2058 2125 2160 2173 2180 2186 2189 2203 2206 2210 2220 2252 2281 2318 2354 2367 2397 2408 2431 2438 2440 2457 2464 2467 2471 2473 2484 2496 2501 2522 2544 2558 2588 2589 2677 2687 2701 2717 2731 2765 2766 2773 2797 2883 2906 2910 2915 2919 2920 2942 2982 3012 3026 3043 3059 3067 3068 3092 3108 3159 3172 3173 3177 3209 3213 3216 3233 3268 3290 3359 3409 3425 3457 3483 3484 3498 3511 3534 3553 3557 3563 3593 3619 3638 3701 3702 3714 3719 3734 3758 3765 3773 3789 3794 3822 3834 3843 3884 3896 3929 3939 3950 3972 3999 4045 4059 4068 4103 20 52 53 305 382 393 432 445 550 581 670 728 746 772 828 865 913 937 1003 1078 1128 1155 1229 1274 1419 1535 1541 1553 1557 1627 1638 1739 1785 1944 2002 2134 2225 2263 2356 2392 2398 2423 2432 2506 CGGTGC/GCACCG 0 -2 217 217 27 -21.7 3 8 47 65 68 94 103 121 131 139 140 198 206 282 299 305 327 330 348 367 370 404 432 457 479 529 538 551 577 617 640 659 661 662 663 670 687 698 768 799 800 825 837 865 873 909 915 955 963 1003 1073 1096 1098 1103 1122 1131 1136 1152 1154 1181 1200 1202 1204 1210 1227 1232 1238 1263 1273 1279 1295 1311 1316 1323 1335 1353 1361 1398 1411 1420 1426 1446 1464 1466 1530 1549 1550 1568 1569 1610 1622 1625 1667 1681 1685 1708 1710 1754 1792 1796 1797 1850 1874 1913 1930 1953 1964 1971 1991 1993 2006 2019 2025 2027 2028 2037 2073 2076 2077 2150 2184 2211 2230 2266 2275 2296 2304 2322 2342 2356 2374 2397 2429 2440 2457 2473 2476 2498 2500 2504 2516 2553 2625 2642 2671 2677 2717 2720 2737 2740 2743 2771 2787 2789 2808 2831 2883 2895 2896 2906 2966 2972 2979 2988 3008 3016 3059 3117 3127 3172 3173 3177 3209 3213 3268 3289 3295 3298 3400 3429 3447 3483 3496 3499 3510 3570 3589 3603 3638 3645 3668 3689 3701 3702 3714 3719 3765 3773 3790 3794 3806 3811 3813 3843 3877 3944 3946 3990 4011 4026 4028 4041 4042 4045 4059 4094 4122 21 353 393 431 432 445 668 865 914 1041 1078 1126 1128 1194 1282 1400 1535 1553 1557 1627 1944 2002 2142 2144 2356 2383 2423 GGGTGG/CCACCC 0 -2 212 213 35 -17.0 14 52 80 105 118 132 142 214 247 259 288 307 324 329 352 385 424 426 433 435 441 446 448 466 469 471 476 481 489 542 543 559 579 582 599 626 639 648 681 686 706 713 723 740 753 787 855 862 883 891 930 937 940 941 948 956 964 966 996 1019 1030 1042 1044 1079 1084 1088 1099 1194 1213 1214 1257 1276 1314 1339 1371 1373 1387 1399 1413 1421 1437 1442 1473 1474 1497 1505 1536 1563 1615 1624 1632 1638 1668 1675 1745 1749 1852 1868 1885 1912 1920 1942 1946 2005 2014 2035 2041 2063 2074 2087 2197 2201 2224 2229 2248 2251 2267 2280 2328 2333 2336 2342 2343 2434 2445 2456 2463 2469 2474 2485 2490 2512 2515 2523 2563 2580 2597 2604 2607 2650 2661 2664 2669 2704 2737 2752 2756 2780 2790 2812 2814 2877 2914 2923 2932 2937 2940 2969 2975 2981 3003 3026 3051 3074 3079 3080 3096 3123 3146 3180 3183 3201 3226 3228 3243 3249 3256 3262 3276 3281 3284 3292 3293 3294 3315 3334 3362 3385 3592 3628 3639 3678 3697 3716 3757 3845 3846 3857 3874 3895 3906 3914 3919 3920 3931 3960 3989 4019 4072 4093 4101 4125 98 138 163 301 347 425 451 505 669 714 737 749 776 778 883 914 1042 1189 1298 1354 1423 1548 1712 1753 1816 1821 1954 1980 2056 2115 2150 2167 2213 2247 2474 GTGGGA/TCCCAC 0 0 208 206 40 -13.9 9 22 55 122 134 136 138 143 145 158 203 204 211 238 240 264 286 292 352 385 417 437 445 448 452 465 466 479 495 510 523 540 547 599 607 610 632 639 684 685 693 765 768 775 777 800 826 862 871 921 938 944 961 973 977 979 997 1002 1012 1020 1024 1039 1046 1063 1086 1089 1106 1109 1137 1149 1174 1181 1205 1209 1222 1280 1310 1411 1422 1426 1450 1503 1518 1533 1537 1564 1627 1644 1675 1699 1700 1754 1777 1781 1788 1866 1869 1870 1877 1942 1947 1999 2005 2051 2082 2117 2161 2174 2180 2205 2248 2249 2259 2264 2320 2379 2399 2494 2502 2527 2533 2568 2653 2679 2682 2688 2695 2723 2742 2756 2815 2877 2908 2909 2926 2934 2958 2981 2992 3012 3041 3065 3107 3111 3118 3123 3130 3165 3183 3290 3292 3309 3312 3331 3359 3379 3380 3387 3388 3397 3401 3417 3435 3453 3461 3462 3470 3473 3495 3505 3516 3530 3579 3581 3632 3665 3677 3689 3710 3730 3775 3777 3785 3789 3792 3794 3813 3833 3842 3855 3875 3900 3906 3914 3920 3955 3972 3977 3979 3985 4022 4040 4044 4059 4063 4076 4078 4083 54 61 209 268 282 324 341 364 384 461 616 673 757 813 854 928 978 1032 1041 1047 1090 1105 1238 1420 1485 1532 1654 1701 1709 1752 1886 1900 2090 2123 2134 2347 2364 2409 2412 2424 GTGGCG/CGCCAC 0 0 206 205 31 -17.7 34 36 62 72 84 89 99 120 145 154 172 197 203 221 243 303 356 376 429 435 445 461 473 486 502 508 509 550 582 587 621 654 658 671 681 702 704 711 719 723 725 736 737 742 781 846 856 874 894 947 948 1045 1046 1076 1119 1123 1134 1156 1176 1201 1216 1257 1268 1286 1288 1314 1321 1324 1338 1350 1368 1400 1435 1436 1449 1450 1468 1473 1487 1494 1525 1551 1564 1566 1605 1614 1622 1649 1678 1684 1701 1729 1738 1745 1747 1759 1793 1798 1858 1862 1873 1892 1904 1908 1909 1919 1943 1972 1975 1982 1990 2042 2069 2085 2116 2149 2158 2215 2220 2232 2262 2306 2344 2367 2408 2458 2467 2494 2570 2589 2619 2621 2628 2634 2695 2715 2730 2745 2749 2779 2795 2802 2825 2873 2874 2903 2905 2911 2930 2942 2950 2983 2993 3078 3098 3102 3114 3129 3131 3134 3151 3161 3171 3187 3242 3247 3272 3291 3302 3306 3344 3380 3392 3395 3422 3423 3427 3476 3479 3509 3540 3572 3586 3608 3612 3615 3622 3648 3661 3668 3674 3682 3693 3711 3773 3898 3920 3957 3972 3975 3977 4034 4040 4104 4112 4118 52 69 72 331 442 577 581 695 786 879 1000 1047 1139 1189 1391 1420 1485 1550 1685 1821 1943 1991 2090 2144 2166 2167 2379 2415 2425 2495 2505 GGTGCC/GGCACC 0 -1 191 192 17 -23.6 12 47 48 56 61 68 74 103 124 175 222 242 309 320 339 370 384 395 479 491 537 543 577 586 686 717 731 766 786 827 845 861 864 869 873 928 1003 1004 1068 1095 1098 1102 1110 1114 1122 1125 1138 1179 1195 1207 1260 1272 1289 1301 1302 1311 1344 1386 1398 1426 1447 1453 1476 1488 1492 1511 1532 1550 1561 1585 1588 1601 1610 1614 1617 1622 1676 1681 1695 1697 1792 1808 1809 1815 1821 1833 1864 1899 1907 1916 1929 1956 1982 2006 2028 2052 2065 2071 2107 2141 2149 2165 2230 2245 2250 2258 2260 2266 2282 2293 2296 2303 2338 2345 2358 2394 2419 2484 2497 2499 2521 2522 2558 2605 2612 2620 2627 2645 2650 2671 2771 2776 2808 2814 2828 2857 2860 2883 2900 2912 2924 2987 3005 3035 3067 3147 3154 3179 3188 3197 3219 3223 3245 3280 3283 3297 3304 3354 3356 3364 3446 3486 3500 3518 3638 3640 3645 3698 3701 3709 3719 3734 3737 3797 3806 3810 3815 3841 3852 3872 3907 3929 3945 3950 3951 3982 4010 4038 4045 4048 4081 21 53 431 668 777 845 847 1041 1282 1400 1449 1729 2002 2059 2185 2356 2384 ACGGTG/CACCGT 0 -3 188 186 35 -13.1 3 24 36 65 68 73 76 106 108 110 155 172 273 276 282 322 344 358 414 432 457 479 551 561 580 595 599 604 617 670 683 758 791 825 847 865 901 973 994 1016 1060 1061 1082 1094 1096 1098 1103 1116 1136 1200 1246 1273 1316 1332 1340 1341 1397 1462 1507 1530 1538 1560 1578 1597 1604 1637 1639 1678 1714 1721 1754 1759 1770 1796 1797 1817 1880 1917 1930 1964 1971 1993 2015 2025 2031 2066 2075 2076 2127 2166 2184 2219 2238 2265 2279 2302 2304 2313 2356 2388 2391 2396 2407 2416 2429 2441 2467 2504 2506 2509 2550 2553 2571 2591 2593 2616 2629 2632 2633 2642 2655 2666 2719 2720 2723 2740 2743 2746 2779 2787 2789 2806 2810 2841 2845 2855 2867 2895 2896 2926 2931 2950 2964 2980 3016 3033 3040 3041 3050 3054 3085 3107 3108 3220 3249 3298 3332 3342 3346 3407 3447 3470 3499 3577 3645 3648 3689 3696 3713 3729 3736 3738 3744 3778 3811 3813 3835 3848 3870 3876 3877 3931 3946 3970 3990 4011 4099 4126 8 19 21 42 431 445 662 820 1032 1041 1075 1106 1145 1195 1259 1282 1304 1337 1400 1451 1526 1554 1685 1831 1995 2004 2110 2142 2146 2238 2268 2373 2390 2428 2464 CGGGTG/CACCCG 0 -3 177 179 19 -20.0 18 20 22 51 102 105 149 217 256 259 268 280 291 302 307 318 322 324 329 337 352 354 362 385 390 397 424 441 446 447 453 455 466 478 489 497 543 582 600 626 639 675 699 706 731 785 819 829 842 855 886 1007 1038 1044 1049 1065 1088 1114 1118 1124 1134 1139 1195 1298 1314 1339 1371 1373 1407 1414 1446 1447 1459 1505 1508 1531 1537 1544 1632 1638 1672 1725 1740 1745 1808 1852 1909 1912 1920 1942 1946 1952 1982 2014 2024 2134 2159 2193 2228 2232 2248 2250 2267 2276 2311 2332 2336 2350 2358 2368 2376 2402 2515 2537 2563 2580 2583 2607 2616 2661 2680 2706 2737 2752 2765 2774 2775 2791 2821 2881 2898 2921 2923 2954 2969 2975 3015 3026 3071 3096 3139 3149 3187 3210 3219 3238 3261 3281 3284 3293 3323 3353 3415 3451 3459 3562 3563 3615 3641 3646 3691 3706 3716 3722 3739 3816 3866 3874 3967 4029 4034 4080 4084 4087 4101 4106 4125 232 276 304 347 485 505 609 664 737 833 854 914 1189 1495 1816 1953 2115 2203 2450 AGGTGC/GCACCT 0 -2 177 177 23 -17.3 4 6 75 87 103 124 136 209 233 235 264 284 294 311 320 362 363 386 543 553 581 632 643 661 674 699 716 760 797 829 835 864 877 881 916 943 948 1110 1115 1145 1173 1269 1272 1302 1308 1348 1349 1361 1382 1386 1432 1439 1463 1478 1489 1516 1521 1523 1532 1568 1594 1601 1610 1617 1631 1633 1671 1718 1731 1742 1753 1776 1787 1814 1815 1822 1824 1829 1833 1888 1900 1928 1935 1978 1987 2026 2052 2062 2065 2135 2139 2141 2216 2219 2223 2246 2257 2260 2285 2293 2303 2338 2411 2435 2521 2524 2551 2554 2556 2557 2558 2627 2631 2676 2704 2765 2770 2803 2808 2811 2828 2864 2924 2950 2987 3017 3020 3027 3055 3063 3089 3115 3117 3118 3121 3127 3156 3188 3189 3194 3237 3250 3280 3327 3364 3394 3455 3462 3486 3490 3536 3542 3544 3545 3565 3616 3640 3646 3663 3726 3734 3750 3798 3807 3814 3840 3859 3862 3875 3900 3907 3929 3938 3945 3964 3985 4032 80 272 331 434 520 743 807 847 866 1198 1219 1351 1365 1368 1418 1585 1693 1766 1934 2115 2376 2403 2427 CGTGGT/ACCACG 0 -4 180 177 23 -17.3 35 45 78 86 112 120 121 122 155 175 189 197 200 202 219 243 244 264 273 296 298 327 414 419 431 465 492 612 627 638 653 679 685 757 834 856 895 925 930 945 1037 1045 1063 1112 1129 1179 1188 1197 1211 1236 1260 1303 1350 1375 1399 1427 1469 1517 1589 1602 1621 1639 1640 1716 1753 1766 1767 1768 1783 1785 1814 1816 1850 1867 1880 1947 1959 1970 2009 2063 2072 2102 2106 2115 2121 2124 2132 2139 2152 2165 2179 2195 2198 2200 2209 2230 2237 2246 2252 2292 2378 2396 2400 2409 2443 2456 2465 2468 2526 2528 2536 2550 2584 2594 2601 2615 2623 2642 2646 2694 2738 2787 2830 2833 2878 2897 2917 2952 2962 2964 2977 3011 3023 3056 3098 3104 3114 3135 3160 3197 3215 3227 3248 3304 3316 3341 3390 3392 3395 3411 3414 3550 3583 3610 3648 3656 3662 3685 3687 3697 3715 3721 3744 3746 3747 3784 3792 3793 3810 3861 3916 3924 3938 3979 3995 4005 4027 4053 4062 4115 7 180 308 490 580 724 829 842 913 1105 1341 1377 1392 1432 1632 1710 1761 1952 2054 2067 2249 2388 2491 GGGTGC/GCACCC 0 -2 158 158 15 -18.9 20 22 44 147 231 245 253 256 268 302 337 360 362 379 397 455 537 549 577 600 633 641 699 706 731 755 807 842 847 861 862 864 886 889 919 950 978 980 990 993 1009 1065 1068 1080 1083 1114 1124 1187 1195 1229 1304 1309 1333 1407 1416 1447 1502 1509 1511 1544 1575 1588 1630 1689 1741 1744 1793 1794 1801 1808 1832 1833 1866 1907 1948 1956 1982 2011 2037 2106 2134 2159 2225 2246 2250 2276 2282 2293 2311 2314 2321 2358 2376 2417 2489 2503 2547 2568 2572 2583 2649 2650 2662 2720 2791 2820 2821 2862 2869 2881 2921 3015 3058 3066 3067 3070 3071 3076 3087 3143 3147 3154 3204 3231 3239 3259 3283 3343 3353 3363 3433 3440 3468 3520 3555 3562 3563 3575 3615 3646 3709 3717 3740 3763 3771 3816 3819 3824 3852 3859 3889 3951 3961 4015 4047 4052 4071 4084 543 609 845 1026 1042 1134 1299 1628 1650 1779 1816 1920 2003 2203 2347 GTGGGG/CCCCAC 0 0 140 142 23 -11.8 0 10 37 44 80 91 102 105 126 144 223 225 247 255 277 288 330 336 368 371 388 417 441 481 499 520 535 604 615 616 629 648 653 682 733 754 889 922 935 936 941 983 986 1025 1058 1086 1101 1104 1185 1299 1302 1316 1339 1341 1368 1373 1377 1402 1430 1438 1515 1574 1633 1662 1668 1689 1706 1752 1783 2049 2050 2064 2122 2144 2284 2320 2328 2330 2356 2392 2398 2422 2425 2461 2510 2553 2619 2623 2636 2639 2666 2683 2685 2710 2729 2751 2756 2784 2879 2886 2887 2904 2920 2937 2959 3037 3041 3067 3142 3158 3190 3214 3221 3228 3256 3314 3359 3402 3406 3454 3482 3504 3569 3577 3586 3720 3780 3857 3861 3879 3880 3887 3897 3942 3956 3960 3997 4009 4021 4072 25 67 85 183 313 464 699 802 883 957 1026 1087 1240 1255 1298 1357 1816 1888 2127 2289 2315 2441 2462 CCGCCG/CGGCGG 1 -2 144 141 22 -12.2 32 50 51 62 72 81 100 119 166 218 243 258 260 308 325 381 445 447 527 533 622 646 652 725 739 762 816 839 843 886 932 954 985 990 1014 1128 1150 1156 1157 1161 1172 1196 1241 1265 1279 1285 1294 1300 1329 1331 1351 1379 1446 1493 1503 1510 1542 1560 1603 1625 1649 1721 1785 1867 1882 1889 1921 1986 2022 2025 2142 2169 2241 2255 2295 2315 2355 2376 2386 2397 2421 2477 2516 2533 2538 2555 2619 2621 2631 2708 2712 2732 2745 2746 2776 2794 2798 2805 2813 2855 2891 3005 3025 3052 3073 3078 3097 3127 3133 3174 3181 3207 3212 3349 3350 3372 3380 3393 3447 3483 3531 3540 3596 3601 3606 3642 3651 3655 3658 3677 3681 3700 3785 3818 3822 3828 3829 3849 3883 3913 4004 4016 4026 4041 18 72 73 229 248 267 334 489 499 509 603 709 937 1502 1750 1918 1944 2167 2239 2240 2356 2424 GCGCCA/TGGCGC 2 -3 127 125 14 -13.8 99 194 229 383 439 448 461 498 568 582 605 654 656 658 671 691 704 711 803 966 1011 1046 1051 1169 1201 1231 1232 1237 1259 1286 1321 1368 1380 1390 1397 1412 1418 1473 1525 1564 1605 1708 1712 1729 1747 1841 1858 1860 1876 1887 1896 1985 2059 2069 2116 2132 2202 2215 2222 2236 2262 2272 2308 2317 2319 2344 2352 2357 2372 2380 2382 2387 2394 2436 2453 2458 2467 2540 2559 2565 2569 2570 2587 2644 2727 2786 2802 2843 2849 2858 2873 2911 2944 2983 2985 3002 3051 3088 3131 3144 3151 3161 3164 3171 3286 3326 3345 3380 3411 3423 3528 3561 3562 3611 3674 3751 3810 3831 3893 3910 3917 3976 3981 3986 4034 4086 4104 84 289 406 642 695 949 1416 1557 1577 1654 1802 1816 2167 2379 GTGCCT/AGGCAC 0 0 123 124 21 -10.1 14 56 68 125 153 209 222 242 261 320 339 343 348 384 420 446 513 520 551 561 586 717 766 785 827 845 864 869 899 921 939 1026 1098 1102 1141 1149 1186 1195 1255 1300 1301 1302 1308 1311 1333 1354 1398 1405 1426 1447 1476 1492 1550 1585 1614 1695 1697 1763 1808 1907 1925 1929 1982 1987 1997 2038 2065 2068 2071 2165 2258 2266 2282 2293 2345 2475 2484 2521 2612 2627 2734 2763 2771 2808 2828 2850 2860 2892 2893 2897 2900 3005 3035 3048 3056 3135 3154 3161 3283 3297 3309 3354 3356 3364 3405 3446 3461 3484 3512 3645 3701 3768 3769 3789 3797 3806 3815 3872 3914 3950 4038 4081 4082 212 290 437 683 698 784 829 1013 1043 1069 1263 1289 1449 1516 1685 1694 1778 1820 1870 2002 2059 GGTGCG/CGCACC 0 -1 114 116 20 -9.3 6 7 20 41 131 147 193 202 251 256 280 295 356 463 491 507 553 555 590 591 600 604 650 651 699 706 763 856 870 876 889 918 950 980 990 993 994 1078 1174 1177 1236 1326 1333 1334 1457 1517 1610 1699 1710 1718 1766 1784 1785 1796 1823 1934 1945 2037 2223 2225 2243 2270 2325 2349 2440 2489 2511 2516 2547 2604 2607 2636 2642 2668 2697 2790 2808 2891 2895 2906 2909 2963 3118 3149 3206 3239 3257 3308 3318 3384 3401 3407 3496 3520 3535 3537 3567 3570 3603 3740 3791 3798 3819 3859 3916 3921 3932 3949 3951 3961 3988 4026 4073 4084 251 331 353 365 434 914 1122 1351 1363 1365 1433 1464 1628 1836 1920 1944 1952 2213 2415 2427 GTGGGC/GCCCAC 0 0 110 113 21 -8.5 9 12 57 113 156 177 181 217 312 332 338 342 398 403 406 443 447 449 665 749 768 769 776 783 793 795 876 904 908 910 930 978 1033 1036 1048 1084 1107 1113 1118 1168 1184 1349 1369 1411 1460 1523 1542 1553 1577 1579 1598 1602 1624 1635 1644 1739 1776 1815 1914 1962 1996 2002 2032 2036 2038 2107 2130 2196 2281 2291 2405 2472 2482 2487 2491 2504 2516 2543 2580 2595 2701 2741 2863 2878 2964 2984 3017 3159 3202 3243 3301 3425 3527 3623 3631 3636 3663 3670 3672 3707 3788 3830 3833 3865 3874 3896 3933 3988 4025 4125 117 337 505 520 575 595 741 744 821 914 1310 1454 1645 1804 1854 1999 2020 2150 2229 2266 2361 CAGCCG/CGGCTG 1 -2 107 107 20 -8.0 7 8 47 136 164 191 193 235 246 320 323 328 359 393 416 424 533 621 625 707 722 725 730 747 799 817 822 843 924 961 965 995 1047 1158 1160 1161 1172 1228 1333 1350 1361 1378 1422 1428 1470 1487 1493 1498 1696 1711 1719 1721 1726 1762 1766 1837 1861 1905 1919 1962 1989 2037 2056 2101 2124 2143 2151 2295 2311 2322 2331 2488 2708 2734 2766 2772 2775 2779 2879 2891 2912 2948 2950 3021 3043 3056 3065 3106 3117 3232 3287 3310 3366 3413 3537 3596 3601 3626 3666 3798 3853 3856 3864 3881 3894 3913 4055 106 162 228 329 403 642 775 937 983 1216 1802 1832 1924 2021 2033 2343 2415 2436 2449 2456 CCGCAG/CTGCGG 1 -2 104 105 16 -9.5 32 34 38 42 119 136 212 248 267 293 320 337 364 497 536 546 621 645 657 695 743 783 872 873 892 895 955 961 1131 1160 1172 1232 1298 1325 1339 1423 1493 1495 1550 1556 1562 1673 1725 1754 1785 1825 1839 1861 1976 2014 2109 2112 2158 2181 2242 2269 2287 2342 2393 2475 2605 2642 2650 2663 2667 2672 2678 2728 2737 2744 2764 2886 2902 2967 2989 3017 3031 3075 3083 3163 3223 3271 3281 3389 3408 3413 3455 3545 3556 3580 3624 3630 3656 3677 3686 3724 3748 3792 3920 3957 3958 3981 4001 4007 431 451 649 679 739 967 983 1055 1373 1478 2096 2129 2327 2395 2408 2435 GGTCGG/CCGACC 0 -1 103 102 12 -11.2 0 88 105 248 252 325 329 394 408 430 476 487 497 500 554 556 593 611 678 687 715 767 769 810 853 899 907 934 947 953 1042 1045 1066 1123 1145 1258 1264 1384 1560 1629 1632 1675 1711 1717 1806 1851 2026 2080 2091 2141 2156 2174 2191 2217 2257 2282 2339 2341 2389 2410 2428 2470 2483 2519 2541 2577 2667 2728 2770 2771 2775 2867 2898 2925 2990 2996 3066 3117 3149 3155 3241 3329 3359 3427 3449 3544 3605 3608 3617 3631 3660 3817 3925 3963 3980 3989 4027 4039 4075 4080 4083 4104 4120 74 78 304 724 741 1088 1224 1727 1814 1977 2160 2508 GGGGTG/CACCCC 0 -3 96 98 13 -10.0 10 14 52 80 91 118 142 223 288 379 397 448 469 476 577 579 653 713 856 861 862 864 891 919 937 940 956 964 990 1086 1097 1213 1229 1257 1334 1339 1386 1399 1437 1497 1536 1624 1675 1689 1741 1744 1749 1752 1793 1794 1832 1866 1868 1948 1956 2106 2197 2273 2280 2328 2398 2422 2463 2469 2489 2510 2523 2568 2649 2650 2666 2790 2877 2903 3012 3051 3058 3147 3190 3221 3228 3256 3315 3334 3592 3678 3819 3846 3852 3859 3889 3920 3946 4071 4072 4119 163 662 669 845 883 1134 1298 1299 1357 1821 2213 2315 2347 GGCGGG/CCCGCC 0 -1 95 95 15 -8.5 11 51 79 89 172 201 221 256 260 310 333 356 391 462 502 545 548 554 560 614 662 678 706 816 868 954 985 1016 1093 1151 1157 1293 1314 1329 1363 1379 1436 1460 1724 1725 1745 1848 1862 1882 1909 1921 1936 1937 1946 1975 1990 2057 2085 2142 2169 2232 2367 2368 2371 2386 2516 2533 2585 2615 2628 2631 2654 2695 2706 2708 2715 2754 2795 2818 2916 2959 2981 3114 3298 3300 3366 3442 3508 3620 3658 3661 3681 3773 3796 3866 3883 3972 4029 4044 4106 29 232 271 300 379 937 1189 1597 1750 1799 1817 1920 2007 2066 2424 GTGCAC/GTGCAC 0 0 84 86 15 -7.1 4 101 268 314 345 366 379 386 485 489 551 581 617 618 661 733 752 760 797 800 825 900 915 944 963 1061 1090 1136 1227 1263 1295 1303 1316 1317 1344 1440 1502 1704 1789 1797 1888 1913 1971 1978 1989 2073 2093 2099 2114 2198 2377 2387 2480 2494 2569 2623 2625 2720 2733 2787 2809 2892 2943 2950 2960 3016 3045 3051 3086 3117 3156 3237 3239 3250 3418 3433 3452 3740 3790 3795 3862 3910 4032 4042 272 345 799 1223 1384 1534 1553 1650 1886 1901 1934 2003 2203 2301 2415 GCCCCA/TGGGGC 2 -3 79 78 11 -7.8 14 25 102 132 204 229 248 255 277 368 441 495 535 616 733 768 922 935 951 986 1008 1079 1134 1209 1302 1316 1377 1397 1430 1433 1447 1536 1537 1574 1623 1737 1769 1783 2180 2222 2242 2312 2320 2388 2489 2507 2527 2544 2556 2623 2636 2685 2701 2816 2861 2904 2924 3112 3140 3142 3147 3244 3256 3263 3264 3269 3314 3406 3482 3561 3569 3573 3683 3861 3942 3969 3982 3997 4021 801 934 957 1033 1126 1141 1273 1804 2127 2151 2441 AGCGCC/GGCGCT 2 -4 75 72 14 -5.5 138 229 347 498 568 582 657 696 726 912 966 1012 1080 1104 1169 1207 1238 1368 1397 1473 1478 1521 1543 1675 1708 1747 1858 1887 1940 1985 2059 2195 2202 2212 2215 2222 2262 2312 2372 2380 2382 2387 2453 2458 2550 2559 2565 2569 2587 2644 2727 2786 2843 3002 3164 3186 3277 3326 3345 3349 3411 3423 3528 3558 3561 3562 3611 3674 3824 3831 3917 3976 3986 4035 4039 18 84 289 393 406 520 789 1234 1557 2167 2229 2298 2379 2441 CGCCGG/CCGGCG 1 -1 68 66 11 -6.0 50 72 100 166 185 243 381 649 691 739 762 839 886 938 962 1157 1196 1207 1231 1294 1300 1446 1493 1503 1510 1542 1561 1649 1652 1721 1726 1738 1785 1889 1921 1965 2014 2093 2133 2295 2355 2439 2467 2516 2573 2616 2627 2641 2696 2855 3005 3078 3098 3346 3349 3350 3500 3655 3660 3681 3700 3818 3849 3913 3948 3953 4004 4016 18 30 913 930 937 2171 2242 2250 2355 2356 2436