#4348/264 #8.29 # k-mer/r.c. Cluster Offset PosCt wPosCt NegCt HGP_10 ACACGT/ACGTGT 0 -2 1151 1218 8 -26.3 9 19 20 23 28 29 31 37 38 43 48 54 57 58 59 60 61 62 63 73 76 78 79 80 81 88 92 97 100 101 102 103 106 110 113 114 115 119 122 124 127 129 131 133 134 136 139 140 141 143 145 147 149 150 153 154 155 156 157 159 160 163 166 167 169 170 171 173 174 177 180 184 186 195 197 199 200 202 204 206 207 210 212 213 214 220 222 224 225 226 229 232 233 234 235 236 238 241 242 244 245 246 247 250 252 258 259 260 261 262 274 275 277 279 281 284 287 289 291 295 298 302 303 305 306 312 313 316 319 320 323 324 325 327 328 329 330 331 332 334 337 343 345 346 347 352 355 356 357 362 364 366 368 373 375 376 378 382 385 387 391 392 393 401 402 404 405 406 407 409 410 415 420 424 427 429 433 435 436 437 438 443 446 447 452 458 462 467 468 469 471 472 476 479 482 484 485 487 500 501 503 505 507 508 514 515 516 517 518 522 531 533 535 537 538 539 543 548 550 554 560 561 563 565 566 567 572 576 577 579 580 581 584 585 588 590 594 596 601 603 605 610 612 616 619 620 622 636 637 638 639 641 642 646 649 650 651 652 654 658 659 660 663 664 665 666 667 668 669 670 677 687 691 692 693 694 700 702 707 712 713 717 720 723 724 727 728 731 735 737 741 744 745 746 747 751 753 755 756 760 764 773 774 778 780 781 783 785 786 794 795 799 800 801 808 814 817 818 819 820 825 827 828 832 839 854 860 861 862 864 865 869 876 878 884 886 890 895 899 900 901 902 903 905 917 918 919 920 923 924 927 930 932 933 934 935 936 938 946 950 957 959 964 966 967 968 970 979 981 983 984 986 989 992 1000 1001 1002 1006 1010 1013 1014 1020 1027 1029 1030 1036 1037 1038 1039 1040 1041 1045 1046 1048 1049 1051 1052 1053 1058 1059 1060 1061 1070 1071 1072 1075 1076 1077 1082 1084 1093 1094 1095 1096 1099 1102 1105 1111 1112 1116 1119 1123 1127 1129 1137 1138 1143 1145 1146 1151 1153 1154 1155 1156 1159 1163 1167 1168 1175 1176 1181 1184 1187 1190 1191 1193 1194 1195 1197 1199 1206 1207 1209 1210 1212 1215 1222 1230 1231 1239 1241 1250 1255 1258 1259 1262 1266 1267 1268 1269 1272 1273 1275 1276 1277 1279 1285 1286 1289 1291 1292 1298 1301 1303 1305 1307 1309 1310 1311 1312 1316 1318 1319 1320 1322 1323 1327 1332 1340 1341 1346 1348 1349 1360 1368 1369 1373 1377 1379 1382 1383 1388 1389 1390 1395 1399 1400 1402 1407 1415 1421 1425 1426 1427 1430 1434 1436 1437 1439 1442 1447 1453 1455 1471 1472 1481 1490 1492 1494 1498 1499 1506 1508 1509 1511 1525 1528 1539 1541 1542 1544 1546 1549 1551 1554 1556 1558 1560 1561 1562 1563 1566 1567 1571 1575 1576 1577 1578 1579 1593 1595 1607 1608 1609 1618 1620 1640 1645 1648 1669 1670 1672 1675 1677 1680 1682 1684 1686 1694 1700 1704 1707 1708 1714 1722 1725 1726 1728 1729 1733 1735 1738 1740 1744 1747 1750 1752 1753 1754 1761 1768 1772 1773 1774 1779 1780 1783 1787 1790 1797 1803 1813 1815 1816 1819 1821 1824 1825 1842 1844 1848 1849 1854 1856 1857 1866 1873 1876 1882 1883 1885 1886 1887 1888 1892 1896 1897 1899 1901 1902 1903 1913 1914 1915 1918 1921 1929 1952 1954 1956 1962 1963 1968 1969 1971 1972 1974 1991 1993 1994 1995 2003 2005 2006 2011 2013 2015 2018 2020 2033 2034 2042 2050 2060 2066 2069 2074 2075 2078 2079 2085 2088 2090 2104 2107 2109 2114 2115 2118 2119 2120 2128 2129 2139 2156 2161 2166 2167 2176 2179 2181 2183 2203 2204 2205 2215 2219 2220 2225 2227 2228 2231 2235 2244 2245 2251 2258 2261 2263 2265 2266 2270 2271 2274 2285 2286 2291 2301 2305 2306 2308 2309 2313 2315 2322 2327 2329 2331 2335 2336 2339 2344 2346 2351 2355 2356 2359 2364 2368 2370 2374 2375 2377 2384 2389 2393 2395 2396 2400 2405 2409 2416 2432 2445 2450 2455 2457 2458 2459 2464 2466 2471 2474 2476 2480 2496 2505 2507 2511 2512 2516 2521 2522 2524 2531 2532 2534 2537 2543 2546 2547 2554 2556 2558 2559 2566 2569 2577 2583 2594 2596 2601 2603 2609 2610 2612 2613 2617 2623 2624 2625 2629 2641 2644 2652 2658 2659 2678 2687 2694 2700 2702 2704 2706 2708 2712 2715 2717 2720 2721 2725 2726 2728 2730 2731 2734 2737 2742 2752 2756 2761 2762 2763 2767 2772 2773 2774 2778 2785 2790 2796 2799 2801 2803 2810 2812 2813 2817 2827 2831 2841 2847 2851 2854 2856 2860 2864 2870 2871 2875 2886 2897 2903 2909 2911 2918 2919 2923 2925 2927 2930 2958 2960 2967 2980 2983 2993 2994 3000 3011 3015 3021 3029 3033 3034 3042 3044 3045 3048 3053 3054 3057 3066 3080 3081 3083 3084 3088 3090 3091 3092 3094 3095 3097 3100 3106 3111 3114 3117 3130 3134 3145 3147 3158 3166 3167 3169 3171 3175 3195 3196 3201 3208 3209 3214 3218 3229 3230 3232 3239 3240 3242 3246 3249 3251 3274 3275 3277 3284 3287 3288 3296 3299 3300 3305 3321 3322 3327 3329 3331 3332 3334 3336 3339 3342 3345 3352 3355 3356 3360 3365 3368 3370 3377 3385 3386 3391 3394 3401 3402 3409 3429 3445 3454 3463 3464 3467 3468 3469 3485 3506 3508 3516 3521 3523 3534 3544 3546 3551 3555 3560 3570 3573 3575 3576 3578 3580 3582 3587 3588 3590 3596 3597 3608 3618 3621 3622 3623 3636 3641 3647 3653 3654 3668 3670 3675 3684 3688 3690 3707 3719 3722 3725 3730 3744 3758 3762 3765 3767 3772 3777 3789 3790 3795 3796 3802 3807 3814 3816 3820 3829 3834 3847 3863 3865 3868 3874 3876 3879 3900 3904 3910 3921 3929 3932 3937 3953 3959 3960 3963 3966 3973 3974 3977 3980 3992 4000 4003 4009 4015 4025 4029 4030 4031 4036 4042 4046 4051 4054 4063 4071 4075 4077 4090 4099 4125 4128 4129 4132 4135 4148 4149 4153 4160 4163 4171 4185 4189 4196 4200 4201 4206 4214 4225 4237 4238 4244 4248 4253 4254 4260 4262 4266 4274 4281 4282 4283 4291 4306 4308 4309 4311 4313 4316 4318 4319 4323 4330 4333 4340 4341 0 15 87 105 132 209 227 255 CCACGT/ACGTGG 0 -2 890 953 1 -27.5 0 3 5 8 11 19 21 31 35 37 51 53 55 60 61 63 64 70 73 75 76 79 82 85 88 90 96 101 110 114 123 127 128 133 135 137 138 139 140 141 142 144 146 148 149 152 153 158 160 164 167 168 171 174 176 182 183 185 187 188 197 203 209 211 212 213 214 215 224 225 226 233 234 237 242 243 244 245 246 247 249 252 253 254 261 265 268 270 273 275 277 279 280 281 283 286 287 291 292 297 307 309 310 315 316 319 323 325 327 328 331 342 348 352 353 356 357 358 363 364 370 374 375 376 377 378 382 384 385 386 388 392 395 397 399 401 406 407 408 409 415 424 426 428 431 433 434 439 441 446 448 449 450 456 465 468 479 485 489 491 492 493 497 504 508 510 513 517 521 522 526 527 529 530 531 533 540 544 552 554 557 558 561 562 567 574 577 580 581 583 591 592 594 596 599 600 605 609 611 613 614 617 618 620 624 628 629 630 635 639 643 651 663 664 669 671 673 674 679 683 685 688 689 697 705 712 713 715 721 722 725 733 737 738 741 745 747 748 751 754 763 767 770 772 773 775 776 779 785 786 788 789 790 793 796 799 803 806 807 808 811 814 821 824 828 832 834 838 839 845 850 853 857 858 863 864 867 875 879 882 884 888 893 900 910 914 915 917 918 923 929 930 931 936 939 944 949 950 952 960 965 968 971 972 973 977 980 981 983 986 994 996 999 1003 1005 1007 1009 1010 1012 1019 1024 1026 1036 1037 1038 1039 1054 1058 1060 1067 1083 1095 1103 1111 1116 1120 1124 1129 1134 1135 1142 1143 1145 1152 1153 1155 1161 1162 1165 1166 1168 1169 1173 1183 1190 1199 1200 1205 1206 1207 1210 1212 1213 1215 1217 1222 1226 1229 1231 1233 1234 1248 1254 1256 1257 1259 1260 1268 1272 1273 1274 1275 1276 1280 1281 1283 1288 1289 1292 1297 1303 1309 1316 1318 1321 1322 1329 1333 1335 1336 1342 1344 1345 1347 1357 1360 1364 1375 1382 1383 1387 1389 1395 1398 1402 1406 1408 1410 1426 1432 1437 1443 1444 1447 1454 1475 1476 1482 1486 1487 1492 1507 1517 1518 1519 1545 1555 1558 1560 1564 1566 1576 1580 1582 1584 1587 1596 1604 1606 1614 1625 1627 1629 1630 1631 1632 1640 1646 1655 1656 1663 1665 1667 1671 1674 1686 1690 1692 1693 1698 1709 1711 1722 1723 1725 1727 1739 1740 1760 1769 1775 1781 1789 1813 1817 1819 1824 1832 1833 1844 1846 1850 1858 1870 1871 1873 1885 1886 1887 1890 1893 1902 1903 1908 1912 1915 1920 1925 1930 1945 1950 1953 1959 1968 1974 1979 1983 1985 1992 2001 2004 2007 2011 2012 2016 2036 2047 2050 2051 2053 2057 2062 2069 2077 2080 2081 2102 2105 2126 2132 2134 2135 2137 2139 2145 2152 2155 2156 2157 2166 2171 2181 2191 2194 2198 2201 2203 2206 2212 2214 2230 2234 2254 2258 2263 2271 2283 2284 2288 2291 2292 2293 2302 2304 2308 2326 2327 2331 2340 2349 2360 2367 2370 2372 2374 2376 2377 2390 2405 2411 2414 2421 2422 2440 2448 2455 2466 2476 2479 2484 2492 2494 2496 2501 2507 2508 2511 2516 2532 2534 2539 2543 2552 2555 2559 2562 2563 2567 2584 2588 2594 2596 2604 2617 2628 2638 2652 2664 2683 2697 2707 2709 2711 2712 2713 2717 2725 2730 2732 2744 2748 2755 2756 2770 2772 2779 2782 2786 2789 2793 2794 2801 2804 2806 2808 2814 2816 2819 2828 2831 2834 2835 2836 2844 2845 2852 2856 2859 2860 2862 2871 2886 2888 2890 2896 2902 2906 2914 2918 2920 2921 2928 2936 2939 2940 2942 2947 2956 2962 2971 2974 2978 2985 2989 2990 2991 3000 3018 3020 3021 3023 3025 3029 3036 3043 3044 3047 3068 3073 3081 3085 3096 3098 3117 3119 3130 3132 3133 3134 3142 3148 3150 3154 3160 3178 3182 3189 3201 3208 3215 3226 3238 3239 3245 3246 3247 3266 3269 3273 3275 3277 3281 3298 3308 3310 3319 3322 3327 3328 3343 3345 3364 3382 3387 3395 3396 3403 3407 3422 3423 3427 3432 3434 3444 3449 3452 3453 3454 3457 3458 3470 3478 3479 3482 3487 3496 3503 3504 3515 3522 3527 3533 3534 3547 3551 3559 3566 3573 3596 3604 3607 3612 3615 3623 3631 3634 3640 3648 3650 3676 3678 3682 3686 3700 3703 3710 3717 3718 3720 3730 3754 3755 3773 3788 3792 3793 3798 3807 3813 3814 3815 3816 3819 3822 3829 3832 3843 3848 3852 3853 3854 3857 3860 3865 3867 3868 3869 3874 3880 3893 3899 3916 3923 3926 3935 3938 3944 3965 3968 3994 3995 3997 4013 4026 4042 4060 4063 4065 4066 4070 4078 4088 4099 4106 4107 4123 4135 4148 4151 4152 4172 4179 4187 4189 4212 4215 4239 4242 4245 4247 4274 4280 4293 4295 4300 4309 4314 4317 4340 4344 144 CACGTG/CACGTG 0 -1 848 933 2 -25.0 5 19 29 31 38 57 58 60 61 63 66 67 72 73 76 78 79 80 81 85 88 90 97 99 101 105 107 110 113 115 122 124 127 128 131 133 134 136 137 139 140 141 143 144 146 147 149 152 153 154 160 163 166 167 169 170 171 173 174 177 180 183 186 194 197 199 206 209 212 213 214 222 224 225 226 227 229 233 234 236 242 244 245 246 247 250 252 253 258 261 262 268 270 273 275 277 279 281 286 287 289 291 292 297 298 299 303 309 310 316 319 320 322 323 325 327 328 330 331 334 338 344 346 348 352 356 357 358 364 375 376 378 380 382 385 386 392 393 397 398 401 402 404 406 407 409 415 420 424 428 433 434 435 436 437 438 439 441 446 456 462 465 467 469 471 476 479 481 484 485 486 487 488 491 495 500 501 505 508 516 517 522 527 531 533 535 539 540 549 550 555 557 560 561 563 565 567 574 576 577 580 581 584 585 588 594 596 599 605 613 614 616 617 619 620 624 632 637 639 641 642 651 652 658 659 660 663 664 665 666 669 670 671 673 683 685 686 687 690 691 693 694 697 707 712 713 715 720 721 722 723 724 725 728 731 733 735 737 741 745 747 751 753 754 758 760 762 764 767 772 773 774 775 778 779 780 783 785 786 788 790 793 795 796 799 800 808 812 814 816 817 818 819 824 825 828 832 839 845 857 860 861 862 863 864 867 868 876 878 882 884 886 900 901 915 918 919 923 930 934 936 950 952 956 959 964 966 967 968 970 977 979 981 982 983 986 989 991 992 996 1000 1003 1010 1014 1024 1029 1036 1037 1038 1039 1040 1045 1048 1051 1052 1053 1054 1058 1059 1060 1067 1070 1071 1075 1093 1095 1099 1102 1111 1116 1119 1120 1122 1123 1129 1135 1143 1145 1146 1151 1153 1155 1156 1159 1161 1163 1167 1168 1169 1176 1190 1194 1195 1199 1200 1206 1207 1209 1210 1212 1215 1222 1230 1231 1234 1239 1250 1259 1263 1267 1268 1269 1272 1273 1275 1276 1280 1281 1285 1289 1292 1294 1303 1309 1311 1312 1314 1316 1318 1322 1323 1325 1336 1340 1360 1373 1377 1379 1382 1383 1388 1389 1395 1402 1407 1408 1421 1426 1430 1432 1436 1437 1439 1444 1448 1452 1455 1469 1475 1490 1492 1508 1509 1517 1523 1528 1542 1544 1545 1549 1558 1560 1566 1567 1576 1577 1578 1579 1589 1595 1599 1601 1604 1607 1609 1614 1618 1620 1625 1627 1629 1631 1640 1655 1665 1667 1669 1670 1674 1675 1682 1686 1690 1692 1693 1708 1709 1714 1722 1723 1725 1728 1735 1740 1752 1753 1754 1768 1774 1789 1790 1797 1813 1815 1816 1817 1819 1821 1824 1825 1837 1842 1844 1856 1858 1873 1877 1885 1886 1887 1888 1893 1898 1901 1902 1903 1908 1915 1920 1922 1934 1947 1951 1955 1968 1971 1985 1988 1991 2001 2007 2011 2016 2018 2028 2033 2050 2051 2055 2066 2069 2074 2075 2078 2079 2090 2105 2119 2129 2139 2152 2155 2156 2161 2166 2167 2181 2201 2203 2204 2225 2227 2230 2243 2254 2258 2263 2265 2271 2283 2285 2291 2306 2308 2309 2313 2327 2328 2329 2331 2344 2349 2351 2370 2371 2374 2376 2377 2390 2396 2405 2416 2419 2421 2422 2432 2440 2455 2458 2459 2467 2474 2492 2494 2496 2501 2503 2507 2511 2516 2524 2532 2534 2539 2543 2546 2559 2566 2569 2570 2572 2594 2596 2603 2617 2623 2644 2652 2658 2683 2686 2687 2688 2694 2702 2707 2709 2711 2712 2717 2721 2725 2728 2730 2737 2742 2756 2763 2764 2772 2794 2799 2801 2806 2813 2828 2829 2830 2831 2835 2836 2840 2841 2847 2851 2852 2856 2860 2862 2864 2871 2880 2886 2890 2902 2906 2914 2918 2919 2921 2925 2930 2936 2942 2947 2950 2962 2983 2991 3000 3015 3021 3029 3040 3043 3044 3047 3054 3061 3081 3094 3095 3098 3106 3117 3130 3133 3134 3152 3171 3189 3201 3208 3215 3222 3231 3239 3242 3245 3246 3248 3255 3275 3277 3287 3308 3322 3327 3332 3345 3402 3407 3414 3445 3454 3463 3479 3523 3527 3534 3535 3551 3559 3578 3592 3596 3618 3622 3623 3634 3635 3654 3668 3710 3722 3730 3749 3773 3807 3814 3816 3834 3847 3848 3853 3859 3864 3865 3874 3879 3893 3909 3927 3929 3938 3959 3963 3992 4000 4013 4026 4029 4030 4031 4036 4063 4070 4075 4099 4106 4107 4135 4148 4149 4152 4160 4172 4185 4189 4196 4210 4243 4245 4247 4248 4274 4282 4291 4295 4299 4309 4312 4316 4323 4330 4340 4342 4344 122 227 GACACG/CGTGTC 0 -3 664 711 2 -18.2 2 19 28 31 33 50 57 58 59 60 62 71 74 76 79 80 81 88 93 97 101 102 104 106 110 112 113 122 124 125 127 129 131 134 136 139 141 143 147 153 154 157 163 166 169 171 180 191 197 199 207 208 212 218 220 223 226 228 229 232 234 241 247 253 258 274 275 279 281 287 289 295 303 311 320 323 325 328 329 331 334 337 347 356 357 358 364 367 368 375 376 387 391 393 394 400 415 419 420 423 424 427 435 437 438 443 447 452 459 461 462 469 471 476 479 482 484 485 487 507 508 513 514 516 517 533 535 538 544 548 550 556 560 563 564 567 576 578 580 581 584 588 590 595 597 601 612 616 619 622 623 625 633 636 637 638 642 643 646 658 670 677 684 686 693 694 700 707 712 713 720 731 735 744 745 747 753 755 759 760 764 773 774 780 782 795 799 800 801 805 808 814 817 818 819 852 854 861 862 871 874 876 878 884 890 897 900 918 919 922 923 925 933 936 945 951 956 962 964 967 968 970 979 982 983 989 992 1001 1014 1017 1020 1027 1029 1038 1045 1046 1048 1052 1053 1057 1059 1061 1069 1070 1071 1075 1077 1082 1093 1094 1095 1099 1102 1116 1123 1145 1146 1153 1155 1159 1163 1167 1172 1175 1176 1187 1190 1195 1199 1206 1212 1216 1237 1239 1241 1250 1255 1267 1268 1272 1276 1291 1292 1298 1301 1302 1303 1305 1307 1316 1318 1319 1320 1322 1323 1327 1331 1340 1360 1373 1378 1379 1382 1383 1390 1394 1395 1402 1421 1426 1427 1436 1437 1439 1442 1450 1455 1464 1472 1473 1474 1490 1496 1497 1508 1509 1530 1549 1551 1561 1576 1577 1578 1579 1590 1593 1603 1607 1609 1613 1616 1620 1640 1648 1653 1658 1669 1670 1675 1677 1680 1714 1728 1729 1735 1745 1752 1754 1761 1768 1780 1785 1797 1813 1815 1816 1819 1823 1831 1842 1855 1856 1857 1867 1873 1878 1886 1887 1888 1896 1902 1914 1915 1918 1929 1936 1968 1971 1978 1986 1993 1995 2005 2011 2015 2017 2018 2030 2033 2042 2045 2050 2066 2074 2079 2083 2087 2090 2092 2100 2109 2114 2116 2118 2125 2127 2139 2166 2183 2203 2219 2228 2231 2237 2258 2263 2265 2271 2305 2306 2308 2313 2324 2331 2335 2342 2353 2355 2356 2364 2365 2368 2377 2382 2383 2385 2393 2395 2396 2432 2439 2445 2446 2455 2457 2459 2474 2486 2493 2496 2497 2505 2507 2511 2512 2521 2534 2536 2546 2558 2561 2564 2566 2569 2571 2581 2586 2594 2595 2596 2603 2609 2616 2617 2623 2625 2631 2633 2635 2644 2672 2675 2687 2694 2712 2717 2725 2728 2742 2746 2752 2756 2761 2762 2763 2767 2771 2772 2775 2803 2831 2832 2841 2842 2843 2847 2851 2860 2864 2870 2871 2876 2889 2919 2925 2927 2931 2946 2951 2981 2983 2993 3011 3045 3049 3057 3071 3092 3105 3117 3123 3130 3138 3141 3147 3168 3171 3186 3190 3202 3208 3217 3223 3229 3239 3246 3264 3274 3275 3280 3287 3300 3301 3305 3321 3329 3333 3340 3345 3351 3355 3363 3368 3369 3378 3382 3393 3408 3413 3415 3417 3431 3445 3462 3464 3467 3485 3497 3500 3501 3529 3534 3537 3551 3557 3570 3573 3587 3601 3647 3653 3657 3659 3664 3675 3722 3727 3748 3759 3777 3779 3794 3799 3801 3816 3844 3863 3868 3874 3876 3879 3900 3904 3929 3930 3933 3943 3963 3977 3989 3991 4000 4031 4034 4036 4058 4075 4089 4093 4094 4098 4099 4121 4129 4149 4153 4182 4189 4196 4206 4214 4225 4234 4235 4248 4254 4289 4291 4300 4307 4309 4319 4331 4340 207 240 CGTGTC/GACACG 1 -4 664 711 2 -18.2 2 19 28 31 33 50 57 58 59 60 62 71 74 76 79 80 81 88 93 97 101 102 104 106 110 112 113 122 124 125 127 129 131 134 136 139 141 143 147 153 154 157 163 166 169 171 180 191 197 199 207 208 212 218 220 223 226 228 229 232 234 241 247 253 258 274 275 279 281 287 289 295 303 311 320 323 325 328 329 331 334 337 347 356 357 358 364 367 368 375 376 387 391 393 394 400 415 419 420 423 424 427 435 437 438 443 447 452 459 461 462 469 471 476 479 482 484 485 487 507 508 513 514 516 517 533 535 538 544 548 550 556 560 563 564 567 576 578 580 581 584 588 590 595 597 601 612 616 619 622 623 625 633 636 637 638 642 643 646 658 670 677 684 686 693 694 700 707 712 713 720 731 735 744 745 747 753 755 759 760 764 773 774 780 782 795 799 800 801 805 808 814 817 818 819 852 854 861 862 871 874 876 878 884 890 897 900 918 919 922 923 925 933 936 945 951 956 962 964 967 968 970 979 982 983 989 992 1001 1014 1017 1020 1027 1029 1038 1045 1046 1048 1052 1053 1057 1059 1061 1069 1070 1071 1075 1077 1082 1093 1094 1095 1099 1102 1116 1123 1145 1146 1153 1155 1159 1163 1167 1172 1175 1176 1187 1190 1195 1199 1206 1212 1216 1237 1239 1241 1250 1255 1267 1268 1272 1276 1291 1292 1298 1301 1302 1303 1305 1307 1316 1318 1319 1320 1322 1323 1327 1331 1340 1360 1373 1378 1379 1382 1383 1390 1394 1395 1402 1421 1426 1427 1436 1437 1439 1442 1450 1455 1464 1472 1473 1474 1490 1496 1497 1508 1509 1530 1549 1551 1561 1576 1577 1578 1579 1590 1593 1603 1607 1609 1613 1616 1620 1640 1648 1653 1658 1669 1670 1675 1677 1680 1714 1728 1729 1735 1745 1752 1754 1761 1768 1780 1785 1797 1813 1815 1816 1819 1823 1831 1842 1855 1856 1857 1867 1873 1878 1886 1887 1888 1896 1902 1914 1915 1918 1929 1936 1968 1971 1978 1986 1993 1995 2005 2011 2015 2017 2018 2030 2033 2042 2045 2050 2066 2074 2079 2083 2087 2090 2092 2100 2109 2114 2116 2118 2125 2127 2139 2166 2183 2203 2219 2228 2231 2237 2258 2263 2265 2271 2305 2306 2308 2313 2324 2331 2335 2342 2353 2355 2356 2364 2365 2368 2377 2382 2383 2385 2393 2395 2396 2432 2439 2445 2446 2455 2457 2459 2474 2486 2493 2496 2497 2505 2507 2511 2512 2521 2534 2536 2546 2558 2561 2564 2566 2569 2571 2581 2586 2594 2595 2596 2603 2609 2616 2617 2623 2625 2631 2633 2635 2644 2672 2675 2687 2694 2712 2717 2725 2728 2742 2746 2752 2756 2761 2762 2763 2767 2771 2772 2775 2803 2831 2832 2841 2842 2843 2847 2851 2860 2864 2870 2871 2876 2889 2919 2925 2927 2931 2946 2951 2981 2983 2993 3011 3045 3049 3057 3071 3092 3105 3117 3123 3130 3138 3141 3147 3168 3171 3186 3190 3202 3208 3217 3223 3229 3239 3246 3264 3274 3275 3280 3287 3300 3301 3305 3321 3329 3333 3340 3345 3351 3355 3363 3368 3369 3378 3382 3393 3408 3413 3415 3417 3431 3445 3462 3464 3467 3485 3497 3500 3501 3529 3534 3537 3551 3557 3570 3573 3587 3601 3647 3653 3657 3659 3664 3675 3722 3727 3748 3759 3777 3779 3794 3799 3801 3816 3844 3863 3868 3874 3876 3879 3900 3904 3929 3930 3933 3943 3963 3977 3989 3991 4000 4031 4034 4036 4058 4075 4089 4093 4094 4098 4099 4121 4129 4149 4153 4182 4189 4196 4206 4214 4225 4234 4235 4248 4254 4289 4291 4300 4307 4309 4319 4331 4340 207 240 GCCACG/CGTGGC 0 -3 597 652 0 -18.1 0 3 8 11 19 22 26 29 31 35 37 40 44 53 55 56 60 61 63 64 70 73 77 79 83 87 88 90 95 108 110 116 120 123 127 128 137 138 139 141 146 148 149 152 153 160 174 176 183 187 197 198 212 214 215 225 226 234 237 239 242 244 245 246 253 254 255 261 266 268 277 281 283 285 286 299 309 310 315 323 325 328 331 335 336 343 348 356 357 363 374 375 376 385 386 389 392 399 401 406 407 408 411 416 426 428 432 433 434 439 441 444 449 454 456 465 485 489 491 492 493 497 498 516 517 520 521 522 527 529 531 533 540 552 554 557 558 559 561 562 574 576 577 581 591 592 599 600 605 611 613 614 618 620 624 628 629 635 643 651 663 669 671 674 683 685 705 713 721 725 736 737 745 748 767 773 775 779 785 786 788 790 796 811 824 825 828 838 839 845 853 857 863 867 888 893 904 914 918 941 947 950 952 960 965 973 980 983 986 996 999 1009 1010 1012 1021 1036 1037 1039 1060 1095 1097 1109 1111 1120 1124 1129 1142 1152 1153 1168 1169 1173 1183 1190 1201 1206 1210 1212 1213 1215 1217 1220 1222 1231 1254 1256 1258 1259 1260 1274 1275 1289 1292 1297 1309 1318 1321 1330 1333 1335 1342 1347 1353 1354 1361 1364 1371 1383 1389 1395 1398 1402 1406 1413 1432 1460 1461 1475 1482 1487 1488 1502 1518 1522 1523 1529 1555 1580 1583 1584 1596 1604 1627 1628 1631 1632 1655 1667 1671 1674 1686 1692 1699 1701 1703 1709 1715 1719 1720 1721 1722 1723 1725 1737 1740 1746 1760 1765 1769 1771 1793 1813 1824 1832 1833 1844 1864 1893 1902 1904 1905 1909 1920 1925 1949 1968 1979 1985 1992 2001 2007 2012 2040 2043 2050 2051 2056 2069 2075 2077 2081 2096 2105 2132 2145 2152 2156 2157 2166 2171 2177 2181 2191 2194 2198 2202 2206 2212 2218 2230 2258 2263 2271 2278 2279 2283 2284 2290 2302 2308 2317 2320 2326 2334 2340 2367 2370 2374 2377 2393 2398 2417 2418 2422 2426 2453 2461 2468 2478 2492 2526 2532 2539 2552 2555 2571 2584 2594 2596 2623 2627 2628 2636 2637 2638 2647 2652 2661 2680 2683 2689 2707 2713 2725 2730 2732 2744 2754 2770 2786 2801 2806 2817 2831 2836 2856 2860 2886 2891 2904 2906 2907 2910 2918 2926 2928 2929 2940 2956 2974 2985 2986 2988 2989 2990 2995 3018 3023 3025 3029 3031 3036 3037 3043 3044 3081 3093 3098 3119 3124 3133 3140 3148 3160 3164 3177 3182 3185 3187 3201 3203 3215 3227 3233 3269 3272 3276 3277 3281 3290 3293 3306 3308 3322 3344 3364 3366 3380 3382 3387 3388 3392 3407 3421 3422 3423 3427 3432 3434 3448 3452 3454 3456 3472 3474 3479 3482 3487 3488 3489 3492 3493 3503 3522 3541 3547 3612 3614 3623 3631 3634 3640 3655 3662 3663 3676 3677 3717 3718 3720 3729 3730 3735 3741 3761 3773 3792 3793 3806 3807 3813 3819 3829 3833 3846 3848 3853 3868 3896 3916 3923 3926 3934 3939 3942 3969 3981 3993 3994 3995 3997 4004 4047 4065 4066 4078 4099 4107 4114 4117 4137 4141 4189 4195 4223 4242 4246 4268 4274 4295 4300 4309 4314 4317 4320 4336 4344 -1 CGTGGC/GCCACG 1 -4 597 652 0 -18.1 0 3 8 11 19 22 26 29 31 35 37 40 44 53 55 56 60 61 63 64 70 73 77 79 83 87 88 90 95 108 110 116 120 123 127 128 137 138 139 141 146 148 149 152 153 160 174 176 183 187 197 198 212 214 215 225 226 234 237 239 242 244 245 246 253 254 255 261 266 268 277 281 283 285 286 299 309 310 315 323 325 328 331 335 336 343 348 356 357 363 374 375 376 385 386 389 392 399 401 406 407 408 411 416 426 428 432 433 434 439 441 444 449 454 456 465 485 489 491 492 493 497 498 516 517 520 521 522 527 529 531 533 540 552 554 557 558 559 561 562 574 576 577 581 591 592 599 600 605 611 613 614 618 620 624 628 629 635 643 651 663 669 671 674 683 685 705 713 721 725 736 737 745 748 767 773 775 779 785 786 788 790 796 811 824 825 828 838 839 845 853 857 863 867 888 893 904 914 918 941 947 950 952 960 965 973 980 983 986 996 999 1009 1010 1012 1021 1036 1037 1039 1060 1095 1097 1109 1111 1120 1124 1129 1142 1152 1153 1168 1169 1173 1183 1190 1201 1206 1210 1212 1213 1215 1217 1220 1222 1231 1254 1256 1258 1259 1260 1274 1275 1289 1292 1297 1309 1318 1321 1330 1333 1335 1342 1347 1353 1354 1361 1364 1371 1383 1389 1395 1398 1402 1406 1413 1432 1460 1461 1475 1482 1487 1488 1502 1518 1522 1523 1529 1555 1580 1583 1584 1596 1604 1627 1628 1631 1632 1655 1667 1671 1674 1686 1692 1699 1701 1703 1709 1715 1719 1720 1721 1722 1723 1725 1737 1740 1746 1760 1765 1769 1771 1793 1813 1824 1832 1833 1844 1864 1893 1902 1904 1905 1909 1920 1925 1949 1968 1979 1985 1992 2001 2007 2012 2040 2043 2050 2051 2056 2069 2075 2077 2081 2096 2105 2132 2145 2152 2156 2157 2166 2171 2177 2181 2191 2194 2198 2202 2206 2212 2218 2230 2258 2263 2271 2278 2279 2283 2284 2290 2302 2308 2317 2320 2326 2334 2340 2367 2370 2374 2377 2393 2398 2417 2418 2422 2426 2453 2461 2468 2478 2492 2526 2532 2539 2552 2555 2571 2584 2594 2596 2623 2627 2628 2636 2637 2638 2647 2652 2661 2680 2683 2689 2707 2713 2725 2730 2732 2744 2754 2770 2786 2801 2806 2817 2831 2836 2856 2860 2886 2891 2904 2906 2907 2910 2918 2926 2928 2929 2940 2956 2974 2985 2986 2988 2989 2990 2995 3018 3023 3025 3029 3031 3036 3037 3043 3044 3081 3093 3098 3119 3124 3133 3140 3148 3160 3164 3177 3182 3185 3187 3201 3203 3215 3227 3233 3269 3272 3276 3277 3281 3290 3293 3306 3308 3322 3344 3364 3366 3380 3382 3387 3388 3392 3407 3421 3422 3423 3427 3432 3434 3448 3452 3454 3456 3472 3474 3479 3482 3487 3488 3489 3492 3493 3503 3522 3541 3547 3612 3614 3623 3631 3634 3640 3655 3662 3663 3676 3677 3717 3718 3720 3729 3730 3735 3741 3761 3773 3792 3793 3806 3807 3813 3819 3829 3833 3846 3848 3853 3868 3896 3916 3923 3926 3934 3939 3942 3969 3981 3993 3994 3995 3997 4004 4047 4065 4066 4078 4099 4107 4114 4117 4137 4141 4189 4195 4223 4242 4246 4268 4274 4295 4300 4309 4314 4317 4320 4336 4344 -1 TCACGT/ACGTGA 0 -2 629 629 5 -12.2 5 22 29 38 48 57 59 65 66 67 72 80 84 85 88 90 99 105 107 115 121 131 134 137 144 146 163 167 173 194 206 214 221 222 227 229 236 239 258 261 262 264 268 269 286 288 298 299 310 317 322 334 338 341 344 346 350 358 359 374 380 383 386 398 400 402 404 409 412 422 441 453 461 481 483 488 491 495 500 536 538 539 540 546 549 553 555 562 565 572 580 585 598 599 602 614 616 617 632 642 645 652 659 666 671 678 681 687 690 696 712 715 718 723 724 728 730 739 743 747 749 754 758 760 762 767 774 776 779 780 792 796 798 816 819 822 825 835 837 838 841 853 859 863 866 868 877 882 885 886 908 911 919 934 936 952 956 973 977 982 990 991 995 1000 1004 1014 1024 1051 1062 1074 1104 1119 1121 1122 1123 1125 1131 1135 1140 1161 1163 1167 1194 1198 1200 1212 1221 1225 1229 1230 1239 1249 1250 1256 1267 1273 1278 1280 1284 1293 1294 1295 1304 1308 1311 1314 1322 1325 1334 1350 1355 1356 1360 1367 1370 1373 1381 1383 1408 1417 1430 1431 1434 1448 1452 1455 1467 1469 1470 1475 1483 1492 1504 1510 1516 1517 1524 1526 1540 1545 1573 1581 1589 1598 1599 1607 1620 1626 1629 1633 1636 1652 1661 1668 1669 1676 1692 1693 1696 1705 1708 1709 1719 1723 1732 1751 1752 1755 1767 1774 1786 1789 1790 1806 1816 1817 1820 1837 1843 1862 1867 1877 1880 1898 1901 1906 1908 1916 1920 1922 1934 1939 1947 1951 1955 1976 1984 1988 1991 1992 1995 2014 2024 2028 2042 2044 2052 2055 2062 2070 2078 2089 2090 2094 2101 2110 2111 2123 2133 2140 2150 2159 2164 2167 2169 2183 2207 2216 2225 2230 2233 2243 2246 2253 2257 2272 2273 2283 2285 2299 2307 2313 2328 2338 2345 2371 2376 2379 2380 2381 2388 2391 2400 2408 2419 2421 2432 2434 2435 2436 2440 2467 2469 2481 2488 2490 2492 2497 2498 2503 2510 2519 2533 2534 2543 2548 2550 2551 2553 2561 2568 2570 2572 2576 2579 2590 2602 2621 2624 2634 2639 2658 2667 2668 2671 2681 2686 2688 2690 2693 2694 2702 2703 2709 2711 2718 2721 2725 2734 2757 2777 2783 2784 2789 2792 2797 2799 2801 2805 2813 2829 2830 2835 2836 2837 2840 2843 2852 2853 2858 2873 2874 2878 2880 2882 2891 2894 2902 2906 2908 2912 2915 2916 2921 2930 2935 2942 2945 2947 2950 2954 2973 2983 2984 2992 3000 3013 3016 3022 3024 3030 3036 3040 3050 3052 3058 3061 3062 3082 3108 3109 3130 3133 3152 3165 3189 3205 3220 3222 3231 3234 3245 3248 3252 3255 3265 3271 3296 3307 3309 3320 3325 3332 3337 3348 3369 3372 3374 3382 3383 3385 3398 3406 3407 3414 3437 3440 3442 3454 3475 3477 3491 3492 3494 3518 3527 3535 3538 3539 3543 3562 3568 3572 3574 3583 3589 3591 3599 3602 3616 3622 3625 3632 3633 3634 3635 3654 3656 3667 3694 3706 3710 3716 3734 3739 3746 3749 3763 3773 3781 3784 3796 3797 3808 3831 3834 3848 3856 3859 3864 3873 3889 3893 3909 3910 3924 3927 3929 3946 3951 3952 3972 3996 3999 4011 4013 4023 4030 4035 4036 4039 4043 4064 4070 4076 4103 4106 4119 4133 4147 4149 4152 4159 4174 4180 4188 4194 4199 4202 4215 4218 4220 4226 4241 4243 4245 4247 4252 4255 4258 4261 4269 4279 4282 4286 4289 4291 4292 4295 4299 4310 4312 4316 4323 4324 4338 4339 4342 4345 11 122 152 155 168 GTGTCA/TGACAC 1 -3 625 629 6 -11.3 7 18 25 33 55 76 81 85 88 99 101 102 104 110 124 125 127 136 143 157 166 169 171 179 180 197 199 206 207 208 217 223 228 230 232 233 234 240 247 248 256 275 287 289 295 308 318 320 325 331 334 337 340 344 349 356 358 360 364 367 368 369 376 392 396 397 417 419 420 437 438 440 459 461 462 463 469 495 509 532 533 535 538 550 560 561 570 576 579 587 588 593 601 602 610 612 615 619 621 633 638 640 642 675 677 686 693 700 704 707 710 712 720 731 732 735 745 747 755 764 777 804 813 814 817 823 849 851 855 874 876 887 890 918 923 951 953 956 958 964 968 975 979 982 1001 1014 1020 1027 1042 1045 1048 1052 1057 1065 1066 1082 1086 1090 1093 1095 1100 1102 1107 1116 1123 1133 1136 1140 1141 1146 1153 1155 1159 1163 1167 1168 1171 1181 1182 1185 1212 1228 1237 1238 1239 1244 1250 1255 1258 1261 1265 1267 1268 1271 1272 1273 1289 1292 1293 1296 1298 1300 1307 1313 1314 1318 1320 1326 1331 1340 1363 1371 1374 1385 1393 1394 1405 1413 1420 1437 1446 1450 1455 1456 1462 1465 1474 1490 1508 1512 1513 1548 1550 1561 1568 1573 1586 1603 1611 1613 1616 1620 1640 1648 1667 1673 1678 1687 1689 1712 1728 1729 1739 1743 1745 1748 1761 1762 1766 1768 1771 1776 1777 1778 1790 1798 1799 1802 1815 1816 1821 1829 1842 1846 1852 1855 1856 1857 1859 1867 1873 1874 1878 1886 1887 1888 1889 1896 1900 1914 1915 1923 1925 1936 1940 1957 1970 1975 1986 1997 2000 2008 2011 2027 2029 2032 2033 2035 2037 2043 2044 2048 2050 2064 2074 2082 2083 2090 2092 2100 2108 2116 2124 2139 2143 2146 2166 2169 2172 2173 2177 2186 2189 2190 2206 2209 2213 2223 2228 2231 2241 2249 2256 2258 2260 2263 2264 2280 2281 2289 2298 2313 2330 2331 2353 2356 2357 2364 2365 2366 2385 2397 2399 2403 2420 2423 2439 2442 2444 2449 2460 2474 2482 2496 2507 2511 2513 2514 2517 2520 2534 2545 2558 2561 2564 2565 2569 2574 2593 2599 2608 2609 2617 2619 2623 2626 2635 2644 2651 2660 2662 2673 2675 2695 2701 2712 2727 2733 2736 2742 2749 2750 2752 2753 2756 2759 2761 2763 2767 2780 2796 2801 2803 2807 2818 2822 2826 2831 2838 2842 2851 2855 2864 2870 2887 2899 2918 2925 2927 2932 2937 2946 2973 2982 2983 2987 2998 3002 3010 3011 3013 3027 3038 3039 3041 3045 3071 3074 3078 3087 3099 3102 3110 3113 3117 3120 3125 3131 3135 3136 3144 3149 3158 3171 3174 3175 3186 3194 3202 3217 3221 3223 3261 3263 3270 3274 3275 3291 3292 3294 3295 3301 3302 3333 3341 3345 3369 3371 3405 3412 3413 3415 3424 3430 3436 3450 3451 3464 3466 3485 3499 3505 3507 3528 3529 3534 3549 3551 3557 3571 3573 3594 3603 3619 3626 3639 3648 3665 3683 3687 3689 3695 3712 3722 3728 3733 3757 3759 3778 3779 3783 3785 3787 3790 3803 3809 3816 3818 3823 3835 3840 3842 3850 3851 3863 3874 3878 3881 3886 3894 3895 3904 3908 3913 3915 3917 3922 3930 3931 3933 3941 3943 3949 3954 3958 3962 3963 3967 3977 3985 3991 4002 4003 4010 4020 4021 4022 4025 4027 4037 4041 4045 4052 4058 4061 4067 4084 4087 4093 4095 4099 4104 4113 4118 4124 4129 4139 4154 4168 4190 4196 4197 4203 4225 4227 4240 4250 4256 4259 4285 4287 4289 4304 4315 4327 62 97 176 207 252 262 CACGTT/AACGTG 0 -1 555 544 5 -10.0 0 9 28 45 48 51 64 75 80 83 84 92 100 103 121 123 141 142 145 148 167 185 195 200 210 211 221 254 288 298 302 306 332 342 343 353 362 370 373 374 384 422 429 447 448 452 460 461 491 493 498 503 510 529 538 539 543 558 602 609 610 618 622 628 643 648 649 650 666 678 681 688 690 696 713 718 727 743 746 748 749 756 760 781 795 800 801 822 827 834 835 836 838 845 853 858 859 865 879 885 890 911 914 917 920 932 949 957 960 973 983 994 1001 1005 1007 1014 1027 1061 1071 1074 1076 1077 1084 1091 1096 1104 1121 1137 1138 1166 1173 1181 1184 1198 1205 1212 1256 1266 1273 1279 1283 1290 1298 1304 1305 1308 1310 1327 1329 1332 1339 1342 1346 1349 1355 1356 1357 1359 1367 1368 1369 1370 1375 1381 1399 1410 1415 1417 1427 1431 1434 1447 1454 1470 1471 1475 1483 1486 1498 1499 1516 1519 1525 1534 1540 1554 1563 1573 1574 1575 1581 1584 1588 1592 1593 1608 1661 1663 1668 1672 1676 1677 1678 1683 1700 1704 1707 1725 1744 1755 1756 1761 1779 1781 1783 1786 1787 1803 1806 1820 1843 1846 1848 1867 1870 1896 1921 1925 1931 1939 1945 1952 1954 1969 1972 1974 1976 1983 1992 1993 1994 1995 2004 2005 2006 2013 2015 2024 2033 2034 2062 2070 2077 2080 2081 2085 2107 2111 2118 2120 2123 2133 2134 2140 2145 2169 2171 2179 2181 2191 2198 2205 2206 2211 2212 2214 2216 2231 2235 2244 2245 2251 2255 2258 2282 2286 2292 2293 2299 2301 2304 2305 2307 2315 2326 2350 2360 2364 2367 2369 2379 2380 2381 2384 2388 2389 2391 2393 2408 2419 2434 2441 2450 2457 2459 2466 2469 2471 2488 2497 2519 2522 2531 2543 2548 2551 2556 2561 2563 2576 2579 2580 2609 2610 2621 2642 2678 2690 2693 2704 2706 2708 2726 2731 2744 2748 2755 2757 2773 2777 2786 2788 2789 2792 2793 2804 2805 2816 2819 2834 2867 2874 2894 2896 2908 2915 2916 2923 2935 2945 2956 2960 2974 2984 3006 3016 3022 3024 3029 3042 3050 3058 3066 3068 3083 3085 3088 3090 3104 3114 3117 3119 3142 3145 3148 3154 3155 3165 3166 3167 3178 3195 3196 3209 3226 3230 3234 3238 3241 3247 3252 3265 3300 3309 3314 3321 3325 3328 3329 3331 3342 3343 3350 3352 3355 3356 3361 3369 3374 3377 3382 3385 3386 3391 3394 3396 3398 3404 3409 3410 3432 3438 3440 3452 3453 3458 3461 3475 3491 3492 3508 3518 3521 3539 3543 3560 3562 3568 3573 3580 3583 3587 3588 3591 3593 3599 3604 3615 3616 3619 3631 3633 3641 3650 3654 3675 3678 3682 3684 3686 3696 3703 3707 3719 3720 3734 3742 3744 3746 3754 3762 3763 3788 3789 3797 3808 3822 3854 3863 3867 3869 3880 3889 3904 3910 3924 3926 3937 3946 3952 3960 3966 3974 3995 3996 3999 4003 4023 4032 4039 4051 4060 4077 4088 4099 4103 4122 4131 4163 4174 4180 4181 4184 4188 4202 4218 4238 4239 4253 4255 4258 4261 4280 4281 4292 4300 4306 4308 4310 4311 4313 4319 4324 4339 4341 8 11 105 132 168 GTGGCA/TGCCAC 1 -3 535 544 1 -14.9 6 8 19 37 39 44 60 61 64 73 79 81 83 88 94 96 108 119 120 123 128 138 141 148 149 152 153 158 160 162 174 175 183 225 231 246 257 258 263 266 282 286 293 296 309 310 312 321 323 328 335 336 341 348 354 357 363 371 374 375 385 401 411 426 433 439 441 454 456 467 491 492 497 511 516 517 522 525 533 540 545 558 571 574 576 582 591 599 605 614 624 628 635 651 656 669 676 680 701 719 721 725 737 748 750 775 785 786 788 790 824 825 828 838 839 845 853 857 863 867 872 888 893 899 912 914 926 940 943 948 950 967 973 980 983 985 986 996 1009 1042 1060 1064 1078 1080 1095 1098 1106 1109 1111 1113 1117 1120 1131 1139 1142 1150 1153 1164 1168 1169 1173 1183 1202 1206 1210 1212 1214 1215 1217 1232 1235 1243 1256 1258 1264 1289 1297 1299 1309 1321 1324 1328 1333 1335 1347 1351 1364 1383 1389 1398 1409 1411 1432 1435 1440 1451 1463 1478 1489 1509 1514 1521 1522 1523 1525 1549 1584 1596 1602 1604 1622 1624 1627 1628 1635 1647 1649 1655 1659 1665 1667 1671 1674 1686 1692 1695 1700 1709 1715 1717 1720 1723 1724 1736 1740 1759 1784 1814 1824 1832 1835 1841 1844 1853 1860 1862 1875 1887 1891 1895 1902 1909 1926 1949 1968 1979 1982 1985 1992 1996 2001 2007 2012 2038 2077 2093 2095 2105 2112 2113 2151 2156 2177 2181 2192 2195 2198 2206 2226 2236 2250 2263 2271 2272 2290 2302 2307 2308 2311 2312 2314 2316 2320 2323 2326 2334 2373 2387 2398 2402 2415 2416 2422 2424 2443 2449 2458 2459 2465 2478 2480 2481 2487 2492 2499 2527 2529 2530 2549 2555 2557 2560 2571 2578 2596 2607 2614 2618 2623 2630 2645 2647 2648 2655 2656 2683 2684 2689 2696 2699 2707 2710 2716 2730 2731 2732 2754 2760 2769 2781 2786 2801 2806 2807 2809 2824 2839 2841 2843 2844 2860 2868 2886 2907 2911 2928 2936 2938 2949 2957 2959 2977 2990 2995 2996 3005 3014 3025 3026 3029 3036 3051 3064 3065 3075 3080 3116 3118 3124 3127 3128 3147 3170 3179 3188 3210 3211 3213 3216 3224 3229 3233 3250 3257 3277 3282 3292 3293 3300 3306 3324 3336 3364 3366 3373 3380 3386 3390 3400 3407 3419 3421 3422 3423 3434 3441 3454 3460 3472 3476 3479 3482 3483 3484 3487 3493 3495 3502 3503 3517 3519 3524 3526 3547 3565 3567 3595 3605 3614 3623 3624 3629 3631 3640 3652 3673 3680 3693 3707 3717 3720 3729 3743 3752 3766 3771 3774 3776 3791 3792 3800 3804 3805 3810 3813 3829 3871 3875 3877 3897 3898 3919 3923 3940 3945 3950 3979 3981 4016 4018 4024 4040 4047 4048 4055 4062 4072 4073 4078 4081 4091 4092 4096 4102 4107 4114 4117 4138 4143 4175 4183 4186 4189 4192 4196 4209 4217 4223 4233 4242 4264 4270 4271 4272 4284 4292 4296 4297 4309 4317 4325 4326 4328 4329 4344 176 TACACG/CGTGTA 0 -3 529 536 2 -13.1 20 29 34 41 54 61 68 69 80 81 88 97 100 103 110 132 133 136 140 141 143 150 155 166 170 174 177 180 186 195 201 202 210 222 224 225 233 235 241 244 260 261 262 264 276 277 284 294 298 299 309 313 316 319 326 332 333 366 378 395 402 404 405 406 420 425 435 437 438 446 451 469 472 473 477 494 503 505 522 537 539 543 551 560 561 577 588 596 599 605 607 624 637 641 642 651 655 658 659 663 664 689 691 692 720 723 729 737 741 742 778 783 786 828 829 832 839 860 861 862 864 878 886 894 901 902 903 919 920 927 946 950 957 964 979 981 983 986 995 1002 1010 1032 1037 1039 1050 1051 1068 1069 1071 1081 1084 1089 1096 1099 1111 1137 1149 1154 1155 1156 1160 1170 1176 1177 1193 1204 1209 1210 1222 1236 1240 1251 1262 1266 1272 1273 1274 1275 1279 1285 1289 1310 1332 1337 1343 1346 1384 1388 1392 1401 1407 1416 1422 1426 1428 1429 1455 1471 1489 1499 1511 1527 1536 1541 1542 1546 1552 1554 1556 1562 1571 1575 1577 1590 1605 1609 1617 1631 1641 1650 1675 1684 1722 1726 1733 1740 1741 1744 1753 1754 1773 1783 1788 1801 1803 1808 1810 1812 1816 1821 1825 1827 1828 1842 1844 1863 1866 1879 1882 1885 1893 1897 1899 1901 1910 1924 1943 1946 1963 1971 1974 1980 1989 1990 1991 2006 2011 2023 2060 2072 2076 2085 2091 2104 2119 2129 2130 2139 2144 2160 2163 2166 2170 2176 2179 2181 2184 2187 2205 2210 2215 2224 2238 2245 2258 2261 2265 2274 2277 2293 2300 2315 2318 2321 2322 2329 2337 2356 2362 2384 2386 2389 2400 2401 2404 2407 2412 2438 2463 2464 2483 2504 2511 2515 2517 2518 2521 2535 2537 2546 2556 2557 2559 2576 2582 2591 2600 2601 2603 2610 2613 2622 2644 2652 2670 2682 2706 2708 2712 2721 2731 2745 2758 2766 2773 2799 2801 2802 2812 2821 2826 2833 2841 2850 2863 2884 2885 2901 2911 2923 2925 2933 2943 2952 2958 2963 2972 3008 3021 3029 3033 3034 3038 3062 3067 3072 3084 3090 3091 3097 3106 3111 3117 3134 3156 3158 3168 3181 3207 3209 3213 3232 3249 3256 3284 3286 3288 3296 3297 3304 3312 3315 3317 3322 3331 3332 3334 3336 3339 3349 3353 3358 3362 3365 3386 3397 3409 3411 3425 3427 3429 3443 3445 3459 3463 3468 3506 3508 3509 3518 3523 3546 3554 3555 3560 3563 3576 3577 3584 3588 3602 3609 3610 3623 3636 3642 3660 3690 3691 3697 3707 3713 3715 3717 3722 3738 3744 3770 3779 3789 3807 3824 3825 3827 3837 3838 3858 3865 3868 3872 3882 3889 3918 3959 3963 3971 3974 4003 4009 4025 4030 4042 4054 4056 4057 4085 4086 4105 4112 4116 4125 4126 4127 4135 4139 4142 4146 4150 4160 4171 4201 4204 4222 4236 4248 4260 4262 4263 4266 4274 4283 4301 4306 4308 4311 4318 4320 4334 4337 15 132 CACGTC/GACGTG 0 -1 489 510 4 -10.1 3 11 21 22 23 35 37 43 57 62 65 70 73 80 102 114 119 123 124 129 133 138 150 155 157 158 164 171 182 188 203 204 207 215 222 232 237 238 239 241 245 246 260 265 269 274 280 291 305 312 313 315 317 324 327 331 337 344 359 364 375 383 387 388 395 399 405 408 427 431 450 453 468 482 483 489 504 513 521 530 537 538 544 546 548 562 566 588 590 596 600 601 603 612 630 638 646 667 677 688 689 702 705 737 739 755 763 767 770 776 779 789 794 803 807 808 811 814 816 837 838 841 853 866 875 877 893 895 899 900 910 927 933 938 939 944 946 971 973 983 999 1002 1004 1006 1009 1013 1019 1020 1037 1046 1049 1062 1072 1082 1083 1094 1103 1105 1112 1125 1127 1131 1134 1135 1145 1152 1162 1173 1175 1183 1187 1191 1213 1225 1226 1229 1240 1256 1257 1260 1262 1274 1277 1288 1291 1293 1295 1301 1314 1344 1345 1347 1348 1350 1352 1364 1387 1398 1406 1443 1447 1453 1467 1472 1476 1482 1487 1494 1507 1510 1511 1518 1524 1551 1556 1561 1562 1567 1580 1582 1596 1606 1623 1626 1632 1633 1648 1652 1696 1698 1705 1711 1719 1727 1732 1733 1738 1767 1769 1773 1775 1832 1850 1854 1857 1862 1866 1871 1882 1883 1902 1930 1950 1953 1984 2003 2012 2047 2057 2077 2088 2089 2094 2101 2104 2115 2126 2132 2135 2137 2139 2159 2164 2176 2181 2183 2219 2233 2234 2253 2261 2274 2284 2288 2328 2332 2335 2336 2338 2339 2345 2346 2355 2372 2377 2395 2400 2411 2414 2435 2436 2445 2448 2455 2464 2475 2476 2480 2481 2484 2505 2511 2519 2537 2546 2552 2553 2554 2555 2588 2610 2612 2628 2634 2638 2641 2659 2664 2668 2671 2681 2697 2703 2713 2715 2718 2720 2725 2734 2752 2779 2783 2784 2785 2789 2796 2803 2808 2810 2827 2829 2844 2845 2859 2870 2875 2888 2891 2908 2909 2919 2927 2928 2954 2958 2971 2973 2978 2979 2989 2990 2993 2994 3000 3013 3018 3023 3033 3034 3052 3053 3057 3073 3092 3097 3130 3132 3147 3175 3205 3251 3269 3273 3284 3298 3299 3307 3310 3319 3320 3339 3348 3372 3395 3401 3406 3422 3423 3427 3429 3434 3442 3444 3449 3467 3468 3482 3485 3494 3503 3504 3515 3522 3538 3544 3546 3547 3575 3576 3602 3621 3632 3636 3640 3647 3648 3694 3717 3725 3784 3796 3802 3813 3815 3824 3829 3831 3852 3860 3868 3916 3921 3923 3935 3968 3972 3973 3994 4009 4015 4042 4046 4054 4066 4076 4078 4090 4128 4129 4133 4151 4152 4187 4189 4199 4212 4237 4241 4244 4252 4260 4279 4283 4284 4289 4293 4314 4317 4338 15 87 155 255 CACGTA/TACGTG 0 -1 501 493 4 -9.6 8 20 37 48 53 54 55 59 82 96 106 114 133 135 137 142 155 156 159 168 176 181 184 187 202 220 235 243 249 259 261 264 283 284 295 307 329 341 345 347 350 355 363 366 368 374 377 378 391 400 401 410 412 426 443 446 449 458 468 469 472 492 497 507 514 515 518 526 536 552 553 554 572 579 583 591 592 598 611 629 635 636 641 645 654 668 674 679 692 700 715 717 730 738 744 776 792 796 798 806 820 821 832 850 854 869 888 902 903 905 908 917 924 929 931 935 936 965 972 973 980 984 990 995 1012 1026 1030 1041 1048 1060 1093 1124 1140 1142 1154 1165 1193 1194 1197 1202 1217 1221 1229 1233 1241 1248 1249 1254 1255 1258 1278 1284 1286 1297 1307 1319 1320 1321 1333 1334 1335 1341 1383 1390 1395 1400 1425 1434 1437 1442 1455 1481 1504 1506 1526 1539 1541 1546 1555 1564 1571 1587 1598 1630 1636 1645 1646 1656 1658 1665 1671 1675 1680 1684 1694 1708 1726 1727 1729 1731 1739 1747 1750 1751 1760 1772 1780 1816 1833 1849 1876 1880 1890 1892 1897 1899 1906 1912 1913 1914 1916 1918 1929 1956 1959 1962 1963 1974 1979 1989 1992 1995 2014 2020 2034 2036 2042 2044 2052 2053 2056 2060 2062 2102 2109 2110 2114 2128 2150 2157 2194 2207 2215 2220 2228 2246 2257 2266 2270 2272 2273 2302 2318 2322 2340 2356 2359 2368 2375 2409 2457 2466 2479 2490 2492 2496 2498 2508 2510 2512 2521 2533 2547 2550 2558 2562 2567 2568 2577 2583 2584 2590 2601 2602 2604 2613 2624 2625 2629 2639 2667 2700 2702 2712 2732 2761 2762 2767 2770 2774 2778 2782 2790 2797 2801 2812 2814 2817 2837 2843 2852 2853 2854 2858 2871 2873 2878 2882 2897 2902 2903 2911 2912 2920 2939 2940 2967 2980 2985 2992 3011 3020 3025 3030 3036 3043 3045 3048 3062 3080 3082 3084 3091 3096 3100 3108 3109 3111 3150 3158 3160 3169 3182 3196 3214 3218 3220 3229 3232 3240 3249 3266 3271 3274 3281 3288 3296 3305 3320 3334 3336 3337 3360 3364 3365 3368 3370 3382 3383 3387 3403 3437 3444 3457 3463 3464 3469 3470 3477 3478 3487 3496 3506 3516 3533 3555 3566 3570 3572 3573 3574 3582 3589 3590 3597 3607 3608 3612 3616 3625 3653 3656 3667 3668 3670 3676 3688 3690 3700 3706 3716 3718 3739 3755 3758 3765 3767 3772 3777 3781 3790 3792 3793 3795 3798 3819 3820 3829 3832 3843 3856 3857 3868 3873 3876 3899 3900 3932 3941 3944 3951 3953 3965 3977 3980 3997 4011 4025 4035 4043 4064 4065 4071 4119 4123 4125 4132 4134 4147 4153 4159 4171 4179 4194 4200 4201 4206 4214 4215 4220 4225 4226 4242 4254 4262 4266 4269 4286 4318 4333 4345 0 144 152 209 CAACGT/ACGTTG 0 -2 475 464 2 -11.1 4 14 17 28 32 47 49 51 70 83 91 94 109 118 141 142 148 160 173 185 190 192 194 196 216 241 247 306 347 362 363 366 408 418 422 430 438 490 491 503 506 519 529 534 538 547 552 558 602 606 607 618 628 636 657 666 688 690 696 698 699 713 743 748 756 761 766 797 801 802 816 834 840 842 844 848 860 861 865 891 896 928 949 957 960 979 983 993 998 1001 1005 1035 1038 1056 1061 1063 1077 1096 1108 1110 1114 1138 1139 1144 1148 1150 1170 1174 1188 1192 1203 1205 1218 1219 1224 1234 1247 1282 1283 1298 1305 1332 1342 1356 1357 1369 1373 1376 1386 1391 1403 1407 1414 1415 1431 1433 1439 1441 1451 1457 1458 1468 1477 1479 1486 1491 1502 1527 1533 1579 1584 1588 1592 1610 1621 1629 1642 1643 1644 1660 1663 1666 1672 1678 1688 1705 1706 1713 1718 1719 1731 1744 1763 1801 1809 1811 1840 1846 1861 1865 1867 1870 1907 1911 1917 1919 1921 1926 1941 1949 1950 1954 1956 1958 1961 1964 1966 1969 1974 1977 1987 2006 2010 2019 2021 2026 2031 2041 2048 2051 2054 2062 2067 2071 2086 2111 2117 2122 2123 2131 2143 2145 2154 2156 2158 2162 2188 2198 2199 2206 2208 2216 2217 2229 2231 2239 2247 2248 2252 2255 2260 2265 2269 2272 2275 2287 2293 2294 2295 2303 2319 2333 2347 2348 2350 2354 2361 2363 2364 2385 2393 2408 2410 2413 2441 2452 2459 2462 2472 2495 2573 2585 2586 2615 2640 2642 2649 2685 2698 2723 2731 2735 2757 2766 2776 2786 2787 2791 2792 2800 2801 2816 2823 2861 2869 2872 2879 2893 2894 2896 2907 2908 2913 2944 2956 2960 2964 2970 2986 2999 3006 3007 3012 3032 3035 3042 3050 3055 3056 3058 3070 3083 3085 3086 3112 3114 3119 3122 3142 3146 3155 3157 3161 3162 3165 3166 3187 3192 3219 3225 3228 3234 3238 3245 3247 3252 3259 3265 3278 3279 3323 3326 3330 3336 3338 3352 3355 3359 3374 3381 3385 3389 3404 3433 3440 3447 3453 3455 3465 3475 3480 3481 3487 3492 3494 3498 3511 3513 3520 3521 3523 3525 3530 3531 3536 3540 3545 3553 3555 3566 3569 3573 3577 3580 3594 3598 3610 3611 3616 3637 3638 3641 3650 3651 3654 3658 3672 3675 3679 3696 3710 3711 3720 3721 3722 3732 3744 3747 3762 3764 3775 3780 3786 3821 3826 3828 3849 3854 3855 3857 3862 3866 3880 3885 3891 3901 3928 3954 3955 3956 3957 3961 3966 3984 3990 3996 4001 4048 4051 4079 4097 4111 4127 4130 4134 4139 4167 4170 4173 4193 4194 4202 4208 4211 4214 4218 4224 4239 4267 4288 4292 4306 4313 4322 4324 8 168 ACGTCA/TGACGT 0 0 375 401 2 -9.4 3 13 21 22 23 32 35 37 43 49 62 65 73 81 86 88 121 129 138 158 164 171 173 182 188 204 207 208 211 215 216 222 235 237 239 241 245 246 254 265 274 280 283 291 305 313 315 317 327 329 331 344 352 359 360 364 368 372 387 388 399 427 450 482 489 490 504 521 530 537 538 544 546 548 566 582 588 590 596 597 600 601 612 646 657 665 667 672 689 706 710 729 737 739 763 765 767 770 771 772 783 807 808 809 811 814 816 823 838 841 842 848 853 860 866 875 876 891 927 939 971 973 977 999 1002 1009 1013 1035 1037 1046 1062 1072 1082 1094 1101 1103 1105 1112 1125 1135 1145 1152 1173 1175 1183 1187 1191 1192 1226 1229 1246 1256 1257 1262 1267 1274 1288 1291 1301 1310 1316 1323 1344 1345 1347 1364 1386 1391 1403 1406 1433 1451 1467 1487 1504 1507 1511 1518 1526 1551 1556 1561 1567 1580 1606 1629 1632 1684 1698 1705 1709 1727 1732 1738 1767 1769 1775 1787 1809 1832 1840 1844 1854 1871 1883 1902 1919 1950 1965 2002 2003 2009 2012 2077 2086 2094 2104 2115 2126 2132 2137 2138 2139 2169 2183 2199 2219 2233 2261 2266 2274 2284 2294 2304 2325 2335 2338 2345 2354 2355 2361 2363 2372 2391 2395 2398 2411 2445 2455 2472 2481 2505 2511 2522 2537 2544 2546 2552 2585 2588 2589 2605 2610 2612 2615 2628 2640 2642 2671 2681 2697 2700 2710 2720 2722 2735 2740 2743 2752 2757 2784 2785 2810 2812 2844 2845 2863 2870 2874 2875 2893 2919 2928 2954 2958 2984 2989 2993 2994 3000 3018 3034 3055 3057 3097 3147 3163 3199 3215 3228 3234 3270 3273 3284 3285 3298 3310 3313 3320 3326 3359 3420 3422 3423 3434 3444 3465 3467 3482 3485 3522 3544 3545 3547 3559 3571 3580 3602 3626 3640 3647 3666 3674 3710 3723 3725 3731 3747 3775 3789 3813 3855 3868 3893 3921 3923 3961 3968 3970 3989 4042 4066 4078 4090 4133 4194 4199 4230 4237 4241 4266 4284 4289 4293 4317 87 111 AACACG/CGTGTT 0 -3 375 386 6 -5.4 38 58 63 65 67 73 78 92 114 115 122 147 149 155 156 159 165 169 170 173 176 177 184 186 204 213 222 236 242 245 246 250 252 259 260 269 289 290 302 305 320 327 333 346 352 355 362 373 385 392 401 406 407 409 410 433 447 458 459 484 515 518 535 543 550 565 566 584 588 596 603 620 649 650 654 660 666 669 691 694 717 720 728 746 751 753 758 765 781 785 801 825 827 845 860 865 869 873 895 905 906 917 924 926 930 932 934 935 938 945 966 980 988 995 1013 1030 1036 1041 1048 1059 1060 1072 1075 1105 1112 1118 1119 1138 1142 1146 1151 1168 1181 1191 1195 1197 1215 1231 1259 1269 1286 1340 1341 1349 1366 1368 1369 1371 1376 1377 1382 1389 1421 1425 1430 1434 1437 1439 1441 1447 1453 1481 1492 1498 1506 1541 1554 1558 1566 1567 1571 1578 1579 1670 1672 1684 1686 1700 1704 1708 1725 1739 1750 1753 1772 1774 1775 1779 1790 1797 1808 1848 1849 1854 1872 1883 1892 1916 1954 1962 1969 1972 2003 2013 2018 2066 2069 2115 2119 2120 2156 2161 2166 2167 2199 2204 2209 2220 2235 2244 2251 2254 2266 2270 2286 2291 2301 2313 2320 2329 2336 2337 2339 2344 2364 2370 2377 2405 2410 2416 2442 2450 2455 2457 2466 2531 2532 2543 2546 2547 2554 2576 2583 2629 2634 2641 2658 2659 2707 2715 2726 2730 2734 2737 2774 2778 2785 2810 2817 2827 2875 2887 2897 2903 2919 2958 2960 2967 2980 3000 3015 3052 3054 3080 3083 3088 3090 3091 3114 3167 3175 3195 3196 3198 3201 3214 3218 3240 3251 3277 3280 3299 3334 3342 3352 3354 3356 3370 3377 3385 3394 3401 3402 3469 3516 3521 3544 3578 3580 3582 3590 3596 3597 3608 3621 3622 3645 3654 3668 3681 3684 3688 3693 3717 3719 3725 3758 3762 3802 3814 3829 3838 3847 3865 3910 3921 3937 3966 3973 3980 3992 4000 4015 4029 4031 4037 4046 4051 4063 4075 4077 4090 4128 4132 4185 4204 4253 4282 4302 4313 4314 4323 4330 4337 4341 24 105 217 227 241 255 CACACG/CGTGTG 0 -3 329 353 3 -7.0 9 11 23 37 43 47 48 57 59 75 78 80 119 124 145 160 167 171 173 182 188 200 206 214 232 238 251 290 291 294 298 306 312 313 320 324 330 340 343 345 382 396 411 420 429 436 465 467 468 469 471 476 485 488 498 500 501 510 517 518 520 531 554 572 576 579 580 585 594 610 620 639 640 641 652 665 667 668 687 693 702 724 727 756 783 794 800 817 818 819 820 832 899 911 919 934 941 956 959 967 984 1000 1006 1040 1047 1048 1049 1052 1058 1060 1071 1076 1093 1127 1129 1137 1143 1151 1156 1163 1184 1194 1207 1213 1230 1258 1269 1273 1277 1309 1311 1312 1336 1348 1360 1389 1390 1399 1400 1407 1413 1415 1434 1436 1461 1494 1525 1528 1539 1544 1547 1549 1560 1563 1567 1577 1589 1590 1595 1599 1608 1618 1645 1647 1672 1682 1694 1707 1714 1725 1728 1735 1738 1747 1783 1787 1790 1815 1821 1824 1849 1876 1882 1887 1903 1913 1921 1952 1956 1960 1972 1994 2020 2033 2034 2043 2075 2078 2079 2088 2096 2107 2119 2128 2129 2182 2224 2225 2227 2234 2276 2285 2309 2327 2345 2346 2351 2359 2374 2375 2409 2416 2430 2458 2459 2471 2476 2480 2516 2522 2524 2536 2543 2566 2569 2577 2612 2624 2666 2675 2678 2700 2702 2704 2720 2732 2737 2767 2775 2790 2796 2813 2854 2856 2864 2886 2908 2909 2918 2919 2930 2983 2994 3003 3005 3042 3044 3048 3053 3054 3066 3081 3094 3095 3100 3145 3166 3169 3225 3230 3242 3279 3326 3327 3351 3360 3391 3411 3557 3575 3618 3620 3641 3670 3680 3730 3743 3758 3765 3767 3772 3790 3795 3796 3820 3834 3894 3932 3953 3960 3963 3980 4070 4071 4116 4125 4141 4148 4163 4200 4237 4238 4244 4266 4281 4282 4308 4316 4333 0 156 209 TCCACG/CGTGGA 0 -3 342 352 2 -8.1 18 21 76 114 128 133 140 142 164 168 171 175 183 188 214 224 246 247 252 253 265 268 273 275 282 291 309 316 319 325 327 342 352 378 382 388 409 415 424 428 446 456 458 513 530 544 556 567 596 630 639 683 685 688 689 697 712 716 721 725 733 738 744 747 751 754 760 767 772 775 776 779 789 793 803 808 814 858 871 875 900 917 929 930 936 939 941 948 968 977 981 986 996 1003 1005 1011 1038 1067 1083 1103 1115 1128 1129 1130 1134 1135 1145 1162 1199 1200 1205 1206 1207 1226 1229 1234 1240 1257 1268 1272 1273 1276 1280 1281 1283 1288 1303 1316 1336 1357 1375 1382 1387 1404 1408 1410 1432 1441 1444 1481 1519 1564 1566 1576 1625 1627 1630 1631 1640 1646 1647 1655 1663 1665 1685 1690 1693 1698 1727 1739 1775 1781 1800 1819 1858 1873 1885 1893 1902 1908 1915 1933 1953 1974 1983 1990 2001 2016 2036 2051 2053 2057 2062 2094 2099 2102 2126 2152 2160 2196 2201 2211 2214 2292 2304 2327 2335 2347 2349 2390 2411 2422 2439 2440 2448 2455 2476 2496 2501 2507 2511 2516 2544 2549 2559 2567 2568 2588 2604 2664 2685 2697 2709 2711 2729 2732 2748 2756 2759 2772 2793 2794 2816 2844 2845 2867 2871 2889 2896 2920 2921 2926 2936 2942 2947 2953 2962 2971 3020 3021 3029 3043 3049 3068 3085 3096 3121 3130 3132 3134 3140 3142 3178 3180 3189 3226 3227 3239 3241 3245 3246 3247 3273 3275 3276 3298 3308 3310 3312 3319 3327 3343 3345 3361 3396 3410 3415 3422 3453 3454 3533 3549 3551 3559 3566 3590 3596 3607 3615 3648 3678 3700 3718 3721 3726 3755 3788 3798 3802 3815 3816 3822 3832 3843 3854 3867 3874 3893 3938 3943 3947 3965 3968 4005 4026 4031 4063 4088 4090 4099 4106 4148 4151 4152 4179 4212 4215 4245 4258 4280 4340 4344 43 144 GTGTCC/GGACAC 1 -3 346 339 2 -7.7 50 58 62 98 106 111 127 134 153 154 178 191 205 212 218 229 253 259 278 292 328 372 393 414 415 443 446 447 452 457 462 466 468 471 484 487 513 528 534 538 554 563 567 578 581 586 589 590 594 622 623 637 643 647 658 670 744 746 760 767 782 784 795 871 878 897 933 936 942 945 969 1016 1073 1076 1079 1088 1094 1120 1145 1159 1172 1175 1177 1180 1187 1204 1212 1216 1239 1270 1302 1303 1305 1306 1323 1343 1365 1378 1379 1397 1402 1419 1438 1442 1473 1496 1508 1509 1537 1538 1551 1557 1569 1575 1584 1586 1613 1637 1639 1651 1653 1669 1670 1677 1679 1680 1681 1685 1697 1714 1734 1735 1742 1792 1795 1819 1823 1826 1858 1884 1935 1948 1968 1978 1995 2011 2017 2018 2022 2026 2030 2045 2049 2058 2061 2068 2074 2089 2097 2099 2112 2118 2127 2136 2149 2183 2196 2203 2262 2265 2271 2276 2295 2297 2305 2324 2341 2351 2377 2394 2396 2406 2428 2429 2430 2445 2451 2454 2457 2459 2470 2485 2486 2497 2501 2509 2523 2536 2561 2587 2594 2597 2606 2612 2631 2632 2643 2650 2657 2666 2672 2674 2705 2717 2746 2763 2768 2771 2772 2775 2847 2856 2860 2866 2871 2895 2898 2905 2907 2919 2922 2936 2951 2953 2966 2975 2981 2993 3003 3010 3028 3042 3046 3069 3076 3089 3090 3130 3141 3143 3147 3153 3180 3183 3204 3206 3212 3235 3236 3246 3267 3285 3287 3289 3300 3303 3335 3340 3351 3354 3355 3363 3376 3378 3379 3399 3426 3445 3446 3457 3462 3471 3473 3490 3514 3532 3542 3548 3570 3581 3586 3613 3620 3643 3657 3662 3671 3674 3698 3704 3708 3714 3737 3741 3751 3760 3770 3794 3811 3813 3843 3883 3884 3902 3906 3920 3925 3978 3986 3987 4017 4031 4053 4075 4100 4101 4108 4120 4121 4145 4157 4164 4177 4191 4196 4198 4216 4221 4231 4235 4251 4273 4275 4300 4305 4331 205 262 TGTGTC/GACACA 1 -4 336 328 3 -6.4 7 18 55 98 100 111 114 136 143 179 206 217 230 240 251 256 259 278 308 321 351 360 369 372 392 417 446 457 466 468 469 492 494 509 532 538 554 561 570 586 589 593 594 610 615 621 625 673 702 704 732 746 767 774 804 813 823 830 849 851 902 946 958 969 975 984 1016 1025 1047 1065 1066 1088 1090 1107 1133 1136 1140 1141 1163 1168 1171 1185 1228 1238 1250 1258 1277 1293 1314 1326 1336 1353 1359 1365 1370 1371 1374 1378 1393 1397 1405 1462 1465 1508 1512 1537 1550 1569 1573 1575 1596 1613 1651 1666 1667 1673 1679 1681 1685 1687 1689 1734 1742 1762 1766 1777 1790 1792 1798 1802 1846 1870 1884 1957 1975 2022 2027 2029 2032 2037 2043 2058 2068 2082 2089 2097 2099 2108 2112 2136 2143 2146 2149 2161 2173 2177 2186 2196 2206 2223 2244 2263 2264 2276 2280 2281 2295 2297 2341 2351 2366 2378 2394 2397 2406 2423 2430 2456 2458 2481 2485 2509 2523 2545 2550 2561 2574 2593 2612 2619 2626 2643 2651 2657 2660 2662 2666 2672 2673 2701 2704 2727 2736 2750 2753 2774 2780 2796 2813 2826 2828 2838 2855 2895 2898 2905 2922 2930 2936 2987 3002 3003 3027 3028 3038 3042 3046 3074 3083 3087 3089 3110 3125 3131 3135 3143 3149 3158 3174 3180 3183 3204 3212 3221 3235 3237 3261 3263 3285 3291 3292 3293 3294 3295 3302 3303 3335 3341 3383 3385 3405 3409 3424 3430 3450 3457 3532 3544 3548 3558 3571 3581 3586 3613 3619 3620 3629 3639 3648 3674 3698 3708 3727 3728 3733 3740 3751 3757 3770 3772 3778 3790 3818 3843 3850 3860 3881 3884 3886 3894 3902 3906 3915 3920 3925 3977 3978 3986 4037 4041 4045 4052 4061 4095 4100 4104 4108 4113 4118 4124 4139 4149 4154 4164 4197 4198 4200 4216 4227 4231 4256 4259 4285 4287 4305 4327 12 124 262 CGACGT/ACGTCG 0 -2 321 327 1 -8.7 11 12 30 41 65 66 94 95 102 109 114 119 123 124 133 150 155 157 160 186 203 232 238 250 304 317 337 360 365 368 379 390 391 395 405 412 453 455 464 490 502 541 542 638 653 655 661 672 677 695 714 726 740 773 776 791 800 802 804 809 815 816 826 848 865 880 895 916 928 944 954 971 978 979 987 1019 1020 1023 1033 1049 1101 1123 1135 1144 1162 1174 1177 1186 1213 1244 1245 1246 1260 1277 1295 1315 1338 1344 1352 1362 1372 1387 1398 1418 1441 1449 1459 1476 1477 1479 1494 1495 1498 1515 1520 1533 1535 1559 1582 1591 1596 1606 1623 1626 1672 1684 1688 1711 1733 1786 1794 1796 1804 1830 1836 1843 1844 1851 1857 1871 1909 1921 1965 1966 1998 2001 2002 2009 2039 2046 2051 2073 2091 2101 2138 2162 2164 2168 2181 2182 2197 2221 2232 2248 2252 2259 2260 2268 2317 2319 2332 2339 2343 2392 2398 2400 2410 2414 2425 2435 2437 2448 2473 2475 2480 2500 2538 2541 2544 2575 2592 2605 2634 2638 2654 2659 2665 2676 2692 2698 2713 2715 2722 2724 2734 2740 2741 2743 2747 2796 2820 2859 2908 2934 2986 3004 3035 3052 3059 3077 3126 3132 3163 3176 3177 3184 3187 3199 3209 3219 3239 3244 3254 3258 3270 3278 3299 3311 3313 3389 3395 3416 3420 3433 3449 3455 3474 3504 3523 3553 3576 3579 3580 3621 3627 3632 3637 3644 3646 3661 3669 3701 3709 3717 3723 3724 3726 3731 3734 3750 3768 3769 3802 3812 3815 3824 3831 3852 3860 3861 3868 3901 3903 3942 3947 3961 3970 3972 3987 3994 3998 4001 4012 4015 4019 4042 4046 4054 4068 4082 4096 4128 4136 4139 4144 4162 4165 4166 4176 4195 4212 4219 4228 4229 4230 4276 4284 4314 4321 4328 4331 155 ACGTTT/AAACGT 0 0 338 326 6 -4.1 9 13 45 53 80 81 84 92 100 103 123 145 155 167 207 235 263 269 294 304 332 367 373 384 391 408 447 448 460 493 498 502 507 510 519 539 543 606 607 618 624 643 649 671 674 729 765 771 781 783 800 840 848 858 876 879 890 957 973 987 1027 1033 1039 1059 1074 1104 1112 1114 1135 1144 1164 1166 1186 1203 1212 1218 1224 1279 1290 1310 1327 1340 1346 1349 1355 1359 1362 1367 1373 1399 1454 1470 1471 1483 1516 1519 1525 1526 1540 1554 1563 1573 1574 1581 1582 1593 1621 1642 1661 1677 1683 1684 1700 1719 1725 1729 1755 1761 1779 1781 1787 1803 1804 1806 1843 1867 1911 1921 1924 1939 1945 1952 1958 1964 1987 1993 1994 2004 2011 2015 2021 2024 2031 2033 2038 2071 2077 2081 2085 2094 2106 2120 2127 2134 2140 2171 2208 2245 2247 2251 2253 2269 2275 2282 2287 2295 2299 2301 2304 2307 2326 2343 2367 2369 2379 2381 2385 2388 2457 2488 2503 2519 2522 2531 2535 2543 2551 2573 2575 2579 2580 2586 2592 2610 2621 2676 2690 2704 2706 2708 2726 2747 2755 2773 2777 2791 2793 2800 2804 2820 2856 2863 2866 2869 2872 2874 2905 2933 2935 2951 2974 2999 3004 3007 3016 3022 3029 3055 3085 3088 3097 3104 3112 3126 3145 3167 3169 3176 3178 3207 3226 3258 3291 3300 3309 3323 3329 3338 3342 3343 3350 3352 3356 3361 3396 3398 3409 3410 3438 3449 3452 3458 3461 3465 3480 3491 3508 3531 3539 3543 3546 3560 3568 3571 3579 3583 3588 3591 3599 3604 3610 3631 3633 3638 3646 3666 3672 3674 3679 3703 3711 3734 3789 3808 3821 3861 3862 3866 3869 3870 3889 3893 3904 3910 3946 3952 3963 3974 3998 4019 4032 4042 4048 4072 4077 4122 4131 4134 4137 4150 4162 4163 4180 4197 4213 4229 4238 4253 4255 4276 4278 4280 4281 4284 4306 4310 4319 4341 11 111 148 177 210 256 CTGCCA/TGGCAG 4 -3 301 287 0 -7.7 44 60 61 81 119 152 153 172 211 231 258 266 282 286 321 328 336 341 363 375 413 426 433 441 470 474 478 491 540 568 571 601 604 608 656 661 669 682 734 752 788 828 830 889 899 907 909 913 914 950 963 986 988 996 997 1008 1009 1034 1047 1060 1085 1095 1113 1128 1153 1189 1213 1235 1243 1264 1287 1289 1299 1309 1321 1324 1335 1347 1358 1409 1440 1467 1525 1547 1572 1609 1612 1622 1634 1655 1657 1659 1695 1709 1710 1730 1740 1744 1759 1764 1770 1784 1791 1800 1807 1812 1814 1818 1824 1828 1834 1835 1839 1845 1847 1868 1869 1872 1902 1909 1937 1938 1968 1999 2001 2025 2063 2065 2081 2093 2095 2142 2175 2178 2180 2185 2192 2198 2200 2222 2240 2271 2296 2310 2312 2314 2323 2352 2358 2373 2386 2398 2402 2413 2420 2427 2432 2443 2449 2456 2480 2481 2491 2528 2530 2549 2573 2578 2596 2598 2611 2618 2620 2623 2656 2663 2677 2684 2707 2714 2730 2732 2738 2751 2759 2760 2786 2795 2798 2815 2824 2825 2827 2843 2848 2849 2857 2865 2883 2900 2907 2936 2948 2949 2955 2965 2974 2977 2997 3034 3060 3063 3101 3107 3115 3127 3137 3139 3159 3173 3193 3197 3237 3250 3253 3260 3268 3282 3293 3316 3318 3336 3364 3373 3423 3483 3552 3556 3561 3564 3585 3606 3666 3685 3692 3699 3702 3705 3720 3736 3745 3753 3771 3776 3782 3817 3830 3841 3870 3871 3887 3892 3905 3914 3964 3982 3988 4007 4008 4013 4033 4044 4050 4059 4069 4078 4092 4096 4103 4109 4143 4156 4158 4192 4194 4196 4217 4223 4232 4271 4274 4290 4292 4296 4309 4317 4326 4328 4335 4346 4347 -1 GTCACG/CGTGAC 0 -3 262 285 4 -4.5 7 9 11 22 29 48 59 65 66 78 85 88 90 99 105 115 121 130 131 146 163 164 206 221 227 231 236 239 253 288 322 325 344 350 359 372 397 398 402 404 443 463 481 483 495 539 540 546 552 559 587 590 602 645 678 681 690 696 700 711 712 715 719 723 724 728 730 742 747 754 774 779 780 781 816 835 841 853 865 866 868 877 910 911 941 952 973 982 991 1000 1024 1035 1077 1083 1116 1122 1125 1131 1135 1163 1167 1182 1212 1219 1225 1230 1237 1239 1249 1250 1267 1273 1294 1300 1308 1314 1316 1355 1391 1417 1430 1431 1448 1467 1526 1573 1589 1599 1631 1680 1692 1705 1709 1719 1723 1732 1733 1739 1789 1817 1843 1851 1898 1947 1948 1988 1995 2005 2014 2024 2028 2029 2042 2043 2126 2138 2140 2156 2164 2183 2225 2233 2243 2246 2272 2273 2274 2283 2285 2306 2313 2328 2345 2356 2371 2399 2419 2435 2467 2481 2488 2510 2517 2533 2543 2548 2561 2572 2590 2639 2655 2668 2686 2695 2706 2766 2777 2801 2836 2853 2858 2874 2880 2906 2916 2925 2933 2942 2950 2983 2989 2992 3000 3016 3024 3050 3057 3058 3102 3152 3205 3238 3245 3252 3255 3265 3271 3283 3302 3320 3369 3407 3491 3492 3527 3572 3589 3594 3635 3734 3764 3775 3834 3873 3881 3910 3952 3962 3997 4035 4070 4119 4194 4218 4242 4252 4265 4289 4295 4299 4310 4324 32 120 122 249 ACGCCA/TGGCGT 2 0 290 285 0 -7.6 22 43 63 117 146 176 193 212 214 215 219 224 226 245 253 254 271 272 290 298 299 316 351 381 389 392 434 451 465 475 493 494 499 527 551 552 561 573 574 577 614 620 631 633 639 674 703 710 716 757 767 769 779 788 796 803 810 837 873 898 906 952 961 973 974 976 984 1010 1011 1015 1044 1053 1055 1087 1088 1115 1132 1179 1182 1201 1242 1275 1302 1362 1380 1396 1404 1415 1423 1424 1461 1466 1506 1546 1565 1570 1585 1597 1600 1619 1631 1632 1654 1662 1680 1691 1695 1702 1788 1801 1805 1808 1822 1833 1894 1895 1927 1933 1942 1944 1946 1960 1966 1967 1971 1981 1985 1995 2040 2059 2083 2096 2098 2106 2125 2147 2183 2202 2242 2283 2325 2431 2433 2447 2453 2489 2502 2506 2540 2542 2583 2589 2621 2628 2632 2646 2653 2669 2679 2680 2691 2719 2729 2739 2745 2765 2770 2776 2779 2811 2877 2881 2892 2910 2924 2926 2941 2950 2968 2969 2979 2989 3001 3009 3017 3019 3071 3079 3098 3119 3121 3129 3151 3156 3172 3191 3198 3200 3201 3219 3227 3243 3262 3283 3315 3318 3346 3347 3357 3367 3375 3384 3398 3418 3428 3435 3439 3486 3497 3500 3510 3512 3550 3558 3563 3590 3600 3617 3628 3630 3645 3649 3650 3655 3670 3681 3721 3740 3756 3757 3761 3836 3839 3845 3888 3890 3907 3911 3912 3936 3948 3975 3976 3983 3999 4005 4006 4014 4019 4028 4038 4043 4049 4065 4074 4080 4083 4110 4112 4115 4140 4141 4155 4161 4178 4205 4207 4213 4249 4259 4265 4274 4277 4278 4294 4298 4302 4303 4332 4343 -1 ACGTAA/TTACGT 0 0 286 281 5 -3.8 8 12 20 48 54 55 59 96 106 114 135 142 194 202 211 235 237 243 247 249 250 259 306 346 347 355 363 368 374 378 400 401 412 426 455 458 469 486 492 513 554 583 607 645 674 700 744 753 773 797 804 820 850 861 888 891 897 902 929 935 950 972 984 1030 1042 1096 1114 1123 1125 1152 1154 1194 1241 1257 1276 1304 1307 1321 1330 1335 1341 1383 1390 1393 1395 1400 1449 1481 1520 1541 1555 1579 1598 1636 1675 1684 1708 1727 1731 1744 1751 1772 1787 1813 1842 1876 1906 1907 1914 1918 1961 1962 1963 1977 1987 1995 2002 2009 2014 2038 2042 2044 2052 2053 2056 2060 2102 2106 2114 2117 2128 2148 2157 2182 2194 2203 2246 2257 2273 2302 2322 2340 2356 2387 2392 2409 2466 2512 2541 2562 2583 2589 2602 2625 2639 2700 2719 2732 2736 2741 2757 2762 2770 2774 2783 2800 2801 2817 2843 2854 2858 2860 2873 2897 2902 2905 2912 2919 2920 2967 2972 2980 2985 3025 3036 3043 3055 3062 3072 3091 3099 3100 3109 3111 3135 3158 3160 3169 3214 3215 3218 3225 3234 3239 3244 3274 3284 3285 3288 3291 3327 3334 3336 3352 3360 3370 3416 3447 3469 3481 3487 3506 3513 3533 3540 3555 3559 3566 3582 3590 3607 3616 3638 3646 3656 3658 3668 3669 3670 3690 3700 3706 3718 3730 3734 3739 3767 3768 3777 3786 3792 3793 3795 3820 3829 3831 3856 3857 3868 3876 3899 3954 3980 3998 4035 4039 4096 4125 4126 4127 4159 4179 4197 4201 4206 4208 4214 4220 4226 4228 4242 4254 4269 4278 4286 4318 115 144 151 152 256 TCAACG/CGTTGA 0 -3 282 277 3 -5.1 28 44 70 89 91 93 118 141 142 160 173 190 247 255 260 264 329 359 372 385 396 408 430 438 457 480 490 503 512 519 522 538 552 581 596 602 607 618 628 636 657 666 685 703 726 742 759 822 825 826 834 860 877 891 957 960 968 970 976 998 1038 1048 1096 1108 1110 1113 1114 1148 1170 1174 1175 1192 1203 1219 1222 1234 1246 1255 1273 1298 1316 1318 1332 1342 1356 1376 1386 1391 1403 1406 1414 1433 1439 1451 1457 1458 1468 1477 1479 1486 1487 1566 1570 1592 1621 1626 1642 1660 1662 1664 1666 1678 1688 1796 1840 1851 1861 1867 1878 1900 1917 1919 1921 1926 1954 1961 1964 1974 2000 2021 2041 2048 2054 2062 2071 2086 2122 2123 2138 2156 2158 2188 2207 2219 2229 2243 2252 2265 2287 2303 2319 2333 2363 2364 2379 2385 2393 2413 2430 2442 2452 2472 2542 2560 2583 2585 2640 2653 2658 2676 2692 2715 2720 2735 2737 2757 2766 2776 2779 2791 2792 2877 2896 2913 2944 2947 2954 2956 2966 2980 2998 3006 3055 3083 3086 3112 3122 3135 3137 3157 3159 3161 3165 3192 3196 3228 3238 3245 3247 3259 3274 3278 3326 3338 3402 3433 3440 3447 3455 3480 3486 3487 3513 3530 3532 3536 3540 3551 3553 3569 3573 3580 3587 3594 3598 3610 3614 3638 3656 3675 3701 3744 3747 3749 3762 3775 3783 3806 3885 3898 3923 3928 3945 3955 3957 3961 4001 4006 4042 4051 4067 4079 4097 4099 4113 4130 4139 4149 4170 4202 4208 4210 4214 4218 4224 4232 4262 4288 4306 4322 4324 4344 8 115 207 ACCACG/CGTGGT 0 -3 247 265 2 -5.8 5 22 37 51 60 71 73 82 85 96 101 133 135 139 143 144 149 167 168 182 199 205 219 233 234 243 245 246 249 270 273 279 280 287 290 291 292 297 307 348 358 364 367 375 383 384 395 428 434 439 450 465 479 504 508 510 527 564 580 582 594 609 624 643 664 673 715 722 741 763 770 779 790 799 807 821 832 834 864 867 884 931 944 947 949 954 972 984 994 1003 1007 1019 1023 1026 1058 1116 1165 1166 1210 1231 1233 1245 1248 1273 1276 1317 1322 1329 1344 1345 1348 1395 1426 1436 1437 1444 1454 1476 1492 1507 1517 1545 1546 1558 1587 1600 1604 1606 1625 1626 1641 1823 1850 1871 1890 1907 1930 1955 1959 2016 2047 2061 2080 2084 2134 2135 2137 2139 2145 2152 2157 2234 2254 2258 2288 2291 2293 2331 2343 2352 2370 2376 2405 2414 2466 2479 2484 2494 2508 2539 2543 2562 2617 2619 2627 2673 2707 2712 2717 2722 2755 2776 2779 2782 2794 2803 2804 2808 2819 2835 2852 2859 2862 2885 2888 2890 2902 2906 2969 2978 2991 2994 3117 3150 3238 3264 3266 3328 3395 3403 3444 3470 3479 3489 3504 3515 3524 3534 3573 3650 3679 3682 3686 3687 3754 3768 3814 3852 3857 3860 3865 3869 3880 3935 3944 3961 4013 4042 4070 4123 4135 4166 4239 4243 4245 4247 4344 53 138 AGACAC/GTGTCT 0 -4 250 260 5 -3.3 19 20 28 48 57 60 98 112 113 115 129 131 141 147 163 171 199 251 258 281 295 303 308 311 323 347 351 357 375 393 394 400 415 423 424 435 476 482 492 494 508 517 538 544 548 560 563 564 615 617 625 646 657 694 702 707 713 732 735 759 764 774 799 800 801 805 808 818 819 830 843 854 861 862 900 919 922 943 962 969 982 983 984 989 992 1017 1022 1029 1038 1045 1046 1053 1059 1061 1075 1099 1116 1138 1176 1187 1250 1277 1301 1327 1353 1360 1370 1374 1378 1383 1390 1421 1427 1439 1472 1530 1549 1577 1579 1593 1607 1609 1613 1620 1653 1664 1672 1675 1737 1754 1780 1824 1831 1832 1852 1870 1888 1918 1929 1993 1997 2033 2079 2109 2161 2169 2237 2244 2263 2306 2335 2355 2368 2378 2382 2383 2432 2446 2457 2460 2481 2496 2546 2571 2581 2586 2595 2625 2694 2725 2728 2734 2762 2774 2813 2828 2841 2843 2870 2871 2889 2902 2931 2939 3057 3079 3083 3092 3105 3121 3168 3174 3190 3208 3221 3237 3239 3277 3305 3321 3329 3379 3382 3383 3385 3393 3395 3406 3408 3409 3417 3431 3467 3497 3500 3534 3537 3544 3609 3611 3647 3653 3659 3664 3727 3748 3777 3799 3801 3844 3850 3853 3876 3879 3906 3967 3977 4000 4098 4149 4189 4206 4235 4248 4254 4291 4307 4319 4326 4340 12 75 124 214 251 ACACGA/TCGTGT 0 -2 267 257 3 -4.7 33 34 65 68 69 71 74 93 104 110 125 132 171 191 208 223 228 251 253 260 276 294 299 411 461 510 518 520 556 599 620 625 640 702 729 765 782 845 871 897 899 906 941 945 962 968 1032 1047 1057 1059 1068 1069 1081 1089 1118 1170 1213 1236 1237 1272 1331 1336 1337 1343 1366 1371 1376 1384 1390 1422 1426 1428 1441 1450 1464 1473 1474 1496 1530 1541 1590 1603 1605 1616 1617 1641 1650 1672 1684 1704 1739 1783 1790 1801 1808 1812 1827 1828 1831 1872 1878 1893 1910 1936 1943 1989 1990 2017 2023 2087 2100 2115 2119 2120 2127 2163 2182 2199 2209 2238 2254 2276 2277 2313 2320 2324 2337 2342 2345 2362 2374 2382 2383 2385 2386 2412 2430 2463 2483 2486 2493 2517 2518 2536 2561 2571 2576 2581 2586 2591 2595 2600 2622 2631 2666 2682 2707 2745 2746 2771 2775 2821 2843 2863 2884 2901 2931 2933 2946 2951 2963 3049 3052 3062 3072 3091 3095 3105 3138 3168 3190 3202 3207 3217 3225 3279 3280 3286 3288 3301 3312 3315 3326 3349 3353 3358 3369 3378 3382 3415 3417 3425 3459 3463 3500 3518 3537 3554 3557 3577 3601 3602 3636 3645 3660 3691 3693 3713 3715 3738 3748 3759 3779 3827 3838 3844 3860 3865 3868 3872 3882 3933 3963 3971 3991 4031 4037 4056 4057 4058 4070 4085 4086 4089 4093 4098 4105 4112 4116 4121 4125 4127 4139 4142 4150 4204 4222 4234 4235 4236 4266 4289 4300 4302 4314 4334 4337 156 217 240 ACGTTA/TAACGT 0 0 252 255 3 -4.6 0 7 14 17 30 47 64 65 114 195 210 221 239 254 287 288 302 306 318 362 365 370 372 452 453 461 541 542 553 584 607 610 622 655 663 671 678 681 698 710 727 746 761 795 804 827 838 853 859 885 888 911 917 932 935 942 993 994 1000 1007 1014 1033 1041 1076 1084 1091 1096 1112 1123 1148 1164 1173 1181 1184 1187 1244 1247 1304 1305 1308 1329 1339 1368 1370 1381 1407 1417 1418 1427 1434 1439 1457 1498 1534 1582 1608 1643 1660 1718 1783 1786 1801 1820 1836 1851 1861 1864 1941 1964 1972 1983 1995 2005 2011 2034 2041 2046 2054 2067 2073 2091 2107 2118 2133 2179 2191 2205 2211 2214 2225 2235 2244 2258 2259 2273 2286 2288 2305 2315 2322 2345 2369 2380 2425 2434 2466 2522 2556 2609 2678 2725 2744 2748 2770 2786 2787 2801 2805 2807 2819 2848 2861 2867 2874 2913 2915 2933 2972 2984 3012 3056 3066 3072 3077 3082 3086 3090 3146 3148 3169 3174 3195 3209 3215 3241 3279 3314 3321 3369 3377 3391 3396 3416 3518 3520 3527 3533 3562 3587 3593 3594 3613 3651 3682 3684 3686 3726 3742 3744 3746 3754 3763 3788 3789 3797 3802 3808 3822 3849 3863 3903 3923 3947 3961 3984 4003 4039 4042 4060 4088 4099 4126 4130 4136 4159 4167 4173 4174 4181 4184 4211 4212 4214 4223 4238 4258 4266 4295 4300 4308 4311 4339 105 151 210 CGCCAC/GTGGCG 0 -4 227 246 2 -5.3 3 11 22 26 42 53 63 70 90 139 146 176 180 212 214 215 216 219 226 234 237 244 245 253 254 268 272 299 315 343 356 376 389 392 406 411 428 432 434 445 465 485 493 494 498 527 552 554 561 562 573 574 577 581 612 614 620 639 674 683 716 767 779 788 796 829 906 918 941 952 973 977 1010 1012 1015 1037 1053 1088 1124 1196 1201 1213 1231 1258 1260 1275 1315 1328 1353 1406 1424 1461 1482 1485 1502 1570 1583 1631 1632 1703 1721 1722 1760 1784 1805 1833 1904 1920 1946 1960 1967 1971 1985 2040 2043 2059 2069 2074 2096 2106 2152 2162 2166 2183 2194 2202 2212 2220 2283 2284 2332 2357 2370 2426 2453 2489 2526 2532 2552 2583 2594 2628 2638 2680 2713 2719 2725 2739 2745 2770 2779 2786 2831 2856 2891 2893 2908 2910 2918 2926 2952 2968 2979 2988 2989 3004 3017 3081 3093 3098 3107 3119 3129 3140 3148 3151 3177 3182 3191 3201 3227 3281 3282 3322 3344 3375 3398 3407 3428 3439 3500 3512 3541 3600 3620 3634 3644 3645 3649 3655 3721 3740 3741 3761 3795 3819 3845 3907 3911 3943 3961 3969 3994 3999 4019 4065 4074 4110 4141 4205 4207 4259 4274 4300 4302 4314 4320 61 196 ACAACG/CGTTGT 0 -3 240 242 4 -3.6 4 14 29 47 49 60 91 94 96 146 185 225 241 306 362 366 398 422 432 436 480 529 534 547 558 573 606 629 690 696 699 727 743 748 769 794 801 802 816 826 829 842 844 861 865 880 898 906 928 944 979 1001 1020 1035 1101 1138 1139 1144 1186 1188 1208 1215 1218 1224 1225 1237 1247 1282 1283 1284 1305 1352 1357 1369 1431 1446 1491 1501 1513 1533 1551 1579 1584 1588 1610 1628 1629 1643 1666 1680 1691 1706 1718 1719 1731 1740 1744 1804 1829 1833 1846 1861 1870 1871 1911 1941 1950 1956 1958 1965 1977 1987 2019 2026 2067 2090 2111 2112 2117 2131 2154 2162 2198 2206 2208 2217 2247 2248 2255 2260 2264 2275 2287 2295 2324 2347 2348 2350 2361 2408 2410 2413 2485 2495 2525 2538 2586 2600 2648 2649 2655 2675 2685 2698 2766 2787 2823 2869 2872 2879 2893 2894 2951 2960 2979 2999 3007 3032 3035 3050 3058 3076 3142 3146 3199 3212 3225 3228 3243 3244 3252 3268 3323 3352 3374 3385 3389 3396 3404 3438 3453 3465 3472 3487 3492 3521 3523 3525 3530 3531 3545 3561 3611 3616 3644 3651 3672 3696 3710 3720 3744 3780 3845 3854 3866 3880 3901 3911 3954 3984 4019 4048 4051 4084 4127 4134 4149 4164 4167 4173 4206 4211 4239 4244 4257 4267 4274 4284 4292 4302 85 111 114 126 ACGTGC/GCACGT 0 0 229 234 2 -5.0 45 72 83 99 107 160 173 181 227 250 297 299 306 330 378 380 397 436 460 461 467 481 486 487 498 505 516 549 557 576 613 641 642 648 659 660 665 686 688 690 715 720 722 762 778 783 795 812 814 820 824 836 839 845 857 885 919 956 959 970 983 986 1014 1040 1054 1070 1091 1151 1167 1194 1202 1230 1234 1240 1263 1290 1314 1322 1323 1336 1339 1352 1359 1469 1490 1492 1509 1523 1528 1534 1544 1567 1574 1588 1589 1592 1601 1618 1623 1658 1665 1678 1683 1708 1727 1731 1756 1825 1837 1922 1931 1934 1955 1971 1989 2028 2034 2055 2056 2075 2155 2161 2181 2201 2204 2211 2254 2255 2282 2285 2309 2318 2332 2350 2351 2369 2371 2416 2419 2422 2432 2440 2441 2458 2459 2467 2474 2475 2501 2524 2570 2580 2610 2642 2687 2742 2764 2788 2794 2806 2828 2829 2840 2862 2867 2930 2962 2979 2991 3006 3015 3043 3094 3095 3104 3106 3155 3196 3222 3231 3241 3242 3248 3287 3314 3320 3350 3361 3404 3410 3414 3438 3444 3461 3523 3535 3559 3578 3592 3593 3616 3618 3619 3654 3668 3696 3742 3824 3847 3859 3879 3938 3941 3959 4032 4107 4122 4131 4134 4160 4172 4181 4184 4185 4210 4282 4284 4330 4342 8 227 AGCCAC/GTGGCT 0 -4 226 233 3 -4.1 0 29 35 42 56 74 87 116 127 186 197 216 242 255 267 277 281 283 285 305 325 342 361 386 395 416 433 441 444 450 475 479 490 500 520 521 529 545 581 585 592 613 618 629 643 663 671 705 736 770 803 811 833 835 901 925 947 960 965 975 985 999 1021 1039 1040 1100 1152 1169 1189 1220 1221 1222 1274 1292 1297 1298 1318 1330 1353 1354 1361 1371 1395 1403 1419 1475 1503 1518 1529 1543 1580 1699 1710 1719 1725 1733 1737 1746 1765 1769 1793 1813 1835 1893 1905 1975 2003 2004 2050 2051 2056 2075 2079 2084 2095 2105 2113 2131 2132 2145 2157 2191 2218 2225 2278 2279 2288 2317 2367 2398 2418 2461 2468 2476 2492 2524 2539 2565 2584 2637 2652 2661 2684 2693 2744 2756 2773 2817 2836 2904 2906 2912 2914 2940 2956 2974 2985 3023 3031 3037 3043 3044 3094 3098 3101 3133 3160 3203 3215 3233 3243 3258 3272 3290 3308 3324 3380 3381 3382 3387 3392 3427 3432 3456 3479 3492 3522 3531 3551 3612 3642 3655 3662 3663 3676 3730 3735 3751 3793 3806 3807 3830 3846 3849 3854 3868 3915 3934 3939 3942 3960 3981 3994 3995 3997 4016 4066 4099 4158 4177 4195 4246 4253 4268 4294 4324 2 6 19 ATACAC/GTGTAT 0 -4 235 231 4 -3.3 20 41 51 80 88 108 110 113 141 143 170 174 176 177 180 190 201 210 222 233 234 298 319 378 402 406 420 425 446 450 469 472 492 530 539 551 572 577 655 659 664 689 692 729 772 804 839 841 894 899 903 979 995 1037 1047 1050 1068 1081 1084 1096 1101 1149 1156 1160 1184 1188 1204 1209 1240 1253 1266 1289 1311 1337 1343 1421 1422 1448 1456 1489 1546 1617 1631 1675 1702 1722 1744 1753 1771 1783 1816 1866 1893 1897 1901 1910 1929 1946 1956 1989 2011 2020 2058 2072 2076 2082 2085 2163 2171 2181 2210 2215 2249 2265 2277 2315 2321 2337 2346 2382 2384 2386 2390 2401 2407 2434 2438 2463 2483 2518 2557 2559 2591 2600 2603 2613 2615 2622 2624 2644 2671 2674 2682 2708 2739 2740 2748 2758 2769 2773 2801 2812 2813 2833 2841 2884 2952 2972 3038 3048 3062 3067 3091 3111 3134 3168 3169 3209 3220 3225 3250 3285 3296 3299 3312 3315 3320 3331 3349 3425 3429 3443 3463 3509 3513 3523 3563 3577 3586 3590 3609 3610 3645 3659 3660 3690 3697 3722 3732 3743 3766 3770 3789 3838 3847 3858 3865 3866 3918 3951 3959 3963 3995 4002 4027 4030 4040 4054 4056 4083 4125 4132 4135 4139 4148 4201 4236 4238 4263 4293 4297 4301 4325 4333 4340 22 130 132 209 ACGTAT/ATACGT 0 0 230 222 3 -3.8 37 53 59 137 156 170 176 184 220 237 269 283 295 345 352 363 366 377 391 410 472 497 518 530 536 547 552 553 572 579 598 611 614 624 635 636 674 679 692 717 730 753 762 776 792 796 800 819 869 896 903 905 924 935 965 971 973 980 995 1039 1048 1100 1108 1197 1233 1254 1255 1269 1278 1284 1297 1319 1333 1434 1437 1455 1493 1504 1515 1535 1546 1571 1587 1621 1630 1656 1658 1671 1694 1701 1709 1726 1729 1739 1763 1780 1788 1833 1849 1880 1890 1897 1899 1909 1912 1916 1917 1926 1956 1959 1974 1988 1989 2026 2034 2038 2042 2060 2109 2127 2143 2150 2154 2168 2215 2221 2237 2239 2318 2319 2375 2452 2479 2498 2500 2503 2508 2510 2547 2550 2559 2568 2577 2590 2624 2692 2702 2712 2724 2757 2761 2774 2782 2812 2814 2860 2873 2879 2972 3011 3048 3070 3082 3084 3099 3108 3150 3157 3162 3177 3196 3220 3229 3240 3249 3259 3284 3364 3365 3368 3381 3437 3516 3532 3533 3569 3598 3653 3667 3675 3755 3758 3765 3769 3772 3781 3790 3798 3828 3843 3852 3873 3897 3932 3941 3944 3953 3963 3977 3989 4039 4064 4065 4119 4123 4132 4137 4171 4194 4200 4215 4225 4262 4295 4321 4322 4323 4328 4333 4339 104 167 209 TGTGGC/GCCACA 1 -4 226 220 1 -5.8 42 74 119 175 186 216 219 258 272 289 293 305 312 321 356 361 389 411 433 444 448 450 475 500 511 545 571 573 574 639 656 668 716 719 750 770 833 835 864 899 912 943 967 1036 1040 1042 1053 1058 1098 1100 1113 1129 1161 1169 1214 1232 1235 1243 1258 1283 1297 1299 1315 1324 1328 1403 1409 1411 1451 1478 1485 1503 1509 1521 1525 1549 1557 1624 1635 1659 1710 1730 1759 1766 1784 1835 1853 1862 1875 1887 1891 1895 1926 1960 1975 2050 2074 2077 2079 2113 2140 2151 2220 2225 2226 2250 2294 2307 2311 2312 2314 2316 2323 2357 2416 2424 2443 2458 2459 2480 2481 2524 2527 2557 2565 2583 2607 2656 2684 2696 2699 2716 2732 2739 2756 2769 2773 2786 2807 2809 2839 2840 2843 2936 2968 2996 3004 3005 3017 3026 3064 3068 3080 3086 3094 3107 3128 3129 3147 3151 3211 3213 3227 3233 3250 3272 3324 3336 3390 3407 3419 3428 3476 3483 3492 3502 3567 3595 3600 3605 3620 3624 3629 3644 3645 3680 3693 3743 3751 3752 3766 3774 3795 3800 3804 3845 3849 3850 3854 3860 3871 3897 3907 3919 3926 3945 3960 4019 4055 4062 4073 4081 4091 4096 4102 4138 4205 4207 4209 4233 4259 4271 4324 4325 4326 4329 176 CTCACG/CGTGAG 0 -3 210 211 2 -4.4 5 41 66 134 137 167 212 232 262 264 269 295 310 374 383 386 398 400 412 444 486 500 536 538 541 549 553 569 580 585 618 627 632 642 652 659 666 687 709 728 739 758 760 762 765 767 792 796 807 822 868 870 919 934 977 995 1123 1135 1149 1167 1198 1229 1230 1280 1284 1295 1296 1299 1308 1322 1350 1360 1370 1373 1381 1424 1452 1475 1497 1504 1523 1545 1578 1598 1620 1626 1629 1661 1668 1672 1676 1736 1745 1774 1786 1851 1880 1898 1901 1908 1934 1947 1988 2018 2055 2138 2159 2191 2199 2216 2242 2243 2244 2253 2307 2321 2328 2338 2358 2400 2432 2440 2481 2551 2568 2570 2572 2576 2590 2621 2624 2659 2711 2725 2745 2760 2784 2805 2829 2840 2843 2880 2885 2898 2902 2912 2921 2925 2950 2984 2986 3030 3050 3052 3061 3063 3081 3130 3265 3270 3307 3309 3318 3361 3374 3380 3385 3414 3440 3458 3474 3477 3535 3543 3568 3574 3591 3603 3616 3622 3625 3634 3635 3654 3746 3749 3773 3796 3797 3798 3848 3870 3889 3900 3927 3965 3972 4039 4043 4079 4106 4107 4159 4269 4273 4279 4282 4292 4301 4323 6 152 ACGTCT/AGACGT 0 0 201 207 2 -4.3 4 7 57 70 80 88 102 180 196 232 239 241 254 260 287 324 363 366 383 408 438 453 464 468 507 513 534 562 603 630 653 688 697 699 726 755 779 791 802 803 823 844 877 880 893 899 928 933 937 942 946 950 983 995 1004 1006 1009 1033 1083 1127 1225 1240 1246 1257 1293 1314 1316 1323 1338 1348 1352 1414 1416 1443 1459 1468 1482 1491 1493 1504 1510 1524 1527 1562 1580 1606 1621 1663 1696 1719 1773 1813 1830 1850 1866 1871 1930 1950 1953 2019 2042 2047 2048 2053 2086 2088 2089 2159 2188 2197 2234 2288 2325 2329 2332 2336 2346 2387 2400 2436 2437 2464 2476 2484 2555 2641 2664 2665 2668 2703 2723 2725 2734 2755 2776 2779 2783 2789 2800 2829 2888 2909 2927 2973 2979 2990 3013 3023 3033 3059 3073 3092 3175 3205 3251 3307 3319 3336 3339 3348 3406 3429 3442 3463 3468 3494 3503 3538 3546 3636 3646 3648 3694 3709 3764 3780 3784 3796 3802 3812 3829 3935 3956 3973 4009 4012 4048 4111 4129 4130 4151 4165 4166 4176 4189 4195 4244 4252 4260 4285 4323 15 104 ACACGC/GCGTGT 0 -2 191 201 1 -5.3 11 58 59 67 75 112 160 165 176 182 218 264 290 294 309 311 326 333 340 358 367 394 395 396 400 419 425 451 465 473 477 494 498 503 551 564 576 578 595 597 607 623 624 633 642 643 655 686 689 720 742 758 783 800 801 829 894 911 919 925 934 951 956 980 995 1048 1069 1149 1160 1177 1187 1240 1251 1258 1274 1302 1378 1389 1394 1416 1461 1489 1536 1577 1582 1599 1631 1741 1775 1788 1808 1863 1867 1882 1916 1956 1960 1971 1972 1978 2043 2045 2072 2083 2091 2096 2111 2125 2130 2144 2187 2210 2224 2227 2237 2293 2300 2318 2321 2364 2404 2410 2439 2442 2504 2521 2535 2564 2576 2582 2616 2634 2670 2675 2732 2758 2766 2775 2833 2850 2885 2889 2908 2972 3005 3008 3067 3071 3090 3123 3141 3156 3181 3198 3297 3317 3333 3351 3362 3363 3393 3397 3408 3411 3413 3443 3462 3497 3509 3563 3584 3609 3681 3697 3717 3758 3770 3779 3799 3801 3825 3918 3930 3943 4094 4116 4141 4146 4182 4320 4331 24 ACGTTC/GAACGT 0 0 200 196 1 -5.2 40 48 75 102 121 192 200 207 208 211 298 306 329 342 343 353 374 418 429 430 609 614 648 650 697 718 740 749 760 794 822 835 836 845 865 914 920 939 977 986 1063 1071 1110 1114 1121 1137 1144 1150 1198 1219 1234 1256 1266 1273 1282 1304 1340 1372 1375 1410 1416 1434 1447 1458 1475 1495 1499 1575 1663 1668 1676 1684 1701 1704 1707 1756 1786 1811 1848 1861 1867 1896 1925 1931 1976 1977 1992 2002 2010 2013 2070 2080 2131 2156 2169 2181 2198 2212 2225 2253 2265 2292 2303 2332 2333 2360 2384 2389 2391 2419 2450 2452 2469 2471 2495 2497 2548 2561 2563 2576 2636 2655 2676 2685 2693 2726 2757 2783 2788 2789 2834 2856 2871 2916 2923 2945 3024 3068 3117 3122 3126 3154 3161 3196 3209 3230 3254 3311 3325 3328 3330 3331 3382 3385 3386 3394 3416 3432 3498 3525 3566 3577 3615 3619 3626 3644 3675 3678 3707 3719 3722 3824 3857 3867 3870 3885 3910 3924 3926 3937 3942 3955 3960 3987 3995 3998 3999 4023 4039 4079 4103 4150 4188 4202 4213 4219 4261 4285 4306 4339 188 GTCCAC/GTGGAC 0 -4 180 188 3 -3.1 0 51 54 62 76 113 147 169 180 205 217 246 253 291 324 327 388 415 428 429 446 456 484 530 539 567 569 586 594 622 630 634 648 684 685 689 697 702 716 721 733 744 756 767 794 831 875 930 980 996 1003 1016 1035 1094 1115 1128 1134 1145 1166 1169 1180 1194 1208 1215 1234 1250 1257 1268 1280 1281 1375 1441 1559 1584 1625 1634 1643 1645 1646 1652 1670 1698 1742 1839 1858 1871 1882 1908 1921 1972 1980 1983 1990 1995 2001 2045 2053 2057 2062 2074 2094 2097 2126 2131 2149 2150 2162 2171 2179 2196 2214 2215 2232 2328 2335 2374 2406 2411 2421 2439 2445 2448 2465 2496 2501 2553 2568 2584 2588 2697 2711 2770 2803 2816 2871 2947 2993 3107 3117 3134 3141 3180 3239 3285 3327 3361 3378 3396 3417 3526 3528 3543 3546 3549 3551 3575 3583 3586 3601 3607 3615 3649 3721 3776 3780 3802 3816 3843 3852 3867 3968 4009 4050 4074 4090 4106 4152 4251 4280 4331 3 32 94 TGTCCT/AGGACA 1 -2 190 188 3 -3.1 58 111 127 129 130 133 153 154 191 193 218 223 229 278 315 345 389 393 394 414 457 468 497 513 534 538 567 593 623 639 649 658 670 672 710 743 746 799 853 862 867 871 878 936 1001 1079 1088 1179 1187 1191 1216 1239 1305 1323 1353 1358 1359 1406 1438 1442 1473 1496 1508 1565 1569 1572 1635 1639 1676 1685 1698 1714 1734 1774 1787 1792 1819 1884 1890 1956 1968 2022 2052 2058 2089 2112 2127 2131 2137 2173 2174 2183 2271 2295 2351 2377 2382 2394 2396 2404 2420 2422 2424 2430 2434 2454 2509 2523 2540 2594 2597 2598 2606 2612 2631 2643 2666 2677 2698 2705 2746 2768 2771 2772 2804 2810 2847 2860 2865 2880 2895 2898 2922 2953 2966 3055 3090 3092 3143 3153 3202 3212 3234 3235 3242 3246 3262 3287 3355 3392 3426 3445 3457 3458 3462 3471 3532 3548 3591 3620 3646 3671 3686 3714 3751 3783 3794 3811 3832 3841 3884 3891 3902 4031 4053 4108 4120 4121 4172 4191 4196 4198 4216 4221 4250 4262 4273 4291 4301 4305 63 248 262 ACGTAG/CTACGT 0 0 177 176 1 -4.6 61 66 82 114 133 139 159 181 187 264 284 294 307 315 346 347 366 390 446 449 468 507 514 515 526 552 592 597 629 636 653 654 699 738 753 762 815 819 881 897 917 990 995 1012 1026 1060 1062 1124 1142 1144 1165 1187 1193 1202 1217 1221 1248 1276 1286 1320 1334 1442 1506 1526 1591 1623 1644 1665 1694 1706 1713 1729 1750 1760 1787 1816 1817 1864 1865 1866 1892 1988 1992 1998 2036 2062 2122 2162 2203 2237 2248 2266 2268 2329 2457 2492 2521 2533 2535 2558 2567 2584 2636 2649 2712 2719 2736 2767 2770 2774 2797 2823 2848 2871 2873 2878 2903 2907 2940 2972 2984 2992 3045 3096 3135 3165 3192 3215 3245 3266 3281 3286 3320 3336 3383 3387 3444 3457 3470 3477 3496 3511 3525 3573 3574 3589 3625 3637 3661 3676 3688 3701 3716 3744 3819 3823 3826 3831 3832 3868 3891 3900 3928 3951 3965 3990 4011 4068 4071 4082 4097 4147 4153 4170 4267 4331 4345 15 CCCACG/CGTGGG 0 -3 165 175 2 -3.5 0 35 75 112 127 137 158 160 176 185 203 209 211 213 214 250 270 320 331 351 353 370 377 397 409 431 448 456 464 468 491 526 583 609 613 617 673 679 690 772 806 824 847 850 879 882 910 915 923 960 971 1024 1028 1029 1054 1058 1107 1120 1143 1155 1161 1166 1173 1201 1213 1360 1365 1379 1431 1443 1447 1475 1486 1488 1560 1582 1603 1614 1629 1656 1667 1711 1769 1789 1817 1846 1870 1873 1886 1887 1903 1912 1943 1945 1950 2004 2011 2155 2203 2258 2300 2304 2305 2337 2342 2349 2360 2372 2421 2465 2470 2492 2494 2524 2532 2534 2563 2599 2789 2814 2828 2834 2914 2936 2939 2970 2989 3000 3008 3047 3057 3073 3105 3154 3197 3208 3215 3227 3267 3437 3445 3449 3457 3458 3478 3496 3527 3604 3618 3703 3710 3793 3822 3853 3899 3911 3922 4010 4026 4060 4081 4172 4187 4219 4293 26 45 CACGAC/GTCGTG 0 -1 166 172 1 -4.5 31 34 56 65 68 69 95 97 110 112 116 125 139 150 175 223 253 285 383 461 487 514 518 520 559 564 587 599 711 729 788 816 871 884 903 906 928 941 954 1023 1047 1069 1089 1117 1170 1191 1213 1220 1236 1237 1245 1276 1312 1315 1336 1343 1366 1371 1384 1390 1426 1428 1430 1431 1436 1441 1459 1488 1496 1522 1564 1583 1590 1595 1623 1628 1641 1672 1684 1701 1737 1739 1753 1757 1783 1831 1909 1910 1936 1943 1949 2005 2015 2075 2087 2100 2120 2153 2164 2177 2182 2199 2209 2238 2242 2244 2324 2325 2337 2342 2374 2388 2479 2493 2506 2517 2561 2568 2595 2600 2637 2721 2745 2794 2891 2910 2919 2931 2963 2986 3049 3052 3138 3217 3225 3288 3349 3353 3456 3474 3489 3537 3557 3577 3601 3679 3734 3779 3827 3838 3868 3882 3900 3938 3947 3961 4004 4010 4086 4089 4139 4142 4162 4219 4265 4314 107 ATTGTG/CACAAT 3 -5 167 167 1 -4.4 20 54 55 59 79 83 99 138 157 162 184 198 206 209 210 222 273 344 360 361 385 405 407 421 422 477 522 539 591 613 660 672 696 718 740 762 872 885 909 954 1042 1044 1051 1055 1067 1093 1100 1140 1158 1177 1189 1262 1269 1413 1450 1462 1495 1521 1528 1547 1657 1660 1674 1705 1736 1763 1799 1811 1835 1853 1862 1891 1893 1911 1913 1923 1946 1973 2050 2060 2076 2083 2103 2112 2113 2151 2236 2280 2304 2323 2354 2379 2436 2437 2459 2509 2518 2530 2565 2591 2593 2638 2639 2695 2738 2757 2778 2884 2922 2937 2973 2987 3009 3011 3015 3017 3028 3038 3046 3078 3096 3111 3179 3213 3325 3390 3407 3412 3428 3441 3456 3502 3513 3516 3528 3584 3605 3645 3648 3725 3752 3767 3787 3795 3805 3837 3906 3958 3974 3978 3980 4074 4102 4120 4122 4138 4149 4167 4184 4205 4236 4242 4252 4259 4286 4290 4324 179 ACGTAC/GTACGT 0 0 168 165 2 -3.3 61 139 155 168 170 173 180 186 194 261 329 341 350 362 366 367 379 423 443 469 506 553 584 591 641 663 668 715 772 788 792 798 806 820 821 832 854 888 908 931 936 972 978 986 998 1035 1041 1042 1056 1093 1140 1188 1229 1249 1258 1269 1305 1376 1390 1425 1442 1539 1564 1587 1607 1623 1643 1645 1646 1660 1680 1684 1731 1744 1747 1842 1857 1866 1871 1913 1929 1956 1979 2020 2052 2110 2148 2207 2220 2228 2266 2270 2272 2273 2317 2322 2359 2368 2462 2490 2496 2559 2601 2604 2613 2624 2629 2667 2710 2726 2778 2790 2837 2852 2853 2866 2882 2911 2939 2964 2992 3020 3030 3080 3085 3097 3165 3182 3207 3229 3232 3271 3286 3296 3305 3337 3382 3403 3463 3464 3465 3478 3532 3541 3555 3570 3572 3597 3598 3608 3612 3627 3644 3724 3819 3823 3955 3957 3974 3997 4025 4039 4042 4043 4134 4136 4224 4266 115 167 AACGTT/AACGTT 0 -1 167 160 2 -3.2 14 17 47 91 192 207 263 318 408 418 430 519 606 607 618 671 698 761 802 840 848 939 957 993 1059 1063 1110 1112 1114 1139 1144 1148 1150 1164 1203 1218 1219 1224 1234 1247 1282 1340 1373 1407 1439 1457 1458 1582 1610 1642 1666 1718 1719 1801 1811 1861 1867 1911 1941 1958 1964 1987 2010 2011 2021 2031 2041 2054 2067 2071 2131 2156 2198 2208 2225 2247 2253 2265 2269 2272 2275 2287 2295 2303 2333 2347 2369 2385 2413 2452 2495 2573 2586 2685 2766 2776 2787 2791 2801 2856 2861 2869 2872 2913 2933 2944 2999 3007 3012 3032 3055 3056 3086 3112 3122 3126 3146 3161 3169 3279 3323 3330 3338 3465 3480 3487 3498 3520 3527 3530 3531 3536 3566 3577 3594 3610 3611 3638 3651 3672 3679 3711 3722 3732 3821 3849 3857 3862 3866 3870 3885 3960 3984 4042 4072 4079 4130 4134 4150 4167 4173 4202 4211 4212 4213 4214 4306 148 210 TCTGCC/GGCAGA 4 -4 156 153 1 -4.0 33 46 60 81 119 152 211 226 266 282 328 336 375 413 491 540 541 571 604 661 669 689 734 830 873 899 907 963 996 997 1009 1047 1079 1151 1235 1287 1324 1347 1358 1409 1440 1467 1469 1525 1547 1552 1609 1653 1709 1710 1730 1740 1757 1784 1805 1807 1814 1825 1834 1835 1845 1869 1882 1890 1902 1913 1937 1946 1999 2001 2063 2069 2081 2095 2129 2136 2142 2181 2240 2271 2312 2358 2373 2386 2427 2449 2456 2478 2480 2481 2528 2573 2578 2598 2611 2635 2703 2707 2738 2743 2751 2786 2795 2815 2824 2827 2843 2848 2865 2883 2900 2907 2936 2965 2966 3045 3047 3115 3132 3159 3173 3174 3226 3293 3295 3316 3318 3364 3423 3556 3564 3585 3606 3656 3666 3720 3742 3841 3871 3879 3887 3905 3960 3962 4007 4008 4092 4096 4126 4143 4194 4232 4271 4317 4328 4347 17 TCGACG/CGTCGA 0 -3 148 150 1 -3.9 11 83 114 133 140 196 232 304 310 317 368 391 455 464 480 493 541 542 634 638 653 672 776 800 804 809 895 898 948 954 955 971 979 1019 1023 1031 1033 1049 1050 1101 1124 1135 1144 1177 1183 1200 1308 1351 1352 1372 1401 1418 1426 1428 1453 1489 1508 1515 1529 1559 1565 1596 1606 1630 1640 1688 1754 1784 1824 1830 1836 1842 1843 2051 2162 2182 2260 2392 2400 2410 2429 2448 2473 2480 2500 2520 2541 2544 2592 2654 2659 2676 2722 2740 2743 2796 2843 2851 2859 3126 3132 3209 3270 3278 3302 3420 3433 3449 3453 3479 3486 3488 3558 3571 3579 3627 3632 3637 3644 3669 3677 3768 3808 3844 3860 3861 3888 3912 3942 3970 3994 3998 4001 4042 4054 4068 4074 4082 4095 4096 4136 4144 4162 4176 4186 4212 4230 4331 74 AACGCC/GGCGTT 2 -1 152 150 1 -3.9 48 63 107 117 146 193 204 214 215 226 260 271 272 284 316 352 373 438 475 571 631 637 703 757 769 773 803 806 810 837 873 877 906 952 961 974 976 1053 1055 1087 1173 1179 1242 1317 1368 1396 1415 1423 1466 1479 1495 1506 1539 1570 1585 1654 1662 1691 1721 1777 1793 1800 1801 1833 1846 1872 1942 1946 1966 1967 1969 2043 2083 2106 2117 2176 2207 2235 2264 2296 2447 2485 2489 2502 2589 2623 2632 2653 2680 2719 2739 2765 2770 2779 2877 2881 2892 2941 2979 2993 3001 3009 3010 3079 3129 3172 3191 3200 3212 3243 3262 3278 3346 3347 3375 3384 3388 3428 3439 3478 3486 3500 3550 3608 3628 3630 3645 3650 3707 3723 3756 3845 3907 3911 3936 3948 4006 4019 4043 4051 4115 4133 4140 4161 4163 4178 4205 4213 4249 4277 4302 4332 77 GGTGGC/GCCACC 1 -4 145 144 1 -3.8 0 35 42 96 231 267 282 303 354 395 467 490 494 515 582 612 676 680 803 866 901 906 925 948 985 1015 1064 1106 1117 1131 1164 1196 1202 1220 1221 1298 1301 1351 1353 1419 1424 1440 1463 1543 1570 1649 1665 1695 1733 1736 1784 1835 1841 1946 1967 1971 1982 2004 2038 2040 2064 2084 2095 2106 2112 2131 2162 2272 2332 2387 2398 2402 2476 2492 2499 2630 2645 2655 2684 2710 2719 2731 2760 2779 2781 2868 2908 2938 2942 2977 2979 3051 3065 3101 3118 3127 3179 3210 3224 3229 3243 3257 3282 3380 3381 3387 3460 3479 3531 3551 3565 3642 3649 3652 3655 3707 3721 3740 3791 3875 3911 3940 3943 3961 3979 3987 4016 4018 4024 4072 4074 4143 4157 4175 4177 4192 4217 4253 4264 4270 4292 4294 4301 4302 4328 61 GGCCAC/GTGGCC 0 -4 131 138 0 -3.7 31 35 40 55 77 95 110 137 187 198 221 239 261 303 331 356 389 399 401 407 408 448 449 489 531 557 559 600 611 668 685 745 746 773 857 864 866 904 1036 1058 1097 1129 1133 1161 1190 1205 1254 1259 1283 1301 1342 1402 1413 1460 1487 1488 1555 1557 1674 1701 1730 1766 1771 1815 1847 1864 1925 1945 1996 2040 2077 2081 2140 2171 2230 2258 2294 2340 2374 2377 2393 2416 2417 2426 2627 2636 2725 2732 2918 2929 2953 2956 2986 3018 3068 3127 3164 3185 3187 3269 3272 3276 3382 3388 3448 3452 3474 3488 3489 3492 3663 3677 3718 3773 3833 3848 3850 3853 3854 3860 3896 3916 3926 3993 4004 4137 4157 4272 4295 4301 4336 -1 GTGGCC/GGCCAC 1 -3 131 138 0 -3.7 31 35 40 55 77 95 110 137 187 198 221 239 261 303 331 356 389 399 401 407 408 448 449 489 531 557 559 600 611 668 685 745 746 773 857 864 866 904 1036 1058 1097 1129 1133 1161 1190 1205 1254 1259 1283 1301 1342 1402 1413 1460 1487 1488 1555 1557 1674 1701 1730 1766 1771 1815 1847 1864 1925 1945 1996 2040 2077 2081 2140 2171 2230 2258 2294 2340 2374 2377 2393 2416 2417 2426 2627 2636 2725 2732 2918 2929 2953 2956 2986 3018 3068 3127 3164 3185 3187 3269 3272 3276 3382 3388 3448 3452 3474 3488 3489 3492 3663 3677 3718 3773 3833 3848 3850 3853 3854 3860 3896 3916 3926 3993 4004 4137 4157 4272 4295 4301 4336 -1 CTCAAG/CTTGAG 5 -3 128 134 1 -3.5 4 49 66 137 192 197 216 220 258 263 277 313 338 380 397 445 526 634 674 695 746 821 890 900 901 929 943 948 988 1001 1035 1053 1066 1077 1079 1172 1220 1222 1254 1307 1319 1324 1334 1345 1346 1396 1397 1419 1440 1463 1503 1511 1528 1565 1570 1598 1660 1748 1769 1770 1779 1822 1829 1831 1835 1837 1838 1839 1851 1856 1870 1876 1907 2008 2035 2040 2061 2063 2091 2135 2236 2254 2270 2312 2363 2391 2399 2414 2462 2477 2598 2658 2683 2931 2933 3019 3132 3136 3137 3187 3192 3221 3262 3397 3433 3436 3479 3547 3603 3654 3732 3759 3795 3902 3913 3988 4004 4019 4057 4110 4160 4190 4197 4207 4221 4279 4328 4335 107 CCACGC/GCGTGG 0 -2 128 133 0 -3.5 37 60 77 83 108 127 149 234 253 255 282 290 351 367 383 389 428 454 456 464 556 716 744 760 824 834 948 960 984 1011 1028 1058 1097 1107 1115 1201 1210 1213 1240 1258 1317 1330 1353 1371 1404 1461 1481 1523 1529 1546 1600 1625 1626 1647 1715 1769 1864 1873 1907 1933 1955 2040 2094 2152 2157 2160 2196 2202 2279 2300 2304 2305 2320 2334 2335 2347 2426 2439 2453 2465 2524 2544 2549 2661 2673 2689 2729 2759 2776 2885 2889 2907 2926 2995 3008 3037 3057 3121 3140 3177 3227 3241 3264 3276 3312 3361 3380 3421 3422 3448 3488 3489 3493 3541 3549 3590 3618 3655 3721 3833 3896 3911 4005 4114 4137 4320 4336 4344 -1 CACGCA/TGCGTG 0 -1 119 124 1 -3.2 58 108 112 149 160 165 239 253 255 282 290 294 311 326 333 367 383 414 425 428 442 477 503 525 574 607 623 624 642 655 689 700 783 800 801 894 919 948 956 1000 1069 1107 1160 1165 1177 1182 1213 1251 1258 1317 1353 1378 1394 1453 1467 1577 1615 1715 1727 1774 1775 1863 1956 2043 2045 2072 2091 2111 2224 2227 2279 2293 2318 2334 2335 2364 2465 2500 2524 2557 2564 2582 2634 2732 2760 2766 2775 2898 2972 3032 3037 3090 3123 3297 3312 3333 3361 3397 3443 3509 3511 3541 3549 3624 3697 3741 3758 3799 3821 3825 3896 3911 3918 3930 3937 4032 4114 4119 4336 120 CGCCAA/TTGGCG 2 1 120 116 1 -3.0 43 70 88 117 224 262 305 314 316 359 381 591 633 757 791 803 810 873 984 1011 1044 1068 1087 1115 1203 1302 1362 1415 1423 1458 1461 1466 1549 1563 1585 1597 1654 1691 1702 1801 1822 1894 1895 1927 1933 1942 1944 1949 1966 1969 1981 2019 2083 2147 2325 2335 2399 2418 2424 2431 2447 2485 2502 2510 2521 2540 2589 2601 2621 2646 2653 2679 2691 2733 2776 2801 2881 2924 3009 3019 3103 3129 3172 3200 3219 3304 3315 3346 3347 3357 3384 3418 3434 3435 3510 3555 3579 3598 3628 3703 3756 3757 3836 3839 3888 3894 3911 3936 3948 4024 4080 4115 4148 4175 4178 4213 4249 4275 4303 4330 37