#1138/1138 #46.19 # k-mer/r.c. Cluster Offset PosCt wPosCt NegCt HGP_10 CACGTG/CACGTG 0 -4 496 535 16 -171.6 0 1 2 3 4 6 8 9 10 11 18 19 20 21 22 23 25 26 27 28 29 31 33 34 35 36 37 38 39 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 54 56 57 60 61 62 65 66 67 71 76 77 80 84 87 88 89 91 92 95 96 97 100 101 102 103 105 107 110 111 112 113 116 117 121 122 123 124 125 127 128 133 134 135 138 139 140 141 144 147 149 153 154 155 157 161 162 165 167 168 169 170 174 175 181 185 188 189 190 194 196 197 201 202 205 207 208 211 212 213 219 221 222 229 234 235 240 242 243 244 245 246 247 248 250 252 253 261 264 266 268 270 271 272 274 275 278 280 281 282 285 286 290 291 292 293 294 298 300 301 302 304 305 307 308 309 312 313 315 320 321 323 328 334 337 342 345 350 352 353 354 356 357 358 364 369 371 372 374 376 382 386 387 388 389 391 394 398 399 400 404 406 408 410 411 414 415 416 418 421 423 424 426 428 430 431 433 434 435 436 437 439 440 442 443 444 446 449 450 451 453 454 456 457 458 459 460 461 465 469 473 474 476 477 478 480 481 482 483 491 492 494 495 496 498 501 508 509 510 513 514 515 520 528 531 532 539 543 544 545 546 548 550 551 553 556 557 560 562 563 566 568 569 575 576 577 579 582 585 586 590 592 594 596 602 603 605 606 608 610 611 612 614 616 617 618 620 621 622 624 626 627 630 632 635 636 640 641 642 644 647 650 657 659 662 663 666 667 669 670 673 676 682 683 687 689 691 692 695 696 697 698 702 705 710 716 719 721 722 725 726 733 734 738 739 740 741 742 743 744 747 748 749 750 751 752 753 754 759 761 762 763 764 766 775 778 781 785 787 788 791 793 796 797 798 801 802 803 805 808 812 813 815 816 828 830 831 833 834 835 836 837 839 840 841 842 851 853 854 857 859 860 861 862 864 865 867 868 872 875 876 877 879 882 885 887 889 890 894 895 897 898 899 916 918 922 924 933 935 936 941 944 946 948 950 951 956 958 965 971 972 973 983 986 990 993 996 997 1004 1005 1007 1010 1012 1014 1016 1018 1021 1024 1029 1031 1032 1037 1038 1041 1045 1050 1051 1056 1057 1060 1067 1068 1078 1079 1082 1089 1092 1094 1095 1101 1102 1103 1105 1108 1117 1125 1129 287 301 324 355 402 404 410 414 524 558 596 628 749 845 874 1021 CACGTG/CACGTG 7 -1 496 535 16 -171.6 0 1 2 3 4 6 8 9 10 11 18 19 20 21 22 23 25 26 27 28 29 31 33 34 35 36 37 38 39 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 54 56 57 60 61 62 65 66 67 71 76 77 80 84 87 88 89 91 92 95 96 97 100 101 102 103 105 107 110 111 112 113 116 117 121 122 123 124 125 127 128 133 134 135 138 139 140 141 144 147 149 153 154 155 157 161 162 165 167 168 169 170 174 175 181 185 188 189 190 194 196 197 201 202 205 207 208 211 212 213 219 221 222 229 234 235 240 242 243 244 245 246 247 248 250 252 253 261 264 266 268 270 271 272 274 275 278 280 281 282 285 286 290 291 292 293 294 298 300 301 302 304 305 307 308 309 312 313 315 320 321 323 328 334 337 342 345 350 352 353 354 356 357 358 364 369 371 372 374 376 382 386 387 388 389 391 394 398 399 400 404 406 408 410 411 414 415 416 418 421 423 424 426 428 430 431 433 434 435 436 437 439 440 442 443 444 446 449 450 451 453 454 456 457 458 459 460 461 465 469 473 474 476 477 478 480 481 482 483 491 492 494 495 496 498 501 508 509 510 513 514 515 520 528 531 532 539 543 544 545 546 548 550 551 553 556 557 560 562 563 566 568 569 575 576 577 579 582 585 586 590 592 594 596 602 603 605 606 608 610 611 612 614 616 617 618 620 621 622 624 626 627 630 632 635 636 640 641 642 644 647 650 657 659 662 663 666 667 669 670 673 676 682 683 687 689 691 692 695 696 697 698 702 705 710 716 719 721 722 725 726 733 734 738 739 740 741 742 743 744 747 748 749 750 751 752 753 754 759 761 762 763 764 766 775 778 781 785 787 788 791 793 796 797 798 801 802 803 805 808 812 813 815 816 828 830 831 833 834 835 836 837 839 840 841 842 851 853 854 857 859 860 861 862 864 865 867 868 872 875 876 877 879 882 885 887 889 890 894 895 897 898 899 916 918 922 924 933 935 936 941 944 946 948 950 951 956 958 965 971 972 973 983 986 990 993 996 997 1004 1005 1007 1010 1012 1014 1016 1018 1021 1024 1029 1031 1032 1037 1038 1041 1045 1050 1051 1056 1057 1060 1067 1068 1078 1079 1082 1089 1092 1094 1095 1101 1102 1103 1105 1108 1117 1125 1129 287 301 324 355 402 404 410 414 524 558 596 628 749 845 874 1021 ACGTGA/TCACGT 0 -3 347 373 24 -96.7 1 2 3 4 8 9 11 18 19 21 23 25 26 27 28 33 35 36 37 38 42 43 45 46 48 50 54 56 57 60 61 65 66 67 76 80 84 88 89 91 95 96 97 100 101 102 103 105 107 110 111 113 116 117 123 125 127 128 133 135 141 144 148 149 153 154 155 161 162 168 174 175 181 185 194 197 201 202 205 207 208 211 213 218 221 222 229 234 235 240 242 244 245 246 247 248 250 252 261 264 266 268 270 275 280 281 282 285 286 290 292 293 300 301 304 305 307 308 313 315 320 321 323 328 334 337 342 345 348 352 353 354 357 358 369 371 376 380 384 387 388 391 398 399 400 404 406 407 408 414 415 416 418 421 424 426 428 430 433 435 437 442 443 444 446 450 454 456 457 458 460 461 469 473 474 476 477 478 481 483 490 491 492 493 494 495 497 501 507 508 509 513 514 515 520 539 540 545 546 548 551 562 566 567 568 577 579 582 585 586 592 596 606 608 610 611 612 614 616 617 618 627 628 630 635 641 642 644 650 657 659 662 663 669 670 682 687 689 691 692 695 696 697 698 705 719 722 726 738 741 742 744 747 748 750 751 752 759 761 763 772 773 775 782 787 788 791 793 796 797 798 801 802 803 805 813 815 830 831 833 836 837 839 841 842 853 854 857 860 861 862 865 867 868 877 879 882 885 887 888 890 895 899 900 913 916 922 924 933 942 946 950 956 958 965 971 973 974 982 983 984 986 1004 1010 1027 1029 1038 1039 1044 1045 1046 1056 1060 1063 1067 1068 1082 1089 1092 1101 1102 1103 1105 1108 1117 1125 1132 44 189 190 287 301 324 355 404 410 414 512 558 596 612 639 668 755 759 808 938 944 960 1021 1113 CACATG/CATGTG 0 -4 361 362 37 -81.1 2 8 9 14 15 17 22 24 30 32 40 43 47 51 53 58 59 62 63 64 65 72 73 74 75 80 81 84 85 86 90 92 98 99 103 104 106 109 111 113 120 122 123 127 130 131 132 136 137 142 146 151 152 156 159 160 163 164 171 172 173 178 179 180 186 191 192 193 195 198 199 206 209 210 214 215 216 217 219 220 223 225 231 232 233 235 237 241 244 249 250 251 255 256 257 258 259 260 263 265 267 269 276 277 279 283 289 295 296 297 302 306 310 313 315 318 319 325 326 327 329 331 335 336 338 339 340 341 348 355 360 361 362 366 370 373 375 377 381 385 393 396 397 398 400 402 409 412 413 419 425 426 427 430 438 441 444 445 451 452 463 475 488 489 493 494 499 503 506 507 511 517 518 519 521 522 523 524 525 526 527 530 534 535 537 538 540 552 554 555 556 561 564 565 572 573 574 575 583 584 588 589 593 595 598 599 600 601 604 605 609 613 619 633 636 637 639 643 645 646 648 652 654 655 656 660 661 664 672 675 677 679 695 699 700 703 706 709 711 712 714 716 717 720 729 731 736 737 739 762 765 768 769 774 779 780 782 783 784 785 786 788 795 800 802 803 806 808 809 810 814 817 822 824 826 834 840 845 846 848 850 855 856 870 880 883 884 886 893 895 902 906 910 911 912 917 920 921 923 925 928 931 939 943 946 948 949 956 961 963 965 967 968 972 973 977 981 984 985 988 997 1002 1003 1008 1009 1019 1021 1023 1026 1028 1030 1033 1038 1042 1047 1048 1049 1052 1059 1064 1072 1073 1074 1075 1080 1081 1083 1087 1092 1096 1098 1100 1101 1103 1110 1116 1121 1122 1130 1132 1134 46 78 107 133 170 197 203 269 317 341 347 418 432 433 461 486 572 591 615 627 660 672 679 704 712 745 748 810 878 920 973 984 986 1019 1043 1051 1128 CCACGT/ACGTGG 0 -5 302 319 15 -86.7 0 1 5 6 8 9 10 19 20 25 26 31 34 35 37 38 42 44 48 49 62 65 66 67 71 77 84 87 88 91 95 100 101 102 105 107 111 116 117 119 121 122 124 125 133 134 140 143 144 147 149 154 155 156 157 161 165 167 169 170 179 181 188 189 202 207 211 212 220 221 229 243 244 246 247 248 250 252 264 266 271 272 274 275 278 291 292 294 298 301 302 304 305 308 309 312 315 321 337 353 354 356 358 364 374 376 382 386 394 410 411 416 418 423 424 431 433 434 435 436 437 439 440 443 451 453 455 457 458 459 465 469 473 474 476 477 480 482 483 491 492 494 495 496 498 501 508 509 510 513 515 517 527 528 531 535 539 543 544 545 557 560 562 563 569 575 577 579 585 586 592 594 602 603 605 606 611 612 614 615 616 617 621 622 626 635 636 640 647 657 662 666 667 673 676 682 683 696 698 702 716 729 733 738 740 741 749 750 753 754 760 762 763 764 771 778 781 785 788 791 793 802 803 805 808 811 812 813 815 830 831 834 835 837 840 841 842 844 854 859 862 864 865 866 871 872 875 876 879 882 885 889 892 894 895 898 901 924 933 936 941 944 946 948 950 951 956 958 972 978 986 990 992 993 994 996 1001 1005 1011 1012 1014 1016 1018 1021 1031 1032 1036 1037 1041 1050 1060 1067 1068 1078 1079 1089 1092 1094 1095 1102 1103 1136 110 146 355 402 492 558 596 606 637 693 735 801 845 892 949 CCACGT/ACGTGG 7 -2 302 319 15 -86.7 0 1 5 6 8 9 10 19 20 25 26 31 34 35 37 38 42 44 48 49 62 65 66 67 71 77 84 87 88 91 95 100 101 102 105 107 111 116 117 119 121 122 124 125 133 134 140 143 144 147 149 154 155 156 157 161 165 167 169 170 179 181 188 189 202 207 211 212 220 221 229 243 244 246 247 248 250 252 264 266 271 272 274 275 278 291 292 294 298 301 302 304 305 308 309 312 315 321 337 353 354 356 358 364 374 376 382 386 394 410 411 416 418 423 424 431 433 434 435 436 437 439 440 443 451 453 455 457 458 459 465 469 473 474 476 477 480 482 483 491 492 494 495 496 498 501 508 509 510 513 515 517 527 528 531 535 539 543 544 545 557 560 562 563 569 575 577 579 585 586 592 594 602 603 605 606 611 612 614 615 616 617 621 622 626 635 636 640 647 657 662 666 667 673 676 682 683 696 698 702 716 729 733 738 740 741 749 750 753 754 760 762 763 764 771 778 781 785 788 791 793 802 803 805 808 811 812 813 815 830 831 834 835 837 840 841 842 844 854 859 862 864 865 866 871 872 875 876 879 882 885 889 892 894 895 898 901 924 933 936 941 944 946 948 950 951 956 958 972 978 986 990 992 993 994 996 1001 1005 1011 1012 1014 1016 1018 1021 1031 1032 1036 1037 1041 1050 1060 1067 1068 1078 1079 1089 1092 1094 1095 1102 1103 1136 110 146 355 402 492 558 596 606 637 693 735 801 845 892 949 ACGTGT/ACACGT 0 -3 210 217 30 -40.4 2 6 10 19 21 22 25 27 29 39 41 48 49 61 62 65 76 80 96 107 112 116 117 121 122 125 127 133 138 140 142 144 147 170 175 178 185 190 196 197 198 212 215 219 234 243 248 250 253 261 275 282 294 300 308 350 356 364 369 372 376 387 388 389 398 400 402 406 411 414 415 421 426 430 438 439 440 449 451 453 454 459 476 477 482 491 499 505 508 510 514 520 532 544 548 550 553 556 563 568 571 576 582 585 586 590 596 597 602 605 606 608 610 612 618 620 621 624 632 633 636 641 642 650 658 677 687 692 693 702 705 715 716 719 721 722 725 731 733 734 739 740 743 744 747 750 754 766 767 779 780 781 791 796 797 801 805 808 816 833 834 839 848 851 853 859 860 861 862 866 872 876 890 897 898 903 916 918 924 935 936 939 948 965 970 973 983 997 1004 1005 1007 1010 1013 1016 1017 1018 1027 1036 1037 1044 1051 1056 1057 1063 1077 1079 1102 1125 1129 1131 8 17 21 77 103 287 300 301 321 402 404 524 628 636 719 745 748 749 754 755 761 780 809 845 853 874 927 1041 1080 1124 CGTGAA/TTCACG 0 -2 180 201 25 -39.2 2 3 4 8 9 10 23 25 27 33 37 38 45 48 50 54 56 57 60 61 67 70 71 76 87 88 89 100 101 102 105 107 112 113 117 125 133 141 149 161 162 168 171 175 185 194 197 202 205 207 208 211 214 217 221 222 227 228 235 240 242 245 246 247 252 267 268 270 275 281 282 285 286 290 292 299 305 313 321 333 334 342 352 354 357 358 380 384 388 399 404 408 433 442 444 446 460 461 469 473 474 481 483 493 494 501 508 509 515 545 546 551 562 568 577 579 585 586 590 597 608 614 617 627 628 630 635 641 644 650 659 663 670 682 687 705 719 722 726 744 748 750 751 761 770 782 786 787 788 813 816 831 836 837 853 868 877 885 887 890 891 899 926 942 950 958 983 984 986 988 1039 1045 1046 1060 1084 1089 1101 1102 1105 1117 44 180 301 315 355 362 400 410 414 461 558 561 612 641 660 700 755 897 938 944 960 1021 1111 1113 1137 TCACAT/ATGTGA 0 -5 205 201 50 -25.3 8 9 22 32 40 47 51 53 59 63 64 66 81 85 86 90 98 99 106 109 111 122 127 132 136 137 142 156 163 164 171 172 175 178 180 191 193 195 198 206 215 216 217 220 223 225 231 232 237 249 251 255 257 265 267 270 276 277 279 295 297 310 315 318 326 327 329 331 336 338 339 340 341 355 360 362 373 375 385 393 402 411 412 413 425 430 445 451 452 489 493 494 514 519 521 522 523 525 530 531 534 535 538 555 557 561 564 572 579 588 589 595 598 599 600 601 604 613 630 637 643 646 652 654 655 656 661 667 678 706 709 711 712 720 729 731 739 741 762 769 774 779 780 784 785 786 800 802 803 806 809 810 822 826 834 846 848 850 855 856 870 875 884 886 893 895 906 909 917 920 921 923 928 939 954 965 967 968 972 978 980 981 983 987 988 1008 1009 1015 1023 1028 1033 1038 1042 1048 1049 1059 1064 1073 1080 1081 1087 1094 1098 1116 1122 29 31 42 46 95 123 133 160 169 184 220 254 258 269 277 279 360 370 410 434 461 473 503 510 544 563 591 609 620 633 672 690 728 745 748 752 761 776 813 854 878 887 892 973 1019 1051 1073 1076 1132 1134 ACATGG/CCATGT 0 -3 186 195 29 -34.8 2 4 14 15 20 24 28 30 32 43 44 50 59 63 64 72 73 75 81 84 85 86 90 98 104 105 120 132 141 142 146 156 159 163 164 171 172 178 186 191 192 193 198 199 200 209 210 215 219 220 231 232 233 244 257 258 259 260 263 273 277 279 282 283 295 296 306 310 313 315 324 326 327 329 330 336 355 370 373 375 377 385 393 396 397 402 405 409 412 414 426 430 453 467 475 481 486 488 489 493 506 525 530 535 537 538 539 552 572 583 588 594 595 599 601 604 613 618 627 636 637 639 642 646 654 661 672 677 680 681 695 701 706 711 712 716 720 724 736 765 768 777 779 780 783 786 809 810 817 840 845 856 880 890 910 911 917 920 925 928 929 943 949 961 963 965 967 981 984 985 991 1004 1008 1033 1048 1059 1069 1075 1080 1081 1087 1096 1100 1116 1130 1132 90 132 133 142 206 214 301 342 418 486 490 549 569 572 610 649 661 679 706 729 745 793 799 819 878 880 936 1044 1084 ACGTGC/GCACGT 0 -3 171 184 10 -46.6 0 2 3 18 27 38 41 43 44 45 46 47 50 61 87 89 92 103 110 112 116 121 124 125 127 128 133 135 139 154 157 167 174 190 194 201 203 204 205 208 212 213 219 229 235 240 242 271 274 278 280 290 291 293 298 305 307 309 312 313 323 328 334 342 369 371 372 374 386 387 389 391 399 404 410 427 428 434 443 446 449 450 451 453 454 456 459 465 478 480 481 486 496 498 514 528 532 543 551 556 560 566 569 577 585 586 590 594 603 605 611 620 630 648 659 667 673 683 697 698 705 710 725 726 739 743 749 751 753 761 762 766 775 778 787 798 816 828 837 839 840 851 853 854 864 865 867 889 897 899 905 918 935 941 948 950 971 972 1010 1012 1014 1024 1031 1041 1046 1060 1094 1117 1125 1128 1129 72 355 410 524 536 558 628 642 775 1021 CCACAT/ATGTGG 0 -5 137 141 31 -19.5 2 14 15 19 58 59 63 73 75 80 84 85 92 104 106 131 146 151 152 156 159 160 173 179 186 191 195 200 202 206 210 217 219 220 231 232 235 249 250 253 256 263 269 270 302 313 341 348 361 366 370 376 381 382 419 426 427 441 444 452 458 463 475 487 503 507 511 517 518 527 529 534 540 545 553 554 555 559 565 573 574 575 583 601 607 619 626 636 639 645 660 665 673 679 680 700 701 703 716 717 737 783 784 792 795 800 804 821 822 824 845 883 884 892 910 912 917 920 928 931 946 949 956 967 969 973 974 979 997 1004 1030 1047 1074 1083 1116 1121 1132 13 43 99 188 197 242 316 317 336 347 513 572 629 634 639 660 679 692 705 712 768 826 894 920 929 930 968 988 1013 1093 1128 ATCACG/CGTGAT 0 -6 128 140 11 -32.1 3 4 11 16 18 19 23 27 35 36 46 60 65 66 78 79 80 84 88 96 108 111 116 117 127 141 151 152 162 168 174 181 213 234 242 244 250 257 261 264 275 281 289 293 300 307 308 315 320 337 345 357 364 369 384 391 411 430 433 435 437 443 444 454 455 469 478 513 514 544 545 566 577 582 606 610 611 612 616 635 644 658 663 669 684 689 691 692 698 747 748 752 754 763 772 773 775 801 839 841 847 854 860 861 865 868 879 887 913 916 922 929 933 946 965 969 971 982 986 1017 1027 1038 1044 1045 1082 1103 1131 1132 80 149 287 306 311 324 668 707 793 809 921 ACATGC/GCATGT 0 -3 142 136 29 -19.2 8 9 17 53 54 58 59 91 92 104 111 136 141 151 152 173 180 195 205 214 216 223 233 237 241 250 251 255 256 265 276 289 297 317 318 319 325 331 338 339 340 361 366 367 381 389 413 414 419 429 431 438 441 445 451 452 459 484 499 503 517 519 524 526 534 554 555 556 564 565 573 574 598 600 601 606 609 617 619 629 633 643 644 645 648 652 655 656 657 660 664 676 678 699 700 706 709 714 739 745 749 753 774 782 785 788 808 809 812 814 824 845 870 883 893 906 912 921 928 939 948 972 973 988 1009 1019 1026 1033 1034 1038 1049 1052 1073 1079 1080 1081 1101 1103 1116 1121 1122 1134 15 33 46 78 170 197 203 205 233 257 268 310 317 388 404 427 504 660 715 823 825 838 889 993 1014 1043 1083 1095 1112 TCCACG/CGTGGA 0 -6 124 130 15 -25.9 5 8 9 25 32 38 48 49 65 84 87 95 100 101 105 107 111 116 117 119 121 133 149 154 165 176 181 188 202 207 220 229 243 248 252 271 274 298 301 302 305 308 315 377 410 411 416 423 431 433 434 435 436 437 443 451 457 474 480 491 508 510 513 517 527 545 562 575 579 602 622 626 633 636 640 647 657 661 676 733 738 740 741 744 750 753 754 761 764 778 787 788 808 840 858 859 864 865 866 871 873 875 879 889 932 936 951 966 971 978 986 990 992 994 1000 1001 1012 1018 1021 1050 1090 1099 1103 1121 75 85 146 178 220 381 430 558 606 745 781 801 832 892 949 TCCCAC/GTGGGA 1 -1 121 130 12 -28.3 6 10 15 20 25 29 37 41 48 69 71 73 77 92 99 103 116 117 134 138 140 144 145 148 150 156 161 169 195 200 210 219 227 228 252 265 275 277 284 287 317 319 326 327 330 348 352 354 376 392 411 431 432 439 440 443 447 448 459 464 483 492 517 525 529 532 539 544 557 560 577 583 585 586 596 613 621 624 632 645 647 660 683 700 749 785 828 831 841 847 853 854 875 887 888 894 907 908 910 912 915 931 947 957 1009 1017 1025 1028 1032 1040 1041 1057 1067 1068 1078 1079 1089 1097 1098 1116 1130 101 192 324 386 391 586 596 682 832 968 1004 1010 TCCACG/CGTGGA 7 -3 124 130 15 -25.9 5 8 9 25 32 38 48 49 65 84 87 95 100 101 105 107 111 116 117 119 121 133 149 154 165 176 181 188 202 207 220 229 243 248 252 271 274 298 301 302 305 308 315 377 410 411 416 423 431 433 434 435 436 437 443 451 457 474 480 491 508 510 513 517 527 545 562 575 579 602 622 626 633 636 640 647 657 661 676 733 738 740 741 744 750 753 754 761 764 778 787 788 808 840 858 859 864 865 866 871 873 875 879 889 932 936 951 966 971 978 986 990 992 994 1000 1001 1012 1018 1021 1050 1090 1099 1103 1121 75 85 146 178 220 381 430 558 606 745 781 801 832 892 949 CTTCAC/GTGAAG 0 -7 118 125 27 -17.5 2 3 8 9 25 27 33 38 54 88 90 100 101 102 105 106 107 136 139 141 149 168 170 172 193 197 202 214 222 225 238 239 240 242 245 246 247 267 286 292 298 299 310 329 333 338 357 358 384 388 406 408 425 438 444 460 461 481 489 492 493 494 501 519 525 545 546 559 577 588 598 608 617 623 627 630 638 643 650 659 663 665 672 682 707 717 722 726 749 753 770 785 807 813 831 836 885 890 891 926 946 948 981 988 1000 1001 1023 1028 1033 1039 1048 1056 1073 1082 1084 1101 1106 1122 37 49 115 132 151 253 301 315 327 414 563 596 608 618 671 676 731 739 748 755 905 910 986 994 1023 1047 1083 CGTGGG/CCCACG 0 -2 119 122 6 -31.5 6 10 19 20 31 34 37 48 62 71 77 91 103 117 124 134 156 167 169 181 189 210 211 212 244 271 272 275 278 288 291 309 312 326 327 353 374 380 382 394 410 411 423 431 439 440 443 447 448 456 459 465 469 473 483 487 492 494 498 501 515 528 531 539 543 544 557 560 569 577 585 586 606 617 621 632 662 667 682 702 708 749 769 775 785 791 813 814 831 835 844 854 858 872 894 895 898 908 924 932 944 946 947 948 993 998 1006 1025 1032 1041 1060 1067 1068 1078 1079 1089 1092 1094 1095 182 355 391 521 596 959 CCCACG/CGTGGG 1 0 119 122 6 -31.5 6 10 19 20 31 34 37 48 62 71 77 91 103 117 124 134 156 167 169 181 189 210 211 212 244 271 272 275 278 288 291 309 312 326 327 353 374 380 382 394 410 411 423 431 439 440 443 447 448 456 459 465 469 473 483 487 492 494 498 501 515 528 531 539 543 544 557 560 569 577 585 586 606 617 621 632 662 667 682 702 708 749 769 775 785 791 813 814 831 835 844 854 858 872 894 895 898 908 924 932 944 946 947 948 993 998 1006 1025 1032 1041 1060 1067 1068 1078 1079 1089 1092 1094 1095 182 355 391 521 596 959 CCCACG/CGTGGG 7 -3 119 122 6 -31.5 6 10 19 20 31 34 37 48 62 71 77 91 103 117 124 134 156 167 169 181 189 210 211 212 244 271 272 275 278 288 291 309 312 326 327 353 374 380 382 394 410 411 423 431 439 440 443 447 448 456 459 465 469 473 483 487 492 494 498 501 515 528 531 539 543 544 557 560 569 577 585 586 606 617 621 632 662 667 682 702 708 749 769 775 785 791 813 814 831 835 844 854 858 872 894 895 898 908 924 932 944 946 947 948 993 998 1006 1025 1032 1041 1060 1067 1068 1078 1079 1089 1092 1094 1095 182 355 391 521 596 959 CCCACA/TGTGGG 1 0 106 111 15 -20.7 16 19 31 41 58 62 63 73 77 81 92 104 108 116 117 140 148 150 151 152 179 180 186 189 191 195 200 210 213 219 220 224 227 228 234 249 250 256 265 270 287 316 334 348 349 356 376 378 382 422 432 438 444 452 470 482 487 493 511 518 529 533 534 548 554 559 580 583 596 607 613 636 638 639 644 645 660 674 679 680 695 700 783 795 799 829 841 843 845 852 880 887 910 920 931 954 957 997 1009 1017 1028 1047 1071 1098 1116 1130 43 74 101 296 784 798 808 832 920 929 976 988 1003 1004 1013 ACCACG/CGTGGT 0 -6 98 110 12 -22.5 0 6 8 9 34 35 42 53 58 66 67 77 108 119 122 123 132 143 144 147 158 165 169 170 179 188 199 212 221 246 247 250 264 266 272 274 292 294 303 304 309 337 354 376 379 418 422 424 436 464 491 509 516 531 557 569 594 602 605 607 611 612 614 615 616 622 640 658 666 673 676 698 716 737 741 756 771 781 793 802 803 812 815 821 830 841 844 882 885 990 993 996 1011 1014 1016 1037 1088 1117 1 110 111 187 297 476 492 568 637 693 735 845 ACCACG/CGTGGT 7 -3 98 110 12 -22.5 0 6 8 9 34 35 42 53 58 66 67 77 108 119 122 123 132 143 144 147 158 165 169 170 179 188 199 212 221 246 247 250 264 266 272 274 292 294 303 304 309 337 354 376 379 418 422 424 436 464 491 509 516 531 557 569 594 602 605 607 611 612 614 615 616 622 640 658 666 673 676 698 716 737 741 756 771 781 793 802 803 812 815 821 830 841 844 882 885 990 993 996 1011 1014 1016 1037 1088 1117 1 110 111 187 297 476 492 568 637 693 735 845 GCCACG/CGTGGC 0 -6 101 106 7 -25.6 1 18 20 25 26 44 48 62 88 102 115 122 125 134 140 155 157 161 170 181 182 189 229 262 266 302 309 321 356 358 364 382 386 394 423 453 455 458 469 476 477 482 495 496 501 508 535 543 563 566 575 592 603 614 635 662 666 676 683 696 702 729 750 760 762 763 764 781 805 811 834 835 837 842 862 871 875 876 892 894 901 933 941 942 947 948 950 951 956 958 972 996 1005 1021 1031 1036 1050 1099 1102 1107 1136 402 746 845 871 896 944 1107 GCCACG/CGTGGC 7 -3 101 106 7 -25.6 1 18 20 25 26 44 48 62 88 102 115 122 125 134 140 155 157 161 170 181 182 189 229 262 266 302 309 321 356 358 364 382 386 394 423 453 455 458 469 476 477 482 495 496 501 508 535 543 563 566 575 592 603 614 635 662 666 676 683 696 702 729 750 760 762 763 764 781 805 811 834 835 837 842 862 871 875 876 892 894 901 933 941 942 947 948 950 951 956 958 972 996 1005 1021 1031 1036 1050 1099 1102 1107 1136 402 746 845 871 896 944 1107 GACACG/CGTGTC 0 -6 99 103 16 -17.9 15 22 25 29 42 65 75 80 107 108 112 117 121 133 138 170 175 185 190 196 197 243 248 251 253 258 275 282 302 308 343 369 376 398 400 402 403 414 421 451 476 477 483 508 510 514 550 553 568 582 600 605 606 608 609 620 624 632 633 636 641 642 650 653 677 712 716 721 725 730 731 733 734 739 740 750 755 781 833 859 890 898 916 935 939 970 973 983 989 1004 1007 1027 1037 1044 1051 1102 1126 1127 1131 8 77 346 402 524 628 636 646 706 745 754 853 874 1041 1046 1080 TGTCAC/GTGACA 0 -7 100 102 22 -14.4 11 32 51 53 65 69 91 95 97 104 119 121 123 127 136 148 153 163 164 175 180 197 203 204 258 265 268 270 277 279 308 320 335 344 345 360 368 372 394 398 400 406 409 414 432 450 454 457 458 476 477 491 519 548 557 575 592 596 600 601 634 644 669 707 709 711 734 745 770 772 773 781 799 805 812 833 842 857 862 873 875 877 880 887 895 909 913 942 956 961 973 980 983 1026 1029 1080 1081 1090 1098 1102 86 121 211 254 258 291 304 311 312 322 333 404 628 657 661 696 789 803 808 874 903 1134 ACCCAC/GTGGGT 1 -1 97 101 13 -19.3 14 19 31 33 34 56 57 62 91 95 99 102 104 124 142 151 152 166 167 176 179 180 189 191 211 212 249 256 259 272 278 279 288 291 308 309 316 334 349 353 355 374 378 382 394 438 449 454 456 470 487 493 496 498 501 511 518 528 534 548 554 580 636 645 667 679 682 702 708 718 752 769 775 777 795 806 816 835 844 846 866 898 910 915 921 924 925 944 946 954 1011 1047 1070 1071 1094 1095 1107 43 173 339 421 521 597 634 741 798 920 959 1003 1013 CCACAC/GTGTGG 2 -4 94 101 12 -20.0 6 12 13 34 39 41 47 60 62 72 81 93 94 95 104 122 141 148 150 180 210 212 224 244 248 249 260 262 265 284 287 294 297 316 334 349 356 365 378 392 409 417 427 432 441 447 448 454 470 483 493 505 512 533 571 579 580 596 608 609 620 638 642 643 644 649 656 679 683 743 745 748 799 830 843 853 862 874 880 882 883 897 908 909 957 997 1009 1017 1038 1057 1061 1065 1071 1107 155 215 228 296 357 408 432 735 976 988 1003 1108 GTGGAC/GTCCAC 3 -3 96 98 9 -21.5 0 12 13 14 15 49 60 65 95 106 107 111 133 156 160 215 217 235 243 246 247 248 253 256 273 301 328 349 359 374 412 431 443 449 451 456 474 483 505 513 517 520 528 558 562 578 579 598 602 608 620 626 640 672 676 679 703 716 734 737 740 744 753 808 811 826 840 855 858 864 866 875 889 892 897 908 912 936 939 946 947 960 966 967 969 992 1000 1001 1007 1030 1047 1051 1061 1074 1090 1135 146 155 242 345 428 438 639 674 832 CACACG/CGTGTG 2 -3 88 97 12 -18.9 6 10 12 13 39 41 42 48 49 56 57 60 72 81 93 94 106 125 138 187 197 219 250 264 284 287 294 309 316 356 372 378 379 387 398 407 430 449 451 453 454 459 470 482 491 499 505 532 544 550 571 580 595 612 618 624 642 658 693 705 715 719 732 743 747 754 760 790 805 808 829 839 843 851 853 862 872 897 908 918 948 965 997 1010 1013 1017 1057 1125 276 402 435 444 748 809 927 954 1003 1017 1108 1124 GACCCA/TGGGTC 1 -2 96 96 20 -14.0 26 27 32 56 57 62 95 99 102 116 128 144 151 152 153 166 171 178 205 212 218 244 253 266 288 291 296 309 316 317 322 350 353 377 378 382 413 421 438 449 454 455 456 487 501 505 534 537 548 552 554 580 591 636 657 662 666 667 671 686 691 702 723 729 739 752 769 775 793 795 806 816 823 844 846 866 869 886 910 912 915 921 924 944 946 954 977 995 1011 1019 1042 1054 1055 1071 1096 1130 43 112 173 175 245 258 298 339 359 430 604 746 844 896 897 934 990 1003 1073 1130 GCACAT/ATGTGC 0 -5 95 92 19 -13.5 14 17 30 40 51 62 65 74 84 109 120 137 192 194 199 209 213 214 220 233 237 241 258 259 260 283 296 302 319 325 335 346 360 367 373 377 394 398 432 438 444 451 465 489 506 524 554 556 575 584 598 600 601 609 631 677 695 699 703 714 716 736 737 768 782 786 808 840 850 855 883 886 902 925 942 943 948 961 963 999 1002 1003 1019 1023 1048 1049 1075 1092 1096 1100 1101 1103 1104 1110 1134 64 100 107 109 170 232 341 418 457 486 660 662 748 810 849 940 1043 1107 1128 GTGGTC/GACCAC 3 -3 86 90 14 -15.8 0 20 37 53 66 72 84 108 110 115 122 134 158 159 179 186 188 198 199 206 220 221 226 231 232 250 266 303 304 326 327 335 349 365 370 376 379 393 400 402 417 424 426 464 468 512 520 531 534 553 555 557 569 571 599 609 612 615 626 637 642 675 686 698 720 725 728 737 783 821 873 876 882 884 888 891 893 997 1012 1016 1031 1088 1115 1122 1126 1127 111 217 455 485 492 524 559 582 614 673 710 735 745 776 CACACA/TGTGTG 2 -3 88 88 27 -9.2 10 34 39 42 47 62 97 103 123 141 150 163 164 172 180 187 188 210 219 224 231 232 244 248 249 264 289 334 349 350 356 361 372 391 392 432 441 470 483 504 505 512 526 576 579 580 581 605 633 642 643 652 664 672 683 732 745 748 755 766 770 788 794 799 806 807 824 827 830 874 880 882 909 911 923 962 974 1009 1013 1032 1061 1070 1072 1073 1076 1110 1130 1131 79 110 130 155 215 274 276 290 296 320 340 357 432 442 444 490 503 687 759 783 809 868 923 976 988 1076 1121 GACATG/CATGTC 6 -6 82 85 26 -9.0 4 20 24 25 28 40 54 91 104 105 107 123 141 145 153 186 235 267 268 273 279 287 330 335 348 360 362 381 382 405 410 414 416 429 431 450 471 481 486 513 519 521 522 526 527 539 561 568 584 587 598 601 617 629 644 676 678 681 699 770 777 786 812 826 834 847 870 875 880 899 902 928 939 972 1008 1034 1042 1047 1052 1069 1090 1121 80 132 211 225 254 257 341 345 369 432 433 476 495 504 534 581 586 657 661 793 803 898 920 973 1019 1121 GTTCAC/GTGAAC 0 -7 72 81 21 -10.0 3 4 8 9 34 37 38 50 61 71 88 99 112 125 161 162 194 211 250 255 268 281 282 285 286 305 326 327 338 342 375 383 431 433 439 440 442 469 470 474 475 483 508 515 530 560 568 605 627 659 687 750 762 786 788 823 856 868 885 887 890 899 905 906 997 1009 1033 1045 1060 1075 1077 1078 24 113 162 279 319 355 419 434 576 587 662 678 700 733 825 897 964 1051 1070 1076 1137 CCACCA/TGGTGG 1 1 77 81 21 -10.0 14 17 37 56 57 86 95 112 119 123 124 131 143 144 169 178 196 241 246 247 249 259 260 271 273 279 283 287 308 313 317 349 358 368 376 392 395 414 422 427 428 441 454 464 475 516 517 520 565 611 620 649 652 663 671 674 699 710 747 816 826 828 831 849 875 880 944 967 1011 1026 1029 1030 1031 1040 1057 1065 1122 1 121 222 226 235 342 378 428 438 454 455 491 571 614 697 717 733 818 947 1087 1097 CCCCAC/GTGGGG 1 -1 80 81 6 -19.2 16 17 30 45 86 108 112 123 130 131 149 161 162 186 210 224 225 245 250 260 270 271 283 313 328 358 372 376 382 395 410 422 423 427 444 449 452 465 469 473 475 482 516 518 533 559 560 569 606 611 622 638 649 660 664 674 680 685 699 755 783 799 814 820 845 849 858 872 880 895 932 993 1006 1030 1032 1050 1060 1065 1092 1122 296 355 621 882 976 988 GTGGGG/CCCCAC 10 -6 80 81 6 -19.2 16 17 30 45 86 108 112 123 130 131 149 161 162 186 210 224 225 245 250 260 270 271 283 313 328 358 372 376 382 395 410 422 423 427 444 449 452 465 469 473 475 482 516 518 533 559 560 569 606 611 622 638 649 660 664 674 680 685 699 755 783 799 814 820 845 849 858 872 880 895 932 993 1006 1030 1032 1050 1060 1065 1092 1122 296 355 621 882 976 988 CCCACC/GGTGGG 1 0 72 80 6 -18.9 14 17 29 33 56 57 69 86 95 112 123 124 131 142 144 149 155 161 166 169 176 259 260 279 283 284 287 308 313 358 376 392 395 427 449 454 464 475 516 517 525 532 542 560 611 645 649 664 683 699 725 752 777 806 816 821 828 831 849 875 888 910 915 932 1006 1011 1017 1030 1040 1065 1070 1122 192 386 586 682 717 968 GGCCCA/TGGGCC 1 -2 69 78 17 -11.2 0 2 6 11 14 19 50 63 67 73 91 124 147 148 163 164 189 200 207 234 244 251 252 254 269 289 290 340 351 356 359 366 397 453 463 505 511 536 561 564 569 589 592 593 607 612 639 644 662 698 714 766 767 821 881 897 900 920 932 993 997 998 1006 1007 1034 1061 1093 1096 1135 74 182 219 285 374 419 420 595 609 618 717 792 795 828 1004 1028 1037 GTCCCA/TGGGAC 1 -2 74 76 9 -15.3 15 25 49 64 91 99 105 116 128 140 145 150 156 166 168 169 171 198 216 226 227 228 266 277 287 317 326 327 348 388 393 400 405 419 439 440 475 505 517 525 544 553 588 601 624 631 647 656 667 675 790 816 828 841 844 847 887 888 908 910 912 919 957 987 994 1008 1027 1040 1052 1057 1061 1089 1129 1130 281 424 504 586 679 703 754 818 1115 CATGGC/GCCATG 0 -2 69 75 11 -13.7 2 14 20 32 50 64 66 72 81 85 86 89 120 134 163 164 172 178 191 199 209 210 250 255 263 283 296 320 329 355 370 389 453 481 500 502 506 519 530 572 573 574 595 620 627 637 639 661 673 680 703 712 733 765 783 809 845 856 883 911 914 928 929 984 985 1020 1048 1069 1135 142 415 582 681 698 805 822 880 945 1112 1134 TCACAC/GTGTGA 2 -4 72 74 19 -9.3 10 42 48 49 78 79 125 138 139 143 163 164 187 188 197 250 264 289 303 309 316 358 367 369 373 379 407 430 439 440 453 470 491 502 527 530 544 550 553 557 576 580 581 583 605 612 624 642 652 658 664 672 705 715 732 755 760 766 770 788 798 805 806 807 882 923 948 960 1050 1070 1084 1125 54 110 130 314 416 442 511 607 639 748 759 779 817 841 865 954 1073 1121 1124 CGTGCT/AGCACG 0 -2 61 68 7 -14.6 2 38 41 47 50 53 61 92 110 112 116 124 125 133 139 157 167 174 190 212 213 229 261 290 298 305 311 334 371 391 399 404 434 496 551 556 560 630 683 743 761 778 787 789 798 821 847 854 864 889 893 899 918 935 971 1009 1010 1031 1050 1094 1129 168 369 642 681 798 1074 1121 TGCACG/CGTGCA 0 -6 61 67 6 -15.2 0 3 41 43 45 71 103 124 128 139 203 204 208 219 235 240 242 271 278 287 293 342 369 372 374 387 389 401 410 450 451 456 459 465 480 481 485 486 498 540 594 639 659 697 705 710 726 739 751 753 808 840 853 867 880 897 930 948 972 1041 1128 72 232 558 715 775 1021 GCCCAT/ATGGGC 1 -1 62 67 13 -10.5 1 2 6 14 15 68 91 106 115 131 147 155 163 164 166 193 251 254 269 289 290 340 351 366 397 453 463 505 546 564 577 582 589 592 593 600 603 612 642 689 714 749 766 768 836 840 881 897 900 914 925 926 932 988 993 1007 1033 1039 1058 1061 1093 1135 159 219 374 420 486 595 609 610 787 792 795 1021 1028 GGTCCC/GGGACC 1 -3 65 64 8 -12.8 10 49 64 99 105 116 128 153 156 166 171 198 208 216 244 266 277 317 335 350 383 393 400 402 419 438 464 472 475 505 517 524 536 561 562 611 624 649 675 704 712 735 795 799 808 816 828 841 844 846 882 888 908 912 919 971 994 995 996 997 1001 1008 1012 1040 1130 324 672 735 745 873 933 1049 1073 GCCCAC/GTGGGC 1 -1 60 63 9 -11.8 11 19 31 50 62 63 73 77 104 124 143 155 169 181 189 192 213 220 234 244 262 312 356 380 484 487 494 515 531 542 543 569 607 617 639 644 662 695 725 753 791 813 821 829 831 843 852 920 931 932 948 997 998 1006 1017 1050 1070 1095 1096 1130 74 182 300 382 717 784 808 929 1004 CGTGAG/CTCACG 0 -2 65 62 9 -11.6 28 33 113 123 141 155 174 218 222 229 301 320 323 328 337 352 353 378 399 407 408 415 416 418 421 428 450 456 495 497 507 523 540 546 606 618 662 685 695 697 698 738 742 751 796 797 805 815 833 836 854 858 867 882 900 942 1004 1010 1024 1029 1038 1056 1064 1108 1125 143 324 364 407 503 512 601 1062 1100 CGTGCC/GGCACG 0 -2 61 62 6 -13.7 2 18 27 87 89 92 121 127 145 154 194 201 205 291 307 312 323 328 427 428 434 453 454 514 532 543 566 577 585 586 590 603 605 611 639 648 673 692 698 725 749 766 829 837 843 845 854 865 867 905 910 915 941 950 1024 1046 1060 1117 1118 1126 1127 355 410 524 572 676 958 GGACCC/GGGTCC 1 -3 62 62 8 -12.2 10 64 99 102 111 116 128 153 156 166 171 178 205 216 217 244 253 260 266 281 296 304 317 328 350 353 383 414 438 475 496 505 528 534 552 597 611 615 662 666 717 719 793 795 808 816 832 844 846 858 874 912 927 946 966 977 984 995 996 1042 1050 1130 125 245 258 376 562 844 933 1073 CCCACT/AGTGGG 1 0 57 60 13 -8.9 11 15 25 30 50 99 102 130 138 143 145 161 162 192 224 225 245 252 262 277 317 319 328 330 352 354 355 372 484 496 518 622 624 647 660 685 718 753 755 814 820 846 847 853 866 907 912 915 921 925 1050 1057 1089 1096 1097 1107 1130 173 300 324 339 358 382 421 621 634 741 882 1004 1010 TGGCCC/GGGCCA 1 -3 57 60 5 -14.0 14 46 50 51 63 66 67 73 77 124 142 148 163 164 189 207 221 244 249 251 252 254 263 269 284 289 351 356 453 463 495 536 550 564 567 589 592 609 644 645 660 691 703 708 714 722 822 929 989 993 998 1061 1084 1086 1093 1121 1135 182 256 419 609 618 GGGCCA/TGGCCC 8 -6 57 60 5 -14.0 14 46 50 51 63 66 67 73 77 124 142 148 163 164 189 207 221 244 249 251 252 254 263 269 284 289 351 356 453 463 495 536 550 564 567 589 592 609 644 645 660 691 703 708 714 722 822 929 989 993 998 1061 1084 1086 1093 1121 1135 182 256 419 609 618 TGACCC/GGGTCA 1 -3 53 59 16 -7.3 8 9 26 27 40 42 62 95 132 137 144 151 152 153 182 187 212 216 218 316 351 377 382 395 396 413 428 454 465 471 473 523 548 554 571 580 657 667 671 686 691 693 752 775 783 806 869 910 915 921 954 1011 1111 43 112 298 359 579 772 865 882 897 990 1003 1075 1099 1124 1128 1130 CGCACG/CGTGCG 0 -6 51 57 7 -11.6 2 24 44 46 47 115 122 135 151 152 153 154 166 188 280 307 309 313 351 371 372 386 387 443 446 449 478 528 569 573 574 607 611 620 651 667 695 725 730 735 775 828 837 839 851 967 994 1012 1014 1050 1125 221 345 381 414 536 628 775 TCCCCA/TGGGGA 1 -2 56 56 11 -8.9 16 45 76 108 112 132 195 203 204 208 210 224 226 229 297 306 313 323 372 382 385 389 421 423 444 452 464 465 469 492 516 524 533 559 577 611 638 669 720 767 814 849 872 878 894 895 904 925 932 942 991 996 1006 1030 1069 1130 159 501 690 735 816 866 911 976 988 1085 1121 TGTCCC/GGGACA 1 -3 55 56 12 -8.4 15 21 22 25 91 107 112 145 150 168 175 226 227 228 251 287 326 327 369 385 405 416 421 439 440 486 516 525 526 553 559 588 619 631 647 667 669 739 767 790 814 825 847 849 878 991 1016 1027 1030 1034 1052 1057 1061 1089 1129 52 240 424 504 586 596 683 747 754 775 868 976 GGCCAC/GTGGCC 8 -5 49 55 9 -9.8 2 6 20 44 59 66 120 124 134 135 140 182 196 207 229 244 249 262 269 280 284 287 351 386 441 453 463 475 482 517 529 592 609 661 679 695 714 762 764 783 811 929 950 1009 1014 1061 1086 1102 1121 81 408 615 618 660 712 871 875 944 GGCCAT/ATGGCC 8 -5 51 55 9 -9.8 2 14 17 20 50 66 67 86 120 130 134 163 164 189 196 210 252 254 263 289 313 355 370 506 512 519 536 550 567 620 661 681 691 702 703 783 843 911 914 916 928 929 950 974 984 991 998 1054 1055 1132 1135 177 493 609 661 692 822 923 1092 1121 ACCCCA/TGGGGT 1 -2 53 54 16 -6.2 30 36 86 108 123 130 132 162 176 182 186 187 250 260 270 271 277 281 283 328 376 395 396 409 410 426 427 462 482 560 571 664 667 680 685 699 718 813 821 845 851 858 880 902 906 973 993 1004 1032 1050 1060 1065 1122 54 159 193 246 296 355 579 621 639 802 808 833 852 882 933 1115 CAGACA/TGTCTG 2 -3 52 54 14 -7.0 4 35 49 74 89 96 118 130 155 158 181 206 216 227 228 253 293 348 350 374 437 446 471 487 513 520 550 560 624 633 637 654 692 693 725 736 750 769 812 835 875 892 902 904 927 939 970 1002 1003 1042 1071 1106 46 132 242 376 435 509 640 699 793 853 905 910 981 1075 TGGGGT/ACCCCA 10 -5 53 54 16 -6.2 30 36 86 108 123 130 132 162 176 182 186 187 250 260 270 271 277 281 283 328 376 395 396 409 410 426 427 462 482 560 571 664 667 680 685 699 718 813 821 845 851 858 880 902 906 973 993 1004 1032 1050 1060 1065 1122 54 159 193 246 296 355 579 621 639 802 808 833 852 882 933 1115 AAGCAC/GTGCTT 0 -7 51 53 11 -8.2 17 38 39 41 92 106 125 139 174 199 209 212 213 233 237 260 261 290 298 311 335 356 364 372 373 404 434 438 494 499 532 556 560 621 630 743 761 812 821 854 864 893 943 949 1031 1049 1050 1056 1093 1094 1100 158 168 170 196 353 412 676 726 776 798 926 CATGCC/GGCATG 0 -2 56 53 8 -9.9 19 58 104 120 136 180 199 214 241 255 265 267 276 289 297 314 325 366 386 431 451 499 502 524 532 546 554 555 573 574 601 614 643 644 648 652 655 657 661 662 678 688 700 753 774 788 809 900 914 962 972 1048 1080 1081 1103 1116 136 385 576 628 660 710 889 1101 GGCATG/CATGCC 6 -6 56 53 8 -9.9 19 58 104 120 136 180 199 214 241 255 265 267 276 289 297 314 325 366 386 431 451 499 502 524 532 546 554 555 573 574 601 614 643 644 648 652 655 657 661 662 678 688 700 753 774 788 809 900 914 962 972 1048 1080 1081 1103 1116 136 385 576 628 660 710 889 1101 ACAGCT/AGCTGT 9 -4 55 50 13 -6.6 110 124 177 182 188 207 246 247 258 262 277 305 306 321 375 386 387 416 457 479 487 497 523 526 545 547 575 597 601 610 626 653 790 796 797 807 818 819 823 863 865 873 897 942 952 955 964 972 975 979 1005 1022 1046 1091 1104 28 103 206 327 378 408 418 518 697 720 791 849 1075 CGCGTG/CACGCG 5 -4 42 49 2 -13.9 3 6 10 42 58 60 71 87 108 166 176 187 211 257 289 334 377 379 394 432 466 540 544 590 607 651 681 685 691 735 751 769 808 814 847 854 858 867 989 1006 1050 1117 821 921 GCGTGA/TCACGC 5 -3 41 49 10 -7.7 3 10 18 38 42 71 87 88 108 112 115 151 152 162 211 214 257 289 337 364 394 432 466 544 590 620 684 685 691 725 751 854 858 867 926 994 1017 1024 1064 1084 1102 40 362 364 561 641 660 897 921 1049 1137 TACACG/CGTGTA 0 -6 46 47 14 -5.5 2 18 19 21 29 61 198 243 261 300 321 388 389 426 491 520 568 596 605 610 686 699 702 709 744 767 779 780 783 796 797 801 816 834 839 859 860 861 866 876 985 1007 1063 1079 1112 1113 21 41 191 287 300 306 341 398 404 719 749 755 821 845 AGCCCA/TGGGCT 1 -2 41 46 15 -5.0 1 2 31 62 68 77 115 143 155 169 193 215 220 223 268 312 351 366 380 395 404 484 515 531 546 582 600 617 622 651 705 733 791 831 852 931 948 1039 1050 1070 1130 277 326 382 452 595 610 618 726 787 788 808 826 929 1061 1135 CCCCAT/ATGGGG 1 -1 46 45 9 -7.3 40 76 108 132 193 203 204 208 226 229 277 297 323 385 389 396 409 421 426 435 460 461 464 486 492 648 667 708 718 720 733 813 822 851 894 902 920 925 942 973 1004 1006 1069 1084 1085 1130 159 246 501 579 763 802 816 833 852 GACAGT/ACTGTC 4 -3 45 45 12 -5.9 41 71 96 97 99 139 150 176 190 265 286 293 303 323 330 332 346 347 369 406 438 441 444 446 485 509 516 606 706 709 757 759 772 773 785 852 860 861 877 892 909 918 927 960 1008 79 134 141 275 311 312 424 595 687 905 922 1014 CACACC/GGTGTG 2 -3 42 43 10 -6.3 12 13 39 95 104 143 148 210 212 248 249 256 260 262 297 316 361 365 368 373 378 427 527 530 533 583 596 609 620 638 649 679 735 806 824 827 951 982 1065 1073 1084 1107 41 54 228 314 408 511 639 735 841 1003 TGACAG/CTGTCA 4 -4 44 43 6 -8.6 11 39 52 53 97 116 137 265 277 304 345 346 370 400 406 441 454 487 544 548 575 611 709 713 772 773 784 833 873 877 897 912 913 939 942 943 952 958 960 973 983 1014 1036 1070 29 63 275 311 312 738 GACAGC/GCTGTC 4 -3 44 42 8 -7.1 5 39 53 74 116 207 258 263 277 311 321 375 439 440 450 457 487 526 545 548 597 611 626 653 693 757 818 823 873 889 897 913 915 942 943 952 972 975 983 1005 1014 1016 1036 1070 378 454 566 720 738 845 1075 1081 GAGGAC/GTCCTC 3 -3 41 41 12 -5.0 35 40 86 120 142 145 154 174 180 183 184 205 243 262 301 330 332 379 393 410 444 556 569 606 697 772 773 784 804 809 823 884 889 890 917 920 939 977 984 989 1041 120 443 476 477 538 557 606 772 802 906 948 1024 GGGGTC/GACCCC 3 -3 37 40 8 -6.6 64 105 108 123 130 132 137 156 162 182 186 187 260 281 283 310 316 328 351 395 396 409 428 473 475 482 571 597 667 717 719 783 832 851 858 1004 1050 477 496 579 621 882 933 1115 1128 TGGACG/CGTCCA 3 -2 41 38 12 -4.4 30 65 68 246 247 248 273 344 359 374 449 466 468 474 483 484 517 532 562 578 602 604 614 672 737 753 808 818 827 864 866 889 960 967 973 992 1001 1007 1024 1072 1128 4 35 52 54 63 103 146 584 589 612 746 996 AGACCC/GGGTCT 1 -3 38 37 12 -4.2 32 56 57 104 137 162 174 186 252 310 322 331 378 409 421 456 482 487 501 537 540 564 623 636 723 729 739 777 778 857 866 944 949 1004 1019 1054 1055 1071 62 132 173 175 265 339 430 538 621 624 1115 1124 AGGCCA/TGGCCT 8 -6 36 37 11 -4.6 14 44 66 86 109 140 174 182 210 222 229 287 313 370 392 475 487 506 512 517 519 567 695 764 881 909 911 914 916 928 929 991 1009 1053 1132 1135 119 408 412 415 660 661 712 813 822 923 1092 TGGCCA/TGGCCA 8 -6 31 37 9 -5.4 2 3 6 20 50 120 130 134 135 196 262 280 355 386 441 482 529 544 661 681 762 783 843 950 974 984 1014 1054 1055 1057 1102 16 81 177 493 504 523 615 871 1052 GTAGGG/CCCTAC 10 -6 34 37 8 -5.9 8 9 22 51 66 78 79 104 128 137 146 331 340 402 503 516 555 561 584 645 659 690 691 759 823 827 875 915 960 1006 1019 1034 1096 1111 133 165 514 703 745 890 1002 1073 CAACGT/ACGTTG 7 -2 38 36 11 -4.4 29 37 54 125 137 190 248 298 328 353 380 462 505 517 551 612 655 705 716 725 756 772 773 798 809 811 862 869 892 907 939 948 969 984 1027 1036 1064 1077 3 72 329 412 536 577 639 754 775 910 987 GTCCCC/GGGGAC 1 -3 35 34 4 -7.6 15 23 112 145 208 251 297 306 385 421 452 464 486 524 533 559 611 618 619 649 669 712 755 767 795 799 814 849 882 888 991 996 1030 1080 1081 5 735 816 976 GCACAC/GTGTGC 2 -4 35 34 4 -7.6 10 39 103 106 165 172 195 219 361 372 378 451 485 499 503 532 544 595 633 642 735 790 808 824 851 872 909 918 965 1010 1013 1032 1057 1072 1130 340 640 926 1108 GGGGAC/GTCCCC 3 -3 35 34 4 -7.6 15 23 112 145 208 251 297 306 385 421 452 464 486 524 533 559 611 618 619 649 669 712 755 767 795 799 814 849 882 888 991 996 1030 1080 1081 5 735 816 976 AGCGTG/CACGCT 5 -4 34 34 6 -6.2 24 88 108 112 151 152 162 251 287 302 326 327 337 371 422 544 573 574 590 595 653 707 726 756 862 880 915 930 947 967 1024 1084 1126 1127 40 146 168 362 414 561 GCGTTT/AAACGC 5 -3 33 34 10 -4.3 52 60 70 102 133 136 153 156 179 181 227 228 231 232 418 527 528 578 595 596 668 684 701 724 738 761 788 883 884 901 917 1027 1039 316 388 686 753 754 825 859 896 965 1060 GTGCGT/ACGCAC 5 -5 28 34 5 -6.9 23 24 30 47 69 76 115 151 152 153 154 214 284 309 367 371 417 528 569 620 633 651 684 695 725 730 967 994 1 660 715 954 1025 TGCCCA/TGGGCA 1 -2 35 32 9 -4.3 51 104 106 131 166 192 213 262 348 487 494 499 542 603 630 642 655 689 695 749 753 768 829 840 843 905 914 925 926 940 973 988 1002 1003 1095 159 300 486 498 665 828 967 1021 1057 GCGTGT/ACACGC 5 -3 29 32 3 -7.8 4 42 60 106 108 151 152 187 251 284 287 302 309 403 407 417 434 544 595 653 681 707 783 860 861 862 989 1126 1127 276 821 954 GGTGCA/TGCACC 11 -5 28 32 8 -4.7 1 8 9 26 158 160 176 222 230 290 296 369 441 456 503 594 646 659 665 696 777 830 894 908 988 1021 1028 1128 340 402 410 443 696 954 1069 1108 CCCCCA/TGGGGG 1 -2 30 31 5 -6.1 17 36 131 149 168 224 225 226 358 371 435 449 460 461 473 475 486 495 541 606 618 619 622 649 674 755 783 799 902 1085 517 681 763 896 1005 GCGCGT/ACGCGC 5 -5 24 29 1 -9.1 6 10 42 71 75 87 121 176 211 334 394 466 560 614 651 657 685 751 769 847 858 1006 1050 1099 1008 GTGCCC/GGGCAC 1 -3 28 27 3 -6.4 27 51 106 166 192 205 262 328 361 454 542 603 611 631 642 695 736 749 768 820 829 840 843 925 1024 1075 1095 1096 159 300 486 TGGCGT/ACGCCA 5 -5 27 26 5 -4.8 18 47 115 136 161 198 230 309 355 364 434 573 574 633 680 729 781 804 835 875 907 1035 1050 1102 1116 1126 1127 85 220 340 646 1075 GTGCAC/GTGCAC 11 -4 24 26 3 -6.1 1 3 103 219 271 369 374 387 410 451 456 465 485 503 506 790 808 894 948 953 965 972 1028 1128 232 340 410 GAGTCG/CGACTC 12 -1 20 26 5 -4.8 12 13 15 18 28 56 57 261 353 402 478 543 565 730 735 784 910 968 1013 1095 354 745 835 1098 1099 GGGCCC/GGGCCC 1 -3 20 25 5 -4.6 2 6 11 63 91 147 199 200 366 511 569 592 612 698 881 900 920 932 1006 1007 74 219 420 795 1037 ACGCGT/ACGCGT 5 -5 23 23 3 -5.3 58 60 108 231 232 257 307 379 412 418 544 551 578 607 691 701 743 808 814 827 867 989 1118 629 821 921 TCGCAC/GTGCGA 0 -7 23 22 4 -4.4 47 74 165 259 307 325 351 386 449 478 573 574 607 667 824 828 837 839 886 965 994 1012 1096 345 381 536 1111 GAGCGT/ACGCTC 5 -5 22 22 5 -3.8 24 88 108 112 162 233 337 371 400 422 551 561 590 707 726 833 885 915 930 1024 1126 1127 146 316 362 414 965 GCGTCA/TGACGC 5 -3 19 22 6 -3.4 10 33 54 58 170 214 371 375 385 434 614 641 651 715 739 747 927 989 1027 340 367 369 656 754 984 TGCGTC/GACGCA 5 -4 21 22 5 -3.8 23 30 92 130 154 318 367 371 375 517 601 604 614 651 725 747 771 914 919 967 1072 367 656 965 984 1020 GGCCCT/AGGGCC 8 -5 23 22 3 -5.1 51 63 66 146 199 242 249 263 447 448 472 645 691 698 703 722 900 929 1006 1059 1084 1086 1121 74 795 1037 CGCGTT/AACGCG 5 -4 20 21 5 -3.6 60 70 71 102 177 231 232 307 412 418 560 578 595 657 701 743 827 858 884 1074 303 461 821 921 1008 GCGTGC/GCACGC 5 -3 24 21 3 -4.8 24 115 166 334 371 540 573 574 607 651 726 730 735 808 847 854 880 893 915 930 967 1050 1126 1127 168 414 715 GCGTGG/CCACGC 5 -3 21 21 6 -3.1 6 58 176 326 327 377 379 422 501 543 607 633 676 756 769 781 814 947 1006 1117 1121 85 146 220 476 521 845 GCCCCA/TGGGGC 1 -2 20 20 1 -6.4 33 40 142 193 245 276 422 518 550 569 611 648 660 685 708 733 820 822 920 1084 81 GAGGCC/GGCCTC 8 -7 19 20 3 -4.5 15 55 146 229 263 313 359 370 463 472 519 567 582 607 764 929 1000 1034 1053 595 661 923 GGACGT/ACGTCC 3 -1 19 19 3 -4.2 5 65 107 234 248 374 508 562 578 602 866 888 910 942 960 992 1007 1017 1024 103 589 612 TCCCCC/GGGGGA 1 -3 18 18 3 -4.0 36 131 168 200 225 358 371 449 486 606 618 619 649 674 755 799 1006 1017 517 763 848 GGGGGA/TCCCCC 10 -4 18 18 3 -4.0 36 131 168 200 225 358 371 449 486 606 618 619 649 674 755 799 1006 1017 517 763 848 GACGCG/CGCGTC 5 -6 18 17 1 -5.4 58 75 170 307 379 418 551 614 676 691 808 814 827 847 859 867 953 989 629 GGCGTT/AACGCC 5 -4 19 17 2 -4.4 133 136 161 181 355 417 573 574 680 720 729 788 802 803 813 835 875 1035 1078 686 896 GGCCAG/CTGGCC 8 -5 16 17 4 -3.1 50 73 109 148 262 280 287 386 392 495 564 645 822 843 1053 1057 415 419 504 871 GGCGTG/CACGCC 5 -4 16 15 3 -3.2 18 38 309 364 543 633 725 781 783 854 1017 1050 1102 1121 1126 1127 85 220 521