#4446/4446 #7.20 # k-mer/r.c. Cluster Offset PosCt wPosCt NegCt HGP_10 TGGTGG/CCACCA 0 -3 436 451 149 -38.7 1 2 6 16 34 37 45 46 50 54 68 77 84 106 111 124 135 142 148 157 159 162 181 198 199 202 207 212 219 220 222 225 235 246 254 274 287 295 325 327 336 339 351 352 353 362 367 371 385 391 392 394 404 410 415 416 427 435 444 446 447 449 450 461 483 493 496 508 524 525 533 534 543 574 579 587 589 591 603 604 612 622 641 647 655 665 670 671 703 719 720 721 733 736 745 761 784 793 800 810 823 824 825 827 828 839 840 841 870 881 905 906 907 925 928 936 940 952 953 965 974 981 983 992 993 1020 1021 1034 1073 1089 1091 1110 1119 1121 1138 1154 1158 1159 1172 1197 1201 1213 1221 1237 1243 1249 1261 1269 1301 1306 1307 1314 1315 1328 1332 1333 1349 1351 1359 1365 1374 1377 1412 1420 1428 1430 1438 1440 1463 1464 1477 1487 1489 1498 1501 1513 1515 1518 1526 1527 1530 1549 1558 1563 1582 1590 1604 1607 1608 1610 1615 1640 1644 1661 1669 1676 1677 1687 1724 1738 1760 1774 1779 1801 1805 1809 1819 1822 1825 1826 1830 1836 1840 1842 1852 1861 1874 1877 1882 1889 1890 1891 1936 1938 1946 1947 1950 1972 1985 1996 2000 2009 2010 2019 2030 2081 2096 2101 2111 2112 2115 2129 2135 2141 2149 2150 2151 2153 2164 2165 2168 2173 2212 2229 2243 2246 2247 2248 2251 2275 2308 2315 2353 2374 2375 2396 2421 2425 2426 2434 2462 2476 2477 2509 2516 2569 2600 2629 2645 2669 2671 2672 2677 2678 2685 2706 2714 2722 2741 2750 2751 2753 2765 2766 2806 2807 2823 2828 2837 2838 2870 2876 2880 2888 2903 2905 2906 2928 2955 2956 2977 2979 2999 3005 3017 3018 3019 3023 3037 3056 3066 3068 3070 3073 3087 3088 3098 3117 3129 3130 3141 3150 3151 3156 3157 3183 3198 3221 3233 3245 3263 3268 3281 3295 3317 3331 3353 3354 3357 3390 3416 3443 3505 3514 3515 3524 3551 3559 3567 3576 3581 3582 3593 3595 3599 3606 3611 3619 3620 3629 3633 3639 3642 3643 3644 3653 3664 3678 3679 3690 3710 3733 3734 3738 3746 3753 3762 3763 3772 3773 3790 3815 3816 3817 3878 3882 3912 3914 3919 3946 3973 3974 4008 4009 4026 4057 4058 4062 4084 4085 4086 4131 4143 4145 4146 4168 4183 4198 4200 4202 4211 4229 4240 4246 4282 4283 4300 4303 4305 4319 4365 4389 4391 4393 4398 4408 0 13 33 54 71 147 163 202 249 250 257 273 274 333 336 343 458 465 495 504 509 551 552 620 684 691 720 738 815 829 830 932 935 1079 1116 1117 1137 1158 1200 1216 1249 1276 1277 1360 1362 1383 1385 1441 1528 1537 1538 1562 1610 1623 1636 1646 1734 1755 1828 1833 1840 1842 1903 1911 1932 1955 1966 1983 1985 2000 2113 2138 2183 2189 2245 2248 2250 2426 2427 2456 2504 2531 2558 2606 2613 2645 2807 2820 2855 2873 2897 2918 2945 2955 2956 3010 3016 3090 3097 3161 3179 3203 3219 3220 3264 3265 3281 3282 3311 3367 3369 3374 3408 3441 3499 3548 3588 3594 3601 3627 3637 3641 3659 3695 3754 3780 3792 3892 3894 3927 3929 3943 3978 4002 4012 4013 4019 4051 4089 4094 4129 4155 4172 4186 4344 4410 4418 4422 4434 GGAGGA/TCCTCC 3 -3 432 445 122 -47.0 1 2 7 8 17 19 26 34 41 68 72 84 86 101 102 106 114 118 129 135 145 151 168 180 181 182 184 198 199 201 212 225 234 240 244 246 287 303 304 312 337 339 343 354 355 373 374 391 420 422 424 431 433 446 447 454 460 462 464 474 493 507 509 539 555 559 562 569 591 595 621 622 623 630 641 676 677 678 684 694 710 720 721 722 723 726 727 733 740 749 750 770 772 773 780 781 782 787 790 818 833 844 875 876 882 893 902 920 928 945 946 951 958 988 989 999 1002 1006 1008 1009 1019 1022 1029 1036 1040 1045 1065 1073 1083 1094 1114 1151 1152 1158 1159 1170 1190 1200 1220 1243 1254 1262 1265 1272 1280 1283 1306 1307 1309 1314 1323 1329 1330 1343 1351 1370 1389 1400 1405 1410 1411 1424 1435 1438 1440 1442 1444 1476 1478 1486 1488 1492 1495 1526 1536 1537 1546 1547 1552 1571 1576 1587 1588 1613 1615 1616 1669 1672 1689 1693 1718 1771 1772 1801 1813 1814 1845 1875 1878 1879 1890 1901 1903 1927 1939 1947 1954 1955 1957 1980 1982 1987 2008 2022 2026 2037 2050 2052 2057 2107 2108 2115 2129 2131 2133 2143 2154 2186 2192 2195 2213 2219 2229 2230 2237 2251 2261 2263 2265 2266 2271 2280 2289 2304 2305 2306 2307 2324 2325 2332 2340 2342 2343 2370 2404 2409 2418 2419 2421 2424 2435 2442 2453 2454 2456 2464 2472 2480 2481 2518 2535 2536 2538 2551 2568 2578 2598 2607 2626 2639 2646 2652 2670 2676 2718 2732 2734 2736 2749 2758 2759 2772 2776 2779 2805 2820 2822 2826 2850 2870 2871 2888 2913 2946 2964 2997 3015 3016 3028 3044 3054 3068 3077 3078 3091 3098 3121 3148 3154 3159 3177 3178 3179 3204 3221 3233 3239 3240 3252 3273 3288 3292 3303 3307 3308 3310 3321 3327 3353 3354 3369 3375 3376 3377 3399 3424 3438 3445 3446 3452 3454 3460 3485 3500 3513 3514 3518 3521 3527 3531 3573 3578 3581 3582 3591 3594 3597 3598 3653 3657 3678 3679 3693 3710 3722 3723 3733 3734 3772 3773 3843 3854 3888 3897 3901 3917 3919 3944 3945 3950 3976 4026 4028 4034 4035 4036 4060 4071 4072 4076 4077 4081 4082 4083 4095 4111 4132 4133 4134 4138 4145 4161 4237 4271 4273 4274 4300 4304 4310 4316 4318 4344 4353 4362 4379 4380 4386 4387 4389 4398 4408 4445 24 55 57 61 67 71 148 186 199 202 310 494 584 627 646 675 721 890 898 913 1079 1098 1116 1117 1121 1124 1182 1192 1213 1248 1265 1378 1383 1548 1563 1567 1623 1637 1677 1708 1716 1736 1753 1767 1867 2091 2178 2203 2217 2223 2317 2357 2393 2414 2426 2479 2481 2507 2561 2562 2600 2608 2645 2655 2695 2703 2704 2724 2811 2843 2872 2876 2911 2942 2946 3016 3058 3072 3097 3107 3151 3182 3197 3205 3257 3275 3279 3288 3289 3365 3378 3388 3392 3407 3429 3468 3494 3528 3534 3562 3592 3623 3659 3676 3725 3738 3755 3759 3932 3966 3967 3978 4016 4174 4185 4228 4337 4376 4401 4415 4430 4435 GTGGTG/CACCAC 0 -1 408 423 100 -51.2 1 2 3 6 16 33 35 46 50 68 69 70 76 84 89 106 111 124 135 152 155 159 162 184 198 199 202 212 219 225 246 254 267 276 287 295 324 327 339 351 352 367 374 375 385 391 392 394 404 415 418 419 427 444 446 447 449 454 456 461 465 483 489 493 496 505 508 524 525 543 546 570 574 575 595 602 612 662 670 671 703 719 720 721 733 745 788 802 824 825 835 839 840 841 878 881 909 928 936 940 953 965 967 981 1004 1032 1034 1040 1060 1063 1073 1088 1089 1102 1110 1119 1121 1137 1138 1144 1158 1159 1172 1201 1220 1221 1224 1225 1228 1237 1243 1248 1249 1269 1301 1315 1316 1318 1328 1341 1342 1349 1351 1359 1365 1412 1420 1430 1438 1464 1489 1501 1510 1513 1526 1539 1549 1558 1563 1582 1586 1600 1604 1607 1608 1615 1619 1644 1651 1661 1669 1676 1677 1688 1724 1738 1760 1764 1767 1790 1797 1801 1808 1809 1822 1825 1826 1830 1834 1840 1852 1861 1869 1877 1881 1882 1884 1890 1895 1910 1918 1921 1922 1927 1936 1938 1945 1949 1952 1953 1967 1968 1972 1982 1985 1990 1996 1997 2000 2029 2045 2062 2068 2106 2111 2112 2115 2135 2141 2147 2149 2150 2151 2153 2161 2162 2164 2165 2169 2212 2246 2247 2248 2251 2264 2269 2270 2275 2308 2368 2374 2375 2383 2384 2396 2421 2426 2434 2447 2472 2491 2516 2532 2579 2617 2618 2629 2630 2672 2677 2678 2685 2698 2723 2724 2751 2791 2806 2827 2837 2841 2855 2870 2876 2887 2888 2891 2904 2905 2942 2955 2956 2968 2979 2986 2994 2999 3005 3017 3037 3051 3057 3070 3114 3120 3141 3142 3150 3151 3156 3166 3173 3183 3198 3205 3221 3225 3230 3245 3246 3263 3281 3295 3311 3317 3318 3319 3353 3354 3357 3390 3403 3425 3434 3443 3481 3490 3505 3547 3564 3567 3573 3581 3582 3594 3606 3610 3619 3625 3629 3639 3641 3642 3653 3664 3673 3674 3678 3679 3682 3691 3710 3715 3733 3734 3746 3751 3753 3790 3816 3817 3840 3877 3882 3894 3898 3912 3914 3919 3946 3951 3958 3973 3974 3990 4003 4004 4009 4046 4047 4075 4085 4086 4122 4131 4143 4145 4168 4183 4202 4211 4229 4253 4263 4319 4365 4391 4404 0 5 19 26 33 79 109 147 163 183 188 202 241 249 250 273 343 433 472 509 524 625 663 684 830 884 935 973 1116 1117 1137 1200 1277 1295 1383 1385 1425 1476 1528 1562 1623 1646 1648 1739 1805 1840 1842 1903 1945 1966 1983 2049 2138 2183 2245 2269 2319 2426 2427 2448 2473 2530 2605 2606 2607 2632 2645 2663 2674 2820 2832 2866 2901 2945 2955 3183 3311 3441 3499 3510 3581 3592 3594 3669 3695 3716 3807 3808 3894 3909 3927 3978 4069 4109 4122 4172 4258 4333 4369 4430 GGTGGT/ACCACC 0 -2 400 412 94 -51.4 1 2 3 6 8 16 33 45 46 54 68 84 89 91 97 98 106 111 124 135 148 154 155 162 198 199 202 212 219 222 225 239 242 254 274 275 322 323 325 327 339 351 352 362 367 374 385 387 391 394 404 416 418 419 427 435 444 449 461 483 489 493 508 524 533 534 543 587 591 596 602 607 612 642 647 655 670 671 677 678 701 703 717 718 720 721 733 739 745 764 774 775 784 810 824 825 827 828 833 839 870 881 884 894 905 906 925 940 965 967 993 1020 1034 1040 1063 1073 1089 1110 1119 1121 1138 1139 1144 1156 1158 1159 1172 1184 1197 1200 1201 1213 1221 1224 1228 1243 1254 1280 1301 1305 1315 1318 1328 1342 1349 1351 1357 1359 1365 1420 1430 1438 1459 1464 1477 1484 1489 1501 1513 1518 1526 1530 1541 1552 1558 1563 1582 1590 1604 1607 1608 1615 1640 1644 1661 1669 1676 1677 1688 1713 1738 1761 1790 1797 1801 1805 1808 1809 1821 1822 1830 1835 1836 1840 1852 1861 1874 1877 1882 1890 1891 1924 1936 1938 1950 1972 1988 1996 2000 2017 2018 2055 2062 2068 2096 2106 2115 2128 2135 2141 2145 2149 2150 2151 2153 2164 2165 2168 2170 2221 2243 2246 2247 2248 2251 2278 2290 2388 2389 2392 2396 2415 2421 2426 2434 2438 2451 2471 2474 2476 2477 2509 2516 2548 2574 2575 2607 2623 2624 2629 2645 2672 2677 2678 2685 2706 2723 2724 2725 2741 2742 2751 2802 2806 2807 2818 2821 2837 2855 2864 2870 2876 2880 2888 2891 2897 2904 2910 2927 2977 2993 2994 2999 3005 3007 3008 3013 3017 3018 3037 3057 3070 3101 3138 3141 3145 3146 3150 3151 3154 3183 3198 3221 3232 3245 3263 3281 3308 3331 3335 3336 3353 3354 3355 3357 3373 3390 3416 3481 3505 3514 3524 3559 3564 3567 3573 3581 3582 3591 3595 3606 3610 3622 3629 3639 3642 3653 3660 3664 3678 3679 3690 3733 3734 3738 3746 3762 3763 3790 3816 3817 3870 3877 3882 3912 3914 3919 3932 3946 3959 3973 3974 4046 4047 4055 4084 4085 4086 4131 4143 4145 4168 4211 4227 4228 4229 4240 4282 4283 4291 4300 4303 4323 4324 4338 4339 4358 4359 4374 4419 13 26 33 71 98 147 163 174 183 188 202 228 249 257 273 333 343 426 466 508 524 552 830 935 985 1079 1106 1116 1117 1174 1200 1209 1249 1277 1344 1362 1383 1476 1519 1528 1548 1562 1623 1653 1734 1750 1764 1774 1828 1903 1985 2183 2245 2248 2276 2426 2427 2448 2481 2606 2619 2645 2820 2855 2866 2873 2945 2955 3097 3151 3179 3203 3311 3374 3441 3581 3594 3659 3807 3892 3894 3929 3963 3978 4094 4122 4129 4155 4161 4344 4348 4369 4413 4434 GAGGAG/CTCCTC 3 -2 392 403 118 -39.7 1 2 17 21 26 51 62 68 71 72 84 86 101 102 111 114 118 135 151 171 180 182 198 199 201 212 213 225 234 244 263 281 294 303 304 308 312 337 338 343 355 373 374 387 391 411 420 422 423 424 431 433 437 440 443 446 447 453 454 462 465 474 493 507 509 526 547 548 557 559 562 587 591 623 637 653 668 676 677 678 684 704 710 720 721 724 726 727 733 735 749 750 770 780 781 785 799 884 885 893 902 907 916 917 920 928 945 951 958 988 1002 1008 1019 1022 1029 1040 1073 1083 1094 1102 1114 1136 1149 1151 1152 1158 1159 1170 1200 1204 1220 1243 1262 1272 1298 1305 1309 1314 1330 1343 1351 1359 1365 1370 1375 1388 1390 1391 1393 1400 1405 1410 1411 1412 1439 1440 1442 1472 1473 1476 1478 1481 1486 1495 1526 1536 1537 1547 1552 1559 1571 1576 1613 1615 1616 1618 1626 1669 1673 1692 1693 1718 1771 1772 1774 1801 1816 1837 1845 1906 1927 1939 1955 1957 1975 1980 1987 1990 2022 2028 2039 2041 2056 2059 2083 2084 2088 2090 2106 2108 2118 2133 2166 2186 2191 2214 2219 2221 2229 2230 2237 2251 2261 2269 2270 2271 2280 2289 2304 2305 2306 2307 2332 2342 2370 2391 2403 2404 2409 2419 2421 2424 2464 2466 2472 2475 2484 2518 2536 2551 2568 2587 2598 2607 2615 2639 2650 2652 2670 2718 2734 2749 2758 2759 2772 2776 2798 2810 2820 2822 2864 2870 2871 2888 2954 2964 2983 3028 3078 3085 3091 3094 3098 3121 3159 3179 3195 3196 3204 3231 3256 3273 3297 3305 3308 3310 3356 3369 3375 3376 3417 3440 3453 3454 3483 3500 3513 3514 3518 3521 3527 3533 3534 3573 3578 3581 3582 3594 3597 3598 3623 3653 3657 3678 3679 3684 3693 3722 3723 3733 3734 3762 3763 3768 3772 3773 3796 3813 3814 3843 3854 3868 3870 3897 3906 3917 3919 3944 3945 3950 3951 3991 4003 4004 4026 4029 4034 4037 4043 4071 4072 4076 4077 4081 4082 4083 4095 4116 4130 4132 4145 4161 4211 4235 4236 4254 4255 4258 4264 4304 4307 4318 4320 4335 4342 4360 4362 4384 4386 4389 4427 4445 10 24 25 33 61 71 148 229 233 310 388 445 466 475 626 627 663 693 770 799 825 890 913 1116 1117 1124 1182 1213 1248 1375 1382 1383 1389 1447 1478 1548 1563 1619 1623 1651 1695 1708 1736 1898 1905 1973 2038 2152 2183 2237 2252 2291 2414 2426 2479 2507 2521 2561 2591 2608 2620 2647 2655 2663 2695 2704 2797 2866 2867 2876 2881 2891 3058 3097 3104 3107 3151 3166 3182 3185 3268 3275 3288 3378 3388 3428 3429 3468 3528 3534 3542 3543 3576 3584 3585 3591 3592 3638 3646 3655 3659 3669 3699 3790 3798 3870 3896 3926 4008 4016 4225 4336 4339 4384 4401 4407 4415 4435 AGGAGG/CCTCCT 3 -4 310 318 84 -34.7 1 2 8 17 46 56 68 71 72 73 86 99 100 101 102 114 129 135 151 166 173 180 201 212 225 243 244 263 283 303 312 337 343 374 388 391 420 422 423 424 427 431 433 440 444 446 447 462 474 491 507 509 562 591 614 623 641 668 677 678 701 710 726 727 733 749 770 796 799 893 902 928 945 946 965 988 1002 1008 1009 1022 1029 1032 1040 1045 1057 1066 1073 1083 1094 1151 1158 1159 1170 1176 1200 1217 1220 1243 1250 1262 1265 1272 1280 1298 1309 1314 1320 1323 1331 1343 1345 1346 1351 1352 1365 1370 1400 1405 1413 1424 1435 1438 1440 1441 1442 1457 1472 1473 1476 1482 1486 1495 1526 1547 1571 1576 1602 1615 1616 1626 1642 1669 1693 1696 1718 1771 1801 1845 1854 1875 1914 1924 1927 1939 1957 1960 1987 2022 2086 2106 2107 2108 2154 2191 2195 2214 2229 2237 2251 2261 2271 2276 2277 2280 2289 2301 2304 2305 2306 2307 2309 2332 2342 2374 2375 2404 2409 2415 2419 2421 2453 2466 2472 2535 2538 2549 2563 2578 2598 2607 2639 2663 2670 2734 2736 2758 2759 2774 2776 2780 2781 2798 2807 2810 2820 2822 2846 2870 2871 2888 2905 2913 3054 3064 3078 3091 3098 3101 3120 3137 3150 3151 3158 3179 3273 3288 3308 3313 3369 3392 3400 3417 3457 3483 3500 3514 3518 3521 3565 3581 3582 3589 3590 3597 3598 3653 3657 3660 3678 3679 3693 3722 3723 3733 3734 3747 3762 3763 3768 3772 3773 3811 3813 3814 3843 3870 3919 3944 3945 3979 4026 4034 4061 4071 4072 4081 4082 4095 4130 4145 4157 4227 4235 4236 4253 4254 4282 4283 4284 4292 4293 4357 4362 4381 4386 4387 4389 4424 4427 4441 24 34 55 71 148 162 172 243 310 373 466 627 675 813 890 913 1116 1117 1124 1192 1248 1284 1378 1383 1389 1452 1488 1548 1563 1567 1637 1690 1695 1708 1716 1736 1753 1867 2147 2178 2217 2414 2426 2507 2562 2608 2620 2647 2703 2704 2724 2843 2866 2867 2881 3016 3058 3072 3106 3151 3182 3205 3275 3279 3287 3288 3388 3407 3468 3534 3592 3659 3738 3755 3793 3797 3798 3934 3966 4185 4337 4384 4401 4413 GCTGCT/AGCAGC 1 -3 303 316 105 -26.9 16 26 30 35 52 56 71 72 87 91 94 108 110 113 118 122 141 164 168 169 177 183 190 205 219 221 226 227 228 230 245 254 255 264 265 270 278 326 336 353 358 375 399 412 424 435 439 448 461 473 507 510 511 533 534 535 537 558 580 587 590 596 602 623 651 655 669 684 754 755 756 766 789 804 822 843 911 928 930 931 944 979 980 981 1014 1020 1038 1039 1056 1057 1059 1073 1088 1111 1118 1119 1128 1164 1181 1185 1209 1211 1252 1255 1264 1295 1308 1316 1327 1341 1350 1386 1416 1429 1430 1431 1520 1543 1547 1548 1556 1557 1580 1593 1665 1705 1728 1741 1742 1745 1758 1771 1772 1782 1805 1819 1820 1825 1826 1827 1828 1850 1860 1863 1876 1921 1922 1943 1944 1946 1947 1950 1963 2002 2003 2024 2037 2043 2061 2067 2070 2091 2125 2130 2156 2159 2171 2176 2203 2209 2235 2238 2241 2244 2259 2296 2318 2319 2322 2330 2339 2371 2378 2398 2407 2418 2507 2508 2522 2537 2560 2583 2620 2631 2632 2688 2693 2701 2740 2746 2757 2769 2775 2777 2799 2805 2821 2832 2833 2834 2837 2861 2863 2866 2869 2870 2872 2886 2901 2911 2916 2919 2927 2928 2944 2945 2948 2982 3009 3035 3036 3057 3073 3152 3170 3174 3181 3182 3185 3186 3205 3207 3243 3249 3250 3336 3398 3409 3445 3446 3460 3468 3471 3477 3481 3501 3537 3543 3547 3593 3595 3599 3613 3638 3639 3673 3674 3715 3739 3775 3786 3787 3812 3866 3867 3869 3892 3921 3927 3930 3931 3936 3952 3964 4051 4080 4114 4117 4118 4141 4147 4155 4156 4178 4179 4192 4219 4231 4263 4370 4386 4423 4443 60 80 82 151 183 261 273 277 348 384 395 430 436 472 480 484 512 524 549 562 748 753 933 956 1057 1126 1132 1184 1193 1276 1283 1320 1336 1365 1406 1416 1485 1513 1610 1636 1651 1711 1731 1739 1794 1805 1831 1835 1914 1929 2095 2230 2327 2345 2385 2400 2406 2427 2490 2505 2542 2558 2600 2640 2661 2706 2738 2766 2801 2808 2811 2819 2860 2884 2933 3081 3173 3185 3202 3456 3480 3560 3613 3621 3729 3791 3796 3919 3921 3929 3933 3965 3966 4014 4029 4056 4093 4100 4137 4221 4306 4401 4436 4437 4441 CGGTGG/CCACCG 0 -3 302 312 62 -43.1 1 2 6 7 26 43 45 84 91 106 124 129 135 146 205 223 225 238 254 275 301 303 305 318 323 337 339 355 379 380 385 399 404 426 427 432 435 446 447 474 483 489 516 524 533 534 543 570 581 607 611 633 634 635 642 655 679 691 717 718 720 721 733 739 745 764 768 774 775 795 817 833 839 851 896 928 951 970 1006 1033 1040 1056 1061 1085 1091 1114 1119 1121 1139 1145 1147 1154 1158 1159 1180 1184 1200 1201 1221 1228 1280 1289 1305 1318 1328 1342 1351 1357 1370 1399 1410 1411 1417 1420 1430 1484 1501 1504 1513 1541 1552 1556 1557 1558 1573 1582 1584 1585 1628 1635 1636 1643 1700 1772 1796 1797 1805 1808 1830 1835 1852 1857 1859 1865 1877 1882 1885 1887 1890 1916 1935 1936 1985 1988 2015 2017 2018 2062 2067 2068 2073 2106 2115 2125 2128 2141 2145 2147 2149 2153 2164 2165 2186 2210 2212 2221 2227 2243 2251 2276 2277 2290 2318 2319 2344 2358 2359 2365 2392 2409 2421 2451 2473 2474 2507 2516 2517 2548 2607 2610 2623 2657 2670 2704 2724 2725 2741 2751 2758 2759 2765 2766 2802 2815 2822 2881 2891 2906 2910 2922 2923 2947 3029 3035 3036 3037 3058 3075 3085 3101 3138 3143 3145 3146 3150 3151 3153 3198 3200 3215 3220 3222 3223 3225 3299 3312 3335 3353 3354 3357 3390 3419 3434 3454 3457 3466 3481 3490 3505 3514 3537 3553 3568 3573 3581 3582 3629 3670 3689 3733 3734 3746 3853 3870 3883 3892 3894 3919 3946 3959 3974 3987 4046 4047 4063 4066 4068 4096 4122 4148 4199 4227 4228 4258 4277 4291 4315 4365 4402 4403 4419 4442 150 183 188 202 258 283 305 330 343 426 508 524 591 611 747 830 873 918 978 1021 1116 1117 1458 1476 1519 1528 1562 1563 1590 1623 1764 1774 1903 2136 2178 2276 2313 2393 2426 2427 2448 2600 2645 2761 2867 2961 2966 3075 3112 3151 3345 3453 3573 3661 3682 3822 3830 3919 4005 4029 4369 4413 CGGTGG/CCACCG 5 0 302 312 62 -43.1 1 2 6 7 26 43 45 84 91 106 124 129 135 146 205 223 225 238 254 275 301 303 305 318 323 337 339 355 379 380 385 399 404 426 427 432 435 446 447 474 483 489 516 524 533 534 543 570 581 607 611 633 634 635 642 655 679 691 717 718 720 721 733 739 745 764 768 774 775 795 817 833 839 851 896 928 951 970 1006 1033 1040 1056 1061 1085 1091 1114 1119 1121 1139 1145 1147 1154 1158 1159 1180 1184 1200 1201 1221 1228 1280 1289 1305 1318 1328 1342 1351 1357 1370 1399 1410 1411 1417 1420 1430 1484 1501 1504 1513 1541 1552 1556 1557 1558 1573 1582 1584 1585 1628 1635 1636 1643 1700 1772 1796 1797 1805 1808 1830 1835 1852 1857 1859 1865 1877 1882 1885 1887 1890 1916 1935 1936 1985 1988 2015 2017 2018 2062 2067 2068 2073 2106 2115 2125 2128 2141 2145 2147 2149 2153 2164 2165 2186 2210 2212 2221 2227 2243 2251 2276 2277 2290 2318 2319 2344 2358 2359 2365 2392 2409 2421 2451 2473 2474 2507 2516 2517 2548 2607 2610 2623 2657 2670 2704 2724 2725 2741 2751 2758 2759 2765 2766 2802 2815 2822 2881 2891 2906 2910 2922 2923 2947 3029 3035 3036 3037 3058 3075 3085 3101 3138 3143 3145 3146 3150 3151 3153 3198 3200 3215 3220 3222 3223 3225 3299 3312 3335 3353 3354 3357 3390 3419 3434 3454 3457 3466 3481 3490 3505 3514 3537 3553 3568 3573 3581 3582 3629 3670 3689 3733 3734 3746 3853 3870 3883 3892 3894 3919 3946 3959 3974 3987 4046 4047 4063 4066 4068 4096 4122 4148 4199 4227 4228 4258 4277 4291 4315 4365 4402 4403 4419 4442 150 183 188 202 258 283 305 330 343 426 508 524 591 611 747 830 873 918 978 1021 1116 1117 1458 1476 1519 1528 1562 1563 1590 1623 1764 1774 1903 2136 2178 2276 2313 2393 2426 2427 2448 2600 2645 2761 2867 2961 2966 3075 3112 3151 3345 3453 3573 3661 3682 3822 3830 3919 4005 4029 4369 4413 TGCTGC/GCAGCA 1 -4 286 304 86 -31.0 9 16 18 26 30 52 56 69 70 71 78 94 110 113 118 122 127 141 154 169 177 183 190 200 201 205 212 226 227 228 230 245 264 265 270 303 326 331 334 336 347 348 350 357 359 363 372 375 393 399 400 412 413 439 461 476 510 511 533 534 537 541 563 564 578 580 585 586 590 596 601 651 654 670 671 684 702 737 767 782 789 792 804 807 822 825 911 928 933 944 954 968 973 991 1014 1022 1038 1039 1060 1073 1088 1096 1102 1112 1118 1119 1142 1164 1170 1185 1231 1249 1264 1266 1295 1308 1341 1370 1416 1450 1464 1520 1543 1547 1619 1634 1659 1665 1686 1698 1705 1728 1742 1758 1771 1781 1786 1790 1795 1806 1822 1827 1828 1850 1870 1876 1918 1939 1946 1947 2001 2002 2003 2024 2055 2063 2064 2067 2094 2106 2125 2130 2147 2156 2159 2160 2171 2176 2181 2209 2226 2241 2285 2318 2319 2321 2330 2339 2371 2378 2418 2507 2508 2521 2528 2560 2609 2631 2632 2633 2688 2693 2732 2733 2740 2757 2769 2775 2800 2801 2805 2820 2834 2837 2842 2861 2863 2866 2916 2921 2940 2944 2945 2948 2971 3009 3035 3036 3037 3048 3049 3073 3105 3131 3174 3181 3185 3186 3243 3249 3250 3355 3373 3398 3411 3445 3446 3460 3465 3469 3471 3477 3481 3490 3501 3541 3550 3593 3595 3600 3601 3607 3613 3639 3665 3673 3674 3820 3866 3867 3868 3884 3892 3921 3952 3980 4051 4062 4080 4093 4141 4147 4178 4179 4186 4201 4219 4321 4322 4347 4379 4380 4381 4386 4423 4443 2 60 80 82 90 124 203 214 268 384 430 480 549 562 564 744 748 772 773 785 869 1051 1057 1117 1132 1184 1193 1279 1355 1513 1536 1612 1693 1701 1739 1794 1835 1972 2095 2099 2106 2164 2286 2324 2327 2345 2377 2385 2392 2400 2427 2490 2640 2698 2706 2738 2766 2933 2967 3058 3081 3093 3128 3184 3311 3410 3433 3456 3500 3560 3590 3619 3621 3784 3786 3796 3802 3929 3958 3966 4056 4068 4093 4137 4221 4436 GCTGCA/TGCAGC 1 -3 273 288 79 -30.3 9 18 20 44 56 63 66 69 70 78 130 151 154 167 170 173 181 184 185 190 201 226 228 240 245 263 282 286 307 330 344 346 356 357 359 368 372 400 403 412 413 417 422 438 463 476 491 521 529 537 541 585 586 627 628 633 655 703 714 736 737 749 767 792 799 807 822 834 838 884 896 909 941 968 973 979 980 993 1006 1012 1034 1044 1060 1063 1088 1092 1096 1102 1109 1118 1126 1127 1142 1179 1183 1194 1212 1231 1234 1266 1308 1347 1372 1390 1391 1394 1395 1450 1459 1462 1464 1465 1467 1482 1496 1505 1548 1555 1568 1603 1607 1608 1619 1634 1646 1652 1659 1665 1698 1737 1745 1750 1758 1762 1797 1827 1828 1836 1841 1870 1880 1897 1918 1919 1963 1974 1979 2001 2025 2031 2055 2060 2061 2063 2064 2073 2074 2094 2106 2135 2160 2180 2205 2209 2222 2226 2233 2241 2269 2270 2274 2294 2295 2309 2333 2407 2453 2459 2479 2504 2507 2521 2528 2534 2537 2541 2598 2599 2609 2622 2633 2649 2693 2732 2757 2764 2799 2800 2802 2814 2818 2842 2851 2866 2888 2909 2921 2940 2948 2996 3025 3035 3036 3064 3073 3105 3131 3164 3181 3182 3185 3186 3189 3218 3289 3290 3291 3300 3374 3445 3446 3455 3469 3473 3474 3480 3486 3541 3550 3551 3665 3694 3713 3730 3771 3786 3787 3792 3802 3820 3884 3891 3967 3968 3980 4044 4067 4085 4086 4122 4150 4151 4172 4201 4235 4236 4263 4277 4336 4337 4379 4380 4428 37 55 82 106 120 124 214 256 318 324 396 480 536 564 660 744 773 868 869 989 1014 1057 1068 1117 1153 1206 1336 1536 1537 1588 1612 1701 1843 1958 1975 2099 2106 2270 2283 2286 2324 2422 2533 2595 2678 2698 2808 2831 2896 2967 3055 3080 3081 3093 3098 3202 3218 3234 3399 3456 3497 3531 3543 3547 3583 3590 3615 3686 3796 3802 4036 4068 4138 4143 4154 4206 4342 4386 4436 CTGCTG/CAGCAG 1 -2 264 274 82 -26.4 0 16 30 56 87 94 106 110 113 121 122 141 144 152 159 177 183 190 205 219 221 228 230 240 245 270 326 334 336 353 358 372 375 378 399 430 439 453 473 507 510 511 535 537 580 587 590 596 615 634 635 655 670 671 684 698 737 748 792 804 822 825 843 872 928 979 980 985 1001 1039 1073 1088 1111 1118 1119 1142 1164 1170 1219 1264 1308 1336 1360 1370 1386 1416 1419 1429 1438 1450 1459 1464 1465 1529 1543 1547 1548 1556 1557 1580 1593 1619 1622 1662 1665 1680 1705 1712 1715 1728 1731 1742 1756 1758 1771 1774 1778 1781 1782 1790 1806 1820 1825 1826 1827 1828 1850 1855 1876 1929 1930 1939 1946 1950 1964 1979 1990 2002 2003 2041 2047 2048 2067 2081 2091 2094 2105 2125 2130 2147 2156 2171 2176 2203 2209 2226 2241 2322 2330 2378 2423 2507 2528 2560 2583 2588 2602 2603 2634 2655 2688 2693 2732 2740 2757 2758 2759 2763 2769 2775 2805 2820 2834 2837 2852 2853 2863 2866 2869 2870 2872 2886 2916 2919 2928 2934 2940 2944 2945 2948 2982 3009 3035 3036 3037 3057 3066 3073 3134 3174 3176 3181 3185 3186 3281 3398 3445 3446 3455 3471 3477 3481 3501 3537 3538 3595 3613 3639 3736 3737 3795 3797 3868 3892 3921 3952 3960 4015 4038 4039 4062 4080 4141 4165 4178 4179 4183 4186 4219 4226 4282 4283 4319 4321 4322 4328 4347 4381 4386 4392 4394 4410 4427 4443 60 82 99 124 214 268 384 410 440 524 549 562 666 748 781 850 981 1014 1036 1078 1117 1151 1184 1276 1279 1355 1359 1446 1513 1605 1623 1636 1731 1794 1831 1835 1921 1929 2095 2384 2385 2392 2400 2403 2427 2490 2558 2640 2698 2706 2714 2738 2787 2801 2860 2884 3025 3093 3114 3185 3211 3243 3425 3434 3439 3480 3560 3590 3705 3760 3786 3796 3929 3993 4056 4082 4127 4128 4137 4215 4221 4436 AGCTGC/GCAGCT 1 -4 239 254 72 -25.9 35 43 63 66 79 87 91 93 94 108 117 122 129 130 151 164 171 173 175 176 183 185 190 201 219 221 224 228 240 245 263 286 344 353 368 373 403 417 422 424 434 438 439 463 473 491 513 521 529 537 558 602 669 685 754 755 756 778 779 813 814 870 909 939 971 979 980 981 993 1012 1056 1066 1080 1092 1111 1126 1128 1179 1183 1223 1229 1234 1252 1255 1262 1305 1308 1327 1334 1347 1350 1368 1369 1413 1459 1465 1467 1489 1496 1500 1502 1521 1548 1556 1557 1568 1580 1593 1595 1603 1646 1705 1719 1731 1734 1741 1745 1758 1778 1819 1820 1827 1880 1895 1897 1921 1922 1951 1963 1974 1979 2012 2025 2031 2037 2067 2070 2073 2074 2091 2106 2125 2150 2171 2203 2205 2222 2233 2238 2259 2269 2270 2294 2295 2298 2310 2330 2378 2407 2426 2458 2479 2495 2507 2583 2589 2598 2609 2620 2622 2688 2693 2701 2746 2757 2764 2777 2799 2802 2817 2818 2836 2870 2872 2886 2909 2919 2927 2941 2967 3009 3025 3057 3117 3152 3161 3170 3181 3182 3189 3219 3289 3336 3348 3349 3379 3381 3409 3438 3455 3468 3537 3543 3547 3595 3638 3713 3715 3730 3775 3784 3786 3787 3792 3936 3964 3975 4141 4163 4172 4192 4219 4231 4235 4236 4336 4337 4391 4423 13 106 120 156 318 324 348 391 436 484 512 536 868 933 981 989 1014 1153 1283 1320 1336 1365 1416 1537 1588 1610 1618 1651 1731 1751 1805 1843 1914 1975 1982 2094 2095 2149 2230 2270 2505 2547 2558 2661 2808 2819 2884 2887 2896 2941 3055 3185 3202 3218 3251 3252 3456 3480 3543 3583 3615 3686 3797 3868 3921 3929 3980 4036 4155 4386 4436 4441 GGTGGC/GCCACC 0 -2 244 253 59 -30.9 1 2 16 33 37 43 45 66 77 84 146 148 162 202 207 220 246 254 274 301 305 336 337 355 367 371 379 380 385 404 432 446 447 493 524 525 533 534 570 574 581 589 603 633 634 635 641 655 670 671 733 736 745 784 795 825 896 921 928 951 953 970 981 1021 1033 1043 1061 1073 1085 1110 1147 1154 1170 1172 1180 1201 1221 1225 1228 1243 1261 1289 1305 1306 1307 1312 1315 1328 1332 1333 1349 1370 1410 1430 1438 1464 1501 1527 1530 1533 1556 1557 1558 1563 1582 1607 1608 1628 1635 1636 1643 1669 1671 1687 1690 1700 1805 1814 1825 1826 1842 1852 1861 1877 1882 1890 1916 1932 1976 1977 1984 2015 2019 2067 2071 2074 2125 2141 2147 2149 2153 2163 2173 2212 2227 2276 2277 2301 2358 2359 2362 2381 2409 2412 2422 2425 2434 2462 2473 2516 2517 2569 2573 2610 2657 2677 2678 2750 2758 2759 2765 2766 2769 2806 2815 2823 2838 2866 2887 2905 2922 2923 2928 2937 2955 2956 2979 3004 3007 3008 3029 3035 3036 3094 3127 3129 3130 3138 3200 3225 3235 3268 3273 3312 3357 3454 3513 3515 3568 3597 3598 3599 3611 3619 3629 3633 3643 3644 3689 3738 3878 3882 3883 3946 4008 4057 4058 4070 4080 4085 4086 4122 4135 4136 4146 4152 4168 4183 4230 4246 4258 4335 4393 4422 54 74 188 250 283 336 366 465 591 684 747 830 873 1021 1116 1117 1137 1158 1213 1593 1623 1636 1750 1766 1826 1966 2001 2035 2071 2178 2313 2427 2456 2507 2531 2600 2613 2656 2867 2894 2897 2966 3219 3264 3282 3345 3441 3453 3499 3562 3573 3780 3830 3919 3927 3943 4002 4012 4422 GCTGGT/ACCAGC 0 -2 227 240 77 -21.4 13 14 16 22 23 39 55 62 75 77 84 103 106 109 116 144 156 196 198 199 203 230 240 249 259 260 270 290 296 335 336 340 385 394 416 427 437 457 458 462 490 492 515 535 570 591 633 648 655 691 699 742 768 800 821 843 878 927 932 941 949 954 976 977 979 980 1020 1029 1032 1034 1042 1043 1054 1077 1125 1128 1139 1238 1239 1261 1269 1339 1380 1401 1419 1435 1440 1465 1478 1490 1527 1550 1568 1580 1582 1643 1667 1705 1748 1749 1758 1766 1774 1796 1818 1825 1826 1840 1893 1894 1910 1920 1929 1930 1941 1943 1944 1956 1957 2025 2063 2064 2095 2150 2169 2198 2199 2204 2205 2210 2223 2251 2254 2271 2300 2315 2347 2348 2396 2423 2512 2553 2573 2602 2603 2645 2672 2730 2731 2741 2753 2757 2786 2807 2838 2850 2852 2853 2863 2866 2870 2884 2927 2940 3021 3022 3050 3052 3062 3063 3066 3087 3088 3142 3144 3191 3238 3263 3367 3368 3373 3398 3406 3407 3412 3416 3445 3446 3503 3504 3507 3514 3522 3526 3567 3576 3688 3697 3736 3737 3792 3797 3818 3912 3953 3965 3966 3989 4016 4038 4039 4043 4048 4049 4093 4096 4109 4112 4141 4143 4210 4263 4282 4283 4425 4427 4434 19 25 91 106 278 293 490 539 597 609 816 918 1014 1068 1125 1167 1249 1286 1340 1392 1446 1528 1530 1537 1682 1683 1685 1753 1754 1834 1886 1909 1920 1933 2002 2089 2144 2319 2385 2426 2427 2448 2613 2664 2801 2859 2867 3023 3074 3203 3220 3281 3348 3374 3452 3480 3483 3490 3512 3699 3723 3860 3902 3903 3972 3980 4117 4127 4128 4137 4147 4272 4305 4323 4397 4434 4436 ACGGTG/CACCGT 5 -1 237 236 70 -23.0 6 33 45 60 83 91 129 146 148 175 176 188 214 224 245 264 265 287 289 299 302 340 355 363 372 387 394 427 432 457 474 483 489 505 543 551 570 607 633 659 665 691 713 742 774 775 791 811 830 851 928 1021 1040 1046 1061 1066 1085 1128 1145 1165 1176 1180 1200 1210 1230 1255 1305 1309 1318 1324 1392 1396 1420 1466 1476 1501 1513 1614 1617 1656 1670 1672 1700 1711 1738 1797 1800 1805 1808 1838 1842 1864 1877 1882 1884 1885 1888 1907 1925 1934 1945 1985 1988 2015 2021 2026 2062 2067 2068 2090 2115 2128 2129 2140 2145 2153 2192 2210 2212 2260 2353 2363 2380 2386 2392 2406 2409 2463 2471 2472 2473 2474 2483 2516 2517 2526 2527 2561 2582 2607 2614 2615 2623 2657 2695 2751 2758 2759 2778 2795 2801 2815 2867 2881 2891 2905 2922 2923 2997 3004 3029 3038 3042 3085 3095 3127 3143 3145 3146 3147 3149 3150 3151 3153 3168 3200 3222 3223 3226 3269 3280 3310 3312 3335 3352 3369 3403 3418 3454 3490 3533 3534 3553 3568 3629 3682 3699 3739 3746 3758 3765 3766 3791 3802 3819 3853 3870 3902 3903 3987 3996 4021 4046 4047 4048 4049 4052 4053 4079 4106 4107 4137 4188 4196 4197 4228 4258 4259 4301 4329 4338 4339 4346 4365 4378 4417 4419 45 53 150 188 202 250 258 303 330 426 475 522 524 611 693 696 701 704 734 881 918 970 1092 1188 1232 1562 1575 1659 1716 1741 1746 1764 1774 1838 1967 1983 2042 2089 2093 2136 2240 2383 2392 2423 2426 2427 2535 2595 2600 2761 2775 2961 3151 3169 3174 3345 3418 3453 3488 3547 3573 3653 3661 3709 3805 4101 4236 4361 4369 4410 TGGTGC/GCACCA 0 -3 224 235 67 -23.9 1 2 3 6 33 35 42 47 52 55 63 69 70 89 104 111 219 223 226 230 254 260 267 301 311 317 335 345 366 384 389 422 427 465 483 492 505 517 529 541 546 561 633 644 649 662 680 703 723 767 788 802 804 878 881 902 929 960 971 1029 1034 1040 1060 1063 1102 1123 1125 1144 1178 1195 1218 1220 1224 1228 1261 1265 1269 1300 1316 1341 1412 1419 1465 1484 1511 1525 1528 1539 1558 1587 1588 1615 1619 1641 1669 1688 1713 1720 1721 1723 1750 1751 1764 1769 1795 1797 1799 1822 1825 1826 1840 1858 1926 1949 1952 1953 1972 2062 2106 2147 2251 2254 2257 2269 2270 2334 2365 2383 2384 2421 2442 2457 2472 2498 2504 2535 2547 2573 2575 2584 2592 2605 2619 2633 2672 2694 2744 2750 2823 2825 2826 2827 2830 2831 2841 2866 2889 2891 2930 2952 2953 2986 3005 3021 3022 3052 3078 3090 3128 3141 3142 3144 3150 3151 3166 3183 3191 3222 3223 3236 3263 3281 3308 3311 3318 3319 3330 3331 3335 3341 3373 3380 3400 3412 3420 3445 3446 3488 3564 3572 3647 3664 3675 3699 3703 3741 3818 3877 3912 3951 4016 4027 4043 4075 4085 4086 4122 4154 4253 4331 4357 4358 4359 4405 19 43 62 98 188 539 564 598 663 771 775 836 884 962 1014 1125 1156 1193 1200 1249 1293 1383 1392 1411 1481 1502 1528 1624 1648 1682 1739 1868 1989 2002 2066 2084 2094 2349 2426 2530 2582 2595 2606 2641 2662 2699 2832 2927 2988 3022 3139 3152 3480 3581 3592 3716 3952 4109 4251 4272 4322 4380 4389 4397 4430 4435 4444 GCGGTG/CACCGC 0 -4 220 228 42 -33.3 1 2 7 44 45 84 106 124 135 225 232 238 275 301 303 312 318 319 323 337 339 379 380 385 399 403 426 435 446 447 490 515 516 524 529 533 534 567 581 601 607 616 634 635 668 717 718 733 739 741 745 761 768 817 822 852 865 881 896 951 970 1027 1033 1056 1091 1114 1121 1129 1161 1164 1228 1242 1280 1286 1289 1305 1328 1351 1357 1386 1399 1410 1417 1430 1438 1443 1484 1502 1552 1556 1557 1558 1582 1598 1643 1734 1738 1772 1807 1830 1852 1857 1859 1865 1887 1909 1935 1936 1946 1947 1985 2000 2013 2017 2018 2062 2073 2076 2081 2123 2124 2125 2141 2147 2184 2186 2195 2212 2251 2276 2277 2290 2318 2319 2344 2365 2386 2409 2421 2422 2435 2456 2513 2523 2542 2592 2610 2670 2677 2678 2679 2680 2741 2773 2801 2822 2866 2872 2906 2970 2997 3029 3035 3036 3138 3150 3151 3171 3180 3191 3215 3225 3232 3299 3325 3353 3354 3357 3390 3419 3434 3455 3466 3486 3505 3544 3545 3562 3565 3578 3599 3633 3641 3642 3689 3733 3734 3821 3882 3898 3900 3919 3946 3959 4007 4030 4031 4066 4068 4071 4072 4110 4122 4124 4167 4277 4348 4360 4388 4442 54 70 106 343 483 628 677 731 747 978 1116 1117 1202 1327 1563 1623 1765 1903 2178 2382 2427 2448 2581 2600 2645 2700 2809 3055 3139 3145 3229 3393 3418 3461 3548 3994 4029 4086 4231 4348 4352 4413 GCGGTG/CACCGC 5 -1 220 228 42 -33.3 1 2 7 44 45 84 106 124 135 225 232 238 275 301 303 312 318 319 323 337 339 379 380 385 399 403 426 435 446 447 490 515 516 524 529 533 534 567 581 601 607 616 634 635 668 717 718 733 739 741 745 761 768 817 822 852 865 881 896 951 970 1027 1033 1056 1091 1114 1121 1129 1161 1164 1228 1242 1280 1286 1289 1305 1328 1351 1357 1386 1399 1410 1417 1430 1438 1443 1484 1502 1552 1556 1557 1558 1582 1598 1643 1734 1738 1772 1807 1830 1852 1857 1859 1865 1887 1909 1935 1936 1946 1947 1985 2000 2013 2017 2018 2062 2073 2076 2081 2123 2124 2125 2141 2147 2184 2186 2195 2212 2251 2276 2277 2290 2318 2319 2344 2365 2386 2409 2421 2422 2435 2456 2513 2523 2542 2592 2610 2670 2677 2678 2679 2680 2741 2773 2801 2822 2866 2872 2906 2970 2997 3029 3035 3036 3138 3150 3151 3171 3180 3191 3215 3225 3232 3299 3325 3353 3354 3357 3390 3419 3434 3455 3466 3486 3505 3544 3545 3562 3565 3578 3599 3633 3641 3642 3689 3733 3734 3821 3882 3898 3900 3919 3946 3959 4007 4030 4031 4066 4068 4071 4072 4110 4122 4124 4167 4277 4348 4360 4388 4442 54 70 106 343 483 628 677 731 747 978 1116 1117 1202 1327 1563 1623 1765 1903 2178 2382 2427 2448 2581 2600 2645 2700 2809 3055 3139 3145 3229 3393 3418 3461 3548 3994 4029 4086 4231 4348 4352 4413 GCTGAG/CTCAGC 8 -2 206 219 68 -20.4 3 27 28 32 40 65 66 87 101 102 110 111 119 146 161 164 179 180 206 207 226 232 284 295 325 334 335 336 390 403 414 453 464 473 483 505 524 543 563 564 578 592 597 605 630 657 658 666 690 692 698 741 763 784 786 790 813 814 836 838 847 848 856 859 864 878 884 894 905 906 947 953 989 1013 1028 1055 1058 1064 1117 1143 1194 1211 1226 1230 1264 1299 1339 1356 1366 1407 1439 1444 1462 1511 1533 1551 1592 1622 1637 1638 1657 1692 1702 1731 1815 1842 1850 1855 1862 1900 1902 1956 1958 2028 2031 2041 2062 2067 2081 2105 2115 2132 2138 2195 2204 2300 2301 2320 2336 2337 2342 2388 2389 2437 2454 2483 2486 2620 2637 2638 2709 2719 2723 2732 2778 2780 2781 2805 2811 2824 2829 2937 2969 2976 2979 2982 2983 3041 3071 3142 3170 3211 3237 3263 3305 3347 3348 3349 3367 3375 3376 3436 3437 3475 3514 3527 3574 3613 3662 3687 3772 3773 3776 3818 3826 3861 3880 3881 3904 3905 3910 3934 3939 3940 4008 4095 4161 4226 4230 4254 4267 4317 4349 4392 4413 4442 41 61 202 363 388 391 395 448 457 466 483 490 627 660 662 718 976 1001 1276 1336 1536 1645 1683 1731 1755 1982 2000 2009 2035 2084 2141 2240 2272 2415 2469 2479 2490 2584 2614 2634 2655 2659 2744 2832 2937 2946 2974 2980 3001 3023 3185 3215 3282 3342 3383 3623 3638 3665 3699 3701 3728 3735 3827 3838 4012 4101 4117 4220 AGGTGG/CCACCT 0 -3 209 212 67 -19.3 3 5 8 16 33 40 46 89 110 111 135 154 162 180 212 239 242 274 309 322 337 341 346 374 383 385 387 391 418 419 427 444 555 596 612 637 648 656 670 671 676 677 678 701 742 764 784 805 872 882 884 894 940 967 990 1002 1034 1040 1063 1065 1087 1144 1154 1170 1228 1243 1254 1312 1315 1365 1389 1401 1438 1453 1457 1459 1464 1497 1533 1580 1591 1592 1640 1669 1688 1690 1761 1797 1843 1844 1861 1877 1915 1950 1976 1977 1980 1984 2055 2067 2071 2074 2086 2160 2195 2204 2246 2247 2264 2278 2280 2289 2301 2307 2350 2362 2381 2388 2389 2412 2422 2438 2443 2467 2471 2570 2657 2713 2742 2745 2769 2814 2818 2864 2866 2869 2870 2871 2889 2904 2923 2927 2931 2937 2974 2975 2984 2994 3007 3008 3017 3021 3022 3057 3070 3094 3141 3154 3221 3235 3277 3280 3331 3336 3355 3357 3373 3470 3505 3513 3564 3591 3597 3598 3615 3639 3653 3664 3678 3679 3693 3732 3790 3912 3919 3933 3934 3950 3987 3996 4070 4093 4135 4136 4148 4152 4168 4191 4227 4246 4266 4272 4300 4318 4323 4324 4335 4338 4339 26 74 88 98 174 184 188 228 366 390 400 466 484 653 734 737 803 904 913 1016 1025 1116 1265 1288 1344 1379 1529 1540 1548 1621 1626 1653 1744 1750 1766 1767 1810 1835 2001 2035 2084 2205 2230 2299 2530 2619 2656 2764 2784 2929 2936 3217 3287 3441 3486 3505 3562 3581 3638 3742 3756 3807 3963 4122 4276 4329 4365 GGCGGT/ACCGCC 0 -2 203 207 45 -26.9 1 2 8 33 45 82 84 124 135 202 225 242 246 279 303 317 318 323 336 337 339 379 380 385 403 421 435 520 529 533 534 567 607 616 626 627 628 634 635 686 731 732 733 739 744 750 769 826 829 849 852 881 896 983 1011 1027 1028 1114 1121 1161 1228 1280 1309 1316 1328 1351 1386 1399 1404 1410 1430 1432 1433 1438 1443 1482 1502 1552 1556 1557 1577 1578 1582 1643 1651 1738 1793 1807 1865 1896 1909 1935 1936 1946 1960 1985 2000 2013 2022 2061 2073 2125 2166 2173 2184 2194 2251 2267 2272 2273 2276 2277 2290 2294 2295 2344 2365 2409 2419 2421 2435 2468 2492 2493 2502 2503 2513 2522 2523 2542 2610 2670 2677 2678 2725 2769 2801 2808 2821 2822 2900 2955 2956 2966 2970 2980 3006 3029 3098 3100 3118 3150 3151 3215 3225 3230 3232 3311 3325 3331 3353 3354 3357 3390 3466 3516 3517 3559 3562 3565 3578 3592 3599 3635 3638 3673 3674 3711 3841 3842 3854 3882 3900 3907 3946 3959 4007 4052 4053 4071 4072 4090 4096 4098 4122 4124 4195 4277 4348 4360 4382 4406 4440 54 70 106 149 158 290 343 555 597 628 731 738 747 1116 1117 1168 1233 1239 1324 1327 1562 1563 1575 1623 1722 1940 2524 2600 2613 2634 2866 2884 3048 3139 3281 3393 3418 3522 3838 4027 4029 4231 4251 4266 4413 GGCGGT/ACCGCC 5 -2 203 207 45 -26.9 1 2 8 33 45 82 84 124 135 202 225 242 246 279 303 317 318 323 336 337 339 379 380 385 403 421 435 520 529 533 534 567 607 616 626 627 628 634 635 686 731 732 733 739 744 750 769 826 829 849 852 881 896 983 1011 1027 1028 1114 1121 1161 1228 1280 1309 1316 1328 1351 1386 1399 1404 1410 1430 1432 1433 1438 1443 1482 1502 1552 1556 1557 1577 1578 1582 1643 1651 1738 1793 1807 1865 1896 1909 1935 1936 1946 1960 1985 2000 2013 2022 2061 2073 2125 2166 2173 2184 2194 2251 2267 2272 2273 2276 2277 2290 2294 2295 2344 2365 2409 2419 2421 2435 2468 2492 2493 2502 2503 2513 2522 2523 2542 2610 2670 2677 2678 2725 2769 2801 2808 2821 2822 2900 2955 2956 2966 2970 2980 3006 3029 3098 3100 3118 3150 3151 3215 3225 3230 3232 3311 3325 3331 3353 3354 3357 3390 3466 3516 3517 3559 3562 3565 3578 3592 3599 3635 3638 3673 3674 3711 3841 3842 3854 3882 3900 3907 3946 3959 4007 4052 4053 4071 4072 4090 4096 4098 4122 4124 4195 4277 4348 4360 4382 4406 4440 54 70 106 149 158 290 343 555 597 628 731 738 747 1116 1117 1168 1233 1239 1324 1327 1562 1563 1575 1623 1722 1940 2524 2600 2613 2634 2866 2884 3048 3139 3281 3393 3418 3522 3838 4027 4029 4231 4251 4266 4413 CGGAGG/CCTCCG 3 -4 212 206 43 -27.6 1 2 72 180 198 199 201 225 269 273 303 337 344 396 460 493 559 568 630 688 717 718 720 721 722 725 726 727 740 784 833 843 844 866 875 902 951 958 966 988 1002 1019 1103 1114 1170 1243 1254 1264 1306 1307 1309 1315 1328 1330 1351 1389 1405 1420 1442 1476 1478 1489 1502 1546 1604 1613 1630 1640 1667 1669 1689 1695 1716 1772 1778 1788 1813 1814 1857 1876 1878 1879 1885 1908 1919 1980 2021 2022 2026 2036 2050 2052 2065 2077 2143 2148 2166 2192 2213 2221 2232 2237 2271 2307 2332 2343 2392 2418 2430 2448 2451 2454 2456 2469 2491 2523 2562 2639 2642 2652 2676 2685 2719 2749 2761 2762 2776 2815 2820 2901 2922 2958 2959 2978 2980 2997 3004 3012 3016 3019 3047 3077 3135 3148 3221 3233 3235 3243 3252 3273 3303 3310 3321 3327 3353 3354 3369 3375 3376 3377 3387 3438 3452 3460 3466 3514 3541 3548 3549 3581 3582 3594 3611 3618 3653 3657 3660 3678 3679 3693 3710 3711 3740 3821 3854 3888 3918 3944 3945 3980 3990 4035 4036 4066 4076 4077 4083 4084 4095 4132 4133 4134 4138 4161 4168 4221 4222 4300 4304 4318 4408 4445 99 128 272 701 737 1111 1116 1435 1474 1623 2317 2393 2507 2512 2619 2631 2656 2872 2881 2911 2946 3083 3135 3136 3149 3235 3323 3378 3433 3441 3640 3656 3670 3725 3765 3809 3830 3831 3848 3935 4017 4063 4228 GGAGGC/GCCTCC 3 -3 199 204 48 -24.9 25 26 73 81 142 166 190 225 246 263 273 299 337 339 343 367 374 385 391 392 410 440 444 460 507 509 568 612 614 663 668 674 676 677 678 684 688 689 717 718 733 735 776 799 807 813 814 852 863 865 866 952 988 1057 1066 1094 1144 1155 1171 1176 1206 1234 1250 1262 1264 1276 1308 1320 1328 1331 1345 1346 1351 1400 1405 1413 1420 1442 1472 1482 1489 1497 1498 1502 1563 1597 1604 1616 1630 1642 1669 1716 1778 1801 1854 1877 1906 1914 1935 1950 1959 1960 2021 2077 2082 2164 2165 2166 2175 2194 2195 2209 2214 2229 2233 2276 2277 2299 2304 2309 2407 2421 2460 2466 2469 2491 2549 2563 2600 2658 2659 2685 2719 2736 2774 2780 2781 2782 2798 2807 2815 2820 2822 2846 2901 2958 2959 2970 2978 3012 3026 3047 3061 3098 3101 3135 3191 3221 3263 3313 3327 3381 3390 3432 3452 3466 3518 3531 3584 3618 3629 3660 3692 3711 3747 3786 3787 3806 3811 3819 3821 3826 3980 3987 3995 4026 4066 4083 4130 4250 4251 4254 4284 4306 4347 4357 4381 4389 4427 144 162 172 373 469 506 813 932 1054 1085 1117 1150 1318 1359 1383 1389 1452 1467 1474 1563 1690 1697 1785 1823 2085 2119 2141 2145 2213 2426 2448 2512 2542 2608 2631 3003 3106 3223 3235 3288 3433 3786 3797 3830 3935 4114 4251 4384 TGCTGG/CCAGCA 0 -3 182 196 64 -17.3 1 2 4 16 47 62 72 75 84 97 98 106 107 113 121 144 152 190 198 199 209 224 230 240 245 274 296 335 340 345 358 365 378 379 380 394 427 437 490 492 510 511 519 535 614 615 650 655 679 811 821 843 872 977 979 980 1029 1034 1054 1073 1125 1219 1226 1238 1261 1419 1435 1462 1465 1490 1495 1556 1557 1580 1594 1667 1669 1680 1692 1702 1705 1744 1748 1749 1756 1758 1766 1774 1796 1818 1825 1826 1840 1929 1930 1941 1957 1979 1990 2047 2067 2081 2223 2251 2299 2378 2396 2423 2442 2487 2488 2512 2553 2573 2584 2588 2602 2603 2655 2688 2758 2759 2797 2823 2841 2847 2848 2850 2863 2866 2870 2886 2891 2919 2928 2940 2944 2945 2993 3000 3025 3057 3066 3111 3173 3182 3263 3272 3281 3358 3368 3374 3398 3412 3445 3446 3455 3472 3514 3537 3654 3736 3737 3775 3792 3797 3891 3912 3946 4016 4038 4039 4043 4125 4143 4178 4179 4183 4210 4328 4410 4427 106 278 364 387 440 446 490 539 597 751 816 867 1014 1032 1078 1151 1167 1286 1363 1446 1528 1537 1682 1683 1685 1754 1835 1921 1933 2001 2089 2138 2178 2385 2426 2427 2438 2614 2787 2801 2820 2884 3174 3220 3243 3374 3440 3480 3490 3903 3993 4048 4082 4127 4128 4137 4194 4221 4349 4380 4397 4434 4435 4436 GGCTGC/GCAGCC 1 -4 188 195 47 -23.4 16 26 44 56 72 105 109 130 165 168 170 181 184 185 226 240 254 255 278 307 309 313 330 335 346 355 356 358 359 379 380 448 479 480 507 611 627 628 633 655 703 714 736 749 799 834 852 853 884 886 928 930 931 941 1006 1044 1059 1088 1102 1127 1170 1180 1201 1205 1209 1212 1236 1264 1318 1341 1347 1372 1390 1391 1394 1395 1431 1450 1465 1482 1509 1533 1555 1567 1624 1704 1705 1742 1746 1747 1750 1762 1775 1782 1797 1828 1836 1841 1860 1888 1963 2025 2031 2060 2061 2129 2135 2140 2141 2172 2180 2194 2230 2241 2279 2296 2309 2322 2406 2407 2422 2504 2534 2541 2599 2832 2833 2855 2865 2869 2881 2888 2901 2911 2916 2949 3006 3035 3036 3164 3185 3186 3207 3218 3246 3260 3290 3291 3300 3398 3440 3471 3473 3474 3518 3551 3606 3695 3696 3739 3775 3802 3869 3891 3892 3904 3905 3930 3931 3987 4052 4053 4083 4090 4117 4118 4122 4150 4151 4155 4156 4167 4237 4263 4303 4340 4360 4386 37 55 151 396 503 561 753 830 1014 1072 1126 1336 1359 1406 1540 1636 1831 1929 2113 2400 2422 2542 2600 2706 2738 2811 2867 2871 3049 3080 3140 3230 3399 3497 3597 3613 3791 3919 3958 4014 4100 4143 4154 4342 4386 4401 4437 CACTGC/GCAGTG 2 -4 181 186 41 -24.0 8 19 29 31 47 53 63 112 255 257 267 331 340 363 364 397 398 409 415 428 442 493 496 512 533 534 546 552 569 606 634 635 670 671 684 687 696 705 741 754 755 756 766 792 803 826 970 992 1060 1110 1113 1121 1124 1130 1138 1142 1241 1301 1328 1336 1340 1370 1392 1394 1395 1406 1423 1450 1517 1568 1579 1582 1587 1588 1607 1608 1616 1664 1665 1737 1746 1747 1774 1845 1852 1882 1887 1888 1895 1916 1951 1990 2023 2024 2069 2081 2087 2096 2105 2126 2130 2147 2171 2204 2205 2237 2313 2323 2469 2610 2612 2647 2648 2651 2656 2721 2740 2772 2810 2816 2887 2917 2918 2988 2989 3004 3037 3059 3071 3098 3142 3160 3182 3188 3212 3213 3257 3296 3322 3327 3365 3366 3374 3441 3551 3596 3653 3730 3749 3750 3753 3765 3766 3767 3832 3848 3891 4040 4051 4062 4131 4169 4178 4179 4250 4251 4280 4321 4322 4325 4326 4328 4331 4351 4352 4370 4381 4402 4403 4427 4438 95 351 686 692 712 858 891 905 935 1054 1137 1194 1201 1299 1352 1359 1465 1643 1684 1699 1782 1967 2271 2352 2440 2637 2699 2868 2898 3025 3071 3114 3187 3212 3232 3275 3300 3480 3725 3918 4383 GCGGTT/AACCGC 5 -1 185 184 44 -22.3 8 82 116 123 126 138 175 176 178 179 202 229 256 279 317 318 335 336 346 430 520 521 560 566 583 602 722 731 732 764 776 826 829 853 896 914 915 978 1001 1021 1028 1143 1184 1203 1236 1256 1296 1329 1344 1348 1386 1404 1432 1433 1434 1482 1502 1530 1543 1606 1611 1612 1668 1734 1738 1779 1793 1804 1827 1887 1893 1894 1909 1943 1944 1960 1985 2022 2038 2040 2054 2101 2110 2117 2180 2202 2204 2267 2272 2273 2291 2309 2311 2321 2335 2358 2359 2365 2368 2419 2439 2475 2486 2498 2503 2529 2536 2605 2620 2632 2637 2638 2690 2691 2693 2709 2757 2768 2797 2845 2892 2907 2908 2919 2955 2956 2980 3006 3007 3008 3048 3049 3064 3100 3118 3131 3145 3146 3181 3230 3260 3311 3331 3338 3357 3358 3434 3516 3517 3559 3638 3673 3674 3711 3716 3799 3818 3854 3917 3971 3972 3983 3984 4014 4052 4053 4076 4077 4096 4098 4105 4122 4135 4136 4141 4145 4195 4212 4237 4279 4340 4405 4406 4414 4415 48 90 158 406 453 555 597 598 738 961 1233 1239 1281 1475 1548 1575 1708 1712 1719 1848 1922 2017 2157 2192 2370 2383 2437 2439 2592 2613 2793 2887 3048 3112 3114 3170 3522 3582 3605 3833 3838 4062 4206 4266 GCCTTG/CAAGGC 7 -2 172 182 53 -18.3 27 34 41 72 132 147 150 171 234 247 248 271 277 308 333 346 373 376 386 395 403 475 488 549 550 560 566 571 579 582 594 597 659 665 674 711 712 717 718 731 732 794 802 822 837 859 873 899 920 942 943 953 958 960 975 1027 1059 1080 1103 1121 1135 1154 1183 1186 1187 1220 1221 1234 1256 1290 1332 1333 1335 1368 1382 1390 1391 1432 1433 1470 1480 1488 1489 1499 1519 1574 1590 1639 1665 1673 1674 1675 1722 1739 1740 1750 1777 1819 1832 1880 1903 1961 1981 1988 2034 2047 2099 2126 2153 2172 2343 2348 2355 2356 2360 2435 2457 2472 2485 2489 2501 2535 2544 2558 2571 2572 2852 2853 2871 2872 2884 2934 2984 2997 3024 3065 3161 3256 3278 3285 3290 3291 3317 3336 3368 3379 3392 3442 3456 3610 3844 3855 3873 3883 3907 3965 3966 4014 4090 4102 4103 4167 4208 4219 4244 4281 4305 4320 4361 4371 4381 4392 13 37 157 238 320 370 478 533 542 573 611 684 712 716 882 989 1309 1382 1383 1491 1540 1660 1677 2105 2262 2288 2446 2482 2546 2628 2675 2679 2702 2710 2768 2790 2796 2835 2856 3024 3155 3453 3499 3584 3604 3985 4014 4173 4198 4249 4265 4305 4317 CACAGC/GCTGTG 2 -4 164 178 51 -18.2 4 9 13 30 69 70 74 81 85 110 118 131 134 137 141 181 183 206 213 236 240 267 272 288 294 300 321 360 382 389 394 405 436 442 454 486 513 523 538 555 605 617 634 635 642 643 668 685 698 741 748 802 831 879 888 919 922 949 1029 1032 1044 1088 1123 1140 1236 1263 1329 1341 1350 1372 1387 1472 1499 1539 1543 1555 1599 1617 1619 1628 1660 1662 1715 1754 1778 1820 1935 1939 2002 2003 2031 2041 2055 2059 2100 2169 2171 2188 2216 2223 2227 2228 2237 2275 2293 2297 2299 2391 2413 2435 2468 2505 2534 2811 2842 2843 2874 2879 2916 2936 2943 2966 3035 3036 3039 3040 3052 3157 3165 3219 3239 3240 3268 3409 3541 3547 3596 3609 3613 3619 3675 3716 3732 3856 3857 3886 3894 3915 3926 4026 4041 4042 4071 4072 4168 4176 4199 4229 4235 4236 4282 4283 4386 4432 391 396 439 442 538 796 809 846 881 981 1224 1283 1318 1365 1414 1447 1458 1488 1559 1605 1623 1711 1751 1790 1920 1935 2017 2056 2221 2260 2503 2519 2640 2660 2732 2860 2868 3105 3155 3191 3234 3262 3311 3439 3459 3614 3702 3718 3795 4293 4416 CGGCGG/CCGCCG 0 -3 182 175 44 -20.3 1 2 43 129 198 199 225 279 287 337 455 493 520 559 591 593 627 628 630 634 635 642 666 676 720 721 724 733 744 754 774 775 849 896 936 953 970 976 983 988 1011 1028 1056 1149 1170 1243 1255 1277 1309 1316 1404 1407 1438 1443 1444 1462 1502 1536 1537 1544 1545 1547 1552 1577 1578 1738 1865 1900 1907 1926 1939 1980 2021 2022 2025 2056 2089 2109 2190 2194 2237 2267 2280 2290 2294 2295 2332 2345 2346 2387 2409 2417 2419 2454 2513 2523 2542 2612 2679 2680 2801 2903 2980 3006 3012 3077 3097 3101 3108 3114 3122 3123 3140 3145 3146 3148 3150 3151 3153 3181 3215 3230 3237 3252 3273 3282 3283 3318 3319 3321 3327 3331 3438 3452 3505 3513 3516 3517 3547 3548 3549 3560 3561 3565 3578 3592 3638 3653 3701 3733 3734 3735 3739 3821 3841 3842 3843 3844 3854 3861 3897 3906 3921 4034 4038 4039 4052 4053 4057 4058 4061 4075 4096 4132 4148 4195 4228 4277 4348 4360 4382 4426 60 106 158 282 597 628 738 1093 1116 1212 1233 1327 1575 1736 1747 1774 1794 1929 2000 2008 2246 2369 2416 2448 2488 2600 2619 2866 2872 2958 2988 3323 3371 3408 3418 3480 3528 3642 3729 3793 3795 3935 4029 4319 GGTGCT/AGCACC 0 -2 164 175 50 -18.0 1 2 28 35 47 52 54 62 84 89 104 162 167 195 198 199 219 223 224 226 230 245 264 265 267 335 345 427 483 492 510 511 517 541 616 633 660 700 702 743 767 787 802 804 852 878 902 945 1034 1040 1060 1096 1102 1123 1164 1166 1218 1261 1269 1335 1386 1419 1443 1476 1511 1525 1558 1573 1614 1615 1625 1669 1711 1723 1786 1840 1859 1952 1953 1972 2009 2010 2028 2106 2123 2124 2130 2168 2184 2229 2251 2254 2334 2396 2399 2442 2472 2507 2526 2527 2547 2605 2613 2619 2643 2672 2710 2729 2744 2757 2815 2823 2825 2826 2841 2861 2866 2881 2917 2918 2986 2993 3005 3019 3021 3022 3107 3128 3134 3142 3183 3191 3220 3253 3263 3269 3308 3311 3335 3380 3387 3412 3445 3446 3457 3488 3514 3584 3623 3635 3682 3699 3772 3773 3877 3903 3912 3915 4011 4043 4187 4221 4222 4417 43 53 98 539 561 564 613 619 663 704 714 729 836 978 1156 1164 1178 1193 1293 1383 1392 1528 1532 1648 1682 1739 2013 2066 2089 2106 2426 2427 2511 2530 2656 2699 3022 3074 3085 3090 3130 3440 3653 3704 3763 4272 4389 4434 4435 4444 GGTGCA/TGCACC 0 -2 164 172 55 -15.6 0 3 6 33 42 69 70 89 111 171 245 259 311 319 347 348 366 389 403 405 422 465 505 529 535 590 596 608 630 634 635 644 662 703 770 788 822 834 862 865 881 895 929 960 986 993 1029 1046 1063 1096 1097 1144 1220 1224 1226 1255 1265 1285 1311 1341 1412 1465 1528 1587 1588 1594 1618 1619 1641 1658 1672 1711 1713 1716 1734 1750 1751 1769 1795 1797 1798 1822 1858 1863 1916 1949 1964 1970 1985 2062 2073 2087 2140 2167 2211 2235 2251 2257 2353 2374 2375 2383 2384 2413 2435 2457 2468 2498 2520 2534 2535 2575 2584 2627 2635 2694 2695 2764 2774 2800 2854 2889 2910 2930 2966 3070 3074 3078 3089 3119 3127 3166 3201 3236 3280 3318 3319 3341 3347 3369 3455 3473 3474 3572 3593 3647 3703 3849 3951 4016 4085 4086 4122 4137 4188 4195 4233 4285 4323 4324 4331 4357 4388 4405 19 45 62 164 274 483 677 721 771 775 778 884 962 1014 1054 1117 1125 1134 1194 1200 1481 1502 1575 1644 1945 2084 2094 2118 2166 2349 2443 2595 2641 2662 2702 2801 2927 2988 3139 3140 3378 3480 3581 3716 3750 3952 4028 4109 4130 4251 4379 4380 4397 4409 4430 TGGCGG/CCGCCA 0 -3 160 167 35 -22.5 1 2 8 33 45 84 96 135 146 180 202 225 254 310 323 336 339 379 380 421 435 487 493 533 534 580 589 621 623 629 686 733 739 755 756 772 773 780 781 829 896 910 930 931 997 998 1114 1147 1161 1228 1264 1328 1345 1346 1399 1410 1414 1415 1428 1430 1432 1433 1435 1436 1438 1530 1538 1556 1557 1571 1582 1669 1700 1706 1707 1711 1793 1801 1828 1882 1896 1909 1935 1936 1976 1977 2000 2013 2057 2061 2073 2097 2125 2163 2173 2221 2251 2272 2273 2341 2344 2358 2359 2468 2492 2493 2503 2610 2624 2634 2677 2678 2729 2732 2769 2808 2820 2821 2900 2920 2955 2956 2957 2966 3029 3100 3101 3164 3173 3243 3265 3273 3311 3325 3357 3392 3441 3513 3515 3516 3517 3537 3559 3599 3635 3673 3674 3740 3781 3882 3900 3907 3946 3994 4122 4301 4360 4386 4406 4440 106 349 466 483 731 747 883 1116 1117 1168 1403 1451 1562 1623 1628 1636 1718 1824 1940 1944 2178 2211 2423 2613 2726 2833 2871 2950 3480 3499 3573 3915 4027 4231 4266 GCTGCG/CGCAGC 1 -3 158 165 34 -22.5 26 38 43 58 59 72 75 79 93 105 109 117 122 130 154 164 175 176 185 200 309 331 334 335 347 348 350 355 393 434 438 513 537 563 564 601 611 685 691 702 778 779 928 933 971 991 1066 1080 1088 1164 1170 1180 1201 1223 1236 1261 1305 1334 1368 1369 1459 1484 1521 1547 1567 1668 1686 1704 1705 1708 1709 1719 1734 1746 1747 1775 1781 1786 1895 1939 2025 2060 2109 2129 2140 2141 2147 2194 2203 2230 2234 2241 2285 2293 2310 2321 2422 2458 2492 2493 2534 2797 2801 2817 2836 2865 2866 2971 3007 3008 3009 3035 3036 3037 3048 3049 3131 3161 3181 3219 3246 3260 3294 3348 3349 3355 3373 3379 3381 3440 3465 3471 3512 3600 3601 3606 3784 3827 3868 3904 3905 3975 3987 4062 4083 4093 4137 4141 4147 4219 4237 4303 4321 4322 4340 4360 4381 4391 2 156 391 503 785 830 981 1279 1406 1751 1792 1793 1972 1982 2094 2113 2149 2164 2392 2488 2547 2706 2887 3058 3140 3184 3223 3597 3619 3786 3919 3926 3980 4386 GCCTTC/GAAGGC 7 -2 159 160 49 -15.4 26 40 114 115 124 137 161 178 227 244 269 291 303 314 330 389 426 435 487 492 554 599 608 614 619 707 708 765 768 826 843 867 908 919 940 977 988 1003 1072 1127 1167 1190 1198 1273 1274 1317 1340 1376 1378 1434 1443 1465 1499 1509 1514 1521 1527 1546 1548 1553 1571 1618 1643 1689 1704 1710 1718 1761 1907 1934 1941 1970 1982 2012 2036 2083 2084 2087 2091 2131 2153 2265 2266 2316 2361 2405 2421 2443 2448 2515 2566 2573 2658 2659 2661 2709 2721 2722 2725 2755 2824 2843 2880 2913 2948 2958 2959 2977 2978 2982 3100 3188 3207 3228 3285 3304 3306 3351 3372 3389 3391 3394 3395 3399 3415 3445 3446 3451 3455 3528 3558 3576 3587 3631 3632 3647 3707 3708 3733 3734 3777 3797 3942 3943 3989 4048 4049 4098 4115 4116 4140 4145 4193 4244 4271 4279 4291 4320 4443 4 123 399 445 658 676 848 1014 1029 1489 1567 1601 1609 1828 1944 2111 2171 2254 2423 2434 2583 2609 2634 2815 2825 2884 2910 2913 3024 3069 3140 3281 3310 3333 3416 3429 3584 3596 3854 3890 4107 4195 4309 4337 4340 4344 4365 4413 4428 CACGGT/ACCGTG 5 -2 158 158 50 -14.6 6 45 79 129 134 152 153 188 223 224 302 324 355 377 382 411 446 447 505 506 540 581 645 646 659 713 715 716 744 811 816 830 851 877 983 1030 1046 1061 1085 1176 1190 1223 1227 1237 1238 1255 1258 1306 1307 1353 1392 1417 1457 1463 1565 1624 1637 1638 1656 1660 1700 1717 1746 1747 1797 1798 1808 1841 1859 1873 1877 1884 1888 1906 1925 1934 1945 1985 2004 2053 2062 2102 2145 2203 2216 2246 2247 2268 2338 2363 2431 2432 2521 2540 2692 2698 2703 2728 2758 2759 2801 2815 2837 2879 2881 2891 2898 2902 3003 3006 3057 3100 3143 3145 3146 3190 3203 3225 3245 3303 3312 3352 3360 3398 3454 3483 3537 3553 3627 3641 3682 3758 3762 3763 3790 3835 3848 3884 3902 3919 3959 3987 3996 4048 4049 4079 4106 4107 4128 4158 4164 4188 4228 4260 4278 4373 4419 4421 45 107 163 208 258 330 453 566 584 663 672 693 734 875 877 896 899 929 970 1033 1331 1504 1529 1620 1737 1764 1778 1931 1969 2042 2139 2427 2478 2594 2761 2937 2954 3345 3366 3418 3587 3643 3661 3779 3798 3848 3984 4199 4409 4410 AGGCGG/CCGCCT 0 -3 151 154 32 -21.0 81 82 137 146 190 194 242 292 300 303 318 333 337 339 385 389 391 403 405 441 444 529 567 591 599 607 612 626 670 671 684 686 731 732 733 750 759 799 826 848 852 863 881 988 1019 1027 1121 1134 1184 1191 1192 1222 1273 1274 1328 1330 1351 1386 1405 1408 1410 1442 1630 1634 1643 1651 1673 1676 1677 1689 1777 1805 1807 1813 1877 1885 1892 1902 1903 1907 1926 1935 1950 1960 1985 2004 2021 2022 2073 2087 2157 2166 2226 2276 2277 2299 2304 2308 2365 2421 2435 2457 2502 2542 2670 2682 2700 2722 2725 2729 2798 2810 2820 2822 2930 2948 2970 2984 3098 3101 3114 3117 3118 3221 3232 3327 3432 3466 3562 3565 3609 3612 3618 3711 3733 3734 3821 3915 3944 3945 3959 3983 3984 4038 4039 4090 4098 4186 4250 4251 4443 149 210 285 290 343 373 399 465 555 626 895 913 1239 1249 1324 1389 1563 2280 2524 2634 2752 3048 3136 3169 3529 3747 3809 3838 4043 4251 4365 4413 GTGGCG/CGCCAC 0 -1 147 152 39 -17.5 1 2 8 33 37 45 60 84 146 202 254 255 310 336 379 380 426 492 493 521 525 533 534 538 581 589 623 634 635 733 739 755 756 772 773 795 829 892 896 951 981 993 1068 1114 1175 1209 1328 1345 1346 1410 1430 1435 1438 1464 1472 1530 1567 1582 1700 1722 1742 1760 1781 1814 1817 1842 1867 1868 1877 1882 1884 1896 1916 1935 1936 1976 1977 1984 2015 2027 2059 2060 2067 2125 2153 2163 2166 2173 2252 2276 2277 2341 2516 2591 2677 2678 2713 2732 2769 2815 2865 2900 2904 2955 2956 2985 3010 3029 3072 3100 3101 3127 3163 3200 3225 3235 3265 3311 3312 3337 3357 3392 3441 3513 3515 3537 3624 3643 3644 3662 3740 3781 3795 3836 3882 3889 3907 4008 4037 4148 4284 4301 4327 4360 4386 4406 4422 53 54 290 413 465 566 883 1116 1117 1451 1562 1623 1636 1668 1718 1776 2001 2178 2346 2406 2437 2534 2584 2600 2613 2619 2663 2696 2822 2894 2950 2957 3434 3453 3499 3529 3555 3573 4390 CGAGCT/AGCTCG 6 -4 141 149 45 -14.6 37 57 65 66 73 117 149 182 206 239 241 264 265 282 294 297 317 332 372 414 416 424 439 459 468 502 508 521 563 564 570 620 653 665 681 730 786 816 923 951 961 1061 1067 1080 1083 1089 1112 1117 1127 1140 1157 1168 1179 1215 1232 1265 1295 1298 1363 1364 1393 1398 1499 1517 1530 1597 1616 1643 1693 1697 1698 1720 1721 1732 1734 1759 1787 1846 1859 1887 2083 2084 2144 2152 2178 2185 2189 2213 2214 2218 2243 2254 2280 2294 2295 2298 2329 2395 2467 2475 2518 2524 2584 2701 2718 2829 2932 2933 2948 2998 3053 3190 3249 3250 3284 3289 3320 3396 3542 3543 3636 3688 3732 3752 3756 3757 3893 3953 3989 4057 4058 4124 4126 4206 4241 4253 4317 4349 4382 4414 4415 148 306 316 354 613 675 685 696 788 846 978 1001 1046 1076 1093 1153 1384 1395 1398 1519 1732 1795 1886 2341 2370 2547 2614 2777 2900 2914 2977 2984 3068 3094 3192 3261 3320 3405 3529 3543 3569 3595 3687 3768 4255 GGCGGA/TCCGCC 0 -2 150 148 30 -20.6 81 137 146 180 198 199 225 261 292 310 337 391 441 455 493 559 589 629 630 666 684 686 720 721 724 733 772 773 780 781 799 848 863 881 953 970 988 1019 1134 1149 1170 1191 1192 1222 1243 1273 1274 1284 1328 1330 1405 1428 1435 1442 1544 1545 1547 1630 1669 1676 1677 1689 1700 1706 1707 1777 1801 1805 1877 1885 1902 1907 1935 1939 1980 2008 2022 2056 2057 2109 2221 2237 2304 2332 2387 2417 2454 2542 2624 2634 2679 2680 2700 2722 2729 2798 2820 2920 2927 2957 3012 3077 3097 3101 3114 3122 3123 3145 3146 3148 3153 3237 3243 3265 3273 3318 3319 3321 3327 3344 3377 3432 3438 3447 3452 3466 3513 3516 3517 3547 3548 3549 3561 3701 3711 3772 3773 3843 3844 3897 3906 3921 4034 4132 4148 4186 4228 4301 4426 4443 60 285 399 483 846 895 1116 1212 1389 1718 1736 1774 2000 2416 2423 2488 2752 2833 2872 2958 2988 3136 3323 3408 3528 3573 3729 3747 3915 3935 AGCGGT/ACCGCT 5 -2 143 147 29 -20.8 44 106 116 178 212 229 232 256 275 312 314 319 346 399 426 446 447 450 515 516 521 560 566 602 617 623 667 668 670 671 692 741 743 745 764 865 896 951 954 970 1001 1059 1121 1132 1164 1239 1281 1282 1289 1296 1297 1298 1344 1357 1417 1430 1434 1484 1496 1558 1607 1608 1611 1612 1681 1738 1772 1830 1852 1943 1944 2038 2054 2076 2081 2091 2110 2117 2125 2186 2195 2290 2311 2368 2386 2439 2443 2498 2529 2620 2628 2637 2638 2690 2691 2741 2757 2768 2797 2851 2866 2907 3006 3007 3008 3029 3035 3036 3060 3064 3138 3180 3260 3261 3299 3379 3390 3419 3434 3642 3716 3733 3734 3811 3818 3898 3919 3928 3946 3975 4014 4068 4076 4077 4105 4122 4135 4136 4212 4277 4294 4296 4442 415 453 480 482 483 656 660 733 985 1475 1548 1706 1719 1755 1848 1989 2157 2370 2383 2427 2448 2581 2793 3114 3461 4000 4086 4150 4206 GCCGGA/TCCGGC 0 -2 148 146 44 -14.4 1 2 40 53 101 102 215 252 339 404 443 448 473 520 559 561 574 581 626 627 628 703 774 775 784 798 802 833 859 869 894 1006 1011 1042 1205 1209 1283 1315 1407 1416 1451 1475 1495 1503 1542 1544 1545 1574 1576 1618 1654 1655 1663 1687 1689 1764 1800 1806 1817 1857 1874 1887 1923 1943 1944 1980 1988 2049 2074 2111 2112 2225 2232 2259 2290 2313 2339 2342 2388 2389 2399 2406 2417 2419 2437 2491 2524 2712 2754 2823 2899 2900 2903 2907 2957 2958 2959 2981 3012 3140 3210 3211 3215 3257 3284 3328 3329 3331 3342 3343 3348 3349 3367 3452 3470 3476 3523 3526 3527 3531 3657 3673 3674 3702 3710 3725 3861 3893 3897 3899 3918 3944 3945 4015 4030 4031 4057 4058 4066 4070 4090 4105 4122 4143 4272 4363 4377 4422 92 128 188 349 417 418 458 561 747 951 1060 1264 1327 1412 1530 1542 1621 1711 1905 2599 2634 2679 2760 2790 3065 3146 3251 3371 3378 3384 3430 3441 3527 3531 3592 3604 3641 3795 3861 3913 3968 4179 4401 4417 CCGGTG/CACCGG 0 -4 142 144 47 -13.0 0 43 62 84 124 155 160 213 223 245 254 269 276 288 301 347 348 355 404 421 570 611 614 638 642 679 713 720 721 795 833 839 862 993 1006 1098 1099 1119 1147 1158 1159 1186 1187 1197 1201 1221 1235 1254 1285 1316 1342 1387 1398 1411 1422 1441 1452 1482 1541 1630 1635 1636 1750 1796 1815 1851 1887 2028 2068 2087 2139 2184 2211 2225 2227 2243 2271 2290 2296 2374 2375 2383 2384 2393 2442 2449 2451 2546 2552 2621 2724 2733 2749 2765 2766 2782 2800 2806 2879 2897 2910 2988 2989 3004 3014 3037 3070 3077 3097 3101 3160 3198 3243 3253 3299 3457 3514 3538 3573 3581 3582 3639 3659 3735 3765 3766 3885 3894 3958 4032 4033 4067 4096 4148 4221 4222 4227 4315 4341 4348 4402 4403 79 129 157 164 183 242 275 308 398 509 591 628 694 873 1092 1164 1402 1458 1476 1503 1519 1526 1624 1700 1764 1945 2033 2246 2276 2393 2592 2870 2966 3075 3112 3191 3433 3490 3573 3682 3792 3919 3978 4005 4230 4409 4434 CACGGC/GCCGTG 2 -4 143 143 32 -18.5 25 32 57 165 202 209 210 287 290 328 355 359 406 407 408 415 477 513 549 550 557 574 604 668 698 744 777 820 886 905 906 954 993 1111 1170 1186 1187 1201 1204 1277 1292 1299 1349 1371 1450 1479 1564 1566 1592 1650 1704 1708 1709 1733 1760 1807 1845 1973 2036 2060 2108 2129 2183 2228 2261 2267 2280 2284 2294 2295 2296 2332 2370 2409 2417 2472 2505 2513 2605 2606 2619 2624 2673 2679 2680 2694 2733 2820 2839 2932 2933 2942 2957 2980 2993 3011 3085 3097 3152 3163 3173 3226 3246 3253 3257 3282 3283 3347 3355 3377 3399 3400 3412 3453 3461 3490 3565 3641 3673 3674 3739 3768 3836 3858 3878 3879 3907 3937 3938 3965 3966 4057 4058 4066 4075 4128 4172 4183 4263 4277 4301 4364 4422 129 282 330 449 924 1398 1400 1423 1476 1913 1966 1989 2060 2132 2256 2448 2486 2490 2665 2832 3018 3140 3429 3557 3591 3642 3657 3810 3825 3951 4220 4421 CATGCC/GGCATG 10 -2 134 138 44 -12.8 12 14 41 61 114 116 127 170 179 219 222 246 273 336 362 369 443 462 482 509 551 556 561 567 573 585 586 654 673 797 802 899 952 953 962 963 1058 1121 1147 1165 1198 1220 1224 1264 1266 1281 1282 1313 1318 1328 1340 1489 1526 1542 1556 1557 1568 1642 1664 1712 1904 1905 1923 1925 1942 1976 1977 2020 2061 2069 2102 2110 2175 2249 2252 2308 2396 2431 2432 2462 2517 2535 2539 2575 2655 2709 2710 2713 2825 3065 3091 3092 3117 3134 3176 3218 3239 3240 3294 3312 3345 3509 3510 3523 3529 3530 3618 3625 3633 3635 3647 3695 3696 3703 3778 3783 3796 3880 3881 3903 3906 3923 3924 3965 3966 3992 4007 4217 4232 4292 4293 4313 4340 4348 175 207 414 416 499 632 647 752 853 894 1178 1186 1264 1292 1375 1653 1707 1754 1801 1823 1875 2012 2105 2112 2214 2222 2456 2502 2651 2709 2909 3021 3181 3422 3437 3444 3459 3480 3643 3884 3902 3945 4061 4276 GCTGCC/GGCAGC 1 -3 129 137 43 -12.9 18 94 127 165 168 171 212 224 240 269 303 313 344 363 368 373 379 380 417 439 446 447 473 507 578 590 654 670 671 726 727 782 813 814 825 852 853 870 886 938 939 954 1022 1057 1080 1112 1170 1205 1229 1249 1262 1270 1318 1341 1370 1410 1413 1430 1465 1474 1489 1500 1502 1509 1533 1558 1624 1731 1778 1790 1795 1806 1822 1827 1852 1888 1951 1961 2012 2025 2031 2150 2172 2176 2226 2279 2284 2293 2298 2406 2407 2426 2495 2587 2657 2688 2693 2705 2733 2745 2820 2855 2881 2941 2949 2967 3006 3117 3434 3438 3490 3518 3561 3600 3601 3607 3678 3679 3845 3846 3921 4052 4053 4090 4163 4167 4186 4219 4347 13 90 203 250 268 542 561 584 772 806 1014 1051 1072 1193 1355 1359 1540 1618 1693 1745 1794 2095 2106 2377 2614 2867 2871 2941 3128 3230 3251 3252 3311 3410 3415 3433 3500 3590 3784 3797 3868 3958 4155 ACGGCG/CGCCGT 2 -3 141 136 43 -12.8 32 64 117 136 163 210 337 455 492 591 593 604 642 666 720 721 736 744 820 849 850 905 906 958 970 984 1057 1073 1201 1211 1243 1277 1288 1309 1371 1407 1438 1475 1502 1509 1542 1552 1592 1650 1663 1674 1675 1676 1677 1738 1752 1800 1816 1857 1889 1900 1973 1980 2015 2056 2068 2089 2108 2141 2151 2194 2196 2237 2267 2280 2294 2295 2332 2343 2387 2409 2417 2472 2505 2513 2673 2679 2680 2698 2733 2905 2912 2931 2942 2967 2980 2993 2997 3006 3070 3097 3148 3210 3226 3293 3377 3389 3415 3438 3505 3536 3547 3548 3549 3560 3561 3565 3578 3619 3739 3836 3843 3854 3934 3987 4034 4035 4036 4052 4053 4057 4058 4095 4115 4117 4118 4128 4132 4148 4172 4228 4277 4321 4322 4348 4360 31 129 282 628 676 738 751 867 970 1001 1097 1116 1264 1370 1423 1458 1512 1736 1926 2000 2008 2247 2448 2508 2619 2665 2820 2835 2872 3002 3089 3323 3393 3642 3669 3670 3727 3831 3967 4220 4246 4319 4421 ACGGCT/AGCCGT 2 -3 131 134 32 -16.5 17 25 109 139 140 146 165 206 209 267 270 282 305 309 328 335 355 477 513 549 550 557 679 680 696 777 836 870 875 886 920 938 964 973 1170 1186 1187 1292 1320 1359 1372 1462 1650 1700 1706 1707 1708 1709 1807 1808 1829 1845 1846 1873 1982 1989 1993 2006 2009 2010 2037 2041 2060 2081 2119 2120 2129 2133 2198 2199 2228 2259 2280 2370 2386 2547 2560 2587 2619 2655 2694 2711 2753 2820 2834 2957 3030 3033 3039 3040 3085 3089 3131 3163 3185 3186 3197 3238 3253 3282 3283 3298 3339 3347 3360 3371 3400 3412 3501 3688 3690 3758 3858 3861 3878 3879 3892 3937 4066 4073 4074 4083 4117 4118 4137 4173 4183 4263 4301 4303 4422 33 55 101 151 253 367 1392 1400 1486 1849 1966 1991 2132 2165 2168 2300 2820 2949 2980 2999 3049 3074 3118 3140 3144 3399 3418 3825 3951 4154 4371 4437 GGCGGC/GCCGCC 0 -2 131 129 27 -17.7 43 93 96 225 300 337 344 355 384 487 493 580 591 593 599 621 623 630 642 670 671 676 720 721 733 754 755 756 774 775 896 910 930 931 936 976 988 1184 1255 1264 1277 1345 1346 1404 1407 1436 1438 1444 1462 1536 1537 1538 1547 1571 1673 1882 1892 1900 1926 1950 1976 1977 2021 2025 2087 2089 2157 2190 2226 2237 2267 2280 2299 2308 2341 2358 2359 2454 2457 2612 2682 2729 2732 2801 2948 3098 3101 3108 3114 3140 3164 3173 3181 3252 3273 3282 3283 3327 3331 3392 3396 3513 3515 3537 3560 3561 3565 3612 3618 3653 3733 3734 3735 3740 3781 3821 3844 3861 3906 3983 3984 4038 4039 4057 4058 4061 4075 4250 4251 4360 4386 106 210 373 465 913 1249 1451 1636 1794 2211 2246 2369 2619 2726 2871 3169 3371 3480 3529 3642 3793 3795 3809 4029 4043 4319 4365 GCCGCC/GGCGGC 1 -3 131 129 27 -17.7 43 93 96 225 300 337 344 355 384 487 493 580 591 593 599 621 623 630 642 670 671 676 720 721 733 754 755 756 774 775 896 910 930 931 936 976 988 1184 1255 1264 1277 1345 1346 1404 1407 1436 1438 1444 1462 1536 1537 1538 1547 1571 1673 1882 1892 1900 1926 1950 1976 1977 2021 2025 2087 2089 2157 2190 2226 2237 2267 2280 2299 2308 2341 2358 2359 2454 2457 2612 2682 2729 2732 2801 2948 3098 3101 3108 3114 3140 3164 3173 3181 3252 3273 3282 3283 3327 3331 3392 3396 3513 3515 3537 3560 3561 3565 3612 3618 3653 3733 3734 3735 3740 3781 3821 3844 3861 3906 3983 3984 4038 4039 4057 4058 4061 4075 4250 4251 4360 4386 106 210 373 465 913 1249 1451 1636 1794 2211 2246 2369 2619 2726 2871 3169 3371 3480 3529 3642 3793 3795 3809 4029 4043 4319 4365 TCGAGC/GCTCGA 6 -5 124 127 39 -12.4 162 165 167 197 238 239 264 265 278 294 308 372 414 416 424 439 459 487 502 529 549 550 570 620 645 646 651 652 675 681 730 760 823 825 910 923 1083 1127 1193 1230 1232 1295 1299 1335 1393 1398 1459 1490 1517 1530 1560 1616 1650 1693 1711 1787 1846 1859 1860 1864 1870 1891 1908 2083 2084 2093 2209 2213 2214 2218 2243 2249 2280 2311 2329 2376 2377 2410 2435 2475 2519 2582 2614 2655 2928 2936 2948 3087 3088 3109 3134 3145 3146 3208 3238 3330 3347 3396 3493 3507 3607 3636 3638 3688 3732 3747 3752 3756 3757 3893 3953 4057 4058 4155 4174 4175 4206 4209 4243 4340 4346 4378 4414 4415 92 93 155 164 354 553 649 690 790 978 1001 1374 1392 1400 1475 1737 1860 1886 1990 2313 2321 2338 2519 2562 2581 2634 2819 3075 3192 3223 3405 3529 3543 3687 3755 3884 4026 4037 4142 CGGTGC/GCACCG 0 -3 120 126 22 -19.5 0 6 28 44 62 84 148 213 224 245 264 265 319 340 347 348 394 403 510 511 524 608 616 630 659 741 817 822 862 865 881 986 993 1046 1066 1180 1210 1255 1286 1386 1443 1452 1614 1618 1672 1711 1734 1738 1750 1786 1797 1838 1863 1887 1925 1964 1985 2009 2010 2028 2062 2073 2123 2124 2167 2168 2184 2192 2211 2353 2363 2374 2375 2386 2406 2413 2435 2442 2471 2472 2635 2695 2774 2801 2815 2881 2910 2966 2993 2997 3004 3014 3029 3127 3143 3149 3191 3226 3243 3253 3269 3280 3369 3455 3457 3514 3682 3735 3791 3903 3920 4071 4072 4137 4167 4188 4221 4222 4315 4417 45 53 157 164 483 677 701 704 881 1164 1548 1575 1746 1945 2089 2393 2443 2511 3461 3653 4409 4434 CAGCTG/CAGCTG 1 -5 115 124 30 -15.2 13 32 43 87 122 129 151 173 215 221 224 228 240 323 344 353 368 403 417 439 473 478 513 529 537 558 755 756 825 888 949 971 979 980 981 1012 1043 1051 1052 1128 1183 1234 1236 1239 1252 1327 1339 1369 1459 1479 1496 1548 1593 1603 1719 1745 1827 1830 1880 1910 1951 1963 2025 2031 2067 2070 2073 2074 2125 2171 2205 2216 2222 2233 2279 2300 2413 2507 2510 2589 2598 2601 2693 2777 2780 2781 2786 2799 2852 2853 2927 2976 3009 3035 3036 3170 3182 3189 3219 3336 3348 3349 3367 3409 3455 3468 3570 3613 3786 3787 4000 4141 4282 4283 4298 106 318 388 391 399 460 561 591 771 796 874 1031 1068 1157 1283 1534 1680 1683 1834 1908 1982 2319 2808 2887 3023 3480 3631 3902 3980 4117 GACGGC/GCCGTC 2 -4 125 122 31 -14.4 117 136 163 309 406 429 455 492 494 549 550 591 626 666 720 721 836 853 875 938 958 964 984 997 998 1022 1057 1121 1211 1309 1359 1407 1416 1438 1497 1509 1674 1675 1676 1677 1786 1790 1808 1851 1852 1857 1866 1873 1900 1912 1934 1989 2009 2010 2015 2041 2068 2116 2126 2133 2149 2168 2172 2198 2199 2237 2242 2259 2388 2389 2548 2560 2619 2698 2711 2753 2895 2905 2942 2966 2967 2980 3006 3030 3033 3039 3040 3089 3148 3185 3186 3210 3238 3293 3313 3318 3319 3369 3371 3377 3389 3400 3432 3536 3758 3800 3854 3892 3982 4034 4035 4036 4052 4053 4095 4117 4118 4132 4149 4173 4227 4239 4321 4322 4348 13 33 628 676 722 751 867 993 1142 1158 1264 1370 1458 1512 1926 1968 2000 2665 2820 2872 2999 3049 3245 3323 3406 3592 3670 3768 3902 4154 4190 CCGCTG/CAGCGG 1 -5 116 119 34 -12.6 8 27 106 116 123 131 181 282 345 399 435 446 447 560 587 590 617 623 670 671 766 838 851 896 938 951 954 978 1001 1039 1057 1064 1088 1100 1109 1146 1194 1211 1271 1296 1312 1316 1330 1386 1410 1417 1430 1484 1530 1547 1558 1564 1576 1607 1608 1678 1744 1772 1788 1805 1852 1889 1907 1914 1943 1944 2025 2054 2061 2091 2098 2192 2198 2199 2204 2290 2468 2522 2537 2557 2637 2638 2649 2684 2690 2691 2757 2797 2851 2866 2982 3035 3036 3064 3191 3221 3269 3434 3486 3495 3496 3547 3561 3642 3659 3716 3735 3779 3818 3861 3967 3968 4067 4277 4442 4443 106 319 327 453 480 483 524 649 660 809 976 1016 1224 1744 1760 1774 1794 1848 1989 2370 2417 2448 2488 2511 2664 2860 3055 3641 3699 3933 4029 4138 4206 4319 GTAGCC/GGCTAC 4 -1 114 119 33 -12.9 10 11 97 98 109 127 177 189 255 264 265 266 295 300 311 329 337 366 371 422 475 537 582 637 669 679 870 921 927 994 996 1007 1124 1170 1206 1272 1306 1307 1310 1315 1317 1359 1377 1387 1390 1391 1396 1434 1456 1501 1624 1669 1676 1677 1699 1704 1731 1810 1811 1871 1873 1884 1936 1978 2187 2253 2262 2335 2392 2437 2446 2460 2473 2490 2536 2548 2552 2563 2613 2619 2725 2755 2829 2837 2907 2978 2996 3026 3033 3126 3128 3131 3177 3178 3233 3329 3371 3394 3395 3565 3568 3575 3584 3592 3635 3892 3985 4133 4134 4201 4263 4304 4327 4340 33 272 611 668 828 873 1071 1093 1124 1277 1475 1478 1823 1826 1849 1979 1982 2431 2485 2803 3384 3418 3721 3734 3817 3848 3864 4027 4067 4126 4249 4382 4409 GGCTGG/CCAGCC 0 -3 111 118 36 -11.7 14 19 21 22 23 52 77 81 150 259 260 290 310 323 336 341 353 429 446 447 462 518 536 570 603 633 648 650 691 699 709 776 791 912 913 927 1012 1033 1042 1157 1228 1315 1374 1401 1464 1465 1489 1491 1643 1684 1685 1780 1781 1797 1875 1980 2095 2111 2112 2118 2150 2169 2198 2199 2210 2271 2315 2342 2348 2448 2610 2709 2721 2730 2731 2760 2838 2851 2863 3050 3191 3238 3273 3329 3344 3362 3416 3452 3462 3463 3522 3526 3553 3704 3705 3769 3818 3875 3876 3965 3966 4012 4013 4048 4049 4109 4282 4283 4361 4374 4434 25 175 349 539 597 684 892 1014 1105 1249 1326 1384 1392 1490 1751 1753 1845 1893 1920 2010 2144 2145 2180 2494 2611 2613 2627 2884 3074 3371 3416 3452 3483 3512 3723 4272 CGCCGC/GCGGCG 1 -4 122 116 38 -10.6 129 225 287 337 384 487 493 559 591 597 630 691 720 721 724 733 793 879 896 928 936 953 976 988 1008 1011 1056 1057 1109 1147 1149 1170 1264 1385 1404 1438 1444 1462 1538 1547 1551 1571 1652 1744 1889 1907 1926 1950 1970 2021 2023 2025 2190 2267 2322 2323 2341 2345 2346 2364 2454 2457 2473 2522 2523 2542 2557 2587 2596 2651 2685 2729 2792 2793 2801 2805 2912 2983 3077 3089 3101 3108 3114 3153 3181 3230 3252 3273 3327 3331 3365 3366 3513 3527 3560 3561 3575 3612 3653 3663 3670 3701 3733 3734 3735 3781 3821 3906 3949 3983 3984 4038 4039 4057 4058 4061 4067 4075 4143 4360 4382 4425 31 60 106 552 597 722 913 1201 1233 1451 1744 1774 1793 1794 1929 2246 2416 2488 2600 2619 2860 2988 3065 3089 3115 3371 3418 3480 3527 3528 3529 3641 3729 3792 3793 3935 4029 4319 CTGCAG/CTGCAG 1 -2 107 115 37 -10.7 9 29 63 95 151 167 201 224 228 255 277 282 344 345 356 359 521 537 541 542 590 627 628 641 660 714 792 807 846 896 968 1060 1102 1109 1127 1212 1280 1308 1347 1361 1362 1372 1394 1395 1450 1459 1462 1482 1568 1622 1646 1679 1737 1781 1828 1919 1963 1979 1991 2001 2025 2031 2055 2061 2106 2160 2180 2205 2222 2507 2541 2598 2609 2622 2645 2693 2757 2764 2818 2842 2866 2909 2948 3017 3097 3157 3181 3182 3289 3290 3291 3341 3374 3382 3428 3445 3446 3455 3486 3720 3891 3947 3980 4244 4300 4379 4380 55 82 106 214 322 375 396 431 562 564 660 1336 1340 1484 1701 1709 2005 2106 2204 2270 2283 2482 2698 3001 3055 3080 3203 3234 3304 3415 3530 3543 3579 3590 3796 4089 4259 CTCGCC/GGCGAG 4 -1 115 115 31 -12.9 52 99 100 149 158 409 416 426 508 591 614 617 627 628 641 676 700 745 759 844 855 916 917 958 959 975 1026 1068 1073 1076 1083 1126 1211 1235 1268 1299 1465 1475 1499 1520 1546 1582 1597 1613 1629 1701 1744 1813 1863 1904 1905 1916 1918 2015 2031 2041 2151 2214 2290 2307 2341 2369 2388 2389 2467 2473 2513 2540 2547 2557 2596 2705 2746 2824 2894 2912 2974 2975 2980 2985 2997 3013 3053 3077 3109 3115 3149 3190 3210 3337 3518 3536 3561 3585 3597 3598 3599 3612 3658 3663 3739 3781 3849 3864 3873 4079 4126 4143 4148 4321 4322 4341 4348 4393 4425 54 139 445 552 566 628 793 877 1014 1544 1941 2246 2285 2323 2482 2494 2760 3089 3135 3189 3223 3282 3425 3527 3567 3719 3810 4094 4206 4305 4402 TGCGTC/GACGCA 9 -3 114 115 30 -13.3 43 52 78 110 122 175 176 268 309 313 354 355 364 472 513 525 526 537 562 563 564 593 611 657 658 685 703 715 716 737 839 855 972 986 1003 1012 1051 1052 1193 1281 1282 1300 1303 1421 1490 1509 1559 1674 1675 1692 1756 1803 1830 1839 1845 1939 2022 2028 2046 2062 2089 2141 2176 2231 2237 2261 2472 2541 2619 2693 2872 2923 2955 2956 3035 3036 3054 3210 3238 3243 3247 3300 3348 3349 3365 3366 3371 3397 3470 3485 3748 3828 3829 3866 3867 3904 3905 3906 4014 4038 4039 4056 4068 4070 4083 4093 4098 4104 4224 4303 4351 4352 4364 4399 84 447 568 675 745 830 973 1098 1279 1444 1954 1983 2069 2138 2174 2202 2253 2814 2898 3084 3233 3333 3502 3528 3646 3682 3729 4233 4281 4401 CGGCTG/CAGCCG 1 -5 113 114 35 -11.2 0 40 165 181 206 207 267 295 309 315 323 335 341 355 359 642 703 831 852 853 886 894 928 930 931 1006 1042 1088 1170 1205 1209 1236 1320 1341 1347 1372 1407 1444 1451 1567 1574 1705 1746 1747 1807 1845 1888 1891 1982 2025 2037 2041 2049 2060 2062 2095 2111 2112 2140 2180 2198 2199 2228 2237 2241 2296 2315 2322 2388 2389 2406 2414 2437 2534 2587 2712 2732 2754 2820 2834 2893 2957 3085 3101 3164 3185 3186 3191 3238 3452 3515 3526 3537 3541 3711 3735 3739 3861 3869 3892 4022 4083 4090 4117 4118 4122 4235 4236 4237 4263 4303 4360 4386 55 210 327 417 503 597 846 1072 1105 1249 1392 1486 1540 1636 1711 2634 2738 2828 2832 2871 2949 2980 3049 3074 3371 3399 3408 3452 3497 3604 3642 3765 4154 4401 4437 CGAGCC/GGCTCG 6 -4 113 112 32 -11.9 80 153 160 197 239 350 459 492 529 549 550 597 620 633 641 645 646 651 652 738 777 825 857 867 875 898 910 939 1003 1026 1056 1085 1125 1143 1193 1200 1441 1446 1447 1560 1577 1578 1622 1631 1650 1712 1755 1793 1846 1853 1864 2070 2093 2126 2151 2170 2177 2184 2209 2249 2301 2415 2465 2548 2582 2614 2655 2670 2782 2821 2824 2872 2928 2936 2962 2991 3046 3082 3087 3088 3109 3145 3146 3191 3197 3199 3238 3347 3400 3438 3548 3549 3612 3619 3631 3632 3636 3638 3710 3725 3747 3811 3819 4002 4071 4072 4156 4175 4209 4243 4327 4346 4378 60 164 282 416 563 690 790 874 1474 1990 2060 2313 2634 2702 2749 2818 3120 3202 3223 3345 3408 3619 3623 3639 3687 3768 3859 3884 3896 4013 4026 4037 AGCCGC/GCGGCT 1 -4 109 109 29 -12.4 43 156 181 207 263 282 287 300 315 341 355 359 422 487 580 587 621 642 643 772 773 872 910 928 1088 1170 1194 1277 1376 1407 1436 1444 1536 1537 1567 1621 1673 1678 1705 1729 1730 1805 1892 1900 2025 2062 2087 2180 2222 2237 2241 2271 2280 2299 2315 2322 2349 2406 2534 2548 2550 2587 2600 2614 2660 2669 2682 2726 2732 2893 2948 2952 2953 3098 3101 3157 3164 3191 3252 3396 3415 3529 3530 3533 3534 3537 3541 3565 3612 3635 3653 3735 3740 3780 3821 3861 3869 3911 3954 4056 4117 4118 4215 4235 4236 4237 4307 4386 4399 106 210 327 484 524 750 1041 1249 1297 1435 1540 1636 2211 2564 2685 2726 2749 2832 2871 3169 3371 3408 3497 3642 3809 3918 3955 4043 4095 GCTGGC/GCCAGC 0 -2 100 107 29 -12.0 13 20 27 52 64 81 121 131 152 189 209 224 236 291 323 345 365 378 379 380 416 429 449 468 518 536 588 665 679 709 755 756 820 825 887 888 907 1064 1109 1146 1219 1228 1298 1532 1666 1669 1678 1684 1685 1692 1943 1944 1979 1986 2062 2091 2169 2251 2299 2386 2448 2487 2488 2520 2541 2588 2655 2688 2721 2727 2760 2778 2811 2928 3111 3144 3173 3191 3273 3329 3428 3461 3478 3479 3564 3575 3704 3705 3775 3796 3891 4012 4013 4125 4150 4151 4255 4323 4324 4361 106 327 387 523 539 561 649 1068 1078 1105 1224 1326 1398 1399 1751 1917 2045 2073 2614 2627 2832 3147 3480 3631 3809 3919 3993 4221 4349 ACTGCC/GGCAGT 2 -3 94 101 23 -13.2 8 24 47 53 66 112 148 182 226 250 251 314 331 360 402 428 458 535 569 582 625 626 652 668 670 671 712 754 794 798 803 829 835 933 988 1130 1166 1221 1328 1394 1395 1551 1582 1587 1588 1607 1608 1616 1664 1704 1713 1845 1852 1882 1935 2069 2079 2126 2226 2313 2410 2469 2470 2474 2487 2488 2561 2598 2610 2772 2920 2966 3004 3098 3111 3212 3213 3257 3320 3327 3415 3466 3500 3559 3653 3753 3901 3906 4017 4018 4224 4227 4381 4427 95 351 508 712 905 1201 1378 1402 1428 1643 1684 1782 1788 2082 2139 2170 2801 2818 2865 3224 3300 3541 3761 CAGTGC/GCACTG 2 -4 95 99 21 -13.7 48 60 224 234 305 331 342 359 363 393 397 398 423 434 512 524 527 553 606 615 631 634 635 667 687 705 730 754 795 861 868 878 992 1026 1053 1130 1241 1244 1245 1266 1290 1316 1406 1472 1495 1534 1560 1618 1622 1716 1746 1747 1833 1899 1916 2069 2096 2126 2181 2200 2309 2316 2335 2351 2382 2610 2612 2642 2644 2756 2995 3105 3110 3182 3238 3296 3355 3391 3465 3577 3661 3775 3797 3837 3838 3848 3852 3886 4198 4201 4272 4281 4402 4403 4440 568 636 851 932 1123 1276 1296 1481 1496 1610 1751 2221 2539 2868 2947 3006 3024 3025 3185 3755 3871 GACTGC/GCAGTC 2 -4 95 97 29 -10.0 24 63 95 160 163 224 250 251 268 290 335 364 378 381 402 428 458 508 546 596 619 632 829 833 882 895 897 989 1010 1061 1102 1111 1134 1360 1447 1462 1497 1622 1663 1680 1781 1881 1887 1891 1949 1964 1985 1991 2001 2145 2203 2234 2278 2294 2295 2297 2348 2367 2470 2695 2757 2771 2778 2906 2963 2976 3037 3111 3166 3181 3225 3236 3290 3291 3300 3312 3338 3477 3481 3487 3500 3635 3797 3901 3969 4015 4030 4031 4165 4176 4191 4244 4299 4413 4442 186 193 200 249 290 396 552 633 706 720 979 1059 1336 1428 1451 1709 1902 2139 2170 2482 2789 2908 2917 3164 3725 4051 4062 4210 4233 CGCAGT/ACTGCG 5 -2 98 95 20 -13.3 192 267 347 348 363 364 378 381 397 398 428 448 496 512 546 619 631 715 716 755 756 793 838 882 989 1061 1083 1111 1256 1377 1544 1545 1553 1629 1881 1887 1985 1998 2022 2036 2113 2114 2145 2183 2203 2204 2237 2294 2295 2297 2302 2323 2575 2593 2656 2658 2659 2709 2711 2810 2878 2906 2988 2989 3037 3081 3093 3188 3233 3300 3358 3365 3366 3373 3487 3544 3545 3635 3805 3969 4030 4031 4038 4039 4076 4077 4098 4131 4176 4178 4179 4250 4251 4345 4351 4352 4396 4401 260 552 686 725 858 935 1230 1300 1497 1902 2529 2614 2643 2664 2789 2898 3232 3269 3586 4233 TGCCGC/GCGGCA 1 -4 94 94 14 -16.3 8 53 93 116 126 305 344 379 380 578 593 599 623 670 671 676 736 754 774 775 887 930 931 976 988 1064 1112 1184 1219 1224 1255 1430 1530 1536 1537 1649 1827 1852 1882 2025 2061 2098 2113 2114 2172 2226 2308 2358 2359 2370 2497 2595 2612 2631 2693 2868 2906 2924 3006 3060 3093 3140 3282 3283 3293 3327 3434 3541 3547 3589 3590 3600 3601 3610 3618 3641 3661 3702 3707 3708 3716 3753 3776 3791 3844 4052 4053 4061 4135 4136 4199 4394 4422 4428 150 249 465 649 806 809 1224 1794 2369 3115 3202 3480 3586 3590 CGTGCT/AGCACG 6 -4 93 93 25 -10.7 9 79 111 123 149 257 277 294 434 439 453 512 524 541 604 627 628 659 663 664 692 792 861 887 1046 1112 1223 1255 1272 1293 1385 1389 1418 1454 1555 1560 1686 1733 1831 1834 1842 1941 1952 1953 1998 2065 2106 2127 2285 2350 2471 2662 2673 2689 2737 2758 2759 2760 2765 2766 2952 2953 2957 2963 2965 2971 2977 2983 3061 3077 3113 3201 3315 3316 3328 3353 3354 3476 3574 3669 3753 3762 3763 3834 3862 3974 4172 4219 4285 4318 4323 4324 4419 39 196 448 480 1124 1140 1528 1611 1704 1738 2249 2367 2390 2599 2634 2699 3149 3184 3232 3578 3661 3680 3684 3906 4177 CCGAGC/GCTCGG 6 -5 90 92 26 -10.1 28 37 117 160 169 186 206 268 282 409 524 563 564 651 655 741 754 791 824 875 887 898 951 996 1067 1112 1140 1157 1168 1200 1215 1239 1255 1441 1577 1578 1610 1643 1651 1697 1698 1712 1793 1814 1834 1853 1888 1900 1911 2070 2189 2249 2298 2334 2365 2370 2395 2465 2518 2569 2582 2718 2834 2962 2991 2998 3006 3029 3191 3197 3199 3249 3250 3284 3338 3399 3438 3548 3549 3619 3636 3725 3819 3848 3989 4071 4072 4124 4187 4241 60 563 613 846 874 1046 1076 1474 1519 1732 1765 1795 2090 2393 2721 2738 2818 2900 3120 3261 3320 3682 3726 3764 3768 4013 GCCGCA/TGCGGC 1 -3 93 90 22 -11.3 116 126 156 305 315 379 380 397 398 527 578 630 691 724 736 772 773 793 810 879 885 928 976 1149 1170 1194 1224 1385 1536 1537 1547 1567 1705 2025 2113 2114 2172 2183 2190 2222 2241 2323 2523 2534 2550 2595 2600 2614 2669 2792 2793 2801 2893 2906 2952 2953 3060 3061 3077 3089 3093 3101 3153 3157 3219 3230 3365 3366 3415 3490 3541 3575 3589 3590 3612 3635 3652 3670 3701 3702 3753 3791 3869 3906 3957 4056 4075 4235 4236 4240 4382 4399 4422 552 750 1158 1201 1297 1358 1435 1929 2375 2564 2600 2685 2988 3065 3115 3202 3371 3418 3480 3586 3935 3955 CTAGCC/GGCTAG 4 -1 89 90 21 -11.7 10 11 156 161 215 229 263 502 510 511 523 525 665 791 903 905 906 1094 1180 1204 1263 1266 1268 1293 1299 1372 1376 1419 1489 1496 1504 1506 1515 1524 1602 1678 1681 1699 1705 1722 1732 1767 1824 1841 1885 1985 2004 2183 2274 2280 2497 2503 2505 2539 2550 2560 2660 2667 2673 2687 2726 2886 3070 3109 3195 3196 3217 3302 3387 3494 3577 3597 3598 3611 3626 3781 3803 3804 3841 3842 4059 4158 4171 4194 4199 4247 4294 4385 4413 441 732 779 783 1206 1383 1399 1427 2262 2379 2456 2524 2537 2825 3503 3592 3809 3863 4190 4369 4404 GGTGCC/GGCACC 0 -2 85 89 25 -9.9 1 2 44 55 260 262 269 301 305 317 335 340 347 348 384 429 524 546 561 626 649 659 741 788 817 833 838 881 887 971 1066 1118 1195 1210 1286 1316 1452 1475 1484 1641 1688 1799 1825 1826 1925 2251 2269 2270 2406 2421 2442 2573 2827 3004 3014 3029 3060 3144 3152 3222 3223 3226 3290 3291 3428 3563 3564 3664 3675 3735 3791 3844 3920 3988 4071 4072 4193 4275 4292 4293 4300 4315 4358 4359 4427 157 188 480 499 1096 1125 1249 1253 1411 1624 1746 1989 2002 2390 2393 2606 2832 3063 3219 3461 3592 3616 3958 4129 4322 GGTGCG/CGCACC 0 -2 87 89 13 -15.7 24 52 63 148 165 175 176 254 262 394 492 562 630 680 703 723 812 830 861 961 1066 1125 1178 1180 1228 1300 1428 1539 1720 1721 1738 1764 1791 1838 1887 1926 1941 2062 2127 2147 2172 2180 2192 2363 2365 2385 2386 2455 2456 2471 2472 2504 2592 2617 2618 2633 2748 2750 2801 2830 2831 2838 2873 2891 2952 2953 2997 3090 3141 3143 3149 3191 3243 3281 3330 3331 3373 3741 3748 3827 3869 3912 4075 4145 4154 4167 4253 598 701 881 1410 1502 1548 1945 2009 2174 2582 2698 3152 3809 GCGTCA/TGACGC 9 -2 88 87 25 -9.4 28 52 57 118 136 227 376 449 532 611 614 661 666 703 711 737 934 952 1031 1032 1051 1052 1175 1230 1255 1592 1613 1622 1658 1752 1809 1869 1929 1930 1933 2070 2166 2180 2193 2213 2222 2234 2245 2274 2300 2338 2580 2581 2595 2614 2651 2672 2685 2693 2776 2835 2948 2955 2956 3092 3161 3184 3209 3247 3267 3277 3348 3349 3418 3495 3496 3579 3580 3640 3715 3725 3934 3956 4041 4042 4061 4083 4224 4284 4330 4351 4352 4364 220 587 800 901 1954 1964 2014 2202 2253 2423 2820 2839 3029 3070 3146 3405 3429 3593 3646 3662 3682 3932 4233 4246 4298 GCCGAG/CTCGGC 8 -2 84 86 28 -8.2 1 2 151 217 282 367 407 408 547 548 634 635 676 754 850 1007 1028 1157 1193 1255 1300 1345 1346 1347 1450 1465 1470 1538 1549 1577 1578 1596 1662 1713 1731 1863 1888 1911 1943 1944 2099 2135 2151 2212 2241 2249 2281 2309 2456 2464 2465 2492 2493 2522 2548 2561 2582 2592 2672 2768 2818 2845 2867 2925 2964 3087 3088 3168 3237 3256 3420 3453 3523 3636 3819 3858 3864 4040 4092 4241 4263 4360 4374 4390 60 149 349 496 693 806 846 1014 1188 1212 1732 1741 1795 2167 2246 2291 2541 2643 2710 2727 2861 2862 3211 3242 3418 3726 4097 4431 TCCCGA/TCGGGA 11 -2 82 84 27 -8.2 88 97 98 144 186 279 379 380 506 519 563 564 576 577 655 693 778 779 824 918 936 937 1177 1200 1215 1219 1330 1398 1422 1435 1453 1526 1576 1614 1667 1701 1791 1815 1834 1843 1906 1926 1969 1980 2109 2144 2178 2313 2336 2337 2433 2446 2509 2555 2556 2599 2713 2839 2841 2916 2950 2951 3189 3235 3252 3295 3327 3358 3444 3588 3699 3874 3900 3964 3978 3997 4032 4033 4112 4162 4357 4367 72 184 349 503 655 663 664 685 853 1000 1086 1225 1375 1767 2091 2276 2558 2829 3022 3488 3569 3652 3669 3726 3773 3774 3787 TGCCGG/CCGGCA 0 -3 79 82 26 -8.1 1 2 41 144 175 176 269 386 443 448 470 473 494 559 561 626 638 712 713 798 802 816 833 869 918 993 1197 1221 1283 1480 1482 1503 1576 1629 1654 1655 1686 1746 1747 1800 1806 1874 1887 2047 2184 2191 2206 2207 2227 2232 2238 2251 2259 2313 2321 2406 2442 2733 2893 2900 3004 3052 3075 3211 3302 3328 3367 3418 3476 3523 3894 3906 4015 4071 4072 4169 4227 4363 4440 99 128 164 451 702 951 1060 1199 1417 1435 1476 1530 1621 1700 2005 2393 2599 2679 2866 3251 3333 3378 3433 3666 4179 4339 GCGGTA/TACCGC 5 -1 80 80 26 -7.7 8 33 246 328 450 533 534 617 626 627 628 667 670 671 686 692 750 769 853 860 954 983 1011 1132 1147 1239 1278 1281 1282 1297 1316 1361 1362 1404 1430 1651 1738 1865 2091 2141 2161 2162 2166 2252 2285 2294 2295 2443 2470 2492 2493 2523 2529 2628 2725 2851 2900 3006 3060 3133 3329 3379 3569 3576 3592 3635 3670 3841 3842 3907 3954 3975 4007 4090 4181 4182 4277 4296 4382 4396 149 157 415 480 482 733 1324 1400 1706 1755 1899 2113 2279 2547 2553 2797 2830 2884 2981 3115 3281 4000 4027 4050 4224 4251 CGTGCC/GGCACG 6 -4 78 80 24 -8.4 3 7 21 142 185 262 277 330 340 406 426 544 557 568 581 627 628 648 674 688 710 767 869 875 962 1009 1043 1050 1085 1186 1187 1204 1297 1480 1665 1720 1721 1746 1747 1934 1959 1996 2070 2184 2228 2242 2414 2645 2808 2813 2815 2928 3279 3328 3355 3392 3454 3525 3551 3597 3598 3619 3641 3651 3800 3839 3907 3939 3940 4115 4135 4136 4215 4239 4261 4262 4421 4422 479 618 665 788 884 924 1197 1242 1452 1697 1835 1911 2147 2315 2406 2612 2832 2916 3187 3680 4143 4152 4163 4421 GCGAGC/GCTCGC 6 -5 78 78 24 -8.0 52 149 257 314 332 350 416 468 492 508 597 600 641 734 786 866 961 1026 1033 1056 1085 1117 1125 1211 1265 1323 1373 1446 1447 1499 1521 1546 1589 1732 1734 1759 1773 1887 2019 2041 2126 2151 2177 2461 2467 2473 2499 2617 2618 2824 2894 2905 2932 2933 2980 3046 3053 3109 3191 3210 3238 3320 3400 3460 3543 3548 3549 3612 3714 3715 3761 3811 3843 3849 4020 4124 4126 4139 255 411 675 1153 1227 1318 1363 1395 1396 1398 1732 1736 2614 2699 2760 2977 3345 3452 3569 3619 3626 3639 3754 4255 CTCCCG/CGGGAG 11 -3 77 78 26 -7.4 29 88 145 311 339 425 506 573 611 693 772 773 778 779 852 936 975 981 1003 1011 1059 1171 1200 1215 1472 1599 1614 1701 1746 1747 1813 1830 1838 1906 1907 1941 1959 1980 2028 2057 2086 2134 2144 2345 2346 2374 2375 2435 2455 2506 2555 2556 2599 2639 2749 2758 2759 2776 2850 2964 3078 3189 3245 3252 3432 3444 3445 3446 3452 3735 3759 3760 3819 3874 3900 4300 4377 225 389 663 920 1071 1079 1093 1246 1327 1399 1404 1511 1656 1767 1931 1943 2091 2407 2447 2632 2865 2894 3003 3333 3488 4121 CCGTGC/GCACGG 6 -5 72 75 17 -10.2 3 9 21 79 123 165 224 277 406 434 477 506 557 581 604 617 659 767 792 810 820 869 983 1009 1043 1085 1204 1255 1279 1454 1480 1733 1746 1747 1877 1934 1941 1959 2044 2062 2065 2228 2521 2619 2645 2673 2698 2717 2758 2759 2808 2815 2957 2983 2993 3347 3352 3461 3641 3758 3762 3763 3907 4057 4058 4164 4172 4301 4318 4364 4419 4421 107 258 1435 1529 2147 2612 2634 2650 2832 2954 3149 3184 3798 4199 4409 4410 4421 GCGGTC/GACCGC 5 -1 70 73 21 -8.1 25 63 167 172 212 242 314 333 379 380 421 450 451 452 567 583 609 623 743 744 1125 1180 1201 1298 1309 1468 1469 1496 1577 1578 1681 1799 1896 1943 1944 1948 2073 2173 2194 2228 2354 2386 2468 2475 2502 2504 2522 2536 2622 2651 2713 2753 2808 2821 2865 3098 3181 3261 3373 3502 3589 3590 3600 3601 3621 3811 3928 4193 4215 4440 290 369 656 747 874 985 1168 1562 1722 1751 1940 1989 2524 2553 2634 2812 2866 3473 3765 3888 4150 CGCGGT/ACCGCG 5 -2 70 71 11 -12.4 25 123 167 172 179 301 490 581 583 609 717 718 722 761 853 1021 1033 1070 1071 1125 1129 1147 1242 1468 1469 1502 1606 1734 1779 1827 1887 1893 1894 1909 1947 2123 2124 2141 2147 2202 2212 2228 2335 2456 2475 2529 2536 2592 2651 2713 2845 2872 2908 3145 3146 3171 3455 3516 3517 3641 3670 3821 3971 3972 4110 4181 4182 4193 4237 4405 369 961 1281 1903 2178 2553 2645 3115 3548 3833 4050 CAGGCC/GGCCTG 10 -2 68 70 15 -10.0 56 154 236 313 315 406 407 408 432 477 582 591 618 637 702 888 895 1042 1080 1162 1163 1218 1266 1332 1333 1344 1425 1463 1480 1512 1558 1711 1733 1774 1982 2082 2246 2247 2291 2399 2413 2478 2547 2593 2818 2844 3012 3253 3273 3281 3342 3343 3398 3399 3482 3664 3686 3738 3791 3803 3804 3885 3886 4191 4215 4285 4357 4361 258 361 469 503 561 578 946 970 1032 2400 2455 2520 3003 4282 4349 CACGGG/CCCGTG 5 -2 62 68 21 -7.1 9 21 40 123 145 165 236 290 304 311 406 424 428 491 573 574 617 645 646 810 869 914 915 923 1010 1043 1059 1134 1137 1279 1454 1486 1597 1795 1828 1941 1959 2024 2065 2250 2294 2295 2342 2380 2435 2571 2572 2599 2645 2727 2821 2958 2959 3041 3048 3049 3296 3525 3662 3806 3813 3814 389 469 737 905 910 964 1052 1216 1451 1491 1833 2138 2384 2521 2634 2695 2832 2865 2908 3272 3309 GTCCCG/CGGGAC 11 -3 66 68 13 -10.5 146 196 254 275 290 293 347 348 379 380 405 576 577 665 715 716 759 918 937 1010 1177 1201 1219 1273 1274 1323 1332 1333 1393 1597 1660 1766 1815 1881 1969 2024 2047 2065 2228 2250 2324 2325 2433 2490 2507 2724 2834 2885 2950 2951 2981 3037 3045 3233 3295 3310 3323 3327 3414 3699 3978 3997 4169 4206 4331 4357 282 453 655 686 778 883 910 2545 2698 2862 3022 3881 4092 TCCCGC/GCGGGA 11 -2 65 67 22 -6.6 29 146 214 254 333 339 347 348 381 405 590 592 729 759 827 828 888 968 975 1001 1011 1020 1171 1194 1273 1274 1296 1323 1332 1333 1383 1438 1459 1551 1614 1746 1747 1813 1830 1838 1903 1907 1926 1941 2097 2134 2345 2346 2455 2468 2507 2757 2758 2759 2834 2930 3045 3327 3476 3554 3735 3779 3820 3994 4300 225 282 535 564 626 686 883 1041 1079 1093 1327 1394 1399 1453 1507 1824 2448 2546 2599 2632 3619 4121 GCGTCC/GGACGC 9 -2 65 65 10 -11.5 110 301 313 331 449 457 481 526 537 562 569 593 715 716 761 839 866 986 1165 1193 1232 1281 1282 1446 1490 1543 1595 1616 1692 1839 1939 2022 2028 2046 2123 2124 2141 2237 2438 2490 2522 2595 2619 2689 2734 2835 2845 2914 3092 3163 3188 3368 3397 3414 3420 3560 3941 3961 4037 4098 4321 4322 4351 4352 4399 675 830 2069 2174 2513 2793 3084 3213 3528 4334 GGGTGC/GCACCC 0 -3 61 63 18 -7.2 24 167 198 199 259 262 269 459 630 634 635 660 700 812 833 852 895 945 961 1096 1118 1164 1226 1311 1475 1573 1594 1791 2087 2147 2172 2269 2270 2399 2468 2507 2520 2526 2527 2617 2618 2854 2861 3019 3134 3220 3290 3291 3341 3387 3584 3623 3635 3748 3849 3915 4011 4187 4233 4285 4300 561 714 778 1410 1502 1532 1945 2009 2106 2118 2166 2390 2427 3440 3750 4028 4129 4130 CTAGCG/CGCTAG 4 -1 61 60 18 -6.6 194 213 315 323 347 348 392 395 439 523 636 955 1232 1270 1297 1426 1427 1541 1552 1648 1732 1734 1735 1736 1745 1777 1846 1847 1855 1871 1900 2027 2315 2443 2468 2497 2499 2504 2632 2687 2688 2743 3103 3104 3112 3118 3138 3163 3177 3178 3480 3611 3681 3731 3810 3901 3930 3931 4011 4059 4426 219 482 679 1288 1399 1453 1636 2042 2324 2476 2656 2698 2812 3175 3245 3497 3641 4263