#5000/5000 #32.83 # k-mer/r.c. Cluster Offset PosCt wPosCt NegCt HGP_10 CACCAC/GTGGTG 0 -3 1092 1121 139 -215.7 0 1 4 5 9 13 16 17 19 22 23 25 31 36 42 44 48 52 54 56 57 59 60 62 67 72 77 80 86 88 91 93 96 98 101 106 110 111 112 113 115 116 127 128 129 131 133 138 146 154 157 158 169 170 174 179 181 191 194 197 199 200 204 209 214 215 216 219 220 223 224 233 240 241 249 259 261 262 264 276 279 280 281 290 291 292 293 299 306 309 314 322 331 333 341 345 346 353 355 359 360 361 363 364 366 367 370 371 374 375 376 381 382 383 385 386 389 392 394 395 402 406 407 408 412 419 424 425 431 436 439 447 449 452 454 456 457 466 468 470 475 479 487 488 493 496 503 504 508 509 519 520 524 529 530 532 542 544 545 554 556 557 559 562 565 572 574 575 584 589 593 595 599 601 603 605 610 617 627 629 630 631 632 634 643 649 652 653 654 660 661 662 668 670 671 672 673 676 679 690 699 701 704 708 714 715 716 719 720 725 728 739 756 759 767 768 774 775 782 784 785 786 794 796 802 815 816 821 827 834 841 844 854 857 859 862 864 865 867 868 872 882 897 905 907 909 915 918 920 927 928 934 941 953 956 958 959 968 969 976 979 982 983 984 995 1004 1005 1016 1017 1022 1023 1025 1030 1034 1037 1048 1058 1078 1080 1083 1084 1088 1091 1099 1102 1117 1122 1124 1126 1133 1134 1142 1143 1149 1150 1153 1154 1158 1162 1165 1173 1176 1178 1186 1188 1194 1217 1221 1230 1232 1235 1243 1246 1249 1256 1258 1265 1269 1273 1284 1289 1295 1297 1308 1314 1319 1321 1324 1325 1329 1336 1338 1344 1347 1348 1356 1366 1370 1385 1386 1387 1397 1398 1400 1401 1405 1408 1410 1415 1422 1426 1444 1448 1450 1451 1453 1455 1456 1457 1459 1467 1474 1480 1481 1486 1491 1492 1501 1502 1506 1509 1510 1515 1517 1521 1529 1532 1533 1536 1544 1545 1548 1550 1577 1579 1582 1586 1587 1590 1594 1602 1603 1609 1611 1612 1628 1629 1632 1634 1645 1648 1651 1653 1655 1663 1667 1669 1673 1679 1680 1682 1685 1688 1693 1694 1700 1704 1707 1710 1712 1714 1717 1718 1720 1723 1730 1732 1734 1738 1740 1742 1747 1748 1749 1752 1757 1759 1762 1766 1771 1772 1776 1790 1794 1800 1801 1806 1809 1811 1813 1815 1817 1820 1823 1837 1845 1849 1850 1852 1856 1858 1860 1872 1877 1892 1898 1901 1902 1906 1908 1909 1918 1922 1928 1933 1934 1936 1939 1940 1946 1951 1952 1954 1958 1965 1983 1988 2005 2008 2016 2020 2021 2025 2035 2041 2048 2049 2051 2061 2063 2070 2078 2083 2085 2088 2095 2096 2098 2099 2102 2109 2118 2122 2123 2126 2131 2133 2136 2139 2148 2150 2153 2155 2163 2164 2168 2174 2176 2178 2191 2196 2204 2205 2225 2227 2229 2231 2232 2234 2236 2237 2238 2247 2263 2270 2273 2279 2282 2288 2294 2295 2296 2297 2298 2308 2309 2311 2316 2319 2330 2336 2337 2343 2344 2349 2359 2363 2374 2376 2379 2380 2383 2390 2399 2405 2406 2425 2435 2438 2455 2456 2472 2479 2486 2488 2493 2498 2501 2506 2509 2519 2522 2523 2524 2540 2541 2546 2550 2551 2553 2555 2562 2570 2573 2576 2588 2590 2605 2606 2613 2615 2618 2630 2631 2638 2644 2645 2649 2677 2679 2685 2687 2689 2695 2696 2705 2706 2707 2708 2713 2720 2721 2723 2728 2733 2747 2749 2756 2758 2765 2775 2781 2785 2787 2790 2793 2799 2804 2805 2810 2817 2823 2828 2829 2833 2835 2842 2844 2849 2856 2859 2866 2872 2874 2878 2880 2888 2894 2912 2916 2917 2918 2919 2920 2925 2933 2936 2947 2951 2953 2974 2979 2980 2987 2991 3000 3008 3011 3012 3016 3022 3024 3028 3032 3035 3041 3042 3047 3054 3062 3064 3073 3079 3081 3091 3093 3094 3095 3098 3099 3101 3102 3119 3123 3125 3129 3138 3155 3156 3165 3167 3175 3178 3180 3184 3185 3190 3192 3199 3208 3211 3212 3216 3227 3237 3239 3243 3245 3248 3252 3257 3262 3269 3272 3276 3284 3285 3290 3293 3299 3306 3310 3313 3321 3335 3348 3360 3366 3370 3372 3384 3386 3407 3411 3415 3420 3429 3430 3431 3432 3434 3446 3447 3452 3454 3457 3459 3465 3466 3469 3470 3471 3473 3474 3475 3476 3479 3480 3482 3483 3484 3485 3487 3494 3503 3507 3510 3513 3520 3527 3532 3534 3552 3563 3572 3577 3579 3584 3587 3593 3606 3610 3611 3612 3621 3623 3624 3627 3628 3649 3652 3655 3659 3660 3668 3672 3674 3689 3705 3707 3721 3725 3726 3732 3740 3747 3748 3756 3758 3765 3766 3771 3778 3781 3783 3795 3797 3800 3801 3807 3810 3818 3820 3822 3835 3842 3844 3847 3854 3857 3866 3873 3874 3875 3878 3879 3881 3889 3891 3901 3902 3905 3908 3910 3915 3918 3919 3926 3936 3943 3944 3951 3955 3958 3962 3965 3968 3974 3978 3979 3982 3987 3991 3992 3994 4002 4004 4014 4015 4016 4018 4022 4023 4025 4027 4033 4036 4037 4047 4061 4073 4080 4088 4091 4092 4099 4110 4112 4116 4120 4130 4133 4144 4151 4163 4168 4170 4172 4184 4191 4194 4202 4205 4206 4207 4210 4217 4221 4223 4226 4227 4230 4232 4237 4246 4249 4257 4259 4263 4272 4274 4278 4281 4282 4286 4290 4299 4300 4302 4313 4314 4316 4317 4321 4327 4337 4341 4346 4348 4352 4362 4363 4366 4371 4373 4375 4384 4386 4388 4391 4406 4407 4413 4423 4428 4435 4436 4440 4444 4449 4453 4455 4463 4473 4477 4478 4483 4487 4495 4496 4498 4500 4502 4504 4506 4509 4512 4522 4525 4536 4544 4545 4547 4549 4554 4557 4558 4562 4563 4565 4571 4578 4579 4580 4583 4588 4590 4593 4594 4599 4600 4605 4613 4615 4617 4622 4624 4625 4628 4629 4636 4642 4643 4644 4646 4652 4659 4660 4668 4676 4678 4691 4713 4715 4723 4730 4735 4736 4756 4767 4777 4785 4786 4793 4796 4802 4817 4818 4821 4823 4827 4835 4854 4855 4859 4860 4865 4878 4879 4885 4892 4897 4904 4912 4924 4928 4935 4941 4974 4977 4979 4999 18 28 29 36 37 61 102 111 164 186 208 250 258 261 268 325 334 368 388 429 441 442 480 495 527 618 681 714 793 794 798 799 803 811 863 1010 1103 1131 1152 1166 1196 1201 1326 1384 1430 1438 1488 1489 1553 1575 1623 1649 1657 1684 1707 1728 1729 1777 1787 1816 1884 2065 2074 2083 2121 2255 2363 2370 2392 2460 2469 2571 2576 2586 2599 2651 2722 2741 2761 2789 2861 2918 2945 2960 3029 3045 3049 3157 3192 3210 3211 3233 3241 3272 3279 3305 3319 3434 3441 3481 3506 3610 3626 3630 3642 3690 3694 3774 3808 3822 3837 3934 3965 3968 4042 4049 4087 4180 4184 4307 4378 4436 4471 4482 4483 4568 4609 4610 4679 4690 4704 4787 4796 4821 4838 4855 4877 4941 4974 CTCCAC/GTGGAG 0 -3 1018 1017 137 -186.1 2 6 11 12 15 16 21 24 25 50 52 57 64 68 70 73 76 81 83 93 104 113 114 116 118 129 132 137 143 148 149 150 151 156 159 167 183 185 190 192 199 204 208 227 229 235 239 244 245 247 248 249 252 260 265 269 270 278 280 293 297 301 309 315 316 319 333 339 340 341 352 356 365 366 371 373 382 385 394 400 401 412 421 422 423 426 445 453 460 465 467 482 503 506 512 514 515 519 529 533 537 538 539 542 545 546 549 550 553 554 555 560 563 591 602 608 612 618 620 624 633 636 637 639 648 654 655 659 660 663 672 677 683 685 688 689 693 695 696 707 720 723 730 734 736 741 744 759 760 762 764 769 771 773 788 789 791 792 799 805 807 814 817 824 829 831 844 846 848 853 854 856 860 861 864 870 872 874 878 880 883 888 893 899 902 928 933 935 937 938 941 943 949 950 961 966 974 975 978 980 992 995 997 1006 1007 1011 1013 1022 1028 1032 1034 1036 1038 1044 1050 1052 1056 1071 1073 1075 1081 1087 1100 1109 1111 1119 1120 1121 1130 1131 1145 1155 1160 1163 1169 1175 1191 1195 1202 1207 1214 1215 1220 1224 1226 1229 1231 1235 1236 1244 1253 1262 1265 1266 1274 1275 1277 1280 1281 1295 1301 1308 1316 1325 1336 1337 1339 1340 1347 1352 1354 1359 1367 1371 1380 1384 1393 1395 1402 1404 1409 1415 1416 1432 1433 1439 1441 1446 1449 1460 1470 1480 1483 1487 1489 1494 1497 1498 1512 1513 1522 1526 1535 1539 1541 1543 1558 1560 1565 1572 1581 1584 1594 1597 1598 1601 1610 1617 1633 1634 1635 1636 1639 1641 1643 1645 1646 1649 1654 1656 1662 1672 1682 1685 1693 1696 1697 1705 1715 1726 1731 1736 1738 1743 1766 1779 1780 1785 1788 1798 1799 1802 1823 1826 1834 1836 1838 1844 1854 1855 1869 1872 1875 1883 1885 1895 1900 1901 1903 1905 1913 1917 1921 1928 1929 1930 1937 1938 1939 1940 1941 1950 1952 1973 1975 1977 1980 1982 1986 1987 1991 1992 2005 2010 2018 2024 2025 2029 2030 2033 2038 2040 2045 2050 2054 2055 2064 2065 2069 2071 2073 2077 2087 2101 2111 2115 2116 2125 2126 2127 2129 2134 2146 2147 2149 2151 2154 2156 2166 2167 2169 2171 2172 2173 2183 2188 2189 2200 2202 2208 2209 2212 2214 2217 2220 2221 2222 2223 2224 2226 2228 2230 2235 2242 2250 2252 2254 2256 2257 2262 2265 2271 2273 2276 2278 2281 2291 2300 2302 2309 2310 2318 2324 2338 2341 2342 2343 2348 2350 2353 2361 2362 2364 2366 2370 2372 2375 2378 2387 2393 2395 2414 2419 2426 2427 2428 2430 2436 2445 2447 2452 2457 2468 2469 2471 2477 2480 2482 2485 2489 2492 2496 2500 2504 2506 2514 2522 2524 2526 2535 2538 2553 2555 2559 2561 2563 2574 2577 2588 2594 2596 2597 2599 2609 2614 2616 2619 2620 2625 2626 2627 2633 2636 2637 2640 2657 2661 2667 2668 2672 2674 2686 2693 2697 2701 2712 2713 2725 2735 2741 2743 2744 2745 2746 2758 2761 2763 2764 2767 2770 2779 2793 2794 2797 2815 2820 2825 2829 2831 2832 2835 2836 2848 2853 2871 2872 2873 2875 2887 2891 2892 2893 2895 2897 2899 2901 2904 2926 2927 2939 2941 2946 2949 2959 2964 2973 2982 2984 2987 3002 3009 3017 3030 3045 3046 3050 3057 3059 3060 3065 3068 3069 3070 3071 3074 3076 3078 3092 3096 3097 3101 3103 3108 3116 3124 3127 3138 3139 3144 3146 3150 3152 3166 3170 3177 3179 3184 3185 3189 3190 3193 3194 3202 3226 3228 3230 3244 3249 3272 3278 3287 3292 3298 3306 3323 3324 3329 3333 3339 3343 3348 3363 3371 3376 3383 3387 3391 3392 3394 3398 3400 3402 3419 3424 3425 3428 3435 3436 3438 3442 3443 3445 3447 3455 3456 3463 3467 3468 3477 3478 3481 3484 3486 3495 3499 3500 3506 3508 3517 3518 3520 3521 3522 3528 3529 3530 3531 3534 3536 3537 3539 3542 3547 3549 3581 3586 3591 3597 3607 3608 3626 3641 3654 3658 3661 3664 3665 3666 3668 3669 3670 3673 3678 3688 3691 3698 3702 3711 3712 3713 3726 3737 3742 3764 3765 3767 3773 3774 3777 3780 3785 3789 3795 3796 3797 3800 3805 3806 3807 3808 3811 3834 3850 3858 3876 3882 3886 3888 3893 3898 3899 3906 3912 3916 3922 3928 3933 3934 3940 3941 3947 3949 3952 3956 3958 3959 3963 3967 3972 3976 3978 3982 3986 3987 4001 4003 4004 4007 4021 4025 4030 4034 4039 4049 4051 4053 4059 4063 4064 4068 4077 4083 4084 4090 4098 4102 4104 4105 4106 4107 4109 4112 4117 4125 4131 4133 4134 4136 4137 4138 4141 4142 4151 4154 4156 4162 4170 4175 4181 4185 4186 4192 4196 4197 4201 4203 4214 4215 4218 4229 4233 4235 4236 4240 4242 4243 4253 4256 4260 4262 4264 4267 4270 4279 4291 4301 4303 4305 4320 4321 4325 4328 4343 4345 4346 4351 4365 4367 4377 4384 4387 4389 4393 4405 4411 4420 4425 4432 4434 4438 4440 4447 4454 4465 4466 4469 4476 4478 4486 4489 4493 4495 4499 4504 4507 4509 4516 4517 4520 4527 4532 4539 4546 4550 4563 4569 4573 4576 4577 4582 4592 4597 4600 4606 4612 4625 4626 4630 4633 4634 4640 4645 4650 4655 4661 4666 4674 4679 4680 4683 4692 4693 4701 4705 4706 4711 4718 4722 4724 4725 4726 4731 4734 4742 4744 4746 4752 4755 4758 4764 4774 4776 4790 4791 4794 4796 4807 4808 4810 4812 4814 4815 4825 4828 4833 4837 4841 4842 4846 4847 4857 4858 4863 4871 4891 4894 4899 4901 4908 4911 4915 4920 4921 4927 4934 4937 4939 4942 4953 4960 4961 4962 4964 4973 4982 4983 4993 4994 9 28 43 102 118 196 420 463 465 496 528 641 669 683 740 748 759 777 789 803 812 820 856 899 901 952 1111 1192 1205 1222 1242 1259 1274 1276 1295 1332 1382 1438 1490 1565 1566 1574 1575 1666 1689 1716 1729 1745 1773 1776 1798 1892 1941 2064 2065 2208 2252 2390 2449 2459 2510 2529 2564 2642 2648 2710 2790 2845 2859 2868 2883 2893 2946 2955 3049 3108 3137 3184 3222 3226 3231 3234 3240 3305 3363 3369 3373 3390 3451 3481 3506 3522 3528 3596 3606 3630 3633 3681 3694 3717 3725 3730 3735 3816 3827 3847 3931 3943 3983 3991 4063 4079 4100 4110 4115 4167 4323 4324 4333 4457 4471 4496 4527 4565 4604 4727 4734 4744 4745 4754 4796 4855 4857 4877 4918 4949 4974 ACCACC/GGTGGT 0 -2 990 1011 134 -186.4 0 1 5 7 9 13 16 17 18 19 21 22 23 25 26 31 37 48 53 54 58 59 60 62 67 71 72 77 79 84 91 93 96 98 101 107 110 111 115 116 127 128 129 138 146 154 157 158 162 171 174 175 177 179 181 193 199 200 204 212 214 215 216 219 224 233 253 256 260 261 262 264 279 280 281 284 287 290 291 292 293 295 298 302 303 309 314 322 341 342 346 349 353 354 361 371 372 375 377 385 386 388 403 404 405 409 412 419 431 436 439 441 447 449 453 454 457 458 466 472 473 487 494 496 497 498 503 508 509 511 519 520 522 532 535 542 545 547 557 559 565 569 574 581 584 585 590 592 593 597 599 601 603 606 611 630 631 634 640 643 660 668 673 690 699 704 706 708 720 725 728 743 745 749 750 759 761 766 781 782 785 797 815 816 823 837 838 841 844 854 859 864 868 871 882 890 900 901 905 907 920 922 924 926 927 934 941 944 945 954 956 957 959 965 969 977 979 982 984 987 1005 1010 1012 1022 1025 1026 1027 1030 1034 1041 1045 1048 1050 1057 1058 1060 1078 1083 1088 1097 1098 1099 1102 1106 1117 1122 1124 1133 1134 1137 1139 1142 1143 1149 1157 1162 1165 1173 1174 1195 1204 1221 1227 1240 1242 1243 1247 1249 1254 1256 1261 1265 1269 1273 1275 1278 1284 1289 1293 1295 1297 1298 1314 1317 1319 1321 1324 1325 1329 1344 1348 1349 1356 1362 1365 1368 1370 1382 1385 1387 1388 1389 1390 1401 1405 1410 1415 1421 1422 1423 1426 1428 1442 1450 1451 1455 1457 1459 1468 1474 1479 1481 1482 1486 1488 1492 1501 1502 1509 1510 1517 1518 1523 1529 1531 1532 1536 1537 1544 1545 1550 1551 1566 1571 1595 1600 1603 1609 1612 1613 1615 1623 1626 1631 1632 1634 1645 1648 1650 1653 1655 1660 1669 1673 1674 1677 1679 1680 1683 1685 1687 1688 1694 1702 1703 1704 1706 1708 1714 1716 1717 1718 1720 1730 1732 1734 1738 1748 1756 1759 1760 1762 1766 1781 1794 1801 1805 1806 1817 1819 1822 1824 1828 1829 1839 1845 1850 1857 1859 1860 1862 1863 1872 1880 1898 1901 1902 1908 1909 1918 1920 1925 1928 1939 1951 1952 1954 1957 1965 1966 1971 1983 2019 2020 2025 2031 2035 2037 2041 2056 2057 2061 2063 2070 2074 2085 2086 2090 2094 2112 2114 2118 2120 2121 2126 2131 2132 2133 2145 2148 2155 2158 2164 2168 2171 2174 2177 2184 2191 2196 2201 2204 2205 2206 2217 2219 2225 2229 2232 2238 2247 2258 2261 2263 2273 2285 2294 2295 2297 2298 2304 2308 2320 2326 2331 2342 2344 2349 2357 2359 2379 2380 2383 2385 2388 2389 2390 2399 2415 2417 2420 2422 2431 2433 2435 2437 2439 2446 2456 2459 2461 2463 2479 2488 2495 2501 2506 2509 2519 2522 2523 2524 2525 2531 2541 2542 2547 2550 2553 2556 2562 2564 2580 2585 2590 2591 2605 2613 2615 2638 2642 2644 2649 2650 2656 2660 2661 2665 2685 2687 2689 2691 2696 2705 2707 2711 2719 2720 2723 2737 2749 2750 2757 2758 2759 2765 2774 2782 2784 2787 2791 2802 2804 2805 2806 2808 2810 2811 2826 2828 2829 2833 2835 2838 2844 2847 2850 2861 2872 2874 2878 2880 2886 2890 2894 2899 2909 2917 2918 2920 2924 2927 2933 2938 2941 2947 2957 2961 2963 2969 2974 2979 2983 2986 2991 2994 3012 3014 3016 3024 3028 3031 3036 3042 3054 3056 3062 3064 3066 3091 3094 3098 3099 3101 3102 3123 3132 3165 3167 3171 3184 3185 3190 3192 3201 3205 3207 3211 3237 3238 3243 3246 3248 3257 3267 3272 3276 3280 3284 3293 3300 3301 3303 3306 3313 3320 3321 3330 3348 3353 3356 3360 3361 3364 3366 3379 3385 3401 3406 3415 3417 3420 3422 3428 3431 3437 3447 3454 3462 3464 3466 3469 3476 3480 3492 3494 3501 3502 3509 3510 3513 3520 3534 3538 3544 3552 3555 3569 3572 3579 3580 3587 3593 3598 3611 3613 3617 3627 3628 3631 3632 3635 3637 3647 3652 3655 3659 3660 3668 3672 3674 3682 3685 3689 3703 3705 3723 3724 3727 3735 3740 3747 3748 3758 3765 3766 3778 3793 3795 3797 3801 3803 3809 3810 3815 3822 3830 3839 3840 3842 3847 3861 3872 3873 3875 3878 3883 3914 3915 3919 3924 3927 3943 3946 3951 3955 3958 3962 3964 3968 3969 3975 3978 3982 3989 3997 4008 4014 4019 4023 4025 4027 4033 4052 4066 4073 4076 4089 4093 4101 4112 4127 4130 4144 4145 4147 4152 4161 4168 4172 4184 4199 4206 4207 4214 4217 4218 4222 4226 4232 4242 4245 4249 4257 4263 4269 4271 4272 4277 4280 4281 4288 4298 4299 4300 4302 4304 4313 4321 4322 4326 4327 4329 4335 4336 4337 4342 4361 4366 4379 4380 4384 4386 4388 4395 4400 4406 4408 4410 4412 4417 4424 4428 4440 4444 4445 4446 4453 4455 4456 4463 4465 4467 4471 4473 4493 4494 4498 4499 4501 4504 4518 4521 4528 4536 4545 4546 4549 4550 4551 4554 4555 4558 4560 4563 4565 4571 4572 4583 4584 4588 4590 4593 4594 4595 4600 4602 4603 4609 4613 4615 4625 4629 4636 4642 4644 4648 4660 4676 4678 4682 4712 4713 4716 4729 4733 4737 4740 4746 4760 4761 4765 4766 4767 4768 4772 4777 4778 4779 4781 4783 4785 4786 4788 4792 4800 4806 4823 4829 4833 4835 4854 4855 4859 4864 4875 4876 4879 4885 4890 4893 4906 4909 4912 4927 4928 4935 4944 4947 4950 4959 4966 4975 4978 4981 4984 4986 4990 4991 4999 28 36 37 102 106 111 153 186 189 208 209 250 258 268 286 325 334 350 388 429 442 480 495 507 512 514 710 717 738 742 794 820 856 1040 1043 1111 1137 1152 1164 1166 1177 1201 1208 1209 1253 1384 1430 1488 1489 1546 1575 1684 1699 1728 1729 1748 1807 1816 1844 1888 1951 1964 2024 2065 2121 2141 2152 2168 2234 2313 2363 2381 2416 2443 2520 2583 2599 2703 2722 2741 2752 2789 2829 2881 2892 2918 2921 2945 2960 2970 3029 3045 3049 3201 3202 3205 3240 3270 3272 3305 3435 3448 3505 3506 3626 3635 3642 3690 3774 3822 3837 3876 3934 4042 4087 4108 4142 4155 4180 4197 4309 4471 4482 4483 4543 4568 4609 4708 4801 4909 4941 4974 4983 4996 CCACCA/TGGTGG 0 -4 890 911 178 -132.5 0 5 7 9 13 15 16 17 23 25 31 37 48 52 53 54 60 62 63 67 77 80 84 88 91 93 98 106 107 112 114 115 116 129 133 138 143 146 153 154 157 158 162 167 169 174 179 181 182 187 196 199 200 204 211 212 214 216 219 224 233 240 241 247 249 261 262 264 279 280 281 287 290 291 293 303 309 322 333 334 341 345 346 349 353 361 365 366 371 375 381 385 393 394 395 403 412 419 425 436 439 447 449 452 454 457 460 470 475 487 504 519 520 522 529 530 531 532 542 544 545 547 550 557 559 563 565 569 572 574 581 584 590 593 595 599 601 603 611 624 630 631 634 636 638 643 654 658 660 662 671 673 690 695 696 699 704 708 716 719 720 725 728 739 759 761 764 766 782 784 785 798 802 807 816 823 827 838 841 844 848 854 859 861 864 868 890 893 900 905 909 922 928 934 941 954 956 957 959 960 965 969 970 979 982 984 1005 1012 1022 1025 1032 1034 1048 1050 1056 1060 1078 1083 1088 1089 1094 1097 1099 1105 1106 1117 1122 1124 1127 1133 1134 1135 1139 1142 1143 1149 1157 1162 1165 1173 1189 1194 1227 1235 1242 1243 1247 1249 1256 1261 1266 1280 1281 1284 1293 1302 1308 1316 1319 1321 1325 1329 1333 1335 1336 1344 1349 1358 1370 1382 1385 1386 1387 1390 1400 1410 1422 1426 1433 1442 1444 1450 1453 1455 1457 1459 1468 1477 1479 1480 1481 1482 1492 1498 1502 1509 1517 1523 1529 1531 1532 1533 1536 1544 1550 1558 1566 1579 1588 1590 1594 1595 1597 1601 1603 1610 1611 1612 1613 1615 1623 1626 1628 1631 1634 1641 1645 1648 1653 1660 1674 1677 1679 1680 1685 1688 1694 1696 1700 1701 1704 1710 1714 1716 1717 1718 1730 1732 1734 1738 1749 1756 1759 1766 1777 1801 1805 1806 1816 1817 1823 1824 1836 1845 1857 1860 1867 1872 1880 1898 1901 1918 1921 1922 1928 1934 1936 1939 1940 1942 1952 1954 1958 1965 1966 1986 1988 2008 2014 2019 2025 2041 2049 2054 2056 2061 2063 2070 2073 2083 2085 2086 2089 2094 2109 2112 2118 2120 2125 2131 2133 2145 2148 2149 2154 2155 2158 2163 2166 2167 2168 2174 2178 2183 2189 2191 2195 2196 2223 2225 2234 2237 2238 2247 2254 2258 2263 2271 2273 2279 2285 2295 2296 2297 2298 2308 2309 2331 2342 2343 2344 2349 2374 2380 2383 2390 2399 2401 2405 2415 2417 2418 2420 2422 2425 2427 2431 2433 2435 2439 2445 2456 2463 2479 2488 2495 2501 2506 2509 2519 2522 2523 2524 2525 2542 2547 2551 2553 2555 2562 2584 2588 2592 2613 2635 2638 2649 2652 2656 2661 2679 2685 2687 2693 2703 2705 2707 2708 2713 2723 2725 2749 2750 2758 2765 2779 2781 2782 2784 2787 2790 2791 2793 2800 2805 2810 2811 2823 2828 2829 2835 2838 2842 2844 2861 2872 2874 2878 2883 2886 2890 2899 2915 2917 2918 2919 2920 2924 2941 2947 2953 2959 2961 2974 2979 2980 2986 2987 2991 3012 3013 3022 3024 3032 3039 3042 3054 3062 3079 3091 3098 3099 3101 3108 3119 3123 3138 3144 3152 3155 3163 3165 3166 3167 3184 3185 3188 3190 3192 3196 3207 3211 3212 3230 3237 3243 3245 3246 3248 3262 3263 3267 3272 3276 3284 3294 3299 3306 3310 3313 3317 3320 3321 3335 3348 3353 3356 3363 3364 3379 3407 3420 3422 3430 3431 3443 3446 3450 3454 3457 3466 3469 3474 3476 3479 3480 3484 3492 3496 3501 3507 3510 3513 3518 3520 3532 3534 3539 3549 3552 3569 3572 3587 3593 3598 3607 3611 3612 3627 3628 3654 3655 3659 3660 3665 3668 3672 3674 3676 3689 3703 3723 3724 3726 3732 3748 3753 3758 3766 3771 3778 3793 3795 3796 3797 3801 3807 3810 3811 3815 3820 3830 3834 3839 3842 3847 3855 3875 3879 3885 3889 3910 3914 3915 3919 3924 3928 3943 3951 3955 3958 3960 3964 3967 3969 3978 3982 3987 3997 4004 4007 4016 4019 4023 4025 4026 4027 4033 4060 4066 4073 4077 4089 4090 4093 4112 4118 4144 4147 4149 4152 4155 4161 4168 4184 4185 4191 4201 4206 4207 4217 4222 4226 4229 4230 4232 4242 4245 4249 4263 4265 4267 4269 4272 4281 4285 4286 4288 4298 4300 4302 4304 4313 4322 4329 4336 4337 4346 4366 4375 4380 4384 4386 4387 4391 4400 4405 4406 4407 4417 4420 4421 4428 4436 4441 4444 4446 4453 4455 4463 4465 4466 4471 4473 4476 4477 4478 4493 4496 4499 4502 4509 4529 4539 4545 4547 4550 4551 4558 4563 4565 4571 4579 4583 4588 4593 4594 4600 4615 4625 4629 4636 4642 4644 4652 4658 4660 4667 4674 4676 4678 4705 4716 4722 4723 4726 4729 4731 4736 4740 4742 4747 4750 4752 4761 4768 4781 4785 4786 4794 4796 4800 4802 4806 4808 4818 4823 4835 4845 4853 4854 4859 4864 4876 4877 4878 4885 4901 4909 4911 4912 4920 4928 4929 4935 4936 4950 4981 4986 4999 28 36 37 60 110 111 208 209 250 261 268 350 380 388 420 429 442 480 495 496 525 702 710 738 754 777 782 789 794 803 811 820 843 847 863 867 911 949 1072 1111 1137 1152 1163 1166 1196 1201 1205 1208 1209 1253 1254 1258 1284 1312 1430 1438 1458 1488 1543 1546 1575 1684 1689 1728 1729 1748 1844 1875 1892 1907 1914 1964 2024 2065 2083 2087 2121 2132 2160 2208 2234 2289 2313 2362 2363 2370 2583 2586 2599 2643 2645 2648 2741 2789 2793 2859 2861 2865 2893 2918 2945 2950 2957 2960 3001 3029 3033 3049 3067 3088 3157 3176 3184 3202 3216 3245 3305 3352 3362 3373 3378 3382 3434 3481 3503 3506 3518 3522 3585 3626 3630 3642 3681 3690 3694 3822 3860 3891 3931 3934 3968 3977 4042 4052 4087 4110 4142 4155 4180 4194 4305 4306 4374 4471 4482 4483 4527 4528 4603 4609 4611 4638 4650 4694 4704 4734 4760 4774 4796 4821 4823 4849 4855 4877 4941 4974 4977 4996 TCCACC/GGTGGA 0 -2 574 583 144 -68.2 6 15 16 17 21 24 25 52 60 62 76 93 100 112 114 115 129 133 143 150 151 156 163 167 187 192 199 202 204 229 240 241 247 249 250 260 264 271 278 280 287 289 293 296 297 309 333 339 341 346 365 368 371 375 382 385 394 412 415 421 425 445 453 460 465 467 470 481 519 529 534 538 542 545 554 555 559 563 572 595 624 628 633 636 637 654 659 660 662 673 677 685 688 695 696 719 724 725 728 730 739 742 759 764 773 782 792 800 802 805 807 816 831 844 846 848 853 854 861 880 893 928 937 941 956 960 966 980 1022 1028 1032 1034 1050 1052 1056 1073 1081 1099 1105 1121 1127 1130 1131 1165 1175 1189 1195 1207 1214 1215 1235 1266 1274 1280 1302 1308 1316 1325 1336 1339 1344 1346 1352 1367 1380 1384 1422 1432 1433 1451 1460 1466 1467 1470 1480 1489 1497 1498 1512 1539 1541 1558 1581 1594 1597 1598 1601 1606 1610 1611 1617 1628 1634 1641 1645 1662 1664 1672 1678 1680 1685 1693 1694 1696 1717 1718 1731 1738 1759 1766 1788 1802 1816 1823 1867 1872 1892 1901 1913 1921 1928 1929 1939 1940 1950 1954 1957 1973 1977 1986 1988 2005 2012 2014 2022 2025 2039 2045 2049 2054 2069 2073 2083 2089 2109 2125 2127 2146 2154 2156 2163 2166 2167 2173 2178 2183 2189 2195 2200 2209 2211 2215 2217 2218 2221 2223 2224 2237 2254 2281 2285 2296 2298 2300 2302 2318 2334 2343 2344 2353 2361 2362 2368 2369 2370 2379 2382 2397 2401 2418 2427 2428 2445 2447 2460 2483 2500 2501 2504 2506 2514 2522 2524 2526 2538 2553 2555 2588 2592 2599 2614 2627 2633 2636 2649 2657 2674 2679 2693 2697 2713 2725 2741 2758 2779 2781 2793 2797 2823 2829 2832 2835 2836 2861 2872 2874 2878 2893 2897 2899 2901 2915 2919 2920 2947 2959 2966 2969 2973 2982 2987 3009 3046 3049 3057 3074 3079 3082 3087 3092 3097 3101 3108 3116 3127 3130 3138 3144 3146 3148 3152 3163 3166 3171 3173 3184 3185 3188 3192 3194 3196 3230 3237 3245 3262 3272 3283 3295 3326 3333 3348 3353 3363 3375 3391 3402 3431 3442 3443 3447 3455 3466 3474 3476 3484 3495 3499 3505 3507 3508 3513 3517 3518 3520 3521 3528 3531 3534 3537 3539 3547 3549 3565 3568 3582 3586 3589 3597 3607 3627 3628 3643 3647 3654 3655 3658 3665 3666 3670 3676 3677 3683 3688 3689 3702 3713 3726 3734 3737 3742 3764 3774 3785 3795 3796 3797 3806 3807 3808 3811 3824 3834 3855 3888 3889 3906 3910 3919 3928 3933 3947 3949 3958 3967 3972 3978 3982 3987 4001 4007 4030 4032 4034 4036 4068 4077 4090 4106 4107 4134 4137 4151 4154 4160 4163 4176 4185 4191 4201 4214 4215 4229 4235 4242 4243 4267 4270 4272 4286 4291 4313 4321 4325 4346 4375 4384 4387 4405 4407 4411 4420 4421 4440 4447 4453 4461 4466 4476 4478 4493 4509 4516 4535 4539 4546 4563 4573 4582 4600 4601 4667 4674 4679 4711 4713 4722 4726 4731 4734 4742 4752 4755 4764 4776 4777 4794 4796 4802 4808 4810 4835 4857 4878 4901 4912 4915 4920 4928 4929 4939 4964 4982 4994 4995 17 28 37 169 178 255 322 326 380 393 420 427 465 495 496 525 624 777 789 803 811 820 845 847 851 863 867 911 949 1044 1072 1075 1082 1163 1205 1222 1254 1258 1284 1295 1298 1312 1382 1387 1438 1458 1464 1465 1543 1544 1574 1575 1689 1719 1728 1729 1798 1815 1866 1874 1875 1892 1972 2043 2064 2065 2078 2121 2208 2289 2304 2319 2459 2564 2642 2648 2704 2859 2861 2863 2893 2946 2957 2994 3049 3067 3157 3176 3178 3184 3216 3222 3245 3305 3373 3378 3390 3434 3481 3491 3506 3518 3528 3543 3585 3596 3630 3642 3665 3681 3694 3734 3860 3891 3931 3933 3968 3977 3983 4115 4155 4194 4276 4333 4408 4419 4457 4471 4527 4589 4603 4611 4650 4658 4694 4704 4734 4745 4754 4796 4855 4877 4941 4977 CCACCG/CGGTGG 0 -1 488 499 85 -76.6 0 1 2 6 21 23 24 25 26 29 31 32 54 60 67 96 100 108 155 156 163 175 177 193 202 224 250 256 262 284 287 293 297 306 314 341 346 354 356 361 382 404 405 415 453 457 466 473 481 494 508 509 519 520 525 526 534 535 536 545 554 565 585 593 597 598 606 608 610 628 633 640 644 660 677 685 688 706 725 730 742 743 745 759 781 785 815 816 831 854 863 867 870 882 893 901 905 907 916 928 934 937 940 945 953 969 970 1026 1027 1030 1041 1056 1057 1058 1068 1081 1098 1102 1110 1121 1122 1137 1174 1175 1192 1195 1214 1265 1269 1273 1274 1278 1297 1298 1317 1324 1339 1344 1346 1348 1352 1362 1374 1384 1389 1390 1405 1410 1413 1415 1423 1428 1443 1451 1455 1466 1470 1486 1489 1512 1531 1539 1541 1589 1609 1632 1653 1662 1664 1669 1672 1673 1678 1683 1685 1688 1693 1694 1702 1708 1717 1718 1738 1746 1748 1754 1762 1778 1792 1802 1806 1819 1829 1859 1872 1873 1901 1902 1920 1924 1928 1939 1940 1950 1952 1957 1965 1971 1973 1994 2005 2022 2025 2031 2035 2045 2057 2070 2085 2104 2114 2121 2127 2137 2146 2149 2156 2164 2174 2179 2184 2191 2193 2200 2204 2205 2209 2211 2215 2219 2224 2225 2229 2232 2264 2294 2300 2302 2318 2353 2357 2361 2365 2369 2379 2382 2389 2397 2428 2437 2483 2500 2526 2538 2541 2550 2555 2614 2615 2627 2649 2655 2657 2660 2665 2683 2697 2713 2733 2737 2749 2757 2759 2779 2781 2793 2804 2808 2810 2830 2832 2841 2850 2874 2880 2927 2931 2948 2963 2966 2969 2985 2991 2994 3009 3010 3014 3028 3036 3042 3044 3049 3062 3074 3075 3087 3097 3098 3101 3102 3109 3116 3123 3130 3133 3146 3152 3161 3165 3171 3184 3211 3220 3237 3244 3272 3284 3295 3316 3321 3326 3330 3333 3353 3364 3375 3406 3410 3415 3417 3420 3428 3437 3442 3447 3454 3457 3462 3466 3469 3499 3508 3510 3511 3513 3521 3531 3567 3568 3579 3586 3589 3597 3617 3643 3647 3652 3667 3670 3682 3685 3688 3702 3705 3713 3730 3735 3747 3765 3774 3786 3794 3801 3806 3808 3809 3840 3872 3906 3919 3927 3933 3946 3947 3958 3959 3972 3978 3982 3989 4001 4008 4068 4072 4074 4076 4090 4106 4107 4134 4151 4154 4160 4172 4176 4214 4218 4242 4257 4270 4291 4321 4327 4380 4386 4388 4406 4408 4412 4456 4468 4493 4498 4516 4521 4528 4535 4537 4560 4566 4573 4582 4584 4595 4601 4613 4619 4634 4648 4660 4676 4679 4692 4711 4713 4716 4738 4760 4764 4776 4779 4783 4788 4810 4832 4839 4855 4859 4870 4872 4877 4928 4939 4951 4966 4984 4994 4995 17 28 37 106 186 192 255 258 322 325 334 427 507 512 514 596 624 717 742 803 809 856 1040 1043 1075 1165 1295 1335 1382 1408 1430 1464 1465 1488 1537 1574 1599 1657 1665 1699 1729 1798 1815 1870 1972 2064 2065 2071 2141 2704 2722 2945 2946 3049 3201 3205 3270 3281 3505 3506 3543 3627 3635 3690 3734 3773 3774 3993 4035 4108 4197 4212 4299 4419 4457 4467 4471 4568 4601 4692 4745 4764 4796 4801 4909 CCTCCA/TGGAGG 0 -4 476 494 134 -52.5 1 10 12 13 15 25 43 47 57 73 76 113 116 132 150 157 158 159 165 167 177 183 192 199 200 204 208 214 225 229 235 239 245 249 252 270 272 278 280 283 285 302 307 309 319 320 341 352 353 356 373 378 382 388 394 417 429 445 457 459 467 495 502 511 512 519 538 542 546 549 552 576 582 584 594 597 602 620 627 630 633 639 655 658 670 674 678 685 689 691 696 727 734 736 741 759 760 762 764 771 775 780 788 789 804 806 807 817 824 846 854 861 868 870 876 880 888 941 943 949 950 978 995 997 1007 1022 1034 1038 1044 1050 1056 1059 1062 1082 1119 1121 1122 1125 1130 1145 1160 1169 1172 1191 1193 1207 1221 1237 1244 1248 1274 1275 1277 1280 1316 1326 1333 1342 1367 1387 1401 1402 1415 1416 1426 1432 1439 1460 1480 1500 1532 1533 1537 1557 1572 1577 1581 1584 1591 1601 1617 1624 1633 1636 1637 1641 1643 1646 1662 1665 1672 1674 1683 1685 1705 1726 1731 1736 1738 1766 1773 1779 1785 1799 1828 1835 1883 1889 1895 1918 1929 1930 1938 1941 1956 1980 1991 1992 2017 2018 2025 2038 2045 2054 2071 2084 2100 2115 2146 2147 2154 2167 2200 2218 2223 2224 2226 2242 2248 2250 2256 2265 2271 2276 2283 2317 2318 2343 2344 2356 2362 2366 2393 2399 2420 2436 2437 2445 2482 2489 2503 2521 2522 2523 2524 2526 2559 2562 2574 2577 2588 2594 2596 2599 2609 2625 2627 2633 2636 2640 2643 2650 2661 2672 2673 2689 2697 2701 2705 2723 2725 2732 2741 2757 2763 2767 2770 2776 2795 2797 2815 2826 2829 2835 2848 2850 2853 2868 2878 2893 2896 2897 2901 2959 2962 3009 3033 3046 3052 3057 3059 3064 3068 3092 3097 3107 3110 3127 3144 3146 3150 3152 3168 3177 3179 3184 3189 3248 3304 3306 3307 3309 3343 3361 3371 3378 3383 3391 3400 3419 3425 3442 3455 3482 3506 3508 3518 3520 3528 3529 3536 3547 3548 3549 3551 3552 3591 3637 3666 3670 3689 3691 3702 3703 3742 3749 3754 3760 3761 3764 3765 3767 3785 3795 3801 3805 3808 3811 3829 3850 3880 3886 3949 3958 3962 3963 3978 3982 3986 3987 4051 4068 4083 4107 4125 4131 4133 4137 4162 4170 4171 4181 4196 4229 4233 4260 4270 4291 4320 4328 4345 4378 4385 4404 4417 4432 4437 4440 4465 4469 4473 4493 4499 4503 4509 4516 4520 4539 4546 4552 4558 4592 4597 4600 4626 4630 4634 4645 4674 4693 4706 4711 4726 4739 4746 4751 4755 4759 4776 4777 4808 4837 4842 4847 4858 4859 4871 4887 4899 4901 4908 4927 4939 4973 4982 4994 67 73 102 107 118 328 347 392 420 465 496 608 740 759 789 795 812 816 818 854 860 918 968 1014 1023 1045 1100 1111 1132 1139 1159 1167 1205 1222 1223 1331 1490 1574 1575 1605 1637 1689 1729 1801 1902 1924 1934 1941 1991 1997 2064 2065 2087 2091 2130 2186 2208 2217 2237 2254 2313 2346 2378 2459 2517 2529 2581 2582 2584 2642 2731 2760 2829 2893 2994 2998 3108 3125 3189 3246 3251 3263 3305 3369 3373 3390 3413 3441 3451 3481 3489 3498 3506 3603 3607 3608 3616 3629 3756 3816 3847 3983 4041 4074 4146 4302 4392 4483 4496 4516 4541 4567 4568 4604 4622 4645 4680 4716 4726 4727 4745 4754 4770 4777 4783 4789 4796 4847 4861 4877 4881 4918 4970 4974 TGGAGG/CCTCCA 1 -4 476 494 134 -52.5 1 10 12 13 15 25 43 47 57 73 76 113 116 132 150 157 158 159 165 167 177 183 192 199 200 204 208 214 225 229 235 239 245 249 252 270 272 278 280 283 285 302 307 309 319 320 341 352 353 356 373 378 382 388 394 417 429 445 457 459 467 495 502 511 512 519 538 542 546 549 552 576 582 584 594 597 602 620 627 630 633 639 655 658 670 674 678 685 689 691 696 727 734 736 741 759 760 762 764 771 775 780 788 789 804 806 807 817 824 846 854 861 868 870 876 880 888 941 943 949 950 978 995 997 1007 1022 1034 1038 1044 1050 1056 1059 1062 1082 1119 1121 1122 1125 1130 1145 1160 1169 1172 1191 1193 1207 1221 1237 1244 1248 1274 1275 1277 1280 1316 1326 1333 1342 1367 1387 1401 1402 1415 1416 1426 1432 1439 1460 1480 1500 1532 1533 1537 1557 1572 1577 1581 1584 1591 1601 1617 1624 1633 1636 1637 1641 1643 1646 1662 1665 1672 1674 1683 1685 1705 1726 1731 1736 1738 1766 1773 1779 1785 1799 1828 1835 1883 1889 1895 1918 1929 1930 1938 1941 1956 1980 1991 1992 2017 2018 2025 2038 2045 2054 2071 2084 2100 2115 2146 2147 2154 2167 2200 2218 2223 2224 2226 2242 2248 2250 2256 2265 2271 2276 2283 2317 2318 2343 2344 2356 2362 2366 2393 2399 2420 2436 2437 2445 2482 2489 2503 2521 2522 2523 2524 2526 2559 2562 2574 2577 2588 2594 2596 2599 2609 2625 2627 2633 2636 2640 2643 2650 2661 2672 2673 2689 2697 2701 2705 2723 2725 2732 2741 2757 2763 2767 2770 2776 2795 2797 2815 2826 2829 2835 2848 2850 2853 2868 2878 2893 2896 2897 2901 2959 2962 3009 3033 3046 3052 3057 3059 3064 3068 3092 3097 3107 3110 3127 3144 3146 3150 3152 3168 3177 3179 3184 3189 3248 3304 3306 3307 3309 3343 3361 3371 3378 3383 3391 3400 3419 3425 3442 3455 3482 3506 3508 3518 3520 3528 3529 3536 3547 3548 3549 3551 3552 3591 3637 3666 3670 3689 3691 3702 3703 3742 3749 3754 3760 3761 3764 3765 3767 3785 3795 3801 3805 3808 3811 3829 3850 3880 3886 3949 3958 3962 3963 3978 3982 3986 3987 4051 4068 4083 4107 4125 4131 4133 4137 4162 4170 4171 4181 4196 4229 4233 4260 4270 4291 4320 4328 4345 4378 4385 4404 4417 4432 4437 4440 4465 4469 4473 4493 4499 4503 4509 4516 4520 4539 4546 4552 4558 4592 4597 4600 4626 4630 4634 4645 4674 4693 4706 4711 4726 4739 4746 4751 4755 4759 4776 4777 4808 4837 4842 4847 4858 4859 4871 4887 4899 4901 4908 4927 4939 4973 4982 4994 67 73 102 107 118 328 347 392 420 465 496 608 740 759 789 795 812 816 818 854 860 918 968 1014 1023 1045 1100 1111 1132 1139 1159 1167 1205 1222 1223 1331 1490 1574 1575 1605 1637 1689 1729 1801 1902 1924 1934 1941 1991 1997 2064 2065 2087 2091 2130 2186 2208 2217 2237 2254 2313 2346 2378 2459 2517 2529 2581 2582 2584 2642 2731 2760 2829 2893 2994 2998 3108 3125 3189 3246 3251 3263 3305 3369 3373 3390 3413 3441 3451 3481 3489 3498 3506 3603 3607 3608 3616 3629 3756 3816 3847 3983 4041 4074 4146 4302 4392 4483 4496 4516 4541 4567 4568 4604 4622 4645 4680 4716 4726 4727 4745 4754 4770 4777 4783 4789 4796 4847 4861 4877 4881 4918 4970 4974 GGAGGA/TCCTCC 1 -3 464 477 156 -41.2 1 2 12 15 25 57 73 76 77 97 119 165 167 168 183 187 199 200 204 208 214 215 229 239 245 249 252 260 278 283 287 304 310 317 319 334 341 345 352 356 359 373 382 388 394 429 445 449 457 467 477 480 495 501 502 509 510 512 519 538 542 543 545 582 585 593 594 596 597 602 608 622 627 628 633 639 643 655 658 665 670 673 674 685 689 699 702 706 724 727 741 749 760 762 764 771 772 775 778 780 782 787 789 807 861 867 868 869 870 880 888 908 918 941 950 963 972 975 978 994 995 997 1007 1026 1034 1044 1056 1061 1065 1067 1070 1109 1112 1119 1121 1122 1131 1145 1160 1171 1187 1191 1200 1207 1218 1220 1221 1232 1237 1249 1251 1267 1277 1289 1315 1316 1318 1324 1333 1387 1397 1401 1402 1415 1426 1432 1439 1445 1458 1473 1480 1533 1572 1577 1591 1601 1617 1622 1624 1641 1643 1646 1672 1674 1675 1705 1738 1766 1773 1778 1789 1791 1817 1828 1845 1846 1857 1870 1883 1895 1929 1930 1938 1939 1942 1956 1964 1986 1992 2009 2010 2018 2036 2045 2052 2135 2147 2161 2199 2200 2206 2218 2223 2224 2250 2274 2276 2283 2298 2307 2317 2318 2349 2354 2362 2364 2366 2390 2395 2436 2437 2452 2473 2482 2503 2506 2519 2522 2523 2524 2540 2551 2559 2582 2586 2588 2594 2596 2598 2613 2625 2627 2636 2640 2673 2684 2694 2697 2701 2709 2723 2725 2732 2741 2744 2767 2770 2776 2797 2824 2826 2835 2848 2849 2850 2853 2854 2863 2866 2872 2878 2883 2893 2896 2897 2901 2934 2962 2965 2985 3013 3020 3021 3026 3036 3046 3052 3068 3097 3107 3109 3123 3127 3150 3168 3172 3173 3177 3189 3200 3208 3237 3244 3245 3250 3254 3277 3306 3307 3310 3313 3343 3344 3345 3367 3371 3383 3391 3400 3407 3419 3422 3469 3482 3490 3506 3518 3520 3536 3548 3549 3552 3571 3626 3652 3654 3666 3689 3698 3702 3703 3710 3742 3749 3754 3758 3760 3764 3767 3775 3785 3795 3808 3809 3811 3819 3830 3849 3880 3886 3891 3893 3897 3958 3962 3982 3987 4042 4051 4068 4080 4083 4107 4119 4133 4137 4170 4180 4181 4196 4197 4204 4233 4242 4244 4249 4260 4270 4281 4305 4315 4320 4326 4342 4378 4379 4393 4400 4437 4440 4447 4465 4469 4473 4493 4509 4516 4520 4526 4527 4537 4539 4552 4564 4592 4597 4600 4605 4606 4626 4630 4634 4672 4688 4693 4696 4706 4711 4743 4759 4776 4793 4815 4839 4842 4847 4858 4901 4908 4927 4947 4972 4984 4994 24 63 67 73 102 107 118 187 209 251 328 329 347 420 562 569 624 690 786 789 795 836 867 868 1023 1045 1107 1132 1181 1259 1357 1439 1504 1523 1574 1598 1605 1640 1671 1729 1787 1847 1859 1860 1867 1893 1902 1924 1933 1934 1997 2064 2065 2130 2152 2167 2186 2191 2202 2211 2217 2224 2254 2312 2313 2343 2346 2439 2459 2517 2533 2534 2563 2581 2583 2584 2612 2642 2758 2790 2796 2893 2908 2968 2994 3006 3027 3034 3108 3114 3124 3125 3158 3162 3175 3189 3241 3243 3246 3314 3326 3327 3373 3390 3409 3441 3449 3489 3492 3552 3629 3662 3694 3756 3839 3847 3886 3942 3984 4035 4041 4074 4094 4206 4302 4361 4375 4419 4423 4438 4440 4444 4445 4483 4496 4516 4541 4567 4604 4614 4645 4650 4680 4681 4705 4745 4770 4777 4783 4789 4796 4847 4881 4887 4890 4962 CAGCAC/GTGCTG 0 -3 462 463 54 -86.5 1 10 18 20 36 65 79 86 89 105 108 112 122 126 132 135 147 180 184 188 189 196 210 222 238 305 309 312 320 321 328 329 335 351 373 397 402 411 417 418 432 433 438 442 443 448 450 455 462 474 480 483 501 505 507 516 551 564 570 584 588 604 626 642 648 656 665 675 680 681 684 705 712 723 751 755 758 765 770 774 775 794 795 798 804 806 812 818 822 833 849 858 877 886 892 896 904 932 960 989 996 1014 1033 1053 1060 1061 1062 1063 1072 1077 1079 1083 1095 1103 1106 1139 1143 1147 1157 1159 1162 1201 1245 1251 1260 1279 1287 1289 1307 1310 1320 1325 1345 1351 1383 1389 1392 1415 1420 1435 1484 1493 1500 1503 1511 1516 1520 1568 1569 1575 1585 1587 1603 1606 1607 1622 1637 1642 1644 1649 1651 1661 1670 1676 1720 1725 1739 1745 1751 1762 1765 1767 1768 1775 1787 1793 1804 1816 1843 1853 1874 1908 1909 1919 1948 1960 1970 1999 2013 2015 2017 2032 2046 2095 2097 2103 2105 2110 2142 2151 2175 2214 2248 2250 2253 2289 2303 2305 2323 2360 2382 2396 2410 2416 2421 2437 2443 2475 2479 2502 2513 2517 2520 2530 2533 2552 2558 2578 2593 2620 2621 2628 2635 2663 2678 2684 2690 2691 2698 2703 2710 2730 2740 2754 2769 2798 2801 2812 2846 2858 2868 2876 2877 2896 2898 2902 2903 2930 2943 2958 2967 2995 2997 3015 3028 3053 3061 3064 3115 3121 3134 3146 3158 3160 3164 3183 3187 3188 3222 3231 3234 3235 3256 3265 3274 3279 3282 3288 3322 3332 3336 3345 3355 3362 3366 3367 3382 3393 3408 3412 3418 3453 3488 3495 3505 3519 3535 3548 3556 3562 3564 3565 3574 3582 3585 3592 3616 3618 3622 3645 3650 3651 3656 3681 3684 3699 3707 3714 3715 3716 3718 3722 3725 3729 3755 3763 3790 3791 3813 3825 3826 3831 3845 3853 3856 3859 3860 3870 3871 3872 3891 3899 3903 3911 3913 3923 3929 3931 3933 3935 3939 3953 3957 3958 3970 3984 3985 4024 4025 4040 4045 4049 4070 4081 4086 4146 4151 4153 4166 4168 4169 4171 4174 4176 4179 4187 4190 4195 4228 4236 4242 4251 4266 4268 4273 4276 4328 4332 4334 4349 4358 4360 4364 4370 4386 4392 4394 4403 4415 4426 4427 4493 4505 4511 4526 4530 4533 4535 4543 4556 4571 4575 4581 4585 4590 4603 4631 4635 4637 4638 4647 4665 4675 4684 4690 4694 4697 4703 4717 4748 4757 4770 4775 4780 4782 4793 4795 4816 4838 4845 4868 4879 4884 4886 4889 4907 4908 4929 4931 4936 4940 4997 0 103 213 529 754 810 976 977 1150 1172 1222 1234 1262 1318 1371 1575 1728 1729 1813 1957 2308 2411 2481 2589 2850 2902 3184 3188 3211 3241 3473 3503 3533 3536 3540 3637 3758 3834 3875 3922 3997 4007 4109 4334 4471 4507 4508 4609 4643 4689 4742 4827 4942 4968 CCACCT/AGGTGG 0 -1 422 432 90 -57.6 17 18 19 21 22 59 60 71 84 104 111 115 116 138 150 151 156 157 179 192 199 200 204 205 215 229 249 253 260 261 262 271 278 279 289 290 309 339 341 342 372 377 386 409 421 431 441 445 453 458 465 467 472 480 497 498 503 508 511 528 538 542 555 559 592 599 601 637 643 647 659 668 677 690 695 759 766 773 782 797 803 805 837 846 880 882 923 924 926 927 935 941 944 956 962 966 980 1005 1022 1028 1034 1045 1050 1062 1091 1099 1115 1130 1133 1134 1165 1173 1195 1196 1204 1207 1215 1221 1254 1256 1275 1295 1314 1329 1339 1356 1358 1367 1368 1381 1388 1401 1421 1432 1434 1451 1460 1467 1481 1488 1496 1501 1510 1518 1551 1571 1581 1598 1606 1612 1630 1634 1645 1650 1652 1655 1669 1679 1687 1692 1720 1759 1760 1766 1781 1788 1794 1828 1850 1862 1863 1901 1908 1909 1918 1925 1951 1957 1965 1977 1983 2012 2020 2025 2037 2039 2126 2132 2141 2146 2168 2170 2171 2173 2189 2195 2201 2206 2217 2221 2233 2251 2261 2285 2298 2304 2312 2326 2334 2344 2349 2359 2370 2380 2383 2385 2398 2399 2434 2437 2446 2447 2501 2504 2506 2512 2522 2524 2526 2553 2556 2562 2580 2585 2590 2591 2599 2633 2636 2687 2689 2691 2711 2720 2723 2758 2774 2787 2793 2797 2802 2816 2836 2837 2847 2861 2897 2899 2901 2909 2918 2933 2938 2941 2973 2982 2983 2998 3031 3046 3056 3057 3059 3062 3066 3082 3091 3092 3094 3127 3144 3148 3172 3173 3201 3257 3280 3293 3300 3303 3360 3361 3385 3391 3401 3406 3455 3464 3476 3502 3505 3509 3517 3518 3528 3531 3537 3538 3547 3555 3580 3587 3599 3613 3627 3631 3635 3637 3655 3658 3666 3677 3689 3727 3734 3737 3739 3740 3742 3752 3757 3764 3797 3803 3808 3822 3824 3861 3878 3880 3888 3955 3958 3962 3968 3982 4032 4034 4052 4101 4107 4127 4130 4137 4163 4199 4214 4215 4232 4235 4243 4263 4277 4280 4299 4313 4321 4325 4336 4342 4361 4384 4395 4410 4411 4424 4440 4445 4455 4461 4467 4494 4501 4518 4536 4545 4546 4549 4554 4572 4583 4590 4600 4602 4603 4642 4712 4733 4734 4737 4746 4755 4766 4767 4772 4777 4778 4792 4833 4854 4857 4875 4879 4893 4906 4927 4944 4964 4975 4982 4990 4991 50 78 102 153 189 286 326 334 423 429 545 624 789 845 1082 1151 1164 1177 1227 1229 1298 1489 1536 1544 1574 1575 1640 1684 1728 1863 2043 2064 2092 2121 2167 2343 2376 2391 2459 2520 2564 2641 2642 2750 2778 2789 2829 2853 2863 2869 2881 2921 2970 3049 3213 3222 3390 3421 3448 3491 3506 3528 3642 3665 3677 3732 3784 3794 3837 3876 3933 3934 3978 4115 4179 4205 4276 4309 4333 4482 4483 4504 4543 4589 4637 4658 4708 4754 4933 4941 CACCGC/GCGGTG 0 -3 417 430 52 -78.9 1 2 21 23 24 25 29 31 32 39 54 60 66 74 96 100 109 119 134 160 163 177 181 204 205 206 221 224 234 250 256 293 297 310 341 354 361 368 416 430 442 453 464 466 478 481 492 494 500 508 509 519 526 534 536 545 565 573 585 597 598 610 614 628 656 664 667 685 687 706 710 725 730 733 742 764 782 783 785 815 851 854 855 901 910 928 934 939 940 942 953 969 970 1009 1024 1039 1049 1050 1056 1058 1066 1074 1081 1091 1098 1110 1121 1152 1154 1161 1165 1174 1179 1192 1200 1214 1267 1273 1295 1297 1317 1346 1352 1361 1373 1374 1377 1389 1405 1410 1415 1452 1453 1461 1466 1472 1484 1496 1539 1544 1554 1574 1583 1589 1614 1619 1622 1630 1659 1664 1669 1672 1673 1688 1699 1708 1721 1725 1738 1747 1753 1778 1789 1792 1795 1802 1833 1842 1859 1873 1888 1914 1928 1952 1971 1978 1979 1985 1995 1996 1998 2005 2011 2022 2041 2053 2070 2076 2091 2136 2137 2156 2179 2190 2193 2200 2203 2209 2210 2211 2215 2222 2224 2240 2266 2279 2290 2294 2299 2300 2327 2335 2352 2357 2361 2365 2369 2373 2397 2449 2494 2500 2503 2510 2515 2516 2526 2528 2553 2567 2595 2600 2602 2615 2627 2632 2649 2651 2665 2668 2669 2683 2687 2700 2733 2737 2742 2748 2794 2818 2821 2822 2841 2850 2874 2879 2882 2899 2907 2931 2966 2967 2968 2975 2988 2991 3014 3021 3042 3049 3051 3074 3075 3082 3085 3087 3098 3101 3102 3109 3111 3126 3130 3146 3159 3181 3184 3200 3210 3211 3237 3244 3260 3284 3290 3295 3297 3304 3305 3308 3312 3326 3333 3338 3342 3348 3369 3375 3383 3406 3413 3457 3460 3466 3472 3497 3508 3511 3514 3521 3526 3545 3559 3568 3589 3597 3613 3643 3652 3667 3688 3696 3713 3750 3751 3765 3772 3776 3779 3781 3794 3801 3808 3823 3880 3887 3946 3947 3958 3990 4001 4008 4020 4055 4068 4074 4078 4082 4106 4154 4160 4172 4188 4204 4238 4248 4250 4252 4296 4321 4323 4360 4392 4403 4406 4414 4416 4462 4468 4483 4515 4516 4535 4538 4540 4559 4571 4578 4582 4601 4614 4621 4639 4649 4656 4660 4673 4701 4703 4713 4719 4738 4770 4776 4783 4797 4811 4832 4835 4870 4872 4882 4921 4945 4988 4994 4995 37 86 108 322 331 507 512 624 673 803 809 818 1043 1183 1335 1414 1464 1465 1488 1537 1574 1575 1599 1657 1798 1859 2064 2065 2202 2759 2780 3271 3369 3403 3505 3506 3571 3575 3697 3734 4035 4185 4186 4212 4406 4471 4481 4589 4723 4726 4745 4764 GCACCA/TGGTGC 0 -4 360 382 76 -52.5 0 1 18 19 22 35 61 81 86 89 93 96 112 122 128 131 147 148 167 170 172 181 188 194 209 221 223 234 273 280 292 306 309 322 338 351 355 359 363 370 371 373 376 382 383 394 400 407 417 439 442 448 454 456 466 474 488 496 508 544 554 564 589 599 605 610 611 629 631 634 661 676 682 695 708 712 719 720 755 774 775 786 793 794 798 818 821 855 864 865 883 919 932 946 949 968 994 1015 1017 1025 1083 1091 1102 1106 1107 1126 1133 1140 1162 1173 1182 1192 1201 1217 1221 1243 1246 1251 1258 1260 1273 1279 1282 1284 1287 1289 1300 1303 1314 1318 1323 1324 1359 1364 1386 1389 1398 1401 1451 1474 1491 1510 1516 1521 1529 1544 1548 1549 1578 1581 1582 1586 1602 1603 1634 1645 1651 1666 1667 1692 1704 1706 1720 1740 1762 1772 1785 1794 1813 1815 1828 1845 1849 1850 1853 1858 1860 1871 1880 1883 1909 1933 1945 1970 1981 1983 2015 2032 2047 2078 2095 2099 2105 2113 2136 2151 2155 2164 2203 2214 2270 2294 2303 2316 2357 2359 2393 2467 2472 2488 2493 2520 2533 2552 2586 2590 2593 2596 2606 2613 2630 2631 2635 2645 2652 2677 2684 2710 2777 2798 2815 2817 2833 2859 2880 2890 2894 2898 2902 2926 2933 2958 2974 2995 3023 3028 3035 3041 3064 3081 3099 3158 3164 3202 3208 3242 3265 3269 3272 3277 3336 3366 3402 3408 3418 3452 3475 3480 3482 3485 3494 3503 3540 3579 3606 3651 3667 3672 3707 3740 3756 3765 3777 3778 3780 3801 3853 3860 3873 3874 3891 3912 3913 3939 3958 3970 3974 3991 3994 4014 4070 4080 4091 4099 4110 4116 4133 4165 4166 4168 4190 4192 4193 4200 4202 4257 4263 4274 4282 4314 4341 4352 4356 4392 4487 4493 4506 4526 4549 4554 4575 4578 4580 4590 4593 4624 4626 4644 4668 4694 4717 4730 4735 4772 4785 4804 4809 4821 4824 4859 4860 4865 4896 4897 4906 4936 4974 4988 4995 4997 29 49 83 151 186 258 334 733 894 906 924 970 1091 1134 1164 1252 1284 1371 1443 1488 1500 1543 1544 1649 1670 1684 1728 1729 1813 1816 1958 2059 2071 2397 2410 2460 2481 2485 2486 2571 2589 2626 2662 2757 2823 2833 3045 3049 3060 3183 3211 3370 3519 3536 3538 3697 3704 3721 3774 3875 3934 4087 4248 4267 4499 4504 4528 4562 4568 4676 4706 4710 4727 4735 4829 4918 GCAGCA/TGCTGC 3 -3 354 367 105 -36.8 10 18 21 34 86 109 110 122 126 133 145 146 147 164 165 168 173 188 201 205 209 210 213 234 249 257 260 270 296 308 312 325 328 333 335 339 341 347 351 373 397 410 417 432 433 438 442 448 455 482 483 486 496 499 502 515 516 528 531 547 564 569 571 584 608 611 620 625 626 642 648 673 674 705 751 755 772 794 813 833 872 879 888 926 944 950 966 969 973 996 1000 1022 1033 1062 1079 1106 1121 1129 1139 1143 1160 1175 1179 1185 1208 1215 1217 1244 1245 1251 1281 1299 1300 1303 1320 1330 1351 1401 1405 1409 1415 1420 1422 1432 1445 1449 1474 1491 1500 1511 1522 1556 1560 1569 1572 1587 1606 1620 1622 1637 1644 1645 1661 1676 1699 1713 1716 1721 1725 1739 1745 1767 1796 1803 1816 1840 1843 1852 1854 1919 1970 1984 2009 2013 2047 2050 2068 2075 2085 2134 2170 2248 2271 2288 2299 2303 2322 2323 2336 2353 2378 2386 2410 2422 2449 2464 2502 2527 2558 2566 2572 2578 2621 2623 2628 2663 2683 2690 2692 2722 2735 2740 2752 2774 2782 2783 2786 2839 2843 2858 2868 2882 2892 2893 2898 2903 2904 2934 2942 2943 2958 2991 2997 3001 3015 3019 3061 3064 3097 3115 3121 3132 3146 3159 3162 3186 3190 3193 3210 3224 3231 3235 3259 3277 3282 3289 3312 3324 3345 3367 3380 3427 3443 3498 3505 3519 3523 3527 3539 3543 3556 3569 3582 3585 3601 3609 3614 3637 3642 3645 3660 3687 3699 3712 3714 3716 3721 3743 3755 3763 3813 3827 3831 3860 3870 3875 3890 3910 3913 3921 3935 3957 3970 4006 4025 4099 4104 4123 4149 4151 4153 4176 4179 4187 4209 4228 4250 4262 4281 4285 4312 4321 4328 4354 4359 4363 4364 4370 4392 4401 4408 4426 4427 4437 4468 4481 4511 4516 4533 4575 4581 4582 4587 4604 4621 4665 4684 4701 4730 4740 4749 4757 4770 4775 4780 4852 4866 4868 4884 4919 4936 4940 4944 4949 0 66 78 94 126 136 183 249 289 308 321 351 355 388 393 440 474 551 668 685 693 711 734 810 837 894 973 1035 1065 1091 1107 1141 1187 1198 1230 1331 1336 1372 1373 1528 1547 1572 1702 1738 1740 1813 1867 1892 1957 2086 2170 2184 2243 2281 2285 2308 2409 2411 2481 2522 2568 2673 2752 2790 2902 3021 3137 3211 3247 3266 3312 3327 3352 3364 3520 3536 3627 3673 3844 3853 3890 3932 4011 4109 4164 4269 4334 4353 4409 4418 4426 4448 4476 4507 4508 4565 4578 4642 4705 4820 4831 4832 4892 4968 4975 CGCCAC/GTGGCG 0 -3 352 355 55 -57.3 1 6 27 47 92 103 106 108 123 160 169 178 179 182 201 206 224 258 294 317 325 333 334 341 350 354 379 390 426 428 456 473 489 526 527 528 531 540 565 568 571 598 628 643 646 726 746 759 766 772 775 825 835 854 863 867 873 877 901 912 913 916 923 930 931 941 948 962 963 970 1005 1015 1021 1064 1068 1069 1070 1084 1085 1089 1108 1110 1112 1115 1116 1135 1144 1148 1165 1180 1190 1198 1234 1268 1299 1332 1333 1335 1363 1372 1375 1378 1390 1391 1398 1413 1419 1425 1434 1436 1440 1447 1477 1524 1540 1556 1562 1572 1585 1589 1592 1599 1605 1633 1668 1678 1688 1690 1701 1783 1807 1836 1852 1868 1870 1894 1904 1922 1928 1942 1944 1953 1965 1968 1971 1994 1996 2042 2092 2104 2108 2124 2137 2141 2143 2144 2146 2179 2180 2185 2195 2209 2243 2272 2277 2328 2339 2349 2357 2400 2424 2425 2433 2451 2454 2465 2491 2499 2507 2508 2522 2526 2541 2545 2551 2565 2569 2584 2624 2641 2643 2652 2672 2680 2685 2687 2713 2733 2738 2800 2805 2816 2837 2842 2857 2862 2863 2865 2870 2884 2910 2941 2942 2948 2950 2962 2985 2998 3010 3012 3013 3042 3044 3080 3084 3101 3104 3106 3114 3123 3125 3136 3168 3193 3195 3196 3212 3213 3225 3242 3244 3247 3266 3296 3311 3317 3327 3331 3347 3349 3362 3364 3405 3406 3433 3450 3455 3457 3466 3496 3515 3521 3531 3583 3612 3613 3625 3648 3657 3668 3677 3679 3713 3730 3732 3748 3749 3752 3757 3775 3786 3798 3812 3848 3862 3863 3864 3884 3909 3960 3981 4026 4041 4046 4071 4072 4115 4118 4122 4155 4167 4191 4247 4250 4309 4310 4312 4359 4381 4388 4411 4415 4442 4457 4485 4508 4529 4537 4598 4606 4610 4619 4634 4645 4646 4658 4681 4700 4713 4723 4732 4747 4753 4771 4776 4785 4830 4836 4839 4849 4853 4870 4872 4877 4888 4900 4909 4929 4951 4959 4967 4994 59 60 78 86 147 236 538 608 754 964 982 1303 1464 1488 1536 1655 1684 1697 1728 1729 1848 2058 2065 2092 2150 2191 2641 2697 2865 3006 3028 3033 3131 3192 3421 3506 3695 3713 3818 3980 4035 4131 4180 4219 4386 4448 4467 4641 4679 4692 4729 4745 4760 4838 4986 TGGCGG/CCGCCA 4 -2 336 343 59 -52.0 1 13 14 24 25 61 63 96 128 136 139 160 178 201 202 204 224 229 254 304 333 334 341 350 354 357 368 427 445 456 463 491 495 508 526 528 531 536 565 576 586 594 615 628 643 650 667 674 678 710 727 733 737 746 751 765 766 772 782 787 815 820 835 850 851 854 863 887 891 892 912 921 941 944 963 970 1005 1021 1022 1029 1084 1107 1110 1115 1116 1138 1144 1165 1198 1199 1211 1236 1288 1290 1303 1327 1353 1363 1376 1378 1390 1391 1396 1398 1400 1413 1417 1419 1429 1431 1434 1436 1440 1447 1505 1534 1538 1540 1555 1572 1664 1678 1688 1703 1705 1719 1755 1806 1808 1836 1861 1868 1870 1926 1928 1932 1942 1953 1955 1965 1968 1970 1971 1995 1996 2005 2007 2012 2041 2092 2104 2108 2117 2130 2137 2161 2195 2209 2239 2240 2321 2328 2339 2349 2358 2368 2391 2400 2423 2425 2433 2465 2466 2473 2483 2484 2489 2521 2528 2529 2541 2551 2589 2615 2632 2641 2647 2681 2685 2687 2701 2702 2733 2762 2800 2806 2812 2841 2857 2869 2884 2891 2931 2950 2967 2998 3010 3018 3021 3023 3042 3048 3067 3077 3100 3101 3123 3125 3159 3184 3186 3193 3195 3212 3213 3225 3232 3244 3251 3275 3286 3297 3314 3315 3349 3358 3362 3396 3405 3406 3450 3457 3460 3466 3521 3596 3602 3612 3613 3628 3638 3657 3662 3668 3713 3716 3730 3738 3744 3748 3750 3752 3757 3760 3782 3794 3799 3862 3883 3887 3900 3909 3932 3938 3958 4072 4074 4079 4108 4115 4129 4135 4149 4157 4164 4198 4219 4247 4248 4250 4296 4309 4311 4312 4315 4318 4369 4372 4376 4381 4388 4418 4421 4457 4461 4497 4508 4529 4531 4591 4607 4610 4619 4638 4654 4658 4660 4681 4698 4713 4748 4776 4789 4839 4843 4846 4866 4870 4894 4908 4909 4935 4963 4965 4994 4995 86 147 236 322 429 643 673 754 795 881 998 1043 1313 1335 1426 1454 1464 1488 1536 1537 1684 1721 1728 1729 2065 2092 2164 2191 2440 2618 2684 2697 3006 3033 3131 3192 3193 3319 3506 3543 3609 3659 3695 3748 3908 4035 4063 4078 4131 4136 4186 4206 4445 4614 4704 4723 4760 4919 4938 CTCCGC/GCGGAG 0 -3 344 339 44 -60.0 52 54 65 77 101 136 152 160 166 168 187 211 266 271 277 304 330 333 334 359 440 445 449 455 477 491 499 504 510 542 554 577 582 587 602 609 637 638 644 658 682 698 724 725 728 738 753 759 777 779 787 811 867 887 895 914 929 941 963 978 981 1005 1037 1043 1046 1055 1056 1067 1110 1115 1121 1132 1143 1144 1166 1182 1187 1200 1210 1232 1259 1274 1283 1291 1303 1322 1326 1350 1357 1361 1378 1388 1418 1434 1443 1468 1475 1501 1538 1539 1540 1561 1567 1599 1640 1654 1666 1695 1703 1717 1735 1778 1836 1860 1887 1896 1897 1917 1923 1924 1939 1949 1964 1965 1986 1989 1997 2036 2047 2072 2089 2104 2108 2192 2199 2213 2280 2284 2286 2306 2307 2321 2370 2377 2397 2400 2403 2423 2434 2444 2447 2452 2462 2466 2473 2483 2490 2497 2526 2532 2582 2586 2608 2611 2612 2613 2639 2653 2657 2658 2659 2685 2709 2712 2726 2760 2768 2772 2777 2789 2799 2808 2812 2840 2860 2881 2891 2896 2900 2920 2931 2933 2935 2940 2954 2965 2978 2985 2987 3001 3003 3007 3010 3013 3020 3026 3038 3057 3089 3100 3101 3105 3117 3124 3137 3148 3162 3173 3206 3215 3240 3244 3276 3290 3309 3344 3346 3366 3381 3395 3408 3422 3450 3490 3491 3496 3512 3516 3525 3531 3533 3546 3550 3551 3560 3567 3571 3573 3575 3597 3604 3609 3612 3680 3687 3710 3719 3736 3744 3746 3748 3752 3762 3787 3802 3811 3821 3828 3849 3855 3857 3867 3878 3892 3894 3897 3900 3907 3920 3925 3982 3988 4005 4028 4037 4039 4051 4065 4079 4115 4135 4139 4140 4143 4164 4180 4182 4204 4249 4250 4263 4265 4281 4297 4306 4315 4324 4372 4396 4402 4481 4496 4552 4568 4570 4586 4615 4620 4651 4672 4696 4706 4707 4721 4754 4775 4784 4787 4789 4803 4822 4861 4870 4896 4902 4905 4910 4916 4948 4965 4968 4982 4987 4994 29 564 630 696 792 851 945 1262 1307 1504 1666 1728 1799 1818 1847 1859 2064 2132 2240 2255 2353 2440 2799 2907 2945 2978 3044 3081 3231 3315 3543 3657 3706 3822 4147 4206 4346 4457 4482 4614 4621 4634 4702 4802 GCTCCA/TGGAGC 0 -4 328 335 105 -30.4 16 20 24 39 57 64 70 75 77 89 101 105 119 128 129 133 138 148 156 225 227 239 260 266 272 280 297 315 316 319 333 371 373 412 414 421 422 430 434 443 448 456 483 493 515 522 539 549 550 554 555 591 623 637 654 677 683 688 695 707 729 730 744 755 799 829 833 857 874 883 899 933 938 962 978 980 1011 1020 1031 1039 1052 1077 1081 1082 1087 1109 1131 1148 1155 1170 1202 1215 1224 1231 1232 1235 1236 1275 1337 1359 1384 1409 1446 1449 1453 1470 1487 1489 1526 1531 1535 1563 1594 1623 1639 1645 1682 1697 1747 1767 1822 1826 1840 1848 1865 1877 1885 1886 1895 1900 1901 1903 1917 1924 1937 1952 1975 1982 2008 2050 2065 2125 2171 2173 2183 2202 2208 2216 2221 2228 2251 2254 2279 2282 2300 2302 2303 2335 2345 2348 2370 2393 2434 2447 2469 2471 2477 2496 2500 2506 2547 2561 2563 2610 2616 2619 2638 2691 2693 2695 2712 2735 2744 2758 2779 2793 2794 2824 2832 2836 2843 2891 2915 2919 2926 2927 2930 2939 2941 2946 2964 2982 3043 3045 3055 3065 3071 3075 3095 3104 3110 3138 3139 3146 3160 3176 3177 3190 3191 3202 3203 3210 3211 3230 3244 3305 3324 3347 3376 3385 3387 3428 3459 3467 3468 3481 3484 3517 3528 3542 3572 3576 3586 3596 3607 3626 3654 3656 3661 3664 3669 3678 3688 3711 3737 3750 3780 3796 3858 3876 3892 3899 3902 3906 3916 3928 3933 3947 3959 3967 3976 3997 4003 4018 4049 4059 4105 4156 4192 4197 4236 4240 4253 4262 4297 4305 4340 4346 4367 4382 4384 4394 4411 4425 4454 4476 4481 4489 4495 4543 4550 4582 4602 4679 4680 4701 4718 4720 4725 4749 4750 4752 4772 4776 4791 4793 4809 4810 4814 4833 4866 4911 4920 4921 4960 4963 4994 4995 96 109 137 441 473 489 541 645 699 729 740 748 788 794 818 819 849 865 899 937 1005 1107 1192 1242 1276 1316 1329 1332 1338 1342 1487 1529 1566 1716 1756 1773 1776 1798 1863 1900 2044 2177 2300 2312 2325 2332 2398 2508 2509 2581 2584 2674 2689 2690 2710 2748 2790 2827 2854 2859 2868 2883 2930 2960 2962 2972 3088 3090 3137 3221 3222 3231 3240 3290 3338 3355 3356 3394 3522 3571 3581 3685 3697 3735 3774 3931 3932 3943 3983 3984 4026 4205 4208 4230 4306 4403 4516 4527 4734 4744 4782 4809 4861 4940 4949 GCTGCA/TGCAGC 3 -3 292 305 91 -29.3 10 14 18 20 21 29 34 50 65 86 110 122 125 132 139 141 164 172 174 201 209 210 231 257 261 299 309 321 336 339 345 351 391 417 421 428 432 433 448 455 486 496 512 515 526 566 596 620 626 642 668 733 752 772 778 783 818 850 865 877 886 888 905 913 926 944 950 966 969 994 996 1000 1010 1017 1033 1039 1070 1079 1090 1092 1139 1175 1203 1215 1245 1248 1251 1276 1281 1299 1300 1333 1338 1371 1407 1411 1420 1445 1479 1488 1491 1507 1513 1521 1549 1556 1588 1606 1612 1622 1624 1637 1644 1645 1648 1652 1661 1662 1676 1696 1713 1716 1721 1725 1745 1747 1803 1840 1894 1931 1934 1961 2009 2013 2040 2050 2075 2170 2200 2248 2271 2272 2300 2323 2336 2353 2355 2360 2374 2410 2428 2443 2447 2449 2484 2502 2503 2527 2533 2534 2584 2588 2596 2628 2643 2647 2671 2683 2692 2705 2710 2735 2752 2778 2782 2790 2855 2870 2880 2882 2890 2898 2903 2933 2942 2943 2953 2970 2978 2987 2991 3001 3015 3019 3021 3115 3138 3157 3162 3182 3186 3207 3208 3215 3218 3229 3234 3235 3260 3282 3289 3293 3295 3312 3322 3332 3345 3373 3377 3417 3427 3439 3446 3461 3475 3482 3499 3500 3505 3519 3523 3543 3556 3569 3576 3601 3609 3614 3629 3637 3642 3645 3680 3687 3699 3714 3743 3781 3827 3831 3911 3920 3924 3957 3970 4021 4025 4033 4041 4054 4123 4146 4187 4203 4209 4270 4294 4312 4318 4363 4364 4368 4370 4376 4437 4459 4496 4575 4587 4621 4637 4658 4662 4665 4684 4694 4726 4730 4773 4849 4936 4949 43 61 64 78 82 91 136 177 249 288 289 460 672 674 704 748 759 810 869 975 1065 1140 1156 1230 1347 1355 1373 1505 1532 1572 1816 1821 1873 1879 1892 1904 1989 2071 2086 2259 2278 2281 2409 2411 2481 2568 2752 2766 2793 2896 2902 2906 3044 3069 3137 3227 3238 3247 3278 3298 3356 3520 3625 3647 3676 3774 3794 3825 3905 3947 3982 4039 4191 4199 4218 4269 4270 4519 4585 4640 4642 4659 4666 4706 4740 4859 4860 4867 4883 4907 4968 ACCGCC/GGCGGT 0 -2 293 301 57 -42.8 1 13 25 31 39 50 54 60 66 96 109 139 160 163 178 181 201 204 224 293 341 354 360 368 396 430 464 508 509 519 526 528 536 543 545 565 570 585 586 597 615 628 643 650 656 664 667 685 710 725 733 782 815 820 850 851 854 855 891 892 901 910 921 929 940 943 953 970 1009 1029 1072 1074 1081 1091 1116 1121 1152 1154 1159 1161 1165 1174 1200 1273 1283 1317 1330 1361 1374 1389 1400 1405 1415 1417 1436 1447 1452 1484 1512 1524 1534 1539 1540 1544 1571 1583 1614 1664 1688 1735 1750 1753 1789 1803 1808 1833 1877 1928 1932 1952 1953 1968 1971 1995 1996 2005 2007 2022 2031 2041 2053 2076 2092 2100 2137 2193 2209 2222 2226 2239 2240 2251 2294 2298 2321 2328 2339 2352 2358 2369 2391 2397 2439 2482 2498 2503 2516 2526 2528 2529 2567 2615 2632 2647 2657 2668 2702 2729 2733 2755 2762 2794 2806 2841 2857 2869 2879 2882 2899 2931 2950 2966 2967 3021 3042 3057 3074 3075 3082 3085 3087 3101 3102 3109 3111 3136 3146 3159 3181 3184 3186 3211 3212 3232 3237 3244 3251 3258 3275 3295 3297 3308 3326 3338 3342 3362 3369 3383 3406 3413 3457 3460 3466 3511 3521 3559 3575 3579 3586 3596 3613 3633 3643 3657 3667 3668 3713 3735 3750 3760 3765 3776 3794 3801 3808 3823 3862 3887 3946 3958 4000 4008 4068 4072 4074 4078 4106 4108 4156 4157 4219 4238 4247 4248 4250 4293 4296 4311 4337 4369 4376 4406 4418 4468 4498 4529 4535 4540 4571 4621 4660 4681 4713 4738 4750 4770 4776 4872 4908 4963 4991 4994 4995 86 144 254 265 322 429 538 643 673 704 953 997 1043 1271 1335 1426 1447 1465 1487 1488 1574 1575 1706 1859 2039 2065 2091 2164 2202 2291 2304 2416 2430 2780 2785 3028 3331 3506 3697 3734 3748 4087 4091 4104 4136 4186 4214 4358 4481 4589 4704 4723 4745 4760 4764 4789 4818 GCCACC/GGTGGC 0 -5 290 298 75 -33.9 1 7 9 54 67 88 104 106 108 115 155 158 169 174 182 224 261 272 306 334 341 350 373 399 442 452 466 494 497 504 508 525 526 528 531 536 545 550 585 598 599 601 608 610 630 647 671 677 695 759 766 785 803 854 863 867 868 870 880 901 909 916 923 935 940 962 970 982 1005 1041 1062 1068 1089 1094 1110 1115 1134 1135 1162 1165 1194 1256 1275 1281 1329 1333 1335 1339 1344 1358 1363 1374 1381 1390 1400 1410 1413 1434 1443 1450 1477 1496 1531 1579 1589 1590 1612 1630 1652 1678 1688 1692 1701 1707 1746 1749 1766 1778 1792 1836 1918 1922 1924 1928 1934 1942 1947 1965 1994 2008 2022 2031 2104 2137 2141 2146 2149 2170 2174 2179 2185 2195 2204 2209 2225 2233 2234 2264 2271 2309 2331 2349 2374 2383 2398 2399 2425 2456 2524 2526 2551 2555 2584 2635 2652 2655 2681 2683 2685 2687 2703 2733 2787 2790 2793 2800 2805 2816 2830 2837 2841 2842 2918 2941 2948 2980 2985 2998 3010 3013 3022 3032 3038 3039 3042 3044 3062 3098 3101 3114 3119 3123 3196 3212 3220 3244 3284 3316 3317 3334 3364 3405 3406 3410 3420 3430 3446 3450 3457 3469 3479 3496 3510 3511 3567 3599 3612 3730 3732 3748 3752 3757 3786 3794 3820 3879 3880 3959 3960 4025 4026 4060 4072 4090 4118 4149 4155 4191 4206 4207 4265 4285 4380 4384 4386 4477 4496 4502 4529 4537 4547 4566 4579 4583 4606 4619 4634 4652 4658 4660 4692 4705 4713 4716 4723 4736 4738 4747 4750 4785 4818 4853 4857 4859 4870 4877 4900 4911 4936 4951 50 60 78 111 192 261 334 702 754 782 789 1095 1151 1196 1227 1335 1464 1488 1537 1574 1684 1728 1729 1870 2064 2065 2083 2087 2092 2132 2160 2241 2391 2641 2750 2793 2865 2869 2950 2956 3001 3033 3049 3088 3352 3421 3434 3522 3627 3773 3784 3794 3832 4035 4179 4180 4205 4212 4299 4305 4374 4467 4471 4528 4601 4614 4638 4692 4745 4760 4764 4821 4823 4849 4933 GAGGTG/CACCTC 1 -2 273 283 81 -28.4 17 22 47 79 84 104 106 113 115 116 120 138 150 151 171 179 192 199 204 205 206 210 249 261 271 278 280 306 309 321 338 341 362 372 409 412 417 445 453 458 467 480 489 497 502 512 513 528 538 576 584 599 627 643 659 677 678 691 721 741 768 773 782 806 809 846 854 861 879 880 882 935 941 957 962 976 1005 1008 1062 1063 1091 1092 1115 1130 1134 1195 1196 1204 1207 1254 1275 1295 1314 1329 1339 1342 1367 1388 1392 1415 1425 1432 1460 1467 1488 1518 1571 1575 1581 1594 1628 1630 1634 1639 1645 1649 1652 1687 1696 1726 1776 1781 1788 1794 1800 1838 1850 1858 1896 1918 1925 1962 1965 2013 2020 2033 2039 2054 2071 2073 2121 2168 2206 2217 2221 2298 2304 2366 2383 2399 2420 2434 2522 2524 2526 2562 2633 2687 2689 2723 2743 2815 2816 2818 2833 2837 2897 2898 2901 2902 2910 2918 2959 2973 2998 3009 3033 3046 3056 3059 3062 3069 3092 3127 3131 3137 3144 3178 3248 3280 3283 3290 3293 3303 3337 3361 3375 3385 3388 3442 3455 3464 3476 3518 3528 3531 3545 3555 3600 3637 3658 3666 3689 3691 3735 3737 3739 3742 3747 3752 3764 3797 3803 3808 3828 3849 3874 3891 3958 3978 3982 4099 4107 4137 4163 4222 4225 4229 4263 4280 4313 4342 4432 4440 4450 4461 4469 4490 4518 4531 4546 4554 4570 4583 4623 4632 4642 4734 4746 4755 4777 4792 4833 4837 4854 4857 4893 4918 4927 4975 4982 4988 4991 0 83 102 149 153 465 496 539 623 624 667 709 753 771 789 804 968 1099 1164 1186 1262 1307 1438 1540 1575 1640 1666 1773 1797 1925 1955 1981 2064 2066 2087 2167 2188 2230 2247 2343 2347 2369 2425 2491 2564 2576 2584 2778 2829 2853 2947 2991 3012 3053 3161 3193 3213 3222 3398 3436 3439 3506 3615 3618 3825 3933 3999 4056 4074 4094 4206 4276 4309 4333 4482 4483 4532 4567 4640 4658 4940 AGCACC/GGTGCT 0 -2 250 263 62 -31.7 1 18 28 33 46 48 66 75 86 96 112 122 128 131 132 147 160 172 184 188 205 222 223 241 303 309 321 328 338 351 371 373 376 378 400 402 411 412 417 430 442 448 462 466 474 501 505 525 544 554 564 570 584 622 712 720 751 755 774 775 794 798 818 861 879 896 932 942 949 956 1063 1072 1083 1106 1162 1191 1201 1246 1251 1260 1279 1287 1289 1314 1351 1359 1389 1392 1396 1415 1418 1484 1516 1521 1578 1583 1597 1603 1649 1651 1676 1692 1720 1725 1740 1749 1775 1843 1853 1883 1909 1910 1919 1933 1945 1981 1983 2013 2015 2032 2047 2049 2059 2078 2095 2105 2138 2142 2151 2152 2214 2303 2323 2393 2396 2437 2520 2533 2538 2552 2593 2630 2631 2635 2649 2652 2684 2710 2729 2801 2817 2858 2877 2890 2894 2898 2902 2926 2958 2959 2995 3007 3028 3064 3082 3099 3146 3154 3160 3161 3164 3183 3202 3208 3265 3269 3322 3332 3336 3366 3408 3418 3494 3505 3565 3651 3656 3675 3681 3707 3774 3777 3826 3845 3853 3860 3874 3891 3899 3913 3939 3958 3970 3994 4014 4015 4045 4070 4099 4110 4165 4166 4168 4169 4190 4193 4242 4323 4360 4386 4493 4543 4547 4554 4571 4575 4580 4590 4637 4675 4690 4694 4717 4730 4735 4757 4772 4793 4809 4824 4879 4896 4897 4908 4929 4931 4936 4974 4979 4997 49 59 142 151 205 469 529 708 823 844 970 976 977 1164 1222 1262 1402 1443 1446 1488 1544 1575 1595 1649 1728 1729 1776 1813 1900 2148 2397 2410 2440 2481 2589 2626 2853 2947 3045 3053 3183 3211 3446 3471 3536 3538 3540 3758 3875 3943 4007 4267 4471 4499 4528 4568 4620 4676 4735 4764 4800 4916 CCACAG/CTGTGG 0 -1 237 247 74 -23.7 8 23 36 37 41 88 93 113 137 159 174 176 186 190 227 239 241 262 298 299 301 317 322 333 344 392 398 402 406 466 470 478 494 533 553 571 578 591 605 612 626 640 648 661 670 671 674 723 734 758 768 814 824 826 833 873 905 910 938 940 1025 1037 1069 1078 1080 1100 1111 1120 1132 1139 1143 1149 1154 1217 1220 1273 1286 1298 1299 1329 1347 1375 1415 1459 1513 1521 1535 1540 1562 1579 1585 1639 1652 1663 1677 1734 1740 1779 1801 1807 1831 1837 1877 1883 1919 1944 1949 1992 1997 2029 2042 2077 2092 2101 2106 2166 2176 2178 2180 2238 2248 2276 2339 2342 2343 2395 2435 2465 2573 2604 2609 2637 2638 2677 2680 2682 2692 2707 2756 2763 2769 2790 2832 2892 2904 2919 2953 2980 3017 3018 3060 3061 3066 3104 3172 3225 3228 3269 3296 3300 3317 3335 3349 3400 3433 3434 3448 3457 3463 3470 3475 3610 3614 3623 3624 3661 3670 3677 3679 3708 3726 3764 3820 3893 3902 3909 3918 3922 3936 3952 3965 3979 4017 4021 4039 4041 4051 4083 4088 4089 4092 4098 4110 4115 4116 4117 4169 4247 4310 4326 4328 4389 4390 4415 4432 4459 4495 4499 4533 4579 4580 4597 4637 4677 4701 4745 4765 4782 4784 4785 4814 4871 4892 4908 4912 4938 4994 29 36 164 174 222 369 410 442 482 645 681 743 746 759 762 865 901 948 1035 1103 1303 1308 1374 1401 1409 1469 1470 1523 1565 1571 1592 1694 1745 1923 1929 2032 2041 2191 2243 2362 2455 2458 2498 2642 2868 3000 3006 3028 3208 3265 3283 3303 3334 3490 3580 3704 3726 3730 3735 3821 3849 4100 4111 4167 4275 4292 4316 4364 4416 4541 4729 4764 4852 4964 CACCGT/ACGGTG 5 -1 246 246 79 -21.8 0 5 140 155 163 216 249 262 274 284 287 326 327 329 346 382 404 405 415 464 473 494 495 510 520 525 540 554 564 599 622 633 644 660 688 699 705 713 743 759 778 816 824 831 863 870 882 905 907 916 917 945 948 956 995 1000 1041 1057 1083 1163 1170 1189 1192 1219 1324 1339 1344 1346 1348 1351 1355 1381 1384 1390 1413 1434 1443 1458 1470 1489 1506 1530 1531 1541 1594 1599 1617 1662 1694 1702 1717 1749 1762 1798 1823 1829 1890 1901 1910 1939 1952 1965 1974 1975 1994 2022 2025 2031 2035 2043 2059 2104 2111 2121 2142 2148 2149 2184 2191 2204 2205 2224 2232 2264 2302 2303 2318 2326 2379 2382 2428 2437 2544 2549 2550 2553 2560 2598 2642 2649 2657 2697 2703 2713 2722 2749 2770 2779 2792 2793 2804 2808 2830 2870 2880 2927 2991 2994 3009 3010 3028 3062 3133 3136 3152 3154 3220 3272 3330 3336 3389 3410 3413 3415 3417 3420 3428 3442 3447 3462 3499 3513 3565 3567 3617 3647 3687 3704 3705 3730 3772 3774 3786 3806 3809 3841 3889 3929 3939 3959 3978 4005 4072 4090 4131 4151 4196 4214 4218 4257 4270 4337 4398 4409 4436 4484 4493 4498 4537 4560 4573 4577 4584 4614 4616 4619 4623 4648 4675 4676 4678 4679 4685 4692 4707 4713 4760 4779 4788 4810 4852 4878 4929 4935 4958 4987 28 36 53 59 142 145 255 322 334 427 508 512 514 587 596 690 717 742 763 804 935 977 1075 1191 1222 1259 1298 1408 1430 1531 1547 1652 1657 1665 1729 1774 1777 1815 1972 2011 2065 2071 2202 2218 2229 2290 2334 2382 2494 2626 2945 2968 3201 3208 3230 3270 3379 3485 3506 3571 3592 3635 3694 3736 3773 3774 3840 4007 4108 4407 4457 4467 4515 4601 4692 4745 4764 4801 4909 TCCACG/CGTGGA 0 -2 237 236 61 -26.3 5 50 61 118 121 132 140 148 149 177 192 208 220 237 246 248 268 316 319 356 404 422 426 437 461 482 506 613 620 655 663 682 689 736 760 762 768 771 782 817 835 856 870 899 902 913 916 933 943 949 975 978 992 1028 1036 1092 1109 1163 1207 1218 1222 1224 1259 1277 1300 1301 1308 1359 1360 1385 1416 1439 1483 1494 1499 1520 1535 1553 1572 1584 1639 1649 1655 1659 1736 1743 1787 1817 1838 1871 1896 1900 1905 1924 1937 1975 1979 1991 2038 2040 2055 2065 2111 2126 2128 2149 2157 2172 2188 2207 2208 2227 2228 2242 2249 2277 2309 2338 2348 2387 2482 2489 2496 2507 2535 2559 2562 2564 2597 2604 2616 2627 2640 2652 2661 2672 2735 2744 2762 2767 2770 2794 2865 2887 2891 2917 2921 2927 2939 2946 2949 3001 3030 3050 3065 3124 3125 3154 3195 3222 3224 3244 3298 3324 3381 3398 3425 3428 3467 3468 3486 3506 3528 3529 3532 3537 3640 3673 3682 3693 3698 3712 3721 3765 3767 3839 3872 3899 3912 3941 3986 4009 4057 4083 4094 4102 4125 4133 4138 4156 4175 4192 4196 4197 4203 4233 4240 4256 4264 4305 4318 4320 4321 4389 4397 4489 4532 4580 4606 4640 4680 4725 4774 4776 4778 4794 4800 4807 4812 4837 4847 4863 4877 4899 4927 4934 4942 118 434 437 518 558 627 641 717 952 998 1332 1466 1476 1692 1793 1878 1879 1915 1950 2087 2132 2227 2239 2430 2472 2528 2615 2631 2632 2710 2790 2883 2969 2970 3132 3184 3200 3369 3374 3575 3630 3794 3806 3827 3991 4007 4079 4108 4258 4394 4457 4460 4488 4495 4575 4735 4744 4764 4781 4865 4974 GACCAC/GTGGTC 0 -3 228 234 75 -20.8 18 21 58 66 71 148 158 161 162 174 177 179 193 209 217 226 253 256 259 262 284 287 308 310 322 341 355 368 377 419 457 458 463 483 497 498 520 557 578 581 592 606 611 613 621 643 690 713 750 782 797 822 833 864 871 901 917 943 959 982 1010 1026 1041 1045 1050 1078 1088 1117 1124 1145 1240 1275 1298 1337 1365 1370 1385 1390 1410 1455 1518 1537 1550 1573 1615 1622 1631 1648 1674 1702 1708 1743 1756 1768 1781 1805 1815 1819 1822 1839 1863 1928 2024 2031 2037 2090 2108 2114 2123 2142 2161 2171 2180 2285 2357 2380 2385 2386 2393 2415 2439 2562 2609 2631 2665 2711 2737 2750 2758 2784 2791 2806 2808 2842 2847 2861 2886 2911 2917 2941 2969 2983 2985 2986 3006 3012 3014 3056 3066 3110 3132 3166 3201 3205 3254 3267 3300 3320 3338 3432 3466 3540 3559 3595 3632 3635 3647 3690 3703 3723 3727 3738 3775 3793 3830 3842 3914 3924 3989 3997 4019 4021 4033 4076 4081 4098 4101 4124 4145 4192 4220 4242 4245 4269 4271 4280 4329 4336 4337 4366 4390 4400 4408 4424 4445 4510 4521 4528 4532 4546 4558 4586 4592 4737 4746 4768 4781 4785 4786 4893 4906 4927 4935 4966 4975 4984 4986 4999 36 104 106 208 209 373 421 456 504 512 581 587 755 941 1043 1057 1094 1142 1146 1222 1397 1408 1410 1470 1490 1541 1571 1748 1773 1868 1888 1897 1951 1996 2005 2053 2115 2362 2416 2455 2520 2568 2583 2588 2703 2881 2970 3126 3154 3201 3240 3330 3378 3527 3765 3768 3837 3899 3934 3961 4083 4108 4131 4163 4197 4316 4501 4546 4642 4646 4657 4714 4841 4899 4983 TCCGCC/GGCGGA 0 -2 233 232 37 -36.9 52 61 77 134 136 160 168 187 202 204 259 267 271 304 306 333 334 357 359 427 445 491 504 523 577 582 594 602 644 686 727 728 746 753 759 779 787 811 815 887 912 918 929 941 963 978 1005 1031 1043 1110 1115 1118 1144 1198 1210 1236 1259 1283 1303 1316 1353 1361 1378 1388 1398 1418 1434 1436 1505 1538 1540 1561 1567 1599 1654 1703 1719 1836 1858 1897 1917 1923 1924 1926 1942 1949 1965 1971 2036 2104 2108 2117 2130 2199 2286 2306 2321 2332 2377 2381 2400 2403 2423 2429 2433 2444 2452 2466 2483 2489 2490 2526 2529 2533 2553 2589 2611 2613 2653 2681 2685 2709 2744 2789 2812 2818 2849 2884 2891 2896 2900 2920 2940 2965 2978 3007 3010 3013 3018 3067 3089 3100 3101 3105 3125 3137 3145 3193 3195 3208 3225 3244 3251 3286 3309 3314 3315 3317 3344 3346 3366 3400 3405 3433 3450 3491 3508 3531 3551 3567 3573 3597 3612 3628 3687 3710 3730 3738 3748 3752 3764 3787 3799 3834 3849 3878 3883 3900 3907 3925 3938 3986 4079 4115 4135 4164 4180 4198 4249 4250 4263 4265 4281 4297 4312 4315 4318 4372 4396 4402 4421 4457 4531 4610 4623 4658 4672 4686 4696 4698 4706 4748 4789 4822 4846 4870 4910 4916 4955 4965 4982 4991 4994 147 322 529 696 792 851 881 1044 1504 1527 1536 1537 1602 1684 1721 1728 1729 1818 2064 2240 2255 2258 2318 2440 2684 2690 2945 3282 3319 3543 3657 4063 4206 4346 4576 4614 4702 TGCACC/GGTGCA 0 -5 215 228 64 -23.5 0 16 19 22 35 61 81 89 93 119 122 163 167 181 194 273 280 292 322 327 329 345 355 359 363 370 376 382 383 394 407 417 433 439 454 464 488 492 496 509 559 583 605 611 631 695 713 719 748 778 793 821 830 855 864 865 919 948 968 994 1009 1012 1015 1017 1074 1092 1102 1107 1115 1123 1133 1161 1165 1182 1201 1217 1221 1258 1284 1287 1300 1303 1323 1324 1381 1394 1398 1401 1491 1510 1548 1554 1581 1606 1622 1634 1645 1662 1667 1696 1747 1762 1772 1794 1813 1815 1828 1845 1849 1850 1871 1873 1932 1969 2066 2071 2082 2113 2136 2155 2165 2270 2303 2375 2399 2408 2472 2476 2488 2493 2567 2573 2613 2645 2677 2722 2734 2777 2815 2822 2833 2859 2880 2906 2908 2924 2974 3031 3035 3041 3081 3126 3272 3282 3293 3297 3312 3328 3367 3374 3375 3402 3452 3475 3480 3482 3526 3553 3672 3687 3696 3707 3772 3778 3780 3781 3831 3873 3987 3991 4091 4093 4116 4133 4193 4200 4202 4250 4252 4257 4325 4341 4352 4469 4473 4493 4526 4538 4593 4619 4621 4624 4626 4658 4673 4717 4750 4785 4821 4853 4860 4865 4906 4957 4988 29 53 83 186 269 512 710 763 818 894 906 924 968 999 1027 1054 1155 1183 1252 1262 1284 1371 1376 1455 1552 1684 1816 1941 2071 2167 2460 2596 2627 2823 2833 3041 3049 3060 3227 3370 3443 3485 3610 3614 3670 3697 3704 3774 3891 3926 3936 4074 4468 4478 4504 4513 4562 4643 4706 4710 4829 4886 4892 4918 ACCACG/CGTGGT 0 -2 217 226 56 -26.2 4 5 13 44 52 57 101 115 148 154 158 169 181 191 197 226 240 253 259 275 288 341 360 364 367 368 374 394 544 554 595 603 613 617 631 697 699 713 714 744 750 754 785 794 796 821 845 867 899 943 952 953 959 976 977 983 992 1023 1078 1084 1088 1152 1170 1186 1188 1230 1258 1306 1313 1336 1373 1397 1398 1409 1533 1544 1564 1605 1628 1651 1652 1667 1694 1698 1707 1710 1711 1712 1727 1742 1749 1768 1772 1809 1817 1933 1936 1958 1985 1988 2021 2078 2089 2095 2098 2101 2109 2118 2136 2148 2150 2153 2161 2227 2236 2243 2270 2296 2311 2330 2374 2465 2486 2493 2498 2519 2540 2546 2551 2555 2576 2585 2606 2609 2679 2685 2706 2713 2747 2775 2781 2785 2793 2806 2817 2874 2917 2951 2983 3012 3047 3079 3093 3119 3125 3129 3132 3178 3195 3208 3239 3245 3254 3346 3394 3430 3432 3447 3466 3482 3484 3485 3487 3503 3527 3606 3682 3732 3738 3781 3873 3901 3905 3926 3942 3987 4002 4015 4021 4037 4081 4200 4202 4205 4206 4220 4221 4246 4259 4300 4317 4363 4375 4398 4407 4449 4451 4460 4547 4602 4646 4691 4779 4793 4802 4835 4892 36 45 135 268 504 631 811 941 1048 1092 1146 1151 1166 1222 1253 1338 1429 1490 1649 1687 1707 1773 1777 1787 1911 1996 2262 2411 2575 2830 2861 2886 2947 2955 3146 3157 3330 3481 3505 3527 3705 3768 3821 3837 3968 3993 4020 4049 4129 4131 4163 4205 4594 4642 4744 4787 CGCCGC/GCGGCG 0 -3 226 223 37 -34.7 31 34 43 52 54 60 63 109 148 187 232 246 259 267 317 351 359 378 391 395 399 435 509 523 526 539 543 545 613 699 717 746 766 800 842 854 887 929 978 1003 1005 1034 1113 1118 1168 1199 1225 1267 1285 1304 1317 1327 1330 1361 1423 1452 1467 1483 1531 1540 1544 1570 1572 1582 1596 1599 1620 1647 1654 1746 1750 1791 1792 1803 1866 1878 1905 1928 1952 1955 1956 1961 1971 1976 2004 2031 2035 2080 2100 2190 2233 2274 2277 2298 2317 2333 2346 2367 2371 2379 2381 2429 2438 2451 2464 2465 2466 2467 2469 2498 2526 2551 2627 2653 2668 2670 2685 2701 2718 2729 2794 2800 2826 2883 2928 2965 2989 3058 3087 3128 3145 3146 3147 3154 3184 3213 3229 3244 3251 3268 3304 3317 3334 3349 3351 3354 3362 3383 3394 3433 3491 3523 3540 3553 3566 3575 3619 3668 3672 3687 3700 3706 3717 3768 3779 3817 3824 3849 3878 3925 3958 3973 4060 4146 4150 4183 4225 4238 4243 4244 4249 4250 4281 4291 4293 4307 4309 4321 4330 4385 4398 4402 4406 4418 4430 4448 4470 4482 4508 4549 4550 4571 4589 4601 4611 4613 4623 4638 4641 4686 4696 4739 4750 4758 4770 4831 4833 4839 4844 4873 4898 4909 4917 4935 4955 4979 66 141 144 192 508 674 675 851 950 1447 1457 1464 1465 1504 1720 1772 2291 2606 2697 2854 2923 3010 3221 3282 3312 3543 3563 3584 3657 3658 4468 4487 4576 4614 4692 4745 4818 CCGCCG/CGGCGG 0 -1 220 220 47 -28.9 1 31 50 52 54 60 77 106 109 134 148 160 187 193 259 267 317 329 359 368 378 395 404 504 509 521 523 526 543 545 570 585 597 602 685 699 746 801 815 854 887 901 918 929 975 978 1003 1005 1026 1027 1118 1199 1259 1267 1283 1317 1327 1330 1361 1374 1385 1405 1452 1467 1540 1544 1561 1582 1583 1599 1654 1722 1753 1789 1803 1858 1877 1878 1917 1924 1928 1949 1952 1971 2004 2022 2031 2035 2053 2055 2100 2137 2199 2222 2233 2286 2298 2302 2317 2321 2333 2346 2377 2381 2397 2429 2438 2439 2444 2464 2465 2466 2467 2490 2498 2526 2553 2613 2627 2653 2657 2668 2709 2729 2755 2789 2794 2818 2849 2896 2920 2928 2965 3007 3082 3087 3136 3145 3146 3154 3181 3184 3211 3213 3244 3251 3268 3295 3309 3351 3366 3383 3433 3491 3511 3523 3531 3567 3575 3579 3586 3597 3619 3643 3668 3687 3700 3706 3787 3834 3849 3878 3925 3958 3973 4000 4106 4146 4152 4238 4243 4244 4249 4250 4263 4273 4281 4293 4307 4321 4330 4398 4402 4406 4418 4482 4498 4526 4550 4571 4601 4606 4621 4623 4641 4686 4696 4706 4738 4750 4758 4770 4839 4872 4910 4917 4955 4982 4991 4994 141 144 265 322 522 674 675 851 1447 1465 1504 1706 1720 1818 1859 2039 2064 2240 2291 2318 2416 2780 2945 3221 3231 3282 3312 3319 3331 3540 3543 3584 3657 3658 3697 3734 3737 4087 4214 4386 4449 4481 4576 4614 4692 4702 4745 GGAGGC/GCCTCC 1 -3 200 216 57 -23.7 2 10 31 39 49 73 85 115 129 132 150 163 164 187 204 209 214 224 278 285 302 307 320 353 373 378 398 430 445 491 515 538 542 545 546 549 554 580 585 593 602 621 630 644 668 676 686 708 734 738 753 759 784 787 788 804 813 824 828 829 851 866 876 887 940 943 948 949 1022 1028 1031 1034 1038 1043 1094 1125 1130 1152 1199 1208 1210 1244 1247 1248 1314 1326 1331 1353 1357 1364 1374 1388 1434 1500 1539 1633 1636 1654 1662 1666 1683 1706 1731 1736 1738 1753 1779 1821 1873 1883 1949 1954 1980 1991 2025 2038 2058 2080 2100 2115 2167 2193 2242 2248 2271 2343 2356 2406 2489 2526 2574 2653 2818 2829 2868 2927 2948 3057 3109 3110 3124 3137 3146 3152 3184 3200 3220 3237 3309 3342 3344 3346 3379 3406 3422 3450 3496 3508 3529 3547 3639 3648 3717 3762 3765 3801 3808 3827 3829 3850 3878 3925 3986 4048 4051 4162 4180 4210 4281 4291 4297 4302 4326 4328 4390 4446 4469 4516 4558 4726 4751 4787 4821 4851 4858 4899 4912 4939 4962 4973 37 184 241 267 332 494 571 630 662 672 740 788 789 854 1434 1504 1574 1575 1644 1689 1728 1763 1941 1991 2065 2091 2428 2443 2529 2760 2829 3126 3130 3193 3263 3293 3306 3343 3369 3413 3483 3543 4074 4090 4305 4310 4343 4423 4444 4621 4682 4692 4716 4786 4861 4918 4970 CGGAGG/CCTCCG 1 -4 203 208 47 -26.2 1 39 40 77 85 129 163 168 187 254 271 304 330 334 359 404 430 449 477 491 499 510 542 554 577 582 587 596 599 628 638 644 682 706 724 728 738 749 753 782 787 790 867 887 918 940 941 948 981 1005 1023 1034 1043 1115 1134 1187 1195 1199 1200 1208 1210 1232 1249 1251 1259 1318 1326 1350 1374 1388 1418 1434 1443 1473 1539 1643 1666 1672 1717 1735 1746 1821 1873 1917 1939 1942 1949 1954 1965 1986 2036 2039 2199 2206 2268 2298 2307 2364 2374 2447 2519 2526 2540 2557 2574 2582 2586 2598 2608 2613 2653 2687 2694 2709 2744 2778 2789 2818 2840 2872 2965 2985 3013 3020 3026 3030 3036 3052 3097 3123 3124 3137 3149 3153 3173 3237 3244 3245 3272 3283 3290 3344 3346 3379 3422 3450 3469 3472 3476 3490 3496 3533 3571 3604 3612 3639 3652 3654 3710 3719 3727 3736 3752 3762 3803 3844 3849 3877 3878 3897 3925 3973 3982 4028 4037 4039 4051 4063 4143 4161 4180 4204 4242 4249 4263 4265 4280 4281 4297 4374 4440 4447 4518 4527 4631 4672 4692 4696 4754 4787 4792 4851 4908 37 152 490 630 644 690 747 749 836 851 1259 1262 1504 1657 1728 1793 1818 1847 1859 2039 2064 2191 2255 2443 2611 3006 3081 3175 3193 3314 3315 3441 3543 3575 3822 3839 4206 4302 4305 4419 4614 4621 4682 4692 4750 4786 4962 CCACCC/GGGTGG 0 -1 191 196 54 -20.7 16 17 54 58 72 76 79 101 108 110 116 127 128 171 260 272 281 292 295 296 298 302 350 368 372 388 466 496 542 630 724 728 749 750 757 792 798 816 853 871 901 920 977 987 1010 1052 1073 1131 1137 1196 1240 1275 1289 1365 1380 1474 1497 1537 1545 1550 1600 1617 1634 1678 1703 1706 1707 1731 1738 1766 1822 1839 1892 1913 1929 1957 2025 2069 2074 2090 2148 2177 2185 2217 2218 2281 2320 2362 2368 2379 2388 2435 2456 2459 2460 2461 2514 2531 2564 2568 2605 2642 2644 2650 2674 2681 2696 2719 2734 2735 2741 2806 2826 2833 2835 2872 2893 2894 2927 2957 2969 3009 3016 3038 3064 3114 3132 3171 3194 3196 3205 3238 3248 3283 3294 3301 3334 3366 3402 3405 3447 3457 3494 3495 3520 3544 3565 3582 3632 3647 3683 3778 3785 3810 3873 3883 3949 3975 4006 4014 4023 4030 4145 4228 4229 4271 4281 4326 4335 4355 4366 4379 4447 4504 4546 4555 4606 4609 4615 4682 4746 4765 4777 4829 4890 4900 4912 4915 4947 4959 4978 60 178 393 420 465 851 1037 1044 1082 1095 1222 1224 1226 1335 1719 1728 1782 1807 1816 1866 1874 1888 1951 2078 2099 2152 2168 2241 2304 2381 2416 2703 2752 2956 2994 3045 3140 3178 3240 3272 3305 3435 3737 3832 3934 3983 4155 4205 4408 4543 4614 4734 4983 4996 CTGCAC/GTGCAG 0 -3 178 188 58 -17.7 16 19 38 50 81 89 122 167 172 194 196 210 248 321 327 339 345 355 360 363 383 415 417 433 439 442 454 486 492 496 509 513 515 559 578 579 606 719 759 778 783 793 821 833 865 913 914 944 948 966 967 994 1001 1012 1015 1017 1092 1102 1107 1133 1201 1217 1221 1245 1248 1253 1281 1287 1300 1303 1323 1324 1381 1412 1491 1521 1554 1555 1606 1622 1634 1637 1645 1652 1662 1667 1747 1762 1784 1794 1795 1849 1871 1932 1969 2027 2029 2038 2050 2140 2170 2200 2272 2284 2301 2314 2375 2399 2408 2567 2582 2584 2605 2722 2833 2859 2880 3041 3081 3088 3093 3129 3149 3207 3234 3272 3282 3288 3293 3312 3328 3358 3446 3475 3482 3499 3576 3637 3687 3696 3707 3746 3831 3847 3873 3917 4044 4053 4091 4103 4106 4133 4193 4203 4308 4312 4325 4349 4352 4363 4364 4368 4370 4461 4493 4574 4587 4596 4621 4624 4658 4708 4717 4736 4750 4846 4853 4936 29 53 127 204 410 762 850 891 942 975 1027 1155 1181 1252 1286 1347 1355 1376 1455 1601 1779 1816 1821 1882 1922 1941 2282 2308 2375 2389 2490 2627 2671 2799 2833 2867 2902 3124 3609 3665 3670 3774 3802 3861 4039 4270 4288 4468 4500 4537 4659 4688 4706 4710 4783 4901 4906 4927 CCACGA/TCGTGG 0 -1 185 183 58 -16.7 51 57 101 140 148 158 179 208 220 253 259 341 356 364 368 390 404 422 426 482 595 625 631 643 663 682 697 736 744 750 754 760 762 778 782 817 830 867 902 936 976 977 992 1028 1036 1042 1084 1088 1108 1188 1214 1222 1313 1336 1373 1409 1416 1474 1499 1520 1544 1572 1626 1628 1649 1651 1667 1712 1736 1772 1862 1871 1900 1936 1937 1985 1988 2021 2040 2089 2095 2098 2128 2136 2149 2153 2188 2227 2251 2272 2328 2387 2444 2482 2496 2498 2507 2535 2540 2546 2554 2562 2576 2597 2604 2616 2679 2706 2747 2770 2775 2785 2927 2946 2989 3047 3050 3065 3079 3129 3178 3208 3222 3242 3245 3266 3298 3324 3327 3381 3394 3425 3430 3468 3472 3484 3487 3497 3613 3698 3739 3781 3873 3899 3905 3926 3941 3981 4009 4081 4083 4102 4125 4138 4203 4205 4221 4246 4264 4318 4398 4407 4408 4411 4442 4451 4501 4532 4547 4602 4606 4610 4680 4691 4774 4794 4800 4807 4812 4835 4837 4891 4899 4942 4945 208 476 558 631 641 897 952 982 1092 1142 1146 1151 1222 1332 1429 1466 1476 1649 1692 1777 1787 1911 2227 2263 2314 2528 2575 2615 2631 2647 2744 2883 2970 2973 3147 3192 3318 3330 3337 3374 3505 3794 3806 3827 3956 4007 4020 4049 4131 4163 4233 4394 4488 4546 4641 4735 4781 4843 CACCGG/CCGGTG 5 -1 179 181 57 -16.7 25 31 33 48 67 95 108 175 193 202 273 306 308 318 334 356 417 461 477 514 520 536 593 599 622 640 644 663 715 745 746 781 863 893 937 953 1026 1028 1030 1034 1068 1122 1195 1202 1265 1269 1298 1344 1361 1428 1451 1486 1519 1597 1603 1606 1653 1657 1678 1683 1685 1693 1746 1754 1765 1802 1843 1902 1903 1924 1950 1973 1998 2041 2045 2057 2058 2119 2127 2245 2263 2312 2318 2324 2346 2353 2389 2399 2500 2510 2555 2573 2614 2615 2635 2655 2687 2714 2733 2759 2781 2832 2880 2915 2917 2948 2985 3007 3036 3044 3097 3098 3116 3137 3161 3163 3165 3171 3187 3281 3290 3316 3338 3374 3400 3430 3437 3447 3454 3457 3510 3531 3553 3567 3579 3586 3617 3656 3670 3682 3702 3735 3781 3813 3826 3831 3840 3872 3899 3904 3933 3972 3982 4045 4076 4113 4242 4291 4325 4332 4380 4386 4388 4398 4412 4456 4600 4613 4675 4685 4764 4839 4851 4855 4857 4859 4908 4928 4932 17 106 121 186 192 205 255 269 325 375 513 515 560 824 844 863 999 1040 1165 1382 1414 1429 1536 1698 1913 1932 2059 2141 2148 2566 2617 2704 2722 2834 2946 3011 3049 3146 3201 3270 3433 3543 3627 3690 3782 3843 4197 4231 4258 4410 4419 4468 4476 4479 4705 4800 4951 TCGCCA/TGGCGA 0 -4 183 180 56 -16.8 103 106 108 142 169 283 294 318 334 428 473 479 489 513 523 527 540 542 568 576 585 598 632 646 775 815 825 832 867 877 887 916 923 930 948 1089 1110 1135 1148 1151 1158 1190 1268 1270 1307 1332 1333 1370 1375 1447 1477 1521 1524 1529 1556 1583 1585 1589 1592 1599 1609 1633 1668 1685 1698 1699 1701 1758 1783 1804 1807 1822 1904 1922 2143 2144 2170 2188 2190 2229 2240 2243 2277 2349 2424 2451 2454 2491 2507 2526 2545 2568 2584 2596 2624 2713 2740 2781 2795 2798 2805 2837 2857 2863 2910 2942 2954 2975 2993 3013 3014 3044 3067 3080 3090 3104 3106 3114 3136 3138 3155 3193 3196 3296 3297 3311 3317 3327 3331 3364 3404 3455 3465 3502 3515 3531 3583 3599 3648 3677 3679 3732 3749 3768 3775 3786 3842 3863 3894 3960 4009 4026 4041 4046 4071 4118 4122 4144 4167 4168 4211 4335 4394 4402 4415 4419 4442 4537 4606 4634 4645 4753 4767 4771 4819 4849 4853 4877 4900 4910 4913 4951 4967 11 19 59 60 78 178 240 461 510 538 554 712 964 1206 1303 1468 1484 1515 1529 1633 1655 1733 1848 1888 1969 1971 1989 2004 2009 2023 2508 2602 2745 2764 2877 2889 3028 3060 3103 3312 3421 3504 3741 3818 3836 3980 4180 4211 4219 4222 4355 4467 4499 4742 4880 4999 CCACGT/ACGTGG 0 -1 174 178 53 -17.5 13 55 148 149 154 160 166 169 181 192 226 237 246 248 268 317 360 374 394 399 437 506 544 597 620 628 631 655 757 796 835 853 856 870 899 941 943 949 953 959 978 983 992 1000 1003 1046 1059 1116 1134 1144 1153 1156 1180 1196 1207 1230 1269 1300 1301 1359 1385 1397 1398 1425 1447 1503 1535 1605 1652 1655 1657 1711 1727 1783 1787 1817 1860 1958 1991 2001 2078 2118 2148 2150 2207 2228 2242 2243 2244 2249 2270 2277 2279 2311 2348 2357 2465 2555 2559 2606 2609 2627 2672 2676 2685 2713 2735 2762 2767 2857 2874 2917 2950 2983 3000 3030 3125 3136 3195 3213 3247 3254 3282 3346 3432 3447 3449 3467 3485 3491 3506 3527 3528 3532 3625 3673 3682 3704 3712 3721 3839 3872 3884 3899 3952 4046 4110 4133 4156 4192 4197 4220 4233 4256 4259 4269 4300 4317 4351 4363 4389 4457 4562 4598 4640 4645 4776 4793 4836 4847 4877 4888 4927 4934 59 118 135 236 306 434 518 613 619 629 811 998 1332 1338 1655 1697 1773 1785 1848 1879 1950 2211 2239 2302 2332 2472 2518 2563 2790 2886 2955 3132 3184 3200 3211 3401 3421 3481 3658 3695 3713 4258 4412 4458 4460 4495 4575 4744 4839 4865 4889 4902 4939 CCGCCT/AGGCGG 0 -1 168 178 42 -21.8 10 31 39 48 59 66 163 204 246 259 293 306 311 341 351 360 396 430 445 464 519 542 543 545 577 582 642 644 656 664 686 725 753 759 779 787 811 887 940 943 953 965 1022 1031 1034 1043 1072 1074 1081 1085 1121 1152 1154 1159 1161 1164 1210 1225 1273 1316 1388 1389 1415 1418 1484 1512 1524 1531 1539 1571 1596 1644 1654 1662 1735 1750 1858 1897 1926 2025 2036 2069 2193 2226 2277 2294 2306 2317 2369 2403 2452 2498 2503 2516 2526 2529 2533 2539 2567 2611 2653 2829 2899 2900 2940 2966 3023 3045 3075 3085 3087 3102 3105 3109 3110 3111 3146 3208 3237 3258 3308 3319 3326 3334 3338 3342 3344 3346 3354 3362 3400 3491 3496 3508 3551 3559 3573 3667 3717 3730 3765 3776 3801 3808 3823 3925 3946 3986 4008 4078 4156 4180 4265 4281 4291 4297 4337 4396 4468 4600 4672 4688 4696 4734 4824 4831 4873 4916 74 254 381 529 538 662 788 792 953 997 1044 1271 1455 1487 1504 1574 1575 1602 2065 2091 2202 2255 2313 2430 2582 2606 2625 2690 2785 3028 3369 3420 3563 3589 4087 4104 4346 4358 4764 4789 4818 4868 ACCGCA/TGCGGT 0 -2 176 177 44 -20.7 2 3 29 30 32 54 74 100 111 272 291 379 453 454 460 481 492 494 508 534 614 646 652 726 783 820 944 950 969 1049 1050 1056 1069 1098 1121 1130 1148 1174 1192 1214 1295 1322 1352 1354 1377 1386 1448 1455 1463 1466 1496 1555 1572 1574 1619 1622 1637 1659 1667 1669 1699 1700 1721 1725 1778 1795 1818 1842 1846 1854 1859 1873 1914 1971 1979 1990 2011 2070 2136 2149 2179 2193 2200 2203 2224 2290 2299 2337 2357 2361 2373 2388 2507 2600 2653 2661 2687 2700 2748 2782 2850 2924 2984 2988 2991 3087 3088 3126 3248 3284 3290 3312 3333 3348 3375 3413 3414 3419 3441 3477 3497 3508 3514 3573 3587 3589 3647 3659 3667 3683 3722 3746 3751 3765 3768 3779 3808 3832 3868 3880 3919 3947 3965 4001 4020 4055 4082 4123 4160 4172 4188 4229 4252 4331 4350 4392 4403 4414 4497 4515 4530 4559 4578 4582 4592 4639 4673 4701 4703 4719 4742 4784 4829 4870 4920 4988 37 66 136 264 501 527 619 803 813 958 1119 1183 1406 1467 1549 1657 1798 1955 2073 2202 2283 2301 2449 3096 3113 3145 3241 3245 3271 3509 3575 3920 4055 4101 4188 4204 4212 4295 4406 4520 4562 4659 4735 4760 TTGCGG/CCGCAA 4 -2 166 167 54 -15.0 2 3 32 54 58 100 166 187 267 272 274 291 327 330 374 410 460 470 481 517 540 589 646 652 717 752 777 778 787 820 838 848 939 987 1002 1050 1056 1093 1098 1118 1121 1127 1148 1164 1173 1295 1322 1357 1386 1400 1455 1475 1496 1535 1589 1659 1669 1699 1829 1846 1854 1914 1952 1964 1971 2032 2049 2100 2145 2162 2179 2193 2274 2290 2373 2379 2469 2507 2525 2529 2582 2596 2600 2648 2685 2699 2700 2753 2808 2826 2881 2901 2924 3057 3088 3140 3232 3287 3312 3321 3333 3348 3358 3394 3395 3413 3419 3512 3514 3525 3553 3565 3589 3600 3659 3717 3746 3751 3765 3770 3788 3802 3811 3849 3880 3919 3947 3982 3988 3994 4001 4020 4067 4086 4091 4123 4139 4143 4148 4243 4306 4340 4350 4409 4472 4497 4512 4519 4530 4559 4592 4688 4703 4704 4742 4770 4784 4787 4829 4854 4898 4902 4920 4921 4948 4988 37 136 501 508 511 619 788 813 851 1031 1103 1142 1161 1230 1342 1467 1735 1772 1799 1816 2051 2151 2202 2385 2449 2845 2987 3006 3081 3096 3113 3145 3245 3262 3271 3509 3548 3555 3575 3661 3771 3821 4055 4101 4212 4287 4318 4487 4520 4668 4683 4760 4930 4994 GCTGCG/CGCAGC 3 -3 157 163 49 -15.9 52 54 93 109 121 122 139 152 168 209 211 213 234 260 296 316 333 335 355 373 397 440 442 453 494 499 547 569 613 646 648 656 673 705 715 755 842 865 900 925 950 975 1049 1096 1106 1113 1121 1143 1153 1185 1188 1194 1208 1224 1289 1304 1317 1330 1351 1374 1405 1425 1463 1511 1569 1572 1599 1620 1637 1645 1676 1700 1714 1724 1747 1767 1778 1795 1852 1917 1919 1991 1997 2047 2072 2076 2080 2085 2101 2135 2149 2153 2168 2199 2299 2300 2385 2386 2422 2429 2558 2572 2600 2604 2611 2663 2690 2724 2806 2858 2893 2904 2938 2984 2991 3058 3090 3097 3130 3193 3229 3277 3503 3523 3532 3548 3573 3590 3625 3647 3721 3757 3808 3852 3868 3886 3890 3902 3918 3935 3978 4129 4149 4187 4318 4321 4408 4480 4619 4648 4657 4701 4758 4764 4770 4866 4944 0 263 321 355 668 674 792 846 1035 1049 1187 1233 1489 1536 1594 1688 1801 1867 2091 2150 2253 2411 2786 2809 3057 3074 3196 3200 3241 3352 3396 3528 3536 3612 3890 3920 3926 3932 4011 4180 4418 4448 4476 4507 4576 4705 4794 4892 4920 CCACGG/CCGTGG 0 -1 153 157 45 -16.1 4 5 44 50 115 191 228 240 246 275 288 316 319 334 404 428 554 603 613 617 699 710 714 749 768 785 797 845 870 908 913 933 1021 1023 1078 1092 1109 1152 1163 1165 1218 1219 1224 1259 1267 1324 1425 1439 1445 1465 1481 1494 1518 1553 1564 1584 1605 1639 1694 1698 1702 1710 1742 1743 1749 1768 1842 1896 1924 1975 1979 1987 2025 2038 2055 2101 2111 2126 2177 2227 2296 2309 2374 2379 2389 2486 2493 2507 2508 2552 2564 2585 2627 2744 2781 2793 2794 2817 2870 2884 2887 2891 2917 2921 2949 2951 3001 3093 3119 3141 3154 3194 3195 3224 3244 3263 3428 3486 3529 3556 3606 3688 3712 3765 3767 3872 3901 3942 3986 4015 4122 4137 4138 4167 4196 4200 4206 4233 4273 4312 4360 4397 4449 4580 4692 4725 4778 4779 4802 4855 4863 4892 4940 36 45 241 268 418 437 495 504 941 964 1008 1048 1166 1253 1594 1618 1707 1793 1878 1996 2087 2262 2830 3157 3369 3374 3506 3527 3540 3575 3608 3821 3837 3908 3991 3993 4108 4205 4457 4594 4704 4764 4888 4906 4974 CGGCAC/GTGCCG 2 -3 148 144 16 -27.8 1 95 140 144 216 254 415 446 502 607 621 625 781 854 883 884 911 917 928 967 973 986 1086 1097 1126 1128 1147 1164 1213 1269 1271 1309 1311 1318 1361 1390 1397 1407 1416 1453 1465 1470 1485 1529 1544 1549 1553 1670 1708 1733 1750 1889 1890 1911 1917 1947 1970 2050 2055 2060 2062 2119 2121 2186 2303 2324 2333 2340 2347 2356 2474 2490 2557 2579 2581 2669 2731 2830 2885 2921 2960 2983 3023 3072 3140 3142 3176 3261 3281 3289 3365 3368 3400 3409 3421 3446 3461 3579 3586 3600 3614 3688 3708 3765 3831 3853 3877 3942 3971 3993 4010 4054 4087 4114 4220 4340 4353 4355 4356 4368 4382 4390 4397 4464 4487 4513 4514 4585 4618 4663 4668 4671 4685 4688 4689 4708 4714 4734 4773 4801 4804 4903 4919 4933 4938 4943 4945 4995 17 619 886 1009 1652 1670 1816 1922 2180 2366 2722 3156 3571 4419 4444 4744 GCTGCC/GGCAGC 3 -3 138 142 43 -13.9 28 61 129 139 152 188 224 227 243 285 312 324 341 378 476 516 531 557 584 608 642 757 828 875 877 888 890 936 940 1022 1038 1047 1057 1059 1062 1079 1092 1097 1153 1177 1214 1244 1279 1324 1374 1415 1445 1572 1662 1746 1753 1766 1778 1796 1837 1857 1978 2021 2022 2068 2075 2114 2232 2256 2293 2297 2322 2336 2346 2428 2457 2464 2473 2527 2539 2540 2566 2604 2618 2632 2683 2702 2722 2740 2765 2823 2832 2834 2854 2859 2892 2950 3015 3061 3105 3118 3146 3187 3231 3307 3349 3353 3380 3498 3523 3582 3585 3700 3712 3763 3860 3894 3913 3954 4006 4129 4148 4175 4176 4328 4340 4401 4404 4419 4425 4468 4516 4533 4575 4581 4644 4669 4740 4795 4821 4936 4940 4970 33 136 351 474 513 551 693 727 754 782 886 894 940 973 1014 1065 1159 1372 1401 1511 1537 1545 1740 1780 1834 1875 2106 2256 2273 2308 2597 2640 2652 2999 3021 3491 3595 3821 4164 4457 4692 4755 4761 AGCACG/CGTGCT 0 -2 137 135 44 -12.2 33 65 78 108 148 194 210 238 305 320 327 329 397 455 491 507 573 588 648 660 680 705 749 753 774 795 852 864 870 922 989 1032 1033 1053 1079 1088 1095 1116 1143 1147 1189 1320 1350 1385 1503 1505 1531 1538 1569 1644 1670 1762 1767 1793 1804 1816 1827 1883 1901 1912 1940 2097 2152 2175 2190 2396 2397 2599 2604 2639 2641 2703 2717 2735 2740 2771 2811 2869 2884 2967 3121 3164 3188 3222 3234 3282 3355 3393 3439 3468 3480 3585 3604 3645 3646 3699 3714 3722 3729 3845 3847 3870 3971 3985 4040 4081 4086 4102 4146 4151 4176 4187 4228 4263 4273 4276 4317 4332 4349 4370 4382 4391 4394 4534 4535 4539 4547 4603 4623 4631 4638 4645 4665 4697 4701 4940 4999 47 144 587 686 723 765 783 810 857 1150 1176 1234 1380 1407 1498 1653 1848 1915 1928 2016 2070 2088 2411 2552 2762 2850 2954 3141 3210 3235 3326 3741 3823 3977 4251 4314 4334 4366 4416 4512 4729 4744 4888 4942 CCACGC/GCGTGG 0 -1 124 126 33 -14.4 13 14 52 61 118 132 177 188 367 426 461 489 575 613 661 689 713 746 750 771 794 808 821 913 916 923 952 975 1065 1151 1170 1186 1258 1277 1293 1303 1306 1308 1331 1360 1466 1483 1533 1562 1572 1659 1690 1707 1754 1809 1838 1873 1905 1933 2065 2109 2122 2157 2172 2180 2208 2236 2330 2338 2431 2435 2451 2489 2519 2551 2569 2618 2640 2650 2652 2661 2663 2862 2865 2939 2950 3012 3124 3125 3132 3239 3273 3398 3439 3482 3503 3537 3544 3640 3682 3693 3717 3732 3738 3749 3890 3912 3981 3987 4002 4021 4037 4057 4078 4094 4175 4183 4202 4240 4305 4320 4321 4375 4442 4460 4489 4508 4646 4849 627 707 717 1347 1687 1915 2132 2411 2430 2632 2644 2710 2861 2947 3010 3146 3326 3338 3528 3630 3705 3713 3768 4079 4129 4219 4448 4589 4642 4787 4847 4983 4986 GGCACC/GGTGCC 2 -2 108 110 27 -13.4 1 134 140 190 234 306 326 342 486 488 523 573 599 629 676 708 786 854 883 884 1025 1034 1039 1126 1189 1243 1282 1318 1361 1364 1377 1386 1401 1453 1474 1529 1544 1549 1586 1602 1666 1704 1722 1785 1858 1890 1970 1998 2119 2121 2153 2186 2190 2279 2299 2316 2326 2340 2467 2490 2590 2606 2613 2635 2640 2731 2798 2830 2900 2975 3023 3158 3321 3368 3586 3600 3606 3614 3686 3735 3740 3765 3813 3853 3880 3923 3942 3974 4152 4200 4274 4282 4314 4356 4370 4409 4464 4487 4506 4644 4668 4685 4701 4705 4804 4878 4935 4995 334 810 1091 1099 1116 1500 1543 1652 1670 2059 2071 2087 2321 2366 2626 3049 3230 3348 3373 3571 3721 3934 4087 4248 4299 4416 4419 ACGGCA/TGCCGT 2 -4 108 109 34 -10.6 59 140 166 197 293 324 345 377 415 602 621 711 740 773 793 797 862 863 875 878 917 967 973 1064 1085 1086 1097 1126 1128 1147 1167 1213 1214 1259 1269 1306 1309 1318 1465 1470 1481 1544 1576 1584 1712 1718 1733 1743 1889 1890 1971 2060 2091 2186 2404 2474 2495 2557 2581 2607 2731 2737 2829 2830 2845 2885 2891 2921 3146 3263 3330 3348 3365 3409 3413 3421 3446 3572 3579 3600 3700 3708 3918 3931 3936 3942 4040 4077 4087 4340 4353 4390 4397 4404 4464 4514 4566 4584 4663 4671 4767 4773 4828 4933 4938 4945 4963 4995 109 307 619 779 857 1092 1226 1229 1245 1334 1652 1780 1827 1875 1922 2102 2112 2237 2260 2366 2427 2645 2652 2719 3156 3260 3374 3591 3629 3871 4187 4578 4696 4988 GGCACT/AGTGCC 2 -2 108 105 34 -9.8 90 175 182 314 362 399 413 415 446 468 530 611 625 656 701 781 793 893 894 911 986 1086 1128 1157 1164 1256 1311 1312 1331 1355 1416 1465 1553 1650 1670 1691 1731 1733 1750 1840 1863 1981 2127 2137 2205 2259 2303 2304 2324 2333 2378 2379 2432 2532 2555 2557 2574 2579 2581 2667 2700 2885 2921 2926 2955 2960 2983 3072 3124 3142 3176 3282 3289 3303 3409 3420 3461 3579 3688 3693 3695 3708 3752 3783 3831 3853 3859 3960 3971 3993 4114 4220 4331 4340 4345 4381 4436 4488 4514 4575 4688 4708 4714 4750 4805 4858 4919 4950 29 111 128 160 231 283 302 627 761 994 1013 1088 1254 1689 1767 1781 2180 2211 2263 2384 2490 2619 2685 2977 3287 3607 3617 3764 3842 3853 4058 4627 4848 4921 ACCGCG/CGCGGT 0 -2 104 102 23 -13.4 24 181 250 305 361 416 422 500 585 598 610 665 687 730 764 784 800 939 940 1024 1039 1058 1066 1091 1110 1147 1347 1373 1374 1410 1461 1472 1478 1537 1554 1589 1708 1738 1747 1900 1996 2072 2190 2210 2211 2213 2215 2217 2365 2433 2453 2598 2602 2627 2632 2649 2680 2737 2742 2818 2822 2874 2885 2941 2974 3014 3016 3126 3210 3222 3260 3284 3304 3472 3506 3545 3568 3652 3679 3688 3751 3772 3901 3937 3990 4010 4035 4074 4078 4204 4238 4249 4321 4323 4337 4416 4455 4483 4538 4646 4783 4832 4835 4877 175 377 493 691 809 1283 1414 1457 1464 1489 1756 1781 1853 1913 2205 2367 2591 2759 3467 3505 3781 4035 4107 GCGGCA/TGCCGC 2 -4 97 101 20 -14.6 46 48 61 224 229 254 292 329 341 352 374 404 415 422 589 607 625 642 643 656 674 748 887 911 912 1022 1043 1164 1258 1311 1324 1361 1388 1390 1407 1416 1419 1549 1662 1722 1750 1870 1899 1917 1939 1951 1961 1970 2055 2161 2164 2170 2303 2333 2340 2347 2367 2464 2467 2515 2551 2568 2579 2849 2854 3009 3015 3023 3077 3140 3261 3516 3523 3600 3662 3744 3765 3770 3831 3849 3935 4010 4099 4148 4149 4220 4340 4368 4471 4526 4585 4654 4673 4688 4708 4734 4894 236 886 1103 1414 1599 1816 2051 2151 2656 2846 2847 3158 3369 3649 3758 3817 3894 4035 4386 4919 CCGCAC/GTGCGG 0 -1 91 94 19 -13.5 29 30 74 148 209 211 232 292 335 454 456 508 510 610 614 625 638 682 726 912 946 969 984 1045 1116 1174 1187 1192 1199 1231 1274 1302 1574 1582 1603 1647 1657 1706 1782 1842 1846 1860 1873 2070 2164 2203 2294 2333 2346 2357 2370 2371 2639 2653 2687 2827 2931 3087 3284 3336 3364 3485 3490 3540 3569 3571 3579 3667 3722 3821 3832 3892 4028 4060 4082 4099 4109 4172 4225 4229 4330 4360 4392 4430 4470 4549 4568 4578 4721 4775 4896 1168 1657 1666 1815 1859 1883 1955 2202 2219 2283 2414 2417 2419 2494 3683 4180 4295 4313 4369 CGCACC/GGTGCG 0 -5 90 92 26 -10.1 148 160 170 177 209 221 456 500 508 589 610 634 661 682 693 775 783 810 946 957 969 1045 1091 1140 1173 1174 1192 1273 1360 1373 1451 1519 1577 1582 1603 1624 1657 1706 1747 1842 1860 1880 1974 1998 2043 2099 2148 2164 2203 2294 2346 2357 2359 2368 2494 2552 2586 2596 2663 2668 2687 2766 2931 2933 3131 3242 3336 3485 3503 3540 3579 3667 3756 3801 3912 4078 4080 4082 4099 4192 4229 4263 4306 4392 4549 4578 4642 4679 4770 4859 258 322 733 1134 1168 1536 1657 1666 1859 1955 1958 2485 2486 2494 2571 2662 2757 2881 2934 3193 3519 3610 3629 3738 4567 4727 GGCGGG/CCCGCC 4 -1 83 85 27 -8.3 10 24 311 350 368 456 463 531 542 576 678 699 765 801 863 1021 1072 1084 1107 1138 1211 1288 1290 1363 1376 1391 1396 1413 1440 1467 1555 1582 1603 1644 1678 1755 1784 1791 1806 1834 1861 1964 2012 2035 2069 2125 2137 2195 2302 2368 2425 2498 2521 2539 2541 2928 3048 3213 3319 3358 3496 3602 3662 3716 3730 3782 3932 4129 4249 4273 4330 4381 4388 4497 4591 4600 4606 4607 4824 4839 4843 4866 4917 141 522 795 998 1313 1454 1455 1847 2092 2191 2240 2618 2625 3131 3369 3420 3540 3584 3589 3609 3695 3737 3934 4087 4131 4445 4868 TCGGCA/TGCCGA 2 -4 85 82 27 -7.8 18 169 180 216 251 327 446 484 618 683 883 884 986 997 1075 1082 1271 1397 1413 1437 1485 1503 1529 1544 1670 1827 1895 1911 1927 2043 2050 2293 2322 2327 2346 2356 2367 2490 2674 2763 2866 2914 2946 2960 3061 3064 3072 3176 3235 3289 3307 3353 3398 3447 3451 3452 3461 3540 3614 3669 3688 3692 3861 3971 3981 3990 3993 4037 4113 4356 4382 4482 4513 4581 4649 4668 4669 4687 4714 4716 4801 4804 4811 4903 4919 318 727 794 886 1009 1246 1502 1644 1670 1780 1902 2180 2348 2528 2607 2617 3114 3131 3252 3313 3744 3767 3912 4226 4360 4444 4628 CTGGCG/CGCCAG 4 -3 78 82 11 -15.1 22 25 96 103 139 160 202 204 229 254 500 513 521 523 586 594 634 674 737 782 815 851 873 892 1227 1277 1278 1363 1411 1430 1505 1555 1685 1719 1861 1894 1955 2041 2112 2209 2240 2270 2280 2435 2473 2514 2529 2568 2574 2596 2632 2647 2762 2781 2806 2865 3077 3184 3251 3297 3314 3358 3396 3602 3625 3638 3794 3865 3894 4002 4074 4372 4402 4591 4638 4789 4866 4935 673 819 1335 2023 2614 2684 3504 3543 4622 4987 4999 CCGGCA/TGCCGG 2 -4 79 76 21 -8.7 1 95 144 190 226 405 502 640 781 784 854 928 1097 1150 1218 1271 1453 1553 1572 1643 1655 1708 1771 1917 1947 2000 2062 2119 2121 2201 2245 2324 2353 2397 2509 2581 2618 2669 2958 2983 3006 3142 3281 3316 3321 3349 3368 3374 3400 3461 3508 3514 3605 3619 3627 3663 3766 3853 3877 3894 4054 4114 4244 4337 4355 4406 4440 4462 4487 4602 4618 4637 4685 4689 4746 4764 4843 4888 4943 17 621 747 1456 1881 1949 1996 2180 2292 2722 2744 3001 3201 3306 3571 3726 4231 4419 4705 4744 4857 CGGCAG/CTGCCG 2 -3 74 75 21 -8.5 18 61 180 190 224 324 329 345 642 643 784 863 875 878 997 1022 1043 1097 1214 1306 1324 1415 1481 1503 1572 1643 1662 1722 1895 1899 1927 2164 2170 2201 2293 2322 2346 2464 2467 2551 2674 2829 2849 2946 3015 3061 3146 3307 3321 3330 3348 3349 3353 3374 3523 3605 3700 3744 3766 3894 3918 3931 3935 4113 4244 4340 4404 4471 4526 4566 4581 4669 4687 4894 727 779 857 886 1245 1780 1996 2112 2151 2237 2348 2617 2652 3131 3158 3313 3591 3758 3817 4035 4231 TCCGCG/CGCGGA 0 -2 72 69 23 -6.6 154 277 455 622 625 658 724 784 821 895 1116 1198 1350 1373 1410 1443 1466 1468 1567 1569 1589 1640 1839 1890 1939 1964 2072 2089 2155 2190 2217 2327 2497 2559 2586 2608 2612 2656 2657 2659 2712 2768 2822 2845 2860 2864 3001 3038 3117 3124 3128 3177 3222 3290 3381 3408 3609 3706 3719 4095 4140 4204 4305 4324 4408 4481 4552 4615 4620 4754 4833 4905 66 399 480 513 945 1033 1154 1756 1922 1970 2132 2220 2353 2591 2807 3231 3488 3890 3925 4002 4035 4147 4615