#2904/2682 #34.60 # k-mer/r.c. Cluster Offset PosCt wPosCt NegCt HGP_10 CCACCG/CGGTGG 0 -3 549 479 43 -94.9 25 38 46 47 49 54 70 85 94 99 102 103 104 111 120 127 138 140 141 148 154 174 178 186 203 232 246 254 256 257 263 272 279 283 285 298 305 306 319 322 343 351 361 363 377 381 382 391 394 397 402 429 430 431 440 441 460 466 478 479 493 497 502 522 527 528 531 536 540 546 563 565 569 572 580 609 622 628 633 634 646 649 653 654 663 665 671 673 676 677 678 683 692 696 699 706 707 715 720 721 740 752 754 756 758 770 771 786 788 794 797 802 806 809 811 813 821 837 839 844 846 852 863 864 869 870 878 884 889 891 892 900 902 907 917 922 928 929 951 964 966 988 994 997 998 1002 1014 1022 1027 1029 1031 1039 1040 1041 1053 1055 1079 1085 1088 1092 1093 1095 1097 1098 1101 1104 1117 1123 1125 1138 1143 1147 1156 1157 1162 1171 1172 1173 1178 1180 1188 1191 1200 1204 1224 1227 1229 1242 1248 1250 1258 1273 1278 1279 1281 1289 1290 1292 1294 1295 1298 1306 1309 1314 1330 1335 1344 1350 1355 1362 1365 1370 1375 1380 1392 1394 1405 1406 1408 1411 1415 1416 1419 1422 1426 1436 1437 1457 1462 1466 1470 1476 1480 1485 1492 1493 1506 1507 1513 1514 1522 1526 1540 1541 1543 1548 1551 1554 1568 1573 1577 1587 1591 1595 1596 1608 1611 1612 1627 1628 1635 1640 1645 1655 1660 1666 1669 1684 1685 1686 1693 1694 1695 1696 1698 1699 1702 1703 1704 1705 1712 1713 1714 1715 1718 1719 1720 1721 1724 1727 1730 1738 1743 1744 1745 1751 1756 1759 1760 1763 1767 1772 1774 1777 1786 1787 1791 1794 1798 1803 1806 1823 1824 1827 1829 1833 1834 1835 1836 1846 1849 1854 1856 1865 1871 1873 1877 1878 1887 1895 1904 1907 1916 1917 1926 1930 1931 1935 1938 1939 1945 1953 1957 1958 1967 1975 1977 1985 1990 1998 2003 2004 2006 2010 2017 2024 2026 2033 2048 2053 2054 2060 2062 2063 2070 2077 2078 2083 2087 2088 2090 2097 2125 2133 2137 2140 2142 2144 2155 2161 2183 2187 2189 2190 2194 2199 2205 2206 2219 2220 2232 2234 2235 2237 2239 2249 2254 2256 2267 2269 2283 2284 2289 2290 2306 2310 2311 2316 2319 2325 2327 2328 2330 2333 2336 2339 2342 2343 2350 2354 2357 2366 2367 2370 2379 2381 2384 2408 2412 2414 2425 2429 2434 2452 2463 2467 2472 2473 2478 2492 2495 2498 2504 2508 2513 2521 2523 2530 2539 2546 2549 2550 2551 2552 2555 2562 2564 2565 2575 2577 2580 2582 2586 2588 2594 2596 2597 2599 2600 2601 2607 2610 2615 2621 2625 2644 2645 2657 2662 2672 2676 2678 2679 2681 2682 2683 2693 2694 2701 2707 2708 2711 2712 2714 2723 2724 2727 2734 2738 2739 2744 2746 2748 2749 2758 2764 2767 2770 2772 2777 2781 2782 2785 2786 2793 2795 2797 2799 2802 2809 2811 2816 2817 2818 2829 2831 2833 2835 2841 2850 2851 2855 2858 2860 2861 2862 2865 2869 2870 2876 2877 2878 2879 2880 2883 2885 2887 2898 2900 5 136 150 212 425 426 914 1068 1139 1140 1168 1223 1244 1245 1284 1303 1381 1394 1446 1526 1563 1656 1733 1736 1770 1835 1867 1893 1979 1999 2056 2111 2217 2242 2245 2382 2383 2384 2385 2454 2517 2631 2664 ACCGCC/GGCGGT 0 -4 388 375 42 -67.1 0 6 25 38 45 47 49 54 73 90 95 99 103 111 112 120 124 138 148 154 169 174 186 232 247 257 263 266 276 278 283 305 306 319 326 329 332 338 340 363 383 385 390 402 430 441 445 447 452 460 466 470 479 500 502 520 522 527 531 540 583 585 590 628 632 634 646 652 659 671 676 680 704 706 707 710 714 715 717 720 721 722 736 743 754 768 776 777 780 786 788 791 792 811 824 826 828 831 833 837 839 841 844 846 852 862 878 883 889 897 917 920 928 930 931 933 938 948 950 953 961 962 964 966 969 971 976 979 994 997 998 1001 1029 1037 1040 1041 1047 1051 1055 1061 1064 1079 1086 1088 1091 1092 1104 1121 1123 1124 1138 1139 1141 1149 1150 1153 1154 1156 1161 1167 1171 1177 1178 1192 1196 1214 1218 1224 1231 1232 1273 1278 1281 1292 1299 1302 1308 1316 1342 1350 1354 1355 1357 1360 1362 1365 1381 1383 1387 1390 1398 1407 1408 1415 1418 1419 1423 1425 1430 1432 1442 1456 1462 1463 1473 1474 1476 1479 1504 1522 1523 1554 1557 1559 1587 1595 1601 1604 1611 1616 1620 1636 1641 1647 1648 1659 1669 1675 1680 1685 1686 1687 1695 1705 1711 1712 1715 1718 1719 1729 1745 1747 1767 1772 1784 1787 1788 1816 1819 1821 1830 1856 1866 1871 1874 1876 1889 1894 1896 1902 1908 1909 1910 1928 1931 1932 1942 1947 1957 1969 1978 1980 1983 1994 1995 1998 1999 2004 2005 2007 2008 2018 2020 2033 2044 2050 2062 2065 2069 2070 2075 2082 2092 2107 2144 2147 2153 2171 2188 2190 2194 2204 2210 2215 2220 2231 2235 2250 2268 2269 2273 2282 2285 2309 2319 2320 2327 2328 2333 2339 2343 2346 2360 2366 2371 2372 2377 2387 2394 2402 2404 2411 2418 2420 2444 2453 2454 2466 2468 2472 2474 2500 2533 2545 2549 2563 2564 2579 2599 2604 2609 2610 2612 2629 2637 2646 2650 2654 2667 2676 2689 2691 2694 2711 2721 2730 2737 2745 2760 2761 2762 2764 2774 2775 2779 2780 2784 2793 2802 2814 2827 2829 2832 2871 2878 2884 2885 2893 149 180 230 332 425 426 486 502 524 664 766 1068 1139 1140 1147 1222 1244 1258 1385 1526 1573 1586 1607 1733 1780 1867 1868 1871 2090 2128 2139 2194 2248 2305 2382 2384 2385 2393 2454 2555 2560 2619 GGAGGA/TCCTCC 1 -2 394 365 112 -30.5 25 38 46 56 64 67 69 70 79 94 97 101 105 109 111 112 120 124 127 132 133 138 144 148 154 164 168 169 174 184 186 203 205 206 214 221 234 242 248 254 256 257 279 283 293 311 321 322 327 340 342 344 347 351 358 362 380 383 388 389 397 402 412 415 427 431 441 442 446 447 452 456 457 460 466 493 497 508 522 526 536 554 555 563 593 594 595 599 607 628 630 633 646 648 672 673 676 677 688 692 703 709 714 715 720 726 742 750 754 767 788 802 809 827 830 837 839 844 845 862 900 907 910 912 925 929 932 935 940 951 961 964 967 972 994 1001 1006 1018 1029 1040 1060 1061 1070 1075 1080 1086 1099 1101 1106 1111 1117 1120 1121 1123 1133 1136 1149 1153 1171 1172 1200 1204 1214 1222 1236 1239 1242 1245 1265 1268 1273 1285 1305 1318 1320 1323 1330 1331 1357 1368 1369 1382 1390 1398 1401 1424 1425 1428 1431 1455 1465 1475 1479 1487 1488 1491 1505 1512 1515 1516 1517 1537 1544 1547 1552 1554 1558 1572 1573 1576 1585 1596 1602 1618 1619 1632 1634 1638 1640 1660 1673 1679 1691 1700 1703 1706 1718 1719 1720 1732 1733 1748 1760 1791 1798 1800 1806 1807 1808 1809 1818 1820 1823 1840 1843 1859 1861 1867 1872 1878 1901 1903 1907 1919 1925 1941 1951 1957 1966 1978 2000 2001 2004 2015 2025 2027 2031 2041 2058 2059 2060 2070 2074 2079 2081 2084 2102 2110 2114 2121 2143 2148 2157 2159 2160 2165 2168 2190 2198 2208 2234 2238 2243 2249 2253 2254 2255 2259 2261 2275 2276 2280 2289 2301 2303 2304 2316 2321 2322 2323 2328 2336 2338 2343 2359 2360 2361 2383 2394 2408 2416 2417 2423 2425 2433 2446 2451 2459 2460 2462 2464 2476 2480 2486 2495 2496 2513 2514 2516 2521 2523 2529 2546 2548 2560 2564 2585 2586 2599 2607 2616 2619 2641 2652 2653 2656 2663 2665 2666 2674 2680 2681 2693 2703 2708 2718 2720 2723 2730 2734 2736 2740 2743 2746 2756 2763 2775 2789 2792 2794 2798 2801 2816 2826 2843 2849 2868 2874 2881 2882 2883 2885 2889 2891 0 102 122 127 135 166 253 259 261 402 419 422 425 426 434 445 476 488 490 500 504 505 509 524 533 563 586 602 620 628 648 675 688 717 726 765 767 792 800 891 941 943 994 995 1005 1024 1038 1064 1074 1083 1098 1100 1115 1121 1144 1226 1231 1238 1244 1321 1335 1341 1407 1444 1504 1558 1568 1572 1600 1605 1635 1656 1704 1713 1740 1759 1815 1826 1852 1867 1892 1937 1988 1990 2025 2128 2162 2229 2283 2304 2305 2306 2307 2314 2383 2407 2412 2453 2472 2473 2477 2478 2479 2480 2489 2498 2561 2595 2596 2609 2632 2640 CACCGC/GCGGTG 0 -2 385 349 45 -58.2 25 38 45 47 49 54 70 74 99 103 111 120 124 127 138 140 148 154 169 172 174 177 186 209 217 230 232 246 247 257 263 283 306 319 323 338 340 351 382 383 385 402 430 441 445 447 460 466 470 479 502 520 522 527 528 531 540 563 577 580 598 604 628 632 633 634 646 648 652 654 671 673 676 692 706 707 710 714 715 720 721 752 754 756 771 786 788 791 794 800 810 811 828 831 833 835 837 839 844 846 852 865 878 882 889 891 892 896 910 917 920 924 928 929 930 934 953 958 962 964 966 969 989 994 997 998 1001 1013 1024 1025 1026 1029 1031 1040 1041 1043 1049 1051 1064 1068 1073 1079 1086 1088 1091 1092 1104 1121 1123 1138 1143 1150 1153 1156 1157 1171 1177 1194 1200 1214 1217 1224 1256 1268 1273 1278 1281 1292 1295 1298 1302 1309 1312 1337 1350 1351 1355 1357 1362 1364 1365 1375 1383 1387 1394 1397 1408 1410 1413 1415 1418 1419 1421 1432 1436 1456 1460 1461 1463 1471 1472 1473 1474 1476 1479 1480 1485 1523 1533 1535 1536 1538 1539 1554 1559 1561 1570 1573 1577 1587 1595 1609 1611 1616 1627 1631 1636 1641 1645 1655 1660 1685 1695 1705 1712 1713 1715 1718 1719 1730 1736 1745 1765 1767 1772 1787 1795 1803 1813 1816 1817 1823 1829 1856 1864 1871 1874 1877 1881 1887 1894 1900 1907 1909 1913 1916 1930 1931 1945 1957 1958 1967 1969 1979 1980 1990 1998 2004 2007 2008 2018 2028 2033 2048 2062 2065 2068 2069 2070 2071 2075 2083 2097 2125 2135 2144 2154 2157 2164 2171 2190 2194 2204 2210 2220 2223 2230 2231 2234 2235 2237 2242 2250 2264 2269 2270 2283 2298 2310 2313 2319 2321 2327 2328 2330 2333 2334 2339 2342 2343 2354 2357 2366 2367 2385 2387 2420 2472 2498 2533 2546 2549 2551 2564 2588 2599 2604 2610 2612 2615 2625 2632 2634 2636 2676 2681 2692 2694 2711 2723 2727 2732 2744 2745 2748 2755 2764 2773 2774 2775 2779 2780 2786 2793 2802 2811 2815 2825 2829 2831 2850 2860 2870 2878 2886 24 26 94 136 149 150 201 212 400 425 426 746 753 766 783 914 1016 1068 1115 1140 1147 1244 1258 1526 1558 1586 1595 1771 1867 1871 1979 2090 2139 2205 2380 2382 2384 2385 2454 2506 2518 2538 2555 2611 2631 ACCACC/GGTGGT 0 -4 368 342 90 -33.9 25 38 45 46 47 49 54 57 62 64 70 79 94 95 99 101 105 111 114 124 130 132 140 141 144 148 154 155 162 163 169 184 195 237 241 246 254 256 264 269 283 284 285 288 305 306 319 336 343 351 366 371 381 382 397 402 430 440 452 466 470 478 479 510 522 527 528 531 536 540 546 561 569 595 607 622 628 632 633 634 646 654 665 666 671 678 699 706 707 714 715 719 720 721 722 740 745 746 752 753 754 756 760 761 788 821 822 835 843 852 858 864 869 889 900 901 902 903 929 933 957 964 966 988 993 997 998 1027 1039 1040 1041 1074 1085 1088 1089 1092 1093 1098 1117 1121 1125 1133 1147 1156 1171 1172 1178 1221 1227 1242 1247 1256 1286 1289 1295 1306 1314 1322 1330 1335 1353 1354 1355 1362 1365 1378 1384 1390 1392 1406 1408 1409 1419 1426 1436 1475 1476 1485 1488 1489 1492 1493 1496 1506 1512 1516 1526 1544 1548 1577 1587 1591 1595 1612 1613 1628 1631 1635 1637 1640 1655 1660 1666 1686 1689 1691 1693 1695 1698 1699 1703 1704 1714 1720 1721 1724 1738 1744 1745 1748 1750 1756 1759 1763 1767 1772 1783 1786 1794 1804 1823 1824 1829 1834 1835 1836 1845 1846 1849 1856 1865 1876 1883 1895 1903 1904 1923 1931 1935 1939 1953 1959 1975 1977 1990 1998 2006 2012 2014 2017 2018 2033 2050 2060 2068 2073 2075 2087 2088 2090 2097 2111 2116 2157 2197 2200 2206 2220 2223 2225 2227 2228 2238 2242 2249 2267 2269 2275 2285 2290 2307 2311 2316 2320 2325 2328 2330 2357 2363 2368 2374 2379 2384 2385 2399 2402 2405 2408 2434 2446 2467 2473 2492 2501 2508 2519 2546 2552 2559 2575 2580 2582 2585 2586 2594 2596 2597 2600 2610 2615 2620 2641 2672 2679 2680 2682 2693 2707 2708 2711 2714 2722 2723 2724 2727 2731 2734 2738 2740 2744 2749 2764 2767 2772 2777 2782 2795 2799 2817 2818 2839 2858 2878 2879 2880 2883 2887 2900 5 10 22 27 28 72 90 135 200 235 283 385 388 419 425 426 489 601 720 767 816 819 842 1059 1060 1068 1088 1100 1132 1134 1140 1168 1174 1179 1223 1244 1245 1291 1369 1382 1383 1394 1430 1446 1461 1479 1526 1564 1565 1586 1602 1607 1635 1733 1736 1756 1825 1837 1840 1875 1902 1984 1985 1991 1992 1995 1996 2053 2054 2058 2064 2141 2210 2266 2304 2306 2307 2381 2382 2383 2385 2403 2477 2478 2480 2498 2525 2559 2560 2664 TCCACC/GGTGGA 0 -4 363 337 96 -30.7 25 38 46 47 49 54 64 70 79 94 95 99 101 105 111 120 124 126 132 138 144 148 154 156 163 169 174 178 203 206 228 229 254 256 257 264 272 280 283 295 306 319 337 361 377 380 397 400 402 417 429 430 441 452 454 466 479 493 497 502 522 526 527 528 531 536 550 551 554 562 563 565 570 572 590 595 628 630 632 633 634 646 657 663 673 676 693 699 711 715 718 720 721 722 726 754 756 758 761 767 770 788 797 809 811 813 822 830 837 839 843 844 863 877 878 900 902 905 907 917 951 964 965 990 993 994 995 998 1002 1006 1016 1020 1022 1029 1041 1069 1088 1089 1104 1106 1116 1117 1123 1124 1125 1132 1143 1149 1156 1159 1162 1171 1172 1177 1180 1209 1214 1224 1245 1257 1258 1283 1294 1296 1298 1310 1344 1370 1375 1380 1394 1401 1408 1416 1422 1436 1438 1444 1457 1462 1466 1470 1475 1478 1479 1488 1496 1507 1512 1513 1514 1540 1541 1543 1548 1554 1558 1568 1573 1575 1596 1611 1613 1645 1660 1669 1676 1691 1696 1698 1700 1702 1706 1718 1719 1720 1721 1727 1730 1742 1745 1751 1760 1763 1772 1774 1777 1787 1791 1794 1798 1803 1806 1823 1827 1834 1845 1852 1873 1878 1907 1908 1916 1917 1930 1938 1939 1957 1960 1967 1977 1985 1988 1991 1994 1995 1998 2004 2010 2024 2027 2048 2054 2057 2062 2066 2070 2083 2087 2090 2099 2114 2125 2144 2155 2157 2161 2187 2189 2190 2202 2217 2238 2249 2254 2256 2272 2275 2283 2284 2289 2291 2306 2307 2319 2320 2325 2333 2336 2339 2342 2356 2358 2367 2381 2412 2414 2425 2429 2434 2452 2463 2478 2498 2513 2521 2539 2550 2565 2576 2580 2585 2594 2600 2607 2617 2625 2634 2644 2657 2662 2676 2681 2683 2693 2699 2701 2723 2738 2748 2772 2781 2785 2793 2797 2802 2809 2816 2817 2818 2829 2831 2833 2850 2855 2861 2870 2875 2878 2879 2880 2884 2885 4 16 25 28 68 69 72 102 150 165 184 212 388 425 426 440 450 487 563 565 599 602 628 661 665 684 721 812 816 848 861 963 987 1031 1047 1054 1061 1076 1086 1139 1199 1226 1244 1291 1341 1382 1422 1493 1528 1563 1565 1567 1586 1592 1611 1638 1665 1706 1835 1839 1840 1852 1894 1947 1996 2006 2033 2111 2205 2210 2217 2245 2271 2304 2305 2306 2349 2355 2381 2382 2383 2384 2385 2399 2407 2454 2477 2478 2484 2517 2613 2628 2632 2642 2665 2681 CCGCCG/CGGCGG 0 -3 349 317 33 -58.2 0 51 54 90 99 101 103 120 138 148 160 162 168 169 173 208 220 229 234 247 256 276 278 283 294 319 329 333 338 340 363 391 392 430 441 445 447 456 463 493 502 522 527 530 561 564 565 584 585 594 595 597 630 659 663 680 686 695 704 705 706 707 715 717 720 722 726 776 777 780 783 805 834 844 849 878 883 890 897 907 941 945 962 967 985 994 998 1004 1018 1029 1030 1033 1040 1047 1048 1051 1055 1064 1075 1086 1096 1097 1106 1117 1147 1150 1153 1154 1156 1171 1175 1178 1189 1196 1199 1214 1221 1224 1230 1244 1247 1252 1267 1273 1276 1281 1288 1329 1331 1333 1335 1342 1354 1355 1359 1360 1371 1393 1397 1399 1408 1441 1455 1456 1462 1464 1479 1485 1504 1505 1508 1513 1541 1544 1545 1554 1564 1570 1572 1598 1601 1602 1604 1610 1616 1620 1630 1632 1638 1641 1647 1648 1649 1657 1669 1672 1685 1686 1693 1712 1715 1719 1732 1735 1749 1784 1785 1787 1797 1798 1801 1808 1821 1830 1832 1858 1861 1874 1897 1902 1909 1920 1923 1925 1929 1942 1944 1947 1954 1963 1969 1972 1994 1998 2000 2008 2027 2037 2051 2057 2058 2065 2066 2069 2070 2072 2073 2074 2075 2092 2095 2103 2109 2115 2132 2134 2146 2148 2154 2163 2171 2194 2215 2231 2235 2238 2272 2274 2275 2276 2279 2280 2294 2299 2300 2307 2308 2316 2319 2333 2338 2343 2345 2361 2370 2371 2372 2376 2380 2389 2394 2397 2398 2404 2405 2407 2409 2445 2454 2459 2488 2494 2499 2500 2509 2513 2519 2542 2552 2554 2556 2558 2559 2564 2566 2574 2583 2588 2590 2607 2612 2615 2619 2629 2635 2643 2659 2665 2666 2676 2680 2688 2689 2690 2691 2694 2698 2711 2720 2721 2726 2728 2735 2736 2763 2766 2779 2780 2789 2793 2798 2802 2804 2829 2832 2834 2837 2843 2848 2859 2866 2870 2874 2878 2880 2881 2885 2887 2893 136 180 404 419 425 524 688 1000 1064 1525 1530 1607 1727 1741 1750 1829 1867 1893 2034 2139 2204 2261 2271 2302 2304 2366 2382 2393 2443 2453 2489 2517 2629 CCGCCA/TGGCGG 0 -3 342 311 44 -49.2 6 25 38 47 64 73 90 99 103 111 112 120 133 138 148 154 163 168 169 186 208 228 232 256 263 266 282 283 302 306 362 394 422 430 441 448 454 459 479 500 501 502 504 527 531 540 561 567 578 583 590 594 595 599 628 632 634 646 657 664 671 676 677 704 706 710 720 721 722 724 768 777 811 824 828 833 838 839 841 844 852 862 864 871 872 875 889 890 897 899 917 930 931 933 938 948 949 964 971 979 997 1004 1021 1040 1041 1042 1061 1064 1079 1088 1091 1092 1104 1107 1111 1121 1124 1128 1132 1134 1141 1149 1159 1161 1167 1177 1192 1194 1218 1224 1232 1241 1258 1273 1280 1290 1299 1308 1320 1328 1346 1350 1365 1371 1373 1376 1382 1387 1389 1390 1395 1398 1407 1408 1419 1429 1434 1443 1451 1473 1475 1476 1482 1486 1492 1513 1520 1522 1523 1539 1572 1587 1595 1611 1631 1641 1675 1681 1682 1687 1693 1705 1707 1715 1722 1747 1767 1798 1803 1816 1818 1819 1821 1856 1857 1876 1880 1889 1896 1899 1910 1923 1931 1944 1945 1947 1949 1969 1980 1983 1998 1999 2001 2004 2013 2018 2020 2024 2033 2036 2050 2059 2086 2091 2097 2102 2112 2113 2117 2128 2140 2142 2146 2147 2151 2163 2171 2186 2193 2204 2210 2220 2236 2244 2245 2257 2261 2269 2273 2285 2297 2303 2309 2311 2312 2319 2323 2327 2328 2339 2349 2359 2360 2361 2370 2374 2377 2382 2383 2387 2389 2394 2405 2407 2411 2418 2427 2432 2434 2437 2441 2454 2457 2458 2466 2472 2479 2483 2491 2493 2495 2519 2533 2552 2556 2558 2560 2561 2562 2563 2566 2576 2579 2588 2598 2599 2605 2607 2610 2616 2618 2630 2631 2637 2646 2647 2649 2654 2655 2669 2673 2687 2694 2716 2723 2736 2760 2761 2762 2764 2778 2780 2827 2849 2852 2854 2859 2862 2871 2893 2896 2899 149 230 332 404 425 426 507 766 772 1020 1068 1093 1147 1150 1173 1222 1258 1293 1458 1539 1733 1780 1806 1829 1843 1867 1868 1922 1983 2000 2002 2051 2230 2248 2305 2306 2381 2384 2385 2416 2454 2555 2560 2588 TCCGCC/GGCGGA 0 -4 321 304 35 -53.4 0 4 64 69 70 90 95 99 101 133 138 148 154 163 168 173 186 208 218 220 228 234 282 283 298 322 325 331 336 358 362 385 391 394 447 448 456 460 463 491 493 504 518 531 561 572 584 592 594 595 597 630 656 657 686 706 714 720 722 724 761 777 778 824 834 838 839 844 849 871 872 897 900 907 917 935 941 945 949 964 967 970 975 978 985 986 994 1001 1004 1018 1033 1040 1047 1048 1060 1070 1075 1079 1096 1097 1106 1111 1117 1119 1128 1134 1153 1159 1168 1175 1220 1230 1244 1247 1258 1266 1273 1276 1282 1288 1290 1320 1328 1331 1343 1346 1350 1359 1373 1376 1382 1393 1399 1429 1443 1455 1457 1475 1479 1482 1501 1509 1520 1544 1554 1555 1564 1568 1570 1572 1586 1589 1602 1611 1638 1677 1682 1706 1707 1732 1735 1749 1760 1761 1767 1789 1808 1818 1851 1857 1858 1861 1880 1892 1897 1899 1920 1923 1925 1929 1944 1947 1949 1956 1958 1969 1972 2000 2013 2020 2023 2027 2036 2046 2057 2058 2059 2066 2067 2070 2072 2074 2086 2091 2095 2097 2101 2102 2103 2109 2111 2112 2115 2117 2128 2132 2140 2142 2143 2148 2151 2236 2244 2246 2257 2261 2276 2279 2280 2288 2294 2297 2300 2303 2308 2315 2316 2328 2338 2343 2349 2358 2359 2361 2368 2376 2382 2383 2398 2399 2405 2407 2409 2413 2415 2417 2427 2428 2430 2434 2437 2446 2457 2458 2465 2479 2491 2494 2495 2512 2513 2519 2538 2542 2552 2556 2557 2558 2559 2560 2561 2562 2564 2566 2599 2603 2607 2626 2631 2635 2643 2659 2665 2669 2680 2687 2690 2717 2720 2723 2726 2729 2730 2740 2763 2764 2766 2789 2798 2808 2837 2839 2846 2852 2853 2859 2866 2874 2881 2887 2893 136 419 425 688 1000 1020 1064 1130 1150 1173 1192 1245 1434 1458 1525 1530 1736 1741 1750 1768 1867 2034 2051 2204 2267 2271 2304 2305 2306 2366 2384 2416 2453 2454 2619 CCTCCG/CGGAGG 0 -3 337 291 37 -48.7 25 54 69 70 95 99 101 133 138 144 148 163 168 205 208 228 240 248 257 263 279 283 292 293 322 327 342 358 383 385 413 415 441 443 456 463 493 506 521 531 536 543 555 561 593 594 595 597 598 606 615 630 633 667 672 676 677 703 714 720 722 742 750 767 777 780 821 827 831 844 869 877 897 906 907 917 925 927 935 940 981 994 1001 1008 1015 1018 1040 1041 1054 1060 1070 1084 1101 1106 1111 1131 1134 1136 1143 1147 1153 1171 1175 1219 1236 1239 1247 1260 1265 1268 1269 1285 1305 1323 1331 1335 1339 1350 1357 1367 1368 1428 1431 1451 1455 1475 1487 1512 1515 1516 1517 1544 1552 1554 1558 1564 1568 1572 1576 1581 1585 1596 1602 1611 1613 1618 1631 1632 1634 1640 1661 1662 1667 1673 1703 1706 1717 1718 1719 1732 1742 1748 1749 1766 1767 1769 1782 1796 1807 1808 1809 1818 1820 1822 1823 1840 1843 1861 1866 1867 1872 1888 1891 1892 1903 1919 1934 1941 1950 1952 1956 1972 1973 1981 1995 2000 2020 2025 2031 2036 2038 2041 2043 2045 2049 2058 2059 2070 2074 2079 2081 2097 2102 2111 2114 2116 2121 2131 2132 2143 2148 2150 2159 2160 2162 2165 2166 2168 2177 2184 2185 2198 2200 2203 2207 2208 2216 2217 2227 2229 2238 2243 2253 2259 2261 2280 2289 2297 2303 2304 2316 2322 2328 2338 2343 2351 2352 2358 2359 2360 2361 2365 2366 2383 2385 2398 2415 2416 2417 2423 2433 2443 2446 2451 2460 2480 2486 2495 2496 2513 2514 2516 2517 2519 2521 2529 2548 2549 2552 2561 2564 2565 2585 2586 2599 2600 2607 2611 2635 2642 2656 2660 2664 2665 2670 2674 2680 2690 2701 2708 2718 2723 2730 2739 2740 2743 2750 2756 2763 2764 2783 2788 2789 2791 2792 2798 2803 2808 2811 2816 2826 2841 2847 2857 2874 2880 2882 0 425 570 580 675 688 767 800 981 995 1022 1038 1064 1100 1169 1173 1244 1245 1335 1498 1572 1579 1656 1749 1759 1867 1937 1988 1995 2124 2128 2283 2304 2307 2362 2453 2485 AGGAGG/CCTCCT 1 -3 271 280 86 -23.3 0 25 46 56 67 69 70 75 79 109 111 112 120 124 127 132 138 140 144 148 154 163 164 168 169 174 184 186 195 203 206 214 219 234 250 254 256 257 258 283 300 305 311 318 321 322 325 327 344 347 351 355 358 366 383 388 389 397 402 412 428 431 432 441 445 446 447 452 457 460 463 466 493 501 508 519 522 536 554 595 599 628 630 633 646 648 661 688 692 709 714 715 720 743 754 767 788 827 830 837 839 841 844 891 900 907 910 929 936 961 964 966 969 994 997 1001 1006 1011 1013 1018 1029 1057 1061 1070 1074 1075 1086 1099 1103 1111 1117 1120 1121 1123 1133 1155 1156 1171 1192 1200 1239 1242 1245 1285 1318 1330 1331 1341 1355 1368 1382 1390 1434 1443 1465 1475 1479 1480 1488 1505 1512 1516 1537 1544 1558 1572 1573 1576 1585 1596 1619 1638 1640 1674 1679 1691 1700 1706 1718 1748 1764 1772 1780 1791 1798 1800 1808 1823 1840 1861 1901 1907 1916 1919 1931 1950 1951 1957 1978 2001 2004 2027 2031 2051 2070 2074 2084 2110 2134 2143 2157 2158 2190 2191 2244 2249 2259 2275 2276 2286 2289 2298 2301 2304 2307 2313 2316 2323 2327 2328 2359 2384 2394 2401 2425 2442 2464 2476 2513 2546 2557 2564 2585 2586 2599 2607 2612 2616 2625 2656 2665 2666 2674 2687 2693 2703 2720 2723 2734 2736 2775 2794 2798 2801 2808 2826 2837 2849 2866 2878 2895 122 135 166 253 259 261 273 402 419 425 426 428 437 445 449 476 488 504 505 531 568 575 585 620 717 726 847 891 1005 1024 1059 1074 1083 1098 1154 1164 1190 1225 1226 1227 1231 1235 1244 1286 1341 1504 1558 1568 1645 1649 1704 1740 1768 1803 1814 1826 1852 1867 1892 1937 1977 1990 2025 2162 2174 2275 2304 2305 2306 2307 2351 2357 2383 2407 2412 2472 2473 2477 2478 2479 2480 2489 2561 2609 2612 2640 CGCCGC/GCGGCG 0 -2 278 252 23 -48.6 0 48 90 99 103 120 138 168 169 173 180 185 199 208 220 229 245 256 276 283 333 391 392 430 431 444 447 448 450 463 479 502 521 522 527 565 569 584 594 595 600 630 659 663 680 695 704 705 707 715 722 780 783 819 844 880 897 926 931 945 962 994 1000 1004 1033 1040 1048 1056 1075 1079 1107 1150 1153 1154 1156 1175 1183 1186 1194 1196 1204 1216 1222 1224 1237 1244 1247 1252 1276 1281 1304 1329 1335 1358 1371 1374 1377 1397 1408 1433 1446 1455 1479 1485 1489 1492 1504 1505 1541 1544 1545 1547 1564 1570 1572 1580 1601 1602 1620 1632 1638 1641 1644 1657 1686 1691 1708 1710 1712 1715 1719 1732 1749 1757 1761 1770 1783 1785 1798 1801 1821 1830 1832 1861 1862 1864 1879 1907 1923 1942 1944 1947 1950 1951 1954 1955 1969 1972 1986 1998 2001 2008 2024 2027 2029 2064 2066 2072 2073 2074 2076 2085 2092 2095 2118 2120 2139 2149 2154 2163 2171 2193 2194 2213 2231 2238 2252 2260 2274 2275 2280 2294 2299 2306 2307 2327 2329 2330 2337 2338 2343 2345 2361 2370 2374 2376 2389 2393 2394 2396 2397 2398 2404 2405 2407 2422 2445 2454 2455 2459 2488 2499 2509 2513 2519 2537 2552 2556 2558 2564 2583 2588 2607 2615 2635 2641 2643 2652 2663 2665 2666 2670 2671 2676 2686 2688 2691 2698 2711 2713 2716 2721 2722 2726 2728 2735 2736 2752 2758 2763 2765 2766 2768 2793 2801 2802 2804 2832 2834 2843 2848 2866 2870 2874 2878 2880 2881 2893 136 404 507 605 1040 1257 1525 1727 1741 1750 1829 1867 1893 1922 1983 2204 2271 2366 2381 2382 2489 2517 2629 CCGCCT/AGGCGG 0 -3 278 244 24 -45.7 45 48 49 69 95 99 124 148 154 168 174 180 208 218 247 257 260 283 305 315 322 325 326 332 336 355 358 383 385 402 444 452 460 463 466 470 479 491 518 520 522 531 569 592 595 597 632 656 669 708 714 715 721 736 743 754 761 777 778 780 786 788 819 824 826 831 837 900 910 917 923 931 935 950 953 961 964 966 970 982 994 997 1001 1019 1040 1041 1059 1070 1075 1119 1123 1138 1139 1150 1153 1156 1168 1201 1205 1231 1255 1266 1282 1287 1290 1302 1316 1338 1348 1350 1357 1358 1362 1397 1415 1418 1423 1432 1442 1446 1457 1463 1479 1484 1485 1522 1537 1555 1557 1559 1568 1580 1586 1589 1629 1636 1641 1659 1665 1671 1677 1680 1682 1685 1718 1745 1749 1760 1761 1767 1772 1776 1785 1789 1851 1866 1868 1871 1888 1892 1894 1908 1928 1931 1932 1940 1951 1954 1956 1957 1958 1969 1978 1995 2005 2007 2020 2023 2044 2046 2057 2062 2064 2067 2070 2082 2084 2089 2101 2107 2120 2143 2144 2145 2153 2154 2156 2181 2188 2190 2197 2238 2258 2268 2282 2288 2292 2303 2306 2315 2320 2328 2331 2343 2346 2358 2366 2368 2378 2397 2402 2413 2415 2417 2420 2427 2430 2444 2445 2446 2453 2465 2468 2474 2486 2489 2512 2513 2538 2545 2549 2557 2564 2599 2603 2604 2609 2610 2613 2626 2641 2650 2653 2670 2690 2720 2721 2723 2726 2729 2730 2737 2740 2763 2765 2774 2784 2793 2804 2808 2839 2842 2846 2853 2856 2892 2893 2902 426 915 1130 1139 1140 1192 1244 1245 1270 1385 1434 1586 1718 1736 1768 1871 2128 2173 2204 2256 2318 2453 2454 2661 GCCACC/GGTGGC 0 -4 241 237 39 -34.2 6 11 25 38 49 64 70 90 99 103 112 127 154 163 173 186 218 232 235 263 266 282 284 322 363 394 402 422 430 431 448 456 460 462 502 522 527 528 546 552 563 569 580 595 609 628 632 633 634 646 649 671 683 692 699 707 719 721 754 762 771 786 794 806 811 844 864 869 878 884 889 892 897 902 903 922 929 933 964 1014 1020 1022 1040 1041 1053 1079 1097 1101 1111 1133 1173 1188 1224 1232 1281 1290 1309 1317 1323 1340 1345 1350 1373 1382 1408 1411 1415 1434 1437 1473 1476 1480 1516 1520 1522 1551 1556 1572 1587 1591 1595 1608 1611 1613 1623 1631 1655 1682 1684 1693 1695 1704 1705 1712 1713 1715 1721 1743 1748 1750 1820 1833 1854 1856 1857 1871 1877 1887 1916 1926 1931 1945 1958 1969 1990 1998 2001 2003 2004 2033 2035 2036 2051 2060 2062 2063 2065 2078 2093 2097 2104 2116 2133 2137 2140 2142 2146 2172 2181 2183 2194 2199 2205 2219 2234 2235 2239 2269 2297 2303 2319 2327 2350 2354 2360 2366 2370 2374 2381 2382 2384 2401 2402 2472 2473 2495 2504 2508 2519 2523 2536 2549 2552 2555 2556 2562 2564 2588 2599 2601 2607 2610 2621 2637 2641 2645 2694 2710 2712 2723 2746 2770 2786 2800 2813 2851 2860 2862 2865 2869 2877 33 136 345 425 426 513 566 623 740 911 913 914 941 1090 1093 1123 1173 1228 1284 1301 1303 1338 1365 1381 1607 1625 1770 1867 1979 2064 2140 2143 2242 2249 2307 2384 2525 2528 2560 CTCCGC/GCGGAG 0 -5 251 233 38 -33.8 0 69 70 86 95 99 101 133 134 138 148 154 163 168 208 220 228 283 292 293 322 327 358 385 413 443 456 460 463 493 521 531 561 584 593 594 595 597 615 630 638 656 677 695 707 714 720 722 761 777 831 837 839 844 897 907 917 935 945 970 981 994 1001 1002 1040 1060 1070 1075 1096 1106 1111 1117 1119 1134 1153 1171 1175 1217 1219 1222 1239 1244 1247 1268 1282 1285 1288 1320 1331 1343 1357 1359 1376 1382 1399 1428 1429 1451 1455 1457 1475 1482 1520 1544 1552 1554 1556 1558 1564 1568 1572 1602 1611 1638 1662 1670 1682 1703 1706 1732 1749 1765 1769 1796 1808 1812 1818 1857 1858 1861 1888 1892 1919 1920 1929 1947 1949 1950 1956 1958 1969 1972 1995 2020 2027 2036 2058 2059 2070 2072 2074 2081 2085 2086 2095 2097 2101 2102 2111 2115 2132 2140 2142 2143 2148 2159 2160 2184 2185 2194 2201 2222 2246 2259 2261 2276 2280 2300 2303 2308 2315 2316 2328 2338 2343 2349 2358 2359 2361 2376 2382 2383 2398 2399 2409 2415 2417 2428 2431 2434 2446 2465 2486 2495 2496 2512 2513 2519 2523 2529 2542 2552 2556 2557 2558 2564 2566 2586 2599 2607 2611 2631 2635 2659 2664 2665 2667 2680 2687 2690 2708 2720 2723 2730 2734 2740 2763 2764 2766 2769 2788 2789 2798 2808 2826 2837 2847 2866 2874 2878 2887 137 256 297 419 425 624 675 677 812 861 995 1064 1068 1173 1192 1245 1253 1325 1434 1444 1458 1530 1572 1741 1750 1774 1828 1867 1979 2266 2271 2304 2305 2306 2362 2384 2453 2454 AACCGC/GCGGTT 0 -5 222 220 50 -25.0 17 23 24 33 34 42 55 73 90 95 103 142 196 197 200 201 230 243 244 270 278 305 317 324 332 358 376 423 460 469 480 499 500 502 503 527 585 590 623 680 689 704 722 723 746 747 768 776 780 792 799 823 826 837 861 898 911 917 931 938 969 971 1037 1055 1061 1065 1066 1076 1102 1109 1110 1138 1139 1141 1149 1154 1156 1158 1167 1178 1195 1196 1218 1231 1232 1238 1299 1308 1342 1347 1369 1381 1390 1407 1417 1423 1442 1462 1463 1477 1483 1504 1554 1571 1580 1611 1615 1620 1645 1647 1659 1669 1680 1686 1687 1712 1734 1750 1761 1777 1788 1811 1819 1821 1830 1834 1841 1876 1889 1896 1902 1905 1908 1910 1914 1921 1932 1942 1943 1944 1961 1969 1983 1995 1999 2005 2012 2020 2044 2050 2075 2082 2092 2101 2127 2176 2178 2181 2188 2215 2230 2232 2240 2253 2262 2267 2273 2285 2309 2319 2320 2326 2334 2346 2360 2371 2372 2377 2382 2395 2402 2404 2412 2418 2434 2444 2453 2466 2472 2474 2483 2484 2536 2537 2545 2622 2629 2640 2646 2650 2654 2656 2667 2691 2704 2721 2730 2737 2762 2768 2804 2813 2814 2819 2827 2832 2839 2840 2868 2874 2893 2897 39 146 172 180 230 315 320 328 332 338 363 368 386 486 502 711 954 969 971 1037 1123 1139 1222 1385 1413 1414 1419 1573 1607 1648 1688 1780 1868 1890 1993 2050 2075 2081 2128 2157 2194 2248 2324 2341 2342 2346 2378 2395 2619 2628 GCCGCC/GGCGGC 0 -4 253 214 30 -34.0 48 90 99 103 120 138 160 168 169 180 208 220 228 229 256 283 294 333 392 430 444 447 459 463 479 502 522 530 565 567 569 594 595 599 663 669 680 695 704 705 715 726 780 783 805 811 819 864 890 897 899 931 982 994 1004 1019 1030 1040 1041 1042 1059 1075 1107 1132 1150 1156 1189 1194 1199 1201 1205 1221 1224 1241 1242 1267 1276 1280 1281 1287 1329 1333 1358 1371 1374 1389 1390 1395 1397 1434 1441 1446 1451 1464 1479 1485 1492 1505 1508 1513 1522 1537 1544 1545 1564 1570 1572 1580 1598 1610 1620 1629 1630 1631 1632 1638 1641 1649 1657 1672 1681 1685 1693 1695 1708 1715 1749 1772 1776 1785 1797 1798 1801 1808 1821 1861 1885 1918 1923 1942 1944 1945 1947 1951 1954 1969 1998 2001 2024 2037 2051 2064 2073 2089 2113 2120 2145 2146 2154 2156 2163 2171 2181 2186 2193 2197 2238 2247 2272 2292 2299 2303 2306 2307 2311 2323 2331 2343 2345 2361 2370 2374 2376 2378 2380 2389 2394 2397 2404 2405 2407 2432 2445 2454 2459 2483 2486 2488 2489 2493 2499 2509 2510 2513 2519 2534 2552 2554 2558 2583 2588 2607 2613 2615 2618 2619 2641 2647 2649 2653 2655 2666 2670 2673 2676 2688 2691 2698 2716 2721 2726 2728 2735 2736 2763 2765 2766 2778 2793 2834 2842 2843 2848 2849 2854 2856 2859 2862 2866 2870 2893 2896 2899 251 404 507 605 649 915 1270 1539 1573 1718 1727 1806 1829 1843 1867 1922 2000 2173 2204 2256 2282 2302 2318 2381 2382 2443 2489 2588 2629 2661 CGCCGT/ACGGCG 0 -2 234 200 37 -26.8 51 54 60 160 162 164 182 193 203 214 276 278 319 334 338 367 392 427 441 445 456 493 498 530 532 542 555 561 564 565 585 597 654 658 663 680 686 701 706 711 713 726 771 776 777 783 794 869 878 890 907 913 972 994 1018 1029 1030 1047 1051 1080 1084 1086 1087 1094 1096 1097 1117 1125 1142 1144 1171 1176 1193 1202 1209 1214 1221 1224 1233 1241 1244 1259 1261 1264 1271 1305 1326 1331 1333 1342 1351 1354 1356 1359 1375 1435 1438 1464 1478 1490 1518 1524 1527 1544 1550 1554 1565 1572 1584 1592 1597 1598 1610 1641 1647 1649 1656 1672 1693 1700 1701 1715 1756 1781 1790 1793 1797 1815 1827 1829 1838 1841 1846 1858 1861 1874 1897 1901 1902 1906 1909 1924 1947 1952 1961 1985 1991 2000 2019 2021 2057 2065 2069 2070 2075 2092 2100 2103 2115 2119 2131 2148 2152 2180 2182 2212 2218 2220 2235 2239 2248 2251 2265 2272 2276 2279 2286 2292 2299 2332 2362 2371 2373 2380 2394 2398 2400 2401 2407 2461 2468 2469 2476 2494 2499 2509 2515 2523 2542 2554 2559 2566 2572 2583 2628 2633 2640 2666 2676 2688 2690 2691 2698 2699 2713 2726 2759 2761 2763 2766 2780 2789 2798 2812 2824 2829 2834 2835 2837 2882 2887 2888 2900 2901 138 180 217 248 345 352 419 425 675 761 1000 1046 1064 1116 1297 1312 1381 1382 1444 1595 1746 1780 1892 2165 2166 2167 2173 2302 2366 2371 2437 2443 2453 2467 2489 2566 2657 TCGCCG/CGGCGA 0 -3 241 198 37 -26.3 178 180 182 193 199 319 334 363 367 386 398 427 431 444 448 450 456 479 498 514 532 555 569 620 622 642 654 663 672 686 701 705 711 713 745 768 779 783 794 819 820 869 913 919 922 1047 1051 1079 1084 1094 1125 1142 1152 1154 1163 1176 1181 1183 1194 1202 1213 1217 1222 1233 1237 1244 1259 1261 1263 1271 1276 1317 1329 1331 1351 1356 1399 1416 1420 1446 1453 1467 1475 1524 1527 1533 1544 1545 1546 1547 1565 1572 1584 1601 1607 1632 1633 1644 1656 1657 1691 1696 1700 1708 1710 1715 1718 1735 1737 1751 1756 1761 1777 1783 1790 1838 1846 1855 1862 1901 1906 1907 1925 1952 1954 1963 1964 1986 1989 1991 2001 2002 2011 2014 2019 2024 2032 2035 2039 2053 2057 2061 2064 2065 2070 2076 2085 2100 2119 2120 2131 2139 2140 2148 2149 2152 2169 2170 2175 2182 2200 2213 2222 2225 2251 2252 2271 2291 2299 2327 2329 2337 2340 2347 2348 2362 2370 2375 2394 2398 2400 2401 2445 2461 2462 2469 2472 2476 2481 2499 2505 2509 2510 2522 2553 2569 2570 2572 2573 2581 2588 2592 2593 2595 2615 2623 2640 2648 2652 2658 2663 2664 2668 2695 2698 2699 2709 2713 2716 2721 2722 2725 2726 2728 2733 2738 2741 2759 2765 2771 2801 2824 2828 2829 2835 2848 2870 2874 2880 2882 2889 8 60 274 352 404 507 571 605 675 761 891 1004 1100 1116 1239 1248 1312 1381 1595 1718 1770 1892 1922 1983 2123 2165 2173 2371 2381 2437 2455 2489 2566 2568 2623 2633 2679 CACCGT/ACGGTG 0 -2 218 192 48 -20.1 7 46 54 104 110 141 180 203 229 263 279 281 285 298 363 397 398 429 431 478 481 489 495 497 540 565 569 577 609 647 670 683 696 701 705 728 772 783 794 802 806 813 821 863 869 878 884 898 900 904 984 997 1002 1007 1014 1027 1039 1053 1064 1095 1097 1101 1135 1147 1173 1191 1192 1204 1227 1242 1250 1279 1290 1306 1335 1344 1380 1406 1416 1422 1457 1469 1493 1497 1507 1514 1515 1531 1536 1543 1548 1560 1565 1596 1612 1633 1635 1652 1666 1693 1702 1726 1743 1760 1763 1774 1776 1786 1791 1794 1798 1800 1806 1817 1824 1835 1836 1840 1841 1846 1858 1865 1870 1904 1917 1939 1961 1985 1990 2006 2009 2010 2022 2024 2026 2031 2053 2054 2058 2060 2063 2071 2075 2077 2088 2090 2133 2140 2150 2199 2205 2207 2219 2232 2249 2254 2261 2284 2300 2311 2315 2316 2319 2325 2336 2350 2380 2381 2384 2408 2425 2452 2463 2473 2478 2492 2508 2513 2530 2539 2550 2555 2575 2577 2580 2600 2601 2607 2621 2644 2657 2659 2672 2678 2679 2707 2708 2727 2734 2738 2739 2770 2777 2786 2795 2797 2817 2818 2835 2852 2861 2865 2874 2877 2880 2883 2887 2898 26 182 418 475 591 655 718 746 845 861 910 1045 1069 1102 1139 1168 1222 1245 1284 1303 1348 1394 1396 1497 1501 1539 1656 1835 1996 2007 2034 2036 2056 2141 2144 2155 2156 2214 2254 2318 2383 2389 2454 2560 2596 2606 2642 2664 GGAGGC/GCCTCC 1 -2 192 181 29 -26.7 49 54 57 69 75 95 99 124 138 140 148 154 163 168 169 174 208 214 219 228 250 283 300 305 319 322 325 351 355 358 383 385 428 432 439 443 445 457 460 463 466 521 522 531 562 571 572 595 597 598 599 628 661 714 715 718 720 743 761 770 780 788 821 831 839 841 844 877 900 906 917 966 969 992 994 997 1001 1011 1013 1029 1041 1048 1070 1074 1123 1131 1150 1156 1175 1192 1209 1260 1269 1348 1357 1362 1378 1434 1451 1498 1510 1512 1537 1558 1572 1611 1632 1640 1655 1661 1674 1709 1717 1725 1749 1760 1767 1769 1771 1772 1780 1798 1809 1814 1866 1888 1908 1929 1931 1940 1950 1969 1972 1973 2000 2016 2020 2031 2038 2045 2058 2062 2084 2097 2114 2131 2144 2158 2162 2184 2190 2195 2216 2229 2259 2286 2287 2288 2289 2301 2320 2351 2359 2366 2385 2401 2405 2415 2442 2465 2513 2517 2544 2549 2557 2565 2599 2600 2603 2635 2664 2667 2670 2687 2690 2720 2723 2763 2783 2808 2866 2895 20 339 426 437 488 536 568 774 816 1024 1164 1169 1190 1193 1225 1244 1245 1567 1572 1579 1645 1649 1839 2276 2305 2359 2609 2612 2664 TGCGGT/ACCGCA 4 -3 167 171 39 -19.5 17 23 24 33 34 42 55 70 196 197 200 209 217 230 244 270 324 376 398 423 480 503 534 577 580 598 623 654 673 692 707 747 766 794 799 800 837 861 891 892 898 911 917 924 929 1007 1025 1061 1065 1066 1076 1110 1120 1138 1143 1157 1158 1195 1217 1238 1256 1334 1347 1369 1375 1379 1397 1408 1413 1417 1436 1445 1471 1477 1480 1535 1536 1538 1561 1580 1609 1615 1620 1627 1631 1649 1655 1660 1730 1734 1761 1765 1795 1811 1817 1841 1856 1887 1900 1905 1914 1921 1930 1943 1944 1945 1958 1961 1962 1967 1990 2012 2028 2068 2075 2097 2101 2125 2127 2135 2164 2176 2178 2181 2230 2234 2237 2240 2242 2298 2310 2313 2326 2334 2342 2353 2357 2367 2382 2395 2404 2426 2434 2470 2483 2484 2520 2536 2547 2551 2634 2636 2692 2704 2727 2755 2764 2773 2804 2813 2819 2822 2840 2850 2860 2865 2868 39 78 94 204 212 315 320 328 334 338 486 711 764 783 969 1016 1037 1100 1123 1413 1414 1419 1558 1683 1688 2075 2081 2096 2249 2324 2341 2342 2346 2378 2382 2395 2518 2538 2619 CGCCTC/GAGGCG 0 -2 185 168 24 -26.5 49 69 99 105 124 148 154 168 172 174 180 208 218 247 257 283 300 305 313 319 322 325 336 358 383 384 460 463 466 470 491 509 522 531 569 590 595 597 622 631 656 706 714 715 721 736 743 761 770 788 811 819 831 837 900 917 931 935 961 966 970 979 982 994 997 1001 1011 1013 1019 1029 1041 1050 1069 1070 1123 1139 1150 1156 1175 1192 1211 1260 1290 1348 1350 1357 1362 1418 1431 1446 1463 1484 1537 1555 1568 1580 1586 1641 1649 1659 1677 1680 1682 1685 1718 1745 1749 1767 1772 1809 1851 1867 1868 1871 1876 1888 1894 1908 1928 1931 1932 1940 1948 1950 1957 1969 1995 2005 2007 2020 2038 2045 2062 2070 2081 2082 2084 2097 2101 2107 2143 2144 2165 2188 2190 2223 2234 2238 2259 2286 2288 2301 2306 2315 2320 2328 2366 2368 2402 2415 2427 2430 2465 2513 2549 2557 2599 2603 2609 2626 2640 2650 2670 2690 2720 2721 2723 2726 2729 2763 2774 2804 2808 2839 2853 38 154 351 426 668 889 1024 1058 1192 1243 1244 1245 1526 1562 1586 1622 1645 1718 1870 2128 2173 2293 2635 2661 TTGCGG/CCGCAA 4 -4 107 153 43 -14.4 1 7 11 17 23 24 33 34 42 55 70 135 157 196 197 200 226 244 268 270 276 324 376 398 423 480 503 580 593 600 604 638 654 672 707 722 744 747 762 812 837 924 994 1007 1015 1157 1159 1175 1186 1195 1238 1239 1256 1342 1343 1413 1443 1498 1536 1545 1580 1599 1601 1609 1655 1660 1712 1765 1795 1802 1817 1930 1936 1942 1961 2079 2095 2119 2135 2176 2181 2230 2237 2242 2260 2275 2309 2310 2313 2338 2353 2357 2367 2404 2470 2534 2551 2582 2636 2708 2722 2758 2764 2802 2804 2819 2842 39 69 210 280 307 309 315 320 326 328 334 338 486 523 531 711 783 969 1014 1037 1100 1253 1257 1395 1413 1414 1419 1558 1607 1651 1727 1741 1774 1946 2075 2081 2152 2302 2324 2342 2346 2517 2550 CCGCAG/CTGCGG 0 -3 173 147 17 -25.9 86 98 128 130 209 222 239 421 428 431 447 463 524 534 554 598 623 650 674 680 692 707 740 766 799 800 803 837 853 861 883 890 892 898 911 922 925 929 1003 1023 1061 1063 1065 1076 1079 1081 1120 1128 1146 1158 1176 1238 1247 1281 1285 1293 1300 1311 1322 1333 1334 1345 1347 1352 1369 1379 1396 1397 1408 1417 1419 1433 1445 1452 1455 1477 1480 1488 1538 1556 1558 1561 1588 1600 1615 1649 1670 1686 1734 1752 1755 1761 1801 1812 1830 1850 1853 1866 1887 1900 1905 1914 1915 1921 1931 1943 1944 1945 1960 1962 2012 2022 2026 2068 2097 2098 2101 2108 2126 2127 2149 2163 2164 2185 2192 2194 2201 2209 2213 2222 2234 2240 2294 2298 2306 2309 2318 2326 2331 2395 2404 2406 2413 2421 2426 2431 2434 2477 2483 2484 2488 2520 2524 2536 2541 2547 2567 2584 2608 2685 2696 2704 2735 2751 2763 2769 2774 2776 2813 2822 2840 2868 2894 78 204 502 1040 1123 1172 1688 1803 1837 1933 2096 2276 2356 2505 2538 2559 2670 CTGCGG/CCGCAG 2 -1 173 147 17 -25.9 86 98 128 130 209 222 239 421 428 431 447 463 524 534 554 598 623 650 674 680 692 707 740 766 799 800 803 837 853 861 883 890 892 898 911 922 925 929 1003 1023 1061 1063 1065 1076 1079 1081 1120 1128 1146 1158 1176 1238 1247 1281 1285 1293 1300 1311 1322 1333 1334 1345 1347 1352 1369 1379 1396 1397 1408 1417 1419 1433 1445 1452 1455 1477 1480 1488 1538 1556 1558 1561 1588 1600 1615 1649 1670 1686 1734 1752 1755 1761 1801 1812 1830 1850 1853 1866 1887 1900 1905 1914 1915 1921 1931 1943 1944 1945 1960 1962 2012 2022 2026 2068 2097 2098 2101 2108 2126 2127 2149 2163 2164 2185 2192 2194 2201 2209 2213 2222 2234 2240 2294 2298 2306 2309 2318 2326 2331 2395 2404 2406 2413 2421 2426 2431 2434 2477 2483 2484 2488 2520 2524 2536 2541 2547 2567 2584 2608 2685 2696 2704 2735 2751 2763 2769 2774 2776 2813 2822 2840 2868 2894 78 204 502 1040 1123 1172 1688 1803 1837 1933 2096 2276 2356 2505 2538 2559 2670 CTGCGG/CCGCAG 4 -4 173 147 17 -25.9 86 98 128 130 209 222 239 421 428 431 447 463 524 534 554 598 623 650 674 680 692 707 740 766 799 800 803 837 853 861 883 890 892 898 911 922 925 929 1003 1023 1061 1063 1065 1076 1079 1081 1120 1128 1146 1158 1176 1238 1247 1281 1285 1293 1300 1311 1322 1333 1334 1345 1347 1352 1369 1379 1396 1397 1408 1417 1419 1433 1445 1452 1455 1477 1480 1488 1538 1556 1558 1561 1588 1600 1615 1649 1670 1686 1734 1752 1755 1761 1801 1812 1830 1850 1853 1866 1887 1900 1905 1914 1915 1921 1931 1943 1944 1945 1960 1962 2012 2022 2026 2068 2097 2098 2101 2108 2126 2127 2149 2163 2164 2185 2192 2194 2201 2209 2213 2222 2234 2240 2294 2298 2306 2309 2318 2326 2331 2395 2404 2406 2413 2421 2426 2431 2434 2477 2483 2484 2488 2520 2524 2536 2541 2547 2567 2584 2608 2685 2696 2704 2735 2751 2763 2769 2774 2776 2813 2822 2840 2868 2894 78 204 502 1040 1123 1172 1688 1803 1837 1933 2096 2276 2356 2505 2538 2559 2670 CACCGA/TCGGTG 0 -2 153 135 33 -14.7 25 60 85 102 156 182 207 222 229 236 243 252 322 323 374 377 381 394 440 546 563 572 619 639 651 653 665 676 678 708 770 797 833 855 905 909 920 922 988 998 1038 1051 1095 1098 1101 1147 1162 1229 1257 1289 1292 1313 1353 1370 1392 1411 1416 1426 1462 1466 1469 1526 1540 1541 1568 1591 1608 1627 1628 1633 1684 1696 1698 1699 1704 1714 1720 1724 1738 1744 1756 1759 1833 1849 1854 1855 1873 1880 1913 1921 1938 1953 1970 1975 1998 2003 2038 2078 2086 2110 2142 2170 2183 2189 2235 2237 2239 2240 2269 2289 2306 2322 2362 2370 2379 2385 2410 2412 2415 2429 2459 2473 2495 2521 2552 2561 2562 2564 2565 2586 2594 2596 2662 2682 2683 2696 2714 2717 2746 2749 2767 2772 2782 2799 2816 2855 2858 2860 2862 2865 2879 2885 2900 60 98 171 351 442 549 579 701 768 898 905 953 1014 1045 1110 1223 1243 1381 1399 1466 1736 1893 1999 2145 2159 2172 2242 2244 2260 2289 2570 2595 2601 GCTGCG/CGCAGC 2 -2 141 130 23 -18.2 4 86 98 131 142 209 239 388 390 419 422 428 431 438 447 494 510 524 541 550 563 584 585 598 674 692 707 757 797 837 861 883 890 894 922 934 962 979 1053 1061 1063 1065 1076 1092 1119 1128 1130 1135 1238 1247 1261 1277 1309 1311 1333 1334 1345 1369 1397 1408 1410 1481 1488 1552 1556 1558 1561 1604 1615 1645 1707 1734 1761 1772 1801 1830 1839 1850 1887 1900 1914 1924 1931 1944 1945 1977 2012 2026 2056 2095 2097 2101 2108 2116 2126 2127 2181 2192 2194 2209 2240 2280 2309 2326 2337 2395 2397 2404 2411 2413 2421 2426 2434 2481 2483 2484 2488 2496 2503 2520 2524 2536 2541 2568 2608 2686 2696 2701 2704 2735 2739 2751 2752 2763 2774 2776 2822 2840 2858 2868 2899 24 214 256 502 503 1024 1379 1563 1587 1733 1837 1845 2062 2159 2298 2302 2356 2379 2421 2521 2559 2569 2675 GCTGCG/CGCAGC 4 -5 141 130 23 -18.2 4 86 98 131 142 209 239 388 390 419 422 428 431 438 447 494 510 524 541 550 563 584 585 598 674 692 707 757 797 837 861 883 890 894 922 934 962 979 1053 1061 1063 1065 1076 1092 1119 1128 1130 1135 1238 1247 1261 1277 1309 1311 1333 1334 1345 1369 1397 1408 1410 1481 1488 1552 1556 1558 1561 1604 1615 1645 1707 1734 1761 1772 1801 1830 1839 1850 1887 1900 1914 1924 1931 1944 1945 1977 2012 2026 2056 2095 2097 2101 2108 2116 2126 2127 2181 2192 2194 2209 2240 2280 2309 2326 2337 2395 2397 2404 2411 2413 2421 2426 2434 2481 2483 2484 2488 2496 2503 2520 2524 2536 2541 2568 2608 2686 2696 2701 2704 2735 2739 2751 2752 2763 2774 2776 2822 2840 2858 2868 2899 24 214 256 502 503 1024 1379 1563 1587 1733 1837 1845 2062 2159 2298 2302 2356 2379 2421 2521 2559 2569 2675 AGCCGC/GCGGCT 0 -5 125 125 25 -16.1 11 20 80 128 160 229 239 262 264 294 346 431 513 524 530 540 567 584 598 657 672 674 695 704 726 768 776 812 826 853 883 890 910 933 1000 1041 1042 1051 1059 1107 1128 1189 1201 1223 1242 1276 1280 1303 1311 1314 1333 1334 1345 1371 1395 1419 1441 1451 1464 1499 1508 1513 1522 1631 1666 1672 1714 1772 1774 1776 1785 1801 1808 1831 1861 1871 1914 1942 1954 1992 2012 2037 2093 2113 2119 2120 2126 2156 2163 2186 2197 2238 2247 2307 2331 2380 2397 2404 2421 2432 2445 2483 2488 2493 2494 2554 2582 2653 2655 2665 2673 2681 2685 2727 2735 2774 2778 2820 2842 2849 2856 2859 2894 2896 2899 33 251 326 373 479 570 649 915 1034 1130 1270 1539 1718 1727 1806 1829 2067 2262 2282 2366 2440 2559 2588 2605 2661 CGCCGG/CCGGCG 0 -2 143 117 20 -16.9 101 148 178 234 238 294 329 361 363 367 398 456 514 622 642 672 699 705 717 820 834 869 883 922 967 1018 1047 1051 1055 1094 1106 1152 1154 1178 1181 1189 1199 1213 1222 1263 1267 1273 1276 1329 1351 1399 1416 1441 1455 1462 1492 1513 1533 1544 1554 1570 1601 1604 1607 1648 1669 1715 1718 1721 1735 1737 1751 1800 1920 1925 1929 1954 1963 1964 1989 2014 2032 2035 2037 2051 2053 2058 2061 2065 2070 2159 2175 2200 2222 2225 2237 2271 2291 2300 2308 2316 2319 2333 2347 2348 2372 2375 2404 2409 2445 2462 2467 2472 2492 2500 2510 2522 2537 2546 2556 2574 2577 2592 2593 2612 2615 2619 2635 2658 2659 2668 2680 2689 2695 2720 2725 2733 2738 2740 2771 2779 2828 2829 2859 2866 2874 2881 2889 60 571 580 744 746 1116 1239 1310 1530 1656 1770 1867 2034 2111 2123 2139 2455 2568 2618 2633 CCGTCG/CGACGG 5 -3 108 117 31 -11.9 0 7 104 133 137 144 220 224 236 263 363 367 444 463 489 521 565 602 732 760 783 794 858 865 869 870 904 907 1002 1014 1018 1037 1047 1051 1101 1143 1147 1173 1177 1227 1230 1234 1260 1261 1282 1416 1422 1529 1548 1560 1565 1582 1594 1602 1630 1633 1641 1647 1755 1798 1890 1897 1913 1917 1918 1961 1979 1986 1991 2021 2024 2054 2071 2074 2078 2097 2119 2144 2148 2150 2173 2199 2200 2207 2254 2261 2265 2308 2352 2362 2380 2387 2400 2511 2542 2559 2577 2629 2640 2670 2672 2713 2755 2802 2835 2880 2896 2901 48 180 182 216 673 773 791 845 948 1014 1020 1064 1074 1137 1202 1296 1312 1386 1581 1839 1928 1966 2090 2166 2181 2261 2402 2407 2490 2598 2678 CGCCAT/ATGGCG 0 -2 124 112 29 -11.7 32 52 73 121 138 168 186 208 228 333 415 441 469 496 501 504 578 583 605 657 679 704 706 710 777 833 838 871 875 890 946 979 1020 1061 1091 1104 1112 1124 1132 1141 1160 1191 1227 1273 1280 1346 1350 1396 1398 1407 1422 1490 1513 1522 1523 1557 1598 1611 1619 1641 1648 1707 1715 1747 1767 1802 1803 1821 1836 1844 1856 1896 1910 1913 1916 1931 1949 1999 2024 2102 2112 2113 2117 2118 2135 2163 2186 2189 2193 2204 2245 2248 2294 2309 2312 2318 2319 2377 2393 2406 2407 2427 2458 2479 2531 2533 2552 2558 2573 2576 2587 2605 2610 2630 2655 2685 2762 2779 2794 2807 2843 2852 2854 2862 7 230 404 468 529 533 609 848 883 1054 1122 1131 1138 1150 1319 1458 1537 1703 1768 1784 1868 1922 1983 2145 2334 2385 2555 2641 2643 TTCCGC/GCGGAA 0 -5 107 108 22 -13.9 1 7 64 80 90 140 282 298 311 325 335 366 391 394 540 592 604 666 692 740 824 837 838 871 940 975 976 978 1004 1097 1111 1168 1176 1230 1238 1241 1258 1276 1290 1293 1313 1328 1352 1373 1382 1393 1479 1483 1501 1586 1608 1638 1674 1749 1755 1761 1767 1851 1877 1923 1925 1942 2000 2013 2023 2043 2057 2109 2156 2178 2227 2246 2257 2279 2294 2306 2318 2342 2405 2406 2427 2457 2491 2512 2538 2541 2562 2566 2603 2626 2643 2650 2669 2687 2696 2717 2723 2729 2774 2775 2832 2837 2846 2852 2853 2859 2893 136 917 1000 1121 1130 1253 1320 1379 1395 1607 1651 1736 1768 2062 2204 2343 2366 2416 2518 2580 2626 2656 GCCGCA/TGCGGC 0 -1 107 104 25 -11.7 11 90 128 157 239 262 268 276 333 431 447 463 524 554 588 600 672 674 680 695 707 722 768 776 812 853 880 883 890 933 994 1033 1063 1076 1079 1107 1120 1128 1153 1175 1186 1237 1247 1281 1303 1311 1333 1345 1359 1419 1433 1452 1455 1504 1601 1686 1691 1712 1783 1801 1830 1831 1861 1942 2022 2076 2095 2098 2118 2119 2120 2126 2149 2163 2192 2194 2213 2260 2275 2294 2298 2327 2329 2338 2398 2404 2421 2488 2567 2582 2584 2665 2685 2721 2722 2735 2754 2758 2763 2774 2802 2820 2832 2842 2862 2881 2894 69 326 570 607 608 1014 1040 1101 1257 1727 1741 1803 1893 1933 1946 2192 2356 2382 2505 2517 2559 2605 2612 2629 2670 TGCGGC/GCCGCA 4 -3 107 104 25 -11.7 11 90 128 157 239 262 268 276 333 431 447 463 524 554 588 600 672 674 680 695 707 722 768 776 812 853 880 883 890 933 994 1033 1063 1076 1079 1107 1120 1128 1153 1175 1186 1237 1247 1281 1303 1311 1333 1345 1359 1419 1433 1452 1455 1504 1601 1686 1691 1712 1783 1801 1830 1831 1861 1942 2022 2076 2095 2098 2118 2119 2120 2126 2149 2163 2192 2194 2213 2260 2275 2294 2298 2327 2329 2338 2398 2404 2421 2488 2567 2582 2584 2665 2685 2721 2722 2735 2754 2758 2763 2774 2802 2820 2832 2842 2862 2881 2894 69 326 570 607 608 1014 1040 1101 1257 1727 1741 1803 1893 1933 1946 2192 2356 2382 2505 2517 2559 2605 2612 2629 2670 ATCCGC/GCGGAT 0 -5 105 103 29 -10.0 4 98 134 173 186 218 226 331 336 345 362 373 400 421 491 504 518 647 650 657 669 686 699 706 710 724 744 777 778 810 834 849 872 898 922 925 949 967 985 1003 1018 1023 1033 1038 1047 1081 1159 1266 1273 1276 1300 1346 1350 1388 1509 1545 1555 1570 1589 1599 1600 1652 1677 1707 1735 1751 1752 1760 1789 1826 1850 1897 1899 1915 1944 1956 1996 2026 2046 2048 2066 2067 2108 2112 2117 2151 2176 2236 2244 2297 2368 2407 2427 2430 2437 2458 2479 2560 2561 2608 2685 2726 2763 2823 2881 309 369 413 452 502 600 688 717 812 948 1018 1044 1101 1172 1228 1266 1525 1530 1595 1674 1844 2034 2071 2267 2474 2501 2589 2603 2619 CGCCTT/AAGGCG 0 -2 100 101 30 -9.2 14 45 48 59 95 105 196 239 315 332 355 444 479 513 520 522 558 649 669 737 754 777 786 824 840 923 964 1001 1059 1091 1153 1168 1183 1201 1205 1231 1255 1266 1316 1358 1364 1423 1432 1442 1457 1484 1485 1522 1589 1597 1636 1761 1767 1776 1785 1789 1795 1805 1892 1951 1956 1978 1993 2023 2057 2145 2153 2154 2156 2181 2197 2224 2249 2268 2292 2303 2378 2380 2397 2413 2420 2444 2445 2474 2538 2564 2570 2590 2610 2653 2730 2740 2786 2793 2808 2836 2842 2886 2892 2893 309 320 366 566 639 838 915 921 1038 1077 1130 1139 1140 1230 1238 1413 1414 1434 1487 1736 1746 1775 1779 1899 2076 2081 2203 2238 2540 2656 CCGCCC/GGGCGG 0 -3 80 97 12 -17.0 0 4 38 70 90 95 259 298 331 385 390 572 652 791 792 839 846 857 889 897 910 920 928 969 975 976 978 986 1037 1060 1079 1200 1220 1242 1278 1292 1343 1374 1381 1383 1425 1430 1474 1492 1501 1509 1554 1638 1695 1706 1708 1711 1729 1788 1832 1885 1918 2111 2132 2246 2247 2250 2282 2343 2376 2399 2428 2501 2510 2534 2663 2667 2691 2717 2730 2745 2775 2814 2837 2884 486 502 649 664 1530 1573 2090 2194 2267 2282 2513 2619 GCAGCG/CGCTGC 2 -2 86 90 21 -10.6 0 103 127 142 209 366 392 450 460 521 541 584 646 650 692 765 771 831 922 979 1002 1051 1063 1083 1090 1158 1216 1278 1309 1312 1342 1343 1397 1406 1408 1552 1564 1604 1610 1632 1714 1721 1734 1761 1777 1801 1806 1820 1830 1871 1899 1911 1914 1919 1923 1931 1958 1993 2033 2056 2074 2094 2127 2144 2147 2192 2208 2231 2277 2309 2366 2486 2501 2503 2588 2619 2622 2643 2645 2652 2752 2785 2787 2862 2881 2899 136 213 356 363 385 479 706 863 948 1055 1379 1674 1756 1787 2062 2071 2195 2356 2366 2393 2604 TGCGGA/TCCGCA 4 -3 79 88 21 -10.2 1 7 80 86 98 140 226 292 322 400 413 421 428 540 593 604 638 650 707 710 740 744 837 898 922 925 1023 1038 1081 1176 1238 1241 1285 1293 1300 1352 1365 1388 1451 1498 1545 1556 1558 1599 1600 1670 1752 1755 1796 1812 1850 1866 1915 1956 2026 2108 2160 2185 2201 2222 2246 2257 2306 2318 2342 2406 2431 2512 2523 2524 2529 2541 2608 2696 2708 2769 2774 2823 2826 137 309 369 452 502 523 1172 1253 1266 1395 1530 1572 1607 1651 1774 1828 1844 1979 1999 2474 2589 CGCCGA/TCGGCG 0 -2 107 86 23 -9.0 220 247 319 340 386 620 686 705 745 768 779 805 849 919 937 941 957 985 998 1064 1147 1154 1163 1217 1230 1241 1276 1288 1317 1329 1331 1355 1360 1393 1420 1453 1456 1467 1475 1505 1508 1545 1546 1616 1630 1633 1657 1685 1696 1749 1777 1784 1787 1795 1808 1855 1879 1929 1994 2002 2011 2039 2057 2092 2097 2109 2132 2134 2140 2146 2148 2169 2170 2215 2220 2265 2340 2370 2459 2481 2499 2505 2511 2551 2553 2569 2570 2573 2581 2586 2590 2595 2615 2623 2629 2648 2664 2669 2676 2691 2694 2709 2741 2843 2848 2880 2885 8 274 371 524 688 742 1004 1046 1047 1100 1116 1248 1312 1607 1712 1718 1962 2261 2304 2393 2623 2657 2679 CCGTGG/CCACGG 5 -3 83 83 20 -9.6 31 71 127 194 204 218 226 273 286 306 366 385 390 405 502 516 558 589 633 653 701 711 764 771 827 844 896 952 1034 1068 1079 1182 1201 1209 1250 1252 1279 1298 1324 1339 1478 1489 1552 1597 1605 1610 1672 1728 1750 1813 1878 1902 1909 1975 1991 2000 2018 2051 2106 2126 2205 2234 2292 2323 2332 2350 2371 2372 2376 2445 2500 2501 2535 2554 2569 2583 2601 2635 2649 2698 2824 2837 2877 72 351 475 744 745 1238 1423 1497 1555 1623 1673 1746 1787 2060 2145 2353 2371 2481 2510 2589 TACCGC/GCGGTA 0 -5 77 76 13 -11.4 6 73 112 138 276 329 358 390 398 452 534 583 586 654 671 717 736 754 766 777 824 841 862 883 933 948 950 961 976 1156 1161 1203 1248 1252 1278 1316 1342 1379 1397 1398 1408 1430 1445 1522 1557 1604 1620 1641 1648 1675 1747 1784 1928 1950 1978 1986 1994 2033 2074 2075 2153 2253 2282 2329 2353 2395 2411 2426 2454 2468 2500 2520 2563 2637 2760 2822 2871 356 764 874 1100 1621 1683 1688 2195 2249 2305 2393 2421 2560 TGCCGC/GCGGCA 0 -5 87 73 17 -8.8 157 168 208 268 392 463 469 576 588 669 752 811 847 864 982 985 1019 1030 1063 1076 1121 1132 1175 1199 1205 1216 1221 1238 1241 1267 1287 1359 1389 1390 1397 1434 1492 1513 1515 1537 1564 1598 1610 1629 1630 1641 1644 1649 1681 1693 1695 1735 1736 1797 1801 1860 1885 1918 1945 2022 2033 2098 2145 2146 2163 2181 2192 2292 2298 2303 2311 2323 2338 2378 2421 2486 2489 2510 2534 2586 2613 2618 2736 2793 2813 2854 2862 79 461 607 608 863 1803 1843 1933 2000 2128 2173 2192 2256 2302 2318 2505 2670 CGCGGC/GCCGCG 4 -3 55 71 4 -16.7 0 20 173 185 229 245 346 447 469 527 584 598 704 776 910 926 1000 1027 1031 1056 1175 1244 1304 1335 1515 1564 1601 1644 1710 1719 1749 1757 1860 1907 1950 1986 1992 2027 2072 2073 2092 2330 2345 2396 2494 2537 2564 2586 2635 2663 2681 2713 2768 2874 2880 461 1038 2050 2366 CGAGCC/GGCTCG 6 0 60 71 20 -7.2 0 128 167 220 247 286 288 371 477 549 572 789 797 887 891 903 922 1059 1083 1094 1101 1108 1182 1223 1248 1276 1296 1370 1384 1411 1438 1472 1480 1627 1655 1738 1804 1811 1910 1957 1960 2054 2063 2114 2120 2131 2170 2172 2187 2215 2285 2355 2488 2530 2569 2578 2743 2769 2771 2859 54 73 112 179 187 800 1130 1270 1393 1492 1493 1603 1650 1718 2008 2449 2497 2536 2568 2626 CCCGCC/GGCGGG 0 -4 79 68 10 -11.3 51 162 256 259 260 302 315 355 422 454 501 564 578 599 664 677 708 721 857 875 910 923 1021 1147 1200 1252 1255 1290 1335 1338 1348 1397 1484 1486 1505 1539 1541 1554 1601 1665 1671 1722 1798 1803 1832 1868 1888 1931 1940 1963 2057 2084 2132 2134 2146 2245 2258 2274 2275 2312 2370 2389 2441 2501 2556 2574 2576 2590 2598 2605 2616 2630 2663 2694 2762 2804 2880 2892 2902 772 1093 1293 1893 1983 2002 2230 2261 2513 2517 GTGCGG/CCGCAC 4 -4 65 59 14 -7.2 62 80 90 140 190 217 230 243 262 322 333 577 695 710 717 768 776 794 898 933 936 1009 1025 1038 1076 1107 1120 1138 1143 1217 1241 1303 1359 1436 1451 1471 1504 1620 1627 1631 1691 1730 1783 1856 2009 2023 2028 2075 2076 2118 2197 2230 2240 2246 2298 2327 2329 2382 2421 2529 2692 2727 2755 2816 2865 137 212 570 764 1253 1572 1844 2249 2474 2518 2605 2612 2619 2629 CGCCTG/CAGGCG 0 -2 68 58 12 -7.9 162 178 283 304 326 331 361 399 402 455 505 708 714 780 787 883 910 953 997 1105 1119 1138 1212 1287 1338 1345 1397 1415 1479 1557 1559 1622 1665 1671 1677 1737 1760 1785 1866 1914 1935 1954 2021 2044 2120 2144 2204 2247 2258 2282 2299 2346 2358 2417 2447 2453 2468 2512 2545 2596 2604 2613 2655 2709 2716 2807 2861 2902 1293 1385 1768 1809 2204 2211 2216 2256 2263 2271 2318 2453 TGCGGG/CCCGCA 4 -3 56 57 14 -6.8 7 62 130 135 190 222 243 339 506 685 694 707 717 762 803 829 918 936 1003 1009 1015 1146 1159 1239 1322 1343 1393 1396 1443 1488 1588 1765 1802 1817 1850 1853 1885 1931 1936 1960 2009 2023 2067 2079 2197 2209 2230 2240 2309 2331 2413 2477 2534 2751 2776 2816 210 280 486 531 678 766 1022 1228 1837 2092 2152 2276 2512 2550 GCAGGC/GCCTGC 3 -4 52 56 16 -5.8 3 122 265 280 283 304 345 402 459 542 609 684 688 731 860 889 906 960 1048 1055 1058 1090 1119 1206 1281 1385 1397 1479 1557 1589 1649 1687 1721 1740 1774 1785 1788 1928 1960 2044 2204 2228 2247 2411 2452 2458 2468 2482 2604 2729 2769 2820 183 435 467 1122 1199 1444 1617 1706 2152 2204 2214 2216 2271 2355 2359 2366 GCGAGC/GCTCGC 6 -1 44 56 16 -5.8 0 170 288 293 304 339 345 371 372 416 444 524 558 569 639 655 787 1213 1248 1363 1429 1619 1662 1708 1735 1738 2032 2092 2120 2131 2276 2318 2456 2488 2569 2607 2622 2663 2667 2683 2685 2743 2771 2846 663 675 678 742 761 1138 1196 1220 1224 1580 1818 2021 2212 2506 2568 2626 CGCGGT/ACCGCG 4 -3 65 55 7 -10.1 57 140 201 230 306 317 351 358 469 689 756 910 926 989 1024 1026 1049 1194 1217 1248 1268 1364 1421 1460 1461 1483 1533 1570 1712 1713 1803 1813 1829 1864 1871 1877 1881 1907 1913 1916 1950 1951 1969 1986 2048 2071 2083 2144 2232 2253 2262 2330 2334 2537 2656 2679 2681 2732 2744 2748 2768 2786 2831 2874 2886 136 146 150 1595 1651 2050 2656 GTAGCG/CGCTAC 2 -2 53 49 13 -5.6 112 138 182 273 319 356 371 379 399 499 591 662 717 752 754 763 766 776 797 827 831 835 844 890 934 945 1156 1196 1200 1221 1239 1483 1557 1601 1611 1626 1645 1725 1815 1826 1869 1921 2079 2227 2373 2382 2520 2671 2750 2775 2785 2804 2878 246 552 644 1042 1121 1196 1771 1817 2075 2114 2380 2440 2517 CCAGGC/GCCTGG 3 -4 49 46 11 -5.8 125 130 208 326 331 435 464 485 510 568 589 610 810 849 883 933 980 987 997 1008 1032 1122 1138 1155 1287 1345 1347 1361 1559 1627 1643 1665 1677 1680 1736 1835 1894 1908 2022 2058 2120 2170 2200 2226 2302 2417 2517 2716 2841 65 67 80 256 422 1447 1578 1947 2092 2428 2560 CCGAGC/GCTCGG 6 -1 51 46 13 -5.0 84 136 220 337 368 386 477 572 575 699 758 786 790 810 827 882 891 922 1079 1101 1138 1296 1370 1428 1480 1548 1618 1627 1811 1935 1951 1991 1992 2003 2086 2114 2133 2134 2170 2172 2215 2285 2334 2347 2415 2430 2440 2471 2606 2623 2853 55 112 403 800 1236 1597 1935 1979 2001 2008 2497 2536 2668 TCGCGG/CCGCGA 4 -4 46 39 7 -6.3 173 230 293 345 346 447 527 598 669 704 776 1024 1026 1049 1219 1233 1248 1276 1421 1568 1570 1601 1710 1712 1719 1749 1757 1765 1874 1950 1951 1969 2027 2071 2092 2156 2330 2334 2345 2586 2656 2667 2679 2713 2748 2831 413 624 663 2266 2501 2603 2626 ACGCGG/CCGCGT 4 -4 43 38 7 -6.0 134 140 201 245 306 317 327 351 371 458 584 756 981 1027 1031 1244 1335 1364 1461 1515 1533 1564 1652 1803 1813 1829 1860 1864 1871 1881 2066 2073 2144 2330 2396 2494 2611 2635 2664 2744 2809 2880 2886 136 146 461 1038 1044 1651 2462