#3771/3771 #6.28 # k-mer/r.c. Cluster Offset PosCt wPosCt NegCt HGP_10 ACCATG/CATGGT 2 -2 147 281 84 -27.2 1 2 12 15 16 17 21 22 29 43 44 45 46 47 52 58 63 69 70 71 81 84 90 103 114 115 119 120 131 159 177 178 179 196 199 257 258 261 268 269 273 297 322 326 361 381 382 436 445 448 461 498 508 552 647 662 667 673 687 699 768 784 792 803 823 826 849 869 878 883 889 905 908 968 1027 1067 1106 1130 1191 1197 1216 1225 1239 1383 1412 1442 1464 1512 1514 1546 1574 1596 1611 1685 1686 1706 1838 1894 1905 1909 1982 2064 2075 2080 2117 2172 2222 2272 2347 2389 2402 2418 2427 2547 2601 2602 2677 2692 2697 2868 2890 2900 2925 2963 3086 3087 3088 3095 3100 3141 3169 3174 3335 3400 3401 3402 3467 3497 3518 3519 3664 3689 3690 3691 3699 3723 3754 111 120 249 312 328 343 414 426 434 545 578 610 717 721 726 733 740 930 953 955 1021 1078 1170 1188 1435 1580 1582 1603 1666 1667 1676 1679 1681 1683 1686 1743 1744 1816 1823 1879 1880 2032 2059 2061 2106 2190 2209 2241 2266 2295 2305 2343 2383 2523 2622 2651 2700 2784 2890 2902 2932 2954 2958 2993 3000 3065 3127 3162 3165 3192 3255 3283 3373 3381 3385 3386 3390 3421 3430 3448 3482 3560 3646 3767 CGGCGG/CCGCCG 0 -2 240 230 56 -27.3 35 36 59 114 115 144 153 163 165 169 177 178 193 194 202 208 224 225 263 272 287 293 305 317 320 325 330 339 364 366 392 396 421 470 474 488 511 530 555 563 569 573 575 576 579 585 587 592 595 630 643 646 648 659 660 676 692 697 698 705 721 726 733 735 746 776 782 822 829 852 866 880 883 885 896 899 917 963 977 983 1013 1020 1025 1026 1052 1055 1062 1072 1073 1080 1084 1091 1092 1094 1120 1128 1140 1156 1165 1166 1226 1228 1230 1233 1234 1251 1276 1279 1280 1282 1292 1297 1315 1316 1317 1326 1333 1338 1341 1363 1377 1407 1411 1477 1485 1504 1509 1515 1522 1527 1551 1609 1665 1692 1711 1714 1777 1806 1808 1815 1816 1895 1910 1933 1934 1950 1965 1976 1991 2001 2028 2029 2030 2042 2043 2067 2070 2101 2114 2139 2140 2151 2221 2241 2253 2276 2314 2340 2355 2371 2387 2394 2422 2434 2442 2443 2444 2453 2455 2466 2479 2499 2503 2535 2539 2555 2594 2616 2619 2656 2657 2661 2706 2720 2753 2775 2786 2792 2856 2859 2866 2882 2886 2887 2898 2899 2973 2979 3020 3022 3023 3057 3060 3065 3077 3078 3091 3136 3196 3229 3272 3305 3306 3311 3314 3337 3387 3390 3406 3435 3454 3461 3490 3516 3556 3561 3593 3616 3617 3662 133 188 189 255 274 281 300 321 346 353 414 415 841 883 954 1018 1023 1062 1095 1134 1325 1355 1476 1512 1521 1538 1547 1584 1943 2050 2077 2184 2200 2271 2275 2291 2366 2380 2414 2436 2462 2588 2618 2870 2879 2916 2927 2946 2952 2978 3024 3218 3262 3440 3688 3702 CGGAGG/CCTCCG 0 -2 238 220 66 -21.4 59 114 115 123 132 152 153 159 163 177 178 179 181 192 193 194 204 226 227 233 245 261 262 267 278 293 306 325 337 345 390 413 433 445 450 452 453 462 467 474 476 478 504 518 526 527 553 570 579 580 583 592 596 597 601 609 612 625 632 650 695 703 726 735 765 776 783 809 820 842 869 872 892 967 983 988 996 999 1000 1020 1045 1082 1094 1138 1194 1207 1217 1226 1227 1236 1241 1268 1282 1286 1295 1300 1312 1317 1322 1324 1334 1404 1407 1420 1421 1443 1455 1520 1557 1575 1579 1582 1606 1621 1632 1634 1640 1652 1665 1677 1688 1689 1711 1720 1721 1731 1742 1757 1777 1781 1788 1808 1810 1812 1818 1837 1873 1964 1965 1999 2002 2003 2014 2018 2025 2091 2122 2123 2127 2140 2148 2155 2169 2177 2179 2191 2230 2275 2276 2283 2340 2345 2355 2363 2372 2373 2382 2394 2406 2453 2466 2499 2517 2537 2571 2607 2616 2624 2657 2672 2765 2775 2787 2808 2809 2810 2850 2859 2866 2879 2893 2943 2947 2988 3028 3060 3075 3080 3096 3099 3105 3107 3108 3114 3138 3163 3177 3185 3186 3197 3231 3232 3268 3277 3278 3295 3309 3310 3311 3324 3340 3386 3405 3438 3462 3489 3527 3536 3556 3598 3662 3666 3689 3690 3692 3713 3742 3761 157 196 281 304 365 414 427 583 803 906 951 952 995 1023 1134 1203 1237 1302 1325 1387 1500 1513 1521 1633 1653 1756 1757 1760 1768 1827 1836 1880 1894 1933 1986 2007 2160 2161 2275 2297 2379 2381 2395 2414 2433 2447 2468 2564 2588 2594 2682 2725 2916 3020 3120 3121 3129 3210 3277 3324 3368 3493 3552 3564 3600 3671 GGCGGT/ACCGCC 0 -1 214 215 62 -21.8 24 59 77 91 92 104 132 135 136 144 146 177 178 179 181 197 208 209 224 227 240 242 260 261 265 267 278 303 317 325 330 331 332 336 337 340 366 392 393 403 431 437 439 440 450 454 456 466 488 490 492 497 501 502 513 527 530 535 537 554 563 569 573 575 576 585 595 596 648 660 665 676 683 701 726 738 746 774 822 829 864 869 873 883 885 892 896 908 964 970 976 977 1012 1013 1026 1055 1061 1071 1072 1076 1084 1138 1142 1189 1194 1233 1241 1252 1292 1307 1315 1316 1333 1341 1362 1363 1367 1380 1460 1495 1511 1551 1608 1609 1633 1643 1680 1692 1700 1719 1760 1849 1910 1991 2001 2021 2033 2043 2044 2077 2078 2097 2114 2120 2165 2177 2221 2283 2314 2358 2362 2383 2387 2394 2413 2422 2442 2443 2444 2445 2461 2485 2496 2499 2503 2555 2594 2599 2601 2602 2619 2657 2661 2775 2853 2866 2882 2886 2887 2898 2905 2920 2979 2985 2996 3009 3020 3022 3023 3057 3065 3066 3067 3091 3126 3136 3141 3217 3218 3272 3288 3289 3305 3306 3390 3423 3435 3460 3467 3513 3550 3620 3662 3756 67 120 133 188 189 231 274 322 346 353 414 415 449 455 456 510 519 554 594 763 844 883 905 927 951 952 953 954 961 1062 1212 1512 1521 1584 1585 1718 1737 1772 1825 1871 1893 1985 2059 2060 2441 2451 2500 2702 2703 2829 2922 2946 3094 3101 3121 3211 3218 3225 3226 3332 3492 3564 GCGGTG/CACCGC 0 0 210 205 66 -18.4 77 91 92 104 132 135 136 144 146 177 178 179 181 197 208 209 218 224 226 227 242 260 261 264 265 267 278 287 303 306 319 330 331 332 336 337 360 366 378 392 393 400 403 450 454 456 466 488 490 492 501 502 527 530 535 537 544 546 554 563 573 575 576 585 595 596 644 648 660 665 682 683 701 726 746 774 780 822 829 869 872 879 883 892 908 922 964 970 976 977 1012 1013 1029 1055 1061 1071 1123 1138 1189 1194 1200 1219 1233 1241 1279 1280 1315 1316 1341 1360 1362 1367 1380 1410 1417 1456 1495 1513 1530 1531 1551 1567 1571 1643 1680 1691 1701 1719 1730 1760 1801 1821 1849 1894 1895 1971 1991 1993 2001 2021 2027 2033 2043 2044 2114 2119 2120 2221 2253 2283 2313 2314 2358 2362 2382 2383 2394 2413 2414 2422 2461 2481 2499 2503 2526 2594 2599 2601 2602 2618 2657 2661 2714 2775 2829 2850 2853 2866 2879 2905 2941 2967 2970 2971 2983 2985 2996 3009 3020 3022 3023 3057 3065 3109 3126 3141 3163 3272 3288 3289 3423 3425 3434 3467 3481 3513 3550 3620 3628 3662 55 101 169 183 188 189 231 255 414 455 456 594 883 905 927 930 951 952 953 1062 1123 1212 1258 1280 1306 1387 1491 1499 1512 1584 1585 1633 1659 1825 1871 1893 1894 1895 1933 1985 2059 2060 2210 2328 2441 2576 2646 2703 2734 2737 2829 3094 3101 3121 3160 3171 3225 3226 3491 3492 3564 3599 3621 3687 3740 3765 CGCAAC/GTTGCG 3 -2 113 202 67 -17.5 3 13 14 19 23 26 32 33 37 38 42 49 60 66 67 68 74 85 109 127 143 155 156 157 201 211 212 234 241 244 298 317 325 351 422 423 439 440 451 456 468 514 530 560 633 691 717 779 818 835 849 1002 1029 1084 1118 1311 1391 1393 1404 1418 1423 1448 1471 1507 1536 1557 1591 1723 1743 1744 1816 1823 1839 1940 1975 1992 2088 2214 2239 2255 2304 2309 2348 2391 2402 2445 2453 2584 2613 2626 2661 2699 2792 2802 2922 2935 2964 2991 3112 3122 3127 3153 3293 3328 3362 3364 3380 3434 3442 3506 3523 3607 3610 18 34 46 275 346 353 473 516 680 711 712 716 720 725 727 734 738 745 747 755 765 775 777 779 783 784 795 810 812 822 830 836 954 1021 1240 1258 1324 1590 1650 1663 1668 1696 1702 1735 1767 1819 1828 1901 2060 2086 2105 2326 2502 2549 2767 2774 2877 2900 3086 3262 3382 3383 3384 3427 3517 3671 3746 GCGGAG/CTCCGC 0 0 194 186 59 -17.1 59 91 92 114 115 121 123 132 150 153 163 181 192 193 194 226 233 262 278 293 306 320 321 325 330 343 345 366 402 413 433 445 452 453 474 476 504 518 546 553 555 556 570 580 590 592 596 601 612 633 643 659 668 679 695 705 714 726 735 776 809 820 842 854 871 892 894 983 1020 1062 1073 1082 1094 1100 1138 1142 1189 1194 1210 1228 1230 1236 1251 1282 1322 1367 1407 1420 1421 1448 1477 1515 1527 1530 1531 1554 1575 1606 1614 1640 1665 1711 1731 1757 1777 1791 1808 1812 1817 1818 1848 1873 1912 1913 1914 1920 1951 1959 1964 1965 1996 2014 2030 2052 2099 2122 2139 2140 2151 2169 2256 2257 2259 2275 2276 2313 2314 2340 2355 2362 2372 2394 2406 2442 2443 2444 2453 2466 2605 2607 2616 2647 2657 2672 2718 2749 2765 2859 2866 2879 2936 2943 2947 3020 3060 3077 3078 3091 3096 3114 3177 3185 3202 3203 3231 3232 3278 3295 3309 3310 3311 3341 3406 3438 3489 3490 3513 3516 3556 3593 3652 3662 3666 3713 128 196 259 300 304 365 414 670 689 862 870 906 951 952 1023 1134 1228 1236 1254 1325 1397 1403 1500 1521 1607 1616 1759 1768 1836 1943 2007 2069 2127 2171 2184 2216 2275 2381 2436 2438 2448 2468 2550 2588 2682 2829 2879 2978 3086 3121 3230 3277 3304 3324 3342 3440 3540 3564 3741 GCGGCG/CGCCGC 0 -3 179 167 48 -17.2 59 101 163 165 169 189 192 197 202 242 263 264 279 287 294 305 308 317 320 325 330 339 364 366 383 439 440 474 488 490 511 512 530 555 563 569 573 575 579 592 595 608 630 646 660 664 676 692 697 698 721 726 732 747 774 831 883 885 906 949 964 977 983 1020 1026 1034 1055 1065 1066 1084 1085 1091 1092 1119 1120 1143 1156 1165 1166 1220 1226 1228 1251 1276 1279 1280 1282 1292 1297 1315 1317 1333 1340 1363 1407 1411 1435 1477 1504 1518 1527 1544 1638 1665 1711 1748 1808 1815 1816 1933 1934 1941 1950 1958 1998 2070 2195 2221 2241 2253 2258 2314 2327 2340 2355 2373 2394 2422 2434 2453 2466 2479 2503 2535 2539 2555 2656 2657 2686 2712 2735 2752 2775 2786 2792 2829 2846 2856 2866 2882 2886 2887 2899 2941 2973 3022 3023 3057 3060 3065 3122 3305 3306 3311 3314 3406 3432 3433 3448 3454 3461 3512 3516 3556 3593 3630 3631 3666 3692 188 189 203 255 274 281 321 365 414 415 472 637 841 954 982 1026 1095 1134 1273 1418 1476 1512 1538 1547 1584 2077 2200 2237 2271 2380 2414 2436 2451 2516 2870 2916 2927 2953 2956 2957 3137 3262 3427 3463 3492 3624 3645 3702 GGCGGC/GCCGCC 0 -1 160 157 42 -17.4 35 36 59 101 163 165 169 190 192 202 216 225 242 249 263 294 305 324 325 330 339 421 470 474 488 511 512 573 575 579 592 595 608 638 646 660 664 692 697 698 719 720 721 726 783 804 835 852 883 885 899 949 964 977 983 1020 1045 1052 1065 1084 1091 1092 1119 1120 1156 1226 1228 1251 1276 1279 1280 1282 1292 1315 1317 1326 1333 1338 1363 1377 1407 1411 1435 1477 1504 1522 1592 1608 1623 1665 1705 1714 1765 1800 1801 1808 1815 1816 1879 1933 1934 1950 2067 2070 2195 2215 2221 2230 2253 2258 2342 2355 2366 2371 2394 2434 2453 2455 2479 2499 2503 2530 2535 2539 2544 2555 2656 2657 2703 2738 2752 2775 2786 2792 2801 2811 2868 2882 2899 2973 3022 3023 3040 3065 3150 3160 3196 3197 3229 3314 3337 3406 3448 3461 3489 3561 3616 3630 3666 3755 179 188 189 274 281 282 321 414 415 472 486 1027 1095 1134 1163 1355 1476 1504 1530 1538 1584 1585 2077 2200 2271 2291 2366 2380 2414 2462 2870 2916 2953 3262 3313 3343 3402 3421 3492 3548 3624 3645 CAGCAC/GTGCTG 1 -5 129 129 42 -11.8 25 106 107 114 115 142 144 150 159 160 166 177 178 193 194 209 227 240 255 295 345 363 367 393 448 450 504 531 550 593 628 642 657 756 765 767 769 793 812 831 905 938 1023 1131 1147 1175 1190 1192 1208 1330 1332 1374 1380 1436 1446 1485 1517 1601 1622 1719 1727 1729 1771 1778 1819 1820 1824 1825 1894 1897 1915 1920 1956 2006 2011 2049 2071 2072 2073 2094 2117 2141 2234 2244 2256 2257 2258 2274 2288 2312 2509 2520 2557 2581 2595 2611 2696 2698 2744 2745 2773 2798 2853 2855 2871 2890 2980 3009 3045 3063 3064 3101 3198 3282 3386 3390 3472 3473 3479 3504 3521 3581 3652 3664 3670 3694 3708 3709 3735 1 12 14 48 93 152 226 283 467 604 606 857 1021 1032 1083 1142 1510 1713 1723 1763 1775 1907 1960 2089 2129 2272 2332 2396 2399 2401 2487 2522 2528 2644 3207 3265 3266 3323 3439 3578 3703 3709 CTGCGG/CCGCAG 0 -2 94 85 28 -8.0 121 130 150 160 166 197 226 232 279 320 337 541 641 650 672 676 714 755 792 796 830 956 1012 1061 1065 1076 1081 1107 1142 1166 1186 1199 1205 1279 1280 1348 1372 1404 1483 1590 1630 1638 1747 1796 1824 1825 1828 1848 1897 1951 2028 2029 2034 2093 2127 2147 2165 2253 2256 2257 2314 2401 2422 2430 2463 2531 2607 2686 2718 2765 2866 2882 2886 2887 2918 2939 2947 2965 3043 3044 3060 3109 3271 3297 3396 3416 3418 3434 3461 3472 3473 3477 3593 3652 301 362 365 393 464 510 670 705 750 992 1385 1419 1483 1512 1759 1820 2077 2303 2711 2934 3041 3351 3355 3438 3463 3484 3569 3581 GCGGTA/TACCGC 0 0 61 61 12 -9.4 24 91 92 160 219 240 298 317 437 451 456 492 588 700 749 750 796 873 1061 1076 1085 1233 1252 1460 1511 1532 1590 1595 1608 1630 1705 1747 1794 1824 1825 1991 2077 2078 2141 2165 2344 2382 2477 2531 2555 2591 2617 2781 2788 2856 2918 2920 3091 3176 3271 3312 3390 3435 3460 3516 3662 133 365 844 855 965 969 1737 1772 1789 2876 3099 3328 CGGCAC/GTGCCG 1 -5 59 57 12 -8.5 144 169 170 171 177 178 183 184 246 327 359 454 483 511 571 590 600 645 672 676 740 759 984 990 1220 1226 1229 1335 1339 1376 1517 1538 1623 1649 1677 1721 1785 1879 2060 2089 2124 2289 2502 2607 2646 2666 2817 2834 2893 2924 3092 3296 3351 3380 3415 3502 3503 3550 3711 97 561 1144 1330 1875 2317 2321 2634 3065 3105 3220 3402 GCGGCA/TGCCGC 0 0 59 51 14 -6.3 249 314 324 454 470 511 520 541 600 629 638 667 676 688 689 792 835 899 983 1065 1142 1228 1229 1286 1338 1371 1623 1705 1714 1800 1879 1895 1933 1934 2014 2067 2215 2342 2366 2453 2455 2544 2584 2732 2811 3069 3085 3150 3160 3229 3259 3337 3351 3410 3415 3502 3503 3616 3641 126 128 362 570 954 1366 1367 1404 1901 1955 2291 2462 2778 3725 CGCACC/GGTGCG 3 -2 52 47 15 -5.1 106 107 235 239 286 326 409 456 481 624 696 742 976 984 1089 1219 1222 1230 1279 1280 1315 1367 1514 1618 1732 1849 2114 2176 2273 2341 2386 2387 2459 2508 2586 2711 2861 2881 2900 2912 2913 2914 2916 2979 3020 3160 3185 3187 3188 3258 3386 3449 236 440 678 1090 1123 1382 1408 1419 1917 2049 2557 2691 2899 3380 3710