#2344/2344 #6.94 # k-mer/r.c. Cluster Offset PosCt wPosCt NegCt HGP_10 CACCAC/GTGGTG 0 -4 359 384 105 -42.6 9 19 22 34 35 36 39 40 42 49 54 56 58 64 66 67 74 81 85 86 89 97 113 114 117 119 126 127 131 132 136 144 145 164 172 173 184 185 191 194 195 197 198 201 202 203 211 225 247 248 249 258 262 272 274 281 288 291 292 294 297 301 309 312 314 320 325 330 331 342 347 364 367 368 371 375 380 381 397 403 404 405 408 409 415 427 428 435 438 441 446 454 458 459 480 482 488 491 492 495 496 499 513 519 520 523 537 551 559 563 565 570 571 572 588 590 594 604 606 608 609 612 617 618 619 620 621 632 633 639 642 650 651 683 684 688 697 702 703 709 710 741 779 786 787 792 805 808 811 819 820 824 832 840 847 849 851 854 857 870 882 888 890 893 907 909 910 917 935 945 946 949 958 967 976 987 1007 1009 1010 1012 1023 1030 1035 1050 1053 1058 1065 1072 1073 1076 1077 1078 1079 1089 1093 1097 1110 1127 1129 1130 1131 1135 1136 1146 1149 1151 1155 1159 1175 1177 1190 1191 1192 1194 1201 1221 1239 1247 1255 1257 1260 1281 1283 1284 1290 1301 1302 1309 1312 1313 1317 1331 1332 1334 1335 1340 1350 1351 1365 1366 1367 1368 1384 1393 1397 1401 1402 1403 1411 1412 1426 1430 1434 1440 1446 1447 1448 1454 1461 1463 1464 1481 1482 1483 1503 1504 1505 1506 1517 1518 1520 1537 1544 1546 1548 1549 1554 1573 1577 1578 1585 1600 1603 1605 1610 1620 1623 1635 1641 1652 1653 1655 1661 1667 1707 1719 1726 1737 1742 1751 1761 1773 1797 1804 1805 1810 1815 1830 1831 1835 1851 1872 1882 1896 1932 1941 1942 1950 1956 1970 1975 1976 1980 1981 1989 1994 2018 2023 2027 2029 2044 2045 2065 2077 2085 2092 2109 2110 2117 2118 2129 2131 2134 2139 2149 2150 2155 2160 2173 2177 2178 2179 2201 2215 2225 2289 2298 2299 2328 39 52 59 60 84 122 172 235 265 295 355 373 412 432 451 504 505 518 519 526 539 561 562 564 613 630 643 666 719 735 760 790 821 837 850 885 886 931 938 993 994 1033 1064 1112 1134 1159 1169 1196 1212 1224 1239 1240 1289 1295 1324 1325 1326 1327 1329 1332 1369 1375 1379 1428 1446 1494 1514 1520 1556 1613 1615 1617 1619 1623 1624 1625 1626 1718 1722 1723 1742 1753 1830 1862 1870 1872 1918 1919 2024 2032 2044 2055 2128 2130 2149 2163 2172 2216 2247 2252 2253 2254 2255 2291 2304 CCACCA/TGGTGG 0 -5 334 361 108 -36.4 9 14 15 19 34 35 36 39 40 42 54 56 61 62 64 66 67 74 81 84 85 86 95 97 113 114 117 126 128 131 132 144 145 156 164 170 172 173 181 182 184 185 189 190 191 194 195 198 201 202 203 208 211 225 233 240 242 247 248 249 255 258 262 272 274 281 288 291 292 294 295 304 314 320 325 330 340 342 349 367 368 397 400 403 406 408 415 421 427 428 441 454 461 480 482 488 489 495 499 513 522 533 537 551 570 571 582 583 594 603 604 606 608 609 612 617 618 619 620 621 633 639 642 650 651 683 684 688 689 697 702 703 720 721 759 760 779 788 792 793 819 820 824 832 839 847 849 851 854 859 869 870 882 888 892 893 898 899 907 909 910 917 920 935 938 943 945 946 949 958 976 987 1006 1007 1010 1012 1030 1035 1050 1051 1052 1053 1057 1072 1073 1076 1077 1078 1079 1080 1081 1087 1089 1093 1097 1110 1127 1132 1134 1141 1146 1147 1151 1165 1166 1176 1190 1194 1198 1201 1221 1222 1238 1253 1257 1260 1279 1281 1283 1284 1289 1290 1293 1301 1305 1316 1317 1340 1346 1350 1351 1365 1366 1367 1368 1380 1384 1393 1397 1403 1411 1412 1420 1425 1426 1430 1440 1461 1463 1464 1473 1481 1500 1502 1503 1504 1520 1531 1537 1544 1546 1548 1549 1556 1560 1577 1578 1582 1585 1600 1603 1605 1606 1610 1620 1635 1640 1641 1644 1645 1652 1653 1661 1662 1663 1667 1705 1751 1804 1805 1809 1831 1835 1842 1872 1882 1941 1942 1950 1956 1975 1976 1980 1989 1994 2018 2020 2023 2065 2077 2085 2094 2109 2110 2129 2130 2139 2149 2150 2155 2160 2173 2174 2179 2215 2220 2225 2236 2237 2262 2265 2289 2298 2299 5 59 60 68 84 172 234 265 273 367 401 409 424 446 451 461 464 478 504 518 519 588 603 613 623 636 661 666 758 788 837 892 925 931 935 993 994 1019 1037 1064 1082 1128 1131 1133 1141 1169 1224 1234 1239 1240 1252 1275 1324 1325 1326 1327 1329 1332 1375 1377 1379 1479 1584 1613 1615 1619 1623 1624 1625 1626 1689 1722 1723 1742 1753 1781 1824 1825 1834 1866 1870 1901 1910 1911 1918 1919 1938 1940 1952 1963 1976 1984 2024 2031 2082 2154 2172 2180 2191 2203 2216 2247 2253 2254 2255 2264 2304 2308 ACCACC/GGTGGT 0 -3 332 355 95 -40.0 9 19 22 34 35 36 39 40 42 49 52 53 54 56 64 66 67 70 73 74 81 85 86 97 113 114 115 119 126 131 132 136 144 145 157 164 175 184 185 188 191 194 195 197 198 201 202 203 209 210 211 221 225 226 240 245 247 248 249 255 258 262 272 274 281 291 292 294 320 325 330 331 342 367 368 375 376 380 381 403 408 409 415 416 419 420 427 428 431 441 454 458 459 480 482 488 489 492 495 496 507 513 514 519 520 543 551 559 571 580 594 604 606 608 609 612 617 618 619 620 633 636 639 640 641 642 650 651 659 660 676 683 684 688 689 697 702 703 743 759 760 779 792 799 804 806 819 820 824 832 839 840 846 847 849 851 870 882 888 907 909 910 935 945 946 948 949 958 976 987 1007 1010 1012 1030 1035 1050 1051 1053 1058 1073 1076 1077 1078 1079 1087 1089 1093 1114 1129 1130 1134 1135 1136 1144 1145 1151 1155 1175 1190 1191 1194 1201 1221 1231 1238 1252 1255 1257 1258 1260 1281 1283 1284 1290 1301 1305 1317 1319 1331 1334 1335 1350 1351 1365 1366 1367 1368 1380 1384 1393 1397 1403 1420 1426 1430 1434 1440 1446 1447 1448 1463 1467 1480 1481 1505 1520 1531 1543 1548 1549 1554 1556 1573 1578 1585 1600 1607 1610 1620 1640 1641 1645 1651 1652 1653 1655 1662 1663 1664 1667 1707 1742 1751 1767 1794 1804 1805 1810 1830 1831 1835 1864 1865 1872 1877 1878 1881 1882 1925 1936 1937 1941 1942 1956 1975 1976 1980 1989 2017 2018 2029 2044 2045 2060 2065 2076 2077 2085 2109 2110 2129 2130 2138 2139 2149 2150 2155 2160 2173 2177 2178 2179 2182 2183 2201 2215 2225 2289 2290 2291 2292 2321 52 59 60 63 95 297 327 355 451 504 505 518 519 526 567 603 613 623 642 654 666 837 885 931 933 938 981 993 994 1019 1038 1064 1070 1107 1112 1116 1134 1169 1208 1234 1239 1240 1295 1324 1325 1326 1327 1332 1360 1374 1375 1390 1395 1407 1521 1525 1533 1567 1613 1615 1619 1623 1625 1626 1643 1718 1722 1723 1740 1742 1753 1824 1825 1830 1837 1870 1876 1901 1910 1911 1918 1919 1938 1939 1940 1941 1952 1958 2031 2195 2216 2231 2253 2254 2304 CTCCAC/GTGGAG 0 -4 242 258 82 -24.0 9 34 40 56 61 62 81 84 85 86 97 103 112 115 127 128 137 144 153 156 165 168 172 173 180 181 182 202 203 209 210 233 234 235 244 260 261 291 310 311 337 339 367 368 373 400 406 415 419 420 421 432 438 441 445 453 470 476 482 513 522 533 537 544 551 569 574 582 591 604 606 617 618 632 642 650 651 661 669 697 718 719 720 742 756 759 760 793 798 808 818 819 820 836 840 843 847 854 863 864 868 882 890 898 899 902 914 918 928 936 943 946 951 953 957 961 973 980 994 1004 1006 1007 1012 1047 1050 1052 1053 1057 1073 1078 1079 1104 1107 1110 1121 1125 1126 1127 1129 1130 1134 1151 1157 1159 1199 1200 1201 1247 1259 1261 1262 1269 1270 1283 1284 1293 1294 1306 1319 1329 1333 1339 1340 1342 1343 1344 1345 1353 1364 1368 1372 1389 1397 1405 1406 1413 1415 1439 1440 1460 1463 1470 1471 1502 1515 1527 1544 1546 1566 1583 1586 1603 1605 1610 1641 1647 1685 1691 1692 1705 1712 1722 1723 1737 1738 1751 1765 1809 1895 1907 1931 1941 1942 1956 1980 2018 2035 2048 2049 2052 2053 2063 2077 2085 2109 2110 2128 2130 2139 2160 2206 2219 2235 2246 2253 2274 2275 2285 2288 2298 2299 2310 23 60 150 162 168 169 186 204 229 383 386 399 421 432 464 518 519 564 567 575 613 642 724 752 788 903 921 958 993 994 1058 1059 1082 1097 1100 1128 1161 1169 1189 1199 1212 1222 1229 1239 1240 1323 1324 1325 1326 1327 1328 1329 1374 1479 1614 1619 1624 1625 1626 1641 1676 1781 1806 1808 1825 1870 1918 1942 1958 1959 1977 1996 2038 2080 2082 2086 2087 2124 2177 2214 2254 2331 CACCGC/GCGGTG 0 -4 203 221 42 -32.4 7 9 11 13 19 24 26 34 39 40 41 42 54 57 65 69 76 79 80 87 88 98 103 112 119 122 126 136 137 144 158 161 174 179 191 202 203 222 226 229 234 235 242 272 280 287 324 335 338 339 349 380 381 390 393 408 423 441 467 470 476 485 488 513 515 522 530 533 543 559 571 582 589 603 604 605 606 619 620 627 636 639 640 641 655 659 660 671 672 676 737 739 743 757 759 760 792 804 806 811 822 859 870 889 914 917 920 939 976 1000 1008 1010 1018 1040 1041 1057 1068 1071 1076 1077 1098 1137 1144 1145 1159 1160 1202 1234 1235 1241 1255 1257 1269 1280 1286 1287 1301 1303 1304 1319 1326 1353 1380 1384 1386 1387 1397 1403 1429 1436 1440 1463 1471 1480 1486 1513 1525 1527 1563 1574 1578 1606 1640 1647 1649 1650 1686 1688 1712 1732 1733 1738 1756 1784 1785 1799 1800 1835 1872 1882 1923 1925 1935 2021 2028 2061 2062 2063 2070 2109 2110 2112 2113 2141 2142 2143 2174 2180 2226 2227 2290 2293 2317 14 135 162 163 168 186 234 267 383 390 399 432 451 567 588 752 788 994 1055 1059 1064 1277 1325 1328 1342 1363 1376 1506 1613 1614 1619 1620 1722 1754 1781 1805 1868 1918 1996 2076 2087 2332 GCAGCA/TGCTGC 2 -3 168 186 41 -24.5 1 4 7 8 13 26 29 43 44 49 54 57 69 71 76 79 80 87 88 90 91 96 107 110 116 130 133 134 141 143 151 161 183 202 212 213 224 228 229 233 254 258 261 284 285 313 338 354 355 356 357 369 372 373 395 452 464 475 480 485 502 538 560 561 573 584 598 614 625 626 647 656 687 690 714 725 728 759 760 774 783 794 796 797 799 808 826 827 894 908 934 981 997 1025 1026 1038 1047 1062 1071 1073 1087 1101 1109 1127 1141 1144 1145 1157 1160 1169 1178 1188 1193 1234 1235 1237 1246 1258 1269 1270 1280 1285 1322 1324 1325 1347 1368 1378 1394 1473 1494 1525 1535 1555 1559 1596 1597 1606 1672 1789 1792 1793 1828 1843 1873 1883 1918 1919 1920 1926 1933 1934 1961 2019 2047 2069 2072 2091 2113 2114 2130 2132 2155 2174 2222 2298 2299 2307 0 3 213 255 456 502 571 580 618 681 697 731 957 963 1077 1136 1149 1151 1195 1205 1209 1273 1333 1337 1346 1367 1514 1604 1608 1653 1679 1780 1801 1864 1871 2018 2055 2141 2187 2223 2248 AGCAGC/GCTGCT 2 -4 170 178 57 -16.5 24 33 54 96 113 114 116 130 133 134 146 159 168 183 197 212 213 228 229 233 234 235 238 241 254 258 272 280 284 285 307 313 318 343 358 369 395 397 462 467 475 479 480 481 486 487 536 538 560 561 562 573 587 604 614 658 687 690 725 728 759 760 774 783 795 796 799 826 827 834 859 893 908 926 933 952 991 997 1024 1025 1026 1062 1071 1073 1080 1081 1084 1087 1101 1109 1127 1133 1138 1141 1160 1169 1172 1175 1184 1203 1215 1216 1234 1235 1237 1246 1255 1270 1277 1285 1321 1322 1331 1352 1368 1378 1406 1409 1414 1416 1473 1507 1566 1579 1580 1596 1597 1639 1672 1709 1710 1724 1789 1792 1793 1809 1837 1838 1843 1870 1883 1894 1904 1905 1918 1919 1920 1933 1934 1959 1960 1964 1965 2047 2052 2053 2069 2091 2114 2130 2143 2194 2203 2210 2232 2251 2259 2260 2289 2307 11 95 136 137 144 169 267 430 456 571 617 618 741 788 842 874 963 1037 1038 1039 1059 1074 1136 1149 1174 1205 1209 1257 1259 1333 1342 1367 1408 1410 1457 1479 1503 1604 1647 1679 1781 1801 1864 1871 1916 1989 2001 2048 2055 2128 2164 2187 2213 2248 2261 2280 2313 CGCCAC/GTGGCG 0 -4 159 166 44 -18.8 5 25 42 77 78 98 108 122 126 156 164 177 178 203 211 225 233 234 235 271 272 287 288 292 305 312 335 380 394 395 413 418 421 435 441 458 459 461 466 505 516 526 530 552 559 571 576 582 600 619 620 630 639 685 691 694 721 726 739 750 751 801 813 819 820 822 825 839 841 869 888 900 901 914 918 925 928 948 949 961 982 1042 1055 1076 1077 1122 1134 1141 1147 1159 1174 1187 1203 1224 1242 1257 1265 1266 1283 1284 1289 1340 1353 1380 1381 1397 1398 1403 1414 1426 1438 1440 1446 1447 1450 1475 1499 1500 1513 1525 1555 1566 1578 1583 1605 1606 1616 1617 1651 1720 1738 1828 1847 1864 1872 1899 1900 1908 1939 1980 2021 2028 2063 2075 2085 2109 2110 2123 2129 2130 2158 2180 2201 2220 2236 2237 2272 2273 2333 90 109 227 298 410 430 446 673 752 788 1045 1059 1064 1106 1131 1133 1190 1198 1221 1287 1326 1360 1376 1410 1479 1613 1614 1619 1620 1623 1780 1781 1796 1868 1917 1996 2078 2082 2084 2154 2172 2188 2308 2331 CTCGAC/GTCGAG 3 -4 159 159 53 -14.1 93 100 101 125 154 158 175 199 228 257 309 322 332 339 347 351 364 369 371 390 393 404 405 431 438 456 469 480 485 509 510 511 514 524 563 573 577 580 583 590 592 594 597 624 637 640 641 642 681 683 688 721 737 782 799 813 818 834 857 866 882 895 903 936 947 968 969 972 1007 1031 1065 1068 1092 1094 1111 1155 1157 1168 1178 1190 1217 1221 1276 1277 1280 1282 1294 1305 1329 1331 1333 1366 1367 1390 1420 1454 1469 1470 1476 1477 1494 1499 1510 1513 1519 1525 1546 1547 1563 1569 1571 1599 1623 1634 1643 1657 1658 1671 1691 1692 1751 1766 1768 1810 1811 1826 1853 1861 1862 1864 1870 1909 1910 1931 2028 2034 2052 2053 2078 2079 2111 2113 2128 2160 2164 2180 2188 2189 2201 2218 2256 2257 2276 2277 2285 2297 2340 2341 2342 25 97 297 298 320 331 332 335 343 489 554 582 596 706 716 729 730 786 792 821 835 939 991 1021 1180 1224 1244 1316 1353 1391 1394 1424 1443 1455 1456 1486 1509 1585 1673 1678 1903 1951 2037 2038 2050 2065 2094 2095 2115 2124 2125 2144 2219 TGCACC/GGTGCA 6 -4 139 153 34 -20.2 7 11 13 26 29 37 38 40 49 55 57 65 69 76 77 78 79 80 87 88 91 98 122 127 136 161 168 172 173 218 219 226 229 231 240 260 273 275 297 338 348 354 355 373 384 400 425 436 456 483 484 489 497 499 527 532 572 586 653 657 696 699 700 707 714 718 719 771 772 811 851 859 865 881 888 893 925 951 992 1034 1049 1098 1114 1154 1198 1297 1302 1309 1310 1361 1365 1379 1394 1410 1430 1448 1473 1502 1506 1553 1559 1589 1599 1603 1661 1707 1715 1716 1737 1765 1822 1823 1824 1825 1828 1830 1851 1871 1892 1945 1946 1961 1970 2070 2083 2151 2163 2170 2179 2185 2186 2187 2194 2196 2197 2224 2290 2306 2318 40 135 163 227 373 379 392 412 562 564 804 862 870 877 1022 1152 1196 1212 1283 1359 1446 1631 1671 1679 1688 1754 1878 2044 2128 2246 2248 2252 2261 2326 CGTCAC/GTGACG 1 -3 146 152 38 -18.2 14 15 42 90 119 130 132 150 156 200 207 209 210 225 226 234 235 247 248 249 265 266 272 281 286 287 288 290 315 316 334 340 353 370 372 382 388 389 415 437 466 468 557 568 571 589 600 612 627 643 644 652 654 665 668 676 683 715 733 749 777 780 782 786 787 813 822 838 849 866 868 905 918 921 935 940 947 948 992 997 1013 1029 1057 1100 1129 1130 1134 1149 1167 1207 1225 1272 1277 1301 1316 1339 1373 1378 1401 1402 1404 1410 1415 1419 1427 1428 1434 1476 1477 1482 1483 1509 1522 1526 1535 1537 1558 1560 1573 1578 1623 1640 1675 1713 1747 1763 1765 1806 1822 1823 1827 1895 1915 1957 1989 2036 2037 2041 2046 2199 2223 2225 2256 2257 2265 2269 24 39 105 213 249 315 415 451 456 489 604 617 618 628 790 824 885 915 952 1011 1122 1150 1172 1175 1252 1294 1472 1517 1586 1604 1711 1834 1837 1912 1984 2139 2184 2310 TGCAGC/GCTGCA 2 -4 129 150 40 -16.9 1 2 4 5 7 11 13 21 26 29 43 44 49 55 57 59 65 69 71 76 79 80 87 88 90 91 92 107 110 141 151 155 161 168 224 240 246 273 310 311 313 338 348 350 373 384 391 400 401 423 464 532 541 542 561 565 577 586 594 617 618 625 626 640 641 647 656 696 718 719 723 748 797 848 894 905 958 993 998 1025 1038 1060 1062 1144 1145 1160 1181 1184 1215 1216 1217 1368 1371 1376 1386 1387 1394 1418 1492 1493 1502 1533 1541 1553 1559 1584 1592 1606 1659 1680 1691 1692 1715 1716 1734 1748 1749 1828 1926 1940 1961 2108 2113 2134 2174 2222 2243 2244 2306 49 115 247 373 571 580 582 591 665 1041 1044 1050 1056 1075 1143 1212 1283 1316 1337 1350 1412 1588 1608 1653 1666 1680 1820 1864 1932 1988 2044 2052 2053 2054 2086 2141 2204 2256 2310 2333 TCGACC/GGTCGA 3 -3 148 149 41 -16.3 59 93 98 100 101 108 122 152 158 175 185 191 199 204 227 238 257 309 322 339 341 347 364 390 393 431 438 453 456 485 509 510 511 514 524 552 563 573 578 580 583 590 597 637 642 657 681 683 688 721 730 731 813 857 866 882 895 903 972 1007 1011 1013 1054 1065 1068 1111 1128 1148 1155 1157 1178 1190 1217 1221 1277 1280 1282 1294 1305 1318 1329 1331 1333 1340 1348 1366 1367 1392 1400 1420 1454 1470 1494 1498 1500 1507 1510 1513 1516 1519 1525 1539 1546 1547 1569 1643 1691 1692 1751 1790 1791 1794 1797 1801 1826 1853 1861 1862 1864 1909 1910 1931 1959 1960 1962 2028 2034 2078 2079 2084 2086 2111 2113 2128 2160 2180 2188 2189 2201 2218 2234 2256 2257 2285 2326 2340 2341 2342 78 297 320 331 332 335 343 473 489 554 671 729 773 786 789 862 939 1016 1055 1184 1307 1357 1391 1393 1424 1426 1456 1951 2022 2037 2038 2050 2064 2094 2095 2096 2124 2125 2223 2283 2308 ACGACG/CGTCGT 10 -2 145 146 40 -16.1 3 42 47 94 111 143 150 164 167 169 172 173 177 193 196 227 277 280 297 319 345 356 357 383 398 467 491 504 541 542 558 605 606 624 637 654 707 735 736 777 795 804 810 818 819 820 830 831 847 850 868 913 919 935 941 943 945 947 963 964 965 966 981 989 990 997 1008 1015 1019 1020 1036 1047 1083 1095 1105 1106 1107 1161 1182 1183 1184 1208 1248 1256 1264 1273 1275 1278 1282 1299 1307 1308 1326 1354 1373 1385 1401 1402 1410 1414 1415 1418 1451 1452 1471 1498 1503 1504 1538 1576 1607 1621 1640 1651 1763 1776 1777 1787 1789 1807 1808 1811 1829 1890 1891 1904 1905 1933 1934 1947 1948 1993 1998 1999 2013 2014 2048 2080 2104 2105 2115 2124 2225 2290 2329 37 39 52 100 136 138 168 213 252 382 402 556 580 653 730 773 818 823 830 842 896 981 1030 1141 1157 1161 1293 1363 1456 1637 1735 1811 1824 1830 1845 2005 2054 2108 2176 2192 CAGCAG/CTGCTG 2 -2 123 134 43 -12.6 7 13 29 49 54 57 69 79 94 113 114 133 134 146 161 183 202 212 213 224 229 233 258 259 277 280 284 285 313 336 338 356 357 372 393 398 414 467 475 480 485 538 561 604 647 687 690 705 714 729 759 760 770 774 783 794 799 826 827 832 851 859 893 908 934 963 1026 1062 1071 1073 1080 1081 1087 1139 1144 1145 1157 1160 1169 1178 1189 1237 1258 1270 1285 1368 1378 1416 1465 1469 1473 1525 1552 1566 1596 1597 1654 1672 1724 1789 1792 1793 1828 1831 1843 1894 1918 1919 1926 1933 1934 1969 1971 1972 1974 2047 2069 2072 2113 2114 2134 2169 2307 90 94 106 216 385 456 494 532 588 618 720 769 788 845 853 963 1004 1039 1064 1074 1136 1205 1209 1259 1282 1333 1410 1457 1479 1503 1604 1613 1647 1679 1780 1864 1884 2049 2069 2174 2211 2304 2313 GCCATG/CATGGC 4 -2 127 134 38 -14.3 10 35 58 68 95 105 106 109 123 128 136 149 166 189 190 220 228 243 246 268 282 283 289 290 293 326 327 381 419 420 442 456 458 459 466 471 472 492 522 532 541 542 566 568 578 591 625 626 629 630 643 644 648 667 700 705 750 751 762 809 835 836 849 880 882 884 888 890 920 930 931 937 977 979 995 1031 1048 1057 1061 1098 1158 1209 1226 1245 1248 1275 1289 1302 1340 1359 1386 1387 1406 1425 1449 1475 1536 1576 1586 1684 1685 1734 1762 1763 1776 1777 1868 1869 1899 1900 1908 1959 1960 1996 2023 2119 2120 2162 2205 2210 2219 2243 2244 2254 2281 2303 2304 54 172 233 256 284 356 385 400 401 491 495 529 540 548 602 615 810 850 853 861 1103 1372 1397 1408 1433 1485 1660 1671 1686 1816 1820 1858 1866 1932 1949 2203 2231 2312 GCAGTG/CACTGC 5 -4 117 134 14 -27.0 2 14 15 17 18 19 24 26 29 55 69 71 77 78 80 87 88 91 107 113 114 126 138 155 161 171 179 181 182 186 187 188 222 224 225 229 288 312 320 338 341 346 352 396 401 425 434 468 489 558 561 565 570 595 647 685 740 799 840 844 851 884 904 906 961 962 989 990 1010 1042 1044 1073 1157 1172 1173 1178 1181 1198 1230 1243 1254 1257 1274 1281 1286 1287 1339 1372 1389 1451 1452 1460 1466 1467 1523 1524 1540 1594 1595 1631 1654 1661 1707 1736 1765 1858 1859 1881 1893 1915 2130 2134 2139 2206 2215 2307 2322 27 178 615 687 720 924 1136 1285 1333 1510 1588 1753 2030 2132 CGCCGC/GCGGCG 0 -4 131 132 35 -15.1 6 9 40 93 103 137 138 162 168 191 199 216 222 229 237 238 261 290 296 315 316 321 382 390 433 503 511 517 524 530 549 567 595 622 623 624 637 648 655 687 721 743 759 760 761 774 775 792 804 813 818 821 888 928 956 960 976 978 981 989 990 998 1004 1010 1070 1072 1088 1114 1120 1126 1164 1168 1197 1198 1211 1212 1222 1244 1252 1257 1258 1260 1346 1356 1373 1382 1398 1435 1453 1461 1499 1508 1548 1549 1557 1622 1626 1639 1649 1650 1655 1656 1665 1680 1691 1692 1720 1722 1723 1726 1735 1776 1777 1780 1854 1855 1879 1916 1925 1936 1937 1949 1951 2055 2057 2123 2236 2237 2265 2310 2316 115 116 168 401 460 636 654 848 867 868 961 1022 1048 1059 1085 1097 1114 1130 1172 1174 1188 1205 1239 1361 1369 1470 1603 1614 1647 1868 1903 2023 2039 2107 2300 CCGTCA/TGACGG 1 -4 129 132 37 -14.3 48 70 156 165 194 195 196 200 209 210 225 234 235 245 247 248 265 266 272 281 288 290 293 326 327 335 340 370 413 437 444 467 489 540 557 560 568 571 589 600 606 646 665 674 675 688 709 710 715 733 766 767 776 777 780 782 784 785 786 787 803 813 824 866 871 872 935 940 945 947 968 969 992 1050 1100 1125 1129 1130 1139 1149 1167 1201 1252 1263 1267 1272 1301 1316 1373 1396 1401 1402 1415 1434 1443 1450 1522 1537 1561 1578 1631 1640 1661 1713 1783 1810 1819 1827 1836 1839 1886 1887 1899 1900 1915 1936 1937 1979 1984 1989 2082 2199 2219 2225 2256 2257 2330 2331 2332 162 239 249 315 411 415 489 604 628 740 760 895 1014 1160 1220 1393 1577 1594 1604 1697 1732 1834 1835 1837 1869 1891 1902 1912 1919 1938 1939 1941 1993 2008 2173 2177 2256 GTCACC/GGTGAC 1 -2 121 128 39 -12.8 14 15 22 32 42 81 115 119 126 137 156 184 207 209 210 211 225 226 249 265 266 268 272 281 287 301 306 319 349 353 372 388 389 458 459 470 551 557 565 571 600 627 649 652 654 665 668 695 700 741 777 786 787 798 813 822 847 849 868 889 930 931 935 956 992 1030 1035 1040 1041 1057 1090 1091 1100 1112 1129 1130 1132 1134 1140 1149 1159 1167 1225 1234 1235 1281 1298 1338 1349 1370 1373 1378 1393 1410 1415 1421 1434 1520 1522 1535 1560 1573 1578 1588 1636 1713 1772 1786 1827 1837 1838 1895 1952 2017 2046 2051 2102 2131 2219 2225 2266 24 39 98 213 236 249 315 451 487 520 530 539 628 698 772 790 885 892 952 992 1086 1181 1250 1252 1289 1394 1458 1514 1580 1825 1910 1911 1912 1947 1984 2030 2163 2173 2208 CACGAC/GTCGTG 0 -4 122 126 30 -15.9 3 21 25 36 39 83 127 145 146 168 169 178 201 205 227 230 254 263 264 270 279 297 320 322 356 357 498 541 542 598 605 617 618 628 634 636 704 708 735 736 754 868 871 872 923 935 936 941 947 963 964 965 1008 1015 1096 1107 1118 1138 1155 1162 1163 1165 1166 1182 1183 1195 1196 1217 1221 1222 1244 1246 1248 1268 1275 1278 1288 1307 1308 1330 1350 1351 1363 1365 1373 1385 1401 1402 1418 1451 1452 1503 1504 1576 1610 1642 1648 1651 1678 1726 1802 1803 1827 1830 1842 1852 1890 1891 1904 1905 1926 1954 1955 2048 2051 2055 2077 2093 2153 2216 2270 2271 11 100 409 594 649 652 653 799 830 842 859 861 896 910 981 1024 1030 1138 1157 1168 1286 1360 1563 1581 1604 1751 1778 1865 2087 2192 CGACCA/TGGTCG 3 -2 121 120 38 -11.5 3 21 39 52 53 93 108 145 175 185 191 204 238 292 309 320 322 364 431 453 482 483 484 509 510 514 552 578 580 617 618 633 654 668 684 688 708 717 721 727 813 873 882 895 907 913 972 983 984 1018 1065 1087 1093 1111 1144 1145 1148 1154 1155 1157 1190 1194 1263 1274 1277 1291 1292 1305 1329 1330 1340 1348 1366 1367 1400 1401 1402 1420 1425 1455 1470 1510 1519 1539 1543 1546 1569 1643 1704 1726 1751 1766 1787 1797 1842 1852 1864 1880 1895 1962 2034 2035 2051 2060 2078 2079 2111 2128 2131 2133 2188 2189 2201 2226 2227 2234 2241 2326 2340 2341 2342 19 78 162 297 301 331 335 412 489 502 652 671 729 799 808 861 1055 1135 1227 1293 1357 1360 1426 1438 1456 1489 1563 1593 1621 1647 1751 1825 1951 2087 2111 2124 2205 2283 CTGCAC/GTGCAG 6 -5 108 119 17 -21.0 7 11 13 26 29 37 38 46 49 57 65 76 77 78 79 80 87 88 91 107 161 168 204 229 231 240 260 275 310 311 338 350 354 355 391 400 409 425 497 499 532 566 586 599 601 638 656 699 707 718 719 727 811 844 848 855 856 942 951 964 965 992 1062 1098 1198 1309 1310 1358 1365 1394 1407 1408 1430 1448 1502 1506 1511 1512 1553 1559 1603 1643 1661 1691 1692 1696 1697 1707 1715 1716 1740 1741 1746 1828 1858 1859 1874 1892 1926 1940 1945 1946 1961 1970 2151 2211 2212 2224 27 237 379 562 862 877 938 967 1152 1196 1212 1245 1283 1483 1679 2086 2326 CAGCCG/CGGCTG 2 -2 105 118 27 -15.4 11 13 24 26 29 50 51 55 57 69 76 77 78 79 80 87 88 91 95 108 113 114 155 159 161 164 170 216 241 250 304 329 338 391 400 401 418 432 434 442 454 479 565 574 589 593 617 618 658 668 690 699 718 719 739 746 757 774 791 940 960 981 996 1044 1062 1114 1122 1125 1149 1155 1237 1247 1258 1267 1321 1390 1424 1431 1432 1499 1502 1567 1568 1574 1587 1690 1691 1692 1724 1743 1780 1789 1876 1904 1905 1916 1966 1994 2068 2177 2178 2216 2217 2319 2320 99 617 624 652 724 760 769 855 868 962 1037 1041 1112 1126 1199 1343 1412 1505 1584 1591 1647 1718 1723 2086 2177 2256 2315 CAGCAC/GTGCTG 0 -4 102 114 30 -13.2 1 4 26 45 49 54 76 80 82 87 88 97 145 151 206 224 228 251 284 285 292 313 315 316 338 365 366 369 373 386 387 393 426 485 491 513 538 559 570 572 573 588 598 614 619 620 647 653 670 756 790 797 808 863 864 879 906 923 943 963 994 1005 1025 1047 1066 1101 1105 1106 1109 1141 1178 1179 1180 1237 1243 1269 1280 1281 1358 1368 1513 1525 1532 1551 1555 1731 1742 1756 1795 1797 1896 1990 2028 2041 2047 2054 2113 2132 2185 2186 2187 2318 0 3 211 290 300 320 484 643 648 776 946 1089 1122 1273 1346 1367 1511 1532 1608 1653 1677 1724 1781 1871 1955 2055 2086 2187 2223 2304 GCCTTG/CAAGGC 4 -2 115 114 38 -10.4 6 10 19 30 31 58 143 149 185 186 187 222 294 295 302 324 328 371 378 384 406 417 455 481 491 527 547 575 624 649 664 748 759 760 789 805 828 829 915 916 970 971 979 1016 1019 1020 1034 1042 1056 1063 1139 1154 1170 1186 1205 1210 1219 1246 1269 1279 1288 1297 1302 1361 1394 1468 1498 1511 1512 1519 1542 1582 1585 1598 1614 1615 1681 1682 1761 1770 1832 1833 1837 1838 1843 1845 1846 1871 1906 1913 1941 1942 1964 1965 1974 2000 2003 2023 2068 2070 2080 2117 2118 2128 2139 2172 2174 2184 2219 2242 2249 2251 2252 2297 2317 8 35 172 178 201 267 360 394 463 469 536 561 699 762 1053 1118 1121 1126 1191 1206 1252 1274 1322 1350 1361 1432 1457 1701 1879 1882 1993 2025 2046 2163 2175 2255 2336 2337 CGCAGC/GCTGCG 2 -4 109 113 26 -14.7 28 46 96 133 134 137 143 145 212 213 216 243 244 250 298 315 316 328 340 356 357 372 391 442 452 480 485 490 500 516 593 598 611 640 641 642 667 669 687 690 723 728 749 774 781 783 791 794 808 819 820 867 896 908 934 981 1014 1026 1034 1047 1070 1076 1077 1092 1114 1125 1160 1178 1181 1188 1232 1258 1269 1280 1290 1324 1325 1346 1347 1388 1424 1525 1550 1555 1587 1618 1665 1669 1672 1764 1789 1828 1849 1850 1875 1879 1896 1904 1905 1921 1922 1923 2069 2072 2155 2167 2209 2259 2260 0 3 115 185 397 434 643 681 793 1084 1126 1152 1212 1337 1397 1678 1723 1894 2018 2023 2107 2125 2177 2191 2197 2330 GCACCG/CGGTGC 5 -4 103 111 35 -10.8 7 11 13 26 54 57 65 69 76 79 80 87 88 98 122 159 161 218 219 226 241 265 266 280 287 326 327 335 338 348 384 391 393 424 485 489 526 533 596 659 660 681 700 808 811 822 859 915 916 925 950 951 1057 1095 1098 1105 1106 1134 1151 1154 1165 1166 1179 1180 1209 1263 1280 1302 1358 1362 1410 1491 1513 1520 1525 1574 1584 1633 1756 1765 1807 1808 1811 1835 1849 1850 1884 1885 1918 1919 1925 1957 1961 2028 2070 2084 2113 2163 2194 2196 2197 2290 2318 14 28 40 71 102 135 163 230 432 461 819 837 862 892 1022 1055 1146 1196 1359 1379 1449 1512 1602 1679 1732 1754 1760 1781 1923 2246 2248 2255 2256 2261 2309 CACGTG/CACGTG 8 -1 105 111 24 -15.2 45 46 118 146 153 160 162 172 173 212 213 234 235 261 271 301 305 306 315 316 334 343 392 402 411 413 464 465 501 534 535 576 593 634 692 694 790 793 817 835 843 844 855 856 885 894 896 904 915 916 917 918 923 960 963 1029 1049 1063 1099 1103 1107 1110 1174 1176 1203 1224 1237 1239 1249 1265 1266 1272 1273 1296 1340 1342 1343 1353 1381 1382 1476 1477 1555 1590 1607 1614 1615 1616 1617 1657 1658 1713 1722 1723 1761 1795 1824 1825 1998 1999 2049 2075 2128 2270 2271 33 73 105 410 412 430 628 673 1032 1058 1098 1106 1190 1456 1506 1637 1719 1862 1923 2024 2028 2216 2260 2309 CCACTC/GAGTGG 12 -3 106 109 31 -11.8 97 120 159 202 241 251 256 275 279 293 309 325 347 354 355 356 357 364 432 438 448 449 454 466 482 497 563 590 596 610 629 645 683 748 775 780 786 787 801 808 825 857 903 921 998 1007 1025 1055 1065 1072 1103 1104 1111 1146 1187 1204 1210 1221 1265 1266 1293 1305 1314 1315 1330 1333 1344 1345 1376 1396 1397 1409 1420 1438 1462 1471 1502 1515 1544 1546 1570 1605 1606 1609 1623 1654 1698 1738 1751 1828 1829 1864 1899 1900 1950 2004 2056 2128 2130 2218 2235 2270 2271 2285 2310 2328 101 236 278 307 556 595 605 639 738 878 886 899 903 1019 1097 1164 1262 1340 1494 1514 1694 1806 1828 1881 1917 1918 1993 2038 2086 2111 2161 GACACC/GGTGTC 11 -3 99 107 25 -13.8 14 15 24 36 50 51 60 96 104 228 229 258 308 365 366 369 400 423 431 462 470 545 553 555 556 560 578 590 591 594 614 656 707 734 759 760 794 807 809 810 819 820 833 834 854 869 908 914 934 961 968 969 1013 1037 1040 1041 1065 1076 1077 1152 1153 1159 1170 1245 1267 1317 1326 1334 1335 1377 1427 1428 1482 1483 1511 1512 1516 1546 1550 1575 1584 1623 1676 1677 1704 1727 1742 1811 1888 2032 2033 2059 2086 2092 2226 2227 2314 2317 2325 124 266 271 288 300 301 418 434 480 537 602 692 846 901 1224 1405 1438 1486 1580 1709 1830 1873 1911 1941 1992 CGTTGC/GCAACG 7 -3 94 100 29 -10.7 94 143 170 197 218 219 224 237 239 243 254 297 298 326 327 353 358 361 367 368 373 392 409 412 416 457 503 507 511 524 545 549 568 591 605 632 637 642 647 654 716 725 728 743 774 793 796 803 812 869 874 875 925 941 979 982 1013 1034 1048 1070 1169 1175 1234 1235 1320 1324 1325 1363 1386 1387 1417 1431 1432 1440 1557 1649 1650 1664 1675 1722 1723 1816 2032 2033 2058 2092 2117 2118 2163 2172 2251 2288 2314 2322 159 224 266 324 449 707 737 772 913 931 948 953 1053 1088 1116 1122 1173 1230 1299 1300 1363 1397 1474 1566 1678 2216 2227 2248 2297 ACAGCC/GGCTGT 2 -3 87 99 33 -9.1 11 13 26 29 50 51 55 57 69 76 77 78 79 80 87 88 91 108 121 131 139 149 155 161 179 194 195 223 225 288 318 320 338 340 378 418 432 434 454 461 574 589 596 599 601 668 699 708 752 900 901 973 994 996 1022 1025 1155 1184 1237 1282 1329 1350 1351 1358 1394 1425 1444 1445 1456 1489 1567 1568 1645 1762 1876 1896 1935 1971 1972 2027 2085 2167 2228 2241 2254 2269 2282 189 235 263 377 394 409 483 597 617 643 763 998 1045 1112 1114 1199 1218 1265 1319 1376 1492 1584 1718 1834 1835 1850 1865 1959 2010 2075 2124 2175 2315 CGTTGG/CCAACG 7 -3 98 99 29 -10.5 33 108 111 150 164 206 212 213 216 233 297 305 323 340 365 366 383 388 389 490 507 544 546 569 603 606 663 727 735 736 752 788 790 798 813 819 820 830 831 881 885 953 957 966 1054 1095 1103 1132 1135 1136 1156 1184 1198 1223 1238 1274 1282 1295 1326 1349 1355 1368 1379 1399 1421 1429 1470 1473 1481 1492 1493 1560 1579 1580 1588 1636 1642 1646 1664 1707 1730 1740 1741 1781 1787 1811 1836 1839 1895 1902 1909 1910 1957 1982 2068 2085 2156 2302 103 105 173 254 286 402 409 431 473 644 652 700 730 777 818 842 980 1027 1059 1130 1146 1161 1391 1394 1402 1779 1792 1866 2267 AGCACC/GGTGCT 0 -6 93 98 32 -9.3 1 4 54 82 95 97 130 136 144 159 206 236 241 265 266 312 313 335 347 365 366 373 391 393 446 485 491 513 519 520 550 559 570 588 619 620 670 709 710 756 757 808 967 1005 1017 1095 1105 1106 1151 1165 1166 1179 1180 1209 1280 1281 1358 1368 1388 1401 1402 1491 1513 1517 1518 1525 1532 1554 1569 1584 1633 1737 1756 1761 1797 1831 1849 1850 1925 1951 1989 1990 2028 2054 2113 2132 2149 2150 2151 2171 2185 2186 2187 14 28 360 461 564 892 946 1055 1089 1130 1134 1363 1367 1381 1449 1511 1602 1677 1781 1833 1853 1862 1980 2024 2055 2086 2101 2187 2223 2304 2309 2335 CGTGAC/GTCACG 1 -3 92 98 23 -12.7 3 75 89 95 102 111 150 162 201 227 234 235 247 248 270 290 298 305 315 316 334 345 404 405 411 437 439 440 466 477 527 568 612 636 652 665 706 749 791 797 838 863 864 905 915 916 918 933 947 949 1029 1049 1103 1118 1226 1233 1236 1249 1250 1258 1268 1272 1380 1401 1402 1466 1467 1476 1477 1558 1585 1614 1615 1640 1651 1657 1658 1713 1722 1723 1752 1810 1829 1961 1998 1999 2041 2145 2146 2223 2269 2301 105 269 380 415 456 481 628 924 1066 1122 1150 1157 1175 1244 1310 1472 1586 1604 1711 1726 1793 2246 2336 GCAGCG/CGCTGC 5 -4 91 98 26 -11.4 11 26 33 49 55 71 80 87 88 94 107 110 151 171 202 234 235 238 246 272 302 305 315 316 348 350 358 380 401 423 467 471 472 486 487 500 515 536 541 542 577 587 749 755 795 859 891 1024 1034 1070 1071 1072 1087 1092 1138 1160 1172 1232 1331 1376 1396 1404 1409 1414 1416 1418 1473 1489 1541 1566 1579 1580 1680 1709 1710 1715 1716 1734 1809 1904 1905 2010 2011 2052 2053 2194 2198 2232 2251 2289 2306 11 126 571 582 617 680 842 1037 1038 1041 1044 1129 1152 1174 1188 1342 1781 1820 1882 1916 1989 2001 2054 2204 2261 2310 GTCACG/CGTGAC 8 -3 92 98 23 -12.7 3 75 89 95 102 111 150 162 201 227 234 235 247 248 270 290 298 305 315 316 334 345 404 405 411 437 439 440 466 477 527 568 612 636 652 665 706 749 791 797 838 863 864 905 915 916 918 933 947 949 1029 1049 1103 1118 1226 1233 1236 1249 1250 1258 1268 1272 1380 1401 1402 1466 1467 1476 1477 1558 1585 1614 1615 1640 1651 1657 1658 1713 1722 1723 1752 1810 1829 1961 1998 1999 2041 2145 2146 2223 2269 2301 105 269 380 415 456 481 628 924 1066 1122 1150 1157 1175 1244 1310 1472 1586 1604 1711 1726 1793 2246 2336 CCTCAC/GTGAGG 1 -3 89 94 31 -8.8 27 45 46 100 101 116 135 151 157 158 159 231 241 252 262 265 266 268 333 346 347 390 395 412 422 451 496 502 509 510 511 516 518 528 529 538 573 583 586 630 646 666 700 723 738 795 800 845 857 935 946 972 1011 1045 1048 1103 1127 1226 1268 1319 1362 1467 1506 1542 1669 1687 1736 1768 1771 1816 1871 1893 1907 1923 1945 1946 2018 2040 2088 2089 2132 2145 2146 2155 2206 2218 2234 2252 2305 75 121 157 197 211 327 353 391 461 559 588 621 776 822 910 1006 1009 1044 1145 1285 1293 1376 1556 1596 1783 1940 1946 2061 2094 2167 2279 GCGTTG/CAACGC 7 -4 91 94 27 -10.2 33 140 152 197 200 216 233 305 319 332 340 350 371 392 402 490 491 501 511 512 545 549 569 574 585 606 637 642 652 663 693 730 731 754 755 778 783 790 796 801 802 812 832 869 877 881 909 910 955 957 1008 1034 1070 1103 1156 1158 1171 1188 1205 1234 1235 1249 1274 1307 1308 1338 1346 1373 1409 1421 1431 1432 1473 1577 1589 1613 1642 1655 1661 1664 1675 1760 1816 1871 2068 2085 2156 2171 2202 2303 2304 65 104 105 251 254 283 339 471 644 700 829 913 923 949 956 1027 1059 1130 1162 1307 1308 1528 1566 1670 2038 2216 2297 CGTCGC/GCGACG 1 -3 84 90 18 -13.2 16 64 129 133 134 140 157 158 160 171 242 243 265 266 300 301 350 388 389 395 424 483 484 503 515 549 561 581 615 622 623 664 673 745 763 766 767 801 817 822 890 914 915 916 921 961 989 990 1008 1042 1053 1072 1115 1159 1182 1183 1210 1252 1256 1271 1286 1287 1364 1382 1392 1398 1419 1460 1554 1573 1584 1660 1722 1723 1807 1808 1843 1903 1921 1922 1927 1984 2017 2163 52 116 634 885 1044 1063 1118 1134 1172 1173 1397 1604 1702 1781 1796 1893 1964 2000 CAGCGG/CCGCTG 2 -2 84 88 24 -10.1 26 36 49 55 70 71 77 78 80 87 88 89 107 113 114 170 202 234 235 238 250 272 274 305 315 316 358 363 401 434 555 556 587 605 648 753 766 767 795 813 851 896 929 1010 1056 1069 1072 1100 1157 1160 1172 1236 1331 1416 1419 1425 1500 1503 1504 1621 1680 1715 1716 1726 1734 1809 1904 1905 1916 1949 2042 2043 2052 2053 2070 2076 2194 2198 2216 2235 2243 2244 2289 2290 64 135 623 635 654 696 772 1037 1041 1114 1152 1174 1209 1342 1402 1584 1647 1781 1882 2039 2054 2076 2261 2308 GGCACG/CGTGCC 8 -3 79 87 14 -14.7 1 4 25 45 56 60 99 120 128 162 166 234 235 263 264 286 343 358 371 465 540 541 542 574 576 616 634 674 675 694 699 712 713 735 736 780 790 794 821 835 858 879 897 1099 1158 1162 1163 1179 1180 1249 1272 1309 1347 1363 1425 1439 1515 1542 1576 1603 1614 1615 1651 1657 1658 1691 1692 1714 1761 1856 1881 1902 1929 1970 2003 2036 2037 2041 2081 96 105 409 412 425 447 583 835 1132 1153 1175 1584 1834 1902 TACAGC/GCTGTA 2 -4 76 85 27 -8.4 11 13 26 29 49 55 57 69 76 77 78 79 80 87 88 91 141 155 161 194 195 223 225 280 288 317 318 338 378 386 387 407 418 432 434 512 566 596 668 699 720 761 813 848 902 1084 1105 1106 1184 1237 1346 1380 1391 1409 1426 1469 1485 1489 1554 1681 1682 1726 1814 1843 1894 1911 1912 1935 1949 1971 1972 1990 2051 2167 2254 2312 211 416 518 519 532 623 776 875 1045 1122 1134 1398 1446 1503 1601 1895 1963 1989 1993 2054 2075 2083 2253 2254 2256 2279 2292 TCGAGC/GCTCGA 3 -3 79 84 27 -8.2 41 92 105 106 127 154 207 228 236 257 295 318 356 357 369 371 378 404 405 456 469 509 510 518 558 583 594 597 700 782 799 823 834 841 845 933 940 944 947 967 972 1000 1061 1092 1197 1203 1234 1235 1366 1367 1374 1390 1470 1476 1477 1482 1483 1508 1519 1569 1571 1639 1688 1691 1692 1766 1814 1826 1854 1855 1947 1948 2028 2048 2080 2100 2101 2145 2146 14 29 40 386 430 489 630 730 768 774 783 784 1035 1053 1191 1391 1509 1599 1726 1761 1768 1836 1951 2115 2171 2208 2309 CTGCCG/CGGCAG 2 -2 78 83 18 -11.6 24 55 77 78 91 107 126 159 162 170 178 188 196 225 241 272 288 312 319 403 443 482 490 492 502 515 540 562 648 653 688 716 726 797 819 820 849 867 891 947 979 981 1044 1060 1063 1104 1152 1153 1193 1202 1254 1339 1344 1345 1396 1446 1447 1453 1489 1535 1567 1568 1642 1661 1764 1874 1875 2010 2011 2025 2080 2097 2147 2148 2269 2270 2271 2321 126 213 255 303 327 403 461 548 1050 1129 1188 1196 1224 1505 1586 1719 1939 2068 GCACGT/ACGTGC 8 -2 77 82 14 -13.5 25 45 46 82 153 162 188 194 195 234 235 286 315 316 334 343 358 392 464 465 500 541 542 576 599 601 634 692 694 790 794 817 835 855 856 879 896 917 1049 1099 1107 1170 1174 1185 1237 1239 1244 1249 1272 1297 1347 1382 1439 1614 1615 1657 1658 1704 1713 1714 1717 1718 1719 1722 1723 1761 1795 1815 1824 1825 1856 1953 1981 2036 2037 2060 2249 33 96 105 187 260 488 628 913 1032 1058 1086 1153 1517 1549 GGTCAC/GTGACC 1 -3 75 81 27 -7.7 3 22 32 47 75 89 95 126 162 201 211 268 281 298 305 319 345 381 404 405 411 461 477 527 574 579 582 636 646 652 695 740 791 840 846 863 864 865 889 904 933 949 962 967 994 1017 1040 1041 1082 1092 1103 1114 1210 1233 1236 1238 1268 1380 1467 1520 1522 1588 1614 1615 1623 1654 1695 1772 1786 1810 1943 2008 2009 2102 2219 57 98 236 255 315 339 410 427 458 505 530 698 741 946 992 1037 1161 1201 1458 1621 1629 1793 1825 2073 2173 2242 2307 CGCTCC/GGAGCG 13 -4 72 81 16 -12.1 7 11 13 27 29 37 38 69 70 77 78 79 107 145 153 227 258 313 338 350 362 482 483 484 523 567 569 634 654 684 721 730 731 735 736 764 786 787 852 853 867 890 951 953 1126 1137 1141 1197 1201 1275 1282 1321 1342 1343 1422 1435 1527 1577 1664 1760 1816 1875 1951 1966 1975 1976 2047 2075 2123 2156 2205 2295 14 389 412 570 624 644 670 760 800 896 1139 1487 1567 1620 2094 2125 ACGAGG/CCTCGT 10 -2 78 79 23 -8.7 35 50 51 124 125 149 168 177 209 210 227 239 265 266 268 270 284 285 342 395 410 450 489 514 575 581 603 637 714 733 839 855 856 1026 1028 1072 1102 1148 1193 1215 1216 1222 1265 1266 1278 1293 1299 1317 1362 1381 1392 1429 1441 1482 1483 1542 1611 1628 1629 1648 1662 1663 1702 1727 1732 1733 1751 1776 1777 1856 1873 1874 1902 1929 2160 2169 2172 2251 65 77 224 277 445 446 627 669 676 707 1053 1143 1191 1213 1285 1339 1355 1404 1547 1668 1823 1836 2251 CGACCT/AGGTCG 3 -2 77 77 20 -9.4 21 98 127 152 158 178 199 217 322 332 339 347 453 485 511 514 524 540 573 583 597 637 657 687 857 866 874 875 903 911 936 1065 1068 1162 1163 1178 1263 1268 1282 1392 1454 1457 1507 1510 1513 1519 1525 1547 1587 1751 1794 1826 1830 1861 1862 1873 1909 1910 1921 1922 1931 2003 2028 2078 2087 2113 2160 2180 2218 2234 2241 2256 2257 2285 2340 2341 2342 229 343 355 409 460 554 823 1016 1336 1391 1513 1529 1604 1697 2037 2038 2064 2095 2171 2311 CGAGCC/GGCTCG 3 -2 73 77 24 -7.9 41 128 136 147 200 207 228 269 295 302 304 404 405 415 417 455 456 478 546 553 700 711 712 713 733 750 751 794 802 823 824 834 841 845 929 933 934 944 955 974 975 1085 1092 1165 1166 1247 1263 1306 1390 1400 1430 1470 1542 1625 1686 1709 1710 1766 1799 1800 1801 1909 1910 1977 2012 2026 2067 2080 2087 2158 2266 2319 2320 40 104 228 307 386 489 730 741 780 781 783 802 846 897 1162 1191 1208 1211 1282 1386 1734 1790 1836 2315 AGGCAC/GTGCCT 8 -4 73 76 20 -9.2 1 5 8 45 128 162 268 299 354 355 371 414 424 452 486 487 526 533 541 542 547 573 593 694 735 736 745 780 794 806 858 879 893 915 916 924 954 1039 1084 1099 1179 1180 1186 1302 1363 1394 1439 1475 1497 1539 1545 1576 1603 1614 1615 1651 1655 1657 1658 1724 1750 1761 1835 1851 1881 1929 1943 1970 2003 2081 2128 2182 2336 355 373 409 568 583 687 771 796 1128 1153 1178 1420 1488 1910 2008 2044 2068 2132 2255 2283 CCTCGC/GCGAGG 1 -3 72 75 25 -7.2 25 52 53 94 102 110 125 171 196 212 213 234 235 258 262 278 370 391 465 522 524 541 542 568 572 580 638 673 684 768 769 812 833 837 869 891 930 931 936 945 976 1006 1042 1067 1088 1140 1141 1223 1236 1275 1352 1374 1438 1442 1478 1479 1509 1784 1785 1860 1875 1888 1939 2075 2195 2274 2275 2326 2329 2334 2335 2336 100 137 267 286 432 489 506 535 602 625 876 1012 1065 1174 1251 1278 1420 1452 1672 1716 2008 2068 2095 2132 2188 AGCACG/CGTGCT 8 -3 70 75 20 -9.0 25 26 43 44 45 49 80 87 88 93 157 158 228 338 369 392 464 500 541 542 564 598 605 614 653 692 704 790 808 835 855 856 896 923 963 968 969 1107 1156 1170 1185 1237 1239 1247 1271 1297 1330 1334 1335 1398 1399 1439 1495 1496 1499 1551 1566 1620 1662 1663 1704 1744 1788 1795 1884 1885 1914 2041 2048 2073 33 211 297 484 555 585 649 776 819 861 1001 1058 1286 1522 1549 1724 1871 1912 2004 2224 CCTGAC/GTCAGG 1 -3 71 72 17 -9.6 93 150 251 265 266 270 325 337 399 413 438 452 468 519 520 558 564 607 655 683 687 695 747 757 789 854 861 873 882 894 958 1007 1070 1102 1104 1116 1149 1182 1183 1185 1213 1228 1229 1231 1267 1385 1393 1427 1428 1443 1446 1447 1455 1540 1728 1751 1794 1839 1864 1886 1887 1958 2079 2095 2096 2160 2177 2178 2194 2201 2290 105 271 273 669 881 882 1160 1374 1813 1916 1942 2059 2185 2246 2249 2261 2297 AGCCGG/CCGGCT 2 -1 61 70 22 -7.2 11 13 26 29 55 57 69 76 77 78 79 80 87 88 91 121 155 161 164 170 193 250 338 370 400 418 429 432 454 594 617 618 636 638 658 718 719 734 757 1176 1219 1220 1321 1390 1502 1509 1523 1524 1668 1686 1690 1724 1743 1988 1994 2068 2132 2177 2178 2196 2197 28 119 188 297 433 461 617 742 862 955 1248 1300 1328 1412 1505 1591 1722 1837 1917 2010 2086 2311 GCACGA/TCGTGC 8 -2 67 70 15 -10.1 25 43 44 83 99 128 207 230 254 263 264 270 279 307 332 351 541 542 564 598 605 616 634 653 735 736 780 858 897 923 963 968 969 1155 1179 1180 1210 1244 1271 1288 1309 1330 1363 1425 1439 1451 1452 1495 1496 1542 1576 1603 1620 1642 1651 1691 1692 1744 1788 1827 1881 1902 1929 1970 2041 2048 2073 409 484 595 649 830 861 1286 1522 1536 1584 1724 1834 1902 2009 2315 CGTCAG/CTGACG 1 -3 71 69 22 -7.0 70 170 209 210 220 315 316 321 325 363 407 413 437 467 468 527 557 558 597 646 687 716 737 747 854 933 958 968 969 1119 1133 1149 1169 1175 1226 1231 1241 1247 1267 1300 1332 1366 1367 1427 1428 1431 1432 1443 1537 1561 1570 1631 1681 1682 1752 1766 1819 1886 1887 1899 1900 1908 1940 1949 2068 2080 2082 2087 2330 2331 2332 90 102 112 239 400 480 484 604 760 870 882 1101 1160 1309 1374 1393 1594 2039 2185 2215 2229 2256 CAGCTG/CAGCTG 2 -2 67 69 21 -7.4 5 46 65 84 92 133 134 149 168 240 263 264 313 367 368 402 470 594 640 641 649 653 667 723 782 861 866 998 1005 1033 1051 1059 1084 1184 1215 1216 1365 1368 1378 1388 1414 1424 1444 1445 1473 1550 1681 1682 1799 1800 1837 1838 1843 1894 1921 1922 1940 2103 2108 2123 2203 2205 2256 2257 2259 2260 2312 115 456 741 788 801 1039 1212 1222 1257 1390 1410 1479 1485 1601 1680 1684 1805 2052 2054 2082 2125 TGCACT/AGTGCA 6 -4 62 69 18 -8.5 11 37 38 55 57 75 76 77 78 79 90 91 104 107 118 129 136 161 273 310 311 350 358 426 457 505 566 657 727 811 848 851 896 922 989 990 1052 1066 1099 1181 1240 1327 1358 1696 1697 1724 1736 1737 1740 1741 1809 1858 1859 1874 1908 1926 2067 2158 2179 2192 2193 2220 27 51 65 86 224 227 237 341 464 491 564 664 911 1109 1294 2051 2052 2086 CTGCAG/CTGCAG 5 -6 54 62 19 -6.7 2 5 11 17 18 21 26 43 44 49 69 80 92 110 135 141 151 240 246 273 313 348 401 541 542 561 565 594 835 848 958 1025 1062 1144 1145 1215 1216 1243 1327 1418 1492 1493 1523 1524 1533 1748 1749 1881 1961 2113 2222 2243 2244 2307 182 280 373 662 665 817 973 1041 1085 1316 1350 1454 1608 1653 1778 2044 2053 2054 2128 GGCACA/TGTGCC 8 -3 57 62 20 -6.3 17 18 22 52 53 149 180 218 219 247 248 253 299 332 343 354 355 391 402 413 414 486 487 547 593 625 626 657 678 722 744 745 885 904 929 950 1033 1039 1083 1122 1191 1227 1270 1373 1475 1545 1565 1655 1724 1786 1853 1938 1943 2182 2240 2254 2262 180 256 356 409 481 568 796 822 1058 1128 1197 1527 1787 1866 1889 1918 1936 2063 2099 2111 CTGCGC/GCGCAG 6 -5 52 58 8 -11.0 7 22 57 69 76 77 78 79 96 107 175 186 187 294 338 391 397 404 405 490 500 536 576 711 783 813 947 981 989 990 1014 1070 1187 1237 1375 1550 1555 1824 1825 1854 1855 1889 1911 1912 1921 1922 1923 1958 1969 2209 2223 2249 646 688 938 1040 2023 2091 2107 2193 CGTAGC/GCTACG 7 -3 54 57 16 -6.8 21 54 94 95 103 110 180 197 238 295 310 311 442 457 483 484 500 561 564 591 624 636 726 805 850 918 924 926 999 1026 1054 1161 1175 1211 1212 1215 1216 1217 1294 1332 1337 1431 1432 1585 1604 1621 1683 1745 1874 2088 2089 2278 2279 2280 146 237 348 535 712 746 849 1143 1205 1287 1845 2043 2118 2213 2229 2336 CGGTAC/GTACCG 9 -6 57 56 11 -8.8 33 109 123 178 193 274 365 366 379 382 413 416 434 478 541 542 569 587 681 735 736 799 851 964 965 980 1171 1191 1243 1244 1247 1336 1457 1486 1502 1581 1649 1650 1668 1687 1727 1799 1800 1807 1808 1928 1988 2071 2147 2148 2152 2207 2208 2223 2233 2234 2246 39 73 111 204 556 915 980 1184 1222 1703 2279 ACCGCG/CGCGGT 0 -3 54 54 14 -6.9 12 24 93 175 226 229 280 297 393 416 467 477 485 490 543 574 589 708 712 713 737 894 921 976 1000 1008 1144 1145 1209 1234 1235 1280 1286 1287 1347 1563 1564 1619 1634 1686 1699 1766 1835 1860 1868 1869 1923 2039 2112 2153 2200 2225 2262 2297 14 332 352 356 358 538 567 923 1039 1532 1563 1568 1570 2087 GCACGC/GCGTGC 8 -2 47 54 14 -6.9 8 24 33 46 60 93 104 110 128 174 194 195 207 228 369 371 409 467 496 500 614 674 675 679 699 704 712 713 808 1303 1304 1334 1335 1366 1367 1404 1476 1477 1566 1666 1788 1884 1885 1914 2064 2072 2170 184 211 412 447 555 776 819 875 938 1001 1122 1132 1483 2310 GCACTG/CAGTGC 5 -4 50 53 13 -7.2 55 91 92 107 138 161 224 240 386 387 425 443 489 505 647 657 685 689 844 851 906 922 989 990 999 1010 1097 1107 1134 1178 1181 1198 1206 1243 1254 1451 1452 1466 1603 1740 1741 1752 1762 1783 1858 1859 1896 2034 2179 2220 86 227 341 643 687 788 924 1102 1134 1479 1757 2082 2255 GCGAGC/GCTCGC 3 -3 49 51 14 -6.3 130 137 138 153 261 388 389 412 422 446 496 512 545 546 553 596 607 730 731 733 778 795 802 824 891 897 918 934 955 974 975 1085 1247 1286 1287 1331 1426 1530 1588 1633 1671 1720 1849 1850 1909 1910 1973 1984 2092 104 161 307 695 823 897 1222 1224 1326 1512 1989 2128 2129 2315 CGCACG/CGTGCG 8 -3 47 51 14 -6.3 8 24 47 110 162 174 188 230 254 270 279 307 315 316 332 334 467 496 634 679 692 740 790 835 917 1107 1174 1210 1288 1303 1304 1366 1367 1382 1404 1476 1477 1500 1666 1713 1722 1723 1788 1824 1825 2060 2064 187 260 410 447 595 628 797 1032 1058 1517 1536 2308 2310 2315 CGAGCG/CGCTCG 3 -2 46 47 10 -7.2 127 137 154 200 207 228 261 301 369 371 378 388 389 422 518 568 709 710 799 834 918 1366 1367 1399 1439 1476 1477 1519 1571 1575 1664 1691 1692 1849 1850 1854 1855 1947 1948 2058 2100 2101 2155 2171 2180 2223 29 489 628 784 823 1153 1391 1512 1726 2115 GGGTAC/GTACCC 9 -6 47 47 14 -5.5 123 141 240 365 366 384 385 401 455 488 589 621 643 644 652 670 741 844 876 880 958 970 971 1068 1108 1113 1117 1513 1525 1534 1727 1734 1801 1840 1841 1849 1850 1861 1862 1956 1979 2028 2180 2291 2292 2334 2335 24 58 227 338 590 823 1391 1565 1652 1667 1866 1929 2087 2180 TGCACG/CGTGCA 6 -4 40 44 13 -5.2 33 46 82 83 104 153 194 195 207 315 316 334 351 391 409 500 599 601 817 844 855 856 1049 1058 1062 1155 1244 1451 1452 1642 1717 1718 1719 1729 1815 1827 1981 2072 2170 2249 184 271 488 820 830 875 913 938 1086 1122 1483 1923 2009 TGCACG/CGTGCA 8 -3 40 44 13 -5.2 33 46 82 83 104 153 194 195 207 315 316 334 351 391 409 500 599 601 817 844 855 856 1049 1058 1062 1155 1244 1451 1452 1642 1717 1718 1719 1729 1815 1827 1981 2072 2170 2249 184 271 488 820 830 875 913 938 1086 1122 1483 1923 2009 CGGGAC/GTCCCG 9 -6 45 44 14 -4.9 142 185 313 371 383 418 483 484 574 648 663 667 738 739 752 776 867 951 964 965 1018 1108 1201 1251 1254 1372 1381 1450 1535 1620 1700 1701 1781 1802 1803 1895 1903 1926 1950 2010 2011 2190 2254 2302 2308 183 211 213 411 645 797 1038 1572 1754 1821 1895 2083 2245 2290 GTGCAC/GTGCAC 6 -5 35 42 9 -6.5 37 38 40 55 82 83 104 136 194 195 207 348 351 384 436 653 657 714 771 772 811 851 922 1049 1302 1369 1589 1719 1737 1809 1815 1981 2170 2179 2194 184 227 564 707 820 875 986 1110 2261