#2163/2163 #14.82 # k-mer/r.c. Cluster Offset PosCt wPosCt NegCt HGP_10 GGTGGT/ACCACC 0 -5 434 346 97 -37.5 83 84 108 111 121 130 131 138 140 141 144 145 151 164 166 168 170 171 178 191 194 196 198 209 211 220 221 224 227 231 233 235 236 237 240 243 244 250 251 252 255 256 261 264 265 271 274 275 278 280 283 286 287 288 289 292 298 302 304 308 309 314 315 316 319 324 328 331 341 343 344 345 347 349 353 354 361 363 364 367 368 370 371 375 376 380 386 387 390 391 394 395 399 400 404 406 408 413 419 421 424 425 426 430 435 439 440 442 447 448 450 451 452 456 458 461 462 463 464 465 470 471 479 481 483 485 489 490 491 493 495 497 501 503 504 508 514 515 521 526 532 536 537 538 539 541 549 550 551 554 556 557 562 570 571 572 573 575 577 578 579 582 589 594 595 602 604 607 610 612 613 618 620 627 629 631 632 635 636 637 639 646 648 649 651 653 656 659 664 670 672 677 685 687 695 697 700 703 704 716 722 728 731 736 738 752 756 759 760 762 768 772 774 775 777 779 782 783 784 789 793 796 797 799 803 811 816 819 824 825 826 827 831 839 840 841 844 847 849 853 854 858 866 869 872 873 874 876 882 890 891 895 898 901 902 906 907 909 915 923 928 934 935 938 940 952 972 977 978 979 980 987 995 1004 1005 1010 1014 1018 1027 1028 1033 1034 1036 1045 1046 1061 1062 1065 1070 1072 1082 1106 1108 1113 1115 1124 1125 1129 1132 1133 1139 1145 1146 1149 1151 1152 1156 1157 1160 1164 1167 1178 1181 1193 1194 1196 1197 1200 1208 1210 1211 1223 1226 1232 1235 1236 1237 1245 1269 1279 1285 1287 1299 1311 1316 1343 1352 1355 1356 1357 1366 1370 1371 1373 1377 1379 1380 1385 1399 1404 1405 1411 1412 1422 1425 1426 1431 1433 1439 1445 1455 1458 1460 1463 1468 1508 1510 1534 1538 1542 1543 1547 1549 1555 1590 1597 1606 1607 1616 1617 1628 1637 1638 1639 1668 1674 1675 1678 1688 1694 1698 1704 1706 1725 1802 1805 1825 1826 1845 1882 1893 1902 1907 1939 1940 1956 1958 1961 1970 1971 1973 1974 1978 1979 1988 2009 2014 2040 2047 2048 2058 2060 2061 2062 2064 2080 2087 2091 2094 2105 2111 2115 2118 2140 47 154 283 429 430 457 459 464 475 476 481 482 544 554 575 588 613 614 672 730 745 746 781 841 873 874 896 901 931 943 983 984 985 986 989 1009 1015 1032 1039 1040 1051 1053 1055 1058 1059 1097 1156 1220 1255 1292 1312 1324 1335 1345 1354 1355 1360 1381 1387 1417 1428 1452 1454 1457 1478 1514 1515 1523 1527 1546 1557 1558 1559 1560 1573 1575 1578 1590 1591 1596 1608 1615 1624 1637 1884 1906 1907 1943 1964 1967 1968 1969 1970 1971 1976 2051 2160 GTGGTG/CACCAC 0 -4 437 344 110 -32.3 108 111 130 131 138 140 141 144 145 151 156 164 166 168 170 171 178 191 194 196 198 209 211 220 221 224 227 231 236 237 240 243 244 250 251 252 253 255 256 261 264 265 271 275 278 280 283 286 287 288 289 292 298 302 304 308 309 315 316 319 324 328 331 335 340 341 343 344 345 347 349 353 354 361 363 364 367 368 370 371 375 376 380 386 387 391 392 394 395 399 404 406 407 408 413 419 421 424 425 426 430 435 437 439 440 442 447 448 450 451 452 456 458 461 462 463 464 465 470 471 475 479 481 483 485 488 489 490 491 493 495 497 498 503 504 508 514 515 521 526 532 536 537 538 541 549 550 551 552 556 557 562 570 572 573 576 577 578 579 589 594 595 602 604 607 610 612 613 618 620 625 626 627 629 631 632 635 636 637 639 640 646 648 649 653 656 657 659 664 667 668 670 671 672 677 678 685 687 695 697 700 703 704 714 716 718 722 729 736 745 746 756 757 760 762 763 768 772 774 775 777 779 782 783 784 789 793 796 800 803 807 819 824 825 826 827 833 839 840 841 844 847 853 854 858 866 869 872 873 874 876 880 890 891 895 898 901 902 906 907 908 910 923 928 934 952 962 963 972 977 978 979 980 982 988 995 1004 1005 1010 1017 1018 1025 1027 1028 1033 1034 1035 1045 1046 1050 1059 1060 1063 1065 1070 1072 1106 1108 1112 1113 1114 1115 1121 1124 1125 1129 1132 1133 1145 1146 1149 1151 1152 1156 1157 1164 1167 1169 1178 1179 1181 1193 1194 1196 1197 1200 1210 1211 1216 1217 1226 1229 1235 1236 1241 1245 1269 1279 1285 1287 1296 1299 1311 1316 1338 1343 1346 1352 1355 1356 1357 1366 1370 1371 1373 1377 1379 1380 1385 1399 1400 1405 1411 1422 1425 1426 1431 1433 1439 1455 1458 1463 1468 1471 1506 1507 1508 1534 1538 1543 1547 1549 1555 1590 1597 1606 1607 1616 1617 1621 1637 1638 1639 1668 1673 1678 1694 1698 1704 1716 1717 1725 1788 1882 1893 1939 1940 1956 1958 1961 1970 1971 1994 1995 2009 2011 2014 2040 2047 2048 2058 2060 2061 2062 2064 2080 2087 2091 2094 2111 2113 2115 2118 2129 2130 2140 2162 47 48 162 163 222 429 430 457 459 464 466 475 476 481 482 506 521 525 544 575 579 588 613 614 615 672 730 745 746 751 781 841 853 861 873 874 896 921 978 983 984 985 986 989 1009 1015 1039 1040 1051 1053 1055 1058 1059 1066 1097 1151 1166 1222 1251 1255 1262 1276 1292 1324 1335 1345 1355 1360 1381 1387 1428 1437 1452 1478 1514 1515 1523 1527 1536 1557 1558 1559 1560 1561 1590 1591 1596 1608 1614 1615 1617 1815 1841 1884 1887 1889 1900 1906 1907 1964 1965 1966 1967 1968 1969 1970 1971 1985 2051 2159 AGAAGG/CCTTCT 1 -1 191 280 87 -26.9 9 12 13 24 26 37 38 42 43 46 58 59 62 66 67 72 73 75 77 86 87 88 89 90 91 92 93 96 105 106 134 179 180 182 213 214 235 245 270 279 280 292 305 306 314 328 332 333 340 344 345 446 464 466 480 503 504 521 531 540 563 573 574 595 602 609 631 633 638 645 647 691 721 738 745 746 765 770 797 825 828 835 843 855 856 860 867 879 881 883 918 925 948 949 985 992 1013 1020 1031 1038 1046 1049 1116 1130 1132 1144 1176 1191 1201 1202 1206 1244 1252 1253 1283 1292 1324 1350 1381 1382 1384 1396 1401 1403 1404 1415 1435 1436 1456 1457 1479 1513 1514 1533 1535 1562 1563 1587 1588 1595 1602 1636 1639 1650 1657 1665 1666 1687 1700 1706 1720 1725 1727 1732 1733 1751 1764 1788 1799 1800 1801 1803 1815 1816 1817 1819 1822 1823 1827 1869 1877 1883 1884 1885 1906 1935 1943 1958 1969 1983 1984 2010 2044 2061 2063 2106 2109 2114 2120 2149 2151 2 6 7 15 38 41 161 162 165 180 196 208 214 220 221 222 226 291 389 430 442 444 445 452 464 630 633 638 641 647 656 658 684 691 693 833 835 845 863 901 906 922 924 944 950 1008 1039 1040 1044 1090 1148 1152 1169 1175 1178 1196 1204 1265 1339 1354 1377 1386 1475 1545 1573 1590 1591 1615 1633 1638 1641 1647 1673 1760 1824 1846 1864 1893 1973 2070 2074 2077 2080 2082 2083 2116 2146 AGGAGG/CCTCCT 1 -1 312 279 92 -25.0 0 1 2 108 120 121 130 131 137 138 140 141 144 145 151 156 164 171 180 194 209 221 237 238 245 249 251 252 253 261 264 265 266 271 275 283 286 287 289 294 295 298 303 308 315 316 323 328 330 331 337 338 339 340 342 343 349 353 355 360 363 365 367 368 371 376 391 396 399 400 404 410 419 435 437 442 446 447 451 456 458 459 463 467 468 472 480 482 489 498 499 503 507 512 514 520 521 530 540 541 548 551 556 572 575 581 598 605 608 610 611 612 613 619 624 628 629 631 636 648 649 653 654 655 656 660 666 668 678 680 681 686 695 718 725 733 734 740 741 743 744 745 746 750 753 754 760 765 766 768 772 779 781 782 793 798 801 823 827 838 849 850 860 862 866 867 869 870 873 874 880 885 887 893 898 906 909 923 925 934 937 959 979 982 1005 1012 1020 1026 1028 1034 1038 1041 1060 1074 1092 1101 1105 1108 1121 1133 1142 1146 1147 1150 1163 1164 1176 1178 1188 1189 1191 1193 1194 1202 1204 1205 1206 1207 1212 1216 1217 1221 1225 1229 1241 1258 1298 1299 1311 1329 1334 1338 1352 1368 1369 1370 1371 1377 1379 1380 1381 1393 1396 1399 1401 1413 1415 1422 1424 1431 1432 1436 1450 1458 1461 1474 1502 1510 1515 1516 1517 1534 1559 1560 1589 1606 1607 1622 1627 1637 1638 1652 1664 1670 1673 1686 1688 1703 1708 1718 1731 1739 1740 1757 1766 1774 1782 1783 1804 1819 1820 1821 1832 1841 1894 1895 1896 1897 1906 1907 1943 1970 1971 2027 2047 2048 2055 2060 2061 2068 2087 2111 72 115 116 118 126 165 391 433 445 447 448 459 460 475 476 478 506 575 593 601 613 614 625 626 705 720 746 757 767 782 841 863 864 901 963 987 1008 1021 1036 1045 1049 1051 1052 1053 1054 1058 1060 1061 1062 1086 1093 1098 1099 1129 1130 1142 1311 1319 1334 1377 1386 1388 1395 1398 1444 1459 1475 1490 1495 1514 1515 1542 1547 1559 1560 1573 1622 1632 1813 1906 1913 1939 1964 1966 1967 1968 1969 1970 1971 2115 2145 2162 GGAGGT/ACCTCC 0 -5 302 249 76 -24.4 85 108 111 120 121 130 131 137 138 146 151 156 164 166 170 171 178 196 213 221 223 225 233 237 238 240 243 245 246 251 252 258 261 265 266 271 275 285 286 288 295 298 302 308 309 315 316 319 323 331 338 339 340 342 343 344 347 349 350 353 355 360 361 362 363 371 391 396 399 400 407 410 416 417 424 425 433 436 442 444 448 451 456 459 463 465 472 480 489 492 493 495 497 498 499 501 503 507 508 512 514 515 530 541 548 549 550 551 554 562 572 575 577 595 598 606 607 610 612 613 615 631 632 635 636 639 648 649 650 653 654 656 662 668 669 672 683 687 697 700 719 726 728 731 733 734 740 750 760 761 765 768 774 775 777 779 787 793 798 801 803 808 809 815 817 823 826 827 838 842 849 861 866 880 882 893 902 922 923 934 949 977 980 982 992 1005 1010 1015 1017 1021 1024 1026 1028 1034 1046 1055 1057 1065 1070 1108 1113 1142 1146 1147 1154 1155 1156 1160 1164 1165 1167 1172 1178 1188 1189 1193 1194 1197 1199 1232 1236 1260 1276 1277 1278 1284 1293 1299 1305 1308 1316 1321 1322 1345 1346 1366 1368 1370 1371 1379 1380 1393 1396 1399 1404 1413 1431 1432 1439 1458 1461 1463 1474 1477 1494 1510 1515 1516 1528 1529 1530 1534 1569 1570 1575 1580 1590 1592 1598 1628 1637 1658 1659 1664 1689 1690 1702 1705 1757 1790 1807 1808 1819 1832 1898 1931 1932 2009 2023 2030 2038 2047 2048 2060 2061 2062 2068 2081 2087 2091 2135 2136 72 148 150 166 430 432 447 448 459 460 475 476 478 519 613 614 730 744 832 841 863 901 1005 1008 1049 1051 1053 1058 1059 1062 1098 1099 1129 1142 1252 1311 1354 1387 1388 1395 1444 1459 1478 1501 1514 1515 1546 1557 1559 1560 1565 1573 1574 1578 1590 1672 1676 1678 1682 1692 1704 1733 1764 1779 1807 1810 1812 1813 1842 1923 1964 1966 1967 1968 1971 2036 GGCGGT/ACCGCC 0 -5 234 235 56 -29.2 0 1 2 20 108 120 131 138 140 141 151 164 166 170 178 180 198 211 220 225 231 233 237 238 244 250 251 255 256 261 265 274 280 283 287 288 289 294 302 303 304 307 308 314 315 316 322 330 331 337 341 342 349 350 356 361 363 364 370 371 376 385 386 396 399 419 420 424 425 426 430 435 451 469 470 471 475 482 483 484 489 490 501 507 508 514 533 536 537 539 540 548 551 554 557 562 571 572 577 578 586 588 593 596 605 610 617 618 619 621 625 626 632 636 639 648 649 653 654 656 664 711 715 718 760 763 766 772 779 782 796 799 801 807 818 823 824 825 832 835 838 844 854 865 868 869 872 907 909 923 925 929 934 935 941 948 949 952 959 964 972 979 1003 1004 1037 1040 1066 1077 1090 1106 1108 1118 1130 1131 1133 1139 1141 1153 1158 1167 1208 1228 1230 1247 1287 1288 1292 1311 1316 1336 1343 1369 1372 1373 1377 1410 1438 1451 1455 1462 1468 1477 1512 1534 1541 1555 1560 1586 1590 1597 1601 1616 1623 1628 1662 1672 1687 1695 1698 1746 1777 1778 1832 1902 1980 1981 2014 2047 2048 2062 2085 2094 2096 2112 71 78 127 272 333 433 436 476 613 670 717 721 722 744 745 746 755 873 941 1021 1042 1051 1054 1058 1059 1061 1089 1096 1098 1099 1251 1324 1334 1353 1360 1386 1395 1438 1480 1483 1558 1620 1773 1776 1811 1829 1884 1927 1960 1964 1966 1967 1971 1992 2139 2147 GGCGGT/ACCGCC 5 -4 234 235 56 -29.2 0 1 2 20 108 120 131 138 140 141 151 164 166 170 178 180 198 211 220 225 231 233 237 238 244 250 251 255 256 261 265 274 280 283 287 288 289 294 302 303 304 307 308 314 315 316 322 330 331 337 341 342 349 350 356 361 363 364 370 371 376 385 386 396 399 419 420 424 425 426 430 435 451 469 470 471 475 482 483 484 489 490 501 507 508 514 533 536 537 539 540 548 551 554 557 562 571 572 577 578 586 588 593 596 605 610 617 618 619 621 625 626 632 636 639 648 649 653 654 656 664 711 715 718 760 763 766 772 779 782 796 799 801 807 818 823 824 825 832 835 838 844 854 865 868 869 872 907 909 923 925 929 934 935 941 948 949 952 959 964 972 979 1003 1004 1037 1040 1066 1077 1090 1106 1108 1118 1130 1131 1133 1139 1141 1153 1158 1167 1208 1228 1230 1247 1287 1288 1292 1311 1316 1336 1343 1369 1372 1373 1377 1410 1438 1451 1455 1462 1468 1477 1512 1534 1541 1555 1560 1586 1590 1597 1601 1616 1623 1628 1662 1672 1687 1695 1698 1746 1777 1778 1832 1902 1980 1981 2014 2047 2048 2062 2085 2094 2096 2112 71 78 127 272 333 433 436 476 613 670 717 721 722 744 745 746 755 873 941 1021 1042 1051 1054 1058 1059 1061 1089 1096 1098 1099 1251 1324 1334 1353 1360 1386 1395 1438 1480 1483 1558 1620 1773 1776 1811 1829 1884 1927 1960 1964 1966 1967 1971 1992 2139 2147 CGGTGG/CCACCG 0 -6 281 221 58 -25.2 108 131 138 140 141 151 166 168 170 171 180 198 211 220 231 233 235 236 237 238 240 243 244 250 256 258 261 265 275 280 283 286 288 289 292 304 307 314 315 324 328 330 331 337 341 342 343 344 356 361 362 363 364 370 371 375 376 380 385 386 387 391 394 395 396 399 408 418 419 420 424 425 426 430 435 444 451 456 458 461 463 464 469 470 471 475 479 483 484 485 490 491 501 508 515 521 526 539 540 551 556 557 572 573 579 586 588 596 604 605 607 608 610 613 618 619 620 625 626 627 631 632 636 639 640 648 649 653 659 665 666 695 700 718 725 731 738 759 760 763 772 774 779 782 783 784 787 792 796 799 801 803 823 824 835 836 838 839 840 844 854 865 866 868 869 872 873 874 884 887 909 915 923 925 934 935 948 949 952 957 972 1003 1004 1033 1040 1045 1046 1066 1094 1101 1106 1108 1132 1133 1139 1145 1146 1149 1153 1158 1164 1166 1167 1181 1228 1230 1241 1279 1287 1292 1300 1308 1336 1342 1343 1344 1355 1356 1369 1371 1373 1385 1404 1410 1415 1438 1444 1451 1455 1468 1470 1487 1508 1512 1541 1546 1549 1555 1560 1564 1579 1586 1590 1591 1606 1607 1616 1628 1639 1668 1672 1673 1688 1693 1698 1735 1758 1773 1831 1832 1855 1856 1857 1902 1961 1970 1971 1988 2047 2048 2062 2068 2085 2094 2096 2101 2105 2110 2111 2112 2131 47 72 127 283 284 433 476 481 482 544 588 613 730 744 745 746 781 841 844 858 874 943 970 987 989 1029 1051 1054 1058 1059 1061 1074 1098 1099 1282 1311 1324 1347 1360 1378 1424 1483 1514 1546 1552 1558 1560 1573 1575 1590 1591 1615 1884 1900 1906 1960 1976 2059 CGGTGG/CCACCG 5 -2 281 221 58 -25.2 108 131 138 140 141 151 166 168 170 171 180 198 211 220 231 233 235 236 237 238 240 243 244 250 256 258 261 265 275 280 283 286 288 289 292 304 307 314 315 324 328 330 331 337 341 342 343 344 356 361 362 363 364 370 371 375 376 380 385 386 387 391 394 395 396 399 408 418 419 420 424 425 426 430 435 444 451 456 458 461 463 464 469 470 471 475 479 483 484 485 490 491 501 508 515 521 526 539 540 551 556 557 572 573 579 586 588 596 604 605 607 608 610 613 618 619 620 625 626 627 631 632 636 639 640 648 649 653 659 665 666 695 700 718 725 731 738 759 760 763 772 774 779 782 783 784 787 792 796 799 801 803 823 824 835 836 838 839 840 844 854 865 866 868 869 872 873 874 884 887 909 915 923 925 934 935 948 949 952 957 972 1003 1004 1033 1040 1045 1046 1066 1094 1101 1106 1108 1132 1133 1139 1145 1146 1149 1153 1158 1164 1166 1167 1181 1228 1230 1241 1279 1287 1292 1300 1308 1336 1342 1343 1344 1355 1356 1369 1371 1373 1385 1404 1410 1415 1438 1444 1451 1455 1468 1470 1487 1508 1512 1541 1546 1549 1555 1560 1564 1579 1586 1590 1591 1606 1607 1616 1628 1639 1668 1672 1673 1688 1693 1698 1735 1758 1773 1831 1832 1855 1856 1857 1902 1961 1970 1971 1988 2047 2048 2062 2068 2085 2094 2096 2101 2105 2110 2111 2112 2131 47 72 127 283 284 433 476 481 482 544 588 613 730 744 745 746 781 841 844 858 874 943 970 987 989 1029 1051 1054 1058 1059 1061 1074 1098 1099 1282 1311 1324 1347 1360 1378 1424 1483 1514 1546 1552 1558 1560 1573 1575 1590 1591 1615 1884 1900 1906 1960 1976 2059 GGTGGC/GCCACC 0 -2 225 208 42 -29.4 5 6 8 20 121 131 138 140 141 144 145 166 180 191 196 231 243 250 256 258 261 274 278 280 304 309 314 316 322 331 337 345 347 350 353 360 361 364 370 371 380 386 387 399 404 407 413 419 420 426 430 435 437 439 448 452 458 461 462 472 475 480 483 489 490 493 497 498 507 508 512 515 536 539 549 554 557 577 578 586 589 596 605 607 608 610 612 619 620 625 626 637 639 640 648 649 653 664 665 668 672 685 687 703 718 738 763 768 774 779 784 787 792 801 803 807 817 819 823 824 825 827 828 838 839 840 844 850 853 858 866 872 890 902 931 948 949 952 980 982 1005 1012 1034 1047 1050 1059 1066 1072 1094 1108 1131 1133 1140 1145 1146 1149 1151 1153 1158 1165 1167 1193 1194 1200 1211 1223 1228 1230 1241 1266 1285 1287 1288 1299 1311 1342 1352 1373 1375 1404 1410 1415 1425 1426 1431 1439 1468 1471 1477 1487 1526 1527 1541 1555 1560 1590 1597 1601 1616 1637 1638 1639 1673 1692 1698 1764 1804 1832 1939 1940 1970 1971 2014 2047 2048 2058 2062 2068 2080 2083 2087 2094 2101 2111 2140 47 54 63 141 161 433 434 447 448 459 475 613 873 874 905 907 1027 1029 1051 1053 1059 1080 1098 1099 1251 1282 1289 1292 1335 1347 1360 1386 1414 1483 1552 1557 1561 1596 1884 1951 1969 2139 GCGGTG/CACCGC 0 -4 244 196 41 -27.0 108 120 131 138 140 141 151 164 166 170 171 178 180 198 211 220 231 233 237 238 244 250 251 255 256 261 265 274 280 283 287 288 289 294 302 304 307 308 314 315 330 331 337 341 342 344 349 356 361 363 364 370 371 376 380 385 386 387 394 395 396 399 419 420 424 425 426 430 435 451 458 469 470 471 475 483 485 490 507 508 514 515 521 537 539 540 551 556 557 562 571 572 578 586 588 596 605 610 613 617 618 619 620 632 636 639 640 648 649 650 653 654 656 664 665 666 677 695 700 711 718 738 760 763 766 772 779 782 792 796 799 807 823 824 835 836 839 840 844 854 865 866 868 869 872 887 907 909 923 925 929 931 934 941 948 949 952 959 964 1003 1004 1027 1037 1040 1066 1101 1106 1108 1113 1133 1137 1139 1149 1153 1158 1167 1175 1212 1230 1241 1287 1288 1292 1311 1336 1342 1343 1349 1355 1356 1369 1370 1372 1373 1377 1385 1404 1410 1417 1438 1444 1451 1455 1467 1468 1470 1512 1555 1560 1586 1590 1597 1601 1616 1628 1662 1664 1668 1672 1673 1674 1675 1693 1695 1698 1735 1746 1773 1829 1832 1902 1961 1980 1981 2014 2047 2048 2062 2068 2094 2096 2105 2111 2112 127 333 428 433 588 613 721 744 745 746 844 1042 1051 1054 1058 1059 1061 1098 1099 1251 1311 1324 1334 1347 1360 1386 1395 1424 1480 1558 1620 1773 1854 1884 1960 1964 1967 1971 1976 2139 2160 GCGGTG/CACCGC 5 -3 244 196 41 -27.0 108 120 131 138 140 141 151 164 166 170 171 178 180 198 211 220 231 233 237 238 244 250 251 255 256 261 265 274 280 283 287 288 289 294 302 304 307 308 314 315 330 331 337 341 342 344 349 356 361 363 364 370 371 376 380 385 386 387 394 395 396 399 419 420 424 425 426 430 435 451 458 469 470 471 475 483 485 490 507 508 514 515 521 537 539 540 551 556 557 562 571 572 578 586 588 596 605 610 613 617 618 619 620 632 636 639 640 648 649 650 653 654 656 664 665 666 677 695 700 711 718 738 760 763 766 772 779 782 792 796 799 807 823 824 835 836 839 840 844 854 865 866 868 869 872 887 907 909 923 925 929 931 934 941 948 949 952 959 964 1003 1004 1027 1037 1040 1066 1101 1106 1108 1113 1133 1137 1139 1149 1153 1158 1167 1175 1212 1230 1241 1287 1288 1292 1311 1336 1342 1343 1349 1355 1356 1369 1370 1372 1373 1377 1385 1404 1410 1417 1438 1444 1451 1455 1467 1468 1470 1512 1555 1560 1586 1590 1597 1601 1616 1628 1662 1664 1668 1672 1673 1674 1675 1693 1695 1698 1735 1746 1773 1829 1832 1902 1961 1980 1981 2014 2047 2048 2062 2068 2094 2096 2105 2111 2112 127 333 428 433 588 613 721 744 745 746 844 1042 1051 1054 1058 1059 1061 1098 1099 1251 1311 1324 1334 1347 1360 1386 1395 1424 1480 1558 1620 1773 1854 1884 1960 1964 1967 1971 1976 2139 2160 CTCCGC/GCGGAG 2 -5 201 194 48 -23.3 0 1 2 99 111 120 130 144 145 153 156 185 209 211 238 245 253 256 264 266 275 283 285 289 293 295 297 298 307 316 317 323 325 326 329 337 341 342 353 354 369 373 374 396 399 407 437 439 451 458 465 467 468 472 478 480 498 508 513 521 530 534 536 547 548 551 555 557 569 572 581 596 605 620 634 636 639 650 653 655 660 662 665 666 669 678 681 683 707 718 726 728 729 731 732 741 743 752 760 763 769 787 789 794 832 865 866 867 868 869 870 887 898 929 960 961 979 1016 1024 1044 1048 1066 1070 1108 1139 1142 1176 1178 1193 1194 1199 1202 1204 1205 1207 1227 1228 1229 1252 1253 1257 1258 1274 1275 1293 1299 1302 1331 1341 1342 1345 1356 1358 1368 1370 1372 1393 1404 1431 1436 1443 1456 1457 1467 1474 1534 1539 1584 1589 1599 1663 1668 1673 1688 1703 1731 1735 1737 1738 1753 1833 1834 1838 1847 1850 1907 1931 1932 1943 1978 1979 1980 1981 2001 2047 2048 2061 2068 2091 2104 2112 72 96 150 151 155 171 434 443 447 454 459 476 519 589 590 614 625 670 758 782 810 844 857 859 1087 1275 1335 1386 1399 1409 1442 1474 1558 1559 1560 1615 1702 1727 1787 1803 1810 1909 1937 1965 1966 1967 1968 2039 TCCGCC/GGCGGA 2 -4 196 193 39 -27.3 0 1 2 25 111 120 121 130 144 145 156 185 209 211 220 238 245 253 256 264 266 275 283 289 295 297 298 307 314 316 323 337 341 353 354 355 361 362 396 399 407 437 439 451 458 465 467 468 472 478 480 481 489 498 508 511 513 515 521 530 536 548 551 556 557 572 581 596 605 608 620 636 640 650 653 655 656 660 662 664 665 666 667 669 678 681 718 728 729 741 743 752 755 760 763 768 769 789 794 832 862 866 867 868 869 887 898 918 929 971 979 986 994 1000 1004 1036 1044 1048 1066 1070 1093 1108 1139 1142 1147 1178 1179 1190 1192 1193 1194 1199 1202 1204 1205 1207 1228 1229 1252 1253 1255 1257 1258 1274 1275 1293 1299 1302 1317 1341 1342 1345 1368 1370 1372 1393 1404 1431 1436 1444 1455 1456 1457 1474 1534 1560 1589 1599 1663 1668 1673 1688 1692 1703 1731 1735 1737 1738 1753 1820 1821 1870 1871 1931 1932 1980 1981 2047 2048 2051 2061 2062 2068 2091 2112 2131 64 72 155 434 447 454 459 476 519 590 593 603 625 670 784 844 859 1149 1244 1252 1275 1335 1347 1386 1443 1474 1535 1550 1558 1559 1560 1561 1579 1615 1813 1965 1966 1967 1968 CCTCCG/CGGAGG 2 -6 214 179 40 -23.5 31 32 33 111 130 131 138 140 141 156 177 185 196 211 238 240 245 253 256 264 266 271 275 283 286 289 294 295 297 298 307 309 316 323 337 341 342 349 353 364 385 390 396 399 407 437 439 442 448 451 456 458 465 467 468 478 480 489 497 499 508 513 521 525 530 536 541 548 549 551 554 572 577 581 605 610 611 613 620 636 639 650 651 653 655 660 662 665 666 669 672 678 681 683 700 719 721 723 726 728 729 731 743 745 746 752 760 763 769 782 787 789 832 866 869 870 876 898 915 922 925 958 979 980 992 1005 1044 1048 1066 1070 1101 1108 1137 1139 1142 1157 1160 1162 1165 1176 1178 1193 1194 1197 1199 1202 1204 1205 1212 1227 1228 1229 1232 1272 1290 1293 1299 1341 1345 1356 1360 1362 1368 1370 1372 1377 1393 1404 1420 1431 1463 1477 1508 1534 1535 1539 1542 1547 1579 1584 1589 1622 1623 1663 1673 1702 1707 1731 1732 1733 1737 1738 1743 1744 1804 1814 1820 1821 1832 1907 1931 1932 1943 1970 1971 1978 1979 2009 2047 2048 2061 2062 2068 2111 45 434 443 445 447 454 459 476 519 589 590 614 706 744 782 832 841 857 863 892 941 987 1288 1334 1361 1375 1386 1395 1415 1433 1474 1478 1514 1558 1559 1560 1810 1842 1969 1970 CGGCGG/CCGCCG 3 3 208 178 34 -26.2 0 1 2 140 141 180 220 225 226 283 288 289 295 304 307 308 330 349 356 363 370 385 406 424 425 426 439 441 444 451 463 465 467 468 469 470 471 475 479 483 484 493 501 513 514 525 533 536 540 548 564 572 578 581 596 605 608 625 626 632 655 662 667 669 681 683 687 693 711 715 726 729 752 760 766 771 779 794 803 818 824 832 835 841 844 845 851 854 865 867 868 869 882 887 898 915 918 923 935 939 941 959 964 971 972 994 1000 1005 1036 1037 1040 1066 1082 1090 1093 1114 1118 1123 1132 1139 1142 1145 1147 1159 1162 1166 1178 1179 1183 1190 1191 1199 1200 1202 1204 1205 1207 1208 1229 1235 1252 1253 1255 1257 1274 1275 1293 1303 1311 1317 1333 1336 1345 1369 1370 1377 1393 1410 1424 1431 1444 1451 1456 1457 1462 1467 1468 1474 1512 1526 1527 1542 1555 1586 1589 1590 1597 1623 1662 1663 1668 1688 1692 1703 1731 1735 1746 1753 1804 1816 1817 1832 1870 1871 1902 1931 1932 1980 1981 2027 2051 2058 2068 2091 2094 2096 2112 2131 10 71 78 436 454 519 590 613 670 755 844 859 862 941 1042 1061 1269 1395 1420 1443 1478 1535 1550 1560 1579 1616 1811 1829 1884 1936 1939 1950 1960 1992 TGGCGG/CCGCCA 5 -5 202 177 48 -19.6 20 111 120 121 130 131 138 140 141 144 145 151 156 166 180 209 220 225 231 233 238 243 244 250 253 255 256 258 261 264 266 274 280 283 287 289 308 314 316 322 323 331 337 341 350 353 361 364 371 396 399 407 418 430 437 439 451 452 458 465 467 468 469 470 471 472 479 480 481 483 489 490 493 498 507 508 511 512 515 536 539 548 554 557 578 586 596 605 608 610 617 620 621 625 626 632 636 640 648 649 653 656 664 665 666 668 687 715 718 724 729 760 763 783 799 803 807 823 824 825 832 838 865 866 872 923 933 941 949 952 962 963 973 1000 1003 1004 1036 1044 1066 1106 1108 1130 1131 1133 1145 1149 1150 1153 1167 1193 1194 1205 1228 1230 1247 1287 1288 1292 1299 1311 1316 1341 1342 1343 1366 1368 1369 1373 1410 1415 1438 1455 1477 1534 1541 1586 1590 1601 1628 1663 1668 1672 1673 1687 1688 1692 1698 1703 1763 1777 1778 1804 2014 2047 2048 2058 2062 2068 2085 2091 2094 2096 3 74 163 272 333 434 447 448 459 565 593 603 722 744 746 756 783 784 873 1042 1098 1099 1244 1251 1324 1334 1335 1347 1353 1360 1438 1483 1537 1557 1558 1559 1561 1813 1861 1951 1965 1966 1967 1968 2038 2044 2139 2147 GCGGCG/CGCCGC 3 2 175 156 24 -26.2 0 1 2 180 185 220 225 283 288 295 308 336 341 349 355 363 390 406 418 424 425 426 439 444 451 452 465 467 468 469 470 471 475 479 483 490 493 501 513 514 525 533 536 538 540 548 564 565 578 581 605 608 625 626 632 646 655 662 666 667 669 681 683 687 704 715 724 726 731 748 752 769 771 779 794 803 818 824 832 848 851 865 869 882 898 923 941 959 971 972 973 994 1000 1036 1037 1040 1049 1050 1053 1066 1093 1114 1118 1123 1132 1139 1142 1145 1147 1150 1159 1166 1178 1183 1185 1190 1191 1199 1200 1202 1204 1205 1215 1229 1235 1257 1311 1317 1336 1345 1369 1370 1377 1393 1444 1451 1456 1457 1462 1467 1468 1495 1496 1512 1520 1586 1589 1590 1598 1636 1662 1663 1668 1672 1688 1692 1703 1731 1735 1746 1804 1832 1901 1902 1931 1932 2011 2051 2058 2068 2091 2094 2096 2112 2131 10 47 78 135 334 436 613 755 756 905 971 1210 1311 1395 1420 1443 1506 1535 1575 1616 1811 1936 1939 1950 AGGCGG/CCGCCT 5 -5 156 135 36 -15.4 108 111 120 144 145 156 164 170 178 185 198 211 220 231 235 237 238 245 250 251 265 274 275 294 297 298 302 303 307 314 315 316 319 330 337 341 342 349 354 355 361 362 363 364 371 376 385 386 399 400 406 419 420 430 435 451 468 478 480 482 489 490 508 513 514 521 530 536 537 538 548 551 557 562 571 572 577 588 592 593 618 619 636 639 650 654 656 660 665 666 669 718 728 741 743 755 763 768 769 772 779 782 794 832 862 868 869 907 925 929 934 948 979 986 1037 1070 1077 1106 1108 1141 1142 1153 1158 1159 1166 1178 1192 1215 1258 1345 1372 1377 1404 1431 1444 1455 1468 1512 1560 1592 1599 1663 1695 1731 1737 1738 1820 1821 1832 1938 1980 1981 2047 2048 2061 2062 64 72 155 433 460 476 613 614 625 670 717 721 749 1021 1051 1052 1054 1058 1059 1089 1096 1149 1196 1275 1311 1386 1480 1483 1558 1575 1615 1810 1811 1964 1967 1971 GGCGGC/GCCGCC 0 -5 148 103 21 -14.8 156 180 185 220 225 235 258 283 288 308 341 349 350 356 361 363 371 400 406 418 430 439 444 451 452 465 468 470 471 479 483 490 493 501 508 513 514 525 538 540 548 564 578 581 608 625 626 632 633 655 666 667 668 669 681 683 687 693 715 724 726 769 771 779 794 803 824 832 841 851 869 882 923 939 959 962 963 971 972 973 994 1000 1005 1036 1037 1040 1053 1066 1093 1114 1118 1123 1132 1139 1145 1149 1150 1159 1162 1166 1178 1183 1191 1199 1200 1204 1205 1215 1257 1300 1303 1311 1336 1345 1366 1369 1456 1457 1462 1467 1468 1526 1527 1542 1586 1592 1599 1662 1663 1668 1688 1692 1703 1731 1746 1804 1816 1817 1832 1902 1938 2027 2068 2091 2094 2096 2112 2131 10 163 565 613 628 755 756 862 1196 1269 1311 1395 1420 1478 1483 1575 1811 1861 1936 1939 1951 GGCGGC/GCCGCC 3 1 148 103 21 -14.8 156 180 185 220 225 235 258 283 288 308 341 349 350 356 361 363 371 400 406 418 430 439 444 451 452 465 468 470 471 479 483 490 493 501 508 513 514 525 538 540 548 564 578 581 608 625 626 632 633 655 666 667 668 669 681 683 687 693 715 724 726 769 771 779 794 803 824 832 841 851 869 882 923 939 959 962 963 971 972 973 994 1000 1005 1036 1037 1040 1053 1066 1093 1114 1118 1123 1132 1139 1145 1149 1150 1159 1162 1166 1178 1183 1191 1199 1200 1204 1205 1215 1257 1300 1303 1311 1336 1345 1366 1369 1456 1457 1462 1467 1468 1526 1527 1542 1586 1592 1599 1662 1663 1668 1688 1692 1703 1731 1746 1804 1816 1817 1832 1902 1938 2027 2068 2091 2094 2096 2112 2131 10 163 565 613 628 755 756 862 1196 1269 1311 1395 1420 1478 1483 1575 1811 1861 1936 1939 1951 CGACGG/CCGTCG 4 -5 70 88 24 -10.1 0 1 2 47 48 160 235 244 364 375 478 549 596 604 620 663 667 681 721 745 746 759 775 854 864 871 879 886 930 935 971 972 999 1077 1093 1116 1132 1160 1162 1200 1215 1238 1241 1244 1272 1274 1275 1410 1474 1478 1520 1563 1591 1623 1662 1686 1753 1813 1829 1846 1851 1864 1883 1884 1891 1892 1902 1935 1967 1968 1 71 145 449 556 755 780 781 819 936 1042 1090 1335 1494 1535 1575 1599 1773 1884 1944 1960 1989 2050 2156 GACGGC/GCCGTC 4 -4 74 79 25 -8.0 0 1 2 375 441 483 525 552 565 590 596 683 688 693 715 726 745 746 756 759 803 832 841 864 865 868 872 879 882 886 887 930 935 939 962 963 964 971 972 1012 1045 1132 1162 1200 1214 1274 1275 1410 1451 1456 1457 1474 1495 1496 1520 1542 1547 1563 1582 1591 1662 1674 1675 1695 1766 1813 1851 1864 1870 1871 1896 1897 1980 1981 34 71 126 166 446 519 780 812 844 853 911 1042 1071 1096 1110 1151 1252 1441 1494 1547 1585 1631 1876 1944 1960 AGCGGC/GCCGCT 3 1 67 78 16 -11.4 0 1 2 287 295 336 355 356 386 390 444 467 475 538 578 605 607 640 646 655 704 724 771 819 848 860 865 994 1040 1049 1050 1093 1142 1147 1159 1179 1190 1202 1215 1229 1235 1329 1331 1370 1374 1377 1393 1405 1407 1451 1467 1512 1590 1599 1636 1701 1830 1851 1864 1886 1887 1901 1931 1932 2011 2058 2096 15 78 135 334 436 530 905 971 1210 1289 1314 1337 1347 1616 1936 1939 GCGGCT/AGCCGC 3 2 52 71 18 -9.0 5 6 27 28 44 45 350 386 430 469 538 564 607 621 633 641 654 669 735 819 860 894 911 939 962 963 994 1005 1114 1123 1145 1208 1246 1266 1278 1303 1329 1330 1348 1374 1393 1444 1467 1542 1592 1599 1701 1708 1830 1864 1994 1995 15 225 333 483 530 628 1062 1094 1196 1269 1289 1314 1337 1455 1478 1483 1861 2046 TTCCGC/GCGGAA 2 -5 50 58 18 -6.2 4 47 48 121 220 316 335 344 345 404 415 439 454 467 481 489 511 536 574 576 584 608 627 640 744 752 755 757 832 862 918 955 1000 1004 1027 1036 1093 1135 1148 1246 1301 1444 1455 1560 1726 1820 1821 1870 1871 2051 102 331 386 409 422 593 595 1035 1075 1134 1141 1198 1335 1347 1499 1561 2021 2133 TGCGGC/GCCGCA 3 1 60 55 12 -8.1 5 6 288 424 425 426 469 536 621 641 654 662 667 669 681 723 731 735 748 752 818 831 894 898 901 911 941 994 1013 1037 1114 1123 1175 1185 1208 1246 1260 1266 1278 1285 1330 1348 1393 1444 1456 1457 1495 1496 1517 1523 1528 1529 1530 1589 1598 1708 1735 1994 1995 2051 47 225 483 1062 1094 1196 1444 1455 1483 1506 1950 2046 AGCGGT/ACCGCT 5 -4 62 43 11 -5.8 168 171 236 289 314 315 344 357 380 387 419 454 458 485 515 556 567 579 596 603 613 640 650 700 721 763 839 840 866 887 931 933 1026 1037 1039 1043 1067 1085 1101 1137 1182 1353 1355 1356 1370 1404 1410 1417 1470 1560 1563 1597 1664 1668 1673 1799 1800 1801 1820 1821 2111 2117 247 729 853 1249 1284 1347 1399 1424 1438 1810 1816 CAGCGG/CCGCTG 3 0 48 30 9 -3.9 287 316 336 387 404 444 475 485 567 572 607 646 650 655 724 819 832 862 865 870 994 1022 1043 1067 1085 1093 1142 1182 1229 1292 1330 1370 1393 1405 1410 1451 1512 1560 1590 1597 1636 1682 1830 1864 1907 1989 2011 2058 247 334 460 530 905 1399 1441 1616 2021 GCGGTA/TACCGC 5 -3 33 30 10 -3.5 20 120 225 316 322 393 419 482 489 548 567 577 621 625 626 721 818 838 909 994 1073 1085 1290 1590 1597 1695 1777 1778 1820 1821 1951 1952 2061 476 670 747 1057 1399 1483 1734 1776 1966 1967 GCGGCA/TGCCGC 3 2 43 28 7 -4.3 156 235 287 356 361 400 444 468 470 471 508 640 668 693 723 841 901 1013 1093 1142 1159 1166 1179 1190 1212 1260 1285 1290 1300 1405 1407 1456 1457 1523 1526 1527 1528 1529 1530 1851 1886 1887 1938 163 862 1347 1444 1605 1939 1951 CGGCAG/CTGCCG 3 3 37 24 7 -3.4 156 235 287 298 400 444 468 470 471 508 668 760 841 858 860 962 963 968 1093 1101 1142 1158 1166 1191 1290 1456 1457 1743 1744 1777 1778 1818 1851 1896 1897 2127 2128 453 862 899 949 1194 1252 1546