Cluster #0, n=48
-3	.TGGTGG	1160	180	-200.2	1000/1109
-1	...GTGGTG	999	129	-186.3	393/598
-2	..GGTGGT	925	122	-169.5	858/874
-2	..GGTGGA	760	133	-117.1	656/711
-3	.CGGTGG	576	71	-105.7	522/525
-3	.AGGTGG	569	89	-92.3	526/528
-2	..GCTGGT	540	77	-92.0	408/475
-2	..GGTGGC	514	68	-90.8	419/455
-3	.TGCTGG	494	69	-84.8	392/423
-4	GCGGTG	358	52	-59.8	146/198
-4	CTGGTG	415	96	-50.8	214/319
-2	..CGTGGT	315	49	-50.7	186/245
-2	..GGCGGT	320	55	-48.5	158/248
-3	.AGGCGG	266	35	-46.8	173/204
-4	ATGGTG	482	144	-46.3	297/299
-1	...GTGGCG	273	44	-43.1	105/150
-3	.TGGCGG	275	45	-43.0	132/205
-3	.AGCTGG	320	70	-41.0	226/256
-2	..GGTGGG	312	67	-40.5	267/283
-1	...GTGGCT	373	101	-39.5	196/223
-1	...GTGGAG	426	138	-37.2	239/271
-3	.CCGTGG	230	37	-36.4	130/174
-2	..GGCGGA	212	31	-35.5	132/154
-1	...GTGGCA	269	70	-29.7	141/158
-3	.GCGTGG	183	32	-27.8	114/134
-4	GAGGTG	266	74	-27.5	143/151
-2	..CGTGGC	222	53	-26.6	125/143
-4	ACGGTG	274	81	-26.6	166/176
-1	...GTGGTC	260	74	-26.3	168/180
-2	..GCTGGC	175	33	-25.3	138/148
-3	.CGGCGG	203	48	-24.6	112/135
-2	..GGCGGC	185	40	-24.2	97/111
-4	GAGGCG	167	32	-24.0	60/88
-2	..GCTGGA	247	75	-23.4	165/176
-4	CCGGTG	189	49	-21.2	107/119
-3	.GGGTGG	178	44	-20.9	151/156
-3	.GGCTGG	165	40	-19.8	109/129
-1	...GTGGCC	160	39	-19.1	102/113
-1	...CTGGTC	190	56	-18.8	87/98
-4	CAGGTG	198	62	-18.3	128/133
-1	...GTGGAC	183	56	-17.4	101/113
-2	..GCTGGG	128	28	-16.9	88/95
-1	...CTGGTA	175	56	-15.9	87/92
-2	..GGCGGG	101	19	-15.2	70/83
-1	...CTGGCG	87	20	-11.5	30/53
-3	.CGCTGG	110	34	-10.8	74/84
-4	AGCGTG	86	24	-9.6	38/44
-1	...CTGGCC	78	21	-9.1	20/39
Cluster #1, n=7
-2	.GTGGTG	999	129	-186.3	980/993
-3	GGTGGT	925	122	-169.5	367/480
-2	.GCGGTG	358	52	-59.8	279/314
-1	..TGGTGC	325	78	-38.5	159/199
-2	.GTGCTG	200	49	-23.5	140/160
-3	AGCGGT	153	34	-19.8	75/81
0	...GGTGCT	188	58	-17.7	54/97
Cluster #2, n=20
-4	ACCAGC	540	77	-92.0	316/361
-3	.CCAGCA	494	69	-84.8	426/437
-2	..CCGCCA	275	45	-43.0	198/217
-2	..CAGCAA	374	108	-37.1	374/374
-2	..CAGCCA	271	80	-26.4	221/235
-4	GCCAGC	175	33	-25.3	91/109
-2	..CAGCAG	285	92	-25.0	235/256
-2	..CCGCCG	203	48	-24.6	152/178
-3	.GCCGCC	185	40	-24.2	71/100
-2	..CAGCAC	200	49	-23.5	112/126
-4	TCCAGC	247	75	-23.4	155/163
-3	.CCAGCC	165	40	-19.8	129/130
-4	CCCAGC	128	28	-16.9	90/94
-2	..CAGCTG	138	36	-15.7	74/192
-3	.CCCGCC	101	19	-15.2	55/56
-4	CGCAGC	133	38	-13.9	59/85
-4	GGCAGC	130	39	-12.9	58/70
-2	..CCGCAA	121	38	-11.5	100/104
-2	..CCGCAG	102	30	-10.6	62/79
-2	..CAGCGG	100	30	-10.2	57/67
Cluster #3, n=5
-2	.CTGCCA	176	42	-21.3	166/166
-3	GCTGCC	130	39	-12.9	114/114
-3	ACTGCC	95	25	-11.1	89/90
-3	CCTGCC	85	21	-10.6	77/78
-2	.CTGCCG	82	23	-9.2	73/74