#4373/4373 #8.26 # k-mer/r.c. Cluster Offset PosCt wPosCt NegCt HGP_10 GGAGGA/TCCTCC 3 -3 444 456 115 -52.3 1 2 7 8 16 30 38 69 75 86 88 93 104 105 108 122 126 136 142 145 176 185 186 189 204 205 209 228 235 247 259 261 313 323 355 360 361 368 375 392 410 424 426 429 435 441 442 446 449 450 452 456 460 463 464 475 483 489 498 503 504 511 515 516 535 546 548 555 558 569 576 592 594 603 604 611 615 617 632 634 639 644 645 658 670 671 676 706 716 717 724 727 730 737 750 760 762 763 767 777 778 780 790 803 817 823 832 842 855 856 858 859 869 876 883 902 912 923 933 940 949 953 954 984 997 999 1002 1015 1019 1033 1056 1072 1075 1084 1085 1091 1124 1126 1134 1135 1142 1143 1158 1159 1176 1185 1196 1212 1215 1238 1250 1267 1297 1300 1301 1310 1311 1313 1320 1324 1340 1341 1350 1383 1384 1385 1398 1401 1411 1412 1413 1415 1417 1423 1428 1434 1449 1455 1469 1491 1511 1524 1525 1533 1540 1541 1555 1563 1568 1569 1570 1588 1589 1602 1616 1617 1639 1651 1657 1661 1685 1687 1717 1747 1748 1749 1781 1783 1816 1818 1832 1886 1905 1933 1947 1958 1959 1966 1970 1973 1974 1995 1996 2030 2036 2043 2047 2057 2081 2089 2092 2102 2104 2123 2126 2138 2173 2189 2199 2206 2217 2224 2226 2229 2237 2242 2252 2267 2269 2270 2271 2276 2291 2292 2305 2306 2311 2321 2376 2377 2387 2393 2396 2407 2408 2414 2419 2420 2426 2443 2481 2482 2486 2492 2499 2510 2543 2545 2570 2571 2573 2575 2577 2584 2593 2599 2611 2615 2628 2645 2652 2653 2661 2666 2672 2675 2677 2687 2693 2711 2727 2742 2752 2788 2808 2818 2827 2832 2837 2841 2845 2856 2862 2870 2890 2891 2912 2927 2934 2937 2954 2960 2983 2990 2993 3020 3030 3033 3053 3078 3079 3092 3095 3111 3115 3117 3132 3139 3147 3149 3164 3181 3183 3210 3259 3261 3271 3280 3284 3286 3301 3318 3319 3370 3381 3393 3405 3408 3411 3427 3431 3444 3445 3447 3463 3465 3469 3475 3476 3483 3498 3500 3506 3509 3519 3537 3540 3586 3603 3605 3606 3607 3608 3640 3642 3674 3675 3711 3712 3735 3737 3739 3740 3762 3769 3787 3796 3805 3827 3832 3839 3877 3879 3904 3907 3951 3952 3959 3993 4004 4008 4009 4016 4017 4018 4020 4022 4023 4066 4069 4084 4101 4106 4107 4108 4127 4137 4202 4220 4229 4240 4241 4259 4263 4287 4295 4318 4319 4320 4330 4331 4339 4357 4372 57 63 66 124 160 166 201 204 220 320 353 354 467 500 584 630 653 699 719 740 862 870 882 1072 1090 1091 1095 1098 1169 1178 1181 1201 1245 1264 1320 1369 1380 1476 1488 1512 1533 1550 1556 1569 1601 1620 1629 1673 1687 1763 1864 1868 2080 2163 2186 2198 2204 2260 2294 2328 2368 2387 2399 2423 2472 2530 2531 2563 2589 2606 2663 2671 2672 2705 2845 2847 2890 2971 2972 3027 3050 3058 3097 3123 3145 3219 3235 3243 3318 3332 3351 3373 3406 3436 3470 3504 3585 3683 3687 3810 3828 3856 3860 3894 3895 3904 3940 4018 4026 4104 4115 4158 4273 4312 4345 TGGTGG/CCACCA 0 -3 438 455 150 -39.2 1 2 6 18 21 26 35 38 40 44 48 50 57 69 70 78 86 108 120 130 136 143 146 148 159 161 164 186 201 202 204 205 208 217 226 229 230 231 235 248 261 263 285 340 357 361 369 370 383 392 394 395 407 411 421 422 436 449 450 451 452 461 477 479 486 490 498 500 509 510 519 531 565 581 592 593 600 601 608 632 644 645 646 666 667 695 697 724 725 734 741 754 756 767 768 773 785 793 802 808 809 811 826 828 831 840 846 860 861 872 874 875 902 903 914 933 942 945 962 968 969 976 983 988 991 1001 1007 1011 1017 1023 1050 1052 1054 1095 1096 1105 1118 1124 1126 1140 1142 1143 1153 1187 1206 1212 1216 1229 1232 1247 1251 1252 1269 1270 1276 1284 1290 1294 1309 1314 1315 1320 1324 1329 1336 1345 1351 1377 1396 1403 1404 1405 1417 1428 1447 1451 1456 1461 1463 1475 1498 1509 1514 1517 1518 1542 1556 1558 1562 1574 1585 1589 1600 1602 1609 1618 1621 1626 1645 1646 1651 1676 1690 1718 1739 1749 1751 1759 1760 1786 1789 1791 1792 1801 1812 1816 1827 1832 1856 1860 1868 1885 1889 1901 1902 1923 1932 1937 1938 1950 1958 1959 1978 1989 2025 2075 2094 2095 2117 2126 2130 2132 2133 2139 2143 2151 2160 2211 2213 2217 2224 2226 2227 2246 2261 2262 2265 2273 2274 2275 2282 2289 2290 2321 2338 2381 2385 2394 2404 2432 2433 2443 2449 2467 2493 2500 2524 2541 2562 2575 2591 2592 2594 2599 2602 2608 2625 2627 2628 2629 2632 2633 2634 2647 2648 2660 2680 2715 2734 2739 2741 2755 2821 2827 2832 2838 2869 2896 2908 2919 2922 2946 2948 2951 2980 2981 2982 2985 2986 3020 3025 3030 3034 3056 3057 3112 3120 3121 3123 3127 3155 3162 3167 3185 3190 3191 3197 3205 3207 3208 3210 3225 3228 3229 3233 3239 3251 3326 3337 3338 3355 3402 3428 3431 3456 3465 3466 3468 3472 3477 3485 3494 3498 3500 3504 3511 3536 3540 3545 3546 3554 3557 3564 3567 3569 3607 3608 3616 3617 3647 3677 3689 3692 3696 3711 3712 3730 3737 3755 3759 3760 3771 3772 3809 3810 3817 3821 3849 3856 3880 3897 3898 3914 3917 3948 3959 3984 3985 4007 4024 4033 4048 4049 4101 4107 4132 4134 4146 4154 4157 4158 4182 4191 4198 4205 4222 4223 4224 4248 4273 4274 4295 4298 4312 4327 4331 4339 4351 0 11 17 33 66 165 181 220 265 266 273 289 290 343 346 353 354 462 469 471 501 510 515 553 554 612 645 662 671 698 720 793 853 901 1090 1091 1111 1143 1189 1207 1246 1275 1276 1345 1347 1373 1380 1382 1432 1492 1513 1522 1523 1549 1608 1611 1620 1628 1640 1734 1742 1745 1751 1828 1833 1836 1844 1891 1902 1910 1962 1984 2003 2014 2100 2104 2123 2168 2227 2229 2295 2370 2399 2400 2430 2431 2437 2458 2500 2527 2576 2606 2630 2752 2780 2793 2824 2839 2847 2864 2885 2959 2971 2972 2981 3045 3050 3121 3143 3161 3162 3208 3209 3225 3226 3253 3352 3381 3441 3490 3528 3563 3567 3585 3647 3682 3708 3724 3818 3820 3853 3871 3904 3936 3937 3945 3977 3986 4008 4015 4020 4059 4085 4102 4116 4150 4251 4354 4362 4366 GTGGTG/CACCAC 0 -1 424 441 108 -51.9 1 2 3 6 18 19 26 35 44 50 69 70 72 73 86 90 95 108 130 136 146 154 158 159 164 189 201 202 204 205 208 217 226 235 241 249 258 261 263 277 326 327 335 346 357 360 361 370 383 392 394 395 407 421 429 436 449 450 452 456 461 477 486 488 490 497 498 500 501 509 510 519 531 545 570 578 581 594 644 645 654 666 667 695 724 725 741 749 756 767 768 776 790 794 809 810 826 828 831 840 846 902 903 907 925 933 939 942 945 961 968 970 991 1001 1021 1023 1045 1050 1052 1054 1095 1096 1105 1117 1118 1122 1124 1125 1126 1142 1143 1206 1208 1211 1212 1227 1229 1243 1251 1252 1276 1284 1290 1294 1309 1320 1324 1336 1344 1363 1382 1396 1405 1428 1451 1456 1461 1475 1490 1516 1518 1537 1542 1562 1567 1584 1589 1600 1602 1609 1616 1617 1618 1621 1626 1634 1637 1645 1646 1676 1688 1690 1708 1712 1717 1718 1739 1741 1749 1759 1760 1762 1773 1789 1791 1792 1816 1827 1832 1856 1857 1860 1865 1885 1894 1901 1902 1919 1920 1923 1932 1935 1950 1958 1959 1973 1978 1982 1989 1990 2020 2021 2056 2062 2069 2094 2095 2117 2122 2126 2128 2130 2132 2133 2139 2141 2142 2143 2151 2218 2224 2226 2238 2246 2248 2265 2273 2289 2290 2308 2324 2341 2342 2385 2387 2400 2414 2443 2445 2467 2489 2493 2500 2540 2541 2583 2587 2591 2592 2594 2599 2607 2626 2628 2629 2632 2633 2647 2671 2680 2706 2715 2734 2737 2753 2758 2776 2806 2811 2817 2827 2831 2832 2838 2869 2887 2896 2922 2933 2943 2948 2950 2958 2974 2980 2981 2982 2983 2985 3030 3084 3091 3102 3107 3112 3120 3121 3123 3155 3167 3205 3207 3208 3213 3224 3225 3228 3229 3239 3243 3251 3293 3295 3296 3297 3326 3355 3372 3380 3386 3394 3402 3408 3418 3423 3428 3431 3432 3456 3494 3497 3498 3500 3504 3519 3529 3530 3545 3548 3554 3564 3567 3569 3572 3588 3607 3608 3616 3624 3625 3672 3677 3692 3694 3696 3699 3711 3712 3715 3755 3759 3760 3809 3817 3821 3822 3830 3833 3849 3880 3884 3893 3894 3906 3917 3984 3985 3991 3992 4002 4016 4024 4040 4066 4067 4068 4089 4101 4107 4134 4154 4182 4210 4211 4222 4223 4224 4261 4274 4295 4312 4327 4347 4351 0 17 24 33 75 165 181 206 220 232 265 266 289 353 354 451 471 482 515 532 645 662 826 856 901 945 950 1089 1090 1091 1111 1128 1189 1276 1380 1382 1418 1430 1492 1549 1611 1640 1642 1717 1744 1745 1747 1801 1844 1902 1921 1940 1984 2014 2046 2104 2123 2168 2244 2296 2309 2355 2399 2400 2437 2448 2458 2595 2606 2630 2641 2752 2793 2837 2839 2847 2868 2895 2908 2925 2981 3000 3209 3253 3381 3441 3452 3521 3595 3644 3682 3724 3744 3820 3853 3904 3998 4008 4019 4033 4050 4102 4108 4124 4150 4192 4251 4318 GGTGGT/ACCACC 0 -2 409 424 97 -52.8 1 2 3 6 8 18 19 26 35 44 48 50 57 69 70 86 90 92 95 108 113 114 125 130 136 148 155 158 164 201 202 204 205 208 217 231 235 255 263 270 285 287 292 357 360 361 369 370 383 388 392 395 407 422 429 430 436 446 452 461 477 486 490 497 498 509 510 519 545 562 567 592 593 639 644 645 646 666 667 670 671 675 695 697 708 709 724 725 741 748 764 765 767 773 790 802 804 809 817 831 840 846 860 861 872 874 875 902 903 904 939 945 952 968 970 991 1011 1017 1023 1050 1052 1062 1063 1096 1105 1118 1124 1125 1126 1141 1142 1143 1170 1171 1181 1185 1187 1206 1211 1212 1229 1243 1251 1267 1269 1270 1276 1284 1288 1290 1294 1309 1324 1336 1344 1351 1405 1428 1451 1461 1462 1463 1475 1498 1514 1517 1518 1542 1556 1558 1562 1589 1600 1602 1618 1621 1626 1634 1637 1645 1646 1690 1708 1717 1718 1749 1759 1760 1762 1765 1766 1773 1787 1788 1789 1809 1812 1816 1820 1827 1832 1839 1856 1860 1868 1885 1901 1902 1923 1924 1932 1937 1950 1958 1959 1989 1994 2055 2056 2059 2062 2069 2076 2117 2126 2130 2132 2133 2139 2143 2148 2151 2160 2185 2213 2224 2226 2244 2273 2286 2296 2346 2347 2353 2385 2432 2433 2435 2443 2449 2458 2467 2500 2510 2511 2517 2519 2541 2550 2555 2575 2591 2592 2594 2599 2608 2628 2629 2632 2633 2645 2647 2648 2671 2680 2683 2691 2704 2715 2734 2737 2741 2751 2786 2806 2811 2821 2827 2831 2832 2838 2852 2865 2869 2874 2880 2881 2896 2908 2919 2922 2933 2940 2941 2948 2953 2958 2980 2981 2982 2985 3030 3071 3107 3112 3114 3120 3121 3123 3139 3155 3162 3167 3172 3185 3205 3207 3208 3225 3228 3229 3245 3286 3305 3324 3326 3349 3355 3408 3423 3428 3431 3456 3465 3477 3494 3500 3504 3519 3540 3548 3554 3562 3563 3564 3567 3568 3569 3607 3608 3616 3647 3677 3689 3694 3696 3711 3712 3719 3809 3812 3817 3821 3849 3856 3880 3893 3894 3984 3985 3991 3992 4005 4016 4024 4033 4101 4107 4132 4154 4182 4191 4194 4205 4223 4224 4227 4234 4244 4288 4293 4294 4295 4312 4327 4344 4345 4351 4353 11 17 24 33 66 94 126 165 181 206 220 244 265 273 289 343 353 354 442 470 477 514 532 554 645 901 961 1090 1091 1189 1198 1246 1276 1331 1347 1373 1380 1448 1492 1504 1513 1533 1549 1550 1587 1611 1649 1734 1745 1746 1760 1828 1902 1921 2014 2104 2168 2227 2251 2399 2400 2582 2606 2730 2793 2824 2837 2839 2981 3050 3097 3121 3143 3209 3253 3381 3521 3585 3602 3647 3682 3724 3818 3820 3891 3904 3986 4008 4020 4050 4059 4085 4091 4150 4251 4255 4280 GAGGAG/CTCCTC 3 -2 379 384 115 -36.9 1 2 16 30 69 75 83 86 88 93 104 105 122 124 126 136 149 185 204 205 209 218 221 235 247 259 305 313 318 323 350 360 361 375 388 392 424 426 427 429 435 439 449 450 452 456 463 464 475 477 489 498 511 515 516 517 550 551 555 561 569 592 593 615 629 639 644 645 658 664 670 671 676 696 702 705 716 717 720 724 737 738 760 788 790 791 823 869 889 899 912 914 933 940 949 984 997 999 1015 1019 1042 1072 1077 1084 1091 1116 1124 1135 1142 1143 1158 1159 1185 1190 1196 1212 1215 1250 1273 1280 1288 1310 1313 1320 1324 1336 1340 1341 1347 1348 1360 1380 1383 1384 1385 1396 1401 1411 1416 1417 1421 1423 1449 1455 1458 1469 1491 1511 1524 1525 1533 1537 1540 1541 1555 1563 1568 1588 1589 1595 1598 1602 1616 1617 1642 1685 1687 1717 1747 1748 1749 1785 1801 1814 1818 1832 1862 1863 1905 1933 1947 1958 1959 1963 1970 1974 1995 2006 2030 2036 2042 2051 2053 2058 2080 2082 2083 2084 2092 2098 2102 2126 2192 2217 2224 2226 2229 2242 2252 2269 2270 2271 2276 2285 2311 2355 2360 2376 2377 2387 2405 2414 2422 2426 2443 2482 2490 2505 2510 2571 2573 2575 2582 2584 2609 2611 2615 2617 2628 2645 2666 2687 2693 2711 2727 2742 2750 2752 2790 2801 2808 2827 2832 2837 2841 2845 2856 2865 2881 2890 2912 2914 2927 2937 2993 3022 3030 3050 3053 3059 3060 3078 3079 3092 3095 3111 3132 3149 3164 3165 3166 3181 3261 3269 3286 3301 3303 3318 3319 3373 3397 3405 3408 3419 3431 3447 3463 3465 3468 3469 3475 3483 3487 3488 3500 3504 3519 3537 3540 3544 3559 3586 3607 3608 3612 3622 3637 3640 3642 3690 3711 3712 3728 3762 3788 3796 3802 3812 3827 3854 3877 3879 3884 3907 3916 3959 3969 3972 3982 3987 3988 3998 3999 4004 4008 4009 4017 4018 4020 4022 4023 4050 4061 4064 4066 4067 4068 4069 4101 4107 4122 4127 4154 4180 4239 4240 4241 4259 4261 4295 4301 4320 4330 4331 4340 4347 4352 4357 4372 8 23 33 57 126 166 201 245 249 293 318 320 353 354 400 459 470 485 673 719 740 754 779 803 862 882 1053 1090 1091 1098 1166 1169 1201 1245 1379 1380 1386 1438 1512 1533 1550 1601 1620 1645 1836 1843 1897 1904 2035 2137 2168 2218 2231 2387 2399 2423 2488 2530 2554 2583 2608 2630 2663 2672 2677 2837 2845 2847 2848 2858 2860 2890 2974 3057 3058 3097 3123 3127 3212 3219 3243 3318 3332 3343 3373 3406 3470 3486 3487 3516 3524 3525 3564 3572 3578 3581 3585 3595 3600 3627 3734 3822 3828 3852 3932 3940 4018 4026 4149 4152 4272 4275 4320 4345 4351 AGCAGC/GCTGCT 1 -4 317 332 106 -29.6 13 14 18 30 33 40 41 44 55 59 65 75 92 96 115 117 122 127 137 138 166 167 171 175 176 181 190 197 212 217 226 227 236 238 260 263 264 280 289 340 349 402 415 441 442 444 461 462 474 476 512 515 532 538 539 541 543 545 567 583 593 615 619 646 665 676 746 747 758 775 797 807 830 834 838 839 860 861 896 897 918 919 933 934 936 937 990 1001 1011 1026 1027 1029 1030 1041 1044 1094 1112 1113 1124 1130 1150 1182 1183 1199 1219 1232 1233 1236 1241 1258 1259 1266 1269 1270 1302 1308 1319 1323 1326 1391 1403 1405 1432 1436 1460 1468 1501 1533 1534 1541 1544 1545 1546 1548 1549 1551 1559 1574 1579 1627 1681 1683 1705 1707 1738 1747 1748 1752 1756 1771 1786 1791 1792 1794 1834 1836 1839 1843 1854 1889 1926 1931 1936 1937 1958 2000 2001 2002 2007 2014 2015 2027 2031 2043 2060 2067 2068 2071 2108 2116 2119 2140 2149 2198 2199 2210 2212 2216 2267 2293 2301 2317 2318 2354 2365 2418 2421 2455 2477 2491 2513 2515 2526 2527 2541 2556 2596 2614 2621 2626 2646 2654 2686 2717 2734 2747 2748 2751 2765 2766 2768 2778 2779 2802 2809 2810 2813 2815 2832 2854 2856 2858 2859 2860 2862 2874 2888 2892 2894 2942 2958 2971 2972 3001 3007 3025 3040 3041 3062 3101 3104 3122 3125 3136 3154 3156 3182 3184 3187 3224 3226 3227 3245 3289 3308 3341 3364 3408 3411 3423 3485 3497 3499 3505 3536 3549 3552 3569 3579 3584 3610 3618 3624 3625 3654 3707 3708 3721 3722 3741 3811 3819 3823 3826 3895 3905 3957 3994 4054 4059 4066 4070 4071 4072 4078 4079 4095 4096 4130 4131 4159 4174 4185 4206 4210 4273 4365 56 76 78 95 146 169 195 201 277 289 358 389 396 407 446 454 472 482 532 551 562 664 730 735 924 953 992 1033 1056 1100 1106 1129 1165 1171 1182 1275 1309 1323 1352 1403 1411 1448 1628 1645 1691 1731 1737 1790 1801 1831 1835 1913 2084 2211 2302 2318 2360 2373 2379 2400 2474 2511 2527 2537 2563 2628 2674 2691 2713 2774 2829 2838 2851 2900 2973 3036 3081 3115 3127 3142 3178 3418 3541 3547 3657 3679 3723 3732 3817 3845 3847 3854 3861 3870 3893 3894 3910 3938 3955 3983 4024 4043 4067 4153 4238 4345 CGGTGG/CCACCG 0 -3 317 325 58 -48.4 1 2 6 7 20 30 47 48 86 92 108 130 136 142 147 172 201 202 212 232 233 235 253 263 287 307 313 316 326 327 331 342 360 361 383 402 407 428 430 438 449 450 475 490 497 513 519 524 562 578 586 623 624 627 644 645 646 657 675 686 708 709 724 748 757 764 765 767 787 790 817 843 905 932 933 952 990 1002 1020 1022 1046 1062 1063 1076 1091 1109 1110 1129 1140 1142 1143 1148 1149 1171 1185 1206 1211 1215 1243 1251 1267 1269 1270 1288 1307 1309 1324 1340 1369 1377 1384 1385 1393 1405 1411 1434 1445 1462 1475 1485 1518 1542 1545 1546 1562 1581 1590 1634 1636 1637 1670 1692 1709 1729 1748 1759 1765 1766 1772 1773 1787 1788 1789 1803 1809 1816 1827 1832 1839 1841 1856 1860 1869 1899 1918 1925 1932 1944 1974 1978 1994 2048 2056 2059 2060 2062 2068 2069 2076 2108 2122 2133 2139 2143 2148 2153 2157 2213 2224 2226 2244 2269 2286 2287 2299 2314 2315 2326 2338 2351 2353 2366 2396 2404 2429 2435 2443 2455 2467 2468 2491 2500 2511 2519 2530 2550 2599 2628 2645 2658 2672 2704 2727 2728 2729 2730 2737 2752 2773 2786 2831 2856 2867 2869 2880 2892 2904 2905 2908 2937 2985 2998 3015 3050 3059 3060 3071 3098 3107 3114 3120 3121 3124 3167 3171 3192 3198 3199 3228 3229 3254 3273 3305 3313 3314 3315 3326 3355 3365 3394 3403 3405 3423 3431 3432 3451 3456 3465 3474 3519 3521 3541 3554 3562 3563 3564 3603 3648 3696 3711 3712 3739 3740 3759 3760 3775 3795 3805 3812 3815 3816 3822 3826 3827 3880 3929 3991 3992 4010 4016 4021 4037 4066 4078 4079 4098 4175 4180 4194 4225 4227 4229 4234 4244 4327 4345 4353 17 101 126 168 206 220 274 340 353 442 514 532 591 605 713 729 740 886 954 995 1090 1091 1504 1549 1550 1611 1760 1963 2163 2210 2224 2251 2290 2368 2399 2400 2471 2499 2563 2606 2845 2847 2914 2923 3030 3063 3097 3393 3513 3587 3602 3608 3766 3816 3817 3845 3955 4106 GCAGCA/TGCTGC 1 -3 294 313 82 -34.5 9 18 22 30 33 40 55 59 65 72 73 79 96 117 122 127 132 137 138 155 165 175 181 190 197 209 212 236 238 260 280 313 336 338 340 349 352 353 354 362 365 386 400 402 403 415 420 441 442 444 461 466 512 522 523 532 538 539 543 567 574 582 583 590 591 620 643 666 667 675 676 682 691 750 759 775 782 797 799 807 831 838 839 846 866 873 896 897 918 919 933 934 935 974 987 999 1006 1026 1027 1086 1087 1099 1112 1124 1127 1128 1130 1150 1170 1183 1206 1213 1219 1252 1258 1259 1260 1269 1270 1296 1302 1340 1363 1391 1397 1431 1432 1445 1451 1463 1468 1501 1533 1534 1537 1541 1548 1549 1559 1574 1607 1627 1635 1650 1681 1683 1711 1714 1715 1733 1738 1747 1752 1755 1762 1794 1836 1845 1854 1889 1926 1934 1958 1999 2001 2002 2007 2014 2015 2021 2031 2055 2060 2067 2068 2102 2108 2109 2122 2140 2149 2168 2210 2228 2267 2354 2409 2451 2455 2471 2513 2526 2544 2554 2556 2596 2602 2621 2624 2626 2646 2654 2669 2675 2688 2717 2726 2734 2735 2742 2768 2777 2802 2813 2854 2857 2858 2859 2862 2866 2894 2902 2961 2971 2972 2985 2995 2996 3025 3062 3073 3104 3136 3156 3164 3267 3289 3308 3324 3330 3334 3349 3364 3374 3396 3411 3423 3432 3499 3505 3536 3542 3543 3544 3547 3552 3565 3569 3610 3624 3625 3707 3708 3733 3766 3823 3826 3900 3905 3914 3957 3961 3994 4007 4031 4042 4043 4044 4054 4095 4096 4102 4130 4131 4152 4174 4262 4275 4276 4277 4303 4318 4319 4365 2 56 76 78 86 146 389 396 446 497 551 562 564 664 726 730 756 757 843 953 992 1033 1091 1106 1165 1171 1182 1228 1278 1342 1372 1521 1570 1691 1693 1790 1835 1971 2013 2067 2084 2088 2149 2265 2302 2318 2360 2367 2373 2389 2400 2645 2666 2674 2713 2782 2900 2924 2973 3036 3048 3078 3081 3127 3354 3442 3518 3530 3547 3714 3718 3732 3738 3817 3854 3886 3894 3910 3983 3996 4067 4335 AGGAGG/CCTCCT 3 -4 305 311 82 -34.0 1 2 8 16 50 59 69 75 87 88 93 102 103 104 105 136 142 174 180 185 209 235 252 259 309 313 360 361 368 392 424 426 427 429 435 449 450 452 463 464 475 477 510 511 515 569 592 602 607 615 632 639 664 670 671 716 717 724 737 760 790 800 804 823 876 899 912 933 949 953 968 984 997 999 1015 1019 1021 1041 1057 1072 1084 1124 1142 1143 1179 1185 1196 1203 1212 1220 1231 1250 1251 1267 1273 1280 1287 1297 1298 1312 1321 1322 1324 1336 1338 1340 1341 1346 1351 1383 1398 1411 1413 1417 1423 1425 1428 1441 1453 1455 1469 1511 1533 1541 1555 1568 1589 1598 1602 1628 1661 1663 1678 1685 1687 1747 1749 1818 1848 1859 1862 1863 1900 1905 1906 1912 1933 1947 1959 1966 1974 2030 2078 2084 2092 2100 2101 2102 2123 2138 2192 2224 2226 2229 2234 2242 2252 2270 2271 2273 2280 2289 2290 2296 2311 2318 2321 2376 2377 2387 2396 2405 2414 2422 2426 2443 2482 2492 2499 2558 2570 2571 2573 2584 2593 2599 2611 2615 2617 2622 2645 2661 2677 2693 2727 2741 2742 2750 2752 2801 2827 2832 2837 2841 2856 2870 2881 2890 2907 2912 2937 2956 2957 2993 3030 3053 3071 3078 3079 3095 3111 3115 3120 3121 3149 3164 3219 3237 3238 3259 3261 3286 3302 3368 3403 3419 3462 3465 3469 3475 3483 3498 3500 3504 3540 3576 3586 3607 3608 3640 3642 3690 3697 3711 3712 3719 3728 3737 3758 3762 3802 3812 3827 3872 3944 3959 3998 3999 4006 4017 4018 4020 4022 4023 4050 4064 4069 4101 4122 4205 4211 4230 4231 4240 4241 4244 4245 4246 4249 4250 4330 4331 4337 4343 4357 34 66 124 166 190 201 320 353 354 383 467 470 653 740 791 862 882 1090 1091 1098 1160 1181 1245 1320 1369 1380 1386 1476 1512 1533 1550 1556 1569 1629 1687 1836 1868 1887 2132 2163 2198 2260 2387 2399 2531 2583 2608 2671 2672 2802 2837 2844 2845 2847 2848 2890 2971 2972 3027 3097 3123 3145 3176 3219 3233 3243 3332 3351 3406 3585 3683 3725 3733 3734 3862 3894 4056 4115 4273 4320 4345 4357 TGCAGC/GCTGCA 1 -4 263 275 82 -26.6 9 22 23 49 59 66 72 73 77 79 139 155 156 165 180 186 189 191 197 209 228 236 244 260 317 324 343 347 351 354 359 362 371 386 403 406 415 420 423 426 436 465 466 492 528 543 590 591 613 614 620 627 646 647 675 691 695 712 737 759 782 791 799 807 818 827 846 853 873 899 905 907 946 974 1002 1003 1006 1020 1023 1043 1082 1086 1087 1092 1127 1128 1130 1167 1183 1206 1213 1252 1260 1268 1343 1347 1348 1361 1362 1420 1427 1431 1436 1445 1451 1453 1472 1488 1526 1537 1549 1558 1582 1606 1619 1627 1650 1667 1710 1738 1752 1773 1794 1812 1845 1915 1931 1934 1952 1985 1999 2016 2027 2033 2044 2055 2072 2073 2102 2109 2117 2159 2168 2170 2178 2188 2210 2228 2243 2259 2260 2280 2297 2340 2365 2396 2411 2421 2455 2478 2513 2544 2546 2554 2558 2560 2573 2586 2602 2624 2635 2639 2654 2669 2675 2688 2690 2691 2712 2726 2769 2777 2792 2820 2827 2828 2857 2866 2894 2907 2923 2924 2980 2981 2998 3025 3059 3060 3073 3087 3104 3133 3154 3173 3174 3260 3265 3267 3289 3313 3314 3334 3339 3340 3341 3351 3396 3406 3416 3417 3435 3499 3565 3610 3673 3676 3682 3720 3721 3722 3729 3730 3733 3759 3760 3761 3766 3857 3858 3901 3902 3903 3914 3937 3940 3961 3984 3985 4024 4032 4089 4102 4113 4144 4152 4205 4206 4210 4225 4257 4318 4319 4350 37 54 78 86 116 218 272 328 334 408 542 564 632 642 726 751 757 842 843 953 965 988 1033 1044 1056 1057 1091 1129 1138 1195 1323 1372 1472 1521 1522 1654 1842 1955 1973 2013 2067 2088 2224 2258 2265 2389 2395 2427 2502 2558 2645 2666 2783 2863 2887 2924 2973 3035 3036 3048 3142 3341 3439 3487 3489 3518 3523 3530 3543 3612 3732 3738 3910 3962 3996 4044 4068 4073 4084 4301 4322 4335 CAGCAG/CTGCTG 1 -2 252 267 78 -26.4 0 13 14 18 20 33 40 59 96 108 117 127 138 144 154 159 175 181 190 197 212 217 226 227 228 260 280 338 340 379 386 402 434 439 441 442 444 462 466 474 512 515 532 538 539 541 543 567 580 583 593 623 624 646 666 667 676 692 736 782 797 807 830 831 846 896 897 933 980 1027 1094 1124 1127 1128 1130 1150 1170 1183 1188 1206 1215 1219 1245 1259 1266 1281 1302 1340 1344 1391 1420 1427 1428 1431 1432 1436 1451 1460 1468 1533 1534 1544 1545 1546 1548 1549 1559 1574 1579 1594 1612 1622 1627 1656 1675 1677 1681 1698 1711 1714 1738 1747 1752 1755 1756 1762 1791 1792 1794 1807 1820 1829 1836 1854 1913 1914 1926 1929 1930 1937 1951 1958 1972 2000 2001 2002 2006 2007 2045 2046 2067 2068 2075 2108 2116 2122 2149 2210 2228 2301 2354 2398 2455 2478 2513 2515 2523 2526 2554 2556 2597 2613 2616 2621 2624 2626 2646 2654 2675 2717 2734 2742 2768 2794 2795 2802 2809 2815 2832 2854 2857 2858 2859 2860 2862 2894 2942 2958 2971 2972 2982 2985 3001 3008 3025 3041 3104 3136 3164 3182 3200 3201 3222 3289 3364 3406 3423 3483 3499 3505 3552 3569 3575 3610 3632 3633 3684 3685 3755 3818 3826 3905 3919 3953 3965 3966 4007 4054 4070 4121 4130 4131 4134 4174 4205 4273 4274 4275 4276 4277 4280 4365 56 78 95 146 244 396 471 472 497 532 551 562 730 953 957 988 992 1091 1136 1171 1275 1278 1342 1611 1628 1645 1731 1737 1790 1831 1835 2084 2359 2360 2367 2373 2389 2400 2527 2537 2541 2666 2674 2713 2766 2774 2782 2829 2851 2920 2963 2973 2982 3048 3081 3127 3151 3187 3369 3377 3418 3502 3517 3530 3633 3688 3695 3718 3732 3910 3919 3983 4057 4058 4067 4141 4302 4335 GCAGCT/AGCTGC 1 -3 252 264 73 -27.6 13 14 47 66 77 81 92 96 97 115 121 127 139 142 165 171 172 180 190 191 197 201 202 209 217 218 226 227 228 234 244 260 326 327 343 347 371 375 406 423 426 436 444 465 474 518 528 543 545 607 647 665 677 691 746 747 769 770 853 872 873 907 950 990 1001 1003 1029 1030 1043 1069 1082 1094 1113 1167 1183 1207 1233 1241 1250 1268 1278 1288 1296 1308 1319 1323 1339 1420 1425 1427 1432 1436 1460 1472 1474 1478 1488 1544 1545 1546 1547 1558 1564 1579 1582 1606 1667 1698 1707 1738 1752 1765 1766 1767 1771 1786 1794 1810 1862 1863 1931 1952 1968 1985 2000 2033 2043 2044 2068 2071 2072 2073 2102 2108 2116 2149 2178 2188 2199 2212 2235 2259 2260 2264 2297 2301 2317 2340 2352 2354 2365 2455 2462 2463 2474 2478 2513 2527 2538 2541 2556 2565 2573 2586 2592 2635 2639 2646 2654 2667 2686 2690 2691 2713 2747 2748 2759 2769 2815 2828 2832 2860 2864 2874 2886 2888 2892 2923 2924 2942 2954 2958 2965 2966 2972 2998 3040 3066 3087 3104 3122 3125 3154 3173 3174 3260 3289 3341 3344 3345 3350 3381 3396 3406 3408 3473 3497 3499 3539 3549 3579 3584 3654 3676 3682 3690 3721 3722 3729 3759 3760 3788 3857 3858 3865 3895 3903 3912 3914 4024 4054 4070 4078 4079 4113 4144 4174 4185 4205 4206 4257 4348 54 86 95 116 174 328 334 358 403 454 542 751 842 957 965 988 992 1056 1057 1129 1138 1182 1309 1323 1352 1411 1522 1621 1645 1654 1731 1747 1801 1842 1913 1973 1983 2083 2084 2134 2211 2427 2474 2516 2527 2537 2628 2851 2854 2863 2908 3076 3104 3127 3130 3142 3178 3195 3196 3418 3487 3523 3543 3550 3612 3733 3829 3847 3962 4085 4301 4322 4335 GGTGGC/GCCACC 0 -2 245 254 61 -30.3 1 2 18 20 21 26 40 47 48 77 78 86 120 147 148 164 172 208 229 230 261 263 285 307 316 340 342 360 370 383 407 410 449 450 498 513 519 531 565 578 581 586 600 608 623 624 627 632 646 666 667 724 741 768 773 787 831 846 905 933 961 969 1001 1007 1022 1046 1076 1096 1105 1124 1140 1148 1149 1170 1206 1208 1211 1212 1216 1229 1247 1265 1269 1270 1288 1294 1309 1314 1315 1340 1384 1403 1405 1428 1445 1451 1463 1475 1509 1514 1545 1546 1562 1636 1638 1648 1670 1691 1696 1709 1718 1729 1751 1759 1760 1783 1791 1792 1816 1827 1856 1860 1899 1916 1925 1950 1959 1964 1965 1974 2025 2044 2048 2060 2063 2068 2108 2114 2122 2133 2139 2166 2211 2227 2234 2267 2273 2274 2275 2299 2314 2315 2325 2338 2371 2381 2385 2429 2443 2467 2468 2472 2524 2530 2534 2632 2633 2672 2715 2728 2729 2730 2734 2739 2755 2773 2856 2867 2882 2904 2905 2940 2941 2947 2980 2981 2998 3015 3034 3053 3059 3060 3123 3171 3233 3303 3313 3314 3326 3355 3365 3405 3420 3431 3447 3466 3468 3472 3485 3498 3511 3521 3545 3554 3648 3656 3689 3759 3760 3771 3772 3775 3809 3817 3827 3880 3948 3984 3985 4048 4049 4066 4091 4103 4104 4109 4134 4157 4158 4180 4198 4255 4273 4352 4364 70 206 266 346 354 469 591 662 729 995 1090 1091 1111 1143 1579 1608 1611 1620 1628 1742 1745 1762 1826 1978 2004 2032 2163 2177 2210 2290 2390 2400 2431 2471 2500 2563 2576 2694 2838 2847 2861 2864 2923 2972 3161 3208 3226 3381 3393 3441 3504 3513 3708 3766 3845 3853 3871 3936 4106 4249 4366 GCTGGT/ACCAGC 0 -2 224 239 70 -23.6 15 18 24 25 43 56 76 78 82 86 108 116 118 144 157 203 204 205 213 214 228 262 268 269 280 296 325 339 340 344 361 383 395 396 422 441 442 445 459 463 466 487 521 541 578 592 619 627 640 646 686 710 729 730 757 793 806 820 829 830 896 897 903 925 935 939 946 952 958 969 979 1011 1019 1021 1023 1028 1078 1108 1113 1119 1124 1179 1221 1247 1320 1417 1427 1432 1436 1449 1464 1488 1492 1509 1536 1549 1562 1636 1665 1702 1703 1708 1719 1731 1734 1752 1769 1772 1774 1778 1782 1791 1792 1801 1807 1820 1877 1878 1894 1901 1902 1908 1913 1914 1947 1979 1985 2016 2111 2128 2151 2181 2182 2184 2188 2226 2227 2242 2268 2273 2282 2293 2297 2327 2361 2366 2399 2402 2442 2443 2514 2534 2595 2602 2608 2613 2629 2639 2718 2739 2741 2788 2794 2795 2802 2832 2842 2874 2903 2908 2943 2971 3001 3002 3012 3013 3056 3057 3097 3113 3153 3179 3185 3214 3225 3279 3320 3328 3347 3349 3408 3428 3434 3458 3465 3495 3499 3557 3575 3632 3643 3652 3684 3685 3778 3849 3856 3893 3894 3965 3966 3975 3988 4011 4031 4037 4054 4058 4149 4205 4210 4357 4358 4366 17 23 67 87 100 148 303 472 494 545 603 744 794 886 988 1044 1099 1156 1313 1389 1513 1522 1600 1601 1668 1679 1683 1750 1834 1908 1928 2005 2078 2103 2129 2296 2360 2399 2400 2412 2537 2576 2774 2828 3029 3047 3143 3162 3225 3292 3293 3392 3418 3421 3432 3627 3647 3651 3695 3792 3900 4040 4057 4058 4067 4077 4086 4206 4237 4341 GCACCA/TGGTGC 1 -3 220 230 71 -21.5 1 2 3 6 26 46 51 55 56 65 66 72 73 90 109 206 217 233 236 249 263 269 277 307 326 327 330 334 339 348 367 380 384 387 414 426 490 501 570 627 641 654 691 695 714 759 761 776 790 794 797 810 837 840 846 912 950 989 1019 1023 1057 1075 1106 1108 1125 1136 1160 1161 1178 1196 1204 1211 1247 1281 1320 1326 1344 1363 1387 1396 1413 1427 1462 1510 1537 1549 1567 1568 1569 1570 1602 1610 1630 1688 1694 1696 1699 1700 1733 1759 1773 1791 1792 1861 1890 1919 1920 1935 1950 1959 2062 2096 2122 2224 2226 2250 2287 2303 2341 2342 2349 2386 2387 2393 2414 2469 2470 2471 2480 2492 2513 2524 2534 2543 2549 2580 2587 2626 2629 2634 2669 2681 2706 2727 2755 2756 2758 2776 2804 2817 2818 2825 2831 2842 2876 2892 2896 2938 2939 2943 2971 2982 3002 3061 3106 3112 3113 3120 3121 3153 3155 3198 3199 3207 3208 3211 3225 3243 3286 3293 3296 3297 3305 3311 3328 3336 3349 3399 3408 3500 3520 3567 3592 3688 3698 3699 3701 3709 3778 3785 3849 3853 3856 3884 3975 3984 3985 3988 4011 4040 4044 4081 4082 4083 4089 4092 4117 4211 4266 4349 41 58 206 545 564 755 759 808 813 856 932 988 1099 1128 1141 1182 1189 1246 1292 1313 1380 1389 1408 1510 1612 1642 1679 1840 1858 1869 1944 1992 2005 2063 2083 2322 2399 2412 2551 2558 2602 2629 2667 2908 2916 2941 2973 2980 3085 3098 3124 3126 3209 3418 3521 3546 3644 3880 3987 3998 4032 4033 4086 4150 4185 4206 4262 4316 4318 4325 4341 GCGGTG/CACCGC 0 -4 214 224 41 -32.9 1 2 7 48 49 86 108 120 130 136 172 201 202 232 235 243 253 287 307 313 331 358 360 361 383 402 406 428 449 450 466 519 521 524 562 571 586 609 623 624 664 693 694 708 709 724 732 754 757 767 783 788 807 840 844 866 867 905 935 990 1022 1062 1063 1085 1091 1122 1150 1169 1211 1223 1267 1269 1270 1288 1309 1324 1369 1377 1384 1393 1405 1407 1411 1421 1424 1428 1438 1462 1478 1545 1546 1562 1581 1621 1636 1678 1748 1759 1787 1788 1789 1800 1803 1810 1811 1827 1841 1869 1889 1918 1921 1944 1978 2019 2059 2062 2075 2105 2106 2108 2122 2140 2164 2224 2226 2250 2267 2269 2286 2287 2338 2351 2353 2397 2404 2408 2443 2465 2472 2479 2491 2504 2511 2599 2632 2633 2636 2637 2688 2693 2699 2727 2735 2752 2815 2856 2869 2892 2908 2918 2934 2971 2994 2998 3015 3059 3060 3107 3120 3121 3153 3209 3215 3228 3229 3270 3273 3277 3278 3313 3314 3326 3353 3354 3355 3394 3406 3456 3472 3485 3486 3494 3510 3564 3576 3588 3648 3696 3711 3712 3769 3773 3775 3817 3830 3880 3946 4021 4055 4169 4175 4225 4295 4343 100 126 353 487 655 713 729 954 1090 1091 1191 1611 1761 1963 2163 2357 2400 2549 2550 2563 2606 2668 2847 3085 3091 3171 3335 3362 3399 3414 3490 3679 3816 3920 3955 4012 4106 4167 4280 4338 4359 AGGTGG/CCACCT 0 -3 217 223 73 -19.5 3 5 8 18 19 26 35 45 50 90 95 117 120 125 126 136 155 164 185 201 202 255 270 285 292 319 345 351 357 360 361 383 388 392 416 429 446 510 558 567 629 640 658 666 667 670 671 729 748 773 790 798 804 836 846 878 879 904 923 939 945 956 970 994 997 1023 1056 1080 1096 1125 1126 1140 1181 1211 1212 1251 1265 1294 1336 1351 1376 1428 1441 1451 1461 1465 1473 1505 1518 1573 1575 1648 1681 1690 1691 1708 1717 1760 1773 1833 1856 1937 1950 1958 1959 1964 1965 2044 2055 2063 2068 2078 2092 2114 2156 2166 2168 2184 2185 2234 2252 2286 2322 2325 2333 2346 2347 2371 2426 2458 2459 2472 2482 2500 2555 2571 2603 2647 2672 2681 2683 2691 2734 2804 2806 2809 2832 2844 2861 2865 2874 2881 2882 2898 2928 2933 2940 2941 2947 2948 2958 3112 3139 3172 3189 3245 3276 3303 3324 3326 3335 3349 3355 3408 3420 3431 3447 3456 3516 3522 3564 3567 3569 3607 3608 3677 3696 3724 3725 3809 3849 3877 3883 3929 3930 4024 4031 4081 4082 4091 4094 4103 4104 4109 4138 4161 4172 4195 4198 4207 4244 4254 4293 4294 4295 4344 4352 24 70 94 124 202 206 244 353 416 470 488 526 635 719 783 990 1090 1264 1287 1331 1370 1492 1514 1525 1533 1587 1611 1614 1649 1707 1740 1745 1762 1763 1806 1835 1902 1966 2004 2032 2177 2210 2211 2306 2497 2582 2694 2711 2745 2838 2839 2896 2903 3159 3233 3381 3424 3504 3521 3564 3670 3684 3784 3891 3998 4050 4150 4188 4210 4255 4267 4298 4303 CGGAGG/CCTCCG 3 -4 222 216 31 -36.6 1 2 75 126 185 204 205 209 235 279 286 313 326 327 347 360 361 401 410 446 460 464 498 516 555 617 634 644 645 683 708 709 711 716 717 727 773 817 830 832 868 883 912 940 978 984 997 1016 1090 1091 1126 1158 1170 1212 1259 1294 1300 1301 1309 1313 1324 1341 1411 1423 1434 1449 1455 1478 1491 1540 1560 1568 1600 1657 1666 1682 1717 1748 1781 1782 1783 1803 1832 1838 1854 1873 1893 1905 1924 1936 1959 1974 1991 2028 2030 2035 2042 2047 2081 2085 2089 2120 2173 2189 2199 2206 2242 2267 2276 2306 2311 2369 2375 2401 2407 2408 2424 2426 2445 2479 2481 2498 2545 2585 2591 2678 2679 2687 2693 2698 2742 2773 2808 2810 2841 2867 2904 2905 2925 2934 2951 2954 2959 2960 3033 3053 3064 3065 3103 3110 3117 3132 3156 3183 3193 3210 3228 3229 3232 3261 3271 3280 3301 3318 3319 3331 3370 3381 3393 3408 3411 3427 3431 3437 3438 3451 3463 3465 3468 3476 3494 3501 3502 3537 3550 3586 3605 3606 3607 3608 3630 3640 3656 3719 3735 3739 3740 3745 3763 3773 3796 3878 3934 3951 3952 3961 4008 4009 4020 4066 4108 4127 4132 4215 4216 4259 4287 4318 4319 4339 4364 4372 136 288 413 719 729 1090 1178 1620 2294 2368 2481 2582 2594 2705 2738 2848 3318 3343 3381 3433 3582 3596 3693 3745 3766 3767 3863 3941 3991 4150 4158 GGCGGT/ACCGCC 0 -2 197 202 46 -25.4 1 2 8 48 84 86 130 136 137 139 201 202 208 235 255 261 290 313 330 331 340 360 361 383 406 425 527 562 568 571 609 613 614 623 624 678 721 722 724 738 745 767 788 812 813 840 841 844 846 854 873 880 905 935 975 983 1018 1060 1061 1085 1091 1096 1123 1211 1267 1269 1270 1292 1309 1324 1357 1369 1370 1371 1379 1384 1405 1408 1409 1411 1424 1428 1478 1492 1545 1546 1562 1581 1584 1621 1636 1678 1688 1738 1765 1766 1800 1811 1830 1841 1918 1978 2019 2030 2042 2059 2072 2108 2164 2224 2226 2239 2259 2260 2267 2286 2287 2336 2338 2377 2431 2443 2446 2447 2465 2477 2479 2480 2504 2511 2531 2599 2632 2633 2693 2727 2734 2735 2751 2752 2852 2856 2890 2918 2949 2959 2994 3004 3005 3015 3069 3090 3120 3121 3183 3209 3228 3229 3249 3277 3278 3293 3326 3382 3485 3486 3494 3532 3564 3576 3581 3584 3624 3625 3656 3696 3755 3769 3775 3796 3817 3880 3891 3946 4000 4001 4015 4037 4075 4078 4079 4143 4169 4225 4295 4338 4343 88 100 167 176 300 353 471 477 497 555 713 729 1090 1091 1157 1224 1236 1237 1611 1718 1937 2491 2549 2563 2576 2597 2837 2847 2851 3005 3085 3126 3225 3335 3362 3464 3501 3828 3943 3953 3955 4106 4167 4185 4322 4338 GCAGCC/GGCTGC 1 -3 190 200 54 -21.6 18 23 30 41 49 59 75 107 116 139 156 166 167 173 176 186 189 191 210 211 228 236 263 264 289 315 317 319 324 339 351 359 362 462 476 485 492 515 573 613 614 627 637 638 646 695 712 737 791 818 844 860 861 886 896 897 899 924 933 936 937 946 954 1002 1013 1020 1044 1079 1149 1170 1199 1206 1218 1232 1259 1302 1326 1343 1347 1348 1361 1362 1394 1403 1427 1431 1432 1453 1463 1526 1537 1549 1550 1551 1637 1672 1738 1745 1756 1773 1812 1813 1823 1843 1852 1931 2016 2027 2033 2036 2114 2117 2119 2121 2152 2159 2210 2217 2280 2336 2365 2472 2491 2515 2546 2558 2560 2712 2765 2766 2809 2810 2811 2827 2854 2878 2991 2992 3001 3007 3020 3059 3060 3101 3133 3182 3187 3194 3265 3313 3314 3339 3340 3341 3380 3397 3416 3417 3469 3494 3499 3610 3632 3650 3651 3654 3673 3730 3759 3760 3761 3811 3819 3826 3873 3874 3929 4000 4001 4004 4059 4071 4072 4089 4143 4159 4202 4210 4303 4346 37 148 169 195 277 408 472 509 561 599 632 735 953 988 1048 1100 1323 1403 1472 1525 1628 1831 1963 2100 2373 2395 2511 2549 2563 2674 2691 2713 2887 2963 3006 3035 3086 3172 3322 3341 3413 3439 3541 3723 3845 3886 3938 4024 4043 4044 4073 4084 4322 4345 TGCTGG/CCAGCA 0 -3 187 199 57 -20.3 1 2 4 18 20 51 75 76 86 108 112 113 114 144 154 195 197 204 205 210 211 222 228 234 260 285 325 339 344 348 361 379 395 441 442 445 466 487 516 526 538 539 541 602 646 657 710 806 829 830 903 925 969 979 1019 1023 1059 1108 1109 1110 1119 1124 1188 1209 1221 1247 1281 1427 1432 1436 1469 1477 1492 1545 1546 1615 1642 1665 1675 1678 1708 1719 1731 1752 1772 1791 1792 1801 1807 1820 1913 1914 1929 1930 1947 1959 1979 2006 2045 2068 2075 2144 2226 2273 2293 2323 2327 2354 2393 2399 2442 2478 2514 2534 2543 2595 2597 2602 2604 2613 2616 2646 2652 2653 2725 2727 2755 2776 2788 2802 2831 2832 2842 2852 2855 2858 2859 2860 2958 2971 2982 3001 3041 3102 3138 3154 3195 3196 3225 3320 3328 3351 3406 3415 3434 3465 3467 3499 3518 3575 3632 3654 3673 3674 3675 3684 3685 3779 3849 3880 3965 3966 3975 3988 4011 4080 4130 4131 4134 4149 4166 4217 4218 4273 4280 4288 4336 100 244 399 460 472 494 545 733 744 794 841 988 1136 1156 1348 1437 1513 1522 1645 1668 1679 1683 1750 1835 1928 1945 1979 2004 2078 2103 2123 2163 2360 2399 2400 2537 2577 2766 2774 2793 2851 2911 2963 3116 3162 3187 3418 3432 3517 3695 3919 3975 4057 4058 4067 4316 4341 GGAGGC/GCCTCC 3 -3 196 198 38 -28.3 27 30 87 143 170 174 192 197 235 261 286 310 326 327 360 361 370 383 392 394 411 452 460 464 510 511 515 593 602 607 655 658 664 670 671 676 683 684 685 708 709 720 724 766 799 844 862 867 868 899 962 984 1016 1041 1084 1125 1126 1137 1138 1163 1183 1220 1229 1231 1250 1259 1287 1298 1309 1312 1321 1322 1324 1341 1367 1383 1411 1423 1425 1453 1473 1478 1560 1587 1600 1640 1678 1682 1749 1848 1856 1876 1900 1912 1918 1936 1937 1940 1959 2028 2042 2051 2065 2084 2085 2100 2101 2125 2143 2155 2178 2192 2224 2280 2286 2323 2365 2422 2424 2445 2457 2482 2498 2558 2562 2585 2591 2677 2710 2741 2742 2752 2763 2764 2773 2801 2810 2904 2905 2918 2925 2948 2956 2957 2962 3011 3064 3065 3071 3103 3110 3153 3219 3225 3232 3237 3238 3398 3469 3506 3527 3550 3554 3631 3656 3697 3719 3721 3722 3728 3745 3755 3763 3773 3815 3816 3860 3929 3959 3961 3998 3999 4024 4050 4105 4122 4183 4184 4230 4231 4234 4264 4275 4331 4337 4364 159 190 383 471 479 512 791 951 1030 1058 1091 1135 1245 1307 1380 1386 1458 1781 1823 1887 2126 2130 2194 2399 2481 2511 2594 2646 2730 3015 3234 3733 3766 3863 4038 4185 4188 4320 GGAGGC/GCCTCC 4 -4 196 198 38 -28.3 27 30 87 143 170 174 192 197 235 261 286 310 326 327 360 361 370 383 392 394 411 452 460 464 510 511 515 593 602 607 655 658 664 670 671 676 683 684 685 708 709 720 724 766 799 844 862 867 868 899 962 984 1016 1041 1084 1125 1126 1137 1138 1163 1183 1220 1229 1231 1250 1259 1287 1298 1309 1312 1321 1322 1324 1341 1367 1383 1411 1423 1425 1453 1473 1478 1560 1587 1600 1640 1678 1682 1749 1848 1856 1876 1900 1912 1918 1936 1937 1940 1959 2028 2042 2051 2065 2084 2085 2100 2101 2125 2143 2155 2178 2192 2224 2280 2286 2323 2365 2422 2424 2445 2457 2482 2498 2558 2562 2585 2591 2677 2710 2741 2742 2752 2763 2764 2773 2801 2810 2904 2905 2918 2925 2948 2956 2957 2962 3011 3064 3065 3071 3103 3110 3153 3219 3225 3232 3237 3238 3398 3469 3506 3527 3550 3554 3631 3656 3697 3719 3721 3722 3728 3745 3755 3763 3773 3815 3816 3860 3929 3959 3961 3998 3999 4024 4050 4105 4122 4183 4184 4230 4231 4234 4264 4275 4331 4337 4364 159 190 383 471 479 512 791 951 1030 1058 1091 1135 1245 1307 1380 1386 1458 1781 1823 1887 2126 2130 2194 2399 2481 2511 2594 2646 2730 3015 3234 3733 3766 3863 4038 4185 4188 4320 GCAGTG/CACTGC 2 -2 187 192 46 -23.2 8 31 36 51 66 70 129 258 264 266 277 336 365 366 390 391 421 443 453 498 500 514 532 554 576 596 623 624 666 667 676 679 689 714 732 746 747 758 782 795 812 922 960 961 988 1045 1079 1096 1105 1107 1118 1119 1120 1122 1127 1128 1222 1245 1269 1270 1284 1309 1326 1340 1359 1361 1362 1421 1430 1431 1445 1477 1488 1493 1560 1562 1569 1570 1589 1592 1609 1627 1629 1676 1680 1685 1710 1765 1766 1818 1827 1831 1852 1860 1869 1925 1953 1968 2007 2011 2031 2072 2075 2122 2149 2184 2188 2213 2308 2424 2438 2441 2495 2496 2507 2513 2572 2578 2602 2617 2621 2624 2638 2668 2711 2721 2734 2750 2781 2808 2819 2839 2840 2930 2931 2943 2980 2981 2985 3024 3048 3049 3053 3130 3144 3145 3154 3161 3172 3184 3287 3327 3343 3351 3393 3573 3574 3618 3672 3673 3676 3692 3714 3730 3775 3776 3777 3778 3879 3899 3921 3958 4007 4081 4082 4130 4131 4183 4184 4186 4266 4276 4277 4280 4281 4282 4370 91 178 472 664 672 690 811 832 863 873 901 953 1030 1111 1183 1190 1339 1456 1596 1637 1682 1697 1922 2104 2246 2323 2415 2600 2667 2747 2865 2982 3026 3131 3137 3139 3152 3174 3219 3242 3418 3906 4154 4297 4301 4319 CGGCGG/CCGCCG 0 -3 190 185 42 -23.4 1 2 47 142 170 204 205 235 290 298 299 360 418 498 516 527 555 592 613 614 617 623 624 644 645 648 658 660 675 705 724 738 764 765 841 880 905 942 983 984 1018 1077 1109 1110 1126 1170 1181 1212 1215 1241 1262 1292 1293 1300 1301 1341 1379 1411 1415 1424 1428 1434 1478 1524 1525 1529 1530 1533 1568 1587 1588 1621 1734 1832 1841 1898 1985 2028 2030 2059 2072 2082 2083 2086 2099 2171 2229 2239 2254 2259 2260 2277 2278 2286 2311 2330 2336 2345 2377 2404 2407 2465 2479 2504 2545 2572 2599 2636 2637 2693 2695 2735 2808 2852 2856 2890 2938 2939 2949 2954 2959 2976 3033 3071 3074 3090 3091 3104 3117 3120 3121 3124 3128 3163 3183 3252 3253 3263 3264 3271 3277 3278 3296 3297 3313 3314 3343 3381 3447 3451 3456 3497 3501 3502 3514 3532 3564 3584 3655 3668 3733 3739 3740 3769 3773 3775 3796 3801 3819 3854 3879 3904 3965 3966 4000 4001 4006 4015 4037 4040 4078 4079 4098 4108 4225 4227 4247 4295 4322 4343 56 88 148 176 497 1067 1090 1224 1316 1739 1790 1868 1924 1943 1944 1979 2003 2225 2345 2563 2582 2768 2837 2839 2941 3243 3265 3311 3362 3418 3470 3481 3568 3657 3725 3727 3855 3863 3943 3955 4106 4150 CAAGGC/GCCTTG 4 -4 172 179 54 -17.3 38 75 141 151 153 165 218 247 256 257 295 300 318 337 351 375 377 385 399 406 478 484 494 536 537 573 579 584 588 637 638 651 685 704 708 709 721 722 761 774 786 794 807 842 847 869 915 929 940 947 948 960 969 977 995 1044 1069 1085 1090 1096 1100 1140 1172 1173 1242 1245 1268 1277 1314 1315 1316 1347 1348 1354 1408 1409 1500 1502 1520 1595 1608 1643 1644 1684 1693 1722 1723 1724 1786 1804 1880 1886 1939 1945 2008 2045 2072 2090 2133 2145 2152 2165 2187 2232 2297 2306 2348 2391 2414 2451 2456 2464 2492 2522 2720 2736 2794 2795 2869 2872 2901 2928 2934 2949 3014 3035 3066 3119 3159 3160 3183 3200 3201 3258 3320 3323 3339 3340 3368 3382 3409 3494 3548 3632 3695 3699 3742 3767 3779 3859 3892 3893 3894 3896 3916 3955 3961 4045 4046 4059 4073 4123 4124 4139 4143 4174 4197 4248 4271 4313 4314 4333 11 37 175 539 571 574 605 662 666 690 692 694 965 1379 1380 1525 1660 1673 1720 1724 1815 2267 2421 2515 2520 2548 2591 2648 2670 2737 2749 2769 2772 2825 2844 2963 3089 3095 3101 3393 3441 3524 3652 3885 3938 3969 4103 4124 4126 4183 4199 4237 4249 4359 GCTGTG/CACAGC 2 -2 168 178 42 -21.8 4 9 15 33 65 72 73 106 117 122 134 138 140 186 190 216 221 226 228 241 250 277 297 305 314 356 363 387 393 395 408 453 456 467 492 518 544 558 564 566 623 624 664 675 677 692 732 736 749 794 856 865 885 927 958 982 1019 1021 1085 1106 1107 1193 1218 1240 1306 1311 1323 1343 1358 1400 1460 1503 1526 1548 1578 1622 1625 1651 1689 1729 1732 1753 1765 1766 1918 2000 2001 2002 2033 2055 2058 2108 2128 2149 2165 2194 2195 2219 2246 2256 2299 2301 2311 2323 2372 2406 2431 2440 2541 2582 2583 2712 2777 2789 2816 2830 2854 2885 2926 2988 2989 3002 3046 3047 3098 3105 3127 3134 3158 3188 3233 3332 3337 3338 3421 3437 3438 3447 3492 3497 3499 3545 3552 3644 3748 3822 3872 3942 3943 3959 3973 3974 3978 3979 4016 4022 4023 4083 4126 4175 4182 4186 4190 4205 4249 4250 4354 4364 403 408 776 822 853 950 957 1060 1166 1215 1307 1409 1449 1544 1611 1713 1737 1747 1786 1930 2016 2053 2202 2239 2498 2627 2707 2829 2847 2908 3101 3156 3176 3206 3253 3397 3542 3630 3646 3727 4227 4302 CAACCG/CGGTTG 7 -2 174 173 50 -17.6 120 128 137 182 233 234 239 265 284 331 340 351 379 397 429 434 456 513 560 565 573 654 674 710 746 747 749 813 838 839 849 857 886 920 921 963 983 989 1007 1014 1023 1165 1242 1265 1276 1303 1311 1314 1315 1327 1337 1370 1371 1379 1406 1411 1423 1454 1456 1481 1496 1497 1514 1531 1532 1548 1549 1594 1616 1617 1621 1660 1676 1726 1738 1749 1777 1844 1869 1877 1878 1927 1942 1943 1978 1983 1987 2037 2048 2049 2072 2107 2137 2147 2159 2194 2210 2212 2251 2273 2287 2314 2315 2324 2378 2380 2390 2398 2437 2475 2485 2545 2611 2631 2649 2654 2676 2734 2736 2755 2780 2892 2907 2980 2981 2988 2989 3069 3071 3183 3223 3235 3249 3250 3266 3301 3309 3326 3394 3396 3474 3532 3619 3620 3624 3625 3656 3690 3696 3755 3762 3778 3781 3796 3798 3842 3843 3925 3926 3963 3964 4000 4001 4016 4054 4089 4101 4120 4128 4156 4170 4334 4338 4346 88 182 288 402 409 415 422 471 541 602 639 741 811 873 1450 1521 1600 1615 1642 1658 1782 1882 1902 2016 2030 2136 2142 2192 2261 2332 2388 2414 2564 2576 3005 3112 3200 3534 3648 3779 3829 3879 3932 3990 4002 4095 4131 4271 4367 4368 TGGCGG/CCGCCA 0 -3 161 168 37 -21.8 1 2 8 26 48 86 101 136 137 139 147 185 201 202 208 226 235 263 322 340 410 425 472 498 565 583 611 615 648 678 724 746 747 762 763 767 777 778 789 813 846 873 905 935 936 937 954 975 1060 1061 1091 1096 1126 1148 1179 1211 1259 1269 1270 1309 1321 1322 1369 1370 1371 1384 1388 1389 1404 1405 1408 1409 1428 1438 1514 1527 1545 1546 1555 1562 1613 1633 1670 1738 1749 1765 1766 1811 1830 1860 1918 1950 1959 1964 1965 1974 2019 2057 2108 2222 2223 2226 2229 2267 2300 2314 2315 2328 2431 2443 2446 2447 2531 2626 2632 2633 2674 2675 2734 2742 2751 2863 2881 2960 3004 3005 3015 3069 3071 3102 3114 3133 3156 3158 3202 3293 3326 3368 3431 3447 3466 3485 3498 3524 3581 3624 3625 3656 3696 3734 3775 3776 3817 3880 3891 3945 3967 4075 4295 4298 4338 100 470 656 713 729 854 855 1090 1091 1157 1310 1400 1442 1611 1616 1628 1824 1937 1939 1985 2192 2396 2549 2576 2699 2838 2847 3126 3343 3418 3441 3472 3513 3841 3953 4167 4322 GAAGGC/GCCTTC 4 -4 161 166 45 -18.0 30 45 93 125 130 140 160 172 177 182 187 188 238 259 279 313 324 328 387 428 441 442 472 487 497 530 532 557 598 602 605 621 625 626 628 753 757 788 812 830 855 856 870 876 916 945 979 984 998 1064 1093 1121 1156 1176 1266 1303 1352 1383 1394 1406 1424 1427 1445 1495 1509 1521 1539 1555 1636 1652 1653 1657 1672 1699 1700 1828 1832 1883 1955 1966 1973 1979 2035 2116 2133 2165 2213 2224 2247 2285 2316 2363 2401 2403 2406 2466 2493 2534 2556 2578 2649 2652 2653 2720 2763 2764 2821 2838 2870 2894 2913 2919 2925 2998 3068 3069 3164 3172 3187 3226 3227 3258 3272 3282 3283 3306 3341 3348 3366 3376 3406 3421 3441 3442 3478 3479 3527 3557 3575 3577 3578 3592 3623 3680 3711 3712 3889 3890 3916 4063 4074 4093 4101 4148 4197 4220 4234 4260 4342 4364 4365 4 415 459 640 654 849 881 988 1475 1491 1556 1595 1828 1939 1980 2013 2098 2156 2233 2304 2396 2407 2497 2568 2597 2645 2798 2819 2851 2880 3024 3086 3225 3252 3277 3360 3373 3524 3786 4241 4273 4276 4303 4311 4372 CGCAGC/GCTGCG 1 -4 158 165 36 -21.6 30 42 47 60 61 75 76 81 97 107 116 121 127 139 155 171 191 201 202 319 326 327 336 338 339 352 353 400 518 522 523 543 582 607 637 638 677 682 686 769 770 866 873 933 950 954 987 1069 1079 1149 1150 1170 1206 1207 1218 1247 1278 1288 1296 1302 1339 1363 1420 1432 1462 1463 1533 1550 1566 1635 1668 1669 1672 1714 1715 1738 1745 1755 1765 1766 1767 1810 1862 1863 1968 1985 2036 2121 2122 2207 2210 2217 2235 2256 2352 2409 2446 2447 2462 2463 2472 2538 2541 2712 2713 2725 2728 2735 2759 2940 2941 2954 2961 2971 2972 2985 2991 2992 2995 2996 3020 3066 3104 3194 3216 3324 3330 3344 3345 3349 3350 3365 3380 3396 3397 3446 3473 3539 3542 3543 3610 3759 3760 3808 3912 3929 4004 4007 4031 4054 4095 4174 4202 4276 4277 4303 4346 4348 2 137 146 148 174 403 497 509 599 957 992 1278 1403 1570 1621 1747 1788 1789 1971 1983 2083 2100 2134 2149 2367 2516 2674 2782 2854 3086 3104 3322 3550 3718 3845 4322 AGCACC/GGTGCT 1 -4 150 161 47 -16.3 1 2 20 35 44 51 55 57 86 90 109 164 204 205 206 222 226 233 234 236 260 277 284 326 327 339 348 349 361 487 490 538 539 548 570 609 627 652 663 682 691 723 733 759 790 794 797 810 844 912 949 1023 1086 1106 1150 1204 1247 1281 1316 1320 1363 1387 1424 1455 1513 1537 1549 1577 1602 1633 1690 1694 1715 1759 1890 1919 1920 1944 1950 1959 2105 2106 2164 2226 2261 2262 2286 2303 2335 2349 2387 2393 2414 2455 2471 2574 2580 2619 2629 2634 2697 2727 2755 2756 2776 2817 2818 2825 2839 2840 2842 2892 2896 2943 2951 2963 2971 2997 3106 3137 3153 3155 3207 3208 3225 3236 3286 3293 3305 3328 3331 3398 3399 3403 3453 3465 3467 3533 3581 3698 3849 3853 3968 3988 4011 4152 4195 4288 4343 4356 41 51 382 492 545 564 607 611 682 808 954 1005 1128 1141 1153 1182 1292 1380 1389 1517 1642 1679 1840 1858 2063 2078 2276 2399 2400 2412 2480 2541 2617 2667 2973 2980 3029 3040 3080 3126 3546 3632 3691 3854 3987 4206 4325 GACGGT/ACCGTC 10 -2 165 161 53 -14.2 32 121 148 260 306 326 327 330 363 388 397 438 475 497 634 649 650 729 748 790 855 880 920 921 960 1007 1009 1058 1081 1097 1098 1129 1169 1185 1201 1215 1265 1286 1288 1290 1292 1303 1392 1405 1411 1448 1456 1475 1495 1518 1542 1577 1590 1592 1633 1670 1749 1754 1782 1783 1810 1826 1839 1840 1853 1860 1880 1882 1887 1888 1911 1932 1978 1988 2034 2048 2056 2076 2089 2121 2137 2175 2176 2199 2287 2366 2397 2415 2435 2437 2467 2502 2523 2530 2576 2593 2611 2645 2663 2694 2728 2814 2864 2889 2916 2917 2980 2981 2987 3001 3050 3053 3080 3094 3124 3148 3153 3155 3167 3169 3190 3191 3236 3261 3287 3301 3407 3431 3432 3516 3554 3555 3556 3585 3619 3620 3705 3815 3816 3819 3852 3912 3929 3935 3944 3951 3952 3967 4000 4001 4016 4019 4020 4038 4039 4056 4057 4059 4180 4230 4240 4241 4258 4295 4327 33 51 206 442 485 535 555 676 815 843 854 855 963 1201 1223 1276 1483 1549 1834 1959 2017 2030 2082 2093 2121 2221 2367 2497 2499 2502 2510 2732 2756 2859 2895 2967 3012 3101 3175 3185 3317 3419 3513 3519 3564 3731 3870 4025 4041 4189 4214 4253 4360 GTGGCG/CGCCAC 0 -1 154 160 40 -18.8 1 2 8 26 40 48 62 86 147 201 202 208 226 263 264 322 340 380 410 428 487 498 528 531 544 565 586 615 623 624 724 746 747 762 763 767 787 813 846 887 901 905 954 991 1001 1060 1061 1091 1096 1148 1151 1179 1199 1228 1269 1270 1309 1321 1322 1384 1405 1428 1451 1514 1550 1562 1568 1574 1625 1670 1693 1739 1751 1755 1783 1856 1860 1865 1903 1918 1925 1950 1964 1965 1974 2048 2058 2068 2108 2133 2200 2211 2267 2338 2353 2443 2467 2490 2530 2555 2632 2633 2675 2734 2773 2806 2929 2945 2998 3004 3005 3015 3069 3071 3084 3171 3202 3281 3293 3326 3368 3420 3421 3431 3447 3466 3498 3511 3534 3554 3603 3656 3696 3734 3775 3776 3785 3786 3817 3818 3827 3891 3948 3967 3980 3987 4066 4157 4158 4189 4231 4295 4298 4338 51 300 312 429 469 854 855 1090 1091 1166 1369 1442 1611 1620 1628 1985 2004 2163 2319 2345 2379 2503 2563 2576 2582 2630 2664 2847 2861 2910 3126 3377 3393 3441 3471 3472 3497 3513 4106 4326 CGTGGC/GCCACG 0 -2 161 159 49 -15.2 8 37 45 58 109 146 199 208 264 322 352 353 380 412 413 428 447 487 499 590 591 643 674 684 713 746 747 767 787 868 883 935 954 991 1005 1021 1037 1044 1091 1094 1122 1131 1151 1160 1161 1172 1173 1184 1228 1283 1296 1329 1366 1451 1452 1464 1482 1506 1507 1521 1534 1568 1603 1634 1637 1651 1668 1669 1672 1691 1701 1738 1750 1756 1765 1766 1784 1799 1806 1852 1857 1946 2053 2071 2248 2355 2435 2465 2483 2490 2520 2521 2522 2575 2702 2725 2747 2748 2804 2836 2902 2975 3004 3005 3020 3069 3089 3116 3128 3162 3167 3175 3202 3204 3252 3253 3271 3282 3293 3324 3347 3365 3413 3421 3474 3521 3522 3532 3596 3603 3633 3673 3683 3696 3754 3767 3785 3786 3791 3799 3818 3855 3891 3910 3911 3960 3967 3980 3987 4038 4044 4045 4046 4096 4111 4160 4189 4209 4231 4234 4338 51 60 150 563 673 812 854 855 856 873 943 1070 1229 1235 1257 1369 1477 1649 1902 1985 2029 2057 2126 2155 2156 2225 2498 2503 2582 2631 2700 2769 2836 2897 3078 3177 3316 3377 3420 3471 3560 3629 3768 3886 3949 3955 4116 4299 4359 GCCGTG/CACGGC 2 -2 154 152 27 -23.1 27 37 58 165 173 195 208 219 300 312 362 376 409 412 413 421 480 518 536 537 561 581 601 664 692 713 738 815 924 935 952 991 1020 1094 1170 1172 1173 1190 1206 1262 1279 1283 1302 1342 1401 1431 1450 1481 1575 1624 1668 1669 1672 1707 1739 1744 1800 1811 1818 1848 2029 2035 2072 2086 2097 2119 2124 2190 2191 2195 2239 2259 2260 2302 2414 2440 2445 2465 2490 2520 2521 2564 2576 2636 2637 2706 2719 2721 2723 2736 2742 2754 2852 2856 2857 2887 2890 2899 2923 2924 2954 2959 3020 3050 3102 3122 3128 3168 3180 3220 3221 3252 3253 3263 3316 3324 3328 3343 3346 3365 3370 3380 3412 3432 3462 3588 3601 3624 3625 3690 3739 3740 3771 3772 3786 3799 3819 3834 3845 3893 3894 3967 4019 4040 4078 4079 4088 4134 4144 4210 4225 4308 4321 4362 340 371 786 892 1149 1395 1397 1739 1992 2057 2235 2453 2459 2687 2977 3086 3373 3568 3583 3746 3761 3879 3943 4150 4166 4168 4365 CGCCGT/ACGGCG 2 -3 160 151 46 -14.6 37 63 121 169 219 300 360 418 487 592 601 644 645 660 675 713 738 815 823 841 855 940 952 1009 1041 1124 1182 1206 1212 1262 1275 1292 1293 1341 1342 1394 1428 1439 1478 1568 1575 1621 1643 1644 1645 1646 1707 1727 1785 1803 1898 1911 1974 2056 2072 2082 2083 2086 2099 2130 2206 2239 2259 2260 2277 2278 2286 2306 2311 2336 2345 2375 2414 2440 2465 2576 2599 2636 2637 2647 2693 2753 2754 2808 2844 2852 2856 2864 2887 2890 2934 2938 2939 2949 2954 2959 3003 3009 3042 3043 3090 3117 3151 3152 3180 3190 3191 3220 3221 3257 3263 3277 3278 3292 3306 3343 3346 3376 3381 3408 3451 3456 3497 3501 3502 3514 3545 3601 3733 3739 3740 3769 3786 3794 3796 3819 3883 3904 3929 3951 3952 4000 4001 4020 4063 4071 4072 4078 4079 4088 4098 4108 4144 4225 4227 4276 4277 4295 4343 4362 29 52 603 654 675 841 942 975 1071 1090 1263 1357 1449 1739 1772 1944 2003 2148 2209 2226 2477 2582 2632 2737 2793 2804 2839 2955 3069 3265 3335 3568 3595 3596 3625 3655 3767 3772 3855 3895 3943 4150 4180 4219 4251 4365 CGTGGT/ACCACG 0 -2 145 146 41 -15.4 146 154 189 192 208 243 259 279 295 324 326 327 335 349 384 449 450 458 477 501 510 519 528 531 545 564 581 588 741 768 883 900 911 991 1001 1005 1021 1050 1052 1076 1078 1122 1151 1172 1173 1208 1231 1252 1276 1290 1319 1342 1366 1382 1395 1475 1584 1599 1616 1617 1659 1671 1716 1727 1780 1840 1857 1874 1891 1894 1950 1978 1990 2028 2051 2094 2095 2112 2132 2250 2302 2389 2400 2414 2445 2591 2623 2685 2710 2753 2754 2758 2831 2899 2909 2958 2974 2980 2981 3030 3091 3102 3125 3161 3162 3168 3205 3243 3271 3293 3296 3297 3372 3402 3432 3443 3494 3498 3529 3530 3588 3624 3625 3634 3659 3715 3759 3760 3817 3828 3830 3833 3854 3917 4066 4088 4097 4122 4134 4188 4209 4210 4274 4361 4362 33 84 181 320 788 856 945 1014 1015 1017 1073 1128 1263 1578 1640 1800 1801 1857 1969 2123 2219 2465 2562 2595 2784 3099 3117 3119 3377 3385 3471 3595 3644 3761 3799 3822 3853 3890 3917 3998 4108 ACGAGC/GCTCGT 8 -5 145 146 48 -13.0 58 67 77 80 87 146 163 303 330 343 349 410 426 427 444 528 535 627 690 702 726 764 765 799 849 858 863 864 868 870 877 900 902 929 969 982 998 1008 1031 1043 1046 1050 1060 1061 1069 1076 1163 1167 1273 1313 1342 1361 1362 1386 1406 1466 1535 1567 1594 1603 1680 1686 1699 1700 1724 1767 1784 1815 1828 1880 1891 1903 1908 1996 2051 2098 2115 2127 2131 2154 2164 2192 2234 2245 2259 2260 2329 2477 2481 2519 2543 2548 2623 2634 2727 2747 2748 2751 2781 2790 2815 2847 2923 2924 3044 3104 3118 3137 3139 3161 3220 3221 3260 3375 3429 3478 3577 3578 3638 3665 3673 3697 3830 3865 3932 3939 3945 4015 4027 4061 4085 4110 4140 4141 4149 4159 4164 4187 4189 4196 4207 4261 4291 4292 4305 29 36 166 432 462 663 676 770 1067 1229 1562 1621 1822 1824 2039 2057 2094 2110 2214 2314 2347 2379 2412 2481 2516 2597 2670 2726 2737 2739 2740 2776 2834 2881 2922 3023 3049 3142 3260 3352 3509 3549 3717 3791 3822 3969 4137 4226 GGCGGA/TCCGCC 0 -2 142 141 29 -19.5 140 147 185 204 205 226 235 249 273 293 322 360 392 410 418 431 464 498 516 555 565 617 644 645 660 676 678 705 724 762 763 777 778 862 930 984 992 1077 1158 1170 1179 1195 1212 1215 1309 1341 1404 1423 1434 1491 1529 1530 1533 1568 1587 1588 1645 1646 1657 1670 1717 1734 1749 1832 1839 1856 1918 1959 2030 2054 2057 2082 2083 2084 2086 2229 2277 2278 2311 2330 2345 2404 2407 2504 2545 2585 2626 2636 2637 2655 2674 2742 2863 2874 2938 2939 2954 3033 3071 3091 3117 3124 3156 3158 3183 3202 3263 3264 3296 3297 3370 3381 3395 3398 3404 3427 3431 3447 3451 3497 3501 3502 3514 3524 3655 3656 3668 3739 3740 3854 3879 3904 3967 3998 3999 4024 4098 4108 4120 4227 4343 4365 56 295 415 656 822 854 867 1090 1386 1739 1868 1943 1944 1979 2003 2396 2548 2839 2906 2941 3265 3352 3470 3472 3513 3657 3841 3863 4150 GGCAGC/GCTGCC 1 -4 130 137 38 -14.7 22 96 132 165 172 173 176 210 211 218 228 234 279 313 347 365 371 375 423 444 449 450 474 512 515 573 574 643 666 667 716 717 750 831 844 872 886 924 935 944 999 1013 1041 1069 1093 1099 1170 1250 1296 1340 1384 1394 1397 1405 1425 1427 1436 1468 1474 1478 1547 1566 1637 1698 1711 1733 1759 1762 1794 1813 1827 1852 1945 1985 2033 2114 2152 2228 2256 2264 2302 2336 2352 2365 2451 2482 2565 2592 2646 2654 2667 2672 2742 2811 2864 2878 2886 2902 2965 2966 2979 3164 3381 3394 3396 3432 3469 3494 3514 3542 3543 3544 3547 3632 3788 3792 3793 3865 3873 3874 3900 4000 4001 4042 4043 4044 4143 4174 4275 4303 86 266 561 584 756 786 988 1048 1182 1228 1342 1525 1693 1790 1963 2084 2549 2577 2645 2908 2963 3076 3078 3130 3172 3195 3196 3354 3359 3413 3442 3530 3714 3733 3829 3886 4085 4335 TTGCGG/CCGCAA 9 -4 137 136 32 -17.0 7 95 120 181 210 211 245 253 301 302 311 316 331 342 390 391 397 434 451 454 455 460 511 534 571 574 662 705 757 762 763 766 767 862 874 875 920 921 963 1099 1154 1168 1192 1254 1307 1339 1355 1383 1408 1409 1524 1525 1548 1550 1710 1786 1795 1841 1911 2037 2050 2097 2112 2141 2142 2147 2159 2210 2240 2291 2292 2317 2349 2379 2382 2392 2427 2491 2503 2559 2562 2581 2586 2611 2654 2668 2701 2735 2736 2860 2869 2892 2940 2941 2946 2999 3071 3101 3109 3126 3127 3158 3250 3284 3309 3313 3314 3376 3528 3610 3614 3615 3655 3692 3698 3716 3735 3741 3750 3811 3841 3842 3843 3875 3892 3958 4108 4110 4117 4140 4141 4170 4191 4249 4250 4315 4338 86 327 541 647 741 1202 1284 1294 1494 1598 1704 1714 1761 2177 2414 2533 2576 2668 2691 2733 2748 2787 2967 2996 3018 3091 3116 3626 3693 3814 4280 4287 AGCCGT/ACGGCT 2 -3 134 135 41 -13.2 16 27 116 147 173 195 216 277 280 308 312 316 319 339 476 480 489 518 536 537 561 657 689 779 822 850 872 883 896 897 924 944 974 1020 1047 1170 1172 1173 1279 1290 1298 1302 1343 1380 1401 1517 1668 1669 1670 1702 1703 1707 1744 1800 1811 1818 1819 1848 1850 1973 1980 1987 2029 2036 2043 2069 2075 2087 2088 2097 2157 2181 2182 2190 2191 2195 2261 2262 2364 2580 2616 2706 2721 2723 2742 2768 2923 2924 2988 2989 3006 3020 3027 3028 3050 3051 3063 3128 3137 3184 3214 3252 3253 3310 3316 3321 3328 3375 3462 3605 3606 3632 3643 3647 3729 3771 3772 3799 3801 3808 3826 3834 3967 4004 4044 4071 4072 4081 4082 4134 4137 4163 4179 4210 33 97 169 246 269 375 526 1149 1389 1397 1472 1473 1477 1548 1866 1888 1966 1994 2150 2153 2277 2687 2737 2751 2793 2952 2963 3006 3029 3067 3086 3341 3362 3557 3761 3879 4084 4151 4153 4166 4308 AGGCGG/CCGCCT 0 -3 132 134 28 -18.3 84 140 147 197 249 255 293 313 314 331 337 360 361 383 387 392 406 408 431 464 510 562 568 571 592 598 666 667 676 678 721 722 724 741 752 788 812 844 862 899 930 984 992 1085 1123 1126 1158 1171 1195 1309 1324 1341 1357 1381 1384 1423 1491 1492 1581 1584 1595 1636 1645 1646 1657 1678 1688 1781 1800 1832 1839 1856 1872 1886 1918 1937 1978 2003 2028 2030 2042 2054 2072 2084 2224 2228 2265 2287 2323 2482 2504 2585 2655 2674 2727 2742 2750 2752 2876 2894 2913 2918 2928 2954 3071 3209 3382 3398 3486 3550 3554 3558 3576 3609 3656 3711 3712 3755 3773 3775 3925 3926 3965 3966 3998 3999 4024 4120 4143 4183 4184 4365 167 228 295 300 353 383 415 469 471 555 867 881 1059 1236 1246 1386 2491 2548 2597 2803 2906 3005 3111 3501 3745 3969 4185 4303 AGGCGG/CCGCCT 4 -2 132 134 28 -18.3 84 140 147 197 249 255 293 313 314 331 337 360 361 383 387 392 406 408 431 464 510 562 568 571 592 598 666 667 676 678 721 722 724 741 752 788 812 844 862 899 930 984 992 1085 1123 1126 1158 1171 1195 1309 1324 1341 1357 1381 1384 1423 1491 1492 1581 1584 1595 1636 1645 1646 1657 1678 1688 1781 1800 1832 1839 1856 1872 1886 1918 1937 1978 2003 2028 2030 2042 2054 2072 2084 2224 2228 2265 2287 2323 2482 2504 2585 2655 2674 2727 2742 2750 2752 2876 2894 2913 2918 2928 2954 3071 3209 3382 3398 3486 3550 3554 3558 3576 3609 3656 3711 3712 3755 3773 3775 3925 3926 3965 3966 3998 3999 4024 4120 4143 4183 4184 4365 167 228 295 300 353 383 415 469 471 555 867 881 1059 1236 1246 1386 2491 2548 2597 2803 2906 3005 3111 3501 3745 3969 4185 4303 CGACGG/CCGTCG 10 -3 143 134 41 -13.0 121 178 290 374 380 497 536 537 546 592 634 880 899 920 921 940 999 1007 1041 1047 1058 1135 1158 1169 1182 1195 1271 1288 1289 1384 1391 1394 1424 1475 1560 1577 1625 1645 1646 1670 1715 1751 1754 1826 1839 1853 1882 1887 1888 1911 1932 1974 1993 2034 2035 2048 2056 2069 2078 2089 2100 2101 2169 2175 2176 2181 2182 2189 2239 2261 2262 2277 2278 2336 2346 2347 2445 2468 2491 2530 2531 2595 2788 2864 2887 2916 2917 2988 2989 3063 3124 3158 3167 3190 3191 3241 3261 3296 3297 3318 3319 3356 3357 3398 3451 3473 3516 3614 3615 3628 3677 3735 3739 3740 3796 3826 3834 3929 3944 3983 4000 4001 4038 4039 4056 4057 4059 4066 4069 4071 4072 4149 4180 4181 4188 4230 4258 4293 4294 4314 4322 4328 4343 51 206 335 413 555 556 673 843 963 1060 1085 1276 1391 1449 1477 1742 1763 1772 1800 1921 1959 2173 2367 2502 2582 2632 2793 2861 3012 3036 3069 3265 3274 3350 3419 3564 3568 3655 3731 3804 3870 GGCGGC/GCCGCC 0 -2 132 133 33 -15.9 47 97 101 106 170 235 298 299 314 342 347 360 384 472 498 583 592 598 611 615 617 644 645 648 658 666 667 675 724 746 747 764 765 789 905 936 937 942 954 984 1109 1110 1126 1171 1179 1181 1241 1259 1262 1293 1321 1322 1379 1415 1428 1438 1524 1525 1527 1533 1555 1595 1613 1830 1860 1872 1898 1937 1964 1965 1985 2028 2099 2171 2228 2239 2254 2265 2300 2311 2314 2315 2323 2407 2545 2572 2674 2675 2695 2735 2808 2894 2913 2954 2959 3071 3074 3091 3102 3104 3128 3133 3163 3252 3253 3271 3343 3368 3447 3466 3498 3514 3550 3558 3609 3711 3712 3734 3773 3775 3801 3854 3925 3926 3965 3966 4006 4040 4183 4184 4295 4322 88 148 228 383 469 782 881 1246 1310 1442 1628 1678 1790 1943 2192 2225 2345 2582 2699 3111 3243 3311 3343 3418 3481 3568 3725 3727 3745 3772 3955 3969 4303 GCCGCC/GGCGGC 1 -3 132 133 33 -15.9 47 97 101 106 170 235 298 299 314 342 347 360 384 472 498 583 592 598 611 615 617 644 645 648 658 666 667 675 724 746 747 764 765 789 905 936 937 942 954 984 1109 1110 1126 1171 1179 1181 1241 1259 1262 1293 1321 1322 1379 1415 1428 1438 1524 1525 1527 1533 1555 1595 1613 1830 1860 1872 1898 1937 1964 1965 1985 2028 2099 2171 2228 2239 2254 2265 2300 2311 2314 2315 2323 2407 2545 2572 2674 2675 2695 2735 2808 2894 2913 2954 2959 3071 3074 3091 3102 3104 3128 3133 3163 3252 3253 3271 3343 3368 3447 3466 3498 3514 3550 3558 3609 3711 3712 3734 3773 3775 3801 3854 3925 3926 3965 3966 4006 4040 4183 4184 4295 4322 88 148 228 383 469 782 881 1246 1310 1442 1628 1678 1790 1943 2192 2225 2345 2582 2699 3111 3243 3311 3343 3418 3481 3568 3725 3727 3745 3772 3955 3969 4303 CCGTGG/CCACGG 0 -3 125 132 30 -17.0 34 45 83 142 146 173 192 199 208 296 326 327 335 342 449 450 477 501 518 536 537 581 590 591 664 700 701 713 741 869 884 920 921 935 991 1014 1044 1046 1094 1172 1173 1231 1252 1276 1290 1296 1329 1382 1393 1441 1481 1482 1637 1659 1668 1669 1672 1691 1716 1719 1738 1750 1799 1811 1852 1978 2028 2035 2051 2105 2106 2112 2125 2132 2214 2257 2259 2260 2367 2368 2445 2490 2662 2698 2710 2754 2831 2836 2899 2925 3020 3102 3122 3125 3128 3159 3160 3205 3252 3253 3267 3301 3324 3328 3346 3365 3397 3405 3419 3432 3474 3494 3499 3521 3529 3530 3568 3690 3696 3799 4088 4111 4134 4209 4210 33 160 181 226 312 320 479 563 812 871 873 892 1177 1198 1478 1902 2057 2123 2453 2465 2498 2836 3251 3373 3568 3761 3853 3890 4108 4354 CGCCGC/GCGGCG 1 -4 137 131 43 -11.8 106 142 170 235 298 299 360 384 472 498 555 584 592 617 644 645 686 705 724 785 880 885 905 933 942 984 1015 1041 1077 1092 1109 1110 1126 1170 1181 1259 1313 1379 1415 1428 1434 1527 1533 1538 1555 1588 1613 1619 1734 1830 1832 1905 1937 1955 1968 1985 2011 2028 2171 2201 2239 2277 2278 2286 2307 2320 2330 2404 2407 2429 2477 2479 2481 2504 2545 2591 2638 2674 2707 2708 2728 2735 2808 2820 2862 2914 2954 3027 3028 3033 3071 3074 3091 3104 3124 3128 3163 3190 3191 3232 3257 3271 3315 3343 3388 3447 3498 3514 3528 3532 3558 3609 3610 3655 3711 3712 3734 3773 3775 3792 3793 3827 3854 3876 3925 3926 3940 3958 3965 3966 4006 4040 4096 4247 4273 4295 4358 29 56 88 146 148 554 674 700 881 1130 1190 1202 1224 1442 1621 1789 1790 1924 1943 1944 1979 2225 2563 2582 2829 2865 2941 3018 3044 3064 3243 3311 3362 3418 3469 3470 3567 3657 3725 3772 3863 3955 4106 CGTGTC/GACACG 6 -3 136 131 43 -11.8 37 58 163 165 187 188 219 245 263 298 299 412 413 418 465 482 595 615 692 776 814 868 870 877 885 1113 1176 1177 1210 1383 1407 1418 1431 1471 1475 1524 1525 1591 1603 1606 1635 1686 1754 1818 1853 1857 1886 1981 1990 2029 2053 2062 2072 2076 2119 2122 2154 2156 2190 2191 2192 2233 2248 2249 2416 2417 2438 2625 2667 2719 2742 2797 2850 2889 2894 2929 2950 2954 2967 2978 2991 2992 2995 2996 3015 3017 3055 3056 3057 3080 3108 3169 3179 3282 3293 3366 3385 3388 3406 3410 3414 3490 3510 3584 3591 3596 3626 3627 3643 3771 3772 3786 3801 3821 3833 3835 3836 3855 3919 3922 3939 3987 4008 4009 4027 4061 4063 4070 4096 4122 4149 4166 4189 4230 4299 4329 60 84 133 150 320 371 414 754 855 901 1146 1190 1345 1448 1588 1649 1660 1772 1812 1894 2017 2124 2156 2187 2275 2309 2314 2556 2662 2664 2673 3027 3084 3260 3362 3530 3583 3592 3726 3879 3949 4294 4328 GCCGTC/GACGGC 2 -2 133 129 34 -14.6 121 169 319 380 409 418 433 487 489 499 536 537 568 592 644 645 660 822 883 886 899 940 944 999 1009 1041 1047 1096 1182 1290 1292 1293 1380 1382 1391 1394 1428 1473 1517 1568 1643 1644 1645 1646 1715 1762 1803 1826 1827 1842 1850 1896 1898 1974 1980 2036 2056 2069 2072 2139 2152 2169 2181 2182 2185 2261 2262 2311 2329 2336 2346 2347 2354 2375 2519 2531 2580 2599 2753 2793 2829 2864 2887 2938 2939 2949 2988 2989 3006 3027 3028 3063 3090 3117 3190 3191 3214 3261 3292 3296 3297 3321 3408 3451 3462 3562 3563 3605 3606 3695 3729 3756 3796 3826 3924 3951 3952 4000 4001 4016 4020 4069 4071 4072 4081 4082 4163 4179 4188 4244 4276 4277 4343 33 246 654 700 841 967 1116 1143 1263 1357 1449 1472 1477 1772 1944 1967 2003 2148 2632 2793 2839 2952 3006 3069 3189 3265 3350 3596 3655 3772 3943 4084 4120 4150 GTGCAG/CTGCAC 1 -5 127 128 35 -14.0 22 46 72 73 90 173 228 268 334 343 358 408 423 426 427 492 534 567 617 695 714 749 803 807 810 846 890 907 927 988 1008 1012 1035 1038 1080 1125 1130 1157 1300 1301 1375 1413 1427 1446 1537 1549 1568 1584 1633 1664 1733 1831 1845 1856 1907 1925 1935 1952 1976 2072 2123 2186 2188 2218 2226 2259 2260 2280 2312 2313 2329 2352 2431 2561 2617 2642 2647 2682 2688 2712 2721 2726 2739 2786 2923 2924 2971 3025 3036 3042 3043 3073 3250 3290 3308 3358 3401 3406 3416 3417 3455 3486 3601 3676 3729 3766 3778 3809 3824 3899 3921 3984 3985 4033 4089 4091 4102 4172 4200 4206 4225 4257 4266 4281 4282 4350 4370 43 77 290 542 570 632 762 827 832 932 988 1030 1056 1091 1108 1183 1510 1687 1939 2083 2099 2322 2413 2558 2602 2717 2886 3036 3086 3139 3489 3826 3998 4127 4154 TGACGG/CCGTCA 10 -3 129 125 41 -11.3 110 121 148 152 260 370 388 398 433 475 556 568 609 644 645 649 650 682 882 883 960 994 1001 1009 1020 1081 1129 1191 1265 1292 1360 1380 1384 1405 1411 1448 1495 1503 1511 1520 1542 1568 1618 1633 1643 1644 1680 1708 1810 1840 1850 1860 1896 1898 1926 1932 1941 1978 2054 2137 2152 2199 2324 2329 2345 2375 2415 2430 2435 2437 2442 2444 2467 2519 2523 2576 2580 2585 2591 2593 2645 2814 2864 2889 2987 3033 3050 3053 3094 3109 3117 3170 3209 3292 3293 3312 3317 3321 3370 3393 3432 3462 3619 3620 3652 3705 3734 3742 3756 3815 3816 3819 3852 3853 3879 3924 3951 3952 4000 4001 4016 4020 4056 4057 4081 4082 4240 4241 4244 93 394 575 644 654 676 719 815 843 855 1098 1116 1449 1472 1834 1840 1944 2017 2121 2136 2415 2465 2499 2550 2839 2859 2952 3006 3178 3185 3513 3549 3641 3676 3727 3935 4041 4150 4189 4214 4255 CGAGCA/TGCTCG 8 -4 123 124 41 -11.1 55 152 163 164 173 183 226 253 266 278 289 305 443 444 497 519 646 728 731 745 764 765 781 799 809 876 892 900 926 929 982 986 1022 1060 1061 1085 1182 1202 1219 1241 1283 1316 1361 1362 1466 1534 1535 1571 1584 1585 1633 1680 1729 1776 1784 1811 1815 1845 1852 1880 1891 1893 1903 1908 1934 1944 1996 2098 2225 2245 2303 2331 2332 2404 2413 2459 2473 2477 2537 2626 2631 2768 2778 2779 2785 2834 2916 2917 2923 2924 2979 3034 3067 3104 3118 3214 3308 3309 3411 3429 3458 3501 3502 3513 3547 3584 3634 3638 3665 3939 3949 3977 4070 4076 4078 4079 4110 4140 4141 4164 4291 4292 4346 36 89 173 427 462 953 954 1218 1307 1348 1363 1393 1397 1822 1863 2011 2079 2110 2303 2311 2379 2412 2486 2531 2667 2713 2740 2776 2834 2908 2922 3030 3260 3392 3551 3692 3750 3969 4072 4137 4226 GGCTGT/ACAGCC 2 -3 119 123 41 -11.0 0 27 46 63 66 72 73 134 159 160 186 190 216 252 277 285 297 387 389 467 514 549 554 566 570 675 707 766 768 785 845 856 873 998 1019 1202 1229 1244 1256 1257 1276 1298 1338 1358 1460 1499 1503 1719 1729 1738 1753 1765 1766 1801 1804 1814 1860 1880 1955 1967 2001 2002 2058 2117 2128 2138 2165 2195 2222 2223 2246 2299 2311 2323 2389 2406 2437 2649 2712 2768 2777 2816 2885 2988 2989 2998 3016 3046 3047 3071 3103 3105 3112 3127 3252 3253 3332 3351 3362 3399 3437 3438 3443 3503 3801 3822 3851 3872 3942 3943 3962 4062 4125 4126 4249 4250 4313 4361 4364 166 318 433 459 526 599 645 822 853 1158 1166 1304 1307 1409 1473 1654 1747 1897 1966 2239 2498 2503 2743 2801 2828 2995 3101 3116 3132 3218 3253 3352 3502 3557 3630 3646 3853 3862 4227 4359 4372 CTGCAG/CTGCAG 1 -5 113 119 32 -13.3 9 31 66 100 209 222 234 264 275 343 347 348 359 362 436 512 528 543 577 612 613 614 632 652 691 712 782 799 853 899 905 922 1006 1087 1092 1183 1252 1256 1257 1267 1343 1361 1362 1420 1431 1453 1488 1537 1594 1606 1630 1633 1648 1710 1738 1755 1915 1931 1941 1985 1999 2016 2027 2033 2055 2102 2109 2159 2168 2188 2455 2513 2546 2573 2586 2602 2608 2654 2690 2691 2769 2777 2828 2894 2948 3104 3127 3154 3260 3263 3289 3313 3314 3339 3340 3341 3351 3385 3406 3673 3681 3759 3760 3766 3857 3858 3881 3914 3961 4197 4318 4319 4320 78 332 338 408 449 562 564 642 789 953 1129 1323 1654 2224 2258 2666 2887 2954 3035 3137 3143 3359 3487 3519 3530 3549 3732 3910 4135 4193 4301 4335 CAGCCG/CGGCTG 1 -2 115 116 34 -12.0 0 26 45 173 186 216 277 294 301 302 319 339 345 362 397 675 695 844 886 896 897 904 924 933 936 937 1002 1020 1028 1079 1170 1199 1202 1218 1256 1257 1276 1293 1298 1302 1343 1415 1432 1549 1550 1800 1818 1852 1874 1953 1973 2036 2043 2062 2094 2095 2111 2119 2121 2137 2159 2181 2182 2195 2210 2282 2311 2336 2346 2347 2388 2389 2491 2558 2610 2640 2675 2712 2742 2768 2833 2991 2992 3050 3071 3103 3133 3153 3214 3344 3345 3362 3437 3438 3466 3495 3513 3632 3801 3811 3819 3826 3962 4004 4022 4023 4071 4072 4089 4143 4202 4210 4249 4250 4361 148 228 318 433 472 509 526 822 1048 1079 1127 1149 1389 1473 1525 1628 1678 1966 2597 2713 2801 2963 3006 3029 3311 3341 3343 3352 3392 3439 3568 3693 4084 4345 GCACCG/CGGTGC 1 -3 109 116 20 -18.2 0 6 44 49 86 148 221 234 260 325 349 352 353 358 395 406 492 519 538 539 605 607 609 617 644 645 651 732 788 807 840 867 1035 1085 1149 1200 1229 1241 1318 1407 1424 1435 1549 1577 1621 1633 1639 1684 1690 1715 1773 1810 1815 1821 1849 1869 1882 1909 1951 1978 2062 2105 2106 2164 2173 2254 2261 2262 2286 2289 2290 2312 2313 2336 2380 2393 2397 2414 2458 2511 2531 2688 2735 2786 2801 2934 3015 3053 3116 3118 3153 3180 3236 3261 3277 3278 3361 3398 3403 3406 3465 3494 3516 3808 3855 4032 4052 4306 4343 43 51 175 182 487 655 682 1101 1153 1230 1533 1940 2078 2418 2480 2541 3399 3473 3854 3943 CGAGCC/GGCTCG 8 -4 119 116 29 -13.9 80 146 163 430 487 536 537 580 582 584 627 632 635 636 726 789 831 849 858 870 883 902 906 965 985 990 998 1008 1031 1076 1108 1185 1302 1313 1342 1346 1426 1452 1594 1599 1603 1677 1686 1714 1724 1750 1811 1819 1840 1867 1898 1932 1984 2071 2072 2130 2134 2164 2225 2234 2258 2296 2329 2330 2416 2417 2481 2519 2616 2618 2631 2720 2727 2751 2781 2815 2885 2911 2984 3041 3044 3056 3057 3075 3137 3153 3169 3214 3220 3221 3277 3278 3316 3381 3462 3501 3502 3545 3558 3577 3578 3584 3673 3691 3697 3748 3867 4015 4022 4023 4027 4064 4149 4155 4159 4187 4196 4229 4348 56 182 432 563 670 772 953 1229 1562 1993 2057 2290 2597 2670 2726 2737 2791 3068 3142 3352 3549 3565 3613 3791 3810 3822 3937 3952 3963 CAAGCG/CGCTTG 7 -2 111 115 26 -15.0 0 12 52 110 111 117 182 210 211 224 271 272 366 461 470 582 678 705 711 719 748 785 841 870 917 927 950 979 981 1205 1228 1296 1318 1327 1358 1366 1369 1407 1447 1465 1479 1480 1540 1550 1552 1553 1591 1649 1686 1695 1699 1700 1772 1789 1795 1827 1879 1907 1921 1928 1955 1956 2096 2102 2108 2121 2268 2274 2275 2291 2292 2304 2326 2746 2793 2836 2916 2917 2919 2943 2991 2992 2998 3037 3038 3267 3327 3330 3362 3368 3500 3510 3511 3568 3614 3615 3705 3733 3748 3749 3812 3846 3880 3915 3927 4028 4166 4175 4276 4277 4350 126 128 276 564 634 1138 1179 1198 1715 1718 1809 1963 2533 2955 3120 3323 3585 3649 3652 3739 3836 3845 3895 3945 4327 4331 CTGCGG/CCGCAG 9 -4 115 114 24 -15.7 75 118 157 168 172 336 337 339 346 381 471 607 686 749 757 767 785 857 866 933 954 981 992 1000 1069 1077 1079 1093 1122 1149 1150 1170 1171 1206 1218 1242 1288 1296 1311 1339 1420 1432 1476 1533 1560 1601 1679 1770 1869 1978 1985 2017 2033 2109 2122 2152 2184 2249 2253 2257 2308 2314 2315 2409 2472 2481 2486 2538 2541 2625 2636 2637 2649 2678 2679 2692 2712 2768 2796 2808 2892 2893 2995 2996 3033 3039 3104 3116 3158 3173 3174 3210 3344 3345 3349 3353 3354 3380 3396 3474 3581 3592 3854 3922 3946 4008 4009 4054 4138 4183 4184 4189 4303 4346 4363 67 146 148 422 554 664 811 1150 1469 1620 1747 2100 2420 2516 2555 2563 2803 2854 3112 3142 3311 3526 3550 3986 GCTGTC/GACAGC 2 -2 102 109 32 -11.3 0 27 36 108 128 159 161 183 223 262 354 431 439 468 481 502 549 570 619 656 702 740 756 772 785 821 847 865 933 967 980 1031 1094 1103 1132 1186 1215 1227 1266 1276 1298 1425 1441 1499 1523 1543 1592 1612 1629 1653 1719 1758 1775 1794 1894 1955 1980 2215 2222 2223 2314 2315 2363 2381 2383 2471 2497 2508 2513 2533 2618 2654 2724 2791 2818 2831 3087 3112 3127 3182 3236 3262 3264 3280 3318 3319 3396 3399 3443 3503 3649 3731 3751 3752 3792 3793 3875 3919 4191 4193 4205 4313 433 645 734 856 1142 1251 1278 1395 1406 1411 1519 1575 1876 2006 2023 2035 2336 2480 2541 2575 2791 2792 2920 2995 3151 3218 3352 3471 3572 3715 4056 4359 AGCCGC/GCGGCT 1 -4 108 107 28 -12.4 26 47 157 170 186 241 301 302 314 342 345 362 397 426 472 583 593 611 648 675 762 763 789 933 1079 1168 1170 1228 1262 1293 1415 1432 1438 1512 1524 1525 1534 1549 1550 1593 1595 1647 1839 1872 1874 1898 1960 2018 2062 2159 2210 2242 2282 2300 2309 2311 2323 2336 2340 2343 2438 2519 2562 2625 2675 2712 2808 2833 2894 2991 2992 3071 3103 3126 3127 3133 3153 3271 3344 3345 3376 3437 3438 3481 3482 3487 3488 3513 3553 3558 3581 3735 3773 3801 3811 3847 3862 3868 3875 3907 4022 4023 4071 4072 4202 4249 4250 4315 100 148 228 488 532 633 782 1017 1130 1294 1525 1628 2192 2533 2699 2726 3111 3311 3343 3352 3439 3568 3591 3745 3844 3883 3969 4021 GCCGCT/AGCGGC 1 -3 105 102 29 -11.0 8 54 186 223 241 301 302 426 472 498 555 593 843 880 892 986 990 1015 1041 1092 1188 1313 1379 1401 1405 1434 1514 1538 1549 1566 1593 1647 1649 1827 1832 1839 1905 1907 1946 1955 1960 1968 2011 2018 2027 2062 2077 2184 2201 2239 2282 2307 2309 2343 2349 2429 2477 2519 2591 2638 2640 2652 2653 2728 2761 2805 2820 2862 2868 3104 3128 3153 3170 3243 3257 3292 3394 3441 3442 3487 3488 3497 3506 3514 3548 3610 3748 3792 3793 3801 3811 3847 3854 3868 3907 3940 4000 4001 4006 4022 4023 4175 4247 4273 4350 29 88 265 532 633 674 700 1059 1130 1215 1224 1621 1790 1963 2726 2829 2832 3044 3352 3380 3530 3567 3652 3657 3725 3844 3955 4021 4255 GCTGGC/GCCAGC 0 -2 93 100 25 -12.2 15 20 23 32 55 63 134 139 154 195 196 210 211 234 250 284 348 379 386 422 433 468 525 542 657 699 746 747 815 831 865 892 914 986 1059 1092 1131 1188 1211 1273 1477 1632 1642 1647 1654 1655 1834 1959 1988 2062 2116 2128 2226 2229 2323 2397 2401 2476 2478 2597 2604 2616 2618 2644 2646 2673 2714 2855 3041 3102 3113 3153 3195 3196 3385 3412 3528 3654 3666 3667 3673 3674 3675 3779 3788 3905 4015 4047 4080 4217 4218 4273 4313 100 399 531 545 561 1044 1079 1215 1315 1395 1396 1510 1562 1916 2042 2066 2577 2590 3093 3418 3557 3745 3845 3919 4322 TGCCGT/ACGGCA 2 -3 105 100 33 -9.2 10 11 165 274 362 376 380 409 429 433 474 568 664 714 840 899 999 1094 1260 1391 1394 1450 1624 1664 1672 1715 1762 1818 1837 1842 1924 2035 2065 2072 2074 2119 2120 2152 2169 2185 2312 2313 2329 2346 2347 2354 2445 2490 2494 2519 2520 2521 2531 2564 2711 2718 2737 2742 2760 2857 2861 2864 2990 2999 3004 3005 3011 3032 3122 3164 3168 3180 3193 3198 3199 3258 3310 3324 3343 3380 3404 3410 3412 3432 3562 3563 3588 3593 3594 3756 3893 3894 3897 3898 3924 4016 4019 4040 4069 4144 4177 4188 4244 4308 4321 59 464 498 892 1008 1116 1122 1480 1944 1992 1993 2235 2431 2453 2459 2977 3087 3189 3350 3373 3418 3475 3583 3621 3626 3668 3692 3746 4073 4093 4120 4148 4168 TGAGCG/CGCTCA 5 -3 98 100 19 -14.9 13 14 17 135 165 223 236 279 306 336 338 389 428 457 536 537 574 601 611 656 684 831 845 982 1010 1018 1022 1122 1123 1188 1291 1365 1377 1391 1438 1668 1669 1691 1779 1855 1881 1891 1918 1981 2069 2147 2212 2240 2241 2268 2343 2396 2401 2458 2477 2478 2492 2519 2535 2536 2568 2593 2616 2652 2653 2676 2693 2694 2735 2953 3052 3128 3249 3284 3298 3336 3388 3423 3439 3441 3442 3457 3462 3484 3493 3545 3548 3610 3637 3811 3955 3981 4028 4030 4040 4179 4295 4312 265 513 720 952 1621 1847 1979 1991 2118 2502 3358 3441 3587 3591 3719 3725 4021 4094 4126 CGCAGT/ACTGCG 2 -3 101 99 24 -12.4 168 200 277 352 353 365 366 379 381 390 391 476 500 514 559 630 700 701 746 747 767 785 827 923 1072 1094 1122 1242 1357 1421 1476 1529 1530 1539 1560 1601 1609 1653 1679 1725 1765 1766 1853 1857 1869 1879 1978 2030 2044 2184 2235 2249 2259 2260 2308 2372 2386 2542 2588 2626 2645 2649 2750 2763 2764 2808 2846 2892 2893 2930 2931 2985 3039 3173 3174 3210 3265 3349 3353 3354 3429 3529 3530 3581 3646 3672 3922 3958 3965 3966 4008 4009 4126 4130 4131 4147 4183 4184 4189 4360 4363 276 554 664 811 832 901 1221 1295 1484 1688 1901 2439 2496 2577 2604 2631 2768 2865 3174 3213 3526 3773 3986 4169 CCGAGC/GCTCGG 8 -5 96 97 27 -10.7 121 163 183 194 216 278 443 519 522 523 580 646 663 732 781 809 819 856 878 879 883 892 906 926 1058 1099 1123 1144 1155 1185 1202 1219 1220 1241 1302 1346 1401 1584 1585 1599 1636 1677 1729 1750 1769 1775 1776 1783 1808 1852 1898 1928 2071 2154 2170 2225 2264 2303 2330 2350 2416 2417 2618 2626 2631 2666 2768 2778 2779 2785 2911 2935 2949 3015 3034 3058 3132 3153 3169 3308 3309 3381 3501 3502 3545 3691 3702 3933 4022 4023 4064 4076 4078 4079 4192 4334 56 563 607 822 1504 1732 1761 1791 2011 2079 2713 2753 2783 2791 2867 2908 3068 3205 3262 3313 3608 3654 3692 3828 3937 4041 4312 TGCGGA/TCCGCA 9 -3 99 97 25 -11.5 75 168 181 286 311 332 336 346 358 371 460 508 511 545 820 851 862 889 938 946 981 992 1069 1097 1098 1099 1149 1154 1254 1296 1307 1339 1465 1503 1560 1601 1604 1605 1699 1700 1710 1786 2017 2033 2042 2109 2112 2249 2251 2291 2292 2309 2331 2332 2349 2424 2479 2490 2531 2538 2541 2559 2581 2636 2637 2668 2691 2701 2705 2951 3210 3284 3474 3592 3610 3614 3615 3698 3716 3717 3719 3741 3749 3750 3764 3811 3841 3905 3993 4008 4009 4108 4138 4140 4141 4183 4184 4211 4338 135 647 808 956 966 1284 1469 1620 1689 1914 1917 1968 2302 2395 2666 2748 2996 3014 3116 3257 3433 3685 3711 4086 4287 TGCCGC/GCGGCA 1 -4 93 94 20 -13.1 8 54 97 118 210 211 301 302 316 347 574 598 615 658 666 667 764 765 892 936 937 984 986 990 1013 1099 1171 1188 1241 1344 1401 1405 1514 1524 1525 1534 1566 1794 1827 1860 1985 2027 2077 2152 2228 2233 2240 2254 2314 2315 2323 2349 2572 2596 2652 2653 2654 2695 2761 2805 2868 2893 2913 2959 2999 3116 3243 3252 3253 3292 3393 3394 3437 3438 3441 3442 3497 3498 3542 3543 3548 3550 3588 3692 3726 3748 3775 3914 4000 4001 4006 4175 4350 168 265 469 786 1059 1215 1310 1678 1790 1963 2345 3064 3142 3243 3418 3481 3526 3530 3626 3652 CCTGTC/GACAGG 6 -3 91 94 29 -9.4 54 92 140 174 217 267 306 374 467 480 514 550 551 609 631 641 665 682 716 717 738 748 769 770 772 835 840 881 890 1136 1197 1261 1286 1305 1327 1395 1517 1555 1645 1646 1779 1928 2041 2042 2118 2169 2185 2455 2486 2489 2508 2558 2571 2572 2669 2727 2805 2852 2898 2929 3004 3005 3067 3099 3112 3113 3157 3228 3229 3332 3334 3382 3383 3427 3481 3482 3537 3575 3649 3724 3725 3732 3735 3848 3969 4004 4061 4077 4114 4300 4302 55 251 384 504 520 780 930 1122 1129 1245 2066 2102 2254 2320 2503 2805 2849 2956 2971 3057 3062 3151 3199 3312 3467 3621 3906 4185 4321 GGCAGT/ACTGCC 2 -3 87 91 22 -11.5 8 28 51 129 148 236 328 336 363 374 405 459 541 568 576 585 588 620 664 666 667 786 795 813 825 834 984 1008 1079 1302 1306 1309 1361 1362 1538 1560 1562 1566 1569 1570 1629 1672 1753 1818 1827 1839 1860 1918 2072 2074 2213 2228 2413 2424 2435 2438 2525 2531 2573 2578 2604 2711 2855 2863 2906 2980 2981 3048 3049 3053 3161 3172 3298 3343 3376 3393 3692 3775 3839 3854 3908 3909 4113 4133 4244 4286 4302 61 91 514 690 873 951 1190 1369 1399 1637 1682 1784 2029 2124 2155 2774 2836 3139 3242 3689 3943 4302 TCAGCG/CGCTGA 5 -3 92 91 28 -9.2 65 149 161 175 184 243 263 269 295 328 380 444 471 485 584 660 707 732 816 885 957 963 980 990 998 1011 1217 1282 1289 1352 1415 1431 1491 1514 1521 1662 1779 1960 1971 2014 2015 2023 2049 2060 2173 2181 2182 2300 2307 2436 2544 2601 2643 2650 2651 2702 2742 2759 2808 2914 3016 3074 3153 3154 3168 3202 3251 3267 3361 3364 3497 3539 3618 3736 3778 3801 3883 3886 4053 4065 4172 4242 4243 4245 4246 4263 4276 4277 4279 4300 4305 4335 57 97 195 332 403 415 475 487 891 948 1059 1295 1793 1939 2003 2367 2665 2952 2956 3126 3175 3286 3314 3358 3421 3488 3860 3942 GCCGCA/TGCGGC 1 -3 93 90 26 -9.7 26 118 157 170 210 211 301 302 316 390 391 397 534 574 617 686 705 762 763 785 802 885 889 933 1077 1168 1170 1344 1432 1512 1524 1525 1533 1534 1550 1985 2152 2171 2210 2240 2479 2481 2486 2562 2625 2692 2707 2708 2712 2735 2808 2833 2893 2999 3011 3027 3028 3033 3071 3116 3124 3126 3127 3158 3163 3315 3344 3345 3376 3432 3437 3438 3498 3513 3528 3558 3581 3596 3655 3692 3775 3811 3854 3862 3914 3958 3986 4040 4096 4191 4249 4250 4315 146 148 554 1143 1190 1202 1294 1924 1944 1979 2352 2533 2563 2941 3018 3064 3142 3243 3311 3362 3418 3526 3626 3863 3883 3955 GGCACC/GGTGCC 1 -4 82 90 21 -11.7 1 2 49 56 166 167 249 269 274 279 307 316 325 330 339 352 353 380 384 433 519 568 607 641 651 732 776 817 827 840 892 950 1057 1109 1110 1160 1161 1178 1200 1215 1407 1435 1439 1462 1567 1610 1696 1791 1792 1882 2224 2226 2336 2393 2513 2534 2549 2758 2804 2999 3015 3053 3113 3116 3122 3180 3198 3199 3204 3336 3385 3408 3567 3699 3791 3855 4083 4092 4148 4200 4245 4246 175 206 505 813 952 1070 1099 1246 1252 1408 1612 1992 2005 2210 2365 3161 3399 3544 3886 4059 4262 TGCGGC/GCCGCA 9 -3 93 90 26 -9.7 26 118 157 170 210 211 301 302 316 390 391 397 534 574 617 686 705 762 763 785 802 885 889 933 1077 1168 1170 1344 1432 1512 1524 1525 1533 1534 1550 1985 2152 2171 2210 2240 2479 2481 2486 2562 2625 2692 2707 2708 2712 2735 2808 2833 2893 2999 3011 3027 3028 3033 3071 3116 3124 3126 3127 3158 3163 3315 3344 3345 3376 3432 3437 3438 3498 3513 3528 3558 3581 3596 3655 3692 3775 3811 3854 3862 3914 3958 3986 4040 4096 4191 4249 4250 4315 146 148 554 1143 1190 1202 1294 1924 1944 1979 2352 2533 2563 2941 3018 3064 3142 3243 3311 3362 3418 3526 3626 3863 3883 3955 CCGGTC/GACCGG 6 -3 86 89 29 -8.4 13 14 84 106 144 152 187 188 203 213 214 233 263 425 446 503 504 521 659 713 808 866 895 960 1109 1110 1313 1343 1346 1602 1699 1700 1706 1712 1735 1740 1836 1909 1971 1991 2069 2089 2116 2185 2202 2203 2320 2364 2441 2460 2596 2608 2619 2726 2804 2822 2826 2830 2833 2882 2916 2917 2926 2944 2952 2985 3062 3139 3151 3152 3249 3254 3301 3336 3373 3386 3414 3541 3710 3814 3818 3854 3867 3879 4036 4126 88 353 722 789 992 1048 1163 1324 1423 1527 1760 1951 2017 2194 2294 2544 2548 2633 2737 2775 3143 3200 3447 3592 3699 3769 3861 3888 4087 GCGTGG/CCACGC 0 -3 86 88 29 -8.3 17 37 68 189 208 220 259 350 352 353 400 418 458 460 487 508 519 530 535 544 698 707 768 823 862 868 1088 1089 1092 1094 1116 1184 1208 1228 1451 1506 1507 1521 1563 1649 1765 1766 1780 1806 1857 1881 2028 2212 2220 2355 2404 2414 2672 2684 2685 2687 2746 2964 2974 3114 3134 3149 3171 3177 3239 3243 3277 3278 3413 3498 3511 3539 3634 3724 3725 3767 3786 3965 3966 4016 4041 4144 4160 4259 4330 4362 357 399 442 477 634 788 1073 1130 1143 1263 1313 1409 1621 1705 1747 1801 2219 2225 2497 2595 2641 2722 2733 2769 3099 3425 3595 3625 3644 GAGGGC/GCCCTC 4 -4 84 88 23 -10.4 10 11 101 104 105 107 155 171 203 208 282 334 374 538 539 602 726 727 808 809 812 848 854 924 967 1021 1028 1039 1040 1079 1132 1254 1415 1519 1545 1546 1547 1554 1582 1616 1617 1673 1717 1784 1862 1863 1882 1923 2001 2002 2192 2195 2238 2503 2570 2571 2647 2710 2834 2863 3040 3075 3290 3295 3344 3345 3411 3542 3543 3630 3690 3724 3725 3758 3892 3919 3944 4022 4023 4060 4148 4188 4204 4286 66 383 430 563 951 1007 1263 1525 1539 2007 2167 2392 2477 2748 2837 3225 3362 3413 3481 3521 3551 3853 4359 GGCTAG/CTAGCC 11 -4 85 88 23 -10.4 10 11 157 160 177 187 188 207 223 239 241 489 531 538 539 566 749 781 878 879 913 918 1084 1149 1190 1193 1219 1255 1272 1283 1343 1377 1432 1472 1485 1486 1563 1640 1647 1680 1693 1716 1741 1799 1838 1870 1871 1978 2003 2113 2233 2243 2245 2438 2440 2498 2501 2509 2561 2623 2647 2714 2826 3075 3165 3166 3173 3174 3256 3331 3401 3449 3468 3571 3734 3841 3907 3960 4111 4125 4142 4175 4297 4335 4341 352 526 714 763 944 1195 1257 1380 1396 1420 1477 1898 2011 2431 2491 2506 2624 2798 3058 3445 3745 3795 4120 GAACGC/GCGTTC 4 -4 80 85 26 -8.7 4 34 60 61 97 166 167 198 215 222 250 277 295 312 394 399 500 543 558 630 704 832 886 887 1184 1197 1218 1235 1242 1278 1354 1366 1492 1516 1561 1662 1701 1709 1803 1906 1913 1914 1998 2023 2074 2256 2279 2320 2326 2380 2477 2543 2544 2551 2552 2654 2673 2682 2719 2754 2767 2909 2922 2980 2981 3000 3045 3103 3234 3334 3443 3510 3705 3883 3928 3980 4109 4172 4197 4202 29 584 673 818 891 1141 1227 1496 1814 1933 2098 2300 2422 2456 2886 3074 3244 3421 3540 3568 3630 3659 3695 3745 4135 4352 CGCTGG/CCAGCG 0 -3 81 84 27 -8.2 32 118 196 213 214 250 331 410 427 479 592 757 810 815 820 865 892 914 935 942 946 952 986 1011 1021 1060 1061 1078 1092 1131 1179 1286 1449 1464 1540 1549 1647 1702 1703 1734 1782 1834 1877 1878 1883 1900 1908 1963 2016 2062 2072 2097 2116 2184 2476 2586 2629 2639 2714 2741 2813 2845 2903 2943 3012 3013 3113 3148 3153 3304 3308 3404 3458 3510 3528 3756 3855 3905 3965 3966 4093 17 88 148 185 274 329 655 843 886 990 1201 1215 1513 1600 1756 1916 2347 2360 3047 3292 3370 3627 3647 3735 3745 3792 4077 CGCACC/GGTGCG 1 -4 82 83 12 -14.8 26 28 55 66 148 173 263 274 395 414 569 617 695 801 814 966 1075 1108 1136 1149 1211 1229 1318 1404 1621 1688 1699 1700 1763 1815 1821 1869 1979 2062 2122 2152 2159 2173 2250 2287 2380 2397 2408 2414 2427 2458 2480 2511 2524 2587 2669 2735 2739 2831 2914 2934 2938 2939 2982 3061 3112 3118 3153 3195 3196 3277 3278 3311 3349 3361 3494 3701 3709 3785 3811 3849 3980 4040 4044 4101 4117 4211 1407 1533 1562 1940 1944 2014 2551 2666 3098 3209 3745 4150 CGTGCC/GGCACG 6 -3 76 80 24 -8.4 3 7 21 29 143 191 274 275 324 325 409 428 549 561 586 613 614 639 640 683 685 713 759 819 883 925 1013 1033 1038 1076 1172 1173 1190 1378 1496 1497 1502 1627 1750 1940 1989 2071 2164 2169 2195 2329 2389 2608 2716 2722 2737 2773 2959 3035 3168 3193 3324 3368 3405 3545 3588 3683 3730 3753 3756 3804 3887 3888 3963 3964 4063 4188 4215 4216 4242 4243 520 610 770 856 892 1186 1239 1387 1445 1835 1910 2132 2292 2379 2571 2883 3069 3131 3606 3695 4073 4082 4093 4365 GGCCGT/ACGGCC 2 -3 68 72 23 -7.2 16 58 208 229 230 409 412 413 421 499 536 537 560 581 683 692 791 802 886 935 991 1004 1096 1190 1204 1283 1382 1431 1473 1481 1492 1520 1643 1644 1739 1759 1770 1822 1826 1827 1896 2092 2124 2139 2302 2531 2591 2658 2719 2736 2793 2829 2899 3102 3365 3370 3432 3624 3625 3687 3690 3695 3808 3910 3911 3922 3970 3971 99 266 340 343 371 700 786 849 942 967 1143 1416 1496 1822 1967 2057 2119 2222 2225 2461 3362 3510 3764 CCTGCC/GGCAGG 6 -3 68 72 14 -11.0 21 26 49 68 108 123 231 393 482 495 536 537 541 631 708 709 784 838 839 910 931 986 990 1000 1019 1074 1086 1125 1193 1218 1223 1327 1337 1355 1374 1451 1586 1698 1972 2167 2227 2249 2352 2462 2463 2793 2816 2861 2994 3537 3542 3543 3726 3755 3892 3906 3944 3946 4006 4016 4040 4054 4232 4244 4286 4293 4294 4334 471 748 1202 1318 1438 1589 1694 1993 2087 2774 3033 3688 4058 4144 GTGCGG/CCGCAC 9 -4 67 69 17 -8.9 26 66 148 274 352 353 485 519 582 617 783 802 860 861 870 889 983 1149 1211 1229 1282 1379 1503 1514 1534 1577 1604 1605 1621 1696 1699 1700 1787 1788 1803 1815 1979 2042 2062 2122 2140 2287 2349 2397 2479 2480 2511 2531 2613 2691 2699 2833 2934 3011 3112 3124 3153 3270 3275 3315 3349 3513 3811 4040 4096 4101 4211 46 135 966 1131 1190 1191 1304 1944 1979 2016 2302 2666 3063 3064 3816 3883 4049 CGCGGT/ACCGCG 0 -2 65 67 13 -10.3 27 120 128 179 184 222 307 466 563 586 589 634 693 694 708 709 754 886 1007 1022 1062 1063 1108 1223 1423 1478 1777 1794 1810 1869 1877 1878 1889 1995 2105 2106 2122 2195 2250 2317 2353 2408 2485 2587 2638 2782 2815 3215 3315 3406 3474 3588 3723 3773 3910 3911 4055 4145 4148 4167 4168 4175 4202 4329 4349 631 931 1280 2029 2163 2522 2606 3064 3321 3490 3769 3976 4359 GCTGGG/CCCAGC 0 -2 62 67 21 -6.9 4 5 26 51 75 113 114 223 285 296 340 345 393 433 542 810 829 939 942 1022 1059 1109 1110 1238 1281 1446 1451 1545 1546 2006 2097 2137 2181 2182 2219 2393 2461 2534 2628 2645 2692 2718 2792 2794 2795 2813 2852 2858 2859 2947 3068 3308 3474 3643 3756 4022 4023 4093 4115 4166 4284 4288 84 274 990 1005 1127 1381 1393 1849 1979 2163 2165 2570 2711 2793 2851 2928 3116 3360 3517 3718 4316 AGGCGT/ACGCCT 4 -2 69 67 21 -6.9 45 182 189 218 238 282 452 472 602 648 757 819 876 915 1090 1100 1174 1175 1259 1285 1354 1564 1582 1608 1653 1658 1780 1809 1870 1871 1947 2231 2365 2391 2412 2456 2464 2483 2551 2552 2604 2640 2677 2684 2909 3103 3110 3159 3160 3209 3303 3334 3361 3421 3510 3532 3634 3649 3754 3804 3829 3867 4063 4074 4083 4137 4197 4220 4345 314 442 657 758 766 2094 2098 2306 2311 2330 2396 2501 2597 2740 2770 3373 3438 3540 3601 3656 4085 CCAGGC/GCCTGG 4 -4 63 66 22 -6.4 26 176 255 267 273 276 359 409 431 513 520 562 592 629 732 761 776 865 890 1073 1080 1095 1106 1137 1138 1195 1219 1244 1260 1381 1435 1503 1526 1602 1685 1690 1726 1882 2113 2114 2124 2219 2253 2287 2498 2502 2542 2801 2869 2913 3116 3123 3173 3174 3377 3558 3742 3775 4027 4080 4245 4246 4341 294 371 441 469 473 770 1246 1472 1510 1742 2161 2363 2413 2687 2694 2859 2907 3142 3442 3584 3926 4105 ACGCGG/CCGCGT 0 -3 63 62 11 -10.2 59 128 179 220 222 307 362 408 586 640 693 694 754 886 912 978 1007 1022 1099 1170 1228 1235 1314 1315 1478 1538 1588 1624 1777 1869 2105 2106 2122 2195 2277 2278 2320 2353 2587 2638 2782 2815 2991 2992 3228 3229 3315 3388 3406 3476 3532 3693 3705 3735 3827 3875 3876 3983 4025 4055 4259 4329 4349 168 236 631 1280 1789 2770 3074 3432 3470 3907 4015