#3182/2699 #33.02 # k-mer/r.c. Cluster Offset PosCt wPosCt NegCt HGP_10 CCACCG/CGGTGG 0 -1 559 492 46 -87.3 31 50 51 53 54 61 64 68 76 88 105 113 119 120 125 131 145 146 157 162 175 181 187 188 213 240 242 247 262 276 280 288 291 298 304 311 314 317 319 320 331 363 364 366 370 377 384 397 402 403 409 416 434 436 437 442 447 448 467 475 476 520 523 525 526 530 535 538 541 548 568 578 587 595 603 606 607 613 617 643 644 646 647 656 663 664 673 677 678 680 681 684 686 700 713 716 720 725 733 741 752 757 760 764 768 769 770 785 787 806 811 813 826 832 839 843 857 859 862 866 867 888 889 893 899 906 919 925 926 932 938 939 949 959 963 965 966 970 974 978 983 986 992 993 1035 1046 1053 1056 1057 1068 1074 1080 1087 1089 1091 1094 1107 1110 1114 1117 1141 1155 1160 1163 1169 1170 1173 1174 1179 1197 1199 1216 1230 1233 1235 1236 1243 1245 1246 1248 1252 1260 1263 1280 1284 1290 1291 1295 1298 1303 1310 1322 1331 1342 1344 1351 1354 1356 1362 1368 1369 1387 1388 1392 1396 1407 1410 1412 1413 1416 1421 1423 1428 1443 1459 1461 1462 1484 1489 1503 1505 1516 1519 1539 1546 1553 1559 1560 1562 1564 1566 1573 1578 1583 1585 1588 1593 1599 1610 1611 1619 1620 1621 1628 1629 1648 1649 1657 1658 1669 1677 1689 1693 1694 1708 1711 1712 1718 1720 1723 1724 1728 1740 1741 1752 1760 1764 1772 1781 1802 1806 1807 1808 1809 1810 1813 1814 1816 1819 1820 1821 1822 1826 1827 1829 1830 1833 1834 1837 1838 1840 1841 1844 1845 1851 1855 1858 1866 1869 1873 1885 1886 1891 1892 1893 1894 1897 1907 1918 1924 1926 1942 1946 1951 1953 1954 1957 1964 1972 1975 1980 1987 1988 1989 1998 2000 2004 2010 2012 2021 2025 2030 2031 2042 2045 2049 2055 2057 2060 2065 2074 2079 2080 2085 2089 2092 2104 2106 2107 2110 2112 2114 2116 2120 2126 2127 2135 2144 2145 2149 2153 2155 2162 2163 2168 2170 2173 2174 2184 2185 2186 2213 2216 2218 2220 2223 2224 2231 2257 2261 2264 2267 2269 2272 2273 2275 2287 2290 2296 2301 2308 2310 2317 2321 2323 2339 2353 2361 2364 2366 2369 2375 2377 2384 2385 2391 2392 2394 2410 2416 2418 2419 2428 2440 2442 2448 2451 2453 2459 2462 2469 2471 2473 2480 2482 2486 2487 2492 2499 2501 2508 2512 2514 2516 2520 2532 2537 2539 2564 2572 2585 2600 2614 2627 2630 2636 2645 2646 2654 2655 2658 2672 2673 2677 2683 2688 2689 2691 2694 2702 2703 2712 2714 2722 2731 2736 2739 2740 2743 2750 2751 2761 2762 2764 2769 2774 2780 2786 2787 2788 2797 2802 2806 2808 2817 2824 2826 2831 2833 2835 2842 2846 2855 2857 2865 2869 2872 2879 2895 2897 2901 2906 2912 2918 2920 2921 2926 2927 2943 2945 2956 2964 2968 2970 2972 2973 2976 2977 2978 2979 2989 3003 3012 3017 3021 3024 3030 3036 3037 3040 3045 3052 3053 3055 3056 3071 3075 3079 3084 3088 3090 3101 3103 3108 3116 3123 3124 3130 3133 3135 3138 3146 3150 3152 3153 3163 3165 3170 3172 5 138 152 210 421 422 913 1067 1137 1139 1143 1144 1172 1233 1252 1253 1277 1296 1315 1393 1406 1456 1538 1574 1669 1743 1746 1778 1843 1875 1901 1985 2005 2065 2120 2228 2253 2256 2397 2398 2399 2400 2469 2532 2646 2679 ACCGCC/GGCGGT 0 -2 396 381 43 -61.5 0 8 31 48 50 53 54 76 82 97 100 113 114 119 120 121 125 157 162 174 175 176 181 187 216 242 271 280 281 293 298 299 314 319 320 324 331 344 353 370 377 406 434 435 448 451 453 467 476 520 523 525 530 538 591 599 606 609 647 656 662 677 678 680 684 711 716 717 720 723 739 747 752 769 770 771 780 786 788 799 804 805 806 811 813 826 832 842 843 845 849 851 866 887 899 906 915 919 925 926 927 940 949 956 965 967 969 970 972 974 978 983 986 989 995 1002 1003 1010 1014 1019 1024 1051 1054 1057 1078 1089 1099 1114 1116 1117 1125 1154 1155 1160 1182 1183 1185 1204 1212 1217 1218 1227 1231 1235 1237 1242 1243 1252 1268 1269 1292 1298 1302 1303 1312 1313 1344 1347 1351 1354 1362 1368 1375 1378 1379 1396 1421 1427 1428 1449 1472 1474 1475 1478 1486 1497 1501 1509 1513 1545 1553 1555 1561 1571 1572 1573 1576 1577 1585 1621 1628 1653 1657 1658 1660 1665 1676 1686 1692 1693 1702 1711 1716 1723 1731 1734 1740 1741 1746 1756 1779 1790 1791 1801 1810 1822 1827 1828 1829 1834 1838 1854 1858 1863 1869 1870 1873 1875 1876 1879 1892 1897 1904 1907 1918 1919 1946 1947 1952 1969 1988 1998 2022 2025 2029 2030 2035 2036 2057 2062 2065 2068 2070 2079 2094 2095 2099 2106 2109 2111 2112 2115 2116 2119 2123 2136 2138 2145 2162 2185 2189 2194 2218 2223 2235 2241 2260 2270 2275 2281 2282 2293 2305 2319 2323 2324 2326 2358 2364 2375 2377 2392 2404 2406 2419 2432 2439 2462 2464 2471 2472 2473 2480 2484 2486 2496 2499 2500 2506 2515 2520 2526 2527 2533 2534 2543 2553 2562 2569 2570 2573 2597 2598 2614 2627 2631 2632 2634 2640 2641 2643 2649 2654 2656 2677 2685 2689 2712 2719 2720 2750 2754 2768 2771 2772 2786 2787 2793 2808 2820 2822 2827 2832 2843 2858 2862 2864 2879 2882 2905 2912 2915 2920 2929 2943 2957 2968 2975 2981 2986 2998 2999 3004 3008 3012 3026 3027 3028 3033 3034 3039 3042 3046 3048 3052 3059 3073 3080 3096 3102 3153 3154 3155 3156 3157 3164 151 180 228 326 421 422 498 522 662 766 1067 1137 1139 1143 1144 1151 1232 1252 1266 1397 1538 1584 1599 1620 1743 1788 1875 1876 1879 2099 2137 2148 2205 2274 2318 2397 2399 2400 2408 2469 2570 2575 2634 CACCGC/GCGGTG 0 0 406 367 47 -55.4 31 48 50 53 54 68 74 76 113 114 119 120 125 131 145 157 162 174 175 178 181 186 187 216 227 228 239 242 247 276 280 281 298 299 314 319 331 353 363 370 377 403 406 434 435 448 451 453 467 476 520 523 525 526 530 538 568 587 603 606 613 644 647 656 657 662 664 677 678 680 684 716 717 720 731 733 752 757 760 769 770 783 786 787 806 811 812 813 826 832 843 849 851 859 862 866 867 870 899 906 918 919 925 926 940 945 947 949 956 962 963 965 966 967 970 972 974 978 983 1000 1003 1008 1010 1036 1051 1057 1059 1083 1084 1085 1089 1091 1110 1114 1116 1132 1137 1154 1155 1160 1169 1182 1218 1230 1231 1233 1235 1243 1260 1277 1290 1298 1303 1306 1340 1351 1354 1362 1368 1369 1373 1378 1386 1387 1390 1393 1396 1410 1413 1421 1422 1428 1435 1439 1459 1474 1477 1490 1497 1503 1516 1545 1555 1561 1564 1571 1572 1573 1577 1578 1583 1585 1593 1628 1630 1642 1644 1657 1658 1660 1661 1672 1677 1693 1709 1711 1716 1723 1726 1731 1740 1741 1752 1760 1764 1784 1786 1797 1810 1817 1822 1827 1829 1830 1834 1838 1842 1843 1845 1854 1858 1869 1873 1892 1897 1903 1907 1916 1918 1942 1946 1947 1948 1953 1958 1967 1969 1988 1998 1999 2025 2027 2030 2042 2045 2049 2053 2057 2065 2068 2070 2078 2079 2080 2085 2091 2095 2104 2106 2109 2110 2112 2114 2116 2123 2131 2136 2145 2148 2149 2162 2168 2170 2175 2185 2189 2194 2202 2208 2212 2218 2223 2225 2228 2231 2235 2261 2266 2275 2294 2298 2305 2310 2319 2323 2324 2326 2358 2361 2364 2366 2371 2375 2376 2377 2381 2392 2400 2403 2406 2410 2419 2422 2434 2439 2448 2453 2454 2462 2465 2471 2473 2480 2484 2486 2495 2499 2508 2514 2516 2520 2542 2550 2571 2614 2627 2647 2654 2677 2689 2690 2699 2712 2720 2750 2754 2771 2780 2786 2787 2808 2824 2827 2832 2835 2845 2847 2864 2879 2895 2910 2912 2919 2920 2926 2927 2943 2956 2964 2968 2969 2973 2977 2982 2986 2989 3012 3026 3027 3033 3034 3045 3046 3052 3059 3061 3076 3088 3101 3123 3126 3135 3146 3153 3164 3168 26 28 96 138 151 152 199 210 394 421 422 746 753 766 783 913 1067 1114 1137 1139 1144 1151 1252 1266 1538 1567 1593 1599 1608 1779 1875 1879 1985 2099 2148 2216 2395 2397 2399 2400 2469 2521 2533 2553 2570 2626 2646 GCGGTG/CACCGC 1 -3 406 367 47 -55.4 31 48 50 53 54 68 74 76 113 114 119 120 125 131 145 157 162 174 175 178 181 186 187 216 227 228 239 242 247 276 280 281 298 299 314 319 331 353 363 370 377 403 406 434 435 448 451 453 467 476 520 523 525 526 530 538 568 587 603 606 613 644 647 656 657 662 664 677 678 680 684 716 717 720 731 733 752 757 760 769 770 783 786 787 806 811 812 813 826 832 843 849 851 859 862 866 867 870 899 906 918 919 925 926 940 945 947 949 956 962 963 965 966 967 970 972 974 978 983 1000 1003 1008 1010 1036 1051 1057 1059 1083 1084 1085 1089 1091 1110 1114 1116 1132 1137 1154 1155 1160 1169 1182 1218 1230 1231 1233 1235 1243 1260 1277 1290 1298 1303 1306 1340 1351 1354 1362 1368 1369 1373 1378 1386 1387 1390 1393 1396 1410 1413 1421 1422 1428 1435 1439 1459 1474 1477 1490 1497 1503 1516 1545 1555 1561 1564 1571 1572 1573 1577 1578 1583 1585 1593 1628 1630 1642 1644 1657 1658 1660 1661 1672 1677 1693 1709 1711 1716 1723 1726 1731 1740 1741 1752 1760 1764 1784 1786 1797 1810 1817 1822 1827 1829 1830 1834 1838 1842 1843 1845 1854 1858 1869 1873 1892 1897 1903 1907 1916 1918 1942 1946 1947 1948 1953 1958 1967 1969 1988 1998 1999 2025 2027 2030 2042 2045 2049 2053 2057 2065 2068 2070 2078 2079 2080 2085 2091 2095 2104 2106 2109 2110 2112 2114 2116 2123 2131 2136 2145 2148 2149 2162 2168 2170 2175 2185 2189 2194 2202 2208 2212 2218 2223 2225 2228 2231 2235 2261 2266 2275 2294 2298 2305 2310 2319 2323 2324 2326 2358 2361 2364 2366 2371 2375 2376 2377 2381 2392 2400 2403 2406 2410 2419 2422 2434 2439 2448 2453 2454 2462 2465 2471 2473 2480 2484 2486 2495 2499 2508 2514 2516 2520 2542 2550 2571 2614 2627 2647 2654 2677 2689 2690 2699 2712 2720 2750 2754 2771 2780 2786 2787 2808 2824 2827 2832 2835 2845 2847 2864 2879 2895 2910 2912 2919 2920 2926 2927 2943 2956 2964 2968 2969 2973 2977 2982 2986 2989 3012 3026 3027 3033 3034 3045 3046 3052 3059 3061 3076 3088 3101 3123 3126 3135 3146 3153 3164 3168 26 28 96 138 151 152 199 210 394 421 422 746 753 766 783 913 1067 1114 1137 1139 1144 1151 1252 1266 1538 1567 1593 1599 1608 1779 1875 1879 1985 2099 2148 2216 2395 2397 2399 2400 2469 2521 2533 2553 2570 2626 2646 ACCACC/GGTGGT 0 -2 385 360 91 -32.2 31 48 50 51 53 54 60 64 65 76 86 97 98 101 107 113 114 115 125 126 129 135 145 146 150 153 157 159 166 168 179 187 194 203 216 240 247 248 254 256 258 262 263 270 276 284 296 299 304 307 314 319 320 331 363 366 370 388 402 403 434 447 467 475 476 502 523 525 526 530 531 535 538 541 548 568 593 604 615 624 627 643 644 647 656 664 677 680 684 686 703 716 720 752 757 758 760 769 770 805 806 811 813 823 839 840 859 882 889 893 906 919 925 927 932 935 939 949 960 963 964 966 970 974 991 999 1018 1035 1037 1041 1046 1050 1053 1057 1062 1087 1114 1139 1141 1144 1148 1150 1155 1156 1160 1163 1169 1173 1174 1180 1191 1197 1216 1243 1245 1248 1252 1261 1266 1287 1298 1299 1322 1326 1340 1349 1362 1392 1395 1396 1407 1410 1412 1413 1427 1428 1456 1488 1505 1573 1583 1584 1586 1588 1596 1599 1610 1620 1628 1637 1641 1650 1654 1657 1689 1693 1712 1718 1720 1724 1726 1728 1741 1760 1764 1771 1795 1803 1805 1806 1809 1810 1816 1819 1820 1833 1834 1837 1840 1841 1851 1857 1866 1873 1876 1879 1885 1892 1894 1897 1899 1902 1907 1926 1934 1939 1946 1951 1953 1954 1969 1975 1978 1988 2010 2012 2021 2025 2031 2046 2048 2057 2065 2074 2089 2092 2104 2106 2107 2112 2116 2120 2127 2128 2134 2135 2136 2141 2155 2158 2163 2165 2184 2192 2195 2200 2209 2210 2213 2216 2217 2218 2220 2224 2225 2231 2232 2264 2276 2281 2298 2305 2310 2339 2344 2353 2367 2376 2384 2392 2410 2416 2418 2419 2440 2443 2451 2459 2464 2473 2492 2514 2525 2530 2532 2539 2542 2560 2564 2572 2580 2598 2620 2646 2650 2655 2672 2673 2677 2691 2712 2740 2742 2747 2757 2762 2769 2770 2774 2779 2788 2796 2797 2802 2806 2808 2816 2825 2826 2830 2835 2852 2865 2896 2901 2918 2943 2945 2958 2964 2970 2972 2976 2977 3005 3010 3012 3017 3030 3031 3037 3052 3053 3055 3075 3084 3088 3114 3133 3152 3153 3160 3165 3170 3172 5 12 24 29 30 74 92 198 233 281 379 382 417 421 422 485 722 767 814 818 841 1054 1055 1067 1087 1099 1130 1132 1138 1139 1144 1172 1177 1180 1185 1233 1252 1253 1303 1381 1394 1395 1406 1440 1456 1471 1489 1538 1575 1576 1599 1615 1620 1648 1743 1746 1764 1833 1845 1848 1881 1910 1990 1991 1997 1998 2001 2002 2060 2061 2067 2073 2150 2221 2279 2317 2319 2320 2396 2397 2398 2400 2418 2492 2493 2495 2513 2540 2574 2575 2679 TCCACC/GGTGGA 0 -2 387 358 97 -29.6 31 50 51 53 54 64 76 86 97 98 101 107 113 114 119 120 125 126 128 129 150 157 158 168 174 181 187 188 213 218 223 237 253 255 256 262 270 288 298 301 303 314 319 331 364 370 397 401 413 415 434 437 448 461 467 476 493 503 523 524 526 530 531 532 535 551 552 555 565 568 575 578 595 599 603 604 606 613 618 639 643 644 647 652 656 666 669 673 678 684 695 696 725 760 764 766 768 769 770 785 787 811 813 823 826 830 832 840 841 848 857 888 899 917 919 925 926 932 934 938 964 970 972 974 978 983 985 986 991 993 1006 1011 1012 1023 1041 1048 1050 1053 1056 1057 1069 1080 1089 1141 1145 1155 1156 1199 1217 1230 1235 1236 1243 1245 1255 1260 1280 1284 1290 1295 1303 1321 1327 1341 1342 1347 1355 1362 1369 1370 1388 1410 1416 1459 1461 1487 1503 1513 1520 1546 1553 1560 1562 1564 1577 1584 1593 1611 1619 1621 1637 1648 1649 1658 1663 1669 1674 1675 1677 1693 1694 1703 1711 1723 1724 1730 1740 1758 1764 1765 1772 1781 1784 1785 1802 1805 1814 1816 1821 1826 1838 1840 1841 1845 1868 1873 1886 1893 1897 1918 1923 1924 1926 1942 1946 1953 1957 1959 1987 2000 2001 2004 2007 2012 2018 2025 2030 2036 2042 2045 2055 2058 2060 2074 2079 2085 2089 2092 2093 2102 2105 2111 2112 2116 2126 2144 2147 2149 2162 2174 2185 2189 2210 2216 2223 2224 2231 2254 2257 2261 2272 2275 2290 2296 2298 2306 2308 2321 2323 2331 2356 2367 2377 2384 2385 2391 2394 2409 2428 2443 2462 2464 2469 2480 2486 2487 2499 2512 2516 2537 2559 2572 2600 2608 2614 2627 2636 2644 2645 2658 2677 2689 2694 2702 2705 2710 2722 2731 2736 2739 2751 2761 2769 2774 2786 2787 2788 2789 2792 2793 2796 2815 2817 2819 2824 2831 2847 2855 2865 2869 2872 2895 2904 2906 2912 2918 2921 2926 2927 2944 2955 2961 2968 2973 2976 2977 2989 3024 3036 3040 3056 3059 3068 3071 3079 3084 3088 3101 3103 3123 3130 3146 3149 3153 3163 3166 3170 4 18 27 30 70 71 74 104 152 165 184 210 382 421 422 434 444 483 561 563 599 626 659 663 686 723 814 847 860 962 988 1026 1042 1049 1056 1075 1085 1137 1138 1139 1143 1176 1205 1236 1252 1303 1353 1394 1432 1503 1540 1574 1576 1578 1599 1605 1624 1651 1678 1716 1843 1847 1848 1860 1902 1955 2002 2012 2040 2120 2216 2221 2228 2256 2284 2317 2318 2319 2364 2370 2396 2397 2398 2399 2400 2414 2469 2492 2493 2499 2532 2628 2643 2647 2657 2680 2698 CCGCCG/CGGCGG 0 -1 354 332 34 -55.8 0 18 52 76 86 100 101 119 120 125 134 138 143 164 166 173 174 175 180 187 207 219 237 249 270 271 281 293 319 331 344 347 353 377 409 410 434 448 451 453 458 493 525 529 546 592 595 604 612 639 652 669 673 679 684 699 711 716 720 739 771 780 788 791 799 805 806 811 813 821 852 874 899 915 938 964 972 978 987 991 1003 1031 1044 1050 1055 1057 1065 1076 1089 1093 1107 1112 1114 1116 1117 1130 1148 1154 1159 1165 1180 1185 1202 1216 1218 1231 1235 1243 1249 1251 1252 1269 1275 1276 1298 1299 1303 1311 1326 1334 1336 1351 1353 1354 1402 1404 1407 1427 1428 1451 1472 1475 1477 1504 1513 1538 1545 1553 1576 1577 1583 1592 1612 1617 1618 1619 1621 1626 1640 1647 1648 1650 1652 1655 1657 1658 1666 1673 1695 1700 1702 1710 1715 1716 1723 1725 1727 1734 1736 1741 1746 1752 1758 1761 1775 1806 1829 1834 1838 1842 1862 1870 1872 1897 1904 1905 1915 1918 1932 1941 1945 1946 1952 1963 1969 1973 1987 2023 2025 2028 2029 2033 2048 2052 2058 2069 2076 2082 2088 2109 2114 2161 2162 2180 2181 2182 2189 2194 2195 2197 2198 2206 2229 2235 2238 2262 2278 2283 2294 2302 2305 2330 2348 2358 2364 2367 2392 2406 2407 2408 2409 2426 2430 2432 2435 2439 2443 2444 2459 2462 2472 2480 2488 2500 2506 2526 2527 2536 2545 2560 2561 2562 2563 2569 2570 2579 2583 2587 2592 2598 2608 2614 2618 2630 2641 2643 2644 2648 2657 2662 2667 2677 2684 2694 2699 2727 2740 2746 2747 2750 2752 2754 2755 2777 2780 2791 2793 2796 2813 2821 2832 2842 2849 2854 2870 2879 2880 2881 2886 2896 2898 2914 2915 2920 2921 2943 2955 2957 2962 2968 2981 2984 3002 3005 3011 3016 3033 3034 3038 3042 3046 3048 3051 3052 3057 3065 3102 3105 3117 3122 3134 3137 3141 3142 3146 3148 3152 3153 3169 3171 3172 3176 3178 3181 138 180 400 417 421 522 605 690 1001 1059 1139 1537 1542 1620 1737 1758 1837 1875 1901 2041 2148 2215 2272 2284 2315 2317 2381 2397 2408 2460 2468 2504 2532 2644 TCCGCC/GGCGGA 0 -2 331 316 35 -51.2 0 5 76 86 97 100 101 119 124 126 134 138 139 157 168 173 180 187 207 219 247 256 258 291 297 317 336 346 365 376 384 406 409 453 454 458 491 493 497 520 530 534 536 546 578 592 601 604 605 612 639 666 669 704 720 721 726 739 777 782 805 811 842 852 856 861 866 873 874 907 919 925 926 936 938 946 963 964 972 975 978 983 986 987 990 991 1001 1013 1020 1031 1032 1042 1044 1050 1055 1065 1076 1093 1107 1112 1114 1130 1165 1180 1182 1191 1195 1196 1207 1224 1231 1249 1251 1276 1301 1304 1307 1311 1326 1342 1351 1353 1360 1367 1375 1391 1401 1404 1420 1421 1426 1453 1470 1472 1474 1495 1504 1508 1513 1538 1544 1546 1577 1581 1595 1602 1606 1613 1617 1627 1637 1640 1650 1654 1658 1666 1669 1673 1675 1684 1688 1697 1700 1711 1715 1729 1734 1736 1758 1771 1772 1782 1787 1842 1858 1862 1886 1892 1902 1905 1920 1941 1963 1973 1981 1983 1987 2005 2012 2014 2023 2026 2028 2033 2040 2048 2052 2058 2069 2072 2077 2080 2088 2106 2109 2114 2129 2138 2143 2157 2180 2182 2193 2197 2206 2215 2222 2229 2232 2234 2235 2238 2240 2246 2249 2255 2259 2269 2273 2274 2283 2288 2330 2345 2348 2359 2365 2379 2382 2398 2407 2412 2421 2430 2435 2438 2444 2455 2459 2473 2488 2507 2519 2525 2538 2543 2560 2563 2574 2579 2583 2588 2592 2602 2608 2610 2618 2620 2628 2648 2657 2659 2661 2670 2683 2694 2696 2699 2727 2740 2744 2746 2747 2748 2749 2750 2752 2755 2813 2821 2829 2837 2838 2842 2844 2849 2854 2868 2870 2879 2880 2883 2896 2914 2953 2955 2962 2965 3011 3012 3016 3019 3031 3051 3057 3065 3080 3114 3120 3127 3134 3141 3142 3148 3152 3166 3169 3171 3172 3173 3181 138 417 421 690 1001 1015 1059 1128 1138 1154 1179 1198 1253 1444 1468 1537 1542 1746 1758 1776 1875 2041 2058 2215 2280 2284 2317 2318 2319 2381 2399 2433 2468 2469 2634 CCGCCA/TGGCGG 0 -1 330 303 46 -41.3 8 31 50 54 76 82 86 100 113 119 120 121 126 157 162 168 173 174 175 176 207 216 242 256 270 280 297 314 318 364 365 376 384 434 448 454 460 476 497 510 523 525 530 538 584 591 599 604 605 607 612 647 656 666 677 678 679 711 717 720 723 726 739 770 805 806 811 826 842 851 861 866 887 889 906 919 920 925 926 927 928 940 946 949 963 967 969 974 978 983 986 989 990 991 1014 1024 1090 1094 1108 1112 1114 1125 1155 1160 1176 1180 1195 1196 1199 1204 1207 1212 1217 1235 1237 1242 1260 1261 1268 1277 1287 1292 1298 1302 1303 1313 1325 1342 1344 1347 1351 1357 1385 1391 1396 1401 1420 1421 1426 1451 1453 1468 1471 1474 1478 1479 1486 1495 1504 1508 1571 1573 1581 1588 1591 1603 1606 1619 1627 1628 1637 1688 1692 1697 1711 1726 1734 1738 1741 1779 1782 1801 1822 1834 1854 1858 1875 1876 1879 1892 1946 1947 1952 1981 1988 2005 2022 2025 2026 2040 2048 2057 2062 2065 2068 2069 2095 2099 2106 2109 2115 2116 2129 2136 2138 2144 2152 2157 2168 2182 2206 2215 2218 2222 2234 2236 2240 2246 2249 2269 2272 2273 2278 2281 2282 2288 2302 2305 2306 2318 2326 2327 2365 2375 2377 2379 2392 2398 2419 2421 2438 2451 2452 2462 2471 2473 2486 2496 2499 2507 2519 2530 2534 2538 2545 2548 2553 2560 2573 2574 2583 2597 2598 2607 2608 2610 2620 2624 2627 2628 2630 2634 2635 2639 2654 2659 2670 2674 2683 2685 2712 2720 2740 2746 2748 2749 2752 2754 2767 2768 2780 2804 2808 2814 2822 2827 2837 2844 2858 2859 2861 2864 2867 2879 2883 2888 2920 2921 2931 2952 2984 2999 3004 3008 3012 3019 3034 3059 3064 3080 3096 3127 3128 3134 3137 3138 3154 3156 3173 3181 21 151 228 326 400 421 422 503 766 772 1015 1067 1092 1138 1139 1151 1154 1179 1232 1266 1305 1468 1551 1743 1788 1814 1837 1851 1875 1876 1930 1989 2006 2008 2058 2241 2318 2319 2396 2399 2400 2433 2469 2570 2575 2603 CTCCGC/GCGGAG 0 -3 322 296 37 -45.1 0 73 76 86 97 101 119 124 134 138 151 157 168 173 187 207 235 247 256 291 297 302 327 348 365 406 458 462 470 490 493 495 520 530 532 536 592 602 604 607 612 623 632 639 649 669 698 699 704 716 721 739 805 811 830 832 834 846 849 856 866 873 877 883 900 907 919 926 936 938 943 963 964 972 975 978 983 986 991 1001 1013 1027 1050 1056 1065 1079 1100 1114 1115 1120 1145 1150 1151 1164 1165 1180 1182 1191 1195 1207 1231 1232 1243 1247 1251 1276 1298 1301 1307 1326 1363 1366 1391 1404 1409 1420 1426 1434 1472 1474 1483 1504 1507 1508 1511 1513 1527 1535 1538 1546 1561 1564 1570 1581 1606 1617 1623 1625 1632 1637 1640 1641 1650 1655 1656 1658 1666 1669 1673 1675 1681 1697 1700 1711 1736 1758 1767 1771 1772 1777 1789 1798 1820 1831 1836 1860 1867 1902 1905 1927 1940 1941 1959 1963 1973 1987 2002 2009 2011 2012 2014 2018 2033 2040 2047 2051 2058 2072 2077 2080 2088 2101 2106 2108 2109 2111 2138 2150 2157 2180 2197 2200 2206 2211 2222 2232 2235 2237 2238 2258 2259 2263 2269 2273 2274 2283 2289 2300 2330 2335 2345 2349 2353 2357 2359 2382 2390 2396 2398 2399 2402 2407 2435 2438 2444 2449 2455 2459 2473 2478 2488 2495 2507 2519 2524 2538 2543 2563 2578 2579 2582 2592 2598 2603 2613 2618 2620 2628 2647 2648 2665 2675 2679 2682 2683 2694 2699 2703 2713 2727 2740 2744 2746 2750 2752 2754 2755 2775 2806 2813 2830 2837 2844 2849 2868 2870 2879 2880 2882 2896 2914 2924 2944 2955 2983 3011 3012 3013 3016 3019 3025 3031 3035 3038 3041 3051 3057 3065 3095 3098 3121 3142 3145 3148 3152 3153 3166 3169 3171 3172 3173 3181 139 254 293 417 421 622 675 677 860 996 1059 1067 1138 1179 1198 1253 1261 1337 1444 1454 1468 1542 1583 1758 1782 1836 1875 1985 2279 2284 2317 2318 2319 2377 2399 2468 2469 GCGGAG/CTCCGC 1 -3 322 296 37 -45.1 0 73 76 86 97 101 119 124 134 138 151 157 168 173 187 207 235 247 256 291 297 302 327 348 365 406 458 462 470 490 493 495 520 530 532 536 592 602 604 607 612 623 632 639 649 669 698 699 704 716 721 739 805 811 830 832 834 846 849 856 866 873 877 883 900 907 919 926 936 938 943 963 964 972 975 978 983 986 991 1001 1013 1027 1050 1056 1065 1079 1100 1114 1115 1120 1145 1150 1151 1164 1165 1180 1182 1191 1195 1207 1231 1232 1243 1247 1251 1276 1298 1301 1307 1326 1363 1366 1391 1404 1409 1420 1426 1434 1472 1474 1483 1504 1507 1508 1511 1513 1527 1535 1538 1546 1561 1564 1570 1581 1606 1617 1623 1625 1632 1637 1640 1641 1650 1655 1656 1658 1666 1669 1673 1675 1681 1697 1700 1711 1736 1758 1767 1771 1772 1777 1789 1798 1820 1831 1836 1860 1867 1902 1905 1927 1940 1941 1959 1963 1973 1987 2002 2009 2011 2012 2014 2018 2033 2040 2047 2051 2058 2072 2077 2080 2088 2101 2106 2108 2109 2111 2138 2150 2157 2180 2197 2200 2206 2211 2222 2232 2235 2237 2238 2258 2259 2263 2269 2273 2274 2283 2289 2300 2330 2335 2345 2349 2353 2357 2359 2382 2390 2396 2398 2399 2402 2407 2435 2438 2444 2449 2455 2459 2473 2478 2488 2495 2507 2519 2524 2538 2543 2563 2578 2579 2582 2592 2598 2603 2613 2618 2620 2628 2647 2648 2665 2675 2679 2682 2683 2694 2699 2703 2713 2727 2740 2744 2746 2750 2752 2754 2755 2775 2806 2813 2830 2837 2844 2849 2868 2870 2879 2880 2882 2896 2914 2924 2944 2955 2983 3011 3012 3013 3016 3019 3025 3031 3035 3038 3041 3051 3057 3065 3095 3098 3121 3142 3145 3148 3152 3153 3166 3169 3171 3172 3173 3181 139 254 293 417 421 622 675 677 860 996 1059 1067 1138 1179 1198 1253 1261 1337 1444 1454 1468 1542 1583 1758 1782 1836 1875 1985 2279 2284 2317 2318 2319 2377 2399 2468 2469 TTGCGG/CCGCAA 1 -5 266 277 43 -37.2 4 9 13 21 27 29 37 38 45 112 140 202 206 210 223 236 246 252 285 287 293 319 350 352 398 415 432 482 519 560 573 585 587 602 610 611 649 658 664 676 695 698 707 714 716 748 749 781 798 801 805 812 832 873 876 900 923 933 953 954 960 962 971 972 1005 1022 1034 1039 1048 1079 1082 1098 1100 1126 1151 1168 1175 1183 1191 1192 1209 1220 1233 1283 1300 1317 1318 1319 1340 1373 1374 1375 1382 1387 1408 1411 1424 1457 1463 1511 1540 1542 1547 1552 1569 1576 1609 1616 1638 1639 1644 1646 1651 1652 1681 1703 1705 1709 1714 1730 1732 1733 1737 1744 1748 1757 1760 1763 1764 1766 1789 1795 1829 1836 1843 1852 1857 1865 1867 1878 1889 1894 1898 1905 1948 1959 1968 1969 1986 1991 2039 2061 2067 2078 2091 2118 2121 2132 2145 2147 2149 2154 2176 2177 2178 2183 2192 2209 2239 2266 2292 2312 2353 2363 2366 2376 2387 2392 2397 2400 2405 2429 2432 2446 2448 2454 2463 2470 2476 2488 2504 2511 2514 2518 2522 2553 2556 2593 2596 2598 2616 2625 2629 2652 2653 2662 2679 2681 2698 2701 2706 2717 2721 2732 2758 2781 2782 2790 2796 2799 2800 2816 2818 2819 2825 2834 2839 2850 2877 2884 2890 2907 2913 2928 2932 2936 2944 2948 2958 2960 2973 2980 2997 3003 3010 3012 3013 3022 3029 3042 3051 3066 3069 3082 3085 3094 3107 3111 3112 3125 3136 3152 3158 3159 3174 3175 41 71 208 278 303 305 314 320 322 328 332 482 504 521 529 713 783 970 1032 1099 1261 1265 1407 1423 1424 1429 1567 1593 1620 1664 1737 1782 1954 2084 2090 2161 2315 2339 2357 2361 2532 2565 2626 GCGGTT/AACCGC 1 -3 287 270 49 -32.5 21 27 29 37 38 45 82 97 100 153 175 202 206 210 214 223 239 246 251 271 287 320 333 350 385 432 511 519 520 525 536 557 573 576 585 599 609 693 698 711 714 723 727 749 780 781 788 792 799 804 805 814 832 845 846 854 876 886 914 916 954 969 986 1005 1010 1014 1021 1023 1025 1034 1048 1098 1099 1117 1125 1166 1175 1185 1204 1205 1209 1212 1213 1217 1221 1227 1235 1242 1250 1252 1269 1272 1292 1298 1302 1312 1313 1317 1319 1375 1379 1418 1433 1440 1448 1457 1472 1475 1486 1513 1522 1542 1544 1552 1553 1554 1555 1569 1575 1576 1590 1593 1597 1607 1621 1638 1651 1653 1676 1680 1686 1692 1705 1711 1737 1743 1744 1746 1754 1756 1757 1763 1765 1773 1790 1791 1797 1801 1829 1852 1857 1863 1876 1879 1894 1904 1916 1919 1943 1952 1978 1979 1991 2022 2029 2032 2035 2036 2044 2063 2069 2072 2075 2078 2099 2109 2111 2113 2115 2118 2119 2128 2130 2138 2139 2147 2154 2176 2204 2241 2245 2250 2256 2260 2270 2281 2285 2322 2325 2356 2363 2372 2387 2392 2420 2432 2446 2462 2464 2467 2472 2496 2504 2506 2511 2515 2526 2527 2533 2534 2543 2558 2562 2569 2570 2573 2584 2597 2598 2632 2634 2652 2654 2656 2663 2677 2685 2695 2696 2711 2719 2725 2728 2758 2790 2798 2799 2810 2820 2840 2851 2858 2862 2875 2882 2885 2905 2907 2934 2936 2948 2957 2959 2963 2975 2981 2997 2998 2999 3008 3018 3028 3042 3073 3078 3080 3083 3094 3096 3102 3114 3115 3144 3148 3156 3157 3158 41 148 172 180 228 314 322 326 332 357 362 380 482 498 504 713 953 970 972 1032 1121 1143 1232 1397 1423 1424 1429 1584 1620 1661 1702 1788 1876 1896 1999 2057 2084 2090 2137 2166 2205 2339 2356 2357 2361 2393 2410 2634 2643 CGCCGC/GCGGCG 0 0 281 268 22 -49.1 0 23 46 86 100 119 120 138 172 173 174 175 180 187 189 195 207 209 237 270 293 319 347 409 410 434 436 450 453 454 455 458 476 490 510 525 541 546 592 595 604 610 612 639 673 676 684 699 711 716 788 791 799 805 806 808 811 813 836 864 943 968 969 972 978 991 1003 1049 1093 1112 1114 1148 1168 1176 1179 1203 1218 1231 1235 1249 1251 1261 1269 1277 1283 1292 1293 1298 1303 1316 1326 1334 1353 1354 1380 1399 1402 1407 1417 1430 1451 1455 1477 1504 1513 1514 1538 1544 1558 1564 1576 1577 1583 1586 1588 1591 1592 1617 1618 1626 1638 1648 1650 1652 1657 1666 1700 1715 1717 1723 1727 1734 1736 1741 1758 1761 1778 1805 1829 1834 1838 1842 1858 1870 1882 1905 1915 1932 1941 1946 1952 1958 1963 1967 1973 1987 2003 2007 2025 2048 2058 2069 2076 2088 2109 2144 2162 2181 2187 2195 2197 2201 2206 2211 2265 2268 2286 2294 2302 2305 2327 2330 2348 2358 2367 2377 2389 2392 2397 2408 2430 2432 2439 2442 2443 2471 2474 2481 2488 2500 2506 2530 2545 2549 2555 2560 2561 2562 2563 2570 2581 2583 2586 2592 2595 2598 2608 2614 2630 2636 2662 2667 2677 2684 2694 2699 2709 2728 2740 2746 2750 2754 2777 2780 2796 2813 2842 2849 2852 2854 2878 2879 2880 2881 2886 2887 2889 2898 2908 2921 2938 2943 2952 2957 2958 2962 2981 2984 2992 3003 3011 3014 3016 3018 3038 3064 3087 3102 3105 3117 3122 3137 3141 3142 3146 3148 3153 3162 3169 3176 3178 138 400 503 605 1035 1265 1537 1737 1758 1837 1875 1901 1930 1989 2215 2284 2381 2396 2397 2504 2532 2644 GCGGCG/CGCCGC 1 -3 281 268 22 -49.1 0 23 46 86 100 119 120 138 172 173 174 175 180 187 189 195 207 209 237 270 293 319 347 409 410 434 436 450 453 454 455 458 476 490 510 525 541 546 592 595 604 610 612 639 673 676 684 699 711 716 788 791 799 805 806 808 811 813 836 864 943 968 969 972 978 991 1003 1049 1093 1112 1114 1148 1168 1176 1179 1203 1218 1231 1235 1249 1251 1261 1269 1277 1283 1292 1293 1298 1303 1316 1326 1334 1353 1354 1380 1399 1402 1407 1417 1430 1451 1455 1477 1504 1513 1514 1538 1544 1558 1564 1576 1577 1583 1586 1588 1591 1592 1617 1618 1626 1638 1648 1650 1652 1657 1666 1700 1715 1717 1723 1727 1734 1736 1741 1758 1761 1778 1805 1829 1834 1838 1842 1858 1870 1882 1905 1915 1932 1941 1946 1952 1958 1963 1967 1973 1987 2003 2007 2025 2048 2058 2069 2076 2088 2109 2144 2162 2181 2187 2195 2197 2201 2206 2211 2265 2268 2286 2294 2302 2305 2327 2330 2348 2358 2367 2377 2389 2392 2397 2408 2430 2432 2439 2442 2443 2471 2474 2481 2488 2500 2506 2530 2545 2549 2555 2560 2561 2562 2563 2570 2581 2583 2586 2592 2595 2598 2608 2614 2630 2636 2662 2667 2677 2684 2694 2699 2709 2728 2740 2746 2750 2754 2777 2780 2796 2813 2842 2849 2852 2854 2878 2879 2880 2881 2886 2887 2889 2898 2908 2921 2938 2943 2952 2957 2958 2962 2981 2984 2992 3003 3011 3014 3016 3018 3038 3064 3087 3102 3105 3117 3122 3137 3141 3142 3146 3148 3153 3162 3169 3176 3178 138 400 503 605 1035 1265 1537 1737 1758 1837 1875 1901 1930 1989 2215 2284 2381 2396 2397 2504 2532 2644 CCGCCT/AGGCGG 0 -1 295 260 28 -42.6 46 48 53 76 97 114 124 139 157 173 181 187 189 207 245 258 286 291 298 299 320 324 330 336 370 372 406 435 450 458 467 476 491 520 523 530 534 536 541 601 604 606 609 680 684 687 704 715 721 739 747 752 769 770 777 782 786 788 811 813 832 836 842 843 845 849 856 864 866 907 919 925 926 936 945 961 969 970 974 975 986 991 995 1002 1013 1022 1032 1077 1078 1114 1182 1183 1191 1218 1224 1227 1231 1251 1281 1282 1292 1307 1312 1339 1344 1360 1362 1367 1375 1378 1379 1414 1419 1421 1426 1430 1446 1449 1470 1472 1477 1497 1513 1544 1546 1555 1561 1577 1582 1583 1585 1602 1638 1645 1653 1654 1660 1669 1676 1684 1686 1693 1715 1721 1729 1731 1740 1756 1758 1770 1771 1772 1787 1790 1791 1863 1873 1886 1892 1902 1907 1915 1920 1983 1995 1998 2011 2012 2014 2030 2035 2036 2057 2064 2070 2072 2076 2077 2079 2080 2094 2106 2109 2111 2112 2119 2123 2138 2143 2145 2158 2185 2187 2193 2214 2223 2241 2243 2255 2259 2260 2270 2274 2275 2277 2293 2294 2297 2316 2319 2323 2324 2345 2354 2359 2367 2395 2402 2404 2412 2438 2442 2455 2464 2473 2479 2515 2520 2523 2525 2533 2535 2543 2560 2561 2562 2588 2598 2602 2614 2622 2631 2632 2640 2649 2656 2661 2665 2668 2677 2694 2719 2744 2750 2776 2786 2808 2820 2828 2838 2843 2852 2862 2866 2868 2911 2912 2914 2926 2929 2955 2957 2961 2962 2965 2975 2985 2998 3011 3014 3025 3026 3028 3031 3039 3080 3089 3114 3120 3131 3155 3157 3166 3171 3179 422 485 914 1128 1137 1138 1143 1144 1198 1252 1253 1282 1397 1444 1538 1599 1728 1746 1776 1879 2137 2182 2215 2267 2331 2468 2469 2676 AGGCGG/CCGCCT 2 -3 295 260 28 -42.6 46 48 53 76 97 114 124 139 157 173 181 187 189 207 245 258 286 291 298 299 320 324 330 336 370 372 406 435 450 458 467 476 491 520 523 530 534 536 541 601 604 606 609 680 684 687 704 715 721 739 747 752 769 770 777 782 786 788 811 813 832 836 842 843 845 849 856 864 866 907 919 925 926 936 945 961 969 970 974 975 986 991 995 1002 1013 1022 1032 1077 1078 1114 1182 1183 1191 1218 1224 1227 1231 1251 1281 1282 1292 1307 1312 1339 1344 1360 1362 1367 1375 1378 1379 1414 1419 1421 1426 1430 1446 1449 1470 1472 1477 1497 1513 1544 1546 1555 1561 1577 1582 1583 1585 1602 1638 1645 1653 1654 1660 1669 1676 1684 1686 1693 1715 1721 1729 1731 1740 1756 1758 1770 1771 1772 1787 1790 1791 1863 1873 1886 1892 1902 1907 1915 1920 1983 1995 1998 2011 2012 2014 2030 2035 2036 2057 2064 2070 2072 2076 2077 2079 2080 2094 2106 2109 2111 2112 2119 2123 2138 2143 2145 2158 2185 2187 2193 2214 2223 2241 2243 2255 2259 2260 2270 2274 2275 2277 2293 2294 2297 2316 2319 2323 2324 2345 2354 2359 2367 2395 2402 2404 2412 2438 2442 2455 2464 2473 2479 2515 2520 2523 2525 2533 2535 2543 2560 2561 2562 2588 2598 2602 2614 2622 2631 2632 2640 2649 2656 2661 2665 2668 2677 2694 2719 2744 2750 2776 2786 2808 2820 2828 2838 2843 2852 2862 2866 2868 2911 2912 2914 2926 2929 2955 2957 2961 2962 2965 2975 2985 2998 3011 3014 3025 3026 3028 3031 3039 3080 3089 3114 3120 3131 3155 3157 3166 3171 3179 422 485 914 1128 1137 1138 1143 1144 1198 1252 1253 1282 1397 1444 1538 1599 1728 1746 1776 1879 2137 2182 2215 2267 2331 2468 2469 2676 TGCGGT/ACCGCA 1 -4 264 247 41 -31.7 21 27 29 37 38 45 68 202 206 210 223 227 228 239 246 287 319 350 398 415 432 519 557 568 572 573 585 587 613 664 698 714 716 731 749 781 799 814 818 832 854 860 862 867 876 886 914 916 923 937 947 951 954 962 963 966 1005 1021 1023 1025 1034 1048 1084 1098 1104 1109 1110 1125 1161 1175 1192 1205 1209 1213 1233 1272 1298 1317 1319 1340 1369 1373 1387 1406 1418 1433 1435 1440 1448 1457 1459 1477 1522 1528 1540 1541 1542 1544 1552 1554 1569 1575 1578 1597 1607 1638 1644 1651 1661 1664 1672 1680 1705 1707 1709 1714 1726 1730 1732 1735 1737 1743 1744 1752 1754 1757 1760 1764 1773 1784 1786 1827 1843 1852 1857 1878 1889 1894 1916 1948 1969 1979 1986 1988 1991 2027 2032 2039 2044 2045 2069 2072 2075 2078 2080 2081 2085 2091 2104 2118 2128 2130 2139 2145 2148 2149 2154 2168 2176 2204 2212 2225 2239 2245 2250 2256 2266 2312 2322 2325 2361 2363 2366 2371 2372 2376 2387 2392 2400 2420 2432 2434 2446 2448 2454 2467 2495 2504 2511 2514 2518 2584 2596 2615 2652 2653 2663 2669 2690 2695 2704 2706 2711 2717 2725 2758 2790 2798 2799 2810 2824 2835 2840 2847 2856 2875 2885 2895 2907 2910 2912 2919 2934 2936 2948 2959 2963 2964 2973 2977 2982 2991 2997 3012 3029 3042 3066 3078 3082 3083 3088 3094 3107 3111 3115 3123 3132 3135 3136 3144 3151 3158 3161 3180 41 80 96 202 210 314 322 328 332 482 504 713 764 783 970 1032 1099 1121 1423 1424 1429 1567 1593 1697 1702 2020 2084 2090 2105 2260 2339 2356 2357 2361 2393 2397 2410 2533 2553 2626 2634 GCCACC/GGTGGC 0 -2 243 241 40 -30.9 8 13 31 53 54 100 121 126 131 134 139 157 162 168 175 176 180 203 238 242 247 280 291 296 312 364 377 384 416 436 454 460 467 520 522 525 526 531 532 541 548 553 568 587 603 604 617 644 646 647 656 675 681 716 733 754 770 801 806 811 813 826 843 862 866 867 889 893 899 906 925 927 932 949 959 963 966 974 978 991 1074 1080 1094 1107 1114 1126 1144 1170 1199 1209 1235 1246 1261 1263 1287 1298 1313 1318 1344 1354 1362 1397 1408 1415 1421 1423 1426 1436 1443 1453 1489 1504 1516 1519 1527 1566 1571 1573 1578 1591 1606 1628 1629 1689 1697 1708 1711 1726 1741 1760 1806 1807 1810 1813 1819 1822 1827 1829 1830 1834 1841 1855 1857 1858 1872 1911 1964 1978 1980 1988 1989 1998 2025 2042 2049 2057 2080 2104 2109 2114 2116 2118 2147 2153 2157 2168 2183 2184 2185 2186 2189 2200 2209 2220 2246 2257 2267 2269 2273 2275 2278 2287 2301 2317 2324 2361 2364 2369 2371 2375 2377 2410 2428 2438 2453 2462 2471 2496 2501 2503 2508 2520 2530 2537 2539 2548 2574 2585 2598 2627 2630 2654 2655 2683 2687 2688 2691 2703 2712 2740 2743 2750 2780 2808 2833 2842 2852 2857 2879 2897 2920 2956 2972 2978 3021 3045 3058 3090 3124 3135 3138 3160 3173 35 339 421 422 511 564 621 740 910 912 913 940 1089 1092 1121 1138 1139 1179 1238 1296 1313 1315 1350 1377 1393 1620 1638 1778 1875 1985 2073 2149 2152 2253 2260 2320 2399 2540 2543 2575 CGCCTC/GAGGCG 0 0 271 236 26 -38.3 53 76 98 114 124 139 157 173 178 181 187 189 207 245 258 291 298 299 320 331 336 349 351 370 405 417 435 458 491 501 513 520 530 536 540 541 599 604 614 680 684 704 720 722 731 747 752 769 770 777 783 811 813 826 832 836 849 866 894 898 907 917 926 936 942 943 963 969 970 972 974 986 991 1002 1013 1018 1024 1032 1058 1063 1066 1069 1077 1089 1101 1171 1182 1191 1218 1227 1240 1241 1268 1292 1320 1323 1333 1364 1375 1414 1419 1421 1426 1438 1472 1476 1482 1495 1497 1513 1523 1525 1555 1561 1582 1585 1601 1602 1625 1638 1645 1653 1669 1686 1693 1715 1718 1740 1752 1756 1758 1768 1769 1772 1787 1790 1811 1868 1873 1874 1892 1899 1907 1914 1917 1921 1927 1930 1931 1935 1937 1974 1983 1985 1995 1998 2011 2012 2016 2024 2030 2035 2036 2038 2057 2064 2070 2072 2079 2093 2106 2109 2111 2112 2119 2123 2138 2145 2185 2188 2199 2223 2241 2243 2251 2259 2270 2274 2275 2281 2304 2313 2323 2324 2345 2361 2367 2368 2370 2396 2402 2412 2417 2436 2442 2455 2458 2464 2473 2494 2515 2520 2523 2525 2533 2554 2557 2560 2565 2577 2598 2602 2606 2661 2677 2693 2694 2715 2716 2730 2734 2737 2744 2759 2786 2823 2838 2851 2862 2868 2892 2911 2912 2914 2917 2925 2926 2929 2955 2957 2961 2962 2965 2974 2996 3001 3011 3015 3023 3025 3026 3028 3031 3080 3099 3104 3106 3114 3160 3166 3171 40 156 345 422 666 888 1019 1053 1137 1138 1198 1251 1252 1253 1538 1573 1599 1635 1658 1728 1878 2137 2182 2306 2650 2676 GAGGCG/CGCCTC 2 -4 271 236 26 -38.3 53 76 98 114 124 139 157 173 178 181 187 189 207 245 258 291 298 299 320 331 336 349 351 370 405 417 435 458 491 501 513 520 530 536 540 541 599 604 614 680 684 704 720 722 731 747 752 769 770 777 783 811 813 826 832 836 849 866 894 898 907 917 926 936 942 943 963 969 970 972 974 986 991 1002 1013 1018 1024 1032 1058 1063 1066 1069 1077 1089 1101 1171 1182 1191 1218 1227 1240 1241 1268 1292 1320 1323 1333 1364 1375 1414 1419 1421 1426 1438 1472 1476 1482 1495 1497 1513 1523 1525 1555 1561 1582 1585 1601 1602 1625 1638 1645 1653 1669 1686 1693 1715 1718 1740 1752 1756 1758 1768 1769 1772 1787 1790 1811 1868 1873 1874 1892 1899 1907 1914 1917 1921 1927 1930 1931 1935 1937 1974 1983 1985 1995 1998 2011 2012 2016 2024 2030 2035 2036 2038 2057 2064 2070 2072 2079 2093 2106 2109 2111 2112 2119 2123 2138 2145 2185 2188 2199 2223 2241 2243 2251 2259 2270 2274 2275 2281 2304 2313 2323 2324 2345 2361 2367 2368 2370 2396 2402 2412 2417 2436 2442 2455 2458 2464 2473 2494 2515 2520 2523 2525 2533 2554 2557 2560 2565 2577 2598 2602 2606 2661 2677 2693 2694 2715 2716 2730 2734 2737 2744 2759 2786 2823 2838 2851 2862 2868 2892 2911 2912 2914 2917 2925 2926 2929 2955 2957 2961 2962 2965 2974 2996 3001 3011 3015 3023 3025 3026 3028 3031 3080 3099 3104 3106 3114 3160 3166 3171 40 156 345 422 666 888 1019 1053 1137 1138 1198 1251 1252 1253 1538 1573 1599 1635 1658 1728 1878 2137 2182 2306 2650 2676 GCCGCC/GGCGGC 0 -2 260 222 32 -31.2 46 86 100 119 120 138 143 164 173 174 175 187 189 207 237 270 347 364 410 434 450 453 458 476 510 529 541 595 604 606 612 652 673 679 684 687 699 711 788 791 799 806 808 811 813 821 826 836 864 889 920 928 969 972 974 991 1077 1090 1094 1112 1114 1159 1176 1199 1202 1218 1235 1251 1261 1275 1277 1281 1282 1287 1292 1299 1303 1322 1325 1336 1344 1353 1354 1357 1385 1402 1414 1430 1446 1451 1468 1471 1477 1504 1513 1535 1576 1577 1583 1588 1591 1592 1612 1618 1619 1626 1638 1645 1647 1650 1652 1655 1662 1666 1695 1710 1715 1721 1723 1725 1726 1727 1736 1741 1752 1761 1772 1775 1806 1810 1834 1842 1872 1915 1932 1945 1946 1952 2020 2025 2048 2069 2076 2109 2112 2144 2152 2158 2161 2168 2181 2182 2187 2195 2198 2206 2214 2236 2243 2277 2278 2294 2297 2302 2305 2306 2318 2327 2348 2354 2367 2377 2392 2402 2409 2415 2426 2432 2438 2442 2443 2447 2451 2479 2506 2523 2530 2535 2536 2545 2548 2560 2561 2562 2583 2592 2598 2607 2608 2614 2630 2635 2639 2642 2644 2662 2665 2667 2668 2674 2677 2684 2694 2721 2740 2746 2754 2776 2777 2780 2791 2792 2804 2842 2852 2859 2861 2866 2867 2879 2881 2886 2888 2898 2921 2926 2933 2952 2957 2962 2984 3002 3011 3014 3016 3038 3064 3105 3117 3122 3128 3131 3134 3137 3138 3142 3146 3166 3176 3178 249 400 485 503 605 647 914 1137 1282 1551 1584 1728 1737 1814 1837 1851 1875 1930 2006 2182 2215 2267 2295 2315 2331 2396 2397 2460 2504 2603 2644 2676 CCTCCG/CGGAGG 0 -4 228 213 36 -27.0 7 31 76 86 97 101 119 134 150 168 173 187 207 216 247 256 259 280 291 297 298 302 311 321 348 365 382 406 435 440 448 458 462 490 493 530 531 535 536 556 602 604 607 612 623 639 669 678 721 739 788 805 811 839 849 866 893 907 919 926 938 943 963 970 972 974 978 986 991 1001 1027 1066 1076 1102 1114 1180 1182 1200 1207 1216 1231 1232 1243 1318 1326 1363 1391 1397 1404 1407 1420 1421 1434 1483 1504 1507 1513 1535 1538 1561 1566 1585 1594 1637 1650 1655 1658 1666 1669 1675 1694 1700 1707 1711 1726 1727 1758 1767 1771 1772 1777 1802 1820 1831 1838 1860 1892 1902 1927 1941 1953 1963 2009 2011 2012 2014 2023 2030 2050 2077 2088 2106 2108 2111 2138 2157 2170 2180 2197 2206 2222 2232 2235 2259 2274 2283 2296 2324 2330 2345 2367 2396 2398 2438 2459 2473 2478 2488 2489 2519 2520 2524 2538 2539 2542 2543 2563 2574 2592 2598 2618 2629 2635 2647 2665 2682 2683 2694 2712 2713 2739 2740 2742 2749 2750 2751 2788 2806 2813 2817 2840 2849 2880 2896 2900 2914 2924 2979 3011 3012 3024 3025 3031 3038 3041 3049 3051 3057 3065 3079 3095 3116 3121 3148 3152 3166 3171 3181 0 421 568 578 675 690 767 802 982 996 1017 1033 1059 1099 1173 1179 1252 1253 1347 1508 1583 1590 1757 1767 1875 1945 1994 2001 2133 2137 2296 2317 2320 2377 2468 2500 GCGGCT/AGCCGC 1 -3 219 204 26 -30.8 13 25 85 143 164 237 279 282 343 352 389 404 425 436 507 509 518 527 529 538 560 570 592 652 659 666 679 699 711 712 734 779 780 798 825 827 845 915 922 927 928 933 941 945 955 974 984 1006 1037 1043 1045 1049 1108 1116 1120 1143 1148 1159 1167 1176 1196 1199 1204 1220 1278 1282 1287 1300 1322 1336 1344 1353 1357 1375 1384 1392 1403 1406 1414 1431 1436 1445 1446 1451 1471 1485 1493 1535 1543 1574 1576 1579 1592 1612 1619 1646 1655 1670 1680 1683 1699 1726 1750 1755 1772 1774 1775 1825 1832 1833 1865 1915 1922 1928 1932 1934 1939 1943 1962 1977 1998 2001 2007 2059 2065 2076 2097 2112 2118 2121 2128 2133 2137 2152 2158 2161 2177 2181 2182 2183 2196 2233 2235 2236 2243 2256 2276 2280 2284 2297 2302 2318 2326 2334 2354 2356 2362 2367 2415 2423 2424 2432 2443 2447 2479 2498 2502 2503 2536 2548 2551 2561 2604 2605 2607 2612 2616 2633 2643 2644 2657 2667 2674 2676 2680 2700 2718 2738 2741 2763 2792 2794 2803 2804 2812 2819 2848 2863 2866 2867 2873 2880 2888 2891 2933 2940 2964 3026 3038 3052 3069 3093 3097 3129 3131 3134 3162 3166 3175 35 249 320 367 475 485 568 647 914 1029 1128 1282 1551 1728 1737 1814 1837 2076 2275 2295 2381 2457 2574 2603 2620 2676 CACCGT/ACGGTG 0 0 229 202 50 -18.6 9 51 105 111 125 146 189 213 237 240 280 300 304 311 317 364 377 383 398 416 436 437 442 472 473 475 477 486 538 541 595 617 643 646 695 700 709 725 741 767 768 810 839 857 862 888 893 899 914 916 929 933 970 1015 1030 1056 1067 1074 1087 1094 1107 1126 1148 1170 1179 1192 1197 1216 1246 1248 1268 1291 1295 1322 1331 1356 1388 1407 1412 1414 1416 1443 1461 1539 1546 1559 1566 1585 1587 1589 1604 1611 1626 1647 1649 1694 1712 1713 1724 1728 1741 1772 1806 1813 1821 1826 1855 1886 1894 1921 1924 1926 1931 1941 1942 1948 1954 1997 2012 2031 2055 2066 2074 2089 2104 2120 2125 2126 2142 2144 2153 2154 2163 2173 2174 2175 2180 2184 2186 2213 2224 2269 2272 2301 2308 2317 2332 2353 2357 2363 2384 2391 2392 2398 2417 2435 2440 2451 2455 2459 2462 2469 2482 2487 2501 2519 2536 2537 2539 2579 2588 2600 2608 2612 2636 2645 2655 2658 2672 2681 2691 2694 2702 2714 2722 2731 2736 2738 2739 2743 2762 2763 2764 2769 2788 2805 2831 2842 2846 2855 2865 2869 2879 2897 2910 2921 2926 2942 2964 2970 2972 2976 2979 2989 3010 3020 3021 3030 3045 3046 3053 3084 3090 3108 3127 3148 3152 3165 3172 28 57 182 416 471 591 653 720 746 844 860 909 1040 1068 1101 1143 1172 1177 1253 1296 1315 1360 1406 1408 1507 1511 1551 1669 1843 2002 2013 2041 2043 2065 2148 2150 2153 2164 2165 2225 2265 2331 2398 2404 2469 2575 2611 2621 2657 2679 GGAGGC/GCCTCC 2 -5 206 195 29 -27.0 53 60 76 78 97 103 114 119 124 125 145 157 168 173 174 179 181 187 207 229 236 261 269 320 331 336 351 363 364 370 372 380 406 417 435 446 451 458 462 490 503 510 512 520 530 531 536 542 546 565 578 590 604 606 671 680 684 688 731 747 752 769 783 788 811 813 839 849 866 917 926 936 943 963 970 972 974 978 983 985 986 991 1023 1037 1040 1066 1089 1102 1108 1130 1139 1171 1178 1182 1191 1200 1209 1218 1240 1259 1268 1323 1343 1392 1419 1420 1456 1464 1472 1492 1504 1513 1535 1561 1601 1602 1614 1617 1625 1645 1653 1690 1696 1707 1711 1727 1740 1758 1760 1772 1811 1847 1850 1874 1886 1892 1901 1931 1974 1985 2011 2012 2023 2033 2036 2057 2064 2067 2088 2106 2108 2109 2112 2116 2138 2145 2180 2185 2192 2199 2223 2239 2243 2259 2275 2299 2304 2324 2332 2333 2345 2396 2412 2427 2436 2464 2497 2504 2520 2542 2557 2560 2565 2598 2619 2620 2677 2694 2724 2730 2744 2751 2788 2827 2849 2882 2912 2914 2921 2926 2955 3065 3106 3142 3160 3166 22 333 422 431 534 566 774 814 1019 1137 1138 1168 1173 1196 1235 1252 1253 1578 1583 1590 1658 1662 1847 2289 2318 2374 2624 2627 2679 GCGGAA/TTCCGC 1 -3 178 173 22 -26.3 4 9 23 85 100 126 145 212 272 317 336 368 378 384 409 538 577 579 601 611 641 688 812 832 837 842 861 871 960 1019 1020 1032 1042 1073 1105 1107 1112 1119 1130 1150 1184 1194 1208 1224 1249 1259 1311 1317 1325 1338 1342 1353 1361 1365 1374 1389 1401 1424 1425 1453 1521 1526 1544 1551 1576 1577 1590 1595 1609 1624 1627 1705 1708 1722 1758 1765 1796 1839 1842 1881 1892 1898 1910 1923 1966 1969 1981 1983 1992 2028 2034 2048 2052 2061 2063 2114 2124 2129 2143 2156 2178 2207 2229 2279 2285 2297 2315 2320 2343 2350 2352 2355 2359 2382 2401 2412 2421 2430 2442 2445 2457 2461 2470 2483 2491 2541 2560 2588 2608 2621 2660 2661 2670 2678 2696 2697 2701 2710 2726 2733 2735 2742 2752 2770 2801 2818 2821 2829 2838 2839 2854 2860 2862 2883 2890 2894 2895 2903 2913 2932 2946 2947 2953 2965 2967 3006 3015 3022 3026 3027 3081 3085 3102 3112 3120 3127 3134 3171 113 138 916 1001 1119 1128 1261 1332 1391 1407 1620 1664 1746 1776 2071 2215 2358 2381 2433 2533 2641 2671 GTTGCG/CGCAAC 1 -6 151 168 42 -15.4 4 9 21 27 29 37 38 45 83 199 206 210 223 285 287 293 319 350 352 398 415 519 560 561 611 649 672 695 716 728 749 805 832 844 876 880 885 915 923 972 1046 1048 1098 1100 1120 1165 1191 1209 1220 1292 1374 1375 1411 1457 1486 1508 1542 1576 1598 1609 1622 1638 1639 1646 1652 1681 1688 1732 1737 1756 1760 1778 1829 1857 1893 1894 1905 1912 1930 1948 1959 1968 1969 1986 1991 2061 2118 2121 2145 2176 2178 2184 2219 2239 2266 2353 2366 2376 2392 2400 2408 2429 2432 2454 2463 2470 2476 2504 2506 2511 2514 2518 2556 2569 2594 2598 2616 2625 2652 2653 2669 2681 2701 2721 2796 2799 2800 2816 2819 2820 2834 2839 2884 2904 2907 2911 2913 2928 2944 2948 3002 3012 3022 3042 3051 3053 3066 3069 3085 3114 3152 21 49 76 180 295 298 299 302 303 305 314 320 322 328 332 482 504 529 696 877 1032 1229 1391 1407 1423 1424 1429 1503 1620 1737 1782 2084 2090 2108 2126 2306 2339 2357 2361 2446 2532 2542 TGCGGA/TCCGCA 1 -4 157 150 21 -21.7 4 9 73 85 95 145 236 252 272 291 327 380 413 431 532 538 602 611 649 658 660 698 707 716 717 812 830 832 900 916 953 959 960 1079 1081 1082 1100 1103 1105 1119 1147 1150 1151 1164 1183 1232 1247 1249 1317 1325 1352 1363 1374 1396 1409 1424 1425 1463 1467 1483 1511 1527 1535 1547 1570 1609 1615 1616 1623 1632 1639 1652 1656 1659 1681 1690 1698 1703 1733 1748 1789 1795 1831 1836 1867 1877 1881 1898 1940 1959 1962 1968 1969 1982 2019 2061 2067 2101 2147 2178 2188 2227 2237 2257 2289 2292 2315 2335 2349 2352 2353 2357 2359 2382 2405 2413 2421 2442 2461 2470 2476 2482 2541 2598 2603 2678 2679 2681 2687 2701 2703 2713 2726 2733 2735 2782 2816 2818 2829 2839 2860 2890 2895 2913 2932 2944 3013 3022 3025 3026 3085 3095 3098 3112 3125 3159 3174 139 305 363 446 498 521 1178 1261 1274 1407 1542 1583 1620 1664 1782 1836 1852 1985 2005 2489 2604 CGCCGT/ACGGCG 0 0 159 148 38 -13.3 18 52 103 125 134 164 166 182 213 220 249 271 281 293 331 410 448 451 482 493 529 556 564 595 652 664 667 673 679 709 718 720 724 733 739 780 791 810 862 893 899 938 964 972 1015 1044 1050 1076 1089 1107 1116 1141 1154 1165 1180 1185 1214 1225 1234 1243 1249 1276 1286 1299 1303 1325 1404 1414 1422 1427 1459 1504 1520 1650 1654 1658 1669 1695 1710 1723 1746 1752 1775 1806 1834 1897 1957 1969 2023 2028 2029 2102 2114 2170 2182 2189 2194 2198 2235 2238 2283 2291 2348 2363 2364 2369 2400 2407 2409 2419 2426 2506 2527 2536 2562 2563 2570 2579 2583 2616 2617 2618 2643 2644 2648 2649 2657 2684 2699 2703 2709 2727 2747 2752 2755 2776 2777 2821 2851 2881 2886 2914 2962 2968 3005 3010 3011 3016 3034 3046 3048 3051 3057 3105 3171 3172 3176 3178 3181 140 180 215 246 339 346 417 421 675 761 872 1001 1041 1059 1115 1309 1324 1393 1394 1454 1608 1754 1788 1900 2174 2175 2176 2182 2315 2381 2386 2454 2460 2468 2482 2504 2581 2672 AGCGGC/GCCGCT 1 -4 155 148 21 -21.3 0 85 209 216 282 343 389 409 410 425 454 455 490 507 509 538 546 583 592 593 639 666 679 712 734 757 780 799 817 827 845 922 941 978 1003 1006 1031 1037 1043 1049 1116 1127 1143 1173 1179 1203 1269 1278 1293 1298 1334 1353 1392 1403 1406 1445 1455 1477 1544 1564 1574 1579 1586 1592 1648 1666 1680 1682 1700 1727 1734 1755 1774 1833 1842 1862 1922 1928 1932 1941 1958 1963 1977 1998 2001 2003 2007 2048 2059 2088 2097 2128 2133 2183 2196 2197 2206 2211 2256 2265 2268 2276 2280 2334 2358 2362 2389 2408 2410 2422 2423 2439 2443 2481 2488 2498 2549 2555 2595 2612 2614 2633 2680 2684 2700 2741 2763 2813 2820 2842 2854 2863 2873 2887 2889 2891 2908 2938 2940 2943 2956 2964 2981 2992 3007 3016 3038 3064 3087 3093 3097 3129 3146 3153 3176 35 81 138 367 475 862 893 1029 1128 1406 1446 1537 1758 1989 2029 2076 2137 2275 2284 2381 2457 TGCGGC/GCCGCA 1 -4 159 146 24 -19.2 13 100 112 279 285 293 347 352 436 453 458 472 482 518 527 555 560 570 597 610 659 676 679 699 716 780 798 805 825 828 915 927 933 968 971 972 984 1039 1045 1093 1109 1128 1146 1167 1168 1176 1196 1204 1220 1231 1276 1283 1300 1316 1326 1343 1354 1375 1381 1382 1399 1408 1417 1436 1514 1536 1576 1646 1657 1670 1683 1699 1717 1750 1758 1766 1786 1805 1825 1829 1858 1865 1905 1932 1939 1962 2007 2065 2096 2121 2122 2141 2142 2162 2166 2177 2181 2233 2286 2302 2330 2397 2430 2432 2434 2463 2471 2474 2475 2488 2500 2551 2553 2563 2566 2586 2589 2605 2616 2625 2636 2661 2662 2667 2676 2699 2753 2778 2779 2794 2796 2811 2812 2819 2834 2848 2850 2880 2899 2930 2949 2957 2958 2994 3000 3003 3010 3011 3026 3038 3052 3069 3102 3109 3138 3141 3152 3166 3175 71 320 568 605 607 608 1035 1100 1265 1737 1811 1901 1941 1954 2203 2371 2397 2520 2532 2574 2620 2627 2644 2687 CCGCAG/CTGCGG 0 -1 169 144 17 -22.9 73 95 135 227 232 380 431 436 453 458 518 555 570 649 659 660 679 716 814 818 825 832 867 886 915 916 947 959 963 966 1045 1048 1081 1109 1125 1128 1147 1150 1196 1215 1247 1249 1298 1317 1326 1343 1354 1360 1363 1395 1399 1406 1417 1418 1425 1436 1448 1454 1469 1477 1514 1527 1528 1536 1544 1554 1575 1578 1584 1597 1607 1623 1657 1659 1661 1672 1680 1698 1699 1707 1743 1750 1752 1786 1831 1858 1877 1881 1932 1939 1940 1982 1984 2019 2027 2032 2044 2057 2065 2069 2072 2075 2081 2096 2101 2128 2142 2166 2168 2171 2181 2225 2227 2245 2250 2256 2257 2286 2302 2330 2335 2341 2349 2361 2372 2413 2430 2432 2434 2442 2461 2479 2482 2500 2584 2586 2589 2603 2605 2615 2636 2663 2667 2676 2687 2695 2699 2704 2725 2726 2733 2735 2753 2778 2779 2789 2891 2912 2959 2963 3011 3026 3066 3078 3098 3115 3132 3144 3180 80 202 498 1035 1121 1178 1702 1811 1845 1941 2105 2289 2371 2520 2553 2574 2687 CTGCGG/CCGCAG 1 -5 169 144 17 -22.9 73 95 135 227 232 380 431 436 453 458 518 555 570 649 659 660 679 716 814 818 825 832 867 886 915 916 947 959 963 966 1045 1048 1081 1109 1125 1128 1147 1150 1196 1215 1247 1249 1298 1317 1326 1343 1354 1360 1363 1395 1399 1406 1417 1418 1425 1436 1448 1454 1469 1477 1514 1527 1528 1536 1544 1554 1575 1578 1584 1597 1607 1623 1657 1659 1661 1672 1680 1698 1699 1707 1743 1750 1752 1786 1831 1858 1877 1881 1932 1939 1940 1982 1984 2019 2027 2032 2044 2057 2065 2069 2072 2075 2081 2096 2101 2128 2142 2166 2168 2171 2181 2225 2227 2245 2250 2256 2257 2286 2302 2330 2335 2341 2349 2361 2372 2413 2430 2432 2434 2442 2461 2479 2482 2500 2584 2586 2589 2603 2605 2615 2636 2663 2667 2676 2687 2695 2699 2704 2725 2726 2733 2735 2753 2778 2779 2789 2891 2912 2959 2963 3011 3026 3066 3078 3098 3115 3132 3144 3180 80 202 498 1035 1121 1178 1702 1811 1845 1941 2105 2289 2371 2520 2553 2574 2687 GCGGGT/ACCCGC 1 -3 131 142 9 -28.6 9 18 23 43 52 65 95 135 140 169 232 234 245 251 318 330 384 424 468 522 524 584 624 685 695 738 748 772 796 819 822 884 890 909 935 957 1022 1048 1102 1126 1153 1158 1172 1193 1194 1244 1285 1327 1345 1352 1395 1397 1411 1432 1437 1464 1465 1479 1531 1569 1584 1603 1687 1690 1753 1763 1776 1783 1830 1849 1884 1948 1950 1994 2004 2011 2017 2133 2140 2167 2183 2191 2192 2193 2209 2248 2272 2329 2452 2456 2463 2505 2545 2556 2558 2559 2580 2601 2622 2624 2629 2650 2671 2705 2710 2732 2767 2783 2789 2796 2814 2824 2831 2900 2908 2911 2916 2931 2950 2960 2961 2980 3008 3025 3058 3066 3068 3074 3089 3100 3160 21 466 1238 1845 2008 2241 2272 2289 2527 GCTGCG/CGCAGC 1 -6 145 137 22 -18.3 5 73 95 103 137 227 304 380 429 436 445 453 460 474 489 502 518 551 569 570 571 576 592 603 649 679 688 716 802 808 825 832 854 886 915 922 959 963 975 1003 1024 1045 1071 1108 1125 1128 1141 1150 1160 1162 1170 1185 1196 1239 1317 1320 1326 1355 1360 1406 1417 1436 1448 1460 1477 1490 1516 1527 1544 1554 1564 1580 1584 1593 1661 1672 1680 1702 1707 1750 1754 1777 1782 1802 1855 1905 1932 1939 1982 1985 2027 2057 2058 2069 2072 2075 2092 2112 2128 2168 2171 2179 2181 2225 2227 2233 2245 2246 2250 2256 2257 2323 2341 2372 2432 2482 2500 2561 2584 2589 2605 2615 2663 2667 2676 2682 2687 2699 2704 2726 2756 2779 2813 2891 2908 2912 2963 2979 2992 3011 3026 3078 3115 3133 3144 26 212 254 498 499 838 1019 1391 1574 1600 1845 1853 2071 2168 2311 2315 2371 2394 2438 2536 2574 2584 ATCCGC/GCGGAT 0 -3 145 136 30 -14.3 5 95 139 151 162 180 236 252 258 346 357 376 392 413 431 491 497 534 605 658 660 666 687 707 717 720 726 739 767 777 782 852 874 916 946 953 959 987 990 1008 1031 1044 1076 1081 1082 1093 1103 1147 1183 1208 1249 1351 1352 1353 1367 1382 1421 1463 1467 1470 1495 1540 1604 1613 1615 1616 1639 1652 1654 1659 1684 1690 1698 1703 1715 1729 1733 1734 1748 1782 1787 1842 1845 1852 1862 1877 1886 1893 1920 1956 1962 1968 1982 2019 2023 2026 2049 2069 2118 2147 2188 2193 2200 2227 2234 2237 2240 2246 2255 2257 2288 2343 2348 2365 2379 2405 2413 2476 2482 2525 2574 2583 2602 2610 2612 2659 2681 2687 2748 2749 2782 2816 2829 2842 2916 2962 3011 3074 3080 3125 3141 3151 3159 3171 3174 305 363 411 446 498 600 690 719 947 968 969 1039 1100 1178 1238 1274 1513 1537 1542 1608 1687 1852 2041 2080 2280 2489 2516 2604 2618 2634 CACCGA/TCGGTG 0 0 151 136 33 -13.0 31 43 61 68 88 136 158 232 237 240 251 264 291 384 386 397 402 447 548 578 603 614 650 661 663 678 686 715 768 851 854 910 934 939 944 956 959 1035 1057 1068 1103 1113 1116 1173 1174 1177 1216 1236 1310 1341 1368 1389 1423 1489 1492 1505 1553 1559 1560 1566 1594 1599 1648 1664 1669 1689 1708 1713 1715 1720 1807 1809 1814 1816 1819 1833 1837 1840 1844 1851 1866 1885 1917 1946 1949 1951 1964 1972 1975 1980 2000 2004 2005 2044 2051 2074 2127 2220 2230 2259 2273 2275 2290 2321 2350 2364 2366 2369 2372 2385 2416 2442 2494 2512 2532 2542 2628 2630 2655 2673 2683 2712 2716 2740 2749 2750 2751 2774 2794 2797 2806 2817 2826 2833 2872 2901 2906 2945 2953 3017 3037 3056 3075 3079 3130 3133 3135 3138 3151 3163 3170 62 74 100 171 345 436 547 577 703 768 897 904 952 1040 1109 1233 1251 1393 1411 1476 1746 1901 2005 2154 2168 2181 2253 2255 2271 2302 2585 2610 2616 GAGCGG/CCGCTC 1 -5 114 127 15 -20.3 0 23 114 126 169 172 209 221 235 256 276 282 507 509 511 594 603 641 657 685 712 757 767 783 792 799 819 827 935 951 1008 1019 1043 1049 1059 1132 1137 1143 1203 1209 1221 1278 1298 1334 1390 1392 1422 1490 1503 1507 1555 1567 1574 1576 1623 1666 1677 1687 1700 1753 1755 1763 1796 1798 1839 1893 1903 1910 1927 1941 1942 1992 2007 2133 2170 2191 2196 2211 2231 2232 2258 2280 2294 2310 2422 2440 2456 2462 2465 2559 2612 2671 2674 2705 2741 2754 2763 2796 2801 2806 2820 2851 2862 2900 2927 3015 3016 3061 3068 3093 3121 3166 3168 3176 35 224 504 753 873 1128 1337 1542 2029 2216 2284 2318 2377 2560 2643 AGCGGT/ACCGCT 1 -4 135 119 33 -10.0 74 119 131 153 175 178 221 227 247 251 276 319 403 511 520 526 576 594 603 644 656 657 677 727 733 757 783 787 792 812 846 859 870 918 978 1000 1008 1010 1059 1089 1091 1098 1132 1137 1166 1169 1221 1250 1306 1334 1362 1390 1393 1410 1413 1422 1486 1490 1503 1516 1526 1555 1567 1583 1593 1607 1628 1653 1662 1677 1711 1744 1763 1765 1786 1797 1879 1897 1903 1942 1953 1960 1969 1971 1978 2037 2044 2110 2114 2131 2138 2147 2170 2197 2202 2221 2228 2231 2261 2285 2294 2298 2310 2356 2403 2410 2422 2440 2462 2465 2467 2474 2498 2508 2520 2542 2571 2654 2674 2677 2689 2696 2780 2845 2851 2927 2943 2956 2973 3061 3076 3114 3126 3146 3168 26 28 172 199 350 357 362 380 394 482 504 579 746 753 913 972 1114 1634 1661 1702 1779 1896 1985 1999 2117 2166 2206 2216 2395 2438 2521 2643 2646 AGCGGA/TCCGCT 1 -4 129 118 33 -9.8 23 138 151 212 235 368 378 392 408 462 470 490 579 607 623 641 688 699 767 832 837 846 849 871 883 1008 1019 1056 1073 1115 1184 1208 1243 1259 1298 1361 1366 1382 1389 1498 1507 1521 1526 1564 1576 1623 1641 1700 1708 1722 1765 1767 1774 1777 1796 1798 1820 1839 1852 1860 1893 1910 1923 1927 1956 1992 2002 2009 2011 2014 2018 2034 2047 2051 2108 2111 2124 2150 2156 2207 2211 2232 2258 2263 2285 2300 2320 2343 2350 2355 2368 2396 2399 2401 2402 2445 2449 2483 2491 2521 2524 2578 2612 2613 2665 2682 2697 2742 2754 2770 2801 2806 2862 2894 2903 2924 2967 2970 2983 3006 3015 3027 3038 3041 3081 3102 3121 3151 3153 113 224 254 293 550 600 675 690 719 860 947 968 969 974 996 1067 1100 1119 1238 1257 1332 1337 1391 1454 1542 1687 1880 2071 2080 2358 2377 2416 2533 ATGCGG/CCGCAT 1 -5 133 116 28 -11.3 9 43 272 327 413 472 527 538 597 613 691 697 731 822 830 847 914 937 951 952 957 968 1021 1093 1104 1105 1110 1119 1146 1150 1161 1164 1167 1169 1213 1231 1232 1244 1272 1280 1316 1352 1369 1396 1409 1433 1459 1464 1483 1522 1535 1541 1570 1615 1632 1656 1690 1730 1735 1754 1758 1773 1825 1916 1950 1962 1969 1979 1982 2080 2085 2091 2104 2130 2133 2141 2162 2188 2193 2204 2212 2237 2289 2315 2322 2325 2352 2357 2359 2421 2463 2467 2475 2505 2563 2566 2580 2661 2690 2696 2703 2711 2798 2810 2811 2812 2821 2829 2835 2847 2848 2860 2875 2880 2885 2895 2899 2930 2957 2977 2982 2991 2994 3000 3083 3095 3102 3109 3123 3135 3138 3141 3166 96 239 363 605 607 608 678 766 1017 1100 1238 1274 1542 1697 1836 1901 1985 2005 2020 2101 2203 2356 2371 2393 2397 2410 2527 2604 CCGCTG/CAGCGG 0 -1 118 113 27 -11.2 23 74 131 175 178 216 227 234 378 408 409 410 424 425 455 470 473 490 509 520 546 576 579 592 656 688 733 734 845 849 883 922 1006 1008 1037 1056 1115 1116 1172 1184 1250 1293 1366 1389 1397 1403 1410 1477 1516 1544 1564 1579 1680 1708 1727 1744 1765 1833 1928 1932 1958 1977 1978 1998 2003 2009 2018 2037 2048 2059 2124 2128 2133 2156 2183 2197 2202 2221 2228 2256 2265 2276 2298 2300 2320 2358 2399 2403 2410 2422 2423 2449 2467 2483 2491 2498 2520 2601 2633 2665 2675 2689 2780 2842 2873 2891 2894 2908 2956 2967 2970 2992 3006 3007 3038 3097 3126 3151 28 138 172 254 350 357 475 600 719 779 862 972 1067 1391 1687 1795 1896 1999 2071 2080 2117 2137 2206 2381 2408 2438 2521 CAGCGG/CCGCTG 1 -5 118 113 27 -11.2 23 74 131 175 178 216 227 234 378 408 409 410 424 425 455 470 473 490 509 520 546 576 579 592 656 688 733 734 845 849 883 922 1006 1008 1037 1056 1115 1116 1172 1184 1250 1293 1366 1389 1397 1403 1410 1477 1516 1544 1564 1579 1680 1708 1727 1744 1765 1833 1928 1932 1958 1977 1978 1998 2003 2009 2018 2037 2048 2059 2124 2128 2133 2156 2183 2197 2202 2221 2228 2256 2265 2276 2298 2300 2320 2358 2399 2403 2410 2422 2423 2449 2467 2483 2491 2498 2520 2601 2633 2665 2675 2689 2780 2842 2873 2891 2894 2908 2956 2967 2970 2992 3006 3007 3038 3097 3126 3151 28 138 172 254 350 357 475 600 719 779 862 972 1067 1391 1687 1795 1896 1999 2071 2080 2117 2137 2206 2381 2408 2438 2521 CCGTCG/CGACGG 3 -4 99 111 29 -10.1 0 9 105 136 138 142 150 234 280 365 377 450 458 486 490 563 577 595 627 632 724 736 768 791 856 862 882 893 904 938 976 992 1056 1066 1074 1099 1116 1216 1246 1307 1311 1314 1384 1388 1530 1564 1566 1654 1662 1678 1700 1725 1746 1823 1881 1894 1963 1980 2023 2024 2144 2145 2152 2153 2174 2175 2197 2219 2235 2283 2308 2362 2363 2391 2398 2444 2519 2536 2569 2587 2590 2616 2618 2709 2727 2738 2747 2764 2840 2851 2891 2921 2926 2961 3059 3108 3169 3171 3181 50 180 182 214 673 773 793 844 947 1015 1059 1073 1135 1208 1308 1324 1398 1592 1847 1936 1972 2099 2175 2190 2272 2417 2505 2613 2695 CGCCTT/AAGGCG 0 0 109 108 30 -9.2 17 46 48 63 97 206 330 372 450 476 507 559 606 609 681 687 739 743 777 813 842 843 909 919 925 961 970 1045 1078 1182 1183 1203 1224 1231 1281 1282 1312 1339 1344 1360 1362 1367 1379 1430 1439 1446 1462 1470 1513 1544 1546 1582 1583 1676 1684 1731 1745 1771 1772 1791 1843 1892 1915 1920 2014 2077 2094 2103 2140 2143 2158 2223 2260 2277 2293 2294 2297 2345 2384 2404 2405 2438 2535 2536 2543 2561 2565 2604 2614 2617 2622 2631 2640 2656 2750 2776 2808 2822 2866 2868 2903 2981 2985 2998 3013 3045 3065 3110 3179 305 314 360 564 637 837 914 920 1033 1076 1128 1143 1144 1246 1423 1424 1444 1497 1746 1754 1783 1787 1907 2085 2090 2214 2249 2421 2555 2671 AAGGCG/CGCCTT 2 -4 109 108 30 -9.2 17 46 48 63 97 206 330 372 450 476 507 559 606 609 681 687 739 743 777 813 842 843 909 919 925 961 970 1045 1078 1182 1183 1203 1224 1231 1281 1282 1312 1339 1344 1360 1362 1367 1379 1430 1439 1446 1462 1470 1513 1544 1546 1582 1583 1676 1684 1731 1745 1771 1772 1791 1843 1892 1915 1920 2014 2077 2094 2103 2140 2143 2158 2223 2260 2277 2293 2294 2297 2345 2384 2404 2405 2438 2535 2536 2543 2561 2565 2604 2614 2617 2622 2631 2640 2656 2750 2776 2808 2822 2866 2868 2903 2981 2985 2998 3013 3045 3065 3110 3179 305 314 360 564 637 837 914 920 1033 1076 1128 1143 1144 1246 1423 1424 1444 1497 1746 1754 1783 1787 1907 2085 2090 2214 2249 2421 2555 2671 CGCCAT/ATGGCG 0 0 122 107 29 -9.3 67 78 82 119 133 162 173 207 295 347 385 448 492 497 584 591 619 666 679 711 717 720 726 739 834 851 861 926 942 1024 1125 1171 1188 1206 1212 1260 1292 1344 1347 1351 1357 1388 1391 1411 1420 1421 1429 1449 1469 1478 1486 1603 1619 1692 1695 1711 1782 1834 1854 1875 1892 1952 1966 1988 2001 2022 2042 2054 2055 2057 2074 2115 2144 2218 2222 2234 2236 2240 2266 2302 2306 2318 2321 2327 2377 2380 2392 2420 2430 2452 2461 2462 2534 2549 2567 2583 2641 2659 2707 2720 2733 2740 2746 2767 2804 2808 2858 2867 2931 3003 3008 3009 3019 3033 3047 3064 3070 3117 3127 3128 3137 3138 7 228 400 464 505 527 531 609 847 1049 1118 1120 1136 1154 1331 1468 1549 1713 1776 1792 1876 1930 1989 2154 2349 2400 2570 2656 2658 CGCGGC/GCCGCG 1 -4 88 107 4 -24.8 0 23 25 172 180 195 237 385 404 453 525 592 711 779 780 834 943 945 955 1049 1087 1091 1094 1108 1120 1148 1249 1348 1380 1384 1407 1431 1485 1493 1543 1558 1617 1624 1666 1778 1832 1838 1870 1882 1922 1934 1943 1967 1973 1987 2058 2118 2137 2177 2195 2201 2235 2284 2316 2356 2424 2502 2503 2504 2570 2581 2592 2604 2643 2657 2709 2718 2728 2738 2750 2803 2806 2830 2849 2878 2898 2956 3018 3079 3148 3159 3162 3169 455 1033 2057 2381 CCGCCC/GGGCGG 0 -1 90 105 13 -16.6 0 5 54 97 100 247 274 317 346 406 578 606 662 804 808 873 881 906 945 956 965 983 1001 1010 1019 1020 1042 1051 1054 1099 1191 1301 1304 1322 1368 1379 1483 1501 1509 1572 1588 1595 1613 1657 1658 1662 1665 1675 1736 1810 1827 1828 1858 1869 1919 2020 2050 2110 2232 2235 2377 2382 2390 2415 2447 2484 2506 2543 2642 2650 2689 2696 2721 2771 2772 2787 2792 2823 2829 2878 2882 2905 2933 2953 2986 3027 3073 3155 3164 3166 498 647 662 1137 1542 1584 2099 2205 2274 2280 2295 2528 2634 CGCCGG/CCGGCG 0 0 118 98 20 -11.3 76 101 143 188 219 257 344 377 398 543 560 669 760 768 838 852 893 915 959 987 1053 1076 1116 1117 1130 1202 1252 1275 1289 1336 1351 1353 1402 1472 1538 1553 1588 1619 1621 1626 1640 1642 1650 1658 1673 1702 1718 1771 1834 1841 1842 1862 1872 1893 1904 1931 1945 1985 2009 2030 2033 2052 2076 2082 2161 2162 2173 2180 2182 2189 2218 2231 2264 2330 2349 2366 2406 2417 2432 2435 2444 2459 2462 2480 2526 2641 2642 2646 2654 2672 2728 2754 2755 2764 2791 2803 2849 2870 2896 2910 2915 2922 2955 2968 2976 2981 3002 3024 3033 3042 3052 3065 3134 3137 3141 3142 3148 3151 62 569 578 744 746 1115 1247 1322 1542 1778 1811 1875 2041 2120 2132 2148 2470 2583 2633 2648 TGCCGC/GCGGCA 0 -3 110 93 18 -11.2 112 173 207 216 285 385 398 410 458 472 482 583 593 597 687 757 817 826 828 889 955 971 1000 1031 1077 1090 1127 1128 1146 1173 1202 1275 1276 1281 1293 1299 1325 1343 1348 1381 1385 1468 1477 1588 1619 1645 1647 1662 1666 1695 1710 1721 1725 1752 1786 1806 1810 1862 1922 1932 2096 2133 2141 2142 2166 2168 2198 2277 2278 2302 2306 2402 2410 2422 2426 2434 2438 2451 2488 2523 2535 2553 2566 2589 2614 2625 2635 2642 2665 2668 2721 2776 2779 2791 2806 2811 2830 2834 2850 2926 2930 2984 3000 3002 3010 3064 3128 3138 3152 3159 81 455 607 608 862 1446 1811 1851 1941 2006 2137 2182 2203 2267 2315 2331 2520 2687 GCGGCA/TGCCGC 1 -3 110 93 18 -11.2 112 173 207 216 285 385 398 410 458 472 482 583 593 597 687 757 817 826 828 889 955 971 1000 1031 1077 1090 1127 1128 1146 1173 1202 1275 1276 1281 1293 1299 1325 1343 1348 1381 1385 1468 1477 1588 1619 1645 1647 1662 1666 1695 1710 1721 1725 1752 1786 1806 1810 1862 1922 1932 2096 2133 2141 2142 2166 2168 2198 2277 2278 2302 2306 2402 2410 2422 2426 2434 2438 2451 2488 2523 2535 2553 2566 2589 2614 2625 2635 2642 2665 2668 2721 2776 2779 2791 2806 2811 2830 2834 2850 2926 2930 2984 3000 3002 3010 3064 3128 3138 3152 3159 81 455 607 608 862 1446 1811 1851 1941 2006 2137 2182 2203 2267 2315 2331 2520 2687 GTGCGG/CCGCAC 1 -5 96 88 14 -12.3 65 68 85 100 145 199 228 239 251 279 291 347 522 532 557 568 572 606 698 699 717 780 799 828 854 860 862 916 927 984 1023 1025 1084 1103 1109 1176 1276 1285 1325 1345 1381 1435 1437 1440 1535 1569 1664 1670 1683 1717 1726 1784 1786 1805 1827 1988 2007 2045 2078 2122 2139 2143 2148 2158 2167 2233 2237 2371 2372 2382 2420 2434 2471 2474 2495 2541 2551 2669 2678 2713 2794 2824 2840 2856 2910 2919 2934 2949 2964 3025 3038 3052 3088 3151 3160 3161 139 210 568 764 1261 1583 1852 2260 2489 2533 2620 2627 2634 2644 TACCGC/GCGGTA 0 -3 92 87 16 -11.0 8 82 119 121 293 344 398 536 572 591 594 664 677 739 799 818 842 860 887 915 927 943 951 989 995 1002 1019 1078 1098 1161 1183 1237 1334 1344 1362 1379 1449 1462 1477 1478 1509 1526 1528 1653 1664 1702 1707 1714 1730 1732 1734 1779 1870 1875 1969 1986 2039 2062 2094 2145 2197 2239 2293 2354 2474 2498 2500 2518 2551 2564 2596 2615 2643 2649 2669 2677 2689 2704 2717 2793 2822 2949 2991 3004 3029 3111 3136 3151 3154 3155 3169 3180 350 482 504 764 1099 1139 1634 1697 1702 2206 2260 2274 2318 2408 2438 2575 GCGGTA/TACCGC 1 -3 92 87 16 -11.0 8 82 119 121 293 344 398 536 572 591 594 664 677 739 799 818 842 860 887 915 927 943 951 989 995 1002 1019 1078 1098 1161 1183 1237 1334 1344 1362 1379 1449 1462 1477 1478 1509 1526 1528 1653 1664 1702 1707 1714 1730 1732 1734 1779 1870 1875 1969 1986 2039 2062 2094 2145 2197 2239 2293 2354 2474 2498 2500 2518 2551 2564 2596 2615 2643 2649 2669 2677 2689 2704 2717 2793 2822 2949 2991 3004 3029 3111 3136 3151 3154 3155 3169 3180 350 482 504 764 1099 1139 1634 1697 1702 2206 2260 2274 2318 2408 2438 2575 TGCGGG/CCCGCA 1 -4 88 84 16 -10.4 9 43 65 135 140 199 232 251 522 606 691 695 697 748 801 822 847 873 952 957 1022 1048 1126 1191 1215 1244 1280 1285 1318 1345 1360 1395 1411 1437 1454 1464 1469 1569 1584 1615 1730 1763 1948 1950 1982 1984 2004 2057 2078 2091 2132 2133 2143 2158 2167 2171 2183 2192 2193 2209 2341 2372 2429 2463 2479 2505 2522 2556 2580 2593 2629 2696 2698 2721 2732 2781 2789 2800 2821 2825 2877 2884 2891 2928 2960 2980 3066 3160 208 239 278 482 504 529 678 766 1017 1238 1845 2101 2161 2289 2527 2565 AGGCGA/TCGCCT 2 -3 99 84 21 -8.2 166 188 193 346 349 351 390 405 417 498 540 547 559 614 720 722 731 743 797 826 915 917 943 957 963 1018 1063 1066 1089 1101 1131 1240 1241 1364 1436 1438 1462 1482 1495 1525 1582 1718 1769 1787 1811 1851 1874 1892 1896 1914 1927 1935 1974 1985 2024 2038 2046 2103 2188 2223 2251 2281 2294 2313 2361 2368 2370 2384 2396 2458 2494 2533 2536 2557 2565 2577 2604 2617 2693 2715 2734 2737 2759 2823 2868 2903 2917 2925 2952 2981 3001 3023 3065 3070 3104 3106 3110 3116 3160 149 345 569 637 666 1076 1573 1635 1787 1803 1817 2222 2249 2276 2284 2421 2455 2477 2555 2650 2671 GACCGC/GCGGTC 0 -3 74 80 12 -11.7 0 60 176 221 227 324 415 511 523 747 760 771 923 937 1024 1054 1104 1109 1192 1204 1268 1306 1347 1406 1427 1501 1540 1541 1567 1607 1662 1665 1735 1778 1786 1828 1870 1878 1889 1960 1971 2037 2081 2162 2221 2275 2282 2312 2377 2404 2440 2467 2495 2631 2640 2641 2653 2674 2706 2768 2772 2843 2856 2915 2929 2973 3034 3039 3048 3066 3082 3107 3132 3161 80 202 522 562 579 662 1664 1743 2020 2105 2117 2671 TAGCGG/CCGCTA 1 -5 93 78 18 -8.3 119 153 389 468 511 538 593 679 738 757 780 817 837 871 978 1000 1003 1010 1089 1098 1130 1173 1259 1269 1334 1362 1382 1455 1498 1521 1583 1592 1593 1607 1648 1653 1684 1711 1722 1734 1767 1774 1783 1797 1862 1884 1923 1956 1963 1971 1985 2034 2044 2047 2051 2088 2100 2110 2111 2114 2207 2211 2285 2329 2334 2343 2356 2402 2408 2439 2481 2488 2508 2571 2595 2612 2613 2654 2677 2684 2700 2742 2770 2824 2845 2887 2924 2940 2981 3027 3114 3129 3153 35 113 290 293 550 860 947 968 969 974 1029 1119 1257 1779 2275 2395 2416 2457 CCGTGG/CCACGG 3 -4 76 78 19 -7.9 14 36 131 139 204 289 314 325 406 417 470 496 532 545 559 560 598 644 663 709 718 733 914 918 931 978 1132 1235 1254 1282 1302 1331 1334 1356 1359 1398 1432 1568 1586 1594 1657 1704 1710 1775 1853 1858 1872 1978 2029 2102 2136 2208 2226 2317 2361 2404 2526 2527 2605 2617 2650 2681 2712 2723 2741 2776 2777 2831 2837 2849 2861 2897 2960 3106 3145 3176 74 345 471 744 745 1246 1433 1507 1564 1636 1686 1754 1795 2069 2154 2368 2496 2525 2604 CCCGCC/GGCGGG 0 -2 80 77 11 -11.6 18 52 166 249 270 274 286 318 330 372 460 584 607 715 770 881 945 961 1022 1108 1148 1191 1216 1260 1334 1339 1407 1419 1477 1479 1483 1582 1603 1618 1648 1658 1738 1770 1995 2011 2050 2057 2064 2082 2110 2182 2235 2262 2272 2278 2316 2390 2395 2408 2452 2496 2545 2587 2622 2624 2630 2650 2767 2796 2814 2823 2828 2878 2911 2920 2921 2931 2961 2985 3005 3008 3025 3089 3156 3179 21 772 1092 1305 1901 1989 2008 2241 2272 2528 2532 ACGCGG/CCGCGT 1 -5 70 69 9 -11.1 23 145 151 172 214 314 333 348 363 388 577 592 760 772 796 877 1027 1087 1091 1102 1230 1260 1290 1348 1365 1407 1434 1439 1551 1604 1617 1630 1642 1666 1705 1817 1922 1934 1958 1987 1994 1998 2049 2137 2195 2201 2208 2248 2275 2279 2316 2354 2356 2457 2565 2582 2652 2657 2699 2718 2775 2783 2849 2864 2946 2947 2956 3071 3079 3159 138 148 455 1033 1039 1139 1213 1664 2477 AGCGGG/CCCGCT 1 -4 60 66 8 -11.0 23 74 95 114 126 169 172 234 245 256 403 424 468 473 509 524 656 685 738 819 884 909 935 951 1130 1153 1158 1172 1193 1209 1327 1352 1397 1531 1684 1687 1753 1783 1849 1884 1985 2100 2140 2191 2329 2456 2559 2601 2671 2675 2705 2796 2824 2900 2908 2950 3058 3068 3100 3166 102 290 466 779 2318 2367 2408 2560 TCGCGG/CCGCGA 1 -5 77 64 8 -10.6 180 239 302 357 404 453 525 624 632 687 711 780 834 890 943 1083 1085 1108 1145 1249 1338 1353 1384 1386 1431 1432 1462 1465 1485 1493 1625 1669 1776 1829 1832 1838 1842 1882 1916 1999 2017 2049 2053 2058 2109 2175 2177 2196 2235 2284 2297 2343 2381 2424 2440 2478 2503 2504 2570 2581 2592 2604 2621 2643 2675 2709 2738 2747 2803 2806 2831 2882 2898 2949 2989 3035 3101 411 622 661 2279 2516 2535 2618 2641 CGCGGT/ACCGCG 1 -4 72 61 8 -9.9 60 145 214 239 314 333 363 385 536 693 760 943 945 1036 1083 1085 1230 1260 1277 1290 1386 1439 1462 1564 1590 1630 1642 1778 1817 1829 1830 1842 1845 1870 1916 1943 1958 1967 1998 1999 2042 2049 2053 2063 2109 2113 2175 2208 2275 2354 2381 2440 2453 2495 2516 2550 2551 2558 2647 2652 2699 2728 2747 2864 2949 2969 2989 3018 3045 3101 3148 3169 138 148 152 1139 1608 1664 2057 2671 CGCGGA/TCCGCG 1 -4 60 59 12 -7.3 23 151 302 348 357 495 577 632 687 834 877 943 1027 1120 1145 1194 1338 1353 1365 1434 1540 1551 1561 1590 1604 1624 1625 1705 1842 1845 1966 2049 2063 2113 2118 2181 2200 2279 2297 2343 2390 2457 2478 2495 2582 2621 2647 2660 2675 2710 2775 2830 2882 2916 2946 2947 3035 3038 3074 3145 411 622 677 916 1039 1513 1608 2279 2516 2618 2641 2671 GCGGCC/GGCCGC 1 -3 46 55 13 -6.1 0 100 364 555 606 679 780 821 920 1039 1087 1091 1094 1109 1382 1408 1536 1543 1624 1682 1766 1872 1945 2020 2122 2214 2316 2409 2463 2475 2504 2639 2661 2753 2778 2820 2859 2861 2887 2899 2949 2956 2994 3007 3079 3109 71 893 1033 1100 1406 1584 1954 2029 2057 2371 2381 2460 2627 GGTGCG/CGCACC 1 -6 59 54 14 -5.5 61 65 85 145 169 228 239 390 522 532 557 606 717 780 819 862 909 927 1023 1103 1285 1381 1462 1528 1561 1664 1726 1786 1814 1947 1988 2010 2041 2078 2095 2118 2125 2167 2249 2371 2397 2417 2434 2471 2647 2678 2773 2794 2840 2873 2934 2953 2964 2986 3025 3052 3088 3151 3160 221 294 543 764 1040 1583 1852 1873 2260 2265 2557 2582 2644 2657 CGCCTG/CAGGCG 0 0 60 51 13 -5.3 166 187 188 324 346 390 467 498 715 721 786 788 797 864 915 945 975 1131 1221 1417 1436 1449 1477 1508 1577 1654 1660 1770 1787 1863 1886 1896 1915 2010 2046 2076 2256 2275 2319 2359 2395 2415 2416 2588 2632 2649 2719 2773 2820 2843 2867 2952 2985 3070 3089 3129 3132 3151 3155 3157 485 1305 1397 1776 1817 2215 2222 2227 2267 2276 2284 2331 2468 CCGCGG/CCGCGG 1 -5 44 51 6 -9.0 23 25 385 495 536 693 943 945 955 1049 1094 1120 1148 1194 1540 1543 1590 1624 1778 1830 1845 1870 1943 1966 1967 1973 2063 2113 2118 2200 2390 2495 2502 2558 2647 2710 2728 2830 2916 3018 3074 3148 3162 3169 677 1513 1608 2057 2381 2671 CAGGCG/CGCCTG 2 -4 60 51 13 -5.3 166 187 188 324 346 390 467 498 715 721 786 788 797 864 915 945 975 1131 1221 1417 1436 1449 1477 1508 1577 1654 1660 1770 1787 1863 1886 1896 1915 2010 2046 2076 2256 2275 2319 2359 2395 2415 2416 2588 2632 2649 2719 2773 2820 2843 2867 2952 2985 3070 3089 3129 3132 3151 3155 3157 485 1305 1397 1776 1817 2215 2222 2227 2267 2276 2284 2331 2468 GTAGCG/CGCTAC 1 -6 57 50 14 -4.8 119 121 289 331 388 400 511 600 672 679 757 761 780 818 849 978 1098 1130 1269 1299 1362 1382 1449 1521 1590 1593 1607 1653 1711 1719 1774 1783 1850 1956 1963 1996 2044 2047 2051 2110 2194 2207 2285 2356 2457 2571 2613 2633 2677 2704 2742 2887 2940 3027 3040 3104 3153 244 550 642 969 1037 1119 1202 1779 1825 2084 2123 2395 2457 2532