#3827/3827 #16.47 # k-mer/r.c. Cluster Offset PosCt wPosCt NegCt HGP_10 GGTGGT/ACCACC 0 -1 416 390 129 -33.7 74 86 87 96 104 105 106 129 130 135 140 146 158 160 166 169 170 175 186 187 189 192 197 204 205 212 213 218 221 223 229 230 235 257 258 260 263 265 275 291 292 293 302 303 312 316 317 318 324 325 334 338 345 346 349 367 368 392 395 397 407 434 435 441 442 449 452 453 459 461 471 472 483 487 488 491 496 499 500 501 508 514 525 527 534 537 538 546 553 555 557 562 570 572 575 581 592 605 612 621 628 639 640 642 644 648 659 666 670 676 678 703 716 729 741 750 751 781 791 816 818 820 831 843 852 855 863 866 868 875 881 885 891 899 918 923 927 929 954 957 964 974 979 980 987 993 1040 1044 1049 1057 1065 1067 1078 1080 1087 1088 1102 1113 1118 1122 1126 1127 1137 1143 1153 1157 1158 1165 1183 1191 1195 1198 1207 1218 1232 1237 1244 1245 1264 1283 1284 1295 1312 1316 1318 1319 1320 1324 1341 1343 1348 1355 1357 1366 1367 1384 1385 1390 1423 1424 1425 1426 1436 1440 1441 1452 1468 1474 1478 1480 1490 1499 1504 1506 1515 1516 1519 1521 1536 1544 1565 1575 1590 1601 1617 1623 1624 1626 1638 1662 1663 1665 1679 1683 1699 1701 1704 1710 1737 1749 1771 1785 1786 1793 1797 1803 1807 1808 1817 1818 1831 1870 1874 1881 1882 1884 1898 1926 1928 1929 1938 1943 1948 1972 1989 2000 2017 2040 2041 2048 2055 2077 2080 2083 2094 2098 2099 2116 2133 2164 2176 2179 2181 2184 2185 2187 2207 2216 2219 2224 2232 2245 2274 2292 2310 2370 2371 2375 2389 2419 2421 2422 2431 2464 2471 2503 2511 2516 2523 2533 2541 2550 2554 2556 2558 2597 2631 2651 2652 2669 2699 2702 2728 2730 2732 2738 2748 2749 2763 2782 2787 2795 2802 2837 2860 2861 2862 2878 2894 2905 2918 2943 2979 2983 3004 3016 3018 3019 3043 3044 3080 3083 3106 3109 3132 3151 3165 3180 3181 3196 3197 3222 3256 3257 3271 3286 3294 3298 3303 3319 3321 3333 3334 3350 3359 3360 3363 3376 3390 3391 3402 3414 3435 3444 3460 3463 3472 3485 3513 3518 3519 3526 3530 3539 3551 3563 3569 3570 3578 3583 3584 3588 3602 3605 3650 3684 3690 3704 3726 3727 3759 3760 3773 3774 3795 3816 46 51 134 152 184 212 251 311 323 342 376 415 416 458 553 560 623 807 848 863 906 912 925 942 988 1036 1044 1056 1064 1195 1201 1277 1357 1391 1392 1411 1432 1451 1457 1466 1483 1489 1506 1514 1550 1552 1595 1598 1666 1672 1799 1890 1906 1907 1913 1931 1959 2000 2022 2042 2073 2119 2157 2176 2177 2247 2250 2284 2315 2317 2348 2357 2362 2364 2405 2418 2421 2422 2471 2501 2503 2522 2526 2545 2555 2560 2570 2613 2751 2764 2773 2785 2795 2827 2888 2889 2890 3053 3074 3087 3095 3149 3157 3158 3162 3163 3184 3185 3220 3238 3248 3254 3273 3274 3276 3281 3484 3509 3540 3551 3553 3563 3569 3625 3637 3658 3763 3802 3803 CGGTGG/CCACCG 0 -2 304 285 93 -25.0 74 96 114 115 118 135 138 169 170 174 175 191 192 196 204 205 213 218 221 223 231 235 246 257 258 260 263 265 275 291 292 298 303 319 326 333 334 338 369 374 379 392 397 399 410 416 449 452 453 461 471 480 483 487 499 500 527 530 534 537 538 545 547 554 555 557 562 570 572 578 579 589 592 624 639 642 644 645 648 660 663 664 672 687 702 703 710 729 738 741 745 746 751 770 780 787 825 831 844 852 856 857 858 866 873 875 881 894 915 927 929 964 968 970 974 980 993 1019 1033 1057 1063 1064 1067 1078 1085 1087 1088 1113 1118 1120 1122 1127 1128 1137 1139 1165 1182 1183 1191 1207 1218 1233 1243 1244 1245 1275 1279 1283 1318 1319 1324 1341 1342 1344 1357 1363 1364 1366 1369 1379 1384 1392 1413 1478 1515 1521 1525 1541 1550 1565 1572 1575 1597 1614 1617 1623 1638 1649 1662 1671 1687 1701 1729 1738 1749 1804 1808 1817 1818 1831 1853 1875 1884 1894 1929 1943 1945 1946 1979 2000 2045 2055 2083 2104 2130 2141 2143 2176 2179 2185 2197 2198 2201 2207 2216 2218 2289 2292 2324 2375 2381 2390 2397 2425 2442 2505 2506 2511 2528 2536 2541 2550 2592 2596 2610 2623 2639 2655 2680 2763 2766 2767 2779 2787 2798 2802 2844 2866 2880 2896 2937 2943 2957 2987 2988 3004 3016 3030 3042 3061 3080 3081 3116 3127 3129 3151 3159 3180 3181 3185 3222 3286 3294 3298 3302 3312 3313 3319 3330 3331 3333 3334 3363 3383 3389 3391 3486 3496 3526 3530 3544 3548 3551 3579 3588 3599 3627 3666 3726 3727 3750 3759 3761 3762 4 98 152 183 184 213 219 252 258 279 323 415 458 538 552 560 594 595 906 940 1036 1064 1195 1201 1286 1312 1357 1392 1393 1483 1488 1489 1493 1514 1520 1527 1597 1598 1637 1666 1672 1762 1882 1905 1906 1907 1909 1913 1947 1959 2022 2073 2087 2099 2104 2189 2217 2348 2352 2415 2421 2440 2467 2631 2743 2751 2763 2764 2781 2785 2789 2795 2888 2972 3043 3076 3087 3111 3156 3163 3185 3208 3274 3281 3298 3299 3332 3384 3549 3553 3658 3680 3802 ACCATG/CATGGT 2 -1 156 285 80 -29.5 1 2 12 15 16 17 25 26 32 42 43 45 46 47 56 57 60 68 76 79 85 97 105 106 112 113 126 146 169 170 175 189 194 237 240 241 254 255 258 270 300 322 327 362 382 383 435 441 446 456 496 506 553 643 662 666 673 691 701 745 746 773 790 799 806 807 828 855 873 880 885 891 913 971 1032 1063 1101 1128 1193 1197 1211 1217 1226 1241 1385 1415 1449 1457 1469 1518 1552 1581 1617 1693 1695 1716 1895 1906 1910 1911 1988 2048 2073 2086 2091 2129 2170 2199 2229 2283 2364 2402 2412 2428 2437 2474 2475 2560 2682 2701 2703 2791 2797 2916 2938 2951 2961 2999 3106 3107 3108 3119 3191 3198 3361 3426 3427 3428 3496 3534 3540 3556 3557 3568 3620 3672 3703 3719 3731 3732 3733 3735 3736 3744 3769 3804 108 117 246 311 327 342 415 427 437 548 579 611 718 722 727 734 741 933 1021 1080 1172 1190 1444 1593 1595 1616 1679 1680 1689 1694 1696 1698 1701 1756 1757 1827 1834 1890 1891 2048 2073 2075 2122 2208 2227 2257 2282 2311 2325 2365 2409 2555 2632 2685 2712 2761 2843 2948 2962 3016 3020 3055 3062 3127 3192 3227 3230 3326 3354 3448 3452 3453 3457 3488 3497 3513 3543 3619 3695 3707 CGGCGG/CCGCCG 0 -2 247 242 56 -30.0 21 22 23 58 105 106 156 157 161 169 170 186 187 196 204 218 220 261 269 284 290 302 304 315 320 324 326 337 364 397 402 467 471 472 483 503 509 530 556 562 568 570 572 573 575 583 585 605 614 625 637 642 645 659 660 677 699 700 705 716 723 729 738 751 781 789 825 831 844 858 870 873 882 885 887 900 922 963 979 980 1030 1051 1058 1073 1078 1080 1087 1088 1091 1115 1127 1139 1155 1163 1164 1173 1220 1227 1229 1233 1234 1244 1253 1280 1283 1284 1296 1299 1318 1319 1324 1329 1336 1341 1344 1367 1379 1414 1484 1492 1509 1513 1519 1525 1530 1561 1615 1670 1702 1722 1783 1804 1812 1820 1821 1851 1894 1896 1913 1914 1936 1937 1955 1964 1998 2011 2040 2041 2042 2054 2055 2077 2082 2083 2113 2125 2141 2153 2163 2197 2209 2237 2248 2271 2321 2324 2357 2375 2383 2388 2401 2431 2432 2443 2453 2454 2455 2464 2466 2506 2511 2538 2546 2550 2568 2605 2622 2626 2663 2664 2718 2730 2732 2769 2787 2802 2844 2861 2869 2871 2880 2881 2901 2902 2913 3042 3043 3044 3082 3086 3091 3098 3099 3111 3138 3139 3159 3223 3224 3253 3298 3319 3330 3331 3338 3363 3385 3391 3414 3419 3431 3441 3452 3482 3497 3526 3553 3594 3597 3629 3651 3652 3684 3701 3738 3739 3785 31 130 183 184 252 271 278 299 320 345 352 415 416 842 884 1018 1027 1064 1099 1140 1329 1360 1483 1527 1536 1551 1560 1597 1747 1959 2091 2202 2218 2287 2291 2307 2392 2406 2440 2462 2490 2617 2681 2930 2939 2976 3008 3014 3040 3086 3283 3291 3333 3554 3750 3764 GGTGGC/GCCACC 0 -1 218 228 76 -19.6 9 10 11 27 118 140 169 170 191 204 205 221 223 229 230 231 235 243 258 263 265 275 289 291 298 303 305 319 324 326 336 345 365 377 378 392 399 407 461 473 487 515 516 527 530 537 547 554 572 581 605 614 624 663 664 672 675 684 687 720 729 731 745 746 747 750 751 782 787 825 833 876 894 904 968 974 980 986 993 1010 1019 1033 1057 1059 1067 1078 1091 1118 1120 1137 1182 1191 1218 1243 1273 1274 1284 1301 1343 1363 1365 1366 1367 1392 1413 1435 1464 1478 1480 1488 1504 1515 1519 1547 1550 1581 1597 1614 1623 1624 1641 1662 1704 1711 1715 1739 1749 1776 1827 1828 1875 1966 1971 1972 1973 1974 1979 2003 2015 2017 2055 2060 2174 2185 2198 2218 2245 2247 2292 2308 2324 2375 2390 2424 2431 2442 2506 2533 2541 2554 2597 2664 2669 2713 2777 2779 2798 2802 2822 2848 2866 2878 2880 2896 2943 2999 3042 3043 3044 3061 3110 3114 3116 3132 3159 3222 3225 3237 3256 3257 3330 3331 3333 3334 3345 3350 3363 3371 3372 3389 3421 3491 3544 3551 3588 3599 3612 3629 3643 3650 3652 3659 3750 3759 3761 3762 3780 3807 32 64 98 183 184 219 221 251 252 259 265 279 290 363 476 593 679 682 865 940 956 958 1036 1064 1167 1312 1357 1405 1483 1488 1597 1598 1608 1765 1796 1905 1909 1916 2112 2159 2176 2177 2217 2266 2362 2419 2440 2467 2524 2632 2637 2673 2684 2771 2965 2986 3014 3020 3040 3072 3076 3157 3163 3208 3226 3281 3298 3299 3382 3384 3553 3554 3611 3761 3809 3812 GGCGGT/ACCGCC 0 -4 217 219 62 -22.6 27 58 74 86 87 96 114 115 129 130 135 138 169 170 174 175 191 204 205 218 223 235 257 258 260 263 265 266 275 298 315 324 326 331 333 334 338 342 345 392 397 430 444 449 451 461 471 483 484 487 495 499 500 511 527 530 537 538 555 562 568 570 572 573 575 583 589 645 646 660 677 687 703 729 741 745 746 751 780 825 831 873 876 885 887 894 899 900 927 964 974 980 993 1019 1057 1067 1070 1078 1080 1127 1136 1137 1141 1191 1220 1233 1243 1244 1255 1296 1310 1318 1319 1344 1366 1367 1369 1382 1466 1500 1515 1614 1615 1649 1659 1687 1702 1709 1749 1766 1815 1851 1853 1890 1913 1972 1998 2008 2009 2011 2045 2055 2109 2125 2141 2175 2185 2186 2197 2256 2292 2324 2375 2378 2397 2401 2425 2432 2453 2454 2455 2456 2472 2496 2503 2506 2511 2568 2605 2609 2622 2626 2664 2680 2787 2866 2880 2881 2901 2902 2913 2932 2947 3004 3016 3030 3042 3043 3044 3086 3091 3111 3151 3159 3180 3181 3222 3240 3241 3298 3312 3313 3330 3331 3385 3389 3391 3419 3441 3490 3496 3551 3659 3684 3701 3807 3820 64 117 130 183 184 230 271 321 345 352 364 415 416 452 458 459 522 557 595 764 845 884 906 961 1064 1357 1527 1536 1597 1598 1731 1750 1785 1836 1882 1905 2001 2073 2074 2467 2477 2523 2530 2763 2764 2888 2982 3008 3156 3163 3185 3278 3281 3283 3291 3298 3299 3403 3553 3623 3686 3687 CGGAGG/CCTCCG 1 -3 235 219 66 -21.1 58 105 106 114 115 118 145 146 156 169 170 174 175 186 187 188 198 201 221 223 242 258 259 260 266 275 290 303 304 324 334 338 384 391 429 434 441 457 458 459 464 472 473 501 516 526 527 554 569 581 589 591 595 605 606 614 615 620 627 649 697 727 729 738 770 781 815 823 846 873 875 894 970 976 979 1005 1006 1031 1075 1091 1102 1137 1198 1208 1218 1227 1228 1236 1243 1284 1301 1304 1315 1323 1326 1343 1348 1409 1423 1424 1451 1461 1478 1561 1564 1583 1584 1587 1590 1601 1612 1624 1637 1643 1646 1670 1683 1697 1698 1728 1729 1734 1739 1740 1742 1750 1762 1765 1783 1786 1804 1812 1816 1841 1875 1894 1971 2007 2012 2013 2023 2030 2035 2038 2104 2133 2134 2161 2165 2186 2188 2201 2237 2238 2286 2292 2321 2357 2361 2375 2381 2383 2389 2390 2396 2430 2431 2464 2506 2538 2548 2587 2615 2631 2664 2776 2787 2803 2823 2824 2825 2865 2871 2880 2896 2907 2958 2963 3007 3049 3082 3095 3101 3116 3118 3123 3125 3126 3132 3162 3185 3201 3210 3222 3223 3225 3256 3257 3294 3300 3318 3319 3322 3333 3334 3350 3366 3413 3452 3466 3491 3524 3564 3574 3594 3633 3701 3706 3729 3731 3732 3759 3785 3787 3814 154 191 278 303 364 415 428 584 804 907 940 995 1027 1140 1205 1243 1308 1329 1392 1515 1528 1536 1646 1666 1771 1772 1775 1781 1838 1847 1891 1906 1947 2002 2023 2176 2177 2291 2313 2405 2421 2440 2444 2473 2594 2616 2617 2623 2630 2645 2743 2786 2976 3082 3101 3184 3185 3194 3277 3348 3395 3439 3611 3623 3659 3733 GCGGTG/CACCGC 0 -3 218 214 59 -22.7 74 86 87 96 114 115 129 130 135 138 169 170 174 175 191 204 205 212 218 221 223 257 258 260 262 263 265 266 275 284 298 303 319 326 331 333 334 338 345 361 367 368 379 392 397 399 449 451 461 471 483 484 487 499 500 527 530 537 538 545 547 555 562 570 572 573 575 583 589 639 645 646 660 687 703 729 745 746 751 780 787 825 831 873 875 881 885 894 925 927 964 974 980 993 1019 1033 1057 1067 1078 1118 1127 1137 1191 1200 1220 1233 1243 1244 1269 1283 1318 1319 1344 1364 1366 1369 1382 1413 1420 1462 1500 1517 1533 1534 1575 1638 1649 1659 1687 1701 1710 1738 1749 1766 1808 1815 1851 1853 1884 1895 1896 1972 1979 1998 2000 2011 2039 2045 2055 2125 2130 2141 2185 2197 2218 2271 2292 2324 2375 2378 2396 2397 2423 2425 2432 2492 2506 2511 2536 2605 2609 2622 2625 2664 2668 2680 2727 2787 2844 2865 2866 2880 2896 2947 2956 2984 2987 2988 3002 3004 3016 3030 3042 3043 3044 3086 3116 3127 3151 3159 3185 3222 3298 3312 3313 3389 3391 3454 3462 3496 3514 3551 3659 3666 3684 3701 3714 3726 52 98 164 178 183 184 230 252 415 458 459 595 884 906 933 1064 1286 1312 1392 1514 1527 1597 1598 1646 1672 1836 1882 1905 1906 1907 1947 2001 2073 2074 2228 2348 2467 2603 2707 2743 2764 2795 2798 2888 3156 3163 3185 3225 3236 3281 3298 3299 3552 3553 3623 3658 3680 3749 3802 GCGGAG/CTCCGC 1 -4 198 190 58 -18.2 58 86 87 105 106 114 115 116 118 141 156 174 186 187 188 201 221 259 260 275 290 303 304 320 321 324 326 343 401 429 434 441 457 458 472 473 501 516 547 554 556 557 569 588 589 595 606 614 615 628 637 659 667 684 697 705 714 729 738 750 781 815 823 846 860 874 894 976 979 1058 1075 1091 1096 1137 1141 1173 1191 1210 1229 1236 1253 1284 1323 1369 1423 1424 1453 1478 1484 1519 1530 1533 1534 1561 1562 1583 1612 1620 1646 1670 1739 1740 1762 1765 1783 1796 1804 1812 1816 1822 1850 1875 1894 1916 1917 1918 1923 1956 1964 1966 1971 1999 2003 2023 2042 2065 2083 2111 2133 2163 2218 2237 2264 2265 2267 2286 2321 2324 2357 2375 2383 2389 2430 2451 2453 2454 2455 2464 2506 2538 2615 2654 2664 2730 2731 2763 2776 2871 2880 2896 2950 2958 2963 3042 3082 3098 3099 3111 3116 3132 3138 3139 3201 3210 3223 3256 3257 3283 3300 3319 3333 3334 3367 3431 3452 3466 3524 3526 3551 3553 3594 3629 3692 3701 3706 3729 3759 3785 31 125 191 256 299 303 364 415 671 690 863 871 907 1027 1140 1234 1242 1260 1329 1399 1406 1412 1515 1536 1620 1629 1774 1781 1847 1959 2023 2083 2143 2187 2202 2234 2291 2462 2464 2474 2580 2617 2637 2743 2888 2939 3000 3040 3148 3185 3303 3348 3375 3395 3413 3599 3623 3803 GGCGGC/GCCGCC 0 -1 161 167 42 -19.5 21 22 23 58 94 156 157 161 184 188 196 201 210 220 246 261 291 302 324 325 326 337 467 472 483 503 509 510 554 570 572 575 605 614 630 642 660 664 699 700 721 722 723 729 808 837 844 858 885 887 952 964 979 980 1051 1061 1080 1087 1088 1102 1114 1115 1155 1227 1229 1244 1253 1280 1283 1284 1296 1318 1329 1336 1341 1367 1379 1414 1444 1484 1509 1525 1603 1614 1626 1670 1715 1722 1771 1807 1808 1812 1820 1821 1880 1936 1937 1955 2077 2082 2141 2153 2169 2209 2223 2238 2271 2321 2359 2375 2384 2388 2431 2443 2464 2466 2506 2511 2541 2546 2550 2557 2568 2641 2663 2664 2682 2715 2750 2768 2787 2802 2817 2826 3043 3044 3061 3086 3138 3139 3170 3179 3224 3225 3253 3256 3257 3338 3363 3421 3431 3477 3497 3524 3597 3651 3669 3706 3738 3739 3806 174 183 184 271 278 279 320 415 416 475 491 1031 1099 1140 1167 1360 1483 1519 1545 1551 1597 1598 2091 2218 2287 2307 2392 2406 2440 2490 2930 2976 3015 3333 3384 3414 3469 3488 3607 3683 3706 3812 GCGGCG/CGCCGC 0 -3 172 160 46 -16.5 58 94 156 157 161 183 188 191 196 201 261 262 276 284 291 302 306 315 320 324 326 337 364 385 472 483 484 509 510 530 556 562 568 570 572 575 605 614 625 642 660 664 677 699 700 723 729 737 752 780 833 885 887 914 952 964 979 980 1037 1061 1062 1080 1081 1087 1088 1114 1115 1129 1155 1163 1164 1221 1227 1229 1244 1253 1280 1283 1284 1296 1298 1299 1318 1336 1367 1414 1444 1484 1509 1522 1530 1550 1561 1644 1670 1734 1756 1771 1804 1812 1820 1821 1851 1936 1937 1945 1955 2006 2042 2082 2141 2153 2169 2197 2209 2248 2271 2321 2324 2340 2357 2375 2390 2432 2443 2464 2511 2538 2546 2550 2568 2663 2664 2725 2746 2768 2787 2802 2844 2869 2880 2901 2902 2956 3043 3044 3082 3086 3138 3139 3143 3223 3319 3330 3331 3338 3346 3347 3431 3477 3482 3497 3550 3553 3572 3583 3584 3594 3629 3669 3706 3785 183 184 202 252 271 278 320 364 415 416 475 638 688 842 982 1030 1099 1140 1279 1427 1483 1527 1551 1560 1597 2091 2218 2255 2287 2406 2440 2462 2477 2546 2930 2976 3015 3018 3019 3202 3333 3494 3530 3683 3706 3764 GGGTGG/CCACCC 0 -2 98 115 37 -10.8 9 10 11 27 158 186 187 292 302 325 331 353 354 395 407 434 441 491 494 501 508 553 614 678 720 731 747 808 1049 1059 1104 1109 1110 1121 1137 1198 1237 1245 1309 1327 1435 1452 1456 1464 1480 1525 1603 1657 1662 1704 1731 1785 1797 1827 1828 1875 1882 1954 2080 2098 2099 2180 2220 2221 2417 2471 2485 2523 2533 2554 2652 2689 2730 2732 2737 2760 2782 2794 2795 2979 3110 3133 3371 3372 3421 3460 3463 3496 3518 3519 3530 3563 3573 3579 3583 3584 3659 3772 13 19 32 53 153 185 221 416 445 613 655 802 963 1299 1384 1405 1416 1550 1608 1632 1809 1853 2042 2166 2214 2362 2418 2545 2576 2826 2827 3020 3143 3295 3298 3304 3551