#1499/1499 #5.75 # k-mer/r.c. Cluster Offset PosCt wPosCt NegCt HGP_10 GAGGAG/CTCCTC 5 -2 172 178 53 -18.4 11 26 41 43 53 54 60 82 92 93 97 98 102 104 112 116 120 123 127 129 132 143 145 164 170 173 181 190 195 196 201 217 229 236 260 268 276 286 290 291 300 301 316 337 354 355 358 360 361 374 384 387 389 390 410 418 420 429 434 444 458 474 475 480 482 487 489 496 500 514 545 563 570 572 577 580 583 585 586 602 603 605 614 633 649 651 657 659 665 668 677 681 685 711 713 717 752 759 765 771 774 779 824 843 847 848 849 854 855 858 859 866 891 899 914 927 928 933 944 959 965 979 990 994 995 996 1000 1017 1020 1021 1057 1083 1084 1092 1124 1133 1142 1152 1156 1160 1164 1170 1177 1178 1183 1195 1206 1225 1230 1241 1263 1312 1313 1315 1331 1337 1351 1352 1353 1354 1357 1362 1381 1382 1397 1414 1437 1457 1465 1466 1480 1481 18 49 65 82 177 183 301 309 310 333 334 345 365 366 390 410 421 532 627 691 699 831 860 861 915 926 952 962 979 982 986 1002 1015 1044 1053 1098 1150 1155 1158 1183 1187 1210 1217 1250 1265 1322 1342 1375 1378 1379 1384 1431 1478 GTGGTG/CACCAC 0 -1 154 163 54 -14.9 4 17 23 26 38 39 41 44 49 51 56 59 66 68 69 78 81 118 126 131 132 142 153 200 211 216 230 234 236 238 240 243 244 245 252 257 273 279 282 286 308 309 358 362 368 371 374 391 392 396 408 418 423 430 434 444 463 470 492 493 495 497 500 503 505 515 519 521 530 533 534 538 569 570 583 585 588 598 599 608 611 613 614 621 639 640 641 648 651 658 662 663 666 673 684 685 693 694 712 713 715 731 738 753 764 773 775 797 798 801 841 844 845 846 860 880 882 888 901 906 963 967 976 977 985 993 1014 1045 1048 1059 1060 1085 1087 1115 1116 1124 1130 1155 1238 1239 1248 1254 1256 1263 1273 1335 1336 1337 1341 1357 1384 1398 1475 1497 40 114 213 253 264 292 302 336 337 353 366 413 433 477 490 532 535 536 547 617 627 644 657 659 696 711 717 727 820 837 873 884 951 1008 1073 1081 1109 1134 1186 1187 1223 1247 1255 1313 1326 1344 1366 1432 1445 1452 1454 1465 1466 1490 GGTGGT/ACCACC 0 -2 152 157 45 -16.9 7 17 23 26 42 43 44 46 49 51 56 59 68 69 78 81 118 120 125 129 132 148 153 216 217 230 237 240 244 245 252 258 263 278 282 286 309 335 336 362 371 374 391 418 423 430 434 435 439 444 450 470 486 487 493 497 505 515 530 534 538 565 569 570 583 585 595 599 608 611 613 621 630 640 641 646 647 651 658 662 663 666 673 684 693 694 712 713 715 730 731 738 753 773 797 798 817 841 845 858 862 863 882 901 905 906 914 924 925 965 966 967 976 977 985 986 987 993 1014 1041 1045 1048 1059 1060 1085 1086 1090 1115 1116 1124 1127 1130 1159 1247 1254 1261 1273 1306 1335 1336 1337 1341 1357 1367 1368 1373 1415 1427 1444 1450 1467 1496 213 214 215 253 315 320 333 366 433 490 535 536 565 587 617 627 657 659 663 671 717 727 734 754 820 884 982 1008 1061 1088 1109 1116 1134 1175 1187 1197 1255 1313 1326 1358 1366 1399 1419 1452 1490 GGAGGA/TCCTCC 5 -3 152 156 51 -14.5 20 26 29 41 43 44 67 72 91 97 102 104 112 116 123 129 132 145 170 171 173 181 190 193 217 220 223 229 236 247 286 300 301 305 337 352 358 374 378 387 398 400 401 404 407 418 420 429 434 458 462 465 482 489 491 505 509 514 520 545 561 567 570 575 577 580 585 588 611 633 649 651 657 668 677 678 681 685 691 706 711 713 771 774 779 799 817 843 847 848 849 859 862 863 891 905 912 914 927 928 965 990 994 995 996 1014 1017 1020 1021 1027 1048 1054 1057 1083 1084 1092 1102 1115 1124 1133 1146 1160 1164 1170 1177 1184 1190 1195 1206 1212 1213 1233 1241 1263 1274 1275 1311 1315 1352 1353 1354 1357 1362 1385 1400 1416 1422 1423 1437 1457 1489 1490 16 49 54 74 177 179 215 216 281 333 334 345 366 390 410 421 431 514 534 558 627 645 699 726 770 828 831 860 861 882 933 943 962 986 988 1015 1050 1052 1053 1155 1186 1187 1240 1250 1265 1322 1378 1384 1399 1407 1447 CGGTGG/CCACCG 0 -3 149 153 31 -22.0 7 14 20 23 43 46 51 56 68 69 96 116 120 125 132 156 190 217 219 225 237 241 258 263 279 280 282 286 306 322 336 340 346 355 362 368 371 387 392 404 411 412 418 422 423 424 430 434 435 456 481 485 486 495 505 508 513 515 534 536 538 548 556 565 570 575 580 595 608 610 613 621 646 647 649 658 673 675 677 679 681 686 693 694 701 715 731 736 743 744 745 760 761 789 798 834 836 845 848 849 850 858 862 863 865 878 905 906 921 924 925 960 964 966 967 976 977 990 993 997 1001 1002 1014 1045 1048 1054 1057 1081 1082 1086 1090 1103 1104 1127 1142 1148 1203 1217 1247 1261 1285 1291 1306 1341 1362 1390 1437 1482 1496 20 101 112 195 214 216 320 385 409 490 565 587 595 627 727 734 736 754 767 820 861 924 965 1093 1187 1377 1381 1419 1461 1478 1479 GTGGAG/CTCCAC 5 -2 138 142 27 -21.4 11 20 26 38 39 43 49 53 54 60 88 91 97 100 129 132 160 173 191 217 225 229 248 258 263 275 280 286 300 323 346 350 352 354 358 374 381 387 392 404 405 406 409 418 436 456 458 481 495 503 513 532 534 536 548 561 564 568 569 573 575 585 614 645 646 647 649 658 665 677 681 701 712 713 726 736 757 760 761 779 788 799 805 806 842 843 844 845 848 849 857 879 887 889 908 951 985 986 987 997 998 999 1012 1048 1054 1057 1072 1083 1084 1097 1103 1104 1128 1137 1148 1178 1212 1213 1247 1253 1254 1255 1263 1283 1285 1289 1290 1291 1341 1354 1394 1395 1402 1417 1430 1437 1482 1497 16 62 96 260 295 346 409 430 518 627 648 684 717 741 770 901 907 930 942 964 1095 1187 1255 1349 1366 1378 1479 ACGGTG/CACCGT 0 -4 121 126 35 -14.1 6 7 46 51 56 68 69 80 95 96 100 101 116 117 132 179 190 205 217 219 223 227 257 266 269 270 280 286 288 306 329 336 342 349 355 368 371 392 423 430 431 432 458 464 490 500 505 506 508 513 515 536 548 563 566 576 580 605 613 620 642 646 647 649 658 672 675 677 681 695 701 715 731 732 743 747 755 760 761 766 767 795 801 824 834 845 854 885 890 905 921 960 979 990 1001 1002 1014 1045 1054 1062 1073 1075 1086 1095 1096 1103 1104 1123 1148 1169 1176 1207 1243 1254 1278 1279 1291 1306 1309 1402 1437 33 112 231 288 320 333 360 365 366 385 409 421 490 565 587 595 725 727 737 767 809 832 861 1230 1255 1258 1263 1284 1291 1297 1322 1325 1419 1478 1479 TGGAGG/CCTCCA 5 -1 116 119 38 -11.5 4 14 20 26 43 49 60 67 91 97 104 116 129 132 160 173 181 192 216 217 219 220 225 229 248 258 263 292 300 310 352 354 358 374 388 404 405 406 407 409 418 420 456 458 473 482 491 500 503 520 536 548 561 564 575 577 585 609 611 633 644 646 647 649 651 658 681 689 713 779 799 809 823 843 845 848 849 903 974 985 990 1014 1048 1054 1083 1084 1088 1089 1146 1171 1184 1206 1212 1213 1228 1257 1258 1263 1289 1290 1291 1311 1315 1341 1354 1402 1413 1437 1444 1457 1462 1484 1485 1489 1490 1497 16 47 51 74 177 215 216 390 430 501 627 645 658 697 717 770 799 836 853 907 942 943 962 964 983 988 995 1015 1050 1052 1069 1143 1174 1186 1187 1349 1358 1407 CCACGT/ACGTGG 2 -3 104 112 29 -13.4 11 29 38 39 41 43 53 54 57 60 65 80 81 85 136 145 148 149 151 172 181 188 201 215 221 231 232 236 237 244 245 247 248 250 258 264 349 359 393 400 401 409 411 412 452 476 478 485 492 544 553 554 561 568 584 617 619 620 666 697 704 709 710 752 760 761 768 769 770 778 788 790 800 801 805 810 846 851 856 867 868 871 913 922 982 985 991 1022 1028 1029 1045 1087 1108 1113 1233 1236 1281 1354 1370 1406 1428 1451 1472 1474 16 36 38 62 194 232 234 408 430 492 579 643 692 764 770 820 864 901 1075 1092 1110 1184 1223 1246 1305 1325 1404 1419 1490 GGTGGA/TCCACC 0 -2 109 111 34 -11.3 20 26 49 60 84 88 91 97 173 190 193 217 225 241 263 275 280 285 286 358 362 380 387 392 404 408 418 422 456 495 502 503 505 513 534 536 548 556 569 570 575 580 585 595 598 599 614 618 639 645 646 647 649 658 677 679 681 701 712 713 731 736 743 744 745 760 761 775 779 788 799 800 834 844 848 849 882 887 934 942 986 987 990 997 1048 1054 1057 1097 1103 1104 1111 1124 1128 1133 1148 1154 1183 1217 1241 1254 1283 1285 1291 1341 1362 1390 1429 1437 1497 67 89 131 213 362 385 409 529 583 627 644 684 691 693 717 820 831 861 924 942 964 965 1023 1027 1187 1232 1255 1288 1307 1313 1366 1378 1478 1479 GATGGT/ACCATC 8 0 116 111 35 -11.0 18 19 21 23 51 78 91 112 118 136 153 186 187 195 196 251 271 272 352 354 360 361 373 394 456 470 497 519 524 530 552 568 570 576 592 593 611 630 632 672 676 682 683 691 692 713 714 715 731 732 736 738 763 764 781 782 788 794 816 841 865 894 915 916 927 928 943 956 957 959 965 967 986 987 1003 1004 1014 1055 1071 1085 1118 1152 1154 1159 1176 1178 1182 1190 1223 1224 1241 1245 1246 1261 1270 1272 1325 1326 1332 1335 1336 1349 1355 1356 1367 1368 1385 1412 1424 1425 1430 1438 1456 1461 1464 1478 58 215 239 259 299 334 347 393 467 497 525 535 537 590 611 630 653 741 749 814 844 863 936 992 1000 1083 1098 1113 1285 1307 1396 1416 1431 1440 1461 AGGAGG/CCTCCT 5 -1 108 110 30 -12.6 17 48 52 57 60 75 76 97 102 104 112 116 123 128 129 143 145 170 173 189 190 199 201 217 229 236 286 300 301 316 321 337 358 387 418 420 429 434 436 480 545 563 570 577 580 582 585 633 645 649 651 657 668 677 681 685 713 714 717 734 735 771 779 814 843 847 848 849 859 891 914 927 928 933 959 965 979 990 1020 1021 1027 1092 1124 1133 1153 1164 1170 1183 1190 1206 1272 1284 1315 1337 1352 1353 1354 1357 1362 1413 1414 1416 1427 1455 1457 1458 1465 1466 49 177 179 281 282 333 334 366 410 421 431 562 649 699 750 755 861 902 982 1015 1053 1116 1155 1322 1366 1378 1379 1381 1399 1447 GCTGCT/AGCAGC 1 -2 103 108 32 -11.4 8 29 36 42 55 71 87 116 119 127 135 154 155 157 188 204 240 263 265 276 278 284 287 304 305 325 339 344 346 350 354 357 359 373 385 386 389 390 393 426 427 436 452 454 460 462 478 496 503 523 534 556 559 566 588 601 610 631 655 697 701 705 746 768 769 784 785 798 811 818 837 838 842 855 857 861 894 929 935 945 946 955 980 1003 1004 1102 1127 1135 1136 1142 1161 1172 1173 1208 1226 1323 1324 1357 1379 1438 1471 1484 1485 9 160 196 213 406 413 524 532 621 646 729 755 816 826 885 924 931 965 1150 1156 1192 1210 1215 1231 1238 1270 1317 1358 1369 1378 1444 1478 CGGAGG/CCTCCG 0 -3 104 107 18 -17.6 29 65 71 72 102 104 126 132 143 161 175 193 208 211 216 217 223 247 275 282 301 305 308 310 341 358 396 398 400 401 409 420 435 462 487 489 505 509 537 561 567 569 590 595 615 622 634 635 657 660 673 678 685 691 696 701 711 712 730 774 779 799 803 815 823 862 863 865 878 891 905 912 914 960 994 995 996 1048 1049 1050 1057 1058 1092 1102 1115 1116 1124 1129 1132 1158 1160 1177 1206 1241 1274 1275 1280 1370 1385 1403 1404 1412 1423 1437 49 274 410 587 751 764 828 831 860 882 963 986 1136 1187 1265 1418 1441 1470 GCCACG/CGTGGC 2 -4 99 104 33 -10.2 11 38 39 57 60 65 80 86 88 96 104 131 133 151 172 198 201 215 227 231 232 234 237 247 248 250 264 289 349 399 407 409 411 412 414 416 417 441 442 444 455 471 472 492 508 528 552 553 554 568 584 619 620 677 746 768 769 770 790 793 800 805 810 812 814 844 856 867 868 913 922 971 982 1022 1025 1028 1029 1041 1057 1087 1093 1094 1128 1132 1158 1207 1219 1233 1236 1243 1270 1281 1311 1370 1406 1417 1428 1451 1474 85 151 232 234 254 274 333 413 453 492 556 579 692 747 764 770 901 1089 1110 1151 1170 1184 1186 1203 1246 1305 1314 1325 1370 1378 1404 1419 1470 CGGCGG/CCGCCG 0 -3 102 103 21 -15.0 21 25 40 43 86 108 120 206 223 231 232 263 268 277 279 301 348 362 376 385 396 405 406 414 424 434 437 438 447 448 478 487 489 507 537 538 568 598 611 617 627 646 647 677 685 693 694 716 727 730 732 738 740 744 745 765 774 778 786 799 803 814 845 862 863 877 897 904 905 937 963 991 997 998 999 1033 1034 1041 1057 1074 1076 1095 1096 1107 1111 1116 1124 1129 1148 1155 1163 1177 1180 1199 1200 1228 1253 1281 1291 1293 1436 1452 133 134 151 213 303 379 410 580 587 595 743 828 832 965 1076 1136 1222 1260 1302 1303 1402 GGTGGC/GCCACC 0 -2 94 100 24 -12.9 18 19 23 26 29 51 59 96 116 123 156 158 191 192 236 240 275 279 282 301 306 310 311 317 322 329 340 345 346 355 368 386 411 412 424 426 436 451 456 470 481 485 495 497 508 530 531 533 534 538 544 569 595 597 610 621 639 640 641 648 673 675 686 693 715 730 731 771 789 811 850 865 878 921 930 960 964 990 1001 1002 1081 1082 1115 1116 1124 1130 1142 1203 1292 1335 1336 1362 1385 1482 20 40 101 114 117 195 292 303 304 320 460 595 627 699 767 809 1073 1093 1103 1158 1440 1461 1466 1487 TCCACG/CGTGGA 2 -4 93 99 20 -14.5 37 43 65 82 105 117 120 145 148 149 151 181 188 191 233 246 248 256 258 265 269 300 318 348 350 354 372 374 381 389 390 400 401 411 412 436 441 442 452 458 464 476 481 500 544 546 549 561 568 645 653 654 665 666 695 709 710 716 757 760 761 789 801 842 845 851 857 871 889 905 912 913 966 985 998 999 1018 1019 1051 1054 1078 1085 1132 1144 1178 1244 1247 1253 1354 1408 1417 1451 1472 16 36 62 92 232 260 408 430 435 500 578 579 891 901 931 1075 1092 1305 1325 1387 CGCCGT/ACGGCG 4 -4 99 99 19 -15.0 18 19 43 70 80 86 106 120 136 137 161 206 228 231 232 246 318 348 376 385 396 405 406 410 424 437 438 440 450 461 489 507 518 548 551 555 556 576 589 611 616 617 622 650 662 677 685 693 694 698 727 738 744 745 778 786 800 809 821 822 901 902 907 937 973 991 998 999 1022 1025 1051 1077 1102 1116 1147 1148 1155 1164 1174 1175 1180 1184 1221 1234 1235 1247 1253 1286 1291 1312 1313 1337 1365 1370 1381 1382 1406 1436 1456 85 115 151 156 228 410 612 665 723 765 766 830 990 993 1044 1302 1368 1402 1468 GCGGTG/CACCGC 0 -4 96 97 17 -15.6 20 21 23 30 31 43 57 58 81 110 120 225 237 241 249 263 279 282 322 362 386 418 422 424 434 435 437 438 445 446 456 481 493 495 513 530 536 570 575 592 608 610 616 646 647 649 658 660 673 679 681 686 691 693 694 736 738 784 785 814 817 848 849 865 878 897 924 925 934 938 952 953 964 993 1041 1049 1050 1058 1072 1075 1081 1082 1102 1112 1127 1142 1166 1185 1227 1254 1301 1316 1317 1411 1413 1420 107 195 262 453 465 587 598 627 681 727 820 942 965 1187 1222 1231 1478 GACGGA/TCCGTC 6 -3 94 93 24 -11.3 48 65 104 114 135 140 141 143 161 165 173 193 211 216 273 280 282 287 288 290 291 305 310 337 338 347 378 384 392 431 460 482 497 509 510 513 552 569 571 592 598 633 676 688 701 709 710 715 725 726 731 772 806 807 814 862 863 870 896 905 907 912 930 952 953 997 1022 1031 1065 1066 1076 1093 1094 1122 1136 1220 1234 1235 1278 1279 1282 1283 1285 1309 1320 1321 1337 1385 1390 1421 1423 1452 1493 1494 26 34 109 134 215 232 545 581 603 622 627 698 788 1021 1076 1083 1149 1236 1240 1294 1322 1400 1429 1439 AGCTGC/GCAGCT 1 -3 86 92 24 -11.1 8 21 28 29 42 48 79 87 110 117 135 143 146 157 159 177 184 191 195 196 204 265 266 274 276 304 305 307 325 339 346 350 373 383 385 424 465 471 472 474 475 544 564 566 572 601 610 631 672 697 705 746 768 769 772 795 802 811 857 901 904 911 920 935 945 946 955 998 999 1000 1079 1136 1142 1153 1209 1212 1213 1228 1379 1384 1400 1413 1416 1430 1439 1454 133 160 489 524 593 622 632 816 821 826 893 1040 1066 1150 1187 1192 1210 1270 1304 1317 1358 1452 1462 1478 GAGCCA/TGGCTC 3 -3 87 92 28 -9.6 11 12 29 38 39 41 58 71 81 88 109 120 133 135 156 163 174 197 214 231 232 242 299 306 346 366 375 377 379 502 504 533 558 571 579 588 591 611 639 640 641 650 661 662 691 720 721 736 751 774 800 801 808 825 841 896 914 915 916 971 981 982 994 1027 1028 1029 1042 1043 1057 1078 1079 1081 1082 1130 1133 1142 1182 1244 1255 1280 1299 1300 1409 1417 1434 1455 1487 180 193 221 304 345 375 405 532 627 661 666 692 724 754 777 809 855 969 1077 1151 1208 1294 1404 1440 1466 1478 1480 1490 TGCTGC/GCAGCA 1 -3 86 90 23 -11.1 0 15 23 28 55 106 116 127 154 155 177 225 240 263 278 279 282 284 287 306 332 337 340 344 357 359 386 393 394 414 418 419 421 426 436 454 462 466 478 509 510 534 556 559 575 588 598 610 634 635 674 697 730 784 785 814 818 837 838 845 852 855 885 894 897 922 929 931 932 980 991 1032 1091 1127 1130 1135 1161 1206 1226 1271 1332 1337 1417 1438 1471 1483 9 196 213 307 408 413 447 532 646 660 712 729 747 755 821 885 924 1186 1187 1192 1215 1238 1452 ACGGAG/CTCCGT 6 -2 88 90 26 -9.9 5 29 50 65 99 104 123 135 140 141 161 175 193 211 212 213 216 282 288 290 291 305 310 330 331 336 337 436 460 496 505 509 543 563 569 582 583 586 590 592 615 617 622 660 678 691 709 710 725 731 782 799 806 809 814 815 823 830 831 862 863 887 896 897 905 907 912 930 994 1006 1007 1022 1057 1058 1076 1100 1122 1136 1177 1206 1241 1285 1370 1385 1390 1412 1493 1494 26 49 134 142 215 232 275 486 545 565 661 663 698 764 765 788 800 854 861 882 910 945 1021 1294 1322 1429 GGCGGT/ACCGCC 0 -5 87 89 18 -13.2 21 23 43 47 57 58 70 81 86 98 108 120 131 151 206 250 263 264 277 323 362 379 418 424 434 437 438 456 483 484 493 495 505 530 532 536 570 585 632 646 647 658 660 673 693 694 738 778 788 814 830 831 848 849 862 863 865 878 897 904 934 938 952 953 963 967 998 999 1041 1058 1095 1096 1127 1170 1180 1185 1189 1205 1210 1211 1227 1253 1254 1301 1411 1413 1420 107 195 213 303 455 498 598 708 743 929 965 1136 1187 1231 1260 1402 1470 1484 CGACGG/CCGTCG 6 -4 91 89 29 -8.6 6 48 51 56 80 101 121 142 162 180 205 250 282 288 290 291 369 370 384 405 406 450 496 498 499 533 562 569 571 589 592 606 607 642 643 649 681 688 709 710 712 725 731 754 760 761 765 772 786 807 814 852 872 881 890 891 896 905 912 950 952 953 997 1001 1002 1022 1044 1065 1066 1095 1096 1103 1104 1136 1138 1155 1221 1241 1247 1278 1279 1285 1301 1337 1338 1339 1351 1383 1402 1437 1457 26 35 101 109 134 151 215 231 293 385 490 565 580 603 612 698 727 767 771 884 990 1021 1240 1255 1263 1294 1427 1428 1429 CGTCGT/ACGACG 4 -4 88 88 29 -8.4 20 51 61 88 89 121 134 142 148 185 226 251 267 288 309 325 327 330 336 366 384 392 405 406 415 419 428 433 441 442 450 479 498 499 529 530 548 550 555 556 566 587 592 618 638 649 681 702 703 711 786 814 824 852 872 881 888 890 891 898 912 921 950 955 965 966 1001 1002 1017 1073 1086 1091 1095 1096 1119 1120 1129 1135 1136 1147 1221 1271 1285 1311 1379 1384 1396 1479 38 48 101 109 113 116 151 215 231 293 325 436 515 565 612 646 727 737 816 920 931 990 1013 1123 1260 1265 1288 1345 1419 GACGGC/GCCGTC 6 -3 82 86 18 -12.4 6 18 19 56 59 70 80 92 93 106 127 153 246 263 264 269 333 334 348 359 383 385 388 405 406 439 440 450 461 464 476 486 494 496 498 499 507 514 531 548 555 562 606 607 616 643 693 712 725 763 765 786 804 806 872 891 901 902 950 967 1022 1025 1042 1043 1044 1080 1088 1089 1131 1138 1145 1147 1155 1164 1177 1221 1247 1291 1320 1321 1351 1357 35 115 151 156 168 276 366 435 516 607 612 990 993 1060 1225 1378 1402 1428 GCTGCA/TGCAGC 1 -2 78 83 19 -11.3 0 8 12 21 22 23 28 55 117 146 177 184 194 204 244 245 268 274 320 337 340 343 348 357 360 361 386 421 456 474 475 481 495 520 544 547 553 554 564 572 672 674 686 772 796 802 845 852 857 859 880 885 897 904 911 920 955 980 998 999 1032 1033 1034 1042 1043 1118 1153 1209 1212 1213 1271 1332 1384 1400 1430 1454 1456 1483 58 133 253 359 408 593 622 712 826 934 1036 1040 1066 1162 1192 1224 1452 1462 1467 GAGCTG/CAGCTC 3 -3 78 82 27 -7.9 9 10 32 33 42 48 79 87 90 135 143 159 176 195 196 214 226 265 284 305 315 324 346 383 387 424 445 446 474 475 496 515 521 525 534 566 572 583 585 618 689 746 797 887 935 945 946 950 955 995 996 998 999 1000 1006 1007 1017 1024 1031 1062 1065 1066 1081 1082 1142 1154 1177 1227 1251 1289 1290 1352 1353 1375 1379 1384 1439 1492 3 228 275 276 297 362 465 531 617 627 685 913 933 939 1015 1068 1109 1150 1187 1210 1211 1236 1305 1369 1400 1444 1478 TGACGG/CCGTCA 6 -4 77 80 19 -10.6 46 51 55 92 93 104 114 121 137 140 141 143 150 161 165 173 180 226 250 258 264 270 273 299 305 310 329 333 334 388 392 423 440 482 486 490 497 508 509 513 548 567 633 676 680 693 715 726 731 758 806 834 901 902 905 912 930 934 936 967 1042 1043 1108 1164 1177 1234 1235 1254 1281 1282 1283 1291 1306 1309 1421 1493 1494 27 234 236 262 276 409 421 516 545 581 583 627 641 708 993 1107 1322 1441 1479 CCACGA/TCGTGG 2 -3 78 79 21 -9.5 17 37 44 78 82 105 117 126 131 133 135 138 139 151 227 234 257 265 309 354 381 389 390 392 436 441 442 444 455 495 519 623 638 645 653 654 695 716 746 793 810 842 844 867 868 888 889 913 969 970 971 972 1040 1041 1059 1060 1078 1113 1132 1144 1151 1207 1218 1243 1253 1260 1270 1272 1286 1311 1314 1322 1341 1365 1380 1384 1493 1494 40 66 151 260 302 435 442 453 460 500 556 643 716 747 822 850 857 1055 1149 1378 1387 CTGCTG/CAGCAG 1 -1 74 77 23 -8.3 15 28 29 44 55 87 92 93 116 127 135 188 240 263 278 279 284 287 306 340 357 386 414 418 436 454 462 466 478 534 536 575 601 612 697 701 707 708 730 734 735 837 838 852 855 857 892 893 894 897 918 929 951 958 980 1003 1004 1014 1091 1102 1115 1127 1130 1135 1142 1161 1206 1271 1306 1357 1416 1438 1471 1482 9 196 213 408 413 456 480 621 646 649 755 821 885 1150 1186 1187 1215 1270 1321 1344 1354 1378 1478 CAACGT/ACGTTG 2 -3 76 77 24 -8.0 3 80 85 99 119 128 180 184 194 201 205 215 221 226 251 264 280 296 297 307 314 327 359 366 382 420 423 426 463 476 490 492 512 519 530 531 533 588 615 620 625 633 636 657 688 722 723 748 789 790 800 801 860 898 935 944 947 955 990 991 1058 1073 1136 1146 1171 1197 1199 1200 1229 1236 1243 1293 1373 1383 1460 1463 62 91 105 231 308 332 333 418 471 489 580 633 634 706 714 733 787 1032 1033 1203 1352 1455 1475 1491 CGGCGT/ACGCCG 4 -4 73 76 14 -12.1 15 47 52 55 135 136 137 161 162 171 246 277 282 288 298 375 416 417 450 461 515 518 529 548 551 555 556 576 577 596 623 627 639 662 665 694 697 698 711 716 725 744 745 751 794 821 822 873 902 979 998 999 1010 1025 1077 1080 1103 1104 1129 1135 1185 1234 1235 1250 1286 1291 1312 1313 1331 1370 1406 1412 1431 97 115 151 156 413 607 623 631 661 740 830 832 1147 1240 GCATCG/CGATGC 9 -2 78 76 16 -11.1 11 13 14 32 61 98 115 167 168 187 274 282 289 308 367 381 397 407 423 426 441 442 463 479 500 529 540 565 583 584 594 616 739 746 749 791 792 811 830 831 874 875 881 885 938 994 1015 1016 1017 1055 1074 1083 1084 1106 1121 1163 1166 1176 1189 1203 1216 1233 1243 1248 1250 1343 1367 1368 1378 1391 1392 1394 1395 1410 1426 1448 1477 1497 131 141 222 302 523 583 688 884 893 1140 1175 1238 1246 1262 1429 1467 AGACGG/CCGTCT 6 -4 75 75 20 -9.1 65 73 80 85 153 158 193 211 216 246 263 280 286 287 305 337 338 359 378 429 430 431 432 458 461 476 482 505 510 515 531 552 584 616 624 679 686 701 709 710 747 756 763 804 862 863 907 910 945 946 979 990 1031 1073 1075 1076 1080 1088 1089 1093 1094 1110 1122 1131 1145 1220 1232 1320 1321 1344 1345 1385 1423 1493 1494 34 40 115 156 168 233 365 607 622 788 860 929 1083 1230 1236 1297 1378 1400 1402 1415 AGGTGG/CCACCT 0 -3 71 74 21 -8.5 17 26 49 59 60 97 129 153 209 216 217 236 275 278 286 321 335 351 374 380 386 391 436 444 451 487 495 533 538 544 565 569 585 599 611 618 645 648 649 651 684 713 730 771 779 781 799 811 814 817 934 942 965 985 986 987 997 1048 1097 1116 1124 1159 1183 1254 1337 1357 1373 1415 1427 1467 1497 64 117 215 297 315 362 583 663 699 884 908 964 982 1088 1109 1116 1255 1288 1313 1333 1487 GGCGGA/TCCGCC 0 -2 70 73 16 -10.4 25 32 47 120 126 179 201 211 217 223 256 268 275 279 282 301 311 328 358 385 396 402 405 406 409 447 448 455 462 478 487 489 507 537 567 598 611 617 632 673 685 694 716 730 732 772 774 779 791 792 803 865 937 997 1048 1076 1083 1084 1111 1115 1116 1124 1134 1155 1163 1177 1214 1293 1385 1452 232 303 410 465 517 580 587 655 670 1076 1136 1157 1184 1381 1395 1402 GCGGCG/CGCCGC 1 -2 71 73 17 -9.9 25 40 52 70 108 116 120 167 168 219 223 225 231 232 263 267 268 277 279 301 354 362 414 434 468 487 489 537 538 572 573 627 639 673 685 693 716 727 730 732 740 765 778 799 845 904 905 997 1010 1041 1046 1047 1074 1103 1104 1107 1111 1124 1129 1139 1161 1177 1180 1199 1200 1206 1228 1250 1281 1293 1477 133 134 151 152 379 580 587 595 661 740 832 965 1136 1184 1186 1302 1303 CAGTGG/CCACTG 0 -3 69 71 22 -7.5 6 18 19 28 45 59 66 74 90 103 108 118 194 215 236 251 273 292 298 328 340 378 414 457 470 477 536 547 578 588 610 624 642 643 655 671 673 702 703 734 735 741 801 806 824 843 880 885 891 915 916 926 929 954 981 1012 1046 1047 1139 1196 1238 1239 1335 1336 1352 1353 1460 1489 1490 67 71 336 365 403 532 534 609 621 666 731 778 821 905 940 1004 1059 1102 1275 1454 1455 1490 AGGAGC/GCTCCT 3 -5 72 71 17 -9.5 11 26 41 100 112 116 132 144 163 170 214 260 268 290 291 315 340 352 373 387 389 390 429 445 446 468 474 475 488 496 500 563 583 622 662 729 752 806 818 836 841 866 872 888 898 917 938 995 996 1017 1041 1072 1133 1142 1152 1177 1189 1204 1206 1260 1280 1289 1290 1352 1353 1365 1396 1449 1455 1471 1479 1487 22 180 297 385 390 427 627 649 677 809 1044 1150 1210 1217 1241 1444 1478 AGGAGC/GCTCCT 5 -1 72 71 17 -9.5 11 26 41 100 112 116 132 144 163 170 214 260 268 290 291 315 340 352 373 387 389 390 429 445 446 468 474 475 488 496 500 563 583 622 662 729 752 806 818 836 841 866 872 888 898 917 938 995 996 1017 1041 1072 1133 1142 1152 1177 1189 1204 1206 1260 1280 1289 1290 1352 1353 1365 1396 1449 1455 1471 1479 1487 22 180 297 385 390 427 627 649 677 809 1044 1150 1210 1217 1241 1444 1478 GCTGCG/CGCAGC 1 -2 65 69 15 -9.9 15 106 116 159 191 195 196 208 219 225 240 259 266 276 279 281 282 306 307 310 332 369 370 384 385 386 394 399 424 426 466 483 484 508 510 575 598 656 730 750 752 772 795 837 838 869 909 922 964 980 1079 1091 1112 1123 1177 1206 1208 1259 1337 1342 1400 1413 1417 1436 1439 133 213 406 447 459 489 580 632 646 681 821 893 1151 1304 1402 CGGAGC/GCTCCG 3 -5 67 69 19 -8.2 5 25 29 32 42 79 109 120 136 170 212 213 241 270 288 305 308 337 385 470 489 496 536 563 572 579 582 583 646 647 689 718 740 791 792 815 844 887 896 897 935 950 955 1006 1007 1017 1039 1042 1043 1061 1081 1082 1110 1158 1177 1206 1285 1308 1346 1362 1379 1385 1403 1404 1407 1409 1434 3 274 275 285 326 465 661 663 714 766 836 846 855 861 1077 1157 1294 1369 1461 CACGAC/GTCGTG 2 -2 68 67 21 -7.0 3 17 29 37 51 56 61 78 82 126 151 265 309 331 354 389 390 392 428 435 441 442 444 495 510 519 550 623 653 654 678 711 754 773 793 810 873 888 889 913 1059 1060 1078 1090 1092 1129 1136 1151 1180 1210 1211 1218 1243 1270 1272 1282 1311 1314 1320 1321 1341 1365 1380 1384 1394 1395 1418 1419 65 66 234 317 435 436 460 556 565 632 643 716 734 845 920 991 1013 1082 1149 1265 1460 CCGTGG/CCACGG 0 -3 64 66 16 -8.8 86 96 104 120 124 191 192 198 227 289 300 318 348 350 404 414 416 417 436 441 442 464 471 472 481 500 520 521 528 537 552 586 601 677 679 685 692 695 800 845 905 912 913 963 998 999 1018 1019 1054 1057 1085 1128 1132 1136 1158 1207 1217 1219 1241 1244 1247 1408 1417 1436 85 92 237 254 274 333 494 578 650 661 663 860 1170 1370 1432 1470 ACCACG/CGTGGT 2 -4 64 66 15 -9.2 2 17 29 41 44 78 81 124 126 131 133 136 194 200 221 236 244 245 257 309 392 393 404 492 495 519 520 521 583 638 685 692 704 752 759 778 788 800 810 846 888 963 969 972 991 1045 1059 1060 1085 1108 1113 1136 1151 1248 1272 1286 1312 1313 1314 1322 1341 1380 1384 1497 40 302 413 460 494 661 663 716 820 822 952 1186 1223 1432 1452 CACGTC/GACGTG 2 -2 62 66 20 -7.2 9 10 25 43 70 90 107 127 148 149 151 172 179 188 210 231 232 244 245 258 326 400 401 405 406 409 410 452 485 505 507 523 550 551 561 571 584 705 725 728 791 792 801 851 865 898 913 985 988 989 991 1022 1026 1044 1045 1079 1354 1375 1396 1451 1453 1472 38 65 204 226 430 492 498 566 579 605 677 736 754 820 920 1022 1075 1199 1305 1325 CCGGTG/CACCGG 0 -4 66 65 19 -7.3 99 156 161 211 243 258 263 285 329 340 346 387 398 404 456 482 485 486 493 501 514 534 556 565 576 591 595 599 646 647 744 745 760 761 763 798 830 831 832 833 850 858 862 863 870 873 902 923 942 967 976 977 1026 1048 1057 1131 1203 1217 1250 1283 1285 1341 1342 1362 1390 1474 20 49 213 216 675 686 754 795 842 924 1044 1093 1186 1295 1377 1405 1447 1461 1467 GGCTGC/GCAGCC 1 -3 58 63 16 -8.1 22 36 58 71 116 146 188 194 208 240 246 253 254 259 277 281 310 320 369 370 384 387 389 390 399 452 456 460 481 503 508 520 686 730 750 752 796 798 845 852 859 869 880 964 1020 1021 1033 1034 1042 1043 1069 1158 1177 1259 1323 1324 1357 1436 58 274 459 479 621 681 682 934 1036 1151 1162 1378 1402 1444 1467 1470 ACGAGC/GCTCGT 3 -5 58 63 15 -8.6 13 33 45 55 81 87 88 106 109 122 134 135 144 162 165 195 196 214 220 226 287 290 291 302 322 324 504 566 618 659 722 723 743 746 768 769 787 793 800 867 868 871 887 920 945 946 981 998 999 1031 1035 1036 1121 1152 1177 1198 1384 1462 17 160 216 233 543 755 854 855 1055 1122 1210 1211 1218 1236 1400 CGAGCT/AGCTCG 3 -4 61 63 20 -6.6 9 10 33 55 87 99 107 109 143 144 162 226 234 265 276 290 291 294 324 394 424 515 517 553 554 566 568 616 618 659 662 672 722 723 744 745 746 768 769 789 877 887 945 946 950 998 999 1031 1035 1036 1075 1193 1194 1198 1209 1226 1262 1280 1307 1384 1400 35 179 276 319 348 423 501 531 854 855 1159 1175 1187 1210 1211 1218 1236 1341 1400 1402 CGTTCC/GGAACG 11 -1 61 63 11 -10.6 14 24 61 142 146 149 159 160 161 165 180 217 219 295 300 331 336 337 339 366 378 411 412 420 426 476 506 536 557 576 617 622 638 675 705 750 819 821 822 903 974 976 977 995 996 997 1032 1062 1123 1133 1165 1204 1310 1331 1370 1381 1382 1390 1431 1451 1496 12 109 321 485 544 565 579 580 588 983 1292 GGAGCA/TGCTCC 3 -4 63 62 18 -7.1 0 17 38 39 112 116 144 191 220 268 270 288 305 307 350 352 373 389 390 488 500 525 536 582 610 718 719 729 752 791 792 818 828 836 879 888 917 984 986 987 1017 1072 1110 1137 1179 1189 1204 1234 1235 1260 1268 1285 1304 1308 1346 1362 1394 1395 1396 1407 1409 1416 1471 102 195 197 285 385 390 455 741 769 930 948 1020 1044 1045 1055 1213 1225 1239 GGCGTT/AACGCC 4 -3 61 62 14 -8.8 44 55 110 111 132 135 136 137 142 161 162 185 203 295 298 391 404 450 457 529 551 627 694 697 698 717 744 745 751 784 785 852 873 902 906 933 979 1000 1010 1025 1031 1032 1041 1046 1047 1103 1104 1149 1187 1205 1234 1235 1237 1260 1286 1311 1329 1331 1359 1370 1496 115 151 251 318 561 631 658 674 741 751 832 1072 1159 1240 CCTTGC/GCAAGG 7 0 59 62 13 -9.3 2 30 31 45 65 119 136 140 141 145 153 159 181 200 209 210 220 303 340 359 464 465 474 475 479 557 575 717 734 735 756 766 767 779 804 844 862 863 873 877 939 972 1020 1021 1032 1130 1189 1196 1204 1226 1242 1243 1271 1277 1310 1315 1413 1437 1496 1 2 152 157 285 611 665 889 955 964 981 1262 1452 TCACGT/ACGTGA 2 -3 56 61 20 -6.2 9 10 29 85 92 93 119 128 142 149 178 180 203 207 209 210 251 280 439 453 455 478 505 537 541 550 551 584 605 636 689 704 707 708 725 726 752 768 769 771 799 828 854 864 898 902 947 991 997 1026 1070 1102 1110 1122 1165 1453 4 65 232 306 349 370 421 566 580 599 605 631 652 676 699 841 902 1033 1133 1460 TGGCGT/ACGCCA 4 -4 58 61 20 -6.2 20 48 85 89 110 111 182 212 213 221 235 249 256 279 281 288 304 333 334 356 391 399 404 504 514 516 542 549 653 654 697 698 718 720 721 733 784 785 811 824 889 906 970 990 1031 1041 1046 1047 1141 1162 1187 1237 1306 1311 1329 1460 1476 1496 95 251 328 453 561 595 684 741 751 780 809 942 978 1013 1031 1072 1170 1378 1432 1444 GAGGAC/GTCCTC 5 -2 61 61 19 -6.5 11 29 91 97 103 104 135 164 171 207 300 335 350 352 378 383 385 422 440 470 479 503 504 509 573 588 662 711 725 729 779 821 822 843 892 893 895 909 914 934 942 958 965 986 987 1048 1147 1184 1223 1224 1249 1271 1354 1357 1380 1407 1437 1448 1476 1489 1490 333 366 493 514 583 828 838 854 887 900 953 993 1050 1085 1254 1265 1378 1384 1463 CGCTGC/GCAGCG 1 -3 56 60 14 -8.3 12 28 55 57 103 119 146 162 194 219 244 245 246 268 276 340 343 354 360 361 386 418 427 449 461 483 484 495 496 523 534 547 553 554 610 655 656 701 712 842 861 909 980 1003 1004 1107 1118 1123 1172 1173 1208 1342 1428 1456 1484 1485 156 253 359 406 580 595 685 931 965 1156 1187 1224 1300 1369 CTGCCA/TGGCAG 1 -1 56 60 19 -6.3 14 18 19 21 28 30 31 48 79 86 91 113 118 188 246 312 329 332 340 372 374 378 414 419 471 472 485 534 547 553 554 568 610 730 768 769 790 805 814 837 838 885 1022 1028 1029 1069 1128 1130 1162 1228 1236 1264 1265 1335 1336 1495 52 173 329 336 344 413 479 481 591 595 747 788 901 1066 1103 1186 1203 1442 1453 CTGAGC/GCTCAG 3 -5 57 59 19 -6.1 52 66 68 69 73 89 91 114 152 188 206 229 276 319 325 340 359 367 376 380 457 491 504 533 561 563 589 591 612 625 631 661 685 691 766 767 804 805 808 905 914 982 1061 1062 1078 1079 1128 1142 1160 1204 1266 1269 1355 1356 1362 1379 1432 174 275 555 566 617 688 722 729 796 816 860 995 1042 1192 1404 1442 1452 1466 1478 GCGGCT/AGCCGC 1 -2 56 58 13 -8.3 47 62 65 79 110 116 128 132 227 266 312 315 332 339 376 391 424 447 448 483 484 493 523 527 566 601 625 632 634 635 677 729 730 737 740 750 783 784 785 823 845 959 1033 1034 1074 1079 1091 1277 1291 1293 1297 1307 1330 1406 1436 1488 320 485 682 740 1073 1109 1122 1136 1142 1156 1222 1245 1295 TCGAGC/GCTCGA 3 -5 58 58 13 -8.3 13 45 70 156 163 169 238 244 245 265 424 437 438 445 446 464 469 483 484 502 514 571 590 616 672 734 735 744 745 784 785 877 879 923 960 994 995 996 1075 1119 1120 1130 1138 1193 1194 1223 1224 1226 1262 1269 1270 1280 1299 1300 1307 1355 1356 1429 35 276 319 348 423 439 501 740 1002 1113 1159 1341 1480 GGCGGC/GCCGCC 0 -2 57 57 19 -5.7 40 65 108 128 143 225 227 231 232 236 263 268 301 362 376 414 447 448 480 487 527 538 573 627 673 677 685 693 706 715 727 740 765 778 799 845 861 905 991 1010 1041 1057 1074 1111 1124 1129 1139 1161 1180 1199 1200 1227 1291 1293 1307 1406 1436 133 134 151 320 379 453 485 525 587 595 832 1026 1122 1186 1222 1302 1303 1378 1401 GGCGGC/GCCGCC 1 -3 57 57 19 -5.7 40 65 108 128 143 225 227 231 232 236 263 268 301 362 376 414 447 448 480 487 527 538 573 627 673 677 685 693 706 715 727 740 765 778 799 845 861 905 991 1010 1041 1057 1074 1111 1124 1129 1139 1161 1180 1199 1200 1227 1291 1293 1307 1406 1436 133 134 151 320 379 453 485 525 587 595 832 1026 1122 1186 1222 1302 1303 1378 1401 CGGCTT/AAGCCG 4 -4 56 57 16 -6.8 21 27 40 56 65 74 86 96 132 137 189 190 269 315 355 420 424 473 486 498 499 511 527 552 553 554 561 615 729 732 754 786 804 814 823 856 918 921 959 1003 1004 1061 1081 1082 1088 1089 1123 1148 1277 1297 1330 1346 1369 1387 1406 1496 50 174 628 672 682 693 861 953 1064 1073 1075 1147 1175 1322 1434 1464 CGGTGT/ACACCG 0 -3 56 55 16 -6.4 43 58 81 95 100 110 179 211 285 372 394 397 432 453 456 458 500 506 527 556 576 591 649 652 658 660 732 736 747 757 758 795 817 818 824 830 831 854 870 885 964 1045 1049 1050 1073 1102 1185 1243 1245 1246 1254 1270 1301 1413 1420 1474 129 133 252 388 453 681 686 725 942 1156 1222 1231 1258 1288 1342 1467 CAGCGT/ACGCTG 4 -4 52 55 15 -6.8 12 22 55 84 119 125 145 152 162 167 168 189 219 225 239 244 245 261 262 267 344 423 428 449 553 554 565 571 589 625 656 705 736 759 784 785 842 909 942 1010 1013 1086 1118 1123 1145 1208 1253 1262 1338 1339 1378 1456 359 360 406 409 605 685 726 739 878 900 931 1156 1287 1419 1453 CGGTTG/CAACCG 0 -3 52 53 14 -6.8 21 47 55 70 85 98 131 186 189 204 214 258 277 292 298 299 356 459 547 589 624 656 668 738 747 752 773 813 824 826 827 860 934 963 980 1091 1107 1153 1170 1215 1217 1219 1234 1235 1248 1253 1276 1338 1339 1351 1359 1366 166 182 373 583 645 727 928 1136 1175 1262 1302 1427 1441 1470 CGACGT/ACGTCG 2 -3 51 53 17 -5.6 14 61 66 70 133 134 148 194 226 267 366 381 400 401 405 406 410 450 479 483 484 507 530 550 555 566 573 584 587 702 703 711 740 763 791 792 854 898 921 955 988 989 1044 1045 1058 1073 1075 1091 1196 1396 1496 24 38 113 116 325 489 566 605 646 665 747 920 928 1123 1265 1368 1455 GAGCAC/GTGCTC 3 -3 52 53 11 -8.1 0 27 52 87 152 157 172 236 251 266 267 269 302 312 428 478 483 484 488 525 527 582 637 685 729 752 770 783 803 834 861 879 899 963 984 995 996 1072 1103 1104 1110 1137 1160 1201 1202 1204 1266 1328 1384 1394 1395 1396 223 237 543 654 702 739 794 1044 1147 1432 1454 CCTCGT/ACGAGG 2 -3 54 52 17 -5.4 32 89 109 120 161 200 207 233 238 258 319 353 355 419 437 438 455 509 529 557 566 594 659 725 729 770 813 821 822 902 909 919 938 951 966 991 1010 1023 1035 1036 1063 1064 1147 1204 1230 1244 1288 1304 1311 1378 1414 1442 1443 1472 18 82 169 262 321 691 800 915 964 972 1042 1104 1246 1250 1315 1363 1464 CGAGCA/TGCTCG 3 -4 53 52 14 -6.6 13 25 45 70 92 93 122 134 135 238 265 322 428 445 446 469 478 483 484 550 551 770 784 785 787 800 871 879 923 981 995 996 1083 1084 1121 1136 1152 1176 1223 1224 1269 1283 1286 1315 1355 1356 1384 1390 1394 1395 1410 1429 1463 17 26 35 155 160 216 306 439 543 582 755 817 1455 1489 AGACCG/CGGTCT 12 -4 52 52 13 -7.0 3 5 47 100 111 124 150 212 213 250 273 296 297 486 501 517 528 578 589 634 635 664 679 712 755 783 802 825 826 827 862 863 900 903 904 917 926 954 1018 1019 1113 1144 1151 1218 1273 1278 1279 1297 1301 1348 1386 1413 210 216 231 303 583 603 604 651 913 962 1316 1453 1469 GAGGCG/CGCCTC 5 -2 48 51 13 -6.8 4 15 17 47 58 75 76 132 143 179 203 221 225 263 266 282 353 396 418 456 480 489 532 536 570 594 636 660 673 682 683 717 756 772 779 823 865 882 886 891 952 953 1000 1170 1257 1258 1260 1359 213 407 595 658 800 982 1136 1143 1159 1184 1187 1395 1441 GAAGGG/CCCTTC 10 0 53 51 13 -6.8 2 34 35 50 146 205 217 242 323 378 402 411 412 431 433 435 518 561 567 682 683 724 762 774 848 849 930 986 987 1035 1036 1093 1094 1107 1114 1133 1135 1163 1184 1191 1192 1222 1226 1227 1293 1302 1303 1371 1387 1394 1395 1437 1492 8 85 348 362 406 490 559 858 892 1038 1103 1236 1401 CCTTGG/CCAAGG 7 0 48 50 16 -5.4 1 26 59 77 83 107 123 135 136 156 178 263 283 312 343 351 405 406 517 523 545 573 584 640 641 695 725 748 778 851 856 861 865 906 1015 1016 1040 1078 1169 1251 1255 1387 1397 1403 1404 1413 1432 1455 74 296 407 516 521 619 738 741 789 809 894 927 1090 1116 1235 1436 GCTGCC/GGCAGC 1 -2 45 49 13 -6.3 48 57 58 79 103 110 143 146 162 246 253 254 277 387 414 418 419 424 449 461 465 471 472 509 534 610 712 730 814 901 931 932 971 991 1000 1020 1021 1069 1107 1130 1158 1228 1413 1416 1428 156 274 307 413 479 595 682 685 747 1186 1187 1300 1452 GAGCGA/TCGCTC 3 -3 46 49 9 -8.2 12 17 37 53 54 56 79 80 100 169 195 196 205 248 309 325 352 381 394 489 527 568 583 589 622 625 696 852 876 887 931 932 1003 1004 1039 1041 1061 1101 1152 1280 1346 1362 1367 1368 1384 1396 129 155 295 422 631 817 870 1157 1298 CAGGAG/CTCCTG 5 -2 50 49 12 -6.8 17 52 57 75 76 100 112 144 173 236 259 306 321 332 352 379 429 434 436 488 522 560 645 818 823 859 938 944 956 957 961 962 991 1110 1163 1199 1200 1231 1251 1271 1327 1362 1416 1449 1458 1471 1479 1487 1489 1490 112 179 390 408 627 649 755 762 770 902 931 1174 CACGGT/ACCGTG 0 -5 46 47 14 -5.5 56 86 95 96 117 227 336 355 356 360 361 416 417 441 442 464 500 578 601 613 642 672 679 701 766 767 801 845 904 905 921 960 963 984 1018 1019 1045 1054 1176 1207 1217 1241 1243 1309 1408 1418 26 112 237 243 333 360 494 650 657 1163 1284 1325 1432 1480 TCTGCC/GGCAGA 1 -2 46 47 14 -5.5 6 30 31 60 77 91 113 135 143 151 160 339 372 485 553 554 568 623 673 689 691 768 769 790 805 826 827 836 837 838 922 979 1022 1028 1029 1076 1103 1104 1183 1236 1264 1265 1358 1371 1417 1495 66 323 336 344 525 547 591 894 1103 1138 1143 1203 1442 1453 CCACGC/GCGTGG 2 -3 46 47 11 -6.8 2 43 88 170 194 200 233 246 256 269 281 372 399 437 438 458 506 508 546 549 583 665 757 759 789 798 812 844 857 871 889 913 934 966 1025 1051 1178 1248 1292 1312 1313 1314 1406 1417 1428 1497 413 609 891 931 952 1075 1089 1151 1186 1203 1314 TACGGA/TCCGTA 6 -3 46 47 15 -5.1 26 41 95 99 104 123 152 183 209 212 213 252 269 330 331 427 485 502 505 557 563 582 590 609 615 622 636 727 790 799 930 982 995 996 1138 1150 1177 1206 1236 1259 1285 1305 1327 1369 1370 1411 55 764 800 813 838 854 859 881 882 976 1020 1133 1361 1404 1453 CTGCCG/CGGCAG 1 -1 42 45 9 -7.3 5 6 103 105 143 151 162 185 236 253 254 277 316 339 387 434 461 509 610 659 697 715 729 826 827 836 843 861 890 901 922 931 932 971 991 1076 1103 1104 1107 1113 1158 1428 156 274 323 525 555 593 685 1138 1452 GGCGTC/GACGCC 4 -3 43 45 13 -5.5 20 85 171 235 249 277 279 282 288 348 416 417 431 548 555 556 576 577 623 639 665 695 718 733 821 822 824 852 882 935 974 990 998 999 1129 1135 1162 1215 1250 1306 1311 1412 1476 95 97 514 595 661 684 740 800 809 944 1013 1147 1170 AGCGGC/GCCGCT 1 -3 43 44 12 -5.7 62 79 84 108 110 120 185 312 316 339 354 391 414 428 434 468 493 495 523 525 539 572 639 685 697 716 729 783 823 857 922 997 1046 1047 1076 1105 1107 1177 1225 1241 1250 1477 1488 152 326 580 661 679 682 907 942 965 1136 1142 1156 CGGTGC/GCACCG 0 -3 44 43 13 -5.1 21 58 161 223 230 237 257 266 329 360 361 434 437 438 464 514 598 619 642 760 761 766 767 801 814 897 967 1026 1095 1096 1123 1168 1169 1227 1278 1279 1309 1316 1317 1342 1384 1390 1402 1444 49 231 288 472 587 598 842 1044 1230 1295 1325 1466 1467 CTGCGG/CCGCAG 1 -1 42 43 9 -6.8 4 5 62 72 116 195 196 208 219 225 240 279 282 328 332 424 461 575 632 649 689 730 837 838 869 880 964 980 983 1063 1064 1079 1091 1142 1167 1206 1217 1342 1371 1413 1416 1436 133 156 157 610 632 664 893 1304 1478 CGAGCC/GGCTCG 3 -4 41 43 10 -6.3 75 76 81 83 88 106 156 169 214 260 287 299 302 377 437 438 464 502 504 514 571 588 590 712 793 800 867 868 877 915 916 994 1130 1138 1299 1300 1342 1355 1356 1409 1462 221 233 276 428 532 740 754 1055 1122 1480 GTGAGC/GCTCAC 3 -5 40 42 14 -4.5 29 30 31 38 39 44 48 56 176 251 270 302 308 375 388 395 492 501 527 566 749 776 777 814 921 945 946 1058 1103 1104 1110 1182 1201 1202 1233 1375 1391 1392 1401 1407 63 169 221 232 292 295 297 631 766 839 999 1188 1198 1208 CTGCAC/GTGCAG 1 -1 40 41 13 -4.6 21 41 49 96 149 186 211 268 320 340 343 357 379 434 495 504 524 597 599 619 773 781 834 880 897 920 998 999 1032 1033 1034 1122 1155 1247 1271 1287 1296 1384 1454 1497 60 179 253 261 307 536 654 739 836 882 944 1162 1192 GGCGTG/CACGCC 4 -3 40 41 9 -6.3 52 75 76 89 182 221 246 256 281 288 304 333 334 399 447 448 504 516 542 549 619 662 665 711 725 794 857 889 913 1077 1185 1237 1250 1291 1312 1313 1314 1406 1431 1437 406 413 536 595 830 978 1031 1075 1259 GAGCGT/ACGCTC 3 -3 40 40 10 -5.6 6 44 67 88 130 163 170 212 213 244 245 288 337 378 487 492 573 579 583 662 734 735 746 860 879 892 893 1119 1120 1148 1178 1207 1269 1270 1289 1290 1305 1346 1442 1443 25 394 461 550 553 726 782 944 1160 1452 CGCGGC/GCCGCG 1 -3 36 39 7 -6.9 25 70 88 167 168 220 223 253 254 256 266 315 465 483 484 485 489 537 566 601 634 635 730 732 750 904 959 985 1033 1034 1103 1104 1228 1281 1315 1369 221 405 740 1073 1136 1295 1408 GGAGCG/CGCTCC 3 -4 37 38 7 -6.6 17 28 100 108 170 212 213 288 308 325 337 381 489 563 568 573 579 583 622 746 819 887 897 1003 1004 1039 1041 1046 1047 1061 1072 1148 1152 1206 1280 1346 1396 326 394 461 645 1136 1157 1470 CTGCGA/TCGCAG 1 -1 38 37 10 -5.0 6 74 224 225 295 296 297 306 307 354 369 370 384 386 477 510 598 610 746 752 772 795 808 966 974 1056 1086 1123 1133 1209 1220 1231 1250 1280 1337 1400 1439 1473 34 179 227 318 408 453 458 489 580 821 ACGTGC/GCACGT 2 -1 36 37 11 -4.6 70 90 107 134 172 176 218 277 295 405 406 439 455 478 524 553 554 560 571 697 704 705 709 710 752 771 799 898 1044 1070 1110 1143 1228 1375 1396 1406 36 102 275 369 421 541 699 729 754 864 1472 CTGCAG/CTGCAG 1 -1 36 36 4 -8.1 8 11 12 21 28 146 177 184 188 204 320 329 360 361 386 429 572 674 709 710 772 845 852 857 880 920 1209 1212 1213 1332 1373 1417 1429 1449 1456 1483 190 408 470 722 CCGCGT/ACGCGG 2 -3 34 36 3 -8.9 5 20 27 88 107 160 237 256 270 279 315 362 372 411 412 424 445 446 524 537 730 750 751 784 785 959 983 995 996 1102 1228 1281 1493 1494 588 740 820 CCTGCA/TGCAGG 1 -2 35 33 10 -4.1 11 41 49 149 153 186 188 280 329 379 426 429 434 597 599 658 773 781 812 991 1161 1181 1185 1205 1248 1251 1288 1296 1376 1383 1429 1433 1449 1461 1462 109 261 307 353 536 654 722 827 836 1379 GACGTC/GACGTC 2 -2 32 33 8 -4.9 67 102 134 242 381 387 395 431 450 479 483 484 555 566 577 587 702 703 711 740 741 763 872 921 1006 1007 1042 1043 1168 1274 1275 1496 38 251 325 646 754 1062 1265 1418 CCGAGC/GCTCGG 3 -5 32 33 6 -6.0 75 76 83 99 143 238 294 299 377 394 428 434 478 517 551 553 554 568 588 712 800 844 915 916 980 1083 1084 1136 1283 1390 1409 1463 133 532 582 754 1187 1402 CGAGCG/CGCTCG 3 -4 30 33 4 -7.3 12 45 79 80 88 130 163 169 195 196 244 245 314 434 734 735 743 844 860 927 928 960 980 1101 1119 1120 1177 1207 1270 1434 133 276 1002 1113 GCCGTA/TACGGC 4 -3 34 33 9 -4.5 6 43 62 86 234 339 424 437 438 496 506 589 592 611 638 694 758 770 907 921 991 998 999 1078 1081 1082 1102 1114 1148 1221 1337 1370 1381 1382 3 357 427 593 612 743 765 1075 1468 TGAGCG/CGCTCA 3 -4 30 31 6 -5.5 30 31 37 44 56 80 111 205 241 248 308 394 492 493 527 589 749 852 876 879 907 1061 1130 1172 1173 1269 1362 1379 1442 1443 553 631 816 907 1160 1452 CTGCGC/GCGCAG 1 -1 26 27 4 -5.7 28 106 119 138 139 153 157 219 266 332 429 456 656 897 922 940 941 971 997 1037 1038 1112 1161 1164 1177 1189 184 213 536 650 CGGCCT/AGGCCG 4 -4 23 26 5 -4.8 53 54 59 74 83 156 240 263 281 300 388 467 537 538 547 549 599 671 717 770 877 1183 1283 227 301 326 571 1026 CCCTGC/GCAGGG 1 -3 24 24 8 -3.0 11 28 41 68 69 86 166 171 340 523 846 852 971 1056 1063 1064 1113 1128 1181 1185 1210 1211 1429 1469 17 265 318 536 593 904 1221 1344 GCCTGC/GCAGGC 1 -3 22 23 6 -3.6 4 5 37 44 70 243 287 534 612 656 658 939 974 1037 1038 1140 1158 1161 1205 1237 1248 1280 274 722 788 827 1442 1492 GACCGC/GCGGTC 12 -3 23 23 2 -6.1 5 62 89 111 160 206 250 379 540 664 862 863 878 900 904 1172 1173 1180 1185 1273 1297 1365 1386 195 326