#1441/1441 #3.84 # k-mer/r.c. Cluster Offset PosCt wPosCt NegCt HGP_10 GTGGTG/CACCAC 0 -4 198 207 57 -23.2 11 13 21 22 24 25 26 28 32 34 49 54 69 70 73 78 80 81 82 86 96 109 115 120 131 134 135 142 174 182 191 192 204 206 208 211 215 216 218 219 227 228 229 231 232 234 237 254 256 261 269 275 277 283 287 296 297 315 325 333 343 346 354 365 370 374 376 377 380 383 387 389 398 400 402 407 420 423 424 425 441 442 449 465 474 478 487 494 506 513 515 533 542 548 553 554 562 564 567 603 610 611 616 617 619 637 640 651 656 677 696 710 715 716 737 739 743 750 751 755 756 767 770 795 818 835 844 847 851 873 876 883 884 896 898 902 905 906 917 919 920 932 944 947 948 949 952 955 972 973 985 994 1028 1037 1045 1050 1051 1058 1059 1065 1082 1084 1085 1086 1087 1090 1098 1103 1109 1124 1143 1178 1181 1182 1186 1188 1209 1238 1246 1247 1249 1260 1261 1269 1287 1298 1330 1338 1344 1360 1365 1371 1373 1379 1380 1403 1414 1432 36 95 102 244 250 263 271 277 307 308 358 362 399 401 436 475 588 594 602 640 727 733 761 763 765 789 792 801 806 827 889 913 930 936 950 1039 1043 1047 1059 1063 1084 1108 1109 1110 1116 1147 1161 1165 1224 1250 1259 1268 1309 1384 1401 1412 1440 AGGAGG/CCTCCT 6 -4 126 137 45 -12.8 3 7 23 28 48 49 54 58 59 69 73 78 92 104 109 117 127 130 146 147 151 171 178 184 186 201 202 227 234 242 256 267 268 280 297 299 303 315 333 339 340 357 360 361 368 373 391 401 405 423 424 429 445 446 467 477 482 486 517 518 521 524 530 533 553 554 564 567 585 588 593 597 600 606 608 610 611 643 644 651 654 671 682 710 715 717 727 739 746 758 778 791 792 798 800 816 823 849 897 898 915 916 933 994 1028 1036 1050 1058 1059 1061 1076 1111 1112 1123 1135 1188 1196 1197 1220 1222 1223 1248 1277 1290 1308 1314 233 291 294 307 308 309 374 424 430 439 459 475 476 519 561 566 567 569 602 646 666 675 695 732 753 790 803 829 929 945 949 950 1007 1024 1025 1075 1086 1088 1109 1161 1162 1258 1340 1421 1424 TGCTGC/GCAGCA 1 -4 114 126 27 -17.5 0 4 5 12 17 20 21 30 31 35 44 45 50 51 64 66 77 100 101 112 113 136 142 148 149 161 165 172 180 194 195 201 202 203 208 210 226 230 240 264 288 292 316 323 383 385 386 392 396 397 399 414 437 439 450 451 457 505 566 571 583 585 587 588 592 597 601 607 638 641 644 647 649 665 670 677 685 686 700 705 781 782 814 815 817 842 893 899 918 927 928 938 1010 1022 1030 1032 1046 1047 1111 1112 1121 1122 1127 1144 1165 1189 1197 1198 1257 1258 1270 1356 1376 1396 193 268 303 308 311 405 431 675 746 757 815 830 877 921 941 964 1016 1043 1127 1142 1237 1261 1327 1329 1373 1402 1403 GCGGTG/CACCGC 0 -4 119 125 36 -13.5 3 7 9 10 12 20 25 35 44 45 49 51 69 93 99 112 113 118 121 122 126 143 155 159 172 184 194 195 196 198 203 204 211 215 218 219 231 232 234 283 296 299 313 326 346 347 380 382 406 421 425 433 445 446 449 458 469 471 490 499 514 515 530 548 550 557 564 565 586 610 611 671 683 692 704 715 731 739 753 760 804 815 828 829 835 843 857 867 870 874 892 896 898 917 923 925 939 963 978 994 1037 1050 1065 1096 1144 1150 1151 1192 1203 1204 1245 1257 1258 1298 1335 1338 1385 1396 1436 227 233 250 263 272 307 308 328 384 387 475 525 545 565 575 624 712 723 728 789 843 888 929 939 946 951 985 1017 1075 1109 1116 1227 1240 1259 1344 1390 GTGGCG/CGCCAC 0 -4 114 120 37 -12.1 6 14 25 26 39 60 64 75 78 92 93 104 133 135 137 138 143 174 184 204 219 231 232 235 246 257 266 273 290 295 296 318 324 347 354 383 388 391 392 419 425 444 445 446 448 458 469 484 494 497 501 506 507 526 530 547 559 560 586 593 596 609 610 611 622 625 671 677 684 692 694 695 696 704 706 725 728 737 739 756 764 810 825 828 829 847 857 870 881 882 896 903 919 925 940 947 950 972 977 994 1030 1037 1050 1075 1131 1144 1150 1187 1229 1234 1288 1344 1349 1365 173 186 242 243 307 308 328 383 463 475 525 545 575 593 706 712 789 795 808 930 951 968 985 1084 1094 1109 1116 1117 1121 1124 1137 1179 1227 1259 1309 1324 1390 AGCTGC/GCAGCT 1 -4 107 116 23 -17.1 4 6 9 10 20 21 27 37 40 41 50 51 66 67 79 86 88 97 109 112 113 121 122 128 135 136 138 148 149 160 162 176 238 255 260 279 288 336 347 349 359 366 367 404 417 437 482 518 522 528 533 537 540 552 557 583 592 601 602 608 626 639 670 680 705 716 717 719 758 761 781 782 797 812 825 893 908 922 927 928 943 952 975 987 996 1010 1029 1032 1056 1073 1083 1109 1114 1121 1156 1201 1202 1257 1258 1312 1347 1351 1382 1406 1423 1434 1438 32 95 107 214 268 300 314 394 417 489 545 601 700 860 989 1016 1019 1021 1024 1172 1344 1362 1382 CGTCAC/GTGACG 3 -1 111 113 28 -14.1 14 40 81 93 114 138 141 145 165 167 169 170 177 180 190 198 212 221 238 244 255 262 263 266 270 276 282 283 301 307 313 315 335 341 347 354 370 371 373 376 377 389 408 425 430 434 447 459 476 497 499 506 507 515 537 542 559 560 576 586 595 605 620 621 643 665 667 668 677 683 709 727 743 753 757 770 771 783 786 821 823 864 888 892 893 911 947 961 964 1000 1003 1036 1039 1042 1055 1066 1098 1103 1105 1117 1188 1194 1209 1226 1227 1229 1233 1234 1241 1242 1406 19 67 162 167 172 263 268 275 399 431 438 439 571 611 623 684 704 779 844 870 885 1036 1126 1254 1286 1287 1322 1378 GCTGCA/TGCAGC 1 -3 95 110 18 -18.4 0 4 5 6 9 10 12 17 20 21 27 30 31 35 43 44 45 50 51 52 61 64 66 77 86 88 97 100 112 113 136 142 148 149 165 172 189 194 195 203 210 226 228 240 255 260 322 345 347 366 367 375 381 383 396 397 414 439 457 482 552 557 558 583 602 603 607 639 641 670 680 735 758 781 782 812 817 881 908 927 928 943 967 987 1010 1029 1032 1114 1156 1274 1312 1347 1382 1406 1420 95 107 214 308 311 314 394 405 702 707 877 964 1016 1142 1172 1334 1382 1403 TGGTGC/GCACCA 1 -4 99 104 18 -16.8 0 5 21 32 39 49 70 82 86 96 120 142 153 199 211 225 228 234 250 251 253 261 262 263 275 287 295 300 311 333 345 365 370 373 441 442 459 474 478 487 489 492 509 510 528 531 565 567 589 617 619 628 637 648 651 666 671 676 680 707 708 710 750 751 773 814 868 876 884 917 927 928 932 967 982 983 1020 1021 1025 1073 1082 1099 1110 1111 1112 1131 1178 1209 1212 1241 1242 1334 1335 1339 1340 1373 1409 1412 1432 226 244 270 271 395 435 461 588 759 792 827 946 1153 1162 1199 1212 1326 1329 GGCGGT/ACCGCC 0 -5 92 101 28 -11.5 3 7 9 10 12 14 20 25 26 35 44 45 49 51 52 69 92 93 112 113 118 133 143 171 172 181 184 187 194 195 203 204 211 218 219 231 232 252 283 296 299 326 359 380 398 406 425 445 446 449 458 469 490 499 515 530 548 564 586 593 610 611 637 692 715 739 760 784 804 870 874 892 896 917 923 925 963 978 994 1037 1050 1137 1151 1157 1213 1274 1301 1338 1349 1385 1388 1398 186 233 263 272 307 308 328 384 387 475 531 565 569 712 728 808 885 929 951 973 1084 1109 1116 1206 1227 1241 1250 1259 GCTGCT/AGCAGC 1 -3 93 97 26 -11.4 37 50 67 76 79 109 128 135 136 138 144 148 155 162 201 205 208 221 226 230 238 264 270 288 290 292 323 336 364 384 390 392 396 397 437 439 450 451 501 505 522 540 566 571 583 585 587 588 592 618 625 626 638 649 659 665 670 677 679 700 705 761 764 797 814 815 842 893 897 918 927 928 938 939 1010 1022 1025 1031 1047 1121 1122 1137 1189 1197 1270 1278 1343 1382 1390 1396 1411 1423 1434 32 92 268 300 431 545 675 699 700 709 712 746 757 815 830 860 921 989 1019 1024 1237 1327 1329 1362 1373 1383 ACCGTC/GACGGT 3 -3 96 96 29 -10.1 24 57 75 89 114 121 122 134 141 156 164 173 183 190 201 221 226 255 282 283 303 312 313 369 378 402 449 450 451 457 476 488 490 497 499 500 506 537 542 586 606 618 638 643 664 715 725 726 727 737 744 746 770 771 788 801 806 835 849 858 859 863 865 866 870 879 887 904 911 944 995 997 1011 1016 1017 1039 1042 1054 1084 1085 1098 1103 1128 1129 1151 1209 1232 1234 1254 1256 1262 1264 1265 1276 1425 1426 130 144 186 242 243 399 401 429 439 520 524 543 581 679 702 705 804 840 870 973 984 1155 1178 1238 1254 1286 1290 1338 1341 ACGTGG/CCACGT 2 -2 90 95 18 -14.6 14 15 42 75 79 85 86 87 110 133 140 141 161 162 177 190 211 237 245 246 257 260 261 270 273 278 305 306 375 400 407 408 418 422 423 424 440 460 464 466 477 501 507 530 536 559 560 562 592 596 599 605 635 640 684 695 707 708 714 725 728 737 745 764 808 820 825 837 844 850 868 881 909 925 934 959 963 969 970 1030 1077 1091 1094 1110 1126 1181 1193 1229 1297 1324 135 171 242 243 244 335 383 442 629 711 795 950 1063 1148 1161 1322 1333 1374 GCCATG/CATGGC 4 -3 88 94 23 -12.0 3 16 28 36 38 52 78 87 103 111 121 122 123 148 150 157 168 174 175 178 187 209 214 224 227 239 270 278 279 284 291 295 336 374 396 397 398 440 457 503 504 509 510 514 519 526 532 534 539 606 613 643 675 676 680 689 692 696 703 713 720 737 804 805 821 826 827 852 903 912 954 1012 1014 1046 1131 1138 1157 1172 1179 1180 1214 1215 1274 1276 1312 1380 1403 1413 61 184 261 315 317 349 428 552 568 591 646 659 662 739 762 768 843 896 980 1000 1163 1171 1334 ACGTGT/ACACGT 2 -2 90 92 29 -9.2 38 41 68 125 161 165 179 187 197 211 225 245 262 263 265 278 300 305 306 308 309 322 339 355 360 361 382 399 400 405 411 418 430 459 464 470 485 505 522 537 559 560 575 579 627 639 657 661 667 668 690 695 719 725 729 734 745 758 764 803 806 850 868 881 887 899 942 959 986 1029 1054 1055 1066 1121 1128 1129 1130 1143 1157 1179 1180 1183 1193 1239 1240 1292 1293 1328 1362 1420 57 145 183 243 274 293 366 413 456 474 610 666 677 701 755 772 781 821 982 1056 1114 1153 1208 1209 1216 1220 1267 1314 1407 CGTGGC/GCCACG 2 -1 87 92 27 -10.0 14 39 58 59 64 75 85 87 92 130 133 136 137 161 174 177 190 243 244 245 246 252 257 259 260 273 278 305 306 318 359 375 383 400 418 422 444 464 468 469 501 507 513 530 589 596 607 622 684 689 695 704 714 722 725 728 737 744 764 766 769 816 825 826 827 868 881 910 919 922 925 930 969 970 1014 1030 1105 1162 1163 1181 1193 1204 1229 1298 1314 1365 1392 171 242 243 244 335 383 431 435 439 463 525 535 545 680 706 749 795 844 979 985 1126 1137 1229 1234 1322 1333 1390 TGACGT/ACGTCA 2 -4 91 91 21 -12.2 14 25 41 85 87 141 180 187 190 198 241 262 263 270 273 276 307 310 317 322 335 376 377 379 394 396 397 408 422 425 430 434 447 466 477 481 501 507 508 599 600 605 615 647 649 657 660 665 667 668 681 683 707 708 728 743 762 763 770 805 825 844 892 904 925 947 964 980 981 993 1063 1064 1066 1117 1128 1129 1148 1201 1202 1209 1226 1227 1229 1233 1234 1262 1304 1324 1352 1393 1424 6 162 198 275 293 340 351 413 440 460 464 568 571 572 701 1057 1126 1241 1271 1322 1333 CCGTCA/TGACGG 3 -2 89 91 24 -10.9 57 59 80 81 114 121 122 130 141 169 170 173 201 207 221 226 229 241 246 255 282 283 301 313 315 329 347 354 371 373 396 397 425 429 459 476 497 499 506 537 542 576 586 595 606 638 643 652 665 690 709 715 716 725 726 730 748 750 751 757 770 771 804 823 858 859 864 887 888 893 911 961 996 1003 1055 1072 1098 1188 1194 1206 1207 1208 1209 1264 1265 1266 1354 1355 1431 19 174 217 243 345 399 429 439 581 626 689 837 989 1132 1155 1181 1209 1254 1286 1287 1298 1338 1341 1430 GACGTG/CACGTC 2 -3 86 90 13 -16.2 41 42 52 85 86 87 101 106 107 125 133 141 165 177 185 187 198 225 257 260 262 263 270 273 322 332 369 375 408 430 440 466 468 470 477 481 501 505 507 536 537 599 605 627 657 661 667 668 683 689 707 708 728 743 786 805 810 825 844 880 909 925 963 964 985 1063 1064 1066 1094 1097 1110 1126 1128 1129 1141 1171 1179 1180 1183 1229 1297 1301 1324 1325 1326 1328 170 293 335 442 456 602 629 701 781 802 950 1322 1333 GCCATC/GATGGC 4 -3 83 90 30 -8.5 4 17 19 20 23 28 31 44 45 50 77 81 95 105 112 113 117 129 151 156 159 185 188 191 192 194 195 199 219 229 254 276 321 338 344 363 370 380 384 385 386 387 403 404 436 438 445 446 489 507 514 542 550 642 669 671 679 681 710 747 765 807 838 849 870 873 877 921 972 980 1020 1021 1039 1082 1106 1118 1148 1179 1180 1264 1265 1374 1409 92 168 326 328 336 342 358 456 540 594 633 666 711 739 772 774 803 870 904 927 959 1073 1074 1090 1128 1150 1301 1346 1383 1424 CTGCTG/CAGCAG 1 -2 82 88 22 -11.1 4 12 19 20 21 35 37 51 77 79 100 109 135 136 142 162 172 180 194 195 201 203 208 226 230 264 288 292 356 383 384 392 396 397 439 448 450 451 551 566 571 583 585 588 592 649 677 700 781 782 797 810 814 815 816 817 845 852 897 914 918 927 928 1010 1022 1032 1047 1061 1111 1112 1113 1122 1127 1150 1189 1304 1329 1356 1360 1376 1396 1423 268 308 431 532 545 675 746 748 753 830 990 997 1016 1019 1024 1109 1125 1127 1267 1327 1373 1431 CGGAGG/CCTCCG 6 -4 85 88 27 -9.1 3 7 28 34 54 59 78 79 86 120 130 139 144 169 170 187 196 208 234 282 294 297 315 339 340 371 388 411 423 424 428 434 461 467 478 499 565 578 593 595 599 622 625 631 632 633 644 655 663 671 681 710 727 739 766 770 819 838 869 885 903 929 933 938 957 969 970 974 986 997 1060 1070 1101 1109 1117 1135 1141 1199 1220 1230 1248 1311 1359 1365 1422 19 67 96 133 205 250 307 430 520 567 569 646 695 702 758 802 914 950 998 1049 1060 1084 1109 1116 1259 1286 1287 CAGCAG/CTGCTG 10 -2 82 88 22 -11.1 4 12 19 20 21 35 37 51 77 79 100 109 135 136 142 162 172 180 194 195 201 203 208 226 230 264 288 292 356 383 384 392 396 397 439 448 450 451 551 566 571 583 585 588 592 649 677 700 781 782 797 810 814 815 816 817 845 852 897 914 918 927 928 1010 1022 1032 1047 1061 1111 1112 1113 1122 1127 1150 1189 1304 1329 1356 1360 1376 1396 1423 268 308 431 532 545 675 746 748 753 830 990 997 1016 1019 1024 1109 1125 1127 1267 1327 1373 1431 GCTGGT/ACCAGC 1 -3 81 86 23 -10.2 3 6 22 39 40 72 85 109 129 187 189 201 208 225 230 262 263 287 292 295 296 310 335 345 356 357 365 384 393 423 424 441 442 472 473 491 517 527 532 625 648 651 653 675 676 707 708 756 779 788 826 827 862 884 895 927 928 947 964 967 968 982 983 994 1020 1021 1025 1051 1061 1124 1140 1152 1161 1162 1163 1194 1224 1275 1385 1421 1434 65 222 270 387 417 429 472 556 598 675 783 1017 1027 1108 1169 1206 1235 1274 1317 1326 1345 1356 1410 GGTGCA/TGCACC 1 -3 79 86 16 -13.5 9 10 12 20 21 35 44 45 51 73 77 82 86 96 99 100 112 113 120 142 153 155 172 194 195 199 203 211 243 250 251 275 287 322 345 395 450 451 452 471 490 531 558 567 579 589 604 617 619 671 680 683 710 727 812 814 840 851 881 917 927 928 932 975 978 982 983 1011 1099 1106 1276 1312 1348 1373 1385 1387 1412 1432 1439 120 225 226 244 271 308 395 598 685 827 964 998 1199 1240 1326 1329 CAGTGG/CCACTG 7 -2 79 86 15 -14.0 4 10 17 20 21 26 27 31 43 44 45 77 88 89 93 108 112 113 125 142 167 194 195 203 204 209 216 236 256 261 266 277 334 343 349 353 362 403 423 424 432 477 500 506 553 554 649 676 677 700 760 819 820 821 844 846 850 870 876 888 904 950 965 966 1028 1043 1044 1070 1086 1087 1100 1116 1131 1132 1176 1191 1301 1320 1350 291 314 358 424 427 489 593 639 843 878 1074 1142 1229 1317 1440 TGGCAG/CTGCCA 7 -5 73 84 14 -14.1 4 9 10 12 17 20 21 23 28 31 44 45 77 108 112 113 116 118 156 161 167 172 176 179 182 194 195 199 202 203 213 252 274 317 332 334 339 383 390 405 432 440 495 518 519 528 594 613 647 687 709 718 720 734 741 742 969 970 975 1008 1016 1017 1025 1083 1086 1087 1096 1140 1241 1242 1289 1403 1435 260 268 431 504 506 591 645 731 1021 1090 1163 1202 1268 1421 CGCTGC/GCAGCG 1 -4 74 83 11 -15.7 4 9 10 17 21 27 30 31 43 44 45 47 54 64 88 98 112 113 118 139 144 155 168 179 182 205 221 226 262 263 270 290 294 322 334 339 347 364 381 384 390 439 491 501 514 530 531 618 625 639 659 734 760 781 782 801 806 881 915 916 939 969 970 987 1022 1031 1137 1189 1235 1278 1335 1343 1390 1420 324 699 702 707 709 788 939 1071 1090 1322 1383 GCAGCG/CGCTGC 7 -3 74 83 11 -15.7 4 9 10 17 21 27 30 31 43 44 45 47 54 64 88 98 112 113 118 139 144 155 168 179 182 205 221 226 262 263 270 290 294 322 334 339 347 364 381 384 390 439 491 501 514 530 531 618 625 639 659 734 760 781 782 801 806 881 915 916 939 969 970 987 1022 1031 1137 1189 1235 1278 1335 1343 1390 1420 324 699 702 707 709 788 939 1071 1090 1322 1383 GCGATG/CATCGC 4 -3 79 82 20 -10.6 13 39 50 64 93 106 107 117 135 156 164 167 179 199 250 251 253 266 268 273 277 293 299 323 356 370 384 385 386 423 424 435 445 446 454 461 483 497 520 521 586 662 671 675 681 693 698 699 706 728 735 748 758 764 851 870 871 887 930 935 936 938 951 972 1008 1010 1089 1106 1117 1124 1282 1283 1284 1289 1305 1306 1346 1409 1432 18 49 133 167 456 559 607 626 645 719 972 1010 1035 1138 1166 1235 1236 1378 1412 1422 GTCGTG/CACGAC 0 -4 80 81 23 -9.2 2 32 37 52 61 62 79 83 92 116 133 134 162 187 191 192 196 216 259 269 272 290 298 300 318 325 337 356 360 361 379 390 422 457 511 603 610 611 704 725 754 762 763 849 867 892 930 932 934 944 955 963 984 1001 1007 1016 1017 1028 1029 1040 1041 1056 1070 1097 1098 1101 1152 1204 1205 1216 1238 1239 1240 1249 1254 1278 1325 1326 1329 1356 241 243 328 399 451 476 554 583 608 618 656 669 677 727 793 799 810 1084 1104 1156 1174 1239 1276 GTCGTG/CACGAC 2 -3 80 81 23 -9.2 2 32 37 52 61 62 79 83 92 116 133 134 162 187 191 192 196 216 259 269 272 290 298 300 318 325 337 356 360 361 379 390 422 457 511 603 610 611 704 725 754 762 763 849 867 892 930 932 934 944 955 963 984 1001 1007 1016 1017 1028 1029 1040 1041 1056 1070 1097 1098 1101 1152 1204 1205 1216 1238 1239 1240 1249 1254 1278 1325 1326 1329 1356 241 243 328 399 451 476 554 583 608 618 656 669 677 727 793 799 810 1084 1104 1156 1174 1239 1276 TCGTCG/CGACGA 3 -2 82 81 26 -8.1 2 24 37 40 91 102 134 144 160 165 169 170 187 209 233 252 338 358 364 379 394 407 416 428 459 461 478 490 530 534 543 544 568 577 598 600 602 681 682 691 700 703 716 729 735 746 785 809 832 858 859 880 902 930 932 945 992 996 1003 1037 1043 1044 1047 1056 1057 1066 1090 1098 1158 1186 1203 1204 1212 1224 1238 1239 1240 1297 1330 1367 1410 1424 12 57 139 161 220 300 399 407 459 523 541 572 630 651 727 799 839 885 903 934 1054 1084 1120 1180 1270 1433 CCATCG/CGATGG 4 -2 79 79 23 -8.8 25 93 106 107 117 135 140 148 156 167 185 199 229 253 266 268 276 277 278 299 314 338 344 369 370 372 382 384 385 386 404 420 425 445 446 449 518 521 543 544 551 573 586 630 642 671 681 710 732 735 747 765 842 851 853 870 895 898 921 972 1004 1008 1037 1039 1089 1106 1118 1124 1148 1193 1199 1292 1293 1299 1300 1351 1367 1402 1409 8 18 29 168 242 456 554 594 627 645 693 834 870 918 947 1027 1074 1235 1236 1374 1378 1412 1424 CACGTG/CACGTG 2 -3 73 78 16 -11.6 14 15 41 68 75 79 161 197 206 211 245 246 260 262 263 278 300 301 305 306 308 309 339 347 355 360 361 399 400 418 430 433 464 466 485 505 522 525 559 560 575 592 607 667 668 684 695 701 719 725 734 737 745 764 786 806 837 850 868 881 899 934 942 959 964 987 1010 1030 1054 1055 1121 1193 1362 34 242 243 244 417 439 611 711 819 821 1036 1136 1153 1209 1267 1333 GCAGTG/CACTGC 7 -3 71 78 15 -12.1 4 8 17 20 26 27 31 43 44 45 74 77 92 99 112 113 150 163 167 194 195 197 203 204 208 216 270 277 316 334 349 362 368 419 426 432 477 485 500 506 563 572 627 629 677 700 736 760 791 792 819 904 930 965 966 969 970 975 980 1010 1043 1044 1086 1087 1096 1132 1176 1250 1276 1352 1413 48 342 428 489 591 610 760 812 888 927 1142 1163 1301 1408 1440 GGCAGT/ACTGCC 7 -4 70 78 14 -12.6 4 8 9 10 12 17 20 21 31 43 44 45 77 92 112 113 118 133 167 172 173 185 194 195 197 203 204 208 274 277 316 334 354 362 405 411 432 440 485 495 506 517 519 538 594 599 620 621 629 680 691 720 730 760 809 822 862 869 976 1046 1072 1076 1086 1087 1096 1140 1148 1395 1407 1408 217 260 342 504 506 531 591 647 745 760 1163 1408 1421 1423 CGTGTC/GACACG 2 -1 72 75 14 -11.9 55 83 125 137 161 165 187 197 200 211 225 242 270 305 306 308 309 318 355 360 361 394 399 400 410 418 459 464 467 485 505 522 550 578 580 581 582 596 598 604 620 621 654 657 661 690 694 703 725 734 745 750 751 754 806 810 837 844 888 899 942 1055 1066 1121 1130 1159 1193 1245 1292 1293 1420 1431 57 99 243 413 430 552 554 735 1128 1153 1209 1216 1358 1407 CGTCGT/ACGACG 3 -1 74 73 22 -7.9 2 37 40 52 91 101 156 187 209 217 223 260 285 338 364 379 390 416 422 425 434 461 478 534 551 563 600 650 659 694 727 729 735 756 785 809 824 832 849 858 859 876 880 892 930 932 934 992 1001 1016 1017 1037 1040 1041 1043 1044 1056 1060 1068 1090 1094 1097 1098 1122 1141 1186 1204 1238 1254 1266 1278 1329 1330 1410 161 198 248 399 529 583 593 651 658 727 746 799 802 812 913 946 1084 1104 1180 1228 1271 1294 ATGCTG/CAGCAT 1 -5 69 72 20 -8.4 17 22 48 56 66 90 96 129 148 165 208 210 217 230 272 273 282 316 323 356 385 386 408 414 440 481 503 504 562 566 587 597 601 619 642 649 675 685 686 700 705 724 731 744 790 826 827 893 899 937 938 953 1010 1018 1032 1047 1051 1139 1140 1144 1187 1205 1270 1307 1315 1389 1391 1421 1432 50 65 303 344 363 394 464 488 675 848 865 964 1023 1108 1129 1169 1178 1301 1309 1402 GCTGCG/CGCAGC 1 -3 71 72 15 -10.6 41 47 50 98 101 149 168 180 262 263 279 294 312 316 334 359 385 386 399 404 437 439 491 514 521 531 533 538 557 566 569 595 597 601 685 686 697 705 761 786 801 804 806 825 899 923 927 928 1030 1046 1051 1056 1067 1078 1109 1111 1112 1127 1144 1145 1151 1198 1201 1202 1257 1258 1278 1333 1335 1351 1376 18 19 95 252 417 548 601 746 921 939 980 1071 1261 1344 1402 CGCAGC/GCTGCG 10 -4 71 72 15 -10.6 41 47 50 98 101 149 168 180 262 263 279 294 312 316 334 359 385 386 399 404 437 439 491 514 521 531 533 538 557 566 569 595 597 601 685 686 697 705 761 786 801 804 806 825 899 923 927 928 1030 1046 1051 1056 1067 1078 1109 1111 1112 1127 1144 1145 1151 1198 1201 1202 1257 1258 1278 1333 1335 1351 1376 18 19 95 252 417 548 601 746 921 939 980 1071 1261 1344 1402 CGTCGC/GCGACG 3 -1 73 71 14 -10.9 24 37 40 89 118 131 144 169 170 190 233 247 248 252 274 294 299 311 371 393 427 459 469 501 511 534 555 556 568 602 645 661 681 691 703 706 714 726 806 825 835 856 863 870 897 915 916 925 978 995 997 1043 1044 1047 1067 1088 1103 1126 1137 1158 1183 1188 1195 1213 1221 1235 1255 1272 1276 1284 1292 1293 1419 12 57 96 139 278 401 572 705 769 939 980 1120 1136 1352 CTCGAC/GTCGAG 9 -5 71 71 23 -7.1 13 54 148 151 154 157 165 227 236 238 249 273 349 351 358 381 391 402 407 489 520 537 552 557 609 623 627 657 667 668 684 711 716 726 729 734 741 742 743 774 784 791 792 795 817 820 832 843 864 873 879 885 897 902 985 996 1069 1076 1106 1131 1203 1225 1249 1288 1314 1319 1379 1392 1399 1407 1408 4 85 185 186 199 201 335 353 405 489 541 547 630 694 747 803 840 859 884 972 1006 1010 1433 GCCGTC/GACGGC 3 -3 70 70 17 -9.2 11 26 30 42 65 124 131 160 167 190 198 229 235 241 246 249 277 331 347 371 373 396 397 459 476 485 506 571 631 632 643 646 650 652 659 714 716 725 727 804 823 838 862 863 892 897 987 996 1014 1067 1072 1088 1095 1100 1151 1194 1213 1216 1221 1255 1272 1278 1284 1292 1293 1316 1317 1354 1355 1431 174 217 243 315 451 525 569 626 811 914 980 989 1022 1175 1181 1229 1430 CAGCCG/CGGCTG 10 -2 63 70 14 -10.7 9 10 20 27 35 43 44 45 51 65 77 100 112 113 136 172 176 193 194 195 203 235 243 270 295 308 309 335 345 365 375 389 396 397 445 446 450 451 521 525 527 548 569 603 675 735 771 786 804 862 882 897 923 967 1025 1078 1122 1213 1224 1269 1278 1411 1420 19 112 162 173 384 451 525 532 702 763 921 963 1173 1229 CTCGCC/GGCGAG 9 -5 68 69 13 -10.9 13 34 52 60 74 85 145 187 190 244 249 277 333 342 347 358 401 402 406 497 520 559 560 604 609 635 659 696 714 728 733 764 776 788 790 797 802 848 864 873 925 933 950 968 1015 1023 1024 1030 1058 1059 1079 1088 1117 1173 1174 1175 1187 1194 1204 1205 1269 1291 1364 1412 1417 1427 1428 1440 173 193 237 383 599 691 694 819 891 980 1094 1181 1204 ACGTGC/GCACGT 2 -2 63 68 15 -9.7 39 41 52 68 101 105 125 149 182 185 197 198 206 229 260 262 263 300 308 309 347 352 355 430 433 466 468 471 475 478 525 575 580 581 582 592 607 689 701 755 786 810 837 850 868 934 961 964 987 995 1006 1010 1053 1063 1064 1143 1167 1198 1229 1325 1326 1331 1332 23 34 69 170 417 439 564 611 711 819 1082 1153 1175 1261 1267 TGCACT/AGTGCA 8 -4 63 67 8 -13.5 10 12 15 31 35 43 71 100 101 142 157 165 172 194 195 211 237 250 251 257 260 279 311 316 350 419 456 475 496 498 502 511 529 663 671 701 714 732 779 811 814 857 867 911 930 965 966 975 976 1025 1052 1082 1084 1085 1115 1135 1156 1226 1227 1341 1348 1357 1373 180 300 492 766 1226 1250 1328 1411 CAGCCA/TGGCTG 10 -2 66 67 22 -6.7 40 43 50 52 56 105 135 150 156 157 159 214 216 228 229 355 362 383 416 418 438 452 506 507 521 538 558 585 595 610 611 613 747 764 812 813 831 888 903 921 941 943 972 994 1014 1020 1021 1022 1025 1046 1067 1079 1090 1118 1121 1124 1145 1148 1162 1163 1176 1179 1180 1274 1314 1403 19 241 345 503 505 548 679 711 712 778 926 951 980 1127 1128 1129 1195 1286 1287 1334 1421 1424 CGGTGC/GCACCG 1 -4 62 66 10 -11.9 9 10 12 20 35 44 45 51 89 93 104 112 113 132 155 159 169 170 172 194 195 198 201 203 242 243 287 322 348 450 451 452 471 490 513 600 604 683 692 727 806 840 843 844 870 881 907 917 959 975 978 1094 1117 1144 1150 1224 1232 1276 1324 1385 1387 1396 51 193 250 588 685 827 1103 1209 1240 1333 GCGGCG/CGCCGC 0 -4 61 65 11 -11.1 1 3 42 69 85 87 98 99 134 146 147 159 184 187 209 218 241 249 259 262 263 274 325 417 439 449 466 482 490 491 521 566 586 631 632 645 655 681 714 760 761 777 790 802 804 929 939 947 963 971 1062 1075 1101 1175 1194 1244 1290 1341 1349 1359 1380 96 272 695 712 770 808 811 830 1116 1293 1352 GTGCTG/CAGCAC 0 -4 60 65 17 -8.1 0 5 21 30 39 44 45 112 113 125 145 185 201 202 203 228 234 240 241 262 263 287 310 322 399 423 424 441 442 525 528 627 651 670 673 723 724 743 814 842 843 884 907 909 927 928 978 1000 1030 1093 1144 1150 1152 1198 1209 1241 1242 1396 1411 1412 97 188 193 293 471 598 675 758 779 798 812 877 941 1017 1142 1162 1261 GTGCTG/CAGCAC 1 -5 60 65 17 -8.1 0 5 21 30 39 44 45 112 113 125 145 185 201 202 203 228 234 240 241 262 263 287 310 322 399 423 424 441 442 525 528 627 651 670 673 723 724 743 814 842 843 884 907 909 927 928 978 1000 1030 1093 1144 1150 1152 1198 1209 1241 1242 1396 1411 1412 97 188 193 293 471 598 675 758 779 798 812 877 941 1017 1142 1162 1261 CGCCAT/ATGGCG 4 -4 62 65 21 -6.6 3 28 38 52 78 85 103 151 187 219 224 276 284 291 370 374 385 386 398 427 436 445 446 465 469 484 491 507 509 510 539 577 635 669 671 675 680 681 689 696 703 713 761 787 795 805 807 821 852 870 945 951 980 998 1012 1039 1157 1274 1290 1380 1431 1440 61 186 231 328 379 633 646 659 665 691 699 787 803 819 843 870 1060 1074 1204 1206 1316 TCCGTC/GACGGA 3 -3 67 64 16 -8.3 57 59 67 130 169 170 200 294 313 315 321 329 340 354 390 411 429 432 434 486 511 534 536 595 616 649 665 690 709 730 748 750 751 757 798 825 841 848 858 859 863 934 1003 1015 1055 1056 1060 1068 1091 1137 1164 1185 1188 1194 1195 1213 1216 1231 1235 1243 1266 1287 1292 1293 1345 1392 1417 19 20 96 242 270 441 689 790 837 1132 1166 1209 1280 1286 1287 1298 GCAGAG/CTCTGC 7 -3 63 64 21 -6.4 41 66 81 133 144 181 193 194 195 203 229 244 268 301 368 392 429 431 444 448 468 491 492 518 564 596 609 634 649 685 686 697 709 718 723 741 742 758 771 781 782 806 819 848 977 1012 1016 1017 1055 1069 1120 1290 1299 1300 1308 1333 1334 1356 1360 1378 1412 1428 1435 190 226 245 373 374 476 547 702 794 827 830 888 958 1108 1121 1142 1195 1202 1268 1373 1424 CCGTCG/CGACGG 3 -2 68 63 18 -7.3 89 131 134 156 190 223 250 251 294 299 340 378 390 434 449 469 489 500 511 534 650 659 664 714 726 727 741 742 746 806 825 835 849 863 870 876 892 897 934 995 997 1016 1017 1042 1060 1067 1068 1088 1095 1103 1128 1129 1137 1151 1188 1195 1213 1221 1231 1235 1254 1276 1284 1292 1293 1392 1425 1426 96 130 144 172 209 248 315 401 441 543 696 705 804 840 980 1175 1178 1280 TGCAGT/ACTGCA 7 -4 57 63 21 -6.3 4 6 8 10 26 30 39 43 74 88 99 105 150 175 216 242 243 258 272 275 291 342 349 410 479 515 523 535 558 627 652 670 711 738 762 763 812 819 842 930 943 965 966 1010 1011 1075 1095 1176 1249 1316 1317 1331 1332 1352 1399 1412 1428 23 38 52 271 288 489 585 656 775 784 810 827 927 1023 1034 1107 1134 1168 1195 1200 1226 GCCGTG/CACGGC 0 -4 61 62 13 -9.3 37 62 75 90 115 136 137 144 162 176 191 192 193 243 245 293 300 326 342 344 373 375 406 411 421 538 550 552 559 560 596 607 620 621 623 637 640 654 655 703 744 750 751 771 804 823 879 959 1057 1077 1078 1105 1229 1244 1269 1298 1311 1352 1357 1363 1392 173 277 430 532 553 570 644 680 763 839 870 986 1234 GCTGCC/GGCAGC 1 -3 59 62 15 -8.3 40 41 54 86 118 121 122 139 146 147 156 160 161 176 179 182 202 221 339 349 390 417 445 446 518 528 530 537 583 601 608 613 644 647 716 717 719 734 760 804 893 907 922 952 969 970 975 996 1022 1025 1073 1083 1165 1213 1235 1257 1258 1356 1438 193 268 303 324 431 489 788 941 1009 1021 1043 1090 1127 1322 1424 CGTGAC/GTCACG 2 -1 60 62 18 -7.1 2 14 71 91 111 114 138 177 193 196 212 262 263 282 301 326 339 344 347 355 369 418 430 434 476 507 525 559 560 576 643 655 666 667 668 726 766 786 788 810 823 835 892 942 964 1000 1029 1042 1055 1057 1077 1105 1141 1175 1224 1229 1262 1404 1405 1430 34 268 275 292 439 570 587 611 647 675 698 779 802 1036 1204 1261 1267 1416 GCCGTG/CACGGC 2 -3 61 62 13 -9.3 37 62 75 90 115 136 137 144 162 176 191 192 193 243 245 293 300 326 342 344 373 375 406 411 421 538 550 552 559 560 596 607 620 621 623 637 640 654 655 703 744 750 751 771 804 823 879 959 1057 1077 1078 1105 1229 1244 1269 1298 1311 1352 1357 1363 1392 173 277 430 532 553 570 644 680 763 839 870 986 1234 ATGCAC/GTGCAT 8 -5 60 62 9 -11.5 19 36 41 68 87 120 148 157 165 182 199 250 251 279 281 289 311 345 350 352 441 442 456 496 546 558 580 581 582 619 718 725 727 732 734 776 803 840 871 899 911 930 967 976 1011 1033 1052 1082 1119 1145 1167 1169 1289 1312 1348 1362 1387 1412 1432 1439 243 598 763 1114 1314 1326 1328 1329 1333 GGTGCT/AGCACC 1 -3 60 61 13 -9.0 0 5 39 132 169 170 201 228 234 240 287 295 331 333 348 379 441 442 492 509 510 528 533 600 637 648 651 666 707 708 724 750 751 806 814 843 876 884 907 909 927 928 999 1020 1021 1043 1044 1093 1094 1111 1112 1144 1150 1178 1209 1241 1242 1324 1334 1396 174 193 210 221 549 588 675 759 792 946 1103 1162 1212 CGTTCC/GGAACG 5 -4 63 61 12 -9.5 57 83 180 193 200 223 281 303 307 323 336 353 372 380 398 444 464 479 483 486 491 531 574 575 577 639 677 685 686 726 733 738 750 751 757 778 796 824 856 892 897 940 942 945 1047 1077 1173 1174 1181 1232 1274 1298 1302 1303 1348 1356 1362 1368 1369 1372 1389 1396 1439 112 405 424 519 595 602 843 879 895 969 1063 1394 ACAGCA/TGCTGT 11 0 59 60 17 -7.1 19 21 37 66 96 106 107 162 182 217 230 264 269 282 292 321 335 384 440 448 503 504 525 528 562 597 601 615 649 700 723 731 744 893 918 927 928 953 978 1018 1047 1051 1061 1093 1109 1122 1175 1191 1192 1205 1280 1301 1307 1315 1322 1323 1360 1389 1411 97 363 394 471 661 746 758 779 882 904 932 942 1162 1175 1267 1301 1415 CCGCTG/CAGCGG 1 -5 55 59 11 -9.6 9 17 21 27 31 32 34 43 44 45 57 88 92 112 113 126 187 205 221 262 263 270 325 334 339 347 384 514 569 618 634 659 711 760 788 801 890 891 914 915 916 939 957 1010 1030 1070 1161 1244 1278 1281 1284 1335 1349 1385 1420 40 315 482 702 770 939 1015 1173 1206 1322 1326 CGTCCA/TGGACG 3 -1 61 59 11 -9.6 28 86 133 160 167 198 235 237 257 319 332 334 343 344 414 419 429 477 490 536 537 605 608 627 689 694 744 762 763 794 797 807 815 865 866 929 946 974 1038 1039 1043 1044 1084 1085 1164 1178 1179 1180 1214 1215 1228 1234 1256 1260 1261 1262 1292 1293 1301 1422 1424 110 232 241 242 294 335 738 830 870 1238 1412 CAGCGG/CCGCTG 10 -2 55 59 11 -9.6 9 17 21 27 31 32 34 43 44 45 57 88 92 112 113 126 187 205 221 262 263 270 325 334 339 347 384 514 569 618 634 659 711 760 788 801 890 891 914 915 916 939 957 1010 1030 1070 1161 1244 1278 1281 1284 1335 1349 1385 1420 40 315 482 702 770 939 1015 1173 1206 1322 1326 CGTGCA/TGCACG 2 -1 55 58 11 -9.3 39 41 68 101 105 149 153 176 181 182 198 206 229 260 262 263 272 294 351 352 375 430 475 511 516 575 580 581 582 641 701 725 761 826 827 867 868 871 961 964 977 1010 1019 1057 1105 1135 1143 1145 1167 1331 1332 1352 1357 1392 1430 23 243 564 583 640 656 819 1121 1326 1333 1397 GCGTGT/ACACGC 2 -2 55 58 16 -7.0 47 48 53 55 58 74 75 83 95 98 102 103 104 137 145 180 220 242 274 284 313 318 333 342 351 388 399 426 445 446 452 461 596 678 681 694 701 703 836 837 930 934 939 988 1000 1119 1158 1159 1195 1235 1267 1268 1415 1419 1431 82 172 257 317 552 672 683 704 711 827 869 896 1005 1064 1091 1420 TGCACG/CGTGCA 8 -4 55 58 11 -9.3 39 41 68 101 105 149 153 176 181 182 198 206 229 260 262 263 272 294 351 352 375 430 475 511 516 575 580 581 582 641 701 725 761 826 827 867 868 871 961 964 977 1010 1019 1057 1105 1135 1143 1145 1167 1331 1332 1352 1357 1392 1430 23 243 564 583 640 656 819 1121 1326 1333 1397 TCCTGC/GCAGGA 1 -4 53 56 18 -5.9 1 35 68 75 94 109 117 123 142 180 317 323 357 383 384 395 440 450 451 480 519 526 538 592 593 594 600 663 666 687 696 717 738 799 812 881 904 909 940 990 991 1001 1111 1112 1126 1204 1285 1287 1289 1290 1309 1310 1376 81 105 173 308 640 660 685 717 748 753 792 939 1348 1389 1408 1412 1424 1430 TCGCTG/CAGCGA 1 -5 55 56 18 -5.9 10 54 64 118 121 122 123 138 139 141 151 153 155 179 296 323 364 390 459 501 530 531 600 624 629 639 661 707 708 717 734 745 781 782 785 806 870 881 981 987 1022 1026 1047 1088 1109 1128 1129 1149 1189 1191 1235 1313 1343 1390 1416 8 57 81 213 282 312 318 543 709 783 803 936 952 1179 1235 1317 1324 1383 GGCGTG/CACGCC 2 -3 53 56 5 -12.8 38 55 56 86 102 103 104 137 138 145 151 212 224 229 275 282 284 295 318 342 383 445 446 469 507 547 561 596 627 680 681 694 703 721 740 744 825 842 889 922 939 1000 1009 1045 1088 1158 1159 1229 1244 1246 1247 1411 1431 172 463 640 648 945 AGCTGG/CCAGCT 1 -4 52 55 16 -6.4 3 6 40 85 140 189 214 225 249 287 292 335 345 349 357 359 383 477 482 532 537 651 656 676 707 708 741 742 756 779 802 806 844 845 887 895 929 943 967 968 982 983 993 994 1031 1051 1061 1124 1224 1316 1317 1434 230 251 270 429 438 556 572 680 745 921 942 971 1027 1235 1274 1434 ACGAGG/CCTCGT 6 -4 57 55 18 -5.7 28 70 102 141 169 170 202 214 308 309 326 358 359 364 394 487 490 511 524 552 591 608 682 695 748 762 763 819 826 827 880 902 905 906 954 965 966 1054 1057 1060 1084 1085 1091 1094 1149 1155 1170 1171 1173 1174 1188 1228 1287 1318 1343 1372 1430 53 181 459 484 611 709 736 776 855 889 1094 1159 1165 1203 1288 1336 1340 1409 CGTGCT/AGCACG 2 -1 52 54 11 -8.4 21 44 45 52 90 98 112 113 125 151 182 185 203 253 308 309 310 311 322 344 466 481 525 529 547 561 592 607 622 730 755 837 842 860 861 975 1000 1001 1006 1040 1041 1063 1064 1152 1198 1275 1329 1372 1411 1415 1427 1428 34 185 293 611 711 791 819 1017 1052 1261 1433 ACCTGC/GCAGGT 1 -4 50 53 15 -6.4 11 12 21 23 30 35 44 45 61 85 99 100 102 139 172 180 203 287 332 335 383 452 502 567 713 760 791 792 814 818 851 908 971 996 999 1008 1019 1111 1112 1150 1164 1170 1189 1222 1223 1226 1227 1329 1376 1435 225 244 406 481 486 645 681 899 1016 1035 1038 1072 1094 1313 1314 CCTGCT/AGCAGG 1 -3 48 53 16 -6.0 3 4 11 12 21 35 62 68 77 85 109 142 160 172 180 194 195 210 335 357 372 383 384 468 503 504 590 600 813 814 817 818 892 940 990 991 1032 1070 1077 1104 1111 1112 1150 1170 1329 1367 1376 1435 81 105 113 225 308 352 486 660 748 753 792 803 1016 1314 1383 1424 CTGCAG/CTGCAG 1 -2 46 53 8 -9.8 4 6 8 9 10 20 21 27 30 50 51 52 61 64 66 88 112 113 136 210 302 322 368 440 450 451 558 583 594 627 639 670 738 922 943 1010 1029 1032 1095 1114 1156 1176 1342 1406 1412 1428 311 405 416 702 1016 1119 1134 1142 GGCTGC/GCAGCC 1 -4 53 53 11 -8.1 50 52 61 76 136 146 147 156 176 189 228 312 345 355 375 396 397 439 445 446 521 538 558 569 585 595 603 613 679 697 735 764 786 804 897 907 922 923 967 1014 1025 1029 1051 1067 1078 1145 1151 1213 1274 1278 1333 1411 1420 18 19 252 548 702 712 921 980 1009 1334 1424 TAGCTG/CAGCTA 1 -5 51 53 15 -6.4 40 66 79 121 122 138 148 160 209 222 260 286 288 302 336 357 359 396 397 437 501 514 522 532 552 608 639 707 708 717 781 782 797 802 837 844 845 857 927 928 1032 1076 1122 1124 1125 1201 1202 1423 1433 1434 1438 27 107 300 314 350 352 394 670 680 919 1016 1019 1027 1287 1344 GGCATG/CATGCC 4 -3 47 53 14 -6.8 3 5 19 22 26 36 41 88 89 102 108 118 171 173 197 292 328 342 345 374 378 379 414 441 442 455 458 493 503 504 529 572 616 656 688 722 762 763 877 973 1003 1108 1277 1331 1332 1406 1414 139 221 383 403 456 526 572 672 887 986 1005 1025 1035 1258 GGCGAT/ATCGCC 4 -4 54 53 17 -5.6 30 93 117 135 167 266 273 277 299 324 370 435 444 445 446 482 520 521 531 540 552 575 586 671 675 678 681 706 721 735 741 742 743 795 851 870 887 938 951 972 1010 1095 1106 1117 1124 1221 1243 1282 1283 1284 1346 1432 1434 1437 14 133 167 211 489 626 633 719 792 859 890 912 972 1203 1378 1414 1416 CTGCAG/CTGCAG 7 -5 46 53 8 -9.8 4 6 8 9 10 20 21 27 30 50 51 52 61 64 66 88 112 113 136 210 302 322 368 440 450 451 558 583 594 627 639 670 738 922 943 1010 1029 1032 1095 1114 1156 1176 1342 1406 1412 1428 311 405 416 702 1016 1119 1134 1142 GCAGCC/GGCTGC 10 -3 53 53 11 -8.1 50 52 61 76 136 146 147 156 176 189 228 312 345 355 375 396 397 439 445 446 521 538 558 569 585 595 603 613 679 697 735 764 786 804 897 907 922 923 967 1014 1025 1029 1051 1067 1078 1145 1151 1213 1274 1278 1333 1411 1420 18 19 252 548 702 712 921 980 1009 1334 1424 AGCCGG/CCGGCT 10 -1 43 49 13 -6.3 9 10 20 27 35 43 44 45 51 65 77 100 112 113 172 186 194 195 196 203 270 282 342 345 365 445 446 548 603 616 719 735 786 864 882 923 967 987 1023 1024 1176 1199 1269 185 251 295 342 643 844 866 963 1126 1167 1289 1342 1398 GCGTTC/GAACGC 5 -5 51 48 9 -8.0 47 181 258 314 363 415 471 479 487 531 577 583 592 645 667 668 677 689 723 750 751 753 773 783 796 824 828 829 831 892 940 945 969 970 982 983 984 1004 1007 1047 1091 1128 1129 1170 1250 1274 1343 1357 1387 1389 1439 92 95 278 709 830 843 849 908 969 GCAGTA/TACTGC 7 -3 42 48 15 -5.3 4 6 8 9 10 12 21 30 31 39 77 118 133 172 194 195 258 354 371 385 386 479 495 508 515 519 551 599 670 680 691 728 809 822 914 1072 1095 1140 1172 1365 1407 1408 5 218 227 283 525 714 779 810 985 997 1168 1200 1226 1327 1390 CCGTCC/GGACGG 3 -2 46 45 12 -5.9 26 30 67 124 160 167 183 198 235 249 277 303 312 331 488 490 536 725 744 760 788 841 865 866 879 904 944 1011 1039 1084 1085 1091 1098 1100 1151 1164 1216 1234 1256 1262 1287 1292 1293 1297 1345 1389 144 242 243 270 399 451 520 702 738 776 870 1238 CGCTCC/GGAGCG 5 -4 39 45 7 -8.4 4 9 10 12 21 31 44 45 57 68 77 100 124 142 172 203 209 268 300 325 353 376 377 402 414 486 707 708 709 857 874 1153 1154 1235 1248 1251 1267 1268 1328 173 244 352 555 745 794 913 GCGTCA/TGACGC 2 -2 43 44 14 -4.9 76 114 138 145 153 173 179 212 215 238 260 262 263 319 430 455 479 483 559 560 620 621 683 753 761 783 786 807 821 824 828 829 914 1000 1004 1015 1031 1036 1039 1042 1288 1321 1413 82 167 234 431 439 461 624 779 844 870 949 1036 1228 1406 CCATGG/CCATGG 4 -2 42 44 8 -7.6 33 36 38 52 103 123 139 154 174 187 214 227 239 270 278 509 510 526 539 561 606 676 692 713 720 737 785 821 826 827 992 1014 1073 1131 1157 1179 1180 1274 1292 1293 1380 1389 210 261 469 568 762 910 1252 1334 CCCTGC/GCAGGG 1 -4 38 43 10 -6.3 4 12 28 35 48 50 77 88 100 142 172 176 194 195 198 210 252 302 317 368 383 459 468 503 504 524 813 817 892 899 961 1111 1112 1218 1219 1257 1258 1289 113 218 344 352 507 640 945 990 998 1383 AGGTCA/TGACCT 12 -2 43 43 10 -6.3 11 121 122 132 273 285 286 328 339 341 403 410 450 451 487 492 574 637 647 666 700 701 738 783 794 796 802 835 864 894 957 994 1005 1032 1075 1077 1197 1213 1328 1398 1428 1433 1435 52 434 523 544 916 1016 1118 1206 1213 1219 CCTGCA/TGCAGG 1 -3 40 42 14 -4.5 30 48 50 61 88 108 117 142 176 198 287 302 323 368 395 440 450 451 452 502 526 527 567 594 713 717 738 851 917 922 961 999 1106 1111 1112 1226 1227 1309 1310 1432 91 225 344 384 523 899 990 998 1035 1072 1313 1411 1412 1423 CGCAGT/ACTGCG 7 -4 41 42 11 -5.6 8 74 162 163 258 355 371 374 400 411 426 427 437 462 463 484 500 508 563 622 644 687 711 728 777 837 863 881 887 969 970 975 978 1006 1114 1250 1284 1298 1365 1413 1427 227 283 470 525 769 779 888 985 1022 1390 1406 GCACTG/CAGTGC 8 -3 42 42 8 -7.1 22 31 43 101 194 195 244 250 251 257 266 316 368 403 419 426 475 496 614 661 690 697 703 732 736 930 934 975 1025 1082 1084 1085 1102 1179 1180 1183 1305 1306 1320 1333 1407 1408 545 591 812 1024 1245 1249 1301 1349 GCGTCG/CGACGC 2 -2 42 41 10 -5.9 37 42 118 246 247 248 274 298 311 371 390 393 416 501 552 563 569 623 694 726 756 824 825 832 835 856 925 929 978 1001 1040 1041 1047 1090 1095 1137 1151 1204 1255 1272 1278 1419 529 583 770 775 812 913 939 1072 1234 1294 TCGCTC/GAGCGA 5 -5 39 41 12 -5.0 8 13 57 68 148 190 259 268 325 373 376 377 437 526 643 645 646 667 668 707 708 750 751 765 798 817 847 857 905 906 921 981 1153 1154 1200 1248 1328 1334 1429 73 87 89 173 244 434 705 1016 1127 1204 1412 1423 CCTGCC/GGCAGG 1 -3 38 40 12 -4.8 0 23 28 63 94 100 104 108 139 252 317 332 383 459 519 592 666 687 696 760 791 792 799 819 881 904 909 1001 1008 1111 1112 1164 1241 1242 1257 1258 1289 1290 13 173 507 645 681 685 939 1094 1389 1421 1424 1430 GGTGCC/GGCACC 1 -3 38 40 10 -5.6 32 48 49 56 70 89 93 104 261 300 365 366 367 370 428 443 459 489 509 510 513 628 713 795 844 868 870 914 959 1078 1110 1118 1232 1285 1335 1339 1340 1409 51 435 461 523 553 611 1095 1209 1333 1348 CCGTGC/GCACGG 2 -2 37 40 5 -8.4 0 5 21 37 44 45 75 90 98 111 112 113 176 193 203 222 253 272 294 344 375 388 481 622 669 670 838 903 940 952 961 1100 1105 1212 1352 1357 1363 185 552 1166 1333 1433 CGTGCC/GGCACG 2 -1 39 40 5 -8.4 0 5 52 94 111 124 193 222 300 347 355 372 468 478 620 621 669 679 689 711 810 838 850 872 903 933 952 961 987 1100 1172 1212 1229 1238 1287 1325 1326 1392 1440 69 244 727 833 1286 CGTGCG/CGCACG 2 -1 38 40 10 -5.6 37 53 56 64 75 116 197 262 263 278 300 388 430 432 433 445 446 471 516 667 668 670 701 786 909 915 916 934 940 969 970 984 995 1007 1053 1116 1136 1138 170 417 439 552 711 1082 1153 1166 1175 1267 TCGTTC/GAACGA 5 -5 41 40 13 -4.5 57 123 141 200 206 223 254 281 360 361 372 380 398 444 483 486 516 543 544 596 639 738 755 785 805 880 895 931 1076 1103 1204 1266 1302 1303 1356 1368 1369 1372 1374 1396 1423 372 389 405 418 442 601 672 879 889 1093 1094 1394 1409 GACGTC/GACGTC 2 -3 38 39 12 -4.6 190 276 285 287 307 317 326 338 379 390 394 396 397 422 427 447 477 508 605 612 645 647 649 660 679 681 728 790 915 916 932 993 1043 1044 1262 1304 1422 1424 12 162 275 278 351 464 568 593 660 746 1241 1271 GCGTGC/GCACGC 2 -2 39 39 4 -8.9 41 53 56 64 151 176 181 182 229 372 432 445 446 547 561 641 667 668 711 761 842 872 909 969 970 977 1057 1116 1145 1172 1230 1275 1287 1411 1415 1427 1428 1430 1440 244 640 791 1121 TCGTGC/GCACGA 2 -2 41 39 13 -4.3 52 94 116 153 272 278 300 310 322 351 511 516 529 620 621 679 725 730 826 827 860 861 867 871 915 916 933 984 1000 1001 1007 1040 1041 1135 1136 1138 1152 1238 1329 1372 1392 23 241 243 293 583 656 727 833 1017 1052 1286 1326 1397 ACGCTC/GAGCGT 5 -5 37 39 9 -5.9 1 9 66 108 114 142 199 316 339 353 363 414 432 483 486 559 560 577 583 623 774 802 874 892 945 951 1001 1040 1041 1071 1098 1105 1176 1235 1267 1268 1389 207 555 821 858 891 913 1174 1321 1426 CGTTCG/CGAACG 5 -4 40 39 10 -5.4 62 119 123 162 181 217 254 257 258 272 326 337 382 384 419 443 464 516 520 689 773 805 831 880 984 1000 1062 1067 1128 1129 1226 1227 1266 1287 1302 1303 1329 1343 1357 1387 156 242 418 587 709 760 849 972 1208 1260 GCACTC/GAGTGC 8 -3 36 38 10 -5.2 12 15 35 71 100 142 157 172 235 260 288 347 350 380 399 402 406 456 671 714 723 811 886 894 908 911 1030 1057 1100 1203 1226 1227 1237 1341 1373 1402 180 188 214 300 809 1072 1251 1396 1422 1430 CGCTCA/TGAGCG 5 -4 35 37 12 -4.2 1 8 66 108 126 180 199 215 316 339 363 373 437 439 548 623 645 667 668 798 892 909 921 956 971 990 991 1001 1040 1041 1098 1105 1334 1389 1413 207 228 417 705 821 942 1016 1075 1309 1412 1420 1426 GTGCCG/CGGCAC 0 -4 35 36 12 -4.0 11 32 93 124 126 247 248 261 300 347 365 366 367 370 375 388 485 513 689 690 711 870 914 933 959 987 1067 1078 1170 1229 1232 1287 1354 1355 1392 69 166 292 435 525 545 553 711 1024 1209 1390 1429 CGCTGG/CCAGCG 1 -4 36 36 7 -6.2 6 8 72 131 153 186 187 233 296 325 393 472 473 527 625 634 641 707 708 722 723 788 834 914 925 947 1030 1070 1139 1161 1191 1275 1281 1313 1385 1416 770 783 952 1007 1206 1317 1326 GCGCCG/CGGCGC 0 -4 34 35 11 -4.2 4 11 131 144 325 388 417 466 480 491 569 586 631 632 646 691 700 733 761 838 841 909 940 947 971 974 990 991 996 1000 1075 1149 1244 1385 67 178 196 516 569 789 839 979 1085 1175 1352 AGCGTC/GACGCT 2 -3 32 34 8 -5.2 1 114 118 138 173 179 293 298 316 319 353 390 393 455 483 577 623 625 634 774 818 925 929 1001 1015 1031 1040 1041 1137 1151 1278 1421 207 461 529 651 927 939 949 1177 GCTGGC/GCCAGC 1 -3 31 33 11 -3.8 8 40 153 159 185 186 214 228 273 325 349 592 610 611 634 722 741 742 802 806 843 844 845 993 1121 1144 1150 1281 1316 1317 1390 532 572 592 770 778 916 973 990 1020 1397 1431 TGCGTC/GACGCA 2 -3 32 33 11 -3.8 37 149 181 247 248 262 263 334 390 416 430 437 471 514 516 563 569 575 645 694 761 786 872 887 914 978 1004 1042 1204 1231 1413 1419 234 324 439 583 602 746 779 1036 1188 1280 1406 GCACTT/AAGTGC 8 -3 33 33 11 -3.8 10 127 165 206 211 237 260 279 311 316 388 445 446 498 502 529 626 663 673 701 743 761 779 814 857 1011 1115 1135 1156 1330 1357 1393 1413 166 275 598 733 738 798 932 1250 1359 1360 1390 GCGCTC/GAGCGC 5 -5 28 32 5 -6.3 4 10 12 21 31 44 45 77 100 144 172 180 194 195 203 276 539 584 667 668 674 779 971 990 991 1003 1145 1314 111 417 541 852 1229 GTGCAC/GTGCAC 8 -5 31 32 7 -5.2 39 101 142 153 211 229 250 251 272 322 351 475 575 589 671 701 761 814 867 917 964 965 966 975 977 1066 1105 1135 1143 1357 1373 23 257 490 672 819 1121 1326 GCGCTG/CAGCGC 0 -4 27 31 4 -6.7 4 6 8 72 127 131 144 168 174 233 290 322 381 439 472 473 479 541 625 696 723 947 971 1007 1139 1173 1174 470 699 808 1014 GCGCTG/CAGCGC 1 -5 27 31 4 -6.7 4 6 8 72 127 131 144 168 174 233 290 322 381 439 472 473 479 541 625 696 723 947 971 1007 1139 1173 1174 470 699 808 1014 GCCGGC/GCCGGC 10 0 25 31 4 -6.7 9 10 20 27 35 43 44 45 51 65 100 102 112 113 118 172 194 195 203 204 318 828 829 987 1338 315 342 963 1126 GCCTGC/GCAGGC 1 -4 28 30 9 -3.9 0 3 62 63 104 108 144 151 160 372 450 451 527 590 645 819 897 917 922 1004 1070 1077 1104 1106 1241 1242 1367 1432 13 91 384 523 791 803 864 1411 1421 GGCTGG/CCAGCC 1 -4 29 29 6 -5.0 40 56 110 135 159 295 345 365 383 441 442 452 491 862 888 967 989 1020 1021 1025 1028 1061 1132 1142 1162 1163 1194 1271 1390 173 222 346 505 592 694 CCAGCC/GGCTGG 10 -3 29 29 6 -5.0 40 56 110 135 159 295 345 365 383 441 442 452 491 862 888 967 989 1020 1021 1025 1028 1061 1132 1142 1162 1163 1194 1271 1390 173 222 346 505 592 694 GTCGCG/CGCGAC 0 -4 27 28 8 -3.8 37 61 144 158 169 170 371 393 405 422 429 583 663 669 703 706 726 750 751 835 950 963 997 1213 1245 1275 1419 49 87 278 724 784 1017 1136 1430 GCATGC/GCATGC 4 -2 25 27 1 -8.5 5 22 89 118 171 220 258 301 342 345 398 441 442 503 504 546 557 558 583 656 722 798 899 1011 1108 948 CGGCAT/ATGCCG 4 -4 25 26 8 -3.4 17 88 102 118 162 197 275 285 337 433 441 442 458 525 569 570 664 692 722 875 941 1027 1328 1354 1355 73 218 331 436 749 768 790 1022 GCTGGG/CCCAGC 1 -3 24 24 8 -3.0 56 110 131 135 233 249 286 359 383 452 641 642 673 887 888 909 943 1028 1093 1132 1139 1271 1329 1437 173 230 251 346 438 554 694 971 CAGCCC/GGGCTG 10 -2 25 24 8 -3.0 61 118 131 189 345 365 441 442 513 695 713 724 740 856 967 1028 1142 1151 1162 1163 1194 1243 1271 1289 1394 222 252 346 548 694 875 1020 1437 CGCTCG/CGAGCG 5 -4 21 21 6 -3.1 86 148 190 520 559 560 584 643 667 668 750 751 774 791 792 817 847 903 971 981 1314 434 541 723 972 1127 1204