#5000/5000 #37.27 # k-mer/r.c. Cluster Offset PosCt wPosCt NegCt HGP_10 AGCCCA/TGGGCT 0 -3 665 661 73 -128.1 1 23 24 28 31 34 36 38 40 42 44 55 75 83 92 99 108 110 111 115 119 124 130 134 135 136 138 145 152 153 157 158 170 175 187 188 189 191 201 206 229 245 252 253 254 259 263 272 289 301 304 317 319 344 349 383 388 393 420 433 437 438 456 464 471 485 489 505 515 520 527 532 543 544 562 573 577 583 591 592 600 621 623 662 672 683 714 727 734 736 741 746 755 764 765 769 775 777 801 808 818 823 848 850 855 860 863 864 868 902 928 945 949 968 974 979 985 993 995 996 997 1001 1004 1016 1020 1033 1040 1046 1047 1060 1077 1082 1094 1102 1112 1115 1129 1172 1181 1184 1188 1189 1190 1194 1195 1201 1209 1217 1236 1250 1254 1274 1276 1288 1312 1316 1344 1362 1378 1399 1409 1428 1448 1452 1470 1474 1477 1483 1489 1515 1517 1521 1522 1530 1543 1549 1554 1556 1557 1561 1568 1577 1578 1579 1584 1601 1621 1638 1640 1648 1649 1651 1656 1657 1667 1705 1713 1714 1735 1766 1812 1815 1823 1831 1849 1862 1871 1877 1878 1883 1888 1900 1903 1904 1909 1916 1933 1946 1954 1956 1958 1959 1962 1971 1979 1984 1985 1986 1994 2009 2018 2025 2030 2031 2035 2039 2042 2057 2064 2067 2070 2071 2087 2126 2141 2167 2171 2174 2182 2189 2193 2196 2200 2205 2217 2230 2235 2252 2260 2263 2268 2285 2288 2296 2305 2309 2311 2324 2330 2331 2338 2340 2343 2357 2359 2364 2366 2384 2388 2398 2401 2434 2457 2471 2474 2487 2489 2498 2502 2509 2512 2527 2538 2549 2552 2553 2559 2562 2571 2576 2577 2585 2598 2599 2609 2613 2614 2617 2635 2636 2637 2640 2645 2647 2654 2657 2678 2679 2709 2717 2718 2720 2724 2730 2744 2754 2757 2763 2770 2776 2780 2791 2797 2800 2802 2805 2812 2815 2819 2820 2825 2833 2836 2841 2845 2848 2851 2855 2860 2862 2883 2888 2914 2925 2929 2931 2935 2940 2955 2965 2972 2979 2989 3002 3003 3031 3035 3038 3053 3059 3060 3061 3073 3076 3077 3081 3088 3100 3118 3122 3129 3136 3144 3147 3148 3163 3169 3173 3181 3191 3198 3208 3212 3214 3221 3222 3229 3230 3233 3234 3254 3259 3263 3272 3286 3303 3314 3315 3319 3329 3348 3350 3352 3375 3385 3395 3396 3402 3408 3420 3428 3430 3443 3444 3447 3448 3452 3455 3456 3459 3460 3466 3475 3477 3479 3488 3489 3493 3494 3504 3508 3524 3525 3526 3534 3535 3541 3549 3561 3563 3576 3594 3601 3603 3604 3605 3623 3627 3651 3656 3662 3667 3674 3678 3680 3701 3704 3710 3713 3722 3725 3736 3743 3749 3752 3769 3780 3814 3815 3818 3823 3826 3832 3836 3837 3844 3846 3860 3863 3868 3870 3871 3875 3877 3878 3880 3887 3894 3900 3904 3914 3932 3933 3942 3945 3946 3949 3951 3952 3955 3956 3968 3969 3982 3989 3990 3993 3995 4005 4013 4022 4025 4029 4030 4042 4043 4047 4048 4052 4061 4067 4079 4081 4084 4085 4089 4090 4094 4113 4125 4127 4132 4139 4149 4150 4152 4153 4155 4162 4165 4175 4179 4185 4186 4200 4213 4221 4244 4264 4276 4285 4294 4301 4314 4315 4318 4319 4320 4329 4337 4345 4359 4365 4372 4387 4397 4400 4408 4420 4424 4425 4432 4436 4439 4441 4445 4453 4458 4466 4474 4477 4485 4505 4521 4528 4530 4536 4538 4540 4549 4550 4551 4552 4558 4559 4561 4566 4571 4594 4615 4617 4620 4625 4639 4643 4650 4652 4661 4664 4672 4673 4684 4698 4699 4703 4722 4725 4726 4733 4739 4742 4744 4754 4756 4757 4759 4765 4766 4781 4791 4792 4794 4805 4806 4813 4832 4848 4867 4878 4881 4892 4901 4903 4912 4945 4954 4956 4961 4964 4977 4982 4991 4993 4995 4999 3 61 106 133 363 466 498 565 885 903 906 923 926 971 1319 1349 1385 1534 1550 1630 1646 1687 1701 1705 1840 1844 1879 1941 2030 2079 2410 2520 2680 2701 2707 2721 2884 2900 2939 2986 3039 3271 3333 3403 3467 3567 3664 3691 3740 3844 3957 4044 4118 4152 4161 4225 4250 4251 4272 4285 4347 4365 4381 4393 4483 4575 4654 4688 4700 4817 4879 4961 4989 GCCCAA/TTGGGC 0 -2 665 653 78 -122.2 1 24 28 31 36 44 49 70 75 81 92 98 99 107 108 110 111 123 135 138 139 145 148 153 157 179 180 187 191 198 214 226 229 245 253 254 273 301 304 313 336 339 344 349 352 383 404 433 437 445 471 472 479 480 483 486 489 501 503 505 515 520 522 531 532 544 554 562 573 591 600 606 610 621 646 662 665 668 672 727 741 744 748 763 764 765 769 776 777 801 808 810 820 842 847 849 863 887 890 945 949 968 993 994 995 996 997 1001 1004 1016 1020 1033 1040 1047 1055 1060 1077 1086 1094 1102 1105 1137 1138 1143 1153 1155 1175 1176 1190 1194 1195 1205 1214 1233 1234 1243 1257 1275 1276 1278 1279 1286 1320 1344 1349 1360 1374 1376 1386 1399 1400 1409 1425 1447 1448 1452 1470 1474 1477 1483 1527 1530 1543 1549 1552 1553 1554 1556 1561 1563 1569 1579 1584 1586 1590 1594 1598 1602 1619 1638 1640 1645 1649 1651 1657 1664 1670 1713 1716 1723 1735 1743 1764 1772 1776 1781 1812 1815 1827 1837 1844 1849 1860 1877 1879 1887 1888 1892 1900 1903 1904 1907 1909 1916 1929 1933 1939 1946 1954 1957 1959 1962 1985 1993 1994 2000 2002 2009 2010 2012 2018 2027 2035 2068 2071 2076 2079 2087 2105 2108 2112 2114 2117 2137 2141 2147 2151 2161 2163 2171 2180 2189 2192 2193 2195 2196 2200 2205 2206 2217 2226 2235 2237 2245 2250 2252 2255 2260 2265 2285 2288 2296 2298 2301 2305 2316 2317 2328 2338 2343 2357 2359 2364 2367 2370 2371 2384 2392 2398 2401 2402 2403 2422 2424 2434 2443 2456 2457 2470 2477 2487 2498 2502 2520 2522 2527 2534 2553 2559 2565 2567 2571 2572 2576 2577 2580 2593 2598 2603 2609 2611 2613 2614 2631 2636 2637 2640 2647 2657 2680 2697 2706 2707 2711 2712 2715 2724 2730 2739 2747 2754 2762 2763 2770 2776 2778 2802 2805 2812 2814 2819 2820 2824 2825 2837 2845 2851 2862 2865 2874 2883 2914 2926 2929 2931 2949 2955 2965 2972 2979 2994 3003 3006 3012 3030 3031 3034 3053 3061 3064 3066 3077 3081 3100 3106 3112 3121 3127 3136 3137 3138 3144 3147 3159 3163 3166 3179 3184 3187 3195 3196 3205 3208 3209 3211 3212 3214 3223 3225 3226 3229 3233 3236 3242 3243 3246 3250 3251 3261 3263 3284 3302 3314 3315 3322 3323 3329 3331 3334 3336 3348 3352 3371 3377 3385 3394 3395 3396 3406 3412 3415 3420 3426 3428 3440 3443 3444 3448 3466 3470 3473 3475 3488 3489 3494 3498 3506 3507 3516 3522 3524 3530 3541 3542 3561 3568 3573 3581 3588 3594 3602 3603 3614 3623 3627 3629 3640 3650 3651 3653 3667 3680 3690 3701 3704 3710 3729 3733 3743 3744 3749 3753 3754 3769 3773 3784 3786 3794 3799 3810 3815 3832 3834 3838 3852 3867 3869 3871 3875 3878 3880 3900 3910 3914 3916 3933 3942 3952 3965 3983 3989 3990 3992 3998 4002 4004 4005 4006 4025 4038 4042 4047 4050 4052 4055 4067 4072 4073 4079 4094 4126 4127 4130 4132 4135 4139 4147 4150 4153 4155 4165 4185 4186 4211 4213 4220 4230 4234 4238 4242 4264 4277 4285 4294 4299 4301 4314 4315 4318 4319 4337 4354 4363 4365 4377 4380 4383 4397 4408 4421 4425 4432 4437 4439 4468 4505 4506 4511 4516 4520 4521 4530 4536 4541 4549 4550 4552 4558 4561 4584 4610 4614 4617 4623 4625 4627 4643 4656 4657 4663 4670 4672 4677 4684 4694 4698 4699 4719 4722 4733 4739 4740 4743 4744 4747 4748 4765 4772 4778 4792 4803 4806 4807 4809 4818 4821 4823 4846 4848 4849 4853 4875 4876 4878 4880 4884 4891 4894 4900 4901 4903 4905 4910 4912 4926 4928 4945 4954 4956 4964 4970 4976 4977 4983 4995 4 61 107 133 313 346 428 442 466 489 664 696 810 838 885 906 1052 1257 1319 1320 1340 1349 1385 1404 1465 1486 1646 1701 2030 2096 2104 2231 2354 2410 2431 2520 2558 2701 2705 2707 2714 2721 2750 2876 2884 2885 2899 2910 2939 3039 3161 3215 3220 3226 3285 3333 3365 3403 3567 3664 3691 3918 3957 4137 4152 4161 4225 4272 4285 4315 4347 4393 4423 4483 4537 4654 4674 4892 GCCCAT/ATGGGC 0 -2 665 646 64 -130.6 15 18 24 28 34 38 40 52 55 69 82 88 99 100 106 110 115 119 130 134 136 137 139 152 176 188 191 213 215 231 252 253 261 265 300 319 335 342 348 374 388 393 398 420 431 438 454 471 475 476 497 499 505 510 516 527 529 534 543 548 571 577 583 589 592 594 609 618 662 667 672 706 731 732 734 736 746 755 775 777 781 784 789 792 805 815 818 850 855 860 864 868 890 902 924 949 962 979 982 993 995 997 1023 1035 1036 1046 1060 1079 1082 1094 1110 1111 1115 1122 1137 1146 1159 1172 1181 1189 1206 1209 1227 1236 1240 1247 1254 1262 1276 1278 1288 1289 1298 1306 1308 1312 1352 1355 1372 1378 1383 1400 1406 1411 1413 1433 1446 1469 1489 1501 1512 1514 1515 1517 1522 1530 1549 1557 1568 1572 1577 1578 1594 1600 1601 1602 1611 1614 1620 1621 1647 1648 1656 1659 1693 1697 1708 1714 1717 1718 1733 1736 1750 1751 1752 1791 1810 1812 1817 1822 1823 1834 1862 1883 1894 1896 1909 1911 1930 1933 1935 1958 1963 1977 1986 1993 1994 2003 2009 2010 2018 2022 2030 2039 2051 2052 2070 2091 2122 2126 2138 2144 2159 2167 2168 2186 2190 2193 2199 2200 2201 2205 2207 2230 2240 2244 2250 2268 2271 2285 2295 2306 2309 2310 2311 2315 2317 2322 2324 2330 2338 2340 2344 2349 2357 2366 2372 2377 2387 2388 2391 2393 2398 2401 2402 2410 2429 2436 2442 2457 2459 2471 2489 2494 2505 2506 2513 2518 2520 2528 2535 2538 2540 2545 2548 2562 2570 2581 2584 2585 2613 2617 2639 2645 2657 2679 2686 2688 2692 2693 2698 2709 2717 2718 2720 2724 2730 2735 2739 2744 2746 2755 2756 2762 2765 2767 2774 2780 2792 2797 2800 2806 2808 2813 2814 2815 2816 2818 2820 2833 2841 2843 2848 2862 2863 2925 2933 2935 2940 2942 2943 2968 2972 2979 2981 2989 3001 3010 3015 3025 3031 3033 3040 3052 3053 3054 3059 3060 3061 3064 3069 3073 3074 3076 3077 3079 3082 3091 3106 3108 3111 3118 3122 3137 3141 3147 3148 3152 3177 3179 3181 3187 3188 3198 3200 3204 3211 3214 3217 3221 3230 3231 3232 3234 3259 3263 3267 3272 3280 3283 3286 3287 3296 3303 3309 3314 3315 3319 3325 3336 3352 3357 3360 3368 3375 3380 3402 3403 3404 3408 3414 3420 3423 3430 3443 3444 3452 3455 3459 3463 3466 3468 3471 3477 3481 3483 3489 3492 3511 3526 3534 3556 3560 3563 3595 3601 3605 3613 3616 3618 3619 3643 3650 3656 3663 3669 3673 3675 3678 3683 3686 3689 3691 3700 3701 3702 3722 3725 3736 3740 3741 3747 3749 3752 3769 3771 3774 3777 3779 3780 3791 3794 3803 3806 3814 3818 3823 3836 3837 3838 3844 3845 3846 3850 3860 3863 3867 3871 3877 3887 3891 3894 3900 3914 3918 3919 3920 3939 3943 3945 3946 3949 3951 3956 3968 3969 3982 3984 3988 3989 3990 3996 3999 4029 4030 4043 4050 4054 4061 4063 4064 4072 4073 4081 4084 4085 4087 4089 4090 4099 4102 4108 4113 4124 4125 4144 4145 4152 4154 4165 4175 4180 4181 4194 4196 4200 4202 4221 4222 4228 4244 4248 4263 4264 4269 4272 4276 4288 4291 4293 4301 4302 4305 4316 4320 4323 4339 4342 4354 4358 4385 4389 4400 4412 4415 4424 4425 4428 4441 4445 4453 4460 4461 4462 4466 4468 4474 4477 4490 4493 4501 4509 4521 4528 4536 4551 4552 4553 4557 4561 4562 4566 4567 4594 4604 4607 4617 4620 4635 4639 4650 4652 4657 4661 4663 4664 4696 4703 4711 4715 4721 4724 4726 4729 4737 4742 4744 4747 4754 4756 4759 4761 4764 4765 4776 4781 4785 4791 4794 4832 4843 4854 4885 4888 4892 4893 4899 4906 4910 4915 4950 4962 4973 4989 4999 3 106 347 384 428 433 565 573 718 744 879 903 923 926 1257 1492 1518 1551 1630 1687 1844 1879 1941 2079 2348 2420 2514 2536 2596 2680 2752 2808 2819 2830 2900 2939 3004 3007 3102 3246 3322 3338 3344 3439 3596 3603 3616 3718 3853 4044 4250 4251 4362 4365 4381 4393 4575 4618 4700 4764 4817 4875 4879 4961 GGCCCA/TGGGCC 0 -3 623 619 46 -137.5 15 17 18 40 49 52 55 80 82 99 107 124 131 145 148 149 152 153 161 188 191 198 213 214 215 217 231 245 253 261 267 273 308 310 317 319 335 336 342 345 348 349 374 381 383 404 431 454 462 472 475 478 479 480 483 486 499 501 502 503 517 519 522 529 531 548 571 588 589 594 600 606 609 630 646 665 667 668 670 706 727 731 754 777 781 784 789 792 797 805 815 842 844 847 848 871 880 887 890 940 945 982 989 993 995 997 1001 1023 1036 1040 1047 1060 1105 1110 1111 1122 1132 1137 1138 1143 1153 1159 1181 1189 1205 1206 1214 1226 1227 1229 1233 1234 1243 1251 1257 1262 1271 1276 1278 1279 1289 1306 1308 1312 1317 1327 1347 1349 1352 1355 1360 1374 1383 1386 1400 1411 1413 1433 1446 1460 1469 1483 1486 1491 1501 1512 1517 1530 1536 1553 1568 1594 1602 1611 1614 1620 1640 1645 1647 1648 1650 1664 1693 1694 1698 1714 1716 1717 1718 1723 1729 1736 1743 1750 1752 1781 1812 1817 1820 1827 1834 1841 1849 1888 1892 1896 1900 1907 1909 1915 1916 1927 1928 1929 1930 1933 1939 1957 1971 1985 1991 1993 2000 2002 2010 2022 2027 2052 2054 2057 2071 2076 2091 2122 2137 2138 2144 2147 2151 2163 2171 2180 2181 2182 2186 2192 2193 2205 2207 2220 2222 2230 2244 2245 2255 2260 2295 2301 2303 2306 2314 2317 2322 2331 2338 2349 2357 2371 2375 2391 2398 2401 2402 2410 2413 2423 2424 2429 2434 2442 2470 2477 2505 2506 2520 2528 2534 2539 2540 2544 2545 2562 2565 2566 2567 2576 2580 2595 2611 2613 2617 2621 2639 2647 2657 2679 2688 2693 2697 2698 2703 2704 2707 2712 2715 2727 2739 2744 2746 2755 2756 2762 2763 2767 2774 2778 2792 2805 2806 2807 2808 2813 2814 2815 2824 2837 2855 2865 2874 2909 2925 2942 2955 2965 2972 2979 2981 2994 3001 3002 3010 3015 3025 3030 3031 3033 3034 3053 3061 3062 3064 3066 3069 3073 3074 3077 3091 3093 3106 3108 3109 3111 3112 3113 3124 3137 3138 3139 3140 3141 3147 3148 3152 3166 3179 3184 3187 3195 3204 3211 3214 3217 3223 3225 3226 3234 3236 3241 3243 3251 3257 3261 3263 3284 3286 3287 3296 3309 3314 3319 3325 3329 3336 3348 3357 3371 3377 3380 3385 3394 3395 3402 3403 3404 3406 3420 3423 3440 3444 3455 3459 3460 3468 3471 3473 3481 3483 3511 3522 3524 3530 3556 3559 3560 3570 3588 3595 3608 3613 3614 3616 3618 3619 3629 3643 3650 3667 3669 3690 3691 3700 3701 3702 3704 3733 3740 3744 3749 3753 3754 3756 3769 3771 3773 3774 3777 3779 3786 3794 3803 3806 3823 3836 3837 3838 3850 3852 3867 3869 3871 3882 3891 3894 3899 3900 3910 3914 3929 3939 3943 3945 3949 3956 3960 3965 3969 3982 3989 3993 3996 3998 3999 4004 4034 4038 4042 4043 4047 4050 4055 4067 4072 4073 4085 4090 4095 4102 4108 4125 4126 4145 4147 4154 4165 4180 4181 4185 4194 4211 4222 4238 4242 4248 4263 4264 4272 4277 4279 4299 4301 4313 4316 4337 4354 4361 4363 4380 4383 4385 4389 4425 4428 4453 4460 4461 4468 4474 4478 4479 4509 4520 4528 4536 4541 4553 4555 4561 4584 4601 4607 4614 4623 4627 4656 4657 4661 4663 4664 4669 4670 4681 4703 4726 4736 4740 4747 4748 4757 4772 4785 4803 4809 4812 4814 4818 4823 4843 4849 4876 4884 4888 4894 4900 4905 4906 4910 4915 4926 4950 4968 4970 4976 4989 3 4 58 133 210 347 428 442 573 576 701 1052 1097 1127 1340 1465 1486 1926 2096 2231 2431 2514 2558 2596 2648 2680 2819 2830 2885 2910 2939 3004 3007 3102 3338 3344 3588 3603 3691 3918 3920 4362 4393 4399 4423 4875 AAGCCC/GGGCTT 0 -4 580 576 59 -114.3 1 24 28 31 33 34 36 38 40 43 44 57 74 75 92 104 107 110 115 119 120 130 135 136 138 145 152 157 158 170 187 201 217 229 245 249 254 259 268 301 304 313 317 324 330 349 371 379 388 390 393 420 425 427 438 443 444 456 464 471 479 515 519 543 562 563 573 583 592 593 597 600 621 623 630 646 662 665 670 672 683 691 697 711 715 734 736 746 749 764 765 769 775 777 796 801 802 804 807 808 837 839 848 850 857 863 887 896 902 908 913 945 946 949 971 974 979 985 987 995 997 1001 1016 1033 1040 1090 1102 1104 1112 1115 1116 1127 1129 1172 1181 1192 1194 1201 1209 1218 1254 1257 1276 1288 1291 1312 1362 1368 1391 1399 1407 1409 1448 1464 1470 1477 1483 1489 1500 1517 1522 1539 1548 1549 1554 1568 1578 1584 1621 1638 1648 1649 1651 1713 1735 1737 1739 1766 1811 1812 1823 1843 1848 1859 1871 1877 1882 1883 1895 1900 1904 1916 1924 1925 1927 1929 1938 1959 1979 1984 1987 1994 2007 2009 2018 2021 2039 2042 2060 2067 2070 2071 2087 2097 2109 2111 2131 2132 2141 2148 2166 2182 2193 2196 2200 2209 2217 2218 2235 2238 2252 2285 2311 2324 2330 2336 2338 2340 2343 2357 2359 2366 2430 2434 2437 2441 2448 2457 2469 2471 2484 2487 2502 2530 2532 2546 2549 2553 2559 2560 2562 2577 2585 2599 2609 2610 2613 2623 2628 2636 2654 2663 2673 2679 2698 2714 2718 2720 2721 2724 2730 2744 2754 2757 2768 2770 2776 2780 2797 2805 2812 2815 2820 2833 2836 2841 2847 2848 2851 2883 2888 2901 2910 2925 2929 2931 2939 2951 2955 2957 2965 2972 2982 2989 3000 3004 3026 3028 3031 3038 3053 3059 3060 3061 3065 3073 3076 3077 3081 3098 3100 3122 3124 3136 3144 3147 3148 3163 3172 3178 3181 3191 3199 3212 3214 3217 3221 3222 3229 3233 3234 3265 3272 3286 3290 3314 3315 3329 3340 3348 3350 3352 3375 3377 3382 3395 3396 3402 3403 3406 3428 3430 3443 3447 3448 3455 3456 3457 3468 3476 3477 3479 3489 3490 3493 3494 3504 3508 3520 3525 3526 3534 3541 3542 3553 3558 3561 3601 3603 3631 3665 3667 3668 3685 3691 3695 3698 3701 3704 3710 3711 3713 3722 3725 3726 3731 3736 3743 3749 3769 3782 3814 3816 3821 3823 3826 3836 3837 3841 3846 3854 3857 3859 3860 3863 3878 3880 3887 3895 3900 3901 3927 3932 3933 3935 3942 3955 3956 3957 3968 3969 4005 4028 4029 4030 4037 4042 4045 4048 4067 4069 4077 4089 4090 4094 4123 4125 4127 4132 4134 4138 4139 4149 4150 4155 4183 4185 4186 4195 4200 4213 4221 4231 4241 4264 4276 4284 4285 4287 4292 4294 4301 4314 4318 4320 4325 4329 4337 4353 4359 4381 4408 4429 4436 4439 4441 4453 4458 4466 4474 4487 4505 4521 4522 4523 4528 4531 4538 4540 4552 4558 4566 4572 4585 4594 4606 4615 4617 4620 4628 4643 4661 4672 4673 4676 4685 4689 4690 4698 4707 4725 4726 4730 4733 4739 4742 4744 4745 4756 4759 4761 4765 4766 4775 4782 4794 4805 4806 4810 4813 4817 4833 4844 4848 4852 4860 4862 4864 4867 4878 4887 4892 4901 4903 4954 4967 4978 4990 4995 4999 84 166 352 363 466 565 757 903 906 923 932 971 1047 1553 1630 1701 1705 1840 1879 2030 2079 2316 2441 2516 2517 2694 2701 2721 2818 2939 3110 3271 3293 3328 3333 3403 3662 3664 3675 3740 3752 3820 3914 4069 4152 4250 4251 4285 4347 4352 4393 4412 4471 4525 4577 4664 4817 4910 4989 GCCCAC/GTGGGC 0 -2 385 400 28 -89.3 17 42 44 49 55 64 65 80 82 83 115 124 131 148 149 152 153 155 161 162 170 174 175 176 183 206 215 221 225 239 246 259 263 267 272 289 295 306 310 317 319 325 341 345 381 404 412 431 456 462 464 478 485 498 502 517 529 560 589 596 623 683 692 704 727 729 754 765 781 784 797 848 861 867 873 880 922 927 928 934 940 951 985 989 997 1006 1011 1040 1044 1054 1082 1129 1132 1151 1154 1165 1173 1179 1181 1184 1188 1189 1190 1197 1217 1226 1229 1249 1250 1251 1271 1273 1281 1307 1316 1317 1324 1362 1423 1437 1447 1486 1507 1521 1568 1614 1650 1667 1694 1698 1705 1723 1729 1738 1750 1765 1766 1777 1780 1800 1817 1820 1829 1871 1888 1915 1916 1928 1956 1971 1979 1983 1985 1991 2010 2022 2025 2031 2057 2059 2064 2067 2075 2082 2101 2116 2137 2174 2180 2181 2182 2214 2220 2222 2227 2228 2248 2260 2262 2263 2289 2295 2314 2331 2340 2345 2358 2366 2371 2375 2376 2380 2413 2423 2466 2485 2492 2505 2509 2512 2528 2539 2544 2549 2552 2566 2575 2576 2586 2595 2597 2599 2611 2635 2663 2671 2678 2685 2703 2704 2718 2727 2744 2755 2757 2762 2791 2805 2806 2826 2836 2855 2869 2874 2909 2925 2955 2978 2988 3005 3006 3060 3062 3074 3090 3109 3113 3129 3139 3140 3148 3169 3191 3212 3216 3222 3236 3241 3273 3282 3287 3294 3296 3319 3348 3350 3395 3402 3455 3456 3459 3460 3467 3482 3483 3486 3493 3524 3525 3549 3552 3556 3557 3559 3569 3570 3604 3608 3619 3628 3641 3662 3669 3677 3704 3730 3754 3760 3788 3826 3827 3850 3864 3868 3870 3877 3882 3899 3932 3934 3949 3955 3960 3980 3993 3995 4010 4013 4014 4050 4052 4114 4120 4125 4149 4155 4162 4167 4242 4252 4278 4279 4298 4321 4322 4328 4329 4337 4345 4359 4360 4376 4387 4390 4392 4417 4420 4436 4438 4463 4478 4485 4489 4502 4526 4528 4536 4538 4540 4544 4571 4577 4605 4615 4619 4648 4662 4663 4669 4673 4725 4736 4741 4751 4753 4757 4760 4766 4805 4812 4814 4846 4881 4961 4982 58 112 133 210 270 576 1097 1103 1127 1357 1550 1705 1929 2338 2648 2986 3004 3007 3254 3338 3344 3464 3467 3740 4118 4137 4167 4688 TGCCCA/TGGGCA 0 -3 397 392 44 -74.2 24 28 33 35 40 64 69 81 86 96 100 106 107 116 130 139 155 162 176 207 213 221 225 226 239 246 256 295 313 322 325 334 339 341 352 357 412 431 445 476 497 498 505 510 529 534 543 562 596 606 649 662 681 692 729 744 747 748 759 763 775 787 810 820 849 850 867 873 887 890 922 924 928 944 951 962 1006 1009 1035 1054 1069 1094 1146 1151 1154 1155 1173 1175 1190 1197 1229 1240 1249 1268 1273 1284 1286 1298 1312 1314 1320 1324 1338 1354 1376 1401 1437 1455 1486 1507 1517 1527 1563 1569 1586 1590 1598 1600 1619 1645 1659 1670 1697 1738 1751 1764 1765 1772 1776 1777 1780 1791 1800 1803 1822 1863 1945 1963 1977 2003 2012 2059 2068 2075 2082 2101 2105 2108 2112 2114 2116 2140 2159 2161 2168 2190 2195 2199 2201 2226 2227 2228 2237 2240 2248 2250 2265 2267 2315 2328 2344 2358 2366 2367 2370 2375 2376 2377 2380 2392 2422 2443 2456 2459 2494 2513 2522 2535 2548 2572 2575 2576 2581 2584 2593 2603 2631 2671 2680 2685 2686 2706 2711 2718 2735 2747 2750 2765 2816 2818 2826 2840 2858 2862 2863 2869 2902 2949 2964 2978 3006 3032 3040 3052 3054 3079 3081 3090 3159 3177 3188 3192 3209 3216 3217 3231 3232 3242 3246 3267 3273 3274 3280 3282 3283 3294 3302 3323 3334 3336 3360 3368 3394 3412 3415 3425 3426 3443 3466 3467 3482 3489 3498 3506 3507 3516 3542 3552 3557 3574 3581 3594 3620 3628 3640 3641 3663 3675 3677 3683 3686 3689 3729 3741 3747 3754 3769 3784 3788 3791 3810 3827 3840 3872 3879 3893 3916 3918 3919 3934 3954 3983 3984 3988 3990 3992 4002 4006 4010 4052 4053 4063 4064 4087 4114 4124 4130 4135 4144 4167 4196 4202 4207 4220 4230 4234 4278 4288 4291 4298 4302 4312 4321 4322 4328 4339 4342 4358 4409 4412 4417 4421 4428 4438 4452 4463 4490 4491 4501 4506 4516 4526 4544 4557 4565 4567 4577 4604 4610 4619 4624 4635 4636 4648 4662 4677 4686 4711 4715 4719 4721 4724 4729 4737 4741 4743 4751 4753 4760 4761 4764 4779 4807 4821 4824 4853 4854 4875 4880 4881 4891 4893 4910 4931 4973 4983 4984 112 270 346 384 433 489 664 696 718 744 1097 1257 1320 1357 1365 1404 1518 1551 1929 2104 2338 2354 2536 2714 2750 2808 2899 3161 3220 3246 3254 3285 3286 3322 3333 3596 3853 4137 4167 4537 4618 4674 4764 4892 CCCATT/AATGGG 0 -1 379 372 117 -33.6 15 18 19 31 58 62 99 106 130 136 137 153 155 176 191 210 259 261 289 305 388 395 420 431 448 451 471 475 502 516 517 520 571 577 592 594 610 618 638 662 667 672 713 746 755 792 850 853 855 868 898 902 924 948 949 958 960 962 979 1020 1023 1030 1035 1036 1060 1079 1094 1132 1172 1181 1209 1231 1236 1240 1243 1258 1274 1289 1306 1312 1352 1362 1365 1383 1406 1411 1489 1501 1514 1517 1530 1549 1571 1578 1601 1611 1620 1635 1647 1659 1668 1697 1713 1714 1736 1751 1752 1773 1782 1812 1827 1834 1859 1862 1877 1883 1886 1894 1896 1909 1947 1963 2000 2018 2019 2022 2062 2070 2082 2091 2122 2154 2167 2190 2199 2200 2245 2250 2268 2285 2309 2310 2311 2317 2322 2337 2357 2366 2377 2382 2388 2391 2393 2400 2401 2402 2410 2429 2440 2442 2446 2460 2494 2505 2513 2514 2518 2520 2535 2538 2545 2570 2581 2584 2588 2613 2614 2617 2639 2645 2662 2679 2692 2693 2726 2730 2738 2739 2746 2762 2767 2780 2792 2815 2816 2820 2833 2848 2856 2867 2871 2881 2911 2939 2951 2972 2979 2989 3001 3009 3025 3031 3040 3053 3064 3073 3095 3111 3112 3114 3141 3147 3152 3160 3179 3184 3188 3200 3204 3211 3214 3226 3232 3234 3258 3263 3272 3280 3314 3315 3319 3340 3352 3375 3380 3401 3402 3404 3441 3444 3451 3455 3456 3466 3468 3477 3483 3489 3492 3511 3534 3546 3560 3562 3587 3601 3613 3618 3650 3656 3667 3673 3678 3683 3689 3700 3701 3702 3725 3737 3749 3753 3759 3769 3771 3774 3782 3794 3818 3823 3836 3844 3846 3860 3871 3877 3883 3894 3929 3943 3945 3946 3949 3956 3988 3999 4019 4029 4043 4072 4073 4081 4084 4085 4089 4090 4098 4099 4144 4154 4165 4192 4194 4196 4221 4264 4269 4288 4316 4320 4330 4331 4333 4358 4376 4389 4412 4428 4453 4460 4461 4462 4466 4468 4477 4501 4509 4523 4525 4604 4617 4652 4657 4661 4663 4664 4686 4715 4721 4729 4744 4747 4765 4772 4791 4794 4812 4818 4822 4830 4843 4873 4886 4893 4906 4910 4915 4989 4999 3 18 19 22 23 35 49 80 108 279 341 384 389 391 442 550 569 600 639 641 718 739 768 903 923 936 1164 1214 1257 1345 1366 1393 1398 1471 1518 1551 1630 1634 1687 1750 1760 1774 1828 1844 1880 1941 1964 2079 2081 2106 2161 2264 2317 2369 2420 2513 2514 2523 2540 2598 2603 2639 2668 2675 2697 2706 2709 2752 2777 2794 2797 2885 2939 3199 3225 3253 3279 3390 3439 3460 3499 3596 3597 3603 3727 3744 3749 3760 3782 3853 3864 3926 4009 4022 4038 4044 4068 4102 4110 4115 4157 4206 4250 4251 4316 4393 4524 4578 4609 4657 4673 4700 4764 4860 4910 4961 4985 AGGCCC/GGGCCT 0 -4 372 362 31 -75.9 15 18 22 51 52 58 60 66 101 142 145 148 149 153 191 231 245 253 254 267 273 308 312 317 319 336 342 349 380 404 454 479 486 502 519 589 600 614 667 668 670 695 706 722 785 789 792 815 844 847 851 904 945 966 986 993 995 1036 1110 1111 1122 1137 1138 1145 1159 1189 1205 1226 1227 1234 1251 1273 1276 1312 1327 1336 1353 1355 1360 1380 1383 1386 1468 1486 1517 1530 1536 1553 1555 1559 1568 1594 1595 1602 1611 1640 1651 1675 1693 1714 1715 1723 1724 1727 1729 1736 1741 1750 1759 1767 1817 1834 1841 1849 1858 1888 1892 1907 1909 1929 1933 1949 1961 1971 1993 2000 2057 2091 2122 2144 2147 2151 2170 2192 2220 2233 2255 2295 2303 2314 2332 2349 2357 2371 2388 2398 2401 2402 2410 2429 2433 2472 2506 2520 2525 2534 2540 2545 2565 2566 2567 2611 2621 2639 2679 2693 2698 2703 2712 2737 2739 2746 2762 2766 2770 2774 2778 2792 2806 2808 2813 2814 2815 2830 2854 2855 2865 2874 2885 2895 2909 2913 2917 2965 2981 3001 3002 3031 3064 3066 3069 3077 3112 3124 3137 3139 3141 3147 3148 3165 3166 3170 3184 3187 3204 3210 3211 3226 3241 3261 3263 3286 3314 3319 3325 3330 3361 3380 3385 3394 3395 3402 3420 3438 3444 3450 3455 3460 3468 3471 3473 3481 3483 3511 3522 3524 3530 3535 3543 3556 3559 3608 3613 3618 3644 3667 3684 3693 3702 3704 3713 3714 3735 3740 3753 3754 3767 3769 3777 3792 3794 3797 3806 3837 3838 3845 3852 3855 3866 3867 3871 3891 3894 3900 3923 3940 3945 3949 3956 3977 3981 3989 3993 3996 4004 4026 4042 4043 4055 4067 4072 4085 4090 4095 4102 4103 4108 4125 4126 4154 4165 4222 4248 4263 4264 4272 4277 4289 4301 4313 4326 4363 4380 4383 4385 4402 4425 4428 4460 4468 4478 4479 4528 4560 4578 4584 4601 4607 4613 4614 4618 4623 4627 4657 4661 4664 4681 4688 4703 4710 4715 4740 4747 4757 4785 4800 4804 4809 4812 4823 4829 4845 4849 4863 4876 4884 4906 4910 4916 4940 4959 4989 4 10 11 58 133 210 347 428 576 1052 1097 1127 1534 1748 1895 2420 2713 2885 2939 3004 3229 3691 3744 3807 3867 3918 3920 4238 4363 4393 4423 AAAGCC/GGCTTT 0 -5 337 331 105 -29.6 7 34 36 38 67 78 102 107 115 119 130 135 138 145 152 166 170 187 189 217 229 268 317 420 443 444 471 479 507 518 541 563 583 589 592 597 604 619 676 683 691 715 736 746 804 807 808 817 877 887 902 913 945 946 949 957 971 986 993 997 1016 1055 1090 1092 1097 1102 1129 1132 1135 1181 1194 1201 1209 1231 1249 1257 1283 1333 1340 1368 1378 1379 1399 1407 1448 1483 1497 1500 1507 1533 1548 1549 1554 1567 1584 1621 1631 1638 1651 1707 1732 1735 1754 1766 1793 1802 1812 1823 1848 1855 1871 1899 1900 1916 1927 1929 1945 1984 2000 2009 2018 2023 2030 2034 2061 2070 2087 2097 2111 2125 2182 2183 2184 2209 2235 2238 2263 2311 2322 2336 2343 2357 2359 2366 2426 2430 2448 2471 2498 2506 2530 2532 2562 2577 2579 2605 2654 2658 2663 2698 2720 2724 2727 2730 2763 2768 2770 2776 2797 2812 2820 2841 2851 2859 2888 2891 2910 2912 2929 2931 2939 2957 2963 2965 2972 2980 2983 2989 2994 3004 3013 3016 3060 3062 3065 3077 3079 3081 3124 3148 3163 3181 3191 3199 3212 3214 3224 3229 3233 3234 3247 3270 3272 3302 3315 3316 3341 3348 3350 3356 3357 3375 3395 3402 3403 3428 3430 3432 3458 3477 3508 3526 3538 3541 3545 3553 3558 3601 3665 3691 3695 3701 3704 3710 3711 3713 3725 3731 3743 3749 3769 3814 3815 3821 3826 3830 3846 3854 3863 3865 3875 3880 3887 3900 3901 3914 3919 3935 3956 3960 4009 4028 4067 4090 4127 4134 4138 4139 4149 4206 4221 4231 4239 4259 4261 4276 4284 4285 4314 4326 4329 4353 4362 4380 4383 4408 4429 4436 4447 4453 4466 4475 4487 4496 4505 4522 4523 4552 4558 4566 4585 4606 4615 4617 4621 4643 4661 4690 4698 4725 4730 4739 4744 4759 4761 4765 4794 4813 4848 4864 4903 4907 4954 4967 4990 4995 4998 84 149 154 241 334 338 342 352 353 363 435 513 523 544 574 630 641 721 797 820 903 905 923 932 1040 1063 1126 1233 1252 1278 1344 1472 1600 1701 1705 1813 1858 1871 1879 1892 2024 2030 2101 2144 2185 2206 2238 2301 2417 2441 2471 2503 2517 2574 2614 2651 2664 2721 2818 2834 2924 2939 3017 3037 3057 3110 3145 3197 3201 3261 3293 3333 3403 3425 3609 3662 3668 3669 3675 3740 3752 3876 3914 3946 4066 4119 4130 4188 4191 4219 4259 4318 4347 4356 4501 4525 4569 4577 4692 4787 4795 4824 4872 4881 4989 TGGCCC/GGGCCA 0 -4 315 313 27 -65.4 1 4 17 80 131 191 199 206 213 217 236 240 273 310 348 374 381 383 421 431 462 464 475 478 486 499 517 529 571 588 609 646 665 667 727 736 754 756 777 781 816 842 877 912 923 924 982 997 1001 1029 1037 1040 1047 1085 1111 1117 1132 1138 1139 1153 1161 1178 1198 1206 1223 1243 1246 1257 1262 1269 1276 1278 1279 1289 1308 1315 1319 1322 1347 1349 1369 1371 1413 1416 1446 1460 1469 1483 1485 1491 1497 1583 1602 1647 1648 1650 1679 1683 1698 1716 1718 1743 1781 1820 1821 1827 1868 1878 1889 1896 1900 1907 1916 1927 1930 1932 1951 1957 1985 1989 2019 2022 2030 2054 2071 2074 2076 2088 2091 2125 2138 2171 2178 2205 2207 2244 2245 2247 2249 2299 2301 2306 2331 2338 2371 2382 2383 2391 2413 2419 2424 2442 2476 2520 2539 2544 2551 2556 2576 2580 2591 2595 2617 2639 2715 2739 2742 2756 2767 2805 2809 2824 2840 2874 2925 2942 2954 2955 2972 2994 3010 3011 3015 3023 3030 3033 3061 3062 3073 3091 3106 3107 3108 3112 3124 3137 3140 3171 3179 3195 3211 3251 3284 3285 3306 3309 3316 3321 3336 3348 3357 3367 3374 3377 3380 3406 3416 3418 3433 3440 3441 3459 3483 3560 3588 3593 3611 3614 3616 3629 3643 3650 3654 3690 3691 3694 3700 3701 3720 3727 3733 3744 3758 3771 3774 3786 3794 3808 3817 3819 3823 3865 3869 3882 3917 3929 3939 3950 3965 3966 3969 3970 3976 3998 3999 4020 4030 4034 4107 4129 4145 4147 4180 4181 4192 4194 4204 4238 4239 4277 4278 4299 4307 4354 4361 4368 4379 4385 4386 4407 4461 4468 4520 4541 4553 4620 4623 4657 4713 4748 4752 4769 4771 4793 4803 4808 4814 4818 4822 4871 4888 4894 4915 4923 4968 3 346 366 442 701 1340 1465 1486 1615 2096 2231 2431 2514 2596 2690 2910 3102 3487 3603 3791 4152 4362 4399 4586 4661 4764 4875 CCCAAT/ATTGGG 0 -1 305 307 97 -27.6 24 28 36 60 70 75 107 110 123 138 139 145 179 180 187 191 202 226 229 241 264 270 273 298 311 339 344 349 404 405 437 445 464 471 477 515 520 544 562 574 600 606 636 646 665 672 691 712 745 764 766 797 830 839 847 887 945 989 997 1001 1065 1105 1137 1138 1153 1173 1175 1190 1205 1243 1257 1279 1289 1311 1371 1477 1483 1530 1543 1549 1556 1569 1586 1590 1594 1602 1664 1684 1705 1708 1743 1757 1812 1827 1842 1849 1868 1875 1900 1901 1902 1903 1904 1926 1929 1962 1994 2000 2006 2018 2027 2071 2076 2081 2087 2089 2094 2096 2105 2137 2147 2161 2163 2171 2180 2193 2200 2203 2260 2316 2322 2343 2364 2367 2371 2398 2402 2403 2456 2457 2470 2508 2514 2539 2553 2576 2577 2613 2622 2627 2631 2637 2706 2707 2730 2732 2747 2763 2767 2776 2790 2802 2812 2820 2847 2862 2884 2944 2965 2972 3012 3031 3034 3053 3060 3064 3066 3077 3085 3112 3147 3152 3157 3163 3166 3184 3187 3199 3211 3233 3236 3240 3243 3315 3331 3348 3352 3359 3385 3396 3406 3418 3420 3426 3440 3443 3470 3475 3476 3480 3498 3516 3522 3527 3541 3578 3594 3603 3614 3629 3650 3654 3701 3704 3733 3743 3747 3750 3753 3773 3794 3803 3821 3838 3869 3871 3880 3910 3911 3933 3964 3965 3987 4041 4047 4050 4055 4067 4073 4085 4094 4122 4135 4139 4153 4157 4158 4165 4212 4227 4230 4238 4260 4264 4285 4299 4301 4332 4337 4363 4401 4409 4432 4439 4468 4477 4482 4505 4535 4538 4541 4553 4558 4584 4617 4623 4625 4629 4699 4713 4740 4744 4818 4823 4849 4863 4875 4878 4880 4903 4905 4935 4954 4965 4995 92 104 109 133 170 222 241 250 313 464 469 491 664 743 940 1036 1133 1233 1235 1249 1257 1269 1360 1377 1404 1443 1454 1456 1538 1625 1632 1731 1815 1850 1869 1975 2030 2093 2097 2174 2231 2244 2289 2309 2399 2430 2481 2520 2527 2546 2558 2565 2585 2630 2670 2717 2729 2783 2805 2876 2884 2885 2902 2939 2993 3095 3117 3166 3187 3233 3369 3520 3525 3595 3664 3833 3834 3876 3903 4006 4266 4285 4423 4427 4441 4480 4537 4563 4577 4601 4654 4674 4755 4768 4786 4880 4953 ATGCCC/GGGCAT 0 -4 295 292 40 -50.3 33 69 83 100 105 107 118 130 136 162 174 176 193 196 209 227 246 256 270 276 295 318 330 334 339 341 356 361 412 431 457 505 510 534 538 595 606 649 662 684 692 748 783 820 821 846 849 867 887 890 926 928 937 944 1007 1040 1054 1065 1070 1087 1092 1128 1142 1146 1154 1155 1167 1190 1204 1216 1229 1274 1284 1286 1301 1312 1314 1324 1326 1376 1378 1382 1385 1387 1401 1419 1437 1455 1465 1488 1507 1517 1542 1550 1570 1574 1586 1590 1598 1617 1619 1659 1670 1705 1721 1734 1758 1772 1822 1863 2029 2038 2047 2049 2059 2075 2086 2101 2105 2108 2112 2134 2140 2149 2150 2161 2169 2190 2199 2201 2208 2221 2226 2260 2265 2267 2269 2272 2273 2377 2396 2426 2450 2459 2467 2494 2507 2513 2535 2537 2542 2572 2584 2624 2672 2687 2718 2723 2735 2765 2798 2810 2816 2818 2826 2835 2853 2873 2902 2912 2938 2975 2978 2998 3006 3032 3040 3052 3054 3056 3081 3083 3095 3096 3116 3125 3150 3177 3201 3216 3218 3231 3232 3274 3291 3334 3336 3342 3394 3409 3412 3415 3417 3443 3482 3489 3497 3505 3516 3521 3550 3552 3581 3587 3594 3622 3692 3754 3769 3783 3801 3811 3833 3879 3902 3915 3918 3919 3983 3992 4002 4015 4052 4053 4063 4071 4094 4116 4124 4128 4144 4167 4176 4202 4220 4223 4273 4290 4302 4312 4322 4324 4333 4335 4355 4417 4428 4430 4440 4463 4470 4473 4483 4499 4506 4507 4544 4546 4557 4563 4577 4604 4612 4624 4636 4653 4662 4667 4668 4680 4708 4709 4721 4764 4779 4806 4807 4870 4880 4898 4910 4914 4935 4937 4965 270 346 396 411 431 512 695 744 1395 1499 1551 1670 1759 1929 2274 2338 2373 2509 2603 2687 2708 2750 2808 2874 3254 3285 3333 3596 3663 3848 3853 3889 3946 3954 4137 4245 4293 4537 4724 4967 CCCATG/CATGGG 0 -1 266 272 61 -34.2 15 18 24 28 34 38 40 53 55 79 82 110 118 119 122 128 130 134 139 185 188 215 239 252 300 330 335 367 393 424 438 499 510 513 529 543 548 583 594 649 715 731 732 734 736 758 775 781 783 784 818 826 860 864 867 890 899 940 948 965 990 1082 1111 1117 1119 1140 1150 1209 1249 1254 1256 1264 1271 1283 1288 1298 1378 1394 1512 1522 1538 1557 1577 1717 1732 1733 1750 1784 1817 1823 1883 1911 1935 1994 2003 2010 2030 2031 2051 2064 2082 2133 2168 2187 2201 2207 2219 2240 2244 2261 2272 2274 2304 2317 2324 2340 2349 2367 2372 2375 2380 2383 2436 2459 2476 2483 2506 2518 2524 2528 2540 2548 2554 2585 2624 2672 2679 2709 2710 2724 2738 2744 2755 2765 2766 2774 2800 2806 2808 2818 2841 2843 2863 2879 2906 2933 2935 2940 2984 2989 3015 3053 3054 3079 3087 3091 3106 3118 3171 3177 3217 3221 3230 3231 3234 3287 3296 3303 3352 3375 3384 3397 3443 3455 3457 3459 3475 3556 3560 3563 3595 3611 3612 3619 3669 3682 3709 3722 3733 3739 3747 3759 3806 3837 3850 3873 3882 3887 3918 3919 3920 3939 3948 3969 3988 4063 4064 4077 4085 4087 4124 4125 4152 4200 4236 4263 4272 4280 4291 4302 4307 4354 4386 4399 4400 4413 4445 4474 4490 4519 4520 4521 4551 4557 4562 4567 4594 4620 4633 4639 4650 4703 4714 4717 4724 4764 4776 4785 4885 4888 4892 4915 4918 4935 4950 4967 3 195 331 428 573 679 815 825 856 874 879 1122 1198 1217 1261 1344 1365 1492 1502 1549 1598 1687 1744 1785 2036 2131 2244 2598 2615 2680 2767 2808 2884 2906 3003 3004 3007 3242 3285 3322 3323 3338 3344 3408 3432 3449 3473 3603 3842 3914 4108 4365 4494 4563 4601 4669 4807 4817 4859 4879 4880 CCCATA/TATGGG 0 -1 266 259 81 -23.7 18 28 52 60 69 70 100 110 123 152 176 179 180 215 253 265 319 348 374 409 422 454 476 505 543 557 592 594 609 649 667 693 706 736 743 758 759 789 792 805 815 822 850 936 1012 1036 1110 1115 1137 1139 1146 1151 1159 1161 1181 1189 1206 1227 1247 1278 1308 1413 1427 1433 1453 1469 1515 1558 1566 1572 1584 1602 1611 1612 1614 1621 1655 1656 1679 1683 1702 1708 1714 1715 1718 1768 1791 1796 1823 1858 1977 2009 2052 2122 2126 2140 2144 2186 2193 2205 2207 2244 2295 2302 2306 2316 2319 2330 2344 2387 2393 2402 2427 2429 2457 2471 2489 2494 2548 2562 2585 2657 2662 2698 2705 2717 2724 2733 2746 2780 2814 2852 2866 2893 2925 2935 2942 2943 2979 2981 3001 3015 3052 3069 3074 3076 3077 3082 3101 3106 3108 3137 3181 3187 3198 3232 3267 3286 3309 3339 3357 3368 3394 3402 3403 3420 3423 3434 3452 3453 3471 3481 3511 3526 3601 3605 3616 3632 3643 3663 3685 3691 3695 3740 3741 3752 3779 3780 3791 3803 3808 3814 3838 3841 3845 3867 3891 3894 3900 3914 3938 3943 3945 3968 3982 3984 3989 3991 4030 4043 4050 4054 4061 4077 4084 4096 4113 4136 4145 4146 4166 4180 4181 4190 4200 4222 4244 4248 4261 4323 4339 4415 4424 4425 4441 4493 4521 4536 4552 4561 4566 4597 4607 4635 4657 4661 4680 4688 4711 4716 4726 4728 4737 4748 4754 4781 4794 4816 4832 4833 4843 4858 4882 4979 4990 4994 39 79 193 204 271 347 419 428 433 483 517 565 739 757 811 980 1051 1162 1187 1298 1430 1465 1603 1622 1650 1656 1720 1831 1839 1879 1938 1945 1958 2155 2252 2388 2427 2476 2536 2701 2703 2750 2819 2830 2897 2900 2945 3102 3189 3246 3389 3428 3458 3489 3518 3593 3616 3662 3682 3718 3854 4004 4013 4087 4194 4265 4296 4362 4378 4381 4502 4575 4593 4618 4622 4703 4732 4898 4907 4956 4958 CCCAAC/GTTGGG 0 -1 239 244 81 -20.8 31 36 81 92 98 101 114 133 135 145 151 178 218 228 245 267 294 390 401 445 475 483 486 489 505 541 544 558 566 597 713 721 727 765 794 795 801 808 820 839 849 875 946 958 986 990 1047 1050 1086 1096 1097 1138 1165 1179 1204 1234 1276 1278 1315 1334 1349 1397 1399 1400 1409 1452 1470 1483 1486 1519 1524 1553 1561 1598 1641 1645 1651 1652 1657 1663 1670 1706 1716 1723 1798 1827 1844 1863 1877 1883 1900 1909 1917 1933 1946 1955 1980 1985 1991 1993 1995 2022 2045 2072 2086 2101 2117 2145 2171 2192 2195 2196 2205 2208 2214 2216 2217 2235 2240 2243 2252 2255 2296 2305 2333 2357 2384 2389 2401 2422 2443 2477 2487 2498 2527 2534 2567 2598 2603 2609 2614 2618 2640 2680 2714 2801 2824 2845 2867 2874 2878 2900 2913 2926 2931 2966 2979 2994 3003 3015 3047 3103 3111 3144 3207 3212 3246 3251 3263 3276 3329 3334 3377 3394 3418 3446 3481 3507 3518 3524 3530 3533 3560 3561 3568 3623 3710 3754 3784 3805 3810 3831 3832 3914 3929 3984 3992 4002 4005 4020 4025 4038 4103 4123 4132 4182 4185 4227 4234 4238 4242 4253 4272 4295 4317 4318 4334 4340 4382 4425 4432 4516 4521 4552 4569 4588 4672 4677 4684 4733 4743 4744 4814 4845 4881 4887 4912 4982 4991 21 38 79 81 383 489 535 565 568 583 603 639 676 734 796 814 838 885 980 985 1020 1062 1076 1097 1151 1215 1230 1248 1340 1351 1397 1557 1567 1585 1588 1636 1710 1725 1817 1872 1956 2016 2039 2058 2104 2254 2315 2414 2431 2501 2693 2721 2899 2909 3039 3093 3094 3109 3200 3391 3403 3492 3601 3603 3762 3775 3807 3915 3968 4102 4152 4161 4266 4315 4352 4402 4424 4589 4614 4640 4691 CCCACC/GGTGGG 1 -4 225 239 48 -32.8 17 30 49 64 72 82 90 124 126 131 137 149 152 162 176 177 183 190 194 209 221 234 243 263 300 306 310 317 322 328 344 348 404 481 485 530 629 642 683 692 741 781 797 821 848 880 938 940 979 989 1011 1054 1082 1096 1115 1124 1129 1151 1165 1173 1189 1190 1230 1232 1271 1281 1307 1317 1367 1418 1437 1447 1454 1521 1568 1614 1698 1720 1726 1746 1750 1757 1765 1766 1777 1782 1817 1820 1838 1892 1897 1956 1984 1991 2022 2025 2067 2071 2101 2133 2147 2214 2220 2269 2295 2296 2314 2333 2340 2358 2375 2376 2381 2408 2423 2503 2512 2528 2544 2575 2586 2595 2599 2617 2618 2635 2648 2663 2670 2678 2686 2689 2718 2744 2755 2759 2805 2826 2832 2872 2874 2875 2921 2955 3074 3075 3090 3113 3140 3171 3206 3212 3249 3257 3266 3287 3292 3294 3296 3319 3344 3372 3456 3467 3483 3513 3551 3556 3604 3628 3636 3644 3656 3657 3661 3669 3674 3723 3765 3811 3843 3864 3866 3868 3885 3949 3955 3960 3995 4010 4052 4060 4081 4108 4114 4120 4123 4126 4162 4167 4192 4252 4266 4279 4307 4321 4359 4433 4443 4538 4582 4605 4641 4669 4677 4725 4741 4758 4813 4814 4816 4827 4877 4892 4980 36 60 121 122 134 162 278 290 390 522 632 724 1036 1097 1103 1299 1303 1342 1357 1420 1886 1898 1929 2104 2127 2133 2167 2198 2218 2219 2224 2225 2392 2474 2617 2690 2746 3004 3007 3038 3093 3163 3675 3686 4118 4268 4324 4688 CCCACA/TGTGGG 0 -1 232 233 55 -28.2 17 42 55 80 83 105 153 155 167 175 196 209 225 246 259 272 284 310 317 319 325 345 381 398 456 483 499 502 505 508 528 529 560 567 595 731 760 765 784 823 827 866 867 881 887 928 934 940 951 955 1006 1044 1050 1134 1154 1178 1179 1189 1204 1249 1271 1281 1324 1486 1543 1553 1614 1667 1675 1705 1718 1723 1729 1737 1780 1793 1861 1871 1888 1911 1916 1928 1971 1979 1998 2015 2020 2031 2038 2048 2057 2075 2082 2103 2116 2137 2149 2174 2181 2182 2195 2207 2227 2248 2254 2262 2295 2330 2331 2334 2355 2358 2375 2380 2412 2413 2432 2505 2509 2518 2524 2542 2549 2611 2671 2674 2695 2703 2704 2718 2727 2732 2764 2791 2806 2836 2856 2867 2869 2902 2937 2955 2979 3073 3074 3109 3139 3169 3191 3216 3236 3317 3344 3348 3350 3386 3402 3431 3459 3460 3469 3482 3493 3526 3559 3560 3641 3662 3682 3701 3704 3753 3823 3826 3827 3844 3866 3870 3882 3912 3932 3960 3964 3980 3985 3988 3996 4013 4014 4062 4123 4125 4149 4155 4173 4252 4278 4290 4324 4337 4360 4371 4412 4426 4438 4476 4478 4544 4572 4589 4611 4615 4650 4662 4663 4673 4724 4725 4736 4738 4751 4753 4766 4792 4812 4839 4846 4881 4901 4912 4961 4994 9 413 598 697 874 899 920 980 1010 1303 1374 1494 1564 1588 1624 1861 1872 1943 2059 2075 2178 2187 2201 2245 2254 2274 2338 2409 2509 2898 2986 3050 3331 3387 3441 3467 3523 3591 3603 3645 3686 3718 3734 3950 4045 4167 4249 4264 4328 4353 4365 4394 4630 4660 4843 GCCCTA/TAGGGC 0 -2 237 232 22 -47.0 31 33 41 51 55 72 99 144 167 199 215 240 254 287 359 389 427 479 545 557 580 595 597 684 717 786 796 809 880 885 896 913 955 980 983 986 987 988 1000 1015 1065 1081 1090 1096 1097 1100 1127 1165 1170 1172 1192 1216 1268 1274 1314 1317 1368 1391 1411 1435 1485 1519 1548 1559 1585 1587 1603 1604 1621 1657 1671 1679 1698 1717 1742 1768 1814 1820 1842 1843 1848 1851 1861 1925 1929 1945 1947 1949 1961 1978 1987 2004 2058 2097 2100 2132 2143 2160 2195 2221 2233 2269 2290 2332 2345 2395 2434 2435 2477 2507 2530 2533 2547 2602 2607 2663 2687 2737 2768 2786 2788 2790 2798 2821 2830 2847 2861 2893 2939 2954 2970 2978 2998 3004 3025 3039 3055 3098 3110 3113 3120 3142 3189 3194 3225 3274 3306 3328 3332 3345 3347 3361 3382 3439 3490 3520 3542 3550 3578 3593 3597 3610 3652 3687 3695 3699 3720 3726 3735 3767 3799 3848 3859 3872 3913 3928 3938 3945 3981 3994 4018 4020 4030 4070 4071 4106 4116 4117 4126 4129 4134 4138 4160 4168 4169 4178 4216 4223 4284 4287 4296 4297 4317 4325 4327 4337 4346 4411 4470 4473 4483 4486 4488 4504 4545 4565 4575 4595 4629 4642 4685 4732 4745 4775 4825 4844 4851 4870 4871 4887 4904 4909 4930 4933 4940 4959 4984 84 257 366 396 1147 1323 1538 1615 1753 2616 2818 3091 3293 3752 3807 3883 3889 4412 4471 4661 4664 4967 TTGGCC/GGCCAA 0 -5 232 227 70 -21.2 1 4 94 96 191 193 226 236 239 247 273 317 324 374 381 401 421 431 464 478 499 588 609 646 665 720 754 756 777 802 803 820 923 936 953 965 1001 1016 1040 1044 1087 1127 1139 1180 1198 1262 1276 1278 1279 1289 1294 1308 1319 1391 1413 1416 1428 1438 1446 1460 1469 1477 1483 1485 1585 1648 1716 1718 1769 1865 1868 1889 1896 1900 1904 1908 1927 1934 1940 1944 1951 1957 1965 1989 2022 2030 2054 2071 2074 2138 2149 2178 2199 2244 2245 2301 2338 2370 2371 2382 2383 2469 2476 2520 2527 2540 2551 2556 2576 2579 2580 2591 2617 2618 2629 2639 2678 2739 2742 2756 2761 2764 2767 2805 2808 2809 2824 2838 2840 2870 2929 2931 2954 2967 2972 2989 2994 2998 3010 3033 3061 3063 3106 3107 3112 3124 3130 3195 3203 3211 3221 3238 3284 3285 3290 3298 3306 3357 3377 3380 3389 3406 3433 3459 3483 3608 3616 3678 3690 3691 3708 3720 3739 3745 3758 3771 3774 3793 3794 3806 3808 3819 3885 3898 3917 3929 3961 3965 3976 3998 4020 4022 4034 4107 4108 4120 4152 4180 4194 4211 4224 4237 4238 4277 4298 4335 4336 4361 4368 4386 4461 4520 4541 4553 4606 4648 4657 4658 4728 4752 4803 4808 4855 4871 4877 4888 4894 4919 4927 4949 4952 4968 27 105 233 245 346 442 476 613 628 722 807 845 909 934 965 971 1434 1526 1554 1671 1908 1919 1948 2024 2096 2231 2232 2236 2305 2336 2651 2655 2671 2690 2838 2906 2908 2911 2973 3043 3102 3118 3130 3192 3286 3308 3487 3553 3585 3603 3697 3771 3820 3889 3948 3963 3992 4039 4113 4166 4227 4315 4362 4385 4523 4568 4651 4788 4833 4855 CAGCCC/GGGCTG 0 -4 227 226 27 -41.7 23 51 115 131 134 175 187 188 191 229 252 272 289 305 319 323 399 471 489 505 520 543 557 559 577 580 591 620 642 714 727 741 765 819 855 860 868 885 906 919 928 978 979 983 1046 1060 1082 1096 1150 1162 1165 1184 1189 1190 1195 1236 1250 1268 1274 1289 1302 1314 1316 1428 1530 1549 1556 1557 1560 1582 1612 1657 1667 1768 1790 1792 1796 1814 1815 1831 1878 1903 1933 1945 1946 1971 1984 1985 1993 1996 2048 2050 2057 2058 2120 2140 2165 2174 2209 2238 2268 2293 2305 2340 2374 2384 2398 2457 2497 2499 2524 2538 2544 2553 2571 2576 2599 2607 2616 2617 2647 2657 2718 2724 2732 2736 2767 2788 2791 2820 2855 2888 2893 2930 2935 2985 3002 3003 3009 3021 3024 3060 3071 3089 3169 3173 3198 3208 3263 3264 3274 3319 3385 3444 3446 3459 3463 3466 3475 3484 3508 3510 3527 3535 3549 3630 3674 3682 3687 3710 3752 3832 3865 3872 3875 3904 3928 3990 3993 4019 4025 4030 4031 4081 4106 4113 4153 4179 4187 4216 4229 4230 4270 4314 4315 4345 4351 4372 4397 4420 4425 4431 4432 4445 4474 4477 4485 4519 4536 4545 4551 4565 4629 4631 4664 4695 4699 4703 4725 4728 4732 4757 4813 4933 4977 4984 4990 3 61 133 302 724 971 1550 1587 1707 1885 2520 2659 2690 2707 3039 3264 3844 3883 3921 3957 4272 4381 4483 4575 4688 4764 4879 GCCCAG/CTGGGC 0 -2 211 216 22 -42.6 23 24 28 33 35 40 86 96 116 134 139 158 189 201 207 217 256 308 319 322 334 357 383 393 431 486 519 588 600 630 649 670 681 714 734 747 759 775 787 815 823 844 871 928 944 974 1009 1043 1051 1069 1112 1133 1189 1190 1219 1229 1234 1262 1268 1274 1284 1314 1327 1338 1347 1352 1354 1374 1401 1428 1455 1460 1491 1536 1640 1648 1694 1803 1831 1841 1863 1878 1927 1945 1971 1984 2042 2054 2057 2140 2144 2147 2182 2230 2267 2303 2325 2343 2413 2423 2474 2576 2621 2647 2654 2750 2763 2807 2812 2840 2855 2858 2860 2888 2902 2964 3002 3032 3035 3038 3081 3088 3093 3112 3124 3152 3173 3181 3192 3217 3254 3257 3274 3286 3394 3425 3443 3447 3460 3479 3504 3508 3535 3541 3549 3574 3576 3585 3620 3674 3713 3756 3840 3872 3879 3893 3904 3924 3929 3954 3982 3991 3993 4022 4034 4042 4047 4048 4053 4082 4090 4095 4100 4179 4207 4225 4279 4312 4313 4361 4372 4409 4452 4458 4479 4491 4555 4559 4565 4567 4601 4624 4636 4669 4681 4686 4703 4726 4727 4732 4757 4779 4813 4824 4867 4869 4931 4968 4984 4991 4993 363 446 498 701 971 1358 1365 1534 1726 1840 2454 2680 2745 3271 3286 3333 3588 3844 3920 4101 4272 4989 CAAGCC/GGCTTG 0 -5 203 209 60 -21.1 1 13 24 28 34 40 92 110 136 162 188 207 245 249 252 254 263 287 301 321 324 349 371 379 383 388 464 497 500 515 543 563 662 672 690 711 724 744 767 775 777 796 802 803 837 896 902 908 972 987 1040 1127 1129 1132 1180 1254 1276 1339 1380 1391 1444 1489 1525 1557 1567 1568 1578 1608 1638 1649 1652 1713 1737 1739 1766 1843 1877 1882 1925 1938 1959 1986 1994 2007 2039 2042 2067 2148 2174 2196 2274 2324 2340 2343 2434 2469 2484 2485 2487 2546 2549 2585 2599 2608 2636 2673 2718 2744 2757 2805 2812 2815 2847 2848 2874 2883 2895 2901 2903 2915 2926 2951 2955 3031 3053 3057 3100 3136 3164 3178 3221 3265 3286 3290 3314 3329 3374 3414 3428 3456 3479 3490 3494 3534 3558 3665 3667 3668 3685 3687 3696 3722 3815 3816 3859 3860 3895 3933 3955 4005 4045 4048 4069 4089 4095 4139 4150 4178 4185 4195 4234 4241 4243 4263 4287 4292 4314 4318 4325 4342 4375 4514 4521 4531 4538 4572 4656 4670 4707 4712 4725 4726 4734 4745 4810 4817 4823 4833 4860 4862 4887 4891 4998 14 133 166 244 278 368 466 529 540 682 845 851 971 990 1163 1263 1357 1362 1409 1421 1485 1840 1900 2079 2155 2181 2355 2743 2863 2913 3164 3271 3353 3473 3562 3669 3694 3718 3744 3820 4009 4069 4128 4250 4285 4362 4393 4412 4446 4448 4469 4471 4531 4538 4549 4557 4628 4849 4855 4901 AGCCCT/AGGGCT 0 -3 207 203 35 -30.9 33 41 51 73 104 120 144 217 249 256 287 305 313 324 359 379 386 399 427 479 557 580 584 597 749 786 796 804 837 857 885 896 908 913 919 946 971 978 980 983 987 1090 1096 1127 1150 1165 1192 1268 1274 1291 1314 1339 1368 1391 1447 1500 1539 1548 1567 1612 1657 1698 1739 1768 1786 1814 1820 1843 1848 1859 1925 1929 1945 1947 1978 1987 1996 2007 2048 2050 2058 2087 2097 2111 2132 2148 2158 2238 2420 2437 2447 2497 2530 2532 2533 2544 2559 2577 2602 2607 2610 2628 2657 2663 2673 2721 2736 2768 2786 2788 2790 2821 2847 2851 2893 2901 2910 2930 2939 2982 3000 3004 3021 3028 3098 3142 3172 3189 3193 3264 3274 3290 3347 3382 3395 3490 3520 3542 3558 3630 3631 3652 3665 3668 3687 3695 3699 3726 3782 3816 3854 3857 3859 3872 3874 3895 3913 3927 4005 4016 4030 4070 4077 4106 4117 4134 4138 4195 4216 4229 4241 4270 4284 4287 4314 4325 4353 4381 4431 4474 4486 4487 4522 4523 4545 4565 4585 4629 4685 4689 4695 4707 4730 4732 4745 4761 4775 4817 4825 4844 4852 4862 4887 4904 4933 4984 4990 84 151 352 366 899 975 1323 1538 1540 1586 1753 2441 2516 2517 2616 2659 2694 2759 2818 3293 3302 3641 3752 3820 3883 3914 4025 4153 4215 4412 4471 4500 4525 4664 4880 TTGCCC/GGGCAA 0 -4 206 203 36 -30.4 24 28 35 40 81 86 96 105 107 139 155 163 165 197 207 222 225 239 277 313 325 449 476 497 568 729 759 775 787 804 809 850 856 887 922 956 962 1009 1015 1035 1107 1151 1173 1175 1204 1240 1268 1298 1311 1338 1345 1476 1524 1527 1535 1600 1604 1697 1712 1718 1742 1777 1780 1882 1963 1967 1995 2012 2013 2049 2081 2115 2116 2128 2143 2154 2183 2227 2237 2240 2250 2294 2342 2344 2361 2392 2411 2435 2443 2522 2545 2548 2575 2581 2603 2683 2685 2706 2747 2858 2862 2949 2970 3034 3039 3043 3044 3079 3090 3110 3156 3188 3194 3217 3246 3255 3267 3273 3280 3283 3302 3310 3345 3360 3379 3439 3451 3466 3467 3539 3542 3557 3574 3590 3612 3620 3658 3663 3675 3677 3689 3732 3741 3747 3764 3775 3788 3790 3791 3799 3825 3843 3934 3954 3984 4018 4050 4064 4093 4114 4135 4158 4160 4227 4230 4255 4268 4291 4296 4297 4317 4319 4339 4342 4358 4411 4438 4488 4533 4569 4575 4595 4602 4619 4640 4677 4713 4719 4729 4737 4741 4743 4753 4812 4816 4824 4851 4854 4877 4891 4930 4931 4983 4984 4986 4994 58 112 341 384 433 718 1019 1256 1357 1365 1404 1518 1615 1649 1695 1739 1964 2104 2156 2502 2737 2813 3091 3161 3220 3286 3315 3322 3549 3783 4167 4268 4618 4674 4771 4892 GAAGCC/GGCTTC 0 -5 202 200 59 -19.7 21 33 43 44 93 112 120 141 147 152 273 313 330 388 390 410 417 425 427 438 472 485 519 564 593 630 632 646 659 665 670 672 675 676 725 777 832 850 856 896 925 951 974 979 985 1104 1112 1115 1116 1152 1192 1216 1288 1296 1362 1415 1449 1464 1491 1522 1539 1540 1551 1648 1693 1699 1802 1811 1848 1882 1883 1895 1924 1935 1979 1987 2021 2060 2089 2109 2131 2132 2164 2166 2177 2183 2252 2285 2288 2321 2338 2368 2437 2441 2454 2457 2530 2553 2559 2623 2663 2724 2754 2780 2815 2836 2883 2925 2992 3022 3026 3028 3059 3061 3073 3098 3144 3147 3148 3157 3171 3172 3191 3192 3222 3340 3387 3406 3457 3493 3495 3498 3520 3542 3561 3711 3712 3726 3742 3743 3782 3823 3841 3857 3873 3878 3879 3932 3968 3983 4001 4037 4042 4077 4094 4123 4125 4132 4155 4183 4200 4247 4271 4294 4301 4381 4441 4456 4458 4497 4509 4528 4536 4540 4557 4563 4564 4591 4670 4676 4685 4689 4726 4730 4733 4742 4760 4782 4805 4814 4834 4844 4867 4878 4892 4901 4903 4917 4919 4978 4990 4994 2 131 183 204 225 277 487 502 558 565 573 602 689 708 757 854 920 956 982 990 1047 1052 1120 1290 1294 1461 1478 1502 1586 1629 1649 1683 1768 1918 1923 2277 2316 2326 2436 2520 2648 2701 2783 3188 3220 3326 3328 3753 3878 3948 3982 4065 4219 4261 4352 4585 4739 4817 4904 CCCAAG/CTTGGG 0 -1 199 195 61 -18.0 1 3 87 157 245 248 253 268 276 281 304 337 345 349 383 483 501 503 563 610 662 672 711 722 744 764 769 776 777 798 802 810 814 842 890 906 943 996 1016 1033 1055 1103 1120 1143 1214 1216 1276 1294 1320 1331 1430 1447 1516 1527 1535 1552 1614 1620 1640 1649 1735 1767 1772 1781 1833 1836 1887 1907 1916 1959 2010 2035 2058 2079 2082 2112 2121 2159 2174 2196 2206 2213 2216 2226 2237 2245 2338 2343 2356 2363 2434 2471 2502 2520 2559 2571 2578 2711 2715 2778 2803 2805 2825 2850 2853 2901 2914 2929 2949 2955 3030 3053 3098 3121 3138 3196 3208 3209 3225 3228 3263 3284 3329 3333 3336 3371 3374 3377 3395 3444 3494 3506 3525 3539 3542 3581 3594 3602 3627 3651 3667 3680 3719 3729 3769 3786 3815 3841 3844 3852 3907 3928 3947 3952 3983 3990 4052 4059 4069 4079 4089 4172 4185 4260 4263 4314 4339 4351 4368 4377 4404 4426 4451 4511 4514 4516 4561 4588 4602 4610 4614 4656 4657 4699 4734 4748 4792 4846 4862 4876 4894 4901 4924 4934 4963 4970 4976 4983 4992 12 80 99 107 140 180 254 278 442 459 696 719 845 892 902 931 941 1055 1169 1214 1278 1349 1385 1553 1567 1676 1761 1862 2040 2096 2227 2357 2431 2656 2673 2684 2701 2705 2707 2878 2884 3258 3281 3291 3320 3448 3637 3691 3890 3914 4181 4191 4195 4314 4347 4519 4554 4603 4646 4871 4879 CCACCT/AGGTGG 1 -3 180 193 63 -17.0 17 19 53 64 72 94 114 131 137 152 161 194 209 213 247 285 295 310 331 333 344 348 358 368 371 396 458 459 509 539 706 710 741 754 781 818 821 840 873 924 940 977 979 985 1002 1028 1054 1103 1129 1151 1173 1189 1204 1271 1309 1316 1326 1399 1418 1421 1445 1447 1521 1534 1610 1698 1724 1726 1743 1750 1769 1771 1772 1782 1793 1816 1820 1871 1897 1924 1940 1979 1991 2000 2022 2049 2054 2067 2073 2124 2154 2229 2269 2296 2314 2376 2380 2495 2503 2512 2586 2610 2617 2623 2635 2638 2643 2678 2699 2726 2785 2809 2832 2872 2874 2921 2947 2955 2990 3014 3023 3096 3150 3209 3239 3277 3288 3294 3319 3344 3364 3372 3386 3410 3419 3513 3544 3551 3555 3565 3585 3588 3657 3843 3868 3885 3904 3922 3949 3960 3990 4025 4081 4107 4122 4123 4124 4126 4142 4162 4278 4279 4286 4288 4307 4443 4515 4531 4537 4541 4644 4702 4736 4816 4827 4868 4920 4933 4952 4953 120 121 126 162 278 299 429 512 540 632 915 989 1136 1243 1342 1381 1649 1695 1720 1721 1874 1898 1929 2091 2104 2135 2136 2198 2224 2225 2282 2371 2402 2474 2750 2797 2851 3057 3072 3305 3318 3350 3356 3472 3503 3517 3675 3738 3755 3915 3919 3975 3999 4016 4043 4118 4276 4286 4465 4651 4682 4722 4770 GCCCCA/TGGGGC 0 -2 200 192 27 -32.9 4 79 82 105 155 161 196 209 216 218 268 276 281 318 337 344 390 395 464 508 566 625 736 760 784 797 827 835 839 881 906 955 979 990 1030 1117 1204 1218 1223 1274 1289 1294 1302 1320 1393 1418 1504 1524 1641 1645 1651 1704 1706 1715 1726 1737 1796 1798 1823 1868 1880 1932 1938 1995 2010 2022 2038 2040 2133 2213 2219 2229 2269 2276 2294 2295 2307 2361 2383 2446 2499 2505 2524 2672 2674 2698 2714 2732 2806 2853 2863 2867 2875 2913 2937 2960 2966 2987 3009 3023 3034 3043 3045 3058 3105 3171 3199 3206 3252 3255 3296 3318 3340 3344 3371 3372 3377 3401 3418 3433 3434 3441 3451 3457 3521 3527 3551 3556 3560 3587 3590 3612 3617 3619 3644 3667 3669 3674 3682 3685 3732 3750 3759 3790 3805 3808 3841 3843 3844 3850 3866 3964 4060 4077 4094 4103 4158 4227 4249 4290 4329 4351 4355 4377 4382 4385 4386 4443 4519 4525 4560 4563 4569 4589 4602 4628 4640 4680 4713 4715 4724 4728 4772 4806 4816 4822 4833 4845 4860 4863 4877 4892 4918 4935 4979 4980 4986 4987 4990 4994 180 250 341 383 577 724 1553 1707 1926 1970 2667 2690 2798 2805 3004 3258 3264 3315 3338 3603 3744 3762 3867 4352 4577 4740 4910 CGGCCC/GGGCCG 0 -4 180 188 17 -38.9 1 40 49 58 100 107 152 170 181 198 218 261 272 284 289 301 308 335 443 449 480 495 501 503 519 531 562 583 606 630 670 731 802 805 815 844 848 871 876 887 985 1068 1100 1105 1137 1143 1170 1172 1214 1229 1234 1262 1278 1306 1320 1374 1386 1400 1433 1510 1512 1536 1555 1611 1620 1656 1664 1752 1812 1936 1991 1993 2004 2022 2027 2052 2133 2137 2144 2163 2171 2181 2193 2260 2317 2322 2345 2375 2410 2416 2446 2470 2505 2508 2562 2564 2611 2613 2647 2657 2697 2712 2727 2744 2763 2792 2796 2806 2807 2837 2873 3022 3027 3034 3058 3064 3093 3105 3106 3111 3138 3158 3179 3214 3234 3252 3275 3313 3403 3404 3517 3570 3575 3595 3693 3773 3779 3803 3804 3836 3867 3881 3899 3910 3939 3945 3982 4038 4047 4050 4086 4126 4211 4242 4267 4316 4354 4362 4389 4411 4460 4474 4504 4555 4561 4564 4609 4656 4663 4670 4726 4736 4747 4849 4884 4900 4905 4926 4970 4976 2 58 103 250 573 1180 2067 2558 2648 2680 2716 2819 2830 3329 3588 3644 3947 AAGGCC/GGCCTT 0 -5 196 185 35 -26.6 15 175 191 231 245 254 273 317 319 336 342 404 415 422 448 454 480 643 667 668 773 789 792 802 815 895 961 995 1010 1036 1137 1145 1189 1205 1227 1273 1276 1312 1353 1355 1360 1395 1416 1468 1486 1553 1559 1595 1602 1607 1640 1723 1724 1736 1759 1849 1887 1892 1959 1971 1993 2021 2057 2144 2147 2192 2320 2349 2357 2391 2410 2429 2433 2442 2487 2506 2520 2534 2545 2591 2621 2639 2693 2698 2732 2761 2766 2774 2808 2830 2855 2884 2885 2913 2929 2981 3001 3002 3028 3031 3063 3066 3069 3077 3139 3147 3148 3165 3178 3184 3211 3226 3261 3310 3319 3325 3354 3361 3377 3380 3402 3450 3473 3481 3511 3522 3524 3572 3613 3615 3618 3667 3682 3702 3704 3739 3767 3769 3806 3838 3852 3855 3866 3871 3894 3923 3940 3945 3956 3959 3961 3981 3989 3993 3996 4004 4029 4043 4064 4067 4072 4085 4090 4125 4218 4248 4263 4264 4277 4326 4335 4383 4385 4402 4428 4460 4468 4478 4554 4578 4590 4607 4614 4657 4681 4703 4715 4740 4757 4785 4823 4824 4828 4829 4888 4906 4 210 352 421 486 807 845 965 1464 1748 2017 2420 2713 2819 2838 2911 3071 3187 3332 3519 3553 3709 3829 3918 3920 3963 4068 4238 4423 4696 4769 4788 4874 4878 4887 CGCCCA/TGGGCG 0 -3 182 184 23 -33.4 24 28 65 70 88 98 110 123 137 139 174 179 180 183 215 265 300 306 398 516 544 554 560 589 610 618 704 732 776 861 927 934 994 1011 1043 1044 1051 1055 1079 1082 1086 1133 1165 1176 1179 1190 1219 1247 1275 1281 1307 1372 1406 1423 1425 1447 1514 1552 1572 1708 1733 1810 1829 1837 1844 1860 1879 1887 1894 1911 1935 1983 2022 2051 2079 2117 2196 2206 2214 2262 2271 2289 2298 2310 2316 2325 2343 2345 2372 2387 2393 2403 2436 2466 2485 2492 2518 2570 2586 2597 2663 2692 2843 2926 2933 2943 2968 2988 3005 3006 3012 3082 3121 3127 3196 3200 3205 3250 3322 3331 3414 3463 3470 3486 3492 3568 3569 3573 3585 3602 3653 3673 3730 3760 3799 3834 3845 3864 3920 3924 3980 3991 4014 4054 4082 4099 4100 4120 4225 4228 4252 4269 4293 4305 4323 4360 4376 4377 4390 4392 4415 4437 4462 4489 4493 4502 4511 4562 4567 4605 4694 4696 4727 4732 4776 4778 4846 4869 4885 4899 4928 4962 107 313 446 810 838 879 1103 1726 2348 2420 2454 2705 2745 2752 2876 3215 3226 3365 3464 3718 4101 4137 4315 GAGCCC/GGGCTC 0 -4 172 177 29 -28.0 1 44 55 73 83 99 108 111 115 134 153 189 206 218 253 263 287 337 344 383 386 388 441 488 532 743 755 844 864 876 915 970 996 997 1004 1020 1077 1094 1321 1344 1352 1378 1496 1567 1579 1640 1649 1664 1689 1698 1705 1714 1820 1838 1862 1888 1895 1947 1958 1986 1990 1994 2009 2025 2030 2031 2064 2126 2158 2295 2324 2331 2364 2401 2447 2474 2483 2489 2527 2533 2552 2577 2598 2601 2637 2640 2645 2654 2657 2674 2678 2717 2757 2763 2776 2790 2819 2821 2825 2836 2845 2860 2862 2914 2940 3060 3129 3142 3173 3174 3193 3254 3303 3395 3408 3418 3488 3523 3524 3541 3563 3564 3594 3605 3651 3662 3667 3680 3699 3759 3780 3815 3818 3868 3874 3877 3880 3894 3914 3927 3945 3952 3982 3989 3995 4013 4016 4047 4052 4070 4084 4152 4257 4319 4351 4359 4365 4377 4413 4424 4504 4525 4559 4625 4652 4684 4791 4805 4892 4904 4981 4982 11 57 151 366 498 885 926 975 1323 1534 1540 1687 1753 1844 2616 2759 2884 3302 3567 3641 3664 3762 4161 4215 4225 4500 4654 4700 4961 TAGCCC/GGGCTA 0 -4 179 177 28 -28.5 31 34 36 38 41 42 124 144 170 195 256 276 281 359 393 433 437 485 497 527 544 584 734 786 818 819 823 968 980 993 1047 1188 1201 1217 1294 1339 1372 1452 1474 1515 1521 1543 1561 1577 1601 1604 1637 1656 1666 1786 1849 1880 1909 1954 1956 1962 1963 1978 1994 2029 2035 2087 2167 2171 2189 2200 2205 2213 2219 2230 2260 2263 2285 2288 2296 2307 2309 2388 2398 2420 2498 2509 2512 2559 2561 2602 2614 2635 2700 2709 2730 2773 2786 2800 2802 2863 2925 2979 2987 2989 3035 3087 3088 3108 3115 3118 3189 3230 3259 3264 3315 3347 3353 3420 3443 3452 3460 3465 3576 3604 3623 3627 3652 3656 3678 3844 3870 3871 3877 3913 3946 3949 3951 3964 4005 4022 4043 4061 4079 4084 4085 4117 4162 4165 4175 4201 4240 4244 4387 4400 4426 4486 4521 4530 4549 4550 4561 4571 4639 4650 4718 4722 4744 4754 4781 4792 4794 4825 4832 4867 4881 4912 4918 4945 4956 4961 4964 4991 4993 106 182 248 383 899 917 1193 1319 1349 1378 1385 1538 1586 1646 1687 1941 2410 2673 2680 2900 2986 3467 3645 3691 4044 4153 4365 4880 TTCGGG/CCCGAA 4 -4 173 176 54 -16.7 21 83 109 122 131 156 168 170 207 256 264 276 308 316 318 330 334 347 380 411 488 507 519 524 542 557 599 616 618 670 692 695 711 715 779 784 844 846 861 877 944 1005 1020 1026 1030 1038 1107 1109 1114 1133 1321 1344 1370 1371 1380 1401 1416 1422 1432 1453 1459 1504 1507 1536 1546 1555 1599 1675 1692 1706 1768 1798 1811 1824 1831 1858 1879 1938 1948 1955 1975 2001 2059 2063 2085 2140 2171 2188 2249 2280 2292 2364 2380 2419 2460 2551 2565 2712 2726 2892 2893 2902 2905 2932 2933 2938 2958 2978 3009 3032 3090 3119 3124 3125 3179 3191 3207 3231 3280 3282 3334 3342 3369 3394 3403 3417 3457 3468 3497 3507 3512 3523 3535 3553 3575 3677 3729 3757 3760 3764 3807 3817 3922 4030 4031 4053 4069 4074 4082 4086 4106 4140 4163 4190 4213 4240 4273 4350 4435 4463 4557 4562 4573 4636 4708 4717 4726 4787 4810 4899 4917 4950 4978 11 14 150 479 568 814 879 898 941 973 991 1003 1148 1189 1193 1234 1249 1350 1615 1649 1683 1759 1944 2183 2447 2681 2685 2708 2745 2808 2831 3093 3095 3180 3188 3199 3344 3438 3518 3657 3778 3807 3901 3921 3968 3994 4069 4115 4116 4728 4791 4792 4948 4949 GCCCGA/TCGGGC 0 -2 169 172 17 -34.6 56 82 83 115 131 163 168 170 197 276 308 330 361 371 380 394 441 444 488 519 548 620 642 670 687 695 711 715 722 743 783 784 790 819 844 846 855 877 915 926 985 1020 1038 1107 1109 1114 1198 1321 1345 1370 1371 1372 1374 1380 1385 1416 1459 1532 1535 1536 1555 1604 1649 1706 1712 1750 1767 1809 1811 1858 1889 1948 1951 1984 1990 2060 2063 2085 2088 2134 2249 2295 2419 2441 2448 2483 2484 2528 2537 2551 2564 2601 2712 2755 2767 2773 2832 2836 2878 2888 2975 2985 3013 3071 3124 3125 3143 3150 3191 3217 3271 3296 3333 3342 3380 3403 3417 3463 3465 3468 3497 3503 3508 3510 3535 3553 3560 3575 3658 3669 3731 3758 3764 3792 3807 3817 3845 3922 3927 3935 4030 4031 4037 4069 4086 4142 4230 4240 4273 4359 4362 4413 4430 4517 4572 4578 4631 4658 4708 4726 4769 4782 4800 4802 4810 4813 4890 4950 4981 11 57 224 248 302 1127 1193 1395 1664 1748 1759 1964 3262 3603 3848 3921 4069 CCACGT/ACGTGG 1 -3 173 171 44 -19.4 17 42 49 83 161 203 239 295 407 417 456 467 482 517 610 653 723 782 885 890 927 970 1022 1072 1078 1093 1126 1180 1216 1221 1224 1240 1242 1260 1316 1342 1352 1412 1429 1441 1547 1551 1577 1664 1676 1678 1680 1706 1721 1754 1762 1812 1829 1830 1838 1856 1919 1977 2010 2015 2025 2034 2114 2159 2178 2239 2257 2277 2286 2293 2307 2331 2345 2354 2378 2415 2423 2428 2458 2485 2491 2492 2496 2497 2529 2532 2552 2562 2568 2574 2663 2680 2706 2741 2757 2772 2839 2857 2867 2930 2974 2977 2982 2997 3013 3041 3051 3129 3197 3239 3251 3270 3296 3304 3308 3320 3334 3338 3348 3389 3393 3447 3495 3518 3524 3556 3604 3612 3619 3662 3669 3699 3730 3773 3819 3850 3882 3909 3931 3940 3970 4017 4026 4044 4110 4138 4168 4215 4279 4286 4322 4335 4345 4409 4417 4421 4485 4495 4512 4541 4560 4581 4643 4669 4811 4816 4845 4872 4923 4927 4966 4975 4997 119 211 393 523 553 579 616 721 1105 1423 1567 1625 1701 1926 2078 2155 2166 2366 2462 2537 2612 2694 2833 2853 3004 3085 3208 3230 3338 3669 3671 3754 3842 3962 4084 4174 4252 4403 4412 4514 4548 4741 4855 4973 CCCTCT/AGAGGG 3 -2 153 170 48 -17.7 0 2 5 8 20 26 27 33 47 73 95 158 166 201 222 235 241 249 257 286 296 301 310 312 327 379 406 462 463 507 538 569 573 621 644 660 678 816 827 896 938 956 1074 1128 1141 1196 1204 1218 1238 1285 1404 1420 1502 1599 1610 1612 1715 1778 1843 1925 1954 1982 2030 2072 2142 2190 2195 2236 2251 2294 2315 2327 2342 2355 2366 2368 2420 2423 2462 2474 2479 2497 2558 2596 2673 2680 2701 2719 2723 2788 2835 2840 2847 2857 2880 2961 3008 3037 3068 3082 3103 3145 3174 3255 3265 3291 3293 3313 3316 3317 3395 3423 3476 3484 3519 3550 3698 3760 3764 3799 3816 3829 3858 3870 3902 3940 3941 3942 4012 4029 4109 4148 4270 4299 4303 4306 4349 4381 4384 4397 4570 4585 4641 4663 4669 4745 4762 4793 4817 4818 4843 4886 4930 60 258 452 486 786 807 1077 1104 1146 1160 1262 1420 1619 1704 1773 1845 2088 2261 2417 2461 2546 2560 2617 2784 3200 3272 3321 3324 3404 3479 3547 3692 3774 3841 3969 4122 4180 4215 4286 4303 4616 4619 4681 4771 4843 4947 4981 4999 GGCCCT/AGGGCC 0 -3 165 168 17 -33.5 31 49 55 60 66 99 124 148 188 199 206 214 215 240 254 301 312 319 421 501 522 562 583 614 756 851 880 904 955 986 989 1023 1037 1060 1085 1100 1105 1170 1172 1178 1193 1233 1273 1317 1319 1353 1411 1468 1485 1501 1510 1555 1559 1583 1595 1679 1717 1724 1741 1759 1907 1949 1961 1989 2002 2004 2030 2122 2125 2178 2186 2222 2233 2332 2345 2416 2433 2434 2472 2476 2477 2508 2525 2567 2591 2688 2737 2742 2796 2830 2854 2873 2885 2895 2954 3022 3025 3027 3109 3113 3165 3170 3210 3225 3243 3252 3257 3306 3313 3321 3329 3361 3416 3418 3423 3438 3543 3593 3611 3684 3694 3713 3714 3720 3735 3767 3797 3804 3819 3865 3871 3881 3917 3923 3943 3945 3950 3970 3981 4020 4026 4126 4129 4185 4239 4289 4326 4327 4337 4371 4474 4504 4509 4609 4618 4752 4771 4793 4808 4829 4871 4894 4916 4940 4959 10 366 1615 2067 2713 2716 3229 3329 3644 3791 3807 3947 4152 4238 4363 4586 4661 TAAGCC/GGCTTA 0 -5 169 166 44 -18.4 31 57 74 75 104 157 158 201 259 301 304 393 427 456 562 573 592 600 615 621 623 697 734 735 746 749 764 765 769 801 828 839 848 857 863 949 995 1001 1033 1112 1172 1218 1262 1273 1291 1312 1355 1409 1470 1477 1517 1638 1713 1791 1804 1852 1859 1869 1888 1904 2018 2071 2093 2099 2141 2165 2193 2200 2217 2218 2330 2351 2406 2424 2478 2502 2560 2609 2610 2622 2628 2660 2679 2714 2721 2804 2833 2851 2982 3000 3038 3076 3122 3181 3212 3217 3220 3348 3352 3377 3382 3396 3414 3426 3443 3447 3448 3455 3457 3468 3476 3489 3500 3504 3524 3525 3553 3566 3593 3600 3603 3631 3683 3698 3704 3722 3733 3736 3836 3837 3843 3927 3942 3957 3986 3993 4029 4030 4059 4062 4186 4200 4213 4221 4264 4305 4320 4329 4337 4359 4439 4538 4552 4580 4594 4617 4620 4628 4672 4673 4707 4742 4756 4766 4775 4795 4806 4852 4999 512 747 794 846 851 906 995 1062 1147 1153 1168 1318 1384 1393 1443 1553 1724 1923 1928 1941 1990 2186 2436 2516 2667 2694 2939 3200 3280 3380 3448 3518 3664 3690 3945 4005 4152 4251 4357 4664 4876 4910 4967 4980 GCCCTT/AAGGGC 0 -2 167 165 39 -20.2 49 54 66 104 124 144 148 165 188 214 313 356 379 399 421 450 522 538 561 568 614 652 804 821 837 851 857 904 908 946 978 989 1023 1037 1060 1070 1085 1128 1178 1233 1291 1326 1439 1476 1494 1500 1501 1567 1570 1612 1724 1739 1740 1786 1794 1859 1940 1989 2007 2013 2047 2048 2050 2111 2128 2148 2149 2178 2180 2186 2222 2238 2250 2269 2273 2416 2437 2476 2525 2542 2559 2567 2591 2610 2628 2657 2668 2673 2703 2736 2742 2839 2851 2885 2901 2910 2912 2930 2938 2982 3000 3008 3028 3044 3056 3096 3172 3193 3201 3264 3290 3291 3298 3310 3321 3329 3418 3438 3515 3558 3699 3735 3775 3783 3801 3816 3819 3865 3879 3890 3895 3917 3923 3970 4015 4077 4128 4185 4241 4314 4333 4338 4371 4374 4431 4451 4474 4487 4509 4523 4531 4533 4609 4612 4667 4668 4689 4697 4709 4724 4771 4772 4808 4849 4862 4898 4990 34 54 151 526 975 1540 1586 1670 1695 1716 1919 2156 2274 2373 2509 2517 2659 2694 2716 2908 3004 3229 3323 3406 3641 3783 3791 3914 3947 4025 4238 4245 4293 4363 4464 4500 4525 4586 4929 AGCCCG/CGGGCT 0 -3 153 157 14 -32.9 31 34 38 74 107 115 131 170 195 218 323 330 371 388 425 441 444 488 497 519 543 559 563 593 620 630 642 670 691 697 711 715 743 802 807 819 844 887 915 970 1020 1104 1116 1201 1289 1321 1372 1407 1464 1496 1560 1582 1604 1637 1649 1664 1666 1689 1713 1811 1838 1862 1882 1895 1924 1927 1963 1984 1990 2021 2029 2060 2131 2140 2209 2218 2336 2398 2430 2441 2448 2483 2484 2561 2601 2623 2698 2700 2767 2773 2836 2888 2985 3026 3071 3089 3108 3115 3124 3178 3191 3217 3265 3353 3403 3463 3465 3468 3508 3510 3523 3553 3564 3667 3710 3731 3803 3821 3927 3935 3957 4019 4028 4031 4037 4045 4069 4183 4187 4201 4230 4240 4292 4359 4413 4426 4429 4531 4572 4606 4631 4676 4718 4726 4782 4794 4805 4810 4813 4864 4967 4978 4981 11 57 248 302 917 932 1193 1587 2316 3110 3675 3921 4069 4764 GGCCCG/CGGGCC 0 -3 147 153 11 -34.3 1 22 31 58 82 100 101 170 181 272 284 289 308 335 380 443 449 472 495 519 548 670 695 722 784 785 790 802 844 876 877 912 923 985 1139 1161 1193 1198 1246 1315 1322 1336 1369 1371 1374 1380 1416 1497 1536 1555 1656 1675 1727 1750 1767 1801 1821 1858 1878 1889 1936 1939 1951 2019 2074 2088 2091 2170 2180 2229 2230 2249 2255 2295 2299 2382 2410 2419 2470 2545 2551 2556 2564 2639 2698 2704 2712 2766 2770 2875 2917 2921 2960 3011 3124 3137 3158 3217 3223 3285 3296 3333 3380 3517 3535 3551 3560 3575 3654 3669 3693 3727 3756 3758 3792 3817 3838 3845 3855 3960 3966 3977 4030 4086 4107 4192 4267 4362 4371 4402 4407 4411 4443 4453 4564 4578 4620 4623 4688 4720 4769 4800 4804 4849 4894 4906 4950 2 58 346 1127 1180 1534 1748 1895 3404 3487 3603 CCGCCC/GGGCGG 0 -4 145 151 13 -32.0 7 24 48 79 98 110 118 137 139 141 168 170 215 300 345 395 508 566 610 625 628 631 651 725 809 835 850 990 994 1051 1081 1082 1086 1087 1142 1165 1179 1210 1372 1418 1447 1475 1494 1519 1546 1552 1621 1641 1671 1702 1715 1778 1798 1836 1861 1894 1935 1940 2010 2017 2022 2072 2088 2196 2203 2206 2229 2243 2269 2271 2276 2289 2310 2343 2345 2352 2358 2372 2458 2466 2468 2504 2518 2570 2668 2680 2770 2861 2872 2878 2943 3005 3006 3077 3120 3127 3200 3298 3404 3414 3463 3470 3492 3503 3589 3600 3610 3673 3765 3799 3844 3848 3903 3922 3938 3941 3980 4014 4099 4142 4143 4168 4173 4205 4295 4305 4323 4332 4392 4462 4467 4531 4567 4589 4605 4642 4658 4697 4724 4756 4772 4799 4801 4879 4962 180 577 838 1776 2433 2798 2805 2876 3215 3406 3661 4137 4315 GCCCGT/ACGGGC 0 -2 145 148 9 -34.8 31 34 58 78 101 107 141 154 178 193 195 257 289 330 335 388 425 503 519 543 559 563 630 631 670 697 775 785 819 844 887 912 970 1007 1104 1116 1161 1167 1201 1336 1382 1407 1464 1496 1497 1617 1637 1656 1664 1666 1689 1706 1721 1727 1801 1838 1862 1882 1927 1931 1936 1948 1963 1964 1967 1976 2019 2029 2091 2115 2131 2140 2179 2255 2260 2299 2352 2382 2411 2454 2470 2488 2623 2639 2710 2770 2810 2917 2952 3011 3026 3108 3124 3156 3158 3178 3265 3333 3353 3379 3422 3517 3523 3539 3564 3654 3693 3811 3821 3838 3957 3960 3979 4019 4093 4176 4183 4197 4201 4253 4255 4268 4283 4371 4402 4407 4411 4426 4429 4440 4442 4453 4489 4620 4623 4676 4718 4784 4801 4804 4805 4812 4894 4937 4978 2 692 917 1019 1386 1895 2316 2737 4764 GCCACC/GGTGGC 1 -4 133 144 40 -15.4 7 13 53 67 78 80 93 98 177 217 285 331 358 367 379 442 465 485 529 539 619 628 629 817 818 829 840 886 896 985 997 1016 1028 1045 1153 1160 1178 1243 1316 1381 1399 1442 1445 1447 1534 1543 1563 1738 1743 1769 1771 1774 1793 1816 1843 1856 1905 1916 1925 1940 1943 1999 2000 2170 2194 2215 2274 2294 2312 2333 2380 2430 2495 2512 2539 2568 2626 2673 2678 2690 2700 2726 2808 2832 2872 2874 2891 2955 2990 3016 3023 3030 3071 3180 3185 3239 3255 3282 3298 3300 3337 3410 3442 3611 3621 3650 3673 3853 3869 3922 3990 4088 4192 4278 4362 4374 4406 4416 4458 4515 4522 4531 4537 4538 4644 4666 4704 4736 4756 4814 4865 4868 4953 162 258 299 477 540 602 696 1126 1242 1243 1373 1556 1579 1603 1649 1720 1853 1871 2301 2431 2618 2750 2782 2797 2851 2886 3110 3152 3194 3471 3472 3473 3865 3915 4140 4191 4261 4399 4439 4465 ACGCCC/GGGCGT 0 -4 138 142 13 -29.6 28 48 65 70 110 123 154 167 168 179 180 208 215 345 375 394 398 450 516 544 561 569 618 652 687 704 861 875 927 934 988 1038 1133 1149 1190 1247 1281 1370 1423 1447 1459 1504 1514 1603 1686 1733 1794 1809 1844 1856 1860 1879 1887 1911 1946 1964 1983 2117 2130 2179 2214 2316 2325 2393 2436 2447 2485 2490 2492 2586 2597 2641 2663 2670 2803 2832 2839 2862 2978 2988 3012 3013 3048 3082 3121 3205 3265 3271 3318 3331 3332 3387 3515 3560 3622 3645 3647 3699 3750 3760 3766 3805 3807 3829 3845 3959 3972 3979 3991 4054 4082 4203 4228 4249 4252 4253 4269 4293 4338 4360 4374 4376 4384 4390 4437 4442 4489 4496 4511 4573 4696 4732 4778 4830 4869 4885 4909 4928 107 313 879 2420 2667 2682 2745 3217 3262 3365 3603 3718 4101 TGCCCT/AGGGCA 0 -3 141 138 31 -17.8 13 54 72 107 118 165 174 227 277 356 428 538 545 568 595 684 769 809 821 887 956 985 1000 1001 1015 1065 1070 1097 1128 1142 1216 1269 1301 1326 1439 1465 1476 1570 1585 1587 1604 1740 1742 1851 1891 2013 2047 2049 2100 2128 2133 2143 2149 2154 2160 2180 2185 2195 2221 2250 2269 2273 2342 2395 2435 2459 2467 2507 2542 2547 2672 2683 2687 2723 2798 2829 2835 2912 2938 2970 2998 3039 3044 3056 3096 3110 3116 3194 3201 3218 3291 3310 3345 3409 3439 3550 3597 3611 3775 3783 3799 3801 3833 3879 3890 3902 3928 3994 4015 4018 4071 4116 4128 4160 4169 4223 4234 4296 4297 4317 4333 4339 4346 4411 4451 4470 4473 4483 4488 4533 4575 4595 4612 4667 4668 4709 4815 4851 4870 4898 4930 58 257 396 431 512 526 1267 1670 1695 1919 2156 2274 2276 2373 2509 3091 3128 3323 3588 3663 3783 3889 4245 4268 4286 4293 4464 4617 4771 4929 4967 GGGCCC/GGGCCC 0 -4 130 136 8 -32.4 18 31 49 55 82 99 124 148 161 188 214 215 319 345 472 483 522 548 594 781 784 790 797 880 890 940 955 989 1023 1060 1172 1181 1193 1233 1271 1317 1352 1374 1411 1501 1614 1645 1694 1717 1750 1801 1817 1915 1928 1939 2002 2010 2122 2137 2147 2180 2182 2186 2222 2229 2230 2295 2317 2423 2434 2470 2477 2505 2528 2688 2698 2704 2707 2755 2762 2875 2921 2960 2979 3025 3053 3074 3109 3113 3137 3152 3217 3223 3225 3236 3243 3252 3257 3287 3296 3329 3333 3371 3423 3551 3556 3560 3619 3650 3669 3674 3749 3756 3838 3850 3914 3943 3960 4073 4185 4279 4327 4337 4371 4443 4453 4509 4536 4663 4669 4720 4772 4843 4894 4950 428 1926 3004 3007 3338 3344 3404 3603 CCCACG/CGTGGG 1 -4 132 135 26 -19.5 17 23 42 49 148 161 169 174 218 237 239 267 289 295 320 418 421 456 517 569 589 627 861 927 970 1197 1218 1226 1228 1259 1315 1316 1352 1425 1487 1504 1563 1613 1650 1721 1777 1829 1830 1838 1885 1992 2010 2025 2034 2059 2064 2180 2257 2260 2263 2281 2293 2331 2345 2423 2454 2485 2492 2505 2529 2597 2663 2680 2685 2740 2757 2857 2911 2913 2960 2978 2988 2997 3006 3101 3148 3164 3222 3241 3255 3266 3282 3296 3334 3348 3364 3374 3386 3518 3524 3556 3604 3612 3619 3669 3677 3730 3788 3816 3850 3904 3918 4058 4138 4173 4237 4242 4279 4298 4322 4345 4387 4390 4417 4463 4478 4489 4619 4643 4648 4669 4691 4760 4816 4827 4864 4923 553 1097 1114 1340 1550 1926 1962 2250 2319 2555 2572 2612 2690 3004 3230 3254 3338 3671 3787 3842 4137 4412 4532 4764 4791 4910 GGTCGG/CCGACC 2 -3 119 131 40 -12.8 21 48 80 91 109 150 168 206 217 239 256 264 267 274 312 335 338 371 394 399 413 414 442 456 511 529 541 599 642 679 687 692 702 757 778 789 829 846 925 936 944 1000 1038 1091 1098 1135 1246 1344 1363 1370 1372 1415 1459 1512 1557 1611 1649 1669 1686 1743 1809 1817 1831 1879 1956 1984 2229 2232 2287 2340 2469 2515 2517 2564 2605 2645 2737 2807 2877 2878 2892 2905 2958 2995 2999 3077 3082 3231 3242 3280 3333 3334 3439 3442 3463 3508 3544 3638 3644 3669 3685 3845 3927 3960 3978 4045 4073 4086 4088 4192 4292 4359 4362 4473 4572 4687 4743 4769 4813 14 192 224 409 797 915 917 939 1266 1316 1321 1833 1926 1945 2055 2592 2599 2703 2849 3132 3391 3393 3431 3524 3573 3697 3807 3814 3999 4053 4074 4170 4263 4457 4473 4563 4644 4829 4879 4949 GTGCCC/GGGCAC 0 -4 125 126 20 -20.6 54 56 64 72 116 118 155 202 209 213 221 226 257 322 357 498 529 744 747 763 827 873 881 951 1030 1069 1094 1114 1142 1269 1320 1354 1422 1486 1563 1585 1587 1706 1726 1738 1740 1751 1764 1776 1800 1801 1823 1851 1891 1945 1977 2040 2082 2100 2114 2159 2168 2195 2250 2269 2328 2370 2380 2395 2528 2547 2593 2631 2671 2680 2686 2710 2750 2755 2770 2840 2863 3143 3159 3206 3323 3426 3434 3507 3597 3641 3683 3840 3872 3890 3893 3928 3988 3994 4006 4060 4087 4126 4130 4196 4207 4230 4234 4278 4283 4328 4346 4382 4409 4412 4452 4501 4526 4565 4635 4711 4724 4751 4760 4761 4784 4875 4881 4973 4979 433 489 664 967 1257 1320 1386 1664 1919 1970 2276 2354 2536 3128 3246 3258 3588 3650 3943 4187 CACCGC/GCGGTG 1 -2 116 126 25 -17.9 59 137 141 143 146 149 159 177 230 266 280 285 294 338 345 362 368 383 387 395 439 461 485 490 549 597 608 629 726 809 829 910 1028 1084 1086 1088 1111 1125 1179 1280 1293 1299 1303 1329 1361 1386 1442 1447 1494 1498 1513 1597 1650 1653 1666 1828 1846 1875 1893 1895 1940 2073 2094 2133 2275 2311 2318 2319 2320 2376 2423 2495 2566 2575 2668 2872 3019 3029 3037 3046 3058 3120 3172 3185 3203 3255 3298 3337 3404 3673 3705 3772 3812 3897 3922 3941 4097 4107 4217 4218 4405 4406 4411 4450 4458 4465 4479 4547 4591 4666 4669 4684 4799 4808 4862 4911 132 161 162 190 489 693 948 1072 1162 1202 1729 1963 2301 2460 2677 3125 3269 3333 3472 3548 3774 4086 4153 4624 4778 CACGTC/GACGTG 1 -2 122 124 35 -13.2 17 42 48 49 83 161 203 239 295 347 389 417 457 482 826 877 885 890 927 970 1019 1126 1199 1221 1281 1316 1326 1331 1342 1412 1423 1429 1577 1714 1750 1754 1762 1763 1764 1776 1796 1812 1896 1919 1953 1970 1977 1983 1997 2010 2015 2025 2152 2263 2277 2328 2345 2370 2378 2423 2428 2458 2485 2496 2497 2552 2562 2593 2663 2680 2682 2741 2757 2772 2841 2867 2930 2965 2997 3041 3051 3146 3177 3239 3245 3296 3338 3386 3393 3495 3518 3556 3576 3604 3619 3662 3669 3784 3829 3830 3850 3970 4017 4027 4130 4209 4224 4286 4306 4360 4421 4455 4457 4476 4532 4581 4669 4684 4927 4977 4990 4997 0 128 211 216 280 408 660 874 1031 1423 1620 1701 1702 1926 2078 2141 2166 2236 2462 2899 3004 3208 3338 3433 3545 3738 3754 3880 4025 4132 4218 4309 4741 4820 4855 CCAGCC/GGCTGG 0 -5 125 123 24 -17.7 78 115 175 191 272 305 319 489 520 549 714 727 810 817 862 868 928 951 956 978 993 1096 1150 1165 1184 1189 1190 1236 1268 1302 1306 1314 1316 1657 1673 1704 1775 1790 1814 1815 1878 1880 1889 1920 1945 1951 1971 1980 1984 1985 2007 2032 2057 2120 2140 2229 2246 2267 2268 2288 2293 2364 2382 2400 2511 2538 2544 2576 2599 2607 2622 2767 2853 2855 2888 2902 3002 3003 3009 3024 3060 3170 3208 3230 3258 3274 3459 3466 3475 3508 3517 3585 3620 3687 3751 3849 3865 3872 3875 3932 3993 4030 4063 4088 4106 4153 4275 4314 4342 4351 4397 4431 4485 4515 4519 4565 4703 4725 4728 4732 4757 4813 4955 4984 4990 21 61 133 175 971 1312 1357 1414 1556 1972 2096 2690 2908 3039 3102 3163 3350 3837 3873 3957 3963 4584 4764 4805 CCACCC/GGGTGG 1 -3 114 123 33 -13.7 22 26 49 62 67 82 90 126 169 176 190 221 224 285 287 306 317 379 405 418 507 692 714 796 814 827 896 938 1011 1115 1160 1281 1290 1307 1370 1437 1543 1612 1650 1727 1746 1757 1817 1838 1843 1925 1934 1954 2015 2026 2101 2147 2294 2295 2312 2333 2375 2381 2430 2494 2512 2528 2614 2618 2623 2626 2655 2673 2689 2695 2700 2755 2759 2801 2826 2875 2891 2898 2939 2997 3001 3080 3090 3212 3257 3266 3282 3287 3296 3336 3364 3456 3556 3604 3644 3669 3864 3866 4010 4032 4060 4167 4172 4192 4359 4362 4374 4538 4674 4677 4741 4756 4858 4901 92 121 190 498 1299 1303 1420 1588 1720 1817 1918 1951 2093 2127 2167 2240 2244 2431 2956 3004 3007 3093 3110 4191 4471 4688 4716 4717 4742 4765 4859 4899 4916 CCCTCC/GGAGGG 3 -2 111 120 31 -13.9 5 20 72 73 107 114 120 133 174 186 275 287 324 481 518 530 582 651 742 886 887 909 914 919 924 971 1053 1087 1150 1151 1264 1269 1291 1315 1319 1352 1386 1447 1463 1539 1636 1646 1653 1778 1836 1856 1999 2049 2137 2154 2166 2211 2269 2315 2426 2438 2459 2467 2491 2503 2514 2529 2539 2569 2649 2712 2829 2873 2880 2907 2948 3065 3116 3218 3277 3321 3376 3386 3423 3579 3599 3611 3660 3833 3856 3857 3881 3886 3927 3943 3953 4005 4144 4203 4228 4234 4267 4295 4304 4362 4416 4602 4603 4653 4661 4666 4678 4691 4799 4894 4914 126 163 341 411 701 1019 1136 1280 1362 1604 1729 2036 2060 2315 2397 2462 2468 2666 2735 2796 2822 2912 2955 3328 3500 3820 4087 4130 4268 4757 4764 TTCGGC/GCCGAA 4 -4 113 118 30 -13.9 37 81 107 138 198 270 278 301 308 312 330 380 419 445 458 503 519 531 578 584 630 645 670 718 731 887 896 920 1125 1135 1143 1170 1212 1214 1262 1278 1294 1306 1340 1386 1400 1416 1536 1555 1662 1674 1707 1726 1752 1769 1812 1845 1848 1985 2164 2181 2186 2229 2260 2350 2387 2423 2549 2631 2641 2656 2693 2712 2744 2806 2807 2837 2964 3016 3028 3034 3106 3138 3162 3166 3275 3282 3299 3320 3531 3548 3553 3728 3738 3751 3813 3881 4050 4208 4211 4213 4316 4389 4401 4414 4415 4456 4460 4515 4563 4618 4669 4726 4728 4900 4905 4926 4963 411 435 810 838 1196 1362 1587 1917 2231 2244 2272 2648 2693 2796 2819 2830 3082 3130 3280 3343 3406 3650 3657 3690 3958 4260 4270 4787 4816 4904 CTGCCC/GGGCAG 0 -4 115 116 20 -18.2 13 24 28 78 106 139 178 344 352 428 445 543 545 562 596 681 760 769 810 924 985 1000 1001 1006 1097 1197 1249 1273 1289 1393 1569 1645 1704 1706 1765 1791 1803 1809 1931 1948 2003 2068 2085 2133 2160 2180 2185 2228 2248 2315 2358 2366 2367 2375 2376 2422 2456 2488 2576 2698 2711 2829 2869 2917 2940 2964 3192 3209 3242 3282 3294 3344 3368 3372 3401 3425 3450 3498 3506 3611 3628 3640 3686 3729 3784 3810 3827 3916 3990 4010 4169 4234 4288 4298 4321 4339 4362 4421 4451 4477 4490 4491 4516 4567 4610 4648 4686 4715 4815 4821 4853 4890 4893 4980 4987 224 257 526 696 701 1097 1267 1721 1729 2714 2899 3323 3405 3944 3968 4028 4286 4464 4764 4804 CACGTG/CACGTG 1 -2 109 115 24 -15.9 17 42 72 89 132 165 226 242 517 551 624 677 723 827 832 881 1003 1022 1072 1093 1159 1242 1352 1400 1441 1473 1496 1547 1551 1640 1676 1706 1719 1726 1829 1830 1838 1856 1870 1884 1891 1965 2020 2025 2034 2078 2114 2159 2164 2182 2185 2195 2207 2257 2265 2277 2281 2286 2293 2307 2318 2331 2354 2385 2395 2415 2486 2491 2521 2529 2547 2556 2586 2626 2674 2677 2680 2700 2741 2762 2857 2928 2982 3129 3270 3304 3308 3348 3389 3431 3554 3609 3699 3730 3882 3910 4138 4168 4373 4495 4512 4529 4681 4701 4724 4811 4872 4923 4966 393 579 616 1120 1506 1625 2173 2345 2366 2427 2550 2833 2853 3025 3085 3230 3671 3811 3962 4160 4174 4636 4870 4974 GCCACG/CGTGGC 1 -4 106 111 22 -16.0 17 42 101 102 141 193 203 233 257 310 351 397 412 417 482 503 736 785 885 927 1061 1072 1078 1117 1124 1125 1224 1441 1478 1551 1577 1650 1693 1706 1732 1754 1812 1856 1869 1930 2015 2034 2114 2131 2159 2257 2277 2281 2286 2329 2347 2354 2382 2485 2496 2511 2532 2562 2568 2706 2741 2843 2901 2930 2982 2997 3022 3091 3129 3130 3197 3251 3304 3320 3348 3389 3393 3396 3431 3600 3643 3779 3819 3905 3909 3999 4017 4023 4044 4129 4239 4322 4335 4362 4392 4409 4421 4495 4560 4581 4609 4837 4872 4927 4966 4997 3 233 342 440 523 721 1105 1118 1423 1603 1934 2078 2155 2300 2853 3057 3085 3205 3679 3947 4084 4855 GGACCG/CGGTCC 2 -3 101 109 27 -13.2 92 136 168 184 185 195 272 282 289 297 298 335 361 368 373 374 394 449 495 508 525 541 553 609 687 775 846 887 971 1046 1052 1087 1117 1203 1208 1243 1259 1366 1370 1433 1459 1478 1485 1512 1563 1673 1703 1773 1795 1895 2062 2162 2170 2223 2261 2264 2340 2363 2376 2422 2484 2531 2556 2591 2610 2650 2702 2707 2733 2771 2949 2966 3007 3047 3053 3117 3146 3154 3280 3312 3321 3358 3375 3450 3811 3884 3972 4040 4197 4258 4274 4363 4429 4478 4560 4589 4663 4893 4913 4925 4995 2 503 513 567 699 739 899 1047 1358 1550 1761 1889 1926 2072 2447 2635 3011 3329 3368 3983 4066 4284 4565 4601 4783 4856 4915 CACCAG/CTGGTG 1 -2 98 105 35 -9.5 3 6 62 85 97 117 118 124 174 217 261 401 489 583 848 867 914 952 956 981 1124 1142 1238 1302 1434 1481 1673 1743 1765 1766 1775 1822 1905 1907 1935 1980 2026 2072 2120 2122 2134 2165 2204 2214 2220 2246 2262 2284 2290 2381 2391 2506 2511 2562 2622 2681 2692 2743 2765 2832 2862 2906 2993 3023 3155 3313 3391 3475 3483 3485 3635 3786 3798 3868 3936 3972 3981 4052 4087 4114 4123 4153 4205 4235 4247 4248 4280 4304 4369 4492 4564 4602 4660 4679 4683 4758 4865 4935 105 180 385 598 835 946 1132 1242 1308 1360 1587 1648 1720 1931 1974 2333 2455 2568 2671 2724 2780 3066 3383 3477 3690 3841 4007 4022 4062 4066 4388 4421 4439 4737 4929 GGACTG/CAGTCC 2 -3 90 104 26 -12.6 13 24 28 35 39 40 92 110 119 134 139 226 272 356 363 393 410 449 498 508 624 632 636 675 734 759 775 877 944 966 974 1002 1026 1049 1058 1062 1124 1227 1250 1327 1412 1489 1535 1550 1554 1631 1702 1809 1814 1832 1836 1840 1857 1859 1914 1974 2003 2008 2070 2278 2308 2445 2446 2528 2743 2755 2841 3026 3135 3160 3190 3243 3338 3443 3467 3541 3627 3672 3717 3935 4032 4123 4127 4146 4260 4345 4365 4478 4546 4643 2 277 570 657 663 694 709 873 990 1152 1284 1393 1552 1600 1645 1893 2201 2215 2462 2705 2999 3611 4357 4412 4502 4900 GCCCTC/GAGGGC 0 -2 100 101 13 -18.7 13 73 107 120 174 208 249 277 297 312 324 345 406 725 756 887 919 956 971 1150 1193 1269 1319 1447 1465 1510 1539 1653 1686 1741 1856 1996 2002 2017 2030 2049 2072 2087 2125 2154 2185 2238 2243 2342 2420 2459 2467 2497 2641 2683 2721 2723 2829 2835 3021 3022 3048 3116 3218 3265 3313 3387 3395 3416 3423 3611 3631 3645 3665 3782 3797 3799 3829 3833 3854 3857 3874 3881 3902 3927 3943 3950 4005 4016 4203 4229 4234 4295 4339 4353 4381 4384 4585 4618 4730 4752 4793 4817 4894 4916 404 1267 2276 2516 3820 3834 4153 4215 4268 4286 4617 4771 4880 TGCCCG/CGGGCA 0 -3 98 101 16 -16.8 56 78 83 118 136 163 178 193 197 202 257 276 330 361 449 783 846 926 937 1007 1040 1087 1092 1107 1114 1142 1167 1345 1382 1385 1535 1542 1617 1645 1706 1712 1721 1734 1809 1882 1931 1948 1967 2029 2085 2115 2134 2183 2208 2260 2272 2396 2411 2488 2528 2537 2624 2710 2755 2770 2810 2917 2940 2975 3083 3125 3143 3150 3156 3342 3379 3417 3450 3497 3539 3622 3658 3692 3764 3811 4093 4126 4176 4255 4268 4273 4283 4335 4430 4440 4477 4708 4713 4784 4812 4890 4937 4965 224 499 695 1019 1386 1395 1664 1739 1759 1964 2737 2874 3405 3848 3944 3954 TGGACG/CGTCCA 2 -4 91 101 29 -10.8 34 35 38 61 70 101 123 142 147 179 180 185 239 289 295 374 414 434 492 609 642 680 703 725 769 775 782 785 821 873 915 927 950 977 1001 1167 1308 1422 1436 1437 1469 1476 1575 1711 1812 1840 1878 1979 2017 2025 2029 2131 2316 2578 2623 2658 2663 2686 2727 2764 2781 2841 2915 2922 3003 3022 3085 3177 3260 3318 3324 3325 3575 3604 3693 3798 4015 4037 4283 4335 4356 4369 4397 4479 4489 4568 4615 4624 4800 4804 4861 250 490 498 723 864 943 1154 1339 1405 1430 1492 1526 1614 1701 1786 1990 2297 2819 3339 3546 3566 3738 3852 4066 4166 4211 4359 4494 4582 GCCCTC/GAGGGC 3 -3 100 101 13 -18.7 13 73 107 120 174 208 249 277 297 312 324 345 406 725 756 887 919 956 971 1150 1193 1269 1319 1447 1465 1510 1539 1653 1686 1741 1856 1996 2002 2017 2030 2049 2072 2087 2125 2154 2185 2238 2243 2342 2420 2459 2467 2497 2641 2683 2721 2723 2829 2835 3021 3022 3048 3116 3218 3265 3313 3387 3395 3416 3423 3611 3631 3645 3665 3782 3797 3799 3829 3833 3854 3857 3874 3881 3902 3927 3943 3950 4005 4016 4203 4229 4234 4295 4339 4353 4381 4384 4585 4618 4730 4752 4793 4817 4894 4916 404 1267 2276 2516 3820 3834 4153 4215 4268 4286 4617 4771 4880 GGACGG/CCGTCC 2 -3 87 100 22 -13.5 3 21 43 70 75 101 123 151 176 179 180 201 211 241 361 374 394 435 559 609 638 642 687 703 737 775 785 795 846 1161 1261 1308 1434 1437 1459 1462 1469 1484 1633 1673 1682 1707 1812 1840 1979 2017 2029 2051 2080 2089 2131 2159 2243 2299 2316 2374 2462 2488 2494 2503 2564 2618 2623 2686 2727 2818 2819 2880 3003 3022 3050 3070 3333 3431 3454 3693 3734 4176 4267 4283 4356 4416 4492 4666 4804 4855 4861 250 336 919 968 1776 1990 2264 2557 2617 2634 2782 2805 3478 3518 3591 3869 3966 4130 4211 4494 4582 4660 GGACCC/GGGTCC 2 -3 92 99 30 -10.0 6 49 161 169 185 215 252 305 328 345 363 404 436 504 517 577 599 649 773 781 862 929 948 1105 1106 1157 1218 1224 1243 1268 1371 1390 1557 1656 1690 1702 1709 1726 1757 1773 1843 1859 1911 1955 2088 2124 2154 2187 2195 2216 2242 2246 2299 2333 2414 2446 2460 2508 2579 2680 2690 2701 2737 2763 2850 2905 3091 3152 3207 3345 3358 3393 3396 3562 3613 3644 3882 4074 4077 4096 4166 4173 4279 4416 4465 4521 4570 4573 4618 4816 4858 4992 217 307 445 778 1020 1036 1083 1235 1238 1263 1306 1333 1383 1567 1907 1926 2264 2283 2585 2681 2766 3807 3975 4031 4173 4424 4427 4805 4879 4910 TGCCCC/GGGGCA 0 -3 102 98 24 -12.1 105 155 196 209 222 270 318 344 457 760 804 827 856 881 1030 1142 1204 1274 1289 1311 1378 1387 1393 1419 1422 1488 1524 1550 1574 1704 1705 1706 1726 1758 1801 1823 1995 2038 2040 2081 2086 2150 2169 2269 2294 2361 2426 2450 2672 2853 2873 3034 3043 3095 3206 3255 3344 3372 3401 3434 3451 3505 3521 3587 3590 3612 3732 3790 3801 3825 3843 3915 4050 4060 4094 4158 4227 4290 4319 4324 4355 4382 4499 4507 4546 4563 4569 4602 4640 4653 4680 4724 4806 4816 4877 4914 4935 4979 4980 4986 4987 4994 341 411 701 967 1256 1499 1615 1649 1721 1729 1970 2502 2603 2687 2708 2813 3258 3315 3650 3946 3968 4028 4724 4804 GGCCCC/GGGGCC 0 -3 99 96 12 -18.1 4 51 82 142 161 218 236 464 736 784 797 816 924 955 966 1029 1068 1117 1145 1172 1223 1269 1320 1645 1651 1683 1715 1868 1915 1928 1932 2010 2022 2133 2137 2247 2383 2446 2505 2698 2806 2809 2840 2875 2913 2960 3023 3058 3105 3107 3171 3252 3275 3296 3316 3321 3330 3367 3371 3374 3433 3441 3450 3551 3556 3560 3619 3644 3667 3669 3674 3808 3850 3866 3939 3940 3976 4103 4204 4278 4307 4327 4368 4379 4385 4386 4443 4479 4560 4613 4710 4713 4715 4772 4822 4845 4863 4884 4923 11 103 250 1926 2690 3004 3338 3404 3603 3744 3867 4764 TCGCCC/GGGCGA 0 -4 94 96 20 -13.5 0 28 88 183 216 265 306 389 406 554 560 589 717 776 850 855 885 956 1043 1044 1055 1079 1109 1176 1219 1406 1435 1532 1572 1653 1686 1708 1733 1829 1837 1842 1976 2051 2063 2079 2290 2298 2342 2387 2454 2490 2692 2832 2843 2867 2874 2926 2952 2966 2968 3008 3045 3055 3250 3322 3328 3507 3568 3569 3573 3578 3585 3602 3617 3653 3799 3834 3864 3920 3924 4078 4100 4120 4178 4197 4225 4377 4415 4489 4493 4502 4562 4694 4727 4776 4846 4849 4892 4899 34 54 351 404 446 810 1103 1550 1716 1726 2348 2454 2705 2752 3157 3226 3464 3710 4303 4740 GGGACC/GGTCCC 2 -4 93 96 29 -9.8 6 49 114 123 180 297 314 329 372 382 517 541 558 715 773 929 936 948 1089 1119 1145 1166 1203 1208 1259 1268 1478 1512 1563 1614 1635 1680 1702 1703 1726 1757 1795 1833 1859 1911 1935 1982 2125 2187 2246 2257 2314 2316 2356 2610 2629 2676 2701 2726 2733 2763 2780 2949 2966 2995 3053 3074 3312 3336 3358 3372 3375 3396 3444 3575 3578 3644 3729 3811 3813 3882 3918 3928 3996 4074 4144 4166 4302 4340 4368 4589 4604 4663 4772 4830 4858 4893 4913 281 307 549 739 787 972 1036 1394 1542 1604 1731 1761 2202 2430 2447 2547 2550 2675 2681 3102 3109 3525 3919 4173 4565 4589 4640 4680 4709 GACACG/CGTGTC 1 -4 90 95 21 -12.8 7 9 72 86 123 133 179 242 341 389 442 601 617 656 766 881 1003 1005 1012 1172 1175 1186 1231 1267 1290 1298 1308 1309 1345 1547 1551 1607 1649 1694 1763 1793 1870 1910 1953 1980 2020 2029 2275 2277 2281 2316 2354 2393 2512 2529 2547 2586 2642 2680 2783 2813 2956 2965 3130 3158 3168 3194 3198 3304 3387 3389 3471 3635 3859 3922 3939 3960 4121 4168 4210 4299 4305 4336 4396 4411 4479 4496 4512 4543 4691 4795 4852 4966 4967 4990 374 448 579 982 1387 1470 1550 1860 2191 2254 2402 2578 2589 2697 2853 2903 3229 3442 4218 4498 4545 CCCAGC/GCTGGG 0 -1 93 94 16 -15.1 23 26 115 201 207 247 319 383 409 549 714 862 868 928 1184 1189 1190 1268 1302 1314 1316 1347 1352 1425 1491 1624 1640 1657 1704 1740 1863 1880 1945 1953 1971 1984 2057 2072 2140 2166 2229 2230 2267 2364 2413 2450 2468 2544 2576 2629 2647 2763 2777 2830 2855 2863 2888 2902 3002 3024 3081 3258 3274 3374 3508 3585 3620 3641 3872 3904 3993 4047 4078 4083 4088 4203 4218 4314 4351 4387 4431 4458 4479 4485 4560 4563 4565 4624 4732 4757 4813 4841 4984 11 368 971 1287 1414 1534 3163 3333 3588 3601 3645 3873 3915 3975 4805 4837 GCCCTG/CAGGGC 0 -2 93 94 14 -16.3 60 118 206 217 227 256 301 305 319 375 386 428 501 562 583 584 651 749 769 809 880 885 985 1001 1105 1142 1273 1301 1317 1339 1353 1468 1555 1583 1595 1702 1759 1891 1907 2122 2133 2433 2447 2472 2508 2532 2544 2577 2688 2796 2854 2862 2872 2873 2874 2895 3027 3109 3165 3170 3210 3243 3252 3257 3396 3409 3543 3630 3668 3684 3694 3713 3714 3804 3871 3972 4026 4078 4195 4239 4270 4289 4326 4467 4474 4522 4695 4707 4756 4761 4815 4829 4852 10 58 512 899 1152 2067 2441 2713 3128 3302 3329 3588 3644 3663 GGTCCG/CGGACC 2 -3 82 93 28 -9.5 56 70 100 123 168 176 179 180 185 195 215 274 293 335 361 373 394 473 495 525 547 566 687 846 862 887 1113 1243 1282 1308 1370 1384 1459 1485 1512 1522 1656 1678 1703 1709 1727 1773 1843 1895 1955 1968 2015 2053 2088 2154 2173 2195 2245 2261 2299 2333 2376 2446 2490 2579 2591 2680 2832 2905 3012 3080 3091 3164 3184 3207 3280 4096 4173 4197 4271 4274 4394 4513 4514 4618 4816 4992 3 70 119 217 488 513 629 954 1072 1083 1238 1333 1372 1465 1889 1926 2529 2576 2766 2944 3329 3436 3791 3886 3983 4066 4596 4805 CCCCTC/GAGGGG 3 -3 85 93 25 -10.7 0 47 51 95 171 198 222 235 275 287 310 327 518 569 582 630 644 816 924 938 966 991 1063 1087 1291 1295 1387 1419 1690 1715 1758 1778 1836 1897 1941 1954 2049 2125 2166 2234 2236 2312 2423 2426 2503 2640 2680 2719 2840 2873 2881 2907 2920 2961 3065 3078 3082 3291 3316 3321 3328 3386 3453 3476 3484 3599 3647 3660 3698 3760 3870 3886 3940 3941 3963 3969 4167 4299 4416 4479 4504 4618 4663 4669 4914 126 163 224 411 701 702 1280 1362 1604 1729 2060 2501 2502 2544 2666 2735 2822 3328 3404 3500 3969 4122 4153 4303 4764 AGCCCC/GGGGCT 0 -3 95 91 18 -13.3 38 43 57 268 276 281 337 390 443 646 665 839 906 979 1162 1218 1257 1294 1302 1352 1737 1790 1792 1796 1880 1938 2109 2120 2165 2166 2209 2213 2219 2293 2295 2307 2374 2469 2499 2524 2546 2560 2616 2674 2714 2732 2863 2951 2957 2987 3009 3024 3065 3087 3174 3199 3264 3340 3377 3406 3418 3446 3457 3476 3484 3527 3682 3685 3691 3698 3701 3711 3759 3841 3865 3901 3928 3964 4077 4123 4231 4257 4329 4351 4377 4504 4519 4525 4628 4690 4728 4833 4860 4918 4990 166 182 383 724 971 1378 1553 1707 1885 2673 2690 3264 3328 3645 3762 4352 4577 4910 ACACGC/GCGTGT 1 -3 81 90 14 -15.3 1 7 9 70 80 104 123 167 179 180 182 246 456 476 529 684 840 1149 1175 1193 1218 1290 1298 1308 1330 1603 1694 1738 1771 1792 1815 1837 1910 2045 2130 2275 2284 2316 2342 2393 2432 2484 2492 2505 2588 2642 2677 2704 2757 2782 2788 2801 2806 2813 2871 2894 2940 3101 3198 3251 3304 3515 3725 3862 3922 4092 4177 4210 4235 4257 4392 4479 4508 4512 4567 4691 4733 4736 4745 4795 4909 1 233 337 846 965 1387 1697 2667 2853 2898 3013 3229 4628 4910 GGGTCG/CGACCC 2 -4 87 90 22 -11.3 109 142 168 186 217 256 264 391 394 413 429 456 541 599 679 692 711 846 944 1030 1091 1104 1197 1246 1311 1344 1363 1370 1459 1537 1611 1649 1669 1743 1827 1831 1879 1956 1975 2000 2088 2171 2232 2272 2287 2486 2544 2617 2645 2699 2740 2878 2884 2892 2905 2958 2995 3077 3164 3214 3231 3232 3241 3280 3333 3334 3525 3644 3755 3843 3845 3937 3962 4045 4086 4192 4212 4292 4359 4362 4590 4609 4644 4687 4691 4927 4999 36 917 1412 1550 2121 2659 2703 2797 2849 3329 3393 3601 3698 3775 3807 3814 3947 4122 4292 4391 4563 4949 ACGGAC/GTCCGT 2 -5 81 89 27 -9.1 43 56 70 119 123 151 176 179 180 211 274 353 373 473 495 512 566 609 632 691 709 869 997 999 1033 1062 1068 1150 1163 1261 1292 1296 1308 1414 1434 1656 1703 1727 1746 1773 1804 1841 1895 1956 2102 2159 2316 2376 2394 2412 2446 2494 2521 2555 2591 2618 2749 2769 2841 2952 3070 3118 3184 3272 3311 3707 3711 3827 3939 4046 4058 4078 4115 4197 4364 4423 4471 4770 4828 4838 4918 3 70 557 629 742 1083 1333 1468 1470 1550 1889 2576 2577 2593 2737 2763 3009 3046 3386 3436 3630 3631 3799 3886 3894 3966 4067 TACGGG/CCCGTA 4 -4 82 87 20 -11.5 31 32 78 107 257 264 308 330 335 380 413 453 519 531 582 630 670 695 697 711 844 887 934 1053 1104 1116 1145 1161 1337 1366 1382 1407 1462 1498 1555 1666 1712 1801 1882 1927 1976 2099 2249 2352 2382 2531 2573 2639 2648 2712 2770 2865 2960 2980 3026 3124 3146 3175 3199 3261 3553 3616 3813 3856 3957 3998 4065 4074 4096 4140 4178 4180 4183 4187 4255 4407 4426 4676 4784 4858 4918 4926 498 510 1386 1776 1865 1871 1976 2316 2744 2813 3353 3386 3888 3998 4031 4392 4494 4859 4948 4960 CACGCC/GGCGTG 0 -5 83 85 12 -15.3 70 123 129 167 168 179 180 394 442 456 465 482 687 704 735 861 927 1114 1125 1259 1281 1308 1370 1459 1603 1709 1721 1738 1771 1792 1809 1856 1878 2015 2059 2069 2130 2214 2286 2312 2316 2393 2432 2492 2586 2588 2597 2663 2780 2811 2839 2933 2940 2943 2978 2988 3013 3059 3121 3129 3198 3205 3255 3413 3445 3515 3677 3762 3766 3788 3805 3922 3959 4016 4203 4235 4463 4511 4619 4675 4736 4869 4909 233 879 1962 2300 2500 2667 2898 3042 3623 3865 4717 4927 CACGCC/GGCGTG 1 -2 83 85 12 -15.3 70 123 129 167 168 179 180 394 442 456 465 482 687 704 735 861 927 1114 1125 1259 1281 1308 1370 1459 1603 1709 1721 1738 1771 1792 1809 1856 1878 2015 2059 2069 2130 2214 2286 2312 2316 2393 2432 2492 2586 2588 2597 2663 2780 2811 2839 2933 2940 2943 2978 2988 3013 3059 3121 3129 3198 3205 3255 3413 3445 3515 3677 3762 3766 3788 3805 3922 3959 4016 4203 4235 4463 4511 4619 4675 4736 4869 4909 233 879 1962 2300 2500 2667 2898 3042 3623 3865 4717 4927 CACGGC/GCCGTG 1 -2 79 84 22 -10.0 67 80 121 161 174 186 190 218 257 266 284 350 529 615 802 809 851 927 1087 1160 1425 1447 1649 1650 1704 1769 1812 1852 1856 1865 1959 2052 2089 2149 2170 2214 2321 2350 2412 2416 2546 2556 2562 2576 2597 2727 2873 2891 2912 2936 2977 3027 3050 3266 3279 3282 3364 3622 3667 3779 3922 4217 4237 4267 4298 4335 4362 4450 4487 4501 4555 4609 4648 4656 4681 4734 4736 4827 4933 108 374 675 800 862 990 1105 1461 1948 1962 2032 2235 2529 2804 3001 3197 3254 3471 3811 3922 3947 4901 CGCCCT/AGGGCG 0 -3 83 83 6 -19.3 118 167 208 215 297 345 375 389 406 450 561 651 652 717 725 809 885 988 1081 1142 1435 1494 1519 1603 1621 1653 1671 1686 1702 1794 1842 1856 1861 1940 2017 2072 2243 2269 2290 2641 2668 2703 2839 2861 2862 2874 2978 3008 3048 3055 3120 3265 3298 3328 3332 3387 3515 3578 3610 3645 3699 3799 3829 3848 3938 3972 4078 4168 4178 4203 4295 4338 4374 4384 4467 4531 4642 4697 4724 4756 4772 4849 4909 34 54 404 1716 2908 3406 CACGCG/CGCGTG 1 -2 78 83 13 -14.2 1 65 80 140 231 233 412 529 581 627 661 704 859 1008 1039 1125 1182 1193 1218 1290 1352 1423 1478 1487 1819 1869 1892 1910 1983 1992 2019 2060 2127 2281 2332 2393 2400 2441 2590 2600 2626 2642 2659 2677 2691 2697 2704 2801 2871 2894 2911 3005 3011 3105 3126 3129 3146 3222 3251 3262 3465 3600 3789 3849 3922 4009 4016 4031 4092 4107 4242 4257 4479 4494 4640 4691 4919 4959 223 233 618 642 933 1031 1169 1387 1817 1904 2327 3811 4910 CCCCCT/AGGGGG 3 -2 73 82 17 -11.8 0 7 20 47 51 90 95 235 249 270 275 327 518 582 644 646 665 924 938 966 1063 1142 1203 1291 1310 1378 1387 1573 1742 1757 1800 2015 2049 2086 2095 2165 2166 2420 2423 2426 2447 2462 2575 2623 2670 2680 2920 2961 3024 3082 3298 3316 3321 3328 3446 3453 3604 3660 3959 3969 4040 4047 4278 4362 4404 4496 4603 4618 4669 4830 4873 4892 4926 161 162 483 635 642 1604 2521 2524 2672 2695 3005 3516 3521 3602 3919 4717 4925 CGCCCC/GGGGCG 0 -3 75 81 15 -12.5 0 7 48 79 121 170 216 345 395 508 566 569 625 628 835 850 875 990 1087 1149 1210 1418 1475 1504 1546 1641 1686 1715 1778 1798 1836 1910 2010 2203 2229 2276 2358 2432 2447 2458 2468 2504 2670 2680 2770 2832 2867 2872 2937 2966 3045 3197 3318 3507 3560 3589 3600 3617 3619 3647 3750 3765 3766 3805 3844 3903 3941 3959 4143 4173 4249 4496 4589 4830 4892 180 351 577 1649 1776 2433 2667 2682 2798 2805 3217 3344 3603 4303 4740 CCCAGG/CCTGGG 0 -1 73 79 13 -13.2 22 43 58 86 114 116 217 247 256 308 318 334 380 386 419 519 584 646 844 943 1033 1133 1234 1246 1338 1401 1455 1531 1555 1648 1822 1831 1854 2000 2027 2038 2144 2532 2750 2817 2860 2964 3032 3074 3088 3091 3152 3203 3257 3394 3460 3510 3535 3585 3617 3644 3713 3795 3879 3991 4031 4053 4060 4179 4409 4452 4478 4589 4636 4681 4779 4867 4869 216 234 915 1365 1502 1696 1970 1972 2745 3233 3264 3639 4901 GCCCGC/GCGGGC 0 -2 77 79 13 -13.2 34 74 100 118 170 181 449 472 495 691 807 816 850 876 937 956 1040 1087 1092 1139 1142 1193 1322 1369 1542 1560 1713 1801 1821 1878 1882 1924 1939 2021 2029 2074 2130 2208 2218 2272 2336 2342 2398 2430 2556 2561 2698 2700 2704 2770 2875 2917 2940 2960 3089 3223 3285 3551 3622 3710 3756 3855 3966 4107 4205 4267 4292 4335 4443 4531 4573 4688 4713 4794 4799 4864 4879 346 1127 1180 1534 1550 1587 1739 3110 3405 3661 3675 3944 3954 GGCACG/CGTGCC 1 -4 74 77 17 -10.6 72 99 114 116 118 226 228 317 482 503 529 744 747 763 765 802 827 828 881 1062 1114 1142 1159 1651 1656 1726 1751 1764 1769 1776 1823 1891 2009 2114 2159 2195 2204 2230 2328 2370 2395 2491 2547 2586 2593 2680 2682 2762 2788 3009 3050 3159 3299 3465 3667 3789 3813 3928 3994 4016 4060 4130 4360 4382 4409 4452 4455 4501 4603 4647 4670 4724 4811 4814 408 416 643 967 1169 1718 1899 2017 2032 2345 2678 3085 3411 4084 4308 4601 4870 GCCCCT/AGGGGC 0 -2 80 76 20 -9.1 48 57 222 236 345 443 569 856 924 1068 1087 1145 1149 1162 1172 1269 1352 1419 1550 1574 1715 1758 1778 1792 1836 1910 2010 2120 2169 2358 2426 2450 2458 2468 2469 2504 2546 2560 2680 2873 2957 3065 3107 3197 3264 3330 3367 3406 3450 3476 3484 3647 3698 3701 3711 3766 3801 3825 3865 3901 3915 3940 3941 3976 4143 4173 4231 4257 4319 4327 4368 4379 4479 4499 4504 4546 4613 4653 4884 4914 166 411 701 967 971 1256 1378 1499 1729 2433 2502 2673 2690 3217 3328 3404 4303 4724 4764 4804 TGACCG/CGGTCA 2 -3 72 74 22 -7.9 3 161 233 252 269 290 300 335 338 445 890 899 905 962 1067 1092 1343 1429 1434 1510 1512 1566 1577 1645 1659 1705 1774 1812 1882 1884 2024 2092 2185 2207 2291 2362 2486 2570 2671 2706 2719 2770 2797 2873 2876 2898 2905 2958 3107 3182 3243 3256 3287 3482 3523 3639 3701 3895 4013 4022 4089 4228 4422 4471 4564 4614 4615 4840 4883 4916 4921 4933 649 970 1212 2140 2280 2635 2663 2917 2987 2993 3007 3237 3461 3478 3623 3827 3843 4056 4121 4539 4756 4878 CCCGTG/CACGGG 0 -1 73 72 20 -8.3 58 102 141 154 193 195 269 289 503 506 569 656 836 970 1142 1167 1231 1283 1336 1357 1412 1727 1838 1931 1936 1964 2019 2029 2114 2179 2260 2342 2409 2411 2454 2508 2589 2623 2686 2760 2810 2962 2987 3108 3158 3265 3517 3523 3564 3606 3845 3928 3979 4019 4129 4268 4322 4382 4411 4417 4429 4430 4442 4489 4621 4681 4695 4741 4805 4812 4837 4978 4997 374 1019 1111 1279 1358 1550 1610 1729 1790 1926 2172 2270 2674 3046 3157 3472 3527 3911 4764 4899 CACGGG/CCCGTG 1 -2 73 72 20 -8.3 58 102 141 154 193 195 269 289 503 506 569 656 836 970 1142 1167 1231 1283 1336 1357 1412 1727 1838 1931 1936 1964 2019 2029 2114 2179 2260 2342 2409 2411 2454 2508 2589 2623 2686 2760 2810 2962 2987 3108 3158 3265 3517 3523 3564 3606 3845 3928 3979 4019 4129 4268 4322 4382 4411 4417 4429 4430 4442 4489 4621 4681 4695 4741 4805 4812 4837 4978 4997 374 1019 1111 1279 1358 1550 1610 1729 1790 1926 2172 2270 2674 3046 3157 3472 3527 3911 4764 4899