#3408/2612 #3.02 # k-mer/r.c. Cluster Offset PosCt wPosCt NegCt HGP_10 ATGGGCT/AGCCCAT 0 -4 86 104 17 -12.3 3 4 39 43 73 134 150 195 225 253 291 296 297 329 335 367 446 535 747 792 824 840 855 885 886 907 978 985 1022 1031 1077 1306 1307 1355 1375 1409 1423 1430 1437 1444 1539 1546 1565 1566 1601 1602 1651 1741 1742 1759 1888 1889 1890 1891 1981 2041 2149 2150 2155 2156 2187 2229 2272 2348 2414 2415 2474 2528 2539 2582 2583 2589 2889 2896 2935 2960 2965 2966 2998 3049 3050 3064 3081 3110 3176 3248 140 517 531 712 970 1063 1076 1077 1099 1200 1202 1293 1849 2062 2203 2352 2378 ACACGTG/CACGTGT 1 -3 130 94 8 -15.9 89 96 113 115 158 161 178 198 214 217 226 228 243 244 248 249 252 263 272 283 291 301 307 308 346 351 355 376 386 400 411 413 417 423 427 448 449 476 477 479 480 500 503 504 534 539 541 563 620 627 661 689 716 777 817 818 821 840 863 874 887 913 916 962 968 1000 1010 1030 1034 1036 1066 1073 1074 1091 1092 1108 1160 1185 1234 1252 1298 1316 1333 1337 1338 1348 1349 1402 1425 1438 1471 1472 1478 1513 1662 1708 1744 1851 1985 2011 2012 2020 2045 2046 2047 2051 2052 2058 2095 2201 2299 2319 2458 2535 2573 2738 2814 2863 2865 2879 2880 2948 2983 2984 3018 3019 3068 3081 3355 3356 291 334 649 1610 1722 1847 1851 2480 TGGGCTT/AAGCCCA 0 -3 106 89 15 -10.5 39 73 134 195 236 286 288 289 296 297 298 320 329 335 366 383 425 436 465 525 526 535 619 667 682 747 824 834 840 873 883 884 885 886 947 984 985 1022 1027 1035 1062 1063 1069 1077 1132 1133 1155 1263 1308 1346 1355 1375 1409 1418 1419 1423 1437 1444 1539 1651 1759 1804 1805 1819 1872 1895 2041 2149 2150 2155 2156 2187 2214 2272 2321 2348 2397 2400 2414 2415 2460 2474 2515 2529 2530 2539 2582 2583 2589 2722 2785 2882 2935 2960 2965 2966 2982 2998 3001 3006 3044 3064 3110 3176 3248 3335 159 517 531 662 712 742 768 970 1003 1063 1076 1099 1849 2352 2411 TTGGGAT/ATCCCAA 0 -4 51 82 18 -7.8 31 32 33 71 72 465 514 515 615 1149 1310 1426 1561 1562 1563 1611 1689 1714 1720 1721 1780 1825 1861 1875 1969 2030 2247 2248 2268 2283 2301 2303 2350 2362 2363 2393 2486 2527 2546 2585 2586 2618 2693 2694 2896 3190 3245 3291 3302 3324 3384 77 144 443 534 605 624 691 1075 1183 1468 1471 1489 1620 1668 1721 1793 1988 2142 CCTCTCT/AGAGAGG 2 -2 90 79 17 -7.7 83 119 217 268 404 420 428 450 452 611 617 621 633 675 678 703 734 746 748 841 924 967 972 973 987 988 1029 1050 1054 1100 1149 1193 1213 1230 1257 1343 1346 1359 1366 1369 1388 1436 1441 1469 1470 1519 1520 1578 1601 1602 1659 1702 1705 1739 1740 1752 1783 1807 1808 1818 1906 1949 1988 2025 2026 2098 2100 2114 2199 2200 2229 2336 2350 2641 2642 2708 2726 2777 2818 2865 2886 2911 2931 2980 3201 3202 3226 3278 3279 3301 231 366 475 476 575 653 658 756 1341 1455 1569 1718 2087 2315 2334 2425 2525 ATGGGCC/GGCCCAT 0 -4 95 78 7 -13.2 39 78 162 166 182 195 236 254 257 258 275 291 295 320 323 335 339 340 394 407 420 425 540 552 571 599 606 626 674 739 783 802 803 832 884 913 926 927 963 992 1016 1031 1047 1065 1069 1235 1277 1312 1313 1314 1409 1492 1538 1571 1579 1580 1591 1612 1641 1727 1804 1805 1833 1837 1859 1870 1886 1966 1991 2004 2041 2131 2185 2229 2273 2317 2318 2515 2518 2519 2585 2586 2795 2853 2854 2866 2882 2914 2941 2997 3006 3064 3132 3229 3248 140 264 332 1202 1703 1848 2333 TATGGGC/GCCCATA 0 -5 51 77 5 -14.6 11 12 43 162 166 253 295 329 335 535 610 739 747 758 802 803 855 913 926 927 963 992 1031 1047 1235 1265 1313 1444 1538 1886 2131 2225 2229 2282 2414 2415 2474 2585 2586 2589 2644 2687 2688 2853 2854 2866 2935 2941 2950 3102 3282 68 264 867 1063 1848 TTGGGCT/AGCCCAA 0 -4 89 75 6 -13.3 73 141 236 254 286 298 320 366 383 412 414 425 436 465 473 513 525 526 534 609 619 655 667 682 764 802 803 807 839 873 883 884 947 952 984 1062 1063 1069 1132 1133 1243 1263 1308 1346 1375 1405 1418 1419 1435 1455 1538 1574 1803 1804 1805 1819 1870 1895 2004 2127 2155 2156 2214 2222 2223 2321 2397 2515 2520 2529 2530 2551 2702 2722 2795 2796 2868 2882 2915 2916 2929 2943 2944 3001 3006 3044 3335 3357 3358 100 159 662 742 860 1003 CACGTGG/CCACGTG 1 -2 111 74 5 -13.9 96 113 151 167 175 178 214 220 222 226 228 239 248 249 263 272 283 301 307 308 309 313 328 386 406 411 413 427 442 443 446 449 452 467 517 523 532 534 557 563 577 587 617 627 716 764 810 819 821 840 851 863 874 880 913 916 962 1004 1030 1034 1055 1088 1091 1092 1111 1141 1217 1220 1230 1252 1265 1275 1298 1316 1337 1338 1348 1349 1396 1397 1438 1466 1471 1472 1564 1594 1646 1647 1662 1693 1708 1944 1985 1996 1997 2045 2046 2047 2051 2052 2058 2095 2144 2319 2535 2879 2880 3018 3019 3371 3372 1416 1847 1851 2350 2480 GACACGT/ACGTGTC 1 -4 103 71 6 -12.4 84 89 113 115 126 149 158 163 178 198 214 217 226 228 243 244 252 292 309 346 351 355 376 406 423 448 476 477 480 499 534 539 541 563 625 627 642 661 712 713 716 724 777 818 916 968 1000 1010 1034 1036 1066 1072 1073 1074 1091 1092 1108 1164 1195 1234 1236 1237 1251 1252 1316 1337 1338 1340 1348 1349 1366 1400 1425 1438 1478 1513 1678 1744 1834 1964 2011 2020 2045 2046 2047 2058 2104 2108 2201 2319 2458 2473 2511 2742 2863 2865 2894 2983 2984 2994 3018 3019 3145 9 291 334 1208 1722 1851 TGGGCCT/AGGCCCA 0 -3 97 70 9 -10.1 192 195 225 235 253 258 314 320 335 339 340 394 420 425 460 500 540 552 599 606 667 674 718 747 783 808 832 848 911 913 947 992 1016 1031 1069 1240 1265 1277 1314 1360 1378 1409 1490 1491 1512 1559 1560 1565 1566 1571 1579 1580 1591 1612 1641 1681 1699 1803 1814 1820 1833 1860 1886 1895 1981 2041 2080 2131 2185 2229 2273 2297 2303 2414 2415 2517 2518 2519 2541 2585 2586 2841 2853 2854 2873 2882 2952 2953 2954 3006 3049 3050 3064 3110 3170 3229 3244 140 264 332 531 1258 1780 1842 1848 2210 AATGGGC/GCCCATT 0 -5 98 68 15 -6.6 39 73 166 195 236 254 296 335 339 340 351 420 425 446 540 571 606 626 674 679 747 783 792 885 886 907 913 978 985 1016 1022 1062 1063 1065 1077 1207 1277 1306 1307 1355 1409 1423 1430 1437 1492 1539 1546 1571 1591 1612 1641 1649 1650 1651 1727 1741 1742 1759 1804 1805 1833 1837 1840 1870 1966 1981 1991 2004 2041 2097 2155 2156 2185 2187 2229 2272 2273 2348 2397 2515 2518 2519 2745 2795 2807 2885 2896 2914 2929 2950 2960 2965 2966 3064 3110 3132 3176 3229 332 531 712 1048 1076 1077 1293 1375 1703 1803 1849 2062 2203 2333 2352 CCTCCAC/GTGGAGG 2 -2 61 65 14 -6.5 1 13 50 79 80 89 151 197 222 301 315 424 510 585 819 831 836 840 881 1051 1052 1089 1090 1107 1110 1177 1178 1206 1231 1505 1524 1665 1666 1674 1694 1748 1855 2046 2047 2082 2144 2180 2209 2237 2341 2342 2345 2374 2457 2649 2650 2862 2893 2986 3158 3159 3283 3286 3328 3386 3387 93 191 721 995 1109 1142 1176 1345 1771 2036 2360 2365 2367 2572 TTATGGG/CCCATAA 0 -6 48 64 8 -9.5 43 48 49 162 253 282 456 473 514 515 739 764 802 803 817 850 906 925 992 1031 1205 1235 1271 1272 1278 1279 1313 1393 1463 1926 2221 2225 2317 2318 2367 2417 2427 2585 2586 2663 2664 2687 2688 2935 2981 2994 3102 3229 191 693 867 937 1110 1612 1848 2411 GCCACGT/ACGTGGC 1 -4 91 63 9 -8.6 90 100 113 158 167 175 202 214 228 239 263 273 283 307 308 313 328 406 411 442 443 446 467 471 523 532 534 540 557 559 562 563 571 627 716 726 727 819 827 851 863 870 874 899 903 916 925 948 962 1000 1031 1070 1111 1126 1195 1220 1230 1252 1258 1265 1275 1298 1316 1374 1415 1441 1466 1471 1472 1495 1640 1662 1708 1785 1833 1944 1985 1996 1997 2004 2058 2095 2205 2319 2520 2535 2743 2880 2930 3026 3238 292 933 1106 1227 1416 1847 2310 2350 2570 CCAACCA/TGGTTGG 6 -3 47 61 12 -6.7 26 52 123 200 285 329 350 370 449 1083 1148 1176 1391 1392 1395 1398 1399 1405 1442 1449 1475 1603 1695 1755 1756 1892 1990 2214 2247 2248 2324 2325 2362 2363 2428 2429 2500 2510 2517 2574 2575 2610 2727 2774 2866 2877 2926 297 390 421 709 734 1252 1443 1507 1643 2234 2405 2415 CCAACGA/TCGTTGG 6 -3 45 61 12 -6.7 88 200 323 332 333 356 379 532 599 628 807 839 866 903 904 914 926 927 942 1070 1093 1208 1263 1331 1696 1697 1722 1862 1877 2040 2066 2331 2379 2380 2449 2568 2569 2570 2576 2589 2595 2827 3073 3111 3122 106 402 437 488 515 1139 1254 1616 1688 1842 2384 2573 CCATCCA/TGGATGG 6 -3 40 61 9 -8.2 18 226 407 439 593 681 851 863 1013 1078 1118 1134 1264 1366 1469 1470 1648 1679 1789 1891 2101 2114 2196 2209 2251 2252 2536 2561 2578 2596 2710 2735 2791 2832 2843 2926 2976 3257 3258 3316 163 336 550 558 589 775 944 1653 2570 AATGTGG/CCACATT 7 -3 42 61 10 -7.7 14 15 19 257 396 562 685 707 850 978 1065 1136 1137 1177 1178 1235 1318 1389 1461 1467 1468 1595 1754 1798 1799 1872 1898 1994 2105 2169 2251 2252 2293 2294 2295 2558 2633 2645 2899 3036 3252 3255 86 167 206 335 819 1375 1492 1808 1868 1990 GGGCTTT/AAAGCCC 0 -2 62 58 12 -6.2 39 236 238 286 297 298 320 366 383 525 526 535 682 747 840 873 884 985 1035 1062 1063 1132 1133 1155 1235 1409 1418 1419 1620 1651 1804 1805 1819 1846 1872 1895 2041 2149 2150 2261 2272 2348 2371 2397 2400 2414 2415 2460 2474 2515 2529 2530 2589 2601 2602 2785 2935 2960 2965 2966 3110 3141 140 159 517 531 662 703 712 941 970 1099 1491 1849 CATGGGC/GCCCATG 0 -5 39 57 6 -9.3 3 4 39 73 134 150 258 291 367 535 783 832 1032 1120 1312 1314 1565 1566 1579 1580 1601 1602 1651 1859 1890 2317 2318 2455 2528 2539 2882 2955 2997 3022 3038 3039 3081 3248 3293 140 517 1099 1200 1202 2378 TGGGGAA/TTCCCCA 0 -3 47 57 14 -5.2 1 23 351 392 440 532 566 567 575 684 759 864 888 889 1050 1131 1177 1178 1278 1279 1284 1292 1348 1349 1671 1726 1942 2033 2079 2176 2292 2335 2504 2505 2619 2689 2690 2730 2776 2798 2823 2834 2938 2947 3004 3031 3346 23 175 472 663 668 1008 1058 1088 1225 1775 2295 2338 2403 2411 CCCTCTC/GAGAGGG 2 -3 40 56 9 -7.3 74 75 76 121 404 428 485 554 703 734 748 756 757 822 841 1100 1149 1240 1343 1366 1601 1602 1659 1752 1783 1945 2229 2329 2336 2404 2445 2481 2617 2641 2642 2708 2722 2818 2911 2931 653 658 685 799 1617 2334 2342 2489 2572 TGACACG/CGTGTCA 1 -5 57 54 4 -10.2 9 10 162 163 226 252 292 311 332 333 391 423 448 539 541 563 625 627 642 713 818 916 968 1000 1036 1066 1072 1105 1108 1164 1252 1425 1445 1691 1782 1807 1808 1959 2045 2104 2201 2228 2458 2473 2675 2885 2899 2983 2984 3018 3019 3158 3159 3236 3239 3332 3382 291 334 1722 2493 TTGGGCC/GGCCCAA 0 -4 78 52 9 -6.5 102 192 225 230 235 253 389 436 460 473 529 552 591 602 603 694 718 739 747 808 827 911 933 934 947 949 992 1016 1022 1031 1047 1065 1079 1156 1226 1240 1287 1378 1395 1444 1490 1491 1512 1529 1530 1538 1565 1566 1613 1623 1641 1681 1769 1803 1814 1820 1860 1895 1947 1981 2080 2216 2297 2303 2348 2451 2517 2520 2541 2714 2752 2841 2906 3094 3103 3110 3170 3280 1 332 1256 1258 1524 1748 1780 1842 2210 TCCCTCT/AGAGGGA 2 -4 40 52 12 -5.1 66 67 101 121 176 440 554 609 611 649 650 703 756 757 779 849 997 1149 1240 1343 1434 1570 1601 1602 1748 1752 2061 2229 2404 2480 2481 2641 2642 2685 2721 2881 2911 2931 3285 3300 93 236 799 1032 1556 1617 2201 2260 2334 2488 2489 2572 TTCCCTC/GAGGGAA 2 -5 39 52 13 -4.7 191 360 422 514 515 554 556 634 779 833 881 896 1163 1240 1261 1545 1570 1601 1602 1708 1942 2362 2363 2422 2423 2480 2481 2648 2649 2650 2685 2751 2763 2798 2818 2839 2881 2931 3300 236 413 875 1032 1098 1207 1243 1658 2126 2260 2280 2334 2495 TATTGGG/CCCAATA 0 -6 59 51 6 -8.0 71 72 141 166 225 254 275 359 418 481 552 591 602 603 682 718 827 933 934 947 951 952 958 1065 1153 1154 1346 1378 1437 1444 1535 1565 1566 1591 1623 1681 1716 1860 1895 1974 1975 2155 2156 2268 2349 2397 2414 2415 2722 2864 2866 2868 2976 3006 3103 3296 3297 3357 3358 624 930 936 1003 1227 2353 TGGGCCA/TGGCCCA 0 -3 61 51 4 -9.5 39 43 78 162 182 192 275 295 356 389 420 436 443 509 527 528 529 552 571 602 603 694 794 827 926 927 949 963 1031 1064 1065 1156 1226 1287 1312 1378 1442 1444 1478 1492 1495 1539 1613 1769 1804 1805 2004 2080 2451 2515 2521 2714 2795 2866 2906 2941 3049 3050 3248 3280 3335 1 563 1256 1524 TGGGCTC/GAGCCCA 0 -3 37 51 8 -6.8 3 4 176 253 284 367 412 414 446 534 565 619 655 764 802 803 839 855 890 1035 1111 1240 1286 1538 1568 1819 1890 2004 2042 2222 2223 2321 2528 2551 2702 2796 3384 71 100 140 405 560 1307 2062 2378 TGGGCTG/CAGCCCA 0 -3 46 51 5 -8.8 43 82 225 356 473 519 535 609 667 747 792 807 908 952 1306 1307 1375 1430 1435 1455 1546 1565 1566 1574 1601 1602 1803 1865 1891 2155 2156 2484 2520 2795 2820 2868 2896 2915 2916 2929 2943 2944 3049 3050 3081 3116 845 1200 2203 2210 2527 TTTGGGC/GCCCAAA 0 -5 54 51 12 -5.0 192 389 425 436 473 502 525 526 534 619 791 883 884 1016 1047 1079 1375 1378 1405 1490 1491 1512 1538 1590 1641 1769 1803 1895 1950 1951 2080 2127 2172 2173 2214 2222 2223 2520 2551 2617 2626 2777 2791 2795 2796 2915 2916 2929 2943 2944 3001 3094 3170 3335 1 111 601 635 662 742 860 1103 1524 1549 1780 2210 TGCCATT/AATGGCA 4 -1 47 51 13 -4.6 20 21 69 133 157 184 188 210 496 500 527 528 604 605 819 841 849 850 1096 1246 1401 1422 1464 1543 1648 1720 1721 1755 1756 1773 1778 1809 1976 1977 2006 2137 2138 2467 2793 2829 2928 3012 3036 3065 3136 3261 3314 402 687 718 945 1401 1576 1653 1948 2093 2094 2290 2488 2500 TCACGTG/CACGTGA 1 -3 75 49 7 -7.0 89 96 116 142 167 229 291 302 309 318 328 400 423 427 446 500 503 504 517 518 595 617 634 642 681 687 774 775 805 846 847 851 854 880 913 956 957 962 968 1000 1004 1006 1027 1030 1088 1110 1141 1160 1185 1402 1422 1453 1487 1513 1564 1594 1622 1644 1645 1734 1944 1954 1968 1974 1975 2095 2103 2293 2294 2295 3152 3178 3191 3371 3372 334 437 1225 1297 1610 1848 2531 TACACGT/ACGTGTA 1 -4 59 48 10 -5.3 101 143 165 217 243 244 272 283 291 308 376 411 412 449 500 529 539 541 661 777 813 840 863 877 913 1088 1187 1212 1234 1293 1294 1311 1475 1570 1662 1708 1744 1966 1985 2020 2347 2379 2380 2436 2495 2535 2573 2701 2738 2814 2863 2867 2879 2880 2970 3178 3192 3193 3302 4 72 85 103 925 968 1349 1443 1605 1847 ATTGGGC/GCCCAAT 0 -5 63 47 9 -5.5 102 141 225 235 254 320 359 383 414 460 465 473 552 591 602 603 667 682 703 718 807 808 827 933 934 947 952 958 1022 1031 1065 1132 1133 1243 1287 1346 1378 1444 1565 1566 1623 1681 1814 1820 1860 1895 1981 2155 2156 2348 2397 2451 2515 2539 2722 2868 2906 3006 3103 3110 3218 3357 3358 100 159 332 457 751 1003 1256 1337 1748 GGGGAAG/CTTCCCC 0 -2 45 47 12 -4.3 66 67 106 273 440 443 532 566 567 575 604 605 684 748 864 888 889 965 970 1050 1083 1131 1177 1178 1193 1284 1726 1897 1955 1992 2106 2107 2154 2176 2194 2335 2635 2682 2702 2730 2742 2902 2930 2948 3004 175 657 663 668 1135 1590 1719 1749 1775 1843 2338 2403 ACGTGGA/TCCACGT 1 -1 64 47 9 -5.5 96 151 178 226 228 272 309 313 328 442 447 458 467 512 583 593 689 712 764 810 819 840 880 962 1034 1055 1111 1141 1281 1337 1338 1420 1423 1438 1564 1594 1646 1647 1652 1693 1779 1798 1799 1944 1996 1997 2020 2045 2046 2047 2121 2122 2144 2338 2339 2369 2687 2688 2986 3018 3019 3264 3371 3372 93 212 1016 1416 1965 2152 2350 2480 2558 CTTGGGA/TCCCAAG 0 -5 32 45 11 -4.3 31 32 33 74 465 550 551 702 852 853 1121 1135 1158 1426 1531 1561 1562 1563 1789 1969 2030 2158 2159 2160 2486 2500 2679 2680 2806 3051 3268 3291 398 590 726 1160 1171 1402 1415 1668 1804 1853 1942 GGGCCTA/TAGGCCC 0 -2 43 45 6 -6.8 314 339 340 394 395 460 595 747 913 947 992 1089 1090 1240 1276 1314 1364 1409 1559 1560 1579 1580 1681 1692 1699 1886 1994 2080 2416 2585 2586 2669 2742 2775 2841 2853 2854 2882 2953 2954 3064 3170 3229 30 264 531 682 1842 2400 TCCTCTA/TAGAGGA 2 -3 44 45 9 -5.2 82 112 181 294 506 537 684 730 731 928 1036 1045 1046 1109 1157 1452 1611 1688 1690 1913 2142 2143 2199 2270 2271 2335 2356 2485 2557 2601 2602 2724 2820 2895 2902 3026 3078 3090 3091 3099 3100 3200 3371 3372 699 770 1117 2011 2340 2433 2436 2577 2589 AGCACCA/TGGTGCT 8 -2 33 45 11 -4.3 0 41 48 49 99 295 342 607 609 1189 1411 1471 1472 1495 1572 1588 1617 1753 1755 1756 1801 2088 2089 2242 2353 2354 2464 2482 2576 3103 3192 3193 3224 297 566 1042 1200 1826 2175 2217 2225 2259 2364 2493 CACGTGC/GCACGTG 1 -2 59 44 5 -7.2 97 115 116 217 220 222 229 239 291 302 351 369 400 432 452 518 539 587 681 687 689 764 774 775 817 846 847 887 913 1006 1110 1217 1265 1333 1422 1644 1646 1647 1656 1851 1954 1974 1975 2012 2095 2162 2293 2294 2295 2299 2573 2814 2865 2887 2948 3068 3081 3152 3191 649 1297 1340 2157 2531 TCCCTCC/GGAGGGA 2 -4 44 43 5 -7.0 54 55 83 194 352 360 481 612 647 766 831 863 881 1163 1177 1178 1261 1288 1351 1473 1485 1486 1545 1694 1720 1721 1783 2240 2273 2330 2362 2363 2390 2494 2648 2649 2650 2751 2818 2839 2893 3073 3129 3246 413 1207 1243 2126 2280 CACGCGC/GCGCGTG 1 -2 63 42 4 -7.5 89 173 194 221 227 248 249 251 352 380 397 398 399 457 479 483 523 534 565 577 621 634 719 726 745 758 805 871 872 900 950 972 973 1004 1038 1087 1107 1111 1112 1122 1123 1176 1227 1313 1327 1445 1553 1605 1606 1693 1722 1779 1830 1831 1952 2180 2183 2184 2211 2322 2334 2378 3169 233 492 871 1295 GTCCACG/CGTGGAC 1 -5 38 42 4 -7.5 178 272 442 447 467 491 558 689 880 907 962 1034 1038 1141 1259 1312 1337 1338 1423 1438 1594 1675 1676 1693 1779 1793 1794 1917 1996 1997 1998 2327 2338 2339 2562 2563 2687 2688 517 1784 1965 2350 GATCCTC/GAGGATC 2 -5 32 42 9 -4.6 89 328 405 521 601 627 854 899 1167 1168 1223 1247 1283 1323 1324 1405 1521 1577 1807 1808 2066 2345 2546 2601 2602 2627 2823 2970 2991 3043 3165 3283 9 161 870 1104 1757 1779 1825 2024 2201 GCGCGTG/CACGCGC 3 -3 63 42 4 -7.5 89 173 194 221 227 248 249 251 352 380 397 398 399 457 479 483 523 534 565 577 621 634 719 726 745 758 805 871 872 900 950 972 973 1004 1038 1087 1107 1111 1112 1122 1123 1176 1227 1313 1327 1445 1553 1605 1606 1693 1722 1779 1830 1831 1952 2180 2183 2184 2211 2322 2334 2378 3169 233 492 871 1295 ATGGGAG/CTCCCAT 0 -4 32 41 7 -5.4 38 135 255 313 338 377 411 429 612 761 850 906 1011 1134 1142 1165 1166 1183 1261 1288 1463 1704 1994 2291 2608 2663 2664 2772 3082 3226 3399 3400 36 773 1454 1781 1822 1902 2083 CTTGGGC/GCCCAAG 0 -5 28 41 4 -7.3 236 298 338 366 412 465 513 609 694 747 873 1069 1156 1268 1269 1308 1455 1574 1803 1819 1870 1947 2303 2572 2640 2692 2714 3280 588 688 742 1258 GATGGGC/GCCCATC 0 -5 42 41 5 -6.6 78 182 195 225 275 297 320 323 394 407 420 552 563 599 739 824 840 884 985 1069 1249 1375 1378 1833 1887 1888 1889 1891 2041 2149 2150 2582 2583 2727 2750 2889 2998 3006 3049 3050 3278 3279 707 892 970 1202 1620 TGGGACC/GGTCCCA 0 -3 47 41 9 -4.5 47 52 114 273 416 419 475 532 599 672 681 866 870 920 921 962 1004 1012 1127 1135 1158 1271 1272 1346 1452 1461 1654 1706 1707 2028 2029 2057 2201 2316 2320 2338 2339 2367 2640 2661 2931 2987 3134 3135 3262 3351 3352 78 556 824 840 944 1396 1712 2289 2590 GAATGGG/CCCATTC 0 -6 37 40 8 -4.7 73 81 352 366 419 473 540 546 674 792 907 915 1065 1104 1207 1409 1508 1692 2082 2203 2204 2273 2322 2468 2568 2569 2570 2807 2855 2914 2960 3064 3082 3110 3215 3216 3346 36 592 1195 1201 1261 1303 1849 2371 GTCATTC/GAATGAC 4 0 26 40 7 -5.2 292 353 458 471 482 541 818 1004 1072 1291 1659 1667 1681 1937 1938 2055 2112 2121 2122 2555 2556 2587 2609 2784 2817 2833 101 111 150 256 725 1161 1258 GTCATTG/CAATGAC 4 0 28 40 9 -4.3 2 9 10 152 169 259 307 386 663 771 1425 1600 1618 1665 1666 1750 1751 1927 1968 2021 2109 2123 2245 2246 2281 2868 2905 3046 15 475 686 1186 1856 1868 2311 2318 2473 GTGTGGG/CCCACAC 0 -6 41 39 6 -5.6 131 132 194 198 351 475 476 477 576 637 638 730 731 920 921 964 1105 1360 1372 1601 1602 1671 1865 1984 2050 2070 2077 2110 2111 2200 2221 2315 2350 2366 2448 2713 2789 3392 3393 3399 3400 393 1364 1449 1638 2259 2453 CACACGT/ACGTGTG 1 -4 60 39 6 -5.6 158 161 214 217 246 248 249 251 355 379 386 413 417 427 433 479 490 503 504 689 730 731 817 887 962 1073 1074 1108 1160 1185 1252 1298 1332 1333 1376 1377 1478 1631 1932 1940 1996 1997 1999 2000 2012 2044 2051 2052 2065 2201 2230 2231 2292 2299 2439 2870 2871 2948 3068 3081 649 757 1211 1876 2188 2480 GTTGGGC/GCCCAAC 0 -5 52 38 6 -5.4 73 230 253 286 436 529 655 667 739 764 802 803 827 839 903 911 949 984 992 1062 1063 1226 1240 1257 1263 1395 1418 1419 1435 1529 1530 1538 1613 1804 1805 2004 2216 2244 2297 2321 2517 2518 2519 2529 2530 2541 2702 2733 2752 2841 2882 3044 361 671 709 757 762 1842 TGGGGTT/AACCCCA 0 -3 34 38 9 -3.9 8 146 261 263 372 433 498 514 515 561 592 632 649 650 657 711 754 761 849 1058 1224 1499 1500 1513 1922 2170 2321 2427 2448 2628 2640 2890 3007 3081 352 521 996 1261 1353 1435 1811 2009 2134 AACCCTC/GAGGGTT 2 -5 29 38 8 -4.4 13 162 250 618 709 734 824 923 1051 1052 1230 1443 1632 1658 1993 2289 2290 2370 2617 2641 2642 2795 2810 2861 2915 2916 3197 3198 3212 401 630 671 1175 1417 1555 1865 1979 GGGACCC/GGGTCCC 0 -2 37 37 1 -9.4 44 114 216 248 249 273 283 475 619 672 870 920 921 923 1004 1073 1074 1097 1112 1135 1139 1158 1427 1461 1642 1654 1969 2028 2029 2316 2338 2339 2367 2572 2640 2775 2894 1799 TTCACGC/GCGTGAA 1 -4 30 37 8 -4.2 248 249 251 318 380 397 398 407 577 702 846 847 1176 1380 1446 1502 1553 1830 1831 2065 2465 2489 2561 2604 2605 2722 3036 3294 3296 3297 233 333 855 1783 2156 2295 2395 2428 CCTCCAT/ATGGAGG 2 -2 36 37 7 -4.6 38 173 196 240 510 601 756 757 863 885 886 971 1120 1266 1267 1503 1517 1632 1685 1686 1802 1907 1908 2054 2273 2337 2394 2395 2447 2494 2551 2713 2879 2978 3138 3388 387 722 997 1384 1709 2355 2397 ACCGACT/AGTCGGT 10 -4 19 37 5 -5.8 137 189 250 484 699 768 1177 1178 1515 1810 2554 2624 2625 2676 2699 2956 3044 3287 3315 1308 1663 1731 1915 2524 GTGGGCC/GGCCCAC 0 -4 36 36 4 -6.2 148 161 192 257 314 322 394 443 500 794 807 808 929 1022 1276 1360 1442 1506 1539 1559 1560 1641 1727 1837 1859 2050 2297 2414 2415 2521 2565 2581 2775 2961 3244 3406 30 531 559 2056 TGCCACG/CGTGGCA 1 -5 53 36 8 -4.0 158 167 175 202 214 239 308 313 328 411 442 446 471 523 540 559 563 676 716 791 819 874 916 925 931 948 1000 1115 1220 1230 1265 1298 1374 1441 1466 1471 1472 1662 1678 1785 1829 1833 1944 1954 2004 2028 2029 2205 2520 2535 2956 3078 3238 158 212 292 698 1185 1227 1416 1916 ACTCCTC/GAGGAGT 2 -5 29 36 6 -5.0 17 52 102 105 108 185 312 336 337 692 762 763 827 1036 1275 1388 1612 1654 1679 1826 1913 2210 2273 2637 2719 2782 2939 2986 3032 840 1205 1285 1335 1902 2178 GAACCTC/GAGGTTC 2 -5 20 36 6 -5.0 20 21 642 704 1001 1028 1043 1477 1677 1767 2315 2447 2533 2597 2598 2783 2785 3008 3035 3397 624 1429 1466 1472 2158 2188 TGGGCCG/CGGCCCA 0 -3 35 35 5 -5.3 45 46 102 148 161 222 236 254 257 323 389 394 591 626 807 827 884 1235 1313 1395 1506 1529 1530 1870 1947 1991 2272 2348 2581 2752 2914 2961 3094 3103 3406 30 559 1748 1842 2333 ACCACGT/ACGTGGT 1 -4 46 35 6 -4.8 173 188 222 272 283 301 308 413 449 452 495 517 557 560 574 810 866 913 982 1000 1024 1025 1030 1088 1091 1092 1217 1243 1345 1348 1349 1466 1593 1693 1776 1932 2274 2275 2437 2438 2458 2557 2879 2949 3398 3405 291 581 1084 1323 1707 2177 GTAGCTG/CAGCTAC 5 -5 18 35 7 -4.3 24 25 310 336 337 361 536 693 897 1001 1261 1836 2367 2603 2774 2787 2827 2893 251 265 660 892 1464 1555 1837 GTTCGCC/GGCGAAC 9 -2 18 35 4 -6.0 11 12 572 656 736 1094 1135 1243 1249 1484 1859 1983 2030 2552 2745 2968 2969 3009 726 1334 1741 2218 ATGGGCA/TGCCCAT 0 -4 33 33 7 -3.9 351 563 610 783 1032 1062 1063 1120 1249 1265 1649 1650 1840 1887 2097 2225 2455 2644 2687 2688 2727 2750 2807 2885 2929 2950 2955 3022 3102 3278 3279 3282 3293 68 707 892 1048 1375 1620 1803 GGGCCTT/AAGGCCC 0 -2 53 33 6 -4.4 192 195 335 420 425 500 552 606 631 718 783 808 848 913 992 1016 1277 1360 1378 1508 1512 1579 1580 1591 1803 1814 1820 1859 1860 1895 2041 2071 2131 2187 2229 2297 2303 2414 2415 2517 2518 2519 2746 2771 2935 2952 2982 3006 3049 3050 3110 3315 3335 107 140 332 600 1258 1780 GGGCTTG/CAAGCCC 0 -2 31 33 4 -5.6 134 288 289 296 338 380 425 426 465 538 546 824 834 873 885 886 1028 1069 1239 1346 1539 1885 2321 2539 2554 2675 2719 2998 3024 3044 3248 671 768 1704 1965 GTTGGGA/TCCCAAC 0 -5 38 33 4 -5.6 73 163 239 514 515 965 1008 1149 1350 1359 1386 1387 1463 1548 1714 1720 1721 1875 1892 2247 2248 2283 2289 2290 2297 2324 2325 2362 2363 2527 2560 2618 2825 2888 3122 3262 3324 3384 605 887 1350 1711 AACCTCG/CGAGGTT 2 -4 22 33 6 -4.4 233 234 632 1055 1316 1456 1477 1795 1838 1839 1974 1975 2008 2315 2399 2402 2492 2493 2495 2533 2595 2652 156 578 593 2034 2127 2346 GCCTCTC/GAGAGGC 2 -3 36 33 6 -4.4 13 71 72 119 164 186 187 481 674 675 748 942 972 973 1054 1116 1193 1303 1304 1517 1578 1594 1702 1739 1740 2025 2026 2098 2199 2350 2507 2726 2777 3129 3301 3396 656 756 1014 1266 2087 2315 GCCATTC/GAATGGC 4 0 25 33 4 -5.6 50 453 496 604 605 819 1462 1648 1773 2006 2022 2240 2293 2294 2295 2387 2388 2647 2648 2863 3036 3136 3167 3168 3300 1 549 1565 1577 GGACCTG/CAGGTCC 5 -5 20 33 4 -5.6 346 832 1481 1675 1676 1984 2057 2139 2177 2178 2541 2554 2559 2560 2696 2890 2929 3138 3228 3254 606 757 1531 2254 ACGCGCT/AGCGCGT 1 -1 40 32 1 -8.2 89 140 173 220 221 251 457 483 512 565 634 708 719 745 758 805 841 875 876 1038 1122 1123 1227 1327 1362 1449 1605 1606 1693 1722 1779 1829 1830 1831 1952 2183 2184 2195 2213 2322 871 AGACACG/CGTGTCT 1 -5 49 32 7 -3.7 100 158 198 214 228 243 244 406 476 477 661 712 716 777 1010 1034 1104 1234 1236 1237 1337 1338 1348 1349 1400 1425 1438 1453 1571 1705 1717 1844 2020 2183 2184 2201 2458 2490 2491 2742 2812 2813 2863 2894 2994 3145 3238 3309 3310 9 246 481 735 1208 1666 2495 AGCGCGT/ACGCGCT 3 -4 40 32 1 -8.2 89 140 173 220 221 251 457 483 512 565 634 708 719 745 758 805 841 875 876 1038 1122 1123 1227 1327 1362 1449 1605 1606 1693 1722 1779 1829 1830 1831 1952 2183 2184 2195 2213 2322 871 GCACCAT/ATGGTGC 8 -1 25 32 7 -3.7 41 48 49 99 168 278 424 609 888 889 1051 1052 1684 1753 1755 1756 1873 1961 1962 2464 2579 2808 2869 3103 3224 378 1200 1536 1903 2175 2312 2493 TCCCTCA/TGAGGGA 2 -4 24 31 5 -4.5 44 105 191 514 515 619 634 681 833 893 931 1246 1391 1392 1453 1642 1708 1942 2422 2423 2562 2563 2765 2829 420 932 1658 1712 2495 AGAGGGC/GCCCTCT 0 -5 18 30 5 -4.3 14 15 74 75 76 203 222 240 554 699 891 892 1753 1945 2053 2329 2336 3230 488 685 756 1501 2489 ATGTGGG/CCCACAT 0 -6 33 30 5 -4.3 19 161 179 247 257 299 314 338 396 500 562 754 788 796 850 935 978 1023 1049 1139 1414 1461 1467 1468 1678 1872 2105 2155 2156 2240 2727 2899 2931 1060 1375 1694 2134 2417 TGGGATC/GATCCCA 0 -3 22 30 5 -4.3 96 168 318 600 795 1149 1215 1353 1362 1689 1734 1875 2114 2350 2384 2527 2546 2727 3147 3148 3149 3295 245 624 1471 1846 2132 GAACACG/CGTGTTC 1 -5 20 30 7 -3.4 220 298 346 497 543 685 821 1157 1428 1429 1611 2310 2351 2352 2547 2548 2749 3006 3154 3165 131 207 1303 1497 1764 2222 2466 GCCCTCT/AGAGGGC 2 -4 18 30 5 -4.3 14 15 74 75 76 203 222 240 554 699 891 892 1753 1945 2053 2329 2336 3230 488 685 756 1501 2489 TCCTCAC/GTGAGGA 2 -3 39 30 3 -5.6 142 240 412 490 905 950 968 1044 1048 1112 1210 1247 1360 1443 1512 1515 1549 1679 1763 1764 1919 1920 2007 2131 2180 2201 2211 2227 2596 2753 2754 2768 2769 2933 2939 3043 3058 3235 3253 1127 2381 2587 ATGTGGG/CCCACAT 7 -2 33 30 5 -4.3 19 161 179 247 257 299 314 338 396 500 562 754 788 796 850 935 978 1023 1049 1139 1414 1461 1467 1468 1678 1872 2105 2155 2156 2240 2727 2899 2931 1060 1375 1694 2134 2417 CCGACTC/GAGTCGG 10 -3 24 30 5 -4.3 290 484 506 923 1105 1177 1178 1264 1404 1515 1688 1810 1959 2253 2255 2270 2271 2366 2465 2554 2624 2625 2956 2967 34 1192 1731 1781 2259 ATGGGGC/GCCCCAT 0 -4 20 29 3 -5.4 26 206 207 230 409 410 546 1048 1380 1656 1692 1888 1889 2307 2317 2318 2391 2597 2598 2982 49 159 693 GGTTGGG/CCCAACC 0 -6 33 29 4 -4.7 73 329 497 514 515 632 759 802 803 984 1083 1176 1395 1463 1529 1530 1613 1714 1892 1983 2263 2321 2324 2325 2362 2363 2517 2702 2727 2752 2848 2956 3384 662 671 709 2338 TGTGGGG/CCCCACA 0 -5 24 29 7 -3.2 124 125 179 299 314 396 562 622 637 638 754 850 961 1601 1602 1671 1678 1816 2315 2448 2713 2822 2899 3405 258 393 1058 1972 2134 2345 2417 CCTCCAG/CTGGAGG 2 -2 22 29 6 -3.6 43 82 157 738 762 763 776 787 1315 1572 1582 1583 1677 1965 2148 2238 2249 2330 2484 2510 2551 2751 256 894 1173 1408 1507 2482 CCTCTAA/TTAGAGG 2 -2 32 29 7 -3.2 82 112 181 225 506 583 649 650 684 709 714 826 1036 1109 1127 1479 1490 1491 1722 1767 1945 2100 2106 2107 2534 2557 2724 3026 3074 3075 3142 3285 83 859 1965 2068 2303 2517 2577 GACCTGA/TCAGGTC 5 -4 20 29 6 -3.6 48 49 108 583 1097 1448 1525 1526 1700 2139 2177 2178 2399 2408 2541 2559 2560 2975 3267 3268 602 1291 1345 1552 1693 2328 TGTGGGG/CCCCACA 7 -1 24 29 7 -3.2 124 125 179 299 314 396 562 622 637 638 754 850 961 1601 1602 1671 1678 1816 2315 2448 2713 2822 2899 3405 258 393 1058 1972 2134 2345 2417 ACGTGGG/CCCACGT 0 -6 39 28 7 -3.0 96 220 248 249 283 386 406 427 433 443 523 532 559 577 587 591 617 619 740 821 1004 1081 1082 1230 1342 1347 1348 1349 1396 1397 1609 1610 2051 2052 2113 2127 2176 2724 2904 598 775 828 1248 1636 2311 2590 GGGCCAC/GTGGCCC 0 -2 25 28 2 -6.1 39 43 134 192 443 467 557 568 571 694 794 827 949 1031 1065 1087 1277 1287 1312 1552 2004 2451 2490 2491 2714 117 563 GGTGGGA/TCCCACC 0 -5 45 28 7 -3.0 168 179 211 214 220 269 416 435 475 481 483 495 510 593 614 672 738 840 1012 1043 1193 1364 1385 1536 1558 1572 1660 1661 1730 1767 1931 1982 2037 2038 2048 2359 2369 2405 2461 2462 2858 2942 3149 3200 3260 681 947 1122 1639 1710 1846 2163 ACACGTC/GACGTGT 1 -3 43 28 7 -3.0 165 246 276 292 309 355 433 490 499 584 642 713 716 730 731 812 813 877 1044 1088 1187 1340 1376 1377 1475 1631 1678 1964 2172 2173 2347 2436 2495 2511 2742 2867 2870 2871 2894 3018 3019 3145 3178 4 103 968 1133 1349 1497 2598 ACGTGGG/CCCACGT 1 -1 39 28 7 -3.0 96 220 248 249 283 386 406 427 433 443 523 532 559 577 587 591 617 619 740 821 1004 1081 1082 1230 1342 1347 1348 1349 1396 1397 1609 1610 2051 2052 2113 2127 2176 2724 2904 598 775 828 1248 1636 2311 2590 AGCCTCT/AGAGGCT 2 -4 31 28 7 -3.0 13 71 72 164 231 232 321 481 487 505 926 927 992 1037 1386 1387 1501 1702 1722 1739 1740 1954 2025 2026 2098 2359 2507 2799 2955 3301 3360 435 859 1155 1351 1509 1832 2315 CCTCAGC/GCTGAGG 2 -2 24 28 3 -5.2 42 95 191 209 318 466 752 1069 1096 1227 1254 1255 1689 1708 2367 2448 2531 2532 2689 2690 2765 2795 3257 3258 1779 1903 2127 CTCCCTC/GAGGGAG 2 -5 39 28 4 -4.5 66 67 101 105 121 194 197 440 647 649 650 703 766 831 863 1219 1246 1247 1288 1453 1461 1473 1694 1720 1721 1748 1752 1783 2061 2240 2273 2390 2494 2721 2829 2911 2970 3073 3285 93 838 1617 2201 AAGCGGC/GCCGCTT 3 -5 18 28 7 -3.0 34 35 597 616 622 916 1008 1354 1524 1653 1658 2153 2174 2175 2250 2333 2821 2856 1278 1322 1636 1782 2047 2155 2252 AGCGGCT/AGCCGCT 3 -4 16 28 5 -3.9 108 622 814 918 1142 1197 1198 1217 1345 1354 1524 2309 2333 2621 2718 3014 557 701 1109 1157 1782 CAGCTGT/ACAGCTG 5 -4 24 28 4 -4.5 160 317 343 344 346 388 554 559 896 972 973 1453 1571 1695 1733 1876 2448 2554 2629 2742 2766 3104 3351 3352 768 844 1279 2012 GTGGGCT/AGCCCAC 0 -4 39 27 5 -3.7 102 176 266 267 284 288 289 565 619 834 890 908 1035 1111 1150 1151 1155 1240 1263 1342 1355 1696 1697 1819 1865 1872 2017 2155 2156 2303 2321 2366 2400 2460 2484 2843 2982 3116 3169 71 845 1748 2210 2411 TGGGCTA/TAGCCCA 0 -3 39 27 4 -4.3 73 102 141 150 254 266 267 291 436 513 535 907 952 1150 1151 1243 1263 1342 1355 1696 1697 1741 1742 1870 1888 1889 1981 2017 2127 2155 2156 2229 2303 2713 2843 3089 3169 3357 3358 1077 1202 1293 1748 AACCACG/CGTGGTT 1 -5 34 27 4 -4.3 174 188 222 273 301 449 583 684 894 913 916 935 1088 1091 1092 1217 1243 1466 1478 1515 1849 1850 2098 2315 2378 2396 2437 2438 2492 2493 2557 3047 3207 3405 190 590 1707 2310 CCACACG/CGTGTGG 1 -5 41 27 2 -5.8 78 151 161 177 194 214 217 246 251 355 413 689 730 731 821 964 1107 1212 1234 1333 1604 1865 1932 2046 2047 2095 2110 2111 2230 2231 2235 2292 2315 2366 2448 2883 2884 2961 3068 3230 3316 1176 1852 CCGCCTC/GAGGCGG 2 -5 29 27 5 -3.7 107 196 357 358 566 567 675 762 763 864 931 1039 1316 1473 1552 1572 1582 1583 1914 2209 2253 2456 2689 2690 2724 2909 2910 3044 3082 275 437 1455 1892 1951 CCTCGTC/GACGAGG 2 -2 29 27 5 -3.7 42 219 433 657 719 1023 1055 1089 1090 1204 1258 1451 1685 1686 1822 1843 1966 1974 1975 2008 2207 2371 2412 2502 2656 2795 2909 2910 3073 741 1175 1500 2155 2159 AGCTGTC/GACAGCT 5 -3 30 27 6 -3.3 128 167 189 343 344 350 596 688 693 825 1296 1479 1544 1733 1842 1848 1876 2539 2554 2742 2761 2762 2780 2897 2919 2920 3104 3185 3351 3352 766 1555 1567 1762 1989 2296 AGTGGGC/GCCCACT 0 -5 29 26 6 -3.1 176 197 284 394 890 908 929 1035 1111 1150 1151 1155 1263 1276 1641 1692 1819 1837 2004 2081 2297 2321 2322 2460 2565 2771 2982 3116 3244 30 93 531 845 2056 2210 GCTTGGG/CCCAAGC 0 -6 24 26 4 -4.1 79 80 208 236 263 465 538 557 609 702 873 1050 1156 1426 1531 1574 2090 2091 2195 2303 2679 2680 2714 2806 588 688 844 1160 GGGCTCT/AGAGCCC 0 -2 19 26 2 -5.6 44 253 412 534 655 855 890 1240 1286 1393 1538 2222 2223 2551 2702 2778 2779 2796 2835 405 2435 GTGGGAT/ATCCCAC 0 -4 33 26 3 -4.8 96 131 132 147 168 312 406 443 476 477 661 738 753 1313 1347 1558 1730 1734 1874 1904 1905 1982 2077 2350 2359 2366 2369 2719 2727 3140 3149 3392 3393 92 1248 1846 TGGGGTA/TACCCCA 0 -3 16 26 3 -4.8 851 1147 1725 1903 1919 1920 2166 2590 2703 2704 2710 2711 2899 3157 3275 3300 21 389 2006 CACGAGG/CCTCGTG 1 -2 18 26 5 -3.6 151 233 234 435 513 759 791 1104 1865 2315 2386 2402 2492 2493 2725 3152 3369 3370 156 528 734 1173 2346 TCACGCG/CGCGTGA 1 -3 38 26 4 -4.1 126 184 248 249 251 352 380 391 397 398 483 523 534 577 621 636 719 758 900 972 973 1038 1112 1122 1123 1247 1327 1553 1605 1606 1779 1830 1831 2007 2065 2180 2211 2322 233 871 1295 1783 AAGCCTC/GAGGCTT 2 -5 32 26 6 -3.1 164 231 232 481 505 926 927 992 1015 1037 1501 1575 1576 1702 1722 1739 1740 1954 2025 2026 2359 2449 2507 2621 2742 2799 2800 2940 3054 3055 3196 3360 435 1253 1254 1942 2235 2508 CCTCACC/GGTGAGG 2 -2 28 26 5 -3.6 372 412 490 754 800 905 950 1030 1048 1179 1360 1374 1401 1608 1919 1920 2001 2241 2451 2466 2596 2608 2915 2916 2933 3059 3060 3253 86 680 684 1127 1384 CCTCGTG/CACGAGG 2 -2 18 26 5 -3.6 151 233 234 435 513 759 791 1104 1865 2315 2386 2402 2492 2493 2725 3152 3369 3370 156 528 734 1173 2346 ACCGGGT/ACCCGGT 3 -4 26 26 2 -5.6 1 212 294 656 974 975 996 1072 1073 1074 1105 1218 1345 1848 1982 2217 2218 2471 2472 2517 2710 2937 2945 3136 3137 3200 676 969 CGCGTGA/TCACGCG 3 -2 38 26 4 -4.1 126 184 248 249 251 352 380 391 397 398 483 523 534 577 621 636 719 758 900 972 973 1038 1112 1122 1123 1247 1327 1553 1605 1606 1779 1830 1831 2007 2065 2180 2211 2322 233 871 1295 1783 AGCTGCA/TGCAGCT 5 -3 28 26 4 -4.1 16 47 113 303 524 561 972 973 1668 1669 1746 1747 1844 1878 1879 1885 1901 2081 2251 2252 2313 2319 2542 2543 3155 3156 3186 3333 548 1279 1696 1869 GACCTGT/ACAGGTC 5 -4 16 26 4 -4.1 8 36 376 416 508 832 1675 1676 1851 1873 2057 2168 2752 3138 3228 3254 1165 1531 2226 2254 GGTTCGC/GCGAACC 9 -3 15 26 3 -4.8 264 388 572 656 736 974 975 979 980 1003 1484 2370 2535 2552 2621 624 1417 2218 GGGGGAG/CTCCCCC 0 -2 22 25 4 -3.9 66 67 322 520 538 766 851 923 1029 1351 1434 1542 1552 1605 1606 2078 2364 2585 2586 2865 2978 3123 561 1169 1972 2559 CCACGTA/TACGTGG 1 -3 25 25 5 -3.4 100 273 433 471 591 670 689 712 740 870 1000 1057 1126 1423 1495 1593 1798 1799 1932 1944 2020 2687 2688 2724 3405 581 1016 1084 1707 2590 CCACCTG/CAGGTGG 5 -5 24 25 4 -3.9 135 273 315 481 549 618 979 980 1201 1380 1435 1469 1470 1490 1491 1555 1665 1666 2359 2390 2465 2517 2565 3246 121 175 667 1280 GCAGCTG/CAGCTGC 5 -5 19 25 4 -3.9 16 280 388 524 972 973 1053 1782 1878 1879 2081 2319 2432 2433 2554 3155 3156 3186 3333 548 709 1266 1279 CTGGGAC/GTCCCAG 0 -4 18 24 4 -3.7 52 170 374 920 921 962 1918 2242 2320 2394 2395 2534 2606 2640 2742 2992 2993 3008 78 142 2234 2351 CTGGGCC/GGCCCAG 0 -4 24 24 2 -5.1 43 45 46 222 356 389 509 527 528 667 848 1265 1478 1495 1699 1865 2080 2272 2873 2952 2953 2954 3049 3050 563 1842 CAACACG/CGTGTTG 1 -5 36 24 5 -3.2 57 58 100 198 225 227 400 411 593 620 726 774 775 874 1028 1293 1294 1303 1304 1688 1691 1844 1947 2009 2011 2085 2365 2469 2812 2813 2880 2890 3133 3277 3355 3356 291 1133 1361 2329 2491 CACGACT/AGTCGTG 1 -2 21 24 3 -4.3 174 259 300 303 311 491 588 651 1040 1332 1622 2098 2507 2578 2816 2893 2956 3076 3077 3133 3252 132 1807 2198 CCACGAC/GTCGTGG 1 -3 22 24 3 -4.3 174 273 300 301 323 491 558 677 1102 1103 1478 1727 2098 2307 2396 2578 2877 2893 2956 3076 3077 3252 212 1195 2374 GGACACG/CGTGTCC 1 -5 36 24 1 -6.2 84 89 113 178 309 355 376 448 476 477 480 493 534 724 818 1034 1066 1073 1074 1091 1092 1332 1340 1366 1646 1647 1678 1744 1760 1846 2046 2047 2082 2511 3018 3019 1851 TACCCTC/GAGGGTA 2 -5 29 24 4 -3.7 54 55 193 209 237 259 372 404 485 710 720 841 917 953 1084 1096 1232 1366 1659 1783 1800 1878 1879 2117 2202 2744 3067 3369 3370 1049 1891 2161 2515 AGCGGTT/AACCGCT 3 -4 15 24 3 -4.3 30 68 402 403 623 800 1760 1840 1881 1882 2663 2664 2793 2834 3179 805 1851 2434 GGGCTAT/ATAGCCC 0 -2 20 23 0 -6.4 73 206 207 254 291 811 959 1150 1151 1444 1912 2155 2156 2303 2307 2573 2619 2843 3357 3358 -1 GGTGGGC/GCCCACC 0 -5 24 23 3 -4.1 102 288 289 322 443 619 794 807 808 834 1035 1480 1506 1604 1696 1697 1727 2017 2303 2484 2517 2581 2775 2843 71 559 1748 TTGGGCG/CGCCCAA 0 -4 13 23 2 -4.9 359 703 791 1950 1951 2172 2173 2244 2518 2519 2539 2626 2692 588 709 CTACACG/CGTGTAG 1 -5 18 23 4 -3.5 167 173 283 291 412 422 529 770 877 1311 1936 2347 2663 2664 2701 2867 3192 3193 57 322 968 1349 CGTCCTC/GAGGACG 2 -5 20 23 1 -5.9 233 234 490 537 609 611 635 701 702 715 1114 1360 1590 1718 1843 1875 2076 2227 2346 3394 1323 AGGTGGG/CCCACCT 0 -6 30 22 4 -3.3 43 102 209 269 322 357 358 443 475 481 498 738 751 807 834 840 1035 1467 1468 1480 1727 1931 2017 2359 2461 2462 2517 2772 2942 3063 681 1156 1173 1748 TGGGCCC/GGGCCCA 0 -3 31 22 3 -3.9 166 230 257 291 322 407 473 739 802 803 929 933 934 1022 1047 1079 1265 1276 1538 1623 1641 1727 1833 1837 1859 1865 1966 2317 2318 2997 3132 1202 1703 2056 TGGGCGT/ACGCCCA 0 -3 13 22 1 -5.7 11 12 559 783 1207 1285 1651 1950 1951 2322 2539 3038 3039 1177 CATCACG/CGTGATG 1 -5 30 22 4 -3.3 96 97 252 318 368 400 423 500 591 851 1006 1101 1102 1103 1110 1157 1266 1267 1418 1419 1450 1487 1695 1734 1941 1968 2740 2815 2816 2863 449 1850 2461 2560 ACCCTCG/CGAGGGT 2 -4 21 22 1 -5.7 91 92 193 710 923 1320 1451 1658 1800 1822 1865 1878 1879 2117 2202 2641 2642 2902 3132 3369 3370 1175 CCCACCT/AGGTGGG 2 -6 30 22 4 -3.3 43 102 209 269 322 357 358 443 475 481 498 738 751 807 834 840 1035 1467 1468 1480 1727 1931 2017 2359 2461 2462 2517 2772 2942 3063 681 1156 1173 1748 TCCTCGG/CCGAGGA 2 -3 17 22 4 -3.3 179 233 234 266 267 371 559 616 854 867 869 1244 1432 1575 1576 2066 2806 650 1735 2052 2601 AACCGGG/CCCGGTT 3 -5 25 22 3 -3.9 212 264 527 528 581 582 656 755 858 974 975 1211 1504 1625 1776 1848 1901 1982 2053 2217 2218 2517 2552 3136 3137 663 711 874 GTTCGCT/AGCGAAC 9 -2 19 22 2 -4.7 103 104 126 264 657 685 893 979 980 1278 1279 1861 2370 2621 2839 3038 3039 3125 3395 1417 1641 AGGGCAT/ATGCCCT 0 -3 20 21 4 -3.1 42 458 555 699 733 771 820 944 1089 1090 1124 1129 1341 1644 1762 1821 1967 2401 2761 2762 364 1780 1786 2214 GGGGTTG/CAACCCC 0 -2 21 21 2 -4.4 261 263 372 514 515 1007 1071 1224 1499 1500 1841 1922 1964 2170 2321 2427 2480 2654 2655 2890 2988 564 1261 TGGGGCT/AGCCCCA 0 -3 19 21 1 -5.4 26 206 207 238 341 409 410 538 850 873 959 1620 1816 2307 2371 2724 2835 2847 3162 117 CACCACG/CGTGGTG 1 -5 34 21 3 -3.7 84 308 309 399 413 499 557 574 730 731 814 900 982 1000 1030 1091 1092 1102 1103 1218 1348 1349 1593 1693 2142 2143 2274 2275 2879 2949 3076 3077 3252 3398 2163 2430 2467 CCACGCG/CGCGTGG 1 -3 33 21 2 -4.4 89 156 227 380 399 620 719 894 900 935 950 1004 1087 1091 1092 1107 1170 1227 1313 1556 1557 1663 1675 1676 1693 1791 1793 1794 1887 2334 2378 2894 3169 492 1924 TCCACGC/GCGTGGA 1 -4 18 21 4 -3.1 13 89 1067 1107 1505 1675 1676 1693 1745 1791 1793 1794 1917 1998 2153 2327 2717 2848 513 1345 1788 1924 ACCCTCC/GGAGGGT 2 -4 16 21 4 -3.1 13 54 55 151 162 209 222 649 650 917 1051 1052 1230 1632 3194 3300 398 474 1555 2453 CAAGGGC/GCCCTTG 0 -5 15 20 3 -3.5 8 44 338 380 458 548 760 820 869 1129 1913 1967 3003 3029 3195 763 839 2214 GGGCATA/TATGCCC 0 -2 15 20 3 -3.5 525 526 527 528 699 826 1341 1396 1397 1536 1644 1967 2657 2658 3131 457 1256 1786 GGGCATG/CATGCCC 0 -2 19 20 2 -4.2 2 498 546 771 783 1048 1124 1268 1269 1370 1899 2401 2761 2762 2950 3008 3177 3218 3282 567 2214 CGCCACG/CGTGGCG 1 -5 32 20 2 -4.2 100 170 263 345 534 726 727 759 863 899 903 962 1070 1111 1126 1135 1197 1198 1252 1258 1275 1415 1599 1640 1762 1985 1996 1997 2909 2910 2930 3126 568 2570 CGTCACG/CGTGACG 1 -5 23 20 2 -4.2 42 126 251 269 284 290 302 472 479 548 838 1187 1511 1779 2103 2130 2261 2322 2447 2504 2505 2894 3178 1741 2178 GTACACG/CGTGTAC 1 -5 29 20 3 -3.5 159 165 228 243 244 272 376 449 500 541 653 661 840 863 1003 1187 1205 1212 1234 1293 1294 1433 1586 1722 1744 1789 1832 2746 3178 85 461 2355 ACTGGGA/TCCCAGT 0 -5 12 19 3 -3.3 52 301 622 920 921 1766 1918 2606 2640 2760 2846 2867 1349 1669 2078 GGGCTAG/CTAGCCC 0 -2 18 19 2 -4.0 47 141 225 266 267 952 1014 1083 1243 1342 1696 1697 1816 1913 2017 2018 2722 3345 146 718 ACACGCG/CGCGTGT 1 -3 25 19 1 -5.0 173 177 194 221 391 457 493 543 565 634 688 726 745 805 871 872 1234 1445 1722 1952 2085 2183 2184 2738 2980 871 ACGCCAC/GTGGCGT 1 -1 26 19 3 -3.3 100 170 197 428 534 705 861 899 903 962 964 1010 1111 1252 1258 1373 1599 1926 2229 2244 2263 2469 2538 2717 3078 3308 0 1066 2225 ACGCGCC/GGCGCGT 1 -1 29 19 3 -3.3 146 194 380 397 398 472 534 565 577 621 636 900 972 973 1004 1087 1107 1112 1170 1316 1445 1553 1688 1989 2180 2211 2334 3145 3169 516 871 1123 CGACACG/CGTGTCG 1 -5 29 19 3 -3.3 85 119 126 149 217 221 346 351 466 661 856 902 1010 1034 1195 1251 1478 1506 1513 1834 1964 2011 2058 2108 2171 2319 2865 3311 3316 1171 1294 2375 GACCACG/CGTGGTC 1 -5 21 19 3 -3.3 173 265 272 300 362 452 507 589 590 771 866 1024 1025 1170 1309 1345 1776 1932 2458 2877 2940 291 870 2539 GGCACGT/ACGTGCC 1 -4 28 19 3 -3.3 97 115 217 229 291 351 369 539 587 825 846 847 887 905 913 959 1006 1265 1370 1422 1954 2006 2145 2162 2228 2887 2925 3353 1177 1340 2157 ACGCGCC/GGCGCGT 2 -7 29 19 3 -3.3 146 194 380 397 398 472 534 565 577 621 636 900 972 973 1004 1087 1107 1112 1170 1316 1445 1553 1688 1989 2180 2211 2334 3145 3169 516 871 1123 CCTCTAG/CTAGAGG 2 -2 15 19 2 -4.0 123 384 615 642 1039 1913 2142 2143 2356 2416 2601 2602 2902 3371 3372 1117 2309 CGCGTGT/ACACGCG 3 -2 25 19 1 -5.0 173 177 194 221 391 457 493 543 565 634 688 726 745 805 871 872 1234 1445 1722 1952 2085 2183 2184 2738 2980 871 GAGGGCA/TGCCCTC 0 -4 12 18 2 -3.7 42 203 240 520 699 1089 1090 1183 1238 1652 1753 2336 764 1780 GGGCTGG/CCAGCCC 0 -2 20 18 2 -3.7 43 82 222 356 389 667 773 952 1865 2155 2156 2520 2713 2868 2896 2929 3049 3050 3116 3254 1154 1815 GGGGACA/TGTCCCC 0 -2 20 18 3 -3.0 145 176 179 208 278 396 440 578 620 690 791 822 950 1061 1389 1733 1781 2128 2722 3102 1108 1626 2417 GGGGTAA/TTACCCC 0 -2 19 18 3 -3.0 99 213 351 455 742 859 1185 1474 1587 1614 1725 2166 2203 2204 2378 2710 2711 2899 3005 454 2006 2515 TGGGCGG/CCGCCCA 0 -3 13 18 2 -3.7 73 359 660 703 758 1604 1609 1610 2043 2539 2626 2771 2950 349 699 CACACGC/GCGTGTG 1 -4 27 18 3 -3.0 110 151 177 194 304 457 543 634 665 821 964 1005 1107 1212 1234 1315 1604 1947 2046 2047 2095 2292 2448 2870 2871 2980 3230 0 1286 1634 CACGCTC/GAGCGTG 1 -2 27 18 2 -3.7 110 129 194 318 368 369 375 411 428 472 702 770 1005 1115 1212 1247 1320 1502 1736 1760 1917 2448 2848 2885 2909 2910 3403 703 1754 CACCTCG/CGAGGTG 2 -4 14 18 2 -3.7 327 356 444 966 1259 1345 1875 2202 2286 2573 2731 2732 3194 3209 291 730 GTCCTCG/CGAGGAC 2 -4 12 18 3 -3.0 233 234 433 616 657 1102 1103 1590 2276 3152 3353 3407 452 733 2210 TGCCCTC/GAGGGCA 2 -5 12 18 2 -3.7 42 203 240 520 699 1089 1090 1183 1238 1652 1753 2336 764 1780 CGTGGGG/CCCCACG 0 -5 21 17 0 -5.0 100 146 216 220 380 401 433 443 532 566 567 620 766 1038 1081 1082 1389 1400 1727 2176 2724 -1 GCTGGGC/GCCCAGC 0 -5 19 17 2 -3.5 43 356 389 519 667 952 989 1027 1478 1513 1568 1865 2080 2713 2785 2820 3049 3050 3089 563 768 GGCTGGG/CCCAGCC 0 -1 18 17 2 -3.5 43 356 389 667 952 989 1075 1076 1238 1390 1513 1568 1865 2080 2520 2713 3049 3050 712 1992 GGGCCGT/ACGGCCC 0 -2 22 17 2 -3.5 118 161 323 389 394 591 626 807 827 1081 1082 1395 1529 1530 1846 1947 2009 2272 2348 2705 2914 2961 595 750 GGGGCAA/TTGCCCC 0 -3 24 17 2 -3.5 144 305 306 421 434 607 1401 1459 1518 1725 1730 2349 2391 2533 2776 2788 2819 2924 2996 3118 3119 3250 3251 3405 716 1698 TGGGGAC/GTCCCCA 0 -3 27 17 1 -4.5 159 179 202 208 216 320 396 440 578 620 950 983 1050 1070 1271 1272 1389 1678 1733 1781 1976 1977 2128 2848 2992 2993 3102 2067 CCCCACG/CGTGGGG 1 -5 21 17 0 -5.0 100 146 216 220 380 401 433 443 532 566 567 620 766 1038 1081 1082 1389 1400 1727 2176 2724 -1 CCCTCGG/CCGAGGG 2 -3 13 17 1 -4.5 91 92 556 710 923 1089 1090 1320 2413 2641 2642 2780 2970 838 CGGGTGA/TCACCCG 3 -2 20 17 1 -4.5 182 305 306 482 490 530 553 1345 1663 1717 1876 2312 2362 2363 2471 2472 3059 3060 3125 3209 246 CCGCACC/GGTGCGG 8 -3 13 17 1 -4.5 409 410 1088 1361 1373 1584 1585 1961 1962 2328 2372 2612 2645 2539 CCGACAC/GTGTCGG 10 -3 17 17 2 -3.5 37 145 221 405 454 637 638 661 688 1180 1181 1195 1439 1440 1506 2108 2288 659 1664 CATGGGG/CCCCATG 0 -5 11 16 2 -3.3 322 392 561 761 898 1413 1656 2079 2590 2640 2982 1799 2008 GAAGGGC/GCCCTTC 0 -5 11 16 1 -4.2 330 331 368 1180 1181 1291 1380 1644 1821 2561 2713 721 GGGGAGG/CCTCCCC 0 -2 17 16 2 -3.3 124 125 520 766 851 945 1177 1178 1275 1351 1434 1965 2364 2579 2818 3061 3194 1027 2504 GTCAGGG/CCCTGAC 0 -6 16 16 2 -3.3 269 591 801 976 977 1635 1636 1642 2490 2491 2675 2708 2752 2800 3208 3345 678 802 CACGTCC/GGACGTG 1 -2 12 16 2 -3.3 328 490 543 560 938 939 1342 1370 1594 2520 2557 2742 233 1323 GTCACGG/CCGTGAC 1 -4 17 16 2 -3.3 129 269 564 571 807 838 902 1023 1187 1262 1374 1539 1934 2213 2908 2931 3181 36 1372 CCTCCCC/GGGGAGG 2 -2 17 16 2 -3.3 124 125 520 766 851 945 1177 1178 1275 1351 1434 1965 2364 2579 2818 3061 3194 1027 2504 AGTGGGG/CCCCACT 0 -5 25 15 2 -3.1 238 318 334 351 620 662 849 1058 1111 1131 1169 1188 1542 1733 1903 1917 1922 1976 1977 1992 2194 2775 2835 3003 3004 663 1749 CGTGGGC/GCCCACG 0 -5 17 15 1 -4.0 148 314 453 559 565 825 1022 1285 1342 1396 1397 1539 1609 1610 2113 2611 3169 1195 GGGCCTG/CAGGCCC 0 -2 24 15 1 -4.0 235 253 320 460 540 599 667 678 723 808 832 911 1016 1265 1490 1491 1571 1833 1860 1981 2770 2819 2873 3066 2210 GGGGCTA/TAGCCCC 0 -2 16 15 1 -4.0 123 206 207 341 811 850 959 1053 1083 1209 1444 1816 2307 2722 2847 3162 339 GTGGGGC/GCCCCAC 0 -4 21 15 2 -3.1 211 238 538 562 637 638 850 873 1081 1082 1087 1467 1468 1623 1816 1899 2724 2822 2835 2996 3405 117 691 ACGCGCG/CGCGCGT 1 -1 21 15 2 -3.1 89 227 248 249 322 352 380 479 625 686 702 713 726 789 871 872 1111 1816 1918 2760 3169 871 1295 CACGCCA/TGGCGTG 1 -2 18 15 2 -3.1 70 100 170 197 407 428 767 861 964 1067 1111 1745 2164 2469 2717 2863 2885 3078 0 1113 GCCCACG/CGTGGGC 1 -5 17 15 1 -4.0 148 314 453 559 565 825 1022 1285 1342 1396 1397 1539 1609 1610 2113 2611 3169 1195 CCTCGGA/TCCGAGG 2 -2 16 15 2 -3.1 179 371 616 752 854 867 869 1089 1090 1575 1576 2413 2708 2747 2806 3146 650 1735 CCTCGGT/ACCGAGG 2 -2 11 15 1 -4.0 292 556 559 710 923 1320 1795 2153 2641 2642 2970 2052 ACCTGCC/GGCAGGT 5 -3 14 15 2 -3.1 54 55 308 1259 1380 1481 1490 1491 1777 2645 2797 2856 2929 3263 1048 1330 CCGTGGG/CCCACGG 0 -6 15 14 0 -4.2 148 216 565 825 1727 1846 2611 2757 2758 2888 2900 2901 3171 3172 3205 -1 CGGGGCA/TGCCCCG 0 -4 12 14 1 -3.7 278 353 421 1518 2533 2726 2731 2732 2776 2818 2819 2996 1777 CCCACGG/CCGTGGG 1 -4 15 14 0 -4.2 148 216 565 825 1727 1846 2611 2757 2758 2888 2900 2901 3171 3172 3205 -1 CGCGCTA/TAGCGCG 1 0 14 14 0 -4.2 140 221 457 708 841 1122 1123 1449 1830 1831 1952 2195 2213 3311 -1 TAGCGCG/CGCGCTA 3 -5 14 14 0 -4.2 140 221 457 708 841 1122 1123 1449 1830 1831 1952 2195 2213 3311 -1 CACCTGC/GCAGGTG 5 -4 16 14 1 -3.7 135 138 139 492 494 549 1325 1326 1380 1490 1491 2323 2489 2645 2856 3180 667 GCCAACC/GGTTGGC 6 -4 17 14 1 -3.7 350 449 473 1391 1392 1475 1603 1755 1756 1990 2500 2610 2774 2866 3014 3197 3198 2084 GGTTGGC/GCCAACC 9 -3 17 14 1 -3.7 350 449 473 1391 1392 1475 1603 1755 1756 1990 2500 2610 2774 2866 3014 3197 3198 2084 GACGCGT/ACGCGTC 1 -2 15 13 1 -3.5 141 159 177 191 493 502 517 620 935 1362 1531 2349 2424 2425 3115 268 TGTCGGG/CCCGACA 0 -6 19 12 1 -3.2 183 213 218 278 328 598 627 1101 1180 1181 1912 1974 1975 2034 2106 2107 2775 2891 2926 2445 ACCACGC/GCGTGGT 1 -4 19 12 1 -3.2 399 499 578 583 730 731 814 861 894 900 935 1091 1092 1170 1227 1515 2334 2378 3047 2163 GCCTCTG/CAGAGGC 2 -3 19 12 1 -3.2 118 175 357 358 482 505 587 760 848 1239 1444 1612 1916 2240 2359 2799 3130 3265 3266 2041 GAACCGC/GCGGTTC 3 -6 16 12 1 -3.2 169 623 654 702 846 847 1195 1247 1262 1760 1999 2000 2736 2793 3021 3217 1641 TGTCCGC/GCGGACA 9 -3 12 12 1 -3.2 181 355 428 865 936 1332 2020 2612 2810 2973 2974 3286 184 CACGCGT/ACGCGTG 1 -2 14 11 0 -3.5 156 177 380 391 493 620 636 688 935 1362 1675 1676 2738 2887 -1 GAGCGGG/CCCGCTC 3 -5 15 11 0 -3.5 47 502 533 587 622 1173 1174 1224 1447 1906 1992 2216 2914 3157 3324 -1 AGGGCTG/CAGCCCT 0 -3 11 10 0 -3.2 222 330 331 368 389 976 977 1291 2713 2780 3254 -1