#3376/1790 #36.89 # k-mer/r.c. Cluster Offset PosCt wPosCt NegCt HGP_10 TTGGGC/GCCCAA 0 -3 626 634 17 -102.2 2 6 10 14 16 31 39 41 53 55 57 59 60 62 63 64 67 76 79 80 83 86 107 110 120 121 123 127 139 142 155 161 167 176 177 181 184 185 188 190 191 195 207 215 227 238 243 251 257 264 269 270 274 280 292 308 312 314 318 325 329 330 332 333 346 351 353 365 367 369 370 375 388 392 404 417 419 426 438 443 446 447 448 466 467 480 485 489 492 493 502 504 510 512 514 525 526 527 531 532 536 537 539 547 550 554 555 557 562 566 569 584 593 596 597 604 606 608 613 623 629 631 643 649 652 656 670 671 676 678 686 689 699 706 707 708 710 715 716 718 723 724 725 732 733 741 742 748 753 754 764 771 772 774 780 800 813 825 826 828 830 836 853 858 870 871 876 877 878 879 901 908 912 918 920 926 927 929 934 938 939 944 949 957 965 975 980 984 990 992 997 1001 1003 1006 1007 1012 1021 1027 1030 1031 1034 1036 1047 1048 1056 1058 1060 1072 1074 1081 1088 1107 1116 1118 1120 1123 1147 1150 1151 1157 1162 1168 1169 1172 1175 1177 1179 1182 1183 1191 1194 1195 1197 1199 1212 1220 1235 1237 1247 1251 1252 1256 1266 1274 1276 1277 1287 1289 1299 1301 1302 1312 1319 1320 1331 1334 1345 1346 1347 1348 1356 1360 1363 1367 1372 1374 1376 1382 1384 1386 1388 1392 1395 1400 1406 1413 1434 1436 1440 1447 1452 1455 1456 1462 1464 1467 1469 1475 1479 1487 1497 1502 1508 1510 1516 1543 1546 1552 1556 1561 1564 1569 1576 1577 1580 1590 1599 1609 1610 1611 1612 1615 1617 1621 1628 1630 1631 1640 1645 1654 1667 1676 1682 1687 1688 1695 1697 1710 1726 1731 1733 1747 1749 1750 1751 1757 1758 1761 1770 1780 1789 1791 1792 1793 1795 1805 1809 1815 1827 1830 1841 1845 1855 1862 1871 1876 1878 1881 1901 1902 1911 1912 1915 1922 1929 1931 1937 1941 1943 1959 1962 1965 1967 1969 1971 1976 1989 2001 2003 2011 2014 2022 2025 2026 2027 2037 2055 2061 2062 2077 2089 2095 2099 2105 2126 2134 2138 2147 2150 2151 2154 2156 2158 2165 2186 2191 2201 2203 2204 2206 2209 2212 2214 2215 2221 2222 2240 2243 2246 2253 2263 2264 2271 2284 2289 2290 2305 2307 2310 2317 2325 2335 2337 2345 2348 2350 2365 2366 2367 2368 2373 2377 2388 2394 2395 2396 2399 2411 2416 2424 2426 2433 2437 2440 2445 2448 2450 2456 2457 2466 2468 2480 2481 2482 2488 2491 2492 2498 2500 2501 2506 2519 2523 2533 2535 2539 2542 2553 2562 2563 2570 2573 2576 2579 2582 2587 2597 2614 2618 2625 2633 2643 2645 2650 2655 2667 2678 2679 2681 2683 2689 2693 2701 2702 2703 2705 2710 2711 2714 2716 2717 2719 2725 2727 2729 2730 2731 2734 2736 2737 2738 2741 2752 2753 2756 2763 2768 2781 2782 2784 2786 2788 2791 2793 2800 2813 2817 2832 2834 2852 2865 2867 2868 2879 2881 2883 2884 2911 2912 2915 2917 2918 2922 2923 2924 2927 2934 2941 2950 2951 2954 2964 2969 2971 2974 2982 2984 2989 2994 2996 3003 3004 3007 3013 3016 3044 3045 3052 3059 3062 3064 3086 3096 3100 3107 3108 3117 3125 3126 3127 3131 3151 3158 3159 3168 3174 3178 3180 3193 3194 3202 3207 3209 3222 3233 3238 3239 3240 3253 3256 3258 3261 3272 3286 3287 3288 3294 3298 3304 3309 3314 3316 3332 3334 3348 3354 13 237 366 442 456 490 592 609 647 657 942 1018 1035 1212 1370 1371 1762 TGGGCT/AGCCCA 0 -2 615 615 21 -93.8 3 4 6 11 31 35 37 39 53 55 57 62 64 67 69 76 79 103 107 116 120 121 152 155 167 177 181 185 186 187 188 190 194 197 204 215 227 238 239 244 246 254 257 260 261 262 263 266 269 274 279 280 284 290 292 297 300 302 312 314 318 320 325 332 333 336 339 346 351 353 360 367 369 370 387 388 404 407 426 429 430 443 446 447 448 450 456 465 468 476 485 503 504 511 512 513 521 524 526 527 529 532 538 539 547 554 565 571 573 581 584 592 593 604 606 611 616 619 621 623 643 649 657 660 664 666 669 682 686 687 689 694 708 716 718 720 725 729 730 732 733 742 743 748 751 753 754 757 758 767 769 774 780 800 813 826 828 834 836 840 843 847 853 858 866 871 874 875 877 880 889 890 910 911 915 920 926 927 929 933 935 938 939 944 953 960 965 977 983 988 990 1002 1003 1012 1014 1024 1026 1047 1048 1051 1056 1059 1065 1069 1087 1093 1100 1103 1107 1118 1128 1133 1136 1139 1144 1147 1149 1153 1157 1163 1169 1172 1173 1175 1177 1182 1191 1194 1197 1198 1199 1202 1210 1213 1217 1219 1220 1224 1237 1243 1247 1254 1256 1257 1261 1276 1293 1296 1298 1299 1301 1302 1311 1312 1318 1319 1320 1331 1335 1347 1348 1357 1367 1370 1382 1384 1386 1388 1393 1399 1400 1401 1402 1406 1413 1428 1434 1436 1440 1445 1455 1462 1475 1477 1479 1483 1485 1487 1490 1502 1510 1534 1547 1562 1564 1573 1576 1580 1589 1593 1601 1611 1612 1615 1616 1619 1622 1623 1633 1643 1654 1663 1667 1686 1695 1697 1706 1725 1733 1750 1751 1754 1757 1761 1770 1771 1780 1783 1791 1793 1794 1796 1805 1822 1830 1831 1833 1835 1836 1840 1841 1845 1855 1862 1865 1872 1881 1887 1901 1903 1912 1922 1959 1966 1971 1988 2003 2014 2023 2026 2030 2040 2054 2055 2062 2063 2072 2080 2089 2090 2095 2105 2109 2113 2123 2127 2138 2147 2150 2154 2168 2175 2178 2179 2186 2191 2201 2204 2206 2212 2215 2221 2229 2230 2234 2235 2236 2237 2240 2242 2244 2250 2254 2255 2271 2279 2294 2295 2301 2304 2305 2310 2335 2337 2338 2342 2345 2360 2365 2366 2367 2368 2369 2373 2378 2393 2403 2405 2409 2421 2424 2428 2433 2442 2448 2451 2456 2457 2461 2469 2478 2480 2481 2488 2491 2492 2496 2498 2501 2502 2506 2510 2511 2516 2518 2522 2529 2532 2533 2534 2539 2542 2544 2553 2562 2563 2567 2573 2582 2586 2587 2590 2601 2608 2625 2633 2636 2638 2645 2655 2656 2659 2665 2667 2679 2683 2685 2692 2695 2700 2702 2705 2708 2716 2718 2719 2727 2731 2734 2736 2738 2742 2756 2773 2775 2777 2780 2781 2784 2786 2787 2788 2793 2794 2805 2809 2810 2813 2816 2824 2834 2838 2846 2851 2863 2873 2874 2879 2883 2884 2893 2905 2915 2916 2921 2934 2939 2940 2941 2948 2957 2958 2960 2966 2968 2969 2978 2984 2996 2998 3004 3007 3021 3035 3045 3047 3058 3059 3061 3065 3075 3086 3100 3104 3108 3125 3127 3135 3136 3149 3150 3153 3154 3156 3157 3158 3164 3168 3170 3174 3176 3180 3186 3190 3194 3202 3209 3218 3219 3222 3231 3238 3243 3253 3255 3258 3259 3261 3286 3291 3298 3300 3304 3312 3314 3316 3318 3320 3332 3339 3348 3354 3358 3362 3369 13 96 181 287 313 442 456 494 547 592 600 609 786 1035 1212 1370 1371 1514 1515 1635 1789 AGCCCA/TGGGCT 3 -4 615 615 21 -93.8 3 4 6 11 31 35 37 39 53 55 57 62 64 67 69 76 79 103 107 116 120 121 152 155 167 177 181 185 186 187 188 190 194 197 204 215 227 238 239 244 246 254 257 260 261 262 263 266 269 274 279 280 284 290 292 297 300 302 312 314 318 320 325 332 333 336 339 346 351 353 360 367 369 370 387 388 404 407 426 429 430 443 446 447 448 450 456 465 468 476 485 503 504 511 512 513 521 524 526 527 529 532 538 539 547 554 565 571 573 581 584 592 593 604 606 611 616 619 621 623 643 649 657 660 664 666 669 682 686 687 689 694 708 716 718 720 725 729 730 732 733 742 743 748 751 753 754 757 758 767 769 774 780 800 813 826 828 834 836 840 843 847 853 858 866 871 874 875 877 880 889 890 910 911 915 920 926 927 929 933 935 938 939 944 953 960 965 977 983 988 990 1002 1003 1012 1014 1024 1026 1047 1048 1051 1056 1059 1065 1069 1087 1093 1100 1103 1107 1118 1128 1133 1136 1139 1144 1147 1149 1153 1157 1163 1169 1172 1173 1175 1177 1182 1191 1194 1197 1198 1199 1202 1210 1213 1217 1219 1220 1224 1237 1243 1247 1254 1256 1257 1261 1276 1293 1296 1298 1299 1301 1302 1311 1312 1318 1319 1320 1331 1335 1347 1348 1357 1367 1370 1382 1384 1386 1388 1393 1399 1400 1401 1402 1406 1413 1428 1434 1436 1440 1445 1455 1462 1475 1477 1479 1483 1485 1487 1490 1502 1510 1534 1547 1562 1564 1573 1576 1580 1589 1593 1601 1611 1612 1615 1616 1619 1622 1623 1633 1643 1654 1663 1667 1686 1695 1697 1706 1725 1733 1750 1751 1754 1757 1761 1770 1771 1780 1783 1791 1793 1794 1796 1805 1822 1830 1831 1833 1835 1836 1840 1841 1845 1855 1862 1865 1872 1881 1887 1901 1903 1912 1922 1959 1966 1971 1988 2003 2014 2023 2026 2030 2040 2054 2055 2062 2063 2072 2080 2089 2090 2095 2105 2109 2113 2123 2127 2138 2147 2150 2154 2168 2175 2178 2179 2186 2191 2201 2204 2206 2212 2215 2221 2229 2230 2234 2235 2236 2237 2240 2242 2244 2250 2254 2255 2271 2279 2294 2295 2301 2304 2305 2310 2335 2337 2338 2342 2345 2360 2365 2366 2367 2368 2369 2373 2378 2393 2403 2405 2409 2421 2424 2428 2433 2442 2448 2451 2456 2457 2461 2469 2478 2480 2481 2488 2491 2492 2496 2498 2501 2502 2506 2510 2511 2516 2518 2522 2529 2532 2533 2534 2539 2542 2544 2553 2562 2563 2567 2573 2582 2586 2587 2590 2601 2608 2625 2633 2636 2638 2645 2655 2656 2659 2665 2667 2679 2683 2685 2692 2695 2700 2702 2705 2708 2716 2718 2719 2727 2731 2734 2736 2738 2742 2756 2773 2775 2777 2780 2781 2784 2786 2787 2788 2793 2794 2805 2809 2810 2813 2816 2824 2834 2838 2846 2851 2863 2873 2874 2879 2883 2884 2893 2905 2915 2916 2921 2934 2939 2940 2941 2948 2957 2958 2960 2966 2968 2969 2978 2984 2996 2998 3004 3007 3021 3035 3045 3047 3058 3059 3061 3065 3075 3086 3100 3104 3108 3125 3127 3135 3136 3149 3150 3153 3154 3156 3157 3158 3164 3168 3170 3174 3176 3180 3186 3190 3194 3202 3209 3218 3219 3222 3231 3238 3243 3253 3255 3258 3259 3261 3286 3291 3298 3300 3304 3312 3314 3316 3318 3320 3332 3339 3348 3354 3358 3362 3369 13 96 181 287 313 442 456 494 547 592 600 609 786 1035 1212 1370 1371 1514 1515 1635 1789 ATGGGC/GCCCAT 0 -3 540 542 21 -79.3 4 11 24 35 43 45 64 67 69 107 108 116 131 137 140 143 152 170 177 179 183 186 187 188 194 197 204 206 216 217 222 235 239 240 244 246 253 254 262 270 276 278 279 290 295 297 302 305 310 311 314 320 333 344 346 353 354 358 360 365 370 403 409 410 411 425 426 428 430 443 447 450 465 468 470 474 478 485 497 501 511 513 518 521 522 527 528 529 535 538 554 565 571 581 583 592 603 606 609 616 619 640 646 660 664 667 668 679 682 683 687 688 689 690 694 703 720 722 727 729 730 734 742 748 754 757 758 762 763 770 780 787 788 800 801 803 806 818 830 840 858 874 875 877 880 884 888 889 890 907 910 911 915 922 927 934 935 939 940 944 953 960 963 977 978 988 1002 1003 1005 1014 1018 1022 1024 1033 1038 1046 1051 1059 1065 1069 1073 1089 1093 1100 1120 1121 1124 1128 1136 1140 1144 1149 1157 1158 1163 1168 1197 1198 1202 1205 1210 1217 1219 1224 1239 1277 1278 1293 1296 1298 1302 1307 1311 1317 1327 1339 1351 1359 1367 1369 1370 1375 1377 1382 1387 1390 1393 1395 1399 1401 1402 1409 1413 1415 1428 1442 1445 1451 1455 1458 1461 1462 1478 1485 1490 1492 1505 1506 1516 1517 1520 1534 1537 1547 1560 1562 1563 1568 1573 1580 1581 1589 1593 1598 1601 1616 1619 1622 1633 1637 1654 1662 1669 1675 1678 1680 1685 1686 1693 1697 1714 1725 1729 1734 1741 1751 1752 1753 1771 1774 1782 1783 1789 1796 1808 1822 1825 1829 1831 1835 1836 1841 1842 1844 1867 1868 1887 1891 1901 1914 1952 1966 1973 1975 1986 2003 2010 2014 2040 2054 2062 2063 2069 2071 2072 2073 2080 2082 2090 2094 2095 2104 2109 2113 2115 2116 2123 2127 2139 2143 2155 2168 2176 2186 2194 2195 2214 2216 2224 2229 2230 2235 2236 2240 2244 2252 2262 2281 2288 2294 2296 2301 2302 2305 2310 2312 2319 2326 2338 2339 2346 2347 2351 2360 2367 2368 2371 2373 2378 2393 2403 2405 2421 2423 2425 2430 2433 2442 2451 2461 2469 2478 2493 2496 2502 2508 2510 2511 2512 2513 2516 2519 2522 2523 2527 2529 2532 2538 2539 2540 2567 2573 2588 2590 2601 2603 2604 2605 2607 2608 2632 2637 2638 2646 2648 2649 2656 2657 2659 2668 2682 2683 2692 2695 2700 2731 2742 2749 2751 2754 2761 2773 2775 2780 2784 2787 2790 2794 2802 2805 2807 2810 2811 2812 2813 2814 2816 2840 2846 2857 2862 2863 2871 2872 2873 2876 2893 2900 2905 2906 2916 2921 2925 2933 2934 2937 2940 2941 2942 2948 2950 2957 2958 2959 2966 2973 2978 2987 3008 3021 3026 3035 3037 3038 3043 3047 3055 3058 3065 3067 3092 3104 3108 3111 3127 3135 3136 3138 3142 3146 3149 3153 3154 3156 3157 3164 3165 3170 3176 3186 3187 3190 3194 3208 3213 3218 3229 3234 3245 3259 3291 3292 3312 3314 3318 3320 3335 3339 3358 3370 29 30 96 181 313 354 382 456 600 710 786 929 1035 1110 1212 1356 1507 1514 1515 1635 1789 GGGCTT/AAGCCC 0 -1 513 518 20 -75.7 3 4 6 10 11 15 19 35 39 46 53 55 57 62 64 65 67 76 79 81 99 102 103 107 111 116 126 130 145 167 177 181 186 189 190 203 204 211 215 227 238 254 257 258 260 262 269 279 280 284 290 294 299 302 318 325 332 333 336 339 348 353 370 379 388 404 415 426 443 446 447 448 450 465 466 468 485 499 512 513 526 527 530 538 539 547 552 553 584 606 616 621 623 625 628 656 660 664 666 669 670 676 686 687 689 696 708 716 718 720 725 729 730 733 736 740 742 753 754 756 758 768 769 779 780 782 785 796 800 812 813 821 834 836 849 850 853 857 866 874 875 885 887 889 890 896 910 914 915 920 927 929 931 933 935 939 944 955 959 960 965 977 979 983 988 990 994 1000 1001 1003 1007 1011 1012 1014 1024 1048 1056 1063 1065 1071 1089 1096 1103 1136 1147 1149 1157 1163 1177 1181 1182 1191 1197 1198 1199 1213 1217 1224 1237 1250 1253 1254 1256 1259 1261 1295 1296 1298 1301 1302 1311 1312 1316 1319 1320 1322 1328 1331 1347 1348 1357 1360 1367 1370 1382 1384 1386 1402 1406 1413 1421 1428 1429 1430 1436 1445 1459 1462 1470 1475 1477 1479 1484 1485 1490 1502 1507 1510 1511 1529 1533 1534 1542 1547 1562 1564 1571 1573 1576 1580 1587 1589 1604 1605 1612 1615 1616 1622 1633 1634 1654 1667 1671 1690 1695 1706 1709 1720 1725 1728 1750 1757 1761 1768 1778 1779 1780 1783 1791 1793 1796 1805 1822 1831 1836 1841 1848 1850 1869 1912 1913 1922 1926 1939 1957 1959 1966 1973 2006 2014 2030 2043 2054 2055 2062 2063 2072 2075 2080 2086 2096 2127 2138 2150 2154 2156 2170 2175 2177 2185 2186 2191 2205 2215 2223 2229 2230 2236 2237 2248 2250 2255 2282 2295 2301 2305 2306 2311 2336 2337 2338 2340 2341 2351 2359 2361 2365 2369 2373 2378 2393 2398 2409 2410 2414 2417 2421 2424 2442 2456 2457 2461 2463 2475 2478 2480 2488 2498 2501 2502 2510 2511 2516 2518 2529 2534 2539 2544 2553 2563 2567 2582 2583 2584 2586 2590 2592 2608 2624 2633 2636 2638 2639 2655 2664 2688 2692 2695 2700 2702 2708 2713 2716 2719 2720 2736 2738 2742 2758 2765 2773 2775 2776 2780 2781 2784 2787 2793 2796 2801 2805 2809 2810 2813 2816 2836 2837 2843 2851 2853 2863 2873 2893 2896 2915 2941 2957 2958 2960 2966 2968 2969 2977 2983 2988 2993 2998 3018 3021 3045 3058 3059 3061 3064 3075 3104 3108 3116 3130 3135 3136 3145 3150 3153 3155 3157 3158 3166 3174 3180 3184 3186 3188 3192 3194 3196 3197 3199 3205 3209 3219 3222 3230 3253 3255 3259 3260 3261 3286 3291 3298 3304 3312 3316 3318 3320 3324 3348 3352 3354 3355 3358 3362 22 98 287 313 321 327 439 456 474 494 522 600 895 1035 1212 1370 1451 1497 1635 1789 AAGCCC/GGGCTT 3 -5 513 518 20 -75.7 3 4 6 10 11 15 19 35 39 46 53 55 57 62 64 65 67 76 79 81 99 102 103 107 111 116 126 130 145 167 177 181 186 189 190 203 204 211 215 227 238 254 257 258 260 262 269 279 280 284 290 294 299 302 318 325 332 333 336 339 348 353 370 379 388 404 415 426 443 446 447 448 450 465 466 468 485 499 512 513 526 527 530 538 539 547 552 553 584 606 616 621 623 625 628 656 660 664 666 669 670 676 686 687 689 696 708 716 718 720 725 729 730 733 736 740 742 753 754 756 758 768 769 779 780 782 785 796 800 812 813 821 834 836 849 850 853 857 866 874 875 885 887 889 890 896 910 914 915 920 927 929 931 933 935 939 944 955 959 960 965 977 979 983 988 990 994 1000 1001 1003 1007 1011 1012 1014 1024 1048 1056 1063 1065 1071 1089 1096 1103 1136 1147 1149 1157 1163 1177 1181 1182 1191 1197 1198 1199 1213 1217 1224 1237 1250 1253 1254 1256 1259 1261 1295 1296 1298 1301 1302 1311 1312 1316 1319 1320 1322 1328 1331 1347 1348 1357 1360 1367 1370 1382 1384 1386 1402 1406 1413 1421 1428 1429 1430 1436 1445 1459 1462 1470 1475 1477 1479 1484 1485 1490 1502 1507 1510 1511 1529 1533 1534 1542 1547 1562 1564 1571 1573 1576 1580 1587 1589 1604 1605 1612 1615 1616 1622 1633 1634 1654 1667 1671 1690 1695 1706 1709 1720 1725 1728 1750 1757 1761 1768 1778 1779 1780 1783 1791 1793 1796 1805 1822 1831 1836 1841 1848 1850 1869 1912 1913 1922 1926 1939 1957 1959 1966 1973 2006 2014 2030 2043 2054 2055 2062 2063 2072 2075 2080 2086 2096 2127 2138 2150 2154 2156 2170 2175 2177 2185 2186 2191 2205 2215 2223 2229 2230 2236 2237 2248 2250 2255 2282 2295 2301 2305 2306 2311 2336 2337 2338 2340 2341 2351 2359 2361 2365 2369 2373 2378 2393 2398 2409 2410 2414 2417 2421 2424 2442 2456 2457 2461 2463 2475 2478 2480 2488 2498 2501 2502 2510 2511 2516 2518 2529 2534 2539 2544 2553 2563 2567 2582 2583 2584 2586 2590 2592 2608 2624 2633 2636 2638 2639 2655 2664 2688 2692 2695 2700 2702 2708 2713 2716 2719 2720 2736 2738 2742 2758 2765 2773 2775 2776 2780 2781 2784 2787 2793 2796 2801 2805 2809 2810 2813 2816 2836 2837 2843 2851 2853 2863 2873 2893 2896 2915 2941 2957 2958 2960 2966 2968 2969 2977 2983 2988 2993 2998 3018 3021 3045 3058 3059 3061 3064 3075 3104 3108 3116 3130 3135 3136 3145 3150 3153 3155 3157 3158 3166 3174 3180 3184 3186 3188 3192 3194 3196 3197 3199 3205 3209 3219 3222 3230 3253 3255 3259 3260 3261 3286 3291 3298 3304 3312 3316 3318 3320 3324 3348 3352 3354 3355 3358 3362 22 98 287 313 321 327 439 456 474 494 522 600 895 1035 1212 1370 1451 1497 1635 1789 TGGGCC/GGCCCA 0 -2 461 479 6 -85.0 1 6 9 10 11 45 54 59 60 71 81 83 85 107 108 123 127 131 136 137 140 142 152 157 161 167 170 179 182 183 186 188 191 195 216 219 237 251 253 254 257 270 276 278 282 292 295 302 308 310 314 325 329 330 331 342 346 353 354 371 381 385 409 419 426 427 428 446 466 467 474 478 480 485 493 497 501 502 522 525 531 550 553 557 562 566 569 581 593 596 601 603 608 613 616 624 640 641 652 656 668 669 676 678 679 683 690 696 703 710 716 722 723 724 725 727 740 741 754 762 763 764 770 772 784 785 788 800 801 811 822 825 826 828 830 840 858 870 876 877 878 879 884 888 901 912 928 929 934 938 939 940 944 957 978 984 1003 1005 1007 1022 1031 1033 1036 1048 1049 1089 1105 1111 1116 1120 1121 1123 1124 1128 1140 1150 1157 1166 1168 1191 1195 1205 1206 1210 1212 1251 1252 1264 1266 1274 1277 1296 1299 1300 1319 1334 1345 1348 1356 1360 1369 1377 1386 1395 1397 1401 1415 1417 1439 1447 1452 1455 1456 1458 1461 1462 1464 1469 1490 1492 1497 1502 1505 1506 1508 1516 1520 1533 1537 1552 1562 1577 1612 1614 1621 1631 1640 1641 1645 1647 1654 1669 1680 1682 1685 1687 1696 1697 1714 1724 1734 1741 1749 1752 1775 1789 1795 1796 1805 1808 1809 1815 1820 1824 1828 1831 1832 1836 1841 1844 1846 1854 1857 1878 1887 1891 1901 1902 1911 1915 1937 1942 1952 1962 1965 1967 1973 1976 1979 1987 1989 2010 2014 2022 2025 2027 2055 2061 2070 2073 2074 2077 2081 2083 2084 2086 2094 2104 2113 2115 2116 2126 2128 2134 2137 2139 2141 2143 2147 2148 2151 2155 2156 2171 2197 2209 2214 2219 2235 2240 2243 2252 2253 2263 2274 2277 2279 2281 2307 2312 2330 2331 2339 2346 2347 2365 2367 2368 2377 2388 2394 2395 2396 2399 2405 2412 2423 2425 2429 2430 2433 2457 2466 2473 2474 2493 2508 2519 2523 2529 2538 2562 2570 2573 2597 2618 2632 2638 2646 2647 2655 2662 2673 2699 2704 2711 2717 2734 2768 2780 2782 2784 2786 2789 2791 2800 2802 2811 2812 2813 2832 2840 2852 2857 2863 2867 2868 2872 2873 2879 2906 2911 2917 2922 2923 2933 2934 2941 2950 2959 2961 2971 2974 2982 2984 2987 2989 3004 3008 3026 3038 3047 3052 3059 3062 3064 3067 3092 3107 3108 3117 3126 3178 3179 3193 3194 3207 3208 3209 3229 3234 3239 3255 3256 3258 3287 3309 3314 3316 3358 3372 456 710 929 942 1035 1507 TTTGGG/CCCAAA 0 -4 480 472 67 -34.9 3 14 31 41 53 57 59 64 72 82 83 87 89 118 120 121 123 125 142 146 161 167 174 176 184 218 237 245 264 265 270 280 286 308 325 329 330 333 340 367 369 371 383 388 419 426 429 445 446 448 450 451 466 467 485 488 493 498 502 504 510 512 514 525 528 532 537 539 545 551 555 566 569 572 589 590 596 604 608 610 613 617 627 631 639 643 670 671 676 678 686 689 698 699 708 716 724 725 732 733 741 745 748 760 764 773 784 800 805 807 808 817 824 826 828 830 831 845 846 853 855 857 870 871 877 879 901 908 918 928 929 965 979 984 1001 1003 1007 1012 1031 1033 1034 1043 1048 1071 1072 1077 1081 1085 1088 1101 1115 1116 1118 1127 1141 1143 1147 1150 1151 1157 1162 1168 1169 1171 1172 1177 1183 1191 1194 1212 1218 1220 1232 1235 1236 1247 1252 1258 1267 1276 1284 1294 1301 1310 1312 1320 1324 1325 1331 1334 1336 1344 1345 1347 1348 1356 1362 1363 1374 1382 1388 1407 1434 1447 1459 1469 1473 1486 1497 1502 1510 1516 1543 1546 1552 1563 1564 1568 1569 1575 1589 1590 1599 1602 1609 1610 1615 1617 1628 1630 1635 1655 1677 1679 1682 1687 1690 1695 1704 1707 1718 1726 1729 1735 1737 1747 1749 1761 1762 1764 1769 1770 1791 1792 1798 1809 1815 1827 1837 1855 1870 1871 1876 1881 1901 1902 1909 1911 1912 1915 1922 1929 1931 1934 1938 1945 1954 1959 1960 1962 1965 1975 1995 2001 2003 2022 2026 2027 2032 2033 2037 2048 2052 2055 2067 2089 2091 2095 2126 2129 2134 2140 2147 2151 2154 2158 2159 2160 2165 2175 2182 2187 2191 2196 2203 2206 2209 2210 2213 2215 2221 2222 2251 2252 2260 2263 2264 2282 2285 2289 2290 2325 2330 2335 2348 2349 2366 2387 2388 2395 2399 2402 2407 2416 2424 2426 2431 2445 2448 2455 2472 2501 2503 2520 2542 2547 2550 2562 2579 2591 2606 2611 2614 2626 2633 2640 2643 2644 2655 2666 2668 2678 2679 2681 2690 2693 2702 2703 2711 2713 2714 2716 2727 2729 2730 2734 2751 2753 2756 2763 2768 2775 2791 2793 2808 2817 2832 2834 2842 2852 2883 2885 2899 2915 2917 2925 2928 2930 2938 2941 2965 2966 2973 2979 2980 2982 2983 2988 2989 2991 2994 3003 3007 3014 3016 3020 3041 3044 3045 3052 3054 3059 3062 3064 3065 3083 3086 3090 3113 3121 3126 3127 3131 3133 3134 3151 3159 3160 3183 3202 3203 3209 3210 3233 3236 3238 3239 3253 3256 3257 3258 3261 3270 3272 3286 3287 3288 3290 3291 3294 3309 3315 3334 3343 3347 3348 3360 3361 3363 3371 13 62 101 128 142 143 167 188 203 240 244 297 299 300 316 327 346 349 381 387 442 490 528 529 543 592 609 671 672 679 801 875 924 942 949 965 998 1018 1034 1066 1094 1137 1145 1168 1174 1185 1245 1290 1292 1313 1356 1365 1416 1433 1470 1523 1528 1547 1555 1653 1661 1662 1733 1762 1763 1770 1773 TGGACC/GGTCCA 0 -2 466 456 20 -63.8 1 3 5 8 16 28 32 39 55 60 95 127 129 133 134 135 140 150 154 157 169 192 200 208 219 221 231 233 252 278 288 299 309 310 314 317 334 340 341 349 355 356 361 368 373 376 384 395 397 406 414 418 419 420 428 431 437 450 460 475 498 502 506 508 518 520 541 543 548 549 551 558 559 561 568 574 578 579 580 584 599 600 604 617 623 642 647 658 713 718 719 729 735 737 744 747 749 752 755 759 763 776 792 794 799 815 823 829 847 848 855 856 873 881 882 883 886 889 892 894 902 920 921 945 951 954 957 961 962 968 981 995 996 1010 1016 1020 1025 1038 1044 1052 1057 1066 1075 1082 1090 1094 1111 1113 1119 1134 1138 1144 1152 1170 1180 1190 1208 1209 1218 1223 1231 1240 1241 1255 1261 1267 1268 1270 1271 1273 1279 1283 1284 1286 1294 1310 1313 1333 1340 1364 1394 1398 1399 1400 1405 1408 1415 1432 1439 1445 1446 1458 1463 1489 1505 1515 1539 1544 1555 1565 1566 1584 1592 1596 1597 1599 1600 1602 1606 1607 1639 1641 1649 1651 1657 1663 1664 1670 1677 1679 1683 1701 1702 1713 1727 1735 1736 1740 1751 1755 1759 1765 1772 1773 1799 1800 1802 1803 1810 1811 1816 1819 1822 1833 1837 1839 1859 1863 1866 1870 1873 1875 1880 1884 1895 1898 1919 1936 1938 1944 1954 1956 1958 1964 1968 1974 1978 1980 1985 1990 1996 1999 2000 2012 2015 2021 2028 2032 2035 2039 2048 2050 2058 2059 2062 2101 2112 2120 2135 2145 2153 2162 2207 2208 2220 2232 2241 2249 2256 2267 2268 2269 2272 2278 2291 2322 2343 2344 2353 2355 2372 2375 2376 2380 2381 2383 2384 2386 2392 2397 2408 2431 2434 2438 2443 2449 2453 2468 2477 2478 2485 2499 2514 2525 2528 2545 2546 2549 2558 2561 2564 2566 2571 2577 2585 2603 2607 2610 2611 2621 2644 2661 2669 2671 2690 2697 2715 2724 2735 2745 2746 2750 2755 2757 2759 2783 2811 2818 2831 2833 2835 2839 2847 2848 2854 2856 2860 2861 2866 2880 2882 2885 2886 2895 2907 2913 2926 2929 2930 2932 2944 2948 2949 2953 2956 2963 2970 2978 2985 3010 3015 3017 3023 3025 3031 3035 3036 3039 3040 3041 3056 3068 3077 3080 3081 3085 3088 3089 3097 3099 3105 3112 3121 3122 3129 3137 3161 3162 3169 3176 3181 3182 3185 3189 3191 3198 3202 3206 3212 3217 3223 3242 3249 3254 3262 3268 3270 3273 3274 3279 3280 3299 3301 3311 3313 3319 3322 3333 3341 3345 3350 3356 3357 3359 3365 3367 113 180 264 424 432 507 606 758 770 814 1038 1059 1080 1091 1206 1265 1505 1709 1750 1751 CCCATG/CATGGG 1 -2 439 429 13 -65.9 5 41 67 68 116 117 131 140 152 166 177 180 187 201 204 206 213 216 235 244 251 254 274 279 281 289 311 313 315 324 338 346 347 358 360 365 372 397 399 403 422 430 435 436 439 443 451 459 472 474 481 486 496 505 513 541 560 565 576 577 583 590 591 602 606 619 635 659 660 664 668 672 675 681 684 688 693 702 712 720 739 746 759 762 775 776 777 783 794 799 804 809 816 819 821 835 837 840 852 854 855 889 899 908 911 913 916 934 935 940 953 954 960 963 964 966 968 972 988 1006 1017 1022 1024 1028 1033 1039 1040 1051 1059 1061 1067 1069 1070 1074 1078 1083 1100 1102 1136 1140 1145 1152 1161 1163 1185 1188 1189 1196 1219 1224 1246 1262 1267 1272 1275 1297 1303 1305 1307 1308 1315 1317 1327 1338 1350 1351 1352 1353 1354 1355 1358 1385 1389 1390 1396 1401 1404 1414 1422 1423 1426 1433 1444 1445 1448 1480 1481 1485 1488 1494 1500 1506 1513 1526 1529 1530 1534 1537 1567 1568 1585 1595 1601 1616 1646 1656 1658 1668 1677 1678 1696 1703 1734 1741 1776 1782 1783 1808 1813 1814 1823 1826 1838 1842 1847 1863 1868 1874 1879 1885 1914 1920 1921 1923 1927 1929 1932 1948 1972 1973 1982 1994 1997 2005 2029 2034 2036 2040 2042 2046 2060 2063 2065 2072 2080 2090 2092 2098 2104 2109 2110 2111 2123 2132 2136 2144 2152 2168 2172 2180 2182 2194 2195 2211 2225 2244 2248 2261 2265 2266 2276 2288 2293 2296 2300 2309 2310 2326 2332 2339 2370 2371 2391 2400 2418 2419 2420 2422 2425 2433 2441 2442 2459 2461 2465 2475 2478 2486 2490 2494 2512 2513 2521 2526 2532 2539 2540 2556 2567 2569 2574 2589 2590 2596 2612 2616 2628 2630 2632 2649 2653 2654 2663 2668 2672 2674 2675 2683 2693 2695 2718 2732 2733 2739 2740 2742 2748 2760 2762 2766 2770 2773 2774 2778 2779 2785 2794 2798 2816 2820 2822 2823 2844 2850 2857 2859 2864 2872 2878 2891 2892 2894 2898 2902 2910 2916 2943 2948 2958 2959 2962 2972 2980 2991 2997 2999 3009 3011 3012 3013 3022 3025 3028 3029 3032 3058 3069 3072 3076 3078 3084 3092 3102 3106 3110 3114 3128 3139 3141 3144 3149 3153 3171 3172 3183 3190 3194 3220 3221 3224 3227 3232 3236 3244 3264 3293 3296 3298 3308 3323 3326 3330 3338 3351 3360 3364 3366 3368 3373 29 176 464 473 595 865 990 992 1065 1074 1234 1322 1412 TGGGTC/GACCCA 0 -2 418 391 19 -52.7 1 5 17 30 76 82 94 97 104 146 151 158 166 181 212 220 251 256 274 286 288 304 321 325 359 363 371 378 405 409 434 445 458 469 471 481 482 483 488 501 508 509 512 516 519 539 546 548 564 566 572 589 595 607 615 617 626 627 632 634 663 673 698 701 735 756 776 790 805 807 808 824 839 842 845 846 855 860 865 866 869 892 894 900 906 917 942 973 986 999 1010 1028 1032 1043 1056 1076 1098 1104 1111 1120 1131 1142 1144 1145 1152 1162 1171 1183 1185 1190 1200 1204 1215 1225 1227 1236 1244 1246 1248 1258 1260 1271 1288 1294 1310 1324 1326 1329 1332 1336 1341 1344 1345 1360 1362 1379 1398 1407 1416 1418 1426 1449 1457 1461 1472 1473 1474 1476 1486 1491 1493 1496 1498 1506 1518 1522 1525 1538 1545 1548 1551 1554 1557 1559 1570 1575 1592 1602 1627 1641 1642 1644 1655 1658 1667 1679 1684 1690 1694 1700 1705 1708 1712 1716 1718 1737 1739 1743 1745 1752 1757 1762 1764 1766 1773 1786 1788 1797 1798 1804 1813 1830 1843 1858 1865 1877 1892 1898 1904 1905 1908 1922 1927 1933 1953 1993 1995 2005 2009 2013 2016 2020 2029 2031 2051 2052 2057 2066 2067 2085 2114 2125 2128 2131 2133 2136 2155 2159 2160 2162 2164 2165 2166 2174 2182 2187 2188 2189 2190 2193 2196 2200 2210 2218 2225 2226 2231 2251 2257 2260 2265 2266 2273 2275 2283 2299 2313 2324 2330 2349 2382 2387 2389 2396 2403 2407 2413 2450 2454 2455 2458 2462 2464 2472 2489 2503 2505 2507 2520 2545 2548 2552 2556 2557 2571 2578 2591 2593 2594 2598 2600 2606 2611 2615 2617 2619 2620 2622 2624 2626 2640 2641 2644 2658 2662 2666 2677 2680 2691 2706 2743 2744 2747 2750 2764 2766 2778 2804 2806 2820 2842 2848 2849 2855 2859 2866 2872 2875 2883 2885 2889 2890 2897 2903 2908 2909 2920 2928 2932 2938 2944 2961 2968 2979 2980 2990 2992 2993 3002 3005 3014 3017 3019 3030 3032 3034 3041 3048 3071 3073 3077 3082 3083 3090 3094 3095 3113 3118 3119 3123 3129 3134 3140 3143 3144 3160 3162 3167 3183 3195 3201 3203 3210 3223 3237 3244 3246 3247 3248 3251 3257 3258 3265 3266 3269 3270 3290 3315 3317 3325 3331 3343 3346 3347 3361 3363 3364 3371 43 165 431 432 528 801 805 826 1065 1077 1298 1322 1327 1416 1418 1442 1624 1662 1770 TGGGCA/TGCCCA 0 -2 375 370 12 -55.8 14 16 24 41 43 65 67 86 92 106 108 110 116 139 168 176 177 184 197 222 235 243 253 254 264 297 305 328 344 354 358 365 375 392 398 417 425 432 443 447 452 463 470 518 523 527 533 534 535 536 537 544 554 555 569 583 597 609 614 631 637 639 646 650 662 667 670 671 674 688 712 715 732 733 734 748 770 787 799 802 803 806 818 832 844 895 905 907 908 922 927 949 967 975 980 985 997 1001 1006 1017 1018 1019 1027 1030 1034 1038 1046 1054 1058 1060 1069 1072 1073 1074 1088 1089 1095 1097 1107 1122 1135 1137 1158 1160 1162 1183 1212 1239 1243 1278 1287 1289 1291 1296 1304 1307 1317 1327 1339 1346 1358 1365 1366 1372 1374 1376 1387 1390 1392 1403 1409 1442 1445 1450 1451 1467 1469 1478 1504 1517 1540 1543 1556 1561 1569 1574 1580 1588 1590 1598 1599 1610 1617 1632 1635 1637 1662 1675 1676 1688 1692 1693 1716 1725 1726 1741 1742 1747 1753 1758 1760 1763 1774 1782 1787 1792 1808 1827 1829 1842 1867 1868 1871 1876 1914 1917 1929 1931 1941 1943 1952 1969 1975 1977 1984 1986 2004 2007 2037 2054 2068 2069 2071 2080 2082 2095 2100 2140 2141 2165 2176 2184 2194 2195 2203 2216 2224 2246 2247 2262 2270 2284 2285 2288 2289 2290 2296 2302 2310 2315 2319 2321 2325 2326 2328 2348 2351 2361 2385 2401 2425 2426 2437 2440 2444 2445 2450 2452 2482 2512 2513 2522 2527 2540 2576 2588 2603 2605 2614 2629 2638 2648 2649 2650 2651 2652 2657 2668 2678 2681 2682 2686 2689 2693 2696 2698 2701 2703 2710 2727 2728 2729 2741 2749 2751 2752 2753 2754 2761 2767 2790 2792 2807 2814 2817 2865 2871 2876 2881 2887 2899 2900 2912 2924 2925 2927 2937 2952 2954 2955 2964 2966 2973 2975 2987 2994 3000 3016 3037 3049 3055 3072 3087 3096 3111 3131 3142 3146 3147 3151 3158 3159 3165 3187 3200 3213 3225 3226 3233 3240 3245 3272 3276 3287 3288 3289 3292 3294 3321 3334 3335 3349 3358 3370 3374 237 256 354 366 657 1006 1110 1229 1356 1709 1762 1767 AATGGG/CCCATT 0 -4 312 309 43 -23.0 4 11 38 69 79 106 107 116 126 131 166 179 183 188 197 204 220 222 239 240 267 270 274 297 305 310 321 333 344 368 370 409 411 425 426 434 460 465 468 478 492 497 501 527 528 535 538 543 581 584 592 603 607 609 615 667 668 669 679 687 689 701 703 720 724 725 729 730 734 742 754 757 763 770 780 787 790 800 825 830 860 874 875 889 890 910 915 917 927 939 942 973 996 1002 1014 1018 1034 1056 1065 1073 1091 1111 1120 1121 1144 1149 1197 1198 1202 1205 1236 1239 1285 1293 1296 1302 1311 1344 1345 1359 1367 1369 1370 1377 1382 1399 1407 1409 1413 1415 1424 1428 1442 1451 1455 1461 1472 1498 1517 1520 1526 1547 1573 1580 1589 1593 1627 1633 1637 1654 1658 1663 1669 1680 1685 1686 1693 1697 1725 1742 1751 1753 1757 1762 1772 1773 1789 1797 1822 1828 1831 1835 1841 1842 1843 1867 1873 1898 1952 1966 1975 2014 2034 2062 2069 2071 2073 2080 2113 2127 2143 2155 2170 2214 2224 2230 2235 2240 2252 2262 2294 2302 2305 2312 2319 2346 2347 2360 2365 2367 2373 2377 2405 2413 2423 2424 2430 2444 2454 2461 2468 2493 2502 2508 2516 2519 2523 2527 2538 2552 2560 2587 2594 2603 2607 2610 2620 2638 2642 2646 2648 2658 2684 2692 2700 2731 2742 2749 2751 2754 2761 2764 2766 2780 2787 2790 2793 2802 2805 2813 2840 2863 2872 2889 2900 2905 2912 2921 2933 2937 2940 2941 2957 2966 2967 2973 2987 2992 3019 3027 3037 3055 3063 3067 3082 3097 3098 3129 3135 3142 3143 3146 3160 3176 3187 3195 3201 3202 3208 3210 3218 3229 3266 3275 3291 3303 3312 3314 3318 3331 3339 3358 259 287 302 313 366 382 408 417 427 431 435 456 540 552 587 600 646 664 710 716 786 825 899 929 1015 1035 1039 1044 1068 1138 1212 1229 1260 1298 1356 1425 1466 1476 1622 1628 1703 1781 1789 ATTGGG/CCCAAT 0 -4 300 304 38 -24.8 2 16 55 62 67 80 107 123 127 177 188 191 195 207 215 223 227 238 243 251 252 257 270 274 312 318 329 346 353 359 361 365 370 375 376 392 419 443 447 452 480 481 485 489 499 512 516 526 527 531 536 539 547 548 550 555 557 562 569 593 606 634 643 647 649 652 656 679 686 707 710 713 735 741 753 764 769 772 780 790 810 812 814 822 825 828 836 845 857 858 872 876 894 912 927 934 938 942 945 949 957 969 992 997 1002 1007 1010 1030 1036 1047 1048 1074 1107 1120 1131 1175 1179 1183 1189 1191 1195 1197 1256 1260 1262 1277 1284 1302 1309 1312 1345 1348 1356 1360 1367 1370 1375 1376 1384 1386 1392 1395 1413 1430 1449 1452 1455 1456 1462 1464 1469 1487 1518 1577 1590 1592 1611 1612 1635 1637 1640 1647 1684 1690 1698 1699 1710 1745 1751 1757 1780 1789 1841 1843 1862 1878 1884 1892 1905 1941 1967 1976 1981 1990 2014 2016 2020 2027 2055 2062 2105 2155 2156 2165 2176 2186 2200 2201 2213 2214 2215 2240 2243 2246 2296 2303 2305 2307 2313 2365 2367 2368 2370 2373 2377 2396 2415 2433 2466 2468 2482 2489 2491 2492 2498 2500 2506 2519 2523 2533 2539 2553 2563 2572 2576 2582 2597 2600 2618 2622 2625 2633 2650 2683 2701 2711 2715 2731 2734 2736 2741 2782 2784 2786 2788 2800 2804 2806 2864 2875 2881 2884 2895 2909 2911 2912 2920 2924 2927 2941 2951 2954 2969 2971 3002 3004 3017 3034 3061 3096 3107 3108 3125 3140 3162 3174 3176 3178 3180 3209 3222 3237 3243 3258 3265 3286 3287 3290 3314 3316 20 57 94 101 189 218 225 237 247 288 366 429 456 511 527 623 657 843 884 942 999 1019 1035 1054 1086 1092 1212 1268 1327 1371 1474 1503 1544 1575 1603 1608 1628 1789 TTGGAC/GTCCAA 0 -3 286 290 35 -24.4 3 8 16 28 32 39 54 55 67 68 80 127 129 133 134 141 171 177 192 200 207 233 254 278 299 309 310 312 317 349 354 355 357 361 365 370 373 376 378 384 387 390 407 420 435 437 443 447 461 518 522 549 559 561 578 584 599 600 606 617 619 642 647 655 657 663 671 682 702 713 718 737 739 753 755 763 776 802 823 828 840 873 881 886 892 896 902 911 920 968 981 982 995 996 1014 1020 1038 1052 1059 1066 1074 1113 1119 1123 1150 1170 1208 1261 1268 1270 1279 1283 1286 1294 1302 1310 1342 1348 1352 1364 1366 1413 1415 1432 1442 1445 1446 1458 1463 1489 1496 1505 1539 1544 1545 1574 1592 1596 1601 1602 1651 1663 1670 1696 1701 1710 1727 1735 1736 1740 1741 1755 1759 1772 1773 1793 1800 1802 1811 1819 1837 1839 1859 1863 1866 1873 1880 1895 1898 1919 1942 1944 1958 1968 1978 1985 1990 1996 2000 2039 2040 2059 2062 2089 2142 2145 2156 2166 2220 2241 2267 2272 2291 2318 2326 2344 2345 2375 2386 2397 2407 2408 2431 2438 2449 2454 2472 2477 2525 2530 2545 2546 2558 2570 2585 2607 2610 2621 2671 2674 2684 2706 2719 2735 2749 2750 2755 2769 2833 2845 2854 2855 2856 2861 2866 2880 2882 2892 2904 2907 2916 2922 2924 2926 2932 2948 2949 2952 2953 2956 2970 2978 2982 3010 3015 3035 3036 3039 3040 3041 3052 3056 3068 3077 3080 3081 3085 3097 3106 3142 3162 3172 3206 3212 3247 3254 3262 3270 3289 3301 3311 3322 3333 3341 3359 3365 37 98 113 125 180 275 321 353 424 535 557 620 720 758 770 793 812 884 1057 1094 1214 1260 1303 1354 1362 1420 1484 1505 1506 1534 1567 1575 1588 1625 1762 GGGCCT/AGGCCC 0 -1 273 274 6 -44.6 11 45 59 71 74 83 85 93 100 107 115 123 131 137 157 161 166 170 178 182 186 188 195 209 219 237 242 247 251 257 270 276 292 314 325 329 331 342 346 353 371 390 396 409 428 466 500 517 531 581 593 620 622 641 645 668 669 676 678 690 695 696 703 722 724 725 728 754 764 785 792 800 826 827 831 858 870 872 877 879 884 888 901 934 939 940 941 957 1003 1012 1022 1031 1085 1108 1114 1116 1120 1125 1128 1156 1157 1164 1166 1193 1195 1205 1239 1277 1286 1296 1299 1300 1319 1323 1330 1369 1377 1395 1415 1424 1447 1452 1461 1497 1516 1520 1582 1619 1621 1631 1659 1682 1697 1719 1744 1749 1785 1789 1796 1805 1806 1809 1828 1846 1857 1862 1878 1887 1897 1902 1911 1937 1942 1946 1949 1952 1955 1967 1983 2010 2027 2056 2081 2086 2113 2116 2122 2137 2139 2142 2143 2155 2197 2235 2252 2274 2297 2303 2320 2330 2331 2333 2338 2346 2347 2357 2367 2368 2377 2395 2405 2429 2430 2433 2457 2491 2492 2508 2515 2519 2523 2537 2538 2551 2562 2565 2570 2572 2573 2575 2602 2627 2632 2638 2660 2717 2722 2734 2768 2771 2784 2786 2789 2795 2797 2799 2802 2811 2812 2840 2845 2857 2867 2868 2870 2873 2923 2933 2935 2941 2945 2950 2959 2974 2976 3001 3004 3019 3024 3026 3052 3063 3107 3178 3179 3207 3208 3229 3235 3239 3252 3255 3258 3275 3285 3287 3314 3316 3337 3353 3358 3372 3375 382 456 710 1452 1485 1575 GGGCCA/TGGCCC 0 -1 266 271 7 -42.8 0 1 6 9 10 54 60 123 127 136 142 167 179 183 188 191 216 219 253 268 270 282 329 346 382 385 426 442 446 467 474 478 493 497 501 513 522 525 550 557 562 601 603 616 624 640 652 656 679 683 692 710 716 723 741 743 759 763 769 770 772 784 788 798 801 813 825 876 878 912 938 939 944 948 950 978 1004 1007 1029 1035 1036 1037 1048 1105 1111 1141 1143 1168 1191 1195 1205 1206 1212 1232 1251 1264 1277 1309 1334 1345 1348 1356 1360 1391 1397 1401 1406 1415 1417 1455 1456 1458 1464 1465 1475 1492 1502 1505 1552 1562 1577 1612 1640 1641 1645 1654 1656 1661 1687 1699 1714 1715 1724 1732 1734 1752 1767 1775 1795 1808 1815 1817 1820 1836 1841 1854 1860 1890 1891 1893 1896 1900 1915 1919 1923 1973 1976 1987 2014 2025 2034 2055 2061 2073 2083 2084 2087 2094 2104 2124 2128 2148 2156 2171 2181 2214 2219 2238 2240 2277 2292 2307 2318 2323 2339 2362 2365 2394 2396 2399 2409 2430 2432 2436 2467 2473 2474 2479 2484 2487 2493 2523 2529 2536 2567 2581 2618 2631 2647 2655 2673 2695 2709 2711 2791 2800 2812 2813 2826 2830 2852 2863 2872 2877 2879 2888 2889 2901 2904 2911 2914 2917 2922 2947 2961 2967 2971 2974 2984 3008 3020 3026 3027 3047 3057 3059 3060 3063 3064 3067 3091 3109 3117 3124 3126 3133 3176 3177 3209 3234 3241 3271 3277 3283 3287 3336 929 942 1035 1377 1625 1687 1789 GTGGGC/GCCCAC 0 -3 263 271 6 -44.0 1 3 6 9 11 57 71 85 103 106 109 136 140 152 157 165 167 182 197 219 234 237 260 263 266 282 290 295 297 300 302 322 331 336 344 381 382 385 402 409 427 432 446 452 456 463 476 480 524 534 544 566 573 598 612 614 624 641 652 662 669 686 712 720 725 743 767 769 770 784 822 826 832 834 840 843 844 847 863 879 905 919 923 933 956 983 991 1017 1089 1095 1107 1111 1122 1133 1137 1139 1155 1160 1166 1173 1189 1210 1213 1237 1243 1257 1264 1291 1299 1304 1318 1335 1357 1358 1366 1395 1397 1400 1415 1428 1436 1439 1450 1483 1490 1531 1533 1540 1562 1588 1610 1612 1614 1632 1635 1641 1647 1663 1692 1696 1706 1716 1724 1754 1760 1763 1783 1796 1809 1828 1833 1840 1846 1851 1854 1865 1872 1883 1887 1917 1960 1987 2007 2044 2068 2070 2074 2088 2113 2137 2141 2146 2147 2171 2178 2179 2219 2234 2237 2242 2247 2250 2254 2255 2270 2279 2281 2285 2304 2321 2331 2342 2354 2361 2369 2373 2401 2421 2425 2428 2429 2473 2474 2518 2522 2534 2544 2562 2636 2651 2652 2673 2685 2696 2698 2704 2708 2726 2727 2728 2767 2777 2787 2789 2792 2809 2819 2824 2838 2874 2887 2906 2939 2952 2960 2961 2968 2984 2987 2998 3000 3046 3049 3059 3061 3072 3087 3108 3150 3200 3219 3225 3231 3243 3263 3276 3289 3302 3328 3349 3362 3372 3374 256 287 547 1006 1427 1767 AAAGCC/GGCTTT 3 -6 248 249 41 -15.8 2 3 5 10 11 23 53 55 62 76 77 102 103 107 116 190 203 204 227 231 257 261 269 290 294 299 302 333 353 370 379 404 446 450 466 499 512 526 527 538 539 547 572 628 629 664 687 689 715 718 732 736 748 753 754 768 779 821 836 848 854 875 877 881 887 910 915 933 939 940 959 960 979 983 990 1001 1003 1007 1009 1017 1024 1028 1043 1048 1056 1096 1149 1161 1191 1213 1219 1253 1259 1281 1300 1302 1319 1320 1324 1331 1347 1367 1374 1406 1413 1428 1429 1430 1436 1470 1475 1479 1485 1490 1502 1533 1558 1562 1587 1589 1612 1615 1622 1641 1651 1726 1728 1738 1779 1780 1791 1799 1822 1836 1848 1926 1957 1959 1966 1977 1987 2043 2055 2062 2075 2076 2083 2156 2167 2175 2177 2181 2215 2223 2228 2229 2230 2250 2255 2290 2301 2305 2306 2336 2338 2340 2359 2364 2365 2369 2381 2409 2410 2414 2415 2421 2456 2461 2462 2498 2502 2511 2539 2544 2567 2583 2607 2633 2636 2649 2654 2655 2702 2713 2734 2738 2742 2760 2765 2780 2787 2796 2805 2810 2817 2836 2837 2843 2844 2851 2869 2870 2941 2966 2968 2969 2988 2998 3007 3018 3045 3059 3082 3096 3116 3135 3145 3153 3155 3174 3180 3184 3188 3196 3219 3222 3253 3255 3261 3286 3291 3318 3324 3330 3352 3353 3354 3355 22 72 157 193 225 259 287 303 381 411 434 439 456 522 584 604 671 748 806 868 895 957 1035 1062 1125 1173 1212 1359 1370 1434 1471 1497 1518 1586 1591 1611 1638 1653 1676 1781 1785 GGACCA/TGGTCC 0 -1 247 242 23 -24.0 8 16 55 80 95 127 130 154 174 190 207 208 268 278 299 310 311 314 317 334 338 349 355 356 360 376 397 406 418 419 420 421 428 437 439 450 475 481 489 502 531 558 559 578 599 600 623 647 658 699 702 707 744 752 763 766 794 815 821 823 848 856 867 881 882 902 921 945 954 962 981 992 995 996 1038 1044 1052 1057 1066 1081 1090 1111 1136 1179 1194 1209 1255 1267 1268 1340 1351 1356 1367 1394 1398 1408 1414 1432 1439 1446 1466 1489 1515 1537 1539 1550 1555 1566 1596 1600 1607 1626 1651 1657 1664 1670 1677 1702 1710 1713 1746 1759 1764 1765 1772 1799 1810 1816 1819 1838 1854 1866 1884 1914 1919 1929 1930 1958 1959 1964 1968 1978 1980 1996 2000 2013 2015 2039 2040 2048 2050 2059 2062 2112 2116 2135 2153 2157 2207 2208 2220 2230 2232 2249 2256 2261 2267 2268 2269 2291 2322 2355 2372 2375 2381 2386 2392 2408 2422 2434 2453 2477 2478 2499 2508 2546 2558 2566 2571 2573 2607 2610 2611 2669 2671 2690 2697 2735 2745 2746 2783 2808 2818 2831 2835 2839 2847 2852 2854 2856 2880 2882 2895 2907 2926 2948 2949 2956 2963 2970 2978 3023 3031 3039 3040 3068 3109 3122 3137 3161 3169 3182 3185 3198 3242 3249 3262 3273 3274 3311 3313 3319 3322 3341 3356 3357 3367 424 507 606 608 679 751 756 758 770 805 879 914 1036 1038 1091 1206 1313 1474 1505 1709 1726 1750 1751 TATGGG/CCCATA 0 -4 245 241 30 -19.8 2 24 30 35 45 64 67 101 104 107 119 142 143 170 186 194 246 302 314 320 344 353 354 363 428 435 443 447 450 458 470 482 501 511 518 521 522 538 554 571 572 581 606 616 640 662 668 682 690 714 715 722 727 729 731 748 755 758 766 788 803 858 878 884 888 907 915 934 977 1001 1002 1032 1038 1046 1089 1093 1124 1128 1143 1149 1158 1168 1180 1200 1205 1210 1217 1285 1339 1346 1375 1377 1379 1387 1391 1402 1458 1461 1462 1477 1478 1505 1506 1508 1516 1522 1540 1560 1573 1579 1598 1619 1642 1655 1680 1716 1752 1762 1771 1813 1829 1831 1836 1844 1887 1891 1898 1901 1910 1922 1944 1946 1950 1986 1994 1995 2003 2040 2052 2054 2063 2072 2074 2094 2095 2104 2113 2114 2147 2184 2186 2188 2216 2229 2235 2238 2281 2288 2294 2301 2329 2331 2338 2346 2351 2368 2378 2393 2405 2421 2458 2483 2487 2496 2510 2511 2522 2529 2567 2578 2588 2601 2604 2608 2628 2641 2646 2657 2659 2662 2707 2742 2749 2766 2775 2791 2796 2798 2807 2812 2814 2846 2849 2862 2873 2893 2906 2916 2925 2933 2934 2950 2957 2978 3008 3021 3022 3035 3038 3043 3047 3067 3077 3098 3108 3111 3112 3118 3119 3134 3136 3138 3154 3164 3170 3186 3213 3234 3245 3259 3320 3324 3335 3370 3371 56 94 109 156 277 354 482 507 569 574 661 687 714 805 925 928 957 1058 1165 1186 1236 1507 1514 1515 1575 1579 1635 1638 1675 1754 CCATGT/ACATGG 1 -1 237 238 36 -16.5 5 58 68 98 116 130 131 157 166 191 201 213 216 252 279 289 312 313 315 351 368 370 387 397 398 403 418 426 436 439 481 496 541 583 590 591 602 604 657 659 664 681 684 688 702 710 744 746 752 762 794 799 801 804 816 821 831 837 840 842 844 855 874 879 889 913 916 935 954 961 964 966 982 994 1017 1022 1024 1033 1037 1039 1040 1051 1066 1070 1072 1102 1111 1137 1139 1140 1164 1185 1186 1189 1221 1225 1227 1251 1267 1272 1303 1315 1317 1338 1352 1358 1362 1384 1396 1401 1426 1429 1448 1471 1481 1488 1500 1526 1550 1568 1585 1595 1597 1607 1613 1616 1634 1658 1667 1677 1696 1703 1760 1781 1782 1808 1813 1838 1847 1860 1874 1875 1927 1972 1974 2005 2015 2024 2029 2040 2065 2069 2080 2098 2099 2112 2123 2136 2162 2172 2180 2211 2232 2244 2256 2310 2332 2335 2370 2400 2418 2419 2422 2425 2426 2441 2442 2459 2461 2465 2526 2539 2557 2569 2590 2611 2616 2620 2632 2649 2653 2675 2718 2732 2733 2739 2748 2762 2778 2798 2816 2820 2826 2844 2891 2892 2895 2948 2959 2988 3009 3022 3048 3057 3071 3072 3073 3084 3092 3110 3128 3153 3159 3169 3171 3189 3232 3263 3293 3298 3308 3315 3323 3326 3330 3351 3364 52 54 115 156 176 208 228 248 268 308 418 464 467 476 507 526 527 562 606 781 840 855 873 1038 1065 1109 1115 1142 1215 1247 1377 1468 1589 1634 1638 1776 ATGGAC/GTCCAT 0 -3 229 230 33 -16.8 1 5 8 60 63 70 116 120 135 140 150 153 154 155 169 208 218 244 252 254 288 312 322 356 365 366 368 371 381 387 395 397 406 419 428 443 447 450 460 475 488 489 498 502 506 508 520 568 580 657 660 664 707 729 744 752 759 764 788 792 794 799 820 842 844 847 855 873 888 889 907 954 957 961 982 988 992 1024 1026 1055 1075 1081 1111 1134 1144 1152 1153 1179 1190 1209 1223 1225 1228 1255 1267 1276 1284 1302 1316 1400 1401 1434 1439 1445 1458 1505 1541 1555 1566 1579 1584 1597 1606 1607 1641 1663 1677 1679 1702 1713 1733 1752 1755 1765 1780 1799 1803 1816 1822 1845 1864 1875 1884 1891 1936 1940 1944 1974 1980 2015 2021 2028 2054 2067 2088 2101 2112 2135 2153 2162 2186 2205 2207 2232 2256 2268 2269 2278 2322 2343 2371 2376 2380 2381 2384 2392 2426 2434 2443 2454 2468 2478 2485 2514 2528 2561 2566 2625 2644 2689 2690 2697 2703 2715 2745 2757 2759 2810 2811 2818 2831 2839 2848 2857 2860 2886 2895 2913 2929 2930 2944 3011 3023 3025 3089 3097 3105 3112 3121 3129 3133 3137 3176 3182 3185 3189 3191 3217 3223 3242 3253 3263 3299 3309 3313 3319 3345 3357 3367 54 75 117 280 432 507 562 606 703 776 797 814 840 848 880 1038 1080 1091 1184 1206 1222 1265 1382 1467 1481 1541 1566 1638 1751 1760 1766 1778 1783 GGCCAA/TTGGCC 0 0 201 204 23 -18.2 0 6 60 87 123 127 132 136 188 216 219 270 282 329 355 362 368 404 416 440 441 446 449 456 493 501 513 515 522 525 536 544 546 550 567 603 607 616 652 654 656 679 683 692 723 736 741 761 763 769 770 784 798 850 878 912 931 944 948 997 1011 1035 1036 1037 1048 1084 1087 1099 1105 1141 1191 1195 1206 1212 1232 1234 1235 1251 1300 1328 1348 1356 1360 1371 1455 1456 1458 1464 1475 1492 1498 1502 1505 1509 1552 1632 1640 1645 1654 1656 1661 1681 1687 1699 1724 1767 1795 1815 1820 1821 1823 1840 1841 1844 1854 1893 1896 1900 1919 1923 1976 1981 1998 2006 2014 2025 2034 2041 2055 2073 2083 2084 2087 2094 2104 2121 2148 2156 2171 2214 2277 2318 2323 2330 2339 2362 2365 2399 2413 2430 2432 2436 2442 2467 2473 2493 2511 2522 2523 2536 2566 2568 2581 2602 2622 2634 2655 2687 2738 2800 2826 2829 2830 2864 2872 2914 2961 2967 2971 2974 2977 3008 3026 3059 3064 3067 3091 3093 3109 3117 3173 3209 3216 3241 3242 3254 3267 3271 3277 3287 3372 104 330 352 370 455 466 485 547 564 635 646 702 770 784 932 942 1104 1160 1274 1462 1591 1625 1664 TCCCAT/ATGGGA 1 -3 204 200 33 -12.8 2 41 45 68 104 180 201 276 281 289 313 315 324 347 364 372 399 422 427 436 486 492 576 584 591 602 659 662 668 684 693 712 715 731 766 780 783 794 804 816 819 821 837 852 854 855 899 916 934 954 968 996 1034 1039 1040 1067 1070 1102 1143 1161 1180 1196 1236 1267 1275 1308 1338 1345 1346 1353 1354 1355 1385 1389 1395 1396 1414 1422 1423 1433 1463 1480 1481 1488 1506 1508 1513 1567 1573 1579 1595 1656 1658 1672 1677 1697 1813 1814 1823 1831 1838 1847 1873 1874 1898 1920 1921 1929 1932 1948 1972 1994 2034 2042 2046 2052 2072 2074 2104 2110 2144 2170 2172 2180 2184 2188 2261 2288 2293 2294 2300 2309 2319 2331 2332 2420 2422 2425 2444 2459 2461 2465 2483 2487 2494 2526 2538 2560 2569 2574 2587 2654 2660 2663 2672 2674 2675 2707 2718 2732 2739 2740 2749 2766 2770 2791 2798 2823 2844 2850 2878 2902 2910 2912 2933 2943 2962 2972 2999 3011 3013 3022 3029 3069 3072 3084 3097 3102 3106 3110 3114 3120 3139 3183 3212 3264 3275 3303 3323 3326 3330 3338 3360 3366 259 274 277 366 408 427 464 473 540 549 552 574 646 697 714 716 957 1044 1067 1074 1137 1165 1186 1234 1260 1444 1476 1575 1579 1622 1703 1754 1781 GTTGGG/CCCAAC 0 -4 201 198 16 -21.7 39 60 62 63 71 79 100 105 110 123 139 155 181 183 185 190 209 212 238 257 269 292 325 378 469 508 512 514 519 554 555 567 584 597 643 662 717 720 741 742 754 771 836 845 857 878 912 920 926 965 968 980 990 1021 1045 1048 1058 1060 1091 1118 1147 1161 1191 1195 1204 1237 1252 1266 1289 1299 1315 1319 1327 1335 1343 1345 1346 1372 1379 1386 1400 1406 1416 1440 1472 1475 1479 1502 1508 1545 1558 1561 1617 1620 1621 1645 1654 1660 1674 1700 1705 1750 1762 1786 1805 1809 1830 1845 1937 1943 1960 1969 1971 2011 2013 2025 2055 2074 2077 2095 2118 2138 2150 2164 2188 2193 2204 2212 2213 2226 2271 2275 2283 2297 2299 2307 2310 2317 2345 2365 2377 2393 2411 2425 2436 2440 2450 2462 2480 2481 2488 2535 2544 2548 2572 2587 2611 2654 2658 2667 2689 2717 2719 2746 2752 2793 2800 2813 2842 2870 2879 2910 2918 2923 2933 2950 2964 2974 2984 3004 3013 3071 3100 3117 3123 3140 3158 3168 3174 3193 3194 3207 3217 3251 3258 3298 3299 3304 3321 3332 3354 43 127 260 264 342 400 529 789 929 992 1063 1242 1346 1568 1650 1751 GGACCC/GGGTCC 0 -1 195 195 9 -26.8 1 3 5 15 18 30 82 104 140 175 221 249 256 288 304 341 343 368 390 431 444 460 469 481 498 508 509 518 519 520 541 548 551 556 566 568 580 617 632 700 701 717 735 765 776 790 799 814 829 839 842 855 865 868 883 892 894 900 973 986 992 1010 1046 1077 1111 1113 1125 1138 1144 1152 1159 1180 1190 1211 1215 1218 1223 1271 1284 1294 1310 1325 1329 1332 1333 1336 1341 1364 1407 1426 1482 1498 1538 1592 1597 1602 1639 1641 1644 1658 1673 1679 1683 1711 1722 1738 1786 1802 1859 1863 1870 1898 1905 1910 1922 1938 1990 1992 1995 2021 2045 2052 2102 2133 2162 2173 2188 2226 2273 2299 2334 2380 2384 2402 2415 2449 2462 2483 2485 2509 2545 2549 2555 2560 2578 2611 2621 2644 2661 2684 2723 2744 2750 2804 2808 2842 2848 2855 2866 2885 2886 2889 2897 2903 2929 2930 2932 2944 2973 3017 3034 3041 3050 3077 3094 3112 3119 3129 3134 3148 3162 3163 3203 3214 3223 3228 3270 3303 3307 3310 3327 3331 3359 3363 3364 43 264 432 814 826 897 1265 1322 1773 CTGGGC/GCCCAG 0 -3 176 184 2 -33.1 37 54 65 67 81 92 168 177 186 244 254 261 284 328 339 342 346 354 365 371 387 398 407 429 443 456 503 523 533 553 587 601 611 621 637 639 650 657 660 666 669 674 696 716 726 740 751 770 785 799 802 811 828 866 895 928 967 985 988 1019 1026 1049 1054 1087 1097 1103 1105 1107 1135 1153 1206 1210 1212 1243 1254 1261 1300 1314 1365 1397 1403 1417 1445 1477 1492 1504 1549 1574 1580 1591 1622 1623 1643 1680 1704 1707 1741 1742 1775 1787 1794 1805 1820 1824 1832 1857 1887 1903 1928 1942 1945 1977 1979 1984 1988 2002 2004 2023 2030 2081 2083 2084 2086 2100 2128 2140 2141 2148 2175 2184 2197 2274 2277 2279 2286 2288 2295 2315 2316 2328 2330 2378 2385 2409 2412 2430 2444 2452 2457 2497 2564 2586 2629 2647 2662 2665 2686 2699 2718 2781 2851 2899 2955 2975 2982 3047 3070 3075 3147 3158 3179 3226 3255 3300 3321 3369 494 1515 GGGCTA/TAGCCC 0 -1 183 183 8 -25.6 62 76 79 128 144 155 164 172 187 202 228 232 240 271 297 300 312 369 387 389 412 433 440 449 504 521 529 533 592 593 594 611 643 649 657 660 694 709 721 781 828 858 859 877 926 938 953 971 982 988 1002 1047 1051 1055 1059 1069 1086 1092 1093 1118 1133 1139 1149 1153 1172 1173 1174 1186 1194 1197 1207 1257 1285 1290 1312 1380 1382 1383 1388 1393 1403 1427 1440 1442 1490 1519 1623 1650 1653 1697 1698 1733 1752 1794 1840 1845 1861 1864 1903 1907 1991 2003 2019 2026 2041 2049 2064 2123 2163 2199 2201 2204 2206 2221 2233 2234 2235 2240 2244 2279 2294 2305 2308 2310 2329 2342 2345 2356 2366 2367 2368 2373 2390 2403 2405 2428 2448 2469 2471 2491 2506 2531 2532 2541 2547 2550 2595 2670 2676 2683 2718 2731 2734 2769 2777 2788 2825 2874 2879 2905 2931 2934 2936 2940 3035 3048 3093 3101 3103 3125 3132 3153 3154 3158 3180 3190 3218 3238 3243 3250 3282 3339 3344 96 183 313 1212 1371 1400 1527 1625 TAGCCC/GGGCTA 3 -5 183 183 8 -25.6 62 76 79 128 144 155 164 172 187 202 228 232 240 271 297 300 312 369 387 389 412 433 440 449 504 521 529 533 592 593 594 611 643 649 657 660 694 709 721 781 828 858 859 877 926 938 953 971 982 988 1002 1047 1051 1055 1059 1069 1086 1092 1093 1118 1133 1139 1149 1153 1172 1173 1174 1186 1194 1197 1207 1257 1285 1290 1312 1380 1382 1383 1388 1393 1403 1427 1440 1442 1490 1519 1623 1650 1653 1697 1698 1733 1752 1794 1840 1845 1861 1864 1903 1907 1991 2003 2019 2026 2041 2049 2064 2123 2163 2199 2201 2204 2206 2221 2233 2234 2235 2240 2244 2279 2294 2305 2308 2310 2329 2342 2345 2356 2366 2367 2368 2373 2390 2403 2405 2428 2448 2469 2471 2491 2506 2531 2532 2541 2547 2550 2595 2670 2676 2683 2718 2731 2734 2769 2777 2788 2825 2874 2879 2905 2931 2934 2936 2940 3035 3048 3093 3101 3103 3125 3132 3153 3154 3158 3180 3190 3218 3238 3243 3250 3282 3339 3344 96 183 313 1212 1371 1400 1527 1625 GGGCAT/ATGCCC 0 -1 179 180 14 -20.2 14 16 24 30 41 65 113 116 124 158 256 266 305 344 375 392 412 436 447 527 535 537 554 564 569 583 590 631 667 697 712 729 732 748 770 787 799 802 803 818 826 837 841 844 882 889 904 905 907 922 980 985 997 1001 1002 1018 1020 1030 1034 1053 1078 1088 1095 1107 1122 1160 1212 1219 1239 1243 1287 1289 1291 1296 1307 1372 1374 1378 1392 1403 1425 1450 1467 1469 1478 1517 1529 1540 1561 1580 1590 1610 1617 1635 1637 1646 1675 1676 1692 1693 1725 1726 1742 1747 1760 1763 1792 1829 1929 1931 1952 1969 1975 2017 2037 2068 2141 2194 2195 2203 2270 2288 2289 2310 2319 2321 2325 2348 2351 2401 2425 2444 2450 2452 2482 2513 2576 2628 2636 2638 2642 2648 2650 2681 2682 2698 2701 2703 2710 2727 2728 2746 2751 2767 2772 2792 2841 2865 2887 2952 2966 2973 2994 3016 3037 3151 3159 3165 3175 3187 3204 3240 3287 3288 3294 3340 3349 3358 3374 354 408 547 657 820 933 957 1029 1095 1529 1651 1667 1709 1738 GGCTTA/TAAGCC 0 0 180 176 22 -14.7 14 19 46 79 93 99 126 186 211 215 280 284 332 347 388 426 440 447 448 485 518 526 538 571 584 616 623 660 666 669 686 689 701 708 716 720 730 733 742 751 782 800 813 853 857 868 910 927 929 931 933 935 988 1000 1063 1089 1147 1157 1176 1182 1197 1198 1199 1217 1237 1244 1256 1296 1298 1299 1301 1347 1348 1357 1367 1404 1436 1459 1462 1477 1492 1510 1538 1542 1547 1564 1573 1576 1633 1635 1654 1667 1706 1725 1750 1757 1768 1783 1793 1808 1850 1912 1915 1922 1959 2030 2049 2060 2071 2115 2127 2139 2140 2150 2154 2167 2215 2286 2331 2337 2341 2378 2385 2393 2398 2417 2434 2463 2478 2488 2510 2516 2534 2562 2563 2584 2586 2608 2638 2692 2695 2700 2718 2736 2742 2760 2771 2775 2784 2801 2809 2813 2893 2895 2924 2957 2958 2960 2977 2983 3021 3075 3082 3104 3130 3136 3150 3157 3158 3192 3197 3206 3230 3265 3298 3304 3312 3353 3358 3362 154 313 321 327 456 500 503 600 706 772 914 1063 1064 1095 1124 1146 1199 1451 1494 1501 1599 1789 TAAGCC/GGCTTA 3 -6 180 176 22 -14.7 14 19 46 79 93 99 126 186 211 215 280 284 332 347 388 426 440 447 448 485 518 526 538 571 584 616 623 660 666 669 686 689 701 708 716 720 730 733 742 751 782 800 813 853 857 868 910 927 929 931 933 935 988 1000 1063 1089 1147 1157 1176 1182 1197 1198 1199 1217 1237 1244 1256 1296 1298 1299 1301 1347 1348 1357 1367 1404 1436 1459 1462 1477 1492 1510 1538 1542 1547 1564 1573 1576 1633 1635 1654 1667 1706 1725 1750 1757 1768 1783 1793 1808 1850 1912 1915 1922 1959 2030 2049 2060 2071 2115 2127 2139 2140 2150 2154 2167 2215 2286 2331 2337 2341 2378 2385 2393 2398 2417 2434 2463 2478 2488 2510 2516 2534 2562 2563 2584 2586 2608 2638 2692 2695 2700 2718 2736 2742 2760 2771 2775 2784 2801 2809 2813 2893 2895 2924 2957 2958 2960 2977 2983 3021 3075 3082 3104 3130 3136 3150 3157 3158 3192 3197 3206 3230 3265 3298 3304 3312 3353 3358 3362 154 313 321 327 456 500 503 600 706 772 914 1063 1064 1095 1124 1146 1199 1451 1494 1501 1599 1789 TGTGGG/CCCACA 0 -4 161 168 19 -15.1 1 6 11 101 106 140 150 152 157 182 198 213 216 217 219 234 242 256 263 266 295 297 300 304 336 361 376 381 395 405 432 440 446 455 459 476 573 595 612 614 624 663 686 705 712 725 767 784 847 883 892 932 986 1017 1047 1057 1098 1122 1137 1140 1166 1173 1175 1189 1211 1213 1237 1243 1252 1257 1264 1271 1291 1335 1392 1397 1400 1428 1474 1483 1538 1548 1598 1657 1679 1685 1692 1696 1716 1730 1783 1804 1809 1813 1828 1833 1883 1887 1961 1973 2032 2049 2066 2074 2077 2116 2178 2179 2218 2219 2237 2257 2270 2273 2279 2281 2283 2301 2304 2342 2349 2361 2362 2369 2389 2418 2464 2518 2537 2557 2562 2617 2636 2651 2677 2696 2708 2726 2728 2746 2775 2777 2792 2809 2838 2851 2903 2906 2939 2952 2990 3219 3223 3225 3243 3256 3276 3302 3317 3362 3372 60 176 199 315 377 472 547 618 812 1035 1076 1079 1200 1294 1454 1641 1655 1765 1767 GTGGAC/GTCCAC 0 -3 160 166 14 -17.9 16 17 52 55 99 100 109 130 158 209 218 219 221 231 244 251 273 301 314 334 361 370 473 475 483 541 543 545 548 551 556 558 579 604 620 626 642 651 653 660 710 719 729 747 749 753 792 815 829 844 882 883 894 919 921 945 951 962 988 1002 1008 1025 1057 1059 1076 1094 1124 1180 1218 1240 1241 1246 1271 1273 1313 1324 1326 1333 1340 1384 1394 1396 1400 1413 1421 1483 1515 1551 1555 1565 1600 1606 1641 1657 1660 1751 1759 1810 1845 1870 1882 1931 1934 1938 1943 1964 1978 1988 2009 2012 2032 2035 2048 2050 2054 2058 2062 2098 2165 2213 2255 2329 2335 2383 2453 2560 2564 2571 2577 2661 2669 2697 2724 2746 2783 2835 2847 2932 2961 2962 2963 2985 3017 3031 3045 3088 3119 3122 3161 3162 3169 3181 3198 3249 3259 3268 3274 3279 3308 3356 148 217 247 264 363 666 986 1020 1346 1482 1579 1624 1709 1723 GGCCGA/TCGGCC 2 -3 174 165 4 -26.7 81 108 122 132 205 241 250 278 280 326 336 364 408 416 441 485 490 494 508 515 522 553 566 567 575 596 610 618 633 676 696 727 740 761 785 786 811 827 930 936 970 974 984 987 1023 1041 1042 1049 1080 1099 1106 1110 1121 1123 1125 1140 1165 1178 1188 1221 1269 1274 1343 1371 1386 1431 1439 1469 1492 1499 1529 1533 1614 1624 1629 1681 1717 1721 1746 1769 1821 1832 1886 1899 1909 1916 1918 1933 1970 1979 1981 1989 1998 2024 2027 2086 2097 2107 2115 2118 2121 2130 2149 2167 2183 2209 2213 2214 2227 2228 2243 2253 2263 2314 2374 2379 2393 2404 2425 2433 2439 2446 2460 2470 2476 2517 2530 2568 2599 2609 2613 2620 2623 2634 2635 2662 2684 2687 2721 2803 2829 2919 2946 2982 2995 3015 3038 3042 3051 3053 3057 3062 3066 3074 3079 3092 3108 3115 3120 3127 3152 3173 3194 3215 3216 3256 3267 3278 3281 3306 3309 3329 3342 3362 276 455 605 1729 GATGGG/CCCATC 0 -4 161 161 24 -11.6 0 5 43 45 104 108 137 203 217 253 262 276 278 290 295 357 364 405 409 410 413 427 468 485 529 546 571 646 668 683 694 801 806 818 842 877 880 906 922 934 939 942 944 970 978 1003 1005 1014 1039 1069 1157 1162 1246 1277 1278 1288 1296 1298 1332 1362 1393 1395 1418 1426 1452 1463 1482 1490 1491 1492 1494 1506 1556 1562 1563 1581 1622 1662 1667 1672 1675 1684 1696 1714 1725 1729 1752 1766 1774 1789 1796 1808 1817 1825 1831 1862 1888 1913 1933 1952 2010 2082 2085 2115 2116 2139 2176 2191 2235 2236 2242 2382 2403 2451 2469 2529 2538 2571 2593 2605 2637 2638 2656 2660 2665 2682 2733 2738 2744 2745 2747 2784 2810 2811 2866 2871 2873 2876 2883 2908 2942 2966 3026 3030 3032 3065 3071 3073 3104 3120 3127 3156 3157 3165 3195 3212 3269 3292 3346 3358 3374 30 42 96 119 274 313 355 432 549 697 1041 1061 1067 1077 1110 1137 1385 1396 1414 1418 1444 1503 1523 1671 GGGCAA/TTGCCC 0 -1 163 160 15 -16.3 19 33 43 67 86 92 106 139 163 177 197 235 236 254 264 297 354 358 365 398 417 425 432 443 452 463 470 523 555 662 670 674 715 718 734 806 807 832 856 895 908 967 975 989 1038 1046 1054 1058 1060 1069 1074 1097 1152 1158 1162 1183 1304 1327 1339 1346 1358 1368 1387 1409 1442 1445 1451 1504 1556 1569 1574 1586 1598 1642 1662 1689 1716 1741 1774 1782 1787 1818 1819 1827 1867 1907 1917 1924 1977 1984 2080 2082 2094 2100 2176 2184 2192 2216 2224 2284 2285 2290 2296 2315 2326 2385 2426 2446 2527 2576 2603 2614 2629 2636 2637 2642 2652 2657 2678 2686 2696 2745 2749 2752 2754 2756 2790 2817 2856 2858 2871 2876 2881 2900 2912 2925 2937 2954 2965 2975 2986 3000 3027 3049 3055 3080 3094 3096 3111 3142 3213 3225 3226 3233 3235 3272 3289 3292 3305 3321 3334 3335 3370 107 237 256 366 498 533 691 1006 1110 1229 1444 1599 1609 1699 1767 CAAGCC/GGCTTG 3 -6 155 160 16 -15.7 6 39 67 107 134 177 181 229 238 254 278 280 318 325 354 355 368 415 443 465 468 513 542 546 552 606 621 642 686 687 725 729 758 769 780 798 812 813 834 843 850 866 874 885 889 890 899 914 920 939 944 955 959 961 983 1011 1012 1014 1019 1027 1031 1099 1163 1164 1224 1254 1271 1295 1302 1312 1322 1328 1347 1384 1389 1445 1465 1483 1500 1511 1580 1604 1605 1615 1634 1690 1695 1709 1761 1778 1796 1822 1831 1841 1901 1913 1936 1939 1973 1987 2006 2011 2014 2029 2054 2063 2080 2126 2138 2162 2185 2191 2282 2295 2307 2351 2361 2373 2395 2432 2442 2451 2457 2462 2475 2480 2502 2553 2582 2612 2624 2633 2645 2666 2688 2708 2720 2737 2738 2773 2781 2799 2856 2868 2922 2961 2985 3058 3061 3166 3230 3238 3259 3316 3348 98 145 166 233 494 647 711 804 886 895 965 1166 1266 1282 1445 1504 CTTGGG/CCCAAG 0 -4 161 158 21 -12.6 6 10 30 47 76 86 314 325 332 351 379 404 412 417 438 439 483 492 505 547 548 558 590 594 618 623 629 673 706 715 718 723 728 774 780 800 813 850 866 869 931 938 939 944 975 1006 1027 1031 1056 1123 1142 1182 1199 1214 1251 1252 1274 1287 1312 1344 1384 1418 1436 1465 1467 1502 1519 1556 1570 1576 1580 1604 1615 1631 1641 1653 1667 1676 1688 1695 1731 1733 1739 1758 1761 1793 1795 1858 1900 1904 1989 1992 2031 2057 2061 2099 2133 2235 2250 2253 2277 2281 2283 2284 2337 2350 2373 2394 2401 2403 2437 2445 2456 2457 2462 2463 2469 2553 2570 2573 2613 2624 2633 2645 2655 2666 2672 2705 2706 2710 2712 2725 2736 2737 2738 2743 2781 2808 2839 2865 2867 2868 2906 2922 2934 2964 2979 2983 2996 3050 3079 3132 3167 3240 3246 3247 3287 3307 3316 3339 3348 27 37 146 171 172 264 327 375 451 584 647 651 897 1097 1108 1224 1400 1417 1445 1585 1719 GGGCTG/CAGCCC 0 -1 150 152 10 -18.6 4 9 37 55 69 72 74 117 188 197 244 246 263 274 290 328 346 367 370 385 387 407 430 449 456 476 524 527 554 571 573 609 619 621 657 679 682 713 720 732 748 751 753 757 774 826 847 871 880 911 915 964 1065 1087 1100 1106 1107 1120 1128 1144 1175 1202 1210 1220 1237 1243 1247 1293 1318 1365 1399 1400 1401 1413 1455 1476 1483 1487 1601 1611 1619 1663 1686 1751 1830 1833 1865 1872 1881 1887 1901 1934 1971 1984 2004 2023 2040 2054 2062 2089 2095 2113 2168 2175 2202 2212 2271 2304 2335 2360 2385 2394 2421 2435 2492 2542 2573 2587 2590 2601 2645 2659 2683 2781 2821 2824 2834 2838 2883 2916 2922 2948 2978 2984 3007 3047 3065 3100 3149 3156 3164 3170 3202 3211 3217 3231 3258 3284 3300 3369 13 63 96 149 217 417 609 1200 1515 1633 CAGCCC/GGGCTG 3 -5 150 152 10 -18.6 4 9 37 55 69 72 74 117 188 197 244 246 263 274 290 328 346 367 370 385 387 407 430 449 456 476 524 527 554 571 573 609 619 621 657 679 682 713 720 732 748 751 753 757 774 826 847 871 880 911 915 964 1065 1087 1100 1106 1107 1120 1128 1144 1175 1202 1210 1220 1237 1243 1247 1293 1318 1365 1399 1400 1401 1413 1455 1476 1483 1487 1601 1611 1619 1663 1686 1751 1830 1833 1865 1872 1881 1887 1901 1934 1971 1984 2004 2023 2040 2054 2062 2089 2095 2113 2168 2175 2202 2212 2271 2304 2335 2360 2385 2394 2421 2435 2492 2542 2573 2587 2590 2601 2645 2659 2683 2781 2821 2824 2834 2838 2883 2916 2922 2948 2978 2984 3007 3047 3065 3100 3149 3156 3164 3170 3202 3211 3217 3231 3258 3284 3300 3369 13 63 96 149 217 417 609 1200 1515 1633 GGGTCA/TGACCC 0 -1 162 150 14 -15.4 17 76 94 158 166 251 286 321 359 445 455 481 482 499 516 539 564 577 583 595 607 627 634 714 845 846 869 917 958 985 999 1028 1032 1056 1076 1104 1142 1145 1185 1225 1244 1246 1248 1258 1295 1326 1344 1354 1360 1379 1397 1404 1418 1493 1496 1522 1536 1551 1557 1559 1575 1627 1642 1655 1705 1737 1739 1752 1757 1762 1763 1788 1797 1830 1843 1852 1865 1877 1908 1927 1985 1997 2005 2009 2013 2016 2029 2031 2050 2057 2114 2128 2136 2155 2159 2165 2166 2182 2187 2188 2189 2210 2218 2231 2265 2283 2382 2387 2413 2458 2505 2507 2548 2556 2571 2594 2615 2622 2626 2658 2677 2680 2691 2706 2708 2743 2747 2766 2806 2849 2859 2872 2908 2920 2938 2958 2968 2990 2991 2992 3032 3034 3048 3083 3090 3113 3118 3144 3160 3167 3195 3221 3237 3246 3251 3257 3269 3303 3317 3343 3350 3371 43 165 204 482 570 805 875 899 1065 1077 1298 1624 1662 1770 GTGGGT/ACCCAC 0 -3 146 148 18 -12.7 1 17 30 37 94 97 128 151 152 158 203 256 266 288 304 336 361 386 405 426 471 480 509 516 564 566 595 604 626 632 637 663 758 806 839 855 865 892 900 948 973 986 999 1075 1076 1098 1104 1167 1190 1227 1244 1252 1271 1326 1332 1392 1398 1420 1457 1474 1493 1538 1548 1551 1557 1559 1582 1620 1636 1644 1679 1708 1743 1777 1788 1804 1813 1877 1898 1902 1908 1921 1923 1934 1941 1993 2009 2052 2066 2077 2095 2131 2166 2174 2175 2189 2190 2212 2218 2231 2257 2273 2281 2283 2324 2335 2349 2389 2450 2464 2505 2507 2545 2557 2598 2615 2617 2619 2628 2677 2680 2685 2691 2750 2775 2834 2843 2848 2855 2862 2885 2890 2903 2906 2944 2961 2990 3034 3048 3094 3095 3123 3223 3256 3317 3325 12 60 77 165 199 208 343 417 590 812 826 1005 1085 1294 1454 1624 1655 1765 AGCCCT/AGGGCT 3 -4 149 148 11 -17.1 10 15 19 46 65 74 76 102 111 164 202 228 232 239 271 294 328 348 389 433 466 533 552 609 615 625 670 779 782 783 849 859 885 887 896 914 955 964 979 994 1000 1011 1037 1055 1086 1106 1186 1207 1253 1259 1285 1295 1316 1322 1328 1365 1403 1427 1429 1430 1459 1476 1507 1511 1542 1587 1604 1650 1671 1690 1709 1728 1768 1848 1861 1869 1913 1926 1939 1957 1960 1973 1984 1991 2004 2006 2043 2075 2080 2149 2156 2163 2170 2185 2223 2271 2282 2306 2308 2311 2341 2359 2361 2394 2398 2414 2417 2421 2471 2531 2541 2584 2590 2595 2639 2664 2713 2724 2758 2765 2776 2801 2825 2837 2843 2853 2922 2931 2988 3018 3048 3064 3101 3103 3116 3130 3132 3155 3158 3166 3184 3196 3197 3199 3250 3260 3282 3324 3352 22 96 217 321 439 511 522 895 1400 1451 1497 GGGTCT/AGACCC 0 -1 155 147 13 -15.6 97 151 181 212 220 274 325 363 371 378 405 414 434 448 483 501 512 546 553 572 615 626 663 673 698 705 756 761 805 807 808 824 845 860 866 895 906 942 968 1043 1098 1131 1162 1183 1204 1227 1236 1259 1318 1324 1364 1398 1405 1411 1416 1449 1461 1472 1473 1474 1486 1506 1530 1545 1548 1554 1667 1684 1690 1700 1716 1718 1745 1748 1766 1773 1798 1804 1813 1892 1898 1899 1920 1933 1953 1957 1985 1993 2020 2051 2066 2067 2077 2085 2125 2131 2133 2160 2164 2190 2193 2196 2225 2275 2313 2389 2403 2407 2454 2455 2464 2503 2520 2553 2557 2591 2593 2598 2600 2606 2617 2641 2662 2666 2690 2764 2778 2779 2820 2875 2883 2890 2909 2979 2980 3002 3005 3014 3030 3043 3073 3082 3095 3134 3143 3183 3201 3247 3248 3290 3315 3316 3325 3347 3361 14 119 541 801 826 1119 1415 1416 1418 1442 1500 1612 1621 TGGGCG/CGCCCA 0 -2 138 144 7 -19.7 2 63 67 80 109 143 165 177 206 207 217 234 240 311 322 365 382 402 403 410 411 438 443 489 492 510 514 528 587 598 606 612 629 643 699 706 707 726 727 771 863 918 919 923 956 963 991 992 1021 1081 1107 1151 1155 1179 1189 1235 1314 1351 1359 1363 1375 1400 1490 1531 1546 1549 1560 1563 1568 1581 1591 1609 1610 1628 1630 1678 1704 1707 1710 1729 1731 1825 1851 1883 1928 1945 1960 2001 2002 2011 2044 2088 2099 2146 2158 2186 2222 2264 2286 2316 2317 2350 2354 2371 2411 2416 2468 2497 2500 2535 2564 2579 2604 2607 2637 2643 2714 2725 2726 2730 2737 2763 2819 2862 2918 2942 2951 3003 3013 3043 3044 3046 3070 3127 3138 3263 3302 3328 29 30 382 490 647 1018 1427 GGTGGG/CCCACC 0 -4 138 141 17 -12.3 3 9 30 85 97 103 109 140 219 260 269 285 302 322 331 344 382 385 386 402 409 452 509 521 524 560 566 598 604 624 626 637 640 641 662 688 700 720 806 822 834 843 855 861 901 923 973 977 983 999 1065 1075 1083 1107 1133 1167 1210 1264 1318 1326 1439 1450 1493 1540 1551 1582 1635 1636 1647 1696 1706 1754 1788 1840 1851 1877 1887 1898 1921 1934 1960 2009 2045 2095 2113 2146 2171 2175 2189 2190 2234 2247 2250 2255 2281 2293 2331 2335 2360 2401 2421 2469 2474 2507 2544 2628 2652 2673 2676 2685 2691 2698 2726 2739 2767 2787 2789 2887 2896 2906 2968 2998 3022 3027 3032 3034 3046 3058 3072 3094 3123 3200 3231 3235 3263 3265 3325 3374 12 149 256 274 342 417 826 1005 1006 1057 1082 1418 1427 1472 1629 1741 1743 GGCCTT/AAGGCC 0 0 139 140 10 -16.6 12 52 85 115 118 123 131 137 157 161 178 188 195 242 251 263 270 286 292 325 329 409 446 500 522 573 581 593 613 669 678 690 754 826 830 852 869 870 888 940 957 1003 1012 1022 1031 1114 1116 1156 1157 1178 1195 1205 1234 1277 1299 1323 1334 1337 1377 1415 1447 1461 1497 1619 1659 1682 1695 1785 1795 1796 1805 1806 1844 1857 1887 1897 1911 1919 1937 1952 1955 1967 2113 2116 2139 2142 2143 2155 2183 2197 2235 2243 2252 2297 2303 2320 2330 2333 2346 2377 2395 2405 2457 2515 2522 2523 2530 2537 2626 2632 2638 2717 2734 2738 2768 2784 2789 2812 2840 2867 2923 2933 2945 2974 3001 3004 3015 3026 3038 3052 3057 3235 3239 3252 3255 3285 3358 3372 3375 382 465 635 903 942 1094 1365 1452 1729 1789 GGGCCG/CGGCCC 0 -1 141 139 3 -23.2 6 81 108 166 179 205 254 278 280 302 308 310 354 381 409 419 485 553 566 569 596 611 613 676 691 696 727 733 740 785 811 847 867 901 928 960 970 984 1013 1049 1110 1120 1121 1123 1124 1140 1150 1153 1238 1274 1300 1373 1386 1424 1439 1462 1469 1490 1492 1508 1516 1533 1537 1614 1619 1663 1741 1748 1832 1844 1882 1886 1888 1899 1901 1916 1965 1979 1989 2027 2031 2070 2077 2079 2086 2088 2115 2126 2130 2134 2141 2147 2209 2213 2214 2239 2243 2253 2263 2274 2279 2287 2331 2393 2423 2425 2427 2433 2445 2466 2495 2519 2559 2597 2613 2662 2684 2704 2707 2760 2768 2827 2832 2886 2893 2934 2941 2982 2987 2989 3038 3051 3054 3062 3092 3108 3193 3194 3215 3256 3309 382 500 1507 GGGCCG/CGGCCC 2 -4 141 139 3 -23.2 6 81 108 166 179 205 254 278 280 302 308 310 354 381 409 419 485 553 566 569 596 611 613 676 691 696 727 733 740 785 811 847 867 901 928 960 970 984 1013 1049 1110 1120 1121 1123 1124 1140 1150 1153 1238 1274 1300 1373 1386 1424 1439 1462 1469 1490 1492 1508 1516 1533 1537 1614 1619 1663 1741 1748 1832 1844 1882 1886 1888 1899 1901 1916 1965 1979 1989 2027 2031 2070 2077 2079 2086 2088 2115 2126 2130 2134 2141 2147 2209 2213 2214 2239 2243 2253 2263 2274 2279 2287 2331 2393 2423 2425 2427 2433 2445 2466 2495 2519 2559 2597 2613 2662 2684 2704 2707 2760 2768 2827 2832 2886 2893 2934 2941 2982 2987 2989 3038 3051 3054 3062 3092 3108 3193 3194 3215 3256 3309 382 500 1507 AGTGGG/CCCACT 0 -4 137 138 13 -14.2 17 42 57 152 158 165 180 197 203 237 266 282 290 309 426 456 463 471 480 516 534 566 573 583 632 652 654 669 743 769 770 826 832 839 840 863 900 905 933 956 991 1076 1089 1095 1104 1139 1160 1190 1243 1244 1282 1332 1333 1335 1357 1366 1395 1398 1415 1439 1457 1490 1531 1557 1559 1562 1588 1612 1614 1641 1724 1743 1760 1763 1777 1796 1825 1865 1872 1905 1917 1923 1957 1987 2007 2044 2052 2070 2079 2131 2139 2141 2147 2166 2174 2188 2212 2254 2285 2354 2373 2391 2425 2429 2446 2473 2505 2545 2575 2598 2615 2619 2680 2704 2727 2740 2787 2819 2824 2848 2855 2874 2960 2961 2984 2987 3000 3048 3049 3059 3061 3087 3095 3108 3119 3328 3349 12 43 77 162 165 287 343 590 826 1085 1137 1159 1538 GGCCTA/TAGGCC 0 0 133 134 11 -14.9 10 11 71 92 93 107 122 131 156 168 186 219 220 276 298 314 320 342 346 353 371 390 396 456 503 517 523 603 613 622 722 724 725 728 764 800 827 831 850 858 869 884 901 941 943 957 1026 1041 1085 1164 1188 1193 1319 1369 1395 1452 1499 1504 1516 1520 1535 1582 1621 1680 1719 1769 1846 1862 1902 1942 1945 2027 2056 2081 2086 2097 2104 2122 2140 2143 2243 2279 2288 2339 2341 2347 2357 2367 2411 2433 2452 2460 2491 2498 2508 2551 2565 2566 2570 2575 2588 2622 2626 2652 2660 2686 2722 2771 2786 2799 2802 2811 2857 2868 2899 2941 2950 2959 2977 3107 3115 3123 3178 3179 3207 3215 3226 3263 3287 3314 3352 3353 3362 10 38 456 485 564 702 784 903 1269 1664 1789 CCATGC/GCATGG 1 -1 138 133 9 -16.2 5 41 43 116 206 222 235 288 317 338 346 399 430 447 459 467 513 569 576 585 605 619 628 637 712 729 739 777 835 837 844 848 854 889 960 961 972 1028 1083 1095 1100 1145 1153 1160 1161 1200 1219 1223 1246 1275 1297 1353 1357 1383 1390 1433 1485 1513 1529 1646 1656 1658 1734 1742 1760 1764 1842 1868 1885 1914 1919 1920 1929 1932 1936 1939 1973 1982 2014 2042 2046 2060 2079 2104 2110 2195 2225 2228 2233 2256 2276 2288 2296 2355 2425 2446 2452 2507 2512 2540 2543 2589 2628 2668 2766 2772 2785 2822 2889 2898 2925 2943 2962 2970 2972 3007 3012 3028 3055 3058 3074 3102 3106 3114 3172 3183 3184 3189 3190 3224 3236 3241 3264 3323 3338 3360 3366 3368 367 432 782 1285 1296 1400 1481 1667 1785 GCCCGA/TCGGGC 2 -3 138 133 3 -22.1 9 72 145 163 203 219 240 266 290 299 307 385 412 427 449 645 651 676 685 696 721 725 731 762 768 781 785 792 817 821 827 837 850 904 959 1033 1045 1053 1089 1092 1108 1117 1127 1164 1169 1171 1172 1250 1368 1378 1381 1425 1490 1501 1506 1529 1533 1586 1592 1634 1646 1689 1730 1744 1790 1818 1852 1858 1924 1934 1946 2017 2047 2064 2086 2087 2089 2129 2159 2161 2175 2177 2202 2205 2248 2252 2274 2336 2352 2356 2358 2369 2393 2435 2504 2537 2559 2580 2583 2624 2636 2670 2694 2724 2745 2772 2795 2799 2812 2821 2826 2828 2836 2841 2858 2889 2893 2914 2965 2981 2982 2986 3006 3033 3057 3093 3098 3175 3181 3204 3205 3211 3284 3295 3297 3305 3336 3340 63 474 1273 GGACCG/CGGTCC 0 -1 121 125 10 -14.1 8 32 39 60 129 134 135 144 150 179 192 200 219 231 252 299 340 361 381 395 414 427 480 549 569 574 579 584 642 718 729 747 759 792 809 847 886 889 920 961 968 1025 1045 1082 1094 1119 1134 1153 1170 1171 1208 1270 1273 1279 1313 1373 1400 1405 1445 1458 1463 1501 1505 1544 1565 1584 1606 1626 1663 1717 1727 1740 1751 1800 1803 1822 1875 1880 1919 1944 1954 1956 1978 1985 2145 2200 2241 2278 2344 2364 2376 2383 2397 2431 2461 2518 2694 2715 2724 2755 2757 2811 2829 2857 2860 2861 2985 3010 3015 3035 3056 3080 3088 3105 3106 3189 3202 3206 3268 3301 3350 113 126 180 306 385 500 802 1059 1316 1470 CGGGCT/AGCCCG 0 -2 119 124 4 -19.2 9 72 79 81 99 144 145 203 240 258 290 299 385 387 415 440 449 468 499 530 553 621 628 651 657 676 679 696 709 721 725 731 740 756 768 781 785 796 812 821 850 959 971 982 1063 1071 1089 1092 1096 1117 1169 1174 1181 1250 1380 1383 1421 1442 1470 1484 1490 1529 1533 1571 1605 1634 1720 1752 1779 1790 1822 1864 1916 1934 2049 2054 2064 2086 2089 2096 2129 2161 2175 2177 2199 2202 2205 2233 2248 2274 2336 2356 2369 2385 2390 2410 2435 2463 2518 2550 2583 2624 2670 2724 2796 2821 2828 2836 2956 2977 2993 3033 3093 3192 3205 3211 3284 3295 3355 63 183 474 1625 AGCCCG/CGGGCT 2 -4 119 124 4 -19.2 9 72 79 81 99 144 145 203 240 258 290 299 385 387 415 440 449 468 499 530 553 621 628 651 657 676 679 696 709 721 725 731 740 756 768 781 785 796 812 821 850 959 971 982 1063 1071 1089 1092 1096 1117 1169 1174 1181 1250 1380 1383 1421 1442 1470 1484 1490 1529 1533 1571 1605 1634 1720 1752 1779 1790 1822 1864 1916 1934 2049 2054 2064 2086 2089 2096 2129 2161 2175 2177 2199 2202 2205 2233 2248 2274 2336 2356 2369 2385 2390 2410 2435 2463 2518 2550 2583 2624 2670 2724 2796 2821 2828 2836 2956 2977 2993 3033 3093 3192 3205 3211 3284 3295 3355 63 183 474 1625 AGGGCC/GGCCCT 0 -2 130 121 5 -17.6 79 152 179 268 280 330 382 396 442 500 517 566 608 611 622 691 733 743 798 822 831 872 879 901 941 948 950 960 1004 1005 1012 1013 1035 1037 1110 1125 1141 1153 1193 1210 1232 1238 1239 1266 1286 1391 1406 1424 1475 1619 1659 1669 1719 1785 1806 1860 1882 1886 1893 1897 1919 1949 1955 2022 2034 2056 2130 2142 2151 2213 2239 2287 2292 2312 2320 2333 2357 2358 2388 2409 2416 2479 2484 2487 2491 2495 2515 2524 2536 2551 2565 2575 2581 2602 2613 2627 2660 2707 2709 2722 2768 2771 2786 2797 2827 2830 2845 2869 2870 2886 2888 2901 2935 2947 2950 3001 3024 3060 3109 3124 3215 3241 3252 3271 3277 3283 3285 3337 3353 3375 382 500 1377 1452 1687 GGCCCT/AGGGCC 3 -4 130 121 5 -17.6 79 152 179 268 280 330 382 396 442 500 517 566 608 611 622 691 733 743 798 822 831 872 879 901 941 948 950 960 1004 1005 1012 1013 1035 1037 1110 1125 1141 1153 1193 1210 1232 1238 1239 1266 1286 1391 1406 1424 1475 1619 1659 1669 1719 1785 1806 1860 1882 1886 1893 1897 1919 1949 1955 2022 2034 2056 2130 2142 2151 2213 2239 2287 2292 2312 2320 2333 2357 2358 2388 2409 2416 2479 2484 2487 2491 2495 2515 2524 2536 2551 2565 2575 2581 2602 2613 2627 2660 2707 2709 2722 2768 2771 2786 2797 2827 2830 2845 2869 2870 2886 2888 2901 2935 2947 2950 3001 3024 3060 3109 3124 3215 3241 3252 3271 3277 3283 3285 3337 3353 3375 382 500 1377 1452 1687 GGGCTC/GAGCCC 0 -1 116 119 8 -14.7 6 30 31 57 64 120 121 152 185 194 204 239 244 261 266 290 292 314 320 351 360 429 456 468 503 511 512 532 565 581 604 615 651 725 731 743 767 781 783 840 843 1026 1037 1117 1169 1219 1276 1299 1335 1378 1428 1434 1593 1643 1754 1770 1771 1790 1835 1855 1862 1916 1988 2080 2089 2090 2105 2109 2129 2147 2149 2161 2178 2179 2242 2254 2274 2373 2433 2451 2481 2496 2518 2522 2533 2562 2625 2656 2665 2667 2679 2685 2705 2724 2727 2756 2793 2794 2828 2846 2884 2921 2939 2956 2996 3004 3033 3086 3127 3168 3176 3275 3295 3314 3332 3348 181 511 547 592 786 1092 1514 1558 GAGCCC/GGGCTC 3 -5 116 119 8 -14.7 6 30 31 57 64 120 121 152 185 194 204 239 244 261 266 290 292 314 320 351 360 429 456 468 503 511 512 532 565 581 604 615 651 725 731 743 767 781 783 840 843 1026 1037 1117 1169 1219 1276 1299 1335 1378 1428 1434 1593 1643 1754 1770 1771 1790 1835 1855 1862 1916 1988 2080 2089 2090 2105 2109 2129 2147 2149 2161 2178 2179 2242 2254 2274 2373 2433 2451 2481 2496 2518 2522 2533 2562 2625 2656 2665 2667 2679 2685 2705 2724 2727 2756 2793 2794 2828 2846 2884 2921 2939 2956 2996 3004 3033 3086 3127 3168 3176 3275 3295 3314 3332 3348 181 511 547 592 786 1092 1514 1558 GGACCT/AGGTCC 0 -1 124 118 6 -16.2 28 129 133 135 157 169 233 258 301 304 309 344 373 384 506 543 561 604 713 719 737 749 755 763 873 951 957 981 1016 1020 1047 1071 1075 1127 1138 1231 1240 1241 1261 1283 1286 1380 1399 1401 1474 1537 1591 1599 1624 1649 1688 1701 1735 1736 1755 1759 1773 1811 1833 1837 1839 1873 1895 1936 1948 1969 1974 1999 2012 2028 2032 2035 2058 2101 2120 2272 2281 2282 2343 2353 2424 2438 2443 2465 2468 2514 2525 2528 2561 2564 2577 2585 2603 2688 2697 2759 2833 2844 2906 2913 2932 2952 2953 2956 3025 3036 3081 3085 3089 3097 3099 3121 3176 3181 3191 3212 3217 3254 3279 3280 3299 3333 3345 3365 288 505 814 1080 1731 1743 GGCCAT/ATGGCC 0 0 118 114 18 -8.1 118 142 156 160 167 179 183 286 326 381 408 426 466 467 474 478 497 518 557 618 633 680 743 788 800 801 825 876 936 943 1004 1007 1026 1029 1042 1129 1143 1168 1205 1221 1277 1337 1345 1371 1372 1391 1397 1417 1465 1577 1581 1714 1732 1734 1746 1775 1795 1808 1891 1919 1964 1973 1987 2024 2104 2128 2161 2181 2228 2238 2240 2256 2292 2307 2371 2374 2394 2404 2409 2413 2446 2474 2487 2529 2588 2602 2631 2632 2667 2695 2709 2711 2721 2803 2852 2863 2864 2877 2881 2888 2889 2911 2916 2917 2920 3014 3020 3047 3057 3120 3152 3176 3177 3193 3234 3263 3278 3336 351 465 466 636 646 929 961 1035 1160 1192 1208 1234 1274 1377 1462 1542 1643 1789 CCATGG/CCATGG 1 -1 112 113 12 -11.0 58 67 140 177 187 204 208 231 244 254 316 324 347 358 360 365 372 406 422 443 478 486 560 606 625 644 660 783 810 819 840 852 899 932 953 988 1006 1059 1067 1074 1134 1152 1188 1305 1354 1389 1422 1445 1480 1494 1505 1537 1566 1601 1668 1741 1814 1823 1838 1845 1879 1923 1994 1997 2028 2036 2040 2109 2111 2157 2219 2256 2266 2309 2326 2356 2371 2376 2404 2420 2469 2478 2571 2612 2630 2654 2665 2690 2695 2709 2740 2760 2770 2794 2848 2857 2860 2862 2878 2895 2910 2916 2944 2963 2997 3025 3042 3141 3144 3191 3221 3329 245 259 392 416 418 473 865 1206 1234 1246 1478 1760 CCCCAT/ATGGGG 1 -3 108 108 14 -9.1 0 26 30 38 106 117 119 338 344 435 460 472 505 541 560 571 572 590 672 675 714 724 739 755 759 799 835 840 908 913 921 942 966 1001 1002 1017 1061 1074 1083 1188 1189 1272 1285 1303 1344 1404 1407 1424 1426 1477 1526 1529 1530 1556 1703 1741 1772 1817 1842 1863 1885 1888 1910 1913 1923 1982 1997 2060 2063 2211 2238 2329 2365 2400 2475 2560 2567 2589 2594 2612 2653 2684 2733 2745 2748 2760 2779 2785 2822 2898 2967 2997 3025 3027 3028 3063 3078 3098 3112 3128 3171 3172 3195 3221 3275 3293 3324 3374 109 119 482 569 587 992 1039 1061 1414 1425 1628 1638 1671 1675 CCCGAA/TTCGGG 2 -2 107 107 12 -10.1 9 145 159 160 203 240 266 299 307 345 385 412 414 484 544 577 627 685 696 721 756 785 821 827 850 959 985 1013 1045 1046 1053 1089 1108 1155 1164 1169 1172 1216 1250 1359 1364 1368 1381 1405 1412 1425 1467 1490 1514 1529 1586 1591 1592 1688 1704 1718 1730 1744 1818 1852 1861 1879 1924 1945 1946 1985 2047 2064 2089 2096 2097 2245 2274 2288 2356 2358 2369 2377 2435 2450 2504 2549 2559 2583 2611 2620 2624 2686 2694 2702 2724 2772 2825 2826 2834 2858 2889 3006 3033 3041 3052 3145 3175 3204 3205 3284 3340 385 474 688 806 1233 1273 1320 1397 1444 1527 1658 1773 TCTGGG/CCCAGA 0 -4 105 105 14 -8.7 65 101 164 339 371 398 414 458 553 587 634 637 639 650 674 685 696 726 740 751 756 785 790 796 799 802 811 846 865 866 986 998 1049 1054 1087 1097 1135 1206 1254 1258 1300 1314 1329 1341 1351 1403 1417 1447 1470 1476 1477 1549 1554 1574 1622 1643 1680 1787 1824 1832 1857 1899 1928 1988 2026 2030 2081 2083 2086 2100 2128 2151 2274 2277 2295 2315 2316 2328 2356 2412 2413 2444 2457 2497 2509 2586 2662 2667 2699 2720 2724 2897 2932 2936 2968 2975 2993 3005 3047 3070 3147 3153 3300 3315 3347 178 470 494 498 850 966 1017 1158 1348 1415 1442 1493 1564 1612 CGGGCC/GGCCCG 0 -2 100 100 3 -16.1 6 79 93 100 115 166 178 205 209 219 242 390 419 427 502 513 620 645 676 695 696 762 785 792 827 847 867 970 1029 1033 1108 1114 1143 1156 1164 1300 1309 1323 1330 1373 1490 1506 1520 1537 1582 1592 1619 1656 1663 1744 1767 1824 1856 1858 1890 1916 1946 1962 2031 2086 2087 2088 2122 2124 2252 2274 2331 2338 2358 2393 2412 2427 2432 2433 2467 2492 2524 2537 2559 2631 2695 2699 2780 2795 2799 2812 2826 2869 2889 2893 2904 2914 2976 2982 3020 3026 3051 3057 3098 3336 826 1485 1625 GGCCTG/CAGGCC 0 0 98 100 8 -11.6 59 92 166 168 177 182 205 237 241 247 257 298 331 346 365 466 503 508 523 550 601 641 645 654 676 683 696 785 792 796 827 831 872 877 939 953 985 1023 1031 1049 1084 1087 1108 1125 1166 1195 1239 1300 1424 1431 1447 1504 1624 1680 1744 1749 1828 1878 1890 1943 1945 1946 1949 2115 2140 2218 2274 2279 2288 2314 2331 2338 2371 2429 2432 2442 2452 2492 2498 2515 2522 2562 2609 2686 2899 2950 2976 3019 3021 3066 3193 3208 3226 3229 3254 3258 3316 3337 710 948 1094 1208 1365 1426 1485 1575 GGCCCG/CGGGCC 2 -4 100 100 3 -16.1 6 79 93 100 115 166 178 205 209 219 242 390 419 427 502 513 620 645 676 695 696 762 785 792 827 847 867 970 1029 1033 1108 1114 1143 1156 1164 1300 1309 1323 1330 1373 1490 1506 1520 1537 1582 1592 1619 1656 1663 1744 1767 1824 1856 1858 1890 1916 1946 1962 2031 2086 2087 2088 2122 2124 2252 2274 2331 2338 2358 2393 2412 2427 2432 2433 2467 2492 2524 2537 2559 2631 2695 2699 2780 2795 2799 2812 2826 2869 2889 2893 2904 2914 2976 2982 3020 3026 3051 3057 3098 3336 826 1485 1625 CTGGAC/GTCCAG 0 -3 94 99 7 -12.1 16 39 54 95 129 157 247 298 310 340 341 354 395 414 418 431 489 568 574 606 623 658 699 707 735 792 848 856 982 992 1010 1016 1024 1044 1082 1090 1131 1138 1179 1231 1257 1261 1390 1398 1399 1405 1407 1408 1428 1482 1496 1579 1599 1631 1639 1649 1651 1664 1683 1833 1909 1954 1956 1999 2120 2177 2178 2208 2249 2253 2304 2318 2353 2355 2372 2461 2499 2549 2603 2610 2611 2828 2885 2915 3007 3099 3100 3142 3202 3239 3273 3280 3301 3350 51 180 475 547 1059 1216 1695 GCCCTA/TAGGGC 3 -3 101 99 11 -9.5 10 46 53 65 74 79 102 152 202 228 256 268 328 466 564 582 609 625 782 859 885 901 914 941 1004 1011 1012 1013 1035 1037 1106 1110 1152 1193 1207 1253 1259 1286 1365 1391 1427 1507 1587 1650 1669 1671 1672 1709 1728 1768 1806 1860 1893 1949 1957 1960 1984 2004 2006 2075 2142 2149 2156 2170 2213 2271 2287 2292 2306 2312 2471 2487 2495 2531 2541 2581 2627 2642 2675 2700 2707 2758 2776 2830 2837 2843 2870 2888 3018 3024 3048 3060 3116 3124 3130 3193 3254 3271 3277 3337 3375 22 107 217 439 522 547 1029 1377 1451 1599 1738 GCCCTT/AAGGGC 3 -3 102 98 12 -8.8 15 19 33 111 158 228 239 271 294 330 396 442 552 566 608 670 718 779 783 798 807 822 879 882 948 950 955 979 989 1005 1037 1055 1069 1232 1238 1239 1266 1403 1406 1429 1459 1511 1542 1604 1719 1907 1913 1919 1939 2022 2034 2043 2080 2130 2151 2185 2223 2239 2282 2358 2359 2388 2394 2416 2417 2421 2484 2491 2536 2575 2584 2590 2639 2722 2724 2761 2768 2786 2801 2825 2827 2845 2856 2869 2886 2901 2947 2950 2988 3064 3099 3109 3155 3197 3199 3215 3241 3250 3252 3260 3283 3285 96 321 382 511 820 895 933 1444 1452 1651 1687 1699 GCCGAA/TTCGGC 2 -2 95 96 13 -8.0 4 81 139 143 157 227 241 258 280 326 336 485 494 553 596 610 676 696 740 747 785 786 811 827 868 873 984 1041 1042 1049 1099 1110 1121 1125 1140 1165 1239 1269 1274 1386 1431 1469 1492 1509 1529 1533 1550 1668 1674 1681 1717 1805 1826 1844 1861 1886 1909 1979 1981 1989 2024 2027 2076 2086 2107 2115 2167 2169 2183 2209 2214 2243 2253 2263 2374 2460 2462 2476 2517 2530 2599 2600 2623 2662 2721 2946 3038 3057 3079 3108 3194 3256 3267 3281 3342 178 276 430 512 605 607 698 811 954 1112 1291 1718 1729 GGGTCG/CGACCC 0 -1 95 93 7 -11.2 10 43 76 146 160 247 307 321 409 437 457 458 471 488 589 678 703 756 787 905 917 958 1013 1045 1120 1171 1200 1216 1260 1288 1341 1345 1362 1378 1381 1457 1476 1491 1501 1518 1525 1570 1681 1694 1708 1712 1743 1764 1837 1858 1904 1945 2031 2097 2157 2165 2174 2200 2245 2251 2257 2260 2266 2324 2330 2349 2393 2396 2441 2450 2472 2489 2552 2619 2620 2622 2624 2640 2694 2928 2961 2993 3015 3019 3041 3071 3123 3140 3210 3244 3258 3265 3266 3287 3346 431 500 528 1077 1152 1233 1327 CGTGGG/CCCACG 0 -4 84 87 6 -10.9 30 37 71 94 128 136 151 167 288 300 311 336 427 480 509 544 564 566 624 693 844 865 879 919 948 999 1089 1111 1151 1155 1227 1271 1299 1304 1358 1420 1436 1465 1490 1533 1557 1610 1620 1632 1644 1663 1708 1734 1846 1854 1908 1941 1993 2065 2068 2088 2090 2137 2231 2242 2297 2321 2324 2334 2390 2425 2428 2450 2485 2522 2534 2628 2750 2792 2834 2843 2862 2885 2890 2944 2961 3094 3150 3289 208 1136 1427 1438 1547 1624 GGCTGA/TCAGCC 0 0 85 86 13 -6.6 9 26 72 78 117 197 244 360 385 430 434 476 524 527 554 611 621 720 732 744 748 757 809 871 899 911 956 991 994 1065 1087 1100 1144 1145 1175 1202 1237 1239 1400 1401 1448 1487 1562 1601 1650 1733 1751 1767 1904 1934 2040 2089 2095 2103 2113 2152 2202 2271 2335 2360 2385 2421 2492 2501 2542 2573 2586 2590 2645 2683 2709 2821 2824 2857 2883 2916 2948 2978 2984 3065 3099 3137 3156 3164 3231 63 149 392 428 559 609 736 781 793 795 930 1512 1633 TCAGCC/GGCTGA 3 -6 85 86 13 -6.6 9 26 72 78 117 197 244 360 385 430 434 476 524 527 554 611 621 720 732 744 748 757 809 871 899 911 956 991 994 1065 1087 1100 1144 1145 1175 1202 1237 1239 1400 1401 1448 1487 1562 1601 1650 1733 1751 1767 1904 1934 2040 2089 2095 2103 2113 2152 2202 2271 2335 2360 2385 2421 2492 2501 2542 2573 2586 2590 2645 2683 2709 2821 2824 2857 2883 2916 2948 2978 2984 3065 3099 3137 3156 3164 3231 63 149 392 428 559 609 736 781 793 795 930 1512 1633 TGAGCC/GGCTCA 3 -6 83 86 10 -8.1 30 37 72 81 95 122 159 182 194 227 244 257 320 349 351 360 456 476 484 503 508 532 565 581 595 599 651 725 783 803 1002 1058 1061 1116 1132 1169 1299 1341 1428 1552 1629 1638 1793 1794 1903 1988 2080 2089 2105 2112 2122 2129 2147 2162 2254 2321 2373 2376 2377 2432 2434 2471 2533 2562 2567 2646 2665 2705 2707 2791 2794 2884 2939 2967 3086 3088 3149 3168 3173 3176 3216 3234 3332 54 181 268 430 581 840 1290 1451 1558 1697 ACGGGC/GCCCGT 0 -3 81 84 2 -14.4 79 100 115 144 166 178 209 242 258 415 449 468 530 553 620 621 676 696 709 740 756 785 867 970 971 1063 1071 1078 1096 1143 1156 1181 1306 1323 1330 1380 1421 1442 1470 1520 1529 1537 1571 1582 1605 1663 1720 1752 1779 1822 1858 1864 2031 2049 2054 2086 2088 2096 2124 2134 2172 2199 2233 2274 2338 2385 2432 2433 2467 2492 2631 2695 2780 2796 2976 2993 3020 3026 3051 3192 3355 1290 1625 GGGCAG/CTGCCC 0 -1 83 84 3 -13.2 26 67 108 110 176 177 184 222 242 307 365 443 518 534 544 609 639 646 671 679 685 706 733 813 835 1006 1017 1019 1069 1234 1271 1278 1337 1348 1386 1543 1588 1632 1688 1758 1793 1842 1876 1914 1941 1943 2007 2047 2054 2095 2159 2247 2288 2302 2352 2440 2504 2522 2540 2588 2649 2651 2668 2689 2693 2753 2768 2807 2862 2927 2954 2964 2981 2987 3006 3025 3065 3072 3181 3193 3235 3254 3276 192 1290 1762 GCCCGT/ACGGGC 2 -3 81 84 2 -14.4 79 100 115 144 166 178 209 242 258 415 449 468 530 553 620 621 676 696 709 740 756 785 867 970 971 1063 1071 1078 1096 1143 1156 1181 1306 1323 1330 1380 1421 1442 1470 1520 1529 1537 1571 1582 1605 1663 1720 1752 1779 1822 1858 1864 2031 2049 2054 2086 2088 2096 2124 2134 2172 2199 2233 2274 2338 2385 2432 2433 2467 2492 2631 2695 2780 2796 2976 2993 3020 3026 3051 3192 3355 1290 1625 ACTGGG/CCCAGT 0 -4 81 82 6 -10.1 67 74 81 99 177 186 244 254 261 279 284 353 354 356 365 387 406 407 429 443 462 657 660 669 716 735 770 828 988 1014 1105 1215 1225 1261 1305 1351 1386 1445 1492 1496 1580 1605 1741 1782 1832 1903 1904 1942 1953 1964 1977 1983 2013 2084 2125 2128 2141 2148 2184 2205 2214 2411 2428 2430 2647 2665 2718 2791 2806 2851 2982 3075 3080 3158 3179 3217 3237 3255 3321 3326 3369 540 782 1142 1509 1515 1737 GCCCCA/TGGGGC 3 -3 74 74 10 -6.4 0 6 26 30 106 117 180 269 379 383 395 412 572 590 679 728 759 769 835 840 857 1002 1065 1083 1089 1290 1424 1519 1642 1647 1685 1698 1699 1778 1888 1900 1923 2074 2079 2094 2238 2297 2303 2329 2362 2436 2445 2446 2475 2547 2567 2572 2628 2642 2676 2684 2720 2746 2760 2896 2936 2967 3025 3027 3054 3065 3080 3094 3098 3112 3133 3153 3217 3235 37 128 149 274 498 543 569 1092 1200 1575 GGCCTC/GAGGCC 0 0 76 72 10 -6.1 45 74 83 100 170 209 428 466 515 518 531 536 620 668 695 703 879 923 934 957 997 1120 1128 1129 1234 1235 1286 1296 1300 1330 1343 1631 1697 1789 1809 1823 1983 2010 2027 2115 2137 2167 2256 2341 2368 2379 2430 2470 2476 2519 2538 2572 2573 2599 2602 2627 2635 2652 2795 2797 2845 2870 2873 2919 2935 2995 3024 3053 3063 3127 3178 3215 3235 3275 3281 3372 13 99 113 276 351 605 784 961 1192 1507 CTGGGT/ACCCAG 0 -3 71 70 9 -6.4 74 76 99 130 164 166 279 339 458 462 634 685 735 756 846 900 915 1014 1120 1151 1215 1225 1248 1258 1293 1329 1341 1360 1386 1465 1476 1496 1525 1554 1694 1712 1782 1830 1832 1853 1865 1872 1899 1904 1953 1983 2013 2026 2051 2125 2128 2162 2214 2271 2373 2411 2413 2667 2724 2742 2806 2897 2932 2968 2993 3005 3237 3248 3315 3326 3347 42 178 186 1158 1327 1348 1442 1493 1612 GCTGGG/CCCAGC 0 -4 64 70 2 -11.8 37 54 102 133 161 208 290 328 339 342 346 456 503 579 601 621 666 895 900 915 928 1026 1103 1107 1120 1151 1210 1212 1243 1290 1293 1365 1397 1465 1494 1742 1748 1775 1778 1794 1820 1830 1865 1872 1887 1979 1984 2002 2004 2051 2175 2187 2197 2271 2330 2385 2409 2564 2629 2742 2781 2955 3248 3255 1327 1743 TGGCCG/CGGCCA 2 -4 69 69 10 -5.7 132 326 362 364 408 416 441 515 544 567 618 633 761 786 930 931 936 987 1042 1080 1099 1106 1165 1221 1234 1269 1328 1371 1389 1498 1509 1529 1604 1632 1681 1721 1737 1746 1780 1821 1840 1933 1964 1970 1981 1998 2024 2117 2118 2121 2149 2228 2316 2374 2404 2446 2568 2634 2687 2721 2803 2829 3074 3120 3152 3173 3216 3267 3278 352 370 428 455 547 905 906 932 1234 1542 GGGCAC/GTGCCC 0 -1 72 68 4 -9.4 106 168 243 253 328 533 536 572 597 614 637 650 688 901 927 949 1027 1072 1073 1083 1089 1135 1137 1227 1317 1365 1366 1376 1390 1599 1672 1753 1808 1868 1871 1986 2004 2069 2071 2125 2140 2165 2172 2189 2246 2262 2328 2361 2437 2445 2512 2550 2605 2675 2700 2729 2741 2761 2814 2862 2877 2899 2924 2955 3087 3112 3131 3146 3147 3158 3200 3245 274 512 569 1356 GGGCGT/ACGCCC 0 -1 68 68 3 -10.3 67 80 165 172 207 217 311 411 489 514 606 643 699 707 727 771 863 991 992 1021 1045 1107 1155 1171 1179 1193 1359 1458 1490 1501 1531 1546 1549 1560 1591 1630 1649 1678 1704 1707 1710 1852 1945 2002 2088 2186 2350 2468 2500 2535 2564 2580 2604 2607 2643 2694 2726 2737 2761 2763 2819 2862 3043 3070 3127 3138 3263 3297 382 647 1018 GGCTGG/CCAGCC 0 0 67 67 6 -7.7 20 102 157 188 263 274 290 328 456 540 571 573 614 682 847 900 915 964 1103 1107 1120 1210 1220 1243 1247 1251 1290 1293 1318 1365 1399 1455 1476 1483 1598 1600 1619 1686 1799 1830 1833 1865 1872 1881 1887 1984 2004 2056 2087 2113 2175 2271 2304 2353 2673 2781 2834 2884 2916 2922 2955 2984 3007 3100 3202 3258 3265 13 34 180 794 1399 1743 CCAGCC/GGCTGG 3 -6 67 67 6 -7.7 20 102 157 188 263 274 290 328 456 540 571 573 614 682 847 900 915 964 1103 1107 1120 1210 1220 1243 1247 1251 1290 1293 1318 1365 1399 1455 1476 1483 1598 1600 1619 1686 1799 1830 1833 1865 1872 1881 1887 1984 2004 2056 2087 2113 2175 2271 2304 2353 2673 2781 2834 2884 2916 2922 2955 2984 3007 3100 3202 3258 3265 13 34 180 794 1399 1743 GCCCTG/CAGGGC 3 -3 64 66 3 -10.0 76 113 124 164 179 232 280 348 500 517 533 611 622 691 733 743 813 831 856 872 887 896 960 1000 1153 1210 1285 1322 1348 1424 1430 1475 1476 1659 1785 1793 1848 1861 1886 1897 1955 2056 2308 2320 2333 2361 2409 2479 2515 2551 2595 2602 2660 2709 2713 2768 2771 2862 2922 2931 2935 2954 3103 3119 500 533 1095 GCCGAC/GTCGGC 2 -2 60 61 7 -6.2 42 73 132 135 143 241 250 364 508 567 575 618 705 744 761 849 936 974 987 1023 1031 1165 1178 1270 1341 1343 1371 1373 1374 1439 1519 1726 1860 1874 1899 1918 2049 2056 2100 2104 2227 2228 2314 2379 2393 2620 2684 2707 2722 2952 3015 3042 3053 3074 3115 3127 3278 3306 3309 3329 86 150 193 590 809 900 1766 GTCTGG/CCAGAC 0 -5 60 60 8 -5.5 101 220 231 268 339 363 371 382 386 414 421 458 553 562 626 637 661 735 799 811 895 1097 1135 1192 1268 1317 1419 1470 1473 1528 1531 1549 1824 1832 1898 1928 2061 2083 2118 2151 2196 2249 2295 2328 2396 2412 2699 2885 2897 2901 2910 2918 2932 2968 2975 3043 3070 3263 3273 3351 428 494 516 580 994 1415 1612 1743 GGGCCC/GGGCCC 0 -1 57 59 0 -11.5 6 79 140 152 295 330 419 427 480 502 566 608 668 762 822 828 830 840 879 934 1005 1033 1089 1210 1252 1266 1395 1506 1647 1669 1680 1685 1696 1789 1824 1831 1856 1858 1962 2022 2074 2151 2281 2312 2358 2388 2412 2524 2646 2699 2780 2782 2869 2906 2982 3098 3108 -1 GGGCCC/GGGCCC 3 -5 57 59 0 -11.5 6 79 140 152 295 330 419 427 480 502 566 608 668 762 822 828 830 840 879 934 1005 1033 1089 1210 1252 1266 1395 1506 1647 1669 1680 1685 1696 1789 1824 1831 1856 1858 1962 2022 2074 2151 2281 2312 2358 2388 2412 2524 2646 2699 2780 2782 2869 2906 2982 3098 3108 -1 GGCCGT/ACGGCC 2 -3 57 58 1 -11.0 108 205 278 308 336 362 409 419 490 494 508 513 544 601 613 852 867 931 1124 1150 1238 1424 1462 1508 1509 1516 1604 1632 1695 1840 1882 1888 1909 1918 1964 1965 2077 2117 2141 2147 2227 2439 2445 2457 2597 2704 2707 2760 2827 2832 2893 2968 2987 2989 3079 3193 3306 547 AGCCCC/GGGGCT 3 -4 55 57 8 -5.0 4 30 117 126 128 130 172 189 211 379 412 526 527 594 656 713 736 800 857 931 1001 1007 1065 1120 1290 1360 1378 1519 1653 1698 1778 1850 1907 2019 2041 2329 2340 2351 2475 2547 2592 2676 2688 2720 2769 2896 2936 2983 3145 3153 3188 3217 3230 3275 3344 149 327 417 1035 1092 1200 1527 1633 GGGGCC/GGCCCC 0 -2 59 56 1 -10.6 0 6 74 247 692 728 759 769 813 831 840 1085 1089 1424 1465 1647 1661 1685 1699 1715 1732 1748 1817 1856 1888 1896 1899 1900 1923 1983 2074 2079 2181 2238 2297 2303 2318 2323 2362 2436 2445 2567 2572 2684 2760 2782 2877 2945 2967 3019 3027 3054 3063 3091 3098 3133 3177 3235 3275 1575 GCCGAG/CTCGGC 2 -2 57 56 3 -8.3 77 108 122 222 278 441 503 515 522 533 566 633 843 970 1080 1106 1123 1125 1188 1221 1492 1533 1577 1614 1624 1629 1746 1769 1780 1790 1832 2008 2029 2046 2118 2130 2140 2213 2404 2425 2433 2439 2470 2568 2635 2676 2747 2829 2919 2979 2982 2995 3062 3079 3173 3216 3362 486 1268 1611 ACCCCT/AGGGGT 3 -4 55 56 9 -4.4 10 34 64 76 109 117 118 322 412 481 509 520 636 945 1053 1091 1132 1241 1248 1271 1329 1409 1424 1446 1455 1635 1673 1711 1779 1788 1797 1900 1950 1958 1985 2000 2065 2102 2157 2204 2241 2384 2441 2459 2598 2670 2680 2721 2808 2815 2872 3228 3287 3310 3350 241 514 555 574 794 970 1459 1531 1633 GGCCAG/CTGGCC 0 0 49 53 6 -5.5 1 9 54 141 263 268 346 364 382 385 449 562 573 601 652 930 1269 1334 1397 1406 1529 1581 1612 1715 1780 1860 1890 2006 2061 2104 2118 2339 2432 2479 2647 2791 2879 2901 2916 2918 2922 2947 2984 3027 3060 3074 3124 3126 3242 13 38 42 99 330 784 CCCCTT/AAGGGG 3 -3 55 53 8 -4.5 34 40 118 189 211 255 439 509 531 656 677 687 692 736 786 856 1006 1248 1337 1360 1409 1424 1622 1643 1661 1715 1782 1850 1896 1907 1950 1985 2041 2103 2157 2181 2241 2311 2318 2441 2459 2598 2670 2688 2691 2721 2815 3063 3091 3132 3145 3188 3275 3282 3310 183 417 549 711 1035 1459 1529 1701 GGGCGA/TCGCCC 0 -1 48 52 5 -6.0 67 138 143 234 240 269 382 383 402 410 438 510 528 587 598 629 638 726 787 817 919 923 956 1314 1351 1363 1375 1381 1628 1851 1928 2001 2011 2099 2134 2158 2264 2354 2411 2416 2497 2725 2730 2918 3013 3099 3302 3328 29 30 81 354 615 CCCTAC/GTAGGG 3 -2 52 52 8 -4.3 112 147 229 256 266 390 499 564 580 582 586 625 636 1012 1013 1035 1037 1068 1152 1193 1218 1232 1277 1369 1426 1519 1560 1635 1639 1672 1673 1768 1958 1960 2003 2075 2264 2312 2487 2581 2610 2642 2661 2690 3024 3047 3048 3060 3070 3165 3277 3350 346 522 703 924 941 1257 1308 1350 GCCTGG/CCAGGC 0 -5 52 51 7 -4.7 92 166 168 182 247 298 331 346 503 508 523 696 712 785 810 827 985 1084 1103 1108 1424 1450 1504 1513 1623 1680 1744 1890 1945 2029 2112 2140 2162 2218 2274 2279 2286 2288 2314 2331 2432 2452 2686 2899 3021 3080 3194 3208 3226 3311 3356 3362 83 186 1139 1365 1485 1558 1575 CCTGGG/CCCAGG 0 -4 48 50 3 -7.2 76 92 129 130 164 166 168 503 523 533 611 785 827 967 985 1019 1153 1248 1360 1504 1525 1591 1623 1680 1694 1704 1707 1712 1805 1853 1861 1945 2023 2140 2162 2218 2274 2279 2286 2288 2373 2378 2452 2584 2686 2899 3194 3226 42 186 1345 CCCAGG/CCTGGG 1 -2 48 50 3 -7.2 76 92 129 130 164 166 168 503 523 533 611 785 827 967 985 1019 1153 1248 1360 1504 1525 1591 1623 1680 1694 1704 1707 1712 1805 1853 1861 1945 2023 2140 2162 2218 2274 2279 2286 2288 2373 2378 2452 2584 2686 2899 3194 3226 42 186 1345 AGCCGT/ACGGCT 3 -4 46 50 7 -4.6 14 52 95 108 122 174 278 352 484 522 544 546 605 813 833 899 908 1043 1103 1104 1151 1176 1290 1328 1435 1500 1552 1632 1635 1656 1889 2060 2103 2123 2162 2189 2226 2321 2412 2483 2502 2578 2607 2645 2646 2771 233 313 325 532 614 1062 1471 TGCCCG/CGGGCA 2 -4 51 49 3 -7.1 163 242 266 307 412 685 697 729 837 889 901 904 1053 1078 1172 1234 1368 1378 1386 1425 1529 1586 1646 1689 1818 1924 2017 2047 2125 2159 2172 2189 2192 2352 2504 2550 2636 2745 2772 2841 2858 2965 2981 2986 3006 3175 3181 3204 3235 3305 3340 1273 1290 1667 AGGCCG/CGGCCT 2 -4 51 48 6 -4.8 122 177 205 241 346 365 446 508 522 601 796 827 852 1023 1041 1178 1188 1298 1343 1431 1499 1535 1624 1695 1769 2027 2097 2167 2183 2314 2379 2460 2470 2476 2522 2530 2599 2609 2635 2919 2995 3015 3038 3053 3057 3066 3115 3127 3235 3281 3362 113 276 605 1426 1507 1729 GCCCTC/GAGGGC 3 -3 53 46 6 -4.5 236 382 389 433 436 849 964 994 1020 1086 1125 1141 1186 1193 1227 1295 1316 1328 1649 1690 1869 1882 1926 1973 1991 2163 2311 2341 2357 2398 2414 2524 2565 2613 2637 2664 2765 2797 2853 2862 2877 3001 3101 3127 3132 3158 3166 3184 3196 3282 3324 3352 3353 81 691 957 1400 1497 1609