#1660/558 #22.07 # k-mer/r.c. Cluster Offset PosCt wPosCt NegCt HGP_10 TAAACG/CGTTTA 0 -4 919 613 4 -87.0 7 40 66 87 90 112 115 124 131 143 148 160 177 217 230 243 245 264 281 282 286 293 298 300 304 305 306 308 309 318 321 323 324 325 329 331 333 340 341 342 344 345 347 348 349 350 351 352 353 354 355 357 358 360 362 363 364 368 369 375 376 378 379 380 381 383 384 386 388 391 393 398 399 402 403 404 405 408 409 410 412 413 414 415 417 418 420 421 422 424 425 426 428 430 431 434 435 436 439 440 442 445 447 448 450 451 452 454 455 456 457 458 459 460 461 463 464 466 468 469 470 473 474 476 477 478 479 480 481 483 487 488 489 490 491 492 493 494 495 496 498 499 501 502 505 506 509 510 511 512 513 514 515 517 518 519 520 521 522 523 524 526 527 528 531 533 535 536 537 538 539 540 541 542 545 547 548 550 551 552 553 555 556 560 562 563 564 566 567 569 573 574 575 577 578 580 583 584 585 587 588 589 590 591 592 594 595 596 598 599 600 603 604 607 608 609 610 611 612 613 614 615 616 618 619 620 621 623 624 625 626 627 628 629 630 631 634 635 636 637 638 639 641 644 646 647 648 649 650 651 652 653 654 655 656 657 658 659 662 663 665 668 669 670 672 673 674 675 677 678 680 682 683 684 685 686 687 688 690 691 692 693 694 695 696 697 698 701 702 703 705 707 708 709 710 711 713 715 716 717 719 721 723 724 725 726 727 728 729 730 731 732 733 734 735 738 739 740 741 744 746 747 748 749 750 752 753 754 757 760 761 763 764 765 766 768 769 770 771 772 774 775 776 777 778 779 780 781 782 783 784 785 787 788 791 792 793 794 795 796 797 799 800 801 802 803 804 806 808 809 810 812 814 816 818 819 821 822 824 825 826 830 831 834 835 836 837 840 841 842 843 844 845 846 847 848 850 851 852 853 854 855 856 858 859 861 862 863 864 865 866 869 871 872 873 874 876 877 878 879 881 882 883 884 885 886 887 888 889 890 891 892 893 895 896 897 898 899 900 901 902 903 905 906 908 909 910 911 913 915 916 917 919 921 922 924 925 928 929 930 931 932 933 935 936 937 938 939 940 942 943 944 947 948 949 950 951 955 956 960 961 962 965 966 967 968 970 972 973 974 975 976 978 979 980 981 982 983 984 985 986 987 988 989 990 991 994 998 999 1003 1004 1005 1006 1008 1009 1010 1012 1014 1015 1016 1017 1018 1019 1020 1021 1022 1023 1024 1026 1027 1028 1031 1033 1034 1036 1037 1039 1040 1041 1042 1045 1046 1047 1048 1050 1052 1053 1054 1055 1056 1059 1060 1061 1062 1063 1065 1066 1068 1070 1071 1072 1073 1075 1076 1077 1078 1081 1083 1084 1085 1086 1088 1089 1091 1092 1093 1095 1096 1097 1098 1099 1100 1101 1102 1103 1104 1105 1111 1114 1116 1117 1119 1121 1123 1124 1126 1127 1128 1129 1131 1133 1135 1136 1138 1139 1140 1141 1145 1146 1147 1148 1151 1152 1153 1154 1155 1156 1157 1158 1159 1160 1161 1163 1164 1165 1166 1167 1168 1169 1170 1172 1173 1174 1175 1177 1178 1179 1180 1182 1183 1184 1185 1186 1187 1188 1189 1190 1191 1192 1193 1194 1195 1196 1197 1198 1199 1200 1201 1202 1204 1205 1207 1208 1209 1210 1211 1212 1213 1214 1218 1220 1221 1223 1226 1227 1228 1229 1231 1232 1235 1236 1237 1238 1240 1241 1242 1243 1244 1246 1247 1248 1250 1251 1252 1254 1255 1256 1257 1258 1259 1260 1262 1264 1265 1266 1268 1271 1273 1274 1276 1277 1278 1281 1282 1283 1284 1285 1286 1287 1288 1290 1291 1293 1294 1298 1301 1304 1305 1306 1307 1308 1309 1310 1312 1313 1314 1316 1318 1319 1321 1323 1325 1326 1327 1330 1331 1332 1334 1335 1337 1338 1340 1341 1342 1344 1346 1347 1348 1349 1350 1352 1353 1354 1355 1357 1358 1359 1360 1361 1363 1365 1367 1368 1369 1371 1372 1374 1375 1377 1378 1379 1380 1381 1382 1383 1385 1388 1390 1391 1392 1393 1395 1396 1399 1401 1404 1408 1410 1411 1412 1414 1415 1416 1417 1419 1420 1421 1422 1423 1424 1426 1427 1429 1430 1431 1432 1434 1436 1438 1439 1441 1442 1443 1444 1445 1448 1450 1451 1452 1453 1454 1455 1456 1458 1459 1460 1462 1465 1466 1467 1469 1470 1472 1473 1475 1476 1478 1480 1481 1482 1483 1485 1488 1490 1492 1493 1495 1497 1500 1502 1504 1505 1506 1509 1510 1512 1513 1514 1515 1518 1519 1520 1521 1522 1524 1525 1527 1530 1532 1533 1535 1536 1537 1538 1539 1542 1544 1547 1548 1549 1550 1551 1552 1553 1554 1557 1560 1561 1564 1565 1566 1567 1572 1574 1575 1576 1579 1581 1582 1584 1585 1586 1587 1603 1611 1623 1651 1653 1658 221 504 514 548 AAACGA/TCGTTT 0 -3 380 267 22 -16.1 10 22 25 58 69 112 124 131 209 230 243 245 260 282 321 324 329 333 349 350 351 352 353 354 364 368 378 381 391 393 396 399 408 410 412 413 420 422 430 454 458 461 463 464 466 468 473 474 477 480 488 490 491 492 494 496 499 501 511 512 526 529 535 537 538 539 542 545 550 561 562 574 575 577 578 579 580 583 584 585 587 588 589 591 595 598 600 603 608 611 616 619 620 623 631 636 640 644 655 657 662 665 668 670 671 673 675 677 684 687 688 691 692 694 695 696 701 703 707 708 713 715 717 719 725 726 730 732 734 739 746 747 748 749 750 753 754 760 761 764 766 770 772 775 776 777 781 784 785 792 793 795 796 799 801 802 809 814 821 826 832 835 843 846 852 853 859 861 866 869 872 874 876 878 883 885 887 891 892 900 901 902 903 908 911 915 921 922 924 931 932 935 937 940 944 951 952 957 965 966 967 970 971 973 975 976 979 983 984 985 988 1003 1004 1005 1008 1012 1014 1015 1019 1021 1023 1024 1026 1028 1033 1036 1037 1039 1040 1041 1050 1053 1056 1058 1059 1060 1061 1068 1072 1076 1083 1086 1093 1102 1105 1113 1122 1135 1138 1139 1140 1141 1148 1152 1154 1157 1160 1164 1166 1168 1170 1179 1188 1189 1191 1193 1196 1198 1199 1200 1202 1206 1208 1209 1212 1213 1218 1221 1223 1229 1231 1235 1236 1240 1246 1248 1250 1251 1252 1257 1264 1265 1266 1271 1273 1281 1286 1287 1288 1290 1291 1294 1302 1307 1314 1327 1331 1334 1340 1342 1344 1346 1347 1349 1355 1357 1358 1360 1361 1375 1377 1379 1380 1381 1383 1390 1399 1401 1408 1410 1411 1419 1421 1422 1425 1426 1432 1436 1438 1446 1450 1462 1465 1469 1473 1475 1480 1488 1492 1493 1502 1504 1506 1509 1515 1519 1521 1522 1524 1527 1529 1530 1533 1537 1546 1550 1553 1554 1561 1564 1566 1574 1579 1581 1586 1603 1614 1623 1649 1651 11 22 78 79 80 87 131 134 220 221 281 304 320 428 432 436 447 519 526 536 547 548 AACGGC/GCCGTT 1 -2 386 265 3 -32.6 2 7 13 42 61 78 103 215 221 262 273 300 318 326 334 336 343 359 367 372 373 377 383 385 392 395 396 400 401 406 407 411 416 423 427 433 436 437 438 441 444 446 447 448 449 452 453 471 472 475 477 478 479 484 485 486 497 500 504 507 508 514 524 525 529 530 534 543 544 546 549 554 557 558 559 561 565 568 570 571 576 577 579 581 582 586 592 593 597 598 602 606 608 612 614 622 632 633 640 642 646 654 659 660 661 663 664 666 671 676 679 681 689 699 700 712 714 718 722 736 742 743 745 751 755 756 758 759 762 767 786 789 790 805 807 811 813 815 817 820 823 824 827 828 829 832 833 836 838 839 844 857 860 867 868 870 875 880 882 888 894 904 907 912 914 918 920 923 926 927 934 941 945 946 952 953 954 957 959 963 964 969 971 977 992 993 995 996 997 1000 1001 1002 1007 1011 1013 1025 1029 1030 1032 1035 1038 1043 1044 1048 1049 1051 1057 1058 1062 1064 1067 1069 1074 1079 1080 1082 1087 1090 1094 1106 1107 1108 1109 1110 1112 1113 1115 1118 1120 1122 1125 1130 1132 1134 1137 1142 1143 1144 1149 1150 1162 1171 1173 1176 1181 1184 1203 1206 1216 1217 1219 1222 1224 1225 1227 1230 1233 1234 1239 1244 1245 1249 1253 1259 1261 1263 1267 1269 1270 1272 1275 1279 1280 1289 1292 1295 1296 1297 1299 1300 1302 1303 1311 1315 1317 1320 1322 1324 1328 1329 1333 1336 1339 1343 1345 1351 1353 1354 1356 1362 1364 1366 1370 1371 1373 1376 1384 1386 1387 1389 1391 1394 1397 1400 1402 1403 1407 1409 1412 1413 1418 1424 1425 1428 1433 1435 1440 1446 1447 1457 1461 1463 1464 1468 1471 1474 1477 1479 1486 1487 1489 1491 1494 1496 1498 1499 1501 1503 1507 1508 1511 1516 1517 1523 1526 1528 1529 1531 1534 1540 1541 1543 1545 1546 1555 1556 1558 1559 1562 1563 1568 1569 1570 1571 1573 1577 1578 1580 1582 1583 1588 1589 1590 1609 1652 1659 118 133 504 AAACGG/CCGTTT 0 -3 300 221 6 -22.8 7 13 42 61 73 115 143 151 154 177 188 210 217 221 249 250 293 300 308 315 318 348 358 359 362 364 369 372 375 376 384 385 388 392 398 400 401 402 406 407 417 423 426 431 434 435 436 437 438 447 448 452 453 472 477 478 479 489 500 504 505 506 513 514 518 521 524 525 529 534 540 543 544 546 547 549 552 567 568 569 570 572 576 581 584 590 592 593 594 598 604 606 608 609 612 614 615 622 637 646 648 654 656 658 659 663 664 669 679 680 682 705 710 712 718 721 723 728 736 740 741 744 745 751 755 756 758 759 765 768 794 802 804 808 824 827 832 833 836 841 855 857 859 870 872 873 875 880 882 884 886 888 913 917 920 922 926 934 938 941 947 957 964 969 972 974 977 979 989 990 992 996 998 999 1013 1016 1020 1029 1038 1045 1047 1048 1049 1057 1058 1062 1063 1064 1071 1078 1079 1082 1083 1094 1098 1100 1106 1107 1110 1114 1116 1126 1131 1138 1146 1147 1149 1151 1162 1163 1165 1167 1168 1171 1173 1180 1184 1186 1192 1194 1197 1213 1219 1220 1227 1230 1233 1244 1256 1259 1267 1268 1271 1275 1279 1280 1285 1295 1316 1318 1320 1322 1323 1350 1353 1354 1360 1362 1363 1367 1368 1370 1371 1385 1386 1391 1393 1394 1395 1397 1400 1404 1409 1412 1413 1416 1418 1423 1424 1425 1441 1443 1450 1457 1463 1466 1470 1477 1478 1479 1491 1495 1497 1498 1501 1516 1518 1520 1528 1545 1556 1565 1567 1571 1582 1583 1590 1609 1653 1658 5 7 130 252 331 504 AAACGG/CCGTTT 1 -3 300 221 6 -22.8 7 13 42 61 73 115 143 151 154 177 188 210 217 221 249 250 293 300 308 315 318 348 358 359 362 364 369 372 375 376 384 385 388 392 398 400 401 402 406 407 417 423 426 431 434 435 436 437 438 447 448 452 453 472 477 478 479 489 500 504 505 506 513 514 518 521 524 525 529 534 540 543 544 546 547 549 552 567 568 569 570 572 576 581 584 590 592 593 594 598 604 606 608 609 612 614 615 622 637 646 648 654 656 658 659 663 664 669 679 680 682 705 710 712 718 721 723 728 736 740 741 744 745 751 755 756 758 759 765 768 794 802 804 808 824 827 832 833 836 841 855 857 859 870 872 873 875 880 882 884 886 888 913 917 920 922 926 934 938 941 947 957 964 969 972 974 977 979 989 990 992 996 998 999 1013 1016 1020 1029 1038 1045 1047 1048 1049 1057 1058 1062 1063 1064 1071 1078 1079 1082 1083 1094 1098 1100 1106 1107 1110 1114 1116 1126 1131 1138 1146 1147 1149 1151 1162 1163 1165 1167 1168 1171 1173 1180 1184 1186 1192 1194 1197 1213 1219 1220 1227 1230 1233 1244 1256 1259 1267 1268 1271 1275 1279 1280 1285 1295 1316 1318 1320 1322 1323 1350 1353 1354 1360 1362 1363 1367 1368 1370 1371 1385 1386 1391 1393 1394 1395 1397 1400 1404 1409 1412 1413 1416 1418 1423 1424 1425 1441 1443 1450 1457 1463 1466 1470 1477 1478 1479 1491 1495 1497 1498 1501 1516 1518 1520 1528 1545 1556 1565 1567 1571 1582 1583 1590 1609 1653 1658 5 7 130 252 331 504 AAACGT/ACGTTT 0 -3 309 203 11 -16.0 39 90 123 160 186 195 233 240 247 298 304 306 308 309 321 323 340 347 363 380 383 386 389 404 405 409 410 415 418 421 424 428 445 447 450 451 454 455 456 457 459 468 469 470 477 479 481 482 487 492 495 498 502 509 511 517 519 520 523 528 531 533 536 537 547 553 554 555 557 560 563 566 573 596 599 607 613 618 624 625 628 629 630 632 634 635 638 639 649 650 651 652 665 674 678 684 686 693 696 702 711 713 716 719 724 733 735 738 744 757 763 769 770 779 780 788 791 797 800 803 806 816 819 821 830 834 840 842 845 847 850 851 852 853 856 863 865 877 886 890 895 896 899 905 906 909 913 916 917 927 928 929 930 932 933 936 939 940 943 949 956 960 961 968 970 972 978 982 987 994 1009 1017 1019 1027 1031 1034 1046 1049 1054 1065 1066 1070 1073 1077 1081 1085 1088 1089 1096 1099 1101 1102 1104 1111 1117 1123 1127 1128 1129 1133 1141 1153 1155 1156 1159 1161 1172 1174 1177 1178 1185 1187 1192 1195 1199 1204 1226 1228 1237 1241 1243 1247 1254 1255 1257 1260 1262 1276 1278 1282 1283 1284 1294 1298 1304 1305 1306 1308 1310 1312 1313 1319 1321 1325 1326 1330 1335 1338 1341 1348 1359 1365 1372 1374 1378 1381 1382 1388 1392 1396 1408 1414 1417 1420 1427 1429 1430 1431 1438 1439 1442 1445 1451 1452 1453 1455 1458 1459 1460 1467 1469 1476 1478 1480 1481 1485 1490 1496 1505 1510 1514 1532 1535 1536 1537 1538 1540 1542 1544 1547 1548 1549 1551 1560 1572 1573 1585 1587 1611 78 95 226 228 300 433 437 511 513 514 524 AAACGC/GCGTTT 0 -3 203 145 8 -11.5 40 66 69 87 132 148 164 217 251 261 264 281 282 283 286 305 325 330 331 341 342 344 345 355 357 360 379 403 414 422 425 439 440 442 454 460 476 483 490 493 510 513 514 515 522 527 541 545 548 551 556 564 600 608 610 621 626 627 628 641 647 653 656 659 672 682 683 685 690 697 698 701 709 727 729 731 742 752 771 774 778 780 782 783 787 789 810 812 818 819 822 825 831 837 844 848 853 854 858 862 864 871 879 881 889 893 897 898 910 919 925 933 942 948 950 955 962 980 981 982 986 991 1006 1010 1018 1022 1042 1052 1055 1075 1084 1091 1092 1095 1097 1103 1119 1121 1124 1136 1145 1158 1166 1169 1175 1182 1183 1190 1201 1205 1207 1210 1211 1214 1232 1238 1242 1258 1265 1274 1276 1277 1286 1293 1301 1309 1332 1337 1352 1356 1369 1415 1434 1443 1444 1448 1452 1454 1456 1472 1480 1482 1483 1497 1498 1500 1512 1513 1525 1530 1539 1541 1543 1546 1552 1557 1561 1569 1575 1576 1581 1584 1657 89 177 257 294 340 372 438 503 ACGGCT/AGCCGT 1 -1 146 96 3 -10.0 61 128 171 262 300 326 336 383 395 401 406 423 433 444 446 448 475 485 497 514 524 525 530 534 546 553 557 561 565 586 592 597 602 622 633 642 661 689 722 736 742 758 759 786 789 807 813 817 820 823 828 833 838 860 870 888 902 914 918 920 923 926 945 946 952 954 969 981 993 996 997 1000 1001 1011 1025 1032 1035 1040 1043 1051 1058 1064 1067 1074 1082 1087 1106 1108 1113 1115 1122 1137 1144 1150 1173 1176 1206 1216 1219 1222 1230 1234 1239 1245 1251 1261 1272 1279 1280 1292 1300 1311 1324 1329 1333 1345 1351 1364 1366 1389 1394 1402 1403 1413 1428 1435 1447 1457 1486 1487 1489 1496 1501 1507 1508 1511 1517 1523 1526 1540 1568 1571 1577 1609 1651 1652 133 504 533 AACGAT/ATCGTT 0 -2 128 94 8 -6.0 10 45 58 69 101 108 131 146 243 321 393 396 399 422 490 499 538 577 584 585 588 595 598 611 644 662 676 677 686 688 694 701 707 717 726 730 739 747 748 749 753 760 761 769 775 776 781 813 866 869 885 891 892 903 911 915 918 921 922 931 934 951 957 975 979 983 984 993 1040 1046 1053 1056 1058 1068 1072 1093 1094 1105 1164 1168 1184 1191 1196 1198 1208 1209 1212 1213 1235 1246 1250 1252 1263 1265 1266 1271 1273 1290 1302 1331 1334 1344 1346 1347 1358 1390 1401 1410 1411 1419 1426 1450 1469 1475 1480 1488 1504 1515 1527 1529 1534 1537 1550 1553 1554 1564 1603 1649 11 87 134 148 432 506 536 547 AACGTA/TACGTT 0 -2 119 90 5 -7.5 160 179 186 195 213 233 240 247 298 306 308 323 340 347 355 363 380 389 404 405 409 418 421 445 459 482 487 543 607 613 624 629 632 634 639 651 652 674 686 693 702 713 716 724 733 735 763 780 800 819 821 830 834 845 856 876 881 886 895 896 928 939 956 960 961 968 977 978 989 1009 1039 1046 1054 1066 1073 1088 1089 1101 1102 1110 1127 1129 1141 1170 1177 1185 1187 1228 1247 1254 1260 1262 1282 1283 1308 1325 1332 1335 1367 1378 1392 1427 1431 1433 1451 1452 1453 1458 1459 1467 1510 1526 1536 1538 1542 1549 1560 1603 1611 78 354 359 407 511 CAACGG/CCGTTG 1 -3 122 90 4 -8.3 78 95 137 153 196 205 208 215 235 262 298 301 334 373 377 383 396 411 418 419 431 433 444 446 449 475 485 497 504 507 530 558 561 569 571 577 582 586 597 602 632 633 642 676 690 703 742 743 762 767 777 789 790 824 868 907 918 923 938 946 952 966 997 1000 1002 1007 1030 1035 1087 1112 1113 1119 1122 1132 1137 1144 1150 1176 1222 1224 1225 1234 1239 1245 1253 1263 1269 1272 1280 1296 1297 1303 1324 1333 1336 1339 1343 1345 1376 1387 1389 1402 1407 1435 1447 1450 1464 1471 1474 1494 1496 1507 1512 1517 1529 1562 1570 1573 1588 1607 1652 1659 71 133 236 533 ACGGCA/TGCCGT 1 -1 115 87 4 -8.0 2 78 103 215 273 318 343 372 392 396 407 416 427 430 438 446 449 452 453 472 484 543 544 549 554 558 568 577 579 598 608 612 631 632 663 664 676 679 681 699 714 745 751 762 805 827 829 836 857 867 868 873 880 904 912 927 941 953 954 957 963 977 1002 1007 1020 1029 1030 1044 1057 1090 1107 1109 1112 1118 1132 1134 1142 1162 1181 1184 1203 1224 1227 1244 1253 1259 1267 1280 1289 1296 1315 1317 1322 1336 1353 1354 1362 1373 1384 1400 1407 1409 1412 1440 1463 1468 1474 1477 1498 1562 1563 1570 1578 1580 1589 32 210 379 548 TAACGG/CCGTTA 0 -3 120 76 6 -5.3 20 103 117 231 273 275 326 336 343 367 408 416 427 441 449 471 484 486 508 511 557 559 565 579 581 582 602 606 624 631 632 660 666 689 699 700 714 745 786 807 811 815 820 838 859 868 880 894 927 945 959 971 993 995 1001 1011 1025 1032 1043 1044 1051 1057 1067 1069 1074 1090 1109 1115 1118 1120 1130 1142 1149 1203 1206 1216 1218 1249 1261 1279 1286 1292 1295 1299 1302 1315 1317 1328 1329 1366 1373 1384 1389 1403 1407 1428 1461 1468 1471 1486 1487 1489 1490 1503 1508 1511 1523 1526 1531 1534 1540 1541 1556 1558 1563 1568 1569 1580 1588 1589 118 136 225 303 325 346 TAACGG/CCGTTA 1 -3 120 76 6 -5.3 20 103 117 231 273 275 326 336 343 367 408 416 427 441 449 471 484 486 508 511 557 559 565 579 581 582 602 606 624 631 632 660 666 689 699 700 714 745 786 807 811 815 820 838 859 868 880 894 927 945 959 971 993 995 1001 1011 1025 1032 1043 1044 1051 1057 1067 1069 1074 1090 1109 1115 1118 1120 1130 1142 1149 1203 1206 1216 1218 1249 1261 1279 1286 1292 1295 1299 1302 1315 1317 1328 1329 1366 1373 1384 1389 1403 1407 1428 1461 1468 1471 1486 1487 1489 1490 1503 1508 1511 1523 1526 1531 1534 1540 1541 1556 1558 1563 1568 1569 1580 1588 1589 118 136 225 303 325 346 AACGGA/TCCGTT 0 -2 99 73 5 -5.6 20 73 95 115 117 143 153 154 205 217 250 275 364 369 388 398 417 426 441 449 506 513 521 540 572 584 590 609 623 624 631 658 680 705 710 721 728 744 777 794 804 811 824 841 855 859 872 873 884 913 917 922 938 947 972 979 989 993 999 1016 1047 1057 1069 1071 1098 1116 1126 1130 1147 1149 1163 1165 1167 1168 1180 1194 1253 1268 1271 1280 1295 1318 1350 1368 1385 1393 1404 1416 1450 1466 1478 1490 1495 1507 1520 1558 1567 1569 1591 71 325 331 346 533 AACGAG/CTCGTT 0 -2 83 72 8 -3.8 9 20 22 23 46 170 324 329 353 378 412 420 466 473 491 492 511 539 542 550 567 587 588 603 644 656 665 668 691 703 746 748 750 764 772 777 796 809 811 871 872 901 924 940 944 948 952 965 967 985 1000 1004 1021 1041 1050 1076 1086 1113 1121 1122 1135 1154 1214 1218 1236 1264 1287 1288 1314 1327 1383 1399 1408 1422 1432 1455 1473 1477 1519 1521 1533 1614 1623 12 31 139 237 307 346 429 548 AACGAC/GTCGTT 0 -2 93 68 6 -4.5 25 124 131 170 182 226 230 269 282 333 368 430 437 454 461 464 468 474 477 491 492 501 512 529 535 537 545 548 561 578 579 592 600 608 616 620 628 631 636 640 669 671 673 680 687 696 770 775 784 814 853 859 908 932 964 965 966 973 984 988 1005 1008 1014 1019 1024 1039 1040 1083 1138 1148 1152 1179 1189 1193 1200 1202 1206 1223 1240 1257 1260 1281 1349 1357 1425 1438 1509 1530 1543 1546 1566 1574 1586 22 42 205 332 513 519 AACGGT/ACCGTT 0 -2 90 66 6 -4.3 61 103 137 177 181 196 210 231 235 249 298 308 348 358 368 375 376 384 402 408 418 419 431 434 441 461 484 511 547 567 582 594 604 606 615 648 656 669 682 690 700 703 723 744 745 765 768 802 808 868 880 882 966 974 990 998 1020 1045 1063 1078 1080 1083 1100 1114 1119 1138 1173 1192 1197 1213 1220 1256 1285 1295 1360 1367 1389 1403 1407 1423 1435 1441 1450 1470 1471 1512 1518 1565 1658 1659 7 90 130 225 236 252 ACGTAA/TTACGT 0 -1 76 64 7 -3.6 186 195 204 233 240 247 298 299 306 308 323 347 380 389 404 409 423 471 472 482 487 513 543 605 613 624 629 632 634 636 639 713 724 733 789 819 826 834 845 871 893 895 931 939 961 968 989 1054 1065 1073 1089 1104 1110 1141 1260 1262 1265 1282 1288 1297 1335 1367 1392 1399 1411 1427 1467 1510 1517 1526 1549 1566 1569 1611 1617 1621 78 107 336 354 461 511 521 ACGGCG/CGCCGT 1 -1 98 64 6 -4.1 7 42 273 282 334 357 377 385 400 411 436 437 441 447 477 507 529 548 559 570 571 576 593 600 606 608 614 640 659 671 700 712 743 755 767 824 832 844 875 894 908 934 959 964 995 1013 1023 1038 1048 1049 1080 1110 1130 1143 1171 1217 1225 1233 1249 1279 1295 1297 1302 1303 1320 1343 1356 1376 1391 1397 1400 1418 1424 1425 1461 1464 1471 1479 1496 1499 1516 1528 1529 1531 1541 1543 1545 1555 1556 1558 1559 1569 1575 1577 1582 1583 1590 1659 118 133 265 309 466 535 TTAACG/CGTTAA 0 -4 76 52 4 -4.0 20 103 108 231 298 343 344 420 424 449 454 471 491 495 511 519 520 531 557 565 579 581 602 650 660 700 710 714 745 786 791 846 859 890 894 899 909 913 927 959 971 993 1023 1057 1069 1109 1126 1129 1130 1156 1206 1214 1218 1222 1282 1286 1292 1302 1304 1310 1315 1317 1354 1373 1403 1469 1471 1486 1489 1490 1526 1534 1540 1558 1563 1589 16 136 226 412 TTAACG/CGTTAA 1 -4 76 52 4 -4.0 20 103 108 231 298 343 344 420 424 449 454 471 491 495 511 519 520 531 557 565 579 581 602 650 660 700 710 714 745 786 791 846 859 890 894 899 909 913 927 959 971 993 1023 1057 1069 1109 1126 1129 1130 1156 1206 1214 1218 1222 1282 1286 1292 1302 1304 1310 1315 1317 1354 1373 1403 1469 1471 1486 1489 1490 1526 1534 1540 1558 1563 1589 16 136 226 412 GAACGG/CCGTTC 1 -3 69 48 2 -5.1 2 17 181 234 368 395 446 461 538 554 586 623 626 631 640 661 671 681 722 805 811 813 817 823 828 829 839 844 860 867 904 912 914 952 953 954 963 1080 1108 1125 1134 1143 1180 1181 1217 1270 1280 1289 1300 1311 1351 1356 1364 1433 1435 1440 1446 1499 1507 1541 1543 1546 1555 1559 1569 1577 1578 1591 1659 90 149 ACGACG/CGTCGT 0 -1 57 42 3 -3.6 18 91 131 230 282 333 377 417 430 436 437 464 472 474 477 501 528 548 576 594 600 619 631 640 671 673 680 696 720 737 784 801 805 859 908 932 964 988 1008 1024 1040 1048 1083 1126 1144 1171 1179 1189 1193 1204 1206 1260 1425 1433 1438 1543 1586 210 413 513 AACGCC/GGCGTT 0 -2 59 39 0 -5.3 40 161 246 264 282 357 369 440 441 513 527 548 594 600 608 610 628 641 659 700 701 709 742 778 782 787 854 871 913 950 982 986 1052 1119 1124 1130 1205 1232 1238 1286 1291 1295 1302 1303 1369 1384 1391 1464 1471 1497 1513 1529 1539 1541 1543 1546 1558 1571 1575 -1 ACGGCC/GGCCGT 1 -1 62 39 0 -5.3 13 221 359 367 373 471 478 479 486 500 504 508 567 581 582 602 646 654 660 666 718 756 790 811 815 839 882 907 971 992 1062 1069 1079 1094 1120 1125 1149 1171 1263 1269 1270 1275 1295 1299 1328 1339 1370 1371 1386 1387 1433 1442 1446 1491 1494 1499 1503 1534 1546 1573 1581 1588 -1 CGGCTC/GAGCCG 1 0 42 37 2 -3.8 23 128 336 401 423 433 475 485 530 534 565 602 622 724 789 817 833 850 888 954 996 997 1074 1106 1122 1144 1176 1219 1272 1280 1351 1387 1486 1487 1496 1501 1538 1540 1609 1628 1652 1657 400 450 ACGGAG/CTCCGT 0 -1 43 35 2 -3.6 25 33 53 62 97 143 153 319 426 449 453 572 590 623 631 668 744 804 873 894 999 1016 1071 1083 1113 1116 1147 1149 1163 1165 1253 1368 1416 1450 1478 1519 1526 1531 1557 1558 1567 1575 1659 419 529 ACGCCG/CGGCGT 0 -1 44 25 1 -3.3 282 436 437 440 441 477 527 529 548 576 600 608 640 659 671 700 712 742 743 964 1048 1052 1130 1225 1289 1295 1302 1303 1369 1391 1400 1425 1464 1471 1496 1529 1541 1543 1546 1556 1558 1575 1582 1590 112 CGGCAT/ATGCCG 1 0 32 25 0 -3.5 103 372 392 407 453 504 549 577 598 681 708 714 829 857 868 873 904 1044 1057 1068 1090 1118 1162 1184 1308 1322 1364 1412 1477 1578 1589 1620 -1 CGGCGT/ACGCCG 1 0 44 25 1 -3.3 282 436 437 440 441 477 527 529 548 576 600 608 640 659 671 700 712 742 743 964 1048 1052 1130 1225 1289 1295 1302 1303 1369 1391 1400 1425 1464 1471 1496 1529 1541 1543 1546 1556 1558 1575 1582 1590 112