#1174/502 #8.19 # k-mer/r.c. Cluster Offset PosCt wPosCt NegCt HGP_10 CCCTTC/GAAGGG 0 -2 460 336 2 -57.5 36 39 50 58 91 119 168 188 193 202 210 216 222 225 226 228 241 243 246 248 250 254 265 268 274 275 278 283 285 287 296 297 299 301 305 306 309 310 311 314 315 316 320 322 325 332 333 336 339 345 347 349 350 352 354 358 360 361 362 365 366 367 368 370 372 373 374 376 377 380 382 384 385 386 388 390 391 394 396 397 404 405 407 409 411 413 414 415 416 418 419 420 421 422 425 426 428 429 431 432 435 436 437 438 439 441 442 443 444 445 448 451 455 458 459 460 464 465 466 467 468 469 471 473 478 479 482 485 486 498 504 505 510 515 517 519 520 522 525 526 530 533 534 539 541 546 548 549 551 553 554 556 557 560 562 563 566 567 568 570 572 573 574 575 576 577 578 580 581 584 585 586 587 588 591 592 593 594 595 597 598 599 601 603 606 609 612 614 617 619 624 625 626 627 628 630 631 632 633 634 635 639 640 646 647 648 649 650 651 652 653 654 657 658 659 660 661 664 665 666 667 668 671 673 675 676 677 678 686 687 689 693 694 698 699 700 704 705 708 709 710 711 715 716 717 718 719 721 723 730 732 734 735 737 742 747 748 750 751 754 756 758 760 761 762 763 765 767 771 772 773 774 776 777 778 779 780 784 785 786 790 794 795 798 799 800 802 804 806 808 810 812 813 814 815 817 819 821 822 825 827 828 829 832 833 834 835 836 837 838 839 841 843 845 846 848 849 850 851 852 854 855 857 858 860 862 863 864 865 866 867 868 870 872 873 874 876 877 880 886 890 892 893 895 897 900 901 902 904 905 906 912 914 916 917 922 923 925 927 929 930 931 932 935 936 937 938 940 942 945 946 950 954 955 957 959 960 964 965 966 969 970 972 973 974 976 977 980 981 983 985 986 987 988 990 991 993 994 999 1003 1005 1007 1008 1009 1010 1015 1016 1018 1019 1020 1021 1027 1028 1031 1033 1038 1039 1040 1042 1043 1044 1045 1047 1049 1050 1051 1052 1056 1058 1059 1061 1065 1066 1067 1069 1071 1073 1081 1083 1086 1088 1099 1100 1102 1104 1106 1107 1108 1109 1112 1115 1122 1127 1134 1150 1159 1165 1167 1168 1173 131 158 CCTTCT/AGAAGG 0 -1 239 195 18 -15.9 6 9 13 18 39 58 61 68 89 110 115 134 153 155 166 168 172 191 193 202 212 241 246 248 256 268 274 286 301 305 306 310 314 325 332 333 344 347 354 358 360 361 365 366 376 377 380 388 407 410 413 416 419 420 425 426 432 435 436 437 438 441 444 448 455 459 460 464 465 471 478 485 486 504 510 515 519 520 525 526 530 533 539 541 549 554 563 567 569 570 574 575 577 578 580 584 585 606 609 614 617 619 624 625 627 628 630 631 633 635 639 640 649 650 659 660 661 666 668 669 671 675 677 678 689 693 698 699 700 705 708 709 710 716 735 737 742 744 747 750 751 755 758 761 762 765 767 770 771 772 774 776 777 778 784 785 786 798 799 804 808 810 812 813 814 815 817 819 821 827 836 837 838 841 854 862 865 867 868 873 874 886 892 902 903 904 905 906 912 916 925 927 929 930 934 936 938 940 959 960 965 970 971 972 976 981 983 986 990 994 1007 1018 1020 1033 1034 1038 1040 1050 1051 1053 1058 1059 1065 1071 1073 1086 1088 1099 1100 1102 1104 1106 1112 1127 1134 1159 1167 1169 1173 32 40 55 89 138 141 158 208 266 270 280 332 335 343 378 383 420 452 CCGTTC/GAACGG 0 -2 255 169 1 -28.0 15 20 39 90 116 170 199 209 219 234 240 269 271 279 282 289 292 294 304 308 313 317 321 323 327 328 330 337 342 343 355 356 359 363 364 371 378 379 383 392 393 398 400 402 409 412 424 427 433 447 452 454 456 461 462 470 472 475 480 481 488 491 493 494 495 496 499 501 506 508 509 511 512 513 514 521 527 528 532 536 538 542 543 544 545 548 550 564 569 571 582 590 596 602 604 607 608 610 611 613 615 618 620 621 622 623 629 641 642 643 644 645 655 662 663 670 672 680 682 684 685 690 691 692 695 696 697 703 707 712 713 714 720 724 725 728 729 736 741 743 744 752 753 755 759 768 769 770 781 783 787 789 793 796 797 803 805 807 809 816 818 826 831 840 842 844 847 853 859 861 875 878 879 881 887 888 889 891 896 898 899 902 907 908 909 910 911 915 918 920 921 928 933 934 937 939 944 949 951 952 953 956 961 962 967 968 978 979 982 984 996 1000 1002 1004 1006 1012 1013 1017 1022 1023 1025 1029 1030 1031 1032 1034 1037 1046 1048 1053 1054 1057 1062 1064 1067 1068 1070 1074 1075 1076 1077 1078 1080 1087 1091 1092 1110 1111 1118 1119 1121 1125 1166 1171 1172 130 TCCCTT/AAGGGA 0 -3 184 151 12 -13.6 40 50 58 95 119 222 226 243 250 254 296 315 327 332 333 358 361 365 368 370 373 380 384 385 394 396 404 409 413 414 425 435 436 437 438 443 447 451 460 467 471 473 478 485 486 519 522 525 534 548 554 568 570 575 578 585 586 593 598 601 603 606 612 617 626 628 631 633 634 635 639 648 649 654 657 659 668 671 673 678 689 694 699 704 708 709 710 711 714 715 719 729 734 737 742 743 747 751 761 762 767 771 777 778 780 782 783 786 790 794 795 798 800 804 810 813 822 825 834 836 850 851 854 855 858 866 870 872 873 880 893 895 897 900 902 904 905 906 914 916 922 927 930 931 940 950 955 966 985 991 994 1005 1007 1010 1014 1018 1021 1031 1033 1038 1039 1043 1044 1052 1056 1061 1065 1066 1067 1071 1073 1081 1086 1088 1093 1094 1099 1100 1107 1115 1122 1155 1161 1168 19 57 104 124 158 207 227 230 260 270 485 493 ACCCTT/AAGGGT 0 -3 161 123 7 -13.2 17 36 91 168 196 204 206 216 224 225 228 231 238 241 246 247 248 249 252 265 274 275 283 285 287 297 299 309 311 316 320 322 327 329 338 339 349 352 362 367 377 382 388 390 404 407 411 415 416 419 420 421 422 428 431 439 441 443 445 448 455 458 459 466 469 489 505 510 520 530 533 549 551 556 563 572 574 580 584 588 595 597 614 619 625 627 630 632 640 646 650 652 664 665 667 676 677 686 687 693 716 718 721 730 732 748 754 774 784 785 819 821 828 833 835 841 848 858 863 864 867 868 874 877 890 901 925 932 935 936 942 957 960 964 972 974 977 983 986 999 1007 1008 1009 1015 1019 1020 1028 1039 1040 1045 1056 1083 1086 1088 1102 1104 1108 1118 1128 1134 1142 26 32 89 97 131 226 444 CCCGTC/GACGGG 0 -2 150 108 1 -17.5 2 8 65 94 131 164 171 173 208 218 223 257 267 276 280 288 307 319 334 338 340 369 375 389 399 401 406 417 423 430 434 440 446 447 449 453 457 463 483 484 487 489 490 492 497 500 503 507 516 521 524 529 535 537 540 547 552 559 565 579 583 589 600 605 608 616 637 638 656 669 674 679 681 683 684 688 701 702 706 722 726 727 733 738 740 745 746 749 764 766 771 775 782 783 788 791 792 801 811 820 823 824 830 840 856 857 860 869 871 882 883 885 894 913 919 924 926 941 943 947 948 958 963 971 975 989 992 995 997 998 1001 1011 1014 1024 1026 1035 1036 1041 1055 1060 1063 1072 1079 1084 1089 1090 1097 1098 1163 1170 356 CCTTCC/GGAAGG 0 -1 133 102 8 -9.5 50 54 56 87 119 167 193 200 216 222 223 226 228 243 250 254 278 293 297 315 339 349 367 370 372 373 375 382 386 391 394 396 397 404 409 411 428 429 435 439 442 451 466 471 491 498 517 522 523 553 562 572 576 577 584 585 586 588 603 628 647 652 654 657 673 676 689 714 715 717 718 719 748 750 753 757 759 779 794 797 800 802 806 808 814 816 822 830 835 839 850 852 855 857 872 873 880 893 895 897 900 914 930 931 937 940 950 953 966 969 973 977 985 988 993 1003 1007 1009 1010 1015 1019 1027 1039 1043 1046 1052 1056 1058 1109 1122 1150 1165 1166 171 207 209 320 345 349 351 357 AGAATG/CATTCT 1 -2 49 92 12 -5.9 34 76 88 144 226 257 310 365 378 401 425 497 532 553 570 574 575 657 671 675 686 721 728 736 738 739 760 800 812 813 826 855 858 897 912 914 925 929 952 1095 1096 1097 1098 1111 1112 1125 1134 1149 1156 6 93 195 197 202 223 317 378 418 446 448 456 CCCCTT/AAGGGG 0 -3 103 91 2 -13.2 77 94 117 143 193 225 254 268 278 306 315 325 332 336 347 354 366 372 374 376 385 386 397 418 426 429 435 437 464 479 482 485 515 517 541 553 562 566 567 573 581 585 586 592 599 609 647 661 666 675 698 717 750 756 758 759 760 763 765 773 776 779 808 810 812 815 827 829 832 837 838 839 843 860 876 886 892 912 917 923 929 938 946 954 959 965 973 983 987 1003 1016 1042 1050 1051 1058 1059 1069 1093 1109 1127 1149 1165 1173 116 210 TTCCCT/AGGGAA 0 -4 89 87 12 -5.3 31 49 50 56 58 94 226 254 315 327 332 339 358 363 367 370 376 380 385 391 394 409 425 431 435 440 451 460 522 525 531 584 593 603 606 635 648 650 654 668 673 678 689 694 701 710 729 734 737 743 748 761 777 778 786 798 800 804 810 813 825 836 850 858 870 897 900 902 905 914 916 940 991 993 1006 1009 1018 1031 1043 1056 1067 1073 1086 1088 1093 1094 1125 1140 1161 57 94 104 132 156 158 207 227 230 361 485 493 ACCCGT/ACGGGT 0 -3 83 84 8 -7.0 2 8 39 65 158 176 178 182 198 208 214 233 269 271 321 323 334 375 402 408 448 463 487 489 490 491 494 496 507 521 524 535 547 559 583 605 608 616 623 638 653 656 672 674 679 681 692 697 701 726 727 783 788 820 824 830 844 856 860 881 882 883 913 915 941 958 989 992 1014 1022 1036 1055 1060 1063 1072 1076 1089 1090 1125 1126 1129 1132 1133 70 71 72 73 233 281 460 476 CCTTCA/TGAAGG 0 -1 148 83 9 -6.4 57 154 188 210 224 225 250 265 275 283 285 287 296 299 309 310 311 316 345 350 362 368 373 374 384 385 390 405 414 415 418 421 422 431 439 441 445 458 459 469 473 479 482 505 534 546 551 556 569 570 581 587 588 591 593 594 595 597 598 599 601 610 612 626 634 646 648 651 653 658 664 665 667 681 686 687 694 721 730 734 750 754 756 760 763 773 780 784 790 795 813 821 825 828 829 832 833 843 845 848 849 851 858 860 863 864 866 870 876 877 890 893 898 901 917 922 923 929 932 935 942 945 946 955 957 960 964 980 987 999 1005 1008 1021 1028 1031 1040 1042 1044 1045 1047 1049 1066 1067 1069 1081 1083 1108 1115 99 168 170 231 246 293 299 319 382 TCCGTT/AACGGA 0 -3 114 83 5 -9.0 16 20 90 102 116 127 138 183 187 197 199 209 219 234 240 258 279 336 356 359 378 379 393 396 413 452 454 456 477 481 488 496 501 509 511 513 521 532 538 542 543 545 569 575 582 604 608 621 622 623 637 641 642 644 645 655 656 663 680 682 685 690 696 703 711 720 725 729 736 753 768 770 793 794 797 805 807 826 842 853 861 875 889 898 899 908 909 918 928 937 939 949 952 956 967 968 987 1000 1004 1013 1021 1025 1032 1046 1053 1057 1060 1062 1078 1091 1092 1110 1153 1166 63 173 300 306 479 CGTTCT/AGAACG 0 -1 94 80 2 -11.5 18 20 90 177 269 278 292 323 328 359 363 379 396 398 415 433 450 463 480 481 508 509 512 521 527 528 532 538 542 544 550 569 602 607 610 611 613 620 629 641 642 643 662 682 695 708 712 714 720 724 728 744 752 769 787 816 842 847 859 883 891 896 902 909 910 911 918 920 933 934 937 952 956 967 978 979 1000 1012 1023 1025 1029 1032 1034 1053 1068 1075 1077 1085 1091 1092 1118 1119 1121 1153 211 287 ACCGTT/AACGGT 0 -3 127 78 5 -8.3 59 151 165 170 185 203 207 227 232 282 289 292 294 304 308 313 317 328 330 337 342 343 352 355 363 364 380 392 397 400 407 412 417 424 427 429 433 440 447 458 461 462 475 478 480 493 495 502 506 509 512 528 548 550 564 571 575 590 596 598 602 610 618 620 629 643 662 684 695 713 714 724 728 741 744 755 759 769 781 783 787 789 809 816 831 856 859 878 879 881 896 900 902 907 911 920 921 933 934 951 953 961 962 975 978 979 982 1002 1012 1013 1017 1023 1029 1030 1031 1037 1055 1066 1067 1070 1074 1077 1080 1121 1125 1133 1172 116 186 197 220 238 CCCATT/AATGGG 3 -4 46 74 9 -5.3 11 19 25 34 159 266 402 425 436 441 444 488 494 497 562 563 564 568 578 657 668 672 691 696 712 735 794 805 809 813 856 862 941 981 1048 1060 1076 1102 1103 1104 1112 1113 1114 1116 1137 1138 75 76 224 236 370 380 387 400 468 GCCCTT/AAGGGC 0 -3 89 73 2 -10.4 39 95 188 202 210 255 290 301 303 305 310 313 314 329 345 350 360 391 405 432 442 444 453 465 468 471 498 499 504 526 533 539 546 557 560 576 577 587 591 594 624 651 653 658 660 700 705 723 735 772 785 799 802 806 814 817 845 846 849 852 857 862 865 873 937 945 969 970 976 980 981 988 990 993 1014 1027 1047 1049 1061 1081 1087 1106 1110 1112 1134 1150 1159 1160 1167 206 356 CCGTCA/TGACGG 0 -1 73 66 4 -7.3 65 80 114 131 164 171 183 204 218 240 267 276 279 288 326 334 338 340 359 400 417 422 423 434 449 453 457 463 464 483 484 489 490 497 507 540 547 558 559 565 600 608 616 651 683 702 722 788 806 828 840 857 871 878 885 919 958 963 982 992 996 997 1011 1014 1016 1041 1055 1080 1084 1089 1090 1097 1098 28 119 127 501 TACCCT/AGGGTA 0 -4 79 64 7 -5.1 17 25 36 169 196 204 206 224 225 228 238 247 248 252 265 275 283 299 309 316 320 329 335 349 352 362 367 377 382 388 390 407 415 419 420 422 428 431 441 443 451 458 466 510 517 520 523 541 549 551 553 563 568 580 584 591 595 614 625 627 667 716 718 732 754 774 785 819 828 848 864 874 942 986 1015 1083 1088 1128 1142 26 32 278 327 346 476 494 TCCCGT/ACGGGA 0 -3 97 64 4 -7.1 94 131 133 164 171 173 218 223 226 263 267 276 280 288 307 319 334 340 369 391 398 417 423 430 434 440 446 447 449 457 489 490 491 492 499 507 516 529 540 565 571 579 589 600 607 608 611 629 679 683 684 702 706 722 733 738 745 746 764 766 771 775 782 801 803 811 823 857 869 879 885 888 891 894 913 919 926 944 947 958 971 995 997 998 1001 1011 1026 1034 1041 1060 1072 1079 1131 1139 1145 1163 1170 208 215 247 358 CTCCCT/AGGGAG 0 -4 60 59 2 -8.2 119 136 222 243 250 305 308 361 365 373 393 414 436 437 438 443 456 473 485 486 529 548 574 578 601 626 631 649 656 659 704 708 729 747 762 767 771 774 794 839 854 855 922 927 943 966 1005 1010 1014 1021 1038 1061 1065 1077 1095 1096 1099 1100 1124 1168 230 270 ATCCCT/AGGGAT 0 -4 53 53 6 -4.3 40 95 109 117 302 333 368 381 384 396 404 413 467 478 534 568 575 586 612 628 633 639 657 671 709 711 714 715 719 734 780 790 822 834 851 864 872 873 931 950 955 968 985 994 1044 1052 1066 1081 1107 1114 1119 1122 1155 124 154 177 260 321 352 CGTTCC/GGAACG 0 -1 78 52 3 -6.2 8 39 146 219 279 308 327 334 342 343 378 383 409 447 452 461 465 472 475 491 499 513 536 545 571 590 608 621 645 682 685 692 696 707 725 729 743 753 759 783 789 793 809 815 831 840 875 879 881 888 889 899 921 949 951 953 961 962 982 984 996 1006 1013 1024 1030 1037 1045 1048 1054 1073 1074 1078 1121 1125 1163 1166 1171 1172 256 280 293 TTACCC/GGGTAA 0 -5 52 49 6 -3.8 7 17 86 150 158 169 196 198 243 247 248 249 257 265 268 292 309 320 336 347 349 352 362 388 403 407 420 424 431 441 443 458 463 466 510 517 526 541 553 568 580 605 672 732 874 883 912 986 1015 1088 1128 1168 236 278 317 327 400 476 CGTTCA/TGAACG 0 -1 69 48 5 -4.2 15 94 116 209 282 286 289 304 321 330 344 355 371 402 470 488 495 501 514 531 543 548 582 596 600 618 622 623 644 663 670 690 691 697 703 736 741 745 755 770 796 797 803 805 807 818 826 842 844 876 881 898 907 908 919 928 939 944 971 1017 1022 1031 1057 1067 1070 1080 1087 1101 1111 97 98 100 123 374 ATACCC/GGGTAT 0 -5 57 46 5 -4.0 39 102 150 158 165 199 204 206 215 224 228 238 252 258 271 275 283 299 319 321 323 329 333 335 373 377 390 419 422 428 451 496 510 517 520 523 535 551 553 563 586 588 595 614 674 716 718 774 828 915 1009 1037 1050 1063 1076 1126 1129 32 260 281 346 485 CCCGTT/AACGGG 0 -3 50 46 5 -4.0 15 39 72 133 135 157 182 241 269 271 321 323 327 334 353 371 383 391 398 402 448 491 494 499 509 571 607 611 620 623 629 672 692 697 796 803 844 857 888 891 913 915 937 944 1022 1034 1076 1118 1119 1125 5 130 233 281 460 CCTATT/AATAGG 3 -4 30 45 5 -3.8 86 123 173 211 240 289 305 310 380 403 544 654 719 786 801 802 810 826 849 872 909 950 1006 1028 1101 1102 1104 1143 1149 1156 131 141 225 354 476 ACCCCT/AGGGGT 0 -4 46 44 3 -5.0 94 143 165 225 248 249 268 306 319 326 336 347 366 372 373 374 385 403 418 426 437 461 482 517 541 553 562 573 592 666 750 758 773 776 786 808 815 876 912 938 946 1050 1087 1109 1165 1173 75 116 236 GTTCGA/TCGAAC 0 0 43 43 6 -3.1 31 50 91 170 273 289 294 299 313 337 356 392 396 424 427 462 506 512 522 558 596 604 607 615 655 680 768 769 777 784 787 827 853 861 991 1002 1004 1046 1117 1128 1147 1153 1154 167 293 308 376 410 483 CCCCGT/ACGGGG 0 -3 30 41 3 -4.6 223 241 257 327 371 399 453 500 503 509 537 616 637 783 792 796 840 857 871 908 937 948 963 1035 1084 1097 1098 1112 1119 1120 130 362 364 CGTTCG/CGAACG 0 -1 57 40 3 -4.5 16 50 116 170 199 234 240 271 280 294 313 317 337 356 364 379 392 393 400 412 424 427 454 456 462 476 493 494 496 506 511 564 596 604 615 655 672 680 684 713 768 781 853 861 878 887 911 915 968 1002 1004 1046 1062 1064 1076 1110 1166 98 119 130 TACCCG/CGGGTA 2 -4 31 40 3 -4.5 7 39 72 102 150 157 158 198 199 258 271 321 323 333 463 496 559 586 605 672 674 697 870 883 915 1063 1076 1126 1129 1132 1133 281 317 476 TCCCCT/AGGGGA 0 -4 45 38 0 -6.4 147 254 278 325 354 382 386 397 416 425 429 464 479 528 566 567 585 599 675 698 759 760 763 765 779 812 839 850 860 893 917 923 954 959 965 973 976 983 1003 1027 1058 1059 1069 1109 1127 -1 CCGTCT/AGACGG 0 -1 55 37 4 -3.4 2 8 22 94 173 187 250 270 306 319 338 375 430 447 487 516 521 524 535 537 548 552 583 658 669 681 684 688 692 696 727 745 746 749 764 775 782 791 792 801 814 823 856 860 882 883 915 924 926 948 995 1035 1063 1163 1172 204 246 418 475 GCCGTT/AACGGC 0 -3 48 36 2 -4.7 7 11 59 163 398 465 470 472 508 514 527 536 544 575 613 615 660 670 691 707 712 743 752 753 770 772 818 840 847 887 910 939 951 984 996 1006 1048 1054 1064 1068 1075 1078 1081 1087 1111 1117 1171 1172 104 457 TGCCCT/AGGGCA 0 -4 46 36 2 -4.7 179 210 255 290 305 313 329 350 360 381 391 432 442 453 465 468 498 533 587 591 660 700 705 723 735 771 785 814 845 849 852 862 865 873 937 970 988 993 1047 1061 1081 1087 1106 1134 1159 1160 160 356 TTGCCC/GGGCAA 0 -5 32 32 1 -5.2 57 179 223 240 290 296 329 332 360 371 376 391 432 442 468 533 552 591 620 669 700 717 785 886 937 970 988 1081 1118 1134 1159 1160 196 GTTCCT/AGGAAC 0 0 44 31 2 -4.0 4 8 18 39 97 287 300 305 333 357 378 445 458 461 465 470 537 545 549 557 590 696 707 720 725 729 740 755 766 789 797 815 831 875 921 948 982 1013 1037 1057 1083 1166 1168 1172 280 498 GTCCCT/AGGGAC 0 -4 40 28 1 -4.5 63 296 382 447 471 519 541 554 570 598 617 634 639 699 715 742 751 770 771 782 783 795 802 866 869 880 893 895 904 906 930 970 1007 1021 1033 1039 1055 1056 1071 1115 19 CTCCGT/ACGGAG 0 -4 45 26 2 -3.2 20 22 67 90 127 197 250 284 306 350 378 452 454 464 477 481 509 513 542 548 582 608 645 684 696 703 736 770 807 842 898 908 918 928 934 941 956 967 987 1032 1053 1072 1078 1080 1172 387 475 GCCCCT/AGGGGC 0 -4 23 22 1 -3.6 77 223 240 315 324 332 376 435 515 581 647 661 710 717 827 829 837 838 886 1016 1042 1093 1149 158 CGTCCC/GGGACG 0 0 28 17 0 -3.1 97 334 440 491 503 507 554 568 608 637 639 664 679 699 771 783 801 869 913 917 930 941 1007 1041 1060 1072 1141 1166 -1