#1183/350 #10.43 # k-mer/r.c. Cluster Offset PosCt wPosCt NegCt HGP_10 AAATGG/CCATTT 0 -2 679 636 12 -78.5 0 3 4 7 10 12 14 15 16 19 20 22 23 24 25 31 33 35 41 42 43 46 47 48 52 54 59 60 61 62 63 68 71 72 75 78 80 81 82 83 88 89 90 94 98 106 108 111 112 113 115 120 124 125 129 130 133 138 145 147 150 153 157 159 160 161 162 164 169 170 171 172 178 179 181 186 188 191 192 195 196 197 198 199 205 207 211 212 213 217 221 222 227 231 234 235 237 239 240 241 242 246 247 249 254 257 259 261 262 264 265 266 267 268 271 277 279 280 281 286 287 288 289 290 291 292 294 296 298 299 300 301 302 303 306 307 308 309 310 311 312 313 314 315 316 317 318 319 321 322 324 325 327 332 334 335 340 342 345 346 347 348 349 350 351 352 353 356 357 358 360 361 362 363 365 367 368 372 373 374 375 376 377 378 379 382 383 384 386 387 388 389 390 391 392 393 394 397 399 400 401 402 404 405 406 410 411 412 413 414 415 419 420 422 423 424 425 426 427 428 430 431 432 434 435 438 442 443 444 445 446 448 449 456 458 459 461 462 465 466 467 469 472 473 477 483 484 485 486 487 488 489 490 494 496 497 499 500 502 503 505 506 507 509 510 511 513 514 516 517 518 520 521 522 523 524 526 527 529 530 531 533 534 535 537 540 543 545 547 548 549 550 551 552 554 556 558 559 560 562 564 565 566 569 572 574 575 580 581 583 585 587 588 589 590 592 593 594 595 599 600 601 603 605 606 607 608 609 611 612 614 615 616 617 619 624 625 626 627 630 631 632 633 636 637 641 643 644 645 648 649 652 654 655 656 657 658 659 660 661 663 665 666 667 668 669 670 671 672 674 676 677 680 682 685 686 689 690 692 694 696 698 699 701 702 703 707 708 709 710 711 712 714 715 716 718 724 729 731 732 736 737 738 739 740 742 743 744 746 747 748 751 753 754 755 756 760 761 763 767 768 769 770 772 773 774 775 776 778 780 781 783 784 785 786 793 797 798 799 801 803 804 806 807 808 811 813 814 815 816 818 820 821 823 826 829 830 831 832 833 836 837 838 839 841 843 845 848 849 850 854 856 858 859 860 861 862 863 864 867 868 869 870 872 873 879 880 881 885 886 887 888 889 890 891 892 894 895 897 898 901 902 903 904 905 906 907 908 909 912 913 916 917 918 920 922 923 924 925 926 927 928 930 931 932 934 936 937 938 941 942 946 949 951 954 956 959 960 961 963 964 965 968 969 971 972 974 975 977 978 979 982 983 984 986 988 989 992 993 996 997 998 1000 1002 1003 1004 1005 1007 1008 1009 1010 1012 1014 1015 1016 1017 1018 1021 1024 1027 1028 1029 1030 1031 1032 1033 1034 1035 1036 1037 1038 1041 1042 1044 1048 1049 1050 1054 1057 1059 1060 1061 1062 1063 1064 1065 1066 1067 1068 1069 1070 1071 1073 1078 1079 1081 1082 1083 1086 1087 1088 1090 1092 1094 1095 1100 1101 1102 1105 1106 1107 1108 1110 1111 1112 1113 1116 1118 1119 1120 1121 1123 1126 1128 1129 1131 1132 1134 1135 1137 1138 1139 1140 1141 1142 1144 1145 1146 1148 1149 1150 1152 1153 1156 1157 1158 1161 1162 1163 1164 1165 1166 1167 1169 1173 1176 1179 1180 1181 29 36 63 67 71 88 144 212 266 303 308 326 AATGGA/TCCATT 0 -1 260 248 12 -18.3 4 10 12 14 19 22 31 43 47 51 52 59 61 62 68 71 72 75 80 81 82 88 106 111 112 113 115 125 128 130 133 138 153 162 169 170 176 181 188 191 195 199 211 221 227 234 237 240 247 254 257 259 261 262 280 281 286 288 290 294 301 303 306 308 315 316 317 322 332 334 345 346 353 357 358 362 367 368 372 374 376 379 381 384 389 393 401 402 404 405 410 415 422 424 425 427 428 435 443 448 456 473 485 490 497 517 518 522 523 524 529 530 543 545 554 558 565 566 572 574 575 587 588 601 606 607 608 611 625 626 630 632 633 641 645 647 648 657 658 659 668 670 677 682 689 690 699 701 707 708 712 714 715 718 719 724 731 740 743 746 748 751 754 755 763 770 773 774 775 780 784 798 799 801 806 811 813 818 838 839 841 845 847 861 863 865 867 870 872 881 888 890 891 894 898 903 907 908 909 920 921 925 927 934 937 938 954 963 968 969 973 977 982 993 996 998 1003 1008 1012 1014 1028 1030 1032 1041 1042 1048 1054 1059 1062 1064 1068 1070 1075 1081 1083 1086 1087 1092 1094 1095 1100 1108 1118 1123 1129 1132 1135 1138 1139 1140 1141 1142 1148 1149 1150 1158 1163 1165 1166 1167 63 67 117 120 162 174 210 212 216 260 300 349 AAAGGG/CCCTTT 0 -2 259 242 4 -25.5 8 12 13 18 30 33 40 44 56 64 84 95 100 101 103 110 114 116 118 127 143 144 145 146 151 156 158 168 176 180 183 184 190 199 200 203 219 220 221 224 225 226 229 230 233 235 243 244 251 255 256 258 269 272 276 284 285 297 301 304 320 323 327 328 329 330 331 336 337 338 341 344 359 364 370 371 381 395 396 398 408 409 417 420 429 433 436 439 441 450 451 452 463 464 465 468 475 476 480 481 482 488 501 504 512 516 536 541 544 545 553 557 567 570 573 578 579 582 596 598 602 604 610 613 618 620 621 622 626 629 635 638 640 646 647 650 651 662 663 665 675 678 688 691 695 701 704 713 733 734 735 750 752 758 759 764 765 771 774 779 789 790 791 792 794 795 796 798 800 802 810 817 819 821 824 825 827 834 835 840 844 846 847 851 852 855 857 874 875 877 883 896 910 911 914 919 921 922 929 930 935 939 945 947 948 950 953 955 957 958 967 976 985 987 991 995 1001 1006 1013 1022 1023 1025 1026 1038 1043 1046 1047 1053 1056 1058 1074 1077 1080 1084 1085 1093 1098 1099 1103 1104 1109 1114 1115 1116 1117 1123 1125 1127 1130 1143 1145 1147 1151 1152 1159 1160 1170 1177 1182 195 314 323 325 AATGGT/ACCATT 0 -1 239 219 14 -13.7 0 10 17 23 33 35 42 46 60 62 71 78 90 93 94 98 120 124 147 159 160 161 164 196 205 213 222 234 241 248 268 292 296 299 300 302 309 310 311 313 321 324 340 342 348 349 350 351 361 365 376 377 378 382 387 388 394 400 406 411 418 420 423 426 428 431 438 442 444 449 458 459 461 462 467 469 477 483 484 487 488 489 496 499 500 506 507 509 510 515 520 521 533 535 536 540 550 558 560 562 569 580 583 588 589 590 592 593 594 599 600 603 605 614 616 624 625 631 636 637 654 655 661 666 667 669 674 676 686 692 694 696 703 709 710 711 715 729 732 736 737 738 756 760 768 772 778 781 784 786 793 797 804 814 832 833 836 837 850 859 860 864 868 873 879 885 887 889 892 895 902 904 905 906 912 913 914 917 922 924 927 928 930 932 937 941 949 954 959 961 964 965 969 974 978 979 984 986 988 989 991 992 997 1000 1002 1007 1012 1015 1018 1024 1029 1031 1033 1038 1044 1049 1050 1061 1063 1066 1067 1078 1097 1101 1106 1112 1113 1120 1121 1126 1131 1145 1152 1156 1157 1162 1169 1180 1181 9 29 46 50 122 125 144 191 201 223 266 303 308 339 AAAAGG/CCTTTT 0 -3 202 201 17 -10.1 24 28 29 40 55 56 64 66 76 84 91 92 99 100 101 103 110 116 118 127 128 141 144 145 146 147 152 167 173 176 177 178 180 183 190 194 196 197 200 219 220 225 227 229 247 255 257 258 259 269 272 273 274 275 276 282 285 289 290 295 297 304 313 323 331 341 344 347 370 372 381 398 409 415 419 430 433 436 437 439 451 475 480 481 482 488 501 504 512 513 516 536 541 553 567 570 578 579 582 596 597 610 618 621 622 626 629 632 634 635 640 644 651 663 665 675 678 685 691 701 704 709 711 713 716 727 729 733 734 735 752 758 764 765 771 774 777 790 791 792 796 798 800 802 810 811 817 819 825 835 846 851 852 857 864 874 893 896 910 911 929 935 936 939 940 945 948 950 953 955 982 985 987 995 1006 1013 1022 1040 1043 1046 1051 1056 1058 1074 1080 1085 1093 1104 1114 1123 1125 1130 1143 1145 1149 1151 1156 1159 1160 1165 1170 1171 26 29 69 71 83 127 148 180 204 220 232 235 249 314 323 325 337 ATGGAA/TTCCAT 0 0 153 156 12 -8.5 4 6 10 12 19 22 41 43 47 52 62 68 72 75 80 88 92 106 112 113 115 125 130 137 138 153 163 169 171 173 186 191 199 211 221 227 254 257 259 261 286 294 301 302 308 317 320 322 334 335 345 354 357 358 374 376 384 389 393 397 402 404 405 410 415 422 431 433 443 456 491 543 545 554 557 565 575 601 606 607 608 611 641 657 658 659 668 670 677 678 682 690 701 707 712 714 718 724 729 731 740 743 746 750 751 761 763 775 784 793 799 801 804 813 815 818 843 847 861 863 867 868 870 881 890 891 903 908 921 925 934 938 954 963 969 973 977 996 1012 1022 1030 1041 1059 1064 1075 1108 1126 1138 1139 1142 1144 1148 1158 39 81 96 117 127 161 263 275 298 299 342 349 AATGGG/CCCATT 0 -1 138 135 9 -8.3 1 7 15 20 54 83 89 94 111 112 129 130 158 171 172 178 186 192 198 231 235 242 265 267 277 279 287 289 291 298 303 313 318 356 360 373 375 384 386 389 399 412 414 419 434 445 460 466 472 473 494 502 503 513 514 516 531 537 547 549 551 552 564 588 594 598 609 612 627 644 646 652 654 656 663 671 672 685 702 742 767 776 783 803 808 816 820 821 823 826 829 830 831 837 839 843 848 849 862 869 880 893 901 909 911 918 923 926 931 936 946 951 956 972 975 983 1004 1005 1010 1017 1027 1036 1045 1057 1065 1073 1079 1082 1087 1102 1107 1116 1134 1137 1153 1164 1173 1181 0 32 36 71 80 88 130 178 186 AAACGG/CCGTTT 0 -2 136 123 4 -10.9 11 17 39 43 51 70 74 77 97 117 127 136 165 166 167 185 186 208 210 232 252 260 263 270 273 275 278 339 350 369 380 385 403 416 430 437 440 454 460 470 471 474 478 487 491 495 508 519 528 532 563 566 603 617 623 634 642 673 679 684 693 697 700 705 706 717 719 722 723 726 727 728 730 745 749 757 782 788 809 812 828 842 853 861 865 866 871 876 878 882 893 899 902 915 933 940 943 944 951 952 962 966 970 973 974 975 980 981 990 994 1011 1019 1020 1036 1039 1040 1045 1052 1055 1072 1075 1076 1089 1091 1096 1097 1122 1124 1136 1154 1155 1168 1171 1175 1178 1179 100 246 250 295 CAAATG/CATTTG 0 -3 138 122 8 -7.7 21 33 38 51 62 69 71 80 88 105 110 120 125 133 157 159 163 169 175 191 192 195 199 201 205 218 225 242 266 277 303 308 313 318 328 334 387 390 427 430 435 438 442 467 481 484 487 523 524 550 566 569 585 590 606 611 615 616 624 625 626 627 630 643 656 667 676 680 689 710 731 732 753 754 756 760 770 772 778 784 795 801 803 808 829 839 862 869 878 879 890 891 892 898 907 915 922 938 954 956 959 962 963 965 968 983 987 998 1008 1009 1018 1029 1041 1049 1065 1066 1068 1078 1081 1082 1096 1102 1106 1108 1109 1110 1113 1114 1128 1134 1137 1138 1140 1150 1156 1157 1162 1167 29 63 74 114 224 231 308 317 AAGGGA/TCCCTT 0 -1 127 119 9 -6.8 4 13 17 30 40 64 100 101 103 116 118 132 144 146 151 158 168 176 183 200 221 224 226 243 251 255 256 258 269 276 297 301 304 329 330 336 337 364 395 417 429 430 436 449 450 451 452 475 480 516 541 544 573 578 582 596 598 600 610 613 629 635 646 650 662 663 688 692 701 704 733 750 758 759 764 765 789 800 802 810 817 819 840 846 875 877 883 894 896 910 914 919 935 939 945 955 957 958 976 985 988 991 995 1001 1013 1019 1026 1046 1056 1074 1080 1085 1087 1098 1104 1115 1117 1125 1130 1131 1144 1152 1153 1159 1160 1170 1177 3 43 78 87 195 281 311 323 325 AATGGC/GCCATT 0 -1 124 117 11 -5.5 3 5 16 24 25 41 48 52 63 108 116 145 147 150 157 179 197 207 212 217 239 246 249 264 266 271 307 312 314 319 325 327 331 335 347 351 352 363 383 390 391 392 397 413 430 432 446 465 486 503 505 509 511 526 527 530 534 548 556 559 569 581 585 595 615 617 619 626 643 649 656 660 665 680 698 716 722 737 739 744 747 753 761 769 785 807 815 829 845 854 856 858 886 897 916 942 960 971 974 1007 1009 1012 1016 1021 1034 1035 1037 1060 1069 1071 1088 1090 1105 1110 1111 1119 1128 1129 1144 1146 1150 1161 1176 1179 53 64 79 211 212 252 272 279 301 326 346 GGAAAG/CTTTCC 1 -2 84 96 5 -7.1 3 9 12 13 18 44 58 61 76 88 92 99 100 103 108 115 116 137 144 145 151 158 173 192 196 199 203 228 232 251 252 254 255 257 259 264 273 276 282 286 306 308 309 327 335 336 358 371 384 401 433 464 465 467 474 528 531 534 554 594 601 604 629 646 678 683 689 701 743 812 856 872 888 921 922 962 1034 1071 1075 1116 1117 1119 1122 1139 22 81 97 243 258 AAGGGT/ACCCTT 0 -1 109 94 6 -6.2 2 12 25 31 110 127 131 143 180 184 190 199 203 219 229 230 233 244 272 290 331 338 341 359 370 375 396 408 433 441 464 465 476 477 482 490 504 512 536 541 545 553 557 567 579 604 618 626 647 651 675 678 691 713 735 771 789 791 792 794 795 798 824 827 834 835 844 846 847 852 874 878 910 911 916 922 935 947 950 953 967 985 987 1006 1022 1023 1025 1038 1043 1047 1053 1058 1084 1099 1103 1109 1116 1123 1125 1127 1145 1147 1149 1156 1159 1160 1170 1177 1182 39 51 77 126 157 344 ATGGTA/TACCAT 0 0 93 89 6 -5.7 0 23 33 35 42 60 94 98 124 136 161 200 268 292 294 296 299 310 330 349 365 376 377 411 418 442 444 446 461 462 475 477 483 488 489 499 505 506 509 558 569 583 588 589 590 592 594 599 605 631 655 669 676 683 693 703 711 715 729 736 768 793 845 850 854 859 868 879 889 906 913 922 924 928 937 955 974 986 990 1002 1009 1012 1018 1044 1060 1061 1067 1112 1120 1126 1132 1139 1145 6 57 122 156 308 339 TAAAGG/CCTTTA 0 -3 89 88 6 -5.6 8 12 13 17 18 33 35 57 89 95 101 114 118 143 158 164 168 184 189 213 244 256 264 305 320 328 329 330 337 338 359 408 417 420 443 451 464 468 489 509 530 545 549 557 567 568 582 602 603 622 625 636 669 758 759 787 795 821 824 846 847 877 883 884 907 908 929 930 938 962 968 976 993 1001 1023 1030 1060 1077 1098 1099 1109 1115 1127 1133 1147 1149 1152 1177 1182 173 204 207 294 325 337 AGGGAA/TTCCCT 0 0 83 87 7 -4.9 9 13 40 53 64 100 101 116 118 132 144 146 158 168 172 176 200 221 226 251 255 258 269 276 280 297 299 304 329 330 336 337 364 367 369 424 448 450 451 480 495 516 539 541 544 578 582 596 598 600 604 610 613 629 640 646 662 663 688 701 719 733 789 800 802 819 875 919 945 957 958 985 1001 1013 1026 1034 1087 1110 1117 1130 1152 1153 1159 64 78 96 129 145 281 323 GGTAAA/TTTACC 0 2 85 87 8 -4.4 0 15 17 33 35 42 63 82 94 98 106 128 133 139 171 193 204 215 221 287 291 320 325 347 349 411 415 423 432 433 439 442 446 464 483 488 489 520 522 527 545 546 583 602 605 613 625 631 652 676 693 697 710 711 729 736 748 765 814 819 825 830 848 859 873 879 887 910 913 929 950 962 971 974 975 977 978 1023 1064 1123 1139 1145 1153 1160 1170 76 140 165 182 228 261 267 348 GAAAGG/CCTTTC 0 -3 69 74 6 -4.3 3 12 18 44 45 46 86 112 128 145 151 199 203 224 226 233 235 243 247 251 276 284 301 308 327 364 371 384 395 441 450 452 462 463 465 476 531 554 562 573 579 598 604 620 638 646 649 650 750 779 789 800 834 840 855 856 875 904 914 921 922 958 1038 1053 1071 1084 1116 1117 1163 3 53 97 116 221 259 ATGGCA/TGCCAT 0 0 62 67 6 -3.7 3 5 48 52 59 63 99 120 145 147 197 207 217 246 266 271 307 314 319 325 346 347 363 383 390 391 413 430 432 456 465 548 559 581 595 615 617 649 660 665 680 716 753 785 807 829 858 897 916 942 964 1007 1009 1012 1016 1060 1069 1119 1129 1146 1150 1173 57 79 84 85 149 252 AAGGGG/CCCCTT 0 -1 44 43 3 -3.2 8 18 44 114 145 156 225 235 284 285 320 323 328 344 381 398 409 420 439 468 481 488 567 620 621 640 695 726 734 752 774 779 790 794 796 825 848 901 921 929 930 1077 1114 1143 209 310 314 AACGGC/GCCGTT 0 -1 31 33 1 -3.9 14 77 117 232 260 263 344 380 416 430 454 470 474 495 727 728 782 853 943 944 966 970 974 976 990 1011 1019 1096 1097 1168 1171 200 AAGGGC/GCCCTT 0 -1 26 26 1 -3.1 33 54 56 84 95 220 327 371 463 501 570 602 622 638 651 665 734 821 851 855 857 948 961 1093 1119 1151 64