#2700/345 #14.27 # k-mer/r.c. Cluster Offset PosCt wPosCt NegCt HGP_10 TTTCTAT/ATAGAAA 0 -4 734 733 7 -34.9 0 2 3 5 10 14 19 21 25 32 33 36 40 46 49 63 65 77 80 82 88 94 106 108 110 113 116 117 119 121 123 130 133 134 136 137 138 140 151 156 160 164 168 170 172 173 179 180 182 184 186 187 188 194 196 204 207 209 216 217 219 222 225 226 227 228 229 234 235 237 246 254 255 258 262 263 266 269 276 279 282 283 285 287 289 296 297 301 302 303 309 312 314 318 321 323 327 328 340 342 352 358 360 365 366 368 372 380 382 387 394 410 411 415 419 421 423 424 429 430 435 436 437 439 445 447 448 450 451 452 454 456 459 460 477 482 495 497 499 503 506 507 508 511 515 516 530 532 541 544 552 557 559 561 563 564 570 576 579 581 582 585 591 595 600 604 611 612 615 617 620 625 631 632 633 638 641 643 648 649 651 657 658 664 667 669 674 675 686 690 702 703 710 732 736 738 747 748 751 753 757 758 759 763 765 766 769 771 772 779 782 783 791 793 794 797 800 813 823 829 835 839 842 844 848 849 850 851 852 853 854 855 857 858 867 869 870 873 876 877 880 882 883 886 890 894 897 903 905 909 911 912 917 922 925 935 936 946 953 955 963 965 976 979 984 992 993 996 1000 1001 1003 1004 1008 1011 1012 1022 1027 1032 1034 1037 1038 1039 1041 1043 1044 1047 1049 1053 1054 1061 1070 1071 1073 1076 1080 1086 1087 1089 1093 1094 1097 1106 1107 1109 1111 1114 1115 1116 1120 1133 1134 1136 1138 1139 1141 1142 1144 1146 1154 1155 1156 1158 1159 1162 1163 1164 1177 1189 1198 1203 1204 1205 1208 1216 1220 1234 1235 1239 1251 1252 1255 1256 1259 1260 1261 1265 1266 1271 1273 1274 1275 1277 1279 1287 1291 1292 1297 1298 1304 1307 1310 1313 1319 1320 1329 1332 1333 1334 1335 1339 1340 1348 1352 1353 1355 1358 1359 1360 1362 1363 1368 1369 1370 1379 1382 1387 1389 1391 1393 1402 1404 1412 1420 1425 1429 1430 1436 1444 1454 1463 1464 1472 1475 1476 1477 1481 1488 1490 1499 1502 1510 1513 1515 1517 1528 1530 1537 1539 1542 1543 1547 1548 1549 1550 1554 1556 1558 1567 1568 1572 1577 1581 1584 1586 1587 1595 1599 1601 1604 1615 1624 1629 1633 1641 1642 1643 1645 1653 1654 1655 1659 1660 1665 1666 1667 1674 1676 1677 1678 1693 1699 1704 1705 1706 1708 1709 1720 1721 1723 1726 1732 1734 1739 1750 1753 1755 1761 1765 1768 1770 1776 1777 1778 1779 1787 1799 1806 1809 1811 1813 1819 1820 1823 1826 1828 1830 1831 1836 1839 1840 1842 1843 1845 1851 1855 1858 1860 1861 1866 1868 1869 1870 1875 1893 1896 1897 1904 1908 1911 1915 1917 1918 1919 1921 1932 1934 1935 1937 1939 1948 1949 1952 1954 1958 1965 1967 1970 1973 1976 1977 1989 1991 1997 1999 2004 2006 2010 2011 2014 2016 2018 2024 2025 2028 2034 2042 2045 2046 2047 2050 2055 2056 2058 2071 2072 2073 2079 2081 2082 2087 2090 2092 2095 2096 2099 2103 2108 2109 2110 2112 2116 2117 2118 2124 2127 2129 2130 2132 2136 2142 2147 2150 2154 2158 2160 2162 2163 2164 2167 2170 2173 2177 2180 2181 2183 2185 2186 2189 2190 2201 2204 2205 2206 2209 2211 2212 2215 2223 2231 2233 2235 2236 2237 2239 2241 2244 2247 2262 2267 2271 2276 2290 2291 2292 2297 2298 2301 2303 2304 2309 2311 2322 2325 2329 2331 2334 2338 2340 2342 2361 2364 2368 2372 2377 2378 2382 2384 2397 2398 2403 2405 2407 2416 2417 2420 2429 2431 2434 2438 2442 2445 2446 2452 2458 2473 2475 2477 2481 2490 2492 2496 2497 2501 2502 2505 2506 2515 2516 2517 2530 2535 2537 2540 2552 2553 2554 2555 2556 2559 2566 2567 2573 2575 2580 2581 2582 2584 2585 2591 2598 2607 2614 2616 2621 2624 2627 2636 2637 2642 2644 2648 2652 2654 2656 2658 2661 2666 2667 2670 2675 2681 2683 2697 2699 138 184 190 219 291 299 329 AAATAGA/TCTATTT 1 -4 693 697 7 -32.5 2 3 5 10 15 19 21 22 25 32 33 36 40 42 59 63 65 67 70 77 80 82 88 94 106 107 108 113 116 117 121 123 126 130 133 138 139 142 151 160 164 168 170 172 173 174 175 179 180 181 185 186 187 196 203 204 206 209 216 219 222 225 226 227 229 231 233 234 236 246 248 250 254 255 257 259 263 266 269 273 276 278 282 283 285 287 290 297 300 301 304 311 318 320 323 326 328 335 336 342 348 349 351 356 359 360 363 365 368 373 376 379 382 385 387 389 394 396 399 406 407 411 415 422 423 424 427 435 436 442 447 448 454 460 461 471 472 473 475 476 479 485 490 492 496 498 502 513 514 519 522 523 528 536 541 542 543 544 546 549 553 559 563 575 585 592 593 594 596 599 600 602 604 623 625 626 628 634 638 641 642 647 649 656 657 673 675 676 677 679 681 682 683 684 686 689 691 703 707 708 709 711 713 715 722 723 728 729 732 733 734 736 740 745 748 750 755 769 772 776 779 781 782 784 792 798 803 807 812 815 817 825 830 833 835 836 840 841 850 855 860 861 862 864 867 868 876 878 879 883 895 896 904 906 910 912 914 919 925 929 930 931 933 934 935 937 951 962 965 966 970 985 986 988 990 995 1000 1001 1002 1003 1010 1015 1016 1022 1040 1044 1057 1059 1062 1069 1072 1093 1097 1101 1103 1111 1128 1130 1136 1145 1146 1150 1153 1164 1167 1168 1171 1172 1175 1180 1181 1186 1187 1196 1201 1206 1208 1215 1219 1225 1243 1244 1248 1250 1251 1257 1259 1262 1264 1266 1267 1269 1271 1281 1286 1288 1291 1293 1294 1296 1299 1303 1312 1323 1328 1329 1331 1335 1336 1341 1343 1344 1345 1348 1352 1355 1361 1364 1366 1377 1380 1393 1401 1403 1404 1405 1409 1411 1415 1416 1418 1422 1431 1437 1443 1444 1446 1461 1462 1469 1471 1477 1479 1480 1482 1483 1485 1488 1493 1494 1502 1503 1504 1508 1509 1514 1515 1524 1525 1531 1539 1540 1542 1546 1549 1556 1559 1561 1562 1566 1569 1570 1571 1578 1579 1582 1583 1586 1591 1596 1597 1600 1609 1612 1614 1616 1619 1634 1636 1643 1646 1650 1651 1652 1658 1662 1663 1677 1679 1681 1690 1694 1696 1698 1703 1710 1717 1730 1732 1733 1736 1737 1739 1742 1746 1750 1753 1754 1755 1758 1761 1768 1769 1770 1779 1780 1784 1785 1788 1794 1798 1799 1802 1814 1815 1817 1818 1819 1821 1828 1834 1838 1843 1846 1851 1853 1854 1863 1864 1868 1872 1883 1890 1891 1893 1901 1904 1914 1924 1931 1945 1956 1958 1962 1963 1964 1967 1968 1969 1970 1971 1972 1976 1979 1980 1981 1985 1991 1992 1993 1996 2002 2003 2004 2006 2007 2018 2022 2026 2029 2030 2035 2037 2043 2046 2047 2048 2055 2056 2064 2070 2071 2078 2080 2083 2089 2098 2099 2111 2112 2114 2116 2117 2119 2129 2133 2139 2142 2144 2148 2154 2156 2169 2172 2174 2178 2188 2193 2194 2204 2210 2214 2218 2220 2224 2226 2234 2237 2246 2248 2251 2255 2256 2257 2260 2263 2284 2292 2293 2294 2295 2296 2299 2300 2302 2303 2306 2307 2308 2311 2327 2343 2344 2351 2352 2355 2356 2363 2368 2381 2382 2383 2386 2389 2390 2392 2393 2394 2395 2396 2405 2409 2411 2414 2415 2416 2418 2428 2432 2433 2436 2439 2440 2446 2448 2449 2472 2477 2479 2484 2495 2507 2511 2512 2517 2519 2524 2528 2530 2541 2550 2552 2554 2563 2572 2576 2577 2582 2583 2586 2590 2591 2592 2595 2597 2600 2605 2613 2628 2631 2633 2635 2637 2640 2644 2645 2646 2647 2648 2650 2660 2661 2662 2673 2677 2681 2682 2688 2689 2690 2691 2693 2698 32 70 184 206 265 296 316 AATAGAA/TTCTATT 1 -3 638 653 5 -32.2 2 3 5 10 14 19 21 25 27 32 33 36 40 49 59 63 65 70 77 80 82 88 94 106 107 108 110 113 116 117 119 121 123 126 130 133 136 138 151 153 160 164 168 170 172 173 174 175 179 180 181 185 186 187 196 204 206 209 216 217 219 222 225 226 227 229 231 234 235 236 237 246 249 250 254 255 261 263 266 269 272 273 276 282 283 285 286 289 296 297 298 301 304 306 309 313 318 320 321 323 328 333 334 336 340 342 348 352 357 358 360 365 368 372 379 382 387 394 400 402 407 410 411 415 423 424 427 428 433 435 436 440 447 448 452 454 460 464 476 477 483 487 499 502 505 507 508 512 519 523 525 534 536 541 542 544 546 549 552 553 554 556 559 561 563 572 576 585 589 592 600 604 605 615 618 625 628 629 631 634 637 638 640 641 642 643 644 648 649 657 670 673 675 676 679 686 688 689 691 703 705 711 717 722 723 732 736 738 741 747 748 756 762 763 769 772 773 774 775 778 779 782 794 802 810 820 835 837 845 850 854 855 858 859 861 867 873 876 878 886 888 890 893 894 896 903 911 912 918 921 925 935 936 942 963 965 971 974 992 996 1000 1001 1003 1010 1011 1015 1016 1022 1034 1037 1038 1044 1046 1064 1065 1073 1093 1097 1104 1107 1111 1120 1124 1128 1130 1135 1136 1144 1146 1158 1159 1162 1164 1167 1170 1172 1177 1198 1201 1208 1225 1226 1230 1232 1235 1237 1239 1249 1250 1251 1252 1256 1257 1259 1266 1270 1271 1273 1275 1277 1278 1281 1283 1291 1292 1300 1304 1310 1318 1319 1322 1328 1329 1335 1336 1342 1348 1355 1359 1363 1366 1367 1369 1373 1379 1382 1387 1393 1394 1401 1404 1405 1414 1421 1422 1423 1425 1436 1443 1444 1449 1464 1468 1472 1475 1476 1477 1480 1483 1487 1501 1502 1504 1507 1515 1517 1519 1520 1524 1525 1529 1539 1540 1542 1543 1549 1554 1556 1562 1567 1586 1591 1592 1597 1598 1599 1600 1614 1617 1619 1636 1643 1651 1652 1659 1663 1667 1673 1675 1691 1696 1697 1700 1702 1710 1718 1721 1725 1726 1729 1732 1733 1734 1739 1742 1750 1755 1761 1764 1768 1770 1779 1792 1799 1804 1814 1815 1817 1819 1820 1824 1826 1828 1829 1830 1831 1836 1839 1843 1845 1851 1853 1868 1870 1878 1890 1893 1897 1898 1901 1904 1911 1914 1917 1918 1919 1920 1921 1931 1937 1943 1952 1956 1957 1958 1965 1967 1969 1970 1971 1972 1976 1980 1985 1991 1993 2004 2006 2009 2018 2020 2028 2030 2033 2034 2035 2042 2046 2047 2051 2055 2056 2059 2065 2068 2075 2091 2096 2099 2108 2112 2116 2119 2129 2142 2147 2148 2149 2154 2156 2158 2161 2163 2169 2174 2175 2183 2188 2196 2204 2224 2226 2233 2237 2243 2248 2251 2255 2257 2258 2267 2273 2277 2292 2295 2298 2303 2307 2311 2313 2316 2322 2325 2329 2334 2336 2337 2344 2345 2349 2368 2375 2377 2378 2379 2381 2382 2383 2385 2386 2387 2400 2401 2403 2405 2414 2416 2423 2425 2428 2432 2442 2448 2450 2460 2470 2471 2477 2479 2480 2487 2493 2505 2508 2509 2510 2514 2516 2517 2519 2524 2528 2530 2542 2550 2552 2553 2554 2555 2576 2577 2582 2584 2588 2590 2595 2596 2600 2610 2613 2614 2620 2632 2637 2645 2648 2650 2657 2660 2661 2662 2675 2679 2680 2681 2682 2686 2689 32 95 184 258 303 AGAAAGT/ACTTTCT 2 0 474 465 4 -21.9 5 6 25 28 46 50 63 74 84 88 90 99 103 106 116 117 119 125 127 129 130 136 138 140 145 148 156 159 162 166 172 175 177 178 184 197 198 202 217 239 243 244 262 266 282 288 296 297 305 307 312 316 317 319 323 331 340 343 344 346 350 354 362 364 374 375 377 378 381 384 388 392 393 401 404 410 420 426 431 432 441 446 458 465 467 468 470 474 480 486 501 517 521 537 538 544 548 559 562 566 569 573 579 588 595 598 603 606 610 616 621 622 627 629 630 635 650 653 655 658 668 695 697 701 720 721 723 724 731 735 742 752 760 767 786 788 799 804 809 814 818 821 822 827 856 870 872 874 876 887 889 891 892 899 901 913 920 926 932 938 939 940 943 944 947 956 958 961 964 976 982 987 991 993 994 997 1005 1007 1009 1019 1024 1028 1029 1030 1033 1035 1042 1045 1048 1051 1056 1058 1060 1077 1083 1086 1088 1090 1091 1095 1098 1102 1110 1112 1123 1127 1131 1148 1151 1166 1174 1191 1193 1194 1195 1196 1199 1202 1209 1213 1218 1226 1229 1233 1240 1241 1253 1258 1263 1284 1285 1286 1290 1301 1304 1314 1327 1343 1347 1350 1351 1363 1371 1376 1400 1407 1413 1417 1427 1433 1434 1442 1448 1451 1455 1459 1470 1486 1497 1498 1516 1532 1534 1538 1552 1563 1564 1589 1590 1602 1611 1613 1623 1626 1628 1631 1636 1639 1640 1648 1667 1669 1670 1671 1685 1692 1693 1711 1722 1728 1731 1735 1738 1740 1743 1745 1751 1756 1760 1761 1762 1772 1782 1783 1790 1795 1796 1797 1807 1812 1835 1850 1857 1861 1865 1867 1880 1882 1885 1888 1894 1900 1907 1909 1916 1917 1923 1927 1930 1937 1941 1942 1944 1946 1947 1951 1959 1974 1982 1987 1988 1994 1995 2001 2017 2019 2027 2028 2032 2036 2040 2052 2055 2064 2066 2074 2086 2100 2102 2106 2121 2123 2131 2135 2140 2141 2143 2145 2147 2165 2168 2182 2187 2189 2192 2195 2207 2213 2216 2219 2227 2233 2237 2252 2253 2254 2264 2268 2270 2272 2275 2281 2282 2288 2291 2305 2312 2313 2314 2317 2319 2320 2321 2326 2328 2332 2340 2341 2346 2348 2350 2353 2360 2362 2365 2370 2371 2372 2374 2375 2388 2402 2405 2406 2407 2422 2424 2426 2429 2443 2447 2453 2455 2463 2464 2465 2499 2518 2525 2527 2529 2534 2546 2549 2558 2564 2570 2571 2578 2581 2601 2602 2604 2606 2608 2622 2626 2634 2638 2639 2655 2666 2668 2669 2671 2672 2674 2676 2678 2681 2684 2685 2695 2697 110 226 243 324 CTTTCTA/TAGAAAG 0 -5 425 458 3 -22.8 0 2 3 5 6 25 28 38 39 42 46 48 50 57 63 65 67 74 82 84 88 89 90 100 103 106 113 116 117 119 123 129 130 135 136 138 140 152 156 160 164 166 172 173 177 183 184 187 188 197 198 200 205 216 217 219 225 232 235 237 256 262 266 269 270 277 282 283 291 296 297 299 312 323 325 340 347 352 358 360 364 380 381 408 410 411 412 417 419 426 429 443 447 448 449 453 466 468 477 481 484 489 494 507 508 515 516 517 530 533 540 541 544 558 559 560 561 562 569 574 577 579 586 595 603 608 620 625 631 633 639 643 654 658 662 686 697 702 719 724 747 754 765 766 777 780 790 791 801 814 841 844 847 854 855 857 867 870 876 881 890 907 908 909 932 949 952 955 958 965 975 976 980 983 984 989 993 997 999 1006 1007 1017 1018 1020 1021 1047 1048 1066 1071 1082 1086 1094 1105 1111 1118 1119 1134 1136 1140 1159 1176 1182 1184 1190 1192 1194 1207 1209 1242 1255 1268 1287 1290 1297 1304 1306 1319 1340 1346 1351 1357 1360 1363 1368 1371 1378 1383 1392 1396 1406 1413 1432 1450 1451 1456 1459 1467 1500 1535 1541 1544 1551 1552 1557 1572 1586 1595 1601 1603 1627 1631 1647 1648 1653 1659 1661 1671 1676 1681 1685 1688 1693 1704 1705 1712 1714 1720 1722 1723 1732 1738 1744 1748 1760 1761 1768 1773 1774 1776 1779 1801 1819 1820 1822 1823 1825 1828 1831 1840 1844 1847 1853 1855 1858 1860 1861 1866 1880 1882 1883 1895 1903 1909 1916 1917 1922 1924 1926 1927 1929 1930 1935 1936 1937 1953 1954 1977 1978 1982 2005 2014 2025 2028 2031 2034 2053 2055 2060 2061 2071 2074 2087 2088 2097 2105 2109 2123 2125 2126 2128 2146 2163 2164 2167 2179 2180 2189 2192 2198 2199 2202 2204 2208 2211 2225 2227 2229 2230 2233 2237 2238 2245 2247 2250 2266 2269 2274 2275 2285 2286 2287 2289 2291 2304 2314 2317 2326 2339 2340 2348 2351 2362 2366 2372 2405 2407 2420 2422 2426 2427 2429 2451 2458 2469 2473 2476 2485 2490 2496 2515 2518 2520 2521 2536 2539 2540 2546 2551 2561 2564 2581 2582 2591 2604 2608 2614 2618 2641 2648 2649 2666 2670 2681 2694 2697 232 329 337 TTTCCAT/ATGGAAA 0 -4 483 455 3 -22.7 7 12 17 18 22 45 60 61 66 69 96 105 112 132 134 145 154 171 191 199 201 208 210 223 241 260 267 271 281 284 294 295 310 315 322 324 332 337 341 353 355 361 367 385 386 389 395 403 409 413 416 418 434 455 457 460 462 469 488 491 493 500 504 509 510 520 529 531 535 541 547 551 565 567 568 578 580 583 590 597 601 607 613 614 619 624 636 645 652 659 660 663 665 666 671 678 680 692 693 698 699 700 712 714 721 726 727 730 737 739 746 749 761 764 768 770 785 795 805 806 808 816 819 826 828 831 838 843 863 865 866 875 885 900 902 915 916 923 924 927 928 941 950 954 959 960 967 968 972 977 981 995 1003 1014 1025 1028 1031 1036 1050 1063 1068 1074 1078 1079 1081 1084 1090 1092 1096 1100 1108 1117 1121 1122 1125 1129 1132 1143 1147 1149 1150 1152 1157 1160 1161 1165 1169 1178 1179 1182 1183 1185 1197 1200 1210 1211 1212 1214 1217 1221 1222 1223 1227 1228 1231 1236 1238 1245 1247 1254 1272 1276 1282 1302 1308 1309 1311 1315 1316 1317 1324 1325 1326 1330 1337 1338 1354 1365 1372 1377 1384 1385 1386 1390 1395 1399 1408 1410 1419 1424 1428 1435 1438 1439 1445 1447 1452 1453 1458 1465 1466 1474 1477 1478 1489 1491 1492 1495 1496 1505 1512 1518 1521 1523 1533 1536 1545 1560 1562 1565 1573 1575 1585 1588 1605 1607 1610 1618 1620 1625 1632 1635 1638 1644 1649 1656 1657 1664 1668 1669 1672 1680 1682 1684 1686 1689 1695 1701 1707 1713 1716 1719 1724 1727 1747 1749 1757 1759 1766 1767 1771 1781 1789 1791 1805 1810 1816 1820 1833 1841 1848 1852 1856 1871 1873 1876 1877 1879 1881 1884 1886 1889 1892 1902 1905 1912 1913 1925 1928 1933 1938 1940 1975 1983 1986 1990 2000 2008 2012 2013 2021 2023 2038 2039 2041 2044 2049 2057 2062 2063 2067 2069 2076 2077 2084 2085 2094 2099 2104 2107 2113 2115 2120 2122 2130 2137 2138 2152 2153 2155 2159 2166 2171 2184 2191 2222 2228 2232 2240 2242 2249 2259 2261 2265 2273 2278 2279 2280 2283 2288 2310 2315 2318 2323 2324 2328 2333 2338 2347 2354 2358 2367 2369 2373 2376 2380 2391 2399 2404 2410 2413 2419 2430 2435 2437 2441 2444 2454 2456 2457 2459 2461 2462 2467 2468 2474 2478 2482 2486 2488 2489 2491 2494 2498 2500 2513 2522 2526 2531 2532 2544 2545 2548 2557 2558 2562 2565 2568 2569 2572 2574 2579 2587 2589 2594 2609 2611 2614 2615 2617 2619 2625 2630 2651 2653 2659 2663 2664 2665 2687 2688 2692 2696 93 209 237 AAAATAG/CTATTTT 1 -5 345 372 8 -12.7 3 5 10 15 19 20 25 26 30 33 36 40 42 54 55 59 67 70 78 80 82 88 94 107 108 111 116 121 123 126 130 133 139 151 152 160 164 169 170 172 173 174 175 179 180 185 187 196 204 206 209 216 222 227 229 231 234 247 250 259 263 266 269 276 278 285 290 297 311 328 342 348 351 352 359 360 363 365 379 385 389 396 399 406 415 422 423 424 427 435 436 448 454 460 473 476 487 492 496 528 536 541 542 543 544 549 553 559 575 585 593 594 602 625 628 642 649 656 657 678 679 681 683 684 686 707 709 711 723 728 733 737 745 769 772 779 781 825 836 840 845 850 861 868 876 892 895 904 912 919 931 934 937 962 965 984 990 1000 1001 1010 1015 1053 1062 1069 1072 1097 1101 1111 1128 1130 1136 1145 1164 1168 1205 1206 1208 1262 1267 1286 1291 1293 1312 1323 1328 1329 1331 1344 1355 1364 1366 1377 1401 1404 1405 1443 1446 1479 1482 1525 1531 1539 1542 1546 1559 1563 1571 1578 1579 1591 1609 1612 1614 1616 1681 1685 1687 1691 1694 1698 1710 1717 1726 1732 1736 1739 1750 1758 1764 1805 1817 1818 1838 1851 1853 1858 1861 1868 1890 1893 1914 1931 1950 1962 1963 1968 1970 1971 1972 1976 1985 1991 1992 1993 1996 2006 2007 2018 2022 2026 2030 2046 2047 2048 2055 2056 2071 2116 2117 2119 2129 2133 2144 2146 2156 2173 2174 2178 2186 2193 2205 2210 2234 2237 2251 2256 2263 2280 2284 2292 2294 2296 2306 2311 2327 2339 2343 2351 2352 2355 2368 2381 2383 2389 2396 2405 2409 2411 2414 2431 2433 2439 2448 2472 2477 2507 2517 2519 2530 2537 2550 2552 2563 2572 2583 2597 2611 2628 2631 2633 2635 2644 2645 2646 2648 2661 2662 2673 2677 2681 2682 2688 2689 2690 2698 34 45 61 192 211 265 279 316 CTTTCCA/TGGAAAG 0 -5 310 328 2 -16.6 1 10 11 12 13 17 18 22 29 31 44 45 46 60 62 66 69 70 124 132 134 138 157 191 208 213 240 241 251 264 274 275 280 295 308 310 315 329 330 332 338 345 370 371 383 391 397 398 399 405 414 418 420 425 434 438 444 463 478 486 500 524 527 539 541 545 550 555 571 574 583 584 587 590 609 646 661 665 671 672 687 694 696 698 704 706 716 718 725 743 744 749 787 789 796 811 816 819 824 832 834 843 846 871 884 898 900 916 923 928 945 948 957 967 969 973 977 978 998 1013 1023 1024 1026 1031 1052 1055 1067 1085 1099 1100 1113 1126 1137 1152 1173 1188 1197 1211 1212 1214 1222 1223 1224 1246 1247 1254 1280 1289 1295 1302 1305 1320 1321 1349 1356 1374 1375 1381 1388 1397 1398 1410 1424 1426 1435 1440 1441 1447 1457 1460 1473 1474 1478 1484 1496 1506 1511 1522 1526 1527 1553 1555 1562 1574 1576 1580 1593 1594 1606 1608 1621 1622 1625 1630 1637 1668 1669 1682 1683 1687 1695 1698 1708 1713 1715 1741 1752 1759 1763 1775 1781 1786 1793 1800 1803 1808 1827 1832 1837 1849 1852 1859 1862 1873 1874 1877 1887 1892 1899 1906 1910 1912 1933 1950 1955 1960 1961 1966 1984 1986 1998 2015 2034 2049 2063 2084 2093 2101 2107 2120 2122 2134 2145 2151 2153 2157 2176 2197 2200 2203 2217 2221 2228 2273 2280 2283 2318 2324 2330 2335 2338 2357 2358 2359 2372 2373 2385 2408 2412 2421 2441 2466 2483 2488 2503 2504 2513 2523 2526 2531 2532 2533 2538 2543 2545 2547 2558 2560 2568 2574 2593 2599 2603 2609 2612 2623 2629 2643 2651 2692 87 159 GAAAGTT/AACTTTC 2 1 207 218 5 -7.5 6 11 28 38 46 63 66 88 99 101 103 106 116 127 129 166 178 186 195 197 202 211 213 240 266 275 280 282 288 296 307 312 315 316 340 354 364 377 381 393 399 404 425 426 446 465 467 468 480 486 538 559 562 566 579 583 590 595 598 609 610 616 635 646 665 668 695 697 700 701 720 721 735 742 786 866 870 872 874 899 926 939 940 943 947 970 997 1005 1028 1045 1077 1083 1090 1102 1112 1123 1148 1166 1174 1176 1209 1213 1215 1222 1233 1247 1258 1280 1285 1290 1304 1309 1314 1343 1347 1374 1400 1413 1417 1427 1433 1442 1486 1502 1517 1534 1538 1541 1552 1576 1589 1590 1602 1621 1622 1623 1625 1626 1631 1639 1667 1668 1692 1711 1721 1731 1738 1743 1745 1760 1761 1762 1782 1796 1797 1857 1882 1885 1917 1923 1933 1941 1974 1979 1982 2019 2036 2050 2055 2063 2064 2066 2100 2121 2123 2141 2147 2192 2227 2228 2233 2272 2317 2321 2332 2340 2341 2346 2360 2370 2372 2402 2406 2407 2429 2443 2455 2464 2525 2527 2543 2564 2578 2634 2678 2685 2692 59 70 110 226 260 TTTTCCA/TGGAAAA 0 -5 222 207 7 -5.6 7 20 25 112 176 201 214 263 265 267 271 288 294 324 337 342 343 353 367 379 385 395 403 413 416 455 460 469 491 493 510 528 529 531 535 541 547 567 601 625 636 652 660 666 678 692 697 699 714 728 737 761 764 770 789 806 825 831 838 863 865 880 924 927 929 941 950 959 960 968 987 995 1003 1014 1050 1068 1078 1079 1092 1108 1121 1122 1125 1129 1130 1132 1143 1149 1160 1169 1178 1182 1185 1200 1217 1221 1227 1228 1272 1276 1282 1324 1325 1326 1330 1337 1338 1354 1372 1377 1384 1385 1399 1408 1453 1456 1466 1477 1489 1491 1492 1505 1512 1518 1523 1533 1536 1545 1560 1588 1593 1605 1607 1618 1635 1644 1701 1740 1747 1748 1766 1767 1771 1779 1841 1876 1879 1884 1886 1889 1902 1905 1975 1983 2013 2023 2041 2044 2047 2049 2062 2069 2076 2085 2094 2130 2134 2137 2138 2155 2166 2171 2185 2190 2191 2222 2232 2240 2242 2265 2278 2279 2288 2296 2310 2323 2328 2333 2334 2340 2347 2376 2391 2399 2404 2410 2413 2459 2461 2462 2463 2468 2474 2482 2486 2491 2498 2515 2522 2544 2569 2572 2594 2605 2614 2615 2617 2625 2653 2659 2687 2688 31 61 62 108 109 176 329 ATTTCTA/TAGAAAT 0 -5 214 206 3 -8.7 2 14 21 33 68 77 80 134 137 156 186 196 227 256 258 289 318 321 336 368 373 382 387 394 421 424 430 439 454 459 460 462 490 495 497 499 532 557 563 564 570 576 604 611 617 638 641 648 649 651 682 692 703 736 748 751 754 757 758 767 779 800 823 829 839 841 848 851 853 877 880 917 925 935 936 992 996 1000 1008 1034 1035 1038 1043 1044 1049 1054 1070 1073 1106 1107 1114 1120 1139 1142 1162 1164 1203 1259 1275 1313 1332 1353 1356 1358 1362 1369 1379 1387 1389 1420 1425 1429 1464 1481 1499 1510 1528 1549 1577 1587 1599 1660 1665 1666 1674 1677 1706 1708 1709 1732 1751 1755 1765 1787 1799 1809 1813 1817 1820 1842 1875 1897 1904 1908 1911 1932 1948 1949 1952 1964 1965 1973 1976 2002 2011 2016 2019 2050 2058 2072 2073 2092 2096 2099 2110 2116 2118 2127 2129 2150 2154 2177 2186 2190 2201 2206 2231 2235 2257 2276 2324 2331 2342 2368 2378 2398 2403 2442 2445 2446 2475 2481 2497 2505 2516 2517 2518 2535 2552 2553 2554 2555 2573 2575 2585 2621 2625 2636 2644 2646 2654 2656 2660 2667 137 184 265 TTCCATT/AATGGAA 0 -3 202 205 7 -5.5 7 12 17 18 45 60 61 66 69 134 139 143 145 154 171 191 199 208 267 281 284 294 295 310 315 355 372 395 400 412 430 434 455 457 460 464 488 493 500 504 522 531 535 578 583 601 613 636 645 659 666 678 692 699 721 727 746 761 768 770 787 801 806 819 885 916 923 924 950 954 968 972 1003 1014 1028 1068 1074 1090 1096 1108 1119 1120 1122 1129 1144 1150 1157 1178 1179 1211 1214 1217 1238 1239 1247 1272 1297 1326 1330 1354 1358 1377 1385 1386 1390 1408 1410 1439 1445 1453 1458 1466 1474 1478 1489 1491 1523 1545 1549 1565 1585 1610 1618 1620 1644 1656 1657 1701 1713 1727 1745 1747 1759 1771 1781 1810 1815 1820 1848 1889 1912 1913 1940 1959 1975 1983 2012 2016 2020 2038 2041 2048 2057 2062 2063 2077 2099 2120 2130 2152 2153 2155 2191 2222 2228 2240 2259 2261 2271 2273 2315 2318 2321 2324 2333 2369 2380 2390 2391 2404 2430 2437 2441 2457 2459 2467 2482 2487 2488 2500 2508 2522 2531 2557 2562 2587 2615 2617 2625 2647 2651 2696 93 168 173 237 254 258 281 TTCTATA/TATAGAA 0 -3 192 176 6 -4.9 10 46 130 140 156 182 184 188 219 237 258 269 279 282 287 303 314 368 380 411 412 437 456 459 482 495 506 511 524 532 564 579 591 612 632 633 658 702 748 753 757 765 783 793 797 813 815 823 844 848 870 876 880 882 897 909 917 922 935 976 993 1027 1032 1039 1043 1047 1053 1070 1076 1087 1089 1094 1104 1106 1114 1133 1134 1155 1156 1163 1164 1178 1189 1216 1220 1233 1265 1291 1298 1334 1340 1353 1358 1362 1412 1420 1423 1429 1463 1488 1490 1530 1577 1584 1587 1595 1604 1615 1624 1630 1660 1665 1675 1699 1709 1720 1738 1753 1765 1778 1860 1861 1866 1875 1908 1915 1932 1934 1949 1954 1973 1989 1997 1999 2011 2025 2071 2072 2082 2090 2099 2103 2110 2117 2130 2136 2167 2173 2185 2186 2189 2190 2209 2211 2241 2244 2262 2276 2291 2304 2309 2338 2341 2364 2384 2398 2417 2420 2431 2446 2452 2481 2492 2497 2506 2512 2515 2535 2556 2573 2580 2581 2585 2591 2607 2616 2627 2636 2642 2652 2654 2699 85 219 251 291 299 329 TCTTTCC/GGAAAGA 0 -6 151 170 5 -5.2 1 9 13 17 18 24 31 43 44 58 60 70 115 162 178 191 208 215 241 244 264 274 295 308 310 335 343 370 371 383 398 405 420 463 478 479 500 539 541 555 574 640 671 687 698 718 743 744 787 796 811 824 832 843 846 871 896 923 967 969 973 977 985 998 1003 1013 1023 1026 1040 1052 1055 1067 1071 1093 1137 1173 1188 1197 1200 1207 1214 1223 1254 1289 1306 1349 1356 1375 1424 1447 1460 1473 1474 1478 1484 1509 1511 1538 1553 1580 1608 1641 1682 1683 1687 1695 1698 1708 1741 1759 1763 1781 1786 1789 1832 1837 1855 1859 1874 1912 1955 1961 1984 1986 2066 2084 2120 2134 2197 2200 2203 2318 2324 2330 2335 2338 2393 2466 2503 2513 2521 2523 2533 2545 2558 2560 2568 2574 2599 2623 2643 48 49 127 156 159 GTTTCTA/TAGAAAC 0 -5 175 167 4 -5.8 32 92 108 110 121 127 133 180 207 209 222 229 254 276 285 296 301 303 309 314 327 342 365 370 415 435 445 450 451 452 456 460 482 511 552 581 585 587 591 632 657 669 674 675 686 710 769 771 782 793 813 841 842 849 869 897 912 946 953 963 979 984 996 1001 1003 1004 1006 1022 1031 1041 1089 1116 1141 1146 1154 1189 1208 1216 1234 1235 1251 1252 1261 1265 1273 1277 1291 1307 1320 1329 1333 1339 1348 1352 1385 1436 1444 1472 1475 1476 1488 1515 1523 1530 1537 1543 1547 1548 1554 1568 1593 1624 1629 1642 1645 1654 1667 1721 1722 1733 1753 1760 1836 1860 1870 1888 1896 1915 1921 1958 1967 1970 1991 1997 1999 2010 2018 2024 2045 2072 2081 2098 2108 2112 2130 2160 2170 2183 2199 2209 2212 2215 2236 2261 2271 2297 2303 2311 2372 2376 2377 2384 2397 2434 2452 2506 2551 2566 2580 2584 2613 2616 2627 2637 2675 23 55 291 328 GAAATAG/CTATTTC 1 -5 164 167 5 -5.1 2 13 21 32 55 93 102 106 113 117 142 162 168 225 320 321 335 356 382 394 399 407 411 447 461 479 490 498 502 503 513 546 592 600 604 626 647 673 676 682 703 722 724 736 750 755 792 803 817 833 841 860 862 879 914 925 966 986 988 995 1022 1044 1054 1103 1150 1167 1175 1181 1196 1203 1215 1243 1250 1264 1269 1303 1335 1336 1343 1356 1380 1393 1409 1420 1422 1431 1450 1461 1462 1463 1469 1477 1480 1483 1503 1504 1509 1515 1564 1569 1582 1597 1655 1663 1677 1737 1742 1754 1755 1768 1769 1779 1788 1794 1815 1821 1863 1872 1883 1904 1945 1956 1963 1967 1969 1979 1980 1981 2003 2035 2037 2043 2064 2073 2078 2080 2089 2096 2098 2099 2113 2127 2148 2154 2155 2172 2218 2224 2257 2293 2299 2344 2395 2449 2479 2511 2512 2517 2554 2590 2592 2626 2650 2681 123 206 241 296 327 TAAATAG/CTATTTA 1 -5 174 166 4 -5.8 22 47 63 77 88 181 186 203 219 226 233 236 246 248 254 257 273 282 287 300 301 304 318 323 326 336 349 376 387 440 471 475 485 519 522 523 561 563 599 634 638 641 708 715 729 734 748 782 807 812 830 836 855 883 895 906 910 929 930 965 970 985 1002 1003 1040 1097 1153 1171 1186 1248 1257 1259 1268 1271 1296 1341 1352 1361 1411 1418 1437 1444 1481 1494 1508 1524 1528 1556 1561 1562 1566 1569 1570 1583 1586 1638 1650 1651 1652 1658 1662 1696 1703 1730 1733 1746 1753 1760 1761 1780 1785 1798 1799 1819 1821 1828 1834 1843 1845 1854 1864 1891 1901 1924 1931 1958 2029 2070 2083 2111 2114 2142 2169 2172 2179 2190 2194 2204 2220 2226 2246 2248 2255 2260 2274 2300 2302 2307 2356 2363 2382 2386 2390 2392 2393 2415 2428 2439 2440 2446 2465 2477 2525 2528 2541 2576 2577 2586 2591 2600 2605 2637 2662 2693 32 184 290 302 GAAAGTG/CACTTTC 2 1 164 155 2 -7.1 10 31 74 132 136 145 162 198 243 244 310 317 319 323 331 343 345 350 378 384 388 392 418 420 425 432 470 474 494 521 544 569 583 588 627 630 655 658 704 723 767 799 814 822 827 889 913 920 938 956 961 964 976 982 987 991 994 1009 1019 1022 1024 1035 1086 1088 1132 1184 1191 1193 1284 1341 1342 1376 1398 1410 1416 1448 1455 1470 1496 1497 1516 1532 1555 1563 1564 1594 1606 1628 1648 1670 1722 1728 1740 1772 1790 1807 1808 1827 1835 1850 1877 1880 1888 1894 1906 1910 1922 1930 1946 1951 1959 1988 2017 2027 2028 2052 2074 2122 2135 2143 2145 2165 2182 2187 2195 2216 2219 2237 2254 2264 2281 2282 2309 2312 2314 2326 2353 2362 2365 2371 2388 2421 2426 2447 2463 2465 2518 2526 2529 2534 2546 2549 2558 2581 2604 2606 2622 2638 2655 2666 2668 2669 2681 2684 87 291 AATAGAT/ATCTATT 1 -3 168 147 6 -3.6 67 139 248 257 259 261 263 287 290 311 349 359 376 396 399 406 407 422 461 473 485 515 522 554 596 647 682 683 708 733 745 750 755 776 798 803 815 817 830 841 868 879 883 895 934 1002 1040 1042 1057 1059 1062 1145 1153 1168 1171 1196 1206 1219 1244 1248 1250 1262 1264 1267 1286 1299 1312 1343 1344 1352 1361 1380 1409 1418 1440 1471 1479 1482 1488 1493 1503 1508 1548 1559 1561 1570 1571 1573 1578 1579 1609 1679 1690 1694 1698 1709 1717 1730 1737 1746 1753 1754 1784 1785 1802 1834 1838 1962 1963 1964 1981 1992 2003 2026 2029 2043 2048 2070 2071 2076 2078 2080 2083 2089 2108 2111 2133 2214 2218 2234 2241 2246 2295 2296 2299 2300 2302 2327 2351 2355 2356 2389 2393 2396 2405 2409 2411 2415 2418 2446 2449 2511 2512 2541 2567 2592 2597 2605 2628 2640 2644 2646 2647 2677 2681 2689 2690 2698 6 70 206 281 296 343 ATTTCCA/TGGAAAT 0 -5 150 146 6 -3.6 4 8 61 96 105 142 154 169 199 210 220 223 245 264 281 294 341 361 386 403 417 456 457 461 462 502 504 513 568 578 614 624 693 699 721 726 730 746 762 768 785 828 848 875 902 954 1028 1063 1074 1081 1084 1096 1114 1144 1150 1161 1179 1183 1210 1231 1236 1238 1245 1271 1309 1315 1316 1317 1341 1347 1386 1390 1395 1428 1438 1439 1449 1452 1458 1465 1495 1521 1565 1575 1585 1610 1620 1632 1638 1649 1656 1686 1689 1716 1724 1727 1749 1757 1789 1805 1808 1810 1816 1820 1848 1913 1925 1938 1990 2012 2021 2033 2038 2057 2077 2099 2104 2152 2154 2159 2173 2184 2220 2249 2259 2310 2318 2354 2366 2367 2369 2373 2414 2419 2428 2430 2435 2444 2456 2478 2548 2562 2565 2589 2600 2619 2630 2637 2663 2696 93 160 163 209 236 241 GAAAGTA/TACTTTC 2 1 146 144 4 -4.8 2 25 45 46 69 125 130 138 140 148 172 217 262 297 307 346 362 410 438 458 468 517 537 548 603 606 621 622 629 701 724 752 760 788 818 821 853 856 887 891 901 932 936 944 958 993 1027 1029 1030 1042 1048 1051 1056 1058 1091 1095 1098 1100 1131 1151 1194 1195 1199 1218 1224 1229 1240 1263 1286 1302 1327 1350 1351 1363 1371 1434 1498 1527 1528 1611 1613 1636 1640 1669 1671 1685 1693 1735 1751 1783 1795 1812 1828 1861 1865 1900 1907 1909 1927 1937 1944 1947 1987 1995 1998 2001 2019 2032 2106 2131 2132 2140 2149 2159 2168 2189 2207 2213 2253 2268 2275 2291 2305 2313 2320 2348 2350 2373 2375 2405 2408 2422 2453 2470 2499 2572 2601 2602 2603 2612 2637 2671 2672 2676 2695 2697 235 243 324 337 ATAGAAG/CTTCTAT 1 -2 144 139 3 -5.3 27 59 107 126 153 174 181 185 229 236 254 269 272 273 304 306 320 334 336 359 367 395 400 420 428 447 464 476 502 505 525 534 546 549 553 554 589 592 605 608 628 634 637 640 642 643 670 673 676 688 705 710 717 722 723 773 774 837 859 861 896 921 942 1015 1046 1065 1111 1201 1226 1230 1233 1237 1270 1281 1291 1318 1342 1367 1373 1405 1414 1423 1483 1529 1614 1663 1673 1691 1700 1718 1725 1729 1742 1815 1817 1829 1842 1878 1901 1931 1943 1956 1980 1985 1993 2009 2020 2059 2068 2075 2148 2161 2175 2188 2238 2248 2272 2307 2313 2316 2334 2336 2349 2375 2379 2383 2387 2428 2460 2487 2493 2495 2508 2516 2528 2543 2550 2596 2610 2620 2632 2662 2680 2689 85 258 266 TTCCATA/TATGGAA 0 -3 143 134 4 -4.3 22 32 60 92 132 201 271 317 324 361 381 386 403 416 462 509 510 520 533 584 597 643 652 660 698 700 730 749 764 785 805 826 828 831 834 863 866 900 902 951 959 960 967 1025 1031 1036 1063 1078 1079 1081 1092 1100 1117 1152 1160 1161 1165 1169 1209 1210 1222 1231 1238 1245 1282 1308 1309 1311 1316 1317 1324 1337 1372 1395 1428 1438 1452 1492 1512 1521 1533 1536 1573 1605 1607 1638 1663 1664 1668 1669 1686 1689 1695 1697 1708 1716 1724 1749 1805 1833 1841 1852 1892 1905 1933 1949 1962 1990 2039 2044 2084 2107 2138 2166 2171 2232 2283 2288 2328 2338 2354 2358 2399 2435 2456 2468 2474 2486 2489 2491 2494 2565 2572 2574 2579 2591 2593 2594 2614 2619 2630 2687 2692 99 153 247 275 TTCTATG/CATAGAA 0 -3 144 127 4 -4.0 207 228 252 262 302 312 362 366 367 419 429 439 450 516 570 581 592 608 611 643 651 664 667 669 674 690 710 751 758 766 791 800 839 842 851 852 857 859 905 946 947 953 979 1008 1012 1041 1053 1109 1115 1116 1139 1154 1204 1234 1260 1261 1274 1287 1292 1320 1332 1339 1352 1360 1368 1373 1379 1389 1391 1402 1430 1481 1499 1536 1558 1572 1581 1601 1629 1634 1654 1655 1674 1678 1704 1706 1776 1777 1787 1811 1813 1820 1823 1842 1858 1896 1904 1911 1935 1948 1976 1977 2014 2024 2045 2079 2081 2087 2095 2109 2118 2132 2150 2160 2164 2170 2180 2181 2201 2206 2212 2215 2231 2236 2239 2271 2272 2290 2297 2301 2334 2340 2342 2434 2458 2475 2501 2502 2540 2575 2598 2658 2666 2697 28 119 138 292 AATAGAG/CTCTATT 1 -3 139 125 2 -5.5 175 203 233 278 300 303 335 351 373 385 389 421 470 471 472 475 492 496 498 513 514 528 599 602 623 642 656 677 681 713 729 734 740 748 784 792 812 825 830 833 836 840 860 862 864 904 910 914 929 931 933 951 962 966 990 995 1068 1072 1150 1175 1181 1243 1269 1288 1293 1294 1331 1341 1345 1364 1403 1415 1446 1461 1462 1469 1494 1503 1509 1514 1531 1557 1582 1583 1612 1634 1662 1677 1681 1703 1742 1758 1794 1798 1818 1821 1827 1846 1854 1863 1864 1872 1891 1924 1963 1964 1971 1973 2002 2007 2037 2064 2098 2114 2178 2193 2194 2210 2220 2293 2306 2308 2343 2363 2392 2395 2402 2433 2440 2469 2472 2495 2507 2554 2583 2586 2591 2635 2691 201 316 TCTATTA/TAATAGA 0 -2 138 124 2 -5.5 49 110 136 153 229 237 254 258 261 272 303 306 352 421 447 464 499 505 552 556 576 631 648 688 717 741 747 748 774 775 802 854 858 873 893 894 903 918 921 935 963 971 992 1011 1034 1037 1038 1042 1046 1064 1124 1135 1158 1159 1162 1177 1223 1249 1252 1270 1275 1283 1310 1331 1359 1367 1369 1379 1382 1414 1423 1436 1440 1475 1501 1529 1554 1557 1572 1592 1617 1659 1691 1697 1702 1718 1721 1725 1734 1772 1804 1820 1829 1830 1831 1839 1845 1898 1917 1921 1937 1952 1957 2020 2028 2034 2042 2065 2076 2129 2158 2163 2243 2258 2313 2325 2329 2337 2375 2387 2403 2416 2425 2442 2469 2493 2509 2514 2516 2555 2567 2584 2610 2614 2620 2660 2680 2686 95 343 TAATAGA/TCTATTA 1 -4 138 124 2 -5.5 49 110 136 153 229 237 254 258 261 272 303 306 352 421 447 464 499 505 552 556 576 631 648 688 717 741 747 748 774 775 802 854 858 873 893 894 903 918 921 935 963 971 992 1011 1034 1037 1038 1042 1046 1064 1124 1135 1158 1159 1162 1177 1223 1249 1252 1270 1275 1283 1310 1331 1359 1367 1369 1379 1382 1414 1423 1436 1440 1475 1501 1529 1554 1557 1572 1592 1617 1659 1691 1697 1702 1718 1721 1725 1734 1772 1804 1820 1829 1830 1831 1839 1845 1898 1917 1921 1937 1952 1957 2020 2028 2034 2042 2065 2076 2129 2158 2163 2243 2258 2313 2325 2329 2337 2375 2387 2403 2416 2425 2442 2469 2493 2509 2514 2516 2555 2567 2584 2610 2614 2620 2660 2680 2686 95 343 ACTTTCC/GGAAAGT 0 -6 91 115 2 -5.0 2 10 11 12 38 45 46 50 66 69 101 132 138 186 211 213 240 251 272 275 280 315 345 399 418 425 434 438 494 527 583 590 609 646 661 665 700 704 725 853 1022 1027 1100 1222 1224 1247 1280 1295 1302 1321 1374 1381 1398 1410 1496 1527 1555 1576 1594 1606 1621 1622 1625 1668 1669 1803 1808 1827 1828 1877 1906 1910 1922 1933 1956 1998 2063 2122 2228 2280 2373 2408 2421 2463 2526 2543 2603 2609 2612 2629 2692 59 87 GTTTCCA/TGGAAAC 0 -5 108 108 2 -4.7 36 44 52 55 91 101 145 171 208 260 284 322 355 389 409 419 488 509 520 533 546 551 565 580 597 607 613 619 645 659 663 680 700 712 727 739 795 805 808 826 866 879 885 915 967 972 981 1025 1036 1090 1117 1147 1157 1165 1205 1308 1311 1365 1419 1445 1477 1573 1620 1657 1664 1672 1680 1684 1707 1719 1772 1791 1833 1856 1871 1881 1928 1940 2000 2008 2039 2040 2067 2113 2115 2242 2261 2315 2359 2380 2437 2454 2457 2467 2489 2494 2500 2519 2531 2539 2546 2557 2579 2587 2611 2615 2664 2665 55 237 TTCCATG/CATGGAA 0 -3 115 105 2 -4.5 41 70 96 168 235 260 294 337 353 385 418 454 469 480 529 541 567 590 619 663 665 680 712 714 739 759 795 808 838 848 865 875 977 981 1008 1014 1050 1121 1125 1143 1182 1183 1185 1200 1211 1212 1213 1223 1227 1228 1236 1302 1315 1316 1325 1338 1365 1372 1424 1435 1447 1477 1496 1505 1535 1562 1625 1632 1672 1684 1707 1719 1789 1884 1902 1925 1928 1966 1986 2008 2013 2019 2021 2023 2049 2067 2076 2090 2094 2104 2113 2122 2137 2140 2242 2249 2271 2280 2310 2318 2367 2376 2410 2413 2419 2454 2513 2545 2558 2569 2609 2611 2659 2664 2688 209 216 CAAATAG/CTATTTG 1 -5 117 104 3 -3.6 65 93 138 255 268 283 368 373 414 442 472 514 532 596 617 623 675 677 689 691 713 732 740 776 784 798 815 835 864 867 876 878 896 925 933 935 951 1001 1016 1057 1059 1093 1146 1172 1180 1181 1187 1201 1219 1225 1244 1251 1266 1281 1288 1294 1299 1345 1348 1403 1415 1416 1471 1485 1488 1493 1498 1502 1514 1540 1549 1596 1600 1619 1634 1636 1643 1646 1674 1679 1690 1746 1770 1784 1802 1814 1846 1964 2002 2004 2091 2112 2139 2188 2214 2247 2295 2303 2308 2394 2405 2416 2418 2432 2436 2484 2495 2524 2563 2582 2595 2613 2626 2640 2647 2660 2691 0 47 70 TTCCATC/GATGGAA 0 -3 110 103 1 -5.5 2 105 112 210 223 241 322 332 341 367 389 409 413 491 547 551 565 568 580 607 614 624 671 693 726 737 803 816 843 905 907 915 927 928 941 981 1023 1035 1084 1132 1147 1149 1197 1221 1243 1254 1276 1305 1317 1384 1399 1419 1460 1465 1495 1518 1560 1575 1588 1635 1649 1680 1682 1757 1766 1767 1791 1816 1828 1856 1864 1871 1873 1876 1877 1879 1881 1886 1938 1945 2000 2057 2069 2085 2115 2159 2184 2240 2265 2278 2279 2323 2347 2373 2444 2461 2462 2478 2498 2526 2531 2532 2544 2548 2568 2589 2653 2663 2665 2671 13 GAATAGA/TCTATTC 1 -4 104 103 1 -5.5 14 27 119 131 175 196 217 235 286 296 309 313 333 334 340 357 358 372 402 410 428 433 440 477 507 508 515 554 561 618 629 637 640 643 686 705 762 763 810 820 859 890 942 996 1073 1144 1226 1230 1250 1273 1278 1292 1300 1304 1319 1322 1363 1373 1392 1421 1425 1464 1476 1487 1503 1507 1519 1567 1675 1729 1764 1826 1836 1911 1918 1971 1973 2033 2051 2059 2068 2074 2075 2096 2108 2175 2196 2277 2295 2345 2349 2379 2385 2400 2402 2471 2480 2505 2508 2510 2516 2596 2679 2689 281 AATAGAC/GTCTATT 1 -3 106 102 1 -5.5 15 22 42 131 142 196 257 258 299 326 356 363 393 442 479 490 498 543 571 575 593 594 626 634 684 707 709 715 728 781 807 876 906 919 930 937 970 985 986 988 1069 1101 1103 1180 1186 1187 1215 1223 1296 1303 1323 1331 1349 1377 1392 1411 1416 1431 1437 1485 1546 1566 1569 1572 1596 1616 1646 1650 1658 1736 1769 1772 1780 1788 1883 1945 1968 1979 1996 2015 2022 2074 2117 2129 2139 2144 2172 2256 2260 2263 2284 2294 2352 2390 2394 2436 2439 2484 2563 2572 2631 2633 2660 2673 2688 2693 265 GAAAGTC/GACTTTC 2 1 86 96 0 -5.3 5 12 50 84 90 117 119 138 156 159 175 177 184 239 251 272 305 344 374 375 401 413 431 434 441 501 517 527 573 650 653 661 725 731 779 804 809 876 892 1007 1033 1060 1110 1127 1196 1202 1218 1226 1241 1253 1295 1301 1321 1381 1407 1451 1459 1756 1803 1867 1916 1942 1994 2040 2075 2086 2102 2252 2270 2280 2288 2319 2328 2374 2424 2463 2514 2570 2571 2606 2608 2609 2626 2629 2639 2674 -1 TCTATAT/ATATAGA 0 -2 101 91 3 -3.0 10 46 140 169 188 219 237 282 368 381 384 459 524 542 579 591 612 702 757 855 861 882 917 922 1039 1047 1089 1100 1114 1133 1163 1166 1178 1180 1189 1216 1233 1334 1340 1344 1423 1488 1587 1594 1604 1615 1630 1638 1660 1675 1681 1682 1709 1720 1738 1753 1759 1778 1915 1949 2011 2071 2082 2092 2103 2110 2146 2148 2167 2173 2186 2241 2244 2262 2291 2304 2331 2341 2364 2384 2398 2417 2424 2446 2489 2492 2512 2544 2562 2568 2581 2591 2593 2636 2642 2652 2654 2667 2677 2681 2699 83 219 266 CCTTTCT/AGAAAGG 0 -6 81 79 1 -4.2 58 65 94 134 160 198 250 256 270 291 408 412 419 429 453 516 533 602 639 686 698 702 703 747 753 844 879 909 955 975 983 1002 1066 1071 1134 1140 1176 1207 1268 1269 1289 1297 1306 1320 1357 1366 1392 1406 1586 1601 1627 1732 1779 1819 1822 1828 1860 1866 1867 1895 1922 1954 2080 2163 2175 2179 2198 2201 2225 2245 2285 2286 2339 2420 2482 2490 2551 2582 2591 2670 2694 243 TTTCTAC/GTAGAAA 0 -4 86 77 1 -4.1 38 216 347 373 381 397 400 426 468 484 517 558 603 625 697 767 801 841 847 912 1007 1031 1082 1140 1190 1194 1207 1242 1351 1371 1385 1396 1413 1432 1450 1500 1523 1541 1544 1552 1555 1667 1688 1722 1744 1748 1751 1760 1790 1825 1847 1858 1888 1916 1922 1924 1926 1929 2005 2019 2034 2061 2097 2126 2128 2192 2208 2225 2266 2269 2274 2280 2286 2306 2317 2326 2348 2365 2366 2476 2487 2546 2551 2561 2573 2604 258 TCCATAT/ATATGGA 0 -2 77 74 0 -4.1 20 92 132 242 286 302 317 380 381 386 403 416 462 520 545 579 660 683 764 826 828 834 866 900 1036 1078 1079 1100 1161 1165 1209 1231 1238 1245 1256 1270 1275 1316 1324 1372 1438 1452 1492 1533 1589 1605 1630 1673 1686 1689 1695 1697 1708 1716 1949 2011 2042 2054 2082 2107 2290 2326 2336 2399 2424 2435 2468 2471 2474 2486 2506 2512 2524 2572 2574 2593 2594 -1 TTTCTAG/CTAGAAA 0 -4 81 74 1 -4.0 2 124 256 291 394 460 490 577 582 586 754 760 780 790 810 813 881 907 952 980 983 989 1006 1017 1021 1044 1048 1066 1105 1164 1182 1268 1306 1341 1362 1383 1406 1438 1551 1593 1611 1647 1671 1681 1714 1722 1773 1774 1822 1844 1853 1883 1895 1927 1964 1978 2018 2031 2053 2074 2125 2179 2198 2199 2230 2250 2257 2351 2372 2451 2518 2520 2539 2616 2624 2625 2641 2649 2660 2669 2675 265 CCTTTCC/GGAAAGG 0 -6 74 73 0 -4.0 29 60 76 109 124 157 329 332 338 390 397 404 414 419 486 545 571 584 587 672 694 716 749 789 819 826 834 846 884 900 957 1031 1099 1126 1254 1305 1320 1397 1440 1457 1506 1522 1526 1562 1574 1593 1630 1637 1752 1793 1852 1960 1966 1976 2049 2093 2101 2107 2145 2153 2176 2221 2273 2283 2357 2483 2488 2491 2504 2531 2532 2538 2648 2651 -1 TCTATGT/ACATAGA 0 -2 79 69 1 -3.7 128 228 252 302 324 362 450 516 581 586 664 669 674 690 710 758 791 839 842 851 852 857 905 947 1008 1053 1073 1115 1235 1266 1274 1287 1292 1332 1339 1352 1368 1389 1424 1497 1549 1572 1581 1586 1601 1654 1655 1678 1699 1704 1706 1811 1858 1904 1911 1923 2014 2024 2087 2109 2132 2150 2160 2170 2206 2212 2271 2272 2297 2300 2342 2423 2434 2458 2499 2501 2575 2598 2658 119 TCCATCT/AGATGGA 0 -2 56 64 1 -3.4 2 3 67 105 180 210 322 332 341 389 413 458 491 551 568 614 671 726 737 803 816 843 915 927 1052 1147 1149 1202 1221 1254 1384 1408 1418 1419 1460 1478 1567 1575 1681 1682 1757 1766 1767 1938 2057 2240 2265 2299 2331 2347 2373 2391 2444 2526 2663 2671 167 GCTTTCC/GGAAAGC 0 -6 64 62 0 -3.4 22 38 62 134 178 320 330 391 444 524 550 696 706 816 898 916 928 945 948 978 1024 1085 1113 1152 1211 1212 1246 1251 1388 1426 1435 1441 1584 1588 1713 1715 1775 1800 1849 1862 1873 1874 1887 1892 1899 1950 2015 2034 2049 2151 2157 2207 2217 2358 2359 2372 2385 2412 2441 2532 2547 2583 2593 2622 -1 AAAGTAG/CTACTTT 2 2 63 58 1 -3.1 141 158 172 216 232 346 438 451 458 468 517 603 622 629 752 760 777 821 856 891 901 936 985 1007 1048 1098 1151 1153 1190 1195 1213 1229 1363 1413 1428 1434 1498 1523 1528 1669 1688 1697 1751 1927 2017 2019 2022 2029 2032 2039 2131 2132 2168 2192 2213 2253 2313 2373 2418 2572 2602 2643 2684 31