]> 0.222 0.278 0.278 0.222 meme -oc xstreme_example_output_files/meme_out -mod zoops -minw 6 -maxw 15 -bfile xstreme_example_output_files/background -markov_order 2 -seed 0 -dna -revcomp -evt 0.05 -nostatus nrmix.nseqs.100.100bp.seed.1.fa -mpi Timothys-Mac-Mini.local zoops 1000 0.05 E-value of product of p-values E-value of product of p-values 6 15 11 1 yes yes 2 2100 0.8 uni 0.5 dirichlet 0.01 50 1e-05 210000 0 0 100000 0 no 1000 both 1000 Stopped because the next motif E-value > 5.00e-02. 0.222 0.278 0.278 0.222 -509 -78 -1391 191 -92 -1391 -103 175 23 -542 -1391 173 -119 -142 -67 149 -164 28 -90 99 -277 -1391 -1391 212 -1391 -210 -225 198 -5 -78 -133 121 -209 -6 -210 148 -85 31 -151 97 -1391 -1391 -1391 217 -1391 -310 7 161 -1391 -1391 -383 214 -509 62 -61 79 63 -67 -1391 111 0.006494 0.162338 0.000000 0.831169 0.116883 0.000000 0.136364 0.746753 0.259740 0.006494 0.000000 0.733766 0.097403 0.103896 0.175325 0.623377 0.071429 0.337662 0.149351 0.441558 0.032468 0.000000 0.000000 0.967532 0.000000 0.064935 0.058442 0.876623 0.214286 0.162338 0.110390 0.512987 0.051948 0.266234 0.064935 0.616883 0.123377 0.344156 0.097403 0.435065 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.032468 0.292208 0.675325 0.000000 0.000000 0.019481 0.980519 0.006494 0.428571 0.181818 0.383117 0.344156 0.175325 0.000000 0.480519 TT[TA]T[TC]TT[TA][TC][TC]T[TG]T[CT][TA] -2 -17 38 -37 152 -217 11 -1436 -1436 -1436 -1436 217 -1436 -1436 183 -396 217 -1436 -1436 -1436 -554 146 -48 -296 -1436 -1436 -1436 217 -354 182 -1436 -1436 217 -1436 -1436 -1436 -322 -170 138 -41 0.219048 0.247619 0.361905 0.171429 0.638095 0.061905 0.300000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.985714 0.014286 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.004762 0.766667 0.200000 0.028571 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.019048 0.980952 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.023810 0.085714 0.723810 0.166667 [GCA][AG]TGA[CG]TCAG -178 3 86 -61 -208 140 -1498 -6 -1498 152 -217 -68 -192 175 -1498 -616 -1498 185 -1498 -1498 -33 -1498 121 -29 -1498 179 -291 -1498 -1498 185 -1498 -1498 -1498 144 -1498 15 -271 169 -1498 -171 -1498 146 -154 -68 0.064815 0.283951 0.506173 0.145062 0.052469 0.734568 0.000000 0.212963 0.000000 0.799383 0.061728 0.138889 0.058642 0.938272 0.000000 0.003086 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.175926 0.000000 0.641975 0.182099 0.000000 0.962963 0.037037 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.753086 0.000000 0.246914 0.033951 0.898148 0.000000 0.067901 0.000000 0.765432 0.095679 0.138889 [GC][CT]CCCGCC[CT]CC -187 167 -1439 -211 -1439 184 -1439 -557 159 -489 -73 -53 -1439 113 50 -1439 -66 46 -125 70 187 -1439 -181 -105 -1439 -1439 185 -1439 66 -1439 120 -457 -225 -1439 118 54 -1439 -1439 185 -1439 -276 -1439 173 -240 -25 137 -1439 -125 60 -244 102 -225 -118 93 13 -166 -62 39 -125 75 0.060748 0.887850 0.000000 0.051402 0.000000 0.995327 0.000000 0.004673 0.668224 0.009346 0.168224 0.154206 0.000000 0.607477 0.392523 0.000000 0.140187 0.383178 0.116822 0.359813 0.813084 0.000000 0.079439 0.107477 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.350467 0.000000 0.640187 0.009346 0.046729 0.000000 0.630841 0.322430 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.032710 0.000000 0.925234 0.042056 0.186916 0.719626 0.000000 0.093458 0.336449 0.051402 0.565421 0.046729 0.098131 0.528037 0.303738 0.070093 0.144860 0.364486 0.116822 0.373832 CCA[CG][CT]AG[GA][GT]GGC[GA][CG][TC] -1339 182 -389 -1339 -1339 -1339 -1339 217 -1339 -1339 -1339 217 217 -1339 -1339 -1339 -1339 -1339 -1339 217 -1339 185 -1339 -1339 -1339 -1339 -1339 217 0.000000 0.981308 0.018692 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 CTTATCT -3 -267 141 -1117 204 -168 -1117 -1117 -235 178 -1117 -1117 -1117 -68 -1117 190 217 -1117 -1117 -1117 -1117 185 -1117 -1117 190 -1117 -68 -1117 97 -267 -1117 123 -1117 78 -168 97 -1117 -1117 -1117 217 -1117 185 -1117 -1117 -1117 185 -1117 -1117 -1117 185 -1117 -1117 190 -1117 -68 -1117 -1117 -168 141 -35 0.217391 0.043478 0.739130 0.000000 0.913043 0.086957 0.000000 0.000000 0.043478 0.956522 0.000000 0.000000 0.000000 0.173913 0.000000 0.826087 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.826087 0.000000 0.173913 0.000000 0.434783 0.043478 0.000000 0.521739 0.000000 0.478261 0.086957 0.434783 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.826087 0.000000 0.173913 0.000000 0.000000 0.086957 0.739130 0.173913 [GA]ACTACA[TA][CT]TCCCAG -1055 -1055 -206 207 -1055 -1055 185 -1055 -1055 185 -1055 -1055 196 -1055 -206 -173 -1055 185 -1055 -1055 -73 -1055 -1055 196 -1055 185 -1055 -1055 -1055 175 -206 -1055 207 -206 -1055 -1055 -1055 -1055 185 -1055 -1055 164 -206 -173 -1055 185 -1055 -1055 -1055 -1055 -1055 217 -1055 -1055 185 -1055 -1055 -1055 185 -1055 0.000000 0.000000 0.066667 0.933333 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.866667 0.000000 0.066667 0.066667 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.133333 0.000000 0.000000 0.866667 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.933333 0.066667 0.000000 0.933333 0.066667 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.866667 0.066667 0.066667 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 TGCACTCCAGCCTGG 164 -138 -58 -405 162 -92 -180 -125 140 -138 -206 11 -1287 111 26 -173 203 -280 -438 -247 -1287 -1287 185 -1287 -1287 -92 162 -1287 217 -1287 -1287 -1287 205 -1287 -1287 -147 -1287 -438 183 -1287 -1287 -238 -1287 209 0.693333 0.106667 0.186667 0.013333 0.680000 0.146667 0.080000 0.093333 0.586667 0.106667 0.066667 0.240000 0.000000 0.600000 0.333333 0.066667 0.906667 0.040000 0.013333 0.040000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.146667 0.853333 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.920000 0.000000 0.000000 0.080000 0.000000 0.013333 0.986667 0.000000 0.000000 0.053333 0.000000 0.946667 AA[AT][CG]AGGAAGT -6 -1333 145 -293 -1333 185 -1333 -1333 -1333 -1333 185 -1333 -1333 164 -103 -1333 84 97 -225 -1333 -1333 -14 -1333 175 -1333 -114 165 -1333 -1333 185 -1333 -1333 -1333 -384 180 -451 -293 180 -1333 -1333 39 -325 129 -1333 0.213592 0.000000 0.757282 0.029126 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.864078 0.135922 0.000000 0.398058 0.543689 0.058252 0.000000 0.000000 0.252427 0.000000 0.747573 0.000000 0.126214 0.873786 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.019417 0.970874 0.009709 0.029126 0.970874 0.000000 0.000000 0.291262 0.029126 0.679612 0.000000 [GA]CGC[CA][TC]GCGC[GA] 155 -1097 33 -1097 -1097 -1097 185 -1097 -1097 152 -48 -1097 -1097 -1097 -1097 217 -15 152 -1097 -1097 217 -1097 -1097 -1097 -215 133 -1097 17 -15 -15 -1097 131 -215 -247 169 -1097 -1097 185 -1097 -1097 217 -1097 -1097 -1097 -56 -1097 161 -1097 -56 122 -147 -115 -115 169 -1097 -1097 -1097 -1097 -1097 217 0.650000 0.000000 0.350000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.800000 0.200000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.200000 0.800000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.050000 0.700000 0.000000 0.250000 0.200000 0.250000 0.000000 0.550000 0.050000 0.050000 0.900000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.150000 0.000000 0.850000 0.000000 0.150000 0.650000 0.100000 0.100000 0.100000 0.900000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 [AG]G[CG]T[CA]A[CT][TCA]GCAGCCT