9434	10.3	11.6	2.6	chr1	1106614	1108045	(247848377)	+	LTR12C	LTR/ERV1	2	1579	(0)	1368
1377	17.6	14.7	6.2	chr1	4024423	4024762	(244931660)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	1	374	(0)	4728
1256	18.5	3.0	18.3	chr1	7144058	7144494	(241811928)	C	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	(16)	374	7	9467
890	16.3	0.0	0.0	chr1	7219754	7219888	(241736534)	+	FLAM_C	SINE/Alu	1	135	(8)	9555
1731	19.3	3.5	5.8	chr1	7219889	7220101	(241736321)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	157	372	(2)	9554
1460	24.3	3.2	4.2	chr1	7565736	7566113	(241390309)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(0)	374	1	10006
1435	21.1	4.3	2.5	chr1	7656200	7656564	(241299858)	C	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	(18)	372	1	10124
672	20.5	12.6	0.0	chr1	8145647	8145812	(240810610)	+	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	201	390	(0)	11015
949	20.0	3.2	3.1	chr1	8311062	8311281	(240645141)	+	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	201	390	(0)	11446
1524	20.7	0.8	5.7	chr1	8690072	8690456	(240265966)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(8)	366	1	12060
932	15.2	7.1	0.0	chr1	9516336	9516519	(239439903)	+	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	193	390	(0)	13775
1249	21.0	5.9	0.4	chr1	11368352	11368623	(237587799)	+	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	103	390	(0)	17555
1618	17.2	14.4	0.6	chr1	11583285	11583606	(237372816)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	1	374	(0)	17993
1485	19.8	5.2	4.7	chr1	13809803	13810162	(235146260)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(12)	362	1	22068
1576	18.8	4.8	8.0	chr1	15096537	15096923	(233859499)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(0)	374	1	24530
1445	17.9	7.3	4.6	chr1	15174642	15174987	(233781435)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(11)	363	8	24707
261	24.6	0.0	0.0	chr1	15460016	15460072	(233496350)	C	AluSz6	SINE/Alu	(13)	299	243	25306
279	32.2	4.0	1.6	chr1	15460088	15460210	(233496212)	C	MIRb	SINE/MIR	(91)	177	52	25307
296	31.6	6.8	0.7	chr1	16164414	16164550	(232791872)	+	MIR	SINE/MIR	73	218	(44)	26824
197	35.3	4.7	2.9	chr1	17765645	17765749	(231190673)	+	L2a	LINE/L2	3221	3327	(99)	30183
662	20.6	7.8	0.7	chr1	17902745	17902886	(231053536)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	180	332	(42)	30479
1454	21.2	8.8	1.4	chr1	19246834	19247192	(229709230)	+	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	3	390	(0)	33286
518	21.2	8.4	3.8	chr1	19469235	19469470	(229486952)	+	MER113	DNA/hAT-Charlie	32	484	(37)	33692
2068	14.8	1.9	2.7	chr1	21030220	21030586	(227925836)	+	THE1B	LTR/ERVL-MaLR	1	364	(0)	36999
1590	19.8	1.6	8.0	chr1	23644430	23644829	(225311593)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	1	374	(0)	42975
1755	16.0	3.1	0.7	chr1	24727249	24727530	(224228892)	C	AluSq2	SINE/Alu	(20)	293	5	45586
13	10.1	5.9	2.8	chr1	27122850	27122883	(221833539)	+	G-rich	Low_complexity	1	36	(0)	50979
1813	17.0	1.6	9.4	chr1	29368268	29368669	(219587753)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(4)	370	1	56477
263	24.4	8.4	6.4	chr1	31170752	31170891	(217785531)	C	MIR3	SINE/MIR	(10)	198	56	60028
263	29.2	2.6	1.0	chr1	31394873	31395002	(217561420)	C	MIR3	SINE/MIR	(77)	153	20	60576
14	19.1	0.0	2.6	chr1	32248485	32248522	(216707900)	+	(GAGCCG)n	Simple_repeat	1	38	(0)	62400
1773	17.7	4.6	1.1	chr1	37439589	37439943	(211516479)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(6)	368	1	72733
1448	21.0	5.4	6.6	chr1	41835183	41835560	(207120862)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(0)	374	2	81547
294	31.4	12.4	5.5	chr1	46340413	46340614	(202615808)	+	L2b	LINE/L2	3009	3226	(149)	89844
1785	18.8	2.2	7.7	chr1	47522582	47522973	(201433449)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(4)	370	1	91778
1705	18.4	5.5	2.3	chr1	48834402	48834751	(200121671)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	6	367	(7)	94100
1569	17.6	7.3	1.6	chr1	52518261	52518623	(196437799)	C	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	(5)	385	1	101015
1567	20.6	0.3	9.7	chr1	53607720	53607958	(195348464)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(0)	374	159	103406
1592	19.4	4.0	5.6	chr1	58414981	58415357	(190541065)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	4	374	(0)	112816
1589	21.8	3.9	4.1	chr1	59620906	59621292	(189335130)	C	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	(0)	390	5	115173
234	30.8	6.0	1.3	chr1	60205057	60205135	(188751287)	+	L2b	LINE/L2	3293	3375	(0)	116163
321	26.0	7.7	5.7	chr1	60205146	60205337	(188751085)	C	L1M5	LINE/L1	(324)	5800	5605	116164
1162	18.1	14.6	8.7	chr1	60524144	60524464	(188431958)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(0)	365	23	116665
1850	14.2	4.8	1.7	chr1	64040508	64040851	(184915571)	C	MLT1A0	LTR/ERVL-MaLR	(7)	358	4	123185
1457	18.3	2.3	8.5	chr1	64573089	64573453	(184382969)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	4	345	(29)	124127
11	13.4	5.7	2.7	chr1	67833344	67833378	(181123044)	+	(CCGCCG)n	Simple_repeat	1	37	(0)	129658
19	6.8	3.2	0.0	chr1	67833416	67833446	(181122976)	+	(CCT)n	Simple_repeat	1	32	(0)	129659
1459	17.5	9.0	7.8	chr1	75764264	75764648	(173191774)	C	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	(0)	390	1	140416
1548	17.1	6.3	9.6	chr1	86820538	86820846	(162135576)	C	MLT1A0	LTR/ERVL-MaLR	(0)	365	55	156148
225	17.5	3.4	1.7	chr1	90642916	90642973	(158313449)	+	HAL1	LINE/L1	2146	2204	(303)	161575
456	25.0	7.1	2.6	chr1	90643001	90643189	(158313233)	+	HAL1	LINE/L1	2310	2507	(0)	161575
1274	25.0	1.6	5.6	chr1	92129955	92130344	(156826078)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(0)	374	1	163943
1754	18.8	4.6	4.6	chr1	94742537	94742926	(154213496)	C	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	(0)	390	1	168239
17	15.9	4.8	0.0	chr1	95117298	95117339	(153839083)	+	(GCCGGA)n	Simple_repeat	1	44	(0)	168893
2169	9.9	0.0	0.3	chr1	109241040	109241322	(139715100)	+	AluSx	SINE/Alu	22	303	(9)	188289
1593	23.9	7.7	1.1	chr1	110498768	110499131	(138457291)	+	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	1	390	(0)	190256
1457	18.4	4.3	8.9	chr1	115078405	115078797	(133877625)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	1	374	(0)	197654
1554	22.9	3.2	4.2	chr1	115669925	115670307	(133286115)	+	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	1	379	(11)	198524
1800	15.8	6.0	0.9	chr1	117108799	117109144	(131847278)	+	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	30	390	(0)	200765
1091	20.8	1.3	1.7	chr1	117281057	117281301	(131675121)	C	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	(0)	408	157	201054
269	25.4	5.6	5.0	chr1	117759061	117759201	(131197221)	C	MIR3	SINE/MIR	(34)	174	33	201767
12	20.4	2.4	2.4	chr1	151071222	151071262	(97885160)	+	G-rich	Low_complexity	1	42	(0)	220420
6325	13.2	1.9	0.2	chr1	151362472	151363452	(97592970)	+	MSTA-int	LTR/ERVL-MaLR	634	1631	(0)	221057
53	0.0	0.0	0.0	chr1	151511436	151511483	(97444939)	+	(GCCCGA)n	Simple_repeat	1	48	(0)	221378
1332	21.5	5.9	5.9	chr1	157303680	157304069	(91652353)	+	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	1	390	(0)	231549
1639	17.7	6.6	1.2	chr1	171495814	171496156	(77460266)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(11)	363	1	252836
1619	22.3	2.7	3.2	chr1	181163065	181163435	(67792987)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(2)	372	4	267577
1881	15.8	5.4	2.4	chr1	182637686	182638062	(66318360)	+	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	1	389	(1)	269794
1806	17.3	2.2	6.3	chr1	184238346	184238728	(64717694)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	2	368	(6)	272324
1669	20.0	1.4	7.6	chr1	185445921	185446315	(63510107)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(4)	370	1	274273
1472	19.6	4.0	4.3	chr1	192729024	192729397	(56227025)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	2	374	(0)	283771
1751	18.2	3.1	16.6	chr1	200263010	200263462	(48692960)	+	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	1	390	(0)	293887
1866	21.2	0.5	5.9	chr1	201245006	201245396	(47711026)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	1	370	(4)	295720
1541	20.7	6.9	6.4	chr1	201764237	201764624	(47191798)	C	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	(0)	390	1	296593
1263	22.0	8.9	3.2	chr1	203446307	203446644	(45509778)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	1	359	(15)	299611
1548	18.7	2.6	1.5	chr1	205035941	205036282	(43920140)	+	MLT1A0	LTR/ERVL-MaLR	20	365	(0)	302669
623	31.8	6.3	4.7	chr1	205473865	205474142	(43482280)	+	L2a	LINE/L2	2807	3072	(354)	303505
1418	21.2	10.7	1.5	chr1	208000532	208000870	(40955552)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(0)	374	1	307460
15	21.3	1.4	8.4	chr1	211416884	211416953	(37539469)	+	(CCG)n	Simple_repeat	1	71	(0)	312657
1599	20.6	4.0	3.8	chr1	212155043	212155415	(36801007)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	1	374	(0)	314004
1370	17.8	8.6	11.4	chr1	212231256	212231641	(36724781)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	1	374	(0)	314175
1469	18.6	10.5	7.2	chr1	214233161	214233536	(34722886)	+	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	1	390	(0)	317411
1847	19.3	3.3	1.4	chr1	220841554	220841911	(28114511)	+	MLT1A0	LTR/ERVL-MaLR	1	365	(0)	326826
1464	20.5	8.4	3.9	chr1	223349849	223350209	(25606213)	+	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	1	379	(11)	330566
17	19.6	6.7	3.8	chr1	223845956	223846030	(25110392)	+	(CCGCG)n	Simple_repeat	1	80	(0)	331314
362	26.5	16.2	3.7	chr1	225657675	225657835	(23298587)	C	MER130	DNA	(1241)	353	169	334316
233	30.2	5.0	13.1	chr1	225830090	225830151	(23126271)	C	L2b	LINE/L2	(143)	3244	3183	334651
5300	15.8	6.2	4.4	chr1	226464024	226465134	(22491288)	+	LTR12D	LTR/ERV1	1	1132	(122)	335955
1296	21.3	6.9	1.8	chr1	226627006	226627335	(22329087)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	27	374	(0)	336208
330	29.3	11.8	0.9	chr1	226778650	226778829	(22177593)	+	MIRc	SINE/MIR	54	247	(21)	336458
1597	22.7	4.1	4.3	chr1	234106348	234106738	(14849684)	C	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	(0)	390	1	347363
1267	21.8	6.9	11.5	chr1	234223752	234224048	(14732374)	C	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	(0)	390	116	347533
770	26.5	3.8	7.0	chr10	2242411	2242767	(131554655)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	30	374	(0)	373496
1471	22.3	4.6	2.5	chr10	6437160	6437518	(127359904)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	1	367	(7)	379515
1627	19.1	2.4	15.8	chr10	6949271	6949699	(126847723)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(1)	373	4	380323
1741	19.2	2.7	4.0	chr10	7039267	7039636	(126757786)	+	MLT1A0	LTR/ERVL-MaLR	1	365	(0)	380454
1521	19.8	8.4	0.6	chr10	7279942	7280282	(126517140)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	1	370	(4)	380768
387	32.0	3.0	4.0	chr10	7297299	7297500	(126499922)	+	MIRb	SINE/MIR	53	252	(16)	380795
2019	12.8	0.0	0.0	chr10	7314626	7314898	(126482524)	+	AluSx1	SINE/Alu	1	273	(39)	380822
1303	20.8	3.8	12.4	chr10	7642915	7643325	(126154097)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	1	374	(0)	381350
2242	9.7	0.0	0.3	chr10	7690696	7690984	(126106438)	+	AluY	SINE/Alu	23	310	(1)	381438
1535	22.8	7.0	0.6	chr10	7690985	7691179	(126106243)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	145	358	(16)	381437
1622	23.1	0.3	2.1	chr10	10864411	10864790	(122932632)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(0)	374	2	386222
1693	22.0	4.3	1.9	chr10	11040941	11041301	(122756121)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(0)	374	5	386450
1664	20.0	6.0	1.1	chr10	11784740	11785103	(122012319)	C	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	(4)	386	4	387515
1588	20.6	3.8	1.6	chr10	12712400	12712764	(121084658)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(0)	374	2	389440
971	17.8	4.9	4.0	chr10	12793477	12793698	(121003724)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(0)	374	151	389585
1371	22.1	3.2	6.3	chr10	12882218	12882599	(120914823)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	5	374	(0)	389747
1672	18.4	5.2	5.9	chr10	13002711	13003098	(120794324)	C	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	(2)	388	4	389944
1451	14.9	4.7	21.3	chr10	13920985	13921264	(119876158)	C	MLT1A0	LTR/ERVL-MaLR	(0)	365	153	391618
1775	18.7	2.5	2.4	chr10	13921876	13922249	(119875173)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	1	404	(7)	391620
1399	18.9	8.8	4.3	chr10	14570959	14571306	(119226116)	C	MLT1A0	LTR/ERVL-MaLR	(0)	365	1	392676
597	21.9	14.8	0.6	chr10	15185660	15185815	(118611607)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(0)	374	193	393789
1445	22.3	6.8	3.5	chr10	17414495	17414865	(116382557)	C	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	(0)	390	7	397336
1631	24.6	1.9	2.1	chr10	17640359	17640732	(116156690)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(0)	374	2	397798
1482	21.5	5.9	4.2	chr10	21204459	21204667	(112592755)	+	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	184	390	(0)	403144
2091	15.4	1.3	8.7	chr10	23034977	23035380	(110762042)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(0)	374	1	406157
1200	22.4	9.1	7.7	chr10	33360231	33360496	(100436926)	C	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	(7)	383	116	423134
1158	23.5	5.6	9.0	chr10	33625597	33625984	(100171438)	C	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	(16)	374	1	423527
1664	18.2	3.1	7.1	chr10	33743684	33743885	(100053537)	C	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	(35)	355	176	423714
1622	20.6	3.5	3.8	chr10	34938880	34939252	(98858170)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(2)	372	1	425631
2517	12.9	2.1	0.0	chr10	44521311	44521690	(89275732)	+	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	1	388	(2)	434925
1542	23.2	2.9	3.7	chr10	46102626	46103005	(87694417)	+	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	13	389	(1)	437203
1353	21.8	0.6	9.1	chr10	49357409	49357806	(84439616)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	11	374	(0)	441787
1283	20.9	4.7	13.0	chr10	50652476	50652898	(83144524)	+	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	5	390	(0)	443701
2113	12.6	3.6	4.9	chr10	63245286	63245478	(70551944)	C	THE1B	LTR/ERVL-MaLR	(2)	362	185	461415
2490	7.9	0.3	0.0	chr10	63245479	63245781	(70551641)	C	AluSq10	SINE/Alu	(9)	304	1	461416
825	17.6	2.6	0.6	chr10	71320366	71320544	(62476878)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(19)	371	188	474997
846	18.8	10.7	8.3	chr10	71933928	71934217	(61863205)	C	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	(0)	390	93	476232
1150	19.5	7.5	8.5	chr10	72759632	72760006	(61037416)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	4	374	(0)	477998
1884	17.3	3.9	5.5	chr10	75484542	75484938	(58312484)	+	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	1	390	(0)	483174
1679	21.0	1.2	2.4	chr10	77141287	77141669	(56655753)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	1	372	(2)	485407
49	0.0	5.8	0.0	chr10	77215879	77215930	(56581492)	+	(TC)n	Simple_repeat	1	55	(0)	485538
1420	19.1	1.7	5.9	chr10	77215931	77216036	(56581386)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	189	293	(81)	485537
1636	16.7	3.7	3.4	chr10	77216042	77216363	(56581059)	+	L1MB8	LINE/L1	5855	6177	(1)	485539
1391	20.2	10.0	7.1	chr10	78183977	78184354	(55613068)	+	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	1	390	(0)	487328
1229	24.3	11.5	2.4	chr10	79337873	79338370	(54459052)	C	MLT1G3	LTR/ERVL-MaLR	(1)	594	1	489449
886	24.4	1.0	1.9	chr10	84714590	84714794	(49082628)	C	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	(0)	390	188	497254
7686	15.0	2.6	6.0	chr10	87030143	87031521	(46765901)	C	LTR12C	LTR/ERV1	(247)	1332	2	500594
2987	14.8	18.1	14.1	chr10	87031522	87031664	(46765758)	C	MER4-int	LTR/ERV1	(5016)	1582	1409	500592
1707	21.7	0.3	5.8	chr10	87838554	87838949	(45958473)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	1	374	(0)	501893
1693	20.2	3.3	4.6	chr10	92786451	92786845	(41010577)	C	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	(0)	390	1	509901
1937	16.5	6.2	3.6	chr10	95884772	95885135	(37912287)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	1	374	(0)	515050
1620	23.2	0.3	2.0	chr10	99461020	99461367	(34336055)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	32	373	(1)	521500
956	27.0	5.1	3.0	chr10	111501510	111501875	(22295547)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(0)	374	1	541206
1706	14.7	9.2	3.3	chr10	113953733	113954069	(19843353)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	15	373	(1)	545139
1916	15.8	5.3	0.0	chr10	116819357	116819697	(16977725)	+	MLT1A0	LTR/ERVL-MaLR	6	365	(0)	549430
981	20.4	7.6	9.1	chr10	118635508	118635849	(15161573)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	33	457	(10)	552370
1192	21.9	4.7	9.5	chr10	118637679	118638056	(15159366)	+	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	1	359	(31)	552374
40	2.2	4.3	0.0	chr10	120400638	120400683	(13396739)	+	(CT)n	Simple_repeat	1	48	(0)	555590
1822	19.5	1.3	4.2	chr10	120400684	120400871	(13396551)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	188	374	(0)	555589
2142	15.5	1.0	5.7	chr10	121708149	121708552	(12088870)	C	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	(3)	387	3	557583
1450	19.7	11.3	2.3	chr10	125427006	125427358	(8370064)	C	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	(0)	390	2	563501
1127	23.5	3.2	7.7	chr10	129477400	129477787	(4319635)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	1	370	(4)	568550
33	5.2	0.0	0.0	chr11	8964364	8964403	(126122219)	+	(GGCTCA)n	Simple_repeat	1	40	(0)	584803
1757	18.4	3.6	7.4	chr11	15332336	15332741	(119753881)	C	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	(0)	390	1	595345
276	25.6	5.7	8.9	chr11	30914393	30914538	(104172084)	C	Charlie4z	DNA/hAT-Charlie	(3)	164	24	619236
1531	20.1	4.9	5.1	chr11	31425393	31425781	(103660841)	C	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	(2)	388	1	619951
1606	19.2	2.2	7.9	chr11	31606878	31607255	(103479367)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	3	358	(16)	620209
1510	19.3	2.8	16.6	chr11	46250282	46250734	(88835888)	C	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	(1)	389	1	643598
1384	22.1	3.6	7.6	chr11	57572086	57572492	(77514130)	C	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	(0)	390	1	654017
28	8.1	0.0	0.0	chr11	68841793	68841832	(66244790)	+	(GCG)n	Simple_repeat	1	40	(0)	674058
1530	20.3	2.5	6.7	chr11	69591418	69591791	(65494831)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	1	358	(16)	675346
900	23.7	2.3	6.2	chr11	69598488	69598761	(65487861)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	112	374	(0)	675357
1556	21.4	1.9	7.1	chr11	70836798	70837190	(64249432)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	3	374	(0)	677431
898	20.7	6.0	8.5	chr11	91972004	91972415	(43114207)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(17)	391	1	713500
1237	24.0	3.0	7.4	chr11	107150523	107150914	(27935708)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(0)	374	1	734498
17	23.7	0.0	3.7	chr11	115504293	115504358	(19582264)	+	(CAGCCG)n	Simple_repeat	1	63	(0)	747726
1576	19.8	4.3	6.5	chr11	123253526	123253908	(11832714)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	1	374	(0)	761179
1594	19.1	3.5	8.8	chr11	124703953	124704348	(10382274)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	1	374	(0)	763438
1350	22.0	7.8	5.5	chr12	3332595	3332959	(129942350)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(0)	374	1	783668
40	7.7	0.0	0.0	chr12	6778328	6778382	(126496927)	+	(CCGGAG)n	Simple_repeat	1	55	(0)	789363
1679	19.1	5.9	4.2	chr12	7447713	7448095	(125827214)	+	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	1	390	(0)	790392
758	23.3	2.4	1.2	chr12	10739778	10739942	(122535367)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	208	374	(0)	795605
1728	19.8	5.2	0.8	chr12	15084729	15085099	(118190210)	C	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	(2)	388	1	802315
1764	16.8	0.5	14.5	chr12	23409682	23409946	(109865363)	C	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	(0)	390	166	813543
1584	14.2	2.4	20.8	chr12	27445716	27445891	(105829418)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(0)	374	215	819559
2332	12.6	0.0	0.0	chr12	27445892	27446201	(105829108)	C	AluSg	SINE/Alu	(0)	310	1	819560
1438	20.8	4.3	0.6	chr12	31017053	31017386	(102257923)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	1	347	(27)	824553
679	32.0	9.0	2.2	chr12	40756619	40756982	(92518327)	+	L2a	LINE/L2	3036	3426	(0)	834147
1078	22.4	18.1	3.2	chr12	40756997	40757309	(92518000)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(0)	374	5	834148
1304	19.7	5.2	8.2	chr12	42958247	42958622	(90316687)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	1	364	(10)	837426
1858	17.4	2.8	6.9	chr12	49084399	49084805	(84190504)	C	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	(0)	390	1	846365
46	0.0	0.0	0.0	chr12	66636716	66636754	(66638555)	+	(TG)n	Simple_repeat	1	39	(0)	874658
1446	20.1	2.1	8.2	chr12	66636755	66636960	(66638349)	+	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	181	386	(4)	874657
1675	21.2	0.3	1.4	chr12	67597420	67597782	(65677527)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	12	370	(4)	876150
962	21.3	15.7	3.5	chr12	69156870	69157341	(64117968)	C	LTR50	LTR/ERVL	(141)	654	22	878797
1437	19.4	6.5	5.0	chr12	69323702	69324081	(63951228)	+	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	1	386	(4)	879064
1794	17.8	5.2	5.9	chr12	89564436	89564824	(43710485)	C	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	(2)	388	3	907241
2013	18.2	1.5	5.0	chr12	94670350	94670578	(38604731)	C	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	(0)	390	179	915607
1513	20.5	4.4	6.9	chr12	106025123	106025499	(27249810)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	4	370	(4)	935461
728	22.7	5.4	1.1	chr12	106567411	106567588	(26707721)	+	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	189	374	(0)	936427
2462	22.6	3.6	3.6	chr12	108947020	108947573	(24327736)	C	L1MC4	LINE/L1	(1025)	7017	6462	941365
1588	20.7	1.6	6.6	chr12	109026768	109027097	(24248212)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(58)	316	2	941582
2424	18.7	7.1	1.5	chr12	109231563	109232093	(24043216)	C	MER68	LTR/ERVL	(0)	563	1	942072
2019	16.4	0.0	0.7	chr12	110994421	110994730	(22280579)	+	AluJb	SINE/Alu	1	308	(4)	946076
1502	20.8	4.9	8.4	chr12	110994731	110995061	(22280248)	C	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	(64)	326	2	946075
1633	17.7	6.2	3.0	chr12	112531303	112531664	(20743645)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	1	374	(0)	949455
1198	20.1	10.8	5.7	chr12	115912328	115912676	(17362633)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(3)	371	3	957064
813	21.6	1.9	8.9	chr12	116624162	116624323	(16650986)	+	MLT1A0	LTR/ERVL-MaLR	167	316	(58)	958553
1752	19.8	4.1	5.8	chr12	117481254	117481650	(15793659)	+	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	1	390	(0)	960458
2249	10.7	0.3	2.9	chr12	117972722	117973031	(15302278)	+	AluSx3	SINE/Alu	2	303	(8)	961525
1350	17.2	5.8	12.5	chr12	117973032	117973370	(15301939)	C	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	(64)	326	11	961524
1331	20.7	7.9	4.2	chr12	119220057	119220409	(14054900)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(0)	374	8	964269
1944	16.4	10.5	4.0	chr12	119663865	119664263	(13611046)	+	MSTA	LTR/ERVL-MaLR	1	428	(0)	965285
1125	25.3	4.6	8.2	chr12	119664264	119664565	(13610744)	C	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	(101)	289	1	965284
367	30.8	2.9	4.3	chr12	124766900	124767106	(8508203)	C	MamRep4096	DNA/hAT-Tip100	(220)	206	3	976784
1185	17.4	13.2	10.9	chr12	124776147	124776484	(8498825)	+	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	1	350	(40)	976810
1120	20.5	19.3	3.7	chr12	125108212	125108543	(8166766)	C	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	(6)	384	1	977584
1398	23.1	0.8	6.7	chr12	125216100	125216485	(8058824)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(11)	363	1	977802
1747	20.2	0.8	8.5	chr12	130900223	130900645	(2374664)	+	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	1	390	(0)	987439
1330	20.5	4.8	7.5	chr13	26705583	26705967	(87658361)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(0)	374	1	1003662
1269	9.6	0.0	5.9	chr13	27040310	27040519	(87323809)	+	AluSg4	SINE/Alu	135	310	(0)	1004215
1559	19.9	7.5	1.4	chr13	28543629	28543979	(85820349)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	1	374	(0)	1006917
1503	21.0	2.3	2.6	chr13	31114675	31115021	(83249307)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(4)	370	25	1010901
1913	17.5	4.0	2.7	chr13	33225869	33226233	(81138095)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	1	370	(4)	1013991
2131	16.6	2.9	0.0	chr13	33274152	33274524	(81089804)	+	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	7	390	(0)	1014057
1016	24.1	5.0	4.3	chr13	35731388	35731686	(78632642)	+	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	89	389	(1)	1017566
325	13.0	0.0	0.0	chr13	36999875	36999928	(77364400)	+	MER53	DNA/hAT	138	191	(2)	1019395
1619	22.6	0.8	2.1	chr13	44316836	44317210	(70047118)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(4)	370	1	1030101
2013	18.2	1.6	2.4	chr13	52750505	52750881	(61613447)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	1	374	(0)	1043596
1093	24.4	2.5	6.3	chr13	64075760	64076092	(50288236)	C	MER52A	LTR/ERV1	(1435)	320	1	1058100
49	0.0	0.0	0.0	chr13	95637605	95637646	(18726682)	+	(TC)n	Simple_repeat	1	42	(0)	1100462
1145	20.2	1.8	2.2	chr13	95637647	95637848	(18726480)	+	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	190	390	(0)	1100460
1985	20.0	0.0	5.6	chr13	96436469	96436881	(17927447)	+	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	1	390	(0)	1101619
1573	19.6	2.0	3.6	chr13	96951272	96951631	(17412697)	+	MLT1A0	LTR/ERVL-MaLR	12	365	(0)	1102291
878	23.0	7.0	14.7	chr13	97638882	97639289	(16725039)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(0)	374	1	1103280
909	21.0	1.5	2.0	chr13	98317670	98317873	(16046455)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(15)	359	157	1104486
1959	16.4	1.8	7.7	chr13	99567937	99568351	(14795977)	C	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	(0)	390	1	1106450
1880	18.3	1.9	2.1	chr13	101490037	101490411	(12873917)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	1	374	(0)	1109482
1479	20.2	5.5	4.3	chr13	111000597	111000985	(3363343)	+	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	1	402	(9)	1122026
1122	26.6	8.6	1.7	chr13	112625559	112625906	(1738422)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(0)	374	1	1123723
1192	24.0	10.2	0.9	chr13	113020438	113020765	(1343563)	C	MLT1A0	LTR/ERVL-MaLR	(3)	362	1	1124135
1517	21.7	7.5	5.8	chr14	35966512	35966893	(71076825)	+	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	1	389	(1)	1150934
19	11.5	2.6	0.0	chr14	50560764	50560801	(56482917)	+	(GGGCGGC)n	Simple_repeat	1	39	(0)	1170157
11	22.8	0.0	7.5	chr14	55107922	55107974	(51935744)	+	(CATGAG)n	Simple_repeat	1	53	(0)	1177072
1954	18.8	3.1	5.0	chr14	58111449	58111679	(48932039)	C	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	(0)	390	175	1181644
1366	21.0	5.9	5.7	chr14	61160824	61161192	(45882526)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	1	370	(4)	1186066
1647	18.2	7.1	2.0	chr14	72522057	72522404	(34521314)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(7)	367	1	1204425
12	18.6	6.7	2.1	chr14	76486228	76486272	(30557446)	+	(GCCT)n	Simple_repeat	1	48	(0)	1212305
1854	19.2	5.4	3.1	chr14	76911811	76912191	(30131527)	+	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	1	390	(0)	1213190
1505	21.1	4.7	2.5	chr14	91222766	91223120	(15820598)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(11)	363	1	1235346
1448	21.4	5.0	2.0	chr14	92330572	92330920	(14712798)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(11)	363	4	1237354
1598	19.2	8.0	2.0	chr14	97051667	97052016	(9991702)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(0)	374	2	1245981
1405	22.7	1.4	6.7	chr14	98884054	98884444	(8159274)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	5	374	(0)	1249116
2632	11.8	2.3	0.5	chr14	99723884	99724266	(7319452)	C	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	(0)	390	1	1250501
1627	21.4	2.4	3.4	chr14	99779909	99780286	(7263432)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(0)	374	1	1250620
1567	18.9	8.0	1.9	chr14	100036792	100037153	(7006565)	+	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	1	386	(4)	1251055
1497	21.9	0.8	8.0	chr14	101717357	101717743	(5325975)	+	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	30	388	(2)	1253533
2558	7.6	0.0	0.3	chr14	103148970	103149283	(3894435)	+	AluSq2	SINE/Alu	1	313	(0)	1256279
16	21.1	5.1	4.9	chr15	28886051	28886128	(73105061)	+	(CGCGC)n	Simple_repeat	1	82	(0)	1274697
14	11.7	3.6	0.0	chr15	28886223	28886250	(73104939)	+	(CGG)n	Simple_repeat	1	29	(0)	1274698
1133	17.0	23.1	1.6	chr15	37020861	37021165	(64970024)	+	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	1	390	(0)	1286409
15	14.7	0.0	0.0	chr15	40286231	40286260	(61704929)	+	(CTCCC)n	Simple_repeat	1	30	(0)	1290967
1785	19.7	3.6	3.6	chr15	48978667	48979056	(53012133)	C	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	(0)	390	1	1305623
1653	20.3	2.7	5.9	chr15	51132323	51132709	(50858480)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	1	374	(0)	1309111
1561	21.7	2.2	1.1	chr15	51156918	51157238	(50833951)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	21	527	(33)	1309156
216	36.4	3.2	1.6	chr15	64894292	64894414	(37096775)	C	MIRb	SINE/MIR	(29)	239	115	1331450
1852	15.6	9.5	3.8	chr15	68603505	68603871	(33387318)	+	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	1	390	(0)	1338653
1344	21.6	4.8	5.1	chr15	69706173	69706388	(32284801)	+	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	179	378	(12)	1340757
280	27.1	7.8	4.6	chr15	69853822	69853995	(32137194)	C	Charlie18a	DNA/hAT-Charlie	(19)	323	144	1341030
1473	26.1	8.1	4.0	chr15	69854082	69854728	(32136461)	C	Arthur1B	DNA/hAT-Tip100	(47)	1178	503	1341031
2133	13.3	0.0	3.4	chr15	70507514	70507836	(31483353)	+	AluJb	SINE/Alu	1	312	(0)	1342276
236	29.9	13.2	2.0	chr15	71364185	71364385	(30626804)	+	MIRb	SINE/MIR	4	230	(38)	1343622
16	9.1	2.6	5.0	chr15	72320149	72320187	(29671002)	+	(CCCGAGC)n	Simple_repeat	1	40	(0)	1345248
1501	17.6	4.6	8.2	chr15	74468730	74469007	(27522182)	C	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	(2)	388	123	1348867
1566	19.6	3.2	5.3	chr15	76068459	76068835	(25922354)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	6	374	(0)	1351941
4456	22.6	8.2	3.7	chr15	79683028	79684229	(22306960)	+	Charlie2a	DNA/hAT-Charlie	971	2287	(574)	1358217
1651	21.0	3.2	2.7	chr15	80426730	80427101	(21564088)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(0)	374	1	1359520
1411	18.1	5.6	8.6	chr15	85350580	85350965	(16640224)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	1	374	(0)	1367657
2036	11.8	4.2	7.2	chr15	89534179	89534526	(12456663)	C	THE1B	LTR/ERVL-MaLR	(0)	364	28	1374406
1090	24.5	1.8	2.9	chr15	98817924	98818200	(3172989)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(69)	305	32	1389205
1796	17.4	7.4	1.2	chr15	98819306	98819647	(3171542)	+	MLT1A0	LTR/ERVL-MaLR	1	365	(0)	1389210
1594	18.4	6.3	0.9	chr15	99136367	99136711	(2854478)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(8)	366	2	1389666
1487	17.6	0.0	1.2	chr16	3156951	3157195	(87181150)	C	AluJb	SINE/Alu	(10)	302	61	1398613
41	0.0	0.0	0.0	chr16	3871200	3871234	(86467111)	+	(CA)n	Simple_repeat	1	35	(0)	1399954
2045	14.3	1.0	0.3	chr16	10962777	10963076	(79375269)	+	AluJb	SINE/Alu	1	302	(10)	1414653
1511	20.6	4.7	9.4	chr16	10963077	10963379	(79374966)	C	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	(97)	293	3	1414652
1378	22.2	4.9	3.5	chr16	11798420	11798741	(78539604)	C	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	(1)	389	62	1416504
2300	9.4	0.0	0.7	chr16	12083022	12083319	(78255026)	+	AluSx1	SINE/Alu	1	296	(16)	1417215
1366	21.4	4.5	7.4	chr16	12083320	12083645	(78254700)	C	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	(75)	315	1	1417214
1461	21.1	8.7	2.5	chr16	19843565	19843929	(70494416)	C	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	(0)	390	1	1434490
1558	22.2	4.6	2.2	chr16	23824844	23825203	(66513142)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	5	373	(1)	1443229
1660	19.8	1.9	4.5	chr16	24038902	24039216	(66299129)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	1	314	(60)	1443735
2337	10.3	0.3	0.6	chr16	24039217	24039528	(66298817)	C	AluSc8	SINE/Alu	(0)	311	1	1443736
1421	20.4	3.0	8.3	chr16	24363044	24363391	(65974954)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(23)	351	23	1444498
1490	20.2	2.4	5.1	chr16	31020641	31020850	(59317495)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	163	374	(0)	1459416
329	31.8	6.2	8.6	chr16	31032686	31032964	(59305381)	+	L3	LINE/CR1	3825	4096	(3)	1459456
947	18.0	6.1	3.3	chr16	46828994	46829253	(43509092)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	1	277	(113)	1466112
1504	21.9	3.9	5.8	chr16	49997458	49997854	(40340491)	+	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	1	389	(1)	1471556
1587	19.3	7.0	6.5	chr16	50628749	50628948	(39709397)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(1)	373	175	1472871
1850	18.1	5.1	2.1	chr16	58379542	58379919	(31958426)	+	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	1	390	(0)	1486963
1222	18.6	7.5	0.4	chr16	71426948	71427184	(18911161)	+	AluJb	SINE/Alu	1	255	(57)	1509673
230	29.1	12.7	2.5	chr16	71427205	71427324	(18911021)	+	L1MC	LINE/L1	5465	5598	(2284)	1509674
1439	21.6	6.5	8.2	chr16	81857408	81857785	(8480560)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(0)	374	4	1528212
1353	21.1	2.7	10.4	chr16	83728797	83729199	(6609146)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(0)	374	4	1531497
723	31.4	6.4	3.8	chr16	85227795	85228329	(5110016)	C	L2b	LINE/L2	(0)	3375	2830	1534438
1273	25.1	2.2	1.6	chr16	85580619	85580982	(4757363)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	1	366	(8)	1535098
1573	24.2	4.7	0.5	chr16	87487724	87488151	(2850194)	+	L1MB7	LINE/L1	5733	6179	(5)	1538501
217	25.1	8.1	0.0	chr16	88501903	88501989	(1836356)	C	MIR3	SINE/MIR	(91)	139	35	1540036
3187	12.7	4.5	1.8	chr17	2484986	2485499	(80771942)	+	MER1A	DNA/hAT-Charlie	1	529	(0)	1549207
1632	22.7	2.4	6.4	chr17	5670158	5670547	(77586894)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(0)	374	1	1555572
1829	19.9	1.6	3.9	chr17	7139010	7139390	(76118051)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(0)	374	3	1558310
11	22.0	2.2	4.3	chr17	7573782	7573827	(75683614)	+	(GCGAGG)n	Simple_repeat	1	47	(0)	1559097
1504	19.7	7.0	2.5	chr17	9860375	9860728	(73396713)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(0)	374	4	1563563
17	7.0	0.0	5.9	chr17	15651820	15651853	(67605588)	+	(CTCAGG)n	Simple_repeat	1	34	(0)	1573445
1274	23.4	4.9	0.7	chr17	31540712	31541021	(51716420)	C	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	(8)	382	59	1594772
1161	24.9	4.5	8.5	chr17	32507637	32507892	(50749549)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	1	265	(109)	1596936
2387	9.6	0.0	0.0	chr17	32507893	32508193	(50749248)	C	AluSg	SINE/Alu	(8)	302	2	1596937
1342	21.9	7.8	6.6	chr17	33047924	33048304	(50209137)	+	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	1	386	(4)	1597868
1469	22.5	1.6	3.5	chr17	33232039	33232393	(50025048)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	5	352	(22)	1598226
1350	17.4	0.8	2.1	chr17	42447298	42447537	(40809904)	C	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	(0)	390	154	1615676
17	10.5	3.2	0.0	chr17	48101208	48101238	(35156203)	+	(CCG)n	Simple_repeat	1	32	(0)	1627295
1431	21.1	5.4	2.8	chr17	56697402	56697761	(26559680)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(4)	370	1	1641772
1530	17.8	6.2	9.2	chr17	59721791	59722193	(23535248)	C	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	(0)	390	1	1647802
1355	21.5	5.3	9.9	chr17	61754541	61754993	(21502448)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(0)	467	1	1651550
1511	19.4	10.4	4.0	chr17	64093441	64093789	(19163652)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(0)	374	1	1655893
1825	18.0	4.0	4.3	chr17	65585973	65586185	(17671256)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(4)	370	166	1658945
1642	20.6	5.3	3.0	chr17	65664788	65665152	(17592289)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(0)	374	1	1659093
1267	25.5	4.6	4.6	chr17	66753579	66753968	(16503473)	+	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	1	390	(0)	1660754
1345	18.0	2.4	17.8	chr17	68009268	68009480	(15247961)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(1)	373	177	1663308
1363	16.7	11.1	2.4	chr17	68298663	68298957	(14958484)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(47)	327	4	1663920
1824	21.3	1.1	2.1	chr17	69030158	69030531	(14226910)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(0)	374	5	1665122
1103	21.3	8.4	5.5	chr17	69344870	69345216	(13912225)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(8)	366	9	1665574
1297	20.0	14.4	3.6	chr17	73020169	73020500	(10236941)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	1	374	(0)	1671456
1575	21.1	3.5	6.2	chr17	73274023	73274341	(9983100)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(65)	309	1	1671968
1525	19.5	6.7	8.7	chr17	73937517	73937897	(9319544)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	1	373	(1)	1673207
1702	23.4	1.9	1.3	chr17	74025053	74025424	(9232017)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(0)	374	1	1673359
1677	18.9	6.4	1.7	chr17	76357629	76357984	(6899457)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	1	374	(0)	1677891
1610	17.4	3.2	3.8	chr17	77901078	77901423	(5356018)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	1	344	(30)	1680843
53	0.0	0.0	0.0	chr17	78254749	78254793	(5002648)	+	(GT)n	Simple_repeat	1	45	(0)	1681498
2141	8.3	0.0	3.5	chr17	78254794	78255082	(5002359)	C	AluSx	SINE/Alu	(33)	279	1	1681499
868	23.5	3.8	9.4	chr17	78549088	78549364	(4708077)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	1	261	(113)	1682018
1514	19.1	1.9	3.0	chr17	79241633	79242004	(4015437)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(1)	373	6	1683173
1395	20.4	11.6	2.7	chr17	79905664	79905991	(3351450)	+	MLT1A0	LTR/ERVL-MaLR	1	361	(4)	1684148
17	15.9	0.0	0.0	chr17	80220323	80220357	(3037084)	+	(GGCTCG)n	Simple_repeat	1	35	(0)	1684680
16	21.4	0.0	8.6	chr17	80220366	80220435	(3037006)	+	(CCCGC)n	Simple_repeat	1	70	(0)	1684681
199	24.4	9.9	2.4	chr17	80450520	80450603	(2806838)	+	L2	LINE/L2	2837	2927	(492)	1685031
1780	19.8	1.4	3.2	chr18	7123913	7124282	(73249003)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(0)	374	12	1699545
1794	17.6	4.9	3.3	chr18	9713686	9714044	(70659241)	C	MLT1A0	LTR/ERVL-MaLR	(0)	365	1	1703545
1269	21.2	5.6	5.6	chr18	22431049	22431438	(57941847)	C	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	(0)	390	1	1714550
1682	17.2	7.0	5.7	chr18	37437828	37438196	(42935089)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	1	374	(0)	1736044
1723	19.8	0.0	13.5	chr18	45789362	45789792	(34583493)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	2	374	(0)	1747444
1407	23.5	3.9	5.1	chr18	48557627	48558021	(31815264)	C	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	(0)	390	1	1752103
1393	20.5	8.2	6.8	chr18	57105672	57106053	(23267232)	C	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	(2)	388	1	1765057
1671	16.5	6.7	4.6	chr18	59764278	59764626	(20608659)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(1)	373	17	1769461
1515	21.8	3.3	4.3	chr18	61972872	61973265	(18400020)	C	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	(0)	390	1	1772734
1093	25.1	1.5	5.6	chr18	63227887	63228321	(17144964)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(23)	405	4	1774736
978	22.8	3.4	20.1	chr18	70411244	70411525	(9961760)	+	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	174	386	(4)	1784574
239	22.2	0.0	1.8	chr18	77965467	77965521	(2407764)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(125)	249	196	1794111
1015	20.6	4.7	7.6	chr18	77965573	77965878	(2407407)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(127)	281	1	1794112
1114	26.8	3.8	3.0	chr18	80175244	80175609	(197676)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(0)	374	6	1796235
220	28.1	5.0	1.2	chr19	510635	510746	(58106870)	C	MIR3	SINE/MIR	(146)	122	3	1797051
1099	18.2	12.6	4.9	chr19	5504873	5505178	(53112438)	+	MLT1A0	LTR/ERVL-MaLR	1	333	(32)	1808177
806	27.7	13.9	4.9	chr19	6379883	6380140	(52237476)	+	L1MEd	LINE/L1	950	1257	(5829)	1810090
1941	19.9	4.1	1.6	chr19	7621885	7622262	(50995354)	+	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	1	388	(2)	1813372
1651	19.3	2.6	1.5	chr19	8075899	8076234	(50541382)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	1	340	(34)	1814331
598	28.9	1.7	1.1	chr19	10535920	10536094	(48081522)	C	MLT1C	LTR/ERVL-MaLR	(9)	458	283	1820021
1011	22.8	22.5	1.0	chr19	13128240	13128532	(45489084)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(0)	374	1	1825936
755	24.4	0.0	0.0	chr19	13823838	13824005	(44793611)	C	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	(8)	382	215	1827903
1382	20.8	6.0	9.4	chr19	14307464	14307846	(44309770)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(1)	373	5	1829136
1856	15.3	3.2	7.5	chr19	14325264	14325624	(44291992)	C	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	(32)	358	3	1829192
951	16.6	0.0	0.0	chr19	14703954	14704110	(43913506)	C	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	(42)	348	192	1830200
1230	22.3	6.6	5.9	chr19	14709516	14709873	(43907743)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	1	361	(13)	1830212
1305	19.7	1.0	7.6	chr19	15169231	15169409	(43448207)	+	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	189	349	(41)	1831279
1742	20.2	2.4	2.2	chr19	16074246	16074614	(42543002)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(0)	374	5	1833064
19	18.4	4.1	0.0	chr19	16076233	16076281	(42541335)	+	GA-rich	Low_complexity	1	51	(0)	1833070
1752	18.1	3.0	0.8	chr19	16418618	16418974	(42198642)	+	MLT1A0	LTR/ERVL-MaLR	1	365	(0)	1833888
1624	20.1	1.1	7.0	chr19	16913248	16913633	(41703983)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	12	374	(0)	1835068
12	5.0	0.0	4.3	chr19	18834010	18834032	(39783584)	+	(AGGG)n	Simple_repeat	1	23	(0)	1839694
7350	14.4	10.3	3.9	chr19	29439846	29441309	(29176307)	+	LTR12C	LTR/ERV1	3	1570	(9)	1850245
1949	16.9	4.6	2.6	chr19	30895501	30895882	(27721734)	C	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	(0)	390	1	1852421
1016	19.6	3.6	1.8	chr19	32434693	32434910	(26182706)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(28)	346	125	1854796
21	19.7	1.4	5.6	chr19	33064925	33064997	(25552619)	+	(GCCCC)n	Simple_repeat	1	69	(0)	1856078
48	21.8	1.6	1.6	chr19	33194658	33194783	(25422833)	+	(AGCCCG)n	Simple_repeat	1	128	(0)	1856394
1749	18.6	7.8	1.7	chr19	33891294	33891644	(24725972)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	1	374	(0)	1857495
1075	19.3	1.4	4.6	chr19	34477855	34478071	(24139545)	+	MER63A	DNA/hAT-Blackjack	1	210	(0)	1858725
1371	21.5	4.6	5.3	chr19	34550278	34550670	(24066946)	C	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	(0)	390	1	1858835
7507	7.5	14.3	1.6	chr19	34569709	34570811	(24046805)	+	MER11A	LTR/ERVK	1	1266	(0)	1858848
1505	25.9	3.8	10.3	chr19	35222922	35223514	(23394102)	C	MLT1E1A	LTR/ERVL-MaLR	(0)	680	8	1859978
1805	15.3	0.3	8.8	chr19	38820997	38821336	(19796280)	+	AluJr	SINE/Alu	1	311	(1)	1867531
9317	8.6	3.4	22.6	chr19	38821337	38823305	(19794311)	+	LTR12C	LTR/ERV1	2	1579	(0)	1867532
1405	24.3	3.2	5.5	chr19	40678463	40678697	(17938919)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	140	374	(0)	1871681
1773	17.2	0.3	5.8	chr19	44619562	44619924	(13997692)	C	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	(47)	343	1	1879137
29	25.4	2.6	3.4	chr19	45076340	45076453	(13541163)	+	(GGCG)n	Simple_repeat	1	117	(0)	1880404
1497	19.5	5.4	6.8	chr19	46548301	46548526	(12069090)	+	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	176	390	(0)	1883972
1288	20.2	1.2	1.2	chr19	48064742	48064991	(10552625)	+	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	141	390	(0)	1887841
1415	26.7	11.0	2.6	chr19	48588604	48589545	(10028071)	C	L2a	LINE/L2	(133)	3293	2253	1889155
1165	26.3	4.6	1.7	chr2	1832048	1832407	(240361122)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	4	374	(0)	1912567
1376	18.3	2.4	8.7	chr2	8986621	8987012	(233206517)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	3	505	(0)	1922135
17	12.3	0.0	5.1	chr2	19358658	19358744	(222834785)	+	(CCACCC)n	Simple_repeat	1	82	(0)	1938707
1562	20.2	4.1	3.6	chr2	23625707	23626022	(218567507)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	4	326	(48)	1944623
2084	13.2	1.5	12.6	chr2	23626023	23626404	(218567125)	C	MER1B	DNA/hAT-Charlie	(0)	339	1	1944624
1920	15.9	3.8	3.8	chr2	23651665	23652037	(218541492)	C	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	(17)	373	1	1944655
1347	24.7	8.2	0.3	chr2	29810743	29811099	(212382430)	+	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	3	390	(0)	1955883
1961	16.1	5.3	3.8	chr2	46833458	46833825	(195359704)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(0)	374	1	1982895
1448	22.7	3.5	5.0	chr2	48169597	48169976	(194023553)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	1	374	(0)	1985484
1104	25.7	3.4	10.1	chr2	56536919	56537325	(185656204)	C	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	(11)	379	1	1997536
269	29.6	3.3	2.2	chr2	60828527	60828616	(181364913)	C	MER91A	DNA/hAT-Tip100	(82)	114	24	2003154
327	23.2	4.9	2.5	chr2	60828643	60828801	(181364728)	C	L2a	LINE/L2	(322)	3104	2942	2003145
1668	20.3	4.0	3.2	chr2	64030450	64030820	(178162709)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(0)	374	1	2008705
1376	13.6	3.2	2.5	chr2	73124035	73124278	(169069251)	C	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	(2)	465	162	2023129
13	32.3	0.0	1.7	chr2	88765390	88765448	(153428081)	+	(CAGCTG)n	Simple_repeat	1	59	(0)	2046589
234	33.0	2.0	0.0	chr2	112866226	112866322	(129327207)	+	L2b	LINE/L2	2729	2827	(592)	2075863
316	22.2	2.6	0.0	chr2	120703493	120703587	(121489942)	+	L2c	LINE/L2	3064	3163	(224)	2087440
1658	18.4	5.4	8.5	chr2	121043337	121043735	(121149794)	+	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	5	390	(0)	2087951
2008	17.2	2.2	3.3	chr2	127156418	127156783	(115036746)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	1	362	(12)	2096972
1818	18.9	2.1	1.9	chr2	135814852	135815224	(106378305)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	1	374	(0)	2109658
2011	17.5	3.1	1.6	chr2	136079704	136080087	(106113442)	C	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	(0)	390	1	2110126
1318	25.5	0.5	3.9	chr2	142296683	142297065	(99896464)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(4)	370	1	2118596
757	20.5	11.9	3.4	chr2	146960846	146961052	(95232477)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(63)	311	85	2124596
1330	20.8	8.7	5.6	chr2	149986769	149987145	(92206384)	+	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	1	390	(0)	2128767
1440	20.8	7.2	2.8	chr2	153368145	153368501	(88825028)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	1	374	(0)	2133648
23	32.0	0.0	2.2	chr2	157876292	157876383	(84317146)	+	GA-rich	Low_complexity	1	92	(0)	2139335
1934	18.2	2.2	0.8	chr2	158060602	158060966	(84132563)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	1	370	(4)	2139659
1380	22.1	2.2	8.3	chr2	166034646	166035040	(76158489)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	1	370	(4)	2150485
1326	21.3	5.8	4.5	chr2	176550936	176551309	(65642220)	C	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	(11)	379	1	2166311
14	12.7	2.6	5.1	chr2	217858706	217858743	(24334786)	+	(CTCC)n	Simple_repeat	1	39	(0)	2225057
1522	19.4	4.6	9.2	chr2	234142339	234142730	(8050799)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	2	374	(0)	2251441
1521	20.0	6.4	3.0	chr2	237756253	237756613	(4436916)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(0)	374	1	2256804
1610	21.9	3.5	3.2	chr20	2761339	2761711	(61682456)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	1	374	(0)	2267539
980	24.0	1.6	2.3	chr20	5662914	5663177	(58780990)	+	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	175	428	(0)	2272986
1312	23.9	5.1	1.7	chr20	22946986	22947346	(41496821)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(0)	374	1	2299045
2112	16.0	7.2	0.3	chr20	23660736	23661123	(40783044)	C	LTR23	LTR/ERV1	(10)	427	11	2299984
4296	20.0	3.9	2.5	chr20	24305823	24307581	(40136586)	C	L1MC3	LINE/L1	(1571)	6214	4440	2300740
43	0.0	0.0	0.0	chr20	32584134	32584170	(31859997)	+	(CA)n	Simple_repeat	1	37	(0)	2308736
13	16.3	2.8	2.7	chr20	32584311	32584346	(31859821)	+	(GCCCG)n	Simple_repeat	1	37	(0)	2308737
2090	17.3	2.1	2.1	chr20	37375736	37376107	(27068060)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(0)	374	3	2319884
1600	22.0	2.7	6.7	chr20	38325285	38325674	(26118493)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(0)	374	1	2321920
1554	19.1	4.5	6.5	chr20	39086481	39086862	(25357305)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	1	374	(0)	2323475
1152	19.6	3.9	4.5	chr20	43868540	43868859	(20575308)	+	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	103	404	(4)	2332165
1379	22.4	5.1	10.8	chr20	44235747	44236161	(20208006)	C	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	(0)	390	1	2332981
1944	19.9	4.5	0.0	chr20	49423104	49423501	(15020666)	+	L1MB7	LINE/L1	5758	6174	(10)	2344382
1674	19.8	4.1	6.0	chr20	60170152	60170549	(4273618)	+	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	1	390	(0)	2365587
1077	24.1	7.0	5.2	chr20	61231945	61232254	(3211913)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	1	316	(58)	2367116
714	23.8	3.2	0.6	chr21	16158860	16159041	(30550942)	+	MER5A	DNA/hAT-Charlie	1	187	(2)	2380067
338	26.7	15.0	2.6	chr21	16159042	16159227	(30550756)	+	MARNA	DNA/TcMar-Mariner	31	245	(341)	2380068
383	31.4	1.3	3.1	chr21	26799371	26799531	(19910452)	+	Charlie4z	DNA/hAT-Charlie	2	159	(8)	2394525
2287	17.4	5.5	5.7	chr21	28895939	28896427	(17813556)	+	MLT1D	LTR/ERVL-MaLR	18	505	(0)	2397407
1707	23.6	2.1	5.0	chr21	29108082	29108464	(17601519)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	1	372	(2)	2397770
1457	23.5	1.4	2.2	chr21	30969330	30969695	(15740288)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	1	363	(11)	2400537
1591	19.9	3.5	4.2	chr21	31165287	31165663	(15544320)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	1	374	(0)	2400857
958	24.7	3.1	5.4	chr21	32505561	32505855	(14204128)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(0)	374	87	2403334
1474	19.9	8.8	1.7	chr21	33691602	33691948	(13018035)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(0)	374	1	2405463
864	21.4	29.3	1.5	chr21	34547922	34548162	(12161821)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	69	374	(0)	2406805
1693	16.8	6.4	1.5	chr21	35045364	35045689	(11664294)	+	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	1	343	(47)	2407527
1209	22.2	5.1	8.0	chr21	35265201	35265520	(11444463)	+	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	89	390	(0)	2407856
1665	20.7	1.1	2.5	chr21	35357491	35357852	(11352131)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	18	374	(0)	2407994
1734	23.2	0.5	1.6	chr21	35524944	35525320	(11184663)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	2	374	(0)	2408231
244	26.8	1.0	12.6	chr21	37430554	37430664	(9279319)	C	HAL1ME	LINE/L1	(1670)	795	698	2411590
1362	21.0	8.8	1.5	chr21	38096196	38096533	(8613450)	+	MLT1A0	LTR/ERVL-MaLR	1	365	(0)	2412571
243	30.3	2.6	8.3	chr21	38096536	38096678	(8613305)	+	MIR3	SINE/MIR	33	174	(94)	2412572
1516	20.3	5.0	3.9	chr21	38224043	38224444	(8485539)	C	LTR76	LTR/ERV1	(0)	675	214	2412760
9711	13.6	1.7	0.8	chr21	38227979	38229403	(8480580)	C	HERV3-int	LTR/ERV1	(6987)	1439	2	2412761
1428	21.9	5.0	3.9	chr21	38229404	38229805	(8480178)	C	LTR76	LTR/ERV1	(0)	675	214	2412761
836	27.0	12.3	3.1	chr21	38798222	38798611	(7911372)	C	L2a	LINE/L2	(4)	3422	2992	2413532
436	23.0	3.4	0.0	chr21	38798675	38798787	(7911196)	C	L2a	LINE/L2	(530)	2889	2773	2413532
1235	21.0	15.8	3.1	chr21	39104921	39105244	(7604739)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(1)	373	1	2414014
1525	24.5	1.8	2.7	chr21	39814712	39815083	(6894900)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	1	464	(3)	2415217
1258	22.6	2.8	3.0	chr21	42697560	42697887	(4012096)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(47)	327	1	2419190
5409	17.2	6.8	10.0	chr21	43842455	43842686	(2867297)	C	L1M4	LINE/L1	(1662)	4484	4249	2420896
40	0.0	0.0	0.0	chr21	43842687	43842720	(2867263)	+	(TG)n	Simple_repeat	1	34	(0)	2420904
5409	17.2	6.8	10.0	chr21	43842721	43843062	(2866921)	C	L1M4	LINE/L1	(1898)	4248	3921	2420896
1670	20.2	3.8	2.2	chr21	44554055	44554413	(2155570)	+	MLT1A0	LTR/ERVL-MaLR	1	365	(0)	2421885
1133	24.7	8.1	0.0	chr21	44836551	44836902	(1873081)	+	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	1	383	(7)	2422221
2104	27.1	5.8	5.3	chr21	45652820	45654338	(1055645)	C	L1ME4a	LINE/L1	(3052)	3094	1565	2423048
1659	18.9	3.4	7.6	chr21	46628091	46628397	(81586)	+	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	100	385	(5)	2424197
1662	19.3	8.2	4.0	chr22	27722432	27722804	(23095664)	+	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	1	390	(0)	2447375
1637	18.7	5.7	1.5	chr22	29118413	29118748	(21699720)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(0)	374	24	2449920
1836	18.1	2.6	5.5	chr22	30072209	30072610	(20745858)	+	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	1	390	(0)	2451893
14	16.4	2.9	0.0	chr22	31212128	31212161	(19606307)	+	(GCCAGA)n	Simple_repeat	1	35	(0)	2454271
13	21.7	3.4	4.9	chr22	31212162	31212220	(19606248)	+	G-rich	Low_complexity	1	61	(0)	2454272
1204	17.8	11.2	10.8	chr22	32775016	32775387	(18043081)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(0)	374	1	2457680
596	27.9	10.3	0.9	chr22	35257128	35257355	(15561113)	+	MIRb	SINE/MIR	2	253	(15)	2462579
1136	23.7	4.1	7.3	chr22	35660112	35660521	(15157947)	+	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	2	366	(24)	2463539
1261	14.3	0.5	0.0	chr22	36460320	36460515	(14357953)	+	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	194	390	(0)	2465106
228	30.1	0.0	6.1	chr22	37429012	37429110	(13389358)	+	L2c	LINE/L2	3264	3356	(31)	2467214
1084	17.2	1.5	3.3	chr22	40979568	40979777	(9838691)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(0)	374	169	2474805
1543	21.2	2.7	5.5	chr22	42542555	42542938	(8275530)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(0)	374	2	2478324
19	16.0	5.9	4.2	chr22	44820850	44820917	(5997551)	+	(CTGGCG)n	Simple_repeat	1	72	(0)	2482720
1819	19.2	4.8	6.8	chr22	44924392	44924772	(5893696)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	2	374	(0)	2482908
1451	23.7	4.0	1.9	chr3	11589609	11589974	(186705585)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(0)	374	1	2511713
1675	21.6	4.9	1.6	chr3	12451459	12451835	(185843724)	+	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	1	390	(0)	2513283
1635	19.4	3.6	10.5	chr3	16359323	16359742	(181935817)	+	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	1	390	(0)	2520369
1545	21.4	5.1	1.1	chr3	31284412	31284770	(167010789)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	1	374	(0)	2541854
1530	20.6	4.8	7.3	chr3	32346391	32346772	(165948787)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(2)	372	1	2543703
1622	20.4	2.4	6.7	chr3	38340733	38341121	(159954438)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	1	372	(2)	2552892
1572	21.6	6.2	5.2	chr3	38356819	38357204	(159938355)	+	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	1	390	(0)	2552924
1814	18.6	4.1	2.9	chr3	39201235	39201617	(159093942)	+	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	1	388	(2)	2554138
1346	22.1	4.9	8.2	chr3	44268137	44268366	(154027193)	C	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	(0)	390	174	2561824
587	25.9	16.0	6.1	chr3	48995101	48995576	(149299983)	+	L2a	LINE/L2	2837	3382	(44)	2570453
1653	19.4	4.4	5.4	chr3	49945910	49946175	(148349384)	+	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	122	384	(6)	2572276
1990	31.4	8.5	3.3	chr3	55087004	55088509	(143207050)	+	L2c	LINE/L2	1173	2764	(655)	2579933
11	18.1	2.4	4.8	chr3	105366741	105366781	(92928778)	+	G-rich	Low_complexity	1	42	(0)	2648180
1886	19.9	0.3	5.2	chr3	111716731	111717116	(86578443)	+	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	24	390	(0)	2656820
1203	20.9	8.2	2.5	chr3	126098118	126098475	(72197084)	+	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	1	380	(10)	2678121
1794	20.2	3.6	6.2	chr3	134261721	134262121	(64033438)	C	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	(0)	390	1	2691159
796	18.0	2.0	0.7	chr3	141305726	141305876	(56989683)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	173	325	(49)	2702089
1428	20.2	7.2	3.9	chr3	170161673	170161978	(28133581)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(48)	326	1	2742469
1732	19.1	3.1	6.7	chr3	183532041	183532444	(14763115)	+	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	1	389	(1)	2762844
1442	20.3	7.8	4.4	chr3	185477727	185478087	(12817472)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(0)	374	1	2766452
1490	18.9	3.5	10.4	chr3	185479667	185480068	(12815491)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(0)	374	2	2766455
2170	17.1	0.8	2.3	chr3	192836360	192836755	(5458804)	+	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	1	390	(0)	2778540
1201	22.6	6.7	3.0	chr4	613441	613801	(189600754)	C	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	(8)	382	8	2789321
693	29.7	15.8	1.5	chr4	1220319	1221052	(188993503)	+	L1ME3	LINE/L1	5177	6028	(913)	2790000
1527	22.6	8.0	3.0	chr4	1343087	1343455	(188871100)	C	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	(1)	389	1	2790128
1355	18.3	4.9	2.2	chr4	3672531	3672826	(186541729)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(0)	374	69	2793456
1106	22.3	1.8	3.9	chr4	4369597	4369880	(185844675)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(91)	283	6	2794610
1733	18.8	3.2	2.4	chr4	4577523	4577893	(185636662)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(0)	374	1	2794981
1663	21.1	1.1	9.3	chr4	7170057	7170464	(183044091)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(0)	374	1	2799740
1501	23.8	7.8	0.3	chr4	8122336	8122681	(182091874)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(0)	374	1	2801270
1638	22.0	5.1	3.3	chr4	10622722	10623088	(179591467)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(0)	374	1	2804799
1366	22.9	1.6	8.9	chr4	13239885	13240287	(176974268)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	1	373	(1)	2809032
1357	24.2	4.9	6.1	chr4	17482992	17483386	(172731169)	C	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	(0)	390	1	2816290
1726	21.4	3.0	2.4	chr4	24779316	24779684	(165434871)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	2	372	(2)	2827737
849	17.8	0.0	0.0	chr4	25223697	25223831	(164990724)	+	FLAM_C	SINE/Alu	1	135	(8)	2828528
914	20.6	0.0	2.7	chr4	25223832	25223883	(164990672)	+	AluJr	SINE/Alu	122	173	(139)	2828529
3505	12.0	5.9	10.9	chr4	25223884	25224596	(164989959)	C	LTR76	LTR/ERV1	(0)	675	1	2828530
1020	24.7	7.6	1.6	chr4	31584778	31585159	(158629396)	C	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	(4)	386	1	2838310
847	21.2	17.0	6.5	chr4	39260652	39260974	(150953581)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(0)	374	11	2849282
1419	21.3	4.0	9.4	chr4	40297017	40297363	(149917192)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	39	372	(2)	2851698
1066	21.4	3.6	4.5	chr4	55905491	55905798	(134308757)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	1	305	(69)	2871661
1557	16.1	5.0	7.2	chr4	56147834	56148221	(134066334)	+	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	1	379	(11)	2872114
1189	27.0	4.6	3.9	chr4	67129139	67129524	(123085031)	C	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	(1)	389	1	2886506
585	28.3	7.7	4.8	chr4	76311900	76312277	(113902278)	C	MLT1J2	LTR/ERVL-MaLR	(0)	448	59	2899058
1543	22.3	4.0	2.7	chr4	90982071	90982439	(99232116)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(0)	374	1	2920655
1634	22.0	1.6	2.1	chr4	94890548	94890923	(95323632)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(0)	374	1	2925712
1178	22.6	12.7	3.6	chr4	102693314	102693648	(87520907)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	1	370	(4)	2936023
1246	23.0	3.5	7.7	chr4	109612038	109612258	(80602297)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(0)	374	157	2945246
1503	20.7	4.6	5.1	chr4	141503031	141503422	(48711133)	+	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	1	390	(0)	2987771
1583	19.4	11.1	0.6	chr4	149527298	149527629	(40686926)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	4	374	(0)	2998509
2067	17.1	1.6	4.8	chr4	151990700	151991098	(38223457)	C	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	(0)	390	5	3002284
1346	20.2	7.1	8.3	chr4	152763565	152763937	(37450618)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	7	374	(0)	3003544
1611	23.0	2.8	5.2	chr4	153184139	153184538	(37030017)	C	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	(0)	390	1	3004180
1559	19.7	0.3	14.5	chr4	168475693	168476126	(21738429)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	1	372	(2)	3024862
1721	19.6	4.5	3.0	chr4	183090645	183091012	(7123543)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	1	374	(0)	3044376
3221	24.7	7.5	7.3	chr4	183091013	183091024	(7123531)	+	L1MC4	LINE/L1	7060	7066	(976)	3044368
818	28.5	5.0	9.8	chr5	360003	360402	(181177857)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	3	382	(8)	3055360
1535	20.1	5.6	6.9	chr5	361986	362364	(181175895)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	1	374	(0)	3055360
232	32.5	9.4	3.3	chr5	5347784	5348477	(176189782)	C	L2a	LINE/L2	(133)	3293	2527	3060452
1240	24.7	8.3	0.8	chr5	7616962	7617329	(173920930)	+	MLT1A1	LTR/ERVL-MaLR	11	408	(0)	3063400
839	18.2	4.3	0.4	chr5	7617330	7617487	(173920772)	+	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	218	493	(12)	3063399
1167	22.8	6.5	3.0	chr5	8724472	8724683	(172813576)	C	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	(0)	390	179	3064702
2335	8.7	0.7	1.6	chr5	8724684	8724993	(172813266)	C	AluSc5	SINE/Alu	(2)	307	1	3064703
1276	22.4	3.8	4.8	chr5	11280313	11280688	(170257571)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(0)	374	3	3068099
1389	22.9	4.6	6.8	chr5	14023775	14024173	(167514086)	C	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	(0)	390	1	3071634
2226	14.1	1.5	4.2	chr5	14546408	14546808	(166991451)	+	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	1	390	(0)	3072314
1907	21.0	1.4	0.8	chr5	16605613	16605972	(164932287)	C	MLT1A0	LTR/ERVL-MaLR	(3)	362	1	3075236
1210	22.9	3.2	8.4	chr5	23218210	23218600	(158319659)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(0)	374	5	3084455
12	34.2	0.0	1.7	chr5	32312855	32312914	(149225345)	+	(GCG)n	Simple_repeat	1	60	(0)	3096591
1533	21.8	5.2	4.5	chr5	33976930	33977309	(147560950)	+	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	3	385	(5)	3099162
993	22.6	0.5	2.3	chr5	34624306	34624522	(146913737)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	151	363	(11)	3100117
1548	14.3	8.7	5.4	chr5	59139499	59139777	(122398482)	C	AluJb	SINE/Alu	(21)	291	3	3129112
1731	17.3	5.1	5.1	chr5	66841404	66841775	(114696484)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(0)	374	3	3140011
1724	17.3	5.1	5.4	chr5	73141145	73141535	(108396724)	C	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	(0)	390	1	3150066
1660	21.3	2.1	8.5	chr5	73422125	73422524	(108115735)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(0)	374	1	3150453
1545	19.5	5.9	5.2	chr5	74376253	74376619	(107161640)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	1	370	(4)	3151877
1717	20.6	5.4	1.9	chr5	74471325	74471700	(107066559)	+	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	1	390	(0)	3152028
1372	22.0	1.6	9.0	chr5	75710335	75710733	(105827526)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	2	370	(4)	3153961
269	29.0	13.6	4.9	chr5	81020488	81020785	(100517474)	C	L2a	LINE/L2	(2)	3424	3036	3162588
1352	20.3	3.8	13.5	chr5	82518594	82519009	(99019250)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(0)	374	1	3164755
1003	18.6	0.0	0.5	chr5	88427241	88427424	(93110835)	+	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	208	390	(0)	3172313
1350	23.6	2.9	2.9	chr5	96950901	96951249	(84587010)	C	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	(0)	390	42	3183387
1304	21.3	4.5	7.3	chr5	103338331	103338715	(78199544)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	1	374	(0)	3191304
1840	14.8	4.8	2.6	chr5	108700130	108700254	(72838005)	+	AluSx1	SINE/Alu	1	136	(176)	3197997
1633	18.9	7.9	4.4	chr5	115294223	115294587	(66243672)	+	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	1	379	(11)	3206582
1750	14.4	6.0	4.7	chr5	115545130	115545471	(65992788)	C	THE1B	LTR/ERVL-MaLR	(0)	364	18	3206942
1529	20.6	2.4	17.1	chr5	116590907	116591179	(64947080)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	166	374	(0)	3208301
2109	3.8	0.7	0.7	chr5	116766890	116767158	(64771101)	+	L1PA5	LINE/L1	5886	6154	(0)	3208580
1555	20.0	6.0	2.8	chr5	133523001	133523355	(48014904)	+	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	24	390	(0)	3231071
1922	16.0	5.2	7.3	chr5	135278811	135279207	(46259052)	C	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	(2)	388	1	3234105
1308	21.1	3.5	9.2	chr5	136926897	136927287	(44610972)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	1	368	(6)	3236295
1533	18.1	11.6	3.1	chr5	142170244	142170596	(39367663)	C	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	(3)	387	1	3245370
1486	23.4	6.4	3.0	chr5	142460202	142460562	(39077697)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(0)	374	1	3246052
1602	21.4	1.3	6.6	chr5	158938476	158938870	(22599389)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(0)	374	1	3275341
1350	21.4	4.9	7.7	chr5	168533479	168533879	(13004380)	C	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	(0)	390	2	3290259
824	20.0	5.7	0.0	chr5	172053296	172053460	(9484799)	+	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	208	382	(8)	3296571
1701	20.1	2.1	2.7	chr5	172478398	172478771	(9059488)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(0)	374	3	3297525
1258	22.5	4.9	5.6	chr5	172543651	172544041	(8994218)	C	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	(0)	390	3	3297671
1473	18.3	7.3	5.8	chr5	173592540	173592904	(7945355)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	4	374	(0)	3299888
1486	21.0	3.3	9.2	chr5	173678470	173678722	(7859537)	C	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	(0)	390	173	3300040
1638	20.0	5.7	2.5	chr5	173706477	173706835	(7831424)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(0)	374	4	3300105
197	25.2	16.5	0.9	chr5	176818289	176818400	(4719859)	C	MIR3	SINE/MIR	(63)	145	13	3306052
1286	23.8	4.3	13.1	chr5	179358401	179358811	(2179448)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	2	374	(0)	3310709
1401	19.8	7.7	7.5	chr5	180223725	180224043	(1314216)	C	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	(58)	332	1	3312265
1503	21.7	4.7	0.6	chr6	6592546	6592892	(164213087)	+	MLT1A0	LTR/ERVL-MaLR	1	362	(3)	3323617
1309	22.0	7.0	2.8	chr6	10194565	10194922	(160611057)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(0)	467	1	3329093
888	21.9	3.5	0.5	chr6	10672706	10672902	(160133077)	+	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	188	390	(0)	3329964
1380	22.4	7.4	6.7	chr6	13145503	13145889	(157660090)	+	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	1	390	(0)	3333765
1862	17.4	5.6	3.4	chr6	13519851	13520231	(157285748)	C	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	(0)	390	1	3334411
1493	23.0	1.5	3.2	chr6	14348815	14349160	(156456819)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(4)	370	31	3335843
1529	20.2	3.6	7.4	chr6	14453945	14454350	(156351629)	C	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	(0)	390	1	3336028
1706	19.6	1.6	7.5	chr6	14770084	14770334	(156035645)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	148	374	(0)	3336526
2057	28.4	10.4	8.2	chr6	15608366	15609318	(155196661)	C	HAL1	LINE/L1	(539)	1968	968	3338145
1701	19.5	3.2	6.3	chr6	16787104	16787486	(154018493)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	4	374	(0)	3340056
1483	22.5	2.7	3.7	chr6	17179053	17179430	(153626549)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	1	374	(0)	3340675
4359	16.6	12.1	0.9	chr6	20984183	20984979	(149821000)	C	LTR1D1	LTR/ERV1	(0)	899	1	3346948
1767	20.2	2.1	2.4	chr6	21473536	21473910	(149332069)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	1	374	(0)	3347700
1092	27.4	8.0	0.3	chr6	24441366	24441665	(146364314)	+	MER119	DNA/hAT-Charlie	1	325	(258)	3351922
3123	24.5	9.1	2.9	chr6	27996597	27997738	(142808241)	+	L1MEc	LINE/L1	3260	4490	(1829)	3357935
2096	14.9	0.0	0.0	chr6	27997750	27998044	(142807935)	+	AluSx1	SINE/Alu	1	295	(17)	3357937
896	25.4	8.3	17.2	chr6	35694447	35694683	(135111296)	C	L1MEg	LINE/L1	(5449)	635	410	3370927
12	13.9	6.2	0.0	chr6	35694691	35694722	(135111257)	+	(TTTTG)n	Simple_repeat	1	34	(0)	3370932
2434	10.5	0.0	0.0	chr6	37041315	37041627	(133764352)	+	AluSq	SINE/Alu	1	313	(0)	3373797
1841	14.6	10.2	2.5	chr6	37041628	37041822	(133764157)	+	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	184	390	(0)	3373796
801	21.9	4.7	1.1	chr6	46152346	46152530	(124653449)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	179	370	(4)	3389750
1354	20.6	3.1	11.3	chr6	52437485	52437901	(118368078)	C	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	(1)	389	8	3398540
908	19.5	3.5	1.0	chr6	56972725	56972921	(113833058)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(0)	374	173	3404924
14323	16.3	2.3	1.6	chr6	83901661	83904692	(86901287)	C	L1MA4A	LINE/L1	(776)	6229	3186	3437136
1643	18.7	2.8	3.7	chr6	89825402	89825726	(80980253)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	5	326	(48)	3445444
1452	19.9	4.0	6.3	chr6	107123562	107123788	(63682191)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(0)	374	161	3468237
1303	22.0	2.5	8.5	chr6	108953854	108954240	(61851739)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(11)	363	1	3471423
1721	18.6	7.1	2.6	chr6	116306674	116307021	(54498958)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	6	370	(4)	3482389
1588	23.3	2.1	2.9	chr6	123842187	123842562	(46963417)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(1)	373	1	3492238
1444	23.0	4.5	3.8	chr6	125567961	125568331	(45237648)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(0)	374	1	3494518
1621	18.1	3.8	7.4	chr6	133585336	133585740	(37220239)	+	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	1	390	(0)	3505423
1464	20.1	8.2	3.2	chr6	135846509	135846878	(34959101)	C	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	(0)	390	1	3509023
1125	24.9	8.2	4.1	chr6	144879260	144879623	(25926356)	+	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	1	380	(10)	3522008
2254	15.8	1.9	2.6	chr6	148808660	148809036	(21996943)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	1	374	(0)	3527479
1430	20.6	3.1	9.3	chr6	149240846	149241262	(21564717)	+	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	1	390	(0)	3528104
1204	20.4	17.6	0.7	chr6	149629225	149629534	(21176445)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	1	374	(0)	3528810
1480	20.4	4.3	8.2	chr6	150367626	150367937	(20438042)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	1	302	(72)	3530112
1316	18.5	7.8	15.8	chr6	150517069	150517491	(20288488)	+	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	5	390	(0)	3530343
11	26.6	5.6	2.7	chr6	150599796	150599812	(20206167)	+	G-rich	Low_complexity	1	29	(46)	3530476
15	14.9	0.0	0.0	chr6	150599813	150599842	(20206137)	+	(GGGGC)n	Simple_repeat	1	30	(0)	3530477
11	26.6	5.6	2.7	chr6	150599843	150599866	(20206113)	+	G-rich	Low_complexity	30	75	(0)	3530476
29	3.2	0.0	0.0	chr6	150599879	150599910	(20206069)	+	(GAGCCC)n	Simple_repeat	1	32	(0)	3530478
418	33.8	6.7	0.9	chr6	154474986	154475209	(16330770)	C	MIRb	SINE/MIR	(12)	256	19	3536464
1425	22.1	4.5	3.5	chr6	155130641	155131010	(15674969)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(0)	374	1	3537692
1862	19.4	2.1	2.1	chr6	157338991	157339364	(13466615)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	1	374	(0)	3540744
1191	21.5	6.8	12.5	chr6	157709002	157709240	(13096739)	C	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	(2)	388	178	3541323
408	29.9	20.2	1.8	chr6	168329012	168329341	(2476638)	+	L2	LINE/L2	2670	3075	(344)	3555377
881	22.6	17.5	0.3	chr7	358514	358811	(158987162)	+	MLT1F	LTR/ERVL-MaLR	182	541	(7)	3558241
1445	20.1	6.7	2.2	chr7	2777438	2777794	(156568179)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	1	374	(0)	3561984
917	21.2	6.8	10.3	chr7	4521357	4521629	(154824344)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(0)	374	112	3565007
2035	19.1	0.8	5.6	chr7	4885825	4886234	(154459739)	C	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	(0)	390	1	3565700
1389	18.9	5.0	3.9	chr7	6183714	6184048	(153161925)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	2	340	(34)	3568756
14	13.0	5.9	0.0	chr7	16753728	16753761	(142592212)	+	G-rich	Low_complexity	1	36	(0)	3582985
11	18.1	2.4	4.8	chr7	16753799	16753839	(142592134)	+	(CGCCGCG)n	Simple_repeat	1	42	(0)	3582986
1722	18.4	8.2	1.6	chr7	22831592	22831955	(136514018)	+	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	1	390	(0)	3591296
1467	19.7	3.9	6.0	chr7	22844468	22844866	(136501107)	C	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	(0)	390	1	3591330
1471	21.1	5.1	5.6	chr7	26590108	26590499	(132755474)	+	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	1	390	(0)	3597287
342	36.7	3.8	2.2	chr7	28862971	28863201	(130482772)	+	MIRb	SINE/MIR	1	235	(33)	3600686
1621	12.4	1.6	8.8	chr7	39590908	39591235	(119754738)	C	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	(0)	390	87	3616766
1719	17.2	4.4	6.2	chr7	41988475	41988762	(117357211)	+	MLT1A0	LTR/ERVL-MaLR	77	365	(0)	3620627
1128	20.2	2.8	2.4	chr7	43335395	43335643	(116010330)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	125	374	(0)	3622486
1540	20.8	2.4	2.1	chr7	44186224	44186596	(115159377)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	1	374	(0)	3623931
22	13.4	0.0	0.0	chr7	44200737	44200770	(115145203)	+	(A)n	Simple_repeat	1	34	(0)	3623953
1612	21.5	4.3	3.5	chr7	45521916	45522281	(113823692)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(0)	374	6	3626040
1471	21.6	1.6	8.7	chr7	51793563	51793963	(107552010)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(2)	372	1	3634114
972	21.9	2.1	0.0	chr7	67368200	67368382	(91977591)	+	MLT1A0	LTR/ERVL-MaLR	179	365	(0)	3652054
1085	24.8	4.4	7.2	chr7	67577895	67578080	(91767893)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(11)	363	188	3652558
37	0.0	2.9	0.0	chr7	67578081	67578115	(91767858)	+	(GA)n	Simple_repeat	1	36	(0)	3652559
1659	17.8	5.9	4.6	chr7	69274399	69274764	(90071209)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(0)	374	4	3656290
1932	19.9	0.5	4.9	chr7	69343830	69344220	(90001753)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	1	374	(0)	3656453
1097	18.8	0.5	0.0	chr7	74279824	74280025	(85065948)	C	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	(0)	390	188	3666661
1315	25.3	2.9	2.7	chr7	88115344	88115716	(71230257)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(0)	374	1	3688128
1703	21.3	3.2	1.9	chr7	98522611	98522979	(60822994)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(0)	374	1	3702801
1481	22.0	4.5	4.8	chr7	98589172	98589548	(60756425)	C	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	(4)	386	11	3702939
5383	19.2	18.0	11.8	chr7	99822868	99824498	(59521475)	+	MER52A	LTR/ERV1	1	1755	(0)	3705340
1825	18.3	2.4	5.0	chr7	101367695	101367907	(57978066)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	159	370	(4)	3708625
1668	19.1	4.2	2.9	chr7	101566490	101566839	(57779134)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(19)	355	1	3709131
1049	23.3	3.5	1.6	chr7	107384654	107384902	(51961071)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	110	363	(11)	3719005
1679	20.3	4.0	2.2	chr7	111604658	111605024	(47740949)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(0)	374	1	3724572
1068	22.5	11.5	6.6	chr7	112193782	112194128	(47151845)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(8)	366	1	3725432
58	4.9	0.0	0.0	chr7	113086162	113086224	(46259749)	+	(AC)n	Simple_repeat	1	63	(0)	3726683
1340	21.1	5.6	7.6	chr7	116237643	116238039	(43107934)	C	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	(0)	467	1	3730773
478	23.2	5.1	0.0	chr7	122293321	122293432	(37052541)	+	MLT1D	LTR/ERVL-MaLR	270	387	(118)	3738916
705	23.5	0.0	0.0	chr7	122293442	122293590	(37052383)	+	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	192	340	(50)	3738917
1085	19.4	0.5	0.0	chr7	132747904	132748094	(26597879)	C	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	(2)	388	197	3754881
1181	19.2	13.9	8.8	chr7	135876333	135876685	(23469288)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	1	374	(0)	3759741
954	21.1	6.6	4.0	chr7	136304354	136304605	(23041368)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	116	374	(0)	3760442
785	18.3	7.1	0.8	chr7	137947108	137947285	(21398688)	+	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	173	374	(16)	3762638
1565	21.3	3.6	3.8	chr7	147744555	147744945	(11601028)	C	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	(0)	390	1	3777699
1760	18.7	2.8	4.5	chr7	148740611	148741007	(10604966)	+	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	1	390	(0)	3779308
1609	20.4	5.1	1.4	chr7	148953064	148953421	(10392552)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	3	374	(0)	3779683
1081	20.1	0.9	2.1	chr7	149265460	149265693	(10080280)	C	MLT1A0	LTR/ERVL-MaLR	(134)	231	1	3780423
1337	24.5	2.5	2.2	chr7	156072104	156072462	(3273511)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	1	360	(14)	3790443
1580	14.5	7.4	6.3	chr7	156286107	156286468	(3059505)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	9	374	(0)	3790716
1188	23.1	6.4	4.4	chr7	156532167	156532532	(2813441)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(0)	374	1	3791013
815	19.5	3.0	0.0	chr8	8659806	8659964	(136478672)	+	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	181	344	(46)	3805096
1484	19.4	3.5	9.1	chr8	9193447	9193843	(135944793)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	1	374	(0)	3806080
1281	22.8	7.2	4.5	chr8	9400999	9401375	(135737261)	C	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	(2)	388	1	3806447
1486	21.1	3.5	2.4	chr8	10959385	10959754	(134178882)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(0)	374	1	3808830
1376	22.6	6.2	5.0	chr8	11241824	11242204	(133896432)	+	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	5	390	(0)	3809322
1164	19.7	9.0	9.4	chr8	13250951	13251342	(131887294)	C	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	(0)	390	1	3812378
1584	22.2	1.4	3.2	chr8	17421450	17421826	(127716810)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	1	370	(4)	3818159
1665	20.8	3.2	0.8	chr8	17518787	17519149	(127619487)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(2)	372	1	3818321
418	23.2	15.5	2.3	chr8	17611108	17611235	(127527401)	+	MIR3	SINE/MIR	40	187	(21)	3818451
1662	18.5	4.7	8.0	chr8	20166691	20167090	(124971546)	+	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	1	386	(4)	3822372
1571	22.3	2.6	6.8	chr8	21580162	21580560	(123558076)	+	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	1	382	(8)	3824680
1330	23.8	3.9	4.3	chr8	21873539	21873929	(123264707)	C	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	(0)	390	2	3825188
1084	21.1	18.5	4.0	chr8	24929911	24930234	(120208402)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(15)	375	5	3830185
1677	21.8	5.3	5.1	chr8	27016699	27017071	(118121565)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(0)	374	1	3833683
1814	15.0	0.8	20.2	chr8	27502432	27502916	(117635720)	C	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	(0)	390	1	3834488
2030	16.9	4.1	1.9	chr8	28261305	28261601	(116877035)	+	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	82	457	(0)	3835793
2285	15.6	1.0	3.5	chr8	29748354	29748657	(115389979)	+	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	95	390	(0)	3838450
1296	23.2	0.9	7.4	chr8	31226836	31227202	(113911434)	C	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	(0)	390	48	3841259
1449	22.6	3.5	1.9	chr8	37386862	37387226	(107751410)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	4	374	(0)	3850235
1696	16.4	9.6	6.1	chr8	37482944	37483334	(107655302)	+	MLT1A1	LTR/ERVL-MaLR	3	408	(0)	3850384
1624	19.4	4.6	8.4	chr8	42096707	42096943	(103041693)	C	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	(0)	390	172	3858130
890	21.9	37.9	0.4	chr8	42704034	42704316	(102434320)	C	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	(0)	390	1	3859325
1504	18.1	9.8	2.5	chr8	51985873	51986195	(93152441)	+	MLT1A0	LTR/ERVL-MaLR	1	349	(16)	3867551
10020	11.6	4.4	4.2	chr8	65976761	65978335	(79160301)	C	LTR12C	LTR/ERV1	(0)	1579	2	3886694
1346	22.3	9.0	0.3	chr8	74669875	74670207	(70468429)	+	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	8	372	(18)	3899957
32	7.2	0.0	0.0	chr8	91040818	91040861	(54097775)	+	(GCTGCTGCC)n	Simple_repeat	1	44	(0)	3921971
12	30.4	1.7	1.7	chr8	102654760	102654817	(42483819)	+	(CCCACCT)n	Simple_repeat	1	59	(0)	3940825
1420	20.9	4.0	6.2	chr8	105481249	105481636	(39657000)	C	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	(0)	390	12	3945204
1455	22.0	3.1	6.2	chr8	124071661	124072029	(21066607)	C	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	(0)	390	34	3973045
245	34.6	7.2	2.2	chr8	127899382	127899564	(17239072)	+	MIRc	SINE/MIR	31	223	(45)	3980359
1717	18.7	3.9	6.2	chr8	133502267	133502666	(11635970)	+	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	1	390	(0)	3990579
1181	24.5	1.6	10.9	chr9	14246788	14247199	(124147518)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	1	373	(1)	4028708
1981	17.0	3.3	1.1	chr9	18542377	18542757	(119851960)	+	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	1	390	(0)	4034818
1385	20.1	8.0	2.6	chr9	21130089	21130440	(117264277)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(0)	374	2	4038888
1480	23.6	3.4	3.4	chr9	26707799	26708184	(111686533)	C	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	(4)	386	1	4046004
191	23.4	0.0	4.1	chr9	34114676	34114724	(104279993)	C	L2a	LINE/L2	(93)	3333	3287	4056755
1327	22.0	8.1	5.0	chr9	38302503	38302861	(100091856)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	1	371	(3)	4064339
590	34.2	3.8	1.6	chr9	77712422	77712730	(60681987)	C	LTR16E1	LTR/ERVL	(0)	538	223	4094690
1516	22.6	4.8	1.1	chr9	83126129	83126486	(55268231)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	1	372	(2)	4102412
1681	18.5	5.7	5.7	chr9	84847867	84848079	(53546638)	C	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	(0)	390	188	4105344
37	0.0	0.0	0.0	chr9	84848080	84848111	(53546606)	+	(AG)n	Simple_repeat	1	32	(0)	4105345
1250	22.4	8.2	3.0	chr9	84976107	84976475	(53418242)	C	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	(0)	390	1	4105539
1591	21.7	1.6	7.3	chr9	86129008	86129404	(52265313)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	1	374	(0)	4107363
1596	22.0	2.9	2.7	chr9	86597213	86597585	(51797132)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(0)	374	1	4108150
1001	23.4	2.4	5.9	chr9	90941827	90942131	(47452586)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(80)	294	1	4114479
973	25.1	4.6	0.6	chr9	91846204	91846548	(46548169)	+	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	1	371	(19)	4115818
1347	21.9	8.2	2.6	chr9	95638193	95638539	(42756178)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(4)	370	3	4121513
1396	19.7	7.8	7.7	chr9	96579600	96579838	(41814879)	+	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	172	505	(0)	4123113
1530	21.8	0.8	8.9	chr9	112056925	112057327	(26337390)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	1	370	(4)	4149075
62	4.5	6.5	0.0	chr9	114718137	114718228	(23676489)	+	(TC)n	Simple_repeat	1	98	(0)	4154296
1421	21.6	8.5	2.5	chr9	114718229	114718420	(23676297)	+	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	202	390	(0)	4154295
1661	19.7	3.2	2.4	chr9	121831832	121832201	(16562516)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(1)	373	1	4167774
1826	17.5	1.9	2.8	chr9	121860513	121860876	(16533841)	+	MLT1A0	LTR/ERVL-MaLR	1	361	(4)	4167820
37	22.7	0.0	0.0	chr9	122228971	122229053	(16165664)	+	(CCT)n	Simple_repeat	1	83	(0)	4168590
20	30.4	0.0	2.9	chr9	122229146	122229214	(16165503)	+	(AC)n	Simple_repeat	1	69	(0)	4168591
1723	19.4	4.9	1.7	chr9	124092137	124092493	(14302224)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	1	369	(5)	4171895
1684	20.7	2.4	2.9	chr9	124121674	124122047	(14272670)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(2)	372	1	4171974
478	30.5	6.5	1.0	chr9	129235490	129235694	(9159023)	C	LTR16E1	LTR/ERVL	(0)	538	322	4182388
495	26.2	12.6	6.6	chr9	129355741	129356014	(9038703)	C	MLT1G	LTR/ERVL-MaLR	(5)	484	192	4182633
1788	19.0	4.3	6.0	chr9	132021644	132022024	(6372693)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	1	374	(0)	4188089
1513	21.3	3.9	2.5	chr9	132495673	132496029	(5898688)	+	MLT1A0	LTR/ERVL-MaLR	4	365	(0)	4189016
1532	21.1	5.0	1.6	chr9	135379372	135379741	(3014976)	+	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	1	383	(7)	4193125
916	22.4	3.5	1.8	chr9	135595929	135596155	(2798562)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(0)	374	144	4193417
1145	19.7	0.9	0.0	chrX	9571032	9571239	(146469656)	C	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	(0)	390	181	4375015
1703	15.8	5.7	12.8	chrX	15678433	15678853	(140362042)	C	MSTD	LTR/ERVL-MaLR	(0)	396	8	4384774
1943	18.0	3.9	1.8	chrX	18404086	18404445	(137636450)	C	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	(0)	390	23	4389457
1523	19.9	8.8	1.7	chrX	23215485	23215831	(132825064)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	1	374	(0)	4397193
23	20.0	4.2	2.7	chrX	24150334	24150405	(131890490)	+	(GGC)n	Simple_repeat	1	75	(0)	4398944
38	4.8	0.0	0.0	chrX	25013654	25013697	(131027198)	+	(GCC)n	Simple_repeat	1	44	(0)	4400467
1661	18.4	4.8	5.7	chrX	39670964	39671352	(116369543)	+	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	1	560	(0)	4420952
1830	17.2	4.9	9.3	chrX	39751961	39752304	(116288591)	+	MLT1B	LTR/ERVL-MaLR	1	336	(54)	4421110
2592	5.3	0.0	0.0	chrX	39752305	39752603	(116288292)	+	AluYh3	SINE/Alu	2	300	(11)	4421111
1717	19.4	3.0	6.0	chrX	41374286	41374669	(114666226)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	3	374	(0)	4424240
1083	12.3	1.7	0.6	chrX	46850047	46850218	(109190677)	C	MLT1A0	LTR/ERVL-MaLR	(14)	351	178	4432905
13	8.0	3.5	3.3	chrX	49039951	49039979	(107000916)	+	(CCTCC)n	Simple_repeat	1	30	(0)	4437366
438	23.6	4.6	5.2	chrX	68345284	68345457	(87695438)	+	L1ME4c	LINE/L1	338	510	(320)	4456084
340	11.3	0.0	0.0	chrX	68345527	68345579	(87695316)	+	L1MC4	LINE/L1	7710	7762	(280)	4456085
46	32.8	0.6	0.6	chrX	74421702	74421873	(81619022)	+	(AGCCGG)n	Simple_repeat	1	173	(0)	4465612
6115	11.3	3.5	0.7	chrX	76191796	76193207	(79847688)	C	L1MA1	LINE/L1	(0)	7721	6269	4467338
19	25.4	0.0	3.1	chrX	130340011	130340074	(25700821)	+	(GCCGG)n	Simple_repeat	1	64	(0)	4536394
1761	27.9	3.0	2.7	chrX	150324424	150324886	(5716009)	+	LTR16E1	LTR/ERVL	2	470	(68)	4565728
1551	23.5	4.5	1.4	chrX	153562762	153563123	(2477772)	C	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	(0)	374	1	4570405
1710	19.5	4.3	3.0	chrX	155534820	155535184	(505711)	+	MLT1A	LTR/ERVL-MaLR	5	374	(0)	4573449